JP2008099669A - Method for producing recombinant protein as soluble protein - Google Patents

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Abstract

<P>PROBLEM TO BE SOLVED: To produce an objective protein as a soluble protein by using a recombinant protein-expressing system. <P>SOLUTION: The expression vector contains (1) an expression inducible promotor sequence, (2) a first encoding sequence containing a polynucleotide encoding a polypeptide expressed by a specific amino acid sequence and (3) a second encoding sequence containing a polynucleotide encoding the objective protein. The method for producing the objective protein comprises the expression of the protein by using the expression vector. <P>COPYRIGHT: (C)2008,JPO&INPIT

Description

本発明は、目的蛋白質を可溶性蛋白質として製造する方法に関する。   The present invention relates to a method for producing a target protein as a soluble protein.

これまでに、細菌、酵母、昆虫、トランスジェニック動物、トランスジェニック植物などの宿主内での組換え蛋白質発現系、無細胞翻訳系などの多くの組換え蛋白質発現系が開発されている。なかでも大腸菌は高密度に増殖させることが容易であり、しかも宿主ベクター系の研究が進んでいることから、異種蛋白質の発現系として広く利用されている。
一方、これらの組換え蛋白質発現系で目的蛋白質を発現させた場合、発現された蛋白質が正確に折り畳まれないためにその蛋白質本来の機能を発現できなかったり、封入体と呼ばれる不溶性の凝集体が形成されることが少なくない。このような場合、例えば封入体を変性剤や界面活性剤等により可溶化した後、再折り畳みを行っても、必ずしも正常に折り畳まれた本来の機能を有する蛋白質が得られるとは限らない。また、本来の機能を発現する蛋白質が得られたとしても、満足な回収率が得られないことも多い。
このような背景において、現在まで発現組換え目的蛋白質の封入体の形成を抑制する方法は、確立されていない。その代法として、可溶性の高い分子量4万のマルトース結合蛋白質またはグルタチオンSトランスフェラーゼ(GST)と不溶性目的蛋白質とを融合させることにより可溶性蛋白として発現さすることが試みられている(非特許文献1:Fox,J.D.and Waugh, D.S. (2003) Maltose-binding protein as a solubility enhancer. Methods Mol. Biol.205:99-117、非特許文献2:Ausubel, F.M. et al. eds. (1996) Current Protocols in Molecular Biology, Vol. 2, 16.0.1)。しかし、可溶性タンパクが本来の活性あるいは機能を示さないこと、マルトース結合蛋白質またはGSTを削除した場合、目的蛋白質が不溶化する等の問題があった。
So far, many recombinant protein expression systems such as recombinant protein expression systems and cell-free translation systems in hosts such as bacteria, yeast, insects, transgenic animals and transgenic plants have been developed. Among these, Escherichia coli is easy to grow at a high density, and since research on host vector systems has been advanced, it is widely used as an expression system for heterologous proteins.
On the other hand, when the target protein is expressed in these recombinant protein expression systems, the expressed protein cannot be folded correctly, so that the original function of the protein cannot be expressed, or insoluble aggregates called inclusion bodies are formed. Often formed. In such a case, for example, even if the inclusion body is solubilized with a denaturant, a surfactant, or the like and then refolded, a protein that is normally folded and has the original function is not necessarily obtained. Moreover, even if a protein that expresses the original function is obtained, a satisfactory recovery rate is often not obtained.
Under such circumstances, a method for suppressing the formation of inclusion bodies of the expressed recombinant target protein has not been established so far. As an alternative, an attempt has been made to express a soluble protein by fusing a highly soluble maltose-binding protein having a molecular weight of 40,000 or glutathione S-transferase (GST) and an insoluble target protein (Non-patent Document 1: Fox, JDand Waugh, DS (2003) Maltose-binding protein as a solubility enhancer. Methods Mol. Biol. 205: 99-117, Non-Patent Document 2: Ausubel, FM et al. Eds. (1996) Current Protocols in Molecular Biology , Vol. 2, 16.0.1). However, there are problems that the soluble protein does not exhibit the original activity or function, and that when the maltose binding protein or GST is deleted, the target protein is insolubilized.

ZZドメインは、プロテインAのIgG結合領域を基に開発された合成のIgG結合領域である(例えば、非特許文献3:Nilsson B. et al., Protein Eng. (1987) 1: 107-113など参照)。
しかしながら、IgG結合領域のZZドメインを目的蛋白質と融合発現した場合、融合蛋白質の可溶性を増す効果および目的蛋白質の効率的な活性型蛋白質へのリフォールディングに関与する効果についての報告はない。今日まで、プロテインA由来のZZドメインは、目的蛋白質と融合蛋白質を発現後、目的蛋白質精製おけるIgG抗体アフィニティークロマト法におけるリガンドとして用いられてきたにすぎない。さらに、IgG抗体カラムは高価であり、ZZドメインを利用して遺伝子組換え融合蛋白質を大量生産利用する場合にも、利用可能な場合は限定されている。

Fox,J.D.and Waugh, D.S. (2003) Maltose-binding protein as a solubility enhancer. Methods Mol. Biol.205:99-117 Ausubel, F.M. et al. eds. (1996) Current Protocols in Molecular Biology, Vol. 2, 16.0.1 Nilsson B. et al., Protein Eng. (1987) 1: 107-113
The ZZ domain is a synthetic IgG binding region developed based on the IgG binding region of protein A (for example, Non-Patent Document 3: Nilsson B. et al., Protein Eng. (1987) 1: 107-113). reference).
However, when the ZZ domain of the IgG binding region is fused and expressed with the target protein, there is no report on the effect of increasing the solubility of the fusion protein and the effect involved in the efficient refolding of the target protein to the active protein. To date, the ZZ domain derived from protein A has only been used as a ligand in IgG antibody affinity chromatography in purifying the target protein after expressing the target protein and the fusion protein. Furthermore, IgG antibody columns are expensive, and there are limited cases where they can be used when mass-producing and utilizing genetically engineered fusion proteins using ZZ domains.

Fox, JDand Waugh, DS (2003) Maltose-binding protein as a solubility enhancer. Methods Mol. Biol. 205: 99-117 Ausubel, FM et al. Eds. (1996) Current Protocols in Molecular Biology, Vol. 2, 16.0.1 Nilsson B. et al., Protein Eng. (1987) 1: 107-113

上記状況において、組換え蛋白質発現系を用いて、目的蛋白質を可溶性蛋白質として製造することが、有用蛋白質の生産のために産業上強く望まれている。また、蛋白質の機能や構造の研究といった研究分野においても強い要望がある。   In the above situation, it is strongly desired industrially to produce a target protein as a soluble protein using a recombinant protein expression system for the production of useful proteins. There is also a strong demand in research fields such as research on the function and structure of proteins.

本発明者らは、上記課題を解決するために鋭意研究を重ねた結果、
(1)発現誘導可能なプロモーター配列;
(2)ZZドメインをコードするポリヌクレオチドを含有する第1のコード配列;および
(3)目的蛋白質をコードするポリヌクレオチドを含有する第2のコード配列
を含有する発現ベクターを用いて目的蛋白質を発現させると、目的蛋白質が可溶性蛋白質として発現されることを見出した。これらの知見に基づいてさらに検討を重ねた結果、本発明を完成するに至った。
As a result of intensive studies to solve the above problems, the present inventors have
(1) a promoter sequence that can induce expression;
(2) a first coding sequence containing a polynucleotide encoding a ZZ domain; and (3) expressing the target protein using an expression vector containing a second coding sequence containing a polynucleotide encoding the target protein. And the target protein was found to be expressed as a soluble protein. As a result of further studies based on these findings, the present invention has been completed.

すなわち、本発明は、
(1) (1)発現誘導可能なプロモーター配列;
(2)式(Z)
(式中、nは1〜5の整数を表し、Zは以下の(a)〜(d)からなる群から選択されるポリペプチドを表す:
(a)配列番号:1のアミノ酸配列からなるポリペプチド、
(b)配列番号:1のアミノ酸配列において1〜複数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加したアミノ酸配列からなるポリペプチド、
(c)配列番号:1のアミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有するアミノ酸配列からなるポリペプチド、および
(d)配列番号:2の塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによってコードされるアミノ酸配列からなるポリペプチド)
で表され、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる機能を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有する第1のコード配列;および
(3)目的蛋白質をコードするポリヌクレオチドを含有する第2のコード配列
を含有する発現ベクター、
(2) 前記式(Z)で表されるポリペプチドが、(Z)で表されるポリペプチドである、上記(1)記載のベクター、
(3) 前記式(Z)で表されるポリペプチドが、
(e)配列番号:3のアミノ酸配列からなるポリペプチド、
(f)配列番号:3のアミノ酸配列において1〜複数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加したアミノ酸配列からなり、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる機能を有するポリペプチド、
(g)配列番号:3のアミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる機能を有するポリペプチド、および
(h)配列番号:4の塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによってコードされるアミノ酸配列からなり、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる機能を有するポリペプチド
からなる群から選択されるポリペプチドである、上記(2)記載のベクター、
(4) 前記発現誘導可能なプロモーター配列が、低温で発現誘導可能なプロモーター配列である、上記(1)〜(3)のいずれかに記載のベクター、
(5) 前記低温で発現誘導可能なプロモーター配列が、コールドショック遺伝子のプロモーター配列である、上記(4)記載のベクター、
(6) 前記コールドショック遺伝子のプロモーター配列が、大腸菌コールドショック遺伝子のプロモーター配列である、上記(5)記載のベクター、
(7) 前記大腸菌コールドショック遺伝子のプロモーター配列が、大腸菌コールドショック遺伝子cspA、cspB、cspG、cspIまたはcsdAのプロモーター配列である、上記(6)記載のベクター、
(8) 前記第1のコード配列と、前記第2のコード配列との間に、さらに切断可能なリンカーペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有するコード配列を含有する、上記(1)〜(7)のいずれかに記載のベクター、
(9) 前記切断可能なリンカーペプチドが、プロテアーゼ切断部位を有するリンカーペプチドである、上記(8)記載のベクター、
(10) 前記第1のコード配列の5’側に、さらに精製のためのアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含有するコード配列を含有する、上記(1)〜(9)のいずれかに記載のベクター、
(11) 前記精製のためのアミノ酸配列が、ヒスチジンタグ配列である、上記(10)記載のベクター、
(12) (1)発現誘導可能なプロモーター配列;
(2)式(Z)
(式中、nは1〜5の整数を表し、Zは以下の(a)〜(d)からなる群から選択されるポリペプチドを表す:
(a)配列番号:1のアミノ酸配列からなるポリペプチド、
(b)配列番号:1のアミノ酸配列において1〜複数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加したアミノ酸配列からなるポリペプチド、
(c)配列番号:1のアミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有するアミノ酸配列からなるポリペプチド、および
(d)配列番号:2の塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによってコードされるアミノ酸配列からなるポリペプチド)
で表され、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる機能を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有する第1のコード配列;および
(3)目的蛋白質をコードするポリヌクレオチドを含有する第2のコード配列を挿入することができる少なくとも1つの制限酵素サイト
を含有する発現ベクター、
(13) 前記式(Z)で表されるポリペプチドが、(Z)で表されるポリペプチドである、上記(12)記載のベクター、
(14) 前記式(Z)で表されるポリペプチドが、
(e)配列番号:3のアミノ酸配列からなるポリペプチド、
(f)配列番号:3のアミノ酸配列において1〜複数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加したアミノ酸配列からなり、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる機能を有するポリペプチド、
(g)配列番号:3のアミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる機能を有するポリペプチド、および
(h)配列番号:4の塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによってコードされるアミノ酸配列からなり、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる機能を有するポリペプチド
からなる群から選択されるポリペプチドである、上記(13)記載のベクター、
(15) 前記発現誘導可能なプロモーター配列が、低温で発現誘導可能なプロモーター配列である、上記(12)〜(14)のいずれかに記載のベクター、
(16) 前記低温で発現誘導可能なプロモーター配列が、コールドショック遺伝子のプロモーター配列である、上記(15)記載のベクター、
(17) 前記コールドショック遺伝子のプロモーター配列が、大腸菌コールドショック遺伝子のプロモーター配列である、上記(16)記載のベクター、
(18) 前記大腸菌コールドショック遺伝子のプロモーター配列が、大腸菌コールドショック遺伝子cspA、cspB、 cspG、cspIまたはcsdAのプロモーター配列である、上記(17)記載のベクター、
(19) 前記第1のコード配列と、前記第2のコード配列との間に、さらに切断可能なリンカーペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有するコード配列を含有する、上記(12)〜(18)のいずれかに記載のベクター、
(20) 前記切断可能なリンカーペプチドが、プロテアーゼ切断部位を有するリンカーペプチドである、上記(19)記載のベクター、
(21) 前記第1のコード配列の5’側に、さらに精製のためのアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含有するコード配列を含有する、上記(12)〜(20)のいずれかに記載のベクター、
(22) 前記精製のためのアミノ酸配列が、ヒスチジンタグ配列である、上記(21)記載のベクター、
(23) (1)式(Z)
(式中、nは1〜5の整数を表し、Zは以下の(a)〜(d)からなる群から選択されるポリペプチドを表す:
(a)配列番号:1のアミノ酸配列からなるポリペプチド、
(b)配列番号:1のアミノ酸配列において1〜複数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加したアミノ酸配列からなるポリペプチド、
(c)配列番号:1のアミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有するアミノ酸配列からなるポリペプチド、および
(d)配列番号:2の塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによってコードされるアミノ酸配列からなるポリペプチド)
で表され、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる機能を有するポリペプチドのアミノ酸配列を含有する第1のアミノ酸配列;および
(2)目的蛋白質のアミノ酸配列を含有する第2のアミノ酸配列
を含有する、可溶性蛋白質として発現させることができる融合蛋白質、
(24) 前記式(Z)で表されるポリペプチドが、(Z)で表されるポリペプチドである、上記(23)記載の融合蛋白質、
(25) 前記式(Z)で表されるポリペプチドが、
(e)配列番号:3のアミノ酸配列からなるポリペプチド、
(f)配列番号:3のアミノ酸配列において1〜複数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加したアミノ酸配列からなり、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる機能を有するポリペプチド、
(g)配列番号:3のアミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる機能を有するポリペプチド、および
(h)配列番号:4の塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによってコードされるアミノ酸配列からなり、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる機能を有するポリペプチド
からなる群から選択されるポリペプチドである、上記(24)記載の融合蛋白質、
(26) 前記目的蛋白質が、アポイクオリン、ガウシアルシフェラーゼおよびエビルシフェラーゼからなる群から選択されるいずれかである、上記(23)〜(25)のいずれかに記載の融合蛋白質、
(27) 前記第1のアミノ酸配列と、前記第2のアミノ酸配列との間に、さらに切断可能なリンカーペプチドのアミノ酸配列を含有するアミノ酸配列を含有する、上記(23)〜(26)のいずれかに記載の融合蛋白質、
(28) 前記切断可能なリンカーペプチドが、プロテアーゼ切断部位を有するリンカーペプチドである、上記(27)記載の融合蛋白質、
(29) 前記第1のアミノ酸配列のアミノ末端側に、さらに精製のためのアミノ酸配列を含有する、上記(23)〜(28)のいずれかに記載の融合蛋白質、
(30) 前記精製のためのアミノ酸配列が、ヒスチジンタグ配列である、上記(29)記載の融合蛋白質、
(31) 式(Z)−L−X
(式中、nは1〜5の整数を表し;Lは切断可能なリンカーペプチドを表し;Zは以下の(a)〜(d)からなる群から選択されるポリペプチドを表し:
(a)配列番号:1のアミノ酸配列からなるポリペプチド、
(b)配列番号:1のアミノ酸配列において1〜複数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加したアミノ酸配列からなるポリペプチド、
(c)配列番号:1のアミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有するアミノ酸配列からなるポリペプチド、および
(d)配列番号:2の塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによってコードされるアミノ酸配列からなるポリペプチド;Xは目的蛋白質のアミノ酸配列を表す)
で表される、可溶性蛋白質として発現させることができる融合蛋白質、
(32) 前記目的蛋白質が、アポイクオリン、ガウシアルシフェラーゼおよびエビルシフェラーゼからなる群から選択されるいずれかである、上記(31)記載の融合蛋白質、
(33) 上記(23)〜(32)のいずれかに記載の融合蛋白質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド、
(34) DNAである、上記(33)記載のポリヌクレオチド、
(35) (1)発現誘導可能なプロモーター配列;
(2)式(Z)
(式中、nは1〜5の整数を表し、Zは以下の(a)〜(d)からなる群から選択されるポリペプチドを表す:
(a)配列番号:1のアミノ酸配列からなるポリペプチド、
(b)配列番号:1のアミノ酸配列において1〜複数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加したアミノ酸配列からなるポリペプチド、
(c)配列番号:1のアミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有するアミノ酸配列からなるポリペプチド、および
(d)配列番号:2の塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによってコードされるアミノ酸配列からなるポリペプチド)
で表され、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる機能を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有する第1のコード配列;および
(3)目的蛋白質をコードするポリヌクレオチドを含有する第2のコード配列
を含有する発現ベクターを用いて蛋白質を発現させることを含む、前記目的蛋白質を可溶性蛋白質として製造する方法、
(36) 前記式(Z)で表されるポリペプチドが、(Z)で表されるポリペプチドである、上記(35)記載の方法、
(37) 前記式(Z)で表されるポリペプチドが、
(e)配列番号:3のアミノ酸配列からなるポリペプチド、
(f)配列番号:3のアミノ酸配列において1〜複数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加したアミノ酸配列からなり、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる機能を有するポリペプチド、
(g)配列番号:3のアミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる機能を有するポリペプチド、および
(h)配列番号:4の塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによってコードされるアミノ酸配列からなり、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる機能を有するポリペプチド
からなる群から選択されるポリペプチドである、上記(36)記載の方法、
(38) 前記発現誘導可能なプロモーター配列が、低温で発現誘導可能なプロモーター配列である、上記(35)〜(37)のいずれかに記載の方法、
(39) 前記低温で発現誘導可能なプロモーター配列が、コールドショック遺伝子のプロモーター配列である、上記(38)記載の方法、
(40) 前記コールドショック遺伝子のプロモーター配列が、大腸菌コールドショック遺伝子のプロモーター配列である、上記(39)記載の方法、
(41) 前記大腸菌コールドショック遺伝子のプロモーター配列が、大腸菌コールドショック遺伝子cspA、cspB、 cspG、cspIまたはcsdAのプロモーター配列である、上記(40)記載の方法、
(42) 前記第1のコード配列と、前記第2のコード配列との間に、さらに切断可能なリンカーペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有するコード配列を含有する、上記(35)〜(41)のいずれかに記載の方法、
(43) 前記切断可能なリンカーペプチドが、プロテアーゼ切断部位を有するリンカーペプチドである、上記(42)記載の方法、
(44) 前記第1のコード配列の5’側に、さらに精製のためのアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含有するコード配列を含有する、上記(35)〜(43)のいずれかに記載の方法、
(45) 前記精製のためのアミノ酸配列が、ヒスチジンタグ配列である、上記(44)記載の方法
などを提供する。
That is, the present invention
(1) (1) a promoter sequence capable of inducing expression;
(2) Formula (Z) n
(In the formula, n represents an integer of 1 to 5, and Z represents a polypeptide selected from the group consisting of the following (a) to (d):
(A) a polypeptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1,
(B) a polypeptide comprising an amino acid sequence in which one or more amino acids are deleted, substituted, inserted and / or added in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1;
(C) a polypeptide comprising an amino acid sequence having 90% or more identity to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, and (d) a polynucleotide comprising a base sequence complementary to the base sequence of SEQ ID NO: 2. A polypeptide comprising an amino acid sequence encoded by a polynucleotide that hybridizes under stringent conditions)
And a first coding sequence comprising a polynucleotide that encodes a polypeptide having a function of allowing the fusion protein to be expressed as a soluble protein when expressed as a fusion protein with the target protein; 3) an expression vector containing a second coding sequence containing a polynucleotide encoding the protein of interest,
(2) The vector according to (1) above, wherein the polypeptide represented by the formula (Z) n is a polypeptide represented by (Z) 2 .
(3) The polypeptide represented by the formula (Z) 2 is
(E) a polypeptide consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3,
(F) When the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3 comprises an amino acid sequence in which one or more amino acids are deleted, substituted, inserted and / or added, and is expressed as a fusion protein with the target protein, A polypeptide having a function capable of expressing a fusion protein as a soluble protein,
(G) When the amino acid sequence has an amino acid sequence having 90% or more identity to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3 and is expressed as a fusion protein with the target protein, the fusion protein is expressed as a soluble protein. And (h) an amino acid sequence encoded by a polynucleotide that hybridizes under stringent conditions with a polynucleotide consisting of a base sequence complementary to the base sequence of SEQ ID NO: 4, and The vector according to (2) above, which is a polypeptide selected from the group consisting of polypeptides having a function capable of being expressed as a soluble protein when expressed as a fusion protein with a target protein,
(4) The vector according to any one of (1) to (3) above, wherein the promoter sequence capable of inducing expression is a promoter sequence capable of inducing expression at low temperature,
(5) The vector according to (4) above, wherein the promoter sequence capable of inducing expression at a low temperature is a cold shock gene promoter sequence,
(6) The vector according to (5) above, wherein the promoter sequence of the cold shock gene is a promoter sequence of an E. coli cold shock gene,
(7) The vector according to (6) above, wherein the promoter sequence of the E. coli cold shock gene is the promoter sequence of the E. coli cold shock gene cspA, cspB, cspG, cspI or csdA.
(8) The above (1) to (7), further comprising a coding sequence containing a polynucleotide encoding a cleavable linker peptide between the first coding sequence and the second coding sequence. A vector according to any one of
(9) The vector according to (8) above, wherein the cleavable linker peptide is a linker peptide having a protease cleavage site,
(10) The coding sequence according to any one of (1) to (9) above, further comprising a coding sequence containing a polynucleotide encoding an amino acid sequence for purification on the 5 ′ side of the first coding sequence. vector,
(11) The vector according to (10) above, wherein the amino acid sequence for purification is a histidine tag sequence,
(12) (1) a promoter sequence capable of inducing expression;
(2) Formula (Z) n
(In the formula, n represents an integer of 1 to 5, and Z represents a polypeptide selected from the group consisting of the following (a) to (d):
(A) a polypeptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1,
(B) a polypeptide comprising an amino acid sequence in which one or more amino acids are deleted, substituted, inserted and / or added in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1;
(C) a polypeptide comprising an amino acid sequence having 90% or more identity to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, and (d) a polynucleotide comprising a base sequence complementary to the base sequence of SEQ ID NO: 2. A polypeptide comprising an amino acid sequence encoded by a polynucleotide that hybridizes under stringent conditions)
And a first coding sequence comprising a polynucleotide that encodes a polypeptide having a function of allowing the fusion protein to be expressed as a soluble protein when expressed as a fusion protein with the target protein; 3) an expression vector containing at least one restriction enzyme site into which a second coding sequence containing a polynucleotide encoding the protein of interest can be inserted;
(13) The vector according to (12) above, wherein the polypeptide represented by the formula (Z) n is a polypeptide represented by (Z) 2 .
(14) The polypeptide represented by the formula (Z) 2 is:
(E) a polypeptide consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3,
(F) When the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3 comprises an amino acid sequence in which one or more amino acids are deleted, substituted, inserted and / or added, and is expressed as a fusion protein with the target protein, A polypeptide having a function capable of expressing a fusion protein as a soluble protein,
(G) When the amino acid sequence has an amino acid sequence having 90% or more identity to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3 and is expressed as a fusion protein with the target protein, the fusion protein is expressed as a soluble protein. And (h) an amino acid sequence encoded by a polynucleotide that hybridizes under stringent conditions with a polynucleotide consisting of a base sequence complementary to the base sequence of SEQ ID NO: 4, and The vector according to (13) above, which is a polypeptide selected from the group consisting of polypeptides having a function capable of being expressed as a soluble protein when expressed as a fusion protein with a target protein,
(15) The vector according to any one of (12) to (14) above, wherein the promoter sequence capable of inducing expression is a promoter sequence capable of inducing expression at low temperature,
(16) The vector according to (15) above, wherein the promoter sequence capable of inducing expression at a low temperature is a cold shock gene promoter sequence,
(17) The vector according to (16) above, wherein the cold shock gene promoter sequence is an E. coli cold shock gene promoter sequence,
(18) The vector according to (17), wherein the promoter sequence of the E. coli cold shock gene is the promoter sequence of the E. coli cold shock gene cspA, cspB, cspG, cspI or csdA.
(19) The above (12) to (18), further comprising a coding sequence containing a polynucleotide encoding a cleavable linker peptide between the first coding sequence and the second coding sequence. A vector according to any one of
(20) The vector according to (19) above, wherein the cleavable linker peptide is a linker peptide having a protease cleavage site,
(21) The coding sequence according to any one of (12) to (20), further comprising a coding sequence containing a polynucleotide encoding an amino acid sequence for purification on the 5 ′ side of the first coding sequence. vector,
(22) The vector according to (21) above, wherein the amino acid sequence for purification is a histidine tag sequence,
(23) (1) Formula (Z) n
(In the formula, n represents an integer of 1 to 5, and Z represents a polypeptide selected from the group consisting of the following (a) to (d):
(A) a polypeptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1,
(B) a polypeptide comprising an amino acid sequence in which one or more amino acids are deleted, substituted, inserted and / or added in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1;
(C) a polypeptide comprising an amino acid sequence having 90% or more identity to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, and (d) a polynucleotide comprising a base sequence complementary to the base sequence of SEQ ID NO: 2. A polypeptide comprising an amino acid sequence encoded by a polynucleotide that hybridizes under stringent conditions)
And a first amino acid sequence containing an amino acid sequence of a polypeptide having a function capable of being expressed as a soluble protein when expressed as a fusion protein with a target protein; and (2) A fusion protein containing a second amino acid sequence containing the amino acid sequence of the target protein and capable of being expressed as a soluble protein;
(24) The fusion protein according to (23), wherein the polypeptide represented by the formula (Z) n is a polypeptide represented by (Z) 2 .
(25) The polypeptide represented by the formula (Z) 2 is:
(E) a polypeptide consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3,
(F) When the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3 comprises an amino acid sequence in which one or more amino acids are deleted, substituted, inserted and / or added, and is expressed as a fusion protein with the target protein, A polypeptide having a function capable of expressing a fusion protein as a soluble protein,
(G) When the amino acid sequence has an amino acid sequence having 90% or more identity to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3 and is expressed as a fusion protein with the target protein, the fusion protein is expressed as a soluble protein. And (h) an amino acid sequence encoded by a polynucleotide that hybridizes under stringent conditions with a polynucleotide consisting of a base sequence complementary to the base sequence of SEQ ID NO: 4, and The fusion protein according to (24) above, which is a polypeptide selected from the group consisting of polypeptides having a function capable of being expressed as a soluble protein when expressed as a fusion protein with a target protein,
(26) The fusion protein according to any one of (23) to (25), wherein the target protein is any one selected from the group consisting of apoaequorin, Gaussia luciferase, and ebyl luciferase,
(27) Any of the above (23) to (26), further comprising an amino acid sequence containing a cleavable linker peptide amino acid sequence between the first amino acid sequence and the second amino acid sequence A fusion protein according to claim 1,
(28) The fusion protein according to (27), wherein the cleavable linker peptide is a linker peptide having a protease cleavage site,
(29) The fusion protein according to any one of (23) to (28), further comprising an amino acid sequence for purification on the amino terminal side of the first amino acid sequence,
(30) The fusion protein according to (29), wherein the amino acid sequence for purification is a histidine tag sequence,
(31) Formula (Z) n- L-X
(Wherein n represents an integer of 1 to 5; L represents a cleavable linker peptide; Z represents a polypeptide selected from the group consisting of the following (a) to (d):
(A) a polypeptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1,
(B) a polypeptide comprising an amino acid sequence in which one or more amino acids are deleted, substituted, inserted and / or added in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1;
(C) a polypeptide comprising an amino acid sequence having 90% or more identity to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, and (d) a polynucleotide comprising a base sequence complementary to the base sequence of SEQ ID NO: 2. A polypeptide comprising an amino acid sequence encoded by a polynucleotide that hybridizes under stringent conditions; X represents the amino acid sequence of the target protein)
A fusion protein that can be expressed as a soluble protein,
(32) The fusion protein according to (31) above, wherein the target protein is any one selected from the group consisting of apoaequorin, Gaussia luciferase and ebyl luciferase.
(33) a polynucleotide containing a polynucleotide encoding the fusion protein according to any one of (23) to (32),
(34) The polynucleotide according to (33), which is DNA,
(35) (1) a promoter sequence capable of inducing expression;
(2) Formula (Z) n
(In the formula, n represents an integer of 1 to 5, and Z represents a polypeptide selected from the group consisting of the following (a) to (d):
(A) a polypeptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1,
(B) a polypeptide comprising an amino acid sequence in which one or more amino acids are deleted, substituted, inserted and / or added in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1;
(C) a polypeptide comprising an amino acid sequence having 90% or more identity to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, and (d) a polynucleotide comprising a base sequence complementary to the base sequence of SEQ ID NO: 2. A polypeptide comprising an amino acid sequence encoded by a polynucleotide that hybridizes under stringent conditions)
And a first coding sequence comprising a polynucleotide that encodes a polypeptide having a function of allowing the fusion protein to be expressed as a soluble protein when expressed as a fusion protein with the target protein; 3) A method for producing the target protein as a soluble protein, comprising expressing the protein using an expression vector containing a second coding sequence containing a polynucleotide encoding the target protein,
(36) The method according to (35) above, wherein the polypeptide represented by the formula (Z) n is a polypeptide represented by (Z) 2 .
(37) The polypeptide represented by the formula (Z) 2 is:
(E) a polypeptide consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3,
(F) When the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3 comprises an amino acid sequence in which one or more amino acids are deleted, substituted, inserted and / or added, and is expressed as a fusion protein with the target protein, A polypeptide having a function capable of expressing a fusion protein as a soluble protein,
(G) When the amino acid sequence has an amino acid sequence having 90% or more identity to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3 and is expressed as a fusion protein with the target protein, the fusion protein is expressed as a soluble protein. And (h) an amino acid sequence encoded by a polynucleotide that hybridizes under stringent conditions with a polynucleotide consisting of a base sequence complementary to the base sequence of SEQ ID NO: 4, and The method according to (36) above, wherein when expressed as a fusion protein with a target protein, the fusion protein is a polypeptide selected from the group consisting of polypeptides having a function capable of being expressed as a soluble protein.
(38) The method according to any one of (35) to (37) above, wherein the promoter sequence capable of inducing expression is a promoter sequence capable of inducing expression at a low temperature.
(39) The method according to (38) above, wherein the promoter sequence capable of inducing expression at a low temperature is a cold shock gene promoter sequence,
(40) The method according to (39) above, wherein the cold shock gene promoter sequence is an E. coli cold shock gene promoter sequence,
(41) The method according to (40) above, wherein the promoter sequence of the E. coli cold shock gene is the promoter sequence of the E. coli cold shock gene cspA, cspB, cspG, cspI or csdA.
(42) The above (35) to (41), further comprising a coding sequence containing a polynucleotide encoding a cleavable linker peptide between the first coding sequence and the second coding sequence. A method according to any of the above,
(43) The method according to (42), wherein the cleavable linker peptide is a linker peptide having a protease cleavage site,
(44) The method according to any one of (35) to (43), further comprising a coding sequence containing a polynucleotide encoding an amino acid sequence for purification on the 5 ′ side of the first coding sequence. Method,
(45) The method according to (44) above, wherein the amino acid sequence for purification is a histidine tag sequence.

