JP2002540813A - Novel antisense-oligo with better stability and antisense effect - Google Patents

Novel antisense-oligo with better stability and antisense effect

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Abstract

(57)【要約】 本発明は、より少ない2次構造を有するmRNA領域に対する一以上のアンチセンス配列を含む新規なアンチセンス(AS)オリゴに関するものである。特に、本発明は、相補的プライマーを用いたライゲーションによって閉環型を形成するように構築される、共有結合で閉環された多重アンチセンス(CMAS)−オリゴ、および両5’末端で相補的な配列を用いたライゲーションによって構築される多重アンチセンス配列を含む2つのループ及びこれらの2つのループを連結する一つのステムから構成される、リボン型のアンチセンス(RiAS)−オリゴに関するものである。本発明の新規なAS−オリゴはエキソヌクレアーゼ活性に対して非常に安定であり、腫瘍細胞の有意な成長阻害を示すので、本発明の新規な型のAS−オリゴを含む薬剤組成物は癌、免疫疾患、感染性疾患、及び異常な遺伝子発現により引き起こされる他のヒトの疾患の処置有効である。 (57) SUMMARY The present invention relates to a novel antisense (AS) oligo comprising one or more antisense sequences for an mRNA region having less secondary structure. In particular, the invention relates to covalently closed multiple antisense (CMAS) -oligos, which are constructed to form closed forms by ligation with complementary primers, and sequences complementary at both 5 'ends. The present invention relates to a ribbon-type antisense (RiAS) -oligo composed of two loops containing a multiple antisense sequence constructed by ligation using, and one stem connecting these two loops. Because the novel AS-oligos of the present invention are very stable to exonuclease activity and show significant inhibition of tumor cell growth, pharmaceutical compositions comprising the novel types of AS-oligos of the present invention may It is effective in treating immune diseases, infectious diseases, and other human diseases caused by abnormal gene expression.

Description

【発明の詳細な説明】DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION

【0001】 発明の分野 本発明は、ターゲット配列の特異性及びヌクレアーゼ活性に対する安定性を改
善するためのより少ない2次構造を有するmRNA領域に対する一以上のアンチ
センス配列を含む新規なアンチセンスオリゴに関するものである。
FIELD OF THE INVENTION [0001] The present invention relates to novel antisense oligos comprising one or more antisense sequences to an mRNA region with less secondary structure to improve the specificity of the target sequence and stability against nuclease activity. Things.

【0002】 特に、本発明は、c−myb、c−mycまた、k−rasなどの多様な癌原
遺伝子のmRNAに対する多重ターゲットアンチセンス配列(multiple target a
ntisense sequence)を含む共有結合で閉環された多重アンチセンス(CMAS)
(covalently-closed multiple antisense)−オリゴに関するものである。このC
MAS−オリゴは、相補的プライマーを用いたライゲ−ションにより、閉環され
た型を形成するように構築される。
In particular, the present invention relates to multiple target antisense sequences for mRNAs of various proto-oncogenes such as c-myb, c-myc and k-ras.
Covalently closed multiple antisense (CMAS) containing ntisense sequence)
(covalently-closed multiple antisense)-pertains to oligos. This C
MAS-oligos are constructed to form a closed form by ligation with complementary primers.

【0003】 さらに、本発明は、c−myb、c−mycまた、k−rasなどの多様な癌
原遺伝子のmRNAに対する多重ターゲットアンチセンス配列(multiple target
antisense sequence)を含むリボン型のアンチセンス(RiAS)(ribbon-type
antisense)−オリゴに関するものである。このRiAS−オリゴは、双方の主
な末端で相補的配列を用いたライゲ−ションにより、ステム−ループ(stem-loop
)構造を形成するように構築される。
Further, the present invention provides a multiple target antisense sequence (mRNA) for mRNA of various proto-oncogenes such as c-myb, c-myc and k-ras.
ribbon-type antisense (RiAS) including antisense sequence
antisense)-for oligos. The RiAS-oligo was ligated with complementary sequences at both major ends, resulting in a stem-loop.
) Constructed to form the structure.

【0004】 本発明は、異常な遺伝子発現(aberrant gene expression)により引き起こされ
る癌、免疫疾患、感染性疾患、及び他のヒトの疾患の処置を目的とする新規な型
のAS−オリゴを含む薬剤組成物に関するものである。
[0004] The present invention relates to a drug comprising a novel type of AS-oligo for the treatment of cancers, immune diseases, infectious diseases, and other human diseases caused by abnormal gene expression. It relates to a composition.

【0005】 背景 アンチセンスオリゴヌクレオチド(antisense oligonucleotides、以下、「A
S−オリゴ」と称する)は、配列に特異的に遺伝子の発現の抑制することによっ
て遺伝子の機能研究に重要である(Tompson, C.B.,et al., Nature, 314, 363-36
6, 1985)。また、腫瘍の発病と進行に関与する遺伝子の異常な発現を除去する分
子的アンチセンス剤を開発するために、多くの努力が重ねられてきた(Chavany,
C., et al.,Mol. Pharm., 48, 738-746, 1995)。
BACKGROUND [0005] Antisense oligonucleotides (hereinafter referred to as "A")
(Referred to as "S-oligo") is important for studying the function of genes by repressing gene expression in a sequence-specific manner (Tompson, CB, et al., Nature, 314, 363-36).
6, 1985). Much effort has also been made to develop molecular antisense agents that eliminate abnormal expression of genes involved in tumor development and progression (Chavany,
C., et al., Mol. Pharm., 48, 738-746, 1995).

【0006】 合成AS−オリゴは、設計及び合成を容易にするために、さらには疾患を引き
起こす遺伝子に対する潜在的な特異性のために、広く利用されて来た。長さの短
い(13〜30ヌクレオチド)のAS−オリゴが、ワトソン−クリック塩基対合
(Watson-Crick base pairing)を形成することによって相補的配列と結合するよ
うに設計され、これにより、特異性及び親和性が提供される。遺伝子発現の阻害
は、DNA−mRNAデュプレックスの形成後のRNaseH活性またはリボソ
ーム複合体(ribosomal complex)の結合の立体障害を介して達成されると考えら
れる(Dolnick, B.J., Cancer Inv., 9, 185-194,1991)。また、AS−オリゴは
、ゲノムDNAと結合してトリプルヘリックス(triple-helix)の形成または主な
目的であるデュプレックスオリゴ−デコイを用いるまたはゲノムDNAのプロモ
ーター領域と競合させることによって遺伝子発現を阻害する努力もなされてきた
(Young, S.L., et al., Proc. Natl. Acad. Sci., USA, 88, 10023-10026, 1991
)。
[0006] Synthetic AS-oligos have been widely used to facilitate design and synthesis, as well as because of their potential specificity for disease-causing genes. Short-length (13-30 nucleotides) AS-oligos show Watson-Crick base pairing
(Watson-Crick base pairing) and is designed to bind to complementary sequences, thereby providing specificity and affinity. Inhibition of gene expression is thought to be achieved through steric hindrance of RNase H activity or ribosomal complex binding after formation of the DNA-mRNA duplex (Dolnick, BJ, Cancer Inv., 9, 185). -194,1991). The AS-oligo also inhibits gene expression by binding to genomic DNA to form a triple-helix or using a duplex oligo-decoy, which is the primary objective, or by competing with the promoter region of genomic DNA. Efforts have been made
(Young, SL, et al., Proc. Natl. Acad. Sci., USA, 88, 10023-10026, 1991
).

【0007】 AS−オリゴの効能は、いくつかの動物モデル及びヒトの疾患に関する最近の
臨床研究を通じて確認された。ホスホロチオエート(phosphorothioate、以下、
「PS」と称する)AS−オリゴを10日間、静脈注射すると、家鴨の肝臓から
B型肝炎ウイルスDNAが消えた(Offenserger, W.B., et al.,EMBO J., 12, 12
57-1262, 1993)。アンギオテンシノゲンに対するAS−オリゴは、高血圧の近親
交配されたラットに注射すると、血圧を下げるのに有効であることが分かった(T
omita, N., et al., Hypertension, 26, 131-136, 1995)。ヌードマウスの皮下
にタンパク質キナーゼAのRIαサブユニットに対するホスホロチオエートAS
−オリゴを適用すると、腫瘍の成長が停止した(Nesterova, M., et al., Nat. M
ed., 1, 528-533, 1995)。また、様々な疾患を引き起こす異なる遺伝子に対する
AS−オリゴを使用した様々な臨床試験により、卵巣癌及びクローン病で結果が
得られつつある(Roush, W., Science, 276, 1192-1193, 1997)。
The efficacy of AS-oligos has been confirmed through several animal models and recent clinical studies on human disease. Phosphorothioate (hereinafter, phosphorothioate)
Hepatitis B virus DNA disappeared from duck liver after 10 days of intravenous injection of AS-oligo (designated "PS") (Offenserger, WB, et al., EMBO J., 12, 12).
57-1262, 1993). AS-oligos against angiotensinogen were found to be effective in lowering blood pressure when injected into hypertensive inbred rats (T
omita, N., et al., Hypertension, 26, 131-136, 1995). Phosphorothioate AS for the RIα subunit of protein kinase A subcutaneously in nude mice
-Application of oligos arrested tumor growth (Nesterova, M., et al., Nat.
ed., 1, 528-533, 1995). Also, various clinical trials using AS-oligos for different genes that cause various diseases are producing results in ovarian cancer and Crohn's disease (Roush, W., Science, 276, 1192-1193, 1997). .

【0008】 しかしながら、多くの研究者からの結果が必ずしも明瞭ではなく、矛盾するこ
ともあるため、遺伝子に対するその配列の特異性及びゆえに疾患に関する可能性
という利点を有するAS−オリゴの高い期待は、しばしば失望に終わった。AS
−オリゴの著しい問題点は、ヌクレアーゼに対する不安定性及び効率の悪い細胞
吸収であった。
However, because the results from many investigators are not always clear and sometimes conflicting, the high expectation of AS-oligos that has the advantage of its sequence specificity for genes and hence the potential for disease is: Often disappointed. AS
-A significant problem with oligos was instability to nucleases and inefficient cell uptake.

【0009】 AS−オリゴの安定性は、ヌクレアーゼに対する安定性を増加させるために使
用されるPS−及びメチルホスホネート(methylphosphonate、以下、「MP」
と称する)−オリゴ等の修飾されたオリゴを使用することによりある程度改善さ
れた。しかしながら、修飾されたヌクレオチドは、それぞれ、配列特異性の欠如
やRNaseHに対する非感受性という問題がそれ自体にある。さらに、加水分
解されたヌクレオチドの再環化時に望ましくない突然変異を導入される懸念が長
く存在する。
[0009] The stability of AS-oligo is determined by the fact that PS- and methylphosphonate (hereinafter "MP") are used to increase the stability to nucleases.
To some extent by using modified oligos such as oligos. However, each of the modified nucleotides has its own problems of lack of sequence specificity and insensitivity to RNaseH. In addition, there has long been a concern that unwanted mutations may be introduced upon recyclization of the hydrolyzed nucleotide.

【0010】 AS−オリゴは、有効である相補的なターゲット配列に結合する。mRNAの
全ての配列がAS−オリゴに対して同一な接近性をみせるわけではない。AS−
オリゴの等しくない結合は、少なくても部分的に、ターゲットmRNAの2次お
よび/または3次構造によって説明されうる(Gryaznov, S.,et al., Nucleic Ac
ids Res., 24, 1508-1514, 1996)。したがって、より少ない2次構造を持つ領域
がAS−オリゴでは容易に標的にされると考えられる。
[0010] AS-oligos bind to complementary target sequences that are effective. Not all sequences of the mRNA show the same accessibility to the AS-oligo. AS-
The unequal binding of oligos can be explained, at least in part, by the secondary and / or tertiary structure of the target mRNA (Gryaznov, S., et al., Nucleic Ac
ids Res., 24, 1508-1514, 1996). Thus, regions with less secondary structure are likely to be easily targeted by AS-oligos.

【0011】 AS−オリゴの安定性を増加させるために、本発明者らは、ステム−ループ構
造または共有結合で閉環された多重アンチセンス配列を有するAS−オリゴを構
築するために、mRNAの2次構造を予測するコンピュターシミュレーションを
使用してより良いターゲット部位を探し出す合理的な方法を考案した。
[0011] To increase the stability of AS-oligos, we needed to construct an AS-oligo with multiple antisense sequences that had a stem-loop structure or covalently closed circles. A rational way to find better target sites using computer simulation to predict the next structure was devised.

【0012】 c−myb遺伝子に対するAS−オリゴは、腫瘍細胞の成長を阻害するのに使
用可能である。
[0012] AS-oligos against the c-myb gene can be used to inhibit tumor cell growth.

【0013】 c−myb癌原遺伝子によりコード化される、Mybタンパク質は、主に、核
内に位置し、細胞周期間のG1/S期の移行に転写調節因子として機能する。癌
原遺伝子c−mybは、造血細胞の増殖と分化に重要な役割を果たす。造血細胞
は、c−mybの分化発現(differential expression)を示し、分化の最後の段
階では、ほとんど発現を示さない(Melani, C., et al., Cancer Res., 51, 2897
-2901, 1991)。白血病細胞では、c−mybが過剰発現(overexpression)するこ
とがしばしば分かった。
[0013] The Myb protein, encoded by the c-myb proto-oncogene, is located primarily in the nucleus and functions as a transcriptional regulator in the G1 / S phase transition between cell cycles. The proto-oncogene c-myb plays an important role in the proliferation and differentiation of hematopoietic cells. Hematopoietic cells show differential expression of c-myb and show little expression at the last stage of differentiation (Melani, C., et al., Cancer Res., 51, 2897).
-2901, 1991). In leukemia cells, c-myb was often found to be overexpressed.

【0014】 AS−オリゴによるc−mybの発現の遮断は、前骨髄癌(promyelocytic can
cer)細胞系HL−60及び慢性骨髄性白血病(chronic myelogenous leukemia)細
胞系K562の成長を抑制することが報告される(Kimura, S., et al., Cancer
Res., 55, 1379-1384, 1995)。しかしながら、上記実験で使用されたc−myb
AS−オリゴは、部分的な効果があることが示される。上記実験で使用された
c−myb AS−オリゴは、ホスホジエステル(以下、「PO」と称する)−
オリゴまたはPSキャップド−オリゴ(PS capped-oligo)である(Anfossi, G., e
t al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 86, 3379-3383, 1989)。これらのオリゴ
分子、特にPO−オリゴは、安定でなく、部分的なアンチセンス効果を説明する
可能性がある。
[0014] Blockage of c-myb expression by AS-oligos is associated with promyelocytic cancer.
cer) cell line HL-60 and chronic myelogenous leukemia cell line K562 are reported to inhibit growth (Kimura, S., et al., Cancer
Res., 55, 1379-1384, 1995). However, the c-myb used in the above experiment
AS-oligos are shown to have a partial effect. The c-myb AS-oligo used in the above experiment is a phosphodiester (hereinafter referred to as “PO”)-
Oligo or PS capped-oligo (Anfossi, G., e
Natl. Acad. Sci. USA, 86, 3379-3383, 1989). These oligo molecules, especially PO-oligos, are not stable and may account for a partial antisense effect.

