JP2012509888A - ＡｐｏＥ関連障害の治療におけるＡｐｏＥ切断活性の阻害 - Google Patents

Abstract

本発明は、ＡｐｏＥ関連障害を治療する方法を提供する、この方法は、全般的に、ＡｐｏＥを切断する酵素の活性を阻害する薬剤の有効量を投与するステップを含む。

Description

相互参照
本出願は、２００８年１１月２１日に出願された米国仮特許出願第６１／１１６，８３８号の利益を主張し、該出願はその全体が参照により本明細書に組み込まれる。

２９９アミノ酸の３４ｋＤａタンパク質であるヒトアポリポタンパク質（ａｐｏ）Ｅは、３つの主なアイソフォーム、ＡｐｏＥ２、ＡｐｏＥ３およびＡｐｏＥ４を有する。ＡｐｏＥ４は、アルツハイマー病（ＡＤ）の主な危険因子である。散発性および家族性のＡＤの症例の６５％〜８０％で見出されるＡｐｏＥ４対立遺伝子は、この疾患の出現を増加し、発症年齢を引き下げる。

アルツハイマー病は、現在のところ回復しない潜行性で進行性の神経障害である。アルツハイマー病についての適切な治療がないことに鑑みて、この神経障害についての治療方法に対する必要性が存在する。

本発明は、ＡｐｏＥ関連障害を治療する方法を提供する。この方法は、全般的に、ＡｐｏＥを切断する酵素の活性を阻害する薬剤の有効量を投与するステップを含む。

ＣｌｐＰポリペプチドのアミノ酸配列を示す図である。 ＣｌｐＰポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を示す図である。 ＡｐｏＥポリペプチドのアミノ酸配列を示す図である。ＦＥＰＬ（配列番号１１）配列に下線を付す。 ＡｐｏＥポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を示す図である。 一次ニューロンにおけるＡｐｏＥ４切断に対するＣｌｐＰのｓｈＲＮＡ媒介ノックダウンの影響を示す図である。 組換えＣｌｐＰによるＡｐｏＥ４のｉｎ ｖｉｔｒｏ切断を示す図である。 ＣｌｐＸポリペプチドのアミノ酸配列を示す図である。 ＣｌｐＸポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を示す図である。 ＣｌｐＸポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を示す図である。

定義
本明細書で用いる場合、「ＡｐｏＥ関連障害」は、細胞、血清、間質液、脳脊髄液または個体の任意のその他の体液中のＡｐｏＥの存在を原因とする任意の障害；ＡｐｏＥドメイン相互作用により影響される任意の生理的プロセスまたは代謝事象；ＡｐｏＥの存在を特徴とする任意の障害；細胞または体液中のＡｐｏＥの存在を原因とする障害の症状；ＡｐｏＥの細胞または体液中での存在を原因とする障害と関連する現象；およびＡｐｏＥの存在を原因とする任意の障害の続発症である。ＡｐｏＥ関連障害は、ＡｐｏＥ関連神経障害および高い血清脂質レベルと関連する障害を含む。ＡｐｏＥ関連神経障害は、それらに限定されないが、散発性アルツハイマー病；家族性アルツハイマー病；脳卒中後の悪い転帰；外傷性頭部損傷後の悪い転帰；および脳虚血を含む。ＡｐｏＥ関連神経障害と関連する現象は、それらに限定されないが、神経原線維変化；アミロイド沈着；記憶喪失；および認識機能の低下を含む。高い血清脂質レベルと関連するＡｐｏＥ関連障害は、それらに限定されないが、アテローム動脈硬化症および冠動脈疾患を含む。このようなＡｐｏＥ関連障害と関連する現象は、高い血清コレステロールレベルを含む。

いくつかの実施形態において、ＡｐｏＥ関連障害は、ＡｐｏＥ４関連障害である。本明細書で用いる場合、「ＡｐｏＥ４関連障害」は、細胞、血清、間質液、脳脊髄液または個体の任意のその他の体液中のＡｐｏＥ４の存在を原因とする任意の障害；ＡｐｏＥ４ドメイン相互作用により影響される任意の生理的プロセスまたは代謝事象；ＡｐｏＥ４の存在を特徴とする任意の障害；細胞または体液中のＡｐｏＥ４の存在を原因とする障害の症状；ＡｐｏＥ４の細胞または体液中での存在を原因とする障害と関連する現象；およびＡｐｏＥ４の存在を原因とする任意の障害の続発症である。ＡｐｏＥ４関連障害は、ＡｐｏＥ４関連神経障害および高い血清脂質レベルと関連する障害を含む。ＡｐｏＥ４関連神経障害は、それらに限定されないが、散発性アルツハイマー病；家族性アルツハイマー病；脳卒中後の悪い転帰；外傷性頭部損傷後の悪い転帰；および脳虚血を含む。ＡｐｏＥ４関連神経障害と関連する現象は、それらに限定されないが、神経原線維変化；アミロイド沈着；記憶喪失；および認識機能の低下を含む。高い血清脂質レベルと関連するＡｐｏＥ４関連障害は、それらに限定されないが、アテローム動脈硬化症および冠動脈疾患を含む。このようなＡｐｏＥ４関連障害と関連する現象は、高い血清コレステロールレベルを含む。

用語「アルツハイマー病」（本明細書において「ＡＤ」と省略する）は、本明細書で用いる場合、主に海馬および大脳皮質でのアミロイドβタンパク質を含む老人斑の形成と関連する状態、ならびに学習および記憶の両方の損傷のことをいう。本明細書で用いる場合、「ＡＤ」は、ＡＤとＡＤ型病態との両方を含むことを意味する。

用語「アルツハイマー病と関連する現象」は、本明細書で用いる場合、ＡＤと関連する構造的、分子的または機能的な事象、特に動物モデルにおいて容易に評価可能な事象のことをいう。このような事象は、それらに限定されないが、アミロイド沈着、神経病理学的発展、学習および記憶の欠陥、ならびにその他のＡＤと関連する特徴を含む。

「作動可能に連結される」とは、そのように記載される要素が、それらが意図する様式でそれらが機能することを許容する関係にある近位のことをいう。例えば、プロモーターは、該プロモーターがコード配列の転写または発現に影響する場合に、コード配列と作動可能に連結されている。

用語「形質転換」は、本明細書において「遺伝子改変」と交換可能に用いられ、新しい核酸（すなわち細胞にとって外因性のＤＮＡ）の導入の後に細胞に誘導される永続的または一過的な遺伝子変化のことをいう。遺伝子変化（「改変」）は、新しいＤＮＡを宿主細胞のゲノムに組み込むこと、または新しいＤＮＡをエピソーム要素として一過的もしくは安定的に維持することのいずれかにより達成できる。

「宿主細胞」は、本明細書で用いる場合、ｉｎ ｖｉｖｏまたはｉｎ ｖｉｔｒｏの真核細胞、原核細胞もしくは単細胞体として培養された多細胞生物からの細胞（例えば株化細胞）のことをいい、ここで、真核細胞または原核細胞は、核酸のレシピエントとして用いることができるかまたは用いられたことがあり、該核酸により遺伝子改変された元来の細胞の子孫を含む。単細胞の子孫は、天然の、偶発的なまたは意図的な変異により、元来の親と形態が完全に同一またはゲノムもしくはトータルＤＮＡが相補的である必要はないと理解される。「組換え宿主細胞」（「遺伝子改変宿主細胞」ともいう）は、異種核酸、例えば発現ベクターが導入された宿主細胞である。

本明細書で用いる場合、用語「ニューロン」または「神経細胞」は、それらに限定されないが、ニューロンを含有する脳細胞の初代培養物、一次神経細胞を含む単離細胞培養物、神経前駆細胞、ニューロンのモデルとして用いられる組織培養細胞およびそれらの混合物を含む、任意の型のニューロンを含む任意の細胞集団を含む。

本明細書で用いる場合、用語「治療」、「治療する」などは、所望の薬理学的および／または生理的効果を得ることをいう。効果は、疾患もしくはその症状を完全または部分的に妨げるという点で予防的であり得、かつ／あるいは疾患および／または疾患の原因である有害な影響を部分的もしくは完全に治癒するという点で治療的であり得る。「治療」は、本明細書で用いる場合、哺乳動物、特にヒトにおける疾患の任意の治療をカバーし、（ａ）疾患の素因を有し得るが、それを有するとまだ診断されていない対象において該疾患が出現することを妨げること；（ｂ）疾患を阻害すること、すなわちその発展を阻止すること；および（ｃ）疾患を緩和すること、すなわち疾患の緩解を引き起こすことを含む。

本明細書において交換可能に用いられる用語「個体」、「対象」および「患者」は、それらに限定されないが、マウス、サル、ヒト、哺乳類の家畜、哺乳類の競技動物および哺乳類のペットを含む哺乳動物のことをいう。

「治療有効量」または「効力のある量」は、疾患を治療するために哺乳動物またはその他の対象に投与した場合に、疾患についてのそのような治療を奏するのに十分な化合物の量を意味する。「治療有効量」は、化合物、疾患およびその重篤度、ならびに治療される対象の年齢、体重などに依存して変動する。

本発明をさらに記載する前に、本発明は、記載される具体的な実施形態に限定されず、それ自体でもちろん変動し得ると理解される。本明細書で用いられる用語は、具体的な実施形態を記載することだけを目的とし、限定することを意図しないことも理解される。なぜなら、本発明の範囲は、添付の特許請求の範囲のよってのみ限定されるからである。

値の範囲が示される場合、その範囲の上限と下限との間の、およびその記述される範囲内の任意のその他の記載されるかもしくは介在する値の文脈がそうでないと明確に示さない限り下限の単位の１０分の１までの介在するそれぞれの値は、本発明に含まれると理解される。これらのより小さい範囲の上限および下限は、より小さい範囲に独立して含まれることができ、記述される範囲内の任意の特に除外される限界によって変わるが、これらもまた本発明に含まれる。記述される範囲が一方または両方の限界を含む場合、これらの含まれる限界のいずれかまたは両方を除外する範囲も、本発明に含まれる。

そうでないと定義しない限り、本明細書で用いられる全ての技術的および科学的用語は、本発明が属する当該技術の当業者により一般的に理解されるのと同じ意味を有する。本明細書に記載されるものと同様または等価な任意の方法および材料を、本発明を実施または試験するために用いることもできるが、好ましい方法および材料は、ここに記載される。本明細書で言及する全ての出版物は、該出版物が引用されることと関連して、方法および／または材料を開示ならびに記載するために参照により本明細書に組み込まれる。

本明細書および添付の特許請求の範囲で用いる場合、単数形「ａ」、「ａｎ」および「ｔｈｅ」は、文脈がそうでないと明確に示さない限り、複数の指示物を含むことに注意しなければならない。よって、例えば、「薬剤」との言及は、複数のそのような薬剤を含み、「ＣｌｐＰポリペプチド」との言及は、１または複数のＣｌｐＰポリペプチドおよび当業者に知られるその均等物を含む、などである。特許請求の範囲は、いずれの任意選択要素も除外するように起草され得ることがさらに注目される。それ自体で、この記述は、クレーム要素の記載に関して「単に」、「のみ」のような排他的用語の使用、または「否定的な」限定の使用についての先行する基礎となることを意図する。

本明細書で議論する出版物は、本出願の出願日前のそれらの開示について単に示す。本明細書中のいずれも、本発明が以前の発明によりそのような出版物に先行する資格がないことを承認しているものと解釈されない。さらに、示される出版物の日時は、実際の出版日時とは異なる場合があり、このことは独立して確認する必要がある場合がある。

詳細な説明
本発明は、個体におけるＡｐｏＥ関連障害（例えばＡｐｏＥ４関連障害）を治療する方法を提供する。この方法は、全般的に、ＡｐｏＥ切断酵素のタンパク質分解活性を阻害する薬剤の有効量を、それを必要とする個体に投与するステップを含む。

用語「ＡｐｏＥ切断酵素」（「ＡＥＣＥ」）は、本明細書で用いる場合、ＡｐｏＥ、例えばＡｐｏＥ４を切断して、神経毒性ＡｐｏＥフラグメントを生成する酵素である。ＡＥＣＥは、セリンプロテアーゼである。いくつかの実施形態において、ＡＥＣＥは、成熟ニューロンに、未熟ニューロンよりも高いレベルで存在する。例えば、ＡＥＣＥは、成熟ニューロンに、未熟ニューロンでのレベルよりも約２５％、約５０％、約２倍、約５倍、約１０倍または１０倍を超えてより高いレベルで存在する。いくつかの実施形態において、ＡＥＣＥは、皮質ニューロンおよび海馬ニューロンに、小脳ニューロンよりも高いレベルで存在する。例えば、ＡＥＣＥは、皮質ニューロンおよび海馬ニューロンに、小脳ニューロンでのレベルよりも約２５％、約５０％、約２倍、約５倍、約１０倍または１０倍を超えてより高いレベルで存在する。いくつかの実施形態において、ＡＥＣＥは、ニューロンに、アストロサイトよりもかなりより高いレベルで存在する。例えば、ＡＥＣＥは、成熟ニューロンに、アストロサイトでのレベルよりも約２倍、約５倍、約１０倍、約２５倍、約５０倍、または約１００倍、または１００倍を超えてより高いベルで存在する。

いくつかの実施形態において、ＡＥＣＥ阻害剤（例えばＣｌｐＰ阻害剤）の「有効量」は、１または複数の用量でそれを必要とする個体に投与した場合に、個体におけるＡｐｏＥ関連障害（例えばＡｐｏＥ４関連障害）の少なくとも１つの有害症状の重篤度を、該阻害剤を用いる治療の非存在下での症状の重篤度と比較して、少なくとも約１０％、少なくとも約１５％、少なくとも約２０％、少なくとも約２５％、少なくとも約３０％、少なくとも約３５％、少なくとも約４０％、少なくとも約５０％、少なくとも約６０％、少なくとも約７０％、少なくとも約８０％、少なくとも約９０％またはそれより多く低減する量である。症状の重篤度が低減されたかは、任意の既知の方法を用いて決定できる。例えば、認知機能低下は、認知機能についての標準的な試験を用いて測定できる。

いくつかの実施形態において、ＡＥＣＥ阻害剤（例えばＣｌｐＰ阻害剤）の「有効量」は、１または複数の用量でそれを必要とする個体に投与した場合に、個体（例えばアルツハイマー病の個体）における認知機能を、該阻害剤を用いる治療の非存在下での認知機能と比較して少なくとも約１０％、少なくとも約１５％、少なくとも約２０％、少なくとも約２５％、少なくとも約３０％、少なくとも約３５％、少なくとも約４０％、少なくとも約５０％または５０％を超えて改善する量である。

ＣｌｐＰ
いくつかの実施形態において、ＡＥＣＥは、哺乳類ＣｌｐＰポリペプチドである。本明細書で用いる場合、「ＣｌｐＰポリペプチド」は、ＡｐｏＥを切断して、神経毒性ＡｐｏＥフラグメントの形成をもたらすセリンプロテアーゼのことをいう。ＣｌｐＰポリペプチドは、図１Ａに示すアミノ酸配列（配列番号１）の約１５０アミノ酸（ａａ）〜約１７５ａａ、約１７５ａａ〜約２００ａａ、約２００ａａ〜約２５０ａａ、または約２５０ａａ〜約２７７ａａの連続するひと続きと少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸を含み得る。

ＣｌｐＰポリペプチドは、図１Ｂに示すヌクレオチド配列（配列番号２）の約５００ヌクレオチド〜約６００ヌクレオチド、約６００ヌクレオチド〜約７００ヌクレオチド、または約７００ヌクレオチド〜８２１ヌクレオチドの連続するひと続きと少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％または１００％のヌクレオチド配列同一性を有するヌクレオチド配列によりコードされ得る。

哺乳類ＣｌｐＰポリペプチド、およびそれらの酵素活性を測定する方法は、文献に記載されている。例えば、Ｂｒｏｓｓら（１９９５）ＦＥＢＳ Ｌｅｔｔｅｒｓ３７７：２４９およびＣｏｒｙｄｏｎら（１９９８）Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｊ．３３１：３０９およびＡｎｄｒｅｓｅｎら（２０００）Ｍａｍｍａｌｉａｎ Ｇｅｎｏｍｅ１１：２７５を参照されたい。

いくつかの実施形態において、ＣｌｐＰポリペプチドは、ＣｌｐＸポリペプチドとの複合体で存在する。よって、いくつかの実施形態において、ＡＥＣＥは、ＣｌｐＰポリペプチドとＣｌｐＸポリペプチドの両方を含む。ＣｌｐＸポリペプチドは、図５Ａに示すアミノ酸配列の約３００ａａ〜約４００ａａ、約４００ａａ〜約５００ａａ、約５００ａａ〜約６００ａａ、または約６００ａａ〜６３３ａａの連続するひと続きと少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸を含み得る。例えばＧｅｎＢａｎｋ受入番号ＣＡＣ０１２９１；Ｓａｎｔａｇａｔａら（１９９９）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７４：１６３１１；Ｋａｎｇら（２００２）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２７７：２１０９５；およびＫａｎｇら（２００５）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２８０：３５４２４を参照されたい。

ＣｌｐＸポリペプチドは、図５Ｂおよび５Ｃに示し、配列番号１２に示すヌクレオチド配列のヌクレオチド７３〜１９７４のうちの約１５００ヌクレオチド〜約１６００ヌクレオチド、約１６００ヌクレオチド〜約１７００ヌクレオチド、約１７００ヌクレオチド〜約１８００ヌクレオチド、または約１８００ヌクレオチド〜約１９００ヌクレオチドの連続するひと続きと少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％または１００％のヌクレオチド配列同一性を有するヌクレオチド配列によりコードされ得る。

ＡｐｏＥ
２９９アミノ酸の３４ｋＤａタンパク質であるヒトアポリポタンパク質（ａｐｏ）Ｅは、３つの主なアイソフォーム、ＡｐｏＥ２、ＡｐｏＥ３およびＡｐｏＥ４を有する。種々の哺乳類の種のＡｐｏＥポリペプチドのアミノ酸配列は、当該技術において知られている。例えばＲａｌｌら（１９８２）Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．２５７：４１７１；Ｗｅｉｓｇｒａｂｅｒ（１９９４）Ａｄｖ．Ｐｒｏｔｅｉｎ Ｃｈｅｍ．４５：２４９〜３０２；ＧｅｎＢａｎｋ ＮＰ＿００００３２を参照されたい。

「ＡｐｏＥポリペプチド」は、図２Ａに示すアミノ酸配列のアミノ酸１９〜３１７のうちの約２００アミノ酸（ａａ）〜約２２５ａａ、約２２５ａａ〜約２５０ａａ、約２５０ａａ〜約２７５ａａ、または約２７５ａａ〜約２９９ａａの連続するひと続きと少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％または１００％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸を含み得る。

神経毒性ＡｐｏＥ
ＡＥＣＥの作用により生じる神経毒性ＡｐｏＥフラグメントは、カルボキシル末端切断型ＡｐｏＥ４およびカルボキシル末端切断型ＡｐｏＥ３を含む。カルボキシル末端切断型ＡｐｏＥ４は、ＡｐｏＥ４の少なくともアミノ酸２４４〜２６０を含み、カルボキシル末端切断型ＡｐｏＥ３は、ＡｐｏＥ３の少なくともアミノ酸２４４〜２６０を含む。神経毒性ＡｐｏＥ４フラグメントは、ｐ−タウおよびｐ−ＮＦ−Ｈの両方と結合するカルボキシル末端切断型ＡｐｏＥ４を含む。

ＡｐｏＥ３またはＡｐｏＥ４のカルボキシル末端からの約２８〜約３０、約３０〜約３５、約３５〜約４０、約４０〜約４５、または約４５〜約４８アミノ酸の欠失は、ｐ−タウと結合し、ｐ−ＮＦ−Ｈと結合するカルボキシル末端切断型ＡｐｏＥをもたらす。神経原線維変化を増加させる特定のカルボキシル末端切断型ＡｐｏＥポリペプチドは、それらに限定されないが、ＡｐｏＥ４Δ２７２〜２９９；ＡｐｏＥ３Δ２７２〜２９９；ＡｐｏＥ４Δ２６１〜２９９；およびＡｐｏＥ４Δ２５２〜２９９を含む。神経毒性ＡｐｏＥフラグメントの記載について、例えば米国特許第６，７８７，５１９号を参照されたい。

