JP2003513883A - ホスホロアミダイト組成物を用いるオリゴマー合成法 - Google Patents

Abstract

(57)【要約】 ホスホロアミダイト組成物を用い、オリゴマーを調製する合成法が提供される。他の共有結合を含んでもよい、ホスホジエステル、ホスホロチオエート、ホスホロジチオエート共有結合を有するオリゴマーが調製される。やはり提供されるのは、こうした方法に有用な組成物である。

Description

【発明の詳細な説明】

【０００１】

【発明の分野】

本発明は、ホスファイト、ホスホジエステル、ホスホロチオエート、またはホ
スホロジチオエートを有するオリゴマーの調製のためホスホロアミダイト組成物
を用いる方法に関する。

【０００２】

【発明の背景】

オリゴヌクレオチドおよびその類似体は、分子生物学の多様な方法において、
プローブ、プライマー、リンカー、アダプター、および遺伝子断片として開発さ
れ、そして用いられてきている。これらの方法に用いられるオリゴヌクレオチド
の修飾には、非同位体標識、例えばフルオレセイン、ビオチン、ジゴキシゲニン
、アルカリホスファターゼ、または他のリポーター分子での標識が含まれる。生
じた類似体のヌクレアーゼ安定性を増加させるために、リボースリン酸骨格への
他の修飾が行われてきている。こうした修飾の例には、メチルホスホネート、ホ
スホロチオエート、またはホスホロジチオエート結合、および２’−Ｏ−メチル
リボース糖単位の取り込みが含まれる。さらなる修飾には、取り込みおよび細胞
分布を調節するために行われるものが含まれる。これらの化合物は、診断および
療法使用両方で成功しており、改善されたオリゴヌクレオチドおよびその類似体
に関する、継続する要求が存在する。

【０００３】 大部分の疾患状態を含む、多細胞生物の身体状態のほとんどは、タンパク質に
より生み出されることが周知である。こうしたタンパク質は、直接またはその酵
素的または他の機能を通じて作用し、動物およびヒトにおいて、多くの疾患およ
び制御機能に、大きな割合で貢献する。疾患状態では、古典的な療法は、一般的
に、こうしたタンパク質との相互作用に焦点を置き、それらの疾患誘引または疾
患助長機能を和らげるよう努めている。より新しい療法的アプローチでは、こう
したタンパク質の実際の産生を調節することが望ましい。タンパク質産生に干渉
することにより、最小限の副作用で最大限の療法効果を得ることが可能である。
したがって、望ましくないタンパク質形成を導くであろう遺伝子発現に干渉する
または別のやり方で該発現を調節するのが、こうした療法アプローチの一般的な
目的である。

【０００４】 特定の遺伝子発現を阻害するための１つの方法は、オリゴヌクレオチド、特に
特定の標的メッセンジャーＲＮＡ（ｍＲＮＡ）配列に相補的なオリゴヌクレオチ
ドの使用を伴うものである。いくつかのオリゴヌクレオチドが、こうした使用に
関し、現在、臨床試験を受けている。ホスホロチオエートオリゴヌクレオチドは
、抗ウイルス剤としての使用を含め、多様な疾患状態に対するヒト臨床試験にお
けるこうしたアンチセンス剤として用いられている。 転写因子は、転写制御中、二本鎖ＤＮＡと相互作用する。オリゴヌクレオチド
は、転写因子の競合的阻害剤として働き、それらの作用を調節することが可能で
ある。いくつかの最近の報告は、こうした相互作用を記載する（Ｂｉｅｌｉｎｓ
ｋａ，Ａ．ら，Ｓｃｉｅｎｃｅ，１９９０，２５０，９９７−１０００；および
Ｗｕ，Ｈ．ら，Ｇｅｎｅ，１９９０，８９，２０３−２０９を参照されたい）。 タンパク質の間接および直接制御因子としてのこうした使用に加え、オリゴヌ
クレオチドおよびその類似体はまた、診断試験における使用も見出してきている
。こうした診断試験は、体液、組織、無傷細胞または単離細胞構成要素を用いて
行ってもよい。遺伝子発現阻害と同様、診断適用は、オリゴヌクレオチドおよび
その類似体が核酸相補鎖にハイブリダイズする能力を利用する。ハイブリダイゼ
ーションは、ワトソン−クリックおよび／またはフーグスティーン塩基対を介し
たＲＮＡまたはＤＮＡへのオリゴマー化合物の配列特異的水素結合である。こう
した塩基対の塩基は、互いに相補的であると言われる。

【０００５】 オリゴヌクレオチドおよびその類似体はまた、研究試薬としても広く用いられ
ている。これらは、多くの他の生物学的分子の機能を理解するために、並びに他
の生物学的分子の調製において有用である。例えば、オリゴヌクレオチドおよび
その類似体を、ＰＣＲ反応のプライマーとして用いることにより、拡大する商業
的産業が生じてきている。ＰＣＲは、商業的および研究実験室の主力となってき
ており、そしてＰＣＲの適用は増大してきている。例えば、ＰＣＲ技術は、現在
、法医学、古生物学、進化的研究および遺伝子カウンセリングに使用が見出され
ている。商業化は、分子生物学のトレーニングを受けていない人員がＰＣＲを適
用するのを補助するキットの開発につながった。天然および合成両方のオリゴヌ
クレオチドおよびその類似体が、こうしたＰＣＲ技術のプライマーとして使用さ
れる。

【０００６】 オリゴヌクレオチドおよびその類似体はまた、他の実験室法においても用いら
れる。これらの使用のいくつかは、一般的な実験室マニュアル、例えば、Ｍｏｌ
ｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ，Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ，第
２版，Ｊ．Ｓａｍｂｒｏｏｋら監修，Ｃｏｌｄ Ｓｐｒｉｎｇ Ｈａｒｂｏｒ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｐｒｅｓｓ，１９８９；およびＣｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏ
ｔｏｃｏｌｓ Ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ，Ｆ．Ｍ．Ａｕｓｕ
ｂｅｌら監修，Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｕｂｌｉｃａｔｉｏｎｓ，１９９３に記載さ
れる。こうした使用には、合成オリゴヌクレオチドプローブとしてのもの、抗体
およびオリゴマー化合物を用いた発現ライブラリーのスクリーニング、ＤＮＡ配
列決定、ポリメラーゼ連鎖反応によるＤＮＡのｉｎ ｖｉｔｒｏ増幅におけるも
の、およびクローニングされたＤＮＡの部位特異的突然変異誘発におけるものが
含まれる。Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｃｌｏｎｉｎｇ，Ａ Ｌａｂｏｒａｔｏｒｙ Ｍａｎｕａｌ、上記のＢｏｏｋ２を参照されたい。Ｃｕｒｒｅｎｔ Ｐｒｏｔｏ
ｃｏｌｓ Ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ、上記のＶｏｌ．２の“
ＤＮＡ−ｐｒｏｔｅｉｎ ｉｎｔｅｒａｃｔｉｏｎｓ ａｎｄ Ｔｈｅ Ｐｏｌ
ｙｍｅｒａｓｅ Ｃｈａｉｎ Ｒｅａｃｔｉｏｎ" も参照されたい。

【０００７】 オリゴヌクレオチドおよびその類似体は、望ましい使用に合わせることが可能
な特別の特性を持つよう合成することが可能である。したがって、診断法におい
て、研究試薬として、そして療法的存在物としての有用さを増加させる、いくつ
かの化学的修飾が、オリゴヌクレオチドに導入されてきている。こうした修飾に
は、標的鎖への結合を増加させる（すなわちその融点、Ｔｍを増加させる）ため
に、オリゴヌクレオチドまたはオリゴヌクレオチド−標的複合体の同定を補助す
るために、細胞浸透を増加させるために、オリゴヌクレオチドおよびその類似体
の構造または活性を崩壊させるかまたはこれらに干渉するヌクレアーゼおよび他
の酵素に対し安定化させるために、配列特異的に標的に結合したときに破壊（終
結事象）の様式を提供するために、そして、オリゴヌクレオチドの薬物動態特性
を改善するために設計されたものが含まれる。

【０００８】 化学文献は、リン含有共有結合を通じ、ヌクレオシドをカップリングし、定義
された配列のオリゴヌクレオチドを生じるための、多くの公知のプロトコルを開
示する。最も日常的に用いられるプロトコルの１つは、ホスホロアミダイトプロ
トコルであり（例えば、Ａｄｖａｎｃｅｓ ｉｎ ｔｈｅ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ
ｏｆ Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ ｂｙ ｔｈｅ Ｐｈｏｓｐｈｏｒ
ａｍｉｄｉｔｅ Ａｐｐｒｏａｃｈ，Ｂｅａｕｃａｇｅ，Ｓ．Ｌ．；Ｉｙｅｒ，
Ｒ．Ｐ．，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ，１９９２，４８，２２２３−２３１１およ
びそれらに引用される参考文献を参照されたい）、フリーのヒドロキシル基を有
するヌクレオシドまたはオリゴヌクレオチドを、弱酸の存在下で、保護されたシ
アノエチルホスホロアミダイト単量体と反応させ、亜リン酸結合構造を形成する
ものである。亜リン酸結合の酸化後、シアノエチル基を加水分解すると、望まし
いホスホジエステルまたはホスホロチオエート結合が生じる。

【０００９】 ホスホロアミダイトは、多様な商業的供給元（Ｇｌｅｎ Ｒｅｓｅａｒｃｈ、
バージニア州スターリング；Ａｍｅｒｓｈａｍ Ｐｈａｒｍａｃｉａ Ｂｉｏｔ
ｅｃｈ Ｉｎｃ．、ニュージャージー州ピスカタウェイ；Ｃｒｕａｃｈｅｍ Ｉ
ｎｃ．、ペンシルバニア州アストン；Ｃｈｅｍｇｅｎｅｓ Ｃｏｒｐｏｒａｔｉ
ｏｎ、マサチューセッツ州ウォルサム；Ｐｒｏｌｉｇｏ ＬＬＣ、コロラド州ボ
ールダー；ＰＥ Ｂｉｏｓｙｓｔｅｍｓ、カリフォルニア州フォスターシティー
；Ｂｅｃｋｍａｎ Ｃｏｕｌｔｅｒ Ｉｎｃ．、カリフォルニア州フラートンが
含まれる）より商業的に入手可能である。商業的に入手可能なホスホロアミダイ
トの純度は、一般的に９８または９９％程度である。いくつかの商業的供給元は
標準を設定し、そしてすべてのホスホロアミダイトは、設定標準と等しいかまた
はそれより高い純度であると主張する。あるいは、いくつかの商業的供給元は、
送付したホスホロアミダイトの各バッチに関するアッセイ結果を含める。商業的
に入手可能なホスホロアミダイトは、大部分、自動化ＤＮＡ合成のために調製さ
れ、そしてこうしたものとして、望ましいオリゴヌクレオチド配列を合成するた
め、すぐ使用できるように調製される。当該技術分野では、合成中の適切なカッ
プリング効率には、高純度が必須であると教えられている。

【００１０】 商業的に入手可能なホスホロアミダイトに適用する、厳格な品質保証規準の代
表的な例は、Ｇｌｅｎ Ｒｅｓｅａｒｃｈカタログに例示される。合成および精
製後、各ホスホロアミダイトを、品質保証試験に供する。これらの試験に含まれ
るのは、ＨＰＬＣ精製であり、この結果を用い、特定のアミダイトの同一性およ
び純度を確立する。さらなる試験には、ＴＬＣ、³¹Ｐ ＮＭＲ、カップリング試
験、溶液試験、および乾燥試験の損失が含まれる。本供給源由来のこれらのアミ
ダイトの閾値純度は、９８％より大きく設定される。製造者は、ホスホロアミダ
イト以外に、他のリン種が存在しないことを、³¹Ｐ ＮＭＲにより、さらに決定
する。

【００１１】 オリゴヌクレオチド合成は、望ましい産物または相応な純度を有する相応な量
の産物を得るのに、ほとんど無菌的な環境を必要とすると報告されている実施と
して発展してきている。この定説は、オリゴヌクレオチドおよび類似体の合成に
関するいくつかの書物で強調されている。Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ ａｎｄ Ａｎａｌｏｇｕｅｓ，Ａ Ｐｒａｃｔｉｃａｌ Ａｐｐｒｏａｃｈ， Ｅｃｋｓｔｅｉｎ監修，ＩＲＬ Ｐｒｅｓｓ；ニューヨーク，１９９１では、カ
ップリング効率、例えば平均工程収率は、産物オリゴヌクレオチドの総収率およ
び純度における主な要因であると言及される。例えば、９９．５％のカップリン
グ効率は、２０量体合成の総収率、９０．９％を生じるであろう。カップリング
効率がわずか９０％に減少すると、２０量体の総収率は、１３．５％に落ちる。
したがって、カップリング効率は、特に、約１０量体より大きいオリゴヌクレオ
チドに関し、非常に抑制的である（９０％カップリング効率で、３８．７％の総
収率）。９８％未満のカップリング効率は、より長い配列の日常的なオリゴヌク
レオチド合成に、完全に許容し得ないことがさらに言及される。低収率から直接
生じる別の要因は、最終オリゴヌクレオチドの精製が、はるかにより困難でそし
て高価になることである。優れた平均カップリング効率を達成するため、優れた
品質の試薬の使用が強調される。

【００１２】 Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ，ａ Ｐｒａｃｔｉｃ
ａｌ Ａｐｐｒｏａｃｈ，Ｇａｉｔ監修，ＩＲＬ Ｐｒｅｓｓ；ニューヨーク，
１９８４は、オリゴヌクレオチド合成を詳述する、別の刊行物である。これもま
た、「最高純度の試薬バッチ」を用いる重要性を強調する。各カップリングでの
不純物の影響は集積的であり、合成後の最終オリゴヌクレオチドからの除去を必
要とすると言及される。こうした不純なオリゴヌクレオチドの精製は、しばしば
、望ましい純度を提供するのに、２つの別個の精製法を必要とすることがさらに
言及される。 オリゴヌクレオチド合成は、古典的には、それ自体困難である、望ましい産物
を得ることを伴ってきた。オリゴヌクレオチド合成は、より最近、キログラム規
模で日常的な合成が行われるところまで発展している。先に進み、次の段階は、
トン規模のオリゴヌクレオチドおよび類似体の合成である。大規模へのオリゴヌ
クレオチド合成技術の発展は、合成法の各側面の再評価を必要とする。１つのこ
うした側面は、オリゴヌクレオチド合成に用いられるホスホロアミダイトの費用
である。

【００１３】 商業的に入手可能な高純度ホスホロアミダイトは、一般的に、オリゴヌクレオ
チド合成の総コストの約４０％を占める。この４０％は、販売前の、ホスホロア
ミダイトの合成およびそれに続くホスホロアミダイトの精製および解析を反映す
る。ホスホロアミダイトの費用の減少は、それから産生されるオリゴヌクレオチ
ドの費用に対し、かなりの影響を有する可能性がある。その結果、当該技術分野
には、これらの問題を克服するであろう合成法への要求が依然としてある。 オリゴヌクレオチド化合物の固相合成に関し、いくつかの方法が既知である。
これらは、一般的に、以下の米国特許第４，４５８，０６６号、１９８４年７月
３日発行；第４，５００，７０７号、１９８５年２月１９日発行；および第５，
１３２，４１８号、１９９２年７月２１日発行に開示される。さらに、ホスホロ
アミダイト中間体を用いたオリゴヌクレオチドの調製法は、米国特許第４，９７
３，６７９号、１９９０年１１月２７日発行に開示される。

【００１４】 ホスホロアミダイト調製法は、米国特許第４，４１５，７３２号、１９８３年
１１月１５日発行に開示される。 ホスホロアミダイトヌクレオシド化合物は、米国特許第４，６６８，７７７号
、１９８７年５月２６日発行に開示される。 β−脱離リン保護基を用いたオリゴヌクレオチド調製法は、米国特許第Ｒｅ．
３４，０６９号、１９９２年９月１５日発行に開示される。 β−脱離またはアリル性リン保護基を用いたオリゴヌクレオチドの調製法は、
米国特許第５，０２６，８３８号、１９９１年６月２５日発行に開示される。

【００１５】

【発明の概要】

本発明は、式：

【００１６】

【化１６】

【００１７】 （式中： Ｘ₁ およびＸ₂ は各々、独立に、ＯまたはＳであり； Ｂｘは保護または未保護複素環塩基部分であり；そして Ｒ₁ は、Ｈ、保護ヒドロキシル基、糖置換基または保護糖置換基である。） の少なくとも１つの部分を有するオリゴマーを調製するための方法であって： （ａ）式：

【００１８】

【化１７】

【００１９】 （式中： Ｔ₁ はヒドロキシル保護基であり；そして Ｔ₂ は固体支持体への共有結合または固体支持体結合ヌクレオシド、ヌクレオ
チド、オリゴヌクレオシドまたはオリゴヌクレオチドである。） の化合物を提供する工程； （ｂ）Ｔ₁ 基を除去して５’−ヒドロキシル基を有する前記化合物を形成する工
程；および （ｃ）５’−ヒドロキシル基を有する前記化合物を、ホスホロアミダイト組成物
で処理して、伸長された化合物を形成する工程であって、前記ホスホロアミダイ
ト組成物が、式：

【００２０】

【化１８】

【００２１】 （式中： Ｔ₃ は保護ヒドロキシル基、ヌクレオシド、ヌクレオチド、オリゴヌクレオシ
ドまたはオリゴヌクレオチドであり； Ｒ₀ はリン保護基であり；そして Ｌ₁ およびＬ₂ は各々、独立に、Ｃ_1-6 アルキルであるか； または、Ｌ₁ およびＬ₂ は、一緒に連結されて、前記Ｌ₁ およびＬ₂ が結合す
る窒素原子を含む４−ないし７−員複素環系であって、場合により、Ｏ、Ｎおよ
びＳから選択される少なくとも１つのさらなるヘテロ原子を含む複素環系を形成
する。） のホスホロアミダイト化合物を含んでなる工程 を含んでなる方法であり、 前記ホスホロアミダイト組成物が、少なくとも約１重量％の少なくとも１つの
３’−ヒドロキシヌクレオシド、前記ホスホロアミダイト化合物と異なるＰ^III 種であって、前記Ｐ^III 種のＰ^III リンへの基の共有結合が酸素またはイオウを
介するＰ^III 種、またはＰ^V 種であって、該Ｐ^V 種への基の共有結合が酸素、イ
オウまたは窒素を介するＰ^V 種をさらに含んでなる方法を開示する。

【００２２】 本発明のいくつかの好ましい方法において、ホスホロアミダイト組成物は、少
なくとも約２重量％の少なくとも１つの３’−ヒドロキシヌクレオシド、前記ホ
スホロアミダイト化合物と異なるＰ^III 種であって、前記Ｐ^III 種のＰ^III リン
への基の共有結合が酸素またはイオウを介するＰ^III 種、またはＰ^V 種であって
、該Ｐ^V 種への基の共有結合が酸素、イオウまたは窒素を介するＰ^V 種を含んで
なる。 本発明の方法は、伸長された化合物を、キャップ剤で処理し、キャップされた
化合物を形成することを含み、これをさらに、酸化剤で処理し、酸化された化合
物を形成してもよい。該方法はまた、酸化された化合物を、該酸化された化合物
を脱保護するのに有効な試薬で処理し、脱保護されたオリゴマーを形成すること
も含む。該方法は、脱保護されたオリゴマーを、固体支持体から該オリゴマーを
切断するのに有効な試薬で処理することをさらに含む。該方法はまた、化合物を
同時に脱保護しそして切断するのに有効な試薬で処理することも含む。該方法は
また、合成が完了した後、５’−ヒドロキシル基を除去することも含む。

