JP2010000055A - Method for predicting development of secondary failure in advance when sulfonylurea agent is administered, and examination kit, primer, and probe used for the same method - Google Patents

Method for predicting development of secondary failure in advance when sulfonylurea agent is administered, and examination kit, primer, and probe used for the same method Download PDF

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Abstract

<P>PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a method for pre-examining whether or not secondary failure is easily developed by administration of a sulfonylurea agent, and to provide an examination kit, a primer, and a probe used for the method. <P>SOLUTION: The method for predicting the development of the secondary failure in advance when the sulfonylurea agent represented by general formula (I): R<SB>1</SB>-SO<SB>2</SB>NHCONH-R<SB>2</SB>is administered includes collecting a gene from a subject; and detecting the presence or absence of at least one kind of polymorphism selected from among the group consisting of (A) 596C>T polymorphism of GPX1 gene; (B) IVS15-3T>C polymorphism of ABCC8 gene; (C) 79A>C polymorphism of HNF1A gene; (D) -1123A>G polymorphism of NFE2L2 gene; and (E) IVS15-29246C>T polymorphism of KCNQ1 gene. The examination kit, the primer, and the probe are used for the method. <P>COPYRIGHT: (C)2010,JPO&INPIT

Description

本発明は、スルホニルウレア剤を投与した場合の二次無効の発生を事前に予測する方法、並びに、該方法に用いられる検査キット、プライマー及びプローブに関し、更に詳しくは、GPX1遺伝子、ABCC8遺伝子、HNF1A遺伝子、NFE2L2遺伝子、又は、KCNQ1遺伝子の多型の有無を検出することにより、スルホニルウレア剤を投与した場合の二次無効の発生を事前に予測する方法、該方法に用いられる検査キット、並びに、GPX1遺伝子及びNFE2L2遺伝子の多型の有無を検出するためのプライマー及びプローブに関する。   The present invention relates to a method for predicting the occurrence of secondary ineffectiveness in the case of administering a sulfonylurea agent, and a test kit, primer and probe used in the method, and more specifically, GPX1 gene, ABCC8 gene, HNF1A gene , A method for predicting the occurrence of secondary ineffectiveness when a sulfonylurea is administered by detecting the presence or absence of a polymorphism of the NFE2L2 gene or the KCNQ1 gene, a test kit used in the method, and the GPX1 gene And a primer and a probe for detecting the presence or absence of a polymorphism in the NFE2L2 gene.

糖尿病は、一度発症すると治癒することのできない進行性の疾患であり、網膜症・腎症・神経障害などの合併症を引き起こすことが知られている。また、糖尿病に伴う動脈硬化症は、虚血性心疾患や脳血管障害の原因となり、予後に重大な影響を及ぼす。このように、糖尿病は患者のQOL(Quality of Life)を著しく低下させるのみならず、医療経済的にも、社会に大きな負担を強いており、今後もその患者数は増大するものと考えられる。   Diabetes is a progressive disease that cannot be cured once it develops, and is known to cause complications such as retinopathy, nephropathy, and neuropathy. In addition, arteriosclerosis associated with diabetes causes ischemic heart disease and cerebrovascular disorder, and has a profound effect on prognosis. Thus, diabetes not only significantly lowers the quality of life (QOL) of patients, but also imposes a heavy burden on society in terms of medical economics, and the number of patients is expected to increase in the future.

現在、我が国で継続的に治療を受けている糖尿病患者は約250万人に達しており、糖尿病予備軍を含めると1870万人となる。日本人における糖尿病の95%以上は2型糖尿病であり、この2型糖尿病の治療には、膵臓のβ細胞上に存在する受容体複合体分子に作用するインスリン分泌促進型経口糖尿病薬、特にスルホニルウレア剤(SU剤)が繁用されている。しかしながらこのスルホニルウレア剤は、一旦は薬効が得られても、数年の長期使用に伴って薬効が減弱し、遂には無効となる「二次無効」の現象が、2割以上の患者で起こることが知られており、臨床上大きな問題となっている(非特許文献1〜3)。
Stryjek-Kaminska D. et al., Diabetes Res. Clin. Pract., 7:149-154(1989) Pontiroli A.E. et al., Diabetes Metab. Rev., 10:31-43(1994) Matthews D.R. et al. Diabet. Med., 15:297-303(1998)
Currently, there are about 2.5 million diabetic patients who are continuously treated in Japan, including 18.7 million including the Diabetes Reserve Army. More than 95% of diabetes in Japan is type 2 diabetes. For the treatment of this type 2 diabetes, insulin secretion-promoting oral diabetes drugs that act on receptor complex molecules present on pancreatic β cells, especially sulfonylurea Agent (SU agent) is frequently used. However, even if this sulfonylurea drug is once effective, the effect of "secondary ineffectiveness" that eventually becomes ineffective occurs in more than 20% of patients with long-term use for several years. Is known and is a clinically significant problem (Non-Patent Documents 1 to 3).
Stryjek-Kaminska D. et al., Diabetes Res. Clin. Pract., 7: 149-154 (1989) Pontiroli AE et al., Diabetes Metab. Rev., 10: 31-43 (1994) Matthews DR et al. Diabet. Med., 15: 297-303 (1998)

この薬効の減弱によって生じる高血糖は、糖の毒性によるインスリン分泌能の低下及びインスリン感受性の低下を引き起こし、これらが更なる薬効低下をもたらすという悪循環に陥ることが知られている。実際に、二次無効発現患者では、インスリン導入後も血糖値のコントロールが不良であり、糖尿病の合併症である網膜症及び神経障害のオッズ比が3-4倍となることから、患者のQOLの低下や、医療費の高騰を招く大きな要因となっている。このため、二次無効発現が予測される糖尿病患者に対しては、早期のインスリン導入等、別の薬物を主とする治療に切り替えることが重要であり、二次無効発現のリスク因子の同定が強く望まれている。   It is known that the hyperglycemia caused by the diminished medicinal effect causes a decrease in insulin secretory ability and insulin sensitivity due to the toxicity of sugar, resulting in a vicious circle in which they cause a further decrease in medicinal effect. In fact, in patients with secondary ineffectiveness, blood glucose levels are poorly controlled even after the introduction of insulin, and the odds ratio of retinopathy and neuropathy, which are complications of diabetes, is 3-4 times higher. This is a major factor that causes a decline in medical expenses and a rise in medical costs. For this reason, it is important to switch to treatments that focus on other drugs, such as early insulin introduction, for diabetic patients who are predicted to develop secondary ineffectiveness. It is strongly desired.

最近の遺伝子解析の進歩に伴い、生体内の蛋白質機能、更にはこれに基づく表現型(フェノタイプ)の個体差が、遺伝的要因によって規定されていることが知られている。二次無効の発現機構は未だ不明であるが、白人を対象にした解析で、インスリン受容体基質-1をコードするIRS1遺伝子の2911G>A(Gly971Arg)多型、及び、膵臓β細胞膜上のスルホニルウレア剤の受容体複合体を形成する、K+チャネル(Kir6.2)をコードするKCNJ11遺伝子の67G>A(Glu23Lys)多型を有するヒトでは、それぞれ二次無効発現のオッズ比が2.0及び1.69であり、二次無効発現のリスクが上昇すると報告されている(非特許文献4及び非特許文献5)。しかしながら、これらの多型について、日本人を対象にして解析を行ったところ、有意な差は認められなかった。
Sesti G. et al., Diabetes Care, 27:1394-1398(2004) Sesti G. et al., J. Clin. Endocrinol. Metab., 91:2334-2339(2006)
With recent advances in genetic analysis, it is known that individual differences in protein function in the living body and phenotypes based on this are defined by genetic factors. The mechanism of secondary ineffective expression is still unclear, but in the analysis of whites, 2911G> A (Gly971Arg) polymorphism of IRS1 gene encoding insulin receptor substrate-1 and sulfonylurea on pancreatic β cell membrane to form a receptor complex of agents, in humans with 67G> a (Glu23Lys) polymorphism KCNJ11 gene encoding K + channel (Kir6.2), with odds ratios of each secondary invalid expression 2.0 and 1.69 Yes, it has been reported that the risk of secondary ineffective expression increases (Non-Patent Document 4 and Non-Patent Document 5). However, when these polymorphisms were analyzed in Japanese, no significant difference was observed.
Sesti G. et al., Diabetes Care, 27: 1394-1398 (2004) Sesti G. et al., J. Clin. Endocrinol. Metab., 91: 2334-2339 (2006)

二次無効の発現機構の一つとして、高血糖による酸化ストレスが考えられており、実際に、高血糖によるヒト膵島細胞内での過酸化物濃度の上昇、及びこれに伴うインスリン分泌の低下が報告されている(非特許文献6)。
Tanaka Y. et al, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 99:12363-12368(2002)
Oxidative stress due to hyperglycemia is considered as one of the mechanisms of secondary ineffectiveness. In fact, the increase in peroxide concentration in human islet cells due to hyperglycemia and the accompanying decrease in insulin secretion It has been reported (Non-Patent Document 6).
Tanaka Y. et al, Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 99: 12363-12368 (2002)

一方、過酸化水素や有機ヒドロペルオキシドを、グルタチオンを利用して水や対応するアルコールに還元することができ、抗酸化ストレス関連酵素として作用するグルタチオンペルオキシダーゼ(GPX1)の発現が、高血糖処理により上昇することが報告されている(非特許文献7及び8)。また、GPX1を強制発現させたラットの膵島では、高血糖によるインスリン分泌の低下が抑制されることが報告されている(非特許文献6)。
Brigelius-Flohe R., Biol. Chem., 387:1329-1335(2006) Laybutt D.R. et al., Diabetes, 51:413-423(2002)
On the other hand, hydrogen peroxide and organic hydroperoxide can be reduced to water and the corresponding alcohol using glutathione, and the expression of glutathione peroxidase (GPX1), which acts as an antioxidant stress-related enzyme, is increased by hyperglycemia treatment It has been reported (Non-Patent Documents 7 and 8). In addition, it has been reported that in pancreatic islets in which GPX1 is forcibly expressed, a decrease in insulin secretion due to hyperglycemia is suppressed (Non-Patent Document 6).
Brigelius-Flohe R., Biol. Chem., 387: 1329-1335 (2006) Laybutt DR et al., Diabetes, 51: 413-423 (2002)

そこで本発明者等は、もし遺伝子多型によりGPX1酵素活性の低下が起こる場合には、インスリン分泌の低下を招く可能性があり、更に二次無効の発現とも関連するのではないかとの仮説を立て、GPX1遺伝子について鋭意研究した結果、比較的発生頻度の高いGPX1遺伝子のハプロタイプである*2aを有する患者が二次無効を発現する可能性が高いこと、更に、596C>T多型が、該ハプロタイプを検出するためのタグとして有用であることを見出した。   Therefore, the present inventors hypothesized that if the genetic polymorphism causes a decrease in GPX1 enzyme activity, it may lead to a decrease in insulin secretion and may also be associated with secondary ineffective expression. As a result of intensive research on the GPX1 gene, it is highly likely that patients with the relatively frequently occurring GPX1 gene haplotype * 2a are likely to develop secondary invalidity, and that the 596C> T polymorphism It was found useful as a tag for detecting haplotypes.

