JP2012044869A - Mutant lipase and application thereof - Google Patents

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Abstract

PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a mutant lipase having excellent stability; to provide a method for producing an oils-and-fats degradation product by using the mutant lipase; and to provide a method for using the degradation product.SOLUTION: A mutant lipase produced by introducing a mutation for increasing the stability of an enzyme into a lipase produced by a microorganism belonging to the genus Cryptococcus, Gibberella, Ustilago or the like is allowed to act on oils-and-fats to produce glycerol and the like. An L-amino acid such as L-lysine, L-threonine or L-tryptophan is produced through a fermentation process using, as a carbon source, the glycerol or the like.

Description

本発明は、優れた安定性を有する変異型リパーゼの製造方法等に関する。   The present invention relates to a method for producing a mutant lipase having excellent stability.

現在、大量に消費されている石油燃料の代表的なものとしてディーゼルオイルがあり、ディーゼル車、船舶、発電機等の産業用のエンジンに使用されている。しかし、近年、化石燃料の需要と供給のバランスが逼迫し、原油の価格が高騰している。更に、国際的な地球環境問題解決の取り組みの一環として、地球温暖化の主な原因とされる化石燃料起源の二酸化炭素の削減が、危急的な目標となっている。そこで、非化石燃料の開発に力が注がれ、特にヨーロッパ諸国では、ディーゼルエンジン用、もしくはガソリンエンジン用に植物油が用いられるようになってきている。植物性油や動物性脂をメタノールと反応させメチルエステル化したものは、バイオディーゼルと呼ばれ、軽油などの代替燃料として使用されている。ヨーロッパ諸国では、主に菜種を中心にバイオディーゼルオイルが製造されている一方、米国では大豆、東南アジアではパーム油などが原料として用いられている。また、廃油やひまわりなども活用されている。   Currently, diesel oil is a representative example of petroleum fuel that is consumed in large quantities, and is used in industrial engines such as diesel cars, ships, and generators. However, in recent years, the balance between supply and demand for fossil fuels has been tight, and the price of crude oil has soared. Furthermore, as part of efforts to solve global environmental problems, the reduction of carbon dioxide originating from fossil fuels, which is a major cause of global warming, has become an urgent goal. Thus, efforts are being made to develop non-fossil fuels, and in particular in European countries, vegetable oil has been used for diesel engines or gasoline engines. A product obtained by reacting vegetable oil or animal fat with methanol to form a methyl ester is called biodiesel and is used as an alternative fuel such as light oil. In European countries, biodiesel oil is mainly produced mainly from rapeseed, while soybean is used as a raw material in the United States and palm oil is used in Southeast Asia. Waste oil and sunflower are also used.

バイオディーゼル燃料生産には現在、アルカリ触媒を用いた化学触媒法が利用されている。しかし、副産物であるグリセロールの回収が困難である上、バイオディーゼルに含まれる不純物が多いなど課題を抱えている。そこで、リパーゼを用いた油脂の酵素分解とメチルエステル化によってバイオディーゼルを生成させる試みが行われている。   Currently, a chemical catalyst method using an alkali catalyst is used for biodiesel fuel production. However, it is difficult to recover glycerol, which is a by-product, and there are problems such as many impurities contained in biodiesel. Therefore, attempts have been made to produce biodiesel by enzymatic degradation and methyl esterification of fats and oils using lipase.

リパーゼとは、脂質を基質としてそのエステル結合を加水分解する酵素である。主に消化液(胃液、膵液)に含まれ脂質の消化を行う消化酵素であり、多くの生物の細胞で脂質の代謝に関与する。リパーゼは多くの生物に存在し、その遺伝子は一部のウイルスにもある。機能も立体構造もさまざまであるが、活性中心にセリン、アスパラギン酸、ヒスチジンを持つものが多い。基質のエステル結合を分解すると同時に逆反応(エステル合成)にも働くことから、人工的なエステル合成・交換反応にも用いられている。   Lipase is an enzyme that hydrolyzes its ester bond using lipid as a substrate. It is a digestive enzyme that digests lipids mainly in digestive juices (gastric juice and pancreatic juice), and is involved in lipid metabolism in cells of many organisms. Lipases are present in many organisms and their genes are also found in some viruses. There are various functions and three-dimensional structures, but many have serine, aspartic acid, and histidine at the active center. It is also used in artificial ester synthesis and exchange reactions because it breaks down the ester bond of the substrate and also works in reverse reactions (ester synthesis).

前記したように、リパーゼを用いて油脂を処理し、バイオディーゼルとグリセロールを生成させることはすでに報告されているが、アルカリ触媒法に比べ酵素の価格が高く実用化に至っていない。そこで、酵素の価格を抑制するために、酵素を改質し活性や安定性を向上させる研究が行われている。例えば、Phage Display法によるBacillus subtilis lipase Aの改変(非特許文献1、2)、DNA shufflingによる活性と安定性の改善(非特許文献3)、CALB法によC.antactica Lipase Bの改変(非特許文献4、5)、CAST法によるPseudomonas aeruginosa lipaseの改変(非特許文献6)などが挙げられる。また、反応プロセスを改善するために、メタノールを反応液に徐々に滴下することによって酵素の失活を抑制する方法(非特許文献7)や、酵母の細胞表面にリパーゼを提示させる方法(非特許文献7、8)なども開発されている。   As described above, it has already been reported that fats and oils are treated with lipase to produce biodiesel and glycerol, but the enzyme is expensive compared to the alkali catalyst method and has not been put into practical use. Therefore, in order to suppress the price of the enzyme, research has been conducted to improve the activity and stability by modifying the enzyme. For example, modification of Bacillus subtilis lipase A by Phage Display method (Non-patent Documents 1 and 2), improvement of activity and stability by DNA shuffling (Non-patent Document 3), modification of C. antactica Lipase B by CALB method (non-patent document 3) Examples thereof include Patent Documents 4 and 5), modification of Pseudomonas aeruginosa lipase by CAST method (Non-Patent Document 6), and the like. In addition, in order to improve the reaction process, a method of suppressing enzyme inactivation by gradually dropping methanol into the reaction solution (Non-patent Document 7), or a method of presenting lipase on the cell surface of yeast (Non-patent Document) Documents 7 and 8) have also been developed.

ところが、このような技術蓄積にも関わらず、酵素を用いたバイオディーゼルの生産コストは未だアルカリ触媒法には及ばず、更なる製法の改善が求められている。このような背景のもと、独立行政法人酒類総合研究所にて新規のリパーゼが報告され、同リパーゼを用いて油脂からバイオディーゼルを生成させることが立証された(特許文献1)。
特許第3507860号 Droge et al., ChemBioChem, 2006, 7:149-157. Danielsen et al., Gene, 2001, 272:267-274. Suen et al., Protein Eng. Design & Selection, 2004, 17:133-140 Qian et al., J. Amer. Chem.Soc., 2005, 127:13466-13467. Zhang et al., Protein Eng., 2003, 16:599-605 Reets et al., Angew. Chem. Int. Ed., 2005, 44:4192-4196. Fukuda et al., J. Biosci. Bioeng., 2001, 92:405-416. Shiraga et al., Appl. Environ. Microbiol., 2005, 71:4335-4338.
However, despite the accumulation of such technology, the production cost of biodiesel using enzymes is still not as high as that of the alkali catalyst method, and further improvement of the production method is required. Against this background, a new lipase was reported at the National Research Institute for Liquors, and it was proved that biodiesel was produced from fats and oils using the lipase (Patent Document 1).
Patent No. 3507860 Droge et al., ChemBioChem, 2006, 7: 149-157. Danielsen et al., Gene, 2001, 272: 267-274. Suen et al., Protein Eng. Design & Selection, 2004, 17: 133-140 Qian et al., J. Amer. Chem. Soc., 2005, 127: 13466-13467. Zhang et al., Protein Eng., 2003, 16: 599-605 Reets et al., Angew. Chem. Int. Ed., 2005, 44: 4192-4196. Fukuda et al., J. Biosci. Bioeng., 2001, 92: 405-416. Shiraga et al., Appl. Environ. Microbiol., 2005, 71: 4335-4338.

本発明の目的は、油脂分解に適した安定性の優れたリパーゼを提供すること、およびこの変異型リパーゼを用いた油脂の分解物の製造法、および分解物の利用方法を提供することである。   An object of the present invention is to provide a lipase with excellent stability suitable for oil degradation, and to provide a method for producing a degradation product of fats and oils using the mutant lipase, and a method for using the degradation product. .

本発明者らは、前記新規酵素の改変体を作製し、安定性を向上させることによって、バイオディーゼル生成に要するコストの削減を目指した。また、副生するグリセロールを炭素源としてアミノ酸や核酸の生産へと転用したり、更には油脂を分解したときに生成する脂肪酸をも同時にアミノ酸生産に活用することができれば、植物原料の有効利用となると考えた。そして、鋭意研究を重ねた結果、野生型リパーゼよりも高い安定性を示すリパーゼ改変体を作製することに成功した。   The present inventors aimed to reduce the cost required for biodiesel production by preparing a modified form of the novel enzyme and improving its stability. In addition, if glycerol produced as a by-product is used as a carbon source for the production of amino acids and nucleic acids, and if fatty acids produced when oils and fats are decomposed can also be used for amino acid production at the same time, effective use of plant raw materials will be possible. I thought. As a result of extensive research, we succeeded in producing a modified lipase exhibiting higher stability than wild-type lipase.

すなわち、本発明は以下のとおりである。   That is, the present invention is as follows.

(1)配列番号7のアミノ酸配列、又は配列番号7において1若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、付加、又は逆位を含むアミノ酸配列を有し、かつ、下記(a)〜(q)から選択される変異を含む、変異型リパーゼ。
(a)32位のグリシンが他のアミノ酸残基に置換される変異
(b)50位のチロシンが他のアミノ酸残基に置換される変異
(c)95位のアラニンが他のアミノ酸残基に置換される変異
(d)126位のリジンが他のアミノ酸残基に置換される変異
(e)131位のシステインが他のアミノ酸残基に置換される変異
(f)133位のバリンが他のアミノ酸残基に置換される変異
(g)153位のグリシンが他のアミノ酸残基に置換される変異
(h)164位のロイシンが他のアミノ酸残基に置換される変異
(i)7位のXがアラニンであって、このアラニンが他のアミノ酸残基に置換される変異(j)42位のXがアラニンであって、このアラニンが他のアミノ酸残基に置換される変異
(k)83位のXがバリンであって、このバリンが他のアミノ酸残基に置換される変異
(l)88位のXがグルタミンであって、このグルタミンが他のアミノ酸残基に置換される変異
(m)154位のXがセリンであって、このセリンが他のアミノ酸残基に置換される変異(n)177位のXがアラニンであって、このアラニンが他のアミノ酸残基に置換される変異
(o)203位のXがアラニンであって、このアラニンが他のアミノ酸残基に置換される変異
(p)206位のXがリジンであって、このリジンが他のアミノ酸残基に置換される変異(q)209位のXがグリシンであって、このグリシンが他のアミノ酸残基に置換される変異
(2)前記(a)〜(q)の変異が、それぞれ下記(A)から(Q)の変異である、前記変異型リパーゼ。
(A)32位のグリシンがアスパラギン酸に置換される変異
(B)50位のチロシンがアスパラギンに置換される変異
(C)95位のアラニンがアスパラギン酸に置換される変異
(D)126位のリジンがイソロイシンに置換される変異
(E)131位のシステインがセリン、トレオニン、イソロイシン、及びロイシンから選択されるアミノ酸残基に置換される変異
(F)133位のバリンがリジンに置換される変異
(G)153位のグリシンがプロリンに置換される変異
(H)164位のロイシンがグルタミンに置換される変異
(I)7位のアラニンがプロリンに置換される変異
(J)42位のアラニンがグルタミンに置換される変異
(K)83位のバリンがグルタミンに置換される変異
(L)88位のグルタミンがアスパラギンに置換される変異
(M)154位のセリンがイソロイシンに置換される変異
(N)177位のアラニンがプロリンに置換される変異
(O)203位のアラニンがロイシンに置換される変異
(P)206位のリジンがグルタミンに置換される変異
(Q)209位のグリシンがプロリンに置換される変異
(3)前記(a)〜(q)から選択される変異が、前記(d)、(e)、(f)又は(o)の変異である、前記変異型リパーゼ。
(4)前記(d)、(e)、(f)又は(o)の変異が、前記(D)、(E)、(F)又は(O)の変異である、前記変異型リパーゼ。
(5)前記変異を有しないリパーゼが、下記(I)又は(II)のタンパク質である、前記変異型リパーゼ。
(I)配列番号2、4、又は6に記載のアミノ酸配列を有するタンパク質。
(II)配列表の配列番号2、4、又は6に記載のアミノ酸配列において、1若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、付加、又は逆位を含むアミノ酸配列からなり、かつ、リパーゼ活性を有するタンパク質。
(6)前記変異型リパーゼをコードするDNA。
(7)下記(i)又は(ii)の塩基配列を有し、かつ、前記アミノ酸配列における変異に相当する変異を有する前記DNA。
(i)配列番号1、3、又は5に記載の塩基配列。
(ii)配列表の配列番号1、3、又は5に記載の塩基配列又は該配列から調製され得るプローブと、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズする配列。
(8)前記DNAを含む形質転換微生物。
(9)前記形質転換微生物がエシェリヒア・コリである前記微生物。
(10)前記形質転換微生物を培地中で培養し、培地中および/または微生物中に前記変異型リパーゼを蓄積させることを特徴とする、変異型リパーゼの製造方法。
(11)前記変異型リパーゼを油脂に作用させて、グリセロールを生成させることを特徴とする、グリセロールの製造方法。
(12)前記変異型リパーゼを油脂に作用させて、グリセロールを生成させ、生成したグリセロールを炭素源として添加した培地で、グリセロール資化能を有し、かつ、目的物質を産生する微生物を培養し、目的物質を培養物中から採取する、目的物質の製造方法。
(13)前記変異型リパーゼを油脂に作用させて、グリセロール及び脂肪酸を生成させ、生成したグリセロール及び脂肪酸を炭素源として添加した培地で、グリセロール及び脂肪酸の資化能を有し、かつ、目的物質を産生する微生物を培養し、目的物質を培養物中から採取する、目的物質の製造方法。
(14)前記微生物が、コリネ型細菌、及び腸内細菌科に属する微生物から選択される細菌である前記方法。
(15)前記目的物質がL−アミノ酸である、前記方法。
(16)前記L−アミノ酸が、L−リジン、L−スレオニン、及びL−トリプトファンか
ら選択される前記方法。
(1) It has an amino acid sequence of SEQ ID NO: 7 or an amino acid sequence containing substitution, deletion, insertion, addition, or inversion of one or several amino acids in SEQ ID NO: 7, and the following (a) to ( A mutant lipase comprising a mutation selected from q).
(A) Mutation in which glycine at position 32 is replaced with another amino acid residue (b) Mutation in which tyrosine at position 50 is replaced with another amino acid residue (c) Alanine at position 95 is replaced with another amino acid residue Mutation to be substituted (d) Mutation in which lysine at position 126 is substituted with other amino acid residues (e) Mutation in which cysteine at position 131 is substituted with other amino acid residues (f) Other valine at position 133 Mutation that is substituted with an amino acid residue (g) Mutation that replaces glycine at position 153 with another amino acid residue (h) Mutation that replaces leucine at position 164 with another amino acid residue (i) Position 7 Mutation in which X is alanine and this alanine is substituted with another amino acid residue (j) Mutation in which X at position 42 is alanine and this alanine is substituted with another amino acid residue (k) 83 X of the place is valine, and this valine is other Mutation to be substituted with amino acid residue (l) X at position 88 is glutamine, Mutation to which this glutamine is substituted with other amino acid residue (m) X at position 154 is serine, Mutation that is substituted with another amino acid residue (n) X at position 177 is alanine, and mutation that this alanine is substituted with another amino acid residue (o) X at position 203 is alanine, Mutation in which alanine is substituted with another amino acid residue (p) X at position 206 is lysine, Mutation in which this lysine is substituted with another amino acid residue (q) X at position 209 is glycine The mutation in which the glycine is substituted with another amino acid residue (2) The mutant lipase, wherein the mutations (a) to (q) are the mutations (A) to (Q) below, respectively.
(A) Mutation in which glycine at position 32 is replaced by aspartic acid (B) Mutation in which tyrosine at position 50 is replaced by asparagine (C) Mutation in which alanine at position 95 is replaced by aspartic acid (D) Position 126 Mutation in which lysine is replaced with isoleucine (E) Mutation in which cysteine at position 131 is replaced with an amino acid residue selected from serine, threonine, isoleucine, and leucine (F) Mutation in which valine at position 133 is replaced with lysine (G) Mutation in which glycine at position 153 is replaced with proline (H) Mutation in which leucine at position 164 is replaced with glutamine (I) Mutation in which alanine at position 7 is replaced with proline (J) Alanine at position 42 Mutation substituted with glutamine (K) Mutation where valine at position 83 is replaced with glutamine (L) Glutamine at position 88 is replaced with asparagine Mutation (M) mutation where serine at position 154 is replaced by isoleucine (N) mutation where alanine at position 177 is replaced by proline (O) mutation where alanine at position 203 is replaced by leucine (P) position 206 Mutation in which lysine is substituted with glutamine (Q) Mutation in which glycine at position 209 is substituted with proline (3) Mutations selected from (a) to (q) above are (d), (e), ( The mutant lipase, which is a mutation of f) or (o).
(4) The mutant lipase, wherein the mutation (d), (e), (f) or (o) is the mutation (D), (E), (F) or (O).
(5) The mutant lipase, wherein the lipase having no mutation is a protein of the following (I) or (II).
(I) A protein having the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 2, 4, or 6.
(II) an amino acid sequence described in SEQ ID NO: 2, 4, or 6 in the sequence listing, consisting of an amino acid sequence containing one or several amino acid substitutions, deletions, insertions, additions, or inversions, and a lipase Protein with activity.
(6) DNA encoding the mutant lipase.
(7) The DNA having a base sequence of the following (i) or (ii) and having a mutation corresponding to the mutation in the amino acid sequence.
(I) The nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 1, 3, or 5.
(Ii) A sequence that hybridizes under stringent conditions with the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 1, 3, or 5 in the Sequence Listing or a probe that can be prepared from the sequence.
(8) A transformed microorganism containing the DNA.
(9) The microorganism as described above, wherein the transformed microorganism is Escherichia coli.
(10) A method for producing a mutant lipase, wherein the transformed microorganism is cultured in a medium, and the mutant lipase is accumulated in the medium and / or in the microorganism.
(11) A method for producing glycerol, characterized in that glycerol is produced by allowing the mutant lipase to act on fats and oils.
(12) The mutated lipase is allowed to act on fats and oils to produce glycerol, and a microorganism having the ability to utilize glycerol and producing a target substance is cultured in a medium to which the produced glycerol is added as a carbon source. A method for producing a target substance, wherein the target substance is collected from the culture.
(13) A medium in which the mutated lipase is allowed to act on fats and oils to produce glycerol and fatty acids, and the produced glycerol and fatty acids are added as a carbon source. A method for producing a target substance, comprising culturing a microorganism that produces the target substance and collecting the target substance from the culture.
(14) The method as described above, wherein the microorganism is selected from a coryneform bacterium and a microorganism belonging to the family Enterobacteriaceae.
(15) The method as described above, wherein the target substance is an L-amino acid.
(16) The method as described above, wherein the L-amino acid is selected from L-lysine, L-threonine, and L-tryptophan.

本発明により、安定性に優れた変異型リパーゼが提供される。本発明の変異型リパーゼは、油脂の分解物の製造に好適に使用することができる。本発明により得られる油脂の分解物はグリセロール及び脂肪酸を含み、アミノ酸や核酸等の発酵生産における原料として使用することができる。   According to the present invention, a mutant lipase having excellent stability is provided. The mutant lipase of the present invention can be suitably used for the production of oil and fat degradation products. The decomposition product of fats and oils obtained by the present invention contains glycerol and fatty acids, and can be used as a raw material in fermentation production of amino acids and nucleic acids.