【００２３】 好ましい複素環塩基部分には、アデニン、Ｎ⁶ −ベンゾイルアデニン、シトシ
ン、Ｎ⁴ −ベンゾイルシトシン、５−メチルシトシン、Ｎ⁴ −ベンゾイル−５−
メチルシトシン、チミン、ウラシル、グアニン、Ｎ² −イソブチリルグアニンま
たは２−アミノアデニンが含まれる。 本発明の１つの態様において、Ｌ₁ およびＬ₂ は各々、Ｃ_1-6 アルキルである
。好ましい態様において、Ｌ₁ およびＬ₂ は各々、イソプロピルである。別の態
様において、Ｌ₁ およびＬ₂ は、一緒に連結されて、Ｌ₁ およびＬ₂ が結合する
窒素原子を含む４−ないし７−員複素環系であって、場合により、Ｏ、Ｎおよび
Ｓから選択される少なくとも１つのさらなるヘテロ原子を含む複素環系となる。
好ましい複素環系はモルホリンである。

【００２４】 本発明の１つの態様において、各Ｒ₁ は、独立に、Ｈ、ヒドロキシル、Ｃ₁ 〜
Ｃ₂₀アルキル、Ｃ₃ 〜Ｃ₂₀アルケニル、Ｃ₂ 〜Ｃ₂₀アルキニル、ハロゲン、チオ
ール、ケト、カルボキシル、ニトロ、ニトロソ、ニトリル、トリフルオロメチル
、トリフルオロメトキシ、Ｏ−アルキル、Ｓ−アルキル、ＮＨ−アルキル、Ｎ−
ジアルキル、Ｏ−アリール、Ｓ−アリール、ＮＨ−アリール、Ｏ−アラルキル、
Ｓ−アラルキル、ＮＨ−アラルキル、アミノ、Ｎ−フタルイミド、イミダゾール
、アジド、ヒドラジノ、ヒドロキシルアミノ、イソシアナト、スルホキシド、ス
ルホン、スルフィド、ジスルフィド、シリル、アリール、複素環、炭素環、イン
ターカレーター、リポーター分子、コンジュゲート、ポリアミン、ポリアミド、
ポリアルキレングリコールまたはポリエーテルであるか； または、Ｒ₁ は、式ＩまたはII：

【００２５】

【化１９】

【００２６】 （式中： ＥはＣ₁ 〜Ｃ₁₀アルキル、Ｎ( Ｑ₁)（Ｑ₂ ）またはＮ＝Ｃ( Ｑ₁)（Ｑ₂ ）であ
り； Ｑ₁ およびＱ₂ は各々、独立に、Ｈ、Ｃ₁ 〜Ｃ₁₀アルキル、ジアルキルアミノ
アルキル、窒素保護基、拘束または非拘束コンジュゲート基、固体支持体へのリ
ンカーであるか； または、Ｑ₁ およびＱ₂ は、一緒になって、窒素保護基、または場合によりＮ
およびＯから選択される少なくとも１つのさらなるヘテロ原子を含む環構造を形
成し； ｑ¹ は１から１０の整数であり； ｑ² は１から１０の整数であり； ｑ³ は０または１であり； ｑ⁴ は０、１または２であり； Ｚ₄ はＯＭ₁ 、ＳＭ₁ またはＮ（Ｍ₁)₂ であり； 各Ｍ₁ は、独立に、Ｈ、Ｃ₁ 〜Ｃ₈ アルキル、Ｃ₁ 〜Ｃ₈ ハロアルキル、Ｃ（
＝ＮＨ）Ｎ（Ｈ）Ｍ₂ 、Ｃ（＝Ｏ）Ｎ（Ｈ）Ｍ₂ またはＯＣ（＝Ｏ）Ｎ（Ｈ）Ｍ ₂ であり； Ｍ₂ はＨまたはＣ₁ 〜Ｃ₈ アルキルであり； Ｚ₁ 、Ｚ₂ およびＺ₃ は各々、独立に、Ｃ₄ 〜Ｃ₇ シクロアルキル、Ｃ₅ 〜Ｃ ₁₄ アリールまたはＣ₃ 〜Ｃ₁₅ヘテロシクリルであり；そして Ｚ₅ はＣ₁ 〜Ｃ₁₀アルキル、Ｃ₁ 〜Ｃ₁₀ハロアルキル、Ｃ₂ 〜Ｃ₁₀アルケニル
、Ｃ₂ 〜Ｃ₁₀アルキニル、Ｃ₆ 〜Ｃ₁₄アリール、Ｎ（Ｑ₁ )(Ｑ₂ ）、ＯＱ₁ 、ハ
ロ、ＳＱ₁ またはＣＮである。） を有する。

【００２７】 前記ヘテロシクリル基のヘテロ原子が、酸素、窒素およびイオウから選択され
ることが好ましい。本発明の１つの態様において、リン保護基は、Ｘ₃ −Ｊであ
り、ここで、Ｘ₃ はＯまたはＳである。好ましい態様において、ＪはＣＨ₂ ＣＨ ₂ ＣＮ、ジフェニルシリルエチル、δ−シアノブテニル、シアノｐ−キシリル（
ＣＰＸ）、メチル−Ｎ−トリフルオロアセチルエチル（ＭＥＴＡ）またはアセト
キシフェノキシエチル（ＡＰＯＥ）である。 本発明は、以下に示す式：

【００２８】

【化２０】

【００２９】 （式中： 各Ｘ₂ は、独立に、ＯまたはＳであり； 各ＪはＣＨ₂ ＣＨ₂ ＣＮ、ジフェニルシリルエチル、δ−シアノブテニル、シ
アノｐ−キシリル（ＣＰＸ）、メチル−Ｎ−トリフルオロアセチルエチル（ＭＥ
ＴＡ）またはアセトキシフェノキシエチル（ＡＰＯＥ）であり； 各Ｔ₄ は、独立に、ヒドロキシル基または保護ヒドロキシル基であり； 各Ｒ₀ はリン保護基であり； Ｌ₁ およびＬ₂ は各々、独立に、Ｃ_1-6 アルキルであるか； または、Ｌ₁ およびＬ₂ は、これらが結合する窒素原子で一緒に連結されて、
４−ないし７−員複素環系であって、場合により、Ｏ、ＮおよびＳから選択され
る少なくとも１つのさらなるヘテロ原子を含む複素環系を形成し； 各Ｂｘは保護または未保護複素環塩基部分であり；そして 各Ｒ₁ は、独立に、Ｈ、保護ヒドロキシル基、糖置換基または保護糖置換基で
ある。） の１つの少なくとも１つの化合物を有する組成物を含む。

【００３０】 本発明の１つの態様において、ホスホロアミダイト組成物は、少なくとも約９
８重量％のホスホロアミダイト化合物を含んでなる。別の態様において、ホスホ
ロアミダイト組成物は、少なくとも約９７重量％のホスホロアミダイト化合物を
含んでなる。さらに別の態様において、ホスホロアミダイト組成物は、少なくと
も約９５重量％のホスホロアミダイト化合物を含んでなる。別の好ましい態様に
おいて、ホスホロアミダイト組成物は、少なくとも約９０重量％のホスホロアミ
ダイト化合物を含んでなる。より好ましい態様において、ホスホロアミダイト組
成物は、少なくとも約８０重量％のホスホロアミダイト化合物を含んでなる。さ
らに別の好ましい態様において、ホスホロアミダイト組成物は、少なくとも約７
５重量％のホスホロアミダイト化合物を含んでなる。

【００３１】 本発明の別の態様において、Ｘ₁ およびＸ₂ は各々独立にＯである。別の態様
において、Ｘ₁ およびＸ₂ は各々独立にＳである。さらなる態様において、前記
Ｘ₁ およびＸ₂ の一方がＯであり、そして前記Ｘ₁ およびＸ₂ の他方がＳである
。 本発明の好ましい態様において、５’ヒドロキシル基を有する化合物を、活性
化剤の存在下で、ホスホロアミダイト組成物で処理する。別の好ましい態様にお
いて、活性化剤は１−Ｈ−テトラゾールである。 本発明のさらなる方法は、ヌクレオチドを、５’−ヒドロキシル基を有するさ
らなるヌクレオチド、ヌクレオシド、オリゴヌクレオシドまたはオリゴヌクレオ
チドに連結させることを含み、５’−ヒドロキシル基を有するさらなるヌクレオ
チド、ヌクレオシド、オリゴヌクレオシドまたはオリゴヌクレオチドを、伸長さ
れた化合物を形成するのに有効な条件下で、適切な溶媒中で、ホスホロアミダイ
ト組成物および活性化剤で処理することを含み、ここで前記ホスホロアミダイト
組成物は、式：

【００３２】

【化２１】

【００３３】 （式中： Ｔ₃ は保護ヒドロキシル基、ヌクレオシド、ヌクレオチド、オリゴヌクレオシ
ドまたはオリゴヌクレオチドであり； Ｒ₀ はリン保護基であり；そして Ｌ₁ およびＬ₂ は各々、独立に、Ｃ_1-6 アルキルであるか； または、Ｌ₁ およびＬ₂ は、一緒に連結されて、Ｌ₁ およびＬ₂ が結合する窒
素原子を含む４−ないし７−員複素環系であって、場合により、Ｏ、ＮおよびＳ
から選択される少なくとも１つのさらなるヘテロ原子を含む複素環系を形成する
。） のホスホロアミダイト化合物で実質的に豊富化されており、 前記ホスホロアミダイト組成物は、さらに、少なくとも約１重量％の、３’−
ヒドロキシヌクレオシド、該ホスホロアミダイト化合物と異なるＰ^III 種であっ
て、該Ｐ^III 種の前記Ｐ^III リンへの基の共有結合が酸素またはイオウを介する
Ｐ^III 種、またはＰ^V 種であって、該Ｐ^V 種への基の共有結合が酸素、イオウま
たは窒素を介するＰ^V 種から選択される少なくとも１種の不純物をさらに含む。
前記ホスホロアミダイト組成物が、少なくとも２重量％のこうした不純物を含む
ことがさらに好ましい。

【００３４】 本発明の別の態様において、２’−５’連結を有するオリゴマーが提供される
。前記オリゴマーは、複数のヌクレオシドを含み、少なくとも１つのヌクレオシ
ドは、別のヌクレオシドに、２’−５’ヌクレオシド間結合により、連結されて
いる。少なくとも１つの２’−５’連結を有する組成物は、式：

【００３５】

【化２２】

【００３６】 （式中、変数は先に記載されたとおりである。） の１つを有する少なくとも１つの化合物を含む。 本発明はまた、式：

【００３７】

【化２３】

【００３８】 （式中： Ｔ₃ は保護ヒドロキシル基、ヌクレオシド、ヌクレオチド、オリゴヌクレオシ
ドまたはオリゴヌクレオチドであり； Ｒ₀ はリン保護基であり；そして Ｌ₁ およびＬ₂ は各々、独立に、Ｃ_1-6 アルキルであるか； または、Ｌ₁ およびＬ₂ は、一緒に連結されて、Ｌ₁ およびＬ₂ が結合する窒
素原子を含む４−ないし７−員複素環系であって、場合により、Ｏ、ＮおよびＳ
から選択される少なくとも１つのさらなるヘテロ原子を含む複素環系を形成する
。） の少なくとも１つのホスホロアミダイト化合物を含むホスホロアミダイト組成物
であって； 少なくとも約１重量％の少なくとも１つの３’−ヒドロキシヌクレオシド、２
’−ヒドロキシヌクレオシド、該ホスホロアミダイト化合物と異なるＰ^III 種で
あって、前記Ｐ^III 種のＰ^III リンへの基の共有結合が酸素またはイオウを介す
るＰ^III 種、またはＰ^V 種であって、該Ｐ^V 種への基の共有結合が酸素、イオウ
または窒素を介するＰ^V 種をさらに含んでなる組成物も提供する。

【００３９】 ホスホロアミダイト組成物が、少なくとも約２重量％の少なくとも１つの３’
−ヒドロキシヌクレオシド、２’−ヒドロキシヌクレオシド、該ホスホロアミダ
イト化合物と異なるＰ^III 種であって、前記Ｐ^III 種のＰ^III リンへの基の共有
結合が酸素またはイオウを介するＰ^III 種、またはＰ^V 種であって、該Ｐ^V 種へ
の基の共有結合が酸素、イオウまたは窒素を介するＰ^V 種を含んでなることがさ
らに好ましい。 本発明の１つの態様において、ホスホロアミダイト組成物は、少なくとも約９
８重量％のホスホロアミダイト化合物を含んでなる。別の態様において、ホスホ
ロアミダイト組成物は、少なくとも約９７重量％のホスホロアミダイト化合物を
含んでなる。さらに別の態様において、ホスホロアミダイト組成物は、少なくと
も約９５重量％のホスホロアミダイト化合物を含んでなる。別の好ましい態様に
おいて、ホスホロアミダイト組成物は、少なくとも約９０重量％のホスホロアミ
ダイト化合物を含んでなる。より好ましい態様において、ホスホロアミダイト組
成物は、少なくとも約８０重量％のホスホロアミダイト化合物を含んでなる。さ
らに別の好ましい態様において、ホスホロアミダイト組成物は、少なくとも約７
５重量％のホスホロアミダイト化合物を含んでなる。 ホスホロアミダイト組成物に含まれるのは、式：

【００４０】

【化２４】

【００４１】 （式中、変数は、先に記載されたとおりである。） の１つを有する、少なくとも１つの化合物である。 本発明はまた、式：

【００４２】

【化２５】

【００４３】 （式中、変数は、先に記載されたとおりである。） の少なくとも１つのホスホロアミダイト化合物を有するホスホロアミダイト組成
物も提供し、該組成物は、式：

【００４４】

【化２６】

【００４５】 （式中、変数は、先に記載されたとおりである の１つを有する、少なくとも１つの化合物もさらに含む。 本発明はまた、式：

【００４６】

【化２７】

【００４７】 の少なくとも１つのホスホロアミダイト化合物、および少なくとも約１重量％の
少なくとも１つの前記ホスホロアミダイト化合物と異なるＰ^III 種であって、前
記Ｐ^III 種のＰ^III リンへの基の共有結合が酸素またはイオウを介するＰ^III 種
、またはＰ^V 種であって、該Ｐ^V 種への基の共有結合が酸素、イオウまたは窒素
を介するＰ^V 種を含んでなるホスホロアミダイト組成物も提供する。 本発明の別の態様において、ホスホロアミダイト組成物は、少なくとも約２重
量％の少なくとも１つの前記ホスホロアミダイト化合物と異なるＰ^III 種であっ
て、前記Ｐ^III 種のＰ^III リンへの基の共有結合が酸素またはイオウを介するＰ ^III 種、またはＰ^V 種であって、該Ｐ^V 種への基の共有結合が酸素、イオウまた
は窒素を介するＰ^V 種を含んでなる。

【００４８】

【好ましい態様の詳細な説明】

本発明は、ホスファイト、ホスホジエステル、ホスホロチオエート、またはホ
スホロジチオエート結合を有するオリゴマーの調製法を提供する。本発明はまた
、こうしたオリゴマーの調製に有用な組成物も提供する。より詳細には、該方法
は、高精製ホスホロアミダイト化合物と対照的に、ホスホロアミダイト組成物を
利用するオリゴマーの合成に有用である。 本発明はさらに、ホスホロアミダイトプロトコルを用いたオリゴマーの調製を
提供する。好ましい態様において、合成は、固相法を用いて行われる。ホスホロ
アミダイト組成物は、オリゴヌクレオチド合成に伝統的に用いられる、高精製ホ
スホロアミダイトの代用になる。

【００４９】 本発明に用いられるようなホスホロアミダイト組成物は、実質的にホスホロア
ミダイト化合物が濃縮され、そして、本質的に不活性不純物であるさらなる化合
物を含む。本発明のホスホロアミダイト組成物は、こうした不純物を、少なくと
も約１重量％含む。本発明のホスホロアミダイト組成物が、こうした不純物を少
なくとも約２重量％含むことがさらに好ましい。 これらの不純物は、ホスホロアミダイト合成から生じる副産物である。異なる
合成経路により、わずかに異なる副産物または不純物が生じる可能性がある。ホ
スホロアミダイト組成物は、精製を行うことなく、ホスホロアミダイト合成から
産物を合成し、沈殿させそして乾燥させることにより調製される。本発明のホス
ホロアミダイト組成物中に存在してもよい不純物または副産物には、３’−ヒド
ロキシヌクレオシド、前記ホスホロアミダイト化合物と異なるＰ^III 種であって
、前記Ｐ^III 種のＰ^III リンへの基の共有結合が酸素またはイオウを介するＰ^{II I} 種、またはＰ^V 種であって、該Ｐ^V 種への基の共有結合が酸素、イオウまたは
窒素を介するＰ^V 種、または他のＰ^III およびＰ^V リン種が含まれる。

【００５０】 本発明は、各組成物が、望ましいホスホロアミダイト化合物で実質的に豊富化
され、そしてまた、望ましいホスホロアミダイト化合物の合成中に産生された、
少なくとも１つの不活性副産物または不純物も含むホスホロアミダイト組成物を
利用する。本発明の１つの態様において、ホスホロアミダイト組成物は、少なく
とも約９８重量％のホスホロアミダイト化合物を含む。別の態様において、ホス
ホロアミダイト組成物は、少なくとも約９７重量％のホスホロアミダイト化合物
を含む。さらに別の態様において、ホスホロアミダイト組成物は、少なくとも約
９５重量％のホスホロアミダイト化合物を含む。別の好ましい態様において、ホ
スホロアミダイト組成物は、少なくとも約９０重量％のホスホロアミダイト化合
物を含む。より好ましい態様において、ホスホロアミダイト組成物は、少なくと
も約８０重量％のホスホロアミダイト化合物を含む。さらに別の好ましい態様に
おいて、ホスホロアミダイト組成物は、少なくとも約７５重量％のホスホロアミ
ダイト化合物を含む。

【００５１】 本発明の１つの態様において、ホスホロアミダイト組成物は、標準法を用い、
望ましいホスホロアミダイト化合物を合成することにより、得られる。合成後、
溶媒を除去し、そして未精製産物を、ハロゲン化溶媒、例えばジクロロメタンに
溶解する。ヘキサンをゆっくり添加し、望ましい組成物を沈殿させ、これをろ過
しそして乾燥させる。本発明の別の態様において、望ましいホスホロアミダイト
組成物は、特別な依頼により、商業的供給元から得られる。これらの組成物は、
商業的供給元の一般的なカタログからの販売では入手可能でないが、いくつかの
商業的供給元は、特注すると沈殿ホスホロアミダイトを供給することが可能であ
った。

【００５２】 本発明に有用であるためには、ホスホロアミダイト組成物は、カップリング効
率に関し、高精製ホスホロアミダイト化合物を厳密に模倣しなければならない。
言い換えると、総収率および純度が、高精製ホスホロアミダイト化合物を用いた
際に得られるものに匹敵しなければならない。既定の供給源、例えば社内または
他の供給源由来のホスホロアミダイト組成物が、有効であるか決定するため、組
成物をまず、ＨＰＬＣにより解析し、組成物に、特に反応性の副産物が存在する
か、そしてもしそうならば濃度はどのくらいか、決定する。成長する鎖に付加し
、そして約０．２％より多いと特に望ましくない分枝を引き起こす可能性がある
、ジヌクレオチド副産物を合成し、そしてＨＰＬＣ実行内に添加し、同定を補助
した。ホスホロアミダイトのいくつかの合成法は、カップリング効率を減少させ
、そしてしたがって総収率を減少させるであろう種類の副産物を高濃度で生じな
かった。いくつかのホスホロアミダイト組成物の供給源に対して行った別の試験
は、単に２０量体オリゴヌクレオチドを調製することであった。ホスホロアミダ
イト組成物の各供給源を用い、２０量体ホスホロチオエートオリゴヌクレオチド
を調製し、そして高精製ホスホロアミダイトを用いて調製した、標準ホスホロチ
オエートオリゴヌクレオチドに比較した。この方法で、各供給源を評価し、最終
オリゴヌクレオチドが、標準オリゴヌクレオチドに匹敵するかどうか決定した。 本発明の１つの態様において、各ホスホロアミダイト化合物の合成後、沈殿か
ら生じたホスホロアミダイト組成物を、オリゴマー合成に使用する。ホスホロア
ミダイト組成物の一般的な合成法を以下に示す：