本発明によれば、目的蛋白質を組換え蛋白質発現系を用いて製造する場合に、目的蛋白質を可溶性蛋白質として製造することができるので、目的蛋白質を変性(可溶化)させる必要がない。よって、本発明によれば、目的蛋白質を効率的に、高い回収率で得ることができる。
したがって、本発明は有用蛋白質や、機能や構造の解析対象となる蛋白質などの蛋白質の製造方法として極めて有用である。
According to the present invention, when a target protein is produced using a recombinant protein expression system, the target protein can be produced as a soluble protein, so that it is not necessary to denature (solubilize) the target protein. Therefore, according to the present invention, the target protein can be obtained efficiently and at a high recovery rate.
Therefore, the present invention is extremely useful as a method for producing useful proteins and proteins such as proteins to be analyzed for functions and structures.

本発明は、(1)式(Z)で表されるポリペプチドのアミノ酸配列を含有する第1のアミノ酸配列、および
(2)目的蛋白質のアミノ酸配列を含有する第2のアミノ酸配列
を含有する融合蛋白質、前記融合蛋白質をコードするポリヌクレオチド、前記ポリヌクレオチドを用いた前記融合タンパク質の製造方法などを提供する。
また、本発明は、(1)発現誘導可能なプロモーター配列、
(2)式(Z)で表されるポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有する第1のコード配列、および
(3)目的蛋白質をコードするポリヌクレオチドを含有する第2のコード配列
を含有する発現ベクター、前記発現ベクターを用いて蛋白質を発現させることを含む前記目的蛋白質の製造方法なども提供する。該製造方法によれば、目的蛋白質を可溶化された状態で製造することができる。
以下、本発明について詳細に説明する。
The present invention includes (1) a first amino acid sequence containing the amino acid sequence of the polypeptide represented by formula (Z) n , and (2) a second amino acid sequence containing the amino acid sequence of the target protein. There are provided a fusion protein, a polynucleotide encoding the fusion protein, a method for producing the fusion protein using the polynucleotide, and the like.
The present invention also provides (1) a promoter sequence capable of inducing expression,
(2) a first coding sequence containing a polynucleotide encoding the polypeptide represented by formula (Z) n , and (3) a second coding sequence containing a polynucleotide encoding the protein of interest. An expression vector, a method for producing the target protein including expression of a protein using the expression vector, and the like are also provided. According to the production method, the target protein can be produced in a solubilized state.
Hereinafter, the present invention will be described in detail.

1.本発明の融合蛋白質
本発明の融合蛋白質は、
(1)式(Z)で表されるポリペプチドのアミノ酸配列を含有する第1のアミノ酸配列、および
(2)目的蛋白質のアミノ酸配列を含有する第2のアミノ酸配列
を含有する。
さらに、本発明の融合蛋白質は、
(3)切断可能なペプチドリンカー
のアミノ酸配列を含有するアミノ酸配列を含んでいてもよい。
以下、本発明の融合蛋白質についてより詳細に説明する。
1. Fusion protein of the present invention The fusion protein of the present invention comprises:
(1) A first amino acid sequence containing the amino acid sequence of the polypeptide represented by formula (Z) n , and (2) a second amino acid sequence containing the amino acid sequence of the target protein.
Furthermore, the fusion protein of the present invention comprises
(3) An amino acid sequence containing the amino acid sequence of a cleavable peptide linker may be included.
Hereinafter, the fusion protein of the present invention will be described in more detail.

(1)式(Z)で表されるポリペプチド
式(Z)で表されるポリペプチドは、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる活性または機能を有する。
Zは、以下の(a)〜(d)からなる群から選択されるポリペプチドを表す:
(a)配列番号:1のアミノ酸配列からなるポリペプチド、
(b)配列番号:1のアミノ酸配列において1〜複数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加したアミノ酸配列からなるポリペプチド、
(c)配列番号:1のアミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有するアミノ酸配列からなるポリペプチド、および
(d)配列番号:2の塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによってコードされるアミノ酸配列からなるポリペプチド。
(1) (Z) polypeptide expression represented by n (Z) polypeptide represented by n, when expressed as a fusion protein with the target protein, the fusion protein can be expressed as a soluble protein Has activity or function.
Z represents a polypeptide selected from the group consisting of the following (a) to (d):
(A) a polypeptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1,
(B) a polypeptide comprising an amino acid sequence in which one or more amino acids are deleted, substituted, inserted and / or added in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1;
(C) a polypeptide comprising an amino acid sequence having 90% or more identity to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, and (d) a polynucleotide comprising a base sequence complementary to the base sequence of SEQ ID NO: 2. A polypeptide comprising an amino acid sequence encoded by a polynucleotide that hybridizes under stringent conditions.

本明細書において、「1〜複数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加したアミノ酸配列」における「1〜複数個」の範囲は、例えば、1〜20個、1〜15個、1〜10個、1〜9個、1〜8個、1〜7個、1〜6個(1〜数個)、1〜5個、1〜4個、1〜3個、1〜2個、1個である。欠失、置換、挿入もしくは付加したアミノ酸の数は、一般的に少ないほど好ましい。上記アミノ酸残基の欠失、置換、挿入および付加のうち2種以上が同時に生じてもよい。このような領域は、「モレキュラークローニング第3版」、「カレント・プロトコールズ・イン・モレキュラー・バイオロジー」、“Nuc. Acids. Res., 10, 6487 (1982)”、“Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 79, 6409 (1982)”、“Gene, 34, 315 (1985)”、“Nuc. Acids. Res., 13, 4431 (1985)”、“Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 82, 488 (1985)”等に記載の部位特異的変異導入法を用いて、取得することができる。   In the present specification, the range of “1 to plural” in “an amino acid sequence in which one or more amino acids are deleted, substituted, inserted and / or added” is, for example, 1 to 20, 1 to 15, 1 to 10, 1 to 9, 1 to 8, 1 to 7, 1 to 6 (1 to several), 1 to 5, 1 to 4, 1 to 3, 1 to 2 One. In general, the smaller the number of amino acids deleted, substituted, inserted or added, the better. Two or more of the amino acid residue deletions, substitutions, insertions and additions may occur simultaneously. Such regions are described in “Molecular Cloning 3rd Edition”, “Current Protocols in Molecular Biology”, “Nuc. Acids. Res., 10, 6487 (1982)”, “Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 79, 6409 (1982) ”,“ Gene, 34, 315 (1985) ”,“ Nuc. Acids. Res., 13, 4431 (1985) ”,“ Proc. Natl. Acad. Sci. USA , 82, 488 (1985) ”and the like.

また、「90%以上の同一性を有するアミノ酸配列からなるポリペプチド」における「90%以上」の範囲は、例えば、90%以上、91%以上、92%以上、93%以上、94%以上、95%以上、96%以上、97%以上、98%以上、99%以上、99.1%以上、99.2%以上、99.3%以上、99.4%以上、99.5%以上、99.6%以上、99.7%以上、99.8%以上、99.9%以上である。上記同一性の数値は、一般的に大きいほど好ましい。なお、アミノ酸配列や塩基配列の同一性は、BLAST(例えば、Altzshul S. F. et al., J. Mol. Biol. 215, 403 (1990)、など参照)やFASTA(Pearson W. R., Methods in Enzymology 183, 63 (1990)、など参照)等の解析プログラムを用いて決定できる。BLASTまたはFASTAを用いる場合は、各プログラムのデフォルトパラメーターを用いる。   In addition, the range of “90% or more” in “polypeptide consisting of an amino acid sequence having 90% or more identity” is, for example, 90% or more, 91% or more, 92% or more, 93% or more, 94% or more, 95% or more, 96% or more, 97% or more, 98% or more, 99% or more, 99.1% or more, 99.2% or more, 99.3% or more, 99.4% or more, 99.5% or more, They are 99.6% or more, 99.7% or more, 99.8% or more, 99.9% or more. In general, the larger the numerical value of identity, the better. The identity of amino acid sequences and base sequences is determined by BLAST (see, for example, Altzshul SF et al., J. Mol. Biol. 215, 403 (1990)) or FASTA (Pearson WR, Methods in Enzymology 183, 63 (See (1990), etc.). When using BLAST or FASTA, the default parameters of each program are used.

ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドについては、後記する。   The polynucleotide that hybridizes under stringent conditions will be described later.

nは、1〜5の整数を表し、2または3であるのが好ましく、特に2であるのが好ましい。
式(Z)で表されるポリペプチドにおいて、各Zは同一であっても異なっていてもよい。
式(Z)で表されるポリペプチドとしては、特に式(Z)で表されるポリペプチドが好ましい。
n represents an integer of 1 to 5, preferably 2 or 3, and particularly preferably 2.
Formula (Z) In the polypeptide represented by n , each Z may be the same or different.
As the polypeptide represented by the formula (Z) n , a polypeptide represented by the formula (Z) 2 is particularly preferable.

式(Z)で表されるポリペプチドとしては、例えば、配列番号:3のアミノ酸配列からなるポリペプチドまたは配列番号:3のアミノ酸配列からなるポリペプチドと実質的に同質の活性もしくは機能を有するポリペプチドが挙げられる。本明細書中、配列番号:3のアミノ酸配列からなるポリペプチドまたは配列番号:3のアミノ酸配列からなるポリペプチドと実質的に同質の活性もしくは機能を有するポリペプチドを「ZZドメイン」と称することがある。
前記「実質的に同質の活性もしくは機能」とは、例えば、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる活性もしくは機能を意味する。このような活性もしくは機能、例えば、ZZドメインのIgG 結合能は、IgGとの結合アッセイ法により測定することができる。
The polypeptide represented by the formula (Z) 2 has, for example, substantially the same activity or function as the polypeptide consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3 or the polypeptide consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3. A polypeptide. In the present specification, a polypeptide consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3 or a polypeptide having substantially the same activity or function as the polypeptide consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3 is referred to as a “ZZ domain”. is there.
The “substantially the same quality of activity or function” means, for example, an activity or function that allows the fusion protein to be expressed as a soluble protein when expressed as a fusion protein with the target protein. Such activity or function, for example, the IgG binding ability of the ZZ domain can be measured by a binding assay with IgG.

式(Z)で表されるポリペプチドとしては、より具体的には、例えば、
(e)配列番号:3のアミノ酸配列からなるポリペプチド、
(f)配列番号:3のアミノ酸配列において1〜複数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加したアミノ酸配列からなり、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる活性もしくは機能を有するポリペプチド、
(g)配列番号:3のアミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる活性もしくは機能を有するポリペプチド、および
(h)配列番号:4の塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによってコードされるアミノ酸配列からなり、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる活性もしくは機能を有するポリペプチド
からなる群から選択されるポリペプチドなどが挙げられる。
More specifically, examples of the polypeptide represented by the formula (Z) 2 include:
(E) a polypeptide consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3,
(F) When the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3 comprises an amino acid sequence in which one or more amino acids are deleted, substituted, inserted and / or added, and is expressed as a fusion protein with the target protein, A polypeptide having an activity or function by which the fusion protein can be expressed as a soluble protein;
(G) When the amino acid sequence has an amino acid sequence having 90% or more identity to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3 and is expressed as a fusion protein with the target protein, the fusion protein is expressed as a soluble protein. And (h) an amino acid sequence encoded by a polynucleotide that hybridizes under stringent conditions with a polynucleotide consisting of a base sequence complementary to the base sequence of SEQ ID NO: 4. And a polypeptide selected from the group consisting of polypeptides having an activity or function that can be expressed as a soluble protein when expressed as a fusion protein with the target protein.

(2)目的蛋白質
本発明の融合蛋白質における目的蛋白質には特に制限はない。例えば、組換え蛋白質発現系で発現させた場合に封入体を形成しやすい蛋白質も、好ましく用いることができる。
本発明の目的蛋白質としては、例えば、B型肝炎ウィルス、C型肝炎ウィルス、HIV、インフルエンザなどの病原性ウィルスゲノムにコードされる、外被タンパク質、コアタンパク質、プロテアーゼ、逆転写酵素、インテグラーゼなどのタンパク質(ウィルス抗原);抗体のFab、(Fab);血小板由来増殖因子(PDGF)、幹細胞成長因子(SCF)、肝細胞成長因子(HGF)、トランスフォーミング成長因子(TGF)、神経成長因子(NGF)、上皮細胞増殖因子(EGF)、線維芽細胞増殖因子(FGF)、インスリン様成長因子(IGF)などの増殖因子;腫瘍壊死因子、インターフェロン、インターロイキンなどのサイトカイン類;エリスロポエチン、顆粒球コロニー刺激因子、顆粒球マクロファージコロニー刺激因子、マクロファージコロニー刺激因子、トロンボポエチンなどの造血因子;黄体形成ホルモン放出ホルモン(LH−RH)、甲状腺刺激ホルモン放出ホルモン(TRH)、インスリン、ソマトスタチン、成長ホルモン、プロラクチン、副腎皮質刺激ホルモン(ACTH)、メラノサイト刺激ホルモン(MSH)、甲状腺刺激ホルモン(TSH)、黄体形成ホルモン(LH)、卵胞刺激ホルモン(FSH)、バソプレシン、オキシトシン、カルシトニン、副甲状腺ホルモン(PTH)、グルカゴン、ガストリン、セクレチン、パンクレオザイミン、コレシストキニン、アンジオテンシン、ヒト胎盤ラクトーゲン、ヒト絨毛性ゴナドトロピン(HCG)、セルレイン、モチリンなどのペプチドホルモン;エンケファリン、エンドルフィン、ディノルフィン、キョウトルフィンなどの鎮痛性ペプチド;スーパーオキシドディスミュターゼ(SOD)、ウロキナーゼ、ティシュープラスミノーゲンアクティベーター(TPA)、アスパラギナーゼ、カリクレインなどの酵素;ボムベシン、ニュウロテンシン、ブラジキニン、サブスタンスPなどのペプチド性神経伝達物質;アルブミン;コラーゲン;プロインスリン;レニン;α1アンチトリプシンなども挙げられるが、これらに限定されない。
(2) Target protein There is no restriction | limiting in particular in the target protein in the fusion protein of this invention. For example, proteins that easily form inclusion bodies when expressed in a recombinant protein expression system can be preferably used.
Examples of the target protein of the present invention include coat protein, core protein, protease, reverse transcriptase, integrase encoded by pathogenic virus genomes such as hepatitis B virus, hepatitis C virus, HIV, influenza, etc. Protein (virus antigen); antibody Fab, (Fab) 2 ; platelet derived growth factor (PDGF), stem cell growth factor (SCF), hepatocyte growth factor (HGF), transforming growth factor (TGF), nerve growth factor (NGF), epidermal growth factor (EGF), fibroblast growth factor (FGF), growth factor such as insulin-like growth factor (IGF); tumor necrosis factor, cytokines such as interferon, interleukin; erythropoietin, granulocyte Colony stimulating factor, granulocyte macrophage colony stimulation Hematopoietic factors such as litter, macrophage colony stimulating factor, thrombopoietin; luteinizing hormone releasing hormone (LH-RH), thyroid stimulating hormone releasing hormone (TRH), insulin, somatostatin, growth hormone, prolactin, corticotropin (ACTH), Melanocyte Stimulating Hormone (MSH), Thyroid Stimulating Hormone (TSH), Luteinizing Hormone (LH), Follicle Stimulating Hormone (FSH), Vasopressin, Oxytocin, Calcitonin, Parathyroid Hormone (PTH), Glucagon, Gastrin, Secretin, Pancreosai Peptide hormones such as min, cholecystokinin, angiotensin, human placental lactogen, human chorionic gonadotropin (HCG), cerulein, motilin; enkephalin, endorphin, di Analgesic peptides such as rufin and kyotorphin; enzymes such as superoxide dismutase (SOD), urokinase, tissue plasminogen activator (TPA), asparaginase and kallikrein; peptides such as bombesin, neurotensin, bradykinin and substance P Examples include, but are not limited to, sex neurotransmitters; albumin; collagen; proinsulin; renin; α1 antitrypsin.

目的タンパク質は、アポタンパク質、すなわちホロタンパク質のタンパク質部分であってもよい。アポタンパク質としては、例えば、アポRLBP(FEBS Lett. 268, 287-290 (1990)など参照)、アポイクオリン(Proc. Natl. Acad. Sci. USA 82, 3154-3158 (1985)など参照 )、アポクライチィン(FEBS Lett. 315, 343-346 (1993)など参照)、アポマイトロコミン(FEBS Lett. 333, 301-305 (1993)など参照)、アポオベリン(Gene 153,273-274 (1995)など参照)などが挙げられる。アポイクオリンのアミノ酸配列を配列番号:21に示す。   The target protein may be an apoprotein, that is, the protein portion of a holoprotein. Examples of the apoprotein include apoRLBP (see FEBS Lett. 268, 287-290 (1990), etc.), apoaequorin (see Proc. Natl. Acad. Sci. USA 82, 3154-3158 (1985), etc.), apocritin (See FEBS Lett. 315, 343-346 (1993), etc.), Apomytrocomin (see FEBS Lett. 333, 301-305 (1993), etc.), Apooverin (See Gene 153,273-274 (1995), etc.) Can be mentioned. The amino acid sequence of apoaequorin is shown in SEQ ID NO: 21.

また、目的蛋白質はガウシアルシフェラーゼ(hGL)、エビルシフェラーゼ(Oplophorus luciferase)の触媒ユニットである19kDa蛋白質(KAZ)であってもよい。ガウシアルシフェラーゼ(hGL)のアミノ酸配列を配列番号:23に示す。エビルシフェラーゼの触媒ユニットである19kDa蛋白質(KAZ)のアミノ酸配列を配列番号:25に示す。   Further, the target protein may be a 19 kDa protein (KAZ) which is a catalytic unit of Gaussia luciferase (hGL) and Evil luciferase (Oplophorus luciferase). The amino acid sequence of Gaussia luciferase (hGL) is shown in SEQ ID NO: 23. The amino acid sequence of 19 kDa protein (KAZ) which is a catalytic unit of Evil luciferase is shown in SEQ ID NO: 25.

本発明の目的タンパク質には、上記蛋白質の変異体も含まれる。そのような変異体としては、例えば、上記蛋白質のアミノ酸配列において、1もしくは複数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加したアミノ酸配列からなり、かつ該蛋白質と同質の活性を有する蛋白質も含まれる。このような蛋白質としては、上記蛋白質のアミノ酸配列において、例えば、1〜100個、1〜90個、1〜80個、1〜70個、1〜60個、1〜50個、1〜40個、1〜30個、1〜20個、1〜10個、1〜9個、1〜8個、1〜7個、1〜6個(1〜数個)、1〜5個、1〜4個、1〜3個、1〜2個、1個のアミノ酸残基が欠失、置換、挿入および/または付加されたアミノ酸配列からなり、かつ該蛋白質と同質の活性を有するタンパク質が挙げられる。上記アミノ酸残基の欠失、置換、挿入および/または付加の数は、一般的には小さい程好ましい。欠失、置換、挿入及び付加のうち2種以上が同時に生じてもよい。   The target protein of the present invention includes mutants of the above proteins. Examples of such a mutant include a protein having an amino acid sequence in which one or a plurality of amino acids are deleted, substituted, inserted and / or added in the amino acid sequence of the protein, and having the same activity as the protein. Is also included. Examples of such a protein include 1 to 100, 1 to 90, 1 to 80, 1 to 70, 1 to 60, 1 to 50, and 1 to 40 in the amino acid sequence of the protein. , 1-30, 1-20, 1-10, 1-9, 1-8, 1-7, 1-6 (1 to several), 1-5, 1-4 A protein having an amino acid sequence in which 1 to 3, 1 to 2, 1 or 2 amino acid residues are deleted, substituted, inserted and / or added, and having the same activity as the protein. In general, the smaller the number of amino acid residue deletions, substitutions, insertions and / or additions, the better. Two or more of deletion, substitution, insertion and addition may occur simultaneously.

本発明の目的蛋白質には、上記蛋白質の「部分ペプチド」も含まれる。蛋白質の部分ペプチドとしては、上記蛋白質のアミノ酸配列の一部の連続するアミノ酸配列からなる部分ペプチドが挙げられ、該蛋白質の活性と同質の活性を有するものが好ましい。そのような部分ペプチドとしては、例えば、上記蛋白質のアミノ酸配列において、少なくとも20個、好ましくは少なくとも50個のアミノ酸残基からなるアミノ酸配列を有するポリペプチドなどが挙げられる。好ましくは、これらのポリペプチドは、上記蛋白質の活性に関与する部分に対応するアミノ酸配列を含有する。また、本発明で使用される部分ペプチドは、上記ポリペプチドにおいて、そのアミノ酸配列中の1または複数個(例えば、1〜20個程度、より好ましくは1〜10個程度、さらにより好ましくは1〜5個程度)のアミノ酸残基が欠失、付加、置換、または挿入により変更されているものでもよい。
本発明で用いられる部分ペプチドは、抗体作成のための抗原としても用いることができる。
The target protein of the present invention includes “partial peptides” of the above proteins. Examples of the partial peptide of the protein include a partial peptide consisting of a part of the amino acid sequence of the protein, and preferably have the same activity as that of the protein. Examples of such a partial peptide include a polypeptide having an amino acid sequence consisting of at least 20, preferably at least 50 amino acid residues in the amino acid sequence of the above protein. Preferably, these polypeptides contain an amino acid sequence corresponding to the portion involved in the activity of the protein. Moreover, the partial peptide used in the present invention is one or more (for example, about 1 to 20, more preferably about 1 to 10, more preferably 1 to 2) in the amino acid sequence of the above polypeptide. About 5 amino acid residues may be changed by deletion, addition, substitution, or insertion.
The partial peptide used in the present invention can also be used as an antigen for antibody production.

