JP2013128461A - Nilaparvata lugens-resistant rice variety - Google Patents

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Abstract

PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a new rice variety resistant to Nilaparvata lugens.SOLUTION: The rice variety is characterized in that: a region corresponding to the region including from 759,931th base to 1,757,667th base in sixth chromosome of a rice variety Nipponbare in sixth chromosome of a rice individual in a chromosome of a rice variety Koshihikari is homolytically substituted with a chromosome fragment formed of the region of a rice variety Rathu Heenati; an upstream end of the chromosome fragment exists in the region corresponding to a region including from 512,802th base to 759,931th base of sixth chromosome of the rice variety Nipponbare; and a downstream end of the chromosome fragment exists in the region corresponding to a region including from 1,757,667th base to 1,957,098th base of sixth chromosome of the rice variety Nipponbare.

Description

本発明は、非遺伝子組み換え法により作出されたトビイロウンカ抵抗性のイネの新品種、当該新品種の鑑別方法、及びイネ個体のトビイロウンカ抵抗性を高める方法に関する。   The present invention relates to a new plant variety of rice plant resistant to rice plant produced by a non-genetic recombination method, a method for distinguishing the new plant species, and a method for increasing the plant plant resistance of a rice individual.

同一生物種に属するが、遺伝的構成が異なるために、ある形質において他の集団と異なる集団を品種という。すなわち、同じ種類の植物であったとしても、品種により、栽培の難易性や病虫害に対する抵抗性、収量、品質等が異なる。このため、農作物、特にイネやムギ類等の主要な作物においては、より優良な品種を得るための品種改良が古くから行われており、近年では、種苗会社等のみならず、国や県等の公的機関においても積極的に行われてきている。   A group that belongs to the same species but has a different genetic composition and is different from other groups in a certain trait is called a breed. That is, even if it is the same kind of plant, the difficulty of cultivation, resistance to pest damage, yield, quality, and the like differ depending on the variety. For this reason, in crops, especially major crops such as rice and wheat, varieties have been improved to obtain better varieties since ancient times. In recent years, not only seed companies, but also countries and prefectures. It has also been actively conducted in the public institutions.

近年、ゲノム解析技術は格段の進歩を遂げ、作物の改良を、高精度かつ容易に行えるようになった。とりわけ、DNAマーカー技術の進捗は著しく、同技術によって、有用な形質を備える新品種を作製することができるようになった。また、DNAマーカーを利用して、これまでに同定された重要遺伝子の有用アレルを含む染色体領域を置換することにより、他の多くの形質に対してほとんど影響を及ぼさずに、目的形質を特異的に改良することが出来るようになった(例えば、特許文献1参照。)。   In recent years, genome analysis technology has made great progress, and it has become possible to improve crops with high accuracy and ease. In particular, the progress of DNA marker technology has been remarkable, and it has become possible to produce new varieties with useful traits. In addition, by using a DNA marker to replace a chromosomal region containing a useful allele of an important gene that has been identified so far, the target trait can be identified with little effect on many other traits. (For example, refer to Patent Document 1).

トビイロウンカは、イネの株元に生息して植物体の汁を直接吸汁する、イネ栽培において最も深刻な被害をもたらす害虫の1つである。被害が甚大な場合は植物体が枯れ、さらに吸汁害が著しい場合には、坪枯れと呼ばれる現象のように水田全体に被害が及ぶ場合もある。その被害はアジアにおけるイネ栽培地域(熱帯〜亜熱帯〜温帯)の広い範囲に及ぶ。トビイロウンカは、ベトナムを中心とする東南アジアには通年生息しており、一部の個体群はジェット気流などに乗り、華南地方を経由し、例年8月中旬から日本へ飛来する。ベトナム及び中国南部より日本へ飛来したトビイロウンカは、九州地方を中心とした イネ栽培に深刻な被害をもたらす。   Brown planthopper is one of the most serious insect pests in rice cultivation that inhabit the rice stock and directly suck the juice of the plant body. If the damage is severe, the plant body will die, and if the sucking damage is significant, the whole paddy field may be damaged like a phenomenon called plowing. The damage covers a wide range of rice cultivation areas (tropical-subtropical-temperate) in Asia. Tobiro planta live throughout the year in Southeast Asia, mainly in Vietnam, and some populations ride on a jet stream and fly to Japan from mid-August through the South China region. Flying planthoppers flying to Japan from Vietnam and southern China cause serious damage to rice cultivation, especially in the Kyushu region.

トビイロウンカの防除方法としては、農薬(殺虫剤)の散布の他、トビイロウンカ抵抗性品種を栽培することが挙げられる。トビイロウンカ抵抗性品種は、例えば、交雑育種法により育成される。具体的には、抵抗性品種と感受性品種を交雑し、交雑系統を自殖により遺伝的固定し、有望な形質を有する(トビイロウンカ抵抗性を有しかつ一般的な農業形質に優れる)品種を育成する。   As a method for controlling the planthopper, it is possible to cultivate planthopper-resistant varieties in addition to the application of agricultural chemicals (insecticides). The planthopper resistant cultivar is bred, for example, by a cross breeding method. Specifically, crossing resistant varieties and susceptible varieties, genetically fixing the crossed lines by self-breeding, cultivating varieties with promising traits (resistant to common planthoppers and excellent in general agricultural traits) To do.

日本において品種登録出願されているトビイロウンカ抵抗性品種は、イネ品種関東BPH1号のみである。イネ品種関東BPH1号は、イネ品種ヒノヒカリの準同質遺伝子系統であり、インド型系統であるイネ品種IR54742(GSK178−2)が持つ野生稲O.officinalis由来のトビイロウンカ抵抗性遺伝子bph11が導入されている。   The rice planthopper resistant variety that has been applied for variety registration in Japan is only the rice variety Kanto BPH1. Rice cultivar Kanto BPH1 is a near-isogenic line of the rice cultivar Hinohikari and is a wild rice O. pneumoniae possessed by the rice cultivar IR54742 (GSK178-2), which is an Indian type. The planthopper resistance gene bph11 derived from officinalis has been introduced.

一方で、トビイロウンカ抵抗性遺伝子に対する加害性は、時間と共に変化する。例えば、日本に飛来するトビイロウンカは、抵抗性遺伝子Bph1を持つイネ品種Mudgo及びイネ品種IR26や、抵抗性遺伝子Bph2を持つイネ品種ASD7に対しては、近年継続的に加害性を増している。一方で、抵抗性遺伝子Bph3を持つイネ品種水稲中間母本農10号や抵抗性遺伝子Bph4を持つイネ品種Babaweeに対する加害性には、顕著な変化は見られていない(例えば、非特許文献1参照。)。つまり、今後、トビイロウンカ抵抗性イネ品種の育種を行う際には、抵抗性遺伝子Bph1やBph2以外の抵抗性遺伝子を導入することが好ましい。   On the other hand, the damage to the brown planthopper resistance gene changes with time. For example, the brown planthopper flying in Japan has been continuously increasing the harm to rice varieties Mudgo and rice varieties IR26 having resistance gene Bph1 and rice varieties ASD7 having resistance gene Bph2. On the other hand, no significant change has been observed in the damage to rice varieties paddy rice intermediate mother farm No. 10 having resistance gene Bph3 and rice cultivar Babayee having resistance gene Bph4 (see, for example, Non-Patent Document 1). .) That is, it is preferable to introduce a resistance gene other than the resistance genes Bph1 and Bph2 when breeding rice planthopper-resistant rice varieties in the future.

