JP2001507027A - General chemical bond - Google Patents

General chemical bond

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Abstract

(57)【要約】 オリゴペプチドを結合し、結合ペプチド生成物を形成する。第一工程において、2つの出発オリゴペプチドを結合し、アミノチオエステル結合を有する中間体を形成する。第二工程において、アミノチオエステル結合は転位を受け、N置換アミド結合を有するペプチドを形成する。任意の第三工程において、アミド結合を化学的に除去し、天然ペプチド結合を形成する。   (57) [Summary] The oligopeptides are linked to form a linked peptide product. In a first step, the two starting oligopeptides are combined to form an intermediate having an aminothioester linkage. In the second step, the aminothioester bond undergoes rearrangement to form a peptide with an N-substituted amide bond. In an optional third step, the amide bond is chemically removed to form a natural peptide bond.

Description

【発明の詳細な説明】 一般的化学結合発明の属する技術分野 本発明は、オリゴペプチドを化学的に結合する方法に関する。より詳細には本 発明は、ペプチド結合を使用してオリゴペプチドの末端と末端を化学的に結合す る方法に関する。政府の権利 本発明は、アメリカ国立衛生研究所より与えられた助成番号R01 GM 4 8897及びP01 GM 48870の下、政府の支援を受けてなされた。ア メリカ合衆国政府は本発明について一定の権利を有する。背景技術 従来の段階的固相方法論によるペプチド合成は、長いペプチドを合成するとき 、低収率により制限される(Merrifield et al.J.Am.Chem.Soc.1963,85,2 149-2154;Kent et al.Ann.Rev.Biochem.1988,57,957-989)。この制限を克 服するために、化学結合により小さい合成ペプチドを別のペプチドへ結合して、 長いペプチドを製造するだろう。 al.,Science 1992,256,221-225;Rose et al.J.Am.Chem.Soc.1994,116 ,30-34; Liu et al.Proc.Natl.Acad.Sci.USA 1994,91,6584-6588)。Sch onolzerにより開示された方法論は、非保護ペプチドセグメントの化学選択的反 応により、結合部位に非天然バックボーン構造を有する生成物を与えることに関 するものである。この方法論は、標準的ペプチド合成法により得られるものより もサイズの大きいペプチドの合成を可能にする(Canne et al.J.Am.Chem.Soc .1995,117,2998-3007;Baca et al.J.Am.Chem.Soc.1995,117,1881-188 7;Williams et al.J.Am.Chem.Soc.1994,116,10797-10798)。更にこ の方法論は、異常な構造及びトポロジーを有するペプチドの合成を可能にする(D awson et al.J.Am.Chem.Soc.1993,115,7263-7266; Rose et al.J.Am. Chem.Soc.1994,116,30-34;Muir et al.Biochemistry 1994,33,7701-7708 ;Canne et al.J.Am.Chem.Soc.1995,117,2998-3007)。従来の段階的固相 ペプチド合成と化学結合とを組み合わせた使用は、化学者が60アミノ酸残基ま での非保護ペプチドを良好な収率及び純度で日常的に製造することを可能にす ら2つの方法論の組み合わせを使用して、タンパク質の全化学合成が達成される かもしれない。 天然のバックボーン構造を有するタンパク質製造のための別の化学結合技術が 報告されている(Dawson et al.Science 1994,266,776-779)。この様式の化学 結合は「天然結合(native ligation)」と名づけられている。この技術において は、C末端α−チオエステルを有する非保護合成ペプチドを、化学選択的態様で 、N末端Cys残基を含む非保護ペプチドと反応させる。チオール交換反応は初 期のチオエステル結合中間体を与え、これは自発的に転位(rearrange)し、2 つのペプチドセグメントが結合している結合部位において天然のアミド結合を与 え、この過程においてCys側鎖チオールを再生する。この天然結合の変形は、 アミノ酸の反応についてWielandにより最初に記載された化学反応を使用する(Wi eland et al.Liebigs Ann.Chem.1953,583,129-149)。最初に記載されてい るように、ネイティブ結合は、X−Cys結合におけるペプチドセグメントの結 合に制限される(Dawson et al.Science 1994,266,776-779)。 必要とされるのは、C末端α−チオエステルペプチドセグメントをN末端アミ ノ酸ペプチドセグメントに結合する一般的方法であって、N末端アミノ酸ペプチ ドセグメントがN末端システインを有することを必要としない方法である。発明の要約 本発明は、非保護オリゴペプチドを化学的に結合し、全てのペプチド結合を有 する生成物を形成する方法に向けられる。第一工程において、2つのオリゴペプ チドを結合し、アミノチオエステル結合を有する結合生成物を形成する。第二工 程において、アミノチオエステル結合を転位し、N置換アミド結合を有する生成 物を形成する。任意の第三工程において、アミド結合上の置換基を、酸性媒体中 Znを用いた容易な処理により取り除き、結合部位に天然のペプチド結合を与え る。 本発明の方法は、2つの出発オリゴペプチド、すなわち第一の出発オリゴペプ チド及び第二の出発オリゴペプチドを使用する。第一のオリゴペプチドはチオエ ステル部分を有するC末端補助基(auxiliary group)を有している。すなわち 、[ペプチド1αCOSR(式中、Rは3−カルボキシ、4−ニトロフェニル 及びベンジルからなる群より選ばれる。)である。第二のオリゴペプチドは非酸 化スルフヒドリル部分を有する補助官能基(auxiliary functional group)を有す る。すなわち、HSCH2CH2(O)−Nα[ペプチド2]である。第一及び第 二の出発オリゴペプチドを、チオエステル交換を促進する条件下で混合したとき 、両ペプチドは互いに縮合し中間体オリゴペプチド生成物を形成する。ここで、 第一及び第二のオリゴペプチドはアミノチオエステル結合を介して結合している 。アミノチオエステル結合は分子内で自発的に転位し、N置換アミド結合により 結合している結合生成物を形成する。分子内転位の間、N末端補助官能基のアミ ノ基はチオエステルを攻撃し、置換スルフヒドリル部分を含む結合したN結合補 助官能基を有するアミド基を形成する。置換スルフヒドリル部分を含むN結合補 助官能基を、化学的手段により適宜取り除き、全ての天然ペプチド結合を有する 生成物を形成してもよい。 本発明の1つの態様は、オリゴペプチド生成物を製造するために第一のオリゴ ペプチドと第二のオリゴペプチドとを末端と末端で結合する方法に向けられる。 より詳細には、本発明の方法は2つの工程及び任意の第三工程を含んでいる。 第一工程は、第一及び第二のオリゴペプチドがδ又はγアミノチオエステル結 合で結合している中間体オリゴペプチドを製造するために、第一のペプチドのC 末端チオエステルと第二のオリゴペプチドの非酸化スルフヒドリル部分とを縮合 させることを含んでいる。第一のオリゴペプチドはC末端残基上にC末端チオエ ステルを含み、第二のオリゴペプチドは非酸化スルフヒドリル部分を有するN末 端残基上にN末端補助官能基を含んでいる。第一のオリゴペプチドのC末端残基 が非グリシンである場合、第二のオリゴペプチドのN末端残基はグリシンである 。第二のオリゴペプチド上のN末端残基が非グリシンである場合、第一のオリゴ ペプチド上のC末端残基はグリシンである。但し、非グリシン残基は、非β分岐 アミノ酸である。 第二工程により、中間体オリゴペプチドのδ又はγ−アミノチオエステル結合 が、δ又はγ−アミノ基のチオエステル部分への分子内攻撃により、転位し、チ オエステル部分由来の副生物としてスルフヒドリル部分を置換する。これにより 、第一及び第二のオリゴペプチドがアミド結合で結合しているオリゴペプチド生 成物を製造する。アミド結合の窒素は、置換スルフヒドリル部分を有する補助官 能基を含んでいる。 任意の第三工程は、天然ペプチド結合を生成するための、還元剤を用いた、ア ミド窒素上の補助官能基のオリゴペプチド生成物からの除去を含んでいる。アミ ド窒素補助官能基は、N−α−O−(CH2n−SH(式中、1≦n≦2である 。)である。還元剤は亜鉛(下線の窒素は結合アミド窒素を表す。)である。 本発明の別の態様には、C末端チオエステルを含む第一のオリゴペプチドセグ メント、非酸化スルフヒドリル部分を有するN末端補助官能基を含む第二のオリ ゴペプチドセグメント、並びに、C末端チオエステル及び補助官能基のスルフヒ ドリル基を結合するアミノチオエステル結合単位を含むオリゴペプチド中間体が 含まれる。図面の簡単な説明 図1は、非保護ペプチドセグメント(式中、Rはβ分岐アミノ酸残基である。 ただし、第一のオリゴペプチド上のC末端残基が非グリシンである場合、第二の オリゴペプチド上のN末端残基はグリシンであり、第二のオリゴペプチド上のN 末端残基が非グリシンである場合、第一のオリゴペプチド上のC末端残基はグリ シンである。)の一般化天然化学結合を示している。R’は、3−カルボキシ、 4−ニトロフェニル及びベンジルからなる群より選ばれる。 図2は、Nα(置換)ペプチドセグメント2a及び2bの化学合成を示す。 図3は、化合物8bの化学合成を示す。 図4は、実施例#1〜5についてのモデル結合の要約に関する表を示す。上付 き文字は以下に示す通りである。(a)チオエステルペプチド(式中、−SNB =3−カルボキシ−4−ニトロフェニルチオエステル、−Sbzl=ベンジルチ オエステルである)。(b)Nα(置換)ペプチド(式中、etsh=Nα(エタ ンチオール)、oetsh=Nα(オキシエタンチオール)である)。(c)ペプ チド2を基礎とする。分析用逆相HPLC(ピーク領域)及びESMSより推定。 (d)pH7.5で示された時間経過後、pH4.5に調節。 図5A〜5Cは、モデル結合を示している。実施例#2(後述)。アミド−Gl y(Nα−OCH2CH2SH)Gly−化合物4bを、6Mグアニジン・HCl 、0.1M Na2HPO4、pH7.5で形成。(A)〜(C)は以下の通り、 HPLCプロットを示す。(A)t=0における分析用HPLC(10〜50% Bで30分間)、ピークa、チオエステルペプチド、1、LYRAαCOS C63(3−CO2H−4−NO2)。ピークb、Nα(オキシエタンチオール)ペ プチド、2b、[HSCH2CH2O]−RNTATIMMQRGNFR−αC ONH2。(B)t=1時間における分析用HPLC(10〜50%Bで30分間 )、ピークc、非ペプチド不純物、ピークd、LYRAG−αCOSC65、チ オフェノールを用いて1のトランスチオエステル化による。ピークe、中間体結 合生成物、4b、LYRAGG(Nα−OCH2CH2SH)RNTATIMMQ RGNFR−αCONH2及び少量の未反応[HSCH2CH2O]−RNTA TIMMQRGNFR−αCONH2(2b)、エレクトロスプレーイオン化MS により測定。(C)HPLC−精製及び酸性HPLC溶媒中でのZnを用いた一 晩の処理後のピークeの分析用HPLC(15〜40%Bで30分間)、ピークf 、最終結合生成物、5b、LYRAGGRNTATIMMQRGNFR−αCH NH2、ピークg、非ペプチド不純物。 図6A〜6Cは、モデル結合を示している。実施例#3(後述)。−Phe(Nα −OCH2CH2SH)Gly−結合生成物4b。結合及び転位は37℃で行っ た。(A)〜(C)は以下の通り、HPLCプロットを示す。(A)6Mグアニ ジン・HCl、0.1M Na2HPO4、pH7.5中で11.5時間後におけ る 分析用HPLC(20〜40%Bで30分間)、ピークa、Nα(オキシエタンチ オール)ペプチド、2b、[HSCH2CH2O]−RNTATIMMQRGN FR−αCONH2、ピークb、非転位中間体結合生成物、4b、LYRAFG( Nα−OCH2CH2SH)RNTATIMMQRGNFR−αCONH2、ピーク d、チオエステルペプチド、1、LYRAαCOSCH265。(B)6 Mグアニジン・HCl、0.1M NaCH3CO2、pH4.5中で11.5時 間後における分析用HPLC(0〜67%Bで30分間)。(C)酸性HPLC 溶媒中でのZnを用いた一晩の処理後のHPLC精製ピークcの分析用HPLC (20〜40%Bで30分間)、ピークf、最終結合生成物、5b、LYRAFG RNTATIMMQRGNFR−αCONH2発明の詳細な説明 本発明は、2つの別のペプチド断片を化学的に結合するための2工程からなる 方法に向けられる。より詳細には、本発明は、非保護ペプチドセグメントを天然 (アミド形成)化学結合し、天然ペプチド結合を精製するための一般的方法論に 関する 第一工程は、第一のペプチドのC末端チオエステルと、第二のオリゴペプチド の非酸化スルフヒドリル部分とを縮合し、第一のオリゴペプチドと第二のオリゴ ペプチドがδ−又はγ−アミノチオエステル結合で結合している中間体オリゴペ プチドを生成することを含んでいる。第一のオリゴペプチド上のC末端残基が非 グリシンである場合、第二のオリゴペプチド上のN末端残基はグリシンである。 第二のオリゴペプチド上のN末端残基が非グリシンである場合、第一のオリゴペ プチド上のC末端残基はグリシンである。ただし、非グリシン残基は非β分岐ア ミノ酸である。 第二工程は、δ又はγ−アミノ基のチオエステル部分への分子内攻撃による中 間体オリゴペプチドのδ又はγ−アミノチオエステル結合の転位、これによる、 チオエステル部分に由来する副生物としてのスルフヒドリル部分の置換、及び、 第一のオリゴペプチド及び第二のオリゴペプチドが天然アミド結合で結合してい るオリゴペプチド生成物の生成を含んでいる。