【００５３】

【化２８】

【００５４】 ホスホロアミダイト化学反応のための標準的固相合成プロトコルに関連し、こ
れらの副産物または不純物は、反応性または不活性として分類することが可能で
ある。不活性と分類される副産物は、オリゴマー合成の鎖伸長工程中、さらなる
副産物を形成する可能性があるが、このさらなる副産物は、続くリンス工程中、
洗い流され、そして他の不活性副産物も同様である。反応性副産物は、例えば、
望ましい産物の収率または純度を減少させることにより、重合過程に負に影響を
与える可能性があるものである。３’−ホスホロアミダイトの調製中に形成され
る、既知の不活性副産物には、式：

【００５５】

【化２９】 （式中ＺはＨであるか、または、式：

【００５６】

【化３０】

【００５７】 の式の１つを有する。） を有するヌクレオシド化合物が含まれる。 既知の不活性副産物は、また、式：

【００５８】

【化３１】

【００５９】 を有する非ヌクレオシド化合物も含む。 さらなる鎖伸長を生み出すであろう反応性副産物には、式：

【００６０】

【化３２】

【００６１】 を有するものが含まれる。 本式を有する反応性不純物は、伸長鎖のフリーのヒドロキシル基とカップリン
グし、そしてさらなる脱ブロッキングおよび鎖伸長に際し、２つの利用可能な５
’位からの結合点で、分枝を引き起こすことが知られる。 ホスホロアミダイト化合物の合成に関しては、当業者に知られる多くの方法が
ある。例えば、合成は、ビス−アミダイト試薬、またはハロゲン化アミダイト試
薬を伴ってもよい。さらに、方法は、異なる溶媒、温度、ｐＨ条件または他の実
験パラメーターを伴ってもよい。ホスホロアミダイトを商業的に調製するのに用
いられる、未開示の所有（ｐｒｏｐｒｉｅｔａｒｙ）法もある。ホスホロアミダ
イト化合物を調製するのに用いられる特定の方法は、沈殿ホスホロアミダイト組
成物に存在する可能性がある、副産物または不純物を決定する。ホスホロアミダ
イト化合物が実質的に濃縮したホスホロアミダイト組成物として、本発明に受け
入れられるためには、他の規準に加え、乾燥ホスホロアミダイト組成物は、反応
性副産物を約９９．８％不含でなければならない。本発明のホスホロアミダイト
組成物を、日常的なオリゴヌクレオチド合成に用いる前に、ホスホロアミダイト
組成物を評価し、約０．２％未満の高反応性副産物を有するかどうか決定する。
本発明の1 つの態様において、ホスホロアミダイト組成物は、例えば、ＨＰＬＣ
、ＮＭＲ、³¹Ｐ ＮＭＲ、または質量分析により解析し、反応性副産物の存在を
決定する。別の態様において、ホスホロアミダイト組成物をオリゴマー合成に用
い、そして高純度のホスホロアミダイトを用いて合成した同一のオリゴマーに比
較する。好ましい態様において、本発明のホスホロアミダイト組成物をまず、ア
ッセイし、そしてその後、比較解析のため、オリゴマーを合成するのに用いる。

【００６２】 沈殿させそして乾燥させたがさらに精製されていないホスホロアミダイトは、
特注により、商業的供給元から得た。ホスホロアミダイトをＨＰＬＣによりアッ
セイし、どの不純物が存在するか、そして総純度はどの程度かを決定した。一般
的に、これらの沈殿ホスホロアミダイトは、９２％より高い純度であった。選択
された不純物を試料に添加した後、最初のおよび添加したＨＰＬＣトレースを比
較することにより、特に反応性の副産物の濃度を決定することが可能であった。
ホスホロアミダイト組成物、例えば副産物を含む沈殿ホスホロアミダイトを用い
てオリゴマーを調製し、そしてこれらの化合物を、同一のオリゴマーに比較した
。比較およびＨＰＬＣトレースから得た情報により、特定の不純物または副産物
、特に反応性副産物の許容可能なレベルの決定が可能になった。

【００６３】 １つの試験において、均質なデオキシホスホロチオエート２０量体（配列番号
１、ＴＣＣ ＣＧＣ ＣＴＧ ＴＧＡ ＣＡＴ ＧＣＡ ＴＴ）を、ホスホロア
ミダイト組成物を用いて調製した同一オリゴマーに比較するため、高純度ホスホ
ロアミダイト（Ｐｈａｒｍａｃｉａ）を用いた標準配列として調製した。標準配
列のホスホロアミダイトをアッセイし、そしてこれらはすべて、以下に論じられ
る産業的規準、例えばアミダイトは９９％以上純粋であることが必要とされ、そ
していかなる単一の不純物もＨＰＬＣにより決定されるように０．５％未満であ
るようなものに等しいかまたはそれより優れていた。 標準配列（配列番号１）に同一の３つのさらなるバッチを、３つの別個の供給
源から得たホスホロアミダイト組成物を用いて調製した（実施例５および１４を
参照されたい）。これらの組成物は、特注により得て、そして商業的カタログの
販売に提供されていない。ホスホロアミダイト組成物は、組成物を供給した供給
源に用いられる特定の方法により作成される、沈殿ホスホロアミダイト化合物を
含む。これらのホスホロアミダイトをＨＰＬＣによりアッセイし、そして結果を
以下に示す：

【００６４】

【表１】

【００６５】 標準配列および３つのバッチ各々を、標準的ホスホロアミダイト法および固相
重合のための技術にしたがい、調製した。ホスホロチオエートオリゴマー上の生
じたトリチルの精製は、標準的逆相ＨＰＬＣによった。各特定の実行の分画上の
すべてのトリチルは、ＣＧＥおよびＳＡＸ解析のためプールし、この結果を以下
に示す：

【００６６】

【表２】

【００６７】 供給元ＡおよびＢ由来のホスホロアミダイト組成物を用いて調製したホスホロ
チオエート２０量体は、高品質ホスホロアミダイトから調製した標準配列に比較
し、予期せぬ匹敵する結果を生じた。 高純度ホスホロアミダイトおよびホスホロアミダイト組成物両方を用いて調製
した多様なオリゴマーの匹敵する結果を解析した後、本発明に受け入れられるホ
スホロアミダイト組成物に関連し、いくつかの予備的規準を考案した。好ましい
態様において、ホスホロアミダイト組成物のＨＰＬＣプロフィールは、９２％以
上のジアステレオ異性体総計を提供する。添加標準アミダイトを用いてもまた、
ＨＰＬＣを行い、共溶出に際し、ショルダーまたは他のピークが存在しないこと
を確認した。この数字は予備的であり、そして既定の組成物に存在する副産物に
応じ、より低い可能性がある。水および酢酸エチル含量は、ＧＣにより決定され
るように、好ましくは、それぞれ、約０．５重量％および３重量％以下である。
ホスホロアミダイトピーク（１４８〜１５０未変性（ｎａｔｉｖｅ）アミダイト
）のモル％は、³¹Ｐ ＮＭＲにより決定されるように、約９０％以上である。本
発明の組成物には、高純度アミダイトと非常に対照的に、他のリン種が存在して
もよく、そしてしばしば存在することに注目すべきである。

【００６８】 オリゴマー合成に用いられるホスホロアミダイトの品質に関し、産業において
委員会すべてで適用される規準の単一の組はないが、現在の規準は非常に厳しい
。例えば、現在、薬剤として意図されるオリゴマー合成に使用するためのホスホ
ロアミダイトを評価するのに用いられているこうした規準の１つは、ホスホロア
ミダイトのＨＰＬＣプロフィールが、０．９５から１．０５の試料および標準の
相対保持（α）を生じることを必要とする。ホスホロアミダイトは、９９％以上
純粋であることが必要とされ、そしていかなる単一の不純物もＨＰＬＣにより、
０．５％未満である。水および酢酸エチル含量は、ＧＣにより決定されるように
、それぞれ、約０．５重量％および３重量％以下であることが好ましい。ホスホ
ロアミダイトピーク（１４８〜１５０未変性アミダイト）のモル％は、³¹Ｐ Ｎ
ＭＲにより決定されるように、約９９％以上である。³¹Ｐ ＮＭＲにより決定さ
れるように、１２０ないし１５０ ｐｐｍでの非ホスホロアミダイトピークの総
計は、０．３％未満でなければならず、そして１７０ ｐｐｍより高い他のピー
クは存在してはならない。 高純度ホスホロアミダイトを販売する商業的供給元から特別の依頼により得ら
れるホスホロアミダイト組成物をＨＰＬＣによりアッセイし、純度および存在す
る主要副産物／混入物質を決定する。１つの供給元由来の沈殿および乾燥デオキ
シシアノエトキシホスホロアミダイト組成物は、以下のデータ：

【００６９】

【表３】

【００７０】 を提供した。 好ましい態様において、本発明の方法を、反復固相オリゴヌクレオチド合成形
式で使用する。これらの方法は、修飾ヌクレオチドを単独で、または未変性ヌク
レオチドと組み合わせて用い、天然に存在しないオリゴマーを調製するのに、等
しく適用可能である。代表的な固相技術は、典型的には、標準的ホスホロアミダ
イト化学合成を利用し、ＤＮＡおよびＲＮＡ合成のため、使用されるものである
。例えば、本明細書に完全に援用される、Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ Ｆｏｒ Ｏｌｉ
ｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ Ａｎｄ Ａｎａｌｏｇｓ， Ａｇｒａｗａｌ，Ｓ
．監修，Ｈｕｍａｎａ Ｐｒｅｓｓ，ニュージャージー州トトワ，１９９３を参
照されたい。好ましい合成固相合成は、活性化リン酸化合物として、ホスホロア
ミダイトのみを利用する。本技術では、ホスホロアミダイト単量体を、成長する
オリゴマー鎖上のフリーのヒドロキシルと反応させ、中間体亜リン酸化合物を産
生し、これを続いて、標準的方法を用い、Ｐ^V 状態に酸化する。本技術は、ホス
ホジエステル、ホスホロチオエート、およびホスホロジチオエート結合を含む、
いくつかの種類の結合の合成に、一般的に用いられる。

【００７１】 典型的には、こうした方法の第一の工程は、保護５’−ヒドロキシルを含む、
第一の単量体またはより高次のサブユニットを、通常、３’または２’位を介し
、リンカーを通じ、標準的方法および当該技術分野に知られる方法を用い、固体
支持体に結合させることである。例えば、本明細書に完全に援用される、Ｏｌｉ
ｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ Ａｎｄ Ａｎａｌｏｇｕｅｓ Ａ Ｐｒａｔｃｉ
ｃａｌ Ａｐｐｒｏａｃｈ，Ｅｃｋｓｔｅｉｎ，Ｆ．監修，ＩＲＬ Ｐｒｅｓｓ
，ニューヨーク，１９９１を参照されたい。第一の単量体サブユニットが結合し
た固体支持体もまた、商業的に入手可能である（Ｇｌｅｎ Ｒｅｓｅａｒｃｈ、
バージニア州スターリング）。その後、支持体結合単量体またはより高次の第一
のシントンを処理し、５’−ヒドロキシル保護基を除去する。典型的には、これ
は、酸性溶液での処理により、達成される。その後、固体支持体結合単量体また
はより高次の化合物を、ホスホロアミダイト化合物で処理し、亜リン酸またはチ
オ亜リン酸結合を有する化合物を形成する。好ましい態様において、例えば１Ｈ
−テトラゾール、５−（４−ニトロフェニル）−１Ｈ−テトラゾール、またはジ
イソプロピルアミノテトラゾリドなどの活性化剤の存在下で、無水条件下で、カ
ップリング工程を行う。

【００７２】 亜リン酸トリエステル、チオ亜リン酸トリエステル、またはジチオ亜リン酸ト
リエステルの酸化または硫化前または後いずれかに、キャップ化工程を行うのが
一般的に好ましい。こうしたキャップ化工程は、オリゴマー鎖が短くなるのを妨
げ、カップリング周期で反応しなかった鎖をブロッキングすることにより、有益
であることが一般的に知られる。キャップ化に用いられる１つの代表的な試薬は
、無水酢酸である。他の適切なキャップ化試薬および方法論は、本明細書に完全
に援用される、米国特許第４，８１６，５７１号、１９８９年３月２８日発行に
見出すことが可能である。 酸でのさらなる処理は、５’−ヒドロキシル保護基を除去し、そしてしたがっ
て、固体支持体結合オリゴマーを、さらなるホスホロアミダイトとの反応により
、次の合成反復に参加することが可能な、さらなる反応性化合物に変換する。望
ましい長さのオリゴマーが産生されるまで、本過程を繰り返す。

【００７３】 生じたオリゴマーを、１つまたはそれ以上のリン保護基により、リンで保護さ
れた保護基で、複素環塩基部分、例えば環外アミノ官能性上に位置する反応性部
位で保護された、好ましくは酸不安定性保護基で、５’端で保護し、そしてスク
シニル基などのリンカー基を介し、２’−または３’−ヒドロキシル基の１つに
より、固体支持体に結合させる。生じたオリゴマーの脱保護および切断は、好ま
しくは、まず、塩基不安定性複素環保護基およびリン保護基の脱保護を可能にす
る試薬での処理による。本戦略は、固体支持体結合オリゴマーを標準的にリンス
することにより、脱保護から生じる化合物の除去を可能にする。より激しい条件
、例えば、より高いｐＨを有する溶液または温度増加または曝露時間増加条件下
での、塩基でのさらなる処理は、固体支持体からのオリゴマーの切断を生じるで
あろう。一般的な脱保護または切断前または後のいかなる時点での酸性溶液での
５’−ヒドロキシル保護基の処理も、フリーの５’−ヒドロキシル基を生じる。

【００７４】 好ましい脱保護／切断計画では、固体支持体に結合した完全に保護されたオリ
ゴマーをまず、リンおよび複素環塩基保護を除去するのに有効な塩基性試薬で処
理する。こうした試薬は、オリゴマーを固体支持体から切断することなく、リン
および複素環塩基保護を選択的に除去することが可能である。同時切断を伴わな
い本選択的脱保護のための代表的な試薬には、限定されるわけではないが、エタ
ノール中のＤＢＵおよびトリエチルアミンが含まれる。 次に、オリゴマーを、固体支持体への共有結合を切断するのに有効な試薬で処
理する。本切断に好ましい試薬は、水性アンモニアである。５’−ヒドロキシル
保護基の除去は、酸溶液での処理により、精製前または後に達成してもよい。保
護基が存在するオリゴマーを精製する１つの利点は、これが精製法を補助するこ
とである。オリゴマーの溶出が遅くなり、したがって、例えばＣ₁₈逆相カラムを
用いたＨＰＬＣ精製を行う際、不純物が最初に溶出するのを可能にする。好まし
い態様において、本発明の方法は、オリゴヌクレオチドおよびオリゴヌクレオチ
ド類似体を含むオリゴマーの調製に用いる。用語「オリゴヌクレオチド」は、天
然および天然に存在しない複素環塩基部分から特定の配列に、一緒に連結された
複数のヌクレオチドを指す。本明細書において、用語「オリゴヌクレオチド類似
体」は、天然発生（すなわち「天然」）、および修飾糖および／または核酸塩基
部分を含むヌクレオシド性サブユニットなど、天然に存在しない（すなわち「合
成」）部分の両方を含んでもよい化合物を意味する。こうしたオリゴヌクレオチ
ド類似体は、典型的には、天然発生または合成野生型オリゴヌクレオチドと構造
的に区別可能であるが、機能的に交換可能である。したがって、オリゴヌクレオ
チド類似体には、例えば標的にハイブリダイズすることにより、有効に機能し、
望ましいＲＮＡまたはＤＮＡ鎖の構造および／または機能を模倣する、こうした
構造すべてが含まれる。

【００７５】 本発明の文脈において、用語「合成ヌクレオシド」は、修飾ヌクレオシドを指
す。代表的な修飾には、天然に存在しない核酸塩基、ヌクレオシドの糖部分、ま
たは同時に両方を提供する、ヌクレオシドの複素環塩基部分の修飾が含まれる。 本発明の文脈において、「複素環系」は、少なくとも１つのヘテロ原子、例え
ばＮ、Ｏ、またはＳを含む環状化合物である。「混合複素環」は、少なくとも２
つのヘテロ原子、例えばＮ、ＯまたはＳを含む環状化合物である。「ヘテロアリ
ール」化合物は、少なくとも１つのヘテロ原子、例えばＮ、ＯまたはＳを含む複
素環であり、そして十分には飽和していない化合物、例えば、部分的に飽和して
いる化合物または完全に飽和している化合物である。「ヘテロアリール」は、１
つまたはそれ以上の融合環がヘテロ原子をまったく含有しない系を包含する融合
系を包含することが意図される。

【００７６】 本発明に受け入れられる好ましいヘテロ環には、限定されるわけではないが、
イミダゾール、ピロール、ピラゾール、インドール、１Ｈ−インダゾール、α−
カルボリン、カルバゾール、フェノチアジン、フェノキサジン、テトラゾール、
トリアゾール、ピロリドン、ピペリジン、ピペラジンおよびモルホリンが含まれ
る。窒素複素環のより好ましい群には、イミダゾール、ピロールおよびカルバゾ
ールが含まれる。 本明細書に記載される化合物および方法に有用な、代表的な複素環塩基部分に
は、アデニン、グアニン、シトシン、ウリジン、およびチミンと共に他の天然に
存在しないおよび天然発生核酸塩基、例えばキサンチン、ヒポキサンチン、２−
アミノアデニン、アデニンおよびグアニンの６−メチルおよび他のアルキル誘導
体、アデニンおよびグアニンの２−プロピルおよび他のアルキル誘導体、５−ハ
ロウラシルおよびシトシン、６−アゾウラシル、シトシンおよびチミン、５−ウ
ラシル（プソイドウラシル）、４−チオウラシル、８−ハロ、オキサ、アミノ、
チオール、チオアルキル、ヒドロキシルおよび他の８−置換アデニン類およびグ
アニン類、５−トリフルオロメチルおよび他の５−置換ウラシル類およびシトシ
ン類、７−メチルグアミンが含まれる。

