JP2001516050A - 光散乱材料で標識した試料をイメージングするための装置および方法 - Google Patents
光散乱材料で標識した試料をイメージングするための装置および方法Info
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Abstract
Description
日に出願された米国仮特許出願番号60/058,183号および1997年1
1月24日に出願された米国仮特許出願番号60/066,432号に対する優
先権を主張する。
/または反射特性を有する材料、例えば金属コロイドマーカー、で標識されてい
る試料の高分解能イメージング用の方法および装置を提供する。本発明によれば
、光散乱および反射光を用いたイメージングを行うことにより、特異的結合分析
物が検出される。
有用な適用には、生体高分子アレーとの使用が含まれる。例えば、高密度核酸ア
レーを作製する先駆的な技術は、米国特許第5,445,934号に記載されて いる。本発明は、強力な光散乱および反射特性を有する標識を目的の分子に付着
することができるいずれの適用においても有用である。
提供する。かかるポリマーアッセイの例には、核酸アレー、タンパク質またはポ
リペプチド・アレー、炭水化物アレーなどが含まれる。加えて、本発明は固定化
された試料および溶液中の試料の双方とともに用いることができる。かなりの数
の可能な試料を本発明で用いることができる。種々のタイプのスキャナーを用い
て、試料から情報が抽出されてきた。例えば、従前の試料判読機器は、特異的な
相互作用またはハイブリダイゼーションを明らかにするために、蛍光に対して応
答性である検出スキームを用いていた。
粒子の溶液を用いることが知られている。例えば、金属コロイドと呼ばれる金属
粒子の溶液を用いることができる。光を散乱するいずれの他の粒子を用いても、
試料を標識することができる。より詳細には、特異的結合タンパク質と対応する
結合性物質との間の反応の1またはそれを超える要素を検出することが知られて
おり、そこにおいては、“Metal Sol Particle Immun
oassay”なる標題の米国特許第4,313,734号に開示されているご
とき、金属、金属化合物またはポリマー核の分散粒子をカップリングさせること
によって得られる1またはそれを超える標識成分が用いられている。
,WangTing Hsieh,Cynthia Jou,Julian G
ordon,Tom Theriault,Ron GambleおよびJoh
n Baldeschwielerによる“Real Time Detect
ion of DNA Hybridization and Melting
on Oligonucleotide Arrays using Opt
ical Wave Guides”に記載されているごとく、DNAアレー上
の捕捉ゾーンで光散乱および反射標識のリアルタイムの結合または融解を測定す
ることができる二次元光導波路を用いる検出方法を利用することができる。
する特異的結合分析物を検出するための技術を利用している。この技術は、エバ
ネッセント波検出としても当該技術分野で知られている。例えば第1図に参照し
て、核酸アレーのベースの透明アレー基体表面の断面図を示す。したがって、核
酸アレー中で用いているガラスおよび水性緩衝液の界面からの内面全反射を達成
するためには、スキャナーからの光の内部入射角度を90°に近づけなければな
らない。空気から重ガラスチップに入る際に照射光線は垂線入射方向に向けて曲
がるため、単に透明アレー基体の面に対してほぼ平行に照射させることによって
は、かかる浅い内部入射角を達成することは不可能である。
ことが可能である。しかしながら、このアプローチは扱いにくく、かつ高価であ
る。さらに、プラスチック製カートリッジ中に存在する試料とともに透明アレー
基体のエッジを照射することは可能となり得るが、かかる配置には基体の1のエ
ッジ面がかなり高い光学的品質のものであることが必要であろう。このことは、
より高い梱包コストを生じるであろう。
であろうもう1つの可能な解決法には、平面表面のエッジ近くに付けたカップリ
ングプリズムの使用が含まれる。かかるカップリングプリズムにより、垂直入射
により近い角度で透明重アレー基体に照射を入れることができる。カップリング
プリズムを用いる内面全反射技術には、プローブ用の空間を排除するカップリン
