JP2005112726A - Dna vaccine against viral hemorrhagic sepsticemia of flatfish - Google Patents
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Abstract
Description
本発明は、ヒラメのウイルス性出血性敗血症ウイルス(Viral Hemorrhagic Septicemia Virus;VHSV)の魚類への感染症に対する防御免疫を誘導するためのDNAワクチンに関する。
本明細書における「ヒラメのウイルス性出血性敗血症」とは、ヒラメVHSVの感染により引き起こされるウイスル性出血性敗血症を意味し、従って、ヒラメにおいて発症したウイルス性出血性敗血症が含まれるだけでなく、ヒラメ以外の魚類[例えば、カレイ科若しくはヒラメ科に属する魚種(例えば、カレイ又はヒラメ等)又はアユ若しくはクロダイ等]において発症したウイルス性出血性敗血症が含まれる。
The present invention relates to a DNA vaccine for inducing protective immunity against infectious diseases of fish of the Japanese flounder viral hemorrhagic septicemia virus (Viral Hemorrhagic Septicemia Virus; VHSV).
As used herein, “flounder viral hemorrhagic septicemia” means virulent hemorrhagic sepsis caused by infection with flounder VHSV, and thus not only includes viral hemorrhagic sepsis that developed in flounder, Viral hemorrhagic sepsis developed in fish other than flounder [for example, fish species belonging to the flounder family or the flounder family (for example, flounder or flounder) or sweetfish or black sea bream].
魚介類を代表とする多くの水生生物の養殖産業において、閉鎖系である養殖領域でのウイルス性疾病及び細菌性疾病は、個体が高密度に存在していることから、それらの感染の影響は大きく、養殖産業において深刻な問題となっている。
ウイルス性出血性敗血症は、ヨーロッパ諸国の養殖ニジマスに産業的被害を引き起こすウイルス病として古くから知られている。その原因ウイルスは多くのサケ科魚類や野生の海産魚類から見つかっており、海産養殖を脅かす問題となっている(非特許文献1)。
ウイルス性出血性敗血症ウイルスはラブドウイルス科に属し、エンベロープを持つ一本鎖RNAウイルスである。ウイルス性出血性敗血症の症状は、体色の黒化、眼球の突出、腹部膨満、貧血、体側・鰭基部の出血を呈する。また、肝臓や腎臓の充出血・腫張・褪色、骨格筋の点状出血がみられる(非特許文献2)。更に、病理組織学的には、腎臓の泌尿系と造血組織の壊死、肝臓・脾臓の部分壊死と骨格筋の出血が顕著である。
In the aquaculture industry of many aquatic organisms such as seafood, viral and bacterial diseases in aquaculture areas that are closed systems exist in high density of individuals. It is a big problem in the aquaculture industry.
Viral hemorrhagic sepsis has long been known as a viral disease that causes industrial damage to cultured rainbow trout in European countries. The causative virus has been found in many salmonid fishes and wild marine fishes, and has become a problem that threatens marine aquaculture (Non-Patent Document 1).
Viral hemorrhagic sepsis virus belongs to the Rhabdoviridae family and is an enveloped single-stranded RNA virus. Symptoms of viral hemorrhagic sepsis include body color blackening, eyeball protrusion, abdominal distension, anemia, and hemorrhage of the body side / base. In addition, hepatic and renal fullness / swelling / scarring and skeletal muscle punctate bleeding are observed (Non-patent Document 2). Further, histopathologically, renal necrosis of the urinary system and hematopoietic tissue, partial necrosis of the liver and spleen, and skeletal muscle bleeding are prominent.
1996年3〜5月にかけて、香川県下の海面小割生簀で起きた養殖ヒラメの大量死はウイルス性出血性敗血症によるものであることが明らかになった。これまでサケ科魚類ではウイルス性出血性敗血症は知られているが、海産魚には知られておらず、海産魚ではじめて本症が発症することが明らかになった。その後、ヒラメのウイルス性出血性敗血症は1998年以降、徐々にその発生海域が拡大し、2000年には瀬戸内海沿岸と豊後水道沿岸の複数県のヒラメ養殖場でも発生し、全国的な問題となっている。本症は12月〜5月の水温8〜15℃で発症し、累積死亡率は育成魚で70%を超える場合もあり、小型魚では全滅することかもある。そのため、ヒラメのウイルス性出血性敗血症は持続的養殖生産確保法が施行されて以来、初めての新疾病に位置づけられた(非特許文献3)。また、本明細書に記載されているヒラメのウイルス性出血性敗血症ウイルス株は分類学上これまで知られているサケ科魚類のウイルス株とはグループが異なると考えられている(非特許文献4)。以上のようにヒラメのウイルス性出血性敗血症は産業的に問題になっている重要な疾病である。
また、ほとんどの魚介類用ワクチンが細菌に対して開発されている。しかし、ウイルス性疾患又は寄生性疾患に効果のあるワクチンは、サケ科魚類の一部及びスズキ目のイリドウイルスに対するワクチン(特許文献1)が開発されているのみでほとんど開発されていない。
From March to May 1996, it became clear that the mass death of cultured flounder that occurred in the sea surface split ginger under Kagawa Prefecture was due to viral hemorrhagic sepsis. Until now, viral hemorrhagic sepsis has been known in salmonids, but not in marine fish, and it has been clarified that this disease occurs only in marine fish. Since 1998, flounder viral hemorrhagic septicemia has gradually expanded, and in 2000, it also occurred in flounder farms in several prefectures along the Seto Inland Sea coast and the Bungo Channel coast. It has become. The disease develops at a water temperature of 8-15 ° C from December to May, and the cumulative mortality rate may exceed 70% in breeding fish, and it may be annihilated in small fish. Therefore, Japanese flounder viral hemorrhagic sepsis has been positioned as the first new disease since the enactment of the method for ensuring continuous aquaculture production (Non-patent Document 3). Further, the flounder virus hemorrhagic septic virus strain described in the present specification is considered to have a different group from the salmonid virus strains known in taxonomy (Non-Patent Document 4). ). As described above, flounder viral hemorrhagic sepsis is an important disease which is an industrial problem.
Most seafood vaccines have also been developed against bacteria. However, vaccines that are effective against viral diseases or parasitic diseases have been developed only for vaccines against a part of salmonid fishes and the iridovirus of the perch (Patent Document 1).
ウイルス感染症の予防又は治療には、一般的にワクチンが使用されている。ワクチンには不活化ワクチン(日本脳炎、ワイル病など)、トキソイド(破傷風、ジフテリアなど)、弱毒ワクチン(BCG、ポリオなど)、遺伝子組換えワクチン(B型肝炎ウイルスなど)などがある。不活化ワクチン及び外毒素を無毒化したトキソイドは、これらに対する抗体を誘導する比較的安全なワクチンである。遺伝子組換えワクチンは、不活化ワクチンと比較すると、不純物を含まないので、より安全なワクチンと考えられている。 Vaccines are generally used for the prevention or treatment of viral infections. Vaccines include inactivated vaccines (Japanese encephalitis, Weil disease, etc.), toxoids (tetanus, diphtheria, etc.), attenuated vaccines (BCG, polio, etc.), and genetically modified vaccines (eg, hepatitis B virus). Inactivated vaccines and toxoids detoxified with exotoxins are relatively safe vaccines that induce antibodies against them. Genetically modified vaccines are considered safer because they do not contain impurities when compared to inactivated vaccines.