【００７７】 好ましい複素環塩基部分には、アデニン、Ｎ⁶ −ベンゾイルアデニン、シトシ
ン、Ｎ⁴ −ベンゾイルシトシン、５−メチルシトシン、Ｎ⁴ −ベンゾイル−５−
メチルシトシン、チミン、ウラシル、グアニン、Ｎ² −イソブチリルグアニン、
および２−アミノアデニンが含まれる。 さらなる天然および天然に存在しない複素環塩基部分には、米国特許第３，６
８７，８０８号（Ｍｅｒｉｇａｎら）に開示されるもの、Ｓａｎｇｈｖｉ，第１
５章，Ａｎｔｉｓｅｎｓｅ Ｒｅｓｅａｒｃｈ ａｎｄ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏ
ｎｓ，中，Ｓ．Ｔ．ＣｒｏｏｋｅおよびＢ．Ｌｅｂｌｅｕ監修，ＣＲＣ Ｐｒｅ
ｓｓ，１９９３に開示されるもの、Ｅｎｇｌｉｓｃｈら，Ａｎｇｅｗａｎｄｔｅ
Ｃｈｅｍｉｅ，Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ Ｅｄｉｔｉｏｎ，１９９１，３
０，６１３−７２２に開示されるもの（特に６２２および６２３ページを参照さ
れたい）、およびｔｈｅ Ｃｏｎｃｉｓｅ Ｅｎｃｙｃｌｏｐｅｄｉａ Ｏｆ Ｐｏｌｙｍｅｒ Ｓｃｉｅｎｃｅ Ａｎｄ Ｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ，Ｊ．Ｉ．
Ｋｒｏｓｃｈｗｉｔｚ監修，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，１９９０，
８５８−８５９ページ、Ｃｏｏｋ，Ｐ．Ｄ．，Ａｎｔｉ−Ｃａｎｃｅｒ Ｄｒｕ
ｇ Ｄｅｓｉｇｎ，１９９１，６，５８５−６０７に開示されるものが含まれ、
これらの各々は、全体が本明細書に組み入れられる。用語「複素環塩基部分」は
、最も古典的な意味ではヌクレオシド性塩基ではないが、ヌクレオシド性塩基と
して作用する、特定の「ユニバーサル塩基」を含む、ヌクレオシド性塩基として
作用することが可能な複素環系を含むよう、さらに意図される。ユニバーサル塩
基として特に言及されるのは、３−ニトロピロールである。

【００７８】 本明細書において、用語「リン保護基」は、最初に、ホスホロアミダイトのリ
ン原子に結合する基を指す。リン保護基は、例えば固相オリゴヌクレオチド合成
形式中、単数または複数のヌクレオチド間連結を含むリンを保護するよう作用す
る。リン保護基を有する、単数または複数のヌクレオチド間連結を、脱保護剤、
例えば水性水酸化アンモニウムで処理すると、リン保護基の除去が生じ、そして
その代わり、ヒドロキシルまたはチオール基が残るであろう。 本発明に有用な、当該技術分野に知られる多くのリン保護基があり、限定され
るわけではないが、β−シアノエチル、ジフェニルシリルエチル、δ−シアノブ
テニル、シアノｐ−キシリル（ＣＰＸ）、メチル−Ｎ−トリフルオロアセチルエ
チル（ＭＥＴＡ）およびアセトキシフェノキシエチル（ＡＰＯＥ）基が含まれる
。リン保護基は、Ｂｅａｕｃａｇｅ，Ｓ．Ｌ．およびＩｙｅｒ，Ｒ．Ｐ．，Ｔｅ
ｔｒａｈｅｄｒｏｎ，１９９３，４９，１９２５−１９６３；Ｂｅａｕｃａｇｅ
，Ｓ．Ｌ．およびＩｙｅｒ，Ｒ．Ｐ．，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ，１９９３，４
９，１０４４１−１０４８８；およびＢｅａｕｃａｇｅ，Ｓ．Ｌ．およびＩｙｅ
ｒ，Ｒ．Ｐ．，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ，１９９２，４８，２２２３−２３１１
にさらに記載される。リン保護基の調製およびホスホロアミダイト化合物へのそ
れらの取り込みを解説する代表的な米国特許には、限定されるわけではないが、
米国特許第５，７８３，６９０号；第５，７６０，２０９号；第５，７０５６２
１号；第５，６１４，６２１号；第５，４５３，４９６号；第５，１５３，３１
９号；第５，１３２，４１８号；第４，９７３，６７９号；第４，７２５，６７
７号；第４，６６８，７７７号；第４，５００，７０７号；第４，４５８，０６
６号；第４，４１５，７３２号；および第Ｒｅ． ３４，０６９号が含まれ、こ
れらの各々の全内容が本明細書に援用される。

【００７９】 複素環塩基部分および２’−糖置換基上に位置するものを含む官能基は、日常
的に、合成中、保護（ブロッキング）基でブロックし、そして続いて脱ブロッキ
ングされる。一般的にブロッキング基は、分子の残りを実質的に損傷することな
く、特定の反応条件に対し、分子の化学的官能性を不活性にし、そして後に、分
子のこうした官能性から除去することが可能である。ＧｒｅｅｎおよびＷｕｔｓ
，Ｐｒｏｔｅｃｔｉｖｅ Ｇｒｏｕｐｓ ｉｎ Ｏｒｇａｎｉｃ Ｓｙｎｔｈｅ
ｓｉｓ，第２版，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，ニューヨーク １９９
１を参照されたい。例えば、アミノ基は、フタルイミド、９−フルオレニルメト
キシカルボニル（ＦＭＯＣ）、トリフェニルメチルスルフェニル、ｔ−ＢＯＣま
たはベンジル基でブロッキングしてもよい。カルボキシル基は、アセチル基とし
て保護してもよい。代表的なヒドロキシル保護基は、Ｂｅａｕｃａｇｅら，Ｔｅ
ｔｒａｈｅｄｒｏｎ１９９２，４８，２２２３に記載される。好ましいヒドロキ
シル保護基は、酸不安定基、例えば、トリチル、モノメトキシトリチル、ジメト
キシトリチル、トリメトキシトリチル、９−フェニルキサンチン−９−イル（Ｐ
ｉｘｙｌ）および９−（ｐ−メトキシフェニル）キサンチン−９−イル（ＭＯＸ
）である。化学的官能基はまた、前駆体型を含むことにより、「ブロッキング」
してもよい。したがって、アジド基は、アミンに容易に変換されるため、アミン
の「ブロッキング」型とみなしてもよい。オリゴヌクレオチド合成に利用される
、さらなる代表的な保護基は、Ａｇｒａｗａｌら， Ｐｒｏｔｏｃｏｌｓ ｆｏ
ｒ Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ Ｃｏｎｊｕｇａｔｅｓ，監修，Ｈｕｍａ
ｎａ Ｐｒｅｓｓ，ニュージャージー，１９９４，Ｖｏｌ．２６，ｐｐ．１−７
２に論じられる。

【００８０】 本明細書において、用語「オリゴヌクレオシド」には、非リン結合部分を有す
る２つまたはそれ以上のヌクレオシドサブユニットを含む、オリゴマーまたはポ
リマーが含まれる。本発明にしたがったオリゴヌクレオシドは、グリコシル結合
を通じ、核酸塩基に結合したリボフラノース部分を有する。本発明の目的のため
のオリゴヌクレオチド／ヌクレオシドは、非リン酸結合により共有結合した少な
くとも２つのヌクレオシドおよびヌクレオチドを伴う少なくとも１つのリン含有
共有結合を有する、混合骨格オリゴマーであり、ここで、単量体ヌクレオチドま
たはヌクレオシド単位の少なくとも１つは、本発明の方法を用いて調製された２
’−Ｏ−置換化合物である。オリゴヌクレオチド／ヌクレオシドは、さらに、リ
ン含有および／または非リン含有結合を通じてカップリングした、複数のヌクレ
オチドおよびヌクレオシドを有してもよい。

【００８１】 本明細書において、用語「糖置換基」または「２’−置換基」には、酸素原子
を含みまたは含まず、リボフラノシル部分の２’−位に結合した基が含まれる。
本発明に受け入れられる糖置換基には、限定されるわけではないが、フルオロ、
Ｏ−アルキル、Ｏ−アルキルアミノ、Ｏ−アルキルアルコキシ、保護Ｏ−アルキ
ルアミノ、Ｏ−アルキルアミノアルキル、Ｏ−アルキルイミダゾールおよび式（
Ｏ−アルキル）_m 、式中、ｍは１から約１０である、のポリエーテル類が含まれ
る。これらのポリエーテル類の中で好ましいのは、直線および環状ポリエチレン
グリコール（ＰＥＧ）、および（ＰＥＧ）含有基、例えばクラウンエーテル類お
よびＯｕｃｈｉら，Ｄｒｕｇ Ｄｅｓｉｇｎ ａｎｄ Ｄｉｓｃｏｖｅｒｙ １
９９２，９，９３；Ｒａｖａｓｉｏら，Ｊ．Ｏｒｇ．Ｃｈｅｍ．１９９１，５６
，４３２９；およびＤｅｌｇａｒｄｏら，Ｃｒｉｔｉｃａｌ Ｒｅｖｉｅｗｓ ｉｎ Ｔｈｅｒａｐｅｕｔｉｃ Ｄｒｕｇ Ｃａｒｒｉｅｒ Ｓｙｓｔｅｍｓ １９９２，９，２４９に開示されるものがあり、これらの各々は、全体が本明細
書に組み入れられる。さらなる糖修飾は、Ｃｏｏｋ，Ｐ．Ｄ．，Ａｎｔｉ−Ｃａ
ｎｃｅｒ Ｄｒｕｇ Ｄｅｓｉｇｎ，１９９１，６，５８５−６０７に開示され
る。フルオロ、Ｏ−アルキル、Ｏ−アルキルアミノ、Ｏ−アルキルイミダゾール
、Ｏ−アルキルアミノアルキル、およびアルキルアミノ置換は、全体が本明細書
に組み入れられる、米国特許出願第０８／３９８，９０１号、１９９５年３月６
日提出、表題“Ｏｌｉｇｏｍｅｒｉｃ Ｃｏｍｐｏｕｎｄｓ ｈａｖｉｎｇ Ｐ
ｙｒｉｍｉｄｉｎｅ Ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ（ｓ） ｗｉｇｈ ２’ａｎｄ ５
’Ｓｕｂｓｔｉｔｕｔｉｏｎｓ" に記載される。

【００８２】 本発明に受け入れられる、さらなる糖置換基には、２’−ＳＲおよび２’−Ｎ
Ｒ₂ 基、式中、各Ｒは、独立に、水素、保護基または置換または非置換アルキル
、アルケニル、またはアルキニルである、が含まれる。２’−ＳＲヌクレオシド
は、全体が本明細書に組み入れられる、米国特許第５，６７０，６３３号、１９
９７年９月２３日発行に開示される。２’−ＳＲ単量体シントンの取り込みは、
Ｈａｍｍら，Ｊ．Ｏｒｇ．Ｃｈｅｍ．，１９９７，６２，３４１５−３４２０に
開示される。２’−ＮＲ₂ ヌクレオシドは、Ｇｏｅｔｔｉｎｇｅｎ，Ｍ．，Ｊ．
Ｏｒｇ．Ｃｈｅｍ．，１９９６，６１，６２７３−６２８１；およびＰｏｌｕｓ
ｈｉｎら，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ Ｌｅｔｔ．，１９９６，３７，３２２７−
３２３０に開示される。本発明に受け入れられるさらなる代表的な糖置換基には
、式ＩまたはII：

【００８３】

【化３３】

【００８４】 の１つを有するものが含まれる。 式Ｉの代表的な２’−Ｏ−糖置換基は、全体が本明細書に組み入れられる、米
国特許出願第０９／１３０，９７３号、１９９８年８月７日提出、表題“Ｃａｐ
ｐｅｄ ２’−Ｏｘｙｅｔｈｏｘｙ Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ" に開
示される。 式IIの代表的な環状２’−Ｏ−糖置換基は、全体が本明細書に組み入れられる
、米国特許出願第０９／１２３，１０８号、１９９８年７月２７日提出、表題“
ＲＮＡ Ｔａｒｇｅｔｅｄ ２’−Ｍｏｄｉｆｉｅｄ Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏ
ｔｉｄｅｓ ｔｈａｔ ａｒｅ Ｃｏｎｆｏｒｍａｔｉｏｎａｌｌｙ Ｐｒｅｏ
ｒｇａｎｉｚｅｄ" に記載される。

【００８５】 リボシル環上にＯ−置換を有する糖もまた、本発明に受け入れられる。環Ｏの
代表的な置換には、限定されるわけではないが、Ｓ、ＣＨ₂ 、ＣＨＦ、およびＣ
Ｆ₂ が含まれる。例えば、全体が本明細書に組み入れられる、Ｓｅｃｒｉｓｔら
，Ａｂｓｔｒａｃｔ ２１，Ｐｒｏｇｒａｍ ＆ Ａｂｓｔｒａｃｔｓ，Ｔｅｎ
ｔｈ Ｉｎｔｅｒｎａｔｉｏｎａｌ Ｒｏｕｎｄｔａｂｌｅ，Ｎｕｃｌｅｏｓｉ
ｄｅｓ，Ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ ａｎｄ ｔｈｅｉｒ Ｂｉｏｌｏｇｉｃａｌ
Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ，ユタ州パークシティー，Ｓｅｐｔ．１６−２０，
１９９２を参照されたい。

【００８６】 さらなる修飾はまた、オリゴヌクレオチド上の他の位、特に３’末端ヌクレオ
チド上の糖の３’位および５’末端ヌクレオチドの５’−位で行ってもよい。例
えば、本発明のオリゴヌクレオチドの１つのさらなる修飾は、オリゴヌクレオチ
ドに、該オリゴヌクレオチドの活性、細胞分布または細胞取り込みを亢進させる
、１つまたはそれ以上の部分またはコンジュゲートを化学的に結合させることを
伴う。こうした部分には、限定されるわけではないが、脂質部分、例えばコレス
テロール部分（Ｌｅｔｓｉｎｇｅｒら，Ｐｒｏｃ．Ｎａｔｌ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ
．ＵＳＡ，１９８９，８６，６５５３）、コール酸（Ｍａｎｏｈａｒａｎら，Ｂ
ｉｏｏｒｇ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．Ｌｅｔ．，１９９４，４，１０５３）、チオエ
ーテル、例えば、ヘキシル−Ｓ−トリチルチオール（Ｍａｎｏｈａｒａｎら，Ａ
ｎｎ．Ｎ．Ｙ．Ａｃａｄ．Ｓｃｉ．，１９９２，６６０，３０６；Ｍａｎｏｈａ
ｒａｎら，Ｂｉｏｏｒｇ．Ｍｅｄ．Ｃｈｅｍ．Ｌｅｔ．，１９９３，３，２７６
５）、チオコレステロール（Ｏｂｅｒｈａｕｓｅｒら，Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ．，１９９２，２０，５３３）、脂肪族鎖、例えばドデカンジオールまた
はウンデシル残基（Ｓａｉｓｏｎ−Ｂｅｈｍｏａｒａｓら，ＥＭＢＯ Ｊ．，１
９９１，１０，１１１；Ｋａｂａｎｏｖら，ＦＥＢＳ Ｌｅｔｔ．，１９９０，
２５９，３２７；Ｓｖｉｎａｒｃｈｕｋら，Ｂｉｏｃｈｉｍｉｅ，１９９３，７
５，４９）、リン脂質、例えばジ−ヘキサデシル−ｒａｃ−グリセリンまたはト
リエチルアンモニウム−１，２−ジ−Ｏ−ヘキサデシル−ｒａｃ−グリセロ−３
−Ｈ−ホスホネート（Ｍａｎｏｈａｒａｎら，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ Ｌｅｔ
ｔ．，１９９５，３６，３６５１；Ｓｈｅａら，Ｎｕｃｌ．Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓ
．，１９９０，１８，３７７７）、ポリアミンまたはポリエチレングリコール鎖
（Ｍａｎｏｈａｒａｎら，Ｎｕｃｌｅｏｓｉｄｅｓ ＆ Ｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅ
ｓ，１９９５，１４，９６９）、アダマンタン酢酸（Ｍａｎｏｈａｒａｎら，Ｔ
ｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ Ｌｅｔｔ．，１９９５，３６，３６５１）、パルミチル
部分（Ｍｉｓｈｒａら，Ｂｉｏｃｈｉｍ．Ｂｉｏｐｈｙｓ．Ａｃｔａ，１９９５
，１２６４，２２９）、またはオクタデシルアミンまたはヘキシルアミノ−カル
ボニル−オキシコレステロール部分（Ｃｒｏｏｋｅら，Ｊ．Ｐｈａｒｍａｃｏｌ
．Ｅｘｐ．Ｔｈｅｒ．，１９９６，２７７，９２３）が含まれる。

【００８７】 本明細書において、用語「リン保護基」は、最初に、ホスホロアミダイトのリ
ン原子に結合している基を指す。リン保護基は、例えば固相オリゴヌクレオチド
合成形式中、単数または複数のヌクレオチド間連結を含むリンを保護するよう作
用する。リン保護基を有する、単数または複数のヌクレオチド間連結を、脱保護
剤、例えば水性水酸化アンモニウムで処理すると、リン保護基の除去が生じ、そ
してその代わり、ヒドロキシルまたはチオール基が残るであろう。 本発明に有用な、当該技術分野に知られる多くのリン保護基があり、限定され
るわけではないが、β−シアノエチル、ジフェニルシリルエチル、δ−シアノブ
テニル、シアノｐ−キシリル（ＣＰＸ）、メチル−Ｎ−トリフルオロアセチルエ
チル（ＭＥＴＡ）、アセトキシフェノキシエチル（ＡＰＯＥ）およびブテン−４
−イル基が含まれる。リン保護基は：Ｂｅａｕｃａｇｅ，Ｓ．Ｌ．およびＩｙｅ
ｒ，Ｒ．Ｐ．，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ，１９９３，４９，１９２５−１９６３
；Ｂｅａｕｃａｇｅ，Ｓ．Ｌ．およびＩｙｅｒ，Ｒ．Ｐ．，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒ
ｏｎ，１９９３，４９，１０４４１−１０４８８；Ｂｅａｕｃａｇｅ，Ｓ．Ｌ．
およびＩｙｅｒ，Ｒ．Ｐ．，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ，１９９２，４８，２２２
３−２３１１にさらに記載される。リン保護基の調製およびホスホロアミダイト
化合物へのそれらの取り込みを解説する代表的な米国特許には、限定されるわけ
ではないが、米国特許第５，７８３，６９０号；第５，７６０，２０９号；第５
，７０５６２１号；第５，６１４，６２１号；第５，４５３，４９６号；第５，
１５３，３１９号；第５，１３２，４１８号；第４，９７３，６７９号；第４，
７２５，６７７号；第４，６６８，７７７号；第４，５００，７０７号；第４，
４５８，０６６号；第４，４１５，７３２号；および第Ｒｅ．３４，０６９号が
含まれ、これらの各々の全内容が本明細書に組み入れられる。

【００８８】 本明細書において、用語「アルキル」には、限定されるわけではないが、直鎖
、分枝鎖および脂環式炭化水素基が含まれる。本発明のアルキル基は、置換され
ていてもよい。代表的なアルキル置換基は、全体が本明細書に組み入れられる、
米国特許第５，２１２，２９５号、第１２欄、４１−５０行に開示される。本明
細書において、用語「低級アルキル」は、６またはそれ未満の炭素を有するアル
キル基を意味するよう、意図される。 本明細書において、用語「アラルキル」は、アリール基、たとえばベンジル基
を持つ、アルキル基を意味する。用語「アルカリル」は、アルキル基、例えばメ
チルフェニル基を持つ、アリール基を意味する。本明細書において、用語「アリ
ール」は、限定されるわけではないが、フェニル、ナフチル、アントラシル、フ
ェナントリルおよびピレニルを含む、芳香環基を意味する。

