JP2013238483A - Virtual slide device - Google Patents
Virtual slide device Download PDFInfo
- Publication number
- JP2013238483A JP2013238483A JP2012111498A JP2012111498A JP2013238483A JP 2013238483 A JP2013238483 A JP 2013238483A JP 2012111498 A JP2012111498 A JP 2012111498A JP 2012111498 A JP2012111498 A JP 2012111498A JP 2013238483 A JP2013238483 A JP 2013238483A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- region
- image
- sample
- standard data
- composition distribution
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Pending
Links
Images
Abstract
Description
本発明は、バーチャルスライド装置に関する。 The present invention relates to a virtual slide device.
病理標本のスライド画像をデジタル撮影するバーチャルスライド装置において、色再現性を向上させる技術が特許文献1に記載されている。以下、特許文献1に記載のバーチャルスライド装置について説明する。
図3は、従来知られているバーチャルスライド装置1000の構成を示した概略図である。図示する例では、光源1001の光は、ステージ1005の上に配置されたサンプル1002を透過して、対物レンズ1003を透過して、ハーフミラー1009で分岐し、一方は視野範囲選択手段1011を通してカラーセンサ1010に入射する。また、ハーフミラー1009で分岐したもう一方の光は、デジタル撮影装置1004に入射する。
FIG. 3 is a schematic diagram illustrating a configuration of a conventionally known
撮影制御手段1006は、サンプル1002の部分画像撮影のために、ステージ1005と、デジタル撮影装置1004と、カラーセンサ1010とを制御する。具体的には、撮影制御手段1006は、ステージ1005を移動させながらデジタル撮影装置1004が画像を撮影し、同時にカラーセンサ1010がスペクトル情報を取得するように制御する。なお、撮影制御手段1006は、タイリング間ののりしろができるようにステージ1005(サンプル1002)を移動しながらデジタル撮影装置1004が画像を撮像するように制御する。
The photographing
画像の貼り合わせ情報生成手段1007は、デジタル撮影装置1004から入力される部分画像の画像処理を行ってのりしろ部を認識し、画像の貼り合わせ情報を生成する。画像ファイル生成手段1008は、カラーセンサ1010の出力値と、予め保持している標準データとに基づいて、デジタル撮影装置1004が撮影した画像の色を補正する。例えば、病理サンプルの色は、染色液の染まり具合などによってサンプルごとにばらつく可能性がある。そこで、カラーセンサ1010の出力値と標準データとを用いて色補正を行うことによって、デジタル撮影装置1004が撮影した画像の色を適正に補正することができる。
The image combining
しかしながら、従来知られているバーチャルスライド装置が備えるカラーセンサのスペクトル情報取得視野は、病理サンプルの細胞核や細胞質、腔などのスペクトル情報を分離して取得するために、デジタル撮影手段の撮像領域の例えば数%程度と小さい。さらに、カラーセンサのスペクトル情報取得視野は、例えばデジタル撮影装置の画像の中心付近に固定されており、病理サンプルに含まれる特定の組織のスペクトル情報を任意に選択して取得できるものではない。そのため、取得されたスペクトル情報から色補正をする際に、サンプルによっては色補正の精度が十分ではないという問題がある。 However, the spectral information acquisition visual field of the color sensor included in the conventionally known virtual slide device is, for example, an imaging region of the digital imaging means in order to separately acquire spectral information such as the cell nucleus, cytoplasm, and cavity of the pathological sample. As small as a few percent. Furthermore, the spectral information acquisition visual field of the color sensor is fixed, for example, in the vicinity of the center of the image of the digital imaging apparatus, and it is not possible to arbitrarily select and acquire the spectral information of a specific tissue included in the pathological sample. Therefore, when performing color correction from the acquired spectrum information, there is a problem that the accuracy of color correction is not sufficient depending on the sample.
本発明は上記の問題を解決するためになされたものであり、より高精度に色補正を行うことができるバーチャルスライド装置を提供することを目的とする。 The present invention has been made to solve the above problems, and an object thereof is to provide a virtual slide device capable of performing color correction with higher accuracy.