以下、本発明を詳細に説明する。
なお、以下に挙げる種々の遺伝子工学的な技法については、Molecular Cloning, 2nd edition, Cold Spring Harbor press (1989)、細胞工学ハンドブック、黒木登志夫ら編、羊土社(1992)、新遺伝子工学ハンドブック改訂第3版、村松ら編、羊土社(1999)など、多くの標準的な実験マニュアルがあり、これらの文献を参考にすることにより当業者であれば実施可能である。
Hereinafter, the present invention will be described in detail.
Note that the various genetic engineering techniques listed below, Molecular Cloning, 2 nd edition, Cold Spring Harbor press (1989), Cell Technology Handbook, Toshio Kuroki et al., Eds., Yodosha (1992), New Genetic Engineering Handbook There are many standard experimental manuals such as the revised third edition, edited by Muramatsu et al., Yochisha (1999), and those skilled in the art can implement them by referring to these documents.

本明細書におけるアミノ酸、ペプチド、核酸、塩基配列などの略号による表示は、IUPAC(International Union of Pure and Applied Chemistry)またはIUBMB(International
Union of Biochemistry and Molecular Biology)による規定、「塩基配列又はアミノ酸配列を含む明細書等の作成のためのガイドライン」(日本国特許庁編)、「Standard for
the presentation of nucleotide and amino acid sequence listings in patent applications」(WIPO Standard ST.25)、および当該分野における慣用記号に従うものとする。
The abbreviations such as amino acids, peptides, nucleic acids, and base sequences in this specification are represented by IUPAC (International Union of Pure and Applied Chemistry) or IUBMB (International
Regulations by the Union of Biochemistry and Molecular Biology), “Guidelines for the creation of specifications including base sequences or amino acid sequences” (edited by the Japan Patent Office), “Standard for
The presentation of nucleotide and amino acid sequence listings in patent applications "(WIPO Standard ST.25), and common symbols in the field.

1.本発明のリパーゼ
本発明のリパーゼは、クリプトコッカス属由来のリパーゼ、例えCryptococcus sp.S-2が産生するリパーゼ、及びそれと一次構造が類似するリパーゼであって、さらに特定の変異を有する変異型リパーゼである。以下、本発明の変異型のリパーゼと区別して、本発明の変異型リパーゼが持つ変異を有しないリパーゼを、野生型のリパーゼと呼ぶことがある。尚、前記特定の変異以外の変異を有するものであって、特定の変異を有しないリパーゼは、本発明にいう野生型リパーゼである。
1. Lipase of the present invention The lipase of the present invention is a lipase derived from Cryptococcus genus, for example, a lipase produced by Cryptococcus sp. S-2, and a lipase having a primary structure similar to that, and a mutant lipase having a specific mutation. is there. Hereinafter, the lipase having no mutation of the mutant lipase of the present invention is sometimes referred to as a wild-type lipase, as distinguished from the mutant lipase of the present invention. The lipase having a mutation other than the specific mutation and having no specific mutation is the wild-type lipase referred to in the present invention.

本発明においてリパーゼとは、油脂分解性を有し、油脂に作用して、グリセロールと脂肪酸に加水分解する酵素であり、トリアシルグリセロール リパーゼ(triacylglycerol lipase)、トリアシルグリセリド リパーゼ(triacylglyceride lipase)とも呼ばれる。油脂は、脂肪酸とグリセロールのエステルであり、トリグリセリドとも呼ばれる。また、リパーゼは、メタノールなどのアルコール存在下では、油脂とアルコールのエステル交換反応を触媒し、脂肪酸エステルを生成する(Jaeger, K. E. and Eggert, T. 2002. Curr. Opin. Biotechnol. 13: 390-397)。ここで、油脂の分解活性とは、前記のようにトリグリセリドに作用して、グリセロールと脂肪酸に加水分解する活性及び、エステル交換反応によって脂肪酸エステルとグリセロールを生成する活性を含む。リパーゼの基質となる油脂を構成する脂肪酸の長さは特に制限されず、その長さに応じて、分解により生成する脂肪酸又は脂肪酸エステルの長さは異なる。   In the present invention, lipase is an enzyme that has oil-degradability and acts on oil to hydrolyze into glycerol and fatty acid, and is also called triacylglycerol lipase or triacylglyceride lipase. . Fats and oils are esters of fatty acids and glycerol, also called triglycerides. Lipase catalyzes the transesterification reaction between fat and alcohol in the presence of alcohol such as methanol to produce fatty acid ester (Jaeger, KE and Eggert, T. 2002. Curr. Opin. Biotechnol. 13: 390- 397). Here, the oil and fat decomposition activity includes the activity of acting on triglycerides to hydrolyze into glycerol and fatty acids as described above, and the activity of generating fatty acid esters and glycerol by transesterification. The length of the fatty acid that constitutes the fat and oil serving as the lipase substrate is not particularly limited, and the length of the fatty acid or fatty acid ester generated by decomposition varies depending on the length.

本発明の変異型リパーゼは、野生型リパーゼに、前記特定の変異を導入することにより、得ることができる。本発明における野生型リパーゼは、これら上記の反応を触媒するリパーゼであって、前記特定の変異を導入することによって、酵素活性が上昇するものであれば、どのような種由来のリパーゼも用いることが可能である。野生型リパーゼとしてより具体的には、配列番号7に示すアミノ酸配列を有するリパーゼが挙げられる。また、野生型リパーゼは、配列番号7において、1若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、
付加、又は逆位を含むアミノ酸配列を有するリパーゼであってもよい。
The mutant lipase of the present invention can be obtained by introducing the specific mutation into a wild type lipase. The wild-type lipase in the present invention is a lipase that catalyzes the above-mentioned reactions, and any lipase derived from any species can be used as long as the enzyme activity is increased by introducing the specific mutation. Is possible. More specifically, examples of the wild-type lipase include a lipase having the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 7. The wild-type lipase is a substitution, deletion, insertion of one or several amino acids in SEQ ID NO: 7,
It may be a lipase having an amino acid sequence containing an addition or inversion.

上記のような野生型リパーゼとしては、特に酵母であるクリプトコッカス属あるいはその近縁種や、Gibberella属、またはUstilago属のリパーゼが好ましい。
例えばクリプトコッカス属としては、以下の微生物が挙げられる。
Cryptococcus neoformans JEC21
Cryptococcus neoformans B-3501A
Cryptococcus sp.S-2 (FERM P-15155) (特許3507860号公報)
Filobasidiella depauperata
Cryptococcus albidus
Cryptococcus terreus
Cryptococcus uniguttulatus
Cryptococcus gastricus
Cryptococcus amylolentus
Cryptococcus bacillisporus
Cryptococcus sp. N6
Cryptococcus neoformans A
Cryptococcus neoformans A/D
Cryptococcus neoformans var. grubii H99
Cryptococcus allantoinivorans
Cryptococcus amylolyticus
Cryptococcus aff. amylolyticus AS 2.2398
Cryptococcus aff. amylolyticus AS 2.2439
Cryptococcus aff. amylolyticus AS 2.2501
Cryptococcus armeniacus
Cryptococcus aureus
Cryptococcus cf. aureus NRRL Y-30213
Cryptococcus cf. aureus NRRL Y-30215
Cryptococcus bestiolae
Cryptococcus carnescens
Cryptococcus cellulolyticus
Cryptococcus cistialbidi
Cryptococcus dejecticola
Cryptococcus dimennae
Cryptococcus fagi
Cryptococcus festucosus
Cryptococcus flavescens
Cryptococcus cf. flavescens CBS 4926
Cryptococcus flavus
Cryptococcus foliicola
Cryptococcus heimaeyensis
Cryptococcus heveanensis
Cryptococcus laurentii
Cryptococcus aff. laurentii A48
Cryptococcus aff. laurentii A57
Cryptococcus aff. laurentii CBS 9007
Cryptococcus aff. laurentii D-072.1a.1
Cryptococcus aff. laurentii SJ008
Cryptococcus luteolus
Cryptococcus cf. luteolus BSR92Y5
Cryptococcus marinus
Cryptococcus nemorosus
Cryptococcus nyarrowii
Cryptococcus paraflavus
Cryptococcus peneaus
Cryptococcus perniciosus
Cryptococcus podzolicus
Cryptococcus rajasthanensis
Cryptococcus skinneri
Cryptococcus statzelliae
Cryptococcus surugaensis
Cryptococcus taibaiensis
Cryptococcus tephrensis
Cryptococcus victoriae
Cryptococcus aff. victoriae CBS 8979
Cryptococcus aff. victoriae CBS 8993
Cryptococcus aff. victoriae CBS 8999
Cryptococcus aff. victoriae CBS 9012
Cryptococcus aff. victoriae CBS 9013
Cryptococcus aff. victoriae CBS 9023
Cryptococcus aff. victoriae CBS 9024
Cryptococcus aff. victoriae CBS 9025
Cryptococcus watticus
Cryptococcus zeae
Cryptococcus sp. 3-12
Cryptococcus sp. Aspoy5E
Cryptococcus sp. AspoyC
Cryptococcus sp. AST-2007a
Cryptococcus sp. BC23
Cryptococcus sp. BC25
Cryptococcus sp. BC28
Cryptococcus sp. BC43
Cryptococcus sp. BI20
Cryptococcus sp. BSR92 Y71
Cryptococcus sp. Car95 Y15
Cryptococcus sp. CBS 10258
Cryptococcus sp. CBS 2993
Cryptococcus sp. CBS 6024
Cryptococcus sp. CBS 6123
Cryptococcus sp. CBS 6578
Cryptococcus sp. CBS 681.93
Cryptococcus sp. CBS 7712
Cryptococcus sp. CBS 7713
Cryptococcus sp. CBS 7743
Cryptococcus sp. CBS 7890
Cryptococcus sp. CBS 8016
Cryptococcus sp. CBS 8024
Cryptococcus sp. CBS 8355
Cryptococcus sp. CBS 8356
Cryptococcus sp. CBS 8358
Cryptococcus sp. CBS 8363
Cryptococcus sp. CBS 8364
Cryptococcus sp. CBS 8365
Cryptococcus sp. CBS 8366
Cryptococcus sp. CBS 8367
Cryptococcus sp. CBS 8368
Cryptococcus sp. CBS 8369
Cryptococcus sp. CBS 8372
Cryptococcus sp. CECT 11955
Cryptococcus sp. CJDX4-Y23
Cryptococcus sp. CJDX4-Y8
Cryptococcus sp. CN2005a
Cryptococcus sp. CRUB 1230
Cryptococcus sp. CSDX3-Y1
Cryptococcus sp. F6
Cryptococcus sp. FYB-2007a
Cryptococcus sp. HB 1222
Cryptococcus sp. HB1042
Cryptococcus sp. HB1048
Cryptococcus sp. HB1052
Cryptococcus sp. HB1104
Cryptococcus sp. HB1122
Cryptococcus sp. HB1134
Cryptococcus sp. HB1144
Cryptococcus sp. HB1155
Cryptococcus sp. HB1160
Cryptococcus sp. HB1163
Cryptococcus sp. HB946
Cryptococcus sp. HB953
Cryptococcus sp. HX-2006a
Cryptococcus sp. HX-2006b
Cryptococcus sp. HX-2006c
Cryptococcus sp. JCM 11356
Cryptococcus sp. KCTC 17061
Cryptococcus sp. KCTC 17062
Cryptococcus sp. KCTC 17063
Cryptococcus sp. KCTC 17064
Cryptococcus sp. KCTC 17065
Cryptococcus sp. KCTC 17066
Cryptococcus sp. KCTC 17067
Cryptococcus sp. KCTC 17068
Cryptococcus sp. KCTC 17069
Cryptococcus sp. KCTC 17070
Cryptococcus sp. KCTC 17071
Cryptococcus sp. KCTC 17072
Cryptococcus sp. KCTC 17073
Cryptococcus sp. KCTC 17074
Cryptococcus sp. KCTC 17075
Cryptococcus sp. KCTC 17076
Cryptococcus sp. KCTC 17077
Cryptococcus sp. KCTC 17078
Cryptococcus sp. KCTC 17079
Cryptococcus sp. LoBar95 Y19
Cryptococcus sp. LoBar95-Y3
Cryptococcus sp. RC93-2B-Y12
Cryptococcus sp. SJ196
Cryptococcus sp. SM13S04
Cryptococcus sp. SS-1727
Cryptococcus sp. SS1
Cryptococcus sp. ST-111
Cryptococcus sp. ST-201
Cryptococcus sp. ST-71
Cryptococcus sp. ST-73
Cryptococcus sp. T-11
Cryptococcus sp. T-26
Cryptococcus sp. YS NB5
Cryptococcus sp. YY1
As the wild-type lipase as described above, a lipase of the genus Cryptococcus or its related species, Gibberella genus, or Ustilago genus, which is a yeast, is particularly preferable.
Examples of the genus Cryptococcus include the following microorganisms.
Cryptococcus neoformans JEC21
Cryptococcus neoformans B-3501A
Cryptococcus sp.S-2 (FERM P-15155) (Patent No. 3507860)
Filobasidiella depauperata
Cryptococcus albidus
Cryptococcus terreus
Cryptococcus uniguttulatus
Cryptococcus gastricus
Cryptococcus amylolentus
Cryptococcus bacillisporus
Cryptococcus sp. N6
Cryptococcus neoformans A
Cryptococcus neoformans A / D
Cryptococcus neoformans var.grubii H99
Cryptococcus allantoinivorans
Cryptococcus amylolyticus
Cryptococcus aff.amylolyticus AS 2.2398
Cryptococcus aff.amylolyticus AS 2.2439
Cryptococcus aff.amylolyticus AS 2.2501
Cryptococcus armeniacus
Cryptococcus aureus
Cryptococcus cf. aureus NRRL Y-30213
Cryptococcus cf. aureus NRRL Y-30215
Cryptococcus bestiolae
Cryptococcus carnescens
Cryptococcus cellulolyticus
Cryptococcus cistialbidi
Cryptococcus dejecticola
Cryptococcus dimennae
Cryptococcus fagi
Cryptococcus festucosus
Cryptococcus flavescens
Cryptococcus cf.flavescens CBS 4926
Cryptococcus flavus
Cryptococcus foliicola
Cryptococcus heimaeyensis
Cryptococcus heveanensis
Cryptococcus laurentii
Cryptococcus aff. Laurentii A48
Cryptococcus aff. Laurentii A57
Cryptococcus aff. Laurentii CBS 9007
Cryptococcus aff.laurentii D-072.1a.1
Cryptococcus aff. Laurentii SJ008
Cryptococcus luteolus
Cryptococcus cf. luteolus BSR92Y5
Cryptococcus marinus
Cryptococcus nemorosus
Cryptococcus nyarrowii
Cryptococcus paraflavus
Cryptococcus peneaus
Cryptococcus perniciosus
Cryptococcus podzolicus
Cryptococcus rajasthanensis
Cryptococcus skinneri
Cryptococcus statzelliae
Cryptococcus surugaensis
Cryptococcus taibaiensis
Cryptococcus tephrensis
Cryptococcus victoriae
Cryptococcus aff.victoriae CBS 8979
Cryptococcus aff.victoriae CBS 8993
Cryptococcus aff.victoriae CBS 8999
Cryptococcus aff.victoriae CBS 9012
Cryptococcus aff.victoriae CBS 9013
Cryptococcus aff.victoriae CBS 9023
Cryptococcus aff.victoriae CBS 9024
Cryptococcus aff.victoriae CBS 9025
Cryptococcus watticus
Cryptococcus zeae
Cryptococcus sp. 3-12
Cryptococcus sp. Aspoy5E
Cryptococcus sp. AspoyC
Cryptococcus sp.AST-2007a
Cryptococcus sp. BC23
Cryptococcus sp. BC25
Cryptococcus sp. BC28
Cryptococcus sp. BC43
Cryptococcus sp.BI20
Cryptococcus sp. BSR92 Y71
Cryptococcus sp. Car95 Y15
Cryptococcus sp. CBS 10258
Cryptococcus sp. CBS 2993
Cryptococcus sp. CBS 6024
Cryptococcus sp. CBS 6123
Cryptococcus sp. CBS 6578
Cryptococcus sp. CBS 681.93
Cryptococcus sp. CBS 7712
Cryptococcus sp. CBS 7713
Cryptococcus sp. CBS 7743
Cryptococcus sp. CBS 7890
Cryptococcus sp. CBS 8016
Cryptococcus sp. CBS 8024
Cryptococcus sp. CBS 8355
Cryptococcus sp. CBS 8356
Cryptococcus sp. CBS 8358
Cryptococcus sp. CBS 8363
Cryptococcus sp. CBS 8364
Cryptococcus sp. CBS 8365
Cryptococcus sp. CBS 8366
Cryptococcus sp. CBS 8367
Cryptococcus sp. CBS 8368
Cryptococcus sp. CBS 8369
Cryptococcus sp. CBS 8372
Cryptococcus sp. CECT 11955
Cryptococcus sp. CJDX4-Y23
Cryptococcus sp. CJDX4-Y8
Cryptococcus sp. CN2005a
Cryptococcus sp. CRUB 1230
Cryptococcus sp. CSDX3-Y1
Cryptococcus sp. F6
Cryptococcus sp. FYB-2007a
Cryptococcus sp. HB 1222
Cryptococcus sp.HB1042
Cryptococcus sp.HB1048
Cryptococcus sp.HB1052
Cryptococcus sp.HB1104
Cryptococcus sp.HB1122
Cryptococcus sp.HB1134
Cryptococcus sp.HB1144
Cryptococcus sp.HB1155
Cryptococcus sp.HB1160
Cryptococcus sp.HB1163
Cryptococcus sp.HB946
Cryptococcus sp.HB953
Cryptococcus sp. HX-2006a
Cryptococcus sp. HX-2006b
Cryptococcus sp. HX-2006c
Cryptococcus sp. JCM 11356
Cryptococcus sp.KCTC 17061
Cryptococcus sp.KCTC 17062
Cryptococcus sp.KCTC 17063
Cryptococcus sp.KCTC 17064
Cryptococcus sp.KCTC 17065
Cryptococcus sp.KCTC 17066
Cryptococcus sp.KCTC 17067
Cryptococcus sp.KCTC 17068
Cryptococcus sp.KCTC 17069
Cryptococcus sp.KCTC 17070
Cryptococcus sp.KCTC 17071
Cryptococcus sp.KCTC 17072
Cryptococcus sp.KCTC 17073
Cryptococcus sp.KCTC 17074
Cryptococcus sp.KCTC 17075
Cryptococcus sp.KCTC 17076
Cryptococcus sp.KCTC 17077
Cryptococcus sp.KCTC 17078
Cryptococcus sp.KCTC 17079
Cryptococcus sp. LoBar95 Y19
Cryptococcus sp. LoBar95-Y3
Cryptococcus sp.RC93-2B-Y12
Cryptococcus sp. SJ196
Cryptococcus sp. SM13S04
Cryptococcus sp.SS-1727
Cryptococcus sp. SS1
Cryptococcus sp.ST-111
Cryptococcus sp. ST-201
Cryptococcus sp. ST-71
Cryptococcus sp. ST-73
Cryptococcus sp. T-11
Cryptococcus sp. T-26
Cryptococcus sp. YS NB5
Cryptococcus sp. YY1

例えばクリプトコッカス属、特にCryptococcus sp.S-2が産生するリパーゼは以下の理化学的性質を有する。   For example, a lipase produced by Cryptococcus spp., Particularly Cryptococcus sp. S-2, has the following physicochemical properties.

(1)作用
油脂分解性を有し、トリグリセリドに作用して、グリセロールと脂肪酸に加水分解する。
(1) Action It has fat and oil degradability, acts on triglycerides, and hydrolyzes into glycerol and fatty acids.

(2)基質特異性
トリブチリン、トリカプリリン、トリパルミチン、トリオレインをよく分解する。トリアセチン、トリカプリン、トリラウリンは中程度に分解する。トリミリスチン、トリステアリンに対する分解力は弱い。
(2) Substrate specificity Decomposes tribtilin, tricaprylin, tripalmitin and triolein well. Triacetin, tricaprin, and trilaurin are moderately degraded. Degradability against trimyristin and tristearin is weak.

