JP2006136319A - Marker gene of large intestine cancer - Google Patents

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Abstract

<P>PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a new human originated mannose transferase gene as a marker gene of large intestine cancer. <P>SOLUTION: Hmat-Xa gene coding either one of the following proteins (A) or (B) is provided; (A) a protein having a specific amino acid sequence, (B) a protein with an amino acid sequence containing substitution, deletion, insertion and/or addition of one or several amino acid substituents for/from/into/to the amino acid sequence having the specific amino acid sequence, and having sugar transferase activity. <P>COPYRIGHT: (C)2006,JPO&NCIPI

Description

本発明は、大腸癌の診断のために有用な新規な腫瘍マーカー遺伝子に関する。    The present invention relates to a novel tumor marker gene useful for diagnosis of colorectal cancer.

バイオテクノロジーの発達により、ヒトのホルモン・血液凝固因子などがバイオ医薬として生産されるようになった。バイオ医薬のかなりのものが、蛋白に糖鎖が共有結合した糖蛋白といわれるものである。これら有用糖蛋白遺伝子のクローニングにもとづく大腸菌での産生系の確立の試みの過程で、大腸菌へのヒト遺伝子の組み換えでは活性が発現できないことがわかった。その主たる原因は、大腸菌ではヒトの体内で産生する際に付加する糖鎖の生合成系が存在しないために、糖鎖を欠いた蛋白が産生されることによる。そのために、有用糖蛋白産生系として、ヒトと同様な糖鎖生合成系を持つチャイニーズハムスター卵巣細胞(CHO細胞)をはじめとする動物培養細胞を用いた産生系が開発され、バイオインダストリーにおける生産で実用化されている。糖蛋白の糖鎖として主要なものにアスパラギン結合型糖鎖とムチン型糖鎖がある。糖蛋白のアスパラギン結合型糖鎖は、リピド中間体[Glc3Man9GlcNAc2-P-P-ドリコール(Dol):Glc; グルコース、Man;マンノース、GlcNAc; N-アセチルグルコサミン、P:リン酸]を前駆体としている。リピド中間体の生合成は粗面小胞体膜の細胞質側で開始され、糖ヌクレオチド(UDP-GlcNAcおよびGDP-Man)を糖供与体とする7段階の反応、そして、粗面小胞体膜の内腔側に転送後のドリコールリン酸糖(Dol-P-ManおよびDol-P-Glc)を糖供与体とする7段階の反応、合計全14段階の糖転移酵素反応によって行われる。リピド中間体の構造およびその生合成過程は、酵母、植物、動物といった真核生物間で共通である。 With the development of biotechnology, human hormones and blood coagulation factors have been produced as biopharmaceuticals. A considerable number of biopharmaceuticals are called glycoproteins in which a sugar chain is covalently bonded to a protein. In the process of establishing a production system in E. coli based on the cloning of these useful glycoprotein genes, it was found that the activity could not be expressed by recombination of the human gene into E. coli. The main reason for this is that in Escherichia coli, there is no sugar chain biosynthetic system to be added when it is produced in the human body, and therefore proteins lacking sugar chains are produced. For this reason, production systems using cultured animal cells such as Chinese hamster ovary cells (CHO cells) that have the same sugar chain biosynthesis system as humans have been developed as useful glycoprotein production systems. It has been put into practical use. The main sugar chains of glycoproteins include asparagine-linked sugar chains and mucin-type sugar chains. Asparagine-linked sugar chain of glycoprotein is a precursor of lipid intermediate [Glc 3 Man 9 GlcNAc 2 -PP-Dolicol (Dol): Glc; glucose, Man; mannose, GlcNAc; N-acetylglucosamine, P: phosphate] The body. The biosynthesis of the lipid intermediate is initiated on the cytoplasmic side of the rough endoplasmic reticulum membrane, a seven-step reaction using sugar nucleotides (UDP-GlcNAc and GDP-Man) as sugar donors, and within the rough endoplasmic reticulum membrane The reaction is carried out by a seven-stage reaction using dolichol phosphate sugars (Dol-P-Man and Dol-P-Glc) after transfer to the cavity side as a sugar donor, for a total of 14 stages of glycosyltransferase reaction. The structure of the lipid intermediate and its biosynthesis process are common among eukaryotes such as yeast, plants and animals.

本発明者のうちの一人は、ヒト・バーキットリンパ腫由来Raji細胞の培養にリピド中間体の生合成過程最初の反応であるN-アセチルグルコサミン-1-リン酸転移酵素を特異的に阻害するツニカマイシンを投与すると、その細胞増殖がG1期で可逆的に停止することを発見した[Nishikawa, Y., Yamamoto, Y., Kaji, K. and Mitsui, H.: Biochem. Biophys. Res. Commun. 97: 1296-1303(1980)]。これは真核細胞の細胞周期上のG1期通過に、リピド中間体の生合成および糖蛋白のアスパラギン結合型糖鎖生合成が必要であることを初めて明らかにしたのである。この発見は、本発明者の一人による、マウス乳癌由来FM3A細胞からのリピド中間体生合成変異株G258(マンノース転移酵素IV変異株と思われる)の分離のための理論的根拠となった[Nishikawa, Y.: J. Cell. Physiol. 119:260-266(1984)]。また、酵母においても追試され、その後の酵母に於けるリピド中間体生合成変異株分離のための理論的根拠になった。以上の研究の流れから、本発明者らは、リピド中間体生合成過程のうち、粗面小胞体膜の細胞質側で行われる、前半5段階のマンノース転移酵素に焦点をあてて研究を行っている。そして、酵母でクローニングされたマンノース転移酵素遺伝子のアミノ酸配列をもとに、ヒト遺伝子のホモロジー・クローニングを行ってきた。すなわち、酵母でクローニングされたALG1遺伝子(マンノース転移酵素I遺伝子)、ALG2遺伝子(マンノース転移酵素III遺伝子とされてきた)、ALG11遺伝子(マンノース転移酵素V遺伝子とされている)に相同なヒト遺伝子としてHmat-1、Hmat-3、Hmat-5 の各遺伝子をクローニングした。そして、その塩基配列を決定し、それから推定アミノ酸配列を得た。それらは、糖ヌクレオチドを糖供与体とする糖転移酵素に特有なlycosyl transferase group 1 domainおよび糖ヌクレオチド結合部位と考えられているDXD(DDX)配列(D:アスパラギン酸、X:任意のアミノ酸)を持っていた。   One of the present inventors is a tunicamycin that specifically inhibits N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase, which is the first reaction in the biosynthesis process of lipid intermediates in the culture of Raji cells derived from human Burkitt lymphoma. It was found that the cell proliferation was reversibly stopped in the G1 phase by administration of [Nishikawa, Y., Yamamoto, Y., Kaji, K. and Mitsui, H .: Biochem. Biophys. Res. Commun. 97 : 1296-1303 (1980)]. This is the first time that the biosynthesis of lipid intermediates and the biosynthesis of asparagine-linked glycans of glycoproteins are necessary for passing through the G1 phase of the eukaryotic cell cycle. This discovery provided the rationale for the isolation of a lipid intermediate biosynthetic mutant G258 (possibly a mannose transferase IV mutant) from mouse breast cancer-derived FM3A cells by one of the inventors [Nishikawa , Y .: J. Cell. Physiol. 119: 260-266 (1984)]. In addition, it was further tested in yeast and became a theoretical basis for the separation of lipid intermediate biosynthetic mutants in yeast. From the above research flow, the present inventors have focused on the first five steps of mannose transferase, which is performed on the cytoplasmic side of the rough endoplasmic reticulum membrane in the lipid intermediate biosynthesis process. Yes. Based on the amino acid sequence of the mannose transferase gene cloned in yeast, human genes have been homologated and cloned. That is, as human genes homologous to the ALG1 gene (mannose transferase I gene), ALG2 gene (which has been referred to as mannose transferase III gene), and ALG11 gene (which has been referred to as mannose transferase V gene) cloned in yeast The genes Hmat-1, Hmat-3 and Hmat-5 were cloned. And the base sequence was determined and the deduced amino acid sequence was obtained from it. They include a lycosyl transferase group 1 domain unique to glycosyltransferases using sugar nucleotides as sugar donors and a DXD (DDX) sequence that is considered to be a sugar nucleotide binding site (D: aspartic acid, X: any amino acid). had.

癌化に伴う糖蛋白糖鎖の構造変化については、1975年前後から報告が出ている。ここでは、癌化による糖蛋白のアスパラギン結合型糖鎖の分岐構造としての、α1-6アームのManα1-6に対してβ1-6結合で付加するN-アセチルグルコサミンの増加と、それに先立つβ1-6N-アセチルグルコサミン転移酵素(N-アセチルグルコサミン転移酵素VI)の発現昂進について述べる。   The structural change of glycoprotein sugar chains accompanying canceration has been reported since around 1975. Here, as an asparagine-linked sugar chain branching structure of glycoprotein due to canceration, N-acetylglucosamine added by β1-6 bond to Manα1-6 of α1-6 arm, followed by β1- The expression promotion of 6N-acetylglucosamine transferase (N-acetylglucosamine transferase VI) is described.

糖蛋白のアスパラギン結合型糖鎖のβ1-6分岐は、N-アセチルグルコサミン転移酵素Vによって形成され、同分岐は、その後のポリラクトサミン構造の生成、シアル酸付加に続く。この分岐の形成は、細胞表層や細胞外マトリックスに存在する糖蛋白が関わる細胞の基質への接着などに影響する。山下ら[J. Biol. Chem. 260: 3893-3969(1985);非特許文献1]によってポリオーマウイルスによるBHK細胞の形質転換によってβ1-6分岐が増加し、かつ、N-アセチルグルコサミン転移酵素V活性が増加することが報告された。この報告を契機に、N-アセチルグルコサミン転移酵素V活性(発現)と形質転換、腫瘍転移[Dennisら Science 236: 582-585(1987) ;非特許文献2、谷口らClin. Cancer Res. 6: 1772-1776(2000) ;非特許文献3]などとの関係に焦点があてられた。そして、Dennisら[J. Biol. Chem. 266: 1772-1782(1991)];非特許文献4]により、ヒト肺ガンなどにおいて、β1-6分岐が増加し、それとN-アセチルグルコサミン転移酵素V活性が対応していることが示されてきた。更に、このN-アセチルグルコサミン転移酵素V活性の上昇は、N-アセチルグルコサミン転移酵素V遺伝子(Mgat-5)転写活性と平行していることについても多くの報告がある[Petretti ら Biochim. Biophys. Acta 1428:209-218(1999);非特許文献5]。この転写は、Ets-1, src、erbB2などの関与が知られており、同遺伝子の5'上流領域にあるets-1結合部位へのEts-1蛋白の結合が促進的に関与していることが、谷口ら[J. Biol. Chem. 271: 26706-26712(1966) ;非特許文献6]により示されている。N-アセチルグルコサミン転移酵素V活性と腫瘍転移との関係では、谷口ら[J. Biol. Chem. 277: 16960-16966(2001) ;非特許文献7]により、N-アセチルグルコサミン転移酵素V活性の上昇により、マトリプターゼは、そのβ1-6 分岐が増加して、蛋白分解に抵抗性となり、タンパク的に安定化され、それが、腫瘍転移に働くウロキナーゼ型プラスミノーゲン活性化因子とHGF(肝細胞増殖因子)の両蛋白の活性化を促進するということで説明されている。また、癌化の過程で、細胞表層のインテグリンであるフィブロネクチンレセプターα5β1のβ1インテグリンのアスパラギン結合型糖鎖における、N-アセチルグルコサミン転移酵素V活性によるβ1-6 分岐の増加が、α5・β1両サブユニットの密集形成を阻害し、結果として、癌細胞の基質への接着性を弱め、より移動しやすくなるという結果も得られている[ Guoら Cancer Res. 62: 6837-6845(2002) ;非特許文献8]。更に、N-アセチルグルコサミン転移酵素V遺伝子ノックアウトマウスを用いた解析において、N-アセチルグルコサミン転移酵素Vが腫瘍増殖と腫瘍転移に必須であること[Dennisら Nature Med. 6:306-312(2000) ;非特許文献9]が示され、今までの研究の流れと矛盾しない。
我々が見いだしたHmat-Xaの腫瘍における発現調節についても、今後、同様にして、詳細な解析が必要となろう。
The β1-6 branch of the asparagine-linked sugar chain of the glycoprotein is formed by N-acetylglucosamine transferase V, which is followed by the subsequent generation of polylactosamine structure and sialic acid addition. The formation of this branch affects the adhesion of cells related to glycoproteins present in the cell surface layer or extracellular matrix to the substrate. According to Yamashita et al. [J. Biol. Chem. 260: 3893-3969 (1985); Non-Patent Document 1], transformation of BHK cells with polyoma virus increases β1-6 branching, and N-acetylglucosaminyltransferase. Increased V activity was reported. With this report, N-acetylglucosamine transferase V activity (expression) and transformation, tumor metastasis [Dennis et al. Science 236: 582-585 (1987); Non-Patent Document 2, Taniguchi et al. Clin. Cancer Res. 6: 1772-1776 (2000); non-patent document 3] etc. were focused on. According to Dennis et al. [J. Biol. Chem. 266: 1772-1782 (1991)]; Non-patent document 4], β1-6 branching is increased in human lung cancer and the like, and N-acetylglucosaminyltransferase V is added. It has been shown that the activity corresponds. Furthermore, there are many reports that this increase in N-acetylglucosamine transferase V activity is parallel to the transcriptional activity of N-acetylglucosamine transferase V gene (Mgat-5) [Petretti et al. Biochim. Biophys. Acta 1428: 209-218 (1999); Non-Patent Document 5]. This transcription is known to be involved in Ets-1, src, erbB2, etc., and promotedly involved Ets-1 protein binding to the ets-1 binding site in the 5 'upstream region of the gene. This is shown by Taniguchi et al. [J. Biol. Chem. 271: 26706-26712 (1966); Non-Patent Document 6]. Regarding the relationship between N-acetylglucosaminyltransferase V activity and tumor metastasis, Taniguchi et al. [J. Biol. Chem. 277: 16960-16966 (2001); As a result, matriptase increases its β1-6 branch, becomes resistant to proteolysis, and is proteinically stabilized, which is a urokinase-type plasminogen activator and HGF (liver) that act on tumor metastasis. It is explained by promoting the activation of both proteins (cell growth factor). Further, in the process of malignant transformation, the beta 1 integrin asparagine-linked oligosaccharide fibronectin receptor alpha 5 beta 1 is integrin cell surface, an increase in β1-6 branch due N- acetylglucosaminyltransferase V activity, alpha It has also been shown that it inhibits the compact formation of both 5 and β 1 subunits, resulting in weaker adhesion of cancer cells to the substrate and easier migration [Guo et al. Cancer Res. 62: 6837- 6845 (2002); Non-Patent Document 8]. Furthermore, in analysis using N-acetylglucosamine transferase V gene knockout mice, N-acetylglucosamine transferase V is essential for tumor growth and tumor metastasis [Dennis et al. Nature Med. 6: 306-312 (2000). Non-Patent Document 9] is shown and is consistent with the current research flow.
In the future, it will be necessary to conduct a detailed analysis of the regulation of Hmat-Xa expression that we found in the same way.

Yamashita, K., Tachibana, Y., Ohkura, T., and Kobata, A. J.Biol.Chem. 260: 3893-3969(1985)Yamashita, K., Tachibana, Y., Ohkura, T., and Kobata, A. J. Biol. Chem. 260: 3893-3969 (1985) Dennis, J.W., Laferte, S., Waghorne, C., Breitman, M.L., Kerbel, R.S. Science 236: 582-585(1987)Dennis, J.W., Laferte, S., Waghorne, C., Breitman, M.L., Kerbel, R.S.Science 236: 582-585 (1987) Murata, K., Miyoshi, E., Kameyama, M., Ishikawa, O., Kabuto, T., Sasaki,Y., Hiratsuka, M., Ohigashi, H., Ishiguro, S., Ito, S., Honda, H., Takemura, F., Taniguchi, N., and Imaoka, S. Clin. Cancer Res. 6: 1772-1776(2000)Murata, K., Miyoshi, E., Kameyama, M., Ishikawa, O., Kabuto, T., Sasaki, Y., Hiratsuka, M., Ohigashi, H., Ishiguro, S., Ito, S., Honda, H., Takemura, F., Taniguchi, N., and Imaoka, S. Clin. Cancer Res. 6: 1772-1776 (2000) Yousefi, S., Higgins, E., Daoling, Z., Pollex-Kruger, A., Hindsgaul, O., and Dennis, J.W. J. Biol. Chem. 266: 1772-1782(1991)Yousefi, S., Higgins, E., Daoling, Z., Pollex-Kruger, A., Hindsgaul, O., and Dennis, J.W. J. Biol. Chem. 266: 1772-1782 (1991) Petretti, T., Schulze, B., Schlag, P.M., and Kemmner, W. Biochim. Biophys. Acta 1428:209-218(1999)Petretti, T., Schulze, B., Schlag, P.M., and Kemmner, W. Biochim. Biophys. Acta 1428: 209-218 (1999) Kang, R., Saito, H., Ihara, Y., Miyoshi, E., Koyama, N., Sheng, Y., and Taniguchi, N. J. Biol. Chem. 271: 26706-26712(1966)Kang, R., Saito, H., Ihara, Y., Miyoshi, E., Koyama, N., Sheng, Y., and Taniguchi, N. J. Biol. Chem. 271: 26706-26712 (1966) Ihara, S., Miyoshi, E., Ko, J.H., Murata, K., Nakahara ,S., Honke, K., Dickson, R.B., Lin, C.Y., and Taniguchi, N. J. Biol. Chem. 277: 16960-16966 (2001)Ihara, S., Miyoshi, E., Ko, JH, Murata, K., Nakahara, S., Honke, K., Dickson, RB, Lin, CY, and Taniguchi, NJ Biol. Chem. 277: 16960-16966 (2001) Guo, H.B., Lee, I., Kamar, M., Akiyama, S.K., and Pierce, M. Cancer Res. 62: 6837-6845(2002)Guo, H.B., Lee, I., Kamar, M., Akiyama, S.K., and Pierce, M. Cancer Res. 62: 6837-6845 (2002) Granovsky, M., Fata, J., Pawling, J., Muller, W.J., Khokha, R., and Dennis, J.W. Nature Med. 6:306-312(2000)Granovsky, M., Fata, J., Pawling, J., Muller, W.J., Khokha, R., and Dennis, J.W.Nature Med. 6: 306-312 (2000)

上記の通り、リピド中間体生合成に働くマンノース転移酵素のうち、幾つかのマンノース転移酵素のクローニングは進んでいるが、未だ全てのマンノース転移酵素がクローニングされているわけではない。リピド中間体生合成に関するマンノース転移酵素のうち、前半の、GDP-Manを糖供与体とする5段階は、それらの過程のうち少なくても2段階に関する変異株が酵母から温度感受性変異株として分離され、更に我々によりマウス乳癌由来FM3A細胞からマンノース転移酵素IV?の変異株としてG258変異株が分離されていることから、真核細胞の増殖にとって必須と考えられる。また、後半の 、Dol-P-Manを糖供与体とする4段階は、マウス細胞やCHO細胞から分離されたDol-P-Man合成酵素欠損変異株[Thy-1-class E(dpm1) 、Lec15(dpm2)]が正常に増殖できることから必須ではない。しかしながら、重篤な脳神経症状や肝機能障害などを呈するヒト先天性グリコシル化異常症(Congenital Disorders of Glycosylation: CDG)タイプIのサブタイプとして、これらマンノース転移酵素活性に欠陥を持ち、その結果、フルサイズのリピド中間体の供給が間に合わず、糖蛋白において、ポリペプチドあたりのアスパラギン結合型糖鎖の数が減少して、上記のような機能障害をもたらすヒト遺伝病の症例が、世界中で、ここ数年、相次いで見つかっている。
マンノース転移酵素としては、リピド中間体生合成以外に、GPIアンカー蛋白における糖鎖の生合成に関わるマンノース転移酵素やO-マンノシル化蛋白のマンノシル化を触媒する酵素も見つかっている。そして、これらにおいても、その欠損により重篤な症状を示すヒト遺伝病が見つかっている。しかし、これらの他にはマンノース転移酵素の存在は知られていない。
以上のように、生体内におけるマンノース転移酵素の役割として、特に癌などの疾患との係わりに関する知見は、まだ蓄積しつつある段階にある。本発明は、ヒト由来の新規なマンノース転移酵素遺伝子(特に、全生物を通じて未知であるGDP-マンノースを糖供与体とするマンノース転移酵素IIおよびマンノース転移酵素IV)をクローニングすることを解決すべき課題とした。さらに本発明は、例えば、その欠陥がヒト先天的グリコシル化異常症の原因遺伝子となるような、また、癌のマーカー遺伝子となるような、マンノース転移酵素遺伝子をクローニングすることを解決すべき課題とした。さらに本発明は、得られたマンノース転移酵素遺伝子を用いて、ヒト先天的グリコシル化異常症の遺伝子診断や癌の診断方法を提供することを解決すべき課題とした。
As described above, among mannose transferases that act on lipid intermediate biosynthesis, some mannose transferases have been cloned, but not all mannose transferases have been cloned. In the first half of the mannose transferase for lipid intermediate biosynthesis, GDP-Man is a sugar donor, and at least two of these processes are isolated from yeast as temperature-sensitive mutants. Are we further mannose transferase IV from mouse breast cancer-derived FM3A cells? Since the G258 mutant strain has been isolated as a mutant strain, it is considered essential for the growth of eukaryotic cells. In the latter half, the four steps using Dol-P-Man as a sugar donor consisted of a Dol-P-Man synthase-deficient mutant strain [Thy-1 - class E (dpm1), Lec15 (dpm2)] is not essential because it can grow normally. However, as a subtype of Human Congenital Disorders of Glycosylation (CDG) type I, which exhibits severe cranial nerve symptoms and liver dysfunction, these mannose transferase activities are defective. There are cases of human genetic diseases around the world where the supply of lipid intermediates in size is not in time, and the number of asparagine-linked glycans per polypeptide in the glycoprotein is reduced, resulting in the above dysfunction. It has been found one after another in recent years.
As mannose transferase, in addition to lipid intermediate biosynthesis, enzymes that catalyze mannosylation of mannose transferase and O-mannosylated protein involved in the biosynthesis of sugar chains in GPI anchor proteins have also been found. And also in these, the human genetic disease which shows a serious symptom by the defect | deletion has been found. However, the existence of mannose transferase other than these is not known.
As described above, knowledge regarding the relationship with diseases such as cancer as a role of mannose transferase in vivo is still being accumulated. The present invention aims to solve the cloning of novel mannose transferase genes derived from humans (especially, mannose transferase II and mannose transferase IV using GDP-mannose as a sugar donor, which is unknown throughout all living organisms). It was. Furthermore, the present invention has a problem to be solved, for example, to clone a mannose transferase gene such that the defect becomes a causative gene of congenital human glycosylation and a marker gene for cancer. did. Furthermore, another object of the present invention is to provide a genetic diagnosis for congenital human glycosylation and a cancer diagnosis method using the obtained mannose transferase gene.