しかしながら、アミド結合上の窒 素は置換スルフヒドリル部分を有する補助官能基を含んでいる。 任意の第三工程は、還元剤を用いてアミド窒素上の補助官能基を、オリゴペプ チド生成物から除去し、天然ペプチド結合を生成することを含んでいる。アミド 窒素補助官能基は、N−α−O−(CH2)N−SH(式中、1≦n≦2である )であり、還元剤は亜鉛である(下線を引いた窒素は結合したアミド窒素を表す) 。)である。 本発明の方法は、天然又は修飾されたバックボーン構造のいずれかを有するペ プチド及びタンパク質の合成を許容する。図1は手順を要約している。ペプチド α―カルボキシチオエステル(1)を、チオール交換を経て、Nα(エタンチオ ール)ペプチド(2a)又はNα(オキシエタンチオール)ペプチド(2b)の いずれかと反応させ、結合生成物3を生成する。このチオエステル結合中間体は 、5又は6員環を含む有利な幾何転位を経て転位し、4aにおいては二級アミド を含むアミド結合生成物4又は4bにおいては類似体N−オキシアルキル化合物 を含むアミド結合生成物4を与える。得られたN−α(置換)アミドも有利な溶 解特性を潜在的に有している(Quibell et al.J.Am.Chem.Soc.1995,117,1 1656-11668)。得られたN−α(O−アルキル)アミド結合生成物は、更に、H F切断条件に対し安定であるという利点を有し、穏やかな条件下で簡単に除去さ れる。4bの場合、亜鉛粉末を酸性溶離剤中の逆相HPLC精製ペプチドへ直接 添加し、O−アルコキシヒドロキサメートのN−O結合を還元し、結合生成物5 bの天然バックボーン構造を得ることができる。 すべてのペプチドセグメントは、tert−ブトキシカルボニル(Boc)化 学についての原位置中和/2−(1H−ベンゾトリアゾール−1−イル)−1, 1,3,3−テトラメチルウロニウムヘキサフルオロホスフェート(HBTU) 活性化プロトコルを使用した確立された固相法により、段階的に合成し、分離用 逆相HPLCにより精製し、エレクトロスプレーマススペクトロメトリー(ES 40,180-193)。ペプチド−α−チオエステル(1)は、対応のペプチド−α−チ オ酸より生成し、次に、Canne et al.Tetrahedron Lett.1995,36,1217-1220 に記載されているようにしてチオエステル樹脂上で合成した。ペプチド−α −チオ酸を、6Mグアニジン・HCl、0.1M 酢酸ナトリウム、pH5.0 〜6.5中、1.5当量の5,5’−ジチオ−ビス(2−ニトロ安息香酸)との 反応により対応の3−カルボキシ−4−ニトロフェニルチオエステルに転換する か、又は、6Mグアニジン・HCl、0.1M 酢酸ナトリウム、pH4.0中 、10当量の臭化ベンジルを使用して対応のベンジルエステルに転換した(Dawso n et al.Science 1994,266,776-779)。両方のチオエステルは、3−カルボキ シ−4−ニトロフェニルチオエステルを有する結合反応用の十分な脱離基を提供 する。これは、対応のベンジルチオエステルよりもやや速い反応速度を示す(Daw son et al.Science 1994,266,776-779)。 Nα(エタンチオール)(2a)及びNα(オキシエタンチオール)(2b)の合 成を図2に示す。適切なα−ブロモカルボン酸(対称性無水物として活性化(ジ クロロメタン中の0.5当量の1,3−ジイソプロピルカルボジイミド(DIC) ))(Robey et al.Anal.Biochem.1989,177,373-377)を、ペプチド−樹脂6 の脱保護N−末端アミノ酸と結合し、ブロモアシル−ペプチド−樹脂7を得た。 臭化物を、DMSO中の8a又は8bのアミン基により、立体化学転換的に置換 し、ペプチド−樹脂9を得た。無水HF中における脱保護及び樹脂からの切断に より、2bを直接得るか、又は、2aをジスルフィド形態で得、これを遊離のチ オールへ還元する。 アミノエタンチオール誘導体8aは、水中の80%アセトニトリル中、2−ア ミノエタンチオール及び5,5’−ジチオ−ビス(2−ニトロ安息香酸)の反応 より、1工程で合成した。アミノオキシエタンチオール誘導体8bの合成も含ま れ、これを図3に示す。臭化物11を、N−ヒドロキシフタルイミド(10)と 大過剰量の1,2−ジブロモエタンとの反応より生成した(Bauer J.Org.Chem .1963,28,1604-1608)。臭化物11を、塩基1,8−ジアザビシクロ[5.4 .0]ウンデカ−7−エン(DBU)の存在下で4−メチルベンジルメルカプタ ンを用いて保護アミノオキシエタンチオール誘導体12に転換した。12のフタ ルイミド基を2工程方法で除去した(Osby et al.Tetrahedron Lett.1984,25 ,2093-2096)。この方法にはNaBH4を用いた還元、続く酢酸を用いた処理に よる所望のアミノオキシエタンチオール誘導体8bを得る工程が含まれる。 X−Cys部位におけるオリジナルの天然化学結合と比較して(Dawson et al .Science 1994,266,776−779)、本発明の結合化学のもっとも注目すべき特徴 は、最初のチオエステル結合生成物の遅い転位である。この例における6員環中 間体を経たα−NH(O−アルキル)基による分子内攻撃は、X−Cys結合に おける非置換α−NH2の容易な5員環媒介攻撃(Dawson et al.Science 1994 ,266,776-779)よりもかなり好まれにくい(Mandolini et al.J.Am.Chem.S oc.1978,100,550-554)。Gly−Gly結合を除いて、ゆっくりと転位させ たのみである本発明のチオエステル−結合初期結合生成物を単離することができ る(図4)。注目すべきことに、両方の結合部位上のCα置換アミノ酸について、 アミド結合への転位は見ることができない。すなわち、チオエステル結合中間体 は、反応条件下では無制限に安定であった。これらの遅い転位は、既報の(N置 換)アミド形成結合化学において見られたものと類似している(Liu et al.Proc .Natl.Acad.Sci.USA 1994,91,6584-6588)。 本発明における、アミド形成性結合における一時的補助官能基の使用は、Kemp により提案された「チオールキャプチャー」戦略(Dawson et al.Science 1994 ,266,776-779Dawson et al.Science 1994,266,776-779)の回想である。天 然化学結合及びチオールキャプチャー法は、定められたゴールとして、長鎖ポリ ペプチド鎖の合成を達成するための、セグメント縮合戦略における非保護ペプチ ドの使用を有している。天然化学結合アプローチの鍵は、初期チオエステル結合 中間体生成物のチオール部分交換を促進する条件下での、両セグメントにその他 のCys残基の存在していてもN末端Cysにおける位置選択的結合を与える反 応である(Dawson et al.Science 1994,266,776-779)。対照的に、「チオール キャプチャー」戦略及び関連する方法(Liu et al.Tetrahedron Lett.1996,3 7,933-936)においては、結合反応前のCys側鎖官能基の位置特異的保護が必 要である(Kemp et al.Peptides:Proceedings of the 11th American Peptide S ymposium Rivier,J.E.;Marshall,G.R.,Eds,ESCOM:Lieden,1990; pp920-92 2)。したがって、これの元の意図を妨げる。 同様に、本発明における、カルボニル活性化α−チオカルボキシル基(すなわ ちα−COSR)の使用は、ペプチドセグメント縮合に使用する従来の化学(Bl ake et al.Proc.Natl.Acad.Sci.USA 1981,78,4055-4058; Yamashiro et al.Int.J.Pept.Protein Res.1988,31,322-334; Hojo et al.Peptide C hemistry Okada,Y.,Ed,Protein Research Foundation: Osaka,1994;pp 9-1 2)の回想である。しかしながら、これらの合成法は、Ag+活性化ペプチド−α COSR上の第二のセグメントのαアミン求核原子による慣習的非化学選択的攻 撃に基づいている。したがって、両セグメントにおけるすべての他のα−及びε −アミン官能基の位置特異的(再)保護を必要とする。 対照的に、チオエステル媒介アミド形成結合化学は、チオールを含む天然に見 出されるすべての側鎖官能基を有するまったく保護されていないペプチドセグメ ントの使用と適合する(Baca et al.J.Am.Chem.Soc.1995,117,1881-1887; Dawson et al.Science 1994,266,776−779)。この理由により、天然化学結合 は、簡単、実用的であり、タンパク質が適当な結合部位を含んでいるならばその タンパク質の全化学合成に対する一般的アプローチになる。 本発明は、結合部位として使用可能なジペプチド配列の数を拡張することによ り、Dawsonら(Dawson et al.Science 1994,266,776-779)により報告されて いる天然化学結合法の有用性を増大させる。その方法論のX−Cys結合部位に 加えて、本明細書には、X−Gly及びGly−X結合部位(すなわち、N末端 残基が非グリシンである場合のC末端残基のグリシン、C末端残基が非グリシン である場合のN末端残基のグリシン)をどのように使用するか開示している。好 ましい態様において、Xはすべての非β分岐アミノ酸である。しかしながら、本 発明者らの過去の研究は、Xは、β分岐アミノ酸例えばValを含むすべてのア ミノ酸であることができることを示した(Dawson et al.Science 1994,266,77 6-779)。 本発明は、潜在的に、3つだけの天然化学結合に適切な部位の数を、タンパク 質に見出される400のジペプチド配列のなかの50より多くへ拡張する。グリ シン残基を含む標的配列における結合部位の選択においてかなりの許容度がある ので、この拡張された適用性は、ほとんどのポリペプチドを天然化学結合により 利用しやすくする。 オリジナルの形態(Dawson et al.Science 1994,266,776-779)又は本明細 書に記載される形態の天然化学結合は、典型的な大きさのタンパク質ドメインの zer et al.Science 1992,256,221-225; Rose et al.Am.Chem.Soc.1994, 116,30-34; Liu et al.Proc.Natl.Acad.Sci.USA 1994,91,6584-6588) を使用して、モジュール様式で合成ドメインを結合し、大きな(すなわち>20 キロダルトン)、完全機能性合成タンパク質を製造することができる(Canne et a l.J.Am.Chem.Soc.1995,117,2998-3007; Baca et al.J.Am.Chem.Soc .1995,117,1881-1887)。すべての適切な化学反応を組み込むほぼ一般的な形 態(Dawson et al.Science 1994,266,776-779)において、化学結合アプロー チは、ポリペプチドの化学合成法の進化において次世代に相当し、再生可能、か つ実用的なタンパク質の全化学合成を提供する。結合例1〜4 結合例の結果を図4に要約する。全ての結合は、8M尿素、0.1MNa2H PO4、pH7.0又は6Mグアニジン・HCl、0.1MNa2HPO4、pH 7.5中、各ペプチド4mg/ml〜8mg/mlの濃度範囲で行った。ペプチ ドセグメントの(solvation)直後、2〜5%ベンジルメルカプタン(結合例# 1)又はチオフェノール(結合例#2〜5),容量の結合用緩衝液を添加し、チ オール基を還元形態に維持した。これは、もとのペプチド−αチオエステル(1 )の有意量をペプチド−αチオベンジルエステル又はペプチド−αチオフェニル エステル(共に、所望の態様でペプチド2と反応する能力を有している)へ交換 する追加の重要性を有していた。結合反応に続いて、分析用逆相HPLCを行い 、生成物をESMSにより同定した。以下に示す実施例において、結合に関連す るアミノ酸残基に下線を引いた。実施例1 ペプチド-αチオ(3−カルボキシ−4−ニトロ)フェニルエステル1は、配列L YRAG-αCOSC6H3(3-CO2H-4-NO2)(配列番号1)(実測質量760Da、計算値7 60Da)を有していた。5−チオ-2−(ニトロ安息香酸)ジスルフィドとし て 保護されているNα(エタンチオール)ペプチド2aは、配列[(3-CO2H-4-NO2)- C6H3-S-SCH2CH2]-GAGPAGD-αCONH2(配列番号2)(実測質量800Da、計算値 800Da)(この配列は結合混合物中で[HSCH2CH2]-GAGPAGD-αCONH2(配列番 号2)(実測質量603Da、計算値603Da)に還元される)を有していた。 1時間後、結合生成物4a[LYRAGG(Nα-CH2CH2SH)AGPAGD-αCONH2(配列番号3 )(実測質量1163±1Da、計算値1163Da)]が有意な程度生成した。 逆相HPLCによる結合生成物の精製後、5,5’−ジチオ−ビス(2−ニトロ 安息香酸)と6M尿素、0.1Mリン酸塩、pH6.0中で1時間処理し予想さ れる−S−ニトロ安息香酸ジスルフィド生成物、LYRAGG[Nα-CH2CH2S-SC6H3(3- CO2H-4-NO2)]AGPAGD-αCONH2(配列番号3)(実測質量1360±1Da、計算 値1360Da)を得た。これにより3aの転位により4aが形成することを確 認した。なぜなら、3aは5,5’−ジチオ−ビス(2−ニトロ安息香酸)に対 して不活性であるからである。結果を図4に要約する。実施例2 図5A〜5Cは結合例#2の過程を示している。ペプチド−αチオエステルセグ メント1(ピークa)は、配列LYRAG-αCOSC6H3(3-CO2H,4-NO2)(配列番号1) (実測質量760Da、計算値760Da、を有していた。Nα(オキシエタン チオール)ペプチド2b(ピークb)は、配列[HSCH2CH2O]-GRNTATIMMQRGNFR-α CONH2(配列番号4)(実測質量1827±1Da、計算値1828Da)から構成さ れていた。添加したチオフェノールの存在下、室温で1時間の反応後、結合生成 物LYRAGG(N-OCH2CH2SH)RNTATIMMQRGNFR-αCONH2(配列番号5)(4b、実測質 量2388±1Da、計算値2389Da)が有意な程度生成し、これは未反応 のNα(オキシエタンチオール)ペプチド2b(ピークe)と共に共溶出した。 