JP2002527758A - Methods for diagnosing, monitoring, staging, imaging and treating prostate cancer - Google Patents

Methods for diagnosing, monitoring, staging, imaging and treating prostate cancer

Info

Publication number
JP2002527758A
JP2002527758A JP2000576884A JP2000576884A JP2002527758A JP 2002527758 A JP2002527758 A JP 2002527758A JP 2000576884 A JP2000576884 A JP 2000576884A JP 2000576884 A JP2000576884 A JP 2000576884A JP 2002527758 A JP2002527758 A JP 2002527758A
Authority
JP
Japan
Prior art keywords
csg
patient
cancer
level
prostate cancer
Prior art date
Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
Pending
Application number
JP2000576884A
Other languages
Japanese (ja)
Inventor
サルセダ,スザナ
レシポン,ハーヴ
カファーキー,ロバート
Original Assignee
ダイアデクスアス・インコーポレーテッド
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by ダイアデクスアス・インコーポレーテッド filed Critical ダイアデクスアス・インコーポレーテッド
Publication of JP2002527758A publication Critical patent/JP2002527758A/en
Pending legal-status Critical Current

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C07ORGANIC CHEMISTRY
    • C07KPEPTIDES
    • C07K14/00Peptides having more than 20 amino acids; Gastrins; Somatostatins; Melanotropins; Derivatives thereof
    • C07K14/82Translation products from oncogenes
    • AHUMAN NECESSITIES
    • A61MEDICAL OR VETERINARY SCIENCE; HYGIENE
    • A61PSPECIFIC THERAPEUTIC ACTIVITY OF CHEMICAL COMPOUNDS OR MEDICINAL PREPARATIONS
    • A61P35/00Antineoplastic agents
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12QMEASURING OR TESTING PROCESSES INVOLVING ENZYMES, NUCLEIC ACIDS OR MICROORGANISMS; COMPOSITIONS OR TEST PAPERS THEREFOR; PROCESSES OF PREPARING SUCH COMPOSITIONS; CONDITION-RESPONSIVE CONTROL IN MICROBIOLOGICAL OR ENZYMOLOGICAL PROCESSES
    • C12Q1/00Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions
    • C12Q1/68Measuring or testing processes involving enzymes, nucleic acids or microorganisms; Compositions therefor; Processes of preparing such compositions involving nucleic acids
    • C12Q1/6876Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes
    • C12Q1/6883Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material
    • C12Q1/6886Nucleic acid products used in the analysis of nucleic acids, e.g. primers or probes for diseases caused by alterations of genetic material for cancer

Landscapes

  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Organic Chemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Nuclear Medicine, Radiotherapy & Molecular Imaging (AREA)
  • Genetics & Genomics (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • Gastroenterology & Hepatology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Oncology (AREA)
  • Chemical Kinetics & Catalysis (AREA)
  • General Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Pharmacology & Pharmacy (AREA)
  • Animal Behavior & Ethology (AREA)
  • Public Health (AREA)
  • Veterinary Medicine (AREA)
  • Measuring Or Testing Involving Enzymes Or Micro-Organisms (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Medicines Containing Antibodies Or Antigens For Use As Internal Diagnostic Agents (AREA)

Abstract

(57)【要約】 本発明は、前立腺癌を検出、診断、監視、病期分類、予測、イメージング及び治療するための新規な方法を提供する。   (57) [Summary] The present invention provides novel methods for detecting, diagnosing, monitoring, staging, predicting, imaging and treating prostate cancer.

Description

【発明の詳細な説明】DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION

【0001】 発明の分野 本発明は、部分的には、癌、特に前立腺癌を検出、診断、監視、病期分類、予
測、イメージング及び治療するための新規開発されたアッセイに関する。
FIELD OF THE INVENTION The present invention relates, in part, to newly developed assays for detecting, diagnosing, monitoring, staging, predicting, imaging and treating cancer, especially prostate cancer.

【0002】 発明の背景 前立腺の癌は、米国では、皮膚癌を除けば成人男性における最も一般的な悪性
腫瘍であり、ますます一般的な健康問題となっている。1996年においては、
米国単独で41,400件の死亡がこの疾患に起因したと推定され、このことは
、同じ集団において前立腺癌が肺癌に次いで最も一般的な死亡原因であることを
示している。早期に診断して治療した場合、癌がまだ前立腺に限定されている時
には、治癒の可能性はかなり高い。
BACKGROUND OF THE INVENTION Prostate cancer is the most common malignancy in adult men, except for skin cancer, in the United States and is an increasingly common health problem. In 1996,
It has been estimated that 41,400 deaths were attributed to the disease in the United States alone, indicating that prostate cancer is the most common cause of death after lung cancer in the same population. If diagnosed and treated early, the chances of cure are quite high when the cancer is still limited to the prostate.

【0003】 個人に対する治療の判断は、その個人に存在する前立腺癌の病期に関連する。
前立腺癌の広がりの一般的な分類は、American Urological Association (AUA)
によって開発された。AUAシステムは、前立腺腫瘍を4つの病期A〜Dに分類
している。病期Aは、前立腺内部の顕微鏡的癌であり、さらに病期A1及びA2
に細分される。下位病期A1は、前立腺内部の1つの部位に限定された高分化癌
である。治療は一般に、観察、前立腺全摘出術、または放射線療法である。下位
病期A2は、前立腺内部の多数の部位における中分化癌から低分化癌である。治
療は前立腺全摘出術または放射線療法である。病期Bは、前立腺内部の触診可能
な塊であり、またさらに下位病期B1及びB2に細分される。下位病期B1にお
いては、癌は、前立腺の1つの葉において小さな結節を形成する。下位病期B2
においては、癌は、大きな若しくは多数の結節を形成するか、または前立腺の両
方の葉において生じる。下位病期B1及びB2の治療は、前立腺全摘出術または
放射線療法である。病期Cは、前立腺の大部分または全てを含む大きな癌腫瘤で
あり、またさらに2つの下位病期に細分される。下位病期C1においては、癌は
、前立腺の外に延在することがある連続的な腫瘤を形成する。下位病期C2にお
いては、癌は、周囲組織を浸潤する連続的な腫瘤を形成する。この両方の下位病
期の治療は放射線療法であり、この癌に対処するための薬剤を併用する場合もし
ない場合もある。4番目の病期である病期Dは転移性癌であり、また2つの下位
病期に細分される。下位病期D1においては、癌は、骨盤のリンパ節内に現れる
。下位病期D2においては、癌は、リンパ節の外の組織を含む。この両方の下位
病期の治療は、癌並びに疼痛に対処するための全身薬である。
[0003] Treatment decisions for an individual are related to the stage of prostate cancer present in the individual.
A common classification of the spread of prostate cancer is the American Urological Association (AUA)
Developed by The AUA system classifies prostate tumors into four stages, AD. Stage A is a microscopic cancer inside the prostate, and additionally stages A1 and A2
Is subdivided into Lower stage A1 is a well-differentiated cancer restricted to one site inside the prostate. Treatment is generally observation, radical prostatectomy, or radiation therapy. Lower stage A2 is a moderately to poorly differentiated cancer at many sites inside the prostate. Treatment is radical prostatectomy or radiation therapy. Stage B is a palpable mass inside the prostate and is further subdivided into lower stages B1 and B2. In lower stage B1, the cancer forms small nodules in one lobe of the prostate. Lower stage B2
In, the cancer forms large or multiple nodules or occurs in both lobes of the prostate. Treatment of lower stages B1 and B2 is radical prostatectomy or radiation therapy. Stage C is a large cancer mass that contains most or all of the prostate and is further subdivided into two sub-stages. In lower stage C1, the cancer forms a continuous mass that may extend outside the prostate. In lower stage C2, the cancer forms a continuous mass that infiltrates the surrounding tissue. The treatment of both lower stages is radiation therapy, with or without drugs to address this cancer. The fourth stage, stage D, is metastatic cancer and is subdivided into two sub-stages. In lower stage D1, cancer appears in the pelvic lymph nodes. In lower stage D2, the cancer involves tissues outside the lymph nodes. Both lower stages of treatment are systemic drugs to address cancer as well as pain.

【0004】 しかしながら、現在の前立腺癌の病期分類方法は限定されたものである。最初
にA2、BまたはCと病期分類された前立腺癌の50%もが、実際は病期Dで転
移性である。転移の発見は重要であり、というのは転移性癌を有する患者の予後
は限局性癌を有する患者よりも不良であり、また、限局性癌を有する患者とは大
きく異なる治療を必要とするからである。限局性及び転移性の前立腺癌を有する
患者の5年生存率は、それぞれ93%及び29%である。
[0004] However, current staging methods for prostate cancer are limited. As many as 50% of prostate cancers initially staged as A2, B or C are stage D and metastatic. Finding metastases is important because patients with metastatic cancer have a worse prognosis than patients with localized cancer and require treatment that is significantly different from patients with localized cancer It is. The 5-year survival rates for patients with localized and metastatic prostate cancer are 93% and 29%, respectively.

【0005】 従って、ヒトにおける癌を病期分類して、そのような癌が転移したかどうかを
確定するための、また、ヒトにおける転移していない癌の経過を、転移の開始に
関して監視するための、より高感度で正確な方法に対する大きな必要性がある。
[0005] Thus, to staging cancer in humans to determine if such cancers have metastasized, and to monitor the course of non-metastatic cancer in humans with respect to the onset of metastasis There is a great need for more sensitive and accurate methods.

【0006】 パブリックドメインにおける多数のタンパク質は、前立腺癌のための診断マー
カーとして有用であることが見い出された。この診断マーカーを本明細書におい
て癌特異的遺伝子すなわちCSGと呼び、以下のものが挙げられるが、これらに
限定されるものではない:ヒト亜鉛−α2−糖タンパク質であるPro109(
Freje et al. Genomics 1993 18(3):575-587);ジンクフィンガーモチーフを有
しヒトシステインに富むタンパク質であるPro112(Liebhaber et al. Nuc
leic Acid Research 1990 18(13):3871-3879;WO9514772及びWO9845436);前立
腺特異的トランスグルタミナーゼであるPro111(Dubbink et al. Genomic
s 1998 51(3):434-444);膜貫通、LDLR、及びSRCRドメインを有し、2
1q22.3に位置する新規なセリンプロテアーゼであるPro115(Paolon
i-Giacobino et al. Genomics 1997 44(3):309-320;WO9837418及びWO987093)
;ヒト乳癌脂肪酸シンターゼであるPro110(米国特許第5,665,874号及びW
O9403599);ホメオボックス遺伝子、HOXB13であるPro113(Steini
cki et al. J. Invest. Dermatol. 1998 111:57-63);ヒトテトラスパンNET
−1であるPro114(WO9839446);及びヒトJM27タンパク質であるP
ro118(WO9845435)。こうしたCSGのESTはSEQ ID NO:1
、3、5、7、9、11、13及び15で示され、一方こうしたCSGの全長コ
ンティグはそれぞれSEQ ID NO:2、4、6、8、10、12、14及
び16で示される。本発明において使用するための追加のCSGは、本明細書に
おいてSEQ ID NO:17、18、19及び20で表される。
[0006] A number of proteins in the public domain have been found to be useful as diagnostic markers for prostate cancer. This diagnostic marker is referred to herein as a cancer-specific gene, or CSG, and includes, but is not limited to, Pro109, a human zinc-α2-glycoprotein (
Freje et al. Genomics 1993 18 (3): 575-587); Pro112 (Liebhaber et al. Nuc), a protein with a zinc finger motif and rich in human cysteine.
leic Acid Research 1990 18 (13): 3871-3879; WO9514772 and WO9845436); Pro111, a prostate-specific transglutaminase (Dubbink et al. Genomic)
s 1998 51 (3): 434-444); which has transmembrane, LDLR, and SRCR domains;
Pro115 (Paolon, a novel serine protease located at 1q22.3
i-Giacobino et al. Genomics 1997 44 (3): 309-320; WO9837418 and WO987093)
Pro110, a human breast cancer fatty acid synthase (US Pat. No. 5,665,874 and W
O9403599); Pro113 which is a homeobox gene, HOXB13 (Steini
cki et al. J. Invest. Dermatol. 1998 111: 57-63); human tetraspan NET
-1 which is Pro114 (WO9839446); and P which is a human JM27 protein
ro118 (WO9845435). These CSG ESTs have SEQ ID NO: 1.
, 3, 5, 7, 9, 11, 13 and 15, while the full length contigs of such CSGs are shown as SEQ ID NOs: 2, 4, 6, 8, 10, 12, 14 and 16, respectively. Additional CSGs for use in the present invention are represented herein by SEQ ID NOs: 17, 18, 19 and 20.

【0007】 本発明においては、本明細書においてCSGと呼ぶ癌特異的遺伝子によって前
立腺癌を検出、診断、監視、病期分類、予測、イメージング及び治療するための
方法を提供する。本発明のために、CSGは、ポリヌクレオチド配列SEQ I
D NO:1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、1
4、15、16、17、18、19または20を含む遺伝子によって発現する天
然のタンパク質を特に指す。また「CSG」が本明細書において意味するのは、
遺伝子コーディングにおける縮重が原因となって、SEQ ID NO:1〜2
0と比べるとヌクレオチド配列中に変異を含むが、依然として同じタンパク質を
コード化するポリヌクレオチドである。他に、本明細書において使用するCSG
が意味するものは、ポリヌクレオチド配列SEQ ID NO:1、2、3、4
、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、1
8、19若しくは20を含む遺伝子によってコード化される天然のmRNA、ポ
リヌクレオチド配列SEQ ID NO:1、2、3、4、5、6、7、8、9
、10、11、12、13、14、15、16、17、18、19若しくは20
を含む遺伝子のレベル、またはストリンジェント条件下でSEQ ID NO:
1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、
16、17、18、19若しくは20のアンチセンス配列とハイブリッド形成で
きるポリヌクレオチドのレベルである。
[0007] The present invention provides methods for detecting, diagnosing, monitoring, staging, predicting, imaging, and treating prostate cancer with a cancer-specific gene referred to herein as CSG. For the purposes of the present invention, CSG comprises the polynucleotide sequence SEQ I
D NO: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 1
It specifically refers to a native protein expressed by a gene comprising 4, 15, 16, 17, 18, 19 or 20. Also, “CSG” means in this specification,
Due to the degeneracy in gene coding, SEQ ID NOs: 1-2
Polynucleotides that contain mutations in the nucleotide sequence as compared to 0, but still encode the same protein. In addition, the CSG used herein
Means the polynucleotide sequence SEQ ID NO: 1, 2, 3, 4
, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 1
Natural mRNA encoded by a gene comprising 8, 19 or 20, polynucleotide sequence SEQ ID NO: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9
, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19 or 20
Or under stringent conditions, SEQ ID NO:
1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15,
The level of polynucleotide that can hybridize to 16, 17, 18, 19 or 20 antisense sequences.