(3)切断可能なリンカーペプチドなど
本発明の融合蛋白質は、前記式(Z)で表されるポリペプチドのアミノ酸配列を含有する第1のアミノ酸配列と、目的蛋白質のアミノ酸配列を含有する第2のアミノ酸配列との間に、さらに、切断可能なリンカーペプチドのアミノ酸配列を含有するアミノ酸配列を含んでいてもよい。
切断可能なリンカーペプチドとは、酵素的または化学的切断物質により切断することができる切断部位を有するリンカーペプチドを意味する。酵素(プロテアーゼ)または化学物質により切断されるペプチドは多数知られている(例えば、Harlow and Lane, Antibodies:A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY (1988);Walsh, Proteins Biochemistry and Biotechnology, John Wiley & Sons, LTD., West Sussex, England (2002)など参照)。切断物質とは、ペプチドにおける切断部位を認識し、ペプチド内の結合の切断によりペプチドを2つのペプチドに分割する化学物質または酵素である。切断物質としては、例えば、化学物質、プロテアーゼなどが挙げられる。
本発明において好ましい切断可能なリンカーペプチドは、プロテアーゼ切断部位を有するリンカーペプチドである。プロテアーゼ切断部位としては、例えば、トロンビン切断部位、ヒトレノウイルス3Cプロテアーゼ切断部位、ファクターXaなどが挙げられる。
本発明の融合蛋白質が切断可能なリンカーペプチドを含む場合には、本発明の融合蛋白質を発現させた後、切断物質で処理することによって、本発明の融合蛋白質から前記第1のアミノ酸配列が除去された目的蛋白質を得ることができる。
(3) A cleavable linker peptide, etc. The fusion protein of the present invention comprises a first amino acid sequence containing the amino acid sequence of the polypeptide represented by the formula (Z) n and a first amino acid sequence containing the amino acid sequence of the target protein. An amino acid sequence containing an amino acid sequence of a cleavable linker peptide may be further included between the two amino acid sequences.
A cleavable linker peptide means a linker peptide having a cleavage site that can be cleaved by an enzymatic or chemical cleaving substance. Numerous peptides are known that are cleaved by enzymes (proteases) or chemicals (eg, Harlow and Lane, Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY (1988); Walsh, Proteins Biochemistry and Biotechnology, John Wiley & Sons, LTD., West Sussex, England (2002)). A cleaving substance is a chemical substance or enzyme that recognizes a cleavage site in a peptide and divides the peptide into two peptides by cleaving the bond in the peptide. Examples of the cleaving substance include chemical substances and proteases.
A preferred cleavable linker peptide in the present invention is a linker peptide having a protease cleavage site. Examples of protease cleavage sites include thrombin cleavage sites, human renovirus 3C protease cleavage sites, factor Xa and the like.
When the fusion protein of the present invention contains a cleavable linker peptide, the first amino acid sequence is removed from the fusion protein of the present invention by expressing the fusion protein of the present invention and then treating with a cleavage substance. Target protein can be obtained.

本発明の融合蛋白質としては、具体的には、例えば、
式(Z)−L−X
(式中、Lは直接結合または切断可能なリンカーペプチドを表し、Xは目的蛋白質のアミノ酸配列を表し、nおよびZは前記と同じ意味を表す)
で表される融合蛋白質も挙げられる。
As the fusion protein of the present invention, specifically, for example,
Formula (Z) n- L-X
(In the formula, L represents a linker peptide that can be directly bonded or cleaved, X represents the amino acid sequence of the target protein, and n and Z have the same meaning as described above.)
The fusion protein represented by is also mentioned.

本発明の融合蛋白質は、さらに、翻訳促進のためのアミノ酸配列および/または精製のためのアミノ酸配列を含んでいてもよい。翻訳促進のためのアミノ酸配列としては、当技術分野において用いられているアミノ酸配列を使用することができる。翻訳促進のためのアミノ酸配列としては、例えば、TEE配列などが挙げられる。精製のためのアミノ酸配列としては、当技術分野において用いられているアミノ酸配列を使用することができる。精製のためのアミノ酸配列としては、例えば、ヒスチジン残基が4残基以上、好ましくは6残基以上連続したアミノ酸配列を有するヒスチジンタグ配列、グルタチオン S−トランストランスフェラーゼのグルタチオンへの結合ドメインのアミノ酸配列などが挙げられる。精製のためのアミノ酸配列は、前記第1のアミノ酸配列のアミノ末端側に存在するのが好ましい。   The fusion protein of the present invention may further contain an amino acid sequence for promoting translation and / or an amino acid sequence for purification. As an amino acid sequence for promoting translation, an amino acid sequence used in this technical field can be used. Examples of amino acid sequences for promoting translation include TEE sequences. As the amino acid sequence for purification, an amino acid sequence used in this technical field can be used. Examples of the amino acid sequence for purification include a histidine tag sequence having an amino acid sequence of 4 or more, preferably 6 or more histidine residues, and an amino acid sequence of a binding domain to glutathione of glutathione S-transferase Etc. The amino acid sequence for purification is preferably present on the amino terminal side of the first amino acid sequence.

2.本発明のポリヌクレオチド
本発明は、前述した本発明の融合蛋白質をコードするポリヌクレオチドも提供する。本発明のポリヌクレオチドとしては、本発明の融合蛋白質をコードする塩基配列を含有するものであればいかなるものであってもよいが、好ましくはDNAである。DNAとしては、ゲノムDNA、ゲノムDNAライブラリー、細胞・組織由来のcDNA、細胞・組織由来のcDNAライブラリー、合成DNAなどが挙げられる。ライブラリーに使用するベクターは、特に制限はなく、バクテリオファージ、プラスミド、コスミド、ファージミドなどいずれであってもよい。また、前記した細胞・組織からtotalRNAまたはmRNA画分を調製したものを用いて直接 Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction(以下、RT-PCR法と略称する)によって増幅することもできる。
2. Polynucleotide of the Present Invention The present invention also provides a polynucleotide encoding the above-described fusion protein of the present invention. The polynucleotide of the present invention may be any polynucleotide as long as it contains the base sequence encoding the fusion protein of the present invention, but is preferably DNA. Examples of DNA include genomic DNA, genomic DNA library, cell / tissue-derived cDNA, cell / tissue-derived cDNA library, and synthetic DNA. The vector used for the library is not particularly limited and may be any of bacteriophage, plasmid, cosmid, phagemid and the like. Moreover, it can also be amplified directly by reverse transcription polymerase chain reaction (hereinafter abbreviated as RT-PCR method) using a total RNA or mRNA fraction prepared from the cells / tissues described above.

本発明のポリヌクレオチドとしては、具体的には、
(1)式(Z)で表され、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる活性または機能を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有する第1のコード配列;および
(2)目的蛋白質をコードするポリヌクレオチドを含有する第2のコード配列
とを含有するポリヌクレオチドなどが含まれる。
ここで、式(Z)は前記と同じ意味を表す。
As the polynucleotide of the present invention, specifically,
(1) A polynucleotide encoding a polypeptide represented by the formula (Z) n and having an activity or function capable of being expressed as a soluble protein when expressed as a fusion protein with a target protein. A first coding sequence containing; and (2) a polynucleotide containing a second coding sequence containing a polynucleotide encoding the protein of interest, and the like.
Here, formula (Z) n represents the same meaning as described above.

本発明のポリヌクレオチドとしては、なかでも、
(1)式(Z)で表されるポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有する第1のコード配列、および
(2)目的蛋白質をコードするポリヌクレオチドを含有する第2のコード配列
を含有するポリヌクレオチドが好ましい。
ここで、式(Z)は前記と同じ意味を表す。
Among the polynucleotides of the present invention, among others,
(1) a first coding sequence containing a polynucleotide encoding a polypeptide represented by formula (Z) 2 ; and (2) a second coding sequence containing a polynucleotide encoding a protein of interest. Polynucleotides are preferred.
Here, formula (Z) 2 represents the same meaning as described above.

式(Z)で表されるポリペプチドをコードするポリヌクレオチドとしては、例えば、以下の(e)〜(h)からなる群から選択されるポリヌクレオチド:
(e)配列番号:4の塩基配列からなるポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド、
(f)配列番号:4の塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつ目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる活性または機能を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド、
(g)配列番号:3のアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド、および
(h)配列番号:3のアミノ酸配列において1〜複数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加したアミノ酸配列からなり、かつ目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる活性または機能を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド
などが挙げられる。
Examples of the polynucleotide encoding the polypeptide represented by the formula (Z) 2 include a polynucleotide selected from the group consisting of the following (e) to (h):
(E) a polynucleotide containing a polynucleotide consisting of the base sequence of SEQ ID NO: 4,
(F) When hybridized with a polynucleotide comprising a base sequence complementary to the base sequence of SEQ ID NO: 4 under stringent conditions and expressed as a fusion protein with the target protein, the fusion protein is soluble A polynucleotide comprising a polynucleotide encoding a polypeptide having an activity or function capable of being expressed as a protein;
(G) a polynucleotide containing a polynucleotide encoding a polypeptide consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3, and (h) one to a plurality of amino acids in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3 deleted, substituted, or inserted And / or a polynucleotide comprising a polynucleotide that encodes a polypeptide having an activity or function that can be expressed as a soluble protein when expressed as a fusion protein with a target protein. Examples include nucleotides.

このような好ましい本発明のポリヌクレオチドとしては、例えば、
(1)以下の(e)〜(h)からなる群から選択される第1のコード配列:
(e)配列番号:4の塩基配列からなるポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド、
(f)配列番号:4の塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつ目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる活性または機能を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド、
(g)配列番号:3のアミノ酸配列からなるポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド、および
(h)配列番号:3のアミノ酸配列において1〜複数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加したアミノ酸配列からなり、かつ目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる活性または機能を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド;と、
(2)目的蛋白質をコードするポリヌクレオチドを含有する第2のコード配列
とを含有するポリヌクレオチドなどが挙げられる。
As such a preferable polynucleotide of the present invention, for example,
(1) A first coding sequence selected from the group consisting of the following (e) to (h):
(E) a polynucleotide containing a polynucleotide consisting of the base sequence of SEQ ID NO: 4,
(F) When hybridized with a polynucleotide comprising a base sequence complementary to the base sequence of SEQ ID NO: 4 under stringent conditions and expressed as a fusion protein with the target protein, the fusion protein is soluble A polynucleotide comprising a polynucleotide encoding a polypeptide having an activity or function capable of being expressed as a protein;
(G) a polynucleotide containing a polynucleotide encoding a polypeptide consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3, and (h) one to a plurality of amino acids are deleted, substituted, or inserted in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3. And / or a polynucleotide comprising a polynucleotide that encodes a polypeptide having an activity or function that can be expressed as a soluble protein when expressed as a fusion protein with a target protein. Nucleotides; and
(2) A polynucleotide containing a second coding sequence containing a polynucleotide encoding the target protein.

ここで、「ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチド(例えば、DNA)」とは、配列番号:2または4の塩基配列と相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドまたは配列番号:1または3のアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドの全部または一部をプローブとして、コロニーハイブリダイゼーション法、プラークハイブリダイゼーション法またはサザンハイブリダイゼーション法などを用いることにより得られるポリヌクレオチド(例えば、DNA)をいう。具体的には、コロニーあるいはプラーク由来のポリヌクレオチドを固定化したフィルターを用いて、0.7〜1.0mol/LのNaCl存在下、65℃でハイブリダイゼーションを行った後、0.1〜2倍濃度のSSC(Saline-sodium citrate)溶液(1倍濃度のSSC溶液の組成は、150mmol/L塩化ナトリウム、15mmol/Lクエン酸ナトリウムよりなる)を用い、65℃条件下でフィルターを洗浄することにより同定できるポリヌクレオチドをあげることができる。   Here, “a polynucleotide that hybridizes under stringent conditions (for example, DNA)” means a polynucleotide comprising a nucleotide sequence complementary to the nucleotide sequence of SEQ ID NO: 2 or 4, or SEQ ID NO: 1 or 3 A polynucleotide (for example, DNA) obtained by using a colony hybridization method, a plaque hybridization method, a Southern hybridization method, or the like using as a probe all or part of a polynucleotide encoding the amino acid sequence of Specifically, hybridization was performed at 65 ° C. in the presence of 0.7 to 1.0 mol / L NaCl using a filter on which a polynucleotide derived from colony or plaque was immobilized, and then 0.1 to 2 Wash the filter at 65 ° C using double-concentration SSC (Saline-sodium citrate) solution (composition of single-concentration SSC solution is 150 mmol / L sodium chloride, 15 mmol / L sodium citrate) Polynucleotides that can be identified by:

ハイブリダイゼーションは、Sambrook J. et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Third Edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press (2001)(以下、モレキュラー・クローニング第3版と略す)、Ausbel F. M. et al., Current Protocols in Molecular Biology, Supplement 1〜38, John Wiley and Sons (1987-1997)、Glover D. M. and Hames B. D., DNA Cloning 1: Core Techniques, A practical Approach, Second Edition, Oxford University Press (1995)等の実験書に記載されている方法に準じて行うことができる。   Hybridization is described in Sambrook J. et al., Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Third Edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press (2001) (hereinafter abbreviated as Molecular Cloning 3rd Edition), Ausbel FM et al., Current Protocols. In experimental documents such as in Molecular Biology, Supplement 1-38, John Wiley and Sons (1987-1997), Glover DM and Hames BD, DNA Cloning 1: Core Techniques, A practical Approach, Second Edition, Oxford University Press (1995) It can be carried out according to the method described.

本明細書でいう「ストリンジェントな条件」は、低ストリンジェントな条件、中ストリンジェントな条件及び高ストリンジェントな条件のいずれでもよい。「低ストリンジェントな条件」は、例えば、5×SSC、5×デンハルト溶液、0.5%(w/v)SDS、50%(v/v)ホルムアミド、32℃の条件である。また、「中ストリンジェントな条件」は、例えば、5×SSC、5×デンハルト溶液、0.5%(w/v)SDS、50%(v/v)ホルムアミド、42℃の条件である。「高ストリンジェントな条件」は、例えば、5×SSC、5×デンハルト溶液、0.5(w/v)%SDS、50%(v/v)ホルムアミド、50℃の条件である。条件を厳しくするほど、二本鎖形成に必要とする相補性が高くなる。具体的には、例えば、これらの条件において、温度を上げるほど高い相同性を有するポリヌクレオチド(例えば、DNA)が効率的に得られることが期待できる。ただし、ハイブリダイゼーションのストリンジェンシーに影響する要素としては温度、プローブ濃度、プローブの長さ、イオン強度、時間、塩濃度など複数の要素が考えられ、当業者であればこれら要素を適宜選択することで同様のストリンジェンシーを実現することが可能である。   As used herein, the “stringent conditions” may be any of low stringency conditions, moderate stringency conditions, and high stringency conditions. “Low stringent conditions” are, for example, conditions of 5 × SSC, 5 × Denhardt's solution, 0.5% (w / v) SDS, 50% (v / v) formamide, 32 ° C. The “medium stringent conditions” are, for example, conditions of 5 × SSC, 5 × Denhardt's solution, 0.5% (w / v) SDS, 50% (v / v) formamide, 42 ° C. “High stringent conditions” are, for example, conditions of 5 × SSC, 5 × Denhardt's solution, 0.5 (w / v)% SDS, 50% (v / v) formamide, 50 ° C. The tighter the conditions, the higher the complementarity required for duplex formation. Specifically, for example, it can be expected that a polynucleotide (eg, DNA) having high homology as the temperature is increased can be efficiently obtained under these conditions. However, multiple factors such as temperature, probe concentration, probe length, ionic strength, time, and salt concentration can be considered as factors that affect hybridization stringency. Those skilled in the art will select these factors as appropriate. It is possible to achieve similar stringency.

なお、ハイブリダイゼーションに市販のキットを用いる場合は、例えばAlkphos Direct Labelling Reagents(アマシャムファルマシア社製)を用いることができる。この場合は、キットに添付のプロトコールにしたがい、標識したプローブとのインキュベーションを一晩行った後、メンブレンを55℃の条件下で0.1% (w/v) SDSを含む1次洗浄バッファーで洗浄後、ハイブリダイズしたDNAを検出することができる。   In addition, when using a commercially available kit for hybridization, Alkphos Direct Labeling Reagents (made by Amersham Pharmacia) can be used, for example. In this case, follow the protocol attached to the kit, incubate with the labeled probe overnight, and then wash the membrane with a primary wash buffer containing 0.1% (w / v) SDS at 55 ° C. , Hybridized DNA can be detected.

これ以外にハイブリダイズ可能なポリヌクレオチドとしては、FASTA、BLAST等の解析プログラムにより、デフォルトのパラメータを用いて計算したときに、配列番号:1または3のアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドと約60%以上、65%以上、70%以上、75%以上、80%以上、85%以上、88%以上、90%以上、92%以上、95%以上、97%以上、98%以上、99%以上、99.3%以上、99.5%以上、99.7%以上、99.8%以上、99.9%以上の同一性を有するDNAをあげることができる。なお、アミノ酸配列や塩基配列の同一性は、前述した方法を用いて決定できる。   Other hybridizable polynucleotides are approximately 60% of the polynucleotide encoding the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1 or 3 when calculated using FASTA, BLAST and other analysis programs using default parameters. Over 65%, over 70%, over 75%, over 80%, over 85%, over 88%, over 90%, over 92%, over 95%, over 97%, over 98%, over 99%, DNA having the identity of 99.3% or more, 99.5% or more, 99.7% or more, 99.8% or more, 99.9% or more can be mentioned. The identity of amino acid sequences and base sequences can be determined using the method described above.

あるアミノ酸配列に対して、1もしくは複数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加したアミノ酸配列を有する領域をコードするポリヌクレオチドは、部位特異的変異導入法(例えば、Gotoh, T. et al., Gene 152, 271-275 (1995)、Zoller, M.J., and Smith, M., Methods Enzymol. 100, 468-500 (1983)、Kramer, W. et al., Nucleic Acids Res. 12, 9441-9456 (1984)、Kramer W, and Fritz H.J., Methods. Enzymol. 154, 350-367 (1987)、Kunkel,T.A., Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 82, 488-492 (1985)、Kunkel, Methods Enzymol. 85, 2763-2766 (1988)、など参照)、アンバー変異を利用する方法(例えば、Gapped duplex法、Nucleic Acids Res. 12, 9441-9456 (1984)、など参照)などを用いることにより得ることができる。   A polynucleotide encoding a region having an amino acid sequence in which one or a plurality of amino acids are deleted, substituted, inserted and / or added to a certain amino acid sequence can be obtained by site-directed mutagenesis (see, eg, Gotoh, T. et al., Gene 152, 271-275 (1995), Zoller, MJ, and Smith, M., Methods Enzymol. 100, 468-500 (1983), Kramer, W. et al., Nucleic Acids Res. 12, 9441-9456 (1984), Kramer W, and Fritz HJ, Methods.Enzymol. 154, 350-367 (1987), Kunkel, TA, Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 82, 488-492 (1985), Kunkel, Methods Enzymol. 85, 2763-2766 (1988), etc.), methods using amber mutation (for example, see Gapped duplex method, Nucleic Acids Res. 12, 9441-9456 (1984), etc.) Can be obtained.

また目的の変異(欠失、付加、置換および/または挿入)を導入した配列をそれぞれの5’端に持つ1組のプライマーを用いたPCR(例えば、Ho S. N. et al., Gene 77, 51 (1989)、など参照)によっても、ポリヌクレオチドに変異を導入することができる。   PCR (for example, Ho SN et al., Gene 77, 51 (for example, Ho SN et al., Gene 77, 51 ( 1989), etc.) can also introduce mutations into polynucleotides.

また欠失変異体の一種である蛋白質の部分断片をコードするポリヌクレオチドは、その蛋白質をコードするポリヌクレオチド中の作製したい部分断片をコードする領域の5’端の塩基配列と一致する配列を有するオリゴヌクレオチドおよび3’端の塩基配列と相補的な配列を有するオリゴヌクレオチドをプライマーとして用いて、その蛋白質をコードするポリヌクレオチドを鋳型にしたPCRを行うことにより取得できる。   A polynucleotide encoding a partial fragment of a protein that is a kind of deletion mutant has a sequence that matches the 5'-end base sequence of the region encoding the partial fragment to be produced in the polynucleotide encoding the protein. It can be obtained by performing PCR using an oligonucleotide and an oligonucleotide having a sequence complementary to the base sequence at the 3 ′ end as a primer and using a polynucleotide encoding the protein as a template.

本発明のポリヌクレオチドの具体例としては、例えば、配列番号:7、配列番号:11、配列番号:15、配列番号:17または配列番号:19のアミノ酸配列からなる融合蛋白質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチドなどがあげられる。配列番号:7に記載のアミノ酸配列からなる融合蛋白質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチドとしては、例えば、配列番号:8に記載の塩基配列からなるポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチドなどが挙げられる。配列番号:11に記載のアミノ酸配列からなる融合蛋白質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチドとしては、例えば、配列番号:12に記載の塩基配列からなるポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチドなどが挙げられる。配列番号:15に記載のアミノ酸配列からなる融合蛋白質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチドとしては、例えば、配列番号:16に記載の塩基配列からなるポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチドなどが挙げられる。配列番号:17に記載のアミノ酸配列からなる融合蛋白質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチドとしては、例えば、配列番号:18に記載の塩基配列からなるポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチドなどが挙げられる。配列番号:19に記載のアミノ酸配列からなる融合蛋白質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチドとしては、例えば、配列番号:20に記載の塩基配列からなるポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチドなどが挙げられる。   Specific examples of the polynucleotide of the present invention include a polynucleotide encoding a fusion protein consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17 or SEQ ID NO: 19. Examples thereof include a polynucleotide. Examples of the polynucleotide containing a polynucleotide encoding a fusion protein consisting of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 7 include a polynucleotide containing a polynucleotide consisting of the base sequence set forth in SEQ ID NO: 8. . Examples of the polynucleotide containing a polynucleotide encoding a fusion protein consisting of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 11 include a polynucleotide containing a polynucleotide consisting of the base sequence set forth in SEQ ID NO: 12. . Examples of the polynucleotide containing a polynucleotide encoding a fusion protein consisting of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 15 include a polynucleotide containing a polynucleotide consisting of the base sequence set forth in SEQ ID NO: 16. . Examples of the polynucleotide containing a polynucleotide encoding a fusion protein consisting of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 17 include a polynucleotide containing a polynucleotide consisting of the base sequence set forth in SEQ ID NO: 18. . Examples of the polynucleotide containing a polynucleotide encoding a fusion protein consisting of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 19 include a polynucleotide containing a polynucleotide consisting of the base sequence set forth in SEQ ID NO: 20. .

本発明のポリヌクレオチドは、前記第1のコード配列と、前記第2のコード配列との間に、さらに、切断可能なリンカーペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有していてもよい。切断可能なリンカーペプチドについては、前述した通りである。   The polynucleotide of the present invention may further contain a polynucleotide encoding a cleavable linker peptide between the first coding sequence and the second coding sequence. The cleavable linker peptide is as described above.

本発明のポリヌクレオチドは、翻訳促進のためのアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド(コード配列)および/または精製のためのアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド(コード配列)を含んでいてもよい。翻訳促進のためのアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチドとしては、当技術分野において用いられている翻訳促進のためのアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチドを使用することができる。翻訳促進のためのアミノ酸配列としては、前記したものなどが挙げられる。精製のためのアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドとしては、当技術分野において用いられている精製のためのアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチドを使用することができる。精製のためのアミノ酸配列としては、前記したものなどが挙げられる。精製のためのアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド(コード配列)は、前記第1のコード配列の5’側に存在するのが好ましい。   The polynucleotide of the present invention comprises a polynucleotide (coding sequence) containing a polynucleotide encoding an amino acid sequence for promoting translation and / or a polynucleotide (coding sequence) containing a polynucleotide encoding an amino acid sequence for purification. ) May be included. As a polynucleotide containing a polynucleotide encoding an amino acid sequence for promoting translation, a polynucleotide containing a polynucleotide encoding an amino acid sequence for promoting translation used in the art may be used. it can. Examples of the amino acid sequence for promoting translation include those described above. As a polynucleotide encoding an amino acid sequence for purification, a polynucleotide containing a polynucleotide encoding an amino acid sequence for purification used in the art can be used. Examples of the amino acid sequence for purification include those described above. The polynucleotide (coding sequence) containing the polynucleotide encoding the amino acid sequence for purification is preferably present on the 5 'side of the first coding sequence.

3.本発明の発現ベクターおよび形質転換体
さらに、本発明は、上述した本発明のポリヌクレオチドを含有する発現ベクターおよび形質転換体を提供する。
(1)発現ベクター
本発明の発現ベクターは、適当なベクターに本発明のポリヌクレオチド(DNA)を連結(挿入)することにより得ることができる。より具体的には、精製されたポリヌクレオチド(DNA)を適当な制限酵素で切断し、適当なベクターの制限酵素部位またはマルチクローニングサイトに挿入して、ベクターに連結することにより得ることができる。
本発明の発現ベクターとしては、具体的には、例えば、
(1)発現誘導可能なプロモーター配列;
(2)式(Z)
(式中、nおよびZ前記と同じ意味を表す。)
で表され、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる機能を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有する第1のコード配列;および
(3)目的蛋白質をコードするポリヌクレオチドを含有する第2のコード配列
を含有する発現ベクターなどが挙げられる。
本発明のポリヌクレオチドを挿入するためのベクターは、宿主中で複製可能なものであれば特に限定されず、例えば、プラスミド、バクテリオファージ、動物ウイルス等が挙げられる。プラスミドとしては、例えば、大腸菌由来のプラスミド(例えばpBR322, pBR325, pUC118, pUC119等)、枯草菌由来のプラスミド(例えばpUB110, pTP5等)、酵母由来のプラスミド(例えばYEp13, YEp24, YCp50等)などがあげられる。バクテリオファージとしては、例えば、λファージなどがあげられる。動物ウイルスとしては、例えば、レトロウイルス、ワクシニアウイルス、昆虫ウイルス(例えば、バキュロウイルスなど)などがあげられる。また、pCold Iベクター、pCold IIベクター、pCold IIIベクター、pCold IVベクター(以上、タカラバイオ社製)なども好適に使用することができる。
3. Expression Vector and Transformant of the Present Invention Furthermore, the present invention provides an expression vector and a transformant containing the above-described polynucleotide of the present invention.
(1) Expression vector The expression vector of the present invention can be obtained by ligating (inserting) the polynucleotide (DNA) of the present invention into an appropriate vector. More specifically, it can be obtained by cleaving a purified polynucleotide (DNA) with a suitable restriction enzyme, inserting it into a restriction enzyme site or a multiple cloning site of a suitable vector, and ligating the vector.
Specific examples of the expression vector of the present invention include, for example,
(1) a promoter sequence that can induce expression;
(2) Formula (Z) n
(Wherein n and Z represent the same meaning as described above.)
And a first coding sequence comprising a polynucleotide that encodes a polypeptide having a function of allowing the fusion protein to be expressed as a soluble protein when expressed as a fusion protein with the target protein; 3) An expression vector containing a second coding sequence containing a polynucleotide encoding the target protein can be mentioned.
The vector for inserting the polynucleotide of the present invention is not particularly limited as long as it can replicate in the host, and examples thereof include plasmids, bacteriophages, animal viruses and the like. Examples of plasmids include plasmids derived from E. coli (eg, pBR322, pBR325, pUC118, pUC119, etc.), plasmids derived from Bacillus subtilis (eg, pUB110, pTP5, etc.), and plasmids derived from yeast (eg, YEp13, YEp24, YCp50, etc.). can give. Examples of the bacteriophage include λ phage. Examples of animal viruses include retroviruses, vaccinia viruses, insect viruses (eg, baculoviruses) and the like. Moreover, a pCold I vector, a pCold II vector, a pCold III vector, a pCold IV vector (manufactured by Takara Bio Inc.) and the like can also be suitably used.

