JP2015171359A - Modified pyranose oxidases - Google Patents

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Abstract

PROBLEM TO BE SOLVED: To provide modified pyranose oxidases unsusceptible to oxygen, genes thereof, vectors, transformed cells and production methods thereof, as well as methods for measuring pyranose by using the enzyme, reagent compositions and sensors for pyranose measurement.SOLUTION: It was found that modified pyranose oxidases having an excellent feature that being unsusceptible to oxygen can be obtained by substituting amino acids of a pyranose oxidase (POD). Further, it was found that by using a polynucleotide encoding the modified enzyme, the enzyme can be produced with efficiency, and that pyranose measurement unsusceptible to oxygen is enabled by using the enzyme of the invention.

Description

本発明は、改変型ピラノース酸化酵素、該酵素をコードするポリヌクレオチド、該酵素の製造方法、該酵素を用いたピラノースの測定方法、測定試薬組成物及びバイオセンサに関する。   The present invention relates to a modified pyranose oxidase, a polynucleotide encoding the enzyme, a method for producing the enzyme, a method for measuring pyranose using the enzyme, a measuring reagent composition, and a biosensor.

ピラノース酸化酵素は、グルコースや他のピラノースを酸化し、酸素に電子を供与して過酸化水素を生成する反応を触媒する酵素である(特許文献1及び特許文献2)。該酵素は、糖尿病のマーカーである1,5−アンヒドログルシトール(1,5−AG)を基質とするため、糖尿病の診断薬に利用されている。   Pyranose oxidase is an enzyme that catalyzes a reaction that oxidizes glucose and other pyranose and donates electrons to oxygen to generate hydrogen peroxide (Patent Documents 1 and 2). Since the enzyme uses 1,5-anhydroglucitol (1,5-AG), which is a marker for diabetes, as a substrate, it is used as a diagnostic agent for diabetes.

1,5−AGは、食事等による影響を受けにくい糖尿病診断マーカーとして重要であり、更に、糖尿病予備軍である食後高血糖の診断マーカーとしても注目されている。1,5−AGの測定法の中には、基質の電子を酵素がメディエータへ供与する工程を含む、メディエータが介在した測定法がある。ピラノース酸化酵素は、メディエータだけでなく、酸素へも電子を供与してしまうため、血中の溶存酸素により測定誤差が生じるという問題があった。このため、血中の溶存酸素の影響を受けにくい酵素が求められていた。   1,5-AG is important as a diagnostic marker for diabetes that is not easily affected by meals and the like, and is also attracting attention as a diagnostic marker for postprandial hyperglycemia, which is a diabetic reserve army. Among the measurement methods for 1,5-AG, there is a measurement method mediated by a mediator, including a step in which an enzyme donates an electron of a substrate to the mediator. Since pyranose oxidase donates electrons not only to the mediator but also to oxygen, there is a problem that measurement errors occur due to dissolved oxygen in the blood. For this reason, there has been a demand for an enzyme that is not easily affected by dissolved oxygen in the blood.

ピラノース酸化酵素は種々の由来酵素が知られており、アミノ酸配列も開示されている(特許文献3及び非特許文献1〜5)。   As for pyranose oxidase, various derived enzymes are known, and amino acid sequences are also disclosed (Patent Document 3 and Non-Patent Documents 1 to 5).

特開平02−42980号公報Japanese Patent Laid-Open No. 02-42980 特開2007−300818号公報JP 2007-300818 A US6146865号公報US Pat. No. 6,146,865

Microbial Cell Factories 9:57(2010)Microbial Cell Factories 9:57 (2010) Appl.Environ.Microbiol.70:5794―5800(2004)Appl. Environ. Microbiol. 70: 5794-5800 (2004) Appl.Microbiol.Biotechnol.67:654―663(2005)Appl. Microbiol. Biotechnol. 67: 654-663 (2005) J.Biotechnol.52:11―20(1996)J. et al. Biotechnol. 52: 11-20 (1996) Biotechnol.Lett.31、1223―1228(2009)Biotechnol. Lett. 31, 1223-1228 (2009)

本発明は、酸素の影響を受けにくい改変型ピラノース酸化酵素及びその製造方法を提供する。更に、該酵素によるピラノースの測定方法、測定試薬組成物及びセンサを提供することを目的とする。   The present invention provides a modified pyranose oxidase that is less susceptible to oxygen and a method for producing the same. Furthermore, it aims at providing the measuring method of a pyranose by this enzyme, a measuring reagent composition, and a sensor.

本発明は、ピラノース酸化酵素(POD)のアミノ酸を置換することで、酸素の影響を受けにくいという優れた特性を有する改変型ピラノース酸化酵素を取得できることを見出した。更に、該酵素をコードするポリヌクレオチドを用いて該酵素を効率的に製造できるということ、及び該酵素を用いて酸素の影響を受けにくいピラノース測定が可能なことを見出し、本発明に至った。   The present invention has found that by replacing an amino acid of pyranose oxidase (POD), it is possible to obtain a modified pyranose oxidase having an excellent characteristic that it is hardly affected by oxygen. Furthermore, the present inventors have found that the enzyme can be efficiently produced using a polynucleotide encoding the enzyme, and that it is possible to measure pyranose that is hardly affected by oxygen using the enzyme.

すなわち、本発明は、以下の[1]〜[9]に関する。
[態様1]
ピラノース酸化酵素のアミノ酸配列において、
配列番号2で示されるアミノ酸配列のP147、L214、L216、Q421、H423又はF447に対応する位置のアミノ酸のうち少なくとも1つのアミノ酸残基における置換を含み、
改変前のピラノース酸化酵素に比べて、蛋白量あたりのピラノース脱水素酵素活性(PDH比活性)と蛋白量あたりのピラノース酸化酵素活性(POD比活性)との比(PDH/POD)が大きくなっている、改変型ピラノース酸化酵素。
[態様2]
ピラノース酸化酵素活性を有するタンパク質のアミノ酸配列であって、配列番号2、9、10、11、12、13もしくは14で示されるアミノ酸配列、配列番号2、9、10、11、12、13もしくは14で示されるアミノ酸配列と少なくとも95%の類似性を有するアミノ酸配列、又は配列番号2、9、10、11、12、13もしくは14で示されるアミノ酸配列において1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列において、
配列番号2で示されるアミノ酸配列のP147、L214、L216、Q421、H423又はF447に対応する位置のアミノ酸のうち少なくとも1つのアミノ酸残基における置換を含む、
態様1記載の改変型ピラノース酸化酵素。
[態様3]
P147に対応する位置のアミノ酸がプロリンであり、L214に対応する位置のアミノ酸がロイシン又はイソロイシンであり、L216に対応する位置のアミノ酸がロイシンであり、Q421に対応する位置のアミノ酸がグルタミンであり、H423に対応する位置のアミノ酸がヒスチジンであり、及びF447に対応する位置のアミノ酸がフェニルアラニンである、態様1又は2記載の改変型ピラノース酸化酵素。
[態様4]
P147、L214、L216、Q421、H423又はF447に対応する位置の少なくとも1つのアミノ酸残基がアラニンに置換された、態様1〜3の何れか1項に記載の改変型ピラノース酸化酵素。
[態様5]
配列番号2で示されるアミノ酸配列を有する酵素のPDH/PODを1倍とした場合に、PDH/PODが少なくとも2倍である、態様1〜4の何れか1項に記載の改変型ピラノース酸化酵素。
[態様6]
態様1〜5の何れか1項に記載の改変型ピラノース酸化酵素をコードするポリヌクレオチド。
[態様7]
態様6記載のポリヌクレオチドを含む組換えベクター。
[態様8]
態様7記載のベクターで形質転換された形質転換細胞。
[態様9]
態様8の形質転換細胞を培養し、得られた培養物から改変型ピラノース酸化酵素を採取することを特徴とする、改変型ピラノース酸化酵素の製造方法。
[態様10]
態様1〜5の何れか1項に記載の改変型ピラノース酸化酵素を使用するピラノース測定方法。
[態様11]
態様1〜5の何れかに1項記載の改変型ピラノース酸化酵素を含むピラノース測定試薬組成物。
[態様12]
態様1〜5の何れかに1項記載の改変型ピラノース酸化酵素を含むピラノース測定用バイオセンサ。
That is, the present invention relates to the following [1] to [9].
[Aspect 1]
In the amino acid sequence of pyranose oxidase,
Comprising substitution at least one amino acid residue among amino acids at positions corresponding to P147, L214, L216, Q421, H423 or F447 of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2,
Compared to the pyranose oxidase before modification, the ratio (PDH / POD) of pyranose dehydrogenase activity (PDH specific activity) per protein amount and pyranose oxidase activity (POD specific activity) per protein amount is increased. A modified pyranose oxidase.
[Aspect 2]
An amino acid sequence of a protein having pyranose oxidase activity, the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2, 9, 10, 11, 12, 13 or 14; SEQ ID NO: 2, 9, 10, 11, 12, 13 or 14 An amino acid sequence having at least 95% similarity to the amino acid sequence shown in FIG. 1, or one or several amino acids in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2, 9, 10, 11, 12, 13 or 14 is deleted or substituted Or in the added amino acid sequence:
Including substitution at at least one amino acid residue among amino acids at positions corresponding to P147, L214, L216, Q421, H423 or F447 of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2.
The modified pyranose oxidase according to aspect 1.
[Aspect 3]
The amino acid at the position corresponding to P147 is proline, the amino acid at the position corresponding to L214 is leucine or isoleucine, the amino acid at the position corresponding to L216 is leucine, and the amino acid at the position corresponding to Q421 is glutamine, The modified pyranose oxidase according to embodiment 1 or 2, wherein the amino acid at the position corresponding to H423 is histidine, and the amino acid at the position corresponding to F447 is phenylalanine.
[Aspect 4]
The modified pyranose oxidase according to any one of aspects 1 to 3, wherein at least one amino acid residue at a position corresponding to P147, L214, L216, Q421, H423 or F447 is substituted with alanine.
[Aspect 5]
The modified pyranose oxidase according to any one of Embodiments 1 to 4, wherein PDH / POD is at least twice when PDH / POD of the enzyme having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 is made 1 time .
[Aspect 6]
A polynucleotide encoding the modified pyranose oxidase according to any one of aspects 1 to 5.
[Aspect 7]
A recombinant vector comprising the polynucleotide according to aspect 6.
[Aspect 8]
A transformed cell transformed with the vector according to aspect 7.
[Aspect 9]
A method for producing a modified pyranose oxidase, comprising culturing the transformed cell of aspect 8 and collecting the modified pyranose oxidase from the obtained culture.
[Aspect 10]
A pyranose measurement method using the modified pyranose oxidase according to any one of aspects 1 to 5.
[Aspect 11]
A reagent composition for measuring pyranose comprising the modified pyranose oxidase according to any one of aspects 1 to 5.
[Aspect 12]
A biosensor for measuring pyranose comprising the modified pyranose oxidase according to any one of aspects 1 to 5.

