JP2005323617A - Method for synthesizing nucleic acid - Google Patents

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Abstract

<P>PROBLEM TO BE SOLVED: To provide a novel method for efficiently amplifying a DNA in a sample by suppressing the action of a PCR inhibitory substance. <P>SOLUTION: In the method for synthesizing a nucleic acid in which an objective gene in a sample is amplified, the action of a PCR inhibitory substance is suppressed by allowing a polyanion and/or an insoluble polymer thereof to exist in a gene amplification reaction liquid. <P>COPYRIGHT: (C)2006,JPO&NCIPI

Description

本発明は核酸合成法、特に、ポリメラーゼ連鎖反応(Polymerase Chain Reaction :以下PCRと略す)法による核酸合成法に関する。 The present invention relates to a nucleic acid synthesis method, and more particularly to a nucleic acid synthesis method by a polymerase chain reaction (hereinafter abbreviated as PCR) method.

PCR法は、DNA鎖の1本鎖への解離、DNA鎖の特定の領域をはさんだプライマーの結合、DNAポリメラーゼの作用によるDNA合成反応を繰り返すことによって、目的のDNA断片を数十万倍にも増幅できる方法である。PCR法は、マリス氏らの発明である特許文献1に述べられている。 The PCR method repeats the DNA synthesis reaction by dissociating the DNA strand into single strands, binding the primer across a specific region of the DNA strand, and the action of the DNA polymerase, thereby increasing the target DNA fragment several hundred thousand times. Can be amplified. The PCR method is described in Patent Document 1 which is an invention of Maris et al.

PCR法は種々の試料中の核酸の高感度分析法として使用可能で、特に動物体液由来試料中の核酸の分析法に使用できる。従って、PCR法は感染症や遺伝子病の診断・モニタリング等に利用される。さらに、PCR法は移植や親子鑑定、個人の遺伝子情報に基づいた医療等でのDNAタイピングの検査にも適した方法である。これらの場合末梢血液が検査対象に選ばれる場合が多い。 The PCR method can be used as a highly sensitive analysis method for nucleic acids in various samples, and in particular, can be used for the analysis of nucleic acids in samples derived from animal body fluids. Accordingly, the PCR method is used for diagnosis and monitoring of infectious diseases and genetic diseases. Furthermore, the PCR method is also suitable for DNA typing tests in transplantation, parentage testing, medical treatment based on individual genetic information, and the like. In these cases, peripheral blood is often selected for testing.

PCR法の1つの欠点は、色素、たんぱく、糖類あるいは未知の夾雑物によって反応が阻害されることである。すなわち、代表的な耐熱性DNAポリメラーゼであるThermus aquaticus 由来のTaqDNAポリメラーゼをはじめ、多くのDNAポリメラーゼは、微量の生体由来の夾雑物がPCR反応液中に混在しても、活性が強く阻害されることが広く知られている。 One disadvantage of the PCR method is that the reaction is inhibited by dyes, proteins, sugars or unknown contaminants. That is, many DNA polymerases including Taq DNA polymerase derived from Thermus aquaticus, which is a typical thermostable DNA polymerase, are strongly inhibited even if trace amounts of biological impurities are mixed in the PCR reaction solution. It is widely known.

そこで、PCR法によるDNA増幅に先立って、被験物から細胞、原虫、真菌、細菌、ウィルス等(以下、遺伝子包含体と称する)を分離し、次に、その遺伝子包含体から核酸を抽出する過程が必要となる。その方法としては、酵素、界面活性剤、カオトロピック剤等により遺伝子包含体を分解し、その後、フェノールあるいはフェノール・クロロホルム等を用いて、遺伝子包含体の分解物から核酸を抽出する方法が従来より使用されている。最近では核酸抽出の過程において、イオン交換樹脂、ガラスフィルター、ガラスビーズあるいはタンパク凝集作用を有する試薬等が使用されている。 Therefore, prior to DNA amplification by the PCR method, a process of separating cells, protozoa, fungi, bacteria, viruses, etc. (hereinafter referred to as gene inclusions) from a test substance, and then extracting nucleic acids from the gene inclusions Is required. As the method, a method in which a gene inclusion body is decomposed with an enzyme, a surfactant, a chaotropic agent, etc., and then a nucleic acid is extracted from the decomposition product of the gene inclusion body using phenol or phenol / chloroform is conventionally used. Has been. Recently, in the process of nucleic acid extraction, ion exchange resins, glass filters, glass beads, reagents having a protein aggregating action, and the like are used.

特開昭61−274697号公報JP-A-61-274697

しかし、これらの方法を用いて試料中の核酸の精製を行っても、不純物の完全な除去は困難であり、かつ試料中の核酸の回収量が一定しない場合も多い。このため引き続く核酸合成が、とりわけ試料中の目的とする核酸の含量が少ない場合には、うまくできない場合もある。また、これら精製法は操作が煩雑で時間を要し、また操作中のコンタミネーションの機会を高めている。従って、これらの問題点を解決するためには、より簡便で、かつ効果的な試料前処理法が望まれる。 However, even if nucleic acid in a sample is purified using these methods, it is difficult to completely remove impurities, and the amount of nucleic acid recovered in the sample is often not constant. Therefore, the subsequent nucleic acid synthesis may not be successful especially when the content of the target nucleic acid in the sample is low. In addition, these purification methods are complicated and time-consuming, and increase the chance of contamination during operation. Therefore, in order to solve these problems, a simpler and more effective sample pretreatment method is desired.

そこで、本発明は、核酸合成阻害物質の作用を抑制して、試料中の核酸を効率よく増幅させる新規な方法を提供することを目的とする。 Accordingly, an object of the present invention is to provide a novel method for efficiently amplifying nucleic acid in a sample by suppressing the action of a nucleic acid synthesis inhibitor.

通常、血液抗凝固剤として用いられるヘパリンはPCR阻害物質として知られ、試料に添加するのに好ましくない物質とされる。しかし我々はこれらの現象を鋭意検討した結果、ヘパリンが生体試料中のPCR阻害物質の作用を抑制することを見だした。また、ヘパリンのみでなくデキストランサルフェイト等の他の硫酸化多糖やポリビニル硫酸等の硫酸化ポリマー、DNA等の燐酸化ポリマー等のポリアニオンおよびその不溶性高分子が同様の作用を示すことを見だし本発明をなすに至った。
本発明は、上記課題を解決するため、試料中の目的とする核酸を増幅する核酸合成法において、核酸増幅反応液にポリアニオン及び/又はその不溶性高分子を添加することを特徴とする。
Usually, heparin used as a blood anticoagulant is known as a PCR inhibitor and is not preferable for addition to a sample. However, as a result of intensive studies on these phenomena, we have found that heparin suppresses the action of PCR inhibitors in biological samples. In addition to heparin, other sulfated polysaccharides such as dextran sulfate, sulfated polymers such as polyvinyl sulfate, polyanions such as phosphorylated polymers such as DNA, and insoluble polymers thereof have been found to exhibit the same action. Invented the invention.
In order to solve the above problems, the present invention is characterized in that, in a nucleic acid synthesis method for amplifying a target nucleic acid in a sample, a polyanion and / or an insoluble polymer thereof is added to a nucleic acid amplification reaction solution.