【0015】 合理的なターゲット部位探索により選択された、改善された安定性を併せ持つ
AS−オリゴは、c−myb mRNAを完全に除去することに使用され、これ
により白血病細胞の成長をより良好に抑制することができる。近年、ヒトの悪性
疾患(malignancies)に対するAS−オリゴストラテジーを基礎とする分子治療(m
olecular therapeutics)の開発に非常な興味が集まっている。したがって、白血
病細胞の成長を完全に遮断する改善されたc−myb アンチセンス分子を発見
することが望まれている。
AS-oligos with improved stability, selected by rational target site search, have been used to completely remove c-myb mRNA, thereby better improving leukemic cell growth. Can be suppressed. Recently, molecular therapy based on AS-oligo strategy (malignancies) for human malignancies (malignancies)
There is great interest in the development of molecular therapeutics). Therefore, it is desirable to find improved c-myb antisense molecules that completely block leukemic cell growth.

【0016】 したがって、より良好な安定性及びアンチセンス効果を有する新規な構造を有
するAS−オリゴを開発するために、本発明者らは、好ましい実施態様において
2次構造分析からc−myb mRNAの8つの部位を選択し、選択されたc−
mybのアンチセンス配列を組み合わせて新規な大きなアンチセンス分子、即ち
、共有結合で閉環された多重アンチセンス(covalently-closed multiple antis
ense、以下、「CMAS」と称する)−オリゴならびにループ及びステム構造を
有するリボン型のアンチセンス(ribbon-type antisense、以下、「RiAS」
と称する)−オリゴを構築した。ゆえに、本発明者らは、これらの新規なAS−
オリゴがヌクレアーゼに対して安定であり、遺伝子発現抑制する有意な特異性を
示すことを示した。
Thus, in order to develop AS-oligos with novel structures with better stability and antisense effects, we in a preferred embodiment analyzed the c-myb mRNA from secondary structure analysis in a preferred embodiment. Eight sites were selected and the selected c-
Myb antisense sequences are combined to create new large antisense molecules, namely covalently-closed multiple antisense molecules.
ense, hereinafter referred to as “CMAS” —Ribbon-type antisense having oligo and loop and stem structures (hereinafter “RiAS”)
-Designed oligos. Therefore, the present inventors have developed these novel AS-
The oligos were shown to be stable to nucleases and show significant specificity to suppress gene expression.

【0017】 発明の要約 本発明の目的は、ターゲット配列に対する特異性及びヌクレアーゼ活性に対す
る安定性を改善させるためにより少ない2次構造を有するmRNA領域について
一以上のアンチセンス配列を含む新規なAS−オリゴを提供することである。
SUMMARY OF THE INVENTION It is an object of the present invention to provide a novel AS-oligo comprising one or more antisense sequences for an mRNA region having less secondary structure to improve specificity for the target sequence and stability against nuclease activity. It is to provide.

【0018】 本発明によれば、前記目的及び利点が容易に得られる。According to the present invention, the above objects and advantages are easily obtained.

【0019】 本発明のこのような概念においては、本発明は、より少ない2次構造を有する
c−myb、c−myc、またはk−rasのmRNA領域から選択されたアン
チセンス配列を提供する。
In this aspect of the invention, the invention provides an antisense sequence selected from a c-myb, c-myc, or k-ras mRNA region having less secondary structure.

【0020】 本発明は、c−myb mRNAに対する多重アンチセンス配列を含む共有結
合で閉環された多重アンチセンス(CMAS)−オリゴを提供する。このCMA
S−オリゴは、相補的プライマーを用いたライゲ−ションにより閉環された型を
形成するように構築される。
The present invention provides covalently closed multiple antisense (CMAS) -oligos comprising multiple antisense sequences to c-myb mRNA. This CMA
The S-oligo is constructed to form a closed form by ligation with complementary primers.

【0021】 本発明はまた、c−myb mRNAに対する多重アンチセンス配列を含むリ
ボン型のアンチセンス(RiAS)−オリゴを提供する。このRiAS−オリゴ
は、多重アンチセンス配列を含む2つのループ及び双方の5’−末端の相補的配
列を用いたライゲ−ションによって構築される2つのループを結ぶステムから構
成される。加えて、本発明は、c−myc mRNAまたはk−ras mRN
Aに対する多重アンチセンス配列を含むRiAS−オリゴを提供する。
The present invention also provides a ribbon-type antisense (RiAS) -oligo comprising multiple antisense sequences to c-myb mRNA. The RiAS-oligo is composed of two loops containing multiple antisense sequences and a stem linking the two loops constructed by ligation using complementary sequences at both 5'-ends. In addition, the present invention relates to c-myc mRNA or k-ras mRN.
A RiAS-oligo comprising multiple antisense sequences to A is provided.

【0022】 本発明はさらに、癌、免疫疾患、感染性疾患、及び異常な遺伝子発現により引
き起こされる他のヒトの疾患の処置を目的とする新規な型のAS−オリゴを含む
薬剤組成物を提供する。
The present invention further provides a pharmaceutical composition comprising a novel type of AS-oligo for the treatment of cancer, immune diseases, infectious diseases, and other human diseases caused by abnormal gene expression. I do.

【0023】 本発明のさらなる目的及び利点は以下に示されるであろう。[0023] Further objects and advantages of the present invention will be set forth below.

【0024】 図面の簡単な説明 図1は、c−myb CMAS−オリゴの構築に関するスキームを示すもので
ある。
BRIEF DESCRIPTION OF THE DRAWINGS FIG. 1 shows a scheme for the construction of c-myb CMAS-oligo.

【0025】 図2は、CMAS−オリゴの電気泳動の移動パタ−ンを示すものである。FIG. 2 shows the migration pattern of electrophoresis of CMAS-oligo.

【0026】 Aは、5%メタファー(Metaphor)アガロ−スゲルで分析されたオリゴであり、
この際、レーン1;サイズマーカー、レーン2;14merのライゲ−ションプ
ライマー、レーン3;リニアな60merのオリゴ、及びレーン4;CMAS−
オリゴ。
A is an oligo analyzed on a 5% Metaphor agarose gel,
At this time, lane 1; size marker, lane 2; 14-mer ligation primer, lane 3; linear 60-mer oligo, and lane 4; CMAS-
Oligo.

【0027】 Bは、変性ポリアクリルアミドゲルにおけるリニアな及び共有結合で閉環され
たオリゴの安定性を示すものであり、この際、 レーン1及び3;エキソヌクレアーゼIIIによる処理なし、ならびにレーン2
及び4;エキソヌクレアーゼIIIによる処理。
B shows the stability of linear and covalently closed oligos in denaturing polyacrylamide gels, lanes 1 and 3; no treatment with exonuclease III, and lane 2
And 4; treatment with exonuclease III.

【0028】 図3は、c−myb RiAS−オリゴの構築に関するスキームを示すもので
ある。
FIG. 3 shows a scheme for the construction of c-myb RiAS-oligo.

【0029】 図4は、RiAS−オリゴの電気泳動の移動パタ−ンを示すものである。FIG. 4 shows a migration pattern of electrophoresis of RiAS-oligo.

【0030】 Aは、15%変性アガロ−スゲルで分析されたオリゴであり、この際、 レーン1;58merのMIJ−78分子、及びレーン2;116merのRi
AS−オリゴ。
A is an oligo analyzed on a 15% denaturing agarose gel, where lane 1 is a 58-mer MIJ-78 molecule and lane 2 is a 116-mer Ri
AS-oligo.

【0031】 Bは、エキソヌクレアーゼIIIによる処理時のMIJ−78及びRiAS−
オリゴの安定性試験を示すものであり、この際、 レーン1及び3;エキソヌクレアーゼIIIによる処理なし、ならびにレーン2
及び4;エキソヌクレアーゼIIIによる処理。
B shows MIJ-78 and RiAS- when treated with exonuclease III
FIG. 3 shows the stability test of oligos, in which lanes 1 and 3; no treatment with exonuclease III, and lane 2
And 4; treatment with exonuclease III.

【0032】 図5は、血清の存在下でのリニアな及びCMAS−オリゴの分解パターンを示
すものである。
FIG. 5 shows the degradation pattern of linear and CMAS-oligos in the presence of serum.

【0033】 Aは、リニアなAS−オリゴの安定性試験を示すものであり、この際、 レーン1;血清未処理(ネガティブコントロール)、レーン2;50%生血清(r
aw serum)による処理、レーン3;FBS処理、及びレーン4;CSで、それぞ
れ24時間。
A shows the stability test of the linear AS-oligo, where lane 1; serum untreated (negative control), lane 2; 50% live serum (r
aw serum), lane 3; FBS treatment, and lane 4; CS, 24 hours each.

【0034】 Bは、CMAS−オリゴの安定性試験を示すものであり、この際、 レーン1;血清未処理(ネガティブコントロール)、レーン2;50%生血清(r
aw serum)による処理、レーン3;FBS処理、及びレーン4;CSで、それぞ
れ24時間。
B shows the stability test of CMAS-oligo, in which lane 1; serum untreated (negative control), lane 2; 50% live serum (r
aw serum), lane 3; FBS treatment, and lane 4; CS, 24 hours each.

【0035】 図6は、血清の存在下でのリニアな及びRiAS−オリゴの分解パターンを示
すものである。
FIG. 6 shows the degradation patterns of linear and RiAS-oligos in the presence of serum.

【0036】 Aは、MIJ−78分子の安定性試験を示すものであり、この際、 レーン1;血清未処理(ネガティブコントロール)、レーン2;50%生血清(r
aw serum)による処理、レーン3;FBS処理、及びレーン4;CSで、それぞ
れ24時間。
A shows the stability test of the MIJ-78 molecule, in which lane 1; serum untreated (negative control), lane 2; 50% live serum (r
aw serum), lane 3; FBS treatment, and lane 4; CS, 24 hours each.

【0037】 Bは、RiAS−オリゴの安定性試験を示すものであり、この際、 レーン1;血清未処理(ネガティブコントロール)、レーン2;50%生血清(r
aw serum)による処理、レーン3;FBS処理、及びレーン4;CSで、それぞ
れ24時間。
B shows the stability test of RiAS-oligo, in which lane 1; serum untreated (negative control), lane 2; 50% live serum (r
aw serum), lane 3; FBS treatment, and lane 4; CS, 24 hours each.

【0038】 図7は、HL−60細胞におけるc−myb発現に関するc−myb CMA
S−オリゴの効果を示すものである。
FIG. 7 shows c-myb CMA for c-myb expression in HL-60 cells.
It shows the effect of S-oligo.

【0039】 Aは、全RNA及び2つのc−mybプライマーを使用して行なったRT−P
CRを示すものであり、この際、 レーン1;60merのCMAS−オリゴ0.3μg+リポフェクチン(lipofec
tin)1μg、レーン2;60merのCMAS−オリゴ1μg+リポフェクチン
1μg、レーン3;スクランブルされた(scrambled)AS−オリゴ1μg+リポ
フェクチン1μg。
A shows RT-P performed using total RNA and two c-myb primers.
This shows CR, in which lane 1; 0.3 μg of 60-mer CMAS-oligo + lipofectin (lipofec
1 μg of tin), lane 2; 1 μg of 60-mer CMAS-oligo + 1 μg of lipofectin, lane 3: 1 μg of scrambled AS-oligo + 1 μg of lipofectin.

【0040】 Bは、全RNA及び2つのc−mybプライマーを使用して行なったRT−P
CRを示すものであり、この際、 上段;c−myb mRNAのハイブリッド形成されたRT−PCRバンド、及
び下段;β−アクチンmRNAのハイブリッド形成されたRT−PCRバンド。
B: RT-P performed using total RNA and two c-myb primers
5 shows CR, where the upper row: hybridized RT-PCR band of c-myb mRNA, and the lower row; hybridized RT-PCR band of β-actin mRNA.

【0041】 図8は、HL−60細胞におけるc−myb mRNAの発現に関するc−m
yb RiAS−オリゴの効果を示すものである。
FIG. 8 shows the cm for expression of c-myb mRNA in HL-60 cells.
It shows the effect of yb RiAS-oligo.

【0042】 Aは、2つのc−mybプライマーを用いて全RNAで行なわれるRT−PC
Rを示すものであり、この際、 レーン1;RiAS−オリゴ 0.1μg+リポフェクチン(lipofectin) 0
.8μg、レーン2;RiAS−オリゴ 0.2μg+リポフェクチン 0.8
μg、及びレーン3;SC−オリゴ 0.2μg+リポフェクチン 0.8μg
A shows RT-PC performed on total RNA using two c-myb primers.
R, where lane 1; RiAS-oligo 0.1 μg + lipofectin 0
. 8 μg, lane 2; RiAS-oligo 0.2 μg + Lipofectin 0.8
μg and lane 3: SC-oligo 0.2 μg + lipofectin 0.8 μg
.

【0043】 Bは、全RNA及び2つのc−mybプライマーを用いて行なわれるRT−P
CRを示すものであり、この際、 上段;c−myb mRNAのハイブリッド形成されたRT−PCRバンド、及
び下段;β−アクチンmRNAのハイブリッド形成されたRT−PCRバンド。
B: RT-P performed using total RNA and two c-myb primers
5 shows CR, where the upper row: hybridized RT-PCR band of c-myb mRNA, and the lower row; hybridized RT-PCR band of β-actin mRNA.

【0044】 図9は、HL−60細胞の増殖に関する60mer CMASまたはリニアな
AS−オリゴの効果を示すものであり、この際、 −◆−;CMAS−オリゴ(1)、−■−;CMAS−オリゴ(2)、−●−;
AS−オリゴ、−▲−;S−MIJ−7、●;リポフェクチン単独、〇;非処理
コントロール、及び(1)または(2);AS−オリゴの処理回数。
FIG. 9 shows the effect of 60-mer CMAS or linear AS-oligo on the proliferation of HL-60 cells, where-◆-; CMAS-oligo (1),-■-; CMAS- Oligo (2),-●-;
AS-oligo,-▲-; S-MIJ-7, ●: lipofectin alone, Δ; untreated control, and (1) or (2); number of AS-oligo treatments.

【0045】 図10は、HL−60細胞の増殖に関するc−myb RiAS−オリゴの効
果を示すものである。
FIG. 10 shows the effect of c-myb RiAS-oligo on proliferation of HL-60 cells.

【0046】 Aは、c−myb RiAS−オリゴのMTTアッセイを示すものである。A shows the MTT assay for c-myb RiAS-oligo.

【0047】 Bは、c−myb RiAS−オリゴの[3H]−チミジンの取込みを示すも
のである。
B shows the incorporation of [ 3 H] -thymidine in the c-myb RiAS-oligo.

【0048】 図11は、c−myb RiAS−オリゴによるHL−60細胞の成長の阻害
に関する顕微鏡写真を示すものである。
FIG. 11 shows a photomicrograph of the inhibition of HL-60 cell growth by c-myb RiAS-oligo.

【0049】 Aは、c−myb RiAS−オリゴであり、Bは、SC−オリゴであり、及
びCは、リポフェクチン単独である。
A is a c-myb RiAS-oligo, B is an SC-oligo, and C is lipofectin alone.

【0050】 図12は、c−myb RiAS−オリゴによるHT−29細胞の成長の阻害
に関する顕微鏡写真を示すものである。
FIG. 12 shows photomicrographs of the inhibition of HT-29 cell growth by c-myb RiAS-oligo.

