JP2014508514A5 - - Google Patents
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Description
本明細書において、ＩＣＤもしくは抗不整脈剤に関する対象の必要性を決定するため、ＳＣＤ、心不全もしくは不整脈に関する対象のリスクを決定するため、または対象への抗不整脈剤の投与が安全となるか決定するために有用なキットがその上さらに提供される。例示的な態様において、キットは、（ｉ）生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを測定するための試薬と、（ｉｉ）生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを測定するための試薬とを含む。例示的な態様において、キットは、使用のための説明書またはそれへのアクセスを含む。例示的な態様において、本明細書においてさらに記載する通り、キットは、システムまたはプロセッサにより実行可能な機械可読命令を記憶したコンピュータ可読記憶媒体を含む。
特定の実施形態では、例えば以下が提供される：
（項目１）
ＩＣＤに関する対象の必要性を決定する方法であって、
対象から得られる生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、
（ｉ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは
（ｉｉ）前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは
（ｉｉｉ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベル
と比較する比率Ｒ Ｓ を決定するステップを含む、方法。
（項目２）
Ｒ Ｓ が閾値比率Ｒ Ｔ 以上である場合、前記対象がＩＣＤを必要とする、項目１に記載の方法。
（項目３）
Ｒ Ｔ が、対照対象から得られる生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、
（ｉ）前記対照対象から得られる前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは
（ｉｉ）前記対照対象から得られる前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは
（ｉｉｉ）前記対照対象から得られる前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベル
と比較する比率であり、
前記対照対象が、
（ｉ）ＩＣＤを有していない、
（ｉｉ）心臓病ではない、
（ｉｉｉ）正常な左心室機能を有する、
（ｉｖ）拡張機能障害がない、または
（ｖ）これらの組み合わせ
であることが既知の対象である、項目２に記載の方法。
（項目４）
Ｒ Ｔ ＝μ＋４．０σであり、
式中、μ＝は、１セットのデータ値のガウス分布の平均値であり、
前記セットの各データ値は、対照対象から得られる生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、
（ｉ）前記対照対象から得られる前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは
（ｉｉ）前記対照対象から得られる前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは
（ｉｉｉ）前記対照対象から得られる前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベル
と比較する比率を表し、
前記対照対象は、
（ｉ）ＩＣＤを有していない、
（ｉｉ）心臓病ではない、
（ｉｉｉ）正常な左心室機能を有する、
（ｉｖ）拡張機能障害がない、または
（ｖ）これらの組み合わせ
であることが既知の対象であり、σは、前記データ値のガウス分布の標準偏差である、項目２に記載の方法。
（項目５）
Ｒ Ｔ が、対照対象から得られる生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、
（ｉ）前記対照対象から得られる前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは
（ｉｉ）前記対照対象から得られる前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは
（ｉｉｉ）前記対照対象から得られる前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベル
と比較する比率であり、前記対照対象が、前記対照対象にショックを与えたことがないＩＣＤを有することが既知の対象である、項目２に記載の方法。
（項目６）
Ｒ Ｔ ＝μ＋Ｘσであり、式中、μ＝は、１セットのデータ値のガウス分布の平均値であり、前記セットの各データ値は、対照対象から得られる生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、
（ｉ）前記対照対象から得られる前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは
（ｉｉ）前記対照対象から得られる前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは
（ｉｉｉ）前記対照対象から得られる前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベル
と比較する比率を表し、前記対照対象は、前記対照対象にショックを与えたことがないＩＣＤを有することが既知の対象であり、σは、前記データ値のガウス分布の標準偏差であり、Ｘは、０．７〜４．０の間の数である、項目２に記載の方法。
（項目７）
Ｒ Ｔ ＝μ−Ｘσであり、式中、μ＝は、１セットのデータ値のガウス分布の平均値であり、前記セットの各データ値は、比率を表し、前記対照対象は、前記対照対象にショックを与えたことがないＩＣＤを有することが既知の対象であり、前記対照対象は、前記対照対象にショックを与えたことのあるＩＣＤを有することが既知の対象であり、σは、前記データ値のガウス分布の標準偏差であり、Ｘは、０．７〜４．０の間の数である、項目２に記載の方法。
（項目８）
Ｘが、約０．７〜約１．０の間の数である、項目７に記載の方法。
（項目９）
Ｘが、約２．０〜約４．０の間の数である、項目７に記載の方法。
（項目１０）
Ｘが、約２．３２６〜約４．０の間の数である、項目９に記載の方法。
（項目１１）
（Ａ）Ｒ Ｓ が決定されるとき、前記対象から得られる（ｉ）前記生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉｉ）前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルが、前記対象から得られる前記生体試料のハウスキーピング遺伝子のレベルに対し正規化される、
（Ｂ）Ｒ Ｔ が決定されるとき、前記対象から得られる（ｉ）前記生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉｉ）前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルが、前記対照対象から得られる前記生体試料のハウスキーピング遺伝子のレベルに対し正規化される、あるいは
（Ｃ）（Ａ）と（Ｂ）との両方である、先行する項目のうちのいずれか一項に記載の方法。
（項目１２）
前記ハウスキーピング遺伝子が、グリセルアルデヒド−３−リン酸デヒドロゲナーゼ（ＧＡＰＤＨ）またはβ−アクチンである、項目１１に記載の方法。
（項目１３）
Ｒ Ｓ が、
であり、式中、
切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔ切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔ完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
ΔΔＣｔ 完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝ΔＣｔ 完全長 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔΔＣｔ 切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝ΔＣｔ 切断型 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔＣｔ 完全長 ＝（［対象試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ 切断型 ＝（［対象試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子 ＝（［対象試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］−［対照試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］）であり、
「対象試料」は、前記対象から得られる生体試料であり、
「対照試料」は、
（ｉ）ＩＣＤを有していない、
（ｉｉ）心臓病ではない、
（ｉｉｉ）正常な左心室機能を有する、
（ｉｖ）拡張機能障害がない、または
（ｖ）これらの組み合わせ
であることが既知の対照対象から得られる生体試料であり、
「完全長」は、ＷＴ ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物もしくはＥ２８Ａ−Ｓ転写産物またはＷＴ ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物およびＥ２８Ａ−Ｓ転写産物の両方を指す、
あるいはＲ Ｓ が、
であり、式中、
切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔ切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔ全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
ΔΔＣｔ 全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝ΔＣｔ 全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔΔＣｔ 切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝ΔＣｔ 切断型 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔＣｔ 全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝（［対象試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ 切断型 ＝（［対象試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子 ＝（［対象試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］−［対照試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］）であり、
「対象試料」は、前記対象から得られる生体試料であり、
「対照試料」は、
（ｉ）ＩＣＤを有していない、
（ｉｉ）心臓病ではない、
（ｉｉｉ）正常な左心室機能を有する、
（ｉｖ）拡張機能障害がない、または
（ｖ）これらの組み合わせ
であることが既知の対照対象から得られる生体試料であり、
「全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物」は、ＷＴ、Ｅ２８Ａ−Ｓ、Ｅ２８Ｂ、Ｅ２８ＣおよびＥ２８Ｄの全てを指す、
先行する項目のうちのいずれか一項に記載の方法。
（項目１４）
Ｒ Ｔ ＝μ＋Ｘσである場合、前記対照対象から得られる前記生体試料の前記比率＝
であり、式中、
切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔ切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔ完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
ΔΔＣｔ 完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝ΔＣｔ 完全長 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔΔＣｔ 切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝ΔＣｔ 切断型 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔＣｔ 完全長 ＝（［ＩＣＤ患者（−）ショックの完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ 切断型 ＝（［ＩＣＤ患者（−）ショックの切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子 ＝（［ＩＣＤ患者（−）ショックのハウスキーピング遺伝子のＣｔ］−［対照試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］）であり、
「ＩＣＤ患者（−）ショック」は、ショックを与えたことがないＩＣＤを有することが既知の対象から得られる生体試料であり、
「対照試料」は、
（ｉ）ＩＣＤを有していない、
（ｉｉ）心臓病ではない、
（ｉｉｉ）正常な左心室機能を有する、
（ｉｖ）拡張機能障害がない、または
（ｖ）これらの組み合わせ
であることが既知の対照対象から得られる生体試料であり、
「完全長」は、ＷＴ ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物もしくはＥ２８Ａ−Ｓ転写産物またはＷＴ ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物およびＥ２８Ａ−Ｓ転写産物の両方を指す
、
あるいは、Ｒ Ｔ ＝μ＋Ｘσである場合、前記対照対象から得られる前記生体試料の前記比率＝
であり、式中、
切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔ切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔ全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
ΔΔＣｔ 全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝ΔＣｔ 全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔΔＣｔ 切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝ΔＣｔ 切断型 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔＣｔ 全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝（［ＩＣＤ患者（−）ショックの全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ 切断型 ＝（［ＩＣＤ患者（−）ショックの切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子 ＝（［ＩＣＤ患者（−）ショックのハウスキーピング遺伝子のＣｔ］−［対照試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］）であり、
「ＩＣＤ患者（−）ショック」は、ショックを与えたことがないＩＣＤを有することが既知の対象から得られる生体試料であり、
「対照試料」は、
（ｉ）ＩＣＤを有していない、
（ｉｉ）心臓病ではない、
（ｉｉｉ）正常な左心室機能を有する、
（ｉｖ）拡張機能障害がない、または
（ｖ）これらの組み合わせ
であることが既知の対照対象から得られる生体試料であり、
「全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物」は、ＷＴ、Ｅ２８Ａ−Ｓ、Ｅ２８Ｂ、Ｅ２８ＣおよびＥ２８Ｄの全てを指す、
項目６および１１〜１３のいずれか一項に記載の方法。
（項目１５）
Ｒ Ｔ ＝μ−Ｘσである場合、前記対照対象から得られる前記生体試料の前記比率が、
であり、式中、
切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔ切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔ完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
ΔΔＣｔ 完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝ΔＣｔ 完全長 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔΔＣｔ 切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝ΔＣｔ 切断型 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔＣｔ 完全長 ＝（［ＩＣＤ患者（＋）ショックの完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ 切断型 ＝（［ＩＣＤ患者（＋）ショックの切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子 ＝（［ＩＣＤ患者（＋）ショックのハウスキーピング遺伝子のＣｔ］−［対照試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］）であり、
「ＩＣＤ患者（＋）ショック」は、ショックを与えたことのあるＩＣＤを有することが既知の対象から得られる生体試料であり、
「対照試料」は、
（ｉ）ＩＣＤを有していない、
（ｉｉ）心臓病ではない、
（ｉｉｉ）正常な左心室機能を有する、
（ｉｖ）拡張機能障害がない、または
（ｖ）これらの組み合わせ
であることが既知の対照対象から得られる生体試料であり、
「完全長」は、ＷＴ ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物もしくはＥ２８Ａ−Ｓ転写産物またはＷＴ ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物およびＥ２８Ａ−Ｓ転写産物の両方を指す、
あるいはＲ Ｔ ＝μ−Ｘσである場合、前記対照対象から得られる前記生体試料の前記比率が、
であり、式中、
切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔ切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔ全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
ΔΔＣｔ 全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝ΔＣｔ 全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔΔＣｔ 切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝ΔＣｔ 切断型 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔＣｔ 全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝（［ＩＣＤ患者（＋）ショックの全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ 切断型 ＝（［ＩＣＤ患者（＋）ショックの切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子 ＝（［ＩＣＤ患者（＋）ショックのハウスキーピング遺伝子のＣｔ］−［対照試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］）であり、
「ＩＣＤ患者（＋）ショック」は、ショックを与えたことのあるＩＣＤを有することが既知の対象から得られる生体試料であり、
「対照試料」は、
（ｉ）ＩＣＤを有していない、
（ｉｉ）心臓病ではない、
（ｉｉｉ）正常な左心室機能を有する、
（ｉｖ）拡張機能障害がない、または
（ｖ）これらの組み合わせ
であることが既知の対照対象から得られる生体試料であり、
「全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物」は、ＷＴ、Ｅ２８Ａ−Ｓ、Ｅ２８Ｂ、Ｅ２８ＣおよびＥ２８Ｄの全てを指す、
項目７〜１３のいずれか一項に記載の方法。
（項目１６）
各ｍＲＮＡレベルが、リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応（Ｒ Ｔ −ＰＣＲ）により決定される、項目１３〜１５のいずれか一項に記載の方法。
（項目１７）
前記切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の前記レベルが、ＳＣＮ５Ａエクソン２８スプライスバリアントＣ（Ｅ２８Ｃ）のレベルまたはＳＣＮ５Ａエクソン２８スプライスバリアントＤ（Ｅ２８Ｄ）のレベルである、先行する項目のうちのいずれか一項に記載の方法。
（項目１８）
切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の前記レベルが、Ｅ２８ＣおよびＥ２８Ｄのレベルである、項目１７に記載の方法。
（項目１９）
前記切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の前記レベルが、（ｉ）ＷＴ ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベル、（ｉｉ）Ｅ２８Ａ−Ｓのレベルまたは（ｉｉｉ）（ｉ）と（ｉｉ）との組み合わせと比較される、先行する項目のうちのいずれか一項に記載の方法。
（項目２０）
前記切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の前記レベルが、ＷＴ ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物、Ｅ２８Ａ−Ｓ、Ｅ２８Ｂ、Ｅ２８ＣおよびＥ２８Ｄの全てのレベルと比較される、先行する項目のうちのいずれか一項に記載の方法。
（項目２１）
前記切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の前記レベルが、（Ａ）および（Ｂ）のレベルと比較され、
（Ａ）が、（ｉ）ＷＴ ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベル、（ｉｉ）Ｅ２８Ａ−Ｓのレベルまたは（ｉｉｉ）（ｉ）と（ｉｉ）との組み合わせのうちの１つであり、
（Ｂ）が、Ｅ２８Ｂ、Ｅ２８ＣおよびＥ２８Ｄのうちの１または複数である、
先行する項目のうちのいずれか一項に記載の方法。
（項目２２）
前記切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物が、Ｅ２８Ｃである、項目１９または２０に記載の方法。
（項目２３）
Ｒ Ｓ ＝Ｒ Ｅ２８Ｃ ＝
であり、式中、
Ｅ２８Ｃ転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔＥ２８Ｃ転写産物
完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔ完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
ΔΔＣｔ 完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝ΔＣｔ 完全長 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔΔＣｔ Ｅ２８Ｃ転写産物 ＝ΔＣｔ Ｅ２８Ｃ転写産物 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔＣｔ 完全長 ＝（［対象試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照
試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ Ｅ２８Ｃ ＝（［対象試料のＥ２８Ｃ転写産物のＣｔ］−［対照試料のＥ２８Ｃ転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子 ＝（［対象試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］−［対照試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］）であり、
「対象試料」は、前記対象から得られる生体試料であり、
「対照試料」は、
（ｉ）ＩＣＤを有していない、
（ｉｉ）心臓病ではない、
（ｉｉｉ）正常な左心室機能を有する、
（ｉｖ）拡張機能障害がない、または
（ｖ）これらの組み合わせ
であることが既知の対照対象から得られる生体試料であり、
「完全長」は、ＷＴ ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物もしくはＥ２８Ａ−Ｓ転写産物またはＷＴ ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物およびＥ２８Ａ−Ｓ転写産物の両方を指す、
あるいはＲ Ｅ２８Ｃ ＝
であり、式中、
Ｅ２８Ｃ転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔＥ２８Ｃ転写産物
全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔ全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
ΔΔＣｔ 全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝ΔＣｔ 全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔΔＣｔ Ｅ２８Ｃ転写産物 ＝ΔＣｔ Ｅ２８Ｃ転写産物 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔＣｔ 全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝（［対象試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ Ｅ２８Ｃ ＝（［対象試料のＥ２８Ｃ転写産物のＣｔ］−［対照試料のＥ２８Ｃ転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子 ＝（［対象試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］−［対照試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］）であり、
「対象試料」は、前記対象から得られる生体試料であり、
「対照試料」は、
（ｉ）ＩＣＤを有していない、
（ｉｉ）心臓病ではない、
（ｉｉｉ）正常な左心室機能を有する、
（ｉｖ）拡張機能障害がない、または
（ｖ）これらの組み合わせ
であることが既知の対照対象から得られる生体試料であり、
「全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物」は、ＷＴ、Ｅ２８Ａ−Ｓ、Ｅ２８Ｂ、Ｅ２８ＣおよびＥ２８Ｄの全てを指す、
項目２２に記載の方法。
（項目２４）
切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物が、Ｅ２８Ｄである、項目１９または２１に記載の方法。
（項目２５）
Ｒ Ｓ ＝Ｒ Ｅ２８Ｄ ＝
であり、式中、
Ｅ２８Ｄ転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔＥ２８Ｄ転写産物
完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔ完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
ΔΔＣｔ 完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝ΔＣｔ 完全長 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔΔＣｔ Ｅ２８Ｄ転写産物 ＝ΔＣｔ Ｅ２８Ｄ転写産物 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔＣｔ 完全長 ＝（［対象試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ Ｅ２８Ｄ ＝（［対象試料のＥ２８Ｄ転写産物のＣｔ］−［対照試料のＥ２８Ｄ転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子 ＝（［対象試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］−［対照試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］）であり、
「対象試料」は、前記対象から得られる生体試料であり、
「対照試料」は、
（ｉ）ＩＣＤを有していない、
（ｉｉ）心臓病ではない、
（ｉｉｉ）正常な左心室機能を有する、
（ｉｖ）拡張機能障害がない、または
（ｖ）これらの組み合わせ
であることが既知の対照対象から得られる生体試料であり、
「完全長」は、ＷＴ ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物もしくはＥ２８Ａ−Ｓ転写産物またはＷＴ ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物およびＥ２８Ａ−Ｓ転写産物の両方を指す、
あるいはＲ Ｅ２８Ｄ ＝
であり、式中、
Ｅ２８Ｄ転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔＥ２８Ｄ転写産物
全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔ全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
ΔΔＣｔ 全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝ΔＣｔ 全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔΔＣｔ Ｅ２８Ｄ転写産物 ＝ΔＣｔ Ｅ２８Ｄ転写産物 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔＣｔ 全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝（［対象試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ Ｅ２８Ｄ ＝（［対象試料のＥ２８Ｄ転写産物のＣｔ］−［対照試料のＥ２８Ｄ転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子 ＝（［対象試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］−［対照試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］）であり、
「対象試料」は、前記対象から得られる生体試料であり、
「対照試料」は、
（ｉ）ＩＣＤを有していない、
（ｉｉ）心臓病ではない、
（ｉｉｉ）正常な左心室機能を有する、
（ｉｖ）拡張機能障害がない、または
（ｖ）これらの組み合わせ
であることが既知の対照対象から得られる生体試料であり、
「全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物」は、ＷＴ、Ｅ２８Ａ−Ｓ、Ｅ２８Ｂ、Ｅ２８ＣおよびＥ２８Ｄの全てを指す、
項目２４に記載の方法。
（項目２６）
第一のＲ Ｓ および第二のＲ Ｓ を決定するステップを含み、ここで前記第一のＲ Ｓ が、Ｅ２８Ｃのレベルを全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の前記レベルと比較し、前記第二のＲ Ｓ が、Ｅ２８Ｄのレベルを全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の前記レベルと比較する、項目２２〜２５のいずれか一項に記載の方法。
（項目２７）
前記第一のＲ Ｓ が、ＲＥ２８Ｃであり、前記第二のＲ Ｓ が、Ｅ２８Ｄである、項目２６に記載の方法。
（項目２８）
植え込み式除細動器（ＩＣＤ）に関する対象の必要性を決定する方法であって、
（Ａ）対象の生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、（ｉ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉ）前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉｉ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルと比較する、比率Ｒ Ｓ を決定するステップと、
（Ｂ）（Ａ）において決定されたＲ Ｓ を閾値比率Ｒ Ｔ と比較するステップであって、項目９７〜１０８のいずれか一項に記載のシステムによりＲ Ｔ が決定されるステップと、を含む、方法。
（項目２９）
Ｒ Ｓ が前記Ｒ Ｔ 以上である場合、前記対象がＩＣＤを必要とする、項目２８に記載の方法。
（項目３０）
心臓性突然死（ＳＣＤ）に関する対象のリスクを決定する方法であって、
対象から得られる生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、（ｉ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉ）前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉｉ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルと比較する、比率Ｒ Ｓ を決定するステップを含む、方法。
