JP2002541794A - Yeast - Google Patents

Yeast

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JP2002541794A
JP2002541794A JP2000611653A JP2000611653A JP2002541794A JP 2002541794 A JP2002541794 A JP 2002541794A JP 2000611653 A JP2000611653 A JP 2000611653A JP 2000611653 A JP2000611653 A JP 2000611653A JP 2002541794 A JP2002541794 A JP 2002541794A
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elastase
allele
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ダンロップ,ジョン
ケルセル,デイビッド,ピーター
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Queen Mary and Westfiled College University of London
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    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
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    • CCHEMISTRY; METALLURGY
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Abstract

(57)【要約】 【課題】エラスターゼ及びそれをコードする核酸の医薬における応用を開発する。 【解決手段】本発明はヒトエラスターゼIの突然変異体をコードする核酸配列を含む単離され又は組換えられたポリヌクレオチドを提供する。この突然変異体ヒトエラスターゼIはコドン(207から225まで)のいずれか一つ、好ましくはコドン208にフレームシフト突然変異を持つ。この突然変異エラスターゼIは乾癬、湿疹、紅斑性狼蒼、紅斑、及び恐らく癌などの過増殖性皮膚病における寄与因子である。   (57) [Summary] [Object] To develop applications of elastase and a nucleic acid encoding the same in medicine. The present invention provides an isolated or recombinant polynucleotide comprising a nucleic acid sequence encoding a mutant of human elastase I. This mutant human elastase I has a frameshift mutation at any one of the codons (207 to 225), preferably at codon 208. This mutant elastase I is a contributing factor in hyperproliferative skin diseases such as psoriasis, eczema, erythematous lupus, erythema, and possibly cancer.

Description

【発明の詳細な説明】DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION

【0001】 本発明はエラスターゼ、それをコードする核酸及びこれらの医薬における使用
に関する。
The present invention relates to elastase, nucleic acids encoding it and their use in medicine.

【0002】 エラスターゼ(EC3.4.21.36)は、「セリンプロテアーゼ」と呼ば
れる酵素の一群であり、該酵素の活性部位におけるセリン残基の反応性により特
徴付けられる。エラスターゼは弾性繊維の特殊なタンパク質であるエラスチンを
分解し、そしてフィブリン、ヘモグロビン及びアルブミンなどの他のタンパク質
を消化する。エラスターゼI、II及びIII (又はプロテアーゼE)と名付けられ
た、エラスターゼの構造的に関連する三つのタイプのエラスターゼが、哺乳類の
外分泌性膵臓により分泌される幾つかのイソ型と共に同定された(マクドナルド
ら,1982、カワシマら, DNA 6: 163-172, 1987、タニら, J. Biol. Chem. 263:
1231-1239, 1988 、シラスら, J. Biochem (Tokyo) 104: 259-264, 1988)。
[0002] Elastase (EC 3.4.21.36) is a group of enzymes called "serine proteases", characterized by the reactivity of serine residues in the active site of the enzyme. Elastase breaks down elastin, a special protein in elastic fibers, and digests other proteins such as fibrin, hemoglobin and albumin. Three structurally related types of elastase, named elastases I, II and III (or protease E), have been identified along with several isoforms secreted by the exocrine pancreas of mammals (McDonald 1982; Kawashima et al., DNA 6: 163-172, 1987; Tani et al., J. Biol. Chem. 263:
1231-1239, 1988, Shirasu et al., J. Biochem (Tokyo) 104: 259-264, 1988).

【0003】 ヒトエラスターゼI(ELA1)をコードする遺伝子は染色体12q13に位
置する(デイビースら,Genomics 29: 766-768, 1995) 。ELA1遺伝子の見か
けの構造的完全さにもかかわらず、それは転写サイレントであると報告されてい
る(タニら,J. Biochem (Tokyo) 101:591-599, 1987、カワシマら, DNA Seq 2:
303-312, 1992) 。膵臓小胞細胞におけるヒトエラスターゼI遺伝子の進化的サ
イレント化はエンハンサー及びプロモーター因子を不活性化する突然変異による
ように見え(ローズら,Hum Mol Genet 6: 897-903, 1997) 、これは膵臓の特異
的転写にとって極めて重要である(ルーら,Genes Dev 3: 1613-1624, 1989、ス
イフトら, Genes Dev 3: 687-696, 1989、スイフトら, J Biol Chem 269: 12809
-12815, 1994、ローズら, Mol Cell Biol 14: 2048-2057, 1994 、クルーズら,
Mol Cell Biol 15: 4385-4394, 1995)。腎臓、心臓、肺臓、大動脈管内膜、及び
末梢血リンパ球由来のヒト組織mRNAのドットブロットでは、32P標識ヒトエ
ラスターゼIDNAプローブへのハイブリダイゼーションを検出できなかった。
エラスターゼImRNAは、ヒト腎臓、肝臓又は心臓ではより感度の高いRT−
PCR技法によっても検出されなかった(カワシマら,DNA Seq 2: 303-312, 19
92) 。文献で、膵臓でのヒトエラスターゼI活性が記述されているときは、それ
は実際はエラスターゼIIAであることに注意すべきである。
[0003] The gene encoding human elastase I (ELA1) is located on chromosome 12q13 (Davies et al., Genomics 29: 766-768, 1995). Despite the apparent structural integrity of the ELA1 gene, it has been reported to be transcriptionally silent (Tani et al., J. Biochem (Tokyo) 101: 591-599, 1987; Kawashima et al., DNA Seq 2:
303-312, 1992). Evolutionary silencing of the human elastase I gene in pancreatic vesicle cells appears to be due to mutations that inactivate enhancer and promoter elements (Rose et al., Hum Mol Genet 6: 897-903, 1997), Critical for specific transcription (Lou et al., Genes Dev 3: 1613-1624, 1989; Swift et al., Genes Dev 3: 687-696, 1989; Swift et al., J Biol Chem 269: 12809
-12815, 1994; Rose et al., Mol Cell Biol 14: 2048-2057, 1994; Cruise et al.,
Mol Cell Biol 15: 4385-4394, 1995). Dot blots of human tissue mRNA from kidney, heart, lung, aortic intima, and peripheral blood lymphocytes failed to detect hybridization to 32 P-labeled human elastase I DNA probe.
Elastase I mRNA is more sensitive to RT- in human kidney, liver or heart.
It was not detected by the PCR technique (Kawashima et al., DNA Seq 2: 303-312, 19
92). When the literature describes human elastase I activity in the pancreas, it should be noted that it is in fact elastase IIA.

【0004】 ヒトエラスターゼIの成熟mRNAのヌクレオチド配列は未だ報告されておら
ず、合成的仮定的mRNA配列(受託:E01447)がゲノム配列から演繹さ
れ、そしてラットエラスターゼI遺伝子及びラットcDNAのヌクレオチド配列
とそれの比較が利用できる(カワシマら,DNA Seq 2: 303-312, 1992)(及び部分
的cDNA142bp断片,受託:D00159)。
[0004] The nucleotide sequence of the mature mRNA of human elastase I has not yet been reported, a synthetic putative mRNA sequence (Accession: E01447) was deduced from the genomic sequence, and the nucleotide sequence of the rat elastase I gene and rat cDNA was A comparison thereof is available (Kawashima et al., DNA Seq 2: 303-312, 1992) (and a partial cDNA 142 bp fragment, accession: D00159).

【0005】 本発明者らは、エラスターゼが哺乳類皮膚の基底細胞層に局在することを免疫
組織化学を用いてここに証明した。本発明者らはヒトエラスターゼIをコードす
るmRNAが培養したケラチン生成細胞中で発現することをも見出し、そしてこ
れから、2塩基置換によりゲノム配列演繹された配列(カワシマら、DNA Seq 2:
303-312, 1992) とは異なるcDNA配列を取得した。幾人かの個体からのゲノ
ムDNAの配列決定及び分析により、驚くべきことに、エラスターゼIタンパク
質の先端切断を生ずる配列変異体が明らかにされた。先端切断された変異体の二
次構造分析は、先端切断がおそらく基質/酵素複合体の形成に悪影響を与えるこ
とにより、このタンパク質の正常な機能を破壊しうるけれども、それは必ずしも
活性部位の破壊をもたらすことはないであろうことを示した。本発明者らは理論
に拘束されることを望むわけではないが、その突然変異タンパク質はエラスチン
やBPAG2などのタンパク質をもはや消化し得ない可能性が高い。このことは
、細胞が分化の際剥がれなくなり、皮膚の肥厚化を生じうることを意味する。こ
うして、この変異体の保持者は、湿疹、乾癬、紅斑性狼蒼、及び紅斑などの過増
殖性皮膚状態を発症する危険がより大きいといいうる。このような無制御細胞増
殖はこの変異体が癌に対する危険因子であることをも意味する。
The present inventors have now demonstrated, using immunohistochemistry, that elastase is localized in the basal cell layer of mammalian skin. We have also found that mRNA encoding human elastase I is expressed in cultured keratinocytes, and from this, the sequence deduced by genomic sequence by two base substitutions (Kawashima et al., DNA Seq 2:
303-312, 1992). Sequencing and analysis of genomic DNA from several individuals has surprisingly revealed sequence variants that result in truncation of the elastase I protein. Secondary structure analysis of truncated mutants may indicate that truncation can disrupt the normal function of this protein, possibly by adversely affecting the formation of the substrate / enzyme complex, but it does not necessarily lead to disruption of the active site. Indicated that it would not bring. Although we do not wish to be bound by theory, it is likely that the mutant protein will no longer be able to digest proteins such as elastin and BPAG2. This means that the cells do not detach during differentiation and can result in thickening of the skin. Thus, carriers of this variant may be at greater risk of developing a hyperproliferative skin condition such as eczema, psoriasis, erythematous lupus, and erythema. Such uncontrolled cell growth also means that the variant is a risk factor for cancer.

【0006】 本発明の第一の側面によれば、ヒトエラスターゼIの突然変異体をコードする
核酸配列を含む単離され又は組換えられたポリヌクレオチドであって、該核酸配
列がコドン207から225までのいずれか一つでフレームシフト突然変異を有
する図3の配列を含むものであるポリヌクレオチドが提供される。
According to a first aspect of the present invention, an isolated or recombinant polynucleotide comprising a nucleic acid sequence encoding a mutant of human elastase I, wherein the nucleic acid sequence comprises codons 207 to 225. A polynucleotide comprising the sequence of FIG. 3 having a frameshift mutation in any one of the foregoing.

【0007】 該フレームシフト突然変異は該タンパク質のC末端の破壊を生じ、おそらく基
質結合に悪影響を与えるのであろう。
[0007] The frameshift mutation results in disruption of the C-terminus of the protein, possibly affecting substrate binding.

【0008】 該フレームシフト突然変異はコドン208における1個の塩基挿入であること
が好ましい。この1個の塩基挿入の結果、そのC末端における26個のアミノ酸
だけ野性型の先端から切断されることになる。この核酸はcDNAであることが
好ましく、そして挿入される1個の塩基はシトシンヌクレオチドであることが好
ましい。
Preferably, the frameshift mutation is a single base insertion at codon 208. As a result of this one base insertion, only 26 amino acids at the C-terminus will be cleaved from the wild type tip. The nucleic acid is preferably a cDNA and the single base inserted is preferably a cytosine nucleotide.

【0009】 本発明の第二の側面によれば、図5に示すアミノ酸配列(ELA1 var)
を含み又はその配列と実質的な配列同一性を有するヒトエラスターゼIの突然変
異体を含む単離されたポリペプチドが提供される。
According to a second aspect of the present invention, the amino acid sequence shown in FIG. var)
Or an isolated polypeptide comprising a mutant of human elastase I comprising or having substantial sequence identity to the sequence thereof.

【0010】 この突然変異により惹起される破壊のため、この変異体タンパク質は、乾癬、
湿疹、紅斑性狼蒼、紅斑、及びおそらく癌などの過増殖性皮膚病における寄与因
子でありうる。従って、この変異体の検出はこのような状態への被験者の素因を
指示することになる。
[0010] Due to the destruction caused by this mutation, this mutant protein is
It may be a contributing factor in hyperproliferative skin diseases such as eczema, erythematous erythema, erythema, and possibly cancer. Thus, detection of this variant will indicate a subject's predisposition to such a condition.

【0011】 こうして、本発明の第三の側面によれば、過増殖皮膚状態又は癌に対する被験
者の素因を決定する方法であって、被験者におけるELA1の対立遺伝子の存在
を検出する工程であり、該対立遺伝子がヒトエラスターゼIの突然変異対立遺伝
子をコードし且つ図3の核酸配列のコドン207から225までのいずれか一つ
におけるフレームシフト突然変異を有するものである工程を含む方法が提供され
る。
Thus, according to a third aspect of the present invention, there is provided a method for determining a subject's predisposition to a hyperproliferative skin condition or cancer, comprising the step of detecting the presence of an ELA1 allele in the subject, A method is provided wherein the allele encodes a mutant allele of human elastase I and has a frameshift mutation at any one of codons 207 to 225 of the nucleic acid sequence of FIG.

【0012】 該フレームシフト突然変異はコドン208における1個の塩基挿入であり、そ
して該挿入される1個の塩基がシトシンヌクレオチドでありうる。
The frameshift mutation is a single base insertion at codon 208, and the single base inserted can be a cytosine nucleotide.

