【特許請求の範囲】
【請求項１】 非コロイド構造に関して固定化されるための能力をコロイド粒子に与えること；および
非コロイド構造へのコロイド粒子の固定化を測定することを包含する方法。
[Claims]
1. A method comprising: providing a colloid particle with the ability to be immobilized with respect to a non-colloid structure; and measuring the immobilization of the colloid particle to the non-colloid structure.
当業者は、本明細書に記載のすべてのパラメータは例示的なものであって、実際のパラメータは本発明が使用される方法および装置についての具体的な用途に依存することを容易に理解するであろう。したがって、先の態様は実施例のためだけに提示されること、および添付の請求項およびそれらと同等のものの範囲内で、具体的な記載とは異なって本発明が実行されてもよいということを理解するべきである。
[請求項１] 非コロイド構造に関して固定化されるための能力をコロイド粒子に与えること；および
非コロイド構造へのコロイド粒子の固定化を測定することを包含する方法。
[請求項２] コロイド粒子が補助的なシグナル伝達実体を包含する、請求項１に記載の方法。
[請求項３] 補助的なシグナル伝達実体が、染料、色素、電気活性分子、化学ルミネッセンス部分、電気化学ルミネッセンス部分、蛍光部分、アップレギュレートしている蛍光体、またはホースラディッシュペルオキシダーゼおよびアルカリホスファターゼを包含する酵素結合シグナル伝達部分を包含する請求項２に記載の方法。
[請求項４] シグナル伝達実体がメタロセンを包含する、請求項３に記載の方法。
[請求項５] シグナル伝達実体がフェロセンまたはフェロセン誘導体を包含する、請求項４に記載の方法。
[請求項６] 複数のコロイド粒子が非コロイド構造に結合すること、および複数の粒子の非コロイド構造への結合を測定することを包含する、請求項１に記載の方法。
[請求項７] 複数のコロイド粒子が補助的なシグナル伝達実体を包含する、請求項６に記載の方法。
[請求項８] 補助的なシグナル伝達実体が、染料、色素、電気活性分子、化学ルミネッセンス部分、電気化学ルミネッセンス部分、蛍光部分、アップレギュレートしている蛍光体、またはホースラディッシュペルオキシダーゼおよびアルカリホスファターゼを含む酵素結合シグナル伝達部分を包含する請求項７に記載の方法。
[請求項９] 非コロイド構造に結合するか、または結合するように適合した生物学的または化学的作用物質、および粒子に結合するか、または結合するように適合した生物学的または化学的作用物質の結合パートナーを提供することをさらに含み、与える工程は作用物質および結合パートナーにより粒子が非コロイド構造に結合することを包含する、請求項１に記載の方法。
[請求項１０] 非コロイド構造がビーズである、請求項１に記載の方法。
[請求項１１] ビーズがポリマー材料、アガロース、テンタゲル、および／または磁性材料を包含する、請求項１０に記載の方法。
[請求項１２] ビーズがポリスチレンビーズである、請求項１１に記載の方法。
[請求項１３] 作用物質を非コロイド構造に結合させ、結合パートナーを粒子に結合させ、および作用物質と結合パートナーをお互いに結合させることを包含する、請求項９に記載の方法。
[請求項１４] 作用物質と結合パートナーがお互いに生物学的に結合させることを包含する、請求項１３に記載の方法。
[請求項１５] 生物学的または化学的作用物質が薬物候補であり、そして結合パートナーが薬物候補の標的である、請求項９に記載の方法。
[請求項１６] 非コロイド構造がビーズである、請求項１５に記載の方法。
[請求項１７] 非コロイド構造が本質的に平面の基質またはチップの表面である、請求項１５に記載の方法。
[請求項１８] 生物学的または化学的作用物質が核酸配列である、請求項９に記載の方法。
[請求項１９] 生物学的または化学的作用物質がペプチドであり、そして結合パートナーがペプチドの結合パートナーである、請求項９に記載の方法。
[請求項２０] 生物学的または化学的作用物質がタンパク質であり、そして結合パートナーがタンパク質の結合パートナーである、請求項９に記載の方法。
[請求項２１] コロイド粒子が固定化リガンドを持ち、そして非コロイド構造がリガンドに対する結合パートナーを持つ、請求項１に記載の方法であって、標的へのリガンド結合の妨害のための候補薬物の存在下で、非コロイド構造に結合する能力をコロイド粒子に与えることを包含する前記方法。
[請求項２２] 非コロイド構造がビーズであり、複数のビーズ、ビーズへの結合に適合した複数の生物学的または化学的作用物質、複数の粒子、および粒子への結合に適合した生物学的または化学的作用物質の複数の結合パートナーを提供することをさらに包含し、ここで少なくともいくつかの作用物質および結合パートナーは互いに結合する能力を有することが推測される、請求項１に記載の方法であって、ここで少なくともビーズのいくつかを少なくとも粒子のいくつかに暴露すること、およびビーズへの粒子の固定化を測定することを包含する前記方法。
[請求項２３] 生物学的または化学的作用物質が薬物候補であり、そして結合パートナーが薬物候補の標的である、請求項２２に記載の方法であって、それぞれが異なる固定化された薬物候補を持つ、２つの異なる位置に少なくとも第１および第２のビーズを提供すること、複数の粒子を少なくとも２つのビーズに暴露すること、そして第１のビーズと第２のビーズへの粒子の結合を区別することを包含する前記方法。
[請求項２４] 少なくとも２つのビーズがマルチウェルプレートの少なくとも２つの異なるウェルに別々に位置する、請求項２３に記載の方法。
[請求項２５] 生物学的または化学的作用物質が薬物候補であり、そして結合パートナーが薬物候補の標的である、請求項２２に記載の方法であって、２つの異なる位置に薬物候補を持つ少なくとも２つのビーズを用意すること、薬物候補の第１の標的を持つコロイド粒子の第１のセットに第１のビーズを暴露すること、および薬物候補の第２の標的を持つコロイド粒子の第２のセットに第２のビーズを暴露すること、ならびに第１のビーズへの第１のセットの粒子の結合に対して、第２のビーズへの第２のセットの粒子への結合を区別することを包含する前記方法。
[請求項２６] 粒子と相互作用して吸収されるか、または透過する電磁波放射のスペクトルの変化を測定することにより、非コロイド構造における粒子の固定化を測定することを包含する、請求項９に記載の方法。
[請求項２７] 目視検査により非コロイド構造における粒子の固定化を測定することを包含する、請求項９に記載の方法。
[請求項２８] 複数のビーズおよびビーズに結合した作用物質、複数の粒子および粒子に結合した結合パートナーを用意すること、ならびにビーズに粒子を暴露すること、およびビーズにおける粒子の固定化を測定することを包含する、請求項２２に記載の方法。
[請求項２９] 作用物質または結合パートナーの少なくとも一つがそれぞれ、親和性タグ／結合パートナー結合により、非コロイド構造または粒子への結合に適合した、請求項９に記載の方法。
[請求項３０] 作用物質または結合パートナーの少なくとも一つがそれぞれ、金属結合タグ／金属／キレート結合により非コロイド構造または粒子への結合に適合した、請求項９に記載の方法。
[請求項３１] 作用物質または結合パートナーの少なくとも一つがそれに固定化された金属を配位結合させるキレートを持ち、そして作用物質または結合パートナーの少なくとも一つがポリアミノ酸タグにより誘導体化される、請求項３０に記載の方法。
[請求項３２] 作用物質または結合パートナーの少なくとも一つが、自己組織化単分子層により、それぞれ非コロイド構造または粒子への結合に適合した、請求項９に記載の方法。
[請求項３３] 作用物質または結合パートナーの少なくとも一つが、相補的核酸配列対により、それぞれビーズまたは粒子への結合に適合した、請求項９に記載の方法。
[請求項３４] 結合パートナーがグルタチオン／グルタチオン−ｓ−トランスフェラーゼリガンド相互作用により、粒子への結合に適合した、請求項９に記載の方法。
[請求項３５] ポリマービーズを包含する少なくとも第１および第２の非コロイド構造ならびに、その第１および第２のビーズにそれぞれ結合した少なくとも第１および第２の作用物質を用意すること；
コロイド粒子に固定化された第１および／または第２の作用物質の推定結合パートナーをそれぞれが持つ複数のコロイド粒子を用意すること；
ビーズを粒子に暴露すること；そして
第１のビーズに対する第２のビーズへの粒子の結合を区別することを包含する、請求項９に記載の方法。
[請求項３６] 第１および第２のポリマービーズに結合した第１および第２の作用物質が結合パートナーと生物学的または化学的相互作用をすると推測され、そして区別する工程が第１の作用物質と結合パートナーに対して第２の作用物質および結合パートナー間の生物学的相互作用を区別することを包含する、請求項３５に記載の方法。
[請求項３７] 以下のことを包含する請求項９に記載の方法：
それぞれが固定化された作用物質を持つ複数の、ビーズを包含する、非コロイド構造を用意すること；
コロイド粒子の第１のセットおよび第２のセットを用意することであって、第１のセットがそれに固定された作用物質の第１の推定結合パートナーをそれぞれ持ち、そして第２のセットがそれに固定された作用物質の第２の推定結合パートナーをそれぞれ持つこと；
少なくとも第１のビーズを粒子の第１のセットに、そして少なくとも第２のビーズを粒子の第２のセットに暴露すること；
第１のビーズへの第１の粒子のセットの結合に対して、ビーズへの第２の粒子のセットの結合を区別すること。
[請求項３８] 第１および第２の推定結合パートナーは作用物質と生物学的または化学的相互作用をすると推測され、そして区別する工程が作用物質と第１の推測結合パートナー間に対して、作用物質と第２の推定結合パートナー間の生物学的相互作用を識別することを包含する、請求項３７に記載の方法。