【0008】 本発明の他の目的、特徴、利点及び態様は、以下の説明から当業者には明瞭に
なろう。しかしながら、以下の説明及び具体例は、本発明の好適な実施例を示し
ているものの、説明のためにのみ与えられることは理解できるはずである。開示
される本発明の精神及び範囲の内の様々な変更及び修正は、以下の説明を読むこ
とで、また、本開示の他の部分を読むことで当業者には容易に明瞭になろう。
[0008] Other objects, features, advantages and aspects of the present invention will become apparent to those skilled in the art from the following description. However, it is to be understood that the following description and specific examples, while illustrating preferred embodiments of the present invention, are provided by way of illustration only. Various changes and modifications within the spirit and scope of the disclosed invention will become readily apparent to those skilled in the art from reading the following description and from reading the other parts of the present disclosure.

【0009】 発明の要約 上述した目標及び他の目標を得るために、本発明の目的は、細胞、組織または
体液中のCSGのレベルの変化に関して、好ましくは同じ細胞、組織または体液
のタイプの正常なヒトの対照中のCSGのレベルと比較して分析することによっ
て、前立腺癌の存在を診断するための方法を提供することにあり、ここで、患者
対正常なヒトの対照におけるCSGのレベルの変化は、前立腺癌に関連している
SUMMARY OF THE INVENTION To achieve the above and other goals, the object of the present invention is to provide a method for altering the level of CSG in a cell, tissue or body fluid, preferably of the same cell, tissue or body fluid type. Providing a method for diagnosing the presence of prostate cancer by analyzing the level of CSG in normal human controls, wherein the level of CSG in patients versus normal human controls is analyzed. The change is associated with prostate cancer.

【0010】 さらに提供するのは、転移したことが分かっていない前立腺癌を有する患者に
おいて転移性の前立腺癌を診断する方法であって、この方法は、転移した前立腺
癌を有すると思われるヒトの患者を同定し;そのような患者から得た細胞、組織
、または体液の試料をCSGに関して分析し;そのような細胞、組織、または体
液中のCSGレベルを、好ましくは同じ細胞、組織、または体液のタイプの正常
なヒトの対照中のCSGのレベルと比較することによって行い、ここで、患者対
正常なヒトの対照におけるCSGレベルの増大は、転移した前立腺癌に関連して
いる。
[0010] Further provided is a method of diagnosing metastatic prostate cancer in a patient having prostate cancer not known to have metastasized, the method comprising the steps of diagnosing a human suspected of having metastatic prostate cancer. Identifying a patient; analyzing a cell, tissue, or fluid sample from such a patient for CSG; determining the level of CSG in such cells, tissue, or fluid, preferably in the same cell, tissue, or fluid. By comparing with the levels of CSG in normal human controls of the type, wherein the increase in CSG levels in patients versus normal human controls is associated with metastatic prostate cancer.

【0011】 また本発明が提供するのは、前立腺癌を有するヒトにおいてそのような癌を病
期分類する方法であって、この方法は、そのような癌を有するヒトの患者を同定
し;そのような患者から得た細胞、組織、または体液の試料をCSGに関して分
析し;そのような細胞、組織、または体液中のCSGレベルを、好ましくは同じ
細胞、組織または体液のタイプの正常なヒトの対照の試料中のCSGのレベルと
比較することによって行い、ここで、患者対正常なヒトの対照におけるCSGレ
ベルの増大は進行中の癌に関連しており、CSGのレベルの減少は減退中または
寛解中の癌に関連している。
[0011] Also provided by the present invention is a method of staging such cancer in a human having prostate cancer, the method identifying a human patient having such cancer; A sample of cells, tissues, or fluids obtained from such a patient is analyzed for CSG; the level of CSG in such cells, tissues, or fluids is preferably determined by normal humans of the same cell, tissue or fluid type By comparing to the level of CSG in a control sample, where the increase in CSG levels in the patient versus normal human control is associated with ongoing cancer, the decrease in CSG levels is in decline or Associated with cancer in remission.

【0012】 さらに提供するのは、前立腺癌を有するヒトにおいて、そのような癌を、転移
の開始に関して監視する方法である。この方法は、転移したことが分かっていな
いそのような癌を有するヒトの患者を同定し;そのような患者から得た細胞、組
織、または体液の試料をCSGに関して定期的に分析し;そのような細胞、組織
、または体液中のCSGレベルを、好ましくは同じ細胞、組織または体液のタイ
プの正常なヒトの対照の試料中のCSGのレベルと比較することを含み、ここで
、患者対正常なヒトの対照におけるCSGレベルの増大は、転移した癌に関連し
ている。
[0012] Further provided is a method of monitoring such cancer in a human having prostate cancer for the onset of metastasis. The method identifies human patients with such cancers that are not known to have metastasized; periodically analyzing samples of cells, tissues, or body fluids from such patients for CSG; Comparing the level of CSG in a healthy cell, tissue or body fluid with a level of CSG in a normal human control sample, preferably of the same cell, tissue or body fluid type, wherein the patient versus normal Increased CSG levels in human controls are associated with metastatic cancer.

【0013】 さらに提供するのは、前立腺癌を有するヒトにおけるCSGのレベルを調べる
ことによって、そのような癌を有するヒトにおけるそのような癌の病期の変化を
監視する方法である。この方法は、そのような癌を有するヒトの患者を同定し;
そのような患者から得た細胞、組織、または体液の試料をCSGに関して定期的
に分析し;そのような細胞、組織、または体液中のCSGレベルを、好ましくは
同じ細胞、組織または体液のタイプの正常なヒトの対照の試料中のCSGのレベ
ルと比較することを含み、ここで、患者対正常なヒトの対照におけるCSGレベ
ルの増大は進行中の癌に関連しており、CSGのレベルの減少は減退中または寛
解中の癌に関連している。
[0013] Further provided is a method of monitoring the change in the stage of such cancer in a person with such cancer by examining the level of CSG in the person with prostate cancer. The method identifies a human patient having such a cancer;
Samples of cells, tissues, or body fluids obtained from such patients are periodically analyzed for CSG; CSG levels in such cells, tissues, or body fluids are preferably measured for the same cell, tissue, or body fluid type. Comprising comparing the level of CSG in a sample of a normal human control, wherein the increase in the level of CSG in the patient versus the normal human control is associated with ongoing cancer and the level of CSG is decreased. Is associated with declining or remissioning cancer.

【0014】 さらに提供するのは、前立腺癌をイメージング及び治療する際に使用するため
の、CSGを標的とした新規な治療剤を設計する方法である。例えば1実施例に
おいては、CSGを標的とした抗体またはそのような抗体の断片等の治療剤を、
疾患または状態を検出または診断する目的で、患者におけるCSGの局在化を検
出またはイメージングするために使用できる。そのような抗体は、ポリクローナ
ル、モノクローナル、若しくはオムニクローナルとすることができ、または、分
子生物学技術によって製造できる。本明細書において全体にわたって使用する「
抗体」という用語はまた、SELEXと呼ばれる当業者には周知の試験管内進化
プロトコールから得られるもの等のアプタマー及び一本鎖オリゴヌクレオチドを
含むことを意図したものである。抗体を、様々な検出可能な標識を用いて標識化
でき、こうした標識としては、放射性同位体及び常磁性金属が挙げられるが、こ
れらに限定されるものではない。抗体またはその断片等の治療剤はまた、CSG
の発現を特徴とする疾患の治療において使用できる。治療への適用においては、
本抗体は、放射性同位体、酵素、毒素、薬剤またはプロドラッグ等の細胞毒性剤
へと誘導体化してもしなくても使用できる。
[0014] Further provided is a method of designing a novel therapeutic agent targeting CSG for use in imaging and treating prostate cancer. For example, in one embodiment, a therapeutic agent such as an antibody targeting CSG or a fragment of such an antibody is
It can be used to detect or image the localization of CSG in a patient for the purpose of detecting or diagnosing a disease or condition. Such antibodies can be polyclonal, monoclonal, or omniclonal, or can be produced by molecular biology techniques. As used throughout this specification,
The term "antibody" is also intended to include aptamers and single-stranded oligonucleotides, such as those obtained from the in vitro evolution protocol well known to those skilled in the art, referred to as SELEX. Antibodies can be labeled with a variety of detectable labels, including, but not limited to, radioisotopes and paramagnetic metals. Therapeutic agents such as antibodies or fragments thereof may also be CSG
Can be used in the treatment of diseases characterized by the expression of In therapeutic applications,
The antibodies can be used with or without derivatization to cytotoxic agents such as radioisotopes, enzymes, toxins, drugs or prodrugs.

【0015】 本発明の他の目的、特徴、利点及び態様は、以下の説明から当業者には明瞭に
なろう。しかしながら、以下の説明及び具体例は、本発明の好適な実施例を示し
ているものの、説明のためにのみ与えられることは理解できるはずである。開示
される本発明の精神及び範囲の内の様々な変更及び修正は、以下の説明を読むこ
とで、また、本開示の他の部分を読むことで当業者には容易に明瞭になろう。
[0015] Other objects, features, advantages and aspects of the present invention will become apparent to those skilled in the art from the following description. However, it is to be understood that the following description and specific examples, while illustrating preferred embodiments of the present invention, are provided by way of illustration only. Various changes and modifications within the spirit and scope of the disclosed invention will become readily apparent to those skilled in the art from reading the following description and from reading the other parts of the present disclosure.

【0016】 発明の詳細な説明 本発明は、ヒトの患者におけるCSGのレベルを正常なヒトの対照中のCSG
のものと比較することによって、癌を検出、診断、監視、病期分類及び予測する
ための、定量的及び定性的の両方の診断アッセイ及び方法に関する。本発明のた
めに、CSGレベルが意味するものは、特に、ポリヌクレオチド配列SEQ I
D NO:1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、1
4、15、16、17、18、19または20を含む遺伝子によって発現する天
然のタンパク質である。また「CSG」が本明細書において意味するのは、遺伝
子コーディングにおける縮重が原因となって、SEQ ID NO:1〜20と
比べるとヌクレオチド配列中に変異を含むが、依然として同じタンパク質をコー
ド化するポリヌクレオチドである。検出対象である天然のタンパク質は、全体、
分解産物、分子の複合体または化学修飾されたものとしてよい。他に、本明細書
において使用するCSGが意味するものは、ポリヌクレオチド配列SEQ ID
NO:1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14
、15、16、17、18、19若しくは20を含む遺伝子によってコード化さ
れる天然のmRNA、ポリヌクレオチド配列SEQ ID NO:1、2、3、
4、5、6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、
18、19若しくは20を含む遺伝子のレベル、またはストリンジェント条件下
でSEQ ID NO:1、2、3、4、5、6、7、8、9、10、11、1
2、13、14、15、16、17、18、19若しくは20のアンチセンス配
列とハイブリッド形成できるポリヌクレオチドのレベルである。そのようなレベ
ルを、正常な及び異常なレベルの決定を含めて、好ましくは少なくとも1つの細
胞、組織及び/または体液中で決定する。従って、例えば、正常な対照の体液、
細胞、または組織試料と比較してCSGタンパク質の過剰発現を診断するための
、本発明に従った診断アッセイを、前立腺癌の存在を診断するために使用してよ
い。
DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION The present invention relates to the level of CSG in a human patient in a normal human control.
To both quantitative and qualitative diagnostic assays and methods for detecting, diagnosing, monitoring, staging and predicting cancer by comparison with those of For the purposes of the present invention, what CSG levels mean is, in particular, the polynucleotide sequence SEQ I
D NO: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 1
It is a natural protein expressed by a gene containing 4, 15, 16, 17, 18, 19 or 20. Also, "CSG" herein means that due to degeneracy in gene coding, it contains mutations in the nucleotide sequence as compared to SEQ ID NOs: 1-20, but still encodes the same protein Polynucleotide. The natural protein to be detected is
It may be a degradation product, a complex of molecules or chemically modified. In addition, as used herein, CSG means polynucleotide sequence SEQ ID
NO: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14
MRNA, polynucleotide sequence SEQ ID NO: 1,2,3, encoded by a gene comprising, 15, 16, 17, 18, 19, or 20
4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17,
SEQ ID NO: 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 1 at the level of the gene containing 18, 19 or 20 or under stringent conditions.
The level of polynucleotide that can hybridize to 2, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, or 20 antisense sequences. Such levels, including determination of normal and abnormal levels, are preferably determined in at least one cell, tissue and / or body fluid. Thus, for example, a normal control body fluid,
A diagnostic assay according to the present invention for diagnosing CSG protein overexpression as compared to a cell or tissue sample may be used to diagnose the presence of prostate cancer.

【0017】 本発明の全ての方法は任意に、CSGのみならず他の癌マーカーのレベルを確
定することを含んでよい。CSGの他に、本発明において有用な他の癌マーカー
は、試験対象である癌によって決まり、当業者には周知である。 診断アッセイ 本発明は、細胞、組織または体液中のCSGのレベルの変化に関して、正常な
ヒトの対照から得た好ましくは同じタイプの細胞、組織または体液中のCSGの
レベルと比較して分析することによって、前立腺癌の存在を診断するための方法
を提供し、ここで、患者対正常なヒトの対照におけるCSGのレベルの増大は前
立腺癌の存在に関連している。
[0017] All methods of the invention may optionally include determining the level of CSG as well as other cancer markers. In addition to CSG, other cancer markers useful in the present invention depend on the cancer being tested and are well known to those skilled in the art. Diagnostic Assays The present invention relates to analyzing changes in the level of CSG in a cell, tissue or body fluid relative to the level of CSG in a cell, tissue or body fluid, preferably of the same type, obtained from a normal human control. Thereby provide a method for diagnosing the presence of prostate cancer, wherein increased levels of CSG in patients versus normal human controls are associated with the presence of prostate cancer.

【0018】 本発明を限定すること無く、一般的に、定量的診断アッセイの場合、試験対象
である患者が癌を有することを示す陽性の結果においては、CSG等の癌マーカ
ーの細胞、組織または体液レベルが、正常なヒトの対照の好ましくは同じ細胞、
組織または体液におけるよりも少なくとも2倍高く、最も好ましくは少なくとも
5倍高い。
Without limiting the invention, in general, in the case of a quantitative diagnostic assay, a positive result indicating that the patient to be tested has cancer has cells, tissues or cancer marker markers such as CSG. A fluid level, preferably the same cells of a normal human control,
At least 2 times higher, most preferably at least 5 times higher than in tissues or body fluids.