本発明により、核酸の分離・精製の過程を経ずに、血清・血漿・血液等のPCR阻害物質を多く含んだ生体試料から、目的の核酸を効率よく増幅することが可能となった。また、本発明により、簡便、迅速に核酸合成の操作を行えるようになり、コンタミネーションの機会の軽減が可能となった。 According to the present invention, it has become possible to efficiently amplify a target nucleic acid from a biological sample containing a large amount of PCR inhibitory substances such as serum, plasma, blood, etc., without going through a process of separating and purifying nucleic acid. In addition, according to the present invention, nucleic acid synthesis can be performed simply and quickly, and the chance of contamination can be reduced.

ここで、ポリアニオンとは、陰イオンを含有した繰り返し構造を持つ高分子化合物およびその塩をいう。陰イオンとしては、例えば、硫酸基、亜硫酸基、燐酸基、カルボキシル基、チオカルボキシル基などを挙げることができるが、これらに限定されない。特に硫酸基を含有した繰り返し構造を持つ高分子化合物およびその塩(硫酸化ポリマー)、燐酸基を含有した繰り返し構造を持つ高分子化合物およびその塩(燐酸化ポリマー)が好ましい。 Here, the polyanion means a polymer compound having a repeating structure containing an anion and a salt thereof. Examples of the anion include, but are not limited to, a sulfate group, a sulfite group, a phosphate group, a carboxyl group, and a thiocarboxyl group. Particularly preferred are a polymer compound having a repeating structure containing a sulfate group and a salt thereof (sulfated polymer), and a polymer compound having a repeating structure containing a phosphate group and a salt thereof (phosphorylated polymer).

硫酸化ポリマーとしては、例えば、へパリン、デキストランサルフェイト等の硫酸化多糖(Sulfated polysaccharide)及びその塩(総称して硫酸化多糖)、ポリビニル硫酸およびその塩などを挙げることができるが、これらに限定されない。なお、その塩は、ナトリウム塩、カリウム塩などを挙げることができるが、これらに限定されない。
硫酸化ポリマーの添加量は、その種類により異なるが、例えばへパリンの場合、0.1μg/ml以上、好ましくは、0.4μg〜25.6μg/ml、デキストランサルフェイトの場合、0.05μg/ml以上、好ましくは、0.12μg〜7.8μg/mlであるが、これら範囲には限定されない。
Examples of the sulfated polymer include sulfated polysaccharides such as heparin and dextran sulfate and salts thereof (generally called sulfated polysaccharides), polyvinyl sulfate and salts thereof, and the like. It is not limited. In addition, although the salt can mention sodium salt, potassium salt, etc., it is not limited to these.
The addition amount of the sulfated polymer varies depending on the type, for example, heparin is 0.1 μg / ml or more, preferably 0.4 μg to 25.6 μg / ml, and dextran sulfate is 0.05 μg / ml. ml or more, preferably 0.12 μg to 7.8 μg / ml, but not limited to these ranges.

燐酸化ポリマーとしては、例えば、DNA、RNAなどを挙げることができるが、これらに限定されない。燐酸化ポリマーの添加量は、その種類により異なるが、例えばDNAの場合、50μlの反応液あたり0.2ng以上、好ましくは、1〜1000ngであるが、これら範囲には限定されない。 Examples of the phosphorylated polymer include, but are not limited to, DNA and RNA. The amount of the phosphorylated polymer added varies depending on the type, but for example, in the case of DNA, it is 0.2 ng or more, preferably 1-1000 ng per 50 μl reaction solution, but is not limited to these ranges.

ポリアニオン及び/又はその不溶性高分子は、試料に加えてから、核酸増幅反応液に添加しても、核酸増幅反応液に予め添加しておいてもよい。また、ポリアニオン及び/又はその不溶性高分子は、核酸増幅反応液に均一に入っていない状態(たとえば試料にポリアニオン及び/又はその不溶性高分子を加えて、この試料を反応液に攪拌せずに添加した場合など)でも同様の効果がある。また、ポリアニオン及び/又はその不溶性高分子は1種でも数種を組み合わせてもよい。またポリアニオンの不溶性高分子は均質なものでなくてもよく、ポリアニオンを含む複合型の不溶性高分子や、核酸合成反応を阻害しない担体にポリアニオンを結合したものでもよい。 The polyanion and / or its insoluble polymer may be added to the nucleic acid amplification reaction solution after being added to the sample, or may be added in advance to the nucleic acid amplification reaction solution. In addition, the polyanion and / or its insoluble polymer is not uniformly contained in the nucleic acid amplification reaction solution (for example, the polyanion and / or its insoluble polymer is added to the sample and this sample is added to the reaction solution without stirring) The same effect). The polyanion and / or its insoluble polymer may be used alone or in combination. The insoluble polymer of the polyanion may not be homogeneous, and may be a complex insoluble polymer containing a polyanion or a polyanion bound to a carrier that does not inhibit the nucleic acid synthesis reaction.

さらに、ポリアニオンを核酸増幅反応液の接する反応容器内壁にコーティングしても、もしくは容器そのものを不溶性ポリアニオンで構成してもよい。コーティングは、スピンコーティング、ホットディップ等いずれの方法でもよく、コーティングの厚さは特に限定されない。また、不溶性ポリアニオンで容器そのものを構成する場合は、射出成形などで成形するが、これには限定されない。 Furthermore, the polyanion may be coated on the inner wall of the reaction vessel in contact with the nucleic acid amplification reaction solution, or the vessel itself may be composed of an insoluble polyanion. The coating may be any method such as spin coating or hot dipping, and the thickness of the coating is not particularly limited. In addition, when the container itself is composed of insoluble polyanions, it is molded by injection molding or the like, but is not limited thereto.

