JP2008185518A - Device and method for detecting bacterium - Google Patents
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Description
本発明は、細菌の蛍光観察に関し、より詳細には、複数の視野から蛍光する細菌が存在する視野を特定する技術に関する。 The present invention relates to bacterial fluorescence observation, and more particularly to a technique for identifying a visual field in which bacteria that fluoresce from a plurality of visual fields are present.
細菌を分類する方法としては寒天培養法が最も一般的な方法である。これは試料を寒天培地に塗り、所定時間培養して形成したコロニーを、染色又は無染色にて、顕微鏡を用いて観察者が分類する検査方法である。しかしこの寒天培養法は、基本的に手作業で行うため処理が煩わしく、また培養するため細菌の種類を判定までに時間を要する。 The agar culture method is the most common method for classifying bacteria. This is an inspection method in which colonies formed by applying a sample to an agar medium and culturing for a predetermined time are classified by an observer using a microscope, with or without staining. However, since this agar culture method is basically performed manually, the process is troublesome, and since it is cultured, it takes time to determine the type of bacteria.
そこで、培養せずに観察する蛍光観察法がある。これは細菌だけが蛍光するように検体を調整し、その蛍光を落斜蛍光顕微鏡などの光学手段を用いて観察者が観察する検査方法である。また、蛍光する細菌の検出は観察者が手動で行っていたが、近年では自動で行うことが考案されている。通常の自動処理として、撮影した1視野分の画像を全走査し、細菌の検出処理を行い、それを全視野分行う。しかし、全視野に対して細菌の検出処理を行うには処理時間を要する。そこで蛍光する細菌の出現頻度が少ない抗酸菌を高速で検出する方法として、撮影した全視野分の画像において、1視野分の画像に加算する。生成した1視野分の画像に対して抗酸菌の検出処理を行い判定する技術が開示されている(例えば、特許文献1参照)。
しかしながら特許文献1の構成では、抗酸菌の有無に関わらず視野中の全画素について走査するため、抗酸菌の検出に処理時間を要する。
However, in the configuration of
また、撮影した画像にノイズが無いことが前提であるが、実際にはノイズが存在する。例えば1枚のプレートにつき1000視野観察する場合、1000視野分の画像を1枚の画像に加算するとノイズも1000倍され、抗酸菌が蛍光している部分との輝度値などの差異を検出することが困難になるため、精度良く判定することが出来ない。 In addition, it is assumed that there is no noise in the photographed image, but there is actually noise. For example, when observing 1000 fields per plate, adding an image for 1000 fields to a single image also increases the noise by 1000, and detects a difference in brightness value from the portion where the acid-fast bacteria are fluorescent. This makes it difficult to make accurate judgments.
本発明は、前記従来の課題を解決するもので、細菌の蛍光観察において複数の視野を観察し、蛍光する細菌の出現頻度が少ない場合に、高速に蛍光する細菌が存在する視野を特定する細菌検出装置及び細菌検出方法を提供することを目的とする。 The present invention solves the above-mentioned conventional problem, and observes a plurality of fields in fluorescence observation of bacteria, and specifies a field where bacteria that rapidly fluoresce exist when the appearance frequency of the bacteria that fluoresce is low An object of the present invention is to provide a detection apparatus and a bacteria detection method.
前記従来の課題を解決するために、本発明の細菌検出装置は、蛍光標識された細菌の有無を検出する細菌検出装置において、検体に特定の波長の光を照射して得られる光を受光し、光情報として出力する光学手段と、前記光学手段の視野を移動させる視野移動手段と、視野を移動中に露光したままの状態で前記光情報を画像として撮像する撮像手段と、前記視野移動手段が対象の視野から隣接する次の視野まで移動を行う際に前記撮像手段が撮影した画像から移動方向を横切る直線または曲線の走査ライン上の輝度情報を抽出して蛍光の有無を判定し、蛍光が含まれる視野の位置を特定する位置特定手段と、前記蛍光が含まれる視野の画像から前記蛍光標識された細菌を検出する細菌検出手段を含むことを特徴とするものである。 In order to solve the above-described conventional problems, the bacteria detection apparatus of the present invention receives light obtained by irradiating a specimen with light of a specific wavelength in a bacteria detection apparatus that detects the presence or absence of fluorescently labeled bacteria. Optical means for outputting as optical information, visual field moving means for moving the visual field of the optical means, imaging means for imaging the optical information as an image while being exposed while moving the visual field, and the visual field moving means When moving from the target field of view to the next field of view adjacent to the target, the luminance information on the scanning line of a straight line or a curve that crosses the moving direction is extracted from the image captured by the imaging unit to determine the presence or absence of fluorescence, And a bacteria detection means for detecting the fluorescently labeled bacteria from the image of the visual field including the fluorescence.
さらに細菌検出装置において、蛍光標識された細菌の有無を検出する細菌検出装置において、検体に特定の波長の光を照射して得られる光を受光し、光情報として出力する光学手段と、前記光学手段の視野を移動させる視野移動手段と、視野を移動中に露光したままの状態で前記光情報を画像として撮像する撮像手段と、前記視野移動手段が1視野より広い範囲の移動を行う際に前記撮像手段が撮影した画像から移動方向を横切る直線または曲線の走査ライン上の輝度情報を抽出して蛍光の有無を判定する範囲特定手段と、前記視野移動手段が1視野分以下の移動を行う際の前記撮像手段が撮影した一視野画像における移動方向を横切る直線または曲線の走査ラインの輝度情報から、蛍光が含まれる視野の位置を特定する位置特定手段と、前記蛍光が含まれる視野の画像から前記蛍光標識された細菌を検出する細菌検出手段を含むことを特徴とするものである。 Furthermore, in the bacteria detection apparatus, in the bacteria detection apparatus for detecting the presence or absence of fluorescently labeled bacteria, optical means for receiving light obtained by irradiating a specimen with light of a specific wavelength and outputting it as optical information; A visual field moving means for moving the visual field of the means, an imaging means for capturing the optical information as an image while being exposed while moving the visual field, and when the visual field moving means moves in a wider range than one visual field. A range specifying means for extracting luminance information on a scanning line of a straight line or a curve crossing the moving direction from an image taken by the imaging means and determining the presence or absence of fluorescence, and the visual field moving means moves by one visual field or less. Position specifying means for specifying the position of the field of view containing fluorescence from the luminance information of a scanning line of a straight line or a curve that traverses the moving direction in the one field of view image taken by the imaging means, It is characterized in that the field of view of the image that contains the fluorescent including bacterial detection means for detecting the fluorescence-labeled bacteria.