【0013】 該対立遺伝子は被験者の染色体12q13由来のゲノムDNAセグメントを配
列決定することにより検出されうる。
[0013] The allele can be detected by sequencing a genomic DNA segment from chromosome 12q13 of the subject.

【0014】 または、対立遺伝子の検出は、(i)ある反応においてELA1対立遺伝子に
選択的にハイブリダイズすることができる一つ以上のポリヌクレオチドプローブ
と被験者由来の核酸試料を混合する工程、及び(ii) 該反応をモニターして該試
料中の該遺伝子対立遺伝子の存在を検出し、それにより被験者が過増殖性皮膚状
態又は癌の危険性があるか否かを示す工程によってもよい。
Alternatively, detecting the allele comprises: (i) mixing a nucleic acid sample from the subject with one or more polynucleotide probes capable of selectively hybridizing to the ELA1 allele in a reaction; and ii) monitoring the reaction to detect the presence of the gene allele in the sample, thereby indicating whether the subject is at risk for a hyperproliferative skin condition or cancer.

【0015】 エラスターゼIの破壊の原因となる遺伝的突然変異を検出し且つ同定するため
に使用しうる、組換えDNA技法から入手可能な幾つかの方法がある。これらに
は、直接プロービング、ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)法及び一本鎖高次構造
分析(SSCA)が挙げられる。
There are several methods available from recombinant DNA technology that can be used to detect and identify genetic mutations that cause elastase I disruption. These include direct probing, the polymerase chain reaction (PCR) method and single-stranded conformation analysis (SSCA).

【0016】 直接プロービングを用いる点突然変異の検出は合成的に若しくはニック翻訳に
より調製されるオリゴヌクレオチドプローブの使用を含む。このDNAプローブ
は、例えば放射標識、酵素標識、蛍光標識、ビオチン−アビジン標識などを用い
て、後の、例えばサザンブロット・ハイブリダイゼーション操作において可視化
するために、適当に標識されうる。この標識されたプローブはニトロセルロース
又はナイロン66基板に結合した試料DNAと反応させられる。標識されたDN
Aプローブに相補的なDNA配列を持つ領域は、再アニーリング反応の結果、そ
れ自体が標識されるようになる。このような標識を示すフィルターの領域を次に
、例えばオートラジオグラフィーにより可視化しうる。
The detection of point mutations using direct probing involves the use of oligonucleotide probes prepared synthetically or by nick translation. The DNA probe can be appropriately labeled, for example, using a radiolabel, an enzyme label, a fluorescent label, a biotin-avidin label, etc., for visualization in a subsequent, for example, Southern blot hybridization operation. The labeled probe is reacted with a sample DNA bound to a nitrocellulose or nylon 66 substrate. Labeled DN
The region having the DNA sequence complementary to the A probe is itself labeled as a result of the reannealing reaction. The area of the filter showing such labels can then be visualized, for example, by autoradiography.

【0017】 リガーゼ連鎖反応(LCR)などの代替的プロービング法は、ミスマッチプロ
ーブ、即ち突然変異の点を除き標的と完全に相補性を有するプローブの使用を含
む。この標的配列を、次に、両者の間を区別する条件の下で、完全な相補性を有
するオリゴヌクレオチドとミスマッチを含むオリゴヌクレオチドの両方にハイブ
リダイズさせる。反応条件を操作することにより、完全な相補性がある場合にの
みハイブリダイゼーションを得ることが可能である。もしミスマッチが存在する
ならば、そのときはハイブリダイゼーションの有意の減少が起こる。
An alternative probing method, such as the ligase chain reaction (LCR), involves the use of mismatched probes, ie, probes that are completely complementary to the target except for the mutation. This target sequence is then hybridized to both oligonucleotides with perfect complementarity and those containing mismatches, under conditions that distinguish between the two. By manipulating the reaction conditions, it is possible to obtain hybridization only when there is perfect complementarity. If a mismatch is present, then a significant decrease in hybridization will occur.

【0018】 ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)は特定のDNA配列を顕著な効率で増幅する
技法である。熱安定酵素タックポリメラーゼを用いて行われる、変性、プライマ
ーアニーリング及び伸長のサイクルの反復は所望のDNA配列の濃度の指数関数
的増大をもたらす。
The polymerase chain reaction (PCR) is a technique that amplifies a particular DNA sequence with significant efficiency. Repeated cycles of denaturation, primer annealing and extension performed with the thermostable enzyme Tac Polymerase result in an exponential increase in the concentration of the desired DNA sequence.

【0019】 エラスターゼIをコードするヌクレオチド配列の知識が与えられれば、目的の
DNAを両側で挟む配列に相補的な合成オリゴヌクレオチドを調製することが可
能である。各オリゴヌクレオチドは二つの鎖の一方に相補的である。次いで、こ
のDNAを高温(例えば95℃)で変性し、次に大過剰モル濃度のオリゴヌクレ
オチドの存在下に再アニーリングする。相互に3’末端を指して向いているオリ
ゴヌクレオチドは標的配列の反対鎖にハイブリダイズし、そして4種のデオキシ
リボヌクレオチド三リン酸の存在下に核酸鋳型に沿って酵素的伸長を開始する。
次に最終産物を別のサイクルのために再び変性する。この三工程サイクルが数回
繰り返された後、100万倍以上のDNAセグメントの増幅が達成できる。次い
で、遺伝的変化の位置決めを行うため、得られたDNAを直接配列決定する。ま
たは、変化したDNAにのみ結合するオリゴヌクレオチドを調製し、その結果突
然変異が存在するときにのみPCRがDNAの増幅を行うようにすることが可能
である。PCRの後、対立遺伝子特異的オリゴヌクレオチドハイブリダイゼーシ
ョン(ジヘッラら, (1988) Lancet 1: 497) を用いてこの突然変異を検出しうる
。または、特異的対立遺伝子の増幅と呼ばれるPCR(PASA)の適用を用い
ることができる。これは1個の塩基対だけが異なる対立遺伝子の間の迅速且つ信
頼しうる区別を行うため差別増幅を用いる。
Given knowledge of the nucleotide sequence encoding elastase I, it is possible to prepare a synthetic oligonucleotide complementary to the sequence flanking the DNA of interest. Each oligonucleotide is complementary to one of the two strands. The DNA is then denatured at elevated temperatures (eg, 95 ° C.) and then re-annealed in the presence of a large molar excess of oligonucleotide. Oligonucleotides pointing toward the 3 'end of each other hybridize to the opposite strand of the target sequence and initiate enzymatic extension along the nucleic acid template in the presence of the four deoxyribonucleotide triphosphates.
The final product is then denatured again for another cycle. After this three-step cycle is repeated several times, amplification of the DNA segment of 1,000,000 times or more can be achieved. The resulting DNA is then directly sequenced to locate the genetic alteration. Alternatively, oligonucleotides can be prepared that bind only to the altered DNA, so that PCR will only amplify the DNA when there is a mutation. After PCR, this mutation can be detected using allele-specific oligonucleotide hybridization (Dichella et al., (1988) Lancet 1: 497). Alternatively, an application of PCR (PASA), called amplification of specific alleles, can be used. It uses differential amplification to make quick and reliable distinctions between alleles that differ by only one base pair.

【0020】 さらに別の方法では、PCRの後に、制限エンドヌクレアーゼ消化を行い、さ
らに得られる生産物の分析を行う。
In yet another method, PCR is followed by restriction endonuclease digestion and further analysis of the resulting product.

【0021】 一本鎖高次構造分析(SSCA)(オリタら(1989) Genomics 5: 874 及びオ
リタら,(1990) Genomics 6: 271) は比較的迅速な検出法を提供する。この方法
は少なくとも一部の場合には適当である。
Single-stranded conformational analysis (SSCA) (Orita et al. (1989) Genomics 5 : 874 and Orita et al. (1990) Genomics 6: 271) provide a relatively rapid method of detection. This method is suitable at least in some cases.

【0022】 特異的な対立遺伝子のPCR増幅(PASA)は一塩基突然変異又は一塩基多
形の迅速な検出法である(ニュートンら(1989) Nucleic Acids Res. 17: 2503
、ニコルスら(1989) Genomics 5: 535、オカヤマら(1989) J. Lab. Clin. Med. 114: 105、ザルカーら, (1990) Anal. Biochem. 186: 64 、ソマーら(1989) May
o Clin. Proc. 64: 1361、ウー(1989) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 86: 275
7)、及びダットンら(1991) Biotechniques 11: 700) 。PASA(対立遺伝子特
異的増幅としても知られる)は二つのオリゴヌクレオチドプライマーでその一方
が対立遺伝子特異的なものを用いる増幅を含む。所望の対立遺伝子は効率的に増
幅される一方、他方の対立遺伝子(単数又は複数)は、それが対立遺伝子特異的
プライマーの3’末端で又はその付近でミスマッチしているので、僅かしか増幅
されない。
[0022] PCR amplification of specific alleles (PASA) is a single nucleotide mutation or single nucleotide multiple
Is a rapid detection method for forms (Newton et al. (1989) Nucleic Acids Res.17: 2503
, Nichols et al. (1989) GenomicsFive: 535, Okayama et al. (1989) J. Lab.Clin. Med. 114: 105, Zulkar et al., (1990) Anal. Biochem.186: 64, Sommer et al. (1989) May
o Clin. Proc.64: 1361, Wu (1989) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.86: 275
7), and Dutton et al. (1991) Biotechniques11: 700). PASA (allele specific
(Also known as differential amplification) is one of two oligonucleotide primers
Include amplification using allele specific. The desired allele is efficiently increased
While being spanned, the other allele (s) is
Little amplification due to mismatch at or near the 3 'end of the primer
Not done.

【0023】 同様に、リガーゼ連鎖反応(LCR)として知られる方法が、鎌状血球貧血症
を惹起するヘモグロビン対立遺伝子中の一塩基置換を検出するため、成功裏に使
用されてきた(バラニーら(1991) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 189 、
ワイス(1991) Science 254: 1292)。LCRプローブは多重異種突然変異を同時
スクリーニングするために組み合わされ、又は多重使用される。
Similarly, a method known as the ligase chain reaction (LCR) has been successfully used to detect single base substitutions in the hemoglobin allele causing sickle cell anemia (Barani et al. Natl. Acad. Sci. USA 88 : 189, Proc.
Weiss (1991) Science 254: 1292). LCR probes are combined or multiplexed to simultaneously screen for multiple heterologous mutations.

【0024】 WO98/14616に開示された方法は多形を検出するために使用しうる。
この方法では、分析すべき核酸試料は一本鎖に分離され、その一方が標的鎖とな
る。一ヌクレオチド多形に隣接する塩基まで標的鎖に相補的であり、一ヌクレオ
チド多形を含むプライマー配列を調製し、そして標的鎖にアニーリングする。次
に、ジデオキシヌクレオチドの形で可能な相補的塩基のそれぞれをDNAポリメ
ラーゼと共に標的−プライマー複合体に添加する。この多形に相補的なジデオキ
シヌクレオチド塩基はプライマー配列に組み込まれ、さらなる塩基の添加を阻止
する。次いで、伸長したプライマー配列を質量スペクトル分光法により分析して
それに添加された相補的塩基、従って多形の部位における塩基の同一性を決定す
ることができる。
The method disclosed in WO 98/14616 can be used to detect polymorphism.
In this method, a nucleic acid sample to be analyzed is separated into single strands, one of which is a target strand. A primer sequence is prepared that is complementary to the target strand up to the base adjacent to the single nucleotide polymorphism and contains the single nucleotide polymorphism, and anneals to the target strand. Next, each of the possible complementary bases in the form of dideoxynucleotides is added to the target-primer complex along with the DNA polymerase. The dideoxynucleotide base that is complementary to the polymorphism is incorporated into the primer sequence and prevents the addition of additional bases. The extended primer sequence can then be analyzed by mass spectroscopy to determine the complementary base added to it, and thus the identity of the base at the polymorphic site.

【0025】 または、WO92/15712に開示された方法は、ELA1のどの対立遺伝
子が存在するかを決定するために用いることができる。この方法はWO98/1
4616の方法に次の点で類似する。即ち、プライマーが調製され、標的配列に
アニーリングされ、そしてプライマーが伸長され、1個のジデオキシオリゴヌク
レオチド塩基により停止されるという点である。しかしながら、この方法では、
添加されたジデオキシヌクレオチド塩基はそれに結合した発蛍光団などの特異的
標識により検出される。
Alternatively, the method disclosed in WO 92/15712 can be used to determine which alleles of ELA1 are present. This method is described in WO98 / 1
The method is similar to the method of 4616 in the following points. That is, the primer is prepared, annealed to the target sequence, and the primer is extended and terminated by one dideoxyoligonucleotide base. However, in this method,
The added dideoxynucleotide base is detected by a specific label attached to it, such as a fluorophore.

【0026】 異なる対立遺伝子を検出する別の方法は、それぞれの対立遺伝子が長さで一つ
だけ異なるという事実を利用する。こうして、PCRは二つのセットのPCRプ
ライマー、一つは一方の対立遺伝子に特異的なセットそして他方は他の対立遺伝
子に特異的なセット、を用いて行われる。次いで、PCR反応のそれぞれの生産
物を配列決定ゲル上で分離し放射性又は蛍光性ヌクレオチド検出のいずれかによ
り検出することができる。
Another method of detecting different alleles takes advantage of the fact that each allele differs by one in length. Thus, PCR is performed with two sets of PCR primers, one set specific for one allele and the other specific for the other allele. The respective products of the PCR reaction can then be separated on a sequencing gel and detected by either radioactive or fluorescent nucleotide detection.