しかしながら、これらのワクチンにおいて抗体産生は誘導することができるが、細胞性免疫は誘導されにくいのが欠点である。また、不活化ワクチン及び弱毒ワクチンは、抗原となるウイルスを産業的には大量に得ることが必要であり、適当な細胞の確保が必須である。更に、弱毒ワクチンで獲得した免疫効果は、長期間維持される場合が多いが、一方で副作用、危険性が指摘されている。不活化ワクチン及び遺伝子組換えワクチンは、抗原の持続性が宿主内において短いと考えられており、アジュバントなどを必要とする。これら従来型のワクチンは製造から被検体に接種するまでの間、冷蔵保存する必要があるため、コストの増加と効力の低下が生じる問題点があった。 However, antibody production can be induced in these vaccines, but cellular immunity is less likely to be induced. Further, inactivated vaccines and attenuated vaccines need to obtain a large amount of virus as an antigen industrially, and it is essential to secure appropriate cells. Furthermore, the immune effect obtained with the attenuated vaccine is often maintained for a long period of time, but side effects and risks have been pointed out. Inactivated vaccines and genetically modified vaccines are considered to have a short antigen persistence in the host, and require an adjuvant or the like. Since these conventional vaccines need to be refrigerated during the period from production to inoculation of a subject, there are problems in that cost increases and efficacy decreases.
最近、ワクチンの研究開発が進み、免疫原性タンパク質をコードするプラスミドDNAの投与をすることにより、免疫誘発をもたらす新しいワクチン種(DNAワクチン)が開発され、次に述べるような従来型ワクチンの不利益が改善されてきている。すなわち、DNAワクチンは、体液性免疫応答のみならず、細胞性免疫を強力に誘導できるので、感染症に対する防御能を賦与することが可能となること、また、高度に純化できること、室温又は高温下でも安定であり、冷蔵保存は必須でなく長期間の貯蔵が可能であること、遺伝子工学的手法によりDNAワクチンの迅速な改良がし易いこと、及びワクチン開発に費やす時間の短縮などの利点がある。 Recently, research and development of vaccines has progressed, and a new vaccine species (DNA vaccine) that induces immunity has been developed by administering plasmid DNA encoding an immunogenic protein. Profits are improving. In other words, DNA vaccines can induce not only humoral immune responses but also cellular immunity, so that they can provide protection against infections and can be highly purified, at room temperature or at high temperatures. However, it is stable, refrigerated storage is not essential, it can be stored for a long time, it is easy to quickly improve DNA vaccines by genetic engineering techniques, and there are advantages such as shortening the time spent on vaccine development .
ラブドウイルス(Rhabdovirus)の構成タンパク質のグリコプロテインをコードしている遺伝子を筋肉に注射することによって、ニジマスの免疫応答を刺激することが知られている(非特許文献5)。また、ニジマスについてはDNAワクチンの報告もある(非特許文献6)。しかし、他の魚種でDNAワクチンの報告はない。
また、ヒラメのウイルス性出血性敗血症ウイルス感染症に対する防御免疫を刺激するためのワクチンの報告はない。
It is known that the immune response of rainbow trout is stimulated by injecting into the muscle a gene encoding glycoprotein, a constituent protein of Rhabdovirus (Non-patent Document 5). There is also a report on DNA vaccines for rainbow trout (Non-patent Document 6). However, there are no reports of DNA vaccines in other fish species.
Moreover, there is no report of a vaccine for stimulating protective immunity against flounder viral hemorrhagic sepsis virus infection.
本発明の課題は、ヒラメのウイルス性出血性敗血症に対する防御免疫を誘導するための魚類用DNAワクチンを提供することにある。 It is an object of the present invention to provide a fish DNA vaccine for inducing protective immunity against flounder viral hemorrhagic sepsis.
本発明者らは、ヒラメのウイルス性出血性敗血症に対する有効なワクチンを鋭意研究した結果、ヒラメのウイルス性出血性敗血症ウイルス(VHSV)のグリコプロテインをコードする遺伝子を有するプラスミドDNAをヒラメに接種したところ、ヒラメのウイルス性出血性敗血症に対する免疫効果を有すること及び免疫関連遺伝子の発現量が増加することを見出し、本発明が完成した。すなわち、本発明は、
1.ヒラメのウイルス性出血性敗血症ウイルスに対する免疫原性ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むDNA、又は前記DNAを含む発現ベクターを有効成分として含むことを特徴とする、魚類用DNAワクチン、
2.前記免疫原性ポリペプチドが、ヒラメのウイルス性出血性敗血症ウイルスのグリコプロテイン又はその部分断片である、上記1に記載の魚類用DNAワクチン、
3.前記グリコプロテインが、配列番号2で表されるアミノ酸配列からなるポリペプチド又はその部分断片である、上記2に記載の魚類用DNAワクチン、
4.前記免疫原性ポリペプチドが、(1)配列番号2で表されるアミノ酸配列を含むポリペプチド、(2)配列番号2で表されるアミノ酸配列において、1若しくは複数個のアミノ酸が欠失、置換、若しくは付加されたアミノ酸配列を含み、しかも、ヒラメのウイルス性出血性敗血症ウイルスに対する免疫原性を有する改変ポリペプチド、若しくは(3)配列番号2で表されるアミノ酸配列との相同性が80%以上であり、しかも、ヒラメのウイルス性出血性敗血症ウイルスに対する免疫原性を有する相同ポリペプチド、又はそれらの部分断片である、上記1に記載の魚類用DNAワクチン、
5.前記ヌクレオチド配列が、(1)配列番号1で表されるヌクレオチド配列、若しくは(2)配列番号1で表されるヌクレオチド配列との相同性が80%以上であり、しかも、ヒラメのウイルス性出血性敗血症ウイルスに対する免疫原性を有するポリペプチドをコードするヌクレオチド配列、又はそれらの部分配列である、上記1に記載の魚類用DNAワクチン、
6.前記発現ベクターが、受託番号FERM P- 19504のプラスミドpCMV−VHSVgである、上記1に記載の魚類用DNAワクチン、
7.上記1〜6のいずれか一項に記載の魚類用DNAワクチンを魚に投与することを特徴とする、ウイルス性出血性敗血症の予防又は治療方法、
8.前記魚が、カレイ科又はヒラメ科に属する魚である、上記7に記載の方法、並びに
9.上記1〜6のいずれか一項に記載の魚類用DNAワクチンの、ヒラメのウイルス性出血性敗血症に対する免疫応答の誘発への使用
に関するものである。
As a result of intensive research on an effective vaccine against flounder viral hemorrhagic sepsis, the present inventors inoculated flounder with a plasmid DNA having a gene encoding a glycoprotein of flounder viral hemorrhagic septic virus (VHSV). However, the present invention was completed by finding that it has an immune effect against flounder viral hemorrhagic sepsis and that the expression level of immune-related genes increases. That is, the present invention
1. A DNA vaccine for fish, comprising as an active ingredient DNA comprising a nucleotide sequence encoding an immunogenic polypeptide against flounder viral hemorrhagic sepsis virus, or an expression vector comprising said DNA,
2. The DNA vaccine for fish according to the above 1, wherein the immunogenic polypeptide is a glycoprotein of flounder virus hemorrhagic septic virus or a partial fragment thereof,
3. The DNA vaccine for fish according to 2 above, wherein the glycoprotein is a polypeptide consisting of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 or a partial fragment thereof,
4). The immunogenic polypeptide is (1) a polypeptide comprising the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2, and (2) one or more amino acids are deleted or substituted in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2. Or a modified polypeptide comprising an added amino acid sequence and having immunogenicity against the Japanese flounder virus hemorrhagic sepsis virus, or (3) 80% homology with the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 The fish DNA vaccine according to 1 above, which is a homologous polypeptide having immunogenicity against flounder viral hemorrhagic sepsis virus, or a partial fragment thereof,
5). The nucleotide sequence is (1) a nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 1, or (2) a homology with the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 1 is 80% or more, and the flounder viral bleeding The DNA vaccine for fish according to the above 1, which is a nucleotide sequence encoding a polypeptide having immunogenicity against sepsis virus, or a partial sequence thereof,
6). 2. The fish DNA vaccine according to 1 above, wherein the expression vector is the plasmid pCMV-VHSVg of accession number FERM P-19504,
7). A method for preventing or treating viral hemorrhagic sepsis, which comprises administering to a fish the DNA vaccine for fish according to any one of 1 to 6 above,
8). 8. The method according to 7 above, wherein the fish is a fish belonging to the flounder family or the flounder family, and 7. The use of the fish DNA vaccine according to any one of the above 1 to 6 for inducing an immune response against flounder viral hemorrhagic sepsis.