更に、2型糖尿病発症との関連性が示唆されている3遺伝子、即ち、膵臓β細胞におけるスルホニルウレア剤の受容体をコードするABCC8遺伝子(非特許文献9)、膵臓β細胞の増殖や正常なインスリン分泌に関与する転写因子HNF-1αをコードするHNF1A遺伝子(非特許文献10)、及び、本発明者等の研究により日本人の2型糖尿病発症に関連することが明らかとなったカリウムチャネルをコードするKCNQ1遺伝子、並びに、種々の抗酸化ストレス遺伝子群の発現を制御する転写因子Nrf2をコードするNFE2L2遺伝子(非特許文献11)の変異が、スルホニルウレア剤を投与した際に発生する二次無効の発現に関与しているのではないかという仮説を立て、これらの多型に関しても解析を行った結果、これらの多型を有する糖尿病患者がスルホニルウレア剤投与による二次無効を起こしやすいことを見出し、本発明を完成した。
Yokoi N. et al., Diabetes, 55:2379-2386, 2006 Holmkvist J. et al., Diabetologia, 49:2882-2891, 2006 Fukushima-Uesaka H. et al., Drug Metab. Pharmacokinet., 22:212-219, 2007
Furthermore, 3 genes that have been suggested to be associated with the onset of type 2 diabetes, namely ABCC8 gene encoding sulfonylurea receptor in pancreatic β cells (Non-patent document 9), pancreatic β cell proliferation and normal insulin HNF1A gene encoding the transcription factor HNF-1α involved in secretion (Non-patent Document 10) and the potassium channel that was found to be related to the onset of type 2 diabetes in Japanese by the present inventors KCNQ1 gene, and NFE2L2 gene (Non-patent Document 11) encoding the transcription factor Nrf2 that regulates the expression of various antioxidant stress genes, secondary ineffective expression that occurs when sulfonylurea is administered As a result of the analysis of these polymorphisms, it was found that diabetic patients with these polymorphisms were treated with sulfonylurea. The present invention was completed by finding that secondary invalidation is likely to occur.
Yokoi N. et al., Diabetes, 55: 2379-2386, 2006 Holmkvist J. et al., Diabetologia, 49: 2882-2891, 2006 Fukushima-Uesaka H. et al., Drug Metab. Pharmacokinet., 22: 212-219, 2007

従って本発明の第1の目的は、GPX1遺伝子の多型、ABCC8遺伝子の多型、HNF1A遺伝子の多型、NFE2L2遺伝子の多型、又は、KCNQ1遺伝子の多型の有無を検出することによって、スルホニルウレア剤の投与により二次無効が生じやすいかどうかを予め検査する方法を提供することにある。
本発明の第2の目的は、GPX1遺伝子の多型又はNFE2L2遺伝子の多型の有無を検出するために用いられるプライマーを提供することにある。
本発明の第3の目的は、GPX1遺伝子の多型又はNFE2L2遺伝子の多型の有無を検出するために用いられるプローブを提供することにある。
Therefore, the first object of the present invention is to detect the presence or absence of a polymorphism of GPX1 gene, polymorphism of ABCC8 gene, polymorphism of HNF1A gene, polymorphism of NFE2L2 gene, or polymorphism of KCNQ1 gene. It is an object of the present invention to provide a method for examining in advance whether secondary ineffectiveness is likely to occur due to administration of a drug.
A second object of the present invention is to provide a primer used for detecting the presence or absence of a polymorphism in the GPX1 gene or a polymorphism in the NFE2L2 gene.
A third object of the present invention is to provide a probe used for detecting the presence or absence of a polymorphism in the GPX1 gene or a polymorphism in the NFE2L2 gene.

本発明の第4の目的は、GPX1遺伝子の多型又はNFE2L2遺伝子の多型の有無を検出するための検査キットを提供することにある。
本発明の第5の目的は、スルホニルウレア剤の投与により二次無効が生じやすいかどうかを予め検査するための検査キットを提供することにある。
A fourth object of the present invention is to provide a test kit for detecting the presence or absence of a polymorphism in the GPX1 gene or a polymorphism in the NFE2L2 gene.
A fifth object of the present invention is to provide a test kit for inspecting in advance whether secondary invalidity is likely to occur due to administration of a sulfonylurea agent.

本発明の上記諸目的は、下記一般式(I)で表されるスルホニルウレア剤を投与した場合の二次無効の発生を事前に予測する方法であって、
該方法が、被験者から遺伝子を採取し、下記(A)〜(E)に記載された遺伝子多型の群の中から選択される少なくとも一種の多型の有無を検出することを特徴とする、スルホニルウレア剤を投与した場合の二次無効の発生を事前に予測する方法、該方法に用いられる検査キット、並びに、GPX1遺伝子及びNFE2L2遺伝子の多型の有無を検出するためのプライマー及びプローブによって達成された。
一般式(I)
R1-SO2NHCONH-R2 (I)
ここでR1は、ハロゲン、アルキル基、アセチル基、又は-(CH2)n-NHCO-R3で適宜置換されたフェニル基であり、R2はアルキル基、又は、アルキル基で適宜置換された、不飽和結合を含まず、ヘテロ原子を含んでもよい炭素環から選択される基であり、R3は、ハロゲン、酸素原子、アルキル基若しくはアルコキシ基で置換されたアリール基又はヘテロアリール基であり、nは1〜5の整数である
(A)GPX1遺伝子:596C>T多型,
(B)ABCC8遺伝子:IVS15-3T>C多型,
(C)HNF1A遺伝子:79A>C多型,
(D)NFE2L2遺伝子:-1123A>G多型,
(E)KCNQ1遺伝子:IVS15-29246C>T多型
The above-mentioned objects of the present invention are methods for predicting in advance the occurrence of secondary ineffectiveness when a sulfonylurea agent represented by the following general formula (I) is administered,
The method is characterized by collecting a gene from a subject and detecting the presence or absence of at least one polymorphism selected from the group of genetic polymorphisms described in the following (A) to (E): It is achieved by a method for predicting the occurrence of secondary ineffectiveness when a sulfonylurea agent is administered in advance, a test kit used for the method, and a primer and probe for detecting the presence or absence of a polymorphism of the GPX1 gene and the NFE2L2 gene It was.
Formula (I)
R 1 -SO 2 NHCONH-R 2 (I)
Here, R 1 is a halogen, an alkyl group, an acetyl group, or a phenyl group optionally substituted with — (CH 2 ) n —NHCO—R 3 , and R 2 is optionally substituted with an alkyl group or an alkyl group. R 3 is a group selected from carbocycles which do not contain an unsaturated bond and may contain a hetero atom, and R 3 is an aryl group or heteroaryl group substituted with a halogen, an oxygen atom, an alkyl group or an alkoxy group. N is an integer from 1 to 5
(A) GPX1 gene: 596C> T polymorphism,
(B) ABCC8 gene: IVS15-3T> C polymorphism,
(C) HNF1A gene: 79A> C polymorphism,
(D) NFE2L2 gene: -1123A> G polymorphism,
(E) KCNQ1 gene: IVS15-29246C> T polymorphism

本発明の方法によれば、上記遺伝子の多型タイピングにより、糖尿病患者各個人について二次無効を発現しやすいか否かを容易に検出することができるため、得られた結果に基づき、二次無効を発現する可能性が高い患者に対しては、他の薬効を有する経口糖尿病薬を主とする治療や早期のインスリン導入のような、スルホニルウレア剤以外の治療法を選択することが可能となる。従って、本発明の方法は、糖尿病薬物治療の有効性を確保することを目的とした薬剤選択のための検査方法として極めて有用である。   According to the method of the present invention, since it is possible to easily detect whether or not secondary invalidity is likely to be expressed for each individual with diabetes by the polymorphic typing of the gene, based on the obtained results, For patients who are likely to develop ineffectiveness, it is possible to select treatments other than sulfonylureas, such as treatment with oral antidiabetics with other medicinal effects and early insulin introduction. . Therefore, the method of the present invention is extremely useful as a test method for drug selection for the purpose of ensuring the effectiveness of diabetes drug treatment.

本発明においてスルホニルウレア剤を投与した場合の二次無効の発生を事前に予測するために検出する多型は、下記(A)〜(E)に記載された遺伝子多型の群から選択される少なくとも一種の多型である。
(A)GPX1遺伝子:596C>T多型(rs1050450)
(B)ABCC8遺伝子:IVS15-3T>C多型(rs1799854)
(C)HNF1A遺伝子:79A>C多型(rs1169288)
(D)NFE2L2遺伝子:-1123A>G多型
(E)KCNQ1遺伝子:IVS15-29246C>T多型(rs2237892)
In the present invention, the polymorphism to be detected in order to predict the occurrence of secondary ineffectiveness when the sulfonylurea agent is administered in advance is at least selected from the group of genetic polymorphisms described in (A) to (E) below. It is a kind of polymorphism.
(A) GPX1 gene: 596C> T polymorphism (rs1050450)
(B) ABCC8 gene: IVS15-3T> C polymorphism (rs1799854)
(C) HNF1A gene: 79A> C polymorphism (rs1169288)
(D) NFE2L2 gene: -1123A> G polymorphism
(E) KCNQ1 gene: IVS15-29246C> T polymorphism (rs2237892)

上記の多型におけるGPX1遺伝子(NCBI,NW_921651.1)は、第3番染色体短腕の21.3に位置し、2個のエクソンから構成されており、過酸化水素や有機ヒドロペルオキシドを、グルタチオンを利用して、水や対応するアルコールに還元する酵素であるグルタチオンペルオキシダーゼ(GPX1)をコードする遺伝子である。
上記ABCC8遺伝子(NCBI,NT_009237.17)は、第11番染色体短腕の15.1に位置し、39個のエクソンから構成されており、膵臓β細胞膜上におけるスルホニルウレア剤の受容体をコードする遺伝子である。
The GPX1 gene (NCBI, NW_921651.1) in the above polymorphism is located in 21.3 of the short arm of chromosome 3, and is composed of two exons, and uses glutathione with hydrogen peroxide and organic hydroperoxide. Thus, it is a gene encoding glutathione peroxidase (GPX1), which is an enzyme that reduces to water and the corresponding alcohol.
The ABCC8 gene (NCBI, NT_009237.17) is located at 15.1 of the short arm of chromosome 11 and is composed of 39 exons and is a gene encoding a receptor for sulfonylurea drugs on the pancreatic β cell membrane .

上記HNF1A遺伝子(NCBI,NT_009775.16)は、第12番染色体長腕の24.2に位置し、10個のエクソンから構成されており、膵臓β細胞の増殖や正常なインスリン分泌に関与する転写因子HNF-1αをコードする遺伝子であり、TCF1遺伝子とも呼ばれる。
上記NFE2L2遺伝子(NCBI,NT_005403.16)は、第2番染色体長腕の31に位置し、5個のエクソンから構成されており、抗酸化ストレス遺伝子群の発現を制御する転写因子Nrf2をコードする遺伝子である。
The HNF1A gene (NCBI, NT_009775.16) is located at 24.2 of the long arm of chromosome 12, and is composed of 10 exons, and is a transcription factor HNF involved in pancreatic β-cell proliferation and normal insulin secretion It is a gene encoding -1α and is also called TCF1 gene.
The NFE2L2 gene (NCBI, NT_005403.16) is located on the long arm 31 of chromosome 2 and is composed of 5 exons and encodes the transcription factor Nrf2 that controls the expression of antioxidant stress genes. It is a gene.

上記KCNQ1遺伝子(NCBI,NT_009237.17)は、第11番染色体短腕の15.5に位置し、16個のエクソンから構成されており、本発明者等の研究により日本人の2型糖尿病発症に関連することが明らかとなったカリウムチャネルをコードする遺伝子である。   The above KCNQ1 gene (NCBI, NT_009237.17) is located at 15.5 of the short arm of chromosome 11 and consists of 16 exons, and is related to the onset of type 2 diabetes in Japanese by the present inventors. It is a gene encoding a potassium channel that has been clarified.

一般的に「多型」とは、遺伝子を構成しているDNA配列の個体差であり、その頻度が1%以上ある状態をいうが、本発明においては、その発生頻度が1%未満の塩基の変化についても「多型」として取り扱う。
本発明における「多型」は、例えば「596C>T多型」のように表記される。ここで数字は各遺伝子の翻訳開始コドン[ATG]のアデニン[A]から3’側に数えた塩基の位置を表し、アルファベットは塩基、即ちアデニン[A]、チミン[T]、グアニン[G]、シトシン[C]を表す。
In general, “polymorphism” is an individual difference of DNA sequences constituting a gene and means a state where the frequency is 1% or more. In the present invention, the occurrence frequency is a base having a frequency of less than 1%. The change of is treated as "polymorphism".
“Polymorphism” in the present invention is represented as “596C> T polymorphism”, for example. Here, the numbers represent the positions of bases counted 3 ′ from the adenine [A] of the translation initiation codon [ATG] of each gene, and the alphabets are bases, that is, adenine [A], thymine [T], guanine [G]. Represents cytosine [C].

従って、GPX1遺伝子の多型である「596C>T多型」は、GPX1遺伝子の翻訳開始コドン[ATG]のアデニン[A]から下流方向に数えて596番目の塩基であるシトシン[C]がチミン[T]に変化したものである。ABCC8遺伝子の多型である「IVS15-3T>C多型」は、ABCC8遺伝子の第15イントロン上に存在し、エクソン16の5’末端から上流方向に数えて3番目の塩基であるチミン[T]がシトシン[C]に変化したものである。HNF1A遺伝子の多型である「79A>C多型」は、HNF1A遺伝子の翻訳開始コドン[ATG]のアデニン[A]から下流方向に数えて79番目のアデニン[A]がシトシン[C]に変化したものである。NFE2L2遺伝子の多型である「-1123A>G多型」は、翻訳開始コドン[ATG]のアデニン[A]から上流1123番目の塩基であるアデニン[A]がグアニン[G]に変化したものである。(E)KCNQ1遺伝子の多型である「IVS15-29246C>T多型」は、KCNQ1遺伝子の第15イントロン上に存在し、エクソン16の5’末端から上流方向に数えて29246番目の塩基であるシトシン[C]がチミン[T]に変化したものである。   Therefore, the GPX1 gene polymorphism “596C> T polymorphism” is a cytosine [C], which is the 596th base counted from the adenine [A] of the translation initiation codon [ATG] of the GPX1 gene, in the downstream direction. Changed to [T]. The polymorphism of the ABCC8 gene, “IVS15-3T> C polymorphism”, is present on the 15th intron of the ABCC8 gene and is the third base thymine [T] counted upstream from the 5 ′ end of exon 16. ] Is changed to cytosine [C]. The polymorphism of the HNF1A gene, the 79A> C polymorphism, changes the 79th adenine [A] from the adenine [A] of the translation start codon [ATG] of the HNF1A gene to cytosine [C]. It is what. The NFE2L2 gene polymorphism, "-1123A> G polymorphism," is a translation of the translation start codon [ATG] from adenine [A] to the upstream 1123th base adenine [A] to guanine [G]. is there. (E) KCNQ1 gene polymorphism `` IVS15-29246C> T polymorphism '' is present on the 15th intron of KCNQ1 gene and is the 29246th base counted from the 5 'end of exon 16 in the upstream direction Cytosine [C] is changed to thymine [T].