ＡＥＣＥ阻害剤
主題の方法において用いるために適するＡＥＣＥタンパク質分解活性を阻害する活性薬剤は、ＡｐｏＥ４が基質である場合に神経毒性ＡｐｏＥ４の生成を低減する任意の薬剤を含む。ＡＥＣＥタンパク質分解活性を阻害する適切な薬剤は、ＡｐｏＥ４に対するＡＥＣＥの作用により形成される神経毒性ＡｐｏＥ４フラグメントの量を、ＡＥＣＥの存在下および薬剤の非存在下で形成される神経毒性ＡｐｏＥ４フラグメントの量と比較して、少なくとも約１０％、少なくとも約２０％、少なくとも約２５％、少なくとも約３０％、少なくとも約３５％、少なくとも約４０％、少なくとも約４５％、少なくとも約５０％、少なくとも約６０％、少なくとも約７０％、または少なくとも約８０％、またはそれより多く低減するものである。

例えば、主題の方法において用いるために適するＣｌｐＰタンパク質分解活性を阻害する活性薬剤は、ＡｐｏＥ４が基質である場合に神経毒性ＡｐｏＥ４の生成を低減する任意の薬剤を含む。ＣｌｐＰタンパク質分解活性を阻害する適切な薬剤は、ＡｐｏＥ４に対するＣｌｐＰの作用により形成される神経毒性ＡｐｏＥ４フラグメントの量を、ＣｌｐＰの存在下および薬剤の非存在下で形成される神経毒性ＡｐｏＥ４フラグメントの量と比較して、少なくとも約１０％、少なくとも約２０％、少なくとも約２５％、少なくとも約３０％、少なくとも約３５％、少なくとも約４０％、少なくとも約４５％、少なくとも約５０％、少なくとも約６０％、少なくとも約７０％、または少なくとも約８０％、またはそれより多く低減するものである。

主題の方法において用いるために適するＡＥＣＥタンパク質分解活性を阻害する活性薬剤は、ＡｐｏＥ３が基質である場合に神経毒性ＡｐｏＥ３フラグメントの生成を低減する任意の薬剤を含む。ＡＥＣＥタンパク質分解活性を阻害する適切な薬剤は、ＡｐｏＥ３に対するＡＥＣＥの作用により形成される神経毒性ＡｐｏＥ３フラグメントの量を、ＡＥＣＥの存在下および薬剤の非存在下で形成される神経毒性ＡｐｏＥ３フラグメントの量と比較して、少なくとも約１０％、少なくとも約２０％、少なくとも約２５％、少なくとも約３０％、少なくとも約３５％、少なくとも約４０％、少なくとも約４５％、少なくとも約５０％、少なくとも約６０％、少なくとも約７０％、または少なくとも約８０％、またはそれより多く低減するものである。

例えば、主題の方法において用いるために適するＣｌｐＰタンパク質分解活性を阻害する活性薬剤は、ＡｐｏＥ３が基質である場合に神経毒性ＡｐｏＥ３フラグメントの生成を低減する任意の薬剤を含む。ＣｌｐＰタンパク質分解活性を阻害する適切な薬剤は、ＡｐｏＥ４に対するＣｌｐＰの作用により形成される神経毒性ＡｐｏＥ３フラグメントの量を、ＣｌｐＰの存在下および薬剤の非存在下で形成される神経毒性ＡｐｏＥ３フラグメントの量と比較して、少なくとも約１０％、少なくとも約２０％、少なくとも約２５％、少なくとも約３０％、少なくとも約３５％、少なくとも約４０％、少なくとも約４５％、少なくとも約５０％、少なくとも約６０％、少なくとも約７０％、または少なくとも約８０％、またはそれより多く低減するものである。

小分子薬剤
いくつかの実施形態において、ＡＥＣＥタンパク質分解活性を阻害する薬剤は、小分子薬剤である。例えば、いくつかの実施形態において、ＣｌｐＰタンパク質分解活性を阻害する薬剤は、小分子薬剤である。小分子阻害剤は、例えば、約２５ｋＤａ未満の化合物、例えば約５０ダルトン〜約２５ｋＤａ、例えば約５０ダルトン〜約１００ダルトン、約１００ダルトン〜約５００ダルトン、約５００ダルトン〜約１キロダルトン（ｋＤａ）、約１ｋＤａ〜約５ｋＤａ、約５ｋＤａ〜約１０ｋＤａ、または約１０ｋＤａ〜約２５ｋＤａの化合物を含む。小分子阻害剤は、約５０ダルトン〜約３０００ダルトン、例えば約５０ダルトン〜約７５ダルトン、約７５ダルトン〜約１００ダルトン、約１００ダルトン〜約２５０ダルトン、約２５０ダルトン〜約５００ダルトン、約５００ダルトン〜約７５０ダルトン、約７５０ダルトン〜約１０００ダルトン、約１０００ダルトン〜約１２５０ダルトン、約１２５０ダルトン〜約１５００ダルトン、約１５００ダルトン〜約２０００ダルトン、約２０００ダルトン〜約２５００ダルトン、または約２５００ダルトン〜約３０００ダルトンの範囲の分子量を有し得る。

小分子ＣｌｐＰ阻害剤は、約１ｐＭ〜約１ｍＭ、例えば約１ｐＭ〜約１０ｐＭ、約１０ｐＭ〜約２５ｐＭ、約２５ｐＭ〜約５０ｐＭ、約５０ｐＭ〜約１００ｐＭ、約１００ｐＭ〜約２５０ｐＭ、約２５０ｐＭ〜約５００ｐＭ、約５００ｐＭ〜約７５０ｐＭ、約７５０ｐＭ〜約１ｎＭ、約１ｎＭ〜約１０ｎＭ、約１０ｎＭ〜約１５ｎＭ、約１５ｎＭ〜約２５ｎＭ、約２５ｎＭ〜約５０ｎＭ、約５０ｎＭ〜約７５ｎＭ、約７５ｎＭ〜約１００ｎＭ、約１００ｎＭ〜約１５０ｎＭ、約１５０ｎＭ〜約２００ｎＭ、約２００ｎＭ〜約２５０ｎＭ、約２５０ｎＭ〜約３００ｎＭ、約３００ｎＭ〜約３５０ｎＭ、約３５０ｎＭ〜約４００ｎＭ、約４００ｎＭ〜約４５０ｎＭ、約４５０ｎＭ〜約５００ｎＭ、約５００ｎＭ〜約７５０ｎＭ、約７５０ｎＭ〜約１μＭ、約１μＭ〜約１０μＭ、約１０μＭ〜約２５μＭ、約２５μＭ〜約５０μＭ、約５０μＭ〜約７５μＭ、約７５μＭ〜約１００μＭ、約１００μＭ〜約２５０μＭ、約２５０μＭ〜約５００μＭ、または約５００μＭ〜約１ｍＭであるＩＣ_５０（最大有効濃度の半分）を有し得る。

いくつかの実施形態において、小分子ＣｌｐＰ阻害剤はＣｌｐＰについて選択的であり、例えば、小分子阻害剤は、ＣｌｐＰ活性の少なくとも５０％の阻害を引き起こす濃度にて、阻害するならばＣｌｐＰ以外の酵素を約２０％未満、約１５％未満、約１０％未満、または約５％未満阻害する。

妨害核酸
いくつかの実施形態において、ＣｌｐＰタンパク質分解活性を阻害する薬剤は、阻害（または「妨害(interfering)」）核酸である。妨害核酸（ＲＮＡｉ）は、細胞、例えば神経細胞におけるＣｌｐＰポリペプチドのレベルの低下をもたらす核酸を含む。妨害核酸は、例えば低分子妨害核酸（ｓｉＮＡ）、低分子妨害ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）、２本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）、マイクロＲＮＡ（ｍｉＲＮＡ）および低分子ヘアピンＲＮＡ（ｓｈＲＮＡ）分子を含む。

用語「低分子妨害核酸」、「ｓｉＮＡ」、「低分子妨害ＲＮＡ」、「ｓｉＲＮＡ」、「低分子妨害核酸分子」、「低分子妨害オリゴヌクレオチド分子」または「化学改変低分子妨害核酸分子」は、本明細書で用いる場合、例えば配列特異的な様式でＲＮＡ妨害「ＲＮＡｉ」または遺伝子発現抑制を媒介することにより、遺伝子発現を阻害または下方制御できる任意の核酸分子のことをいう。標的遺伝子が与えられている場合のＲＮＡｉ分子の設計は、当該技術において日常的である。米国特許出願公開第２００５／０２８２１８８号（参照により本明細書に組み込まれる）およびそこに引用される参考文献も参照されたい。例えば、ＰｕｓｈｐａｒａｊらＣｌｉｎ Ｅｘｐ Ｐｈａｒｍａｃｏｌ Ｐｈｙｓｉｏｌ．２００６年５月〜６月；３３（５〜６）：５０４〜１０；ＬｕｔｚｅｌｂｅｒｇｅｒらＨａｎｄｂ Ｅｘｐ Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．２００６；（１７３）：２４３〜５９；ＡｒｏｎｉｎらＧｅｎｅ Ｔｈｅｒ．２００６年３月；１３（６）：５０９〜１６；ＸｉｅらＤｒｕｇ Ｄｉｓｃｏｖ Ｔｏｄａｙ．２００６年１月；１１（１〜２）：６７〜７３；ＧｒｕｎｗｅｌｌｅｒらＣｕｒｒ Ｍｅｄ Ｃｈｅｍ．２００５；１２（２６）：３１４３〜６１；およびＰｅｋａｒａｉｋらＢｒａｉｎ Ｒｅｓ Ｂｕｌｌ．２００５年１２月１５日；６８（１〜２）：１１５〜２０．Ｅｐｕｂ ２００５年９月９日を参照されたい。

所望の標的に対するｓｉＲＮＡの設計および生成のための方法は、当該技術において知られており、ＣｌｐＰコード核酸へのそれらの応用は、当業者に容易に理解され、例えば、例えば安定性、バイオアベイラビリティーおよび治療剤としての使用を増進するその他の特性の増進をもたらすために改変（例えば化学改変）を有するｓｉＲＮＡの生成方法も同様である。さらに、ｓｉＲＮＡの処方および対象へのデリバリー(delivery)のための方法も、当該技術において公知である。例えば、それぞれが参照により本明細書に組み込まれる米国特許出願公開第２００５／０２８２１８８号；米国特許出願公開第２００５／０２３９７３１号；米国特許出願公開第２００５／０２３４２３２号；米国特許出願公開第２００５／０１７６０１８号；米国特許出願公開第２００５／００５９８１７号；米国特許出願公開第２００５／００２０５２５号；米国特許出願公開第２００４／０１９２６２６号；米国特許出願公開第２００３／００７３６４０号；米国特許出願公開第２００２／０１５０９３６号；米国特許出願公開第２００２／０１４２９８０号；および米国特許出願公開第２００２／０１２０１２９号を参照されたい。

ｓｉＲＮＡの設計を促進するための公共で利用可能なツールが、当該技術において利用可能である。例えば、ＤＥＱＯＲ：Ｄｅｓｉｇｎ ａｎｄ Ｑｕａｌｉｔｙ Ｃｏｎｔｒｏｌ ｏｆ ＲＮＡｉ（ｃｌｕｓｔｅｒ−１．ｍｐｉ−ｃｂｇ．ｄｅ／Ｄｅｑｏｒ／ｄｅｑｏｒ．ｈｔｍｌでインターネットにて利用可能）を参照されたい。また、ＨｅｎｓｃｈｅｌらＮｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．２００４年７月１日；３２（Ｗｅｂ Ｓｅｒｖｅｒ版）：Ｗ１１３〜２０も参照されたい。ＤＥＱＯＲは、ｓｉＲＮＡ設計のための最新式のパラメータに基づくスコアリングシステムを用いてｓｉＲＮＡの阻害能力を評価するウェブベースのプログラムである。よって、ＤＥＱＯＲは、（ｉ）塩基対組成に基づいて高い発現抑制能を示す遺伝子内の領域、および（ｉｉ）化学合成のための高い発現抑制能力を有するｓｉＲＮＡの予測を補助できる。さらに、入力クエリから得られる各ｓｉＲＮＡは、選択された生物のトランスクリプトームまたはゲノムに対してＢＬＡＳＴ検索を行うことにより、可能性のある交差発現抑制活性について評価される。よって、ＤＥＱＯＲは、ｍＲＮＡフラグメントが細胞内のその他の遺伝子と交差反応する可能性を予測でき、科学者がｓｉＲＮＡまたは化学設計ｓｉＲＮＡの特異性を試験する実験を設計することを補助する。

ｓｉＮＡ分子は、任意の種々の形態であり得る。例えば、ｓｉＮＡは、自己相補的センスおよびアンチセンス領域を含む２本鎖ポリヌクレオチド分子であって、アンチセンス領域が標的核酸分子またはその一部のヌクレオチド配列に相補的であるヌクレオチド配列を含み、センス領域が標的核酸配列またはその一部に相当するヌクレオチド配列を有する分子であり得る。ｓｉＮＡは、２つの別々のオリゴヌクレオチドから組み立てることもでき、ここで、一方の鎖はセンス鎖であり、他方はアンチセンス鎖であり、アンチセンス鎖およびセンス鎖は自己相補的である。この実施形態において、それぞれの鎖は、通常、他方の鎖のヌクレオチド配列に相補的なヌクレオチド配列を含み；例えばアンチセンス鎖とセンス鎖とが２重または２本鎖構造を形成し、例えば２本鎖領域が約１５塩基対〜約３０塩基対、例えば約１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９または３０塩基対であり；アンチセンス鎖が、標的核酸分子またはその一部のヌクレオチド配列と相補的であるヌクレオチド配列を含み、センス鎖が、標的核酸配列またはその一部に相当するヌクレオチド配列を含む（例えばｓｉＮＡ分子の約１５ヌクレオチド〜約２５以上のヌクレオチドが、標的核酸またはその一部に相補的である）。

代わりに、ｓｉＮＡは、単一オリゴヌクレオチドから組み立てることができ、ここで、ｓｉＮＡの自己相補的センスおよびアンチセンス領域は、核酸ベースまたは非核酸ベースのリンカー（複数可）により連結される。ｓｉＮＡは、２重鎖、非対称２重鎖、ヘアピンまたは非対称ヘアピン２次構造で、自己相補的センスおよびアンチセンス領域を有するポリヌクレオチドであって、アンチセンス領域が別の標的核酸分子またはその一部のヌクレオチド配列に相補的なヌクレオチド配列を含み、センス領域が標的核酸配列またはその一部に相当するヌクレオチド配列を有するポリヌクレオチドであり得る。

ｓｉＮＡは、２つ以上のループ構造と、自己相補的センスおよびアンチセンス領域を含むステムとを有する環状１本鎖ポリヌクレオチドであって、アンチセンス領域が標的核酸分子またはその一部のヌクレオチド配列に相補的であるヌクレオチド配列を含み、センス領域が標的核酸配列またはその一部に相当するヌクレオチド配列を有し、環状ポリヌクレオチドがｉｎ ｖｉｖｏまたはｉｎ ｖｉｔｒｏのいずれかで加工されて、ＲＮＡｉを媒介できる活性ｓｉＮＡ分子を生じることができるポリヌクレオチドであり得る。ｓｉＮＡは、標的核酸分子またはその一部のヌクレオチド配列に相補的なヌクレオチド配列を有する１本鎖ポリヌクレオチド（例えば、このようなｓｉＮＡ分子が、標的核酸配列またはその一部に相当するヌクレオチド配列がｓｉＮＡ分子内に存在することを必要としない場合）であって、１本鎖ポリヌクレオチドが、５’−ホスフェート（例えばＭａｒｔｉｎｅｚら、２００２、Ｃｅｌｌ．、１１０、５６３〜５７４およびＳｃｈｗａｒｚら、２００２、Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｅｌｌ、１０、５３７〜５６８を参照されたい）または５’，３’−ジホスフェートのような末端ホスフェート基をさらに含み得るポリヌクレオチドも含み得る。

ある実施形態において、ｓｉＮＡ分子は、センスおよびアンチセンス領域が、当該技術において知られるようなヌクレオチドまたは非ヌクレオチドリンカーにより共有結合しているか、または代わりにイオン性相互作用、水素結合、ファンデルワールス相互作用、疎水性相互作用および／もしくはスタッキング相互作用により非共有結合している、別々のセンスおよびアンチセンス配列または領域を含有する。あるいくつかの実施形態において、ｓｉＮＡ分子は、標的遺伝子のヌクレオチド配列に相補的であるヌクレオチド配列を含む。別の実施形態において、ｓｉＮＡ分子は、標的遺伝子の発現の阻害を引き起こす様式で標的遺伝子のヌクレオチド配列と相互作用する。

本明細書で用いる場合、ｓｉＮＡ分子は、ＲＮＡのみを含有するこれらの分子に限定される必要はないが、化学改変ヌクレオチドおよび非ヌクレオチドをさらに含む。ある実施形態において、本発明の低分子妨害核酸分子は、２’−ヒドロキシ（２’−ＯＨ）含有ヌクレオチドを欠く。ｓｉＮＡは、ＲＮＡｉを媒介するために２’−ヒドロキシ基を有するヌクレオチドの存在を必ずしも要求せず、それ自体で、本発明のｓｉＮＡ分子は、所望により、いずれのリボヌクレオチド（例えば２’−ＯＨ基を有するヌクレオチド）も含まない。ＲＮＡｉを支持するためにｓｉＮＡ分子内に１もしくは複数のリボヌクレオチドの存在を要求しないこのようなｓｉＮＡ分子は、しかし、２’−ＯＨ基を有するヌクレオチドを含有する、結合した１もしくは複数のリンカーまたはその他の結合もしくは会合した基、部分または鎖を有し得る。所望により、ｓｉＮＡ分子は、約５、１０、２０、３０、４０または５０％のヌクレオチドの位置にリボヌクレオチドを含み得る。本発明の改変低分子妨害核酸分子は、低分子妨害改変オリゴヌクレオチド「ｓｉＭＯＮ」ともいうことができる。

本明細書で用いる場合、用語ｓｉＮＡは、配列特異的ＲＮＡｉを媒介できる核酸分子、例えば低分子妨害ＲＮＡ（ｓｉＲＮＡ）、２本鎖ＲＮＡ（ｄｓＲＮＡ）、マイクロＲＮＡ（ｍｉＲＮＡ）、低分子ヘアピンＲＮＡ（ｓｈＲＮＡ）、低分子妨害オリゴヌクレオチド、低分子妨害核酸、低分子妨害改変オリゴヌクレオチド、化学改変ｓｉＲＮＡ、転写後遺伝子発現抑制ＲＮＡ（ｐｔｇｓＲＮＡ）などを記載するために用いられるその他の用語と等価であることを意味する。さらに、本明細書で用いる場合、用語ＲＮＡｉは、転写後遺伝子発現抑制、翻訳阻害またはエピジェネティクスのような配列特異的ＲＮＡ妨害を記載するために用いられるその他の用語と等価であることを意味する。例えば、本発明のｓｉＮＡ分子は、転写後レベルおよび／または転写前レベルにて標的遺伝子をエピジェネティクスにより発現抑制するために用いることができる。非限定的な例において、本発明のｓｉＮＡ分子による遺伝子発現のエピジェネティクスによる制御は、遺伝子発現を変化させるためのクロマチン構造またはメチル化パターンのｓｉＮＡ媒介改変に起因できる（例えばＶｅｒｄｅｌら、２００４、Ｓｃｉｅｎｃｅ、３０３、６７２〜６７６；Ｐａｌ−Ｂｈａｄｒａら、２００４、Ｓｃｉｅｎｃｅ、３０３、６６９〜６７２；Ａｌｌｓｈｉｒｅ、２００２、Ｓｃｉｅｎｃｅ、２９７、１８１８〜１８１９；Ｖｏｌｐｅら、２００２、Ｓｃｉｅｎｃｅ、２９７、１８３３〜１８３７；Ｊｅｎｕｗｅｉｎ、２００２、Ｓｃｉｅｎｃｅ、２９７、２２１５〜２２１８；およびＨａｌｌら、２００２、Ｓｃｉｅｎｃｅ、２９７、２２３２〜２２３７を参照されたい）。