本発明の魚類用DNAワクチンによれば、ヒラメVHSVによるウイルス性出血性敗血症に対する免疫能を付与することができる。より詳細には、本発明の魚類用DNAワクチンによれば、ヒラメVHSVの感染症、あるいは、ヒラメVHSVの感染に起因するウイルス性出血性敗血症に対する免疫応答(体液性免疫応答及び細胞性免疫応答を含む)を誘導することができるので、ヒラメVHSVの感染の予防又は治療、あるいは、前記ウイルス性出血性敗血症の予防又は治療に有効である。例えば、本発明の魚類用DNAワクチンの有効成分として用いることのできるpCMV−VHSVgは、ヒラメでのウイルス性出血性敗血症ウイルス感染防御試験及び免疫関連の遺伝子の発現量の大幅な増加を確認した結果から、DNAワクチンの有効成分として有効であり、ヒラメでのウイルス性出血性敗血症ウイルスの感染の予防に期待ができる。 According to the fish DNA vaccine of the present invention, it is possible to confer immunity against viral hemorrhagic sepsis caused by flounder VHSV. More specifically, according to the fish DNA vaccine of the present invention, an immune response (humoral immune response and cellular immune response against flounder VHSV infection or viral hemorrhagic sepsis caused by flounder VHSV infection). Therefore, it is effective for the prevention or treatment of Japanese flounder VHSV infection or the prevention or treatment of the viral hemorrhagic sepsis. For example, pCMV-VHSVg that can be used as an active ingredient of the fish DNA vaccine of the present invention is a result of confirming a significant increase in the expression level of viral hemorrhagic sepsis virus infection test in flounder and immune-related genes. Therefore, it is effective as an active ingredient of a DNA vaccine, and can be expected to prevent the infection of flounder with viral hemorrhagic sepsis virus.
本発明の魚類用DNAワクチンは、ヒラメのウイルス性出血性敗血症ウイルスに対する免疫原性ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列1つ以上を少なくとも含むDNA構築物である限り、特に限定されるものではないが、本発明の魚類用DNAワクチンには、例えば、
(a)ヒラメのウイルス性出血性敗血症ウイルスに対する免疫原性ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を含むDNA、又は
(b)前記DNA(a)を含む発現ベクター
が含まれる。前記DNA(a)は、免疫原性ポリペプチドの発現に必要な各種の調節配列を更に含むことができ、前記発現ベクター(b)も、前記調節配列を含むことができる。
本明細書において「ヒラメのウイルス性出血性敗血症ウイルスに対する免疫原性ポリペプチド」とは、ヒラメVHSVに対する免疫(体液性免疫及び細胞性免疫を含む)を生体内で誘導することのできるポリペプチドを意味する。
The fish DNA vaccine of the present invention is not particularly limited as long as it is a DNA construct comprising at least one nucleotide sequence encoding an immunogenic polypeptide against flounder viral hemorrhagic sepsis virus. In the fish DNA vaccine of the invention, for example,
(A) DNA containing a nucleotide sequence encoding an immunogenic polypeptide against flounder viral hemorrhagic sepsis virus, or (b) an expression vector containing said DNA (a). The DNA (a) can further include various regulatory sequences necessary for expression of the immunogenic polypeptide, and the expression vector (b) can also include the regulatory sequences.
As used herein, “immunogenic polypeptide against flounder viral hemorrhagic sepsis virus” means a polypeptide capable of inducing immunity against flounder VHSV (including humoral immunity and cellular immunity) in vivo. means.
ヒラメVHSVに対する免疫原性ポリペプチドとしては、ヒラメVHSVに対する免疫(体液性免疫及び細胞性免疫を含む)を生体内で誘導することができるポリペプチドである限り、特に限定されるものではないが、例えば、ラブドウイルス科に属するウイルス(特には、ヒラメVHSV)の構造タンパク質である5つのタンパク質(室賀清邦、江草周三編集、魚病学概論)、すなわち、グリコプロテイン、ヌクレオキャプシドプロテイン、RNA依存的RNA合成酵素、並びにマトリックスプロテインM1及びM2(室賀清邦、江草周三編集、魚病学概論)、並びにそれらの部分断片を挙げることができる。前記免疫原性ポリペプチドとしては、ヒラメVHSVのグリコプロテイン又はその部分断片が好ましく、配列番号2で表されるアミノ酸配列からなるポリペプチド又はその部分断片がより好ましい。 The immunogenic polypeptide against flounder VHSV is not particularly limited as long as it is a polypeptide capable of inducing immunity against flounder VHSV (including humoral immunity and cellular immunity) in vivo. For example, five proteins that are structural proteins of viruses belonging to the Rhabdoviridae family (especially flounder VHSV) (Kurokuni Muraga, Shuzo Egusa, Introduction to Fish Diseases): glycoprotein, nucleocapsid protein, RNA-dependent Mention may be made of RNA synthetases, and matrix proteins M1 and M2 (Kurokuni Muraga, Shuzo Egusa, Introduction to Fish Diseases), and partial fragments thereof. The immunogenic polypeptide is preferably a flounder VHSV glycoprotein or a partial fragment thereof, more preferably a polypeptide consisting of the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 or a partial fragment thereof.
また、前記免疫原性ポリペプチドとしては、更に、(1)配列番号2で表されるアミノ酸配列を含むポリペプチド、(2)配列番号2で表されるアミノ酸配列において、1若しくは複数個のアミノ酸が欠失、置換、若しくは付加されたアミノ酸配列を含み、しかも、ヒラメのウイルス性出血性敗血症ウイルスに対する免疫原性を有する改変ポリペプチド、若しくは(3)配列番号2で表されるアミノ酸配列との相同性が80%以上(好ましくは85%以上、より好ましくは90%以上、更に好ましくは95%以上、最も好ましくは98%以上)であり、しかも、ヒラメのウイルス性出血性敗血症ウイルスに対する免疫原性を有する相同ポリペプチド、又はそれらの部分断片を挙げることができる。 The immunogenic polypeptide further includes (1) a polypeptide comprising the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2, and (2) one or more amino acids in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2. A modified polypeptide having an amino acid sequence deleted, substituted, or added, and having immunogenicity against flounder viral hemorrhagic sepsis virus, or (3) the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2 Homology is 80% or more (preferably 85% or more, more preferably 90% or more, more preferably 95% or more, most preferably 98% or more), and the immunogen against flounder viral hemorrhagic sepsis virus The homologous polypeptide which has sex, or those partial fragments can be mentioned.
本明細書において、改変ポリペプチドとは、配列番号2で表されるアミノ酸配列において、1以上(例えば、1〜数個、好ましくは1〜10個、より好ましくは1〜5個、更に好ましくは1〜3個、更に好ましくは1〜2個、特に好ましくは1個)のアミノ酸の改変(例えば、欠失、置換、及び/又は付加)が生じたタンパク質であって、依然として本発明が適用される魚類に対して免疫を付与することのできるものを意味する。 In the present specification, the modified polypeptide is one or more (for example, 1 to several, preferably 1 to 10, more preferably 1 to 5, more preferably 1) in the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2. 1 to 3, more preferably 1 to 2, particularly preferably 1 amino acid modification (eg, deletion, substitution, and / or addition), and the present invention still applies Means that can immunize fish.