（項目３１）
Ｒ Ｓ が閾値比率Ｒ Ｔ 以上である場合、前記対象にＳＣＤのリスクがある、項目３０に記載の方法。
（項目３２）
抗不整脈療法に関する対象の必要性を決定する方法であって、
対象から得られる生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、（ｉ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉ）前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉｉ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルと比較する、比率Ｒ Ｓ を決定するステップを含む、方法。
（項目３３）
Ｒ Ｓ が閾値比率Ｒ Ｔ 以上である場合、前記対象が抗不整脈療法を必要とする、項目３２に記載の方法。
（項目３４）
前記抗不整脈剤が、Ｓｉｎｇｈ Ｖａｕｇｈａｎ ＷｉｌｌｉａｍｓクラスＩＡ、ＩＢ、ＩＣまたはＩＩＩ抗不整脈剤である、項目３２または３３に記載の方法。
（項目３５）
前記Ｓｉｎｇｈ Ｖａｕｇｈａｎ ＷｉｌｌｉａｍｓクラスＩＡ抗不整脈剤が、キニジン、プロカインアミドまたはジソピラミドである、項目３２または３３に記載の方法。
（項目３６）
前記Ｓｉｎｇｈ Ｖａｕｇｈａｎ ＷｉｌｌｉａｍｓクラスＩＢ抗不整脈剤が、リドカイン、フェニトイン、メキシレチンまたはトカイニドである、項目３２または３３に記載の方法。
（項目３７）
前記Ｓｉｎｇｈ Ｖａｕｇｈａｎ ＷｉｌｌｉａｍｓクラスＩＣ抗不整脈剤が、フレカイニド、プロパフェノン、モリシジンまたはエンカイニドである、項目３２または３３に記載の方法。
（項目３８）
前記Ｓｉｎｇｈ Ｖａｕｇｈａｎ ＷｉｌｌｉａｍｓクラスＩＩＩ抗不整脈剤が、ドロネダロン、アミオダロンまたはイブチリドである、項目３２または３３に記載の方法。
（項目３９）
前記抗不整脈剤が、ＮＡＤ＋またはｍｉｔｏＴＥＭＰＯである、項目３２または３３に記載の方法。
（項目４０）
対象における心臓性突然死（ＳＣＤ）のリスクを低下させる方法であって、
（ａ）対象から得られる生体試料の、切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、（ｉ）完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉ）全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルと比較する、比率Ｒ Ｓ を決定するステップと、
（ｂ）Ｒ Ｓ が閾値比率Ｒ Ｔ と比べて増加している場合、前記対象にＩＣＤを植え込むステップと、
のうちのステップを含む、方法。
（項目４１）
Ｒ Ｔ が、対照対象から得られる生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、（ｉ）前記対照対象から得られる前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉ）前記対照対象から得られる前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉｉ）前記対照対象から得られる前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルと比較する比率であり、前記対照対象が、（ｉ）ＩＣＤを有していない、（ｉｉ）心臓病ではない、（ｉｉｉ）正常な左心室機能を有する、（ｉｖ）拡張機能障害がない、または（ｖ）これらの組み合わせであることが既知の対象である、項目３１および３３〜４０のいずれか一項に記載の方法。
（項目４２）
Ｒ Ｔ ＝μ＋４．０σであり、式中、μ＝は、１セットのデータ値のガウス分布の平均値であり、前記セットの各データ値は、対照対象から得られる生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、（ｉ）前記対照対象から得られる前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉ）前記対照対象から得られる前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉｉ）前記対照対象から得られる前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルと比較する比率を表し、前記対照対象は、（ｉ）ＩＣＤを有していない、（ｉｉ）心臓病ではない、（ｉｉｉ）正常な左心室機能を有する、（ｉｖ）拡張機能障害がない、または（ｖ）これらの組み合わせ
であることが既知の対象であり、σは、前記データ値のガウス分布の標準偏差である、項目３１および３３〜４０のいずれか一項に記載の方法。
（項目４３）
Ｒ Ｔ が、対照対象から得られる生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、（ｉ）前記対照対象から得られる前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉ）前記対照対象から得られる前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉｉ）前記対照対象から得られる前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルと比較する比率であり、前記対照対象が、前記対照対象にショックを与えたことがないＩＣＤを有することが既知の対象である、項目３１および３３〜４０のいずれか一項に記載の方法。
（項目４４）
Ｒ Ｔ ＝μ＋Ｘσであり、式中、μ＝は、１セットのデータ値のガウス分布の平均値であり、前記セットの各データ値は、対照対象から得られる生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、（ｉ）前記対照対象から得られる前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉ）前記対照対象から得られる前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉｉ）前記対照対象から得られる前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルと比較する比率を表し、前記対照対象は、前記対照対象にショックを与えたことがないＩＣＤを有することが既知の対象であり、σは、前記データ値のガウス分布の標準偏差であり、Ｘは、０．７〜４．０の間の数である、項目３１および３３〜４０のいずれか一項に記載の方法。
（項目４５）
Ｒ Ｔ ＝μ−Ｘσであり、式中、μ＝は、１セットのデータ値のガウス分布の平均値であり、前記セットの各データ値は、比率を表し、前記対照対象は、前記対照対象にショックを与えたことがないＩＣＤを有することが既知の対象であり、前記対照対象は、前記対照対象にショックを与えたことのあるＩＣＤを有することが既知の対象であり、σは、前記データ値のガウス分布の標準偏差であり、Ｘは、０．７〜４．０の間の数である、項目３１および３３〜４０のいずれか一項に記載の方法。
（項目４６）
Ｘが、約０．７〜約１．０の間の数である、項目４５に記載の方法。
（項目４７）
Ｘが、約２．０〜約４．０の間の数である、項目４５に記載の方法。
（項目４８）
Ｘが、約２．３２６〜約４．０の間の数である、項目４７に記載の方法。
（項目４９）
（Ａ）Ｒ Ｓ が決定されるとき、前記対象から得られる（ｉ）前記生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉｉ）前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルが、前記対象から得られる前記生体試料のハウスキーピング遺伝子のレベルに対し正規化される、
（Ｂ）Ｒ Ｔ が決定されるとき、前記対象から得られる（ｉ）前記生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉｉ）前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルが、前記対照対象から得られる前記生体試料のハウスキーピング遺伝子のレベルに対し正規化される、あるいは
（Ｃ）（Ａ）と（Ｂ）の両方である、
項目３０〜４８のいずれか一項に記載の方法。
（項目５０）
前記ハウスキーピング遺伝子が、グリセルアルデヒド−３−リン酸デヒドロゲナーゼ（
ＧＡＰＤＨ）またはβ−アクチンである、項目４９に記載の方法。
（項目５１）
Ｒ Ｓ が、
であり、式中、
切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔ切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔ完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
ΔΔＣｔ 完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝ΔＣｔ 完全長 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔΔＣｔ 切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝ΔＣｔ 切断型 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔＣｔ 完全長 ＝（［対象試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ 切断型 ＝（［対象試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子 ＝（［対象試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］−［対照試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］）であり、
「対象試料」は、前記対象から得られる生体試料であり、
「対照試料」は、
（ｉ）ＩＣＤを有していない、
（ｉｉ）心臓病ではない、
（ｉｉｉ）正常な左心室機能を有する、
（ｉｖ）拡張機能障害がない、または
（ｖ）これらの組み合わせ
であることが既知の対照対象から得られる生体試料であり、
「完全長」は、ＷＴ ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物もしくはＥ２８Ａ−Ｓ転写産物またはＷＴ ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物およびＥ２８Ａ−Ｓ転写産物の両方を指す、
あるいはＲ Ｓ が、
であり、式中、
切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔ切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔ全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
ΔΔＣｔ 全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝ΔＣｔ 全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔΔＣｔ 切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝ΔＣｔ 切断型 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔＣｔ 全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝（［対象試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転
写産物のＣｔ］−［対照試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ 切断型 ＝（［対象試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子 ＝（［対象試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］−［対照試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］）であり、
「対象試料」は、前記対象から得られる生体試料であり、
「対照試料」は、
（ｉ）ＩＣＤを有していない、
（ｉｉ）心臓病ではない、
（ｉｉｉ）正常な左心室機能を有する、
（ｉｖ）拡張機能障害がない、または
（ｖ）これらの組み合わせ
であることが既知の対照対象から得られる生体試料であり、
「全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物」は、ＷＴ、Ｅ２８Ａ−Ｓ、Ｅ２８Ｂ、Ｅ２８ＣおよびＥ２８Ｄの全てを指す、
項目２８〜５０のいずれか一項に記載の方法。
（項目５２）
Ｒ Ｔ ＝μ＋Ｘσである場合、前記対照対象から得られる前記生体試料の比率＝
であり、式中、
切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔ切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔ完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
ΔΔＣｔ 完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝ΔＣｔ 完全長 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔΔＣｔ 切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝ΔＣｔ 切断型 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔＣｔ 完全長 ＝（［ＩＣＤ患者（−）ショックの完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ 切断型 ＝（［ＩＣＤ患者（−）ショックの切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子 ＝（［ＩＣＤ患者（−）ショックのハウスキーピング遺伝子のＣｔ］−［対照試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］）であり、
「ＩＣＤ患者（−）ショック」は、ショックを与えたことがないＩＣＤを有することが既知の対象から得られる生体試料であり、
「対照試料」は、
（ｉ）ＩＣＤを有していない、
（ｉｉ）心臓病ではない、
（ｉｉｉ）正常な左心室機能を有する、
（ｉｖ）拡張機能障害がない、または
（ｖ）これらの組み合わせ
であることが既知の対照対象から得られる生体試料であり、
「完全長」は、ＷＴ ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物もしくはＥ２８Ａ−Ｓ転写産物またはＷＴ ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物およびＥ２８Ａ−Ｓ転写産物の両方を指す、
あるいは、Ｒ Ｔ ＝μ＋Ｘσである場合、前記対照対象から得られる前記生体試料の比率＝
であり、式中、
切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔ切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔ全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
ΔΔＣｔ 全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝ΔＣｔ 全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔΔＣｔ 切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝ΔＣｔ 切断型 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔＣｔ 全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝（［ＩＣＤ患者（−）ショックの全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ 切断型 ＝（［ＩＣＤ患者（−）ショックの切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子 ＝（［ＩＣＤ患者（−）ショックのハウスキーピング遺伝子のＣｔ］−［対照試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］）であり、
「ＩＣＤ患者（−）ショック」は、ショックを与えたことがないＩＣＤを有することが既知の対象から得られる生体試料であり、
「対照試料」は、
（ｉ）ＩＣＤを有していない、
（ｉｉ）心臓病ではない、
（ｉｉｉ）正常な左心室機能を有する、
（ｉｖ）拡張機能障害がない、または
（ｖ）これらの組み合わせ
であることが既知の対照対象から得られる生体試料であり、
「全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物」は、ＷＴ、Ｅ２８Ａ−Ｓ、Ｅ２８Ｂ、Ｅ２８ＣおよびＥ２８Ｄの全てを指す、
項目４４および４９〜５１のいずれか一項に記載の方法。
（項目５３）
Ｒ Ｔ ＝μ−Ｘσである場合、前記対照対象から得られる前記生体試料の比率が、
であり、式中、
切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔ切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔ完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
ΔΔＣｔ 完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝ΔＣｔ 完全長 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔΔＣｔ 切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝ΔＣｔ 切断型 −ΔＣｔ ハウスキーピン
グ遺伝子
ΔＣｔ 完全長 ＝（［ＩＣＤ患者（＋）ショックの完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ 切断型 ＝（［ＩＣＤ患者（＋）ショックの切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子 ＝（［ＩＣＤ患者（＋）ショックのハウスキーピング遺伝子のＣｔ］−［対照試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］）であり、
「ＩＣＤ患者（＋）ショック」は、ショックを与えたことのあるＩＣＤを有することが既知の対象から得られる生体試料であり、
「対照試料」は、
（ｉ）ＩＣＤを有していない、
（ｉｉ）心臓病ではない、
（ｉｉｉ）正常な左心室機能を有する、
（ｉｖ）拡張機能障害がない、または
（ｖ）これらの組み合わせ
であることが既知の対照対象から得られる生体試料であり、
「完全長」は、ＷＴ ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物もしくはＥ２８Ａ−Ｓ転写産物またはＷＴ ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物およびＥ２８Ａ−Ｓ転写産物の両方を指す、
あるいはＲ Ｔ ＝μ−Ｘσである場合、前記対照対象から得られる前記生体試料の比率が、
であり、式中、
切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔ切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔ全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
ΔΔＣｔ 全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝ΔＣｔ 全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔΔＣｔ 切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝ΔＣｔ 切断型 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔＣｔ 全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝（［ＩＣＤ患者（＋）ショックの全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ 切断型 ＝（［ＩＣＤ患者（＋）ショックの切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子 ＝（［ＩＣＤ患者（＋）ショックのハウスキーピング遺伝子のＣｔ］−［対照試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］）であり、
「ＩＣＤ患者（＋）ショック」は、ショックを与えたことのあるＩＣＤを有することが既知の対象から得られる生体試料であり、
「対照試料」は、
（ｉ）ＩＣＤを有していない、
（ｉｉ）心臓病ではない、
（ｉｉｉ）正常な左心室機能を有する、
（ｉｖ）拡張機能障害がない、または
（ｖ）これらの組み合わせ
であることが既知の対照対象から得られる生体試料であり、
「全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物」は、ＷＴ、Ｅ２８Ａ−Ｓ、Ｅ２８Ｂ、Ｅ２８ＣおよびＥ２８Ｄの全てを指す、
項目４５〜５１のいずれか一項に記載の方法。
（項目５４）
各レベルが、リアルタイムポリメラーゼ連鎖反応（Ｒ Ｔ −ＰＣＲ）により決定される、項目２８〜５３のいずれか一項に記載の方法。
（項目５５）
前記切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の前記レベルが、ＳＣＮ５Ａエクソン２８スプライスバリアントＣ（Ｅ２８Ｃ）のレベルまたはＳＣＮ５Ａエクソン２８スプライスバリアントＤ（Ｅ２８Ｄ）のレベルである、項目２８〜５４のいずれか一項に記載の方法。
（項目５６）
切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の前記レベルが、Ｅ２８ＣおよびＥ２８Ｄのレベルである、項目５５に記載の方法。
（項目５７）
前記切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の前記レベルが、（ｉ）ＷＴ ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベル、（ｉｉ）Ｅ２８Ａ−Ｓのレベルまたは（ｉｉｉ）（ｉ）および（ｉｉ）の組み合わせと比較される、項目２８〜５６のいずれか一項に記載の方法。
（項目５８）
前記切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の前記レベルが、ＷＴ ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物、Ｅ２８Ａ−Ｓ、Ｅ２８Ｂ、Ｅ２８ＣおよびＥ２８Ｄの全てのレベルと比較される、項目２８〜５６のいずれか一項に記載の方法。
（項目５９）
前記切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の前記レベルが、（Ａ）および（Ｂ）のレベルと比較され、
（Ａ）が、（ｉ）ＷＴ ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベル、（ｉｉ）Ｅ２８Ａ−Ｓのレベルまたは（ｉｉｉ）（ｉ）および（ｉｉ）の組み合わせのうちの１つであり、
（Ｂ）が、Ｅ２８Ｂ、Ｅ２８ＣおよびＥ２８Ｄのうちの１または複数である、
項目２８〜５６のいずれか一項に記載の方法。
（項目６０）
前記切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物が、Ｅ２８Ｃである、項目５７または５８に記載の方法。
（項目６１）
Ｒ Ｓ ＝Ｒ Ｅ２８Ｃ ＝
であり、式中、
Ｅ２８Ｃ転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔＥ２８Ｃ転写産物
完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔ完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
ΔΔＣｔ 完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝ΔＣｔ 完全長 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔΔＣｔ Ｅ２８Ｃ転写産物 ＝ΔＣｔ Ｅ２８Ｃ転写産物 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔＣｔ 完全長 ＝（［対象試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ Ｅ２８Ｃ ＝（［対象試料のＥ２８Ｃ転写産物のＣｔ］−［対照試料のＥ２８Ｃ転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子 ＝（［対象試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］−［対照試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］）であり、
「対象試料」は、前記対象から得られる生体試料であり、
「対照試料」は、
（ｉ）ＩＣＤを有していない、
（ｉｉ）心臓病ではない、
（ｉｉｉ）正常な左心室機能を有する、
（ｉｖ）拡張機能障害がない、または
（ｖ）これらの組み合わせ
であることが既知の対照対象から得られる生体試料であり、
「完全長」は、ＷＴ ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物もしくはＥ２８Ａ−Ｓ転写産物またはＷＴ ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物およびＥ２８Ａ−Ｓ転写産物の両方を指す、
あるいはＲ Ｅ２８Ｃ ＝
であり、式中、
Ｅ２８Ｃ転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔＥ２８Ｃ転写産物
全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔ全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
ΔΔＣｔ 全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝ΔＣｔ 全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔΔＣｔ Ｅ２８Ｃ転写産物 ＝ΔＣｔ Ｅ２８Ｃ転写産物 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔＣｔ 全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝（［対象試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ Ｅ２８Ｃ ＝（［対象試料のＥ２８Ｃ転写産物のＣｔ］−［対照試料のＥ２８Ｃ転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子 ＝（［対象試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］−［対照試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］）であり、
「対象試料」は、前記対象から得られる生体試料であり、
「対照試料」は、
（ｉ）ＩＣＤを有していない、
（ｉｉ）心臓病ではない、
（ｉｉｉ）正常な左心室機能を有する、
（ｉｖ）拡張機能障害がない、または
（ｖ）これらの組み合わせ
であることが既知の対照対象から得られる生体試料であり、
「全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物」は、ＷＴ、Ｅ２８Ａ−Ｓ、Ｅ２８Ｂ、Ｅ２８ＣおよびＥ２８Ｄの全てを指す、
項目６０に記載の方法。
（項目６２）
切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物が、Ｅ２８Ｄである、項目５７または５８に記載の方法。
（項目６３）
Ｒ Ｓ ＝Ｒ Ｅ２８Ｄ ＝
であり、式中、
Ｅ２８Ｄ転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔＥ２８Ｄ転写産物
完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔ完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
ΔΔＣｔ 完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝ΔＣｔ 完全長 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔΔＣｔ Ｅ２８Ｄ転写産物 ＝ΔＣｔ Ｅ２８Ｄ転写産物 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔＣｔ 完全長 ＝（［対象試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ Ｅ２８Ｄ ＝（［対象試料のＥ２８Ｄ転写産物のＣｔ］−［対照試料のＥ２８Ｄ転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子 ＝（［対象試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］−［対照試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］）であり、
「対象試料」は、前記対象から得られる生体試料であり、
「対照試料」は、
（ｉ）ＩＣＤを有していない、
（ｉｉ）心臓病ではない、
（ｉｉｉ）正常な左心室機能を有する、
（ｉｖ）拡張機能障害がない、または
（ｖ）これらの組み合わせ
であることが既知の対照対象から得られる生体試料であり、
「完全長」は、ＷＴ ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物もしくはＥ２８Ａ−Ｓ転写産物またはＷＴ ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物およびＥ２８Ａ−Ｓ転写産物の両方を指す、
あるいはＲ Ｅ２８Ｄ ＝
であり、式中、
Ｅ２８Ｄ転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔＥ２８Ｄ転写産物
全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔ全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
ΔΔＣｔ 全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝ΔＣｔ 全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔΔＣｔ Ｅ２８Ｄ転写産物 ＝ΔＣｔ Ｅ２８Ｄ転写産物 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔＣｔ 全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝（［対象試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ Ｅ２８Ｄ ＝（［対象試料のＥ２８Ｄ転写産物のＣｔ］−［対照試料のＥ２８Ｄ転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子 ＝（［対象試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］−［対照試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］）であり、
「対象試料」は、前記対象から得られる生体試料であり、
「対照試料」は、
（ｉ）ＩＣＤを有していない、
（ｉｉ）心臓病ではない、
（ｉｉｉ）正常な左心室機能を有する、
（ｉｖ）拡張機能障害がない、または
（ｖ）これらの組み合わせ
であることが既知の対照対象から得られる生体試料であり、
「全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物」は、ＷＴ、Ｅ２８Ａ−Ｓ、Ｅ２８Ｂ、Ｅ２８ＣおよびＥ２８Ｄの全てを指す、
項目６２に記載の方法。
（項目６４）
第一のＲ Ｓ および第二のＲ Ｓ を決定するステップを含み、ここで、前記第一のＲ Ｓ が、Ｅ２８Ｃのレベルを全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の前記レベルと比較し、前記第二のＲ Ｓ が、Ｅ２８Ｄのレベルを全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の前記レベルと比較する、項目２８〜６３のいずれか一項に記載の方法。
（項目６５）
前記第一のＲ Ｓ が、ＲＥ２８Ｃであり、前記第二のＲ Ｓ が、Ｅ２８Ｄである、項目６４に記載の方法。
（項目６６）
不整脈に関する対象のリスクを決定する方法であって、
対象から得られる生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、（ｉ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉ）前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉｉ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルと比較する、比率Ｒ Ｓ を決定するステップを含む、方法。
（項目６７）