【0019】 本発明はまた、まだ転移していない前立腺癌を有する患者において、転移性の
前立腺癌を、転移の開始に関して診断する方法を提供する。本発明の方法におい
ては、転移したかもしれない(しかし転移したことは前もって分かっていない)
前立腺癌を有すると思われるヒトの癌患者を同定する。これは、当業者には周知
の様々な手段によって成し遂げられる。
[0019] The invention also provides a method of diagnosing metastatic prostate cancer with respect to the onset of metastasis in a patient having prostate cancer that has not yet metastasized. In the method of the present invention, metastasis may have occurred (but metastasis is not known in advance).
A human cancer patient suspected of having prostate cancer is identified. This can be accomplished by various means known to those skilled in the art.

【0020】 本発明においては、細胞、組織または体液中のCSGレベルの存在を決定する
ことは、転移していない前立腺癌と転移した前立腺癌とを区別するために特に有
用である。既存の技術は、転移した前立腺癌と転移していない前立腺癌とを区別
することが困難であり、適切な治療の選択は、そのようなことを知っているかに
しばしば依存する。
In the present invention, determining the presence of CSG levels in cells, tissues or body fluids is particularly useful for distinguishing between non-metastatic and metastatic prostate cancer. Existing techniques have difficulty distinguishing metastatic prostate cancer from non-metastatic prostate cancer, and the choice of appropriate treatment often depends on knowing such.

【0021】 本発明においては、上述の細胞、組織または体液中で測定する癌マーカーレベ
ルはCSGであり、これを、好ましくは同じ細胞、組織または体液のタイプの正
常なヒトの対照中のCSGのレベルと比較する。すなわち、観察対象である癌マ
ーカーがまさに血清中のCSGである場合、このレベルを好ましくは、正常なヒ
トの対照の血清中のCSGのレベルと比較する。患者対正常なヒトの対照におけ
るCSGの増大は、転移した前立腺癌に関連している。
In the present invention, the cancer marker level measured in the above-mentioned cell, tissue or body fluid is CSG, which is preferably the level of CSG in a normal human control of the same cell, tissue or body fluid type. Compare with level. That is, if the cancer marker being observed is exactly CSG in serum, this level is preferably compared to the level of CSG in serum of a normal human control. Elevated CSG in patients versus normal human controls is associated with metastatic prostate cancer.

【0022】 本発明を限定すること無く、一般的に、定量的診断アッセイの場合、試験また
は監視対象である患者における癌が転移したことを示す陽性の結果においては、
CSG等の癌マーカーの細胞、組織または体液レベルが、正常な患者の好ましく
は同じ細胞、組織または体液におけるよりも少なくとも2倍高く、最も好ましく
は少なくとも5倍高い。
Without limiting the invention, generally, in the case of a quantitative diagnostic assay, a positive result indicating that the cancer has metastasized in the patient being tested or monitored includes:
The cell, tissue or fluid level of a cancer marker such as CSG is at least two times higher, and most preferably at least five times higher than in a normal patient, preferably in the same cells, tissues or fluids.

【0023】 本明細書において使用する正常なヒトの対照は、癌を有しないヒトの患者及び
/またはこの患者から得た癌でない試料を含む;転移に関して診断または監視す
るための本方法においては、正常なヒトの対照はまた好ましくは、転移していな
い前立腺癌を有することが信頼性の高い方法によって確定したヒトの患者から得
た試料を含んでよい。 病期分類 本発明はまた、ヒトの患者において前立腺癌を病期分類する方法を提供する。
この方法は、そのような癌を有するヒトの患者を同定し、そのようなヒトの患者
から得た細胞、組織、または体液をCSGに関して分析することを含む。次に、
患者における確定したCSGレベルを、好ましくは同じ細胞、組織または体液の
タイプの正常なヒトの対照中のCSGのレベルと比較し、ここで、ヒトの患者対
正常なヒトの対照におけるCSGレベルの増大は進行中の癌に関連しており、C
SGのレベルの減少(しかし依然として真の正常レベルよりも増大した状態であ
る)は減退中または寛解中の癌に関連している。 監視 さらに提供するのは、前立腺癌を有するヒトの患者において、そのような癌を
、転移の開始に関して監視する方法である。この方法は、転移したことが分かっ
ていないそのような癌を有するヒトの患者を同定し;そのようなヒトの患者から
得た細胞、組織、または体液をCSGに関して定期的に分析し;ヒトの患者にお
ける確定したCSGレベルを、好ましくは同じ細胞、組織または体液のタイプの
正常なヒトの対照中のCSGのレベルと比較することを含み、ここで、ヒトの患
者対正常なヒトの対照におけるCSGレベルの増大は、転移した癌に関連してい
る。この方法においては、正常なヒトの対照の試料はまた前の患者の試料を含ん
でよい。
As used herein, a normal human control includes a human patient without cancer and / or a non-cancer sample obtained from the patient; in the method for diagnosing or monitoring for metastasis, A normal human control may also preferably include a sample obtained from a human patient that has been reliably determined to have prostate cancer that has not metastasized. Staging The invention also provides a method of staging prostate cancer in a human patient.
The method includes identifying a human patient with such a cancer and analyzing cells, tissues, or body fluids obtained from such a human patient for CSG. next,
The determined CSG level in the patient is compared to the level of CSG in a normal human control, preferably of the same cell, tissue or fluid type, wherein the increase in CSG levels in a human patient versus a normal human control Is associated with ongoing cancer and C
Decreased levels of SG (but still above true normal levels) are associated with declining or remissioning cancer. Monitoring Also provided is a method of monitoring such cancer in a human patient with prostate cancer for the onset of metastasis. This method identifies human patients with such cancers that are not known to have metastasized; periodically analyzes cells, tissues, or fluids from such human patients for CSG; Comparing the determined CSG level in the patient to the level of CSG in a normal human control, preferably of the same cell, tissue or fluid type, wherein the CSG in a human patient versus a normal human control Increased levels are associated with metastatic cancer. In this method, the normal human control sample may also include a previous patient sample.

【0024】 さらに本発明が提供するのは、前立腺癌を有するヒトの患者において、そのよ
うな癌の病期の変化を監視する方法である。この方法は、そのような癌を有する
ヒトの患者を同定し;そのようなヒトの患者から得た細胞、組織、または体液を
CSGに関して定期的に分析し;ヒトの患者における確定したCSGレベルを、
好ましくは同じ細胞、組織または体液のタイプの正常なヒトの対照中のCSGの
レベルと比較することを含み、ここで、ヒトの患者対正常なヒトの対照における
CSGレベルの増大は病期が進行中の癌に関連しており、CSGのレベルの減少
は病期が減退中または寛解中の癌に関連している。この方法においては、正常な
ヒトの対照の試料はまた前の患者の試料を含んでよい。
[0024] Further provided by the present invention is a method of monitoring changes in the stage of such cancer in a human patient having prostate cancer. The method includes identifying a human patient with such a cancer; periodically analyzing cells, tissues, or fluids obtained from such a human patient for CSG; determining the determined CSG levels in the human patient. ,
Preferably, the method comprises comparing the level of CSG in a normal human control of the same cell, tissue or fluid type, wherein an increase in the level of CSG in a human patient versus a normal human control progresses through the stage. It is associated with cancers in the middle, and reduced levels of CSG are associated with cancers that are declining or in remission. In this method, the normal human control sample may also include a previous patient sample.

【0025】 転移の開始に関する患者の監視は定期的なものであり、好ましくは年4回行う
。しかしながらこの頻度は、癌、個々の患者、及び癌の病期によって変えてよい
。 アッセイ技術 患者から得た試料中の、本発明のCSG等の遺伝子の発現のレベル(タンパク
質レベルを含む)を決定するために使用できるアッセイ技術は、当業者には周知
である。そのようなアッセイ方法としては、限定するものではなく、ラジオイム
ノアッセイ、逆転写PCR(RT−PCR)アッセイ、免疫組織化学アッセイ、
インサイチューハイブリダイゼーション法、競合的結合アッセイ、ウェスタンブ
ロット分析、ELISA及びプロテオミックアプローチ:二次元ゲル電気泳動法
(2D電気泳動法)並びに非ゲルベース手法の例えば質量分析法またはタンパク
質相互作用プロファイリングが挙げられる。こうしたものの中ではELISAは
、生物学的流体中の遺伝子の発現したタンパク質を診断するために好ましいこと
が多い。
Patient monitoring for the onset of metastasis is regular, preferably performed quarterly. However, this frequency may vary depending on the cancer, the individual patient, and the stage of the cancer. Assay Techniques Assay techniques that can be used to determine levels of expression (including protein levels) of a gene such as CSG of the present invention in a sample obtained from a patient are well-known to those of skill in the art. Such assay methods include, but are not limited to, radioimmunoassay, reverse transcription PCR (RT-PCR) assay, immunohistochemical assay,
In situ hybridization, competitive binding assays, western blot analysis, ELISA and proteomic approaches: include two-dimensional gel electrophoresis (2D electrophoresis) and non-gel based techniques such as mass spectrometry or protein interaction profiling. Of these, ELISA is often preferred for diagnosing expressed proteins of genes in biological fluids.

【0026】 ELISAは最初に、CSGに特異的な抗体、好ましくはモノクローナル抗体
を、市販源から容易に入手可能でない場合に作製することを含む。加えて一般に
、CSGに特異的に結合するレポーター抗体を作製する。レポーター抗体を、検
出可能な試薬の例えば放射性試薬、蛍光性試薬または酵素試薬の例として西洋ワ
サビペルオキシダーゼ酵素及びアルカリホスファターゼに付着させる。
An ELISA involves first making an antibody specific to CSG, preferably a monoclonal antibody, if not readily available from commercial sources. In addition, a reporter antibody that specifically binds to CSG is generally generated. The reporter antibody is attached to a detectable reagent such as a radioactive, fluorescent or enzymatic reagent, eg, horseradish peroxidase enzyme and alkaline phosphatase.

【0027】 ELISAを実行するためには、CSGに特異的な抗体を、この抗体と結合す
るポリスチレン皿等の固体支持体表面でインキュベートする。皿表面の自由なタ
ンパク質結合部位を次に被覆するために、非特異的タンパク質の例えばウシ血清
アルブミンと共にインキュベートする。次いで、分析対象である試料を皿中でイ
ンキュベートし、その間にCSGは、ポリスチレン皿に付着した特異的抗体と結
合する。未結合の試料を緩衝液で洗い流す。CSGを特異的に指向しかつ西洋ワ
サビペルオキシダーゼ等の検出可能な試薬と結合したレポーター抗体を皿に入れ
、レポーター抗体とCSGに結合したモノクローナル抗体との結合をもたらす。
未付着のレポーター抗体を次に洗い流す。比色用基質をはじめとする、ペルオキ
シダーゼ活性に関する試薬を次に皿に加える。CSG抗体と結合した固定化ペル
オキシダーゼは、着色した反応生成物を生成する。所定の時間に生じた色の量は
、試料中に存在するCSGタンパク質の量に比例する。定量的結果は一般的には
、標準曲線を参照することで得られる。
To perform the ELISA, an antibody specific for CSG is incubated on the surface of a solid support, such as a polystyrene dish, that binds the antibody. The non-specific proteins, such as bovine serum albumin, are then incubated to cover the free protein binding sites on the dish surface. The sample to be analyzed is then incubated in the dish, during which time CSG binds to the specific antibody attached to the polystyrene dish. Wash away unbound sample with buffer. A reporter antibody specifically directed to CSG and conjugated to a detectable reagent such as horseradish peroxidase is placed in a dish, resulting in binding of the reporter antibody to the monoclonal antibody conjugated to CSG.
Unattached reporter antibody is then washed away. Reagents for peroxidase activity, including a colorimetric substrate, are then added to the dish. Immobilized peroxidase bound to the CSG antibody produces a colored reaction product. The amount of color generated at a given time is proportional to the amount of CSG protein present in the sample. Quantitative results are generally obtained by reference to a standard curve.

【0028】 競合アッセイも用いることができ、このアッセイでは、CSGに特異的な抗体
を固体支持体に付着させ、標識化したCSGと宿主から得た試料とを、固体支持
体の上を通す。固体支持体に付着しかつ検出された標識の量を、試料中のCSG
の量と相関させることができる。
[0028] A competition assay can also be used, in which an antibody specific for CSG is attached to a solid support, and labeled CSG and a sample obtained from a host are passed over the solid support. The amount of label attached to the solid support and detected was determined by the amount of CSG in the sample.
Can be correlated with the amount of

【0029】 また核酸法を、前立腺癌のためのマーカーとしてCSGのmRNAを検出する
ために使用することができる。ポリメラーゼ連鎖反応(PCR)、他の核酸法の
例えばリガーゼ連鎖反応(LCR)及び核酸配列ベースの増幅(NASABA)
を、様々な悪性腫瘍を診断及び監視する目的で悪性細胞を検出するために使用で
きる。例えば、逆転写PCR(RT−PCR)は強力な技術であり、何千もの他
のmRNA種の複雑な混合物中の特定のmRNA集団の存在を検出するために使
用できる。RT−PCRにおいては、mRNA種をまず逆転写酵素を使用して相
補的DNA(cDNA)に逆転写する;cDNAを次に、標準的なPCR反応に
おけるように増幅する。RT−PCRは従って、増幅によって、単一種のmRN
Aの存在を明らかにできる。従って、mRNAが、これを生産する細胞に非常に
特異的である場合、RT−PCRを使用して特定のタイプの細胞の存在を同定で
きる。
[0029] Nucleic acid methods can also be used to detect CSG mRNA as a marker for prostate cancer. Polymerase chain reaction (PCR), other nucleic acid methods such as ligase chain reaction (LCR) and nucleic acid sequence based amplification (NASABA)
Can be used to detect malignant cells for the purpose of diagnosing and monitoring various malignancies. For example, reverse transcription PCR (RT-PCR) is a powerful technique and can be used to detect the presence of a particular mRNA population in a complex mixture of thousands of other mRNA species. In RT-PCR, the mRNA species is first reverse transcribed using reverse transcriptase to complementary DNA (cDNA); the cDNA is then amplified as in a standard PCR reaction. RT-PCR, therefore, allows amplification of a single species of mRN
The existence of A can be clarified. Thus, if the mRNA is very specific for the cell that produces it, RT-PCR can be used to identify the presence of a particular type of cell.