本発明は、サンプルを設置し、撮影領域に前記サンプルを順次提示するステージと、前記サンプルを照明する光源と、前記サンプルの全体領域に含まれる第1の領域の像を第1の平面に結像させ、前記第1の領域に含まれる第2の領域からの光を第2の平面に導入させる光学系と、前記第1の平面に結像された像を撮像し、前記第1の領域の像の画像データを取得する撮像素子と、前記第2の平面に導入された光のスペクトル情報を取得するカラーセンサと、前記撮像素子が取得した前記画像データに基づいて、前記第1の領域に含まれ前記第2の領域を含む第3の領域に含まれる前記サンプルの組成分布情報を取得する組成分布取得部と、前記組成の分布状態に対応した、前記画像データの色補正に用いる標準データを複数種類記憶する記憶部と、前記組成分布取得部が取得した前記サンプルの組成分布情報に基づいて、前記記憶部が記憶する前記標準データのうち前記色補正に用いる前記標準データを選択する標準データ選択部と、前記標準データ選択部が選択した前記標準データと前記カラーセンサが取得した前記スペクトル情報とに基づいて前記画像データの色補正を行う補正処理部と、を備えることを特徴とするバーチャルスライド装置である。 According to the present invention, a stage on which a sample is set and the sample is sequentially presented in an imaging region, a light source that illuminates the sample, and an image of a first region included in the entire region of the sample are connected to a first plane. An optical system configured to image and introduce light from a second region included in the first region into a second plane; and an image formed on the first plane is captured; and the first region An image sensor that acquires image data of the image of the image, a color sensor that acquires spectral information of light introduced into the second plane, and the first region based on the image data acquired by the image sensor. A composition distribution acquisition unit for acquiring composition distribution information of the sample included in the third region including the second region, and a standard used for color correction of the image data corresponding to the distribution state of the composition Memorize multiple types of data A standard data selection unit that selects the standard data used for the color correction among the standard data stored in the storage unit, based on the composition distribution information of the sample acquired by the component distribution acquisition unit, A virtual slide device comprising: a correction processing unit that performs color correction of the image data based on the standard data selected by a standard data selection unit and the spectral information acquired by the color sensor.
また、本発明のバーチャルスライド装置において、前記組成分布取得部は、前記撮像素子が取得した前記画像データから所定の画素を間引いた間引き画像データに基づいて前記第1の領域に含まれ前記第2の領域を含む第3の領域に含まれる前記サンプルの組成分布情報を取得することを特徴とする。 In the virtual slide device of the present invention, the composition distribution acquisition unit is included in the first region based on thinned image data obtained by thinning predetermined pixels from the image data acquired by the imaging element. The composition distribution information of the sample included in the third region including the region is acquired.
また、本発明のバーチャルスライド装置において、前記撮像素子は赤色の光を検出するR画素と、緑色の光を検出するG画素と、青色の光を検出するB画素とを含み、前記組成分布取得部は、前記R画素と、前記G画素と、前記B画素とのうちいずれかの画素の出力に基づいて前記第1の領域に含まれ前記第2の領域を含む第3の領域に含まれる前記サンプルの組成分布情報を取得することを特徴とする。 In the virtual slide device of the present invention, the imaging element includes an R pixel that detects red light, a G pixel that detects green light, and a B pixel that detects blue light, and obtains the composition distribution. The unit is included in the third region including the second region and included in the first region based on the output of any one of the R pixel, the G pixel, and the B pixel. The composition distribution information of the sample is acquired.
また、本発明のバーチャルスライド装置において、前記第3の領域は、前記第1の領域と同一の領域であることを特徴とする。 In the virtual slide device of the present invention, the third area is the same area as the first area.
また、本発明のバーチャルスライド装置において、前記記憶部は、前記サンプルに細胞核が分布している状態に対応した前記標準データと、前記サンプルに細胞質が分布している状態に対応した前記標準データと、前記サンプルに組織が分布していない状態に対応した前記標準データとのうち、少なくとも1つの前記標準データを記憶することを特徴とする。 In the virtual slide device of the present invention, the storage unit includes the standard data corresponding to a state where cell nuclei are distributed in the sample, and the standard data corresponding to a state where cytoplasm is distributed in the sample. In addition, at least one standard data among the standard data corresponding to a state in which no tissue is distributed in the sample is stored.