Ｒ Ｓ が閾値比率Ｒ Ｔ 以上である場合、前記対象に不整脈のリスクがある、項目６６に記載の方法。
（項目６８）
前記不整脈が、心房性不整脈、場合により、心房細動である、項目６６または６７に記載の方法。
（項目６９）
心不全に関する対象のリスクを決定する方法であって、
対象から得られる生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、（ｉ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉ）前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉｉ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルと比較する、比率Ｒ Ｓ を決定するステップを含む、方法。
（項目７０）
Ｒ Ｓ が閾値比率Ｒ Ｔ 以上である場合、前記対象に心不全のリスクがある、項目６９に記載の方法。
（項目７１）
前記対象から得られる生体試料の（ｉ）完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベル、（ｉｉ）切断型ＳＣＮ５Ａ転写産物のレベルまたは（ｉｉｉ）全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを測定するステップを含む、先行する項目のうちのいずれか一項に記載の方法。
（項目７２）
前記測定するステップが、ポリメラーゼ連鎖反応、場合によりリアルタイムＰＣＲを行うステップを含む、項目７１に記載の方法。
（項目７３）
（Ａ）前記対象から得られる生体試料の（ｉ）完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベル、（ｉｉ）切断型ＳＣＮ５Ａ転写産物のレベルまたは（ｉｉｉ）全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを測定するステップと、
（Ｂ）前記対象の医療記録から、（ｉ）完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベル、（ｉｉ）切断型ＳＣＮ５Ａ転写産物のレベルまたは（ｉｉｉ）全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを得るステップと、
を含む、項目７１または７２に記載の方法。
（項目７４）
前記対象に抗不整脈療法を与えるステップを含む、先行する項目のうちのいずれか一項に記載の方法。
（項目７５）
ＩＣＤを植え込む必要があると決定された対象にＩＣＤを植え込むステップを含む、項目７４に記載の方法。
（項目７６）
前記対象に抗不整脈剤を投与するステップを含む、項目７４または７５に記載の方法。
（項目７７）
前記抗不整脈剤が、ナトリウムチャネル遮断剤である、項目７６に記載の方法。
（項目７８）
（ｉ）６〜１２カ月毎に前記対象から生体試料を得るステップと、（ｉｉ）得られた各生体試料のＲ Ｓ を決定するステップとを含む、先行する項目のうちのいずれか一項に記載の方法。
（項目７９）
前記試料におけるＳＣＮ５Ａスプライシング因子もしくはＵＰＲタンパク質、またはシャペロンタンパク質のレベルを決定するステップを含む、先行する項目のうちのいずれか一項に記載の方法。
（項目８０）
ｈＬｕｃ７Ａ、ＲＢＭ２５またはＰＥＲＫのレベルを決定するステップを含む、項目７９に記載の方法。
（項目８１）
前記シャペロンタンパク質が、ＣＨＯＰまたはカルネキシンである、項目７９に記載の方法。
（項目８２）
前記生体試料が、前記対象由来の白血球、心臓細胞または筋肉細胞を含む、先行する項目のうちのいずれか一項に記載の方法。
（項目８３）
前記生体試料が、前記対象由来の血液である、項目８２に記載の方法。
（項目８４）
前記対象が、５０％未満または約５０％の慢性左心室駆出率を患う、先行する項目のうちのいずれか一項に記載の方法。
（項目８５）
前記対象が、４０％未満または約４０％の慢性左心室駆出率を患う、項目８４に記載の方法。
（項目８６）
前記対象が、３５％未満または約３５％の慢性左心室駆出率を患う、項目８５に記載の方法。
（項目８７）
前記対象が、（ｉ）心筋梗塞後少なくとも４０日で非虚血性拡張型心筋症または虚血性心疾患を患う、（ｉｉ）慢性的に医学療法を受けていながらも、ＮＹＨＡ機能的クラスＩＩまたはＩＩＩ対象として分類される、または（ｉｉｉ）（ｉ）および（ｉｉ）の両方で
ある、先行する項目のうちのいずれか一項に記載の方法。
（項目８８）
前記対象が、構造的心疾患を有する、先行する項目のうちのいずれか一項に記載の方法。
（項目８９）
前記対象が、ＩＣＤを有する、項目３０〜４４および４６〜８３のいずれか一項に記載の方法。
（項目９０）
前記対象が、ＨＦと診断されている、先行する項目のうちのいずれか一項に記載の方法。
（項目９１）
キットであって、
（ａ）Ｅ２８Ｃ結合剤および／またはＥ２８Ｄ結合剤、
（ｂ）ＷＴ ＳＣＮ５Ａ結合剤および／またはＥ２８Ａ−Ｓ結合剤、ならびに
使用のための説明書
を含むキット。
（項目９２）
全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物：ＷＴ、Ｅ２８Ａ−Ｓ、Ｅ２８Ｂ、Ｅ２８ＣおよびＥ２８Ｄに対する結合剤をさらに含む、項目９１に記載のキット。
（項目９３）
前記結合剤が、核酸である、項目９１または９２に記載のキット。
（項目９４）
キットであって、
（Ｉ）各データ値が、第一の集団の対象から得られる生体試料から決定された比率である複数のデータ値であって、前記比率が、切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、（ｉ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉ）前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉｉ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルと比較し、前記第一の集団の各対象が、ショックを与えたＩＣＤを有することが既知の対象である、複数のデータ値、
（ＩＩ）前記複数のデータ値のガウス分布、
（ＩＶ）前記ガウス分布の平均値および標準偏差または
（Ｖ）前記複数のデータ値の前記ガウス分布の平均値および標準偏差に基づく閾値比率Ｒ Ｔ
を記憶したコンピュータ可読記憶媒体、あるいは
（Ｉ）〜（Ｖ）のうちいずれか１もしくは複数へのアクセス
を含むキット。
（項目９５）
キットであって、
（Ｉ）各データ値が、第一の集団の対象から得られる生体試料から決定された比率である複数のデータ値であって、前記比率が、切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、（ｉ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉ）前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉｉ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルと比較し、前記第一の集団の各対象が、ショックを与えたことがないＩＣＤを有することが既知の対象である、複数のデータ値、
（ＩＩ）前記複数のデータ値のガウス分布、
（ＩＶ）前記ガウス分布の平均値および標準偏差または
（Ｖ）前記複数のデータ値の前記ガウス分布の前記平均値および前記標準偏差に基づく閾値比率Ｒ Ｔ
を記憶したコンピュータ可読記憶媒体、あるいは
（Ｉ）〜（Ｖ）のうちいずれか１もしくは複数へのアクセス
を含むキット。
（項目９６）
キットであって、
（Ｉ）各データ値が、第一の集団の対象から得られる生体試料から決定された比率である複数のデータ値であって、前記比率が、切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、（ｉ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉ）前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉｉ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルと比較し、前記第一の集団の各対象が、（Ｉ）ＩＣＤを有していない、（ＩＩ）心臓病ではない、（ＩＩＩ）正常な左心室機能を有する、（ＩＶ）拡張機能障害がない、または（Ｖ）これらの組み合わせであることが既知の対象である、複数のデータ値、
（ＩＩ）前記複数のデータ値のガウス分布、
（ＩＶ）前記ガウス分布の平均値および標準偏差または
（Ｖ）前記複数のデータ値の前記ガウス分布の前記平均値および前記標準偏差に基づく閾値比率Ｒ Ｔ
を記憶したコンピュータ可読記憶媒体、あるいは
（Ｉ）〜（Ｖ）のうちいずれか１もしくは複数へのアクセス
を含むキット。
（項目９７）
システムであって、
プロセッサと、
前記プロセッサに連結したメモリデバイスであって、前記メモリデバイスは、前記プロセッサにより実行されると、前記プロセッサに、
（ｉ）各データ値が、第一の集団の対象から得られる生体試料から決定された比率である複数のデータ値であって、前記比率が、対象から得られる生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、（Ａ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（Ｂ）前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（Ｃ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルと比較し、前記第一の集団の各対象が、ショックを与えたことのあるＩＣＤを有することが既知の対象である複数のデータ値を受け取らせ、
（ｉｉ）前記複数のデータ値を第一のガウス分布に適合させ、
（ｉｉｉ）前記第一のガウス分布の平均値μおよび標準偏差σを決定させ、
（ｉｖ）第一の閾値比率Ｒ Ｔ を、μ−Ｘσに設定させ、式中、Ｘは、０．７〜４．０の間の数である、
機械可読命令を記憶する、メモリデバイスと、
を含むシステム。
（項目９８）
Ｒ Ｔ ＝μ−Ｘσであり、Ｘが、０．７〜１．０の間の数である、項目９７に記載のシステム。
（項目９９）
Ｒ Ｔ ＝μ−Ｘσであり、Ｘが、２．０〜４．０の間の数である、項目９７に記載のシステム。
（項目１００）
Ｒ Ｔ ＝μ−Ｘσであり、Ｘが、２．３２６〜４．０の間の数である、項目９９に記載のシステム。
（項目１０１）
前記プロセッサにより実行されると、前記プロセッサに、インプットとしてＲ Ｓ を受け取らせ、Ｒ Ｓ をＲ Ｔ と比較させる機械可読命令を含む、項目９７〜１００のいずれか一項に記載のシステム。
（項目１０２）
前記プロセッサにより実行されると、前記プロセッサに、Ｒ Ｓ とＲ Ｔ との間の関係性を表示するアウトプットを提示させる機械可読命令を含む、項目１０１に記載のシステム。
（項目１０３）
前記プロセッサにより実行されると、前記プロセッサに、
（ｉ）第二の複数のデータ値の各データ値が、第二の集団の対象から得られる生体試料から決定された比率である第二の複数のデータ値であって、前記比率が、対象から得られる生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、（Ａ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（Ｂ）前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（Ｃ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルと比較し、前記第二の集団の各対象が、ショックを与えたことがないＩＣＤを有することが既知の対象である第二の複数のデータ値を受け取らせ、
（ｉｉ）前記第二の複数のデータ値を第二のガウス分布に適合させ、
（ｉｉｉ）前記第二のガウス分布の平均値μおよび標準偏差σを決定させ、
（ｉｖ）第二の閾値比率Ｒ Ｔ２ を、μ＋Ｘσに設定させ、式中、Ｘは、０．７〜４．０の間の数である、
機械可読命令を含む、項目９７〜１０２のいずれか一項に記載のシステム。
（項目１０４）
Ｒ Ｔ２ ＝μ＋Ｘσであり、Ｘが、０．７〜１．０の間の数である、項目１０３に記載のシステム。
（項目１０５）
Ｒ Ｔ２ ＝μ＋Ｘσであり、Ｘが、２．０〜４．０の間の数である、項目１０３に記載のシステム。
（項目１０６）
Ｒ Ｔ２ ＝μ＋Ｘσであり、Ｘが、２．３２６〜４．０の間の数である、項目１０５に記載のシステム。
（項目１０７）
前記プロセッサにより実行されると、前記プロセッサに、
（ｉ）第三の複数のデータ値の各データ値が、第二の集団の対象から得られる生体試料から決定された比率である第三の複数のデータ値であって、前記比率が、対象から得られる生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、（Ａ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（Ｂ）前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（Ｃ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルと比較し、前記第三の集団の各対象が、（Ｉ）ＩＣＤを有していない、（ＩＩ）心臓病ではない、（ＩＩＩ）正常な左心室機能を有する、（ＩＶ）拡張機能障害がない、または（Ｖ）これらの組み合わせであることが既知の対象である第三の複数のデータ値を受け取らせ、
（ｉｉ）前記第三の複数のデータ値を第三のガウス分布に適合させ、
（ｉｉｉ）前記第三のガウス分布の平均値μおよび標準偏差σを決定させ、
（ｉｖ）第三の閾値比率Ｒ Ｔ３ を、μ＋４．０σに設定させる、
機械可読命令を含む、項目９７〜１０６のいずれか一項に記載のシステム。
（項目１０８）
前記プロセッサにより実行されると、前記プロセッサに、前記第一のガウス分布の曲線下面積が最大化され、前記第二のガウス分布の曲線下面積が最小化される点に、組み合わ
せた閾値比率Ｒ Ｔ組み合わせ を設定させる機械可読命令を含む、項目１０３〜１０７のいずれか一項に記載のシステム。
（項目１０９）
システムであって、
プロセッサと、
前記プロセッサに連結したメモリデバイスであって、前記メモリデバイスは、前記プロセッサにより実行されると、前記プロセッサに、
（ｉ）複数のデータ値の各データ値が、集団の対象から得られる生体試料から決定された比率である複数のデータ値であって、前記比率が、対象から得られる生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、（Ａ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（Ｂ）前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（Ｃ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルと比較し、前記集団の各対象が、ショックを与えたことがないＩＣＤを有することが既知の対象である複数のデータ値を受け取らせ、
（ｉｉ）前記複数のデータ値をガウス分布に適合させ、
（ｉｉｉ）前記ガウス分布の平均値μおよび標準偏差σを決定させ、
（ｉｖ）閾値比率Ｒ Ｔ２ を、μ＋Ｘσに設定させ、式中、Ｘは、０．７〜４．０の間の数である、
機械可読命令を記憶するメモリデバイスと、
を含むシステム。
（項目１１０）
Ｒ Ｔ２ ＝μ＋Ｘσであり、Ｘが、０．７〜１．０の間の数である、項目１０９に記載のシステム。
（項目１１１）
Ｒ Ｔ２ ＝μ＋Ｘσであり、Ｘが、２．０〜４．０の間の数である、項目１０９に記載のシステム。
（項目１１２）
Ｒ Ｔ２ ＝μ＋Ｘσであり、Ｘが、２．３２６〜４．０の間の数である、項目１１１に記載のシステム。
（項目１１３）
システムであって、
プロセッサにより実行されると、前記プロセッサに、
（ｉ）複数のデータ値の各データ値が、集団の対象から得られる生体試料から決定された比率である複数のデータ値であって、前記比率が、対象から得られる生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、（Ａ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（Ｂ）前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（Ｃ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルと比較し、前記集団の各対象が、（Ｉ）ＩＣＤを有していない、（ＩＩ）心臓病ではない、（ＩＩＩ）正常な左心室機能を有する、（ＩＶ）拡張機能障害がない、または（Ｖ）これらの組み合わせであることが既知の対象である複数のデータ値を受け取らせ、
（ｉｉ）前記複数のデータ値をガウス分布に適合させ、
（ｉｉｉ）前記ガウス分布の平均値μおよび標準偏差σを決定させ、
（ｉｖ）閾値比率Ｒ Ｔ３ を、μ＋４．０σに設定させる、
機械可読命令を含むシステム。
（項目１１４）
プロセッサにより実行可能な機械可読命令を記憶したコンピュータ可読記憶媒体であって、
（ｉ）前記プロセッサに複数のデータ値を受け取らせるための命令であって、各データ
値が、第一の集団の対象から得られる生体試料から決定された比率であり、前記比率が、対象から得られる生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、（Ａ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（Ｂ）前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（Ｃ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルと比較し、前記第一の集団の各対象が、ショックを与えたことのあるＩＣＤを有することが既知の対象である、命令と、
（ｉｉ）前記プロセッサに、前記複数のデータ値を第一のガウス分布に適合させるための命令と、
（ｉｉ）前記プロセッサに、前記第一のガウス分布の平均値μおよび標準偏差σを決定させるための命令と、
（ｉｉｉ）前記プロセッサに、第一の閾値比率Ｒ Ｔ を、μ−Ｘσに設定させるための命令であって、式中、Ｘは、０．７〜４．０の間の数である、命令と、
を含む、コンピュータ可読記憶媒体。
（項目１１５）
Ｒ Ｔ ＝μ−Ｘσであり、Ｘが、０．７〜１．０の間の数である、項目１１４に記載のコンピュータ可読記憶媒体。
（項目１１６）
Ｒ Ｔ ＝μ−Ｘσであり、Ｘが、２．０〜４．０の間の数である、項目１１４に記載のコンピュータ可読記憶媒体。
（項目１１７）
Ｒ Ｔ ＝μ−Ｘσであり、Ｘが、２．３２６〜４．０の間の数である、項目１１６に記載のコンピュータ可読記憶媒体。
（項目１１８）
前記プロセッサに、インプットとしてＲ Ｓ を受け取らせ、Ｒ Ｓ をＲ Ｔ と比較させるための命令を含む、項目１１４〜１１７のいずれか一項に記載のコンピュータ可読記憶媒体。
（項目１１９）
前記プロセッサに、Ｒ Ｓ とＲ Ｔ との間の関係性を示すアウトプットを提示させるための命令を含む、項目１１８に記載のコンピュータ可読記憶媒体。
（項目１２０）
前記プロセッサに、
（ｉ）第二の複数のデータ値の各データ値が、第二の集団の対象から得られる生体試料から決定された比率である第二の複数のデータ値であって、前記比率が、対象から得られる生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、（Ａ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（Ｂ）前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（Ｃ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルと比較し、前記第二の集団の各対象が、ショックを与えたことがないＩＣＤを有することが既知の対象である第二の複数のデータ値を受け取らせ、
（ｉｉ）前記第二の複数のデータ値を第二のガウス分布に適合させ、
（ｉｉｉ）前記第二のガウス分布の平均値μおよび標準偏差σを決定させ、
（ｉｖ）第二の閾値比率Ｒ Ｔ２ を、μ＋Ｘσに設定させ、式中、Ｘは、０．７〜４．０の間の数である、
ための命令を含む、項目１１４〜１１９のいずれか一項に記載のコンピュータ可読記憶媒体。
（項目１２１）
Ｒ Ｔ２ ＝μ＋Ｘσであり、Ｘが、０．７〜１．０の間の数である、項目１２０に記載のコンピュータ可読記憶媒体。
（項目１２２）
Ｒ Ｔ２ ＝μ＋Ｘσであり、Ｘが、２．０〜４．０の間の数である、項目１２０に記載のコンピュータ可読記憶媒体。
（項目１２３）
Ｒ Ｔ２ ＝μ＋Ｘσであり、Ｘが、２．３２６〜４．０の間の数である、項目１２２に記載のコンピュータ可読記憶媒体。
（項目１２４）
前記プロセッサに、
（ｉ）第三の複数のデータ値の各データ値が第二の集団の対象から得られる生体試料から決定された比率である第三の複数のデータ値であって、前記比率が、対象から得られる生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、（Ａ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（Ｂ）前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（Ｃ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルと比較し、前記第三の集団の各対象が、（Ｉ）ＩＣＤを有していない、（ＩＩ）心臓病ではない、（ＩＩＩ）正常な左心室機能を有する、（ＩＶ）拡張機能障害がない、または（Ｖ）これらの組み合わせであることが既知の対象である第三の複数のデータ値を受け取らせ、
（ｉｉ）前記第三の複数のデータ値を第三のガウス分布に適合させ、
（ｉｉｉ）前記第三のガウス分布の平均値μおよび標準偏差σを決定させ、
（ｉｖ）第三の閾値比率Ｒ Ｔ３ を、μ＋４．０σに設定させる
ための命令を含む、項目１１４〜１２３のいずれか一項に記載のコンピュータ可読記憶媒体。
（項目１２５）
前記プロセッサに、前記第一のガウス分布の曲線下面積が最大化され、前記第二のガウス分布の曲線下面積が最小化される点において、組み合わせた閾値比率Ｒ Ｔ組み合わせ を設定させるための命令を含む、項目１２０〜１２４のいずれか一項に記載のコンピュータ可読記憶媒体。
（項目１２６）
プロセッサにより実行可能な機械可読命令を記憶したコンピュータ可読記憶媒体であって、
（ｉ）前記プロセッサに複数のデータ値を受け取らせるための命令であって、前記複数のデータ値の各データ値が、集団の対象から得られる生体試料から決定された比率であり、前記比率が、対象から得られる生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、（Ａ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（Ｂ）前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（Ｃ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルと比較し、前記集団の各対象が、ショックを与えたことがないＩＣＤを有することが既知の対象である、命令と、
（ｉｉ）前記プロセッサに、前記複数のデータ値をガウス分布に適合させるための命令と、
（ｉｉｉ）前記プロセッサに、前記ガウス分布の平均値μおよび標準偏差σを決定させるための命令と、
（ｉｖ）前記プロセッサに、閾値比率Ｒ Ｔ２ を、μ＋Ｘσに設定させるための命令であって、式中、Ｘは、０．７〜４．０の間の数である、命令と、
を含む、コンピュータ可読記憶媒体。
（項目１２７）
Ｒ Ｔ２ ＝μ＋Ｘσであり、Ｘが、０．７〜１．０の間の数である、項目１２６に記載のコンピュータ可読記憶媒体。
（項目１２８）
Ｒ Ｔ２ ＝μ＋Ｘσであり、Ｘが、２．０〜４．０の間の数である、項目１２６に記載
のコンピュータ可読記憶媒体。
（項目１２９）
Ｒ Ｔ２ ＝μ＋Ｘσであり、Ｘが、２．３２６〜４．０の間の数である、項目１２８に記載のコンピュータ可読記憶媒体。
（項目１３０）
プロセッサにより実行可能な機械可読命令を記憶したコンピュータ可読記憶媒体であって、
（ｉ）前記プロセッサに複数のデータ値を受け取らせるための命令であって、前記複数のデータ値の各データ値が、集団の対象から得られる生体試料から決定された比率であり、前記比率が、対象から得られる生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、（Ａ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（Ｂ）前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（Ｃ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルと比較し、前記集団の各対象が、（Ｉ）ＩＣＤを有していない、（ＩＩ）心臓病ではない、（ＩＩＩ）正常な左心室機能を有する、（ＩＶ）拡張機能障害がない、または（Ｖ）これらの組み合わせであることが既知の対象である、命令と、
（ｉｉ）前記プロセッサに、前記複数のデータ値をガウス分布に適合させるための命令と、
（ｉｉｉ）前記プロセッサに、前記ガウス分布の平均値μおよび標準偏差σを決定させるための命令と、
（ｉｖ）前記プロセッサに、閾値比率Ｒ Ｔ３ をμ＋４．０σに設定させるための命令と、
を含む、コンピュータ可読記憶媒体。
（項目１３１）
コンピュータにおいてプロセッサにより実施される方法であって、
（ｉ）複数のデータ値を受け取るステップであって、各データ値が第一の集団の対象から得られる生体試料から決定された比率であり、前記比率が、対象から得られる生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、（Ａ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（Ｂ）前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（Ｃ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルと比較し、前記第一の集団の各対象が、ショックを与えたことのあるＩＣＤを有することが既知の対象である、ステップと、
（ｉｉ）前記複数のデータ値を第一のガウス分布に適合させるステップと、
（ｉｉ）前記第一のガウス分布の平均値μおよび標準偏差σを決定するステップと、
（ｉｉｉ）第一の閾値比率Ｒ Ｔ をμ−Ｘσに設定するステップであって、式中、Ｘは、０．７〜４．０の間の数である、ステップと、
を含む、方法。
（項目１３２）
Ｒ Ｔ ＝μ−Ｘσであり、Ｘが、０．７〜１．０の間の数である、項目１３１に記載の方法。
（項目１３３）
Ｒ Ｔ ＝μ−Ｘσであり、Ｘが、２．０〜４．０の間の数である、項目１３１に記載の方法。
（項目１３４）
Ｒ Ｔ ＝μ−Ｘσであり、Ｘが、２．３２６〜４．０の間の数である、項目１３３に記載の方法。
（項目１３５）
インプットとしてＲ Ｓ を受け取り、Ｒ Ｓ をＲ Ｔ と比較するステップを含む、項目１３
１〜１３４のいずれか一項に記載の方法。
（項目１３６）
Ｒ Ｓ とＲ Ｔ との間の関係性を示すアウトプットを提示するステップを含む、項目１３５に記載の方法。
（項目１３７）
（ｉ）第二の複数のデータ値を受け取るステップであって、前記第二の複数のデータ値の各データ値が、第二の集団の対象から得られる生体試料から決定された比率であり、前記比率が、対象から得られる生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、（Ａ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（Ｂ）前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（Ｃ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルと比較し、前記第二の集団の各対象が、ショックを与えたことがないＩＣＤを有することが既知の対象である、ステップと、
（ｉｉ）前記第二の複数のデータ値を第二のガウス分布に適合させるステップと、
（ｉｉｉ）前記第二のガウス分布の平均値μおよび標準偏差σを決定するステップと、
（ｉｖ）第二の閾値比率Ｒ Ｔ２ を、μ＋Ｘσに設定するステップであって、式中、Ｘは、０．７〜４．０の間の数である、ステップと、
を含む、項目１３１〜１３６のいずれか一項に記載の方法。
（項目１３８）
Ｒ Ｔ２ ＝μ＋Ｘσであり、Ｘが、０．７〜１．０の間の数である、項目１３７に記載の方法。
（項目１３９）
Ｒ Ｔ２ ＝μ＋Ｘσであり、Ｘが、２．０〜４．０の間の数である、項目１３７に記載の方法。
（項目１４０）
Ｒ Ｔ２ ＝μ＋Ｘσであり、Ｘが、２．３２６〜４．０の間の数である、項目１３９に記載の方法。
（項目１４１）
（ｉ）第三の複数のデータ値を受け取るステップであって、前記第三の複数のデータ値の各データ値が、第二の集団の対象から得られる生体試料から決定された比率であり、前記比率が、対象から得られる生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、（Ａ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（Ｂ）前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（Ｃ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルと比較し、前記第三の集団の各対象が、（Ｉ）ＩＣＤを有していない、（ＩＩ）心臓病ではない、（ＩＩＩ）正常な左心室機能を有する、（ＩＶ）拡張機能障害がない、または（Ｖ）これらの組み合わせであることが既知の対象である、ステップと、
（ｉｉ）前記第三の複数のデータ値を第三のガウス分布に適合させるステップと、
（ｉｉｉ）前記第三のガウス分布の平均値μおよび標準偏差σを決定するステップと、
（ｉｖ）第三の閾値比率Ｒ Ｔ３ を、μ＋４．０σに設定するステップと、
を含む、項目１３１〜１４０のいずれか一項に記載の方法。
（項目１４２）
前記第一のガウス分布の曲線下面積が最大化され、前記第二のガウス分布の曲線下面積が最小化される点に、組み合わせた閾値比率Ｒ Ｔ組み合わせ を設定するステップを含む、項目１３７〜１４１のいずれか一項に記載の方法。
（項目１４３）
コンピュータにおいてプロセッサにより実施される方法であって、
（ｉ）複数のデータ値を受け取るステップであって、前記複数のデータ値の各データ値が、集団の対象から得られる生体試料から決定された比率であり、前記比率が、対象から
得られる生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、（Ａ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（Ｂ）前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（Ｃ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルと比較し、前記集団の各対象が、ショックを与えたことがないＩＣＤを有することが既知の対象である、ステップと、
（ｉｉ）前記複数のデータ値をガウス分布に適合させるステップと、
（ｉｉｉ）前記ガウス分布の平均値μおよび標準偏差σを決定するステップと、
（ｉｖ）閾値比率Ｒ Ｔ２ を、μ＋Ｘσに設定するステップであって、式中、Ｘは、０．７〜４．０の間の数である、ステップと、
を含む、方法。
（項目１４４）
Ｒ Ｔ２ ＝μ＋Ｘσであり、Ｘが、０．７〜１．０の間の数である、項目１３４に記載の方法。
（項目１４５）
Ｒ Ｔ２ ＝μ＋Ｘσであり、Ｘが、２．０〜４．０の間の数である、項目１３４に記載の方法。
（項目１４６）
Ｒ Ｔ２ ＝μ＋Ｘσであり、Ｘが、２．３２６〜４．０の間の数である、項目１４５に記載の方法。
（項目１４７）
コンピュータにおいてプロセッサにより実施される方法であって、
（ｉ）複数のデータ値を受け取るステップであって、前記複数のデータ値の各データ値が、集団の対象から得られる生体試料から決定された比率であり、前記比率が、対象から得られる生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、（Ａ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（Ｂ）前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（Ｃ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルと比較し、前記集団の各対象が、（Ｉ）ＩＣＤを有していない、（ＩＩ）心臓病ではない、（ＩＩＩ）正常な左心室機能を有する、（ＩＶ）拡張機能障害がない、または（Ｖ）これらの組み合わせであることが既知の対象である、ステップと、
（ｉｉ）前記複数のデータ値をガウス分布に適合させるステップと、
（ｉｉｉ）前記ガウス分布の平均値μおよび標準偏差σを決定するステップと、
（ｉｖ）閾値比率Ｒ Ｔ３ を、μ＋４．０σに設定するステップと、
を含む、方法。
As used herein, to determine a subject's need for an ICD or antiarrhythmic agent, to determine a subject's risk for SCD, heart failure or arrhythmia, or to determine whether administration of an antiarrhythmic agent to a subject is safe Further useful kits are further provided. In an exemplary embodiment, the kit measures (i) a reagent for measuring the level of full-length SCN5A exon 28 transcript in a biological sample and (ii) the level of a truncated SCN5A exon 28 transcript in the biological sample. And a reagent for. In an exemplary embodiment, the kit includes instructions for use or access to it. In an exemplary aspect, as further described herein, the kit includes a computer readable storage medium having stored machine readable instructions executable by the system or processor.