中でも、抵抗性遺伝子Bph3は、スペクトラムが広い。抵抗性遺伝子Bph3を有するイネ品種としては、スリランカ原産のイネ品種Rathu Heenati及びイネ品種PTB33が知られている。これらの第6染色体に、抵抗性遺伝子Bph3は存在する(例えば、非特許文献2参照。)。   Among them, the resistance gene Bph3 has a wide spectrum. As rice varieties having the resistance gene Bph3, rice varieties Rathu Heenati and rice varieties PTB33, which are native to Sri Lanka, are known. The resistance gene Bph3 is present on these chromosomes 6 (see, for example, Non-Patent Document 2).

特許第4409610号公報Japanese Patent No. 4409610

農業環境技術研究所、「日本に飛来するトビイロウンカにおける抵抗性品種加害性の増大」、関東東山病虫研報、1999年、第46巻、第85〜88ページ。National Institute for Agro-Environmental Sciences, “Increased resistance of resistant cultivars in brown planthoppers flying to Japan”, Kanto Higashiyama Insect Research Bulletin, 1999, Vol. 46, pages 85-88. ジャイリン(Jairin)、他4名、モル・ブリーディング(Mol Breeding)、2007年、第19巻、第35〜44ページ。Jairin, 4 others, Mol Breeding, 2007, Volume 19, pages 35-44. タナカ(Tanaka)、ペスト・サイエンス・アンド・マネジメント(Pest science and management)、2000年、第18〜19ページ。Tanaka, Pest science and management, 2000, pages 18-19.

近年の温暖化現象の影響により、九州より北東の地域にも、トビイロウンカの被害が拡大するおそれがある。一方で、イネ品種ヒノヒカリは、その出穂特性から、九州をその栽培中心地とする。従って、イネ品種ヒノヒカリの準同質遺伝子系統であるイネ品種関東BPH1号の栽培適地も九州である。つまり、九州よりも北の地域で栽培可能なトビイロウンカ抵抗性のイネ品種は育成されてこなかった。   Due to the recent global warming phenomenon, the damage of brown planthoppers may spread to the northeast of Kyushu. On the other hand, rice cultivar Hinohikari uses Kyushu as its cultivation center because of its heading characteristics. Accordingly, Kyushu is also suitable for cultivation of rice cultivar Kanto BPH1, which is a near-isogenic line of the rice cultivar Hinohikari. In other words, no rice plant resistant to the brown planthopper that can be cultivated in the area north of Kyushu.

本発明は、トビイロウンカへの抵抗性を有しつつ、一般的な農業形質についても優れたイネの新品種を提供することを目的とする。   It is an object of the present invention to provide a new rice cultivar having resistance to a brown planthopper and having excellent general agricultural characters.

本発明者は、上記課題を解決すべく鋭意研究した結果、野生稲のイネ品種Rathu Heenatiの第6染色体に存在する抵抗性遺伝子Bph3を含む領域の染色体断片を、イネ品種コシヒカリにホモで置換することにより、トビイロウンカへの抵抗性を有しつつ、一般的な農業形質についても優れたイネの新品種を育種できることを見出し、本発明を完成させた。   As a result of diligent research to solve the above-mentioned problems, the present inventor has replaced the chromosome fragment of the region containing the resistance gene Bph3 present in the chromosome 6 of the wild rice rice variety Rathu Heenati with the rice variety Koshihikari. As a result, it was found that a new rice cultivar having resistance to the brown planthopper and having excellent general agricultural characters can be bred, and the present invention has been completed.

すなわち、本発明は、
(1) イネ品種コシヒカリの染色体中、
イネ個体の第6染色体中の、イネ品種日本晴の第6染色体中の759,931番目の塩基から1,757,667番目の塩基までを含む領域に相当する領域が、イネ品種Rathu Heenatiの当該領域からなる染色体断片にホモ置換されており、かつ前記染色体断片の上流端が、イネ品種日本晴の第6染色体の512,802番目の塩基から759,931番目の塩基までを含む領域に相当する領域に存在し、かつ当該染色体断片の下流端が、イネ品種日本晴の第6染色体の1,757,667番目の塩基から1,957,098番目の塩基までを含む領域に相当する領域に存在していることを特徴とするイネ品種、
(2) 受託番号がFERM P−22183である、イネ品種コシヒカリえいち7号(Oryza sativa L.cultivar Koshihikari−eichi7 gou)、
(3) 前記(1)記載の品種の個体、前記(1)記載の品種の個体の後代個体、前記(2)記載の品種の個体、及び前記(2)記載の品種の個体の後代個体からなる群より選択される2個体を交配して得られる後代個体、
(4) あるイネ個体が、イネ品種コシヒカリえいち7号であるか否かを鑑別する方法であって、
イネ品種日本晴の第6染色体中の512,801番目のSNP(一塩基多型)に相当するSNP(イネ品種コシヒカリではG、イネ品種Rathu HeenatiではC)をDNAマーカーM1とし、
イネ品種日本晴の第6染色体の759,931番目のSNPに相当するSNP(イネ品種コシヒカリではA、イネ品種Rathu HeenatiではT)をDNAマーカーM2とし、
イネ品種日本晴の第6染色体の1,757,667番目のSNPに相当するSNP(イネ品種コシヒカリではC、イネ品種Rathu HeenatiではG)をDNAマーカーM3とし、
イネ品種日本晴の第6染色体の1,957,099番目のSNPに相当するSNP(イネ品種コシヒカリではG、イネ品種Rathu HeenatiではT)をDNAマーカーM4とし、
当該イネ個体のゲノム解析により、前記DNAマーカーM1〜M4をタイピングし、
得られたタイピング結果が、前記DNAマーカーM1はG(グアニン)であり、前記DNAマーカーM2はT(チミン)であり、前記DNAマーカーM3はG(グアニン)であり、前記DNAマーカーM4はGである場合に、当該イネ個体がイネ品種コシヒカリえいち7号であると鑑別することを特徴とする、イネ品種の鑑別方法、
(5) イネ個体の第6染色体中の、イネ品種日本晴の第6染色体中の759,931番目の塩基から1,757,667番目の塩基までを含む領域に相当する領域を、請求項1に記載のイネ品種、イネ品種コシヒカリえいち7号、又はイネ品種Rathu Heenatiの当該領域からなる染色体断片にホモ置換することを特徴とする、イネ個体のトビイロウンカ抵抗性を高める方法、
(6) 前記(5)に記載のイネ個体のトビイロウンカ抵抗性を高める方法により作出されたイネ品種、
(7) 前記(6)記載の品種の個体及び前記(6)記載の品種の個体の後代個体からなる群より選択される2個体を交配して得られる後代個体、
を、提供するものである。
That is, the present invention
(1) In the chromosome of the rice variety Koshihikari,
The region corresponding to the region from the 759th, 931st base to the 1,757th, 667th base in the 6th chromosome of the rice cultivar Nipponbare in the 6th chromosome of the rice individual is the region of the rice cultivar Ratu Heenati And the upstream end of the chromosome fragment is a region corresponding to the region from the 512th, 802th base to the 759th, 931st base of the 6th chromosome of the rice cultivar Nipponbare. And the downstream end of the chromosomal fragment is present in a region corresponding to the region from the first 757,667th base to the first 1,957,098th base of the sixth chromosome of the rice cultivar Nipponbare. Rice varieties characterized by
(2) Rice cultivar Koshihikari eichi 7 (Oryza sativa L. cultivar Koshihikari-eichi7 gou), whose accession number is FERM P-22183,
(3) From the individual of the breed described in (1), the progeny individual of the individual of the breed described in (1), the individual of the breed of (2), and the progeny individual of the individual of the breed described in (2) A progeny individual obtained by mating two individuals selected from the group consisting of:
(4) A method for discriminating whether a rice individual is the rice variety Koshihikari eichi 7 or not,
The SNP corresponding to the SNP (single nucleotide polymorphism) at positions 512 and 801 in the chromosome 6 of rice cultivar Nipponbare is G DNA for rice cultivar Koshihikari and C for rice cultivar Rathu Heenati as DNA marker M1,
SNP corresponding to the 759th and 931st SNP of chromosome 6 of rice cultivar Nipponbare (A for rice cultivar Koshihikari and T for rice cultivar Rathu Heenati) is DNA marker M2,
The SNP corresponding to the 1,757,667th SNP of chromosome 6 of rice cultivar Nipponbare (C for rice cultivar Koshihikari and G for rice cultivar Rathu Heenati) is defined as DNA marker M3,
SNP corresponding to the 1,957,099th SNP of chromosome 6 of rice cultivar Nipponbare (G for rice cultivar Koshihikari and T for rice cultivar Rathu Heenati) is DNA marker M4,
The DNA markers M1 to M4 are typed by genome analysis of the rice individual,
As a result of typing, the DNA marker M1 is G (guanine), the DNA marker M2 is T (thymine), the DNA marker M3 is G (guanine), and the DNA marker M4 is G. In some cases, the rice cultivar is identified as the rice cultivar Koshihikari eichi No. 7;
(5) The region corresponding to the region including from the 759th, 931st base to the 1,757th, 667th base in the 6th chromosome of the rice variety Nipponbare in the 6th chromosome of the rice individual A method for increasing resistance to the brown planthopper of a rice individual, characterized by homo-substituting a chromosome fragment comprising the region of the rice cultivar, rice cultivar Koshihikari eichi 7 or rice cultivar Ratu Heenati,
(6) A rice cultivar produced by the method for enhancing resistance to brown planthopper of a rice individual according to (5),
(7) A progeny individual obtained by mating two individuals selected from the group consisting of an individual of the variety described in (6) and a progeny individual of the individual of the variety described in (6),
Is provided.

