JP2013535971A - 炎症性腸疾患をクローン病としてまたは潰瘍性大腸炎として分類するための方法 - Google Patents
炎症性腸疾患をクローン病としてまたは潰瘍性大腸炎として分類するための方法 Download PDFInfo
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Abstract
Description
本発明は、患者の炎症性腸疾患を、クローン病としてまたは潰瘍性大腸炎として分類するための方法に関する。
クローン病(CD)および潰瘍性大腸炎(UC)などの炎症性腸疾患(IBD)は、消化管の重度で再発性の免疫学的に媒介される慢性疾病である。IBDsは、共生腸内細菌のサブセットに対する過度に活動的な炎症応答をもたらす種々の遺伝的異常によって特徴づけられる不均質な疾患である。
本発明は、患者の炎症性腸疾患をCDとしてまたはUCとして分類するための方法に関し、前記方法は、患者からの試料中のmiRNAの発現プロファイルを測定する工程を含み、前記miRNAは、miR15a, miR26a, miR29a, miR29b, miR30c, miR126*, miR127-3p, miR-142-3p, miR-142-5p, miR-146a, miR-146b-5p, miR150, miR-181d, miR-182, miR185, miR196a, miR199a-3p, miR199a-5p, miR199b-5p, miR-203, miR223, miR-299-5p, miR320a, miR324-3p, miR-328である。
本発明者らの目的は、健康個体に対する、IBD患者の無活動の炎症のない大腸粘膜におけるmiRNA遺伝子発現の変化を特定することであった。従って、本発明者らは、正常な健康組織と比較して、活動的なUCおよびCDを有する患者の静止状態の粘膜におけるmiRNA遺伝子発現のパターンのゲノム全体での変化を研究した。本発明者らは静止状態の粘膜組織において高度に変化した発現を有する22個(UC)および34個(CD)のmiRNAのサブセットを同定し、10個は炎症のないUC組織およびCD組織において一般的に調節不全であった(表B)。より具体的には、本発明者らは、発現が、UC患者およびCD患者の炎症のない大腸生検材料において統計学的に差がある15個のmiRNAを選択した(表Bおよび図1参照)。これらのmiRNAおよび炎症のないUC組織およびCD組織において一般的に調節不全である10個を、その後、CDとUCとを区別するその能力について試験した。UCまたはCDとしての患者のパネルの臨床的分類に基づくと、25個のmiRNAの選択は、16人中15人の患者をその真のクラスに予測することができた(表V)。
材料および方法:
IBD患者およびコントロール:大腸ピンチ生検は、大腸内視鏡検査スクリーニングを受けた軽度から重度のCD患者およびUC患者並びに健康個体の内視鏡検査中に得られた(表I)(地域倫理委員会によって承認されたプロトコール)。
IBD組織におけるmiRNA発現の変化を調査する上での本発明者らの目的は、UC患者およびCD患者の無活動の大腸粘膜における早期の上皮細胞機能異常を説明し得る特異的な改変について確認することであった(表I)。従って、本発明者らはグレード0および1の生検材料に焦点を当てたが、グレード2〜4(炎症を有する粘膜)も、疾患の両段階の比較のために研究した。
本出願全体を通して、種々の参考文献が、本発明が属する技術分野の最新技術を記載する。これらの参考文献の開示は、本開示への参照により本明細書に組み入れられる。
Claims (4)
- クローン病としてまたは潰瘍性大腸炎として患者の炎症性腸疾患を分類するための方法であって、前記方法は、患者からの試料中のmiRNAsの発現プロファイルを測定する工程であって、ここで前記miRNAsは、miR15a, miR26a, miR29a, miR29b, miR30c, miR126*, miR127-3p, miR-142-3p, miR-142-5p, miR-146a, miR-146b-5p, miR150, miR-181d, miR-182, miR185, miR196a, miR199a-3p, miR199a-5p, miR199b-5p, miR-203, miR223, miR-299-5p, miR320a, miR324-3p, miR-328であり、そして患者の試料中の前記miRNAsの発現プロファイルを、前記miRNAsのコントロールプロファイルと比較することからなる工程であって、ここで前記発現プロファイル間の差異または類似性はクローン病または潰瘍性大腸炎を示す工程を含む、方法。
- 試料が、患者の大腸で実施された内視鏡的生検から得られる、請求項1記載の方法。
- 試料が、患者の大腸の炎症のない粘膜において単離される、請求項2記載の方法。
- 前記キットが、(i)患者から得られた試料中のmiRNAsの発現プロファイルを測定するための手段、および(ii)CDまたはUCとして前記発現プロファイルを分類するためのツールを含む、請求項1〜3のいずれか記載の方法を実施するためのキット。
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