JP2012044944A - トルエン検出方法 - Google Patents
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Abstract
【課題】前処理をすることなく、長期に亘って、安価且つ簡便にトルエンを検出することができるトルエン検出方法の提供。
【解決手段】嫌気性細菌にベクターを導入し、形質転換体を作製する工程と、前記形質転換体と、レポータータンパク質により発色又は発光する水溶性部位を有する検出化合物とを用いて、試料中のトルエン含有量を定量する工程とを有するトルエン検出方法であって、前記ベクターは、トルエン分解酵素活性を有するタンパク質をコードする遺伝子と、その下流に位置し、レポータータンパク質をコードする遺伝子とが組み込まれたものであることを特徴とするトルエン検出方法。
【選択図】なし
【解決手段】嫌気性細菌にベクターを導入し、形質転換体を作製する工程と、前記形質転換体と、レポータータンパク質により発色又は発光する水溶性部位を有する検出化合物とを用いて、試料中のトルエン含有量を定量する工程とを有するトルエン検出方法であって、前記ベクターは、トルエン分解酵素活性を有するタンパク質をコードする遺伝子と、その下流に位置し、レポータータンパク質をコードする遺伝子とが組み込まれたものであることを特徴とするトルエン検出方法。
【選択図】なし
Description
本発明は、嫌気性細菌を用いたトルエン検出方法に関する。
人体に対して健康被害を及ぼし得る有害物質による、土壌や地下水の汚染が問題となっている。近年では、土壌汚染対策法が施行され、土地所有者に対して、土壌汚染状況の把握、土壌汚染による人の健康被害の防止に関する措置等の土壌汚染対策の実施が課せられた。また、近年では地下水汚染判明事例件数が年間３００件を超え、平成２０年度末までの累積件数は５８００件を上回っており、さらなる地下水汚染への対策が求められている。
しかしながら、特に埋没型タンクや地下配管等の地下設備からの有害物質の漏洩は発見が難しく、その上、影響の及ぶ範囲が拡大しやすいという問題がある。そのため、万が一有害物質が漏洩した場合に備え、土壌や地下水中の有害物質の定期的若しくは常時モニタリングが必要となる。
しかしながら、特に埋没型タンクや地下配管等の地下設備からの有害物質の漏洩は発見が難しく、その上、影響の及ぶ範囲が拡大しやすいという問題がある。そのため、万が一有害物質が漏洩した場合に備え、土壌や地下水中の有害物質の定期的若しくは常時モニタリングが必要となる。
上記のような有害物質の１つとして、トルエンがある。トルエンは地下水における要監視項目の１つとなっており、その指針値は０．６ｍｇ／Ｌ以下である。また、水道水の水質管理におけるトルエンの目標値は０．２ｍｇ／Ｌである。
トルエンは、ポリウレタン製造に用いられるトリレンジイソシアネートの原料や、フェノール、クレゾール等の原料として用いられるほか、印刷インキ、油性塗料、接着剤等の溶剤として用いられる。トルエンの輸入及び製造量は年間１５０万トン弱と、有害物質の中でも非常に多く、広範な分野で用いられることから、トルエンをモニタリングする方法に対する要求がある。
トルエンは、ポリウレタン製造に用いられるトリレンジイソシアネートの原料や、フェノール、クレゾール等の原料として用いられるほか、印刷インキ、油性塗料、接着剤等の溶剤として用いられる。トルエンの輸入及び製造量は年間１５０万トン弱と、有害物質の中でも非常に多く、広範な分野で用いられることから、トルエンをモニタリングする方法に対する要求がある。
現在、有害物質のモニタリングとしては、対象となる土壌、地下水等の試料から対象有害物質を抽出及び濃縮した後、ガスクロマトグラフ、液体クロマトグラフ、マススペクトロメーター等の装置を用いて検出する方法や、高分子薄膜素子（センサチップ）と光学的センシング技術（干渉増幅反射法）とを組み合わせたＶＯＣセンサを用いて検出する方法等が用いられている。
また、特許文献１には、汚染浄化能力を有する嫌気性微生物を利用する地下水汚染の浄化方法であって、嫌気性微生物のための薬剤を投入すること、及び、地下水の総有機炭素量、ｐＨ、溶存酸素及び酸化還元電位を含む項目をモニタリングすることを含む、地下水汚染の浄化方法が開示されている。
また、特許文献１には、汚染浄化能力を有する嫌気性微生物を利用する地下水汚染の浄化方法であって、嫌気性微生物のための薬剤を投入すること、及び、地下水の総有機炭素量、ｐＨ、溶存酸素及び酸化還元電位を含む項目をモニタリングすることを含む、地下水汚染の浄化方法が開示されている。
上記したような従来の有害物質モニタリング方法では、土壌、地下水等の試料から対象となる有害物質を抽出及び濃縮することが必要であるため、検出に手間がかかるという問題があった。また、検出には高価な装置が必要となるという問題もあった。
さらに、上記特許文献１に記載された発明は、地下水のモニタリング結果に応じて、嫌気性微生物を栄養源等により活性化し、該嫌気性微生物に有害物質を分解させることを目的とした発明であるが、地下水のモニタリングは従来公知の装置等を用いて行っており、モニタリングの手間やコストは依然として解決されていなかった。
さらに、上記特許文献１に記載された発明は、地下水のモニタリング結果に応じて、嫌気性微生物を栄養源等により活性化し、該嫌気性微生物に有害物質を分解させることを目的とした発明であるが、地下水のモニタリングは従来公知の装置等を用いて行っており、モニタリングの手間やコストは依然として解決されていなかった。
本発明は、上記問題点に鑑みてなされたものであって、前処理をすることなく、長期に亘って、安価且つ簡便にトルエンを検出することができるトルエン検出方法を提供することを課題とする。
本発明者らは、上記課題を解決すべく鋭意研究した結果、地下水等の酸素濃度の低い環境下においても生存可能である嫌気性細菌をバイオセンサとして用いることにより、前処理をすることなく、長期に亘って、安価且つ簡便にトルエンを検出することができることを見出し、本発明を完成させた。
すなわち、本発明は下記の特徴を有するトルエン検出方法を提供する。
（１）嫌気性細菌にベクターを導入し、形質転換体を作製する工程と、前記形質転換体と、レポータータンパク質により発色又は発光する水溶性部位を有する検出化合物とを用いて、試料中のトルエン含有量を定量する工程とを有するトルエン検出方法であって、前記ベクターは、トルエン分解酵素活性を有するタンパク質をコードする遺伝子と、その下流に位置し、レポータータンパク質をコードする遺伝子とが組み込まれたものであることを特徴とするトルエン検出方法。
（２）前記嫌気性細菌が、Ａｚｏａｒｃｕｓ ｓｐ．（アゾアルカス・スピーシーズ）であることを特徴とする（１）のトルエン検出方法。
（３）前記嫌気性細菌及び形質転換体が、Ｄ−リボース、Ｔｗｅｅｎ８０、Ｄ−アラビノース、Ｌ−アラビノース、Ｄ−キシロース、Ｄ−プシコース、α−ケドグルタル酸、マンノース、Ｄ−タガトース、Ｄ−フルクトース−６−リン酸、グルクロンアミド、Ｄ−フルクトース、ラムノース、Ｄ−ガラクトース、Ｄ−グルクロン酸、グリセロール、乳酸、酵母抽出液、カサミノ酸、ＮＢブロス、及びＬＢブロスからなる群から選ばれる１種以上を含む培地で培養されることを特徴とする（１）又は（２）のトルエン検出方法。
（４）前記レポータータンパク質がβ−ガラクトシダーゼであり、前記検出化合物が、ルシフェラーゼを含む検出化合物であることを特徴とする（１）〜（３）のいずれかのトルエン検出方法。
