JP2014525266A5 - - Google Patents
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Description
本発明は、ミクロビオーム組成および/または活性の再現可能および検出可能な変化が、心欠陥の発症および/またはリスクに関連するという認識を含む。本発明は、このような変化を反映している微生物の特性の確認および/または特徴づけを可能にし、この微生物の特性を使用することについて、例えば、心欠陥の発症および/またはリスクを評価するための系も提供する。
実施形態において、本発明は、例えば、下記の項目を提供する。
(項目1)
心欠陥の発症および/またはリスクを特定しおよび/または特徴づける方法であって、
心欠陥の範囲または程度に相関する参照の微生物の特性を提供すること、および
心欠陥の発症および/またはリスクが特定される、または特徴づけられるべき個体からの微生物叢の試料に存在する微生物の特性を決定すること
を含む方法。
(項目2)
心欠陥の発症および/またはリスクが特定される、または特徴づけられるべき個体からの微生物叢の試料に存在する微生物の特性を参照の微生物の特性と比較することをさらに含む項目1に記載の方法。
(項目3)
微生物叢の試料が個体の特定の臓器または組織に認められる1種類以上の微生物を含む、項目1に記載の方法。
(項目4)
微生物叢の試料が個体の特定の臓器または組織に認められる実質的に全種類の微生物のセットを含む、項目1に記載の方法。
(項目5)
個体の特定の臓器または組織が個体の消化管である、項目3または4に記載の方法。
(項目6)
微生物叢の試料が糞便の試料である項目5に記載の方法。
(項目7)
個体がヒトである項目1に記載の方法。
(項目8)
個体が動物である項目1に記載の方法。
(項目9)
微生物の特性が微生物叢の試料に存在する1種類以上の微生物または要素または産生物のレベルまたはレベルのセットを含む、項目1に記載の方法。
(項目10)
微生物の特性が、微生物叢の試料に存在する実質的に全種類の微生物または要素または産生物のセットのレベルのセットを含む、項目1に記載の方法。
(項目11)
微生物の特性が、微生物叢の試料に存在する1つ以上の16S RNA遺伝子配列のレベルのまたはレベルのセットを含む、項目9または10に記載の方法。
(項目12)
微生物の特性が、微生物叢の試料に存在する1つ以上の微生物代謝産物のレベルまたはレベルのセットを含む、項目9または10に記載の方法。
(項目13)
心臓の処置を受ける予定がある、または受けたことのある患者をモニターする方法であって、
心欠陥の範囲または程度に相関する参照の微生物の特性を提供し、および
心欠陥の発症および/またはリスクが特定される、または特徴づけられるべき患者からの微生物叢の試料に存在する微生物の特性を決定することを含む方法。
(項目14)
心欠陥の発症および/またはリスクが特定される、または特徴づけられるべき個体からの微生物叢の試料に存在する微生物の特性を、参照の微生物の特性と比較することをさらに含む、項目13に記載の方法。
(項目15)
微生物叢の試料が個体の特定の臓器または組織に認められる1種類以上の微生物を含む、項目13に記載の方法。
(項目16)
微生物叢の試料が個体の特定の臓器または組織に認められる実質的に全種類の微生物のセットを含む、項目13に記載の方法。
(項目17)
個体の特定の臓器または組織が個体の消化管である、項目15または16に記載の方法。
(項目18)
微生物叢の試料が糞便の試料である項目17に記載の方法。
(項目19)
個体がヒトである項目13に記載の方法。
(項目20)
個体が動物である項目13に記載の方法。
(項目21)
微生物の特性が、微生物叢の試料に存在する1種類以上の微生物または要素または産生物のレベルまたはレベルのセットを含む、項目13に記載の方法。