更に一晩、室温下で反応させた後、結合生成物をHPLCにより精製し、亜鉛粉 末をHPLC溶離剤中に集めたペプチドへ直接添加し、室温下で一晩攪拌した。 これらの条件下、亜鉛はN−O結合を効率的に還元した。このタイプの還元は、 種種の試薬により可能である(Kecketal.TetrahedronLett.1995,36,7419-7922)。 得られたペプチド(ピークf)はN−O結合の還元により生成した LYRAGGRNTATIMMQRGNFR-αCONH2(配列番号5)(5b、実測質量2313±1Da 、計算値2313Da)と一致した質量を与えた。これにより、図1に示すよう に3bから4bへの転位を確認した。なぜなら、未転位3bにおけるN−O結合 の切断は有意に低い質量の2つの異なるペプチドの形成を引き起こすからである 。実施例3 図6A〜6Cは結合例#3の過程を示している。ペプチド−αチオエステルセ グメント1(ピークd)は、C末端フェニルアラニンチオエステル[LYRAF-αCOS CH2C6H5(配列番号6)(実測質量775Da、計算値775Da)]を有するペ プチドから構成されていた。したがって、前記の場合(結合例#1及び#2)( C末端グリシンチオエステルを含む)よりも立体障害を提供する。Nα(オキシ エタンチオール)ペプチド2b(ピークa)は、[HSCH2CH2O]-GRNTATIMMQRGNFR-α CONH2(配列番号7)(実測質量1827±1Da、計算値1828Da)から 構成されていた。より立体障害を受けたチオエステルの存在は、障害を受けてい ないモデルと比較して反応を低下させた。しかしながら、37℃での加熱は初期 結合速度を促進することを見出した。図6Aは、37℃で11.5時間後の結合 反応を示している。3bから4bへの転位速度は、未転位生成物3b、LYRAF-[α COSCH2CH2O]-GRNTATIMMQRGNFR-αCONH2(配列番号8)(ピークb、実測質量2 478±1Da、計算値2478Da)を観察するのに十分なほど遅く、転位生 成物4b、LYRAFG(Nα-OCH2CH2SH)RNTATIMMQRGNFR-αCONH2(配列番号9)(ピー クc、実測質量2478±1Da、計算値2478Da)のわずか前に溶離した 。同一の質量を有する、未転位及び転位生成物3b及び4bを、亜鉛還元生成物 により同定した。中間体3b、ピークbは、亜鉛還元時に、それぞれペプチド配 列LYRAF-αCOOH(チオエステル加水分解)及びGRNTATIMMQRGNFR-αCONH2に対応 する669Da及び1753Daの質量を有する2つのペプチドを与えた。次い で粗反応混合物を6Mグアニジン・HCl、0.1M酢酸ナトリウム、pH4.0 で(容量の5倍まで)希釈して初期結合後のpHを4.5に低下させることによ り、転位速度が加速したことを測定した。図6Bは、初期結合生成物3bから4 b(ピークc)への転位が、pH4.5、37℃で10時間後に完了したことを 示している。 このピークのHPLC精製及び続く亜鉛還元により、予想される質量を有するペ プチド(ピークf)LYRAFGRNTATIMMQRGNFR-αCONH2(配列番号9)(5b、実測質 量2403±1Da、計算値2404Da)を得た。実施例4 LYRAG-αCOSCH2C6H51(配列番号1)(実測質量685Da、計算値685D a)を、[HSCH2CH2O]-AARHTVHQRHLHG-αCOOH2b(配列番号10)(実測質量15 95±1Da、計算値1596Da)へ、pH7.5で結合した。本実施例は、 結合例#3の結合部位とは反対側のAla残基形態の立体障害を提供した。反応速 度は実施例3と同様であり、未障害例(結合例#1及び#2)よりも有意に遅い 速度であるが、37℃での加熱により加速した。未転位(3b、LYRAG-α[COSCH2 CH2O]-AARHTVHQRHLHG-αCOOH)(配列番号11)及び転位(4b、LYRAGA(Nα-O CH2CH2SH)ARHTVHQRHLHG-αCOOH)(配列番号12)結合生成物が形成し、実測質 量(未転位及び転位ともに)2156±1Da、計算値2157Daであった。 しかしながら、結合例#3と異なり、アミドへの成功した還元に示されるように pHにかかわらず37℃で2日後に転位はほぼ完了したが、転位速度は、初期結 合後にpHを4.5に低下させても加速しなかった。 最終結合生成物5b(LYRAGAARHTVHQRHLHG-αCOOH(配列番号12)、実測質量 2080±1Da、計算値2080Da)における有意数のヒスチジンの存在に より、ペプチドの亜鉛への結合が起こったことに注目すべきである。N−O結合 の還元後、EDTAをHPLC緩衝液/Zn混合物に添加して、ペプチドを亜鉛 から遊離させる必要がある。この結果を図4に要約する。実施例5 実施例5は、結合部位の両側に立体的バルク(steric bulk)を有する例を提 供する。LYRAF-αCOSCH2C6H51(配列番号6)(実測質量775Da、計算値7 75Da)を、[HSCH2CH2O]-AARHTVHQRHLHG-αCOOH2b(配列番号13)(実測質 量1595±1Da、計算値1596Da)にpH7.5で結合した。初期(す なわち未転位)結合生成物3bが観察されたが、LYRAF-α[COSCH2CH2O]- A ARHTVHQRHLHG-αCOOH(配列番号14)(実測質量2246±1Da、計算値2 247Da)、低pH下であっても、時間内に転位の証拠は存在しなかった。結 合部位の両側の側鎖の存在は、明らかに立体障害を与えたため、使用した条件下 では6員環中間体を経た転位は起こらなかった。結果を図4に要約する。 前記の例は、本発明者らのオリジナルの天然結合化学(Dawson et al.Science 1994,266,776-779)の驚くべき能力を強調する。これは、最近モデル結合研究 (Tametal.Proc.Natl.Acad.Sci.USA 1995,92,12485-12489)において本 質的に同一の形態で独立して繰り返された。本発明者らは、このオリジナルの天 然ペプチド結合-形成結合反応を、完全な生物学的活性を有するいくつかのタン パク質の化学合成に使用した。これらには、ケモカインIL−8(Dawson et al .Science 1994,266,776-779)、酵素HIV−1プロテアーゼ及びバーナーゼ( barnase)、セリンプロテアーゼ阻害剤シチメンチョウオボムコイド第三ドメイン 及びエグリン(eglin)C及びab/HLH転写因子が含まれる。この結合反応 は、MaxBrenner(Brenner M.peptides,Proceedings of the Eighth Europeanp eptide Symposium Beyerman,H.C.,Ed.,NorthHolland: Amsterdam,1976;pp1-7 )により公表された原理に基づくものであり、Wieland(Wieland et al.Liebig s Ann.Chem.1953,583,129-149)により最初に記載された化学を使用してい る。 実験プロトコル 概略 機械補助固相ペプチド合成を、カスタム修正(custom-modified)したアプラ イドバイオシステムズ(Applied Biosystems)430Aペプチド合成機中で行っ た(Schnolzer et al.Int.J.Pept.Protein Res.1992,40,180-193)。逆相 HPLCを、バイダック(Vydac)C−18計算用カラム(5μm、0.46× 15cm)及び準分離用(10μm、1.0×25cm)カラムを使用したライニ ン(Rainin)HPLCシステムで214nmのUV検出を用いて行った。クロマ トグラフィー分離は、緩衝液A中の緩衝液B(A=水中の0.1%TFA、B= 90%CH3CN/0.09%TFA含有10%水)の直線勾配を30 〜60分間、1ml/分(計算値)又は3ml/分(準分離用)で使用して達成 した。全てのペプチドセグメントのマススペクトルは、SciexAPI-IIIエレクトロ スプレー四極マススペクトロメーターを用いて得た。実測質量は、プログラムマ ックスペック(MacSpec)(サイエックス(Sciex))を使用しての、分子種について の全ての観察されたプロトン化状態についての実験m/z値に由来した。計算質 量は、平均アイソトープ組成物に基づき、かつプログラムマックプロマス(MacP roMass)(テリー・リー・アンド・サニル・ベムリ)(Terry Lee and Sunil Vemur i)、ベックマン・リサーチ・インスティテュート(Beckman Research Institut e)、デュアルテ、カリフォルニア)の使用に由来した。その他すべてのマススペ クトロメトリーは、ザ・スクリップス・リサーチ・インスティテュートのマスス ペクトロメトリー施設で行った。1HNMRスペクトルは、ブルッカー(Bruker )250MHzスペクトロフォトメーターに記録し、化学シフトは、Me4Si 由来の低磁場百万分率で報告した。微量分析は、ザ・スクリップス・リサーチ・ インスティテユートのX腺結晶学施設で行い、これは計算値±0.4%で一致し た。Boc−L−アミノ酸及びHBTUは、ノババイオケム(Novabiochem)(ラ ジョラ、カリフォルニア)より購入した。4−ヒドロメチルフェニルアセトアミ ドメチル(PAM)樹脂及びジイソプロピルエチルアミン(DIEA)は、アプ ライド・バイオシステムズ(Applied Biosystems)(フォスターシティ、カリフ ォルニア)より入手し、メチルベンズヒドリルアミン(MBHA)はペニーシュ ラ・ラボラトリーズ(Peninsula Laboratories,Inc)(サンカルロス、カリフォ ルニア)より入手した。合成用ジメチルホルムアミド(DMF)はベーカー(Bak er)より入手し、AR用CH2Cl2及びHPLC用CH3CNはフィッシャー(Fisher)より入 手した。トリフルオロ酢酸(TFA)はハロカーボン(Halocarbon)(ニュージャ ージー)より入手した。HFはマセソンガス(Matheson Gas)より購入した。4 −メチルベンジルメルカプタンはランカスター(Lancaster)より入手した。そ の他全ての試薬はAr用又はそれより良く、アルドリッチ・ケミカル(Aldrich Chemical)又はフィッシャーより入手した。ペプチドセグメント合成鎖の組立て ペプチドを、Boc化学についての原位置中和/HBTU活性化プロトコルを 使用した確立された固相法により段階的に合成した(Schnolzer et al.Int.J. Pept.Protein Res.1992,40,180-193)。側鎖の保護は以下に示すとおりであ った。Boc-Arg(p-トルエンスルホニル)-OH、Boc-Asn(キサンチル)-OH、Boc- Asp(O−シクロヘキシル)-OH、Boc-His(ジニトロフェニル)-OH、Boc-Thr(ベ ンジル)-OH及びBoc-Tyr(2-ブロモベンジルオキシカルボニル)-OH。Boc-Gln-O H及びBoc-Met-OHは側鎖の保護なしに使用した。カップリング反応を、定量的ニ ンヒドリンアッセイによりモニターし(Sarinetal,Anal.Biochem.,1981,117 ,147-157)、典型的には>99%であった。鎖の組立が完了した後、ペプチドを 脱保護し、同時に、HF含有5%p−クレゾールを用いた0℃で5時間の処理に より樹脂から切断し、ペプチド-αCOSH、-αCONH2又は-αCO2Hを得た。減圧下で HFを除去した後、粗ペプチドを無水Et2O(ジエチルエーテル)中に沈殿さ せ、HPLC緩衝液(40〜50%B)中に溶解し、凍結乾燥した。図1に示すペプチド-αチオエステル(1)の合成 チオ酸ペプチドは、[4-[α-(N-t-Boc-アミノアシル-S)ベンジル]フェノキシ ]酢酸、DCHA塩(Canne et al.Tetrahedron Lett.1995,36,1217-1220),( 2.0当量)及びアミノメチル−樹脂(1当量、DMF中10%DIEA(アル ドリッチ)で洗浄)を、活性化剤として添加したHBTU(1.6当量、アルド リッチ)及びDIEA(1当量、アルドリッチ)を用いて、DMF(ジメチルホ ルムアミド)中でカップリングすることにより、適切なBoc−アミノアシル− S−樹脂上で合成した。ペプチド-αCOSC6H3(3-CO2H-4-NO2)チオエステルは、 粗ペプチド-αCOSH(15〜20mg)を6Mグアニジン・HCl、0.1M酢 酸ナトリウム、pH5.0〜6.5に溶解することにより生成し、これに1.5 当量の5,5’−ジチオ-ビス(2−ニトロ安息香酸)を添加した(Dawson et al .Science 1994,266,776-779)。混合物を簡単にボルテックスし、10分後生 成した。ペプチド-αCOSC6H3(3-CO2H-4-NO2)エステルの同一性は、正確なエレ クトロスプレー質量測定により明確に確認し、これはLiuら(Tetrahedron Lett . 1996,37,933-936)と一致した。ペプチド-αCOSCH2C6H5チオエステルは、粗ペ プチド-αCOSH(15〜20mg)を6Mグアニジン・HCl、0.1M酢酸ナ トリウム、pH4.0中に溶解し、これに10当量の臭化ベンジルを添加するこ とにより生成した(Dawson et al.Science 1994,266,776-779)。混合物を 簡単にボルテックスし、1時間後精製した。LYRAG-αCOSC6H3(3-CO2H-4-NO2)( 実測質量760Da、計算値760Da)を、準分離用HPLC(20〜60% Bで40分間)により精製し、20〜30%の収率を得た。LYRAG-αCOSCH2C6H5( 実測質量685Da、計算値685Da)を準分離用HPLC(15〜45%B で60分間)精製し、25〜30%の収率を得た。LYRAF-αCOSCH2C6H5(実測質 量775Da、計算値775Da)を準分離用HPLC(30〜60%Bで60 分間)により精製し、25〜30%の収率を得た。収率の損失のほとんどは、単 にHPLC回収によるものであった。図2に示すNα(エタンチオール)及びNα(オキシエタンチオール)ペプチド (2)の合成 これらのペプチドを、MBHA(シグマ(Sigma))又は適切なBoc-アミノアシ ル-OCH2-PAM-樹脂(シグマ)のいずれかにおいて合成した。鎖の組立を完了し、 NαBoc基を純粋TFAで除去し(1分間の処理2回)、DMF中の10%DI EA中和(1分間の処理2回)後、ペプチドをRobeyの方法(Robey et al.Anal .Biochem.1989,177,373-377)によりブロモアセチル化した。