[請求項３９] 非コロイド構造が細胞である、請求項１に記載の方法。
[請求項４０] 粒子への結合に適合した、細胞表面の受容体またはタンパク質に対するリガンドを用意することをさらに含み、与える工程が受容体またはタンパク質と相互作用するリガンドにより粒子を細胞に結合させることを包含する、請求項３９に記載の方法。
[請求項４１] リガンドが自己組織化単分子層を介して粒子に結合するように適合した、請求項３９に記載の方法。
[請求項４２] リガンドがペプチド、タンパク質、抗体、酵素、または小分子である、請求項４０に記載の方法。
[請求項４３] リガンドが親和性タグ／結合パートナー結合により、粒子に結合するように適合した、請求項４０に記載の方法。
[請求項４４] リガンドが金属結合タグ／金属／キレート結合により、粒子に結合するように適合した、請求項４０に記載の方法。
[請求項４５] リガンドがポリアミノ酸タグを持ち、そして粒子が金属を配位結合させる固定化キレートを持つ、請求項４２に記載の方法。
[請求項４６] キレートがニトリロ三酢酸である、請求項４５に記載の方法。
[請求項４７] 粒子がニトリロ三酢酸を含む自己組織化単分子層を持つ、請求項４５に記載の方法。
[請求項４８] 粒子が固定化キレートを含む自己組織化単分子層を持つ、請求項４５に記載の方法。
[請求項４９] リガンドおよび粒子を細胞に暴露すること、リガンドを粒子に結合させること、および受容体またはタンパク質へのリガンドの結合を測定することを包含する、請求項４０に記載の方法。
[請求項５０] 粒子と相互作用して吸収されるか、または透過する電磁波放射のスペクトルの変化を測定することにより、細胞上の粒子の固定化を測定することを包含する、請求項３９に記載の方法。
[請求項５１] 電子工学的に細胞上の粒子の固定化を測定することを包含する、請求項３９に記載の方法。
[請求項５２] 交流ボルタンメトリーにより、細胞上の粒子の固定化を測定することを包含する、請求項５１に記載の方法。
[請求項５３] 目視検査により、細胞上の粒子の固定化を測定することを包含する、請求項５０に記載の方法。
[請求項５４] 以下のことを包含する請求項３９に記載の方法：
その表面に受容体またはタンパク質を提示する細胞を用意すること；
コロイド粒子を用意すること；および
コロイド粒子を受容体またはタンパク質に結合させること。
[請求項５５] コロイド粒子が補助的なシグナル伝達実体を包含する、請求項５４に記載の方法。
[請求項５６] 非コロイド構造がその表面に受容体またはタンパク質を露出する細胞であり、粒子への結合に適合した受容体またはタンパク質に対するリガンドを用意すること、およびリガンドと受容体またはタンパク質間の相互作用を妨害するための候補薬物の存在下で細胞にリガンドおよび粒子を暴露すること；ならびに細胞への粒子の結合を測定することをさらに包含する、請求項１に記載の方法。
[請求項５７] 測定工程が、受容体またはタンパク質／標的タンパク質間の相互作用を妨害することにおける候補薬物の有効性を表す、細胞への粒子の結合の阻害を測定することを包含する、請求項５６に記載の方法。
[請求項５８] 少なくとも第１および第２の細胞を異なる位置に提供すること；
第１の細胞を第１の細胞の細胞受容体またはタンパク質に対するリガンドおよびコロイド粒子、粒子への結合に適合したリガンド、ならびにリガンドと受容体またはタンパク質間の相互作用を妨害するための第１の候補薬物に暴露すること；および
第２の細胞にリガンドおよびコロイド、ならびにリガンドと受容体またはタンパク質間の相互作用を妨害するための第２の候補薬物を添加すること；ならびに
第１の細胞に対して第２の細胞への粒子の結合を区別するすること；
を包含する、請求項５６に記載の方法。
[請求項５９] 非コロイド構造がその表面に受容体またはタンパク質を露出する細胞である、請求項１に記載の方法であって、さらに：
少なくとも２つの細胞を異なる位置に提供すること；
細胞受容体またはタンパク質に対する異なる標的タンパク質およびそれぞれの標的タンパク質への結合に適合したコロイド粒子にそれぞれの細胞を暴露すること；および
細胞受容体またはタンパク質への異なる標的タンパク質の結合を表す、細胞への粒子の結合を測定すること、を包含する方法。
[請求項６０] 非コロイド構造が磁気ビーズであり、そしてコロイド粒子が補助的なシグナル伝達実体を包含する、請求項９に記載の方法。
[請求項６１] シグナル伝達実体がメタロセンである、請求項６０に記載の方法。
[請求項６２] シグナル伝達実体がフェロセンまたはフェロセン誘導体である、請求項６０に記載の方法。
[請求項６３] 作用物質および結合パートナーの存在下、さらに作用物質および結合パートナーを開裂する能力を有する酵素の存在下で粒子をビーズに暴露することを包含する、請求項６０に記載の方法。
[請求項６４] はじめに作用物質および結合パートナーを酵素に暴露し、その後粒子およびビーズを作用物質および結合パートナーに暴露することを包含する、請求項６３に記載の方法。
[請求項６５] 作用物質、結合パートナー、および酵素の存在下、さらに酵素活性を調節するための候補薬物の存在下で粒子をビーズに暴露することを包含する、請求項６３に記載の方法。
[請求項６６] 結合パートナーが酵素による開裂が可能なタンパク質またはペプチドを包含する、請求項６５に記載の方法。
[請求項６７] タンパク質がコロイド粒子への、およびビーズへの結合に適合した、請求項６６に記載の方法。
[請求項６８] タンパク質が金属結合タグおよびビオチンを含み、コロイドまたはビーズの一つが金属を配位結合するキレートを含み、および他のコロイドまたはビーズがストレプトアビジンを包含する、請求項６７に記載の方法。
[請求項６９] タンパク質が金属結合タグおよびビオチンを含み、コロイドが金属を配位結合させるキレートを含み、そしてビーズがストレプトアビジンを含む、請求項６７に記載の方法。
[請求項７０] シグナル伝達実体がメタロセンであり、結合パートナーが酵素による開裂が可能なタンパク質を含む請求項６０に記載の方法であって、作用物質、結合パートナー、および酵素の存在下、さらに酵素活性の調節のための候補薬物の存在下で粒子をビーズに暴露すること、ビーズを電極の近くに磁気的に引き寄せること、および電極を活性化することにより電極へのメタロセンの接近度を測定し、それによって酵素の開裂活性を阻害する薬物候補の有効性を測定することを包含する前記方法。
[請求項７１] 実体を開裂する能力を有する酵素、および酵素活性を調節するための候補薬物の両方の存在下で、コロイド粒子および非コロイド構造の両方への結合に適合した実体にコロイド粒子および非コロイド構造を暴露することを包含する、請求項１に記載の方法。
[請求項７２] 非コロイド構造が磁気ビーズであり、コロイド粒子が固定化された電気活性種を持つ、請求項７１に記載の方法であって、ビーズを電極の近くに磁気的に引き寄せること、および電極を活性化することにより電極への電気活性種の接近度を測定し、それによって酵素の開裂活性を阻害する薬物候補の有効性を測定することを包含する、前記方法。
[請求項７３] 非コロイド構造が電極の表面であり、コロイド粒子が固定化された電気活性種を持つ、請求項７１に記載の方法であって、電極をコロイド粒子、コロイド粒子および電極の両方への結合に適合した実体、酵素、および候補薬物に暴露すること、および電極を活性化することにより電極への電気活性種の接近度を測定し、それによって酵素の開裂活性を阻害する薬物候補の有効性を測定することを包含する前記方法。
[請求項７４] コロイド粒子および非コロイド構造を、非コロイド構造への結合に適合した酵素の基質、粒子への結合に適合した、酵素活性により基質に結合可能な分子種、および基質に対する酵素に暴露することを包含する、請求項１に記載の方法。
[請求項７５] 酵素活性を調節するための候補薬物にコロイド粒子および非コロイド構造を暴露することをさらに包含する、請求項７４に記載の方法。
[請求項７６] 非コロイド構造が磁気ビーズであり、コロイド粒子が固定化された電気活性実体を持つ、請求項７４に記載の方法であって、ビーズを電極の近くに磁気的に引き寄せること、および電極を活性化することにより電極への電気活性実体の接近度を測定し、それによって酵素の活性を調節する薬物候補の有効性を測定することを包含する前記方法。
[請求項７７] 非コロイド構造が電極の表面であり、コロイド粒子が固定化された電気活性実体を持つ、請求項７４に記載の方法であって、電極表面をコロイド粒子、基質、酵素、および候補薬物に暴露すること、および電極を活性化することにより電極への電気活性実体の接近度を測定し、それによって酵素の活性を調節する薬物候補の有効性を測定することを包含する前記方法。
[請求項７８] 非コロイド構造が磁気ビーズである、請求項７４に記載の方法。
[請求項７９] コロイド粒子が補助的なシグナル伝達実体を包含する、請求項７８に記載の方法。
[請求項８０] シグナル伝達実体がメタロセンである、請求項７８に記載の方法。
[請求項８１] シグナル伝達実体がフェロセンまたはフェロセン誘導体である、請求項７８に記載の方法。
[請求項８２] 基質および結合パートナーの存在下、さらに酵素活性を調節するための候補薬物の存在下で粒子をビーズに暴露することを包含する、請求項７８に記載の方法。
[請求項８３] 結合パートナーが金属結合タグ／金属／キレート結合により粒子に結合するように適合し、そして基質がビオチン／ストレプトアバジン結合によりビーズに結合するように適合した、請求項８２に記載の方法。
[請求項８４] シグナル伝達実体がメタロセンである請求項８２に記載の方法であって、ビーズを電極の近くに磁気的に引き寄せること、および電極を活性化することにより電極へのメタロセンの接近度を測定し、それによって酵素活性を調節する薬物候補の有効性を測定することを包含する前記方法。
[請求項８５] 複数のシグナル伝達実体により、第１の生物学的または化学的作用物質の単一の結合を第２の生物学的または化学的作用物質にシグナル伝達することを包含する方法。