【００８９】 本明細書において、用語「アルカノイル」は、式−Ｃ（＝Ｏ）−アルキルの基
として、その習慣的な意味を有する。好ましいアルカノイル基はアセチル基であ
る。 一般的に、用語「ヘテロ」は、炭素以外の原子、排他的ではないが、好ましく
は、Ｎ、Ｏ，またはＳを意味する。したがって、用語「ヘテロシクロアルキル」
は、1 つまたはそれ以上のヘテロ原子（すなわち非炭素原子）を有するアルキル
環系を意味する。好ましいヘテロシクロアルキル基には、例えば、モルホリノ基
が含まれる。本明細書において、用語「ヘテロシクロアルケニル」は、１つまた
はそれ以上の二重結合および１つまたはそれ以上のヘテロ原子を有する環系を意
味する。好ましいヘテロシクロアルケニル基には、例えば、ピロリジノ基が含ま
れる。

【００９０】 本発明のいくつかの好ましい態様において、第一のヌクレオシドまたはオリゴ
マーは、所望によるリンカーを用い、固体支持体に結合している。固体支持体は
、固相合成方法論の固相として働くことが可能な支持体であり、例えば、米国特
許第４，４１５，７３２号；第４，４５８，０６６号；第４，５００，７０７号
；第４，６６８，７７７号；第４，９７３，６７９号；および第５，１３２，４
１８号（Ｃａｒｕｔｈｅｒｓ）；および米国特許第４，７２５，６７７号および
第Ｒｅ．３４，０６９号（Ｋｏｓｔｅｒ）に記載されるものがある。リンカーは
、固相合成技術において、最初のシントン分子の官能基（例えばヒドロキシル基
）に、固体支持体を連結する働きをする、短い分子として、当該技術分野に知ら
れる。適切なリンカーは、例えば、Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ Ａｎｄ
Ａｎａｌｏｇｕｅｓ Ａ Ｐｒａｃｔｉｃａｌ Ａｐｐｒｏａｃｈ，Ｅｃｋｓ
ｔｅｉｎ，Ｆ．監修，ＩＲＬ Ｐｒｅｓｓ，ニューヨーク，１９９１，第１章，
１−２３ページに開示される。

【００９１】 本発明にしたがった固体支持体には、固相方法論に使用するのに適しているこ
とが、当該技術分野に一般的に知られるものが含まれ、例えば調節孔ガラス（Ｃ
ＰＧ）、オキサリル調節孔ガラスが含まれる。例えば、全体が本明細書に組み入
れられる、Ａｌｕｌら，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ １９
９１，１９，１５２７を参照されたい。固体支持体には、さらに、アミノポリエ
チレングリコール誘導体化支持体である、ＴｅｎｔａＧｅｌ支持体（Ｗｒｉｇｈ
ｔら，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ Ｌｅｔｔｅｒｓ １９９３，３４，３３７３、
全体が本明細書に組み入れられる）およびポリスチレン／ジビニルベンゼンのコ
ポリマーである、Ｐｏｒｏｓが含まれる。

【００９２】 本発明にしたがったヒドロキシル保護基には、多様な基が含まれる。好ましく
は、保護基は、塩基性条件下で安定であるが、酸性条件下で除去することが可能
である。一般的に、保護基は、分子の残りを実質的に損傷することなく、化学的
官能性を特定の反応条件に不活性にし、そして分子中のこうした官能性に付加し
、そして該官能性から除去することが可能である。代表的なヒドロキシル保護基
は、各々全体が本明細書に組み入れられる、Ｂｅａｕｃａｇｅら，Ｔｅｔｒａｈ
ｅｄｒｏｎ １９９２，４８，２２２３−２３１１およびＧｒｅｅｎｅおよびＷ
ｕｔｓ，Ｐｒｏｔｅｃｔｉｖｅ Ｇｒｏｕｐｓ ｉｎ Ｏｒｇａｎｉｃ Ｓｙｎ
ｔｈｅｓｉｓ，第２章，第２版，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，ニュー
ヨーク １９９１に開示される。Ｒ₂ 、Ｒ₃ およびＲ_3aに用いられる好ましい保
護基には、限定されるわけではないが、ジメトキシトリチル（ＤＭＴ）、モノメ
トキシトリチル、９−フェニル−キサンテン−９−イル（Ｐｉｘｙｌ）および９
−（ｐ−メトキシフェニル）キサンテン−９−イル（Ｍｏｘ）が含まれる。Ｒ₂ またはＲ₃ 基は、当該技術分野に公知の技術により、本発明のオリゴマーから除
去し、フリーのヒドロキシルを形成してもよい。例えば、ジメトキシトリチル保
護基は、プロトン酸、例えばギ酸、ジクロロ酢酸、トリクロロ酢酸、ｐ−トルエ
ンスルホン酸により、またはルイス酸、例えば臭化亜鉛で、除去してもよい。例
えば、ＧｒｅｅｎｅおよびＷｕｔｓ、上記を参照されたい。

【００９３】 本発明のいくつかの好ましい態様において、アミノ基を、アルキルまたは他の
基、例えば２’−アルコキシ基に付加する。こうしたアミノ基はまた、天然発生
および天然に存在しない核酸塩基にも、一般的に存在する。これらのアミノ基が
、本発明のオリゴマーの合成中、保護型にあることが、一般的に好ましい。これ
らの目的に適した代表的なアミノ保護基は、ＧｒｅｅｎｅおよびＷｕｔｓ，Ｐｒ
ｏｔｅｃｔｉｖｅ Ｇｒｏｕｐｓ ｉｎ Ｏｒｇａｎｉｃ Ｓｙｎｔｈｅｓｉｓ
，第７章，第２版，Ｊｏｈｎ Ｗｉｌｅｙ ＆ Ｓｏｎｓ，ニューヨーク，１９
９１に論じられる。一般的に、本明細書において、用語「保護」は、「核酸塩基
」などの分子部分と関連して用いられると、分子部分が、保護基により保護され
た１つまたはそれ以上の官能性を含むことを示す。

【００９４】 酸化中に用いられ、ホスホロチオエートおよびホスホロジチオエート結合を形
成する硫化剤には、Ｂｅａｕｃａｇｅ試薬（Ｉｙｅｒ，Ｒ．Ｐ．ら，Ｊ．Ｃｈｅ
ｍ．Ｓｏｃ．，１９９０，１１２，１２５３−１２５４、およびＩｙｅｒ，Ｒ．
Ｐ．ら，Ｊ．Ｏｒｇ．Ｃｈｅｍ．，１９９０，５５，４６９３−４６９９）；テ
トラエチルチウラム・ジスルフィド（Ｖｕ，Ｈ．，Ｈｉｒｓｃｈｂｅｉｎ，Ｂ．
Ｌ．，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏｎ Ｌｅｔｔ．，１９９１，３２，３００５−３０
０８）；ジベンゾイル・テトラスルフィド（Ｒａｏ，Ｍ．Ｖ．ら，Ｔｅｔｒａｈ
ｅｄｒｏｎ Ｌｅｔｔ．，１９９２，３３，４８３９−４８４２）；ジ（フェニ
ルアセチル）ジスルフィド（Ｋａｍｅｒ，Ｐ．Ｃ．Ｊ．，Ｔｅｔｒａｈｅｄｒｏ
ｎ Ｌｅｔｔ．，１９８９，３０，６７５７−６７６０）；ビス（Ｏ，Ｏ−ジイ
ソプロポキシ ホスフィノチオイル）ジスルフィド類（Ｓｔｅｃら，Ｔｅｔｒａ
ｈｅｄｒｏｎ Ｌｅｔｔ．，１９９３，３４，５３１７−５３２０）；３−エト
キシ−１，２，４−ジチアゾリン−５−オン（Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒ
ｅｓｅａｒｃｈ，１９９６ ２４，１６０２−１６０７、およびＮｕｃｌｅｉｃ
Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ，１９９６ ２４，３６４３−３６４４）；ビ
ス（ｐ−クロロベンゼンスルホニル）ジスルフィド（Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄ
ｓ Ｒｅｓｅａｒｃｈ，１９９５ ２３，４０２９−４０３３）；イオウ、トリ
アリール、トリアルキル、トリアラルキル、またはトリアルカリルホスフィン類
のようなリガンドと組み合わせたイオウが含まれる。前述の参考文献は、全体が
本明細書に組み入れられる。

【００９５】 ホスホジエステルまたはホスホロチオエート結合を形成するのに用いられる、
有用な酸化剤には、ヨウ素／テトラヒドロフラン／水／ピリジンまたは過酸化水
素／水またはｔｅｒｔ−ブチルヒドロペルオキシドまたはｍ−クロロ過安息香酸
のようないかなるものでもよい過酸が含まれる。硫化の場合、反応は、空気、特
に酸素を排除し，無水条件下で行われるが、酸化の場合、反応は、水性条件下で
行うことが可能である。 本発明にしたがった、特定の標的にハイブリダイズ可能なオリゴヌクレオチド
またはオリゴヌクレオチド類似体は、好ましくは、約５ないし約５０単量体サブ
ユニットを含む。こうした化合物が、約１０ないし約３０単量体サブユニットを
含むことがより好ましく、１５ないし２５単量体サブユニットが特に好ましい。
より大きいオリゴマーに組み立てる、「構築ブロック」として用いる場合、より
小さいオリゴマーが好ましい。

【００９６】 本発明の１つの側面において、本発明の化合物を用い、その形成または活性が
調節されることが望ましいタンパク質をコードするＲＮＡまたはＤＮＡを調節す
る。使用しようとする組成物の標的部分は、したがって、ＤＮＡまたはＲＮＡの
あらかじめ選択された部分に相補的であるよう選択され、その部分にハイブリダ
イズ可能である。 本発明の化合物および方法において、Ｘ₁ およびＸ₂ は、独立に、ＯまたはＳ
である。したがって、キラルリン結合を有する化合物が、本発明に意図される。
Ｓｔｅｃ，Ｗ．Ｊ．およびＬｅｓｎｉｋｏｗｓｋｉ，Ｚ．Ｊ．，Ｍｅｔｈｏｄｓ
ｉｎ Ｍｏｌｅｃｕｌａｒ Ｂｉｏｌｏｇｙ Ｖｏｌ．２０中：Ｐｒｏｔｏｃ
ｏｌｓ ｆｏｒ Ｏｌｉｇｏｎｕｃｌｅｏｔｉｄｅｓ ａｎｄ Ａｎａｌｏｇｓ
，Ｓ．Ａｇｒａｗａｌ監修，Ｈｕｍａｎａ Ｐｒｅｓｓ，ニュージャージー州ト
トワ（１９９３）、第１４章を参照されたい。また、各々、全体が本明細書に組
み入れられる、Ｓｔｅｃ，Ｗ．Ｊ．ら，Ｎｕｃｌｅｉｃ Ａｃｉｄｓ Ｒｅｓｅ
ａｒｃｈ，Ｖｏｌ．１９，Ｎｏ．２１，５８８３−５８８８（１９９１）；およ
び欧州特許出願ＥＰ０５０６２４２Ａ１も参照されたい。

【００９７】 本発明のオリゴマーは、診断、療法に、そして研究試薬およびキットとして用
いてもよい。該オリゴマーは、適切な薬学的に許容しうる希釈剤またはキャリア
ーを含むことにより、薬剤組成物中に用いてもよい。該オリゴマーはさらに、タ
ンパク質の望ましくない産生により特徴付けられる疾患を有する生物を治療する
のに用いることも可能である。望ましくないタンパク質をコードする核酸の鎖と
特異的にハイブリダイズすることが可能な配列を有するオリゴヌクレオチドと、
該生物を接触させる。この種類の治療は、単細胞原核および真核生物から多細胞
真核生物の範囲に渡る、多様な生物に実施してもよい。その遺伝、代謝または細
胞調節の基本的な部分としてＤＮＡ−ＲＮＡ転写またはＲＮＡ−タンパク質翻訳
を利用するいかなる生物も、本発明にしたがった、療法および／または予防的治
療に感受性である。外見上、多様な生物、例えば、細菌、酵母、原生動物、藻類
、すべての植物、および温血動物を含むすべての動物を治療することが可能であ
る。さらに、多細胞真核生物は、細胞活性の不可欠な部分として、ＤＮＡ−ＲＮ
Ａ転写およびＲＮＡ−タンパク質翻訳両方を含むため、これらの各細胞を治療す
ることも可能である。さらに、真核細胞の細胞小器官（例えばミトコンドリアお
よび葉緑体）の多くもまた、転写および翻訳機構を含む。したがって、単一の細
胞、細胞集団または細胞小器官もまた、療法または診断オリゴヌクレオチドで治
療することが可能な生物の定義に含まれる。

【００９８】 療法組成物の処方および続く投与は、当業者の技術の範囲内であると考えられ
る。一般的に、療法のため、こうした療法が必要な患者に、一般的に、薬学的に
許容しうるキャリアー中の本発明にしたがったオリゴマーを、患者の年齢および
治療しようとする疾患の重症度に応じ、体重１ｋｇ当たり、０．０１μｇないし
１００ｇの範囲の用量で投与する。さらに、治療は、単回用量でもよいし、また
は特定の疾患の性質、その重症度および患者の全身状態に応じ異なるであろう期
間に渡って続く可能性がある措置であってもよいし、そして１日１回から２０年
ごとに１回までに渡ってもよい。治療後、状態変化および疾患状態の症状の軽減
に関し、患者をモニターする。現在の投薬レベルに対し、患者が有意に反応しな
い場合、オリゴマーの投薬量を増加させてもよいし、または疾患状態の症状の軽
減が観察された場合、または疾患状態が除去された場合、用量を減少させてもよ
い。

【００９９】 いくつかの場合、他の伝統的な療法様式と組み合わせ、本発明のオリゴマーで
患者を治療することがより効果的である可能性がある。例えば、ＡＩＤＳのため
治療される患者に、ＡＺＴと組み合わせてオリゴマーを投与してもよいし、また
は、アテローム性動脈硬化症患者を血管形成術後、本発明のオリゴマーで治療し
、治療される動脈の再閉塞を防いでもよい。 投薬は治療しようとする疾患状態の重症度および反応性に応じ、治療過程は数
日から数ヶ月、あるいは治癒が達成されるまでまたは疾患状態の軽減が達成され
るまで持続する。最適投薬計画は、患者の体内の薬剤集積の測定値から計算する
ことが可能である。一般の当業者は、最適投薬、投薬方法論および反復率を容易
に決定することが可能である。最適投薬は、個々のオリゴマーの相対強度に応じ
異なる可能性があり、そして一般的にｉｎ ｖｉｔｒｏおよびｉｎ ｖｉｖｏ動
物モデルで有効であることが見出されたＥＣ₅₀に基づき、概算することが可能で
ある。一般的に、投薬は体重１ｋｇ当たり０．０１μｇないし１００ｇであり、
そして毎日、毎週、毎月または毎年１回またはそれ以上、あるいは２ないし２０
年ごとに１回、投与してもよい。

【０１００】 治療の成功後、患者に疾患状態の再発を防ぐ維持療法を受けさせることが望ま
しい可能性があり、ここで、オリゴマーは、毎日１回またはそれ以上、ないし２
０年ごとに１回、体重１ｋｇ当たり０．０１μｇないし１００ｇの範囲の維持用
量で投与される。 本発明の薬剤組成物は、局所または全身治療が望ましいかどうかに応じ、そし
て治療しようとする領域に応じ、いくつかの方式で投与してもよい。投与は、局
所（眼、膣、直腸、鼻腔内、経皮を含む）、経口または非経口であってもよい。
非経口投与は、静脈内滴注、皮下、腹腔内または筋内注射、または鞘内または脳
室内投与を含む。 局所投与のための処方は、経皮パッチ、軟膏、ローション、クリーム、ゲル、
ドロップ、座薬、スプレー、液体および粉末を含んでもよい。慣用的な薬剤キャ
リアー、水性、粉末または油性基剤、増粘剤およびそれらに匹敵するものが必要
であるまたは望ましい可能性がある。被覆コンドーム、手袋およびそれらに匹敵
するものもまた、有用である可能性がある。

【０１０１】 経口投与のための組成物には、粉末または顆粒、水または非水性媒体中の懸濁
物または溶液、カプセル、サシェー剤（ｓａｃｈｅｔ）または錠剤が含まれる。
増粘剤、フレーバー付与剤、希釈剤、乳化剤、分散補助または結合剤が望ましい
可能性もある。 鞘内または脳室内投与のための組成物は、緩衝剤、希釈剤および他の適切な添
加物も含んでもよい、無菌水性溶液を含んでもよい。 非経口投与のための処方は、緩衝剤、希釈剤および他の適切な添加物も含んで
もよい、無菌水性溶液を含んでもよい。 認識されるであろうように、本発明の方法の工程は、いかなる特定の回数また
はいかなる特定の配列で行う必要もない。本発明のさらなる目的、利点、および
新規の特徴は、限定することを意図しない、以下の例示的実施例を調べると、当
業者に明らかになるであろう。

【０１０２】

【実施例】実施例１ Ｔ−Ｔホスホロチオエート二量体の合成 エステル結合を通じ、ＣＰＧ（調節孔ガラス）に結合した５’−Ｏ−ジメトキ
シトリチルチミジン（１００ｍｇ、４ｍｍｏｌ）をガラス反応装置に取り、そし
て２％ジクロロ酢酸のジクロロメタン溶液（体積／体積）を添加し、５’−ヒド
ロキシル基を脱保護した。産物をジクロロメタンで、そしてその後、アセトニト
リルで洗浄した。その後、アセトニトリル中の５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキ
シトリチル）チミジン−３’−Ｏ−（２−シアノエチル）−Ｎ，Ｎ−ジイソプロ
ピルホスホロアミダイト（組成物として得られる）の０．２Ｍ溶液およびアセト
ニトリル中の１Ｈ−テトラゾールの０．４５Ｍ溶液を添加し、そして室温で５分
間反応させた。産物を、アセトニトリルで洗浄し、そしてその後、アセトニトリ
ル中のＢｅａｕｃａｇｅ試薬の０．０５Ｍ溶液を添加し、そして室温で５分間反
応させた。本硫化工程をもう1 度、５分間繰り返した。支持体をアセトニトリル
で、そしてその後、無水酢酸／ルチジン／ＴＨＦ（１：１：８）の溶液で洗浄し
、そしてＮ−メチルイミダゾール／ＴＨＦを添加し、未反応５’−ヒドロキシル
基をキャップした。産物をアセトニトリルで洗浄した。 固体支持体を、水性３０％ 水酸化アンモニウムで９０分間処理した。水性溶
液をろ過し、減圧下で濃縮し、表題Ｔ−Ｔ二量体を得た。

【０１０３】実施例２ Ｃ−Ｔホスホロチオエート二量体の合成 エステル結合を通じ、ＣＰＧ（調節孔ガラス）に結合した５’−Ｏ−ジメトキ
シトリチルチミジン（１００ｍｇ、４ｍｍｏｌ）をガラス反応装置に取り、そし
て２％ ジクロロ酢酸のジクロロメタン溶液（体積／体積）を添加し、５’−ヒ
ドロキシル基を脱保護した。産物をアセトニトリルで洗浄した。その後、アセト
ニトリル中のＮ⁴ −ベンゾイル−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）
−２’−デオキシシチジン−３’−Ｏ−（２−シアノエチル）−Ｎ，Ｎ−ジイソ
プロピルホスホロアミダイト（組成物として得られる）の０．２Ｍ溶液およびア
セトニトリル中の１Ｈ−テトラゾールの０．４Ｍ溶液を添加し、そして室温で５
分間反応させた。産物を、アセトニトリルで洗浄し、そしてその後、アセトニト
リル中のＢｅａｕｃａｇｅ試薬の０．０５Ｍ溶液を添加し、そして室温で５分間
反応させた。本硫化工程をもう1 度、５分間繰り返した。支持体をアセトニトリ
ルで、そしてその後、無水酢酸／ルチジン／ＴＨＦ（１：１：８）の溶液で洗浄
し、そしてＮ−メチルイミダゾール／ＴＨＦを添加し、未反応５’−ヒドロキシ
ル基をキャップした。産物をアセトニトリルで洗浄した。 固体支持体を、水性３０％ 水酸化アンモニウムで９０分間処理した後、５５
℃で１２時間インキュベーションした。生じた混合物をろ過し、そして生じた溶
液をろ過し、減圧下で濃縮し、そしてＴＨＦ中のテトラ−ｎ−ブチルアンモニウ
ムフルオリドの１．０Ｍ溶液で、室温で処理し、表題ホスホロチオエートｄＣ−
Ｔ二量体を得た。