ブロモ酢酸( 2.0mmol)をCH2Cl2(2ml)に溶解し、これにDIC(1mmol、2 −ジメチルアミノイソプロピルクロリド又はヒドロクロリド、アルドリッチ又は シグマ)を添加した。10〜15分間活性化し、対称性無水物を形成した後、混 合物をDMF(2ml)で希釈し、ペプチド−樹脂に添加し、30分間カップリ ングした。次いで樹脂をDMSOで洗浄し、8a(DMSO中2M)又は8b( DMSO中の1M)を添加し、ブロモアセチル化ペプチド−樹脂と8〜23時間 反応させた。ペプチドを、樹脂からの除去後、修飾なしに精製した。[(3-CO2H- 4-NO2)-C6H3-S-SCH2CH2]-AGPAGD-αCONH2(2a)(実測質量800Da、計算 値800Da)を、準分離用HPLC(0〜67%Bで60分間)により精 製し、〜24%を得た。[HSCH2CH2O]-GRNTATIMMQRGNFR-αCONH2(2b)(実測質 量1827±1Da、計算値1828Da)を準分離用HPLC(15〜40% Bで60分間)により精製し、〜25%の収率を得た。[HSCH2CH2O]-AARHTVHQRH LHG-αCOOH(2b)を、ブロモ酢酸の代わりに2−ブロモプロピオン酸のラセミ 化合物を使用し前記の方法により合成した。得られた粗凍結乾燥生成物は、所望 のペプチド及びブロモプロピオン酸塩化ペプチド(CH2=CHCO-ARHTVHQRHLHG-αCO OH、実測質量1502±1Da、計算値1502Da)からのHBrの除去によ り生じたペプチドの混合物であった。混合物を準分離用HPLC(10〜40% Bで60分間)により精製し、[HSCH2CH2O]-AARHTVHQRHLHG-αCOOH(実測質量1 595±1Da、計算値1596Da)を〜10%の収率で得た。図2に示すS−[(3−カルボキシ−4−ニトロ)フェニルチオ]2−アミノエタ ンチオール(8a)の合成 2−アミノエタンチオール(1.0g、13.0mmol)及び5,5’−ジ チオ−ビス(2−ニトロ安息香酸)(1.75g、4.4mmol)を、アセトニ トリル(100ml)及び水(25ml)と組み合わせ、室温で14時間攪拌し た。反応混合物を水(450ml)で希釈し、ウォーターズ・デルタ・プレップ (Waters Delta Prep)4000(バイダック5.0×2.5cm分離用C− 18カラムを有する)中の分離用逆相HPLCで精製し、8a(1.0g、40 %)を得た。 図3に示すN−(2−ブロモエトキシ)フタルイミド(11)の合成 N−(2−ブロモエトキシ)フタルイミド(11)を、Bauer及びSureshl(Bauer e t al.J.Org.Chem.1963,28,1604-1608)の手順の修飾により合成した。N −ヒドロキシフタルイミド(16.0g、98mmol、アルドリッチ)、トリエ チルアミン(30ml、215mmol)及び1,2−ジブロモエタン(35m l、406mmol、アルドリッチ)をDMF(115ml)で組み合わせ、室 温下で一晩攪拌した。固体をろ過し、DMFで洗浄した。ろ液を水(800m l)で希釈し、得られた沈殿物をろ過し、EtOAc(200ml)中に希釈し 、1NHCl(2×50ml),水(1×50ml)、飽和NaCl(1×50ml )で洗浄し、MgSO4で乾燥した。揮発物質を減圧下で除去し、得られた固体 を95%EtOHより再結晶化し、11を白色固体として得た(16.6g、6 3%)。 図3に示すN−[2−[S−(4−メチルベンジル)]メルカプト]エトキシ]フタ ルイミド(12)の合成 臭化物11(16.6、62mmol)、4−メチルベンジルメルカプタン(8 .5ml、63mmol)及びDBU(9.5ml、64mmol、1,8−ジ アザビシクロ[5.4.0]ウンデカ−7−エン、アルドリッチ)をベンゼン(150 ml)中で組み合わせ、室温下で8時間撹拌した。固体をろ過し、ベンゼンで洗 浄し、ろ液を1N HCl(2×35ml)、水(1×35ml)、飽和NaCl( 1×35ml)で洗浄し、MgSO4で乾燥した。揮発物質を減圧下で除去し、 得られた固体をEtOAc/ヘキサンから再結晶化し、12を白色固体として得 た(14.8g、74%)。 図3に示すS−(4-メチルベンジル)−2−アミノオキシエタンチオール(8b の合成 S−(4−メチルベンジル)−2−アミノオキシエタンチオールを、Osby(Osby et al.Tetrahedron Lett.1984,25,2093-2096)の方法により合成した。N− 置換フタルイミド12(7.4g、23mmol)をイソプロパノール(203 ml)及び水(35ml)中に懸濁し、これにNaBH4(3.5g、92 mmol)を添加した。混合物を室温下で一晩撹拌した。酢酸(25ml)を泡 立ちが停止するまでゆっくりと添加し、フラスコに栓をし、50℃で2〜3時間 加熱した。揮発物質を減圧下で除去し、得られた溶液を1N NaOHで希釈し 、EtOAc(4×50ml)で抽出した。組み合わせたEtOAC抽出物を飽 和NaCl(1×50ml)で洗浄し、MgSO4で乾燥した。揮発物質を減圧 下で除去し、得られた油をフラッシュクロマトグラフィー(1:1ヘキサン:E tOAc)により精製し、8bを透明かつ無色(3.2g、72%)の油として 得た。 DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION                              General chemical bondTechnical field to which the invention belongs   The present invention relates to a method for chemically binding oligopeptides. More specifically the book The invention uses peptide bonds to chemically link the ends of the oligopeptide How to do.Government rights   The present invention is based on the grant number R01 GM 4 awarded by the National Institutes of Health. It was made with government support under 8897 and P01 GM 48870. A The United States Government has certain rights in the invention.Background art   Traditional step-wise solid-phase peptide synthesis is often used to synthesize long peptides. , Low yield (Merrifield et al. J. Am. Chem. Soc. 1963, 85, 2). 149-2154; Kent et al. Ann. Rev. Biochem. 1988, 57, 957-989). Overcome this limitation To submit a smaller synthetic peptide to another peptide in a chemical bond, Will produce long peptides. al., Science 1992, 256, 221-225; Rose et al. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116 , 30-34; Liu et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1994, 91, 6584-6588). Sch The methodology disclosed by onolzer relies on the chemoselective reaction of unprotected peptide segments. The reaction provides a product having a non-natural backbone structure at the binding site. Is what you do. This methodology is better than that obtained by standard peptide synthesis methods. Also allow the synthesis of large peptides (Canne et al. J. Am. Chem. Soc. . 1995, 117, 2998-3007; Baca et al. J. Am. Chem. Soc. 1995,117,1881-188 7; Williams et al. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 10797-10798). More Method allows the synthesis of peptides with unusual structures and topologies (D awson et al. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 7263-7266; Rose et al. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 30-34; Muir et al. Biochemistry 1994, 33, 7701-7708 ; Canne et al. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 2998-3007). Conventional stepwise solid phase The combined use of peptide synthesis and chemical bonding has led chemists to use up to 60 amino acid residues. Can be routinely produced in good yields and purity of unprotected peptides at Using a combination of these two methodologies, total chemical synthesis of proteins is achieved Maybe.   Another chemical bonding technology for the production of proteins with natural backbone structures It has been reported (Dawson et al. Science 1994, 266, 776-779). This style of chemistry The linkage has been termed "native ligation". In this technology Converts unprotected synthetic peptides with C-terminal α-thioesters in a chemoselective manner. , With an unprotected peptide containing an N-terminal Cys residue. First thiol exchange reaction Thioester-linked intermediate, which rearranges spontaneously, Provides a natural amide bond at the binding site where two peptide segments bind In this process, the Cys side chain thiol is regenerated. This natural bond variant is Use the chemistry first described by Wieland for the reaction of amino acids (Wi eland et al. Liebigs Ann. Chem. 1953, 583, 129-149). First listed As such, the native linkage is the linkage of the peptide segments in the X-Cys linkage. (Dawson et al. Science 1994, 266, 776-779).   What is needed is a C-terminal α-thioester peptide segment with an N-terminal amino acid. A general method of coupling to a peptide peptide comprising an N-terminal amino acid peptide This is a method that does not require that the do segment has an N-terminal cysteine.Summary of the Invention   The present invention chemically binds unprotected oligopeptides and has all peptide bonds. Directed to a method of forming a product. In the first step, two oligo peptides The tide is linked to form a linkage product having an aminothioester linkage. Second construction In which the aminothioester bond is rearranged to form an N-substituted amide bond Form an object. In an optional third step, the substituent on the amide bond is removed in an acidic medium. Removed by easy treatment with Zn to give a natural peptide bond at the binding site You.   