JP2006345744A - New aromatic alcohol oxidase gene and method for producing aromatic carboxylic acid - Google Patents

New aromatic alcohol oxidase gene and method for producing aromatic carboxylic acid Download PDF

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Abstract

<P>PROBLEM TO BE SOLVED: To obtain a gene encoding an enzyme to oxidize various aromatic alcohols and convert to aldehydes and provide a means for producing an aromatic carboxylic acid by using a recombinant microorganism having the gene transferred/expressed in the microorganism. <P>SOLUTION: The invention relates to an alcohol dehydrogenase gene of Rhodococcus erythropolis PR4 strain and a method for producing an aromatic carboxylic acid by using the gene. <P>COPYRIGHT: (C)2007,JPO&INPIT

Description

本発明は、芳香族アルコールを酸化し、カルボン酸に変換する新規な酵素、それをコードする遺伝子、この遺伝子を導入した微生物に関するものである。また、この遺伝子が導入された微生物を利用した、芳香族アルコールから芳香族カルボン酸への製造法に関するものである。   The present invention relates to a novel enzyme that oxidizes an aromatic alcohol and converts it into a carboxylic acid, a gene that encodes it, and a microorganism into which this gene has been introduced. The present invention also relates to a method for producing an aromatic carboxylic acid from an aromatic alcohol using a microorganism into which this gene has been introduced.

ベンジルアルコールから安息香酸への変換は、芳香族アルコールデヒドロゲナーゼ(aromatic alcohol dehydrogenase)及び芳香族アルデヒドデヒドロゲナーゼ(aromatic aldehyde dehydrogenase)という2つの酵素で行われる(図2)。芳香族アルコールデヒドロゲナーゼはベンジルアルコール(benzyl alcohol)をベンズアルデヒド(benzaldehyde)に可逆的に変換する酵素で、シュードモナス・プチダ(Pseudomonas putida)のTOLプラスミドpWW0にコードされているトルエン代謝系のXylB酵素が最もよく研究されている(非特許文献1)。XylBはその酵素活性がNAD(P)+および亜鉛イオンに依存し、ベンジルアルコールだけではなくo-、m-、p-メチルベンジルアルコール、o-、m-、p-メトキシベンジルアルコールも基質としてそれぞれのアルデヒド体に変換する。しかし、o-メチルベンジルアルコール及びo-メトキシベンジルアルコールを基質とした場合、変換効率は悪かった(非特許文献2)。最近、NAD(P)+および亜鉛イオンに依存せず、TOLプラスミドのXylBとも相同性の低い4-ニトロベンジルアルコールデヒドロゲナーゼ(NtnD)をコードする遺伝子がシュードモナス(Pseudomonas)属TW3株から単離された(James, K. D., Hughes, M. A., and Williams, P. A., Cloning and expression of ntnD, encoding a novel NAD(P)+-independent 4-nitrobenzyl alcohol dehydrogenase from Pseudomonas sp. strain TW3. J. Bacteriol. 182, 3136-3141, 2000)。NtnDは、ベンジルアルコール、m-、p-ニトロベンジルアルコール、o-、m-、p-メチルベンジルアルコール、m-ヒドロキシベンジルアルコール、p-エチルベンジルアルコール、2,4-、3,4-、3,5-ジメチルベンジルアルコールを基質として利用しそれぞれのアルデヒド体を合成したが、o-ニトロベンジルアルコール、o-、p-ヒドロキシベンジルアルコール、2,5-ジメチルベンジルアルコールは変換できなかった。また、アリールエーテル資化菌アシネトバクター(Acinetobacter)属ADP1株から単離された芳香族アルコール(ベンジルアルコール)デヒドロゲナーゼAreBはTOLプラスミドpWW0のXylBと高い相同性を持ち、o-、m-、p-メチルベンジルアルコール、o-、m-、p-ヒドロキシベンジルアルコールに対する活性が報告された(Jones, R. M.., Collier, L. S., Neidle, E. L., and Williams, P. A., areABC genes determine the catabolism of aryl esters in Acinetobacter sp. ADP1, J. Bacteriol. 181, 4568-4575, 1999)。 Conversion of benzyl alcohol to benzoic acid is carried out by two enzymes, aromatic alcohol dehydrogenase and aromatic aldehyde dehydrogenase (FIG. 2). Aromatic alcohol dehydrogenase is an enzyme that reversibly converts benzyl alcohol to benzaldehyde, and the XylB enzyme of the toluene metabolism system encoded by the TOL plasmid pWW0 of Pseudomonas putida is the best. It has been studied (Non-Patent Document 1). XylB depends its enzymatic activity in the NAD (P) + and zinc ions, not only benzyl alcohol o -, m -, p - methylbenzyl alcohol, o -, m -, p - methoxybenzyl alcohol also respectively as substrates To the aldehyde form. However, o - methylbenzyl alcohol and o - If the methoxybenzyl alcohol was used as a substrate, the conversion efficiency was poor (non-patent document 2). Recently, a gene encoding 4-nitrobenzyl alcohol dehydrogenase (NtnD), which does not depend on NAD (P) + and zinc ions and has low homology with XylB of the TOL plasmid, has been isolated from Pseudomonas TW3 strain (James, KD, Hughes, MA, and Williams, PA, Cloning and expression of ntnD , encoding a novel NAD (P) + -independent 4-nitrobenzyl alcohol dehydrogenase from Pseudomonas sp. Strain TW3. J. Bacteriol. 182, 3136- 3141, 2000). NtnD are benzyl alcohol, m -, p - nitrobenzyl alcohol, o -, m -, p - methylbenzyl alcohol, m - hydroxybenzyl alcohol, p - ethylbenzyl alcohol, 2,4, 3,4, 3 Each aldehyde was synthesized using 1,5-dimethylbenzyl alcohol as a substrate, but o -nitrobenzyl alcohol, o- , p -hydroxybenzyl alcohol and 2,5-dimethylbenzyl alcohol could not be converted. Furthermore, aryl ether-utilizing bacteria Acinetobacter (Acinetobacter) genus ADP1 aromatic isolated from strain alcohol (benzyl alcohol) dehydrogenase AreB has a XylB high homology of TOL plasmid pWW0, o -, m -, p - methyl benzyl alcohol, o -, m -, p -. activity against hydroxy benzyl alcohol has been reported (Jones, RM, Collier, LS , Neidle, EL, and Williams, PA, areABC genes determine the catabolism of aryl esters in Acinetobacter sp ADP1, J. Bacteriol. 181, 4568-4575, 1999).

芳香族アルデヒドデヒドロゲナーゼはベンズアルデヒドから安息香酸(benzoic acid)までの反応を触媒する。最もよく知られているものはTOLプラスミドpWW0にコードされるXylC酵素であり、その酵素活性はNAD(P)+に依存する(非特許文献1)。また、アシネトバクター・カルコアセチカス(Acinetobacter calcoaceticus)NCIB 8250からもxylBxylC遺伝子が単離され、それらがコードするアミノ酸配列はTOLプラスミドのXylB、XylCと高い相同性を持ち、基質特異性もほぼ同じであった(Gillooly, D. J., Robertson, A. G., and Fewson, C. A., Molecular characterization of benzyl alcohol dehydrogenase and benzaldehyde dehydrogenase II of Acinetobacter calcoaceticus. Biochem. J. 330, 1375-1381, 1998)。また、1,4-ジメチルナフタレン資化菌スフィンゴモナス(Sphingomonas)属14DN61株から単離されたアルデヒドデヒドロゲナーゼPhnNは基質特異性が広く、様々な芳香族アルデヒドをカルボン酸に変換する能力を持っている(Peng, X., Maruyama, T., Shindo, K., Kanoh, K., Ikenaga, H., and Misawa, N., International Congress on Biocatalysis, Hamburg 2004, Book of Abstracts, p. 227, 2004)。PhnNは、ベンズアルデヒドのような単環式アルデヒドだけでなく、2-ナフチルアルデヒド(2-naphthyl aldehyde)のような多環式アルデヒドも、それぞれのカルボン酸に変換することができる基質特異性のきわめて広い酵素である。 Aromatic aldehyde dehydrogenase catalyzes the reaction from benzaldehyde to benzoic acid. The most well-known one is the XylC enzyme encoded by the TOL plasmid pWW0, whose enzyme activity depends on NAD (P) + (Non-patent Document 1). In addition, xylB and xylC genes were isolated from Acinetobacter calcoaceticus NCIB 8250, and the amino acid sequences encoded by them were highly homologous to XylB and XylC of TOL plasmids, and the substrate specificity was almost the same. (Gillooly, DJ, Robertson, AG, and Fewson, CA, Molecular characterization of benzyl alcohol dehydrogenase and benzaldehyde dehydrogenase II of Acinetobacter calcoaceticus . Biochem. J. 330, 1375-1381, 1998). Aldehyde dehydrogenase PhnN isolated from 1,4-dimethylnaphthalene-utilizing bacterium Sphingomonas sp. 14DN61 has a wide substrate specificity and has the ability to convert various aromatic aldehydes to carboxylic acids. (Peng, X., Maruyama, T., Shindo, K., Kanoh, K., Ikenaga, H., and Misawa, N., International Congress on Biocatalysis, Hamburg 2004, Book of Abstracts, p. 227, 2004) . PhnN is not only a monocyclic aldehyde such as benzaldehyde, but also a polycyclic aldehyde such as 2-naphthyl aldehyde, which can be converted into each carboxylic acid with a very wide substrate specificity. It is an enzyme.