【0027】 対立遺伝子の検出は、(i)被験者からのエラスターゼIタンパク質試料を免
疫学的アッセイにおいて該対立遺伝子に特異的な抗体試薬と混合する工程、及び
(ii) このアッセイをモニターして抗体試薬とタンパク質試料の間の特異的結合
を測定し、それにより被験者が過増殖性皮膚状態又は癌の危険性があるか否かを
示す工程を含みうる。
Detection of the allele comprises: (i) mixing a sample of elastase I protein from the subject with an antibody reagent specific for the allele in an immunological assay; and (ii) monitoring the assay to determine the antibody Measuring the specific binding between the reagent and the protein sample may include indicating whether the subject is at risk for a hyperproliferative skin condition or cancer.

【0028】 この抗体試薬は対立遺伝子に特異的な抗原決定基、好ましくは本発明の第二の
側面に記載のポリペプチドと特異的に反応するモノクローナル抗体であってもよ
い。このようなモノクローナル抗体は本発明の第五の側面を形成する。
[0028] The antibody reagent may be a monoclonal antibody that specifically reacts with an antigenic determinant specific to the allele, preferably a polypeptide according to the second aspect of the invention. Such a monoclonal antibody forms the fifth aspect of the present invention.

【0029】 モノクローナル抗体はハイブリドーマから製造することができる。ハイブリド
ーマは不死細胞系統を形成するため、骨髄腫細胞と所望の抗体を生産する脾臓細
胞を融合することにより形成できる。これは周知のコーラー及びミルステイン法
である(Nature 256 52-55 (1975))。
[0029] Monoclonal antibodies can be produced from hybridomas. Hybridomas can be formed by fusing myeloma cells with spleen cells producing the desired antibody to form an immortal cell line. This is the well-known Kohler and Millstein method (Nature 256 52-55 (1975)).

【0030】 特定のタンパク質に結合するモノクローナル抗体及びポリクローナル抗体を生
産する方法は当分野で十分に開発されている。これらは標準的免疫学の教科書、
例えば、ロアットら,Immunology second edition (1989), チャーチル・リビン
グストン, ロンドンで論じられている。
[0030] Methods for producing monoclonal and polyclonal antibodies that bind to a particular protein are well developed in the art. These are standard immunology textbooks,
For example, discussed in Roat et al., Immunology second edition (1989), Churchill Livingston, London.

【0031】 完全抗体に加え、本発明は、本発明の第二の側面のポリペプチドに結合できる
その誘導体を含む。
In addition to whole antibodies, the present invention includes derivatives thereof capable of binding to the polypeptide of the second aspect of the present invention.

【0032】 こうして、本発明は抗体断片及び合成構築物を含む。抗体断片及び合成構築物
の例は、ドウゴールら,Tibtech 12 372-379 (1994年 9月) に記載されている。
Thus, the present invention includes antibody fragments and synthetic constructs. Examples of antibody fragments and synthetic constructs are described in Dougall et al., Tibtech 12 372-379 (September 1994).

【0033】 抗体断片には、例えば、Fab、F(ab’)2 及びFv断片(ロアットら前
掲)が挙げられる。Fv断片は一本鎖Fv(scFv)分子として知られる合成
構築物を生産するように修飾できる。これは分子の安定性に寄与するVh領域と
Vl領域を共有結合で連結するぺプチドリンカーを含む。
[0033] Antibody fragments include, for example, Fab, F (ab ') 2 and Fv fragments (Roat et al., Supra). Fv fragments can be modified to produce synthetic constructs known as single-chain Fv (scFv) molecules. It contains a peptide linker that covalently links the Vh and Vl regions that contribute to the stability of the molecule.

【0034】 他の合成構築物はCDRぺプチドを含む。これらは抗原結合決定基を含む合成
ぺプチドである。ぺプチド模倣物も使用しうる。これらの分子は通常CDRルー
プの構造を模倣し且つ抗原相互作用性の側鎖を有する高次構造的に制限された有
機環である。
[0034] Other synthetic constructs include CDR peptides. These are synthetic peptides containing antigen binding determinants. Peptide mimetics may also be used. These molecules are usually conformationally restricted organic rings that mimic the structure of CDR loops and have antigen-interacting side chains.

【0035】 合成構築物はキメラ分子を含む。こうして、例えば、ヒト化(若しくは霊長類
化)抗体又はその誘導体は本発明の範囲内にある。ヒト化抗体の一例は、ヒトの
フレームワーク領域を持つがげっ歯類の超可変領域を持つ抗体である。合成構築
物には、分子に抗原結合性に加え幾つかの望ましい特性を付与する共有結合した
部分を含む分子も含まれる。例えば、該部分は標識(例えば、蛍光性若しくは放
射性の標識)又は薬学的に活性な物質であってもよい。
[0035] Synthetic constructs include chimeric molecules. Thus, for example, humanized (or primatized) antibodies or derivatives thereof are within the scope of the invention. One example of a humanized antibody is an antibody that has a human framework region but has a rodent hypervariable region. Synthetic constructs also include molecules that contain covalently attached moieties that impart some desirable properties to the molecule in addition to antigen binding. For example, the moiety can be a label (eg, a fluorescent or radioactive label) or a pharmaceutically active substance.

【0036】 本発明の抗体若しくはその誘導体は極めて多様な用途を持つ。それらは本発明
の第二の側面のポリペプチドの生成及び/又は同定に使用できる。それらは本発
明のポリペプチドをスクリーニングするためのキットの形で提供できる。
[0036] The antibodies or derivatives thereof of the present invention have very diverse uses. They can be used for the production and / or identification of the polypeptide according to the second aspect of the invention. They can be provided in the form of a kit for screening the polypeptide of the present invention.

【0037】 本発明の第六の側面によれば、ELA1遺伝子のコドン208における少なく
とも一つの多形の有無を検出する工程を含むヒト被験者の遺伝子分析のための方
法が提供される。
According to a sixth aspect of the present invention there is provided a method for genetic analysis of a human subject, comprising the step of detecting the presence or absence of at least one polymorphism at codon 208 of the ELA1 gene.

【0038】 さらなる側面では、本発明は過増殖性皮膚状態又は癌の治療に有用な薬物をス
クリーニングする方法であって、本発明の第二の側面のポリペプチドの活性を阻
害し又は強化する活性について試験化合物をスクリーニングする工程を含む方法
を提供する。また、このスクリーニング方法により検出される薬物、過増殖性皮
膚状態又は癌の治療のための医薬の製造におけるこのような薬物の使用、このよ
うな薬物及び薬学的に許容しうる担体を含む医薬組成物、このような薬物を含み
、任意選択的に該薬物の使用のための説明書をも含むキット、及び過増殖性皮膚
状態又は癌の治療法であって、患者に該薬物の一つ以上又は該薬物を含む医薬組
成物の薬学的に有効な量を投与する工程を含む方法も本発明の範囲内に含まれる
In a further aspect, the invention is a method of screening for a drug useful for treating a hyperproliferative skin condition or cancer, wherein the activity inhibits or enhances the activity of the polypeptide of the second aspect of the invention. A method comprising screening a test compound for Also a drug detected by this screening method, the use of such a drug in the manufacture of a medicament for the treatment of a hyperproliferative skin condition or cancer, a pharmaceutical composition comprising such a drug and a pharmaceutically acceptable carrier A kit comprising such a drug, and optionally also instructions for use of the drug, and a method for treating a hyperproliferative skin condition or cancer, wherein the patient has one or more of the drugs. Alternatively, a method comprising the step of administering a pharmaceutically effective amount of a pharmaceutical composition containing the drug is also included in the scope of the present invention.

【0039】 本発明は添付する図面の図3の核酸配列を含む単離され又は組換えられたポリ
ヌクレオチドをも提供する。
The present invention also provides an isolated or recombinant polynucleotide comprising the nucleic acid sequence of FIG. 3 of the accompanying drawings.

【0040】 本発明は添付する図面の図5の核酸配列を含む単離され又は組換えられたポリ
ヌクレオチドをも提供する。
The present invention also provides an isolated or recombinant polynucleotide comprising the nucleic acid sequence of FIG. 5 of the accompanying drawings.

【0041】 本発明のポリヌクレオチドはベクター中に挿入し、さらなる研究用に大量のD
NA又はRNAを提供するためクローニングできる。適切なベクターを宿主細胞
中に導入して、当業者に知られた技法を用いて本発明のポリペプチドを発現させ
ることができる。
The polynucleotides of the present invention can be inserted into vectors and used for large amounts of D for further study.
It can be cloned to provide NA or RNA. Appropriate vectors can be introduced into host cells to express the polypeptides of the invention using techniques known to those skilled in the art.

【0042】 クローニング、タンパク質及びポリペプチドの発現、及びタンパク質の精製の
ための技法は、当業者に周知である。このような種々の技法は、例えば、サムブ
ルックら〔Molecular Cloning 第二版、コールド・スプリング・ハーバー・ラボ
ラトリー・プレス(1989)〕、オウルド及びプリムローズ〔Principles of Gene M
anipulation 第五版、ブラックウェル・サイエンティフィック・パブリケーショ
ンズ(1994)、及びストライアー〔Biochemistry第四版、W H フリーマン・アンド
・カンパニー(1995)〕に開示されている。適当な発現系を用いることにより、本
発明のポリペプチドはグリコシル化型又は非グリコシル化型で発現しうる。非グ
リコシル化型は大腸菌などの原核宿主中での発現により生産できる。
Techniques for cloning, expressing proteins and polypeptides, and purifying proteins are well known to those skilled in the art. Such various techniques are described, for example, in Sambrook et al. (Molecular Cloning Second Edition, Cold Spring Harbor Laboratory Press (1989)), Oold and Primrose (Principles of Gene M
Anipulation Fifth Edition, Blackwell Scientific Publications (1994), and Strier [Biochemistry Fourth Edition, WH Freeman and Company (1995)]. By using a suitable expression system, the polypeptides of the invention can be expressed in glycosylated or non-glycosylated form. Non-glycosylated forms can be produced by expression in prokaryotic hosts such as E. coli.

【0043】 N末端のメチオニンを含むポリペプチドはある発現系を用いて生産しうるが、
他の発現系では成熟ポリペプチドはこの残基を欠く。
A polypeptide containing an N-terminal methionine can be produced using certain expression systems,
In other expression systems, the mature polypeptide lacks this residue.

【0044】 こうして、本発明は本発明の第一の側面のポリヌクレオチドを含むベクター及
び該ベクターを含む宿主をも提供する。本発明の第二の側面のポリペプチドは、
このポリペプチドを発現させる条件の下で該宿主をインキュベートする工程及び
次いで該ポリペプチドを精製する工程を含む方法により取得しうる。
Thus, the present invention also provides a vector comprising the polynucleotide of the first aspect of the present invention and a host comprising the vector. The polypeptide of the second aspect of the present invention comprises:
It can be obtained by a method comprising a step of incubating the host under conditions for expressing the polypeptide, and then a step of purifying the polypeptide.

【0045】 本発明のポリヌクレオチド及びポリペプチドが図に示す配列から変わり得るこ
とは当業者には理解されるはずである。
It should be understood by those skilled in the art that the polynucleotides and polypeptides of the present invention may vary from the sequences shown in the figures.

【0046】 こうして、図5Aに示すアミノ酸配列は、種々の理由で付与される付加的なN
末端アミノ酸配列及び/又は付加的なC末端アミノ酸配列を有しうる。このよう
な付加的な配列付与する技法は当分野で周知である。
Thus, the amino acid sequence shown in FIG. 5A may have additional N
It may have a terminal amino acid sequence and / or an additional C-terminal amino acid sequence. Such additional alignment techniques are well-known in the art.

【0047】 付加的な配列は特定のポリペプチドの特性を変えるために付与される。これは
特定の発現系での発現の改善若しくは発現の調節に有用であり得る。例えば、付
加的な配列はプロテアーゼによる切断に対するある程度の保護を付与しうる。付
加的な配列は同定又は精製の助けとなるようにポリペプチドの特性を変える場合
にも有用である。例えば、アフィニティクロマトグラフィーにより単離できる部
分にポリペプチドが連結された融合タンパク質が提供される。この部分は抗原又
はエピトープであり、そしてこのアフィニティカラムは該抗原又はエピトープに
結合する(望ましくは高度の特異性でもって)固定化抗体又は固定化抗体断片を
含んでいてもよい。この融合タンパク質は適当な緩衝液の添加により該カラムか
ら通常溶出できる。
[0047] Additional sequences are provided to alter the properties of a particular polypeptide. This may be useful for improving or regulating expression in certain expression systems. For example, additional sequences may provide some protection against cleavage by proteases. Additional sequences are also useful in altering the properties of the polypeptide to aid in identification or purification. For example, provided is a fusion protein in which a polypeptide is linked to a moiety that can be isolated by affinity chromatography. This portion is an antigen or epitope, and the affinity column may contain immobilized antibodies or immobilized antibody fragments that bind (preferably with high specificity) to the antigen or epitope. This fusion protein can usually be eluted from the column by adding an appropriate buffer.