【0051】 Aは、c−myb RiAS−オリゴであり、Bは、SC−オリゴであり、及
びCは、リポフェクチン単独である。
A is a c-myb RiAS-oligo, B is an SC-oligo, and C is lipofectin alone.

【0052】 図13は、c−myc RiAS−オリゴによるHT−29細胞の成長の阻害
に関する顕微鏡写真を示すものである。
FIG. 13 shows photomicrographs of the inhibition of HT-29 cell growth by c-myc RiAS-oligo.

【0053】 Aは、c−myc RiAS−オリゴであり、Bは、SC−オリゴであり、及
びCは、リポフェクチン単独である。
A is a c-myc RiAS-oligo, B is an SC-oligo, and C is lipofectin alone.

【0054】 図14は、k−ras RiAS−オリゴによるHT−29細胞の成長の阻害
に関する顕微鏡写真を示すものである。
FIG. 14 shows a micrograph of the inhibition of HT-29 cell growth by k-ras RiAS-oligo.

【0055】 Aは、k−ras RiAS−オリゴであり、Bは、SC−オリゴであり、及
びCは、リポフェクチン単独である。
A is a k-ras RiAS-oligo, B is an SC-oligo, and C is lipofectin alone.

【0056】 好ましい実施態様の詳細な説明 以下、本発明を詳細に説明する。DETAILED DESCRIPTION OF THE PREFERRED EMBODIMENTS Hereinafter, the present invention will be described in detail.

【0057】 一態様によると、本発明は、より少ない2次構造を有する領域に対する一以上
のアンチセンス配列を含む新規なAS−オリゴを提供するものである。
According to one aspect, the present invention provides novel AS-oligos comprising one or more antisense sequences for regions having less secondary structure.

【0058】 特に、好ましい実施態様においては、アンチセンスオリゴのターゲット部位と
して、癌原遺伝子の一つである、c−myb mRNAの8つの異なる領域が選
択された。AS−オリゴに関する合理的なターゲット部位の探索を用いて、天然
の2次構造を予想すするチャンスを改良する。上記8つのアンチセンス配列は、
選択されたターゲット部位の配列と相補的である。AS−オリゴに関する8つの
選択されたターゲット部位のうち、最小限の分子内2次構造を形成する(表1を
参照)ため、4つの部位(MIJ−1、MIJ−2、MIJ−3、及びMIJ−
4)を、CMAS分子を形成する際に最終的に組み合わせて選択し、3つの部位
(MIJ−3、MIJ−4、及びMIJ−17)を組み合わせてRiAS分子を
形成する。
In a particularly preferred embodiment, eight different regions of the c-myb mRNA, one of the proto-oncogenes, were selected as target sites for the antisense oligo. The rational target site search for AS-oligos is used to improve the chance of predicting the native secondary structure. The eight antisense sequences are:
Complementary to the sequence of the selected target site. Of the eight selected target sites for the AS-oligo, four sites (MIJ-1, MIJ-2, MIJ-3, and 4) to form a minimal intramolecular secondary structure (see Table 1) MIJ-
4) is finally selected in combination when forming a CMAS molecule, and the three sites (MIJ-3, MIJ-4, and MIJ-17) are combined to form a RiAS molecule.

【0059】 ホスホジエステル骨格(phosphodiester backbone)を有するAS−オリゴは、
良好なアンチセンスの適用に必須である安定性が欠如していた。PS−オリゴま
たはMP−オリゴ等の、修飾されたオリゴは、改善された安定性を発揮したが、
安定性の増加は部分的でしかなく、DNA複製または修復中の加水分解された修
飾ヌクレオチドの潜在的な危険な誤取込み(misincorporation)を内包していた。
カチオン性リポソーム(cationic liposome)と複合するステム−ループオリゴも
また部分的な安定性の増加を示すことは既に報告された。しかしながら、AS−
オリゴに関しては、安定性が未だ重要な関心がある。このため、本発明者らは、
より良好な安定性を有する改善されたAS−オリゴの開発を試みた。
An AS-oligo having a phosphodiester backbone is
Lack of stability which is essential for good antisense application. Modified oligos, such as PS-oligos or MP-oligos, exhibited improved stability,
The increase in stability was only partial and involved a potential dangerous misincorporation of hydrolyzed modified nucleotides during DNA replication or repair.
It has been previously reported that stem-loop oligos complexing with cationic liposome also show a partial increase in stability. However, AS-
For oligos, stability is still an important concern. For this reason, the present inventors
An attempt was made to develop improved AS-oligos with better stability.

【0060】 したがって、本発明は、共有結合で閉環された多重アンチセンス(covalently-
closed multiple antisense)(CMAS)−オリゴを提供するものである。
Thus, the present invention provides covalently closed multiple antisense (covalently-
closed multiple antisense (CMAS) -provides an oligo.

【0061】 特に、AS−オリゴの細胞内の2次構造は、AS−オリゴ及びターゲットmR
NA間にデュプレックスの形成を伴わずに構築された。好ましい実施態様におい
ては、ループにおいて配列番号1、2、3及び4によって記載される4つのアン
チセンス配列(MIJ−1、MIJ−2、MIJ−3、及びMIJ−4)を含む
CMAS(共有結合で閉環された多重アンチセンス)−オリゴの形態を称するこ
れらのAS−オリゴが、CMAS−オリゴの長さを増すためにタンデムに置かれ
る(図1を参照)。CMAS−オリゴは、15%変性PAGEゲル上でリニアな
前駆体に比して約10%遅い電気泳動の移動パターン(electrophoretic mobilit
y pattern)を示す(図2のAを参照)。CMAS−オリゴは、予想されるとおり
、エキソヌクレアーゼIIIに対して耐性を有し、変性PAGEゲル上で多重の
バンドで示され、この際、モノマー(60mer)が最も豊富であり、ダイマー
(120mer)及びトリマー(180mer)がある。CMAS−オリゴとは
反対に、リニアなオリゴは、エキソヌクレアーゼIIIで2時間インキュベーシ
ョンした後完全に分解する(図2のBを参照)。
In particular, the intracellular secondary structure of the AS-oligo was determined by the AS-oligo and target mR
Built without duplex formation between NAs. In a preferred embodiment, a CMAS (covalently linked) comprising four antisense sequences (MIJ-1, MIJ-2, MIJ-3, and MIJ-4) described by SEQ ID NOs: 1, 2, 3, and 4 in a loop These AS-oligos, referred to as multiple antisense) -oligo forms closed in tandem, are placed in tandem to increase the length of the CMAS-oligo (see FIG. 1). The CMAS-oligo is about 10% slower than the linear precursor on a 15% denaturing PAGE gel,
y pattern) (see FIG. 2A). The CMAS-oligo is, as expected, resistant to exonuclease III and shows multiple bands on denaturing PAGE gels, where the monomer (60 mer) is the most abundant and the dimer (120 mer) And a trimmer (180mer). In contrast to CMAS-oligos, linear oligos are completely degraded after 2 hours incubation with exonuclease III (see FIG. 2B).

【0062】 本発明はまた、リボン型のアンチセンス(RiAS)−オリゴを提供するもの
である。
The present invention also provides a ribbon type antisense (RiAS) -oligo.

【0063】 CMAS−オリゴは、非常に安定しているが、後に除去されなければならない
分子内ライゲ−ションのためのプライマーを必要とする。このため、ライゲ−シ
ョンプライマーの使用を避け、AS−オリゴの相同的な集団を得るために、本発
明者らは、2つのAS−オリゴを酵素的に結合させることによって、RiAS−
オリゴと称するリボン形の閉環分子を形成する。
[0063] CMAS-oligos are very stable, but require primers for intramolecular ligation that must be subsequently removed. Thus, in order to avoid the use of ligation primers and to obtain a homogenous population of AS-oligos, we have established that the RiAS-
A ribbon-shaped closed molecule called an oligo is formed.

【0064】 RiAS−オリゴ(116mer)は、2つのループと2つのループを連結す
る一つのステムから構成される(図3を参照)。好ましい実施態様においては、
ループにおいて配列番号3、4及び5によって記載される3つのアンチセンス配
列(MIJ−3、MIJ−4及びMIJ−17)が、CMAS−オリゴの長さを
増すためにタンデムに置かれる。その結果、3つの異なるアンチセンス配列の2
コピー(全6つのアンチセンス配列)がRiAS−オリゴにある。RiAS−オ
リゴにおけるこのような伸長した長さのループは、ターゲットmRNA配列とデ
ュプレックスを形成することによって生じるねじり応力をやわらげる。RiAS
−オリゴは、変性PAGEゲル上でそのリニアな前駆体(MIJ−78)より顕
著に遅いことが分かる(図4のAを参照)。RiAS−オリゴは、予想どおり、
エキソヌクレアーゼIIIに対して耐性を有し、PAGEゲル上で主要なバンド
(116mer)に示される。RiAS−オリゴとは反対に、MIJ−78は、
エキソヌクレアーゼIIIで2時間インキュベーションした後完全に分解する(
図4のBを参照)。
The RiAS-oligo (116mer) is composed of two loops and one stem connecting the two loops (see FIG. 3). In a preferred embodiment,
Three antisense sequences (MIJ-3, MIJ-4 and MIJ-17) described by SEQ ID NOs: 3, 4 and 5 in the loop are placed in tandem to increase the length of the CMAS-oligo. As a result, two of the three different antisense sequences
Copies (all six antisense sequences) are on the RiAS-oligo. Such extended length loops in the RiAS-oligo relieve the torsional stress caused by forming a duplex with the target mRNA sequence. RiAS
-The oligo is found to be significantly slower than its linear precursor (MIJ-78) on denaturing PAGE gels (see Fig. 4A). RiAS-oligo, as expected,
It is resistant to exonuclease III and is shown on the PAGE gel as a major band (116 mer). Contrary to RiAS-oligo, MIJ-78 is
Completely degraded after 2 hours incubation with exonuclease III (
(See FIG. 4B).

【0065】 本発明のCMAS−オリゴ及びRiAS−オリゴのヌクレアーゼ活性に対する
促進された安定性を示すために、CMAS−オリゴ及びRiAS−オリゴをヌク
レアーゼ活性を維持するために熱で不活性化しない血清と共にインキュベートし
た。
In order to demonstrate the enhanced stability of the CMAS-oligos and RiAS-oligos of the invention to nuclease activity, the CMAS-oligos and RiAS-oligos with heat-inactivated serum to maintain nuclease activity. Incubated.

【0066】 その結果、リニアな60merのオリゴ(CMAS−オリゴの前駆体、図5の
Aを参照)及びリニアな59merのオリゴ(RiAS−オリゴの前駆体、図6
のAを参照)は、血清の存在下で24時間インキュベーション後に完全に消化さ
れる。しかしながら、CMAS−オリゴ及びRiAS−オリゴは、生のヒト血清
、FBS、及びウシ血清と共に24時間インキュベーションした後でもほとんど
そのまま残ることから、ヌクレアーゼ活性に対するリニアなものに比して有意に
改善された安定性を発揮する(図5のB及び図6のBを参照)。
As a result, a linear 60-mer oligo (precursor of CMAS-oligo, see FIG. 5A) and a linear 59-mer oligo (precursor of RiAS-oligo, FIG. 6)
A) is completely digested after 24 hours incubation in the presence of serum. However, CMAS-oligos and RiAS-oligos remain almost intact after 24 hours of incubation with raw human serum, FBS, and bovine serum, thus significantly improving stability compared to the linear one for nuclease activity. (See FIG. 5B and FIG. 6B).

【0067】 加えて、CMAS−オリゴが配列に特異的にターゲットmRNAを良好に排除
するよう機能することが示される。
In addition, it is shown that CMAS-oligos function to better eliminate sequence-specific target mRNAs.

【0068】 特に、CMAS−オリゴは、リポフェクチンと組み合わせて細胞内にデリバー
された。リポフェクチンは、細胞に毒性が少なく、再現性ある結果を出すことが
分かっているので使用される。MIJ−5、即ち、ヒトc−mybに対するCM
AS−オリゴは、コントロールのSC−オリゴに比べてc−myb mRNAの
95%以上を減すことができる。一方、MIJ−5のリニアなカウンターパート
である、MIJ−5Aは、c−myb mRNAの約37%を減少させる(図7
のAを参照)。これらの結果は、本発明のCMAS−オリゴが、たとえより少な
い量で使用されても、ターゲットmRNAを切除するのにリニアなものより優れ
ていることを示す。
In particular, CMAS-oligo was delivered intracellularly in combination with Lipofectin. Lipofectin is used because it has been shown to be less toxic to cells and produce reproducible results. MIJ-5, a CM for human c-myb
AS-oligo can reduce 95% or more of c-myb mRNA compared to control SC-oligo. On the other hand, MIJ-5A, a linear counterpart of MIJ-5, reduces about 37% of c-myb mRNA (FIG. 7).
A). These results indicate that the CMAS-oligos of the invention are superior to the linear ones for excision of target mRNA, even when used in lower amounts.

【0069】 ターゲットmRNAを除去するというRiAS−オリゴの機能は、CMAS−
オリゴにおけるのと同様の方法によって示された。
The function of RiAS-oligo to remove target mRNA is that CMAS-
Indicated by a similar method as in the oligo.

【0070】 HL−60細胞を、RiAS−オリゴ、スクランブルされた(scrambled)(S
C)−オリゴ、さらにはリポフェクチン単独で試験した。RiAS−オリゴを、
リポフェクチンと複合体を形成させた後、細胞中にデリバーする。その結果、R
iAS−オリゴは、c−myb mRNAを完全に切除することができる。これ
に対して、SC−オリゴは、リポフェクチン単独で処理したものに比べて約30
%のc−myb mRNAの若干の減少を示す(図8のAを参照)。これらの結
果は、本発明のRiAS−オリゴは、たとえ少量で使用されてもターゲットmR
NAを切除するのに優れていることを示す。
The HL-60 cells were transformed with RiAS-oligo, scrambled (S
C) -oligos and also lipofectin alone were tested. RiAS-oligo,
After forming a complex with lipofectin, it is delivered into cells. As a result, R
iAS-oligos can completely excise c-myb mRNA. In contrast, SC-oligo was about 30 times less than that treated with lipofectin alone.
% Of c-myb mRNA (see FIG. 8A). These results indicate that the RiAS-oligos of the present invention show that the target mR
It shows that it is excellent for excision of NA.

【0071】 本発明者らはまた、PCR産物のサザンブロット法によってCMAS−オリゴ
及びRiAS−オリゴのアンチセンス効果を調べた。
The present inventors also examined the antisense effect of CMAS-oligo and RiAS-oligo by Southern blot of PCR products.

【0072】 CMAS−オリゴの場合には、c−mybのメッセージがRT−PCRで増幅
されると、90%超のメッセージがMIJ−5の処理により減少することがわか
る(図7のBを参照)。
In the case of CMAS-oligo, it can be seen that when the c-myb message is amplified by RT-PCR, more than 90% of the message is reduced by the MIJ-5 treatment (see FIG. 7B). ).