イネ品種コシヒカリえいち7号をはじめとする本発明の新品種は、コシヒカリよりもトビイロウンカへの抵抗性が高いが、品質や収穫量等のその他の特性はコシヒカリとほぼ同等な新品種である。   The new varieties of the present invention, including the rice cultivar Koshihikari Eichi No. 7, are more resistant to the brown planthopper than Koshihikari, but other properties such as quality and yield are similar to Koshihikari.

抵抗性遺伝子Bph3が存在する領域Lの近隣に設定したDNAマーカーM1〜M4の位置を模式的に示した図である。It is the figure which showed typically the position of the DNA markers M1-M4 set to the vicinity of the area | region L where resistance gene Bph3 exists. イネ品種コシヒカリとイネ品種Rathu Heenatiの間で多型を示す分子マーカーのゲノム中における位置を、イネ品種日本晴のゲノム中の相当する位置に模式的に示した図である。It is the figure which showed typically the position in the genome of the molecular marker which shows a polymorphism between the rice cultivar Koshihikari and the rice cultivar Rathu Heenati in the corresponding position in the genome of the rice cultivar Nipponbare. イネ品種コシヒカリえいち7号のゲノムを模式的に表した図である。It is the figure which represented typically the genome of rice varieties Koshihikari eichi 7go. 実施例1において、イネ品種コシヒカリ、イネ品種Rathu Heenati、及びイネ品種コシヒカリえいち7号の、放飼開始から5日間経過後のトビイロウンカの死亡率(%)を示した図である。In Example 1, it is the figure which showed the mortality (%) of the brown planthopper of rice cultivar Koshihikari, the rice cultivar Rathu Heenati, and the rice cultivar Koshihikari eichi 7 after 5 days from the start of release.

本発明及び本願明細書において「イネ品種日本晴の染色体のX番目の塩基からY番目の塩基までの領域」は、RGB(Rice Genome Research Program:http://rgp.dna.affrc.go.jp/publicdata.html)において公開されているイネ品種日本晴のゲノムDNAの塩基配列(TIGER バージョン2)に基づいて決定される領域である。   In the present invention and the specification of the present application, “region from the Xth base to the Yth base of the chromosome of rice cultivar Nipponbare” is RGB (Rice Genome Research Program: http://rgp.dna.affrc.go.jp/ (publicdata.html) is a region determined based on the base sequence (TIGER version 2) of the genomic DNA of rice cultivar Nipponbare.

また、本発明及び本願明細書において、「イネ品種日本晴の染色体のX番目の塩基からY番目の塩基までの領域に相当する領域」とは、イネ個体の染色体中のイネ品種日本晴の染色体中の当該領域と相同性の高い領域であり、イネ品種日本晴の公知のゲノムDNAと当該イネ個体のゲノムDNAの塩基配列を、最もホモロジーが高くなるようにアラインメントすることにより決定することができる。また、イネ品種日本晴以外のイネ個体中の「イネ品種日本晴のSNP(Single Nucleotide Polymorphism、一遺伝子多型)に相当するSNP」は、当該SNPを含む領域において、イネ品種日本晴の公知のゲノムDNAと当該イネ個体のゲノムDNAの塩基配列を、最もホモロジーが高くなるようにアラインメントした場合に、当該SNPに対応する位置にある塩基を意味する。   Further, in the present invention and the present specification, “the region corresponding to the region from the Xth base to the Yth base of the chromosome of rice cultivar Nipponbare” refers to the chromosome of the rice cultivar Nipponbare in the chromosome of the rice individual. This region is highly homologous to the region, and can be determined by aligning the known genomic DNA of the rice cultivar Nipponbare and the base sequence of the genomic DNA of the rice individual so as to have the highest homology. In addition, “SNP corresponding to SNP (Single Nucleotide Polymorphism) of rice varieties Nipponbare” in rice individuals other than the rice cultivar Nipponbare is a known genomic DNA of the rice cultivar Nipponbare in the region containing the SNP. When the base sequence of the genomic DNA of the rice individual is aligned so as to have the highest homology, it means a base at a position corresponding to the SNP.

本発明において品種とは、同一種の植物であって、遺伝的構成が異なるために、ある形質において同種内の他品種から明確に識別し得る集団を意味する。また、イネ品種日本晴及びイネ品種コシヒカリの遺伝子情報等は、例えば、国際的な塩基配列データベースであるNCBI(National center for Biotechnology Information)やDDBJ(DNA Data Bank of Japan)等において入手することができる。特にイネの各品種の遺伝子情報は、KOME(Knowledge−based Oryza Molecular biological Encyclopedia、http://cdna01.dna.affrc.go.jp/cDNA/)等において入手することができる。   In the present invention, a variety means a group that is a plant of the same species and can be clearly discriminated from other varieties in the same species in a certain trait due to different genetic constitution. In addition, genetic information of rice varieties Nipponbare and rice cultivar Koshihikari can be obtained from, for example, NCBI (National Center for Biotechnology Information) and DDBJ (DNA Data Bank of Japan), which are international base sequence databases. In particular, genetic information of rice varieties can be obtained at KOME (Knowledge-based Oryzal Molecular Biological Encyclopedia, http://cdna01.dna.affrc.go.jp/cDNA/) and the like.