（５）前記嫌気性細菌へのベクターの導入を、接合伝達法を用いて行うことを特徴とする（１）〜（４）のいずれかのトルエン検出方法。
すなわち、本発明は下記の特徴を有するトルエン検出方法を提供する。
（１）嫌気性細菌にベクターを導入し、形質転換体を作製する工程と、前記形質転換体と、レポータータンパク質により発色又は発光する水溶性部位を有する検出化合物とを用いて、試料中のトルエン含有量を定量する工程とを有するトルエン検出方法であって、前記ベクターは、トルエン分解酵素活性を有するタンパク質をコードする遺伝子と、その下流に位置し、レポータータンパク質をコードする遺伝子とが組み込まれたものであることを特徴とするトルエン検出方法。
（２）前記嫌気性細菌が、Ａｚｏａｒｃｕｓ ｓｐ．（アゾアルカス・スピーシーズ）であることを特徴とする（１）のトルエン検出方法。
（３）前記嫌気性細菌及び形質転換体が、Ｄ−リボース、Ｔｗｅｅｎ８０、Ｄ−アラビノース、Ｌ−アラビノース、Ｄ−キシロース、Ｄ−プシコース、α−ケドグルタル酸、マンノース、Ｄ−タガトース、Ｄ−フルクトース−６−リン酸、グルクロンアミド、Ｄ−フルクトース、ラムノース、Ｄ−ガラクトース、Ｄ−グルクロン酸、グリセロール、乳酸、酵母抽出液、カサミノ酸、ＮＢブロス、及びＬＢブロスからなる群から選ばれる１種以上を含む培地で培養されることを特徴とする（１）又は（２）のトルエン検出方法。
（４）前記レポータータンパク質がβ−ガラクトシダーゼであり、前記検出化合物が、ルシフェラーゼを含む検出化合物であることを特徴とする（１）〜（３）のいずれかのトルエン検出方法。
（５）前記嫌気性細菌へのベクターの導入を、接合伝達法を用いて行うことを特徴とする（１）〜（４）のいずれかのトルエン検出方法。
本発明のトルエン検出方法は、嫌気性微生物を用いてトルエンの有無を視覚的に検出する方法であるため、試料の前処理、高価な装置及び熟練した技能を必要とせず、安価且つ簡便にトルエンを検出することができる。また、嫌気性微生物は、地下水等の嫌気性環境下において自活することができるため、メンテナンスやエネルギー補給を必要とせず、長期に亘ったトルエンの検出が可能となる。
本発明のトルエン検出方法は、嫌気性細菌にベクターを導入し、形質転換体を作製する工程（以下、「形質転換体作製工程」という）と、前記形質転換体と、レポータータンパク質により発色又は発光する水溶性部位を有する検出化合物とを用いて、試料中のトルエン含有量を定量する工程（以下、「検出工程」という。）と、を有する。
以下、工程ごとに説明する。
以下、工程ごとに説明する。
［形質転換体作製工程］
まず、形質転換体作成工程において、嫌気性細菌にベクターを導入し、形質転換体を作製する。
本発明において、嫌気性細菌としては特に限定されるものではないが、トルエン分解酵素活性を有するタンパク質を内在的に有する嫌気性細菌（以下、「トルエン分解嫌気性細菌」という。）であることが好ましい。本発明では、嫌気性細菌を用いることにより、地下水等の嫌気性環境下において該菌が自活することができ、エネルギー等を補給する必要がない。また、トルエン分解嫌気性細菌を用いる場合、後述するベクターの導入や、本願発明に必要な形質転換体の作製が容易であるため好ましい。
トルエン分解嫌気性細菌は、公知のトルエン分解嫌気性細菌を用いてもよく、新たにトルエン分解嫌気性細菌を単離してもよい。トルエン分解嫌気性細菌を単離する方法は特に限定されるものではなく、トルエンを含有する培地において嫌気性細菌を培養し、スクリーニングを行う等の公知の方法により行うことができる。
このような嫌気性細菌として具体的には、アゾアルカス・スピーシーズ、タウエラ・アロマティカ等が挙げられ、より具体的には、アゾアルカス・スピーシーズ ＤＳＭ９５０６株、タウエラ・アロマティカ Ｋ１７２株、タウエラ・アロマティカ Ｔ１株が挙げられる。なかでも、本発明の嫌気性細菌としては、アゾアルカス・スピーシーズであることが好ましく、アゾアルカス・スピーシーズ ＤＳＭ９５０６株であることがより好ましい。
まず、形質転換体作成工程において、嫌気性細菌にベクターを導入し、形質転換体を作製する。
本発明において、嫌気性細菌としては特に限定されるものではないが、トルエン分解酵素活性を有するタンパク質を内在的に有する嫌気性細菌（以下、「トルエン分解嫌気性細菌」という。）であることが好ましい。本発明では、嫌気性細菌を用いることにより、地下水等の嫌気性環境下において該菌が自活することができ、エネルギー等を補給する必要がない。また、トルエン分解嫌気性細菌を用いる場合、後述するベクターの導入や、本願発明に必要な形質転換体の作製が容易であるため好ましい。
トルエン分解嫌気性細菌は、公知のトルエン分解嫌気性細菌を用いてもよく、新たにトルエン分解嫌気性細菌を単離してもよい。トルエン分解嫌気性細菌を単離する方法は特に限定されるものではなく、トルエンを含有する培地において嫌気性細菌を培養し、スクリーニングを行う等の公知の方法により行うことができる。
このような嫌気性細菌として具体的には、アゾアルカス・スピーシーズ、タウエラ・アロマティカ等が挙げられ、より具体的には、アゾアルカス・スピーシーズ ＤＳＭ９５０６株、タウエラ・アロマティカ Ｋ１７２株、タウエラ・アロマティカ Ｔ１株が挙げられる。なかでも、本発明の嫌気性細菌としては、アゾアルカス・スピーシーズであることが好ましく、アゾアルカス・スピーシーズ ＤＳＭ９５０６株であることがより好ましい。
本発明においてベクターは、トルエン分解酵素活性を有するタンパク質をコードする遺伝子（以下、「トルエン分解酵素遺伝子」という。）と、その下流に位置し、レポータータンパク質をコードする遺伝子とが組み込まれたものである。
トルエン分解酵素遺伝子としては、特に限定されるものではなく、公知のトルエン分解酵素遺伝子を人工的に合成したものであってもよく、トルエン分解酵素遺伝子を有する生物からクローニングしたものであってもよい。また、トルエン分解酵素遺伝子は、該遺伝子のみの全配列であってもよく、該遺伝子上流側の部分配列のみであってもよく、該遺伝子と、上流側から該遺伝子を制御する制御遺伝子とを含む配列やその部分配列であってもよい。
トルエン分解酵素遺伝子を人工的に合成する場合、その方法は特に限定されるものではなく、公知の化学合成法を用いて行うことができる。また、合成するトルエン分解酵素遺伝子としては、２種以上の遺伝子をつなぎ合わせたキメラ遺伝子であってもよく、いずれかの生物種が有する遺伝子を変異させた変異遺伝子であってもよい。変異としては、遺伝子を構成する塩基配列の一部を欠損させてもよく、一部を置換してもよく、新たな配列を挿入してもよい。
トルエン分解酵素遺伝子をクローニングする場合、その方法は特に限定されるものではなく、目的の遺伝子やＤＮＡを分離する際に用いられる公知のいずれの方法を用いてもよい。このようなクローニング方法として、例えば、試料中のトルエン分解酵素遺伝子を含むＤＮＡ領域の、両末端の塩基配列と相補的な塩基配列を有するプライマーを用いて、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）法によりクローニングを行うことができる。このようにしてクローニングされたトルエン分解酵素遺伝子を含むＤＮＡ断片は、電気泳動装置やＤＮＡシークエンサー等の公知慣用の装置を用いることにより、目的としたＤＮＡ断片であるか否かを判別することができる。なお、クローニングするトルエン分解酵素遺伝子は、ベクターを導入する嫌気性細菌で発現し得るものであればその由来は特に限定されるものではなく、同種の嫌気性細菌からクローニングしたものであってもよく、当該嫌気性細菌以外の生物種からクローニングしたものであってもよい。