【0030】 固体支持体表面に配列したクローンまたはオリゴヌクレオチドへのハイブリダ
イゼーション(すなわちグリッディング)を、上記遺伝子の発現の検出及び上記
遺伝子の発現のレベルの定量に使用できる。この手法においては、CSG遺伝子
をコード化するcDNAを基体に固定する。基体は任意の適切なタイプとしてよ
く、ガラス、ニトロセルロース、ナイロンまたはプラスチックが挙げられるが、
これらに限定されるものではない。CSG遺伝子をコード化するDNAの少なく
とも一部を基体に付着させ、次に、考察の対象となっている組織から分離したR
NAまたはこのRNAの相補的DNA(cDNA)コピーとしてよい被検体と共
にインキュベートする。基体に結合したDNAと被検体との間のハイブリダイゼ
ーションを幾つかの手段によって検出及び定量でき、こうした手段としては、被
検体の放射性標識化若しくは蛍光標識化またはハイブリッドを検出するように設
計された第2の分子が挙げられるが、これらに限定されるものではない。遺伝子
発現のレベルの定量は、被検体から得た信号の強度を既知の標準試料から求めた
ものと比較することで行うことができる。標準試料を得るためには、標的遺伝子
をインビトロ転写し、収率を定量し、次にこの材料を使用して標準曲線を生成す
る。
[0030] Hybridization (ie, gridding) to clones or oligonucleotides arrayed on the surface of a solid support can be used to detect expression of the gene and to quantify the level of expression of the gene. In this technique, a cDNA encoding the CSG gene is immobilized on a substrate. The substrate may be of any suitable type, including glass, nitrocellulose, nylon or plastic,
It is not limited to these. At least a portion of the DNA encoding the CSG gene is attached to a substrate and then isolated from the tissue of interest.
Incubate with the analyte, which may be NA or a complementary DNA (cDNA) copy of this RNA. Hybridization between the DNA bound to the substrate and the analyte can be detected and quantified by a number of means, such as those designed to detect radioactive or fluorescent labeling or hybrids of the analyte. A second molecule includes, but is not limited to. Quantification of the level of gene expression can be performed by comparing the intensity of the signal obtained from the subject with that obtained from a known standard sample. To obtain a standard sample, the target gene is transcribed in vitro, the yield is quantified, and the material is then used to generate a standard curve.

【0031】 プロテオミックアプローチの中では、2D電気泳動法は当業者には周知の技術
である。血清等の試料からの個々のタンパク質の分離を、通常ポリアクリルアミ
ドゲル表面で、様々な特性によって、タンパク質の逐次分離を使用して成し遂げ
る。まずタンパク質を電流を使用して大きさによって分離する。電流は全てのタ
ンパク質に均一に作用するので、より小さなタンパク質は、より大きなタンパク
質よりも遠くまでゲル表面を移動する。第2の次元では、第1の次元と直角に交
わる電流を流し、タンパク質を、大きさによってではなく各タンパク質が帯びる
特異的な電荷によって分離する。配列が異なるどの2つのタンパク質も、大きさ
及び電荷の両方が同一になることはないので、2D分離の結果は、各々のタンパ
ク質が唯一のスポットを占める正方形のゲルである。化学的プローブ若しくは抗
体プローブを用いたスポットの分析、またはその後のタンパク質マイクロシーク
エンシングは、所定のタンパク質の相対的存在量と試料中のタンパク質の正体と
を明らかにすることができる。
[0031] Among the proteomic approaches, 2D electrophoresis is a technique well known to those skilled in the art. Separation of individual proteins from a sample, such as serum, is accomplished using sequential separation of proteins, usually on a polyacrylamide gel surface, with various properties. First, proteins are separated by size using current. Because the current acts uniformly on all proteins, smaller proteins travel farther on the gel surface than larger proteins. In the second dimension, a current is passed perpendicular to the first dimension, separating the proteins not by size, but by the specific charge that each protein carries. The result of a 2D separation is a square gel in which each protein occupies a unique spot, as no two proteins with different sequences will be identical in both size and charge. Analysis of spots using chemical or antibody probes, or subsequent protein microsequencing, can reveal the relative abundance of a given protein and the identity of the protein in a sample.

【0032】 上記の試験を、患者から得たホモジェネートまたは可溶化した組織等の様々な
細胞、体液及び/または組織抽出物から得た試料に関して実行できる。組織抽出
物は、慣例的には組織生検及び解剖材料から得られる。本発明において有用な体
液としては、血液、尿、唾液若しくは任意の他の身体の分泌物またはこれらの派
生物が挙げられる。血液は、全血、血漿、血清または血液の任意の派生物を含む
ことを意図したものである。 CSGのインビボでのターゲッティング 上述したCSGの同定はまた、癌、特に前立腺癌をイメージング及び治療する
ための新規な治療法の合理的な設計において有用である。例えば、1実施例にお
いては、CSGに特異的に結合する抗体は、前立腺癌に罹患していると思われる
患者においてインビボで上昇させ、使用することができる。CSGに特異的に結
合する抗体を、前立腺癌を有すると思われる患者に、診断及び/または治療目的
で注射できる。インビボ診断のための抗体の製造及び使用は従来技術において周
知である。例えば、インジウム−111で標識化した抗体−キレート化剤は、癌
胎児性抗原を発現する腫瘍のラジオイムノシントグラフィックイメージングにお
ける使用に関して説明されている(Sumerdon et al. Nucl. Med. Biol. 1990 17
:247-254)。特にこうした抗体−キレート化剤は、再発性直腸結腸癌を有すると
思われる患者において腫瘍の検出の際に使用されてきた(Griffin et al. J. Cl
in. Onc. 1991 9:631-640)。磁気共鳴映像法において使用するための標識とし
て常磁性イオンを用いた抗体もまた説明されている(Lauffer, R.B. Magnetic R
esonance in Medicine 1991 22:339-342)。CSGを指向する抗体を同様にして
使用できる。CSGに特異的に結合する標識抗体を、前立腺癌を有すると思われ
る患者に、患者の疾患の状態の診断または病期分類の目的で注射できる。使用す
る標識は、使用するイメージング形式に従って選択する。例えば、放射性標識の
例えばインジウム−111、テクネチウム−99mまたはヨウ素−131は、平
面走査またはシングルフォトン断層撮影(SPECT)のために使用できる。陽
電子放射標識の例えばフッ素−19は、陽電子放射断層法において使用できる。
常磁性イオンの例えばガドリニウム(III)またはマンガン(II)は、磁気
共鳴映像法(MRI)において使用できる。標識の局在化によって、癌の広がり
の測定が可能になる。また臓器または組織内部の標識の量によって、この臓器ま
たは組織中に癌が存在するかしないかを決定することが可能になる。
The above tests can be performed on samples obtained from various cells, body fluids and / or tissue extracts, such as homogenates or solubilized tissues obtained from patients. Tissue extracts are routinely obtained from tissue biopsies and dissected material. Body fluids useful in the present invention include blood, urine, saliva or any other bodily secretions or derivatives thereof. Blood is intended to include whole blood, plasma, serum or any derivative of blood. In vivo targeting of CSG The identification of CSG described above is also useful in the rational design of novel therapeutics for imaging and treating cancer, especially prostate cancer. For example, in one embodiment, an antibody that specifically binds to CSG can be raised and used in vivo in a patient suspected of having prostate cancer. Antibodies that specifically bind to CSG can be injected into patients suspected of having prostate cancer for diagnostic and / or therapeutic purposes. The production and use of antibodies for in vivo diagnosis is well known in the art. For example, antibody-chelators labeled with indium-111 have been described for use in radioimmunosyntographic imaging of tumors that express carcinoembryonic antigen (Sumerdon et al. Nucl. Med. Biol. 1990 17
: 247-254). In particular, such antibody-chelators have been used in the detection of tumors in patients suspected of having recurrent colorectal cancer (Griffin et al. J. Cl.
in. Onc. 1991 9: 631-640). Antibodies using paramagnetic ions as labels for use in magnetic resonance imaging have also been described (Lauffer, RB Magnetic R
esonance in Medicine 1991 22: 339-342). Antibodies directed against CSG can be used in a similar manner. A labeled antibody that specifically binds to CSG can be injected into a patient suspected of having prostate cancer for the purpose of diagnosing or staging the patient's disease state. The label used is chosen according to the imaging format used. For example, radioactive labels such as indium-111, technetium-99m or iodine-131 can be used for planar scanning or single photon tomography (SPECT). Positron emitting labels such as fluorine-19 can be used in positron emission tomography.
Paramagnetic ions such as gadolinium (III) or manganese (II) can be used in magnetic resonance imaging (MRI). Localization of the label allows measurement of the spread of the cancer. Also, the amount of label inside an organ or tissue makes it possible to determine whether cancer is present in this organ or tissue.

【0033】 前立腺癌と診断された患者の場合、CSGに特異的に結合する抗体の注射はま
た、治療上の利益を有し得る。抗体はその治療効果を単独で発揮できるかもしれ
ない。他に、抗体を、その治療効果を強化するために、薬剤、毒素または放射性
核種等の細胞毒性剤と結合させることができる。薬剤モノクローナル抗体は、従
来技術において、例えばGarnett and Baldwin, Cancer Research 1986 46:2407-
2412に説明されている。様々な癌の治療のための、モノクローナル抗体と結合し
た毒素の使用はまた、Pastan et al. Cell 1986 47:641-648に説明されている。
イットリウム−90標識化モノクローナル抗体は、腫瘍に送達する線量を最大に
し同時に正常組織への毒性を制限することに関して説明されている(Goodwin an
d Meares Cancer Supplement 1997 80:2675-2680)。他の細胞毒性放射性核種(
銅−67、ヨウ素−131及びレニウム−186が挙げられるが、これらに限定
されるものではない)もCSGに対する抗体の標識化のために使用できる。
For patients diagnosed with prostate cancer, injection of an antibody that specifically binds to CSG may also have therapeutic benefit. Antibodies may be able to exert their therapeutic effects alone. Alternatively, the antibody can be conjugated to a cytotoxic agent such as a drug, toxin or radionuclide to enhance its therapeutic effect. Drug monoclonal antibodies have been described in the prior art, for example, in Garnett and Baldwin, Cancer Research 1986 46: 2407-.
2412. The use of toxins conjugated to monoclonal antibodies for the treatment of various cancers is also described in Pastan et al. Cell 1986 47: 641-648.
Yttrium-90 labeled monoclonal antibodies have been described for maximizing dose delivered to tumors and at the same time limiting toxicity to normal tissues (Goodwin an).
d Meares Cancer Supplement 1997 80: 2675-2680). Other cytotoxic radionuclides (
(Including, but not limited to, copper-67, iodine-131, and rhenium-186) can also be used for labeling antibodies to CSG.

【0034】 こうしたインビボ方法において使用できる抗体としては、ポリクローナル、モ
ノクローナル及びオムニクローナル抗体並びに分子生物学技術によって製造され
る抗体が挙げられる。抗体断片、並びにSELEXと呼ばれる当業者には周知の
試験管内進化プロトコールから得られるもの等のアプタマー及び一本鎖オリゴヌ
クレオチドもまた使用できる。
[0034] Antibodies that can be used in such in vivo methods include polyclonal, monoclonal and omniclonal antibodies and antibodies produced by molecular biology techniques. Antibody fragments, as well as aptamers and single-stranded oligonucleotides, such as those obtained from in vitro evolution protocols well known to those skilled in the art, referred to as SELEX, can also be used.

【0035】 CSGの諸領域に特異的に結合することがコンピュータイメージングによって
予測される小さな分子もまた、前立腺癌をイメージング及び治療する際に使用す
るために設計し、合成し、試験できる。さらに、本明細書において同定されたC
SGに分子が結合する能力を評価することで、分子のライブラリを、潜在的な制
癌剤を得るためにふるい分けできる。CSGに結合できるとしてライブラリ中で
同定された分子は、前立腺癌を治療する際に使用するためにさらに評価するため
の主要な候補である。
Small molecules predicted by computer imaging to specifically bind to regions of the CSG can also be designed, synthesized, and tested for use in imaging and treating prostate cancer. In addition, the C identified herein
By assessing the ability of a molecule to bind to SG, a library of molecules can be screened for potential anti-cancer agents. Molecules identified in the library as being capable of binding CSG are prime candidates for further evaluation for use in treating prostate cancer.

【0036】 実施例 本発明を以下の実施例によってさらに説明する。この実施例を、具体的な実施
例を参照することで本発明を説明するためにのみ提供する。こうした例示は本発
明の特定の態様を説明するが、開示される本発明の限定を示すものでも範囲を定
めるものでもない。
EXAMPLES The present invention is further described by the following examples. This example is provided only to illustrate the invention by reference to specific examples. Such exemplifications illustrate particular embodiments of the invention, but are not intended to be limiting or limiting of the disclosed invention.

【0037】 本明細書において略述する実施例の全てを、特に詳細に説明しない限り、当業
者には周知であり常用の標準的な手法を使用して実行した。以下の実施例の常用
の分子生物学的手法は、Sambrook et al., MOLECULAR CLONING: A LABORATORY M
ANUAL, 2nd Ed.; Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor,
N.Y. (1989)等の標準的な実験室便覧に説明するようにして実行できる。 実施例1:CSGの同定 CSGの同定は、diaDexus LLC, Santa Clara, CAが開発したデータマイニン
グCancer Leads Automatic Search Package(CLASP)を使用して、Incyte
Pharmaceuticals, Palo Alto, CAから入手可能なLIFESEQデータベース中
のデータの体系的分析によって実行した。
[0037] All of the examples outlined herein, unless otherwise specified, were performed using standard techniques well known and routine to those skilled in the art. Common molecular biology techniques in the following examples are described in Sambrook et al., MOLECULAR CLONING: A LABORATORY M
ANUAL, 2nd Ed .; Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor,
It can be performed as described in standard laboratory manuals such as NY (1989). Example 1: Identification of CSG CSG was identified using Incyte using the Data Mining Cancer Leads Automatic Search Package (CLASP) developed by diaDexus LLC, Santa Clara, CA.
Performed by systematic analysis of data in the LIFESEQ database available from Pharmaceuticals, Palo Alto, CA.

【0038】 CLASPは以下のステップを実行する:標的臓器対他の全ての臓器における
、対応するESTの存在量レベルに基づいた、高発現した臓器特異的遺伝子の選
択;正常、腫瘍組織、疾患組織及び腫瘍または疾患に関連した組織ライブラリ中
の、各高発現した臓器特異的遺伝子の発現レベルの分析;構成要素ESTは腫瘍
ライブラリ中にのみまたはよりしばしば見い出されたことを証明する候補の選択
。CLASPは、高発現した臓器及び癌特異的遺伝子の同定を可能にする。深さ
評価における最後のマニュアルを次に実行して、CSGの選択を完結する。
CLASP performs the following steps: selection of highly expressed organ-specific genes based on abundance levels of the corresponding ESTs in the target organ versus all other organs; normal, tumor tissue, diseased tissue And analysis of the expression levels of each highly expressed organ-specific gene in a tumor or disease-related tissue library; selection of candidates demonstrating that the component EST was found only or more often in the tumor library. CLASP allows the identification of highly expressed organs and cancer-specific genes. The last manual in depth evaluation is then executed to complete the CSG selection.