【0048】 しかしながら、付加的N末端又はC末端配列は、本発明の物質を得るために使
用される特定の技法の結果として単に存在し、そしていかなる特定の有利な特性
をも付与する必要がなくてもよい。
However, additional N-terminal or C-terminal sequences are merely present as a result of the particular technique used to obtain the materials of the present invention, and need not confer any particular advantageous properties. You may.

【0049】 さらに、変異体(しばしば「突然変異タンパク質」と呼ばれる)を生産するた
めにタンパク質のアミノ酸配列に種々の変更を加えることができることを当業者
は認めるであろう。本発明の変異体の一例は本発明の第二の側面のポリペプチド
、又は一つ以上のアミノ酸を一つ以上の他のアミノ酸で置換することに加えて、
図3又は図5のポリヌクレオチドによりコードされるポリペプチドである。種々
のアミノ酸が類似の性質を持つことを当業者は知っている。ある物質のこのよう
なアミノ酸の一つ以上をこの物質の望ましい活性を失うことなく一つ以上の他の
このようなアミノ酸でしばしば置換できる。こうして、アミノ酸グリシン、アラ
ニン、バリン、ロイシン、及びイソロイシンはしばしば相互に置換できる(脂肪
族側鎖を持つアミノ酸)。これらの考えられる置換の中で、グリシンとアラニン
は相互置換に使用することが好ましく(これらは短い側鎖を持つから)、バリン
、ロイシン及びイソロイシンは相互置換に使用しうる(これらは疎水性の大きな
脂肪族側鎖を持つから)。しばしば相互に置換できる他のアミノ酸としては、フ
ェニルアラニン、チロシン及びトリプトファン(芳香族側鎖を持つアミノ酸)、
リジン、アルギニン及びヒスチジン(塩基性側鎖を持つアミノ酸)、アスパラギ
ン酸塩及びグルタミン酸塩(酸性側鎖を持つアミノ酸)、アスパラギン及びグル
タミン(アミド側鎖を持つアミノ酸)、及びシステイン及びメチオニン(硫黄含
有側鎖を持つアミノ酸)が挙げられる。この性質の置換はしばしば「同類」又は
「半同類」アミノ酸置換と呼ばれる。
Further, those skilled in the art will recognize that various changes can be made in the amino acid sequence of a protein to produce variants (often referred to as “mutant proteins”). One example of a variant of the invention is a polypeptide of the second aspect of the invention, or in addition to replacing one or more amino acids with one or more other amino acids.
It is a polypeptide encoded by the polynucleotide of FIG. 3 or FIG. One skilled in the art knows that various amino acids have similar properties. One or more of such amino acids in a substance can often be replaced with one or more other such amino acids without losing the desired activity of the substance. Thus, the amino acids glycine, alanine, valine, leucine and isoleucine can often be substituted for each other (amino acids with aliphatic side chains). Of these possible substitutions, glycine and alanine are preferably used for mutual substitution (since they have short side chains) and valine, leucine and isoleucine can be used for mutual substitution (these are hydrophobic Because they have large aliphatic side chains). Other amino acids that can often be substituted for each other include phenylalanine, tyrosine and tryptophan (amino acids with aromatic side chains),
Lysine, arginine and histidine (amino acids with basic side chains), aspartate and glutamate (amino acids with acidic side chains), asparagine and glutamine (amino acids with amide side chains), and cysteine and methionine (sulfur-containing side Amino acids having a chain). Substitutions of this nature are often referred to as "conservative" or "semi-conservative" amino acid substitutions.

【0050】 アミノ酸欠失又はアミノ酸挿入もアミノ酸配列に関してなされうる。物質の特
性を変えるため(例えば、融合タンパク質に関して上に説明したように、同定、
精製又は発現を助けるため)アミノ酸挿入を使用できる。
[0050] Amino acid deletions or insertions can also be made with respect to the amino acid sequence. To alter the properties of a substance (eg, as described above for fusion proteins, identification,
Amino acid insertions (to aid purification or expression) can be used.

【0051】 アミノ酸の変更は任意の適当な技法を用いて、例えば部位特異的突然変異誘発
を用いることにより行うことができる。アミノ酸置換又はアミノ酸挿入は天然型
又は非天然型のアミノ酸を用いて行うことができる。天然のアミノ酸が用いられ
ようと合成のアミノ酸が用いられようと、L−アミノ酸だけが存在することが好
ましい。
Amino acid changes can be made using any suitable technique, for example by using site-directed mutagenesis. Amino acid substitution or amino acid insertion can be performed using natural or unnatural amino acids. It is preferred that only L-amino acids are present, whether natural or synthetic amino acids are used.

【0052】 アミノ酸配列の同一性の程度は、任意の二つの配列の間の類似性の最良セグメ
ントを発見するための「ベストフィット」(スミス及びウォータマン,Advances
in Applied Mathematics, 482-489 (1981))などのプログラムを用いて計算でき
る。整列は、シュワルツ及びデイホフ(1979) Atlas of Protein Sequence and
Structure, Dayhof, M.O., Ed pp 353-358により記載されたような、アミノ酸類
似性のマトリックスを用いて得られる配点の最大化に基づいてなされる。
The degree of amino acid sequence identity can be measured by a “best fit” (Smith and Waterman, Advances) to find the best segment of similarity between any two sequences.
in Applied Mathematics, 482-489 (1981)). The alignment is based on Schwartz and Deihoff (1979) Atlas of Protein Sequence and
It is based on maximizing the scoring obtained using a matrix of amino acid similarities, as described by Structure, Dayhof, MO, Ed pp 353-358.

【0053】 本発明の単離され又は組換えられたポリヌクレオチドは、遺伝子コードの縮重
のため、添付の図面に示すものに一致した配列を持つ必要がないことは、当業者
に理解されるであろう。
It will be appreciated by those skilled in the art that the isolated or recombinant polynucleotide of the present invention need not have a sequence corresponding to that shown in the accompanying drawings due to the degeneracy of the genetic code. Will.

【0054】 本発明は上に論じたポリヌクレオチドに相補的な核酸分子をも含む。こうして
、例えば、二本鎖核酸分子の両方の鎖が本発明の範囲内に含まれる(それらが相
互に結合していようといまいと)。また、mRNA分子及び相補的なDNA分子
(例えば、cDNA分子)も含まれる。
[0054] The present invention also includes nucleic acid molecules that are complementary to the polynucleotides discussed above. Thus, for example, both strands of a double-stranded nucleic acid molecule are included within the scope of the present invention (whether or not they are linked to each other). Also, mRNA molecules and complementary DNA molecules (eg, cDNA molecules) are included.

【0055】 上に論じた核酸分子のいずれかにハイブリダイズできる核酸分子も本発明によ
りカバーされる。このような核酸分子は「ハイブリダイズする」核酸分子と本明
細書では呼ばれる。ハイブリダイズする核酸分子は、それらが特異的にハイブリ
ダイズできるとき、例えばプローブ又はプライマーとして有用である。このよう
なハイブリダイズする分子は長さが少なくとも10ヌクレオチドであることが望
ましく、長さが少なくとも25又は少なくとも50ヌクレオチドであることが好
ましい。
[0055] Nucleic acid molecules capable of hybridizing to any of the nucleic acid molecules discussed above are also covered by the present invention. Such a nucleic acid molecule is referred to herein as a "hybridizing" nucleic acid molecule. Hybridizing nucleic acid molecules are useful when they can specifically hybridize, for example, as probes or primers. Desirably, such hybridizing molecules are at least 10 nucleotides in length, preferably at least 25 or at least 50 nucleotides in length.

【0056】 ハイブリダイズする分子は厳格なハイブリダイゼーション条件の下でこのよう
な分子にハイブリダイズすることが望ましい。厳格なハイブリダイゼーション条
件の一例は、試みられるハイブリダイゼーションが約0.9モル濃度の塩溶液を
用い約35℃から約65℃の温度で行われる。しかしながら、熟練者は、存在す
るプローブの長さ、塩基の組成、イオンの型などの変数を考慮に入れるためにこ
のような条件を適当に変えることができる。
It is desirable that the hybridizing molecule hybridize to such a molecule under stringent hybridization conditions. One example of stringent hybridization conditions is where the hybridization attempted is performed at a temperature of about 35 ° C. to about 65 ° C. using an about 0.9 molar salt solution. However, the skilled artisan can alter such conditions appropriately to take into account variables such as the length of the probe present, the composition of the base, the type of ion, and the like.

【0057】 エラスターゼ阻害剤である、皮膚由来の抗ロイコプロテイナーゼ(SKALP
:シャークウイークら,Br J Dermatol 122: 631-641, 1990、シャークウイーク
ら,Biochim Biophys Acta 1096: 148-154,1991)、エラフィンとも呼ばれる(ウ
ィードウら,J Biol Chem 265: 14791-14795, 1990) が、これはスケーリング・
スキン障害(scaling skin disorders) を患う患者の皮膚から単離された( チャ
ング, A.ら, 1990) 。SKALPは好中球のエラスティン分解酵素であるプロテ
イナーゼ3(ウィードウら,Biochem Biophys Res Commun 174: 6-10, 1991) 並
びにブタ膵臓エラスターゼ及びヒト白血球エラスターゼの強力なそして特異的な
阻害剤であることが示された(ウィードウら,J Biol Chem 265: 14791-14795,
1990) 。SKALP/エラフィンの結晶構造及び阻害機構は、ヒトエラスターゼ
Iのブタ相同体であるそのブタ膵臓エラスターゼとの複合体から決定された(ツ
ネミら,Biochem 35: 11570-11576, 1996)。これはSKALPがエラスターゼI
を阻害することを示唆する。
An elastase inhibitor, a skin-derived anti-leukoproteinase (SKALP)
Shark Week et al., Br J Dermatol 122: 631-641, 1990; Shark Week et al., Biochim Biophys Acta 1096: 148-154, 1991). But this is scaling
It was isolated from the skin of patients suffering from scaling skin disorders (Chang, A. et al., 1990). SKALP is a potent and specific inhibitor of neutrophil elastin-degrading enzyme, proteinase 3 (Weedow et al., Biochem Biophys Res Commun 174: 6-10, 1991) and porcine pancreatic elastase and human leukocyte elastase. (Weedow et al., J Biol Chem 265: 14791-14795,
1990). The crystal structure and mechanism of inhibition of SKALP / elafin was determined from its complex with porcine pancreatic elastase, a porcine homolog of human elastase I (Tsunemi et al., Biochem 35: 11570-11576, 1996). This is because SKALP is elastase I
To inhibit.

【0058】 SKALPは乾癬(チャング, A.ら,1990;シャークウイークら,Br J Derma
tol 122: 631-641, 1990、シャークウイークら,Biochim Biophys Acta 1096: 1
48-154,1991)及びウィードウら,J Invest Dermatol 101: 305-309, 1993、ノノ
ムラら, J Invest Dermatol 103: 88-91, 1994)及び創傷治癒(ベルグレンら,
Arch Dermatol Res 288: 458-562, 1996) などの過増殖状態にある表皮のケラチ
ノサイトにより発現される。それは、舌、義歯床、舌の扁桃、歯肉、咽頭、喉頭
蓋、声帯、食道、子宮頸、膣、毛包などの環境的刺激に曝される他の多くの成人
上皮に存在することが報告されてきた(フントら,J Clin Invest 98: 1389-139
9, 1996)。これらの組織の全てにおいて、炎症性細胞の存在が生理学的であり、
そしてSKALPの発現は白血球プロテアーゼに対して保護する働きがあり、そ
れにより上皮の完全性の維持を助けるものと考えられている。
SKALP is used for psoriasis (Chang, A. et al., 1990; Shark Week et al., Br J Derma
tol 122: 631-641, 1990, Shark Week et al., Biochim Biophys Acta 1096: 1
48-154, 1991) and Weedow et al., J Invest Dermatol 101: 305-309, 1993; Nonomura et al., J Invest Dermatol 103: 88-91, 1994) and wound healing (Bergren et al., 1993).
Arch Dermatol Res 288: 458-562, 1996) and is expressed by keratinocytes in the hyperproliferative epidermis. It is reported to be present in many other adult epithelia exposed to environmental stimuli such as tongue, denture base, tongue of the tongue, gingiva, pharynx, epiglottis, vocal cords, esophagus, cervix, vagina, hair follicles, etc. (Hunt et al., J Clin Invest 98: 1389-139
9, 1996). In all of these tissues, the presence of inflammatory cells is physiological,
It is believed that the expression of SKALP acts to protect against leukocyte proteases, thereby helping to maintain epithelial integrity.

【0059】 本発明者らはヒトエラスターゼIが主として表皮の余り分化していない基底細
胞層に限定されることを示した。これに反して、SKALPは表皮組織のどのタ
イプでも基底層には決して見出されなかった。実際、SKALPは正常なヒト表
皮には事実上存在しない。このことは、SKALPが皮膚におけるエラスターゼ
Iの正常な生理学的役割を妨害しないことを示唆する。しかしながら、エラスタ
ーゼIの先端切断変異体は何らかの方法でこの正常な生理学的役割を破壊し、こ
の変異体の保持者に過増殖性皮膚病又は癌を発症させる危険性を増大させる可能
性がある。
The inventors have shown that human elastase I is mainly restricted to the less differentiated basal cell layer of the epidermis. In contrast, SKALP was never found in the basal layer of any type of epidermal tissue. In fact, SKALP is virtually absent from normal human epidermis. This suggests that SKALP does not interfere with the normal physiological role of elastase I in the skin. However, truncated mutants of elastase I may in some way disrupt this normal physiological role and increase the risk of developing a hyperproliferative skin disease or cancer in the holder of the mutant.

