JP2013198426A - Rna detective reagent, examination method, and reagent for synthesizing the rna detective reagent - Google Patents

Rna detective reagent, examination method, and reagent for synthesizing the rna detective reagent Download PDF

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晶 小野
Itaru Okamoto
到 岡本
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Abstract

PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a new RNA detective reagent capable of selectively detecting an RNA strand as a target, and to provide a reagent for synthesizing such an RNA detective reagent.SOLUTION: The new RNA detective reagent to be used comprises: an oligonucleotide having a sequence complementary to RNA as a target; a divalent linker unit with its one end condensed with the 5'-terminated hydroxy group of the oligonucleotide; a fluorescent coloring unit bound to the other end of the divalent linker unit; and a boronic acid unit bound to the fluorescent coloring unit and represented by general formula (1).

Description

本発明は、RNA検出用試薬、検査方法及びRNA検出用試薬を合成するための試薬に関する。   The present invention relates to a reagent for RNA detection, a test method, and a reagent for synthesizing a reagent for RNA detection.

ゲノムの解析は、ゲノムを構成するDNA(デオキシリボ核酸)分子の塩基配列を決定することから始まる。しかしながら、塩基配列のデータからだけでは、どこにどのような遺伝子があり、さらに特定の遺伝子が細胞内のどの場所で発現しているか等といった情報は得られない。そこで、DNAから転写して作られるmessenger RNA(mRNA;RNAはリボ核酸の略である。)や、これを翻訳して作られるタンパク質等といった遺伝子産物の解析をはじめ、生物種間で塩基配列がどれだけ似ているのか等の比較、さらに大腸菌や発芽酵母等の実験生物を使用した様々なアプローチによって解析された個々の遺伝子に関するデータ等をもとにゲノムの解析が進められる。   Genome analysis begins with determining the base sequence of the DNA (deoxyribonucleic acid) molecules that make up the genome. However, it is not possible to obtain information such as where and what gene is present, and where in the cell a specific gene is expressed, only from the data of the base sequence. Therefore, analysis of gene products such as messenger RNA (mRNA; RNA is an abbreviation of ribonucleic acid) transcribed from DNA and proteins produced by translating this, and the nucleotide sequence between species Analysis of the genome proceeds based on comparisons of how similar they are, and further on data on individual genes analyzed by various approaches using experimental organisms such as E. coli and budding yeast.

細胞核中のDNAのもつ遺伝情報はRNAへと転写される。通常、転写されたRNAは細胞質内へと移動し、タンパク質に翻訳される。こうした転写や翻訳の調節に様々な生体高分子が関わっていることが既に知られているが、近年、タンパク質に翻訳されないRNA(non−cording RNA;ncRNAとも呼ばれる。)がこれらの調節を含めた遺伝子調節に大きな役割を果たしていることがわかってきている。ncRNAは、タンパク質に翻訳されないRNAの総称であり、transfer RNA(tRNA)、ribosomal RNA(rRNA)、micro RNA(miRNA)、small interfering RNA(siRNA)等が挙げられる。   Genetic information of DNA in the cell nucleus is transcribed into RNA. Usually, the transcribed RNA moves into the cytoplasm and is translated into protein. Although it is already known that various biopolymers are involved in the regulation of such transcription and translation, recently, RNA that is not translated into protein (also referred to as non-coding RNA; ncRNA) includes these regulation. It has been found that it plays a major role in gene regulation. ncRNA is a general term for RNA that is not translated into protein, and examples include transfer RNA (tRNA), ribosomal RNA (rRNA), micro RNA (miRNA), and small interfering RNA (siRNA).

近年になり、人間を初めとする高等生物の細胞内では上記転写や翻訳に関する複雑な調節が行われているという証拠が得られてきている。これらは、RNAが、生物学において従来考えられてきたよりも広い領域で、特に遺伝子調節に用いられているという可能性を指摘するものでもある。例えば、FireやMellowらによって発見された、ncRNAの一種がもたらすRNAi現象は、線虫から人間に至るまで多くの生物で見られるものであり、他の遺伝子を制御するという重要な役割を果たしている。現在では、このRNAi現象を利用した遺伝子ノックアウト方法が分子生物学の研究において広く用いられる手法となっている(非特許文献1及び2を参照)。   In recent years, evidence has been obtained that complex regulation of transcription and translation is carried out in cells of higher organisms such as humans. These also point out the possibility that RNA is used in a wider area than previously thought in biology, especially in gene regulation. For example, the RNAi phenomenon found by Fire and Mellow et al. And caused by a type of ncRNA is found in many organisms from nematodes to humans, and plays an important role in controlling other genes. . At present, the gene knockout method using this RNAi phenomenon is widely used in molecular biology research (see Non-Patent Documents 1 and 2).

このような背景のもと、種々のncRNAについて細胞内での働きを探ること等を目的として、RNAを検出する手法の開発が盛んに行われている(例えば、特許文献1を参照)。   Against this background, techniques for detecting RNA have been actively developed for the purpose of exploring the action of various ncRNAs in cells (see, for example, Patent Document 1).

特表2007−533324号公報Special table 2007-533324 gazette

Okazaki,Y.et al.,Nature,420,563−573(2002)Okazaki, Y .; et al. , Nature, 420, 563-573 (2002). Ota,T. et al.,Nat Genet,36,40−45(2004)Ota, T .; et al. Nat Genet, 36, 40-45 (2004).

本発明は、以上の状況に鑑みてなされたものであり、標的となるRNA鎖を選択的に検出することが可能な新規のRNA検出用試薬、及びそのようなRNA検出用試薬を合成するための試薬を提供することを目的とする。   The present invention has been made in view of the above situation, and is for synthesizing a novel RNA detection reagent capable of selectively detecting a target RNA strand and such an RNA detection reagent. It is an object of the present invention to provide a reagent.

本発明者らは、鋭意検討を重ねた結果、標的となるRNAと相補的な配列をもつオリゴヌクレオチドの5’−末端に、結合基であるリンカーユニットを介して、蛍光発色基からなる蛍光発色ユニット、及び3級アミノ基とフェニルボロン酸基とを備えたボロン酸ユニットを結合させた化合物をRNA検出用試薬として使用すると、溶液中で、標的となるRNAが存在するときには、そうでないときに比べてRNA検出用試薬からの蛍光が増強されることを見出した。本発明は、以上の知見に基づき完成されたものであり、以下のものを提供する。   As a result of intensive studies, the present inventors have developed a fluorescent color developing group consisting of a fluorescent coloring group on the 5′-end of an oligonucleotide having a sequence complementary to the target RNA via a linker unit as a binding group. When a compound in which a boronic acid unit having a unit and a tertiary amino group and a phenylboronic acid group is bound is used as a reagent for RNA detection, when the target RNA is present in the solution, It was found that the fluorescence from the reagent for RNA detection was enhanced as compared. The present invention has been completed based on the above findings, and provides the following.

(1)本発明は、標的となるRNAと相補的な配列をもつオリゴヌクレオチドと、一端が前記オリゴヌクレオチドの5’−末端の水酸基と縮合した二価のリンカーユニットと、前記二価のリンカーユニットの他端に結合した蛍光発色ユニットと、前記蛍光発色ユニットに結合した下記一般式(1)で表されるボロン酸ユニットと、を備えたRNA検出用試薬である。
(上記一般式(1)中、Rは水素原子又はアルキル基であり、m及びnはそれぞれ独立に0〜4の整数である。また、上記一般式(1)で表されるボロン酸ユニットは、波線を付した単結合により前記蛍光発色ユニットに結合される。)
(1) The present invention provides an oligonucleotide having a sequence complementary to a target RNA, a divalent linker unit in which one end is condensed with a hydroxyl group at the 5′-end of the oligonucleotide, and the divalent linker unit The reagent for RNA detection provided with the fluorescence coloring unit couple | bonded with the other end of this, and the boronic acid unit represented by following General formula (1) couple | bonded with the said fluorescence coloring unit.
(In the general formula (1), R 1 is a hydrogen atom or an alkyl group, and m and n are each independently an integer of 0 to 4. The boronic acid unit represented by the general formula (1) Is bound to the fluorescent coloring unit by a single bond with a wavy line.)

(2)前記蛍光発色ユニットは、ヘテロ原子を有してもよい縮合多環芳香族化合物から水素原子でもよい置換基を2つ除いて得られる二価の有機基であることが好ましい。   (2) The fluorescent coloring unit is preferably a divalent organic group obtained by removing two substituents which may be hydrogen atoms from a condensed polycyclic aromatic compound which may have a hetero atom.

(3)上記RNA検出用試薬は、下記一般式(2)で表されることが好ましい。
(上記一般式(2)中、Nuは前記オリゴヌクレオチドから5’−末端の水酸基を除いてなる基であり、Xはヘテロ原子を有してもよい縮合多環芳香族化合物から水素原子でもよい置換基を2つ除いて得られる二価の有機基である前記蛍光発色ユニットであり、Lは2価の有機基である前記リンカーユニットであり、Rは上記一般式(1)と同様である。なお、上記一般式(2)において、NuとLとの間に存在する酸素原子は、前記オリゴヌクレオチドの5’−末端の水酸基から水素原子を除いたあとに残る酸素原子を意味する。)
(3) The RNA detection reagent is preferably represented by the following general formula (2).
(In the general formula (2), Nu is a group formed by removing the 5′-terminal hydroxyl group from the oligonucleotide, and X may be a hydrogen atom from a condensed polycyclic aromatic compound which may have a hetero atom. The fluorescent coloring unit that is a divalent organic group obtained by removing two substituents, L is the linker unit that is a divalent organic group, and R 1 is the same as in the general formula (1). In the above general formula (2), the oxygen atom present between Nu and L means the oxygen atom remaining after removing the hydrogen atom from the 5′-terminal hydroxyl group of the oligonucleotide. )

(4)上記RNA検出用試薬は、下記一般式(3)で表されることが好ましい。
(上記一般式(3)中、Nuは前記オリゴヌクレオチドから5’−末端の水酸基を除いてなる基であり、Xはヘテロ原子を有してもよい縮合多環芳香族化合物から水素原子でもよい置換基を2つ除いて得られる二価の有機基である前記蛍光発色ユニットであり、Rは上記一般式(1)と同様であり、Rは水素原子又はアルキル基であり、Zは二価の基又は単結合であり、nは1〜18の整数である。なお、上記一般式(3)において、NuとZとの間に存在する酸素原子は、前記オリゴヌクレオチドの5’−末端の水酸基から水素原子を除いたあとに残る酸素原子を意味する。)
(4) The RNA detection reagent is preferably represented by the following general formula (3).
(In the above general formula (3), Nu is a group formed by removing the 5′-terminal hydroxyl group from the oligonucleotide, and X may be a hydrogen atom from a condensed polycyclic aromatic compound which may have a hetero atom. In the fluorescent color developing unit, which is a divalent organic group obtained by removing two substituents, R 1 is the same as in the general formula (1), R 2 is a hydrogen atom or an alkyl group, and Z is It is a divalent group or a single bond, and n is an integer of 1 to 18. In the general formula (3), the oxygen atom present between Nu and Z is the 5′- of the oligonucleotide. (This means the oxygen atom remaining after removing the hydrogen atom from the terminal hydroxyl group.)

(5)上記一般式(3)におけるZは、−P(=O)(−OH)O−であることが好ましい。   (5) Z in the general formula (3) is preferably —P (═O) (— OH) O—.

(6)本発明は、上記RNA検出用試薬を検査対象に添加し、当該検査対象に紫外線又は可視光線を照射した際に、上記RNA検出用試薬の有する蛍光が増強するか否かを観察することにより上記検査対象内に標的となるRNAが含まれるか否かを判断する検査方法でもある。   (6) The present invention observes whether the fluorescence of the RNA detection reagent is enhanced when the RNA detection reagent is added to the test target and the test target is irradiated with ultraviolet rays or visible light. Thus, it is also an inspection method for determining whether or not the target RNA is included in the inspection object.