【0039】 以下の表1に表すクローンは、前立腺癌を診断、監視、病期分類、イメージン
グ及び治療する際に有用なCSGである。
The clones shown in Table 1 below are CSGs useful in diagnosing, monitoring, staging, imaging and treating prostate cancer.

【0040】[0040]

【表1】 [Table 1]

【0041】 実施例2:遺伝子発現の相対的定量 蛍光性Taqmanプローブを用いたリアルタイム定量PCRは、Taq D
NAポリメラーゼの5’−3’ヌクレアーゼ活性を利用する定量検出系である。
この方法は、5’レポーター染料及び下流の3’消光剤染料を用いて標識化した
内部蛍光性オリゴヌクレオチドプローブ(Taqman)を使用する。PCRの
最中に、Taq DNAポリメラーゼの5’−3’ヌクレアーゼ活性はレポータ
ーを放出し、次にレポーターの蛍光を、モデル7700配列検出系(PE applied
Biosystems, Foster City, CA, USA)のレーザー検出器で検出できる。
Example 2: Relative quantification of gene expression Real-time quantitative PCR using a fluorescent Taqman probe was performed using Taq D
This is a quantitative detection system utilizing the 5'-3 'nuclease activity of NA polymerase.
This method uses an internal fluorescent oligonucleotide probe (Taqman) labeled with a 5 'reporter dye and a downstream 3' quencher dye. During PCR, the 5'-3 'nuclease activity of Taq DNA polymerase releases the reporter, and then the fluorescence of the reporter is measured using the model 7700 sequence detection system (PE applied
Biosystems, Foster City, CA, USA).

【0042】 内因性対照の増幅を使用して、反応に加えた試料RNAの量を標準化し、逆転
写酵素(RT)の効力に関して正規化する。シクロフィリン、グリセルアルデヒ
ド−3−リン酸脱水素酵素(GAPDH)、ATPアーゼ、または18Sリボソ
ームRNA(rRNA)をこの内因性対照として使用する。調査した全ての試料
間の相対的定量を計算するために、1つの試料の標的RNAレベルを、比較結果
のための基準として使用した(キャリブレータ)。「キャリブレータ」を基準と
した定量は、標準曲線法または比較法を使用して得られる(使用者用小雑誌#2
:ABI PRISM 7700配列検出系)。
Using the amplification of the endogenous control, the amount of sample RNA added to the reaction is normalized and normalized for reverse transcriptase (RT) potency. Cyclophilin, glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase (GAPDH), ATPase, or 18S ribosomal RNA (rRNA) is used as this endogenous control. To calculate the relative quantification between all the samples examined, the target RNA level of one sample was used as a reference for the comparison results (calibrators). Quantitation based on the "Calibrator" is obtained using the standard curve method or the comparison method (user magazine # 2
: ABI PRISM 7700 sequence detection system).

【0043】 正常組織及び癌組織における全ての試料に関して、組織分布及び標的遺伝子の
レベルを評価した。全RNAを、正常組織及び癌組織から、並びに癌及び対応す
るマッチド隣接組織から抽出した。続いて第1の鎖のcDNAを逆転写酵素を用
いて作製し、各標的遺伝子に特異的なプライマー及びTaqmanプローブを使
用してポリメラーゼ連鎖反応を行った。結果は、ABI PRISM 7700
配列検出器を使用して分析した。無名数は、特定の組織中の標的遺伝子の発現を
キャリブレータ組織と比較した相対的レベルである。 クローンID3424528H1(Pro109)の発現: CSG Pro109の場合、リアルタイム定量PCRは、以下のプライマー
を使用して実行した。 フォワードプライマー: 5’−ATCAGAACAAAGAGGCTGTGTC−3’(SEQ ID
NO:21) リバースプライマー: 5’−ATCTCTAAAGCCCCAACCTTC−3’(SEQ ID N
O:22) 表2に示す無名数は、12の正常な異なる組織中での、Pro109と呼ぶC
SGの発現の相対的レベルである。全ての値は正常な胃(キャリブレータ)と比
較してある。このRNA試料は市販のプールであり、異なる個人から得た特定の
組織のプール試料に由来する。
[0043] Tissue distribution and target gene levels were evaluated for all samples in normal and cancerous tissues. Total RNA was extracted from normal and cancerous tissues, and from cancer and corresponding matched adjacent tissues. Subsequently, first-strand cDNA was prepared using reverse transcriptase, and a polymerase chain reaction was performed using primers specific to each target gene and a Taqman probe. The results were from ABI PRISM 7700
Analyzed using a sequence detector. Anonymous numbers are the relative levels of target gene expression in a particular tissue compared to calibrator tissue. Expression of clone ID 3424528H1 (Pro109): For CSG Pro109, real-time quantitative PCR was performed using the following primers. Forward primer: 5'-ATCAGAACAAAGAGGCTGTGTC-3 '(SEQ ID
NO: 21) Reverse primer: 5'-ATCTCTAAAGCCCCAACCTTC-3 '(SEQ ID N
O: 22) The anonymous numbers shown in Table 2 indicate the C called Pro109 in 12 normal different tissues.
Relative level of SG expression. All values are relative to a normal stomach (calibrator). This RNA sample is a commercially available pool and is derived from a pool sample of a particular tissue obtained from a different individual.

【0044】[0044]

【表2】 [Table 2]

【0045】 表2における発現の相対的レベルは、Pro109のmRNA発現は、肝臓(
14.83)を除けば、分析した他の全ての正常組織と比較して前立腺において
より高い(11.24)ことを示す。膵臓(相対的発現レベル4.38)は、P
ro109のかなりのmRNAを発現する唯一の他の組織である。
The relative levels of expression in Table 2 show that Pro109 mRNA expression
14.83) shows higher (11.24) in prostate compared to all other normal tissues analyzed. Pancreas (relative expression level 4.38)
It is the only other tissue that expresses significant mRNA for ro109.

【0046】 表2における無名数は、異なる個人から得た特定の組織の試料のプールを分析
して得られた。これは、表3における単一の個人の組織試料から得たRNAに由
来する無名数と比較することはできない。
The absolute numbers in Table 2 were obtained by analyzing a pool of specific tissue samples from different individuals. This cannot be compared to the anonymous numbers derived from RNA from a single individual's tissue sample in Table 3.

【0047】 表3に示す無名数は、マッチング試料の28のペア及び4つのアンマッチド試
料中のPro109の発現の相対的レベルである。全ての値は正常な胃(キャリ
ブレータ)と比較してある。マッチングしたペアは、特定の組織の癌試料から得
たmRNA及び同じ個人から得た同じ組織の正常隣接試料から得たmRNAによ
って形成する。
The absolute numbers shown in Table 3 are the relative levels of expression of Pro109 in 28 pairs of matching samples and 4 unmatched samples. All values are relative to a normal stomach (calibrator). A matched pair is formed by mRNA from a cancer sample of a particular tissue and mRNA from a normal adjacent sample of the same tissue from the same individual.

【0048】[0048]

【表3】 [Table 3]

【0049】[0049]

【表4】 [Table 4]

【0050】 マッチング試料の分析において、より高いレベルの発現は前立腺中にあり、前
立腺組織に対する高い程度の組織特異性を示した。前立腺とは異なる分析した全
ての試料の中で、4つの癌試料(癌試料の乳房1は13.5、結腸1は16.1
1、肝臓1は8.43、及び肺2は7.39だった)のみが、前立腺中のmRN
A発現に匹敵する発現を示した。こうした結果は、正常なプール化試料のパネル
(表2)を用いて得られたある程度の組織特異性を裏付けた。
In analysis of matching samples, higher levels of expression were in the prostate, indicating a high degree of tissue specificity for prostate tissue. Among all samples analyzed different from the prostate, 4 cancer samples (13.5 for breast 1 and 16.1 for colon 1 of cancer samples)
1, liver 1 was 8.43 and lung 2 was 7.39) only mRN in prostate
It showed expression comparable to A expression. These results confirmed some tissue specificity obtained using a panel of normal pooled samples (Table 2).

【0051】 さらに、mRNA発現のレベルを、癌試料と、同じ個人から得た同質遺伝子型
の正常隣接組織とにおいて比較した。この比較は、癌に対する特異性を示す(例
えば、正常隣接部分と比較して、癌試料中のより高いレベルのmRNA発現)。
表3では、9つのうちの6つの原発性前立腺癌組織中のPro109の過剰発現
を、そのそれぞれの正常隣接部分と比較したものが示されている。このように、
試験した前立腺マッチング試料(合計で9つの前立腺マッチング試料)の66.
66%において、癌組織中の過剰発現が観察された。
In addition, levels of mRNA expression were compared in cancer samples and normal isogenic adjacent tissues from the same individual. This comparison indicates specificity for the cancer (eg, higher levels of mRNA expression in the cancer sample compared to the normal flanking region).
Table 3 shows the overexpression of Pro109 in six out of nine primary prostate cancer tissues compared to their respective normal neighbors. in this way,
66. Prostate matching samples tested (total of 9 prostate matching samples)
In 66%, overexpression in cancer tissue was observed.

【0052】 全体的に見て、組織特異性の程度に加えて、試験した原発性の前立腺マッチン
グ試料の66.66%におけるmRNAの過剰発現は、Pro109が、前立腺
癌のための診断マーカーであることを示す。 クローンID578349H1(Pro112)の発現: CSG Pro112の場合、リアルタイム定量PCRは、以下のプライマー
を使用して実行した。 フォワードプライマー: 5’−TGCCGAAGAGGTTCAGTGC−3’(SEQ ID NO:
23) リバースプライマー: 5’−GCCACAGTGGTACTGTCCAGAT−3’(SEQ ID
NO:24) 表4に示す無名数は、12の正常な異なる組織中での、CSG Pro112
の発現の相対的レベルである。全ての値は正常な胸腺(キャリブレータ)と比較
してある。このRNA試料は市販のプールであり、異なる個人から得た特定の組
織のプール試料に由来する。
Overall, in addition to the degree of tissue specificity, mRNA overexpression in 66.66% of the primary prostate matching samples tested makes Pro109 a diagnostic marker for prostate cancer. Indicates that Expression of clone ID 578349H1 (Pro112): For CSG Pro112, real-time quantitative PCR was performed using the following primers. Forward primer: 5'-TGCCGAAGAGGTTCAGGTGC-3 '(SEQ ID NO:
23) Reverse primer: 5'-GCCACAGGTGGTACTGTCCAGAT-3 '(SEQ ID
NO: 24) The anonymous numbers shown in Table 4 are for CSG Pro112 in 12 normal different tissues.
Is the relative level of expression. All values are relative to normal thymus (calibrator). This RNA sample is a commercially available pool and is derived from a pool sample of a particular tissue obtained from a different individual.

【0053】[0053]

【表5】 [Table 5]

【0054】 表4における発現の相対的レベルは、Pro112のmRNA発現は、分析し
た合計で12の組織と比較して(子宮及び乳房に次いで)正常前立腺組織のプー
ル中で3番目に高発現した遺伝子であることを示す。表4における無名数は、異
なる個人から得た特定の組織の試料のプールを分析して得られた。こうした結果
は、Pro112のmRNA発現は前立腺に特異的であることを証明し、従って
Pro112が、前立腺の疾患、特に癌のための診断マーカーであることを示す
。 クローンID1794013H1(Pro111)の発現: CSG Pro111の場合、リアルタイム定量PCRは、以下のプライマー
を使用して実行した。 フォワードプライマー: 5’−GCTGCAAGTTCTCCACATTGA−3’(SEQ ID N
O:25) リバースプライマー: 5’−CAGCCGCAGGTGAAACAC−3’(SEQ ID NO:2
6) 表5に示す無名数は、12の正常な異なる組織中での、CSG Pro111
の発現の相対的レベルである。全ての値は正常な精巣(キャリブレータ)と比較
してある。このRNA試料は市販のプールであり、異なる個人から得た特定の組
織のプール試料に由来する。
The relative levels of expression in Table 4 show that Pro112 mRNA expression was the third highest expressed in a pool of normal prostate tissue (after uterus and breast) compared to a total of 12 tissues analyzed. Indicates a gene. The anonymous numbers in Table 4 were obtained by analyzing a pool of specific tissue samples from different individuals. These results demonstrate that Pro112 mRNA expression is prostate-specific, and thus indicate that Pro112 is a diagnostic marker for prostate disease, especially cancer. Expression of Clone ID 1794013H1 (Pro111): For CSG Pro111, real-time quantitative PCR was performed using the following primers. Forward primer: 5'-GCTGCAAGTTCTCCACATTGA-3 '(SEQ ID N
O: 25) Reverse primer: 5′-CAGCCGCAGGTGAAACAC-3 ′ (SEQ ID NO: 2
6) The anonymous numbers shown in Table 5 indicate CSG Pro111 in 12 normal different tissues.
Is the relative level of expression. All values are relative to normal testis (calibrator). This RNA sample is a commercially available pool and is derived from a pool sample of a particular tissue obtained from a different individual.

【0055】[0055]

【表6】 [Table 6]

【0056】 表5における発現の相対的レベルは、Pro111のmRNA発現は、筋肉(
5166.6)を除けば、分析した他の全ての組織と比較して正常前立腺のプー
ル(1483.72)中で並外れて高いことを示す。こうした結果は、Pro1
11のmRNA発現は前立腺及び筋肉に対する特異性を示すことを証明する。
The relative levels of expression in Table 5 show that Pro111 mRNA expression
With the exception of 5166.6), it shows extraordinarily high levels in the pool of normal prostate (1483.72) compared to all other tissues analyzed. These results show that Pro1
11 demonstrates that mRNA expression indicates specificity for prostate and muscle.

【0057】 表5における無名数は、異なる個人から得た特定の組織の試料のプールを分析
して得られた。これは、表6における単一の個人の組織試料から得たRNAに由
来する無名数と比較することはできない。
The anonymous numbers in Table 5 were obtained by analyzing a pool of specific tissue samples from different individuals. This cannot be compared to the absolute numbers from RNA from single individual tissue samples in Table 6.

【0058】 表6に示す無名数は、マッチング試料の48のペア及び18のアンマッチド試
料中のPro111の発現の相対的レベルである。全ての値は正常な精巣(キャ
リブレータ)と比較してある。マッチングしたペアは、特定の組織の癌試料から
得たmRNA及び同じ個人から得た同じ組織の正常隣接試料から得たmRNAに
よって形成する。
The absolute numbers shown in Table 6 are the relative levels of expression of Pro111 in 48 pairs of matching samples and 18 unmatched samples. All values are relative to normal testis (calibrator). A matched pair is formed by mRNA from a cancer sample of a particular tissue and mRNA from a normal adjacent sample of the same tissue from the same individual.