さらに細菌検出装置において、前記位置特定手段において、前記走査ラインの輝度情報の蛍光する特徴がある箇所を基に、蛍光が含まれる視野の移動方向に対する垂直方向の領域を特定することを特徴とするものである。 Furthermore, in the bacteria detection apparatus, the position specifying unit specifies a region in a direction perpendicular to a moving direction of a visual field including fluorescence based on a location where the luminance information of the scanning line has a feature of fluorescence. Is.
さらに細菌検出装置において、前記位置特定手段において、複数の前記走査ラインの輝度情報の蛍光する特徴と、複数の前記走査ラインの軌跡を示す領域を基に、蛍光が含まれる視野を移動方向に領域を特定することを特徴とするものである。 Further, in the bacteria detection apparatus, in the position specifying unit, the visual field including the fluorescence is an area in the moving direction based on the feature that the luminance information of the plurality of scanning lines fluoresces and the area indicating the trajectory of the plurality of scanning lines. It is characterized by specifying.
さらに細菌検出装置において、前記位置特定手段において、前記走査ラインの輝度情報の蛍光する特徴がある箇所と複数の前記走査ラインの輝度情報の蛍光する特徴と、複数の前記走査ラインの軌跡を示す領域を基に、蛍光が含まれる視野の移動方向に対する垂直方向と移動方向に領域を特定することを特徴とするものである。 Further, in the bacteria detection apparatus, in the position specifying unit, a region having a fluorescent feature of the luminance information of the scanning line, a fluorescent feature of the luminance information of the plurality of scanning lines, and a region indicating the trajectory of the plurality of scanning lines Based on the above, the region is specified in the vertical direction and the moving direction with respect to the moving direction of the visual field including the fluorescence.
さらに細菌検出装置において、前記位置特定手段において領域を特定した場合、前記細菌検出工程において特定した領域を詳細に撮影した画像から細菌を検出することを特徴とするものである。 Furthermore, in the bacteria detection apparatus, when the region is specified by the position specifying means, bacteria are detected from an image obtained by photographing the region specified in the bacteria detection step in detail.
さらに本発明の細菌検出方法において、検体の蛍光反応の観察において、撮像手段が観察する視野を現在観察している視野から1視野分以下の移動量で移動する間に、露光したまま撮影して一視野画像を取得する露光撮影工程と、前記一視野画像において、視野の移動方向を横切る直線または曲線の走査ラインの輝度情報から、前記撮像手段が観察する視野中で蛍光が含まれる視野の位置を特定する位置特定工程と、前記蛍光が含まれる視野の画像から検体中の蛍光する細菌を検出する細菌検出工程を含むことを特徴とするものである。 Furthermore, in the bacteria detection method of the present invention, in the observation of the fluorescence reaction of the specimen, the field of view observed by the imaging means is photographed while being exposed while moving from the currently observed field of view by a movement amount of one field or less. The exposure photographing step for acquiring a single field image, and the position of the field of view in which fluorescence is included in the field of view observed by the imaging means from the luminance information of a scanning line of a straight line or a curve that crosses the moving direction of the field of view in the single field of view image And a bacteria detection step of detecting fluorescent bacteria in the specimen from the image of the visual field containing the fluorescence.
さらに細菌検出方法において、検体の蛍光反応の観察において、撮像手段が観察する視野を現在観察している視野から1視野より広い範囲を移動している間に、露光したまま撮影して広視野画像を取得する広視野露光撮影工程と、前記広視野画像において、視野の移動方向を横切る直線または曲線の走査ラインの輝度情報から前記広い範囲に蛍光が含まれるか否かを判定する範囲特定工程と、前記蛍光が含まれる範囲において、撮像手段が観察する視野を現在観察している視野から1視野分以下の移動量で移動する間に、露光したまま撮影して一視野画像を取得する露光撮影工程と、前記一視野画像において、視野の移動方向を横切る直線または曲線の走査ラインの輝度情報から、前記撮像手段が観察する視野中で蛍光が含まれる視野の位置を特定する位置特定工程と、前記蛍光が含まれる視野の画像から検体中の蛍光する細菌を検出する細菌検出工程を含むことを特徴とするものである。 Further, in the method for detecting bacteria, in the observation of the fluorescence reaction of the specimen, the field of view observed by the imaging means is photographed while being exposed while moving from the field of view currently observed to a range wider than one field of view. A wide-field exposure photographing step of acquiring a range, and a range specifying step of determining whether or not fluorescence is included in the wide range from luminance information of a scanning line of a straight line or a curved line crossing the moving direction of the visual field in the wide-field image, In the range including the fluorescence, exposure shooting is performed in which the field of view observed by the imaging unit moves while moving from the currently observed field of view by an amount of movement equal to or less than one field of view and is captured while being exposed. A position of a visual field including fluorescence in the visual field observed by the imaging unit, based on luminance information of a scanning line that is a straight line or a curved line that traverses the moving direction of the visual field in the one-field image Is characterized in that comprises a position specifying step of specifying, a bacteria detection step of detecting the fluorescence bacteria in the sample from the field of view of the image that contains the fluorescent.
さらに細菌検出方法において、前記位置特定工程において、前記走査ラインの輝度情報の蛍光する特徴がある箇所を基に、蛍光が含まれる視野の移動方向に対する垂直方向の領域を特定することを特徴とするものである。 Further, in the method for detecting bacteria, in the position specifying step, a region perpendicular to the moving direction of the visual field including the fluorescence is specified based on a location where the luminance information of the scanning line has a fluorescent feature. Is.
さらに細菌検出方法において、前記位置特定工程において、複数の前記走査ラインの輝度情報の蛍光する特徴と、複数の前記走査ラインの軌跡を示す領域を基に、蛍光が含まれる視野を移動方向に領域を特定することを特徴とするものである。 Further, in the bacteria detection method, in the position specifying step, the field of view including the fluorescence is a region in the moving direction based on the feature that the luminance information of the plurality of scanning lines fluoresces and the region indicating the trajectory of the plurality of scanning lines. It is characterized by specifying.
さらに細菌検出方法において、前記位置特定工程において、前記走査ラインの輝度情報の蛍光する特徴がある箇所と複数の前記走査ラインの輝度情報の蛍光する特徴と、複数の前記走査ラインの軌跡を示す領域を基に、蛍光が含まれる視野の移動方向に対する垂直方向と移動方向に領域を特定することを特徴とするものである。 Further, in the bacteria detection method, in the position specifying step, a region having a fluorescent feature of the luminance information of the scanning line, a fluorescent feature of the luminance information of the plurality of scanning lines, and a region indicating the trajectory of the plurality of scanning lines Based on the above, the region is specified in the vertical direction and the moving direction with respect to the moving direction of the visual field including the fluorescence.