本発明においてスルホニルウレア剤は、下記一般式(I)で表される化合物を包含する。
R1-SO2NHCONH-R2 (I)
ここでR1はハロゲン、アルキル基、アセチル基、又は-(CH2)n-NHCO-R3で適宜置換されたフェニル基であり、R2はアルキル基、又は、アルキル基で適宜置換された不飽和結合を含まず、ヘテロ原子を含んでもよい炭素環から選択される基であり、R3は、ハロゲン、酸素原子、アルキル基若しくはアルコキシ基で置換されたアリール基又はヘテロアリール基であり、nは1〜5の整数である。
In the present invention, the sulfonylurea agent includes a compound represented by the following general formula (I).
R 1 -SO 2 NHCONH-R 2 (I)
Here, R 1 is a halogen, an alkyl group, an acetyl group, or a phenyl group optionally substituted with — (CH 2 ) n —NHCO—R 3 , and R 2 is optionally substituted with an alkyl group or an alkyl group. A group selected from carbocycles which do not contain an unsaturated bond and may contain a hetero atom, R 3 is an aryl group or a heteroaryl group substituted with a halogen, an oxygen atom, an alkyl group or an alkoxy group; n is an integer of 1-5.

本発明においては、特に、R1がクロル等のハロゲン、メチル基、エチル基等の炭素数1〜3のアルキル基、アセチル基、又は-(CH2)n-NHCO-R3で適宜置換されたフェニル基であることが好ましい。R2は、エチル基、プロピル基、ブチル基等の炭素数2〜5のアルキル基、又は、メチル基若しくはエチル基で適宜置換された、不飽和結合を含まず、O、N、S等のヘテロ原子を含んでもよい、シクロヘキシル基、ピロリジン基、アザビシクロオクチル基等の炭素環から選択される基であることが好ましい。
また、R3は、クロル等のハロゲン、メチル基、エチル基等の炭素数1〜3のアルキル基、メトキシ基又はエトキシ基で置換された炭素数5若しくは6のアリール基、又は、酸素原子、メチル基、エチル基等の炭素数1〜3のアルキル基、メトキシ基又はエトキシ基で置換された炭素数4若しくは5のヘテロアリール基であることが好ましい。アリール基としてはフェニル基等、ヘテロアリール基としてはピロリン基等が挙げられる。R3の具体例として2−メトキシ-5-クロロフェニル基、2-オキソ-3-エチル-4-メチルピロリン基を例示することができる。
In the present invention, in particular, R 1 is appropriately substituted with a halogen such as chloro, an alkyl group having 1 to 3 carbon atoms such as a methyl group or an ethyl group, an acetyl group, or — (CH 2 ) n —NHCO—R 3. It is preferably a phenyl group. R 2 is an alkyl group having 2 to 5 carbon atoms such as an ethyl group, a propyl group, or a butyl group, or an unsaturated group that is appropriately substituted with a methyl group or an ethyl group, such as O, N, and S. It is preferably a group selected from carbocyclic rings such as cyclohexyl group, pyrrolidine group, azabicyclooctyl group and the like, which may contain a hetero atom.
R 3 is a halogen such as chloro, an alkyl group having 1 to 3 carbon atoms such as a methyl group or an ethyl group, an aryl group having 5 or 6 carbon atoms substituted with a methoxy group or an ethoxy group, or an oxygen atom, A heteroaryl group having 4 or 5 carbon atoms substituted with an alkyl group having 1 to 3 carbon atoms such as a methyl group or an ethyl group, a methoxy group, or an ethoxy group is preferable. Examples of the aryl group include a phenyl group, and examples of the heteroaryl group include a pyrroline group. Specific examples of R 3 include a 2-methoxy-5-chlorophenyl group and a 2-oxo-3-ethyl-4-methylpyrroline group.

上記一般式(I)で表されるスルホニルウレア剤としては、例えば、グリメピリド、グリベンクラミド、グリクラジド、トリブタミド、アセトヘキサミド、クロルプロパミド、グリクロピラミド等を例示することができる。   Examples of the sulfonylurea represented by the general formula (I) include glimepiride, glibenclamide, gliclazide, tributamide, acetohexamide, chlorpropamide, glyclopyramide and the like.

本発明における多型の有無を検出する方法は公知の方法により適宜実施することができるが、例えば、被験者の末梢血白血球、膵臓等の組織細胞、口腔粘膜、毛髪等の細胞や爪から、GPX1遺伝子、ABCC8遺伝子、HNF1A遺伝子、NFE2L2遺伝子及びKCNQ1遺伝子を含むDNA又はRNAを調製し、一塩基多型の解析を行うことにより検出することができる。   The method for detecting the presence or absence of a polymorphism in the present invention can be appropriately carried out by a known method. For example, GPX1 can be obtained from cells and nails of a subject's peripheral blood leukocytes, tissue cells such as pancreas, oral mucosa, hair and the like. It can be detected by preparing DNA or RNA containing the gene, ABCC8 gene, HNF1A gene, NFE2L2 gene and KCNQ1 gene and analyzing the single nucleotide polymorphism.

上記の一塩基多型の解析方法としては公知の解析方法を用いることができるが、例えば、ダイレクト・シークエンシング法、パイロ・シークエンシング法、一本鎖DNA高次構造多型(SSCP)解析、制限酵素断片長多型(RFLP)解析、アレル特異的オリゴヌクレオチド(ASO)法、DNAチップ/マイクロアレイ法、マトリクス支援レーザー脱離イオン化-飛行時間型質量分析(MALDI-TOF/MS)法、TaqMan法、インベーダー法等が挙げられる。   As a method for analyzing the above single nucleotide polymorphism, a known analysis method can be used. For example, a direct sequencing method, a pyro sequencing method, a single-stranded DNA conformation polymorphism (SSCP) analysis, Restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis, allele-specific oligonucleotide (ASO) method, DNA chip / microarray method, matrix-assisted laser desorption / ionization time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF / MS) method, TaqMan method And an invader method.

ダイレクト・シークエンシング法は、目的とする遺伝子にハイブリダイズするプライマーを用いて、単離したDNA又はRNAを鋳型としたPCR等によって多型を含む塩基を増幅し、ダイプライマー法やダイターミネーター法等のサイクルシークエンシング法により、増幅したDNAの塩基配列を決定する方法である(Kwok P.Y. and Duan S., Methods Mol. Biol. 212: 71-84 (2003)参照)。   The direct sequencing method uses a primer that hybridizes to the gene of interest, amplifies the bases containing the polymorphism by PCR using the isolated DNA or RNA as a template, the die primer method, the dye terminator method, etc. In this method, the base sequence of the amplified DNA is determined by the cycle sequencing method (see Kwok PY and Duan S., Methods Mol. Biol. 212: 71-84 (2003)).

例えば、GPX1遺伝子、ABCC8遺伝子、HNF1A遺伝子、NFE2L2遺伝子及びKCNQ1遺伝子にハイブリダイズするプライマーを用い、単離したDNAを鋳型として多型を含む領域をPCR増幅した後、サイクルシークエンシング法により増幅したDNAの塩基配列を決定することができる。なお、上記プライマーとして本発明のプライマーを用いることもできるが、本発明はこれらによって限定されるものではない。
このようにして決定したDNAの塩基配列を対照と比較して、GPX1遺伝子、ABCC8遺伝子、HNF1A遺伝子、NFE2L2遺伝子及びKCNQ1遺伝子の遺伝子多型を検出する。
For example, using primers that hybridize to the GPX1 gene, ABCC8 gene, HNF1A gene, NFE2L2 gene, and KCNQ1 gene, using the isolated DNA as a template, PCR-amplified the region containing the polymorphism, and then the DNA amplified by the cycle sequencing method Can be determined. In addition, although the primer of this invention can also be used as said primer, this invention is not limited by these.
The DNA base sequence determined in this way is compared with a control to detect genetic polymorphisms of the GPX1, ABCC8, HNF1A, NFE2L2 and KCNQ1 genes.

一般に、健常人のGPX1遺伝子、ABCC8遺伝子、HNF1A遺伝子、NFE2L2遺伝子及びKCNQ1遺伝子の配列は正常であると考えられることから、上記の「対照と比較する」とは、通常、健常人のGPX1遺伝子、ABCC8遺伝子、HNF1A遺伝子、NFE2L2遺伝子及びKCNQ1遺伝子の配列とそれぞれ比較することを意味する。本発明においては、GenBankに野生型として登録されているGPX1遺伝子の配列(NCBI,NW_921651.1)、ABCC8遺伝子の配列(NCBI,NT_009237.17)、HNF1A遺伝子の配列(NCBI,NT_009775.16)、NFE2L2遺伝子の配列(NCBI,NT_005403.16)、KCNQ1遺伝子の配列(NCBI,NT_009237.17)とそれぞれ比較してもよい。   In general, since the sequences of the GPX1 gene, ABCC8 gene, HNF1A gene, NFE2L2 gene and KCNQ1 gene of a healthy person are considered normal, the above-mentioned `` compared to the control '' usually refers to the GPX1 gene of a healthy person, It means comparing with sequences of ABCC8 gene, HNF1A gene, NFE2L2 gene and KCNQ1 gene, respectively. In the present invention, the sequence of GPX1 gene (NCBI, NW — 921651.1) registered as a wild type in GenBank, the sequence of ABCC8 gene (NCBI, NT — 009237.17), the sequence of HNF1A gene (NCBI, NT — 009775.16), You may compare with the arrangement | sequence (NCBI, NT_005403.16) of NFE2L2 gene, and the arrangement | sequence (NCBI, NT_009237.17) of KCNQ1 gene, respectively.

パイロ・シークエンシング法は、親鎖との相補性に基づき、DNAポリメラーゼによる塩基伸長反応を利用した解析方法であり、一塩基多型の1〜数塩基上流からシークエンスするように設計されたプライマーをアニーリングさせ、dNTPsを系に一種類ずつ添加し、1塩基ごとに、伸長するかどうかを解析して、当該部位の塩基の種類を判定する方法である。伸長の検出は、塩基伸長反応が起こる際にdNTPsから定量的に放出されるピロリン酸を、アデノシン-5'-ホスホ硫酸を基質とし、スルフリラーゼを用いてATPに変換し、このATPとルシフェリンを基質として生じるルシフェラーゼ発光反応を、CCDカメラにより検出することによって行う(Langaee T. and Ronaghi M., Mutat Res. 573: 96-102(2005)参照)。   Pyrosequencing is an analysis method that uses a base extension reaction by DNA polymerase based on complementarity with the parent strand. Primers designed to sequence from one to several bases upstream of a single nucleotide polymorphism are used. This is a method of annealing, adding dNTPs to the system one by one, analyzing whether each base is extended, and determining the type of base at the site. In the detection of elongation, pyrophosphate released quantitatively from dNTPs when a base elongation reaction occurs is converted to ATP using adenosine-5'-phosphosulfate as a substrate and sulfurylase, and this ATP and luciferin are converted into substrates. The luciferase luminescence reaction generated as follows is detected by a CCD camera (see Langaee T. and Ronaghi M., Mutat Res. 573: 96-102 (2005)).

例えば、GPX1遺伝子、ABCC8遺伝子、HNF1A遺伝子、NFE2L2遺伝子及びKCNQ1遺伝子にハイブリダイズするプライマーを用いて、単離したDNAを鋳型として、多型を含む領域をPCR増幅した後一本鎖化し、一塩基多型の数塩基上流からシークエンスするように設計されたプライマーをアニーリングさせる。次いで、dNTP(dATP,dTTP,dCTP,dGTP)を一種類ずつ添加してルシフェラーゼ発光を測定し、その結果から、DNAの塩基配列を決定することができる。   For example, using primers that hybridize to the GPX1 gene, ABCC8 gene, HNF1A gene, NFE2L2 gene, and KCNQ1 gene, using the isolated DNA as a template, the region containing the polymorphism is PCR-amplified and then single-stranded, single nucleotides Primers designed to sequence from several bases upstream of the polymorphism are annealed. Next, dNTPs (dATP, dTTP, dCTP, dGTP) are added one by one and luciferase luminescence is measured. From the results, the DNA base sequence can be determined.