(3)位置特異性
トリオレインに作用せしめると、オレイン酸と少量の1,2(2,3)-ジオレインが生成し、1,3-ジオレインとモノオレインは検出されない。
(3) Regiospecificity When it acts on triolein, oleic acid and a small amount of 1,2 (2,3) -diolein are produced, and 1,3-diolein and monoolein are not detected.

(4)至適pH及び安定pH範囲
至適pH:7.0
安定pH範囲:5〜9
(4) Optimal pH and stable pH range Optimal pH: 7.0
Stable pH range: 5-9

(5)反応最適温度及び温度による失活の条件
反応最適温度:37℃
温度による失活の条件:温度上昇による活性の失活は緩やかであり、60℃、30分の熱処理においても活性を維持するが、60℃、20時間の熱処理でより、活性は20%以下に低下する。
(5) Reaction optimum temperature and temperature deactivation conditions Reaction optimum temperature: 37 ° C
Conditions of deactivation due to temperature: Deactivation of activity due to temperature rise is moderate, and the activity is maintained even after heat treatment at 60 ° C for 30 minutes, but the activity is less than 20% after heat treatment at 60 ° C for 20 hours descend.

(6)有機溶媒に対する安定性、活性化
有機溶媒に安定であり、更にジメチルスルホキシド、ジエチルエーテルによってエステル交換活性が上昇する。
(6) Stability to organic solvent, stable to activated organic solvent, and further increased transesterification activity by dimethyl sulfoxide and diethyl ether.

(7)分子質量
21kDa(Expasy Compute pI/Mw)
(7) Molecular mass
21kDa (Expasy Compute pI / Mw)

このような性質を有するクリプトコッカス属のリパーゼあるいはそれと構造が類似するリパーゼは、特許3507860号に記載の方法と同様の方法で取得することが出来るし、下述するリパーゼをコードする遺伝子配列の相同性を利用しても取得することが出来る。   A lipase of the genus Cryptococcus having such properties or a lipase having a structure similar to that can be obtained by a method similar to the method described in Japanese Patent No. 3507860, and the homology of the gene sequence encoding the lipase described below. You can also get it using.

クリプトコッカス属由来のリパーゼをコードする遺伝子として、Cryptococcus sp.S-2 (FERM P-15155)のリパーゼ遺伝子CS2遺伝子が知られている(特開2004-73123号公報)。本CS2遺伝子の塩基配列を配列番号1に、本CS2遺伝子がコードするリパーゼの前駆体のアミノ酸配列を配列番号2に示す。配列番号2に示すアミノ酸配列において、-30〜-1位はシグナルペプチド、1〜250位は成熟タンパク質に相当すると予想される。Cryptococcus sp.S-2は、1995年9月5日付けで工業技術院生命工学工業技術研究所(現独立行政法人産業
技術総合研究所 特許生物寄託センター)(〒305-5466 日本国茨城県つくば市東1丁目1番地1 中央第6)にFERM P-15155の受託番号で寄託され、2008年4月25日にブダペスト条約に基づく国際寄託に移管され受託番号FERM BP-10961が付与されている。
As a gene encoding a lipase derived from the genus Cryptococcus, the lipase gene CS2 gene of Cryptococcus sp. S-2 (FERM P-15155) is known (Japanese Patent Laid-Open No. 2004-73123). The base sequence of this CS2 gene is shown in SEQ ID NO: 1, and the amino acid sequence of the lipase precursor encoded by this CS2 gene is shown in SEQ ID NO: 2. In the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2, positions -30 to -1 are expected to correspond to a signal peptide, and positions 1 to 250 are expected to correspond to a mature protein. Cryptococcus sp.S-2 is the National Institute of Biotechnology, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (currently the National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, Patent Biological Deposit Center) on September 5, 1995 (Tsukuba, Ibaraki, Japan 305-5466) Deposited at FERM P-15155 under No. 1 at 1-chome, 1-chome, City East, and transferred to an international deposit based on the Budapest Treaty on April 25, 2008, and assigned the accession number FERM BP-10961.

また、本発明においてリパーゼは、上記配列番号1又は2の配列との相同性に基づき、クリプトコッカス属あるいは近縁種の酵母、その他の微生物からクローニングされるリパーゼ遺伝子のホモログであってもよい。アミノ酸配列および塩基配列の相同性は、例えばKarlin および AltschulによるアルゴリズムBLAST(Pro. Natl. Acad. Sci. USA, 90, 5873(1993))やPearsonによるFASTA(MethodsEnzymol., 183, 63 (1990))を用いて決定することができる。このアルゴリズムBLASTに基づいて、BLASTNやBLASTXとよばれるプログラムが開発されている(http://www.ncbi.nlm.nih.gov参照)。また、アミノ酸配列および塩基配列の相同性は、CLUSTALW(Thompson J.D., Higgins D.G. and Gibson T.J. Nucleic Acids Res. 1994, 22:4673-4680)によっても計算することができる。例えば、Cryptococcus sp.S-2のCS2遺伝子と相同性の高い遺伝子として、Gibberella zeae (ジベレラ・ゼアエ)PH-1の遺伝子(Genbank Accession No. gi|42549908|gb|EAA72751.1|[42549908] 、塩基配列:配列番号3、アミノ酸配列:配列番号4)、Ustilago maydis(ウスチラゴ・マイジス)521由来の遺伝子(Genbank Accession No.gi|46096123|gb| EAK81356.1|[46096123]、塩基配列:配列番号5、アミノ酸配列:配列番号6)を利用することが出来る。   In the present invention, the lipase may be a homologue of a lipase gene cloned from a yeast of a genus Cryptococcus or a close species, or other microorganisms based on homology with the sequence of SEQ ID NO: 1 or 2. The homology between the amino acid sequence and the base sequence is, for example, the algorithm BLAST by Karlin and Altschul (Pro. Natl. Acad. Sci. USA, 90, 5873 (1993)) and FASTA by Pearson (Methods Enzymol., 183, 63 (1990)). Can be determined. Based on this algorithm BLAST, programs called BLASTN and BLASTX have been developed (see http://www.ncbi.nlm.nih.gov). The homology between amino acid sequences and base sequences can also be calculated by CLUSTALW (Thompson J.D., Higgins D.G. and Gibson T.J. Nucleic Acids Res. 1994, 22: 4673-4680). For example, as a gene having high homology with the CS2 gene of Cryptococcus sp. S-2, Gibberella zeae PH-1 gene (Genbank Accession No. gi | 42549908 | gb | EAA72751.1 | [42549908] Nucleotide sequence: SEQ ID NO: 3, amino acid sequence: SEQ ID NO: 4), gene derived from Ustilago maydis (Genbank Accession No.gi | 46096123 | gb | EAK81356.1 | [46096123], nucleotide sequence: SEQ ID NO: 5. Amino acid sequence: SEQ ID NO: 6) can be used.

なお、配列番号4においてシグナルペプチドは-19〜-1位、成熟型タンパク質は1〜204位に相当し、配列番号6においてシグナルペプチドは-20〜-1位、成熟型タンパク質は1〜204位に相当すると予想される。
尚、上記各リパーゼにおいて、シグナルペプチド及び成熟タンパク質の位置は、SignalP(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/)を用いて予測した。
In SEQ ID NO: 4, the signal peptide corresponds to positions -19 to -1 and the mature protein corresponds to positions 1 to 204. In SEQ ID NO: 6, the signal peptide corresponds to positions -20 to -1 and the mature protein corresponds to positions 1 to 204. Is expected to correspond to
In each of the above lipases, the positions of the signal peptide and the mature protein were predicted using SignalP (http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP/).

リパーゼ遺伝子のホモログとは、他の微生物由来または天然もしくは人工の変異型遺伝子で、クリプトコッカスのCS2遺伝子と構造が高い類似性を示し、リパーゼ活性を示す遺伝子を意味する。リパーゼ遺伝子のホモログは、配列番号2の1〜205位のアミノ酸配列全体に対して、80%以上、好ましくは90%以上、より好ましくは95%、特に好ましくは98%以上の相同性を有し、かつ、リパーゼの機能を有するタンパク質をコードするものを意味する。なお、リパーゼの機能を有することは、これらの遺伝子を宿主細胞で発現させ、油脂分解能を確認することによって確かめることが出来る。
尚、本明細書において、「相同性」(homology)」は、「同一性」(identity)を指すことがある。
The lipase gene homolog is a gene derived from other microorganisms or a natural or artificial mutant gene, which shows a high similarity in structure to the CS2 gene of cryptococcus and exhibits lipase activity. The homologue of the lipase gene has a homology of 80% or more, preferably 90% or more, more preferably 95%, particularly preferably 98% or more with respect to the entire amino acid sequence at positions 1 to 205 of SEQ ID NO: 2. And a protein encoding a protein having a lipase function. In addition, having a lipase function can be confirmed by expressing these genes in a host cell and confirming the oil / fat resolution.
In the present specification, “homology” may refer to “identity”.

また本発明に使用できるリパーゼは、配列番号1、3、又は5の塩基配列に相補的な塩基配列又は該配列から調製され得るプローブとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするDNAであって、リパーゼとしての機能を有するタンパク質をコードするDNAであってもよい。ここで、「ストリンジェントな条件」とは、いわゆる特異的なハイブリッド
が形成され、非特異的なハイブリッドが形成されない条件をいう。この条件を明確に数値化することは困難であるが、一例を示せば、相同性が高いDNA同士、例えば80%、好ましくは90%以上、より好ましくは95%、特に好ましくは98%以上の相同性を有するDNA同士がハイブリダイズし、それより相同性が低いDNA同士がハイブリダイズしない条件、あるいは通常のサザンハイブリダイゼーションの洗いの条件である60℃、1×SSC,0.1%SDS、好ましくは、0.1×SSC、0.1%SDSさらに好ましくは、68℃、0.1×SSC、0.1%SDSに相当する塩濃度、温度で、1回より好ましくは2〜3回洗浄する条件が挙げられる。
The lipase that can be used in the present invention is a DNA that hybridizes under stringent conditions with a nucleotide sequence complementary to the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1, 3, or 5 or a probe that can be prepared from the nucleotide sequence. It may be a DNA encoding a protein having a function as Here, “stringent conditions” refers to conditions under which so-called specific hybrids are formed and non-specific hybrids are not formed. Although it is difficult to clearly quantify this condition, for example, DNAs with high homology, for example, 80%, preferably 90% or more, more preferably 95%, particularly preferably 98% or more are present. DNAs having homology hybridize to each other, DNAs having lower homology to each other do not hybridize, or normal Southern hybridization washing conditions at 60 ° C., 1 × SSC, 0.1% SDS, Preferably, 0.1 × SSC, 0.1% SDS, more preferably 68 ° C., salt concentration and temperature corresponding to 0.1 × SSC, 0.1% SDS, more preferably 1 to 3 times. The conditions to wash | clean are mentioned.

前記配列番号2、4及び6のアミノ酸配列(成熟タンパク質部分)のアラインメントを、図1に示す。これらの配列の下に、共通配列を示した。共通配列中「X」で示したアミノ酸は、3種のリパーゼで共通していないことを示す。「-」は、その位置にアミノ酸が存在しないことを示す。また、四角形で囲んだアミノ酸は、本発明の変異型リパーゼが持つ変異点を示す。さらに、アスタリスク(*)で示したアミノ酸は、配列番号2に示すCryptococcus sp.S-2のリパーゼに由来する変異型リパーゼの持つ他の変異点を示す。   An alignment of the amino acid sequences of SEQ ID NOs: 2, 4 and 6 (mature protein portion) is shown in FIG. A consensus sequence is shown below these sequences. The amino acid indicated by “X” in the common sequence indicates that it is not common to the three lipases. “-” Indicates that no amino acid is present at that position. In addition, amino acids surrounded by a rectangle indicate a mutation point possessed by the mutant lipase of the present invention. Furthermore, the amino acid indicated by an asterisk (*) indicates another mutation point possessed by the mutant lipase derived from the lipase of Cryptococcus sp. S-2 shown in SEQ ID NO: 2.

上記のように、3種のリパーゼは高い相同性を有している。また、後述するように、Cryptococcus sp.S-2のリパーゼにおいて、リパーゼ活性が上昇する17箇所の変異のうち8箇所は、3種のリパーゼの間でアミノ酸が共通している。したがって、本発明において野生型リパーゼは、配列番号7に示すアミノ酸配列を有するタンパク質として特定することができる。
尚、各リパーゼ成熟タンパク質間の相同性を表すSCOREをCLUSTALWversion1.83により決定したところ、配列番号2と配列番号4では64、配列番号2と配列番号6では58、配列番号4と配列番号6では59であった。
As described above, the three lipases have high homology. Further, as described later, in the lipase of Cryptococcus sp. S-2, 8 out of 17 mutations in which lipase activity is increased, the amino acid is common among the three lipases. Therefore, in the present invention, wild-type lipase can be identified as a protein having the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 7.
When SCORE representing homology between lipase mature proteins was determined by CLUSTALWversion1.83, it was 64 for SEQ ID NO: 2 and SEQ ID NO: 4, 58 for SEQ ID NO: 2 and SEQ ID NO: 6, and for SEQ ID NO: 4 and SEQ ID NO: 6. 59.

2.本発明の変異型リパーゼ
本発明の変異型リパーゼとは、上記のような野生型リパーゼに変異を導入することにより、野生型リパーゼよりさらに安定性が高くなったリパーゼを意味する。安定性とは、熱安定性を意味する。変異型リパーゼは、60℃で20時間処理した後の残存活性が、好ましくは20%以上、より好ましくは30%以上であることが望ましい。
2. Mutant lipase of the present invention The mutant lipase of the present invention means a lipase that is more stable than the wild-type lipase by introducing a mutation into the wild-type lipase as described above. Stability means thermal stability. The mutant lipase preferably has a residual activity of 20% or more, more preferably 30% or more after treatment at 60 ° C. for 20 hours.

変異導入の方法としては、野生型リパーゼ遺伝子のコード領域の配列をヒドロキシルアミン等でインビトロ処理する方法、および該遺伝子を保持する微生物、例えばリパーゼ遺伝子を導入したエシェリヒア・コリを、紫外線またはN-メチル-N'-ニトロ-N-ニトロソグアニジン(NTG)もしくはエチルメタンスルフォネート(EMS)等の通常変異処理に用いられている変異剤によって処理する方法、エラープローンPCR(Cadwell,R.C. PCR Meth. Appl. 2, 28(1992))、DNA shuffling(Stemmer,W.P. Nature 370, 389(1994))、StEP-PCR(Zhao,H. Nature Biotechnol. 16, 258(1998))等によって、遺伝子組換えにより人工的にリパーゼに変異を導入する方法が挙げられる。これらの変異型リパーゼ遺伝子のリパーゼ活性は、例えば、p-ニトロフェニルブチル酸またはp-ニトロフェニルパルミチン酸を基質とした分光光度法によりエステラーゼ活性を測定することによって確認することが出来る。   As a method for introducing a mutation, a method of treating the coding region sequence of a wild-type lipase gene in vitro with hydroxylamine or the like, and a microorganism carrying the gene, for example, Escherichia coli into which the lipase gene has been introduced, with ultraviolet light or N-methyl -N'-Nitro-N-nitrosoguanidine (NTG) or ethyl methanesulfonate (EMS), a method of treatment with mutagen that is usually used for mutagenesis, error prone PCR (Cadwell, RC PCR Meth. Appl 2, 28 (1992)), DNA shuffling (Stemmer, WP Nature 370, 389 (1994)), StEP-PCR (Zhao, H. Nature Biotechnol. 16, 258 (1998)), etc. In particular, there is a method of introducing a mutation into the lipase. The lipase activity of these mutant lipase genes can be confirmed, for example, by measuring the esterase activity by spectrophotometry using p-nitrophenylbutyric acid or p-nitrophenylpalmitic acid as a substrate.

また、変異型リパーゼの活性は、変異型リパーゼ、油脂、アルコールを混合、インキュベートした後に、原料である油脂含量の低下、もしくは脂肪酸エステルまたはグリセロールの生成を測定することによっても評価することができる。あるいは、変異型リパーゼ、油脂、水を混合、インキュベートした後に、原料である油脂含量の低下、もしくは脂肪酸またはグリセロールの生成を測定してもよい。   The activity of the mutant lipase can also be evaluated by measuring the decrease in the content of fat or oil as a raw material or the production of fatty acid ester or glycerol after mixing and incubating the mutant lipase, fat and alcohol, and alcohol. Alternatively, after mixing and incubating the mutant lipase, fats and oils, and water, the decrease in the content of fats and oils as raw materials or the production of fatty acids or glycerol may be measured.

リパーゼの安定性を上昇させる変異として具体的には、以下の(a)から(q)のよう
な変異を挙げることができる。尚、いずれの位置も、配列番号7における位置である。
Specific examples of the mutation that increases the stability of the lipase include the following mutations (a) to (q). Each position is the position in SEQ ID NO: 7.

(a)32位のGlyが他のアミノ酸残基に置換される変異
ここで他のアミノ酸残基とは天然型アミノ酸であればいずれのアミノ酸でもよく、Lys, Glu, Thr, Val, Leu, Ile, Ser, Asp, Asn, Gln, Arg, Cys, Met, Phe, Trp, Tyr, Ala, Pro, Hisから選択されるアミノ酸であればいずれでもよい。なかでも、特に、Aspに置換されることが最も好ましい。
(A) Mutation in which Gly at position 32 is substituted with another amino acid residue Here, the other amino acid residue may be any amino acid as long as it is a natural amino acid, Lys, Glu, Thr, Val, Leu, Ile , Ser, Asp, Asn, Gln, Arg, Cys, Met, Phe, Trp, Tyr, Ala, Pro, and His may be any amino acid. Of these, substitution to Asp is most preferable.

(b)50位のTyrが他のアミノ酸残基に置換される変異
ここで他のアミノ酸残基とは天然型アミノ酸であればいずれのアミノ酸でもよく、Lys, Glu, Thr, Val, Leu, Ile, Ser, Asp, Asn, Gln, Arg, Cys, Met, Phe, Trp, Gly, Ala, Pro, Hisから選択されるアミノ酸であればいずれでもよい。なかでも、特に、Asnに置換されることが最も好ましい。
(B) Mutation in which Tyr at position 50 is substituted with another amino acid residue Here, the other amino acid residue may be any amino acid as long as it is a natural amino acid. Lys, Glu, Thr, Val, Leu, Ile , Ser, Asp, Asn, Gln, Arg, Cys, Met, Phe, Trp, Gly, Ala, Pro, and His may be any amino acid. Of these, substitution to Asn is most preferable.

(c)95位のAlaが他のアミノ酸残基に置換される変異
ここで他のアミノ酸残基とは天然型アミノ酸であればいずれのアミノ酸でもよく、Lys, Glu, Thr, Val, Leu, Ile, Ser, Asp, Asn, Gln, Arg, Cys, Met, Phe, Trp, Tyr, Gly, Pro, Hisから選択されるアミノ酸であればいずれでもよい。なかでも、特に、Aspに置換されることが最も好ましい。
(C) Mutation in which Ala at position 95 is substituted with another amino acid residue. The other amino acid residue may be any amino acid as long as it is a natural amino acid. Lys, Glu, Thr, Val, Leu, Ile , Ser, Asp, Asn, Gln, Arg, Cys, Met, Phe, Trp, Tyr, Gly, Pro, and His may be any amino acid. Of these, substitution to Asp is most preferable.

(d)126位のLysが他のアミノ酸残基に置換される変異
ここで他のアミノ酸残基とは天然型アミノ酸であればいずれのアミノ酸でもよく、Glu, Thr, Val, Leu, Ile, Ser, Asp, Asn, Gln, Arg, Cys, Met, Phe, Trp, Tyr, Gly, Ala, Pro, Hisから選択されるアミノ酸であればいずれでもよい。なかでも、特に、Ileに置換されることが最も好ましい。
(D) Mutation in which Lys at position 126 is substituted with another amino acid residue The other amino acid residue may be any amino acid as long as it is a natural amino acid. Glu, Thr, Val, Leu, Ile, Ser Asp, Asn, Gln, Arg, Cys, Met, Phe, Trp, Tyr, Gly, Ala, Pro, and His may be any amino acid. Of these, substitution to Ile is most preferable.

