JP2011529132A - 耕作土壌または牧草地土壌の肥沃度を向上させるための固体無機組成物の使用 - Google Patents
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Abstract
Description
炭酸カルシウム 4.58〜77.8重量%
ドロマイト 3.85〜69.29重量%
塩化ナトリウム 5.7〜12.4重量%
リグノスルフェート 4.25〜8.49重量%
硫酸カリウム 0.37〜2.44重量%
酸化マグネシウム 0.01〜0.07重量%
元素状硫黄 0.009〜0.066重量%
から成る固体無機組成物(上記の各化合物の重量百分率は上記無機組成物の乾燥全重量に対する百分比)の、(i)ホスファターゼ、(ii)β−キシロシダーゼ、(iii)α−グルコシダーゼおよび(iv)β−グルコシダーゼの中から選択される土壌中に含まれる少なくとも一種の酵素の活性を増加させるための土壌の肥沃度向上での使用にある。
炭酸カルシウム 4.58〜77.8重量%、
ドロマイト 3.85〜69.29重量%、
塩化ナトリウム 5.7〜12.4重量%、
リグノスルフェート 4.25〜8.49重量%、
硫酸カリウム 0.37〜2.44重量%、
酸化マグネシウム 0.01〜0.07重量%、
元素状硫黄 0.009〜0.066重量%。
から成る固体無機組成物(上記の各化合物の重量百分率は上記無機組成物の乾燥全重量に対する百分比)の、(i)アルカリ性ホスファターゼ、(ii)β−キシロシダーゼ、(iii)α−グルコシダーゼおよび(iv)β−グルコシダーゼの中から選択される土壌中に含まれる少なくとも一種の酵素の活性を増加させるための土壌の肥沃度向上での使用にある。
重炭酸ナトリウム 0.007〜0.158重量%、
硫酸鉄 0.0009〜0.0434重量%、
硫酸マンガン 0.004〜0.040重量%、
酸化亜鉛 0.0006〜0.0040重量%、
沃化カリウム 0.0004〜0.0032重量%、
硫酸銅 0.0002〜0.0040重量%、
硼酸 0.0006〜0.0040重量%。
(各化合物の重量百分率は上記無機組成物の乾燥全重量に対する百分比)
45.78重量%の炭酸カルシウム、
38.49重量%のドロマイト、
9.52重量%の塩化ナトリウム、
5.66重量%のリグノスルフェート、
0.49重量%の硫酸カリウム、
0.014重量%の酸化マグネシウム、
0.015重量%の元素状硫黄および
重炭酸ナトリウム、硫酸鉄、硫酸マンガン、酸化亜鉛、沃化カリウム、硫酸銅および硼酸の中から選択される化合物またはその少なくとも2つの化合物の組合せの適切な量
(各化合物の重量百分率は上記無機組成物の乾燥全重量に対する百分比)
ホスファターゼ活性用: 4-ニトロフェニルのジ-またはトリ−リン酸塩、
β−グルコシダーゼ活性用: 4-ニトロフェニルβ−-D-グルコピラノシド、
β−キシロシダーゼ活性用:4-ニトロフェニルβ-キシロシド、
α−グルコシダーゼ活性用:4-ニトロフェニルα−グルコシド。
以下、本発明の実施例を示す。
A.1.材料
土壌はタルドノワ地域(フランス国ピカルディ(Picardie)地域)から集めたシルト質粘土の農業用土壌を用いた。土壌を任意にサンプリングした後、室温で乾燥し、網目サイズ2mmの篩でふるいにかけた。
マイクロコズム(microcosms)は1kgの乾燥した土を含むプラスチックポットである。これを屋外でその限界まで繰り返し水気に触れさせた。対象となるポットには6g/kgの乾燥した土のバイオマスにミミズを加えた。また、対象となるポットには1グラムのライグスクの種を植えた。ライグスクの胚が約5cmに達したときミミズをポットに加えた。
1グラムの土壌を、5ml、4℃の蒸留水中に再懸濁した。この再懸濁液が酵素アッセイの生エキスになる。
1.ヘテロシダーゼ(Heterosidase)分析(PNP)