In certain embodiments, for example, the following are provided:
(Item 1)
A method for determining a subject's need for ICD, comprising:
The level of truncated SCN5A exon 28 transcript in a biological sample obtained from the subject,
(I) the level of full-length SCN5A exon 28 transcript of said biological sample or
(Ii) the level of total SCN5A exon 28 transcript in the biological sample or
(Iii) the level of the full-length SCN5A exon 28 transcript and the level of one or more truncated SCN5A exon 28 transcripts in the biological sample
R to compare with S Determining the method.
(Item 2)
R S Is the threshold ratio R T A method according to item 1, wherein the subject requires ICD if it is above.
(Item 3)
R T Is the level of truncated SCN5A exon 28 transcript in a biological sample obtained from a control subject,
(I) the level of full length SCN5A exon 28 transcript of the biological sample obtained from the control subject or
(Ii) the level of total SCN5A exon 28 transcript of the biological sample obtained from the control subject or
(Iii) the level of full-length SCN5A exon 28 transcript and the level of one or more truncated SCN5A exon 28 transcripts of the biological sample obtained from the control subject
And the ratio to compare with
The control subject is
(I) has no ICD,
(Ii) not heart disease,
(Iii) has normal left ventricular function,
(Iv) There is no extended function failure, or
(V) These combinations
3. A method according to item 2, which is a subject known to be
(Item 4)
R T = Μ + 4.0σ,
Where μ = is the average value of a Gaussian distribution of a set of data values,
Each data value in the set represents the level of truncated SCN5A exon 28 transcript in a biological sample obtained from a control subject,
(I) the level of full length SCN5A exon 28 transcript of the biological sample obtained from the control subject or
(Ii) the level of total SCN5A exon 28 transcript of the biological sample obtained from the control subject or
(Iii) the level of full-length SCN5A exon 28 transcript and the level of one or more truncated SCN5A exon 28 transcripts of the biological sample obtained from the control subject
Represents the ratio to be compared with
The control subject is
(I) has no ICD,
(Ii) not heart disease,
(Iii) has normal left ventricular function,
(Iv) There is no extended function failure, or
(V) These combinations
The method according to item 2, wherein σ is a standard deviation of a Gaussian distribution of the data values.
(Item 5)
R T Is the level of truncated SCN5A exon 28 transcript in a biological sample obtained from a control subject,
(I) the level of full length SCN5A exon 28 transcript of the biological sample obtained from the control subject or
(Ii) the level of total SCN5A exon 28 transcript of the biological sample obtained from the control subject or
(Iii) the level of full-length SCN5A exon 28 transcript and the level of one or more truncated SCN5A exon 28 transcripts of the biological sample obtained from the control subject
3. The method of item 2, wherein the control subject is a subject known to have an ICD that has not shocked the control subject.
(Item 6)
R T = Μ + Xσ, where μ = is the average value of a Gaussian distribution of a set of data values, each data value of the set being a cleaved SCN5A exon 28 transcript of a biological sample obtained from a control Level
(I) the level of full length SCN5A exon 28 transcript of the biological sample obtained from the control subject or
(Ii) the level of total SCN5A exon 28 transcript of the biological sample obtained from the control subject or
(Iii) the level of full-length SCN5A exon 28 transcript and the level of one or more truncated SCN5A exon 28 transcripts of the biological sample obtained from the control subject
The control subject is a subject known to have an ICD that has never shocked the control subject, σ is the standard deviation of the Gaussian distribution of the data values, and X The method of item 2, wherein is a number between 0.7 and 4.0.
(Item 7)
R T = Μ−Xσ, where μ = is the mean of a Gaussian distribution of a set of data values, each data value of the set represents a ratio, and the control subject is shocked to the control subject And the control subject is a subject known to have an ICD that has shocked the control subject, and σ is the data value Item 3. The method according to Item 2, wherein X is a number between 0.7 and 4.0.
(Item 8)
8. The method of item 7, wherein X is a number between about 0.7 and about 1.0.
(Item 9)
8. The method of item 7, wherein X is a number between about 2.0 and about 4.0.
(Item 10)
10. The method of item 9, wherein X is a number between about 2.326 and about 4.0.
(Item 11)
(A) R S (I) the level of a truncated SCN5A exon 28 transcript of the biological sample or (ii) the level of the full-length SCN5A exon 28 transcript of the biological sample or (iii) The level of total SCN5A exon 28 transcript in the sample is normalized to the level of housekeeping genes in the biological sample obtained from the subject;
(B) R T (I) the level of a truncated SCN5A exon 28 transcript of the biological sample or (ii) the level of the full-length SCN5A exon 28 transcript of the biological sample or (iii) The level of total SCN5A exon 28 transcript in the sample is normalized to the level of housekeeping gene in the biological sample obtained from the control subject, or
(C) The method according to any one of the preceding items, wherein both (A) and (B).
(Item 12)
Item 12. The method according to Item 11, wherein the housekeeping gene is glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH) or β-actin.
(Item 13)
R S But,
Where
Calibration abundance of truncated SCN5A exon 28 transcript = 2 -ΔΔCt truncated SCN5A exon 28 transcript
Calibration abundance of full-length SCN5A exon 28 transcript = 2 -ΔΔCt full length SCN5A exon 28 transcript
ΔΔCt Full-length SCN5A exon 28 transcript = ΔCt Full length -ΔCt Housekeeping genes
ΔΔCt Cleaved SCN5A exon 28 transcript = ΔCt Cutting type -ΔCt Housekeeping genes
ΔCt Full length = ([Ct of full length SCN5A exon 28 transcript of subject sample]-[Ct of full length SCN5A exon 28 transcript of control sample])
ΔCt Cutting type = ([Ct of truncated SCN5A exon 28 transcript of target sample]-[Ct of truncated SCN5A exon 28 transcript of control sample])
ΔCt Housekeeping genes = ([Ct of housekeeping gene of target sample] − [Ct of housekeeping gene of control sample])
"Target sample" is a biological sample obtained from the target,
The “control sample”
(I) has no ICD,
(Ii) not heart disease,
(Iii) has normal left ventricular function,
(Iv) There is no extended function failure, or
(V) These combinations
A biological sample obtained from a control subject known to be
“Full length” refers to WT SCN5A exon 28 transcript or E28A-S transcript or both WT SCN5A exon 28 transcript and E28A-S transcript.
Or R S But,
Where
Calibration abundance of truncated SCN5A exon 28 transcript = 2 -ΔΔCt truncated SCN5A exon 28 transcript
Calibration abundance of all SCN5A exon 28 transcripts = 2 -ΔΔCt whole SCN5A exon 28 transcript
ΔΔCt Total SCN5A exon 28 transcript = ΔCt Total SCN5A exon 28 transcript -ΔCt Housekeeping genes
ΔΔCt Cleaved SCN5A exon 28 transcript = ΔCt Cutting type -ΔCt Housekeeping genes
ΔCt Total SCN5A exon 28 transcript = ([Ct of all SCN5A exon 28 transcripts of subject sample]-[Ct of all SCN5A exon 28 transcripts of control sample])
ΔCt Cutting type = ([Ct of truncated SCN5A exon 28 transcript of target sample]-[Ct of truncated SCN5A exon 28 transcript of control sample])
ΔCt Housekeeping genes = ([Ct of housekeeping gene of target sample] − [Ct of housekeeping gene of control sample])
"Target sample" is a biological sample obtained from the target,
The “control sample”
(I) has no ICD,
(Ii) not heart disease,
(Iii) has normal left ventricular function,
(Iv) There is no extended function failure, or
(V) These combinations
A biological sample obtained from a control subject known to be
“Total SCN5A exon 28 transcript” refers to all of WT, E28A-S, E28B, E28C and E28D.
A method according to any one of the preceding items.
(Item 14)
R T = Μ + Xσ, the ratio of the biological sample obtained from the control subject =
Where
Calibration abundance of truncated SCN5A exon 28 transcript = 2 -ΔΔCt truncated SCN5A exon 28 transcript
Calibration abundance of full-length SCN5A exon 28 transcript = 2 -ΔΔCt full length SCN5A exon 28 transcript
ΔΔCt Full-length SCN5A exon 28 transcript = ΔCt Full length -ΔCt Housekeeping genes
ΔΔCt Cleaved SCN5A exon 28 transcript = ΔCt Cutting type -ΔCt Housekeeping genes
ΔCt Full length = ([Ct of full length SCN5A exon 28 transcript of ICD patient (-) shock]-[Ct of full length SCN5A exon 28 transcript of control sample])
ΔCt Cutting type = ([Ct of ICD patient (-) shock truncated SCN5A exon 28 transcript]-[Ct of truncated SCN5A exon 28 transcript of control sample])
ΔCt Housekeeping genes = ([Ct of housekeeping gene of ICD patient (−) shock] − [Ct of housekeeping gene of control sample])
An “ICD patient (−) shock” is a biological sample obtained from a subject known to have an ICD that has never shocked,
The “control sample”
(I) has no ICD,
(Ii) not heart disease,
(Iii) has normal left ventricular function,
(Iv) There is no extended function failure, or
(V) These combinations
A biological sample obtained from a control subject known to be
“Full length” refers to WT SCN5A exon 28 transcript or E28A-S transcript or both WT SCN5A exon 28 and E28A-S transcripts.
,
Or R T = Μ + Xσ, the ratio of the biological sample obtained from the control subject =
Where
Calibration abundance of truncated SCN5A exon 28 transcript = 2 -ΔΔCt truncated SCN5A exon 28 transcript
Calibration abundance of all SCN5A exon 28 transcripts = 2 -ΔΔCt whole SCN5A exon 28 transcript
ΔΔCt Total SCN5A exon 28 transcript = ΔCt Total SCN5A exon 28 transcript -ΔCt Housekeeping genes
ΔΔCt Cleaved SCN5A exon 28 transcript = ΔCt Cutting type -ΔCt Housekeeping genes
ΔCt Total SCN5A exon 28 transcript = ([Ct of all SCN5A exon 28 transcripts in ICD patient (-) shock]-[Ct of all SCN5A exon 28 transcripts in control sample))
ΔCt Cutting type = ([Ct of ICD patient (-) shock truncated SCN5A exon 28 transcript]-[Ct of truncated SCN5A exon 28 transcript of control sample])
ΔCt Housekeeping genes = ([Ct of housekeeping gene of ICD patient (−) shock] − [Ct of housekeeping gene of control sample])
An “ICD patient (−) shock” is a biological sample obtained from a subject known to have an ICD that has never shocked,
The “control sample”
(I) has no ICD,
(Ii) not heart disease,
(Iii) has normal left ventricular function,
(Iv) There is no extended function failure, or
(V) These combinations
A biological sample obtained from a control subject known to be
“Total SCN5A exon 28 transcript” refers to all of WT, E28A-S, E28B, E28C and E28D.
14. The method according to any one of items 6 and 11-13.
(Item 15)
R T = Μ−Xσ, the ratio of the biological sample obtained from the control subject is
Where
Calibration abundance of truncated SCN5A exon 28 transcript = 2 -ΔΔCt truncated SCN5A exon 28 transcript
Calibration abundance of full-length SCN5A exon 28 transcript = 2 -ΔΔCt full length SCN5A exon 28 transcript
ΔΔCt Full-length SCN5A exon 28 transcript = ΔCt Full length -ΔCt Housekeeping genes
ΔΔCt Cleaved SCN5A exon 28 transcript = ΔCt Cutting type -ΔCt Housekeeping genes
ΔCt Full length = ([Ct of full length SCN5A exon 28 transcript of ICD patient (+) shock]-[Ct of full length SCN5A exon 28 transcript of control sample])
ΔCt Cutting type = ([Ct of ICD patient (+) shock truncated SCN5A exon 28 transcript]-[Ct of truncated SCN5A exon 28 transcript of control sample])
ΔCt Housekeeping genes = ([Ct of housekeeping gene of ICD patient (+) shock]-[Ct of housekeeping gene of control sample])
An “ICD patient (+) shock” is a biological sample obtained from a subject known to have an ICD that has shocked,
The “control sample”
(I) has no ICD,
(Ii) not heart disease,
(Iii) has normal left ventricular function,
(Iv) There is no extended function failure, or
(V) These combinations
A biological sample obtained from a control subject known to be
“Full length” refers to WT SCN5A exon 28 transcript or E28A-S transcript or both WT SCN5A exon 28 transcript and E28A-S transcript.
Or R T = Μ−Xσ, the ratio of the biological sample obtained from the control subject is
Where
Calibration abundance of truncated SCN5A exon 28 transcript = 2 -ΔΔCt truncated SCN5A exon 28 transcript
Calibration abundance of all SCN5A exon 28 transcripts = 2 -ΔΔCt whole SCN5A exon 28 transcript
ΔΔCt Total SCN5A exon 28 transcript = ΔCt Total SCN5A exon 28 transcript -ΔCt Housekeeping genes
ΔΔCt Cleaved SCN5A exon 28 transcript = ΔCt Cutting type -ΔCt Housekeeping genes
ΔCt Total SCN5A exon 28 transcript = ([Ct of all SCN5A exon 28 transcripts in ICD patient (+) shock]-[Ct of all SCN5A exon 28 transcripts in control sample])
ΔCt Cutting type = ([Ct of ICD patient (+) shock truncated SCN5A exon 28 transcript]-[Ct of truncated SCN5A exon 28 transcript of control sample])
ΔCt Housekeeping genes = ([Ct of housekeeping gene of ICD patient (+) shock]-[Ct of housekeeping gene of control sample])
An “ICD patient (+) shock” is a biological sample obtained from a subject known to have an ICD that has shocked,
The “control sample”
(I) has no ICD,
(Ii) not heart disease,
(Iii) has normal left ventricular function,
(Iv) There is no extended function failure, or
(V) These combinations
A biological sample obtained from a control subject known to be
“Total SCN5A exon 28 transcript” refers to all of WT, E28A-S, E28B, E28C and E28D.
14. The method according to any one of items 7 to 13.
(Item 16)
Each mRNA level is expressed in real time polymerase chain reaction (R T The method according to any one of items 13 to 15, which is determined by -PCR).
(Item 17)
Any of the preceding items, wherein the level of the truncated SCN5A exon 28 transcript is the level of SCN5A exon 28 splice variant C (E28C) or the level of SCN5A exon 28 splice variant D (E28D) The method described.
(Item 18)
18. The method of item 17, wherein the level of truncated SCN5A exon 28 transcript is the level of E28C and E28D.
(Item 19)
The level of the truncated SCN5A exon 28 transcript is compared to (i) the level of WT SCN5A exon 28 transcript, (ii) the level of E28A-S or (iii) a combination of (i) and (ii). The method according to any one of the preceding items.
(Item 20)
The level of said truncated SCN5A exon 28 transcript is compared to any level of WT SCN5A exon 28 transcript, E28A-S, E28B, E28C and E28D, any one of the preceding items. the method of.
(Item 21)
The level of the truncated SCN5A exon 28 transcript is compared to the levels of (A) and (B);
(A) is one of (i) a level of WT SCN5A exon 28 transcript, (ii) a level of E28A-S or (iii) a combination of (i) and (ii);
(B) is one or more of E28B, E28C and E28D,
A method according to any one of the preceding items.
(Item 22)
21. A method according to item 19 or 20, wherein the truncated SCN5A exon 28 transcript is E28C.
(Item 23)
R S = R E28C =
Where
Calibration abundance of E28C transcript = 2 -ΔΔCtE28C transcript
Calibration abundance of full-length SCN5A exon 28 transcript = 2 -ΔΔCt full length SCN5A exon 28 transcript
ΔΔCt Full-length SCN5A exon 28 transcript = ΔCt Full length -ΔCt Housekeeping genes
ΔΔCt E28C transcript = ΔCt E28C transcript -ΔCt Housekeeping genes
ΔCt Full length = ([Ct of full length SCN5A exon 28 transcript of subject sample]-[control
Ct of sample full length SCN5A exon 28 transcript])
ΔCt E28C = ([Ct of E28C transcript of target sample]-[Ct of E28C transcript of control sample])
ΔCt Housekeeping genes = ([Ct of housekeeping gene of target sample] − [Ct of housekeeping gene of control sample])
"Target sample" is a biological sample obtained from the target,
The “control sample”
(I) has no ICD,
(Ii) not heart disease,
(Iii) has normal left ventricular function,
(Iv) There is no extended function failure, or
(V) These combinations
A biological sample obtained from a control subject known to be
“Full length” refers to WT SCN5A exon 28 transcript or E28A-S transcript or both WT SCN5A exon 28 transcript and E28A-S transcript.
Or R E28C =
Where
Calibration abundance of E28C transcript = 2 -ΔΔCtE28C transcript
Calibration abundance of all SCN5A exon 28 transcripts = 2 -ΔΔCt whole SCN5A exon 28 transcript
ΔΔCt Total SCN5A exon 28 transcript = ΔCt Total SCN5A exon 28 transcript -ΔCt Housekeeping genes
ΔΔCt E28C transcript = ΔCt E28C transcript -ΔCt Housekeeping genes
ΔCt Total SCN5A exon 28 transcript = ([Ct of all SCN5A exon 28 transcripts of subject sample]-[Ct of all SCN5A exon 28 transcripts of control sample])
ΔCt E28C = ([Ct of E28C transcript of target sample]-[Ct of E28C transcript of control sample])
ΔCt Housekeeping genes = ([Ct of housekeeping gene of target sample] − [Ct of housekeeping gene of control sample])
"Target sample" is a biological sample obtained from the target,
The “control sample”
(I) has no ICD,
(Ii) not heart disease,
(Iii) has normal left ventricular function,
(Iv) There is no extended function failure, or
(V) These combinations
A biological sample obtained from a control subject known to be
“Total SCN5A exon 28 transcript” refers to all of WT, E28A-S, E28B, E28C and E28D.
Item 23. The method according to Item 22.
(Item 24)
Item 22. The method according to Item 19 or 21, wherein the truncated SCN5A exon 28 transcript is E28D.
(Item 25)
R S = R E28D =
Where
Calibration abundance of E28D transcript = 2 -ΔΔCtE28D transcript
Calibration abundance of full-length SCN5A exon 28 transcript = 2 -ΔΔCt full length SCN5A exon 28 transcript
ΔΔCt Full-length SCN5A exon 28 transcript = ΔCt Full length -ΔCt Housekeeping genes
ΔΔCt E28D transcript = ΔCt E28D transcript -ΔCt Housekeeping genes
ΔCt Full length = ([Ct of full length SCN5A exon 28 transcript of subject sample]-[Ct of full length SCN5A exon 28 transcript of control sample])
ΔCt E28D = ([Ct of E28D transcript of target sample]-[Ct of E28D transcript of control sample])
ΔCt Housekeeping genes = ([Ct of housekeeping gene of target sample] − [Ct of housekeeping gene of control sample])
"Target sample" is a biological sample obtained from the target,
The “control sample”
(I) has no ICD,
(Ii) not heart disease,
(Iii) has normal left ventricular function,
(Iv) There is no extended function failure, or
(V) These combinations
A biological sample obtained from a control subject known to be
“Full length” refers to WT SCN5A exon 28 transcript or E28A-S transcript or both WT SCN5A exon 28 transcript and E28A-S transcript.
Or R E28D =
Where
Calibration abundance of E28D transcript = 2 -ΔΔCtE28D transcript
Calibration abundance of all SCN5A exon 28 transcripts = 2 -ΔΔCt whole SCN5A exon 28 transcript
ΔΔCt Total SCN5A exon 28 transcript = ΔCt Total SCN5A exon 28 transcript -ΔCt Housekeeping genes
ΔΔCt E28D transcript = ΔCt E28D transcript -ΔCt Housekeeping genes
ΔCt Total SCN5A exon 28 transcript = ([Ct of all SCN5A exon 28 transcripts of subject sample]-[Ct of all SCN5A exon 28 transcripts of control sample])
ΔCt E28D = ([Ct of E28D transcript of target sample]-[Ct of E28D transcript of control sample])
ΔCt Housekeeping genes = ([Ct of housekeeping gene of target sample] − [Ct of housekeeping gene of control sample])
"Target sample" is a biological sample obtained from the target,
The “control sample”
(I) has no ICD,
(Ii) not heart disease,
(Iii) has normal left ventricular function,
(Iv) There is no extended function failure, or
(V) These combinations
A biological sample obtained from a control subject known to be
“Total SCN5A exon 28 transcript” refers to all of WT, E28A-S, E28B, E28C and E28D.
25. A method according to item 24.
(Item 26)
First R S And the second R S Determining the first R S Compares the level of E28C with the level of total SCN5A exon 28 transcript and said second R S 26. The method of any one of items 22-25, wherein the level of E28D is compared to the level of total SCN5A exon 28 transcript.
(Item 27)
Said first R S Is RE28C and the second R S 27. The method according to item 26, wherein E28D.
(Item 28)
A method for determining a subject's need for an implantable defibrillator (ICD) comprising:
(A) the level of a truncated SCN5A exon 28 transcript of the biological sample of interest, (i) the level of full-length SCN5A exon 28 transcript of the biological sample or (ii) the total SCN5A exon 28 transcript of the biological sample Or (iii) the ratio R compared to the level of full-length SCN5A exon 28 transcript and the level of one or more truncated SCN5A exon 28 transcripts of said biological sample S A step of determining
(B) R determined in (A) S Threshold ratio R T And comparing with R by the system according to any one of items 97-108. T Is determined.
(Item 29)
R S Is said R T 29. A method according to item 28, wherein the subject requires an ICD.
(Item 30)
A method for determining a subject's risk for sudden cardiac death (SCD) comprising:
The level of a truncated SCN5A exon 28 transcript in a biological sample obtained from a subject is determined by: (i) the level of full-length SCN5A exon 28 transcript in the biological sample or (ii) the level of total SCN5A exon 28 transcript in the biological sample. Or (iii) a ratio R comparing the level of the full length SCN5A exon 28 transcript and the level of one or more truncated SCN5A exon 28 transcripts of said biological sample S Determining the method.
(Item 31)
R S Is the threshold ratio R T 31. The method of item 30, wherein the subject is at risk for SCD if it is above.
