JP2008530554A - 表面張力に保持された蛍光ナノドロップからの信号を測定する装置及び測定方法 - Google Patents
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Abstract
Description
装置は、
下記の3つの状態のいずれか1つに向かって少なくとも一方が他方に対して動作可能な第1及び第2のアンビル表面と、サンプルを照明するための少なくとも1つの手段とを含んでおり、
前記3つの状態が、
表面が対向し実質的に平行で且つ近づいた状態で離間して、少なくとも一方の動作可能な表面と他方の表面との上に濡れたエリアを形成する両方の表面に液体が広がるように、少なくとも一方の動作可能な表面と他方の表面とが遠ざかった状態で離間して、ドロップレットが第1の表面上に位置できるように選択された、調節可能なサンプル載置状態(an adjustable sample loading position)と、
アンビル表面が対向し実質的に平行で且つ近づいた状態で離間して、それぞれの上に濡れたエリアを形成する両方の表面上に液体が広がるように選択された、調節可能な圧縮状態(an adjustable sample compressing position)と、
対向し実質的に平行な表面が離れた状態で離間して、サンプルを引っ張ってカラムとするように選択された、調節可能なサンプル測定状態(an adjustable sample measuring position)であって、サンプルが表面張力によって保持されて、それによって蛍光を測定するための光路を提供するサンプル測定状態とであり、それに加えて
サンプル表面が十分に遠ざかって、両方の表面を拭き取る又は別の手段で清浄にしてサンプル及びいずれの関連する残余を除去することを許容する開放状態(an open position)と、であり、
一方のアンビル表面は、濡れたエリア内にその表面と面一で、且つ所定の伝達開口数(a selected transmission numerical aperture)(開口数の説明は、「光学の基礎(Fundamentals of Optics)」、Francis A. Jenkins と Harvey E. Whiteの共著、McGraw-Hill、1957年、307頁を参照されたい)で軸外の又は高い開口数の励起光又は周囲の光を最小にする第1のマルチモード光ファイバの近位端部を有し、第1の光ファイバの遠位端部は分光計又は良好な蛍光検出器を形成できるような十分な波長識別が可能な他の検出器と動作可能に繋がって(in active connection)おり、
信号をモディファイする手段(signal-modifying means)を含む他方のアンビル表面は、濡れたエリア内にその表面と面一に終端しており、所定の伝達開口数の近位端部を有する第2の光ファイバを含み、第2の光ファイバの遠位端部は信号をモディファイする手段を有しており、
サンプルを照明する手段は、最小限の光がそれらの所定の開口数内で光ファイバに入るように、サンプルの保持エリアから離れて設置されサンプルを側方から照射する少なくとも1つの光源からの相対的にコリメートされたライトを含んでおり、光源は安定した波長の強度分布を有している。
i. 蛍光を含まないサンプルを使用して光源のスペクトルを記録する工程と、
ii. 少なくとも1つの蛍光を発するターゲットを選択して、そのターゲットをサンプルに取り込む工程と、
iii. 蛍光を発する波長の全て又は殆どを含む規定の波長間隔(a default wavelength interval)を選択する工程と、
iv. 分光計で前記サンプルの蛍光を測定する工程と、
v. 工程ivの測定を、計算するためにプログラムされた手段に出力する工程と、
vi. 記録された光源のスペクトルのスケールを変えて、蛍光の信号が蛍光のピークの5%以下であると知られており一般的に蛍光のピークの短波長側であるある波長におけるサンプルの強度に一致させて、サンプルの個々の蛍光を計算する工程と、
vii. 蛍光の信号のみならず、いくらかの散乱された光源の放射をも含む信号のスペクトルから、スケールを変えた光源のスペクトルを差し引く工程と、
viii. 得られた信号のスペクトルを表示する工程と、を含む方法である。
i. 蛍光を含まないサンプルを使用して光源のスペクトルを記録する工程と、
ii. 少なくとも1つの蛍光を発するターゲットを選択して、そのターゲットをサンプルに取り込む工程と、
iii. 蛍光を発する波長の全て又は殆どを含む規定の波長間隔を選択する工程と、
iv. 分光計を用いて前記サンプルの蛍光を測定する工程と、
v. 工程ivの測定を、計算するためにプログラムされた手段に出力する工程と、
vi. 前もって記録された光源のスペクトルを独立してスケールを変えて、選択されそれらの値の間に直線的に補完する(linearly interpolating)発光の波長について特定の間隔におけるサンプルの強度に一致させて、サンプルの個々の蛍光を計算する工程と、