以上述べてきたように、芳香族アルコールデヒドロゲナーゼ及び芳香族アルデヒドデヒドロゲナーゼは、芳香族アルコール及び芳香族アルデヒドをそれぞれ、芳香族アルデヒド及び芳香族カルボン酸に変換する酵素である。これら2つの酵素の働きにより、ベンジルアルコールのような芳香族アルコールがカルボン酸に変換されるのである。   As described above, aromatic alcohol dehydrogenase and aromatic aldehyde dehydrogenase are enzymes that convert aromatic alcohol and aromatic aldehyde to aromatic aldehyde and aromatic carboxylic acid, respectively. By the action of these two enzymes, aromatic alcohols such as benzyl alcohol are converted to carboxylic acids.

Harayama, S., Rekik, M., Wubbolts, M., Rose, K., Leppik, R. A., and Timmis, K. N, Characterization of five genes in the upper-pathway operon of TOL plasmid pWW0 from Pseudomonas putida and identification of the gene products. J. Bacteriol. 171, 5048-5055, 1989Harayama, S., Rekik, M., Wubbolts, M., Rose, K., Leppik, RA, and Timmis, K. N, Characterization of five genes in the upper-pathway operon of TOL plasmid pWW0 from Pseudomonas putida and identification of the gene products. J. Bacteriol. 171, 5048-5055, 1989 Shaw, J. P., Schwager, F., and Harayama, S., Substrate-specificity of benzyl alcohol dehydrogenase and benzaldehyde dehydrogenase encoded by TOL plasmid pWW0. Metabolic and mechanistic implications. Biochem. J. 283, 789-794, 1992Shaw, J. P., Schwager, F., and Harayama, S., Substrate-specificity of benzyl alcohol dehydrogenase and benzaldehyde dehydrogenase encoded by TOL plasmid pWW0. Metabolic and mechanistic implications. Biochem. J. 283, 789-794, 1992

本発明の課題は、種々の芳香族アルコールを酸化し、アルデヒドに変換する酵素をコードする遺伝子を取得することである。そして更に、この遺伝子を導入・発現させた組換え微生物を利用した、種々の芳香族カルボン酸の製造法を提供することである。   An object of the present invention is to obtain a gene encoding an enzyme that oxidizes various aromatic alcohols and converts them into aldehydes. Still another object is to provide a method for producing various aromatic carboxylic acids using a recombinant microorganism into which this gene has been introduced and expressed.

本発明者らは、上記の課題を達成すべく鋭意研究を行った結果、トルエン資化細菌ロドコッカス・エリスロポリス(Rhodococcus erythropolis)PR4株由来の芳香族アルコールデヒドロゲナーゼ遺伝子が、様々な芳香族アルデヒド、たとえば、ベンズアルデヒド(benzaldehyde)や その置換体、さらには、ヒドロキシメチルナフタレン(hydroxymethylnaphthalene)や その置換体をそれぞれのアルデヒドに変換する新規の酵素であることを見出した。さらに本発明者らは、この芳香族アルコールデヒドロゲナーゼ遺伝子とともに、芳香族アルデヒドデヒドロゲナーゼ遺伝子を発現した大腸菌が、上記の様々な芳香族アルデヒドをそれぞれのカルボン酸に変換できることを明らかにし、本発明を完成するに至った。 As a result of intensive studies to achieve the above problems, the present inventors have found that aromatic alcohol dehydrogenase genes derived from the toluene-utilizing bacterium Rhodococcus erythropolis PR4 have various aromatic aldehydes such as Benzaldehyde and its substitutes, as well as hydroxymethylnaphthalene and its substitutes, were found to be novel enzymes that convert the respective aldehydes. Furthermore, the present inventors have clarified that Escherichia coli expressing an aromatic aldehyde dehydrogenase gene together with the aromatic alcohol dehydrogenase gene can convert the above various aromatic aldehydes into respective carboxylic acids, thereby completing the present invention. It came to.

即ち、本発明は、以下の(1)〜(6)を提供するものである。   That is, the present invention provides the following (1) to (6).

(1)以下の(a)、(b)、又は(c)に示すペプチド:
(a)配列番号4、配列番号5、又は配列番号6記載のアミノ酸配列からなるペプチド、
(b)配列番号4、配列番号5、又は配列番号6記載のアミノ酸配列において1もしくは複数個のアミノ酸が付加、欠失もしくは置換されたアミノ酸配列からなり、かつ芳香族アルコールデヒドロゲナーゼ活性を有するペプチド、
(c)配列番号1、配列番号2、又は配列番号3記載の塩基配列からなるDNA又はそれと相補的なDNAとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするDNAがコードする細菌由来のペプチドであって、芳香族アルコールデヒドロゲナーゼ活性を有するペプチド。
(1) Peptides shown in the following (a), (b), or (c):
(A) a peptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5 or SEQ ID NO: 6,
(B) a peptide comprising an amino acid sequence in which one or more amino acids are added, deleted or substituted in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5 or SEQ ID NO: 6, and having an aromatic alcohol dehydrogenase activity;
(C) a peptide derived from a bacterium encoded by DNA that hybridizes under stringent conditions with DNA consisting of the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, or SEQ ID NO: 3 or DNA complementary thereto, A peptide having aromatic alcohol dehydrogenase activity.

(2)(1)に記載のペプチドをコードする遺伝子。 (2) A gene encoding the peptide according to (1).

(3)(2)に記載の遺伝子を導入して得られる微生物であって、芳香族アルコールを芳香族カルボン酸に変換できる微生物。 (3) A microorganism obtained by introducing the gene according to (2), which can convert an aromatic alcohol into an aromatic carboxylic acid.

(4)微生物が大腸菌であることを特徴とする(3)に記載の微生物。 (4) The microorganism according to (3), wherein the microorganism is Escherichia coli.

(5)(3)又は(4)に記載の微生物を、芳香族アルコールを含む培地で培養して培養物又は菌体から芳香族カルボン酸を得ることを特徴とする、芳香族カルボン酸の製造法。 (5) Production of an aromatic carboxylic acid, wherein the microorganism according to (3) or (4) is cultured in a medium containing an aromatic alcohol to obtain an aromatic carboxylic acid from the culture or the cells. Law.