反応物の準備:
(a)Na2CO3:2グラムを蒸留水100mlに溶解させた。
(b)酵素基質:10mlの水に80mgの下記基質を溶解して溶液を作った。
(1)4-ニトロフェニルジ(トリ)リン酸塩(PHP-リン酸塩):この基質によって、有機リン酸塩の無機化による酵素フォスファターゼの活性をみることができる。
(2)4-ニトロフェニル−β-D-グルコピラノシド(PNP-β-グルコシド):この基質を加水分解することでセルロース分解の最後の段階によるβグルコシダーゼの活性を与えることができる。
(3)4-ニトロフェニル N-アセチル-β-D-グルコサミン (PNP N-アセチル-β-D-グルコサミン):キチンは、土壌中に幅広く分布し、節足動物の上皮から得られ、複数の菌類の細胞膜抗生物質である基質である。この基質のキチナーゼ及びN-アセチル-グルコサミニダーゼ媒介分解は、炭素サイクル及び窒素サイクルの両方による、アミノ糖放出の最初の段階である。
(4)4-ニトロフェニルβ-キシロシド(PNP-b-D-キシロイド)はキシラン(植物の細胞壁中に多く含まれる物質の一つ)の分解の最終段階によるβ-キシロダーゼを通じて加水分解する。
(5)4-ニトロフェニル α-グルコシド(PNP-a-グルコシド):この基質を加水分解したα-グルコシドは、澱粉の分解による酵素の一つである。
これらの溶液はスモーク瓶で4℃で保存した。
(d)pH9のホウ酸塩緩衝液:0.1Mの塩酸10mLが、0.1Mホウ酸ナトリウム90mLとを組合せた。
緩衝溶液は4℃で保存した。
アッセイはマイクロプレートで行った。各酵素(酸ホスファターゼ、アルカリフォスファターゼ、β-グルコシダーゼ、α-グルコシダーゼ、β-キシロダーゼ)毎に1つのブランク、3つの対照基質、3つの対照酵素、3つのアッセイを、以下の手順で行った。
(1)ブランク:蒸留水100μlと、テスト酵素に応じてpH5または9のMac llvain 緩衝液 25μl
(2)対照基質:蒸留水50μlと、pH5のリン酸塩緩衝液25μl又はアルカリフォスファターゼのためのpH9のホウ酸塩緩衝液と、PNP基質50μl
(3)対照酵素:蒸留水50μlと、pH5または9のMc llvain 緩衝液 25μlと、酵素基質(アース)50μl
(4)アッセイ:PNP基質50μlと、pH5または9のMc llvain 緩衝液 25μlと、酵素基質(アース)50μl。
予め求めた標準範囲から始めてODとフェノール量と間の関係は下記の式で与えられる:
X(フェノール(μg))=OD計算値×1.14
(ここで、計算値=ODアッセイ−(OD対照基質+OD対照酵素)である)
酵素活性は土壌/h当たりに対する放出されたフェノール量/gで定義される。
反応物の調整:
(1)FDA:10mLのアセトンに溶解した0.3gmpFDAを、ガラス瓶にそれぞれ1mLずつ均等に分配する。-20℃で保存されたこの溶液は、貯蔵液である。アッセイを行う前にこの貯蔵液を即座に1:10に希釈した。
(2)pH7のリン酸塩緩衝液:0.1Mクエン酸6.5mL + Na2HPO4, 12H2O (0.2 M)。
アッセイはマイクロプレートで行った。各測定で1つのブランク、3つの対照基質、3つの対照酵素、3つのアッセイを以下の手順で行った。
(1)ブランク:水150μlと、pH7のリン酸塩緩衝液50μl、
(2)対照酵素:水150μlと、pH7のMac llvain 緩衝液50μlと、土壌100μl、
(3)対照基質:水100μlと、pH7のMac llvain 緩衝液50μlと、FDA(希釈液)50μl、
(4)アッセイ:土壌100μlと、pH7のMac llvain 緩衝液50μlと、FDA 50μl。
FDAについては酵素活性を土壌/h当たりのフルオレセイン量/gで表される。
標準範囲を定めることで下記の式によってODとフェノール量(μg)との関係を知ることができる。