本発明において意図するｓｉＮＡ分子は、２重鎖形成オリゴヌクレオチド（ＤＦＯ）を含むことができる（例えば参照により本明細書に組み込まれるＷＯ０５／０１９４５３および米国特許出願公開第２００５／０２３３３２９号を参照されたい）。これもまた本発明において意図するｓｉＮＡ分子は、多機能性ｓｉＮＡを含む（例えばＷＯ０５／０１９４５３および米国特許出願公開第２００４／０２４９１７８号を参照されたい）。多機能性ｓｉＮＡは、例えばＳｋｐ２の２つの領域を標的にする配列を含むことができる。

本発明において意図するｓｉＮＡ分子は、非対称ヘアピンまたは非対称２重鎖を含むことができる。「非対称ヘアピン」により、本明細書で用いる場合、アンチセンス領域と、ヌクレオチドまたは非ヌクレオチドを含み得るループ部分と、センス領域がアンチセンス領域と塩基対形成し、かつループと２重鎖を形成するのに十分な相補的ヌクレオチドを有する程度にアンチセンス領域より少ないヌクレオチドを含むセンス領域とを含む直鎖状ｓｉＮＡ分子を意味する。例えば、非対称ヘアピンｓｉＮＡ分子は、細胞またはｉｎ ｖｉｔｒｏ系でＲＮＡｉを媒介するのに十分な長さを有するアンチセンス領域（例えば約１５〜約３０、または約１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９もしくは３０ヌクレオチド）と、約４〜約１２（例えば約４、５、６、７、８、９、１０、１１または１２）ヌクレオチドを含むループ領域と、アンチセンス領域に相補的な約３〜約２５（例えば約３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４または２５）ヌクレオチドを有するセンス領域とを含み得る。非対称ヘアピンｓｉＮＡ分子も、化学的に改変され得る５’末端ホスフェート基を含み得る。非対称ヘアピンｓｉＮＡ分子のループ部分は、ヌクレオチド、非ヌクレオチド、リンカー分子または本明細書に記載されるコンジュゲート分子を含み得る。

「非対称２重鎖」により、本明細書で用いる場合、センス領域とアンチセンス領域とを含む２つの別々の鎖を有するｓｉＮＡ分子であって、センス領域が、センス領域がアンチセンス領域と塩基対形成し、かつ２重鎖を形成するのに十分な相補的ヌクレオチドを有する程度にアンチセンス領域より少ないヌクレオチドを含む分子を意味する。例えば、本発明の非対称２重鎖ｓｉＮＡ分子は、細胞またはｉｎ ｖｉｔｒｏ系でＲＮＡｉを媒介するのに十分な長さを有するアンチセンス領域（例えば約１５〜約３０、または約１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４、２５、２６、２７、２８、２９もしくは３０ヌクレオチド）と、アンチセンス領域に相補的な約３〜約２５（例えば約３、４、５、６、７、８、９、１０、１１、１２、１３、１４、１５、１６、１７、１８、１９、２０、２１、２２、２３、２４または２５）ヌクレオチドを有するセンス領域とを含み得る。

ｓｉＲＮＡの安定性および／または半減期は、血清リボヌクレアーゼによるそれらの分解を防ぐことができ、それらの能力を増加できる改変（塩基、糖および／またはホスフェート）を有する核酸分子を化学合成することにより改善できる（例えば、本明細書に記載される核酸分子の塩基、ホスフェートおよび／または糖部分に作製できる種々の化学的改変について記載する、全てが本明細書に参照により組み込まれるＥｃｋｓｔｅｉｎら、国際公開第ＷＯ９２／０７０６５号；Ｐｅｒｒａｕｌｔら、１９９０Ｎａｔｕｒｅ３４４、５６５；Ｐｉｅｋｅｎら、１９９１、Ｓｃｉｅｎｃｅ２５３、３１４；ＵｓｍａｎおよびＣｅｄｅｒｇｒｅｎ、１９９２、Ｔｒｅｎｄｓ ｉｎ Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｓｃｉ．１７、３３４；Ｕｓｍａｎら、国際公開第ＷＯ９３／１５１８７号；ならびにＲｏｓｓｉら、国際公開第ＷＯ９１／０３１６２号；Ｓｐｒｏａｔ、米国特許第５，３３４，７１１号；Ｇｏｌｄら、米国特許第６，３００，０７４号；ならびにＢｕｒｇｉｎら、既出を参照されたい）。細胞におけるそれらの効力を増進し、核酸分子からの塩基の除去を増進してオリゴヌクレオチド合成時間を短くして化学物質の必要量を低減する改変が望ましい。

例えば、ヌクレアーゼ耐性基を用いる改変、例えば２’−アミノ、２’−Ｃ−アリル、２’−フルオロ、２’−Ｏ−メチル、２’−Ｏ−アリル、２’−Ｈ、ヌクレオチド塩基改変によりオリゴヌクレオチドを改変して安定性を増進し、かつ／または生物学的活性を増進する（概説として、ＵｓｍａｎおよびＣｅｄｅｒｇｒｅｎ、１９９２、ＴＩＢＳ．１７、３４；Ｕｓｍａｎら、１９９４、Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｓｙｍｐ．Ｓｅｒ．３１、１６３；Ｂｕｒｇｉｎら、１９９６、Ｂｉｏｃｈｅｍｉｓｔｒｙ、３５、１４０９０を参照されたい）。核酸分子の糖の改変は、当該技術において詳細に記載されている（それぞれが参照によりその全体で本明細書に組み込まれるＥｃｋｓｔｅｉｎら、国際公開ＰＣＴ第ＷＯ９２／０７０６５号；Ｐｅｒｒａｕｌｔら、Ｎａｔｕｒｅ、１９９０、３４４、５６５〜５６８；ＰｉｅｋｅｎらＳｃｉｅｎｃｅ、１９９１、２５３、３１４〜３１７；ＵｓｍａｎおよびＣｅｄｅｒｇｒｅｎ、Ｔｒｅｎｄｓ ｉｎ Ｂｉｏｃｈｅｍ．Ｓｃｉ．、１９９２、１７、３３４〜３３９；Ｕｓｍａｎら国際公開ＰＣＴ第ＷＯ９３／１５１８７号；Ｓｐｒｏａｔ、米国特許第５，３３４，７１１号およびＢｅｉｇｅｌｍａｎら、１９９５、Ｊ．Ｂｉｏｌ．Ｃｈｅｍ．、２７０、２５７０２；Ｂｅｉｇｅｌｍａｎら、国際ＰＣＴ公開第ＷＯ９７／２６２７０号；Ｂｅｉｇｅｌｍａｎら、米国特許第５，７１６，８２４号；Ｕｓｍａｎら、米国特許第５，６２７，０５３号；Ｗｏｏｌｆら、国際ＰＣＴ公開第ＷＯ９８／１３５２６号；Ｔｈｏｍｐｓｏｎら、１９９８年４月２０日にファイルされた米国特許出願第６０／０８２，４０４号；Ｋａｒｐｅｉｓｋｙら、１９９８、Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ Ｌｅｔｔ．、３９、１１３１；ＥａｍｓｈａｗおよびＧａｉｔ、１９９８、Ｂｉｏｐｏｌｙｍｅｒｓ（Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ）、４８、３９〜５５；ＶｅｒｍａおよびＥｃｋｓｔｅｉｎ、１９９８、Ａｎｎｕ．Ｒｅｖ．Ｂｉｏｃｈｅｍ．、６７、９９〜１３４；ならびにＢｕｒｌｉｎａら、１９９７、Ｂｉｏｏｒｇ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．、５、１９９９〜２０１０を参照されたい）。このような教示の観点で、本明細書に記載されるのと同様の改変を用いて、細胞におけるＲＮＡｉを促進するｓｉＮＡの能力が著しく阻害されない限りは、本明細書に開示されるｓｉＮＡ核酸分子を改変できる。

活性を維持または増進する化学的改変を有する低分子妨害核酸（ｓｉＮＡ）分子を、本発明において意図する。このような核酸は、通常、未改変核酸よりも、ヌクレアーゼに対する耐性もより高い。よって、ｉｎ ｖｉｔｒｏおよび／またはｉｎ ｖｉｖｏ活性は、著しくは低下しない。外因的にデリバリーされる核酸分子は、通常、標的遺伝子生成物のレベルの低減を促進するようにコードされるｍＲＮＡおよび／またはポリペプチドの生成の調節を生じかつもたらすように、標的ＲＮＡの転写および／または翻訳のために十分な期間は少なくとも細胞内で安定であるように選択される。

ＲＮＡおよびＤＮＡ分子の生成は、合成により達成でき、ヌクレアーゼ安定性を増進するようにヌクレオチド改変の導入を提供できる（例えば本明細書に参照により組み込まれるＷｉｎｃｏｔｔら、１９９５、Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．２３、２６７７；Ｃａｒｕｔｈｅｒｓら、１９９２、Ｍｅｔｈｏｄｓ ｉｎ Ｅｎｚｙｍｏｌｏｇｙ ２１１、３〜１９を参照されたい）。ある実施形態において、本発明の核酸分子は、１または複数（例えば約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０またはそれより多く）のＧクランプヌクレオチドを含み、これらは、２重鎖内の相補的グアニンのワトソン−クリック面およびフーグスティーン面の両方で水素結合する能力を与え、核酸標的に対する親和性および特異性を増進させ得る改変シトシン類似体である（例えばＬｉｎら１９９８、Ｊ．Ａｍ．Ｃｈｅｍ．Ｓｏｃ．、１２０、８５３１〜８５３２を参照されたい）。別の例において、核酸分子は、２’，４’−Ｃメチレンビシクロヌクレオチドのような１または複数（例えば約１、２、３、４、５、６、７、８、９、１０またはそれより多く）のＬＮＡ「ロックド核酸」ヌクレオチドを含み得る（例えばＷｅｎｇｅｌら、ＷＯ００／６６６０４およびＷＯ９９／１４２２６を参照されたい）。

ｓｉＮＡ分子は、例えば細胞へのｓｉＮＡ分子のデリバリーを促進するために、コンジュゲートおよび／または複合体として提供できる。例示的なコンジュゲートおよび／または複合体は、ｓｉＮＡと小分子、脂質、コレステロール、リン脂質、ヌクレオシド、抗体、毒素、負に荷電したポリマー（例えばタンパク質、ペプチド、ホルモン、炭水化物、ポリエチレングリコールまたはポリアミン）とで構成されるものを含む。一般的に、記載される輸送体は、分解可能なリンカーを有するかまたは有さずに、個別にまたは多重構成要素系の一部として用いられるように設計される。これらの化合物は、血清の存在下もしくは非存在下で細胞への核酸分子のデリバリーおよび／または局在化を改善できる（例えば米国特許第５，８５４，０３８号を参照されたい）。本明細書に記載される分子のコンジュゲートは、生分解性核酸リンカー分子のような生分解性のリンカーにより生物学的活性分子と結合できる。

マウス細胞で用いるために適するｓｈＲＮＡをコードするヌクレオチド配列の非限定的な例は、例えば、
５’−ＧＣＣＣＡＴＴＣＡＴＡＴＧＴＡＴＡＴＣＡＡ−３’（配列番号０６）；
５’−ＧＣＣＣＡＡＴＴＣＣＡＧＡＡＴＣＡＴＧＡＴ−３’（配列番号０７）；
５’−ＧＣＣＣＡＴＴＣＡＴＴＡＧＴＡＴＡＴＣＡＡ−３’（配列番号０８）；および
５’−ＣＧＡＧＣＧＣＧＣＴＴＡＴＧＡＣＡＴＡＴＡ−３’（配列番号０９）
を含む。

図１Ｂは、ヒトＣｌｐＰポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を示す。当業者は、ヒトＣｌｐＰポリペプチドをコードするヌクレオチド配列に鑑みて、ヒト細胞、例えばヒトニューロンにおけるＣｌｐＰポリペプチドのレベルを低減するｓｉＲＮＡ（例えばｓｈＲＮＡ）を容易に設計できる。例えば、ｓｈＲＮＡは、上記のｓｈＲＮＡ配列に基づいて容易に設計できる。

ペプチド阻害剤
いくつかの実施形態において、ＣｌｐＰ阻害剤はペプチドである。適切なペプチドは、約３アミノ酸〜約５０、約５〜約３０または約１０〜約２５アミノ酸長のペプチドを含む。

ＣｌｐＰ阻害剤の非限定的な例は、ベンジルオキシカルボニル−ロイシルチロシンクロロメチルケトン（ｚ−ＬＹ−ＣＭＫ）である。

ペプチドは、天然に存在するアミノ酸および天然に存在しないアミノ酸を含み得る。ペプチドは、Ｄ−アミノ酸、Ｄ−アミノ酸とＬ−アミノ酸との組合せおよびペプチドに特別の性質を伝える種々の「デザイナー」アミノ酸（例えばβ−メチルアミノ酸、Ｃα−メチルアミノ酸およびＮα−メチルアミノ酸など）を含んでよい。さらに、ペプチドは環状ペプチドであってよい。ペプチドは、特定の立体構造モチーフを導入するために非古典的アミノ酸を含んでよい。任意の既知の非古典的アミノ酸を用いることができる。非古典的アミノ酸は、それらに限定されないが、１，２，３，４−テトラヒドロイソキノリン−３−カルボキシレート；（２Ｓ，３Ｓ）−メチルフェニルアラニン、（２Ｓ，３Ｒ）−メチル−フェニルアラニン、（２Ｒ，３Ｓ）−メチル−フェニルアラニンおよび（２Ｒ，３Ｒ）−メチル−フェニルアラニン；２−アミノテトラヒドロナフタレン−２−カルボン酸；ヒドロキシ−１，２，３，４−テトラヒドロイソキノリン−３−カルボキシレート；β−カルボリン（ＤおよびＬ）；ＨＩＣ（ヒスチジンイソキノリンカルボン酸）；ならびにＨＩＣ（ヒスチジン環状尿素）を含む。それらに限定されないが、ＬＬ−Ａｃｐ（ＬＬ−３−アミノ−２−プロペニドン−６−カルボン酸）、β−ターン誘導ジペプチド類似体；β−シート誘導類似体；β−ターン誘導類似体；α−ヘリックス誘導類似体；γ−ターン誘導類似体；Ｇｌｙ−Ａｌａターン類似体；アミド結合アイソスター；テトラゾールなどを含むアミノ酸類似体およびペプチド模倣物をペプチドに組み込んで、特定の２次構造を誘導するかまたはそのような構造に有利にしてよい。

ペプチドは、デプシペプチドであってよく、これは、直鎖状または環状のデプシペプチドであってよい。Ｋｕｉｓｌｅら（１９９９）Ｔｅｔ．Ｌｅｔｔｅｒｓ４０：１２０３〜１２０６。「デプシペプチド」は、少なくとも２つのアルファアミノ酸と少なくとも１つのアルファヒドロキシカルボン酸とが少なくとも１つの通常のペプチド結合とヒドロキシカルボン酸に由来するエステル結合とにより結合した配列を含有する化合物であり、「直鎖状デプシペプチド」は、Ｓ−Ｓブリッジによるかあるいはヒドロキシアミノ酸もしくはメルカプトアミノ酸のヒドロキシまたはメルカプト基と別のアミノ酸もしくはヒドロキシ酸のカルボキシル基とにより形成される環を含み得るが、ヒドロキシカルボン酸に由来するペプチドまたはエステル結合によってのみ形成される環を含まない。「環状デプシペプチド」は、ヒドロキシカルボン酸に由来するペプチドまたはエステル結合によってのみ形成される少なくとも１つの環を含有するペプチドである。

ペプチドは、環式または二環式であってよい。例えば、Ｃ末端カルボキシル基またはＣ末端エステルの環化は、カルボキシル基またはエステルのそれぞれ−ＯＨまたはエステル（−ＯＲ）をＮ末端アミノ基で内部置換して、環状ペプチドを形成することにより誘導できる。例えば、合成および切断によりペプチド酸を得た後に、遊離の酸を、溶液、例えば塩化メチレン（ＣＨ_２Ｃｌ_２）、ジメチルホルムアミド（ＤＭＦ）混液中のジシクロヘキシルカルボジイミド（ＤＣＣ）のような適切なカルボキシル基活性化剤により活性化エステルに変換する。環状ペプチドを、次いで、活性化エステルをＮ末端アミンで内部置換することにより形成する。重合に対抗する内部環化は、非常に希薄な溶液を用いることにより増進できる。環状ペプチドを作製する方法は、当該技術において公知である。

用語「二環式」は、２つの閉鎖環があるペプチドのことをいう。閉鎖環は、ペプチド中のアミノ酸同士の共有結合により形成される。２つの非隣接アミノ酸同士の共有結合は、共有ペプチド結合により既に結合している隣接アミノ酸の対の間の２つ目の共有結合と同様に、閉鎖環を構成する。閉鎖環を形成する共有結合は、アミド結合、すなわちあるアミノ酸上の遊離のアミノと２つ目のアミノ酸の遊離のカルボキシルとの間に形成される結合、またはペプチド中のアミノ酸の側鎖もしくは「Ｒ」基同士の間に形成される結合であってよい。つまり、二環式ペプチドは、「真の」二環式ペプチド、すなわちペプチドのＮ末端とＣ末端との間のペプチド結合の形成により環化されたペプチドであってよいか、または「デプシ二環式」ペプチド、すなわち末端アミノ酸がそれらの側鎖部分により共有結合したペプチドであってよい。

デスアミノまたはデスカルボキシ残基をペプチドの末端に組み込んで、末端アミノまたはカルボキシル基をなくし、プロテアーゼへの感受性を低下させるかまたはペプチドの立体構造を制限できる。Ｃ末端官能基は、アミド、アミド低級アルキル、アミドジ（低級アルキル）、低級アルコキシ、ヒドロキシおよびカルボキシ、ならびにそれらの低級エステル誘導体、ならびにそれらの医薬的に許容され得る塩を含む。

上記のＮ末端およびＣ末端改変に加えて、ペプチドまたはペプチド模倣物は、１もしくは複数の種々の親水性ポリマーで改変するか、またはそのようなポリマーと共有結合して、ペプチドの溶解性および循環半減期を増加できる。ペプチドと結合するための適切な非タンパク質性親水性ポリマーは、それらに限定されないが、ポリエチレングリコールおよびポリプロピレングリコールにより例示されるポリアルキルエーテル類、ポリ乳酸、ポリグリコール酸、ポリオキシアルケン類、ポリビニルアルコール、ポリビニルピロリドン、セルロースおよびセルロース誘導体、デキストランおよびデキストラン誘導体などを含む。通常、このような親水性ポリマーは、約５００〜約１００，０００ダルトン、約２，０００〜約４０，０００ダルトンまたは約５，０００〜約２０，０００ダルトンの範囲の平均分子量を有する。ペプチドは、Ｚａｌｌｉｐｓｋｙ，Ｓ．、Ｂｉｏｃｏｎｊｕｇａｔｅ Ｃｈｅｍ．、６：１５０〜１６５（１９９５）；Ｍｏｎｆａｒｄｉｎｉ，Ｃら、Ｂｉｏｃｏｎｊｕｇａｔｅ Ｃｈｅｍ．、６：６２〜６９（１９９５）；米国特許第４，６４０，８３５号；第４，４９６，６８９号；第４，３０１，１４４号；第４，６７０，４１７号；第４，７９１，１９２号；第４，１７９，３３７号またはＷＯ９５／３４３２６に記載される任意の方法を用いてこのようなポリマーで誘導体化できるか、またはこのようなポリマーと結合できる。