The method of the present invention comprises two starting oligopeptides, a first starting oligopeptide. A tide and a second starting oligopeptide are used. The first oligopeptide is thioe It has a C-terminal auxiliary group with a steal moiety. Ie ,[peptide1]αCOSR (where R is 3-carboxy, 4-nitrophenyl And benzyl. ). The second oligopeptide is non-acid Has an auxiliary functional group with a sulfhydryl moiety You. That is, HSCHTwoCHTwo(O) -Nα[peptideTwo]. First and second When the two starting oligopeptides are mixed under conditions that promote thioester exchange , Both peptides condense with each other to form an intermediate oligopeptide product. here, First and second oligopeptides are linked via an aminothioester bond . The aminothioester bond is spontaneously rearranged in the molecule, and is linked by an N-substituted amide bond. Form a binding product that is bound. During the intramolecular rearrangement, the amine of the N-terminal auxiliary functional group Ano groups attack thioesters and provide a bound N-linked complement containing a substituted sulfhydryl moiety. An amide group having an auxiliary functional group is formed. N-linked complement containing substituted sulfhydryl moieties Auxiliary functional groups are removed as appropriate by chemical means and have all natural peptide bonds A product may be formed.   One aspect of the present invention is a method for producing an oligopeptide product comprising the steps of: It is directed to a method of joining a peptide and a second oligopeptide end to end. More specifically, the method of the present invention comprises two steps and an optional third step.   In the first step, the first and second oligopeptides are linked to a δ or γ aminothioester. In order to produce an intermediate oligopeptide linked together, the C Condensation of terminal thioester with non-oxidized sulfhydryl moiety of second oligopeptide Includes making The first oligopeptide has a C-terminal thioe on the C-terminal residue. And the second oligopeptide comprises an N-terminal having a non-oxidized sulfhydryl moiety. Contains an N-terminal auxiliary function on the terminal residue. C-terminal residue of the first oligopeptide Is non-glycine, the N-terminal residue of the second oligopeptide is glycine . If the N-terminal residue on the second oligopeptide is non-glycine, the first oligo The C-terminal residue on the peptide is glycine. However, non-glycine residues are non-β-branched Amino acids.   In the second step, the δ- or γ-aminothioester bond of the intermediate oligopeptide Is rearranged by intramolecular attack on the thioester moiety of the δ or γ-amino group, Displace the sulfhydryl moiety as a by-product from the olester moiety. This An oligopeptide in which the first and second oligopeptides are linked by an amide bond Produce a product. The nitrogen of the amide bond is an auxiliary with a substituted sulfhydryl moiety Contains functional groups.   An optional third step involves using a reducing agent to generate a natural peptide bond. Includes removal of auxiliary functional groups on the mid nitrogen from the oligopeptide product. Ami The nitrogen assisting functional group is N-α-O- (CHTwo)n-SH (where 1 ≦ n ≦ 2 . ). The reducing agent is zinc (the underlined nitrogen represents the bound amide nitrogen).   In another aspect of the invention, there is provided a first oligopeptide seg comprising a C-terminal thioester. A second orientation containing an N-terminal auxiliary functional group having a non-oxidized sulfhydryl moiety. Gopeptide segments and sulfhydryls of C-terminal thioesters and auxiliary functional groups Oligopeptide intermediates containing an aminothioester linking unit linking the drill group included.BRIEF DESCRIPTION OF THE FIGURES   FIG. 1 shows an unprotected peptide segment (where R is a β-branched amino acid residue). However, if the C-terminal residue on the first oligopeptide is non-glycine, the second The N-terminal residue on the oligopeptide is glycine, and the N-terminal residue on the second oligopeptide is If the terminal residue is non-glycine, the C-terminal residue on the first oligopeptide is Shin. 3) shows a generalized natural chemical bond of the present invention. R 'is 3-carboxy, It is selected from the group consisting of 4-nitrophenyl and benzyl.   FIG.α2 shows the chemical synthesis of (substituted) peptide segments 2a and 2b.   FIG. 3 shows the chemical synthesis of compound 8b.   FIG. 4 shows a table for a summary of model combinations for Examples # 1-5. Superscript The characters are as shown below. (A) thioester peptide (wherein, -SNB = 3-carboxy-4-nitrophenylthioester, -Sbzl = benzylthio Oester). (B) Nα(Substituted) peptide (where etsh = Nα(Eta Thiol), oetsh = Nα(Oxyethanethiol)). (C) Pep Based on Pide 2. Estimated by analytical reverse phase HPLC (peak area) and ESMS. (D) After the time indicated by pH 7.5, the pH was adjusted to 4.5.   5A to 5C show model combinations. Example # 2 (described below). Amide-Gl y (Nα-OCHTwoCHTwoSH) Gly-compound 4b is converted to 6M guanidine.HCl , 0.1 M NaTwoHPOFourFormed at pH 7.5. (A) to (C) are as follows: 3 shows an HPLC plot. (A) Analytical HPLC at t = 0 (10-50% B for 30 minutes), peak a, thioester peptide, 1, LYRAGαCOS C6HThree(3-COTwoH-4-NOTwo). Peak b, Nα(Oxyethanethiol) Peptide, 2b, [HSCHTwoCHTwoO]-GRNATTIMMQRGGNFR-αC ONHTwo. (B) Analytical HPLC at t = 1 hour (10-50% B for 30 minutes ), Peak c, non-peptide impurity, peak d, LYRAG-αCOSC6HFive, By transthioesterification of 1 with ophenol. Peak e, intermediate formation Synthetic product, 4b, LYRAGG(Nα-OCHTwoCHTwoSH) RNTATIMMQ RGNFR-αCONHTwoAnd a small amount of unreacted [HSCHTwoCHTwoO]-GRNTA TIMMQRGNFR-αCONHTwo(2b), electrospray ionization MS Measured by (C) HPLC-purification and use of Zn in acidic HPLC solvents. Analytical HPLC of peak e after overnight treatment (30 minutes at 15-40% B), peak f , Final conjugation product, 5b, LYRAGGRNATTIMMQRGGNFR-αCH NHTwo, Peak g, non-peptide impurity.   