本発明によれば、ステージは、サンプルを設置し、撮影領域にサンプルを順次提示する。また、光源は、サンプルを照明する。また、光学系は、サンプルの全体領域に含まれる第1の領域の像を第1の平面に結像させ、第1の領域に含まれる第2の領域からの光を第2の平面に導入させる。また、撮像素子は、第1の平面に結像された像を撮像し、第1の領域の像の画像データを取得する。また、カラーセンサは、第2の平面に導入された光のスペクトル情報を取得する。また、組成分布取得部は、撮像素子が取得した画像データに基づいて、第1の領域に含まれ第2の領域を含む第3の領域に含まれるサンプルの組成分布情報を取得する。また、記憶部は、組成の分布状態に対応した、画像データの色補正に用いる標準データを複数種類記憶する。また、標準データ選択部は、組成分布取得部が取得したサンプルの組成分布情報に基づいて、記憶部が記憶する標準データのうち色補正に用いる前記標準データを選択する。また、補正処理部は、標準データ選択部が選択した標準データとカラーセンサが取得したスペクトル情報とに基づいて画像データの色補正を行う。 According to the present invention, the stage installs samples and sequentially presents the samples in the imaging area. The light source illuminates the sample. The optical system forms an image of the first region included in the entire region of the sample on the first plane, and introduces light from the second region included in the first region into the second plane. Let The imaging device captures an image formed on the first plane and acquires image data of the image in the first region. Further, the color sensor acquires spectral information of light introduced into the second plane. The composition distribution acquisition unit acquires the composition distribution information of the sample included in the third region that is included in the first region and includes the second region, based on the image data acquired by the imaging element. The storage unit stores a plurality of types of standard data used for color correction of image data corresponding to the distribution state of the composition. The standard data selection unit selects the standard data used for color correction from the standard data stored in the storage unit based on the sample composition distribution information acquired by the composition distribution acquisition unit. The correction processing unit performs color correction of the image data based on the standard data selected by the standard data selection unit and the spectrum information acquired by the color sensor.
これにより、サンプルの組成分布に応じた標準データとカラーセンサが取得したスペクトル情報とに基づいて画像データの色補正を行うことができるため、より高精度に色補正を行うことができる。 Thereby, since color correction of image data can be performed based on the standard data corresponding to the composition distribution of the sample and the spectrum information acquired by the color sensor, color correction can be performed with higher accuracy.
以下、本発明の一実施形態について図面を参照して説明する。図1は、本実施形態におけるバーチャルスライド装置1の構成を示した概略図である。図示する例では、バーチャルスライド装置1は、ステージ102と、ステージ駆動部103と、光源104と、対物レンズ105と、ハーフミラー106と、撮像素子107(撮像部)と、視野領域変更部108と、カラーセンサ109と、撮像制御部110と、画像ファイル生成部111(補正処理部)と、間引き画像生成部112と、組成分布検出部113(組成分布取得部)と、記憶部114と、標準データ選択部115と、貼り合わせ情報生成部116とを備える。なお、例えば、対物レンズ105とハーフミラー106とが、請求項に係る光学系に相当する。