本発明者らは上記課題を解決することを目的として、以下のパラメーターを用いてバイオインフォーマティックスの手法で、未知遺伝子のクローニングを企てた。今回、検索に用いたパラメーターは、(1)既知の糖転移酵素の相同性に基づいた分類のデータベースであるCaZY などを用いた、ヒトのマンノース転移酵素I、マンノース転移酵素III、マンノース転移酵素Vを始めとする、GDP-マンノースなどの糖ヌクレオチドを糖供与体とする糖転移酵素に共通なドメインGlycosyltransferase group 1 domainを持つ糖転移酵素および糖転移酵素候補のアミノ酸配列、(2)既知の全生物のマンノース転移酵素のアミノ
酸配列、(3)糖ヌクレオチドを供与体とする糖転移酵素に共通の、DXDあるいは DDX 配列、(4)糖ヌクレオチドにおけるα-グリコシド結合を、そのまま維持して結合するretaining typeの糖転移酵素に共通のEX7E配列、(5)酵母リピド中間体生合成に働く糖転移酵素、酵母ドリコールキナーゼ(Sec59蛋白)、イヌオリゴ糖転移酵素ribophorin Iサブユニットなどで提唱された仮想的ドリコール認識配列PDRSの、以上、5つである。
In order to solve the above-mentioned problems, the present inventors attempted to clone an unknown gene by a bioinformatics technique using the following parameters. The parameters used in the search were (1) human mannose transferase I, mannose transferase III, mannose transferase V using CaZY, a database of classification based on homology of known glycosyltransferases. Amino acid sequences of glycosyltransferases and glycosyltransferase candidates that have a domain common to glycosyltransferases that use sugar nucleotides such as GDP-mannose as sugar donors, including (2) all known organisms (3) DXD or DDX sequence common to glycosyltransferases using sugar nucleotides as donors, and (4) α-glycosidic bonds in sugar nucleotides are maintained and retained. EX 7 E sequence common to all types of glycosyltransferases, (5) glycosyltransferases acting on yeast lipid intermediate biosynthesis, yeast dolichol kinase (Sec59 protein), These are five of the hypothetical dolichol recognition sequences PDRS proposed by the canine oligosaccharide transferase ribophorin I subunit.

そして、先ず、Glycosyltransferase group 1 domainを持つショウジョウバエQ9VXN0蛋白のアミノ酸配列をもとに、ヒトESTデータベースを探索した結果、Q9VXN0蛋白に相同なヒト蛋白をコードするESTクローンとしてBI770600およびAU119344を同定した。
次に、これらの塩基配列およびアミノ酸配列の情報をもとに、更に検索を進めて得た全ORFと思われる領域を含む塩基配列をもとに設計したプライマーを用いてヒト胎児脳cDNAプールを鋳型にPCRを行った。さらに、得られたPCR産物を用いて、ヒト胎児脳cDNA ライブラリーを検索した結果、アミノ酸457残基をコードする1371塩基から成るORFを同定することに成功し、本発明を完成するに至った。
First, as a result of searching a human EST database based on the amino acid sequence of the Drosophila Q9VXN0 protein having the Glycosyltransferase group 1 domain, BI770600 and AU119344 were identified as EST clones encoding a human protein homologous to the Q9VXN0 protein.
Next, based on these nucleotide and amino acid sequence information, human fetal brain cDNA pools were constructed using primers designed based on the nucleotide sequence including the region considered to be all ORFs obtained by further searching. PCR was performed on the template. Furthermore, as a result of searching the human fetal brain cDNA library using the obtained PCR product, the inventors succeeded in identifying an ORF consisting of 1371 bases encoding the amino acid 457 residue and completed the present invention. .

即ち、本発明によれば、下記(A)又は(B)の何れかの蛋白質が提供される。
(A)配列番号2に記載のアミノ酸配列を有する蛋白質。
(B)配列番号2に記載のアミノ酸配列において、1若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入及び/又は付加を含むアミノ酸配列を有し、かつ、糖転移酵素活性を有する蛋白質。
That is, according to the present invention, the following protein (A) or (B) is provided.
(A) A protein having the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 2.
(B) A protein having an amino acid sequence containing substitution, deletion, insertion and / or addition of one or several amino acids and having glycosyltransferase activity in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2.

本発明の別の側面によれば、下記(A)又は(B)の何れかの蛋白質をコードするDNAが提供される。
(A)配列番号2に記載のアミノ酸配列を有する蛋白質。
(B)配列番号2に記載のアミノ酸配列において、1若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入及び/又は付加を含むアミノ酸配列を有し、かつ、糖転移酵素活性を有する蛋白質。
According to another aspect of the present invention, DNA encoding any of the following proteins (A) or (B) is provided.
(A) A protein having the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 2.
(B) A protein having an amino acid sequence containing substitution, deletion, insertion and / or addition of one or several amino acids and having glycosyltransferase activity in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2.

本発明のさらに別の側面によれば、下記(a)、(b)又は(c)の何れかのDNAが提供される。
(a)配列番号1に記載の塩基配列を有するDNA。
(b)配列番号1に記載の塩基配列において、1若しくは数個の塩基の置換、欠失、挿入及び/又は付加を含む塩基配列を有し、かつ、糖転移酵素活性を有する蛋白質をコードするDNA。
(c)配列番号1に記載の塩基配列を有するDNAとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつ、糖転移酵素活性を有する蛋白質をコードするDNA。
According to still another aspect of the present invention, the following DNA (a), (b) or (c) is provided.
(A) DNA having the base sequence set forth in SEQ ID NO: 1.
(B) The base sequence described in SEQ ID NO: 1 has a base sequence including substitution, deletion, insertion and / or addition of one or several bases, and encodes a protein having glycosyltransferase activity DNA.
(C) A DNA that hybridizes with a DNA having the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 1 under a stringent condition and encodes a protein having glycosyltransferase activity.

本発明のさらに別の側面によれば、上記した本発明のDNAを含有する、組み換えベクターが提供される。
本発明のさらに別の側面によれば、上記した本発明のDNA又は組み換えベクターを有する、形質転換体が提供される。
According to still another aspect of the present invention, there is provided a recombinant vector containing the above-described DNA of the present invention.
According to still another aspect of the present invention, a transformant having the above-described DNA or recombinant vector of the present invention is provided.

本発明のさらに別の側面によれば、上記した本発明の蛋白質に対する抗体、上記した本発明の蛋白質に対する抗体を含む大腸癌の診断薬、並びに生体試料中における上記蛋白質の発現を上記抗体を用いて検出又は測定することを含む大腸癌の診断方法が提供される。   According to still another aspect of the present invention, an antibody against the protein of the present invention described above, a diagnostic agent for colorectal cancer containing an antibody against the protein of the present invention described above, and expression of the protein in a biological sample using the antibody. And a method for diagnosing colorectal cancer comprising detecting or measuring the same.

本発明のさらに別の側面によれば、上記した本発明のDNAの塩基配列の部分配列又はその相補配列から成るオリゴヌクレオチド、上記した本発明のDNAの塩基配列の部分配列又はその相補配列から成るオリゴヌクレオチドを含む大腸癌の診断薬、並びに生体試料中における上記DNAの発現を上記オリゴヌクレオチドを用いて検出又は測定することを含む大腸癌の診断方法が提供される。
本発明のさらに別の側面によれば、大腸癌のマーカーとして上記した本発明の蛋白質を使用する方法が提供される。
According to still another aspect of the present invention, the oligonucleotide comprises a partial sequence of the base sequence of the DNA of the present invention described above or a complementary sequence thereof, and comprises a partial sequence of the base sequence of the DNA of the present invention described above or a complementary sequence thereof. A diagnostic agent for colorectal cancer comprising an oligonucleotide and a method for diagnosing colorectal cancer comprising detecting or measuring expression of the DNA in a biological sample using the oligonucleotide are provided.
According to still another aspect of the present invention, there is provided a method of using the above-described protein of the present invention as a marker for colorectal cancer.

本発明によれば、Glycosyltransferase group 1 domainを含む新規な遺伝子としてHmat-Xa遺伝子が提供される。本発明の遺伝子は、健常人の大腸腺上皮組織では発現が低いが、大腸腺癌組織では特異的に発現が昂進しているため、大腸腺癌の腫瘍マーカーとして有用である。   According to the present invention, the Hmat-Xa gene is provided as a novel gene containing Glycosyltransferase group 1 domain. The gene of the present invention is useful as a tumor marker for colorectal adenocarcinoma because its expression is low in the colon gland epithelial tissue of healthy individuals but is specifically promoted in colorectal adenocarcinoma tissue.

以下、本発明についてさらに具体的に説明する。
(1)本発明の蛋白質
本発明の蛋白質は、下記(A)又は(B)の何れかの蛋白質である。
(A)配列番号2に記載のアミノ酸配列を有する蛋白質。
(B)配列番号2に記載のアミノ酸配列において、1若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入及び/又は付加を含むアミノ酸配列を有し、かつ、糖転移酵素活性を有する蛋白質。
Hereinafter, the present invention will be described more specifically.
(1) Protein of the present invention The protein of the present invention is one of the following proteins (A) or (B).
(A) A protein having the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 2.
(B) A protein having an amino acid sequence containing substitution, deletion, insertion and / or addition of one or several amino acids and having glycosyltransferase activity in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2.

本明細書で言う糖転移酵素活性を有する蛋白質とは、糖を転移する酵素活性を有する限り特に限定されないが、好ましくは、Glycosyltransferase group 1 domainを有し、さらに好ましくは糖ヌクレオチドを糖供与体とする糖転移酵素に特有のDXD(Xは任意:例えば、DKD)あるいはDDX(Xは任意:例えば、DDY)配列を有する蛋白質を意味する。   The protein having glycosyltransferase activity referred to in the present specification is not particularly limited as long as it has an enzyme activity to transfer sugar, but preferably has a Glycosyltransferase group 1 domain, more preferably a sugar nucleotide as a sugar donor. Means a protein having a DXD (X is arbitrary: for example, DKD) or DDX (X is arbitrary: for example, DDY) sequence unique to glycosyltransferases.

上記した「配列番号2に記載のアミノ酸配列において、1若しくは数個のアミノ酸の置
換、欠失、挿入及び/又は付加を含むアミノ酸配列」における「1若しくは数個」の範囲は特には限定されないが、例えば、1から20個、好ましくは1から10個、より好ましくは1から7個、さらに好ましくは1から5個、特に好ましくは1から3個程度を意味する。
The range of “one or several” in the above-mentioned “amino acid sequence including substitution, deletion, insertion and / or addition of one or several amino acids in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2” is not particularly limited. Is, for example, 1 to 20, preferably 1 to 10, more preferably 1 to 7, further preferably 1 to 5, and particularly preferably about 1 to 3.

本発明の蛋白質の入手・製造方法は特に限定されず、天然由来の蛋白質でも、化学合成した蛋白質でも、遺伝子組み換え技術により作製した組み換え蛋白質の何れでもよい。比較的容易な操作でかつ大量に製造できるという点では、組み換え蛋白質が好ましい。   The method for obtaining and producing the protein of the present invention is not particularly limited, and may be a naturally derived protein, a chemically synthesized protein, or a recombinant protein produced by a gene recombination technique. Recombinant proteins are preferred in that they can be produced in large quantities with relatively easy operations.

天然由来の蛋白質を入手する場合には、該蛋白質を発現している細胞又は組織から蛋白質の単離・精製方法を適宜組み合わせて単離することができる。化学合成蛋白質を入手する場合には、例えば、Fmoc法(フルオレニルメチルオキシカルボニル法)、tBoc法(t-ブチルオキシカルボニル法)等の化学合成法に従って本発明の蛋白質を合成することができる。また、各種の市販のペプチド合成機を利用して本発明の蛋白質を合成することもできる。   When a naturally derived protein is obtained, it can be isolated from cells or tissues expressing the protein by an appropriate combination of protein isolation and purification methods. When obtaining a chemically synthesized protein, for example, the protein of the present invention can be synthesized according to a chemical synthesis method such as the Fmoc method (fluorenylmethyloxycarbonyl method) or the tBoc method (t-butyloxycarbonyl method). . Moreover, the protein of the present invention can be synthesized using various commercially available peptide synthesizers.

本発明の蛋白質を組み換え蛋白質として産生するには、該蛋白質をコードする塩基配列(例えば、配列番号1に記載の塩基配列)を有するDNA又はその変異体又は相同体を入手し、これを好適な発現系に導入することにより本発明の蛋白質を製造することができる。   In order to produce the protein of the present invention as a recombinant protein, a DNA having a base sequence encoding the protein (for example, the base sequence described in SEQ ID NO: 1) or a variant or homologue thereof is obtained, and this is preferably used. The protein of the present invention can be produced by introducing it into an expression system.

発現ベクターとしては、好ましくは宿主細胞において自立複製可能であるか、あるいは宿主細胞の染色体中へ組込み可能であるものであればよく、本発明の遺伝子を発現できる位置にプロモーターを含有しているものが使用される。また、本発明の蛋白質をコードする遺伝子を有する形質転換体は、上記の発現ベクターを宿主に導入することにより作製することができる。宿主は、細菌、酵母、動物細胞、昆虫細胞のいずれでもよく、また宿主への発現ベクターの導入は、各宿主に応じた公知の手法により行えばよい。    The expression vector is preferably any one that can replicate autonomously in the host cell or can be integrated into the host cell chromosome, and contains a promoter at a position where the gene of the present invention can be expressed. Is used. Moreover, the transformant which has the gene which codes the protein of this invention can be produced by introduce | transducing said expression vector into a host. The host may be any of bacteria, yeast, animal cells, and insect cells, and the expression vector may be introduced into the host by a known method according to each host.

本発明においては、上記のようにして作製した本発明の遺伝子を有する形質転換体を培養し、培養物中に本発明の蛋白質を生成蓄積させ、該培養物より本発明の蛋白質を採取することにより組み換え蛋白質を単離することができる。   In the present invention, the transformant having the gene of the present invention produced as described above is cultured, the protein of the present invention is produced and accumulated in the culture, and the protein of the present invention is collected from the culture. The recombinant protein can be isolated by

本発明の形質転換体が大腸菌等の原核生物、酵母菌等の真核生物である場合、これら微生物を培養する培地は、該微生物が資化し得る炭素源、窒素源、無機塩類等を含有し、形質転換体の培養を効率的に行える培地であれば天然培地、合成培地のいずれでもよい。また培養条件も該微生物を培養するのに通常用いられる条件にて行えばよい。培養後、形質転換体の培養物から本発明の蛋白質を単離精製するには、通常の蛋白質の単離、精製法を用いればよい。   When the transformant of the present invention is a prokaryote such as Escherichia coli or a eukaryote such as yeast, the medium for culturing these microorganisms contains a carbon source, a nitrogen source, inorganic salts and the like that can be assimilated by the microorganism. As long as the medium can efficiently culture the transformant, either a natural medium or a synthetic medium may be used. Moreover, the culture conditions may be the conditions usually used for culturing the microorganism. In order to isolate and purify the protein of the present invention from the culture of the transformant after culturing, ordinary protein isolation and purification methods may be used.

なお、配列番号2に記載のアミノ酸配列において、1若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入及び/又は付加を含むアミノ酸配列を有する蛋白質は、配列番号2に記載のアミノ酸配列をコードするDNA配列の一例示す配列番号1に記載の塩基配列の情報に基づいて当業者であれば適宜製造又は入手することができる。   A protein having an amino acid sequence containing substitution, deletion, insertion and / or addition of one or several amino acids in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2 is a DNA encoding the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2. Those skilled in the art can appropriately produce or obtain the information based on the information of the base sequence described in SEQ ID NO: 1 showing an example of the sequence.

即ち、配列番号2に記載のアミノ酸配列において、1若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入及び/又は付加を含むアミノ酸配列を有する蛋白質をコードする塩基配列を有する遺伝子(変異遺伝子)は、化学合成、遺伝子工学的手法又は突然変異誘発などの当業者に既知の任意の方法で作製することもできる。具体的には、配列番号1に記載の塩基配列を有するDNAを利用し、これらDNAに変異を導入することにより変異DNAを取得することができる。   That is, in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2, a gene (mutant gene) having a base sequence encoding a protein having an amino acid sequence containing substitution, deletion, insertion and / or addition of one or several amino acids, It can also be produced by any method known to those skilled in the art, such as chemical synthesis, genetic engineering techniques or mutagenesis. Specifically, mutant DNA can be obtained by using DNA having the base sequence described in SEQ ID NO: 1 and introducing mutation into these DNAs.

例えば、配列番号1に記載の塩基配列を有するDNAに対し、変異原となる薬剤と接触作用させる方法、紫外線を照射する方法、遺伝子工学的手法等を用いて行うことができる。遺伝子工学的手法の一つである部位特異的変異誘発法は特定の位置に特定の変異を導入できる手法であることから有用であり、Molecular Cloning: A laboratory Mannual, 3rd ed., Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY., 2001(以下、モレキュラークローニング第3版と略す)、Current Protocols in Molecular Biology, Supplement 1-38, John Wiley & Sons (1987-1997)(以下、カレント・プロトコールズ・イン・モレキュラー・バイオロジーと略す)等に記載の方法に準じて行うことができる。 For example, the DNA having the base sequence described in SEQ ID NO: 1 can be contacted with a mutagen agent, a method of irradiating with ultraviolet light, a genetic engineering method, or the like. Site-directed mutagenesis, which is one of the genetic engineering methods, is useful because it can introduce a specific mutation at a specific position. Molecular Cloning: A laboratory Mannual, 3 rd ed., Cold Spring Harbor Laboratory, Cold Spring Harbor, NY., 2001 (hereinafter abbreviated as Molecular Cloning 3rd Edition), Current Protocols in Molecular Biology, Supplement 1-38, John Wiley & Sons (1987-1997) (hereinafter referred to as Current Protocols (Abbreviated as in-molecular biology) and the like.