(7)本発明は、下記一般式(4)で表される、RNA検出用試薬を合成するための試薬でもある。
(上記一般式(4)中、Xはヘテロ原子を有してもよい縮合多環芳香族化合物から水素原子でもよい置換基を2つ除いて得られる二価の有機基であり、Lは2価の有機基であり、Rは水素原子又はアルキル基であり、R及びRはそれぞれ独立にボロン酸の保護基であって、R及びRは互いに結合して環を形成してもよく、Rは亜リン酸基の保護基であり、R及びRはそれぞれ独立にアルキル基であって、R及びRは互いに結合して環を形成してもよい。)
(7) This invention is also a reagent for synthesize | combining the reagent for RNA detection represented by following General formula (4).
(In the general formula (4), X is a divalent organic group obtained by removing two substituents which may be hydrogen atoms from a condensed polycyclic aromatic compound which may have a hetero atom, and L is 2 R 1 is a hydrogen atom or an alkyl group, R 3 and R 4 are each independently a boronic acid protecting group, and R 3 and R 4 are bonded to each other to form a ring. R 5 is a protecting group for the phosphite group, R 6 and R 7 are each independently an alkyl group, and R 6 and R 7 may be bonded to each other to form a ring. )

(8)上記試薬は、下記一般式(5)で表されることが好ましい。
(上記一般式(5)中、X、R、R、R、R、R及びRは上記一般式(4)と同様であり、Rは水素原子又はアルキル基であり、nは1〜18の整数である。)
(8) The reagent is preferably represented by the following general formula (5).
(In the general formula (5), X, R 1 , R 3 , R 4 , R 5 , R 6 and R 7 are the same as those in the general formula (4), and R 2 is a hydrogen atom or an alkyl group. , N is an integer of 1-18.)

本発明によれば、標的となるRNA鎖を選択的に検出することが可能な新規のRNA検出用試薬、及びそのようなRNA検出用試薬を合成するための試薬が提供される。   According to the present invention, a novel RNA detection reagent capable of selectively detecting a target RNA strand and a reagent for synthesizing such an RNA detection reagent are provided.

図1は、実施例における、(U12)+(B12)、(T12)+(B12)及び(B12)単独についての蛍光スペクトルであり、(a)はpH7.0における蛍光スペクトルであり、(b)はpH7.5における蛍光スペクトルであり、(c)はpH8.0における蛍光スペクトルである。FIG. 1 is a fluorescence spectrum for (U12) + (B12), (T12) + (B12) and (B12) alone in the example, (a) is a fluorescence spectrum at pH 7.0, (b ) Is a fluorescence spectrum at pH 7.5, and (c) is a fluorescence spectrum at pH 8.0.

以下、本発明のRNA検出用試薬、当該RNA検出用試薬を使用した検査方法、及びRNA検出用試薬を合成するための試薬についての一実施形態をそれぞれ説明する。なお、本発明は、以下の実施形態に限定されるものではなく、本発明の範囲において適宜変更を加えて実施することができる。   Hereinafter, an embodiment of the reagent for RNA detection of the present invention, a test method using the reagent for RNA detection, and a reagent for synthesizing the reagent for RNA detection will be described. The present invention is not limited to the following embodiments, and can be implemented with appropriate modifications within the scope of the present invention.

本発明のRNA検出用試薬は、標的となるRNAと相補的な配列をもつオリゴヌクレオチドと、一端が前記オリゴヌクレオチドの5’−末端の水酸基と縮合した二価のリンカーユニットと、当該二価のリンカーユニットの他端に結合した蛍光発色ユニットと、上記蛍光発色ユニットに結合した下記一般式(1)で表されるボロン酸ユニットと、を備える。本発明のRNA検出用試薬によれば、任意の塩基配列を持つRNAを選択的に検出することができる。   The RNA detection reagent of the present invention comprises an oligonucleotide having a sequence complementary to a target RNA, a divalent linker unit having one end condensed with the 5′-terminal hydroxyl group of the oligonucleotide, and the divalent linker unit. A fluorescent coloring unit bonded to the other end of the linker unit; and a boronic acid unit represented by the following general formula (1) bonded to the fluorescent coloring unit. According to the RNA detection reagent of the present invention, RNA having an arbitrary base sequence can be selectively detected.

(上記一般式(1)中、Rは水素原子又はアルキル基であり、m及びnはそれぞれ独立に0〜4の整数である。また、上記一般式(1)で表されるボロン酸ユニットは、波線を付した単結合により前記蛍光発色ユニットに結合される。) (In the general formula (1), R 1 is a hydrogen atom or an alkyl group, and m and n are each independently an integer of 0 to 4. The boronic acid unit represented by the general formula (1) Is bound to the fluorescent coloring unit by a single bond with a wavy line.)

本発明のRNA検出用試薬は、標的となるRNAと相補的な配列をもつオリゴヌクレオチドの5’−末端側に、上記一般式(1)で表されるボロン酸ユニットが結合された蛍光発色ユニットを備える。まず、本発明のRNA検出用試薬の作用を説明するために、模式的な化学反応図を下記に示す。下記の化学反応図では、一例として、蛍光発色ユニットとしてアントラセン骨格を用い、上記一般式(1)におけるRがメチル基であり、上記一般式(1)におけるm及びnが1である場合を示したが、本発明はこれに限定されるものではない。 The reagent for detecting RNA according to the present invention is a fluorescent coloring unit in which a boronic acid unit represented by the above general formula (1) is bound to the 5′-terminal side of an oligonucleotide having a sequence complementary to a target RNA. Is provided. First, in order to explain the action of the reagent for RNA detection of the present invention, a schematic chemical reaction diagram is shown below. In the chemical reaction diagram below, as an example, a case where an anthracene skeleton is used as a fluorescence coloring unit, R 1 in the general formula (1) is a methyl group, and m and n in the general formula (1) are 1 is shown. Although shown, the present invention is not limited to this.

上記一般式(1)で表されるボロン酸ユニットは、フェニルボロン酸と3級アミノ基とを備え、フェニルボロン酸が標的となるRNAの3’−末端に存在するcis−2,3−ジオール構造と結合を形成する。しかし、通常、フェニルボロン酸とRNAの3’−末端ジオールとの間の溶液中での結合形成反応は解離側に大きく偏った平衡反応であり、RNAを含む溶液にフェニルボロン酸が単独で存在していたとしても、そのフェニルボロン酸はRNAと結合を形成することができない。本発明のRNA検出用試薬では、標的となるRNAと相補的な配列をもつオリゴヌクレオチドの5’−末端側に上記のボロン酸ユニットを配することにより、当該相補的な配列をもつオリゴヌクレオチドが標的となるRNAと二重鎖を形成してこれを捕捉した際に、上記ボロン酸ユニットが標的となるRNAの3’−末端側に配置される。これにより、ボロン酸ユニットが標的となるRNAの3’−末端ジオールとの間で結合を形成させる機会を大きく増加させる。つまり、標的となるRNAがボロン酸ユニットの周囲に濃縮されたのと同じ状況となり、上記平衡反応が結合形成側に大きく傾くことになる。その一方で、溶液中に標的とならないRNAが存在していたとしても、このRNAは、RNA検出用試薬に含まれるオリゴヌクレオチドによって捕捉されないので、ボロン酸ユニットと当該RNAとの平衡反応は解離側に大きく偏ったままであり、ボロン酸ユニットに含まれるフェニルボロン酸と結合しない。   The boronic acid unit represented by the general formula (1) includes a phenylboronic acid and a tertiary amino group, and cis-2,3-diol present at the 3′-end of RNA targeted by phenylboronic acid. Form a bond with the structure. However, the bond formation reaction between phenylboronic acid and the 3'-terminal diol of RNA in the solution is an equilibrium reaction largely biased toward the dissociation side, and phenylboronic acid exists alone in the solution containing RNA. Even so, the phenylboronic acid cannot form a bond with RNA. In the RNA detection reagent of the present invention, by arranging the boronic acid unit on the 5′-terminal side of the oligonucleotide having a sequence complementary to the target RNA, the oligonucleotide having the complementary sequence can be obtained. When a double strand is formed with the target RNA and captured, the boronic acid unit is arranged on the 3′-terminal side of the target RNA. This greatly increases the opportunity for the boronic acid unit to form a bond with the 3'-terminal diol of the targeted RNA. That is, the situation is the same as when the target RNA is concentrated around the boronic acid unit, and the equilibrium reaction is greatly inclined toward the bond formation side. On the other hand, even if non-target RNA is present in the solution, this RNA is not captured by the oligonucleotide contained in the RNA detection reagent, so the equilibrium reaction between the boronic acid unit and the RNA is on the dissociation side. It does not bind to phenylboronic acid contained in the boronic acid unit.

そして、上記のようにボロン酸ユニットが標的となるRNAの3’−末端側に結合すると、RNA検出用試薬は、その事実を蛍光発光として発信する。次に、このメカニズムについて説明する。   When the boronic acid unit binds to the 3′-terminal side of the target RNA as described above, the RNA detection reagent transmits the fact as fluorescence. Next, this mechanism will be described.

上述のように、ボロン酸ユニットには3級アミノ基が含まれ、この3級アミノ基は、ボロン酸ユニットに含まれるフェニルボロン酸と蛍光発色ユニットとの間に挟まれて存在する。この3級アミノ基の窒素原子に含まれる非共有電子対の電子は、励起光が照射された際に、光誘起電子移動(Photoinduced Electron Transfer;PET)現象により、近隣に存在する蛍光発色ユニットに移動して当該蛍光発色ユニットからの蛍光を消失させる。しかしながら、上記のように、ボロン酸ユニットに含まれるフェニルボロン酸が標的となるRNAの3’−末端と結合すると、PET現象が生じなくなり、励起光が照射された際に蛍光発色ユニットからの蛍光が生じることになる。これは、あたかも蛍光が増強されたかのように観察されることになる。   As described above, the boronic acid unit includes a tertiary amino group, and this tertiary amino group is sandwiched between the phenylboronic acid contained in the boronic acid unit and the fluorescence coloring unit. The electrons of the unshared electron pair contained in the nitrogen atom of the tertiary amino group, when irradiated with excitation light, cause a photochromic electron transfer (PET) phenomenon to occur in the fluorescent coloring unit existing in the vicinity. It moves and the fluorescence from the fluorescence coloring unit disappears. However, as described above, when the phenylboronic acid contained in the boronic acid unit binds to the 3′-end of the target RNA, the PET phenomenon does not occur, and the fluorescence from the fluorescent coloring unit when irradiated with excitation light. Will occur. This will be observed as if the fluorescence was enhanced.

このような作用により、本発明のRNA検出用試薬は、標的となるRNAが存在すると、当該RNAと結合してその事実を蛍光発光として発信することができる。すなわち、本発明のRNA検出用試薬は、励起光が照射された際に、溶液中に標的となるRNAが存在すれば蛍光を増強させ、溶液中に標的となるRNAが存在しなければ蛍光を増強させない。以上のような作用により、本発明のRNA検出用試薬は、標的となるRNAの存在の有無を検出することができる。   By such an action, when the target RNA exists, the RNA detection reagent of the present invention can bind to the RNA and transmit the fact as fluorescence. That is, the RNA detection reagent of the present invention enhances the fluorescence when the target RNA is present in the solution when the excitation light is irradiated, and fluoresces when the target RNA is not present in the solution. Do not increase. By the above actions, the RNA detection reagent of the present invention can detect the presence or absence of target RNA.

標的となるRNAと相補的な配列をもつオリゴヌクレオチドは、標的となるRNAと二重鎖を形成することで、これを捕捉する認識部位として機能する。既に述べたように、この認識部位は、標的となるRNAを捉えるとともに、標的となるRNAの3’−末端側のcis−2,3−ジオール構造をボロン酸ユニットの側へ配向させる働きをもつ。   An oligonucleotide having a sequence complementary to the target RNA forms a duplex with the target RNA and functions as a recognition site for capturing it. As already mentioned, this recognition site has the function of capturing the target RNA and orienting the cis-2,3-diol structure on the 3′-terminal side of the target RNA toward the boronic acid unit. .

標的となるRNAと相補的な配列をもつオリゴヌクレオチドは、標的となるRNAの塩基配列に基づいて塩基配列が決定され、この決定された塩基配列に基づいてオリゴヌクレオチドの自動合成機(DNA/RNA自動合成機)等により合成される。オリゴヌクレオチドの自動合成機によるオリゴヌクレオチドの合成は、既に確立された手法であり、本発明における上記標的となるRNAと相補的な配列をもつオリゴヌクレオチドもそのような手法に基づいて合成すればよい。   An oligonucleotide having a sequence complementary to the target RNA is determined based on the base sequence of the target RNA, and an oligonucleotide automatic synthesizer (DNA / RNA) is determined based on the determined base sequence. Synthesized by an automatic synthesizer). Oligonucleotide synthesis by an automated oligonucleotide synthesizer is an established technique, and an oligonucleotide having a sequence complementary to the target RNA in the present invention may be synthesized based on such technique. .