このようにして決定したDNAの塩基配列を、上記ダイレクト・シークエンシング法の場合と同様にして対照と比較し、GPX1遺伝子、ABCC8遺伝子、HNF1A遺伝子、NFE2L2遺伝子及びKCNQ1遺伝子の遺伝子多型を検出する。
なお、上記プライマーとして本発明のプライマーを用いることもできるが、それに限定されるものではない。
The base sequence of the DNA thus determined is compared with the control in the same manner as in the above direct sequencing method, and the polymorphisms of the GPX1, ABCC8, HNF1A, NFE2L2 and KCNQ1 genes are detected. .
In addition, although the primer of this invention can also be used as said primer, it is not limited to it.

一本鎖DNA高次構造多型(SSCP)解析とは、二本鎖DNA断片を一本鎖に解離させると、各一本鎖はその塩基配列に依存した独自の高次構造を形成するという性質を利用した方法である。この解離したDNA鎖を用いて、変性剤を含まないポリアクリルアミドゲル中で電気泳動を行うと、それぞれの高次構造の差に応じて、同じ鎖長の一本鎖DNAがゲル内の異なる位置に移動する。一塩基の置換・欠失・挿入によってもこの一本鎖DNAの高次構造は変化し、ポリアクリルアミドゲル電気泳動において異なる移動度を示す。従って、この移動度の変化を検出することにより、DNA断片に点突然変異や欠失、あるいは挿入等による変異が存在することを確認することができる(Tahira T. et al., Methods Mol. Biol. 212: 37-46 (2003)参照)。   Single-stranded DNA conformation polymorphism (SSCP) analysis means that when a double-stranded DNA fragment is dissociated into single strands, each single strand forms a unique high-order structure depending on its base sequence. This is a method that uses properties. When this dissociated DNA strand is used for electrophoresis in a polyacrylamide gel that does not contain a denaturing agent, single-stranded DNA with the same strand length varies depending on the difference in each higher-order structure. Move to. The higher-order structure of this single-stranded DNA also changes by substitution, deletion, or insertion of a single base, and shows different mobility in polyacrylamide gel electrophoresis. Therefore, by detecting this change in mobility, it is possible to confirm that a mutation caused by point mutation, deletion, insertion or the like exists in the DNA fragment (Tahira T. et al., Methods Mol. Biol 212: 37-46 (2003)).

制限酵素断片長多型(RFLP)解析とは、点突然変異による多型の配列が特定の制限酵素によって認識されるサイトである場合に、変異によりサイトが消失したり出現したりすることを利用して、一塩基多型を検出する方法である(Kim S. and Misra A., Annu Rev Biomed Eng.9:289-320(2007)参照)。   Restriction fragment length polymorphism (RFLP) analysis is based on the fact that a site disappears or appears due to a mutation when the polymorphic sequence resulting from a point mutation is a site recognized by a specific restriction enzyme. Thus, this is a method for detecting a single nucleotide polymorphism (see Kim S. and Misra A., Annu Rev Biomed Eng. 9: 289-320 (2007)).

例えば、GPX1遺伝子、ABCC8遺伝子、HNF1A遺伝子、NFE2L2遺伝子及びKCNQ1遺伝子の多型部位を含む領域のDNAを、特定の制限酵素を用いて処理した後、サザンブロットハイブリダイゼーションを行うこと等によって解析することができる。
上記特定の制限酵素は、変異を検出することができる限り特に制限されることはないが、例えば、GPX1遺伝子の解析にはApaI又はBpu1102I等、HNF1A遺伝子の解析にはDpnI等、ABCC8遺伝子の解析にはPstI、KCNQ1遺伝子の解析にはSmaI等を用いることができる。
For example, analysis of the DNA containing the polymorphic site of GPX1 gene, ABCC8 gene, HNF1A gene, NFE2L2 gene and KCNQ1 gene using a specific restriction enzyme followed by Southern blot hybridization, etc. Can do.
The specific restriction enzyme is not particularly limited as long as it can detect mutations. For example, ApaI or Bpu1102I is used for analysis of GPX1 gene, DpnI is used for analysis of HNF1A gene, and ABCC8 gene is analyzed. For the analysis of PstI and KCNQ1 genes, SmaI and the like can be used.

アレル特異的オリゴヌクレオチド(ASO)法とは、変異が存在すると考えられる塩基配列を含むオリゴヌクレオチドを作製し、これと試料DNAの間でハイブリダイゼーションを行わせると、一塩基置換を含む変異が存在する場合には、ハイブリッド形成の効率が低下する。それを、サザンブロット法や、特殊な蛍光試薬がハイブリッドのギャップにインターカレーションすることにより消光する性質を利用する方法等により検出する方法である。また、リボヌクレアーゼAミスマッチ切断法による検出も可能である。
本発明においては、上記の変異が存在すると考えられる塩基配列を含むオリゴヌクレオチドとして、本発明のプローブを用いることができるが、それに限定されるものではない。
The allele-specific oligonucleotide (ASO) method is the creation of an oligonucleotide containing a base sequence that is considered to have a mutation, and when hybridization is performed between this and the sample DNA, a mutation containing a single base substitution exists. If so, the efficiency of hybridization is reduced. This can be detected by Southern blotting or a method that utilizes the property of quenching by intercalating a special fluorescent reagent into the hybrid gap. Moreover, detection by the ribonuclease A mismatch cleavage method is also possible.
In the present invention, the probe of the present invention can be used as an oligonucleotide containing a base sequence considered to have the above mutation, but is not limited thereto.

DNAチップ/マイクロアレイ法とは、被検者から調製した多型部位を含むDNA、および該DNAとハイブリダイズするヌクレオチドプローブが固定された基板を用意し、次いで前記DNAと該基板を接触させ、該DNA試料と基板に固定されたヌクレオチドプローブとのハイブリダイズの有無又はその強度の差を検出して、前記多型の有無を判定する方法である(Lindroos K. et al., Methods Mol. Biol. 212: 149-165 (2003)等参照)。
上記検出は、例えば、予めDNA試料を蛍光色素等で標識しておき、蛍光シグナルをスキャナー等で読み取ることによって行うことができる。
The DNA chip / microarray method includes preparing a substrate containing a polymorphic site prepared from a subject and a substrate on which a nucleotide probe that hybridizes with the DNA is immobilized, and then bringing the DNA into contact with the substrate, This is a method for determining the presence or absence of the polymorphism by detecting the presence or absence of hybridization between the DNA sample and the nucleotide probe immobilized on the substrate, or the intensity difference thereof (Lindroos K. et al., Methods Mol. Biol. 212: 149-165 (2003) etc.).
The detection can be performed, for example, by previously labeling a DNA sample with a fluorescent dye or the like and reading the fluorescent signal with a scanner or the like.

なお、一般にDNAチップは、高密度に基板にプリントされた何千ものヌクレオチドで構成されている。通常これらのDNAは非透過性の基板の表層にプリントされる。基板の表層は、一般的にはガラスであるが、基板の表層として透過性の膜、例えばニトロセルロースメンブレンを使用することもできる。基板としては平面状のものだけではなく、ビーズ等を使用するなどの方法もある。
本発明においては、上記のDNAとハイブリダイズするヌクレオチドプローブとして本発明のプローブを用いることができるが、これに制限されるものではない。
In general, a DNA chip is composed of thousands of nucleotides printed on a substrate at high density. Usually, these DNAs are printed on the surface of an impermeable substrate. The surface layer of the substrate is generally glass, but a permeable film such as a nitrocellulose membrane can also be used as the surface layer of the substrate. As a substrate, not only a planar substrate but also a method using beads or the like is available.
In the present invention, the probe of the present invention can be used as a nucleotide probe that hybridizes with the above DNA, but is not limited thereto.

マトリクス支援レーザー脱離イオン化-飛行時間型質量分析(MALDI-TOF/MS)法とは、対象とする多型部位の直前の塩基までを有するプライマーを用意し、これを、該多型部位を含むDNAとハイブリダイズさせた後、該多型部位に該当する複数のダイデオキシ塩基を加え、更に酵素的に一塩基伸長させ、得られた一塩基伸長したプライマーの分子量をMALDI-TOF/MSにより解析する方法である。伸長した塩基の分子量が異なるため、一塩基伸長したプライマーの分子量も異なることとなる。これにより、前記多型部位の塩基を判定することが可能となる(Storm N. et al., Methods Mol. Biol. 212: 241-262 (2003)参照)。
なお、上記プライマーとして本発明のプライマーを用いることもできるが、それに限定されるものではない。
Matrix-assisted laser desorption / ionization-time-of-flight mass spectrometry (MALDI-TOF / MS) method is to prepare a primer having up to the base immediately before the polymorphic site of interest, which contains the polymorphic site After hybridizing with DNA, add multiple dideoxy bases corresponding to the polymorphic site, and further enzymatically extend one base, and analyze the molecular weight of the resulting single base extended primer by MALDI-TOF / MS It is a method to do. Since the molecular weight of the extended base is different, the molecular weight of the primer extended by one base is also different. This makes it possible to determine the base of the polymorphic site (see Storm N. et al., Methods Mol. Biol. 212: 241-262 (2003)).
In addition, although the primer of this invention can also be used as said primer, it is not limited to it.

TaqMan法(登録商標)とは、5'末端を2種類の異なる蛍光色素で標識し、3'末端を消光物質で標識したTaqManプローブを2種、対象とする多型部位の塩基に相補的となるように作製し、該多型を含む領域を増幅するように設計したプライマーおよびTaq DNAポリメラーゼを用いてPCRを行う方法である。該PCRに伴い、前記多型部位の塩基と相補的な塩基を有するプローブは切断され、蛍光色素が消光物質と遊離し、前記DNAがホモ接合体であれば1種類の蛍光が検出され、ヘテロ接合体であれば2種類の蛍光が同時に検出される。この蛍光の種類や強度により、対象となった多型を判定するものである(Livak K.J. Methods Mol. Biol. 212: 129-147 (2003)参照)。
なお、上記プライマーとして本発明のプライマーを用いることもできるが、それに限定されるものではない。
The TaqMan method (registered trademark) refers to two TaqMan probes that are labeled with two different fluorescent dyes at the 5 'end and labeled with a quenching substance at the 3' end, and are complementary to the target polymorphic site base. PCR is performed using a primer designed to amplify a region containing the polymorphism and Taq DNA polymerase. Along with the PCR, the probe having a base complementary to the base of the polymorphic site is cleaved, the fluorescent dye is released from the quencher, and if the DNA is a homozygote, one type of fluorescence is detected and the heterozygote is detected. In the case of a conjugate, two types of fluorescence are detected simultaneously. The target polymorphism is determined based on the type and intensity of the fluorescence (see Livak KJ Methods Mol. Biol. 212: 129-147 (2003)).
In addition, although the primer of this invention can also be used as said primer, it is not limited to it.

インベーダー(登録商標)法とは、PCR反応を用いずに多型を検出する方法であり、ミスマッチ部分(フラップ配列)と多型部位配列を含むシグナルプローブと、多型部位がオーバーラップするインベーダーオリゴとを、多型部位を有するDNAに結合させた後、Cleavase(登録商標)と呼ばれる特別な酵素を作用させると、シグナルプローブの多型部位の塩基が該DNAの配列と相補的な時だけ、この酵素でフラップ配列が切断される。切断されたフラップ配列は、シグナルを生成するFRETプローブ(蛍光色素と消光物質を有する)にインベーダーオリゴとなって作用する結果、FRETプローブは切断されて消光物質と蛍光色素が遊離し、蛍光を発する。この蛍光の種類・強度により、対象となった多型を判定する(Lyamichev V. and Neri B. Methods Mol. Biol. 212: 229-240 (2003)参照)。
本発明においては、多型部位配列を含むオリゴヌクレオチドとして、本発明のプローブを用いることができるが、それに限定されるものではない。
The Invader (registered trademark) method is a method for detecting a polymorphism without using a PCR reaction, and a signal probe including a mismatch portion (flap sequence) and a polymorphic site sequence, and an invader oligo in which the polymorphic sites overlap. And a special enzyme called Cleavase (registered trademark) after binding to DNA having a polymorphic site, only when the base of the polymorphic site of the signal probe is complementary to the DNA sequence, The flap sequence is cleaved by this enzyme. The cleaved flap sequence acts as an invader oligo to the FRET probe (which has a fluorescent dye and a quencher) that generates a signal. As a result, the FRET probe is cleaved to release the quencher and the fluorescent dye and emit fluorescence. . The target polymorphism is determined based on the type and intensity of the fluorescence (see Lyamichev V. and Neri B. Methods Mol. Biol. 212: 229-240 (2003)).
In the present invention, the probe of the present invention can be used as an oligonucleotide containing a polymorphic site sequence, but is not limited thereto.