(2)本発明のDNA
本発明のDNAは、上記(1)に記載した本発明の蛋白質をコードするDNAであり、好ましくは、下記(a)、(b)又は(c)の何れかのDNAである。
(a)配列番号1に記載の塩基配列を有するDNA。
(b)配列番号1に記載の塩基配列において、1若しくは数個の塩基の置換、欠失、挿入及び/又は付加を含む塩基配列を有し、かつ、糖転移酵素活性を有する蛋白質をコードするDNA。
(c)配列番号1に記載の塩基配列を有するDNAとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつ、糖転移酵素活性を有する蛋白質をコードするDNA。
(2) DNA of the present invention
The DNA of the present invention is a DNA encoding the protein of the present invention described in (1) above, and is preferably any one of the following DNAs (a), (b) or (c).
(A) DNA having the base sequence set forth in SEQ ID NO: 1.
(B) The base sequence described in SEQ ID NO: 1 has a base sequence including substitution, deletion, insertion and / or addition of one or several bases, and encodes a protein having glycosyltransferase activity DNA.
(C) A DNA that hybridizes with a DNA having the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 1 under a stringent condition and encodes a protein having glycosyltransferase activity.

上記した「配列番号1に記載の塩基配列において、1若しくは数個の塩基の置換、欠失、挿入及び/又は付加を含む塩基配列」における「1若しくは数個」の範囲は特には限定されないが、例えば、1から60個、好ましくは1から30個、より好ましくは1から20個、さらに好ましくは1から15個、さらに好ましくは1から10個、さらに好ましくは1から5個、特に好ましくは1から3個程度を意味する。   The range of “one or several” in the above-described “base sequence including substitution, deletion, insertion and / or addition of one or several bases in the base sequence described in SEQ ID NO: 1” is not particularly limited. For example, 1 to 60, preferably 1 to 30, more preferably 1 to 20, more preferably 1 to 15, further preferably 1 to 10, further preferably 1 to 5, particularly preferably It means about 1 to 3 pieces.

上記した「ストリンジェントな条件下でハイブリダイズする」とは、DNAをプローブとして使用し、コロニー・ハイブリダイゼーション法、プラークハイブリダイゼーション法、あるいはサザンブロットハイブリダイゼーション法等を用いることにより得られるDNAの塩基配列を意味し、例えば、コロニーあるいはプラーク由来のDNA又は該DNAの断片を固定化したフィルターを用いて、0.7〜1.0MのNaCl存在下、65℃でハイブリダイゼーションを行った後、0.1〜2×SSC溶液(1×SSC溶液は、150mM塩化ナトリウム、15mMクエン酸ナトリウム)を用い、65℃条件下でフィルターを洗浄することにより同定できるDNA等を挙げることができる。ハイブリダイゼーションは、モレキュラークローニング第3版等に記載されている方法に準じて行うことができる。   The above-mentioned “hybridizes under stringent conditions” means a DNA base obtained by using DNA as a probe and using a colony hybridization method, a plaque hybridization method, a Southern blot hybridization method, or the like. Means a sequence, for example, after hybridization at 65 ° C. in the presence of 0.7 to 1.0 M NaCl using a filter on which DNA derived from colonies or plaques or a fragment of the DNA is immobilized, 0 .1 to 2 × SSC solution (1 × SSC solution is 150 mM sodium chloride, 15 mM sodium citrate), and DNA that can be identified by washing the filter under 65 ° C. can be used. Hybridization can be performed according to the method described in Molecular Cloning 3rd edition and the like.

ストリンジェントな条件下でハイブリダイズするDNAとしては、プローブとして使用するDNAの塩基配列と一定以上の相同性を有するDNAが挙げられ、例えば70%以上、好ましくは80%以上、より好ましくは90%以上、さらに好ましくは93%以上、特に好ましくは95%以上、最も好ましくは98%以上の相同性を有するDNAが挙げられる。   Examples of DNA that hybridizes under stringent conditions include DNA having a certain degree of homology with the base sequence of DNA used as a probe, for example, 70% or more, preferably 80% or more, more preferably 90%. More preferably, DNA having homology of 93% or more, particularly preferably 95% or more, and most preferably 98% or more is mentioned.

本発明のDNAの取得方法は特に限定されない。本明細書中の配列表の配列番号1および配列番号2に記載した塩基配列及びアミノ酸配列の情報に基づいて適当なブローブやプライマーを調製し、それらを用いてヒトなどのcDNAライブラリーをスクリーニングすることにより本発明のDNAを単離することができる。cDNAライブラリーは、本発明のDNAを発現している細胞、器官又は組織から作製することが好ましい。   The method for obtaining the DNA of the present invention is not particularly limited. Appropriate probes and primers are prepared based on the nucleotide sequence and amino acid sequence information described in SEQ ID NO: 1 and SEQ ID NO: 2 in the sequence listing in this specification, and a human or other cDNA library is screened using them. Thus, the DNA of the present invention can be isolated. The cDNA library is preferably prepared from cells, organs or tissues expressing the DNA of the present invention.

PCR法により配列番号1に記載した塩基配列を有するDNAを取得することもできる。ヒト染色体DNA又はヒトcDNAライブラリーを鋳型として使用し、配列番号1に記載した塩基配列を増幅できるように設計した1対のプライマーを用いてPCRを行う。PCRの反応条件は適宜設定することができ、例えば、94℃で30秒間(変性)、55℃で30秒〜1分間(アニーリング)、72℃で2分間(伸長)からなる反応工程を1サイクルとして、例えば30サイクル行った後、72℃で7分間反応させる条件などを挙げることができる。次いで、増幅されたDNA断片を、大腸菌等の宿主で増幅可能な適切なベクター中にクローニングすることができる。   DNA having the base sequence described in SEQ ID NO: 1 can also be obtained by PCR. Using human chromosomal DNA or a human cDNA library as a template, PCR is performed using a pair of primers designed to amplify the base sequence described in SEQ ID NO: 1. PCR reaction conditions can be set as appropriate. For example, one cycle of a reaction step consisting of 94 ° C. for 30 seconds (denaturation), 55 ° C. for 30 seconds to 1 minute (annealing), and 72 ° C. for 2 minutes (extension) For example, after 30 cycles, a condition of reacting at 72 ° C. for 7 minutes can be exemplified. The amplified DNA fragment can then be cloned into a suitable vector that can be amplified in a host such as E. coli.

上記したプローブ又はプライマーの調製、cDNAライブラリーの構築、cDNAライブラリーのスクリーニング、並びに目的遺伝子のクローニングなどの操作は当業者に既知であり、例えば、モレキュラークローニング第3版、カレント・プロトコールズ・イン・モレキュラー・バイオロジー等に記載された方法に準じて行うことができる。   The above-described procedures such as probe or primer preparation, cDNA library construction, cDNA library screening, and target gene cloning are known to those skilled in the art. For example, Molecular Cloning 3rd Edition, Current Protocols In -It can be performed according to the method described in Molecular Biology etc.

(3)本発明の抗体
本発明は、上記した本発明の蛋白質をエピトープ(抗原)として認識する抗体に関する。
(3) Antibody of the present invention The present invention relates to an antibody that recognizes the above-described protein of the present invention as an epitope (antigen).

本発明の抗体はポリクローナル抗体でもモノクローナル抗体でもよく、その作製は定法により行なうことができる。   The antibody of the present invention may be a polyclonal antibody or a monoclonal antibody, and can be produced by a conventional method.

例えば、ポリクローナル抗体は、本発明の蛋白質を抗原として哺乳動物を免疫感作し、該哺乳動物から血液を採取し、採取した血液から抗体を分離・精製することにより得ることができる。例えば、マウス、ハムスター、モルモット、ニワトリ、ラット、ウサギ、イヌ、ヤギ、ヒツジ、ウシ等の哺乳動物を免疫することができる。免疫感作の方法は当業者に公知であり、例えば抗原を、例えば7〜30日間隔で2〜3回投与すればよい。投与量は1回につき、例えば抗原約0.05〜2mg程度とすることができる。投与経路も特に限定されず、皮下投与、皮内投与、腹膜腔内投与、静脈内投与、筋肉内投与等を適宜選択することができる。また、抗原は適当な緩衝液、例えば完全フロイントアジュバント又は水酸化アルミニウム等の通常用いられるアジュバントを含有する適当な緩衝液に溶解して用いることができる。   For example, a polyclonal antibody can be obtained by immunizing a mammal with the protein of the present invention as an antigen, collecting blood from the mammal, and separating and purifying the antibody from the collected blood. For example, mammals such as mice, hamsters, guinea pigs, chickens, rats, rabbits, dogs, goats, sheep and cows can be immunized. Methods of immunization are known to those skilled in the art. For example, the antigen may be administered 2 to 3 times at intervals of 7 to 30 days, for example. The dose can be about 0.05 to 2 mg of antigen per dose, for example. The administration route is not particularly limited, and subcutaneous administration, intradermal administration, intraperitoneal administration, intravenous administration, intramuscular administration, and the like can be appropriately selected. The antigen can be used after being dissolved in an appropriate buffer, for example, a complete buffer containing a commonly used adjuvant such as Freund's complete adjuvant or aluminum hydroxide.

免疫感作した哺乳動物を一定期間飼育した後、抗体価が上昇してきたら、例えば100μg〜1000μgの抗原を用いて追加免疫を行なうことができる。最後の投与から1〜2ケ月後に免疫感作した哺乳動物から血液を採取して、該血液を、例えば遠心分離、硫酸アンモニウム又はポリエチレングリコールを用いた沈澱、ゲルろ過クロマトグラフィー、イオン交換クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィー等のクロマトグラフィー等の常法によって分離・精製することにより、ポリクローナル抗血清として、本発明の蛋白質を認識するポリクローナル抗体を得ることができる。   After the immunized mammal has been bred for a certain period of time, if the antibody titer increases, booster immunization can be performed using, for example, 100 μg to 1000 μg of antigen. Blood is collected from the immunized mammal 1 to 2 months after the last administration, and the blood is collected, for example, by centrifugation, precipitation using ammonium sulfate or polyethylene glycol, gel filtration chromatography, ion exchange chromatography, affinity. A polyclonal antibody that recognizes the protein of the present invention can be obtained as a polyclonal antiserum by separation and purification by a conventional method such as chromatography.

一方、モノクローナル抗体はハイブリドーマを調製して得ることができる。例えば、抗体産生細胞とミエローマ細胞株との細胞融合によりハイブリドーマを得ることができる。本発明のモノクローナル抗体を産生するハイブリドーマは、以下のような細胞融合法によって得ることができる。    On the other hand, a monoclonal antibody can be obtained by preparing a hybridoma. For example, a hybridoma can be obtained by cell fusion between an antibody-producing cell and a myeloma cell line. The hybridoma producing the monoclonal antibody of the present invention can be obtained by the following cell fusion method.

抗体産生細胞としては、免疫された動物からの脾細胞、リンパ節細胞、Bリンパ球等を使用する。抗原としては、本発明の蛋白質又はその部分ペプチドを使用する。免疫動物としてはマウス、ラット等を使用でき、これらの動物への抗原の投与は常法により行う。例えば完全フロインドアジュバント、不完全フロインドアジュバントなどのアジュバントと抗原である本発明の蛋白質との懸濁液もしくは乳化液を動物の静脈、皮下、皮内、腹腔内等に数回投与することによって動物を免疫化する。免疫化した動物から抗体産生細胞として例えば脾細胞を取得し、これとミエローマ細胞とを公知の方法(G.Kohler et al .,Nature,256 495(1975))により融合してハイブリドーマを作製することができる。   As antibody-producing cells, spleen cells, lymph node cells, B lymphocytes and the like from immunized animals are used. As the antigen, the protein of the present invention or a partial peptide thereof is used. Mice, rats and the like can be used as immunized animals, and antigens are administered to these animals by conventional methods. For example, an animal is administered by administering a suspension or emulsion of an adjuvant such as complete Freund's adjuvant or incomplete Freund's adjuvant and the protein of the present invention as an antigen several times into the vein, subcutaneous, intradermal, intraperitoneal, etc. of the animal. Immunize. For example, spleen cells are obtained as antibody-producing cells from the immunized animal and fused with myeloma cells by a known method (G. Kohler et al., Nature, 256 495 (1975)) to produce a hybridoma. Can do.

細胞融合に使用するミエローマ細胞株としては、例えばマウスではP3X63Ag8、P3U1株、Sp2/0株などが挙げられる。細胞融合を行なうに際しては、ポリエチレングリコール、センダイウイルスなどの融合促進剤を用い、細胞融合後のハイブリドーマの選択にはヒポキサンチン・アミノプテリン・チミジン(HAT)培地を常法に従って使用する。細胞融合により得られるハイブリドーマは限界希釈法等によりクローニングする。さらに必要に応じて、本発明の蛋白質を用いた酵素免疫測定法によりスクリーニングを行うことにより、本発明の蛋白質を特異的に認識するモノクローナル抗体を産生する細胞
株を得ることができる。
Examples of myeloma cell strains used for cell fusion include P3X63Ag8, P3U1 strain, Sp2 / 0 strain and the like in mice. When cell fusion is performed, a fusion promoter such as polyethylene glycol or Sendai virus is used, and hypoxanthine / aminopterin / thymidine (HAT) medium is used in accordance with a conventional method for selection of hybridomas after cell fusion. Hybridomas obtained by cell fusion are cloned by limiting dilution or the like. Furthermore, if necessary, a cell line producing a monoclonal antibody that specifically recognizes the protein of the present invention can be obtained by screening by an enzyme immunoassay using the protein of the present invention.

このようにして得られたハイブリドーマから目的とするモノクローナル抗体を製造するには、通常の細胞培養法や腹水形成法により該ハイブリドーマを培養し、培養上清あるいは腹水から該モノクローナル抗体を精製すればよい。培養上清もしくは腹水からのモノクローナル抗体の精製は、常法により行なうことができる。例えば、硫安分画、ゲルろ過、イオン交換クロマトグラフィー、アフィニティークロマトグラフィーなどを適宜組み合わせて使用できる。   In order to produce the desired monoclonal antibody from the hybridoma thus obtained, the hybridoma is cultured by a normal cell culture method or ascites formation method, and the monoclonal antibody is purified from the culture supernatant or ascites. . Purification of the monoclonal antibody from the culture supernatant or ascites can be performed by a conventional method. For example, ammonium sulfate fractionation, gel filtration, ion exchange chromatography, affinity chromatography and the like can be used in appropriate combination.

また、上記した抗体の断片も本発明の範囲内である。抗体の断片としては、F(ab')2フラグメント、Fab'フラグメント等が挙げられる。    The above-mentioned antibody fragments are also within the scope of the present invention. Examples of the antibody fragment include F (ab ′) 2 fragment, Fab ′ fragment and the like.

さらに、上記した抗体の標識抗体も本発明の範囲内である。即ち、上記のようにして作製した本発明の抗体は標識して使用することができる。抗体の標識の種類及び標識方法は当業者に公知である。例えば、西洋ワサビペルオキシダーゼ又はアルカリホスファターゼなどの酵素標識、FITC(フルオレセインイソチオシアネート)又はTRITC(テトラメチルローダミンBイソチオシアネート)等の蛍光標識、コロイド金属および着色ラテックスなどの呈色物質による標識、ビオチンなどのアフィニティー標識、あるいは125Iなどの同位体標識などを挙げることができる。 Furthermore, labeled antibodies of the above-mentioned antibodies are also within the scope of the present invention. That is, the antibody of the present invention produced as described above can be used after being labeled. The types of antibody labeling and labeling methods are known to those skilled in the art. For example, enzyme labels such as horseradish peroxidase or alkaline phosphatase, fluorescent labels such as FITC (fluorescein isothiocyanate) or TRITC (tetramethylrhodamine B isothiocyanate), labels with colored substances such as colloidal metals and colored latex, biotin, etc. An affinity label or an isotope label such as 125 I can be mentioned.

(4)本発明の抗体を用いた大腸癌の診断薬及び診断方法
本発明は、上記した本発明の蛋白質に対する抗体を含む大腸癌の診断薬、並びに、生体試料中における本発明の蛋白質の発現を本発明の抗体を用いて検出又は測定することを含む大腸癌の診断方法に関する。ここで用いる生体試料としてはヒトや動物から採取した生体試料(例えば、臓器、生体組織、血液、尿など)、あるいはこれらの生体試料から樹立した初代培養細胞又は細胞株などが用いられる。
(4) Diagnostic Agent and Diagnostic Method for Colorectal Cancer Using the Antibody of the Present Invention The present invention relates to a diagnostic agent for colorectal cancer containing an antibody against the protein of the present invention described above, and the expression of the protein of the present invention in a biological sample. The present invention relates to a method for diagnosing colorectal cancer, which comprises detecting or measuring the above using the antibody of the present invention. As the biological sample used here, biological samples collected from humans or animals (for example, organs, biological tissues, blood, urine, etc.) or primary cultured cells or cell lines established from these biological samples are used.

上記(3)に記載した本発明の抗体を用いて、本発明の蛋白質を免疫学的に検出する方法としては、免疫組織化学染色法、フローサイトメトリー、ウェスタンブロッティング法、サンドイッチELISA等の酵素免疫測定法(EIA)、又は放射性免疫測定法(RIA)などがあり、これらの技術は当業者に周知である。   As a method for immunologically detecting the protein of the present invention using the antibody of the present invention described in (3) above, enzyme immunization such as immunohistochemical staining, flow cytometry, Western blotting, sandwich ELISA, etc. There are assay methods (EIA) or radioimmunoassay methods (RIA), and these techniques are well known to those skilled in the art.

免疫組織化学染色法は、生体組織や細胞を固定化し、本発明の抗体を反応させ、さらに蛍光物質、酵素、ビオチン、金コロイド、放射性物質等で標識した抗イムノグロブリン抗体あるいは抗体断片を反応させた後、必要に応じて標識抗体の可視化を行い、顕微鏡等を用いて観察することにより組織や細胞中における本発明の蛋白質の存在を検出又は測定する方法である。蛍光物質標識としては、フルオレセイン・イソチオシアネート(FITC)、テトラメチルローダミン・イソチオシアネート等が用いられる。酵素標識の場合はペルオキシダーゼやアルカリフォスファターゼ等が用いられ、酵素により発色する基質を添加して発色反応させることができる。   In the immunohistochemical staining method, biological tissue or cells are immobilized, the antibody of the present invention is reacted, and an anti-immunoglobulin antibody or antibody fragment labeled with a fluorescent substance, enzyme, biotin, colloidal gold, radioactive substance or the like is further reacted. Thereafter, the labeled antibody is visualized as necessary, and observed using a microscope or the like to detect or measure the presence of the protein of the present invention in tissues or cells. As the fluorescent substance label, fluorescein isothiocyanate (FITC), tetramethylrhodamine isothiocyanate, or the like is used. In the case of enzyme labeling, peroxidase, alkaline phosphatase, or the like is used, and a color developing reaction can be performed by adding a substrate that develops color with an enzyme.

フローサイトメトリーでは、細胞に本発明の抗体を反応させ、さらに蛍光物質でラベルした抗イムノグロブリン抗体あるいは抗体断片を反応させた後、蛍光色素をフローサイトメーターで測定することにより、細胞中での本発明の蛋白質の発現を検出することができる。   In flow cytometry, cells are reacted with the antibody of the present invention, further reacted with a fluorescent substance-labeled anti-immunoglobulin antibody or antibody fragment, and then the fluorescent dye is measured with a flow cytometer. Expression of the protein of the present invention can be detected.

ウェスタンブロッティング法は、生体組織や細胞の破砕液をSDS-PAGEで分画した後、ゲルを膜にブロッティングし、この膜に本発明の抗体を反応させ、さらにペルオキシダーゼやアルカリフォスファターゼなどの酵素や125I等の放射性物質で標識した抗イムノグロブリン抗体を反応させた後、 本発明の蛋白質のバンドを検出する方法である。 In the Western blotting method, a biological tissue or cell lysate is fractionated by SDS-PAGE, the gel is blotted on a membrane, the antibody of the present invention is reacted with this membrane, and an enzyme such as peroxidase or alkaline phosphatase, or 125 This is a method for detecting a protein band of the present invention after reacting with an anti-immunoglobulin antibody labeled with a radioactive substance such as I.