X(フルオレセイン、μg)=OD計算値×0.086
土壌に適応する様々な処置を有する優性及び/又は対象微生物集団に特異的な16SリボソームDNA遺伝子配列決定のために、DNAをアルコールに含まれる土壌サンプルから再抽出した。
土壌からDNAを抽出するために選択した方法はCTBA緩衝液(セチル-トリメチル-アンモニウム臭化物:Cetyl-Trimethyl-Ammonium Bromide)が用いる方法である。それぞれ500mgの土壌サンプル24(8つのモダリティー(様相、modalities)):S, S+P, S+M, S+V, S+V+P, S+P+M, S+V+M, S+V+M+P、の3回の繰り返し)を回収し、セラミック、シリカ、ガラスビーズ(Lysing Matrix E, MP Biomedicals社)に導入して、1000μLの抽出緩衝液CTABと混合した。FastPrep-24型(MP Biomedicals社)を用いて、6.5m/sで45秒間、細胞溶解を行った。その後試料を65℃の水浴で1時間培養した。Phase Lock Gel Tubes (VWR社)と組合せたフェノール・クロロホルム・イソアミル基(24:24:1)及びクロロホルム・イソアミル基(24:1)を用いて、核酸を抽出及び培養した。PEG (ポリエチレングリコール)を用いて DNAを抽出し、ペレットを70度のエタノールで洗浄し、50μLの緩衝液EB(トリス塩酸)を用いて回収した。3回の繰り返しで抽出したDNAは、その後の反応に十分な量となるように、8つのモダリティー(様相、modalities)全てでまとめた。よって、DNAの量が確保でき、分光光度計(Nanodrop社)を用いて、純度を評価(フミン酸及びタンパク質の欠如)できた。
TC-3000型(Techne社)サーモサイクラーを用い、ユニバーサルバクテリアプライマーを使って、PCR(ポリメラーゼ連鎖反応)を行った。各プライマー0.25μL、10μL のPCT緩衝液10X、MgCl2を1.5mM、dNTP(デオキシヌクレオシド三リン酸)を0.2mM、6UのTaq Polymerase、15〜80ngのDNAマトリックス、減菌水を最終体積100μL、各反応に加えた。PCRに用いたプライマーは、518r(5'- ATT ACC GCG GCT GCT GG- 3' - SEQ ID NO:1)及びGC-338f (5' - CGC CCG CCG CGC GCG GCG GGC GGG GCG GGG GCA CGC GGG GAC TCC TAC GGG AGG CAG CAG-3' - SEQ ID NO:2)であり、バクテリア(約200pb)内の16SリボソームDNAの可変領域V3を正確に増幅した。GC-338fプライマーの5‘末端に付加するGCリッチ配列(GCクランプ)が、DGGEを通してのPCR断片の分離中に全二重らせん変性を阻害した。PCR増幅は、94℃で5分間の初期変性することに始まり、以下の32のサイクルが続く:1)94℃で30秒間の変性、2)54℃で45秒間のハイブリダイゼーション、3)72℃で1.5時間のエクステンション。最後に、72℃で20分間最終エクステンションした。
PCR生成物は、1X濃縮のSYBR Safe(Invitrogen社)を用いて2%のアガロースゲルに沈着した。PCR断片はUVプレート上に可視化され、SmartLadder 型の量サイズマーカー、(Eurogentec社)を用いて定量化した。