これらの方法によって、被験者の細胞からGPX1遺伝子、ABCC8遺伝子、HNF1A遺伝子、NFE2L2遺伝子及びKCNQ1遺伝子の多型が一種でも検出された場合には、該被験者は、スルホニルウレア剤を投与した場合に二次無効を起こしやすいことが予測される。これに対して、全く検出されなかった場合には、二次無効を起こしにくいことが予測される。   If any one of the GPX1 gene, ABCC8 gene, HNF1A gene, NFE2L2 gene and KCNQ1 gene polymorphism is detected from the subject's cells by these methods, the subject is secondary ineffective when administered with a sulfonylurea agent. Is expected to occur. On the other hand, when it is not detected at all, it is predicted that secondary invalidation is unlikely to occur.

本発明の方法により、被験者がスルホニルウレア剤を投与したときに二次無効を起こしやすいことが分かった場合には、スルホニルウレア剤を投与せず、早期のインスリン導入や、他の経口糖尿病薬、例えば、ブホルミン、メトホルミン等のビグアナイド系薬、アカルボース、ボグリボース等のα−グルコシダーゼ阻害薬、ピオグリタゾン等のインスリン抵抗性改善薬を投与するなどの治療方法を採用することができる。   When it is found by the method of the present invention that the subject tends to cause secondary ineffectiveness when administered with a sulfonylurea agent, the sulfonylurea agent is not administered, early insulin introduction, other oral diabetes drugs, for example, Therapeutic methods such as administration of biguanides such as buformin and metformin, α-glucosidase inhibitors such as acarbose and voglibose, and insulin sensitizers such as pioglitazone can be employed.

本発明の他の態様は、GPX1遺伝子を含む配列部分を増幅する該遺伝子の多型を検出するためのプライマーであって、配列番号1、3、8〜10、12、17〜20、23、25及び26の少なくとも一部の塩基配列を含むプライマー、及び、NFE2L2遺伝子を含む配列部分を増幅する該遺伝子の多型を検出するためのプライマーであって、配列番号27、28、37、42及び43の少なくとも一部の塩基配列を含むプライマーである。特に、配列番号20、25、26、28、42及び43の少なくとも一部の塩基配列を含むプライマーがパイロシークエンシング用プライマーとして好ましい。   Another embodiment of the present invention is a primer for detecting a polymorphism of the gene that amplifies a sequence portion containing the GPX1 gene, comprising SEQ ID NOs: 1, 3, 8-10, 12, 17-20, 23, A primer containing at least a part of the nucleotide sequence of 25 and 26, and a primer for detecting a polymorphism of the gene that amplifies a sequence portion containing the NFE2L2 gene, comprising SEQ ID NOs: 27, 28, 37, 42 and It is a primer comprising at least a part of the base sequence of 43. In particular, a primer containing at least a part of the base sequence of SEQ ID NOs: 20, 25, 26, 28, 42 and 43 is preferable as a primer for pyrosequencing.

本発明におけるプライマーは、公知の方法により適宜作製することができる。また、本発明のプライマーは、10〜30塩基、特に、15〜25塩基程度のヌクレオチドであることが、ゲノムへの結合性及びその特異性、並びに伸長反応の温度の点から好ましい。   The primer in the present invention can be appropriately prepared by a known method. In addition, the primer of the present invention is preferably a nucleotide of about 10 to 30 bases, particularly about 15 to 25 bases, from the viewpoint of binding to the genome and its specificity, and the temperature of the extension reaction.

GPX1遺伝子の多型を検出するためのプライマーは、GPX1遺伝子の多型塩基を含む配列部分を増幅するものであり、且つ、配列番号1、3、8〜10、12、17〜20、23、25及び26の少なくとも一部の配列を含むプライマーである限り、特に制限されることはない。また、NFE2L2遺伝子の多型を検出するためのプライマーは、NFE2L2遺伝子の多型塩基を含む配列部分を増幅するものであり、且つ、配列番号27、28、37、42及び43の少なくとも一部の配列を含むプライマーである限り特に制限されることはない。   The primer for detecting the polymorphism of the GPX1 gene is for amplifying the sequence portion containing the polymorphic base of the GPX1 gene, and SEQ ID NOs: 1, 3, 8 to 10, 12, 17 to 20, 23, The primer is not particularly limited as long as it is a primer including at least a part of the sequences of 25 and 26. Further, the primer for detecting the polymorphism of the NFE2L2 gene is for amplifying a sequence portion containing the polymorphic base of the NFE2L2 gene, and at least a part of SEQ ID NOs: 27, 28, 37, 42 and 43. There is no particular limitation as long as the primer includes a sequence.

また、本発明においては、これらのプライマーと相補的な塩基配列を有するプライマーを使用することも可能であり、本発明のプライマーを、上記した本発明の方法に用いることができる。   In the present invention, it is also possible to use a primer having a base sequence complementary to these primers, and the primer of the present invention can be used in the above-described method of the present invention.

本発明の他の態様は、GPX1遺伝子又はNFE2L2遺伝子の多型塩基を含む配列部分を有する、該多型を検出するためのプローブである。
本発明におけるプローブは、公知の方法により適宜作製することができ、GPX1遺伝子又はNFE2L2遺伝子の多型塩基を含む配列部分を有する限り、特に制限されることはない。ここで、GPX1遺伝子又はNFE2L2遺伝子を含む配列部分とは、これらの多型塩基を含む10〜50塩基の配列部分を指し、例えば、それぞれ、配列番号44及び45の塩基配列を例示することができる。特に、15〜25塩基程度の配列が、特異性および結合性の点から好ましい。
Another embodiment of the present invention is a probe for detecting a polymorphism having a sequence portion containing a polymorphic base of GPX1 gene or NFE2L2 gene.
The probe in the present invention can be appropriately prepared by a known method, and is not particularly limited as long as it has a sequence portion containing a polymorphic base of GPX1 gene or NFE2L2 gene. Here, the sequence portion containing the GPX1 gene or NFE2L2 gene refers to a sequence portion of 10 to 50 bases containing these polymorphic bases, and examples thereof can include the base sequences of SEQ ID NOs: 44 and 45, respectively. . In particular, a sequence of about 15 to 25 bases is preferable from the viewpoint of specificity and binding property.

GPX1遺伝子の多型である596C>T多型を検出するためには、本発明のプローブに含まれるGPX1遺伝子の翻訳開始コドン[ATG]のアデニン[A]から下流方向に数えて596番目の塩基は、シトシン[C]又はチミン[T]であることが必要である。   In order to detect the 596C> T polymorphism of the GPX1 gene polymorphism, the 596th base counted in the downstream direction from the adenine [A] of the translation start codon [ATG] of the GPX1 gene contained in the probe of the present invention Is required to be cytosine [C] or thymine [T].

また、NFE2L2遺伝子の多型である-1123A>G多型を検出するためには、本発明のプローブに含まれるNFE2L2遺伝子の翻訳開始コドンのアデニンから上流1123番目の塩基は、アデニン[A]又はグアニン[G]であることが必要である。
なお本発明においては、これらのプローブと相補的な塩基配列を有するプローブを使用することも可能である。
Further, in order to detect the -1123A> G polymorphism that is a polymorphism of the NFE2L2 gene, the 1123th base upstream from the adenine of the translation initiation codon of the NFE2L2 gene contained in the probe of the present invention is adenine [A] or It must be guanine [G].
In the present invention, it is also possible to use probes having a base sequence complementary to these probes.

本発明のプローブは、上記した本発明の方法に用いることができる。また、検出を容易にするために、適宜、公知の方法で標識して用いることが可能であり、例えば、放射性同位元素、酵素、蛍光色素等で標識して用いることができる。   The probe of the present invention can be used in the above-described method of the present invention. Further, in order to facilitate detection, it can be appropriately labeled by a known method, and for example, it can be labeled with a radioisotope, an enzyme, a fluorescent dye or the like.

本発明の他の態様は、前記GPX1遺伝子の多型を検出するためのプライマー及び/又はプローブを有する、上記GPX1遺伝子の多型の有無を検出するための検査キットである。また、本発明の他の態様は、前記NFE2L2遺伝子の多型を検出するためのプライマー及び/又はプローブを有する、上記NFE2L2遺伝子の多型の有無を検出するための検査キットである。これらの検査キットは、本発明のプライマー及び/又はプローブに加え、DNAの抽出試薬、精製試薬、制限酵素、PCR増幅用試薬、蛍光色素、発光試薬、発色試薬等の中から適宜組み合わせて検査キットとすることができる。   Another aspect of the present invention is a test kit for detecting the presence or absence of the GPX1 gene polymorphism, which comprises a primer and / or a probe for detecting the GPX1 gene polymorphism. Another aspect of the present invention is a test kit for detecting the presence or absence of the polymorphism of the NFE2L2 gene, which has a primer and / or a probe for detecting the polymorphism of the NFE2L2 gene. These test kits are appropriately combined with the primer and / or probe of the present invention from among DNA extraction reagents, purification reagents, restriction enzymes, PCR amplification reagents, fluorescent dyes, luminescent reagents, coloring reagents, etc. It can be.

また、本発明の他の態様は、本発明のプライマーから選択される少なくとも一種のプライマー、及び/又は、本発明のプローブから選択される少なくとも一種のプローブを有する、スルホニルウレア剤を投与した場合の二次無効の発生を事前に予測するための検査キットである。上記した本発明のプライマー及び/又はプローブに加え、ABCC8遺伝子、HNF1A遺伝子及びKCNQ1遺伝子の多型塩基を含む配列を増幅するためのプライマー、シークエンシング用プライマー及びプローブ、DNAの抽出試薬、精製試薬、制限酵素、PCR増幅用試薬、蛍光色素、発光試薬、発色試薬等の中から適宜組み合わせて検査キットとすることもできる。   In addition, another aspect of the present invention relates to a case where a sulfonylurea agent having at least one primer selected from the primers of the present invention and / or at least one probe selected from the probes of the present invention is administered. It is a test kit for predicting the occurrence of the next invalid in advance. In addition to the primer and / or probe of the present invention described above, a primer for amplifying sequences containing polymorphic bases of ABCC8 gene, HNF1A gene and KCNQ1 gene, sequencing primer and probe, DNA extraction reagent, purification reagent, A test kit can also be obtained by appropriately combining restriction enzymes, PCR amplification reagents, fluorescent dyes, luminescent reagents, coloring reagents, and the like.

以下、実施例によって本発明を更に具体的に説明するが、本発明はこれらの実施例によって限定されるものではない。   EXAMPLES Hereinafter, although an Example demonstrates this invention further more concretely, this invention is not limited by these Examples.

<ダイレクト・シークエンシングによるGPX1遺伝子多型の検出>
日本人の2型糖尿病患者74例のゲノムDNAを用いて、ダイレクト・シークエンシングによりGPX1遺伝子の多型を検出し、その結果を基にハプロタイプ推定を行った。ダイレクト・シークエンシングに用いたプライマーを〔表1〕に示す。
なお、このうち32例については、実施例2及び3における二次無効相関解析にも、それらのデータを使用した。
<Detection of GPX1 gene polymorphism by direct sequencing>
GPX1 gene polymorphism was detected by direct sequencing using genomic DNA from 74 Japanese patients with type 2 diabetes, and haplotype estimation was performed based on the results. The primers used for direct sequencing are shown in [Table 1].
Of these, 32 cases were also used for the secondary invalid correlation analysis in Examples 2 and 3.

ゲノム配列(NCBI,NW_921651.1)に基づいてGPX1遺伝子全領域を増幅するため、上記〔表1〕に示すGPX1に特異的な、1st PCR用のフォワードプライマー及びリバースプライマーを設計した。第一段目のPCRは、この1st PCR用のフォワードプライマーとリバースプライマーを各1μM、Z-Taqを0.025 units/μL(タカラバイオ社)、及びゲノムDNAを50ng用いて、全量50μLの系でGPX1遺伝子の全長を増幅した。この際のPCRの条件は、[熱変性 98℃,5秒;アニーリング 55℃,5秒;伸張反応 72℃,190秒]×30サイクルとした。   In order to amplify the entire GPX1 gene region based on the genomic sequence (NCBI, NW — 921651.1), the forward primer and reverse primer for 1st PCR specific to GPX1 shown in [Table 1] above were designed. The first-stage PCR uses 1 μM each of the forward primer and reverse primer for 1st PCR, 0.025 units / μL of Z-Taq (Takara Bio Inc.), and 50 ng of genomic DNA in a total volume of 50 μL of GPX1 The full length of the gene was amplified. The PCR conditions in this case were [thermal denaturation 98 ° C., 5 seconds; annealing 55 ° C., 5 seconds; extension reaction 72 ° C., 190 seconds] × 30 cycles.