【0060】 本発明者らは培養したヒト皮膚ケラチノサイトから膵臓エラスターゼIの全長
転写物をクローニングし配列決定した。本発明者らはまたELA1遺伝子のコー
ド領域におけるヌクレオチド多形をも見出した。これはこのタンパク質の先端切
断及びエラスターゼ−SKALP複合体の潜在的不安定化をもたらすであろう。
この明細書で言及した先行技術の文献は関連する司法権により許される程度まで
に本明細書にインコーポレートされる。
We cloned and sequenced the full-length transcript of pancreatic elastase I from cultured human skin keratinocytes. The present inventors have also found nucleotide polymorphisms in the coding region of the ELA1 gene. This will result in truncation of this protein and potential destabilization of the elastase-SKALP complex.
The prior art documents referred to in this specification are incorporated herein to the extent permitted by the relevant jurisdiction.

【0061】 本発明は下記の制限的でない実施例でさらに記述される。添付する下記の図面
を参照する。
The present invention is further described in the following non-limiting examples. Reference is made to the accompanying drawings, in which:

【0062】材料と方法 免疫組織化学 免疫染色は、Superfrost (登録商標) プラス(‘BDH’ラボラトリー・サプ
ライズ,メルク)顕微鏡用スライドガラス上で凍結皮膚の4−5μm切片につい
て行った。新鮮な皮膚を液体窒素中で瞬時凍結し−70℃で貯蔵した。この材料
を凍結切片化し、この切片を風乾し、標準的免疫組織化学的手法により染色した
。この切片を、製造者の説明書に従って DAKO En Vision ( 商標) +システムHR
P (DAB)(ダコ・コーポレーション、カーピンテリア、CA、USA)を用いて染色した
。組織切片を正常ブタ血清(PBSA中で1:5に希釈)でブロックした後、一
次抗体とインキュベートした。抗ブタ膵臓エラスターゼウサギモノクローナル抗
体(ケミコン・インターナショナル・インク、テメキュラ、CA、USA )を0.1
%BSAを含むPBSA中に1:5000まで希釈した。対照の切片は、一次抗
体の代わりに、リン酸緩衝化食塩水(PBSA)、0.1%ウシ血清アルブミン
(BSA)と共にインキュベートした。DAKO製の抗ヒト白血球エラスターゼマウ
スモノクローナル抗体を1:50及び1:100希釈で用いた。
Materials and Methods Immunohistochemistry Immunostaining was performed on 4-5 μm sections of frozen skin on Superfrost® Plus ('BDH' Laboratory Surprise, Merck) microscope slides. Fresh skin was snap frozen in liquid nitrogen and stored at -70 ° C. The material was cryosectioned, the sections air dried and stained by standard immunohistochemical techniques. This section is then prepared according to the manufacturer's instructions with the DAKO En Vision ™ + System HR
Staining was performed using P (DAB) (Dako Corporation, Carpinteria, CA, USA). Tissue sections were blocked with normal porcine serum (diluted 1: 5 in PBSA) and then incubated with the primary antibody. 0.1% anti-porcine pancreatic elastase rabbit monoclonal antibody (Chemicon International, Inc., Temecula, CA, USA)
Diluted 1: 5000 in PBSA with% BSA. Control sections were incubated with phosphate buffered saline (PBSA), 0.1% bovine serum albumin (BSA) instead of the primary antibody. Anti-human leukocyte elastase mouse monoclonal antibody from DAKO was used at 1:50 and 1: 100 dilutions.

【0063】RNA単離 ナブサリアら,Keratinocyte methods (レイ, IM, ワット, FM編、ケンブリッ
ジ・ユニバーシティ・プレス), pp 5-12, 1994に記述されたように、ヒト皮膚一
次ケラチノサイトを、放射されたマウス3T3フィーダーで培養した。ケラチノ
サイトのコンフルエント培養及び瞬時凍結組織試料からの総RNAを、製造業者
の指示書に従って一工程手順でRNAzol(商標)B(テル−テスト・インク
、フレンズウッド、TX、USA)を用いて単離した。抽出された総RNAの量及び完
全性は、エチジウム−ブロミド染色アガロースゲル(示していない)での18S
及び28SrRNAの肉眼的検査によりチェックした。
Primary human keratinocytes were irradiated as described in RNA isolation Nabsaria et al., Keratinocyte methods (Rey, IM, Watt, FM, Ed., Cambridge University Press), pp 5-12, 1994. The cells were cultured in a mouse 3T3 feeder. Total RNA from confluent cultures of keratinocytes and snap frozen tissue samples was isolated using RNAzol ™ B (Tel-Test Inc., Friendswood, TX, USA) in a one-step procedure according to the manufacturer's instructions. . The amount and integrity of total RNA extracted was determined by 18S on ethidium-bromide stained agarose gel (not shown).
And 28S rRNA were checked by visual inspection.

【0064】RT−PCR及びcDNAのクローニング RT−PCRのために、GeneAmp(登録商標)RNA PCR Kit (パーキン−エルマー
)を用いた。総RNA試料を65℃で2分間加熱してmRNAのポリAセグメン
トをマスクしうるであろう二次構造を破壊し、RNAの1μgを、2.5μMの
オリゴd(T)16、50mMのKCl、5mMのMgCl2 、10mMのトリス
塩酸pH8.3、それぞれ1mMのdNTP、1U/μlのRNアーゼ阻害剤及
び2.5U/μlのMuLV逆転写酵素、最終容量20μlを含むマスター混合
液中にピペットで直接注入した。プライマーのアニーリングのために反応物を室
温で10分間インキュベートし、ホットトップPCR装置中で逆転写を42℃で
30分間行い、次いで99℃で5分間の変性を行い、そして5℃で5分間冷却工
程を行った。PCR工程のために、遺伝子特異的プライマー及び1ユニットのタ
ックポリメラーゼを添加し、この反応物を2.2mMのMgCl2 及び0.2m
MのdNTPに希釈し、最終容量100μlとした。増幅は95℃で30秒間の
変性、61℃で1分間のアニーリング、及び72℃で2分間の伸長の40サイク
ルをパーキン−エルマーDNAサーマル・サイクラー中で行った。
RT-PCR and cDNA Cloning For RT-PCR, the GeneAmp® RNA PCR Kit (Perkin-Elmer) was used. The total RNA sample was heated at 65 ° C. for 2 minutes to disrupt secondary structures that would mask the polyA segment of mRNA, and 1 μg of RNA was replaced with 2.5 μM oligo d (T) 16 , 50 mM KCl Pipette in a master mixture containing 5 mM MgCl 2 , 10 mM Tris-HCl pH 8.3, 1 mM dNTP, 1 U / μl RNase inhibitor and 2.5 U / μl MuLV reverse transcriptase, 20 μl final volume. Was injected directly. Incubate the reaction for 10 minutes at room temperature for primer annealing, reverse transcription at 42 ° C. for 30 minutes in a hot-top PCR device, followed by denaturation at 99 ° C. for 5 minutes and cooling at 5 ° C. for 5 minutes The process was performed. For the PCR step, gene specific primers and one unit of tack polymerase were added and the reaction was reconstituted with 2.2 mM MgCl 2 and 0.2 mM
Diluted in M dNTPs to a final volume of 100 μl. Amplification was performed in a Perkin-Elmer DNA thermal cycler for 40 cycles of denaturation at 95 ° C. for 30 seconds, annealing at 61 ° C. for 1 minute, and extension at 72 ° C. for 2 minutes.

【0065】 完全長のヒト膵臓エラスターゼI転写物をカバーする二つの重なり合うPCR
断片を下記のプライマー対を用いて増幅した。即ち、 前向きプライマー 5’CAAGAAGGCAGTGGTCTACT3’及び 逆向きプライマー 5’CTGACATCCAGAGCGAACTC3’ は639bpのN末端断片を生じ、そして 前向きプライマー 5’CAATGGGCAGCTGGCCCAGA3’と 逆向きプライマー 5’TCGCAAGTCCTATTGCAGATC3’ は370bpのC末端断片を生ずる。これらの二つの断片の125bpの重なり
合う領域はユニークなPstI部位を含む。このPCR生産物を1.5%アガロ
ースゲル中で分離した。これらの断片を GeneClean (バイオ101・インク、ビ
スタ、CA、USA)を用いてゲル精製し、pGEM−Tベクター(プロメガ、マジソ
ン、 WI 、USA)中にサブクローニングした。このクローンをPCR並びに追加の
内部プライマーを用いて両方向で配列決定した。異なる皮膚タイプの異なる一次
ケラチノサイト培養からのさらなる断片を精製し、直接配列決定をするために十
分な639bp鋳型を創るため45PCRサイクルが要求されたものの、直接配
列決定した。
Two Overlapping PCRs Covering Full-Length Human Pancreatic Elastase I Transcript
The fragments were amplified using the following primer pairs. That is, the forward primer 5'CAAGAAGGCAGTGGTCTACT3 'and the reverse primer 5'CTGACATCCAGAGCGAACTC3' yield a 639 bp N-terminal fragment, and the forward primer 5'CAATGGGCAGCTGGCCCAGA3 'and the reverse primer 5'TCGCCAAGTCCTCGCAGTCATCGCATCTCTGCATCCATCTGCATGCTCGTCGCATCTCTGCATCTCTGCATCTCTGCATGCTCTCA, respectively. The 125 bp overlapping region of these two fragments contains a unique PstI site. The PCR products were separated in a 1.5% agarose gel. These fragments were gel purified using GeneClean (Bio 101, Inc., Vista, CA, USA) and subcloned into the pGEM-T vector (Promega, Madison, WI, USA). This clone was sequenced in both directions using PCR as well as additional internal primers. Additional fragments from different primary keratinocyte cultures of different skin types were purified and sequenced directly, although 45 PCR cycles were required to create enough 639 bp template for direct sequencing.

【0066】 ヒトエラスターゼII又はエラスターゼIII の検出のためのRT−PCRプライ
マーは、対応する酵素の既知のイソ型全てを認識するように設計した。既知のm
RNA配列を整列させ、mRNAの完全な同一領域に基づいてプライマーが選択
された。
RT-PCR primers for the detection of human elastase II or elastase III were designed to recognize all known isoforms of the corresponding enzymes. Known m
The RNA sequences were aligned and primers were selected based on the exact same region of the mRNA.

【0067】 ゲンバンク(受託:D00236、E01220、M16631、M1665
2、M16653)に寄託されたmRNA配列に基づくエラスターゼII(ELS
2)用のRT−PCRプライマー配列は、 421bp5’断片: 前向きプライマー 5’GCTGGAGCCCTCAGTTGTGGG3’ 逆向きプライマー 5’TGTTGGGTAGAATGGTGCCGG3’ 520bp3’断片: 前向きプライマー 5’AGTCCGGCTCGCTGGCAG3’ 逆向きプライマー5’GCAATCACCGAATTGATCCAGTCG3’
そしてエラスターゼIII (EL3)(ゲンバンク受託:M18692、J035
16、E01257)用: 430bp5’断片: 前向きプライマー5’GCTCAGTTCCCTCCTCCTTGTGG3’ 逆向きプライマー5’ACCAGCCGGAGGGAGTGAGG3’ 615bp3’断片: 前向きプライマー5’GCTCCCGGACCTACCAGGTGG3’ 逆向きプライマー5’TCGATCAGCACTGCCAGCTGG3’
Genbank (Accession: D00236, E01220, M16631, M1665
2, Elastase II (ELS) based on the mRNA sequence deposited in M16653)
The RT-PCR primer sequence for 2) is a 421 bp 5 'fragment: forward primer 5' GCTGGAGCCCTCAGTGTGGG3 'reverse primer 5' TGTTGGTGTAGAATGGTGCCGG3 '520 bp 3' fragment: forward primer 5 '
And elastase III (EL3) (Genbank contract: M18692, J035
16, E01257): 430 bp 5 'fragment: forward primer 5' GCTCAGTTCCCTCCTCCTTGTGG3 'reverse primer 5' ACCAGCCGGAGGGGAGTGAGG3 '615 bp3' fragment: forward primer 5 'GCTCCCGGACCTACCAGGTGCTGCATCGATCGATCGATGCRTG

【0068】ゲノムDNAの配列決定 DNAはヒト血液試料から Nucleon (登録商標) BACC3 DNA 抽出キット( ヌュ
ークレオン・バイオサイエンシーズ、ストラスクライド、UK) を用い製造業者の
指示に従って単離した。PCR反応は60〜62℃のプライマーアニーリングで
AB熱安定DNAポリメラーゼ及び反応緩衝液(「アドバンスド・バイオテクノ
ロジーズ」、エプソム、サレー、UK) を用いて通常のように行った。
Sequencing of genomic DNA DNA was isolated from human blood samples using the Nucleon® BACC3 DNA extraction kit (Nucleon Biosciences, Strathclyde, UK) according to the manufacturer's instructions. The PCR reaction was performed as usual using AB thermostable DNA polymerase and reaction buffer ("Advanced Biotechnologies", Epsom, Surrey, UK) with primer annealing at 60-62 ° C.