また、本明細書において、アミノ酸配列における相同性とは、2種類のアミノ酸配列をコンピューター解析ソフト(SDCソフトウェア)にて比較解析し、同一種のアミノ酸が同じ位置に存在する場合にアミノ酸が2種類の配列で同一であるとして算出した同一性を意味する。 In this specification, homology in amino acid sequences means that two types of amino acid sequences are compared and analyzed by computer analysis software (SDC software), and two types of amino acids are present when the same type of amino acid is present at the same position. Means the identity calculated as being the same in the sequence.
本発明に用いる、免疫原性ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列としては、これまで挙げた各免疫原性ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列を挙げることができ、例えば、ラブドウイルス科に属するウイルス(特には、ヒラメVHSV)の各構造タンパク質、配列番号2で表されるアミノ酸配列を含むポリペプチド、前記改変ポリペプチド、若しくは前記相同ポリペプチド、又はそれらの部分断片をコードするヌクレオチド配列を挙げることができる。 Examples of the nucleotide sequence encoding the immunogenic polypeptide used in the present invention include nucleotide sequences encoding each of the immunogenic polypeptides listed so far, for example, viruses belonging to the Rhabdoviridae family (particularly, , Flounder VHSV), a polypeptide comprising the amino acid sequence represented by SEQ ID NO: 2, the modified polypeptide, the homologous polypeptide, or a nucleotide sequence encoding a partial fragment thereof.
前記ヌクレオチド配列としては、(1)配列番号1で表されるヌクレオチド配列、若しくは(2)配列番号1で表されるヌクレオチド配列との相同性が80%以上であり、しかも、ヒラメのウイルス性出血性敗血症ウイルスに対する免疫原性を有するポリペプチドをコードするヌクレオチド配列、又はそれらの部分配列が好ましい。なお、本明細書において、ヌクレオチド配列における相同性とは、2種類のヌクレオチド配列をコンピューター解析ソフト(SDCソフトウェア)にて比較解析し、同一種のヌクレオチドが同じ位置に存在する場合にヌクレオチドが2種類の配列で同一であるとして算出した値を意味する。また、前記部分配列の長さは、その部分ヌクレオチド配列によりコードされるポリペプチドが、ヒラメVHSVに対する免疫(体液性免疫及び細胞性免疫を含む)を生体内で誘導することができる限り、特に限定されるものではない。 As the nucleotide sequence, (1) the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 1 or (2) the homology with the nucleotide sequence represented by SEQ ID NO: 1 is 80% or more, and the flounder viral bleeding A nucleotide sequence encoding a polypeptide having immunogenicity against septic virus, or a partial sequence thereof is preferred. In this specification, homology in nucleotide sequence means that two types of nucleotide sequences are compared and analyzed by computer analysis software (SDC software), and two types of nucleotides are present when the same type of nucleotide is present at the same position. Means a value calculated as being identical in the array. The length of the partial sequence is particularly limited as long as the polypeptide encoded by the partial nucleotide sequence can induce immunity against flounder VHSV (including humoral immunity and cellular immunity) in vivo. Is not to be done.
また、免疫原性ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列は、天然由来のものであっても、全合成したものであっても良く、また、天然由来のものの一部を利用して合成を行ったものでもよい。 In addition, the nucleotide sequence encoding the immunogenic polypeptide may be naturally derived or totally synthesized, or synthesized using a part of the naturally derived one. But you can.
本発明に用いる免疫原性ポリペプチド(例えば、グリコプロテイン)をコードするヌクレオチド配列は、例えば、ラブドウイルス科に属するウイルス、具体的にはヒラメのウイルス性出血性敗血症ウイルスから得ることができる。本発明に用いる前記ヌクレオチド配列の典型的な取得方法としては、遺伝子工学の分野で慣用されている方法、例えば、部分アミノ酸配列の情報を基にして作製した適当なDNAプローブを用いて、スクリーニングを行う方法などが挙げられる。 A nucleotide sequence encoding an immunogenic polypeptide (for example, glycoprotein) used in the present invention can be obtained, for example, from a virus belonging to the rhabdoviridae family, specifically a Japanese flounder virus hemorrhagic septicemia virus. A typical method for obtaining the nucleotide sequence used in the present invention is a method commonly used in the field of genetic engineering, for example, screening using an appropriate DNA probe prepared on the basis of partial amino acid sequence information. The method of performing etc. is mentioned.
本発明に用いる発現ベクターは、魚類の細胞内で発現可能なベクターである限り、特に限定されるものではない。本発明に用いる発現ベクターは、自己複製ベクター、すなわち、染色体外の独立体として存在し、その複製が染色体の複製に依存しない、例えば、プラスミドを基本に構築することができる。また、前記発現ベクターは、宿主に導入されたとき、その宿主のゲノム中に取り込まれ、それが組み込まれた染色体と一緒に複製されるものであってもよい。本発明に用いることのできる発現ベクターの構築の手順及び方法は、遺伝子工学の分野で慣用されているものを用いることができる。 The expression vector used in the present invention is not particularly limited as long as it is a vector that can be expressed in fish cells. The expression vector used in the present invention can be constructed on the basis of a self-replicating vector, that is, as an extrachromosomal independent substance, and its replication does not depend on chromosomal replication, for example, a plasmid. In addition, the expression vector may be incorporated into the genome of the host when it is introduced into the host and replicated together with the chromosome into which it has been integrated. As a procedure and method for constructing an expression vector that can be used in the present invention, those commonly used in the field of genetic engineering can be used.
本発明で用いることのできる転写調節配列としては、例えば、構成プロモーター、誘導性又は調節性プロモーター、組織特異的プロモーター、又は発現されている抗原の遺伝子由来のプロモーター等が挙げられるが、魚類の細胞内で発現可能である限り、特にそれらに限定されない。構成プロモーターとしては、例えば、サイトメガロウイルス(CMV)由来のプロモーター配列、又はラウス肉腫ウイルス(RSV)、シミアンウイルス−40(SV-40)、筋βアクチンプロモーター、又は単純ヘルペスウイルス(HSV)などの強力プロモーター等が挙げられる。組織特異的プロモーターとしては、例えば、チミヂンキナーゼプロモーター等が挙げられる。誘導性又は調節性プロモーターとしては、例えば、成長ホルモン調節性プロモーター、lacオペロン配列の制御下にあるプロモーター、又は亜鉛誘導性メタロチオネインプロモーターを挙げることができる。前記転写調節配列は、免疫原性ポリペプチドをコードするヌクレオチド配列に、操作可能に(すなわち、前記ヌクレオチド配列の発現を調節することができるように)結合させることができる。 Examples of transcriptional regulatory sequences that can be used in the present invention include constitutive promoters, inducible or regulatory promoters, tissue-specific promoters, promoters derived from the genes of expressed antigens, and the like. As long as it can be expressed in the cell, it is not particularly limited thereto. Examples of the constitutive promoter include a promoter sequence derived from cytomegalovirus (CMV), or rous sarcoma virus (RSV), simian virus-40 (SV-40), muscle β-actin promoter, or herpes simplex virus (HSV). Examples include strong promoters. Examples of the tissue-specific promoter include a thymidine kinase promoter. Inducible or regulatable promoters include, for example, growth hormone regulatable promoters, promoters under the control of the lac operon sequence, or zinc inducible metallothionein promoters. The transcriptional regulatory sequence can be operably linked to a nucleotide sequence encoding an immunogenic polypeptide (ie, so that expression of the nucleotide sequence can be regulated).