続いて1st PCR反応液50μLに、PCR Product Pre-Sequencing Kit(USB社)のExonuclease Iを2μL、Shrimp alkaline phosphataseを2μL、及び精製水を16μL加えて、37℃で15分、80℃で15分処理した後、4℃に冷却した。   Next, add 2 μL of Exonuclease I from the PCR Product Pre-Sequencing Kit (USB), 2 μL of Shrimp alkaline phosphatase, and 16 μL of purified water to 50 μL of the 1st PCR reaction solution, 15 minutes at 37 ° C, and 15 minutes at 80 ° C. After the treatment, it was cooled to 4 ° C.

次に、プロモーター及び各エクソン領域を増幅するため、上記〔表1〕に示す配列を有する2nd PCR用のフォワードプライマー及びリバースプライマーを設計した。この2nd PCR用のフォワードプライマーとリバースプライマーを各0.5μM、及びLA-Taqを0.05 units/μL(タカラバイオ社)用いて、GPX1遺伝子の1st PCR産物(5μL)からプロモーター領域又は各エクソン領域を含むDNA断片を、全量50μLの系で増幅した。この際のPCR条件は、熱変性 94℃,5分、[熱変性 94℃,30秒;アニーリング 55℃,1分;伸張反応 72℃,2分]×30サイクル、伸張反応 72℃,7分とした。   Next, in order to amplify the promoter and each exon region, a forward primer and a reverse primer for 2nd PCR having the sequences shown in [Table 1] above were designed. Using the 2nd PCR forward primer and reverse primer 0.5μM each and LA-Taq 0.05 units / μL (Takara Bio Inc.), including the promoter region or each exon region from the 1st PCR product of GPX1 gene (5μL) The DNA fragment was amplified in a total volume of 50 μL. PCR conditions at this time were heat denaturation 94 ° C., 5 minutes, [thermal denaturation 94 ° C., 30 seconds; annealing 55 ° C., 1 minute; extension reaction 72 ° C., 2 minutes] × 30 cycles, extension reaction 72 ° C., 7 minutes. It was.

続いて、2nd PCR増幅産物のうちの5μLに、PCR Product Pre-Sequencing Kit(USB社)のExonuclease Iを0.2μL、Shrimp alkaline phosphataseを0.2μL、及び精製水を1.6μL加えて合計7μLとし、37℃で15分、80℃で15分処理した後、4℃に冷却した。   Subsequently, 5 μL of the 2nd PCR amplification product was added with 0.2 μL of PCR Product Pre-Sequencing Kit (USB), 0.2 μL of Shrimp alkaline phosphatase, and 1.6 μL of purified water to make a total of 7 μL. After 15 minutes at 80 ° C. and 15 minutes at 80 ° C., the mixture was cooled to 4 ° C.

次に、プロモーター及び各エクソン領域について、上記〔表1〕に示す配列を有するシークエンス用のプライマーを設計した。PCR Product Pre-Sequencing Kitで処理した2nd PCR増幅産物の両鎖について、設計したシークエンス用のプライマーを用いて、ABI BigDye Terminator Cycle Sequencing Kit〔バージョン3.1〕(アプライドバイオシステムズ社)により直接塩基配列を決定した。   Next, primers for sequencing having the sequences shown in [Table 1] above were designed for the promoter and each exon region. For both strands of the 2nd PCR amplification product treated with PCR Product Pre-Sequencing Kit, ABI BigDye Terminator Cycle Sequencing Kit [Version 3.1] (Applied Biosystems) is directly used for sequencing. did.

より具体的には、上記した合計7μLの2nd PCR増幅産物に、1μMの上記したシークエンス用のプライマー 1.6μL、BigDye 2μL、5x Sequencing buffer 3μL、及び、精製水7μLを加えて、合計20.6μLとし、[熱変性 96℃,10秒;アニーリング 50℃,5秒;伸張反応 60℃,4分]×25サイクルの条件で処理し、その後4℃に冷却した。
DyeEx96 plate(キアゲン社)を用いて過剰な色素を除去し、溶出液全量の20.6μLをABI Prism 3730 DNA Analyzer(アプライドバイオシステムズ社)を用いて分析した。その際、溶出液は、94℃で2分間、ヒートショックを行った。
More specifically, 1 μM of the above-described sequencing primer 1.6 μL, BigDye 2 μL, 5 × Sequencing buffer 3 μL, and purified water 7 μL are added to the total 7 μL of the 2nd PCR amplification product to make a total of 20.6 μL, [Thermal denaturation 96 ° C., 10 seconds; annealing 50 ° C., 5 seconds; extension reaction 60 ° C., 4 minutes] × 25 cycles, and then cooled to 4 ° C.
Excess dye was removed using DyeEx96 plate (Qiagen), and 20.6 μL of the total eluate was analyzed using ABI Prism 3730 DNA Analyzer (Applied Biosystems). At that time, the eluate was subjected to heat shock at 94 ° C. for 2 minutes.

このようにして、日本人の2型糖尿病患者74例のゲノムDNAについて、GPX1遺伝子領域の配列解析を行い、合計9種の多型を見出した〔表2〕。これらの多型のうちアミノ酸置換を引き起こすものは、既知の33_34insGCG(Alall_Alal2ins Ala)と596C>T(Pro199Leu)の2種類で、その頻度は0.088であった。なお、「33_34insGCG」は、GPX1遺伝子の翻訳開始コドン[ATG]のアデニン[A]から下流方向に33番目の塩基と34番目の塩基の間に、GCG(グアニン-シトシン-グアニン)が挿入された変異を意味し、「Alall_Alal2ins Ala」は、GPX1のN末端側から11番目のアミノ酸であるアラニン(Ala)と12番目のアミノ酸であるアラニン(Ala)の間にアラニン(Ala)が挿入されていることを意味する。また、「Pro199Leu」は、GPX1のN末端側から199番目のアミノ酸であるプロリン(Pro)が、ロイシン(Leu)に変化していることを意味する。   Thus, sequence analysis of the GPX1 gene region was performed on the genomic DNA of 74 Japanese type 2 diabetic patients, and a total of nine polymorphisms were found [Table 2]. Among these polymorphisms, there are two types that cause amino acid substitution, known 33_34insGCG (Alall_Alal2ins Ala) and 596C> T (Pro199Leu), and the frequency was 0.088. "33_34insGCG" has GCG (guanine-cytosine-guanine) inserted between the 33rd and 34th bases downstream from the adenine [A] of the translation start codon [ATG] of the GPX1 gene. "Alall_Alal2ins Ala" means that the alanine (Ala) is inserted between the 11th amino acid alanine (Ala) and the 12th amino acid alanine (Ala) from the N-terminal side of GPX1. Means that. “Pro199Leu” means that proline (Pro), which is the 199th amino acid from the N-terminal side of GPX1, is changed to leucine (Leu).

市販のソフトウェアSNPAlyzeバージョン3.1(ダイナコム社)による|D'|値及びγ値を用いた解析の結果、解析領域のほぼ全長で強い連鎖不平衡が認められたため、全領域を一つのブロックとしてハプロタイプ解析を行った。なお、|D'|値およびγ2値については、「ヒトゲノムの連鎖分析」(J. オット著,五條堀孝 監訳、安田徳一 訳;講談社刊;156-162頁)の記載に基づいて算出した。
ハプロタイプは染色体上の多型同士の連鎖を表すもので、1カ所の多型を用いる場合より、医薬品の有効性・副作用等のフェノタイプと、より高い相関を示すことが知られている(Judson R et al., Pharmacogenomics, 1:15-26(2000)参照)。
As a result of analysis using | D '| value and γ 2 value by commercially available software SNPAlyze version 3.1 (Dynacom), strong linkage disequilibrium was observed over almost the entire analysis region, so the entire region was regarded as one block and the haplotype Analysis was performed. The | D '| and γ 2 values were calculated based on the description in "Linkage analysis of the human genome" (J. Ott, translated by Takashi Gojobori, translated by Tokuichi Yasuda; published by Kodansha; pages 156-162). .
Haplotypes represent linkages between polymorphisms on chromosomes, and are known to show a higher correlation with phenotypes such as drug efficacy and side effects than when using a single polymorphism (Judson R et al., Pharmacogenomics, 1: 15-26 (2000)).

本実施例においては、ハプロタイプ推定の標準法であるExpectation-Maximizationアルゴリズムに基づき、ソフトウェアSNPAlyzeバージョン3.1により推定した。ハプロタイプ名は、アミノ酸置換を有しないものは*1、アミノ酸置換を有するものは*2とし、亜型(サブタイプ)は、*番号+小文字のアルファベットで表記した[表2]。   In this example, estimation was performed by software SNPAlyze version 3.1 based on the Expectation-Maximization algorithm which is a standard method of haplotype estimation. The haplotype names are * 1 for those that do not have amino acid substitutions, * 2 for those that have amino acid substitutions, and subtypes are indicated by * numbers + lowercase alphabets [Table 2].

5種の*1サブタイプと2種の*2サブタイプを推定した。*2ハプロタイプは、連鎖している-649A>G、-46C>T、33_34insGCG(Alall_Alal2ins Ala)、及び596C>T(Pro199Leu)の多型を含んでおり、既に公知のハプロタイプである(Hamanishi T. et al, Diabetes, 53:2455-2460(2004))。推定したハプロタイプのうち、頻度0.05以上のものは、*1a,*1b,*2aの3種であり、この3種を分類するためのタグとなる多型として、2種[794(*185)A>G及び596C>T(Pro199Leu)]を選定した。なお、「*185」は、翻訳終止コドン[TAG]のグアニン[G]より185塩基下流に位置する塩基を表している。   Five * 1 subtypes and two * 2 subtypes were estimated. * 2 Haplotypes include the polymorphisms -649A> G, -46C> T, 33_34insGCG (Alall_Alal2ins Ala), and 596C> T (Pro199Leu), which are already known haplotypes (Hamanishi T. et al, Diabetes, 53: 2455-2460 (2004)). Among the estimated haplotypes, those with a frequency of 0.05 or more are * 1a, * 1b, * 2a, and 2 types [794 (* 185) as polymorphisms that serve as tags for classifying these 3 types A> G and 596C> T (Pro199Leu)] were selected. “* 185” represents a base located 185 bases downstream from guanine [G] of the translation termination codon [TAG].

<スルホニルウレア剤長期有効患者群及び二次無効患者群のパイロシークエンシングによるタイピング>
実施例1で選定した頻度0.05以上のハプロタイプのタグ多型につき、パイロシークエンシング法によるタイピング系を開発し、日本人のスルホニルウレア剤長期有効患者278名(スルホニルウレア剤を5年以上使用し、現在でも有効)、及び、二次無効患者80名(過去にスルホニルウレア剤を3年以上使用し、現在はインスリン治療に移行)を対象としてタイピングを行った。これらの患者の背景情報及び臨床情報を〔表3〕に示す。なお、スルホニルウレア剤を使用した患者としては、グリメピリド、グリベンクラミド、トルブタミド、グリクラジドから選択されるスルホニルウレア剤の一種、又は、二種類以上を投与した患者を対象とした。
<Typing of sulfonylurea long-term effective patient group and secondary ineffective patient group by pyrosequencing>
For the haplotype tag polymorphism selected in Example 1 with a frequency of 0.05 or more, we developed a typing system based on the pyrosequencing method, and used 278 Japanese sulfonylurea long-term effective patients (for more than 5 years using sulfonylurea, Effective) and 80 patients with secondary ineffectiveness (previously used sulfonylurea for more than 3 years and now shifted to insulin treatment). The background information and clinical information of these patients are shown in [Table 3]. In addition, as a patient who used the sulfonylurea agent, the patient who administered one or more types of sulfonylurea agents selected from glimepiride, glibenclamide, tolbutamide, and gliclazide was used.

二次無効患者群では糖尿病の合併症である神経障害及び網膜症の頻度が有意に高いことが確認された(ボンフェローニ法により多重比較補正を施したフィッシャーの正確確率検定のp値は、p<0.005であった)。なお、ボンフェローニ法については、鎌谷直之著、実感と納得の統計学、121頁、羊土社刊を参照した。 It was confirmed that the frequency of neuropathy and retinopathy, which are complications of diabetes, was significantly higher in the secondary ineffective patient group (P value of Fisher's exact test with multiple comparison correction by Bonferroni method is p <0.005). Regarding the Bonferroni method, I refer to Naoyuki Kamatani, Statistics of Reality and Consciousness, p. 121, published by Yodosha.

パイロシークエンシング法は、まずGPX1のゲノム配列(NCBI, NW_921651.1)に基づきプライマーを設計した。設計したプライマーを〔表4〕に示す。   In the pyrosequencing method, primers were first designed based on the GPX1 genomic sequence (NCBI, NW — 921651.1). The designed primers are shown in [Table 4].