(e)131位のCysが他のアミノ酸残基に置換される変異
ここで他のアミノ酸残基とは天然型アミノ酸であればいずれのアミノ酸でもよく、Lys, Glu, Thr, Val, Leu, Ile, Ser, Asp, Asn, Gln, Arg, Met, Phe, Trp, Tyr, Gly, Ala, Pro, Hisから選択されるアミノ酸であればいずれでもよい。なかでも、特に、Ser、Thr、Leu、又はIleに置換されることが最も好ましい。
(E) Mutation in which Cys at position 131 is substituted with another amino acid residue Here, the other amino acid residue may be any amino acid as long as it is a natural amino acid, Lys, Glu, Thr, Val, Leu, Ile , Ser, Asp, Asn, Gln, Arg, Met, Phe, Trp, Tyr, Gly, Ala, Pro, and His may be any amino acid. Of these, substitution to Ser, Thr, Leu, or Ile is most preferable.

(f)133位のValが他のアミノ酸残基に置換される変異
ここで他のアミノ酸残基とは天然型アミノ酸であればいずれのアミノ酸でもよく、Lys, Glu, Thr, Leu, Ile, Ser, Asp, Asn, Gln, Arg, Cys, Met, Phe, Trp, Tyr, Gly, Ala, Pro, Hisから選択されるアミノ酸であればいずれでもよい。なかでも、特に、Lysに置換されることが最も好ましい。
(F) Mutation in which Val at position 133 is substituted with another amino acid residue Here, the other amino acid residue may be any amino acid as long as it is a natural amino acid, Lys, Glu, Thr, Leu, Ile, Ser Asp, Asn, Gln, Arg, Cys, Met, Phe, Trp, Tyr, Gly, Ala, Pro, and His may be any amino acid. Of these, substitution to Lys is most preferable.

(g)153位のGlyが他のアミノ酸残基に置換される変異
ここで他のアミノ酸残基とは天然型アミノ酸であればいずれのアミノ酸でもよく、Lys, Glu, Thr, Val, Leu, Ile, Ser, Asp, Asn, Gln, Arg, Cys, Met, Phe, Trp, Tyr, Ala, Pro, Hisから選択されるアミノ酸であればいずれでもよい。なかでも、特に、Proに置換されることが最も好ましい。
(G) Mutation in which Gly at position 153 is substituted with another amino acid residue Here, the other amino acid residue may be any amino acid as long as it is a natural amino acid. Lys, Glu, Thr, Val, Leu, Ile , Ser, Asp, Asn, Gln, Arg, Cys, Met, Phe, Trp, Tyr, Ala, Pro, and His may be any amino acid. Of these, substitution to Pro is most preferable.

(h)164位のLeuが他のアミノ酸残基に置換される変異
ここで他のアミノ酸残基とは天然型アミノ酸であればいずれのアミノ酸でもよく、Lys, Glu, Thr, Val, Ile, Ser, Asp, Asn, Gln, Arg, Cys, Met, Phe, Trp, Tyr, Gly, Ala, Pro, Hisから選択されるアミノ酸であればいずれでもよい。なかでも、特に、Glnに置換されることが最も好ましい。
(H) Mutation in which Leu at position 164 is substituted with another amino acid residue Here, the other amino acid residue may be any amino acid as long as it is a natural amino acid, Lys, Glu, Thr, Val, Ile, Ser Asp, Asn, Gln, Arg, Cys, Met, Phe, Trp, Tyr, Gly, Ala, Pro, and His may be any amino acid. Of these, substitution to Gln is most preferable.

(i)7位のXがAlaであって、このAlaが他のアミノ酸残基に置換される変異
ここで他のアミノ酸残基とは天然型アミノ酸であればいずれのアミノ酸でもよく、Lys,
Glu, Thr, Leu, Ile, Ser, Asp, Asn, Gln, Arg, Cys, Met, Phe, Trp, Tyr, Gly, Pro,
Hisから選択されるアミノ酸であればいずれでもよい。なかでも、特に、Proに置換されることが最も好ましい。
(I) A mutation in which X at position 7 is Ala, and this Ala is substituted with another amino acid residue. The other amino acid residue may be any amino acid as long as it is a natural amino acid, Lys,
Glu, Thr, Leu, Ile, Ser, Asp, Asn, Gln, Arg, Cys, Met, Phe, Trp, Tyr, Gly, Pro,
Any amino acid selected from His may be used. Of these, substitution to Pro is most preferable.

(j)42位のXがAlaであって、このAlaが他のアミノ酸残基に置換される変異
ここで他のアミノ酸残基とは天然型アミノ酸であればいずれのアミノ酸でもよく、Lys, Glu, Thr, Val, Leu, Ile, Ser, Asp, Asn, Gln, Arg, Cys, Met, Phe, Trp, Tyr, Gly, Pro, Hisから選択されるアミノ酸であればいずれでもよい。なかでも、特に、Glnに置換されることが最も好ましい。
(J) A mutation in which X at position 42 is Ala, and this Ala is substituted with another amino acid residue. The other amino acid residue may be any amino acid as long as it is a natural amino acid, and Lys, Glu , Thr, Val, Leu, Ile, Ser, Asp, Asn, Gln, Arg, Cys, Met, Phe, Trp, Tyr, Gly, Pro, and His may be any amino acid. Of these, substitution to Gln is most preferable.

(k)83位のXがValであって、このValが他のアミノ酸残基に置換される変異
ここで他のアミノ酸残基とは天然型アミノ酸であればいずれのアミノ酸でもよく、Lys, Glu, Thr, Leu, Ile, Ser, Asp, Asn, Gln, Arg, Cys, Met, Phe, Trp, Tyr, Gly, Ala, Pro, Hisから選択されるアミノ酸であればいずれでもよい。なかでも、特に、Glnに置換されることが最も好ましい。
(K) A mutation in which X at position 83 is Val and this Val is substituted with another amino acid residue. The other amino acid residue may be any amino acid as long as it is a natural amino acid, and Lys, Glu , Thr, Leu, Ile, Ser, Asp, Asn, Gln, Arg, Cys, Met, Phe, Trp, Tyr, Gly, Ala, Pro, His may be any amino acid. Of these, substitution to Gln is most preferable.

(l)88位のXがGlnであって、このGlnが他のアミノ酸残基に置換される変異
ここで他のアミノ酸残基とは天然型アミノ酸であればいずれのアミノ酸でもよく、Lys, Glu, Thr, Val, Leu, Ile, Ser, Asp, Asn, Arg, Cys, Met, Phe, Trp, Tyr, Gly, Ala, Pro, Hisから選択されるアミノ酸であればいずれでもよい。なかでも、特に、Asnに置換されることが最も好ましい。
(L) Mutation in which X at position 88 is Gln, and this Gln is substituted with another amino acid residue. The other amino acid residue may be any amino acid as long as it is a natural amino acid, Lys, Glu , Thr, Val, Leu, Ile, Ser, Asp, Asn, Arg, Cys, Met, Phe, Trp, Tyr, Gly, Ala, Pro, His may be any amino acid. Of these, substitution to Asn is most preferable.

(m)154位のXがSerであって、このSerが他のアミノ酸残基に置換される変異
ここで他のアミノ酸残基とは天然型アミノ酸であればいずれのアミノ酸でもよく、Lys, Glu, Thr, Val, Leu, Ile, Asp, Asn, Gln, Arg, Cys, Met, Phe, Trp, Tyr, Gly, Ala, Pro, Hisから選択されるアミノ酸であればいずれでもよい。なかでも、特に、Ileに置換されることが最も好ましい。
(M) Mutation in which X at position 154 is Ser, and this Ser is substituted with another amino acid residue. The other amino acid residue may be any amino acid as long as it is a natural amino acid, Lys, Glu , Thr, Val, Leu, Ile, Asp, Asn, Gln, Arg, Cys, Met, Phe, Trp, Tyr, Gly, Ala, Pro, His may be any amino acid. Of these, substitution to Ile is most preferable.

(n)177位のXがAlaであって、このAlaが他のアミノ酸残基に置換される変異
ここで他のアミノ酸残基とは天然型アミノ酸であればいずれのアミノ酸でもよく、Lys, Glu, Thr, Val, Leu, Ile, Ser, Asp, Asn, Gln, Arg, Cys, Met, Phe, Trp, Tyr, Gly, Pro, Hisから選択されるアミノ酸であればいずれでもよい。なかでも、特に、Proに置換されることが最も好ましい。
(N) A mutation in which X at position 177 is Ala, and this Ala is substituted with another amino acid residue. The other amino acid residue may be any amino acid as long as it is a natural amino acid, Lys, Glu , Thr, Val, Leu, Ile, Ser, Asp, Asn, Gln, Arg, Cys, Met, Phe, Trp, Tyr, Gly, Pro, and His may be any amino acid. Of these, substitution to Pro is most preferable.

(o)203位のXがAlaであって、このAlaが他のアミノ酸残基に置換される変異
ここで他のアミノ酸残基とは天然型アミノ酸であればいずれのアミノ酸でもよく、Lys, Glu, Thr, Val, Leu, Ile, Ser, Asp, Asn, Gln, Arg, Cys, Met, Phe, Trp, Tyr, Gly, Pro, Hisから選択されるアミノ酸であればいずれでもよい。なかでも、特に、Leuに置換されることが最も好ましい。
(O) A mutation in which X at position 203 is Ala, and this Ala is substituted with another amino acid residue. The other amino acid residue may be any amino acid as long as it is a natural amino acid, and Lys, Glu , Thr, Val, Leu, Ile, Ser, Asp, Asn, Gln, Arg, Cys, Met, Phe, Trp, Tyr, Gly, Pro, and His may be any amino acid. Of these, substitution with Leu is most preferable.

(p)206位のXがLysであって、このLysが他のアミノ酸残基に置換される変異
ここで他のアミノ酸残基とは天然型アミノ酸であればいずれのアミノ酸でもよく、Glu, Thr, Val, Leu, Ile, Ser, Asp, Asn, Gln, Arg, Cys, Met, Phe, Trp, Tyr, Gly, Ala, Pro, Hisから選択されるアミノ酸であればいずれでもよい。なかでも、特に、Glnに置換されることが最も好ましい。
(P) Mutation in which X at position 206 is Lys, and this Lys is substituted with another amino acid residue. The other amino acid residue may be any amino acid as long as it is a natural amino acid, Glu, Thr , Val, Leu, Ile, Ser, Asp, Asn, Gln, Arg, Cys, Met, Phe, Trp, Tyr, Gly, Ala, Pro, and His may be any amino acid. Of these, substitution to Gln is most preferable.

(q)209位のXがGlyであって、このGlyが他のアミノ酸残基に置換される変異
ここで他のアミノ酸残基とは天然型アミノ酸であればいずれのアミノ酸でもよく、Lys, G
lu, Thr, Val, Leu, Ile, Ser, Asp, Asn, Gln, Arg, Cys, Met, Phe, Trp, Tyr, Ala, Pro, Hisから選択されるアミノ酸であればいずれでもよい。なかでも、特に、Proに置換されることが最も好ましい。
(Q) Mutation in which X at position 209 is Gly, and this Gly is substituted with another amino acid residue. The other amino acid residue may be any amino acid as long as it is a natural amino acid, Lys, G
Any amino acid selected from lu, Thr, Val, Leu, Ile, Ser, Asp, Asn, Gln, Arg, Cys, Met, Phe, Trp, Tyr, Ala, Pro, and His may be used. Of these, substitution to Pro is most preferable.

上記変異の中では、安定性の点からは、(d)、(e)、(f)、及び(o)が好ましい。また、変異型リパーゼの比活性(タンパク質量当りの酵素活性)の点からは、(k)、(e)及び(p)が好ましい。   Among the above mutations, (d), (e), (f), and (o) are preferable from the viewpoint of stability. Moreover, (k), (e), and (p) are preferable from the viewpoint of the specific activity (enzyme activity per protein amount) of the mutant lipase.

上記(a)〜(q)の7位、32位、42位、50位、83位、88位、95位、126位、131位、133位、153位、154位、164位、177位、203位、206位、209位は、それぞれ、配列番号2のアミノ酸配列においては、1位、26位、36位、44位、77位、82位、89位、120位、125位、127位、147位、148位、158位、171位、197位、200位、203位に相当する。配列番号4及び6における変異の位置は、図1に示すアラインメントにおいて、(a)〜(q)に記載した位置に相当する。   7th, 32nd, 42nd, 50th, 83rd, 88th, 95th, 126th, 131st, 133th, 153rd, 154th, 164th, 164th, 177th of (a) to (q) above 203, 206, and 209 are the 1st, 26th, 36th, 44th, 77th, 82th, 89th, 120th, 125th, 127th positions in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2, respectively. , 147, 148, 158, 171, 197, 200, 203. The positions of mutations in SEQ ID NOs: 4 and 6 correspond to the positions described in (a) to (q) in the alignment shown in FIG.

本明細書において、変異型リパーゼが持つ変異は、表1に示すようにアミノ酸残基の略号および配列表に示すアミノ酸配列中の部位より特定する。例えば、配列番号2における変異に関し、変異型1の「C125I」とは、配列番号2の配列の第125位のアミノ酸残基システインをイソロイシンに置換したことを示す。すなわち、変異型の表記は、野生型(配列番号2で特定されるアミノ酸)のアミノ酸残基の種類;配列番号2に記載のアミノ酸配列におけるアミノ酸残基の位置;変異導入後のアミノ酸残基の種類を示す。他の変異型の表記も同様である。   In this specification, the mutation possessed by the mutant lipase is specified from the abbreviations of amino acid residues as shown in Table 1 and the site in the amino acid sequence shown in the Sequence Listing. For example, regarding the mutation in SEQ ID NO: 2, “C125I” of variant 1 indicates that the amino acid residue cysteine at position 125 in the sequence of SEQ ID NO: 2 was substituted with isoleucine. That is, the notation of the mutant type is the type of amino acid residue of the wild type (amino acid specified in SEQ ID NO: 2); the position of the amino acid residue in the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 2; Indicates the type. The same applies to other variants.

Figure 2012044869
Figure 2012044869

本発明の変異型リパーゼは、優れた安定性を有する。すなわち、野生型のリパーゼに比べ、熱に対する耐性が高い。より具体的には、本発明の変異型リパーゼはそれぞれ、温度安定性などの特性について、野生型タンパク質よりも性能が向上している。   The mutant lipase of the present invention has excellent stability. That is, it has higher resistance to heat than wild-type lipase. More specifically, each of the mutant lipases of the present invention has improved performance over the wild type protein in terms of properties such as temperature stability.

本発明の変異型リパーゼは、安定性に加えて、他の酵素学的性質が改善される変異を有していてもよい。そのような変異としては、例えば、比活性、pH特性、基質特異性等が挙げられる。上記変異型リパーゼが持つ変異の中には、リパーゼの比活性を低下させる変異も存在する。変異型リパーゼがそのような変異を有する場合、さらに比活性を高める変異を導入することによって、安定性及び比活性を両立させることができる。   In addition to stability, the mutant lipase of the present invention may have a mutation that improves other enzymatic properties. Examples of such mutations include specific activity, pH characteristics, substrate specificity, and the like. Among the mutations possessed by the mutant lipase, there are mutations that reduce the specific activity of the lipase. When the mutant lipase has such a mutation, it is possible to achieve both stability and specific activity by introducing a mutation that further increases the specific activity.

本発明者らは、リパーゼの比活性を高める変異として、下記の変異を見出している。これらの変異は、配列番号7のアミノ酸配列、又は配列番号7において1若しくは数個のア
ミノ酸の置換、欠失、挿入、付加、又は逆位を含むアミノ酸配列を有する野生型リパーゼにおける変異である。
The present inventors have found the following mutations as mutations that increase the specific activity of lipase. These mutations are mutations in the wild-type lipase having the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7 or an amino acid sequence containing one or several amino acid substitutions, deletions, insertions, additions, or inversions in SEQ ID NO: 7.

(i)22位のグリシンが他のアミノ酸残基に置換される変異
(ii)53位のバリンが他のアミノ酸残基に置換される変異
(iii)58位のフェニルアラニンが他のアミノ酸残基に置換される変異
(iv)131位のシステインが他のアミノ酸残基に置換される変異
(v)160位のバリンが他のアミノ酸残基に置換される変異
(vi)173位のバリンが他のアミノ酸残基に置換される変異
(vii)187位のロイシンが他のアミノ酸残基に置換される変異
(viii)180位のXがフェニルアラニンであって、このフェニルアラニンがイソロイシンまたはバリンに置換する変異
(ix)185位のXがグルタミンであって、このグルタミンがグルタミン酸またはロイシンに置換する変異
(I) Mutation in which glycine at position 22 is replaced with another amino acid residue (ii) Mutation in which valine at position 53 is replaced with another amino acid residue (iii) Phenylalanine at position 58 is replaced with another amino acid residue Mutation to be substituted (iv) Mutation in which cysteine at position 131 is substituted with other amino acid residues (v) Mutation in which valine at position 160 is substituted with other amino acid residues (vi) Other valine at position 173 Mutation to be substituted with an amino acid residue (vii) Mutation in which leucine at position 187 is substituted with another amino acid residue (viii) X at position 180 is phenylalanine, and this phenylalanine is substituted with isoleucine or valine ( ix) Mutation in which X at position 185 is glutamine and glutamine is substituted with glutamic acid or leucine

上記(i)〜(vii)の変異としてより具体的には、下記変異が挙げられる。
(I)22位のグリシンがアラニンに置換される変異
(II)53位のバリンがロイシン又はアルギニンに置換される変異
(III)58位のフェニルアラニンがイソロイシン、ロイシン、バリン、及びトリプトファンから選択されるアミノ酸残基に置換される変異
(IV)131位のシステインがアラニンに置換される変異
(V)160位のバリンがイソロイシンに置換される変異
(IV)173位のバリンがイソロイシンに置換される変異
(VII)187位のロイシンがフェニルアラニンに置換される変異
上記(I)〜(VII)、又は(viii)もしくは(ix)の変異を有する変異型リパーゼの比活性が野生型リパーゼより高いことは、後述の実施例1〜5と同様の方法により確認されている。
More specific examples of the mutations (i) to (vii) include the following mutations.
(I) Mutation in which glycine at position 22 is substituted with alanine (II) Mutation in which valine at position 53 is replaced with leucine or arginine (III) Phenylalanine at position 58 is selected from isoleucine, leucine, valine, and tryptophan Mutation substituted with amino acid residue (IV) Mutation where cysteine at position 131 is substituted with alanine (V) Mutation where valine at position 160 is replaced with isoleucine (IV) Mutation where valine at position 173 is replaced with isoleucine (VII) Mutation in which leucine at position 187 is substituted with phenylalanine The specific activity of the mutant lipase having the mutation (I) to (VII), or (viii) or (ix) is higher than that of the wild-type lipase. It has been confirmed by the same method as in Examples 1 to 5 described later.

2.本発明の変異型リパーゼの製造方法
本発明の変異型リパーゼの製造方法、並びにこれに用いられる組換え体および形質転換体の作製方法について説明する。
上記変異型リパーゼは、野生型リパーゼをコードするDNAに上記変異を導入し、これを適当なベクターにクローニングした後、適切な宿主に導入し、発現させることによって変異型リパーゼを製造することができる。
2. Method for Producing Mutant Lipase of the Present Invention A method for producing the mutant lipase of the present invention, and a method for producing recombinants and transformants used therefor will be described.
The mutant lipase can be produced by introducing the mutation into DNA encoding wild-type lipase, cloning it into an appropriate vector, introducing it into an appropriate host, and expressing it. .