本発明において、試料は生体由来試料もしくは生体由来試料中の遺伝子包含体をいい、生体由来試料とは、動植物組織、体液、排泄物等をいい、遺伝子包含体とは、細胞、原虫、真菌、細菌、ウィルス等をいう。体液には血液、髄液、唾液、乳が含まれ、排泄物には糞便、尿、汗が含まれるが、これに限定されるものではない。細胞には血液中の白血球、血小板が含まれるが、これらに限定されるものではない。 In the present invention, the sample refers to a biological sample or a gene inclusion in a biological sample, and the biological sample refers to animal and plant tissue, body fluid, excrement, etc., and the gene inclusion includes cells, protozoa, fungi, It refers to bacteria, viruses, etc. Body fluids include blood, cerebrospinal fluid, saliva, and milk, while excreta includes, but is not limited to, feces, urine, and sweat. Cells include, but are not limited to, white blood cells and platelets in blood.

核酸増幅反応液は、通常、pH緩衝液並びにMgCl2、KCl等の塩類、プライマー、デオキシリボヌクレオチド類及び核酸合成酵素を含むものである。また、上記の塩類は適宜他の塩類に変更して使用されている。また、ゼラチン、アルブミン等のタンパク、ジメチルスルホキシド、界面活性剤等種々の物質が添加される場合がある。 The nucleic acid amplification reaction solution usually contains a pH buffer solution and salts such as MgCl 2 and KCl, primers, deoxyribonucleotides, and nucleic acid synthase. Further, the above salts are used by appropriately changing to other salts. In addition, various substances such as proteins such as gelatin and albumin, dimethyl sulfoxide, and surfactants may be added.

pH緩衝液は、トリス(ヒドロキシメチル)アミノメタンと塩酸、硝酸、硫酸等の鉱酸の組合せであり、鉱酸の中で望ましいものは塩酸である。また、トリシン、CAPSO(3ーNーCyclohexylamino −2 −hydroxypropanesulfonic acid )あるいはCHES(2ー(Cyclohexylamino )ethanesulfonic acid )と苛性ソーダ、苛性カリとの組み合わせによるpH緩衝液等種々のpH緩衝液が使用され得る。pH調整された緩衝液は、核酸増幅反応液の中で10mMから100mMの間の濃度で使用される。 The pH buffer is a combination of tris (hydroxymethyl) aminomethane and a mineral acid such as hydrochloric acid, nitric acid, sulfuric acid, etc., and a desirable mineral acid is hydrochloric acid. In addition, various pH buffer solutions such as a pH buffer solution using a combination of tricine, CAPSO (3-N-Cyclohexylamino-2-hydroxypropanesulfonic acid) or CHES (2- (Cyclohexylamino) ethanesulfonic acid) with caustic soda and caustic potash can be used. The pH-adjusted buffer is used at a concentration between 10 mM and 100 mM in the nucleic acid amplification reaction solution.

プライマーは、鋳型と増幅用試薬等の存在下に合成の開始点として働くオリゴヌクレオチドをいう。プライマーは一本鎖であることが望ましいが、二本鎖も使用できる。もし、プライマーが二本鎖の場合には、増幅反応に先立って一本鎖にすることが望ましい。プライマーは、公知の方法により合成することができるし、また、生物界から単離することもできる。 A primer refers to an oligonucleotide that serves as a starting point for synthesis in the presence of a template, an amplification reagent, and the like. The primer is preferably single-stranded, but double-stranded can also be used. If the primer is double-stranded, it is desirable to make it single-stranded prior to the amplification reaction. The primer can be synthesized by a known method, or can be isolated from the biological world.

核酸合成酵素は、デオキシリボヌクレオチド類付加により核酸を合成する酵素、あるいはかような化学合成系を意味する。適切な核酸合成酵素としては、E.coliのDNAポリメラーゼI、E.coliのDNAポリメラーゼのクレノーフラグメント、T4DNAポリメラーゼ、TaqDNAポリメラーゼ、T.litoralisDNAポリメラーゼ、TthDNAポリメラーゼ、PfuDNAポリメラーゼそして逆転写酵素などがあるが、これらにのみ限定されるものではない。 Nucleic acid synthase means an enzyme that synthesizes nucleic acid by addition of deoxyribonucleotides, or such a chemical synthesis system. Suitable nucleic acid synthases include E. coli. DNA polymerase I, E. coli Examples include, but are not limited to, the Klenow fragment of Escherichia coli DNA polymerase, T4 DNA polymerase, Taq DNA polymerase, T. litoralis DNA polymerase, Tth DNA polymerase, Pfu DNA polymerase, and reverse transcriptase.

また、本発明では核酸増幅反応液のpHを調節することにより、相乗効果が得られる。例えば、pHは25℃の温度条件下で8.1以上、好ましくは8.5〜 9.5である。 In the present invention, a synergistic effect can be obtained by adjusting the pH of the nucleic acid amplification reaction solution. For example, the pH is 8.1 or more, preferably 8.5 to 9.5 under a temperature condition of 25 ° C.

なお、本発明の核酸合成法の手順は、反応液中にポリアニオン及び/又はその不溶性高分子を添加する以外、通常の方法と何ら変わらない。例えば、核酸合成法としてPCR法を使用する場合においては、先ず、増幅しようとする目的の2本鎖DNA断片を熱変性により1本鎖のDNAにする(ディナチュレーション工程)。次に増幅させたい領域を挟むプライマーをハイブリダイズさせる(アニーリング工程)。次に4種類のデオキシリボヌクレオチド類(dATP、dGTP、dCTP、dTTP)の共存下にDNAポリメラーゼを作用させ、プライマーの伸長反応を行う(ポリメライゼーション工程)。 The procedure of the nucleic acid synthesis method of the present invention is not different from the usual method except that a polyanion and / or an insoluble polymer thereof is added to the reaction solution. For example, when the PCR method is used as a nucleic acid synthesis method, first, a target double-stranded DNA fragment to be amplified is converted into a single-stranded DNA by heat denaturation (dynalation step). Next, a primer sandwiching the region to be amplified is hybridized (annealing step). Next, a DNA polymerase is allowed to act in the presence of four types of deoxyribonucleotides (dATP, dGTP, dCTP, dTTP) to perform a primer extension reaction (polymerization step).