本発明により、酸素の影響を受けにくいという優れた特性を有する改変型ピラノース酸化酵素を利用することが可能になった。更に、本発明の改変型ピラノース酸化酵素を効率的に製造できるようになり、酸素が存在する試料においても、該酵素を用いてより正確なピラノース測定が可能になった。   According to the present invention, it is possible to use a modified pyranose oxidase having an excellent characteristic that it is hardly affected by oxygen. Furthermore, the modified pyranose oxidase of the present invention can be efficiently produced, and even in a sample in which oxygen is present, more accurate pyranose measurement can be performed using the enzyme.

本発明の改変型ピラノース酸化酵素の評価結果を示す図である。各酵素のPOD比活性(蛋白量あたりのPOD活性)を白い棒、各酵素のPDH比活性(蛋白量あたりのPDH活性)をストライプの棒で示した。三角及び数値は、WTの改変率(倍)を1倍としたときの、各改変型酵素の改変率(倍)を示した。It is a figure which shows the evaluation result of the modified | denatured pyranose oxidase of this invention. The POD specific activity (POD activity per protein amount) of each enzyme is indicated by a white bar, and the PDH specific activity (PDH activity per protein amount) of each enzyme is indicated by a stripe bar. Triangles and numerical values show the modification rate (fold) of each modified enzyme when the modification rate (fold) of WT is set to 1. 本発明の改変型ピラノース酸化酵素による1,5−AGの測定結果を示す図である。It is a figure which shows the measurement result of 1, 5-AG by the modified | denatured pyranose oxidase of this invention. 本発明の改変型ピラノース酸化酵素によるグルコースの測定結果を示す図である。It is a figure which shows the measurement result of glucose by the modified | denatured pyranose oxidase of this invention. 配列番号2、9、10、11、12、13及び14をUniProtのAlignで、Run Alignした結果に、改変位置を四角で囲んで示した図である。FIG. 5 is a diagram showing the result of Run Alignment of SEQ ID NOs: 2, 9, 10, 11, 12, 13, and 14 with UniProt Align, and the modification positions surrounded by squares.

本明細書の“改変型酵素”とは、ピラノース酸化酵素を構成する一部のアミノ酸を別のアミノ酸に置換した酵素である。
本明細書の“酸素への電子供与能”とは、酵素が、基質であるピラノースから受け取った電子を酸素に供与する能力である。本発明では、後述のピラノース酸化酵素活性測定法により測定した。
本明細書の“メディエータへの電子供与能”とは、酵素が、基質であるピラノースから受け取った電子をメディエータに供与する能力である。本発明では、後述のピラノース脱水素酵素活性測定法により測定した。
本発明の“改変率(倍)”とは、各酵素の蛋白量あたりのピラノース脱水素酵素活性(PDH比活性)と蛋白量あたりのピラノース酸化酵素活性(POD比活性)との比(PDH/POD)を算出し、配列番号2で示されるアミノ酸配列を有する酵素(WT)のPDH/PODを1倍とした場合の、各改変型酵素のPDH/PODの倍率である。尚、配列番号2で示されるアミノ酸配列を有する酵素(WT)のPDH/PODは、0.63である。
The “modified enzyme” in the present specification is an enzyme obtained by substituting a part of amino acids constituting a pyranose oxidase with another amino acid.
As used herein, “electron donating ability to oxygen” refers to the ability of an enzyme to donate electrons received from a substrate pyranose to oxygen. In this invention, it measured with the below-mentioned pyranose oxidase activity measuring method.
As used herein, “electron donating ability to mediator” is the ability of an enzyme to donate electrons received from a substrate pyranose to a mediator. In the present invention, the measurement was performed by a pyranose dehydrogenase activity measurement method described later.
The “modification rate (times)” of the present invention is the ratio (PDH / activity) of pyranose dehydrogenase activity (PDH specific activity) per protein amount and pyranose oxidase activity (POD specific activity) per protein amount of each enzyme. POD) is a ratio of PDH / POD of each modified enzyme when PDH / POD of the enzyme (WT) having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 is set to 1. The PDH / POD of the enzyme (WT) having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 is 0.63.

本明細書ではアミノ酸残基を1文字表記で表現することがあり、アラニンはA、ロイシンはL、イソロイシンはI、フェニルアラニンはF、グルタミンはQ、ヒスチジンはH、プロリンはPで表す。   In the present specification, amino acid residues may be expressed by single letter notation. Alanine is represented by A, leucine is represented by L, isoleucine is represented by I, phenylalanine is represented by F, glutamine is represented by Q, histidine is represented by H, and proline is represented by P.

本発明の改変型ピラノース酸化酵素は、
ピラノース酸化酵素のアミノ酸配列において、
配列番号2で示されるアミノ酸配列のP147、L214、L216、Q421、H423又はF447に対応する位置のアミノ酸のうち少なくとも1つのアミノ酸残基における置換を含む。尚、該改変型ピラノース酸化酵素は改変前のピラノース酸化酵素に比べて、PDH/PODが大きくなっている。
The modified pyranose oxidase of the present invention is
In the amino acid sequence of pyranose oxidase,
It includes substitution at at least one amino acid residue among amino acids at positions corresponding to P147, L214, L216, Q421, H423 or F447 of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2. The modified pyranose oxidase has a higher PDH / POD than the unmodified pyranose oxidase.

改変前のピラノース酸化酵素のアミノ酸配列は、ピラノース酸化酵素活性を有するタンパク質のアミノ酸配列であれば特に限定されず、公知のピラノース酸化酵素配列を利用できる。例えば、UniProtのP59097、Q75ZP8、Q6QWR1、Q6UG02、P79076及びB9V8M9の配列が例示できる。好ましくは、配列番号2、9、10、11、12、13又は14で示されるアミノ酸配列であり、該配列と相同性を有する配列でも良い。更に、該配列を有するタンパク質は、ピラノース酸化酵素活性を有する。   The amino acid sequence of the pyranose oxidase before modification is not particularly limited as long as it is an amino acid sequence of a protein having pyranose oxidase activity, and a known pyranose oxidase sequence can be used. For example, UniProt's P59097, Q75ZP8, Q6QWR1, Q6UG02, P79076 and B9V8M9 sequences can be exemplified. Preferably, it is an amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2, 9, 10, 11, 12, 13 or 14, and may be a sequence having homology with the sequence. Furthermore, the protein having the sequence has pyranose oxidase activity.