vii. 蛍光の信号のみならずいくらかの散乱された光源の放射をも含む信号のスペクトルから、スケールを変えられた光源のスペクトルを差し引いて蛍光を発する範囲の外側にある全ての蛍光の信号の値をゼロにするようにセットする工程と、
viii. 得られた信号のスペクトルを表示する工程と、を含む方法である。
Robertsonに開示されたサンプル保持のシステムを用いることにより、最小のフィルタリング用光学部品(filtering optics)を用いて、他の透明なサンプルの良好な蛍光測定が可能である。
スケールを変えられた光源の表現を単純に差し引くことにより蛍光を抽出するのが実現可能な場合、極めて高い除去率のマルチモード光ファイバは、光ファイバの透過開口数の角度よりも著しく大きい角度の光を有し、サンプルの測定に関係する全ての表面の濡れ又は光学的接触の合計は、光源からのバックグラウンドの光を水平まで低減するのに十分である。これを実現可能にするためのさらなる要素は、スペクトル出力の相対的強度に対する固体状態の発光ダイオード(LEDs)の波長の高い再現性である。照明の配置を示したダイアグラムを、図1に示す。
i 図9aに蛍光用に示され、符号295として図9bのアレクサ(Alexa)647用に示された発光の最大波長ごとに、ソフトウェアは図9a及び図9bに符号270として示され最大波長295の両側に30nmずつ伸びた規定の波長間隔を自動で取り込む。発光の仮想フィルタリングの間隔(D1)はここでは任意で対称に適用されているが、それは必須ではない。この、スケールを変えられた又は補正された光源スペクトルは図9bの符号280として示されており、強度は図4の符号295として示された蛍光ピークの位置で測定された。選択された初期設定±20nmの設定可能な参照波長の間隔Δλは、個々の波長範囲であり、その範囲にわたって(スケールを変えられた、安定した光源のスペクトルの差し引きによる)残りのサンプルの蛍光の信号が表示される。
ii 間隔D1にわたって、間隔の端部の波長の位置における強度値のスケールを変えることにより光源スペクトルはスケールを変えられ、D1の間隔の端部の間での直線的補完を用いてサンプルのスペクトルの対応する値と設定された中間値とを一致させる。
iii スケールを変えられた光源スペクトルは、サンプルのスペクトルから、蛍光スペクトルの強度を残して差し引かれる。
FRETペアは、シングルストランド(single-strand)のヌクレオチドプローブ(ループ)及びダブルストランド(double-strand)のヌクレオチド(ステム)構造を含むヘアピン構造の中に拘束された。蛍光ドナー(フルオレセイン)はステムの一端に共有結合し、アクセプタ(Cy5)はステムの他端に共有結合した。そして、プローブ(ループ)に相補的ヌクレオチド配列(complimentary nucleotide sequence)が存在しないときは、ヘアピンのダブルストランド(塩基対)のステム構造が保護される。励起されたドナーの蛍光510は、アクセプタに比例的に移動して、より長い波長の蛍光発光540を波長530の位置に生じた。シングルストランドのプローブ(ループ)に相補的ヌクレオチド配列が存在するときは、ヘアピンの塩基対のステム構造は崩壊し、ダブルストランドのプローブが形成され、そして励起されたドナー510からの共鳴エネルギーは波長530の位置のアクセプタに移動しなかった(520)。ポジティブコントロールは、波長530の位置の長い波長のアクセプタの発光520を減少または排除することにより、スペクトル的に区別された。
200nm異なる最大励起を有するフルオロフォアの複合混合物が、図4の符号140で示されている単一のブロードな波長のフィルターされていない白色LED光源を用いて励起されている。各々が波長の境界270内でほぼ50nm異なっている4つのフルオロフォアの仮想フィルタリング発光スペクトルの結果は、表示され、符合550でラベルされた。
Claims (16)
- 実質的に平行な関係にある2つのアンビル表面の間に、表面張力によって保持された蛍光励起された液滴の形態の、蛍光励起されたサンプルの蛍光を測定する装置であって、
光路は2つの表面のそれぞれの濡れたエリアの間に確立されていることを特徴とする蛍光測定装置。 - サンプルからの蛍光が、光ファイバにより検出器に伝達されることを特徴とする請求項1に記載の蛍光測定装置。
- 検出器が分光計であることを特徴とする請求項2に記載の蛍光測定装置。
- 実質的に平行な関係にある2つのアンビル表面の間に、表面張力によって保持された蛍光励起された液滴の形態の、蛍光励起されたサンプルの蛍光を測定する装置であって、
光路は2つの表面のそれぞれの濡れたエリアの間に確立され、