酵素免疫測定法の一種であるサンドイッチELISAでは、抗原認識部位の異なる2種類の本発明の抗体を用意し、一方の抗体はプレートに吸着させておく。生体組織や細胞から調製した細胞破砕液を試験サンプルとしてプレートに接触させて反応を行い、さらに抗原認識部位の異なる他方の抗体を反応させ、さらにペルオキシダーゼやアルカリフォスファターゼなどの酵素で標識した抗イムノグロブリン抗体を反応させる。酵素により発色する基質を添加して発色反応させた後、分光光度計により発色強度を測定することにより、サンプル中の本発明の蛋白質の検出または測定を行うことができる。   In sandwich ELISA, which is a kind of enzyme immunoassay, two types of antibodies of the present invention having different antigen recognition sites are prepared, and one antibody is adsorbed on a plate. Anti-immunoglobulin labeled with an enzyme such as peroxidase or alkaline phosphatase, which is reacted by contacting a cell disruption solution prepared from biological tissue or cells with a test sample as a test sample, and reacting with another antibody with a different antigen recognition site. The antibody is reacted. After adding a substrate that develops color with an enzyme and causing a color reaction, the protein of the present invention in the sample can be detected or measured by measuring the color intensity with a spectrophotometer.

また、放射性免疫測定法は、酵素でなく125I等の放射性物質で標識した抗体を用いて、酵素免疫測定法と同様の操作を行い、シンチレーションカウンターで放射線を測定する方法である。 The radioimmunoassay is a method in which radiation is measured with a scintillation counter by performing the same operation as the enzyme immunoassay using an antibody labeled with a radioactive substance such as 125 I instead of an enzyme.

上記した方法を利用することにより、生体試料中における本発明の蛋白質の発現を本発明の抗体を用いて検出又は測定することができる、これにより大腸癌の診断を行うことができる。即ち、生体試料中における本発明の蛋白質の発現量が、正常の場合と比較して高まっている場合には大腸癌の疑いがあると診断することができる。   By utilizing the above-described method, the expression of the protein of the present invention in a biological sample can be detected or measured using the antibody of the present invention, whereby colorectal cancer can be diagnosed. That is, when the expression level of the protein of the present invention in the biological sample is increased compared to the normal case, it can be diagnosed that there is a suspicion of colorectal cancer.

(5)本発明のオリゴヌクレオチド
本発明は、上記した本発明のDNAの塩基配列の部分配列又はその相補配列から成るオリゴヌクレオチドに関する。
本発明のオリゴヌクレオチドの具体例としては、本発明のDNAの塩基配列中の連続した5〜100塩基と同じ配列を有するセンスオリゴヌクレオチド、当該センスオリゴヌクレオチドと相補的な配列を有するアンチセンスオリゴヌクレオチド、および、当該センスまたはアンチセンスオリゴヌクレオチドのオリゴヌクレオチド誘導体などが挙げられる。さらに具体的には、配列番号1の塩基配列中の連続した5〜100塩基と同じ配列を有するDNAまたは該DNAと相補的な配列を有するDNAを挙げることができる。また、配列の長さは、一般的には5〜100塩基であり、好ましくは10〜60塩基であり、より 好ましくは15〜50塩基である。
(5) Oligonucleotide of the present invention The present invention relates to an oligonucleotide comprising a partial sequence of the base sequence of the DNA of the present invention or a complementary sequence thereof.
Specific examples of the oligonucleotide of the present invention include a sense oligonucleotide having the same sequence as 5 to 100 consecutive bases in the base sequence of the DNA of the present invention, and an antisense oligonucleotide having a sequence complementary to the sense oligonucleotide. And oligonucleotide derivatives of the sense or antisense oligonucleotide. More specifically, a DNA having the same sequence as 5 to 100 consecutive bases in the base sequence of SEQ ID NO: 1 or a DNA having a sequence complementary to the DNA can be mentioned. The length of the sequence is generally 5 to 100 bases, preferably 10 to 60 bases, and more preferably 15 to 50 bases.

本発明のオリゴヌクレオチドは、本発明のDNAまたはその断片の塩基配列情報を基に、核酸合成機などを用いる常法により製造することができる。   The oligonucleotide of the present invention can be produced by a conventional method using a nucleic acid synthesizer or the like based on the base sequence information of the DNA of the present invention or a fragment thereof.

また、上記のオリゴヌクレオチドの誘導体も本発明のオリゴヌクレオチドとして利用することができる。オリゴヌクレオチド誘導体としては、オリゴヌクレオチド中のリン酸ジエステル結合がホスホロチオエート結合に変換されたオリゴヌクレオチド誘導体、オリゴヌクレオチド中のリン酸ジエステル結合がN3'-P5'ホスフォアミデート結合に変換されたオリゴヌクレオチド誘導体、オリゴヌクレオチド中のリボースとリン酸ジエステル結合がペプチド核酸結合に変換されたオリゴヌクレオチド誘導体、オリゴヌクレオチド中のウラシルがC-5プロピニルウラシルで置換されたオリゴヌクレオチド誘導体、オリゴヌクレオチド中のウラシルがC-5チアゾールウラシルで置換されたオリゴヌクレオチド誘導体、オリゴヌクレオチド中のシトシンがC-5プロピニルシトシンで置換されたオリゴヌクレオチド誘導体、オリゴヌクレオチド中のシトシンがフェノキサジン修飾シトシンで置換されたオリゴヌクレオチド誘導体、オリゴヌクレオチド中のリボースが2'-O-プロピルリボースで置換されたオリゴヌクレオチド誘導体、あるいはオリゴヌクレオチド中のリボースが2'-メトキシエトキシリボースで置換されたオリゴヌクレオチド誘導体等をあげることができる。   In addition, derivatives of the above oligonucleotides can also be used as the oligonucleotide of the present invention. Oligonucleotide derivatives include oligonucleotide derivatives in which phosphodiester bonds in oligonucleotides are converted to phosphorothioate bonds, oligonucleotides in which phosphodiester bonds in oligonucleotides are converted to N3′-P5 ′ phosphoramidate bonds Derivatives, oligonucleotide derivatives in which ribose and phosphodiester bonds in oligonucleotides are converted to peptide nucleic acid bonds, oligonucleotide derivatives in which uracil in oligonucleotides is replaced with C-5 propynyluracil, uracil in oligonucleotides is C Oligonucleotide derivatives substituted with -5 thiazoleuracil, cytosines in oligonucleotides substituted with C-5 propynylcytosine, cytosines in oligonucleotides Is an oligonucleotide derivative substituted with phenoxazine modified cytosine, an oligonucleotide derivative in which the ribose in the oligonucleotide is substituted with 2'-O-propylribose, or the ribose in the oligonucleotide is substituted with 2'-methoxyethoxyribose And oligonucleotide derivatives.

(6)本発明のオリゴヌクレオチドを用いた大腸癌の診断薬及び診断方法
本発明は、上記した本発明のオリゴヌクレオチドを含む大腸癌の診断薬、並びに、生体試料中における本発明のDNAの発現を本発明のオリゴヌクレオチドを用いて検出又は測定することを含む大腸癌の診断方法に関する。
(6) Diagnostic Agent and Diagnostic Method for Colorectal Cancer Using Oligonucleotide of the Present Invention The present invention relates to a diagnostic agent for colorectal cancer containing the oligonucleotide of the present invention described above, and the expression of the DNA of the present invention in a biological sample. The present invention relates to a method for diagnosing colorectal cancer, which comprises detecting or measuring the above using the oligonucleotide of the present invention.

具体的には、上記(5)に記載した本発明のオリゴヌクレオチドを用いて、本発明のDNAのmRNAを検出することにより、本発明のDNAの発現を検出又は測定することができる。   Specifically, the expression of the DNA of the present invention can be detected or measured by detecting the mRNA of the DNA of the present invention using the oligonucleotide of the present invention described in (5) above.

本発明のDNAのmRNAを検出する方法としては、例えばノーザンブロット法、in situハイブリダイゼーション法、定量的PCR法、ディファレンシャル・ハイブリダイゼーション法、DNAチップ法、リボヌクレアーゼ保護アッセイ法等があげられる。これらの方法により各種試料における本発明のDNAのmRNAレベルでの発現量を調べることができる。これらの方法によって、本発明のDNAがどのような組織や細胞で発現しているかという情報を得ることができる。ここで用いる試料としてはヒトや動物から採取した生体試料(例えば、臓器、生体組織、血液、尿など)、あるいはこれらの生体試料から樹立した初代培養細胞又は細胞株などが用いられる。   Examples of the method for detecting mRNA of DNA of the present invention include Northern blotting, in situ hybridization, quantitative PCR, differential hybridization, DNA chip method, ribonuclease protection assay and the like. By these methods, the expression level of the DNA of the present invention at the mRNA level in various samples can be examined. By these methods, it is possible to obtain information on in which tissues and cells the DNA of the present invention is expressed. Examples of the sample used here include biological samples collected from humans and animals (for example, organs, biological tissues, blood, urine, etc.) or primary cultured cells or cell lines established from these biological samples.

ノーザンブロット法は、試料から抽出した全RNAあるいはmRNAをゲル電気泳動で分離後、膜に転写し、本発明のオリゴヌクレオチドを標識で標識して調製した標識プローブを用いてハイブリダイゼーション及び洗浄を行い、本発明のDNAのmRNAを、標識プローブが結合したバンドとして検出する方法である。バンドの強度は、本発明のDNAのmRNA量を反映しているので、本発明のDNAのmRNAレベルでの発現量を定量することもできる。   Northern blotting is a method in which total RNA or mRNA extracted from a sample is separated by gel electrophoresis, transferred to a membrane, and subjected to hybridization and washing using a labeled probe prepared by labeling the oligonucleotide of the present invention with a label. This is a method for detecting mRNA of the DNA of the present invention as a band bound to a labeled probe. Since the band intensity reflects the mRNA level of the DNA of the present invention, the expression level at the mRNA level of the DNA of the present invention can also be quantified.

In situハイブリダイゼーション法は、試料である臓器や生体組織からパラフィン包埋切片あるいはクリオスタット切片を作製し、該切片に対して本発明のオリゴヌクレオチドより調製した標識プローブを用いてハイブリダイゼーション及び洗浄を行い、組織内における本発明のDNAの発現細胞の種類や発現部位などを詳細に検出する方法である。 The in situ hybridization method prepares a paraffin-embedded section or a cryostat section from a sample organ or biological tissue, and performs hybridization and washing on the section using a labeled probe prepared from the oligonucleotide of the present invention. This is a method for detecting in detail the type and expression site of cells expressing the DNA of the present invention in the tissue.

定量的PCR法は、試料由来RNAからオリゴdTプライマーと逆転写酵素を用いて合成したcDNAを鋳型として本発明のオリゴヌクレオチドプライマーを用いてPCRを行い、本発明のDNAのmRNAに由来するDNA断片を特異的に増幅する方法である。増幅されたDNA断片量は、試料中における本発明のDNAのmRNAの量を反映することから、本発明のDNAのmRNAを定量することが可能である。   In the quantitative PCR method, PCR is performed using a cDNA synthesized from a sample-derived RNA using an oligo dT primer and a reverse transcriptase, using the oligonucleotide primer of the present invention as a template, and a DNA fragment derived from the mRNA of the DNA of the present invention. Is a method of specifically amplifying Since the amount of the amplified DNA fragment reflects the amount of mRNA of the DNA of the present invention in a sample, it is possible to quantify the mRNA of the DNA of the present invention.

ディファレンシャル・ハイブリダイゼーション法やDNAチップ法は、本発明のオリゴヌクレオチドを固定化させた基盤に対して、試料由来RNAから合成した標識cDNAをプローブとしてハイブリダイゼーション及び洗浄を行うことで、試料中の本発明のDNAのmRNAレベルでの発現を検出する方法である。   The differential hybridization method and the DNA chip method are performed by performing hybridization and washing using a labeled cDNA synthesized from a sample-derived RNA as a probe on a substrate on which the oligonucleotide of the present invention is immobilized. It is a method for detecting the expression of the DNA of the invention at the mRNA level.

リボヌクレアーゼ保護アッセイでは、まず本発明のDNAの3'端にT7プロモーターなどのプロモーター配列を結合し、標識NTPおよびプロモーター特異的なRNAポリメラーゼを用いたインビトロの転写系により標識したアンチセンスRNAを合成する。この標識アンチセンスRNAを試料から調製したRNAとハイブリダイゼーションさせ、検体中の本発明のmRNAとRNA-RNAハイブリッドを形成させた後、リボヌクレアーゼで消化し、ハイブリッドの形成によりリボヌクレアーゼによる消化から保護されたバンドをゲル電気泳動で検出する。保護されたバンドを定量することで、本発明のDNAのmRNAレベルでの発現を定量することができる。   In the ribonuclease protection assay, first, a promoter sequence such as a T7 promoter is bound to the 3 ′ end of the DNA of the present invention, and a labeled antisense RNA is synthesized by an in vitro transcription system using labeled NTP and a promoter-specific RNA polymerase. . This labeled antisense RNA was hybridized with RNA prepared from a sample to form an RNA-RNA hybrid with the mRNA of the present invention in a specimen, and then digested with ribonuclease, and protected from digestion by ribonuclease by the formation of the hybrid. Bands are detected by gel electrophoresis. By quantifying the protected band, the expression of the DNA of the present invention at the mRNA level can be quantified.

以上のような方法により、被検者および健常者から生検等により採取した臓器や生体組織、血液等の生体試料、あるいはこれから培養した初代培養細胞を検体として用い、両者における本発明のDNAのmRNAレベルでの発現の定量を行って比較することにより、本発明のDNAのmRNAレベルの発現量が健常者と比べて増加しているかどうかを診断することができる。そして、検体中における本発明のDNAの発現量が、健常者の場合と比較して高まっている場合には、大腸癌の疑いがあると診断することができる。   Using the above-described method, a biological sample such as an organ, biological tissue, blood or the like collected from a subject and a healthy person by biopsy or the like, or a primary cultured cell cultured from now on, is used as a specimen. By quantifying the expression at the mRNA level and comparing it, it is possible to diagnose whether the expression level of the mRNA level of the DNA of the present invention is increased compared with that of a healthy person. Then, when the expression level of the DNA of the present invention in the sample is increased as compared with that of a healthy person, it can be diagnosed that there is a suspicion of colorectal cancer.

以下の実施例により本発明をさらに具体的に説明するが、本発明は実施例によって限定されるものではない。   The following examples further illustrate the present invention, but the present invention is not limited to the examples.

実施例1:新規遺伝子の検索とHmat-Xa遺伝子の同定
段落番号0008に記したように、全生物を通じて、その遺伝子が未だにクローニングされていないマンノース転移酵素IIおよびマンノース転移酵素IVも、上記のマンノース転移酵素I、マンノース転移酵素IIIおよびマンノース転移酵素Vと同様に、糖ヌクレオチドであるGDP-マンノースをマンノース供与体としている。そこで、以下のパラメーターを用いてバイオインフォーマティックスの手法で、未知遺伝子のクローニングを企てた。検索に用いたパラメーターは、(1)CaZY などを用いた、ヒトのマンノース転移酵素I、マンノース転移酵素III、マンノース転移酵素Vを始めとする、糖ヌクレオチドを糖供与体とする糖転移酵素に共通なドメインGlycosyltransferase group 1 domainを持つ糖転移酵素および糖転移酵素候補のアミノ酸配列、(2)既知の全生物のマンノース転移酵素のアミノ酸配列、(3)糖ヌクレオチドを供与体とする糖転移酵素に共通の、DXDあるいは DDX 配列、(4)糖ヌクレオチドにおけるα-グリコシド結合を維持して結合する糖転移酵素に共通のEX7E配列、(5)酵母リピド中間体生合成に働く糖転移酵素、酵母ドリコールキナーゼ(Sec59蛋白)、イヌオリゴ糖転移酵素ribophorin Iサブユニットなどで提唱された仮想的ドリコール認識配列PDRS、である。
以上のことから、まず、Pfamに登録されているGlycosyltransferase group 1 domainを持つ糖転移酵素グループに属する約1000の蛋白のうち、真核生物由来のもので、機能未知のものをリストアップした。
Example 1: Search for novel gene and identification of Hmat-Xa gene As described in paragraph 0008, mannose transferase II and mannose transferase IV in which the gene has not yet been cloned are also expressed in the above-described mannose. Similar to transferase I, mannose transferase III, and mannose transferase V, the sugar nucleotide GDP-mannose is used as a mannose donor. Therefore, we attempted to clone an unknown gene using bioinformatics techniques using the following parameters. The parameters used in the search are (1) common to glycosyltransferases using sugar nucleotides as sugar donors, such as human mannose transferase I, mannose transferase III, and mannose transferase V using CaZY. Glycosyltransferase group 1 domain glycosyltransferase and amino acid sequences of glycosyltransferase candidates, (2) amino acid sequences of mannose transferases of all known organisms, (3) common to glycosyltransferases using sugar nucleotides as donors DX4 or DDX sequence, (4) EX 7 E sequence common to glycosyltransferases that maintain α-glycoside bonds in sugar nucleotides, (5) Glycosyltransferases acting on yeast lipid intermediate biosynthesis, yeast This is a hypothetical dolichol recognition sequence PDRS proposed by dolichol kinase (Sec59 protein), canine oligosaccharide transferase ribophorin I subunit and the like.
From the above, first of all, about 1000 proteins belonging to the glycosyltransferase group having Glycosyltransferase group 1 domain registered in Pfam, those that are derived from eukaryotes and whose functions are unknown are listed.

その結果、ショウジョウバエQ9VXN0、シロイヌナズナQ9LPN6、イネQ9AXB1、Trypanosoma Q9U532、シロイヌナズナQ9M147などが、リストアップされた。そして、それらのアミノ酸配列をパラメーターとして、DDBJのヒトESTデータベースをtBLASTnサーチした。   As a result, Drosophila Q9VXN0, Arabidopsis Q9LPN6, rice Q9AXB1, Trypanosoma Q9U532, Arabidopsis Q9M147, etc. were listed. Then, tDBLASTn search was performed on the human EST database of DDBJ using those amino acid sequences as parameters.

そのうち、Q9VXN0のアミノ酸配列によるヒトESTデータベースのtBLASTnサーチで本発明の遺伝子に関する結果が得られた。すなわち、高いbitでヒト未知EST2種にヒットした。そのうち1つのグループはQ9VXN0のアミノ酸配列のC末端側に位置する、Glycosyltransferase group 1 domain部分に相同、もう一つは、Q9VXN0のアミノ酸配列のN末端に相同であった。前者に属するヒトESTクローンとしてBI770600、AU119344などがあり、後者に属するヒトESTクローンとして、BI488854などがある。尚、Q9VXN0のGlycosyltransferase group 1 domain部分に相同性を示すヒト既知遺伝子として、マンノース転移酵素III遺伝子Hmat-3とGPIアンカーにおける糖鎖生合成の第一段階に働くN-アセチルグルコサミン転移酵素遺伝子PIG-Aが検出された。   Among them, the result of the gene of the present invention was obtained by tBLASTn search of the human EST database with the amino acid sequence of Q9VXN0. In other words, two human unknown ESTs were hit with high bits. One group was homologous to the Glycosyltransferase group 1 domain portion located on the C-terminal side of the amino acid sequence of Q9VXN0, and the other was homologous to the N-terminus of the amino acid sequence of Q9VXN0. Examples of the human EST clone belonging to the former include BI770600 and AU119344, and examples of the human EST clone belonging to the latter include BI488854. In addition, as a known human gene showing homology to the Glycosyltransferase group 1 domain part of Q9VXN0, mannose transferase III gene Hmat-3 and N-acetylglucosaminyltransferase gene PIG- acting in the first stage of sugar chain biosynthesis in GPI anchor A was detected.

そこで、更に、ヒトESTクローンBI770600に相同なヒトESTをサーチすると、高い相同性を示すグループと、未知遺伝子3種にヒットした。尚、BI770600は2番染色体に由来することもこの段階で判明した。次に、BI770600およびBI770600に相同なヒトESTとして検出されたAU119344、AI082171、BG682274をもとに、272アミノ酸からなる部分的 アミノ酸配列(配列番号5)を作成した。   Therefore, when a human EST homologous to the human EST clone BI770600 was further searched, a group showing high homology and three unknown genes were hit. It was also found at this stage that BI770600 was derived from chromosome 2. Next, a partial amino acid sequence (SEQ ID NO: 5) consisting of 272 amino acids was created based on AU119344, AI082171, and BG682274 detected as human ESTs homologous to BI770600 and BI770600.