さらに細菌検出方法において、前記位置特定工程において領域を特定した場合、前記細菌検出工程において特定した領域を詳細に撮影した画像から細菌を検出することを特徴とするものである。 Furthermore, in the bacteria detection method, when an area is specified in the position specifying step, bacteria are detected from an image obtained by photographing the area specified in the bacteria detecting step in detail.
本発明の細菌検出装置及び細菌検出方法によれば、細菌の蛍光観察において複数の視野を観察し、蛍光する細菌の出現頻度が少ない場合に、蛍光する細菌の出現する視野を高速に特定することができる。 According to the bacteria detection apparatus and the bacteria detection method of the present invention, a plurality of visual fields are observed in the fluorescence observation of bacteria, and when the frequency of appearance of fluorescent bacteria is low, the field of appearance of fluorescent bacteria is identified at high speed. Can do.
以下に、本発明の細菌検出装置及び細菌検出方法の実施の形態を図面とともに詳細に説明する。 Embodiments of the bacteria detection apparatus and bacteria detection method of the present invention will be described below in detail with reference to the drawings.
図1は、本発明の第1の実施例における細菌検出装置のブロック図を示す。図1において、プレート1は検査する対象物である。光学手段11はプレート1に励起光を照射し、プレート1からの光を撮像手段12へ出力する。
FIG. 1 shows a block diagram of a bacteria detection apparatus in the first embodiment of the present invention. In FIG. 1, a
撮像手段12は制御手段18から撮影を制御する信号を取得する。撮像手段12は蛍光観察している領域を撮影して画像を生成し、制御手段18へ送信する。露光撮影手段13は1視野分移動している間は露光を行い、撮影するための信号を制御手段18へ送信する。また、位置特定手段14は可能性判定手段15と視野特定手段16を備える。可能性判定手段15は制御手段18から撮影した画像を取得し、蛍光する細菌が存在する可能性を判定し、判定した結果を制御手段18へ送信する。視野特定手段16は制御手段18から走査ラインの情報を取得し、蛍光する細菌が存在する可能性のある視野を特定し、特定した視野の結果を制御手段18へ送信する。細菌検出手段17は制御手段18から特定した視野の画像を取得し、特定した視野の画像から細菌を検出し、細菌の検出結果を制御手段18へ送信する。制御手段18は撮像手段12から撮影した画像と、露光撮影手段13から露光撮影するための信号と、可能性判定手段15から判定した結果と、視野特定手段16から特定した視野の結果と、細菌検出手段17から検出結果を取得する。また、制御手段18は撮像手段12に撮影を制御する信号と、可能性判定手段15に露光撮影した画像と、視野特定手段16に走査ラインの情報と、細菌検出手段17に特定した視野の画像と、移動手段20に移動を制御する信号と、表示手段19に検出結果を送信する。表示手段19は検出結果を取得し、検出結果を表示する。移動手段20は制御手段18から移動を制御する信号を取得し、観察している視野の移動を行う。
The
次にプレート1について詳細に説明する。プレート1は、スライドガラスを用いており、細菌が蛍光するように調整された検体が塗られている。また、必要であれば熱処理などの処理を施す。検体としては例えば人の痰や便などである。なお、プレート1として、シャーレなどの任意のプレート1を採用してもよい。
Next, the
次に光学手段11について図2を用いて詳細に説明する。光学手段11は、蛍光顕微鏡を用いて蛍光観察を行う。図2は蛍光観察において光学手段11の処理の一例を示す説明図である。まず、プレート1に紫外線を含む光源21からの光22を照射するために光源21として水銀ランプなどを使用する。光源21からの光22は、励起フィルタ23を通る。励起フィルタ23は細菌が蛍光するのに必要な波長の光(以下、励起光24)を透過し、不要な光を遮光する。次に、ダイクロイックミラー29にて励起光24を対物レンズ25に導き、対物レンズ25を経由してプレート1に照射される。ダイクロイックミラー29は光源21に対して45度の角度で設置され、特定の波長のみ反射する。照射された励起光24で検体が蛍光し、その蛍光27は対物レンズ25を経由して、吸収フィルタ28を通り、撮像手段12へ蛍光を導く。吸収フィルタ28は蛍光27を透過し、反射した励起光24や外光などの蛍光以外の光26を遮光する。なお、光学手段11として蛍光観察が可能なマイクロメータなど任意の光学手段11を採用してもよい。
Next, the
次に撮像手段12について詳細に説明する。撮像手段12は、モノクロCCDカメラを用いており、光学手段11である蛍光顕微鏡にCマウントで接合している。なお、撮像手段12として、カラーCCDカメラなど任意の撮像手段12を採用してもよい。光学手段11により導かれた検体からの蛍光27を、CCDカメラで撮影し、撮影した画像を制御手段18へ送信する。
Next, the imaging means 12 will be described in detail. The imaging means 12 uses a monochrome CCD camera and is joined to a fluorescence microscope as the optical means 11 with a C mount. Note that any imaging means 12 such as a color CCD camera may be employed as the imaging means 12. The
次に露光撮影手段13について図3と図4を用いて詳細に説明する。図3は一回の撮影における移動の一例を示す説明図である。図3(a)は撮影する領域33が現在の視野31にある状態を示す図である。図3(b)は撮影する領域33が現在の視野31から次の視野32へ1視野分移動した状態を示す図である。
Next, the
図4は露光を行いながら撮影した一視野画像41と走査ライン42の一例を示す説明図である。図4(a)は図3のように現在の視野31から次の視野32へ移動している間、露光を行いながら撮影した一視野画像41と、移動方向に垂直で直線の走査ライン42を示す図である。走査ライン42は、移動方向を横切る直線または曲線に予め定めておく。また、走査ライン42の位置は、撮影した画像の中央の位置にするなど予め定めておく。図4(b)は、図4(a)の上部から下部に向けて1画素ずつ輝度値を順に取得する走査ライン42において、各画素の輝度値を示すグラフである。
FIG. 4 is an explanatory diagram showing an example of the one-field image 41 and the
まず、露光撮影手段13は図3(a)の位置に撮影する領域33がある状態で、撮像手段12が露光を開始する制御信号を制御手段18へ送信する。次に、露光撮影手段13は、現在の視野31から次の視野32へ移動する制御信号を制御手段18へ送信する。図3(b)の位置に撮影する領域33が移動すると、撮像手段12の露光を終了する制御信号を制御手段18へ送信する。撮影した一視野画像41に蛍光する細菌44などの蛍光27が存在する場合、蛍光の軌跡43が線状に撮影される。
First, the