(項目22)
微生物の特性が、微生物叢の試料に存在する実質的に全種類の微生物または要素または産生物のセットのレベルのセットを含む、項目13に記載の方法。
(項目23)
微生物の特性が、微生物叢の試料に存在する1つ以上の16S RNA遺伝子配列のレベルまたはレベルのセットを含む、項目21または22に記載の方法。
(項目24)
微生物の特性が、微生物叢の試料に存在する1つ以上の微生物代謝産物のレベルまたはレベルのセットを含む、項目21または22に記載の方法。
(項目25)
心欠陥の発症および/またはリスクに相関する微生物の特性を特定する、および/または特徴づける方法であって、
微生物叢の試料の第1の収集物中の1種類以上の微生物または要素または産生物のレベルの第1のセットを決定することであって、ここで、微生物叢の試料の第1の収集物の各試料は、心欠陥の発症および/またはリスクの共通の特徴を共有する、決定することと、
微生物叢の試料の第2の収集物中の1種類以上の微生物または要素または産生物のレベルの第2のセットを決定することであって、微生物叢の試料の第2の収集物は、心欠陥の発症および/またはリスクの共通の特徴を共有しないが、それ以外では微生物叢の試料の第1のセットと同等である、決定することと、
心欠陥の発症および/またはリスクの共通の特徴の存在または非存在に相関する第1または第2のセットにおけるレベルを含んでいる微生物の特性を特定すること
を含む方法。
(項目26)
微生物叢の試料は、微生物叢の試料が収集される決定の臓器または組織に認められる1種類以上の微生物の試料を含む、項目25に記載の方法。
(項目27)
微生物叢の試料が収集される特定の臓器または組織に認められる実質的に全種類の微生物の試料を含む、項目25に記載の方法。
(項目28)
特定の臓器または組織が消化管である項目26または27に記載の方法。
(項目29)
微生物叢の試料が糞便の試料である項目28に記載の方法。
(項目30)
1種類以上の微生物または要素または産生物のレベルまたはレベルのセットが、微生物叢の試料に存在する1つ以上の16S RNA遺伝子配列のレベルまたはレベルのセットを含む、項目25に記載の方法。
(項目31)
1種類以上の微生物または要素または産生物のレベルまたはレベルのセットが、微生物叢の試料に存在する1つ以上の微生物代謝産物のレベルまたはレベルのセットを含む、項目25に記載の方法。
(項目32)
微生物叢の試料は宿主生物から得られ、心欠陥の発症および/またはリスクの共通の特徴は宿主生物における冠動脈性心疾患の発症を含む、項目25に記載の方法。
(項目33)
微生物叢の試料は宿主生物から得られ、心欠陥の発症および/またはリスクの共通の特徴は宿主生物における心筋梗塞の前病歴を含む、項目25に記載の方法。
(項目34)
微生物叢の試料は宿主生物から得られ、心欠陥の発症および/またはリスクの共通の特徴は、宿主生物における虚血/再灌流傷害への感受性の増加を含む、項目25に記載の方法。
(項目35)
心欠陥の発症および/またはリスクの共通の特徴は、心欠陥に相関することが知られているミクロビオームを変化させる作用因子に曝露することを含む、項目25に記載の方法。
(項目36)
ミクロビオームを変化させる作用因子は1つ以上の抗生物質を含む項目35に記載の方法。
(項目37)
抗生物質は非吸収性の抗生物質を含む項目36に記載の方法。
(項目38)
非吸収性の抗生物質はバンコマイシン、ネオマイシン、ストレプトマイシン、バシトラシン、および/またはポリミキシンBまたはその組み合わせを含む、項目36に記載の方法。
(項目39)
ミクロビオームを変化させる作用因子は微生物を含む項目35に記載の方法。
(項目40)
微生物はラクトバチルス・プランタルムおよび/またはビフィドバクテリウム・ラクティスを含む項目39に記載の方法。
(項目41)