(実験例1)
PCR反応液にヒト血漿を直接添加してPCRを行う実験系で、硫酸化多糖の一種であるヘパリン添加の効果を検討した。PCR反応液には、10mM Tris-HCl, 50mM KCl, 1.5mM MgCl2, 各200μMのdATP, dCTP, dGTP及びdTTP, 各0.4μMのprimer, 1.25units/50μl のTaq DNA ポリメラーゼ(TaKaRa Taq: Takara shuzo, Kyoto, Japan)反応液を用いた。なお、鋳型DNAとしては3 fgのPUC18プラスミドDNAを、PCRのプライマーとしてはPUC18プラスミドDNAのplus鎖の塩基配列をもつオリゴヌクレオチド(RV−M:配列番号1)及びminus 鎖の塩基配列をもつオリゴヌクレオチド(M13−47:配列番号2)を使用した。プライマーの配列は以下の通りであり、この2種類のプライマーを用いたPCRの結果、150bp の増幅産物を得ることができる。
RV−M: 5'GAGCGGATAACAATTTCACACAGG3'
M13−47:5'CGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGAC3'
(Experimental example 1)
In an experimental system in which human plasma was directly added to a PCR reaction solution to perform PCR, the effect of adding heparin, a kind of sulfated polysaccharide, was examined. The PCR reaction solution contained 10 mM Tris-HCl, 50 mM KCl, 1.5 mM MgCl 2 , 200 μM each of dATP, dCTP, dGTP and dTTP, 0.4 μM each primer, 1.25 units / 50 μl Taq DNA polymerase (TaKaRa Taq: Takara shuzo , Kyoto, Japan). The template DNA is 3 fg of PUC18 plasmid DNA, the PCR primer is an oligonucleotide having a plus chain base sequence (RV-M: SEQ ID NO: 1) of PUC18 plasmid DNA and an oligonucleotide having a minus chain base sequence. Nucleotides (M13-47: SEQ ID NO: 2) were used. Primer sequences are as follows, and as a result of PCR using these two types of primers, an amplification product of 150 bp can be obtained.
RV-M: 5′GAGCGGATAACAATTTCACACAGGG3 ′
M13-47: 5 ′ CGCCAGGGTTTCCCAGTCACGAC3 ′

PCRは、94℃、3分間のプレヒーティングの後、94℃ 30秒間、55℃ 1分間、72℃ 1分間の条件で40サイクル、最後に72℃ 7分間のポリメライゼーションを行った。
PCR終了後、反応液5μlを用いて、2.5%アガロースを含む、0.5μg/ml臭化エチジウム添加TAE(40mM Tris-acetate, 1mM EDTA) 液中で電気泳動を行い検出した。
PCR was performed at 94 ° C. for 3 minutes, followed by 40 cycles of 94 ° C. for 30 seconds, 55 ° C. for 1 minute, 72 ° C. for 1 minute, and finally 72 ° C. for 7 minutes.
After completion of PCR, 5 μl of the reaction solution was used for electrophoresis and detection in 0.5 μg / ml ethidium bromide-added TAE (40 mM Tris-acetate, 1 mM EDTA) solution containing 2.5% agarose.

PCR反応液(50μl)に1μlのヒト血漿および種々の濃度のヘパリンナトリウム塩 (Heparin Sodium: Wako, Osaka, Japan) を添加して、 PUC18プラスミドDNAを鋳型としてPCRを行ったときの増幅産物の電気泳動図を図1に示す。図中Mは分子量マーカー(HincIIで切断した250ng のφ X174-RF DNA)、1はヘパリンナトリウム塩無添加、2は0.025μg/ml、3は0.05μg/ml、4は0.1μg/ml、5は0.2μg/ml、6は0.4μg/ml、7は0.8μg/ml、8は1.6μg/ml、9は3.2μg/ml、10は6.4μg/ml、11は12.8μg/ml、12は25.6μg/ml、13は51.2μg/ml、14は102.4μg/ml添加でPCRを行った時の結果を示している。
ヘパリンを添加することによって、PCR増幅産物が得られることが示されている。ヘパリンナトリウム塩を0.1μg/ml(レーン4)以上、特に0.4μg〜25.6μg/ml(レーン6〜12)添加した時に良好な結果が得られている。
1 μl of human plasma and various concentrations of heparin sodium salt (Heparin Sodium: Wako, Osaka, Japan) were added to the PCR reaction solution (50 μl), and the electricity of the amplified product when PCR was performed using PUC18 plasmid DNA as a template. The electropherogram is shown in FIG. In the figure, M is a molecular weight marker (250 ng φX174-RF DNA cut with HincII), 1 is no heparin sodium salt added, 2 is 0.025 μg / ml, 3 is 0.05 μg / ml, 4 is 0.1 μg / ml, 5 Is 0.2 μg / ml, 6 is 0.4 μg / ml, 7 is 0.8 μg / ml, 8 is 1.6 μg / ml, 9 is 3.2 μg / ml, 10 is 6.4 μg / ml, 11 is 12.8 μg / ml, 12 is 25.6 μg / ml, 13 is 51.2 μg / ml, and 14 is the result when PCR is performed with 102.4 μg / ml added.
It has been shown that PCR amplification products can be obtained by adding heparin. Good results have been obtained when heparin sodium salt is added in an amount of 0.1 μg / ml (lane 4) or more, particularly 0.4 μg to 25.6 μg / ml (lanes 6 to 12).

(実験例2)
本例は、実験例1で増幅効率の良かった0.8μg/mlのヘパリンナトリウム塩存在あるいは非存在の条件下で、段階希釈したヒト血液を直接反応液に添加して、PCRを行った実験である。反応に用いたPCR反応液の組成は、鋳型DNAおよびプライマーを除いては実験1と同様である。
鋳型DNAとしては血液中のDNAを、PCRのプライマーとしてはヒトβ−グロビン遺伝子領域内に位置するplus鎖の塩基配列をもつオリゴヌクレオチド(GH20:配列番号3)及びminus 鎖の塩基配列をもつオリゴヌクレオチド(GH21:配列番号4)を使用した。プライマーの配列は以下の通りであり、この2種類のプライマーを用いたPCRの結果、408bp の増幅産物を得ることができる。
GH20:5'GAAGAGCCAAGGACAGGTAC3'
GH21:5'GGAAAATAGACCAATAGGCAG3'
PCRの条件、PCR後の電気泳動の条件は実験例1と同様である。
(Experimental example 2)
This example is an experiment in which PCR was performed by adding serially diluted human blood directly to the reaction solution in the presence or absence of 0.8 μg / ml heparin sodium salt, which had good amplification efficiency in Experimental Example 1. is there. The composition of the PCR reaction solution used for the reaction is the same as in Experiment 1 except for the template DNA and the primers.
DNA in blood as template DNA, oligonucleotide having a plus strand base sequence (GH20: SEQ ID NO: 3) located in the human β-globin gene region and oligonucleotide having a minus strand base sequence as PCR primers Nucleotides (GH21: SEQ ID NO: 4) were used. Primer sequences are as follows, and as a result of PCR using these two types of primers, an amplification product of 408 bp can be obtained.
GH20: 5'GAAGAGCCAAGGACAGGTAC3 '
GH21: 5′GGAAAATAGCCAATAGGGCAG3 ′
The conditions for PCR and the conditions for electrophoresis after PCR are the same as in Experimental Example 1.