DGGEアッセイ(変性ポリアクリルアミドゲル電気泳動勾配)をDCode Universal Mutation Detection システム(Bio-Rad)上で行った。PCR生成物サンプル(100μLたとえば約500 ng)を、TAE(トリス酢酸EDTA) 0.5X中で、8%のポリアクリルアミドゲル上にロードした。30〜70%の線的な変性勾配を有するポリアクリルアミドを得るために、11.2mLの溶液0%(アクリルアミドを20mL、50X のTAEを2mL、水を適量、合計100mL)及び4.8mLの溶液100% (アクリルアミド20mL、50XのTAEを2mLホルムアミドを40mL、尿素を42 g 、水を適量、合計100mL)を混合し、低溶液(30%)を得た。同様に、4.8mLの溶液0%、11.2mLの溶液100%を混合し、高溶液(70%)を得た。60℃で16時間、電圧75Vで電気泳動を行った。泳動後、ゲルをエチジウムブロマイドバスに浸し、UV下で写真を撮影した。外科用メスを用いて、有意なバンドを切り出し、回収した。
バンドに含まれるDNAは、切り出したバンドを、50μLの超純水中で、4℃において一晩置いておくことにより、個別に溶出した。上記プロトコルによりPCRによってバンドを個別に増幅させるために、2μLの溶出液を用いた。PCR生成物それぞれに単一バンドが存在することを確認するために、PCR生成物をDDGEゲル(勾配30〜50%)上の、オリジナル試料の付近に沈着した。この作業を、PCR生成物それぞれに単一バンドが現れるまで繰り返した。純粋PCR生成物をシークエンシング(Gexbyweb、Genome Express社)にトランスミットした。
1.プロファイルのグラフ分析及び静的分析
ゲルイメージを復元し、Quantity One software v4.6.5 (Biorad社)を用いて分析することで、DGGEプロファイルのバンドを自動的に検出することができるようになった。プロファイルバンドを表すバイナリマトリックスは、以下のように行った:同一ゲルのすべての試料中に検出されうるバンドに関し、バンドが存在する場合には「1」をコードし、存在しない場合には」「0」をコードする。このバイナリマトリックスに基づき、類似係数を用いることで、距離行列(distance matrix)を作ることができる。ここでは、Dice係数(SDice = 2NAB / (NA + NB) :ここで、NA 及び NB はそれぞれ試料A及びBのバンド数を表し、NAB は共通バンドの数を表す)を用いることができる。UPGMA グルーピング (Unweighted Pairwise Grouping with Mathematical Average)及び近接結合法を用いて距離行列を分析することで、そこからすべての異なる試料間の距離を図形的に示す系統樹を推測することが可能になった。
配列のクロマトグラフを復元しChromas LITE software version 2.01を用いて可視化して、配列を手作業で回収できるようにした。BLAST分析を通じてNCBIデータバンクから得られるシークエンスと、上記配列を比較したところ、テスト配列と比較した場合に比べて同一性スコアが最も高い配列を示した。Ribosomal Database Project II Classifierを用いて分類学的地位分析を行った。
CLUSTALWを用いて、得られた配列を、M7部位のバクテリア、TM6の2配列、第一郡シロアリの2配列、NCBIデータベースから入手できる緑色非硫黄細菌の2配列を表す47配列に並べた。配列(140pb)をSEAVIEWプログラムを用いて手作業で回収した。MEGA4を用いてブートストラップ反復を1000回繰り返すことで、最終的には隣接して連結する樹が得られた。
実施例1
土壌酵素活性における式(I)の組成物の効果
酵素活性測定の結果全てが[図1]に表されており、それぞれ:全酵素活性([図1A])、酸ホスファターゼ活性([図1B])、アルカリホスファターゼ活性([図1C])、β-グルコシダーゼ活性([図1D])、β-キシロターゼ活性([図1E])、α-グルコシダーゼ活性([図1F])、N-アセチル-グルコサミニダーゼ([図1G])である。