本発明のポリヌクレオチドは、通常、適当なベクター中のプロモーター(発現誘導可能なプロモーター)の下流に、発現可能なように連結される。用いられるプロモーターとしては、形質転換する際の宿主が動物細胞である場合には、SV40由来のプロモーター、レトロウイルスのプロモーター、メタロチオネインプロモーター、ヒートショックプロモーター、サイトメガロウイルスプロモーター、SRαプロモーターなどが好ましい。宿主がエシェリヒア属菌である場合は、Trpプロモーター、T7プロモーター、lacプロモーター、recAプロモーター、λPLプロモーター、lppプロモーターなどが好ましい。宿主がバチルス属菌である場合は、SPO1プロモーター、SPO2プロモーター、penPプロモーターなどが好ましい。宿主が酵母である場合は、PHO5プロモーター、PGKプロモーター、GAPプロモーター、ADH1プロモーター、GALプロモーターなどが好ましい。宿主が昆虫細胞である場合は、ポリヘドリンプロモーター、P10プロモーターなどが好ましい。また、低温で発現誘導可能なプロモーターも好適に使用することができる。低温で発現誘導可能なプロモーターとしては、例えば、コールドショック遺伝子のプロモーター配列などが挙げられる。コールドショック遺伝子としては、例えば、大腸菌コールドショック遺伝子(例えば、cspA、cspB、cspG、cspI、csdAなど)、Bacillus caldolyticusコールドショック遺伝子(例えば、Bc−Cspなど)、Salmonella entericaコールドショック遺伝子(例えば、cspEなど)、Erwinia carotovoraコールドショック遺伝子(例えば、cspGなど)などが挙げられる。低温で発現誘導可能なプロモーターとしては、なかでも、例えば、cspAプロモーター、cspBプロモーター、cspGプロモーター、cspIプロモーター、csdAプロモーターなどを好適に使用することができる。   The polynucleotide of the present invention is usually ligated so that it can be expressed downstream of a promoter (promoter capable of inducing expression) in an appropriate vector. The promoter used is preferably an SV40-derived promoter, a retrovirus promoter, a metallothionein promoter, a heat shock promoter, a cytomegalovirus promoter, an SRα promoter or the like when the host to be transformed is an animal cell. When the host is Escherichia, a Trp promoter, T7 promoter, lac promoter, recA promoter, λPL promoter, lpp promoter and the like are preferable. When the host is Bacillus, SPO1 promoter, SPO2 promoter, penP promoter and the like are preferable. When the host is yeast, PHO5 promoter, PGK promoter, GAP promoter, ADH1 promoter, GAL promoter, etc. are preferable. When the host is an insect cell, polyhedrin promoter, P10 promoter and the like are preferable. A promoter capable of inducing expression at a low temperature can also be suitably used. Examples of the promoter capable of inducing expression at a low temperature include a promoter sequence of a cold shock gene. Examples of cold shock genes include E. coli cold shock genes (eg, cspA, cspB, cspG, cspI, csdA, etc.), Bacillus caldolyticus cold shock genes (eg, Bc-Csp, etc.), Salmonella enterica cold shock genes (eg, cspE, etc.). Erwinia carotovora cold shock gene (for example, cspG etc.) and the like. Among them, for example, a cspA promoter, a cspB promoter, a cspG promoter, a cspI promoter, a csdA promoter and the like can be suitably used as a promoter capable of inducing expression at a low temperature.

本発明の発現ベクターには、以上の他に、所望によりエンハンサー、スプライシングシグナル、ポリA付加シグナル、リボソーム結合配列(SD配列)、選択マーカーなどを含有しているものを用いることができる。選択マーカーとしては、例えば、ジヒドロ葉酸還元酵素遺伝子、アンピシリン耐性遺伝子、ネオマイシン耐性遺伝子などがあげられる。   In addition to the above, the expression vector of the present invention may contain those containing an enhancer, a splicing signal, a poly A addition signal, a ribosome binding sequence (SD sequence), a selection marker and the like as desired. Examples of the selection marker include a dihydrofolate reductase gene, an ampicillin resistance gene, a neomycin resistance gene, and the like.

また、本発明の発現ベクターは、翻訳促進のためのアミノ酸配列をコードする塩基配列を含有するポリヌクレオチドおよび/または精製のためのアミノ酸配列をコードする塩基配列を含有するポリヌクレオチドを含んでいてもよい。翻訳促進のためのアミノ酸配列をコードする塩基配列を含有するポリヌクレオチドとしては、当技術分野において用いられている翻訳促進のためのアミノ酸配列をコードする塩基配列を含有するポリヌクレオチドを使用することができる。翻訳促進のためのアミノ酸配列としては、前記したものなどが挙げられる。精製のためのアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドとしては、当技術分野において用いられている精製のためのアミノ酸配列をコードする塩基配列を含有するポリヌクレオチドを使用することができる。精製のためのアミノ酸配列としては、前記したものなどが挙げられる。   Further, the expression vector of the present invention may include a polynucleotide containing a base sequence encoding an amino acid sequence for promoting translation and / or a polynucleotide containing a base sequence encoding an amino acid sequence for purification. Good. As the polynucleotide containing a base sequence encoding an amino acid sequence for promoting translation, a polynucleotide containing a base sequence encoding an amino acid sequence for promoting translation used in the art may be used. it can. Examples of the amino acid sequence for promoting translation include those described above. As a polynucleotide encoding an amino acid sequence for purification, a polynucleotide containing a base sequence encoding an amino acid sequence for purification used in the art can be used. Examples of the amino acid sequence for purification include those described above.

(2)形質転換体
このようにして得られた、本発明のポリヌクレオチド(すなわち、本発明の融合蛋白質をコードするポリヌクレオチド)を含有する発現ベクターを、適当な宿主中に導入することによって、形質転換体を作成することができる。宿主としては、本発明のポリヌクレオチド(DNA)を発現できるものであれば特に限定されるものではなく、例えば、エシェリヒア属菌、バチルス属菌、シュードモナス属菌、リゾビウム属菌、酵母、動物細胞または昆虫細胞などがあげられる。エシェリヒア属菌としては、例えば、エシェリヒア・コリ(Escherichia coli)などがあげられる。バチルス属菌としては、例えば、バチルス・ズブチリス(Bacillus subtilis)などがあげられる。シュードモナス属菌としては、例えば、シュードモナス・プチダ(Pseudomonas putida)などがあげられる。リゾビウム属菌としては、例えば、リゾビウム・メリロティ(Rhizobium meliloti)などがあげられる。酵母としては、例えば、サッカロミセス・セレビシエ(Saccharomyces cerevisiae)、シゾサッカロミセス・ポンベ(Schizosaccharomyces pombe)などがあげられる。動物細胞としては、例えば、COS細胞、CHO細胞などがあげられる。昆虫細胞としては、例えば、Sf9、Sf21などがあげられる。
(2) Transformant By introducing the expression vector containing the polynucleotide of the present invention (that is, the polynucleotide encoding the fusion protein of the present invention) thus obtained into a suitable host, Transformants can be created. The host is not particularly limited as long as it can express the polynucleotide (DNA) of the present invention. For example, Escherichia, Bacillus, Pseudomonas, Rhizobium, yeast, animal cells or Insect cells. Examples of the genus Escherichia include Escherichia coli. Examples of the genus Bacillus include Bacillus subtilis. Examples of Pseudomonas spp. Include Pseudomonas putida. Examples of the genus Rhizobium include Rhizobium meliloti. Examples of the yeast include Saccharomyces cerevisiae and Schizosaccharomyces pombe. Examples of animal cells include COS cells and CHO cells. Examples of insect cells include Sf9 and Sf21.

発現ベクターの宿主への導入方法およびこれによる形質転換方法は、一般的な各種方法によって行うことができる。発現ベクターの宿主細胞への導入方法としては、例えば、例えばリン酸カルシウム法(Virology, 52, 456-457 (1973))、リポフェクション法(Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 84, 7413 (1987))、エレクトロポレーション法(EMBO J., 1, 841-845 (1982))などがあげられる。エシェリヒア属菌の形質転換方法としては、例えば、Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 69, 2110 (1972)、Gene, 17, 107 (1982)などに記載の方法などがあげられる。バチルス属菌の形質転換方法としては、例えば、Molecular & General Genetics,168, 111 (1979)に記載の方法などがあげられる。酵母の形質転換方法としては、例えば、Proc. Natl. Acad. Sci. USA,75,1929 (1978)に記載の方法などがあげられる。動物細胞の形質転換方法としては、例えば、Virology,52, 456 (1973)に記載の方法などがあげられる。昆虫細胞の形質転換方法としては、例えば、Bio/Technology, 6, 47-55 (1988)に記載の方法などがあげられる。このようにして、本発明の融合蛋白質をコードするポリヌクレオチド(本発明のポリヌクレオチド)を含有する発現ベクターで形質転換された形質転換体を得ることができる。   The method for introducing the expression vector into the host and the transformation method using the expression vector can be performed by various general methods. Examples of methods for introducing an expression vector into a host cell include, for example, the calcium phosphate method (Virology, 52, 456-457 (1973)) and the lipofection method (Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 84, 7413 (1987)). Electroporation method (EMBO J., 1, 841-845 (1982)). Examples of the transformation method of the genus Escherichia include the methods described in Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 69, 2110 (1972), Gene, 17, 107 (1982) and the like. Examples of the method for transforming Bacillus include the method described in Molecular & General Genetics, 168, 111 (1979). Examples of yeast transformation methods include the method described in Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 75, 1929 (1978). Examples of methods for transforming animal cells include the method described in Virology, 52, 456 (1973). Examples of the method for transforming insect cells include the method described in Bio / Technology, 6, 47-55 (1988). Thus, a transformant transformed with an expression vector containing a polynucleotide encoding the fusion protein of the present invention (polynucleotide of the present invention) can be obtained.

(3)低温で発現誘導可能なプロモーター配列を含有する発現ベクターおよび形質転換体
本発明の発現ベクターとしては、なかでも低温で発現誘導可能なプロモーター配列を含有する発現ベクターが好ましい。低温で発現誘導可能なプロモーター配列を含有する発現ベクターを用いることによって、本発明の融合蛋白質を可溶性蛋白質として発現させることができる。
低温で発現誘導可能なプロモーター配列を含有する発現ベクターとは、具体的には、
(1)低温で発現誘導可能なプロモーター配列;
(2)式(Z)
(式中、nおよびZは前記と同じ意味を表す。)
で表され、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる活性または機能を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有する第1のコード配列;および
(3)目的蛋白質をコードするポリヌクレオチドを含有する第2のコード配列
を含有する発現ベクターを意味する。
式(Z)で表されるポリペプチドについては、前記した通りである。
(3) Expression vector and transformant containing promoter sequence capable of inducing expression at low temperature As the expression vector of the present invention, an expression vector containing a promoter sequence capable of inducing expression at low temperature is particularly preferable. By using an expression vector containing a promoter sequence capable of inducing expression at a low temperature, the fusion protein of the present invention can be expressed as a soluble protein.
Specifically, an expression vector containing a promoter sequence capable of inducing expression at low temperature is:
(1) Promoter sequence capable of inducing expression at low temperature;
(2) Formula (Z) n
(In the formula, n and Z have the same meaning as described above.)
A first coding sequence comprising a polynucleotide that encodes a polypeptide having an activity or function that can be expressed as a soluble protein when expressed as a fusion protein with the target protein; And (3) An expression vector containing a second coding sequence containing a polynucleotide encoding the protein of interest.
The polypeptide represented by formula (Z) n is as described above.

低温で発現誘導可能なプロモーター配列を含有する発現ベクターとしては、なかでも、
(1)低温で発現誘導可能なプロモーター配列;
(2)式(Z)
(式中、Zは前記と同じ意味を表す。)
で表されるポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有する第1のコード配列;および
(3)目的蛋白質をコードするポリヌクレオチドを含有する第2のコード配列
を含有する発現ベクターが好ましい。
式(Z)で表されるポリペプチドについては、前記した通りである。
式(Z)で表されるポリペプチドをコードするポリヌクレオチドについても、前記した通りである。
As an expression vector containing a promoter sequence capable of inducing expression at low temperature,
(1) Promoter sequence capable of inducing expression at low temperature;
(2) Formula (Z) 2
(In the formula, Z represents the same meaning as described above.)
And (3) an expression vector containing a second coding sequence containing a polynucleotide encoding the protein of interest.
The polypeptide represented by the formula (Z) 2 is as described above.
The polynucleotide encoding the polypeptide represented by formula (Z) 2 is also as described above.

低温で発現誘導可能なプロモーター配列とは、宿主細胞を増殖させる培養条件から、温度を下げることによって目的蛋白質の発現を誘導可能なプロモーター配列を意味する。低温で発現誘導可能なプロモーターとしては、例えば、コールドショック蛋白質をコードする遺伝子(コールドショック遺伝子)のプロモーターが挙げられる。コールドショック遺伝子のプロモーターとしては、例えば、大腸菌のコールドショック遺伝子のプロモーター、Bacillus caldolyticusコールドショック遺伝子のプロモーター(例えば、Bc−Cspなど)、Salmonella entericaコールドショック遺伝子のプロモーター(例えば、cspEなど)、Erwinia carotovoraコールドショック遺伝子のプロモーターなど(例えば、cspGなど)が挙げられる。大腸菌のコールドショック遺伝子のプロモーターとしては、例えば、cspAプロモーター、cspBプロモーター、cspGプロモーター、cspIプロモーター、csdAプロモーターなどが挙げられ、cspAプロモーターが好ましい。Bacillus caldolyticusコールドショック遺伝子のプロモーターとしては、例えば、Bc−Cspなどが挙げられる。Salmonella entericaコールドショック遺伝子のプロモーターとしては、例えば、cspEなどが挙げられる。Erwinia carotovoraコールドショック遺伝子のプロモーターとしては、例えば、cspGなどが挙げられる。   The promoter sequence capable of inducing expression at a low temperature means a promoter sequence capable of inducing the expression of the target protein by lowering the temperature from the culture conditions for growing the host cells. Examples of the promoter capable of inducing expression at a low temperature include a promoter of a gene encoding a cold shock protein (cold shock gene). Examples of the cold shock gene promoter include, for example, the cold shock gene promoter of Escherichia coli, Bacillus caldolyticus cold shock gene promoter (for example, Bc-Csp), Salmonella enterica cold shock gene promoter (for example, cspE), Erwinia carotovora Examples include cold shock gene promoters (eg, cspG). Examples of the E. coli cold shock gene promoter include cspA promoter, cspB promoter, cspG promoter, cspI promoter, csdA promoter and the like, with cspA promoter being preferred. Examples of the Bacillus caldolyticus cold shock gene promoter include Bc-Csp. Examples of the promoter of the Salmonella enterica cold shock gene include cspE. Examples of the Erwinia carotovora cold shock gene promoter include cspG.

本発明で用いられる低温で発現誘導可能なプロモーターが発現誘導しうる温度としては、通常30℃以下、好ましくは25℃以下、より好ましくは20℃以下、特に好ましくは15℃以下である。ただし、低温にしすぎると発現効率が低下するので、通常は5℃以上、好ましくは10℃以上、特に好ましくは約15℃で発現誘導させる。   The temperature at which the promoter capable of inducing expression at a low temperature used in the present invention is usually 30 ° C. or lower, preferably 25 ° C. or lower, more preferably 20 ° C. or lower, particularly preferably 15 ° C. or lower. However, since the expression efficiency decreases when the temperature is too low, the expression is usually induced at 5 ° C or higher, preferably 10 ° C or higher, and particularly preferably about 15 ° C.

本発明の低温で発現誘導可能なプロモーター配列を含有する発現ベクターを作製する場合、本発明のポリヌクレオチドを挿入するためのベクターとしては、pCold Iベクター、pCold IIベクター、pCold IIIベクター、pCold IVベクター(以上、タカラバイオ社製)などを好適に使用することができる。これらのベクターを使用して、原核細胞を宿主として発現させた場合、本発明の融合蛋白質を宿主細胞の細胞質中に可溶性蛋白質として産生させることができる。   When preparing an expression vector containing a promoter sequence capable of inducing expression at low temperature of the present invention, vectors for inserting the polynucleotide of the present invention include pCold I vector, pCold II vector, pCold III vector, pCold IV vector (Above, manufactured by Takara Bio Inc.) and the like can be suitably used. When these vectors are used to express prokaryotic cells as a host, the fusion protein of the present invention can be produced as a soluble protein in the cytoplasm of the host cell.

本発明の低温で発現誘導可能なプロモーター配列を含有する発現ベクターを導入する宿主としては、原核細胞が好ましく、さらに大腸菌が好ましく、特にBL21株、JM109株が好ましく、なかでもBL21株が好ましい。   As a host into which an expression vector containing a promoter sequence capable of inducing expression at low temperature of the present invention is introduced, prokaryotic cells are preferable, Escherichia coli is more preferable, particularly BL21 strain and JM109 strain are preferable, and BL21 strain is particularly preferable.

本発明の低温で発現誘導可能なプロモーター配列を含有する発現ベクターが導入された形質転換体を細胞増殖させる培養温度は、通常25〜40℃、好ましくは30〜37℃である。発現誘導させる温度は、通常4〜25℃、好ましくは10〜20℃、より好ましくは12〜18℃、特に好ましくは15℃である。   The culture temperature for cell growth of the transformant introduced with the expression vector containing a promoter sequence capable of inducing expression at a low temperature of the present invention is usually 25 to 40 ° C., preferably 30 to 37 ° C. The temperature for inducing expression is usually 4 to 25 ° C, preferably 10 to 20 ° C, more preferably 12 to 18 ° C, and particularly preferably 15 ° C.

また、本発明の発現ベクターとしては、
(1)発現誘導可能なプロモーター配列;
(2)式(Z)
(式中、nおよびZは前記と同じ意味を表す。)
で表され、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる活性または機能を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有する第1のコード配列;および
(3)目的蛋白質をコードするポリヌクレオチドを含有する第2のコード配列を挿入することができる少なくとも1つの制限酵素サイト
を含有する発現ベクターなども挙げられる。
発現誘導可能なプロモーターとしては、低温で発現誘導可能なプロモーターが好ましい。
式(Z)で表されるポリペプチドについては、前記した通りである。
「目的蛋白質をコードするポリヌクレオチドを含有する第2のコード配列を挿入することができる少なくとも1つの制限酵素サイト」とは、目的蛋白質をコードするポリヌクレオチドを含有する第2のコード配列を挿入することができる制限酵素認識部位を有するポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチドである。前記制限酵素サイトとしては、目的蛋白質をコードするポリヌクレオチドを含有する第2のコード配列を挿入することができればよく、特に制限はないが、いわゆるマルチクローニングサイトであるのが好ましい。マルチクローニングサイトなどの制限酵素サイトは、当技術分野において周知であり、報告されている(例えば、Yanisch-Perron, C., Vieira, J. and Messing, J. Gene 33 (1985) 103-119、Improved M13 phage cloning vectors and host strains: Nucleotide sequences of the M13mp18 and pUC19 vectors. Gene 33 (1985) 103-119など参照)。
In addition, as the expression vector of the present invention,
(1) a promoter sequence that can induce expression;
(2) Formula (Z) n
(In the formula, n and Z have the same meaning as described above.)
A first coding sequence comprising a polynucleotide that encodes a polypeptide having an activity or function that can be expressed as a soluble protein when expressed as a fusion protein with the target protein; And (3) an expression vector containing at least one restriction enzyme site into which a second coding sequence containing a polynucleotide encoding the target protein can be inserted.
As a promoter capable of inducing expression, a promoter capable of inducing expression at a low temperature is preferable.
The polypeptide represented by formula (Z) n is as described above.
“At least one restriction enzyme site capable of inserting a second coding sequence containing a polynucleotide encoding a protein of interest” refers to inserting a second coding sequence containing a polynucleotide encoding a protein of interest A polynucleotide comprising a polynucleotide having a restriction enzyme recognition site. The restriction enzyme site is not particularly limited as long as a second coding sequence containing a polynucleotide encoding the target protein can be inserted, but is preferably a so-called multicloning site. Restriction enzyme sites such as multicloning sites are well known and reported in the art (eg, Yanisch-Perron, C., Vieira, J. and Messing, J. Gene 33 (1985) 103-119, Improved M13 phage cloning vectors and host strains: Nucleotide sequences of the M13mp18 and pUC19 vectors. See Gene 33 (1985) 103-119).

このような発現ベクターの(3)目的蛋白質をコードするポリヌクレオチドを含有する第2のコード配列を挿入することができる少なくとも1つの制限酵素サイトに、上述の目的蛋白質をコードするポリヌクレオチドを連結(挿入)することにより、本発明の融合蛋白質を発現できる発現ベクターを作製することができる。   In such an expression vector, (3) the polynucleotide encoding the target protein is linked to at least one restriction enzyme site into which the second coding sequence containing the polynucleotide encoding the target protein can be inserted ( Insertion), an expression vector capable of expressing the fusion protein of the present invention can be prepared.

このような発現ベクターとしては、なかでも、
(1)低温で発現誘導可能なプロモーター配列;
(2)式(Z)
(式中、Zは前記と同じ意味を表す。)
で表されるポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有する第1のコード配列;および
(3)目的蛋白質をコードするポリヌクレオチドを含有する第2のコード配列を挿入することができる少なくとも1つの制限酵素サイト
を含有する発現ベクターが好ましい。
式(Z)で表されるポリペプチドについては、前記した通りである。
式(Z)で表されるポリペプチドをコードするポリヌクレオチドについても、前記した通りである。
Among such expression vectors,
(1) Promoter sequence capable of inducing expression at low temperature;
(2) Formula (Z) 2
(In the formula, Z represents the same meaning as described above.)
A first coding sequence containing a polynucleotide encoding a polypeptide represented by: and (3) at least one restriction enzyme into which a second coding sequence containing a polynucleotide encoding a protein of interest can be inserted. Expression vectors containing the site are preferred.
The polypeptide represented by the formula (Z) 2 is as described above.
The polynucleotide encoding the polypeptide represented by formula (Z) 2 is also as described above.

前記第1のコード配列と、前記少なくとも1つの制限酵素サイトとの間に、さらに、切断可能なリンカーペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有していてもよい。切断可能なリンカーペプチドについては、前記した通りである。
前記第1のコード配列の5’側に、さらに精製のためのアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含有するコード配列を含有していてもよい。精製のためのアミノ酸配列については、前記した通りである。
A polynucleotide encoding a cleavable linker peptide may further be included between the first coding sequence and the at least one restriction enzyme site. The cleavable linker peptide is as described above.
A coding sequence containing a polynucleotide encoding an amino acid sequence for purification may further be contained on the 5 ′ side of the first coding sequence. The amino acid sequence for purification is as described above.

4.本発明の融合蛋白質の製造
また、本発明は、前記形質転換体を培養し、本発明の融合蛋白質を生成させる工程を含む、本発明の融合蛋白質の製造方法を提供する。本発明の融合蛋白質は、前記形質転換体を本発明の融合蛋白質をコードするポリヌクレオチド(DNA)が発現可能な条件下で培養し、本発明の融合蛋白質を生成・蓄積させ、分離・精製することによって製造することができる。
4). Production of fusion protein of the present invention The present invention also provides a method for producing the fusion protein of the present invention, comprising the steps of culturing the transformant to produce the fusion protein of the present invention. In the fusion protein of the present invention, the transformant is cultured under conditions capable of expressing the polynucleotide (DNA) encoding the fusion protein of the present invention, and the fusion protein of the present invention is produced, accumulated, separated and purified. Can be manufactured.

(形質転換体の培養)
本発明の形質転換体の培養は、宿主の培養に用いられる通常の方法に従って行うことができる。該培養によって、形質転換体によって本発明の融合蛋白質が生成され、形質転換体内または培養液中などに本発明の融合蛋白質が蓄積される。
(Culture of transformants)
The transformant of the present invention can be cultured according to a usual method used for host culture. By the culture, the fusion protein of the present invention is produced by the transformant, and the fusion protein of the present invention is accumulated in the transformant or in the culture solution.