PCR反応は、上記〔表4〕に示す増幅用のフォワードプライマー及びリバースプライマーを各0.25μM、LA-Taqを0.05units/μL、及びゲノムDNAを25ng用いて、全量50μLの系でDNAを増幅した。この際のPCRの条件は、熱変性 94℃,5分、[熱変性 94℃,30秒;アニーリング 55℃,45秒;伸張反応 72℃,30秒]×50サイクル、伸張反応 72℃,5分とした。   In the PCR reaction, DNA was amplified in a total volume of 50 μL using 0.25 μM each of the amplification forward primer and reverse primer shown in [Table 4], LA-Taq 0.05 units / μL, and 25 ng of genomic DNA. . The PCR conditions were as follows: heat denaturation 94 ° C., 5 minutes, [thermal denaturation 94 ° C., 30 seconds; annealing 55 ° C., 45 seconds; extension reaction 72 ° C., 30 seconds] × 50 cycles, extension reaction 72 ° C., 5 Minutes.

続いて、Saeki M. et al, Clin. Chem., 49:1182-1185,(2003)に記載されている条件に従ってPCR産物の精製及び一本鎖化を行い、上記〔表4〕シークエンス用のプライマー(10pmol)を加えて95℃で2分間処理し、更に冷却することによりハイブリダイズさせた。これをパイロシークエンサーPSQ96MA装置(バイオタージAB社)により、Pyro Gold試薬キット(バイオタージAB社)を用いてミニシークエンシング反応を行い、多型部位の塩基を解析した。   Subsequently, the PCR product was purified and single-stranded according to the conditions described in Saeki M. et al, Clin. Chem., 49: 1182-1185, (2003), and the above [Table 4] sequence was used. Primer (10 pmol) was added, treated at 95 ° C. for 2 minutes, and further cooled to hybridize. This was subjected to a mini-sequencing reaction using a pyro sequencer PSQ96MA apparatus (Biotage AB) and a Pyro Gold reagent kit (Biotage AB) to analyze the base of the polymorphic site.

<ハプロタイプ解析及びGPX1ハプロタイプと二次無効発現との相関解析>
実施例2で分析した多型部位の塩基解析の結果に基づき、スルホニルウレア剤長期有効患者群及び二次無効患者について、ソフトウェアSNPAlyzeバージョン3.1により、それぞれハプロタイプ推定を行い、ハプロタイプ頻度を算出した。その結果を〔表5〕に示す。
<Haplotype analysis and correlation analysis between GPX1 haplotype and secondary ineffective expression>
Based on the results of the base analysis of the polymorphic site analyzed in Example 2, haplotype estimation was performed for each sulfonylurea long-term effective patient group and secondary ineffective patient by software SNPAlyze version 3.1, and the haplotype frequency was calculated. The results are shown in [Table 5].

二次無効患者群(80例)及びスルホニルウレア剤長期有効患者群(278例)のハプロタイプ頻度を比較したところ、二次無効患者群で*2aの頻度(0.125)がスルホニルウレア剤長期有効患者群(0.059)に比して、有意に高い(ボンフェローニ法にて多重比較補正後のp=0.028、オッズ比2.3)ことが明らかとなった(〔表5〕上段)。この有意差は、スルホニルウレア剤治療開始10年以内にインスリン治療に移行した二次無効患者群(42例)と11年以上有効なスルホニルウレア剤長期有効患者群(130例)というサブグループ間を比較した場合に、より顕著(補正後のp=0.0009、オッズ比4.5)であった(〔表5〕下段)。一方、*1bハプロタイプの頻度については、2群間で有意な差は認められなかった。   When the haplotype frequencies of the secondary ineffective patient group (80 cases) and the sulfonylurea long-term effective patient group (278 cases) were compared, the frequency of * 2a (0.125) in the secondary ineffective patient group (0.059) ) Was significantly higher (p = 0.028 after the multiple comparison correction by the Bonferroni method, odds ratio 2.3) ([Table 5] upper row). This significant difference was compared between the subgroups of the secondary ineffective patient group (42 cases) who transitioned to insulin treatment within 10 years of the start of sulfonylurea treatment and the sulfonylurea long-term effective patient group (130 cases) effective for 11 years or more. In the case (p = 0.0009 after correction, odds ratio 4.5) ([Table 5] lower row). On the other hand, there was no significant difference between the two groups in the frequency of the * 1b haplotype.

最後に、ロジスティック回帰分析を行った。その結果を〔表6〕に示す。なお、ロジスティック回帰分析については、市販のソフトウェアJMPバージョン6(SAS Institute Inc., Cary, NC, USA)を用い、変数増減時のp値を各0.1としたステップワイズ法により行った。
Finally, a logistic regression analysis was performed. The results are shown in [Table 6]. The logistic regression analysis was performed by a stepwise method using commercially available software JMP version 6 (SAS Institute Inc., Cary, NC, USA) and setting the p-value at the time of variable increase / decrease to 0.1.

まずスルホニルウレア剤長期有効患者群(278例)及び二次無効患者群(80例)の解析では、*2aハプロタイプはp=0.014で有意な変数となった。この他にスルホニルウレア剤治療の開始年齢(p<0.0001)及び2型糖尿病の期間[発症からの期間](P=0.017)が、有意な変数となった。一方、スルホニルウレア剤治療開始10年以内にインスリン治療に移行した二次無効患者群(42例)と11年以上有効なスルホニルウレア剤長期有効患者群(130例)のサブグループ間比較では、*2aハプロタイプのみがp=0.0009で有意な変数となり、上記2種の患者背景因子は有意とはならなかった。
これらの結果から、GPX1遺伝子の*2aハプロタイプが、二次無効発現と有意な相関を示すことが明らかとなった。
First, in the analysis of sulfonylurea long-term effective patient group (278 cases) and secondary ineffective patient group (80 cases), the * 2a haplotype became a significant variable at p = 0.014. In addition to this, the starting age of sulfonylurea treatment (p <0.0001) and the duration of type 2 diabetes [period from onset] (P = 0.017) were significant variables. On the other hand, in the comparison between subgroups of the secondary ineffective patient group (42 cases) who transitioned to insulin treatment within 10 years from the start of sulfonylurea treatment and the sulfonylurea long-term effective patient group (130 cases) effective for more than 11 years, * 2a haplotype Only became a significant variable at p = 0.0009, and the above two patient background factors were not significant.
These results revealed that the * 2a haplotype of the GPX1 gene showed a significant correlation with secondary ineffective expression.

<ABCC8遺伝子、HNF1A遺伝子及びKCNQ1遺伝子のTaqMan法による多型解析>
スルホニルウレア剤治療開始10年以内にインスリン治療に移行した患者(二次無効患者群 42例)、及び、11年以上有効な患者(スルホニルウレア剤長期有効患者群 130例)のサンプルを用い、ABCC8遺伝子のIVS15-3T>C(rs1799854)多型、HNF1A遺伝子の79A>C (Ile27Leu、rs1169288)多型、KCNQ1遺伝子のIVS15-29246C>T (rs2237892)多型について、TaqMan SNP Genotyping Assay Kit (アプライドバイオシステムズ社)による多型解析を行った。なお、スルホニルウレア剤を使用した患者としては、グリメピリド、グリベンクラミド、トルブタミド、グリクラジドから選択されるスルホニルウレア剤の一種、又は、二種類以上を投与した患者を対象とした。
具体的には、TaqMan Universal PCR Master Mix (2X、アプライドバイオシステムズ社)を12.5μL、20X TaqMan SNP Genotyping Mixを1.25μL、滅菌精製水を11.25μL混和して25μLとし、PCR反応を行った。PCR条件は、熱変性 95℃,10分、[熱変性 92℃,15秒;アニーリング及び伸長反応 60℃,1分」×40サイクルとした。PCR反応終了後、反応液の蛍光量をABI 7500 Real Time PCR System (アプライドバイオシステムズ社)により測定し、各塩基を有する場合の蛍光量から多型の判定を行った。
<Polymorphism analysis of ABCC8 gene, HNF1A gene and KCNQ1 gene by TaqMan method>
Using samples of patients who transitioned to insulin therapy within 10 years after the start of sulfonylurea treatment (42 patients with secondary ineffectiveness) and patients who were effective for 11 years or longer (130 patients with long-term sulfonylurea treatment), the ABCC8 gene TaqMan SNP Genotyping Assay Kit (Applied Biosystems) for IVS15-3T> C (rs1799854) polymorphism, HNF1A gene 79A> C (Ile27Leu, rs1169288) polymorphism, and KCNQ1 gene IVS15-29246C> T (rs2237892) polymorphism ) Polymorphism analysis. In addition, as a patient who used the sulfonylurea agent, the patient who administered one or more types of sulfonylurea agents selected from glimepiride, glibenclamide, tolbutamide, and gliclazide was used.
Specifically, 12.5 μL of TaqMan Universal PCR Master Mix (2X, Applied Biosystems), 1.25 μL of 20X TaqMan SNP Genotyping Mix, and 11.25 μL of sterilized purified water were mixed to 25 μL, and the PCR reaction was performed. PCR conditions were heat denaturation 95 ° C., 10 minutes, [thermal denaturation 92 ° C., 15 seconds; annealing and extension reaction 60 ° C., 1 minute] × 40 cycles. After completion of the PCR reaction, the fluorescence amount of the reaction solution was measured by ABI 7500 Real Time PCR System (Applied Biosystems), and polymorphism was determined from the fluorescence amount when each base was present.

<NFE2L2遺伝子のパイロ・シーケンシング法による多型解析>
実施例4と同じサンプルを用い、NFE2L2遺伝子のハプロタイプタグ多型6種[-1123A>G, -769G>A, -767G>A, -733C>A, 697C>T (Pro233Ser), 2229 (*411)T>G]について、パイロシーケンシング法による多型解析を行った。
NFE2L2のゲノム配列(NCBI, NT_005403.16)に基づいてプライマーを設計した。パイロ・シークエンシングに用いたプライマーを〔表7〕に示す。
<Polymorphism analysis of NFE2L2 gene by pyro-sequencing method>
Using the same sample as in Example 4, 6 haplotype tag polymorphisms of NFE2L2 gene [-1123A> G, -769G> A, -767G> A, -733C> A, 697C> T (Pro233Ser), 2229 (* 411 ) T> G] was analyzed by pyrosequencing.
Primers were designed based on the genomic sequence of NFE2L2 (NCBI, NT_005403.16). Primers used for pyro sequencing are shown in [Table 7].

PCR反応は、上記〔表7〕に示す増幅用のフォワードプライマー及びリバースプライマーを各0.2μM、Ex-Taqを0.02units/μL(タカラバイオ社)、ゲノムDNA 20ngを用いて、全量50μLの系でDNAを増幅した。なお、-733C>A多型解析については、前記Ex-Taqの代わりにLA-Taq 0.05units/μL(タカラバイオ社)を用いた。この際のPCRの条件は、熱変性 94℃,5分、[熱変性 94℃,30秒;アニーリング 55℃,45秒;伸張反応 72℃,30秒]×50サイクル、伸張反応72℃,5分とした。   The PCR reaction was carried out in a system with a total volume of 50 μL using 0.2 μM each of the amplification forward primer and reverse primer shown in [Table 7], 0.02 units / μL of Ex-Taq (Takara Bio Inc.), and 20 ng of genomic DNA. DNA was amplified. For the -733C> A polymorphism analysis, LA-Taq 0.05 units / μL (Takara Bio Inc.) was used instead of Ex-Taq. The PCR conditions were as follows: thermal denaturation 94 ° C., 5 minutes, [thermal denaturation 94 ° C., 30 seconds; annealing 55 ° C., 45 seconds; extension reaction 72 ° C., 30 seconds] × 50 cycles, extension reaction 72 ° C., 5 Minutes.

続いて、Saeki M. et al, Clin. Chem., 49:1182-1185, (2003))に記載されている条件に従って、PCR産物の精製及び一本鎖化を行い、上記〔表7〕に示すシークエンス用のプライマー(10pmol)を加えて、95℃で2分間処理し、更に冷却することによりハイブリダイズさせた。次いでパイロシークエンサーPSQ96MA装置(バイオタージ AB社)と、Pyro Gold試薬キット(バイオタージ AB社)を用いて、ミニシーケンシング反応を行い、多型部位の塩基を解析した。   Subsequently, the PCR product was purified and single-stranded according to the conditions described in Saeki M. et al, Clin. Chem., 49: 1182-1185, (2003)). The sequence primer shown (10 pmol) was added, the mixture was treated at 95 ° C. for 2 minutes, and further cooled to allow hybridization. Next, using a Pyrosequencer PSQ96MA device (Biotage AB) and a Pyro Gold reagent kit (Biotage AB), a mini-sequencing reaction was performed to analyze the base of the polymorphic site.