トルエン分解酵素遺伝子を人工的に合成する場合、その方法は特に限定されるものではなく、公知の化学合成法を用いて行うことができる。また、合成するトルエン分解酵素遺伝子としては、２種以上の遺伝子をつなぎ合わせたキメラ遺伝子であってもよく、いずれかの生物種が有する遺伝子を変異させた変異遺伝子であってもよい。変異としては、遺伝子を構成する塩基配列の一部を欠損させてもよく、一部を置換してもよく、新たな配列を挿入してもよい。
トルエン分解酵素遺伝子をクローニングする場合、その方法は特に限定されるものではなく、目的の遺伝子やＤＮＡを分離する際に用いられる公知のいずれの方法を用いてもよい。このようなクローニング方法として、例えば、試料中のトルエン分解酵素遺伝子を含むＤＮＡ領域の、両末端の塩基配列と相補的な塩基配列を有するプライマーを用いて、ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）法によりクローニングを行うことができる。このようにしてクローニングされたトルエン分解酵素遺伝子を含むＤＮＡ断片は、電気泳動装置やＤＮＡシークエンサー等の公知慣用の装置を用いることにより、目的としたＤＮＡ断片であるか否かを判別することができる。なお、クローニングするトルエン分解酵素遺伝子は、ベクターを導入する嫌気性細菌で発現し得るものであればその由来は特に限定されるものではなく、同種の嫌気性細菌からクローニングしたものであってもよく、当該嫌気性細菌以外の生物種からクローニングしたものであってもよい。
レポータータンパク質としては、後述する検出化合物を用いて検出可能なものであれば特に限定されるものではなく、β−ガラクトシダーゼ、ＧＦＰ、ＢＦＰ、ＲＦＰ、ＣＦＰ、ルシフェラーゼ、ｅｖｏｇｌｏｗ（商品名、フナコシ社製）、β−グルクロニダーゼ（ＧＵＳ）、クロラムフェニコールアセチルトランスフェラーゼ、ＥＧＦＰ（増強緑色蛍光タンパク質）、アルカリ性ホスファターゼ、ＤｓＲｅｄ、ペルオキシダーゼ、クロラムフェニコール・アセチルトランスフェラーゼ（ＣＡＴ）等が挙げられる。
なかでも、本発明におけるレポータータンパク質としては、β−ガラクトシダーゼであることが好ましい。
なかでも、本発明におけるレポータータンパク質としては、β−ガラクトシダーゼであることが好ましい。
本発明においてベクターは、上記のようなトルエン分解酵素遺伝子と、レポータータンパク質をコードする遺伝子とが組み込まれたものであれば特に限定されるものではなく、公知のプラスミドベクター等を用いることができる。このようなプラスミドベクターとしては、上記遺伝子の他に、プロモーター配列、抗生物質耐性遺伝子等を有する公知のものを好適に用いることができる。
本発明において、嫌気性細菌にベクターを導入し、形質転換体を作製する方法は特に限定されるものではなく、化学的処理によりベクターを導入する化学法、パルス電圧によってベクターを導入する電子穿孔法、カーボンナノチューブを用いて細胞膜に孔を開けベクターを導入する方法、嫌気性細菌間の遺伝子伝播現象を利用した接合伝達法等を用いることができ、なかでもより確実にベクターを導入できることから、接合伝達法が好ましい。
導入するベクターが抗生物質耐性遺伝子等の選択可能な遺伝子を有する場合は、上記のようにして嫌気性細菌にベクターを導入した後、当該抗生物質を含む培地にて嫌気性細菌を培養することにより、ベクターの導入された形質転換体のみを選択することができる。
導入するベクターが抗生物質耐性遺伝子等の選択可能な遺伝子を有する場合は、上記のようにして嫌気性細菌にベクターを導入した後、当該抗生物質を含む培地にて嫌気性細菌を培養することにより、ベクターの導入された形質転換体のみを選択することができる。
本発明において、嫌気性細菌及び形質転換体を培養する方法は、該細菌が好適に生育するものであれば特に限定されるものではない。例えば具体的には、嫌気性細菌がアゾアルカス・スピーシーズ ＤＳＭ９５０６株である場合には、リン酸二水素カリウム又は塩化アンモニウム、塩化マグネシウム、硝酸ナトリウム等を含む嫌気性細菌の基本培地に、さらに、Ｄ−リボース、Ｔｗｅｅｎ８０、Ｄ−アラビノース、Ｌ−アラビノース、Ｄ−キシロース、Ｄ−プシコース、α−ケドグルタル酸、マンノース、Ｄ−タガトース、Ｄ−フルクトース−６−リン酸、グルクロンアミド、Ｄ−フルクトース、ラムノース、Ｄ−ガラクトース、Ｄ−グルクロン酸、グリセロール、乳酸、酵母抽出液、カサミノ酸、ＮＢブロス、及びＬＢブロスからなる群から選ばれる１種以上を含む培地で培養することが好ましい。
本発明では、上記のようなベクターを嫌気性細菌に導入することにより、嫌気性細菌がトルエン分解酵素活性を有するタンパク質を発現する必要性が生じた際、具体的には、嫌気性細菌がトルエンの存在下にある際に、トルエン分解酵素遺伝子と共に、レポータータンパク質をコードする遺伝子が発現する。そのため、後述する検出工程において、レポータータンパク質を何らかの形で検出することにより、嫌気性細菌の存在環境におけるトルエンの有無を感知することが可能となる。
［検出工程］
次に、前記形質転換体と、レポータータンパク質により発色又は発光する水溶性部位を有する検出化合物とを用いて、試料中のトルエン含有量を定量する。
本発明において、試料としては特に限定されるものではなく、例えば、トルエンの存在が疑われる土壌、地下水、大気等が挙げられる。
次に、前記形質転換体と、レポータータンパク質により発色又は発光する水溶性部位を有する検出化合物とを用いて、試料中のトルエン含有量を定量する。
本発明において、試料としては特に限定されるものではなく、例えば、トルエンの存在が疑われる土壌、地下水、大気等が挙げられる。
本発明において、検出化合物は、レポータータンパク質により発色又は発光する水溶性部位を有する。
発色又は発光する水溶性部位（水溶性の色素又は蛍光物質）としては、特に限定されるものではなく、色素又は蛍光の検出に通常用いられるもののうち、水溶性のものを用いることができる。例えば、ルシフェラーゼ等の蛍光物質や、β−フラノシド基質やカテコール基質のような発色物質を用いることができる。
本発明において、検出化合物としては、例えばレポータータンパク質がβ−ガラクトシダーゼの場合、検出化合物として、β−ガラクトピラノシドと、上記のような水溶性の色素又は蛍光物質との融合化合物を用いることができる。この場合、トルエン存在下の形質転換体において、トルエン分解酵素遺伝子と共にβ−ガラクトシダーゼ遺伝子が発現し、生産されたβ−ガラクトシダーゼが、検出化合物中のβ−ガラクトピラノシド部分を分解することにより、β−ガラクトピラノシドに結合されていた水溶性の色素又は蛍光物質が発色又は発光する。
このような検出化合物として具体的には、ｏ−Ｎｉｔｒｏｐｈｅｎｙｌ−β−Ｄ−ｇａｌａｃｔｏｐｙｒａｎｏｓｉｄｅ（ＯＮＰＧ）、３’，４’−Ｄｉｈｙｄｒｏｘｙｆｌａｖｏｎｅ−４’−β−Ｄ−ｇａｌａｃｔｏｐｙｒａｎｏｓｉｄｅ（ＤＨＦ−Ｇａｌ）のような色素を用いた検出化合物、６−Ｏ−β−ｇａｌａｃｔｏｐｙｒａｎｏｓｙｌ−ｌｕｃｉｆｅｒｉｎ（Ｌｕｃ−Ｇａｌ）のような蛍光を用いた検出化合物等が挙げられる。なかでも、試料中のトルエン含有量を定量する際の精度が高いことから、ルシフェラーゼを含む検出化合物、具体的には上記Ｌｕｃ−Ｇａｌを用いることが好ましい。
本発明では、検出化合物の発色又は発光する部位として水溶性のものを用いることで、該発色又は発光化合物が嫌気性細菌に吸着することがないため、精度よく試料中のトルエン含有量を定量することができる。