前記調節配列は、プロモーター(例えば、前記誘導性又は構成性プロモーター)DNA配列を含む発現制御配列を含むことができ、所望により、更に、エンハンサー要素、転写又はポリアデニル化シグナル[例えば、シミアンウイルス−40(SV−40)又はウシ成長ホルモン由来]のスプライシングのためのイントロン配列、又はCpGモチーフとして知られている免疫刺激DNA配列のうち、1つ若しくはそれ以上のコピーを含むことができる。 The regulatory sequence can include an expression control sequence including a promoter (eg, the inducible or constitutive promoter) DNA sequence, optionally further comprising an enhancer element, transcription or polyadenylation signal [eg, simian virus-40. One or more copies of the intron sequence for splicing (derived from (SV-40) or bovine growth hormone), or the immunostimulatory DNA sequence known as the CpG motif may be included.
また、発現ベクターは、所望により、例えば、細菌複製起点配列、あるいは、選別させるための抗生物質耐性(例えば、カナマイシンなど)遺伝子又は非抗生物質耐性遺伝子(例えば、β−ガラクトシダーゼ遺伝子など)等の選択性マーカーを含むことができる。 In addition, the expression vector may be selected, for example, from a bacterial replication origin sequence, or an antibiotic resistance (eg, kanamycin) gene or a non-antibiotic resistance gene (eg, β-galactosidase gene) for selection. Sex markers can be included.
非メチル化CpGヌクレオチドを有するオリゴヌクレオチドは、免疫系を活性化することが知られている(A. Krieg et al.、Nature, 1995, 374, 546-549)。フランキング配列に依存して、或るCpGモチーフはB細胞又はT細胞応答に対してより免疫刺激的であり、優先的にある種を刺激する。DNA発現ベクターにおけるCpGモチーフのコピーは、発現タンパク質に対する免疫応答を誘発するアジュバントとして作用する。CpGモチーフ、すなわち、特異化された配列内のCpGジヌクレオチドを含むDNA伸長部は、長さが5〜40塩基対程度から選ぶことができる。複数のCpGモチーフが、発現ベクターの非コード領域に挿入されてもよい。体液性応答が所望であるとき、好ましいCpGモチーフはCD8+T細胞応答を刺激することが知られているサイトカインの分泌を刺激するCpGモチーフである。 Oligonucleotides with unmethylated CpG nucleotides are known to activate the immune system (A. Krieg et al ., Nature, 1995, 374, 546-549). Depending on the flanking sequence, certain CpG motifs are more immunostimulatory to B cell or T cell responses and preferentially stimulate certain species. The copy of the CpG motif in the DNA expression vector acts as an adjuvant that elicits an immune response against the expressed protein. A DNA extension comprising a CpG motif, ie, a CpG dinucleotide within the specified sequence, can be selected from about 5-40 base pairs in length. Multiple CpG motifs may be inserted into non-coding regions of the expression vector. When a humoral response is desired, a preferred CpG motif is a CpG motif that stimulates secretion of cytokines known to stimulate CD8 + T cell responses.
本発明を適応することができる魚類としては、ヒラメVHSVが感染する可能性のある魚類である限り、特に限定されるものではないが、例えば、カレイ科若しくはヒラメ科に属する魚種(例えば、カレイ又はヒラメ等)又はアユ若しくはクロダイなどが挙げられる。 The fish to which the present invention can be applied is not particularly limited as long as it is a fish that can be infected by flounder VHSV. For example, fish species belonging to the flounder family or the flounder family (for example, flounder) Or flounder etc.) or sweetfish or black sea bream.
DNAワクチンの接種法は、例えば、経口投与、筋肉内注射、腹腔内注射、遺伝子銃を用いた投与及び液浸が挙げられるが、好ましくは筋肉内注射、遺伝子銃を用いた投与である。遺伝子銃を用いた投与とは、プラスミドを1μm程の大きさの金粒子にコーティングし、高圧ヘリウムガスを用い、専用の器具で被検体の皮膚、細胞又は組織に空気銃の要領で撃ち込む方法である。この遺伝子銃による投与は、筋肉内注射と比較し、100〜1000分の1のDNA量で、同等の免疫効果を挙げることができる点、筋肉内注射と比較し再現性に優れている点などの優れた特徴を有している。 Examples of the DNA vaccine inoculation method include oral administration, intramuscular injection, intraperitoneal injection, administration using a gene gun, and immersion, and intramuscular injection and administration using a gene gun are preferable. Administration using a gene gun is a method in which a plasmid is coated with gold particles of about 1 μm in size, and high-pressure helium gas is used to shoot the skin, cells, or tissues of the subject with a special instrument in the manner of an air gun. is there. Compared with intramuscular injection, this gene gun can provide the same immune effect with 100 to 1000 times less DNA, and it has better reproducibility than intramuscular injection. It has excellent characteristics.
また、アジュバントは、免疫系を刺激して抗原に対する免疫反応を高めるものであり、主にワクチンに補助剤として添加される。代表的なアジュバントとしては、例えば、アルミニウム化合物、ポリヌクレオチド又は細菌の菌体成分などが知られているが、これらの中には本発明に適用するには充分な効果が得られないものも多い。特に、アジュバントの作用は抗原物質に広く有効であるため、抗原に含まれる不純物の抗原刺激性を増強したり、有害な副作用を生ずる危険もあり、使用する抗原の純度に充分な配慮をする必要があるなどの問題がある。そのような中で、例えばIL-1βはアジュバントとして有効であることが報告されている(J. Y. Scheerlinck, Genetic adjuvants for DNA Vaccine, 19, 2647-2656, 2001)。本発明においては、魚類(例えばヒラメなど)の体内で発現可能なようにIL-1β遺伝子を挿入したプラスミドを作製し、本発明のワクチンとともに魚類に接種することができる。 Adjuvants stimulate the immune system and enhance the immune response to antigens, and are mainly added as adjuvants to vaccines. As typical adjuvants, for example, aluminum compounds, polynucleotides or bacterial cell components are known, but there are many of these that do not provide sufficient effects for application to the present invention. . In particular, since the action of an adjuvant is widely effective for antigenic substances, there is a risk of enhancing the antigenic stimulation of impurities contained in the antigen and causing harmful side effects, and it is necessary to give due consideration to the purity of the antigen used. There are problems such as. Among them, for example, IL-1β has been reported to be effective as an adjuvant (J. Y. Scheerlinck, Genetic adjuvants for DNA Vaccine, 19, 2647-2656, 2001). In the present invention, a plasmid into which IL-1β gene has been inserted so that it can be expressed in the body of fish (eg, flounder) can be prepared and inoculated into fish together with the vaccine of the present invention.
免疫機構は、様々な役割を担った細胞が相互に機能調節を行いながら、多様な生理機能を発揮している。生体防御に重要な役割を担っている因子であるT細胞及びB細胞の細胞表面上に存在しているT細胞抗原レセプター(TCR)、主要組織適合性複合体(MHC)、又は免疫グロブリン(Ig)の発現量を指標に、免疫システムの活性化を調べることが可能である。本発明においては、例えば、ヒラメのウイルス性出血性敗血症に対するDNAワクチンをヒラメに接種後、魚体内における生体防御機構の活性化について解析するため、例えば、TCR、MHC、及びIgの発現量の変化についてリアルタイムPCRを行い定量的に確認し、免疫システムの活性化を調べることができる。 The immune mechanism exerts a variety of physiological functions while cells that play various roles mutually regulate the function. T cell antigen receptor (TCR), major histocompatibility complex (MHC), or immunoglobulin (Ig) present on the cell surface of T cells and B cells, factors that play an important role in host defense It is possible to examine the activation of the immune system using the expression level of In the present invention, for example, in order to analyze the activation of the biological defense mechanism in the fish after inoculating the flounder with a DNA vaccine against flounder viral hemorrhagic sepsis, for example, changes in the expression level of TCR, MHC, and Ig Real-time PCR can be quantitatively confirmed for the activation of the immune system.