テストした酵素の種類にかかわらず、植物に覆われていない土壌とミミズがいない土壌の間では、式(I)の無機組成物を処理しようがしまいが、大きな上昇は見られなかった。同様に、有害な効果も一切見られなかった。
FDA分解は、式(I)の無機組成物の存在によって影響を受けることはなかった。式(I)の無機組成物の存在下での酸ホスファターゼ、β-グルコシダーゼ、N-アセチル-グルコサミニダーゼの活性は、管理下で測定した場合に比べ、高かった。しかしながら、変動性があるため、見られる差異は5%の誤差であり、重大ではない。一方で、アルカリホスファターゼ、β-キシロターゼ、α-グルコシダーゼの活性は、それぞれ増倍率10、4、4と著しく上昇している。
(1)土壌酵素活性において、式(I)の酵素活性の効果がある、
(2)酵素活性がマイナーな酵素にも適用できる、
式(I)の無機組成物をミミズ(lumbricus)の存在下で土壌に加えたときに、2つの酵素の酵素活性を著しく上昇した。これらの酵素はβ-キシロターゼであり、酵素活性が6倍になり、α-グルコシダーゼは、土壌sec-1 h-1中の対照活性が25から112Ugに上昇した。他のテストした酵素の活性に変化はなかった。
ミミズ及びライグスクの存在下では、式(I)の無機組成物によって、3の要素によりアルカリホスファターゼの活性が、1.5の要素によりβ-グルコシダーゼの活性が、2.5の要素によりβ-キシロターゼの活性が、4の要素によりαグルコシダーゼの活性が上昇した。
この分析は、様々なテストされたモダリティー(様相、modalities)(植物及び/又はミミズ等)に依存する土壌酵素活性における、式(I)の無機組成物の効果の存在を統計的に無効化することを目的とする。
[図2A]に示す相関円は、35%の全分散を表す軸1は、アルカリホスファターゼ、αグルコシダーゼ、β-キシロターゼの活性及びFDA分解により定義されることを示す。21%の分散に対応する軸2は、同様に酸ホスファターゼ、N-アセチル-グルコサミニダーゼ、β-グルコシダーゼの活性より定義される。
[図2B]に示すように、両軸のオブジェクト投影は、式(I)の無機組成物の処理と様々な対照処理の明らかな差異を有する。従って、テストした酵素プロファイルにおける式(I)の無機組成物には実際に効果があることがわかる。
[図1A]〜[図1G]に示す素活性測定の結果は、本明細書の末尾の[表1]に示した。
“S”は植物に覆われておらず、ミミズもいない土壌を意味し、
“S+M”は、式(I)の無機組成物で処理した土壌“S” を意味し、
“S+V”は、植物に覆われていないが、ミミズはいる土壌を意味し、
“S+V+M”は、式(I)の無機組成物で処理した土壌“S+V”を意味し、
“S+P”は、植物に覆われているが、ミミズはいない土壌を意味し、
“S+P+M”は、式(I)の無機組成物で処理した土壌“S+P”を意味し、
“S+V+P”は、植物に覆われており、ミミズもいる土壌を意味し、
“S+V+P+M”は式(I)の無機組成物で処理した土壌“S+V+P” を意味する。
また、土壌酵素ポテンシャルを有機材料の無機化を最適化するために式(I)の無機組成物を加えることで、主要成分の分析を通じて証明されたことが、確認された。しかしながら、得られた結果は、式(I)の無機組成物の有利な結果は下記に依存することを示している。
2つのメジャーな活性すなわち本土壌を特徴付ける酸ホスファターゼとβ-グルコシダーゼの活性は式(I)の無機組成物の影響を最も受けている酵素ではない。実際に、こうした有利な効果は、「マイナーな」酵素(土壌でのパフォーマンスではなく、活性レベルに関して)、例えばβ-キシロターゼ、αグルコシダーゼ、アルカリホスファターゼに見ることができる。これは、式(I)の無機組成物によって、他の活性を一切減少させることなく、土壌プロファイルを「再バランス」することができることを意味している。