(Item 32)
A method for determining a subject's need for antiarrhythmic therapy comprising:
The level of a truncated SCN5A exon 28 transcript in a biological sample obtained from a subject is determined by: (i) the level of full-length SCN5A exon 28 transcript in the biological sample or (ii) the level of total SCN5A exon 28 transcript in the biological sample. Or (iii) a ratio R comparing the level of the full length SCN5A exon 28 transcript and the level of one or more truncated SCN5A exon 28 transcripts of said biological sample S Determining the method.
(Item 33)
R S Is the threshold ratio R T 34. The method of item 32, wherein if so, the subject requires antiarrhythmic therapy.
(Item 34)
34. The method of item 32 or 33, wherein the antiarrhythmic agent is a Singh Vaghan Williams class IA, IB, IC or III antiarrhythmic agent.
(Item 35)
34. A method according to item 32 or 33, wherein the Singh Vaghan Williams class IA antiarrhythmic agent is quinidine, procainamide or disopyramide.
(Item 36)
34. A method according to item 32 or 33, wherein the Singh Vaghan Williams class IB antiarrhythmic agent is lidocaine, phenytoin, mexiletine or tocainide.
(Item 37)
34. A method according to item 32 or 33, wherein the Singh Vaghan Williams class IC antiarrhythmic agent is flecainide, propafenone, moricidin or encainide.
(Item 38)
34. A method according to item 32 or 33, wherein the Singh Vaghan Williams class III antiarrhythmic agent is dronedarone, amiodarone or ibutilide.
(Item 39)
34. The method of item 32 or 33, wherein the antiarrhythmic agent is NAD + or mitoTEMPO.
(Item 40)
A method for reducing the risk of sudden cardiac death (SCD) in a subject comprising:
(A) comparing the level of a truncated SCN5A exon 28 transcript in a biological sample obtained from a subject to the level of (i) the full-length SCN5A exon 28 transcript or (ii) the level of the entire SCN5A exon 28 transcript; Ratio R S A step of determining
(B) R S Is the threshold ratio R T Implanting ICD in the subject if increased compared to
A method comprising the steps of:
(Item 41)
R T Is the level of a truncated SCN5A exon 28 transcript in a biological sample obtained from a control subject, (i) the level of a full-length SCN5A exon 28 transcript in the biological sample obtained from the control subject, or (ii) the level of the control subject Level of total SCN5A exon 28 transcript of said biological sample obtained from or (iii) level of full length SCN5A exon 28 transcript of said biological sample obtained from said control subject and one or more truncated SCN5A exon 28 transcript The control subject is (i) has no ICD, (ii) has no heart disease, (iii) has normal left ventricular function, (iv) has diastolic dysfunction None of (v) items 31 and 33-40, which are subjects known to be combinations thereof The method according to the deviation or claim.
(Item 42)
R T = Μ + 4.0σ, where μ = is the mean of a Gaussian distribution of a set of data values, each data value of the set being a truncated SCN5A exon 28 transcript of a biological sample obtained from a control subject The level of product is either (i) the level of full-length SCN5A exon 28 transcript of the biological sample obtained from the control subject or (ii) the level of total SCN5A exon 28 transcript of the biological sample obtained from the control subject or (Iii) represents a level relative to the level of full-length SCN5A exon 28 transcript and one or more truncated SCN5A exon 28 transcripts of the biological sample obtained from the control subject, the control subject comprising: ) No ICD, (ii) not heart disease, (iii) normal left ventricular function, (iv) dilation There is no intolerance, or (v) a combination of these
41. The method according to any one of items 31 and 33-40, wherein σ is a subject known to be and σ is a standard deviation of a Gaussian distribution of the data values.
(Item 43)
R T Is the level of a truncated SCN5A exon 28 transcript in a biological sample obtained from a control subject, (i) the level of a full-length SCN5A exon 28 transcript in the biological sample obtained from the control subject, or (ii) the level of the control subject Level of total SCN5A exon 28 transcript of said biological sample obtained from or (iii) level of full length SCN5A exon 28 transcript of said biological sample obtained from said control subject and one or more truncated SCN5A exon 28 transcript 41. The item according to any one of items 31 and 33-40, wherein the control subject is a subject known to have an ICD that has not shocked the control subject. Method.
(Item 44)
R T = Μ + Xσ, where μ = is the average value of a Gaussian distribution of a set of data values, each data value of the set being the cleaved SCN5A exon 28 transcript of a biological sample obtained from a control subject. Levels (i) levels of full-length SCN5A exon 28 transcript of the biological sample obtained from the control subject or (ii) levels of total SCN5A exon 28 transcript of the biological sample obtained from the control subject or (iii) ) Representing the level of full-length SCN5A exon 28 transcript and the level of one or more truncated SCN5A exon 28 transcripts of the biological sample obtained from the control subject, wherein the control subject is A subject known to have an ICD that has never shocked, and σ is the Gaussian of the data value Is the standard deviation of the cloth, X is a number between 0.7 to 4.0 The method according to any one of items 31 and 33-40.
(Item 45)
R T = Μ−Xσ, where μ = is the mean of a Gaussian distribution of a set of data values, each data value of the set represents a ratio, and the control subject is shocked to the control subject And the control subject is a subject known to have an ICD that has shocked the control subject, and σ is the data value 41. The method according to any one of items 31 and 33-40, wherein the standard deviation of the Gaussian distribution of X and X is a number between 0.7 and 4.0.
(Item 46)
46. The method of item 45, wherein X is a number between about 0.7 and about 1.0.
(Item 47)
46. The method of item 45, wherein X is a number between about 2.0 and about 4.0.
(Item 48)
48. The method of item 47, wherein X is a number between about 2.326 and about 4.0.
(Item 49)
(A) R S (I) the level of a truncated SCN5A exon 28 transcript of the biological sample or (ii) the level of the full-length SCN5A exon 28 transcript of the biological sample or (iii) The level of total SCN5A exon 28 transcript in the sample is normalized to the level of housekeeping genes in the biological sample obtained from the subject;
(B) R T (I) the level of a truncated SCN5A exon 28 transcript of the biological sample or (ii) the level of the full-length SCN5A exon 28 transcript of the biological sample or (iii) The level of total SCN5A exon 28 transcript in the sample is normalized to the level of housekeeping gene in the biological sample obtained from the control subject, or
(C) Both (A) and (B).
49. A method according to any one of items 30 to 48.
(Item 50)
The housekeeping gene is glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (
50. A method according to item 49, which is GAPDH) or β-actin.
(Item 51)
R S But,
Where
Calibration abundance of truncated SCN5A exon 28 transcript = 2 -ΔΔCt truncated SCN5A exon 28 transcript
Calibration abundance of full-length SCN5A exon 28 transcript = 2 -ΔΔCt full length SCN5A exon 28 transcript
ΔΔCt Full-length SCN5A exon 28 transcript = ΔCt Full length -ΔCt Housekeeping genes
ΔΔCt Cleaved SCN5A exon 28 transcript = ΔCt Cutting type -ΔCt Housekeeping genes
ΔCt Full length = ([Ct of full length SCN5A exon 28 transcript of subject sample]-[Ct of full length SCN5A exon 28 transcript of control sample])
ΔCt Cutting type = ([Ct of truncated SCN5A exon 28 transcript of target sample]-[Ct of truncated SCN5A exon 28 transcript of control sample])
ΔCt Housekeeping genes = ([Ct of housekeeping gene of target sample] − [Ct of housekeeping gene of control sample])
"Target sample" is a biological sample obtained from the target,
The “control sample”
(I) has no ICD,
(Ii) not heart disease,
(Iii) has normal left ventricular function,
(Iv) There is no extended function failure, or
(V) These combinations
A biological sample obtained from a control subject known to be
“Full length” refers to WT SCN5A exon 28 transcript or E28A-S transcript or both WT SCN5A exon 28 transcript and E28A-S transcript.
Or R S But,
Where
Calibration abundance of truncated SCN5A exon 28 transcript = 2 -ΔΔCt truncated SCN5A exon 28 transcript
Calibration abundance of all SCN5A exon 28 transcripts = 2 -ΔΔCt whole SCN5A exon 28 transcript
ΔΔCt Total SCN5A exon 28 transcript = ΔCt Total SCN5A exon 28 transcript -ΔCt Housekeeping genes
ΔΔCt Cleaved SCN5A exon 28 transcript = ΔCt Cutting type -ΔCt Housekeeping genes
ΔCt Total SCN5A exon 28 transcript = ([All SCN5A exons of target sample 28
Ct of transcript]-[Ct of all SCN5A exon 28 transcripts in control sample])
ΔCt Cutting type = ([Ct of truncated SCN5A exon 28 transcript of target sample]-[Ct of truncated SCN5A exon 28 transcript of control sample])
ΔCt Housekeeping genes = ([Ct of housekeeping gene of target sample] − [Ct of housekeeping gene of control sample])
"Target sample" is a biological sample obtained from the target,
The “control sample”
(I) has no ICD,
(Ii) not heart disease,
(Iii) has normal left ventricular function,
(Iv) There is no extended function failure, or
(V) These combinations
A biological sample obtained from a control subject known to be
“Total SCN5A exon 28 transcript” refers to all of WT, E28A-S, E28B, E28C and E28D.
51. A method according to any one of items 28-50.
(Item 52)
R T When μ = Xσ, the ratio of the biological sample obtained from the control subject =
Where
Calibration abundance of truncated SCN5A exon 28 transcript = 2 -ΔΔCt truncated SCN5A exon 28 transcript
Calibration abundance of full-length SCN5A exon 28 transcript = 2 -ΔΔCt full length SCN5A exon 28 transcript
ΔΔCt Full-length SCN5A exon 28 transcript = ΔCt Full length -ΔCt Housekeeping genes
ΔΔCt Cleaved SCN5A exon 28 transcript = ΔCt Cutting type -ΔCt Housekeeping genes
ΔCt Full length = ([Ct of full length SCN5A exon 28 transcript of ICD patient (-) shock]-[Ct of full length SCN5A exon 28 transcript of control sample])
ΔCt Cutting type = ([Ct of ICD patient (-) shock truncated SCN5A exon 28 transcript]-[Ct of truncated SCN5A exon 28 transcript of control sample])
ΔCt Housekeeping genes = ([Ct of housekeeping gene of ICD patient (−) shock] − [Ct of housekeeping gene of control sample])
An “ICD patient (−) shock” is a biological sample obtained from a subject known to have an ICD that has never shocked,
The “control sample”
(I) has no ICD,
(Ii) not heart disease,
(Iii) has normal left ventricular function,
(Iv) There is no extended function failure, or
(V) These combinations
A biological sample obtained from a control subject known to be
“Full length” refers to WT SCN5A exon 28 transcript or E28A-S transcript or both WT SCN5A exon 28 transcript and E28A-S transcript.
Or R T When μ = Xσ, the ratio of the biological sample obtained from the control subject =
Where
Calibration abundance of truncated SCN5A exon 28 transcript = 2 -ΔΔCt truncated SCN5A exon 28 transcript
Calibration abundance of all SCN5A exon 28 transcripts = 2 -ΔΔCt whole SCN5A exon 28 transcript
ΔΔCt Total SCN5A exon 28 transcript = ΔCt Total SCN5A exon 28 transcript -ΔCt Housekeeping genes
ΔΔCt Cleaved SCN5A exon 28 transcript = ΔCt Cutting type -ΔCt Housekeeping genes
ΔCt Total SCN5A exon 28 transcript = ([Ct of all SCN5A exon 28 transcripts in ICD patient (-) shock]-[Ct of all SCN5A exon 28 transcripts in control sample))
ΔCt Cutting type = ([Ct of ICD patient (-) shock truncated SCN5A exon 28 transcript]-[Ct of truncated SCN5A exon 28 transcript of control sample])
ΔCt Housekeeping genes = ([Ct of housekeeping gene of ICD patient (−) shock] − [Ct of housekeeping gene of control sample])
An “ICD patient (−) shock” is a biological sample obtained from a subject known to have an ICD that has never shocked,
The “control sample”
(I) has no ICD,
(Ii) not heart disease,
(Iii) has normal left ventricular function,
(Iv) There is no extended function failure, or
(V) These combinations
A biological sample obtained from a control subject known to be
“Total SCN5A exon 28 transcript” refers to all of WT, E28A-S, E28B, E28C and E28D.
52. The method according to any one of items 44 and 49-51.
(Item 53)
R T = Μ−Xσ, the ratio of the biological sample obtained from the control subject is
Where
Calibration abundance of truncated SCN5A exon 28 transcript = 2 -ΔΔCt truncated SCN5A exon 28 transcript
Calibration abundance of full-length SCN5A exon 28 transcript = 2 -ΔΔCt full length SCN5A exon 28 transcript
ΔΔCt Full-length SCN5A exon 28 transcript = ΔCt Full length -ΔCt Housekeeping genes
ΔΔCt Cleaved SCN5A exon 28 transcript = ΔCt Cutting type -ΔCt Housekeeping
Gene
ΔCt Full length = ([Ct of full length SCN5A exon 28 transcript of ICD patient (+) shock]-[Ct of full length SCN5A exon 28 transcript of control sample])
ΔCt Cutting type = ([Ct of ICD patient (+) shock truncated SCN5A exon 28 transcript]-[Ct of truncated SCN5A exon 28 transcript of control sample])
ΔCt Housekeeping genes = ([Ct of housekeeping gene of ICD patient (+) shock]-[Ct of housekeeping gene of control sample])
An “ICD patient (+) shock” is a biological sample obtained from a subject known to have an ICD that has shocked,
The “control sample”
(I) has no ICD,
(Ii) not heart disease,
(Iii) has normal left ventricular function,
(Iv) There is no extended function failure, or
(V) These combinations
A biological sample obtained from a control subject known to be
“Full length” refers to WT SCN5A exon 28 transcript or E28A-S transcript or both WT SCN5A exon 28 transcript and E28A-S transcript.
Or R T = Μ−Xσ, the ratio of the biological sample obtained from the control subject is
Where
Calibration abundance of truncated SCN5A exon 28 transcript = 2 -ΔΔCt truncated SCN5A exon 28 transcript
Calibration abundance of all SCN5A exon 28 transcripts = 2 -ΔΔCt whole SCN5A exon 28 transcript
ΔΔCt Total SCN5A exon 28 transcript = ΔCt Total SCN5A exon 28 transcript -ΔCt Housekeeping genes
ΔΔCt Cleaved SCN5A exon 28 transcript = ΔCt Cutting type -ΔCt Housekeeping genes
ΔCt Total SCN5A exon 28 transcript = ([Ct of all SCN5A exon 28 transcripts in ICD patient (+) shock]-[Ct of all SCN5A exon 28 transcripts in control sample])
ΔCt Cutting type = ([Ct of ICD patient (+) shock truncated SCN5A exon 28 transcript]-[Ct of truncated SCN5A exon 28 transcript of control sample])
ΔCt Housekeeping genes = ([Ct of housekeeping gene of ICD patient (+) shock]-[Ct of housekeeping gene of control sample])
An “ICD patient (+) shock” is a biological sample obtained from a subject known to have an ICD that has shocked,
The “control sample”
(I) has no ICD,
(Ii) not heart disease,
(Iii) has normal left ventricular function,
(Iv) There is no extended function failure, or
(V) These combinations
A biological sample obtained from a control subject known to be
“Total SCN5A exon 28 transcript” refers to all of WT, E28A-S, E28B, E28C and E28D.
52. A method according to any one of items 45-51.
(Item 54)
Each level is a real-time polymerase chain reaction (R T 54. A method according to any one of items 28 to 53, determined by -PCR).
(Item 55)
55. The item according to any one of items 28 to 54, wherein the level of the truncated SCN5A exon 28 transcript is the level of SCN5A exon 28 splice variant C (E28C) or the level of SCN5A exon 28 splice variant D (E28D). the method of.
(Item 56)
56. The method of item 55, wherein the level of truncated SCN5A exon 28 transcript is the level of E28C and E28D.
(Item 57)
The level of the truncated SCN5A exon 28 transcript is compared to (i) the level of WT SCN5A exon 28 transcript, (ii) the level of E28A-S or (iii) a combination of (i) and (ii) The method according to any one of items 28 to 56.
(Item 58)
57. The item of any of paragraphs 28-56, wherein the level of the truncated SCN5A exon 28 transcript is compared to all levels of WT SCN5A exon 28 transcript, E28A-S, E28B, E28C, and E28D. Method.
(Item 59)
The level of the truncated SCN5A exon 28 transcript is compared to the levels of (A) and (B);
(A) is one of (i) a level of WT SCN5A exon 28 transcript, (ii) a level of E28A-S or (iii) a combination of (i) and (ii);
(B) is one or more of E28B, E28C and E28D,
57. The method according to any one of items 28 to 56.
(Item 60)
59. The method of item 57 or 58, wherein the truncated SCN5A exon 28 transcript is E28C.
(Item 61)
R S = R E28C =
Where
Calibration abundance of E28C transcript = 2 -ΔΔCtE28C transcript
Calibration abundance of full-length SCN5A exon 28 transcript = 2 -ΔΔCt full length SCN5A exon 28 transcript
ΔΔCt Full-length SCN5A exon 28 transcript = ΔCt Full length -ΔCt Housekeeping genes
ΔΔCt E28C transcript = ΔCt E28C transcript -ΔCt Housekeeping genes
ΔCt Full length = ([Ct of full length SCN5A exon 28 transcript of subject sample]-[Ct of full length SCN5A exon 28 transcript of control sample])
ΔCt E28C = ([Ct of E28C transcript of target sample]-[Ct of E28C transcript of control sample])
ΔCt Housekeeping genes = ([Ct of housekeeping gene of target sample] − [Ct of housekeeping gene of control sample])
"Target sample" is a biological sample obtained from the target,
The “control sample”
(I) has no ICD,
(Ii) not heart disease,
(Iii) has normal left ventricular function,
(Iv) There is no extended function failure, or
(V) These combinations
A biological sample obtained from a control subject known to be
“Full length” refers to WT SCN5A exon 28 transcript or E28A-S transcript or both WT SCN5A exon 28 transcript and E28A-S transcript.
Or R E28C =
Where
Calibration abundance of E28C transcript = 2 -ΔΔCtE28C transcript
Calibration abundance of all SCN5A exon 28 transcripts = 2 -ΔΔCt whole SCN5A exon 28 transcript
ΔΔCt Total SCN5A exon 28 transcript = ΔCt Total SCN5A exon 28 transcript -ΔCt Housekeeping genes
ΔΔCt E28C transcript = ΔCt E28C transcript -ΔCt Housekeeping genes
ΔCt Total SCN5A exon 28 transcript = ([Ct of all SCN5A exon 28 transcripts of subject sample]-[Ct of all SCN5A exon 28 transcripts of control sample])
ΔCt E28C = ([Ct of E28C transcript of target sample]-[Ct of E28C transcript of control sample])
ΔCt Housekeeping genes = ([Ct of housekeeping gene of target sample] − [Ct of housekeeping gene of control sample])
"Target sample" is a biological sample obtained from the target,
The “control sample”
(I) has no ICD,
(Ii) not heart disease,
(Iii) has normal left ventricular function,
(Iv) There is no extended function failure, or
(V) These combinations
A biological sample obtained from a control subject known to be
“Total SCN5A exon 28 transcript” refers to all of WT, E28A-S, E28B, E28C and E28D.
61. The method according to item 60.
(Item 62)
59. The method of item 57 or 58, wherein the truncated SCN5A exon 28 transcript is E28D.
(Item 63)
R S = R E28D =
Where
Calibration abundance of E28D transcript = 2 -ΔΔCtE28D transcript
Calibration abundance of full-length SCN5A exon 28 transcript = 2 -ΔΔCt full length SCN5A exon 28 transcript
ΔΔCt Full-length SCN5A exon 28 transcript = ΔCt Full length -ΔCt Housekeeping genes
ΔΔCt E28D transcript = ΔCt E28D transcript -ΔCt Housekeeping genes
ΔCt Full length = ([Ct of full length SCN5A exon 28 transcript of subject sample]-[Ct of full length SCN5A exon 28 transcript of control sample])
ΔCt E28D = ([Ct of E28D transcript of target sample]-[Ct of E28D transcript of control sample])
ΔCt Housekeeping genes = ([Ct of housekeeping gene of target sample] − [Ct of housekeeping gene of control sample])
"Target sample" is a biological sample obtained from the target,
The “control sample”
(I) has no ICD,
(Ii) not heart disease,
(Iii) has normal left ventricular function,
(Iv) There is no extended function failure, or
(V) These combinations
A biological sample obtained from a control subject known to be
“Full length” refers to WT SCN5A exon 28 transcript or E28A-S transcript or both WT SCN5A exon 28 transcript and E28A-S transcript.
Or R E28D =
Where
Calibration abundance of E28D transcript = 2 -ΔΔCtE28D transcript
Calibration abundance of all SCN5A exon 28 transcripts = 2 -ΔΔCt whole SCN5A exon 28 transcript
ΔΔCt Total SCN5A exon 28 transcript = ΔCt Total SCN5A exon 28 transcript -ΔCt Housekeeping genes
ΔΔCt E28D transcript = ΔCt E28D transcript -ΔCt Housekeeping genes
ΔCt Total SCN5A exon 28 transcript = ([Ct of all SCN5A exon 28 transcripts of subject sample]-[Ct of all SCN5A exon 28 transcripts of control sample])
ΔCt E28D = ([Ct of E28D transcript of target sample]-[Ct of E28D transcript of control sample])
ΔCt Housekeeping genes = ([Ct of housekeeping gene of target sample] − [Ct of housekeeping gene of control sample])
"Target sample" is a biological sample obtained from the target,
The “control sample”
(I) has no ICD,
(Ii) not heart disease,
(Iii) has normal left ventricular function,
(Iv) There is no extended function failure, or
(V) These combinations
A biological sample obtained from a control subject known to be
“Total SCN5A exon 28 transcript” refers to all of WT, E28A-S, E28B, E28C and E28D.
63. The method according to item 62.
(Item 64)
First R S And the second R S Determining the first R S Compares the level of E28C with the level of total SCN5A exon 28 transcript and said second R S 64. The method of any one of items 28-63, wherein the level of E28D is compared to the level of total SCN5A exon 28 transcript.
(Item 65)
Said first R S Is RE28C and the second R S 65. The method of item 64, wherein is E28D.
(Item 66)
A method for determining a subject's risk for arrhythmia, comprising:
The level of a truncated SCN5A exon 28 transcript in a biological sample obtained from a subject is determined by: (i) the level of full-length SCN5A exon 28 transcript in the biological sample or (ii) the level of total SCN5A exon 28 transcript in the biological sample. Or (iii) a ratio R comparing the level of the full length SCN5A exon 28 transcript and the level of one or more truncated SCN5A exon 28 transcripts of said biological sample S Determining the method.
(Item 67)
R S Is the threshold ratio R T 70. The method of item 66, wherein if so, the subject is at risk of arrhythmia.
(Item 68)
68. A method according to item 66 or 67, wherein the arrhythmia is atrial arrhythmia, optionally atrial fibrillation.
(Item 69)
A method for determining a subject's risk for heart failure, comprising:
The level of a truncated SCN5A exon 28 transcript in a biological sample obtained from a subject is determined by: (i) the level of full-length SCN5A exon 28 transcript in the biological sample or (ii) the level of total SCN5A exon 28 transcript in the biological sample. Or (iii) a ratio R comparing the level of the full length SCN5A exon 28 transcript and the level of one or more truncated SCN5A exon 28 transcripts of said biological sample S Determining the method.