次に可能性判定手段15について図4(b)を用いて詳細に説明する。まず、可能性判定手段15は制御手段18から撮影した一視野画像41を取得する。次に、可能性判定手段15は撮影した一視野画像41を用いて、走査ライン42の輝度情報から視野中に蛍光する細菌44が存在する可能性を判定する。蛍光する細菌44が存在する可能性を判定する方法として、図4(b)において所定値45以上の輝度値が連続する範囲46が所定範囲内である場合に、蛍光する細菌44が存在する可能性があると判定する。背景領域と蛍光領域の輝度値の間で最適な所定値45を定めておく。最適な値はシステムの構成や撮影条件などにより異なるため、観察者は複数サンプルの画像を基に評価を行い、所定値45を予め定めておく。例えば、複数サンプルの背景領域と蛍光領域の輝度値の平均値をそれぞれ算出し、その中央値を所定値45とする。また、蛍光27の大きさの最小と最大を予め定めておき、その範囲を所定範囲として予め定めておく。最適な値はシステムの構成や撮影条件などにより異なるため、観察者は複数サンプルの画像を基に評価を行い、所定範囲を予め定めておく。例えば、複数サンプルにおいて蛍光27の大きさの最小値と最大値を算出し、その範囲を所定範囲とする。次に、可能性判定手段15は判定した結果を制御手段18へ送信する。
Next, the possibility determination means 15 will be described in detail with reference to FIG. First, the
次に視野特定手段16について図5を用いて詳細に説明する。図5は視野を特定する一例を示す説明図である。図5(a)は次の視野32に蛍光物体51があることを示す図である。図5(b)は、図3のように左から右へ移動した場合に、走査ライン42の軌跡の領域53を示す図である。図5(c)は走査ライン42の軌跡の領域53を撮影したときの特定された視野の画像54と蛍光物体51を示す図である。
Next, the visual field specifying means 16 will be described in detail with reference to FIG. FIG. 5 is an explanatory diagram showing an example of specifying the visual field. FIG. 5A is a diagram showing that the
視野特定手段16は前述の可能性判定手段15において可能性がある場合、制御手段18から現在の位置31や走査ライン42の位置などの位置情報を取得し、走査ライン42の軌跡の領域53を包含する視野を特定する。
If there is a possibility in the above-described possibility determination means 15, the visual field identification means 16 acquires position information such as the
視野を特定する方法の一例を説明する。まず、図3のように移動した場合を考える。図5(a)の位置に蛍光物体51があるとすると、図4(a)のように撮影した一視野画像41が撮影される。走査ライン42は図4(a)のように移動方向に垂直で直線とし、画像の中央の位置と定める。撮影する領域33を次の視野32の位置から、走査ライン42の軌跡の領域53を包含する位置へ移動する。例えば、次の視野32の左端から現在の視野31における走査ライン42の位置52まで、移動方向とは逆方向に次の視野32から現在の視野31へ戻す。この状態で撮影すると図5(c)のような特定された視野の画像54が撮影される。特定された視野の画像54に蛍光物体51が存在すると特定する。視野特定手段16は特定した結果を制御手段18に送信する。
An example of a method for specifying the field of view will be described. First, consider the case of movement as shown in FIG. If the
次に細菌検出手段17について詳細に説明する。細菌検出手段17は制御手段18から特定された視野の画像54において、輝度情報などを基に細菌があるか否かの判定を行う。例えば、各画素における輝度値が所定値45以上である連結した画素の面積が、細菌の大きさの範囲内であるか否かを判定する。細菌の大きさの範囲はシステムの構成や撮影条件などにより異なるため、観察者は複数サンプルの画像を基に評価を行い、細菌の大きさの範囲を予め定めておく。また、細菌検出手段17は細菌検出した結果を制御手段18へ送信する。
Next, the bacteria detection means 17 will be described in detail. The bacteria detecting means 17 determines whether or not there is bacteria in the
次に制御手段18について図6を用いて詳細に説明する。まず、撮影する領域33の全視野中での移動について図6を用いて説明する。図6は露光撮影を全視野61終了するまでに、撮影する領域33が全視野61を移動していく様子の一例を示す図である。図6(a)は露光撮影を全視野61終了するまでに、撮影する領域33が全視野61を移動していく様子の一例を示す図である。図6(b)は図6(a)において、両端に走査対象ではない領域62を用意しておき、撮影する領域33が全視野61を移動していく際に、走査ライン42の軌跡の領域53が全視野61の領域を含む一例を示す図である。
Next, the control means 18 will be described in detail with reference to FIG. First, the movement of the
制御手段18は以下のように全視野61の走査を制御する。全視野61の走査において、たとえば図6(a)のように開始位置が全視野61において左上の1行目にあるとすると、左端から右端へ1視野分ずつ移動して撮影する。右端へ移動し1行目が終了すると、2行目の左端へ移動し、2行目についても同様の作業を行う。最終行について終了すると処理を終了する。走査ライン42が移動方向に垂直で直線の観察領域の中央に位置しているとすると、全視野61の移動において左端と右端の1視野の半分の領域について、走査ライン42の軌跡の領域53に含まれないので、両端の領域については走査できていない。そのため走査ライン42の軌跡の領域53が全視野61の領域を含むようにする。たとえば、図6(b)のように予め全視野61の両端に走査対象ではない領域62を用意しておき、走査ライン42の軌跡の領域53が全視野61の領域を含むようにする。
The control means 18 controls the scanning of the entire visual field 61 as follows. In the scanning of the entire visual field 61, for example, as shown in FIG. 6A, if the start position is in the first upper left line in the entire visual field 61, the image is moved from the left end to the right end by one visual field. After moving to the right end and completing the first line, the second line is moved to the left end and the same operation is performed for the second line. When the process is finished for the last line, the process is terminated. Assuming that the
また、制御手段18は以下の情報を制御し、処理を行う。制御手段18は撮像手段12から撮影した画像と、露光撮影手段13から露光撮影するための信号と、可能性判定手段15から判定した結果と、視野特定手段16から特定した視野の結果と、細菌検出手段17から検出結果を取得し、制御手段18は撮像手段12に撮影を制御する信号と、可能性判定手段15に露光撮影した画像と、視野特定手段16に走査ライン42の情報と、細菌検出手段17に特定した視野の画像と、移動手段20に移動を制御する信号を送信する。また、制御手段18は全視野61の走査が終了すると検出結果を表示手段19へ送信する。
The control means 18 controls the following information and performs processing. The control means 18 is an image photographed from the imaging means 12, a signal for exposure photographing from the
表示手段19としては、例えばCRTモニタを用いる。なお、表示手段19として、タッチパネルなど任意の表示手段19を採用してもよい。 As the display means 19, for example, a CRT monitor is used. As the display means 19, any display means 19 such as a touch panel may be adopted.