[請求項８６] 単一の結合を複数のシグナル伝達実体により同時にシグナル伝達することを包含する、請求項８５に記載の方法。
[請求項８７] 複数のシグナル伝達実体を持つ第１の作用物質を提供すること、第１の作用物質を第２の作用物質に結合させること、およびシグナル伝達実体により結合を測定することを包含する、請求項８５に記載の方法。
[請求項８８] シグナル伝達実体が固定化された粒子に第１の作用物質が結合する、請求項８７に記載の方法。
[請求項８９] ポリマーにより第１の作用物質がシグナル伝達実体に結合する、請求項８７に記載の方法。
[請求項９０] 第１の作用物質がデンドリマーによりシグナル伝達実体に結合する、請求項８７に記載の方法。
[請求項９１] 第１の作用物質が生物学的または化学的リガンドであり、そして第２の作用物質がその表面に受容体またはタンパク質を提示する細胞である、請求項８７に記載の方法であって、リガンドが受容体またはタンパク質に結合させることを包含する前記方法。
[請求項９２] 複数のシグナル伝達実体が第１の作用物質に結合したポリマーに結合した複数のシグナル伝達実体を包含する、請求項８７に記載の方法。
[請求項９３] 複数のシグナル伝達実体が第１の作用物質に結合したデンドリマーに結合した複数のシグナル伝達実体を包含する、請求項８７に記載の方法。
[請求項９４] 複数の固定化されたシグナル伝達実体を含むコロイド粒子に第１の作用物質を固定した、請求項８７に記載の方法。
[請求項９５] 複数のシグナル伝達実体が複数の電気活性分子を包含する、請求項８５に記載の方法。
[請求項９６] 複数の電気活性分子が複数のメタロセンを包含する、請求項９５に記載の方法。
[請求項９７] 複数の電気活性分子が複数のフェロセンまたはフェロセン誘導体を包含する、請求項９５に記載の方法。
[請求項９８] ポリマーが親和性タグ／結合パートナー結合により第１の作用物質に結合した、請求項９２に記載の方法。
[請求項９９] ポリマーが結合タグ／金属／キレート結合により第１の作用物質に結合する、請求項９２に記載の方法。
[請求項１００] 第１の作用物質がポリアミノ酸タグを有し、そしてポリマーが金属を配位結合させるキレートを持つ、請求項９９に記載の方法。
[請求項１０１] デンドリマーが結合タグ／金属／キレート結合により第１の作用物質に結合する、請求項９２に記載の方法。
[請求項１０２] 第１の作用物質がポリアミノ酸タグを持ち、そしてデンドリマーが金属を配位結合させるキレートを持つ、請求項１０１に記載の方法。
[請求項１０３] 少なくとも補助的なシグナル伝達実体の一つが、染料、色素、電気活性分子、蛍光部分、アップレギュレートしている蛍光体、またはホースラディッシュペルオキシダーゼおよびアルカリホスファターゼを含む酵素結合シグナル伝達部分を包含する請求項８５に記載の方法。
[請求項１０４] タンパク質またはリガンドのいずれも標識せずにＳＰＲの非存在下でタンパク質／リガンド相互作用を測定することを包含する方法。
[請求項１０５] リガンドと相互作用すると推測されるタンパク質にリガンド、すなわちタンパク質への接近度に依存した電気活性シグナルを有する、電気活性実体と一定の近接関係にあるリガンド、を暴露することを包含する、請求項１０４に記載の方法。
[請求項１０６] 電気活性実体が、電気活性実体とタンパク質間の接近度の変化に依存して変わることができる電気活性シグナルを有する、請求項１０４に記載の方法。
[請求項１０７] リガンドと電気活性実体がともに固定化される表面にタンパク質を暴露することを包含する、請求項１０４に記載の方法。
[請求項１０８] 表面が電極の表面である、請求項１０７に記載の方法。
[請求項１０９] リガンドおよび電気活性実体がそれぞれ表面の自己組織化単分子層の部分を形成する、請求項１０７に記載の方法。
[請求項１１０] 自己組織化単分子層が、電子に対する自己組織化単分子層の透過性を促進する種を含む、請求項１０９に記載の方法。
[請求項１１１] 電子に対する透過性を促進する種が伝導性自己組織化単分子層形成種を包含する、請求項１１０に記載の方法。
[請求項１１２] 電子に対する透過性を促進する種が自己組織化単分子層に欠陥部位を生じさせる種を包含する、請求項１１０に記載の方法。
[請求項１１３] 電気活性実体がメタロセンを包含する、請求項１０４に記載の方法。
[請求項１１４] 電気活性実体がフェロセンまたはフェロセン誘導体を包含する、請求項１０４に記載の方法。
[請求項１１５] 電気活性実体がフェロセンジカルボン酸を包含する、請求項１０４に記載の方法。
[請求項１１６] リガンドが親和性タグ／結合パートナー結合により自己組織化単分子層形成種に結合する、請求項１０９に記載の方法。
[請求項１１７] リガンドが金属結合タグ／金属／キレート結合により自己組織化単分子層形成種に結合する、請求項１０９に記載の方法。
[請求項１１８] 以下のことを包含する方法：
ａ）ｉ）コロイド（前記コロイドは細胞表面分子と相互作用することができるリガンドを包含する）を包含する溶液、およびｉｉ）成長細胞を包含する電極を包含する組成物（前記細胞は前記リガンドと相互作用することができる少なくとも１つの細胞表面分子を包含する）を提供すること、
ｂ）少なくとも前記コロイドの部分を前記組成物に添加すること。
[請求項１１９] さらに以下のことを包含する請求項１１８に記載の方法：
ｃ）前記リガンドと前記細胞表面分子の相互作用の尺度として前記コロイドの凝集を検出すること。
[請求項１２０] 前記コロイドが金コロイドである、請求項１１８に記載の方法。
[請求項１２１] 工程（ａ）の前に、前記金コロイドがチオール基を取り込むように処理される、請求項１２０に記載の方法。
[請求項１２２] 工程（ａ）の前に、前記リガンドが結合パートナーを有する部分により誘導体化される、請求項１１８に記載の方法。
[請求項１２３] 工程（ａ）の前に、前記リガンドが金属キレートに結合することができる部分により誘導体化される、請求項１２２に記載の方法。
[請求項１２４] 前記部分がヒスチジンタグを包含する、請求項１２３に記載の方法。
[請求項１２５] 以下のことを包含する方法：
ａ）ｉ）コロイド（前記コロイドは細胞表面分子と相互作用することができるリガンドを含む）を包含する溶液、ｉｉ）候補薬物、およびｉｉｉ）成長細胞を包含する電極を包含する組成物（前記細胞は前記リガンドと相互作用することができる少なくとも１つの細胞表面分子を包含する）を提供すること、
ｂ）少なくとも前記コロイドの部分を前記薬物および前記組成物と混合すること。
[請求項１２６] 磁気材料を使用して電子工学的シグナル伝達実体を電極に補充することを包含する方法。
[請求項１２７] シグナル伝達実体と磁気ビーズ間の固定化に関与するタンパク質／タンパク質結合により部分的に電極にシグナル伝達実体を補充することを包含する、請求項１２６に記載の方法。
[請求項１２８] タンパク質／タンパク質結合が抗体ではないタンパク質を伴う、請求項１２７に記載の方法。
[請求項１２９] 表面、および表面に関してそれぞれ固定化されたタンパク質および電気活性実体と相互作用すると推測されるリガンドを有するアーティクル。
[請求項１３０] 表面に関して固定化された電子の表面の透過性を促進する種をさらに包含する、請求項１２９に記載のアーティクル。
[請求項１３１] 第２の作用物質への生物学的または化学的結合が可能な、複数のシグナル伝達実体に関して固定化された第１の生物学的または化学的作用物質を包含するアーティクル。
[請求項１３２] シグナル伝達実体が固定化される粒子に第１の作用物質が結合する、請求項１３１に記載のアーティクル。
[請求項１３３] 第１の作用物質がポリマーによりシグナル伝達実体に関して固定化される、請求項１３１に記載のアーティクル。
[請求項１３４] 第１の作用物質がデンドリマーによりシグナル伝達実体に関して固定化される、請求項１３１に記載のアーティクル。
[請求項１３５] 表面、およびアーティクルの表面に形成された自己組織化単分子層を有するアーティクルであって、単分子層は第１分子種（表面が暴露される流体と表面との電気的連絡を妨げるように、堅く詰まった様式で他の第１分子種とともに表面での自己組織化を促進する分子構造を有する）と第２分子種（第１の種と異なる分子構造を有し、堅く詰まった自己組織化構造の破壊を引き起こして、堅く詰まった構造中に欠陥を生じ、表面が曝露される流体と表面の電気的連絡を可能にする）の混合物を包含する、上記アーティクル。
[請求項１３６] 第１の種が本質的に直線状であり、第２の種が少なくとも１つの非直線部分を包含する、請求項３５に記載のアーティクル。
[請求項１３７] 第１分子が細胞表面受容体またはタンパク質と相互作用することができるリガンドである、前記第１分子および固体支持体に結合した１つまたはそれより多くのシグナル伝達実体を包含する組成物。
[請求項１３８] 前記固体支持体がコロイドである、請求項１３７に記載の組成物。
[請求項１３９] 前記コロイドが金コロイドである、請求項１３８に記載の組成物。
[請求項１４０] 前記リガンドが直接前記コロイドに共有結合する、請求項１３８に記載の組成物。
[請求項１４１] 前記シグナル伝達実体が電気活性分子である、請求項１３８に記載の組成物。
[請求項１４２] 前記電気活性分子がフェロセンまたはフェロセン誘導体を包含する、請求項１４１に記載の組成物。
[請求項１４３] 前記リガンドがペプチドである、請求項１３７に記載の組成物。
[請求項１４４] 前記ペプチドが金属キレートに結合することができる部分とともに誘導体化される、請求項１４３に記載の組成物。
[請求項１４５] 前記部分がヒスチジンタグを包含する、請求項１４４に記載の組成物。
[請求項１４６] 前記固体支持体が金属キレートを含み、そして前記ペプチドが前記金属キレートへの前記部分の結合により前記固体支持体に結合する、請求項１４４に記載の組成物。
[請求項１４７] 固体支持体が第２分子の単分子層を包含する、請求項１３７に記載の組成物。