次に、この配列をもとに、蛋白のドメイン構造を検索するインターネットのサイトであるProdomで、同プログラムをもとに、ドメイン検索した結果、この配列がマンノース転移酵素ドメイン(K150-W253)を持つことが判明した。更に、このProdomの検索でこれらの配列を持つヒト蛋白として、Q9HE5があることも判明した(但し、機能は未知であり、Glycosyltransferase group 1 domainを持つもののリストには入っていなかった。)。以上から、新規糖転移遺伝子である可能性が高いと考え、この遺伝子をHmat-Xaと命名して、遺伝子のクローニングに着手した。尚、Hmat-Xa遺伝子に相同な配列は、酵母遺伝子には見あたらなかった。
また、CAZYのglycosyltransferase family の方の検索をすると、Hmat-3遺伝子およびHmat-5遺伝子が属しているglycosyltransferase family 4に未知ヒトESTクローンAK021815があり、それは我々が見いだしたHmat-Xa遺伝子に相同であることがわかった。
Next, based on this sequence, Prodom, an Internet site that searches the domain structure of proteins, searched for a domain based on the same program. As a result, this sequence was found to contain the mannose transferase domain (K150-W253). It turns out to have. Furthermore, the Prodom search revealed that there was Q9HE5 as a human protein having these sequences (however, the function was unknown and it was not included in the list of those having the Glycosyltransferase group 1 domain). Based on the above, it was considered that this was a novel glycosyltransferase gene, and this gene was named Hmat-Xa and cloning of the gene was started. A sequence homologous to the Hmat-Xa gene was not found in the yeast gene.
In addition, when searching for the glycosyltransferase family of CAZY, there is an unknown human EST clone AK021815 in glycosyltransferase family 4 to which the Hmat-3 and Hmat-5 genes belong, which is homologous to the Hmat-Xa gene we found. I found out.

実施例2:Hmat-Xa遺伝子のクローニング:
このAK021815 をもとに、以下の検索をおこなった。EST クローンAK021815と、これにBLASTでヒットしたESTクローンAK091684を比較して、AK091684がAK021815よりも5'側に637bp伸長していることを見出した(同時にAK091684がエクソン1つ分スキップしていることも見出した; 下図の黒の大文字配列が欠如したエクソンに相当)。また、AK021815の最上流側エクソンを含むゲノミッククローンAC010681には、このAK091684の637bp配列は含まれていなかった。そこで、AK091684の配列(全長2353bp)で再度BLAST検索を行ったところ、AC010681に隣接するゲノミッククローンAC009957が検出され、この中にAK091684の2〜613番目のヌクレオチドが4分割されて含まれていた(614〜967番目のヌクレオチドは、同時に検出されたAC010681中に含まれていた)。また、AK091684の2〜400番目のヌクレオチドを元にESTデータベースを検索したところ、AK091684よりもさらに5'側に伸長したESTクローンが複数検出され(BG027230, BG427368等)、これらESTクローンの5'側伸長部分のコンセンサスをとり、Hmat-Xa cDNA配列を5'側にさらに59bp伸長させた(この59bp配列は、ゲノミッククローンAC009957にさらに5'側に隣接するゲノミッククローンAC010130に含まれる)。この59bp配列の5'側には、なおもスプライシングによりエクソンが連結している可能性が残されているが、59bp配列中には、in frameで終止コドン(TAG)が存在するため、開始コドンは、AK091684の93〜95番目の位置(ATG)であると結論づけられた。
Example 2: Cloning of the Hmat-Xa gene:
Based on this AK021815, the following searches were performed. Comparing EST clone AK021815 with EST clone AK091684 that was hit by BLAST, we found that AK091684 was extended 637 bp to the 5 'side of AK021815 (at the same time AK091684 skipped one exon) (Corresponding to the exon lacking the black capital sequence in the figure below). The genomic clone AC010681 containing the most upstream exon of AK021815 did not contain the 637 bp sequence of AK091684. Therefore, when BLAST search was performed again with the sequence of AK091684 (full length 2353 bp), a genomic clone AC009957 adjacent to AC010681 was detected, and this included the 2nd to 613rd nucleotides of AK091684 divided into 4 parts ( The nucleotides 614 to 967 were contained in AC010681 detected at the same time). In addition, when the EST database was searched based on the 2nd to 400th nucleotides of AK091684, multiple EST clones extended further 5 'than AK091684 were detected (BG027230, BG427368, etc.). The consensus of the extended portion was taken, and the Hmat-Xa cDNA sequence was further extended by 59 bp to the 5 ′ side (this 59 bp sequence is contained in the genomic clone AC010130 further adjacent to the genomic clone AC009957 by 5 ′). On the 5 'side of this 59 bp sequence, there is still a possibility that an exon is linked by splicing, but since there is a stop codon ( TAG ) in frame in the 59 bp sequence, the start codon It was concluded that this is the 93rd to 95th position ( ATG ) of AK091684.

以上の結果から、下図の配列(配列番号6)に、Hmat-Xa遺伝子ORFの全長が含まれると考えた。/(改行)はエクソン境界部を示す。黒大文字部分のエクソンを欠如したAK091684パターンのスプライシングが生じると、下流の大文字のTAAでORF(ORF2)が終了するのに対して、このエクソンを含むAK021815パターンのスプライシングが生じると、さらに下流の大文字のTGAまでORF(ORF1)が続き、Glycosyltransferase group 1 domainに有為な相同性を示す。 From the above results, it was considered that the full length of the Hmat-Xa gene ORF was included in the sequence (SEQ ID NO: 6) in the figure below. / (Line feed) indicates an exon boundary. Splicing of the AK091684 pattern, which lacks the exon in the black uppercase part, terminates the ORF (ORF2) in the uppercase TAA downstream, whereas the splicing of the AK021815 pattern that contains this exon causes further lowercase capitalization ORF (ORF1) continues to TGA, and shows significant homology to the Glycosyltransferase group 1 domain.

/gtatctctgcatTAGccagattggacatatgtaaagggacatcagtatatctggatcatcag/
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cctgtggcggcttcagatctccaatccctgccaccaccccaactcaaattaaatacagattcctagagacgttatgatgg
ttacacatgtcctcggcatcacatgtaggagactgttcaaaaaaaatatgtggcctgttgtataaccgcactcatgtatc
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tgattcctgatcacagacccaaggatctggaaagcatcatcagacccaagtgccaagttatttactttcccatcaggttt
cctgatgtgagcag /
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cccttccttttcagccagagcagagagattcagaggatttattgaagaattttaattcagagtgtgatacacactgtggc
cttgatactgcacgacaagaatatttgggtaactcattaagacaggaatcagacttgaaaaaatccacctcgtcagataa
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ggagcatgataaagatccagaaagcttttttaaggtattaatgcatcttaaagacttag gactcaatttccacgtgtctg
tacttggag aaaccttcacagatgtcccag
ATATTTTTTCAGAGGCCAAAAAGGCATTGGGATCTTCTGTCTTACACTGGGGCTACTTACCCAGCAAAGATGACTACTTC
CAAGTACTGTGCATGGCTGATGTTGTCATCTCAACAGCTAAGCATGAATTCTTTGGAGTGGCAAT /
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ctgaatatctgtattctacacctgaacagctttcaaaaaggctccagaatttctgcaagagaccagatatta TAA gaaaa
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g TGA cagatggggctaagtcacaaacttgcagcctaaggcagagtctgaagaactttccagagtgtgcccatatttacct
gatcagagagaaaagaaaatct gcagaggaagctgagcctggctgcttgtca tagctgacacagagccatctgccacaaa
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catacttgttttaatttttttcccagcgtaaaaatagaaaaatcaaaatactcctaacaaaaccagtgattttgatagaa
atatttctccaatatacttgcatccacctacaaatataaccttttcaagataaatcgcttatgatttcaatagtcaaact
gctgtgtttgttgatgtaaagatgttttgaatggctagatggtaaaataaattcttaataaagtacccactgc

この推定された全長配列に基づき、pUC118またはpUC119ベクターのSmaI部位へのクローニング用のPCRプライマーとして、
XA-9F : ATCAGATTGTGCTTCAAGAAGACCATAGGG (配列番号7)
XA-10R : TGACAAGCAGCCAGGCTCAGCTTCCTCTGC (配列番号8)
を設計し(グライナージャパンに委託合成)、brain及びliverのcDNAプール(MTC Panel Human I;Clontech)を鋳型にして、以下の条件で、PCRを行った。
Based on this deduced full-length sequence, as a PCR primer for cloning into the SmaI site of pUC118 or pUC119 vector,
XA-9F: ATCAGATTGTGCTTCAAGAAGACCATAGGG (SEQ ID NO: 7)
XA-10R: TGACAAGCAGCCAGGCTCAGCTTCCTCTGC (SEQ ID NO: 8)
Was designed (consigned synthesis to Greiner Japan), and PCR was performed using the brain and liver cDNA pools (MTC Panel Human I; Clontech) as a template under the following conditions.

反応液組成:
Human MTC Panel のcDNA (brainまたはliver) 5μl
dH2O 36.25μl
10×buffer (酵素付属、No.1) 5μl
10mM dNTP mix 1μl
10μM各プライマー 1μlずつ
Expand Long Template PCR System (Roche Diagnostics)のenzyme mix 0.75μl
反応液のtotal 50μl
Reaction solution composition:
Human MTC Panel cDNA (brain or liver) 5 μl
dH 2 O 36.25μl
10 x buffer (enzyme attached, No.1) 5μl
10 mM dNTP mix 1 μl
1 μl of 10 μM each primer
Expand Long Template PCR System (Roche Diagnostics) enzyme mix 0.75μl
Total 50 μl of reaction solution

反応条件:
94℃ 1 minの後、(94℃ 30 sec・68℃ 3 min) × 50 cycles、68℃ 2 min
Reaction conditions:
After 94 ℃ 1 min, (94 ℃ 30 sec ・ 68 ℃ 3 min) × 50 cycles, 68 ℃ 2 min

1%アガロースゲル電気泳動の結果、ヒトのbrainとliver、いずれの組織からも予想された2つのサイズ(約1.6kb及び1.45kb)の増幅断片が確認された。このPCR反応液をPCR Product Purification Kit (Roche Diagnostics)を用いてマニュアル通り精製し、EtOH沈殿を行って濃縮した後、Sma I切断したpUC118またはpUC119ベクターに連結し(Takara Ligation Kit ver.2をマニュアル通り使用)、大腸菌JM109を形質転換してクローニングした。
こうして、pUCベクターにクローニング後、それら2つのサイズの陽性クローンの塩基配列を決定した。
As a result of 1% agarose gel electrophoresis, amplified fragments of two sizes (about 1.6 kb and 1.45 kb) expected from human brain and liver, both tissues, were confirmed. This PCR reaction solution was purified using the PCR Product Purification Kit (Roche Diagnostics) according to the manual, concentrated by EtOH precipitation, and then ligated to the Sma I cleaved pUC118 or pUC119 vector (Takara Ligation Kit ver. E. coli JM109 was transformed and cloned.
Thus, after cloning into the pUC vector, the base sequences of these two size positive clones were determined.

pUCベクターにクローニング後の配列決定用プライマーとして、以下のプライマーを用いた。
puCF: CGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGAC (配列番号9)
pUCR: CGGATAACAATTTCACACAGGAAAC (配列番号10)
XA-5R: TCTGCTCTGGCTGAAAAGGAAGGGCCATGG (配列番号11)
XA-7F: GAAGATGCTCGGCCTTAAAGGAAATGGCGG (配列番号12)
The following primers were used as primers for sequencing after cloning into the pUC vector.
puCF: CGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGAC (SEQ ID NO: 9)
pUCR: CGGATAACAATTTCACACAGGAAAC (SEQ ID NO: 10)
XA-5R: TCTGCTCTGGCTGAAAAGGAAGGGCCATGG (SEQ ID NO: 11)
XA-7F: GAAGATGCTCGGCCTTAAAGGAAATGGCGG (SEQ ID NO: 12)

上記の通り、ORFは2種類あり、その第1(ORF1)は、ORFが1374塩基(アミノ酸458残基をコード)あり、第2(ORF2)はORFが1128塩基(アミノ酸376残基をコード)あった。この2つのORF のうち、ORF1のみにGlycosyltransferase group 1 domainが含まれていた。すなわち、このORF1 がHmat-Xa遺伝子である。   As described above, there are two types of ORFs. The first (ORF1) has 1374 bases (encoding amino acid 458 residues), and the second (ORF2) has 1128 bases ORF (coding amino acid 376 residues). there were. Of these two ORFs, only ORF1 contained Glycosyltransferase group 1 domain. That is, this ORF1 is the Hmat-Xa gene.

配列番号1: Hmat-Xa遺伝子(ORF1)を含む塩基配列
開始コドンと終始コドンを大文字で示した。
gtatctctgcatTAGccagattggacatatgtaaagggacatcagtatatctggatcatcagattgtgcttcaagaagac
catagggaagaacgcattttcatcttgctgcaaaagttgcaatagaagatctgaaggtttgaatgggccaATGagtatcc
tcatcattgaagcattctatggaggctcccataaacagctggtggatcttcttcaagaagagttaggagactgtgtcgtt
tatacccttcctgcaaagaaatggcattggagagcccggacatctgctttatatttctctcagaccattcccatcagtga
gcattacaggaccctctttgcaagttcagtgcttaacctgaccgaactggctgcccttcggcctgaccttgggaaactga
aaaagattctgtattttcacgagaaccagttgatatatcctgtcaagaaatgtcaggagagggatttccaatatggatac
aaccaaattctttcatgcctggtggctgatgtggttgtattcaactcagtttttaatatggaatcatttctcacttccat
gggaaaatttatgaagctgattcctgatcacagacccaaggatctggaaagcatcatcagacccaagtgccaagttattt
actttcccatcaggtttcctgatgtgagcagattcatgcccaagcacaaaacaacccatttaaagaagatgctcggcctt
aaaggaaatggcggtgcggttctgtccatggcccttccttttcagccagagcagagagattcagaggatttattgaagaa
ttttaattcagagtgtgatacacactgtggccttgatactgcacgacaagaatatttgggtaactcattaagacaggaat
cagacttgaaaaaatccacctcgtcagataattcaagctctcatcatggtgaaaataaacaaaatctgactgttgatccc
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tccagaaagcttttttaaggtattaatgcatcttaaagacttaggactcaatttccacgtgtctgtacttggagaaacct
tcacagatgtcccagATATTTTTTCAGAGGCCAAAAAGGCATTGGGATCTTCTGTCTTACACTGGGGCTACTTACCCAGC
AAAGATGACTACTTCCAAGTACTGTGCATGGCTGATGTTGTCATCTCAACAGCTAAGCATGAATTCTTTGGAGTGGCAAT
gttggaagctgtgtactgtgggtgttacccactttgtcctaaagatttggtttatcccgaaatatttccagctgaatatc
tgtattctacacctgaacagctttcaaaaaggctccagaatttctgcaagagaccagatattaTAAgaaaacatctctat
aagggtgaaatcgctccgttttcttgggcagccctacatggtaaattcaggtctctgcttacaacagaacctagggaaga
tttgTGAcagatggggctaagtcacaaacttgcagcctaaggcagagtctgaagaactttccagagtgtgcccatattta
cctgatcagagagaaaagaaaatctgcagaggaagctgagcctggctgcttgtcatagctgacacagagccatctgccac
aaacctgtggcggcttcagatctccaatccctgccaccaccccaactcaaattaaatacagattcctagagacgttatga
tggttacacatgtcctcggcatcacatgtaggagactgttcaaaaaaaatatgtggcctgttgtataaccgcactcatgt
atcccatatgtggtgccacattgaatttccggttgaatccgtttttatcctttgtactggatgacatggtgcctgaattc
tttcttttcgccgacacgatggcagccaaactgcagcttcaaacgctcacacttggctgggtttctacctaggttgccag
gttatcatcggagccttcttgtgtcctcaaagggccacgaggcctgaaaggaggatcagaatgctttgggattaattggg
cagccatcgcagaattgtttgtgggcaaagggctgctttagcacttttcttttagcaaattaatgactctcaggcacagg
gggttttaagtgaaggtattaataagaggtctggcaggtattcccatgattcacagagttacatttgcatttaattaatc
ttaaagttgcaagataaacagctgtaattcggacaaacatgacaaacacagtgaagccaactatcccataaaatgaacac
tgacatacttgttttaatttttttcccagcgtaaaaatagaaaaatcaaaatactcctaacaaaaccagtgattttgata
gaaatatttctccaatatacttgcatccacctacaaatataaccttttcaagataaatcgcttatgatttcaatagtcaa
actgctgtgtttgttgatgtaaagatgttttgaatggctagatggtaaaataaattcttaataaagtacccactgc
SEQ ID NO: 1: Base sequence containing Hmat-Xa gene (ORF1) The start and stop codons are shown in capital letters.
gtatctctgcatTAGccagattggacatatgtaaagggacatcagtatatctggatcatcagattgtgcttcaagaagac
catagggaagaacgcattttcatcttgctgcaaaagttgcaatagaagatctgaaggtttgaatgggcca ATG agtatcc
tcatcattgaagcattctatggaggctcccataaacagctggtggatcttcttcaagaagagttaggagactgtgtcgtt
tatacccttcctgcaaagaaatggcattggagagcccggacatctgctttatatttctctcagaccattcccatcagtga
gcattacaggaccctctttgcaagttcagtgcttaacctgaccgaactggctgcccttcggcctgaccttgggaaactga
aaaagattctgtattttcacgagaaccagttgatatatcctgtcaagaaatgtcaggagagggatttccaatatggatac
aaccaaattctttcatgcctggtggctgatgtggttgtattcaactcagtttttaatatggaatcatttctcacttccat
gggaaaatttatgaagctgattcctgatcacagacccaaggatctggaaagcatcatcagacccaagtgccaagttattt
actttcccatcaggtttcctgatgtgagcagattcatgcccaagcacaaaacaacccatttaaagaagatgctcggcctt
aaaggaaatggcggtgcggttctgtccatggcccttccttttcagccagagcagagagattcagaggatttattgaagaa
ttttaattcagagtgtgatacacactgtggccttgatactgcacgacaagaatatttgggtaactcattaagacaggaat
cagacttgaaaaaatccacctcgtcagataattcaagctctcatcatggtgaaaataaacaaaatctgactgttgatccc
tgtgacattttgggtggagttgataatcagcaaagactgctacacattgtctggcctcacaggtgggagcatgataaaga
tccagaaagcttttttaaggtattaatgcatcttaaagacttag gactcaatttccacgtgtctgtacttggag aaacct
tcacagatgtcccagATATTTTTTCAGAGGCCAAAAAGGCATTGGGATCTTCTGTCTTACACTGGGGCTACTTACCCAGC
AAAGATGACTACTTCCAAGTACTGTGCATGGCTGATGTTGTCATCTCAACAGCTAAGCATGAATTCTTTGGAGTGGCAAT
gttggaagctgtgtactgtgggtgttacccactttgtcctaaagatttggtttatcccgaaatatttccagctgaatatc
tgtattctacacctgaacagctttcaaaaaggctccagaatttctgcaagagaccagatattaTAAgaaaacatctctat
aagggtgaaatcgctccgttttcttgggcagccctacatggtaaattcaggtctctgcttacaacagaacctagggaaga
tttg TGA cagatggggctaagtcacaaacttgcagcctaaggcagagtctgaagaactttccagagtgtgcccatattta
cctgatcagagagaaaagaaaatct gcagaggaagctgagcctggctgcttgtca tagctgacacagagccatctgccac
aaacctgtggcggcttcagatctccaatccctgccaccaccccaactcaaattaaatacagattcctagagacgttatga
tggttacacatgtcctcggcatcacatgtaggagactgttcaaaaaaaatatgtggcctgttgtataaccgcactcatgt
atcccatatgtggtgccacattgaatttccggttgaatccgtttttatcctttgtactggatgacatggtgcctgaattc
tttcttttcgccgacacgatggcagccaaactgcagcttcaaacgctcacacttggctgggtttctacctaggttgccag
gttatcatcggagccttcttgtgtcctcaaagggccacgaggcctgaaaggaggatcagaatgctttgggattaattggg
cagccatcgcagaattgtttgtgggcaaagggctgctttagcacttttcttttagcaaattaatgactctcaggcacagg
gggttttaagtgaaggtattaataagaggtctggcaggtattcccatgattcacagagttacatttgcatttaattaatc
ttaaagttgcaagataaacagctgtaattcggacaaacatgacaaacacagtgaagccaactatcccataaaatgaacac
tgacatacttgttttaatttttttcccagcgtaaaaatagaaaaatcaaaatactcctaacaaaaccagtgattttgata
gaaatatttctccaatatacttgcatccacctacaaatataaccttttcaagataaatcgcttatgatttcaatagtcaa
actgctgtgtttgttgatgtaaagatgttttgaatggctagatggtaaaataaattcttaataaagtacccactgc