ＣｌｐＰポリペプチドの活性を低減するための別の適切な作用剤は、ペプチドアプタマーである。ペプチドアプタマーは、タンパク質機能の優勢な阻害剤として作用するペプチドまたは小ポリペプチドである。ペプチドアプタマーは、標的タンパク質と特異的に結合し、それらの機能的能力を遮断する。ＫｏｌｏｎｉｎおよびＦｉｎｌｅｙ、ＰＮＡＳ（１９９８）９５：１４２６６〜１４２７１。ペプチドアプタマーの高度に選択的な性質により、これらは、特定のタンパク質を標的にするためだけでなく、ある所定のタンパク質の特定の機能（例えばシグナル伝達機能）を標的にするために用いることもできる。さらに、ペプチドアプタマーは、時間的、空間的または誘導可能な様式で発現を制御するプロモーターを用いることにより制御された様式で発現できる。ペプチドアプタマーは優勢に作用する。よって、これらは、機能欠失型変異体が利用可能でないタンパク質を分析するために用いることができる。

標的タンパク質と高い親和性および特異性で結合するペプチドアプタマーは、当該技術において知られる種々の技術により単離できる。ペプチドアプタマーは、酵母二重ハイブリッドスクリーニングによりランダムペプチドライブラリーから単離できる（Ｘｕら、ＰＮＡＳ（１９９７）９４：１２４７３〜１２４７８）。これらは、ファージライブラリー（Ｈｏｏｇｅｎｂｏｏｍら、Ｉｍｍｕｎｏｔｅｃｈｎｏｌｏｇｙ（１９９８）４：１〜２０）または化学的に作製されたペプチド／ライブラリーから単離することもできる。

製剤、投与量および投与経路
ＡＥＣＥ（例えばＣｌｐＰ）のタンパク質分解活性を阻害する薬剤は、医薬的に許容され得る賦形剤と一緒に提供できる。医薬的に許容され得る賦形剤は、当業者に知られており、例えばＡ．Ｇｅｎｎａｒｏ（１９９５）「Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ：Ｔｈｅ Ｓｃｉｅｎｃｅ ａｎｄ Ｐｒａｃｔｉｃｅ ｏｆ Ｐｈａｒｍａｃｙ」、第１９版、Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ，Ｗｉｌｌｉａｍｓ，＆Ｗｉｌｋｉｎｓを含む種々の出版物に詳細に記載されている。

製剤
ＣｌｐＰのタンパク質分解活性を阻害する薬剤は、本明細書において「活性薬剤」、「薬剤」または「薬物」ともいう。主題の方法において、活性薬剤（複数可）は、疾患症状の所望の低減をもたらし得る任意の簡便な手段を用いて受容者に投与してよい。

活性薬剤は、治療用投与のための種々の製剤に組み込むことができる。より具体的には、活性薬剤は、適切な医薬的に許容され得る担体または希釈剤との組合せにより医薬組成物中に処方でき、錠剤、カプセル剤、散剤、顆粒剤、軟膏剤、液剤、坐剤、注射剤、吸入剤およびエアロゾルのような固体、半固体、液体または気体の形態の調製物中に処方してよい。

医薬的剤形において、活性薬剤は、それらの医薬的に許容され得る塩の形態で投与してよいか、またはこれらは、単独もしくはその他の医薬的に活性な化合物との適切な会合および併用にて用いてもよい。以下の方法および賦形剤は単に例示であり、全く限定しない。

経口調製物のために、薬剤は、単独または適切な添加物、例えばラクトース、マンニトール、コーンスターチまたはバレイショデンプンのような通常の添加物；結晶セルロース、セルロース誘導体、アカシア、コーンスターチまたはゼラチンのような結合剤；コーンスターチ、バレイショデンプンまたはカルボキシメチルセルロースナトリウムのような崩壊剤；タルクまたはステアリン酸マグネシウムのような滑沢剤；ならびに所望により希釈剤、緩衝剤、湿潤剤、防腐剤および香料と併用して、錠剤、散剤、顆粒剤またはカプセル剤を作製できる。

薬剤は、植物油もしくはその他の類似の油、合成脂肪族系酸グリセリド、高級脂肪族系酸またはプロピレングリコールのエステルのような水性または非水性の溶剤中に、そして所望により可溶化剤、等張化剤、懸濁化剤、乳化剤、安定化剤および防腐剤のような従来の添加物とともに薬剤を溶解、懸濁または乳化することにより注射用調製物に処方できる。

薬剤は、吸入により投与するためのエアロゾル製剤に利用することができる。本発明の化合物は、ジクロロジフルオロメタン、プロパン、窒素などのような加圧可能噴射剤に処方できる。

さらに、薬剤は、乳化基剤または水溶性基剤のような種々の基剤と混合することにより坐剤にすることができる。活性薬剤は、坐剤により直腸投与できる。坐剤は、カカオ脂、カーボワックスおよびポリエチレングリコールのような体温で溶融するが室温では固化する媒体を含み得る。

各投与単位、例えば茶匙量、大匙量、錠剤または坐剤が、１または複数の活性薬剤を含有する組成物の予め決定された量を含有するシロップ剤、エリキシル剤および懸濁剤のような経口または直腸投与用の単位剤形を用いてよい。同様に、注射または静脈内投与用の単位剤形は、滅菌水、通常の塩水または別の医薬的に許容され得る担体中の溶液として組成物中に薬剤（複数可）を含んでよい。

用語「単位剤形」は、本明細書で用いる場合、ヒトおよび動物の対象のために単一の投与量として適切な物理的に別個の単位であって、各単位が、医薬的に許容され得る希釈剤、担体もしくは媒体とともに、所望の効果を生じるのに十分な量で計算された活性薬剤の予め決定された量を含有する単位のことをいう。活性薬剤の詳細は、用いられる具体的な化合物および達成される効果、ならびに受容者における各化合物に関連する薬物動態に依存する。

投与のその他の形態も、主題の発明において用いることができる。例えば、活性薬剤は、坐剤、そしていくつかの場合においてはエアロゾルおよび鼻内組成物に処方できる。坐剤について、媒体組成物は、ポリアルキレングリコールまたはトリグリセリドのような従来の結合剤および担体を含む。このような坐剤は、約０．５％〜約１０％（ｗ／ｗ）または約１％〜約２％の範囲で活性成分を含有する混合物から形成してよい。

鼻内製剤は、通常、鼻粘獏に刺激を引き起こさず、繊毛機能も著しく妨げない媒体を含む。水、塩水またはその他の既知の物質のような希釈剤を、主題の発明とともに用いることができる。鼻内製剤は、それらに限定されないが、クロロブタノールおよび塩化ベンザルコニウムのような防腐剤も含んでよい。鼻粘膜による主題のタンパク質の吸収を増進するために、界面活性剤が存在してよい。

活性薬剤は、注射剤として投与できる。典型的には、注射用組成物は、液体の液剤または懸濁剤として調製される。注射前に液体の媒体に溶解または懸濁するために適切な固体の形態も調製してよい。調製物は、乳化してもよいか、または活性成分をリポソーム媒体に被包化してもよい。

適切な賦形剤媒体は、例えば水、塩水、ブドウ糖、グリセロール、エタノールなどおよびそれらの組合せである。さらに、所望により、媒体は、湿潤もしくは乳化剤またはｐＨ緩衝剤のような補助物質を少量含有してよい。このような剤形を調製する実際の方法は、当業者に知られているか、または明らかである。例えばＲｅｍｉｎｇｔｏｎ’ｓ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｓｃｉｅｎｃｅｓ、Ｍａｃｋ Ｐｕｂｌｉｓｈｉｎｇ Ｃｏｍｐａｎｙ、Ｅａｓｔｏｎ、Ｐｅｎｎｓｙｌｖａｎｉａ、第１７版、１９８５；Ｒｅｍｉｎｇｔｏｎ：Ｔｈｅ Ｓｃｉｅｎｃｅ ａｎｄ Ｐｒａｃｔｉｃｅ ｏｆ Ｐｈａｒｍａｃｙ、Ａ．Ｒ．Ｇｅｎｎａｒｏ（２０００）Ｌｉｐｐｉｎｃｏｔｔ、Ｗｉｌｌｉａｍｓ＆Ｗｉｌｋｉｎｓを参照されたい。投与される組成物または製剤は、いずれにしても、治療される対象において所望の状態を達成するために適切な量の薬剤を含有する。

媒体、アジュバント、担体または希釈剤のような医薬的に許容され得る賦形剤は、公衆にとって容易に利用可能である。さらに、ｐＨ調整および緩衝剤、浸透圧調整剤、安定化剤、湿潤剤などのような医薬的に許容され得る補助物質は、公衆にとって容易に利用可能である。

経口製剤
いくつかの実施形態において、活性薬剤は、そのような薬剤を必要とする個体への経口デリバリーのために処方される。

経口デリバリーのために、活性薬剤を含む主題の製剤は、いくつかの実施形態において、腸溶コーティング材料を含む。適切な腸溶コーティング材料は、ヒドロキシプロピルメチルセルロースアセテートスクシネート（ＨＰＭＣＡＳ）、ヒドロキシプロピルメチルセルロースフタレート（ＨＰＭＣＰ）、セルロースアセテートフタレート（ＣＡＰ）、ポリビニルフタレートアセテート（ＰＶＰＡ）、Ｅｕｄｒａｇｉｔ（商標）およびシェラックを含む。

適切な経口製剤のある非限定的な例として、米国特許第６，３４６，２６９号に記載されるように、活性薬剤を、１または複数の医薬的賦形剤とともに処方して、腸溶コーティングで被覆する。例えば、活性薬剤と安定化剤とを含む溶液で、医薬的に許容され得る賦形剤を含むコアを被覆して、活性薬剤で被覆したコアを形成する。副コーティング層を、活性薬剤で被覆したコアに用い、これを次いで腸溶コーティング層で被覆する。コアは、通常、ラクトース、デンプン、マンニトール、カルボキシメチルセルロースナトリウム、グリコール酸デンプンナトリウム、塩化ナトリウム、塩化カリウム、色素、アルギン酸の塩、タルク、二酸化チタン、ステアリン酸、ステアレート、微結晶セルロース、グリセリン、ポリエチレングリコール、クエン酸トリエチル、クエン酸トリブチル、プロパニルトリアセテート、リン酸水素カルシウム、リン酸三ナトリウム、硫酸カルシウム、シクロデキストリンおよびひまし油のような医薬的に不活性な構成要素を含む。活性薬剤についての適切な溶剤は、水性溶剤を含む。適切な安定化剤は、アルカリ金属およびアルカリ土類金属、ホスフェートおよび有機酸塩の塩基ならびに有機アミンを含む。副コーティング層は、接着剤、可塑剤および粘着防止剤の１または複数を含む。適切な粘着防止剤は、タルク、ステアリン酸、ステアレート、ナトリウムステアリルフマレート、グリセリルベヘネート、カオリンおよびアエロジルを含む。適切な接着剤は、ポリビニルピロリドン（ＰＶＰ）、ゼラチン、ヒドロキシエチルセルロース（ＨＥＣ）、ヒドロキシプロピルセルロース（ＨＰＣ）、ヒドロキシプロピルメチルセルロース（ＨＰＭＣ）、酢酸ビニル（ＶＡ）、ポリビニルアルコール（ＰＶＡ）、メチルセルロース（ＭＣ）、エチルセルロース（ＥＣ）、ヒドロキシプロピルメチルセルロースフタレート（ＨＰＭＣＰ）、セルロースアセテートフタレート（ＣＡＰ）、キサンタンガム、アルギン酸、アルギン酸の塩、Ｅｕｄｒａｇｉｔ（商標）、ポリビニルアセテートフタレート（ＰＶＡＰ）とアクリル酸メチル／メタクリル酸メチルのコポリマーを含む。適切な可塑剤は、グリセリン、ポリエチレングリコール、クエン酸トリエチル、クエン酸トリブチル、プロパニルトリアセテートおよびひまし油を含む。適切な腸溶コーティング材料は、ヒドロキシプロピルメチルセルロースアセテートスクシネート（ＨＰＭＣＡＳ）、ヒドロキシプロピルメチルセルロースフタレート（ＨＰＭＣＰ）、セルロースアセテートフタレート（ＣＡＰ）、ポリビニルフタレートアセテート（ＰＶＰＡ）、Ｅｕｄｒａｇｉｔ（商標）およびシェラックを含む。

適切な経口製剤は、以下のいずれかとともに処方された活性薬剤も含む：微粒剤（例えば米国特許第６，４５８，３９８号を参照されたい）；生分解性マクロマー（例えば米国特許第６，７０３，０３７号を参照されたい）；生分解性ヒドロゲル（例えばＧｒａｈａｍおよびＭｃＮｅｉｌｌ（１９８９）Ｂｉｏｍａｔｅｒｉａｌｓ５：２７〜３６を参照されたい）；生分解性粒子状ベクター（例えば米国特許第５，７３６，３７１号を参照されたい）；生体吸収性ラクトンポリマー（例えば米国特許第５，６３１，０１５号を参照されたい）；緩徐放出タンパク質ポリマー（例えば米国特許第６，６９９，５０４号；Ｐｅｌｉａｓ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｉｎｃ．を参照されたい）；ポリ（ラクチド−ｃｏ−グリコリド／ポリエチレングリコールブロックコポリマー（例えば米国特許第６，６３０，１５５号；Ａｔｒｉｘ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｉｅｓ，Ｉｎｃ．を参照されたい）；生体適合性ポリマーと、該ポリマー中に分散された金属カチオンで安定化された作用剤の粒子とを含む組成物（例えば米国特許第６，３７９，７０１号；Ａｌｋｅｒｍｅｓ Ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓ，Ｉｎｃ．を参照されたい）；およびミクロスフェア（例えば米国特許第６，３０３，１４８号；Ｏｃｔｏｐｌｕｓ，Ｂ．Ｖ．を参照されたい）。

適切な経口製剤は、以下のいずれかとともに処方された活性薬剤も含む：Ｅｍｉｓｐｈｅｒｅ（登録商標）（Ｅｍｉｓｐｈｅｒｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｉｎｃ．）のような担体；キサンタンガムとローカストビーンガムを組み合わせた、ブドウ糖の存在下で水中にて強い結合剤ゲルを形成する親水性マトリクスであるＴＩＭＥＲｘ（Ｐｅｎｗｅｓｔ）；Ｇｅｍｉｎｅｘ（商標）（Ｐｅｎｗｅｓｔ）；Ｐｒｏｃｉｓｅ（商標）（ＧｌａｘｏＳｍｉｔｈＫｌｉｎｅ）；ＳＡＶＩＴ（商標）（Ｍｉｓｔｒａｌ Ｐｈａｒｍａ Ｉｎｃ．）；ＲｉｎｇＣａｐ（商標）（Ａｌｚａ Ｃｏｒｐ．）；Ｓｍａｒｔｒｉｘ（登録商標）（Ｓｍａｒｔｒｉｘ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ，Ｉｎｃ．）；ＳＱＺｇｅｌ（商標）（ＭａｃｒｏＭｅｄ，Ｉｎｃ．）；Ｇｅｏｍａｔｒｉｘ（商標）（Ｓｋｙｅ Ｐｈａｒｍａ，Ｉｎｃ．）；Ｏｒｏｓ（登録商標）Ｔｒｉ−ｌａｙｅｒ（Ａｌｚａ Ｃｏｒｐｏｒａｔｉｏｎ）など。

米国特許第６，２９６，８４２号（Ａｌｋｅｒｍｅｓ Ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃｓ，Ｉｎｃ．）；米国特許第６，１８７，３３０号（Ｓｃｉｏｓ，Ｉｎｃ．）などに記載されるもののような製剤も、用いるために適切である。

腸吸収増進剤を含む製剤も、本発明において用いるために適切である。適切な腸吸収増進剤は、それらに限定されないが、カルシウムキレート剤（例えばクエン酸塩、エチレンジアミン四酢酸）；界面活性剤（例えばドデシル硫酸ナトリウム、胆汁酸塩、パルミトイルカルニチンおよび脂肪酸のナトリウム塩）；毒素（例えば密着帯毒素）などを含む。

制御放出製剤
いくつかの実施形態において、活性薬剤は、制御放出製剤に処方される。

本発明の範囲内の制御放出は、いくつかの伸長放出剤形の任意の１つを意味すると考えることができる。以下の用語は、本発明の目的のために、制御放出と実質的に等価であると考えてよい：連続放出、制御放出、遅延放出、デポー、徐放、長期放出、プログラム化された放出、延長放出、比例放出、長期化放出、持続性、遅滞、緩徐放出、間隔をあけた放出、持続放出、時間被覆、時限放出、遅延作用、伸長作用、層状時間作用、長期作用、延長作用、反復作用、緩徐作用、持続作用、持続作用薬物療法、および伸長放出。これらの用語についてのさらなる議論は、Ｌｅｓｃｚｅｋ Ｋｒｏｗｃｚｙｎｓｋｉ、Ｅｘｔｅｎｄｅｄ−Ｒｅｌｅａｓｅ Ｄｏｓａｇｅ Ｆｏｒｍｓ、１９８７（ＣＲＣ Ｐｒｅｓｓ，Ｉｎｃ．）で見出すことができる。

種々の制御放出技術が、非常に広い範囲の薬物剤形をカバーしている。制御放出技術は、それらに限定されないが、物理的な系および化学的な系を含む。

物理的な系は、それらに限定されないが、マイクロカプセル化、マクロカプセル化および膜の系のような速度制御膜を用いるレザバー系；中空繊維、超微孔性セルローストリアセテートならびに多孔性ポリマー基材およびフォームのような、速度制御膜を用いないレザバー系；非多孔性、ポリマーまたはエラストマーのマトリクス（例えば非侵食性、侵食性、環境作用剤内殖および分解性）に物理的に溶解した系、および非多孔性、ポリマーまたはエラストマーのマトリクス（例えば非侵食性、侵食性、環境作用剤内殖および分解性）に物理的に溶解した材料を含むモノリシックの系；外側の制御層と化学的に類似または相違するレザバー層を含む積層構造；ならびに浸透圧ポンプ、またはイオン交換樹脂への吸着のようなその他の物理的方法を含む。

化学的な系は、それらに限定されないが、ポリマーマトリクスの化学的侵食（例えば不均質または均質な侵食）、またはポリマーマトリクスの生物学的侵食（例えば不均質または均質）を含む。制御放出のための系のカテゴリーのさらなる議論は、Ａｇｉｓ Ｆ．Ｋｙｄｏｎｉｅｕｓ、Ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ Ｒｅｌｅａｓｅ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ：Ｍｅｔｈｏｄｓ，Ｔｈｅｏｒｙ ａｎｄ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ、１９８０（ＣＲＣ Ｐｒｅｓｓ，Ｉｎｃ．）で見出すことができる。

経口投与用に開発されたいくつかの制御放出薬物製剤がある。これらは、それらに限定されないが、浸透圧制御胃腸デリバリー系；動水圧制御胃腸デリバリー系；微孔性膜透過制御胃腸デリバリーデバイスを含む膜透過制御胃腸デリバリー系；胃液抵抗性腸標的制御放出胃腸デリバリーデバイス；ゲル拡散制御胃腸デリバリー系；ならびにカチオンおよびアニオンの薬物を含むイオン交換制御胃腸デリバリー系を含む。制御放出薬物デリバリー系に関するさらなる情報は、Ｙｉｅ Ｗ．Ｃｈｉｅｎ、Ｎｏｖｅｌ Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖｅｒｙ Ｓｙｓｔｅｍｓ、１９９２（Ｍａｒｃｅｌ Ｄｅｋｋｅｒ，Ｉｎｃ．）で見出すことができる。これらの処方のいくつかを、ここでより詳細に議論する。

腸溶コーティングを錠剤に用いて、胃での薬物の放出を妨げ、不快な副作用の危険性を低減するかまたはそうでなければ胃の環境に曝露されると分解の対象となる薬物の安定性を維持する。この目的のために用いられるほとんどのポリマーは、水性溶媒中でのそれらの溶解性がｐＨ依存性である事実により機能するポリ酸であり、これらは、胃で通常遭遇するよりも高いｐＨの条件を必要とする。