変異型リパーゼを設計、作製するに当っては、配列番号7のアミノ酸配列をコードするDNA、例えば配列番号2、4、6のアミノ酸配列をコードする遺伝子のうち、上記変異に対応するコドンを部位特異的変異法により改変し、得られた改変遺伝子を適当なベクターに組込んだ後宿主に導入し、形質転換体を培養すればよい。目的とする変異型リパーゼは形質転換体の培養菌体より回収することができる。得られた変異型リパーゼは、野生型リパーゼに比べて高い安定性を有することを確認することが好ましい。   When designing and preparing a mutant lipase, a DNA encoding the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, for example, a gene encoding the amino acid sequence of SEQ ID NO: 2, 4, 6 is located in the codon corresponding to the mutation What is necessary is just to modify | change by a specific variation | mutation method, introduce | transduce the obtained modified gene in a suitable vector, introduce | transduce into a host, and to culture | cultivate a transformant. The target mutant lipase can be recovered from cultured cells of the transformant. It is preferable to confirm that the obtained mutant lipase has higher stability than wild-type lipase.

DNAの目的部位に目的の変異を起こす部位特異的変異法としては、実施例に示したPCRを用いる方法〔R.ヒグチ、DNA操作へのPCRの使用、イン PCR テクノロジー(Higuchi, R., Using PCR to engineer DNA, in PCR technology)、H.A.エーリッヒ(Erlich,H. A.編、ストックトンプレス(Stockton press))、第61頁、(1989))〕;〔P.カーター、メソッズ インエンザイモロジー(Carter, P., Meth. In Enzymol)、第154巻、第382頁(1987)〕以外に、ファージを用いる方法(W.クレーマー、及びH.J.フリッツ(Kramer, W. and Frits, H. J.)、メソッズ イン エンザイモロジー、第154巻、第350頁 (1987); T. Aクンケルほか(Kunkel,T.A.et,al)メソッズ イン エンザイモロジー、第15
4巻、第367頁 (1987)、などがある。
As a site-specific mutagenesis method for causing a target mutation at a target site of DNA, a method using PCR shown in Examples [R. Higuchi, PCR for DNA manipulation, in PCR technology (Higuchi, R., Using PCR to engineer DNA, in PCR technology). A. Erich (Erlich, HA, Stockton press), p. 61, (1989))]; [P. In addition to Carter, P., Meth. In Enzymol, Vol. 154, p. 382 (1987)], a method using phage (W. Kramer and H. J. Fritz (Kramer , W. and Frits, HJ), Methods in Enzymology, Volume 154, 350 (1987); T. A Kunkel et al. (Kunkel, TA et al.) Methods in Enzymology, 15
Volume 4, Page 367 (1987).

なお、変異型リパーゼをコードする遺伝子を組込むベクターとしては、宿主において複製可能なものであれば特に制限はない。宿主としてエシェリヒア・コリを用いる場合には当該細菌で自律複製できるプラスミドを挙げることができる。例えば、pUC19、pET、pGEMEX等が使用可能である。また、好ましい宿主としては、エシェリヒア・コリ菌株が挙げられるが、これ以外にも、構築した組換えDNAの複製起点と変異型リパーゼ遺伝子が機能し、組換えDNAが複製可能でかつ変異型リパーゼ遺伝子の発現が可能な微生物ならば、すべて宿主として利用できる。宿主としては、例えばエシェリヒア・コリ(Escherichia coli)等のエシェリヒア属細菌、エンペドバクター属細菌、スフィンゴバクテリウム属細菌、フラボバクテリウム属細菌、及びバチルス・ズブチリス(Bacillus subtilis)をはじめとする種々の原核細胞、サッカロマイセス・セレビシエ(Saccharomyces cerevisiae)、ピヒア・スティピティス(Pichia stipitis)、アスペルギルス・オリゼ(Aspergillus oryzae)をはじめとする種々の真核細胞を用いることができる。   The vector into which the gene encoding the mutant lipase is incorporated is not particularly restricted providing it can be replicated in the host. When Escherichia coli is used as a host, a plasmid capable of autonomous replication in the bacterium can be exemplified. For example, pUC19, pET, pGEMEX, etc. can be used. Preferred hosts include Escherichia coli strains. In addition to this, the origin of replication of the constructed recombinant DNA and the mutant lipase gene function, and the recombinant DNA can replicate and the mutant lipase gene. Any microorganism can be used as a host if it can be expressed. Examples of hosts include various Escherichia bacteria such as Escherichia coli, Empedobacter bacteria, Sphingobacterium bacteria, Flavobacterium bacteria, and various species including Bacillus subtilis. Various eukaryotic cells, including prokaryotic cells, Saccharomyces cerevisiae, Pichia stipitis, Aspergillus oryzae, can be used.

変異型リパーゼをコードする遺伝子を含むDNA断片とベクターとを連結させてなる組換えDNAを宿主に導入する方法としては特に制限はなく、通常の方法により行うことができる。宿主としてエシェリヒア・コリを用いる場合は、塩化カルシウム法〔ジャーナル
オブ モレキュラー バイオロジー(J.Mol. Biol.)、第53巻、第159頁 (1970)〕、ハナハン(Hanahan)法〔ジャーナル オブ モレキュラー バイオロジー、第166巻、第557頁 (1983)〕、SEM法〔ジーン(Gene)、第96巻、第23頁(1990)〕、チャング(Chung)らの方法〔プロシーディングズ オブ ザ ナショナル アカデミー オブ サイエンシーズ オブ ザ USA、第86巻、第2172頁(1989)〕などの方法を用いることができる。
There is no particular limitation on the method for introducing a recombinant DNA obtained by ligating a DNA fragment containing a gene encoding a mutant lipase and a vector into a host, and it can be performed by a usual method. When Escherichia coli is used as a host, the calcium chloride method [J. Mol. Biol., Vol. 53, pp. 159 (1970)], the Hanahan method [Journal of Molecular Bio Roth, 166, 557 (1983)], SEM method (Gene, 96, 23 (1990)), Chung et al. [Proceedings of the National Academy of Science of the USA, Vol. 86, p. 2172 (1989)].

変異型リパーゼをコードする遺伝子を発現させるためのプロモーターは、野生型遺伝子固有のプロモーターが宿主で機能する場合は、固有のプロモーターを使用することができるが、他のプロモーターを使用してもよい。また、固有のプロモーターが宿主で機能しない場合は、その宿主で機能するプロモーターを使用する。例えば、エシェリヒア・コリで機能するプロモーターとしては、lacプロモーター、trpプロモーター、trcプロモーター、tacプロモーター、ラムダファージのPRプロモーター、PLプロモーター、tetプロモーター等が挙げられる。   As a promoter for expressing a gene encoding a mutant lipase, a native promoter can be used when a promoter unique to the wild type gene functions in the host, but other promoters may be used. When a unique promoter does not function in the host, a promoter that functions in the host is used. For example, promoters that function in Escherichia coli include lac promoter, trp promoter, trc promoter, tac promoter, lambda phage PR promoter, PL promoter, tet promoter and the like.

また、変異型リパーゼは、シグナルペプチドを含む前駆体タンパク質として発現させてもよく、成熟タンパク質を直接発現させてもよい。さらに、宿主に適したシグナルペプチドに変異型リパーゼの前駆体タンパク質又は成熟タンパク質を連結したものを発現させてもよい。例えば、宿主がエシェリヒア・コリの場合は、pelB、ompT等の遺伝子のシグナルペプチドが挙げられる。   The mutant lipase may be expressed as a precursor protein containing a signal peptide, or a mature protein may be expressed directly. Further, a signal peptide suitable for a host and a mutant lipase precursor protein or mature protein linked thereto may be expressed. For example, when the host is Escherichia coli, signal peptides of genes such as pelB and ompT can be mentioned.

上記のようにして得られる変異型リパーゼをコードする遺伝子を含む組換えDNAを導入した形質転換体は、炭素源、窒素源、無機イオン、更に必要ならば有機栄養源を含む適当な培地で培養することにより変異型リパーゼを発現させることができる。   The transformant introduced with the recombinant DNA containing the gene encoding the mutant lipase obtained as described above is cultured in a suitable medium containing a carbon source, nitrogen source, inorganic ions, and if necessary, an organic nutrient source. By doing so, a mutant lipase can be expressed.

3.変異型リパーゼの利用
本発明の変異型リパーゼと油脂と水を反応させることによって、脂肪酸とグリセロールが生成する(加水分解反応)。また、変異型リパーゼ、油脂、アルコールを反応させることによって、脂肪酸エステルとグリセロールが生成する(エステル交換反応)。本発明の変異型リパーゼは、野生型リパーゼに比べて安定性が高いので、油脂を加水分解して得られるグリセロール、脂肪酸を効率よく生成させることができる。
3. Utilization of Mutant Lipase By reacting the mutant lipase of the present invention, fats and oils and water, fatty acid and glycerol are produced (hydrolysis reaction). In addition, a fatty acid ester and glycerol are produced by reacting mutant lipase, fats and oils (transesterification reaction). Since the mutant lipase of the present invention is more stable than the wild-type lipase, it is possible to efficiently produce glycerol and fatty acids obtained by hydrolyzing fats and oils.

リパーゼを作用させる油脂としては、動物(魚類を含む)及び植物由来の油脂の1種ま
たは2種以上がすべて使用可能であり、例えば、パーム油、オリーブ油、菜種油、大豆油、米糠油、クルミ油、ゴマ油、ツバキ油、ピーナッツ油等の植物油、バター、豚脂、牛脂、羊脂、鳥脂、鶏油等の動物油、クジラ油、イワシ油、ニシン油、タラ肝油等の魚油などが挙げられるが、これらに限定されるものではない。また、油脂は固形油脂でもよい。さらに、油脂原料は、純粋な油脂であってもよいし、油脂以外の物質を含む混合物であってもよい。例えば、油脂が植物由来のものである場合は、油脂を含む植物抽出物又はその分画物が挙げられる。
As fats and oils that act on lipase, one or more of animal and fats (including fish) and plants can be used. For example, palm oil, olive oil, rapeseed oil, soybean oil, rice bran oil, walnut oil , Vegetable oils such as sesame oil, camellia oil, peanut oil, animal oils such as butter, pork fat, beef tallow, sheep fat, chicken oil, fish oil such as whale oil, sardine oil, herring oil, cod liver oil, etc. However, it is not limited to these. The fats and oils may be solid fats and oils. Furthermore, the fat and oil raw material may be pure fat or oil, or a mixture containing substances other than fats and oils. For example, when fats and oils are a plant origin, the plant extract containing fats and oils or its fraction is mentioned.

アルコールとしては、メタノール等の低級アルコールのほか各種のアルコールが使用可能であり、例えば、メチルアルコール、エチルアルコール、プロピルアルコール、イソプロピルアルコール、ブチルアルコール、イソブチルアルコール、S−ブチルアルコール、t−ブチルアルコール、アルミアルコール、ヘキシルアルコール等脂肪族アルコール;アリルアルコール、プロパルギルアルコール等の不飽和脂肪族アルコール;シクロヘキサノール、シクロペンタノール等の脂環式アルコール;ベンジルアルコール、シンナミルアルコール等の芳香族アルコール;その他の各種アルコールなどが挙げられるが、これらに限定されるものではない。   As the alcohol, various alcohols other than lower alcohols such as methanol can be used. For example, methyl alcohol, ethyl alcohol, propyl alcohol, isopropyl alcohol, butyl alcohol, isobutyl alcohol, S-butyl alcohol, t-butyl alcohol, Aliphatic alcohols such as aluminum alcohol and hexyl alcohol; unsaturated aliphatic alcohols such as allyl alcohol and propargyl alcohol; alicyclic alcohols such as cyclohexanol and cyclopentanol; aromatic alcohols such as benzyl alcohol and cinnamyl alcohol; Although various alcohol etc. are mentioned, it is not limited to these.

生成されるグリセロールや脂肪酸は、腸内細菌科に属する細菌を培養するための培地の炭素源として使用することができる。油脂のリパーゼとの反応生成物には、細菌の生育を大きく損なう不純物が含まれておらず、生成される脂肪酸やグリセロールを精製せずに、培養に利用することが可能である。また、油脂の加水分解反応は、油脂と水から、脂肪酸とグリセロールを生成する反応であり、室温付近の温度においては、グリセロールが溶解した水相である下層と、脂肪酸を含む油相である上層に分離しているのが、一般的である。水相に生じるグリセロール、及び、油相に生じる脂肪酸のいずれもが発酵原料として利用可能である。また、   The produced glycerol and fatty acid can be used as a carbon source for a medium for culturing bacteria belonging to the family Enterobacteriaceae. The reaction product of fats and oils with lipase does not contain impurities that greatly impair the growth of bacteria, and can be used for culture without purifying the fatty acids and glycerol produced. The hydrolysis reaction of fats and oils is a reaction for producing fatty acids and glycerol from fats and oils and water. At temperatures near room temperature, a lower layer that is an aqueous phase in which glycerol is dissolved and an upper layer that is an oil phase containing fatty acids. It is general that they are separated. Both glycerol produced in the aqueous phase and fatty acids produced in the oil phase can be used as fermentation raw materials. Also,

油脂の加水分解物としてグリセロール及び脂肪酸を含むものを用いる場合は、油脂の加水分解物を乳化処理することが好ましい。乳化処理としては、乳化促進剤添加、攪拌、ホモジナイズ、超音波処理等が挙げられる。乳化処理によって、細菌がグリセロール及び脂肪酸を資化しやすくなり、L−アミノ酸発酵がより有効になると考えられる。乳化処理は、L−アミノ酸生産能を有する細菌が、脂肪酸とグリセロールの混合物を資化しやすくする処理であれば、どのようなものでも構わない。例えば、乳化方法として、乳化促進剤や界面活性剤を加える等が考えられる。ここで乳化促進剤としては、リン脂質やステロールが挙げられる。また界面活性剤としては、非イオン界面活性剤では、ポリ(オキシエチレン)ソルビタンモノオレイン酸エステル(Tween 80)などのポリオキシエチレンソルビタン脂肪酸エステル、n-オクチルβ-D-グルコシドなどのアルキルグルコシド、ショ糖ステアリン酸エステルなどのショ糖脂肪酸エステル、ポリグリセリンステアリン酸エステルなどのポリグリセリン脂肪酸エステル等が挙げられる。両性イオン界面活性剤としては、アルキルベタインであるN,N-ジメチル-N-ドデシルグリシンベタインなどが挙げられる。これ以外にも、トライトンX-100(Triton X-100)、ポリオキシエチレン(20)セチルエーテル(Brij-58)やノニルフェノールエトキシレート(Tergitol NP-40)等の一般的に生物学の分野で用いられる界面活性剤が利用可能である。   When using the thing containing glycerol and a fatty acid as a hydrolyzate of fats and oils, it is preferable to emulsify the hydrolyzate of fats and oils. Examples of the emulsification treatment include emulsification accelerator addition, stirring, homogenization, ultrasonic treatment and the like. It is thought that the emulsification treatment makes it easier for bacteria to assimilate glycerol and fatty acids, and L-amino acid fermentation becomes more effective. The emulsification treatment may be any treatment as long as the bacteria having the ability to produce L-amino acids can easily assimilate the mixture of fatty acid and glycerol. For example, as an emulsification method, an emulsification accelerator or a surfactant may be added. Here, examples of the emulsification promoter include phospholipids and sterols. As the surfactant, nonionic surfactants include polyoxyethylene sorbitan fatty acid esters such as poly (oxyethylene) sorbitan monooleate (Tween 80), alkyl glucosides such as n-octyl β-D-glucoside, Examples thereof include sucrose fatty acid esters such as sucrose stearate and polyglycerin fatty acid esters such as polyglycerin stearate. Examples of the zwitterionic surfactant include N, N-dimethyl-N-dodecylglycine betaine which is an alkylbetaine. Other than this, Triton X-100 (Triton X-100), polyoxyethylene (20) cetyl ether (Brij-58), nonylphenol ethoxylate (Tergitol NP-40), etc. are generally used in the field of biology Available surfactants are available.

さらに、脂肪酸のような難溶解性物質の乳化や均一化を促進するための操作も有効である。この操作は、脂肪酸とグリセロールの混合物の乳化や均一化を促進する操作であれば、どのような操作でも構わない。具体的には、攪拌処理、ホモジナイザー処理、ホモミキサー処理、超音波処理、高圧処理、高温処理などが挙げられるが、攪拌処理、ホモジナイザー処理、超音波処理およびこれらの組合せがより好ましい。   Furthermore, an operation for promoting emulsification and homogenization of a hardly soluble substance such as a fatty acid is also effective. This operation may be any operation that promotes emulsification and homogenization of a mixture of fatty acid and glycerol. Specifically, stirring treatment, homogenizer treatment, homomixer treatment, ultrasonic treatment, high pressure treatment, high temperature treatment and the like can be mentioned, and stirring treatment, homogenizer treatment, ultrasonic treatment and combinations thereof are more preferable.

上記乳化促進剤による処理と、攪拌処理、ホモジナイザー処理及び/または超音波処理
を組み合わせることが特に好ましく、これらの処理は、脂肪酸がより安定なアルカリ条件下で行われることが望ましい。アルカリ条件としては、pH9以上が好ましく、pH10以上がより好ましい。
It is particularly preferable to combine the treatment with the above emulsification accelerator with the stirring treatment, the homogenizer treatment and / or the ultrasonic treatment, and these treatments are desirably performed under alkaline conditions where the fatty acid is more stable. The alkaline condition is preferably pH 9 or higher, more preferably pH 10 or higher.

グリセロール又は脂肪酸を炭素源とした発酵生産により出来る目的物質としては、L−アミノ酸(EP1715056、EP1715055、国際公開2007/013695号パンフレット)、有機酸(Dharmadi Y, Murarka A, Gonzalez R. 2006. Biotechnol Bioeng. 94:821-829.)、エタノール(Ito T, Nakashimada Y, Senba K, Matsui T, Nishio N. 2005. J Biosci Bioeng. 100:260-255.、Cheng KK, Liu DH, Sun Y, Liu WB. 2004. Biotechnol Lett. 26:911-915.)、水素(to T, Nakashimada Y, Senba K, Matsui T, Nishio N. 2005. J Biosci Bioeng. 100:260-255)等が挙げられる。尚、目的物質が塩を形成し得る場合は、その塩も目的物質に包含される。   Examples of target substances that can be produced by fermentation using glycerol or fatty acid as a carbon source include L-amino acids (EP1715056, EP1715055, International Publication No. 2007/013695), organic acids (Dharmadi Y, Murarka A, Gonzalez R. 2006. Biotechnol Bioeng 94: 821-829.), Ethanol (Ito T, Nakashimada Y, Senba K, Matsui T, Nishio N. 2005. J Biosci Bioeng. 100: 260-255., Cheng KK, Liu DH, Sun Y, Liu WB 2004. Biotechnol Lett. 26: 911-915.), Hydrogen (to T, Nakashimada Y, Senba K, Matsui T, Nishio N. 2005. J Biosci Bioeng. 100: 260-255) and the like. In addition, when the target substance can form a salt, the salt is also included in the target substance.

L−アミノ酸は、L−アラニン、L−アルギニン、L−アスパラギン、L−アスパラギン酸、L−システイン、L−グルタミン酸、L−グルタミン、グリシン、L−ヒスチジン、L−イソロイシン、L−ロイシン、L−リジン、L−メチオニン、L−フェニルアラニン、L−プロリン、L−セリン、L−スレオニン、L−トリプトファン、L−チロシン及びL−バリン等を含む。特に、L−スレオニン、L−リジン、L−トリプトファン及びL−グルタミン酸が好ましい。   L-amino acids are L-alanine, L-arginine, L-asparagine, L-aspartic acid, L-cysteine, L-glutamic acid, L-glutamine, glycine, L-histidine, L-isoleucine, L-leucine, L- Examples include lysine, L-methionine, L-phenylalanine, L-proline, L-serine, L-threonine, L-tryptophan, L-tyrosine and L-valine. In particular, L-threonine, L-lysine, L-tryptophan and L-glutamic acid are preferable.