本発明の改変型ピラノース酸化酵素は、
(a)配列番号2、9、10、11、12、13もしくは14で示されるアミノ酸配列、
(b)配列番号2、9、10、11、12、13もしくは14で示されるアミノ酸配列と相同性を有するアミノ酸配列、又は
(c)配列番号2、9、10、11、12、13もしくは14で示されるアミノ酸配列において1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列
において、配列番号2で示されるアミノ酸配列のP147、L214、L216、Q421、H423又はF447に対応する位置のアミノ酸のうち少なくとも1つのアミノ酸残基における置換を含むアミノ酸配列を有するタンパク質である。尚、改変前のタンパク質である、前記(a)、(b)及び(c)に記載のアミノ酸配列を有するタンパク質は、何れもピラノース酸化酵素活性を有する。
The modified pyranose oxidase of the present invention is
(A) the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2, 9, 10, 11, 12, 13 or 14,
(B) an amino acid sequence having homology with the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2, 9, 10, 11, 12, 13 or 14, or (c) SEQ ID NO: 2, 9, 10, 11, 12, 13 or 14 In the amino acid sequence in which one or several amino acids are deleted, substituted or added in the amino acid sequence shown by the above, the position corresponding to P147, L214, L216, Q421, H423 or F447 of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2 A protein having an amino acid sequence containing a substitution in at least one amino acid residue among amino acids. In addition, the protein which has an amino acid sequence as described in said (a), (b) and (c) which is a protein before modification has all pyranose oxidase activity.

相同性を有するとは、類似性が好ましくは少なくとも90%、又は95%、より好ましくは少なくとも96%、97%又は98%のアミノ酸配列である。又は同一性が好ましくは少なくとも50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、92%又は95%のアミノ酸配列である。   Homology is an amino acid sequence that preferably has at least 90%, or 95% similarity, more preferably at least 96%, 97%, or 98%. Or the identity is preferably at least 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 92% or 95% amino acid sequence.

類似性は、GENETYX(株式会社ゼネティックス製)のアミノ酸配列同士のホモロジー解析により算出されたSimilarityの値に基づく。
同一性は、GENETYX(株式会社ゼネティックス製)の塩基配列同士又はアミノ酸配列同士のホモロジー解析により算出されたidentityの値に基づく。
Similarity is based on the value of Similarity calculated by homology analysis between amino acid sequences of GENETYX (manufactured by GENETICS).
The identity is based on the value of identity calculated by homology analysis between the base sequences of GENETYX (manufactured by Genetics Co., Ltd.) or between amino acid sequences.

1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたとは、好ましくは多くとも60個、より好ましくは多くとも55個、50個、40個、30個、20個、10個又は5個のアミノ酸の欠失、置換及び/又は付加である。   A deletion, substitution or addition of one or several amino acids is preferably at most 60, more preferably at most 55, 50, 40, 30, 20, 10, or 5 Amino acid deletion, substitution and / or addition.

ピラノース酸化酵素のアミノ酸配列において「配列番号2で示されるアミノ酸配列のP147、L214、L216、Q421、H423又はF447に対応する位置」という表現は、配列番号2で示されるアミノ酸配列の開始アミノ酸であるメチオニン(M)を1番目とした場合の147番目のプロリン、214番目のロイシン、216番目のロイシン、421番目のグルタミン、423番目のヒスチジン又は447番目のフェニルアラニンに対応するアミノ酸を意味し、配列番号2との配列アライメントにより特定できる。例えば図4に示したように対応する位置を特定できる。   In the amino acid sequence of pyranose oxidase, the expression “position corresponding to P147, L214, L216, Q421, H423 or F447 of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2” is the starting amino acid of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2. The amino acid corresponding to 147th proline, 214th leucine, 216th leucine, 421th glutamine, 423th histidine or 447th phenylalanine when methionine (M) is the first is represented by SEQ ID NO: Can be identified by sequence alignment with 2. For example, the corresponding position can be specified as shown in FIG.

対応する位置のアミノ酸は、P147に対応するのはプロリンであることが好ましく、L214に対応するのはロイシンであることが好ましく、L216に対応するのはロイシン又はイソロイシンであることが好ましく、ロイシンであることがより好ましく、Q421に対応するのはグルタミンであることが好ましく、H423に対応するのはヒスチジンであることが好ましく、F447に対応するのはフェニルアラニンであることが好ましい。   The amino acid at the corresponding position is preferably proline corresponding to P147, preferably leucine corresponding to L214, preferably leucine or isoleucine corresponding to L216, More preferably, Qamine corresponds to glutamine, H423 preferably corresponds to histidine, and F447 preferably corresponds to phenylalanine.

また、置換するアミノ酸について、アラニンであることが好ましい。つまり、P147、L214、L216、Q421、H423又はF447に対応する位置の少なくとも1つのアミノ酸残基がアラニンに置換されることが好ましい。   Moreover, it is preferable that it is alanine about the amino acid to substitute. That is, it is preferable that at least one amino acid residue at a position corresponding to P147, L214, L216, Q421, H423, or F447 is substituted with alanine.

本発明の改変型ピラノース酸化酵素は、ピラノース脱水素酵素(PDH)比活性とピラノース酸化酵素(POD)比活性との比(PDH/POD)が改変前のピラノース酸化酵素より大きく、好ましくは少なくとも1.0であり、より好ましくは少なくとも1.2、1.5又は2.0であって、改変前のピラノース酸化酵素に比べ、酸素の影響を受けにくい。更に、本発明の改変型ピラノース酸化酵素は、配列番号2で示されるアミノ酸配列を有する酵素のPOD比活性を100%とした場合に、POD比活性が好ましくは多くとも90%、80%、70%又は60%である。   The modified pyranose oxidase of the present invention has a ratio (PDH / POD) of pyranose dehydrogenase (PDH) specific activity and pyranose oxidase (POD) specific activity larger than that of the pyranose oxidase before modification, preferably at least 1 0.0, more preferably at least 1.2, 1.5 or 2.0, which is less susceptible to oxygen than the pyranose oxidase prior to modification. Furthermore, the modified pyranose oxidase of the present invention preferably has a POD specific activity of at most 90%, 80%, 70 when the POD specific activity of the enzyme having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 is 100%. % Or 60%.

本発明の改変型ピラノース酸化酵素は、配列番号2で示されるアミノ酸配列を有する酵素のPDH比活性とPOD比活性との比(PDH/POD)を1倍とした場合に、PDH/PODが好ましくは少なくとも2倍、より好ましくは少なくとも2.5倍、3倍、4倍又は5倍である。つまり、改変率(倍)が好ましくは少なくとも2倍、より好ましくは少なくとも2.5倍、3倍、4倍又は5倍である。   The modified pyranose oxidase of the present invention is preferably PDH / POD when the ratio of the PDH specific activity to the POD specific activity (PDH / POD) of the enzyme having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 is 1-fold. Is at least 2 times, more preferably at least 2.5 times, 3 times, 4 times or 5 times. That is, the modification rate (times) is preferably at least 2 times, more preferably at least 2.5 times, 3 times, 4 times or 5 times.

本発明のポリヌクレオチドは、態様1〜5の何れかに記載の改変型ピラノース酸化酵素をコードするポリヌクレオチドである。該ポリヌクレオチドは、イントロンを含む配列であっても良く、cDNAでも良い。例えば、配列番号2、9、10、11、12、13又は14で示されるアミノ酸配列又は該アミノ酸配列と相同性を有するアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドが例示できる。   The polynucleotide of the present invention is a polynucleotide encoding the modified pyranose oxidase according to any one of Embodiments 1 to 5. The polynucleotide may be a sequence containing an intron or may be cDNA. For example, the polynucleotide which codes the amino acid sequence shown by sequence number 2, 9, 10, 11, 12, 13, or 14 or the amino acid sequence which has homology with this amino acid sequence can be illustrated.

本発明のポリヌクレオチドは、公知の方法で容易に調製することができる。例えば、前記の本発明のポリヌクレオチドを鋳型とし、適切なプライマーセットを用いた公知の各種PCR法を利用して、変異を導入することにより調製することができる。又は、人工的に合成しても良い。形質転換細胞に応じてコドンユーセージを最適化したポリヌクレオチドでも良い。   The polynucleotide of the present invention can be easily prepared by a known method. For example, it can be prepared by introducing mutations using the polynucleotide of the present invention as a template and various known PCR methods using appropriate primer sets. Or you may synthesize | combine artificially. The polynucleotide may be a codon usage optimized according to the transformed cell.