実験結果(電気泳動図)を図2に示す。図中Mは分子量マーカー、1、5は血液0.5%、2、6は0.25%、3、7は0.125%添加、4、8は無添加でのPCRの結果を示している。なお1〜4はヘパリンナトリウム塩非存在下、5〜8は存在下でPCRを行った結果である。本実験例により、 PCR阻害物質の作用がヘパリンで抑制されることにより、血液を反応液に直接添加してPCRを行っても、高感度に増幅産物が検出できることがわかる。 The experimental results (electrophoresis diagram) are shown in FIG. In the figure, M represents a molecular weight marker, 1, 5 represents blood 0.5%, 2, 6 represents 0.25%, 3, 7 represents 0.125% added, and 4 and 8 represent PCR results without addition. 1-4 are the results of PCR in the absence of heparin sodium salt and 5-8 are in the presence. According to this experimental example, it can be seen that the amplification product can be detected with high sensitivity even when PCR is performed by directly adding blood to the reaction solution by suppressing the action of the PCR inhibitory substance with heparin.

(実験例3)
PCR反応液にヒト血清を直接添加してPCRを行う実験系で、硫酸化多糖の一種であるデキストランサルフェイト添加の効果を検討した。反応に用いたPCR反応液の組成およびPCR後の電気泳動の条件は実験例1と同様である。PCRは94℃、4分30秒間のプレヒーティングの後、94℃30秒間、58℃ 1分間、72℃ 1分間の条件で40サイクル、最後に72℃7分間のポリメライゼーションを行った。
(Experimental example 3)
In an experimental system in which human serum was directly added to a PCR reaction solution to perform PCR, the effect of adding dextran sulfate, which is a kind of sulfated polysaccharide, was examined. The composition of the PCR reaction solution used for the reaction and the electrophoresis conditions after PCR are the same as in Experimental Example 1. The PCR was preheated at 94 ° C. for 4 minutes and 30 seconds, followed by 40 cycles at 94 ° C. for 30 seconds, 58 ° C. for 1 minute, 72 ° C. for 1 minute, and finally at 72 ° C. for 7 minutes.

PCR反応液(50μl)に1μlのヒト血清および種々の濃度のデキストランサルフェイトナトリウム塩(平均分子量5、500)(Sodium Dextran Sulfate,Nacalai tesque, Kyoto, Japan)を添加して、 PUC18プラスミドDNA を鋳型としてPCRを行ったときの増幅産物の電気泳動図を図3に示す。図中Mは分子量マーカー、1はデキストランサルフェイトナトリウム塩100μg、2は25μg、3は6.3μg、4は1.6μg、5は390ng、6は97ng、7は24ng、8は6.1ng、9は1.52ng、10は0.38ng、11は0.095ng、12は0.023ng、13は無添加でPCRを行った時の結果を示している。なお、14はヒト血清もデキストランサルフェイトナトリウム塩も添加しない陽性対照である。
デキストランサルフェイトナトリウム塩を390ng〜6.1ng (レーン5-8) 添加してPCRを行った場合に、増幅産物が検出できている。
以上の結果から、デキストランサルフェイトが血清中のPCR阻害物質の作用を抑制し、反応を回復させる効果のあることが明らかとなった。
Add 1 μl of human serum and various concentrations of dextran sulfate sodium salt (average molecular weight 5,500) (Sodium Dextran Sulfate, Nacalai tesque, Kyoto, Japan) to the PCR reaction solution (50 μl), and use PUC18 plasmid DNA as a template. Fig. 3 shows an electrophoretogram of the amplified product when PCR is performed. In the figure, M is a molecular weight marker, 1 is dextran sulfate sodium salt 100 μg, 2 is 25 μg, 3 is 6.3 μg, 4 is 1.6 μg, 5 is 390 ng, 6 is 97 ng, 7 is 24 ng, 8 is 6.1 ng, and 9 is 1.52 ng, 10 is 0.38 ng, 11 is 0.095 ng, 12 is 0.023 ng, and 13 is the result when PCR is performed without addition. 14 is a positive control to which neither human serum nor dextran sulfate sodium salt is added.
When PCR was performed with dextran sulfate sodium salt added at 390 ng to 6.1 ng (lanes 5-8), amplification products were detected.
From the above results, it has been clarified that dextran sulfate has an effect of suppressing the action of a PCR inhibitory substance in serum and recovering the reaction.

本実験例で効果の認められた濃度は、0.12μg/ml (6.1ng/50μl)から7.8μg/ml (390ng/50μl)の範囲であったが、他の実験から、使用するデキストランサルフェイトの分子量や血清の添加量で、有効な濃度範囲が変動することを確認しており、効果のある濃度範囲を前記の範囲に限定するものではない。 The concentration at which the effect was observed in this experimental example was in the range of 0.12 μg / ml (6.1 ng / 50 μl) to 7.8 μg / ml (390 ng / 50 μl), but from other experiments, the concentration of dextran sulfate used was It has been confirmed that the effective concentration range varies depending on the molecular weight and the amount of serum added, and the effective concentration range is not limited to the above range.

(実験例4)
PCR反応液にヒト血液を直接添加してPCRを行う実験系で、デキストランサルフェイト添加の効果を検討した。反応に用いたPCR反応液の組成は実験例2と同様であり、PCR条件はアニーリング温度を55℃に設定した以外は実験例3と同様であり、PCR後の電気泳動の条件は実験例1と同様である。
(Experimental example 4)
The effect of adding dextran sulfate was examined in an experimental system in which PCR was performed by directly adding human blood to a PCR reaction solution. The composition of the PCR reaction solution used for the reaction was the same as in Experimental Example 2, the PCR conditions were the same as in Experimental Example 3 except that the annealing temperature was set to 55 ° C., and the electrophoresis conditions after PCR were the same as in Experimental Example 1. It is the same.