リアルタイムPCRとは、PCRによる遺伝子の増幅の過程を蛍光検知装置により、リアルタイムで追跡し、そのPCR反応曲線をプロファイリングする検出技術である。検査対象の検体がPCRにより増幅された場合、指数増加カーブに到達するPCRサイクル数を検査すれば、正確なDNA量を計算することが可能となる。リアルタイムPCRには、例えば、Perkin-Elmer社製のTaqMan、BioRad社製のiCyclerを用い行うことができる。 Real-time PCR is a detection technique for profiling the PCR reaction curve by tracking the gene amplification process by PCR in real time using a fluorescence detector. When the sample to be examined is amplified by PCR, it is possible to calculate an accurate DNA amount by examining the number of PCR cycles that reach the exponential increase curve. For real-time PCR, for example, TaqMan manufactured by Perkin-Elmer or iCycler manufactured by BioRad can be used.
リアルタイムPCRでは、リアルタイムPCR用(SG)及び標準DNA用(SG200)の二種類のプライマーを用いる。リアルタイムPCR用(SG)は、アンプリコンは短め(60〜100 bp)でGC含量が少なくなるよう設計する。3' UTR部分にプライマーを作製すると、比較的容易で、かつ正確に遺伝子特異的プライマーを設計することができる。また、ソフト(例えば、primer express;PEバイオシステムジャパン株式会社)を使ってコンピュータ上でも設計する方法もある。リアルタイムPCRで設計したプライマーの外側に標準DNA用プライマー(SG200)を設計する。遺伝子同士を比較したい場合、アンプリコンは揃えるのが望ましい。 In real-time PCR, two types of primers for real-time PCR (SG) and standard DNA (SG200) are used. For real-time PCR (SG), the amplicon should be designed to be short (60-100 bp) and low GC content. Generating a primer in the 3 ′ UTR portion makes it possible to design a gene-specific primer relatively easily and accurately. There is also a method of designing on a computer using software (for example, primer express; PE Biosystems Japan). A standard DNA primer (SG200) is designed outside the primer designed by real-time PCR. If you want to compare genes, it is desirable to have amplicons.
標準DNAの調製は、まず測定したい遺伝子それぞれに対し特異的なプライマー(SG200)を用い、全量 50μLのPCRをプラトーに達するまで反応させる(PCRは95℃で2分間処理後、次いで95℃で30秒間、55℃で30秒間、72℃で1分間を1サイクルとする処理を30回行う)。その後、PCR産物をカラム(例えば、Microcon-PCR Centrifugal Filter Devices;MILLIPORE社製)を用い余分なプライマーを除去し、濃度を測る。アボガドロ定数(1mol=6.022 × 1023molecules)よりコピー数を算出する。次いで、PCR産物は21段階の希釈系列(コピー数1013〜10-7)を作り、内側に設計したプライマー(SG)を用いて再度PCRを行う。この際、増幅が指数関数的に起こる様、サイクル数は14サイクルで行う。このようにして得たPCR産物をアガロースゲル電気泳動し、バンドが全く見えなくなってからの5段階が指数関数的に増幅しているため、この5段階を標準DNAとして実際のリアルタイムPCRに用いる。
For preparation of standard DNA, first use a primer (SG200) specific to each gene to be measured, and react a total volume of 50 μL of PCR until it reaches a plateau (PCR is treated at 95 ° C. for 2 minutes, then at 95 ° C. for 30 minutes For 30 seconds at 55 ° C for 30 seconds and 72 ° C for 1 minute). Thereafter, the PCR product is removed using a column (for example, Microcon-PCR Centrifugal Filter Devices; manufactured by MILLIPORE), the excess primer is removed, and the concentration is measured. The copy number is calculated from the Avogadro constant (1 mol = 6.022 × 10 23 molecules). Next, the PCR product makes a 21-step dilution series (
以下、実施例によって本発明を具体的に詳述するが、本発明はこれらに限定されるものではない。 EXAMPLES Hereinafter, although an Example demonstrates this invention concretely in detail, this invention is not limited to these.
実施例1:ヒラメのウイルス性出血性敗血症ウイルス(VHSV)由来グリコプロテイン遺伝子の単離
(1)PCRプライマーの作製
J.R. Winton and K. Einer-Jensen又はP. Ahrens and K. Einer-Jensenによって報告されているニジマスのウイルス性出血性敗血症ウイルスのグリコプロテイン遺伝子(GenBank= AF345857)のアミノ酸配列を元に、対応するDNAの塩基配列から下記のPCRプライマーを、常法に従い、作製した。
VHSV-glys: 5-TTTGCTAGCATGGAATGGAATACTTTTTTCTTG-3(配列番号3)
VHSV-glya: 5-TTTGAATTCTCAGACCATCTGACTTCTGG-3 (配列番号4)
Example 1: Isolation of a glycoprotein gene derived from Japanese flounder viral hemorrhagic sepsis virus (VHSV) (1) Preparation of PCR primers
Corresponding DNA based on the amino acid sequence of the rainbow trout viral hemorrhagic sepsis virus glycoprotein gene (GenBank = AF345857) reported by JR Winton and K. Einer-Jensen or P. Ahrens and K. Einer-Jensen From the base sequence, the following PCR primers were prepared according to a conventional method.
VHSV-glys: 5-TTTGCTAGCATGGAATGGAATACTTTTTTCTTG-3 (SEQ ID NO: 3)
VHSV-glya: 5-TTTGAATTCTCAGACCATCTGACTTCTGG-3 (SEQ ID NO: 4)
(2)cDNAの単離
市販のL-15培地(インビトロジェン株式会社)に、20%となるようにウシ胎児血清(FBS)を加え、ペニシリン及びストレプトマイシンの終濃度がそれぞれ100units/mLと100μg/mLとなるように調整した後、この培地にてEPC細胞[Fijian, N. D. Sulimanavois et al., Some properties of the epithelioma papulosum cyprini (EPC) cell line from carp Cyprinus carpio. Annual Viology, 134E, 207-220, 1983]を20℃で培養した。コンフルエントとなるまで培養したEPC細胞に、−80℃で保管しておいたヒラメのウイルス性出血性敗血症ウイルスkrrv 9822株(Nishizawa et al. Dis.Aquat.Org.2002.48.143-148)を感染させた。krrv 9822株のEPC細胞への感染後、2〜7日でCPE(Cytopathic Effect)を観察することができる。
(2) Isolation of cDNA Add fetal bovine serum (FBS) to a commercially available L-15 medium (Invitrogen Corporation) to 20%, and the final concentrations of penicillin and streptomycin are 100 units / mL and 100 μg / mL, respectively. EPC cells [Fijian, ND Sulimanavois et al., Some properties of the epithelioma papulosum cyprini (EPC) cell line from carp Cyprinus carpio . Annual Viology, 134E, 207-220, 1983 ] Was cultured at 20 ° C. EPC cells cultured to confluence were infected with flounder viral hemorrhagic sepsis virus krrv 9822 strain (Nishizawa et al . Dis. Aquat. Org. 2002.48.143-148) stored at -80 ° C. It was. CPE (Cytopathic Effect) can be observed 2 to 7 days after infection of EPC cells with krrv 9822 strain.
krrv 9822株の培養液(1.0x108TCID50/mL)150μL及びTRIzol(GIBCO社製)1mLを混和し、5分間室温に静置した。次にクロロホルム200μLを加えよく混和し、室温で5分間静置した後、遠心分離(15,000rpm、4℃、5分間)を行い、上層を新しい遠心管に移した。上層に対して等量のイソプロピルアルコールを加え、10分間室温に放置した。遠心分離後(15,000rpm、10分間)、上層を捨てペレット状態となったゲノミックRNAを乾燥させ、ジエチルピロカルボネート(DEPC)処理水10μLに溶解した。 150 μL of krrv 9822 strain culture solution (1.0 × 10 8 TCID 50 / mL) and 1 mL of TRIzol (GIBCO) were mixed and allowed to stand at room temperature for 5 minutes. Next, 200 μL of chloroform was added and mixed well, allowed to stand at room temperature for 5 minutes, then centrifuged (15,000 rpm, 4 ° C., 5 minutes), and the upper layer was transferred to a new centrifuge tube. An equal amount of isopropyl alcohol was added to the upper layer and left at room temperature for 10 minutes. After centrifugation (15,000 rpm, 10 minutes), the upper layer was discarded and the pelleted genomic RNA was dried and dissolved in 10 μL of diethylpyrocarbonate (DEPC) -treated water.