本発明及び本願明細書において、DNAマーカーとは、異なる品種由来の染色体断片同士を識別し得る染色体上のDNA配列の差異を検出し得るものである。DNA配列の差異とは、具体的には、SNPである。   In the present invention and the specification of the present application, a DNA marker can detect a difference in DNA sequence on a chromosome that can distinguish chromosome fragments derived from different varieties. Specifically, the difference in DNA sequence is SNP.

DNAマーカーによる、ある品種由来アレルとその他の品種由来アレルとの識別は、常法により行うことができる。例えば、各個体から抽出したDNAを鋳型とし、特定のSNPやSSRと特異的にハイブリダイズし得るプライマー等を用いてPCRを行い、電気泳動法等を用いてPCR産物の有無を検出し、各多型を識別することができる。また、各個体から抽出したDNAを制限酵素処理した後、電気泳動法等を用いてDNA断片のパターンを検出し、各多型を識別することができる。なお、特定のSNPと特異的にハイブリダイズし得るプライマー等は、該SNPの塩基配列に応じて、汎用されているプライマー設計ツール等を用いて常法により設計することができる。また、設計されたプライマー等は、当該技術分野においてよく知られている方法のいずれを用いても合成することができる。
なお、これらのDNAマーカーによる、ある品種由来アレルとその他の品種由来アレルとの識別は、常法により行うことができる。例えば、各個体から抽出したDNAを鋳型とし、特定のSNPやSSRと特異的にハイブリダイズし得るプライマー等を用いてPCRを行い、電気泳動法等を用いてPCR産物の有無を検出し、各多型を識別することができる。また、各個体から抽出したDNAを制限酵素処理した後、電気泳動法等を用いてDNA断片のパターンを検出し、各多型を識別することができる。なお、特定のSNPと特異的にハイブリダイズし得るプライマー等は、該SNPの塩基配列に応じて、汎用されているプライマー設計ツール等を用いて常法により設計することができる。また、設計されたプライマー等は、当該技術分野においてよく知られている方法のいずれを用いても合成することができる。
Discrimination between a certain variety-derived allele and another variety-derived allele by a DNA marker can be performed by a conventional method. For example, using DNA extracted from each individual as a template, performing PCR using a primer that can specifically hybridize with a specific SNP or SSR, detecting the presence or absence of a PCR product using electrophoresis or the like, Polymorphism can be identified. In addition, after DNA extracted from each individual is treated with a restriction enzyme, the pattern of the DNA fragment can be detected using electrophoresis or the like to identify each polymorphism. In addition, a primer or the like that can specifically hybridize with a specific SNP can be designed by a conventional method using a commonly used primer design tool or the like according to the base sequence of the SNP. In addition, designed primers and the like can be synthesized using any method well known in the art.
In addition, the discrimination between a certain variety-derived allele and other variety-derived alleles by these DNA markers can be performed by a conventional method. For example, using DNA extracted from each individual as a template, performing PCR using a primer that can specifically hybridize with a specific SNP or SSR, detecting the presence or absence of a PCR product using electrophoresis or the like, Polymorphism can be identified. In addition, after DNA extracted from each individual is treated with a restriction enzyme, the pattern of the DNA fragment can be detected using electrophoresis or the like to identify each polymorphism. In addition, a primer or the like that can specifically hybridize with a specific SNP can be designed by a conventional method using a commonly used primer design tool or the like according to the base sequence of the SNP. In addition, designed primers and the like can be synthesized using any method well known in the art.

本発明者らは、九州以北の地域で広く栽培されている良食味系統であるイネ品種コシヒカリに、野生稲のイネ品種Rathu Heenatiの第6染色体に存在する抵抗性遺伝子Bph3を導入することにより、トビイロウンカへの抵抗性を有しつつ、イネ品種コシヒカリと同様の優れた品質を有する新品種を育種し得ると考えた。   By introducing the resistance gene Bph3 present in the chromosome 6 of the rice cultivar Ratu Heenati of wild rice into the rice cultivar Koshihikari, which is a good tasting line widely cultivated in the area north of Kyushu. Therefore, it was considered that a new variety having excellent quality similar to that of the rice cultivar Koshihikari can be bred while having resistance to brown planthopper.

トビイロウンカは、その遺伝的な変化により、従来は抵抗性を示していた品種を加害するトビイロウンカの個体群が出現する可能性がある。このため、迅速なトビイロウンカ抵抗性の育種が求められていた。しかしながら、従来技術においては、トビイロウンカへの抵抗性を有しつつ、一般的な農業形質についても優れた系統の選抜を、形質調査の結果のみから行う。つまり、形質調査の結果に基づいて、膨大な交雑系統群の中から目的とする系統を選抜する必要がある。こうした事情から、品種育成期間が長期間(一般的に10年以上)に及ぶという問題点がある。   Due to its genetic change, the planthopper of green planthopper may appear to infest the cultivar that had previously shown resistance. For this reason, rapid breeding of leafhopper resistance has been demanded. However, in the prior art, selection of a line that is resistant to the brown planthopper and excellent in general agricultural traits is performed only from the results of the trait survey. That is, it is necessary to select a target line from a huge group of hybrid lines based on the results of the trait survey. Under such circumstances, there is a problem that the breeding period is long (generally 10 years or more).

そこで、本発明者らは、より迅速に育種を達成するために、トビイロウンカ抵抗性の新品種を、非遺伝子組み換え法により得られた後代個体からDNAマーカーを用いて所望の個体を選抜する特許文献1に記載の方法を用いて育種した。具体的には、イネ品種コシヒカリとイネ品種Rathu Heenatiを交配し、得られた後代個体に対して自家交配又は戻し交配を繰返し、DNAマーカーを用いた選抜により、イネ品種Rathu Heenatiの第6染色体に存在する抵抗性遺伝子Bph3を含む領域以外は、イネ品種コシヒカリ由来の染色体のみで構成される新品種を育種した。   Therefore, in order to achieve more rapid breeding, the present inventors select a desired individual using a DNA marker from a progeny individual obtained by non-genetic recombination for a new plant that is resistant to brown planthopper. Breeding using the method described in 1. Specifically, the rice cultivar Koshihikari and the rice cultivar Ratu Heenati were crossed, and the resulting progeny individuals were self-mated or backcrossed repeatedly, and by selection using a DNA marker, Except for the region containing the existing resistance gene Bph3, a new variety consisting only of chromosomes derived from the rice cultivar Koshihikari was bred.

まず、イネ品種コシヒカリ由来の染色体とイネ品種Rathu Heenati由来の染色体を識別するためのDNAマーカーを設定した。具体的には、まず、図1に示すように、イネ品種コシヒカリとイネ品種Rathu Heenatiの間で、多型を示す分子マーカーM1〜M4を、抵抗性遺伝子Bph3が存在する領域(Bph3領域、図1中、「Bph3」)を挟む形で設定した。図1中、「G」はイネ品種コシヒカリの染色体、「L」はイネ品種Rathu Heenati由来の染色体断片である。さらに、その他の全ゲノム領域を対象として、イネ品種コシヒカリとイネ品種Rathu Heenatiの間で多型を示す分子マーカーセットを、約10Mb置きに122個(DNAマーカー1〜122)を作製した。   First, a DNA marker for distinguishing a chromosome derived from the rice cultivar Koshihikari and a chromosome derived from the rice cultivar Ratu Heenati was set. Specifically, first, as shown in FIG. 1, between the rice cultivar Koshihikari and the rice cultivar Rathu Heenati, molecular markers M1 to M4 indicating polymorphisms are assigned to the region where the resistance gene Bph3 is present (Bph3 region, FIG. 1 and “Bph3”). In FIG. 1, “G” is a chromosome of the rice cultivar Koshihikari, and “L” is a chromosome fragment derived from the rice cultivar Rathu Heenati. Furthermore, for other whole genome regions, 122 molecular marker sets (DNA markers 1 to 122) having a polymorphism between rice cultivar Koshihikari and rice cultivar Rathu Heenati were prepared at intervals of about 10 Mb.