移動手段20としては、例えば顕微鏡用の自動XYステージを用いる。また、自動XYステージは光学手段11の蛍光顕微鏡のステージとして取り付ける。その後、自動XYステージにプレート1を設置する。なお、今回はプレート1を移動することで視野の移動を行っているが、例えば、撮像手段12を移動することで視野の移動を実現してもよい。
As the moving means 20, for example, an automatic XY stage for a microscope is used. The automatic XY stage is attached as a stage of a fluorescence microscope of the
上記のように構成された細菌検出装置の動作の一例について図7を参照して説明する。図7は、細菌検出方法における各ステップの一例を示すフローチャートである。 An example of the operation of the bacteria detection apparatus configured as described above will be described with reference to FIG. FIG. 7 is a flowchart showing an example of each step in the bacteria detection method.
まず、ステップS1において、視野を開始位置に移動するなどの初期設定を行う。次に、ステップS2の露光撮影工程において、露光撮影手段13は1視野分移動している間は露光を行い、撮影するための制御信号を制御手段18へ送信する。制御手段18は露光撮影手段13から露光撮影するための制御信号を取得し、撮像手段12に露光を開始する制御信号を送信する。また、光学手段11はプレート1を蛍光観察し、観察している蛍光27を撮像手段12へ出力する。撮像手段12は観察している蛍光27を光学手段11から取得し、制御手段18から露光を開始する制御信号を取得し、露光を開始する。続いて制御手段18は移動手段20に移動を制御する信号を送信する。移動手段20は移動を制御する信号を制御手段18から取得し、1視野分移動する。続いて制御手段18は撮像手段12に露光を終了する制御信号を送信する。撮像手段12は制御手段18から露光を終了する制御信号を取得し、露光を終了し、撮影した一視野画像41を制御手段18へ送信する。
First, in step S1, initial settings such as moving the visual field to the start position are performed. Next, in the exposure photographing process of step S2, the
次に、ステップS3の走査ライン42の輝度情報取得において、制御手段18は撮影した一視野画像41を撮像手段12から取得し、可能性判定手段15へ送信する。可能性判定手段15は撮影した一視野画像41を制御手段18から取得し、例えば、撮影した一視野画像41において上部から下部に向けて1画素ずつ輝度値を取得する。
Next, in acquiring luminance information of the
次に、ステップS4の蛍光の特徴を調べる工程で、制御手段18は可能性判定手段15が蛍光の特徴があるか否か判定した結果を可能性判定手段15から取得する。判定した結果、撮影した一視野画像41に蛍光する細菌44が存在する可能性がある場合は、制御手段18は可能性を判定した結果を可能性判定手段15から取得し、ステップS5へ遷移する。また、可能性がない場合はステップS7へ遷移する。
Next, in the step of examining the fluorescence feature in step S <b> 4, the
次に、ステップS5は視野特定工程であり、制御手段18は可能性を判定した結果の走査ライン42の情報を視野特定手段16へ送信する。視野特定手段16は走査ライン42の情報を制御手段18から取得し、視野を特定した結果を制御手段18へ送信する。制御手段18は視野を特定した結果を視野特定手段16から取得する。制御手段18は視野を特定した結果から特定した視野へ移動するための制御信号を移動手段20へ送信する。移動手段20は特定した視野へ移動するための制御信号を制御信号18から取得し、特定した視野へ移動する。続いて制御手段18は特定した視野を撮影するための制御信号を撮像手段12へ送信する。撮像手段12は特定した視野を撮影するための制御信号を制御手段18から取得し、特定された視野を撮影する。また、撮像手段12は特定された視野の画像54を制御手段18へ送信する。
Next, step S <b> 5 is a visual field specifying step, and the
次に、ステップS6は細菌検出工程であり、制御手段18は特定された視野の画像54を撮像手段12から取得し、特定された視野の画像54を細菌検出手段17へ送信する。細菌検出手段17は特定された視野の画像54を制御手段18から取得し、蛍光する細菌44の検出結果を制御手段18へ送信する。制御手段18は検出結果を取得する。
Next, step S <b> 6 is a bacteria detection step, and the
次に、ステップS7において、判定を行う全視野61について終了した場合、制御手段18はステップS8において結果を表示手段19へ出力し、処理を終了する。一方、次の視野32があれば、ステップS2に戻り、ステップS3〜S6を繰り返す。
Next, in step S7, when the entire visual field 61 to be determined is completed, the
以上のように、本実施例1において1視野分移動している間は露光を行い撮影し、撮影した一視野画像41から蛍光する細菌44が存在する可能性を判定する。また、可能性がある視野を特定し、特定された視野の画像54に細菌が含まれるか否かを判定する。1視野に蛍光する細菌44の出現頻度が少ない場合に、1視野分を一部の走査で判定を行えるので、高速に細菌の蛍光27を判定することができる。
As described above, in the first embodiment, exposure is performed while moving for one field of view, and the possibility of the presence of
また、本実施例1の図7のステップS5である視野特定工程において、特定された視野の画像54で移動方向に領域を絞る方法として以下の方法がある。図8は特定された視野の画像54において、図4(b)で所定値45以上の輝度値が連続する範囲46を包含する範囲82内の移動方向の領域を、蛍光物体51が存在する可能性のある領域81として絞り込むことを示す説明図である。細菌検出における対象とする領域を図8のように絞ることで、処理時間を短縮することができる。
Further, in the visual field specifying step, which is step S5 in FIG. 7 of the first embodiment, there is the following method as a method for narrowing the region in the moving direction with the