実際に、テストしたモダリティー(様相、modalities)(ライグスク/オオミミズの存在又は欠如)に依存すると、得られる結果は明らかに異なる。従って式(I)の無機組成物の効果は、生きている生物(植物/動物)に依存する。この結果は、式(I)の無機組成物は、土壌中のある生物学的活性を刺激する触媒として働くということを強く示唆している。
土壌微生物集団における式(I)の無機組成物の影響
PCRで増幅した16S rRNA遺伝子断片(8つのマイクロコムスで得られたもの)のDGGE分析を、細菌集団の遺伝的多様性の変化の可視化と比較し、様々な処理をした。DGGEプロファイルの外観調査によって、細菌集団の数は、土壌に施した処理の結果、実質的な変化はなかった。対照的に、優位な細菌集団は、土壌に施した処理に応じて、かなり異なるようであった。
結果を[図3]に示す。式(I)の無機組成物によって、土壌のみ(プロファイルS)に比較して、細菌集団の構造内で変化が起こる。土壌のみ(in red)の中の支配的な集団は、式(I)の無機組成物を加えた土壌ではもはや支配的ではなかった(バンドが消えたか、薄くなった)。しかしながら、バンドの消失/濃度の減少は、必ずしも関連する分類群(taxon)の喪失と解釈すべきではない。実際に、単に集団の密度に関する変化を反映しているだけかもしれない。というのも、ある集団が増加すると、他の集団を、DGGEを検出できる閾値未満に減少させてしまうことがあるからである。式(I)の組成を加えた土壌では、土壌に既に他の集団が存在したにもかかわらず、支配的に存在するある微生物集団が見られた(in green)。これは、組成(I)の存在下でのこの集団の成長か、土壌にのみで存在していた集団が衰退したかどちらかを示唆していると考えられる。この最後の仮説は、組成(I)で処理した土壌、すなわちモジュレータとして働く土壌サンプルのバンド濃度プロファイルがより相同(homogenous)であるという事実により確認できるだろう。
結果は[図4]に示す。ライグラスの存在下(プロファイルS+P)で、微生物集団の構造が、土壌のみの場合に比べ、劇的に変化した。支配的な集団の中で、土壌のみでは見られなかったかなり優位な集団(バンド9)が観察された。
ライグラスの存在下で組成物(I)を加えることで、これらの支配的な集団は見ることができなくなった。このプロファイルの中で最も濃く見えるバンドEは、組成物(I)の存在下で活性化したか、ライグラスのみの存在下で支配的であった集団が衰退した結果支配的になったかのいずれかであろう。
従って、組成物(I)は間違いなく土壌に存在する微生物集団においてモジュレータとして働くことが見てとれる。
結果を[図5]に示す。ミミズの存在下(プロファイルS+V)で、土壌中の細菌集団も再設計されたようである。かなり多くのバンドが共通であるが、集団の相対比率はかなり修正された。特筆すべきは、ミミズの存在下における3つの支配的な集団である(バンド1、4、7)。
ミミズの存在下で組成(I)を加えた結果、集団間でいまだはっきり異なった構造を有していた。プロファイルS+Vに共通の集団が実際に観察できたら、それらの相対比率は変化していると考えられる。実際に、バンドAと6に対応する集団の支配は少なく、一方でバンド3に対応する集団は、組成(I)の存在下で支配的になった。このバンド3は、プロファイルS+V(配列参照)で検出されるバンドCには対応しない。
濃いバンド、すなわち支配的なグループは存在するが、組成(I)の存在下におけるすべてのプロファイルのについて、PRP効果は、比較的均一な密度を有する微生物個体群の高い多様性として表されることが観察できる。この場合、組成(I)は、ミミズの存在下でもモジュレータの役割を果たすことが見てとれる。
結果を[図6]に示す。ライグラスとミミズの組み合わせ(プロファイルS+V+P)は、土壌中のみ(プロファイルS)と比較して、細菌集団に実質的な効果を有する。バンドDと8に対応する集団が支配的になった。