宿主がエシェリヒア属菌、バチルス属菌である形質転換体を培養する培地としては、該形質転換体の生育に必要な炭素源、窒素源、無機塩類等を含有し、形質転換体の培養を効率的に行うことができる培地であれば、天然培地、合成培地のいずれを用いてもよい。炭素源としては、グルコース、フラクトース、スクロース、デンプンなどの炭水化物、酢酸、プロピオン酸などの有機酸、エタノール、プロパノール等のアルコール類が用いられる。窒素源としては、アンモニア、塩化アンモニウム、硫酸アンモニウム、酢酸アンモニウム、リン酸アンモニウムなどの無機酸もしくは有機酸のアンモニウム塩またはその他の含窒素化合物のほか、ペプトン、肉エキス、コーンスティープリカーなどが用いられる。無機塩類としては、リン酸第一カリウム、リン酸第二カリウム、リン酸マグネシウム、硫酸マグネシウム、塩化ナトリウム、硫酸第一鉄、硫酸マンガン、硫酸銅、炭酸カルシウムなどが用いられる。培養中は必要に応じてアンピシリンやテトラサイクリン等の抗生物質を培地に添加してもよい。プロモーターとして誘導性のプロモーターを用いた発現ベクターで形質転換した形質転換体を培養する場合は、必要に応じてインデューサーを培地に添加してもよい。例えば、Lacプロモーターを用いた発現ベクターで形質転換した形質転換体を培養するときにはイソプロピル-β-D-チオガラクトピラノシド(IPTG)などを、trpプロモーターを用いた発現ベクターで形質転換した形質転換体を培養するときにはインドールアクリル酸(IAA)などを培地に添加してもよい。   As a medium for cultivating transformants whose hosts are Escherichia or Bacillus genus, it contains a carbon source, nitrogen source, inorganic salts, etc. necessary for the growth of the transformant, so that transformants can be cultured efficiently. Any natural or synthetic medium may be used as long as it can be performed automatically. As the carbon source, carbohydrates such as glucose, fructose, sucrose and starch, organic acids such as acetic acid and propionic acid, and alcohols such as ethanol and propanol are used. As the nitrogen source, ammonia, ammonium salts of inorganic or organic acids such as ammonium chloride, ammonium sulfate, ammonium acetate, and ammonium phosphate, or other nitrogen-containing compounds, peptone, meat extract, corn steep liquor, and the like are used. Examples of inorganic salts include monopotassium phosphate, dipotassium phosphate, magnesium phosphate, magnesium sulfate, sodium chloride, ferrous sulfate, manganese sulfate, copper sulfate, and calcium carbonate. During culture, an antibiotic such as ampicillin or tetracycline may be added to the medium as necessary. When culturing a transformant transformed with an expression vector using an inducible promoter as a promoter, an inducer may be added to the medium as necessary. For example, when cultivating a transformant transformed with an expression vector using the Lac promoter, transformation by transforming isopropyl-β-D-thiogalactopyranoside (IPTG) with an expression vector using the trp promoter When culturing the body, indoleacrylic acid (IAA) or the like may be added to the medium.

宿主がエシェリヒア属菌の場合、培養は通常約15〜43℃で約3〜24時間行い、必要により、通気や撹拌を加える。宿主がバチルス属菌の場合、培養は通常約30〜40℃で約6〜24時間行ない、必要により通気や撹拌を加える。   When the host is an Escherichia bacterium, the culture is usually carried out at about 15 to 43 ° C. for about 3 to 24 hours, and if necessary, aeration or agitation is added. When the host is a genus Bacillus, the culture is usually performed at about 30 to 40 ° C. for about 6 to 24 hours, and if necessary, aeration or agitation is added.

宿主が酵母である形質転換体を培養する培地としては、たとえばバークホールダー(Burkholder)最小培地(Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 77, 4504 (1980))や0.5%(w/v)カザミノ酸を含有するSD培地(Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81, 5330 (1984))があげられる。培地のpHは約5〜8に調整するのが好ましい。培養は通常約20℃〜35℃で約24〜72時間行い、必要に応じて通気や撹拌を加える。   As a medium for cultivating a transformant whose host is yeast, for example, a Burkholder minimum medium (Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 77, 4504 (1980)) or 0.5% (w / v ) SD medium containing casamino acid (Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 81, 5330 (1984)). The pH of the medium is preferably adjusted to about 5-8. Culture is usually performed at about 20 ° C. to 35 ° C. for about 24 to 72 hours, and aeration and agitation are added as necessary.

宿主が動物細胞である形質転換体を培養する培地としては、たとえば約5〜20%(v/v)の胎児牛血清を含むMEM培地(Science, 122, 501 (1952)),DMEM培地(Virology, 8, 396 (1959))などが用いられる。pHは約6〜8であるのが好ましい。培養は通常約30℃〜40℃で約15〜60時間行い、必要に応じて通気や撹拌を加える。   As a medium for culturing a transformant whose host is an animal cell, for example, a MEM medium (Science, 122, 501 (1952)) containing about 5 to 20% (v / v) fetal calf serum, a DMEM medium (Virology) , 8, 396 (1959)). The pH is preferably about 6-8. The culture is usually performed at about 30 ° C. to 40 ° C. for about 15 to 60 hours, and aeration and agitation are added as necessary.

宿主が昆虫細胞である形質転換体を培養する培地としては、Grace's Insect Medium(Nature,195,788(1962))に非働化した10%(v/v)ウシ血清等の添加物を適宜加えたものなどが用いられる。培地のpHは約6.2〜6.4に調整するのが好ましい。培養は通常約27℃で約3〜5日間行い、必要に応じて通気や撹拌を加える。   As a medium for cultivating transformants whose host is an insect cell, an appropriate addition of an additive such as 10% (v / v) bovine serum inactivated in Grace's Insect Medium (Nature, 195, 788 (1962)) Is used. The pH of the medium is preferably adjusted to about 6.2 to 6.4. The culture is usually performed at about 27 ° C. for about 3 to 5 days, and aeration and agitation are added as necessary.

なお、本発明の低温で発現誘導可能なプロモーター配列を含有する発現ベクターが導入された形質転換体を細胞増殖させる培養温度および発現誘導させる温度は、前記した通りである。   The culture temperature for cell growth and the temperature for inducing expression of the transformant introduced with the expression vector containing the promoter sequence capable of inducing expression at low temperature of the present invention are as described above.

(本発明の融合蛋白質の分離・精製)
上記培養物から、本発明の融合蛋白質を分離・精製することによって、本発明の融合蛋白質を得ることができる。ここで、培養物とは、培養液、培養菌体もしくは培養細胞、または培養菌体もしくは培養細胞の破砕物のいずれをも意味する。本発明の融合蛋白質の分離・精製は、通常の方法に従って行うことができる。
(Separation and purification of the fusion protein of the present invention)
The fusion protein of the present invention can be obtained by separating and purifying the fusion protein of the present invention from the culture. Here, the culture means any of a culture solution, cultured cells or cultured cells, or disrupted cultured cells or cultured cells. Separation and purification of the fusion protein of the present invention can be carried out according to ordinary methods.

具体的には、本発明の融合蛋白質が培養菌体内もしくは培養細胞内に蓄積される場合には、培養後、通常の方法(例えば、超音波、リゾチーム、凍結融解など)で菌体もしくは細胞を破砕した後、通常の方法(例えば、遠心分離、ろ過など)により本発明の融合蛋白質の粗抽出液を得ることができる。本発明の融合蛋白質がペリプラズムスペース中に蓄積される場合には、培養終了後、通常の方法(例えば浸透圧ショック法など)により目的蛋白質を含む抽出液を得ることができる。本発明の融合蛋白質が培養液中に蓄積される場合には、培養終了後、通常の方法(例えば、遠心分離、ろ過など)により菌体もしくは細胞と培養上清とを分離することにより、本発明の融合蛋白質を含む培養上清を得ることができる。   Specifically, when the fusion protein of the present invention is accumulated in cultured cells or cultured cells, after culturing, the cells or cells are removed by a usual method (for example, ultrasonic, lysozyme, freeze-thaw, etc.). After crushing, a crude extract of the fusion protein of the present invention can be obtained by ordinary methods (eg, centrifugation, filtration, etc.). When the fusion protein of the present invention is accumulated in the periplasmic space, an extract containing the target protein can be obtained by an ordinary method (for example, osmotic shock method) after completion of the culture. When the fusion protein of the present invention is accumulated in the culture solution, the cells or cells and the culture supernatant are separated from each other by a conventional method (for example, centrifugation, filtration, etc.) after completion of the culture. A culture supernatant containing the fusion protein of the invention can be obtained.

このようにして得られた抽出液もしくは培養上清中に含まれる本発明の融合蛋白質の精製は、通常の分離・精製方法に従って行うことができる。分離・精製方法としては、例えば、硫酸アンモニウム沈殿、ゲルろ過クロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィー、逆相高速液体クロマトグラフィー、透析法、限外ろ過法などを単独で、または適宜組み合わせて用いることができる。本発明の融合蛋白質が上述した精製のためのアミノ酸配列を含有する場合、これを用いて精製するのが好ましい。具体的には、本発明の融合蛋白質がヒスチジンタグ配列を含有する場合にはニッケルキレートアフィニティークロマト法、S−トランストランスフェラーゼのグルタチオンへの結合ドメインを含有する場合にはグルタチオン結合ゲルによるアフィニティークロマト法を用いることができる。   Purification of the fusion protein of the present invention contained in the extract or culture supernatant thus obtained can be performed according to a conventional separation / purification method. Separation / purification methods include, for example, ammonium sulfate precipitation, gel filtration chromatography, ion exchange chromatography, affinity chromatography, reverse phase high performance liquid chromatography, dialysis, ultrafiltration, etc., alone or in appropriate combination. be able to. When the fusion protein of the present invention contains the above-described amino acid sequence for purification, it is preferably purified using this. Specifically, when the fusion protein of the present invention contains a histidine tag sequence, a nickel chelate affinity chromatography method is used, and when the fusion protein of the present invention contains a binding domain to glutathione of S-transferase, an affinity chromatography method using a glutathione binding gel is used. Can be used.

なお、本発明の目的、特徴、利点、及びそのアイデアは、本明細書の記載により、当業者には明らかであり、本明細書の記載から、当業者であれば、容易に本発明を実施できる。発明を実施するための最良の形態及び具体的な実施例などは、本発明の好ましい実施態様を示すものであり、例示又は説明のために示されているのであって、本発明をそれらに限定するものではない。本明細書で開示されている本発明の意図ならびに範囲内で、本明細書の記載に基づき、様々に修飾ができることは、当業者にとって明らかである。   The objects, features, advantages, and ideas of the present invention will be apparent to those skilled in the art from the description of the present specification, and those skilled in the art can easily implement the present invention from the description of the present specification. it can. The best mode for carrying out the invention and specific examples show preferred embodiments of the present invention and are shown for illustration or description, and the present invention is not limited thereto. Not what you want. It will be apparent to those skilled in the art that various modifications can be made based on the description of the present specification within the spirit and scope of the present invention disclosed herein.

参考例1 アポAQ発現ベクター(pCold-AQ)の構築
カルシウム結合発光蛋白質アポイクオリン(アポイクオリンを「アポAQ」と略記することがある。)をコードするイクオリン遺伝子はpAQ440(特開昭61-135586号公報参照)のコーデング領域であるHindIII-EcoRI フラグメントを含むpAM-HEよりPCR法により調製した。発現ベクターとしてpCold II ベクター(タカラバイオ社)を使用した。
pAM-HEを鋳型として2種のPCRプライマー:AQ-EcoRI-Met(5’ ccg GAA TTC ATG AAA CTT ACA TCA GAC TTC GAC AAC 3’(配列番号:27);EcoRI制限酵素部位はアンダーライン)およびAQ-C-SalI(5’ cgc gtc gac tta ggg gac agc tcc acc gta gag ctt 3’(配列番号:28);SalI制限酵素部位はアンダーライン)を用いて、PCRキット(タカラバイオ社製)にてPCR(サイクル条件25サイクル;1分/94℃、1分/50℃、1分/72℃)を実施して、所望のイクオリン遺伝子領域を増幅した。得られたDNA断片をPCR精製キット(キアゲン社製)で精製した。精製されたDNA断片を常法により制限酵素EcoRI/SalIにて消化した後、pColdIIの制限酵素EcoRI/SalI部位に連結することによって、図1に示す発現ベクターpCold-AQを構築した。なお、DNA シークエンサー(ABI社製)により塩基配列を決定することにより、インサートDNAの確認を行った。
Reference Example 1 Construction of apoAQ expression vector (pCold-AQ) The aequorin gene encoding the calcium-binding photoprotein apoaequorin (Apoaequorin may be abbreviated as “apoAQ”) is pAQ440 (Japanese Patent Laid-Open No. 61-135586). It was prepared by PCR from pAM-HE containing the HindIII-EcoRI fragment, which is a coding region of No. gazette). A pCold II vector (Takara Bio Inc.) was used as an expression vector.
Two PCR primers using pAM-HE as a template: AQ-EcoRI-Met (5 'ccg GAA TTC ATG AAA CTT ACA TCA GAC TTC GAC AAC 3' (SEQ ID NO: 27); EcoRI restriction enzyme site is underlined) and Using AQ-C-SalI (5 'cgc gtc gac tta ggg gac agc tcc acc gta gag ctt 3' (SEQ ID NO: 28); SalI restriction enzyme site is underlined), PCR kit (manufactured by Takara Bio Inc.) PCR (cycle conditions 25 cycles; 1 minute / 94 ° C., 1 minute / 50 ° C., 1 minute / 72 ° C.) was performed to amplify the desired aequorin gene region. The obtained DNA fragment was purified with a PCR purification kit (Qiagen). The purified DNA fragment was digested with restriction enzymes EcoRI / SalI by a conventional method, and then ligated to the restriction enzyme EcoRI / SalI sites of pColdII to construct the expression vector pCold-AQ shown in FIG. The insert DNA was confirmed by determining the base sequence with a DNA sequencer (manufactured by ABI).

実施例1 ZZ-アポAQ融合蛋白質発現ベクター(pCold-ZZ-AQ)の構築
大腸菌において組換えZZ−アポAQ融合蛋白質を発現させるために、ZZ遺伝子およびイクオリン遺伝子を以下に記載する方法に従って調製した。IgG結合ドメインであるZZドメインをコードする ZZ遺伝子はpEZZ18(アマシャムバイオサイエンス社)から、PCR法により調製した。アポイクオリンをコードするイクオリン遺伝子はpAQ440(特開昭61-135586号公報参照)のコーディング領域であるHindIII-EcoRI フラグメントを含むpAM-HEよりPCR法により調製した。発現ベクターとしてpCold II ベクター(タカラバイオ社)を使用した。ZZ−アポAQ融合蛋白質発現ベクターの構築法は以下の通りである。
Example 1 Construction of ZZ-Apo AQ Fusion Protein Expression Vector (pCold-ZZ-AQ) In order to express a recombinant ZZ- apo AQ fusion protein in E. coli, the ZZ gene and the aequorin gene were prepared according to the method described below. . A ZZ gene encoding a ZZ domain that is an IgG binding domain was prepared from pEZZ18 (Amersham Biosciences) by PCR. The aequorin gene encoding apoaequorin was prepared by PCR from pAM-HE containing HindIII-EcoRI fragment which is the coding region of pAQ440 (see JP-A-61-135586). A pCold II vector (Takara Bio Inc.) was used as an expression vector. A method for constructing a ZZ-ApoAQ fusion protein expression vector is as follows.

pEZZ18を鋳型として2種のPCRプライマー:
6ZZ-N-NdeI(5’ CCG CAT ATG GCG CAA CAC GAT GAA GCC GTG3’(配列番号:29);NdeI制限酵素部位はアンダーライン)および
7ZZ-C-BamHI(5’ GGC GGA TCC CGA GCT CGA ATT TGC GTC TAC3’(配列番号:30);BamHI制限酵素部位はアンダーライン)を用いて、PCRキット(タカラバイオ社製)にてPCR(サイクル条件25サイクル;1分/94℃、1分/50℃、1分/72℃)を実施して、所望のDNA領域を増幅した。得られたDNA断片をPCR精製キット(キアゲン社製)で精製した。精製されたDNA断片を常法により制限酵素NdeI/BamHIにて消化した後、参考例1で得られたpCold-AQの制限酵素NdeI/BamHI部位に連結することによって、図2に示す発現ベクターpCold-ZZ-AQを構築した。本発現ベクターは、低温で誘導可能である。発現したZZ-アポAQは、アミノ末端にヒスチジンダグを有する。
Two PCR primers using pEZZ18 as template:
6ZZ-N-NdeI (5 'CCG CAT ATG GCG CAA CAC GAT GAA GCC GTG3' (SEQ ID NO: 29); NdeI restriction enzyme site is underlined) and
PCR with 7ZZ-C-BamHI (5 ′ GGC GGA TCC CGA GCT CGA ATT TGC GTC TAC3 ′ (SEQ ID NO: 30); BamHI restriction enzyme site is underlined) with PCR kit (manufactured by Takara Bio Inc.) Cycle conditions 25 cycles; 1 min / 94 ° C., 1 min / 50 ° C., 1 min / 72 ° C.) were performed to amplify the desired DNA region. The obtained DNA fragment was purified with a PCR purification kit (Qiagen). The purified DNA fragment is digested with the restriction enzyme NdeI / BamHI by a conventional method, and then ligated to the restriction enzyme NdeI / BamHI site of pCold-AQ obtained in Reference Example 1, thereby expressing the expression vector pCold shown in FIG. -Built ZZ-AQ. This expression vector can be induced at low temperatures. The expressed ZZ-Apo AQ has a histidine doug at the amino terminus.

参考例2 hGL発現ベクター(pCold-hGL)の構築
深海コペポーダであるガウシアプリンセス由来のガウシアルシフェラーゼ蛋白質を大腸菌内で発現させるために、ガウシアルシフェラーゼ遺伝子(hGL遺伝子)を、ガウシアルシフェラーゼ遺伝子を有するpcDNA3-hGL(LUX社製)から調製した。発現ベクターとしてpCold II(タカラバイオ社製)を使用した。
ガウシアルシフェラーゼ遺伝子を有するpcDNA3-hGL(LUX社製)を鋳型として2種のPCRプライマー:
GL5-N/SacI(5’ gcc GAG CTC AAG CCC ACC GAG AAC AAC GAA 3’(配列番号:31);SacI制限酵素部位はアンダーライン)およびGL2-C/EcoRI(5’gcc GAA TTC TTA GTC ACC ACC GGC CCC CTT 3’(配列番号:32);EcoRI制限酵素部位はアンダーライン)を用いて、PCRキット(タカラバイオ社製)にてPCR(サイクル条件25サイクル;1分/94℃、1分/50℃、1分/72℃)を実施して、所望のDNA領域を増幅した。得られた断片をPCR精製キット(キアゲン社製)で精製し、常法により制限酵素SacI/EcoRIにて消化した後、pColdIIの制限酵素SacI/EcoRI部位に連結することによって、図3に示す発現ベクターpCold-hGLを構築した。
Reference Example 2 Construction of hGL expression vector (pCold-hGL) In order to express Gaussia luciferase protein derived from Gausia Princess, a deep-sea co-poda in Escherichia coli, Gaussia luciferase gene (hGL gene) PcDNA3-hGL (manufactured by LUX). PCold II (Takara Bio Inc.) was used as an expression vector.
Two kinds of PCR primers using pcDNA3-hGL (manufactured by LUX) having Gaussia luciferase gene as a template:
GL5-N / SacI (5 'gcc GAG CTC AAG CCC ACC GAG AAC AAC GAA 3' (SEQ ID NO: 31); SacI restriction enzyme site is underlined) and GL2-C / EcoRI (5 'gcc GAA TTC TTA GTC ACC ACC GGC CCC CTT 3 '(SEQ ID NO: 32); EcoRI restriction enzyme site is underlined, PCR with PCR kit (manufactured by Takara Bio Inc.) (cycle conditions 25 cycles; 1 minute / 94 ° C, 1 minute) / 50 ° C., 1 minute / 72 ° C.) to amplify the desired DNA region. The resulting fragment is purified with a PCR purification kit (Qiagen), digested with restriction enzymes SacI / EcoRI by a conventional method, and then ligated to the restriction enzyme SacI / EcoRI sites of pColdII to obtain the expression shown in FIG. The vector pCold-hGL was constructed.

実施例2 ZZ-hGL発現ベクター(pCold-ZZ-hGL)の構築
大腸菌において組換えZZ-hGL融合蛋白質を発現させるために、ZZ遺伝子およびガウシアルシフェラーゼ遺伝子を以下に記載する方法に従って調製した。IgG結合ドメインであるZZドメインをコードする ZZ遺伝子は、ZZ遺伝子を有するpEZZ18(アマシャムバイオサイエンス社)から、PCR法により調製した。ガウシアルシフェラーゼ遺伝子(hGL遺伝子)は、ガウシアルシフェラーゼ遺伝子を有するpcDNA3-hGL(LUX社製)から、PCR法により調製した。発現ベクターとしては、pCold II(タカラバイオ社)を使用した。
pcDNA3-hGLを鋳型として2種のPCRプライマー:GL6-N/EcoRI(5’ gcc GAA TTC AAG CCC ACC GAG AAC AAC GAA 3’(配列番号:33);EcoRI制限酵素部位はアンダーライン)およびGL-C/XbaI(5’ gcc TCT AGA TTA GTC ACC ACC GGC CCC CTT 3’(配列番号:34);XbaI制限酵素部位はアンダーライン)を用いて、PCRキット(タカラバイオ社製)にてPCR(サイクル条件25サイクル;1分/94℃、1分/50℃、1分/72℃)を実施して、所望のDNA領域を増幅した。得られた断片をPCR精製キット(キアゲン社製)で精製し、常法により制限酵素EcoRI/XbaIにて消化した後、pCold-ZZ-AQの制限酵素EcoRI/XbaI部位に連結することによって、図4に示す発現ベクターpCold-ZZ-hGLを構築した。
Example 2 Construction of ZZ-hGL Expression Vector (pCold-ZZ-hGL) In order to express a recombinant ZZ-hGL fusion protein in E. coli, a ZZ gene and a Gaussia luciferase gene were prepared according to the method described below. The ZZ gene encoding the ZZ domain, which is an IgG binding domain, was prepared by PCR from pEZZ18 (Amersham Bioscience) having the ZZ gene. Gaussia luciferase gene (hGL gene) was prepared from pcDNA3-hGL (manufactured by LUX) having Gaussia luciferase gene by PCR. PCold II (Takara Bio Inc.) was used as an expression vector.
pcDNA3-hGL as a template, two PCR primers: GL6-N / EcoRI (5 'gcc GAA TTC AAG CCC ACC GAG AAC AAC GAA 3' (SEQ ID NO: 33); EcoRI restriction enzyme site is underlined) and GL- PCR with C / XbaI (5 'gcc TCT AGA TTA GTC ACC ACC GGC CCC CTT 3' (SEQ ID NO: 34); XbaI restriction enzyme site is underlined) with PCR kit (Takara Bio) Conditions 25 cycles; 1 min / 94 ° C., 1 min / 50 ° C., 1 min / 72 ° C.) were performed to amplify the desired DNA region. The resulting fragment was purified with a PCR purification kit (Qiagen), digested with restriction enzymes EcoRI / XbaI by a conventional method, and then ligated to the restriction enzyme EcoRI / XbaI sites of pCold-ZZ-AQ. The expression vector pCold-ZZ-hGL shown in 4 was constructed.

参考例3 KAZ発現ベクター(pCold-KAZ)の構築
深海エビであるヒメヒオドシエビ由来のエビルシフェラーゼの触媒ユニットである19kDa蛋白質(KAZ)を大腸菌内で発現させるために、19kDa蛋白質コードする遺伝子(KAZ遺伝子)をpHis-KAZ(Inouye et al. FEBS Lett. 2000:481、19-25)から調製した。発現ベクターとしてpCold II(タカラバイオ社製)を使用した。
pHis-KAZを鋳型として2種のPCRプライマー:
KAZ-17N/NdeI(5’ gcg CAT ATG TTT ACG TTG GCA GAT TTC GTT 3’(配列番号:35);NdeI制限酵素部位はアンダーライン)およびKAZ-12C/EcoRI(5’ cgc GAA TTC TTA GGC AAG AAT GTT CTC GCA AAG CCT 3’(配列番号:36);EcoRI制限酵素部位はアンダーライン)を用いて、PCRキット(タカラバイオ社製)にてPCR(サイクル条件25サイクル;1分/94℃、1分/50℃、1分/72℃)を実施して、所望のDNA領域を増幅した。得られた断片をPCR精製キット(キアゲン社製)で精製し、常法により制限酵素NdeI/EcoRIにて消化した後、pColdIIの制限酵素NdeI/EcoRI部位に連結することによって、図5に示す発現ベクターpCold-KAZを構築した。
Reference Example 3 Construction of KAZ expression vector (pCold-KAZ) A 19 kDa protein-encoding gene (KAZ gene) is used to express a 19 kDa protein (KAZ), which is a catalytic unit of Evil luciferase derived from the deep-sea shrimp, Hime Shido shrimp, in Escherichia coli. Was prepared from pHis-KAZ (Inouye et al. FEBS Lett. 2000: 481, 19-25). PCold II (Takara Bio Inc.) was used as an expression vector.
Two PCR primers using pHis-KAZ as template:
KAZ-17N / NdeI (5 'gcg CAT ATG TTT ACG TTG GCA GAT TTC GTT 3' (SEQ ID NO: 35); NdeI restriction enzyme site is underlined) and KAZ-12C / EcoRI (5 'cgc GAA TTC TTA GGC AAG AAT GTT CTC GCA AAG CCT 3 ′ (SEQ ID NO: 36); EcoRI restriction enzyme site is underlined, PCR with PCR kit (manufactured by Takara Bio Inc.) (cycle conditions 25 cycles; 1 minute / 94 ° C., 1 min / 50 ° C., 1 min / 72 ° C.) to amplify the desired DNA region. The resulting fragment was purified with a PCR purification kit (Qiagen), digested with the restriction enzyme NdeI / EcoRI by a conventional method, and then ligated to the restriction enzyme NdeI / EcoRI site of pColdII to obtain the expression shown in FIG. The vector pCold-KAZ was constructed.