また、本実施例1の制御手段18のステップS5である視野特定工程において、特定された視野の画像54で移動方向に対して垂直方向に領域を絞る方法として以下の方法がある。図9は特定された視野の画像54で移動方向に対して垂直方向に領域を絞る方法を示す説明図である。図9(a)は露光しながら撮影した一視野画像41に対して走査ライン42を左端と中央に2本取得することを示す図である。図9(b)は走査ライン42aが1視野分移動する移動するときに描く走査ライン42aの軌跡の領域53aと走査ライン42bが1視野分移動する移動するときに描く走査ライン42bの軌跡の領域53bを示す説明図である。図9(c)は、例えば、走査ライン42aに蛍光する特徴がなく、走査ライン42bに蛍光する特徴がある場合、走査ライン42bの軌跡の領域53bから走査ライン42aの軌跡の領域53aが重なる部分を除いた蛍光物体51が存在する可能性のある領域91として絞り込むことを示す説明図である。細菌検出における対象とする領域を図9(c)のように絞ることで、処理時間を短縮することができる。
Further, in the visual field specifying step, which is step S5 of the control means 18 of the first embodiment, there is the following method as a method for narrowing the region in the direction perpendicular to the moving direction in the
また、本実施例1の図7のステップS5である視野特定工程において、特定された視野の画像54で移動方向と移動方向に対して垂直方向に領域の両方向に領域を絞る方法として以下の方法がある。図10は図8のように移動方向に領域を絞り、さらに図9のように移動方向に対して垂直方向に領域を絞った蛍光物体51が存在する可能性のある領域101を示す説明図である。細菌検出における対象とする領域を図10のように絞ることで、さらに処理時間を短縮することができる。
Further, in the visual field specifying step, which is step S5 in FIG. 7 of the first embodiment, the following method is used as a method of narrowing down the region in both the direction perpendicular to the moving direction and the moving direction in the
また、本実施例1では、細菌検出手段17で特定された視野の画像54を用いて細菌の検出を行っているが、前述の方法で蛍光する細菌44が存在する領域を特定された視野から絞り、光学手段11により、例えば、倍率を上げて蛍光物体51が存在する可能性のある領域101を撮影し、その詳細に蛍光物体51が存在する可能性のある領域101を撮影した画像を用いて細菌の検出を行うことで、精度良く細菌の検出を行うことができる。
In the first embodiment, the bacteria are detected using the
また、本実施例1では、撮像手段12としてモノクロCCDで撮影しているが、RGBなどカラーで撮影可能な撮像手段12を用いて撮影した画像では、例えば蛍光する細菌44に特定の色情報が無いなどの特徴がある場合、走査ライン42において蛍光の特徴を算出する際に、特定の色情報が無いなどの条件を追加することにより蛍光の特徴を精度良く検出することができる。
In the first embodiment, the
実施例1との相違点のみ図11を用いて説明する。図11は図1において、広視野露光撮影手段111は全視野61の内の1行を移動している間は露光を行い、撮影するための信号を制御手段18へ送信する。範囲特定手段112は制御手段18から走査ライン42の情報を取得し、蛍光する細菌44が存在する可能性のある範囲を特定し、特定した範囲の結果を制御手段18へ送信する。制御手段18は広視野露光撮影手段111から広視野を露光撮影するための信号と、範囲特定手段112から特定した範囲の結果をさらに取得する。また、制御手段18は範囲特定手段112に走査ライン42の情報をさらに送信する。
Only differences from the first embodiment will be described with reference to FIG. In FIG. 11, the wide-field
次に広視野露光撮影手段111について図12を用いて詳細に説明する。図12は全視野61中で左端に撮影する領域33があり、右端へ移動している間は露光を行い撮影することを示す説明図である。
Next, the wide-field
まず、広視野露光撮影手段111は全視野61中で左端にある状態で露光を開始する制御信号を制御手段18へ送信する。次に、広視野露光撮影手段111は、撮影する領域33が全視野61中で左端から右端へ移動する制御信号を制御手段18へ送信する。全視野61中で右端の位置に撮影する領域33が移動すると、撮像手段12の露光を終了する制御信号を制御手段18へ送信する。つまり、露光撮影手段13が1視野分移動している間は露光を行いながら撮影するのに対し、広視野露光撮影手段111は図12のように、全視野61中で左端から右端への1行分移動している間は露光を行いながら撮影する。この時実施例1と同様に両端の領域を含むように、図6(b)に示したものと同様の走査対象でない領域を設けるようにしても良い。
First, the wide-field
次に範囲特定手段112について図4(b)を用いて詳細に説明する。まず、範囲特定手段112は制御手段18から撮影した広視野画像を取得する。次に、範囲特定手段112は撮影した広視野画像を用いて、走査ライン42の輝度情報から視野中に蛍光する細菌44が存在する可能性を判定する。蛍光する細菌44が存在する可能性を判定する方法として、図4(b)において所定値45以上の輝度値が連続する範囲46が所定範囲内である場合に、蛍光する細菌44が存在する可能性があると判定する。次に、範囲特定手段112は判定した結果を制御手段18へ送信する。
Next, the range specifying means 112 will be described in detail with reference to FIG. First, the
上記のように構成された細菌検出装置の動作の一例について図13を参照して説明する。図13は、細菌検出方法における各ステップの一例を示すフローチャートである。 An example of the operation of the bacteria detection apparatus configured as described above will be described with reference to FIG. FIG. 13 is a flowchart showing an example of each step in the bacteria detection method.