前記装置は、下記の3つの状態のいずれか1つに向かって一方が他方に対して動作可能で実質的に平行な第1及び第2のアンビル表面と、サンプルを照明するための少なくとも1つの手段と、を含んでおり、
前記3つの状態が、
少なくとも一方の動作可能な表面と他方の表面とが遠ざかった状態で離間して、ドロップレットが第1の表面上に位置できるように選択された、調節可能なサンプル載置状態と、
アンビル表面が対向し実質的に平行で且つ近づいた状態で離間して、それぞれの上に濡れたエリアを形成する両方の表面上に液体が広がるように選択された、調節可能な圧縮状態と、
対向し実質的に平行な表面が離れた状態で離間して、サンプルを引っ張ってカラムとするように選択された、調節可能なサンプル測定状態であって、サンプルが表面張力によって保持されて、それによって蛍光を測定するための光路を提供するサンプル測定状態とであり、
一方の前記アンビル表面は、前記濡れたエリア内にその表面と面一の第1の光ファイバの近位端部を有し、前記第1の光ファイバの遠位端部は分光計の検出器と動作可能に繋がっており、
他方の前記アンビル表面は、前記第1の光ファイバに対応して、前記濡れたエリア内にその表面と面一の第2の光ファイバの近位端部を有し、第2の光ファイバの遠位端部は該光ファイバ内で伝達された光信号をモディファイする手段を有しており、
サンプルを照明するための少なくとも1つの手段は、サンプルの保持エリアから離れて設置された少なくとも1つの光源から最小限の光が光ファイバにその伝達開口数内で入るように、相対的にコリメートされたライトを含んでおり、
前記光源は、所定範囲の安定した波長分布を有し、前記サンプルのターゲット分子の蛍光を励起することを特徴とする請求項2に記載の蛍光測定装置。 - 信号をモディファイする手段が鏡面状のキャップを含み、それにより前記蛍光計への蛍光信号が強められることを特徴とする請求項4に記載の蛍光測定装置。
- 信号をモディファイする手段が光シンクを含み、それにより前記蛍光計に伝達される励起された周囲の光信号が最小になることを特徴とする請求項4に記載の蛍光測定装置。
- 信号をモディファイする手段が吸収する光ファイバ又はロッドを含み、それにより前記蛍光計に伝達される励起する周囲の光の信号が最小になることを特徴とする請求項4に記載の蛍光測定装置。
- 前記サンプルを照明するための手段が青色LEDであることを特徴とする請求項4に記載の蛍光測定装置。
- 前記サンプルを照明するための手段が白色LEDであることを特徴とする請求項4に記載の蛍光測定装置。
- 前記サンプルを照明するための手段が紫外LEDであることを特徴とする請求項4に記載の蛍光測定装置。
- 前記サンプルを照明するための少なくとも3つの手段があることを特徴とする請求項4に記載の蛍光測定装置。
- 請求項4に記載の蛍光測定装置の実質的に平行な2つのアンビル表面の間に、表面張力によって保持された液体のナノドロップサンプルの蛍光を測定する方法であって、
前記装置を、前記サンプル載置状態に開く工程と、
前記ナノドロップを前記アンビル表面の上に載置する工程と、
前記装置を、前記サンプル圧縮状態に閉じる工程と、
前記装置を、前記サンプル測定状態に開く工程と、
前記サンプルを前記励起ライトで照明する工程と、
前記サンプルから発する蛍光を測定してサンプルのスペクトルを得る工程と、
を含むことを特徴とする蛍光測定方法。 - スケールを変えられた光源のスペクトルを前記測定した蛍光スペクトルから差し引いてサンプルの蛍光スペクトルを得ることを含む、光源からの光を照射されたサンプルの蛍光スペクトルを測定する方法であって、
ix. 蛍光を含まないサンプルを使用して光源のスペクトルを記録する工程、
x. 少なくとも1つの蛍光を発するターゲットを選択して、そのターゲットをサンプルに取り込む工程と、
xi. 蛍光を発する波長の全て又は殆どを含む規定の波長間隔を選択する工程と、
xii. 分光計で前記サンプルの蛍光を測定する工程と、
xiii. 工程ivの測定を、計算するためのプログラムされた手段に出力する工程と、
xiv. 記録された光源のスペクトルのスケールを変えて、蛍光を発する波長範囲より外側の強度を可能な限り一致させることにより、サンプルの個々の蛍光を計算する工程と、
xv. 蛍光の信号のみならずいくらかの散乱された光源の放射も含む信号のスペクトルから、スケールを変えた光源のスペクトルを差し引く工程と、
xvi. 得られた信号のスペクトルを表示する工程と、を含むことを特徴とする蛍光スペクトル測定方法。 - 前記サンプルが、表面張力によって保持されたナノドロップであることを特徴とする請求項13に記載の蛍光スペクトル測定方法。
- 1つより多いターゲットがあることを特徴とする請求項13に記載の蛍光スペクトル測定方法。
- 規定の波長間隔が、20〜40ナノメーターの範囲で選択されることを特徴とする請求項13に記載の蛍光スペクトル測定方法。
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