【0059】[0059]

【表7】 [Table 7]

【0060】[0060]

【表8】 [Table 8]

【0061】[0061]

【表9】 [Table 9]

【0062】[0062]

【表10】 [Table 10]

【0063】 マッチング試料の分析において、より高いレベルの発現は前立腺中にあり、前
立腺に対する高い程度の組織特異性を示した。こうした結果は、正常なプール化
試料(表5)を用いて得られた組織特異性の結果を裏付ける。
In analysis of the matching samples, higher levels of expression were in the prostate, indicating a high degree of tissue specificity for the prostate. These results confirm the tissue specificity results obtained with the normal pooled samples (Table 5).

【0064】 さらに、癌試料と、同じ個人から得た同質遺伝子型の正常隣接組織とにおいて
、mRNA発現のレベルを比較した。この比較は、癌に対する特異性を示す(例
えば、正常隣接部分と比較して、癌試料中のより高いレベルのmRNA発現)。
表6では、16のうちの5つの原発性前立腺癌試料中のPro111の過剰発現
を、そのそれぞれの正常隣接部分と比較したもの(前立腺試料2、5、10、1
7及び19)が示されている。同様の発現レベルが、3つのアンマッチド前立腺
癌(前立腺試料13、14、15)、2つの前立腺炎(前立腺試料20、21)
、及び6つの良性の前立腺過形成試料(前立腺試料22〜27)において観察さ
れた。このように、試験した前立腺マッチング試料(合計で16の前立腺マッチ
ング試料)の31.25%において、癌組織中の過剰発現がある。
In addition, the level of mRNA expression was compared between the cancer sample and isogenic normal adjacent tissues obtained from the same individual. This comparison indicates specificity for the cancer (eg, higher levels of mRNA expression in the cancer sample compared to the normal flanking region).
In Table 6, the overexpression of Pro111 in 5 out of 16 primary prostate cancer samples compared to their respective normal neighbors (prostate samples 2, 5, 10, 1).
7 and 19) are shown. Similar expression levels indicate that three unmatched prostate cancers (prostate samples 13, 14, 15) and two prostatitis (prostate samples 20, 21)
, And six benign prostate hyperplasia samples (prostate samples 22-27). Thus, in 31.25% of the prostate matching samples tested (16 prostate matching samples in total), there is overexpression in cancerous tissue.

【0065】 全体的に見て、高いレベルの組織特異性に加えて、試験した前立腺マッチング
試料の31.25%におけるmRNAの過剰発現は、Pro111が、前立腺癌
のための診断マーカーであることを示す。 クローンID2189835H1(Pro115)の発現: CSG Pro115の場合、リアルタイム定量PCRは、以下のプライマー
を使用して実行した。 フォワードプライマー: 5’−TGGCTTTGAACTCAGGGTCA−3’(SEQ ID NO
:27) リバースプライマー: 5’−CGGATGCACCTCGTAGACAG−3’(SEQ ID NO
:28) 表7に示す無名数は、12の正常な異なる組織中での、CSG Pro115
の発現の相対的レベルである。全ての値は正常な胸腺(キャリブレータ)と比較
してある。このRNA試料は市販のプールであり、異なる個人から得た特定の組
織のプール試料に由来する。
Overall, in addition to high levels of tissue specificity, overexpression of mRNA in 31.25% of the tested prostate matching samples indicates that Pro111 is a diagnostic marker for prostate cancer. Show. Expression of Clone ID 2189835H1 (Pro115): For CSG Pro115, real-time quantitative PCR was performed using the following primers. Forward primer: 5'-TGGCTTTTGAACTCAGGGTCA-3 '(SEQ ID NO:
: 27) Reverse primer: 5'-CGGATGCACCTCGTAGACAG-3 '(SEQ ID NO:
: 28) The anonymous numbers shown in Table 7 indicate that CSG Pro115 in 12 normal different tissues.
Is the relative level of expression. All values are relative to normal thymus (calibrator). This RNA sample is a commercially available pool and is derived from a pool sample of a particular tissue obtained from a different individual.

【0066】[0066]

【表11】 [Table 11]

【0067】 表7における発現の相対的レベルは、Pro115のmRNA発現は、分析し
た他の全ての正常組織と比較して前立腺においてより高い(337.79)こと
を示す。肺(相対的発現レベル112.99)及び乳房(29.446)は、P
ro115の中程度のレベルのmRNAを発現する他の組織である。こうした結
果は、Pro115のmRNA発現が前立腺に非常に特異的であることを確定す
る。
The relative levels of expression in Table 7 indicate that Pro115 mRNA expression is higher in the prostate (337.79) compared to all other normal tissues analyzed. Lung (relative expression level 112.99) and breast (29.446)
ro115 is another tissue that expresses moderate levels of mRNA. These results confirm that Pro115 mRNA expression is highly specific for prostate.

【0068】 表7における無名数は、異なる個人から得た特定の組織の試料のプールを分析
して得られた。これは、表8における単一の個人の組織試料から得たRNAに由
来する無名数と比較することはできない。
The anonymous numbers in Table 7 were obtained by analyzing a pool of specific tissue samples from different individuals. This cannot be compared to the anonymous numbers from RNA from single individual tissue samples in Table 8.

【0069】 表8に示す無名数は、マッチング試料の17のペア及び21のアンマッチド試
料中のPro115の発現の相対的レベルである。全ての値は正常な胸腺(キャ
リブレータ)と比較してある。マッチングしたペアは、特定の組織の癌試料から
得たmRNA及び同じ個人から得た同じ組織の正常隣接試料から得たmRNAに
よって形成する。
The anonymous numbers shown in Table 8 are the relative levels of expression of Pro115 in 17 pairs of matching samples and 21 unmatched samples. All values are relative to normal thymus (calibrator). A matched pair is formed by mRNA from a cancer sample of a particular tissue and mRNA from a normal adjacent sample of the same tissue from the same individual.

【0070】[0070]

【表12】 [Table 12]

【0071】[0071]

【表13】 [Table 13]

【0072】 より高いレベルの発現は前立腺中に見られ、前立腺組織に対する高い程度の組
織特異性を示した。前立腺とは異なる分析した全ての試料の中で、2つの癌試料
(結腸2は116.97及び卵巣2は261.4)及び5つの正常隣接組織試料
(小腸2、結腸1、結腸2、腎臓1及び肺2)のみが、前立腺中のmRNA発現
に匹敵する発現を示した。こうした結果は、正常なプール化試料のパネル(表7
)を用いて得られた組織特異性の結果を裏付けた。
[0072] Higher levels of expression were found in the prostate, indicating a high degree of tissue specificity for prostate tissue. Among all samples analyzed different from the prostate, two cancer samples (116.97 for colon 2 and 261.4 for ovary 2) and five normal adjacent tissue samples (small intestine 2, colon 1, colon 2, kidney Only 1 and lung 2) showed expression comparable to mRNA expression in prostate. These results are shown in a panel of normal pooled samples (Table 7).
) Confirmed the tissue specificity results obtained.

【0073】 さらに、癌試料と、同じ個人から得た同質遺伝子型の正常隣接組織とにおいて
、mRNA発現のレベルを比較した。この比較は、癌に対する特異性を示す(例
えば、正常隣接部分と比較して、癌試料中のより高いレベルのmRNA発現)。
表8では、4つのうちの3つのマッチド前立腺癌組織(前立腺試料1、5及び8
)中のPro115のより高い発現が示されている。
In addition, the levels of mRNA expression were compared between cancer samples and isogenic normal adjacent tissues obtained from the same individual. This comparison indicates specificity for the cancer (eg, higher levels of mRNA expression in the cancer sample compared to the normal flanking region).
In Table 8, three of the four matched prostate cancer tissues (prostate samples 1, 5 and 8)
Higher expression of Pro115 in is shown.

【0074】 全体的に見て、高いレベルの組織特異性に加えて、試験した前立腺マッチング
試料の75%におけるより高い発現は、Pro115が、前立腺癌のための診断
マーカーであることを示す。 クローンID3277219H1(Pro110)の発現: CSG Pro110の場合、リアルタイム定量PCRは、以下のプライマー
を使用して実行した。 フォワードプライマー: 5’−CGGCAACCTGGTAGTGAGTG−3’(SEQ ID NO
:29) リバースプライマー: 5’−CGCAGCTCCTTGTAAACTTCAG−3’(SEQ ID
NO:30) 表9に示す無名数は、12の正常な異なる組織中での、CSG Pro110
の発現の相対的レベルである。全ての値は正常な小腸(キャリブレータ)と比較
してある。このRNA試料は市販のプールであり、異なる個人から得た特定の組
織のプール試料に由来する。
Overall, in addition to the high level of tissue specificity, higher expression in 75% of the tested prostate matching samples indicates that Pro115 is a diagnostic marker for prostate cancer. Expression of Clone ID 3277219H1 (Pro110): For CSG Pro110, real-time quantitative PCR was performed using the following primers. Forward primer: 5'-CGGCAACCTGGGTAGTGAGTG-3 '(SEQ ID NO:
: 29) Reverse primer: 5'-CGCAGCTCCTTGTAAACTTCAG-3 '(SEQ ID
NO: 30) The anonymous numbers shown in Table 9 indicate CSG Pro110 in 12 normal different tissues.
Is the relative level of expression. All values are relative to normal small intestine (calibrator). This RNA sample is a commercially available pool and is derived from a pool sample of a particular tissue obtained from a different individual.

【0075】[0075]

【表14】 [Table 14]

【0076】 表9における発現の相対的レベルは、Pro110のmRNA発現は、正常な
前立腺(3.01)においては、分析した他の全ての正常組織と比較して同じ程
高くはないことを示す。
The relative levels of expression in Table 9 indicate that Pro110 mRNA expression is not as high in normal prostate (3.01) compared to all other normal tissues analyzed. .

【0077】 表9における無名数は、異なる個人から得た特定の組織の試料のプールを分析
して得られた。これは、表10における単一の個人の組織試料から得たRNAに
由来する無名数と比較することはできない。
The anonymous numbers in Table 9 were obtained by analyzing a pool of specific tissue samples from different individuals. This cannot be compared to the anonymous numbers derived from RNA from a single individual's tissue sample in Table 10.

【0078】 表10に示す無名数は、マッチング試料の33のペア中のPro110の発現
の相対的レベルである。全ての値は正常な小腸(キャリブレータ)と比較してあ
る。マッチングしたペアは、特定の組織の癌試料から得たmRNA及び同じ個人
から得た同じ組織の正常隣接試料から得たmRNAによって形成する。
The anonymous numbers shown in Table 10 are the relative levels of Pro110 expression in 33 pairs of matching samples. All values are relative to normal small intestine (calibrator). A matched pair is formed by mRNA from a cancer sample of a particular tissue and mRNA from a normal adjacent sample of the same tissue from the same individual.

【0079】[0079]

【表15】 [Table 15]

【0080】[0080]

【表16】 [Table 16]

【0081】 癌試料と、同じ個人から得た同質遺伝子型の正常隣接組織とにおいて、mRN
A発現のレベルを比較した。この比較は、癌に対する特異性を示す(例えば、正
常隣接部分と比較して、癌試料中のより高いレベルのmRNA発現)。表10で
は、9つのうちの8つの原発性前立腺癌組織中のPro110の過剰発現を、そ
のそれぞれの正常隣接部分と比較したもの(前立腺4を除く)が示されている。
このように、試験した前立腺マッチング試料(合計で9つの前立腺マッチング試
料)と比較して、癌前立腺組織の88.88%において癌組織中の過剰発現があ
った。
In cancer samples and isogenic normal adjacent tissues from the same individual, mRN
The level of A expression was compared. This comparison indicates specificity for the cancer (eg, higher levels of mRNA expression in the cancer sample compared to the normal flanking region). Table 10 shows Pro110 overexpression in eight of nine primary prostate cancer tissues compared to their respective normal adjacent parts (except prostate 4).
Thus, there was overexpression in cancer tissue in 88.88% of the cancer prostate tissue compared to the prostate matching samples tested (9 prostate matching samples in total).

【0082】 組織特異的ではないが、Pro110のmRNA発現は、前立腺癌組織中でア
ップレギュレーションを受けている。試験した原発性の前立腺マッチング癌試料
の88.88%におけるmRNAの過剰発現は、Pro110が、前立腺癌のた
めの診断マーカーであることを示す。Pro110はまた、小腸、結腸、肝臓、
乳房及び肺を含む、試験した幾つかの他の癌において過剰発現を示した(表10
を参照されたい)。従ってPro110を、他のタイプの癌のためにも診断マー
カーとしてよい。 クローンID1857415;遺伝子ID346880(Pro113)の発現
: CSG Pro113の場合、リアルタイム定量PCRは、以下のプライマー
を使用して実行した。 フォワードプライマー: 5’−CGGGAACCTACCAGCCTATG−3’(SEQ ID NO
:31) リバースプライマー: 5’−CAGGCAACAGGGAGTCATGT−3’(SEQ ID NO
:32) 表11に示す無名数は、12の正常な異なる組織中での、CSG Pro11
3の発現の相対的レベルである。全ての値は正常な胸腺(キャリブレータ)と比
較してある。このRNA試料は市販のプールであり、異なる個人から得た特定の
組織のプール試料に由来する。
Although not tissue specific, Pro110 mRNA expression is up-regulated in prostate cancer tissue. Overexpression of mRNA in 88.88% of the primary prostate matching cancer samples tested indicates that Pro110 is a diagnostic marker for prostate cancer. Pro110 is also used in the small intestine, colon, liver,
It showed overexpression in several other cancers tested, including breast and lung (Table 10).
Please refer to). Thus, Pro110 may be a diagnostic marker for other types of cancer. Clone ID 1857415; Expression of Gene ID 346880 (Pro113): For CSG Pro113, real-time quantitative PCR was performed using the following primers. Forward primer: 5′-CGGGAACCTCACCAGCCTATG-3 ′ (SEQ ID NO:
: 31) Reverse primer: 5'-CAGGCAACAGGGAGCATCATGT-3 '(SEQ ID NO:
: 32) The anonymous numbers shown in Table 11 are for CSG Pro11 in 12 normal different tissues.
3 is the relative level of expression. All values are relative to normal thymus (calibrator). This RNA sample is a commercially available pool and is derived from a pool sample of a particular tissue obtained from a different individual.