[請求項１４８] 前記単分子層が自己組織化単分子層である、請求項１４７に記載の組成物。
[請求項１４９] 前記第２分子がチオールである、請求項１４７に記載の組成物。
[請求項１５０] 固体支持体に結合した第１分子、第２分子および第３分子を包含する組成物：ここで前記第１分子は細胞表面受容体またはタンパク質と相互作用可能なリガンドを含み、ここで第２分子は前記固体支持体上で単分子層を形成し、そしてここで前記第３分子は電気活性である。
[請求項１５１] 前記固体支持体がコロイドである、請求項１５０に記載の組成物。
[請求項１５２] 前記コロイドが金コロイドである、請求項１５１に記載の組成物。
[請求項１５３] 前記リガンドが前記コロイドに直接共有結合する、請求項１５１に記載の組成物。
[請求項１５４] 前記電気活性分子がフェロセンまたはフェロセン誘導体を包含する、請求項１５３に記載の組成物。
[請求項１５５] 前記リガンドがペプチドである、請求項１５３に記載の組成物。
[請求項１５６] 前記ペプチドが金属キレートに結合可能な部分とともに誘導体化される、請求項１５５に記載の組成物。
[請求項１５７] 前記部分がヒスチジンタグを包含する、請求項１５６に記載の組成物。
[請求項１５８] 前記固体支持体が金属キレートを含み、そして前記ペプチドが前記金属キレートへの前記部分の結合により前記固体支持体に結合する、請求項１５６に記載の組成物。
[請求項１５９] 前記固体支持体がリポソームである、請求項１３７に記載の組成物。
[請求項１６０] 前記リポソームが反応基を含有する少なくとも１つの脂質を包含する、請求項１４７に記載の組成物。
[請求項１６１] 表面上で細胞の成長を支持するように構築され、配列された金属支持体を包含するアーティクル：前記金属支持体は少なくとも１つのタイプの分子の単分子層を含み、前記単分子層は金属支持体を電極として使用できるように設計される。
[請求項１６２] 金属支持体上で増殖する細胞をさらに包含する、請求項１６１に記載のアーティクル。
[請求項１６３] 以下のものを包含する組成物：
コロイド粒子
コロイド粒子に関して固定化されたシグナル伝達実体；および
コロイド粒子に関して固定化されたタンパク質。
[請求項１６４] 以下のものを包含する組成物：
生物学的または化学的作用物質に結合するように適合した複数のシグナル伝達実体を持つポリマーまたはデンドリマー。
[請求項１６５] ポリマーまたはデンドリマーが金属結合タグ／金属／キレート結合により化学的または生物学的作用物質に結合するように適合した、請求項１６４に記載の種。
[請求項１６６] ポリマーまたはデンドリマーが金属を配位結合させることができるキレートを持つ、請求項１６４に記載の種。
[請求項１６７] ポリマーまたはデンドリマーが複数の電気活性種を持つ、請求項１６４に記載の種。
[請求項１６８] ポリマーまたはデンドリマーが複数のメタロセンを持つ、請求項１６４に記載の種。
[請求項１６９] ポリマーまたはデンドリマーが複数のフェロセンまたはフェロセン誘導体を持つ、請求項１６４に記載の種。
[請求項１７０] グルタチオン誘導体に関して固定化されたコロイド粒子および少なくとも１つのシグナル伝達実体を包含するアーティクル。
[請求項１７１] グルタチオン誘導体を包含する自己組織化単分子層を表面上に持つコロイド粒子を包含するアーティクル。
[請求項１７２] 非コロイド構造が生物学的試料である、請求項１に記載の方法。
[請求項１７３] 生物学的試料がヒトまたは動物から採取される、請求項１７２に記載の方法。
[請求項１７４] 生物学的試料が細胞または組織切片を包含する、請求項１７３に記載の方法。
[請求項１７５] 少なくとも第１および第２生物学的試料を用意すること；
試料により提示される結合パートナーに結合する能力が推測されるまたはそれを有する固定化された種を持つコロイド粒子に、第１および第２試料を暴露すること、
を包含する請求項１７２に記載の方法。
[請求項１７６] 第１および第２生物学的試料が感染または疾病の異なる状態の試料である、請求項１７５に記載の方法。
[請求項１７７] 異なる試料に対する結合と第１試料へのコロイド粒子の結合の違いを測定することを包含する、請求項１７５に記載の方法。
[請求項１７８] 違いが結合レベルの違いを包含する、請求項１７７に記載の方法。
[請求項１７９] 違いがコロイド固定化パターンの違いである、請求項１７７に記載の方法。
[請求項１８０] 試料のいずれかまたは両方へのコロイド粒子の固定化を測定することをさらに包含する請求項１７５に記載の方法。
[請求項１８１] 試料により発現された、結合パートナーの発現レベルおよび／またはパターンにより測定できる疾患状態の修飾のための候補薬物で生物学的試料またはその供与源が前処理されている、請求項１７５に記載の方法。
[請求項１８２] 非コロイド構造が表面を有するアーティクル、およびアーティクルの表面で形成される自己組織化単分子層を包含し、単分子層は第１分子種（表面が暴露されている流体と表面との電気的連絡を妨げ、堅く詰まった様式で他の第１分子種とともに表面での自己組織化を促進する、分子構造を有する）と第２分子種（分子ワイヤを包含する）の混合物を包含する、請求項１に記載の方法。
[請求項１８３] 非コロイド構造が固体支持体である、請求項１に記載の方法。
[請求項１８４] 表面が電極の表面である、請求項１８３に記載の方法。
[請求項１８５] コロイド粒子の表面での自己組織化単分子層の部分をそれぞれ形成するリガンドおよび電気活性実体をさらに包含する、請求項１８３に記載の方法。
[請求項１８６] 自己組織化単分子層が電子の自己組織化単分子層の透過性を促進する種を含む、請求項１８５に記載の方法。
[請求項１８７] 電子の透過性を促進する種が伝導性自己組織化単分子層形成種を包含する、請求項１８６に記載の方法。
[請求項１８８] 電子の透過性を促進する種が自己組織化単分子層中に欠陥部位を生じる種を包含する、請求項１８６に記載の方法。
[請求項１８９] 電気活性実体がフェロセンジカルボン酸を包含する、請求項１０４に記載の方法。
[請求項１９０] 金属結合タグ／金属／キレート結合により、リガンドが自己組織化単分子層形成種に結合する、請求項１８５に記載の方法。
[請求項１９１] 固体支持体が実質的に平面の基質を包含する、請求項１８３に記載の方法。
[請求項１９２] アーティクルの表面が自己組織化単分子層を持つ、請求項１８３に記載の方法。
[請求項１９３] 自己組織化単分子層が伝導性自己組織化単分子層である、請求項１９２に記載の方法。
[請求項１９４] 自己組織化単分子層が親和性タグの結合パートナーを包含する、請求項１９２に記載の方法。
[請求項１９５] 結合パートナーが金属を配位結合させることができるキレートである、請求項１９４に記載の方法。
[請求項１９６] 親和性タグの結合パートナーがグルタチオンまたはビオチンを包含する、請求項１９４に記載の方法。
[請求項１９７] ＥＤＣ／ＮＨＳカップリング化学により自己組織化単分子層に固定される化学的または生物学的作用物質をさらに包含する、請求項１９３に記載の方法。
[請求項１９８] 自己組織化単分子層に固定され、そして自己組織化単分子層を横切って任意に分配される複数の化学的または生物学的結合パートナーを包含する、請求項１９３に記載の方法。
[請求項１９９] 自己組織化単分子層が、それに固定された唯一の化学的または生物学的結合パートナーをそれぞれさらに包含する隔離された領域を含む、請求項１９３に記載の方法。
[請求項２００] コロイド構造が結合パートナーであるか、または、アーティクルの表面に固定される化学的または生物学的作用物質の結合パートナーであると推測される、それに固定された化学的または生物学的作用物質を含む、請求項１８２に記載の方法。
[請求項２０１] コロイド粒子が補助的なシグナル伝達実体を包含する、請求項２００に記載の方法。
[請求項２０２] コロイド粒子の表面に自己組織化単分子層をさらに包含する、請求項２００に記載の方法。
[請求項２０３] 補助的なシグナル伝達実体が電気活性シグナル伝達実体である、請求項２０１に記載の方法。
[請求項２０４] 補助的なシグナル伝達実体が可視シグナル伝達実体である、請求項２０１に記載の方法。
Those skilled in the art will readily appreciate that all parameters described herein are exemplary and that the actual parameters will depend on the particular application for the method and apparatus in which the invention is used. Will. Therefore, the foregoing embodiments are presented by way of example only, and that the invention may be practiced differently from the specific description within the scope of the appended claims and their equivalents. You should understand.
Claim 1. Giving the colloid particles the ability to be immobilized with respect to non-colloidal structures;
A method comprising measuring the immobilization of colloidal particles on a non-colloidal structure.
2. The method of claim 1, wherein the colloidal particles include an auxiliary signaling entity.