個体のミクロビオームを変化させることによって、個体の心欠陥を治療し、またはそのリスクを軽減する方法であって、
心欠陥の重症度またはリスクが変化することに相関するように、個体のミクロビオームを変化させるように、心欠陥を罹患しているまたは感受性のある個体に、ミクロビオームを変化させる作用因子を投与するステップを含む方法。
(項目42)
ミクロビオームを変化させる作用因子は1つ以上の抗生物質を含む項目41に記載の方法。
(項目43)
抗生物質は非吸収性の抗生物質を含む項目42に記載の方法。
(項目44)
非吸収性の抗生物質はバンコマイシン、ネオマイシン、ストレプトマイシン、バシトラシン、および/またはポリミキシンB、またはそれらの組み合わせを含む、項目43に記載の方法。
(項目45)
ミクロビオームを変化させる作用因子は1種類以上の微生物を含む項目41に記載の方法。
(項目46)
微生物はラクトバチルス・プランタルムおよび/またはビフィドバクテリウム・ラクティスを含む項目45に記載の方法。
(項目47)
心欠陥の重症度またはリスクの変化は、レプチンのレベルの減少を含む項目41に記載の方法。
(項目48)
心欠陥の重症度またはリスクの変化は、1つ以上の微生物代謝産物のレベルの変化を含む項目41に記載の方法。
(項目49)
1つ以上の微生物代謝産物のレベルの変化は、キヌレニン、インドール酢酸、インドールプロピオン酸、3−インドキシル硫酸、フェニル乳酸、フェニルアセチルグリシン、フェニル酢酸塩、3−フェニルプロピオン酸、桂皮酸エステル、p−クレゾール硫酸塩、フェノール硫酸塩、3−(4−ヒドロキシフェニル)乳酸塩、および/または4−ヒドロキシフェニルピルビン酸、またはその組み合わせの減少を含む、項目48に記載の方法。
(項目50)
個体に投与されたときに、心欠陥の重症度またはリスクが変化することに相関するように、個体のミクロビオームを変化させるミクロビオームを変化させる作用因子を含む組成物。
(項目51)
薬剤的に許容可能な担体をさらに含む項目50に記載の組成物。
(項目52)
食品製品、機能性食品または栄養補助食品中に、または、食品製品として提供される項目50に記載の組成物。
(項目53)
心欠陥の重症度またはリスクの減少を達成することに相関する投与計画に沿った投与のための単位用量が単位剤形で含まれる、項目50に記載の組成物。
(項目54)
ミクロビオームを変化させる作用因子は微生物細胞である、または、それを含む、項目50に記載の組成物。
(項目55)
食品製品、機能性食品または栄養補助食品中に、または、食品製品として提供される項目54に記載の組成物。
(項目56)
ミクロビオームを変化させる作用因子は少なくとも1,000個の微生物細胞である、または、それを含む、項目54に記載の組成物。
(項目57)
ミクロビオームを変化させる作用因子は抗生物質である、または、それを含む、項目50に記載の組成物。
(項目58)
ミクロビオームを変化させる作用因子は抗生物質をさらに含む項目54に記載の組成物。
実施形態において、本発明は、例えば、下記の項目を提供する。
(項目1)
心欠陥の発症および/またはリスクを特定しおよび/または特徴づける方法であって、
心欠陥の範囲または程度に相関する参照の微生物の特性を提供すること、および
心欠陥の発症および/またはリスクが特定される、または特徴づけられるべき個体からの微生物叢の試料に存在する微生物の特性を決定すること
を含む方法。
(項目2)
心欠陥の発症および/またはリスクが特定される、または特徴づけられるべき個体からの微生物叢の試料に存在する微生物の特性を参照の微生物の特性と比較することをさらに含む項目1に記載の方法。
(項目3)
微生物叢の試料が個体の特定の臓器または組織に認められる1種類以上の微生物を含む、項目1に記載の方法。
(項目4)