【0083】[0083]

【表17】 [Table 17]

【0084】 表11における発現の相対的レベルは、Pro113のmRNA発現は、分析
した他の全ての正常組織と比較して前立腺においてより高い(489.44)こ
とを示す。精巣(相対的発現レベル0.35)、子宮(0.13)、胸腺(1.
0)、腎臓(0.01)及び脳(0.03)が、Pro113のより低いmRN
Aレベルを発現する他の組織に含まれている。こうした結果は、Pro113の
mRNA発現が前立腺に非常に特異的であることを確定する。
The relative levels of expression in Table 11 indicate that Pro113 mRNA expression is higher (489.44) in the prostate compared to all other normal tissues analyzed. Testis (relative expression level 0.35), uterus (0.13), thymus (1.
0), kidney (0.01) and brain (0.03) have lower mRN of Pro113.
Included in other tissues that express A levels. These results confirm that Pro113 mRNA expression is highly specific for prostate.

【0085】 表11における無名数は、異なる個人から得た特定の組織の試料のプールを分
析して得られた。これは、表12における単一の個人の組織試料から得たRNA
に由来する無名数と比較することはできない。
The anonymous numbers in Table 11 were obtained by analyzing a pool of specific tissue samples from different individuals. This is the RNA from a single individual's tissue sample in Table 12.
Cannot be compared with the anonymous number derived from

【0086】 表12に示す無名数は、マッチング組織試料の78のペア及び25のアンマッ
チド組織試料中のPro113の発現の相対的レベルである。全ての値は正常な
胸腺(キャリブレータ)と比較してある。マッチングしたペアは、特定の組織の
癌試料から得たmRNA及び同じ個人から得た同じ組織の正常隣接試料から得た
mRNAによって形成する。同じ個人から正常隣接試料を得ることが可能でなか
った癌(例えば、卵巣)においては、異なる正常な個人から得た試料を分析した
The anonymous numbers shown in Table 12 are the relative levels of expression of Pro113 in 78 pairs of matching tissue samples and 25 unmatched tissue samples. All values are relative to normal thymus (calibrator). A matched pair is formed by mRNA from a cancer sample of a particular tissue and mRNA from a normal adjacent sample of the same tissue from the same individual. In cancers where it was not possible to obtain a normal adjacent sample from the same individual (eg, ovary), samples from different normal individuals were analyzed.

【0087】[0087]

【表18】 [Table 18]

【0088】[0088]

【表19】 [Table 19]

【0089】[0089]

【表20】 [Table 20]

【0090】[0090]

【表21】 [Table 21]

【0091】[0091]

【表22】 [Table 22]

【0092】 マッチング試料の分析において、より高いレベルの発現は前立腺中にあり、前
立腺組織に対する高い程度の組織特異性を示した。前立腺癌試料におけるより高
い発現レベルに加えて、Pro113の発現は、幾つかの他の癌において誘導さ
れる(正常隣接組織において発現しない場合)かまたはある程度アップレギュレ
ーションを受けることが見い出された。しかしながら、前立腺癌試料における相
対的発現及び倍率の増大は、他の癌組織におけるものをはるかに超え、非常に大
きい。
[0092] In analysis of the matching samples, higher levels of expression were in the prostate, indicating a high degree of tissue specificity for prostate tissue. In addition to higher expression levels in prostate cancer samples, Pro113 expression was found to be induced (if not expressed in normal adjacent tissues) in some other cancers or to some extent upregulated. However, the increase in relative expression and fold in prostate cancer samples is much greater than in other cancer tissues.

【0093】 さらに、癌試料と、同じ個人から得た同質遺伝子型の正常隣接組織とにおいて
、mRNA発現のレベルを比較した。この比較は、癌に対する特異性を示す(例
えば、正常隣接部分と比較して、癌試料中のより高いレベルのmRNA発現)。
表12では、16のうちの13の原発性前立腺癌組織中のPro113の過剰発
現を、そのそれぞれの正常隣接部分と比較したもの(前立腺試料2、3、4、5
、6、7、8、9、10、11、13、14、16)が示されている。このよう
に、試験した前立腺マッチング試料の81.25%について、癌組織中の過剰発
現があった。前立腺癌組織試料中の発現のレベルの中央値は609であるが、他
の全ての癌の中央値は、1つの結腸試料の結腸9を除けばわずかに7.93であ
る。結腸9の発現は、前立腺癌組織中に見られるものと同様だった。
In addition, the level of mRNA expression was compared between the cancer sample and isogenic normal adjacent tissues obtained from the same individual. This comparison indicates specificity for the cancer (eg, higher levels of mRNA expression in the cancer sample compared to the normal flanking region).
In Table 12, overexpression of Pro113 in 13 out of 16 primary prostate cancer tissues compared to their respective normal adjacent parts (prostate samples 2, 3, 4, 5).
, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 13, 14, 16). Thus, 81.25% of the tested prostate matching samples had overexpression in cancerous tissue. The median level of expression in prostate cancer tissue samples is 609, while the median value for all other cancers is only 7.93 except for colon 9 in one colon sample. Colon 9 expression was similar to that found in prostate cancer tissue.

【0094】 全体的に見て、高いレベルの組織特異性に加えて、試験した原発性の前立腺マ
ッチング試料の81.25%におけるmRNAの過剰発現は、Pro113が、
前立腺癌のための診断マーカーであることを示す。発現はまた、他の癌組織にお
いて、そのそれぞれの正常隣接組織と比較してより高いことが見い出され(腎臓
、膀胱、精巣、皮膚、胃、小腸、結腸、膵臓、肺、乳房、子宮内膜、子宮及び卵
巣)、従って、Pro113が汎癌マーカーであることを示す。 クローンID1810463H1(Pro114)の発現: CSG Pro114の場合、リアルタイム定量PCRは、以下のプライマー
を使用して実行した。 フォワードプライマー: 5’−TGGGCATCTGGGTGTCAA−3’(SEQ ID NO:3
3) リバースプライマー: 5’−CGGCTGCGATGAGGAAGTA−3’(SEQ ID NO:
34) 表13に示す無名数は、12の正常な異なる組織中での、CSG Pro11
4の発現の相対的レベルである。全ての値は正常な筋肉(キャリブレータ)と比
較してある。このRNA試料は市販のプールであり、異なる個人から得た特定の
組織のプール試料に由来する。
Overall, in addition to high levels of tissue specificity, overexpression of mRNA in 81.25% of the primary prostate matching samples tested indicates that Pro113
Indicates a diagnostic marker for prostate cancer. Expression is also found to be higher in other cancerous tissues compared to their respective normal adjacent tissues (kidney, bladder, testis, skin, stomach, small intestine, colon, pancreas, lung, breast, endometrium Uterus and ovary), thus indicating that Pro113 is a pan-cancer marker. Expression of clone ID 181463H1 (Pro114): For CSG Pro114, real-time quantitative PCR was performed using the following primers. Forward primer: 5'-TGGGCATCTGGGTGTTCA-3 '(SEQ ID NO: 3
3) Reverse primer: 5'-CGGCTGCGATGAGGAAGTA-3 '(SEQ ID NO:
34) The anonymous numbers shown in Table 13 indicate CSG Pro11 in 12 normal different tissues.
4 is the relative level of expression. All values are relative to normal muscle (calibrator). This RNA sample is a commercially available pool and is derived from a pool sample of a particular tissue obtained from a different individual.

【0095】[0095]

【表23】 [Table 23]

【0096】 表13における発現の相対的レベルは、Pro114のmRNA発現は、分析
した他の全ての正常組織と比較して前立腺においてより高い(1951)ことを
示す。肺(相対的発現レベル882.2)、腎臓(414.4)、精巣(367
.1)、及び子宮(139.6)は、Pro114のより高いレベルのmRNA
を発現する他の組織である。こうした結果は、Pro114のmRNA発現が、
検討した他の組織よりも前立腺に特異的であることを確定する。
The relative levels of expression in Table 13 indicate that Pro114 mRNA expression is higher in the prostate (1951) compared to all other normal tissues analyzed. Lung (relative expression level 882.2), kidney (414.4), testis (367)
. 1), and the uterus (139.6) have higher levels of Pro114 mRNA
Is another tissue that expresses These results indicate that Pro114 mRNA expression
To determine that it is more specific to the prostate than the other tissues examined.

【0097】 高いレベルの組織特異性は、Pro114が、前立腺の疾患、特に癌のための
診断マーカーであることを示す。 クローンIDzr65g11(Pro118)の発現: CSG Pro118の場合、リアルタイム定量PCRは、以下のプライマー
を使用して実行した。 フォワードプライマー: 5’−GCCCATCTCCTGCTTCTTTAGT−3’(SEQ ID
NO:35) リバースプライマー: 5’−CGTGGAGATGGCTCTGATGTA−3’(SEQ ID N
O:36) 表14に示す無名数は、12の正常な異なる組織中での、CSG Pro11
8の発現の相対的レベルである。全ての値は正常な腎臓(キャリブレータ)と比
較してある。このRNA試料は市販のプールであり、異なる個人から得た特定の
組織のプール試料に由来する。
[0097] The high level of tissue specificity indicates that Pro114 is a diagnostic marker for prostate disease, especially cancer. Expression of clone IDzr65g11 (Pro118): For CSG Pro118, real-time quantitative PCR was performed using the following primers. Forward primer: 5′-GCCCCATCTCCTGCTTCTTTAGT-3 ′ (SEQ ID
NO: 35) Reverse primer: 5'-CGTGGAGATGGCTCTGATGTTA-3 '(SEQ ID N
O: 36) The anonymous numbers shown in Table 14 indicate CSG Pro11 in 12 normal different tissues.
8 is the relative level of expression. All values are relative to a normal kidney (calibrator). This RNA sample is a commercially available pool and is derived from a pool sample of a particular tissue obtained from a different individual.

【0098】[0098]

【表24】 [Table 24]

【0099】 表14における発現の相対的レベルは、Pro118のmRNA発現は、女性
特有の組織である子宮内膜(19282)及び子宮(1064)に次いで、前立
腺(962.1)において3番目に高いことを示す。精巣(相対的発現レベル3
43.7)は、Pro118の中程度のレベルのmRNAを発現する唯一の他の
男性組織である。こうした結果は、Pro118のmRNA発現が、前立腺を含
む生殖組織に非常に特異的であることを確定する。
The relative levels of expression in Table 14 show that Pro118 mRNA expression is the third highest in prostate (962.1), following the endometrium (19282) and uterus (1064), which are female-specific tissues. Indicates that Testis (relative expression level 3
43.7) is the only other male tissue that expresses moderate levels of Pro118 mRNA. These results confirm that Pro118 mRNA expression is highly specific for reproductive tissues, including the prostate.

【0100】 表14における無名数は、異なる個人から得た特定の組織の試料のプールを分
析して得られた。これは、表15における単一の個人の組織試料から得たRNA
に由来する無名数と比較することはできない。
The abundances in Table 14 were obtained by analyzing a pool of specific tissue samples from different individuals. This is the RNA from a single individual's tissue sample in Table 15.
Cannot be compared with the anonymous number derived from

【0101】 表15に示す無名数は、マッチング試料の59のペア及び21のアンマッチド
試料中のPro118の発現の相対的レベルである。全ての値は正常な腎臓(キ
ャリブレータ)と比較してある。マッチングしたペアは、特定の組織の癌試料か
ら得たmRNA及び同じ個人から得た同じ組織の正常隣接試料から得たmRNA
によって形成する。
The absolute numbers shown in Table 15 are the relative levels of expression of Pro118 in 59 pairs of matching samples and 21 unmatched samples. All values are relative to a normal kidney (calibrator). Matched pairs are mRNA from a cancer sample of a particular tissue and mRNA from a normal adjacent sample of the same tissue from the same individual.
Formed by

【0102】[0102]

【表25】 [Table 25]

【0103】[0103]

【表26】 [Table 26]

【0104】[0104]

【表27】 [Table 27]

【0105】[0105]

【表28】 [Table 28]

【0106】[0106]

【表29】 [Table 29]

【0107】 マッチング試料の分析において、より高いレベルの発現は前立腺、子宮内膜、
精巣、及び卵巣中にあり、生殖組織に対する高い程度の組織特異性を示した。こ
うした結果は、正常なプール化試料のパネル(表14)を用いて得られた組織特
異性の結果を裏付けた。
In the analysis of matching samples, higher levels of expression were detected in prostate, endometrium,
It was found in testis and ovaries and showed a high degree of tissue specificity for reproductive tissues. These results confirmed the tissue specificity results obtained with a panel of normal pooled samples (Table 14).

【0108】 さらに、癌試料と、同じ個人から得た同質遺伝子型の正常隣接組織とにおいて
、mRNA発現のレベルを比較した。この比較は、癌に対する特異性を示す(例
えば、正常隣接部分と比較して、癌試料中のより高いレベルのmRNA発現)。
表15では、14のうちの5つの原発性前立腺癌組織中のPro118の過剰発
現を、そのそれぞれの正常隣接部分と比較したもの(前立腺試料1、8、10、
11、15)が示されている。このように、試験した前立腺マッチング試料(合
計で14の前立腺マッチング試料)の35.71%において、癌組織中の過剰発
現があった。Pro118の発現は、3つのアンマッチド癌組織(前立腺試料9
、13、14)、2つの前立腺炎(前立腺試料20、21)、及び6つの良性の
過形成組織(前立腺試料22〜27)において、同様により高かった。
In addition, the level of mRNA expression was compared between cancer samples and isogenic normal adjacent tissues from the same individual. This comparison indicates specificity for the cancer (eg, higher levels of mRNA expression in the cancer sample compared to the normal flanking region).
In Table 15, the overexpression of Pro118 in 5 of 14 primary prostate cancer tissues is compared to its respective normal adjacent part (prostate samples 1, 8, 10,
11, 15) are shown. Thus, 35.71% of the prostate matching samples tested (a total of 14 prostate matching samples) had overexpression in cancerous tissue. Pro118 expression was detected in three unmatched cancer tissues (prostate sample 9
, 13, 14) were also higher in two prostatitis (prostate samples 20, 21) and six benign hyperplastic tissues (prostate samples 22-27).

【0109】 全体的に見て、高いレベルの組織特異性に加えて、試験した原発性の前立腺マ
ッチング試料の35.71%におけるmRNAの過剰発現は、Pro118が、
前立腺癌のための診断マーカーであることを示す。
Overall, in addition to high levels of tissue specificity, overexpression of mRNA in 35.71% of the primary prostate matching samples tested indicates that Pro118
Indicates a diagnostic marker for prostate cancer.