【0069】 ゲノムDNAプライマー由来のヒトエラスターゼIのPCR増幅用のプライマ
ーをゲンバンク(カワシマらによる寄託 1992 、受託: X62252-X62259)の配列に
基づいて設計した。公表ドメインで隣接配列の数bpのみが利用可能であったエ
キソンについては、プライマーはイントロンを増幅するためそのエキソン中に置
かれた。Long range Advantage (登録商標) ゲノムポリメラーゼミックス(クロ
ーンテック、パロアルト、CA、USA)及び68℃アニーリング温度を用いて長い断
片のPCRを行った。イントロン6については、ゲノム歩行アプローチ(シーベ
ルトら,Nucleic Acids Res 23: 1087-1088, 1995)に記述された方法) が必要で
あった。アダプター連結ゲノムDNA断片ライブラリー及びアダプター特異的プ
ライマーはイアン グレイ博士から恵与された。一次PCR反応は隣接するエキ
ソンの中央における外側のアダプタープライマー及び外側の遺伝子特異的プライ
マーを用いて行った。その後、一次反応物を50倍希釈し、対応する内側プライ
マーを用いて「ネスティッド」PCR反応を行った。この「ネスティッド」PC
Rは明瞭な1本のバンドを生じ、これをカラムで精製し、そして直接配列決定し
た。
Primers for PCR amplification of human elastase I from genomic DNA primers were designed based on the sequence of Genbank (deposited by Kawashima et al., 1992, accession: X62252-X62259). For exons where only a few bp of adjacent sequences were available in the published domain, primers were placed in the exon to amplify the intron. Long fragment PCR was performed using the Long range Advantage® Genomic Polymerase Mix (Clontech, Palo Alto, CA, USA) and a 68 ° C. annealing temperature. For Intron 6, a genome walking approach (the method described in Sievert et al., Nucleic Acids Res 23: 1087-1088, 1995) was required. Adapter-linked genomic DNA fragment libraries and adapter-specific primers were kindly provided by Dr. Ian Gray. Primary PCR reactions were performed using outer adapter primers and outer gene-specific primers in the middle of adjacent exons. The primary reaction was then diluted 50-fold and a "nested" PCR reaction was performed using the corresponding inner primer. This "nested" PC
R produced a distinct band which was purified on a column and sequenced directly.

【0070】 得られたイントロン配列に基づいて設計されたプライマー配列を用いて、突然
変異/多形についてヒトエラスターゼIのコード領域及びスプライス部位をスク
リーニングした。ELA1遺伝子の8エキソンを増幅するこのプライマー対は下
記のとおりである(これらのプライマーは本発明の側面を形成する)、 エキソン1: 前向きプライマー:5’ATGGATGACAAGGGGTGCTCCC3’ 逆向きプライマー:5’GGGCCTGAATAGCCAGTGGCC3’ エキソン2: 前向きプライマー:5’CTCAGAGAACTCACAGCTGGGCC3’
逆向きプライマー:5’ACCACCTAAGCCTGATCCCATCC3’
エキソン3: 前向きプライマー:5’CAGCTCNTAGGCTCAACTGATCCTC
3’ 逆向きプライマー:5’GAGAGGGCAAAATTATATCCTCTTT
CAG3’ エキソン4: 前向きプライマー:5’CCATTCTCCTATCTCTAAAGTGGGC
3’ 逆向きプライマー:5’CTCCTGGACGAATGAGCCAGC3’ エキソン5: 前向きプライマー:5’GCTGCAATACCAATGTCCCACC3’ 逆向きプライマー:5’CCTGGTCTCTGGCCATAAGCAC3’ エキソン6: 前向きプライマー:5’CCTGAGCTCAGCTTTCACGAGAG3’
逆向きプライマー:5’AAGTGAGGGCATCGAGCAAGATC3’
エキソン7: 前向きプライマー:5’TTTAGGATTCTGTTTCTCCTCCCTG
C3’ 逆向きプライマー:5’AAGGAAGATGACGGCTTGCCC3’ エキソン8: PCR前向きプライマー:5’GCTTGAGAGTTAGGTGAGGCTC
TG3’ 逆向きプライマー:5’AGGGACCCCTGCTCTGGAGG3’ これで前向き配列決定:5’GCTCACGGCCATTTCAAGGTC3’
The coding and splice sites of human elastase I were screened for mutations / polymorphisms using primer sequences designed based on the resulting intron sequences. This primer pair that amplifies the 8 exons of the ELA1 gene is as follows (these primers form an aspect of the present invention): 2: Forward primer: 5'CTCAGAGAACTCACAGCTGGGGCC3 '
Reverse primer: 5'ACCACCTAAGCCTGATCCCATCC3 '
Exon 3: Forward primer: 5'CAGCCTCNTAGGCTCACTGATCCCTC
3 'reverse primer: 5'GAGAGGGCAAAAATTATATCCCTCTTT
CAG3 'exon 4: forward primer: 5' CCATTCTCCTATCTCTAAAGTGGGGC
3 'reverse primer: 5'CTCCTGGACGAATGAGCCAGC3' exon 5: forward primer: 5 'GCTGCAATACCAATGTCCCACC3' reverse primer: 5 'CCTGGTCTCTGCCCATAAGCAC3' exon 6: forward primer: 5 'CCTGAGCTCAGCTTTCGAGA
Reverse primer: 5'AAGTGAGGGGCATCGAGCAAGATC3 '
Exon 7: forward primer: 5'TTTAGGATTCTGTTTTCCCTCCCCTG
C3 'Reverse primer: 5' AAGGAAGATGACGGCTTGCCC3 'Exon 8: PCR forward primer: 5' GCTTGAGAGTTAGGTTGAGGCTC
TG3 'Reverse primer: 5'AGGGACCCCTGCTCTGGAGGG3' Forward sequencing: 5'GCTCACGGCCATTTCAAGGTC3 '

【0071】 PCR生産物をキアクイックPCR精製カラム(キアゲン)を用いて精製し、 ABI PRISM (商標) ローダミン又は BigDye ( 登録商標) ターミネーター・シー
ケンシング・レディ反応ミックス(パーキン・エルマー)を用いABI377自
動シーケンサー上で両方の鎖の配列を決定した。
The PCR product was purified using a Qiaquick PCR purification column (Qiagen), and ABI377 automated using an ABI PRISM ™ Rhodamine or BigDye® Terminator Sequencing Ready Reaction Mix (Perkin Elmer). Both strands were sequenced on a sequencer.

【0072】実施例1 膵臓のエラスターゼ様タンパク質は正常ヒト皮膚中に存在する そのヒト相同体と89%のアミノ酸同一性を有する(それぞれの配列の整列は
図5Aに示す)ブタ膵臓エラスターゼ(PPE)に対する抗体を形成させた。こ
の抗体を用いてELA1タンパク質の存在及び位置について正常なヒト皮膚の切
片をスクリーニングした。この抗体は胸、手のひら、足の裏及び包皮からの正常
なヒトの皮膚の基底層中にエラスターゼ様タンパク質の発現を検出した。
Example 1 Pancreatic elastase-like protein has 89% amino acid identity with its human homologue present in normal human skin (sequence alignment is shown in FIG. 5A). Porcine pancreatic elastase (PPE) Antibodies. Using this antibody, sections of normal human skin were screened for the presence and location of the ELA1 protein. This antibody detected the expression of elastase-like protein in the basal layer of normal human skin from the chest, palms, soles and foreskin.

【0073】 抗ブタ膵臓エラスターゼ抗体を用いて得られたヒトの足の裏の皮膚の免疫組織
化学的染色の結果を図1に示す。ここで、表皮の基底細胞層の明瞭な連続した染
色がb)で見られ得る。これは膵臓エラスターゼ様タンパク質がヒトの皮膚に存
在することを示唆するものである。
FIG. 1 shows the results of immunohistochemical staining of the human sole skin obtained using an anti-porcine pancreatic elastase antibody. Here, a clear continuous staining of the basal cell layer of the epidermis can be seen in b). This suggests that pancreatic elastase-like protein is present on human skin.

【0074】 ヒト白血球エラスターゼに対して形成された抗体はこのタンパク質を認識しな
かった(示していない)。
Antibodies formed against human leukocyte elastase did not recognize this protein (not shown).

【0075】 ヒトの皮膚における膵臓エラスターゼ様タンパク質の存在は、ヒトエラスター
ゼI遺伝子のプロモーターエンハンサー領域における変化(ローズら,Hum Mol
Genet 6: 897-903, 1997) が皮膚におけるその発現に悪影響を与えないか否かあ
るいは膵臓から皮膚へと発現を切り換えるのか否かという問題を提起する。そこ
で、ブタ及びマウスの皮膚の凍結切片を同じ抗PPE抗体で染色した。この抗体
はこれらの皮膚切片の基底層を明らかに染色したが、毛包及び皮脂腺上皮をも染
色した。これらの観察は、膵臓で該酵素を発現することが知られている他の哺乳
類の皮膚に同様なタンパク質が存在することを示唆する。
The presence of a pancreatic elastase-like protein in human skin is due to changes in the promoter enhancer region of the human elastase I gene (Rose et al., Hum Mol
Genet 6: 897-903, 1997) raises the question of whether it does not adversely affect its expression in skin or whether it switches expression from pancreas to skin. Thus, frozen sections of pig and mouse skin were stained with the same anti-PPE antibody. This antibody clearly stained the basal layer of these skin sections, but also stained hair follicles and sebaceous gland epithelium. These observations suggest that similar proteins are present in the skin of other mammals known to express the enzyme in the pancreas.

【0076】実施例2 正常なヒトのケラチノサイトはエラスターゼI(ELA1)を発現する 膵臓エラスターゼ類の間における高レベルのアミノ酸保存のため、抗PPE抗
体と他の二つの既知膵臓エラスターゼとの交差反応が排除され得ないであろう。
膵臓エラスターゼIはヒトの膵臓では存在しないことが証明されたが、ヒト膵臓
からの凍結切片 (cryosections) において腺房細胞の極めて弱い染色がより高濃
度の抗PPE抗体で観察され得た。このことはこの抗体が他の膵臓エラスターゼ
をも検出できることを示唆する。
Example 2 Because normal human keratinocytes have a high level of amino acid conservation among pancreatic elastases that express elastase I (ELA1) , cross-reactivity of anti-PPE antibodies with two other known pancreatic elastases is not possible. Will not be excluded.
Although pancreatic elastase I was demonstrated to be absent in the human pancreas, very weak staining of acinar cells in cryosections from the human pancreas could be observed at higher concentrations of anti-PPE antibody. This suggests that this antibody can also detect other pancreatic elastases.

【0077】 従って、3種の既知のエラスターゼ遺伝子(ELA1、ELS2及びEL3)
すべてに対するmRNA特異的プライマーを作成し、ヒトの培養ケラチノサイト
及び新鮮な膵臓組織におけるmRNAの発現をRT−PCR(材料と方法を参照
)により研究した。
Thus, three known elastase genes (ELA1, ELS2 and EL3)
MRNA specific primers for all were generated and the expression of mRNA in human cultured keratinocytes and fresh pancreatic tissue was studied by RT-PCR (see Materials and Methods).

【0078】 二つのヌクレオチド多形がELA1遺伝子のエキソン1配列で示唆された(カ
ワシマら,DNA Seq 2: 303-312, 1992、受託 X62258 、X62259) 。従って、両配
列変異体において同一である翻訳開始コドンの上流の領域における遺伝子特異的
プライマーを設計した。
Two nucleotide polymorphisms were suggested in the exon 1 sequence of the ELA1 gene (Kawashima et al., DNA Seq 2: 303-312, 1992, accession X62258, X62259). Therefore, gene-specific primers in the region upstream of the translation initiation codon that were identical in both sequence variants were designed.

【0079】 その結果は図2に示す。ここで、Kはケラチノサイトから単離された断片を示
し、Pは膵臓から単離された断片を示す。該二つのELA1特異的断片はケラチ
ノサイトの総RNA調製品では見出すことができた(レーン1、2)が、膵臓の
総RNA調製品では見出せなかった。
FIG. 2 shows the results. Here, K indicates a fragment isolated from keratinocytes, and P indicates a fragment isolated from pancreas. The two ELA1-specific fragments could be found in keratinocyte total RNA preparations (lanes 1, 2), but not in pancreatic total RNA preparations.

【0080】 RT−PCRは、ヒト膵臓由来の総RNA調製品から、予想された大きさの断
片4個を増幅した(エラスターゼIIの421bp断片及び520bp断片(レー
ン7、8)及びエラスターゼIII の430bp断片及び615bp断片(レーン
11、12))。しかしながら、これらの断片は培養したヒト一次ケラチノサイ
ト中では検出されなかった(レーン5、6、9及び10)。
RT-PCR amplified four fragments of the expected size from a total RNA preparation from human pancreas (elastase II 421 bp and 520 bp fragments (lanes 7, 8) and elastase III 430 bp). Fragment and 615 bp fragment (lanes 11, 12)). However, these fragments were not detected in cultured human primary keratinocytes (lanes 5, 6, 9, and 10).

【0081】 このことは、表皮中で抗PPE抗体により検出されるタンパク質はヒトエラス
ターゼIである可能性が高いことを示唆する。
This suggests that the protein detected by the anti-PPE antibody in the epidermis is likely to be human elastase I.