ライグラス及びミミズの存在下で組成(I)を加えた結果、細菌集団が劇的に変わった。バンドDと8に対応する集団はもはや支配的ではなく、他の集団(in green、配列は得られていない)は組成(I)を通じて直接活性化したか、他の集団が衰退した利益を受けたかのいずれかであろう。この場合、他のモダリティー(様相、modalities)に見られる組成(I)の調節作用(modulating effect)はあまり際立っていない。
支配的細菌集団における式(I)の無機組成物の効果の特異性
バンドの存在(すなわち細菌集団の存在)及びその濃度を考慮しつつ各種処理について類似の研究を行った([図7])。この分析は下記の2つのシナリオからなる:
(1)組成物(I)の効果はあまり無い。この場合、組成物(I)を含まない土壌の細菌プロファイルは組成物(I)で処理した同じ土壌の細菌プロファイルとかなり類似するであろう。[図7]に示す類似系統樹において、これら2つのmodalitiesは起源を同じにするか、近接する。
(2)組成物(I)の効果が著しい。この場合、組成物(I)で処理した土壌の細菌プロファイルの類似係数は、組成物(I)で処理していない同じ土壌の細菌プロファイルに比べて低い。系統樹におけるそれぞれの位置は比較的相互に離れている。
支配的細菌集団に対応する16S rDNAの配列決定による同定アッセイ
A シークエンシングに用いるDGGEゲル
[図8]はDGGEゲルを回収し、精製し、シークエンシングした様々なバンドを表している。これらのバンドは、比較的プロファイルの濃度が高いため選択された。なお、精製に難があったため、優位なバンドにもシークエンスできなかったものがあった。
組成物(I)(S+M)加えた土壌(S+M)において、ひとつの細菌集団が支配的に示された(バンド15)。BLAST分析では、この群と不可耕細菌分類群、すなわち形態学的に非同一構造の群(Access number Genbank: EF 157158. 同一性パーセント: 97%)とを比較した。RDPII Classifier(http://rdp.cme.msu.edu/classifier/classifier参照)によれば、こうした集団は、割り当て率91%を有するバクテリア部位TM7に関連する可能性がある。上記のこの部位は周囲に広く分布する部分を有する。土壌では部位TM7の細菌は、根圏及び泥炭層中に証拠付けることができる。
バンド9の16S rDNAのシークエンシングではライグラスを含む土壌に極めて支配的なこの集団を同定することができない。実際に、BLAST分析(access number Genbank EU134275. 99% の同一性)によると、最も類似する配列はプレーリー土に由来する未同定の細菌クローンに対応する([表2]参照)。
ライグラスの存在下で組成物(I)を加えることで、バンドEは最も濃くなったようである。16S rDNAシークエンシングは、比較的近隣の配列はアクセス番号EU283406(98%の同一性, 活性スラッジに由来する集団)に対応することを示している(表2参照)。RDPII Classifierによれば、この集団は、割り当て率97%を有する細菌分裂TM7に関連する。
ミミズを含む土壌(S+V)に関しては、分子分析及び分類学的地位分析によれば、3つの集団(バンド1、4、7)が細菌分裂TM7(それぞれの近隣の配列: AN EU283406, 98%の同一性; AN AJ232811, 99%の同一性、AN AF269024, 99%の同一性)に関連する([表2])。系統発生分析([図2])により、これらの分類が確認できる。農業用土壌に由来する配列DQ 828869(同一性98%)と類縁にあるが、集団Cは、同定された細菌群と、これまで関連を有していない。