鋳型となるポリヌクレオチドは、配列番号1に記載の配列を合成しても良い。又は、配列番号2記載のアミノ酸配列を用いて、公開配列に対して例えばBLAST(blastp又はtblastn)等のホモロジー検索を行って、ヒットした類似性及び/又は同一性を有するアミノ酸配列をコードする遺伝子配列も利用できる。公開配列からプライマーをデザインし、該遺伝子配列の由来株のDNA又はRNAを鋳型としてPCR又はRT−PCRにより増幅して得ることができる。公開配列の由来株と同種又は同属の株からも得ることができる。又は、公開配列情報から人工的に合成できる。類似性は、好ましくは少なくとも90%、95%、97%又は98%である。同一性は、好ましくは少なくとも50%、55%、60%、65%、70%、75%、80%、85%、90%、92%又は95%である。尚、配列番号1に記載の配列は野生型のピラノース酸化酵素のアミノ酸配列である配列番号2の配列をコードする塩基配列である。   As the template polynucleotide, the sequence described in SEQ ID NO: 1 may be synthesized. Alternatively, a gene that encodes an amino acid sequence having similarity and / or identity by hitting a homology search such as BLAST (blastp or tblastn) to the public sequence using the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 2 Arrays are also available. Primers can be designed from the public sequence and amplified by PCR or RT-PCR using the DNA or RNA of the strain derived from the gene sequence as a template. It can also be obtained from strains of the same species or genus as the strain derived from the public sequence. Alternatively, it can be synthesized artificially from public sequence information. The similarity is preferably at least 90%, 95%, 97% or 98%. The identity is preferably at least 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 92% or 95%. The sequence described in SEQ ID NO: 1 is a base sequence encoding the sequence of SEQ ID NO: 2, which is the amino acid sequence of wild-type pyranose oxidase.

本発明の組換えベクターは、クローニングベクター又は発現ベクターであり、ベクターは適宜選択し、インサートとして本発明のポリヌクレオチドを含む。インサートは、宿主が真核細胞の場合、イントロンを含んでいても良い。発現ベクターとしては、原核細胞発現用ベクター又は真核細胞発現用ベクターの何れでも良く、pUC系、pBluescriptII、pET発現システム、pGEX発現システム、pCold発現システム等が例示できるが、タンパク質の大量発現が可能なベクターが好ましい。尚、必要に応じて、シャペロンやリゾチーム等の発現に寄与するポリヌクレオチドを、本発明のポリヌクレオチドと同一及び/又は別のベクターに導入することも可能である。   The recombinant vector of the present invention is a cloning vector or an expression vector, and the vector is appropriately selected and contains the polynucleotide of the present invention as an insert. The insert may contain an intron when the host is a eukaryotic cell. The expression vector may be either a prokaryotic expression vector or a eukaryotic expression vector, and examples thereof include a pUC system, pBluescript II, pET expression system, pGEX expression system, pCold expression system, etc. Preferred vectors. If necessary, a polynucleotide that contributes to the expression of chaperone, lysozyme, etc. can be introduced into the same and / or different vector as the polynucleotide of the present invention.

本発明の形質転換細胞としては、例えば、大腸菌、枯草菌等の原核細胞や、真菌(酵母、アスペルギルス属等の子嚢菌、担子菌等)、昆虫細胞、哺乳動物細胞等の真核細胞等を使用することができ、本発明のベクターで形質転換させて得ることができる。   Examples of the transformed cells of the present invention include prokaryotic cells such as Escherichia coli and Bacillus subtilis, eukaryotic cells such as fungi (yeast, Aspergillus genus Ascomycetes, basidiomycetes, etc.), insect cells, mammalian cells and the like. And can be obtained by transformation with the vector of the present invention.

本発明の形質転換細胞を培養して得られた培養物から改変型ピラノース酸化酵素を採取することによって、組換え改変型ピラノース酸化酵素を製造することができる。   A recombinant modified pyranose oxidase can be produced by collecting the modified pyranose oxidase from a culture obtained by culturing the transformed cell of the present invention.

本発明で使用される改変型ピラノース酸化酵素生産菌の培養には、通常の微生物培養用培地が使用できる。例えば、炭素源、窒素源、ビタミン類、無機物、その他使用する微生物が必要とする微量栄養素を程よく含有するものであれば、合成培地、天然培地の何れでも使用可能である。炭素源としては、グルコース、スクロース、デキストリン、澱粉、グリセリン、糖蜜等が使用できる。窒素源としては、塩化アンモニウム、硝酸アンモニウム、硫酸アンモニウム、リン酸アンモニウム等の無機塩類、DL−アラニン、L−グルタミン酸等のアミノ酸類、ペプトン、肉エキス、酵母エキス、麦芽エキス、コーンスティープリカー等の窒素含有天然物が使用できる。ビタミン類としては、リボフラビン、ピリドキシン、ナイアシン(ニコチン酸)、チアミン等が使用できる。無機物としては、リン酸一ナトリウム、リン酸二ナトリウム、リン酸一カリウム、リン酸二カリウム、硫酸マグネシウム、塩化第二鉄等が使用できる。更に、タンパク質の発現の調整に必要な化合物を適宜添加しても良い。   For culturing the modified pyranose oxidase-producing bacterium used in the present invention, a normal microorganism culture medium can be used. For example, any of a synthetic medium and a natural medium can be used as long as they contain moderate amounts of carbon sources, nitrogen sources, vitamins, inorganic substances, and other micronutrients required by microorganisms to be used. As the carbon source, glucose, sucrose, dextrin, starch, glycerin, molasses and the like can be used. Nitrogen sources include inorganic salts such as ammonium chloride, ammonium nitrate, ammonium sulfate, and ammonium phosphate, amino acids such as DL-alanine and L-glutamic acid, nitrogen containing peptone, meat extract, yeast extract, malt extract, corn steep liquor, etc. Natural products can be used. As vitamins, riboflavin, pyridoxine, niacin (nicotinic acid), thiamine and the like can be used. As the inorganic substance, monosodium phosphate, disodium phosphate, monopotassium phosphate, dipotassium phosphate, magnesium sulfate, ferric chloride and the like can be used. Furthermore, compounds necessary for adjusting protein expression may be added as appropriate.

本発明の改変型ピラノース酸化酵素を得るための培養は、通常、振盪培養や通気攪拌等の方法により行うのが良い。改変型ピラノース酸化酵素生産菌の特性を踏まえて、改変型ピラノース酸化酵素の生産に適した培養条件に設定すれば良い。例えば、培養温度は10℃から45℃、且つpH4からpH10の範囲で行うのが好ましく、生産性を考慮して培養中にpH調整をしても良い。培養期間は回分培養であれば、1日から6日の範囲が好ましいが、流加培養や連続培養による生産量増大を行うのであれば、生産性が最適と判断される範囲で期間を延ばすことができる。   The culture for obtaining the modified pyranose oxidase of the present invention is usually preferably performed by a method such as shaking culture or aeration stirring. Based on the characteristics of the modified pyranose oxidase-producing bacterium, culture conditions suitable for production of the modified pyranose oxidase may be set. For example, the culture temperature is preferably 10 to 45 ° C. and pH 4 to pH 10, and the pH may be adjusted during the culture in consideration of productivity. If the culture period is batch culture, the range of 1 to 6 days is preferable, but if the amount of production is increased by fed-batch culture or continuous culture, the period is extended within the range where productivity is judged to be optimal. Can do.

培養物中から改変型ピラノース酸化酵素を得る方法は、通常のタンパク質の製造方法が利用できる。例えば、最初に改変型ピラノース酸化酵素生産菌を培養後、遠心分離により培養上清液を得る。又は培養菌体を得、適当な方法で該培養微生物を破砕し、破砕液から遠心分離等によって上清液を得る。次に、これらの上清液中に含まれる改変型ピラノース酸化酵素を、通常のタンパク質の精製方法で精製し、精製酵素を得ることができる。例えば、限外ろ過、塩析、溶媒沈殿、熱処理、透析、イオン交換クロマトグラフィー、疎水性クロマトグラフィー、ゲルろ過、アフィニティークロマトグラフィー等の精製操作を組み合わせることによって精製できる。   As a method for obtaining the modified pyranose oxidase from the culture, an ordinary protein production method can be used. For example, after first cultivating a modified pyranose oxidase-producing bacterium, a culture supernatant is obtained by centrifugation. Alternatively, cultured cells are obtained, the cultured microorganisms are crushed by an appropriate method, and a supernatant is obtained from the crushed liquid by centrifugation or the like. Next, the modified pyranose oxidase contained in these supernatants can be purified by an ordinary protein purification method to obtain a purified enzyme. For example, it can be purified by combining purification operations such as ultrafiltration, salting out, solvent precipitation, heat treatment, dialysis, ion exchange chromatography, hydrophobic chromatography, gel filtration, and affinity chromatography.