実施例3 ZZ-KAZ発現ベクター(pCold-ZZ-KAZ)の構築
大腸菌において組換えZZ-KAZ融合蛋白質を発現させるために、ZZ遺伝子およびKAZ遺伝子を以下に記載する方法に従って調製した。IgG結合ドメインであるZZドメインをコードする ZZ遺伝子は、ZZ遺伝子を有するpEZZ18(アマシャムバイオサイエンス社)から、PCR法により調製した。エビ由来のルシフェラーゼ遺伝子は、エビ由来のルシフェラーゼ遺伝子を有するpHis-KAZ(Inouye et al. FEBS Lett. 2000:481、19-25)から、PCR法により調製した。発現ベクターとしては、pCold II 発現ベクター(タカラバイオ社)を用いた。
pHis-KAZ-NXを鋳型として2種のPCRプライマー:KAZ-8N/EcoRI(5’ gcg GAA TTC TTT ACG TTG GCA GAT TTC GTT GGA 3’(配列番号:37);EcoRI制限酵素部位はアンダーライン)およびKAZ-5C/XbaI(5’ cc gcT CTA GAA TTA GGC AAG AAT GTT CTC GCA AAG-CCT 3’(配列番号:38);XbaI制限酵素部位はアンダーライン)を用いて、PCRキット(タカラバイオ社製)にてPCR(サイクル条件25サイクル;1分/94℃、1分/50℃、1分/72℃)を実施して、所望のDNA領域を増幅した。得られた断片をPCR精製キット(キアゲン社製)で精製し、常法により制限酵素EcoRI/XbaIにて消化した後、pCold-ZZ-AQの制限酵素EcoRI/XbaI部位に連結することによって、図6に示す発現ベクターpCold-ZZ-KAZを構築した。
Example 3 Construction of ZZ-KAZ Expression Vector (pCold-ZZ-KAZ) In order to express a recombinant ZZ-KAZ fusion protein in E. coli, the ZZ gene and KAZ gene were prepared according to the method described below. The ZZ gene encoding the ZZ domain, which is an IgG binding domain, was prepared by PCR from pEZZ18 (Amersham Bioscience) having the ZZ gene. The shrimp-derived luciferase gene was prepared by PCR from pHis-KAZ (Inouye et al. FEBS Lett. 2000: 481, 19-25) having a shrimp-derived luciferase gene. As an expression vector, a pCold II expression vector (Takara Bio Inc.) was used.
Two PCR primers with pHis-KAZ-NX as template: KAZ-8N / EcoRI (5 'gcg GAA TTC TTT ACG TTG GCA GAT TTC GTT GGA 3' (SEQ ID NO: 37); EcoRI restriction enzyme site is underlined) And KAZ-5C / XbaI (5 ′ cc gc T CTA GA A TTA GGC AAG AAT GTT CTC GCA AAG-CCT 3 ′ (SEQ ID NO: 38); XbaI restriction enzyme site is underlined) PCR (cycle condition 25 cycles; 1 minute / 94 ° C., 1 minute / 50 ° C., 1 minute / 72 ° C.) was carried out by Bio Inc., and the desired DNA region was amplified. The resulting fragment was purified with a PCR purification kit (Qiagen), digested with restriction enzymes EcoRI / XbaI by a conventional method, and then ligated to the restriction enzyme EcoRI / XbaI sites of pCold-ZZ-AQ. The expression vector pCold-ZZ-KAZ shown in FIG. 6 was constructed.

実施例4 pCold-ZZ-T-hGLおよびpCold-ZZ-P-hGLの発現ベクターの構築
実施例2で示したZZ融合hGL蛋白質よりZZ蛋白質部分を切断除去するための、融合部分にトロンビンまたはヒトレノウイルス3Cプロテアーゼ切断部位持つ2種のベクター、pCold-ZZ-T-hGLまたはpCold-ZZ-P-hGL、を以下の通り構築した。
実施例2で得たpCold-ZZ-hGL を制限酵素BamHI/EcoRI で消化後、プロテアーゼ切断部位配列相当部分のオリゴヌクレオチドを合成し挿入した。トロンビン切断認識配列オリゴヌクレオチドとしては、Thronbin B/E-F 5’ GA TCT CTG GTT CCG CGT GGA TCC G 3’(配列番号:39)および Thrombin B/E-R 5’ AA TTC GGA TCC ACG CGG AAC CAG A 3’(配列番号:40)を用いた。ヒトレノウイルス3Cプロテアーゼ切断認識配列オリゴヌクレオチドとしては、 PreScission B/E-F 5’ GA TCT CTG GAA GTT CTG TTC CAG GGG CCC G 3’(配列番号:41)及び PreScission B/E-R5’ AA TTC GGG CCC CTG GAA CAG AAC TTC CAG A 3’(配列番号:42)を用いた。これらのオリゴヌクレオチドをアニーリングさせ、常法により実施例2で得た発現ベクターpCold-ZZ-hGL のBamHI/EcoRIにより挿入して、図7に示す発現ベクターpCold-ZZ-T-hGLまたは図8に示す発現ベクターpCold-ZZ-P-hGLを構築した。
Example 4 Construction of pCold-ZZ-T-hGL and pCold-ZZ-P-hGL Expression Vectors Thrombin or human in the fusion part for cleaving and removing the ZZ protein part from the ZZ fusion hGL protein shown in Example 2 Two vectors having a renovirus 3C protease cleavage site, pCold-ZZ-T-hGL or pCold-ZZ-P-hGL, were constructed as follows.
After digesting pCold-ZZ-hGL obtained in Example 2 with restriction enzymes BamHI / EcoRI, an oligonucleotide corresponding to the protease cleavage site sequence was synthesized and inserted. Thrombin B / EF 5 ′ GA TCT CTG GTT CCG CGT GGA TCC G 3 ′ (SEQ ID NO: 39) and Thrombin B / ER 5 ′ AA TTC GGA TCC ACG CGG AAC CAG A 3 ′ (SEQ ID NO: 40) was used. Human renovirus 3C protease cleavage recognition sequence oligonucleotides include PreScission B / EF 5 ′ GA TCT CTG GAA GTT CTG TTC CAG GGG CCC G 3 ′ (SEQ ID NO: 41) and PreScission B / E-R5 ′ AA TTC GGG CCC CTG GAA CAG AAC TTC CAG A 3 ′ (SEQ ID NO: 42) was used. These oligonucleotides were annealed and inserted into the expression vector pCold-ZZ-T-hGL shown in FIG. 7 or the expression vector pCold-ZZ-T-hGL shown in FIG. The expression vector pCold-ZZ-P-hGL shown was constructed.

実施例5 組換えZZ-アポAQ融合蛋白質の調製法
組換えZZ−アポAQ融合蛋白質の調製は、以下に記載するように、組換えZZ−アポAQ融合蛋白質を大腸菌で発現させた後、発現された該融合蛋白質を抽出し、抽出した該融合蛋白質を各種クロマトグラフ法を用いて精製することによって行った。
なお、精製過程における融合蛋白質の発光活性の測定は、以下のようにして行った。まず、10 mM EDTA を含む50mM Tris-HCl (pH7.6)の緩衝液1ml 中で、粗ZZ−アポAQ融合蛋白質溶液、2-メルカプトエタノール(1μl)、エタノールに溶解した基質セレンテラジン(1μg/μl)を混合した後、氷上(4℃)で2時間放置することにより発光活性を持つZZ−AQ融合蛋白質を調製した。得られたZZ−AQ融合蛋白質溶液に50mM CaCl2 100μlを加えることにより発光反応を開始させ、発光測定装置PSN AB2200(アトー社製)で10秒間発光活性の測定を行った。発光活性(最大値(Imax)など)は、相対発光強度(rlu)で評価した。
Example 5 Preparation Method of Recombinant ZZ-Apo AQ Fusion Protein Recombinant ZZ-apo AQ fusion protein was prepared by expressing recombinant ZZ-apo AQ fusion protein after expression in E. coli as described below. The extracted fusion protein was extracted, and the extracted fusion protein was purified using various chromatographic methods.
The measurement of the luminescence activity of the fusion protein during the purification process was performed as follows. First, in 1 ml of 50 mM Tris-HCl (pH 7.6) buffer containing 10 mM EDTA, a crude ZZ-apo AQ fusion protein solution, 2-mercaptoethanol (1 μl), and a substrate coelenterazine dissolved in ethanol (1 μg / μl) ) And then left on ice (4 ° C.) for 2 hours to prepare a ZZ-AQ fusion protein having luminescence activity. Luminescence reaction was started by adding 100 μl of 50 mM CaCl 2 to the obtained ZZ-AQ fusion protein solution, and luminescence activity was measured for 10 seconds with a luminescence measuring device PSN AB2200 (manufactured by ATTO). Luminescent activity (maximum value (Imax) etc.) was evaluated by relative luminescence intensity (rlu).

1) 組換えZZ−アポAQ融合蛋白質の大腸菌での発現
実施例1で得た発現ベクターpCold-ZZ-AQをポリエチレングリコール法により大腸菌BL21株に導入し、形質転換株を得た。得られた形質転換株を37℃で18時間培養した。培養後、その形質転換株をアンピシリン(100μg/ml)を含有する10mlのLB液体培地(水1リットルあたり、バクトトリプトン10g、イーストエクストラクト5g、塩化ナトリウム5g、pH7.2)に植菌し、さらに37℃で18時間培養を行った。次いで、その培養菌体液を新たなLB液体培地2リットル(400mlx5本)に添加して、37℃で4.5時間培養した。培養後、その培養菌体液を氷水上で冷却して、イソプロピル-β-D(−)-チオガラクトピラノシド(IPTG、和光純薬工業社製)を最終濃度0.1mMになるように培養液に添加し、15℃にて17時間培養を行った。培養菌体を、冷却遠心機により5分間、5,000rpm(6000×g)で集菌した。
1) Expression of recombinant ZZ-apo AQ fusion protein in Escherichia coli The expression vector pCold-ZZ-AQ obtained in Example 1 was introduced into the Escherichia coli BL21 strain by the polyethylene glycol method to obtain a transformed strain. The obtained transformant was cultured at 37 ° C. for 18 hours. After culturing, the transformed strain is inoculated into 10 ml of LB liquid medium (10 g of bactotryptone, 5 g of yeast extract, 5 g of sodium chloride, pH 7.2 per liter of water) containing ampicillin (100 μg / ml). The culture was further performed at 37 ° C. for 18 hours. Subsequently, the cultured bacterial cell solution was added to 2 liters of fresh LB liquid medium (400 ml × 5) and cultured at 37 ° C. for 4.5 hours. After culturing, the cultured bacterial solution is cooled on ice water, and isopropyl-β-D (−)-thiogalactopyranoside (IPTG, manufactured by Wako Pure Chemical Industries, Ltd.) is cultured to a final concentration of 0.1 mM. And cultured at 15 ° C. for 17 hours. The cultured cells were collected at 5,000 rpm (6000 × g) for 5 minutes using a cooling centrifuge.

2) 培養菌体からのZZ−アポAQ融合蛋白質の抽出
上記1)で集菌した菌体を200 ml(40mlx5本)の50mM Tris-HCl (pH7.6)で懸濁し、氷冷下で超音波破砕処理(ブランソン社製、ソニファイアーモデル250)を各2分間、3回行った。その菌体破砕液を10,000rpm(12,000×g)で20分間遠心分離後、得られた溶解性画分をZZ−アポAQ融合蛋白質精製の出発材料とした。
2) Extraction of ZZ-ApoAQ fusion protein from cultured cells Suspend the cells collected in 1) above in 200 ml (40 ml x 5) 50 mM Tris-HCl (pH 7.6). Sonication treatment (Branson, Sonifier Model 250) was performed 3 times for 2 minutes each. The cell disruption solution was centrifuged at 10,000 rpm (12,000 × g) for 20 minutes, and the obtained soluble fraction was used as a starting material for purifying the ZZ-apo AQ fusion protein.

3) Q-セファロースカラムクロマトグラフ法によるZZ−アポAQ融合蛋白質の精製
上記2)で得られた溶解性画分(200 ml)を、50mM Tris-HCl (pH7.6)で平衡化したQ-セファロースカラム(アマシャムバイオサイエンス社、カラムサイズ:直径2.5×6cm)に添加して吸着させた後、カラムを250 mlの50mM Tris-HCl (pH7.6)で洗浄した。カラムに吸着した蛋白質を全量100mlで、塩化ナトリウム濃度0〜1.0Mの直線濃度勾配により溶出した。塩化ナトリウム濃度0.45〜0.65Mにて発光活性を有するZZ−アポAQ融合蛋白質の溶出が確認された(25 ml;ZZ−アポAQ活性画分)。
3) Purification of ZZ-ApoAQ fusion protein by Q-Sepharose column chromatography The soluble fraction (200 ml) obtained in 2) above was equilibrated with 50 mM Tris-HCl (pH 7.6). After adding and adsorbing to a Sepharose column (Amersham Biosciences, column size: diameter 2.5 × 6 cm), the column was washed with 250 ml of 50 mM Tris-HCl (pH 7.6). The protein adsorbed on the column was eluted in a total volume of 100 ml with a linear concentration gradient with a sodium chloride concentration of 0 to 1.0 M. Elution of ZZ-apo AQ fusion protein having luminescence activity was confirmed at a sodium chloride concentration of 0.45 to 0.65 M (25 ml; ZZ-apo AQ activity fraction).

4) ニッケルキレートカラムクロマトグラフ法によるZZ−アポAQ融合蛋白質の精製
Q-セファロースカラムから溶出したZZ−アポAQ活性画分を、50mM Tris-HCl (pH7.6)で平衡化したニッケルキレートカラム(アマシャムバイオサイエンス社、カラムサイズ:直径1.5×5cm)に添加してZZ−アポAQ融合蛋白質を吸着させた。吸着したZZ−アポAQ融合蛋白質を、全量100mlで、イミダゾール濃度0〜0.3M(和光純薬工業社製)の直線濃度勾配により溶出した。イミダゾール濃度0.06〜0.12Mにて、発光活性を有するZZ−アポAQ融合蛋白質の溶出が確認された(26 ml;ZZ−アポAQ活性画分)。
4) Purification of ZZ-Apo AQ fusion protein by nickel chelate column chromatography
The ZZ-ApoAQ active fraction eluted from the Q-Sepharose column was added to a nickel chelate column (Amersham Biosciences, column size: diameter 1.5 × 5 cm) equilibrated with 50 mM Tris-HCl (pH 7.6). A ZZ-apo AQ fusion protein was adsorbed. The adsorbed ZZ-Apo AQ fusion protein was eluted with a linear concentration gradient having an imidazole concentration of 0 to 0.3 M (manufactured by Wako Pure Chemical Industries, Ltd.) in a total volume of 100 ml. The elution of the ZZ-apo AQ fusion protein having luminescence activity was confirmed at an imidazole concentration of 0.06 to 0.12 M (26 ml; ZZ-apo AQ activity fraction).

5) IgG-セファロースカラムクロマトグラフ法によるZZ−アポAQ融合蛋白質の精製
ニッケルキレートカラムから溶出したZZ−アポAQ活性画分の一部を、アミコンウルトラ-4 遠心フィルターデバイス(分子量10,000カット;ミリポア社製)を用いて濃縮した。濃縮した溶液4mlを、IgG-セファロース 6FastFlowカラム(アマシャムバイオサイエンス社、カラムサイズ:直径1.5×4cm)に添加して、ZZ−アポAQ融合蛋白質を吸着させた。吸着したZZ−アポAQ融合蛋白質を、0.5Mの酢酸アンモニウム(pH3.4)(和光純薬工業社製)にて溶出した。
12%SDS-ポリアクリルアミド電気泳動法により、図9に示すように純度は95%以上であることを確認した。
精製の収率を、表1にまとめた。IgGセファロースカラムにより、培養液420ml相当から純度95%以上で7.8mgの精製ZZ−アポAQを得た。

Figure 2008099669
5) Purification of ZZ-ApoAQ fusion protein by IgG-Sepharose column chromatography A portion of the ZZ-ApoAQ active fraction eluted from the nickel chelate column was subjected to Amicon Ultra-4 centrifugal filter device (molecular weight 10,000 cut; Concentrated using Millipore). 4 ml of the concentrated solution was added to an IgG-Sepharose 6 FastFlow column (Amersham Biosciences, column size: diameter 1.5 × 4 cm) to adsorb the ZZ-Apo AQ fusion protein. The adsorbed ZZ-Apo AQ fusion protein was eluted with 0.5 M ammonium acetate (pH 3.4) (manufactured by Wako Pure Chemical Industries, Ltd.).
The purity was confirmed to be 95% or more by 12% SDS-polyacrylamide electrophoresis as shown in FIG.
The purification yields are summarized in Table 1. By using an IgG Sepharose column, purified ZZ-Apo AQ having a purity of 95% or more and 7.8 mg was obtained from 420 ml of the culture solution.
Figure 2008099669

実施例6 ZZ−AQ融合蛋白質の調製法
ZZ−アポAQ融合蛋白質からZZ−AQ融合蛋白質への変換は、以下の条件で行った。
実施例5で得た精製ZZ−アポAQ融合蛋白質(1mg)を10mM DTTおよび、10mM EDTAを含む50mM Tris-HCl (pH7.6) 5mlに溶解し、エタノールに溶解した1.2倍当量のセレンテラジン 24μgを加え、4℃で一昼夜放置し、ZZ−AQ融合蛋白質へと変換した。得られたZZ−AQ融合蛋白質は、アミコンウルトラ-4(分子量10,000カット)で濃縮後、10mM EDTAを含む50mM Tris-HCl (pH7.6) 8ml(2mlで4回)で洗浄し、余剰のセレンテラジンを除いた。活性の回収率95%でZZ−AQ融合蛋白質を得た。
Example 6 Preparation Method of ZZ-AQ Fusion Protein Conversion from ZZ-Apo AQ fusion protein to ZZ-AQ fusion protein was performed under the following conditions.
The purified ZZ-ApoAQ fusion protein (1 mg) obtained in Example 5 was dissolved in 5 ml of 50 mM Tris-HCl (pH 7.6) containing 10 mM DTT and 10 mM EDTA, and 24 μg of 1.2-fold equivalent coelenterazine dissolved in ethanol was dissolved. In addition, it was left overnight at 4 ° C. and converted into a ZZ-AQ fusion protein. The obtained ZZ-AQ fusion protein was concentrated with Amicon Ultra-4 (molecular weight 10,000 cut), washed with 8 ml of 50 mM Tris-HCl (pH 7.6) containing 10 mM EDTA (4 times 2 ml), and excess coelenterazine. Was excluded. A ZZ-AQ fusion protein was obtained with an activity recovery rate of 95%.

実施例7 組換え蛋白質の発酵活性の測定
(1)組換え蛋白質の大腸菌での発現
ZZ融合蛋白質発現ベクター(pCold-ZZ-AQ、pCold-ZZ-hGL、pCold-ZZ-KAZ)またはZZ非融合蛋白質発現ベクター(pCold-AQ、pCold-hGL、pCold-KAZ)をポリエチレングリコール法により宿主大腸菌BL21株に導入し、形質転換体を得た。得られた形質転換株をアンピシリン(100μg/ml)を含有する10mlのLB液体培地(水1リットルあたり、バクトトリプトン10g、イーストエクストラクト5g、塩化ナトリウム5g、pH7.2)(本実施例中の以下すべての培養に関しても、同様にLB液体培地を用いた)に植菌し、さらに37℃で18時間培養を行った。次いで、その培養菌体液を新たなLB液体培地10mlに添加して、37℃で4.5時間培養した。培養後、その培養液を氷水上で冷却して、イソプロピル-β-D(−)-チオガラクトピラノシド(IPTG、和光純薬工業社製)を最終濃度0.1mMになるように培養液に添加し、15℃にて17時間培養を行った。培養菌体1mlを、冷却遠心機により5分間、5,000rpm(6000×g)で集菌した。
Example 7 Measurement of fermentation activity of recombinant protein (1) Expression of recombinant protein in Escherichia coli
ZZ fusion protein expression vector (pCold-ZZ-AQ, pCold-ZZ-hGL, pCold-ZZ-KAZ) or ZZ non-fusion protein expression vector (pCold-AQ, pCold-hGL, pCold-KAZ) hosted by polyethylene glycol method The product was introduced into E. coli BL21 strain to obtain a transformant. The obtained transformant was treated with 10 ml of LB liquid medium containing ampicillin (100 μg / ml) (10 g of bactotryptone, 5 g of yeast extract, 5 g of sodium chloride, pH 7.2 per liter of water) (in this example) All the following cultures were similarly inoculated into LB liquid medium) and further cultured at 37 ° C. for 18 hours. Subsequently, the cultured bacterial cell solution was added to 10 ml of a new LB liquid medium and cultured at 37 ° C. for 4.5 hours. After culturing, the culture solution is cooled on ice water, and isopropyl-β-D (−)-thiogalactopyranoside (IPTG, manufactured by Wako Pure Chemical Industries, Ltd.) is added to the culture solution to a final concentration of 0.1 mM. The mixture was added and cultured at 15 ° C. for 17 hours. 1 ml of the cultured cells was collected at 5,000 rpm (6000 × g) for 5 minutes by a cooling centrifuge.

(2)培養菌体からの組換え蛋白質の抽出
集菌した菌体を1mlの10 mM EDTA を含む50mM Tris-HCl (pH7.6)で懸濁し、氷冷下で超音波破砕処理(ブランソン社製、ソニファイアーモデル250)を30秒行った。その菌体破砕液を10,000rpm(12,000×g)で3分間遠心分離し、上清を可溶性画分として使用した。次いで、沈殿を10mM EDTAを含む50mM Tris-HCl (pH7.6)1mlに懸濁し、不溶性画分として使用した。
(2) Extraction of recombinant protein from cultured cells The collected cells are suspended in 50 mM Tris-HCl (pH 7.6) containing 1 ml of 10 mM EDTA, and subjected to ultrasonic crushing treatment with ice cooling (Branson) Made by Sonifire Model 250) for 30 seconds. The cell disruption solution was centrifuged at 10,000 rpm (12,000 × g) for 3 minutes, and the supernatant was used as a soluble fraction. Next, the precipitate was suspended in 1 ml of 50 mM Tris-HCl (pH 7.6) containing 10 mM EDTA and used as an insoluble fraction.

(3−1)発光蛋白質イクオリンの発光活性の測定
上記(2)で得た可溶性画分および不溶性画分50μlを0.95mlの10 mM EDTA を含む50mM Tris-HCl (pH7.6)に溶解し、2-メルカプトエタノール(1μl)、エタノールに溶解した基質セレンテラジン(1μg/μl)を混合した後、アポイクオリン画分を添加し、氷上(4℃)で2時間放置することにより発光活性を持つイクオリンに再生させた。再生イクオリン1μlにCaCl2100μlを加えることにより発光反応を開始させ、発光測定装置Luminescencer-PSN AB2200(アトー社製)で10秒間発光活性を測定した。発光活性は、前記した発光活性の測定を3回行い、発光活性の最大値(Imax)の平均値(rlu)で評価した。
(3-1) Measurement of luminescent activity of photoprotein aequorin 50 μl of the soluble fraction and insoluble fraction obtained in (2) above were dissolved in 50 mM Tris-HCl (pH 7.6) containing 0.95 ml of 10 mM EDTA, After mixing 2-mercaptoethanol (1 μl) and the substrate coelenterazine (1 μg / μl) dissolved in ethanol, add the apoaequorin fraction and leave it on ice (4 ° C.) for 2 hours to obtain aequorin with luminescent activity Regenerated. Luminescence reaction was started by adding 100 μl of CaCl 2 to 1 μl of regenerated aequorin, and the luminescence activity was measured for 10 seconds with a luminescence measuring device Luminescencer-PSN AB2200 (manufactured by ATTO). Luminescent activity was evaluated by the average value (rlu) of the maximum value (Imax) of luminescent activity after measuring the above-mentioned luminescent activity three times.

(3−2)エビルシフェラーゼの発光活性の測定
上記(2)で得た可溶性画分および不溶性画分1μlを0.1mlの10 mM EDTA を含む50mM Tris-HCl (pH7.6)に溶解し、エタノールに溶解した基質セレンテラジン(1μg/μl)を混合して発光反応を開始させ、発光測定装置Luminescencer-PSN AB2200(アトー社製)で60秒間発光活性を測定した。発光活性は、前記した発光活性の測定を3回行い、発光活性の最大値(Imax)の平均値(rlu)で評価した。
(3-2) Measurement of luminescence activity of Evil luciferase 1 μl of the soluble fraction and the insoluble fraction obtained in (2) above were dissolved in 50 mM Tris-HCl (pH 7.6) containing 0.1 ml of 10 mM EDTA, and ethanol was added. The substrate coelenterazine (1 μg / μl) dissolved in was mixed to start the luminescence reaction, and the luminescence activity was measured for 60 seconds with a luminescence measuring device Luminescencer-PSN AB2200 (manufactured by Ato). Luminescent activity was evaluated by the average value (rlu) of the maximum value (Imax) of luminescent activity after measuring the above-mentioned luminescent activity three times.

(3−3)ガウシアルシフェラーゼの発光活性の測定
上記(2)で得た可溶性画分および不溶性画分1μlを0.1mlの10 mM EDTA を含む50mM Tris-HCl (pH7.6)に溶解し、エタノールに溶解した基質セレンテラジン(1μg/μl)を混合して発光反応を開始させ、発光測定装置Luminescencer-PSN AB2200(アトー社製)で60秒間発光活性を測定した。発光活性は、前記した発光活性の測定を3回行い、発光活性の最大値(Imax)の平均値(rlu)で評価した。
その結果を表2に示す。異種蛋白質を大腸菌内で発現させる場合、ZZ融合蛋白質として発現する方が、可溶性率が明らかに高い。

Figure 2008099669
(3-3) Measurement of luminous activity of Gaussia luciferase 1 μl of the soluble fraction and the insoluble fraction obtained in (2) above was dissolved in 50 mM Tris-HCl (pH 7.6) containing 0.1 ml of 10 mM EDTA, The substrate coelenterazine (1 μg / μl) dissolved in ethanol was mixed to start the luminescence reaction, and the luminescence activity was measured for 60 seconds with a luminescence measuring device Luminescencer-PSN AB2200 (manufactured by Ato). Luminescent activity was evaluated by the average value (rlu) of the maximum value (Imax) of luminescent activity after measuring the above-mentioned luminescent activity three times.
The results are shown in Table 2. When a heterologous protein is expressed in E. coli, the solubility is clearly higher when expressed as a ZZ fusion protein.
Figure 2008099669

アポイクオリン(アポAQ)は、分子内にシステイン残基が3カ所存在しする。大腸菌内での発現では、通常温度(37℃)で発現した場合、アポイクオリンは不溶性蛋白質として発現する。可溶化には、変性剤を使用することが必要である。しかし、ZZ融合蛋白質として発現させると、ZZ-アポAQは可溶性であり且つ発光活性を持つイクオリンへ変化させること(再生)が可能であった。また、pCold-AQにおける不溶性画分は、低温で発現させた場合、変性剤無しで約30%強が、イクオリンへの再生が可能であった。
さらに、ガウシアルシフェラーゼ(hGL)はその分子内にシステイン残基が10カ所存在する。天然のガウシアルシフェラーゼは、還元剤処理によりその発光活性が完全に失活することが知れている。また、ガウシアルシフェラーゼは、大腸菌内でのリホールディングの効率が悪いことが知られている。しかし、ZZ融合蛋白質として発現させると、ZZ非融合蛋白質発現系に比べ約5倍のリホールディングの効率があがることが示された。また、低温で培養することによって、リホールディングの効率があがる場合もあることも示唆された。
一方、エビルシフェラーゼ(KAZ)を大腸菌内で発現させた場合は、既報(Inouye et al. FEBS Lett. 2000:481、19-25)にあるように、不溶性蛋白質として発現し、大腸菌の粗抽出物の発光活性は非常に低い。しかし、ZZ融合蛋白質として発現させたKAZは、可溶性であり且つ発光活性を有することが明らかとなった。
Apoaequorin (apo AQ) has three cysteine residues in the molecule. In expression in E. coli, apoaequorin is expressed as an insoluble protein when expressed at normal temperature (37 ° C.). It is necessary to use a denaturing agent for solubilization. However, when expressed as a ZZ fusion protein, ZZ-apoAQ was soluble and could be changed (regenerated) to aequorin having luminescent activity. In addition, the insoluble fraction in pCold-AQ, when expressed at a low temperature, was about 30% more without a denaturant and could be regenerated into aequorin.
Furthermore, Gaussia luciferase (hGL) has 10 cysteine residues in the molecule. Natural Gaussia luciferase is known to have its luminescence activity completely inactivated by treatment with a reducing agent. Gaussia luciferase is known to have poor refolding efficiency in E. coli. However, when expressed as a ZZ fusion protein, it was shown that the refolding efficiency was about 5 times higher than that of the ZZ non-fusion protein expression system. It was also suggested that refolding efficiency may be improved by culturing at low temperature.
On the other hand, when Evil luciferase (KAZ) is expressed in E. coli, it is expressed as an insoluble protein as described in (Inouye et al. FEBS Lett. 2000: 481, 19-25). The luminescence activity of is very low. However, it was revealed that KAZ expressed as a ZZ fusion protein is soluble and has luminescent activity.