【0082】実施例3 cDNA配列分析 ヒトケラチノサイトの総RNAからRT−PCRにより得た640bp断片及
び370bp断片(図2、レーン1、2)のそれぞれ及び該遺伝子コード配列の
全長をpGEM−T中にサブクローニングした。これらの二つの断片の125b
pの重なり合う領域はユニークなPstI部位を含む。配列決定は材料と方法で
記述したように行った。
Example 3 Analysis of cDNA Sequence Each of the 640 bp fragment and the 370 bp fragment (FIG. 2, lanes 1 and 2) obtained from the total RNA of human keratinocytes by RT-PCR and the full length of the gene coding sequence were expressed in pGEM-T. Subcloned. 125b of these two fragments
The overlapping region of p contains a unique PstI site. Sequencing was performed as described in Materials and Methods.

【0083】 ヒトエラスターゼIの全長cDNA配列(ゲンバンク受託番号:AF1204
93)及び配列決定により得られたコード領域のアミノ酸翻訳を図3に示す。
The full length cDNA sequence of human elastase I (Genbank accession number: AF1204
93) and the amino acid translation of the coding region obtained by sequencing are shown in FIG.

【0084】 図3において、下線を引いたヌクレオチドは該配列とカワシマら,DNA Seq 2:
303-312, 1992により提案された配列の間の相違を示す。こうして、このcDN
A配列は提案された配列と比べ二つのヌクレオチド置換(エキソン3におけるt
→c及びエキソン7におけるg→a)を含む。これらの置換はコードされたアミ
ノ酸の交換を招く。即ち、Trp−44はArg残基により置換され、Arg−
243はGln残基により置換される。同じヌクレオチド相違が本発明者らのゲ
ノムDNA試料の全てにおいても見出された(以下を参照)。しかしながら、こ
れらの変化はカフカス集団とモンゴル集団の間の対立遺伝子多形を反映するもの
かも知れない。
In FIG. 3, the underlined nucleotides correspond to the sequence and Kawashima et al., DNA Seq 2:
The differences between the sequences proposed by 303-312, 1992 are shown. Thus, this cDN
The A sequence has two nucleotide substitutions (t in exon 3) compared to the proposed sequence.
→ c and g → a) in exon 7. These substitutions result in a replacement of the encoded amino acid. That is, Trp-44 is replaced by an Arg residue and Arg-
243 is replaced by a Gln residue. The same nucleotide differences were found in all of our genomic DNA samples (see below). However, these changes may reflect allelic variants between the Caucasian and Mongolian populations.

【0085】 触媒的三組のアミノ酸(His−63、Asp−111及びSer−206)
は二重下線を付して太字で印刷してある。一重線を付した太字の文字は基質結合
ポケットの口の所に存在するVal−227残基とThr−239残基を強調し
ており、これらはエラスターゼIの基質特異性に寄与している。太字イタリック
体で印刷されたアミノ酸はエラフィン(SKALP)と酵素複合体の一次接触に
関与する。
Catalytic triad of amino acids (His-63, Asp-111 and Ser-206)
Is printed in bold with double underlining. Single-lined bold letters highlight Val-227 and Thr-239 residues at the mouth of the substrate binding pocket, which contribute to the substrate specificity of elastase I. Amino acids printed in bold italics are involved in the primary contact of elafin (SKALP) with the enzyme complex.

【0086】 この遺伝子(受託X62258)のエキソン1の長さが40bpだけ異なる二
つの代替的スプライス変異体が提案され(カワシマら,DNA Seq 2: 303-312, 19
92) 、短い型のみがここに同定され得た。これは第一のスプライス部位がケラチ
ノサイトにおけるmRNAスプライスに優先的に用いられることを意味する。翻
訳産物のシグナルぺプチド(僅か8アミノ酸)は、従って、分泌酵素にとって短
か過ぎる。分泌されるようには見えないが、エラスターゼIは上の層へのそれら
の移動に際し基底膜からの細胞の脱着に関与しうるであろう。
Two alternative splice variants have been proposed in which the length of exon 1 of this gene (Accession X62258) differs by 40 bp (Kawashima et al., DNA Seq 2: 303-312, 19).
92), only the short form could be identified here. This means that the first splice site is used preferentially for mRNA splice in keratinocytes. The translation product signal peptide (only 8 amino acids) is therefore too short for secreted enzymes. Although not appearing to be secreted, elastase I could be involved in detachment of cells from the basement membrane upon their migration to the upper layers.

【0087】 正常なヒトの身体の異なる部位(胸、腹、手のひら)の皮膚から培養された一
次ケラチノサイトの総RNA調製品は異なる人種起源の個体からのものと同様に
この二つのヒトエラスターゼIRT−PCR断片について陽性であった。RT−
PCR産物は正常な皮膚の総RNA試料からも得られうるであろう。
A total RNA preparation of primary keratinocytes cultured from the skin of different parts of the normal human body (chest, abdomen, palms) is used to prepare the two human elastase IRTs as well as from individuals of different ethnic origins. -Positive for PCR fragment. RT-
PCR products could also be obtained from normal skin total RNA samples.

【0088】実施例4 多形は該酵素の活性部位の直ぐ下流に存在する ゲノムDNAにおけるELA1遺伝子(スプライス部位を含む)のコード領域
を幾人かの個体についてスクリーニングした。
Example 4 The polymorphism was screened for some individuals for the coding region of the ELA1 gene (including the splice site) in the genomic DNA located immediately downstream of the active site of the enzyme .

【0089】 この配列決定から、エキソン7における1個のヌクレオチド多形が明らかにさ
れた。この変異型についての野性型(上部)、ヘテロ接合型(中央)及びホモ接
合型(下部)の個体の配列決定による追跡を図4で比較する。
This sequencing revealed a single nucleotide polymorphism in exon 7. The tracking of the wild type (top), heterozygous (center) and homozygous (bottom) individuals for this mutant by sequencing is compared in FIG.

【0090】 余分のCの挿入は、矢印で示すように、逆鎖(3’→5’)に対する余分のG
として現れる。この挿入は5個のグアニジンヌクレオチドの伸びとそれに続く5
個のシトシンヌクレオチドから成る潜在的突然変異「ホットスポット」中にある
The insertion of the extra C, as indicated by the arrow, caused the extra G to the opposite strand (3 ′ → 5 ′)
Appear as. This insertion is an extension of 5 guanidine nucleotides followed by 5
In a potential mutation "hot spot" consisting of one cytosine nucleotide.

【0091】 図3を参照すると、この「ホットスポット」が該酵素の活性部位ポケットをコ
ードする配列の直ぐ下流にあること、及び該変異体におけるこの挿入が早めの停
止コドンを作らせ仮定的258アミノ酸タンパク質を26アミノ酸だけ短くする
フレームシフトを生じさせることを見ることができる。この変異体のヌクレオチ
ド配列は図5に示す。
Referring to FIG. 3, that this “hot spot” is immediately downstream of the sequence encoding the active site pocket of the enzyme, and that this insertion in the mutant creates an early stop codon and putative 258 It can be seen that a frame shift occurs that shortens the amino acid protein by 26 amino acids. The nucleotide sequence of this variant is shown in FIG.

【0092】 ヒトエラスターゼ遺伝子(ELA1 ヒト)及びその先端切断変異体(ELA
var)のアミノ酸配列は図6Aに比較してある。触媒的三組のアミノ酸(
His−63、Asp−111及びSer−206)は二重下線を付した太字で
示す。二重下線を付し太字イタリックで印刷したアミノ酸は酵素/阻害剤複合体
とSKALPとの一次接触に関与する。一重下線を付した太字の文字は基質結合
ポケットの口の所に存在し、エラスターゼIの基質特異性に寄与するVal−2
27残基とThr−239残基を強調する。
The human elastase gene (ELA1 Human) and its truncated mutant (ELA)
1 The amino acid sequence of var) is compared to FIG. 6A. Catalytic triad of amino acids (
His-63, Asp-111 and Ser-206) are shown in bold and double underlined. Amino acids double-underlined and printed in bold italics are involved in the primary contact of the enzyme / inhibitor complex with SKALP. Single underlined bold letters are located at the mouth of the substrate binding pocket and contribute to Val-2, which contributes to the substrate specificity of elastase I.
Residue 27 and Thr-239 are highlighted.

【0093】 この変異体と関係のない70人の正常な個体のスクリーニングから、比較的高
頻度の対立遺伝子(約25%)が明らかにされた。この突然変異についてホモ接
合体である個体は正常であるか明白な皮膚病をもっていないようにみえる。不幸
にも、僅かな表皮の変化を研究するため、この多形(7%)についてのホモ接合
性である個体から皮膚生検を入手することはできなかった。
Screening of 70 normal individuals unrelated to this variant revealed a relatively high frequency of alleles (about 25%). Individuals who are homozygous for this mutation do not appear to have normal or overt dermatoses. Unfortunately, no skin biopsies were available from individuals homozygous for this polymorphism (7%) to study subtle epidermal changes.

【0094】実施例5 ELA1の二次構造に対する多形の評価 見かけ上正常な個体の中に該タンパク質の先端切断変異体が予想外に高い頻度
で存在するので、翻訳されたタンパク質の折り畳みに及ぼすフレームシフトのあ
りうる効果を評価した。
Example 5 Evaluation of Polymorphism for the Secondary Structure of ELA1 The unexpectedly high frequency of truncated variants of the protein in apparently normal individuals has an effect on the folding of the translated protein. The possible effects of frame shifting were evaluated.

【0095】 ELA1タンパク質の活性部位は触媒的三組のアミノ酸(His−63、As
p−111及びSer−206)を含む。これらの残基は、該タンパク質の二次
構造を安定化するシステイン残基の最後のものを除き全てのものと同様に該フレ
ームシフトの上流にコードされており、影響を受けないでいる(図6Aの整列を
参照)。
The active site of the ELA1 protein contains a catalytic triad of amino acids (His-63, As
p-111 and Ser-206). These residues, like all but the last of the cysteine residues that stabilize the secondary structure of the protein, are encoded upstream of the frameshift and are unaffected (Fig. 6A).

【0096】 二つの仮定的遺伝子産物の二次構造を解析し、SOPMタンパク質解析プログ
ラム(ゲウールジョンら,Prot Engineering 7: 157-164, 1994)を用いて比較し
た。その結果を図6Bに示す。ここで、矢印はSer−206を含む活性部位ポ
ケットを示す。二次構造のレベルについては、この多形は末端ヘリックスの前に
ある短いシート−コイル−ターン−コイル−ターン−コイル−シートのループを
切断する形で現れる。このループは、エラフィン/エラスターゼ複合体形成の一
次接触に関与する8個のアミノ酸 (図3を参照)(ツネミら,Biochem 35: 1157
0-11576, 1996)のうちの5個を保持し、並びに基質結合ポケットの口の位置に存
在し、エラスターゼIの基質特異性に寄与する、鍵となるアミノ酸残基Val−
227及びThr−239(図3で強調)を保持する。これらの観察は、配列変
異体が阻害剤結合能力を失うことなく該酵素の基質特異性を改変することを示唆
する。
The secondary structures of the two hypothetical gene products were analyzed and compared using a SOPM protein analysis program (Geourjon et al., Prot Engineering 7: 157-164, 1994). The result is shown in FIG. 6B. Here, the arrow indicates the active site pocket containing Ser-206. At the secondary structure level, this polymorphism manifests itself in breaking a short sheet-coil-turn-coil-turn-coil-sheet loop in front of the terminal helix. This loop contains eight amino acids (see FIG. 3) involved in the primary contact of elafin / elastase complex formation (Tsunemi et al., Biochem 35: 1157).
0-11576, 1996) as well as a key amino acid residue, Val-, which is located at the mouth of the substrate binding pocket and contributes to the substrate specificity of elastase I.
227 and Thr-239 (highlighted in FIG. 3). These observations suggest that the sequence variants alter the substrate specificity of the enzyme without losing inhibitor binding capacity.

【図面の簡単な説明】[Brief description of the drawings]

【図1】 図1は、膵臓のエラスターゼ様タンパク質についての正常なヒトの足裏皮膚の
免疫染色の結果を示す、凍結切片の写真である。ここで、a)は染色されていな
い対照の切片(二次ABのみ)を示し、b)は抗PPEウサギモノクローナル抗
体で染色した切片を示す。
FIG. 1 is a photograph of a frozen section showing the results of immunostaining of normal human sole skin for pancreatic elastase-like protein. Here, a) shows an unstained control section (secondary AB only), and b) shows a section stained with an anti-PPE rabbit monoclonal antibody.

【図2】 図2は、ケラチノサイト(K)及び膵臓(P)からの総RNA調製品由来の既
知のヒト膵臓エラスターゼI、エラスターゼII 及びエラスターゼIII のRT−
PCRの結果を示すアガロースゲルの写真である。
FIG. 2. RT- of known human pancreatic elastase I, elastase II and elastase III from total RNA preparations from keratinocytes (K) and pancreas (P).
It is a photograph of the agarose gel which shows the result of PCR.

【図3】 図3は、一次ケラチノサイトから得られたヒトエラスターゼIcDNAの配列
及びそのコード領域のアミノ酸翻訳を示す。
FIG. 3 shows the sequence of human elastase I cDNA obtained from primary keratinocytes and the amino acid translation of its coding region.