発色又は発光する水溶性部位（水溶性の色素又は蛍光物質）としては、特に限定されるものではなく、色素又は蛍光の検出に通常用いられるもののうち、水溶性のものを用いることができる。例えば、ルシフェラーゼ等の蛍光物質や、β−フラノシド基質やカテコール基質のような発色物質を用いることができる。
本発明において、検出化合物としては、例えばレポータータンパク質がβ−ガラクトシダーゼの場合、検出化合物として、β−ガラクトピラノシドと、上記のような水溶性の色素又は蛍光物質との融合化合物を用いることができる。この場合、トルエン存在下の形質転換体において、トルエン分解酵素遺伝子と共にβ−ガラクトシダーゼ遺伝子が発現し、生産されたβ−ガラクトシダーゼが、検出化合物中のβ−ガラクトピラノシド部分を分解することにより、β−ガラクトピラノシドに結合されていた水溶性の色素又は蛍光物質が発色又は発光する。
このような検出化合物として具体的には、ｏ−Ｎｉｔｒｏｐｈｅｎｙｌ−β−Ｄ−ｇａｌａｃｔｏｐｙｒａｎｏｓｉｄｅ（ＯＮＰＧ）、３’，４’−Ｄｉｈｙｄｒｏｘｙｆｌａｖｏｎｅ−４’−β−Ｄ−ｇａｌａｃｔｏｐｙｒａｎｏｓｉｄｅ（ＤＨＦ−Ｇａｌ）のような色素を用いた検出化合物、６−Ｏ−β−ｇａｌａｃｔｏｐｙｒａｎｏｓｙｌ−ｌｕｃｉｆｅｒｉｎ（Ｌｕｃ−Ｇａｌ）のような蛍光を用いた検出化合物等が挙げられる。なかでも、試料中のトルエン含有量を定量する際の精度が高いことから、ルシフェラーゼを含む検出化合物、具体的には上記Ｌｕｃ−Ｇａｌを用いることが好ましい。
本発明では、検出化合物の発色又は発光する部位として水溶性のものを用いることで、該発色又は発光化合物が嫌気性細菌に吸着することがないため、精度よく試料中のトルエン含有量を定量することができる。
本発明において、形質転換体と、上記検出化合物とを用いてトルエン含有量を定量する方法は特に限定されるものではないが、例えば、試料と、形質転換体及び検出化合物とを有する培地とを接触させ、検出化合物の発色又は発光の強度を、分光光度計、蛍光光度計等の公知の装置によって測定し、検量線を用いることで、トルエン含有量の定量を行うことができる。検量線は、既知量のトルエンを含有する試料を、同様の形質転換体、同様の検出化合物、及び同様の装置を用いて測定することにより作製することができる。
また、本発明のトルエン検出方法では、検出工程において、試料中のトルエン含有量の定量を行う前に、さらに、トルエンの有無のみの検出や、トルエン含有量の半定量等の簡易検出を行ってもよい。
トルエンの簡易検出の方法としては特に限定されるものではないが、例えば、上記検出化合物を、検量線を用いずにその発色又は発光のみを検出してもよい。また、レポータータンパク質が単体で発色又は発光する物質、例えばＥＧＦＰ等である場合には、検出化合物を介さずに、該発色又は発光を分光又は蛍光光度計により直接検出し、発色や発光の有無により簡易検出を行うことができる。さらに、レポータータンパク質がβ−ガラクトシダーゼの場合には、５−ブロモ−４−クロロ−３−インドリル−β−Ｄ−ガラクトピラノシド（Ｘ−ｇａｌ）等の水溶性ではないが一般的且つ簡便な検出化合物を用いて、簡易検出を行うこともできる。
トルエンの簡易検出の方法としては特に限定されるものではないが、例えば、上記検出化合物を、検量線を用いずにその発色又は発光のみを検出してもよい。また、レポータータンパク質が単体で発色又は発光する物質、例えばＥＧＦＰ等である場合には、検出化合物を介さずに、該発色又は発光を分光又は蛍光光度計により直接検出し、発色や発光の有無により簡易検出を行うことができる。さらに、レポータータンパク質がβ−ガラクトシダーゼの場合には、５−ブロモ−４−クロロ−３−インドリル−β−Ｄ−ガラクトピラノシド（Ｘ−ｇａｌ）等の水溶性ではないが一般的且つ簡便な検出化合物を用いて、簡易検出を行うこともできる。
本発明のトルエン検出方法によれば、例えば、嫌気性細菌にベクターを導入した形質転換体や検出化合物を、離散しないように担体等の表面に固着させ、これを地下水中に静置して、該地下水中のトルエン汚染の有無及びトルエン含有量を検出することができる。
また、例えば、地下水を定期的又は恒常的に、観測井戸等からポンプ等を用いて汲み上げ、汲み上げた地下水試料と、嫌気性細菌にベクターを導入した形質転換体と、検出化合物とを接触させ、分光光度計や蛍光光度計を用いてトルエン汚染の有無及びトルエン含有量を検出することができる。
また、例えば、地下水を定期的又は恒常的に、観測井戸等からポンプ等を用いて汲み上げ、汲み上げた地下水試料と、嫌気性細菌にベクターを導入した形質転換体と、検出化合物とを接触させ、分光光度計や蛍光光度計を用いてトルエン汚染の有無及びトルエン含有量を検出することができる。
次に実施例を示して本発明をさらに詳細に説明するが、本発明は以下の実施例に限定されるものではない。なお、以下の実施例中、特に記載がない限り、「％」は「質量％」を意味する。
［参考例１］
（アゾアルカス・スピーシーズ ＤＳＭ９５０６株の培養条件の検討）
まず、アゾアルカス・スピーシーズ ＤＳＭ９５０６株（以下、単に「ＤＳＭ９５０６株」という。）の利用可能な炭素源について検討した。
なお、ＤＳＭ９５０６株は嫌気性細菌であるため、以下の検討において、ＤＳＭ９５０６株の植菌や培地調整等の作業は、酸素濃度が大気中の１０万分の１程度である嫌気グローブボックス内で行い、培養は酸素を通さないブチルゴム栓で密閉したガラス容器内で行った。また、ガラス容器には、酸素除去剤として、酸化チタン−クエン酸ナトリウム溶液、硫化ナトリウム九水和物を添加し、嫌気環境を維持した上で、嫌気指示薬であるレサズリンを用いて嫌気環境であることを確認し、指示薬の結果から嫌気環境が損なわれたと考えられる試料は破棄した。
９６ウェルマイクロプレートの各ウェル内に、９５種の炭素源となる化合物が充填されたマイクロプレート（商品名、バイオログ社製）を用いて検討したところ、ＤＳＭ９５０６株は、Ｄ−リボース、Ｔｗｅｅｎ８０、Ｄ−アラビノース、Ｌ−アラビノース、Ｄ−キシロース、Ｄ−プシコース、α−ケドグルタル酸、マンノース、Ｄ−タガトース、Ｄ−フルクトース−６−リン酸、グルクロンアミド、Ｄ−フルクトース、ラムノース、Ｄ−ガラクトース、又は、Ｄ−グルクロン酸、を炭素源として利用可能であることが分かった。
（アゾアルカス・スピーシーズ ＤＳＭ９５０６株の培養条件の検討）
まず、アゾアルカス・スピーシーズ ＤＳＭ９５０６株（以下、単に「ＤＳＭ９５０６株」という。）の利用可能な炭素源について検討した。
なお、ＤＳＭ９５０６株は嫌気性細菌であるため、以下の検討において、ＤＳＭ９５０６株の植菌や培地調整等の作業は、酸素濃度が大気中の１０万分の１程度である嫌気グローブボックス内で行い、培養は酸素を通さないブチルゴム栓で密閉したガラス容器内で行った。また、ガラス容器には、酸素除去剤として、酸化チタン−クエン酸ナトリウム溶液、硫化ナトリウム九水和物を添加し、嫌気環境を維持した上で、嫌気指示薬であるレサズリンを用いて嫌気環境であることを確認し、指示薬の結果から嫌気環境が損なわれたと考えられる試料は破棄した。
９６ウェルマイクロプレートの各ウェル内に、９５種の炭素源となる化合物が充填されたマイクロプレート（商品名、バイオログ社製）を用いて検討したところ、ＤＳＭ９５０６株は、Ｄ−リボース、Ｔｗｅｅｎ８０、Ｄ−アラビノース、Ｌ−アラビノース、Ｄ−キシロース、Ｄ−プシコース、α−ケドグルタル酸、マンノース、Ｄ−タガトース、Ｄ−フルクトース−６−リン酸、グルクロンアミド、Ｄ−フルクトース、ラムノース、Ｄ−ガラクトース、又は、Ｄ−グルクロン酸、を炭素源として利用可能であることが分かった。