経口制御放出構造のある例示的な型は、固体または液体の剤形の腸溶コーティングである。腸溶コーティングは、容易な吸収のために腸の流体中で崩壊するように設計されている。腸溶コーティングを用いて製剤中に組み込まれている活性薬剤の吸収の遅延は、胃腸管を通る移動速度に依存するので、胃内容排出の速度が重要な因子である。いくらかの研究者が、顆粒剤のような多重単位型の剤形が、単一単位型よりも優れる場合があると報告している。よって、ある例示的な実施形態において、活性薬剤は、腸溶多重単位剤形に含まれる。例示的な実施形態において、活性薬剤剤形は、不活性コア材料上に活性薬剤−腸溶コーティング剤固体分散体の顆粒を噴霧被覆することにより調製される。これらの顆粒は、良好なバイオアベイラビリティーとともに薬物の延長された吸収をもたらすことができる。

適切な腸溶コーティング剤は、それらに限定されないが、ヒドロキシプロピルメチルセルロースフタレート、メタクリル酸−メタクリル酸エステルコポリマー、ポリビニルアセテート−フタレートおよびセルロースアセテートフタレートを含む。Ａｋｉｈｉｋｏ Ｈａｓｅｇａｗａ、Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎ ｏｆ ｓｏｌｉｄ ｄｉｓｐｅｒｓｉｏｎｓ ｏｆ Ｎｉｆｅｄｉｐｉｎｅ ｗｉｔｈ ｅｎｔｅｒｉｃ ｃｏａｔｉｎｇ ａｇｅｎｔ ｔｏ ｐｒｅｐａｒｅ ａ ｓｕｓｔａｉｎｅｄ−ｒｅｌｅａｓｅ ｄｏｓａｇｅ ｆｏｒｍ、Ｃｈｅｍ．Ｐｈａｒｍ．Ｂｕｌｌ．３３：１６１５〜１６１９（１９８５）。種々の腸溶コーティング材料を、最初から設計された腸溶コーティングされた剤形を達成するための試験に基づいて選択して、溶解時間、コーティング厚さおよび直径方向破砕強さの最適な組合せを得ることができる。Ｓ．Ｃ．Ｐｏｒｔｅｒら、Ｔｈｅ Ｐｒｏｐｅｒｔｉｅｓ ｏｆ Ｅｎｔｅｒｉｃ Ｔａｂｌｅｔ Ｃｏａｔｉｎｇｓ Ｍａｄｅ Ｆｒｏｍ Ｐｏｌｙｖｉｎｙｌ Ａｃｅｔａｔｅ−ｐｈｔｈａｌａｔｅ ａｎｄ Ｃｅｌｌｕｌｏｓｅ ａｃｅｔａｔｅ Ｐｈｔｈａｌａｔｅ、Ｊ．Ｐｈａｒｍ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．２２：４２頁（１９７０）。

別の型の有用な経口制御放出構造は、固体分散体である。固体分散体は、溶融（融合）、溶媒または溶融−溶媒法により調製される、固体状態の不活性担体またはマトリクス中の１もしくは複数の活性成分の分散体と定義できる。Ａｋｉｈｉｋｏ Ｈａｓｅｇａｗａ、Ｓｕｐｅｒ Ｓａｔｕｒａｔｉｏｎ Ｍｅｃｈａｎｉｓｍ ｏｆ Ｄｒｕｇｓ ｆｒｏｍ Ｓｏｌｉｄ Ｄｉｓｐｅｒｓｉｏｎｓ ｗｉｔｈ Ｅｎｔｅｒｉｃ Ｃｏａｔｉｎｇ Ａｇｅｎｔｓ、Ｃｈｅｍ．Ｐｈａｒｍ．Ｂｕｌｌ．３６：４９４１〜４９５０（１９９８）。固体分散体は、固体状態分散体と称することもできる。用語「共沈殿物」も、溶媒法により得られるこれらの調製物のことをいうために用いることができる。

担体の選択は、分散された薬物（例えば活性薬剤）の溶解特性に影響し得る。なぜなら、表面からの成分の溶出速度は、多重構成要素混合物中のその他の構成要素により影響され得るからである。例えば、水溶性担体は、マトリクスからの薬物の迅速な放出をもたらし得るか、または乏しい可溶性もしくは不溶性の担体は、マトリクスからの薬物のより遅い放出を導き得る。活性薬剤の溶解性は、担体とのいくらかの相互作用により増加することもある。

固体分散体における有用な担体の例は、それらに限定されないが、ポリエチレングリコール、ポリビニルピロリドンおよびヒドロキシプロピルメチルセルロースのような水溶性ポリマーを含む。代替の担体は、ホスファチジルコリンを含む。ホスファチジルコリンは両親媒性であるが水不溶性の脂質であり、ホスファチジルコリン固体分散体中での非晶質状態のそうでなければ不溶性の活性薬剤の溶解性を改善できる。

その他の担体は、ポリオキシエチレン硬化ひまし油を含む。水溶性に乏しい活性薬剤を、ヒドロキシプロピルメチルセルロースフタレートおよびカルボキシメチルエチルセルロースのような腸溶ポリマーならびに非腸溶ポリマーであるヒドロキシプロピルメチルセルロースを含む固体分散体系に含めてよい。別の固体分散体の剤形は、対象薬物（例えば活性薬剤）を、種々の比率のエチルセルロースとステアリン酸に組み込むことを含む。

固体分散体を調製するための種々の方法が一般的に知られている。これらは、それらに限定されないが、溶融法、溶媒法および溶融−溶媒法を含む。

別の制御放出剤形は、イオン交換樹脂と活性薬剤との複合体である。イオン交換樹脂−薬物複合体は、酸性および塩基性の薬物の持続放出製品を処方するために用いられている。ある例示的な実施形態において、ポリマーフィルムコーティングをイオン交換樹脂−薬物複合体粒子に設けて、これらの粒子からの薬物放出を拡散制御する。Ｙ．Ｒａｇｈｕｎａｔｈａｎら、Ｓｕｓｔａｉｎｅｄ−ｒｅｌｅａｓｅｄ ｄｒｕｇ ｄｅｌｉｖｅｒｙ ｓｙｓｔｅｍ Ｉ：Ｃｏｄｅｄ ｉｏｎ−ｅｘｃｈａｎｇｅ ｒｅｓｉｎ ｓｙｓｔｅｍｓ ｆｏｒ ｐｈｅｎｙｌｐｒｏｐａｎｏｌａｍｉｎｅ ａｎｄ ｏｔｈｅｒ ｄｒｕｇｓ、Ｊ．Ｐｈａｒｍ．Ｓｃｉｅｎｃｅｓ７０：３７９〜３８４（１９８１）を参照されたい。

注射用ミクロスフェアは、別の制御放出剤形である。注射用ミクロスフェアは、非水相分離技術、および噴霧乾燥技術により調製できる。ミクロスフェアは、ポリ乳酸またはコポリ（乳酸／グリコール酸）、Ｓｈｉｇｅｙｕｋｉ Ｔａｋａｄａ、Ｕｔｉｌｉｚａｔｉｏｎ ｏｆ ａｎ Ａｍｏｒｐｈｏｕｓ Ｆｏｒｍ ｏｆ ａ Ｗａｔｅｒ−Ｓｏｌｕｂｌｅ ＧＰＩＩｂ／ＩＩＩａ Ａｎｔａｇｏｎｉｓｔ ｆｏｒ Ｃｏｎｔｒｏｌｌｅｄ Ｒｅｌｅａｓｅ Ｆｒｏｍ Ｂｉｏｄｅｇｒａｄａｂｌｅ Ｍｉｃｒｏ ｓｐｈｅｒｅｓ、Ｐｈａｒｍ．Ｒｅｓ．１４：１１４６〜１１５０（１９９７）およびエチルセルロース、Ｙｏｓｈｉｙｕｋｉ Ｋｏｉｄａ、Ｓｔｕｄｉｅｓ ｏｎ Ｄｉｓｓｏｌｕｔｉｏｎ Ｍｅｃｈａｎｉｓｍ ｏｆ Ｄｒｕｇｓ ｆｒｏｍ Ｅｔｈｙｌ Ｃｅｌｌｕｌｏｓｅ Ｍｉｃｒｏｃａｐｓｕｌｅｓ、Ｃｈｅｍ．Ｐｈａｒｍ．Ｂｕｌｌ．３５：１５３８〜１５４５（１９８７）を用いて調製できる。

用い得るその他の制御放出技術は、それらに限定されないが、Ｅｌａｎ Ｐｈａｒｍａｃｅｕｔｉｃａｌ Ｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓから入手可能なＳＯＤＡＳ（回転楕円体経口薬物吸収システム）、ＩＮＤＡＳ（不溶性薬物吸収システム）、ＩＰＤＡＳ（腸管保護薬物吸収システム）、ＭＯＤＡＳ（多孔性経口薬物吸収システム）、ＥＦＶＡＳ（発泡性薬物吸収システム）、ＰＲＯＤＡＳ（プログラム化された経口薬物吸収システム）およびＤＵＲＥＤＡＳ（２重放出薬物吸収システム）を含む。ＳＯＤＡＳは、制御放出ビーズを利用する多重粒子状剤形である。ＩＮＤＡＳは、溶解性が乏しい薬物の溶解性を増加させるために設計された薬物デリバリー技術のファミリーである。ＩＰＤＡＳは、高密度制御放出ビーズと即時放出顆粒との組合せを利用する多重粒子状錠剤形である。ＭＯＤＡＳは、制御放出単一単位剤形である。各錠剤は、薬物放出の速度を制御する半透過性で多重分泌性の膜で囲まれた内部コアからなる。ＥＦＶＡＳは、発泡性薬物吸収システムである。ＰＲＯＤＡＳは、即時放出ミニ錠剤と制御放出ミニ錠剤との組合せを利用する多重粒子状製剤のファミリーである。ＤＵＲＥＤＡＳは、１つの剤形で２重の放出速度をもたらす２重層錠剤製剤である。これらの剤形は当業者に知られているが、これらの剤形のいくつかをここでより詳細に議論する。

ＩＮＤＡＳは、水溶性が乏しい薬物の溶解性および吸収の特徴を改善するために特に開発された。溶解性、および特に胃腸管の流体内での溶解は、水溶性が乏しい薬物の全体的な経口バイオアベイラビリティーを決定するのに重要な因子である。溶解性を増進することにより、薬物の全体的なバイオアベイラビリティーを増加して、投与量を結果的に低減できる。ＩＮＤＡＳは、高エネルギーマトリクス錠剤の形態であり、この製造は、２つの別々のステップを含む：問題のアデノシン類似体を、エネルギー、賦形剤および独特の処理手順の組合せにより非晶質形態に変換する。

所望の物理的形態に一旦変換されると、得られた高エネルギー複合体は、再結晶化を防ぐための新規なポリマー架橋技術を利用する吸収プロセスにより安定化され得る。用いる賦形剤の可溶性の特徴と結びついた活性薬剤の物理的状態の変化の組合せが、活性薬剤の可溶性を増進する。得られた吸収された非晶質薬物複合体顆粒は、ゲル形成性侵食性錠剤系とともに処方して、実質的に平滑で連続的な吸収を促進できる。

ＩＰＤＡＳは、潜在的に刺激性で潰瘍発生性の薬物の胃腸での耐容性を増進し得る多重粒子状錠剤技術である。腸管保護は、胃腸管全体で刺激性のリポエートの分散を促進するＩＰＤＡＳ製剤の多重粒子状の性質により促進される。個別のビーズの制御放出特性は、高濃度の薬物が局所的に放出され、全身的に吸収されることの両方を回避し得る。両方のアプローチの組合せにより、活性薬剤の潜在的な害を最小限にして、患者に利益をもたらす。

ＩＰＤＡＳは、多数の高密度制御放出ビーズで構成される。各ビーズは、活性薬剤が埋め込まれたマイクロマトリクスの最初の生成と、ｉｎ ｖｉｖｏで速度制限半透過性膜を形成するポリマー溶液でのこのマイクロマトリクスのその後の被覆とを含む２ステッププロセスにより製造できる。ＩＰＤＡＳ錠剤が一旦摂取されると、これは胃で崩壊してビーズを遊離する。これらのビーズは、その後、摂食状態とは関係なく、例えば制御された漸進的な様式で十二指腸の中および胃腸管に沿って通過し得る。活性薬剤の放出は、マイクロマトリクスを通って、そしてその後速度制御半透過性膜における孔を通って拡散プロセスにより生じる。ＩＰＤＡＳ錠剤からの放出速度は、最適化された臨床上の利益と関連した薬物特異的吸収プロファイルをもたらすようにカスタマイズできる。活性の迅速な開始が必要であれば、即時放出顆粒を錠剤に含めることができる。錠剤は、個別の調節のために用量の低減が必要であれば、薬物放出を実質的に損なうことなく、投与の前に砕くことができる。

ＭＯＤＡＳは、水溶性薬剤の吸収を制御するために用い得る薬物デリバリー系である。物理的に、ＭＯＤＡＳは、ｉｎ ｖｉｖｏで形成される半透過性膜による速度制限拡散のプロセスにより薬物放出を操作する非崩壊性タブレット製剤である。拡散プロセスは、胃腸の流体への薬物の提示の速度に本質的に影響して、体への取込みを制御する。賦形剤を最小限に用いるので、ＭＯＤＡＳは、小投与量サイズの形態に容易に対応できる。各ＭＯＤＡＳ錠剤は、活性薬物と賦形剤とを含有するコアとして開始する。このコアが、不溶性ポリマーと可溶性賦形剤との溶液で被覆される。錠剤が一旦摂取されると、胃腸管の流体は、外側のコーティングの可溶性賦形剤を溶解して、実質的に不溶性ポリマーを残すことができる。その結果、胃腸管からの流体を、水溶性薬物の内側の薬物コアに連結する小さく狭いチャネルのネットワークが得られる。この流体がこれらのチャネルを通ってコアに入り、薬物を溶解し、得られる薬物の溶液が制御された様式で外に拡散し得る。このことにより、制御された溶解および吸収の両方が可能になる。この系の利点は、錠剤の薬物放出孔が、錠剤の実質的に表面全体に分布していることである。このことにより、均質な薬物吸収が促進され、積極的な１方向の薬物デリバリーが低減される。ＭＯＤＡＳは、内側のコアおよび外側の半透過性膜の両方が、薬物の個別のデリバリー要件に適するように変化し得るという非常に柔軟な剤形である。特に、内側のコアに賦形剤を加えると、より予測可能な放出および吸収の速度を促進する錠剤内での微小環境の生成が補助され得る。即時放出性の外側のコーティングを加えることにより、組合せ製品の開発が可能になり得る。

さらに、ＰＲＯＤＡＳは、活性薬剤をデリバリーするために用いることができる。ＰＲＯＤＡＳは、直径１．５〜４ｍｍのサイズ範囲の制御放出ミニ錠剤の生成に基づく多重粒子状薬物デリバリー技術である。ＰＲＯＤＡＳ技術は、多重粒子と親水性マトリクス錠剤アプローチのハイブリッドであり、１つの剤形中に、これらの薬物デリバリー系の両方の利点を組み込むことができる。

その最も基本的な形態において、ＰＲＯＤＡＳは、即時放出顆粒を直接圧縮して、活性薬剤を含有する個別のミニ錠剤を生成することを含む。これらのミニ錠剤は、その後、最終的な剤形であるハードゲルおよびカプセルに組み込まれる。この技術のより有益な使用は、制御放出製剤の生成にある。この場合、種々のポリマーの組合せを顆粒に組み込むことにより、個別のミニ錠剤のそれぞれからの薬物の放出速度を遅らせることができる。これらのミニ錠剤は、その後、制御放出ポリマー溶液で被覆して、さらなる遅延放出特性を提供し得る。水溶性が高い薬物またはおそらく胃刺激性の薬物の場合には、さらなるコーティングが必要である場合があり、ここで、放出は、製剤が胃腸管からより遠位の領域に到達するまで遅延できる。ＰＲＯＤＡＳ技術の１つの価値は、処方が元来柔軟であることにあり、このことにより、それぞれ異なる放出速度を有するミニ錠剤の組合せが１つの剤形に組み合わせられる。特定の期間にわたって制御吸収を潜在的に可能にすることに加えて、このことによっても、胃腸管全体にわたる特定の吸収部位への薬物の標的化されたデリバリーが可能になる。異なる活性成分が処方されたミニ錠剤を用いる組合せ製品も可能である。

ＤＵＲＥＤＡＳは、活性薬剤を処方するために用いることができる２重層錠剤形成技術である。ＤＵＲＥＤＡＳは、２つの異なる放出速度、または１つの剤形からの薬物の２重放出を提供するために開発された。用語２重層は、錠剤形成プロセス中に生じる２つの別々の直接圧縮事象のことをいう。例示的な実施形態において、即時放出顆粒をまず圧縮し、その後、制御放出要素を加えて、これが次いでこの最初の錠剤上に圧縮される。このことにより、最終的な剤形でみられる特徴的な２重層を得ることができる。

制御放出特性は、親水性ポリマーの組合せにより提供し得る。あるいくつかの場合において、治療効果の迅速な開始を促進するために、活性薬剤の迅速な放出が望ましい場合がある。よって、錠剤の１層を即時放出顆粒として処方できる。対照的に、錠剤の第２層は、例えば親水性ポリマーの使用により制御された様式で薬物を放出できる。この制御放出は、親水性ポリマーマトリクスを通しての拡散と侵食との組合せに起因し得る。

ＤＵＲＥＤＡＳ技術のさらなる拡張は、制御放出併用剤形の生成である。この場合、２つの異なる活性薬剤を２重層錠剤に組み込むことができ、各層からの薬物の放出を制御して、併用の治療効果を最大限にできる。

活性薬剤は、上記の制御放出剤形またはその他の従来の剤形のいずれか１つに組み込むことができる。各用量に含まれる活性薬剤の量は、個別の患者の必要性および徴候に合致するように調整できる。本開示を読んだ当業者は、活性薬剤のデリバリーおよびそのバイオアベイラビリティーを最適化するために、制御放出製剤中の活性薬剤のレベルおよび放出速度をどのように調整するかを容易に認識する。

吸入製剤
活性薬剤は、いくつかの実施形態において、吸入経路による医薬的なデリバリー系により患者に投与される。活性薬剤は、吸入による投与に適する形態で処方され得る。投与の吸入経路は、吸入された薬物が血液脳関門を迂回し得るという利点をもたらす。医薬的なデリバリー系は、活性薬剤を気管支の粘膜裏層にデリバリーすることによる呼吸器系療法に適するものである。本発明は、容器から活性薬剤を排出するために圧縮気体の力に依存する系を利用できる。この目的のために、エアロゾルまたは加圧包装を用いることができる。

本明細書で用いる場合、用語「エアロゾル」は、非常に微細な液体または固体の粒子が加圧下に噴射気体により治療のための施用部位まで運ばれることをいう、その通常の意味で用いられる。医薬的なエアロゾルを本発明において用いる場合、エアロゾルは、治療活性化合物（例えば活性薬剤）を含有し、これは、流体の担体と噴射剤との混合物に溶解、懸濁または乳化できる。エアロゾルは、溶液、懸濁液、乳液、粉末または半固体の調製物の形態であり得る。本発明において用いられるエアロゾルは、微細な固体粒子として、または液体のミストとしての患者の気道を介する投与を意図する。当業者に知られる種々の型の噴射剤を利用できる。適切な噴射剤は、それらに限定されないが、炭化水素またはその他の適切な気体を含む。加圧エアロゾルの場合、投与量単位は、計量された量をデリバリーするための値を提供することにより決定し得る。

活性薬剤は、ネブライザーを用いるデリバリーのために処方することもでき、これは、気体中に、実質的に均質なサイズの非常に微細な液体粒子を生じる装置である。例えば、活性薬剤を含有する液体を、液滴として分散させる。小液滴は、ネブライザーの出口管を通る気体の流れにより運ばれ得る。得られるミストは、患者の気道に浸透する。

滑沢剤、担体もしくは噴射剤とともにまたはそれらなしで活性薬剤を含有する粉末組成物を、治療を必要とする哺乳動物に投与できる。本発明のこの実施形態は、吸入により粉末医薬組成物を投与するための従来のデバイスを用いて行うことができる。例えば、化合物とラクトースまたはデンプンのような適切な粉末基材との粉末混合物を、吸入器の補助によりそこから粉末が投与され得る例えばカプセルもしくはカートリッジ、例えばゼラチンまたはブリスタパック中の単位剤形にすることができる。