【0073】 RiAS−オリゴでは、RT−PCRにより増幅されたc−mybのメッセー
ジが標識された内部ハイブリダイゼーションオリゴ(30mer)と共に検出さ
れる(図8のBを参照)。上記結果から、増幅されたメッセージが真にc−my
b由来であることを確認される。
In the RiAS-oligo, the c-myb message amplified by RT-PCR is detected together with a labeled internal hybridization oligo (30mer) (see FIG. 8B). From the above results, the amplified message is truly c-my
b.

【0074】 本発明はまた、癌、免疫疾患、感染性疾患、及び異常な遺伝子発現により引き
起こされる他のヒトの疾患の処置を目的とする新規な型のAS−オリゴを含む薬
剤組成物を提供するものである。
The present invention also provides a pharmaceutical composition comprising a novel type of AS-oligo for the treatment of cancer, immune diseases, infectious diseases, and other human diseases caused by abnormal gene expression. Is what you do.

【0075】 c−myb CMAS−オリゴまたはc−myb RiAS−オリゴが白血病
細胞の成長を阻害することが示される。特に、白血病細胞に対するc−myb
CMAS−オリゴ及びc−myb RiAS−オリゴの成長阻害を、3種の方法
、MTTアッセイ、[3H]チミジンの取込みまたはソフトアガロースでのコロ
ニーの形成によって測定した。
It is shown that c-myb CMAS-oligo or c-myb RiAS-oligo inhibits leukemic cell growth. In particular, c-myb against leukemia cells
Growth inhibition of CMAS-oligo and c-myb RiAS-oligo was measured by three methods, MTT assay, [ 3 H] thymidine incorporation or colony formation on soft agarose.

【0076】 MTTアッセイの結果、細胞数が、MIJ−5、即ち、ヒトのc−mybに対
するCMAS−オリゴの量を増して処理すると次第に減少する。細胞の成長の阻
害は、細胞をMIJ−5で2回処理すると、より顕著である。HL−60細胞の
80%超の成長の阻害が低い濃度でも観察される(図9を参照)。一方、リニア
な60merのAS−オリゴ、即ち、MIJ−5A、及びリニアなセンスオリゴ
は、擬似的なコントロールに比べて、細胞の成長の有意な阻害をもたらさない。
これらの結果から、本発明のc−myb CMAS−オリゴは有用なアンチセン
ス剤であり、濃度に依存して腫瘍の成長に対して有効であることが示される。
As a result of the MTT assay, the cell number gradually decreases with increasing amounts of MIJ-5, a CMAS-oligo against human c-myb. Inhibition of cell growth is more pronounced when cells are treated twice with MIJ-5. Inhibition of growth of more than 80% of HL-60 cells is also observed at low concentrations (see FIG. 9). On the other hand, the linear 60-mer AS-oligo, MIJ-5A, and the linear sense oligo, do not result in significant inhibition of cell growth as compared to the sham control.
These results indicate that the c-myb CMAS-oligo of the present invention is a useful antisense agent and is effective for tumor growth depending on the concentration.

【0077】 加えて、細胞の成長がRiAS−オリゴにより91%以上阻害されることが観
察される(図9のAを参照)。一方、SC−オリゴ及びリポフェクチン単独は、
未処理のコントロールのものに比べて細胞の成長を有意に阻害しない。これらの
結果から、本発明のc−myb RiAS−オリゴもまた白血病細胞の成長の阻
害に対して効果的なアンチセンス剤であることが示される。
In addition, it is observed that cell growth is inhibited by more than 91% by RiAS-oligo (see FIG. 9A). On the other hand, SC-oligo and lipofectin alone,
Does not significantly inhibit cell growth as compared to untreated controls. These results indicate that the c-myb RiAS-oligo of the present invention is also an effective antisense agent for inhibiting the growth of leukemic cells.

【0078】 ソフトアガロースでのコロニー形成では、MIJ−5は、90%超、コロニー
の形成数を減少する(表2を参照)。MIJ−5Aはまた、成長の阻害では効果
はより低いものの、形成されるコロニーを減少させ、約70%のコロニーを減少
する。これに対して、センスオリゴ及びSC−オリゴは、各々、約11%及び3
2%という、わずかなコロニーの減少を示す。
For colony formation on soft agarose, MIJ-5 reduces the number of colonies formed by more than 90% (see Table 2). MIJ-5A also reduces the number of colonies formed, although less effective at inhibiting growth, reducing about 70% of the colonies. In contrast, sense oligo and SC-oligo were about 11% and 3%, respectively.
It shows a slight colony reduction of 2%.

【0079】 また、細胞中にトランスフェクトされたc−myb RiAS−オリゴは、未
処理のコントロールに比して約92%ほど(表3を参照)コロニーの形成数を減
少できる。一方、SC−オリゴ及びリポフェクチン単独は、各々、約7.9%及
び7.1%という、わずかなコロニーの減少を示す。
In addition, c-myb RiAS-oligo transfected into cells can reduce the number of colonies formed by about 92% (see Table 3) as compared to the untreated control. On the other hand, SC-oligo and Lipofectin alone show a slight colony reduction of about 7.9% and 7.1%, respectively.

【0080】 加えて、白血病細胞に対するc−myb RiAS−オリゴの成長の阻害を[ 3 H]チミジンの取込みによって観察する。特に、RiAS−オリゴは、HL−
60細胞の成長を93%阻害する。一方、SC−オリゴ及びリポフェクチン単独
は、それぞれ、約16.8%及び15.4%という、ゆるやかな細胞成長の阻害
を示す(図10のBを参照)。顕微鏡観察では、c−myb RiAS−オリゴ
で処理した後に、HL−60細胞の成長は、スクランブルされた(scrambled)オ
リゴ及びリポフェクチン単独で処理された細胞に比べて著しく阻害される(図1
1を参照)。
In addition, inhibition of growth of c-myb RiAS-oligo on leukemia cells [ Three H] Observed by thymidine incorporation. In particular, RiAS-oligos are HL-oligos.
Inhibits the growth of 60 cells by 93%. On the other hand, SC-oligo and Lipofectin alone
Shows a moderate inhibition of cell growth of about 16.8% and 15.4%, respectively.
(See FIG. 10B). Microscopic observation revealed that c-myb RiAS-oligo
After treatment with HL-60 cells, the growth of HL-60 cells was scrambled.
It is significantly inhibited compared to cells treated with rigo and lipofectin alone (FIG. 1).
1).

【0081】 本発明におけるc−myb RiAS−オリゴの顕著な阻害活性によって鼓舞
されて、本発明者らは、2つの異なる癌原遺伝子、c−myc及びk−rasに
対する他のRiAS−オリゴを構築して、c−myc RiAS−オリゴ及びk
−ras RiAS−オリゴが細胞成長の阻害に良好に機能するかどうかを調べ
た。
Inspired by the remarkable inhibitory activity of c-myb RiAS-oligos in the present invention, we constructed other RiAS-oligos for two different proto-oncogenes, c-myc and k-ras. And c-myc RiAS-oligo and k
It was investigated whether -ras RiAS-oligo functions well in inhibiting cell growth.

【0082】 顕微鏡観察の結果では、HT−29細胞の成長は、スクランブルされた(scram
bled)オリゴ及びリポフェクチン単独で処理した細胞に比して、すべてのRiA
S−オリゴ、c−myb RiAS−オリゴ、c−myc RiAS−オリゴ及
びk−ras RiAS−オリゴによって顕著に阻害される(図12、図13及
び図14を参照)。
According to the results of microscopic observation, the growth of HT-29 cells was scrambled (scram
bled) All RiA compared to cells treated with oligo and lipofectin alone
It is significantly inhibited by S-oligo, c-myb RiAS-oligo, c-myc RiAS-oligo and k-ras RiAS-oligo (see FIGS. 12, 13 and 14).

【0083】 したがって、本発明の新規なRiAS−オリゴは、様々なターゲット配列に対
する腫瘍細胞の有効な成長阻害、さらにはヌクレアーゼ活性に対する促進された
安定性を示す。このため、本発明の新規なRiAS−オリゴは、様々なヒトの疾
患を治療するための分子状アンチセンスオリゴの開発に有用に使用される。
Thus, the novel RiAS-oligos of the present invention exhibit effective growth inhibition of tumor cells against various target sequences, as well as enhanced stability against nuclease activity. For this reason, the novel RiAS-oligos of the present invention are usefully used for the development of molecular antisense oligos for treating various human diseases.

【0084】 実施例 本発明の実際の及び現在の好ましい実施態様を、以下の実施例で示されるよう
に、詳述する。
EXAMPLES The actual and presently preferred embodiments of the present invention are described in detail, as set forth in the following examples.

【0085】 しかしながら、当業者は、この開示を考慮して、本発明の精神及び概念内で修
飾及び改良をすることは考えられる。
However, it is conceivable that those skilled in the art, in light of this disclosure, will make modifications and improvements within the spirit and concept of the invention.

【0086】 実施例1:AS−オリゴに対するターゲット部位の選択 AS−オリゴのターゲット部位の選択は、アンチセンス効果、ターゲットmR
NAの減少または切除を達成するために重要であることは分かっていた。しかし
ながら、ターゲット部位の選択方法はむしろ任意であった。このため、本発明者
らは、推定の2次構造に関してヒトのc−myb mRNAの完全な配列をスキ
ャンして、好ましい実施態様における合理的なターゲット部位を探索した。
Example 1 Selection of Target Site for AS-Oligo The selection of the target site for AS-oligo was based on
It was found to be important in achieving NA reduction or ablation. However, the method of selecting the target site was rather arbitrary. For this reason, we scanned the complete sequence of human c-myb mRNA for putative secondary structure and searched for a reasonable target site in the preferred embodiment.

【0087】 特に、2次構造のシミュレーションは、DNAsisプログラム(Hitachi So
ftware、日本)を使用して行なった。完全なc−myb配列を、100塩基の連
続したフレームにおける2次構造の形成に関して順次スキャンした。次に、2次
構造のシミュレーション用のフレームを、30塩基ずつずらしていき、5’側の
60塩基の重複を得た。このプロセスを、所定の配列を3つの異なるフレームに
おける潜在的な2次構造に関してスキャンするように、再度繰り返した。
In particular, the simulation of the secondary structure is performed by the DNAsis program (Hitachi So
ftware, Japan). The complete c-myb sequence was scanned sequentially for the formation of secondary structure in a continuous frame of 100 bases. Next, the frame for the simulation of the secondary structure was shifted by 30 bases at a time to obtain an overlap of 60 bases on the 5 ′ side. This process was repeated again to scan a given sequence for potential secondary structures in three different frames.

【0088】 その結果、3つの異なるフレームにおける最小の2次構造を有する8つの配列
がc−myb mRNA配列から選択された(表1)。AS−オリゴに関する合
理的なターゲット部位の探索を用いて、天然の2次構造を予想できるチャンスが
改良された。
As a result, eight sequences having the minimum secondary structure in three different frames were selected from the c-myb mRNA sequence (Table 1). Using a rational target site search for AS-oligos has improved the chance of predicting the native secondary structure.

【0089】[0089]

【表1】 [Table 1]

【0090】 表1に示されるように、上記8つのアンチセンス配列は選択されたターゲット
部位に対して相補的であった。AS−オリゴに関する8つの選択されたターゲッ
ト配列のうち、最小限の内部分子の2次構造を形成するので、4つの部位(MI
J−1、MIJ−2、MIJ−3、及びMIJ−4)がCMAS分子を形成する
際に組み合わせて選択され、3つの部位(MIJ−3、MIJ−4、及びMIJ
−17)がRiAS−オリゴを形成するのに組み合わせて選択された。
As shown in Table 1, the eight antisense sequences were complementary to the selected target sites. Of the eight selected target sequences for the AS-oligo, four sites (MI
J-1, MIJ-2, MIJ-3, and MIJ-4) are selected in combination when forming a CMAS molecule, and three sites (MIJ-3, MIJ-4, and MIJ) are selected.
-17) was selected in combination to form RiAS-oligos.

【0091】 実施例2:共有結合で閉環された多重アンチセンス(CMAS)−オリゴの構
築 本発明者らは、より良好な安定性を有する改善されたAS−オリゴの開発を試
みた。
Example 2: Construction of multiple antisense (CMAS) -oligos covalently closed We tried to develop improved AS-oligos with better stability.

【0092】 実施例1によって得られた4つの異なるAS−オリゴ((MIJ−1、MIJ
−2、MIJ−3、及びMIJ−4)を用いてCMAS−オリゴを構築した。よ
り容易にターゲット部位に結合するように、2次構造を最小化する組み合わせの
4つの異なるアンチセンス配列を収容させて、一つのCMAS−オリゴを構築し
た。AS−オリゴは、5’末端での合成中にリン酸化された後、分子内または分
子間共有結合によるライゲーションが起こる(図1)。4つの異なるアンチセン
ス配列を含む60merのAS−オリゴの配列は、配列番号7によって記載され
る。AS−オリゴの両末端は、60merのAS−オリゴの両末端配列(各側で
7塩基)に双方の半分が相補的な配列を有するライゲーションプライマーで結合
している。14merのライゲーションプライマーの配列は、配列番号6によっ
て記載される。ライゲーションプライマーをAS−オリゴと混合して、85℃で
2分間加熱した後、周囲温度にまで徐々に冷却した。1ユニットのT4リガーゼ
を添加して、16℃で16時間、インキュベートして、共有結合で閉環された分
子を生成した。CMAS−オリゴを、5%メタファーアガロ−スゲル(MetaphorT M agarose gel)(FMC,USA)でまたは12%変性PAGEで電気泳動して、エキソ
ヌクレアーゼIIIに対する耐性及びリニアな60merのオリゴに比した若干
のゲルの遅延で同定した。ライゲーションプライマーは、エキソヌクレアーゼI
IIにより分解されたまたは90℃でオリゴを加熱させた後、変性ゲルで泳動す
ることによってCMAS−オリゴから脱離した。
The four different AS-oligos obtained according to Example 1 ((MIJ-1, MIJ
-2, MIJ-3, and MIJ-4) were used to construct CMAS-oligos. One CMAS-oligo was constructed to accommodate a combination of four different antisense sequences that minimizes secondary structure so as to more easily bind to the target site. AS-oligos are phosphorylated during synthesis at the 5 'end, followed by intramolecular or intermolecular covalent ligation (Figure 1). The sequence of a 60-mer AS-oligo containing four different antisense sequences is set forth by SEQ ID NO: 7. Both ends of the AS-oligo are ligated with ligation primers having a sequence complementary to both ends of the 60-mer AS-oligo at both ends (7 bases on each side). The sequence of the 14mer ligation primer is set forth by SEQ ID NO: 6. The ligation primer was mixed with the AS-oligo, heated at 85 ° C. for 2 minutes, and then gradually cooled to ambient temperature. One unit of T4 ligase was added and incubated at 16 ° C. for 16 hours to produce a covalently closed molecule. The CMAS- oligo, 5% Metaphor A Gallo - Sugeru (Metaphor T M agarose gel) ( FMC, USA) or were electrophoresed on 12% denaturing PAGE, and compared to oligo resistance and linear 60mer to exonuclease III Identified by some gel delay. The ligation primer was exonuclease I
After being digested by II or heating the oligo at 90 ° C., it was detached from the CMAS-oligo by running on a denaturing gel.