Hereinafter, an embodiment of the present invention will be described with reference to the drawings. FIG. 1 is a schematic diagram illustrating a configuration of a
ステージ102は、スライドガラス上にサンプル101を載置した試料を載置するための台である。ステージ駆動部103は、撮像制御部110の制御に基づいて、ステージ102を、撮像素子107の撮像面と水平な方向及び垂直な方向(三次元方向)に駆動させる。光源104は、サンプル101を照射する光を発生する。
The
対物レンズ105は、サンプル101の部分領域(第1の領域)の画像(部分画像)を拡大して撮像するために用いる対物レンズである。また、対物レンズ105は、サンプル101に対向するように配置されており、サンプル101の所定領域からの光束を集光させ、集光させた光をハーフミラー106に対して照射する。ハーフミラー106は、対物レンズ105からの光の一部を視野領域変更部108の方向に反射し、一部を透過する。
The
撮像素子107は、ハーフミラー106が透過した光を受光する位置に配置され、受光した光の強度に応じた電気信号に光電変換することで画像を撮像し、画像データを取得する。撮像素子107に入射する光はサンプル101の部分領域の光であるため、撮像素子107が取得する画像データはサンプル101の部分領域(第1の領域)の画像データである。なお、撮像素子107は、ベイヤ配列のカラーフィルタを備えている。これにより、撮像素子107が有する画素のうち、赤色の光を透過するカラーフィルタが配置された画素(R画素)は赤色の光を検出する。また、撮像素子107が有する画素のうち、緑色の光を透過するカラーフィルタが配置された画素(G画素)は緑色の光を検出する。また、撮像素子107が有する画素のうち、青色の光を透過するカラーフィルタが配置された画素(B画素)は青色の光を検出する。
The
視野領域変更部108は、ハーフミラー106とカラーセンサ109との間に配置されており、ハーフミラー106からの光のうち、一部の領域の光を遮り、一部の領域(第2の領域)の光を透過する。視野領域変更部108を透過した光は、カラーセンサ109に入射する。この構成により、カラーセンサ109の視野範囲は第2の領域となる。
The field-of-view
カラーセンサ109は、サンプル101からの光のうち、視野領域変更部108を透過した光のスペクトル情報を検出する。すなわち、カラーセンサ109は、第2の領域のスペクトル情報を検出する。なお、第2の領域は、第1の領域に含まれる領域である。撮像制御部110は、ステージ駆動部103と、対物レンズ105と、撮像素子107と、カラーセンサ109との制御を行い、サンプル101の第1の領域の画像データおよび第2の領域のスペクトル情報を取得する。具体的には、撮像制御部110は、ステージ駆動部103を制御してステージ102を移動させながら撮像素子107が画像を撮影し、同時にカラーセンサ109がスペクトル情報を取得するように制御する。なお、撮影制御部110は、タイリング間ののりしろができるようにステージ102(サンプル101)を移動しながら撮像素子107が画像(部分画像)を撮像するように制御する。
The
間引き画像生成部112は、撮像素子107が撮像した画像データから一部の画素の情報を間引き、間引き画像データを生成する。例えば、間引き画像生成部112は、撮像素子107が撮像した画像データの周辺部分の領域に含まれる画素の情報を間引き、中心部分(カラーセンサ109の視野範囲の近傍)の領域に含まれる画素の情報のみを含んだ間引き画像データを生成してもよい。また、例えば、間引き画像生成部112は、撮像素子107が撮像した画像データから所定間隔で画素の情報を間引き、画像データの全体の情報を含みつつ、画像データの情報量を削減した間引き画像データを生成してもよい。
The thinned
また、間引き画像生成部112は、例えば、R画素が出力する信号と、G画素が出力する信号と、B画素が出力する信号とのうち一部の画素が出力する信号を間引き、一部の画像が出力する信号のみを含んだ間引き画像データを生成してもよい。具体的には、撮像素子107がベイヤ配列のカラーフィルタを有している場合、例えば、R画素が出力する信号とB画素が出力する信号とを間引き、G画素が出力する信号のみを用いて間引き画像データを生成してもよい。
In addition, the thinned-out
また、間引き画像生成部112は、例えば、R画素とG画素とB画素とが出力する信号とを加算平均し、加算平均した信号を用いて間引き画像データを生成してもよい。具体的には、撮像素子107がベイヤ配列のカラーフィルタを有している場合、例えば、ベイヤ配列の単位画素格子4画素(R画素、G画素、G画素、B画素)の画素値を加算平均して1画素の値とする方法で間引き画像データを生成してもよい。また、間引き画像生成部112は、上記の複数の方法を組み合わせて間引き画像データを生成してもよい。
In addition, the thinned