なお、言うまでもないが、相補的なオリゴヌクレオチド同士は、一方のオリゴヌクレオチドの5’−末端側と他方のオリゴヌクレオチドの3’−末端側とが組み合い、かつ、一方のオリゴヌクレオチドの3’−末端側と他方のオリゴヌクレオチドの5’−末端側とが組み合うように、ペアとなる塩基同士が結合して二重鎖を形成する。これも言うまでもないが、ペアになる塩基とは、互いに、C(シトシン)及びG(グアニン)、又はA(アデニン)及びU若しくはT(ウラシル若しくはチミン)の組み合わせとなるような塩基のことをいい、一方の塩基配列のある位置にCGAUの塩基配列が存在すれば、他方の塩基配列におけるそれと対応する位置にはGCUAという塩基配列が存在することになる。   Needless to say, the complementary oligonucleotides are a combination of the 5′-end side of one oligonucleotide and the 3′-end side of the other oligonucleotide, and the 3′-end of one oligonucleotide. A pair of bases are combined to form a double strand so that one side and the 5′-end side of the other oligonucleotide are combined. Needless to say, the paired bases are bases that are a combination of C (cytosine) and G (guanine), or A (adenine) and U or T (uracil or thymine). If the base sequence of CGAU is present at a certain position of one base sequence, the base sequence GCUA is present at the position corresponding to that of the other base sequence.

標的となるRNAと相補的な配列をもつオリゴヌクレオチドの5’−末端側の水酸基には、二価のリンカーユニットの一端側が縮合して結合される。このリンカーユニットの他端側には、後述する蛍光発色ユニットが結合される。これにより、標的となるRNAと相補的な配列をもつオリゴヌクレオチド(すなわち認識部位)の5’−末端側と蛍光発光ユニットとがリンカーユニットを介して互いに結合される。   One end of the divalent linker unit is condensed and bound to the hydroxyl group on the 5'-terminal side of the oligonucleotide having a sequence complementary to the target RNA. A fluorescent coloring unit, which will be described later, is bonded to the other end of the linker unit. As a result, the 5'-terminal side of the oligonucleotide having a sequence complementary to the target RNA (that is, the recognition site) and the fluorescence unit are bound to each other via the linker unit.

二価のリンカーユニットとしては、特に限定されない。このようなリンカーユニットとしては、標的となるRNAと相補的な配列をもつオリゴヌクレオチド(すなわち認識部位)及び蛍光発色ユニットと結合するための結合基を両端に備えた、ヘテロ原子を有してもよい炭素鎖を例示することができる。この場合、両端の結合基は互いに独立に決定可能であり、そのような結合基としては、エーテル結合、エステル結合、リン酸ジエステル結合、アミド結合、カーボネート結合、ウレタン結合、アルキレン基等が例示されるが特に限定されない。   The divalent linker unit is not particularly limited. As such a linker unit, an oligonucleotide having a sequence complementary to a target RNA (that is, a recognition site) and a hetero atom having a binding group for binding to a fluorescent coloring unit at both ends may be used. A good carbon chain can be exemplified. In this case, the bonding groups at both ends can be determined independently of each other. Examples of such bonding groups include ether bonds, ester bonds, phosphodiester bonds, amide bonds, carbonate bonds, urethane bonds, alkylene groups, and the like. However, it is not particularly limited.

ヘテロ原子を有してもよい炭素鎖は、鎖中に炭素原子でない原子を何個でも有してもよい炭素鎖であり、炭素鎖には単結合の他、二重結合や三重結合も含まれてよい。また、炭素鎖の端がヘテロ原子であってもよい。ヘテロ原子を有してもよい炭素鎖に含まれる原子数としては、特に限定されないが、1〜25個程度を例示することができる。なお、ヘテロ原子を有してもよい炭素鎖は、標的となるRNAと相補的な配列をもつオリゴヌクレオチド(すなわち認識部位)と蛍光発色ユニットとの間の結合部分に相当するので、その始点は、上記認識部位の5’−末端に存在する酸素原子(すなわち5’−末端水酸基から水素原子を除いたあとに残る酸素原子)に結合している原子となり、終点は、蛍光発色ユニットに結合している原子となる。   A carbon chain that may have a hetero atom is a carbon chain that may have any number of non-carbon atoms in the chain, and the carbon chain includes a single bond, a double bond, and a triple bond. It may be. Moreover, the end of the carbon chain may be a heteroatom. Although it does not specifically limit as number of atoms contained in the carbon chain which may have a hetero atom, About 1-25 pieces can be illustrated. The carbon chain that may have a heteroatom corresponds to the binding portion between the oligonucleotide (that is, the recognition site) having a sequence complementary to the target RNA and the fluorescent coloring unit, so the starting point is , An atom bonded to the oxygen atom existing at the 5′-end of the recognition site (that is, the oxygen atom remaining after removing the hydrogen atom from the 5′-terminal hydroxyl group), and the end point is bonded to the fluorescent coloring unit. It becomes an atom.

蛍光発色ユニットとしては、紫外光や可視光といった光の照射を受けて蛍光を発する基であって、これに近接して設けられた窒素原子からのPET現象により蛍光が消光する基が用いられる。このような基としては、ヘテロ原子を有してもよい縮合多環芳香族化合物から水素原子でもよい置換基を2つ除いて得られる二価の有機基が挙げられる。「二価の有機基」である理由は、蛍光発色ユニットが上記二価のリンカーユニットと結合されるとともに後述のボロン酸ユニットにも結合されるためである。   As the fluorescence coloring unit, a group that emits fluorescence upon irradiation with light such as ultraviolet light or visible light, and a group that quenches fluorescence by a PET phenomenon from a nitrogen atom provided in the vicinity thereof is used. Examples of such a group include a divalent organic group obtained by removing two substituents which may be hydrogen atoms from a condensed polycyclic aromatic compound which may have a hetero atom. The reason for being a “divalent organic group” is that the fluorescent coloring unit is bound to the divalent linker unit and also to the boronic acid unit described later.

ヘテロ原子を有してもよい縮合多環芳香族化合物としては、アントラセン、ナフタセン、ペンタセン、ベンゾピレン、クリセン、ピレン、トリフェニレン、ペリレン、フルオレセイン等が例示される。これらの中でも、アントラセンやピレンを好ましく例示できる。   Examples of the condensed polycyclic aromatic compound which may have a hetero atom include anthracene, naphthacene, pentacene, benzopyrene, chrysene, pyrene, triphenylene, perylene, fluorescein and the like. Among these, anthracene and pyrene can be preferably exemplified.

ボロン酸ユニットは、上述の蛍光発色ユニットに結合されるユニットであり、下記の一般式(1)で表される。既に説明したように、ボロン酸ユニットにはフェニルボロン酸基と3級アミノ基とが含まれる。フェニルボロン酸基は、標的となるRNAの3’−末端に存在するcis−2,3−ジオール構造と結合を形成させるために用いられる。そして、本発明のRNA検出用試薬に光が照射された際、フェニルボロン酸基がフリーのときには、3級アミノ基に含まれる非共有電子対電子のPETにより蛍光発色ユニットの蛍光が消光され、フェニルボロン酸が結合を形成しているときには、上記PETが生じないので蛍光発色ユニットからの蛍光が観察される。こうして、本発明のRNA検出用試薬は、溶液中に標的となるRNAの存在の有無を検出することができる。   The boronic acid unit is a unit bonded to the above-described fluorescence coloring unit and is represented by the following general formula (1). As already explained, the boronic acid unit contains a phenylboronic acid group and a tertiary amino group. The phenylboronic acid group is used to form a bond with the cis-2,3-diol structure present at the 3'-end of the target RNA. And when light is irradiated to the reagent for RNA detection of the present invention, when the phenylboronic acid group is free, the fluorescence of the fluorescence coloring unit is quenched by PET of the unshared electron pair electron contained in the tertiary amino group, When phenylboronic acid forms a bond, the PET is not generated, and fluorescence from the fluorescence coloring unit is observed. Thus, the RNA detection reagent of the present invention can detect the presence or absence of target RNA in the solution.

上記一般式(1)中、Rは水素原子又はアルキル基であり、m及びnはそれぞれ独立に0〜4の整数である。また、上記一般式(1)で表されるボロン酸ユニットは、波線を付した単結合により上記蛍光発色ユニットに結合される。なお、上記一般式(1)において、ボロン酸基は、ボロン酸基が結合するベンゼン環における置換可能な炭素原子のいずれに結合してもよい。Rとしては、メチル基が好ましく例示される。 In the general formula (1), R 1 is a hydrogen atom or an alkyl group, and m and n are each independently an integer of 0 to 4. Further, the boronic acid unit represented by the general formula (1) is bound to the fluorescence coloring unit by a single bond with a wavy line. In the general formula (1), the boronic acid group may be bonded to any substitutable carbon atom in the benzene ring to which the boronic acid group is bonded. R 1 is preferably exemplified by a methyl group.

本発明のRNA検出用試薬は以上の構成を備えるが、本発明のRNA検出用試薬の好ましい一例として、下記一般式(2)で表される化合物を挙げることができる。   Although the reagent for RNA detection of this invention is equipped with the above structure, the compound represented by following General formula (2) can be mentioned as a preferable example of the reagent for RNA detection of this invention.

上記一般式(2)中、Nuは、標的となるRNAと相補的な配列をもつオリゴヌクレオチドから5’−末端の水酸基を除いてなる基である。Xは、ヘテロ原子を有してもよい縮合多環芳香族化合物から水素原子でもよい置換基を2つ除いて得られる二価の有機基であり、上記蛍光発色ユニットである。Lは2価の有機基である上記リンカーユニットである。Rは上記一般式(1)と同様である。なお、上記一般式(2)において、NuとLとの間に存在する酸素原子は、上記オリゴヌクレオチドの5’−末端の水酸基から水素原子を除いたあとに残る酸素原子である。各ユニットの詳細については、既に説明した通りである。上記一般式(2)におけるL(リンカーユニット)をより具体的に示したRNA検出用試薬の一例として、下記一般式(3)で表される化合物を挙げることができる。 In the above general formula (2), Nu is a group obtained by removing the 5′-terminal hydroxyl group from an oligonucleotide having a sequence complementary to the target RNA. X is a divalent organic group obtained by removing two substituents which may be hydrogen atoms from a condensed polycyclic aromatic compound which may have a hetero atom, and is the above-described fluorescence coloring unit. L is the linker unit which is a divalent organic group. R 1 is the same as in the general formula (1). In the above general formula (2), the oxygen atom present between Nu and L is the oxygen atom remaining after removing the hydrogen atom from the 5′-terminal hydroxyl group of the oligonucleotide. Details of each unit are as described above. As an example of the reagent for RNA detection which showed L (linker unit) in the said General formula (2) more specifically, the compound represented by following General formula (3) can be mentioned.

上記一般式(3)中、Nuは、上記の通り、標的となるRNAと相補的な配列をもつオリゴヌクレオチドから5’−末端の水酸基を除いてなる基である。Xは、上記の通り、ヘテロ原子を有してもよい縮合多環芳香族化合物から水素原子でもよい置換基を2つ除いて得られる二価の有機基であり、上記蛍光発色ユニットである。Rは、上記一般式(1)と同様であり、Rは水素原子又はアルキル基であり、Zは二価の基又は単結合であり、nは1〜18の整数である。なお、上記一般式(3)において、NuとZとの間に存在する酸素原子は、上記オリゴヌクレオチドの5’−末端の水酸基から水素原子を除いたあとに残る酸素原子である。 In the general formula (3), Nu is a group obtained by removing the 5′-terminal hydroxyl group from an oligonucleotide having a sequence complementary to the target RNA as described above. X is a divalent organic group obtained by removing two substituents, which may be hydrogen atoms, from the condensed polycyclic aromatic compound which may have a heteroatom, as described above, and is the fluorescence coloring unit. R 1 is the same as in the general formula (1), R 2 is a hydrogen atom or an alkyl group, Z is a divalent group or a single bond, and n is an integer of 1 to 18. In the general formula (3), the oxygen atom present between Nu and Z is an oxygen atom remaining after removing the hydrogen atom from the 5′-terminal hydroxyl group of the oligonucleotide.

上記一般式(3)において、リンカーユニットに相当する部分は、ZからC(=O)N(R)CHまでとなる。このリンカーユニットは、結合基としてZ及びメチレン基を備えることになる。リンカーユニットにおける炭素鎖は、アルキレン基及びアミド基となる。 In the above general formula (3), the portion corresponding to the linker unit is from Z to C (═O) N (R 2 ) CH 2 . This linker unit will comprise Z and methylene groups as linking groups. The carbon chain in the linker unit becomes an alkylene group and an amide group.