[Claim 3] The auxiliary signaling entity is a dye, a dye, an electroactive molecule, a chemiluminescent moiety, an electrochemiluminescent moiety, a fluorescent moiety, an up-regulating fluorophore, or horseradish peroxidase and alkaline phosphatase. 3. The method of claim 2, comprising an enzymatic binding signaling moiety.
4. The method of claim 3, wherein the signaling entity comprises a metallocene.
[5] The method according to [4], wherein the signaling entity comprises ferrocene or a ferrocene derivative.
6. The method of claim 1, comprising binding the plurality of colloidal particles to the non-colloidal structure and measuring the binding of the plurality of particles to the non-colloidal structure.
7. The method of claim 6, wherein the plurality of colloid particles include an auxiliary signaling entity.
Claim 8 The auxiliary signaling entity is a dye, dye, electroactive molecule, chemiluminescent moiety, electrochemiluminescent moiety, fluorescent moiety, up-regulating fluorophore, or horseradish peroxidase and alkaline phosphatase. 9. The method of claim 7, comprising an enzyme-linked signaling moiety.
9. A biological or chemical agent that binds or is adapted to bind to a non-colloidal structure, and a biological or chemical effect that binds to or binds to a particle. 2. The method of claim 1, further comprising providing a binding partner of the substance, wherein the providing step comprises binding the particle to the non-colloidal structure by the agent and the binding partner.
[10] The method according to claim 1, wherein the non-colloidal structure is a bead.
11. The method of claim 10, wherein the beads comprise a polymeric material, agarose, tentagel, and / or a magnetic material.
[12] The method according to claim 11, wherein the beads are polystyrene beads.
13. The method of claim 9, comprising binding the agent to the non-colloidal structure, binding the binding partner to the particle, and binding the agent and the binding partner to each other.
14. The method of claim 13, comprising binding the agent and the binding partner biologically to each other.
15. The method of claim 9, wherein the biological or chemical agent is a drug candidate and the binding partner is a target for the drug candidate.
16. The method according to claim 15, wherein the non-colloidal structure is a bead.
17. The method of claim 15, wherein the non-colloidal structure is an essentially planar substrate or chip surface.
[18] The method of claim 9, wherein the biological or chemical agent is a nucleic acid sequence.
[19] The method of claim 9, wherein the biological or chemical agent is a peptide, and the binding partner is a binding partner of the peptide.
20. The method of claim 9, wherein the biological or chemical agent is a protein and the binding partner is a protein binding partner.
21. The method of claim 1, wherein the colloidal particles have an immobilized ligand and the non-colloidal structure has a binding partner for the ligand, wherein the non-colloidal structure comprises a candidate drug for blocking ligand binding to a target. Such a method, comprising providing the colloid particles with the ability to bind to a non-colloidal structure in the presence.
22. The non-colloidal structure is a bead, a plurality of beads, a plurality of biological or chemical agents adapted for binding to the beads, a plurality of particles, and a biological adapted for binding to the particles. Or the method of claim 1, further comprising providing a plurality of binding partners of the chemical agent, wherein at least some of the agents and the binding partners are presumed to have the ability to bind to each other. Wherein the method comprises exposing at least some of the beads to at least some of the particles, and measuring the immobilization of the particles on the beads.
23. The method of claim 22, wherein the biological or chemical agent is a drug candidate and the binding partner is a target of the drug candidate, each of which is a different immobilized drug candidate. Providing at least first and second beads at two different locations, exposing the plurality of particles to at least two beads, and binding the particles to the first and second beads. Such a method, comprising distinguishing.
24. The method of claim 23, wherein the at least two beads are separately located in at least two different wells of a multi-well plate.