【図4】 図4は、ELA1のエキソン7に見出された多形遺伝子座の配列決定追跡の比
較である。上段は変異体についての野性型の個体を示し、中段は変異体について
のヘテロ接合型の個体を示し、そして下段は変異体についてのホモ接合型の個体
を示す。
FIG. 4 is a comparison of sequencing traces of the polymorphic locus found in exon 7 of ELA1. The upper row shows wild-type individuals for the mutant, the middle row shows heterozygous individuals for the mutant, and the lower row shows homozygous individuals for the mutant.

【図5】 図5は、一次ケラチノサイトから得られた変異体ヒトエラスターゼIcDNA
の配列を示す。
FIG. 5 shows a mutant human elastase I cDNA obtained from primary keratinocytes.
The following shows the sequence.

【図6A】 図6Aは、ブタ膵臓エラスターゼ(EL1 ブタ)、ヒトエラスターゼI(E
LA1 ヒト)及びヒトエラスターゼI先端切断変異体(ELA1 var)の
アミノ酸配列の比較を示す。
FIG. 6A shows porcine pancreatic elastase (EL1). Pig), human elastase I (E
LA1 Human and human elastase I truncation mutant (ELA1 4 shows a comparison of amino acid sequences of var).

【図6B】 図6Bは、SOPMソフトウエアを用いるELA1 ヒト(上段)及びELA
var(下段)についてのタンパク質二次構造の予測を示す。
FIG. 6B shows ELA1 using SOPM software. Human (top) and ELA
1 4 shows prediction of protein secondary structure for var (bottom).

───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) C12N 5/10 C12Q 1/68 A 4H045 9/50 Z C12Q 1/68 G01N 33/573 A 33/574 A G01N 33/573 C12P 21/08 33/574 C12N 15/00 ZNAA // C12P 21/08 5/00 A (81)指定国 EP(AT,BE,CH,CY, DE,DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,I T,LU,MC,NL,PT,SE),OA(BF,BJ ,CF,CG,CI,CM,GA,GN,GW,ML, MR,NE,SN,TD,TG),AP(GH,GM,K E,LS,MW,SD,SL,SZ,TZ,UG,ZW ),EA(AM,AZ,BY,KG,KZ,MD,RU, TJ,TM),AE,AG,AL,AM,AT,AU, AZ,BA,BB,BG,BR,BY,CA,CH,C N,CR,CU,CZ,DE,DK,DM,DZ,EE ,ES,FI,GB,GD,GE,GH,GM,HR, HU,ID,IL,IN,IS,JP,KE,KG,K P,KR,KZ,LC,LK,LR,LS,LT,LU ,LV,MA,MD,MG,MK,MN,MW,MX, NO,NZ,PL,PT,RO,RU,SD,SE,S G,SI,SK,SL,TJ,TM,TR,TT,TZ ,UA,UG,US,UZ,VN,YU,ZA,ZW (72)発明者 ゲルスト−タラス,ウルビ イギリス国、イー1 4エヌエス ロンド ン、マイル エンド ロード、クイーン メアリー アンド ウェストフィールド カレッジ (72)発明者 ダンロップ,ジョン イギリス国、イー1 4エヌエス ロンド ン、マイル エンド ロード、クイーン メアリー アンド ウェストフィールド カレッジ (72)発明者 ケルセル,デイビッド,ピーター イギリス国、イー1 4エヌエス ロンド ン、マイル エンド ロード、クイーン メアリー アンド ウェストフィールド カレッジ Fターム(参考) 4B024 AA01 AA12 BA14 BA41 CA04 CA09 EA04 GA11 HA01 HA12 HA15 HA19 4B050 CC04 DD11 LL01 LL03 4B063 QA01 QA13 QQ02 QQ42 QR32 QR56 QR62 QS25 QS34 4B064 AG27 DA13 DA14 4B065 AA01X AA57X AA72X AA87X AA93Y AB01 AC14 BA02 CA25 CA33 CA44 CA46 4H045 AA10 AA11 AA20 AA30 CA40 DA76 DA89 EA20 EA28 EA51 FA72 FA73 FA74 ──────────────────────────────────────────────────の Continued on the front page (51) Int.Cl. 7 Identification symbol FI Theme coat ゛ (Reference) C12N 5/10 C12Q 1/68 A 4H045 9/50 Z C12Q 1/68 G01N 33/573 A 33/574 A G01N 33/573 C12P 21/08 33/574 C12N 15/00 ZNAA // C12P 21/08 5/00 A (81) Designated countries EP (AT, BE, CH, CY, DE, DK, ES, FI, FR , GB, GR, IE, IT, LU, MC, NL, PT, SE), OA (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN, GW, ML, MR, NE, SN, TD) , TG), AP (GH, GM, KE, LS, MW, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZW), EA (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ) , TM), AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BY, CA, CH, CN, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EE , ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP, KE, KG, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, NO, NZ, PL, PT, RO, RU, SD, SE, SG, SI, SK, SL, TJ, TM, TR, TT , TZ, UA, UG, US, UZ, VN, YU, ZA, ZW (72) Inventor Gerst-Talas, Urbi United Kingdom, E14 NS, Mile End Road, Queen Mary and Westfield College (72) Inventor Dunlop John Britain, E14 NS London, Mile End Road, Queen Mary and Westfield College (72) Inventor Kersel, David, Peter United Kingdom, E14 NS London, Mile End Road, Queen Mary and Westfield College F-term (reference) 4B024 AA01 AA12 BA14 BA41 CA04 CA09 EA04 GA11 HA01 HA12 HA15 HA19 4B050 CC04 DD11 LL01 LL03 4B063 QA01 QA13 QQ02 QQ42 QR32 QR56 QR62 QS25 QS34 4B064 AG27 DA13 CA14 AAXA01A14A01X CA46 4H045 AA10 AA11 AA20 AA30 CA40 DA76 DA89 EA20 EA28 EA51 FA72 FA73 FA74

Claims (16)

【特許請求の範囲】[Claims] 【請求項1】 ヒトエラスターゼIの突然変異体をコードする核酸配列であ
って、コドン207から225までのいずれか一つとフレームシフト突然変異を
持つ図3の配列を含む核酸配列を含む、単離され又は組換えられたポリヌクレオ
チド。
1. An isolated nucleic acid sequence encoding a mutant of human elastase I, comprising a nucleic acid sequence comprising the sequence of FIG. 3 having any one of codons 207 to 225 and a frameshift mutation. Or recombinant polynucleotide.
【請求項2】 該フレームシフト突然変異がコドン208における1個の塩
基挿入である、請求項1記載のポリヌクレオチド。
2. The polynucleotide of claim 1, wherein said frameshift mutation is a single base insertion at codon 208.
【請求項3】 該挿入された1個の塩基がシトシンヌクレオチドである、請
求項1又は請求項2記載のポリヌクレオチド。
3. The polynucleotide according to claim 1, wherein the one inserted base is a cytosine nucleotide.
【請求項4】 ヒトエラスターゼIの突然変異体であって、図6A(ELA
var)に示すアミノ酸配列を含み又はその配列と実質的な配列同一性を有
する突然変異体を含む、単離されたポリペプチド。
4. A mutant of human elastase I, FIG. 6A (ELA
1 var) or an isolated polypeptide comprising a mutant having substantial sequence identity to that sequence.
【請求項5】 過増殖皮膚状態若しくは癌に対する被験者の素因を決定する
方法であって、被験者におけるELA1の対立遺伝子の存在を検出する工程を含
み、該対立遺伝子がヒトエラスターゼIの突然変異体をコードし、且つ、図3の
核酸配列のコドン207から225までのいずれか一つにフレームシフト突然変
異を持つものである方法。
5. A method for determining a predisposition of a subject to a hyperproliferative skin condition or cancer, comprising detecting the presence of an allele of ELA1 in the subject, wherein the allele comprises a mutant of human elastase I. 3. A method which encodes and has a frameshift mutation in any one of codons 207 to 225 of the nucleic acid sequence of FIG.
【請求項6】 該フレームシフト突然変異がコドン208における1個の塩
基挿入である、請求項5記載の方法。
6. The method of claim 5, wherein said frameshift mutation is a single base insertion at codon 208.
【請求項7】 該挿入された1個の塩基がシトシンヌクレオチドである、請
求項6記載の方法。
7. The method according to claim 6, wherein said one inserted base is a cytosine nucleotide.
【請求項8】 該対立遺伝子が被験者の染色体12q13由来のゲノムDN
Aセグメントを配列決定することにより検出されるものである、請求項5、請求
項6又は請求項7に記載の方法。
8. The genome DN wherein the allele is derived from chromosome 12q13 of the subject.
The method according to claim 5, 6 or 7, wherein the method is detected by sequencing the A segment.
【請求項9】 該対立遺伝子が、(i)被験者由来の核酸試料を、反応中に
ELA1対立遺伝子に選択的にハイブリダイズすることができる一つ以上のポリ
ヌクレオチドプローブと混合する工程、及び(ii) 試料中に遺伝子対立遺伝子酸
(gene allele acid) が存在するか否かを決定するため該反応をモニターし、そ
れにより被験者に過増殖皮膚状態若しくは癌の危険性があるか否かを示す工程、
により検出されるものである、請求項5、請求項6又は請求項7に記載の方法。
9. The method according to claim 9, wherein the allele is: (i) mixing a nucleic acid sample from the subject with one or more polynucleotide probes capable of selectively hybridizing to the ELA1 allele during the reaction; ii) monitoring the reaction to determine if a gene allele acid is present in the sample, thereby indicating whether the subject is at risk for a hyperproliferative skin condition or cancer Process,
The method according to claim 5, 6 or 7, wherein the method is detected by:
【請求項10】 対立遺伝子の検出が、(i)被験者由来のヒトエラスター
ゼIタンパク質試料を該対立遺伝子に特異的な抗体試薬と免疫学的アッセイにお
いて混合する工程、及び(ii) 該抗体試薬とタンパク質試料の間の特異的結合を
測定するため該アッセイをモニターし、それにより該被験者が過増殖皮膚状態又
は癌の危険性があるか否かを示す工程を含むものである、請求項5、請求項6又
は請求項7に記載の方法。
10. The method for detecting alleles comprises: (i) mixing a human elastase I protein sample from a subject with an antibody reagent specific for the allele in an immunological assay; and (ii) 6. The method according to claim 5, comprising monitoring the assay to determine specific binding between the protein samples, thereby indicating whether the subject is at risk for a hyperproliferative skin condition or cancer. A method according to claim 6 or claim 7.
【請求項11】 該抗体試薬が対立遺伝子に特異的な抗原決定基と特異的に
反応するモノクローナル抗体である、請求項10記載の方法。
11. The method of claim 10, wherein said antibody reagent is a monoclonal antibody that specifically reacts with an antigenic determinant specific for an allele.
【請求項12】 該抗体試薬が請求項4記載のポリペプチドと特異的に反応
するモノクローナル抗体である、請求項11記載の方法。
12. The method according to claim 11, wherein the antibody reagent is a monoclonal antibody that specifically reacts with the polypeptide according to claim 4.
【請求項13】 請求項4記載のポリペプチドと特異的に反応するモノクロ
ーナル抗体。
13. A monoclonal antibody which specifically reacts with the polypeptide according to claim 4.
【請求項14】 請求項1、請求項2又は請求項3に記載のポリヌクレオチ
ドを含むベクター。
14. A vector comprising the polynucleotide according to claim 1, 2, or 3.
【請求項15】 請求項14記載のベクターを含む宿主。15. A host comprising the vector according to claim 14. 【請求項16】 請求項4記載のポリペプチドを取得する方法であって、請
求項15記載の宿主を該ポリペプチドを発現させる条件の下でインキュベートす
る工程及び次いで該ポリペプチドを精製する工程を含む方法。
16. A method for obtaining the polypeptide according to claim 4, wherein the step of incubating the host according to claim 15 under conditions for expressing the polypeptide and the step of purifying the polypeptide are then performed. Including methods.
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Families Citing this family (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
AU2013204017B2 (en) * 2007-12-04 2016-06-02 Proteon Therapeutics, Inc. Recombinant elastase proteins and methods of manufacturing and use thereof
US8501449B2 (en) 2007-12-04 2013-08-06 Proteon Therapeutics, Inc. Recombinant elastase proteins and methods of manufacturing and use thereof

Family Cites Families (7)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JPS60186284A (en) * 1984-03-07 1985-09-21 Kirin Brewery Co Ltd Biotechnological production of butaerastase i
JPS60207583A (en) * 1984-03-29 1985-10-19 Sankyo Co Ltd Swine pancreas elastase
JPH0673456B2 (en) * 1986-04-26 1994-09-21 三共株式会社 Human / Pancreas Elastase ▲ I ▼
JPH0286777A (en) * 1988-09-22 1990-03-27 Sankyo Co Ltd Siminan pancreatic elastase i
DE4107765A1 (en) * 1990-07-28 1992-01-30 Schebo Tech Medizinisch Biolog PANCREAS ELASTASE-1 SPECIFIC ANTIBODY, A METHOD FOR ITS OBTAINMENT AND A TEST KIT CONTAINING SUCH ANTIBODIES
AU7142796A (en) * 1995-10-02 1997-04-28 Erasmus University Rotterdam Diagnosis method and reagents
US5885775A (en) * 1996-10-04 1999-03-23 Perseptive Biosystems, Inc. Methods for determining sequences information in polynucleotides using mass spectrometry

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WO2000061728A2 (en) 2000-10-19
AU3981400A (en) 2000-11-14
GB9908458D0 (en) 1999-06-09

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