(6)芳香族アルコールが、1,4-ジヒドロキシメチルナフタレン、2-ヒドロキシメチル-6-メチルナフタレン、1-ヒドロキシメチルナフタレン、2-ヒドロキシメチルナフタレン、ベンジルアルコール、2-メチルベンジルアルコール、3-メチルベンジルアルコール、4-メチルベンジルアルコール、2-ヒドロキシベンジルアルコール、4-ヒドロキシベンジルアルコール、3-メトキシベンジルアルコール、4-メトキシベンジルアルコール、3-クロロベンジルアルコール、又はバニリルアルコールであり、前記芳香族アルコールから生成する芳香族カルボン酸がそれぞれ4-ヒドロキシメチル-1-ナフトエ酸、6-メチル-2-ナフトエ酸、1-ナフトエ酸、2-ナフトエ酸、安息香酸、2-メチル安息香酸、3-メチル安息香酸、4-メチル安息香酸、2-ヒドロキシ安息香酸、4-ヒドロキシ安息香酸、3-メトキシ安息香酸、4-メトキシ安息香酸、3-クロロ安息香酸、又は桂皮酸であることを特徴とする(5)に記載の芳香族カルボン酸の製造法。 (6) The aromatic alcohol is 1,4-dihydroxymethylnaphthalene, 2-hydroxymethyl-6-methylnaphthalene, 1-hydroxymethylnaphthalene, 2-hydroxymethylnaphthalene, benzyl alcohol, 2-methylbenzyl alcohol, 3-methyl Benzyl alcohol, 4-methylbenzyl alcohol, 2-hydroxybenzyl alcohol, 4-hydroxybenzyl alcohol, 3-methoxybenzyl alcohol, 4-methoxybenzyl alcohol, 3-chlorobenzyl alcohol, or vanillyl alcohol, the aromatic alcohol Aromatic carboxylic acids produced from 4-hydroxymethyl-1-naphthoic acid, 6-methyl-2-naphthoic acid, 1-naphthoic acid, 2-naphthoic acid, benzoic acid, 2-methylbenzoic acid, 3-methyl, respectively. Benzoic acid, 4-methylbenzoic acid, 2-hydroxybenzoic acid, 4-hydroxy The method for producing an aromatic carboxylic acid according to (5), which is cibenzoic acid, 3-methoxybenzoic acid, 4-methoxybenzoic acid, 3-chlorobenzoic acid, or cinnamic acid.

本発明は、芳香族カルボン酸の新規な製造手段を提供する。芳香族カルボン酸は、医薬品の原料や香料などとして利用されており、本発明は、これらの製造に有用である。   The present invention provides a novel means for producing aromatic carboxylic acids. Aromatic carboxylic acids are used as raw materials and fragrances for pharmaceuticals, and the present invention is useful for the production thereof.

以下、本発明を詳細に説明する。   The present invention will be described in detail below.

最初に本発明のペプチドについて説明する。   First, the peptide of the present invention will be described.

本発明のペプチドには、以下の(a)、(b)、又は(c)に示すペプチドが含まれる。   The peptides of the present invention include the peptides shown in the following (a), (b), or (c).

(a)配列番号4、配列番号5、又は配列番号6記載のアミノ酸配列からなるペプチド
(b)配列番号4、配列番号5、又は配列番号6記載のアミノ酸配列において1もしくは複数個のアミノ酸が付加、欠失もしくは置換されたアミノ酸配列からなり、かつ芳香族化合物デヒドロゲナーゼ活性を有するペプチド
(c)配列番号1、配列番号2、又は配列番号3記載の塩基配列からなるDNA又はそれと相補的なDNAとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするDNAがコードする細菌由来のペプチドであって、芳香族アルコールデヒドロゲナーゼ活性を有するペプチド
(a)のペプチドは、ロドコッカス・エリスロポリス(Rhodococcus erythropolis)PR4株中に含まれる3種類の芳香族アルコールデヒドロゲナーゼ遺伝子(遺伝子番号:052-0446M、010-0034N、049-0049M)がコードする芳香族アルコールデヒドロゲナーゼである。これらの3種類のペプチドは1,4-ジヒドロキシメチルナフタレン、2-ヒドロキシメチル-6-メチルナフタレン、1-ヒドロキシメチルナフタレン、2-ヒドロキシメチルナフタレン、ベンジルアルコール、2-メチルベンジルアルコール、3-メチルベンジルアルコール、4-メチルベンジルアルコール、2-ヒドロキシベンジルアルコール、4-ヒドロキシベンジルアルコール、3-メトキシベンジルアルコール、4-メトキシベンジルアルコール、3-クロロベンジルアルコール、及びバニリルアルコール基質として芳香族アルデヒドを生成する。また、配列番号6記載のアミノ酸配列からなるペプチドは上記芳香族アルコール以外にもキシレン-α,α’-ジオールを基質とし、配列番号5記載のアミノ酸配列からなるペプチドは上記芳香族アルコール以外にも3-ヒドロキシベンジルアルコールを基質とし、芳香族アルデヒドを生成する。
(A) A peptide comprising the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, or SEQ ID NO: 6 (b) One or more amino acids are added to the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5, or SEQ ID NO: 6. A peptide comprising a deleted or substituted amino acid sequence and having aromatic compound dehydrogenase activity (c) a DNA comprising the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, or SEQ ID NO: 3 or a DNA complementary thereto A peptide derived from a bacterium encoded by DNA that hybridizes under stringent conditions and having aromatic alcohol dehydrogenase activity (a) is included in Rhodococcus erythropolis PR4 strain Three types of aromatic alcohol dehydrogenase genes (gene number: 052-0446M, 010-0034N) 049-0049M) an aromatic alcohol dehydrogenase encoded. These three peptides are 1,4-dihydroxymethylnaphthalene, 2-hydroxymethyl-6-methylnaphthalene, 1-hydroxymethylnaphthalene, 2-hydroxymethylnaphthalene, benzyl alcohol, 2-methylbenzyl alcohol, 3-methylbenzyl Produces aromatic aldehydes as substrates for alcohol, 4-methylbenzyl alcohol, 2-hydroxybenzyl alcohol, 4-hydroxybenzyl alcohol, 3-methoxybenzyl alcohol, 4-methoxybenzyl alcohol, 3-chlorobenzyl alcohol, and vanillyl alcohol . Further, the peptide consisting of the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 6 uses xylene-α, α′-diol as a substrate in addition to the aromatic alcohol, and the peptide consisting of the amino acid sequence described in SEQ ID NO: 5 other than the aromatic alcohol. 3-hydroxybenzyl alcohol is used as a substrate to produce aromatic aldehydes.

(b)のペプチドは、(a)のペプチドに、(a)のペプチドと同様の芳香族アルコールデヒドロゲナーゼ活性を失わせない程度の変異が導入されたペプチドである。このような変異は、自然界において生じる変異のほかに、人為的な変異をも含む。人為的変異を生じさせる手段としては、部位特異的変異誘発法(Nucleic Acids Res. 10, 6487-6500, 1982)などを挙げることができるが、これに限定されるわけではない。変異したアミノ酸の数は、前記した活性を失わせない限り、その個数は制限されないが、通常は、30アミノ酸以内であり、好ましくは20アミノ酸以内であり、更に好ましくは10アミノ酸以内であり、最も好ましくは5アミノ酸以内である。   The peptide of (b) is a peptide in which a mutation is introduced into the peptide of (a) so as not to lose the same aromatic alcohol dehydrogenase activity as that of the peptide of (a). Such mutations include artificial mutations in addition to mutations that occur in nature. Examples of means for causing artificial mutation include site-directed mutagenesis (Nucleic Acids Res. 10, 6487-6500, 1982), but are not limited thereto. The number of mutated amino acids is not limited as long as the activity described above is not lost, but is usually within 30 amino acids, preferably within 20 amino acids, more preferably within 10 amino acids, most preferably Preferably it is within 5 amino acids.

(c)のペプチドは、DNA同士のハイブリダイゼーションを利用することにより得られる(a)のペプチドと同様の芳香族アルコールデヒドロゲナーゼ活性を持つペプチドである。(c)のタンパク質における「ストリンジェントな条件」とは、特異的なハイブリダイゼーションのみが起き、非特異的なハイブリダイゼーションが起きないような条件をいう。このような条件は、通常、37℃でのハイブリダイゼーション及び1×SSC、0.1%SDSを含む緩衝液による37℃での洗浄処理といった条件であり、好ましくは、42℃でのハイブリダイゼーション及び0.5×SSC、0.1%SDSを含む緩衝液による42℃での洗浄処理といった条件であり、更に好ましくは、65℃でのハイブリダイゼーション及び0.2×SSC、0.1%SDSを含む緩衝液による65℃での洗浄処理といった条件である。ハイブリダイゼーションにより得られるDNAは、配列番号1、配列番号2、又は配列番号3記載の塩基配列で表されるDNAと通常高い相同性を有する。高い相同性とは、60%以上の相同性、好ましくは75%以上の相同性、更に好ましくは90%以上の相同性を指す。   The peptide (c) is a peptide having the same aromatic alcohol dehydrogenase activity as the peptide (a) obtained by utilizing hybridization between DNAs. The “stringent conditions” in the protein of (c) refer to conditions under which only specific hybridization occurs and non-specific hybridization does not occur. Such conditions are usually conditions such as hybridization at 37 ° C. and washing treatment at 37 ° C. with a buffer containing 1 × SSC and 0.1% SDS, preferably hybridization at 42 ° C. and 0.5 × Conditions such as washing at 42 ° C. with a buffer containing SSC and 0.1% SDS, more preferably hybridization at 65 ° C. and washing at 65 ° C. with a buffer containing 0.2 × SSC and 0.1% SDS This is the condition. DNA obtained by hybridization usually has high homology with the DNA represented by the nucleotide sequence described in SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, or SEQ ID NO: 3. High homology refers to homology of 60% or more, preferably 75% or more, more preferably 90% or more.