グプリズム用の空間を提供することが必要である。
ベルまで低下する試料で用いることができるが、かかる適用においては、内面全
反射技術はガラス/水性界面およびガラス/空気界面の両方から望ましくないバ
ックグラウンド散乱を生じる。
不適当な場所で結合または反応する傾向がある。例えば、金属コロイドがブロッ
トアッセイ、例えば家庭用妊娠検査キットで用いられている。一般的に、かかる
キットは、コロイド凝集が白色の基体上で起こる比色アッセイを用いている。検
査結果は、色を導入する金属コロイドによる光減衰によって判定される。 高散乱特性を有する散乱標識で標識されている試料をイメージングする装置お
よび方法に対して要望が存在する。
き試料をスキャンするためのスキャナー機器および方法に指向される。特に、反
射イメージングと散漫散乱イメージングとの組合せ使用が、散乱標識で標識され
、かつ核酸アレーに結合した試料に対するダイナミックレンジおよび検出限界を
最大限化することを見出した。この新規な光散乱および反射技術は、種々の適用
において首尾よく用いることができる。なぜならば、かかる適用は、以下に記載
するごとく、特定の光学特性を示す透明アレー基体を用いるからである。本発明
による試料は強力な光散乱および反射特性を有する散乱標識で標識されている。
かかる散乱標識の1つの例は金属コロイドであるが、本発明は金属コロイドの使
用に限定されるものではなく、実際に、強力な光散乱および反射特性を有するい
ずれの材料をも用いることができる。本発明は、エバネッセント波または内面全
反射技術に依存するものではない。本発明の光散乱および反射光技術は、従前の
方法よりも優れた光学的結果を、極めてより低いコストで供するものである。
および反射照射技術を用い、そこにおいては反射モードイメージングのみを用い
る。本発明のもう1つの具体例において、反射モードイメージングと散乱モード
イメージングとの新規な組合せを介して試料をイメージングする。用いる光の外
部入射角度は、典型的には表面垂線に対して測定してほぼ0°から45°を超え
る範囲の角度であるが、いずれの角度をも用いることができる。 加えて、前記の新規な照射および採取技術によるイメージングを提供する機器
を開示する。
および反射光を用いる新規な方法および装置が提供される。本発明の好ましい具
体例によれば、反射モードイメージング単独を用いて試料をイメージングする。
第2の具体例において、反射モードイメージングと散乱モードイメージングとの
組合せを用いる。
し、それから反射された光を試料から集めるものである。反射モードイメージン
グにおけるそのもう1つの方法では、集める光は鏡面反射である。反射モードイ
メージングは、金属ゾル標識のごとく光を散乱させる強力な能力を有する散乱標
識の平面凝集物の信号を取出すことによってダイナミックヘッドルームを高める
。その結果、反射モードイメージングは強度スケールの高端部において最もよく
作動する。反射モードイメージングは幾分かの反射バックグラウンドを生じるが
、本発明者らは反射モードイメージングの使用によってイメージング試料を単独
で検出することに成功した。一方、散乱モードイメージングにおいては、集める
いずれかの光は、反射されたもの以外の光である。したがって、散乱モードイメ
ージングで集めた光は再放射光であって非−鏡面である。散乱モードイメージン
グは、ガラス/水性界面からのバックグラウンド信号を最小限化することによっ
てダイナミック“レッグルーム”を高める。したがって、散乱モードイメージン
グは、強度スケールの低端部において最もよく作動する。この技術の不利な点は
、高粒子密度における散乱等方性の損失によるダイナミックヘッドルームの損失
である。したがって、反射および散乱モードイメージングを組合せて使用するこ
とにより、最大理論ダイナミックレンジを生じる。本発明者らはイメージング技
術のかかるユニークな組合せが良好な結果を提供することを見出した。
めて小さい、例えば散乱波長の1/10もと小さい場合でさえも可視光を強力に
散乱するであろう。本発明によりスキャンする試料は非常に高い光学的品質を有
する透明アレー基体上に常に位置し、さらには、該透明アレー基体は多くの光を
散乱しない水性緩衝液と接触しているため、本発明による透明アレー基体および
水性緩衝液の界面の結果としていずれの種類の拡散光散乱もほぼ全く発生しない
。