なお、イネ品種Rathu Heenatiのゲノムの塩基配列は、解析されていなかった。つまり、DNAマーカーM1〜M4、DNAマーカー1〜122は、本発明者らにより初めて見出されたものである。   In addition, the base sequence of the genome of the rice variety Rathu Heenati has not been analyzed. That is, the DNA markers M1 to M4 and the DNA markers 1 to 122 were first discovered by the present inventors.

DNAマーカーM1は、イネ品種日本晴の第6染色体中の512,801番目のSNP(一塩基多型)に相当するSNP(イネ品種コシヒカリではG(グアニン)、イネ品種Rathu HeenatiではC(シトシン))である。DNAマーカーM2は、イネ品種日本晴の第6染色体の759,931番目のSNPに相当するSNP(イネ品種コシヒカリではA(アデニン)、イネ品種Rathu HeenatiではT(チミン))である。DNAマーカーM3は、イネ品種日本晴の第6染色体の1,757,667番目のSNPに相当するSNP(イネ品種コシヒカリではC、イネ品種Rathu HeenatiではG)である。DNAマーカーM4は、イネ品種日本晴の第6染色体の1,957,099番目のSNPに相当するSNP(イネ品種コシヒカリではG、イネ品種Rathu HeenatiではT)である。DNAマーカーM1〜M4及び識別に使用可能なプライマーの塩基配列を表1に示す。   The DNA marker M1 is a SNP corresponding to the SNP (single nucleotide polymorphism) at positions 512 and 801 in the chromosome 6 of the rice cultivar Nipponbare (G (guanine) for the rice cultivar Koshihikari and C (cytosine) for the rice cultivar Rathu Heenati). It is. The DNA marker M2 is an SNP corresponding to the 759th and 931st SNPs of chromosome 6 of the rice cultivar Nipponbare (A (adenine) in the rice cultivar Koshihikari and T (thymine) in the rice cultivar Rathu Heenati). The DNA marker M3 is a SNP corresponding to the 1,757,667th SNP of chromosome 6 of the rice cultivar Nipponbare (C for the rice cultivar Koshihikari and G for the rice cultivar Ratu Heenati). The DNA marker M4 is a SNP corresponding to the 1957th and 099th SNP of chromosome 6 of the rice cultivar Nipponbare (G for the rice cultivar Koshihikari and T for the rice cultivar Rathu Heenati). Table 1 shows the base sequences of DNA markers M1 to M4 and primers that can be used for identification.

Figure 2013128461
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図2に、各DNAマーカーのゲノム中の位置を、イネ品種日本晴のゲノム中の相当する位置に模式的に示した。図中、実線部分は、イネ品種コシヒカリのゲノムに当該部分に相当する領域が存在する領域であり、点線部分はイネ品種コシヒカリのゲノムに当該部分に相当する領域が存在していない領域である。また、各DNAマーカーの位置を、表2〜4に示す。なお、各表の染色体中の位置情報は、イネ品種日本晴のゲノム中の相当するSNPの位置である。   FIG. 2 schematically shows the position of each DNA marker in the genome at the corresponding position in the genome of the rice cultivar Nipponbare. In the figure, the solid line portion is a region where the region corresponding to the portion exists in the genome of the rice variety Koshihikari, and the dotted line portion is a region where the region corresponding to the portion does not exist in the genome of the rice variety Koshihikari. Moreover, the position of each DNA marker is shown in Tables 2-4. In addition, the positional information in the chromosome of each table | surface is the position of the corresponding SNP in the genome of rice cultivar Nipponbare.

Figure 2013128461
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DNAマーカーを設定した後、イネ品種コシヒカリとイネ品種Rathu Heenatiの間で、イネ品種コシヒカリを戻し親とする戻し交雑を行い、得られたイネ個体に対してDNAマーカーM1〜M4及びDNAマーカー1〜122によるタイピングを行い、Bph3領域はイネ品種コシヒカリ由来の染色体断片とイネ品種Rathu Heenati由来の染色体断片のヘテロであり、その他の領域は全てイネ品種コシヒカリ由来の染色体であるイネ個体(以下、NILヘテロ)が得られるまで戻し交雑と自殖を繰り返した。その後、得られたNILヘテロの自殖後代から、DNAマーカーM1〜M4のタイピングし、両アレルにおいて、DNAマーカーM1及びM4がイネ品種コシヒカリタイプであり、DNAマーカーM2及びM3がイネ品種Rathu Heenatiタイプであるイネ個体、すなわち、Bph3領域がイネ品種Rathu Heenati由来の染色体断片のホモであるイネ個体を選抜した。得られたイネ個体は、トビイロウンカに対する抵抗性を有していた。本発明者らは、当該方法により、3年10ヶ月という非常に短い育成期間でトビイロウンカ抵抗性品種の育成を完了した。   After setting the DNA marker, backcrossing with the rice cultivar Koshihikari as the back parent between the rice cultivar Koshihikari and the rice cultivar Rathu Heenati was carried out, and DNA markers M1 to M4 and DNA markers 1 to 122, the Bph3 region is heterozygous of a chromosome fragment derived from rice cultivar Koshihikari and the rice cultivar Ratu Heenati, and all other regions are rice individuals (hereinafter referred to as NIL heterozygous) that are chromosomes derived from rice cultivar Koshihikari. Backcrossing and self-breeding were repeated until Thereafter, DNA markers M1 to M4 were typed from the obtained NIL heterozygous progeny, and in both alleles, DNA markers M1 and M4 were rice cultivar Koshihikari type, and DNA markers M2 and M3 were rice cultivar Rathu Heenati type. Rice individuals, ie, rice individuals whose Bph3 region is homologous to a chromosomal fragment derived from the rice cultivar Ratu Heenati were selected. The obtained rice individuals had resistance to the brown planthopper. The inventors of the present invention have completed the cultivation of the brown planthopper-resistant cultivar in a very short growing period of 3 years and 10 months.

本発明者らは、得られたイネ個体を、イネ品種コシヒカリえいち7号と命名した。図3はコシヒカリえいち7号のゲノムを模式的に表した図である。イネ品種コシヒカリえいち7号は、イネ品種Rathu Heenati由来のBph3領域を有しつつ、それ以外の領域はイネ品種コシヒカリ由来の染色体のみで構成される、イネ品種コシヒカリの準同質遺伝子系統であり、トビイロウンカ抵抗性を有しつつ、イネ品種コシヒカリが有する味等の優良形質を維持しているという非常に優れた品種である。そこで、出願人は、コシヒカリえいち7号を、独立行政法人産業技術総合研究所特許生物寄託センター(茨城県つくば市東1−1−1 つくばセンター中央第6)に新規植物として寄託した(寄託日:平成23年11月1日)。受託番号はFERM P−22183である。   The present inventors named the obtained rice individual the rice variety Koshihikari eichi 7go. FIG. 3 is a diagram schematically showing the genome of Koshihikari eichi 7go. Rice cultivar Koshihikari eichi No. 7 is a near isogenic line of rice cultivar Koshihikari, which has a Bph3 region derived from rice cultivar Rathu Heenati, but the other regions are composed only of chromosomes derived from rice cultivar Koshihikari, It is a very excellent variety that maintains the excellent traits such as taste of rice cultivar Koshihikari while having resistance to brown planthopper. Therefore, the applicant has deposited Koshihikari eichi 7 as a new plant at the National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, Patent Biological Deposit Center (1-1-1 Tsukuba Center, Tsukuba, Ibaraki Pref.) : November 1, 2011). The accession number is FERM P-22183.