実施例8 組換え蛋白質のSDS−PAGE分析
(1)組換え蛋白質の大腸菌での発現
ZZ融合蛋白質発現ベクター(pCold-ZZ-AQ、pCold-ZZ-hGL、pCold-ZZ-KAZ、pCold-ZZ-T-hGL、pCold-ZZ-P-hGL)またはZZ非融合蛋白質発現ベクター(pCold-AQ、pCold-hGL、pCold-KAZ)をポリエチレングリコール法により宿主大腸菌BL21株に導入し、形質転換体を得た。得られた形質転換株をアンピシリン(100μg/ml)を含有する10mlのLB液体培地(水1リットルあたり、バクトトリプトン10g、イーストエクストラクト5g、塩化ナトリウム5g、pH7.2)に植菌し、さらに37℃で18時間培養を行った。次いで、その培養菌体液0.1 mlを新たなLB液体培地10mlに添加して、37℃で4.5時間培養した。培養後、その培養液を氷水上で冷却して、イソプロピル-β-D(−)-チオガラクトピラノシド(IPTG、和光純薬工業社製)を最終濃度0.1mMになるように培養液に添加し、15℃にて17時間培養を行った。培養菌体1mlを、冷却遠心機により5,000rpm(6000 x g)、5分で集菌した。
(2)培養菌体からの組換え蛋白質の抽出
集菌した菌体を0.5mlの10 mM EDTA を含む50mM Tris-HCl (pH7.6)で懸濁し、氷冷下で超音波破砕処理(ブランソン社製、ソニファイアーモデル250)を30秒行った。その菌体破砕液を10,000rpm(12,000×g)で3分間遠心分離し、上清を可溶性画分(S)として使用した。次いで、沈殿を10mM EDTAを含む50mM Tris-HCl (pH7.6)0.5mlに懸濁し、不溶性画分(P)として使用した。
(3)組換え蛋白質のSDS−PAGE分析
上記(2)で得た可溶性画分および不溶性画分20μlにLaemmli のサンプルバッファー20μl 添加して、95℃、 3分間処理を行い、12%(w/v)SDS-PAGE ゲル(TEFCO社製)に供し、25mAで90min電気泳動を行った。泳動後のゲルは、固定液(メタノール:酢酸:水=50ml:10ml:40ml)で30分間処理した後、コロイドCBB染色キット(TEFCO社製)により1時間染色した。脱色は蒸留水200mlにより洗浄することにより行った。その結果を図10に示した。ZZ非融合蛋白質発現ベクター系であるpCold-AQ、 pCold-hGL、 pCold-KAZを用いた場合、その発現蛋白質は、主に不溶性画分(P)に認められた。一方、ZZ融合蛋白質発現ベクター系であるpCold-ZZ-AQ、 pCold-ZZ-hGL、 pCold-ZZ-KAZを用いた場合、その発現蛋白質は、主に可能性画分(S)に認められた。この結果は、発光活性とも相関があり、ZZ融合蛋白質として発現させた場合の方が、ZZ非融合蛋白質として発現させた場合より発光活性が高かった。
これらの結果から、ZZ蛋白質と融合することにより、活性を持つ蛋白質を効率的に可溶性蛋白質として発現させることが可能であることが示された。
同様に、プロテアーゼ切断認識部位を有するpCold-ZZ-T-hGL、pCold-ZZ-P-hGLベクターを用いた発現においても、図11に示すように、活性を持つ蛋白質を効率的に可溶性蛋白質として発現させることが可能であることが示された。
Example 8 SDS-PAGE Analysis of Recombinant Protein (1) Expression of Recombinant Protein in E. coli
ZZ fusion protein expression vector (pCold-ZZ-AQ, pCold-ZZ-hGL, pCold-ZZ-KAZ, pCold-ZZ-T-hGL, pCold-ZZ-P-hGL) or ZZ non-fusion protein expression vector (pCold- AQ, pCold-hGL, pCold-KAZ) were introduced into the host E. coli BL21 strain by the polyethylene glycol method to obtain transformants. The obtained transformant was inoculated into 10 ml of LB liquid medium containing ampicillin (100 μg / ml) (10 g of bactotryptone, 5 g of yeast extract, 5 g of sodium chloride, pH 7.2 per liter of water), Furthermore, culture was performed at 37 ° C. for 18 hours. Next, 0.1 ml of the cultured bacterial cell solution was added to 10 ml of fresh LB liquid medium and cultured at 37 ° C. for 4.5 hours. After culturing, the culture solution is cooled on ice water, and isopropyl-β-D (−)-thiogalactopyranoside (IPTG, manufactured by Wako Pure Chemical Industries, Ltd.) is added to the culture solution to a final concentration of 0.1 mM. The mixture was added and cultured at 15 ° C. for 17 hours. 1 ml of cultured cells was collected at 5,000 rpm (6000 × g) for 5 minutes using a cooling centrifuge.
(2) Extraction of recombinant protein from cultured bacterial cells The collected bacterial cells are suspended in 50 mM Tris-HCl (pH 7.6) containing 0.5 ml of 10 mM EDTA, and subjected to ultrasonic crushing treatment (Branson Sonicator model 250) manufactured by the company was carried out for 30 seconds. The cell disruption solution was centrifuged at 10,000 rpm (12,000 × g) for 3 minutes, and the supernatant was used as the soluble fraction (S). The precipitate was then suspended in 0.5 ml of 50 mM Tris-HCl (pH 7.6) containing 10 mM EDTA and used as the insoluble fraction (P).
(3) SDS-PAGE analysis of recombinant protein 20 μl of Laemmli sample buffer was added to 20 μl of the soluble and insoluble fractions obtained in (2) above, treated at 95 ° C. for 3 minutes, and 12% (w / v) An SDS-PAGE gel (manufactured by TEFCO) was subjected to 90 min electrophoresis at 25 mA. The gel after electrophoresis was treated with a fixing solution (methanol: acetic acid: water = 50 ml: 10 ml: 40 ml) for 30 minutes and then stained with a colloid CBB staining kit (manufactured by TEFCO) for 1 hour. Decolorization was performed by washing with 200 ml of distilled water. The results are shown in FIG. When pCold-AQ, pCold-hGL, and pCold-KAZ, which are ZZ non-fusion protein expression vector systems, were used, the expressed protein was found mainly in the insoluble fraction (P). On the other hand, when pCold-ZZ-AQ, pCold-ZZ-hGL, and pCold-ZZ-KAZ, which are ZZ fusion protein expression vector systems, were used, the expressed protein was found mainly in the possibility fraction (S). . This result was also correlated with the luminescence activity, and the luminescence activity was higher when expressed as a ZZ fusion protein than when expressed as a ZZ non-fusion protein.
From these results, it was shown that the active protein can be efficiently expressed as a soluble protein by fusing with the ZZ protein.
Similarly, in the expression using pCold-ZZ-T-hGL and pCold-ZZ-P-hGL vectors having a protease cleavage recognition site, as shown in FIG. 11, an active protein is efficiently converted into a soluble protein. It was shown that it can be expressed.

本発明の発現ベクター、本発明の目的蛋白質の製造方法によれば、目的蛋白質を可溶性蛋白質として製造することができるので、目的蛋白質を可溶化させる必要がない。よって、本発明によれば、目的蛋白質を効率的に、高い回収率で得ることができる。したがって、本発明は有用蛋白質や、機能や構造の解析対象となる蛋白質などの蛋白質の製造に有用である。
また、本発明の、少なくとも1つの制限酵素サイトを含有する発現ベクターは、目的蛋白質をコードする遺伝子を制限酵素サイトに挿入して発現させることによって、目的蛋白質を可溶性蛋白質として製造することができる。よって、前記発現ベクターは、有用蛋白質などの目的蛋白質の製造に好適に用いることができる。
According to the expression vector of the present invention and the method for producing the target protein of the present invention, since the target protein can be manufactured as a soluble protein, it is not necessary to solubilize the target protein. Therefore, according to the present invention, the target protein can be obtained efficiently and at a high recovery rate. Therefore, the present invention is useful for producing useful proteins and proteins such as proteins whose functions and structures are to be analyzed.
In addition, the expression vector containing at least one restriction enzyme site of the present invention can be produced as a soluble protein by inserting a gene encoding the target protein into the restriction enzyme site and expressing it. Therefore, the expression vector can be suitably used for production of a target protein such as a useful protein.

図1は、参考例1で得られた発現ベクターpCold-AQを示す。FIG. 1 shows the expression vector pCold-AQ obtained in Reference Example 1. 図2は、実施例1で得られた発現ベクターpCold-ZZ-AQを示す。FIG. 2 shows the expression vector pCold-ZZ-AQ obtained in Example 1. 図3は、参考例2で得られた発現ベクターpCold-hGLを示す。FIG. 3 shows the expression vector pCold-hGL obtained in Reference Example 2. 図4は、実施例2で得られた発現ベクターpCold-ZZ-hGLを示す。FIG. 4 shows the expression vector pCold-ZZ-hGL obtained in Example 2. 図5は、参考例3で得られた発現ベクターpCold-KAZを示す。FIG. 5 shows the expression vector pCold-KAZ obtained in Reference Example 3. 図6は、実施例3で得られた発現ベクターpCold-ZZ-KAZを示す。FIG. 6 shows the expression vector pCold-ZZ-KAZ obtained in Example 3. 図7は、実施例4で得られた発現ベクターpCold-ZZ-T-hGLを示す。FIG. 7 shows the expression vector pCold-ZZ-T-hGL obtained in Example 4. 図8は、実施例4で得られた発現ベクターpCold-ZZ-P-hGLを示す。FIG. 8 shows the expression vector pCold-ZZ-P-hGL obtained in Example 4. 図9は、実施例5のZZ−アポイクオリンの精製過程におけるSDS−PAGE分析の結果を示す図である。各レーンの試料は次の通りである。レーン1:蛋白質分子量マーカー(テフコ社):β−ガラクトシダーゼ(116,000)、ホスホリパーゼB(97,400)、ウシ血清アルブミン(69,000)、グルタミン酸デヒドロゲナーゼ(55,000)、乳酸デヒドロゲナーゼ(36,500)、炭酸脱水素酵素(29,000)、トリプシンインヒビター(20,100)、レーン2:組換えZZ−アポAQを発現させた大腸菌の形質転換株の超音波破砕物を12,000gで遠心して得られた上清(蛋白質5.4μg)、レーン3:Q−セファロースカラムからの溶出画分(蛋白質16μg)、レーン4:ニッケルキレートカラムからの溶出画分(蛋白質4.8μg)、レーン5:IgGセファロースカラムからの溶出画分(蛋白質1.3μg)。FIG. 9 is a diagram showing the results of SDS-PAGE analysis in the purification process of ZZ-apoaequorin in Example 5. Samples in each lane are as follows. Lane 1: protein molecular weight marker (Tefco): β-galactosidase (116,000), phospholipase B (97,400), bovine serum albumin (69,000), glutamate dehydrogenase (55,000), lactate dehydrogenase (36,500), carbonic acid dehydrogenase (29,000) , Trypsin inhibitor (20,100), Lane 2: Supernatant obtained by centrifuging an ultrasonic disruption of an E. coli transformant expressing recombinant ZZ-apoAQ at 12,000 g (Protein 5.4 μg), Lane 3 : Elution fraction from Q-sepharose column (protein 16 μg), Lane 4: Elution fraction from nickel chelate column (protein 4.8 μg), Lane 5: Elution fraction from IgG sepharose column (protein 1.3 μg). 図10は、実施例8のSDS−PAGE分析の結果を示す図である。図中、Mは蛋白質分子量マーカー(テフコ社):β−ガラクトシダーゼ(116,000)、ホスホリパーゼB(97,400)、ウシ血清アルブミン(69,000)、グルタミン酸デヒドロゲナーゼ(55,000)、乳酸デヒドロゲナーゼ(36,500)、炭酸脱水素酵素(29,000)、トリプシンインヒビター(20,100)、を示す。発現プラスミドを発現させた大腸菌の形質転換株の超音波破砕物を12,000gで3分間遠心して得られた上清の可溶性画分をS、沈殿の不溶性画分をPとした。10 is a diagram showing the results of SDS-PAGE analysis of Example 8. FIG. In the figure, M is a protein molecular weight marker (Tefco): β-galactosidase (116,000), phospholipase B (97,400), bovine serum albumin (69,000), glutamate dehydrogenase (55,000), lactate dehydrogenase (36,500), carbonic acid dehydrogenase ( 29,000), trypsin inhibitor (20,100). The soluble fraction of the supernatant obtained by centrifuging an ultrasonically disrupted E. coli transformed strain expressing the expression plasmid at 12,000 g for 3 minutes was designated as S, and the insoluble fraction of the precipitate as P. 図11は、実施例8のSDS−PAGE分析の結果を示す図である。各レーンの試料は次の通りである。レーン1:蛋白質分子量マーカー(テフコ社):β−ガラクトシダーゼ(116,000)、ホスホリパーゼB(97,400)、ウシ血清アルブミン(69,000)、グルタミン酸デヒドロゲナーゼ(55,000)、乳酸デヒドロゲナーゼ(36,500)、炭酸脱水素酵素(29,000)、トリプシンインヒビター(20,100)、レーン2:組換えZZ−P−hGLを発現させた大腸菌の形質転換株の超音波破砕物を12,000gで3分間遠心して得られた上清(可溶性画分(S))、レーン3:組換えZZ−P−hGLを発現させた大腸菌の形質転換株の超音波破砕物を12,000gで3分間遠心して得られた沈殿(不溶性画分(P))、レーン4:組換えZZ−T−hGLを発現させた大腸菌の形質転換株の超音波破砕物を12,000gで3分間遠心して得られた上清(可溶性画分(S))、レーン5:組換えZZ−T−hGLを発現させた大腸菌の形質転換株の超音波破砕物を12,000gで3分間遠心して得られた沈殿(不溶性画分(P))。FIG. 11 is a diagram showing the results of SDS-PAGE analysis of Example 8. Samples in each lane are as follows. Lane 1: protein molecular weight marker (Tefco): β-galactosidase (116,000), phospholipase B (97,400), bovine serum albumin (69,000), glutamate dehydrogenase (55,000), lactate dehydrogenase (36,500), carbonic acid dehydrogenase (29,000) , Trypsin inhibitor (20,100), lane 2: supernatant obtained by centrifuging an ultrasonic disruption of a transformant of E. coli expressing recombinant ZZ-P-hGL at 12,000 g for 3 minutes (soluble fraction ( S)), Lane 3: Precipitation (insoluble fraction (P)) obtained by centrifuging an ultrasonically disrupted E. coli transformant expressing recombinant ZZ-P-hGL at 12,000 g for 3 minutes. Lane 4: Supernatant obtained by centrifuging an ultrasonic disruption of an E. coli transformant expressing recombinant ZZ-T-hGL at 12,000 g for 3 minutes (soluble fraction) (S)), Lane 5: Precipitation obtained by centrifuging an ultrasonically disrupted E. coli transformant expressing recombinant ZZ-T-hGL at 12,000 g for 3 minutes (insoluble fraction (P)) .

[配列番号:1]式Zで表されるポリペプチドのアミノ酸配列を表す。
[配列番号:2]配列番号:1で表されるアミノ酸配列をコードするDNAの塩基配列を示す。
[配列番号:3]式(Z)で表されるポリペプチドのアミノ酸配列を示す。
[配列番号:4]配列番号:3で表されるアミノ酸配列をコードするDNAの塩基配列を示す。
[配列番号:5]参考例1で作製したアポイクオリン発現ベクターpCold-AQに挿入されたDNAにコードされている、組換えアポイクオリンのアミノ酸配列を示す。
[配列番号:6]参考例1で作製したアポイクオリン発現ベクターpCold-AQに挿入された、組換えアポイクオリンをコードするDNAの塩基配列を示す。
[配列番号:7]実施例1で作製したZZ−アポイクオリン融合蛋白質発現ベクターpCold-ZZ-AQに挿入されたDNAにコードされている、組換えZZ−アポイクオリン融合蛋白質のアミノ酸配列を示す。
[配列番号:8]実施例1で作製したZZ−アポイクオリン融合蛋白質発現ベクターpCold-ZZ-AQに挿入された、組換えZZ−アポイクオリン融合蛋白質をコードするDNAの塩基配列を示す。
[配列番号:9]参考例2で作製したガウシアルシフェラーゼ発現ベクターpCold-hGLに挿入されたDNAにコードされている、組換えガウシアルシフェラーゼのアミノ酸配列を示す。
[配列番号:10]参考例2で作製したガウシアルシフェラーゼ発現ベクターpCold-hGLに挿入された、組換えガウシアルシフェラーゼをコードするDNAの塩基配列を示す。
[配列番号:11]実施例2で作製したZZ−ガウシアルシフェラーゼ融合蛋白質発現ベクターpCold-ZZ-hGLに挿入されたDNAにコードされている、組換えZZ−ガウシアルシフェラーゼ融合蛋白質のアミノ酸配列を示す。
[配列番号:12]実施例2で作製したZZ−ガウシアルシフェラーゼ融合蛋白質発現ベクターpCold-ZZ-hGLに挿入された、組換えZZ−ガウシアルシフェラーゼ融合蛋白質をコードするDNAの塩基配列を示す。
[配列番号:13]参考例3で作製したエビルシフェラーゼの触媒ユニットである19KDa蛋白質(KAZ)発現ベクターpCold-KAZに挿入されたDNAにコードされている、組換えKAZのアミノ酸配列を示す。
[配列番号:14]参考例3で作製したエビルシフェラーゼの触媒ユニットである19KDa蛋白質(KAZ)発現ベクターpCold-KAZに挿入された、組換えKAZをコードするDNAの塩基配列を示す。
[配列番号:15]実施例3で作製したZZ−KAZ融合蛋白質発現ベクターpCold-ZZ-KAZに挿入されたDNAにコードされている、組換えZZ−KAZ融合蛋白質のアミノ酸配列を示す。
[配列番号:16]実施例3で作製したZZ−KAZ融合蛋白質発現ベクターpCold-ZZ-KAZに挿入された、組換えZZ−KAZ融合蛋白質をコードするDNAの塩基配列を示す。
[配列番号:17]実施例4で作製した、トロンビン切断部位を有するZZ−ガウシアルシフェラーゼ融合蛋白質発現ベクターpCold-ZZ-T-hGLに挿入されたDNAにコードされている、組換えZZ−ガウシアルシフェラーゼ融合蛋白質のアミノ酸配列を示す。
[配列番号:18]実施例4で作製した、トロンビン切断部位を有するZZ−ガウシアルシフェラーゼ融合蛋白質発現ベクターpCold-ZZ-T-hGLに挿入された、組換えZZ−ガウシアルシフェラーゼ融合蛋白質をコードするDNAの塩基配列を示す。
[配列番号:19]実施例4で作製した、ヒトレノウイルス3Cプロテアーゼ切断部位を有するZZ−ガウシアルシフェラーゼ融合蛋白質発現ベクターpCold-ZZ-P-hGLに挿入されたDNAにコードされている、組換えZZ−ガウシアルシフェラーゼ融合蛋白質のアミノ酸配列を示す。
[配列番号:20]実施例4で作製した、ヒトレノウイルス3Cプロテアーゼ切断部位を有するZZ−ガウシアルシフェラーゼ融合蛋白質発現ベクターpCold-ZZ-P-hGLに挿入された、組換えZZ−ガウシアルシフェラーゼ融合蛋白質をコードするDNAの塩基配列を示す。
[配列番号:21]アポイクオリンのアミノ酸配列を示す。
[配列番号:22]アポイクオリンをコードするDNAの塩基配列を示す。
[配列番号:23]ガウシアルシフェラーゼのアミノ酸配列を示す。
[配列番号:24]ガウシアルシフェラーゼをコードするDNAの塩基配列を示す。
[配列番号:25]エビルシフェラーゼの触媒ユニットである19KDa蛋白質(KAZ)のアミノ酸配列を示す。
[配列番号:26]エビルシフェラーゼの触媒ユニットである19KDa蛋白質(KAZ)をコードするDNAの塩基配列を示す。
[配列番号:27]参考例1で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
[配列番号:28]参考例1で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
[配列番号:29]実施例1で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
[配列番号:30]実施例1で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
[配列番号:31]参考例2で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
[配列番号:32]参考例2で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
[配列番号:33]実施例2で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
[配列番号:34]実施例2で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
[配列番号:35]参考例3で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
[配列番号:36]参考例3で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
[配列番号:37]実施例3で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
[配列番号:38]実施例3で用いられたプライマーの塩基配列を示す。
[配列番号:39]実施例4で用いられたトロンビン切断認識配列オリゴヌクレオチドの塩基配列を示す。
[配列番号:40]実施例4で用いられたトロンビン切断認識配列オリゴヌクレオチドの塩基配列を示す。
[配列番号:41]実施例4で用いられたヒトレノウイルス3Cプロテアーゼ切断認識配列オリゴヌクレオチドの塩基配列を示す。
[配列番号:42]実施例4で用いられたヒトレノウイルス3Cプロテアーゼ切断認識配列オリゴヌクレオチドの塩基配列を示す。
[SEQ ID NO: 1] This represents the amino acid sequence of the polypeptide represented by formula Z.
[SEQ ID NO: 2] This shows the base sequence of DNA encoding the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 1.
[SEQ ID NO: 3] This shows the amino acid sequence of the polypeptide represented by formula (Z) 2 .
[SEQ ID NO: 4] This shows the base sequence of DNA encoding the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 3.
[SEQ ID NO: 5] This shows the amino acid sequence of recombinant apoaequorin encoded by DNA inserted into apoaequorin expression vector pCold-AQ prepared in Reference Example 1.
[SEQ ID NO: 6] This shows the base sequence of DNA encoding recombinant apoaequorin inserted into the apoaequorin expression vector pCold-AQ prepared in Reference Example 1.
[SEQ ID NO: 7] This shows the amino acid sequence of recombinant ZZ-apoiquorin fusion protein encoded by DNA inserted into ZZ-apoaequorin fusion protein expression vector pCold-ZZ-AQ prepared in Example 1.
[SEQ ID NO: 8] This shows the base sequence of the DNA encoding the recombinant ZZ-apoaequorin fusion protein inserted into the ZZ-apoaequorin fusion protein expression vector pCold-ZZ-AQ prepared in Example 1.
[SEQ ID NO: 9] This shows the amino acid sequence of recombinant Gaussia luciferase encoded by DNA inserted in Gaussia luciferase expression vector pCold-hGL prepared in Reference Example 2.
[SEQ ID NO: 10] This shows the base sequence of DNA encoding recombinant Gaussia luciferase inserted into Gaussia luciferase expression vector pCold-hGL prepared in Reference Example 2.
[SEQ ID NO: 11] The amino acid sequence of the recombinant ZZ-gaussia luciferase fusion protein encoded by the DNA inserted into the ZZ-gaussia luciferase fusion protein expression vector pCold-ZZ-hGL prepared in Example 2 Show.
[SEQ ID NO: 12] This shows the base sequence of DNA encoding recombinant ZZ-Gaussia luciferase fusion protein inserted into ZZ-Gaussia luciferase fusion protein expression vector pCold-ZZ-hGL prepared in Example 2.
[SEQ ID NO: 13] This shows the amino acid sequence of recombinant KAZ encoded by the DNA inserted into 19 KDa protein (KAZ) expression vector pCold-KAZ, which is the catalytic unit of Evil luciferase prepared in Reference Example 3.
[SEQ ID NO: 14] This shows the base sequence of DNA encoding recombinant KAZ inserted into 19 KDa protein (KAZ) expression vector pCold-KAZ, which is the catalytic unit of Evil luciferase prepared in Reference Example 3.
[SEQ ID NO: 15] This shows the amino acid sequence of recombinant ZZ-KAZ fusion protein encoded by DNA inserted into ZZ-KAZ fusion protein expression vector pCold-ZZ-KAZ prepared in Example 3.
[SEQ ID NO: 16] This shows the base sequence of the DNA encoding the recombinant ZZ-KAZ fusion protein inserted into the ZZ-KAZ fusion protein expression vector pCold-ZZ-KAZ prepared in Example 3.
[SEQ ID NO: 17] Recombinant ZZ-gau encoded by DNA inserted in ZZ-gaussia luciferase fusion protein expression vector pCold-ZZ-T-hGL having a thrombin cleavage site, prepared in Example 4 The amino acid sequence of sialiferase fusion protein is shown.
[SEQ ID NO: 18] encodes a recombinant ZZ-Gaussia luciferase fusion protein inserted in the ZZ-Gaussia luciferase fusion protein expression vector pCold-ZZ-T-hGL having a thrombin cleavage site, prepared in Example 4 This shows the base sequence of DNA.
[SEQ ID NO: 19] A set encoded by DNA inserted into the ZZ-Gaussia luciferase fusion protein expression vector pCold-ZZ-P-hGL having a human renovirus 3C protease cleavage site, prepared in Example 4. The amino acid sequence of the modified ZZ-Gaussia luciferase fusion protein is shown.
[SEQ ID NO: 20] Recombinant ZZ-Gaussia luciferase inserted in ZZ-Gaussia luciferase fusion protein expression vector pCold-ZZ-P-hGL having a human renovirus 3C protease cleavage site prepared in Example 4 This shows the base sequence of DNA encoding the fusion protein.
[SEQ ID NO: 21] This shows the amino acid sequence of apoaequorin.
[SEQ ID NO: 22] This shows the base sequence of DNA encoding apoaequorin.
[SEQ ID NO: 23] This shows the amino acid sequence of Gaussia luciferase.
[SEQ ID NO: 24] This shows the base sequence of DNA encoding Gaussia luciferase.
[SEQ ID NO: 25] This shows the amino acid sequence of 19 KDa protein (KAZ), which is the catalytic unit of Evil luciferase.
[SEQ ID NO: 26] This shows the base sequence of DNA encoding 19 KDa protein (KAZ) which is a catalytic unit of Evil luciferase.
[SEQ ID NO: 27] This shows the base sequence of the primer used in Reference Example 1.
[SEQ ID NO: 28] This shows the base sequence of the primer used in Reference Example 1.
[SEQ ID NO: 29] This shows the base sequence of the primer used in EXAMPLE 1.
[SEQ ID NO: 30] This shows the base sequence of the primer used in EXAMPLE 1.
[SEQ ID NO: 31] This shows the base sequence of the primer used in Reference Example 2.
[SEQ ID NO: 32] This shows the base sequence of the primer used in Reference Example 2.
[SEQ ID NO: 33] This shows the base sequence of the primer used in EXAMPLE 2.
[SEQ ID NO: 34] This shows the base sequence of the primer used in EXAMPLE 2.
[SEQ ID NO: 35] This shows the base sequence of the primer used in Reference Example 3.
[SEQ ID NO: 36] This shows the base sequence of the primer used in Reference Example 3.
[SEQ ID NO: 37] This shows the base sequence of the primer used in EXAMPLE 3.
[SEQ ID NO: 38] This shows the base sequence of the primer used in EXAMPLE 3.
[SEQ ID NO: 39] This shows the base sequence of the thrombin cleavage recognition sequence oligonucleotide used in EXAMPLE 4.
[SEQ ID NO: 40] This shows the base sequence of thrombin cleavage recognition sequence oligonucleotide used in EXAMPLE 4.
[SEQ ID NO: 41] This shows the base sequence of human renovirus 3C protease cleavage recognition sequence oligonucleotide used in EXAMPLE 4.
[SEQ ID NO: 42] This shows the base sequence of human renovirus 3C protease cleavage recognition sequence oligonucleotide used in EXAMPLE 4.