、反射散乱を用いれば測定可能である。生じ得るガラス/水性界面からのいずれ
の散乱バックグラウンドをも最小限化するためには、ガラス/水性界面からの鏡
面反射がスキャン機器の採取光学素子に入るのを妨ぐことが必須である。散漫散
乱ジオメトリーは、金属ゾル標識のごとき極めて低い表面密度の散乱標識の検出
を許容する。かかるアプローチの欠点は、増大してゆく高粒子密度においては、
散乱光の空間分布がより低い等方性となるかまたは散乱することである。100
%充填率の限界においては、結合した金粒子の層は、純鏡面反射として試料から
出た全“散乱”光でもって、金鏡のごとくふるまう。したがって、散漫散乱のみ
を検出する光学構造では、金属粒子の非常に高度の被覆の存在を有効に検出する
ことができず、ダイナミックヘッドルームを失ってしまう。
路または図3に示す2つの検出経路のいずれかを使用することができる。オフ−
オクシス(off−axis)光路は45°の入射角で図示されているが、この
値に限定されるものではない。これらの構造のいずれを用いても、散漫散乱(“
S”モード)および鏡面反射(“R”モード)の双方をイメージングすることが
できる。Sモードで遭遇する低バックグラウンド散乱は、低粒子密度を有する特
徴(feature)の検出を最適化する。Rモードにおいては、観察される信
号レベルは、最高の達成可能な密度で粒子密度によりずっと密接に比例している
と予想される。したがって、RおよびS検出モードは互いに相補物として考察す
ることができ、一緒になって測定プロセスのダイナミックレンジを増大させる。
タを獲得し分析することができる。最初に、RおよびS光源からの同時照射で単
一のイメージが作り出される(図2)。この場合において、R光源の強度は、バ
ックグラウンド反射に対するその寄与を最小限化するためにS光源のものよりも
実質的に低くすべきである。R光源によって発生したバックグラウンドは、それ
を面内(in−plane)偏光させることによってさらに低減することができ
る。2番目および3番目のアプローチにおいて、独立したイメージがSおよびR
モードで作り出される。該RおよびSイメージは単一の検出アレーを用いて連続
して(図2)か、または2つの検出アレーを用いて平行して(図3)獲得するこ
とができる。アルゴリズムによって、2つのイメージから強度データが選択され
る。
反射モードイメージが5個/μm2よりも実質的に低い粒子密度でさえ信号にお ける非常に大きな増強を生じることを見出した。この増強は1個/μm2よりも ずいぶん低い密度まで持続する。これらの知見は、1個/μm2の範囲の密度で さえも散乱標識のクラスター化が起こっており、この現象を利用して信号レベル
を押し上げ得るという概念を支持している。したがって、本発明者らは反射モー
ドイメージング単独を用いてアッセイの最大限のダイナミックレンジにわたり十
分な信号対雑音を達成し得ることを見出した。図4は強力な光散乱特性を有する
散乱標識の反射モードイメージングが蛍光標識を用いて行うイメージングもと良
好である結果を供することを示すグラフデータを供している。
直径においてほぼ50nmまでの粒子に関しては、散乱断面は粒子半径の6乗に
比例し、非常に大きく、すなわち従来技術の発蛍光団よりも〜105大きい。よ り大きな粒子に関しては、本発明者らはより弱い依存性を見出している。例えば
、100nmの粒子は80nmの粒子よりもほぼ2倍強いことが測定により判定
されている。
場合に良好な結果が得られるが、用いる粒子の数は10ないし100個の粒子の
範囲とし得ると判断した。粒子の数、特徴サイズおよびダイナミックレンジに関
する結果は図10に見出される。作製するのに最も簡便な粒子は金粒子である。
しかしながら、他の金属および非−金属も用いることができる。粒子に関する必
須の基準は、それが強力な光散乱および反射特徴を示すことである。金は用いる
金属の典型的な例であり;強力な光散乱および反射特徴を示す非−金属の例には
、大部分の半導体材料および半金属が含まれる。前記の散乱標識をスキャンする
ことによって発生する信号は蛍光標識を用いて発生する信号よりも大きいため、
本発明は、例えばLED、アーク灯およびレーザーダイオードのごとき励起用の
弱い光源を用いて利用することができる。
代わりに、例えば、光散乱粒子を抗体で標識し、標的試料をその抗体に対して相
補的な抗原で標識する。典型的には、標的はビオチンで標識する。光散乱粒子は