【０１０４】実施例３ ５’−ＴＴＴＴＴＴＴ−３’ホスホロチオエート七量体の合成 エステル結合を通じ、ＣＰＧ（調節孔ガラス）に結合した５’−Ｏ−ジメトキ
シトリチルチミジン（５０ｍｇ、２ｍｍｏｌ）をガラス反応装置に取り、そして
３％ ジクロロ酢酸のトルエン溶液（体積／体積）を添加し、５’−ヒドロキシ
ル基を脱保護した。産物をアセトニトリルで洗浄した。その後、アセトニトリル
中の５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）チミジン−３’−Ｏ−（２−
シアノエチル）−Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルホスホロアミダイト（組成物として得
られる）の０．２Ｍ溶液およびアセトニトリル中の１Ｈ−テトラゾールの０．４
Ｍ溶液を添加し、そして室温で５分間反応させた。産物を、アセトニトリルで洗
浄し、そしてその後、アセトニトリル中のフェニルアセチルジスルフィドの０．
２Ｍ溶液：３−ピコリン（１：１ｖ／ｖ）を添加し、そして室温で３分間反応さ
せた。本硫化工程をもう1 度、３分間繰り返した。支持体をアセトニトリルで、
そしてその後、無水酢酸／ルチジン／ＴＨＦ（１：１：８）の溶液で洗浄し、そ
してＮ−メチルイミダゾール／ＴＨＦを添加し、いかなる未反応５’−ヒドロキ
シル基もキャップした。産物をアセトニトリルで洗浄した。 本完全周期をさらに５回繰り返し、完全に保護されたチミジン七量体を生じた
。化合物を含むキャリアーを、３０％ 水性水酸化アンモニウムで９０分間、室
温で処理した。水性溶液をろ過し、そして減圧下で濃縮し、ホスホロチオエート
七量体、ＴＴＴＴＴＴＴを得た。

【０１０５】実施例４ ５’−ｄ（ＧＡＣＴ）−３’ホスホロチオエート四量体の合成 エステル結合を通じ、ＣＰＧ（調節孔ガラス）に結合した５’−Ｏ−ジメトキ
シトリチルチミジン（５０ｍｇ、２ｍｍｏｌ）をガラス反応装置に取り、そして
トルエン中の３％ジクロロ酢酸の溶液（体積／体積）を添加し、５’−ヒドロキ
シル基を脱保護した。産物をアセトニトリルで洗浄した。その後、アセトニトリ
ル中の５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）チミジン−３’−Ｏ−（２
−シアノエチル）−Ｎ，Ｎ−ジイソプロピルホスホロアミダイト（組成物として
得られる）の０．２ Ｍ溶液およびアセトニトリル中の１Ｈ−テトラゾールの０
．４Ｍ溶液を添加し、そして室温で５分間反応させた。産物を、アセトニトリル
で洗浄し、そしてその後、アセトニトリル中のフェニルアセチルジスルフィドの
０．２Ｍ溶液：３−ピコリン（１：１ｖ／ｖ）を添加し、そして室温で３分間反
応させた。本硫化工程をもう1 度、３分間繰り返した。支持体をアセトニトリル
で、そしてその後、無水酢酸／ルチジン／ＴＨＦ（１：１：８）の溶液で洗浄し
、そしてＮ−メチルイミダゾール／ＴＨＦを添加し、未反応５’−ヒドロキシル
基をキャップした。産物をアセトニトリルで洗浄した。 トルエン中の３％ ジクロロ酢酸の溶液（体積／体積）を添加し、５’−ヒド
ロキシル基を脱保護した。産物をアセトニトリルで洗浄した。その後、アセトニ
トリル中のＮ⁴ −ベンゾイル−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）−
２’−デオキシシチジン−３’−Ｏ−（２−シアノエチル）−Ｎ，Ｎ−ジイソプ
ロピルホスホロアミダイト（組成物として得られる）の０．２Ｍ溶液およびアセ
トニトリル中の１Ｈ−テトラゾールの０．４Ｍ溶液を添加し、そして室温で５分
間反応させた。産物を、アセトニトリルで洗浄し、そしてその後、アセトニトリ
ル中のフェニルアセチルジスルフィドの０．２Ｍ溶液：３−ピコリン（１：１ｖ
／ｖ）を添加し、そして室温で３分間反応させた。本硫化工程をもう1 度、３分
間繰り返した。支持体をアセトニトリルで、そしてその後、無水酢酸／ルチジン
／ＴＨＦ（１：１：８）の溶液で洗浄し、そしてＮ−メチルイミダゾール／ＴＨ
Ｆを添加し、いかなる未反応５’−ヒドロキシル基もキャップした。産物をアセ
トニトリルで洗浄した。

【０１０６】 トルエン中の３％ジクロロ酢酸の溶液（体積／体積）を添加し、５’−ヒドロ
キシル基を脱保護した。産物をアセトニトリルで洗浄した。その後、無水アセト
ニトリル中のＮ⁶ −ベンゾイル−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリチル）
−２’−デオキシアデノシン−３’−Ｏ−（２−シアノエチル）−Ｎ，Ｎ−ジイ
ソプロピルホスホロアミダイト（組成物として得られる）の０．２Ｍ溶液および
アセトニトリル中の１Ｈ−テトラゾールの０．４Ｍ溶液を添加し、そして室温で
５分間反応させた。産物を、アセトニトリルで洗浄し、そしてその後、アセトニ
トリル中のフェニルアセチルジスルフィドの０．２Ｍ溶液：３−ピコリン（１：
１ｖ／ｖ）を添加し、そして室温で３分間反応させた。本硫化工程をもう1 度、
３分間繰り返した。支持体をアセトニトリルで、そしてその後、無水酢酸／ルチ
ジン／ＴＨＦ（１：１：８）の溶液で洗浄し、そしてＮ−メチルイミダゾール／
ＴＨＦを添加し、未反応５’−ヒドロキシル基をキャップした。産物をアセトニ
トリルで洗浄した。

【０１０７】 トルエン中の３％ ジクロロ酢酸の溶液（体積／体積）を添加し、５’−ヒド
ロキシル基を脱保護した。産物をアセトニトリルで洗浄した。その後、アセトニ
トリル中の療法等級Ｎ² −イソブチル−５’−Ｏ−（４，４’−ジメトキシトリ
チル）−２’−デオキシグアノシン−３’−Ｏ−（２−シアノエチル）−Ｎ，Ｎ
−ジイソプロピルホスホロアミダイト（組成物として得られる）の０．２Ｍ溶液
およびアセトニトリル中の１Ｈ−テトラゾールの０．４Ｍ溶液を添加し、そして
室温で５分間反応させた。産物を、アセトニトリルで洗浄し、そしてその後、ア
セトニトリル中のフェニルアセチルジスルフィドの０．２Ｍ溶液：３−ピコリン
（１：１ｖ／ｖ）を添加し、そして室温で３分間反応させた。本硫化工程をもう
1 度、３分間繰り返した。支持体をアセトニトリルで、そしてその後、無水酢酸
／ルチジン／ＴＨＦ（１：１：８）の溶液で洗浄し、そしてＮ−メチルイミダゾ
ール／ＴＨＦを添加し、いかなる未反応５’−ヒドロキシル基もキャップした。
産物をアセトニトリルで洗浄した。 化合物を含むキャリアーを、３０％ 水性水酸化アンモニウムで９０分間、室
温で処理し、そしてその後、５５℃で２４時間インキュベーションした。水性溶
液をろ過し、減圧下で濃縮し、５’−ｄＧ−ｄＡ−ｄＣ−Ｔ−３’のホスホロチ
オエート四量体を得た。

【０１０８】実施例５ 完全に修飾された５’−ｄ（ＴＣＣ−ＣＧＣ−ＣＴＧ−ＴＧＡ−ＣＡＴ−ＧＣＡ −ＴＴ）−３’ホスホロチオエート２０量体（配列番号１）の合成 上記配列の合成を、組成物としてＰｈａｒｍａｃｉａから得たシアノエチルホ
スホロアミダイトおよびＰｈａｒｍａｃｉａのＨＬ３０プライマー（ｐｒｉｍａ
ｒ）支持体を用い、１８０ｍｍｏｌ規模で、Ｐｈａｒｍａｃｉａ ＯｌｉｇｏＰ
ｉｌｏｔ ＩＩ合成装置上で行った。脱トリチル化は、トルエン中の３％ジクロ
ロ酢酸（体積／体積）を用いて行った。ホスホロアミダイトは、アセトニトリル
中の１Ｈ−テトラゾールの０．４Ｍ溶液で活性化した。硫化は、アセトニトリル
中のフェニルアセチルジスルフィドの０．２Ｍ溶液：３−ピコリン（１：１ｖ／
ｖ）を用いて、２分間行った。合成終了時、支持体をアセトニトリルで洗浄し、
切断し、脱保護し、そして通常の方式で精製した。

【０１０９】実施例６ 完全に修飾された５’−ｄ（ＧＣＣ−ＣＡＡ−ＧＣＴ−ＧＧＣ−ＡＴＣ−ＣＧＴ −ＣＡ）−３’ホスホロチオエート２０量体（配列番号２）の合成 上記配列の合成を、組成物としてＰｈａｒｍａｃｉａから得たシアノエチルホ
スホロアミダイトおよびＰｈａｒｍａｃｉａのＨＬ３０プライマー支持体を用い
、１８０ｍｍｏｌ規模で、Ｐｈａｒｍａｃｉａ ＯｌｉｇｏＰｉｌｏｔ ＩＩ合
成装置上で行った。脱トリチル化は、トルエン中の３％ジクロロ酢酸（体積／体
積）を用いて行った。ホスホロアミダイトは、アセトニトリル中の１Ｈ−テトラ
ゾールの０．４Ｍ溶液で活性化した。硫化は、アセトニトリル中のフェニルアセ
チルジスルフィドの０．２Ｍ溶液：３−ピコリン（１：１ｖ／ｖ）を用いて、２
分間行った。合成終了時、支持体をアセトニトリルで洗浄し、切断し、脱保護し
、そして通常の方式で精製した。

【０１１０】実施例７ 完全に修飾された５’−ｄ（ＧＣＧ−ＴＴＴ−ＧＣＴ−ＣＴＴ−ＣＴＴ−ＣＴＴ −ＧＣＧ）−３’ホスホロチオエート２１量体（配列番号３）の合成 上記配列の合成を、組成物としての対応するシアノエチルホスホロアミダイト
およびＰｈａｒｍａｃｉａのプライマー支持体を用い、１８０ｍｍｏｌ規模で、
Ｐｈａｒｍａｃｉａ ＯｌｉｇｏＰｉｌｏｔ ＩＩ合成装置上で行った。脱トリ
チル化は、トルエン中の３％ジクロロ酢酸（体積／体積）を用いて行った。ホス
ホロアミダイトは、アセトニトリル中の１Ｈ−テトラゾールの０．４Ｍ溶液で活
性化した。硫化は、アセトニトリル中のフェニルアセチルジスルフィドの０．２
Ｍ溶液：３−ピコリン（１：１ｖ／ｖ）を用いて、２分間行った。合成終了時、
支持体をアセトニトリルで洗浄し、切断し、脱保護し、そして通常の方式で精製
した。

【０１１１】実施例８ 完全に修飾された５’−ｄ（ＧＴＴ−ＣＴＣ−ＧＣＴ−ＧＧＴ−ＧＡＧ−ＴＴＴ −ＣＡ）−３’ホスホロチオエート２０量体（配列番号４）の合成 上記配列の合成を、組成物としてのシアノエチルホスホロアミダイトおよびＰ
ｈａｒｍａｃｉａのＨＬ３０プライマー支持体を用い、１８０ｍｍｏｌ規模で、
Ｐｈａｒｍａｃｉａ ＯｌｉｇｏＰｉｌｏｔ ＩＩ合成装置上で行った。脱トリ
チル化は、トルエン中の３％ジクロロ酢酸（体積／体積）を用いて行った。ホス
ホロアミダイトは、アセトニトリル中の１Ｈ−テトラゾールの０．４ Ｍ溶液で
活性化した。硫化は、アセトニトリル中のフェニルアセチルジスルフィドの０．
２Ｍ溶液：３−ピコリン（１：１ｖ／ｖ）を用いて、２分間行った。合成終了時
、支持体をアセトニトリルで洗浄し、切断し、脱保護し、そして通常の方式で精
製した。

【０１１２】実施例９ 完全に修飾された５’−ｄ（ＴＣＣ−ＧＴＣ−ＡＴＣ−ＧＣＴ−ＣＣＴ−ＣＡＧ −ＧＧ）−３’ホスホロチオエート２０量体（配列番号５）の合成 上記配列の合成を、組成物としてＰｈａｒｍａｃｉａから得たシアノエチルホ
スホロアミダイトおよびＰｈａｒｍａｃｉａのＨＬ３０プライマー支持体を用い
、１８０ｍｍｏｌ規模で、Ｐｈａｒｍａｃｉａ ＯｌｉｇｏＰｉｌｏｔ ＩＩ合
成装置上で行った。脱トリチル化は、トルエン中の３％ジクロロ酢酸（体積／体
積）を用いて行った。ホスホロアミダイトは、アセトニトリル中の１Ｈ−テトラ
ゾールの０．４Ｍ溶液で活性化した。硫化は、アセトニトリル中のフェニルアセ
チルジスルフィドの０．２Ｍ溶液：３−ピコリン（１：１ｖ／ｖ）を用いて、２
分間行った。合成終了時、支持体をアセトニトリルで洗浄し、切断し、脱保護し
、そして通常の方式で精製した。

【０１１３】実施例１０ 完全に修飾された５’−ｄ（ＴＣＣ−ＧＴＣ−ＡＴＣ−ＧＣＴ−ＣＣＴ−ＣＡＧ −ＧＧ）−３’ホスホロチオエート２０量体（配列番号５）の合成 上記配列の合成を、組成物としてＣｒｕａｃｈｅｍ Ｉｎｃ．、ペンシルバニ
ア州アストンから得たシアノエチルホスホロアミダイトおよびＰｈａｒｍａｃｉ
ａのＨＬ３０プライマー支持体を用い、１８０ｍｍｏｌ規模で、Ｐｈａｒｍａｃ
ｉａ ＯｌｉｇｏＰｉｌｏｔ ＩＩ合成装置上で行った。脱トリチル化は、トル
エン中の３％ジクロロ酢酸（体積／体積）を用いて行った。ホスホロアミダイト
は、アセトニトリル中の１Ｈ−テトラゾールの０．４Ｍ溶液で活性化した。硫化
は、アセトニトリル中のフェニルアセチルジスルフィドの０．２Ｍ溶液：３−ピ
コリン（１：１ｖ／ｖ）を用いて、２分間行った。合成終了時、支持体をアセト
ニトリルで洗浄し、切断し、脱保護し、そして通常の方式で精製した。

【０１１４】実施例１１ 完全に修飾された５’−ｄ（ＴＣＣ−ＧＴＣ−ＡＴＣ−ＧＣＴ−ＣＣＴ−ＣＡＧ −ＧＧ）−３’ホスホロチオエート２０量体（配列番号５）の合成 上記配列の合成を、組成物としてＰｒｏｌｉｇｏ ＬＬＣ、コロラド州ボール
ダーから得たシアノエチルホスホロアミダイトおよびＰｈａｒｍａｃｉａのＨＬ
３０プライマー支持体を用い、１８０ｍｍｏｌ規模で、Ｐｈａｒｍａｃｉａ Ｏ
ｌｉｇｏＰｉｌｏｔ ＩＩ合成装置上で行った。脱トリチル化は、トルエン中の
３％ ジクロロ酢酸（体積／体積）を用いて行った。ホスホロアミダイトは、ア
セトニトリル中の１Ｈ−テトラゾールの０．４Ｍ溶液で活性化した。硫化は、ア
セトニトリル中のフェニルアセチルジスルフィドの０．２Ｍ溶液：３−ピコリン
（１：１ｖ／ｖ）を用いて、２分間行った。合成終了時、支持体をアセトニトリ
ルで洗浄し、切断し、脱保護し、そして通常の方式で精製した。

【０１１５】実施例１２ 完全に修飾された５’−ｄ（ＧＣＣ−ＣＡＡ−ＧＣＴ−ＧＧＣ−ＡＴＣ−ＣＧＴ −ＣＡ）−３’ホスホロチオエート２０量体（配列番号２）の合成 上記配列の合成を、組成物としてＣｒｕａｃｈｅｍ Ｉｎｃ．、ペンシルバニ
ア州アストンから得たシアノエチルホスホロアミダイトおよびＰｈａｒｍａｃｉ
ａのＨＬ３０プライマー支持体を用い、１８０ｍｍｏｌ規模で、Ｐｈａｒｍａｃ
ｉａ ＯｌｉｇｏＰｉｌｏｔ ＩＩ合成装置上で行った。脱トリチル化は、トル
エン中の３％ジクロロ酢酸（体積／体積）を用いて行った。ホスホロアミダイト
は、アセトニトリル中の１Ｈ−テトラゾールの０．４Ｍ溶液で活性化した。硫化
は、アセトニトリル中のフェニルアセチルジスルフィドの０．２Ｍ溶液：３−ピ
コリン（１：１ｖ／ｖ）を用いて、２分間行った。合成終了時、支持体をアセト
ニトリルで洗浄し、切断し、脱保護し、そして通常の方式で精製した。

【０１１６】実施例１３ 完全に修飾された５’−ｄ（ＧＣＣ−ＣＡＡ−ＧＣＴ−ＧＧＣ−ＡＴＣ−ＣＧＴ −ＣＡ）−３’ホスホロチオエート２０量体（配列番号２）の合成 上記配列の合成を、組成物としてＰｒｏｌｉｇｏ ＬＬＣ、コロラド州ボール
ダーから得たシアノエチルホスホロアミダイトおよびＰｈａｒｍａｃｉａのＨＬ
３０プライマー支持体を用い、１８０ｍｍｏｌ規模で、Ｐｈａｒｍａｃｉａ Ｏ
ｌｉｇｏＰｉｌｏｔ ＩＩ合成装置上で行った。脱トリチル化は、トルエン中の
３％ジクロロ酢酸（体積／体積）を用いて行った。ホスホロアミダイトは、アセ
トニトリル中の１Ｈ−テトラゾールの０．４Ｍ溶液で活性化した。硫化は、アセ
トニトリル中のフェニルアセチルジスルフィドの０．２Ｍ溶液：３−ピコリン（
１：１ ｖ／ｖ）を用いて、２分間行った。合成終了時、支持体をアセトニトリ
ルで洗浄し、切断し、脱保護し、そして通常の方式で精製した。