まず、ステップS21において、視野を開始位置に移動するなどの初期設定を行う。次に、ステップS22の広視野露光撮影工程において、広視野露光撮影手段111は1行分移動している間は露光を行い、撮影するための制御信号を制御手段18へ送信する。制御手段18は広視野露光撮影手段111から露光撮影するための制御信号を取得し、撮像手段12に露光を開始する制御信号を送信する。また、光学手段11はプレート1を蛍光観察し、観察している蛍光27を撮像手段12へ出力する。撮像手段12は観察している蛍光27を光学手段11から取得し、制御手段18から露光を開始する制御信号を取得し、露光を開始する。続いて制御手段18は移動手段20に移動を制御する信号を送信する。移動手段20は移動を制御する信号を制御手段18から取得し、1行分移動する。続いて制御手段18は撮像手段12に露光を終了する制御信号を送信する。撮像手段12は制御手段18から露光を終了する制御信号を取得し、露光を終了し、撮影した広視野画像を制御手段18へ送信する。また、制御手段18は撮影した広視野画像を撮像手段12から取得する。
First, in step S21, initial settings such as moving the visual field to the start position are performed. Next, in the wide-field exposure photographing process in step S22, the wide-field
次に、ステップS23の走査ライン42の輝度情報取得において、制御手段18は範囲特定手段112へ撮影した広視野画像を送信する。範囲特定手段112は撮影した広視野画像を制御手段18から取得し、例えば、撮影した一視野画像41において上部から下部に向けて1画素ずつ輝度値を取得する。
Next, in acquiring the luminance information of the
次に、ステップS24の蛍光の特徴を調べる工程で、範囲特定手段112は撮影した広視野画像に蛍光物体51が含まれる可能性を判定する。また、可能性を判定した結果を制御手段18へ送信する。制御手段18は可能性を判定した結果より、可能性がある場合は移動した行の開始位置へ移動するための制御信号を移動手段20へ送信する。移動手段20は行の開始位置へ移動するための制御信号を制御手段18から取得し、右端にある撮影する領域33の位置を左端に移動し、ステップS25へ遷移する。可能性がない場合は、ステップS31へ遷移する。
Next, in the step of examining the fluorescence characteristics in step S24, the
次に、ステップS25の露光撮影工程において、露光撮影手段13は1視野分移動している間は露光を行い、撮影するための制御信号を制御手段18へ送信する。制御手段18は露光撮影手段13から露光撮影するための制御信号を取得し、撮像手段12に露光を開始する制御信号を送信する。また、光学手段11はプレート1を蛍光観察し、観察している蛍光27を撮像手段12へ出力する。撮像手段12は観察している蛍光27を光学手段11から取得し、制御手段18から露光を開始する制御信号を取得し、露光を開始する。続いて制御手段18は移動手段20に移動を制御する信号を送信する。移動手段20は移動を制御する信号を制御手段18から取得し、1視野分移動する。続いて制御手段18は撮像手段12に露光を終了する制御信号を送信する。撮像手段12は制御手段18から露光を終了する制御信号を取得し、露光を終了し、撮影した一視野画像41を制御手段18へ送信する。
Next, in the exposure photographing process of step S25, the
次に、ステップS26の走査ライン42の輝度情報取得において、制御手段18は撮影した一視野画像41を撮像手段12から取得し、可能性判定手段15へ送信する。可能性判定手段15は撮影した一視野画像41を制御手段18から取得し、例えば、撮影した一視野画像41において上部から下部に向けて1画素ずつ輝度値を取得する。
Next, in acquiring the luminance information of the
次に、ステップS27の蛍光の特徴を調べる工程で、制御手段18は可能性判定手段15が蛍光の特徴があるか否か判定した結果を可能性判定手段15から取得する。判定した結果、撮影した一視野画像41に蛍光する細菌44が存在する可能性がある場合は、制御手段18は可能性を判定した結果を可能性判定手段15から取得し、ステップS28へ遷移する。また、可能性がない場合はステップS30へ遷移する。
Next, in the step of examining the fluorescence characteristics in step S <b> 27, the control means 18 acquires the result of the possibility determination means 15 determining whether or not there is a fluorescence characteristic from the possibility determination means 15. As a result of the determination, if there is a possibility that the
次に、ステップS28は視野特定工程であり、制御手段18は可能性を判定した結果の走査ライン42の情報を視野特定手段16へ送信する。視野特定手段16は走査ライン42の情報を制御手段18から取得し、視野を特定した結果を制御手段18へ送信する。制御手段18は視野を特定した結果を視野特定手段16から取得する。制御手段18は視野を特定した結果から特定した視野へ移動するための制御信号を移動手段20へ送信する。移動手段20は特定した視野へ移動するための制御信号を制御手段18から取得し、特定した視野へ移動する。続いて制御手段18は特定した視野を撮影するための制御信号を撮像手段12へ送信する。撮像手段12は特定した視野を撮影するための制御信号を制御手段18から取得し、特定された視野を撮影する。また、撮像手段12は特定された視野の画像54を制御手段18へ送信する。
Next, step S28 is a visual field specifying step, and the
次に、ステップS6は細菌検出工程であり、制御手段18は特定された視野の画像54を撮像手段12から取得し、特定された視野の画像54を細菌検出手段17へ送信する。細菌検出手段17は特定された視野の画像54を制御手段18から取得し、蛍光する細菌44の検出結果を制御手段18へ送信する。制御手段18は検出結果を取得する。
Next, step S <b> 6 is a bacteria detection step, and the
次に、ステップS30において、判定を行う1行について終了した場合、制御手段18はステップS31へ遷移する。一方、次の視野32があれば、ステップS25に戻り、ステップS26〜S29を繰り返す。
Next, in step S30, when it complete | finishes about 1 line which performs determination, the control means 18 transfers to step S31. On the other hand, if there is the next
次に、ステップS31において、判定を行う全視野61について終了した場合、制御手段18はステップS32において結果を表示手段19へ出力し、処理を終了する。一方、次の行があれば、制御手段18は次の行へ移動するための制御信号を移動手段20へ送信する。また、移動手段20は次の行へ移動するための制御信号を取得し、次の行へ移動する。その後、ステップS22に戻り、ステップS23〜S30を繰り返す。
Next, in step S31, when the entire visual field 61 to be determined is finished, the control means 18 outputs the result to the display means 19 in step S32, and the process is finished. On the other hand, if there is a next line, the control means 18 transmits a control signal for moving to the next line to the movement means 20. Further, the moving
以上のように、本実施例2において1行分移動している間は露光を行い撮影し、撮影した広視野画像から蛍光する細菌44が存在する可能性を判定する。また、可能性がある行に対して、1視野分移動している間は露光を行い撮影し、撮影した一視野画像41から蛍光する細菌44が存在する可能性を判定する。また、可能性がある視野を特定し、特定された視野の画像54に細菌が含まれるか否かを判定する。1行に蛍光する細菌44の出現頻度が少ない場合に、1行分を一部の走査で判定を行うことで本実施例1に比べてさらに高速に細菌の蛍光27を判定することができる。
As described above, while moving by one line in the second embodiment, exposure is performed to photograph, and the possibility of the presence of
本発明にかかる細菌検出装置及び細菌検出方法は、移動している間は露光して発光物体を撮影し、撮影した画像の特徴から一部を走査することで移動した領域に発光物体が存在する可能性を判定する機能を有し、画像認識技術等として有用である。 According to the bacteria detection apparatus and the bacteria detection method of the present invention, a luminescent object is present in a moved area by exposing and photographing a luminescent object while moving and scanning a part from the characteristics of the photographed image. It has a function of determining possibility and is useful as an image recognition technique.