6A to 6C show model combinations. Example # 3 (described below). −Phe (Nα -OCHTwoCHTwoSH) Gly-linked product 4b. Binding and rearrangement are performed at 37 ° C. Was. (A)-(C) show HPLC plots as follows. (A) 6M guani Gin / HCl, 0.1M NaTwoHPOFourAfter 11.5 hours in pH 7.5 To Analytical HPLC (20-40% B for 30 minutes), peak a, Nα(Oxyethane All) peptide, 2b, [HSCHTwoCHTwoO]-GRNATTIMMQRGN FR-αCONHTwo, Peak b, non-rearranged intermediate binding product, 4b, LYRAFG( Nα-OCHTwoCHTwoSH) RNTATIMMQRGGNFR-αCONHTwo,peak d, thioester peptide, 1, LYRAFαCOSCHTwoC6HFive. (B) 6 M guanidine · HCl, 0.1M NaCHThreeCOTwo11.5 hours in pH 4.5 Analytical HPLC after (30 min at 0-67% B). (C) Acidic HPLC Analytical HPLC of HPLC purified peak c after overnight treatment with Zn in solvent (20-40% B for 30 min), peak f, final bound product, 5b, LYRAFG RNATTIMMQRGGNFR-αCONHTwo.Detailed description of the invention   The invention consists of two steps for chemically linking two separate peptide fragments Aimed at the way. More particularly, the present invention relates to a method for converting unprotected peptide segments to native (Amide formation) A general methodology for chemically bonding and purifying natural peptide bonds Concerning   The first step involves the C-terminal thioester of the first peptide and the second oligopeptide Of the first oligopeptide and the second oligopeptide Intermediate oligopeppe in which peptides are linked by δ- or γ-aminothioester bonds Generating the peptide. The C-terminal residue on the first oligopeptide is non- When glycine, the N-terminal residue on the second oligopeptide is glycine. If the N-terminal residue on the second oligopeptide is non-glycine, The C-terminal residue on the peptide is glycine. However, non-glycine residues are non-β-branched Amino acids.   The second step involves the intramolecular attack of the δ or γ-amino group on the thioester moiety. Rearrangement of the δ or γ-aminothioester bond of the interstitial oligopeptide, thereby Substitution of the sulfhydryl moiety as a by-product derived from the thioester moiety, and The first oligopeptide and the second oligopeptide are linked by a natural amide bond The formation of an oligopeptide product. However, nitrogen on the amide bond The element contains an auxiliary functional group having a substituted sulfhydryl moiety.   An optional third step involves reducing the auxiliary functional group on the amide nitrogen with a reducing agent to form the oligopeptide. Removing from the tide product to produce a natural peptide bond. Amide The nitrogen assisting functional group is N-α-O- (CHTwo) N-SH (where 1 ≦ n ≦ 2) ) And the reducing agent is zinc (the underlined nitrogen represents the attached amide nitrogen) . ).   The method of the present invention provides a method for penetrating either natural or modified backbone structures. Allows synthesis of peptides and proteins. FIG. 1 summarizes the procedure. peptide The α-carboxythioester (1) is converted into Nα(Ethanthio )) Peptide (2a) or NαOf the (oxyethanethiol) peptide (2b) React with any of them to produce a coupled product 3. This thioester linked intermediate is Rearrangement via an advantageous geometric rearrangement involving a 5- or 6-membered ring; An analogous N-oxyalkyl compound in the amide bond product 4 or 4b containing To give an amide bond product 4 containing The obtained N-α(Substituted) amides are also advantageous Potentially having solution properties (Quibell et al. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 1). 1656-11668). The obtained N-αThe (O-alkyl) amide bond product further comprises H F has the advantage of being stable to cutting conditions and is easily removed under mild conditions. It is. In the case of 4b, zinc powder was directly applied to reverse phase HPLC purified peptide in acidic eluent To reduce the N—O bond of the O-alkoxyhydroxamate to give the bond product 5 The natural backbone structure of b can be obtained.   All peptide segments are tert-butoxycarbonyl (Boc) ylated In situ neutralization for chemistry / 2- (1H-benzotriazol-1-yl) -1, 1,3,3-tetramethyluronium hexafluorophosphate (HBTU) Stepwise synthesis and separation by established solid-phase method using activation protocol Purified by reverse phase HPLC, electrospray mass spectrometry (ES 40, 180-193). Peptide-α-thioester (1) is the corresponding peptide-α-thio From acid, and then Canne et al. Tetrahedron Lett. 1995, 36, 1217-1220 Synthesized on thioester resin as described in. Peptide-α -Thioic acid was prepared using 6M guanidine-HCl, 0.1M sodium acetate, pH 5.0 -6.5 with 1.5 equivalents of 5,5'-dithio-bis (2-nitrobenzoic acid) Conversion to the corresponding 3-carboxy-4-nitrophenylthioester by reaction Or in 6 M guanidine-HCl, 0.1 M sodium acetate, pH 4.0 Converted to the corresponding benzyl ester using 10 equivalents of benzyl bromide (Dawso n et al. Science 1994, 266, 776-779). Both thioesters are 3-carboxy Provides sufficient leaving groups for conjugation reactions with c-4-nitrophenylthioesters I do. This shows a slightly faster reaction rate than the corresponding benzylthioester (Daw son et al. Science 1994, 266, 776-779).   Nα(Ethanethiol) (2a) and Nα(Oxyethanethiol) (2b) The result is shown in FIG. Suitable α-bromocarboxylic acids (activated as symmetrical anhydrides (di- 0.5 equivalent of 1,3-diisopropylcarbodiimide (DIC) in chloromethane )) (Robey et al. Anal. Biochem. 1989, 177, 373-377). And bromoacyl-peptide-resin 7 was obtained. The bromide is stereochemically displaced by the amine group 8a or 8b in DMSO. Thus, peptide-resin 9 was obtained. For deprotection and cleavage from resin in anhydrous HF Thus, 2b is obtained directly, or 2a is obtained in disulfide form, which is Reduce to oars.   The aminoethanethiol derivative 8a was prepared from 2-A in 80% acetonitrile in water. Reaction of minoethanethiol and 5,5'-dithio-bis (2-nitrobenzoic acid) The synthesis was performed in one step. Also includes synthesis of aminooxyethanethiol derivative 8b This is shown in FIG. Bromide 11 is combined with N-hydroxyphthalimide (10) Produced from reaction with a large excess of 1,2-dibromoethane (Bauer J. Org. Chem. . 1963, 28, 1604-1608). The bromide 11 is converted to the base 1,8-diazabicyclo [5.4 . 0] 4-Methylbenzylmercapta in the presence of undec-7-ene (DBU) To a protected aminooxyethanethiol derivative 12. 12 lids The imide group was removed in a two step process (Osby et al. Tetrahedron Lett. 1984, 25). , 2093-2096). This method uses NaBHFourReduction using acetic acid, followed by treatment with acetic acid To obtain the desired aminooxyethanethiol derivative 8b.   