このように抽出したゲノミックRNAから、市販のcDNA合成キット(cDNA SYNTHESIS KIT 1st STRAND with AMV Reverse Transcriptase;宝酒造社製)により、添付の操作方法に従ってcDNAを合成した。このcDNAを鋳型に、実施例1(1)で作製したPCRプライマーを用いて、常法に従いPCRを行なった。PCRは、添付の10xbuffer 5μL、dNTP 4μL、VHSV -glys 1μL(25pmol/μL)、VHSV-glya 1μL(25pmol/μL)、DNAポリメラーゼ0.5μL(5units/μL)、cDNA 3μL(10ng)、及び滅菌水35.5μLで50μLに調製後、95℃で5分間処理後、次いで95℃で30秒間、55℃で30秒間、及び72℃で2分間を1サイクルとする処理を30回施した後、72℃で2分間処理するという反応条件で行った。得られたPCR産物をアガロースゲル電気泳動した結果、約1.5kbp程のDNA断片が増幅されていたことを目視にて確認した。 From thus extracted genomic RNA, commercially available cDNA synthesis kit; by (cDNA SYNTHESIS KIT 1 st STRAND with AMV Reverse Transcriptase Takara Shuzo Co., Ltd.), cDNA was synthesized according to the attached method of operation. Using this cDNA as a template, PCR was performed according to a conventional method using the PCR primer prepared in Example 1 (1). PCR included 10xbuffer 5μL, dNTP 4μL, VHSV-glys 1μL (25 pmol/μL), VHSV-glya 1μL (25 pmol/μL), DNA polymerase 0.5μL (5units / μL), cDNA 3μL (10ng), and sterile water 35.5μL to 50μL, treated at 95 ° C for 5 minutes, then treated 30 times at 95 ° C for 30 seconds, 55 ° C for 30 seconds, and 72 ° C for 2 minutes, then 72 ° C For 2 minutes. As a result of agarose gel electrophoresis of the obtained PCR product, it was visually confirmed that a DNA fragment of about 1.5 kbp was amplified.
(3)DNA塩基配列の解析
その増幅されたDNA断片をpGEM-T Eazyベクター (プロメガ社製)へと挿入し、蛍光標識されたM13プライマー(日清紡績社製)及び市販のシークエンスキット(Thermo Sequence Fluorescent Labeled Primer Cycle Sequencing Kit with 7-deaza-dGTP;amersham pharmacia bitech社製) を用いてダイデオキシ法(Dideoxy method)でサンプルを作成した後、DNAシークエンサー(DNA sequencer model 4000;LI-COR社製)を用いて塩基配列を決定した。この配列を解析したところ、PCRで増幅されたDNA断片は、1524bpからなるオープンリーディングフレーム(ORF)が存在した(配列番号1)。このORFから予測されるタンパク質は、507アミノ酸残基であり、相同性検索(FASTA)を行なった結果、J.R. Winton and K. Einer-JensenまたはP. Ahrens and K. Einer-Jensenによって報告されているニジマスのウイルス性出血性敗血症ウイルスのグリコプロテイン遺伝子(GenBank= AF345857)のDNA塩基配列との相同性は85.6%であり、アミノ酸配列との相同性は91.5%であった。また、S.M. Kim and S.I. Parkによって報告されているヒラメのウイルス性出血性敗血症ウイルスのグリコプロテイン遺伝子(GenBank= AY167587)のDNA塩基配列との相同性は99.0%であり、アミノ酸配列との相同性は98.6%であった。以下、得られた、ヒラメのウイルス性出血性敗血症ウイルスのグリコプロテインを「VHSVg」と称することがある。
(3) Analysis of DNA base sequence The amplified DNA fragment was inserted into a pGEM-T Eazy vector (Promega), a fluorescently labeled M13 primer (Nisshinbo Co., Ltd.) and a commercially available sequence kit (Thermo Sequence). Fluorescent Labeled Primer Cycle Sequencing Kit with 7-deaza-dGTP (manufactured by amersham pharmacia bitech) was used to prepare a sample by the dideoxy method and then a DNA sequencer (DNA sequencer model 4000; manufactured by LI-COR) Was used to determine the base sequence. When this sequence was analyzed, the DNA fragment amplified by PCR had an open reading frame (ORF) consisting of 1524 bp (SEQ ID NO: 1). The protein predicted from this ORF is 507 amino acid residues, and as a result of homology search (FASTA), reported by JR Winton and K. Einer-Jensen or P. Ahrens and K. Einer-Jensen The homology of the rainbow trout viral hemorrhagic septic virus glycoprotein gene (GenBank = AF345857) with the DNA base sequence was 85.6%, and the homology with the amino acid sequence was 91.5%. In addition, the homology with the DNA sequence of the glycoprotein gene (GenBank = AY167587) of Japanese flounder viral hemorrhagic septic virus reported by SM Kim and SI Park is 99.0%, and the homology with the amino acid sequence is It was 98.6%. Hereinafter, the resulting glycoprotein of Japanese flounder virus hemorrhagic septic virus may be referred to as “VHSVg”.
実施例2:プラスミドpCMV−VHSVgの作製
実施例1(3)のDNA塩基配列の解析で用いたプラスミドをEcoRI及びNhe Iで処理した。そして、pGEM-T Easyベクターから切り出された実施例1(2)で得られたkrrv 9822株由来のグリコプロテイン遺伝子を、pCDNA3.1ベクター (インビトロジェン社製)のヒトサイトメガロウイルス由来のプロモーター領域がコードされている配列の下流に位置するマルチクローニングサイトのEcoRI及びNhe I認識部位へ挿入し、プラスミドpCMV−VHSVgを作製した。なお、pCMV−VHSVgは、2003年(平成15年)8月29日に独立行政法人産業技術総合研究所特許生物寄託センター(あて名:〒305-8566 日本国茨城県つくば市東1丁目1番地1 中央第6)に国内寄託されたものであり、その受託番号は、FERM P- 19504である。
Example 2: Construction of plasmid pCMV-VHSVg The plasmid used in the analysis of the DNA base sequence of Example 1 (3) was treated with Eco RI and Nhe I. The glycoprotein gene derived from the krrv 9822 strain obtained in Example 1 (2) excised from the pGEM-T Easy vector is replaced with the human cytomegalovirus-derived promoter region of the pCDNA3.1 vector (Invitrogen). The plasmid pCMV-VHSVg was constructed by inserting into the Eco RI and Nhe I recognition sites of the multicloning site located downstream of the encoded sequence. In addition, pCMV-VHSVg is the National Institute of Advanced Industrial Science and Technology Patent Biological Deposit Center on August 29, 2003 (Address: 1 1 Higashi 1-chome, Tsukuba City, Ibaraki, Japan 305-8566, Japan No. 6) was deposited domestically and its deposit number is FERM P-19504.