本発明と関連して用いることができるいくつかの異なる型の吸入法がある。活性薬剤は、基本的に、吸入のための３つの異なる型の製剤に処方できる。第１に、活性薬剤は、低沸点噴射剤とともに処方できる。このような製剤は、通常、従来の定量噴霧式吸入器（ＭＤＩ）により投与される。しかし、従来のＭＤＩは、米国特許第５，４０４，８７１号および第５，５４２，４１０号に議論されるように、患者の吸気容量および流速を測定する技術を用いることにより反復可能な投与を行う能力を増加するように改変できる。

代わりに、活性薬剤は、水性またはエタノール性の溶液に処方して、従来のネブライザーによりデリバリーできる。いくつかの実施形態において、このような溶液製剤は、米国特許第５，４９７，７６３号；第５，５４４，６４６号；第５，７１８，２２２号；および第５，６６０，１６６号に開示されるようなデバイスおよびシステムを用いてエアロゾル化される。

活性薬剤は、乾燥粉末製剤に処方できる。このような製剤は、粉末のエアロゾルミストを創出した後に乾燥粉末製剤を単純に吸入することにより投与できる。このようなことを行うための技術は、１９９８年７月７日に発行された米国特許第５，７７５，３２０号および１９９８年４月２１日に発行された米国特許第５，７４０，７９４号に記載される。

投与量
用いられる投与量は、達成される臨床上の目標に依存して変動するが、適切な投与量範囲は、ニューロンにおけるＣｌｐＰタンパク質分解活性を阻害する薬剤の約１μｇ〜約１，０００μｇまたは約１０，０００μｇまでを提供し、単一用量で投与できるものである。代わりに、ニューロンにおけるＣｌｐＰタンパク質分解活性を低減する薬剤の目標投与量は、薬剤の投与後の最初の２４〜４８時間以内に採血された受容者の血液試料中の約０．１〜１０００μＭ、約０．５〜５００μＭ、約１〜１００μＭまたは約５〜５０μＭの範囲付近であると考えることができる。

当業者は、用量レベルが、特定の化合物、症状の重篤度および副作用に対する患者の感受性の関数として変動し得ることを容易に認識する。ある所定の化合物についての好ましい投与量は、種々の手段により当業者が容易に決定できる。

いくつかの実施形態において、活性薬剤の複数回用量が投与される。活性薬剤の投与頻度は、任意の種々の因子、例えば症状の重篤度などに依存して変動し得る。例えば、いくつかの実施形態において、活性薬剤は、１カ月１回、１カ月２回、１カ月３回、隔週（ｑｏｗ）、週１回（ｑｗ）、週２回（ｂｉｗ）、週３回（ｔｉｗ）、週４回、週５回、週６回、１日おき（ｑｏｄ）、毎日（ｑｄ）、１日２回（ｑｉｄ）または１日３回（ｔｉｄ）投与される。いくつかの実施形態において、活性薬剤は、連続的に投与される。

活性薬剤の投与期間、例えば活性薬剤がその間投与される期間は、任意の種々の因子、例えば患者の応答に依存して変動し得る。例えば、活性薬剤は、約１日〜約１週間、約２週間〜約４週間、約１カ月〜約２カ月、約２カ月〜約４カ月、約４カ月〜約６カ月、約６カ月〜約８カ月、約８カ月〜約１年、約１年〜約２年、または約２年〜約４年、またはそれより長い範囲の期間にわたって投与できる。いくつかの実施形態において、ＣｌｐＰタンパク質分解活性を阻害する薬剤は、個体の生涯にわたって投与される。

いくつかの実施形態において、活性薬剤の投与は不連続であり、例えば活性薬剤は、第１の期間、第１の投与頻度で投与され、活性薬剤の投与は、ある期間中止され、そして活性薬剤は、第２の期間、第２の投与頻度で投与される。活性薬剤の投与が中止される期間は、種々の因子、例えば個体の認知機能に依存して変動でき、通常、約１週間〜約６カ月、例えば約１週間〜約２週間、約２週間〜約４週間、約１カ月〜約２カ月、約２カ月〜約４カ月、または約４カ月〜約６カ月、またはそれより長い範囲である。第１の期間は、第２の期間と同じまたは異なっていてよく、第１の投与頻度は、第２の投与頻度と同じまたは異なっていてよい。

投与経路
ＣｌｐＰタンパク質分解活性を阻害する薬剤は、ｉｎ ｖｉｖｏおよびｅｘ ｖｉｖｏの方法、ならびに全身的および局所的な投与経路を含む薬物デリバリーに適する任意の利用可能な方法および経路を用いて個体に投与される。

従来の医薬的に許容され得る投与経路は、鼻内、筋肉内、気管内、皮下、皮内、外用塗布、静脈内、直腸、鼻、経口およびその他の非経口の投与経路を含む。投与経路は、所望により組み合わせるか、または薬剤および／もしくは所望の効果に依存して調整してよい。組成物は、単回用量または複数回用量で投与できる。

薬剤は、全身的または局所的な経路を含む従来の薬物デリバリーに適する任意の利用可能な従来の方法および経路を用いて受容者に投与できる。一般的に、本発明が意図する投与経路は、それらに必ずしも限定されないが、経腸、非経口または吸入経路を含む。

吸入投与以外の非経口投与経路は、それらに必ずしも限定されないが、外用、経皮、皮下、筋肉内、眼窩内、関節内、脊髄内、胸骨内、頭蓋内および静脈内の経路、すなわち消化管を通る以外の任意の投与経路を含む。非経口投与は、薬剤の全身的または局所的なデリバリーをもたらすために行うことができる。全身的なデリバリーが望ましい場合、投与は、典型的には、医薬調製物の侵襲的または全身吸収性の外用もしくは粘膜投与を含む。

薬剤は、経腸投与により対象にデリバリーすることもできる。経腸投与経路は、それらに必ずしも限定されないが、経口および直腸（例えば坐剤を用いて）デリバリーを含む。

皮膚または粘膜を通しての薬剤の投与方法は、それらに必ずしも限定されないが、適切な医薬調製物の外用塗布、経皮透過、注射および表皮投与を含む。経皮透過のために、吸収促進剤またはイオン泳動が適切な方法である。イオン泳動透過は、それらの製品を連続的に電気パルスにより、破壊されていない皮膚を通して数日以上の期間デリバリーする、商業的に入手可能な「パッチ」を用いて達成し得る。

いくつかの実施形態において、活性薬剤は、連続デリバリー系によりデリバリーされる。用語「連続デリバリー系」は、本明細書において「制御デリバリー系」と交換可能に用いられ、カテーテル、注射デバイスなどと組み合わせた連続的（例えば制御された）デリバリーデバイス（例えばポンプ）を含み、その広い種類が当該技術において知られている。

機械的または電気機械的な注入ポンプも、本発明での使用に適切であり得る。このようなデバイスの例は、例えば米国特許第４，６９２，１４７号；第４，３６０，０１９号；第４，４８７，６０３号；第４，３６０，０１９号；第４，７２５，８５２号；第５，８２０，５８９号；第５，６４３，２０７号；第６，１９８，９６６号などに記載されるものを含む。一般的に、活性薬剤のデリバリーは、任意の種々の補充可能なポンプシステムを用いて達成できる。ポンプは、経時的に一定で制御された放出をもたらす。いくつかの実施形態において、薬剤は、薬物不浸透性レザバー中の液体製剤であり、個体に連続的な様式でデリバリーされる。

ある実施形態において、薬物デリバリー系は、少なくとも部分的に移植可能なデバイスである。移植可能なデバイスは、任意の適切な移植部位にて、当該技術において公知の方法およびデバイスを用いて移植できる。移植部位は、薬物デリバリーデバイスが導入されて配置される、対象の体内の部位である。移植部位は、それらに必ずしも限定されないが、真皮下、皮下、筋肉内または対象の体内のその他の適切な部位を含む。薬物デリバリーデバイスの移植および除去が簡便であるので、皮下移植部位がいくつかの実施形態において用いられる。

本発明において用いるのに適する薬物放出デバイスは、任意の種々の操作形態に基づくことができる。例えば、薬物放出デバイスは、拡散性の系、対流系または侵食性の系（例えば侵食に基づく系）に基づくことができる。例えば、薬物放出デバイスは、電気化学的ポンプ、浸透圧ポンプ、電気浸透性ポンプ、蒸気圧ポンプまたは浸透圧破裂マトリクスであり得、ここでは、例えば薬物がポリマー内に組み込まれ、該ポリマーが薬物含浸ポリマー材料（例えば生分解性薬物含浸ポリマー材料）の分解に付随して薬物製剤の放出を提供する。その他の実施形態において、薬物放出デバイスは、電気拡散系、電解ポンプ、発泡性ポンプ、圧電ポンプ、加水分解系などに基づく。

機械的または電気機械的注入ポンプに基づく薬物放出デバイスも、本発明での使用に適切である。このようなデバイスの例は、例えば米国特許第４，６９２，１４７号；第４，３６０，０１９号；第４，４８７，６０３号；第４，３６０，０１９号；第４，７２５，８５２号などに記載されるものを含む。一般的に、主題の治療方法は、任意の種々の補充可能で交換不可能なポンプ系を用いて達成できる。ポンプおよびその他の対流系は、一般的に、経時的に概してより一定な制御放出のために好ましい。浸透圧ポンプは、より一定な制御放出と比較的小さいサイズと組み合わせた利点により、いくつかの実施形態において用いられる（例えばＰＣＴ公開公報第ＷＯ９７／２７８４０号ならびに米国特許第５，９８５，３０５号および第５，７２８，３９６号を参照されたい））。本発明で用いるために適する例示的な浸透圧駆動デバイスは、それらに必ずしも限定されないが、米国特許第３，７６０，９８４号；第３，８４５，７７０号；第３，９１６，８９９号；第３，９２３，４２６号；第３，９８７，７９０号；第３，９９５，６３１号；第３，９１６，８９９号；第４，０１６，８８０号；第４，０３６，２２８号；第４，１１１，２０２号；第４，１１１，２０３号；第４，２０３，４４０号；第４，２０３，４４２号；第４，２１０，１３９号；第４，３２７，７２５号；第４，６２７，８５０号；第４，８６５，８４５号；第５，０５７，３１８号；第５，０５９，４２３号；第５，１１２，６１４号；第５，１３７，７２７号；第５，２３４，６９２号；第５，２３４，６９３号；第５，７２８，３９６号などに記載されるものを含む。

いくつかの実施形態において、薬物デリバリーデバイスは、移植可能なデバイスである。薬物デリバリーデバイスは、任意の適切な移植部位にて、当該技術において公知の方法およびデバイスを用いて移植できる。以下からわかるように、移植部位は、薬物デリバリーデバイスが導入されて配置される、対象の体内の部位である。移植部位は、それらに必ずしも限定されないが、真皮下、皮下、筋肉内または対象の体内のその他の適切な部位を含む。

いくつかの実施形態において、活性薬剤は、移植可能な薬物デリバリー系、例えば薬剤の投与をもたらすためにプログラム可能である系を用いてデリバリーされる。例示的なプログラム可能で移植可能な系は、移植可能な注入ポンプを含む。例示的な移植可能な注入ポンプまたはそのようなポンプとの関連で有用なデバイスは、例えば米国特許第４，３５０，１５５号；第５，４４３，４５０号；第５，８１４，０１９号；第５，９７６，１０９号；第６，０１７，３２８号；第６，１７１，２７６号；第６，２４１，７０４号；第６，４６４，６８７号；第６，４７５，１８０号；および第６，５１２，９５４号に記載される。本発明に適合できるさらなる例示のデバイスは、Ｓｙｎｃｈｒｏｍｅｄ注入ポンプ（Ｍｅｄｔｒｏｎｉｃ）である。

血液脳関門の横断
血液脳関門は、全身の循環からの脳および脊髄への多数の治療薬剤の取込みを制限する。血液脳関門を横断する分子は、２つの主要な機構、自由拡散および促進輸送を用いる。血液脳関門が存在するので、中枢神経系（ＣＮＳ）におけるある所定の治療薬剤の有益な濃度を達成するために、薬物デリバリーストラテジーの使用が必要である。ＣＮＳへの治療薬剤のデリバリーは、いくつかの方法により達成できる。

１つの方法は、神経外科的な技術に依拠する。事故の犠牲者または種々の形態の認知症に罹患した患者のような重症患者の場合、その付随する危険性にもかかわらず外科的介入が正当化される。例えば、治療薬剤は、薬物の脳室内またはくも膜下腔内注射のようなＣＮＳへの直接の物理的な導入によりデリバリーできる。脳室内注射は、例えばＯｍｍａｙａレザバーのようなレザバーに付属する脳室内カテーテルにより促進し得る。導入の方法は、補充可能または生分解性のデバイスにより行うこともできる。別のアプローチは、血液脳関門の透過性を増加する物質による血液脳関門の崩壊である。その例は、マンニトールのような拡散性が乏しい作用剤、エトポシドのような脳血管透過性を増加させる医薬品またはロイコトリエンのような血管作動性薬剤の動脈内注入を含む。ＮｅｕｗｅｌｔおよびＲａｐｐｏｐｏｒｔ（１９８４）Ｆｅｄ．Ｐｒｏｃ．４３：２１４〜２１９；Ｂａｂａら（１９９１）Ｊ．Ｃｅｒｅｂ．Ｂｌｏｏｄ Ｆｌｏｗ Ｍｅｔａｂ．１１：６３８〜６４３；ならびにＧｅｎｎｕｓｏら（１９９３）Ｃａｎｃｅｒ Ｉｎｖｅｓｔ．１１：６３８〜６４３。

さらに、医薬剤を、治療を必要とする領域に局所的に投与することが望ましい場合がある。このことは、例えば、カテーテルによるかあるいはサイラスティック膜のような膜もしくは線維を含む多孔性、非多孔性またはゼラチン状の材料のインプラントによる注射による手術中の局所的注入により達成し得る。

治療用化合物は、化学改変または血液脳関門を横断する類似体のスクリーニングを含む薬理学的技術を用いることによってもデリバリーできる。化合物を改変して、分子の疎水性を増加するか、分子の正味の電荷もしくは分子量を低下させるかまたは血液脳関門を通常横断して輸送されるものに類似するように分子を改変することができる。Ｌｅｖｉｎ（１９８０）Ｊ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．２３：６８２〜６８４；Ｐｅｐｔｉｄｅ Ｄｒｕｇ Ｄｅｌｉｖｅｒｙ ｔｏ ｔｈｅ Ｂｒａｉｎ 中のＰａｒｄｒｉｄｇｅ（１９９１）およびＫｏｓｔｉｓら（１９９４）Ｊ．Ｃｌｉｎ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ．３４：９８９〜９９６。

リポソームのような疎水性環境への薬物の被包化も、薬物をＣＮＳへデリバリーする際に効果的である。例えばＷＯ９１／０４０１４は、血液脳関門を通常横断して輸送される分子を加えたリポソーム内に薬物が被包化されたリポソームデリバリー系について記載している。

血液脳関門を通過するための薬剤を処方する別の方法は、薬物をシクロデキストリンに被包化することである。それらに限定されないが、α−シクロデキストリン、β−シクロデキストリンおよびそれらの誘導体を含む、血液脳関門を通過する任意の適切なシクロデキストリンを用い得る。全般的に、米国特許第５，０１７，５６６号、第５，００２，９３５号および第４，９８３，５８６号を参照されたい。このような組成物は、米国特許第５，１５３，１７９号に記載されるようなグリセロール誘導体も含み得る。

デリバリーは、治療用薬剤を輸送可能な作用剤にコンジュゲーションさせて新しいキメラ輸送可能治療用薬剤を得ることにより行うこともできる。例えば、血管作動性小腸ペプチド類似体（ＶＩＰａ）は、特異的担体分子トランスフェリン受容体に対するモノクローナル抗体（Ｍａｂ）へのコンジュゲーションの後にのみその血管作動性効果を発揮し、このことは、血液脳関門を通してのＶＩＰａ−Ｍａｂコンジュゲートの取込みを促進した。Ｐａｒｄｒｉｄｇｅ（１９９１）；およびＢｉｃｋｅｌら（１９９３）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ Ｓｃｉ．ＵＳＡ９０：２６１８〜２６２２。いくつかのその他の特異的輸送系が同定されており、これらは、それらに限定されないが、インスリンまたはインスリン様成長因子ＩおよびＩＩを輸送するためのものを含む。その他の適切な非特異的担体は、それらに限定されないが、ピリジニウム、脂肪酸、イノシトール、コレステロールおよびグルコース誘導体を含む。あるいくつかのプロドラッグが記載されており、これにより、中枢神経系に侵入する際に、薬物が担体から切断されて活性薬物を放出する。米国特許第５，０１７，５６６号。

併用療法
ＣｌｐＰ阻害剤（例えばＡｐｏＥを切断するＣｌｐＰタンパク質分解活性を阻害する薬剤）は、１または複数のさらなる治療用薬剤との併用療法において投与できる。

適切なさらなる治療用薬剤は、それらに限定されないが、Ａｒｉｃｅｐｔ（ドネペジル）、Ｅｘｅｌｏｎ（リバスチグミン）、メトリホネートおよびタクリン（Ｃｏｇｎｅｘ）を含むアセチルコリンエステラーゼ阻害剤；それらに限定されないが、イブプロフェンおよびインドメタシンを含む非ステロイド性抗炎症剤；Ｃｅｌｅｂｒｅｘのようなシクロオキシゲナーゼ−２（Ｃｏｘ２）阻害剤；ならびにＳｅｌｅｇｉｌｅｎｅ（ＥｌｄｅｐｒｙｌまたはＤｅｐｒｅｎｙｌ）のようなモノアミンオキシダーゼ阻害剤を含むが、それらに限定されない。上記の薬剤のそれぞれについての投与量は、当該技術において知られている。例えば、Ａｒｉｃｅｐｔは、通常、１日あたり５０ｍｇが６週間にわたり、そして個体が良好に許容するならばその後１日あたり１０ｍｇが経口投与される。

いくつかの実施形態において、主題の併用療法は、ＣｌｐＰ活性を阻害する薬剤とアセチルコリンエステラーゼ阻害剤の投与を含む。いくつかの実施形態において、主題の併用療法は、ＣｌｐＰ活性を阻害する薬剤と抗炎症剤の投与を含む。いくつかの実施形態において、主題の併用療法は、ＣｌｐＰ活性を阻害する薬剤とＡｐｏＥ４ドメイン相互作用を低減するＡｐｏＥ４「構造修正剤」である薬剤の投与を含む。ＡｐｏＥ４ドメイン相互作用を低減する薬剤は、例えば、米国特許出願公開第２００６／００７３１０４号；およびＹｅら（２００５）Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ１０２：１８７００に記載される薬剤を含む。

いくつかの実施形態において、主題の併用療法は、ＣｌｐＰ活性を阻害する薬剤と「ミトコンドリア保護剤」、例えば神経毒性ＡｐｏＥフラグメントの有害な影響からミトコンドリアを保護する薬剤、例えばミトコンドリアと神経毒性ＡｐｏＥフラグメントとの相互作用を低減する薬剤の投与を含む。

本発明の治療用薬剤を用いる治療に適する対象
主題の方法を用いる治療に適する対象は、ＡｐｏＥ関連障害、例えばＡｐｏＥ４関連障害を有する任意の個体、例えばヒトを含む。主題の方法を用いる治療に適する対象は、少なくとも１つのＡｐｏＥ４対立遺伝子を有する任意の個体、特にヒトを含む。適切な対象は、ＡｐｏＥ関連障害を有するか、ＡｐｏＥ関連障害を発生する危険性があるか、ＡｐｏＥ関連障害を有していたがＡｐｏＥ関連障害の再発の危険性があるか、またはＡｐｏＥ関連障害から回復している個体を含む。

そのような対象は、それらに限定されないが、アルツハイマー病であると診断された個体；１または複数の脳卒中に罹患した個体；外傷性頭部損傷に罹患した個体；高い血清コレステロールレベルを有する個体；脳組織にＡβ沈着を有する個体；１または複数の心臓の事象を有した個体；心臓手術を受ける対象；および多発性硬化症の対象を含む。