【0093】 その結果、AS−オリゴの細胞内2次構造を、AS−オリゴ及びターゲットm
RNAのデュプレックス形成をせずに構築した。このAS−オリゴを、CMAS
(共有結合で閉環された多重アンチセンス)−オリゴと命名した。CMAS−オ
リゴは、15%変性PAGEゲルでリニアな前駆体に比して約10%程度遅い電
気泳動の移動パターンを示した(図2のA)。CMAS−オリゴは、予想どおり
、エキソヌクレアーゼIIIに対して耐性があり、変性PAGEゲル上に多数の
バンドで示され、この際、モノマー(60mer)が最も豊富であり、次にダイ
マー(120mer)及びトリマー(180mer)であった(図2のB)。C
MAS−オリゴとは反対に、リニアなオリゴは、エキソヌクレアーゼIIIで2
時間インキュベーションした後完全に分解した。
As a result, the intracellular secondary structure of the AS-oligo was
Constructed without duplex formation of RNA. This AS-oligo was used for CMAS
(Multiple antisense covalently closed) -oligo. The CMAS-oligo showed an electrophoretic migration pattern that was about 10% slower than the linear precursor on a 15% denaturing PAGE gel (FIG. 2A). The CMAS-oligo is, as expected, resistant to exonuclease III, showing multiple bands on denaturing PAGE gels, where the monomer (60 mer) is the most abundant, followed by the dimer (120 mer) and It was a trimmer (180mer) (FIG. 2B). C
Contrary to the MAS-oligo, the linear oligo is exonuclease III
After a period of incubation, it was completely degraded.

【0094】 実施例3:リボン型のアンチセンス(RiAS)−オリゴの構築 本発明者らは、2つのAS−オリゴを酵素的に連結させて、RiAS−オリゴ
と称するリボン型の閉環分子を形成した。
Example 3 Construction of Ribbon-Type Antisense (RiAS) -Oligo We enzymatically link two AS-oligos to form a ribbon-type closed ring molecule called RiAS-oligo. did.

【0095】 特に、RiAS−オリゴは、2つのループと2つのループを連結する一つのス
テムから構成される。それぞれのループは、配列番号3、4、及び5によって記
載される3つの異なるアンチセンス(MIJ−3、MIJ−4、及びMIJ−1
7)配列を含んだ。ターゲット部位により容易に結合するために、可能なかぎり
少ない2次構造を有する3つのアンチセンス配列の組み合わせをAS−オリゴの
ために選択した。C−myb AS−オリゴ(MIJ−78)は、5’末端でリ
ン酸化された。58merのMIJ−78の配列は配列番号8によって記載され
る。MIJ−78は、ステム−ループ構造を形成する。ステムは、それぞれのオ
リゴの両末端の相補的な配列により形成された。ステムの5’末端は、5’−(
p)GATC−3’の単一の標準的な配列の4塩基を持っていた。2つのMIJ
−78分子を、両5’末端の相補的4塩基配列により結合した。MIJ−78分
子を混合して、85℃で2分間加熱した後、周囲温度まで徐々に冷却した。1ユ
ニットのT4 DNAリガーゼを添加して、16℃で24時間、インキュベート
して、ダイアド(diad)−対称を有する共有結合で連結された分子を生成した(図
3)。RiAS−オリゴを15%変性ポリアクリルアミドゲルで電気泳動し、エ
キソヌクレアーゼIIIに対する耐性及びゲルの遅延を調べた。
In particular, the RiAS-oligo is composed of two loops and one stem connecting the two loops. Each loop has three different antisenses (MIJ-3, MIJ-4, and MIJ-1) described by SEQ ID NOs: 3, 4, and 5.
7) Included sequence. A combination of three antisense sequences with as few secondary structures as possible was chosen for the AS-oligo to bind more easily to the target site. C-myb AS-oligo (MIJ-78) was phosphorylated at the 5 'end. The sequence of the 58mer MIJ-78 is set forth by SEQ ID NO: 8. MIJ-78 forms a stem-loop structure. The stem was formed by the complementary sequences at both ends of each oligo. The 5 'end of the stem is 5'-(
p) Had 4 bases of a single standard sequence of GATC-3 '. Two MIJs
-78 molecules were linked by complementary 4 base sequences at both 5 'ends. MIJ-78 molecules were mixed, heated at 85 ° C. for 2 minutes, and then gradually cooled to ambient temperature. One unit of T4 DNA ligase was added and incubated at 16 ° C. for 24 hours to produce a diad-symmetric covalently linked molecule (FIG. 3). RiAS-oligos were electrophoresed on a 15% denaturing polyacrylamide gel to determine resistance to exonuclease III and gel delay.

【0096】 その結果、2つのループと2つのループを連結する一つのステムから構成され
るRiAS−オリゴ(116mer)が構築された。ループ中の3つのアンチセ
ンス配列をRiAS−オリゴの長さを増加させるためにタンデムに置いた。その
結果、3つの異なるアンチセンス配列の2コピー(全6つのアンチセンス配列)
がRiAS−オリゴにあった。RiAS−オリゴにおけるこのような伸長した長
さのループは、ターゲットmRNA配列とデュプレックスを形成することによっ
て生じるねじり応力をやわらげた。RiAS−オリゴは、変性PAGEゲル上で
そのリニアな前駆体(MIJ−78)より顕著に遅いことが分かった(図4のA
)。RiAS−オリゴは、予想どおり、エキソヌクレアーゼIIIに対して耐性
を有し、PAGEゲル上で主要なバンド(116mer)に示された(図4のB
)。RiAS−オリゴとは反対に、MIJ−78は、エキソヌクレアーゼIII
で2時間インキュベーションした後完全に分解した。
As a result, a RiAS-oligo (116 mer) composed of two loops and one stem connecting the two loops was constructed. The three antisense sequences in the loop were placed in tandem to increase the length of the RiAS-oligo. As a result, two copies of three different antisense sequences (all six antisense sequences)
Was in the RiAS-oligo. Such extended length loops in the RiAS-oligo relieved the torsional stress created by forming a duplex with the target mRNA sequence. RiAS-oligo was found to be significantly slower than its linear precursor (MIJ-78) on denaturing PAGE gels (FIG. 4A).
). The RiAS-oligo was, as expected, resistant to exonuclease III and showed a major band (116 mer) on the PAGE gel (FIG. 4B).
). Contrary to RiAS-oligo, MIJ-78 is an exonuclease III
Was completely degraded after incubation for 2 hours.

【0097】 実施例4:ヌクレアーゼ活性に対するCMAS−オリゴ及びRiAS−オリゴ
の促進された安全性 ヌクレアーゼ活性に対する本発明のCMAS−オリゴ及びRiAS−オリゴの
安定性を試験するために、CMAS−オリゴ及びRiAS−オリゴをヌクレアー
ゼ活性を維持するために熱で不活性化しない血清と共にインキュベートした。
Example 4: Enhanced safety of CMAS-oligos and RiAS-oligos on nuclease activity To test the stability of the CMAS-oligos and RiAS-oligos of the invention on nuclease activity, CMAS-oligos and RiAS-oligos -Oligos were incubated with serum that was not heat inactivated to maintain nuclease activity.

【0098】 特に、非特異的なコントロール−ホスホジエステルオリゴ(リニアな60me
r)の各々の1μg及びCMAS−オリゴを、生のヒト血清、FBS及びウシ血
清(加熱せずに不活性化された;HyClone, Logan, Utah, USA)またはエキソヌ
クレアーゼIIIと共にインキュベートした。15%の血清をそれぞれ、100
μlの反応容積のAS−オリゴに添加して、37℃で24時間、インキュベート
した。次に、AS−オリゴをフェノール及びクロロホルムで抽出して、15%変
性PAGEゲルで調べた。160U/μgオリゴのエキソヌクレアーゼIII(T
akara, Japan)をリニアな及びCMAS−オリゴに添加して、37℃で2時間、
インキュベートした。エキソヌクレアーゼIIIで処理されたAS−オリゴをま
た、上記と同じ方法で抽出し、電気泳動した。
In particular, non-specific control-phosphodiester oligos (linear 60 me
1 μg of each of r) and CMAS-oligo were incubated with raw human serum, FBS and bovine serum (inactivated without heating; HyClone, Logan, Utah, USA) or exonuclease III. 15% serum was added to each 100
Added to μl reaction volume of AS-oligo and incubated at 37 ° C. for 24 hours. Next, the AS-oligo was extracted with phenol and chloroform and examined on a 15% denaturing PAGE gel. 160 U / μg oligo exonuclease III (T
akara, Japan) to the linear and CMAS-oligos at 37 ° C. for 2 hours,
Incubated. AS-oligo treated with exonuclease III was also extracted and electrophoresed in the same manner as described above.

【0099】 CMAS−オリゴの結果、リニアな60merのオリゴは、血清の存在下で2
4時間インキュベーション後に、完全に消化された(図5のA)。しかしながら
、本発明のCMAS−オリゴは、生のヒト血清、FBS、及びウシ血清と共に2
4時間インキュベーションした後でも、大部分がそのまま残っていることから、
ヌクレアーゼに対してリニアなものより有意に改善された安定性を示した(図5
のB)。
As a result of the CMAS-oligo, the linear 60-mer oligo was 2
After 4 hours incubation, it was completely digested (FIG. 5A). However, the CMAS-oligos of the present invention were used with live human serum, FBS, and bovine serum for
Even after 4 hours of incubation, most remain intact,
It showed significantly improved stability to nucleases than the linear ones (FIG. 5).
B).

【0100】 RiAS−オリゴの場合では、リニアな58merは、各々の異なる血清の存
在下で24時間インキュベーション後、完全に加水分解された(図6のA)。し
かしながら、本発明のRiAS−オリゴは、生の血清と共に24時間インキュベ
ーションした後でも、大部分がそのまま残っていることから、ヌクレアーゼに対
してリニアなものより有意に改善された安定性を示した(図5のB)。
In the case of RiAS-oligo, the linear 58mer was completely hydrolyzed after 24 hours incubation in the presence of each different serum (FIG. 6A). However, the RiAS-oligos of the invention showed significantly improved stability over the nuclease-linear one, since most remained intact even after 24 h incubation with live serum ( FIG. 5B).

【0101】 実施例5:CMAS−オリゴ及びRiAS−オリゴによるc−myb mRN
Aの特異的な減少 本発明におけるCMAS−オリゴ及びRiAS−オリゴの顕著な安定性に鼓舞
されて、本発明者らは、AS−オリゴが配列に特異的にターゲットmRNAを除
去するよう良好に機能するかどうを調べた。
Example 5: c-myb mRN with CMAS-oligo and RiAS-oligo
Specific Reduction of A Inspired by the remarkable stability of CMAS-oligos and RiAS-oligos in the present invention, we have found that AS-oligos function well to sequence-specifically remove target mRNAs. I checked whether to do it.

【0102】 <5−1>細胞系及び組織培養 白血病細胞系である、HL−60(前骨髄性白血病細胞系(promyelocytic leu
kemia cell line)及びK562(慢性骨髄性白血病細胞系(chronic myelogenous
leukemia cell line)を、ATCC(American Type Culture Collection, USA)
から得て、10%熱で不活性化されたFBS(HyClone, USA)及び1%ペニシリン
/ストレプトマイシンを補足したRPMI 1640(Gibco BRL, USA)で培養し
た。細胞を37℃でCO2インキュベーターに維持した。定常的な細胞培養のプ
ラクティスは、適正な細胞密度を維持し、ストックバイアルを解凍してから5世
代を越えないように細胞を培養するように、厳格に実行された。培養液は、AS
−オリゴで処理する一日前に交換した。
<5-1> Cell line and tissue culture A leukemia cell line, HL-60 (promyelocytic leu
kemia cell line) and K562 (chronic myelogenous cell line)
leukemia cell line) and ATCC (American Type Culture Collection, USA)
, And cultured in RPMI 1640 (Gibco BRL, USA) supplemented with 10% heat inactivated FBS (HyClone, USA) and 1% penicillin / streptomycin. Cells were maintained at 37 ° C. in a CO 2 incubator. Routine cell culture practices were rigorously implemented to maintain the proper cell density and thaw the stock vials and culture the cells no more than 5 generations. The culture solution is AS
-Changed one day before treating with oligo.

【0103】 <5−2>カチオン性リポソームと複合体を形成したCMAS−オリゴ及びR
iAS−オリゴのトランフェクション 0.3μgのCMAS−オリゴと0.8μgのLipofectinTM(Gibco BRL, USA)
または0.2μgのRiAS−オリゴと0.8μgのLipofectinTMを、20μl
のOPTI−MEMTMにそれぞれ稀釈して、周囲温度で40分間インキュベート
した。それぞれの成分を、周囲温度で15分間複合体を形成するように混合した
。オリゴを添加する一日前に、細胞を、抗生物質を含まない新鮮な培養液(RP
MI 1640+10%FBS)に添加し、実験をする前にOPTI−MEMで
2回洗浄した。細胞密度を5×105細胞/mlに調節して、48ウェルプレー
ト(Falcon, USA)に100μlずつ分注した。40μlのリポソーム−オリゴ複
合体を、細胞に、1回は0日目に及び1回は1日目の、2回、添加した。オリゴ
で処理された細胞を37℃、5%CO2で4時間インキュベートした後、10%
FBSを含むOPTI−MEM100μlを添加した。次の日、100μlの上
清を注意しながら除去し、オリゴ−リポソーム複合体を含む新鮮なOPTI−M
EM 20μlに交換した。4時間後、細胞に抗生物質を含む完全培地100μ
lをさらに添加し、アッセイ前にもう一日37℃でインキュベートした。
<5-2> CMAS-oligo and R Formed in Complex with Cationic Liposomes
Transfection of iAS-oligo 0.3 μg CMAS-oligo and 0.8 μg Lipofectin (Gibco BRL, USA)
Alternatively, add 0.2 μg of RiAS-oligo and 0.8 μg of Lipofectin to 20 μl
Of OPTI-MEM each and incubated for 40 minutes at ambient temperature. Each component was mixed to form a complex at ambient temperature for 15 minutes. One day before the addition of the oligos, the cells were washed with a fresh culture medium (RP
MI 1640 + 10% FBS) and washed twice with OPTI-MEM before conducting the experiment. The cell density was adjusted to 5 × 10 5 cells / ml, and 100 μl was dispensed into a 48-well plate (Falcon, USA). 40 μl of the liposome-oligo complex was added to the cells twice, once on day 0 and once on day 1. The oligo treated cells were incubated for 4 hours at 37 ° C., 5% CO 2 , followed by 10%
100 μl of OPTI-MEM containing FBS was added. The next day, 100 μl of the supernatant was carefully removed and fresh OPTI-M containing oligo-liposome complexes was removed.
Replaced with 20 μl of EM. After 4 hours, the cells were treated with 100 μl of complete medium containing antibiotics.
1 was added and incubated another day at 37 ° C. before the assay.