25. The method of claim 22, wherein the biological or chemical agent is a drug candidate and the binding partner is a target of the drug candidate, wherein the method has the drug candidate at two different locations. Providing at least two beads, exposing the first beads to a first set of colloidal particles having a first target of the drug candidate, and providing a second set of colloidal particles having a second target of the drug candidate. Exposing the second bead to the set of particles and distinguishing the binding of the second set of particles to the second bead from the binding of the first set of particles to the first bead The method comprising:
26. The method of claim 9, further comprising measuring the immobilization of the particles in the non-colloidal structure by measuring a change in the spectrum of the electromagnetic radiation that is absorbed or transmitted by interacting with the particles. The method described in.
27. The method of claim 9, comprising measuring the immobilization of the particles in the non-colloidal structure by visual inspection.
Claim 28. Providing a plurality of beads and an agent bound to the beads, a plurality of particles and a binding partner bound to the particles, and exposing the particles to the beads, and measuring immobilization of the particles on the beads. 23. The method of claim 22, comprising:
29. The method of claim 9, wherein at least one of the agent or binding partner is adapted for binding to a non-colloidal structure or particle by affinity tag / binding partner binding, respectively.
30. The method of claim 9, wherein at least one of the agent or binding partner is adapted for binding to a non-colloidal structure or particle by a metal binding tag / metal / chelate bond, respectively.
31. The method of claim 31, wherein at least one of the agent or binding partner has a chelate for coordinating a metal immobilized thereon, and at least one of the agent or binding partner is derivatized with a polyamino acid tag. 30. The method according to 30.
32. The method of claim 9, wherein at least one of the agent or the binding partner is adapted for binding to a non-colloidal structure or particle, respectively, by a self-assembled monolayer.
33. The method of claim 9, wherein at least one of the agent or binding partner is adapted for binding to a bead or particle, respectively, by a complementary nucleic acid sequence pair.
34. The method of claim 9, wherein the binding partner is adapted for binding to the particle by a glutathione / glutathione-s-transferase ligand interaction.
35. Providing at least a first and a second non-colloidal structure comprising polymer beads and at least a first and a second agent respectively bound to the first and second beads;
Providing a plurality of colloid particles each having a putative binding partner of the first and / or second agent immobilized on the colloid particles;
Exposing the beads to the particles; and
10. The method of claim 9, comprising distinguishing binding of a particle to a second bead relative to a first bead.
36. The method of claim 36, wherein the first and second agents bound to the first and second polymer beads are presumed to have a biological or chemical interaction with the binding partner, and the step of distinguishing is the first effect. 36. The method of claim 35, comprising distinguishing a biological interaction between the second agent and the binding partner relative to the agent and the binding partner.
[Claim 37] The method of claim 9, comprising:
Providing a non-colloidal structure, including a plurality of beads, each with an immobilized agent;
Providing a first set and a second set of colloidal particles, wherein the first set has a first putative binding partner of the agent immobilized thereon, respectively, and the second set has immobilized thereon. Each having a second putative binding partner of the identified agent;
Exposing at least a first bead to a first set of particles and at least a second bead to a second set of particles;
Distinguishing the binding of a second set of particles to a bead relative to the binding of a first set of particles to a first bead.
Claim 38: The first and second putative binding partners are presumed to have a biological or chemical interaction with the agent, and the step of distinguishing is between the agent and the first putative binding partner. 38. The method of claim 37, comprising identifying a biological interaction between the agent and the second putative binding partner.
[39] The method according to [1], wherein the non-colloidal structure is a cell.
[40] The method of claim 40, further comprising providing a ligand for a cell surface receptor or protein adapted for binding to the particle, wherein the step of providing comprises binding the particle to the cell by a ligand that interacts with the receptor or protein. 40. The method of claim 39, comprising:
41. The method of claim 39, wherein the ligand is adapted to bind to the particle via a self-assembled monolayer.
[42] The method according to [40], wherein the ligand is a peptide, protein, antibody, enzyme, or small molecule.
43. The method of claim 40, wherein the ligand is adapted to bind to the particle by affinity tag / binding partner binding.
44. The method of claim 40, wherein the ligand is adapted to bind to the particle via a metal binding tag / metal / chelate bond.
45. The method of claim 42, wherein the ligand has a polyamino acid tag and the particle has an immobilized chelate that coordinates the metal.
46. The method of claim 45, wherein the chelate is nitrilotriacetic acid.
47. The method of claim 45, wherein the particles have a self-assembled monolayer comprising nitrilotriacetic acid.
48. The method of claim 45, wherein the particles have a self-assembled monolayer comprising an immobilized chelate.
49. The method of claim 40, comprising exposing the ligand and the particle to a cell, binding the ligand to the particle, and measuring binding of the ligand to a receptor or protein.
50. The method of claim 39, comprising measuring the immobilization of the particle on the cell by measuring a change in the spectrum of electromagnetic radiation that is absorbed or transmitted by interacting with the particle. The described method.
51. The method of claim 39, comprising measuring the immobilization of the particles on the cells electronically.
52. The method of claim 51, comprising measuring the immobilization of the particles on the cells by alternating current voltammetry.
53. The method of claim 50, comprising measuring the immobilization of the particles on the cells by visual inspection.
[Claim 54] The method of claim 39, comprising:
Providing cells that present receptors or proteins on their surface;
Providing colloidal particles; and
Binding of colloid particles to receptors or proteins.
55. The method of claim 54, wherein the colloidal particles include an auxiliary signaling entity.
[Claim 56] The non-colloidal structure is a cell that exposes a receptor or protein on its surface, providing a ligand for the receptor or protein suitable for binding to a particle, and providing a cell between the ligand and the receptor or protein. 2. The method of claim 1, further comprising exposing the cell to a ligand and a particle in the presence of a candidate drug to disrupt the interaction; and measuring the binding of the particle to the cell.
57. The method of claim 57, wherein the measuring step comprises measuring the inhibition of binding of the particle to cells, indicating the effectiveness of the candidate drug in interfering with the receptor or protein / target protein interaction. Item 56. The method according to Item 56.
[Claim 58] providing at least the first and second cells at different locations;
Ligand and colloid particles for a cell receptor or protein of the first cell, ligand adapted for binding to the particle, and first candidate for disrupting the interaction between the ligand and the receptor or protein in the first cell Exposure to drugs; and
Adding to the second cell a ligand and a colloid, and a second candidate drug to disrupt the interaction between the ligand and the receptor or protein; and
Distinguishing the binding of the particles to the second cell relative to the first cell;
57. The method of claim 56, comprising:
59. The method of claim 1, wherein the non-colloidal structure is a cell that exposes a receptor or protein on its surface, further comprising:
Providing at least two cells at different locations;
Exposing each cell to a different target protein for a cell receptor or protein and colloid particles adapted for binding to the respective target protein; and
Measuring the binding of the particles to the cells, representing the binding of the different target proteins to the cell receptor or protein.
60. The method of claim 9, wherein the non-colloidal structure is a magnetic bead and the colloidal particles include ancillary signaling entities.
61. The method of claim 60, wherein the signaling entity is a metallocene.
62. The method of claim 60, wherein the signaling entity is ferrocene or a ferrocene derivative.
63. The method of claim 60, comprising exposing the particles to the beads in the presence of the agent and the binding partner, and further in the presence of an enzyme capable of cleaving the agent and the binding partner.
64. The method of claim 63, comprising first exposing the agent and the binding partner to the enzyme and then exposing the particles and beads to the agent and the binding partner.
65. The method of claim 63, comprising exposing the particles to the beads in the presence of an agent, a binding partner, and an enzyme, and further in the presence of a candidate drug to modulate enzyme activity.
66. The method of claim 65, wherein the binding partner comprises an enzymatically cleavable protein or peptide.
67. The method of claim 66, wherein the protein is adapted for binding to colloid particles and to beads.
68. The method of claim 67, wherein the protein comprises a metal binding tag and biotin, one of the colloids or beads comprises a chelate that coordinates the metal, and the other colloid or beads comprises streptavidin. Method.
69. The method of claim 67, wherein the protein comprises a metal binding tag and biotin, the colloid comprises a chelate for coordinating the metal, and the beads comprise streptavidin.
70. The method of claim 60, wherein the signaling entity is a metallocene and the binding partner comprises a protein cleavable by an enzyme, wherein the enzyme is present in the presence of the agent, the binding partner, and the enzyme. Measuring the proximity of the metallocene to the electrode by exposing the particles to the beads in the presence of candidate drugs for modulation of activity, magnetically attracting the beads near the electrode, and activating the electrode Measuring the effectiveness of a drug candidate that thereby inhibits the cleavage activity of the enzyme.