有機酸としては、コハク酸、クエン酸、フマル酸、リンゴ酸等を含むが、特にコハク酸が好ましい。
エタノールとしては、エタノール、プロパノール、1,3−プロパンジオール等が挙げられる。
発酵生産に使用できる微生物は、腸内細菌科に属する微生物、コリネ型細菌に属する微生物等が挙げられる。
Examples of the organic acid include succinic acid, citric acid, fumaric acid, malic acid and the like, and succinic acid is particularly preferable.
Examples of ethanol include ethanol, propanol, 1,3-propanediol and the like.
Examples of microorganisms that can be used for fermentation production include microorganisms belonging to the family Enterobacteriaceae, microorganisms belonging to coryneform bacteria, and the like.

腸内細菌科に属する微生物は、エシェリヒア、エンテロバクター、エルビニア、クレブシエラ、パントエア、フォトルハブドゥス、プロビデンシア、サルモネラ、セラチア、シゲラ、モルガネラ、イェルシニア等の属に属する細菌を含む。特に、NCBI(National Center for Biotechnology Information)のデータベース(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?id=91347)で用いられている分類法により腸内細菌科に分類されている細菌が好ましい。   Microorganisms belonging to the family Enterobacteriaceae include bacteria belonging to the genera such as Escherichia, Enterobacter, Erbinia, Klebsiella, Pantoea, Photorhabdus, Providencia, Salmonella, Serratia, Shigella, Morganella, Yersinia and the like. In particular, Enterobacteriaceae according to the taxonomy used in NCBI (National Center for Biotechnology Information) database (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?id=91347) Bacteria classified in the family are preferred.

エシェリヒア属に属する細菌とは、当該細菌が微生物学の専門家に知られている分類により、エシェリヒア属に分類されていることを意味する。本発明において使用されるエシェリヒア属に属する細菌の例としては、エシェリヒア・コリ(E.coli)が挙げられるが、これに限定されない。   The bacterium belonging to the genus Escherichia means that the bacterium is classified into the genus Escherichia according to the classification known to microbiologists. Examples of bacteria belonging to the genus Escherichia used in the present invention include, but are not limited to, Escherichia coli (E. coli).

本発明において使用することができるエシェリヒア属に属する細菌は、特に制限されないが、例えば、ナイトハルトらの著書(Neidhardt, F. C. Ed. 1996. Escherichia coli and Salmonella: Cellular and Molecular Biology/Second Edition pp. 2477-2483. Table 1. American Society for Microbiology Press, Washington, D.C.)に記述されている系統のものが含まれる。具体的には、プロトタイプの野生株K12株由来のエシェリヒア・コリ W3110(ATCC 27325)、エシェリヒア・コリ MG1655(ATCC 47076)等が挙げられる。
これらの菌株は、例えばアメリカン・タイプ・カルチャー・コレクション(住所 P.O.
Box 1549 Manassas, VA 20108, United States of America)より分譲を受けることが出来る。すなわち各菌株に対応する登録番号が付与されており、この登録番号を利用して分譲を受けることが出来る。各菌株に対応する登録番号は、アメリカン・タイプ・カルチャ
ー・コレクションのカタログに記載されている。
The bacteria belonging to the genus Escherichia that can be used in the present invention are not particularly limited. For example, Neidhardt et al. (Neidhardt, FC Ed. 1996. Escherichia coli and Salmonella: Cellular and Molecular Biology / Second Edition pp. 2477- 2483. Table 1. Includes those described in the American Society for Microbiology Press, Washington, DC. Specific examples include Escherichia coli W3110 (ATCC 27325) and Escherichia coli MG1655 (ATCC 47076) derived from the prototype wild type K12 strain.
These strains are for example the American Type Culture Collection (address PO
Box 1549 Manassas, VA 20108, United States of America). That is, the registration number corresponding to each strain is given, and it can receive distribution using this registration number. The registration number corresponding to each strain is described in the catalog of American Type Culture Collection.

パントエア属に属する細菌とは、当該細菌が微生物学の専門家に知られている分類により、パントエア属に分類されていることを意味する。エンテロバクター・アグロメランスのある種のものは、最近、16S rRNAの塩基配列分析等に基づき、パントエア・アグロメランス、パントエア・アナナティス、パントエア・ステワルティイその他に再分類された(Int. J. Syst. Bacteriol., 43, 162173 (1993))。本発明において、パントエア属に属する細菌には、このようにパントエア属に再分類された細菌も含まれる。   The bacterium belonging to the genus Pantoea means that the bacterium is classified into the genus Pantoea according to the classification known to experts in microbiology. Certain types of Enterobacter agglomerans have recently been reclassified as Pantoea agglomerans, Pantoea ananatis, Pantoea stewarty, etc. (Int. J. Syst. Bacteriol., 43, 162173 (1993)). In the present invention, the bacteria belonging to the genus Pantoea include bacteria that have been reclassified to the genus Pantoea in this way.

コリネ型細菌としては、バージーズ・マニュアル・オブ・デターミネイティブ・バクテリオロジー(Bergey's Manual of Determinative Bacteriology)第8版599頁(1974)に定義されている一群の微生物であり、好気性,グラム陽性,非抗酸性,胞子形成能を有しない桿菌に分類される微生物が利用できる。なお、コリネ型細菌は、従来ブレビバクテリウム属に分類されていたが現在はコリネバクテリウム属細菌として統合された細菌(Int.J. Syst. Bacteriol., 41, 255 (1991))、及びコリネバクテリウム属と非常に近縁なブレビバクテリウム属細菌及びミクロバテリウム属細菌を含む。   Coryneform bacteria are a group of microorganisms defined in the Bergey's Manual of Determinative Bacteriology, 8th edition, page 599 (1974), aerobic, Gram-positive, Non-acidic, microorganisms classified as gonococci having no sporulation ability can be used. Coryneform bacteria were previously classified as genus Brevibacterium but are now integrated as Corynebacterium (Int.J. Syst. Bacteriol., 41, 255 (1991)), and coryneform bacteria. Includes Brevibacterium and Microbatterium bacteria that are very closely related to the genus Bacteria.

このようなコリネ型細菌の例として以下のものが挙げられる。
コリネバクテリウム・アセトアシドフィラム
コリネバクテリウム・アセトグルタミカム
コリネバクテリウム・アルカノリティカム
コリネバクテリウム・カルナエ
コリネバクテリウム・グルタミカム
コリネバクテリウム・リリウム
コリネバクテリウム・メラセコーラ
コリネバクテリウム・サーモアミノゲネス(コリネバクテリウム・エフィシェンス)
コリネバクテリウム・ハーキュリス
ブレビバクテリウム・ディバリカタム
ブレビバクテリウム・フラバム
ブレビバクテリウム・インマリオフィラム
ブレビバクテリウム・ラクトファーメンタム
ブレビバクテリウム・ロゼウム
ブレビバクテリウム・サッカロリティカム
ブレビバクテリウム・チオゲニタリス
コリネバクテリウム・アンモニアゲネス
ブレビバクテリウム・アルバム
ブレビバクテリウム・セリヌム
ミクロバクテリウム・アンモニアフィラム
Examples of such coryneform bacteria include the following.
Corynebacterium acetoacidophilum Corynebacterium acetoglutamicum Corynebacterium alkanolyticum Corynebacterium carnae Corynebacterium glutamicum Corynebacterium lylium Corynebacterium merasecola Corynebacterium thermoaminogenes ( Corynebacterium efficiens
Corynebacterium herculis Brevibacterium divaricatam Brevibacterium flavum Brevibacterium inmariophilum Brevibacterium lactofermentum Brevibacterium roseum Brevibacterium saccharolyticum Brevibacterium thiogenitalis Corynebacterium Umm ammoniagenes Brevibacterium album Brevibacterium cerinum Microbacterium ammonia film

具体的には、下記のような菌株を例示することができる。
コリネバクテリウム・アセトアシドフィラム ATCC13870
コリネバクテリウム・アセトグルタミカム ATCC15806
コリネバクテリウム・アルカノリティカム ATCC21511
コリネバクテリウム・カルナエ ATCC15991
コリネバクテリウム・グルタミカム ATCC13020, ATCC13032, ATCC13060
コリネバクテリウム・リリウム ATCC15990
コリネバクテリウム・メラセコーラ ATCC17965
コリネバクテリウム・エッフィシエンス AJ12340(FERM BP-1539)
コリネバクテリウム・ハーキュリス ATCC13868
ブレビバクテリウム・ディバリカタム ATCC14020
ブレビバクテリウム・フラバム ATCC13826, ATCC14067, AJ12418(FERM BP-2205)
ブレビバクテリウム・インマリオフィラム ATCC14068
ブレビバクテリウム・ラクトファーメンタム ATCC13869(コリネバクテリウム・グルタミカムATCC13869)
ブレビバクテリウム・ロゼウム ATCC13825
ブレビバクテリウム・サッカロリティカム ATCC14066
ブレビバクテリウム・チオゲニタリス ATCC19240
コリネバクテリウム・アンモニアゲネス ATCC6871、ATCC6872
ブレビバクテリウム・アルバム ATCC15111
ブレビバクテリウム・セリヌム ATCC15112
ミクロバクテリウム・アンモニアフィラム ATCC15354
Specifically, the following strains can be exemplified.
Corynebacterium acetoacidophilum ATCC13870
Corynebacterium acetoglutamicum ATCC15806
Corynebacterium alkanolyticum ATCC21511
Corynebacterium carnae ATCC15991
Corynebacterium glutamicum ATCC13020, ATCC13032, ATCC13060
Corynebacterium lilium ATCC15990
Corynebacterium melasecola ATCC17965
Corynebacterium efficiens AJ12340 (FERM BP-1539)
Corynebacterium herculis ATCC13868
Brevibacterium divaricatam ATCC14020
Brevibacterium flavum ATCC13826, ATCC14067, AJ12418 (FERM BP-2205)
Brevibacterium immariophilum ATCC14068
Brevibacterium lactofermentum ATCC13869 (Corynebacterium glutamicum ATCC13869)
Brevibacterium rose ATCC13825
Brevibacterium saccharolyticum ATCC14066
Brevibacterium thiogenitalis ATCC19240
Corynebacterium ammoniagenes ATCC6871, ATCC6872
Brevibacterium album ATCC15111
Brevibacterium cerinum ATCC15112
Microbacterium ammonia film ATCC15354

これらを入手するには、例えばアメリカン・タイプ・カルチャー・コレクションより分譲を受けることができる(住所 P.O. Box 1549, Manassas, VA 2010812301 Parklawn Drive, Rockville, Maryland 20852, United States of America)。すなわち、菌株毎に対応する登録番号が付与されており、この登録番号を利用して分譲を受けることができる。また、AJ12340株は、1987年10月27日付けで通商産業省工業技術院生命工学工業技術研究所(現独立行政法人産業技術総合研究所 特許生物寄託センター)(〒305-5466 日本国茨城県つくば市東1丁目1番地1 中央第6)にFERM BP-1539の受託番号でブダペスト
条約に基づいて寄託されている。また、AJ12418株は、1989年1月5日付けで通商産業省工業技術院生命工学工業技術研究所にFERM BP-2205の受託番号でブダペスト条約に基づいて寄託されている。
These can be obtained, for example, from the American Type Culture Collection (address PO Box 1549, Manassas, VA 2010812301 Parklawn Drive, Rockville, Maryland 20852, United States of America). That is, a corresponding registration number is assigned to each strain, and distribution can be received using this registration number. In addition, AJ12340 shares were issued on October 27, 1987 at the Institute of Biotechnology, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (currently the National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, Patent Biological Depositary Center) (Ibaraki, 305-5466, Japan) It is deposited under the Budapest Treaty under the accession number of FERM BP-1539 in 1st, 1st East, 1st Street, Tsukuba City. In addition, AJ12418 stock was deposited on January 5, 1989 at the Institute of Biotechnology, Ministry of International Trade and Industry under the contract number FERM BP-2205 under the Budapest Treaty.

本発明に用いる細菌は、グリセロールの資化性を高めるために、glpR遺伝子(EP1715056)の発現が弱化されているか、glpA、glpB、glpC、glpD、glpE、glpF、glpG、glpK、glpQ、glpT、glpX、tpiA、gldA、dhK、dhaL、dhaM、dhaR、fsa及びtalC遺伝子等のグリセロール代謝遺伝子(EP1715055A、国際公開2007/013695号パンフレット)の発現が強化されていてもよい。   In order to enhance the utilization of glycerol, the bacterium used in the present invention has a reduced expression of glpR gene (EP1715056), glpA, glpB, glpC, glpD, glpE, glpF, glpG, glpK, glpQ, glpT, Expression of glycerol metabolism genes (EP1715055A, WO 2007/013695 pamphlet) such as glpX, tpiA, gldA, dhK, dhaL, dhaM, dhaR, fsa and talC genes may be enhanced.

目的物質を産生する微生物は、グリセロール又は脂肪酸を炭素源として含む培地で培養したときに目的物質を産生するものであれば特に制限されない。例えば、L−アミノ酸を生産する微生物としては、特開2005-261433号公報(米国特許出願公開第20050214911A1号)に記載の微生物及び菌株が挙げられる。尚、L−アミノ酸生産能を付与又は増強する方法も、これらの公報に開示されている。   The microorganism producing the target substance is not particularly limited as long as it produces the target substance when cultured in a medium containing glycerol or fatty acid as a carbon source. Examples of microorganisms that produce L-amino acids include microorganisms and strains described in JP-A-2005-261433 (US Patent Application Publication No. 20050214911A1). In addition, methods for imparting or enhancing L-amino acid producing ability are also disclosed in these publications.

L−アミノ酸生産菌の一例として、L−リジン生産菌について以下に例示する。
エシェリヒア属に属するL−リジン生産菌の例としては、L−リジンアナログに耐性を有する変異株が挙げられる。L−リジンアナログはエシェリヒア属に属する細菌の生育を阻害するが、この阻害は、L−リジンが培地に共存するときには完全にまたは部分的に解除される。L−リジンアナログの例としては、オキサリジン、リジンヒドロキサメート、S−(2−アミノエチル)−L−システイン(AEC)、γ−メチルリジン、α−クロロカプロラクタムなどが挙げられるが、これらに限定されない。これらのリジンアナログに対して耐性を有する変異株は、エシェリヒア属に属する細菌を通常の人工変異処理に付すことによって得ることができる。L−リジンの生産に有用な細菌株の具体例としては、Escherichia coli AJ11442 (FERM BP-1543, NRRL B-12185; 米国特許第4,346,170号参照)及びEscherichia coli VL611が挙げられる。これらの微生物では、アスパルトキナーゼのL−リジンによるフィードバック阻害が解除されている。
As an example of L-amino acid-producing bacteria, L-lysine-producing bacteria are exemplified below.
Examples of L-lysine producing bacteria belonging to the genus Escherichia include mutants having resistance to L-lysine analogs. L-lysine analogues inhibit the growth of bacteria belonging to the genus Escherichia, but this inhibition is completely or partially desensitized when L-lysine is present in the medium. Examples of L-lysine analogs include, but are not limited to, oxalysine, lysine hydroxamate, S- (2-aminoethyl) -L-cysteine (AEC), γ-methyllysine, α-chlorocaprolactam, and the like. . Mutant strains resistant to these lysine analogs can be obtained by subjecting bacteria belonging to the genus Escherichia to normal artificial mutation treatment. Specific examples of bacterial strains useful for the production of L-lysine include Escherichia coli AJ11442 (FERM BP-1543, NRRL B-12185; see US Pat. No. 4,346,170) and Escherichia coli VL611. In these microorganisms, feedback inhibition of aspartokinase by L-lysine is released.

WC196株は、Escherichia coliのL−リジン生産菌として使用できる。この菌株は、Escherichia coli K-12に由来するW3110株にAEC耐性を付与することにより育種された。同株
は、Escherichia coli AJ13069と命名され、1994年12月6日、工業技術院生命工学工業技術研究所(現 独立行政法人 産業技術総合研究所 特許生物寄託センター、〒305-8566 日本国茨城県つくば市東1丁目1番地1 中央第6)に受託番号FERM P-14690として寄託され、1995年9月29日にブダペスト条約に基づく国際寄託に移管され、受託番号FERM BP-5252が付与されている(米国特許第5,827,698号)。
The WC196 strain can be used as an L-lysine-producing bacterium of Escherichia coli. This strain was bred by conferring AEC resistance to the W3110 strain derived from Escherichia coli K-12. This strain was named Escherichia coli AJ13069. On December 6, 1994, the Institute of Biotechnology, National Institute of Advanced Industrial Science and Technology (currently the National Institute of Advanced Industrial Science and Technology, Patent Biological Depositary Center, Ibaraki, 305-8566, Japan Deposited as FERM P-14690 in Tsukuba City Higashi 1-chome 1 1 Central 6), transferred to the international deposit under the Budapest Treaty on 29 September 1995, and assigned the accession number FERM BP-5252 (US Pat. No. 5,827,698).

L−リジン生産菌又はそれを誘導するための親株の例としては、L−リジン生合成系酵素の1種又は2種以上の活性が増強されている株も挙げられる。かかる酵素の例としては、ジヒドロジピコリン酸シンターゼ(dapA)、アスパルトキナーゼ(lysC)、ジヒドロジピコリン酸レダクターゼ(dapB)、ジアミノピメリン酸デカルボキシラーゼ(lysA)、ジアミノピメリン酸デヒドロゲナーゼ(ddh) (米国特許第6,040,160号)、フォスフォエノールピルビン酸カルボキシラーゼ(ppc)、アスパルテートセミアルデヒドデヒドロゲナーゼ遺伝子、ジアミノピメリン酸エピメラーゼ(dapF)、テトラヒドロジピコリン酸スクシニラーゼ(dapD)、スクシニルジアミノピメリン酸デアシラーゼ(dapE)及びアスパルターゼ(aspA) (EP 1253195 A)が挙げられるが、これらに限定されない。これらの酵素の中では、ジヒドロジピコリン酸レダクターゼ、ジアミノピメリン酸デカルボキシラーゼ、ジアミノピメリン酸デヒドロゲナーゼ、フォスフォエノールピルビン酸カルボキシラーゼ、アスパラギン酸アミノトランスフェラーゼ、ジアミノピメリン酸エピメラーゼ、アスパルテートセミアルデヒドデヒドロゲナーゼ、テトラヒドロジピコリン酸スクシニラーゼ、及び、スクシニルジアミノピメリン酸デアシラーゼが特に好ましい。また、親株は、エネルギー効率に関与する遺伝子(cyo) (EP 1170376 A)、ニコチンアミドヌクレオチドトランスヒドロゲナーゼをコードする遺伝子(pntAB) (米国特許第5,830,716号)、ybjE遺伝子(WO2005/073390)、または、これらの組み合わせの発現レベルが増大していてもよい。   Examples of L-lysine-producing bacteria or parent strains for deriving the same also include strains in which one or more activities of L-lysine biosynthetic enzymes are enhanced. Examples of such enzymes include dihydrodipicolinate synthase (dapA), aspartokinase (lysC), dihydrodipicolinate reductase (dapB), diaminopimelate decarboxylase (lysA), diaminopimelate dehydrogenase (ddh) (US Pat.No. 6,040,160). ), Phosphoenolpyruvate carboxylase (ppc), aspartate semialdehyde dehydrogenase gene, diaminopimelate epimerase (dapF), tetrahydrodipicolinate succinylase (dapD), succinyl diaminopimelate deacylase (dapE) and aspartase (aspA) ( EP 1253195 A), but is not limited to these. Among these enzymes, dihydrodipicolinate reductase, diaminopimelate decarboxylase, diaminopimelate dehydrogenase, phosphoenolpyruvate carboxylase, aspartate aminotransferase, diaminopimelate epimerase, aspartate semialdehyde dehydrogenase, tetrahydrodipicolinate succinylase, and Succinyl diaminopimelate deacylase is particularly preferred. In addition, the parent strain is a gene involved in energy efficiency (cyo) (EP 1170376 A), a gene encoding nicotinamide nucleotide transhydrogenase (pntAB) (US Pat.No. 5,830,716), a ybjE gene (WO2005 / 073390), or The expression level of these combinations may be increased.