微生物叢の試料が個体の特定の臓器または組織に認められる実質的に全種類の微生物のセットを含む、項目1に記載の方法。
(項目5)
個体の特定の臓器または組織が個体の消化管である、項目3または4に記載の方法。
(項目6)
微生物叢の試料が糞便の試料である項目5に記載の方法。
(項目7)
個体がヒトである項目1に記載の方法。
(項目8)
個体が動物である項目1に記載の方法。
(項目9)
微生物の特性が微生物叢の試料に存在する1種類以上の微生物または要素または産生物のレベルまたはレベルのセットを含む、項目1に記載の方法。
(項目10)
微生物の特性が、微生物叢の試料に存在する実質的に全種類の微生物または要素または産生物のセットのレベルのセットを含む、項目1に記載の方法。
(項目11)
微生物の特性が、微生物叢の試料に存在する1つ以上の16S RNA遺伝子配列のレベルのまたはレベルのセットを含む、項目9または10に記載の方法。
(項目12)
微生物の特性が、微生物叢の試料に存在する1つ以上の微生物代謝産物のレベルまたはレベルのセットを含む、項目9または10に記載の方法。
(項目13)
心臓の処置を受ける予定がある、または受けたことのある患者をモニターする方法であって、
心欠陥の範囲または程度に相関する参照の微生物の特性を提供し、および
心欠陥の発症および/またはリスクが特定される、または特徴づけられるべき患者からの微生物叢の試料に存在する微生物の特性を決定することを含む方法。
(項目14)
心欠陥の発症および/またはリスクが特定される、または特徴づけられるべき個体からの微生物叢の試料に存在する微生物の特性を、参照の微生物の特性と比較することをさらに含む、項目13に記載の方法。
(項目15)
微生物叢の試料が個体の特定の臓器または組織に認められる1種類以上の微生物を含む、項目13に記載の方法。
(項目16)
微生物叢の試料が個体の特定の臓器または組織に認められる実質的に全種類の微生物のセットを含む、項目13に記載の方法。
(項目17)
個体の特定の臓器または組織が個体の消化管である、項目15または16に記載の方法。
(項目18)
微生物叢の試料が糞便の試料である項目17に記載の方法。
(項目19)
個体がヒトである項目13に記載の方法。
(項目20)
個体が動物である項目13に記載の方法。
(項目21)
微生物の特性が、微生物叢の試料に存在する1種類以上の微生物または要素または産生物のレベルまたはレベルのセットを含む、項目13に記載の方法。
(項目22)
微生物の特性が、微生物叢の試料に存在する実質的に全種類の微生物または要素または産生物のセットのレベルのセットを含む、項目13に記載の方法。
(項目23)
微生物の特性が、微生物叢の試料に存在する1つ以上の16S RNA遺伝子配列のレベルまたはレベルのセットを含む、項目21または22に記載の方法。
(項目24)
微生物の特性が、微生物叢の試料に存在する1つ以上の微生物代謝産物のレベルまたはレベルのセットを含む、項目21または22に記載の方法。
(項目25)
心欠陥の発症および/またはリスクに相関する微生物の特性を特定する、および/または特徴づける方法であって、
微生物叢の試料の第1の収集物中の1種類以上の微生物または要素または産生物のレベルの第1のセットを決定することであって、ここで、微生物叢の試料の第1の収集物の各試料は、心欠陥の発症および/またはリスクの共通の特徴を共有する、決定することと、
微生物叢の試料の第2の収集物中の1種類以上の微生物または要素または産生物のレベルの第2のセットを決定することであって、微生物叢の試料の第2の収集物は、心欠陥の発症および/またはリスクの共通の特徴を共有しないが、それ以外では微生物叢の試料の第1のセットと同等である、決定することと、
心欠陥の発症および/またはリスクの共通の特徴の存在または非存在に相関する第1または第2のセットにおけるレベルを含んでいる微生物の特性を特定すること