71. An entity that is adapted to bind to both colloidal and non-colloidal structures in the presence of both an enzyme capable of cleaving the entity and a candidate drug for modulating enzyme activity. 2. The method of claim 1, comprising exposing the non-colloidal structure.
72. The method of claim 71, wherein the non-colloidal structure is a magnetic bead and the colloidal particles have immobilized electroactive species, wherein the bead is magnetically attracted near the electrode. And measuring the proximity of the electroactive species to the electrode by activating the electrode, thereby determining the efficacy of a drug candidate that inhibits the cleavage activity of the enzyme.
73. The method of claim 71, wherein the non-colloidal structure is the surface of the electrode and the colloidal particles have immobilized electroactive species, wherein the electrode comprises both colloidal particles, both colloidal particles and the electrode. Exposure to entities, enzymes, and candidate drugs that are compatible with binding to, and the proximity of the electroactive species to the electrode by activating the electrode, thereby inhibiting drug cleavage activity of the enzyme Said method comprising measuring the efficacy of
[Claim 74] The colloid particles and the non-colloid structure are converted into a substrate of an enzyme suitable for binding to the non-colloid structure, a molecular species suitable for binding to the particles and capable of binding to the substrate by enzymatic activity, and an enzyme for the substrate. 2. The method of claim 1, comprising exposing.
75. The method of claim 74, further comprising exposing the colloidal particles and the non-colloidal structure to a candidate drug for modulating enzyme activity.
76. The method of claim 74, wherein the non-colloidal structure is a magnetic bead and the colloidal particle has an immobilized electroactive entity, wherein the method magnetically attracts the bead to an electrode. And measuring the proximity of the electroactive entity to the electrode by activating the electrode, thereby determining the effectiveness of the drug candidate in modulating the activity of the enzyme.
77. The method of claim 74, wherein the non-colloidal structure is a surface of the electrode and the colloidal particles have an immobilized electroactive entity, wherein the electrode surface comprises colloidal particles, a substrate, an enzyme, The method comprising exposing to a candidate drug and determining the proximity of the electroactive entity to the electrode by activating the electrode, thereby determining the effectiveness of the drug candidate in modulating the activity of the enzyme. .
78. The method of claim 74, wherein the non-colloidal structure is a magnetic bead.
79. The method of claim 78, wherein the colloidal particles include an auxiliary signaling entity.
80. The method of claim 78, wherein the signaling entity is a metallocene.
[81] The method of [78], wherein the signaling entity is ferrocene or a ferrocene derivative.
82. The method of claim 78, comprising exposing the particles to the beads in the presence of a substrate and a binding partner, as well as in the presence of a candidate drug to modulate enzyme activity.
83. The method of claim 82, wherein the binding partner is adapted to bind to the particle via a metal binding tag / metal / chelate bond and the substrate is adapted to bind to the beads via a biotin / streptavadin bond. the method of.
84. The method of claim 82, wherein the signaling entity is a metallocene, wherein the beads are magnetically attracted near the electrode, and the proximity of the metallocene to the electrode by activating the electrode. Measuring the efficacy of a drug candidate that thereby modulates enzyme activity.
85. A method comprising signaling a single bond of a first biological or chemical agent to a second biological or chemical agent by a plurality of signaling entities.
86. The method of claim 85, comprising signaling a single binding simultaneously by a plurality of signaling entities.
87. Providing a first agent having a plurality of signaling entities, binding the first agent to a second agent, and measuring binding with the signaling entity. 86. The method of claim 85, wherein
88. The method of claim 87, wherein the first agent binds to the particle to which the signaling entity has been immobilized.
89. The method of claim 87, wherein the first agent is attached to the signaling entity by a polymer.
90. The method of claim 87, wherein the first agent binds to the signaling entity via a dendrimer.
91. The method of claim 87, wherein the first agent is a biological or chemical ligand and the second agent is a cell that presents a receptor or protein on its surface. Wherein said ligand comprises binding to a receptor or protein.
92. The method of claim 87, wherein the plurality of signaling entities comprises a plurality of signaling entities attached to a polymer attached to the first agent.
93. The method of claim 87, wherein the plurality of signaling entities comprises a plurality of signaling entities bound to a dendrimer bound to a first agent.
94. The method of claim 87, wherein the first agent is immobilized on colloidal particles comprising a plurality of immobilized signaling entities.
95. The method of claim 85, wherein said plurality of signaling entities comprises a plurality of electroactive molecules.
96. The method of claim 95, wherein the plurality of electroactive molecules comprises a plurality of metallocenes.
97. The method of claim 95, wherein said plurality of electroactive molecules comprises a plurality of ferrocenes or ferrocene derivatives.
98. The method of claim 92, wherein the polymer is attached to the first agent via an affinity tag / binding partner binding.
99. The method of claim 92, wherein the polymer is attached to the first agent via a binding tag / metal / chelate linkage.
100. The method of claim 99, wherein the first agent has a polyamino acid tag and the polymer has a chelate that coordinates the metal.
101. The method of claim 92, wherein the dendrimer binds to the first agent via a binding tag / metal / chelate bond.
102. The method of claim 101, wherein the first agent has a polyamino acid tag and the dendrimer has a chelate that coordinates the metal.
Claim 103. At least one of the ancillary signaling entities is a dye, dye, electroactive molecule, fluorescent moiety, up-regulating fluorophore, or enzyme-linked signaling moiety comprising horseradish peroxidase and alkaline phosphatase. 86. The method of claim 85, comprising:
[104] A method comprising measuring a protein / ligand interaction in the absence of SPR without labeling either the protein or the ligand.
Claim 105. Exposing a protein suspected of interacting with the ligand with the ligand, ie, a ligand having an electroactive entity that has an electroactive signal dependent on the proximity to the protein and which is in a close proximity to the electroactive entity. 105. The method of claim 104, wherein
106. The method of claim 104, wherein the electroactive entity has an electroactive signal that can change depending on a change in proximity between the electroactive entity and the protein.
107. The method of claim 104, comprising exposing the protein to a surface on which the ligand and the electroactive entity are both immobilized.
108. The method of claim 107, wherein the surface is a surface of an electrode.
109. The method of claim 107, wherein the ligand and the electroactive entity each form part of a self-assembled monolayer on the surface.
110. The method of claim 109, wherein the self-assembled monolayer comprises a species that promotes the permeability of the self-assembled monolayer for electrons.
111. The method of claim 110, wherein the species that promotes permeability to electrons include conductive self-assembled monolayer-forming species.
112. The method of claim 110, wherein the species that promotes permeability to electrons include species that create defect sites in the self-assembled monolayer.
113. The method of claim 104, wherein the electroactive entity comprises a metallocene.
114. The method of claim 104, wherein the electroactive entity comprises ferrocene or a ferrocene derivative.
115. The method of claim 104, wherein the electroactive entity comprises ferrocene dicarboxylic acid.
116. The method of claim 109, wherein the ligand binds to the self-assembled monolayer-forming species by affinity tag / binding partner binding.
117. The method of claim 109, wherein the ligand binds to the self-assembled monolayer-forming species via a metal binding tag / metal / chelate bond.
[Claim 118] A method comprising:
a) a solution comprising i) a colloid which comprises a ligand capable of interacting with a cell surface molecule; and ii) a composition comprising an electrode comprising a growing cell, wherein said cell comprises said ligand. Including at least one cell surface molecule capable of interacting).
b) adding at least a portion of the colloid to the composition.
[Claim 119] The method of claim 118, further comprising:
c) detecting the aggregation of the colloid as a measure of the interaction between the ligand and the cell surface molecule.
120. The method of claim 118, wherein said colloid is gold colloid.
121. The method of claim 120, wherein prior to step (a), the colloidal gold is treated to incorporate thiol groups.
122. The method of claim 118, wherein prior to step (a), said ligand is derivatized with a moiety having a binding partner.
123. The method of claim 122, wherein prior to step (a), said ligand is derivatized with a moiety capable of binding a metal chelate.
124. The method of claim 123, wherein said moiety comprises a histidine tag.
[Claim 125] A method comprising:
a) a solution comprising i) a colloid, said colloid comprising a ligand capable of interacting with a cell surface molecule; ii) a candidate drug; and iii) a composition comprising an electrode comprising growing cells (the cells comprising Comprises at least one cell surface molecule capable of interacting with said ligand).
b) mixing at least a portion of the colloid with the drug and the composition.
126. A method comprising recruiting an electronic signaling entity to an electrode using a magnetic material.
127. The method of claim 126, comprising partially recruiting the signaling entity to the electrode by a protein / protein bond involved in immobilization between the signaling entity and the magnetic beads.
Claim 128. The method of claim 127 wherein the protein / protein binding involves a protein that is not an antibody.