リンカーユニットにおける一方の結合基であるZとしては、−P(=O)(−OH)O−を好ましく挙げることができる。この場合、Nuで表されるオリゴヌクレオチドと、リンカーユニット、蛍光発色ユニット及びボロン酸ユニットからなるその他の部分とは、リン酸ジエステル結合(ホスホジエステル結合)により連結されることになる。例えば、上記一般式(3)におけるZからボロン酸ユニットまでに相当する構造をもつホスホアミダイド化合物を用意し、Nuで表されるオリゴヌクレオチドを自動合成機で合成する際の最終工程として当該ホスホアミダイド化合物を作用させる工程を実行すれば、Zがホスホジエステル結合に相当するものになる。このような手法によれば、本発明のRNA検出用試薬をオリゴヌクレオチドの自動合成機で合成できるので好ましい。次に、本発明のRNA検出用試薬の合成方法の一例として、上記ホスホアミダイド化合物を使用した合成方法について説明する。   As Z which is one bonding group in the linker unit, —P (═O) (— OH) O— can be preferably exemplified. In this case, the oligonucleotide represented by Nu and the other part composed of the linker unit, the fluorescence coloring unit and the boronic acid unit are linked by a phosphodiester bond (phosphodiester bond). For example, a phosphoramidide compound having a structure corresponding to Z to a boronic acid unit in the general formula (3) is prepared, and the phosphoramidide compound is used as a final step when an oligonucleotide represented by Nu is synthesized by an automatic synthesizer. If the process of making it act is performed, Z will correspond to a phosphodiester bond. Such a method is preferable because the RNA detection reagent of the present invention can be synthesized by an automated oligonucleotide synthesizer. Next, as an example of a method for synthesizing the reagent for detecting RNA of the present invention, a synthesis method using the phosphoramidide compound will be described.

この合成方法では、下記一般式(4)で表されるホスホアミダイド化合物を、RNA検出用試薬を合成するための試薬として用いる。このようなRNA検出用試薬を合成するための試薬も本発明の一つである。下記一般式(4)で表されるホスホアミダイド化合物は、上述のリンカーユニット、蛍光発色ユニット及び保護基を有するボロン酸ユニットに相当する部分を含んだものであり、オリゴヌクレオチドの5’−末端に作用させることにより、当該オリゴヌクレオチドにこれらのユニットを導入することができる。すなわち、標的となるRNAと相補的な配列をもつオリゴヌクレオチドの5’−末端に下記一般式(4)で表されるホスホアミダイド化合物を作用させてから脱保護を行うことにより、本発明のRNA検出用試薬が合成される。   In this synthesis method, a phosphoramidide compound represented by the following general formula (4) is used as a reagent for synthesizing an RNA detection reagent. A reagent for synthesizing such a reagent for RNA detection is also one aspect of the present invention. The phosphoramidide compound represented by the following general formula (4) includes a portion corresponding to the above-described linker unit, fluorescent coloring unit and boronic acid unit having a protecting group, and acts on the 5′-end of the oligonucleotide. These units can be introduced into the oligonucleotide. That is, the RNA detection of the present invention is carried out by allowing the phosphoramidide compound represented by the following general formula (4) to act on the 5′-end of an oligonucleotide having a sequence complementary to the target RNA, followed by deprotection. Reagents are synthesized.

上記一般式(4)中、Xは、ヘテロ原子を有してもよい縮合多環芳香族化合物から水素原子でもよい置換基を2つ除いて得られる二価の有機基である。このXは、上述の蛍光発色ユニットに相当する。Lは、2価の有機基であり、上述のリンカーユニットに相当する。Rは、水素原子又はアルキル基であり、R及びRは、それぞれ独立にボロン酸の保護基である。なお、R及びRは互いに結合して環を形成してもよい。Rは、亜リン酸基の保護基であり、R及びRはそれぞれ独立にアルキル基である。なお、R及びRは、互いに結合して環を形成してもよい。 In the general formula (4), X is a divalent organic group obtained by removing two substituents which may be hydrogen atoms from the condensed polycyclic aromatic compound which may have a hetero atom. This X corresponds to the above-described fluorescence coloring unit. L is a divalent organic group and corresponds to the linker unit described above. R 1 is a hydrogen atom or an alkyl group, and R 3 and R 4 are each independently a protecting group for boronic acid. R 3 and R 4 may be bonded to each other to form a ring. R 5 is a protecting group for a phosphite group, and R 6 and R 7 are each independently an alkyl group. R 6 and R 7 may be bonded to each other to form a ring.

ボロン酸の保護基であるR及びRとしては、公知のボロン酸保護基を特に限定なく挙げることができる。このような保護基として、N−メチルイミノ二酢酸エステル(MIDA保護基とも呼ぶ。)を好ましく挙げることができる。MIDA保護基は、ボロン酸ユニットに含まれるフェニルボロン酸にN−メチルイミノ二酢酸を作用させることで導入される。また、MIDA保護基を有するボロン酸化合物が各種市販されているので、これを用いて上記化合物(4)のホスホアミダイド化合物を合成してもよい。MIDA保護基についての理解を助けるために、MIDA保護基が導入されたフェニルボロン酸の化学式を下記に示す。下記化学式からも理解できるように、ボロン酸の保護基としてMIDA保護基を用いる場合、上記一般式(4)におけるR及びRは、互いに結合して環を形成することになる。 Examples of R 3 and R 4 which are boronic acid protecting groups include known boronic acid protecting groups without any particular limitation. As such a protecting group, N-methyliminodiacetic acid ester (also referred to as MIDA protecting group) can be preferably exemplified. The MIDA protecting group is introduced by allowing N-methyliminodiacetic acid to act on phenylboronic acid contained in the boronic acid unit. Moreover, since various boronic acid compounds having a MIDA protecting group are commercially available, the phosphoramidide compound of the above compound (4) may be synthesized using this. To assist in understanding the MIDA protecting group, the chemical formula of phenylboronic acid into which the MIDA protecting group has been introduced is shown below. As can be understood from the chemical formula below, when a MIDA protecting group is used as a protecting group for boronic acid, R 3 and R 4 in the general formula (4) are bonded to each other to form a ring.

MIDA保護基は塩基性条件下で容易に脱保護される。そのため、オリゴヌクレオチドの自動合成機を用いて、オリゴヌクレオチド部分及びフェニルボロン酸基に保護基を有する状態で固相担体上に合成された本発明のRNA検出用試薬を、塩基性条件下で固相担体から切り出す際に、これらの保護基が全て脱離して本発明のRNA検出用試薬が得られる。   MIDA protecting groups are easily deprotected under basic conditions. For this reason, the RNA detection reagent of the present invention synthesized on a solid phase carrier with a protective group in the oligonucleotide moiety and phenylboronic acid group using an oligonucleotide automatic synthesizer is immobilized under basic conditions. When cutting out from the phase carrier, all of these protecting groups are eliminated, and the RNA detection reagent of the present invention is obtained.

亜リン酸基の保護基であるRは、特に限定されない。このような保護基としては、メチル基、エチル基、イソプロピル基等のアルキル基や、シアノエチル基等が例示される。それぞれ独立にアルキル基であるR及びRは、特に限定されない。このようなアルキル基としてはイソプロピル基を例示できる。なお、R及びRは、互いに結合して環を形成してもよい。 R 5 which is a protecting group for the phosphite group is not particularly limited. Examples of such protecting groups include alkyl groups such as methyl group, ethyl group, and isopropyl group, and cyanoethyl group. R 6 and R 7 which are each independently an alkyl group are not particularly limited. An isopropyl group can be exemplified as such an alkyl group. R 6 and R 7 may be bonded to each other to form a ring.

上記一般式(4)におけるL(リンカーユニット)をより具体的に示したホスホアミダイド化合物の一例として、下記一般式(5)で表される化合物を挙げることができる。   As an example of the phosphoramidide compound showing L (linker unit) in the general formula (4) more specifically, a compound represented by the following general formula (5) can be given.

上記一般式(5)中、X、R、R、R、R、R及びRは、上記一般式(4)と同様である。Rは、水素原子又はアルキル基であり、メチル基が好ましく例示される。nは、1〜18の整数である。 In the general formula (5), X, R 1 , R 3 , R 4 , R 5 , R 6 and R 7 are the same as those in the general formula (4). R 2 is a hydrogen atom or an alkyl group, preferably a methyl group. n is an integer of 1-18.

このようなホスホアミダイド化合物として、さらに具体的には、下記化学式(6)で表される化合物を挙げることができる。   More specific examples of such phosphoramidide compounds include compounds represented by the following chemical formula (6).

次に、上記ホスホアミダイド化合物の合成経路の一例を下記に示す。なお、下記では、本発明のRNA検出用試薬を合成するための試薬の一例として上記化学式(6)で表されるホスホアミダイド化合物についての合成経路を示したが、本発明は上記化学式(6)で表されるホスホアミダイド化合物に限定されるものではない。   Next, an example of the synthesis route of the phosphoramidide compound is shown below. In the following, a synthesis route for the phosphoramidide compound represented by the above chemical formula (6) is shown as an example of a reagent for synthesizing the reagent for RNA detection of the present invention. However, the present invention is represented by the above chemical formula (6). It is not limited to the phosphoramidide compound represented.

上記合成経路にて、Bocとはtert−ブチロキシカルボニル基を表し、BocOとは二炭酸ジ−tert−ブチルを表し、SO−pyridineとは三酸化硫黄−ピリジン錯体を表し、TEAはトリエチルアミンを表し、MIDAはN−メチルイミノ二酢酸を表し、DIPEAはN,N−ジイソプロピルエチルアミンを表す。 In the above synthetic route, Boc represents a tert-butyloxycarbonyl group, Boc 2 O represents di-tert-butyl dicarbonate, SO 3 -pyridine represents a sulfur trioxide-pyridine complex, and TEA represents Represents triethylamine, MIDA represents N-methyliminodiacetic acid, and DIPEA represents N, N-diisopropylethylamine.

上記のホスホアミダイド化合物は、ホスホアミダイド法が適用されるオリゴヌクレオチドの自動合成機において、RNA検出用試薬を合成するための試薬として用いることができる。オリゴヌクレオチドの自動合成機において使用されるホスホアミダイド法は、固相法であり、固相である担体粒子の表面に、ホスホアミダイド化合物の縮合反応を利用してオリゴヌクレオチドを化学合成する方法である。本発明のRNA検出用試薬を合成する手順としては、まず、公知のホスホアミダイド法に従って、標的となるRNAと相補的な配列をもつオリゴヌクレオチドを合成し、次いで、当該オリゴヌクレオチドの5’−末端の水酸基が脱保護された状態で上記のホスホアミダイド化合物を作用させることにより、オリゴヌクレオチドの5’−側の末端にリンカーユニット、蛍光発色ユニット及びボロン酸ユニットを導入し、最後に、塩基性条件下にて、固相担体の表面からオリゴヌクレオチドを切り出すことが挙げられる。この切り出しの際に、オリゴヌクレオチドに付加された各種の保護基や、フェニルボロン酸に付加された保護基が脱離して、本発明のRNA検出用試薬が得られる。要するに、本発明のRNA検出用試薬を合成するための試薬は、オリゴヌクレオチドを伸長させる際に使用されるヌクレオシドのホスホアミダイドと同様にホスホアミダイド部位を有するので、ヌクレオシドのホスホアミダイドと同様に自動合成機に適用することが可能である。したがって、自動合成機を適切にプログラムすることにより、オリゴヌクレオチドが所望の長さとなった後に本発明のRNA検出用試薬を合成する試薬を自動的に反応系内に投入し、オリゴヌクレオチドの5’−側の末端にリンカーユニット、蛍光発色ユニット及びボロン酸ユニットを導入することが可能である。   The above phosphoramidide compound can be used as a reagent for synthesizing a reagent for RNA detection in an automated oligonucleotide synthesizer to which the phosphoamidide method is applied. The phosphoamidide method used in an oligonucleotide automatic synthesizer is a solid phase method, in which oligonucleotides are chemically synthesized on the surface of carrier particles, which are solid phases, using a condensation reaction of a phosphoamidide compound. As a procedure for synthesizing the RNA detection reagent of the present invention, first, an oligonucleotide having a sequence complementary to a target RNA is synthesized according to a known phosphoramidide method, and then the 5′-terminal of the oligonucleotide is synthesized. By reacting the above phosphoramidide compound with the hydroxyl group deprotected, a linker unit, a fluorescence coloring unit and a boronic acid unit are introduced at the 5′-end of the oligonucleotide, and finally, under basic conditions. Then, the oligonucleotide is cut out from the surface of the solid support. At the time of this excision, various protecting groups added to the oligonucleotide and protecting groups added to phenylboronic acid are eliminated, and the RNA detection reagent of the present invention is obtained. In short, since the reagent for synthesizing the reagent for RNA detection of the present invention has a phosphoamidide site in the same manner as the nucleoside phosphoamidide used for extending the oligonucleotide, it can be applied to an automatic synthesizer in the same manner as the nucleoside phosphoamidide. Is possible. Accordingly, by appropriately programming an automatic synthesizer, a reagent for synthesizing the RNA detection reagent of the present invention is automatically introduced into the reaction system after the oligonucleotide has reached the desired length, and the oligonucleotide 5 ' It is possible to introduce a linker unit, a fluorescence coloring unit and a boronic acid unit at the end on the-side.