また、イネ品種コシヒカリえいち7号を得た方法と同様にして、イネ品種コシヒカリとイネ品種Rathu Heenatiから、イネ品種コシヒカリの染色体中、イネ個体の第6染色体中の、イネ品種日本晴の第6染色体中の759,931番目の塩基から1,757,667番目の塩基までを含む領域に相当する領域が、イネ品種Rathu Heenatiの当該領域からなる染色体断片にホモ置換されており、かつ前記染色体断片の上流端が、イネ品種日本晴の第6染色体の512,802番目の塩基から759,931番目の塩基までを含む領域に相当する領域に存在し、かつ当該染色体断片の下流端が、イネ品種日本晴の第6染色体の1,757,667番目の塩基から1,957,098番目の塩基までを含む領域に相当する領域に存在しているイネ品種を作出することができる。得られたイネ品種は、イネ品種Rathu Heenati由来のBph3領域を含む染色体断片をホモで有するイネ品種コシヒカリの準同質遺伝子系統であるため、イネ品種コシヒカリえいち7号と同様に、トビイロウンカ抵抗性が高く、かつ品質や収穫量等の収穫期以外の特性はコシヒカリとほぼ同等なイネ品種である。   In the same manner as the method for obtaining rice cultivar Koshihikari eichi No. 7, from rice cultivar Koshihikari and rice cultivar Rathu Heenati, in the chromosome of rice cultivar Koshihikari, in the sixth chromosome of rice cultivar Nipponbare 6 The region corresponding to the region from the 759th, 931st base to the 1,757th, 667th base in the chromosome is homo-replaced with a chromosomal fragment of the rice cultivar Ratu Heenati, and the chromosomal fragment Is located in the region corresponding to the region from the 512th, 802th base to the 759th, 931st base of the sixth chromosome of the rice cultivar Nipponbare, and the downstream end of the chromosome fragment is the rice cultivar Nipponbare. The region corresponding to the region from base 1,757,667 to base 1,957,098 of chromosome 6 Rice varieties existing in the area can be created. The obtained rice cultivar is a near-isogenic line of rice cultivar Koshihikari that has a homologous chromosomal fragment containing the Bph3 region derived from rice cultivar Ratu Heenati. Rice varieties that are high and have characteristics similar to those of Koshihikari in terms of quality and yield other than the harvest period.

これらの結果から、イネ個体の第6染色体中の、少なくともDNAマーカーM2−AtからDNAマーカーM3−Cgまでの領域(すなわち、イネ品種日本晴の第6染色体中の759,931番目の塩基から1,757,667番目の塩基までを含む領域に相当する領域)を、イネ品種Rathu Heenatiの当該領域からなる染色体断片に置換することにより、当該イネ個体を元品種よりもトビイロウンカに対する抵抗性を高めることができることが明らかである。なお、イネ品種コシヒカリえいち7号の当該領域は、イネ品種Rathu Heenatiの当該領域からなる染色体断片により構成されているため、イネ品種コシヒカリえいち7号の当該領域からなる染色体断片によって置換してもよい。また、イネ品種Rathu Heenatiの当該領域からなる染色体断片を導入することによりトビイロウンカ抵抗性を付与するイネ個体は、当該領域がイネ品種コシヒカリと同一若しくは近似した塩基配列を有している品種であればよく、イネ品種コシヒカリに限定されるものではないが、消費者の嗜好性等から、イネ品種コシヒカリ又はそれを親品種として作出された新品種であることが好ましい。   From these results, at least the region from the DNA marker M2-At to the DNA marker M3-Cg in the chromosome 6 of the rice individual (i.e., from the 759th and 931st bases in the chromosome 6 of the rice variety Nipponbare, 1, By replacing a region corresponding to the region including the 757th and 667th bases) with a chromosome fragment comprising the region of the rice cultivar Ratu Heenati, the rice individual can be more resistant to brown planthopper than the original cultivar. Obviously you can. Since the region of rice variety Koshihikari eichi 7 is composed of a chromosome fragment comprising the region of rice variety Rathu Heenati, the region is replaced by the chromosome fragment comprising the region of rice variety Koshihikari eichi 7 Also good. In addition, a rice individual that confers resistance to brown planthopper by introducing a chromosomal fragment from the region of the rice cultivar Ratu Heenati is a cultivar having the same or similar base sequence as the rice cultivar Koshihikari. Well, it is not limited to the rice cultivar Koshihikari, but it is preferably a rice cultivar Koshihikari or a new cultivar produced as a parent varieties because of consumer preference.

また、導入されるイネ品種Rathu Heenati由来(若しくはイネ品種コシヒカリえいち7号由来)の染色体断片の上流端が、DNAマーカーM1−Gcよりも下流であってDNAマーカーM2−Atまでの領域(すなわち、イネ品種日本晴の第6染色体中の512,802番目の塩基から759,931番目の塩基までを含む領域に相当する領域)に存在し、その下流端が、DNAマーカーM3−CgからDNAマーカーM4−Gtよりも上流までの領域(すなわち、イネ品種日本晴の第6染色体中の1,757,667番目の塩基から1,957,098番目の塩基までを含む領域に相当する領域)に存在するように、当該染色体断片をイネ個体の第6染色体中に導入することにより、その他の形質に明らかな影響を及ぼすことなく、当該イネ個体を、元品種よりもトビイロウンカに対する抵抗性を高めることができる。   Further, the upstream end of the chromosomal fragment derived from the rice cultivar Ratu Heenati (or derived from the rice cultivar Koshihikari eichi 7) is located downstream of the DNA marker M1-Gc and up to the DNA marker M2-At (ie, , A region corresponding to the region from the 512th to 802th bases to the 759th and 931st bases in the chromosome 6 of the rice cultivar Nipponbare, the downstream end of which is from the DNA marker M3-Cg to the DNA marker M4. -It seems to exist in the region up to the upstream of Gt (that is, the region corresponding to the region from the 1,757,667th base to the 1,957,098th base in the chromosome 6 of the rice cultivar Nipponbare) In addition, by introducing the chromosome fragment into the 6th chromosome of rice individuals, it has obvious effects on other traits Ku, the rice individuals, it is possible to enhance the resistance to rice brown planthopper than the original cultivar.

イネ品種コシヒカリえいち7号をはじめとする、イネ品種Rathu Heenati由来のBph3領域を有するイネ品種コシヒカリの準同質遺伝子系統は、元品種コシヒカリと同様の手法により、栽培し、自家交配や人工交配により米を収穫することができる。また、イネ品種コシヒカリえいち7号及びその後代個体は、元品種コシヒカリと同様に、新品種育成の親個体とすることができる。例えば、イネ品種コシヒカリえいち7号の個体と別の品種の個体とを交配し、得られた後代個体を、イネ品種コシヒカリえいち7号の個体と戻し交配することにより、新品種の育種を試みることもできる。   The rice cultivar Koshihikari with the Bph3 region derived from the rice cultivar Rashi Heenati, including the rice cultivar Koshihikari eichi No. 7, is cultivated by the same method as the original cultivar Koshihikari. Rice can be harvested. Moreover, the rice variety Koshihikari eichi No. 7 and its progeny individuals can be used as parent individuals for breeding new varieties, like the original variety Koshihikari. For example, by breeding an individual of the rice cultivar Koshihikari eichi 7 and an individual of another cultivar and backcrossing the obtained progeny individual with an individual of the rice cultivar Koshihikari eichi 7 You can also try.