【０１１７】実施例１４ デオキシＰ＝Ｓ ２０量体（５’−ＴＣＣ ＣＧＣ ＣＴＧ ＴＧＡ ＣＡＴ ＧＣＡ ＴＴ）（配列番号１）合成のための一般的な方法 上記配列の合成を、高純度ホスホロアミダイトを販売する商業的供給元から、
特注により得た各組成物を用い、１８０ｍｍｏｌ規模で、Ｐｈａｒｍａｃｉａ ＯｌｉｇｏＰｉｌｏｔ ＩＩ合成装置上で行った。ＰｈａｒｍａｃｉａのＨＬ３
０チミジンプライマー支持体を用いた。脱トリチル化は、トルエン中の３％ジク
ロロ酢酸（体積／体積）を用いて行った。ホスホロアミダイトは、アセトニトリ
ル中の１Ｈ−テトラゾールの０．４Ｍ溶液で活性化した。硫化は、アセトニトリ
ル中のフェニルアセチルジスルフィドの０．２Ｍ溶液：３−ピコリン（１：１ ｖ／ｖ）を用いて、２分間行った。合成終了時、支持体をアセトニトリルで洗浄
し、切断し、脱保護し、そして通常の方式で精製した。オリゴヌクレオチドは、
逆相ＨＰＬＣにより精製し、そしてすべてのＤＭＴ分画を合わせ、そしてキャピ
ラリーゲル電気泳動により解析した。

【０１１８】 本明細書において言及されまたは引用された特許、出願、印刷刊行物、および
他の公表文書は各々、全体が本明細書に組み入れらることが意図される。 当業者は、本発明の好ましい態様に、多くの変化および修飾を行ってもよく、
そしてこうした変化および修飾は、本発明の精神から逸脱することなく、行うこ
とが可能であることを認識するであろう。したがって、付随する請求項は、すべ
てのこうした同等の変動を、本発明の真の精神および範囲内に属するものとして
含むよう、意図される。

【配列表】

───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.⁷ 識別記号 ＦＩ テーマコート゛(参考） Ａ６１Ｐ 31/18 Ａ６１Ｐ 31/18 43/00 １０５ 43/00 １０５ Ｃ０７Ｈ 21/04 Ｃ０７Ｈ 21/04 Ａ (81)指定国 ＥＰ(ＡＴ，ＢＥ，ＣＨ，ＣＹ， ＤＥ，ＤＫ，ＥＳ，ＦＩ，ＦＲ，ＧＢ，ＧＲ，ＩＥ，Ｉ Ｔ，ＬＵ，ＭＣ，ＮＬ，ＰＴ，ＳＥ)，ＯＡ(ＢＦ，ＢＪ ，ＣＦ，ＣＧ，ＣＩ，ＣＭ，ＧＡ，ＧＮ，ＧＷ，ＭＬ， ＭＲ，ＮＥ，ＳＮ，ＴＤ，ＴＧ)，ＡＰ(ＧＨ，ＧＭ，Ｋ Ｅ，ＬＳ，ＭＷ，ＳＤ，ＳＬ，ＳＺ，ＴＺ，ＵＧ，ＺＷ )，ＥＡ(ＡＭ，ＡＺ，ＢＹ，ＫＧ，ＫＺ，ＭＤ，ＲＵ， ＴＪ，ＴＭ)，ＡＥ，ＡＧ，ＡＬ，ＡＭ，ＡＴ，ＡＵ， ＡＺ，ＢＡ，ＢＢ，ＢＧ，ＢＲ，ＢＹ，ＣＡ，ＣＨ，Ｃ Ｎ，ＣＲ，ＣＵ，ＣＺ，ＤＥ，ＤＫ，ＤＭ，ＤＺ，ＥＥ ，ＥＳ，ＦＩ，ＧＢ，ＧＤ，ＧＥ，ＧＨ，ＧＭ，ＨＲ， ＨＵ，ＩＤ，ＩＬ，ＩＮ，ＩＳ，ＪＰ，ＫＥ，ＫＧ，Ｋ Ｐ，ＫＲ，ＫＺ，ＬＣ，ＬＫ，ＬＲ，ＬＳ，ＬＴ，ＬＵ ，ＬＶ，ＭＡ，ＭＤ，ＭＧ，ＭＫ，ＭＮ，ＭＷ，ＭＸ， ＮＯ，ＮＺ，ＰＬ，ＰＴ，ＲＯ，ＲＵ，ＳＤ，ＳＥ，Ｓ Ｇ，ＳＩ，ＳＫ，ＳＬ，ＴＪ，ＴＭ，ＴＲ，ＴＴ，ＴＺ ，ＵＡ，ＵＧ，ＵＺ，ＶＮ，ＹＵ，ＺＡ，ＺＷ (72)発明者 カパルディ，ダニエル・シー アメリカ合衆国カリフォルニア州92122， サンディエゴ，ノベル・ドライブ 3855， アパートメント・ナンバー 2125 (72)発明者 コール，ダグラス・ティー アメリカ合衆国カリフォルニア州92130， サンディエゴ，スミス・キャニオン・コー ト 4992 Ｆターム(参考） 4C057 BB04 DD01 MM02 MM04 4C084 AA13 NA14 ZA452 ZB212 ZC552 4C086 AA01 AA03 AA04 EA16 EA17 EA18 NA14 ZA45 ZB21 ZC55

Claims (80)