以上、本発明のRNA検出用試薬及びRNA検出用試薬を合成するための試薬について説明したが、本発明のRNA検出用試薬を検査対象に添加し、当該検査対象に紫外線又は可視光線を照射した際に、RNA検出用試薬の有する蛍光が増強するか否かを観察することにより、上記検査対象内に標的となるRNAが含まれるか否かを判断する検査方法もまた、本発明の一つである。このような検査方法については、上記本発明のRNA検出用試薬の説明で既に述べたので、ここでの説明を省略する。   As described above, the RNA detection reagent of the present invention and the reagent for synthesizing the RNA detection reagent have been described. However, the RNA detection reagent of the present invention was added to the test object, and the test object was irradiated with ultraviolet rays or visible light. In this case, a test method for determining whether the target RNA is included in the test target by observing whether the fluorescence of the RNA detection reagent is enhanced is also one of the present inventions. It is. Since such an inspection method has already been described in the description of the reagent for RNA detection of the present invention, description thereof is omitted here.

以下、実施例を示すことにより本発明をさらに具体的に説明するが、本発明は以下の実施例に何ら限定されるものではない。   EXAMPLES Hereinafter, the present invention will be described more specifically with reference to examples, but the present invention is not limited to the following examples.

[合成例1]trans−ジスピロ[オキシラン−2,9’(10H)−アントラセン−10’,2’’−オキシラン](8)の合成
Synthesis Example 1 Synthesis of trans-dispiro [oxirane-2,9 ′ (10H) -anthracene-10 ′, 2 ″ -oxirane] (8)

市販のアントラキノン(7)(6.2g、30mmol)を乾燥DMSO(ジメチルスルホキシド)120mLに溶解させ、系内をアルゴンガスで置換した後、水素化ナトリウム(2.2eq、2.4g、66mmol、純度60%)を加え、室温・遮光下で撹拌し、そこに乾燥DMSO80mLに溶解させたトリメチルスルホニウムヨージド(2.2eq、13.4g、66mmol)を30分間かけて滴下した。5時間後、TLC(薄層クロマトグラフィ−)で反応の進行を確認し、ガラスフィルターで濾過した。濾液を氷水300mLに加え、1時間撹拌した。析出した固体を濾取し、水で洗浄し、目的物である化合物(8)を黄色固体(4.9g、20.6mmol、収率69%)として得た。
化合物(8)の各物性値は、以下の通りである。
H NMR(500MHz、DMSO−d)δ(ppm):7.42−7.40(m,4H,An−1,4,5,8),7.32−7.29(m,4H,An−2,3,6,7),3.12(s,4H,O−CH
Commercially available anthraquinone (7) (6.2 g, 30 mmol) was dissolved in 120 mL of dry DMSO (dimethyl sulfoxide), and the system was purged with argon gas. Then, sodium hydride (2.2 eq, 2.4 g, 66 mmol, purity) 60%) was added, and the mixture was stirred at room temperature and protected from light, and trimethylsulfonium iodide (2.2 eq, 13.4 g, 66 mmol) dissolved in 80 mL of dry DMSO was added dropwise thereto over 30 minutes. After 5 hours, the progress of the reaction was confirmed by TLC (thin layer chromatography) and filtered through a glass filter. The filtrate was added to 300 mL of ice water and stirred for 1 hour. The precipitated solid was collected by filtration and washed with water to obtain the target compound (8) as a yellow solid (4.9 g, 20.6 mmol, yield 69%).
The physical property values of compound (8) are as follows.
1 H NMR (500 MHz, DMSO-d 6 ) δ (ppm): 7.42-7.40 (m, 4H, An-1, 4, 5, 8), 7.32-7.29 (m, 4H , An-2,3,6,7), 3.12 ( s, 4H, O-CH 2)

[合成例2]10−ヒドロキシメチル−9−アントラアルデヒド(9)の合成
[Synthesis Example 2] Synthesis of 10-hydroxymethyl-9-anthraldehyde (9)

化合物(8)(4.9g、20.6mmol)を乾燥アセトニトリル400mLに溶解させ、臭化リチウム(2.0eq、3.6g、41.2mmol)を加えて60℃で撹拌した。91時間後、TLCで反応の進行を確認し、反応溶液を室温まで冷却し、さらに−40℃で30分間冷却した。析出した固体を濾取し、水で洗浄し、目的物である化合物(9)を黄色固体(3.3g、13.8mmol、収率67%)として得た。
化合物(9)の各物性値は、以下の通りである。
H NMR(500MHz、DMSO−d)δ(ppm):11.46(s,1H,CH=O),8.95(d,J=9.0Hz,2H,An−1,8),8.61(d,J=8.5Hz,2H,An−4,5),7.74−7.65(m,4H,An−2,3,6,7),5.57(t,J=5.3Hz,1H,OH),5.49(d,J=5.5Hz,2H,CH
Compound (8) (4.9 g, 20.6 mmol) was dissolved in 400 mL of dry acetonitrile, lithium bromide (2.0 eq, 3.6 g, 41.2 mmol) was added, and the mixture was stirred at 60 ° C. After 91 hours, the progress of the reaction was confirmed by TLC, the reaction solution was cooled to room temperature, and further cooled at −40 ° C. for 30 minutes. The precipitated solid was collected by filtration and washed with water to obtain the target compound (9) as a yellow solid (3.3 g, 13.8 mmol, yield 67%).
The physical property values of compound (9) are as follows.
1 H NMR (500 MHz, DMSO-d 6 ) δ (ppm): 11.46 (s, 1H, CH═O), 8.95 (d, J = 9.0 Hz, 2H, An-1, 8), 8.61 (d, J = 8.5 Hz, 2H, An-4, 5), 7.74-7.65 (m, 4H, An-2, 3, 6, 7), 5.57 (t, J = 5.3 Hz, 1H, OH), 5.49 (d, J = 5.5 Hz, 2H, CH 2 )

[合成例3](10−メチルアミノメチルアントラセン−9−イル)メタノール(10)の合成
Synthesis Example 3 Synthesis of (10-methylaminomethylanthracen-9-yl) methanol (10)

化合物(9)(3.3g、13.8mmol)にメタノール150mL、THF(テトラヒドロフラン)70mL、及びメチルアミンの40%水溶液30mLを加え、アルゴン雰囲気下、室温で1時間撹拌した。その溶液に、水素化ホウ素ナトリウム(2.8eq、1.5g、38.6mmol)を加え、さらに4時間撹拌し、TLCで反応の進行を確認した。溶媒を減圧下で留去し、酢酸エチルに溶解させ、水で洗浄した後、飽和食塩水で洗浄した。洗浄に使用した水系液からも酢酸エチルで抽出した。有機層を集め、硫酸マグネシウムで乾燥させた後、濾過して溶媒を留去し、目的物である化合物(10)を黄色固体(3.3g、13.2mmol、収率95%)として得た。
化合物(10)の各物性値は、以下の通りである。
H NMR(500MHz、DMSO−d)δ(ppm):8.49−8.43(m,4H,An−1,4,5,8),7.61−7.54(m,4H,An−2,3,6,7),5.43(d,J=5.5Hz,2H,CH),5.30(t,J=5.3Hz,1H,OH),4.59(s,2H,N−CH
To the compound (9) (3.3 g, 13.8 mmol) were added 150 mL of methanol, 70 mL of THF (tetrahydrofuran), and 30 mL of a 40% aqueous solution of methylamine, and the mixture was stirred at room temperature for 1 hour in an argon atmosphere. To the solution was added sodium borohydride (2.8 eq, 1.5 g, 38.6 mmol), and the mixture was further stirred for 4 hours, and the progress of the reaction was confirmed by TLC. The solvent was distilled off under reduced pressure, dissolved in ethyl acetate, washed with water, and then washed with saturated brine. The aqueous solution used for washing was also extracted with ethyl acetate. The organic layer was collected, dried over magnesium sulfate, filtered and the solvent was distilled off to obtain the target compound (10) as a yellow solid (3.3 g, 13.2 mmol, yield 95%). .
The physical property values of compound (10) are as follows.
1 H NMR (500 MHz, DMSO-d 6 ) δ (ppm): 8.49-8.43 (m, 4H, An-1, 4, 5, 8), 7.61-7.54 (m, 4H) , An-2, 3, 6, 7), 5.43 (d, J = 5.5 Hz, 2H, CH 2 ), 5.30 (t, J = 5.3 Hz, 1H, OH), 4.59 (s, 2H, N-CH 2)

[合成例4](10−ヒドロキシメチルアントラセン−9−イルメチル)メチルカルバミン酸tert−ブチルエステル(11)の合成
(上記化学式中、Bocは、tert−ブチロキシカルボニル基を表す。以下、同様である。)
Synthesis Example 4 Synthesis of (10-hydroxymethylanthracen-9-ylmethyl) methylcarbamic acid tert-butyl ester (11)
(In the above chemical formula, Boc represents a tert-butyloxycarbonyl group. The same applies hereinafter.)

化合物(10)(3.3g、13.2mmol)にメタノール180mL及び二炭酸ジ−tert−ブチル(2.1eq、6.4mL、27.7mmol)を加え、室温で64時間撹拌した。TLCで反応の進行を確認し、溶媒を減圧下で留去し、残渣を酢酸エチルに溶解させ、水で2回、10%炭酸ナトリウム水溶液で1回、塩化ナトリウム水溶液で2回洗浄した。洗浄に使用した水系液からも酢酸エチルで抽出した。有機層を集め、硫酸マグネシウムで乾燥させた後、濾過し、溶媒を減圧下で留去した。得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィーで精製した。目的物を含むフラクションを集め、溶媒を減圧下で留去し、目的物である化合物(11)を淡黄色泡状固体(4.0g、11.5mmol、収率87%)として得た。
化合物(11)の各物性値は、以下の通りである。
H NMR(500MHz、DMSO−d)δ(ppm):8.54−8.50(m,4H,An−1,4,5,8),7.59−7.58(m,4H,An−2,3,6,7),5.46−5.45(m,4H,N−CH),5.35(m,1H,OH),2.38(s,3H,N−CH),1.58−1.47(br,9H,H−Boc)
Methanol 180 mL and di-tert-butyl dicarbonate (2.1 eq, 6.4 mL, 27.7 mmol) were added to compound (10) (3.3 g, 13.2 mmol), and the mixture was stirred at room temperature for 64 hours. The progress of the reaction was confirmed by TLC, the solvent was distilled off under reduced pressure, the residue was dissolved in ethyl acetate, washed twice with water, once with 10% aqueous sodium carbonate and twice with aqueous sodium chloride. The aqueous solution used for washing was also extracted with ethyl acetate. The organic layer was collected, dried over magnesium sulfate, filtered, and the solvent was removed under reduced pressure. The obtained residue was purified by silica gel column chromatography. Fractions containing the desired product were collected, and the solvent was distilled off under reduced pressure to obtain the desired compound (11) as a pale yellow foamy solid (4.0 g, 11.5 mmol, yield 87%).
The physical property values of compound (11) are as follows.
1 H NMR (500 MHz, DMSO-d 6 ) δ (ppm): 8.54-8.50 (m, 4H, An-1, 4, 5, 8), 7.59-7.58 (m, 4H) , An-2,3,6,7), 5.46-5.45 ( m, 4H, N-CH 2), 5.35 (m, 1H, OH), 2.38 (s, 3H, N -CH 3), 1.58-1.47 (br, 9H, H-Boc)

[合成例5](10−ホルミルアントラセン−9−イルメチル)メチルカルバミン酸tert−ブチルエステル(12)の合成
Synthesis Example 5 Synthesis of (10-formylanthracen-9-ylmethyl) methylcarbamic acid tert-butyl ester (12)