本発明の改変型ピラノース酸化酵素を用いて、ピラノースを測定することができる。本発明のピラノース測定方法は、ピラノースを含む被検試料と本発明の改変型ピラノース酸化酵素とを接触させる工程を備えることにより、被検試料中のピラノースを定量できる。測定対象は、本発明の酵素が作用するピラノースであれば特に限定されない。例えば、グルコース測定用、キシロース測定用、ガラクトース測定用又は1,5−AG測定用として有用である。本発明の酵素は酸素の影響を受けにくいため、溶存酸素の影響を受ける測定系であっても、本発明の酵素を用いることで正確な測定値が得られる。本発明の測定対象は特に限定されないが、例えば生体試料が例示でき、具体例として血液試料が例示できる。更に、本発明の測定法は、被験試料中に存在する、測定に影響を与える夾雑物質を消去、分離又は除去するステップと組み合わせることができる。例えば、1,5−AGを測定対象とする場合は、グルコースを消去、分離又は除去する工程と組み合わせることができる。   Pyranose can be measured using the modified pyranose oxidase of the present invention. The pyranose measurement method of the present invention includes a step of bringing a test sample containing pyranose into contact with the modified pyranose oxidase of the present invention, whereby the pyranose in the test sample can be quantified. The measurement target is not particularly limited as long as it is a pyranose on which the enzyme of the present invention acts. For example, it is useful for glucose measurement, xylose measurement, galactose measurement, or 1,5-AG measurement. Since the enzyme of the present invention is hardly affected by oxygen, an accurate measurement value can be obtained by using the enzyme of the present invention even in a measurement system that is affected by dissolved oxygen. Although the measuring object of this invention is not specifically limited, For example, a biological sample can be illustrated and a blood sample can be illustrated as a specific example. Furthermore, the measurement method of the present invention can be combined with a step of eliminating, separating or removing impurities present in the test sample that affect the measurement. For example, when 1,5-AG is a measurement target, it can be combined with a step of eliminating, separating or removing glucose.

本発明の改変型ピラノース酸化酵素を用いて、ピラノース測定試薬組成物を製造することができ、該酵素を含むピラノース測定試薬組成物を簡便に製造することが可能となった。本発明の試薬組成物は、酵素として本発明の改変型ピラノース酸化酵素を含む試薬組成物であれば良い。該組成物中の酵素量は、測定対象を測定できれば特に限定されないが、0.0001から50U程度が好ましく、0.001から20U程度がより好ましい。更に、任意のメディエータ(電子受容体)を含ませることができ、例えば、フェリシアン化化合物、キノン系化合物、オスミウム系化合物、フェナジン系化合物、フェノチアジン系化合物等が例示できる。また、該組成物は、安定化剤又は緩衝剤等の当業者に公知の他の任意成分を適宜含有させ、該酵素や試薬成分の熱安定性や保存安定性を高めることができる。牛血清アルブミン(BSA)若しくは卵白アルブミン、該酵素と作用性のない糖類若しくは糖アルコール類、カルボキシル基含有化合物、アルカリ土類金属化合物、アンモニウム塩、硫酸塩又はタンパク質等が例示できる。更に、被験試料中に存在する、測定に影響を与える夾雑物質の影響を抑える公知の物質を、該測定試薬に含ませることができる。   Using the modified pyranose oxidase of the present invention, a pyranose measuring reagent composition can be produced, and a pyranose measuring reagent composition containing the enzyme can be easily produced. The reagent composition of the present invention may be a reagent composition containing the modified pyranose oxidase of the present invention as an enzyme. The amount of enzyme in the composition is not particularly limited as long as the measurement target can be measured, but is preferably about 0.0001 to 50 U, more preferably about 0.001 to 20 U. Furthermore, arbitrary mediators (electron acceptors) can be included, and examples include ferricyanide compounds, quinone compounds, osmium compounds, phenazine compounds, phenothiazine compounds, and the like. In addition, the composition may appropriately contain other optional components known to those skilled in the art such as a stabilizer or a buffering agent, thereby enhancing the thermal stability and storage stability of the enzyme and reagent components. Examples include bovine serum albumin (BSA) or ovalbumin, saccharides or sugar alcohols having no activity with the enzyme, carboxyl group-containing compounds, alkaline earth metal compounds, ammonium salts, sulfates or proteins. Furthermore, a known substance that suppresses the influence of contaminants that affect the measurement present in the test sample can be included in the measurement reagent.

本発明の改変型ピラノース酸化酵素を使用したバイオセンサを製造できる。本発明のバイオセンサは、酵素として本発明の改変型ピラノース酸化酵素を反応層に含むセンサであれば良い。例えば、該バイオセンサは、絶縁性基板上にスクリーン印刷や蒸着等の方法を利用して電極系を形成し、更に該酵素とメディエータとを備えることによって作製される。この他に、発色強度又はpH変化等を検知する方式のバイオセンサも構築可能である。酸素の影響を受けにくい、グルコースセンサ、キシロースセンサ、ガラクトースセンサ又は1,5−AGセンサ等を作製することができる。   A biosensor using the modified pyranose oxidase of the present invention can be produced. The biosensor of the present invention may be any sensor that includes the modified pyranose oxidase of the present invention in the reaction layer as an enzyme. For example, the biosensor is manufactured by forming an electrode system on an insulating substrate using a method such as screen printing or vapor deposition, and further including the enzyme and a mediator. In addition, it is possible to construct a biosensor that detects color development intensity or pH change. A glucose sensor, a xylose sensor, a galactose sensor, a 1,5-AG sensor, or the like that is hardly affected by oxygen can be manufactured.

更に本発明の改変型ピラノース酸化酵素は、バイオ電池に用いることができる。本発明のバイオ電池は、酸化反応を行うアノード極及び還元反応を行うカソード極から構成され、必要に応じてアノードとカソードを隔離する電解質層を含んで構成される。上記の電子メディエータ及び改変型ピラノース酸化酵素を含む酵素電極をアノード電極に使用し、基質を酸化することによって生じた電子を電極に取り出すと共に、プロトンを発生させる。一方、カソード側には、一般的にカソード電極に使用される酵素を使用すれば良く、例えばラッカーゼ、アスコルビン酸オキシダーゼ又はビリルビンオキシダーゼを使用し、アノード側で発生させたプロトンを酸素と反応させることによって水を生成させる。電極としては、カーボン、金、白金等、一般的にバイオ電池に使用される電極を用いることができる。   Furthermore, the modified pyranose oxidase of the present invention can be used in a biobattery. The biobattery according to the present invention includes an anode electrode that performs an oxidation reaction and a cathode electrode that performs a reduction reaction, and includes an electrolyte layer that separates the anode and the cathode as necessary. An enzyme electrode containing the above-mentioned electron mediator and modified pyranose oxidase is used as an anode electrode, and electrons generated by oxidizing the substrate are taken out to the electrode and protons are generated. On the other hand, an enzyme generally used for the cathode electrode may be used on the cathode side, for example, by using laccase, ascorbate oxidase or bilirubin oxidase, and reacting protons generated on the anode side with oxygen. Generate water. As the electrode, an electrode generally used for a bio battery such as carbon, gold, or platinum can be used.

以下、実施例に則して本発明を更に詳しく説明する。尚、本発明の技術的範囲はこれらの記載によって何等制限されるものではない。又、本明細書中に引用される文献に記載された内容は、本明細書の一部として本明細書の開示内容を構成するものである。   Hereinafter, the present invention will be described in more detail with reference to examples. The technical scope of the present invention is not limited by these descriptions. Moreover, the content described in the literature referred in this specification comprises the content disclosed by this specification as a part of this specification.

[実施例1]
(変異導入遺伝子の取得)
変異導入用プライマーを用いてPCRにより変異導入を行った。具体的には、テンプレートのアンチセンス鎖に、5’側をリン酸化させたプライマーをアニールさせ、ポリメラーゼで伸長させた。伸長したDNA断片を同反応液中でDNAリガーゼを用いてつなぎ、変異導入された部分以外が鋳型と相補的なものを得るという手法で行った。
[Example 1]
(Acquisition of mutation transgene)
Mutagenesis was performed by PCR using the mutagenesis primer. Specifically, a primer phosphorylated on the 5 ′ side was annealed to the antisense strand of the template and extended with a polymerase. The extended DNA fragment was ligated in the same reaction solution using DNA ligase, and a method in which a portion other than the mutated portion was complementary to the template was obtained.