PCR反応液(50μl)に0.05μlのヒト血液および種々の濃度のデキストランサルフェイトナトリウム塩を添加して、 血液中のDNAを鋳型としてPCRを行ったときの増幅産物の電気泳動図を図4に示す。図中Mは分子量マーカー、2はデキストランサルフェイトナトリウム塩無添加、3は10μg、4は2.5μg、5は0.625μg、6は156ng、7は39ng、8は9.76ng、9は2.44ng、10は0.61ng添加してPCRを行った時の結果を示している。なお、1は血液もデキストランサルフェイトナトリウム塩も添加しない陰性対照である。
デキストランサルフェイトナトリウム塩を156ng〜2.44ng (レーン6-9) 添加してPCRを行った場合に、増幅産物が検出できている。
Fig. 4 shows the electrophoretogram of the amplified product when PCR was performed using 0.05 µl of human blood and various concentrations of dextran sulfate sodium salt in the PCR reaction solution (50 µl) and using DNA in the blood as a template. Show. In the figure, M is a molecular weight marker, 2 is dextran sulfate sodium salt not added, 3 is 10 μg, 4 is 2.5 μg, 5 is 0.625 μg, 6 is 156 ng, 7 is 39 ng, 8 is 9.76 ng, 9 is 2.44 ng, 10 Shows the results when PCR was performed with 0.61 ng added. 1 is a negative control to which neither blood nor dextran sulfate sodium salt is added.
When dextran sulfate sodium salt is added from 156 ng to 2.44 ng (lanes 6-9) and PCR is performed, amplification products can be detected.

以上の結果から、デキストランサルフェイトが血液中のPCR阻害物質の作用を抑制し、反応を回復させる効果のあることが明らかとなった。本実験例で効果の認められた濃度は、0.049μg/ml (2.44ng/50μl)から3.1μg/ml (156ng/50μl)の範囲であったが、他の実験から、使用するデキストランサルフェイトの分子量や血清の添加量で、有効な濃度範囲が変動することを確認しており、効果のある濃度範囲を前記の範囲に限定するものではない。 From the above results, it has been clarified that dextran sulfate has an effect of suppressing the action of a PCR inhibitory substance in blood and recovering the reaction. The concentration at which the effect was observed in this experimental example was in the range of 0.049 μg / ml (2.44 ng / 50 μl) to 3.1 μg / ml (156 ng / 50 μl), but from other experiments, the concentration of dextran sulfate used was It has been confirmed that the effective concentration range varies depending on the molecular weight and the amount of serum added, and the effective concentration range is not limited to the above range.

(実験例5)
PCR反応液にヒト血漿を直接添加してPCRを行う実験系で、硫酸化ポリマーの一種であるポリビニル硫酸添加の効果を検討した。PCR反応液の組成およびPCR後の電気泳動の条件は実験例1と同様であり、PCRの条件は実験例3と同様である。
(Experimental example 5)
In an experimental system in which PCR is performed by directly adding human plasma to a PCR reaction solution, the effect of adding polyvinyl sulfate, which is a kind of sulfated polymer, was examined. The composition of the PCR reaction solution and the electrophoresis conditions after PCR are the same as in Experimental Example 1, and the PCR conditions are the same as in Experimental Example 3.

PCR反応液(50μl)に種々の量のヒト血漿を直接添加して、1ngのポリビニル硫酸カリウム塩 (Polyvinylsulfuric Acid Potassium Salt: Nacalai tesque)存在下もしくは非存在下でPUC18プラスミドDNAを鋳型にしてPCRを行ったときの増幅産物の電気泳動図を図5に示す。図中Mは分子量マーカー、1は血漿2μl、2は1μl、以下3〜10は、順次2倍段階で量を減らした血漿を直接反応液に添加してPCRを行った時の結果を示している。なお、11は血漿を添加しない時の結果である。ポリビニル硫酸カリウム塩添加の場合(図中A)では血漿0.5μl(レーン3)以下の添加量でPCR産物が検出されているが、無添加の場合(図中B)では、0.0125μl(レーン5)以下の添加量でPCR産物が検出されている。 このことは、ポリビニル硫酸をPCR反応液に添加することにより、添加しない場合に比べ、約4倍量の血漿中PCR阻害物質に対応できることを示している。 Various amounts of human plasma were added directly to the PCR reaction solution (50 μl), and PCR was performed using PUC18 plasmid DNA as a template in the presence or absence of 1 ng of polyvinylsulfuric acid potassium salt (Nacalai tesque). An electropherogram of the amplification product when performed is shown in FIG. In the figure, M is a molecular weight marker, 1 is 2 μl of plasma, 2 is 1 μl, and the following 3 to 10 are the results when PCR was carried out by directly adding plasma, which was reduced in volume in the order of 2 times, to the reaction solution. Yes. In addition, 11 is a result when plasma is not added. In the case of adding polyvinyl sulfate potassium salt (A in the figure), the PCR product was detected at an addition amount of 0.5 μl or less of plasma (lane 3), but in the case of no addition (B in the figure), 0.0125 μl ( Lane 5) PCR products are detected with the following addition amount. This indicates that by adding polyvinyl sulfate to the PCR reaction solution, it is possible to cope with about four times the amount of a PCR inhibitor in plasma compared to the case where it is not added.

(実験例6)
PCR反応液にヒト血清を直接添加してPCRを行う実験系で、燐酸化ポリマーの一種であるDNA添加の効果を検討した。
PCR反応液の組成およびPCR後の電気泳動の条件は実験例1と同様であり、PCRの条件は実験例3と同様である。
(Experimental example 6)
In an experimental system in which PCR was performed by directly adding human serum to a PCR reaction solution, the effect of adding DNA, a kind of phosphorylated polymer, was examined.
The composition of the PCR reaction solution and the electrophoresis conditions after PCR are the same as in Experimental Example 1, and the PCR conditions are the same as in Experimental Example 3.

PCR反応液(50μl)に1μlのヒト血清および種々の濃度のヒトゲノムDNAを添加して、PUC18プラスミドDNAを鋳型にしてPCRを行ったときの増幅産物の電気泳動図を図6に示す。図中Mは分子量マーカー、1はDNA100ng, 2は10ng, 3は1ng, 4は0.1ng, 5は0.01ng添加, 6は無添加でPCRを行った時の結果を示している。
DNAをPCR反応液に1ng(レーン3)以上添加してPCRを行った場合にPCR産物が検出されている。以上の結果は、DNAを添加してPCRを行うことにより血清由来のPCR阻害物質の作用を抑制したことを示している。
FIG. 6 shows an electrophoretogram of amplification products when 1 μl of human serum and various concentrations of human genomic DNA were added to the PCR reaction solution (50 μl) and PCR was performed using PUC18 plasmid DNA as a template. In the figure, M is a molecular weight marker, 1 is DNA 100 ng, 2 is 10 ng, 3 is 1 ng, 4 is 0.1 ng, 5 is 0.01 ng, and 6 is no addition.
PCR products are detected when PCR is performed with 1 ng (lane 3) or more of DNA added to the PCR reaction solution. The above results show that the action of serum-derived PCR inhibitory substances was suppressed by adding DNA and performing PCR.