化合物(11)(4.0g、11.5mmol)を乾燥DMSO40mLに溶解させ、トリエチルアミン(TEA)40mLを加え、アルゴン雰囲気下、室温で撹拌し、そこに乾燥DMSO35mLに溶解させた三酸化硫黄−ピリジン錯体(SO−pyridine、7.0eq、12.6g、80.5mmol)を30分間かけて滴下した。1時間後、TLCで反応の進行を確認し、反応液を氷水100mLに注いだ。反応液を分液ロートに洗い移し、酢酸エチルで抽出し、水で2回、10%次亜塩素酸ナトリウム水溶液で2回洗浄した。洗浄に使用した水系液からも酢酸エチルで抽出した。有機層を集め、硫酸マグネシウムで乾燥させ、濾過し、溶媒を減圧下で留去することにより、目的物である化合物(12)を黄色あめ状固体(5.1g、14.6mmol)として定量的に得た。
化合物(12)の各物性値は、以下の通りである。
H NMR(500MHz、DMSO−d)δ(ppm):11.46(s,1H,CH=O),8.92(d,J=9.0Hz,2H,An−4,5),8.63(d,J=9.0Hz,2H,An−1,8),7.74−7.61(m,4H,An−2,3,6,7),5.54(s,2H,N−CH),2.40(s,3H,N−CH),1.75−1.48(brs,9H,H−Boc)
Compound (11) (4.0 g, 11.5 mmol) is dissolved in 40 mL of dry DMSO, added with 40 mL of triethylamine (TEA), stirred at room temperature under an argon atmosphere, and sulfur trioxide-pyridine dissolved in 35 mL of dry DMSO. The complex (SO 3 -pyridine, 7.0 eq, 12.6 g, 80.5 mmol) was added dropwise over 30 minutes. After 1 hour, the progress of the reaction was confirmed by TLC, and the reaction solution was poured into 100 mL of ice water. The reaction solution was washed into a separatory funnel, extracted with ethyl acetate, washed twice with water and twice with a 10% aqueous sodium hypochlorite solution. The aqueous solution used for washing was also extracted with ethyl acetate. The organic layer was collected, dried over magnesium sulfate, filtered, and the solvent was distilled off under reduced pressure to quantitatively obtain the target compound (12) as a yellow candy-like solid (5.1 g, 14.6 mmol). I got it.
The physical property values of compound (12) are as follows.
1 H NMR (500 MHz, DMSO-d 6 ) δ (ppm): 11.46 (s, 1H, CH═O), 8.92 (d, J = 9.0 Hz, 2H, An-4, 5), 8.63 (d, J = 9.0 Hz, 2H, An-1, 8), 7.74-7.61 (m, 4H, An-2, 3, 6, 7), 5.54 (s, 2H, N-CH 2), 2.40 (s, 3H, N-CH 3), 1.75-1.48 (brs, 9H, H-Boc)

[合成例6]メチル−(10−メチルアミノメチルアントラセン−9−イルメチル)カルバミン酸tert−ブチルエステル(13)の合成
Synthesis Example 6 Synthesis of methyl- (10-methylaminomethylanthracen-9-ylmethyl) carbamic acid tert-butyl ester (13)

化合物(12)(5.1g、14.6mmol)にメタノール120mL、THF120mL、及びメチルアミンの40%水溶液60mLを加え、アルゴン雰囲気下、室温で30分間撹拌した。その溶液に、水素化ホウ素ナトリウム(4.0eq、2.2g、54.4mmol)を加え、さらに2時間撹拌した。TLCで反応の進行を確認し、溶媒を減圧下で留去した。残渣を酢酸エチルに溶解させ、水で3回洗浄した。洗浄に使用した水系液からも酢酸エチルで抽出した。有機層を集め、硫酸マグネシウムで乾燥させた後、濾過して溶媒を留去し、目的物である化合物(13)を黄色固体(4.0g、11.1mmol、収率76%)として得た。
化合物(13)の各物性値は、以下の通りである。
H NMR(500MHz、DMSO−d)δ(ppm):8.54−8.49(m,4H,An−1,4,5,8),7.61−7.55(m,4H,An−2,3,6,7),5.46(s,2H,N−CH),4.56(s,2H,N−CH),2.37(s,3H,N−CH),1.47(br,9H,H−Boc)
To compound (12) (5.1 g, 14.6 mmol) were added methanol 120 mL, THF 120 mL, and methylamine 40 mL aqueous solution 60 mL, and the mixture was stirred at room temperature for 30 minutes in an argon atmosphere. To the solution was added sodium borohydride (4.0 eq, 2.2 g, 54.4 mmol) and stirred for another 2 hours. The progress of the reaction was confirmed by TLC, and the solvent was distilled off under reduced pressure. The residue was dissolved in ethyl acetate and washed 3 times with water. The aqueous solution used for washing was also extracted with ethyl acetate. The organic layer was collected, dried over magnesium sulfate, filtered and the solvent was distilled off to obtain the target compound (13) as a yellow solid (4.0 g, 11.1 mmol, yield 76%). .
The physical property values of compound (13) are as follows.
1 H NMR (500 MHz, DMSO-d 6 ) δ (ppm): 8.54-8.49 (m, 4H, An-1, 4, 5, 8), 7.61-7.55 (m, 4H) , An-2,3,6,7), 5.46 ( s, 2H, N-CH 2), 4.56 (s, 2H, N-CH 2), 2.37 (s, 3H, N- CH 3), 1.47 (br, 9H, H-Boc)

[合成例7]tert−ブチル((10−((6−ヒドロキシ−N−メチルヘキサンアミド)メチル)アントラセン−9−イル)メチル)(メチル)カルバメート(14)の合成
Synthesis Example 7 Synthesis of tert-butyl ((10-((6-hydroxy-N-methylhexaneamido) methyl) anthracen-9-yl) methyl) (methyl) carbamate (14)

化合物(13)(2.0g、5.0mmol)にメタノール30mLを加えて溶解させ、6−ヒドロキシカプロン酸(1.2eq、786mg、6.0mmol)及び4−(4,6−ジメトキシ−1,3,5−トリアジン−2−イル)−4−メチルモルホリニウム(3.0eq、4.2g、15mmol)を加え、系内をアルゴン置換し、室温で45分間撹拌した。TLCで反応の進行を確認し、溶媒を減圧下で留去した。残渣を酢酸エチルに溶解させ、水で2回、塩化ナトリウム水溶液で2回洗浄した。洗浄に使用した水系液からも酢酸エチルで抽出した。有機層を集め、硫酸マグネシウムで乾燥させた後、濾過し、溶媒を減圧下で留去した。得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィーで精製した。目的物を含むフラクションを集め、溶媒を減圧下で留去し、目的物である化合物(14)を黄色泡状固体(1.9g、3.97mmol、収率79%)として得た。
化合物(14)の各物性値は、以下の通りである。
H NMR(600MHz、DMSO−d)δ(ppm):8.52(m,4H,An−1,4,5,8),7.54(m,4H,An−2,3,6,7),5.59(s,2H,N−CH),5.45(s,2H,N−CH),4.31(t,J=5.2Hz,1H,OH),3.35(m,2H,OHに結合したCH),2.49(s,3H,N−CH),2.35(s,3H,N−CH),2.29(t,J=7.2Hz,2H,O=C−CH),1.46(br,15H,H−Boc,CH−CH−CH
Compound (13) (2.0 g, 5.0 mmol) was dissolved by adding 30 mL of methanol, and 6-hydroxycaproic acid (1.2 eq, 786 mg, 6.0 mmol) and 4- (4,6-dimethoxy-1, 3,5-Triazin-2-yl) -4-methylmorpholinium (3.0 eq, 4.2 g, 15 mmol) was added, the inside of the system was replaced with argon, and the mixture was stirred at room temperature for 45 minutes. The progress of the reaction was confirmed by TLC, and the solvent was distilled off under reduced pressure. The residue was dissolved in ethyl acetate and washed twice with water and twice with aqueous sodium chloride solution. The aqueous solution used for washing was also extracted with ethyl acetate. The organic layer was collected, dried over magnesium sulfate, filtered, and the solvent was removed under reduced pressure. The obtained residue was purified by silica gel column chromatography. Fractions containing the desired product were collected, and the solvent was distilled off under reduced pressure to obtain the desired compound (14) as a yellow foamy solid (1.9 g, 3.97 mmol, yield 79%).
The physical property values of compound (14) are as follows.
1 H NMR (600 MHz, DMSO-d 6 ) δ (ppm): 8.52 (m, 4H, An-1, 4, 5, 8), 7.54 (m, 4H, An-2, 3, 6 7), 5.59 (s, 2H, N—CH 2 ), 5.45 (s, 2H, N—CH 2 ), 4.31 (t, J = 5.2 Hz, 1H, OH), 3 .35 (CH 2 bound to m, 2H, OH), 2.49 (s, 3H, N—CH 3 ), 2.35 (s, 3H, N—CH 3 ), 2.29 (t, J = 7.2Hz, 2H, O = C -CH 2), 1.46 (br, 15H, H-Boc, CH 2 -CH 2 -CH 2)

[合成例8]6−ヒドロキシ−N−メチル−N−((10−((メチルアミノ)メチル)アントラセン−9−イル)メチル)ヘキサンアミド(15)の合成
Synthesis Example 8 Synthesis of 6-hydroxy-N-methyl-N-((10-((methylamino) methyl) anthracen-9-yl) methyl) hexanamide (15)

化合物(14)(1.9g、3.97mmol)をジクロロメタン80mLに溶解させ、トリフルオロ酢酸30mLを加え、系内をアルゴン置換し、室温で1時間撹拌した。TLCで反応の進行を確認し、溶媒を減圧下で留去した。残渣をクロロホルムに溶解させ、水で1回、塩化ナトリウム及び炭酸ナトリウムの水溶液で2回洗浄した。洗浄に使用した水系液からもクロロホルムで抽出した。有機層を集め、硫酸マグネシウムで乾燥させた後、濾過し、溶媒を減圧下で留去した。得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィーで精製した。目的物を含むフラクションを集め、溶媒を減圧下で留去し、目的物である化合物(15)を黄色あめ状固体(1.1g、2.88mmol、収率73%)として得た。
化合物(15)の各物性値は、以下の通りである。
H NMR(500MHz、DMSO−d)δ(ppm):8.44(m,4H,An−1,4,5,8),7.56(m,4H,An−2,3,6,7),5.57(s,2H,N−CH),4.77(s,2H,N−CH),4.30(s,1H,NH),3.33(m,2H,OHに結合したCH),2.58(s,3H,N−CH),2.45(s,3H,NHに結合したCH),2.29(t,J=7.2Hz,2H,O=C−CH),1.54−1.32(m,6H,CH−CH−CH
Compound (14) (1.9 g, 3.97 mmol) was dissolved in 80 mL of dichloromethane, 30 mL of trifluoroacetic acid was added, the inside of the system was purged with argon, and the mixture was stirred at room temperature for 1 hour. The progress of the reaction was confirmed by TLC, and the solvent was distilled off under reduced pressure. The residue was dissolved in chloroform and washed once with water and twice with an aqueous solution of sodium chloride and sodium carbonate. Extraction was also performed with chloroform from the aqueous solution used for washing. The organic layer was collected, dried over magnesium sulfate, filtered, and the solvent was removed under reduced pressure. The obtained residue was purified by silica gel column chromatography. Fractions containing the desired product were collected, and the solvent was distilled off under reduced pressure to obtain the desired compound (15) as a yellow candy-like solid (1.1 g, 2.88 mmol, yield 73%).
The physical property values of compound (15) are as follows.
1 H NMR (500 MHz, DMSO-d 6 ) δ (ppm): 8.44 (m, 4H, An-1, 4, 5, 8), 7.56 (m, 4H, An-2, 3, 6 7), 5.57 (s, 2H, N—CH 2 ), 4.77 (s, 2H, N—CH 2 ), 4.30 (s, 1H, NH), 3.33 (m, 2H) , CH 2 bonded to OH), 2.58 (s, 3H, N—CH 3 ), 2.45 (CH 3 bonded to s, 3H, NH), 2.29 (t, J = 7.2 Hz). , 2H, O = C-CH 2), 1.54-1.32 (m, 6H, CH 2 -CH 2 -CH 2)

[合成例9]化合物(16)の合成
[Synthesis Example 9] Synthesis of Compound (16)