ストレプトアビジンまたはヤギ抗−ビオチン抗体で共有的に標識する。
し得ることを見出した。一般的にいえば、粒子を互いから独立させた場合、それ
らは全方向に等しく光を散乱する傾向がある。しかしながら、本発明者らは、粒
子は試料の最も稠密な領域で互いにクラスター化する傾向があることを注記する
。クラスター化は1個/μm2領域未満の密度においても存在する。この粒子の クラスター化は、全方向で光を反射するというよりも入る光が出る光に対して相
反関係になるように、より鏡面様式で光を散乱させるより鏡−様に作用する傾向
がある透明アレー基体上の平面アレーで島を生成する。図5aおよび5bに図示
するこの現象は、得ることができるダイナミックレンジを大きく制限している。
ドイメージングを見出した。本発明による反射モードイメージングを用いれば、
優れたスキャン機器感度を生じるダイナミックレンジの増強ならびに使用の簡便
性が供される。図7は表面垂線に対して0°および30°の角度の照射を用いて
イメージングした場合(各々、散漫散乱モード反射および反射モードイメージン
グという)に得られた強度における差異を示すグラフである。
散乱波長に対応するように選択した光源によって励起した異なるサイズまたは組
成の粒子を用いることによって達成することができる。散乱バンド幅は広く、よ
ってクロストークを最小限化し、散乱最大の間の波長スペクトル分離は好ましく
は用いるバンドパスフィルターの幅の2倍とすべきである。より広いバンドパス
は信号の増大を生じる。採取検出器も同一のバンドパスフィルターを用いて濾す
。球形散乱標識は散乱の際の入射光の偏光を実質的に維持し、偏光方向は粒子の
方向ではなく入射光子の偏光に依存する。したがって、各励起チャンネルを直交
的に偏光することができる。直交偏光はチャンネル間のクロストークを低減する
であろう。チップ上の欠陥、傷および汚染物も光を散乱し、検出信号における雑
音を出すであろう。しかしながら、散乱のスペクトルは粒子サイズの関数であり
、欠陥は異なる外形を有し、したがって異なる散乱スペクトルを有するにちがい
ない。したがって、検出チャンネルで受光した信号を相関させて、バックグラウ
ンド散乱ノイズを最小限化することができる。
ることができる。典型的には、ガラス/空気界面からの反射は最も強力である。
加えて、プラスチック製であるカートリッジの背面からかなりの散乱が発生する
。この反射は光学系の励起および/または採取ボリュームを低下することによっ
て空間的に排除しなければならない。意義深いことに、本発明者らはオフ−アク
シス照射がこの反射を効果的に排除することを見出した。オフ−アクシス照射を
用いれば、投光照射およびCCD、ビデオカメラ、フィルムほかのごとき広視野
イメージングを用いるいずれのイメージング方法に対しても、バックグラウンド
干渉が顕著に低減される。
優れた深度分解能を供する機器構成要素の新規な組み合せを発見した。2つの光
源、そのうちの1つは反射モード光源として作用し、もう1つは散漫散乱光源と
して作用する、が該装置に配されている。照射は界面からの望ましくない反射を
空間的に排除するのに十分に狭い線に集束される。本発明の機器には励起用の集
束系およびビーム形成光学構成が含まれていてもよい。
ルターを通過させてもよい。しかしながら、単なる設計上の好みである偏光子お
よびバンドパスフィルターを用いなくても良好な結果を得ることができる。集め
る深度は500μ未満のFWHMに維持して、ガラス/空気およびプラスチック
/水性界面からの散乱および反射を排除すべきである。その結果、本発明の機器
は他の界面、例えばガラス/空気界面からの散乱光を集めることを回避し、優れ
た深度分解能を許容する。本発明を用いれば、DNA表面から出る光を集め、他
の表面からの散乱光を排除し、優れた感度を生じる。
、各フィルター/アナライザアセンブリを移動ステージまたはホイールによって
適所に移動させることができる。多重線形または領域(area)CCDアレー
を用いることもできる。標識表面は移動ステージを用いて入射ビームを横切って
スキャンする。検光器からの電流を電圧に変換し、それをA/Dコンバータによ
ってデジタル化する。ついで、そのデジタル信号をイメージとしてコンピュータ
に保存する。コンピュータは機器のすべての機能を制御する。
を向上させることが可能である。100nmの金粒子による光散乱および反射は
おおよそ等方性であり、粒子が結合する界面からの鏡面反射を排除する採取角度