【0104】 <5−3>全RNAの単離及びRT−PCR 製造会社によって推奨された方法に従って、TripureTM単離試薬(Tripu
reTM Isolation Reagent)(Boehringer Manhein, Germany)を用いて、全RNAを
単離した。簡単には、集めた細胞に、0.4mlのTripure試薬、10μ
gのグリコーゲン及び80μlのクロロホルムを添加して、全RNAを得た。R
T−PCRを、AccessTM RT−PCRキット(Promega, USA)を使って一
つの反応チューブで行なった。PCRチューブに、RNA、PCRプライマー、
AMV逆転写酵素(5U/μl)、Tfl DNAポリメラーゼ(5U/μl)
、dNTP(10mM、1μl)及びMgSO4(25mM、2.5μl)を添
加した。第一の鎖(first strand)cDNAの合成は、48℃で45分間、DNA
ターマルサイクラー(termal cycler)(Hybaid, USA)で行った。次に、PCR増幅
を、製造会社によって推奨された方法に従って、25サイクル行なった。増幅さ
れたPCR産物は、1%アガロ−スゲルで確認され、ゲルドキュメンテーション
プログラム(gel documentation program)(Bio-Rad, USA)で定量が行なわれた。
<5-3> Isolation of Total RNA and RT-PCR According to the method recommended by the manufacturer, Tripure isolation reagent (Tripu
total RNA was isolated using re Isolation Reagent) (Boehringer Manhein, Germany). Briefly, 0.4 ml of Tripure reagent, 10 μl was added to the collected cells.
g of glycogen and 80 μl of chloroform were added to obtain total RNA. R
T-PCR was performed in one reaction tube using the Access RT-PCR kit (Promega, USA). RNA, PCR primer,
AMV reverse transcriptase (5 U / μl), Tfl DNA polymerase (5 U / μl)
, DNTPs (10 mM, 1 μl) and MgSO 4 (25 mM, 2.5 μl). First strand cDNA synthesis was performed at 48 ° C for 45 minutes.
Performed on a termal cycler (Hybaid, USA). Next, PCR amplification was performed for 25 cycles according to the method recommended by the manufacturer. The amplified PCR product was confirmed on a 1% agarose gel and quantified by a gel documentation program (Bio-Rad, USA).

【0105】 <5−4>RT−PCR断片のサザンハイブリダイゼーション RT−PCR産物を1%アガロ−スゲルで電気泳動した。DNAを、0.4M
NaOH中で4時間、ナイロン膜(New England Biolab, USA)上に移した。膜
をECL3’末端オリゴラベリングで標識された30merの内部プライマー及
び検出システム(Amersham Life Science, England)でハイブリダイゼーションし
た。30merの内部プライマーの配列は、配列番号9によって記載される。ハ
イブリダイゼーションは、5×SSC、0.02%SDSを含む6mlのバッフ
ァー中で62℃で、60分間行なった。膜を、15分ずつ、0.1%SDSを含
む5×SSCで2回洗浄し、0.1%SDSを含む1×SSCで2回洗浄した。
膜をブロッキング溶液でブロックした後、オートラジオグラフィ前に30分間、
HRP(西洋ワサビのペルオキシダーゼ)抗フルオレセイン接合抗体で処理した
<5-4> Southern Hybridization of RT-PCR Fragment The RT-PCR product was electrophoresed on a 1% agarose gel. 0.4M DNA
Transferred onto a nylon membrane (New England Biolab, USA) for 4 hours in NaOH. The membrane was hybridized with a 30 mer internal primer labeled with ECL 3'-end oligolabeling and a detection system (Amersham Life Science, England). The sequence of the 30 mer internal primer is set forth by SEQ ID NO: 9. Hybridization was performed at 62 ° C. for 60 minutes in 6 ml of a buffer containing 5 × SSC and 0.02% SDS. The membrane was washed twice with 5 × SSC containing 0.1% SDS and twice with 1 × SSC containing 0.1% SDS for 15 minutes.
After blocking the membrane with the blocking solution, 30 minutes before autoradiography,
Treated with HRP (horseradish peroxidase) anti-fluorescein conjugated antibody.

【0106】 本発明のCMAS−オリゴは、配列に特異的にターゲットmRNAを除去する
よう良好に機能をすることが示された。
The CMAS-oligos of the present invention have been shown to work well to remove target mRNA specifically to the sequence.

【0107】 特に、CMAS−オリゴは、リポフェクチンと複合体を形成して、細胞内にデ
リバーされた。リポフェクチンは、細胞に毒性が少なく、再現性ある結果を出す
ことが分かっているので使用された。その結果、0.3μgのMIJ−5、ヒト
のc−mybに対するCMAS−オリゴを、HL−60細胞にトランスフェクシ
ョンするために1μgのリポフェクチンと複合体を形成させた。MIJ−5は、
コントロールSC−オリゴに比べて95%超のc−myb mRNAを減少させ
ることができた。一方、MIJ−5のリニアなカウンターパートである、MIJ
−5Aは、c−myb mRNAの約37%を減少させた(図7のA)。これら
の結果から、本発明のCMAS−オリゴは、たとえより少ない量で使用されても
、ターゲットmRNAを切除するのにリニアなものより優れていることが示され
た。
In particular, CMAS-oligos were complexed with lipofectin and delivered intracellularly. Lipofectin was used because it has been shown to be less toxic to cells and to give reproducible results. As a result, a complex was formed with 1 μg of lipofectin for transfection of HL-60 cells with 0.3 μg of MIJ-5 and CMAS-oligo against human c-myb. MIJ-5 is
The c-myb mRNA could be reduced by more than 95% compared to the control SC-oligo. On the other hand, MIJ-5's linear counterpart, MIJ
-5A reduced c-myb mRNA by about 37% (FIG. 7A). These results indicate that the CMAS-oligos of the invention are superior to the linear ones for excision of target mRNA, even when used in lower amounts.

【0108】 本発明のRiAS−オリゴが配列に特異的にターゲットmRNAを除去するよ
う良好に機能をすることもまた示された。
It has also been shown that the RiAS-oligos of the present invention function well to remove target mRNA specifically to the sequence.

【0109】 HL−60細胞を、RiAS−オリゴ、SC−オリゴ、さらにはリポフェクチ
ン単独でトランスフェクションした。RiAS−オリゴを、リポフェクチンと複
合体を形成させた後、細胞中にデリバーした。ヒトのc−mybに対するRiA
S−オリゴ(0.1μgまたは0.2μg)を、HL−60細胞中にトランスフ
ェクションするために0.8μgのリポフェクチンと複合体を形成させた。その
結果、0.2μgのRiAS−オリゴ(40nM)は、c−myb mRNAを
完全に切除することができた。一方、0.1μgのRiAS−オリゴはc−my
b mRNAの約70%を減少した(図8のA)。これに対して、SC−オリゴ
は、リポフェクチン単独で処理したものに比べて約30%のc−myb mRN
Aの若干の減少を示した。しかしながら、下段に示されたβ−アクチンの発現は
、RiAS−オリゴの処理、さらには他の処理条件による影響を受けなかった。
これらの結果から、RiAS−オリゴは、たとえ少量で使用されてもターゲット
mRNAを切除するのに優れていることが示された。
HL-60 cells were transfected with RiAS-oligo, SC-oligo, and lipofectin alone. The RiAS-oligo was delivered into cells after forming a complex with Lipofectin. RiA against human c-myb
S-oligo (0.1 μg or 0.2 μg) was complexed with 0.8 μg lipofectin for transfection into HL-60 cells. As a result, 0.2 μg of RiAS-oligo (40 nM) was able to completely excise c-myb mRNA. On the other hand, 0.1 μg of RiAS-oligo was c-my
b Reduced about 70% of mRNA (FIG. 8A). In contrast, SC-oligo had about 30% c-myb mRN compared to that treated with lipofectin alone.
A showed a slight decrease. However, the expression of β-actin shown at the bottom was not affected by the treatment of RiAS-oligo and further by other treatment conditions.
These results indicated that RiAS-oligo was excellent at excision of target mRNA even when used in small amounts.

【0110】 本発明者らはまた、PCR産物によるサザンブロット法によってCMAS−オ
リゴ及びRiAS−オリゴのアンチセンス効果を調査した。HL−60細胞をM
IJ−5及び、ントロールオリゴなどのオリゴでトランスフェクションし、これ
らの細胞を全DNAを単離するために使用した。
We also investigated the antisense effect of CMAS-oligo and RiAS-oligo by Southern blotting with PCR products. HL-60 cells in M
Transfected with IJ-5 and oligos such as control oligos, these cells were used to isolate total DNA.

【0111】 CMAS−オリゴの場合では、c−mybのメッセージをRT−PCRでする
と、90%超のメッセージがMIJ−5の処理により減少することが分かった(
図7のB)。しかしながら、下段に示されたβ−アクチンの発現は、MIJ−5
の処理の影響を受けなかった。
In the case of CMAS-oligo, it was found that when the c-myb message was subjected to RT-PCR, more than 90% of the messages were reduced by MIJ-5 treatment (
FIG. 7B). However, the expression of β-actin shown at the bottom shows that MIJ-5
Was not affected by the treatment.

【0112】 RiAS−オリゴの場合には、RT−PCRにより増幅されたC−mybメッ
セージが、標識された内部ハイブリダイゼーションオリゴ(30mer)で検出
された(図8のB)。これらの結果から、増幅されたメッセージは確かにc−m
yb由来であり、0.2μgのc−myb RiAS−オリゴで処理することに
よってメッセージを完全に除去できることが確認された。
In the case of RiAS-oligo, C-myb message amplified by RT-PCR was detected with a labeled internal hybridization oligo (30mer) (FIG. 8B). From these results, the amplified message is indeed cm-m
It was derived from yb, and it was confirmed that the message could be completely removed by treating with 0.2 μg of c-myb RiAS-oligo.

【0113】 実施例6:c−myb CMAS−オリゴ及びc−myb RiAS−オリゴ
による白血病細胞の有効な成長の阻害 c−mybが白血球の増殖に対して重要な役割を果たすことが報告された。c
−mybに対するAS−オリゴの作用も、白血病細胞の成長を選択的に遮断する
ことが報告された。このため、本発明者らは、白血病細胞の成長の阻害について
本発明のc−myb CMAS−オリゴ及びc−myb RiAS−オリゴを試
験した。
Example 6 Inhibition of Effective Growth of Leukemia Cells by c-myb CMAS-Oligo and c-myb RiAS-Oligo It was reported that c-myb plays a key role in leukocyte proliferation. c
The effect of AS-oligo on -myb was also reported to selectively block leukemic cell growth. For this reason, we tested the c-myb CMAS-oligo and c-myb RiAS-oligo of the invention for inhibition of leukemic cell growth.

【0114】 特に、白血病細胞に対するc−myb CMAS−オリゴ及びc−myb R
iAS−オリゴの成長の阻害は、3種の方法、即ち、MTTアッセイ、[3H]
チミジンの取込みまたはソフトアガロースでのコロニー形成によって測定された
In particular, c-myb CMAS-oligo and c-myb R against leukemic cells
Inhibition of iAS-oligo growth was measured in three different ways: MTT assay, [ 3 H].
It was determined by thymidine incorporation or colony formation on soft agarose.

【0115】 <6−1>MTTアッセイ MTT(3,−[4,5−ジメチルチアゾール−2−イル]2,5−ジフェニ
ルテトラゾリウムブロミド(3,-[4,5-Dimethylthiazol-2-yl]2,5-diphenyl-tetra
zolium bromide)、以下、「MTT」と称する)アッセイを目的として、HL−
60細胞をOPTI−MEMで2回洗浄し、50μlずつ96ウェルプレート(
5×103細胞/ウェル)に分注した。細胞を、異なる量のオリゴ(CMAS−
オリゴでは、0.01〜1μg/15μlまたはRiAS−オリゴでは、0.2
μg/15μl)及びリポフェクチン(0.2μg/15μl)間で行なわれた
複合体で5時間処理し、5日間培養した。次に、細胞を100μl容積で集め、
20μl(100μg)のMTT試薬(PBS中に5mg/ml;Sigma, USA)
を添加した後、37℃で4時間インキュベートした。100μlのイソプロパノ
ール(0.1N HClを含む)を細胞に添加し、周囲温度でさらに1時間イン
キュベートした。吸光度をELISAリーダーで570nmで測定して、生きて
いる細胞の量を計測した。
<6-1> MTT Assay MTT (3,-[4,5-dimethylthiazol-2-yl] 2,5-diphenyltetrazolium bromide (3,-[4,5-Dimethylthiazol-2-yl] 2) , 5-diphenyl-tetra
zolium bromide) (hereinafter referred to as “MTT”).
60 cells were washed twice with OPTI-MEM, and 50 μl was added to a 96-well plate (
(5 × 10 3 cells / well). Cells were harvested with different amounts of oligo (CMAS-
For oligos, 0.01-1 μg / 15 μl or for RiAS-oligos, 0.2-1 μg / 15 μl.
μg / 15 μl) and lipofectin (0.2 μg / 15 μl) were treated for 5 hours and cultured for 5 days. Next, the cells were collected in a volume of 100 μl,
20 μl (100 μg) of MTT reagent (5 mg / ml in PBS; Sigma, USA)
Was added and incubated at 37 ° C. for 4 hours. 100 μl of isopropanol (containing 0.1 N HCl) was added to the cells and incubated for another hour at ambient temperature. Absorbance was measured at 570 nm in an ELISA reader to determine the amount of living cells.

【0116】 CMAS−オリゴでは、細胞数は、MIJ−5の量を増やして処理すると次第
に減少した。細胞をMIJ−5で2回処理した場合には、細胞成長の阻害がさら
に環著になった。80%超のHL−60細胞の成長阻害が、低濃度、即ち、0.
13μg(全体0.24μg)のCMAS−オリゴでさえ観察された(図9)。
一方、リニアなの60merのAS−オリゴ、MIJ−5A及びリニアなセンス
オリゴは、擬似コントロールと比較して、細胞成長の有意な阻害はもたらされな
かった。これらの結果から、c−myb CMAS−オリゴは、効果的なアンチ
センス剤であり、濃度に依存して腫瘍の成長に対する有効な薬剤であることが示
された。
For CMAS-oligo, cell numbers progressively decreased with increasing amounts of MIJ-5. When cells were treated twice with MIJ-5, the inhibition of cell growth became even more pronounced. Greater than 80% growth inhibition of HL-60 cells is achieved at low concentrations, ie, 0.
Even 13 μg (0.24 μg total) of CMAS-oligo was observed (FIG. 9).
On the other hand, the linear 60-mer AS-oligo, MIJ-5A and the linear sense oligo did not result in significant inhibition of cell growth as compared to the sham control. These results indicated that c-myb CMAS-oligo was an effective antisense agent and, depending on concentration, an effective agent for tumor growth.

【0117】 RiAS−オリゴでは、細胞の成長は、RiAS−オリゴで91%阻害される
ことも観察された(図10のA)。一方、SC−オリゴ及びリポフェクチン単独
は、未処理のコントロールのものと比較した場合、細胞の成長を有意に阻害しな
かった。これらの結果から、c−myb RiAS−オリゴは、白血病細胞の成
長を阻害するための効果的なアンチセンス剤であることが示された。
With RiAS-oligo, cell growth was also observed to be inhibited by 91% with RiAS-oligo (FIG. 10A). On the other hand, SC-oligo and lipofectin alone did not significantly inhibit cell growth when compared to untreated controls. These results indicated that c-myb RiAS-oligo was an effective antisense agent for inhibiting leukemic cell growth.