図2は、本実施形態において、間引き画像生成部112が生成する間引き画像データの例を示した概略図である。図2(1)は、撮像素子107が撮像した画像データの例を示した概略図である。図示する例では、撮像素子107が撮像した画像データは、R画素が出力する信号と、G画素が出力する信号と、B画素が出力する信号とを含んでいる。図2(2)は、間引き画像生成部112が、R画素が出力する信号とB画素が出力する信号とを間引き、G画素が出力する信号のみを用いて生成した間引き画像データを示した概略図である。図示する例では、間引き画像生成部112が生成した間引き画像データは、G画素が出力する信号のみを含んでいる。また、図2(2)に示した間引き画像データの領域は、撮像素子107が撮像した画像データの領域と同様の領域である。
FIG. 2 is a schematic diagram illustrating an example of the thinned image data generated by the thinned
図2(3)は、間引き画像生成部112が、撮像素子107が撮像した画像データの周辺部分の領域に含まれる画素の情報と、R画素が出力する信号とB画素が出力する信号とを間引き、中心部分(カラーセンサ109の視野範囲の近傍)の領域に含まれるG画素の情報のみを用いて生成した間引き画像データを示した概略図である。図示する例では、間引き画像生成部112が生成した間引き画像データは、G画素が出力する信号のみを含んでいる。また、図2(2)に示した間引き画像データの領域は、撮像素子107が撮像した画像データの領域のうち中心部分の領域である。
In FIG. 2 (3), the thinned
以下、図1の説明に戻る。組成分布検出部113は、間引き画像生成部112が生成した間引き画像データに基づいて、サンプル101の部分領域(第1の領域)に含まれ、カラーセンサ109の視野範囲(第2の領域)を含む領域である第3の領域に含まれる組織の分布(組成分布)を検出する。以下、組成分布の検出方法について説明する。
Returning to the description of FIG. The composition
(1)サンプル101に含まれる組織の形状に基づいて組成分布を検出する方法
間引き画像生成部112が生成した間引き画像データに基づいて、間引き画像のコントラスト値を算出し、コントラスト値が高ければ細胞核が分布していると判定し、コントラスト値が中程度であれば細胞質が分布していると判定し、コントラスト値が低ければ腔か背景(スライド)が分布していると判定する。
(1) Method of detecting composition distribution based on the shape of tissue included in
(2)サンプル101に含まれる組織の色に基づいて組成分布を検出する方法
間引き画像生成部112が生成した間引き画像データに基づいて、間引き画像の色が赤に近ければ血管もしくは血液が分布していると判定し、濃い紫に近ければ細胞核が分布していると判定し、ピンクに近ければ細胞質が分布していると判定し、色がなく透明に近ければ背景か腔が分布していると判定する。なお、この方法を用いる場合、間引き画像生成部112が生成する間引き画像データは、色情報が間引かれていない間引き画像データである。
(2) Method of detecting composition distribution based on tissue color included in
(3)サンプル101に含まれる組織のテクスチャ(色と形状の両方)に基づいて組成分布を検出する方法
A)癌などの組織の病状の変化を検出する
a)癌の細胞は、細胞核の円形度が失われて歪な形になる。さらに通常の細胞核の色より黒ずんだ濃い色になる。そこで、間引き画像生成部112が生成した間引き画像の画素値の色情報の分布(ヒストグラム)と細胞核の円形度をパターン認識で算出し、正常な細胞が分布しているか癌細胞が分布しているか判定する。
b)組成分布の異常性に基づいて、正常な細胞が分布しているか癌細胞が分布しているか判定する。具体的には、間引き画像生成部112が生成した間引き画像に基づいてパターン認識処理を行い、間引き画像に含まれる細胞核の数を算出する。そして、一定面積内の細胞核の数が正常な場合には正常な細胞が分布していると判定し、細胞核の数が異常な場合には癌細胞が分布していると判定する。
B)肝臓、脾臓、肺などの病理サンプルの特徴に基づいて検出する
肝臓は、細胞核と細胞質が疎でもなく密でもなく腔はほとんどなく、色はピンクに近い。脾臓は、細胞核が集中する傾向があり、濃い紫の色に近い。肺は、腔が多く細胞質は少なく、白っぽい色になる傾向がある。そこで、間引き画像生成部112が生成した間引き画像に基づいて、細胞核と細胞質の分布の様子をパターン認識で抽出し、さらに色情報を取得し、分布している組織(組成分布)を判定する。
(3) Method of detecting composition distribution based on tissue texture (both color and shape) contained in sample 101 A) Detecting changes in pathology of tissues such as cancer a) Cancer cells are circular in nucleus The degree is lost and becomes distorted. Furthermore, it becomes darker and darker than the normal cell nucleus color. Therefore, the color information distribution (histogram) of the pixel values of the thinned image generated by the thinned