を含む方法。
(項目26)
微生物叢の試料は、微生物叢の試料が収集される決定の臓器または組織に認められる1種類以上の微生物の試料を含む、項目25に記載の方法。
(項目27)
微生物叢の試料が収集される特定の臓器または組織に認められる実質的に全種類の微生物の試料を含む、項目25に記載の方法。
(項目28)
特定の臓器または組織が消化管である項目26または27に記載の方法。
(項目29)
微生物叢の試料が糞便の試料である項目28に記載の方法。
(項目30)
1種類以上の微生物または要素または産生物のレベルまたはレベルのセットが、微生物叢の試料に存在する1つ以上の16S RNA遺伝子配列のレベルまたはレベルのセットを含む、項目25に記載の方法。
(項目31)
1種類以上の微生物または要素または産生物のレベルまたはレベルのセットが、微生物叢の試料に存在する1つ以上の微生物代謝産物のレベルまたはレベルのセットを含む、項目25に記載の方法。
(項目32)
微生物叢の試料は宿主生物から得られ、心欠陥の発症および/またはリスクの共通の特徴は宿主生物における冠動脈性心疾患の発症を含む、項目25に記載の方法。
(項目33)
微生物叢の試料は宿主生物から得られ、心欠陥の発症および/またはリスクの共通の特徴は宿主生物における心筋梗塞の前病歴を含む、項目25に記載の方法。
(項目34)
微生物叢の試料は宿主生物から得られ、心欠陥の発症および/またはリスクの共通の特徴は、宿主生物における虚血/再灌流傷害への感受性の増加を含む、項目25に記載の方法。
(項目35)
心欠陥の発症および/またはリスクの共通の特徴は、心欠陥に相関することが知られているミクロビオームを変化させる作用因子に曝露することを含む、項目25に記載の方法。
(項目36)
ミクロビオームを変化させる作用因子は1つ以上の抗生物質を含む項目35に記載の方法。
(項目37)
抗生物質は非吸収性の抗生物質を含む項目36に記載の方法。
(項目38)
非吸収性の抗生物質はバンコマイシン、ネオマイシン、ストレプトマイシン、バシトラシン、および/またはポリミキシンBまたはその組み合わせを含む、項目36に記載の方法。
(項目39)
ミクロビオームを変化させる作用因子は微生物を含む項目35に記載の方法。
(項目40)
微生物はラクトバチルス・プランタルムおよび/またはビフィドバクテリウム・ラクティスを含む項目39に記載の方法。
(項目41)
個体のミクロビオームを変化させることによって、個体の心欠陥を治療し、またはそのリスクを軽減する方法であって、
心欠陥の重症度またはリスクが変化することに相関するように、個体のミクロビオームを変化させるように、心欠陥を罹患しているまたは感受性のある個体に、ミクロビオームを変化させる作用因子を投与するステップを含む方法。
(項目42)
ミクロビオームを変化させる作用因子は1つ以上の抗生物質を含む項目41に記載の方法。
(項目43)
抗生物質は非吸収性の抗生物質を含む項目42に記載の方法。
(項目44)
非吸収性の抗生物質はバンコマイシン、ネオマイシン、ストレプトマイシン、バシトラシン、および/またはポリミキシンB、またはそれらの組み合わせを含む、項目43に記載の方法。
(項目45)
ミクロビオームを変化させる作用因子は1種類以上の微生物を含む項目41に記載の方法。
(項目46)
微生物はラクトバチルス・プランタルムおよび/またはビフィドバクテリウム・ラクティスを含む項目45に記載の方法。
(項目47)
心欠陥の重症度またはリスクの変化は、レプチンのレベルの減少を含む項目41に記載の方法。
(項目48)
心欠陥の重症度またはリスクの変化は、1つ以上の微生物代謝産物のレベルの変化を含む項目41に記載の方法。
(項目49)