また、表1に記載の4種類のDNAマーカー(DNAマーカーM1−Gc、DNAマーカーM2−At、DNAマーカーM3−Cg、及びDNAマーカーM4−Gt)は、イネ品種コシヒカリえいち7号に特有のゲノム情報である。したがって、イネ品種コシヒカリえいち7号は、これらの4種類のDNAマーカーを適宜用いて鑑別することができる。   In addition, the four types of DNA markers (DNA marker M1-Gc, DNA marker M2-At, DNA marker M3-Cg, and DNA marker M4-Gt) listed in Table 1 are specific to rice cultivar Koshihikari eichi 7 Genome information. Therefore, the rice cultivar Koshihikari eichi 7 can be distinguished using these four types of DNA markers as appropriate.

具体的には、本発明のイネ品種の鑑別方法は、あるイネ個体が、イネ品種コシヒカリえいち7号であるか否かを鑑別する方法であって、当該イネ個体のゲノム解析により、DNAマーカーM1−Gc、DNAマーカーM2−At、DNAマーカーM3−Cg、及びDNAマーカーM4−Gtをタイピングし、得られたタイピング結果が、イネ品種コシヒカリえいち7号の結果と一致する場合、すなわち、DNAマーカーM1−GcはGであり、DNAマーカーM2−AtはTであり、DNAマーカーM3−CgはGであり、DNAマーカーM4−GtはGである場合に、当該イネ個体がイネ品種コシヒカリえいち7号であると鑑別することを特徴とする。   Specifically, the method for distinguishing rice varieties of the present invention is a method for distinguishing whether a rice individual is the rice cultivar Koshihikari eichi 7 or not. When M1-Gc, DNA marker M2-At, DNA marker M3-Cg, and DNA marker M4-Gt are typed, and the obtained typing result matches the result of rice cultivar Koshihikari eichi no. 7, that is, DNA When the marker M1-Gc is G, the DNA marker M2-At is T, the DNA marker M3-Cg is G, and the DNA marker M4-Gt is G, the rice individual is the rice variety Koshihikari eichi It is distinguished that it is No. 7.

次に実施例を示して本発明をさらに詳細に説明するが、本発明は以下の実施例に限定されるものではない。   EXAMPLES Next, although an Example is shown and this invention is demonstrated further in detail, this invention is not limited to a following example.

[実施例1]
前述の方法により作出したイネ品種コシヒカリえいち7号のトビイロウンカに対する抵抗性を検定した。イネ品種コシヒカリ及びイネ品種Rathu Heenatiについても検定し、比較した。トビイロウンカ抵抗性の検定方法は、タナカらの方法(非特許文献3参照。)に準拠して行った。すなわち、イネ個体にトビイロウンカを放飼した後のトビイロウンカの死亡率を調べた。トビイロウンカ非抵抗性のイネの場合、トビイロウンカは葉の汁を吸うことができ、生存し得るが、トビイロウンカ抵抗性のイネの場合、トビイロウンカは葉の汁を吸うことができないため、死亡する。
検定のための植物サンプルとしては、各イネ品種のそれぞれについて15個体ずつ用いた。播種後1ヶ月程度育成した分げつ期の苗の登頂部を主茎の高さが約15cmとなるように切断した後、孵化から4週間程度育成したトビイロウンカ(羽化直後の短翅型雌成虫)を、苗1個体当たり5頭ずつ放飼した。5日間経過後、生存しているトビイロウンカの頭数を計数し、トビイロウンカの死亡率を算出した。
[Example 1]
The resistance of the rice cultivar Koshihikari eichi 7 produced by the above method to the brown planthopper was tested. The rice cultivar Koshihikari and the rice cultivar Rathu Heenati were also tested and compared. The test method of the brown planthopper resistance was performed according to the method of Tanaka et al. (See Non-Patent Document 3). That is, the mortality of the brown planthopper after releasing the brown planthopper to the rice individuals was examined. In the case of rice plant that is not resistant, the planthopper can suck and survive, but in the case of rice plant that is resistant, the planthopper dies because it cannot suck the leaf juice.
As plant samples for testing, 15 individuals were used for each rice variety. After cutting so that the top of the tillering seedling grown for about one month after sowing was cut so that the height of the main stalk was about 15 cm, the brown planthopper grown for about 4 weeks after hatching (short-winged female adult just after emergence) ) Were released at a rate of 5 per seedling. After 5 days, the number of living brown planthoppers was counted, and the death rate of the flying planthopper was calculated.

この結果、イネ品種コシヒカリでは、15個体中14個体において、放飼開始から5日間経過後に、5頭全てのトビイロウンカが生存していた、すなわち、トビイロウンカの死亡率は0%であった。また、イネ品種Rathu Heenatiでは、15個体中10個体において、放飼開始から5日間経過後のトビイロウンカの死亡率は100%であり、残る5個体においても、5頭のうち1頭しか生存しておらず、トビイロウンカの死亡率は80%であった。これに対して、イネ品種コシヒカリえいち7号では、15個体中10個体において、放飼開始から5日間経過後のトビイロウンカの死亡率は100%であり、残る5個体においても、5頭のうち1頭しか生存しておらず、トビイロウンカの死亡率は80%であった。図4に、イネ品種コシヒカリ、イネ品種Rathu Heenati、及びイネ品種コシヒカリえいち7号の、放飼開始から5日間経過後のトビイロウンカの死亡率(%)を示した。これらの結果から、イネ品種コシヒカリえいち7号は、イネ品種コシヒカリよりも明らかにトビイロウンカ抵抗性が高く、イネ品種Rathu Heenatiと同様にトビイロウンカ抵抗性品種であることが確認された。   As a result, in the rice cultivar Koshihikari, in 5 out of 15 individuals, all 5 brown planthoppers were alive after 5 days from the start of release, that is, the death rate of the brown planthopper was 0%. In the rice cultivar Rathu Heenati, 10 of 15 individuals have a 100% mortality rate after 5 days from the start of release, and the remaining 5 individuals survived only 1 out of 5 In addition, the death rate of the brown planthopper was 80%. In contrast, in the rice variety Koshihikari eichi 7 in 10 out of 15 individuals, the mortality rate of brown planthoppers after 5 days from the start of release is 100%, and among the remaining 5 individuals, Only one lived, and the brown mortality rate was 80%. FIG. 4 shows the mortality rate (%) of the brown planthopper of the rice cultivar Koshihikari, the rice cultivar Ratu Heenati, and the rice cultivar Koshihikari eichi 7 after 5 days from the start of release. From these results, it was confirmed that the rice variety Koshihikari eichi No. 7 is clearly higher in the resistance to leafhopper than the rice variety Koshihikari, and is a leafhopper resistance variety similar to the rice variety Rathu Heenati.