本発明のペプチドをコードする遺伝子を導入することによって、芳香族アルコールを芳香族カルボン酸に変換できる微生物を作ることができる。   By introducing a gene encoding the peptide of the present invention, a microorganism capable of converting an aromatic alcohol into an aromatic carboxylic acid can be produced.

遺伝子導入の対象とする微生物は特に限定されないが、大腸菌が好ましい。また、芳香族アルコールから芳香族カルボン酸を生産するには、芳香族アルコールデヒドロゲナーゼと芳香族アルデヒドデヒドロゲナーゼが必要なので、遺伝子導入の対象とする微生物が芳香族アルデヒドデヒドロゲナーゼを生産しない場合には、芳香族アルデヒドデヒドロゲナーゼ遺伝子も導入する。このとき導入する芳香族アルデヒドデヒドロゲナーゼ遺伝子は特に限定されず、例えば、シュードモナス・プチダのTOLプラスミドpWW0中に含まれるxylC遺伝子、アシネトバクター・カルコアセチカスNCIB 8250が有するxylC遺伝子、スフィンゴモナス属14DN61株が有するphnN遺伝子などを挙げることができる。 The microorganism to be gene-transferred is not particularly limited, but Escherichia coli is preferable. In addition, since aromatic alcohol dehydrogenase and aromatic aldehyde dehydrogenase are required to produce aromatic carboxylic acid from aromatic alcohol, if the microorganism to be introduced does not produce aromatic aldehyde dehydrogenase, aromatic An aldehyde dehydrogenase gene is also introduced. Aromatic aldehyde dehydrogenase gene to be introduced at this time is not particularly limited, for example, XylC genes contained in the TOL plasmid pWW0 Pseudomonas putida, XylC gene possessed by Acinetobacter calcoaceticus NCIB 8250, phnN gene possessed by the genus Sphingomonas 14DN61 strain And so on.

このような微生物を、芳香族アルコールを含む培地で培養し、培養物又は菌体から芳香族カルボン酸を採取することにより芳香族カルボン酸を製造することができる。使用する培地は、微生物が基質として利用できる芳香族アルコールを含む培地であれば特に限定されず、例えば、1,4-ジヒドロキシメチルナフタレン、2-ヒドロキシメチル-6-メチルナフタレン、1-ヒドロキシメチルナフタレン、2-ヒドロキシメチルナフタレン、ベンジルアルコール、2-メチルベンジルアルコール、3-メチルベンジルアルコール、4-メチルベンジルアルコール、2-ヒドロキシベンジルアルコール、4-ヒドロキシベンジルアルコール、3-メトキシベンジルアルコール、4-メトキシベンジルアルコール、3-クロロベンジルアルコール、及びバニリルアルコールからなる群から選ばれる少なくとも1種を含む培地を使用することができる。また、配列番号6記載のアミノ酸配列からなるペプチド又はこれと同様の酵素活性をもつペプチドをコードする遺伝子を導入した微生物を用いる場合は、キシレン-α,α’-ジオールを含む培地を用いてもよく、配列番号5記載のアミノ酸配列からなるペプチド又はこれと同様の酵素活性をもつペプチドをコードする遺伝子を導入した微生物を用いる場合は、3-ヒドロキシベンジルアルコールを含む培地を用いてもよい。なお、本発明において「芳香族アルコール」とは、芳香環を持ち、芳香環を構成する炭素以外の炭素と結合するヒドロキシル基(好ましくは、ヒドロキシメチル基)を少なくとも一つ持つ物質をいう。   An aromatic carboxylic acid can be produced by culturing such a microorganism in a medium containing an aromatic alcohol and collecting the aromatic carboxylic acid from the culture or the cells. The medium to be used is not particularly limited as long as it contains an aromatic alcohol that can be used as a substrate by microorganisms. For example, 1,4-dihydroxymethylnaphthalene, 2-hydroxymethyl-6-methylnaphthalene, 1-hydroxymethylnaphthalene 2-hydroxymethylnaphthalene, benzyl alcohol, 2-methylbenzyl alcohol, 3-methylbenzyl alcohol, 4-methylbenzyl alcohol, 2-hydroxybenzyl alcohol, 4-hydroxybenzyl alcohol, 3-methoxybenzyl alcohol, 4-methoxybenzyl A medium containing at least one selected from the group consisting of alcohol, 3-chlorobenzyl alcohol, and vanillyl alcohol can be used. In addition, when using a microorganism into which a gene encoding a peptide consisting of the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 6 or a peptide having the same enzyme activity is used, a medium containing xylene-α, α′-diol may be used. When using a microorganism into which a gene encoding a peptide consisting of the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 5 or a peptide having the same enzyme activity is used, a medium containing 3-hydroxybenzyl alcohol may be used. In the present invention, the “aromatic alcohol” refers to a substance having an aromatic ring and having at least one hydroxyl group (preferably a hydroxymethyl group) bonded to carbon other than carbon constituting the aromatic ring.

以下、実施例により本発明を更に詳細に説明する。   Hereinafter, the present invention will be described in more detail with reference to examples.

〔実施例1〕 遺伝子操作実験
プラスミドの調製、制限酵素処理、ライゲーション反応、形質転換などの通常の遺伝子操作実験は、SambrookらのMolecular Cloning(Sambrook, J., Fritsch, E.F., and Maniatis, T., 1989, “Molecular cloning -a laboratory manual”, 2nd edition、または、 Sambrook, J., Russell, D.W., 2001, "Molecular cloning -a laboratory manual", Third edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y.)に示された方法、または、試薬のプロトコールに示された方法により行った。
[Example 1] Gene manipulation experiment Normal gene manipulation experiments such as plasmid preparation, restriction enzyme treatment, ligation reaction, transformation and the like were performed by Sambrook et al. In Molecular Cloning (Sambrook, J., Fritsch, EF, and Maniatis, T. et al. , 1989, “Molecular cloning -a laboratory manual”, 2nd edition, or Sambrook, J., Russell, DW, 2001, "Molecular cloning -a laboratory manual", Third edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY) or the method shown in the reagent protocol.