(実験例7)
PCR反応液にヒト血漿を直接添加してPCRを行う実験系で、ポリアニオンの不溶性高分子の一種であるデキストランサルフェイトゲル添加の効果を検討した。反応に用いたPCR反応液の組成は、鋳型DNAおよびプライマーを除いては実験1と同様である。
(Experimental example 7)
In an experimental system in which human plasma was directly added to a PCR reaction solution to perform PCR, the effect of adding dextran sulfate gel, which is a kind of insoluble polymer of polyanion, was examined. The composition of the PCR reaction solution used for the reaction is the same as in Experiment 1 except for the template DNA and the primers.

鋳型DNAとしてはpBR322プラスミド由来テトラサイクリン耐性遺伝子配列をもつコントロールRNA( Takara shuzo)1000コピーより逆転写したcDNAを、PCRのプライマーとしてはテトラサイクリン耐性遺伝子領域内に位置するplus鎖の塩基配列をもつオリゴヌクレオチド(F−1、 Takara shuzo:配列番号5)及びminus 鎖の塩基配列をもつオリゴヌクレオチド(R−1、 Takara shuzo:配列番号6)を使用した。プライマーの配列は以下の通りであり、この2種類のプライマーを用いたPCRの結果、462bp の増幅産物を得ることができる。
F−1:5'CTCGTCGCTTCGCATCTTGGA3'
R−1:5'CGGCACCTGTCCTACGAGTTG3'
PCRの条件はアニーリング温度を64℃に設定した以外は実験例1と同様であり、PCR後の電気泳動の条件は実験例1と同様である。
As template DNA, cDNA reverse-transcribed from 1000 copies of control RNA (Takara shuzo) having a tetracycline resistance gene sequence derived from pBR322 plasmid, and as a PCR primer, an oligonucleotide having a plus-strand base sequence located in the tetracycline resistance gene region (F-1, Takara shuzo: SEQ ID NO: 5) and an oligonucleotide having a minus chain base sequence (R-1, Takara shuzo: SEQ ID NO: 6) were used. Primer sequences are as follows, and as a result of PCR using these two types of primers, an amplification product of 462 bp can be obtained.
F-1: 5 ′ CTCGTCGCCTCGCATCTTGGA3 ′
R-1: 5'CGGCACCCTGCTCTACGAGTTG3 '
The PCR conditions were the same as in Experimental Example 1 except that the annealing temperature was set to 64 ° C., and the electrophoresis conditions after PCR were the same as in Experimental Example 1.

PCR反応液(50μl)に0.125μlのヒト血漿および種々の量のデキストランサルフェイトゲル (Dextran beads, sulfated D5650:SIGMA, Missouri, USA)を添加して、cDNAを鋳型としてPCRを行った時の増幅産物の電気泳動図を図7に示す。 このデキストランサルフェイトゲルには安定剤として乳糖が添加されているため、蒸留水にて洗浄後乾燥したものを用いた。 図中Mは分子量マーカー、1はデキストランサルフェイトゲル無添加、2は0.2μg 、3は0.4μg 、4は0.8μg 、5は1.6μg 、6は3.2μg 、7は6.3μg 、8は12.5μg 、9は25μg 、10は50μg添加でPCRを行った時の結果を示している。 Amplification when PCR was performed using 0.125 μl of human plasma and various amounts of dextran sulfate sulfate gel (Dextran beads, sulfated D5650: SIGMA, Missouri, USA) added to the PCR reaction solution (50 μl) The electropherogram of the product is shown in FIG. Since this dextran sulfate gel had lactose added as a stabilizer, it was washed with distilled water and dried. In the figure, M is a molecular weight marker, 1 is no dextran sulfate gel added, 2 is 0.2 μg, 3 is 0.4 μg, 4 is 0.8 μg, 5 is 1.6 μg, 6 is 3.2 μg, 7 is 6.3 μg, 8 is 12.5 μg , 9 shows the results when PCR was performed with 25 μg and 10 with 50 μg added.

デキストランサルフェイトゲルを添加することによって、PCR増幅産物が得られることが示されている。デキストランサルフェイトゲルを1.6μg (レーン5)以上、特に3.2〜25μg (レーン6〜9)添加した時に良好な結果が得られている。
本実験例で効果の認められた量は、反応液50μlあたり1.6μgから50μgの範囲であったが、使用するデキストランサルフェイトゲルへの硫酸基の導入率の違い等により、有効量の範囲は変動するため、効果のある量を前記の範囲に限定するものではない。
It has been shown that PCR amplification products can be obtained by adding dextran sulfate gel. Good results have been obtained when dextran sulfate gel is added in an amount of 1.6 μg (lane 5) or more, particularly 3.2 to 25 μg (lanes 6 to 9).
The amount in which the effect was recognized in this experimental example was in the range of 1.6 μg to 50 μg per 50 μl of the reaction solution. However, the range of effective amount is different depending on the difference in the rate of introduction of sulfate groups into the dextran sulfate gel used. Because of the variation, the effective amount is not limited to the above range.

(実験例8)
本例は、実験例7で増幅効率の良かった12.5μg/50μlのデキストランサルフェイトゲル存在下あるいは非存在下で、段階希釈した血漿を直接反応液に添加して、 pBR322由来テトラサイクリン耐性遺伝子のcDNAを鋳型にしてPCRを行った実験である。反応に用いたPCR反応液の組成およびPCRの条件は実験例7と同様であり、 PCR後の電気泳動の条件は実験例1と同様である。
PCR反応液(50μl)に12.5μgのデキストランサルフェイトゲルおよび段階希釈したヒト血漿を添加して、cDNAを鋳型としてPCRを行った時の増幅産物の電気泳動図を図8に示す。
図中Mは分子量マーカー、1、7は血漿無添加、2、8は0.063%、3、9は0.125%、4、10は0.25%、5、11は0.5%、6、12は1%添加でPCRを行った時の結果を示している。 なお1〜6はデキストランサルフェイトゲル無添加、7〜12はデキストランサルフェイトゲルを添加したものである。
(Experimental example 8)
In this example, serially diluted plasma was directly added to the reaction solution in the presence or absence of 12.5 μg / 50 μl of dextran sulfate gel, which had good amplification efficiency in Experimental Example 7, and the pBR322-derived tetracycline resistance gene This is an experiment in which PCR was performed using cDNA as a template. The composition of the PCR reaction solution used for the reaction and the PCR conditions were the same as in Experimental Example 7, and the electrophoresis conditions after PCR were the same as in Experimental Example 1.
FIG. 8 shows an electrophoretogram of the amplification product when 12.5 μg of dextran sulfate gel and serially diluted human plasma were added to the PCR reaction solution (50 μl) and PCR was performed using cDNA as a template.
In the figure, M is a molecular weight marker, 1, 7 is no plasma added, 2, 8 is 0.063%, 3, 9 is 0.125%, 4, 10 is 0.25%, 5, 11 is 0.5%, 6, 12 is 1% added Shows the results when PCR was performed. In addition, 1-6 are dextran sulfate gel additive-free, 7-12 are dextran sulfate gel added.