Compared to the original natural chemical bond at the X-Cys site (Dawson et al. . Science 1994, 266, 776-779), the most noteworthy feature of the coupling chemistry of the present invention. Is a slow rearrangement of the first thioester bond product. In the six-membered ring in this example The intramolecular attack by the α-NH (O-alkyl) group via the interstitial forms X-Cys bond. Α-NHTwoFive-member ring mediated attack (Dawson et al. Science 1994) , 266, 776-779) (Mandolini et al. J. Am. Chem. S. oc. 1978, 100, 550-554). With the exception of the Gly-Gly bond, Only the thioester-linked initial bond product of the present invention can be isolated. (FIG. 4). Notably, C on both binding sitesαFor the substituted amino acids, No rearrangement to the amide bond can be seen. That is, a thioester-bonded intermediate Was indefinitely stable under the reaction conditions. These slow dislocations have been reported (N ) Similar to those found in amide-forming linkage chemistry (Liu et al. Proc. . Natl. Acad. Sci. USA 1994, 91, 6584-6588).   In the present invention, the use of a temporary auxiliary function in the amide-forming linkage is described by Kemp "Thiol capture" strategy proposed by Dawson et al. Science 1994 266, 776-779 Dawson et al. Science 1994, 266, 776-779). Heaven Naturally, chemical bonding and thiol capture methods have long- Unprotected peptides in a segment condensation strategy to achieve peptide chain synthesis Have the use of The key to the natural chemical bonding approach is the initial thioester bond Other segments in both segments under conditions that promote thiol partial exchange of intermediate products Giving a regioselective bond at the N-terminal Cys even when the Cys residue of (Dawson et al. Science 1994, 266, 776-779). In contrast, "thiol Capture strategy and related methods (Liu et al. Tetrahedron Lett. 1996, 3 7,933-936), the regiospecific protection of the Cys side chain functional group before the binding reaction is necessary. (Kemp et al. Peptides: Proceedings of the 11th American Peptide S ymposium Rivier, J.E .; Marshall, G.R., Eds, ESCOM: Lieden, 1990; pp920-92 2). Therefore, it hinders its original intention.   Similarly, in the present invention, a carbonyl-activated α-thiocarboxyl group (ie, The use of α-COSR is based on the conventional chemistry (Bl ake et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1981, 78, 4055-4058; Yamashiro et  al. Int. J. Pept. Protein Res. 1988, 31, 322-334; Hojo et al. Peptide C hemistry Okada, Y., Ed, Protein Research Foundation: Osaka, 1994; pp 9-1 It is a recollection of 2). However, these synthetic methods involve the use of Ag+Activating peptide-α Conventional non-chemoselective attack by α-amine nucleophile of the second segment on COSR Based on the fire. Therefore, all other α- and ε in both segments Requires regiospecific (re) protection of the amine function.   In contrast, thioester-mediated amide-forming conjugation chemistry is not naturally occurring, including thiols. No unprotected peptide segment with all issued side chain functional groups (Baca et al. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 1881-1887; Dawson et al. Science 1994, 266, 776-779). For this reason, natural chemical bonds Is simple and practical, if the protein contains a suitable binding site It becomes a general approach to total chemical synthesis of proteins.   The present invention extends the number of dipeptide sequences that can be used as binding sites. And reported by Dawson et al. (Dawson et al. Science 1994, 266, 776-779). Increase the usefulness of certain natural chemical bonding methods. In the X-Cys binding site of the methodology In addition, as used herein, X-Gly and Gly-X binding sites (ie, N-terminal Glycine at the C-terminal residue when the residue is non-glycine, non-glycine at the C-terminal residue Glycine at the N-terminal residue) is disclosed. Good In a preferred embodiment, X is any non-β-branched amino acid. However, the book Our previous work has shown that X can be any amino acid containing a β-branched amino acid such as Val. Have been shown to be amino acids (Dawson et al. Science 1994, 266, 77). 6-779).   The present invention potentially reduces the number of sites appropriate for only three natural chemical bonds to proteins. Extends to more than 50 of the 400 dipeptide sequences found in quality. Guri Considerable latitude in selecting binding sites in target sequences containing syn residues Therefore, this extended applicability allows most polypeptides to be Make it easier to use.   Original form (Dawson et al. Science 1994, 266, 776-779) or this specification The natural chemical bonds in the form described in this document are of typical size for protein domains. zer et al. Science 1992, 256, 221-225; Rose et al. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 30-34; Liu et al. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1994, 91, 6584-6588) Are used to join synthetic domains in a modular fashion and produce large (ie> 20) Kilodaltons) to produce fully functional synthetic proteins (Canne et a l. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 2998-3007; Baca et al. J. Am. Chem. Soc . 1995, 117, 1881-1887). Almost common form that incorporates all appropriate chemical reactions (Dawson et al. Science 1994, 266, 776-779) Is the next generation in the evolution of chemical synthesis of polypeptides and is renewable. To provide one practical total chemical synthesis of proteins.Combination examples 1-4   The results of the combined example are summarized in FIG. All linkages are 8 M urea, 0.1 M NaTwoH POFour, PH 7.0 or 6 M guanidine.HCl, 0.1 M NaTwoHPOFour, PH In 7.5, the concentration range was 4 mg / ml to 8 mg / ml for each peptide. Pepti Immediately after (solvation) of the dosegment, 2-5% benzyl mercaptan (bonding example # 1) Add thiophenol (binding examples # 2 to 5) and a volume of binding buffer. All groups were kept in reduced form. This is the original peptide-αThioester (1 ) Is a significant amount of peptide-αThiobenzyl ester or peptide-αThiophenyl Exchange for esters (both having the ability to react with peptide 2 in the desired manner) Had additional significance. Following the coupling reaction, analytical reverse-phase HPLC was performed. The product was identified by ESMS. In the examples described below, Amino acid residues are underlined.Example 1 peptide-αThio (3-carboxy-4-nitro) phenyl ester 1 has the sequence L YRAG-αCOSC6HThree(3-COTwoH-4-NOTwo) (SEQ ID NO: 1) (actual mass 760 Da, calculated value 7) 60 Da). 