[実施例2]
イネ品種コシヒカリえいち7号とイネ品種コシヒカリの形質を比較検討した(千葉県にて、2009年、2010年に実施)。形質の検討は、種苗法(平成10年法律第83号)第5条第1項に基づく品種登録出願のための特性審査に準拠して行った。検討結果を表5〜7に示す。この結果、イネ品種コシヒカリえいち7号は、トビイロウンカに対する抵抗性がイネ品種コシヒカリよりも明らかに高くなっていたが、それ以外の形質は基本的にイネ品種コシヒカリと同じであった。
[Example 2]
The characteristics of rice variety Koshihikari eichi 7 and rice variety Koshihikari were compared (implemented in Chiba Prefecture in 2009 and 2010). The examination of the traits was conducted in accordance with the characteristic examination for the variety registration application based on Article 5 Paragraph 1 of the Seedling and Seedling Law (Act No. 83 of 1998). The examination results are shown in Tables 5-7. As a result, the rice cultivar Koshihikari eichi 7 was clearly higher in resistance to the brown planthopper than the rice cultivar Koshihikari, but other traits were basically the same as the rice cultivar Koshihikari.

Figure 2013128461
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イネ品種コシヒカリえいち7号をはじめとする本発明の新品種は、イネ品種コシヒカリよりもトビイロウンカに対する抵抗性が高い以外は、イネ品種コシヒカリと同様の品質や収穫量を備えるため、特に農業の分野において利用が可能である。   The new varieties of the present invention including the rice cultivar Koshihikari eichi 7 have the same quality and yield as the rice cultivar Koshihikari except that they are more resistant to the brown planthopper than the rice cultivar Koshihikari. Can be used in

FERM P−22183 FERM P-22183

Claims (7)

イネ品種コシヒカリの染色体中、
イネ個体の第6染色体中の、イネ品種日本晴の第6染色体中の759,931番目の塩基から1,757,667番目の塩基までを含む領域に相当する領域が、イネ品種Rathu Heenatiの当該領域からなる染色体断片にホモ置換されており、かつ前記染色体断片の上流端が、イネ品種日本晴の第6染色体の512,802番目の塩基から759,931番目の塩基までを含む領域に相当する領域に存在し、かつ当該染色体断片の下流端が、イネ品種日本晴の第6染色体の1,757,667番目の塩基から1,957,098番目の塩基までを含む領域に相当する領域に存在していることを特徴とするイネ品種。
In the chromosome of the rice variety Koshihikari,
The region corresponding to the region from the 759th, 931st base to the 1,757th, 667th base in the 6th chromosome of the rice cultivar Nipponbare in the 6th chromosome of the rice individual is the region of the rice cultivar Ratu Heenati And the upstream end of the chromosome fragment is a region corresponding to the region from the 512th, 802th base to the 759th, 931st base of the 6th chromosome of the rice cultivar Nipponbare. And the downstream end of the chromosomal fragment is present in a region corresponding to the region from the first 757,667th base to the first 1,957,098th base of the sixth chromosome of the rice cultivar Nipponbare. Rice varieties characterized by that.
受託番号がFERM P−22183である、イネ品種コシヒカリえいち7号(Oryza sativa L.cultivar Koshihikari−eichi7 gou)。   Rice cultivar Koshihikari Eichi No. 7 (Accessory No. FERM P-22183) (Oryza sativa L. multivar Koshihikari-eichi 7 gou). 請求項1記載の品種の個体、請求項1記載の品種の個体の後代個体、請求項2記載の品種の個体、及び請求項2記載の品種の個体の後代個体からなる群より選択される2個体を交配して得られる後代個体。   2 selected from the group consisting of an individual of the breed according to claim 1, a progeny individual of the individual of claim 1, an individual of the breed of claim 2, and a progeny individual of the individual of claim 2 Progeny individuals obtained by mating individuals. あるイネ個体が、イネ品種コシヒカリえいち7号であるか否かを鑑別する方法であって、
イネ品種日本晴の第6染色体中の512,801番目のSNP(一塩基多型)に相当するSNP(イネ品種コシヒカリではG、イネ品種Rathu HeenatiではC)をDNAマーカーM1とし、
イネ品種日本晴の第6染色体の759,931番目のSNPに相当するSNP(イネ品種コシヒカリではA、イネ品種Rathu HeenatiではT)をDNAマーカーM2とし、
イネ品種日本晴の第6染色体の1,757,667番目のSNPに相当するSNP(イネ品種コシヒカリではC、イネ品種Rathu HeenatiではG)をDNAマーカーM3とし、
イネ品種日本晴の第6染色体の1,957,099番目のSNPに相当するSNP(イネ品種コシヒカリではG、イネ品種Rathu HeenatiではT)をDNAマーカーM4とし、
当該イネ個体のゲノム解析により、前記DNAマーカーM1〜M4をタイピングし、
得られたタイピング結果が、前記DNAマーカーM1はG(グアニン)であり、前記DNAマーカーM2はT(チミン)であり、前記DNAマーカーM3はG(グアニン)であり、前記DNAマーカーM4はGである場合に、当該イネ個体がイネ品種コシヒカリえいち7号であると鑑別することを特徴とする、イネ品種の鑑別方法。
A method for discriminating whether a rice individual is the rice variety Koshihikari eichi 7 or not,
The SNP corresponding to the SNP (single nucleotide polymorphism) at positions 512 and 801 in the chromosome 6 of rice cultivar Nipponbare is G DNA for rice cultivar Koshihikari and C for rice cultivar Rathu Heenati as DNA marker M1,
SNP corresponding to the 759th and 931st SNP of chromosome 6 of rice cultivar Nipponbare (A for rice cultivar Koshihikari and T for rice cultivar Rathu Heenati) is DNA marker M2,
The SNP corresponding to the 1,757,667th SNP of chromosome 6 of rice cultivar Nipponbare (C for rice cultivar Koshihikari and G for rice cultivar Rathu Heenati) is defined as DNA marker M3,
SNP corresponding to the 1,957,099th SNP of chromosome 6 of rice cultivar Nipponbare (G for rice cultivar Koshihikari and T for rice cultivar Rathu Heenati) is DNA marker M4,
The DNA markers M1 to M4 are typed by genome analysis of the rice individual,
As a result of typing, the DNA marker M1 is G (guanine), the DNA marker M2 is T (thymine), the DNA marker M3 is G (guanine), and the DNA marker M4 is G. In some cases, the rice cultivar is identified as the rice cultivar Koshihikari eichi no.7.
イネ個体の第6染色体中の、イネ品種日本晴の第6染色体中の759,931番目の塩基から1,757,667番目の塩基までを含む領域に相当する領域を、請求項1に記載のイネ品種、イネ品種コシヒカリえいち7号、又はイネ品種Rathu Heenatiの当該領域からなる染色体断片にホモ置換することを特徴とする、イネ個体のトビイロウンカ抵抗性を高める方法。   The region corresponding to the region from the 759th, 931st base to the 1,757th, 667th base in the 6th chromosome of the rice cultivar Nipponbare in the 6th chromosome of the rice individual, A method for enhancing resistance to brown planthoppers, comprising homo-replacement with a chromosomal fragment comprising the region of rice cultivar, rice cultivar Koshihikari eichi 7 or rice cultivar Rathu Heenati. 請求項5に記載のイネ個体のトビイロウンカ抵抗性を高める方法により作出されたイネ品種。   A rice cultivar produced by the method for enhancing resistance to brown planthopper of a rice individual according to claim 5. 請求項6記載の品種の個体及び請求項6記載の品種の個体の後代個体からなる群より選択される2個体を交配して得られる後代個体。   A progeny individual obtained by mating two individuals selected from the group consisting of an individual of the cultivar according to claim 6 and a progeny individual of the cultivar of claim 6.
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