〔実施例2〕 Rhodococcus erythropolis PR4株によるトルエンの変換
ロドコッカス・エリスロポリス(Rhodococcus erythropolis)PR4株はMBIC 01337として (株) 海洋バイオテクノロジー研究所より分譲されているものを用いた。なお、この菌株は(独)製品評価技術基盤機構に寄託されている(受領番号:NITE AP-90、受領日:2005年6月14日)。R. erythropolis PR4株を1 mMのトルエンあるいはベンジルアルコールを含むTSB(Tryptic Soy Broth, DIFCO)培地で二日間培養した。この培養液100 μlに対し酢酸エチル 150 μl、3N塩酸10 μlを加えボルテックス攪拌を行い、15,000 rpmで5分間遠心し、上清の酢酸エチル相を回収後乾固した。次に、トリメチルシリル化剤(ジーエルサイエンス(株))でトリメチルシリル化してガスクロマトグラフィー-マススペクトロスコピー(GC-MS)用サンプルとした。GC-MSはQP5050A(島津製作所製)を使用し、カラムはDB-5 カラム(30 x0.25mm、J&W Scientific社製の)を使用した。カラム温度は最初50℃で5分間を保った後、300℃まで10℃/分の速度で昇温し、300℃で4分間を保った(1サンプルにつき計34分の測定条件)。注入温度と検出温度は300℃であった。
[Example 2] Conversion of toluene by Rhodococcus erythropolis PR4 strain Rhodococcus erythropolis PR4 strain used as MBIC 01337 was distributed by Marine Biotechnology Research Institute. This strain has been deposited with the National Institute for Product Evaluation Technology (reception number: NITE AP-90, date of receipt: June 14, 2005). The R. erythropolis PR4 strain was cultured in TSB (Tryptic Soy Broth, DIFCO) medium containing 1 mM toluene or benzyl alcohol for 2 days. To 100 μl of this culture solution, 150 μl of ethyl acetate and 10 μl of 3N hydrochloric acid were added, vortexed, centrifuged at 15,000 rpm for 5 minutes, and the ethyl acetate phase of the supernatant was recovered and dried. Next, it was trimethylsilylated with a trimethylsilylating agent (GL Science Co., Ltd.) to obtain a sample for gas chromatography-mass spectroscopy (GC-MS). GC-MS used QP5050A (manufactured by Shimadzu Corporation), and DB-5 column (30 × 0.25 mm, manufactured by J & W Scientific) was used as the column. The column temperature was initially maintained at 50 ° C. for 5 minutes, then increased to 300 ° C. at a rate of 10 ° C./minute, and maintained at 300 ° C. for 4 minutes (measurement conditions for a total of 34 minutes per sample). The injection temperature and detection temperature were 300 ° C.

分析結果を図1に示す。トルエンを含む培地で培養した場合、産物Iと産物IIのピークが検出された(図1A)。これらは、それぞれベンジルアルコール、安息香酸と同定された。ベンジルアルコールを含む培地で培養した場合、ベンジルアルコールのピークのほか、産物IIのピークが検出された(図1B)。産物IIは安息香酸と同定された。以上の結果から、R. erythropolis PR4株は図2に示すようなトルエン代謝経路を有しており、トルエンを分解するためのモノオキシゲナーゼ、アルコールデヒドゲナーゼ及びアルデヒドデヒドロゲナーゼ遺伝子を持っていることが示唆された。 The analysis results are shown in FIG. When cultured in a medium containing toluene, peaks of product I and product II were detected (FIG. 1A). These were identified as benzyl alcohol and benzoic acid, respectively. When cultured in a medium containing benzyl alcohol, the peak of product II was detected in addition to the peak of benzyl alcohol (FIG. 1B). Product II was identified as benzoic acid. The above results suggest that the R. erythropolis PR4 strain has a toluene metabolic pathway as shown in Fig. 2 and has a monooxygenase, alcohol dehydrogenase and aldehyde dehydrogenase genes for degrading toluene. It was done.

〔実施例3〕 Rhodococcus erythropolis PR4株からの染色体DNAの調製
R. erythropolis PR4株を300 mlのTryptic Soy Broth (TSB) 培地(Difco)で30℃、一日培養した。菌体を集菌後、STE緩衝液(100 mM NaCl, 10 mM Tris・HCl, 1 mM EDTA, pH 8.0 )で二回洗浄し、68℃で15分間熱処理をした後、5 mg/ml のリゾチーム(Sigma)と100 μg/mlのRNase (Sigma)を含むI液 (50 mM グルコース、25 mM Tris・HCl, 10 mM EDTA, pH 8.0)に懸濁した。37℃で1時間インキュベートした後、10 mg/mlになるようにProtenase K (Sigma)を加え、37℃で10分間インキュベートした。さらに最終濃度が1% になるようにN-ラウロイルサルコシン・Naを添加し、転倒混和により穏やかに完全に混合した後37℃で3時間インキュベートした。さらにフェノール/クロロホルム抽出を数回行った後、2倍量のエタノールをゆっくりと添加しながら、析出してきた染色体DNAをガラス棒で巻きつけ、70% エタノールでリンスした後、2 mlのTE緩衝液(10 mM Tris・HCl, 1 mM EDTA, pH 8.0)に溶解して、染色体DNA溶液とした。
[Example 3] Preparation of chromosomal DNA from Rhodococcus erythropolis PR4
R. erythropolis PR4 strain was cultured in 300 ml Tryptic Soy Broth (TSB) medium (Difco) at 30 ° C. for one day. After collecting the cells, they were washed twice with STE buffer (100 mM NaCl, 10 mM Tris / HCl, 1 mM EDTA, pH 8.0), heat-treated at 68 ° C. for 15 minutes, and then 5 mg / ml lysozyme (Sigma) and 100 μg / ml RNase (Sigma) -containing solution I (50 mM glucose, 25 mM Tris · HCl, 10 mM EDTA, pH 8.0). After incubating at 37 ° C. for 1 hour, Protenase K (Sigma) was added to 10 mg / ml and incubated at 37 ° C. for 10 minutes. Further, N-lauroyl sarcosine / Na was added to a final concentration of 1%, and the mixture was gently and thoroughly mixed by inversion, followed by incubation at 37 ° C. for 3 hours. After several phenol / chloroform extractions, slowly add 2 volumes of ethanol, wind up the precipitated chromosomal DNA with a glass rod, rinse with 70% ethanol, and then add 2 ml of TE buffer. It was dissolved in (10 mM Tris · HCl, 1 mM EDTA, pH 8.0) to obtain a chromosomal DNA solution.

〔実施例4〕 PCR法によりアルコールデヒドロゲナーゼ遺伝子(xylB)の取得
R. erythropolis PR4株のゲノム情報からこれまで知られていたxylB遺伝子と類似性を示す三つのアルコールデヒドロゲナーゼ遺伝子が見つかった(遺伝子番号:052-0446M、010-0034N、049-0049M)。これらの遺伝子をクローニングするためにPCRを行った。052-0446Mの全領域DNA配列を含む断片をプライマー(5’GTGAAAACACGGCGCCATGT3’(配列番号7)および5’CGACGCGATCGACTCGCAAT 3’(配列番号8))で増幅し、NovagenのベクターpT7Blueに挿入してプラスミドpT7-0446Mを構築した。010-0034Nの全領域DNA配列を含む断片をプライマー(5’ACGACGAATTCCTTGTTGTT3’(配列番号9)および5’ CGGCAACCGAAATAGCTAGT3’(配列番号10))で増幅し、pT7Blueに挿入してプラスミドpT7-0034Nを構築した。049-0049Mの全領域DNA配列を含む断片をプライマー(5’TGATTCGCGCCGAACAGAAT3’(配列番号11)および5’ GAATGAGACATTTCGCCCCT3’(配列番号12) で増幅し、pT7Blueに挿入してプラスミドpT7-0049Mを構築した。052-0446M、010-0034N、及び049-0049Mの塩基配列をそれぞれ配列番号1、配列番号2、及び配列番号3に示す。また、これらの遺伝子がコードするペプチドのアミノ酸配列をそれぞれ配列番号4、配列番号5、及び配列番号6に示す。
[Example 4] Acquisition of alcohol dehydrogenase gene ( xylB ) by PCR
From the genome information of R. erythropolis PR4 strain, three alcohol dehydrogenase genes showing similarity to the xylB gene known so far were found (gene numbers: 052-0446M, 010-0034N, 049-0049M). PCR was performed to clone these genes. A fragment containing the entire DNA sequence of 052-0446M was amplified with primers (5′GTGAAAACACGGCGCCATGT3 ′ (SEQ ID NO: 7) and 5′CGACGCGATCGACTCGCAAT 3 ′ (SEQ ID NO: 8)), inserted into the vector pT7Blue of Novagen, and the plasmid pT7- 0446M was built. A fragment containing the entire region DNA sequence of 010-0034N was amplified with primers (5'ACGACGAATTCCTTGTTGTT3 '(SEQ ID NO: 9) and 5' CGGCAACCGAAATAGCTAGT3 '(SEQ ID NO: 10)) and inserted into pT7Blue to construct plasmid pT7-0034N . A fragment containing the entire region DNA sequence of 049-0049M was amplified with primers (5′TGATTCGCGCCGAACAGAAT3 ′ (SEQ ID NO: 11) and 5 ′ GAATGAGACATTTCGCCCCT3 ′ (SEQ ID NO: 12), and inserted into pT7Blue to construct plasmid pT7-0049M. The base sequences of 052-0446M, 010-0034N, and 049-0049M are shown in SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, and SEQ ID NO: 3, respectively, and the amino acid sequences of peptides encoded by these genes are shown in SEQ ID NO: 4, It is shown in SEQ ID NO: 5 and SEQ ID NO: 6.