【特許請求の範囲】
1. 【請求項１】 式： 【化１】 （式中： Ｘ₁ およびＸ₂ は各々、独立に、ＯまたはＳであり； Ｂｘは保護または未保護複素環塩基部分であり；そして 各Ｒ₁ は、独立に、Ｈ、保護ヒドロキシル基、糖置換基または保護糖置換基で
   ある。） の少なくとも１つの部分を有するオリゴマーを調製する方法であって： （ａ）式： 【化２】 （式中： Ｔ₁ はヒドロキシル保護基であり；そして Ｔ₂ は固体支持体への共有結合または固体支持体結合ヌクレオシド、ヌクレオ
   チド、オリゴヌクレオシドまたはオリゴヌクレオチドである。） の化合物を提供する工程； （ｂ）Ｔ₁ 基を除去して５’−ヒドロキシル基を有する前記化合物を形成する工
   程；および （ｃ）５’−ヒドロキシル基を有する前記化合物を、ホスホロアミダイト組成物
   で処理し、伸長された化合物を形成する工程であって、前記ホスホロアミダイト
   組成物が、式： 【化３】 （式中： Ｔ₃ は保護ヒドロキシル基、ヌクレオシド、ヌクレオチド、オリゴヌクレオシ
   ドまたはオリゴヌクレオチドであり； Ｒ₀ はリン保護基であり；そして Ｌ₁ およびＬ₂ は各々、独立に、Ｃ_1-6 アルキルであるか； または、Ｌ₁ およびＬ₂ が一緒に連結されてＬ₁ およびＬ₂ が結合する窒素原
   子を含む４−ないし７−員複素環系であって、場合により、Ｏ、ＮおよびＳから
   選択される少なくとも１つのさらなるヘテロ原子を含む複素環系を形成する。）
   のホスホロアミダイト化合物を含んでなる工程 を含んでなる方法であり、 前記ホスホロアミダイト組成物が、少なくとも約１重量％の少なくとも１つの
   ３’−ヒドロキシヌクレオシド、前記ホスホロアミダイト化合物と異なるＰ^III 種であって、前記Ｐ^III 種のＰ^III リンへの基の共有結合が酸素またはイオウを
   介するＰ^III 種、またはＰ^V 種であって、Ｐ^V 種への基の共有結合が酸素、イオ
   ウまたは窒素を介するＰ^V 種をさらに含んでなる方法。
2. 【請求項２】 前記ホスホロアミダイト組成物が、さらに、少なくとも約２
   重量％の少なくとも１つの３’−ヒドロキシヌクレオシド、前記ホスホロアミダ
   イト化合物と異なるＰ^III 種であって、前記Ｐ^III 種のＰ^III リンへの基の共有
   結合が酸素またはイオウを介するＰ^III 種、またはＰ^V 種であって、Ｐ^V 種への
   基の共有結合が酸素、イオウまたは窒素を介するＰ^V 種を含んでなる、請求項１
   の方法。
3. 【請求項３】 前記伸長された化合物を、キャップ剤で処理してキャップさ
   れた化合物を形成することをさらに含む、請求項１の方法。
4. 【請求項４】 前記キャップされた化合物を、酸化剤で処理して酸化された
   化合物を形成することをさらに含む、請求項２の方法。
5. 【請求項５】 前記酸化された化合物を、前記酸化された化合物を脱保護す
   るのに有効な試薬で処理して脱保護されたオリゴマーを形成することをさらに含
   む、請求項４の方法。
6. 【請求項６】 前記脱保護されたオリゴマーを、該固体支持体から前記オリ
   ゴマーを切断するのに有効な試薬で処理することをさらに含む、請求項５の方法
   。
7. 【請求項７】 前記試薬が、該固体支持体から脱保護されたオリゴマーを切
   断するのにも有効である、請求項５の方法。
8. 【請求項８】 前記伸長された化合物を、前記保護ヒドロキシル基から保護
   基を除去するのに有効な試薬で処理することをさらに含む、請求項１の方法。
9. 【請求項９】 前記複素環塩基部分が、アデニン、Ｎ⁶ −ベンゾイルアデニ
   ン、シトシン、Ｎ⁴ −ベンゾイルシトシン、５−メチルシトシン、Ｎ⁴ −ベンゾ
   イル−５−メチルシトシン、チミン、ウラシル、グアニン、Ｎ² −イソブチリル
   グアニンまたは２−アミノアデニンである、請求項１の方法。
10. 【請求項１０】 Ｌ₁ およびＬ₂ が各々、独立に、Ｃ_1-6 アルキルである、
    請求項１の方法。
11. 【請求項１１】 Ｌ₁ およびＬ₂ が各々、独立に、イソプロピルである、請
    求項１０の方法。
12. 【請求項１２】 Ｌ₁ およびＬ₂ が、一緒に連結されて、前記Ｌ₁ およびＬ ₂ が結合する窒素原子を含む複素環系であって、場合により、Ｏ、ＮおよびＳか
    ら選択される少なくとも１つのさらなるヘテロ原子を含む複素環系を形成する、
    請求項１の方法。
13. 【請求項１３】 前記複素環系がモルホリンである、請求項１２の方法。
14. 【請求項１４】 各Ｒ₁ が、独立に、Ｈ、ヒドロキシル、Ｃ₁ 〜Ｃ₂₀アルキ
    ル、Ｃ₃ 〜Ｃ₂₀アルケニル、Ｃ₂ 〜Ｃ₂₀アルキニル、ハロゲン、チオール、ケト
    、カルボキシル、ニトロ、ニトロソ、ニトリル、トリフルオロメチル、トリフル
    オロメトキシ、Ｏ−アルキル、Ｓ−アルキル、ＮＨ−アルキル、Ｎ−ジアルキル
    、Ｏ−アリール、Ｓ−アリール、ＮＨ−アリール、Ｏ−アラルキル、Ｓ−アラル
    キル、ＮＨ−アラルキル、アミノ、Ｎ−フタルイミド、イミダゾール、アジド、
    ヒドラジノ、ヒドロキシルアミノ、イソシアナト、スルホキシド、スルホン、ス
    ルフィド、ジスルフィド、シリル、アリール、複素環、炭素環、インターカレー
    ター、リポーター分子、コンジュゲート、ポリアミン、ポリアミド、ポリアルキ
    レングリコールまたはポリエーテルであるか； または、Ｒ₁ は、式ＩまたはII： 【化４】 （式中： ＥはＣ₁ 〜Ｃ₁₀アルキル、Ｎ( Ｑ₁)（Ｑ₂ ）またはＮ＝Ｃ( Ｑ₁)（Ｑ₂ ）であ
    り； Ｑ₁ およびＱ₂ は各々、独立に、Ｈ、Ｃ₁ 〜Ｃ₁₀アルキル、ジアルキルアミノ
    アルキル、窒素保護基、拘束（ｔｅｔｈｅｒｅｄ）または非拘束コンジュゲート
    基、固体支持体へのリンカーであるか； または、Ｑ₁ およびＱ₂ は、一緒になって、窒素保護基、または場合によりＮ
    およびＯから選択される少なくとも１つのさらなるヘテロ原子を含む環構造を形
    成し； ｑ¹ は１から１０の整数であり； ｑ² は１から１０の整数であり； ｑ³ は０または１であり； ｑ⁴ は０、１または２であり； Ｚ₄ はＯＭ₁ 、ＳＭ₁ またはＮ（Ｍ₁)₂ であり； 各Ｍ₁ は、独立に、Ｈ、Ｃ₁ 〜Ｃ₈ アルキル、Ｃ₁ 〜Ｃ₈ ハロアルキル、Ｃ（
    ＝ＮＨ）Ｎ（Ｈ）Ｍ₂ 、Ｃ（＝Ｏ）Ｎ（Ｈ）Ｍ₂ またはＯＣ（＝Ｏ）Ｎ（Ｈ）Ｍ ₂ であり； Ｍ₂ はＨまたはＣ₁ 〜Ｃ₈ アルキルであり； Ｚ₁ 、Ｚ₂ およびＺ₃ は各々、独立に、Ｃ₄ 〜Ｃ₇ シクロアルキル、Ｃ₅ 〜Ｃ ₁₄ アリールまたはＣ₃ 〜Ｃ₁₅ヘテロシクリルであって、ヘテロシクリル基中のヘ
    テロ原子は、酸素、窒素およびイオウから選択され；そして Ｚ₅ はＣ₁ 〜Ｃ₁₀アルキル、Ｃ₁ 〜Ｃ₁₀ハロアルキル、Ｃ₂ 〜Ｃ₁₀アルケニル
    、Ｃ₂ 〜Ｃ₁₀アルキニル、Ｃ₆ 〜Ｃ₁₄アリール、Ｎ（Ｑ₁ )(Ｑ₂ ）、ＯＱ₁ 、ハ
    ロ、ＳＱ₁ またはＣＮである。） の一方を有する、請求項１の方法。
15. 【請求項１５】 前記リン保護基が、Ｘ₃ −Ｊであって、Ｘ₃ がＯまたはＳ
    であり、そしてＪがＣＨ₂ ＣＨ₂ ＣＮ、ジフェニルシリルエチル、δ−シアノブ
    テニル、シアノｐ−キシリル（ＣＰＸ）、メチル−Ｎ−トリフルオロアセチルエ
    チル（ＭＥＴＡ）またはアセトキシフェノキシエチル（ＡＰＯＥ）である、請求
    項１の方法。
16. 【請求項１６】 前記組成物が、式： 【化５】 （式中： 各Ｘ₂ は、独立に、ＯまたはＳであり； 各ＪはＣＨ₂ ＣＨ₂ ＣＮ、ジフェニルシリルエチル、δ−シアノブテニル、シ
    アノｐ−キシリル（ＣＰＸ）、メチル−Ｎ−トリフルオロアセチルエチル（ＭＥ
    ＴＡ）またはアセトキシフェノキシエチル（ＡＰＯＥ）であり； 各Ｔ₄ は、独立に、ヒドロキシル基または保護ヒドロキシル基であり； 各Ｒ₀ はリン保護基であり； Ｌ₁ およびＬ₂ は各々、独立に、Ｃ_1-6 アルキルであるか； または、Ｌ₁ およびＬ₂ は、これらが結合する窒素原子と一緒に連結されて、
    ４−ないし７−員複素環系であって、場合により、Ｏ、ＮおよびＳから選択され
    る少なくとも１つのさらなるヘテロ原子を含む複素環系を形成し； 各Ｂｘは保護または未保護複素環塩基部分であり；そして 各Ｒ₁ は、独立に、Ｈ、保護ヒドロキシル基、糖置換基または保護糖置換基で
    ある。） の１つを有する少なくとも１つの化合物を含む、請求項１の方法。
17. 【請求項１７】 前記ホスホロアミダイト組成物が、少なくとも約９８重量
    ％の前記ホスホロアミダイト化合物を含んでなる、請求項１の方法。
18. 【請求項１８】 前記ホスホロアミダイト組成物が、少なくとも約９７重量
    ％の前記ホスホロアミダイト化合物を含んでなる、請求項１の方法。
19. 【請求項１９】 前記ホスホロアミダイト組成物が、少なくとも約９５重量
    ％の前記ホスホロアミダイト化合物を含んでなる、請求項１の方法。
20. 【請求項２０】 前記ホスホロアミダイト組成物が、少なくとも約９０重量
    ％の前記ホスホロアミダイト化合物を含んでなる、請求項１の方法。
21. 【請求項２１】 前記ホスホロアミダイト組成物が、少なくとも約８０重量
    ％の前記ホスホロアミダイト化合物を含んでなる、請求項１の方法。
22. 【請求項２２】 前記ホスホロアミダイト組成物が、少なくとも約７５重量
    ％の前記ホスホロアミダイト化合物を含んでなる、請求項１の方法。
23. 【請求項２３】 前記Ｘ₁ およびＸ₂ が各々Ｏである、請求項１の方法。
24. 【請求項２４】 前記Ｘ₁ およびＸ₂ が各々Ｓである、請求項１の方法。
25. 【請求項２５】 前記Ｘ₁ およびＸ₂ の一方がＯであり、そして前記Ｘ₁ お
    よびＸ₂ の他方がＳである、請求項１の方法。
26. 【請求項２６】 ５’−ヒドロキシル基を有する前記化合物を、活性化剤の
    存在下で、前記ホスホロアミダイト組成物と処理する、請求項１の方法。
27. 【請求項２７】 前記活性化剤が１−Ｈ−テトラゾールである、請求項２６
    の方法。
28. 【請求項２８】 ヌクレオチドを、５’−ヒドロキシル基を有するさらなる
    ヌクレオチド、ヌクレオシド、オリゴヌクレオシドまたはオリゴヌクレオチドに
    連結させる方法であって、前記の５’−ヒドロキシル基を有するさらなるヌクレ
    オチド、ヌクレオシド、オリゴヌクレオシドまたはオリゴヌクレオチドを、ホス
    ホロアミダイト組成物であって、式： 【化６】 （式中： Ｔ₃ は保護ヒドロキシル基、ヌクレオシド、ヌクレオチド、オリゴヌクレオシ
    ドまたはオリゴヌクレオチドであり； Ｂｘは保護または未保護複素環塩基部分であり； 各Ｒ₁ は、独立に、Ｈ、保護ヒドロキシル基、糖置換基または保護糖置換基で
    あり； Ｒ₀ はリン保護基であり；そして Ｌ₁ およびＬ₂ は各々、独立に、Ｃ_1-6 アルキルであるか； または、Ｌ₁ およびＬ₂ は、一緒に連結されて、Ｌ₁ およびＬ₂ が結合する窒
    素原子を含む４−ないし７−員複素環系であって、場合により、Ｏ、ＮおよびＳ
    から選択される少なくとも１つのさらなるヘテロ原子を含む複素環系を形成する
    。） のホスホロアミダイト化合物を含んでなるホスホロアミダイト組成物で処理して
    伸長された化合物を形成することを含んでなり； 前記ホスホロアミダイト組成物が、さらに、少なくとも約１重量％の少なくと
    も１つの３’−ヒドロキシヌクレオシド、前記ホスホロアミダイト化合物と異な
    るＰ^III 種であって、前記Ｐ^III 種のＰ^III リンへの基の共有結合が酸素または
    イオウを介するＰ^III 種、またはＰ^V 種であって、該Ｐ^V 種への基の共有結合が
    酸素、イオウまたは窒素を介するＰ^V 種を含んでなる方法。
29. 【請求項２９】 前記ホスホロアミダイト組成物が、少なくとも約２重量％
    の少なくとも１つの３’−ヒドロキシヌクレオシド、前記ホスホロアミダイト化
    合物と異なるＰ^III 種であって、前記Ｐ^III 種のＰ^III リンへの基の共有結合が
    酸素またはイオウを介するＰ^III 種、またはＰ^V 種であって、Ｐ^V 種への基の共
    有結合が酸素、イオウまたは窒素を介するＰ^V 種を含んでなる、請求項２８の方
    法。
30. 【請求項３０】 前記伸長された化合物を、キャップ剤で処理し、キャップ
    された化合物を形成することをさらに含む、請求項２８の方法。
31. 【請求項３１】 前記キャップされた化合物を、酸化剤で処理して酸化され
    た化合物を形成することをさらに含む、請求項３０の方法。
32. 【請求項３２】 前記酸化された化合物を、前記酸化された化合物を脱保護
    するのに有効な試薬で処理して脱保護されたオリゴマーを形成することをさらに
    含む、請求項３１の方法。
33. 【請求項３３】 前記脱保護されたオリゴマーを、該固体支持体から前記オ
    リゴマーを切断するのに有効な試薬で処理することをさらに含む、請求項３２の
    方法。
34. 【請求項３４】 前記伸長された化合物を、前記保護ヒドロキシル基から保
    護基を除去するのに有効な試薬で処理することをさらに含む、請求項２８の方法
    。
35. 【請求項３５】 前記ホスホロアミダイト組成物が、少なくとも約９８重量
    ％の前記ホスホロアミダイト化合物を含んでなる、請求項２８の方法。
36. 【請求項３６】 前記ホスホロアミダイト組成物が、少なくとも約９７重量
    ％の前記ホスホロアミダイト化合物を含んでなる、請求項２８の方法。
37. 【請求項３７】 前記ホスホロアミダイト組成物が、少なくとも約９５重量
    ％の前記ホスホロアミダイト化合物を含んでなる、請求項２８の方法。
38. 【請求項３８】 前記ホスホロアミダイト組成物が、少なくとも約９０重量
    ％の前記ホスホロアミダイト化合物を含んでなる、請求項２８の方法。
39. 【請求項３９】 前記ホスホロアミダイト組成物が、少なくとも約８０重量
    ％の前記ホスホロアミダイト化合物を含んでなる、請求項２８の方法。
40. 【請求項４０】 前記ホスホロアミダイト組成物が、少なくとも約７５重量
    ％の前記ホスホロアミダイト化合物を含んでなる、請求項２８の方法。
41. 【請求項４１】 式： 【化７】 （式中： Ｘ₁ およびＸ₂ は各々、独立に、ＯまたはＳであり； Ｂｘは保護または未保護複素環塩基部分であり；そして Ｒ₁ は、Ｈ、保護ヒドロキシル基、糖置換基または保護糖置換基である。） の少なくとも１つの部分を有するオリゴマーを調製する方法であって： （ａ）式： 【化８】 （式中： Ｔ₁ はヒドロキシル保護基であり；そして Ｔ₂ は固体支持体への共有結合または固体支持体結合ヌクレオシド、ヌクレオ
    チド、オリゴヌクレオシドまたはオリゴヌクレオチドである。） の一方を有する化合物を提供する工程； （ｂ）Ｔ₁ 基を除去して５’−ヒドロキシル基を有する前記化合物を形成する工
    程；及び （ｃ）５’−ヒドロキシル基を有する前記化合物を、ホスホロアミダイト組成物
    で処理して、伸長された化合物を形成する工程であって、前記ホスホロアミダイ
    ト組成物が、式： 【化９】 （式中： Ｔ₃ は保護ヒドロキシル基、ヌクレオシド、ヌクレオチド、オリゴヌクレオシ
    ドまたはオリゴヌクレオチドであり； Ｒ₀ はリン保護基であり；そして Ｌ₁ およびＬ₂ は各々、独立に、Ｃ_1-6 アルキルであるか； または、Ｌ₁ およびＬ₂ は、一緒に連結されて、前記Ｌ₁ およびＬ₂ が結合す
    る窒素原子を含む４−ないし７−員複素環系であって、場合により、Ｏ、Ｎおよ
    びＳから選択される少なくとも１つのさらなるヘテロ原子を含む複素環系を形成
    する。） のホスホロアミダイト化合物を含んでなる工程 を含んでなる方法であり、 前記ホスホロアミダイト組成物が、少なくとも約１重量％の少なくとも１つの
    ２’−ヒドロキシヌクレオシド、前記ホスホロアミダイト化合物と異なるＰ^III 種であって、前記Ｐ^III 種のＰ^III リンへの基の共有結合が酸素またはイオウを
    介するＰ^III 種、またはＰ^V 種であって、該Ｐ^V 種への基の共有結合が酸素、イ
    オウまたは窒素を介するＰ^V 種をさらに含んでなる方法。
42. 【請求項４２】 前記ホスホロアミダイト化合物が、少なくとも約２重量％
    の少なくとも１つの２’−ヒドロキシヌクレオシド、前記ホスホロアミダイト化
    合物と異なるＰ^III 種であって、前記Ｐ^III 種のＰ^III リンへの基の共有結合が
    酸素またはイオウを介するＰ^III 種、またはＰ^V 種であって、該Ｐ^V 種への基の
    共有結合が酸素、イオウまたは窒素を介するＰ^V 種を含んでなる、請求項４１の
    方法。
43. 【請求項４３】 前記伸長された化合物を、キャップ剤で処理してキャップ
    された化合物を形成することをさらに含む、請求項４１の方法。
44. 【請求項４４】 前記キャップされた化合物を、酸化剤で処理して酸化され
    た化合物を形成することをさらに含む、請求項４３の方法。
45. 【請求項４５】 前記酸化された化合物を、前記酸化された化合物を脱保護
    するのに有効な試薬で処理して、脱保護されたオリゴマーを形成することをさら
    に含む、請求項４４の方法。
46. 【請求項４６】 前記脱保護されたオリゴマーを、該固体支持体から前記オ
    リゴマーを切断するのに有効な試薬で処理することをさらに含む、請求項４５の
    方法。
47. 【請求項４７】 前記伸長された化合物を、前記保護ヒドロキシル基から保
    護基を除去するのに有効な試薬で処理することをさらに含む、請求項４１の方法
    。
48. 【請求項４８】 前記組成物が、式： 【化１０】 （式中： 各Ｘ₂ は、独立に、ＯまたはＳであり； 各ＪはＣＨ₂ ＣＨ₂ ＣＮ、ジフェニルシリルエチル、δ−シアノブテニル、シ
    アノｐ−キシリル（ＣＰＸ）、メチル−Ｎ−トリフルオロアセチルエチル（ＭＥ
    ＴＡ）またはアセトキシフェノキシエチル（ＡＰＯＥ）であり； 各Ｔ₄ は、独立に、ヒドロキシル基または保護ヒドロキシル基であり； 各Ｒ₀ はリン保護基であり； Ｌ₁ およびＬ₂ は各々、独立に、Ｃ_1-6 アルキルであるか； または、Ｌ₁ およびＬ₂ は、前記Ｌ₁ およびＬ₂ が結合する窒素原子と一緒に
    連結されて、４−ないし７−員複素環系であって、場合により、Ｏ、ＮおよびＳ
    から選択される少なくとも１つのさらなるヘテロ原子を含む複素環系を形成し； 各Ｂｘは保護または未保護複素環塩基部分であり；そして 各Ｒ₁ は、独立に、Ｈ、保護ヒドロキシル基、糖置換基または保護糖置換基で
    ある。） の１つを有する少なくとも１つの化合物を含む、請求項４１の方法。
49. 【請求項４９】 前記ホスホロアミダイト組成物が、少なくとも約９８重量
    ％の前記ホスホロアミダイト化合物を含んでなる、請求項４１の方法。
50. 【請求項５０】 前記ホスホロアミダイト組成物が、少なくとも約９７重量
    ％の前記ホスホロアミダイト化合物を含んでなる、請求項４１の方法。
51. 【請求項５１】 前記ホスホロアミダイト組成物が、少なくとも約９５重量
    ％の前記ホスホロアミダイト化合物を含んでなる、請求項４１の方法。
52. 【請求項５２】 前記ホスホロアミダイト組成物が、少なくとも約９０重量
    ％の前記ホスホロアミダイト化合物を含んでなる、請求項４１の方法。
53. 【請求項５３】 前記ホスホロアミダイト組成物が、少なくとも約８０重量
    ％の前記ホスホロアミダイト化合物を含んでなる、請求項４１の方法。
54. 【請求項５４】 前記ホスホロアミダイト組成物が、少なくとも約７５重量
    ％の前記ホスホロアミダイト化合物を含んでなる、請求項４１の方法。
55. 【請求項５５】 式： 【化１１】 （式中： Ｔ₃ は保護ヒドロキシル基、ヌクレオシド、ヌクレオチド、オリゴヌクレオシ
    ドまたはオリゴヌクレオチドであり； Ｂｘは保護または未保護複素環塩基部分であり； 各Ｒ₁ は、独立に、Ｈ、保護ヒドロキシル基、糖置換基または保護糖置換基で
    あり； Ｒ₀ はリン保護基であり；そして Ｌ₁ およびＬ₂ は各々、独立に、Ｃ_1-6 アルキルであるか； または、Ｌ₁ およびＬ₂ は、一緒に連結されて、Ｌ₁ およびＬ₂ が結合する窒
    素原子を含む４−ないし７−員複素環系であって、場合により、Ｏ、ＮおよびＳ
    から選択される少なくとも１つのさらなるヘテロ原子を含む複素環系を形成する
    。） の少なくとも１つのホスホロアミダイト化合物を含む組成物であって、 少なくとも約１重量％の少なくとも１つの３’−ヒドロキシヌクレオシド、２
    ’−ヒドロキシヌクレオシド、前記ホスホロアミダイト化合物と異なるＰ^III 種
    であって、前記Ｐ^III 種のＰ^III リンへの基の共有結合が酸素またはイオウを介
    するＰ^III 種、またはＰ^V 種であって、該Ｐ^V 種への基の共有結合が酸素、イオ
    ウまたは窒素を介するＰ^V 種をさらに含んでなる組成物。
56. 【請求項５６】 前記組成物が、少なくとも約２重量％の少なくとも１つの
    ３’−ヒドロキシヌクレオシド、２’−ヒドロキシヌクレオシド、前記ホスホロ
    アミダイト化合物と異なるＰ^III 種であって、前記Ｐ^III 種のＰ^III リンへの基
    の共有結合が酸素またはイオウを介するＰ^III 種、またはＰ^V 種であって、該Ｐ ^V 種への基の共有結合が酸素、イオウまたは窒素を介するＰ^V 種を含んでなる、
    請求項５５の組成物。
57. 【請求項５７】 式： 【化１２】 （式中： 各Ｘ₂ は、独立に、ＯまたはＳであり； 各ＪはＣＨ₂ ＣＨ₂ ＣＮ、ジフェニルシリルエチル、δ−シアノブテニル、シ
    アノｐ−キシリル（ＣＰＸ）、メチル−Ｎ−トリフルオロアセチルエチル（ＭＥ
    ＴＡ）またはアセトキシフェノキシエチル（ＡＰＯＥ）であり； 各Ｔ₄ は、独立に、ヒドロキシル基または保護ヒドロキシル基であり； 各Ｒ₀ はリン保護基であり； Ｌ₁ およびＬ₂ は各々、独立に、Ｃ_1-6 アルキルであるか； または、Ｌ₁ およびＬ₂ は、前記Ｌ₁ およびＬ₂ が結合する窒素原子で一緒に
    連結されて、４−ないし７−員複素環系であって、場合により、Ｏ、ＮおよびＳ
    から選択される少なくとも１つのさらなるヘテロ原子を含む複素環系を形成し； 各Ｂｘは保護または未保護複素環塩基部分であり；そして 各Ｒ₁ は、独立に、Ｈ、保護ヒドロキシル基、糖置換基、または保護糖置換基
    である。） の１つを有する少なくとも１つの化合物を含む、請求項５５の組成物。
58. 【請求項５８】 前記ホスホロアミダイト組成物が、少なくとも約９８重量
    ％の前記ホスホロアミダイト化合物を含んでなる、請求項５５の組成物。
59. 【請求項５９】 前記ホスホロアミダイト組成物が、少なくとも約９７重量
    ％の前記ホスホロアミダイト化合物を含んでなる、請求項５５の組成物。
60. 【請求項６０】 前記ホスホロアミダイト組成物が、少なくとも約９５重量
    ％の前記ホスホロアミダイト化合物を含んでなる、請求項５５の組成物。
61. 【請求項６１】 前記ホスホロアミダイト組成物が、少なくとも約９０重量
    ％の前記ホスホロアミダイト化合物を含んでなる、請求項５５の組成物。
62. 【請求項６２】 前記ホスホロアミダイト組成物が、少なくとも約８０重量
    ％の前記ホスホロアミダイト化合物を含んでなる、請求項５５の組成物。
63. 【請求項６３】 前記ホスホロアミダイト組成物が、少なくとも約７５重量
    ％の前記ホスホロアミダイト化合物を含んでなる、請求項５５の組成物。
64. 【請求項６４】 式： 【化１３】 （式中： Ｔ₃ は保護ヒドロキシル基、ヌクレオシド、ヌクレオチド、オリゴヌクレオシ
    ドまたはオリゴヌクレオチドであり； Ｂｘは保護または未保護複素環塩基部分であり； 各Ｒ₁ は、独立に、Ｈ、保護ヒドロキシル基、糖置換基または保護糖置換基で
    あり； Ｒ₀ はリン保護基であり；そして Ｌ₁ およびＬ₂ は各々、独立に、Ｃ_1-6 アルキルであるか； または、Ｌ₁ およびＬ₂ は、一緒に連結されて、Ｌ₁ およびＬ₂ が結合する窒
    素原子を含む４−ないし７−員複素環系であって、場合により、Ｏ、ＮおよびＳ
    から選択される少なくとも１つのさらなるヘテロ原子を含む複素環系を形成する
    。） の少なくとも１つのホスホロアミダイト化合物を含んでなる組成物であって； 少なくとも約１重量％の少なくとも１つの３’−ヒドロキシヌクレオシド、２
    ’−ヒドロキシヌクレオシド、前記ホスホロアミダイト化合物と異なるＰ^III 種
    であって、前記Ｐ^III 種のＰ^III リンへの基の共有結合が酸素またはイオウを介
    するＰ^III 種、またはＰ^V 種であって、該Ｐ^V 種への基の共有結合が酸素、イオ
    ウまたは窒素を介するＰ^V 種をさらに含んでなる組成物。
65. 【請求項６５】 少なくとも約２重量％の少なくとも１つの３’−ヒドロキ
    シヌクレオシド、２’−ヒドロキシヌクレオシド、前記ホスホロアミダイト化合
    物と異なるＰ^III 種であって、前記Ｐ^III 種のＰ^III リンへの基の共有結合が酸
    素またはイオウを介するＰ^III 種、またはＰ^V 種であって、該Ｐ^V 種への基の共
    有結合が酸素、イオウまたは窒素を介するＰ^V 種を含んでなる、請求項６４の組
    成物。
66. 【請求項６６】 式： 【化１４】 （式中： 各Ｘ₂ は、独立に、ＯまたはＳであり； 各ＪはＣＨ₂ ＣＨ₂ ＣＮ、ジフェニルシリルエチル、δ−シアノブテニル、シ
    アノｐ−キシリル（ＣＰＸ）、メチル−Ｎ−トリフルオロアセチルエチル（ＭＥ
    ＴＡ）またはアセトキシフェノキシエチル（ＡＰＯＥ）であり； 各Ｔ₄ は、独立に、ヒドロキシル基または保護ヒドロキシル基であり； 各Ｒ₀ はリン保護基であり； Ｌ₁ およびＬ₂ は各々、独立に、Ｃ_1-6 アルキルであるか； または、Ｌ₁ およびＬ₂ は、一緒に連結されて、前記Ｌ₁ およびＬ₂ が結合す
    る窒素原子を含む４−ないし７−員複素環系であって、場合により、Ｏ、Ｎおよ
    びＳから選択される少なくとも１つのさらなるヘテロ原子を含む複素環系を形成
    し； 各Ｂｘは保護または未保護複素環塩基部分であり；そして 各Ｒ₁ は、独立に、Ｈ、保護ヒドロキシル基、糖置換基または保護糖置換基で
    ある。） の１つを有する少なくとも１つの化合物を含む、請求項６４の組成物。
67. 【請求項６７】 少なくとも約９８重量％の前記ホスホロアミダイト化合物
    を含んでなる、請求項６４の組成物。
68. 【請求項６８】 少なくとも約９７重量％の前記ホスホロアミダイト化合物
    を含んでなる、請求項６４の組成物。
69. 【請求項６９】 少なくとも約９５重量％の前記ホスホロアミダイト化合
    物を含んでなる、請求項６４の組成物。
70. 【請求項７０】 少なくとも約９０重量％の前記ホスホロアミダイト化合物
    を含んでなる、請求項６４の組成物。
71. 【請求項７１】 少なくとも約８０重量％の前記ホスホロアミダイト化合物
    を含んでなる、請求項６４の組成物。
72. 【請求項７２】 少なくとも約７５重量％の前記ホスホロアミダイト化合物
    を含んでなる、請求項６４の組成物。
73. 【請求項７３】 式： 【化１５】 （式中： Ｔ₃ は保護ヒドロキシル基、ヌクレオシド、ヌクレオチド、オリゴヌクレオシ
    ドまたはオリゴヌクレオチドであり； Ｂｘは保護または未保護複素環塩基部分であり； 各Ｒ₁ は、独立に、Ｈ、保護ヒドロキシル基、糖置換基または保護糖置換基で
    あり； Ｒ₀ はリン保護基であり；そして Ｌ₁ およびＬ₂ は各々、独立に、Ｃ_1-6 アルキルであるか； または、Ｌ₁ およびＬ₂ は、一緒に連結されて、前記Ｌ₁ およびＬ₂ が結合す
    る窒素原子を含む４−ないし７−員複素環系であって、場合により、Ｏ、Ｎおよ
    びＳから選択される少なくとも１つのさらなるヘテロ原子を含む複素環系を形成
    する。） のホスホロアミダイト化合物を少なくとも１つ含む組成物であって、 少なくとも約１重量％の少なくとも１つの、前記ホスホロアミダイト化合物と
    異なるＰ^III 種であって、前記Ｐ^III 種のＰ^III リンへの基の共有結合が酸素ま
    たはイオウを介するＰ^III 種、またはＰ^V 種であって、Ｐ^V 種への基の共有結合
    が酸素、イオウまたは窒素を介するＰ^V 種をさらに含んでなる組成物。
74. 【請求項７４】 少なくとも約２重量％の少なくとも１つの、前記ホスホロ
    アミダイト化合物と異なるＰ^III 種であって、前記Ｐ^III 種のＰ^III リンへの基
    の共有結合が酸素またはイオウを介するＰ^III 種、またはＰ^V 種であって、Ｐ^V 種への基の共有結合が酸素、イオウまたは窒素を介するＰ^V 種を含んでなる、請
    求項７３の組成物。
75. 【請求項７５】 少なくとも約９８重量％の前記ホスホロアミダイト化合物
    を含んでなる、請求項７３の組成物。
76. 【請求項７６】 少なくとも約９７重量％の前記ホスホロアミダイト化合物
    を含んでなる、請求項７３の組成物。
77. 【請求項７７】 少なくとも約９５重量％の前記ホスホロアミダイト化合物
    を含んでなる、請求項７３の組成物。
78. 【請求項７８】 少なくとも約９０重量％の前記ホスホロアミダイト化合物
    を含んでなる、請求項７３の組成物。
79. 【請求項７９】 少なくとも約８０重量％の前記ホスホロアミダイト化合物
    を含んでなる、請求項７３の組成物。
80. 【請求項８０】 少なくとも約７５重量％の前記ホスホロアミダイト化合物
    を含んでなる、請求項７３の組成物。