【0118】 <6−2>ソフトアガロースでのコロニー形成 白血病細胞に対するc−myb CMAS−オリゴ及びc−myb RiAS
−オリゴの成長阻害を、他の方法としてのソフトアガロースでのコロニー形成に
よっても測定した。
<6-2> Colony formation with soft agarose c-myb CMAS-oligo and c-myb RiAS for leukemia cells
-Oligo growth inhibition was also measured by colony formation on soft agarose as an alternative.

【0119】 特に、K562細胞を実施例6に記載されたのと同様にしてトランスフェクシ
ョンし、37℃で、5%CO2で24時間培養した。0.8%の低融点アガロー
ス及び2(20%FBS及び抗生物質を含むRPMI−1640の等容の混合物
を細胞に添加し、6ウェルプレートに播種して固化させた。6ウェルプレートを
4℃にまで5分間で冷却し、15日間インキュベートした。20個超の細胞を含
むコロニーを陽性として計測した。
In particular, K562 cells were transfected as described in Example 6 and cultured at 37 ° C. with 5% CO 2 for 24 hours. An equal volume of a mixture of 0.8% low melting point agarose and 2 (RPMI-1640 containing 20% FBS and antibiotics) was added to the cells and seeded into 6-well plates to solidify. And incubated for 15 days, colonies containing more than 20 cells were scored as positive.

【0120】 その結果、CMAS−オリゴ MIJ−5は、90%超、コロニーの形成数を
減少させた(表2)。MIJ−5Aはまた、成長の阻害では効果はより低いもの
の、形成されるコロニーを減少させ、約70%のコロニーが減少した。これに対
して、センスオリゴ及びSC−オリゴは、各々、約11%及び32%という、わ
ずかなコロニーの減少を示した。
As a result, CMAS-oligo MIJ-5 reduced the number of colonies formed by more than 90% (Table 2). MIJ-5A also reduced the number of colonies formed, although less effective at inhibiting growth, and reduced about 70% of the colonies. In contrast, the sense oligo and SC-oligo showed a slight colony reduction of about 11% and 32%, respectively.

【0121】[0121]

【表2】 [Table 2]

【0122】 これに対して、c−myb RiAS−オリゴでトランスフェクションされた
細胞は、未処理のコントロールと比較して、コロニーの形成数を約92%(表3
)減少させることができた。一方、SC−オリゴ及びリポフェクチン単独は、各
々約7.9%及び7.1%というわずかなコロニーの減少を示した。
In contrast, cells transfected with c-myb RiAS-oligo had about 92% more colonies formed than untreated controls (Table 3).
) Could be reduced. On the other hand, SC-oligo and Lipofectin alone showed a slight colony reduction of about 7.9% and 7.1%, respectively.

【0123】[0123]

【表3】 [Table 3]

【0124】 <6−3>[3H]チミジンの取り込み c−myb RiAS−オリゴによる白血病細胞の成長阻害を、[3H]チミ
ジンの取り込みによっても測定した。
<6-3> Incorporation of [ 3 H] thymidine Inhibition of leukemic cell growth by c-myb RiAS-oligo was also measured by [ 3 H] thymidine incorporation.

【0125】 [3H]チミジンの取り込みでは、HL−60細胞を上記したのと同様にして
AS−オリゴで処理した。細胞に、0.5μCiの[3H]チミジン(2.0C
i/mmol;Amersham, England)を添加し、3連で16時間インキュベート
した。次に、細胞をガラスミクロ繊維フィルター(Whatman GF/C, England)上に
集めた。フィルターを冷PBS、5%TCA及び無水エタノールの順で洗浄した
。[3H]チミジンの取り込みは、トルエン、トリトン(Triton)X−100、P
PO及びPOPOPを含むカクテル溶液で液体シンチレーションカウンターで測
定した。
For incorporation of [ 3 H] thymidine, HL-60 cells were treated with AS-oligo as described above. Cells were treated with 0.5 μCi of [ 3 H] thymidine (2.0 C
i / mmol; Amersham, England) and incubated in triplicate for 16 hours. The cells were then collected on glass microfiber filters (Whatman GF / C, England). The filters were washed sequentially with cold PBS, 5% TCA and absolute ethanol. [ 3 H] thymidine incorporation was measured in toluene, Triton X-100, P
A cocktail solution containing PO and POPOP was measured with a liquid scintillation counter.

【0126】 その結果、RiAS−オリゴ(0.2μg)は、HL−60細胞の成長を93
%阻害した(図10のB)。一方、SC−オリゴ及びリポフェクチン単独は、各
々約16.8%及び15.4%程の軽い細胞の成長の阻害を示した。顕微鏡で観
察すると、c−myb RiAS−オリゴで処理した後は、スクランブルされた
(scrambled)オリゴ及びリポフェクチン単独で処理された細胞と比較した際、H
L−60の成長が顕著に阻害された(図11)。
As a result, RiAS-oligo (0.2 μg) inhibited the growth of HL-60 cells by 93
% Inhibition (FIG. 10B). On the other hand, SC-oligo and lipofectin alone showed about 16.8% and 15.4% inhibition of light cell growth, respectively. When observed under a microscope, it was scrambled after treatment with c-myb RiAS-oligo.
(scrambled) when compared to cells treated with oligo and lipofectin alone,
L-60 growth was significantly inhibited (FIG. 11).

【0127】 実施例8:c−myc RiAS−オリゴ及びk−ras RiAS−オリゴ
の効果的な成長阻害 本発明におけるc−myb RiAS−オリゴの顕著な阻害活性に鼓舞され、
本発明者らは、実施例3におけるのと同様の方法で、2個の異なる癌原遺伝子、
c−myc及びk−rasに対する他のRiAS−オリゴを構築した。
Example 8: Effective growth inhibition of c-myc RiAS-oligo and k-ras RiAS-oligo Inspired by the remarkable inhibitory activity of c-myb RiAS-oligo in the present invention,
We proceeded in a similar manner as in Example 3 with two different proto-oncogenes,
Other RiAS-oligos for c-myc and k-ras were constructed.

【0128】 次に、c−myc RiAS−オリゴ及びk−ras RiAS−オリゴが細
胞の成長を阻害するように良好に機能するかどうかを調べた。
Next, it was examined whether c-myc RiAS-oligo and k-ras RiAS-oligo function well to inhibit cell growth.

【0129】 特に、本発明者らは、異なる細胞系である、結腸直腸腺癌細胞系HT−29を
使用した。腫瘍細胞に対するc−myc RiAS−オリゴ及びk−ras R
iAS−オリゴの成長阻害は、実施例<6−3>におけるのと同様の方法である
3H]チミジンの取込みによって測定した。HT−29細胞は、それぞれ、0
.2μgのc−myb RiAS−オリゴ及び0.6μgのリポフェクチンまた
は0.5μgのc−myc RiAS−オリゴ及び1.5μgのリポフェクチン
または0.5μgのk−ras RiAS−オリゴ及び1.5μgのリポフェク
チンのカチオン性リポソーム複合体で処理した。それぞれのRiAS−オリゴで
5日間処理した後、顕微鏡を使用してHT−29細胞の成長を観察した。各顕微
鏡写真は、RiAS−オリゴ(A)、スクランブルされたオリゴ(B)及びリポ
フェクチン単独(C)で処理された後の成長阻害に関する効果を示した。
In particular, we used a different cell line, the colorectal adenocarcinoma cell line HT-29. C-myc RiAS-oligo and k-ras R for tumor cells
Inhibition of iAS-oligo growth was measured by [ 3 H] thymidine incorporation in the same manner as in Example <6-3>. HT-29 cells each had 0
. Cations of 2 μg c-myb RiAS-oligo and 0.6 μg lipofectin or 0.5 μg c-myc RiAS-oligo and 1.5 μg lipofectin or 0.5 μg k-ras RiAS-oligo and 1.5 μg lipofectin Treated with a soluble liposome complex. After treatment with each RiAS-oligo for 5 days, the growth of HT-29 cells was observed using a microscope. Each micrograph showed the effect on growth inhibition after treatment with RiAS-oligo (A), scrambled oligo (B) and lipofectin alone (C).

【0130】 顕微鏡写真を観察した結果、HT−29細胞の成長は、スクランブルされたオ
リゴ及びリポフェクチン単独で処理された細胞と比較して、すべてのRiAS−
オリゴ、c−myb RiAS−オリゴ、c−myc RiAS−オリゴ及びk
−ras RiAS−オリゴによって顕著に阻害された(図12、図13及び図
14)。
Observation of the micrographs showed that the growth of HT-29 cells was comparable to that of all RiAS- cells compared to cells treated with scrambled oligo and lipofectin alone.
Oligo, c-myb RiAS-oligo, c-myc RiAS-oligo and k
Significantly inhibited by -ras RiAS-oligo (FIGS. 12, 13 and 14).

【0131】 したがって、本発明の新規なRiAS−オリゴは、様々なターゲット配列に対
する腫瘍細胞の効果的な成長阻害、さらにはヌクレアーゼ活性に対する促進され
た安定性を示した。このため、本発明の新規なRiAS−オリゴは、様々なヒト
の疾患に対する分子状アンチセンスオリゴの開発に効果的に使用される。
Thus, the novel RiAS-oligos of the present invention showed effective growth inhibition of tumor cells against various target sequences, as well as enhanced stability against nuclease activity. For this reason, the novel RiAS-oligos of the present invention can be effectively used for the development of molecular antisense oligos against various human diseases.

【0132】 産業上利用可能性 本発明は、より少ない2次構造を有するmRNA領域に対する一以上のアンチセ
ンス配列を含み、より良好なターゲット配列の特異性及びヌクレアーゼ活性に対
する安定性を有する新規なAS−オリゴを提供するものである。
INDUSTRIAL APPLICABILITY The present invention relates to a novel AS comprising one or more antisense sequences for mRNA regions having less secondary structure and having better target sequence specificity and stability against nuclease activity. Providing an oligo.

【0133】 特に、本発明は、相補的プライマーを用いたライゲーションによって閉環型を
形成するように構築されるc−myb mRNAに対する多重ターゲットアンチ
センス配列を含む共有結合で閉環された多重アンチセンス(CMAS)−オリゴ
を提供するものである。加えて、本発明は、両5’末端で相補的な配列を用いた
ライゲーションによってステム−ループ構造を形成するように構築されるc−m
yb mRNAに対する多重ターゲットアンチセンス配列を含むリボン型のアン
チセンス(RiAS)−オリゴを提供するものである。
In particular, the present invention relates to covalently closed multiple antisense (CMAS) comprising multiple target antisense sequences to c-myb mRNA constructed to form a closed form by ligation with complementary primers. ) -Provides an oligo. In addition, the present invention relates to a cm that is constructed to form a stem-loop structure by ligation with sequences complementary at both 5 'ends.
The present invention provides a ribbon-type antisense (RiAS) -oligo containing multiple target antisense sequences for yb mRNA.

【0134】 ヒトンの腫瘍細胞を、c−myb RiAS−オリゴ及びc−myb CMA
S−オリゴ、さらにはc−myc RiAS−オリゴ及びk−ras RiAS
−オリゴで処理すると、異常な遺伝子の発現が本発明の新規なAS−オリゴによ
って効果的に除去されることが示される。したがって、本発明の新規なAS−オ
リゴは、疾患を引き起こす様々な遺伝子に対する分子状アンチセンス剤を開発す
るのに、さらには遺伝子の機能的な研究に使用されることが示唆される。特に、
本発明の新規なAS−オリゴは、癌、免疫疾患、感染性疾患、または異常な遺伝
子の発現により引き起こされる他のヒトの疾患の処置を目的とする薬剤組成物の
開発に使用される。
Human cell lines were analyzed for c-myb RiAS-oligo and c-myb CMA.
S-oligos, and also c-myc RiAS-oligos and k-ras RiASs
-Treatment with oligos shows that aberrant gene expression is effectively eliminated by the novel AS-oligos of the invention. Thus, it is suggested that the novel AS-oligos of the present invention will be used to develop molecular antisense agents against a variety of disease-causing genes, as well as for functional studies of genes. In particular,
The novel AS-oligos of the present invention are used in the development of pharmaceutical compositions for the treatment of cancer, immune diseases, infectious diseases, or other human diseases caused by abnormal gene expression.

【0135】 当業者は、前記記載で開示された概念及び特定の実施態様は、本発明の同一な
目的を遂行するために異なる実施態様を修飾するまたは設計するための基礎とし
て容易に利用できると考えるであろう。当業者はまた、このような等価の実施態
様が添付の請求の範囲に記載されるような本発明の精神及び概念から逸脱しない
と考えるであろう。
Those skilled in the art will recognize that the concepts and specific embodiments disclosed in the foregoing description are readily available as a basis for modifying or designing different embodiments to accomplish the same purpose of the invention. Will think. Those skilled in the art will also appreciate that such equivalent embodiments do not depart from the spirit and concept of the invention as set forth in the appended claims.

【配列表】[Sequence list]

【図面の簡単な説明】[Brief description of the drawings]

【図1】 c−myb CMAS−オリゴの構築に関するスキームを示すものである。FIG. 1 shows a scheme for the construction of c-myb CMAS-oligo.

【図2】 CMAS−オリゴの電気泳動の移動パタ−ンを示すものである。FIG. 2 shows the migration pattern of CMAS-oligo electrophoresis.

【図3】 c−myb RiAS−オリゴの構築に関するスキームを示すものである。FIG. 3 shows a scheme for the construction of c-myb RiAS-oligo.

【図4】 RiAS−オリゴの電気泳動の移動パタ−ンを示すものである。FIG. 4 shows the migration pattern of RiAS-oligo electrophoresis.

【図5】 血清の存在下でのリニアな及びCMAS−オリゴの分解パターンを示すもので
ある。
FIG. 5 shows the degradation pattern of linear and CMAS-oligos in the presence of serum.

【図6】 血清の存在下でのリニアな及びRiAS−オリゴの分解パターンを示すもので
ある。
FIG. 6 shows the degradation pattern of linear and RiAS-oligos in the presence of serum.

【図7】 HL−60細胞におけるc−myb発現に関するc−myb CMAS−オリ
ゴの効果を示すものである。
FIG. 7 shows the effect of c-myb CMAS-oligo on c-myb expression in HL-60 cells.

【図8】 HL−60細胞におけるc−myb mRNAの発現に関するc−myb R
iAS−オリゴの効果を示すものである。
FIG. 8: c-myb R for expression of c-myb mRNA in HL-60 cells
It shows the effect of iAS-oligo.

【図9】 HL−60細胞の増殖に関する60mer CMASまたはリニアなAS−オ
リゴの効果を示すものである。
FIG. 9 shows the effect of 60mer CMAS or linear AS-oligo on proliferation of HL-60 cells.

【図10】 HL−60細胞の増殖に関するc−myb RiAS−オリゴの効果を示すも
のである。
FIG. 10 shows the effect of c-myb RiAS-oligo on the proliferation of HL-60 cells.

【図11】 c−myb RiAS−オリゴによるHL−60細胞の成長の阻害に関する顕
微鏡写真を示すものである。
FIG. 11 shows a micrograph of the inhibition of HL-60 cell growth by c-myb RiAS-oligo.

【図12】 c−myb RiAS−オリゴによるHT−29細胞の成長の阻害に関する顕
微鏡写真を示すものである。
FIG. 12 shows a micrograph of the inhibition of HT-29 cell growth by c-myb RiAS-oligo.