052-0446M、010-0034N、049-0049Mと関連のタンパク質のアミノ配列を用いて系統樹を作製した(図3)。図中の数字はbootscrap値である(1000回テスト)。また、図中の「052-0446M_Rhodococcus PR4」、「010-0034N_Rhodococcus PR4」、及び「049-0049M_Rhodococcus PR4」は、それぞれ前述した052-0446M、010-0034N、及び049-0049Mのアルコールデヒドロゲナーゼ遺伝子がコードするタンパク質を表す。図中の「TerpD_Pseudomonas」は Pseudomonas属のTerpD(Peterson, J. A., Lu, J. Y., Geisselsoder, J., Graham-Lorence, S., Carmona, C., Witney, F., Lorence, M. C., Cytochrome P-450terp. Isolation and purification of the protein and cloning and sequencing of its operon. J. Biol. Chem. Jul 15;267(20):14193-14203. 1992.)を表し、「XylB_Rhodococcus TKN14」は Rhodococcus opacus TKN14株のXylB(発明者が所属する(株)海洋バイオテクノロジー研究所所有のデータ)を表し、「MyrB_Pseudomonas」はPseudomonas sp. M1株のアルコールデヒドロゲナーゼMyrB(Iurescia, S., Marconi, A. M., Tofani, D., Gambacorta, A., Paterno, A., Devirgiliis, C., van der Werf, M. J., Zennaro, E. Identification and sequencing of beta-myrcene catabolism genes from Pseudomonas sp. strain M1. Appl. Environ. Microbiol. Jul;65(7):2871-2876. 1999.)を表し、「XylB_TOL」はPseudononas putida strain mt-2のTOL プラスミドにコードされるXylB(Shaw, J. P., Rekik, M., Schwager, F., and Harayama, S., Kinetic studies on benzyl alcohol dehydrogenase encoded by TOL plasmid pWW0, J. Biological Chemistry, 268, 10842-10850, 1993)を表し、「XylB_pWW0」はPseudononas putida TOL プラスミドpWW0にコードされるXylB(Harayama, S., Rekik, M., Wubbolts, M., Rose, K., Leppik, R. A., and Timmis, K., Characterization of five genes in the upper-pathway operon of TOL plasmid pWW0 from Pseudomonas putida and identification of the gene products. J. Bacteriol. 171(9), 5048-5055, 1989)を表し、「AreB_Acineto」はAcinetobater sp. ADP1株のAreB(Jones, R. M., Collier, L. S., Neidle, E. L., Williams, P. A., areABC genes determine the catabolism of aryl esters in Acinetobacter sp. Strain ADP1. J. Bacteriol. Aug;181(15):4568-4575. 1999)を表し、「XylB_Acineto」はAcinetobater calcoaceticus NCIB 8250のXylBを表し、「XylB_AcinetoII」はAcinetobacter calcoaceticus NCIB 8250のXylB(Gillooly, D. J., Robertson, A. G. S., and Fewson, C. A., Molecular characterization of benzyl alcohol dehydrogenase and benzaldehyde dehydrogenase II of Acinetobacter calcoaceticus. Biochem. J. 330, 1375-1381, 1998)を表し、「ADH1_Man」はヒトのアルコールデヒドロゲナーゼ(Matsuo, Y., Yokoyama, S., Molecular structure of the human alcohol dehydrogenase 1 gene. FEBS Lett., 243, 57-60, 1989)を表す。 A phylogenetic tree was created using amino sequences of proteins related to 052-0446M, 010-0034N, and 049-0049M (FIG. 3). The numbers in the figure are bootscrap values (1000 tests). In addition, “052-0446M_Rhodococcus PR4”, “010-0034N_Rhodococcus PR4”, and “049-0049M_Rhodococcus PR4” in the figure are encoded by the above-described alcohol dehydrogenase genes 052-0446M, 010-0034N, and 049-0049M, respectively. Represents a protein. “TerpD_Pseudomonas” in the figure is TerpD of the genus Pseudomonas (Peterson, JA, Lu, JY, Geisselsoder, J., Graham-Lorence, S., Carmona, C., Witney, F., Lorence, MC, Cytochrome P-450terp Isolation and purification of the protein and cloning and sequencing of its operon. J. Biol. Chem. Jul 15; 267 (20): 14193-14203. 1992.), “XylB_Rhodococcus TKN14” is XylB of Rhodococcus opacus TKN14 strain (MyrB_Pseudomonas) represents the alcohol dehydrogenase MyrB (Iurescia, S., Marconi, AM, Tofani, D., Gambacorta) of the Pseudomonas sp. M1 strain. , A., Paterno, A., Devirgiliis, C., van der Werf, MJ, Zennaro, E. Identification and sequencing of beta-myrcene catabolism genes from Pseudomonas sp. Strain M1. Appl. Environ. Microbiol. Jul; 65 ( 7): 2871-2876. 1999.), “XylB_TOL” is XylB (Shaw, JP, Rekik, M., Schwager, F) encoded by the TOL plasmid of Pseudononas putida strain mt-2 , and Harayama, S., Kinetic studies on benzyl alcohol dehydrogenase encoded by TOL plasmid pWW0, J. Biological Chemistry, 268, 10842-10850, 1993), “XylB_pWW0” is XylB encoded by Pseudononas putida TOL plasmid pWW0 (Harayama, S., Rekik, M., Wubbolts, M., Rose, K., Leppik, RA, and Timmis, K., Characterization of five genes in the upper-pathway operon of TOL plasmid pWW0 from Pseudomonas putida and identification 171 (9), 5048-5055, 1989), “AreB_Acineto” is Acinetobater sp. ADP1 strain AreB (Jones, RM, Collier, LS, Neidle, EL, Williams, PA , areABC genes determine the catabolism of aryl esters in Acinetobacter sp. Strain ADP1. J. Bacteriol. Aug; 181 (15): 4568-4575. 1999), “XylB_Acineto” represents XylB of Acinetobater calcoaceticus NCIB 8250, “ XylB_AcinetoII ”is an Acinetobacter calcoaceticus NCIB 8250 XylB (Gillooly, DJ, Robertson, AGS, and Fewson, CA, Molecular characterization of benzyl al cohol dehydrogenase and benzaldehyde dehydrogenase II of Acinetobacter calcoaceticus . Biochem. J. 330, 1375-1381, 1998), "ADH1_Man" is human alcohol dehydrogenase (Matsuo, Y., Yokoyama, S., Molecular structure of the human alcohol dehydrogenase 1 gene. FEBS Lett., 243, 57-60, 1989).

010-0034Nと049-0049Mにコードされるタンパク質がお互いに46%の相同性(同一性)を示し、一つのグループを形成した。また、これらのタンパク質は、これまでよく研究されていたTOLプラスミドのキシレン代謝系のXylBタンパク質グループと42%〜46%の相同性を示した。これに対して052-0446Mにコードされるタンパク質はTOLプラスミドのキシレン代謝系のXylBタンパク質グループと30%の相同性しか認められなかった。以上の結果から、今回解析した052-0446M、010-0034N、049-0049M遺伝子は既存のものとはいずれも、コードされるアミノ酸配列レベルで46%以下の相同性しか有さない新規な遺伝子であることが明らかとなった。   The proteins encoded by 010-0034N and 049-0049M showed 46% homology (identity) with each other, forming a group. In addition, these proteins showed 42% to 46% homology with the XylB protein group of the xylene metabolic system of the TOL plasmid, which has been well studied so far. In contrast, the protein encoded by 052-0446M showed only 30% homology with the XylB protein group in the xylene metabolism system of the TOL plasmid. Based on the above results, the 052-0446M, 010-0034N, and 049-0049M genes analyzed this time are all novel genes having no more than 46% homology at the encoded amino acid sequence level. It became clear that there was.