(Item 70)
R S Is the threshold ratio R T 70. The method of item 69, wherein if so, the subject is at risk for heart failure.
(Item 71)
Measuring (i) the level of full-length SCN5A exon 28 transcript, (ii) the level of truncated SCN5A exon 28 or (iii) the level of total SCN5A exon 28 transcript of a biological sample obtained from said subject, A method according to any one of the preceding items.
(Item 72)
72. A method according to item 71, wherein the measuring step comprises performing a polymerase chain reaction, optionally real-time PCR.
(Item 73)
(A) measuring (i) the level of full-length SCN5A exon 28 transcript, (ii) the level of truncated SCN5A exon 28 or (iii) the level of total SCN5A exon 28 transcript of a biological sample obtained from said subject When,
(B) obtaining from said subject's medical record (i) the level of full-length SCN5A exon 28 transcript, (ii) the level of truncated SCN5A exon 28 or (iii) the level of total SCN5A exon 28 transcript;
The method according to item 71 or 72, comprising:
(Item 74)
The method of any one of the preceding items, comprising providing anti-arrhythmic therapy to the subject.
(Item 75)
75. The method of item 74, comprising implanting the ICD in a subject that is determined to need to be implanted.
(Item 76)
76. The method of item 74 or 75, comprising administering an antiarrhythmic agent to the subject.
(Item 77)
77. The method of item 76, wherein the antiarrhythmic agent is a sodium channel blocker.
(Item 78)
(I) obtaining a biological sample from the subject every 6 to 12 months; (ii) R of each obtained biological sample S The method according to any one of the preceding items comprising: determining.
(Item 79)
The method according to any one of the preceding items, comprising determining the level of SCN5A splicing factor or UPR protein or chaperone protein in the sample.
(Item 80)
80. The method of item 79, comprising determining the level of hLuc7A, RBM25 or PERK.
(Item 81)
80. The method of item 79, wherein the chaperone protein is CHOP or calnexin.
(Item 82)
The method according to any one of the preceding items, wherein the biological sample comprises white blood cells, heart cells or muscle cells from the subject.
(Item 83)
83. A method according to item 82, wherein the biological sample is blood derived from the subject.
(Item 84)
The method of any one of the preceding items, wherein the subject suffers from a chronic left ventricular ejection fraction of less than 50% or about 50%.
(Item 85)
85. The method of item 84, wherein the subject suffers from a chronic left ventricular ejection fraction of less than 40% or about 40%.
(Item 86)
86. The method of item 85, wherein the subject suffers from a chronic left ventricular ejection fraction of less than 35% or about 35%.
(Item 87)
The subject suffers from (i) non-ischemic dilated cardiomyopathy or ischemic heart disease at least 40 days after myocardial infarction; (ii) chronically receiving medical therapy but with NYHA functional class II or III Classified as subject, or (iii) in both (i) and (ii)
A method according to any one of the preceding items.
(Item 88)
The method of any one of the preceding items, wherein the subject has structural heart disease.
(Item 89)
84. The method of any one of items 30-44 and 46-83, wherein the subject has ICD.
(Item 90)
The method of any one of the preceding items, wherein the subject has been diagnosed with HF.
(Item 91)
A kit,
(A) an E28C binder and / or an E28D binder,
(B) a WT SCN5A binder and / or an E28A-S binder, and
Instructions for use
Including kit.
(Item 92)
92. A kit according to item 91, further comprising a binding agent for all SCN5A exon 28 transcripts: WT, E28A-S, E28B, E28C and E28D.
(Item 93)
93. The kit according to item 91 or 92, wherein the binding agent is a nucleic acid.
(Item 94)
A kit,
(I) each data value is a plurality of data values that are ratios determined from a biological sample obtained from a subject of the first population, wherein said ratio is the level of truncated SCN5A exon 28 transcript ( i) level of full-length SCN5A exon 28 transcript in the biological sample or (ii) level of total SCN5A exon 28 transcript in the biological sample or (iii) level of full-length SCN5A exon 28 transcript in the biological sample and 1 Or a plurality of data values, wherein each subject of said first population is a subject known to have a shocked ICD as compared to the level of a plurality of truncated SCN5A exon 28 transcripts,
(II) a Gaussian distribution of the plurality of data values;
(IV) Mean value and standard deviation of the Gaussian distribution or
(V) a threshold ratio R based on an average value and standard deviation of the Gaussian distribution of the plurality of data values T
A computer-readable storage medium storing
Access to any one or more of (I) to (V)
Including kit.
(Item 95)
A kit,
(I) each data value is a plurality of data values that are ratios determined from a biological sample obtained from a subject of the first population, wherein said ratio is the level of truncated SCN5A exon 28 transcript ( i) level of full-length SCN5A exon 28 transcript in the biological sample or (ii) level of total SCN5A exon 28 transcript in the biological sample or (iii) level of full-length SCN5A exon 28 transcript in the biological sample and 1 Or a plurality of data values, wherein each subject of said first population is a subject known to have an ICD that has never shocked, as compared to the level of a plurality of truncated SCN5A exon 28 transcripts,
(II) a Gaussian distribution of the plurality of data values;
(IV) Mean value and standard deviation of the Gaussian distribution or
(V) a threshold ratio R based on the average value and the standard deviation of the Gaussian distribution of the plurality of data values T
A computer-readable storage medium storing
Access to any one or more of (I) to (V)
Including kit.
(Item 96)
A kit,
(I) each data value is a plurality of data values that are ratios determined from a biological sample obtained from a subject of the first population, wherein said ratio is the level of truncated SCN5A exon 28 transcript ( i) level of full-length SCN5A exon 28 transcript in the biological sample or (ii) level of total SCN5A exon 28 transcript in the biological sample or (iii) level of full-length SCN5A exon 28 transcript in the biological sample and 1 Or compared to the levels of multiple truncated SCN5A exon 28 transcripts, each subject of the first population has (I) no ICD, (II) no heart disease, (III) normal left A plurality of data values having a ventricular function, (IV) no diastolic dysfunction, or (V) a subject known to be a combination of these,
(II) a Gaussian distribution of the plurality of data values;
(IV) Mean value and standard deviation of the Gaussian distribution or
(V) a threshold ratio R based on the average value and the standard deviation of the Gaussian distribution of the plurality of data values T
A computer-readable storage medium storing
Access to any one or more of (I) to (V)
Including kit.
(Item 97)
A system,
A processor;
A memory device coupled to the processor, the memory device being executed by the processor;
(I) Each data value is a plurality of data values that are ratios determined from a biological sample obtained from a subject of the first population, wherein the ratio is a truncated SCN5A exon 28 of the biological sample obtained from the subject. Transcript levels can be expressed as (A) full-length SCN5A exon 28 transcript level of the biological sample or (B) total SCN5A exon 28 transcript level of the biological sample or (C) full-length SCN5A exon of the biological sample. Each subject of said first population is known to have an ICD that has shocked, compared to the level of 28 transcripts and the level of one or more truncated SCN5A exon 28 transcripts Accept multiple data values,
(Ii) fitting the plurality of data values to a first Gaussian distribution;
(Iii) determining an average value μ and a standard deviation σ of the first Gaussian distribution;
(Iv) First threshold ratio R T Is set to μ−Xσ, where X is a number between 0.7 and 4.0,
A memory device for storing machine-readable instructions;
Including system.
(Item 98)
R T 98. The system of item 97, wherein [mu] -X [sigma] and X is a number between 0.7 and 1.0.
(Item 99)
R T 98. The system according to item 97, wherein [mu] -X [sigma] and X is a number between 2.0 and 4.0.
(Item 100)
R T 100. The system of item 99, wherein [mu] -X [sigma] and X is a number between 2.326 and 4.0.
(Item 101)
When executed by the processor, the processor receives R as an input. S , R S R T 101. The system of any one of items 97-100, comprising machine readable instructions to be compared with.
(Item 102)
When executed by the processor, the processor S And R T 102. The system of item 101, comprising machine readable instructions that cause output to be displayed that indicates a relationship between the
(Item 103)
When executed by the processor, the processor
(I) each of the second plurality of data values is a second plurality of data values that are ratios determined from biological samples obtained from a second population of subjects, wherein the ratio is the subject The level of the truncated SCN5A exon 28 transcript of the biological sample obtained from (A) the level of the full-length SCN5A exon 28 transcript of the biological sample or (B) the level of the total SCN5A exon 28 transcript of the biological sample or (C) comparing the level of full-length SCN5A exon 28 transcript and the level of one or more truncated SCN5A exon 28 transcripts of the biological sample, each subject of the second population was shocked Receiving a second plurality of data values that are known to have no ICD;
(Ii) fitting the second plurality of data values to a second Gaussian distribution;
(Iii) determining the mean value μ and the standard deviation σ of the second Gaussian distribution;
(Iv) Second threshold ratio R T2 Is set to μ + Xσ, where X is a number between 0.7 and 4.0,
103. A system according to any one of items 97 to 102, comprising machine-readable instructions.
(Item 104)
R T2 108. The system of item 103, wherein μ + Xσ, and X is a number between 0.7 and 1.0.
(Item 105)
R T2 108. The system of item 103, wherein = μ + Xσ and X is a number between 2.0 and 4.0.
(Item 106)
R T2 106. The system of item 105, wherein = μ + Xσ and X is a number between 2.326 and 4.0.
(Item 107)
When executed by the processor, the processor
(I) a third plurality of data values, wherein each data value of the third plurality of data values is a ratio determined from a biological sample obtained from a target of the second population, wherein the ratio is the target The level of the truncated SCN5A exon 28 transcript of the biological sample obtained from (A) the level of the full-length SCN5A exon 28 transcript of the biological sample or (B) the level of the total SCN5A exon 28 transcript of the biological sample or (C) comparing the level of full-length SCN5A exon 28 transcript in the biological sample and the level of one or more truncated SCN5A exon 28 transcript, each subject of the third population has (I) ICD Not (II) not heart disease, (III) have normal left ventricular function, (IV) no diastolic dysfunction, or (V) combinations thereof There it was does not receive a third plurality of data values is a known object,
(Ii) fitting the third plurality of data values to a third Gaussian distribution;
(Iii) determining an average value μ and a standard deviation σ of the third Gaussian distribution;
(Iv) Third threshold ratio R T3 Is set to μ + 4.0σ,
109. A system according to any one of items 97 to 106, comprising machine-readable instructions.
(Item 108)
When executed by the processor, the processor is combined in that the area under the curve of the first Gaussian distribution is maximized and the area under the curve of the second Gaussian distribution is minimized.
Threshold ratio R T combination 108. A system according to any one of items 103 to 107, comprising machine-readable instructions for causing
(Item 109)
A system,
A processor;
A memory device coupled to the processor, the memory device being executed by the processor;
(I) Each data value of a plurality of data values is a plurality of data values that are ratios determined from a biological sample obtained from a target of a group, and the ratio is a truncated SCN5A of the biological sample obtained from the target The level of exon 28 transcript is expressed as (A) the full-length SCN5A exon 28 transcript level of the biological sample or (B) the level of the total SCN5A exon 28 transcript of the biological sample or (C) the full length of the biological sample. A plurality of subjects in which each subject of the population is known to have an ICD that has never shocked as compared to the level of SCN5A exon 28 transcript and the level of one or more truncated SCN5A exon 28 transcripts Receive the data value of
(Ii) fitting the plurality of data values to a Gaussian distribution;
(Iii) determining the mean value μ and standard deviation σ of the Gaussian distribution;
(Iv) Threshold ratio R T2 Is set to μ + Xσ, where X is a number between 0.7 and 4.0,
A memory device for storing machine-readable instructions;
Including system.
(Item 110)
R T2 110. The system according to item 109, wherein μ + Xσ, and X is a number between 0.7 and 1.0.
(Item 111)
R T2 110. The system of item 109, wherein μ + Xσ, and X is a number between 2.0 and 4.0.
(Item 112)
R T2 111. The system of item 111, wherein μ + Xσ, and X is a number between 2.326 and 4.0.
(Item 113)
A system,
When executed by a processor, the processor
(I) Each data value of a plurality of data values is a plurality of data values that are ratios determined from a biological sample obtained from a target of a group, and the ratio is a truncated SCN5A of the biological sample obtained from the target The level of exon 28 transcript is expressed as (A) the full-length SCN5A exon 28 transcript level of the biological sample or (B) the level of the total SCN5A exon 28 transcript of the biological sample or (C) the full length of the biological sample. Each subject of the population compared to the level of SCN5A exon 28 transcript and the level of one or more truncated SCN5A exon 28 transcripts, (I) not having ICD, (II) not having heart disease, In subjects known to have (III) normal left ventricular function, (IV) no diastolic dysfunction, or (V) a combination thereof A plurality of data values not receive that,
(Ii) fitting the plurality of data values to a Gaussian distribution;
(Iii) determining the mean value μ and standard deviation σ of the Gaussian distribution;
(Iv) Threshold ratio R T3 Is set to μ + 4.0σ,
A system containing machine-readable instructions.
(Item 114)
A computer readable storage medium storing machine readable instructions executable by a processor,
(I) instructions for causing the processor to receive a plurality of data values, each data
The value is a ratio determined from a biological sample obtained from a subject of the first population, wherein the ratio is the level of a truncated SCN5A exon 28 transcript of the biological sample obtained from the subject, (A) the biological sample Full-length SCN5A exon 28 transcript level or (B) the total SCN5A exon 28 transcript level of the biological sample or (C) the full-length SCN5A exon 28 transcript level and one or more truncated forms of the biological sample An instruction wherein each subject of said first population is a subject known to have an ICD that has shocked, as compared to the level of SCN5A exon 28 transcript;
(Ii) instructions for adapting the plurality of data values to a first Gaussian distribution to the processor;
(Ii) instructions for causing the processor to determine an average value μ and a standard deviation σ of the first Gaussian distribution;
(Iii) The processor has a first threshold ratio R T Is an instruction for setting μ to Xσ, where X is a number between 0.7 and 4.0, and
A computer-readable storage medium including:
(Item 115)
R T 119. The computer readable storage medium of item 114, wherein [mu] -X [sigma] and X is a number between 0.7 and 1.0.
(Item 116)
R T 119. The computer readable storage medium of item 114, wherein [mu] -X [sigma] and X is a number between 2.0 and 4.0.
(Item 117)
R T 119. The computer readable storage medium of item 116, wherein [mu] -X [sigma] and X is a number between 2.326 and 4.0.
(Item 118)
R as an input to the processor S , R S R T 118. A computer readable storage medium according to any one of items 114 to 117, comprising instructions for comparison with.
(Item 119)
The processor includes R S And R T 119. The computer-readable storage medium of item 118, comprising instructions for presenting an output indicating a relationship between the first and second outputs.
(Item 120)
In the processor,
(I) each of the second plurality of data values is a second plurality of data values that are ratios determined from biological samples obtained from a second population of subjects, wherein the ratio is the subject The level of the truncated SCN5A exon 28 transcript of the biological sample obtained from (A) the level of the full-length SCN5A exon 28 transcript of the biological sample or (B) the level of the total SCN5A exon 28 transcript of the biological sample or (C) comparing the level of full-length SCN5A exon 28 transcript and the level of one or more truncated SCN5A exon 28 transcripts of the biological sample, each subject of the second population was shocked Receiving a second plurality of data values that are known to have no ICD;
(Ii) fitting the second plurality of data values to a second Gaussian distribution;
(Iii) determining the mean value μ and the standard deviation σ of the second Gaussian distribution;
(Iv) Second threshold ratio R T2 Is set to μ + Xσ, where X is a number between 0.7 and 4.0,
120. A computer readable storage medium according to any one of items 114 to 119, comprising instructions for.
(Item 121)
R T2 123. The computer readable storage medium of item 120, wherein [mu] + X [sigma] and X is a number between 0.7 and 1.0.
(Item 122)
R T2 123. The computer readable storage medium of item 120, wherein [mu] + X [sigma] and X is a number between 2.0 and 4.0.
(Item 123)
R T2 123. The computer readable storage medium of item 122, wherein [mu] + X [sigma] and X is a number between 2.326 and 4.0.
(Item 124)
In the processor,
(I) a third plurality of data values, wherein each data value of the third plurality of data values is a ratio determined from a biological sample obtained from a subject of the second population, wherein the ratio is from the subject The level of truncated SCN5A exon 28 transcript in the resulting biological sample is expressed as (A) the level of full-length SCN5A exon 28 transcript in the biological sample or (B) the level of total SCN5A exon 28 transcript in the biological sample or ( C) comparing the level of full length SCN5A exon 28 transcript and the level of one or more truncated SCN5A exon 28 transcript of said biological sample, each subject of said third population has (I) ICD Not (II) not heart disease, (III) have normal left ventricular function, (IV) no diastolic dysfunction, or (V) in these combinations Rukoto not have received a third plurality of data values is a known object,
(Ii) fitting the third plurality of data values to a third Gaussian distribution;
(Iii) determining an average value μ and a standard deviation σ of the third Gaussian distribution;
(Iv) Third threshold ratio R T3 Is set to μ + 4.0σ
124. The computer readable storage medium of any one of items 114 to 123, comprising instructions for.
(Item 125)
The processor has a combined threshold ratio R in that the area under the curve of the first Gaussian distribution is maximized and the area under the curve of the second Gaussian distribution is minimized. T combination 129. The computer readable storage medium according to any one of items 120 to 124, comprising an instruction for causing the user to set the item.
(Item 126)
A computer readable storage medium storing machine readable instructions executable by a processor,
(I) instructions for causing the processor to receive a plurality of data values, wherein each data value of the plurality of data values is a ratio determined from a biological sample obtained from a population subject; , The level of the truncated SCN5A exon 28 transcript in the biological sample obtained from the subject, (A) the level of the full-length SCN5A exon 28 transcript in the biological sample or (B) the total SCN5A exon 28 transcript in the biological sample. Each subject of the population has not been shocked as compared to the level or (C) the level of full-length SCN5A exon 28 transcript and the level of one or more truncated SCN5A exon 28 transcripts in the biological sample An instruction that is a subject known to have an ICD;
(Ii) instructions for adapting the plurality of data values to a Gaussian distribution to the processor;
(Iii) instructions for causing the processor to determine an average value μ and a standard deviation σ of the Gaussian distribution;
(Iv) The processor has a threshold ratio R T2 Is an instruction for setting μ to Xσ, where X is a number between 0.7 and 4.0, and
A computer-readable storage medium including:
(Item 127)
R T2 127. The computer readable storage medium of item 126, wherein = μ + Xσ and X is a number between 0.7 and 1.0.
(Item 128)
R T2 = Μ + Xσ and X is a number between 2.0 and 4.0.
Computer readable storage medium.
(Item 129)
R T2 129. The computer readable storage medium of item 128, wherein [mu] + X [sigma] and X is a number between 2.326 and 4.0.
(Item 130)
A computer readable storage medium storing machine readable instructions executable by a processor,
(I) instructions for causing the processor to receive a plurality of data values, wherein each data value of the plurality of data values is a ratio determined from a biological sample obtained from a population subject; , The level of the truncated SCN5A exon 28 transcript in the biological sample obtained from the subject, (A) the level of the full-length SCN5A exon 28 transcript in the biological sample or (B) the total SCN5A exon 28 transcript in the biological sample. Each subject of the population has (I) ICD as compared to the level or (C) the level of full-length SCN5A exon 28 transcript and one or more truncated SCN5A exon 28 transcripts in the biological sample Not (II) not heart disease, (III) have normal left ventricular function, (IV) no diastolic dysfunction, or ( ) Is a known object that is a combination thereof, and instructions,
(Ii) instructions for adapting the plurality of data values to a Gaussian distribution to the processor;
(Iii) instructions for causing the processor to determine an average value μ and a standard deviation σ of the Gaussian distribution;
(Iv) The processor has a threshold ratio R T3 For setting the value to μ + 4.0σ,
A computer-readable storage medium including:
(Item 131)
A method implemented by a processor in a computer comprising:
(I) a step of receiving a plurality of data values, wherein each data value is a ratio determined from a biological sample obtained from a target of the first population, and the ratio is a cutting type of the biological sample obtained from the target The level of SCN5A exon 28 transcript is determined by (A) the level of full-length SCN5A exon 28 transcript of the biological sample or (B) the level of total SCN5A exon 28 transcript of the biological sample or (C) the complete level of the biological sample. It is known that each subject of the first population has an ICD that has shocked as compared to the level of the long SCN5A exon 28 transcript and the level of one or more truncated SCN5A exon 28 transcripts The target step, and
(Ii) fitting the plurality of data values to a first Gaussian distribution;
(Ii) determining an average value μ and a standard deviation σ of the first Gaussian distribution;
(Iii) First threshold ratio R T Is set to μ−Xσ, where X is a number between 0.7 and 4.0;
Including the method.
(Item 132)
R T 132. A method according to item 131, wherein [mu] -X [sigma] and X is a number between 0.7 and 1.0.
(Item 133)
R T 134. The method according to item 131, wherein [mu] -X [sigma] and X is a number between 2.0 and 4.0.
(Item 134)
R T 134. The method according to item 133, wherein [mu] -X [sigma] and X is a number between 2.326 and 4.0.
(Item 135)
R as input S Receive R S R T Item 13 including the step of comparing with
The method according to any one of 1 to 134.
(Item 136)
R S And R T 136. The method of item 135, comprising the step of presenting an output indicative of the relationship between.
(Item 137)
(I) receiving a second plurality of data values, wherein each data value of the second plurality of data values is a ratio determined from a biological sample obtained from a second population of subjects; The ratio is the level of a truncated SCN5A exon 28 transcript in a biological sample obtained from the subject, (A) the level of a full-length SCN5A exon 28 transcript in the biological sample, or (B) the total SCN5A exon 28 in the biological sample. Each subject of the second population is compared to the level of transcript or (C) the level of full length SCN5A exon 28 transcript and the level of one or more truncated SCN5A exon 28 transcripts of the biological sample. A step known to have an ICD that has not been given
(Ii) fitting the second plurality of data values to a second Gaussian distribution;
(Iii) determining an average value μ and a standard deviation σ of the second Gaussian distribution;
(Iv) Second threshold ratio R T2 Is set to μ + Xσ, where X is a number between 0.7 and 4.0;
141. The method according to any one of items 131-136, comprising:
(Item 138)
R T2 138. The method of item 137, wherein [mu] + X [sigma] and X is a number between 0.7 and 1.0.
(Item 139)
R T2 138. The method of item 137, wherein [mu] + X [sigma] and X is a number between 2.0 and 4.0.
(Item 140)
R T2 140. The method of item 139, wherein μ + Xσ, and X is a number between 2.326 and 4.0.