Claims (45)

(1)発現誘導可能なプロモーター配列;
(2)式(Z)
(式中、nは1〜5の整数を表し、Zは以下の(a)〜(d)からなる群から選択されるポリペプチドを表す:
(a)配列番号:1のアミノ酸配列からなるポリペプチド、
(b)配列番号:1のアミノ酸配列において1〜複数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加したアミノ酸配列からなるポリペプチド、
(c)配列番号:1のアミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有するアミノ酸配列からなるポリペプチド、および
(d)配列番号:2の塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによってコードされるアミノ酸配列からなるポリペプチド)
で表され、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる機能を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有する第1のコード配列;および
(3)目的蛋白質をコードするポリヌクレオチドを含有する第2のコード配列
を含有する発現ベクター。
(1) a promoter sequence that can induce expression;
(2) Formula (Z) n
(In the formula, n represents an integer of 1 to 5, and Z represents a polypeptide selected from the group consisting of the following (a) to (d):
(A) a polypeptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1,
(B) a polypeptide comprising an amino acid sequence in which one or more amino acids are deleted, substituted, inserted and / or added in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1;
(C) a polypeptide comprising an amino acid sequence having 90% or more identity to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, and (d) a polynucleotide comprising a base sequence complementary to the base sequence of SEQ ID NO: 2. A polypeptide comprising an amino acid sequence encoded by a polynucleotide that hybridizes under stringent conditions)
And a first coding sequence comprising a polynucleotide that encodes a polypeptide having a function that allows the fusion protein to be expressed as a soluble protein when expressed as a fusion protein with the target protein; 3) An expression vector containing a second coding sequence containing a polynucleotide encoding the target protein.
前記式(Z)で表されるポリペプチドが、(Z)で表されるポリペプチドである、請求項1記載のベクター。 The vector according to claim 1, wherein the polypeptide represented by the formula (Z) n is a polypeptide represented by (Z) 2 . 前記式(Z)で表されるポリペプチドが、
(e)配列番号:3のアミノ酸配列からなるポリペプチド、
(f)配列番号:3のアミノ酸配列において1〜複数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加したアミノ酸配列からなり、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる機能を有するポリペプチド、
(g)配列番号:3のアミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる機能を有するポリペプチド、および
(h)配列番号:4の塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによってコードされるアミノ酸配列からなり、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる機能を有するポリペプチド
からなる群から選択されるポリペプチドである、請求項2記載のベクター。
The polypeptide represented by the formula (Z) 2 is:
(E) a polypeptide consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3,
(F) When the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3 comprises an amino acid sequence in which one or more amino acids are deleted, substituted, inserted and / or added, and is expressed as a fusion protein with the target protein, A polypeptide having a function capable of expressing a fusion protein as a soluble protein,
(G) The fusion protein is expressed as a soluble protein when it consists of an amino acid sequence having 90% or more identity to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3 and is expressed as a fusion protein with the target protein. And (h) an amino acid sequence encoded by a polynucleotide that hybridizes under stringent conditions with a polynucleotide consisting of a base sequence complementary to the base sequence of SEQ ID NO: 4, and The vector according to claim 2, wherein the vector is a polypeptide selected from the group consisting of polypeptides having a function capable of being expressed as a soluble protein when expressed as a fusion protein with a target protein.
前記発現誘導可能なプロモーター配列が、低温で発現誘導可能なプロモーター配列である、請求項1〜3のいずれかに記載のベクター。   The vector according to any one of claims 1 to 3, wherein the promoter sequence capable of inducing expression is a promoter sequence capable of inducing expression at low temperature. 前記低温で発現誘導可能なプロモーター配列が、コールドショック遺伝子のプロモーター配列である、請求項4記載のベクター。   The vector according to claim 4, wherein the promoter sequence capable of inducing expression at a low temperature is a cold shock gene promoter sequence. 前記コールドショック遺伝子のプロモーター配列が、大腸菌コールドショック遺伝子のプロモーター配列である、請求項5記載のベクター。   The vector according to claim 5, wherein the promoter sequence of the cold shock gene is an E. coli cold shock gene promoter sequence. 前記大腸菌コールドショック遺伝子のプロモーター配列が、大腸菌コールドショック遺伝子cspA、cspB、cspG、cspIまたはcsdAのプロモーター配列である、請求項6記載のベクター。   The vector according to claim 6, wherein the promoter sequence of the E. coli cold shock gene is a promoter sequence of the E. coli cold shock gene cspA, cspB, cspG, cspI or csdA. 前記第1のコード配列と、前記第2のコード配列との間に、さらに切断可能なリンカーペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有するコード配列を含有する、請求項1〜7のいずれかに記載のベクター。   8. The coding sequence according to claim 1, further comprising a coding sequence containing a polynucleotide encoding a cleavable linker peptide between the first coding sequence and the second coding sequence. vector. 前記切断可能なリンカーペプチドが、プロテアーゼ切断部位を有するリンカーペプチドである、請求項8記載のベクター。   The vector according to claim 8, wherein the cleavable linker peptide is a linker peptide having a protease cleavage site. 前記第1のコード配列の5’側に、さらに精製のためのアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含有するコード配列を含有する、請求項1〜9のいずれかに記載のベクター。   The vector according to any one of claims 1 to 9, further comprising a coding sequence containing a polynucleotide encoding an amino acid sequence for purification on the 5 'side of the first coding sequence. 前記精製のためのアミノ酸配列が、ヒスチジンタグ配列である、請求項10記載のベクター。   The vector according to claim 10, wherein the amino acid sequence for purification is a histidine tag sequence. (1)発現誘導可能なプロモーター配列;
(2)式(Z)
(式中、nは1〜5の整数を表し、Zは以下の(a)〜(d)からなる群から選択されるポリペプチドを表す:
(a)配列番号:1のアミノ酸配列からなるポリペプチド、
(b)配列番号:1のアミノ酸配列において1〜複数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加したアミノ酸配列からなるポリペプチド、
(c)配列番号:1のアミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有するアミノ酸配列からなるポリペプチド、および
(d)配列番号:2の塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによってコードされるアミノ酸配列からなるポリペプチド)
で表され、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる機能を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有する第1のコード配列;および
(3)目的蛋白質をコードするポリヌクレオチドを含有する第2のコード配列を挿入することができる少なくとも1つの制限酵素サイト
を含有する発現ベクター。
(1) a promoter sequence that can induce expression;
(2) Formula (Z) n
(In the formula, n represents an integer of 1 to 5, and Z represents a polypeptide selected from the group consisting of the following (a) to (d):
(A) a polypeptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1,
(B) a polypeptide comprising an amino acid sequence in which one or more amino acids are deleted, substituted, inserted and / or added in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1;
(C) a polypeptide comprising an amino acid sequence having 90% or more identity to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, and (d) a polynucleotide comprising a base sequence complementary to the base sequence of SEQ ID NO: 2. A polypeptide comprising an amino acid sequence encoded by a polynucleotide that hybridizes under stringent conditions)
And a first coding sequence comprising a polynucleotide that encodes a polypeptide having a function that allows the fusion protein to be expressed as a soluble protein when expressed as a fusion protein with the target protein; 3) An expression vector containing at least one restriction enzyme site into which a second coding sequence containing a polynucleotide encoding the target protein can be inserted.
前記式(Z)で表されるポリペプチドが、(Z)で表されるポリペプチドである、請求項12記載のベクター。 The vector according to claim 12, wherein the polypeptide represented by the formula (Z) n is a polypeptide represented by (Z) 2 . 前記式(Z)で表されるポリペプチドが、
(e)配列番号:3のアミノ酸配列からなるポリペプチド、
(f)配列番号:3のアミノ酸配列において1〜複数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加したアミノ酸配列からなり、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる機能を有するポリペプチド、
(g)配列番号:3のアミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる機能を有するポリペプチド、および
(h)配列番号:4の塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによってコードされるアミノ酸配列からなり、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる機能を有するポリペプチド
からなる群から選択されるポリペプチドである、請求項13記載のベクター。
The polypeptide represented by the formula (Z) 2 is:
(E) a polypeptide consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3,
(F) When the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3 comprises an amino acid sequence in which one or more amino acids are deleted, substituted, inserted and / or added, and is expressed as a fusion protein with the target protein, A polypeptide having a function capable of expressing a fusion protein as a soluble protein,
(G) The fusion protein is expressed as a soluble protein when it consists of an amino acid sequence having 90% or more identity to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3 and is expressed as a fusion protein with the target protein. And (h) an amino acid sequence encoded by a polynucleotide that hybridizes under stringent conditions with a polynucleotide consisting of a base sequence complementary to the base sequence of SEQ ID NO: 4, and The vector according to claim 13, which is a polypeptide selected from the group consisting of polypeptides having a function capable of being expressed as a soluble protein when expressed as a fusion protein with a target protein.
前記発現誘導可能なプロモーター配列が、低温で発現誘導可能なプロモーター配列である、請求項12〜14のいずれかに記載のベクター。   The vector according to any one of claims 12 to 14, wherein the promoter sequence capable of inducing expression is a promoter sequence capable of inducing expression at a low temperature. 前記低温で発現誘導可能なプロモーター配列が、コールドショック遺伝子のプロモーター配列である、請求項15記載のベクター。   The vector according to claim 15, wherein the promoter sequence capable of inducing expression at a low temperature is a cold shock gene promoter sequence. 前記コールドショック遺伝子のプロモーター配列が、大腸菌コールドショック遺伝子のプロモーター配列である、請求項16記載のベクター。   The vector according to claim 16, wherein the promoter sequence of the cold shock gene is a promoter sequence of E. coli cold shock gene. 前記大腸菌コールドショック遺伝子のプロモーター配列が、大腸菌コールドショック遺伝子cspA、cspB、 cspG、cspIまたはcsdAのプロモーター配列である、請求項17記載のベクター。   The vector according to claim 17, wherein the promoter sequence of the E. coli cold shock gene is a promoter sequence of the E. coli cold shock gene cspA, cspB, cspG, cspI or csdA. 前記第1のコード配列と、前記第2のコード配列との間に、さらに切断可能なリンカーペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有するコード配列を含有する、請求項12〜18のいずれかに記載のベクター。   19. The coding sequence according to any one of claims 12 to 18, further comprising a coding sequence containing a polynucleotide encoding a cleavable linker peptide between the first coding sequence and the second coding sequence. vector. 前記切断可能なリンカーペプチドが、プロテアーゼ切断部位を有するリンカーペプチドである、請求項19記載のベクター。   The vector according to claim 19, wherein the cleavable linker peptide is a linker peptide having a protease cleavage site. 前記第1のコード配列の5’側に、さらに精製のためのアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含有するコード配列を含有する、請求項12〜20のいずれかに記載のベクター。   21. The vector according to any one of claims 12 to 20, further comprising a coding sequence containing a polynucleotide encoding an amino acid sequence for purification on the 5 'side of the first coding sequence. 前記精製のためのアミノ酸配列が、ヒスチジンタグ配列である、請求項21記載のベクター。   The vector according to claim 21, wherein the amino acid sequence for purification is a histidine tag sequence. (1)式(Z)
(式中、nは1〜5の整数を表し、Zは以下の(a)〜(d)からなる群から選択されるポリペプチドを表す:
(a)配列番号:1のアミノ酸配列からなるポリペプチド、
(b)配列番号:1のアミノ酸配列において1〜複数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加したアミノ酸配列からなるポリペプチド、
(c)配列番号:1のアミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有するアミノ酸配列からなるポリペプチド、および
(d)配列番号:2の塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによってコードされるアミノ酸配列からなるポリペプチド)
で表され、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる機能を有するポリペプチドのアミノ酸配列を含有する第1のアミノ酸配列;および
(2)目的蛋白質のアミノ酸配列を含有する第2のアミノ酸配列
を含有する、可溶性蛋白質として発現させることができる融合蛋白質。
(1) Formula (Z) n
(In the formula, n represents an integer of 1 to 5, and Z represents a polypeptide selected from the group consisting of the following (a) to (d):
(A) a polypeptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1,
(B) a polypeptide comprising an amino acid sequence in which one or more amino acids are deleted, substituted, inserted and / or added in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1;
(C) a polypeptide comprising an amino acid sequence having 90% or more identity to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, and (d) a polynucleotide comprising a base sequence complementary to the base sequence of SEQ ID NO: 2. A polypeptide comprising an amino acid sequence encoded by a polynucleotide that hybridizes under stringent conditions)
And a first amino acid sequence containing the amino acid sequence of a polypeptide having a function capable of being expressed as a soluble protein when expressed as a fusion protein with a target protein; and (2) A fusion protein comprising a second amino acid sequence containing the amino acid sequence of the target protein and capable of being expressed as a soluble protein.
前記式(Z)で表されるポリペプチドが、(Z)で表されるポリペプチドである、請求項23記載の融合蛋白質。 The fusion protein according to claim 23, wherein the polypeptide represented by the formula (Z) n is a polypeptide represented by (Z) 2 . 前記式(Z)で表されるポリペプチドが、
(e)配列番号:3のアミノ酸配列からなるポリペプチド、
(f)配列番号:3のアミノ酸配列において1〜複数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加したアミノ酸配列からなり、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる機能を有するポリペプチド、
(g)配列番号:3のアミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる機能を有するポリペプチド、および
(h)配列番号:4の塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによってコードされるアミノ酸配列からなり、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる機能を有するポリペプチド
からなる群から選択されるポリペプチドである、請求項24記載の融合蛋白質。
The polypeptide represented by the formula (Z) 2 is:
(E) a polypeptide consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3,
(F) When the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3 comprises an amino acid sequence in which one or more amino acids are deleted, substituted, inserted and / or added, and is expressed as a fusion protein with the target protein, A polypeptide having a function capable of expressing a fusion protein as a soluble protein,
(G) The fusion protein is expressed as a soluble protein when it consists of an amino acid sequence having 90% or more identity to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3 and is expressed as a fusion protein with the target protein. And (h) an amino acid sequence encoded by a polynucleotide that hybridizes under stringent conditions with a polynucleotide consisting of a base sequence complementary to the base sequence of SEQ ID NO: 4, and The fusion protein according to claim 24, which is a polypeptide selected from the group consisting of polypeptides having a function capable of being expressed as a soluble protein when expressed as a fusion protein with a target protein.
前記目的蛋白質が、アポイクオリン、ガウシアルシフェラーゼおよびエビルシフェラーゼからなる群から選択されるいずれかである、請求項23〜25のいずれかに記載の融合蛋白質。   The fusion protein according to any one of claims 23 to 25, wherein the target protein is any one selected from the group consisting of apoaequorin, Gaussia luciferase and ebyl luciferase. 前記第1のアミノ酸配列と、前記第2のアミノ酸配列との間に、さらに切断可能なリンカーペプチドのアミノ酸配列を含有するアミノ酸配列を含有する、請求項23〜26のいずれかに記載の融合蛋白質。   27. The fusion protein according to any one of claims 23 to 26, further comprising an amino acid sequence containing a cleavable linker peptide amino acid sequence between the first amino acid sequence and the second amino acid sequence. . 前記切断可能なリンカーペプチドが、プロテアーゼ切断部位を有するリンカーペプチドである、請求項27記載の融合蛋白質。   28. The fusion protein according to claim 27, wherein the cleavable linker peptide is a linker peptide having a protease cleavage site. 前記第1のアミノ酸配列のアミノ末端側に、さらに精製のためのアミノ酸配列を含有する、請求項23〜28のいずれかに記載の融合蛋白質。   The fusion protein according to any one of claims 23 to 28, further comprising an amino acid sequence for purification on the amino terminal side of the first amino acid sequence. 前記精製のためのアミノ酸配列が、ヒスチジンタグ配列である、請求項29記載の融合蛋白質。   30. The fusion protein according to claim 29, wherein the amino acid sequence for purification is a histidine tag sequence. 式(Z)−L−X
(式中、nは1〜5の整数を表し;Lは切断可能なリンカーペプチドを表し;Zは以下の(a)〜(d)からなる群から選択されるポリペプチドを表し:
(a)配列番号:1のアミノ酸配列からなるポリペプチド、
(b)配列番号:1のアミノ酸配列において1〜複数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加したアミノ酸配列からなるポリペプチド、
(c)配列番号:1のアミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有するアミノ酸配列からなるポリペプチド、および
(d)配列番号:2の塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによってコードされるアミノ酸配列からなるポリペプチド;Xは目的蛋白質のアミノ酸配列を表す)
で表される、可溶性蛋白質として発現させることができる融合蛋白質。
Formula (Z) n- L-X
(Wherein n represents an integer of 1 to 5; L represents a cleavable linker peptide; Z represents a polypeptide selected from the group consisting of the following (a) to (d):
(A) a polypeptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1,
(B) a polypeptide comprising an amino acid sequence in which one or more amino acids are deleted, substituted, inserted and / or added in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1;
(C) a polypeptide comprising an amino acid sequence having 90% or more identity to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, and (d) a polynucleotide comprising a base sequence complementary to the base sequence of SEQ ID NO: 2. A polypeptide comprising an amino acid sequence encoded by a polynucleotide that hybridizes under stringent conditions; X represents the amino acid sequence of the target protein)
A fusion protein that can be expressed as a soluble protein.
前記目的蛋白質が、アポイクオリン、ガウシアルシフェラーゼおよびエビルシフェラーゼからなる群から選択されるいずれかである、請求項31記載の融合蛋白質。   32. The fusion protein according to claim 31, wherein the target protein is one selected from the group consisting of apoaequorin, Gaussia luciferase and ebyl luciferase. 請求項23〜32のいずれかに記載の融合蛋白質をコードするポリヌクレオチドを含有するポリヌクレオチド。   A polynucleotide comprising a polynucleotide encoding the fusion protein according to any one of claims 23 to 32. DNAである、請求項33記載のポリヌクレオチド。   34. The polynucleotide of claim 33, which is DNA. (1)発現誘導可能なプロモーター配列;
(2)式(Z)
(式中、nは1〜5の整数を表し、Zは以下の(a)〜(d)からなる群から選択されるポリペプチドを表す:
(a)配列番号:1のアミノ酸配列からなるポリペプチド、
(b)配列番号:1のアミノ酸配列において1〜複数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加したアミノ酸配列からなるポリペプチド、
(c)配列番号:1のアミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有するアミノ酸配列からなるポリペプチド、および
(d)配列番号:2の塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによってコードされるアミノ酸配列からなるポリペプチド)
で表され、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる機能を有するポリペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有する第1のコード配列;および
(3)目的蛋白質をコードするポリヌクレオチドを含有する第2のコード配列
を含有する発現ベクターを用いて蛋白質を発現させることを含む、前記目的蛋白質を可溶性蛋白質として製造する方法。
(1) a promoter sequence that can induce expression;
(2) Formula (Z) n
(In the formula, n represents an integer of 1 to 5, and Z represents a polypeptide selected from the group consisting of the following (a) to (d):
(A) a polypeptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1,
(B) a polypeptide comprising an amino acid sequence in which one or more amino acids are deleted, substituted, inserted and / or added in the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1;
(C) a polypeptide comprising an amino acid sequence having 90% or more identity to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 1, and (d) a polynucleotide comprising a base sequence complementary to the base sequence of SEQ ID NO: 2. A polypeptide comprising an amino acid sequence encoded by a polynucleotide that hybridizes under stringent conditions)
And a first coding sequence comprising a polynucleotide that encodes a polypeptide having a function of allowing the fusion protein to be expressed as a soluble protein when expressed as a fusion protein with the target protein; 3) A method for producing the target protein as a soluble protein, comprising expressing the protein using an expression vector containing a second coding sequence containing a polynucleotide encoding the target protein.
前記式(Z)で表されるポリペプチドが、(Z)で表されるポリペプチドである、請求項35記載の方法。 36. The method according to claim 35, wherein the polypeptide represented by the formula (Z) n is a polypeptide represented by (Z) 2 . 前記式(Z)で表されるポリペプチドが、
(e)配列番号:3のアミノ酸配列からなるポリペプチド、
(f)配列番号:3のアミノ酸配列において1〜複数個のアミノ酸が欠失、置換、挿入および/または付加したアミノ酸配列からなり、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる機能を有するポリペプチド、
(g)配列番号:3のアミノ酸配列に対して90%以上の同一性を有するアミノ酸配列からなり、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる機能を有するポリペプチド、および
(h)配列番号:4の塩基配列に相補的な塩基配列からなるポリヌクレオチドとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするポリヌクレオチドによってコードされるアミノ酸配列からなり、かつ、目的蛋白質との融合蛋白質として発現された場合に、該融合蛋白質が可溶性蛋白質として発現されうる機能を有するポリペプチド
からなる群から選択されるポリペプチドである、請求項36記載の方法。
The polypeptide represented by the formula (Z) 2 is:
(E) a polypeptide consisting of the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3,
(F) When the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3 comprises an amino acid sequence in which one or more amino acids are deleted, substituted, inserted and / or added, and is expressed as a fusion protein with the target protein, A polypeptide having a function capable of expressing a fusion protein as a soluble protein,
(G) When the amino acid sequence has an amino acid sequence having 90% or more identity to the amino acid sequence of SEQ ID NO: 3 and is expressed as a fusion protein with the target protein, the fusion protein is expressed as a soluble protein. And (h) an amino acid sequence encoded by a polynucleotide that hybridizes under stringent conditions with a polynucleotide consisting of a base sequence complementary to the base sequence of SEQ ID NO: 4, and 37. The method according to claim 36, wherein when expressed as a fusion protein with a target protein, the fusion protein is a polypeptide selected from the group consisting of polypeptides having a function capable of being expressed as a soluble protein.
前記発現誘導可能なプロモーター配列が、低温で発現誘導可能なプロモーター配列である、請求項35〜37のいずれかに記載の方法。   The method according to any one of claims 35 to 37, wherein the promoter sequence capable of inducing expression is a promoter sequence capable of inducing expression at a low temperature. 前記低温で発現誘導可能なプロモーター配列が、コールドショック遺伝子のプロモーター配列である、請求項38記載の方法。   The method according to claim 38, wherein the promoter sequence capable of inducing expression at a low temperature is a cold shock gene promoter sequence. 前記コールドショック遺伝子のプロモーター配列が、大腸菌コールドショック遺伝子のプロモーター配列である、請求項39記載の方法。   40. The method of claim 39, wherein the cold shock gene promoter sequence is an E. coli cold shock gene promoter sequence. 前記大腸菌コールドショック遺伝子のプロモーター配列が、大腸菌コールドショック遺伝子cspA、cspB、 cspG、cspIまたはcsdAのプロモーター配列である、請求項40記載の方法。   41. The method of claim 40, wherein the promoter sequence of the E. coli cold shock gene is the promoter sequence of the E. coli cold shock gene cspA, cspB, cspG, cspI or csdA. 前記第1のコード配列と、前記第2のコード配列との間に、さらに切断可能なリンカーペプチドをコードするポリヌクレオチドを含有するコード配列を含有する、請求項35〜41のいずれかに記載の方法。   The coding sequence according to any one of claims 35 to 41, further comprising a coding sequence containing a polynucleotide encoding a cleavable linker peptide between the first coding sequence and the second coding sequence. Method. 前記切断可能なリンカーペプチドが、プロテアーゼ切断部位を有するリンカーペプチドである、請求項42記載の方法。   43. The method of claim 42, wherein the cleavable linker peptide is a linker peptide having a protease cleavage site. 前記第1のコード配列の5’側に、さらに精製のためのアミノ酸配列をコードするポリヌクレオチドを含有するコード配列を含有する、請求項35〜43のいずれかに記載の方法。   44. The method according to any one of claims 35 to 43, further comprising a coding sequence containing a polynucleotide encoding an amino acid sequence for purification on the 5 'side of the first coding sequence. 前記精製のためのアミノ酸配列が、ヒスチジンタグ配列である、請求項44記載の方法。   45. The method of claim 44, wherein the amino acid sequence for purification is a histidine tag sequence.
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