スクリーニング法
本発明は、個体におけるＡｐｏＥ関連障害（例えばＡｐｏＥ４関連障害）を治療するための候補薬剤を同定する方法を提供する。本方法は、全般的に、酵素活性ＣｌｐＰポリペプチドを、試験薬剤およびＡｐｏＥポリペプチド基質と接触させるステップと、ＡｐｏＥ基質をタンパク質切断するＣｌｐＰポリペプチドの活性に対する試験薬剤の影響があるならばそれを決定するステップとを含む。

適切なＡｐｏＥ基質は、全長ＡｐｏＥポリペプチド（例えばＡｐｏＥ３ポリペプチド；ＡｐｏＥ４ポリペプチドなど）；およびＣｌｐＰにより切断されるＡｐｏＥポリペプチドのフラグメントを含む。適切なフラグメントは、例えば、約４アミノ酸（ａａ）〜約２９０ａａ、例えば約４ａａ〜約１０ａａ、約１０ａａ〜約１５ａａ、約１５ａａ〜約２５ａａ、約２５ａａ〜約５０ａａ、約５０ａａ〜約１００ａａ、約１００ａａ〜約１５０ａａ、約１５０ａａ〜約２００ａａ、約２００ａａ〜約２５０ａａ、または約２５０ａａ〜約２９０ａａの長さのポリペプチドを含む。適切なＡｐｏＥ基質の非限定的な例は、配列Ｐｈｅ−Ｇｌｕ−Ｐｒｏ−Ｌｅｕ（ＦＥＰＬ；配列番号１１）のペプチドである。

いくつかの実施形態において、適切なＡｐｏＥ基質は、蛍光発生性である。例えば、ＡｐｏＥポリペプチドは、蛍光部分とコンジュゲートしてＡｐｏＥポリペプチド−蛍光部分コンジュゲートを形成して、ＡｐｏＥポリペプチドとコンジュゲートしたときに蛍光部分は蛍光シグナルを生成せず、例えば蛍光が消光されており、ＡｐｏＥポリペプチド−蛍光部分コンジュゲートがＣｌｐＰにより切断されたときに、蛍光部分が放出されて蛍光シグナルを生成することができる。このような部分の非限定的な例は、７−アミノ−４−メチル−クマリン（ＡＭＣ）である。よって、例えば適切な基質は、ＦＥＰＬ（配列番号１１）ペプチドがＡＭＣ部分と共有結合しているＦＥＰＬ−ＡＭＣを含む。

いくつかの実施形態において、方法は、ｉｎ ｖｉｔｒｏでの無細胞法である。無細胞法は、全般的に、単離（例えば精製）ＣｌｐＰポリペプチドを試験薬剤と接触させるステップと、ＣｌｐＰポリペプチドの酵素活性に対する試験薬剤の影響があるならばそれを決定するステップとを含む。精製ＣｌｐＰポリペプチドは、少なくとも７５％純粋、少なくとも８０％純粋、少なくとも８５％純粋、少なくとも９０％純粋、少なくとも９５％純粋、または少なくとも９８％純粋、例えば少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％その他の（非ＣｌｐＰ）タンパク質、その他の巨大分子（ＡｐｏＥ基質以外）またはその他の混入物を含まないＣｌｐＰポリペプチドを含む。ＣｌｐＰポリペプチドは、上に記載される。主題の無細胞ｉｎ ｖｉｔｒｏアッセイは、細胞可溶化液、例えば一次ニューロンまたはＣｌｐＰおよびＣｌｐＸを合成するその他の細胞の可溶化液；ＣｌｐＰおよびＣｌｐＸをコードするヌクレオチド配列を含む核酸（複数可）で遺伝子改変された遺伝子改変細胞の可溶化液を用いて行うこともできる。

いくつかの実施形態において、ＣｌｐＰポリペプチドは、ＣｌｐＸポリペプチドとの複合体に存在する。よって、いくつかの実施形態において、主題のスクリーニング方法は、ＣｌｐＰポリペプチドとＣｌｐＸポリペプチドとの両方を含む複合体を用いて行われる。ＣｌｐＰおよびＣｌｐＸポリペプチドは、上に記載される。いくつかの実施形態において、ＣｌｐＰ／ＣｌｐＸ複合体中のＣｌｐＰおよびＣｌｐＸポリペプチドは精製されている。いくつかの実施形態において、複合体中のＣｌｐＸポリペプチドおよびＣｌｐＰポリペプチドは、少なくとも７５％純粋、少なくとも８０％純粋、少なくとも８５％純粋、少なくとも９０％純粋、少なくとも９５％純粋、または少なくとも９８％純粋、例えば少なくとも７５％、少なくとも８０％、少なくとも８５％、少なくとも９０％、少なくとも９５％その他の（非ＣｌｐＸおよび非ＣｌｐＰ）タンパク質、その他の巨大分子（ＡｐｏＥ基質以外）またはその他の混入物を含まない。

その他の実施形態において、方法は、ｉｎ ｖｉｔｒｏでの細胞に基づく方法である。細胞に基づく方法は、全般的に、ＣｌｐＰポリペプチドを生成する細胞をｉｎ ｖｉｔｒｏにて試験薬剤と接触させるステップと、細胞におけるＣｌｐＰポリペプチドのレベルおよび／または活性に対する試験薬剤の影響があるならばそれを決定するステップとを含む。アッセイがｉｎ ｖｉｔｒｏでの細胞に基づくアッセイである場合、任意の種々の細胞を用いることができる。アッセイにおいて用いられる細胞は、通常、それらに限定されないが、げっ歯類細胞、ヒト細胞および酵母細胞を含む真核細胞である。適切な細胞は、ｉｎ ｖｉｔｒｏ細胞培養に適応した哺乳類細胞を含む。細胞は、初代細胞培養物であり得るか、または不死化株化細胞であり得る。細胞は「組換え」であってよく、例えば細胞には、ＣｌｐＰポリペプチドおよび／またはＣｌｐＸポリペプチドと、ＡｐｏＥ基質をコードするヌクレオチド配列とを含む１または複数の構築物（例えばプラスミド、組換えウイルスベクターまたは任意のその他の適切なベクター）が一過的または安定的に導入されてよい。ＣｌｐＰポリペプチドおよび／またはＣｌｐＸポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、転写制御要素、例えばニューロン特異的プロモーターと作動可能に連結され得る。

ニューロン特異的プロモーターおよびその他の制御要素（例えばエンハンサー）は、当該技術において知られている。適切なニューロン特異的制御配列は、それらに限定されないが、ニューロン特異的エノラーゼ（ＮＳＥ）プロモーター（例えばＥＭＢＬ ＨＳＥＮＯ２、Ｘ５１９５６を参照されたい）；芳香族アミノ酸デカルボキシラーゼ（ＡＡＤＣ）プロモーター；神経フィラメントプロモーター（例えばＧｅｎＢａｎｋ ＨＵＭＮＦＬ、Ｌ０４１４７を参照されたい）；シナプシンプロモーター（例えばＧｅｎＢａｎｋ ＨＵＭＳＹＮＩＢ、Ｍ５５３０１を参照されたい）；ｔｈｙ−１プロモーター（例えばＣｈｅｎら（１９８７）Ｃｅｌｌ５１：７〜１９を参照されたい）；セロトニン受容体プロモーター（例えばＧｅｎＢａｎｋ Ｓ６２２８３を参照されたい）；チロシンヒドロキシラーゼプロモーター（ＴＨ）（例えばＮｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ．Ｒｅｓ．１５：２３６３〜２３８４（１９８７）およびＮｅｕｒｏｎ６：５８３〜５９４（１９９１）を参照されたい）；ＧｎＲＨプロモーター（例えばＲａｄｏｖｉｃｋら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ８８：３４０２〜３４０６（１９９１）を参照されたい）；Ｌ７プロモーター（例えばＯｂｅｒｄｉｃｋら、Ｓｃｉｅｎｃｅ２４８：２２３〜２２６（１９９０）を参照されたい）；ＤＮＭＴプロモーター（例えばＢａｒｔｇｅら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ８５：３６４８〜３６５２（１９８８）を参照されたい）；エンケファリンプロモーター（例えばＣｏｍｂら、ＥＭＢＯ Ｊ．１７：３７９３〜３８０５（１９８８）を参照されたい）；ミエリン塩基性タンパク質（ＭＢＰ）プロモーター；およびＣＭＶエンハンサー／血小板由来成長因子βプロモーター（例えばＬｉｕら（２００４）Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒａｐｙ１１：５２〜６０を参照されたい）を含む。

適切な哺乳類細胞は、初代細胞および不死化株化細胞を含む。適切な哺乳類株化細胞は、ヒト株化細胞、非ヒト霊長類株化細胞、げっ歯類（例えばマウス、ラット）株化細胞などを含む。適切な哺乳類株化細胞は、それらに限定されないが、ＨｅＬａ細胞（例えばＡｍｅｒｉｃａｎ Ｔｙｐｅ Ｃｕｌｔｕｒｅ Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ（ＡＴＣＣ）第ＣＣＬ−２号）、ＣＨＯ細胞（例えばＡＴＣＣ第ＣＲＬ９６１８号、第ＣＣＬ６１号、第ＣＲＬ９０９６号）、２９３細胞（例えばＡＴＣＣ第ＣＲＬ−１５７３号）、Ｖｅｒｏ細胞、ＮＩＨ ３Ｔ３細胞（例えばＡＴＣＣ第ＣＲＬ−１６５８号）、Ｈｕｈ−７細胞、ＢＨＫ細胞（例えばＡＴＣＣ第ＣＣＬ１０号）、ＰＣ１２細胞（ＡＴＣＣ第ＣＲＬ１７２１号）、ＣＯＳ細胞、ＣＯＳ−７細胞（ＡＴＣＣ第ＣＲＬ１６５１号）、ＲＡＴ１細胞、マウスＬ細胞（ＡＴＣＣ第ＣＣＬ１．３号）、ヒト胎児由来腎臓（ＨＥＫ）細胞（ＡＴＣＣ第ＣＲＬ１５７３号）、ＨＬＨｅｐＧ２細胞などを含む。

いくつかの実施形態において、細胞は、神経細胞またはニューロン様細胞である。細胞は、ヒト、非ヒト霊長類、マウスもしくはラット起源のものであり得るか、またはヒト、非ヒト霊長類、ラットもしくはマウス以外の哺乳動物に由来し得る。適切な株化細胞は、それらに限定されないが、ヒト神経膠腫株化細胞、例えばＳＶＧｐ１２（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−８６２１）、ＣＣＦ−ＳＴＴＧ１（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−１７１８）、ＳＷ １０８８（ＡＴＣＣ ＨＴＢ−１２）、ＳＷ １７８３（ＡＴＣＣ ＨＴＢ−１３）、ＬＬＮ−１８（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−２６１０）、ＬＮＺＴＡ３ＷＴ４（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−１１５４３）、ＬＮＺＴＡ３ＷＴ１１（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−１１５４４）、Ｕ−１３８ ＭＧ（ＡＴＣＣ ＨＴＢ−１６）、Ｕ−８７ ＭＧ（ＡＴＣＣ ＨＴＢ−１４）、Ｈ４（ＡＴＣＣ ＨＴＢ−１４８）およびＬＮ−２２９（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−２６１１）；ヒト髄芽腫由来株化細胞、例えばＤ３４２ Ｍｅｄ（ＡＴＣＣ ＨＴＢ−１８７）、Ｄａｏｙ（ＡＴＣＣ ＨＴＢ−１８６）、Ｄ２８３ Ｍｅｄ（ＡＴＣＣ ＨＴＢ−１８５）；ヒト腫瘍由来ニューロン様細胞、例えばＰＦＳＫ−１（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−２０６０）、ＳＫ−Ｎ−ＤＺ（ＡＴＣＣＣＲＬ−２１４９）、ＳＫ−Ｎ−ＡＳ（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−２１３７）、ＳＫ−Ｎ−ＦＩ（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−２１４２）、ＩＭＲ−３２（ＡＴＣＣ ＣＣＬ−１２７）など；マウス神経株化細胞、例えばＢＣ３Ｈ１（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−１４４３）、ＥＯＣ１（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−２４６７）、Ｃ８−Ｄ３０（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−２５３４）、Ｃ８−Ｓ（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−２５３５）、Ｎｅｕｒｏ−２ａ（ＡＴＣＣ ＣＣＬ−１３１）、ＮＢ４１Ａ３（ＡＴＣＣ ＣＣＬ−１４７）、ＳＷ１０（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−２７６６）、ＮＧ１０８−１５（ＡＴＣＣ ＨＢ−１２３１７）；ラット神経株化細胞、例えばＰＣ−１２（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−１７２１）、ＣＴＸ ＴＮＡ２（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−２００６）、Ｃ６（ＡＴＣＣ ＣＣＬ−１０７）、Ｆ９８（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−２３９７）、ＲＧ２（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−２４３３）、Ｂ３５（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−２７５４）、Ｒ３（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−２７６４）、ＳＣＰ（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−１７００）、ＯＡ１（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−６５３８）を含む。

本明細書で用いる場合、用語「決定する」は、定量的および定性的の両方の決定のことをいい、それ自体で、用語「決定する」は、本明細書において、「アッセイする」、「測定する」などと交換可能に用いられる。

用語「候補薬剤」、「試験薬剤」、「薬剤」、「物質」および「化合物」は、本明細書において交換可能に用いられる。候補薬剤は、多数の化学的な部門、典型的には合成、半合成または天然に存在する無機もしくは有機分子を含む。候補薬剤は、合成または天然の化合物の大きいライブラリーで見出されるものを含む。例えば、合成化合物ライブラリーは、Ｍａｙｂｒｉｄｇｅ Ｃｈｅｍｉｃａｌ Ｃｏ．（Ｔｒｅｖｉｌｌｅｔ、Ｃｏｒｎｗａｌｌ、ＵＫ）、ＣｏｍＧｅｎｅｘ（Ｓｏｕｔｈ Ｓａｎ Ｆｒａｎｃｉｓｃｏ、ＣＡ）およびＭｉｃｒｏＳｏｕｒｃｅ（Ｎｅｗ Ｍｉｌｆｏｒｄ、ＣＴ）から商業的に入手可能である。希な化学物質ライブラリーは、Ａｌｄｒｉｃｈ（Ｍｉｌｗａｕｋｅｅ、Ｗｉｓ．）から入手可能であり、これもまた用いることができる。代わりに、細菌、真菌、植物および動物抽出物の形態の天然化合物ライブラリーは、Ｐａｎ Ｌａｂｓ（Ｂｏｔｈｅｌｌ、ＷＡ）から入手可能であるか、または容易に生成できる。

候補薬剤は、５０ダルトンを超え、約２，５００ダルトン未満の分子量を有する小さい有機または無機化合物であってよい。候補薬剤は、タンパク質との構造的相互作用、例えば水素結合に必要な官能基を含んでよく、少なくともアミン、カルボニル、ヒドロキシルまたはカルボキシル基を含んでよく、少なくとも２つの化学官能基を含有してよい。候補薬剤は、１もしくは複数の上記の官能基で置換された環状炭素または複素環構造および／あるいは芳香族または多重芳香族構造を含んでよい。候補薬剤は、ペプチド、糖類、脂肪酸、ステロイド類、プリン、ピリミジン、それらの誘導体、構造類似体または組合せを含む生体分子からも見出される。

本発明のアッセイは対照を含み、適切な対照は、試験薬剤の非存在下での試料（例えばＣｌｐＰポリペプチドとＡｐｏＥ基質とを含む試料、またはＣｌｐＰポリペプチドとＡｐｏＥ基質とを合成する細胞を含む試料）を含む。通常、異なる薬剤濃度を有する複数のアッセイ混合物を並行して運転して、種々の濃度に対する示差的な応答を得る。典型的には、これらの濃度の１つは陰性対照、すなわちゼロ濃度または検出レベル未満の濃度となる。

種々のその他の試薬をスクリーニングアッセイに含めることができる。これらは、最適なタンパク質同士の結合を促進しかつ／または非特異的もしくはバックグラウンドの相互作用を低減するために用いられる塩、中立タンパク質、例えばアルブミン、洗浄剤などのような試薬を含む。プロテアーゼ阻害剤、ヌクレアーゼ阻害剤、抗菌剤などのようなアッセイの効率を改善する試薬を用いてよい。アッセイ混合物の構成要素は、必須の結合またはその他の活性をもたらす任意の順序で加えられる。インキュベーションは、任意の適切な温度、典型的には４℃〜４０℃で行われる。インキュベーション期間は、最適活性について選択されるが、迅速なハイスループットスクリーニングを促進するように最適化してもよい。典型的には、０．１〜１時間で十分である。

スクリーニング方法は、当該技術において知られているように種々のアッセイの構成およびプロトコルを用い得るいくつかの異なる様式で設計できる。例えば、構成要素の１つが固体支持体と結合し、残りの構成要素が支持体と結合した構成要素と接触してよい。方法の上記の構成要素は、実質的に同時または異なる時間にて組み合わせてよい。

対象の試験薬剤は、試験薬剤が存在しない対照と比較したときに、少なくとも約１０％、少なくとも約２０％、少なくとも約２５％、少なくとも約３０％、少なくとも約３５％、少なくとも約４０％、少なくとも約４５％、少なくとも約５０％、少なくとも約５５％、少なくとも約６０％、少なくとも約６５％、少なくとも約７０％、少なくとも約８０％、少なくとも約９０％またはそれより多くＣｌｐＰタンパク質のレベルを低減するかまたはＣｌｐＰタンパク質分解活性を阻害するものである。

候補薬剤は、アッセイにおいて用いる細胞に対して示され得る任意の細胞毒性活性について、トリパンブルー色素排除、ＭＴＴ（３−（４，５−ジメチルチアゾール−２−イル）−２，５−ジフェニル−２Ｈ−テトラゾリウムブロミド）アッセイなどのような公知のアッセイを用いて評価される。細胞毒性活性を示さない薬剤が、候補薬剤とみなされる。

本開示は、ＣｌｐＰおよび／またはＣｌｐＸポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸（複数可）で遺伝子改変された遺伝子改変宿主細胞（例えば単離されたｉｎ ｖｉｔｒｏでの遺伝子改変宿主細胞）を提供する。遺伝子改変宿主細胞は、主題のスクリーニング方法において用いることができるＣｌｐＰポリペプチドおよび／またはＣｌｐＸポリペプチド（精製されているかまたは細胞から調製した可溶化液にあるかのいずれか）を生成するために有用である。適切な細胞は、ｉｎ ｖｉｔｒｏでの細胞培養物に適合された哺乳類細胞を含む。細胞は、初代細胞培養物であり得るか、または不死化株化細胞であり得る。主題の遺伝子改変宿主細胞を作製するために適切な哺乳類細胞は、ＣｌｐＰおよび／またはＣｌｐＸポリペプチドを通常合成しない哺乳類細胞を含む。

主題の遺伝子改変宿主細胞は、一過的または安定的に導入された核酸を用いて遺伝子改変され、核酸は、ＣｌｐＰポリペプチドおよび／またはＣｌｐＸポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む組換え構築物（例えばプラスミド、組換えウイルスベクターまたは任意のその他の適切なベクター）であり得る。適切な発現ベクターは、それらに限定されないが、プラスミドベクターおよびウイルスベクター（例えばワクシニアウイルス、ポリオウイルス、アデノウイルス、アデノ随伴ウイルス、ＳＶ４０、単純ヘルペスウイルス、レンチウイルスなどに基づくウイルスベクター）を含む。ＣｌｐＰポリペプチドおよび／またはＣｌｐＸポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、転写制御要素、例えばニューロン特異的プロモーターと作動可能に連結され得る。

