JP2012100636A5 - - Google Patents

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  1. 配列番号4〜10のいずれかで示される塩基配列、又は当該塩基配列において、1若しくは数個の塩基が欠失、置換若しくは付加された塩基配列を含むRNAからなることを特徴とする、新型インフルエンザのHAタンパク質に対する結合能を有するアプタマーRNA。
  2. 配列番号4〜9のいずれかで示される塩基配列、又は当該塩基配列において、1若しくは数個の塩基が欠失、置換若しくは付加された塩基配列を含むRNAが構成する2次構造において、HAタンパク質に対する結合能を有する先端領域部の構造を保持するように短鎖化された塩基配列からなることを特徴とする、新型インフルエンザのHAタンパク質に対する結合能を有するアプタマーRNA。
  3. アプタマーRNAを構成するヌクレオチドのリボース部位の少なくとも1箇所が、化学修飾されていることを特徴とする、請求項1及び2のいずれかに記載のアプタマーRNA。
  4. 前記化学修飾が、リボース部位の2’位に対するフルオロ基(2’-F)もしくはメトキシ基(2’-OMe)による修飾、又は水素による置換(2’-deoxy)であることを特徴とする、請求項に記載のアプタマーRNA。
  5. アプタマーRNAの3’および/または5’末端がインバーストデオキシチミジン(idT)あるいはポリエチレングリコール(PEG)により修飾されていることを特徴とする、請求項1〜4のいずれかに記載のアプタマーRNA。
  6. 請求項1又は2に記載のアプタマーRNAと同一の塩基配列又は当該塩基配列と相補的な塩基配列を含み、かつ請求項1又は2に記載のアプタマーに変換可能な一本鎖DNA、二本鎖DNA又は相補的RNA。
  7. 請求項1〜5のいずれかに記載のアプタマーRNAを有効成分として含有する、新型インフルエンザウイルスの検出剤。
  8. 請求項1〜5のいずれかに記載のアプタマーRNAを有効成分として含有する、新型インフルエンザウイルス用診断剤。
  9. 請求項1〜5のいずれかに記載のアプタマーRNAを有効成分として含有する、新型インフルエンザウイルスのHAタンパク質の亜型又は株を特定するための診断用キット。
  10. 被検試料に対して請求項1〜5のいずれかに記載のアプタマーRNAを有効成分として作用させる工程を含むことを特徴とする新型インフルエンザウイルスの検出方法。
  11. 被検試料に対して請求項1〜5のいずれかに記載のアプタマーRNAを有効成分として作用させる工程を含むことを特徴とする、新型インフルエンザウイルスのHAタンパク質の亜型又は株を特定するための方法。
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JP6103637B2 (ja) * 2013-06-04 2017-03-29 国立研究開発法人産業技術総合研究所 高病原性鳥インフルエンザウイルスの検出及びサーベイランス
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JP7353622B2 (ja) * 2019-08-02 2023-10-02 国立大学法人北陸先端科学技術大学院大学 アプタマーの製造方法とその応用
US11732267B2 (en) 2020-10-30 2023-08-22 Arkray, Inc. Nucleic acid aptamer for influenza virus and detection of influenza virus
CN114854760A (zh) * 2022-06-27 2022-08-05 华侨大学 小鼠抗体的dna适配体及其应用

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* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2006525796A (ja) * 2003-02-27 2006-11-16 イェダ リサーチ アンド デベロップメント カンパニー リミテッド インフルエンザウイルス感染を処置および検出するために有用な核酸分子、ポリペプチド、抗体、およびそれらを含有する組成物
JP4441618B2 (ja) * 2003-10-06 2010-03-31 独立行政法人産業技術総合研究所 インフルエンザウイルスの検出方法

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