(1)変異導入用プライマー
ピラノース酸化酵素(POD)遺伝子に部位特異的変異を導入するために、下記のようなプライマーをデザインし、合成した。
配列番号2のアミノ酸配列の147番目のプロリン(P)をアラニン(A)に置換させる(P147A)ためのプライマーをPROD-P147A(配列番号3)とした。同様に、その他のアミノ酸置換用のプライマーを、PROD-L214A、PROD-L216A、PROD-Q421A、PROD-H423A及びPROD-F447A(配列番号4〜8)とした。
PROD-P147A:5’TGGACCTGCGCTACAGCGGAGTTCTTCAAGGAA 3’(配列番号3)
PROD-L214A:5’CGCGGTATCAAACCTGCCCCGCTCGCATGTCAT 3’(配列番号4)
PROD-L216A:5’ATCAAACCTCTCCCGGCCGCATGTCATCGTCTT 3’(配列番号5)
PROD-Q421A:5’TTCCCTTGGCACGCAGCGATTCATCGCGACGCG 3’(配列番号6)
PROD-H423A:5’TGGCACGCACAGATTGCTCGCGACGCGTTCAGC 3’(配列番号7)
PROD-F447A:5’GTCGACCTAAGGTTCGCTGCTCGTCAGGCCAGA 3’(配列番号8)
(1) Primer for introducing mutation In order to introduce site-specific mutation into the pyranose oxidase (POD) gene, the following primers were designed and synthesized.
PROD-P147A (SEQ ID NO: 3) was used as a primer for replacing the 147th proline (P) in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2 with alanine (A) (P147A). Similarly, other primers for amino acid substitution were PROD-L214A, PROD-L216A, PROD-Q421A, PROD-H423A and PROD-F447A (SEQ ID NOs: 4 to 8).
PROD-P147A: 5'TGGACCTGCGCTACAGCGGAGTTCTTCAAGGAA 3 '(SEQ ID NO: 3)
PROD-L214A: 5'CGCGGTATCAAACCTGCCCCGCTCGCATGTCAT 3 '(SEQ ID NO: 4)
PROD-L216A: 5'ATCAAACCTCTCCCGGCCGCATGTCATCGTCTT 3 '(SEQ ID NO: 5)
PROD-Q421A: 5'TTCCCTTGGCACGCAGCGATTCATCGCGACGCG 3 '(SEQ ID NO: 6)
PROD-H423A: 5'TGGCACGCACAGATTGCTCGCGACGCGTTCAGC 3 '(SEQ ID NO: 7)
PROD-F447A: 5'GTCGACCTAAGGTTCGCTGCTCGTCAGGCCAGA 3 '(SEQ ID NO: 8)

(2)プライマーの5'リン酸化
100μM プライマー 2μl、10× T4 polynucleotide kinase buffer 5μl、0.1M ATP 1.0μl、滅菌水 41μl及び10U/μl T4 polynucleotide kinase 1μlを混合し、37℃で60分間インキュベートした。これにより、5’側リン酸化プライマーを調製した。
(2) Primer 5 ′ phosphorylation 100 μM Primer 2 μl, 10 × T4 polynucleotide kinase buffer 5 μl, 0.1 M ATP 1.0 μl, sterile water 41 μl and 10 U / μl T4 polynucleotide kinase 1 μl were mixed at 37 ° C. for 60 minutes. did. Thereby, a 5 ′ phosphorylated primer was prepared.

(3)変異導入用PCR
未変異のPOD遺伝子をプラスミドpET21a(+)のマルチクローニングサイトにあるNdeI−EcoRI部位に挿入した、プラスミドpET21a(+)/PODを変異導入PCRのテンプレートとした。尚、該POD遺伝子配列は、配列番号1に記載の塩基配列である。
(3) PCR for mutation introduction
Plasmid pET21a (+) / POD, in which the unmutated POD gene was inserted into the NdeI-EcoRI site at the multiple cloning site of plasmid pET21a (+), was used as a template for mutagenesis PCR. The POD gene sequence is the base sequence set forth in SEQ ID NO: 1.

5’リン酸化プライマー 4μl、テンプレート(pET21a(+)/POD) 100ng、10× polymerase buffer 2.5μl、10× DNA ligase buffer 2.5μl、2.5mM dNTPs 1μl、2.5U/μl polymerase(pfu) 1μl及び40U/μl Taq DNA ligase 0.5μlに滅菌水を加え、50μlのPCR反応液とした。各プライマーについてPCR反応液を調製し、下記反応条件でPCRを行った。   5 ′ phosphorylated primer 4 μl, template (pET21a (+) / POD) 100 ng, 10 × polymerase buffer 2.5 μl, 10 × DNA ligase buffer 2.5 μl, 2.5 mM dNTPs 1 μl, 2.5 U / μl polymerase (pfu) Sterile water was added to 1 μl and 40 U / μl Taq DNA ligase 0.5 μl to obtain 50 μl of a PCR reaction solution. A PCR reaction solution was prepared for each primer, and PCR was performed under the following reaction conditions.

(反応条件)
1)65℃ 5分
2)95℃ 2分
3)95℃ 30秒
4)50℃ 30秒
5)65℃ 10分
上記の3)〜5)を30サイクル繰り返す
6)75℃ 10分
(Reaction conditions)
1) 65 ° C for 5 minutes 2) 95 ° C for 2 minutes 3) 95 ° C for 30 seconds 4) 50 ° C for 30 seconds 5) 65 ° C for 10 minutes Repeat the above 3) to 5) for 30 cycles 6) 75 ° C for 10 minutes

(4)DpnI処理
各PCR産物にDpnIを1μl加えて37℃で1時間インキュベートすることで、テンプレートプラスミドを分解した。
(4) DpnI treatment The template plasmid was decomposed by adding 1 μl of DpnI to each PCR product and incubating at 37 ° C. for 1 hour.

(5)変異導入遺伝子の取得
DpnI処理後の各サンプルで、各大腸菌JM109を形質転換した。培養した各大腸菌からプラスミド抽出を行った。抽出した各プラスミドベクターの挿入部分の塩基配列を解析した結果、挿入部分のPOD遺伝子には何れも目的の変異が導入されていたことが確認できた。変異導入遺伝子を含む各プラスミドベクターを、pET21a(+)/P147A、pET21a(+)/L214A、pET21a(+)/L216A、pET21a(+)/Q421A、pET21a(+)/H423A及びpET21a(+)/F447Aとした。
(5) Acquisition of Mutation Transgene Each E. coli JM109 was transformed with each sample after DpnI treatment. Plasmid extraction was performed from each cultured Escherichia coli. As a result of analyzing the base sequence of the inserted portion of each extracted plasmid vector, it was confirmed that the target mutation was introduced into the POD gene in the inserted portion. Each plasmid vector containing the mutagenesis gene was transformed into pET21a (+) / P147A, pET21a (+) / L214A, pET21a (+) / L216A, pET21a (+) / Q421A, pET21a (+) / H423A and pET21a (+) / It was set to F447A.

[実施例2]
(改変型酵素の活性評価)
(1)変異株の取得
実施例1で得られた変異導入遺伝子を含む各プラスミドベクターで、各大腸菌BL21(DE3)を形質転換した。変異導入遺伝子を含む各形質転換大腸菌を、変異株とした。各変異株を、液体培地で培養後、遠心分離により集菌した。尚、液体培地は、アンピシリンを終濃度100μg/mL、IPTGを終濃度0.1mM含む。
[Example 2]
(Evaluation of activity of modified enzyme)
(1) Acquisition of Mutant Strains Each Escherichia coli BL21 (DE3) was transformed with each plasmid vector containing the mutant transgene obtained in Example 1. Each transformed Escherichia coli containing a mutation transgene was used as a mutant. Each mutant strain was cultured in a liquid medium and then collected by centrifugation. The liquid medium contains ampicillin at a final concentration of 100 μg / mL and IPTG at a final concentration of 0.1 mM.

(2)改変型酵素の取得
集菌した各変異株を、DNaseIを終濃度2.5μg/mL、リゾチームを終濃度0.1mg/mLになるように添加した50mMリン酸緩衝液(KPB)(pH7.5)に懸濁した。該懸濁液を、各々96ディープウェルに0.4mLずつ分注し、37℃で15分インキュベートした。次に、Tween20(ポリオキシエチレン(20)ソルビタンモノラウレート、和光純薬製)を終濃度1%になるように添加し、37℃で15分インキュベートした。更に、該液を−80℃で凍結させ、37℃で融解させた。続いて、遠心分離して各々沈殿を除去し、上清(CFE)を回収した。回収した各CFEを、改変型酵素液とした。各改変型酵素を、P147A、L214A、L216A、Q421A、H423A及びF447Aとした。
(2) Acquisition of modified enzyme 50 mM phosphate buffer (KPB) to which each of the collected mutant strains was added with DNase I to a final concentration of 2.5 μg / mL and lysozyme to a final concentration of 0.1 mg / mL ( suspended in pH 7.5). 0.4 mL of this suspension was dispensed into 96 deep wells and incubated at 37 ° C. for 15 minutes. Next, Tween 20 (polyoxyethylene (20) sorbitan monolaurate, manufactured by Wako Pure Chemical Industries, Ltd.) was added to a final concentration of 1% and incubated at 37 ° C. for 15 minutes. Furthermore, the liquid was frozen at −80 ° C. and thawed at 37 ° C. Subsequently, each precipitate was removed by centrifugation, and the supernatant (CFE) was collected. Each collected CFE was used as a modified enzyme solution. Each modified enzyme was P147A, L214A, L216A, Q421A, H423A, and F447A.