L−リジン生産菌又はそれを誘導するための親株の例としては、L−リジンの生合成経路から分岐してL−リジン以外の化合物を生成する反応を触媒する酵素の活性が低下または欠損している株も挙げられる。L−リジンの生合成経路から分岐してL−リジン以外の化合物を生成する反応を触媒する酵素の例としては、ホモセリンデヒドロゲナーゼ、リジンデカルボキシラーゼ(米国特許第5,827,698号)、及び、リンゴ酸酵素(WO2005/010175)が挙げられる。   Examples of L-lysine producing bacteria or parent strains for deriving the same include a decrease or loss of the activity of an enzyme that catalyzes a reaction that branches off from the biosynthetic pathway of L-lysine to produce a compound other than L-lysine. There are also stocks. Examples of enzymes that catalyze reactions that branch off from the biosynthetic pathway of L-lysine to produce compounds other than L-lysine include homoserine dehydrogenase, lysine decarboxylase (US Pat. No. 5,827,698), and malate enzyme ( WO2005 / 010175).

好ましいL−リジン生産菌として、エシェリヒア・コリWC196ΔcadAΔldc/pCABD2が挙げられる(WO2006/078039)。この菌株は、リジンデカルボキシラーゼをコードするcadA及びldcC遺伝子が破壊されたWC196株に、米国特許第6040160に記載されたプラスミドpCABD2が導入することにより得られた株である。pCABD2は、L−リジンによるフィードバック阻害が解除された変異を有するエシェリヒア・コリ由来のジヒドロジピコリン酸合成酵素(DDPS)をコードする変異型dapA遺伝子と、L−リジンによるフィードバック阻害が解除された変異を有するエシェリヒア・コリ由来のアスパルトキナーゼIIIをコードする変異型lysC遺伝子と、エシェリヒア・コリ由来のジヒドロジピコリン酸レダクターゼをコードするdapB遺伝子と、ブレビバクテリウム・ラクトファーメンタム由来ジアミノピメリン酸デヒドロゲナーゼをコードするddh遺伝子を含んでいる。   A preferred L-lysine-producing bacterium is Escherichia coli WC196ΔcadAΔldc / pCABD2 (WO2006 / 078039). This strain is obtained by introducing the plasmid pCABD2 described in US Pat. No. 6,040,160 into the WC196 strain in which the cadA and ldcC genes encoding lysine decarboxylase are disrupted. pCABD2 is a mutant dapA gene encoding dihydrodipicolinate synthase (DDPS) derived from Escherichia coli having a mutation in which feedback inhibition by L-lysine is released, and a mutation in which feedback inhibition by L-lysine is released. A mutant lysC gene encoding aspartokinase III derived from Escherichia coli, dapB gene encoding dihydrodipicolinate reductase derived from Escherichia coli, and ddh encoding a diaminopimelate dehydrogenase derived from Brevibacterium lactofermentum Contains genes.

以下に実施例を挙げ、本発明をさらに詳しく説明する。本発明は、この実施例により何ら限定されない。   The following examples further illustrate the present invention. The present invention is not limited in any way by this example.

〔実施例1〕リパーゼ遺伝子の大腸菌における発現
Cryptococcus sp.S-2 (FERM BP-10961)の分泌シグナルを除いた成熟型リパーゼをコードする遺伝子(CS遺伝子)をpET-22b(+)ベクター(Novagen社製)のcloning/expression region の欄にあるMscI(pelB leader直後付近)とNotI(His・Tagの上流)で切断し、pe
lBleader直下に成熟型リパーゼの遺伝子を挿入した。
CS遺伝子をpET-22b(+)ベクター(Novagen社製)のpelB leader直下へ挿入して、プラスミドpET-22b(+)_CLEを作製した。pelB遺伝子は、T7lacプロモーターによって制御され、イソプロピル-β-D-チオガラクトピラノシドで発現が誘導される。このpET-22b(+)_CLEを用いて、エシェリヒア・コリ OrigamiB(DE3)を形質転換し、100μg/mlのアンピシリンを含むLB寒天培地に植菌しアンピシリン耐性を指標として目的のプラスミドを有する株を選択した。なお、pET-22b(+)_CLEを保有するエシェリヒア・コリ OrigamiB(DE3)をpET-22b(+)_CLE/OrigamiB(DE3)株とも表す。
[Example 1] Expression of lipase gene in E. coli
The gene encoding the mature lipase excluding the secretion signal of Cryptococcus sp.S-2 (FERM BP-10961) (CS gene) is placed in the cloning / expression region column of the pET-22b (+) vector (Novagen) Cut with a certain MscI (near pelB leader) and NotI (upstream of His / Tag), and pe
The gene for mature lipase was inserted directly under lBleader.
The CS gene was inserted directly under the pelB leader of the pET-22b (+) vector (Novagen) to prepare plasmid pET-22b (+) _ CLE. The pelB gene is controlled by the T7lac promoter and expression is induced with isopropyl-β-D-thiogalactopyranoside. Using this pET-22b (+) _ CLE, Escherichia coli OrigamiB (DE3) is transformed, inoculated into an LB agar medium containing 100 μg / ml ampicillin, and having a target plasmid having ampicillin resistance as an indicator. Selected. Note that Escherichia coli OrigamiB (DE3) carrying pET-22b (+) _ CLE is also referred to as pET-22b (+) _ CLE / OrigamiB (DE3) strain.

pET-22b(+)_CLE/OrigamiB(DE3)を、100μg/mlのアンピシリンを含むLB培地にて25℃で18時間振盪培養した。この培養液を、100μg/mlのアンピシリンを含むLB培地に適量加え、培養液の600nmにおける濁度(OD600)の値が1.0になるまで37℃で振盪培養した後、終濃度が0.5mMとなるようにイソプロピル-β-D-チオガラクトピラノシドを加え、25℃で18時間振盪培養した。得られた培養液中に含まれる菌体からの粗抽出液のエステラーゼ活性を実施例5の手順に従い測定し、粗抽出液がエステラーゼ活性を有することを確認した。また、pET-22b(+)_CLE/ OrigamiB(DE3)の代わりに、形質転換を行わないエシェリヒア・コリ OrigamiB(DE3)を用いて同様に培養し得られた菌体粗抽出液は、エステラーゼ活性を有しないことを確認した。 pET-22b (+) _ CLE / OrigamiB (DE3) was cultured with shaking in LB medium containing 100 μg / ml ampicillin at 25 ° C. for 18 hours. An appropriate amount of this culture solution is added to LB medium containing 100 μg / ml ampicillin, and after shaking culture at 37 ° C. until the turbidity at 600 nm (OD 600 ) of the culture solution reaches 1.0, the final concentration is 0.5 mM. Isopropyl-β-D-thiogalactopyranoside was added, and the mixture was cultured with shaking at 25 ° C. for 18 hours. The esterase activity of the crude extract from the microbial cells contained in the obtained culture broth was measured according to the procedure of Example 5, and it was confirmed that the crude extract had esterase activity. The crude cell extract obtained by culturing in the same manner using Escherichia coli OrigamiB (DE3) without transformation instead of pET-22b (+) _ CLE / OrigamiB (DE3) has esterase activity. It was confirmed that it does not have.

〔実施例2〕変異型リパーゼの構築
変異型リパーゼを構築するために、pET-22b(+)_CLEプラスミドを部位特異的突然変異誘発法の鋳型として使用した。突然変異誘発は、PCR反応を利用する市販のポリメラーゼ(PrimeSTAR HS Polymerase, TaKaRa Bio,Inc..)を使用し、製造元のプロトコルに従い行った。各標的残基への部位特異的変異の導入には、各標的残基に対応するコドンを中央に含み、その前後に野生型リパーゼ配列に相当する15mer程度ずつを加えたプライマーを用いた。各プライマーの配列を表2に示す。
[Example 2] Construction of mutant lipase In order to construct mutant lipase, pET-22b (+) _ CLE plasmid was used as a template for site-directed mutagenesis. Mutagenesis was performed using a commercially available polymerase (PrimeSTAR HS Polymerase, TaKaRa Bio, Inc.) using a PCR reaction according to the manufacturer's protocol. In order to introduce site-specific mutations into each target residue, a primer containing a codon corresponding to each target residue in the center and about 15 mer each corresponding to the wild type lipase sequence was used. The sequence of each primer is shown in Table 2.

Figure 2012044869
Figure 2012044869

表2中の各プライマーの配列中央部「XXX」は、導入したいアミノ酸残基の種類に応じて、対応するコドンの配列に置き換えて用いた。アミノ酸残基に対応する各コドンを、表3に示す。   The central portion “XXX” of each primer in Table 2 was used by replacing it with the corresponding codon sequence depending on the type of amino acid residue to be introduced. Table 3 shows each codon corresponding to an amino acid residue.

Figure 2012044869
Figure 2012044869

変異導入PCR後、DpnIで処理し鋳型の二本鎖DNA(pET-22b(+)_CLEプラスミド)を消化したPCR産物を用いて、エシェリヒア・コリ JM109株を形質転換し、アンピシリン耐性を指標として、変異型リパーゼ遺伝子を含む目的のプラスミドを有する株を選択した。なお、変異型リパーゼ遺伝子を含む目的のプラスミドを包括的にpET-22b(+)_CLE_Mと命名した。形質転換株からpET-22b(+)_CLE_Mを単離し、エシェリヒア・コリOrigamiB(DE3)を形質転換した。pET-22b(+)_CLE_Mを保有するエシェリヒア・コリ OrigamiB(DE3)pET-22b(+)_CLE_M/OrigamiB(DE3)株とも表す。   After mutagenesis PCR, using a PCR product digested with double-stranded DNA (pET-22b (+) _ CLE plasmid) treated with DpnI and transformed into Escherichia coli JM109 strain, using ampicillin resistance as an index, A strain having the desired plasmid containing the mutant lipase gene was selected. The target plasmid containing the mutant lipase gene was generically named pET-22b (+) _ CLE_M. PET-22b (+) _ CLE_M was isolated from the transformed strain, and Escherichia coli OrigamiB (DE3) was transformed. It is also referred to as Escherichia coli OrigamiB (DE3) pET-22b (+) _ CLE_M / OrigamiB (DE3) strain carrying pET-22b (+) _ CLE_M.

また、pET-22b(+)_CLE_Mについてその具体的な変異型を示す場合、pET-22b(+)_CLE_L181Fのように、「M」の部分を変異型の内容で置き換えて表示する場合がある。また、2種
以上の変異を含む場合には変異型を「/」で区切り、各々の変異型を列挙する場合がある。例えば、pET-22b(+)_CLE_A50P/I125Sは、pET-22b(+)_CLEに搭載するリパーゼの遺伝子にA50PおよびC125Sの変異が導入されたものである。各プラスミドに目的の変異のみが導入されていることは、塩基配列決定により確認した。
In addition, when pET-22b (+) _ CLE_M indicates a specific mutant type, the part “M” may be replaced with the content of the mutant type and displayed as in pET-22b (+) _ CLE_L181F. When two or more types of mutations are included, the mutant types may be separated by “/” and each mutant type may be listed. For example, pET-22b (+) _ CLE_A50P / I125S is obtained by introducing A50P and C125S mutations into the lipase gene carried in pET-22b (+) _ CLE. It was confirmed by nucleotide sequencing that only the target mutation was introduced into each plasmid.

〔実施例3〕リパーゼの発現
pET-22b(+)_CLE/OrigamiB(DE3)およびpET-22b(+)_CLE_M/OrigamiB(DE3)を、100μg/mlのアンピシリンを含むLB培地にて37℃で16時間振盪培養した。この培養液を、100μg/mlのアンピシリンを含むLB培地に適量加え、培養液の600nmにおける濁度(OD600)の値が1.0になるまで37℃で振盪培養した後、終濃度が0.5mMとなるようにイソプロピル-β-D-チオガラクトピラノシドを加え、25℃で18時間振盪培養した。
[Example 3] Expression of lipase
pET-22b (+) _ CLE / OrigamiB (DE3) and pET-22b (+) _ CLE_M / OrigamiB (DE3) were cultured with shaking at 37 ° C. for 16 hours in LB medium containing 100 μg / ml ampicillin. An appropriate amount of this culture solution is added to LB medium containing 100 μg / ml ampicillin, and after shaking culture at 37 ° C. until the turbidity at 600 nm (OD 600 ) of the culture solution reaches 1.0, the final concentration is 0.5 mM. Isopropyl-β-D-thiogalactopyranoside was added, and the mixture was cultured with shaking at 25 ° C. for 18 hours.

〔実施例4〕リパーゼ発現菌体からの粗抽出液の調製
1.5mLチューブに実施例3で得られた培養液を1mL取り、14000gで1分間遠心分離した。上清を廃棄し、沈殿した菌体に400μlの非イオン界面活性剤を含む細胞溶解液(CelLytic B, Sigma)を加え、2分間ボルテックスした。室温で10分間インキュベーションした後、14000gで5分間遠心分離し、上清を粗抽出液として得た。リパーゼが粗抽出液に含まれていることは、SDS-PAGEで対応する分子量のバンドが存在することと、後に述べる方法で粗抽出液がエステラーゼ活性を有することから確認した。なお、エステラーゼ活性の測定を行う際、粗抽出液をPBS(-)あるいは100 mM 酢酸ナトリウム pH5.5で10倍に希釈して用いた。
[Example 4] Preparation of crude extract from lipase-expressing cells
1 mL of the culture solution obtained in Example 3 was taken in a 1.5 mL tube and centrifuged at 14000 g for 1 minute. The supernatant was discarded, and 400 μl of cell lysate containing nonionic surfactant (CelLytic B, Sigma) was added to the precipitated cells and vortexed for 2 minutes. After incubation at room temperature for 10 minutes, the mixture was centrifuged at 14000 g for 5 minutes to obtain a supernatant as a crude extract. The presence of lipase in the crude extract was confirmed by the presence of a band of the corresponding molecular weight by SDS-PAGE and the fact that the crude extract had esterase activity by the method described later. When measuring the esterase activity, the crude extract was diluted 10-fold with PBS (-) or 100 mM sodium acetate pH 5.5.

〔実施例5〕リパーゼ発現菌体からの粗抽出液のエステラーゼ活性測定
エステラーゼ活性は、p-ニトロフェニルブチル酸を基質とした分光光度法により測定した。測定に用いる反応溶液として、体積比で4(w/w)% Triton X-100 52.6%、1M 酢酸バッファ(pH 5.5)10.5%、超純水36.9%からなる混合液に、終濃度が5.26mMとなるよう基質を溶かした溶液を調製した。反応液を95μLずつ96穴プレート(Nunc-Immuno Plate, 475094)に分注し、実施例4に記載した方法により得られる粗抽出液5μLを加えた。
[Example 5] Measurement of esterase activity of crude extract from lipase-expressing bacterial cells The esterase activity was measured by spectrophotometry using p-nitrophenylbutyric acid as a substrate. The reaction solution used for the measurement is 4 (w / w)% Triton X-100 52.6% by volume, 1M acetate buffer (pH 5.5) 10.5%, and ultra-pure water 36.9%. The final concentration is 5.26 mM. A solution in which the substrate was dissolved was prepared so that 95 μL of the reaction solution was dispensed into 96-well plates (Nunc-Immuno Plate, 475094), and 5 μL of the crude extract obtained by the method described in Example 4 was added.

反応液を37℃、20分間インキュベートし、反応を停止させるために150μLずつアセトンを加えた。上記操作後、吸光度計(Micro plate reader)にて410nmの吸光度を測定した。
100 mM 酢酸ナトリウム pH5.5で10倍希釈した粗抽出液を、60℃で20時間熱処理し、上記と同様にしてエステラーゼ活性を測定した。
The reaction solution was incubated at 37 ° C. for 20 minutes, and 150 μL of acetone was added to stop the reaction. After the above operation, the absorbance at 410 nm was measured with an absorptiometer (Micro plate reader).
The crude extract diluted 10-fold with 100 mM sodium acetate pH 5.5 was heat-treated at 60 ° C. for 20 hours, and the esterase activity was measured in the same manner as described above.

変異型1から20のリパーゼ粗抽出液の、熱処理前後におけるエステラーゼ活性の残存率を図2に示す。熱処理後、いずれの変異型リパーゼも、p-ニトロフェニルブチル酸を基質として、野生型リパーゼよりも高い割合でエステラーゼ活性を保持した。中でも、変異型11(C125S)は、60℃で20時間加熱処理を行っても高い活性保持率を示した。   FIG. 2 shows the residual rate of esterase activity before and after heat treatment of the lipase crude extracts of variants 1 to 20. After the heat treatment, all mutant lipases retained esterase activity at a higher rate than wild-type lipase using p-nitrophenylbutyric acid as a substrate. Among them, the mutant type 11 (C125S) showed a high activity retention even after 20 hours of heat treatment at 60 ° C.

60℃で20時間加熱処理した後の、野生型、変異型の残存エステラーゼ活性を図2に示す。野生型リパーゼより変異型リパーゼ、特に、C125Sが高い残存エステラーゼ活性を示した。   FIG. 2 shows the remaining esterase activity of wild type and mutant after heat treatment at 60 ° C. for 20 hours. Mutant lipase, particularly C125S, showed higher residual esterase activity than wild-type lipase.

また、これらの変異型リパーゼの、野生型リパーゼに対する相対加水分解活性を図3に示す。   Moreover, the relative hydrolysis activity of these mutant lipases with respect to wild-type lipase is shown in FIG.

野生型リパーゼと変異型リパーゼが何れもエステル分解活性を有することから、以下に示す、野生型リパーゼで実施した油脂分解およびその分解物を用いたL−リジン発酵が、変異型リパーゼを用いた油脂分解物でも可能であると考えられる。   Since both wild-type lipase and mutant-type lipase have esterolytic activity, the following oil-and-oil decomposition carried out with wild-type lipase and L-lysine fermentation using the decomposed product show fat and oil using the mutant-type lipase. It is thought that a decomposition product is also possible.

〔実施例6〕野生型リパーゼの精製
実施例3で得られたpET-22b(+)_CLE/OrigamiB(DE3)の培養液から遠心機を用いて菌体を回収し、100mM リン酸バッファ(pH 7.0)で菌体を懸濁した後、再び菌体を回収した。回収した菌体を適量の100mM リン酸バッファ(pH 7.0)で懸濁した後、超音波破砕機(INSONATOR 201M、KUBOTA)にて180Wで25分間超音波破砕を行った。得られた液を15000rpmで20分間遠心し、上清を回収後、再び15000rpmで20分間遠心し上清を回収した後、得られた上清を0.22μmのフィルター(MILLEX-GV、MILLIPORE)で濾過した。その後、得られた濾過液を、FPLCシステム(Akta explorer 10S、GE Healthcare Bio-Sciences)を用いた疎水相互作用クロマトグラフィーにて精製した。その具体的な手順を以下に示す。
[Example 6] Purification of wild-type lipase Cells were collected from the culture solution of pET-22b (+) _ CLE / OrigamiB (DE3) obtained in Example 3 using a centrifuge, and 100 mM phosphate buffer (pH After the cells were suspended in 7.0), the cells were collected again. The collected cells were suspended in an appropriate amount of 100 mM phosphate buffer (pH 7.0), and then subjected to ultrasonic crushing at 180 W for 25 minutes using an ultrasonic crusher (INSONATOR 201M, KUBOTA). Centrifuge the resulting solution at 15000 rpm for 20 minutes, collect the supernatant, and then centrifuge again at 15000 rpm for 20 minutes to collect the supernatant. The resulting supernatant is filtered with a 0.22 μm filter (MILLEX-GV, MILLIPORE). Filtered. Thereafter, the obtained filtrate was purified by hydrophobic interaction chromatography using an FPLC system (Akta explorer 10S, GE Healthcare Bio-Sciences). The specific procedure is shown below.