また、上記９５種類以外の化合物についても炭素源となり得るか否かを個別に検討したところ、グリセロール、乳酸、酵母抽出液、カサミノ酸、ＮＢブロス、又はＬＢブロスの６種の化合物も炭素源として利用可能であることが分かった。これら６種の化合物を炭素源とした場合の、ＤＳＭ９５０６株の吸光度により測定した生育量を図１に示す。図１中、横軸が培養期間（日）、縦軸が６６０ｎｍにおける吸光度である。
図１の結果から、乳酸、及びカサミノ酸を炭素源とした場合にＤＳＭ９５０６株の生育が良好となることが分かった。そこで、以下の検討では、乳酸を炭素源とした。
図１の結果から、乳酸、及びカサミノ酸を炭素源とした場合にＤＳＭ９５０６株の生育が良好となることが分かった。そこで、以下の検討では、乳酸を炭素源とした。
次に、炭素源として乳酸を用いた場合の、乳酸濃度によるＤＳＭ９５０６株の生育量について検討した。
乳酸濃度を０．０７％、０．１４％、０．２１％、０．２８％、０．３５％にそれぞれ調整した基本培地（リン酸二水素カリウム又は塩化アンモニウム、塩化マグネシウム、及び硝酸ナトリウムを含む培地）において、ＤＳＭ９５０６株を４８時間培養し、ＤＳM９５０６株の生育量を培養開始２４時間後及び４８時間後に、吸光度により測定した。結果を図２に示す。図２中、横軸が培養期間（日）であり、縦軸が６６０ｎｍにおける吸光度である。
図２の結果から、４８時間後においては、乳酸濃度が高い程生育が良いものの、２４時間後においては乳酸濃度０．１４％の培地が最も生育が良かった。これは、乳酸が高濃度である場合、該乳酸が増殖初期段階においてＤＳＭ９５０６株の生育に悪影響を及ぼすためと考えられる。そのため、４８時間後において、最も乳酸濃度の高い０．３５％の培地と得られる菌体量に大差がなく、且つ、増殖初期である２４時間後においても生育が良好である乳酸濃度０．２１％を以下の検討において採用することとした。
乳酸濃度を０．０７％、０．１４％、０．２１％、０．２８％、０．３５％にそれぞれ調整した基本培地（リン酸二水素カリウム又は塩化アンモニウム、塩化マグネシウム、及び硝酸ナトリウムを含む培地）において、ＤＳＭ９５０６株を４８時間培養し、ＤＳM９５０６株の生育量を培養開始２４時間後及び４８時間後に、吸光度により測定した。結果を図２に示す。図２中、横軸が培養期間（日）であり、縦軸が６６０ｎｍにおける吸光度である。
図２の結果から、４８時間後においては、乳酸濃度が高い程生育が良いものの、２４時間後においては乳酸濃度０．１４％の培地が最も生育が良かった。これは、乳酸が高濃度である場合、該乳酸が増殖初期段階においてＤＳＭ９５０６株の生育に悪影響を及ぼすためと考えられる。そのため、４８時間後において、最も乳酸濃度の高い０．３５％の培地と得られる菌体量に大差がなく、且つ、増殖初期である２４時間後においても生育が良好である乳酸濃度０．２１％を以下の検討において採用することとした。
次いで、無機塩の種類によるＤＳＭ９５０６株の生育量について検討した。
培地１Ｌ中にリン酸二水素カリウム０．５２ｇ（ＫＨ２ＰＯ４）、塩化アンモニウム０．２ｇ（ＮＨ４Ｃｌ）、塩化マグネシウム六水和物０．４ｇ（ＭｇＣｌ２−６Ｈ２Ｏ）及び硝酸ナトリウム０．２ｇ（ＮａＮＯ３）を含む基本培地に、乳酸０．２１％を添加し、さらにリン酸水素二カリウム１ｇ（Ｋ２ＨＰＯ４）又は塩化カルシウム二水和物（ＣａＣｌ２−２Ｈ２Ｏ）０．１ｇを添加して、該培地におけるＤＳＭ９５０６株の生育量を調べた。
その結果、リン酸二水素カリウム及び塩化カルシウムのいずれかを添加することにより若干の生育量の向上が認められたが、これら２種の間に大きな効果の差は認められなかった。そのため、以下の検討では、上記基本培地に、乳酸及び塩化カルシウムを添加した培地を用いることとした。
培地１Ｌ中にリン酸二水素カリウム０．５２ｇ（ＫＨ２ＰＯ４）、塩化アンモニウム０．２ｇ（ＮＨ４Ｃｌ）、塩化マグネシウム六水和物０．４ｇ（ＭｇＣｌ２−６Ｈ２Ｏ）及び硝酸ナトリウム０．２ｇ（ＮａＮＯ３）を含む基本培地に、乳酸０．２１％を添加し、さらにリン酸水素二カリウム１ｇ（Ｋ２ＨＰＯ４）又は塩化カルシウム二水和物（ＣａＣｌ２−２Ｈ２Ｏ）０．１ｇを添加して、該培地におけるＤＳＭ９５０６株の生育量を調べた。
その結果、リン酸二水素カリウム及び塩化カルシウムのいずれかを添加することにより若干の生育量の向上が認められたが、これら２種の間に大きな効果の差は認められなかった。そのため、以下の検討では、上記基本培地に、乳酸及び塩化カルシウムを添加した培地を用いることとした。
さらに、微生物種によっては、培養開始時の菌体数が少ない場合に生育しないおそれがあるため、培養開始時の菌体数が生育に与える影響について検討した。
ＤＳＭ９５０６株を、リン酸二水素カリウム０．５２ｇ（ＫＨ２ＰＯ４）、塩化アンモニウム０．２ｇ（ＮＨ４Ｃｌ）、塩化マグネシウム六水和物０．４ｇ（ＭｇＣｌ２−６Ｈ２Ｏ）及び硝酸ナトリウム０．２ｇ（ＮａＮＯ３）、乳酸０．２１％を１Ｌ中に含む培地で２４時間前培養を行った。その後、前培養液を１〜１０％の範囲で量を変えて本培養の培地中に添加し、生育量を調べた。結果を図３に示す。なお、本培養の培地組成は前培養と同様である。
この結果、２４時間後では培養開始時の添加菌体数に比例して生育量が多いが、４８時間後には添加菌体数の多寡に関わらずほぼ同程度の生育量となった。いずれの菌体添加量であっても２４時間後に菌体量が１０倍となっており、初期添加量が１〜１０％の範囲内であれば生育速度に差がないことが分かった。そのため、以下の検討では、菌体の初期添加量を１０％とした。
ＤＳＭ９５０６株を、リン酸二水素カリウム０．５２ｇ（ＫＨ２ＰＯ４）、塩化アンモニウム０．２ｇ（ＮＨ４Ｃｌ）、塩化マグネシウム六水和物０．４ｇ（ＭｇＣｌ２−６Ｈ２Ｏ）及び硝酸ナトリウム０．２ｇ（ＮａＮＯ３）、乳酸０．２１％を１Ｌ中に含む培地で２４時間前培養を行った。その後、前培養液を１〜１０％の範囲で量を変えて本培養の培地中に添加し、生育量を調べた。結果を図３に示す。なお、本培養の培地組成は前培養と同様である。
この結果、２４時間後では培養開始時の添加菌体数に比例して生育量が多いが、４８時間後には添加菌体数の多寡に関わらずほぼ同程度の生育量となった。いずれの菌体添加量であっても２４時間後に菌体量が１０倍となっており、初期添加量が１〜１０％の範囲内であれば生育速度に差がないことが分かった。そのため、以下の検討では、菌体の初期添加量を１０％とした。
［実施例１］
（１）トルエン分解酵素遺伝子を含むＤＮＡ断片のクローニング
まず、ＤＳＭ９５０６株において公知となっているトルエン分解酵素遺伝子（Ｇｅｎｂａｎｋアクセッション番号：ＡＹ０３２６７６）の１４６番目〜３３６２番目の塩基配列（３２１７ｂｐ）の両末端と相補的な塩基配列を有するプライマーを設計した。そして、常法により抽出したＤＳＭ９５０６株のゲノムＤＮＡをテンプレートとして、上記プライマーとＫＯＤ−Ｐｌｕｓ（商品名、東洋紡績(株)社製）とを用いて、ＰＣＲ法によりトルエン分解酵素遺伝子を含むＤＮＡ断片のＰＣＲ産物を得た。用いたプライマーの配列を、Ｐｒｉｍｅｒ１（ｆｏｒｗａｒｄ；配列番号１）とＰｒｉｍｅｒ２（ｒｅｖｅｒｓｅ；配列番号２）として表１に示す。
アガロース電気泳動を用いて、得られたＰＣＲ産物の全長を確認したところ、目的産物と同等の３２００ｂｐ程度のＰＣＲ産物が得られていることが確認できた。また、ＰＣＲ産物の一部の配列についてＤＮＡシークエンサーを用いて解析を行ったところ、目的のトルエン分解酵素遺伝子を含むＤＮＡ断片が得られていることが確認できた。