1つ以上の微生物代謝産物のレベルの変化は、キヌレニン、インドール酢酸、インドールプロピオン酸、3−インドキシル硫酸、フェニル乳酸、フェニルアセチルグリシン、フェニル酢酸塩、3−フェニルプロピオン酸、桂皮酸エステル、p−クレゾール硫酸塩、フェノール硫酸塩、3−(4−ヒドロキシフェニル)乳酸塩、および/または4−ヒドロキシフェニルピルビン酸、またはその組み合わせの減少を含む、項目48に記載の方法。
(項目50)
個体に投与されたときに、心欠陥の重症度またはリスクが変化することに相関するように、個体のミクロビオームを変化させるミクロビオームを変化させる作用因子を含む組成物。
(項目51)
薬剤的に許容可能な担体をさらに含む項目50に記載の組成物。
(項目52)
食品製品、機能性食品または栄養補助食品中に、または、食品製品として提供される項目50に記載の組成物。
(項目53)
心欠陥の重症度またはリスクの減少を達成することに相関する投与計画に沿った投与のための単位用量が単位剤形で含まれる、項目50に記載の組成物。
(項目54)
ミクロビオームを変化させる作用因子は微生物細胞である、または、それを含む、項目50に記載の組成物。
(項目55)
食品製品、機能性食品または栄養補助食品中に、または、食品製品として提供される項目54に記載の組成物。
(項目56)
ミクロビオームを変化させる作用因子は少なくとも1,000個の微生物細胞である、または、それを含む、項目54に記載の組成物。
(項目57)
ミクロビオームを変化させる作用因子は抗生物質である、または、それを含む、項目50に記載の組成物。
(項目58)
ミクロビオームを変化させる作用因子は抗生物質をさらに含む項目54に記載の組成物。
Claims (58)
- 個体からの微生物叢の試料に存在する微生物の特性を、心欠陥の発症および/またはリスクを特定しおよび/または特徴づけることの指標とするための方法であって、
心欠陥の範囲または程度に相関する参照の微生物の特性を提供すること、および
心欠陥の発症および/またはリスクが特定される、または特徴づけられるべき該個体からの該微生物叢の試料に存在する該微生物の特性を決定すること
を含む方法。 - 心欠陥の発症および/またはリスクが特定される、または特徴づけられるべき個体からの微生物叢の試料に存在する微生物の特性を参照の微生物の特性と比較することをさらに含む請求項1に記載の方法。
- 微生物叢の試料が個体の特定の臓器または組織に認められる1種類以上の微生物を含む、請求項1に記載の方法。
- 微生物叢の試料が個体の特定の臓器または組織に認められる実質的に全種類の微生物のセットを含む、請求項1に記載の方法。
- 個体の特定の臓器または組織が個体の消化管である、請求項3または4に記載の方法。
- 微生物叢の試料が糞便の試料である請求項5に記載の方法。
- 個体がヒトである請求項1に記載の方法。
- 個体が動物である請求項1に記載の方法。
- 微生物の特性が微生物叢の試料に存在する1種類以上の微生物または要素または産生物のレベルまたはレベルのセットを含む、請求項1に記載の方法。
- 微生物の特性が、微生物叢の試料に存在する実質的に全種類の微生物または要素または産生物のセットのレベルのセットを含む、請求項1に記載の方法。
- 微生物の特性が、微生物叢の試料に存在する1つ以上の16S RNA遺伝子配列のレベルのまたはレベルのセットを含む、請求項9または10に記載の方法。
- 微生物の特性が、微生物叢の試料に存在する1つ以上の微生物代謝産物のレベルまたはレベルのセットを含む、請求項9または10に記載の方法。
- 患者からの微生物叢の試料に存在する微生物の特性を、心臓の処置を受ける予定がある、または受けたことのある患者をモニターすることの指標とするための方法であって、
心欠陥の範囲または程度に相関する参照の微生物の特性を提供し、および