(3)ピラノース酸化酵素活性測定法
水2.1mL、10mM KPB(pH7.0)0.1mL、50U/mL ペルオキシダーゼ0.2mL、12.4mM 4−アミノアンチピリン0.2mL、210mM フェノール0.2mL及び1M D−グルコース0.1mLを混合し、37℃で10分間インキュベートした。次いで、これに酵素試料0.1mLを加えて、500nmにおけるΔOD/minを測定し、初速度法により次式を用いて活性を算出した。
ピラノース酸化酵素(POD)活性(U/mL)=(ΔOD/min×3.0(mL)×酵素の希釈倍率)/(10.66×1/2×1.0×酵素添加量(mL))
※10.66:500nmにおけるキノンイミン色素の分子吸光係数
※1.0 :光路長(cm)
本法により、酸素への電子供与能を測定した。
(3) Pyranose oxidase activity measurement method Water 2.1 mL, 10 mM KPB (pH 7.0) 0.1 mL, 50 U / mL peroxidase 0.2 mL, 12.4 mM 4-aminoantipyrine 0.2 mL, 210 mM phenol 0.2 mL and 0.1 mL of 1M D-glucose was mixed and incubated at 37 ° C. for 10 minutes. Next, 0.1 mL of the enzyme sample was added thereto, ΔOD / min at 500 nm was measured, and the activity was calculated by the following equation using the initial velocity method.
Pyranose oxidase (POD) activity (U / mL) = (ΔOD / min × 3.0 (mL) × dilution ratio of enzyme) / (10.66 × 1/2 × 1.0 × enzyme addition amount (mL) )
* 10.66: Molecular extinction coefficient of quinoneimine dye at 500 nm * 1.0: Optical path length (cm)
By this method, the ability to donate electrons to oxygen was measured.

(4)ピラノース脱水素酵素活性測定法
水0.61mL、100mM KPB(pH7.0)1mL、3mM DCIP 0.14mL、3mM 1−m−PMS0.2mL、1M D−グルコース1mLを混合し、37℃で10分間インキュベートした。次いで、これに酵素試料0.05mLを加えて、600nmにおけるΔOD/minを測定し、初速度法により次式を用いて活性を算出した。
ピラノース脱水素酵素(PDH)活性(U/mL)=(ΔOD/min×3.0(mL)×酵素の希釈倍率)/(16.3×1.0×酵素添加量(mL))
※16.3:600nmにおけるDCIPの分子吸光係数
※1.0 :光路長(cm)
本法により、メディエータへの電子供与能を測定した。
(4) Pyranose dehydrogenase activity assay method 0.61 mL of water, 1 mL of 100 mM KPB (pH 7.0), 3 mM DCIP 0.14 mL, 3 mM 1-m-PMS 0.2 mL, 1 M D-glucose 1 mL are mixed, and 37 ° C. Incubated for 10 minutes. Next, 0.05 mL of the enzyme sample was added thereto, ΔOD / min at 600 nm was measured, and the activity was calculated by the following equation using the initial velocity method.
Pyranose dehydrogenase (PDH) activity (U / mL) = (ΔOD / min × 3.0 (mL) × dilution ratio of enzyme) / (16.3 × 1.0 × addition amount of enzyme (mL))
* 16.3: Molecular extinction coefficient of DCIP at 600 nm * 1.0: Optical path length (cm)
By this method, the ability to donate electrons to the mediator was measured.

(5)蛋白濃度測定
蛋白濃度測定は、BIO−RADプロテインアッセイキットを用いたブラッドフォード法によって測定した。測定値は比活性の算出に使用した。
(5) Protein concentration measurement The protein concentration was measured by the Bradford method using a BIO-RAD protein assay kit. The measured value was used for calculation of specific activity.

(6)各改変型酵素の評価
(2)で得た各改変型酵素について、前記の方法でPOD活性、PDH活性及び蛋白濃度を測定した。尚、実施例1でPCRのテンプレートに使用したPOD構造遺伝子を含む形質転換大腸菌を未変異株とした。改変型酵素液と同様に、未変異株からCFEを調製し、未変異型酵素液(WT)とした。
(6) Evaluation of each modified enzyme About each modified enzyme obtained in (2), POD activity, PDH activity, and protein concentration were measured by the above-mentioned method. The transformed E. coli containing the POD structural gene used in Example 1 as a PCR template was used as an unmutated strain. Similarly to the modified enzyme solution, CFE was prepared from the unmutated strain and used as an unmutated enzyme solution (WT).

各測定値から各サンプルのPOD比活性(U/mg)及びPDH比活性(U/mg)を算出した。更に、WTのPOD比活性を100%として、各サンプルのPOD比活性の相対値(%)を算出した。表1に結果を示した。
全ての改変型酵素において、POD比活性が低下しており、アミノ酸置換P147A、L214A、L216A、Q421A、H423A又はF447Aによって、WTに比べて改変型酵素の酸素への電子供与能が60%以下に低下したことが分かった。
From each measured value, the POD specific activity (U / mg) and PDH specific activity (U / mg) of each sample were calculated. Furthermore, the relative value (%) of the POD specific activity of each sample was calculated with the POD specific activity of WT as 100%. Table 1 shows the results.
In all the modified enzymes, the POD specific activity is reduced, and the amino acid substitution P147A, L214A, L216A, Q421A, H423A or F447A reduces the ability of the modified enzyme to donate electrons to oxygen by 60% or less compared to WT. It turned out that it fell.

更に、PDH比活性とPOD比活性との比(PDH/POD)を算出し、表1に示した。
WTのPDH/PODは0.629だった。これは、WTが、メディエータへの電子供与能より、酸素への電子供与能の方が高いことを意味する。これに対し、得られた改変型酵素P147A、L214A、L216A、Q421A、H423A又はF447Aは、PDH/PODが1.46、4.39、3.14、5.33、44.4又は23.1と、何れも改変前のピラノース酸化酵素(WT)に比べてPDH/PODが大きくなっており、具体的には何れもPDH/PODが1.0以上だった。
Further, the ratio of PDH specific activity to POD specific activity (PDH / POD) was calculated and shown in Table 1.
WT PDH / POD was 0.629. This means that WT has a higher ability to donate electrons to oxygen than to give electrons to the mediator. In contrast, the obtained modified enzymes P147A, L214A, L216A, Q421A, H423A or F447A have PDH / POD of 1.46, 4.39, 3.14, 5.33, 44.4 or 23.1. In both cases, PDH / POD was larger than that of pyranose oxidase (WT) before modification, and specifically, PDH / POD was 1.0 or more in all cases.

更に、WTのPDH/PODを1倍とした場合の各改変型酵素のPDH/PODを、改変率(倍)として算出し、表1に示した。
得られた改変型酵素P147A、L214A、L216A、Q421A、H423A又はF447Aは、改変率(倍)が2.3、7.0、5.0、8.5、71又は37と、何れも2倍以上だった。
このことから、本願で得られた改変型酵素は全て、酸素よりもメディエータへ電子を供与する能力が、WTに比べて2倍以上高くなったことが分かった。
Furthermore, the PDH / POD of each modified enzyme when the PDH / POD of WT is 1-fold was calculated as the modification rate (fold) and shown in Table 1.
The obtained modified enzymes P147A, L214A, L216A, Q421A, H423A or F447A have a modification rate (times) of 2.3, 7.0, 5.0, 8.5, 71, or 37, each of which is twice. That was all.
From this, it was found that all of the modified enzymes obtained in the present application were more than twice as capable of donating electrons to the mediator as compared to WT.

以上より、酸素の影響を受けにくい改変型ピラノース酸化酵素が得られたことが分かった。   From the above, it was found that a modified pyranose oxidase that was not easily affected by oxygen was obtained.