を選択することを可能とし、それによって低い粒子密度で良好な信号−バックグ
ラウンド比を供することができる。コロイド状金を検出するためのプロトタイプ
機器は、アレー表面垂線から45°の照射および表面垂線に沿った検出、または
その逆を利用する。
互関係は、粒子当たりの有効散乱断面が約5個/μm2まで一定であることを確 立し、その上ではそれはかなり鋭敏に落ちる。電子顕微鏡によってこの挙動が高
密度の粒子の平面凝集が形成された結果であることが明らかになった。凝集サイ
ズが増大するにしたがって、散乱の方向依存性は、独立した粒子のほぼ等方性の
散乱特性から金金属の平面層の純鏡面反射特性へと変化する。散乱光は鏡面反射
角度上に集中した円錐部にますます“濃縮(concentrated)”され
るようになり、鏡面反射角度から離れた観察角度における粒子密度に対しての見
かけの飽和に通じる。このダイナミックレンジ飽和は、反射モードイメージング
を用いることによって実質的に低下することが見出されている。
であり、本発明で用いる強力な光散乱粒子がいかにして光を散乱するかを示して
いる。図9は、単純なカメラを用いて粒子の空間分布を記録することができるこ
とも示している。
射を用いることは、蛍光イメージングに関して信号線形のほぼ完全な回復を示す
ことを見出した。その照射法を特定の適用、例えば遺伝子発現のごとき低信号適
用に応じて作ることもできることは、拡散モードに有利となり、高信号適用は反
射モードから恩恵を受け得る。
ションによる試料の分析は生物学における広範な適用を見出しつつある。アレー
に対する核酸結合の検出は、分析物DNAの蛍光標識および共焦点レーザー走査
型蛍光顕微鏡によって慣例的になされている。本発明は散乱光に対して強力な能
力を有する材料で標識した試料をイメージングするための新規な装置および方法
を提供する。 本発明者らは、本願明細書中に参照したすべての特許および刊行物を出典明示
して本明細書の一部とみなす。
を用いて得られた結果を比較するグラフである。
る。
ラで撮影した写真である。
Claims (13)
- 【請求項1】 試料に反射モード光を供する第1光源; 該試料に散漫散乱光を供する第2光源; 該試料から反射された光および再放射された光を別々に受光する検出器を含む
機器。 - 【請求項2】 該検出器が該反射モード光を受光することを特徴とする請求
項1記載の機器。 - 【請求項3】 該第1光源が該試料に対して垂直な線から第1の角度で設置
されていることを特徴とする請求項2記載の機器。 - 【請求項4】 該検出器が該試料に対して垂直な線から第2の角度で設置さ
れていることを特徴とする請求項3記載の機器。 - 【請求項5】 該第1光源が該試料に対して垂直な線の上方に設置されてい
ることを特徴とする請求項4記載の機器。 - 【請求項6】 該検出器が該試料に対して垂直な線の下方に設置されている
ことを特徴とする請求項5記載の機器。 - 【請求項7】 該第2の角度が該第1の角度と同一数値であることを特徴と
する請求項6記載の機器。 - 【請求項8】 反射モード光を供する光源からの光を試料に投射し; 該試料から反射された光を検出することを含む試料をイメージングする方法。
- 【請求項9】 さらに、該検出光を記録することを含む請求項8記載の方法
。 - 【請求項10】 第1光源からの光を試料に投射し; 該試料から反射した該第1光源からの光を検出し; 第2光源からの光を該試料に投射し; 該試料から反射された光を除く再放射された光を検出することを含む試料をイ
メージングする方法。 - 【請求項11】 第1光源からの光を試料に投射し; 該試料から反射された光を除く全ての周囲(ambient)光を検出し; 第2光源からの光を該試料に投射し; 該試料から反射された該第2光源からの光を検出することを含む試料をイメー
ジングする方法。 - 【請求項12】 第1光源からの光を試料に投射し; 該試料からの全ての鏡面反射を検出し; 第2光源からの光を該試料に投射し; 全ての非−鏡面光を検出することを含む試料をイメージングする方法。
- 【請求項13】 光を試料に供するための第1光源; 光を該試料に供するための第2光源; 該試料から反射された鏡面光と非−鏡面光とを別々に受光するための検出器を
含む機器。
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