ミミズ+組成物(I)(S+V+M)の場合、プロファイルS+Vに共通の集団が明らかになるが、それらの相対比率は変化すると考えられる。実際に、例えば、バンドA(idem 1, division TM7)に対応する集団は、PRP無機生成物の存在下では、より支配的ではない。一方で、バンド1、4、7に対応する集団は、プロファイルS+Eにおいて支配的に際立っているのに対し、プロファイル(S+E+M)の支配的集団は、バンド6(比較的近隣の配列: AN AF269024, 99%, division TM7)及び3(比較的近隣の配列: AN AY820689, 99% identity, division TM7)に対応する集団である。
なお、興味深いことに、試料S+V+PにおいてバンドDに対応する集団(プロファイルS+V+Pにおいて優位)は、バンドE(プロファイルS+P+Mにおいて優位)、1(プロファイルS+Vにおいて優位)、A(プロファイルS+P+Mにおいて優位)に対応する集団と同一(あるいは非常に類似)であり、すなわち、division TM7に関連する細菌である。ミミズ/ライグラス混合(S+V+P)において、バンド8に対応する他の支配的集団は、分子的に同定できなかった。BLASTによって見つかった比較的近隣の集団は、実際は、アメリカヤマナラシ(AN EF020305. 、同一性97%)に関連する土壌に由来する未同定細菌群であり、RDPII分類学的地位によって部位の配列と関連することはできない。
植生バイオマスの生成における式(I)の無機組成物の効果
結果を[図10A]及び[図10B]に示す。
式(I)の無機組成物の存在下におけるライグラスの生成により、バイオマス乾燥重量の劇的な倍加が可能になった。ミミズの存在下でも、同様の傾向が見られた。
Claims (9)
- 下記の式(I):
炭酸カルシウム 4.58〜77.8重量%
ドロマイト 3.85〜69.29重量%
塩化ナトリウム 5.7〜12.4重量%
リグノスルフェート 4.25〜8.49重量%
硫酸カリウム 0.37〜2.44重量%
酸化マグネシウム 0.01〜0.07重量%
元素状硫黄 0.009〜0.066重量%
から成る固体無機組成物(上記の各化合物の重量百分率は上記無機組成物の乾燥全重量に対する百分比)の、(i)ホスファターゼ、(ii)β−キシロシダーゼ、(iii)α−グルコシダーゼおよび(iv)β−グルコシダーゼの中から選択される土壌中に含まれる少なくとも一種の酵素の活性を増加させるための土壌の肥沃度向上での使用。 - 固体無機組成物が(i)アルカリホスファターゼ、(ii)β-キシロシダーゼ、(iii)α−グルコシダーゼおよびβ-グルコシダーゼの中から選択される少なくとも一つの酵素の活性を1.5倍、好ましくは少なくとも2倍に増加させる請求項1に記載の使用。
- 上記固体無機組成物がホスファターゼの活性を少なくとも2倍に増加させる請求項1に記載の使用。
- 上記固体無機組成物がβ−キシロシダーゼの活性を少なくとも2倍に増加させる請求項1に記載の使用。
- 上記固体無機組成物がα−グルコシダーゼの活性を少なくとも2倍に増加させる請求項1に記載の使用。
- 上記固体無機組成物がβ-グルコシダーゼの活性を少なくとも2倍る増加させる請求項1に記載の使用。
- 上記無機組成物が、土壌中に存在するバクテリアタクソン(taxons bacteriens)の優性比(rapports de predominance)を検出可能な程度に変化させる請求項1に記載の使用。
- 上記固体無機組成物が土壌の植物バイオマスの生産を少なくとも1.5倍増加させる請求項1または2に記載の使用。
- 肥沃化すべき土壌中に式(I)の無機組成物をm2当たり少なくとも0.01kg且つ0.10kg/m2までの量、好ましくは0.02〜0.04kg/m2の量だけ加えられる請求項1〜8のいずれか一項に記載の使用。
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