【図13】 c−myc RiAS−オリゴによるHT−29細胞の成長の阻害に関する顕
微鏡写真を示すものである。
FIG. 13 shows photomicrographs of the inhibition of HT-29 cell growth by c-myc RiAS-oligo.

【図14】 k−ras RiAS−オリゴによるHT−29細胞の成長の阻害に関する顕
微鏡写真を示すものである。
FIG. 14 shows photomicrographs of the inhibition of HT-29 cell growth by k-ras RiAS-oligo.

───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) A61P 35/02 A61P 37/00 37/00 C12Q 1/68 Z C12Q 1/68 C12N 15/00 A (81)指定国 EP(AT,BE,CH,CY, DE,DK,ES,FI,FR,GB,GR,IE,I T,LU,MC,NL,PT,SE),OA(BF,BJ ,CF,CG,CI,CM,GA,GN,GW,ML, MR,NE,SN,TD,TG),AP(GH,GM,K E,LS,MW,SD,SL,SZ,TZ,UG,ZW ),EA(AM,AZ,BY,KG,KZ,MD,RU, TJ,TM),AE,AG,AL,AM,AT,AU, AZ,BA,BB,BG,BR,BY,CA,CH,C N,CR,CU,CZ,DE,DK,DM,DZ,EE ,ES,FI,GB,GD,GE,GH,GM,HR, HU,ID,IL,IN,IS,JP,KE,KG,K P,KR,KZ,LC,LK,LR,LS,LT,LU ,LV,MA,MD,MG,MK,MN,MW,MX, NO,NZ,PL,PT,RO,RU,SD,SE,S G,SI,SK,SL,TJ,TM,TR,TT,TZ ,UA,UG,US,UZ,VN,YU,ZA,ZW──────────────────────────────────────────────────続 き Continued on the front page (51) Int.Cl. 7 Identification symbol FI Theme coat ゛ (Reference) A61P 35/02 A61P 37/00 37/00 C12Q 1/68 Z C12Q 1/68 C12N 15/00 A (81 ) Designated countries EP (AT, BE, CH, CY, DE, DK, ES, FI, FR, GB, GR, IE, IT, LU, MC, NL, PT, SE), OA (BF, BJ, CF) , CG, CI, CM, GA, GN, GW, ML, MR, NE, SN, TD, TG), AP (GH, GM, KE, LS, MW, SD, SL, SZ, TZ, UG, ZW) ), EA (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM), AE, AG, AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BY CA, CH, CN, CR, CU, CZ, DE, DK, DM, DZ, EE, ES, FI, GB, GD, GE, GH, GM, HR, HU, ID, IL, IN, IS, JP , KE, KG, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, MA, MD, MG, MK, MN, MW, MX, NO, NZ, PL, PT, RO, RU, SD, SE, SG, SI, SK, SL, TJ, TM, TR, TT, TZ, UA, UG, US, UZ, VN, YU, ZA, ZW

Claims (23)

【特許請求の範囲】[Claims] 【請求項1】 より少ない2次構造を有するmRNA領域に対する一以上の
アンチセンス配列を含むことによってそのターゲット配列の特異性を改善し、閉
環型を構築することによってヌクレアーゼ活性に対するその安定性を改善する新
規なアンチセンスオリゴ。
1. Improving the specificity of its target sequence by including one or more antisense sequences to mRNA regions with less secondary structure and improving its stability to nuclease activity by constructing a closed form New antisense oligo.
【請求項2】 該mRNAは、ヒト疾患を引き起こす様々な遺伝子から転写
される、請求項1に記載の新規なAS−オリゴ。
2. The novel AS-oligo according to claim 1, wherein said mRNA is transcribed from various genes that cause human diseases.
【請求項3】 共有結合で閉環された多重アンチセンス(CMAS)−オリ
ゴであり、CMAS−オリゴはライゲーションプライマーを用いたAS−オリゴ
のライゲーションによって閉環型に構築される、請求項1に記載の新規なAS−
オリゴ。
3. The method of claim 1, wherein the antisense is a multiple antisense (CMAS) -oligo covalently closed, wherein the CMAS-oligo is constructed in a closed form by ligation of the AS-oligo with a ligation primer. New AS-
Oligo.
【請求項4】 AS−オリゴは、配列番号7によって記載される60mer
のAS−オリゴである、請求項3に記載のCMAS−オリゴ。
4. The AS-oligo is a 60-mer described by SEQ ID NO: 7.
The CMAS-oligo according to claim 3, which is an AS-oligo of (1).
【請求項5】 配列番号7は、配列番号1、2、3及び4によって記載され
る4つのアンチセンス配列からなる、請求項4に記載のCMAS−オリゴ。
5. The CMAS-oligo according to claim 4, wherein SEQ ID NO: 7 consists of the four antisense sequences described by SEQ ID NOs: 1, 2, 3, and 4.
【請求項6】 ライゲーションプライマーは、配列番号6によって記載され
る14merのヌクレオチドからなる、請求項3に記載のCMAS−オリゴ。
6. The CMAS-oligo according to claim 3, wherein the ligation primer consists of the 14-mer nucleotide set forth by SEQ ID NO: 6.
【請求項7】 ヒトの疾患に関係する異常な遺伝子の発現を除去するまたは
抑制するのに有効である、請求項3に記載のCMAS−オリゴ。
7. The CMAS-oligo according to claim 3, which is effective for eliminating or suppressing the expression of an abnormal gene associated with a human disease.
【請求項8】 該遺伝子は、癌原遺伝子、c−myc、c−mybまたはk
−rasである、請求項7に記載のCMAS−オリゴ。
8. The gene may be a proto-oncogene, c-myc, c-myb or k
The CMAS-oligo according to claim 7, which is -ras.
【請求項9】 腫瘍細胞の成長を効果的に阻害する、請求項3に記載のCM
AS−オリゴ。
9. The CM according to claim 3, which effectively inhibits the growth of tumor cells.
AS-oligo.
【請求項10】 該腫瘍細胞は、前骨髄性白血病細胞系HL−60、慢性骨
髄性白血病細胞系K562、または結腸直腸腺癌細胞系HT−29である、請求
項9に記載のCMAS−オリゴ。
10. The CMAS-oligo according to claim 9, wherein the tumor cells are the promyelocytic leukemia cell line HL-60, the chronic myeloid leukemia cell line K562, or the colorectal adenocarcinoma cell line HT-29. .
【請求項11】 リボン型のアンチセンス(RiAS)−オリゴであり、R
iAS−オリゴは、各5’末端で相補的な配列を用いた2つのAS−オリゴのラ
イゲーションによってリボン型に構築される、請求項1に記載の新規なAS−オ
リゴ。
11. An antisense (RiAS) -oligo of the ribbon type, wherein R
2. The novel AS-oligo according to claim 1, wherein the iAS-oligo is constructed in a ribbon form by ligation of two AS-oligos with sequences complementary at each 5 'end.
【請求項12】 2つのループ及び2つのループを連結する一つのステムを
有するステム−ループ構造を有する、請求項11に記載のRiAS−オリゴ。
12. The RiAS-oligo according to claim 11, which has a stem-loop structure having two loops and one stem connecting the two loops.
【請求項13】 該AS−オリゴは、配列番号8によって記載される58m
erのAS−オリゴである、請求項11に記載のRiAS−オリゴ。
13. The AS-oligo according to claim 58, wherein the AS-oligo is 58 m
12. The RiAS-oligo of claim 11, which is an AS-oligo of er.
【請求項14】 該配列番号8は、配列番号3、4及び5によって記載され
る3つのアンチセンス配列からなる、請求項13に記載のRiAS−オリゴ。
14. The RiAS-oligo according to claim 13, wherein said SEQ ID NO: 8 consists of the three antisense sequences set forth by SEQ ID NOs: 3, 4, and 5.
【請求項15】 該相補的な配列は、5’−(p)GATC−3’で記載さ
れる、請求項11に記載のRiAS−オリゴ。
15. The RiAS-oligo of claim 11, wherein said complementary sequence is described as 5 '-(p) GATC-3'.
【請求項16】 ヒトの疾患に関係する異常な遺伝子の発現を除去するまた
は抑制するのに有効である、請求項11に記載のRiAS−オリゴ。
16. The RiAS-oligo according to claim 11, which is effective for eliminating or suppressing the expression of an abnormal gene associated with a human disease.
【請求項17】 該遺伝子は、癌原遺伝子、c−myc、c−mybまたは
k−rasである、請求項11に記載のRiAS−オリゴ。
17. The RiAS-oligo according to claim 11, wherein the gene is a proto-oncogene, c-myc, c-myb or k-ras.
【請求項18】 腫瘍細胞の成長を効果的に阻害する、請求項11に記載の
RiAS−オリゴ。
18. The RiAS-oligo of claim 11, which effectively inhibits tumor cell growth.
【請求項19】 該腫瘍細胞は、前骨髄性白血病細胞系HL−60、慢性骨
髄性白血病細胞系K562、または結腸直腸腺癌細胞系HT−29である、請求
項18に記載のRiAS−オリゴ。
19. The RiAS-oligo according to claim 18, wherein the tumor cells are the promyelocytic leukemia cell line HL-60, the chronic myeloid leukemia cell line K562, or the colorectal adenocarcinoma cell line HT-29. .
【請求項20】 請求項3に記載のCMAS−オリゴまたは請求項11に記
載のRiAS−オリゴを含むAS−オリゴ−リポソーム複合体。
20. An AS-oligo-liposome complex comprising the CMAS-oligo according to claim 3 or the RiAS-oligo according to claim 11.
【請求項21】 該リポソームは、カチオン性リポソームである、請求項2
0に記載のAS−オリゴ−リポソーム複合体。
21. The liposome of claim 2, wherein the liposome is a cationic liposome.
0. The AS-oligo-liposome complex according to 0.
【請求項22】 請求項3に記載のCMAS−オリゴまたは請求項11に記
載のRiAS−オリゴを有効成分として含む薬剤組成物。
22. A pharmaceutical composition comprising the CMAS-oligo according to claim 3 or the RiAS-oligo according to claim 11 as an active ingredient.
【請求項23】 癌、免疫疾患、感染性疾患、または異常な遺伝子発現によ
り引き起こされる他のヒトの疾患の処置に使用される、請求項22に記載の薬剤
組成物。
23. The pharmaceutical composition according to claim 22, which is used for treating cancer, an immune disease, an infectious disease, or other human diseases caused by abnormal gene expression.
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Cited By (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2014527819A (en) * 2011-09-14 2014-10-23 ラナ セラピューティクス インコーポレイテッド Multimeric oligonucleotide compounds
US9790494B2 (en) 2012-09-14 2017-10-17 Translate Bio Ma, Inc. Multimeric oligonucleotide compounds having non-nucleotide based cleavable linkers

Families Citing this family (13)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US6156535A (en) 1995-08-04 2000-12-05 University Of Ottawa Mammalian IAP gene family, primers, probes, and detection methods
US6673917B1 (en) 2000-09-28 2004-01-06 University Of Ottawa Antisense IAP nucleic acids and uses thereof
KR100397275B1 (en) * 2001-03-08 2003-09-17 주식회사 웰진 Novel high-throughput system for functional genomics using unidirectional antisense cDNA library
AU2004242533B2 (en) * 2001-03-08 2007-08-30 Welgene, Inc. Large circular target-specific antisense nucleic acid compounds
KR20030056538A (en) * 2001-12-28 2003-07-04 주식회사 웰진 EFFECTIVE INHIBITION OF TRANSFORMING GROWTH FACTOR-β1 BY A RIBBON-TYPE ANTISENSE OLIGONUCLEOTIDE
US20060009409A1 (en) 2002-02-01 2006-01-12 Woolf Tod M Double-stranded oligonucleotides
ATE529512T1 (en) 2002-02-01 2011-11-15 Life Technologies Corp DOUBLE STRANDED OLIGONUCLEOTIDES
WO2003080638A2 (en) 2002-03-27 2003-10-02 Aegera Therapeutics, Inc. Antisense iap nucleobase oligomers and uses thereof
AU2004276684A1 (en) * 2003-09-30 2005-04-07 Anges Mg, Inc. Staple type oligonucleotide and drug comprising the same
US8012944B2 (en) 2003-10-30 2011-09-06 Pharmascience Inc. Method for treating cancer using IAP antisense oligomer and chemotherapeutic agent
WO2019195738A1 (en) 2018-04-06 2019-10-10 Children's Medical Center Corporation Compositions and methods for somatic cell reprogramming and modulating imprinting
EP3929295A1 (en) 2020-06-26 2021-12-29 Universitat Pompeu Fabra Artificial rnas for modulating rna fragments
WO2023128874A1 (en) * 2021-12-31 2023-07-06 National University Of Singapore Nucleic acid sponges comprising several stem-loop structures in one molecule

Family Cites Families (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US5208149A (en) * 1983-10-20 1993-05-04 The Research Foundation Of State University Of New York Nucleic acid constructs containing stable stem and loop structures
US5683874A (en) * 1991-03-27 1997-11-04 Research Corporation Technologies, Inc. Single-stranded circular oligonucleotides capable of forming a triplex with a target sequence
AU680843B2 (en) * 1992-11-03 1997-08-14 Gene Shears Pty. Limited TNF-alpha ribozymes and degradation resistant mRNA derivatives linked to TNF-alpha ribozymes
AU685080B2 (en) * 1993-01-07 1998-01-15 Thomas Jefferson University Antisense inhibition of C-MYC to modulate the proliferation of smooth muscle cells
US5714320A (en) * 1993-04-15 1998-02-03 University Of Rochester Rolling circle synthesis of oligonucleotides and amplification of select randomized circular oligonucleotides
DE69514351T2 (en) * 1994-06-01 2000-08-10 Hybridon Inc Branched oligonucleotides as pathogen-inhibiting agents
US5939262A (en) * 1996-07-03 1999-08-17 Ambion, Inc. Ribonuclease resistant RNA preparation and utilization
KR20000010886A (en) * 1997-03-10 2000-02-25 미즈노 마사루 Antisense base sequences

Cited By (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2014527819A (en) * 2011-09-14 2014-10-23 ラナ セラピューティクス インコーポレイテッド Multimeric oligonucleotide compounds
US9580708B2 (en) 2011-09-14 2017-02-28 Rana Therapeutics, Inc. Multimeric oligonucleotides compounds
US9732340B2 (en) 2011-09-14 2017-08-15 Translate Bio Ma, Inc. Multimeric oligonucleotides compounds having cleavable linkers
US9732341B2 (en) 2011-09-14 2017-08-15 Translate Bio Ma, Inc. Methods of delivering multiple targeting oligonucleotides to a cell using cleavable linkers
US10093924B2 (en) 2011-09-14 2018-10-09 Translate Bio Ma, Inc. Multimetric oligonucleotide compounds
US10704046B2 (en) 2011-09-14 2020-07-07 Translate Bio Ma, Inc. Multimeric oligonucleotide compounds
US9790494B2 (en) 2012-09-14 2017-10-17 Translate Bio Ma, Inc. Multimeric oligonucleotide compounds having non-nucleotide based cleavable linkers
US10844375B2 (en) 2012-09-14 2020-11-24 Translate Bio Ma, Inc. Multimeric oligonucleotide compounds having non-nucleotide based cleavable linkers

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