（１）トルエン分解酵素遺伝子を含むＤＮＡ断片のクローニング
まず、ＤＳＭ９５０６株において公知となっているトルエン分解酵素遺伝子（Ｇｅｎｂａｎｋアクセッション番号：ＡＹ０３２６７６）の１４６番目〜３３６２番目の塩基配列（３２１７ｂｐ）の両末端と相補的な塩基配列を有するプライマーを設計した。そして、常法により抽出したＤＳＭ９５０６株のゲノムＤＮＡをテンプレートとして、上記プライマーとＫＯＤ−Ｐｌｕｓ（商品名、東洋紡績(株)社製）とを用いて、ＰＣＲ法によりトルエン分解酵素遺伝子を含むＤＮＡ断片のＰＣＲ産物を得た。用いたプライマーの配列を、Ｐｒｉｍｅｒ１（ｆｏｒｗａｒｄ；配列番号１）とＰｒｉｍｅｒ２（ｒｅｖｅｒｓｅ；配列番号２）として表１に示す。
アガロース電気泳動を用いて、得られたＰＣＲ産物の全長を確認したところ、目的産物と同等の３２００ｂｐ程度のＰＣＲ産物が得られていることが確認できた。また、ＰＣＲ産物の一部の配列についてＤＮＡシークエンサーを用いて解析を行ったところ、目的のトルエン分解酵素遺伝子を含むＤＮＡ断片が得られていることが確認できた。
（２）レポータータンパク質をコードする遺伝子を含むＤＮＡ断片のクローニング
レポータータンパク質であるＥＧＦＰ、β−ガラクトシダーゼをコードする遺伝子を含むＤＮＡ断片をクローニングした。
ＥＧＦＰは、プラスミドベクターであるｐＥＧＦＰ（商品名、クロンテック社製）をテンプレートとして、ＫＯＤ−Ｐｌｕｓ（商品名、東洋紡績(株)社製）、並びに下記プライマーＰｒｉｍｅｒ３（ｆｏｒｗａｒｄ；配列番号３）及びＰｒｉｍｅｒ４（ｒｅｖｅｒｓｅ；配列番号４）を用いて、ＰＣＲ増幅を行い、産物であるＥＧＦＰ遺伝子断片を得た。
β−ガラクトシダーゼは、プラスミドベクターであるｐＳＶ−β−Ｇａｌａｃｔｏｓｉｄａｓｅ Ｖｅｃｔｏｒ（商品名、プロメガ社製）をテンプレートとして、ＫＯＤ−Ｐｌｕｓ（商品名、東洋紡績(株)社製）、並びに下記プライマー、Ｐｒｉｍｅｒ５（ｆｏｒｗａｒｄ；配列番号５）及びＰｒｉｍｅｒ６（ｒｅｖｅｒｓｅ；配列番号６）を用いて、ＰＣＲ増幅を行い、産物であるβ−ガラクトシダーゼ遺伝子断片（β−Ｇａｌ）を得た。
得られたＰＣＲ産物をアガロース電気泳動にて確認したところ、ＰＣＲ産物はいずれも目的の産物長（ＥＧＦＰ：８５０ｂｐ、βガラクトシダーゼ：３１００ｂｐ）であったため、ＥＧＦＰ、β−ガラクトシダーゼ共に目的のレポータータンパク質遺伝子断片であることが確認できた。
レポータータンパク質であるＥＧＦＰ、β−ガラクトシダーゼをコードする遺伝子を含むＤＮＡ断片をクローニングした。
ＥＧＦＰは、プラスミドベクターであるｐＥＧＦＰ（商品名、クロンテック社製）をテンプレートとして、ＫＯＤ−Ｐｌｕｓ（商品名、東洋紡績(株)社製）、並びに下記プライマーＰｒｉｍｅｒ３（ｆｏｒｗａｒｄ；配列番号３）及びＰｒｉｍｅｒ４（ｒｅｖｅｒｓｅ；配列番号４）を用いて、ＰＣＲ増幅を行い、産物であるＥＧＦＰ遺伝子断片を得た。
β−ガラクトシダーゼは、プラスミドベクターであるｐＳＶ−β−Ｇａｌａｃｔｏｓｉｄａｓｅ Ｖｅｃｔｏｒ（商品名、プロメガ社製）をテンプレートとして、ＫＯＤ−Ｐｌｕｓ（商品名、東洋紡績(株)社製）、並びに下記プライマー、Ｐｒｉｍｅｒ５（ｆｏｒｗａｒｄ；配列番号５）及びＰｒｉｍｅｒ６（ｒｅｖｅｒｓｅ；配列番号６）を用いて、ＰＣＲ増幅を行い、産物であるβ−ガラクトシダーゼ遺伝子断片（β−Ｇａｌ）を得た。
得られたＰＣＲ産物をアガロース電気泳動にて確認したところ、ＰＣＲ産物はいずれも目的の産物長（ＥＧＦＰ：８５０ｂｐ、βガラクトシダーゼ：３１００ｂｐ）であったため、ＥＧＦＰ、β−ガラクトシダーゼ共に目的のレポータータンパク質遺伝子断片であることが確認できた。
（３）発現ベクターの調整
次いで、上記（１）で得られたトルエン分解酵素遺伝子断片と、上記（２）で得られたレポータータンパク質遺伝子断片とを、それぞれ制限酵素処理した後、ラピッドＤＮＡライゲーションキット（商品名、ロッシュ社製）を用いて連結した。以下、得られたＥＧＦＰを含む遺伝子断片をトルエン−ＥＧＦＰ、β−ガラクトシダーゼを含む遺伝子断片をトルエン−β−ガラクトシダーゼという。これら遺伝子断片は、アガロース電気泳動により目的の産物であることを確認した。
上記のようにして得られたトルエン−ＥＧＦＰと、トルエン−β−ガラクトシダーゼをＡｐａＩ及びＳｐｅＩで処理した後、同じくＡｐａＩ及びＳｐｅＩで処理したプラスミドＤＮＡの発現ベクターであるｐＢＢＲ１ＭＣＳ２（Ｋｏｖａｃｈら、Ｇｅｎｅ、１６６、１９９５年）に、ラピッドＤＮＡライゲーションキット（商品名、ロッシュ社製）を用いて組み込んだ。得られたｐＢＢＲ１−トルエン−ＥＧＦＰ、及びｐＢＢＲ１−トルエン−β−ガラクトシダーゼは、ＡｐａＩ及びＳｐｅＩで処理した後アガロース電気泳動を行い、目的の発現ベクターであることを確認した。また、これらの発現ベクターは、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ ｃｏｌｉ（大腸菌）ＪＭ１０９株にハナハン法を用いて形質転換し、増幅及び保存を行った。
次いで、上記（１）で得られたトルエン分解酵素遺伝子断片と、上記（２）で得られたレポータータンパク質遺伝子断片とを、それぞれ制限酵素処理した後、ラピッドＤＮＡライゲーションキット（商品名、ロッシュ社製）を用いて連結した。以下、得られたＥＧＦＰを含む遺伝子断片をトルエン−ＥＧＦＰ、β−ガラクトシダーゼを含む遺伝子断片をトルエン−β−ガラクトシダーゼという。これら遺伝子断片は、アガロース電気泳動により目的の産物であることを確認した。
上記のようにして得られたトルエン−ＥＧＦＰと、トルエン−β−ガラクトシダーゼをＡｐａＩ及びＳｐｅＩで処理した後、同じくＡｐａＩ及びＳｐｅＩで処理したプラスミドＤＮＡの発現ベクターであるｐＢＢＲ１ＭＣＳ２（Ｋｏｖａｃｈら、Ｇｅｎｅ、１６６、１９９５年）に、ラピッドＤＮＡライゲーションキット（商品名、ロッシュ社製）を用いて組み込んだ。得られたｐＢＢＲ１−トルエン−ＥＧＦＰ、及びｐＢＢＲ１−トルエン−β−ガラクトシダーゼは、ＡｐａＩ及びＳｐｅＩで処理した後アガロース電気泳動を行い、目的の発現ベクターであることを確認した。また、これらの発現ベクターは、Ｅｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ ｃｏｌｉ（大腸菌）ＪＭ１０９株にハナハン法を用いて形質転換し、増幅及び保存を行った。
（４）形質転換体の作製
上記参考例１で検討した条件において培養を行ったＤＳＭ９５０６株に対し、化学法、電子穿孔法、カーボンナノチューブを用いて細胞膜に孔を開けベクターを導入する方法、及びＥｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ ｃｏｌｉ（大腸菌）Ｓ１７−１株を用いた接合伝達法のいずれかを用いて、ｐＢＢＲ１−トルエン−ＥＧＦＰベクター、又はｐＢＢＲ１−トルエン−β−ガラクトシダーゼベクターの導入を試みた。その後、ｐＢＢＲ１ベクター内に存在するカナマイシン耐性遺伝子を利用して、ＤＳＭ９５０６株の培地にカナマイシンを（５０ｍｇ／Ｌ）で添加し、形質転換体の選択を行った。
その結果、接合伝達法を用いた場合に、最も効率よく形質転換体が製造できることが分かった。以下の検討では、接合伝達法により得られた形質転換体を用いた。