化合物(15)(1.1g、2.99mmol)をDMF(ジメチルホルムアミド)25mLに溶解させ、4−ホルミルフェニルボロン酸−N−メチルイミノ二酢酸エステル(1.2eq、937mg、3.59mmol)及びナトリウムトリアセトキシボロヒドリド(1.4eq、889mg、4.19mmol)を加え、系内をアルゴン置換し、室温で23時間撹拌した。TLCで反応の進行を確認した後、反応溶液に酢酸エチルを加えて抽出し、有機層を水で2回、塩化ナトリウム水溶液で3回洗浄した。洗浄に使用した水系液からも酢酸エチルで10回抽出した。有機層を集め、硫酸マグネシウムで乾燥させた後、濾過し、溶媒を減圧下で留去した。得られた残渣をシリカゲルカラムクロマトグラフィーで精製した。目的物を含むフラクションを集め、溶媒を減圧下で留去し、少量のジクロロメタンに溶解させ、再沈殿法により目的物と副生成物とを分離し、濾液を減圧下で濃縮し、目的物である化合物(16)を淡黄色泡状固体(1.1g、1.73mmol、収率58%)として得た。
化合物(16)の各物性値は、以下の通りである。
H NMR(500MHz、DMSO−d)δ(ppm):8.54(m,2H,An−1,8)8.40(d,2H,An−4,5),7.52(m,4H,phenyl),7.33(d,J=8.0Hz,2H,An−2,7),7.24(d,J=8.0Hz,2H,An−3,6),5.56(s,2H,N−CH),4.47(s,2H,N−CH),4.32(t,J=5.0Hz,1H,OH),4.25(d,J=17.0Hz,2H,N−CH−C=O),4.02(d,J=17.0Hz,2H,N−CH−C=O),3.65(s,2H,N−CH),3.34(q,J=6.3Hz,2H,OHに結合したCH),2.49(s,3H,N−CH),2.40(s,3H,N−CH),2.28(t,J=7.3Hz,2H,O=C−CH),2.04(s,3H,N−CH),1.53−1.28(m,6H,CH−CH−CH
Compound (15) (1.1 g, 2.99 mmol) is dissolved in 25 mL of DMF (dimethylformamide), 4-formylphenylboronic acid-N-methyliminodiacetic ester (1.2 eq, 937 mg, 3.59 mmol) and sodium Triacetoxyborohydride (1.4 eq, 889 mg, 4.19 mmol) was added, and the system was purged with argon, followed by stirring at room temperature for 23 hours. After confirming the progress of the reaction by TLC, ethyl acetate was added to the reaction solution for extraction, and the organic layer was washed twice with water and three times with an aqueous sodium chloride solution. The aqueous solution used for washing was extracted 10 times with ethyl acetate. The organic layer was collected, dried over magnesium sulfate, filtered, and the solvent was removed under reduced pressure. The obtained residue was purified by silica gel column chromatography. Fractions containing the target product are collected, the solvent is distilled off under reduced pressure, dissolved in a small amount of dichloromethane, the target product and by-products are separated by reprecipitation, and the filtrate is concentrated under reduced pressure. A certain compound (16) was obtained as a pale yellow foamy solid (1.1 g, 1.73 mmol, yield 58%).
The physical property values of compound (16) are as follows.
1 H NMR (500 MHz, DMSO-d 6 ) δ (ppm): 8.54 (m, 2H, An-1, 8) 8.40 (d, 2H, An-4, 5), 7.52 (m , 4H, phenyl), 7.33 (d, J = 8.0 Hz, 2H, An-2, 7), 7.24 (d, J = 8.0 Hz, 2H, An-3, 6), 5. 56 (s, 2H, N—CH 3 ), 4.47 (s, 2H, N—CH 3 ), 4.32 (t, J = 5.0 Hz, 1H, OH), 4.25 (d, J = 17.0 Hz, 2H, N—CH 2 —C═O), 4.02 (d, J = 17.0 Hz, 2 H, N—CH 2 —C═O), 3.65 (s, 2H, N) -CH 2), 3.34 (q, J = 6.3Hz, 2H, CH 2) bonded to OH, 2.49 (s, 3H, N-CH 3), 2.40 (s, 3H, N -CH ), 2.28 (t, J = 7.3Hz, 2H, O = C-CH 2), 2.04 (s, 3H, N-CH 3), 1.53-1.28 (m, 6H, CH 2 -CH 2 -CH 2)

[合成例10]ホスホアミダイド化合物(6)の合成
[Synthesis Example 10] Synthesis of phosphoramidide compound (6)

化合物(16)(400mg、0.64mmol)を乾燥ピリジンで共沸脱水し、乾燥トルエンでピリジンを共沸除去した後、系内をアルゴン置換し、ジクロロメタンに溶解させ、N,N−ジイソプロピルエチルアミン(DIPEA)(2.4eq、268μL、1.54mmol)及び2−シアノエチル−N,N−ジイソプロピルクロロホスホアミダイド(1.2eq、191μL、0.77mmol)を加え、アルゴン雰囲気下、室温で1時間撹拌した。TLCで反応の進行を確認した後、溶媒を減圧下で留去した。残渣をクロロホルムに溶解させ、炭酸水素ナトリウム水溶液で2回、塩化ナトリウム水溶液で2回洗浄した。有機層を集め、硫酸マグネシウムで乾燥させた後、濾過し、溶媒を減圧下で留去した。残渣をアセトニトリルに溶解させ、リサイクル分取HPLCで精製した。目的物を含むフラクションを集め、溶媒を減圧下で留去し、目的物である化合物(6)を淡黄色泡状固体(246mg、0.30mmol、収率47%)として得た。
化合物(6)の各物性値は、以下の通りである。
H NMR(600MHz、CDCl)δ(ppm):8.54(m,2H,An−1,8),8.33(m,2H,An−4,5),7.53(m,4H,phenyl),7.41(d,J=7.8Hz,An−2,3),7.32(d,J=8.4Hz,2H,An−6,7),5.66(s,2H,N−CH),4.51(s,2H,N−CH),3.95(d,J=16.2Hz,2H,N−CH−C=O),3.85(m,2H,O−CH),3.77(m,2H,O−CH),3.72(d,J=16.8Hz,2H,N−CH−C=O),3.59(m,2H,N−CH),2.62(t,J=6.3Hz,2H,CH−CN),2.56(s,3H,N−CH),2.47(s,3H,N−CH),2.37(t,J=7.5Hz,2H,CH−CH−C=O),2.24(s,3H,N−CH),1.74−1.27(m,6H,CH−CH−CH),1.18(m,12H,i−Pr)
31P NMR(243MHz,CDCl)δ(ppm):147.8
Compound (16) (400 mg, 0.64 mmol) was azeotropically dehydrated with dry pyridine, azeotropically removed with dry toluene, the interior of the system was purged with argon, dissolved in dichloromethane, and N, N-diisopropylethylamine ( DIPEA) (2.4 eq, 268 μL, 1.54 mmol) and 2-cyanoethyl-N, N-diisopropylchlorophosphoamidide (1.2 eq, 191 μL, 0.77 mmol) were added and stirred at room temperature for 1 hour under an argon atmosphere. did. After confirming the progress of the reaction by TLC, the solvent was distilled off under reduced pressure. The residue was dissolved in chloroform and washed twice with an aqueous sodium bicarbonate solution and twice with an aqueous sodium chloride solution. The organic layer was collected, dried over magnesium sulfate, filtered, and the solvent was removed under reduced pressure. The residue was dissolved in acetonitrile and purified by recycle preparative HPLC. Fractions containing the desired product were collected, and the solvent was distilled off under reduced pressure to obtain the desired compound (6) as a pale yellow foamy solid (246 mg, 0.30 mmol, 47% yield).
The physical property values of compound (6) are as follows.
1 H NMR (600 MHz, CDCl 3 ) δ (ppm): 8.54 (m, 2H, An-1, 8), 8.33 (m, 2H, An-4, 5), 7.53 (m, 4H, phenyl), 7.41 (d, J = 7.8 Hz, An-2, 3), 7.32 (d, J = 8.4 Hz, 2H, An-6, 7), 5.66 (s) , 2H, N—CH 2 ), 4.51 (s, 2H, N—CH 2 ), 3.95 (d, J = 16.2 Hz, 2H, N—CH 2 —C═O), 3.85. (M, 2H, O—CH 2 ), 3.77 (m, 2H, O—CH 2 ), 3.72 (d, J = 16.8 Hz, 2H, N—CH 2 —C═O), 3 .59 (m, 2H, N—CH), 2.62 (t, J = 6.3 Hz, 2H, CH 2 —CN), 2.56 (s, 3H, N—CH 3 ), 2.47 ( s, 3H, N -CH 3), 2.37 (t, J = 7.5Hz, 2H, CH 2 -CH 2 -C = O), 2.24 (s, 3H, N-CH 3), 1.74-1. 27 (m, 6H, CH 2 -CH 2 -CH 2), 1.18 (m, 12H, i-Pr)
31 P NMR (243 MHz, CDCl 3 ) δ (ppm): 147.8

[実施例1]オリゴヌクレオチドの合成
オリゴヌクレオチドの自動合成機を用いて、下記(B12)、(T12)及び(U12)で表す配列を有する3種のオリゴヌクレオチドを合成した。(B12)にて「B」の符号で示したものは、オリゴヌクレオチドの5’−末端に付加された、下記化学式で表されるリンカーユニット、蛍光発色ユニット及びボロン酸ユニットである。これは、自動合成機によりオリゴヌクレオチドの合成が完了した後に化合物(6)を作用させることにより、オリゴヌクレオチドの5’−末端に付加されたものである。なお、RNAが溶液中で比較的不安定であることに鑑み、下記(B12)、(T12)及び(U12)では、DNAにおけるヌクレオチドを由来としたオリゴヌクレオチドとした。但し、(U12)のみ、3’−末端のヌクレオチドをウリジン(U)とすることで3’−末端をRNAと同様の構造とし、これをRNAの模擬オリゴヌクレオチドとして用いた。(B12)及び(T12)は、互いに相補的な塩基配列を有するオリゴヌクレオチドであり、(B12)及び(U12)は、互いに相補的な塩基配列を有するオリゴヌクレオチドである。つまり、(B12)は、標的となるRNA(RNAの模擬オリゴヌクレオチドであるU12)と相補的な配列をもつオリゴヌクレオチドと、二価のリンカーユニットと、蛍光発色ユニットとボロン酸ユニットとを備える本発明のRNA検出用試薬である。
[Example 1] Synthesis of oligonucleotides Using an oligonucleotide automatic synthesizer, three types of oligonucleotides having sequences represented by the following (B12), (T12) and (U12) were synthesized. What is indicated by the symbol “B” in (B12) is a linker unit, a fluorescence coloring unit and a boronic acid unit which are added to the 5′-end of the oligonucleotide and represented by the following chemical formula. This was added to the 5′-end of the oligonucleotide by allowing compound (6) to act after the synthesis of the oligonucleotide was completed by an automatic synthesizer. In view of the fact that RNA is relatively unstable in solution, in the following (B12), (T12), and (U12), oligonucleotides derived from nucleotides in DNA were used. However, only (U12), the 3′-terminal nucleotide was uridine (U) so that the 3′-terminal had the same structure as RNA, and this was used as a simulated oligonucleotide for RNA. (B12) and (T12) are oligonucleotides having base sequences complementary to each other, and (B12) and (U12) are oligonucleotides having base sequences complementary to each other. That is, (B12) is a book comprising an oligonucleotide having a sequence complementary to the target RNA (U12, which is an RNA mimetic oligonucleotide), a divalent linker unit, a fluorescence coloring unit, and a boronic acid unit. It is a reagent for RNA detection of the invention.

5’ B AAC GCA TGT CAC 3’ (B12)
5’ GTG ACA TGC GTT 3’ (T12)
5’ GTG ACA TGC GTU 3’ (U12)
5 'B AAC GCA TGT CAC 3' (B12)
5 'GTG ACA TGC GTT 3' (T12)
5 'GTG ACA TGC GTU 3' (U12)

(上記化学式において、波線は、「B」に結合したオリゴヌクレオチド鎖を表す。) (In the above chemical formula, the wavy line represents the oligonucleotide chain bound to “B”.)

