JP2012525579A - ミクロ切断方法及び情報処理システム - Google Patents
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Abstract
本発明は、本発明の他の側面において、生物学、組織学及び病理学のために使用する情報処理システムであり、前記情報処理システムは、既定の一組の処理識別子(64);生物材料を含む対象物(10)に関連する一組のデータ記録(68、70、72);前記データ記録のそれぞれが:前記対象物のスライス(12、14)を識別するスライス識別子及び前記一組の処理識別子から選択される処理識別子を含み、前記処理識別子が前記スライスが対象とされる処理を指示し;ユーザが前記一組のデータ記録からデータ記録を選択できるように、ユーザーインターフェース(52、56、58、60)を含む、情報処理システムを提供する。
Description
前記第二のスライスの前記関心領域から材料を抽出する手段を含む。
Claims (18)
- 生物学、組織学及び病理学のために使用する方法であり、前記方法は:
生物材料を含む対象物の第一のスライスの第一のデジタルイメージの準備;
前記対象物の第二のスライスの第二のデジタルイメージの生成;
前記第一のイメージの領域に基づき前記第二のスライスの関心領域の決定;
前記第二のイメージの領域に基づき前記第二のスライスの関心領域の決定;及び
前記第二のスライスの前記関心領域から材料を抽出することを含む、方法。 - 請求項1に記載の方法であり、前記第二のイメージの関心領域の決定が、
前記第一のイメージの特徴の位置を前記第二のイメージの類似の特徴の位置へマッピングする幾何学変換を決定すること;及び
該幾何学変換を前記第一のイメージの関心領域へ適用することを含む、方法。 - 請求項1に記載の方法であり、前記第二の関心領域の決定は、前記第一のイメージと第二のイメージを、前記第一のイメージの少なくともいくつかの特徴が第二のイメージの類似の特徴上に重なるように並べるか及び/又は前記第一のイメージと第二のイメージの重なりのコントラストが最大化されるように並べることを含む、方法。
- 請求項1に記載の方法であり、前記第二のスライスの関心領域を決定し、そこから材料を抽出することは、
前記第二のイメージの関心領域に基づいて、前記第二のスライスに関して切断道具の新たな位置を決定し;及び
前記第二のスライスに関して前記切断道具を前記新たな位置へ移動させることを含む、方法。 - 請求項4に記載の方法であり、前記新たな位置の決定には、ルックアップテーブル参照又は機能評価、前記第二のイメージの位置を前記第二のスライスに関して切断道具の位置へ又は前記第二のスライスに関して前記切断道具の位置と同等の情報に関連付けるルックアップテーブル又は機能が含まれる、方法。
- 生物学、組織学及び病理学において使用される装置又はシステムであり、前記装置又はシステムは:
生物材料を含む対象物の第一のスライスの第一のデジタルイメージを準備する手段;
前記対象物の第二のスライスの第二のデジタルイメージを生成する手段;
前記第一のイメージの領域に基づき前記第二のスライスの関心領域決定する手段;
前記第二のイメージの領域に基づき前記第二のスライスの関心領域決定する手段;及び
前記第二のスライスの前記関心領域から材料を抽出する手段を含む、装置又はシステム。 - 請求項6に記載の装置又はシステムであり、前記第二のスライスの関心領域を決定し、そこから材料を抽出するための手段は、
前記第二のスライスから材料を切断するための切断道具を準備する装置;
前記第二のイメージの関心領域に基づいて、前記第二のスライスに関して前記切断道具の新たな位置を決定する手段;
前記新たな位置へ前記第二のスライスに関して前記切断道具を動かす手段を含む、装置又はシステム。 - 請求項6に記載の装置又はシステムであり、前記第二のイメージを生成する手段は顕微鏡対象物を含むことができ、材料を抽出する手段はレーザービーム生成のためのレーザーを含むことができ、及び前記装置又はシステムは、前記顕微鏡対象物を介して前記第二のスライスへレーザービームを透過させるように構成され得る、装置又はシステム。
- 請求項1乃至5のいずれか一項に記載の方法を実施するための、請求項6乃至8のいずれか一項に記載の装置又はシステムを制御するための指示を含む、データキャリア。
- 生物学、組織学及び病理学のために使用する情報処理システムであり、前記情報処理システムは、
既定の一組の処理識別子を提供し;
生物材料を含む対象物に関連する一組のデータ記録を準備し;前記データ記録のそれぞれが:前記対象物のスライスを識別するスライス識別子及び前記一組の処理識別子から選択される処理識別子を含み、前記処理識別子が前記スライスが対象とされる処理を指示し;
ユーザが前記一組のデータ記録からデータ記録を選択できるように、インターフェースを提供するように構成される、情報処理システム。 - 請求項10に記載の情報処理システムであり、前記一組の処理識別子には、次のスライスに関する処理:
前記スライスにつきなにもしない;
前記スライスを記録する;
前記スライスを取り出す;
前記スライスのイメージを生成する;
前記スライスを顕微鏡スライド又はカートリッジに含める;
前記スライスを他の実験室へ送る;
前記スライスから材料を抽出する;
前記スライスを凍結する;
前記スライスを加熱する;
前記スライスをシールする;
前記スライスの関心領域をマークする;
前記スライスを染色する;
前記スライスを第一の染色方法で染色する;
前記スライスを第二の染色方法で染色する;及び
2つの染色方法の間で色の変換を定める、ことから選択される処理を識別する処理識別子を含む、情報処理システム。 - 請求項10に記載の情報処理システムであり、前記一組のデータ記録は、前記スライス識別子により示される少なくともいくつかのスライスにつき、前記少なくともいくつかのスライスが前記対象物から切断される前に配置される順序に対応する順序を示すことができる、情報処理システム。
- 請求項10に記載の情報処理システムであり、前記ユーザーイターフェースが、前記ユーザが、前記選択されたデータ記録の前記プロセス識別子を、前記プロセス識別子のセットから他のプロセス識別子を選択することで変更することを可能とするように構成される、情報処理システム。
- 請求項10に記載の情報処理システムであり、前記データ記録のセットの第一のデータ記録が第一のイメージ又は第一のイメージ識別子を含み、前記第一のイメージが、前記第一のデータ記録の前記スライス識別子により識別される前記スライスのデジタルイメージである、情報処理システム。
- 請求項14に記載の情報処理システムであり、前記第一のデータ記録が、前記第1のイメージの興味領域を示す情報を含み、前記興味領域がユーザ及びミクロ切断のための前記対象物の第二のスライスを調製するために実験室へ送られるために記録された前記情報により定められた、情報処理システム。
- 請求項15に記載の情報処理システムであり、前記情報処理システムが前記第二のスライスから切断される興味領域を、前記第一のイメージ及び前記第二のスライスの第二のデジタルイメージを重ね合わせ、前記第一のイメージに定められる前記興味領域を前記第二のイメージに投影することで、決定するように構成される情報処理システム。
- 請求項10に記載の情報処理システムであり、前記ユーザーインタフェースが、ユーザが、一組の実験室識別子から選択される実験室識別子を前記選択されたデータ記録に追加し、及び前記選択されたデータ記録又は選択されたコンポーネントを、前記選択された実験室識別子により識別された実験室へ送ることができるように構成される、情報処理システム。
- 請求項10に記載の情報処理システムであり、前記ユーザインタフェースが、前記病理学者が実験室に、生理学的材料を含む対象物から2つのスライスを切断し、これら2つのスライスのデジタルイメージを生成することを依頼するように構成される、情報処理システム。
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