ニューロン特異的プロモーターおよびその他の制御要素（例えばエンハンサー）は、当該技術において知られている。適切なニューロン特異的制御配列は、それらに限定されないが、ニューロン特異的エノラーゼ（ＮＳＥ）プロモーター（例えばＥＭＢＬ ＨＳＥＮＯ２、Ｘ５１９５６を参照されたい）；芳香族アミノ酸デカルボキシラーゼ（ＡＡＤＣ）プロモーター；神経フィラメントプロモーター（例えばＧｅｎＢａｎｋ ＨＵＭＮＦＬ、Ｌ０４１４７を参照されたい）；シナプシンプロモーター（例えばＧｅｎＢａｎｋ ＨＵＭＳＹＮＩＢ、Ｍ５５３０１を参照されたい）；ｔｈｙ−１プロモーター（例えばＣｈｅｎら（１９８７）Ｃｅｌｌ５１：７〜１９を参照されたい）；セロトニン受容体プロモーター（例えばＧｅｎＢａｎｋ Ｓ６２２８３を参照されたい）；チロシンヒドロキシラーゼプロモーター（ＴＨ）（例えばＮｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ．Ｒｅｓ．１５：２３６３〜２３８４（１９８７）およびＮｅｕｒｏｎ６：５８３〜５９４（１９９１）を参照されたい）；ＧｎＲＨプロモーター（例えばＲａｄｏｖｉｃｋら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ８８：３４０２〜３４０６（１９９１）を参照されたい）；Ｌ７プロモーター（例えばＯｂｅｒｄｉｃｋら、Ｓｃｉｅｎｃｅ２４８：２２３〜２２６（１９９０）を参照されたい）；ＤＮＭＴプロモーター（例えばＢａｒｔｇｅら、Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．ＵＳＡ８５：３６４８〜３６５２（１９８８）を参照されたい）；エンケファリンプロモーター（例えばＣｏｍｂら、ＥＭＢＯ Ｊ．１７：３７９３〜３８０５（１９８８）を参照されたい）；ミエリン塩基性タンパク質（ＭＢＰ）プロモーター；およびＣＭＶエンハンサー／血小板由来成長因子βプロモーター（例えばＬｉｕら（２００４）Ｇｅｎｅ Ｔｈｅｒａｐｙ１１：５２〜６０を参照されたい）を含む。

本開示は、遺伝子改変宿主細胞がＣｌｐＰポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸で遺伝子改変された遺伝子改変宿主細胞（例えば一次ニューロンおよび不死化神経細胞のような神経細胞を含む哺乳類細胞）を提供する。ＣｌｐＰポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、図１Ｂに示すヌクレオチド配列（配列番号２）の約５００ヌクレオチド〜約６００ヌクレオチド、約６００ヌクレオチド〜約７００ヌクレオチド、または約７００ヌクレオチド〜８２１ヌクレオチドの連続するひと続きと少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％または１００％のヌクレオチド配列同一性を有し得る。いくつかの実施形態において、ＣｌｐＰコードヌクレオチド配列は、ニューロン特異的プロモーターと作動可能に連結される。

本開示は、遺伝子改変宿主細胞がＣｌｐＸポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む核酸で遺伝子改変された遺伝子改変宿主細胞（例えば一次ニューロンおよび不死化神経細胞のような神経細胞を含む哺乳類細胞）を提供する。ＣｌｐＸポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、図５Ｂおよび５Ｃに示し、配列番号１２に示すヌクレオチド配列のヌクレオチド７３〜１９７４のうちの約１５００ヌクレオチド〜約１６００ヌクレオチド、約１６００ヌクレオチド〜約１７００ヌクレオチド、約１７００ヌクレオチド〜約１８００ヌクレオチド、または約１８００ヌクレオチド〜約１９００ヌクレオチドの連続するひと続きと少なくとも約７５％、少なくとも約８０％、少なくとも約８５％、少なくとも約９０％、少なくとも約９５％、少なくとも約９８％、少なくとも約９９％または１００％のヌクレオチド配列同一性を有し得る。いくつかの実施形態において、ＣｌｐＸコードヌクレオチド配列は、ニューロン特異的プロモーターと作動可能に連結される。

本開示は、遺伝子改変宿主細胞がＣｌｐＰおよびＣｌｐＸポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む１または複数の核酸で遺伝子改変された遺伝子改変宿主細胞（例えば一次ニューロンおよび不死化神経細胞のような神経細胞を含む哺乳類細胞）を提供する。ＣｌｐＰおよびＣｌｐＸポリペプチドをコードする適切なヌクレオチド配列は、上に記載されるとおりである。いくつかの実施形態において、ＣｌｐＰコードヌクレオチド配列およびＣｌｐＸコードヌクレオチド配列は、ニューロン特異的プロモーターと作動可能に連結される。

主題の遺伝子改変宿主細胞を作製するために適切な哺乳類細胞は、初代細胞および不死化株化細胞を含む。適切な哺乳類株化細胞は、ヒト株化細胞、非ヒト霊長類株化細胞、げっ歯類（例えばマウス、ラット）株化細胞などを含む。適切な哺乳類株化細胞は、それらに限定されないが、ＨｅＬａ細胞（例えばＡｍｅｒｉｃａｎ Ｔｙｐｅ Ｃｕｌｔｕｒｅ Ｃｏｌｌｅｃｔｉｏｎ（ＡＴＣＣ）第ＣＣＬ−２号）、ＣＨＯ細胞（例えばＡＴＣＣ第ＣＲＬ９６１８号、第ＣＣＬ６１号、第ＣＲＬ９０９６号）、２９３細胞（例えばＡＴＣＣ第ＣＲＬ−１５７３号）、Ｖｅｒｏ細胞、ＮＩＨ ３Ｔ３細胞（例えばＡＴＣＣ第ＣＲＬ−１６５８号）、Ｈｕｈ−７細胞、ＢＨＫ細胞（例えばＡＴＣＣ第ＣＣＬ１０号）、ＰＣ１２細胞（ＡＴＣＣ第ＣＲＬ１７２１号）、ＣＯＳ細胞、ＣＯＳ−７細胞（ＡＴＣＣ第ＣＲＬ１６５１号）、ＲＡＴ１細胞、マウスＬ細胞（ＡＴＣＣ第ＣＣＬＩ．３号）、ヒト胎児由来腎臓（ＨＥＫ）細胞（ＡＴＣＣ第ＣＲＬ１５７３号）、ＨＬＨｅｐＧ２細胞などを含む。

いくつかの実施形態において、細胞は、神経細胞またはニューロン様細胞である。細胞は、ヒト、非ヒト霊長類、マウスもしくはラット起源のものであり得るか、またはヒト、非ヒト霊長類、ラットもしくはマウス以外の哺乳動物に由来し得る。適切な株化細胞は、それらに限定されないが、ヒト神経膠腫株化細胞、例えばＳＶＧｐ１２（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−８６２１）、ＣＣＦ−ＳＴＴＧ１（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−１７１８）、ＳＷ １０８８（ＡＴＣＣ ＨＴＢ−１２）、ＳＷ １７８３（ＡＴＣＣ ＨＴＢ−１３）、ＬＬＮ−１８（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−２６１０）、ＬＮＺＴＡ３ＷＴ４（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−１１５４３）、ＬＮＺＴＡ３ＷＴ１１（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−１１５４４）、Ｕ−１３８ ＭＧ（ＡＴＣＣ ＨＴＢ−１６）、Ｕ−８７ ＭＧ（ＡＴＣＣ ＨＴＢ−１４）、Ｈ４（ＡＴＣＣ ＨＴＢ−１４８）およびＬＮ−２２９（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−２６１１）；ヒト髄芽腫由来株化細胞、例えばＤ３４２ Ｍｅｄ（ＡＴＣＣ ＨＴＢ−１８７）、Ｄａｏｙ（ＡＴＣＣ ＨＴＢ−１８６）、Ｄ２８３ Ｍｅｄ（ＡＴＣＣ ＨＴＢ−１８５）；ヒト腫瘍由来ニューロン様細胞、例えばＰＦＳＫ−１（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−２０６０）、ＳＫ−Ｎ−ＤＺ（ＡＴＣＣＣＲＬ−２１４９）、ＳＫ−Ｎ−ＡＳ（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−２１３７）、ＳＫ−Ｎ−ＦＩ（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−２１４２）、ＩＭＲ−３２（ＡＴＣＣ ＣＣＬ−１２７）など；マウス神経株化細胞、例えばＢＣ３Ｈ１（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−１４４３）、ＥＯＣ１（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−２４６７）、Ｃ８−Ｄ３０（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−２５３４）、Ｃ８−Ｓ（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−２５３５）、Ｎｅｕｒｏ−２ａ（ＡＴＣＣ ＣＣＬ−１３１）、ＮＢ４１Ａ３（ＡＴＣＣ ＣＣＬ−１４７）、ＳＷ１０（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−２７６６）、ＮＧ１０８−１５（ＡＴＣＣ ＨＢ−１２３１７）；ラット神経株化細胞、例えばＰＣ−１２（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−１７２１）、ＣＴＸ ＴＮＡ２（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−２００６）、Ｃ６（ＡＴＣＣ ＣＣＬ−１０７）、Ｆ９８（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−２３９７）、ＲＧ２（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−２４３３）、Ｂ３５（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−２７５４）、Ｒ３（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−２７６４）、ＳＣＰ（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−１７００）、ＯＡ１（ＡＴＣＣ ＣＲＬ−６５３８）を含む。

以下の実施例は、本発明をどのように作製して用いるかについての完全な開示および記述を当業者に示すために記載され、本発明者らが発明であると考えるものの範囲を限定することを意図せず、以下の実験だけが行われた全ての実験であることを示すことも意図しない。用いられる数字（例えば量、温度など）に関して精度を確実にするための努力を行ったが、いくらかの実験誤差および偏差がある。そうでないと記載しない限り、部は重量部であり、分子量は重量平均分子量である、温度は摂氏温度である、圧力は大気圧またはその付近である。標準的な略語、例えばｂｐ、塩基対（複数可）；ｋｂ、キロベース（複数可）；ｐｌ、ピコリットル（複数可）；ｓまたはｓｅｃ、秒（複数可）；ｍｉｎ、分（複数可）；ｈまたはｈｒ、時間（複数可）；ａａ、アミノ酸（複数可）；ｋｂ、キロベース（複数可）；ｂｐ、塩基対（複数可）；ｎｔ、ヌクレオチド（複数可）；ｉ．ｍ．、筋肉内（で）；ｉ．ｐ．、腹腔内（で）；ｓ．ｃ．、皮下（で）などを用いることがある。

実施例１：ＣｌｐＰはＡｐｏＥ４の切断を媒介する
ＣｌｐＰのｓｈＲＮＡ媒介ノックダウンは、一次ニューロンにおけるＡｐｏＥ４切断を低下させる。海馬および皮質からの７日間培養したマウス一次ニューロンに、ＣｌｐＰ配列の種々の領域を標的にする種々のＬｅｎｔｉ−ＣｌｐＰ−ｓｈＲＮＡ構築物（ＣｌｐＰ−ｓｈＲＮＡ−２、ＣｌｐＰ−ｓｈＲＮＡ−３、ＣｌｐＰ−ｓｈＲＮＡ−５およびＣｌｐＰ−ｓｈＲＮＡ−６）を感染させた。ＣｌｐＰ−ｓｈＲＮＡのヌクレオチド配列は、次のとおりであった：ＣｌｐＰ−ｓｈＲＮＡ−２：５’−ＧＣＴＡＴＡＣＡＡＣＡＴＣＴＡＣＧＣＣＡＡ−３’（配列番号１０）；ＣｌｐＰ−ｓｈＲＮＡ−３：５’−ＧＣＣＣＡＡＴＴＣＣＡＧＡＡＴＣＡＴＧＡＴ−３’（配列番号０７）；ＣｌｐＰ−ｓｈＲＮＡ−５：５’−ＣＧＡＧＣＧＣＧＣＴＴＡＴＧＡＣＡＴＡＴＡ−３’（配列番号０９）；ＣｌｐＰ−ｓｈＲＮＡ−６：５’−ＧＣＣＣＡＴＴＣＡＴＡＴＧＴＡＴＡＴＣＡＡ−３’（配列番号０６）。空のレンチウイルスベクターを対照として用いた。

データを図３に示す。レンチウイルスベクターの感染の１０日後に、一次ニューロンを回収して２群に分けた。細胞の一方の群は、抗ＡｐｏＥウェスタンブロットによるＡｐｏＥフラグメント化を分析するために用いた（ゲル画像の４つのパネル）。細胞の他方の群は、ＣｌｐＰのｍＲＮＡレベルを決定するために用いた（バーグラフ）。ＣｌｐＰ−ｓｈＲＮＡ−３、ＣｌｐＰ−ｓｈＲＮＡ−５およびＣｌｐＰ−ｓｈＲＮＡ−６は、ＣｌｐＰのｍＲＮＡレベルを著しく低下させ、ＡｐｏＥ４フラグメント化を著しく低下させたが、ＣｌｐＰ−ｓｈＲＮＡ−２は、ＣｌｐＰのｍＲＮＡレベルを低下させず、ＡｐｏＥ４フラグメント化を変化させなかった。

組換えヒトＣｌｐＰ（タンパク質分解性サブユニット）およびＣｌｐＸ（調節サブユニット）複合体は、ＡｐｏＥ４をｉｎ ｖｉｔｒｏで切断する。データを図４に示す。組換えヒトＣｌｐＰ／ＣｌｐＸ複合体によりｉｎ ｖｉｔｒｏで得られたＡｐｏＥ４フラグメント化パターンは、ＡｐｏＥ４を発現するマウス一次ニューロンで見られるものと同一である。

実施例２：ＣｌｐＰ阻害剤の同定
ＣｌｐＰプロテアーゼの阻害剤を、精製ＣｌｐＰ（例えば精製ＣｌｐＰと精製ＣｌｐＸとの複合体）またはＣｌｐＰとＣｌｐＸとを合成する細胞から作製される細胞可溶化液を用いて同定できる。

例えば、一次ニューロン培養細胞を、リン酸緩衝食塩水（ＰＢＳ）で洗浄して回収する。細胞を、凍結／融解により可溶化して、ホモジナイズする。細胞デブリを遠心分離により回収する。上清を新しいチューブに移す。上清は、後続のステップにおいて一次ニューロン可溶化液という。

基質であるＦＥＰＬ−ＡＭＣは、７−アミノ−４−メチル−クマリン（ＡＭＣ）部分とコンジュゲートした４アミノ酸のペプチド（ＦＥＰＬ；配列番号１１）である。ＦＥＰＬ−ＡＭＣに対するＣｌｐＰの作用の際に、ＡＭＣ部分が放出され、蛍光シグナルを生成する。

黒色９６ウェルアッセイプレートを用いて、以下の反応を設定する：
１）ブランク：ＦＥＰＬ＋Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ；
２）対照１：一次ニューロン可溶化液＋ＦＥＰＬ＋Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ＋ジメチルスルホキシド（ＤＭＳＯ）；
３）対照２：一次ニューロン可溶化液＋ＦＥＰＬ＋Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ＋ベンジルオキシカルボニル−ロイシルチロシンクロロメチルケトン（ＬＹ−ＣＭＫ；陽性対照阻害剤）；
４）試験試料：一次ニューロン可溶化液＋ＦＥＰＬ＋Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ＋試験薬剤。

構成要素を、以下の順序でウェルに加える：Ｔｒｉｓ−ＨＣｌ；一次ニューロン可溶化液；ＤＭＳＯ、陽性対照阻害剤または試験薬剤；およびＦＥＰＬ−ＡＭＣ。

ウェルの内容物を混合し、プレートを３７℃にて４時間保持する。プレートを、蛍光を検出する装置で読み取る。プレートは、次いで、３７℃にて２４時間保持でき、２４時間の期間の後に再び読み取る。対照１と比較して蛍光生成物の量を低減させる試験薬剤が、ＡｐｏＥ４のＣｌｐＰにより媒介される切断の阻害を含む方法において用いるための候補薬剤である。

本発明を、その特定の実施形態を参照して記載したが、本発明の真の精神および範囲から逸脱することなく種々の変更を行うことができ、均等物で置き換えることができることが当業者に理解される。さらに、本発明の目的、精神および範囲に対して多くの改変を行って、特定の状況、材料、物質の組成物、プロセス、１または複数のプロセスステップに適応させることができる。このような全ての改変は、本明細書に添付される特許請求の範囲の範囲内であることを意図する。

Claims (21)

1. 個体におけるアポリポタンパク質Ｅ（ＡｐｏＥ）関連障害を治療する方法であって、個体のニューロンにおけるＡｐｏＥ４のタンパク質切断を阻害する薬剤の有効量を個体に投与するステップを含み、前記タンパク質切断が、図１Ａに示すアミノ酸配列と少なくとも約７５％のアミノ酸配列同一性を有するＣｌｐＰポリペプチドにより媒介される方法。
2. 個体におけるアポリポタンパク質Ｅ４（ＡｐｏＥ４）関連障害を治療する方法であって、個体のニューロンにおけるＡｐｏＥのタンパク質切断を阻害する薬剤の有効量を個体に投与するステップを含み、前記タンパク質切断が、図１Ａに示すアミノ酸配列と少なくとも約７５％のアミノ酸配列同一性を有するＣｌｐＰポリペプチドにより媒介される方法。
3. 薬剤が、ＣｌｐＰポリペプチドの小分子阻害剤である、請求項１または請求項２に記載の方法。
4. 薬剤が、神経細胞における酵素活性ＣｌｐＰポリペプチドのレベルを低減する妨害核酸である、請求項１または請求項２に記載の方法。
5. 薬剤が、ペプチドである、請求項１または請求項２に記載の方法。
6. 薬剤が、経口投与される、請求項１または請求項２に記載の方法。
7. 薬剤が、注射により投与される、請求項１または請求項２に記載の方法。
8. アセチルコリンエステラーゼ阻害剤の有効量を投与するステップをさらに含む、請求項１または請求項２に記載の方法。
9. 抗炎症剤の有効量を投与するステップをさらに含む、請求項１または請求項２に記載の方法。
10. ＡｐｏＥ４ドメイン相互作用を低減させる薬剤を投与するステップをさらに含む、請求項２に記載の方法。
11. ＡｐｏＥ関連障害またはＡｐｏＥ４関連障害が、アルツハイマー病である、請求項１または請求項２に記載の方法。
12. アポリポタンパク質Ｅ４（ＡｐｏＥ４）関連障害を治療するための候補薬剤を同定するｉｎ ｖｉｔｒｏ方法であって、
    ＣｌｐＰポリペプチドを、試験薬剤およびＡｐｏＥ基質と接触させるステップであって、ＣｌｐＰポリペプチドが、配列番号１に示すアミノ酸配列と少なくとも約７５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含むステップと、
    ＡｐｏＥ基質を切断するＣｌｐＰポリペプチドの活性に対する試験薬剤の影響があるならばそれを決定するステップとを含み、
    ＡｐｏＥ基質を切断するＣｌｐＰポリペプチドの活性の少なくとも１０％を阻害する試験薬剤が、ＡｐｏＥ４関連障害を治療するための候補薬剤である方法。
13. アッセイが、細胞ベースのアッセイであり、ＣｌｐＰポリペプチドおよびＡｐｏＥ基質が、細胞内に存在する、請求項１２に記載の方法。
14. 細胞が、神経細胞である、請求項１３に記載の方法。
15. アッセイが、無細胞アッセイであり、ＣｌｐＰポリペプチドが、少なくとも７５％純粋である、請求項１２に記載の方法。
16. ＡｐｏＥ基質が、蛍光発光性である、請求項１２に記載の方法。
17. ＣｌｐＰポリペプチドが、精製され、ＣｌｐＰポリペプチドが、配列番号５に示すアミノ酸配列と少なくとも約７５％のアミノ酸配列同一性を有するアミノ酸配列を含む精製ＣｌｐＸポリペプチドとの複合体にある、請求項１２に記載の方法。
18. ＣｌｐＰポリペプチドが、細胞可溶化液中に存在する、請求項１２に記載の方法。
19. 細胞可溶化液が、ＣｌｐＰポリペプチドを通常合成する神経細胞から得られる、請求項１８に記載の方法。
20. 細胞可溶化液が、遺伝子改変宿主細胞から得られ、宿主細胞が、ＣｌｐＰポリペプチドを通常合成しないものであり、遺伝子改変宿主細胞が、ＣｌｐＰポリペプチドおよびＣｌｐＸポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含む１または複数の核酸で遺伝子改変されている、請求項１８に記載の方法。
21. ＣｌｐＰポリペプチドおよびＣｌｐＸポリペプチドをコードするヌクレオチド配列が、ニューロン特異的プロモーターと作動可能に連結される、請求項２０に記載の方法。