(Item 141)
(I) receiving a third plurality of data values, wherein each data value of the third plurality of data values is a ratio determined from a biological sample obtained from a second population of subjects; The ratio is the level of a truncated SCN5A exon 28 transcript in a biological sample obtained from the subject, (A) the level of a full-length SCN5A exon 28 transcript in the biological sample, or (B) the total SCN5A exon 28 in the biological sample. Each subject of the third population is compared to the level of transcript or (C) the level of full-length SCN5A exon 28 transcript and one or more truncated SCN5A exon 28 transcripts in the biological sample, I) no ICD, (II) no heart disease, (III) normal left ventricular function, (IV) no diastolic dysfunction, or Is a known object that V) a combination thereof, a step,
(Ii) fitting the third plurality of data values to a third Gaussian distribution;
(Iii) determining an average value μ and a standard deviation σ of the third Gaussian distribution;
(Iv) Third threshold ratio R T3 Setting to μ + 4.0σ;
141. The method of any one of items 131-140, comprising:
(Item 142)
The combined threshold ratio R to the point where the area under the curve of the first Gaussian distribution is maximized and the area under the curve of the second Gaussian distribution is minimized. T combination 142. The method according to any one of items 137-141, comprising the step of setting.
(Item 143)
A method implemented by a processor in a computer comprising:
(I) receiving a plurality of data values, wherein each data value of the plurality of data values is a ratio determined from a biological sample obtained from a target of the population, and the ratio is determined from the target
The level of truncated SCN5A exon 28 transcript in the resulting biological sample is expressed as (A) the level of full-length SCN5A exon 28 transcript in the biological sample or (B) the level of total SCN5A exon 28 transcript in the biological sample or ( C) Each subject of the population has an ICD that has never shocked as compared to the level of full-length SCN5A exon 28 transcript and one or more truncated SCN5A exon 28 transcripts in the biological sample A step that is a known subject, and
(Ii) fitting the plurality of data values to a Gaussian distribution;
(Iii) determining an average value μ and a standard deviation σ of the Gaussian distribution;
(Iv) Threshold ratio R T2 Is set to μ + Xσ, where X is a number between 0.7 and 4.0;
Including the method.
(Item 144)
R T2 135. The method of item 134, wherein [mu] + X [sigma] and X is a number between 0.7 and 1.0.
(Item 145)
R T2 135. A method according to item 134, wherein [mu] + X [sigma] and X is a number between 2.0 and 4.0.
(Item 146)
R T2 145. The method of item 145, wherein [mu] + X [sigma] and X is a number between 2.326 and 4.0.
(Item 147)
A method implemented by a processor in a computer comprising:
(I) a step of receiving a plurality of data values, wherein each data value of the plurality of data values is a ratio determined from a biological sample obtained from a target of a group, and the ratio is obtained from a target The level of truncated SCN5A exon 28 transcript in the sample is determined by: (A) the level of full-length SCN5A exon 28 transcript in the biological sample or (B) the level of total SCN5A exon 28 transcript in the biological sample or (C) Each subject of said population has (I) no ICD as compared to the level of full length SCN5A exon 28 transcript and one or more truncated SCN5A exon 28 transcripts in a biological sample, (II) Not heart disease, (III) with normal left ventricular function, (IV) no diastolic dysfunction, or (V) combinations thereof Is a known object that there, the steps,
(Ii) fitting the plurality of data values to a Gaussian distribution;
(Iii) determining an average value μ and a standard deviation σ of the Gaussian distribution;
(Iv) Threshold ratio R T3 Setting to μ + 4.0σ;
Including the method.
Claims (17)
ここで、Ｒ Ｓ は、対象から得られる生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、
（ｉ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは
（ｉｉ）前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは
（ｉｉｉ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベル
と比較し、
該方法は、
（Ａ）比率ＲＳを決定するステップ、および
（Ｂ）Ｒ Ｓ が閾値比率Ｒ Ｔ 以上である場合、前記対象がＩＣＤを必要とすることを決定するステップを含む、方法。 A method of using the ratio R S as an indicator of a subject's need for an implantable cardioverter defibrillator ( ICD ) comprising :
Here, RS is the level of a truncated SCN5A exon 28 transcript in a biological sample obtained from the subject,
(I) the level of full length SCN5A exon 28 transcript in the biological sample or (ii) the level of total SCN5A exon 28 transcript in the biological sample or (iii) the level of full length SCN5A exon 28 transcript in the biological sample and Compared to the level of one or more truncated SCN5A exon 28 transcripts ;
The method
(A) determining a ratio R S ; and
(B) If R S is greater than or equal to a threshold ratio R T , the method includes determining that the object requires ICD .
（ｉ）前記対照対象から得られる前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは
（ｉｉ）前記対照対象から得られる前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは
（ｉｉｉ）前記対照対象から得られる前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベル
と比較する比率であり、
前記対照対象が、
（ｉ）ＩＣＤを有していない、
（ｉｉ）心臓病ではない、
（ｉｉｉ）正常な左心室機能を有する、
（ｉｖ）拡張機能障害がない、または
（ｖ）これらの組み合わせ
であることが既知の対象であるか；
（ｉｉ）Ｒ Ｔ が、μ＋４．０σに等しく、
式中、μは、１セットのデータ値のガウス分布の平均値であり、
前記セットの各データ値は、対照対象から得られる生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、
（ｉ）前記対照対象から得られる前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは
（ｉｉ）前記対照対象から得られる前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは
（ｉｉｉ）前記対照対象から得られる前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベル
と比較する比率を表し、
前記対照対象は、
（ｉ）ＩＣＤを有していない、
（ｉｉ）心臓病ではない、
（ｉｉｉ）正常な左心室機能を有する、
（ｉｖ）拡張機能障害がない、または
（ｖ）これらの組み合わせ
であることが既知の対象であり、σは、前記データ値のガウス分布の標準偏差であるか；
（ｉｉｉ）Ｒ Ｔ が、対照対象から得られる生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、
（ｉ）前記対照対象から得られる前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは
（ｉｉ）前記対照対象から得られる前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは
（ｉｉｉ）前記対照対象から得られる前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベル
と比較する比率であり、前記対照対象が、前記対照対象にショックを与えたことがないＩＣＤを有することが既知の対象であるか；
（ｉｖ）Ｒ Ｔ が、μ＋Ｘσに等しく、式中、μは、１セットのデータ値のガウス分布の平均値であり、前記セットの各データ値は、対照対象から得られる生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、
（ｉ）前記対照対象から得られる前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは
（ｉｉ）前記対照対象から得られる前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは
（ｉｉｉ）前記対照対象から得られる前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベル
と比較する比率を表し、前記対照対象は、前記対照対象にショックを与えたことがないＩＣＤを有することが既知の対象であり、σは、前記データ値のガウス分布の標準偏差であり、Ｘは、０．７〜４．０の間の数であるか；あるいは
（ｖ）Ｒ Ｔ が、μ−Ｘσに等しく、式中、μは、１セットのデータ値のガウス分布の平均値であり、前記セットの各データ値は、比率を表し、前記対照対象は、前記対照対象にショックを与えたことがないＩＣＤを有することが既知の対象であり、前記対照対象は、前記対照対象にショックを与えたことのあるＩＣＤを有することが既知の対象であり、σは、前記データ値のガウス分布の標準偏差であり、Ｘは、０．７〜４．０の間の数である、請求項１に記載の方法。 (I) RT is the level of a truncated SCN5A exon 28 transcript in a biological sample obtained from a control subject,
(I) the level of full length SCN5A exon 28 transcript of the biological sample obtained from the control subject or (ii) the level of total SCN5A exon 28 transcript of the biological sample obtained from the control subject or (iii) the control A ratio relative to the level of full length SCN5A exon 28 transcript and the level of one or more truncated SCN5A exon 28 transcript of said biological sample obtained from a subject;
The control subject is
(I) has no ICD,
(Ii) not heart disease,
(Iii) has normal left ventricular function,
(Iv) Is the subject known to have no dysfunction or (v) a combination thereof ;
(Ii) R T is equal to μ + 4.0σ,
Where μ is the average value of a Gaussian distribution of a set of data values,
Each data value in the set represents the level of truncated SCN5A exon 28 transcript in a biological sample obtained from a control subject,
(I) the level of full length SCN5A exon 28 transcript of the biological sample obtained from the control subject or
(Ii) the level of total SCN5A exon 28 transcript of the biological sample obtained from the control subject or
(Iii) the level of full-length SCN5A exon 28 transcript and the level of one or more truncated SCN5A exon 28 transcripts of the biological sample obtained from the control subject
Represents the ratio to be compared with
The control subject is
(I) has no ICD,
(Ii) not heart disease,
(Iii) has normal left ventricular function,
(Iv) There is no extended function failure, or
(V) These combinations
Whether σ is the standard deviation of the Gaussian distribution of the data values;
(Iii) RT is the level of truncated SCN5A exon 28 transcript in a biological sample obtained from a control subject,
(I) the level of full length SCN5A exon 28 transcript of the biological sample obtained from the control subject or
(Ii) the level of total SCN5A exon 28 transcript of the biological sample obtained from the control subject or
(Iii) the level of full-length SCN5A exon 28 transcript and the level of one or more truncated SCN5A exon 28 transcripts of the biological sample obtained from the control subject
The control subject is a subject known to have an ICD that has never shocked the control subject;
(Iv) R T is equal to μ + Xσ, where μ is the mean of a Gaussian distribution of a set of data values, each data value of the set being a truncated SCN5A of a biological sample obtained from a control subject Exon 28 transcript levels
(I) the level of full length SCN5A exon 28 transcript of the biological sample obtained from the control subject or
(Ii) the level of total SCN5A exon 28 transcript of the biological sample obtained from the control subject or
(Iii) the level of full-length SCN5A exon 28 transcript and the level of one or more truncated SCN5A exon 28 transcripts of the biological sample obtained from the control subject
The control subject is a subject known to have an ICD that has never shocked the control subject, σ is the standard deviation of the Gaussian distribution of the data values, and X Is a number between 0.7 and 4.0; or
(V) R T is equal to μ−Xσ, where μ is the mean of a Gaussian distribution of a set of data values, each data value of the set represents a ratio, and the control subject is The subject is known to have an ICD that has not shocked the control subject, the control subject is a subject known to have an ICD that has shocked the control subject, and σ The method of claim 1 , wherein is a standard deviation of a Gaussian distribution of the data values, and X is a number between 0.7 and 4.0 .
（ｉ）約０．７〜約１．０の間の数であるか、
（ｉｉ）約２．０〜４．０の間の数であるか、または
（ｉｉｉ）Ｘが、約２．３２６〜約４．０の間の数である、請求項２の項目（ｖ）に記載の方法。 R T = μ−Xσ, where μ is the average value of a Gaussian distribution of a set of data values, each data value of the set represents a ratio, and the control subject is the control subject The subject is known to have an ICD that has never shocked, the control subject is a subject known to have an ICD that has shocked the control subject, and σ is the data Is the standard deviation of the Gaussian distribution of values, X is a number between 0.7 and 4.0, and X is
(I) a number between about 0.7 and about 1.0 ,
(Ii) a number between about 2.0 and 4.0, or
(Iii) The method of item (v) of claim 2 , wherein X is a number between about 2.326 and about 4.0 .
（Ｂ）ＲＴが決定されるとき、前記対象から得られる（ｉ）前記生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉｉ）前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルが、前記対照対象から得られる前記生体試料のハウスキーピング遺伝子のレベルに対し正規化される、あるいは
（Ｃ）（Ａ）と（Ｂ）との両方であり、場合によって、前記ハウスキーピング遺伝子が、グリセルアルデヒド−３−リン酸デヒドロゲナーゼ（ＧＡＰＤＨ）またはβ−アクチンである、請求項１〜３のうちのいずれか一項に記載の方法。 (A) when RS is determined, obtained from said subject (i) the level of truncated SCN5A exon 28 transcript of said biological sample or (ii) the level of full-length SCN5A exon 28 transcript of said biological sample or (Iii) the level of total SCN5A exon 28 transcript in the biological sample is normalized to the level of housekeeping genes in the biological sample obtained from the subject;
(B) when RT is determined, obtained from said subject (i) the level of truncated SCN5A exon 28 transcript of said biological sample or (ii) the level of full-length SCN5A exon 28 transcript of said biological sample or (Iii) the level of total SCN5A exon 28 transcript in the biological sample is normalized to the level of housekeeping gene in the biological sample obtained from the control subject, or (C) (A) and (B) both der is, if the by, the housekeeping gene is glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH) or β- actin claimed in any one of 請 Motomeko 1-3 and the method of.
であり、式中、
切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２−ΔΔＣｔ切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２−ΔΔＣｔ完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
ΔΔＣｔ完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物＝ΔＣｔ完全長−ΔＣｔハウスキーピング遺伝子
ΔΔＣｔ切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物＝ΔＣｔ切断型−ΔＣｔハウスキーピング遺伝子
ΔＣｔ完全長＝（［対象試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ切断型＝（［対象試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔハウスキーピング遺伝子＝（［対象試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］−［対照試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］）であり、
「対象試料」は、前記対象から得られる生体試料であり、
「対照試料」は、
（ｉ）ＩＣＤを有していない、
（ｉｉ）心臓病ではない、
（ｉｉｉ）正常な左心室機能を有する、
（ｉｖ）拡張機能障害がない、または
（ｖ）これらの組み合わせ
であることが既知の対照対象から得られる生体試料であり、
「完全長」は、ＷＴ ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物もしくはＥ２８Ａ−Ｓ転写産物またはＷＴ ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物およびＥ２８Ａ−Ｓ転写産物の両方を指す、
あるいはＲＳが、
であり、式中、
切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２−ΔΔＣｔ切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２−ΔΔＣｔ全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
ΔΔＣｔ全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物＝ΔＣｔ全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物−ΔＣｔハウスキーピング遺伝子
ΔΔＣｔ切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物＝ΔＣｔ切断型−ΔＣｔハウスキーピング遺伝子
ΔＣｔ全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物＝（［対象試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ切断型＝（［対象試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔハウスキーピング遺伝子＝（［対象試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］−［対照試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］）であり、
「対象試料」は、前記対象から得られる生体試料であり、
「対照試料」は、
（ｉ）ＩＣＤを有していない、
（ｉｉ）心臓病ではない、
（ｉｉｉ）正常な左心室機能を有する、
（ｉｖ）拡張機能障害がない、または
（ｖ）これらの組み合わせ
であることが既知の対照対象から得られる生体試料であり、
「全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物」は、ＷＴ、Ｅ２８Ａ−Ｓ、Ｅ２８Ｂ、Ｅ２８ＣおよびＥ２８Ｄの全てを指す、
請求項１〜４のうちのいずれか一項に記載の方法。 R S is
Where
Calibration abundance of truncated SCN5A exon 28 transcript = 2- ΔΔCt truncated SCN5A exon 28 transcript
Calibration abundance of full length SCN5A exon 28 transcript = 2- ΔΔCt full length SCN5A exon 28 transcript
ΔΔCt full length SCN5A exon 28 transcript = ΔCt full length −ΔCt housekeeping gene
ΔΔCt truncated SCN5A exon 28 transcript = ΔCt truncated −ΔCt housekeeping gene
ΔCt full length = ([Ct of full length SCN5A exon 28 transcript of subject sample] − [Ct of full length SCN5A exon 28 transcript of control sample])
ΔCt cleavage type = ([Ct of the cleaved SCN5A exon 28 transcript of the target sample] − [Ct of the cleaved SCN5A exon 28 transcript of the control sample])
ΔCt housekeeping gene = ([Ct of housekeeping gene of target sample] − [Ct of housekeeping gene of control sample])
"Target sample" is a biological sample obtained from the target,
The “control sample”
(I) has no ICD,
(Ii) not heart disease,
(Iii) has normal left ventricular function,
(Iv) a biological sample obtained from a control subject known not to have diastolic dysfunction, or (v) a combination thereof,
“Full length” refers to WT SCN5A exon 28 transcript or E28A-S transcript or both WT SCN5A exon 28 transcript and E28A-S transcript.
Or R S is
Where
Calibration abundance of truncated SCN5A exon 28 transcript = 2- ΔΔCt truncated SCN5A exon 28 transcript
Calibration abundance of total SCN5A exon 28 transcript = 2- ΔΔCt total SCN5A exon 28 transcript
ΔΔCt total SCN5A exon 28 transcript = ΔCt total SCN5A exon 28 transcript -ΔCt housekeeping gene
ΔΔCt truncated SCN5A exon 28 transcript = ΔCt truncated −ΔCt housekeeping gene
ΔCt total SCN5A exon 28 transcript = ([Ct of all SCN5A exon 28 transcripts of subject sample] − [Ct of all SCN5A exon 28 transcripts of control sample])
ΔCt cleavage type = ([Ct of the cleaved SCN5A exon 28 transcript of the target sample] − [Ct of the cleaved SCN5A exon 28 transcript of the control sample])
ΔCt housekeeping gene = ([Ct of housekeeping gene of target sample] − [Ct of housekeeping gene of control sample])
"Target sample" is a biological sample obtained from the target,
The “control sample”
(I) has no ICD,
(Ii) not heart disease,
(Iii) has normal left ventricular function,
(Iv) a biological sample obtained from a control subject known not to have diastolic dysfunction, or (v) a combination thereof,
“Total SCN5A exon 28 transcript” refers to all of WT, E28A-S, E28B, E28C and E28D.
The method according to any one of the 請 Motomeko 1-4.
であり、式中、
切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２−ΔΔＣｔ切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２−ΔΔＣｔ完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
ΔΔＣｔ完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物＝ΔＣｔ完全長−ΔＣｔハウスキーピング遺伝子
ΔΔＣｔ切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物＝ΔＣｔ切断型−ΔＣｔハウスキーピング遺伝子
ΔＣｔ完全長＝（［ＩＣＤ患者（−）ショックの完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ切断型＝（［ＩＣＤ患者（−）ショックの切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔハウスキーピング遺伝子＝（［ＩＣＤ患者（−）ショックのハウスキーピング遺伝子のＣｔ］−［対照試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］）であり、
「ＩＣＤ患者（−）ショック」は、ショックを与えたことがないＩＣＤを有することが既知の対象から得られる生体試料であり、
「対照試料」は、
（ｉ）ＩＣＤを有していない、
（ｉｉ）心臓病ではない、
（ｉｉｉ）正常な左心室機能を有する、
（ｉｖ）拡張機能障害がない、または
（ｖ）これらの組み合わせ
であることが既知の対照対象から得られる生体試料であり、
「完全長」は、ＷＴ ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物もしくはＥ２８Ａ−Ｓ転写産物またはＷＴ ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物およびＥ２８Ａ−Ｓ転写産物の両方を指す、
あるいは、ＲＴ＝μ＋Ｘσである場合、前記対照対象から得られる前記生体試料の前記比率＝
であり、式中、
切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２−ΔΔＣｔ切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２−ΔΔＣｔ全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
ΔΔＣｔ全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物＝ΔＣｔ全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物−ΔＣｔハウスキーピング遺伝子
ΔΔＣｔ切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物＝ΔＣｔ切断型−ΔＣｔハウスキーピング遺伝子
ΔＣｔ全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物＝（［ＩＣＤ患者（−）ショックの全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ切断型＝（［ＩＣＤ患者（−）ショックの切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔハウスキーピング遺伝子＝（［ＩＣＤ患者（−）ショックのハウスキーピング遺伝子のＣｔ］−［対照試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］）であり、
「ＩＣＤ患者（−）ショック」は、ショックを与えたことがないＩＣＤを有することが既知の対象から得られる生体試料であり、
「対照試料」は、
（ｉ）ＩＣＤを有していない、
（ｉｉ）心臓病ではない、
（ｉｉｉ）正常な左心室機能を有する、
（ｉｖ）拡張機能障害がない、または
（ｖ）これらの組み合わせ
であることが既知の対照対象から得られる生体試料であり、
「全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物」は、ＷＴ、Ｅ２８Ａ−Ｓ、Ｅ２８Ｂ、Ｅ２８ＣおよびＥ２８Ｄの全てを指す、
請求項２の項目（ｉｖ）、４および５のいずれか一項に記載の方法。 When R T = μ + Xσ, the ratio of the biological sample obtained from the control subject =
Where
Calibration abundance of truncated SCN5A exon 28 transcript = 2- ΔΔCt truncated SCN5A exon 28 transcript
Calibration abundance of full length SCN5A exon 28 transcript = 2- ΔΔCt full length SCN5A exon 28 transcript
ΔΔCt full length SCN5A exon 28 transcript = ΔCt full length −ΔCt housekeeping gene
ΔΔCt truncated SCN5A exon 28 transcript = ΔCt truncated −ΔCt housekeeping gene
ΔCt full length = ([ICt patient (−) full length SCN5A exon 28 transcript Ct of shock] − [control sample full length SCN5A exon 28 transcript Ct])
ΔCt truncation type = ([Ct of ICD patient (−) shock truncation SCN5A exon 28 transcript] − [Ct of truncation SCN5A exon 28 transcript of control sample])
ΔCt housekeeping gene = ([Ct of housekeeping gene of ICD patient (−) shock] − [Ct of housekeeping gene of control sample])
An “ICD patient (−) shock” is a biological sample obtained from a subject known to have an ICD that has never shocked,
The “control sample”
(I) has no ICD,
(Ii) not heart disease,
(Iii) has normal left ventricular function,
(Iv) a biological sample obtained from a control subject known not to have diastolic dysfunction, or (v) a combination thereof,
“Full length” refers to WT SCN5A exon 28 transcript or E28A-S transcript or both WT SCN5A exon 28 transcript and E28A-S transcript.
Alternatively, if R T = μ + Xσ, the ratio of the biological sample obtained from the control subject =
Where
Calibration abundance of truncated SCN5A exon 28 transcript = 2- ΔΔCt truncated SCN5A exon 28 transcript
Calibration abundance of total SCN5A exon 28 transcript = 2- ΔΔCt total SCN5A exon 28 transcript
ΔΔCt total SCN5A exon 28 transcript = ΔCt total SCN5A exon 28 transcript -ΔCt housekeeping gene
ΔΔCt truncated SCN5A exon 28 transcript = ΔCt truncated −ΔCt housekeeping gene
ΔCt total SCN5A exon 28 transcript = ([Ct of all SCN5A exon 28 transcripts in ICD patients (-) shock]-[Ct of all SCN5A exon 28 transcripts in control sample])
ΔCt truncation type = ([Ct of ICD patient (−) shock truncation SCN5A exon 28 transcript] − [Ct of truncation SCN5A exon 28 transcript of control sample])
ΔCt housekeeping gene = ([Ct of housekeeping gene of ICD patient (−) shock] − [Ct of housekeeping gene of control sample])
An “ICD patient (−) shock” is a biological sample obtained from a subject known to have an ICD that has never shocked,
The “control sample”
(I) has no ICD,
(Ii) not heart disease,
(Iii) has normal left ventricular function,
(Iv) a biological sample obtained from a control subject known not to have diastolic dysfunction, or (v) a combination thereof,
“Total SCN5A exon 28 transcript” refers to all of WT, E28A-S, E28B, E28C and E28D.