カラムには疎水相互作用カラム(HiLoad 16/10 Phenyl Sepharose High Performance、GE Healthcare Bio-Sciences)を用い、溶出液としてA液(100mM リン酸バッファ(pH
7.0))およびB液(エチレングリコール 80%、100mM リン酸バッファ(pH 7.0) 20%)を用いた。A液75%、B液25%の組成で溶出液を20.1ml流してカラムを平衡化した後、前記の濾過液をFPLCシステムへインジェクトし、さらにA液75%、B液25%の組成で溶出液を90.5ml流した。続けて、溶出液を265.5ml流す間に溶出液の組成がA液75%、B液25%からA液42%、B液58%へと直線的に変化するように溶出液を流した後、さらに溶出液を20.1ml流す間に溶出液の組成がA液42%、B液58%からA液0%、B液100%へと直線的に変化するように溶出液を流し、続けてB液100%の組成で溶出液を36.2ml流した。得られた各画分をSDS−PAGEにて分析し、目的のリパーゼのみ存在が確認された画分を回収し、実施例5の手順に従いエステラーゼ活性を有することを確認した。
A hydrophobic interaction column (HiLoad 16/10 Phenyl Sepharose High Performance, GE Healthcare Bio-Sciences) was used as the column, and solution A (100 mM phosphate buffer (pH) was used as the eluent.
7.0)) and solution B (ethylene glycol 80%, 100 mM phosphate buffer (pH 7.0) 20%). The column was equilibrated by flowing 20.1 ml of the eluate with the composition of 75% of A liquid and 25% of B liquid, and the above filtrate was injected into the FPLC system. Furthermore, the composition of 75% of A liquid and 25% of B liquid The eluate was run through 90.5 ml. After flowing the eluate so that the composition of the eluate changes linearly from 75% of solution A and 25% of solution B to 42% of solution A and 58% of solution B while flowing 265.5 ml of solution. In addition, while flowing 20.1 ml of eluate, flow the eluate so that the composition of the eluate changes linearly from 42% of solution A and 58% of solution B to 0% of solution A and 100% of solution B. 36.2 ml of the eluate was flowed with a composition of B solution 100%. Each obtained fraction was analyzed by SDS-PAGE, and the fraction in which only the target lipase was confirmed was collected and confirmed to have esterase activity according to the procedure of Example 5.

〔実施例7〕オリーブ油の加水分解反応物の調製
実施例6で得られた精製酵素液の溶媒を、分画分子量10,000Daの遠心式濃縮フィルターユニット(Amicon Ultra-15 10k、MILLIPORE)を用いて100mM NaClを含む10mM 酢酸バッファ(pH 5.5)に置換し、0.37mMの酵素溶液を調製した。この酵素溶液11mlとオリーブ油(Sigma-Aldrich)120mlと超純水120mlを1L三角フラスコに張り込み、30℃、180rpmの条件にて168時間振盪した。
[Example 7] Preparation of olive oil hydrolysis reaction product The solvent of the purified enzyme solution obtained in Example 6 was used using a centrifugal concentration filter unit (Amicon Ultra-15 10k, MILLIPORE) with a molecular weight cut off of 10,000 Da. The enzyme solution was replaced with 10 mM acetate buffer (pH 5.5) containing 100 mM NaCl to prepare a 0.37 mM enzyme solution. 11 ml of this enzyme solution, 120 ml of olive oil (Sigma-Aldrich) and 120 ml of ultrapure water were put into a 1 L Erlenmeyer flask and shaken for 168 hours at 30 ° C. and 180 rpm.

〔実施例8〕オリーブ油のエステル交換反応物の調製
実施例7と同じ酵素溶液11mlとオリーブ油(Sigma-Aldrich)120mlとメタノール(純正化学株式会社、特級試薬)1.64mlを1L三角フラスコに張り込み、30℃、180rpmの条件にて10時間振盪した。その後、メタノール1.64mlを添加し同条件で24時間振盪後、さらにメタノール1.64mlを添加し同条件で134時間振盪した。
[Example 8] Preparation of transesterification product of olive oil 11 ml of the same enzyme solution as in Example 7, 120 ml of olive oil (Sigma-Aldrich) and 1.64 ml of methanol (Pure Chemical Co., Ltd., special grade reagent) were placed in a 1 L Erlenmeyer flask. The mixture was shaken at 180 ° C. for 10 hours. Thereafter, 1.64 ml of methanol was added and shaken under the same conditions for 24 hours, and further 1.64 ml of methanol was added and shaken under the same conditions for 134 hours.

〔実施例10〕油脂分解物を炭素源に用いたL-リジン生産培養
L−リジン生産菌として国際公開第2006/078039号パンフレット記載のエシェリヒア・コリWC196ΔcadAΔldc/pCABD2 (以降、「WC196LC/pCABD2」と記載)を用いた。WC196LC/pCABD2を、ストレプトマイシン硫酸塩20mg/Lを含有するLB寒天培地(トリプトン10g/L、酵母エキス5g/L、NaCl 10g/L、寒天15g/L)にて37℃で24時間培養した。寒天培地上の細胞を掻き取り、本培養培地20mlを張り込んだ500ml容坂口フラスコに植菌し、37℃で48時間培養を行った。本培養培地には、野生型のリパーゼを用いて、実施例7のオリーブ油の加水分解反応物、もしくは実施例8のオリーブ油のエステル交換反応物、またはグリセロール(ナカライテスク社 試薬特級)を炭素源として用いた。
前記オリーブ油の加水分解反応物及びエステル交換反応物中のグリセロールは、いずれも固定化酵素電極法バイオセンサ(BF-5、王子計測機器株式会社)により測定した。測定されたグリセロールの量が40g/Lとなるように、各炭素源を培地に加えた。本培養培地の組成を以下に示す。
[Example 10] L-lysine production culture using fat and oil degradation product as a carbon source Escherichia coli WC196ΔcadAΔldc / pCABD2 (hereinafter referred to as "WC196LC / pCABD2") described in International Publication No. 2006/078039 as an L-lysine producing bacterium Used). WC196LC / pCABD2 was cultured at 37 ° C. for 24 hours in an LB agar medium (tryptone 10 g / L, yeast extract 5 g / L, NaCl 10 g / L, agar 15 g / L) containing 20 mg / L of streptomycin sulfate. Cells on the agar medium were scraped off, inoculated into a 500 ml Sakaguchi flask with 20 ml of the main culture medium, and cultured at 37 ° C. for 48 hours. In the main culture medium, a wild-type lipase is used as a carbon source of the hydrolysis reaction product of olive oil of Example 7, or the transesterification product of olive oil of Example 8, or glycerol (special grade reagent of Nacalai Tesque). Using.
Glycerol in the olive oil hydrolysis reaction product and transesterification reaction product was measured with an immobilized enzyme electrode biosensor (BF-5, Oji Scientific Instruments). Each carbon source was added to the medium so that the measured amount of glycerol was 40 g / L. The composition of the main culture medium is shown below.

[本培養培地組成]
炭素源 40g/L
酵母エキス 2g/L
FeSO4・7H2O 10mg/L
MnSO4・4H2O 10mg/L
KH2PO4 1.0g/L
MgSO4・7H2O 1g/L
(NH4)2SO4 24g/L
ストレプトマイシン硫酸塩 20mg/L
[Main culture medium composition]
Carbon source 40g / L
Yeast extract 2g / L
FeSO 4・ 7H 2 O 10mg / L
MnSO 4・ 4H 2 O 10mg / L
KH 2 PO 4 1.0g / L
MgSO 4・ 7H 2 O 1g / L
(NH 4 ) 2 SO 4 24g / L
Streptomycin sulfate 20mg / L

培養終了後、培地に残存するグリセロールの濃度を固定化酵素電極法バイオセンサにて、生育度を600nmにおける濁度(OD600)にて、それぞれ測定した。L−リジン量をバイオテックアナライザー(AS210、サクラ精機)にて測定した。各炭素源につきフラスコ2本ずつ培養を行った。その結果の平均値を表4に示す。 After completion of the culture, the concentration of glycerol remaining in the medium was measured with an immobilized enzyme electrode biosensor, and the degree of growth was measured with turbidity (OD 600 ) at 600 nm. The amount of L-lysine was measured with a Biotech Analyzer (AS210, Sakura Seiki). Two flasks were cultured for each carbon source. The average value of the results is shown in Table 4.

Figure 2012044869
Figure 2012044869

配列番号2、4及び6のアミノ酸配列(成熟タンパク質部分)のアラインメントを示す図。「X」は、3種のリパーゼで共通していないことを示す。「-」は、その位置にアミノ酸が存在しないことを示す。四角形で囲んだアミノ酸は、変異点を示す。アスタリスク(*)で示したアミノ酸は、配列番号2に示すCryptococcus sp.S-2のリパーゼに由来する変異型リパーゼの持つ他の変異点を示す。The figure which shows the alignment of the amino acid sequence (mature protein part) of sequence number 2, 4, and 6. FIG. “X” indicates that the three lipases are not common. “-” Indicates that no amino acid is present at that position. Amino acids surrounded by a rectangle indicate a mutation point. The amino acid indicated by an asterisk (*) indicates another mutation point possessed by the mutant lipase derived from the lipase of Cryptococcus sp. S-2 shown in SEQ ID NO: 2. 60℃、20時間で加熱処理前後における、野生型リパーゼと各変異型リパーゼの残存エステラーゼ活性を示す図。The figure which shows the residual esterase activity of wild-type lipase and each mutant-type lipase before and behind heat processing at 60 degreeC for 20 hours. 加熱処理前の、野生型リパーゼと各変異型リパーゼのエステラーゼ活性を示す図。The figure which shows the esterase activity of a wild-type lipase and each variant lipase before heat processing.

Claims (16)

配列番号7のアミノ酸配列、又は配列番号7において1若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、付加、又は逆位を含むアミノ酸配列を有し、かつ、下記(a)〜(q)から選択される変異を含む、変異型リパーゼ。
(a)32位のグリシンが他のアミノ酸残基に置換される変異
(b)50位のチロシンが他のアミノ酸残基に置換される変異
(c)95位のアラニンが他のアミノ酸残基に置換される変異
(d)126位のリジンが他のアミノ酸残基に置換される変異
(e)131位のシステインが他のアミノ酸残基に置換される変異
(f)133位のバリンが他のアミノ酸残基に置換される変異
(g)153位のグリシンが他のアミノ酸残基に置換される変異
(h)164位のロイシンが他のアミノ酸残基に置換される変異
(i)7位のXがアラニンであって、このアラニンが他のアミノ酸残基に置換される変異(j)42位のXがアラニンであって、このアラニンが他のアミノ酸残基に置換される変異
(k)83位のXがバリンであって、このバリンが他のアミノ酸残基に置換される変異
(l)88位のXがグルタミンであって、このグルタミンが他のアミノ酸残基に置換される変異
(m)154位のXがセリンであって、このセリンが他のアミノ酸残基に置換される変異(n)177位のXがアラニンであって、このアラニンが他のアミノ酸残基に置換される変異
(o)203位のXがアラニンであって、このアラニンが他のアミノ酸残基に置換される変異
(p)206位のXがリジンであって、このリジンが他のアミノ酸残基に置換される変異(q)209位のXがグリシンであって、このグリシンが他のアミノ酸残基に置換される変異
It has the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, or an amino acid sequence containing substitution, deletion, insertion, addition, or inversion of one or several amino acids in SEQ ID NO: 7, and from the following (a) to (q) A mutant lipase containing a selected mutation.
(A) Mutation in which glycine at position 32 is replaced with another amino acid residue (b) Mutation in which tyrosine at position 50 is replaced with another amino acid residue (c) Alanine at position 95 is replaced with another amino acid residue Mutation to be substituted (d) Mutation in which lysine at position 126 is substituted with other amino acid residues (e) Mutation in which cysteine at position 131 is substituted with other amino acid residues (f) Other valine at position 133 Mutation that is substituted with an amino acid residue (g) Mutation that replaces glycine at position 153 with another amino acid residue (h) Mutation that replaces leucine at position 164 with another amino acid residue (i) Position 7 Mutation in which X is alanine and this alanine is substituted with another amino acid residue (j) Mutation in which X at position 42 is alanine and this alanine is substituted with another amino acid residue (k) 83 X of the place is valine, and this valine is other Mutation to be substituted with amino acid residue (l) X at position 88 is glutamine, Mutation to which this glutamine is substituted with other amino acid residue (m) X at position 154 is serine, Mutation that is substituted with another amino acid residue (n) X at position 177 is alanine, and mutation that this alanine is substituted with another amino acid residue (o) X at position 203 is alanine, Mutation in which alanine is substituted with another amino acid residue (p) X at position 206 is lysine, Mutation in which this lysine is substituted with another amino acid residue (q) X at position 209 is glycine , Mutations that replace this glycine with another amino acid residue
前記(a)〜(q)の変異が、それぞれ下記(A)〜(Q)の変異である、請求項1に記載の変異型リパーゼ。
(A)32位のグリシンがアスパラギン酸に置換される変異
(B)50位のチロシンがアスパラギンに置換される変異
(C)95位のアラニンがアスパラギン酸に置換される変異
(D)126位のリジンがイソロイシンに置換される変異
(E)131位のシステインがセリン、トレオニン、イソロイシン、及びロイシンから選択されるアミノ酸残基に置換される変異
(F)133位のバリンがリジンに置換される変異
(G)153位のグリシンがプロリンに置換される変異
(H)164位のロイシンがグルタミンに置換される変異
(I)7位のアラニンがプロリンに置換される変異
(J)42位のアラニンがグルタミンに置換される変異
(K)83位のバリンがグルタミンに置換される変異
(L)88位のグルタミンがアスパラギンに置換される変異
(M)154位のセリンがイソロイシンに置換される変異
(N)177位のアラニンがプロリンに置換される変異
(O)203位のアラニンがロイシンに置換される変異
(P)206位のリジンがグルタミンに置換される変異
(Q)209位のグリシンがプロリンに置換される変異
The mutant lipase according to claim 1, wherein the mutations (a) to (q) are the following mutations (A) to (Q), respectively.
(A) Mutation in which glycine at position 32 is replaced by aspartic acid (B) Mutation in which tyrosine at position 50 is replaced by asparagine (C) Mutation in which alanine at position 95 is replaced by aspartic acid (D) Position 126 Mutation in which lysine is replaced with isoleucine (E) Mutation in which cysteine at position 131 is replaced with an amino acid residue selected from serine, threonine, isoleucine, and leucine (F) Mutation in which valine at position 133 is replaced with lysine (G) Mutation in which glycine at position 153 is replaced with proline (H) Mutation in which leucine at position 164 is replaced with glutamine (I) Mutation in which alanine at position 7 is replaced with proline (J) Alanine at position 42 Mutation substituted with glutamine (K) Mutation where valine at position 83 is replaced with glutamine (L) Glutamine at position 88 is replaced with asparagine Mutation (M) mutation where serine at position 154 is replaced by isoleucine (N) mutation where alanine at position 177 is replaced by proline (O) mutation where alanine at position 203 is replaced by leucine (P) position 206 Mutation in which lysine is replaced with glutamine (Q) Mutation in which glycine at position 209 is replaced with proline
前記(a)〜(q)から選択される変異が、前記(d)、(e)、(f)又は(o)の
変異である、請求項1に記載の変異型リパーゼ。
The mutant lipase according to claim 1, wherein the mutation selected from (a) to (q) is the mutation of (d), (e), (f), or (o).
前記(d)、(e)、(f)又は(o)の変異が、前記(D)、(E)、(F)又は(O)の変異である、請求項3に記載の変異型リパーゼ。   The mutant lipase according to claim 3, wherein the mutation (d), (e), (f) or (o) is the mutation (D), (E), (F) or (O). . 前記変異を有しないリパーゼが、下記(I)又は(II)のタンパク質である、請求項1〜5のいずれか一項に記載の変異型リパーゼ。
(I)配列番号2、4、又は6に記載のアミノ酸配列を有するタンパク質。
(II)配列表の配列番号2、4、又は6に記載のアミノ酸配列において、1若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入、付加、又は逆位を含むアミノ酸配列からなり、かつ、リパーゼ活性を有するタンパク質。
The mutant lipase according to any one of claims 1 to 5, wherein the lipase having no mutation is a protein of the following (I) or (II).
(I) A protein having the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 2, 4, or 6.
(II) an amino acid sequence described in SEQ ID NO: 2, 4, or 6 in the sequence listing, consisting of an amino acid sequence containing one or several amino acid substitutions, deletions, insertions, additions, or inversions, and a lipase Protein with activity.
請求項1〜5のいずれか一項に記載の変異型リパーゼをコードするDNA。   DNA encoding the mutant lipase according to any one of claims 1 to 5. 下記(i)又は(ii)の塩基配列を有し、かつ、前記アミノ酸配列における変異に相当する変異を有する請求項6に記載のDNA。
(i)配列番号1、3、又は5に記載の塩基配列。
(ii)配列表の配列番号1、3、又は5に記載の塩基配列又は該配列から調製され得るプローブと、ストリンジェントな条件下でハイブリダイズする配列。
The DNA according to claim 6, which has the following nucleotide sequence (i) or (ii) and has a mutation corresponding to the mutation in the amino acid sequence.
(I) The nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 1, 3, or 5.
(Ii) A sequence that hybridizes under stringent conditions with the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 1, 3, or 5 in the Sequence Listing or a probe that can be prepared from the sequence.
請求項6又は7に記載のDNAを含む形質転換微生物。   A transformed microorganism comprising the DNA according to claim 6 or 7. 前記形質転換微生物がエシェリヒア・コリである請求項6に記載の微生物。   The microorganism according to claim 6, wherein the transformed microorganism is Escherichia coli. 請求項8または9に記載の形質転換微生物を培地中で培養し、培地中および/または微生物中に請求項1〜5のいずれか一項に記載の変異型リパーゼを蓄積させることを特徴とする、変異型リパーゼの製造方法。   The transformed microorganism according to claim 8 or 9 is cultured in a medium, and the mutant lipase according to any one of claims 1 to 5 is accumulated in the medium and / or the microorganism. A method for producing a mutant lipase. 請求項1〜5に記載の変異型リパーゼを油脂に作用させて、グリセロールを生成させることを特徴とする、グリセロールの製造方法。   A method for producing glycerol, characterized in that glycerol is produced by allowing the mutant lipase according to claim 1 to act on oils and fats. 請求項1〜5に記載の変異型リパーゼを油脂に作用させて、グリセロールを生成させ、生成したグリセロールを炭素源として添加した培地で、グリセロール資化能を有し、かつ、目的物質を産生する微生物を培養し、目的物質を培養物中から採取する、目的物質の製造方法。   A mutant lipase according to any one of claims 1 to 5 is allowed to act on fats and oils to produce glycerol, and a medium to which the produced glycerol is added as a carbon source has glycerol utilization ability and produces a target substance. A method for producing a target substance, comprising culturing a microorganism and collecting the target substance from the culture. 請求項1〜5に記載の変異型リパーゼを油脂に作用させて、グリセロール及び脂肪酸を生成させ、生成したグリセロール及び脂肪酸を炭素源として添加した培地で、グリセロール及び脂肪酸の資化能を有し、かつ、目的物質を産生する微生物を培養し、目的物質を培養物中から採取する、目的物質の製造方法。   The lipase of claim 1 to 5 is allowed to act on fats and oils to produce glycerol and fatty acids, and the produced glycerol and fatty acids are added as a carbon source, and has the ability to assimilate glycerol and fatty acids, A method for producing a target substance, comprising culturing a microorganism that produces the target substance and collecting the target substance from the culture. 前記微生物が、コリネ型細菌、及び腸内細菌科に属する微生物から選択される細菌である請求項13に記載の方法。   The method according to claim 13, wherein the microorganism is a bacterium selected from a coryneform bacterium and a microorganism belonging to the family Enterobacteriaceae. 前記目的物質がL−アミノ酸である、請求項13又は14に記載の方法。   The method according to claim 13 or 14, wherein the target substance is an L-amino acid. 前記L−アミノ酸が、L−リジン、L−スレオニン、及びL−トリプトファンから選択される請求項15に記載の方法。   16. The method of claim 15, wherein the L-amino acid is selected from L-lysine, L-threonine, and L-tryptophan.
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