上記参考例１で検討した条件において培養を行ったＤＳＭ９５０６株に対し、化学法、電子穿孔法、カーボンナノチューブを用いて細胞膜に孔を開けベクターを導入する方法、及びＥｓｃｈｅｒｉｃｈｉａ ｃｏｌｉ（大腸菌）Ｓ１７−１株を用いた接合伝達法のいずれかを用いて、ｐＢＢＲ１−トルエン−ＥＧＦＰベクター、又はｐＢＢＲ１−トルエン−β−ガラクトシダーゼベクターの導入を試みた。その後、ｐＢＢＲ１ベクター内に存在するカナマイシン耐性遺伝子を利用して、ＤＳＭ９５０６株の培地にカナマイシンを（５０ｍｇ／Ｌ）で添加し、形質転換体の選択を行った。
その結果、接合伝達法を用いた場合に、最も効率よく形質転換体が製造できることが分かった。以下の検討では、接合伝達法により得られた形質転換体を用いた。
（５）ｐＢＢＲ１−トルエン−ＥＧＦＰベクターを用いた簡易検出
ｐＢＢＲ１−トルエン−ＥＧＦＰベクターを導入したＤＳＭ９５０６株の形質転換体を栄養培地（ＤＩＦＣＯ Ｎｕｔｒｉｅｎｔ Ｂｒｏｔｈ ４ｇ／Ｌ、カナマイシン ５０ｍｇ／Ｌ）で増殖させた後、遠心分離器を用いて回収し、上記基本培地で洗浄後、トルエンの簡易検出を行った。
まず、トルエン（１ｍｇ／Ｌ）を添加した上記基本培地３０ｍＬに形質転換体を移し、嫌気条件下で培養を行ったところ、形質転換体が緑色の蛍光を発することが確認できた。また、この緑色蛍光を発する形質転換体を好気環境下に移すと蛍光が消え、その後嫌気環境下に戻すと再度蛍光を発することが確認できた。
この結果から、形質転換体では、設計通りにトルエンが存在する嫌気環境下においてＥＧＦＰが産生されていることが確認できた。また、トルエンが分解できない大気中（好気環境下）に移すことで蛍光が消失することは、ＥＧＦＰが長期間存在し得ないことを示しており、つまり、形質転換体周囲のトルエンが全て分解されてトルエン汚染がなくなれば蛍光も消失すると考えられる。
よって、ＥＧＦＰ等に由来する緑色蛍光の有無を指標としてトルエンの存在を検知することができると考えられた。
ｐＢＢＲ１−トルエン−ＥＧＦＰベクターを導入したＤＳＭ９５０６株の形質転換体を栄養培地（ＤＩＦＣＯ Ｎｕｔｒｉｅｎｔ Ｂｒｏｔｈ ４ｇ／Ｌ、カナマイシン ５０ｍｇ／Ｌ）で増殖させた後、遠心分離器を用いて回収し、上記基本培地で洗浄後、トルエンの簡易検出を行った。
まず、トルエン（１ｍｇ／Ｌ）を添加した上記基本培地３０ｍＬに形質転換体を移し、嫌気条件下で培養を行ったところ、形質転換体が緑色の蛍光を発することが確認できた。また、この緑色蛍光を発する形質転換体を好気環境下に移すと蛍光が消え、その後嫌気環境下に戻すと再度蛍光を発することが確認できた。
この結果から、形質転換体では、設計通りにトルエンが存在する嫌気環境下においてＥＧＦＰが産生されていることが確認できた。また、トルエンが分解できない大気中（好気環境下）に移すことで蛍光が消失することは、ＥＧＦＰが長期間存在し得ないことを示しており、つまり、形質転換体周囲のトルエンが全て分解されてトルエン汚染がなくなれば蛍光も消失すると考えられる。
よって、ＥＧＦＰ等に由来する緑色蛍光の有無を指標としてトルエンの存在を検知することができると考えられた。
（６）ｐＢＢＲ１−トルエン−β−ガラクトシダーゼベクターを用いた簡易検出
次に、ｐＢＢＲ１−トルエン−ＥＧＦＰベクターを導入したＤＳＭ９５０６株の形質転換体を栄養培地（ＤＩＦＣＯ Ｎｕｔｒｉｅｎｔ Ｂｒｏｔｈ ４ｇ／Ｌ、カナマイシン ５０ｍｇ／Ｌ）で増殖させた後、遠心分離器を用いて回収し、上記基本培地で洗浄後、トルエンの簡易検出を行った。
まず、トルエン（１ｍｇ／Ｌ）又はベンゼン（１ｍｇ／Ｌ）を添加した上記基本培地３０ｍＬに、形質転換体、及び発色基質であるＸ−ｇａｌ（２００ｕｇ／Ｌ）を加えて静置培養した。１週間後に観察したところ、トルエンを添加した培地では、β−ガラクトシダーゼの作用によりＸ−ｇａｌから青色の色素が遊離し、培地が青色となった。一方、ベンゼンを添加した培地では、培地の色の変化はなかった。
この結果から、形質転換体では、設計通りにトルエンが存在する環境下においてβ−ガラクトシダーゼが産生されていることが確認できた。よって、β−ガラクトシダーゼのＸ−ｇａｌ分解に由来する青色色素の有無を指標として、トルエンの存在を検知することができると考えられた。
次に、ｐＢＢＲ１−トルエン−ＥＧＦＰベクターを導入したＤＳＭ９５０６株の形質転換体を栄養培地（ＤＩＦＣＯ Ｎｕｔｒｉｅｎｔ Ｂｒｏｔｈ ４ｇ／Ｌ、カナマイシン ５０ｍｇ／Ｌ）で増殖させた後、遠心分離器を用いて回収し、上記基本培地で洗浄後、トルエンの簡易検出を行った。
まず、トルエン（１ｍｇ／Ｌ）又はベンゼン（１ｍｇ／Ｌ）を添加した上記基本培地３０ｍＬに、形質転換体、及び発色基質であるＸ−ｇａｌ（２００ｕｇ／Ｌ）を加えて静置培養した。１週間後に観察したところ、トルエンを添加した培地では、β−ガラクトシダーゼの作用によりＸ−ｇａｌから青色の色素が遊離し、培地が青色となった。一方、ベンゼンを添加した培地では、培地の色の変化はなかった。
この結果から、形質転換体では、設計通りにトルエンが存在する環境下においてβ−ガラクトシダーゼが産生されていることが確認できた。よって、β−ガラクトシダーゼのＸ−ｇａｌ分解に由来する青色色素の有無を指標として、トルエンの存在を検知することができると考えられた。
また、増殖させた上記ＤＳＭ９５０６株の形質転換体を、上記同様にトルエン及びＸ−ｇａｌを含む基本培地に懸濁し、旋回式振とう培養装置を用いて振とう培養を行ったところ、トルエンによる青色色素の誘導は認められなかった。これは、振とう培養によって酸素濃度が上昇したためにトルエン分解が妨げられ、その結果、レポータータンパク質であるβ−ガラクトシダーゼが発現しなくなったためと考えられる。
次いで、増殖させた上記ＤＳＭ９５０６株の形質転換体を、上記同様にトルエン及びＸ−ｇａｌを添加した基本培地に添加し、さらに、各培地にタンパク質合成阻害剤（クロラムフェニコール）を５０ｍｇ／Ｌ添加して１週間静置したところ、青色色素は認められなかった。この結果から、青色色素の発色がβ−ガラクトシダーゼ遺伝子の発現の結果であることが確認できた。よって、β−ガラクトシダーゼとレポータータンパク質とをコードする遺伝子を有する発現ベクターを用いることで、嫌気環境下でのトルエン検出が可能であることが確認できた。
次いで、増殖させた上記ＤＳＭ９５０６株の形質転換体を、上記同様にトルエン及びＸ−ｇａｌを添加した基本培地に添加し、さらに、各培地にタンパク質合成阻害剤（クロラムフェニコール）を５０ｍｇ／Ｌ添加して１週間静置したところ、青色色素は認められなかった。この結果から、青色色素の発色がβ−ガラクトシダーゼ遺伝子の発現の結果であることが確認できた。よって、β−ガラクトシダーゼとレポータータンパク質とをコードする遺伝子を有する発現ベクターを用いることで、嫌気環境下でのトルエン検出が可能であることが確認できた。
（８）トルエン含有量の定量−１
トルエンによって誘導される青色色素の生産量と、トルエン濃度との関係について調べた。
まず、トルエンを０、１、５、又は１０ｍｇ／Ｌの濃度で含有する培地を上記（７）と同様に作製し、ｐＢＢＲ１−トルエン−β−ガラクトシダーゼベクターを導入したＤＳＭ９５０６株を植菌した。１週間静置培養した後、青色色素の吸光度（ＯＤ６２０ｎｍ）を分光光度計（ベックマン社製ＤＵ６５０）により測定し、トルエン濃度と青色色素量との関係について検討した。結果を図４に示す。
図４の結果から、トルエン濃度に比例して色素生産量も高くなることが明らかである。しかしながら、Ｘ−ｇａｌ由来の青色色素（５−ブロモ−４−クロロ−３−インドール）は、水溶性でなく、ＤＳＭ９５０６株の表面に吸着するため、吸光度が必ずしも色素量を正確に反映していないと考えられる。