心欠陥の発症および/またはリスクが特定される、または特徴づけられるべき該患者からの該微生物叢の試料に存在する該微生物の特性を決定することを含む方法。 - 心欠陥の発症および/またはリスクが特定される、または特徴づけられるべき個体からの微生物叢の試料に存在する微生物の特性を、参照の微生物の特性と比較することをさらに含む、請求項13に記載の方法。
- 微生物叢の試料が個体の特定の臓器または組織に認められる1種類以上の微生物を含む、請求項13に記載の方法。
- 微生物叢の試料が個体の特定の臓器または組織に認められる実質的に全種類の微生物のセットを含む、請求項13に記載の方法。
- 個体の特定の臓器または組織が個体の消化管である、請求項15または16に記載の方法。
- 微生物叢の試料が糞便の試料である請求項17に記載の方法。
- 個体がヒトである請求項13に記載の方法。
- 個体が動物である請求項13に記載の方法。
- 微生物の特性が、微生物叢の試料に存在する1種類以上の微生物または要素または産生物のレベルまたはレベルのセットを含む、請求項13に記載の方法。
- 微生物の特性が、微生物叢の試料に存在する実質的に全種類の微生物または要素または産生物のセットのレベルのセットを含む、請求項13に記載の方法。
- 微生物の特性が、微生物叢の試料に存在する1つ以上の16S RNA遺伝子配列のレベルまたはレベルのセットを含む、請求項21または22に記載の方法。
- 微生物の特性が、微生物叢の試料に存在する1つ以上の微生物代謝産物のレベルまたはレベルのセットを含む、請求項21または22に記載の方法。
- 1種類以上の微生物または構成要素またはその産生物のレベルのセットを、心欠陥の発症および/またはリスクに相関する微生物の特性を特定する、および/または特徴づけることの指標とするための方法であって、
微生物叢の試料の第1の収集物中の1種類以上の微生物または要素または産生物のレベルの第1のセットを決定することであって、ここで、微生物叢の試料の第1の収集物の各試料は、心欠陥の発症および/またはリスクの共通の特徴を共有する、決定することと、
微生物叢の試料の第2の収集物中の1種類以上の微生物または要素または産生物のレベルの第2のセットを決定することであって、微生物叢の試料の該第2の収集物は、心欠陥の発症および/またはリスクの共通の特徴を共有しないが、それ以外では微生物叢の試料の第1のセットと同等である、決定することと、
心欠陥の発症および/またはリスクの共通の特徴の存在または非存在に相関する第1または第2のセットにおけるレベルを含んでいる微生物の特性を特定すること
を含む方法。 - 微生物叢の試料は、微生物叢の試料が収集される決定の臓器または組織に認められる1種類以上の微生物の試料を含む、請求項25に記載の方法。
- 微生物叢の試料が収集される特定の臓器または組織に認められる実質的に全種類の微生物の試料を含む、請求項25に記載の方法。
- 特定の臓器または組織が消化管である請求項26または27に記載の方法。
- 微生物叢の試料が糞便の試料である請求項28に記載の方法。
- 1種類以上の微生物または要素または産生物のレベルまたはレベルのセットが、微生物叢の試料に存在する1つ以上の16S RNA遺伝子配列のレベルまたはレベルのセットを含む、請求項25に記載の方法。
- 1種類以上の微生物または要素または産生物のレベルまたはレベルのセットが、微生物叢の試料に存在する1つ以上の微生物代謝産物のレベルまたはレベルのセットを含む、請求項25に記載の方法。
- 微生物叢の試料は宿主生物から得られ、心欠陥の発症および/またはリスクの共通の特徴は宿主生物における冠動脈性心疾患の発症を含む、請求項25に記載の方法。
- 微生物叢の試料は宿主生物から得られ、心欠陥の発症および/またはリスクの共通の特徴は宿主生物における心筋梗塞の前病歴を含む、請求項25に記載の方法。
- 微生物叢の試料は宿主生物から得られ、心欠陥の発症および/またはリスクの共通の特徴は、宿主生物における虚血/再灌流傷害への感受性の増加を含む、請求項25に記載の方法。