1 プレート
11 光学手段
12 撮像手段
13 露光撮影手段
14 位置特定手段
15 可能性判定手段
16 視野特定手段
17 細菌検出手段
18 制御手段
19 表示手段
20 移動手段
21 光源
22 光源21からの光
23 励起フィルタ
24 励起光
25 対物レンズ
26 蛍光以外の光
27 蛍光
28 吸収フィルタ
29 ダイクロイックミラー
31 現在の視野
32 次の視野
33 撮影する領域
41 一視野画像
42 走査ライン
43 蛍光の軌跡
44 蛍光する細菌
45 所定値
46 連続する範囲
51 蛍光物体
52 次の視野32の左端から現在の視野31における走査ライン42の位置
53 走査ライン42の軌跡の領域
54 特定された視野の画像
61 全視野
62 走査対象ではない領域
81 蛍光物体51が存在する可能性のある領域
82 範囲
91 蛍光物体51が存在する可能性のある領域
101 蛍光物体51が存在する可能性のある領域
111 広視野露光撮影手段
112 範囲特定手段
DESCRIPTION OF
Claims (12)
検体に特定の波長の光を照射して得られる光を受光し、光情報として出力する光学手段と、
前記光学手段の視野を移動させる視野移動手段と、
視野を移動中に露光したままの状態で前記光情報を画像として撮像する撮像手段と、
前記視野移動手段が対象の視野から隣接する次の視野まで移動を行う際に前記撮像手段が撮影した画像から移動方向を横切る直線または曲線の走査ライン上の輝度情報を抽出して蛍光の有無を判定し、蛍光が含まれる視野の位置を特定する位置特定手段と、
前記蛍光が含まれる視野の画像から前記蛍光標識された細菌を検出する細菌検出手段を含む、
ことを特徴とする細菌検出装置。 In a bacteria detection apparatus for detecting the presence or absence of fluorescently labeled bacteria,
Optical means for receiving light obtained by irradiating a specimen with light of a specific wavelength and outputting it as optical information;
Visual field moving means for moving the visual field of the optical means;
An imaging means for imaging the optical information as an image while being exposed while moving the field of view;
When the visual field moving means moves from the target visual field to the next adjacent visual field, the luminance information on a scanning line of a straight line or a curved line crossing the moving direction is extracted from the image captured by the imaging means to determine the presence or absence of fluorescence. A position specifying means for determining and specifying a position of a visual field including fluorescence;
Bacteria detection means for detecting the fluorescently labeled bacteria from an image of a field of view containing the fluorescence,
Bacterial detection device characterized by that.
検体に特定の波長の光を照射して得られる光を受光し、光情報として出力する光学手段と、
前記光学手段の視野を移動させる視野移動手段と、
視野を移動中に露光したままの状態で前記光情報を画像として撮像する撮像手段と、
前記視野移動手段が1視野より広い範囲の移動を行う際に前記撮像手段が撮影した画像から移動方向を横切る直線または曲線の走査ライン上の輝度情報を抽出して蛍光の有無を判定する範囲特定手段と、
前記視野移動手段が1視野分以下の移動を行う際の前記撮像手段が撮影した一視野画像における移動方向を横切る直線または曲線の走査ラインの輝度情報から、蛍光が含まれる視野の位置を特定する位置特定手段と、
前記蛍光が含まれる視野の画像から前記蛍光標識された細菌を検出する細菌検出手段を含む、
ことを特徴とする細菌検出装置。 In a bacteria detection apparatus for detecting the presence or absence of fluorescently labeled bacteria,
Optical means for receiving light obtained by irradiating a specimen with light of a specific wavelength and outputting it as optical information;
Visual field moving means for moving the visual field of the optical means;
An imaging means for imaging the optical information as an image while being exposed while moving the field of view;
Specifying a range for determining the presence or absence of fluorescence by extracting luminance information on a scanning line of a straight line or a curve crossing the moving direction from an image taken by the imaging unit when the visual field moving unit moves in a wider range than one visual field Means,
The position of the visual field including the fluorescence is specified from the luminance information of a scanning line of a straight line or a curve that crosses the moving direction in the one visual field image captured by the imaging unit when the visual field moving unit moves by one field of view or less. Positioning means;
Bacteria detection means for detecting the fluorescently labeled bacteria from an image of a field of view containing the fluorescence,
Bacterial detection device characterized by that.
前記一視野画像において、視野の移動方向を横切る直線または曲線の走査ラインの輝度情報から、前記撮像手段が観察する視野中で蛍光が含まれる視野の位置を特定する位置特定工程と、
前記蛍光が含まれる視野の画像から検体中の蛍光する細菌を検出する細菌検出工程を含む、
ことを特徴とする細菌検出方法。 In the observation of the fluorescence reaction of the specimen, an exposure photographing step of obtaining a single field image by photographing while moving while moving the field of view observed by the imaging means by a moving amount of one field or less from the field of view currently observed When,
In the one-field image, a position specifying step for specifying a position of a visual field including fluorescence in a visual field observed by the imaging unit from luminance information of a scanning line of a straight line or a curve that traverses the moving direction of the visual field,
Including a bacteria detecting step of detecting fluorescent bacteria in a specimen from an image of a field of view containing the fluorescence,
A method for detecting bacteria.
前記広視野画像において、視野の移動方向を横切る直線または曲線の走査ラインの輝度情報から前記広い範囲に蛍光が含まれるか否かを判定する範囲特定工程と、
前記蛍光が含まれる範囲において、撮像手段が観察する視野を現在観察している視野から1視野分以下の移動量で移動する間に、露光したまま撮影して一視野画像を取得する露光撮影工程と、
前記一視野画像において、視野の移動方向を横切る直線または曲線の走査ラインの輝度情報から、前記撮像手段が観察する視野中で蛍光が含まれる視野の位置を特定する位置特定工程と、
前記蛍光が含まれる視野の画像から検体中の蛍光する細菌を検出する細菌検出工程を含む、
ことを特徴とする細菌検出方法。 In the observation of the fluorescence reaction of the specimen, a wide-field exposure is performed in which the field of view observed by the imaging means moves from a field currently being observed to a range wider than one field of view, and a wide-field image is obtained while being exposed. Shooting process,
In the wide-field image, a range specifying step for determining whether fluorescence is included in the wide range from luminance information of a straight line or a curved scanning line that crosses the moving direction of the visual field, and
An exposure photographing step in which a field of view observed by the imaging means is moved by a moving amount of one field of view or less from the field of view currently observed in the range including the fluorescence to capture a single field of view image while being exposed. When,
In the one-field image, a position specifying step for specifying a position of a visual field including fluorescence in a visual field observed by the imaging unit from luminance information of a scanning line of a straight line or a curve that traverses the moving direction of the visual field,
Including a bacteria detecting step of detecting fluorescent bacteria in a specimen from an image of a field of view containing the fluorescence,
A method for detecting bacteria.
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