<各遺伝子多型と二次無効発現との相関解析及び多変量解析>
実施例4及び5において多型解析した、遺伝子多型のアリルモデル、優性モデル、劣勢モデルを用いた解析は、市販のSNPAlyzeソフトウェアバージョン7.0(ダイナコム社)を用いて行った。
遺伝子多型解析の結果を〔表8〕に示す。ABCC8遺伝子のIVS15-3T>C多型、HNF1A遺伝子の79A>C多型(Ile27Leu)、NFE2L2遺伝子の-1123A>G多型及び2229(*411)T>G多型がアリルモデルと優性モデルで、KCNQ1 IVS15-29246C>T多型が劣性モデルで、それぞれ有意な頻度差(P<0.05)を示した。なおこれらの結果は、全て統計学的な多重性補正前のデータである。
<Correlation analysis and multivariate analysis between each gene polymorphism and secondary ineffective expression>
Analysis using the polymorphism allele model, dominant model, and inferior model of the polymorphism analyzed in Examples 4 and 5 was performed using commercially available SNPAlyze software version 7.0 (Dynacom).
The results of gene polymorphism analysis are shown in [Table 8]. ABCC8 gene IVS15-3T> C polymorphism, HNF1A gene 79A> C polymorphism (Ile27Leu), NFE2L2 gene -1123A> G polymorphism and 2229 (* 411) T> G polymorphism are allele model and dominant model The KCNQ1 IVS15-29246C> T polymorphism was a recessive model and showed a significant frequency difference (P <0.05). These results are all data before statistical multiplicity correction.

また、上記「アリルモデル」とはメジャーアリルおよびマイナーアリルの数(各個人は2個を有する)を比較する方法、「優性モデル」とは「メジャーアリルのホモ接合」と「ヘテロ接合+マイナーアリルのホモ接合」の人数を比較する方法、「劣性モデル」とは「メジャーアリルのホモ接合+ヘテロ接合」と「マイナーアリルのホモ接合」の人数を比較する方法である。   The “allele model” is a method for comparing the number of major alleles and minor alleles (each individual has 2), and the “dominant model” is “homozygous major allele” and “heterozygous + minor allele” The “recessive model” is a method of comparing the numbers of “major allele homozygous + heterozygous” and “minor allele homozygous”.

次に、GPX1 *2aハプロタイプとこれら5多型を含めてロジスティック回帰分析を行った。なお、ロジスティック回帰分析については、実施例3と同様に、市販のソフトウェアJMPバージョン6(SAS Institute Inc., Cary, NC, USA)を用い、変数増減時のp値を各0.1とした、ステップワイズ法により行った。
ロジスティック回帰分析の結果を〔表9〕に示す。この結果に基づいて、NFE2L2 2229(*411)T>G以外の5遺伝子多型を含む二次無効予測モデルを確立した。この場合、性別、スルホニルウレア剤治療の開始年齢及び2型糖尿病の期間等の患者背景因子は有意な説明変数とならなかった。従って、GPX1 *2aハプロタイプ[596C>T(Pro199Leu)多型]、及びABCC8 IVS15-3T>C、HNF1A 79A>C (Ile27Leu)、NFE2L2 -1123A>G、KCNQ1 IVS15-29246C>Tの各遺伝子多型が、スルホニルウレア剤による二次無効発現の予測に有用であることが明らかとなった。
Next, a logistic regression analysis was performed including the GPX1 * 2a haplotype and these five polymorphisms. For logistic regression analysis, as in Example 3, commercially available software JMP version 6 (SAS Institute Inc., Cary, NC, USA) was used, and the p-value at the time of variable increase / decrease was set to 0.1. Done by law.
The results of logistic regression analysis are shown in [Table 9]. Based on this result, we established a secondary ineffective prediction model containing 5 gene polymorphisms other than NFE2L2 2229 (* 411) T> G. In this case, patient background factors such as sex, age of sulfonylurea treatment onset and type 2 diabetes duration were not significant explanatory variables. Therefore, GPX1 * 2a haplotype [596C> T (Pro199Leu) polymorphism] and ABCC8 IVS15-3T> C, HNF1A 79A> C (Ile27Leu), NFE2L2 -1123A> G, KCNQ1 IVS15-29246C> T gene polymorphism However, it became clear that it was useful for the prediction of the secondary ineffective expression by a sulfonylurea agent.

これらの結果から、GPX1遺伝子の596C>T多型、ABCC8遺伝子のIVS15-3T>C多型、HNF1A遺伝子の79A>C多型、NFE2L2遺伝子の-1123A>G多型及びKCNQ1遺伝子のIVS15-29246C>T多型を有する患者は、スルホニルウレア剤投与時に二次無効を起こしやすいことを予想することが可能であることが確認された。   From these results, GPX1 gene 596C> T polymorphism, ABCC8 gene IVS15-3T> C polymorphism, HNF1A gene 79A> C polymorphism, NFE2L2 gene -1123A> G polymorphism and KCNQ1 gene IVS15-29246C It was confirmed that patients with> T polymorphism can be expected to be prone to secondary ineffectiveness when administered with sulfonylureas.

本発明によれば、スルホニルウレア剤投与時に、特定の遺伝子多型を調べることによって、二次無効を発現しやすいかどうかを予測することができるので、ハイリスク群の同定及びこれら患者に対する早期インスリン導入や他の経口糖尿病薬の積極的投与によって、二次無効を回避することが可能となる上、合併症の低減及び患者QOLの維持の観点から極めて有効である。   According to the present invention, it is possible to predict whether or not secondary invalidity is likely to occur by examining a specific genetic polymorphism at the time of administration of a sulfonylurea agent, so that identification of a high-risk group and early insulin introduction for these patients In addition, it is possible to avoid secondary ineffectiveness by aggressive administration of oral and other oral diabetes drugs, and it is extremely effective from the viewpoint of reducing complications and maintaining patient QOL.

Claims (9)

下記一般式(I)で表されるスルホニルウレア剤を投与した場合の二次無効の発生を事前に予測する方法であって、
該方法が、被験者から遺伝子を採取し、下記(A)〜(E)に記載された遺伝子多型の群の中から選択される少なくとも一種の多型の有無を検出することを特徴とする、スルホニルウレア剤を投与した場合の二次無効の発生を事前に予測する方法;
一般式(I)
R1-SO2NHCONH-R2 (I)
ここでR1は、ハロゲン、アルキル基、アセチル基、又は-(CH2)n-NHCO-R3で適宜置換されたフェニル基であり、R2はアルキル基、又は、アルキル基で適宜置換された、不飽和結合を含まず、ヘテロ原子を含んでもよい炭素環から選択される基であり、R3は、ハロゲン、酸素原子、アルキル基若しくはアルコキシ基で置換されたアリール基又はヘテロアリール基であり、nは1〜5の整数である;
(A)GPX1遺伝子:596C>T多型,
(B)ABCC8遺伝子:IVS15-3T>C多型,
(C)HNF1A遺伝子:79A>C多型,
(D)NFE2L2遺伝子:-1123A>G多型,
(E)KCNQ1遺伝子:IVS15-29246C>T多型。
A method for predicting in advance the occurrence of secondary ineffectiveness when a sulfonylurea agent represented by the following general formula (I) is administered,
The method is characterized by collecting a gene from a subject and detecting the presence or absence of at least one polymorphism selected from the group of genetic polymorphisms described in the following (A) to (E): A method for predicting the occurrence of secondary ineffectiveness when a sulfonylurea is administered;
Formula (I)
R 1 -SO 2 NHCONH-R 2 (I)
Here, R 1 is a halogen, an alkyl group, an acetyl group, or a phenyl group optionally substituted with — (CH 2 ) n —NHCO—R 3 , and R 2 is optionally substituted with an alkyl group or an alkyl group. R 3 is a group selected from carbocycles which do not contain an unsaturated bond and may contain a hetero atom, and R 3 is an aryl group or heteroaryl group substituted with a halogen, an oxygen atom, an alkyl group or an alkoxy group. And n is an integer from 1 to 5;
(A) GPX1 gene: 596C> T polymorphism,
(B) ABCC8 gene: IVS15-3T> C polymorphism,
(C) HNF1A gene: 79A> C polymorphism,
(D) NFE2L2 gene: -1123A> G polymorphism,
(E) KCNQ1 gene: IVS15-29246C> T polymorphism.
前記遺伝子多型を検出する方法が、ダイレクト・シークエンシング法又はパイロ・シークエンシング法である、請求項1に記載されたスルホニルウレア剤を投与した場合の二次無効の発生を事前に予測する方法。   The method for predicting the occurrence of secondary ineffectiveness when the sulfonylurea agent according to claim 1 is administered, wherein the method for detecting the gene polymorphism is a direct sequencing method or a pyro sequencing method. GPX1遺伝子の翻訳開始コドンのアデニンから下流596番目の塩基を含む配列部分を増幅する、GPX1遺伝子の多型を検出するためのプライマーであって、配列番号1、3、8〜10、12、17〜20、23、25及び26の少なくとも一部を含む塩基配列、又は、該塩基配列と相補的な塩基配列を有するプライマー。   A primer for detecting a polymorphism of the GPX1 gene, which amplifies a sequence portion including the 596th base downstream from the adenine of the translation initiation codon of the GPX1 gene, which is SEQ ID NO: 1, 3, 8 to 10, 12, 17 A primer having a base sequence containing at least a part of -20, 23, 25 and 26, or a base sequence complementary to the base sequence. NFE2L2遺伝子の翻訳開始コドンのアデニンから上流1123番目の塩基を含む配列部分を増幅する、NFE2L2遺伝子の多型を検出するためのプライマーであって、配列番号27、28、37、42及び43の少なくとも一部を含む塩基配列、又は、該塩基配列と相補的な塩基配列を有するプライマー。   A primer for detecting a polymorphism of the NFE2L2 gene, which amplifies a sequence portion including the 1123th base upstream from the translation start codon adenine of the NFE2L2 gene, comprising at least SEQ ID NOs: 27, 28, 37, 42 and 43 A primer having a partial base sequence or a base sequence complementary to the base sequence. GPX1遺伝子の翻訳開始コドンのアデニンから下流596番目の塩基を含む配列部分、又は、これらと相補的な塩基配列を有する、GPX1遺伝子の多型を検出するためのプローブ。   A probe for detecting a polymorphism of the GPX1 gene having a sequence portion containing the 596th base downstream from the adenine of the translation initiation codon of the GPX1 gene, or a base sequence complementary thereto. NFE2L2遺伝子の翻訳開始コドンのアデニンから上流1123番目の塩基を含む配列部分、又は、これらと相補的な塩基配列を有する、NFE2L2遺伝子の多型を検出するためのプローブ。   A probe for detecting a polymorphism of the NFE2L2 gene having a sequence portion containing the 1123th base upstream from the translation start codon adenine of the NFE2L2 gene or a base sequence complementary thereto. 請求項3に記載されたプライマー及び/又は請求項5に記載されたプローブを含むことを特徴とする、GPX1遺伝子の多型を検出するための検査キット。   A test kit for detecting a polymorphism of the GPX1 gene, comprising the primer according to claim 3 and / or the probe according to claim 5. 請求項4に記載されたプライマー及び/又は請求項6に記載されたプローブを含むことを特徴とする、NFE2L2遺伝子の多型を検出するための検査キット。   A test kit for detecting a polymorphism of the NFE2L2 gene, comprising the primer according to claim 4 and / or the probe according to claim 6. 下記一般式(I)で表されるスルホニルウレア剤を投与した場合の二次無効の発生を事前に予測する検査キットであって、請求項3〜4に記載されたプライマーから選択される少なくとも一種のプライマー、及び/又は、請求項5〜6に記載されたプローブから選択される少なくとも1種のプローブを含むことを特徴とする、スルホニルウレア剤を投与した場合の二次無効の発生を事前に予測するための検査キット;
R1-SO2NHCONH-R2 (I)
ここでR1は、ハロゲン、アルキル基、アセチル基、又は-(CH2)n-NHCO-R3で適宜置換されたフェニル基であり、R2はアルキル基、又は、アルキル基で適宜置換された、不飽和結合を含まず、ヘテロ原子を含んでもよい炭素環から選択される基であり、R3は、ハロゲン、酸素原子、アルキル基若しくはアルコキシ基で置換されたアリール基又はヘテロアリール基であり、nは1〜5の整数である。
A test kit for predicting in advance the occurrence of secondary ineffectiveness when a sulfonylurea agent represented by the following general formula (I) is administered, comprising at least one selected from the primers described in claims 3 to 4 Predicting the occurrence of secondary ineffectiveness when a sulfonylurea agent is administered, comprising at least one probe selected from a primer and / or a probe according to claims 5 to 6 Test kit for;
R 1 -SO 2 NHCONH-R 2 (I)
Here, R 1 is a halogen, an alkyl group, an acetyl group, or a phenyl group optionally substituted with — (CH 2 ) n —NHCO—R 3 , and R 2 is optionally substituted with an alkyl group or an alkyl group. R 3 is a group selected from carbocycles which do not contain an unsaturated bond and may contain a hetero atom, and R 3 is an aryl group or heteroaryl group substituted with a halogen, an oxygen atom, an alkyl group or an alkoxy group. And n is an integer from 1 to 5.
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