- 心欠陥の発症および/またはリスクの共通の特徴は、心欠陥に相関することが知られているミクロビオームを変化させる作用因子に曝露することを含む、請求項25に記載の方法。
- ミクロビオームを変化させる作用因子は1つ以上の抗生物質を含む請求項35に記載の方法。
- 抗生物質は非吸収性の抗生物質を含む請求項36に記載の方法。
- 非吸収性の抗生物質はバンコマイシン、ネオマイシン、ストレプトマイシン、バシトラシン、および/またはポリミキシンBまたはその組み合わせを含む、請求項36に記載の方法。
- ミクロビオームを変化させる作用因子は微生物を含む請求項35に記載の方法。
- 微生物はラクトバチルス・プランタルムおよび/またはビフィドバクテリウム・ラクティスを含む請求項39に記載の方法。
- 個体のミクロビオームを変化させることによって、個体の心欠陥を治療し、またはそのリスクを軽減するための組成物であって、
ミクロビオームを変化させる作用因子であって、該組成物が該個体に投与されることによって、心欠陥の重症度またはリスクが変化することに相関するように、個体のミクロビオームを変化させることを特徴とする、ミクロビオームを変化させる作用因子を
含む、組成物。 - ミクロビオームを変化させる作用因子は1つ以上の抗生物質を含む請求項41に記載の組成物。
- 抗生物質は非吸収性の抗生物質を含む請求項42に記載の組成物。
- 非吸収性の抗生物質はバンコマイシン、ネオマイシン、ストレプトマイシン、バシトラシン、および/またはポリミキシンB、またはそれらの組み合わせを含む、請求項43に記載の方組成物。
- ミクロビオームを変化させる作用因子は1種類以上の微生物を含む請求項41に記載の組成物。
- 微生物はラクトバチルス・プランタルムおよび/またはビフィドバクテリウム・ラクティスを含む請求項45に記載の組成物。
- 心欠陥の重症度またはリスクの変化は、レプチンのレベルの減少を含む請求項41に記載の組成物。
- 心欠陥の重症度またはリスクの変化は、1つ以上の微生物代謝産物のレベルの変化を含む請求項41に記載の組成物。
- 1つ以上の微生物代謝産物のレベルの変化は、キヌレニン、インドール酢酸、インドールプロピオン酸、3−インドキシル硫酸、フェニル乳酸、フェニルアセチルグリシン、フェニル酢酸塩、3−フェニルプロピオン酸、桂皮酸エステル、p−クレゾール硫酸塩、フェノール硫酸塩、3−(4−ヒドロキシフェニル)乳酸塩、および/または4−ヒドロキシフェニルピルビン酸、またはその組み合わせの減少を含む、請求項48に記載の組成物。
- 個体に投与されたときに、心欠陥の重症度またはリスクが変化することに相関するように、個体のミクロビオームを変化させるミクロビオームを変化させる作用因子を含む組成物。
- 薬剤的に許容可能な担体をさらに含む請求項50に記載の組成物。
- 食品製品、機能性食品または栄養補助食品中に、または、食品製品として提供される請求項50に記載の組成物。
- 心欠陥の重症度またはリスクの減少を達成することに相関する投与計画に沿った投与のための単位用量が単位剤形で含まれる、請求項50に記載の組成物。
- ミクロビオームを変化させる作用因子は微生物細胞である、または、それを含む、請求項50に記載の組成物。
- 食品製品、機能性食品または栄養補助食品中に、または、食品製品として提供される請求項54に記載の組成物。
- ミクロビオームを変化させる作用因子は少なくとも1,000個の微生物細胞である、または、それを含む、請求項54に記載の組成物。
- ミクロビオームを変化させる作用因子は抗生物質である、または、それを含む、請求項50に記載の組成物。
- ミクロビオームを変化させる作用因子は抗生物質をさらに含む請求項54に記載の組成物。
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