b) Based on the abnormality of the composition distribution, it is determined whether normal cells or cancer cells are distributed. Specifically, pattern recognition processing is performed based on the thinned image generated by the thinned
B) Detecting based on characteristics of pathological samples such as liver, spleen, lung, etc. The liver has a cell nucleus and cytoplasm that are not sparse and dense, has almost no cavity, and has a color close to pink. The spleen tends to concentrate cell nuclei and is close to a deep purple color. The lungs tend to be whitish with more cavities and less cytoplasm. Therefore, based on the thinned image generated by the thinned
以下、図1の説明に戻る。記憶部114は、分布している組織(組成分布)に基づいた標準データを複数種類記憶している。染色として例えばHE染色液などが一般に使用されるが、H染色液とE染色液の比率や量、病理サンプルの厚みの違いなどで色が変化する。そのため、条件によって染色時の色が異なっている場合においても標準的な染色状態に補正するために、各条件(部位、組成、病状など)で分類したものに対応して、事前にある病理サンプルで取得したスペクトル情報を標準データとして保存しておく。そして、バーチャルスライド装置1で画像を撮像する際に、サンプル101の組成分布情報に基づいて、記憶部114が記憶する標準データのうち色補正に用いる標準データを選択し、最も近い標準データのスペクトル情報に合うように画像の色補正を行う。記憶部114は、例えば、細胞核が分布している場合の標準データと、細胞質が分布している場合の標準データと、腔か背景(スライド)が分布している(組織が分布していない)場合の標準データとを記憶している。なお、記憶部114が記憶する標準データはこれに限らず、どのような組成分布に基づいた標準データを記憶していてもよい。また、記憶部114は予め複数種類の標準データを記憶していてもよく、記憶部114に任意に標準データを追記できるようにしてもよい。
Returning to the description of FIG. The
標準データ選択部115は、組成分布検出部113が検出し組成分布に基づいて、記憶部114が記憶する複数種類の標準データのうち、画像データの補正に用いる標準データを選択する。具体的には、例えば、組成分布検出部113が検出した組成分布が細胞質である場合、標準データ選択部115は細胞質に基づいた標準データを選択する。
The standard
貼り合わせ情報生成部116は、撮像素子107が撮像した複数枚の部分画像それぞれに対して隣接する部分画像を認識し、さらに、隣接する部分画像同士ののりしろ部を認識し、認識した結果に基づいて全ての部分画像を貼り合わせて一枚の全体画像を生成するために用いる貼り合わせ情報を生成する。
The pasting
画像ファイル生成部111は、カラーセンサ109が取得したスペクトル情報と、標準データ選択部115が選択した標準データとに基づいて、撮像素子107が撮像した部分画像の色補正を行う。以下、部分画像の色補正方法について説明する。
The image
(1)標準データ選択部115が選択した標準データと、カラーセンサ109が取得したスペクトル情報との色の差で補正値を算出する方法
画像ファイル生成部111は、カラーセンサ109が取得したスペクトル情報と、標準データのスペクトル情報の差分を計算して補正値を算出する。そして、画像ファイル生成部111は、撮像素子107が撮像した画像データを、算出した補正値を用いて補正する。これにより、画像ファイル生成部111は、撮像素子107が撮像した画像データの色をより正確に補正することができる。
なお、スペクトル情報と標準データとの差分を用いて補正値を算出する方法は、例えば特開2011−99823号広報に記載されている方法と同様の方法を用いる。
(1) A method for calculating a correction value based on a color difference between the standard data selected by the standard
In addition, the method similar to the method described in Unexamined-Japanese-Patent No. 2011-99823 public information is used for the method of calculating a correction value using the difference of spectrum information and standard data, for example.