なお、オリゴヌクレオチドの自動合成では、自動合成機(Applied Biosystems 394 DNA/RNA Synthesizer)上、ホスホアミダイド法に従った固相合成法を用いた。オリゴヌクレオチドを合成するための各種ホスホロアミダイドユニットは、Glen Research社からの市販品を用いた。固相担体(CPG;controlled pore grass)に結合されたヌクレオシド保護体(1μmol)から出発し、Applied Biosystems社の推奨するプロトコールに、若干の修正を加えたプロトコールを用いた。すなわち、化合物(6)のアミダイドユニットの縮合時間を300秒とし、通常用いられる天然型アミダイドユニットのそれよりも長時間の縮合時間とした。(T12)及び(U12)については、5’−末端にDMTr基(ジメトキシトリチル保護基)を残した状態で合成を終了した。合成終了時、アルゴンガスを100秒間通じて固相担体を乾燥させた。完全保護オリゴヌクレオチドの結合した固相担体をバイアル瓶に移し、固相担体からオリゴヌクレオチドの切り出しを行った。この切り出し操作により、合成されたオリゴヌクレオチドが固相担体から切り出されるとともに、オリゴヌクレオチドに結合していた全ての保護基が脱離することになる。切り出しの操作は、(T12)及び(U12)については28%アンモニア水溶液を用い、(B12)については0.4M水酸化ナトリウムメタノール溶液を用い、固相担体を綿栓濾過により取り除き、精製操作を行った。その後、逆相シリカゲル担体を用いたHPLCにより、目的物の分取を行った。得られた各オリゴヌクレオチドは、UV測定及びMALDI−TOF MASSにて分析を行い、目的物であることを確認した。下記に、(B12)の固相担体からの切り出し操作における化学反応式を示す。下記の化学反応式において、黒丸で示したものは固相担体を表し、Baseは核酸塩基を表し、Bproは保護基を有する核酸塩基を表す。 In addition, in the automatic synthesis | combination of oligonucleotide, the solid-phase synthesis method according to the phosphoamidide method was used on the automatic synthesizer (Applied Biosystems 394 DNA / RNA Synthesizer). Commercially available products from Glen Research were used as various phosphoramidite units for synthesizing oligonucleotides. A protocol starting from a nucleoside protector (1 μmol) bound to a solid phase carrier (CPG) and using a protocol modified by Applied Biosystems with some modifications was used. That is, the condensation time of the amidite unit of compound (6) was set to 300 seconds, and the condensation time was longer than that of a commonly used natural amidite unit. For (T12) and (U12), the synthesis was completed with the DMTr group (dimethoxytrityl protecting group) left at the 5′-end. At the end of the synthesis, argon gas was passed for 100 seconds to dry the solid support. The solid support to which the fully protected oligonucleotide was bound was transferred to a vial, and the oligonucleotide was cut out from the solid support. By this excision operation, the synthesized oligonucleotide is excised from the solid phase carrier and all the protecting groups bonded to the oligonucleotide are eliminated. For the cutting operation, 28% ammonia aqueous solution was used for (T12) and (U12), 0.4M sodium hydroxide methanol solution was used for (B12), the solid phase carrier was removed by cotton plug filtration, and the purification operation was performed. went. Then, the target object was fractionated by HPLC using a reverse phase silica gel carrier. Each obtained oligonucleotide was analyzed by UV measurement and MALDI-TOF MASS, and confirmed to be the target product. The chemical reaction formula in the cutting-out operation from the solid phase carrier (B12) is shown below. In the following chemical reaction formula, those indicated by black circles represent a solid phase carrier, Base represents a nucleobase, and B pro represents a nucleobase having a protecting group.

[蛍光測定試験]
オリゴヌクレオチド鎖の末端にジオール構造を有する(U12)、及びオリゴヌクレオチド鎖の末端にジオール構造が存在しない(T12)のそれぞれについて、これらと相補的なオリゴヌクレオチド鎖を備えた(B12)を加えた際の蛍光スペクトルを測定した。この測定は、pHが(a)7.0、(b)7.5及び(c)8.0のリン酸緩衝溶液にてそれぞれ行った。その測定結果を図1に示す。なお、図1では、(B12)+(U12)、(B12)+(T12)、及び対照用として(B12)単独のそれぞれについての蛍光スペクトルを示している。なお、蛍光スペクトルの測定は、励起光の波長を379nmとし、(U12)、(T12)及び(B12)のそれぞれの濃度を2μMとし、1MNaClOを含んだ100mMリン酸緩衝溶液中にて実施した。
[Fluorescence measurement test]
For each of the oligonucleotide chain having a diol structure at the end (U12) and the diol structure not existing at the end of the oligonucleotide chain (T12), (B12) having an oligonucleotide chain complementary thereto was added. The fluorescence spectrum was measured. This measurement was performed with phosphate buffer solutions having pHs of (a) 7.0, (b) 7.5, and (c) 8.0, respectively. The measurement results are shown in FIG. In addition, in FIG. 1, the fluorescence spectrum about each of (B12) + (U12), (B12) + (T12), and (B12) independent as a control | contrast is shown. The fluorescence spectrum was measured in a 100 mM phosphate buffer solution containing 1 M NaClO 4 with a wavelength of excitation light of 379 nm and concentrations of (U12), (T12) and (B12) of 2 μM. .

図1に示すように、(B12)+(T12)における蛍光スペクトルは、相補鎖を加えていない(B12)単独の場合の蛍光スペクトルとほぼ同様だった。すなわち、(T12)を相補鎖とした場合には、ボロン酸エステルが形成されないため、PETの解消が起こらず、蛍光強度に変化が見られないと考えられる。一方、(U12)+(B12)における蛍光スペクトルは、(B12)単独の場合や(T12)+(B12)の場合に比べて、強度が増加した。このことは、本発明のRNA検出用試薬である(B12)が、(U12)の3’−末端におけるcis−2,3−ジオール構造を認識してボロン酸エステルを形成した結果、PETが解消され、蛍光が回復したことによりもたらされていると考えられる。つまり、本発明のRNA検出用試薬によれば、標的となるRNAが溶液中に存在するか否かを蛍光強度の観察により判断できることが理解される。   As shown in FIG. 1, the fluorescence spectrum in (B12) + (T12) was almost the same as the fluorescence spectrum in the case of (B12) alone with no complementary strand added. That is, when (T12) is used as a complementary strand, no boronic acid ester is formed, so that it is considered that PET is not eliminated and the fluorescence intensity is not changed. On the other hand, the intensity of the fluorescence spectrum in (U12) + (B12) increased compared to the case of (B12) alone or (T12) + (B12). This is because (B12), which is the reagent for detecting RNA of the present invention, recognizes the cis-2,3-diol structure at the 3′-end of (U12) and forms a boronic ester, thereby eliminating PET. It is thought that this is caused by the recovery of fluorescence. That is, according to the reagent for RNA detection of the present invention, it is understood that whether or not target RNA is present in a solution can be determined by observation of fluorescence intensity.

Claims (8)

標的となるRNAと相補的な配列をもつオリゴヌクレオチドと、一端が前記オリゴヌクレオチドの5’−末端の水酸基と縮合した二価のリンカーユニットと、前記二価のリンカーユニットの他端に結合した蛍光発色ユニットと、前記蛍光発色ユニットに結合した下記一般式(1)で表されるボロン酸ユニットと、を備えたRNA検出用試薬。
(上記一般式(1)中、Rは水素原子又はアルキル基であり、m及びnはそれぞれ独立に0〜4の整数である。また、上記一般式(1)で表されるボロン酸ユニットは、波線を付した単結合により前記蛍光発色ユニットに結合される。)
Oligonucleotide having a sequence complementary to the target RNA, a divalent linker unit condensed at one end with the hydroxyl group at the 5′-end of the oligonucleotide, and fluorescence bound to the other end of the divalent linker unit A reagent for RNA detection comprising a color developing unit and a boronic acid unit represented by the following general formula (1) bonded to the fluorescent color developing unit.
(In the general formula (1), R 1 is a hydrogen atom or an alkyl group, and m and n are each independently an integer of 0 to 4. The boronic acid unit represented by the general formula (1) Is bound to the fluorescent coloring unit by a single bond with a wavy line.)
前記蛍光発色ユニットが、ヘテロ原子を有してもよい縮合多環芳香族化合物から水素原子でもよい置換基を2つ除いて得られる二価の有機基である請求項1記載のRNA検出用試薬。   The reagent for RNA detection according to claim 1, wherein the fluorescent coloring unit is a divalent organic group obtained by removing two substituents which may be hydrogen atoms from a condensed polycyclic aromatic compound which may have a hetero atom. . 下記一般式(2)で表される請求項1又は2記載のRNA検出用試薬。
(上記一般式(2)中、Nuは前記オリゴヌクレオチドから5’−末端の水酸基を除いてなる基であり、Xはヘテロ原子を有してもよい縮合多環芳香族化合物から水素原子でもよい置換基を2つ除いて得られる二価の有機基である前記蛍光発色ユニットであり、Lは2価の有機基である前記リンカーユニットであり、Rは上記一般式(1)と同様である。なお、上記一般式(2)において、NuとLとの間に存在する酸素原子は、前記オリゴヌクレオチドの5’−末端の水酸基から水素原子を除いたあとに残る酸素原子を意味する。)
The reagent for RNA detection of Claim 1 or 2 represented by following General formula (2).
(In the general formula (2), Nu is a group formed by removing the 5′-terminal hydroxyl group from the oligonucleotide, and X may be a hydrogen atom from a condensed polycyclic aromatic compound which may have a hetero atom. The fluorescent coloring unit that is a divalent organic group obtained by removing two substituents, L is the linker unit that is a divalent organic group, and R 1 is the same as in the general formula (1). In the above general formula (2), the oxygen atom present between Nu and L means the oxygen atom remaining after removing the hydrogen atom from the 5′-terminal hydroxyl group of the oligonucleotide. )
下記一般式(3)で表される請求項1〜3のいずれか1項記載のRNA検出用試薬。
(上記一般式(3)中、Nuは前記オリゴヌクレオチドから5’−末端の水酸基を除いてなる基であり、Xはヘテロ原子を有してもよい縮合多環芳香族化合物から水素原子でもよい置換基を2つ除いて得られる二価の有機基である前記蛍光発色ユニットであり、Rは上記一般式(1)と同様であり、Rは水素原子又はアルキル基であり、Zは二価の基又は単結合であり、nは1〜18の整数である。なお、上記一般式(3)において、NuとZとの間に存在する酸素原子は、前記オリゴヌクレオチドの5’−末端の水酸基から水素原子を除いたあとに残る酸素原子を意味する。)
The reagent for RNA detection of any one of Claims 1-3 represented by following General formula (3).
(In the above general formula (3), Nu is a group formed by removing the 5′-terminal hydroxyl group from the oligonucleotide, and X may be a hydrogen atom from a condensed polycyclic aromatic compound which may have a hetero atom. In the fluorescent color developing unit, which is a divalent organic group obtained by removing two substituents, R 1 is the same as in the general formula (1), R 2 is a hydrogen atom or an alkyl group, and Z is It is a divalent group or a single bond, and n is an integer of 1 to 18. In the general formula (3), the oxygen atom present between Nu and Z is the 5′- of the oligonucleotide. (This means the oxygen atom remaining after removing the hydrogen atom from the terminal hydroxyl group.)
上記一般式(3)におけるZが−P(=O)(−OH)O−である請求項4記載のRNA検出用試薬。   The reagent for RNA detection according to claim 4, wherein Z in the general formula (3) is -P (= O) (-OH) O-. 請求項1〜5のいずれか1項記載のRNA検出用試薬を検査対象に添加し、当該検査対象に紫外線又は可視光線を照射した際に、前記RNA検出用試薬の有する蛍光が増強するか否かを観察することにより前記検査対象内に標的となるRNAが含まれるか否かを判断する検査方法。   Whether or not the fluorescence of the RNA detection reagent is enhanced when the RNA detection reagent according to any one of claims 1 to 5 is added to the test object and the test object is irradiated with ultraviolet rays or visible light. A test method for determining whether or not a target RNA is contained in the test object by observing the above. 下記一般式(4)で表される、RNA検出用試薬を合成するための試薬。
(上記一般式(4)中、Xはヘテロ原子を有してもよい縮合多環芳香族化合物から水素原子でもよい置換基を2つ除いて得られる二価の有機基であり、Lは2価の有機基であり、Rは水素原子又はアルキル基であり、R及びRはそれぞれ独立にボロン酸の保護基であって、R及びRは互いに結合して環を形成してもよく、Rは亜リン酸基の保護基であり、R及びRはそれぞれ独立にアルキル基であって、R及びRは互いに結合して環を形成してもよい。)
A reagent for synthesizing a reagent for RNA detection represented by the following general formula (4).
(In the general formula (4), X is a divalent organic group obtained by removing two substituents which may be hydrogen atoms from a condensed polycyclic aromatic compound which may have a hetero atom, and L is 2 R 1 is a hydrogen atom or an alkyl group, R 3 and R 4 are each independently a boronic acid protecting group, and R 3 and R 4 are bonded to each other to form a ring. R 5 is a protecting group for the phosphite group, R 6 and R 7 are each independently an alkyl group, and R 6 and R 7 may be bonded to each other to form a ring. )
下記一般式(5)で表される請求項7記載の試薬。
(上記一般式(5)中、X、R、R、R、R、R及びRは上記一般式(4)と同様であり、Rは水素原子又はアルキル基であり、nは1〜18の整数である。)
The reagent of Claim 7 represented by following General formula (5).
(In the general formula (5), X, R 1 , R 3 , R 4 , R 5 , R 6 and R 7 are the same as those in the general formula (4), and R 2 is a hydrogen atom or an alkyl group. , N is an integer of 1-18.)
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