〔実施例5〕 プラスミドpPhnN-XylB0446M、pPhnN-XylB0034NおよびpPhnN-XylB0049Mの作製
今回クローニングしたアルコールデヒドロゲナーゼ遺伝子は単独ではそれらがコードする酵素の活性を検出しにくいので、それぞれの遺伝子をphnN遺伝子の上流に配置したプラスミド(pPhnN-XylBシリーズ)を作製し、酵素活性の測定を行った。phnN遺伝子は1,4-ジメチルナフタレン資化菌Sphingomonas sp. 14DN61株から単離された芳香族アルデヒドデヒドロゲナーゼ遺伝子である(Peng, X., Maruyama, T., Shindo, K., Kanoh, K., Ikenaga, H., and Misawa, N., International Congress on Biocatalysis, Hamburg 2004, Book of Abstracts, p. 227, 2004)。プラスミドpPhnN(pNB2.18N)は、このphnN遺伝子を含む2.18-kb NotI-BamHI断片がpBluescript II SK+のNotI-BamHI部位に挿入されたプラスミドである。今回作製したプラスミドpPhnN-XylBシリーズ(図4)を持つ大腸菌は、芳香族アルデヒドからカルボン酸へ容易に変換できるようになり、カルボン酸の生成量を定量することによってxylB遺伝子産物の活性が評価できると考えられる。プラスミドは以下のように作製した。プラスミドpT7-0446の1.1-kb HindIII-KpnI断片をpPhnNのHindIII-KpnIに挿入してpPhnN-XylB0446Mを作製した。PT7-0034Nの1.2-kb BamHI-HindIII断片をpPhnNのBamHI-HindIIIに挿入してpPhnN-XylB0034Nを作製した。pT7-0049Mの1.1-kb HindIII-KpnI断片をpPhnNのHindIII-KpnIに挿入してpPhnN-XylB0049Mを作製した。
[Example 5] Construction of plasmids pPhnN-XylB0446M, pPhnN-XylB0034N and pPhnN-XylB0049M Since the alcohol dehydrogenase genes cloned this time are difficult to detect the activity of the enzyme encoded by them alone, each gene is placed upstream of the phnN gene. The arranged plasmid (pPhnN-XylB series) was prepared, and the enzyme activity was measured. The phnN gene is an aromatic aldehyde dehydrogenase gene isolated from the 1,4-dimethylnaphthalene-utilizing bacterium Sphingomonas sp. 14DN61 strain (Peng, X., Maruyama, T., Shindo, K., Kanoh, K., Ikenaga, H., and Misawa, N., International Congress on Biocatalysis, Hamburg 2004, Book of Abstracts, p. 227, 2004). The plasmid pPhnN (pNB2.18N) is a plasmid in which the 2.18-kb Not I- Bam HI fragment containing this phnN gene is inserted into the Not I- Bam HI site of pBluescript II SK +. E. coli with the plasmid pPhnN-XylB series (Fig. 4) prepared this time can be easily converted from aromatic aldehyde to carboxylic acid, and the activity of the xylB gene product can be evaluated by quantifying the amount of carboxylic acid produced. it is conceivable that. The plasmid was prepared as follows. A 1.1-kb Hin dIII- Kpn I fragment of plasmid pT7-0446 was inserted into Hin dIII- Kpn I of pPhnN to prepare pPhnN-XylB0446M. A 1.2-kb Bam HI- Hin dIII fragment of PT7-0034N was inserted into Bam HI- Hin dIII of pPhnN to prepare pPhnN-XylB0034N. A 1.1-kb Hin dIII- Kpn I fragment of pT7-0049M was inserted into Hin dIII- Kpn I of pPhnN to prepare pPhnN-XylB0049M.

〔実施例6〕 xylB遺伝子を持つ大腸菌の芳香族アルコールの変換活性
プラスミドpPhnNおよびpPhnN-XylBシリーズをそれぞれ含む大腸菌JM101を10 mlのアンピシリン100μg/mlを含むLB培地で30℃にて12時間培養を行った後、菌体を遠心操作により回収後、アンピシリン100μg/ml、0.2%(w/v)グルコース、0.01%(w/v)チアミン、1 mMのIPTGを含むM9培地(Na2HPO4, 6 g/L; KH2PO4, 3 g/L; NaCl, 0.5 g/L; NH4Cl, 1 g/L; MgSO4, 1 mM; CaCl2, 0.1 mM;FeSO4, 0.01 mM)3 mlに懸濁した。この菌体液を基質の数と同数用意し、各菌体液にそれぞれの基質溶液(100 mM DMSO溶液)を、基質の最終濃度が0.5 mMになるように添加した。この菌体を含む基質溶液を栓つき試験管に移し、蓋を密閉して30℃で二日間培養を行った。この培養液それぞれ200 μlを等量のメタノールと混ぜて遠心分離後、高速液体クロマトグラフィー(HPLC)の分析に供した。HPLCはWaters Alliance(Waters社製)を使用し、カラムはオクタデシルシリカ逆相カラム(長さ:10 cm、直径:4.6 mm、Waters社製)を使用した。流速は1 ml/ minとした。サンプル注入後溶媒A(0.1% リン酸水溶液)を2分間流した後、溶媒B (0.1% リン酸アセトニトリル溶液) で70%までのグラジエントをかけ、その後、70%の溶媒B を5分間流した。検出は230から280 nm間で最大値を示す波長(max plot)で測定した。
[Example 6] Conversion activity of aromatic alcohol of Escherichia coli having xylB gene Escherichia coli JM101 containing plasmids pPhnN and pPhnN-XylB series was cultured in LB medium containing 10 ml of ampicillin 100 µg / ml at 30 ° C for 12 hours. After the cells were collected by centrifugation, ampicillin 100 μg / ml, 0.2% (w / v) glucose, 0.01% (w / v) thiamine, M9 medium containing 1 mM IPTG (Na 2 HPO 4 , 6 g / L; KH 2 PO 4 , 3 g / L; NaCl, 0.5 g / L; NH 4 Cl, 1 g / L; MgSO4, 1 mM; CaCl 2 , 0.1 mM; FeSO 4 , 0.01 mM) 3 ml It was suspended in. The same number of substrate solutions as the number of substrates were prepared, and each substrate solution (100 mM DMSO solution) was added to each cell solution so that the final concentration of the substrate was 0.5 mM. The substrate solution containing the microbial cells was transferred to a stoppered test tube, and the lid was sealed and cultured at 30 ° C. for 2 days. 200 μl of each culture was mixed with an equal volume of methanol, centrifuged, and subjected to high performance liquid chromatography (HPLC) analysis. HPLC used Waters Alliance (made by Waters), and the column used the octadecyl silica reverse phase column (length: 10 cm, diameter: 4.6 mm, Waters). The flow rate was 1 ml / min. After sample injection, solvent A (0.1% phosphoric acid aqueous solution) was allowed to flow for 2 minutes, then a gradient up to 70% was applied with solvent B (0.1% phosphoric acid acetonitrile solution), and then 70% solvent B was allowed to flow for 5 minutes. . Detection was performed at a wavelength (max plot) showing a maximum value between 230 and 280 nm.

この結果を表1に示す。   The results are shown in Table 1.