129. An article comprising a surface and a ligand suspected of interacting with a protein and an electroactive entity immobilized on the surface, respectively.
130. The article of claim 129, further comprising a species that promotes the permeability of the surface of the immobilized electrons with respect to the surface.
131. An article comprising a first biological or chemical agent immobilized with respect to a plurality of signaling entities that is capable of biological or chemical binding to a second agent.
132. The article of claim 131, wherein the first agent binds to a particle to which the signaling entity is immobilized.
133. The article of claim 131, wherein the first agent is immobilized on the signaling entity by a polymer.
134. The article of claim 131, wherein the first agent is immobilized on the signaling entity by a dendrimer.
135. An article having a surface and a self-assembled monolayer formed on the surface of the article, wherein the monolayer comprises a first molecular species (electrical communication between the surface and the fluid to which the surface is exposed). And a second molecular species (having a different molecular structure from the first species, having a molecular structure that promotes self-assembly at the surface with other first molecular species in a tightly packed manner so as to prevent The above-described article causes a disruption of the packed self-assembled structure, causing defects in the tightly packed structure and allowing electrical communication of the surface with the fluid to which the surface is exposed.
136. The article of claim 35, wherein the first species is essentially linear and the second species includes at least one non-linear portion.
137. The first molecule and one or more signaling entities bound to a solid support, wherein the first molecule is a ligand capable of interacting with a cell surface receptor or protein. Composition.
138. The composition of claim 137, wherein said solid support is a colloid.
139. The composition of claim 138, wherein said colloid is gold colloid.
140. The composition of claim 138, wherein said ligand is covalently linked directly to said colloid.
141. The composition of claim 138, wherein said signaling entity is an electroactive molecule.
142. The composition of claim 141, wherein said electroactive molecule comprises ferrocene or a ferrocene derivative.
143. The composition of claim 137, wherein said ligand is a peptide.
144. The composition of claim 143, wherein said peptide is derivatized with a moiety capable of binding a metal chelate.
145. The composition of claim 144, wherein said moiety comprises a histidine tag.
146. The composition of claim 144, wherein said solid support comprises a metal chelate, and wherein said peptide is attached to said solid support by attachment of said moiety to said metal chelate.
147. The composition of claim 137, wherein the solid support comprises a monolayer of the second molecule.
148. The composition of claim 147, wherein said monolayer is a self-assembled monolayer.
149. The composition of claim 147, wherein said second molecule is a thiol.
150. A composition comprising a first molecule, a second molecule and a third molecule bound to a solid support, wherein said first molecule comprises a ligand capable of interacting with a cell surface receptor or protein, Here, the second molecule forms a monolayer on the solid support, and wherein the third molecule is electroactive.
[151] The composition of claim 150, wherein the solid support is a colloid.
[152] The composition according to [151], wherein the colloid is a gold colloid.
153. The composition of claim 151, wherein said ligand is directly covalently bound to said colloid.
154. The composition of claim 153, wherein said electroactive molecule comprises ferrocene or a ferrocene derivative.
155. The composition of claim 153, wherein said ligand is a peptide.
156. The composition of claim 155, wherein said peptide is derivatized with a moiety capable of binding to a metal chelate.
157. The composition of claim 156, wherein said moiety comprises a histidine tag.
158. The composition of claim 156, wherein said solid support comprises a metal chelate, and wherein said peptide is attached to said solid support by attachment of said moiety to said metal chelate.
159. The composition of claim 137, wherein said solid support is a liposome.
160. The composition of claim 147, wherein said liposome comprises at least one lipid containing a reactive group.
161. An article comprising a metal support constructed and arranged to support cell growth on a surface, wherein the metal support comprises a monolayer of at least one type of molecule. The molecular layer is designed so that the metal support can be used as an electrode.
162. The article of claim 161, further comprising cells growing on a metal support.
[Claim 163] A composition comprising:
Colloid particles
A signaling entity immobilized with respect to the colloid particles; and
Protein immobilized with respect to colloid particles.
[Claim 164] A composition comprising:
A polymer or dendrimer having a plurality of signaling entities adapted to bind to a biological or chemical agent.
165. The species of claim 164, wherein the polymer or dendrimer is adapted to bind to a chemical or biological agent via a metal binding tag / metal / chelate bond.
166. The species of claim 164, wherein the polymer or dendrimer has a chelate that can coordinate a metal.
167. The species of claim 164, wherein the polymer or dendrimer has multiple electroactive species.
168. The species of claim 164, wherein the polymer or dendrimer has multiple metallocenes.
169. The species of claim 164, wherein the polymer or dendrimer has more than one ferrocene or ferrocene derivative.
170. An article comprising colloid particles immobilized on a glutathione derivative and at least one signaling entity.
[171] An article comprising a colloid particle having a self-assembled monolayer containing a glutathione derivative on its surface.
172. The method of claim 1, wherein the non-colloidal structure is a biological sample.
173. The method of claim 172, wherein the biological sample is taken from a human or animal.
174. The method of claim 173, wherein the biological sample comprises a cell or tissue section.
[Claim 175] providing at least a first and a second biological sample;
Exposing the first and second samples to colloidal particles with immobilized species that are presumed to have or have the binding partner presented by the sample;
172. The method of claim 172 comprising:
176. The method of claim 175, wherein the first and second biological samples are samples with different states of infection or disease.
177. The method of claim 175, comprising measuring a difference between binding to a different sample and binding of the colloid particles to the first sample.
178. The method of claim 177, wherein the differences include differences in binding levels.
179. The method of claim 177, wherein the difference is a difference in the pattern of colloid immobilization.
180. The method of claim 175, further comprising measuring the immobilization of the colloid particles on either or both of the samples.
Claim 181. The biological sample or source thereof is pretreated with a candidate drug expressed by the sample for the modification of a disease state that can be measured by the expression level and / or pattern of the binding partner. 175.
182. The non-colloidal structure includes an article having a surface, and a self-assembled monolayer formed at the surface of the article, wherein the monolayer comprises a first molecular species (a fluid and a surface to which the surface is exposed). A mixture of a second molecular species (including a molecular wire) and a second molecular species (including molecular wires) that disrupts electrical communication with and promotes self-assembly at the surface with other first molecular species in a tightly packed manner. The method of claim 1, comprising:
183. The method of claim 1, wherein the non-colloidal structure is a solid support.
184. The method of claim 183, wherein the surface is a surface of an electrode.
185. The method of claim 183, further comprising a ligand and an electroactive entity that respectively form part of a self-assembled monolayer at the surface of the colloid particles.
186. The method of claim 185, wherein the self-assembled monolayer comprises a species that promotes the permeability of the self-assembled monolayer for electrons.
187. The method of claim 186, wherein the species that promotes electron transmission comprises a conductive self-assembled monolayer-forming species.
188. The method of claim 186, wherein the species that promote electron permeability include species that create defect sites in the self-assembled monolayer.
189. The method of claim 104, wherein the electroactive entity comprises ferrocene dicarboxylic acid.
190. The method of claim 185, wherein the ligand binds to the self-assembled monolayer forming species via a metal binding tag / metal / chelate bond.
191. The method of claim 183, wherein the solid support comprises a substantially planar substrate.
192. The method of claim 183, wherein the surface of the article has a self-assembled monolayer.
193. The method of claim 192, wherein the self-assembled monolayer is a conductive self-assembled monolayer.
194. The method of claim 192, wherein the self-assembled monolayer includes a binding partner for an affinity tag.
195. The method of claim 194, wherein the binding partner is a chelate capable of coordinating a metal.
196. The method of claim 194, wherein the binding partner of the affinity tag comprises glutathione or biotin.
197. The method of claim 193, further comprising a chemical or biological agent immobilized on the self-assembled monolayer by EDC / NHS coupling chemistry.
198. The method of claim 193, comprising a plurality of chemical or biological binding partners immobilized on the self-assembled monolayer and optionally distributed across the self-assembled monolayer. Method.
199. The method of claim 193, wherein the self-assembled monolayer comprises an isolated region that further includes a unique chemical or biological binding partner immobilized thereon, respectively.
[Claim 200] A chemical or biological molecule immobilized on a colloidal structure which is suspected to be a binding partner or a chemical or biological agent immobilized on the surface of the article 182. The method of claim 182, comprising a biological agent.
[201] The method of [200], wherein the colloidal particles comprise an auxiliary signaling entity.
202. The method of claim 200, further comprising a self-assembled monolayer on the surface of the colloid particles.
203. The method of claim 201, wherein the auxiliary signaling entity is an electroactive signaling entity.
204. The method of claim 201, wherein the auxiliary signaling entity is a visible signaling entity.