トルエンによって誘導される青色色素の生産量と、トルエン濃度との関係について調べた。
まず、トルエンを０、１、５、又は１０ｍｇ／Ｌの濃度で含有する培地を上記（７）と同様に作製し、ｐＢＢＲ１−トルエン−β−ガラクトシダーゼベクターを導入したＤＳＭ９５０６株を植菌した。１週間静置培養した後、青色色素の吸光度（ＯＤ６２０ｎｍ）を分光光度計（ベックマン社製ＤＵ６５０）により測定し、トルエン濃度と青色色素量との関係について検討した。結果を図４に示す。
図４の結果から、トルエン濃度に比例して色素生産量も高くなることが明らかである。しかしながら、Ｘ−ｇａｌ由来の青色色素（５−ブロモ−４−クロロ−３−インドール）は、水溶性でなく、ＤＳＭ９５０６株の表面に吸着するため、吸光度が必ずしも色素量を正確に反映していないと考えられる。
（９）トルエン含有量の定量−２
そこで、β−ガラクトシダーゼにより発色又は発光する水溶性部位を有する３種の化合物をＸ−ｇａｌに変えて用い、０．００１、０．０１、０．１、又は１ｍｇ／Ｌのトルエンを含む上記同様の培地にて上記（７）と同様に検討を行った。３種の化合物としては、ｏ−Ｎｉｔｒｏｐｈｅｎｙｌ−β−Ｄ−ｇａｌａｃｔｏｐｙｒａｎｏｓｉｄｅ（ＯＮＰＧ）、３’，４’−Ｄｉｈｙｄｒｏｘｙｆｌａｖｏｎｅ−４’−β−Ｄ−ｇａｌａｃｔｏｐｙｒａｎｏｓｉｄｅ（ＤＨＦ−Ｇａｌ）、及び６−Ｏ−β−ｇａｌａｃｔｏｐｙｒａｎｏｓｙｌ−ｌｕｃｉｆｅｒｉｎ（Ｌｕｃ−Ｇａｌ）を用い、ＯＮＰＧは４２０ｎｍ、ＤＨＦ−Ｇａｌは６２０ｎｍにおいて上記同様の分光光度計を用い、Ｌｕｃ−Ｇａｌはルミテスター Ｋ−２００（商品名、キッコーマン社製）を用いて発色又は発光を定量化した。
その結果、β−ガラクトシダーゼにより発色するＯＮＰＧ、ＤＨＦ−Ｇａｌの発色よりも、β−ガラクトシダーゼにより発光するＬｕｃ−Ｇａｌにおいて安定した発光が得られた。Ｌｕｃ−Ｇａｌの定量結果を図５に示す。
図５の結果から、Ｌｕｃ−Ｇａｌを検出化合物として用いた場合、トルエン濃度が０．００１ｍｇ／Ｌと非常に低濃度であっても、発光が確認できることが分かった。また、その発光量は、トルエン濃度が０．０１〜１ｍｇ／Ｌの範囲でトルエン濃度に比例して強くなり、定量が可能であることが確認できた。
これらの結果から、嫌気性細菌にベクターを導入した形質転換体と、レポータータンパク質により発色又は発光する水溶性部位を有する検出化合物とを用いることで、試料中のトルエンの有無を検出できるのみならず、トルエン含有量を定量できることが確認できた。
そこで、β−ガラクトシダーゼにより発色又は発光する水溶性部位を有する３種の化合物をＸ−ｇａｌに変えて用い、０．００１、０．０１、０．１、又は１ｍｇ／Ｌのトルエンを含む上記同様の培地にて上記（７）と同様に検討を行った。３種の化合物としては、ｏ−Ｎｉｔｒｏｐｈｅｎｙｌ−β−Ｄ−ｇａｌａｃｔｏｐｙｒａｎｏｓｉｄｅ（ＯＮＰＧ）、３’，４’−Ｄｉｈｙｄｒｏｘｙｆｌａｖｏｎｅ−４’−β−Ｄ−ｇａｌａｃｔｏｐｙｒａｎｏｓｉｄｅ（ＤＨＦ−Ｇａｌ）、及び６−Ｏ−β−ｇａｌａｃｔｏｐｙｒａｎｏｓｙｌ−ｌｕｃｉｆｅｒｉｎ（Ｌｕｃ−Ｇａｌ）を用い、ＯＮＰＧは４２０ｎｍ、ＤＨＦ−Ｇａｌは６２０ｎｍにおいて上記同様の分光光度計を用い、Ｌｕｃ−Ｇａｌはルミテスター Ｋ−２００（商品名、キッコーマン社製）を用いて発色又は発光を定量化した。
その結果、β−ガラクトシダーゼにより発色するＯＮＰＧ、ＤＨＦ−Ｇａｌの発色よりも、β−ガラクトシダーゼにより発光するＬｕｃ−Ｇａｌにおいて安定した発光が得られた。Ｌｕｃ−Ｇａｌの定量結果を図５に示す。
図５の結果から、Ｌｕｃ−Ｇａｌを検出化合物として用いた場合、トルエン濃度が０．００１ｍｇ／Ｌと非常に低濃度であっても、発光が確認できることが分かった。また、その発光量は、トルエン濃度が０．０１〜１ｍｇ／Ｌの範囲でトルエン濃度に比例して強くなり、定量が可能であることが確認できた。
これらの結果から、嫌気性細菌にベクターを導入した形質転換体と、レポータータンパク質により発色又は発光する水溶性部位を有する検出化合物とを用いることで、試料中のトルエンの有無を検出できるのみならず、トルエン含有量を定量できることが確認できた。
本発明のトルエン検出方法によれば、地下水や土壌等のトルエンを安価且つ簡便に検出や定量することができるため、環境分野において好適に利用することができる。
Claims (5)
- 嫌気性細菌にベクターを導入し、形質転換体を作製する工程と、
前記形質転換体と、レポータータンパク質により発色又は発光する水溶性部位を有する検出化合物とを用いて、試料中のトルエン含有量を定量する工程とを有するトルエン検出方法であって、
前記ベクターは、トルエン分解酵素活性を有するタンパク質をコードする遺伝子と、その下流に位置し、レポータータンパク質をコードする遺伝子とが組み込まれたものであることを特徴とするトルエン検出方法。 - 前記嫌気性細菌が、Ａｚｏａｒｃｕｓ ｓｐ．（アゾアルカス・スピーシーズ）であることを特徴とする請求項１に記載のトルエン検出方法。
- 前記嫌気性細菌及び形質転換体が、Ｄ−リボース、Ｔｗｅｅｎ８０、Ｄ−アラビノース、Ｌ−アラビノース、Ｄ−キシロース、Ｄ−プシコース、α−ケドグルタル酸、マンノース、Ｄ−タガトース、Ｄ−フルクトース−６−リン酸、グルクロンアミド、Ｄ−フルクトース、ラムノース、Ｄ−ガラクトース、Ｄ−グルクロン酸、グリセロール、乳酸、酵母抽出液、カサミノ酸、ＮＢブロス、及びＬＢブロスからなる群から選ばれる１種以上を含む培地で培養されることを特徴とする請求項１又は２に記載のトルエン検出方法。
- 前記レポータータンパク質がβ−ガラクトシダーゼであり、前記検出化合物が、ルシフェラーゼを含む検出化合物であることを特徴とする請求項１〜３のいずれか一項に記載のトルエン検出方法。
- 前記嫌気性細菌へのベクターの導入を、接合伝達法を用いて行うことを特徴とする請求項１〜４のいずれか一項に記載のトルエン検出方法。
Priority Applications (1)
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| Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
|---|---|---|---|---|
| JP2015533128A (ja) * | 2012-10-11 | 2015-11-19 | アーマロン バイオ ピーティーワイ リミテッド | 新規フラボノイド化合物およびその使用 |
-
2010
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|---|---|---|---|---|
| JP2015533128A (ja) * | 2012-10-11 | 2015-11-19 | アーマロン バイオ ピーティーワイ リミテッド | 新規フラボノイド化合物およびその使用 |
| JP2018184414A (ja) * | 2012-10-11 | 2018-11-22 | アーマロン バイオ ピーティーワイ リミテッド | 新規フラボノイド化合物およびその使用 |
| US10316053B2 (en) | 2012-10-11 | 2019-06-11 | Armaron Bio Pty Ltd | Flavonoid compounds and uses thereof |
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