(2)標準データ選択部115が選択した標準データと、カラーセンサ109が取得したスペクトル情報に基づいて判定した染色液の種類とに基づいて補正値を算出する方法
例えば、HE染色のように病理診断で代表的に使用される染色液はH(ヘマトキシリン)、E(イオジン)と色の分布が標準的に決まっている。染色液の色の分布をそれぞれの状態に合わせて標準データとして記憶しており、カラーセンサ109が取得したスペクトル情報と標準データとを比較することで補正値を算出する。そして、画像ファイル生成部111は、撮像素子107が撮像した画像データを、算出した補正値を用いて補正する。これにより、画像ファイル生成部111は、撮像素子107が撮像した画像データの色をより正確に補正することができる。
(2) A method for calculating a correction value based on the standard data selected by the standard
また、画像ファイル生成部111は、貼り合わせ情報生成部116が生成した貼り合わせ情報に基づいて、色補正を行った全ての部分画像を貼り合わせて一枚のサンプル画像を生成する。なお、画像ファイル生成部111は、貼り合わせ情報生成部116が生成した貼り合わせ情報に基づいて、部分画像を貼り合わせて一枚のサンプル画像を生成した後に、色補正を行ってもよい。
In addition, the image
上述した通り、本実施形態によれば、撮像素子107はサンプル101の画像データを生成する。また、間引き画像生成部112は、撮像素子107が撮像した画像データに基づいて間引き画像データを生成する。また、組成分布検出部113は、間引き画像データに基づいて、画像データに含まれる組成分布を検出する。また、標準データ選択部115は、組成分布検出部113が検出した組成分布に基づいて、画像データの補正に最適な標準データを選択する。また、画像ファイル生成部111は、標準データ選択部115が選択した標準データと、カラーセンサ109が取得したスペクトル情報とに基づいて、撮像素子107が撮像した画像データの色補正を行う。
As described above, according to the present embodiment, the
これにより、サンプル101の組成分布に応じた標準データと、カラーセンサ109が取得したスペクトル情報とに基づいて画像データの色補正を行うことができるため、より高精度に色補正を行うことができる。
As a result, the color correction of the image data can be performed based on the standard data corresponding to the composition distribution of the
以上、この発明の一実施形態について図面を参照して詳述してきたが、具体的な構成はこの実施形態に限られるものではなく、この発明の要旨を逸脱しない範囲の設計等も含まれる。 Although one embodiment of the present invention has been described in detail with reference to the drawings, the specific configuration is not limited to this embodiment, and includes design and the like within a scope not departing from the gist of the present invention.
1・・・バーチャルスライド装置、101・・・サンプル、102・・・ステージ、103・・・ステージ駆動部、104・・・光源、105・・・対物レンズ、106・・・ハーフミラー、107・・・撮像素子、108・・・視野領域変更部、109・・・カラーセンサ、110・・・撮像制御部、111・・・画像ファイル生成部、112・・・間引き画像生成部、113・・・組成分布検出部、114・・・記憶部、115・・・標準データ選択部、116・・・貼り合わせ情報生成部
DESCRIPTION OF
Claims (5)
前記サンプルを照明する光源と、
前記サンプルの全体領域に含まれる第1の領域の像を第1の平面に結像させ、前記第1の領域に含まれる第2の領域からの光を第2の平面に導入させる光学系と、
前記第1の平面に結像された像を撮像し、前記第1の領域の像の画像データを取得する撮像素子と、
前記第2の平面に導入された光のスペクトル情報を取得するカラーセンサと、
前記撮像素子が取得した前記画像データに基づいて、前記第1の領域に含まれ前記第2の領域を含む第3の領域に含まれる前記サンプルの組成分布情報を取得する組成分布取得部と、
前記組成の分布状態に対応した、前記画像データの色補正に用いる標準データを複数種類記憶する記憶部と、
前記組成分布取得部が取得した前記サンプルの組成分布情報に基づいて、前記記憶部が記憶する前記標準データのうち前記色補正に用いる前記標準データを選択する標準データ選択部と、
前記標準データ選択部が選択した前記標準データと前記カラーセンサが取得した前記スペクトル情報とに基づいて前記画像データの色補正を行う補正処理部と、
を備えることを特徴とするバーチャルスライド装置。 A stage for installing the sample and sequentially presenting the sample in the imaging area;
A light source for illuminating the sample;
An optical system for forming an image of a first region included in the entire region of the sample on a first plane, and introducing light from the second region included in the first region into the second plane; ,
An image sensor that captures an image formed on the first plane and acquires image data of the image of the first region;
A color sensor for acquiring spectral information of light introduced into the second plane;
Based on the image data acquired by the imaging device, a composition distribution acquisition unit that acquires the composition distribution information of the sample included in the third region included in the first region and including the second region;
A storage unit that stores a plurality of types of standard data used for color correction of the image data corresponding to the distribution state of the composition;
Based on the composition distribution information of the sample acquired by the composition distribution acquisition unit, a standard data selection unit that selects the standard data used for the color correction among the standard data stored by the storage unit;
A correction processing unit that performs color correction of the image data based on the standard data selected by the standard data selection unit and the spectrum information acquired by the color sensor;
A virtual slide device comprising:
ことを特徴とする請求項1に記載のバーチャルスライド装置。 The composition distribution acquisition unit is included in a third region that is included in the first region and includes the second region based on thinned image data obtained by thinning predetermined pixels from the image data acquired by the image sensor. The virtual slide device according to claim 1, wherein composition distribution information of the sample is acquired.