Figure 2015171359
Figure 2015171359

[実施例3]
(改変型酵素の精製)
pET21a(+)/H423Aで形質転換した変異株の培養菌体をリン酸緩衝液に懸濁し、超音波破砕した。続いて、遠心分離して沈殿を除去し、上清(CFE)を回収した。回収したCFEを、熱処理した後、硫安分画処理した。処理後のサンプルを脱塩し、最終的に陰イオン交換樹脂(商品名:DEAEセルロファインA500m、東ソー製)カラムで夾雑蛋白を除去し、精製酵素を得た。該精製酵素をSDS−ポリアクリルアミド電気泳動に供したところ、約70kDaの単一バンドを示すことを確認した。
[Example 3]
(Purification of modified enzyme)
The cultured cells of the mutant strain transformed with pET21a (+) / H423A were suspended in a phosphate buffer and sonicated. Subsequently, the precipitate was removed by centrifugation, and the supernatant (CFE) was collected. The recovered CFE was heat treated and then subjected to an ammonium sulfate fraction treatment. The sample after the treatment was desalted, and finally the contaminating protein was removed with an anion exchange resin (trade name: DEAE Cellulofine A500m, manufactured by Tosoh Corporation) column to obtain a purified enzyme. When the purified enzyme was subjected to SDS-polyacrylamide electrophoresis, it was confirmed to show a single band of about 70 kDa.

[実施例4]
(改変型酵素を用いた1,5−AGの測定)
実施例3で得た精製酵素を使用し、実施例2(4)のPDH活性測定法に基づき、分光光度計を用いて1,5−AGの定量を行った。基質として、終濃度が0.01、0.05、0.1、1.0、10、20、50mMとなるように1,5−AGを添加した。測定結果から酵素活性を算出し、1,5−AG濃度(0.01、0.05、0.1、1.0、10、20、50mM)に対して相対値(%)でプロットした結果を、図2に示した。
図2に示したように、本発明の改変型ピラノース酸化酵素を用いて、少なくとも0.01〜50mMの濃度範囲で1,5−AGの定量が可能であることが分かった。
[Example 4]
(Measurement of 1,5-AG using a modified enzyme)
Using the purified enzyme obtained in Example 3, 1,5-AG was quantified using a spectrophotometer based on the PDH activity measurement method of Example 2 (4). 1,5-AG was added as a substrate so that the final concentrations were 0.01, 0.05, 0.1, 1.0, 10, 20, 50 mM. The enzyme activity was calculated from the measurement results, and plotted as relative values (%) against 1,5-AG concentrations (0.01, 0.05, 0.1, 1.0, 10, 20, 50 mM) Is shown in FIG.
As shown in FIG. 2, it was found that 1,5-AG can be quantified in the concentration range of at least 0.01 to 50 mM using the modified pyranose oxidase of the present invention.

[実施例5]
(改変型酵素を用いたグルコースの測定)
実施例3で得た精製酵素を使用し、実施例2(4)のPDH活性測定法に基づき、分光光度計を用いてグルコースの定量を行った。基質として、終濃度が1.0、3.0、10、20、55mMとなるようにグルコースを添加した。測定結果から酵素活性を算出し、グルコース濃度(1.0、3.0、10、20、55mM)に対して相対値(%)でプロットした結果を、図3に示した。
図3に示したように、本発明の改変型ピラノース酸化酵素を用いて、少なくとも1.0〜55mMの濃度範囲でグルコースの定量が可能であることが分かった。
[Example 5]
(Measurement of glucose using a modified enzyme)
Using the purified enzyme obtained in Example 3, glucose was quantified using a spectrophotometer based on the PDH activity measurement method of Example 2 (4). Glucose was added as a substrate so that the final concentrations were 1.0, 3.0, 10, 20, and 55 mM. The enzyme activity was calculated from the measurement result, and the result plotted with the relative value (%) against the glucose concentration (1.0, 3.0, 10, 20, 55 mM) is shown in FIG.
As shown in FIG. 3, it was found that glucose can be quantified in the concentration range of at least 1.0 to 55 mM using the modified pyranose oxidase of the present invention.

Claims (12)

ピラノース酸化酵素のアミノ酸配列において、
配列番号2で示されるアミノ酸配列のP147、L214、L216、Q421、H423又はF447に対応する位置のアミノ酸のうち少なくとも1つのアミノ酸残基における置換を含み、
改変前のピラノース酸化酵素に比べて、蛋白量あたりのピラノース脱水素酵素活性(PDH比活性)と蛋白量あたりのピラノース酸化酵素活性(POD比活性)との比(PDH/POD)が大きくなっている、改変型ピラノース酸化酵素。
In the amino acid sequence of pyranose oxidase,
Comprising substitution at least one amino acid residue among amino acids at positions corresponding to P147, L214, L216, Q421, H423 or F447 of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2,
Compared to the pyranose oxidase before modification, the ratio (PDH / POD) of pyranose dehydrogenase activity (PDH specific activity) per protein amount and pyranose oxidase activity (POD specific activity) per protein amount is increased. A modified pyranose oxidase.
配列番号2、9、10、11、12、13もしくは14で示されるアミノ酸配列、配列番号2、9、10、11、12、13もしくは14で示されるアミノ酸配列と少なくとも95%の類似性を有するアミノ酸配列、又は配列番号2、9、10、11、12、13もしくは14で示されるアミノ酸配列において1もしくは数個のアミノ酸が欠失、置換もしくは付加されたアミノ酸配列において、
配列番号2で示されるアミノ酸配列のP147、L214、L216、Q421、H423又はF447に対応する位置のアミノ酸のうち少なくとも1つのアミノ酸残基における置換を含む、
請求項1記載の改変型ピラノース酸化酵素。
It has at least 95% similarity with the amino acid sequence shown by SEQ ID NO: 2, 9, 10, 11, 12, 13 or 14 and the amino acid sequence shown by SEQ ID NO: 2, 9, 10, 11, 12, 13 or 14. In an amino acid sequence or an amino acid sequence in which one or several amino acids are deleted, substituted or added in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2, 9, 10, 11, 12, 13 or 14,
Including substitution at at least one amino acid residue among amino acids at positions corresponding to P147, L214, L216, Q421, H423 or F447 of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2.
The modified pyranose oxidase according to claim 1.
P147に対応する位置のアミノ酸がプロリンであり、L214に対応する位置のアミノ酸がロイシン又はイソロイシンであり、L216に対応する位置のアミノ酸がロイシンであり、Q421に対応する位置のアミノ酸がグルタミンであり、H423に対応する位置のアミノ酸がヒスチジンであり、及びF447に対応する位置のアミノ酸がフェニルアラニンである、請求項1又は2記載の改変型ピラノース酸化酵素。 The amino acid at the position corresponding to P147 is proline, the amino acid at the position corresponding to L214 is leucine or isoleucine, the amino acid at the position corresponding to L216 is leucine, and the amino acid at the position corresponding to Q421 is glutamine, The modified pyranose oxidase according to claim 1 or 2, wherein the amino acid at the position corresponding to H423 is histidine, and the amino acid at the position corresponding to F447 is phenylalanine. P147、L214、L216、Q421、H423又はF447に対応する位置の少なくとも1つのアミノ酸残基がアラニンに置換された、請求項1〜3の何れか1項に記載の改変型ピラノース酸化酵素。 The modified pyranose oxidase according to any one of claims 1 to 3, wherein at least one amino acid residue at a position corresponding to P147, L214, L216, Q421, H423 or F447 is substituted with alanine. 配列番号2で示されるアミノ酸配列を有する酵素のPDH/PODを1倍とした場合に、PDH/PODが少なくとも2倍である、請求項1〜4の何れか1項に記載の改変型ピラノース酸化酵素。 The modified pyranose oxidation according to any one of claims 1 to 4, wherein PDH / POD is at least doubled when PDH / POD of the enzyme having the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 is multiplied by 1. enzyme. 請求項1〜5の何れか1項に記載の改変型ピラノース酸化酵素をコードするポリヌクレオチド。 A polynucleotide encoding the modified pyranose oxidase according to any one of claims 1 to 5. 請求項6記載のポリヌクレオチドを含む組換えベクター。 A recombinant vector comprising the polynucleotide according to claim 6. 請求項7記載のベクターで形質転換された形質転換細胞。 A transformed cell transformed with the vector according to claim 7. 請求項8の形質転換細胞を培養し、得られた培養物から改変型ピラノース酸化酵素を採取することを特徴とする、改変型ピラノース酸化酵素の製造方法。 A method for producing a modified pyranose oxidase, comprising culturing the transformed cell of claim 8 and collecting the modified pyranose oxidase from the obtained culture. 請求項1〜5の何れか1項に記載の改変型ピラノース酸化酵素を使用するピラノース測定方法。 The pyranose measuring method using the modified pyranose oxidase of any one of Claims 1-5. 請求項1〜5の何れか1項に記載の改変型ピラノース酸化酵素を含むピラノース測定試薬組成物。 A reagent composition for measuring pyranose comprising the modified pyranose oxidase according to any one of claims 1 to 5. 請求項1〜5の何れか1項に記載の改変型ピラノース酸化酵素を含むピラノース測定用バイオセンサ。 The biosensor for a pyranose measurement containing the modified pyranose oxidase of any one of Claims 1-5.
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