本実験例により、 PCR阻害物質の作用がデキストランサルフェイトゲルで抑制されることにより、血漿を反応液に直接添加してPCRを行っても、高感度に増幅産物が検出できることがわかる。
実験例7および8の結果より、反応液中にポリアニオンを溶液として添加する場合のみでなく、不溶性のポリアニオンを添加する場合でも阻害物質の作用が抑制できることがわかる。なお、このことは本例のようにゲルとして不溶性ポリアニオンを添加する場合だけでなく、反応液の接する反応容器内壁にポリアニオンをコーティングした場合や容器そのものが不溶性ポリアニオンで構成されている場合も有効である。
According to this experimental example, it can be understood that the amplification product can be detected with high sensitivity even when PCR is carried out by directly adding plasma to the reaction solution by suppressing the action of the PCR inhibitory substance with dextran sulfate gel.
From the results of Experimental Examples 7 and 8, it can be seen that the action of the inhibitor can be suppressed not only when the polyanion is added to the reaction solution as a solution but also when an insoluble polyanion is added. This is effective not only when insoluble polyanion is added as a gel as in this example, but also when the polyanion is coated on the inner wall of the reaction vessel in contact with the reaction solution or when the vessel itself is composed of insoluble polyanion. is there.

PCR反応液(50μl)に1μlのヒト血漿および濃度の異なるヘパリンナトリウム塩を添加し、PCRを行った電気泳動図Electrophoretic diagram of PCR performed by adding 1 μl of human plasma and heparin sodium salt of different concentration to the PCR reaction solution (50 μl) 実験例1で増幅効率の良かった0.8μg/mlのヘパリンナトリウム塩を反応液に加えた場合と加えない場合において、ヒト血液を段階希釈して反応液に添加しPCRを行った電気泳動図Electrophoretic diagram of PCR in which human blood was serially diluted and added to the reaction solution with and without 0.8 μg / ml heparin sodium salt, which had good amplification efficiency in Experimental Example 1. PCR反応液(50μl)に1μlのヒト血清および濃度の異なるデキストランサルフェイトナトリウム塩を添加し、PCRを行った電気泳動図Electrophoresis diagram of PCR performed by adding 1 μl of human serum and dextran sulfate sodium salt with different concentrations to the PCR reaction solution (50 μl) PCR反応液(50μl)に0.05μlのヒト血液および濃度の異なるデキストランサルフェイトナトリウム塩を添加し、PCRを行った電気泳動図Electrophoretic diagram of PCR performed by adding 0.05 μl of human blood and dextran sulfate sodium salt with different concentrations to the PCR reaction solution (50 μl) PCR反応液(50μl)に種々の量のヒト血漿および1ngのポリビニル硫酸カリウム塩を添加し、PCRを行った電気泳動図Electrophoretic diagram of PCR performed by adding various amounts of human plasma and 1 ng potassium polyvinyl sulfate to the PCR reaction solution (50 μl) PCR反応液(50μl)に1μlのヒト血清および濃度の異なるヒトゲノムDNAを添加し、PCRを行った電気泳動図Electrophoresis diagram of PCR performed by adding 1 μl of human serum and human genomic DNA of different concentrations to the PCR reaction solution (50 μl) PCR反応液(50μl)に0.125μlのヒト血漿および量の異なるデキストランサルフェイトゲルを添加し、PCRを行った電気泳動図Electrophoretic diagram of PCR performed by adding 0.125 μl of human plasma and different amounts of dextran sulfate gel to the PCR reaction solution (50 μl) 実験例7で増幅効率の良かった12.5μg/mlのデキストランサルフェイトゲルを反応液に加えた場合と加えない場合において、ヒト血漿を段階希釈して反応液に添加しPCRを行った電気泳動図。Electrophoresis in which PCR was performed by serially diluting human plasma and adding it to the reaction solution when adding or not adding 12.5 μg / ml dextran sulfate gel, which had good amplification efficiency in Experimental Example 7. Figure.

Claims (5)

試料中の目的とする核酸を増幅する核酸合成法において、核酸増幅反応液に陰イオンを含有した繰り返し構造を持つ高分子化合物 (polyanion) およびその塩(以下総称してポリアニオンと称する)及び/又はその不溶性高分子を添加することを特徴とする核酸合成法。 In a nucleic acid synthesis method for amplifying a target nucleic acid in a sample, a polymer compound (polyanion) having a repetitive structure containing an anion in a nucleic acid amplification reaction solution and a salt thereof (hereinafter collectively referred to as a polyanion) and / or A nucleic acid synthesis method comprising adding the insoluble polymer. ポリアニオンが、硫酸基を含有した繰り返し構造を持つ高分子化合物 (polysulfate) およびその塩(以下総称して硫酸化ポリマーと称する)である請求項1記載の核酸合成法。 2. The nucleic acid synthesis method according to claim 1, wherein the polyanion is a polymer compound having a repeating structure containing a sulfate group (polysulfate) and a salt thereof (hereinafter collectively referred to as a sulfated polymer). 硫酸化ポリマーがポリビニル硫酸およびその塩である請求項2記載の核酸合成法。 The nucleic acid synthesis method according to claim 2, wherein the sulfated polymer is polyvinyl sulfate and a salt thereof. 試料中の目的とする核酸を増幅する核酸合成法において、核酸増幅反応液の接する反応容器内壁にポリアニオンをコーティング、もしくは容器そのものが不溶性ポリアニオンで構成されていることを特徴とする核酸合成法。 In a nucleic acid synthesis method for amplifying a target nucleic acid in a sample, a polyanion is coated on the inner wall of a reaction vessel in contact with a nucleic acid amplification reaction solution, or the vessel itself is composed of an insoluble polyanion. 試料が生体由来試料もしくは生体由来試料中の遺伝子包含体であり、かつ試料を直接核酸増幅反応液に添加することを特徴とする請求項1〜4に記載の核酸合成法。 The nucleic acid synthesis method according to claim 1, wherein the sample is a biological sample or a gene inclusion in the biological sample, and the sample is directly added to the nucleic acid amplification reaction solution.
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