Figure 2006345744
Figure 2006345744

プラスミドpPhnN-XylB0049M、pPhnN-XylB0034N、pPhnN-XylB0046Mを持つ大腸菌(E. coli)JM101株は、多種類の芳香族アルコールを変換して芳香族カルボン酸を合成することができた。たとえば、1,4-ジヒドロキシメチルナフタレンから4-ヒドロキシメチル-1-ナフトエ酸を、2-ヒドロキシメチル-6-メチルナフタレンから6-メチル-2-ナフトエ酸を、1-ヒドロキシメチルナフタレンから1-ナフトエ酸を、2-ヒドロキシメチルナフタレンから2-ナフトエ酸を、ベンジルアルコールから安息香酸を、2-、3-、4-メチルベンジルアルコールからそれぞれ2-、3-、4-メチル安息香酸を、2-、4-ヒドロキシベンジルアルコールからそれぞれ2-、4-ヒドロキシ安息香酸を、3-、4-メトキシベンジルアルコールからそれぞれ3-、4-メトキシ安息香酸を、3-クロロベンジルアルコールから3-クロロ安息香酸を、バニリルアルコールからから桂皮酸を生成することが確認された。カルボン酸の生成量は、コントロールのプラスミドpPhnNを持つE. coli JM101のよりかなり高いことから、各XylBが機能した結果であることは明らかである。特に、ナフタレン骨格を持つアルコール化合物、すなわち、1,4-ジヒドロキシメチルナフタレン、2-ヒドロキシメチル-6-メチルナフタレン、1-ヒドロキシメチルナフタレン、2-ヒドロキシメチルナフタレンの変換活性が高いことは注目に値する。一方、3種類のプラスミドを持つ大腸菌のうち、キシレン-α,α’-ジオールは大腸菌(pPhnN-XylB0049M)のみが、3-ヒドロキシベンジルアルコールは大腸菌(pPhnN-XylB0034N)のみが、それぞれのカルボン酸に変換することができた。なお、2-メトキシベンジルアルコールに対する変換活性は、3種類の組換え大腸菌ともに確認されなかった。 E. coli JM101 strains carrying plasmids pPhnN-XylB0049M, pPhnN-XylB0034N, and pPhnN-XylB0046M were able to synthesize aromatic carboxylic acids by converting many types of aromatic alcohols. For example, 1,4-dihydroxymethylnaphthalene to 4-hydroxymethyl-1-naphthoic acid, 2-hydroxymethyl-6-methylnaphthalene to 6-methyl-2-naphthoic acid, and 1-hydroxymethylnaphthalene to 1-naphthoic acid. Acid, 2-hydroxymethylnaphthalene to 2-naphthoic acid, benzyl alcohol to benzoic acid, 2-, 3-, 4-methylbenzyl alcohol to 2-, 3-, 4-methylbenzoic acid, 2- 4-hydroxybenzyl alcohol, 2-, 4-hydroxybenzoic acid, 3-, 4-methoxybenzyl alcohol, 3-, 4-methoxybenzoic acid, 3-chlorobenzyl alcohol, 3-chlorobenzoic acid, respectively. It was confirmed that cinnamic acid was produced from vanillyl alcohol. Since the amount of carboxylic acid produced is considerably higher than that of E. coli JM101 with the control plasmid pPhnN, it is clear that each XylB is a functioning result. In particular, it is noteworthy that alcohol compounds having a naphthalene skeleton, ie 1,4-dihydroxymethylnaphthalene, 2-hydroxymethyl-6-methylnaphthalene, 1-hydroxymethylnaphthalene and 2-hydroxymethylnaphthalene have high conversion activity. . On the other hand, among E. coli with three types of plasmids, xylene-α, α'-diol is only E. coli (pPhnN-XylB0049M) and 3-hydroxybenzyl alcohol is only E. coli (pPhnN-XylB0034N). Could be converted. The conversion activity for 2-methoxybenzyl alcohol was not confirmed in all three types of recombinant E. coli.

ロドコッカス・エリスロポリスPR4株のトルエン(A)、ベンジルアルコール(B)代謝産物のGC-MSによる解析結果を示す図である。It is a figure which shows the analysis result by GC-MS of the toluene (A) and benzyl alcohol (B) metabolite of Rhodococcus erythropolis PR4 strain. ロドコッカス・エリスロポリスPR4株のトルエン代謝経路を示した図である。It is the figure which showed the toluene metabolic pathway of Rhodococcus erythropolis PR4 strain. XylBおよび関連酵素の系統樹を示す図である。It is a figure which shows the phylogenetic tree of XylB and related enzyme. プラスミドpPhnN-XylB0446M、pPhnN-XylB0034N、pPhnN-XylB0049Mの構造を示す図である(制限酵素:N, Not I;B, BamHI;K, KpnI;H, HindIII)。Plasmid pPhnN-XylB0446M, pPhnN-XylB0034N, illustrates the structure of pPhnN-XylB0049M (restriction enzymes: N, Not I; B, Bam HI; K, Kpn I; H, Hin dIII).

Claims (6)

以下の(a)、(b)、又は(c)に示すペプチド:
(a)配列番号4、配列番号5、又は配列番号6記載のアミノ酸配列からなるペプチド、
(b)配列番号4、配列番号5、又は配列番号6記載のアミノ酸配列において1もしくは複数個のアミノ酸が付加、欠失もしくは置換されたアミノ酸配列からなり、かつ芳香族アルコールデヒドロゲナーゼ活性を有するペプチド、
(c)配列番号1、配列番号2、又は配列番号3記載の塩基配列からなるDNA又はそれと相補的なDNAとストリンジェントな条件下でハイブリダイズするDNAがコードする細菌由来のペプチドであって、芳香族アルコールデヒドロゲナーゼ活性を有するペプチド。
Peptides shown in the following (a), (b), or (c):
(A) a peptide comprising the amino acid sequence of SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5 or SEQ ID NO: 6,
(B) a peptide comprising an amino acid sequence in which one or more amino acids are added, deleted or substituted in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 5 or SEQ ID NO: 6, and having an aromatic alcohol dehydrogenase activity;
(C) a peptide derived from a bacterium encoded by DNA that hybridizes under stringent conditions with DNA consisting of the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, or SEQ ID NO: 3 or DNA complementary thereto, A peptide having aromatic alcohol dehydrogenase activity.
請求項1に記載のペプチドをコードする遺伝子。   A gene encoding the peptide according to claim 1. 請求項2に記載の遺伝子を導入して得られる微生物であって、芳香族アルコールを芳香族カルボン酸に変換できる微生物。   A microorganism obtained by introducing the gene according to claim 2, wherein the microorganism can convert an aromatic alcohol into an aromatic carboxylic acid. 微生物が大腸菌であることを特徴とする請求項3に記載の微生物。   The microorganism according to claim 3, wherein the microorganism is Escherichia coli. 請求項3又は4に記載の微生物を、芳香族アルコールを含む培地で培養して培養物又は菌体から芳香族カルボン酸を得ることを特徴とする、芳香族カルボン酸の製造法。   A method for producing an aromatic carboxylic acid, comprising culturing the microorganism according to claim 3 or 4 in a medium containing an aromatic alcohol to obtain the aromatic carboxylic acid from the culture or the cells. 芳香族アルコールが、1,4-ジヒドロキシメチルナフタレン、2-ヒドロキシメチル-6-メチルナフタレン、1-ヒドロキシメチルナフタレン、2-ヒドロキシメチルナフタレン、ベンジルアルコール、2-メチルベンジルアルコール、3-メチルベンジルアルコール、4-メチルベンジルアルコール、2-ヒドロキシベンジルアルコール、4-ヒドロキシベンジルアルコール、3-メトキシベンジルアルコール、4-メトキシベンジルアルコール、3-クロロベンジルアルコール、又はバニリルアルコールであり、前記芳香族アルコールから生成する芳香族カルボン酸がそれぞれ4-ヒドロキシメチル-1-ナフトエ酸、6-メチル-2-ナフトエ酸、1-ナフトエ酸、2-ナフトエ酸、安息香酸、2-メチル安息香酸、3-メチル安息香酸、4-メチル安息香酸、2-ヒドロキシ安息香酸、4-ヒドロキシ安息香酸、3-メトキシ安息香酸、4-メトキシ安息香酸、3-クロロ安息香酸、又は桂皮酸であることを特徴とする請求項5に記載の芳香族カルボン酸の製造法。
Aromatic alcohol is 1,4-dihydroxymethylnaphthalene, 2-hydroxymethyl-6-methylnaphthalene, 1-hydroxymethylnaphthalene, 2-hydroxymethylnaphthalene, benzyl alcohol, 2-methylbenzyl alcohol, 3-methylbenzyl alcohol, 4-methylbenzyl alcohol, 2-hydroxybenzyl alcohol, 4-hydroxybenzyl alcohol, 3-methoxybenzyl alcohol, 4-methoxybenzyl alcohol, 3-chlorobenzyl alcohol, or vanillyl alcohol, which is produced from the aromatic alcohol Aromatic carboxylic acids are 4-hydroxymethyl-1-naphthoic acid, 6-methyl-2-naphthoic acid, 1-naphthoic acid, 2-naphthoic acid, benzoic acid, 2-methylbenzoic acid, 3-methylbenzoic acid, 4-methylbenzoic acid, 2-hydroxybenzoic acid, 4-hydroxybenzoic acid 6. The process for producing an aromatic carboxylic acid according to claim 5, wherein the process is aromatic acid, 3-methoxybenzoic acid, 4-methoxybenzoic acid, 3-chlorobenzoic acid, or cinnamic acid.
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