前記組成分布取得部は、前記R画素と、前記G画素と、前記B画素とのうちいずれかの画素の出力に基づいて前記第1の領域に含まれ前記第2の領域を含む第3の領域に含まれる前記サンプルの組成分布情報を取得する
ことを特徴とする請求項1に記載のバーチャルスライド装置。 The imaging device includes an R pixel that detects red light, a G pixel that detects green light, and a B pixel that detects blue light,
The composition distribution acquisition unit includes a third region that is included in the first region and includes the second region based on an output of any one of the R pixel, the G pixel, and the B pixel. The virtual slide device according to claim 1, wherein composition distribution information of the sample included in a region is acquired.
ことを特徴とする請求項1に記載のバーチャルスライド装置。 The virtual slide device according to claim 1, wherein the third region is the same region as the first region.
ことを特徴とする請求項1に記載のバーチャルスライド装置。 The storage unit includes the standard data corresponding to a state in which cell nuclei are distributed in the sample, the standard data corresponding to a state in which a cytoplasm is distributed in the sample, and a tissue not distributed in the sample. The virtual slide apparatus according to claim 1, wherein at least one of the standard data corresponding to a state is stored.
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2012111498A JP2013238483A (en) | 2012-05-15 | 2012-05-15 | Virtual slide device |
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP2012111498A JP2013238483A (en) | 2012-05-15 | 2012-05-15 | Virtual slide device |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2013238483A true JP2013238483A (en) | 2013-11-28 |
Family
ID=49763641
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP2012111498A Pending JP2013238483A (en) | 2012-05-15 | 2012-05-15 | Virtual slide device |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
JP (1) | JP2013238483A (en) |
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US10416469B2 (en) | 2017-08-30 | 2019-09-17 | JVC Kenwood Corporation | Imaging scanner |
-
2012
- 2012-05-15 JP JP2012111498A patent/JP2013238483A/en active Pending
Cited By (1)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US10416469B2 (en) | 2017-08-30 | 2019-09-17 | JVC Kenwood Corporation | Imaging scanner |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US9224193B2 (en) | Focus stacking image processing apparatus, imaging system, and image processing system | |
JP4921978B2 (en) | Cell culture device, image processing device, and cell detection system | |
US20160014328A1 (en) | Image processing device, endoscope apparatus, information storage device, and image processing method | |
US20160328848A1 (en) | Methods and systems for laser speckle imaging of tissue using a color image sensor | |
EP2979607A1 (en) | Image processing device, endoscopic device, program and image processing method | |
EP3333609A1 (en) | Image pickup apparatus, solid-state image pickup device, and image pickup method | |
US8854448B2 (en) | Image processing apparatus, image display system, and image processing method and program | |
US8237785B2 (en) | Automatic focusing apparatus for use in a microscope in which fluorescence emitted from a cell is captured so as to acquire a cell image, and automatic focusing method therefor | |
US11025812B2 (en) | Imaging apparatus, imaging method, and imaging system | |
US20200341252A1 (en) | Image processing apparatus and image processing method | |
US9916665B2 (en) | Cell tracking device and method, and storage medium non-transitory storing computer-readable cell tracking programs | |
JP2009219096A (en) | Image processing device, imaging device, correction coefficient calculating method, and image processing program | |
JP5943393B2 (en) | Imaging device | |
JP5698489B2 (en) | Inspection device | |
US9406118B2 (en) | Stain image color correcting apparatus, method, and system | |
EP3700195A1 (en) | Information processing device, information processing method, imaging device and program | |
CA2932985A1 (en) | Medical imaging | |
JP2016051167A (en) | Image acquisition device and control method therefor | |
JP2015035782A (en) | Image processing device, imaging device, microscope system, image processing method, and image processing program | |
JP2013238483A (en) | Virtual slide device | |
US20200074628A1 (en) | Image processing apparatus, imaging system, image processing method and computer readable recoding medium | |
CN111007020B (en) | Double-frame four-spectrum imaging method and application | |
JP2009053116A (en) | Image processor and image processing program | |
CN105359517B (en) | Image processing apparatus and image processing method | |
JP2013130686A (en) | Imaging apparatus |