配列番号2:ORF1のアミノ酸配列
下線部はORF2のアミノ酸配列とは異なる配列を示す。
MSILIIEAFYGGSHKQLVDLLQEELGDCVVYTLPAKKWHWRARTSALYFSQTIPISEHYRTLFASSVLNLTELAALRPDL
GKLKKILYFHENQLIYPVKKCQERDFQYGYNQILSCLVADVVVFNSVFNMESFLTSMGKFMKLIPDHRPKDLESIIRPKC
QVIYFPIRFPDVSRFMPKHKTTHLKKMLGLKGNGGAVLSMALPFQPEQRDSEDLLKNFNSECDTHCGLDTARQEYLGNSL
RQESDLKKSTSSDNSSSHHGENKQNLTVDPCDILGGVDNQQRLLHIVWPHRWEHDKDPESFFKVLMHLKDLGLNFHVSVL
GETFTDVPDIFSEAKKALGSSVLHWGYLPSKDDYFQVLCMADVVISTAKHEFFGVAMLEAVYCGCYPLCPKDLVYPEIFP
AEYLYSTPEQLSKRLQNFCKRPDIIRKHLYKGEIAPFSWAALHGKFRSLLTTEPREDL(term)
SEQ ID NO: 2: amino acid sequence of ORF1 The underlined portion indicates a sequence different from the amino acid sequence of ORF2.
MSILIIEAFYGGSHKQLVDLLQEELGDCVVYTLPAKKWHWRARTSALYFSQTIPISEHYRTLFASSVLNLTELAALRPDL
GKLKKILYFHENQLIYPVKKCQERDFQYGYNQILSCLVADVVVFNSVFNMESFLTSMGKFMKLIPDHRPKDLESIIRPKC
QVIYFPIRFPDVSRFMPKHKTTHLKKMLGLKGNGGAVLSMALPFQPEQRDSEDLLKNFNSECDTHCGLDTARQEYLGNSL
RQESDLKKSTSSDNSSSHHGENKQNLTVDPCDILGGVDNQQRLLHIVWPHRWEHDKDPESFFKVLMHLKDLGLNFHVSVL
GETFTDVP DIFSEAKKALGSSVLHWGYLPSKDDYFQVLCMADVVISTAKHEFFGVAMLEAVYCGCYPLCPKDLVYPEIFP
AEYLYSTPEQLSKRLQNFCKRPDIIRKHLYKGEIAPFSWAALHGKFRSLLTTEPREDL (term)

配列番号3: ORF2を含む塩基配列
開始コドンと終始コドンを大文字で示した。
gtatctctgcatTAGccagattggacatatgtaaagggacatcagtatatctggatcatcagattgtgcttcaagaagac
catagggaagaacgcattttcatcttgctgcaaaagttgcaatagaagatctgaaggtttgaatgggccaATGagtatcc
tcatcattgaagcattctatggaggctcccataaacagctggtggatcttcttcaagaagagttaggagactgtgtcgtt
tatacccttcctgcaaagaaatggcattggagagcccggacatctgctttatatttctctcagaccattcccatcagtga
gcattacaggaccctctttgcaagttcagtgcttaacctgaccgaactggctgcccttcggcctgaccttgggaaactga
aaaagattctgtattttcacgagaaccagttgatatatcctgtcaagaaatgtcaggagagggatttccaatatggatac
aaccaaattctttcatgcctggtggctgatgtggttgtattcaactcagtttttaatatggaatcatttctcacttccat
gggaaaatttatgaagctgattcctgatcacagacccaaggatctggaaagcatcatcagacccaagtgccaagttattt
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Agaaaacatctctataagggtgaaatcgctccgttttcttgggcagccctacatggtaaattcaggtctctgcttacaac
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SEQ ID NO: 3: Base sequence including ORF2 Start codon and end codon are shown in capital letters.
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gtacccactgc

配列番号4: ORF2のアミノ酸配列
下線部はORF1のアミノ酸配列とは異なる配列を示す。
MSILIIEAFYGGSHKQLVDLLQEELGDCVVYTLPAKKWHWRARTSALYFSQTIPISEHYRTLFASSVLNLTELAALRPDL
GKLKKILYFHENQLIYPVKKCQERDFQYGYNQILSCLVADVVVFNSVFNMESFLTSMGKFMKLIPDHRPKDLESIIRPKC
QVIYFPIRFPDVSRFMPKHKTTHLKKMLGLKGNGGAVLSMALPFQPEQRDSEDLLKNFNSECDTHCGLDTARQEYLGNSL
RQESDLKKSTSSDNSSSHHGENKQNLTVDPCDILGGVDNQQRLLHIVWPHRWEHDKDPESFFKVLMHLKDLGLNFHVSVL
GETFTDVPGWKLCTVGVTHFVLKIWFIPKYFQLNICILHLNSFQKGSRISARDQIL(term)
SEQ ID NO: 4: Amino acid sequence of ORF2 The underlined portion indicates a sequence different from the amino acid sequence of ORF1.
MSILIIEAFYGGSHKQLVDLLQEELGDCVVYTLPAKKWHWRARTSALYFSQTIPISEHYRTLFASSVLNLTELAALRPDL
GKLKKILYFHENQLIYPVKKCQERDFQYGYNQILSCLVADVVVFNSVFNMESFLTSMGKFMKLIPDHRPKDLESIIRPKC
QVIYFPIRFPDVSRFMPKHKTTHLKKMLGLKGNGGAVLSMALPFQPEQRDSEDLLKNFNSECDTHCGLDTARQEYLGNSL
RQESDLKKSTSSDNSSSHHGENKQNLTVDPCDILGGVDNQQRLLHIVWPHRWEHDKDPESFFKVLMHLKDLGLNFHVSVL
GETFTDVP GWKLCTVGVTHFVLKIWFIPKYFQLNICILHLNSFQKGSRISARDQIL (term)

実施例3:ホモロジー検索
上記の方法によるHmat-Xa遺伝子のクローニングと平行して、微生物起源のマンノース転移酵素のアミノ酸配列をもとに、ヒトESTデータベースに対して、新規糖転移酵素遺伝子候補をtBLASTn検索した結果、結核菌Mycobacterium tuberculosisのPimC遺伝子の遺伝子産物である仮想的マンノース転移酵素(Q9RLP4)およびMethanosarcina mazeiのマンノース転移酵素(Q8PZ44)が、Hmat-Xa遺伝子と相同性を持つ蛋白して検出された。このことから、Hmat-Xa遺伝子がマンノース転移酵素をコードする遺伝子である可能性が示唆された。
Example 3: Homology search In parallel with the cloning of the Hmat-Xa gene by the above method, a novel glycosyltransferase gene candidate was obtained from a human EST database based on the amino acid sequence of a mannose transferase derived from microorganisms. As a result of the search, the hypothetical mannose transferase (Q9RLP4) and Methanosarcina mazei mannose transferase (Q8PZ44), which are gene products of the PimC gene of Mycobacterium tuberculosis, were detected as proteins with homology to the Hmat-Xa gene. It was. This suggested that the Hmat-Xa gene may be a gene encoding mannose transferase.

実施例4:Hmat-Xa遺伝子の発現(mRNAの発現)
Hmat-Xa遺伝子(ORF1)のヒト組織別の発現および正常腺上皮および腺癌における発現をRT-PCR法により、半定量的に検討した。具体的には、以下の通り行った。
Example 4: Expression of Hmat-Xa gene (mRNA expression)
The expression of Hmat-Xa gene (ORF1) in human tissues and in normal glandular epithelium and adenocarcinoma was semi-quantitatively examined by RT-PCR. Specifically, it was performed as follows.

XA-17F : GACTCAATTTCCACGTGTCTGTACTTGGAG(配列番号13)とXA-10R(配列番号8)を用いて、RT-PCRを行った。試験した組織は、MTC Panel Human I及びMTC Panel Human II(いずれも正常組織由来、Clontech)に含まれる14組織と、MTC Panel Human Tumor(ガン組織由来、Clontech)である。   XA-17F: RT-PCR was performed using GACTCAATTTCCACGTGTCTGTACTTGGAG (SEQ ID NO: 13) and XA-10R (SEQ ID NO: 8). The tissues examined were 14 tissues included in MTC Panel Human I and MTC Panel Human II (both normal tissue origin, Clontech) and MTC Panel Human Tumor (cancer tissue origin, Clontech).

反応液組成:
MTC Panelの各cDNA 5μl
dH2O 36.25μl
10×buffer (酵素付属、No.1) 5μl
10mM dNTP mix 1μl
プライマーmix(XA-17FおよびXA-10R;各10μM) 2μl
Expand Long Template PCR System (Roche Diagnostics)のenzyme mix 0.75μl
反応液のtotal 50μl
Reaction solution composition:
5 μl of each MTC Panel cDNA
dH 2 O 36.25μl
10 x buffer (enzyme attached, No.1) 5μl
10 mM dNTP mix 1 μl
Primer mix (XA-17F and XA-10R; 10 μM each) 2 μl
Expand Long Template PCR System (Roche Diagnostics) enzyme mix 0.75μl
Total 50 μl of reaction solution

反応条件:
94℃ 30 secの後、(94℃ 30 sec(変性)・68℃ 2 min(アニーリング)) ×30または34 cycles、68℃ 2 min(伸長)
Reaction conditions:
After 94 ° C for 30 sec, (94 ° C for 30 sec (denaturation), 68 ° C for 2 min (annealing)) x 30 or 34 cycles, 68 ° C for 2 min (extension)

PCR後、反応液の10μlを用いて1%アガロースゲル電気泳動を行い、全ての組織から、予想された2つのサイズ、すなわち、ORF1 の部分配列(約570bp)及びORF2 の部分配列(420bp)の増幅断片を検出した。   After PCR, 1% agarose gel electrophoresis was performed using 10 μl of the reaction mixture. From all tissues, two predicted sizes of ORF1 partial sequence (about 570 bp) and ORF2 partial sequence (420 bp) were obtained. Amplified fragments were detected.

結果を図1(a)および(b)に示す。図1(a)の結果より分かるように、Hmat-Xa遺伝子の発現は、胎盤、卵巣、腎臓、肝臓、膵臓で高く、大腸、心臓、骨格筋で低かった。コントロールとして、グリセルアルデヒドー3-リン酸デヒドロゲナーゼ(G3PDH)についても、Clontechのhuman G3PDH control primer setを用いてRT-PCR(22サイクル)を行った。その結果、G3PDHは調べた全ての組織で同程度の発現が見られた。
Hmat-Xa遺伝子は、前記したように、酵母に相同な配列が見あたらない、そして、本項に示したように、ヒト組織間で発現の程度に相違がある。一方、リピド中間体生合成に働く遺伝子は真核生物間で普遍に存在している(保存されている)遺伝子であり、また、常に発現している、いわゆる、ハウスキーピング遺伝子であり、真核生物の各組織で同程度に発現している遺伝子である(私達は、ヒト・マンノース転移酵素I遺伝子およびヒト・マンノース転移酵素III遺伝子の組織別発現を検討したが、組織に於ける発現の程度に大きな違いは見られなかった)。そのようなことから、Hmat-Xa遺伝子はリピド中間体生合成に働くマンノース転移酵素ではないことが予想される。
The results are shown in FIGS. 1 (a) and (b). As can be seen from the results in FIG. 1A, the expression of the Hmat-Xa gene was high in the placenta, ovary, kidney, liver and pancreas, and low in the large intestine, heart and skeletal muscle. As a control, glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (G3PDH) was also subjected to RT-PCR (22 cycles) using Clontech's human G3PDH control primer set. As a result, G3PDH showed the same level of expression in all tissues examined.
As described above, the Hmat-Xa gene does not have a homologous sequence in yeast, and as shown in this section, the expression level differs between human tissues. On the other hand, genes that act on lipid intermediate biosynthesis are genes that are ubiquitous (conserved) among eukaryotes, and are so-called housekeeping genes that are always expressed. It is a gene that is expressed at the same level in each tissue of living organisms (we investigated the expression of human mannose transferase I gene and human mannose transferase III gene by tissue, Not much difference). Therefore, it is expected that the Hmat-Xa gene is not a mannose transferase that acts on lipid intermediate biosynthesis.

図1(b)に示した結果は、Hmat-Xa遺伝子の正常腺上皮と腺癌における転写を、肺、大腸、前立腺、卵巣、膵臓の5つの組織について、RT-PCRで比較したものである。コントロールとして、グリセルアルデヒド-3-リン酸デヒドロゲナーゼ(G3PDH)についてもRT-PCR(22サイクルのPCR)を行った。その結果、G3PDHは5つの組織において、正常・癌を問わず、ほぼ同程度の発現が見られた。一方、Hmat-Xa遺伝子については、以下の結果が得られた。肺では正常組織・腺癌組織では発現が低かった。大腸では正常組織では発現が低かったが、腺癌で発現の著しい昂進が見られた。一方、前立腺、卵巣、膵臓では正常組織では顕著な発現が見られたが、腺癌では発現が著しく低下した。このことから、大腸腺癌でHmat-Xa遺伝子の転写昂進が腫瘍マーカーとなりうることが示された。   The result shown in FIG. 1 (b) is a comparison of the transcription of the Hmat-Xa gene in normal glandular epithelium and adenocarcinoma by RT-PCR for five tissues: lung, large intestine, prostate, ovary, and pancreas. . As a control, RT-PCR (22 cycles of PCR) was also performed for glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (G3PDH). As a result, almost the same level of G3PDH was observed in 5 tissues regardless of normal or cancer. On the other hand, the following results were obtained for the Hmat-Xa gene. The expression was low in normal and adenocarcinoma tissues in the lung. In the large intestine, the expression was low in normal tissues, but the expression was significantly increased in adenocarcinoma. On the other hand, in the prostate, ovary, and pancreas, significant expression was observed in normal tissues, but in adenocarcinoma, the expression was significantly decreased. This indicates that the transcriptional progression of the Hmat-Xa gene can be a tumor marker in colorectal adenocarcinoma.

実施例5:Hmat-Xa遺伝子の発現(蛋白レベルでの発現)
この目的のために、まずHAタグ付加Hmat-Xa遺伝子を作製した。すなわち、すでにpUCベクターにクローニングしたORF1を含む配列(配列番号1)をPCRで増幅し、動物細胞発現用ベクター(pMH; Roche Diagnostics)のKpnI-NotI部位間に組み込んだ。
PCRの条件と反応組成液は、実施例2に記してある通りである。但し、鋳型DNAは形質転換株由来であり、プライマーは下記の通りである。
Example 5: Expression of Hmat-Xa gene (expression at the protein level)
For this purpose, an HA-tagged Hmat-Xa gene was first prepared. That is, a sequence (SEQ ID NO: 1) containing ORF1 already cloned into the pUC vector was amplified by PCR and inserted between KpnI-NotI sites of an animal cell expression vector (pMH; Roche Diagnostics).
PCR conditions and reaction composition are as described in Example 2. However, the template DNA is derived from the transformant and the primers are as follows.

用いたPCRプライマー:
XA-11FK aaggtaccaccATGAGTATCCTCATCATTG(配列番号14)
XA-12RN gggcggccgCAAATCTTCCCTAGGCTCTGT(配列番号15)
PCR primers used:
XA-11FK aaggtaccaccATGAGTATCCTCATCATTG (SEQ ID NO: 14)
XA-12RN gggcggccgCAAATCTTCCCTAGGCTCTGT (SEQ ID NO: 15)

また、酵母発現用には、上記の方法でpMHベクターにHmat-Xa 遺伝子を組み込んだ後に、構築されたHAタグ含有Hmat-Xa遺伝子部分をPCRで増幅し、酵母発現用ベクター(pESC-URA; Stratagene)のSalI-XhoI部位間に組み込んだ。
PCR の条件と反応液組成は、実施例2に記してある通りである。但し、鋳型DNA は形質転換株由来であり、プライマーは下記の通りである。
In addition, for yeast expression, the Hmat-Xa gene was constructed by incorporating the Hmat-Xa gene into the pMH vector by the above method, and then the constructed HA tag-containing Hmat-Xa gene portion was amplified by PCR, and the yeast expression vector (pESC-URA; Stratagene) was integrated between the SalI and XhoI sites.
PCR conditions and reaction solution composition are as described in Example 2. However, the template DNA is derived from the transformant and the primers are as follows.

プライマー
HA-RX: ggctcgagTTAGACGTAGTCTGGGACGTCG (配列番号16)
XA-11FS: gggtcgacATGAGTATCCTCATCATTGAAG (配列番号17)
Primer
HA-RX: ggctcgagTTAGACGTAGTCTGGGACGTCG (SEQ ID NO: 16)
XA-11FS: gggtcgacATGAGTATCCTCATCATTGAAG (SEQ ID NO: 17)

以上によって、構築されたHAタグ付加Hmat-Xa遺伝子含有pMHベクターおよびHAタグ付加Hmat-Xa遺伝子含有pESC-URAベクターにより、HeLa細胞あるいは酵母の形質転換を行った。   As described above, transformation of HeLa cells or yeast was performed using the constructed HA tag-added Hmat-Xa gene-containing pMH vector and HA-tag-added Hmat-Xa gene-containing pESC-URA vector.

A. HAタグ付加Hmat-Xa遺伝子導入HeLa細胞の作成
Fugene 6(Roche)を 6μl、HAタグ付加Hmat-Xa 遺伝子含有コンストラクトを2μg含み、無血清DMEM培地で全量を100μlとした後、その全量を、HeLa細胞をDMEM培地で対数増殖期(3×105細胞/ml)まで4ml量培養したシャーレに加えた。3日間培養後、コロニー形成させるために、細胞懸濁液を1/64および1/128に希釈して、ジェネティシン(400 μg/ml)含有DMEM培地4ml中にまいた。さらに10日間培養後、コロニー形成した細胞を集め、96穴プレート、24穴プレート、100mmシャーレの順に培養して行き、1コロニー由来の細胞を増やした。このような中から、形質転換株を得た。
A. Preparation of HA-tagged Hmat-Xa transgenic HeLa cells
After containing 6 μl of Fugene 6 (Roche) and 2 μg of the HA-tagged Hmat-Xa gene-containing construct, the total volume was adjusted to 100 μl with serum-free DMEM medium, and then the total volume of the HeLa cells was expanded to the logarithmic growth phase (3 × 10 5 ml / ml) was added to a petri dish cultured in a volume of 4 ml. After 3 days of culture, the cell suspension was diluted 1/64 and 1/128 and colonized in 4 ml of DMEM medium containing geneticin (400 μg / ml) for colony formation. After further culturing for 10 days, colony-formed cells were collected and cultured in the order of 96-well plate, 24-well plate, and 100 mm petri dish to increase the number of cells derived from one colony. A transformant was obtained from the above.

B.HAタグ付加Hmat-Xa遺伝子導入酵母の作成
<方法>
酵母YPH499株をYPDA培地1mlにて、30℃恒温槽で9時間振盪培養後、遠心で集菌し、そこに、100μlのOne Step Buffer(0.2M 酢酸リチウム、40% PEG4000、100mM DTT)を加えて懸濁。HAタグ付加Hmat-Xa遺伝子含有pESC-URAベクター溶液3μl(2μg)を加えて混合し、45℃恒温槽で、30分間、ヒートショックを与えた後、SD-URA寒天培地に、塗布し、30℃で3日間培養した。
B. Preparation of H-tagged Hmat-Xa transgenic yeast
<Method>
The yeast YPH499 strain is shaken and cultured in 1 ml of YPDA medium for 9 hours in a 30 ° C constant temperature bath, then collected by centrifugation, and 100 μl of One Step Buffer (0.2 M lithium acetate, 40% PEG4000, 100 mM DTT) is added thereto. Suspended. Add HA-tagged Hmat-Xa gene-containing pESC-URA vector solution 3 μl (2 μg), mix, heat shock for 30 minutes in a 45 ° C constant temperature bath, apply to SD-URA agar medium, and apply 30 The cells were cultured for 3 days at 0 ° C.

C.形質転換細胞中に於ける導入遺伝子の確認とそのmRNA への転写の確認
HeLa 細胞におけるHAタグ付加Hmat-Xa遺伝子の存在をPCR 法で、また、同遺伝子のRNAへの発現(転写)をRT-PCR 法で確認した。また、酵母におけるHAタグ付加Hmat-Xa遺伝子の存在をPCR 法で確認した。
C. Confirmation of transgene and its transcription to mRNA in transformed cells
The presence of the HA-tagged Hmat-Xa gene in HeLa cells was confirmed by PCR, and the expression (transcription) of the gene to RNA was confirmed by RT-PCR. The presence of HA-tagged Hmat-Xa gene in yeast was confirmed by PCR.