6. The method according to any one of items (iv), 4 and 5 of claim 2 .
であり、式中、
切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２−ΔΔＣｔ切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２−ΔΔＣｔ完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
ΔΔＣｔ完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物＝ΔＣｔ完全長−ΔＣｔハウスキーピング遺伝子
ΔΔＣｔ切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物＝ΔＣｔ切断型−ΔＣｔハウスキーピング遺伝子
ΔＣｔ完全長＝（［ＩＣＤ患者（＋）ショックの完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ切断型＝（［ＩＣＤ患者（＋）ショックの切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔハウスキーピング遺伝子＝（［ＩＣＤ患者（＋）ショックのハウスキーピング遺伝子のＣｔ］−［対照試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］）であり、
「ＩＣＤ患者（＋）ショック」は、ショックを与えたことのあるＩＣＤを有することが既知の対象から得られる生体試料であり、
「対照試料」は、
（ｉ）ＩＣＤを有していない、
（ｉｉ）心臓病ではない、
（ｉｉｉ）正常な左心室機能を有する、
（ｉｖ）拡張機能障害がない、または
（ｖ）これらの組み合わせ
であることが既知の対照対象から得られる生体試料であり、
「完全長」は、ＷＴ ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物もしくはＥ２８Ａ−Ｓ転写産物またはＷＴ ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物およびＥ２８Ａ−Ｓ転写産物の両方を指す、
あるいはＲＴ＝μ−Ｘσである場合、前記対照対象から得られる前記生体試料の前記比率が、
であり、式中、
切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２−ΔΔＣｔ切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２−ΔΔＣｔ全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
ΔΔＣｔ全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物＝ΔＣｔ全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物−ΔＣｔハウスキーピング遺伝子
ΔΔＣｔ切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物＝ΔＣｔ切断型−ΔＣｔハウスキーピング遺伝子
ΔＣｔ全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物＝（［ＩＣＤ患者（＋）ショックの全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ切断型＝（［ＩＣＤ患者（＋）ショックの切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔハウスキーピング遺伝子＝（［ＩＣＤ患者（＋）ショックのハウスキーピング遺伝子のＣｔ］−［対照試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］）であり、
「ＩＣＤ患者（＋）ショック」は、ショックを与えたことのあるＩＣＤを有することが既知の対象から得られる生体試料であり、
「対照試料」は、
（ｉ）ＩＣＤを有していない、
（ｉｉ）心臓病ではない、
（ｉｉｉ）正常な左心室機能を有する、
（ｉｖ）拡張機能障害がない、または
（ｖ）これらの組み合わせ
であることが既知の対照対象から得られる生体試料であり、
「全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物」は、ＷＴ、Ｅ２８Ａ−Ｓ、Ｅ２８Ｂ、Ｅ２８ＣおよびＥ２８Ｄの全てを指す、
請求項２の項目（ｖ）、３、４および５のいずれか一項に記載の方法。 When R T = μ−Xσ, the ratio of the biological sample obtained from the control subject is
Where
Calibration abundance of truncated SCN5A exon 28 transcript = 2- ΔΔCt truncated SCN5A exon 28 transcript
Calibration abundance of full length SCN5A exon 28 transcript = 2- ΔΔCt full length SCN5A exon 28 transcript
ΔΔCt full length SCN5A exon 28 transcript = ΔCt full length −ΔCt housekeeping gene
ΔΔCt truncated SCN5A exon 28 transcript = ΔCt truncated −ΔCt housekeeping gene
ΔCt full length = ([Ct of full length SCN5A exon 28 transcript of ICD patient (+) shock] − [Ct of full length SCN5A exon 28 transcript of control sample])
ΔCt truncation type = ([Ct of ICD patient (+) shock truncation SCN5A exon 28 transcript] − [Ct of truncation SCN5A exon 28 transcript of control sample])
ΔCt housekeeping gene = ([Ct of housekeeping gene of ICD patient (+) shock] − [Ct of housekeeping gene of control sample])
An “ICD patient (+) shock” is a biological sample obtained from a subject known to have an ICD that has shocked,
The “control sample”
(I) has no ICD,
(Ii) not heart disease,
(Iii) has normal left ventricular function,
(Iv) a biological sample obtained from a control subject known not to have diastolic dysfunction, or (v) a combination thereof,
“Full length” refers to WT SCN5A exon 28 transcript or E28A-S transcript or both WT SCN5A exon 28 transcript and E28A-S transcript.
Alternatively, if R T = μ−Xσ, the ratio of the biological sample obtained from the control subject is
Where
Calibration abundance of truncated SCN5A exon 28 transcript = 2- ΔΔCt truncated SCN5A exon 28 transcript
Calibration abundance of total SCN5A exon 28 transcript = 2- ΔΔCt total SCN5A exon 28 transcript
ΔΔCt total SCN5A exon 28 transcript = ΔCt total SCN5A exon 28 transcript -ΔCt housekeeping gene
ΔΔCt truncated SCN5A exon 28 transcript = ΔCt truncated −ΔCt housekeeping gene
ΔCt total SCN5A exon 28 transcript = ([Ct of all SCN5A exon 28 transcripts in ICD patient (+) shock]-[Ct of all SCN5A exon 28 transcripts in control sample])
ΔCt truncation type = ([Ct of ICD patient (+) shock truncation SCN5A exon 28 transcript] − [Ct of truncation SCN5A exon 28 transcript of control sample])
ΔCt housekeeping gene = ([Ct of housekeeping gene of ICD patient (+) shock] − [Ct of housekeeping gene of control sample])
An “ICD patient (+) shock” is a biological sample obtained from a subject known to have an ICD that has shocked,
The “control sample”
(I) has no ICD,
(Ii) not heart disease,
(Iii) has normal left ventricular function,
(Iv) a biological sample obtained from a control subject known not to have diastolic dysfunction, or (v) a combination thereof,
“Total SCN5A exon 28 transcript” refers to all of WT, E28A-S, E28B, E28C and E28D.
The method according to any one of items (v), 3, 4 and 5 of claim 2 .
（Ｂ）前記切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の前記レベルが、ＷＴ ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物、Ｅ２８Ａ−Ｓ、Ｅ２８Ｂ、Ｅ２８ＣおよびＥ２８Ｄの全てのレベルと比較されるか；
（Ｃ）前記切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の前記レベルが、（１）および（２）のレベルと比較され、
（１）が、（ｉ）ＷＴ ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベル、（ｉｉ）Ｅ２８Ａ−Ｓのレベルまたは（ｉｉｉ）（ｉ）と（ｉｉ）との組み合わせのうちの１つであり、
（２）が、Ｅ２８Ｂ、Ｅ２８ＣおよびＥ２８Ｄのうちの１または複数である、
請求項１〜９のうちのいずれか一項に記載の方法。 (A) the level of the truncated SCN5A exon 28 transcript is (i) the level of WT SCN5A exon 28 transcript, (ii) the level of E28A-S or (iii) a combination of (i) and (ii) Compared to ;
(B) is the level of the truncated SCN5A exon 28 transcript compared to all levels of WT SCN5A exon 28 transcript, E28A-S, E28B, E28C and E28D;
(C) the level of the truncated SCN5A exon 28 transcript is compared to the levels of (1) and (2);
(1) is one of (i) a level of WT SCN5A exon 28 transcript, (ii) a level of E28A-S or (iii) a combination of (i) and (ii);
(2) is one or more of E28B, E28C and E28D,
The method according to any one of the 請 Motomeko 1-9.
Ｒ Ｓ ＝Ｒ Ｅ２８Ｃ ＝
であり、式中、
Ｅ２８Ｃ転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔＥ２８Ｃ転写産物
完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔ完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
ΔΔＣｔ 完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝ΔＣｔ 完全長 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔΔＣｔ Ｅ２８Ｃ転写産物 ＝ΔＣｔ Ｅ２８Ｃ転写産物 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔＣｔ 完全長 ＝（［対象試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照
試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ Ｅ２８Ｃ ＝（［対象試料のＥ２８Ｃ転写産物のＣｔ］−［対照試料のＥ２８Ｃ転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子 ＝（［対象試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］−［対照試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］）であり、
「対象試料」は、前記対象から得られる生体試料であり、
「対照試料」は、
（ｉ）ＩＣＤを有していない、
（ｉｉ）心臓病ではない、
（ｉｉｉ）正常な左心室機能を有する、
（ｉｖ）拡張機能障害がない、または
（ｖ）これらの組み合わせ
であることが既知の対照対象から得られる生体試料であり、
「完全長」は、ＷＴ ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物もしくはＥ２８Ａ−Ｓ転写産物またはＷＴ ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物およびＥ２８Ａ−Ｓ転写産物の両方を指す、
あるいはＲ Ｅ２８Ｃ ＝
であり、式中、
Ｅ２８Ｃ転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔＥ２８Ｃ転写産物
全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔ全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
ΔΔＣｔ 全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝ΔＣｔ 全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔΔＣｔ Ｅ２８Ｃ転写産物 ＝ΔＣｔ Ｅ２８Ｃ転写産物 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔＣｔ 全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝（［対象試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ Ｅ２８Ｃ ＝（［対象試料のＥ２８Ｃ転写産物のＣｔ］−［対照試料のＥ２８Ｃ転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子 ＝（［対象試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］−［対照試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］）であり、
「対象試料」は、前記対象から得られる生体試料であり、
「対照試料」は、
（ｉ）ＩＣＤを有していない、
（ｉｉ）心臓病ではない、
（ｉｉｉ）正常な左心室機能を有する、
（ｉｖ）拡張機能障害がない、または
（ｖ）これらの組み合わせ
であることが既知の対照対象から得られる生体試料であり、
「全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物」は、ＷＴ、Ｅ２８Ａ−Ｓ、Ｅ２８Ｂ、Ｅ２８ＣおよびＥ２８Ｄの全てを指す、
請求項１０の項目（Ａ）または（Ｂ）に記載の方法。 The truncated SCN5A exon 28 transcript, E28C der is, optionally,
R S = R E28C =
Where
Calibration abundance of E28C transcript = 2- ΔΔCtE28C transcript
Calibration abundance of full length SCN5A exon 28 transcript = 2- ΔΔCt full length SCN5A exon 28 transcript
ΔΔCt full length SCN5A exon 28 transcripts = ACt full length -ΔCt housekeeping genes
ΔΔCt E28C transcripts = ΔCt E28C transcripts -ΔCt housekeeping gene
ΔCt full length = ([Ct of full length SCN5A exon 28 transcript of subject sample] − [control
Ct of sample full length SCN5A exon 28 transcript])
ΔCt E28C = ([Ct of E28C transcript of target sample] − [Ct of E28C transcript of control sample])
ΔCt housekeeping gene = ([Ct of housekeeping gene of target sample] − [Ct of housekeeping gene of control sample])
"Target sample" is a biological sample obtained from the target,
The “control sample”
(I) has no ICD,
(Ii) not heart disease,
(Iii) has normal left ventricular function,
(Iv) There is no extended function failure, or
(V) These combinations
A biological sample obtained from a control subject known to be
“Full length” refers to WT SCN5A exon 28 transcript or E28A-S transcript or both WT SCN5A exon 28 transcript and E28A-S transcript.
Or R E28C =
Where
Calibration abundance of E28C transcript = 2- ΔΔCtE28C transcript
Calibration abundance of total SCN5A exon 28 transcript = 2- ΔΔCt total SCN5A exon 28 transcript
ΔΔCt all SCN5A exon 28 transcripts = ΔCt all SCN5A exon 28 transcripts -ΔCt housekeeping gene
ΔΔCt E28C transcripts = ΔCt E28C transcripts -ΔCt housekeeping gene
ΔCt total SCN5A exon 28 transcript = ([Ct of all SCN5A exon 28 transcripts of subject sample] − [Ct of all SCN5A exon 28 transcripts of control sample])
ΔCt E28C = ([Ct of E28C transcript of target sample] − [Ct of E28C transcript of control sample])
ΔCt housekeeping gene = ([Ct of housekeeping gene of target sample] − [Ct of housekeeping gene of control sample])
"Target sample" is a biological sample obtained from the target,
The “control sample”
(I) has no ICD,
(Ii) not heart disease,
(Iii) has normal left ventricular function,
(Iv) There is no extended function failure, or
(V) These combinations
A biological sample obtained from a control subject known to be
“Total SCN5A exon 28 transcript” refers to all of WT, E28A-S, E28B, E28C and E28D .
The method according to item (A) or (B) of claim 10 .
Ｒ Ｓ ＝Ｒ Ｅ２８Ｄ ＝
であり、式中、
Ｅ２８Ｄ転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔＥ２８Ｄ転写産物
完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔ完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
ΔΔＣｔ 完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝ΔＣｔ 完全長 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔΔＣｔ Ｅ２８Ｄ転写産物 ＝ΔＣｔ Ｅ２８Ｄ転写産物 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔＣｔ 完全長 ＝（［対象試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ Ｅ２８Ｄ ＝（［対象試料のＥ２８Ｄ転写産物のＣｔ］−［対照試料のＥ２８Ｄ転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子 ＝（［対象試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］−［対照試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］）であり、
「対象試料」は、前記対象から得られる生体試料であり、
「対照試料」は、
（ｉ）ＩＣＤを有していない、
（ｉｉ）心臓病ではない、
（ｉｉｉ）正常な左心室機能を有する、
（ｉｖ）拡張機能障害がない、または
（ｖ）これらの組み合わせ
であることが既知の対照対象から得られる生体試料であり、
「完全長」は、ＷＴ ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物もしくはＥ２８Ａ−Ｓ転写産物またはＷＴ ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物およびＥ２８Ａ−Ｓ転写産物の両方を指す、
あるいはＲ Ｅ２８Ｄ ＝
であり、式中、
Ｅ２８Ｄ転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔＥ２８Ｄ転写産物
全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物の較正存在量＝２ −ΔΔＣｔ全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物
ΔΔＣｔ 全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝ΔＣｔ 全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔΔＣｔ Ｅ２８Ｄ転写産物 ＝ΔＣｔ Ｅ２８Ｄ転写産物 −ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子
ΔＣｔ 全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物 ＝（［対象試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］−［対照試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ Ｅ２８Ｄ ＝（［対象試料のＥ２８Ｄ転写産物のＣｔ］−［対照試料のＥ２８Ｄ転写産物のＣｔ］）
ΔＣｔ ハウスキーピング遺伝子 ＝（［対象試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］−［対照試料のハウスキーピング遺伝子のＣｔ］）であり、
「対象試料」は、前記対象から得られる生体試料であり、
「対照試料」は、
（ｉ）ＩＣＤを有していない、
（ｉｉ）心臓病ではない、
（ｉｉｉ）正常な左心室機能を有する、
（ｉｖ）拡張機能障害がない、または
（ｖ）これらの組み合わせ
であることが既知の対照対象から得られる生体試料であり、
「全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物」は、ＷＴ、Ｅ２８Ａ−Ｓ、Ｅ２８Ｂ、Ｅ２８ＣおよびＥ２８Ｄの全てを指す、
請求項１０の項目（Ａ）または（Ｃ）に記載の方法。 The truncated SCN5A exon 28 transcript, E28D der is, optionally,
R S = R E28D =
Where
Calibration abundance of E28D transcript = 2- ΔΔCtE28D transcript
Calibration abundance of full length SCN5A exon 28 transcript = 2- ΔΔCt full length SCN5A exon 28 transcript
ΔΔCt full length SCN5A exon 28 transcripts = ACt full length -ΔCt housekeeping genes
ΔΔCt E28D transcripts = ΔCt E28D transcripts -ΔCt housekeeping gene
ΔCt full length = ([Ct of full length SCN5A exon 28 transcript of subject sample] − [Ct of full length SCN5A exon 28 transcript of control sample])
ΔCt E28D = ([Ct of E28D transcript of target sample] − [Ct of E28D transcript of control sample])
ΔCt housekeeping gene = ([Ct of housekeeping gene of target sample] − [Ct of housekeeping gene of control sample])
"Target sample" is a biological sample obtained from the target,
The “control sample”
(I) has no ICD,
(Ii) not heart disease,
(Iii) has normal left ventricular function,
(Iv) There is no extended function failure, or
(V) These combinations
A biological sample obtained from a control subject known to be
“Full length” refers to WT SCN5A exon 28 transcript or E28A-S transcript or both WT SCN5A exon 28 transcript and E28A-S transcript.
Or R E28D =
Where
Calibration abundance of E28D transcript = 2- ΔΔCtE28D transcript
Calibration abundance of total SCN5A exon 28 transcript = 2- ΔΔCt total SCN5A exon 28 transcript
ΔΔCt all SCN5A exon 28 transcripts = ΔCt all SCN5A exon 28 transcripts -ΔCt housekeeping gene
ΔΔCt E28D transcripts = ΔCt E28D transcripts -ΔCt housekeeping gene
ΔCt total SCN5A exon 28 transcript = ([Ct of all SCN5A exon 28 transcripts of subject sample] − [Ct of all SCN5A exon 28 transcripts of control sample])
ΔCt E28D = ([Ct of E28D transcript of target sample] − [Ct of E28D transcript of control sample])
ΔCt housekeeping gene = ([Ct of housekeeping gene of target sample] − [Ct of housekeeping gene of control sample])
"Target sample" is a biological sample obtained from the target,
The “control sample”
(I) has no ICD,
(Ii) not heart disease,
(Iii) has normal left ventricular function,
(Iv) There is no extended function failure, or
(V) These combinations
A biological sample obtained from a control subject known to be
“Total SCN5A exon 28 transcript” refers to all of WT, E28A-S, E28B, E28C and E28D.
The method according to item (A) or (C) of claim 10 .
プロセッサと、 A processor;
前記プロセッサに連結したメモリデバイスであって、前記メモリデバイスは、前記プロセッサにより実行されると、前記プロセッサに、 A memory device coupled to the processor, the memory device being executed by the processor;
（ｉ）各データ値が、第一の集団の対象から得られる生体試料から決定された比率である複数のデータ値であって、前記比率が、対象から得られる生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、（Ａ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（Ｂ）前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（Ｃ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルと比較し、前記第一の集団の各対象が、ショックを与えたことのあるＩＣＤを有することが既知の対象である複数のデータ値を受け取らせ、 (I) Each data value is a plurality of data values that are ratios determined from a biological sample obtained from a subject of the first population, wherein the ratio is a truncated SCN5A exon 28 of the biological sample obtained from the subject. Transcript levels can be expressed as (A) full-length SCN5A exon 28 transcript level of the biological sample or (B) total SCN5A exon 28 transcript level of the biological sample or (C) full-length SCN5A exon of the biological sample. Each subject of said first population is known to have an ICD that has shocked, compared to the level of 28 transcripts and the level of one or more truncated SCN5A exon 28 transcripts Accept multiple data values,
（ｉｉ）前記複数のデータ値を第一のガウス分布に適合させ、 (Ii) fitting the plurality of data values to a first Gaussian distribution;
（ｉｉｉ）前記第一のガウス分布の平均値μおよび標準偏差σを決定させ、 (Iii) determining an average value μ and a standard deviation σ of the first Gaussian distribution;
（ｉｖ）第一の閾値比率Ｒ (Iv) First threshold ratio R ＴT を、μ−Ｘσに設定させ、式中、Ｘは、０．７〜４．０の間の数である、Is set to μ−Xσ, where X is a number between 0.7 and 4.0,
機械可読命令を記憶する、メモリデバイスと、A memory device for storing machine-readable instructions;
を含む、請求項１〜１３のうちのいずれか一項に記載の方法。The method according to claim 1, comprising:
ａ．心臓性突然死（ＳＣＤ）に関する対象のリスク、
ｂ．抗不整脈療法に関する対象の必要性、
ｃ．不整脈に関する対象のリスク、
ｄ．心不全に関する対象のリスク、
の指標とする方法であって、
Ｒ Ｓ は、対象から得られる生体試料の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、（ｉ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉ）前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉｉ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルと比較し、
前記方法は、
（Ａ）Ｒ Ｓ を決定するステップ、および
（Ｂ）Ｒ Ｓ が閾値比率Ｒ Ｔ 以上である場合、前記対象をＳＣＤ、不整脈もしくは心不全のリスクがあると決定するステップ、またはＲ Ｓ が閾値比率Ｒ Ｔ 以上である場合、前記対象を抗不整脈療法についての必要性があると決定するステップ
を含む、方法。 The ratio R S
a. Heart臓性suddenly subject to risks related to death (SCD),
b. The subject's need for antiarrhythmic therapy,
c. Subject's risk for arrhythmia,
d. The subject's risk for heart failure,
It is a method of using
R S is the level of truncated SCN5A exon 28 transcripts in a biological sample obtained from the subject, (i) the level of full-length SCN5A exon 28 transcripts of the biological sample, or (ii) the biological sample of whole SCN5A exon 28 Compared to the level of transcript or (iii) the level of full-length SCN5A exon 28 transcript and the level of one or more truncated SCN5A exon 28 transcript of said biological sample ;
The method
(A) determining RS , and
(B) if R S is the threshold value ratio R T or more, the target SCD, step determines that there is arrhythmia or heart failure risk or R S is the threshold value ratio R T or more, and the subject antiarrhythmic Determining that there is a need for therapy .
（ａ）Ｅ２８Ｃ結合剤および／またはＥ２８Ｄ結合剤、
（ｂ）ＷＴ ＳＣＮ５Ａ結合剤および／またはＥ２８Ａ−Ｓ結合剤、ならびに
使用のための説明書
を含むキット。 A kit,
(A) an E28C binder and / or an E28D binder,
(B) A kit comprising a WT SCN5A binding agent and / or an E28A-S binding agent and instructions for use.
（Ｉ）各データ値が、第一の集団の対象から得られる生体試料から決定された比率である複数のデータ値であって、前記比率が、切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルを、（ｉ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉ）前記生体試料の全ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルまたは（ｉｉｉ）前記生体試料の完全長ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルおよび１もしくは複数の切断型ＳＣＮ５Ａエクソン２８転写産物のレベルと比較し、前記第一の集団の各対象が、（Ａ）ショックを与えたＩＣＤを有することが既知の対象、または（Ｂ）ショックを与えたことがないＩＣＤを有することが既知の対象、または（Ｃ）（ａ）ＩＣＤを有していないか、（ｂ）心臓病ではないか、（ｃ）正常な左心室機能を有するか、（ｄ）拡張機能障害がないか、もしくは（ｅ）これらの組み合わせであることが既知の対象である、複数のデータ値、
（ＩＩ）前記複数のデータ値のガウス分布、
（ＩＩＩ）前記ガウス分布の平均値および標準偏差または
（ＩＶ）前記複数のデータ値の前記ガウス分布の平均値および標準偏差に基づく閾値比率ＲＴ
を記憶したコンピュータ可読記憶媒体、あるいは
（Ｖ）（Ｉ）〜（Ｖ）のうちいずれか１もしくは複数へのアクセス
を含むキット。 A kit,
(I) each data value is a plurality of data values that are ratios determined from a biological sample obtained from a subject of the first population, wherein said ratio is the level of truncated SCN5A exon 28 transcript ( i) level of full-length SCN5A exon 28 transcript in the biological sample or (ii) level of total SCN5A exon 28 transcript in the biological sample or (iii) level of full-length SCN5A exon 28 transcript in the biological sample and 1 Or compared to the levels of multiple truncated SCN5A exon 28 transcripts, each subject of the first population was (A) a subject known to have a shocked ICD , or (B) shocked Or (C) (a) not having ICD, (b) not having heart disease, (c) A plurality of data values that are known to have) normal left ventricular function; (d) no diastolic dysfunction; or (e) a combination thereof .
(II) a Gaussian distribution of the plurality of data values;
(I II) mean and standard deviation of the Gaussian or (I V) mean and threshold ratio based on the standard deviation of the Gaussian distribution of the plurality of data values R T
A computer-readable storage medium storing
(V) A kit comprising access to any one or more of (I) to (V).
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