実施例3:グリコプロテイン遺伝子の発現確認
COS細胞(理研バイオリソースセンター)にpCMV−VHSVgを市販のトランスフェクション試薬(EffecteneTM Transfection Reagent;QIAGEN社製) を用いてトランスフェクションした後、48時間間培養した。次に、培養した細胞を遠心管に集め、遠心分離(3,000rpm、5分間)し、培地のみを捨て、実施例1(2)と同様の方法で培養細胞の総RNAを抽出し、RT-PCRを行った。その結果、グリコプロテイン遺伝子が発現していることを確認した。更に、市販の転写翻訳系(TnT Quick Coupled Transcription/Translation system;promega) を用いてVHSVgの分子量を確認した。
Example 3: Confirmation of glycoprotein gene expression
CCM cells (RIKEN BioResource Center) were transfected with pCMV-VHSVg using a commercially available transfection reagent (Effectene ™ Transfection Reagent; manufactured by QIAGEN), and then cultured for 48 hours. Next, the cultured cells are collected in a centrifuge tube, centrifuged (3,000 rpm, 5 minutes), the medium alone is discarded, and the total RNA of the cultured cells is extracted in the same manner as in Example 1 (2). PCR was performed. As a result, it was confirmed that the glycoprotein gene was expressed. Furthermore, the molecular weight of VHSVg was confirmed using a commercially available transcription translation system (TnT Quick Coupled Transcription / Translation system; promega).
図1に、グリコプロテイン遺伝子の発現の確認した結果を示し、図2に、VHSVgの分子量を確認した結果を示す。
図1における各レーンは以下のとおりである:
レーン1:λ DNAを制限酵素HindIIIで処理した分子サイズマーカー
レーン2:pCMV−VHSVgで形質転換したCOS細胞
レーン3:pCDNAベクターで形質転換したCOS細胞(対照)
レーン4:未処理COS細胞
レーン5:100bp DNAマーカー
また、図2における各レーンは以下のとおりである:
レーンM:広範囲分子サイズマーカー
レーン1:pCMV−VHSVg
レーン2:pCDNA3.1ベクター
FIG. 1 shows the result of confirming the expression of the glycoprotein gene, and FIG. 2 shows the result of confirming the molecular weight of VHSVg.
Each lane in FIG. 1 is as follows:
Lane 1: Molecular size marker obtained by treating λ DNA with restriction enzyme Hind III Lane 2: COS cell transformed with pCMV-VHSVg Lane 3: COS cell transformed with pCDNA vector (control)
Lane 4: untreated COS cells Lane 5: 100 bp DNA marker Each lane in FIG. 2 is as follows:
Lane M: Wide molecular size marker Lane 1: pCMV-VHSVg
Lane 2: pCDNA3.1 vector
実施例4:pCMV−VHSVgのヒラメへの導入
ヒラメ一尾当たり10.0μgのpCMV−VHSVgをリン酸緩衝化生理食塩水(PBS)50μLとともに、27Gの注射針を装着した注射器を用いて筋肉へと接種した。
Example 4: Introduction of pCMV-VHSVg into flounder 10.0 μg of pCMV-VHSVg per flounder together with 50 μL of phosphate buffered saline (PBS) and into a muscle using a syringe equipped with a 27G needle Vaccinated.
実施例5:ヒラメに対する感染防御試験
各試験区には、ヒラメ稚魚(全長約5cm、平均魚体重2g)を用いた。試験魚は、60Lの水槽で、ろ過処理した天然海水を循環して飼育し、平均水温13.0℃で飼育した。
まず、実施例4の方法に準じて、pCMV−VHSVg 10.0μg、コントロールとしてPBS 50μL、pCDNA3.1ベクター10.0μg、又はホルマリンによって不活化したVHSV(1.0 × 102TCID50/魚)をそれぞれヒラメへ接種した。その接種の30日後に、実施例1(2)の条件と同様にEPC細胞(L-15培地+20%FBS)で培養したkrrv9822株培養上澄を、1.0 × 102TCID50/50μL又は1.0 × 103TCID50/50μLまで希釈した濃度で、ヒラメ1尾当り50μLを腹腔内注射により接種した。感染防御試験を行なった区画は、次の通りである。
試験区1:pCMV−VHSVg+1.0 × 102TCID50krrv 9822株/ヒラメ1尾
試験区2:pCDNA3.1ベクター+1.0 × 102TCID50krrv 9822株/ヒラメ1尾
試験区3:PBS+1.0 × 102TCID50krrv 9822株/ヒラメ1尾
試験区4:ホルマリン不活化VHSV+1.0 × 102TCID50krrv 9822株/ヒラメ1尾
試験区5:pCMV−VHSVg+1.0 × 103TCID50krrv 9822株/ヒラメ1尾
試験区6:pCDNA3.1ベクター+1.0 × 103TCID50krrv 9822株/ヒラメ1尾
試験区7:PBS+1.0 × 103TCID50krrv 9822株/ヒラメ1尾
試験区8:ホルマリン不活化VHSV+5 × 103TCID50krrv 9822株/ヒラメ1尾
Example 5: Infection protection test against flounder In each test section, flounder larvae (total length: about 5 cm, average fish weight: 2 g) were used. The test fish were bred in a 60 L water tank by circulating natural filtered seawater and bred at an average water temperature of 13.0 ° C.
First, according to the method of Example 4, pCMV-VHSVg 10.0 μg, PBS 50 μL as a control, pCDNA3.1 vector 10.0 μg, or VHSV (1.0 × 10 2 TCID 50 / fish) inactivated by formalin were each transferred to flounder. Vaccinated. 30 days after the inoculation, the culture supernatant of krrv9822 strain cultured in EPC cells (L-15 medium + 20% FBS) in the same manner as in Example 1 (2) was added at 1.0 × 10 2 TCID 50/50 μL or 1.0 50 μL per flounder was inoculated by intraperitoneal injection at a concentration diluted to × 10 3 TCID 50/50 μL. The compartments where the infection protection test was conducted are as follows.
Test group 1: pCMV-VHSVg + 1.0 × 10 2 TCID 50 krrv 9822 strain /
krrv 9822株感染後、ヒラメを2週間観察し続け、試験区1〜試験区8のヒラメの累積死亡率(死亡個体数/試験個体数)×100(%)を算出し、その結果を1.0 × 102TCID50/50μL感染群(試験区1〜4)及び1.0 × 103TCID50/50μL感染群(試験区5〜8)に分けて図3及び図4並びに表1に示す。なお、表における「RPS」は、relative percent survivalの略であり、以下の計算式で算出する:
RPS={1−(X/C)}×100
[式中、記号Xは「%ワクチン接種区の死亡率」であり、Cは「%陰性コントロール区の死亡率」である]
ワクチンの効果は、その比較によって判定した。
その結果、試験区2、3、及び4は、それぞれ約96、73、及び91%累積死亡率であるのに対して、試験区1のそれは約5%であった。また、試験区6、7、及び8はそれぞれ約95、100、及び90%累積死亡率であるのに対して、試験区5のそれは約0%であったことから、krrv 9822株感染に対するpCMV−VHSVgの感染防御の有効性、すなわち、ワクチン効果が明らかとなった。
Continue to observe flounder for 2 weeks after infection with krrv 9822 strain, and calculate cumulative mortality (number of dead / number of tested individuals) x 100 (%) of flounder in
RPS = {1- (X / C)} × 100
[In the formula, the symbol X is “% mortality in the vaccination group” and C is “mortality in the% negative control group”]
The effectiveness of the vaccine was determined by comparison.
As a result,
本発明のDNAワクチンは、ヒラメのウイルス性出血性敗血症の予防又は治療の用途に適用することができる。 The DNA vaccine of the present invention can be applied for use in the prevention or treatment of Japanese flounder viral hemorrhagic sepsis.
以下の配列表の数字見出し<223>には、「Artificial Sequence」の説明を記載する。具体的には、配列番号3で表される塩基配列は、プライマーVHSV-glysであり、配列番号4で表される塩基配列は、プライマーVHSV-glyaである。 The numerical heading <223> in the sequence listing below describes the “Artificial Sequence”. Specifically, the base sequence represented by SEQ ID NO: 3 is primer VHSV-glys, and the base sequence represented by SEQ ID NO: 4 is primer VHSV-glya.
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