HAタグ配列付加Hmat-Xa遺伝子導入HeLa細胞において、PCRおよびRT-PCRに使用したプライマー
HeLa導入HAタグ配列付加Hmat-Xa遺伝子の存在および転写確認用
Forward: XR-17F(前述)
Reverse: H1-CHR(HA タグ配列 含有プライマー)
GACGTAGTCTGGGACGTCGTATGGGTACACTACCCATACGACGTCCCAGACTACGTCTAA (配列番号18)
Primers used for PCR and RT-PCR in Hmat-Xa transgenic HeLa cells with HA tag sequence
Presence and transcription confirmation of HLa-introduced Htag-added Hmat-Xa gene
Forward: XR-17F (described above)
Reverse: H1-CHR (HA tag sequence-containing primer)
GACGTAGTCTGGGACGTCGTATGGGTACACTACCCATACGACGTCCCAGACTACGTCTAA (SEQ ID NO: 18)

HeLa内在性 Hmat-Xa遺伝子の存在および転写確認用
Forward: XR-17F(前述)
Reverse: XR-10R(前述)
Presence and transcription confirmation of HeLa endogenous Hmat-Xa gene
Forward: XR-17F (described above)
Reverse: XR-10R (described above)

A. PCR
(1)PCR反応液組成:
0.2mM dNTPmix
0.2μM Fプライマー
0.2μM Rプライマー
0.75μg template DNA
2.6U Expand High Fidelity PCR System Enzyme(Roche Diagnostics)
10 X Buffer (酵素液に付随)
15mM MgCl2
Total 50μl
A. PCR
(1) PCR reaction solution composition:
0.2 mM dNTPmix
0.2 μM F primer
0.2 μM R primer
0.75μg template DNA
2.6U Expand High Fidelity PCR System Enzyme (Roche Diagnostics)
10 X Buffer (attached to enzyme solution)
15 mM MgCl 2
Total 50μl

(2)PCR反応条件:
1、 94℃ 1min (変性)
2、 94℃ 1min (変性)
3、 55℃ 1min (アニーリング)
4、 72℃ 1min (伸長)
5、 4℃ 30min
2〜4を35回繰り返す。
(2) PCR reaction conditions:
1, 94 ℃ 1min (denaturation)
2, 94 ℃ 1min (denaturation)
3, 55 ℃ 1min (annealing)
4, 72 ℃ 1min (extension)
5, 4 ℃ 30min
Repeat steps 2 to 4 35 times.

B.RT-PCR
(1)RT-PCR反応液組成:
Ready-To-Go RT-PCR Beads (Amersham Pharmacia Biotech)
200nM F、Rプライマー
RNA 1ng
0.1% DEPC含有滅菌水
Total 50μl
B. RT-PCR
(1) RT-PCR reaction solution composition:
Ready-To-Go RT-PCR Beads (Amersham Pharmacia Biotech)
200nM F, R primer
RNA 1ng
Sterilized water containing 0.1% DEPC
Total 50μl

(2)RT-PCR反応条件:
1、 42℃ 45min (逆転写酵素反応)
2、 94℃ 5min (変性)
3、 94℃ 1min (変性)
4、 55℃ 1min (アニーリング)
5、 72℃ 1min (伸長)
6、 4℃ 30min
3〜5を45回繰り返す。
(2) RT-PCR reaction conditions:
1, 42 ℃ 45min (reverse transcriptase reaction)
2, 94 ℃ 5min (denaturation)
3, 94 ℃ 1min (denaturation)
4, 55 ℃ 1min (annealing)
5, 72 ℃ 1min (extension)
6, 4 ℃ 30min
Repeat steps 3-5 45 times.

HAタグ配列付加Hmat-Xa遺伝子導入HeLa酵母において、HAタグ配列付加Hmat-Xa遺伝子の存在確認用のPCRに使用したプライマーは、
Forward: XR-17F(前述)
Reverse: H1-CHR(HA タグ配列 含有プライマー、前述)
In the HA tag sequence-added Hmat-Xa gene-introduced HeLa yeast, the primers used for PCR for confirming the presence of the HA tag sequence-added Hmat-Xa gene are:
Forward: XR-17F (described above)
Reverse: H1-CHR (HA tag sequence-containing primer, mentioned above)

結果を図2に示す。
図2(a)は、HAタグ付加Hmat-Xa遺伝子形質転換細胞に於ける同遺伝子の存在をPCRで確認した結果を示す。その結果、図の様に、プライマーから予想された、長さ約980bPのサイズのバンドがHeLa細胞の系(レーン2)および酵母の系(レーン3)で検出されたので、同遺伝子が両細胞内に導入されたことが確認できた。
The results are shown in FIG.
FIG. 2 (a) shows the results of PCR confirming the presence of the same gene in the HA-tagged Hmat-Xa gene transformed cells. As a result, as shown in the figure, a band of about 980 bP in length predicted from the primer was detected in the HeLa cell system (lane 2) and the yeast system (lane 3). It was confirmed that it was introduced inside.

図2(b)は、HAタグ付加Hmat-Xa導入HeLa細胞から全RNAを抽出後、HAタグ付加Hmat-Xa特異的プライマーを用いてRT-PCRを行った結果を示す。その結果、レーン2に示すように、やはり、プライマーから予想された、長さ約980bpのサイズのバンドが検出され、Hmat-Xa遺伝子がmRNAに転写されていることがわかった。尚、レーン2(HAタグ付加Hmat-Xa遺伝子形質転換HeLa)およびレーン3(非形質転換HeLa)で見られた520bpのバンドは、HeLa細胞の内在性のHmat-Xa遺伝子の発現によるものである。   FIG. 2 (b) shows the results of RT-PCR using HA-tagged Hmat-Xa specific primers after extraction of total RNA from HA-tagged Hmat-Xa-introduced HeLa cells. As a result, as shown in lane 2, a band of about 980 bp in length expected from the primer was detected, and it was found that the Hmat-Xa gene was transcribed into mRNA. The 520 bp band seen in lane 2 (HA-tagged Hmat-Xa gene transformed HeLa) and lane 3 (non-transformed HeLa) is due to the expression of the endogenous Hmat-Xa gene in HeLa cells. .

また、抗HAタグ抗体を用いたウエスタンで蛋白としての発現を検討した。
ウエスタン法
1.HAタグ付加Hmat-Xa遺伝子形質転換HeLa細胞からのSDS-PAGE用サンプルの調製
HAタグ付加Hmat-Xa遺伝子形質転換HeLa細胞を、DMEM 培地+ 10%FCSを含む100mmの組織培養用シャーレ12枚で培養後、培地を除去し、さらに、細胞を氷冷PBS(-)で2度洗浄した。次に、細胞を2%EDTA-PBS(-)溶液ではがして遠心で回収した。沈殿した細胞をPBS(-)200μlで洗浄し湿重量を測定した。細胞湿重量の10倍量のサンプルバッファー[2%SDS, 100mM DTT, 0.36M Tris-HCl(pH6.8), 1mM PMSF]を加えピペッテング後、100℃で、5分間煮沸した。サンプルを氷冷後、20Gの注射針をつけたシリンジで30秒間、続いて、26Gの注射針をつけたシリンジで30秒間吸引排出した後、15000rpm、4℃、15min遠心し、上清(SDS可溶化画分)を回収した。そして、上清の蛋白量を測定した。
Moreover, the expression as a protein was examined in Western using an anti-HA tag antibody.
Western method Preparation of SDS-PAGE samples from HA-tagged Hmat-Xa gene-transformed HeLa cells
After culturing HA-tagged Hmat-Xa gene-transformed HeLa cells in 12 100 mm tissue culture dishes containing DMEM medium + 10% FCS, the medium was removed, and the cells were further washed with ice-cold PBS (-). Washed once. Next, the cells were removed with a 2% EDTA-PBS (−) solution and collected by centrifugation. The precipitated cells were washed with 200 μl of PBS (−) and wet weight was measured. Sample buffer [2% SDS, 100 mM DTT, 0.36 M Tris-HCl (pH 6.8), 1 mM PMSF] 10 times the wet cell weight was added and pipetting, followed by boiling at 100 ° C. for 5 minutes. After cooling the sample on ice, the sample was aspirated and discharged for 30 seconds with a syringe with a 20G needle, followed by 30 seconds with a syringe with a 26G needle, and then centrifuged at 15000 rpm, 4 ° C for 15 minutes, and the supernatant (SDS The solubilized fraction) was collected. Then, the amount of protein in the supernatant was measured.

2.サンプルのSDS-PAGEとPDF膜への転写(ブロッティング)
ゲル板で、縦9 cm、横10cm、厚さ1mmの、1%SDS-10%ポリアクリルアミドゲルを作成し、蛋白量を揃えたサンプル質溶液をゲルのウェルに加えた。30mA/gelの定電流で泳動した。ゲルをプラステック容器に移し、転写buffer 100mlを加えて洗浄した(この洗浄を5回繰り返した)後、ブロッティング装置にてPVDF膜に転写した。さらに、ブロッティング後のPVDF膜を10%スキムミルク溶液でブロッキング後、TBS-Tで洗浄した。
2. SDS-PAGE of sample and transfer to PDF membrane (blotting)
A 1% SDS-10% polyacrylamide gel having a length of 9 cm, a width of 10 cm, and a thickness of 1 mm was prepared using a gel plate, and a sample solution with the same protein content was added to the well of the gel. Electrophoresis was performed at a constant current of 30 mA / gel. The gel was transferred to a plastic container, washed with 100 ml of transfer buffer (this washing was repeated 5 times), and transferred to a PVDF membrane with a blotting apparatus. Further, the PVDF membrane after blotting was blocked with a 10% skim milk solution and then washed with TBS-T.

3.抗体処理
PVDF膜をハイブリダイゼーション用パック中で、家兎抗HA抗体(Bethyl laboratories, Inc:A190-108A)の10%スキムミルク溶液による1000倍希釈液5mlと、室温で1時間反応させた。PVDF膜をTBS-Tで洗浄した(この洗浄を5回繰り返した)後、ペルオキシダーゼ標識ロバ抗家兎抗体(Amersham Biosciences NIF824)の、10%スキムミルク溶液による1000倍希釈液10mlと、室温で1時間反応させた。PVDF膜をTBS-Tで洗浄した(この洗浄を5回繰り返した)
3. Antibody treatment
The PVDF membrane was reacted in a hybridization pack with 5 ml of a 1000-fold diluted solution of rabbit anti-HA antibody (Bethyl laboratories, Inc: A190-108A) in 10% skim milk at room temperature for 1 hour. After the PVDF membrane was washed with TBS-T (this wash was repeated 5 times), a 10-fold diluted solution of peroxidase-labeled donkey anti-rabbit antibody (Amersham Biosciences NIF824) in a 10% skim milk solution and 1 hour at room temperature Reacted. PVDF membrane was washed with TBS-T (this wash was repeated 5 times)

4.検出
PVDF膜をラップの上に置き、PVDF膜面積(cm2)あたり、0.1mlの検出液(Amersham Bio sciences: RPN2132)をのせ、5分間放置した。検出液を除去後、PVDF膜をラップで包み 、その上にX線フィルム[Hyper film ECL (Amersham: 型番 RPN2104K)]を置き、Hyper film cassetteにセットし、30秒間、1分間、5分間、30分間露光させた。続いて、露光させたX線フィルムを現像した。
4). detection
The PVDF membrane was placed on the wrap, and 0.1 ml of detection solution (Amersham Biosciences: RPN2132) was placed on the PVDF membrane area (cm 2 ) and left for 5 minutes. After removing the detection solution, wrap the PVDF membrane with a wrap, place an X-ray film [Hyper film ECL (Amersham: Model No. RPN2104K)] on it, set it in the Hyper film cassette, 30 seconds, 1 minute, 5 minutes, 30 Exposed for 1 minute. Subsequently, the exposed X-ray film was developed.

上記の通り、HAタグ付加Hmat-Xa導入HeLa細胞とMockの系およびHAタグ付加Hmat-Xa導入酵母(導入遺伝子を誘導した系と非誘導の系)を界面活性剤で可溶化してSDS-PAGE後、抗HA抗体を用いたウエスタンブロット解析を行った。その結果、図3に示すように、HAタグ付加Hmat-Xa導入HeLa細胞およびHAタグ付加Hmat-Xa導入酵母のHmat-Xa発現誘導の系で、予想された52.07kDaの位置にHAタグ付加Hmat-Xa蛋白のバンドが検出された。すなわち、Hmat-Xa遺伝子が蛋白として発現(翻訳)していることが確認できた。   As described above, the HA-tagged Hmat-Xa-introduced HeLa cells and Mock system and the HA-tagged Hmat-Xa-introduced yeast (transgene-induced system and non-inducible system) were solubilized with surfactants and SDS- After PAGE, Western blot analysis using anti-HA antibody was performed. As a result, as shown in FIG. 3, in the Hmat-Xa expression induction system of the HA-tagged Hmat-Xa-introduced HeLa cells and the HA-tagged Hmat-Xa-introduced yeast, the HA-tagged Hmat at the expected 52.07 kDa position. -Xa protein band was detected. That is, it was confirmed that the Hmat-Xa gene was expressed (translated) as a protein.

図1は、Hmat-Xa遺伝子( ORF-1 )のヒト組織別の発現をRT-PCR法により調 べた結果を示す。FIG. 1 shows the results of examining the expression of the Hmat-Xa gene (ORF-1) for each human tissue by RT-PCR. 図2は、HAタグ付加Hmat-Xa遺伝子形質転換HeLa細胞におけるHAタグ付加Hmat-Xa遺伝子の転写を調べた結果を示す。(a)形質転換細胞におけるHAタグ付加Hmat-Xa遺伝子の存在レーン1:マーカー、レーン2:HAタグ付加Hmat-Xa導入HeLa、レーン3:HAタグ付加Hmat-Xa導入酵母(b)形質転換細胞におけるHAタグ付加Hmat-Xa遺伝子の転写レーン1:マーカー、レーン2:HAタグ付加Hmat-Xa導入HeLa、レーン3:非導入HeLaFIG. 2 shows the results of examining the transcription of the HA-tagged Hmat-Xa gene in HA-tagged Hmat-Xa gene-transformed HeLa cells. (A) Presence of HA-tagged Hmat-Xa gene in transformed cells Lane 1: Marker, Lane 2: HA-tagged Hmat-Xa-introduced HeLa, Lane 3: HA-tagged Hmat-Xa-introduced yeast (b) Transformed cell Transcription of HA-tagged Hmat-Xa gene in lane 1: marker, lane 2: HA-tagged Hmat-Xa introduced HeLa, lane 3: non-introduced HeLa 図3は、抗HA 抗体によるウエスタン解析の結果を示す。FIG. 3 shows the results of Western analysis using anti-HA antibody.