【配列表】 [Sequence list]

───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.7 識別記号 FI テーマコート゛(参考) A61P 35/00 C07K 16/32 C07K 16/32 C12Q 1/68 A C12N 15/09 ZNA G01N 33/577 B C12Q 1/68 A61K 49/02 A G01N 33/577 C12N 15/00 ZNAA (72)発明者 カファーキー,ロバート アメリカ合衆国カリフォルニア州95134, サン・ホゼ,エラン・ヴィレッジ・レイン 350,アパートメント ナンバー 218 Fターム(参考) 4B024 AA01 AA12 BA45 CA01 HA15 4B063 QA19 QQ02 QQ03 QQ53 QQ79 QQ96 QR32 QR48 QR56 QS33 QS34 QX01 QX02 4C085 AA13 AA25 AA26 BB01 CC32 EE01 HH03 HH07 KA03 KA28 KA29 LL18 4H045 AA11 AA30 BA10 CA44 DA76 EA26 EA51 FA74 ──────────────────────────────────────────────────続 き Continued on the front page (51) Int.Cl. 7 Identification symbol FI Theme coat ゛ (Reference) A61P 35/00 C07K 16/32 C07K 16/32 C12Q 1/68 A C12N 15/09 ZNA G01N 33/577 B C12Q 1/68 A61K 49/02 A G01N 33/577 C12N 15/00 ZNAA (72) Inventor Kafarky, Robert 95134, California, United States of America, San Jose, Elan Village Lane 350, Apartment Number 218 F-term (reference) 4B024 AA01 AA12 BA45 CA01 HA15 4B063 QA19 QQ02 QQ03 QQ53 QQ79 QQ96 QR32 QR48 QR56 QS33 QS34 QX01 QX02 4C085 AA13 AA25 AA26 BB01 CC32 EE01 HH03 HH07 KA03 KA28 KA29 KA18 KA18

Claims (12)

【特許請求の範囲】[Claims] 【請求項1】 患者における前立腺癌の存在を診断するための方法であって
: (a)患者における細胞、組織または体液中のCSGのレベルを確定することと
; (b)前記CSGの確定したレベルを、正常なヒトの対照から得た細胞、組織ま
たは体液中のCSGのレベルと比較することと; を含む方法において、前記患者対前記正常なヒトの対照におけるCSGの確定し
たレベルの変化は、前立腺癌の存在に関連している、方法。
1. A method for diagnosing the presence of prostate cancer in a patient, comprising: (a) determining the level of CSG in cells, tissues or body fluids in the patient; and (b) determining the CSG. Comparing the level to the level of CSG in cells, tissues or body fluids obtained from a normal human control, wherein the change in the determined level of CSG in said patient versus said normal human control is , Methods that are associated with the presence of prostate cancer.
【請求項2】 患者における前立腺癌の転移を診断する方法であって: (a)転移したことが分かっていない前立腺癌を有する患者を同定することと;
(b)前記患者から得た細胞、組織または体液の試料中のCSGレベルを確定す
ることと; (c)前記確定したCSGレベルを、正常なヒトの対照の細胞、組織または体液
中のCSGのレベルと比較することと; を含む方法において、前記患者対前記正常なヒトの対照における確定したCSG
レベルの増大は、転移した癌に関連している、方法。
2. A method of diagnosing prostate cancer metastasis in a patient, comprising: (a) identifying a patient with prostate cancer that is not known to have metastasized;
(B) determining the CSG level in a cell, tissue or fluid sample obtained from the patient; and (c) determining the determined CSG level of the CSG in a normal human control cell, tissue or fluid. Comparing the CSG level in said patient versus said normal human control.
The method wherein the increased level is associated with a metastatic cancer.
【請求項3】 前立腺癌を有する患者における前立腺癌を病期分類する方法
であって: (a)前立腺癌を有する患者を同定することと; (b)前記患者から得た細胞、組織または体液の試料中のCSGレベルを確定す
ることと; (c)前記確定したCSGレベルを、正常なヒトの対照の細胞、組織または体液
中のCSGのレベルと比較することと; を含む方法において、前記患者対前記正常なヒトの対照における確定したCSG
レベルの増大は、進行中の癌に関連しており、前記確定したCSGレベルの減少
は減退中または寛解中の癌に関連している、方法。
3. A method for staging prostate cancer in a patient with prostate cancer, comprising: (a) identifying a patient with prostate cancer; and (b) cells, tissue or fluid obtained from said patient. Determining the level of CSG in the sample of (c); comparing the determined level of CSG with the level of CSG in normal human control cells, tissues or body fluids. Established CSG in the patient versus the normal human control
The method wherein the increased level is associated with an ongoing cancer and the determined decrease in CSG levels is associated with a declining or remissioning cancer.
【請求項4】 患者における前立腺癌を、転移の開始に関して監視する方法
であって: (a)転移したことが分かっていない前立腺癌を有する患者を同定することと;
(b)前記患者から得た細胞、組織、または体液の試料中のCSGのレベルを定
期的に確定することと; (c)前記定期的に確定したCSGレベルを、正常なヒトの対照の細胞、組織ま
たは体液中のCSGのレベルと比較することと; を含む方法において、前記患者対前記正常なヒトの対照における前記定期的に確
定したCSGレベルの任意の1つの増大は、転移した癌に関連している、方法。
4. A method of monitoring prostate cancer in a patient for the onset of metastasis, comprising: (a) identifying a patient with prostate cancer not known to have metastasized;
(B) periodically determining the level of CSG in a cell, tissue, or body fluid sample obtained from said patient; and (c) determining said periodically determined CSG level in normal human control cells. Comparing the level of CSG in a tissue or body fluid with said one of said regularly increased CSG levels in said patient versus said normal human control. Related, method.
【請求項5】 患者における前立腺癌の病期の変化を監視する方法であって
: (a)前立腺癌を有する患者を同定することと; (b)前記患者から得た細胞、組織、または体液中のCSGのレベルを定期的に
確定することと; (c)前記定期的に確定したCSGレベルを、正常なヒトの対照の細胞、組織ま
たは体液中のCSGのレベルと比較することと; を含む方法において、前記患者対前記正常なヒトの対照における前記定期的に確
定したCSGレベルの任意の1つの増大は、病期が進行中の癌に関連しており、
減少は病期が減退中または寛解中の癌に関連している、方法。
5. A method for monitoring a prostate cancer stage change in a patient, the method comprising: (a) identifying a patient with prostate cancer; and (b) cells, tissue, or fluid obtained from the patient. (C) comparing said periodically determined CSG level to the level of CSG in normal human control cells, tissues or body fluids; The method of any of the preceding claims, wherein any one increase in the regularly determined CSG level in the patient versus the normal human control is associated with an advanced stage cancer;
The method wherein the reduction is associated with a cancer whose stage is decreasing or in remission.
【請求項6】 前立腺癌をイメージング及び治療する際に使用するための潜
在的な治療剤を同定する方法であって、CSGに結合する能力に関して分子をふ
るい分けることを含む方法において、分子がCSGに結合する前記能力は、該分
子が前立腺癌をイメージング及び治療する際に有用であることを示す、方法。
6. A method for identifying a potential therapeutic agent for use in imaging and treating prostate cancer, comprising screening the molecule for its ability to bind to CSG, wherein the molecule comprises CSG. The method wherein the ability to bind to is indicative that the molecule is useful in imaging and treating prostate cancer.
【請求項7】 前記CSGは、SEQ ID NO:1、2、3、4、5、
6、7、8、9、10、11、12、13、14、15、16、17、18、1
9若しくは20、または、それによってコード化されるポリペプチドを含む、請
求項1、2、3、4、5または6に記載の方法。
7. The CSG comprises SEQ ID NO: 1, 2, 3, 4, 5,
6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 1,
7. The method of claim 1, 2, 3, 4, 5, or 6, comprising 9 or 20, or a polypeptide encoded thereby.
【請求項8】 CSGに特異的に結合する抗体。8. An antibody that specifically binds to CSG. 【請求項9】 患者における前立腺癌をイメージングする方法であって、請
求項8に記載の抗体を前記患者に投与することを含む方法。
9. A method of imaging prostate cancer in a patient, comprising administering the antibody of claim 8 to said patient.
【請求項10】 前記抗体は常磁性イオンまたは放射性同位体を用いて標識
化される、請求項9に記載の方法。
10. The method of claim 9, wherein said antibody is labeled with a paramagnetic ion or a radioisotope.
【請求項11】 患者における前立腺癌を治療する方法であって、請求項7
に記載の抗体を前記患者に投与することを含む方法。
11. A method for treating prostate cancer in a patient, comprising the steps of:
A method comprising administering to the patient the antibody of claim 1.
【請求項12】 前記抗体は細胞毒性剤と結合している、請求項11に記載
の方法。
12. The method of claim 11, wherein said antibody is conjugated to a cytotoxic agent.
JP2000576884A 1998-10-19 1999-10-19 Methods for diagnosing, monitoring, staging, imaging and treating prostate cancer Pending JP2002527758A (en)

Applications Claiming Priority (3)

Application Number Priority Date Filing Date Title
US10473798P 1998-10-19 1998-10-19
US60/104,737 1998-10-19
PCT/US1999/024331 WO2000023111A1 (en) 1998-10-19 1999-10-19 Method of diagnosing, monitoring, staging, imaging and treating prostate cancer

Publications (1)

Publication Number Publication Date
JP2002527758A true JP2002527758A (en) 2002-08-27

Family

ID=22302100

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
JP2000576884A Pending JP2002527758A (en) 1998-10-19 1999-10-19 Methods for diagnosing, monitoring, staging, imaging and treating prostate cancer

Country Status (4)

Country Link
EP (1) EP1131095A4 (en)
JP (1) JP2002527758A (en)
CA (1) CA2347081A1 (en)
WO (1) WO2000023111A1 (en)

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2010513901A (en) * 2006-12-19 2010-04-30 ザ ユニバーシティ オブ サリー Cancer biomarker

Families Citing this family (17)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
US7037667B1 (en) 1998-06-01 2006-05-02 Agensys, Inc. Tumor antigen useful in diagnosis and therapy of prostate and colon cancer
US6960433B1 (en) 1998-10-19 2005-11-01 Diadexus, Inc. Method of diagnosing, monitoring, staging, imaging and treating prostate cancer
US6902892B1 (en) 1998-10-19 2005-06-07 Diadexus, Inc. Method of diagnosing, monitoring, staging, imaging and treating prostate cancer
AU4484400A (en) * 1999-04-23 2000-11-10 University Of Washington Prostate-specific polynucleotides, polypeptides and their methods of use
US20020048777A1 (en) 1999-12-06 2002-04-25 Shujath Ali Method of diagnosing monitoring, staging, imaging and treating prostate cancer
EP1299727B1 (en) * 2000-07-12 2009-04-22 Agensys, Inc. Novel tumor antigen useful in diagnosis and therapy of bladder, ovary, lung and kidney cancers
WO2002074907A2 (en) * 2001-02-02 2002-09-26 Bayer Pharmaceuticals Corporation Methods of modulating surfactant production
US7425700B2 (en) 2003-05-22 2008-09-16 Stults John T Systems and methods for discovery and analysis of markers
US7893197B2 (en) 2004-08-25 2011-02-22 Janssen Pharmaceutica N.V. Relaxin-3 chimeric polypeptides and their preparation and use
US9957569B2 (en) 2005-09-12 2018-05-01 The Regents Of The University Of Michigan Recurrent gene fusions in prostate cancer
AU2006291054B2 (en) 2005-09-12 2011-10-13 The Brigham And Women's Hospital, Inc. Recurrent gene fusions in prostate cancer
US20100086912A1 (en) * 2005-11-15 2010-04-08 Clerc Roger G AZGP Gene Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs)
ES2376509T3 (en) 2007-07-06 2012-03-14 The Regents Of The University Of Michigan REPORTS OF GENES MIPOL 1-ETV1.
WO2009020521A2 (en) 2007-08-03 2009-02-12 The Brigham And Women's Hospital, Inc. Identification and treatment of estrogen responsive prostate tumors
US9938582B2 (en) 2009-09-17 2018-04-10 The Regents Of The University Of Michigan Recurrent gene fusions in prostate cancer
US8945556B2 (en) 2010-11-19 2015-02-03 The Regents Of The University Of Michigan RAF gene fusions
CN117169534A (en) 2019-08-05 2023-12-05 禧尔公司 Systems and methods for sample preparation, data generation, and protein crown analysis

Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
DE69943020D1 (en) * 1998-06-01 2011-01-20 Agensys Inc TUMORANTIGEN USEFUL IN THE DIAGNOSIS AND THERAPY OF PROSTATE AND THICK-DARM CANCER
AU4823599A (en) * 1998-06-22 2000-01-10 Incyte Pharmaceuticals, Inc. Prostate cancer-associated genes

Cited By (1)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
JP2010513901A (en) * 2006-12-19 2010-04-30 ザ ユニバーシティ オブ サリー Cancer biomarker

Also Published As

Publication number Publication date
CA2347081A1 (en) 2000-04-27
WO2000023111A1 (en) 2000-04-27
EP1131095A4 (en) 2003-04-23
EP1131095A1 (en) 2001-09-12

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US6902892B1 (en) Method of diagnosing, monitoring, staging, imaging and treating prostate cancer
US6960433B1 (en) Method of diagnosing, monitoring, staging, imaging and treating prostate cancer
JP3422776B2 (en) Novel method for diagnosing, monitoring, staging, imaging and treating breast cancer
JP2002523760A (en) Novel methods for diagnosing, monitoring, staging, imaging and treating various cancers
JP2002527758A (en) Methods for diagnosing, monitoring, staging, imaging and treating prostate cancer
US20050266483A1 (en) Novel method of diagnosing, monitoring, staging, imaging and treating colon cancer
JP3524061B2 (en) Novel way to diagnose, monitor, stage, image and treat lung cancer
JP2002527757A (en) Methods for diagnosing, monitoring, staging, imaging and treating prostate cancer
JP2002526760A (en) Novel method for diagnosing, monitoring, staging, imaging and treating gastrointestinal cancer
JP2002526055A (en) Methods for diagnosing, monitoring, staging, imaging and treating gynecological and testicular cancer
US6858386B1 (en) Method of diagnosing, monitoring, staging, imaging and treating colon cancer
US6962779B1 (en) Method of diagnosing, monitoring, staging, imaging and treating gastrointestinal cancers
US6869592B1 (en) Method and antibody for imaging lung cancer
US7014996B1 (en) Method of diagnosing, monitoring, staging, imaging and treating gynecologic cancers
JP2002527723A (en) Novel method for diagnosing, monitoring, staging, imaging and treating gynecological cancer
CA2346326A1 (en) A novel method of diagnosing, monitoring, staging and treating gynecological and prostatic cancers

Legal Events

Date Code Title Description
A911 Transfer of reconsideration by examiner before appeal (zenchi)

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A911

Effective date: 20031226

A912 Removal of reconsideration by examiner before appeal (zenchi)

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A912

Effective date: 20040305

A601 Written request for extension of time

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A601

Effective date: 20060822

A602 Written permission of extension of time

Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A602

Effective date: 20060825