SEQUENCE LISTING
<110> Tokai University
<120> A marker gene for colon cancer
<130> A51782A
<160> 18
<210> 1
<211> 2556
<212> DNA
<213> Human
<400> 1
gtatctctgc attagccaga ttggacatat gtaaagggac atcagtatat ctggatcatc 60
agattgtgct tcaagaagac catagggaag aacgcatttt catcttgctg caaaagttgc 120
aatagaagat ctgaaggttt gaatgggcca atgagtatcc tcatcattga agcattctat 180
ggaggctccc ataaacagct ggtggatctt cttcaagaag agttaggaga ctgtgtcgtt 240
tatacccttc ctgcaaagaa atggcattgg agagcccgga catctgcttt atatttctct 300
cagaccattc ccatcagtga gcattacagg accctctttg caagttcagt gcttaacctg 360
accgaactgg ctgcccttcg gcctgacctt gggaaactga aaaagattct gtattttcac 420
gagaaccagt tgatatatcc tgtcaagaaa tgtcaggaga gggatttcca atatggatac 480
aaccaaattc tttcatgcct ggtggctgat gtggttgtat tcaactcagt ttttaatatg 540
gaatcatttc tcacttccat gggaaaattt atgaagctga ttcctgatca cagacccaag 600
gatctggaaa gcatcatcag acccaagtgc caagttattt actttcccat caggtttcct 660
gatgtgagca gattcatgcc caagcacaaa acaacccatt taaagaagat gctcggcctt 720
aaaggaaatg gcggtgcggt tctgtccatg gcccttcctt ttcagccaga gcagagagat 780
tcagaggatt tattgaagaa ttttaattca gagtgtgata cacactgtgg ccttgatact 840
gcacgacaag aatatttggg taactcatta agacaggaat cagacttgaa aaaatccacc 900
tcgtcagata attcaagctc tcatcatggt gaaaataaac aaaatctgac tgttgatccc 960
tgtgacattt tgggtggagt tgataatcag caaagactgc tacacattgt ctggcctcac 1020
aggtgggagc atgataaaga tccagaaagc ttttttaagg tattaatgca tcttaaagac 1080
ttaggactca atttccacgt gtctgtactt ggagaaacct tcacagatgt cccagatatt 1140
ttttcagagg ccaaaaaggc attgggatct tctgtcttac actggggcta cttacccagc 1200
aaagatgact acttccaagt actgtgcatg gctgatgttg tcatctcaac agctaagcat 1260
gaattctttg gagtggcaat gttggaagct gtgtactgtg ggtgttaccc actttgtcct 1320
aaagatttgg tttatcccga aatatttcca gctgaatatc tgtattctac acctgaacag 1380
ctttcaaaaa ggctccagaa tttctgcaag agaccagata ttataagaaa acatctctat 1440
aagggtgaaa tcgctccgtt ttcttgggca gccctacatg gtaaattcag gtctctgctt 1500
acaacagaac ctagggaaga tttgtgacag atggggctaa gtcacaaact tgcagcctaa 1560
ggcagagtct gaagaacttt ccagagtgtg cccatattta cctgatcaga gagaaaagaa 1620
aatctgcaga ggaagctgag cctggctgct tgtcatagct gacacagagc catctgccac 1680
aaacctgtgg cggcttcaga tctccaatcc ctgccaccac cccaactcaa attaaataca 1740
gattcctaga gacgttatga tggttacaca tgtcctcggc atcacatgta ggagactgtt 1800
caaaaaaaat atgtggcctg ttgtataacc gcactcatgt atcccatatg tggtgccaca 1860
ttgaatttcc ggttgaatcc gtttttatcc tttgtactgg atgacatggt gcctgaattc 1920
tttcttttcg ccgacacgat ggcagccaaa ctgcagcttc aaacgctcac acttggctgg 1980
gtttctacct aggttgccag gttatcatcg gagccttctt gtgtcctcaa agggccacga 2040
ggcctgaaag gaggatcaga atgctttggg attaattggg cagccatcgc agaattgttt 2100
gtgggcaaag ggctgcttta gcacttttct tttagcaaat taatgactct caggcacagg 2160
gggttttaag tgaaggtatt aataagaggt ctggcaggta ttcccatgat tcacagagtt 2220
acatttgcat ttaattaatc ttaaagttgc aagataaaca gctgtaattc ggacaaacat 2280
gacaaacaca gtgaagccaa ctatcccata aaatgaacac tgacatactt gttttaattt 2340
ttttcccagc gtaaaaatag aaaaatcaaa atactcctaa caaaaccagt gattttgata 2400
gaaatatttc tccaatatac ttgcatccac ctacaaatat aaccttttca agataaatcg 2460
cttatgattt caatagtcaa actgctgtgt ttgttgatgt aaagatgttt tgaatggcta 2520
gatggtaaaa taaattctta ataaagtacc cactgc 2556
<210> 2
<211> 458
<212> PRT
<213> Human
<400> 2
Met Ser Ile Leu Ile Ile Glu Ala Phe Tyr Gly Gly Ser His Lys Gln
1 5 10 15
Leu Val Asp Leu Leu Gln Glu Glu Leu Gly Asp Cys Val Val Tyr Thr
20 25 30
Leu Pro Ala Lys Lys Trp His Trp Arg Ala Arg Thr Ser Ala Leu Tyr
35 40 45
Phe Ser Gln Thr Ile Pro Ile Ser Glu His Tyr Arg Thr Leu Phe Ala
50 55 60
Ser Ser Val Leu Asn Leu Thr Glu Leu Ala Ala Leu Arg Pro Asp Leu
65 70 75 80
Gly Lys Leu Lys Lys Ile Leu Tyr Phe His Glu Asn Gln Leu Ile Tyr
85 90 96
Pro Val Lys Lys Cys Gln Glu Arg Asp Phe Gln Tyr Gly Tyr Asn Gln
100 105 110
Ile Leu Ser Cys Leu Val Ala Asp Val Val Val Phe Asn Ser Val Phe
115 120 125
Asn Met Glu Ser Phe Leu Thr Ser Met Gly Lys Phe Met Lys Leu Ile
130 135 140
Pro Asp His Arg Pro Lys Asp Leu Glu Ser Ile Ile Arg Pro Lys Cys
145 150 155 160
Gln Val Ile Tyr Phe Pro Ile Arg Phe Pro Asp Val Ser Arg Phe Met
165 170 175
Pro Lys His Lys Thr Thr His Leu Lys Lys Met Leu Gly Leu Lys Gly
180 185 190
Asn Gly Gly Ala Val Leu Ser Met Ala Leu Pro Phe Gln Pro Glu Gln
195 200 205
Arg Asp Ser Glu Asp Leu Leu Lys Asn Phe Asn Ser Glu Cys Asp Thr
210 215 220
His Cys Gly Leu Asp Thr Ala Arg Gln Glu Tyr Leu Gly Asn Ser Leu
225 230 235 240
Arg Gln Glu Ser Asp Leu Lys Lys Ser Thr Ser Ser Asp Asn Ser Ser
245 250 255
Ser His His Gly Glu Asn Lys Gln Asn Leu Thr Val Asp Pro Cys Asp
260 265 270
Ile Leu Gly Gly Val Asp Asn Gln Gln Arg Leu Leu His Ile Val Trp
275 280 285
Pro His Arg Trp Glu His Asp Lys Asp Pro Glu Ser Phe Phe Lys Val
290 295 300
Leu Met His Leu Lys Asp Leu Gly Leu Asn Phe His Val Ser Val Leu
305 310 315 320
Gly Glu Thr Phe Thr Asp Val Pro Asp Ile Phe Ser Glu Ala Lys Lys
325 330 335
Ala Leu Gly Ser Ser Val Leu His Trp Gly Tyr Leu Pro Ser Lys Asp
340 345 350
Asp Tyr Phe Gln Val Leu Cys Met Ala Asp Val Val Ile Ser Thr Ala
355 360 365
Lys His Glu Phe Phe Gly Val Ala Met Leu Glu Ala Val Tyr Cys Gly
370 375 380
Cys Tyr Pro Leu Cys Pro Lys Asp Leu Val Tyr Pro Glu Ile Phe Pro
385 390 395 400
Ala Glu Tyr Leu Tyr Ser Thr Pro Glu Gln Leu Ser Lys Arg Leu Gln
405 410 415
Asn Phe Cys Lys Arg Pro Asp Ile Ile Arg Lys His Leu Tyr Lys Gly
420 425 430
Glu Ile Ala Pro Phe Ser Trp Ala Ala Leu His Gly Lys Phe Arg Ser
435 440 445
Leu Leu Thr Thr Glu Pro Arg Glu Asp Leu
450 455
<210> 3
<211> 2411
<212> DNA
<213> Human
<400> 3
gtatctctgc attagccaga ttggacatat gtaaagggac atcagtatat ctggatcatc 60
agattgtgct tcaagaagac catagggaag aacgcatttt catcttgctg caaaagttgc 120
aatagaagat ctgaaggttt gaatgggcca atgagtatcc tcatcattga agcattctat 180
ggaggctccc ataaacagct ggtggatctt cttcaagaag agttaggaga ctgtgtcgtt 240
tatacccttc ctgcaaagaa atggcattgg agagcccgga catctgcttt atatttctct 300
cagaccattc ccatcagtga gcattacagg accctctttg caagttcagt gcttaacctg 360
accgaactgg ctgcccttcg gcctgacctt gggaaactga aaaagattct gtattttcac 420
gagaaccagt tgatatatcc tgtcaagaaa tgtcaggaga gggatttcca atatggatac 480
aaccaaattc tttcatgcct ggtggctgat gtggttgtat tcaactcagt ttttaatatg 540
gaatcatttc tcacttccat gggaaaattt atgaagctga ttcctgatca cagacccaag 600
gatctggaaa gcatcatcag acccaagtgc caagttattt actttcccat caggtttcct 660
gatgtgagca gattcatgcc caagcacaaa acaacccatt taaagaagat gctcggcctt 720
aaaggaaatg gcggtgcggt tctgtccatg gcccttcctt ttcagccaga gcagagagat 780
tcagaggatt tattgaagaa ttttaattca gagtgtgata cacactgtgg ccttgatact 840
gcacgacaag aatatttggg taactcatta agacaggaat cagacttgaa aaaatccacc 900
tcgtcagata attcaagctc tcatcatggt gaaaataaac aaaatctgac tgttgatccc 960
tgtgacattt tgggtggagt tgataatcag caaagactgc tacacattgt ctggcctcac 1020
aggtgggagc atgataaaga tccagaaagc ttttttaagg tattaatgca tcttaaagac 1080
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ccaaactgca gcttcaaacg ctcacacttg gctgggtttc tacctaggtt gccaggttat 1860
catcggagcc ttcttgtgtc ctcaaagggc cacgaggcct gaaaggagga tcagaatgct 1920
ttgggattaa ttgggcagcc atcgcagaat tgtttgtggg caaagggctg ctttagcact 1980
tttcttttag caaattaatg actctcaggc acagggggtt ttaagtgaag gtattaataa 2040
gaggtctggc aggtattccc atgattcaca gagttacatt tgcatttaat taatcttaaa 2100
gttgcaagat aaacagctgt aattcggaca aacatgacaa acacagtgaa gccaactatc 2160
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tcaaaatact cctaacaaaa ccagtgattt tgatagaaat atttctccaa tatacttgca 2280
tccacctaca aatataacct tttcaagata aatcgcttat gatttcaata gtcaaactgc 2340
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gtacccactg c 2411
<210> 4
<211> 376
<212> PRT
<213> Human
<400> 4
Met Ser Ile Leu Ile Ile Glu Ala Phe Tyr Gly Gly Ser His Lys Gln
1 5 10 15
Leu Val Asp Leu Leu Gln Glu Glu Leu Gly Asp Cys Val Val Tyr Thr
20 25 30
Leu Pro Ala Lys Lys Trp His Trp Arg Ala Arg Thr Ser Ala Leu Tyr
35 40 45
Phe Ser Gln Thr Ile Pro Ile Ser Glu His Tyr Arg Thr Leu Phe Ala
50 55 60
Ser Ser Val Leu Asn Leu Thr Glu Leu Ala Ala Leu Arg Pro Asp Leu
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85 90 96
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Ile Leu Ser Cys Leu Val Ala Asp Val Val Val Phe Asn Ser Val Phe
115 120 125
Asn Met Glu Ser Phe Leu Thr Ser Met Gly Lys Phe Met Lys Leu Ile
130 135 140
Pro Asp His Arg Pro Lys Asp Leu Glu Ser Ile Ile Arg Pro Lys Cys
145 150 155 160
Gln Val Ile Tyr Phe Pro Ile Arg Phe Pro Asp Val Ser Arg Phe Met
165 170 175
Pro Lys His Lys Thr Thr His Leu Lys Lys Met Leu Gly Leu Lys Gly
180 185 190
Asn Gly Gly Ala Val Leu Ser Met Ala Leu Pro Phe Gln Pro Glu Gln
195 200 205
Arg Asp Ser Glu Asp Leu Leu Lys Asn Phe Asn Ser Glu Cys Asp Thr
210 215 220
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Arg Gln Glu Ser Asp Leu Lys Lys Ser Thr Ser Ser Asp Asn Ser Ser
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275 280 285
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<400> 5
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1 5 10 15
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<210> 6
<211> 2556
<212> DNA
<213> Human
<400> 6
gtatctctgc attagccaga ttggacatat gtaaagggac atcagtatat ctggatcatc 60
agattgtgct tcaagaagac catagggaag aacgcatttt catcttgctg caaaagttgc 120
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tatacccttc ctgcaaagaa atggcattgg agagcccgga catctgcttt atatttctct 300
cagaccattc ccatcagtga gcattacagg accctctttg caagttcagt gcttaacctg 360
accgaactgg ctgcccttcg gcctgacctt gggaaactga aaaagattct gtattttcac 420
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gaatcatttc tcacttccat gggaaaattt atgaagctga ttcctgatca cagacccaag 600
gatctggaaa gcatcatcag acccaagtgc caagttattt actttcccat caggtttcct 660
gatgtgagca gattcatgcc caagcacaaa acaacccatt taaagaagat gctcggcctt 720
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gtttctacct aggttgccag gttatcatcg gagccttctt gtgtcctcaa agggccacga 2040
ggcctgaaag gaggatcaga atgctttggg attaattggg cagccatcgc agaattgttt 2100
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acatttgcat ttaattaatc ttaaagttgc aagataaaca gctgtaattc ggacaaacat 2280
gacaaacaca gtgaagccaa ctatcccata aaatgaacac tgacatactt gttttaattt 2340
ttttcccagc gtaaaaatag aaaaatcaaa atactcctaa caaaaccagt gattttgata 2400
gaaatatttc tccaatatac ttgcatccac ctacaaatat aaccttttca agataaatcg 2460
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<210> 7
<211> 30
<212> DNA
<213> Artificial
<220>
<223> primer
<400> 7
atcagattgt gcttcaagaa gaccataggg 30
<210> 8
<211> 30
<212> DNA
<213> Artificial
<220>
<223> primer
<400> 8
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<212> DNA
<213> Artificial
<220>
<223> primer
<400> 9
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<211> 24
<212> DNA
<213> Artificial
<220>
<223> primer
<400> 10
cggataacaa tttcacacag gaaac 24
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<211> 30
<212> DNA
<213> Artificial
<220>
<223> primer
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tctgctctgg ctgaaaagga agggccatgg 30
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<212> DNA
<213> Artificial
<220>
<223> primer
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<211> 30
<212> DNA
<213> Artificial
<220>
<223> primer
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<212> DNA
<213> Artificial
<220>
<223> primer
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<212> DNA
<213> Artificial
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<212> DNA
<213> Artificial
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<212> DNA
<213> Artificial
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<212> DNA
<213> Artificial
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<223> primer
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gacgtagtct gggacgtcgt atgggtacac tacccatacg acgtcccaga ctacgtctaa 60
SEQUENCE LISTING
<110> Tokai University
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gaatcatttc tcacttccat gggaaaattt atgaagctga ttcctgatca cagacccaag 600
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gatgtgagca gattcatgcc caagcacaaa acaacccatt taaagaagat gctcggcctt 720
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tgtgacattt tgggtggagt tgataatcag caaagactgc tacacattgt ctggcctcac 1020
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<213> Human
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<211> 2411
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<213> Human
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cagaccattc ccatcagtga gcattacagg accctctttg caagttcagt gcttaacctg 360
accgaactgg ctgcccttcg gcctgacctt gggaaactga aaaagattct gtattttcac 420
gagaaccagt tgatatatcc tgtcaagaaa tgtcaggaga gggatttcca atatggatac 480
aaccaaattc tttcatgcct ggtggctgat gtggttgtat tcaactcagt ttttaatatg 540
gaatcatttc tcacttccat gggaaaattt atgaagctga ttcctgatca cagacccaag 600
gatctggaaa gcatcatcag acccaagtgc caagttattt actttcccat caggtttcct 660
gatgtgagca gattcatgcc caagcacaaa acaacccatt taaagaagat gctcggcctt 720
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catcggagcc ttcttgtgtc ctcaaagggc cacgaggcct gaaaggagga tcagaatgct 1920
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tttcttttag caaattaatg actctcaggc acagggggtt ttaagtgaag gtattaataa 2040
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tccacctaca aatataacct tttcaagata aatcgcttat gatttcaata gtcaaactgc 2340
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<211> 376
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<213> Human
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aggtgggagc atgataaaga tccagaaagc ttttttaagg tattaatgca tcttaaagac 1080
ttaggactca atttccacgt gtctgtactt ggagaaacct tcacagatgt cccagatatt 1140
ttttcagagg ccaaaaaggc attgggatct tctgtcttac actggggcta cttacccagc 1200
aaagatgact acttccaagt actgtgcatg gctgatgttg tcatctcaac agctaagcat 1260
gaattctttg gagtggcaat gttggaagct gtgtactgtg ggtgttaccc actttgtcct 1320
aaagatttgg tttatcccga aatatttcca gctgaatatc tgtattctac acctgaacag 1380
ctttcaaaaa ggctccagaa tttctgcaag agaccagata ttataagaaa acatctctat 1440
aagggtgaaa tcgctccgtt ttcttgggca gccctacatg gtaaattcag gtctctgctt 1500
acaacagaac ctagggaaga tttgtgacag atggggctaa gtcacaaact tgcagcctaa 1560
ggcagagtct gaagaacttt ccagagtgtg cccatattta cctgatcaga gagaaaagaa 1620
aatctgcaga ggaagctgag cctggctgct tgtcatagct gacacagagc catctgccac 1680
aaacctgtgg cggcttcaga tctccaatcc ctgccaccac cccaactcaa attaaataca 1740
gattcctaga gacgttatga tggttacaca tgtcctcggc atcacatgta ggagactgtt 1800
caaaaaaaat atgtggcctg ttgtataacc gcactcatgt atcccatatg tggtgccaca 1860
ttgaatttcc ggttgaatcc gtttttatcc tttgtactgg atgacatggt gcctgaattc 1920
tttcttttcg ccgacacgat ggcagccaaa ctgcagcttc aaacgctcac acttggctgg 1980
gtttctacct aggttgccag gttatcatcg gagccttctt gtgtcctcaa agggccacga 2040
ggcctgaaag gaggatcaga atgctttggg attaattggg cagccatcgc agaattgttt 2100
gtgggcaaag ggctgcttta gcacttttct tttagcaaat taatgactct caggcacagg 2160
gggttttaag tgaaggtatt aataagaggt ctggcaggta ttcccatgat tcacagagtt 2220
acatttgcat ttaattaatc ttaaagttgc aagataaaca gctgtaattc ggacaaacat 2280
gacaaacaca gtgaagccaa ctatcccata aaatgaacac tgacatactt gttttaattt 2340
ttttcccagc gtaaaaatag aaaaatcaaa atactcctaa caaaaccagt gattttgata 2400
gaaatatttc tccaatatac ttgcatccac ctacaaatat aaccttttca agataaatcg 2460
cttatgattt caatagtcaa actgctgtgt ttgttgatgt aaagatgttt tgaatggcta 2520
gatggtaaaa taaattctta ataaagtacc cactgc 2556
<210> 7
<211> 30
<212> DNA
<213> Artificial
<220>
<223> primer
<400> 7
atcagattgt gcttcaagaa gaccataggg 30
<210> 8
<211> 30
<212> DNA
<213> Artificial
<220>
<223> primer
<400> 8
tgacaagcag ccaggctcag cttcctctgc 30
<210> 9
<211> 24
<212> DNA
<213> Artificial
<220>
<223> primer
<400> 9
cgccagggtt ttcccagtca cgac 24
<210> 10
<211> 24
<212> DNA
<213> Artificial
<220>
<223> primer
<400> 10
cggataacaa tttcacacag gaaac 24
<210> 11
<211> 30
<212> DNA
<213> Artificial
<220>
<223> primer
<400> 11
tctgctctgg ctgaaaagga agggccatgg 30
<210> 12
<211> 30
<212> DNA
<213> Artificial
<220>
<223> primer
<400> 12
gaagatgctc ggccttaaag gaaatggcgg 30
<210> 13
<211> 30
<212> DNA
<213> Artificial
<220>
<223> primer
<400> 13
gactcaattt ccacgtgtct gtacttggag 30
<210> 14
<211> 30
<212> DNA
<213> Artificial
<220>
<223> primer
<400> 14
aaggtaccac catgagtatc ctcatcattg 30
<210> 15
<211> 30
<212> DNA
<213> Artificial
<220>
<223> primer
<400> 15
gggcggccgc aaatcttccc taggctctgt 30
<210> 16
<211> 30
<212> DNA
<213> Artificial
<220>
<223> primer
<400> 16
ggctcgagtt agacgtagtc tgggacgtcg 30
<210> 17
<211> 30
<212> DNA
<213> Artificial
<220>
<223> primer
<400> 17
gggtcgacat gagtatcctc atcattgaag 30
<210> 18
<211> 60
<212> DNA
<213> Artificial
<220>
<223> primer
<400> 18
gacgtagtct gggacgtcgt atgggtacac tacccatacg acgtcccaga ctacgtctaa 60

Claims (12)

下記(A)又は(B)の何れかの蛋白質。
(A)配列番号2に記載のアミノ酸配列を有する蛋白質。
(B)配列番号2に記載のアミノ酸配列において、1若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入及び/又は付加を含むアミノ酸配列を有し、かつ、糖転移酵素活性を有する蛋白質。
The following protein (A) or (B).
(A) A protein having the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 2.
(B) A protein having an amino acid sequence containing substitution, deletion, insertion and / or addition of one or several amino acids and having glycosyltransferase activity in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2.
下記(A)又は(B)の何れかの蛋白質をコードするDNA。
(A)配列番号2に記載のアミノ酸配列を有する蛋白質。
(B)配列番号2に記載のアミノ酸配列において、1若しくは数個のアミノ酸の置換、欠失、挿入及び/又は付加を含むアミノ酸配列を有し、かつ、糖転移酵素活性を有する蛋白質。
DNA encoding any of the following proteins (A) or (B).
(A) A protein having the amino acid sequence set forth in SEQ ID NO: 2.
(B) A protein having an amino acid sequence containing substitution, deletion, insertion and / or addition of one or several amino acids and having glycosyltransferase activity in the amino acid sequence shown in SEQ ID NO: 2.
下記(a)、(b)又は(c)の何れかのDNA。
(a)配列番号1に記載の塩基配列を有するDNA。
(b)配列番号1に記載の塩基配列において、1若しくは数個の塩基の置換、欠失、挿入及び/又は付加を含む塩基配列を有し、かつ、糖転移酵素活性を有する蛋白質をコードするDNA。
(c)配列番号1に記載の塩基配列を有するDNAとストリンジェントな条件下でハイブリダイズし、かつ、糖転移酵素活性を有する蛋白質をコードするDNA。
DNA of any of the following (a), (b) or (c).
(A) DNA having the base sequence set forth in SEQ ID NO: 1.
(B) The base sequence described in SEQ ID NO: 1 has a base sequence including substitution, deletion, insertion and / or addition of one or several bases, and encodes a protein having glycosyltransferase activity DNA.
(C) A DNA that hybridizes with a DNA having the nucleotide sequence set forth in SEQ ID NO: 1 under a stringent condition and encodes a protein having glycosyltransferase activity.
請求項2又は3に記載のDNAを含有する、組み換えベクター。 A recombinant vector comprising the DNA according to claim 2 or 3. 請求項2又は3に記載のDNA又は請求項4に記載の組み換えベクターを有する、形質転換体。 A transformant comprising the DNA according to claim 2 or 3 or the recombinant vector according to claim 4. 請求項1に記載の蛋白質に対する抗体。 An antibody against the protein according to claim 1. 請求項1に記載の蛋白質に対する抗体を含む、大腸癌の診断薬。 A diagnostic agent for colorectal cancer, comprising an antibody against the protein according to claim 1. 生体試料中における請求項1に記載の蛋白質の発現を請求項6に記載の抗体を用いて検出又は測定することを含む、大腸癌の診断方法。 A method for diagnosing colorectal cancer, comprising detecting or measuring the expression of the protein of claim 1 in a biological sample using the antibody of claim 6. 請求項2又は3に記載のDNAの塩基配列の部分配列又はその相補配列から成るオリゴヌクレオチド。 An oligonucleotide comprising a partial sequence of the base sequence of the DNA according to claim 2 or 3 or a complementary sequence thereof. 請求項2又は3に記載のDNAの塩基配列の部分配列又はその相補配列から成るオリゴヌクレオチドを含む、大腸癌の診断薬。 A diagnostic agent for colorectal cancer comprising an oligonucleotide consisting of a partial sequence of the base sequence of the DNA according to claim 2 or 3 or a complementary sequence thereof. 生体試料中における請求項2又は3に記載のDNAの発現を請求項9に記載のオリゴヌクレオチドを用いて検出又は測定することを含む、大腸癌の診断方法。 A method for diagnosing colorectal cancer, comprising detecting or measuring the expression of the DNA according to claim 2 or 3 in a biological sample using the oligonucleotide according to claim 9. 大腸癌のマーカーとして請求項1に記載の蛋白質を使用する方法。


A method of using the protein of claim 1 as a marker for colorectal cancer.


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