5-thio-2- (nitrobenzoic acid) disulfide hand Protected NαThe (ethanethiol) peptide 2a has the sequence [(3-COTwoH-4-NOTwo)- C6HThree-S-SCHTwoCHTwo]-GAGPAGD-αCONHTwo(SEQ ID NO: 2) (actual mass 800 Da, calculated value 800 Da) (this sequence is [HSCHTwoCHTwo]-GAGPAGD-αCONHTwo(Array number No. 2) (reduced to measured mass 603 Da, calculated 603 Da). One hour later, the coupled product 4a [LYRAGG(Nα-CHTwoCHTwoSH) AGPAGD-αCONHTwo(SEQ ID NO: 3 ) (Actual mass 1163 ± 1 Da, calculated 1163 Da)]. After purification of the coupled product by reverse phase HPLC, the 5,5'-dithio-bis (2-nitro (Benzoic acid) and 6 M urea, 0.1 M phosphate, pH 6.0 -S-nitrobenzoic acid disulfide product, LYRAGG[Nα-CHTwoCHTwoS-SC6HThree(3- COTwoH-4-NOTwo)] AGPAGD-αCONHTwo(SEQ ID NO: 3) (actual mass 1360 ± 1 Da, calculated 1360 Da). This confirms that 4a is formed by dislocation of 3a. I accepted. Because 3a is compatible with 5,5'-dithio-bis (2-nitrobenzoic acid). This is because they are inactive. The results are summarized in FIG.Example 2 5A to 5C show a process of connection example # 2. Peptide-αThioester seg Mention 1 (peak a) is the sequence LYRAG-αCOSC6HThree(3-COTwoH, 4-NOTwo) (SEQ ID NO: 1) (It had an actual mass of 760 Da and a calculated value of 760 Da. Nα(Oxyethane Thiol) peptide 2b (peak b) has the sequence [HSCHTwoCHTwoO]-GRNTATIMMQRGNFR-α CONHTwo(SEQ ID NO: 4) (measured mass: 1827 ± 1 Da, calculated value: 1828 Da) Had been. After 1 hour reaction at room temperature in the presence of added thiophenol, bond formation LYRAGG (N-OCHTwoCHTwoSH) RNTATIMMQRGNFR-αCONHTwo(SEQ ID NO: 5) (4b, actual measurement) 2388 ± 1 Da, calculated value 2389 Da), which is significant NαCo-eluted with (oxyethanethiol) peptide 2b (peak e). After further reacting at room temperature overnight, the bound product was purified by HPLC and zinc powder The powder was added directly to the peptide collected in the HPLC eluent and stirred overnight at room temperature. Under these conditions, zinc effectively reduced the NO bond. This type of reduction This is possible with various reagents (Kecketal. Tetrahedron Lett. 1995, 36, 7419-7922). The resulting peptide (peak f) was produced by reduction of the NO bond. LYRAGGRNTATIMMQRGNFR-αCONHTwo(SEQ ID NO: 5) (5b, observed mass 2313 ± 1 Da , Calculated 2313 Da). Thereby, as shown in FIG. In addition, dislocation from 3b to 4b was confirmed. The reason is that the N—O bond in the untransposed 3b Cleavage causes the formation of two distinct peptides of significantly lower mass .Example 3   6A to 6C show a process of connection example # 3. Peptide-αThioesterse Fragment 1 (peak d) is a C-terminal phenylalanine thioester [LYRAF-αCOS CHTwoC6HFive(SEQ ID NO: 6) (actual mass 775 Da, calculated value 775 Da)] It was composed of peptides. Therefore, in the above case (combination examples # 1 and # 2) ( (Including C-terminal glycine thioesters). Nα(Oxy (Ethanethiol) peptide 2b (peak a)TwoCHTwoO]-GRNTATIMMQRGNFR-α CONHTwo(SEQ ID NO: 7) (actual mass 1827 ± 1 Da, calculated value 1828 Da) Was composed. The presence of more sterically hindered thioesters Reduced response compared to no model. However, heating at 37 ° C It has been found that it promotes the binding rate. FIG. 6A shows binding after 11.5 hours at 37 ° C. The reaction is shown. The rate of rearrangement from 3b to 4b is determined by the untransposed product 3b, LYRAF- [α COSCHTwoCHTwoO]-GRNTATIMMQRGNFR-αCONHTwo(SEQ ID NO: 8) (peak b, measured mass 2 478 ± 1 Da, calculated 2478 Da) slow enough to observe Adult 4b, LYRAFG(Nα-OCHTwoCHTwoSH) RNTATIMMQRGNFR-αCONHTwo(SEQ ID NO: 9) (P C, eluted slightly before observed mass 2478 ± 1 Da, calculated 2478 Da) . The unrearranged and rearranged products 3b and 4b having the same mass are converted to zinc reduction products. Identified by Intermediate 3b and peak b show the peptide arrangement at the time of zinc reduction, respectively. Column LYRAF-αCOOH (thioester hydrolysis) andGRNTATIMMQRGNFR-αCONHTwoCompatible with Two peptides with masses of 669 Da and 1753 Da were obtained. Next The crude reaction mixture with 6M guanidine.HCl, 0.1M sodium acetate, pH 4.0 (5 times the volume) to reduce the pH after initial binding to 4.5. It was measured that the dislocation velocity was accelerated. FIG. 6B shows the initial binding products 3b-4 that the rearrangement to b (peak c) was completed after 10 hours at pH 4.5 and 37 ° C. Is shown. HPLC purification of this peak, followed by zinc reduction, resulted in a pellet with the expected mass. Peptide (peak f) LYRAFGRNTATIMMQRGNFR-αCONHTwo(SEQ ID NO: 9) (5b, actual measurement) 2403 ± 1 Da, calculated 2404 Da).Example 4   LYRAG-αCOSCHTwoC6HFive1 (SEQ ID NO: 1) (actual mass 685 Da, calculated value 685 D a) to [HSCHTwoCHTwoO]-AARHTVHQRHLHG-αCOOH2b (SEQ ID NO: 10) (actual mass 15 95 ± 1 Da, calculated 1596 Da) at pH 7.5. In this embodiment, It provided steric hindrance in the form of an Ala residue on the opposite side of the binding site of Binding Example # 3. Reaction speed The degree is the same as in Example 3, and is significantly slower than the non-failed cases (combined examples # 1 and # 2). The speed was accelerated by heating at 37 ° C. Undislocated (3b, LYRAG-α[COSCHTwo CHTwoO]-AARHTVHQRHLHG-αCOOH) (SEQ ID NO: 11) and rearrangement (4b, LYRAGA(Nα-O CHTwoCHTwoSH) ARHTVHQRHLHG-αCOOH) (SEQ ID NO: 12) binding product formed, The amount (both undislocation and dislocation) was 2156 ± 1 Da, and the calculated value was 2157 Da. However, unlike Conjugation Example # 3, as shown by the successful reduction to the amide Dislocation was almost complete after 2 days at 37 ° C regardless of pH, but the dislocation rate was The pH was not accelerated when the pH was reduced to 4.5 after the combination.   Final coupled product 5b (LYRAGAARHTVHQRHLHG-αCOOH (SEQ ID NO: 12), measured mass 2080 ± 1 Da, calculated value 2080 Da) due to the presence of a significant number of histidines Rather, it should be noted that binding of the peptide to zinc has occurred. N-O bond After reduction of the peptide, EDTA was added to the HPLC buffer / Zn mixture to convert the peptide to zinc. Must be released from The results are summarized in FIG.Example 5   Example 5 provides an example having a steric bulk on both sides of the binding site. Offer. LYRAF-αCOSCHTwoC6HFive1 (SEQ ID NO: 6) (actual mass 775 Da, calculated 7) 75Da) to [HSCHTwoCHTwoO]-AARHTVHQRHLHG-αCOOH2b (SEQ ID NO: 13) (actual quality measurement) An amount of 1595 ± 1 Da, calculated 1596 Da) was bound at pH 7.5. Early (Ie, untransposed) bonded product 3b was observed, but LYRAF-α[COSCHTwoCHTwoO]- A ARHTVHQRHLHG-αCOOH (SEQ ID NO: 14) (actual mass 2246 ± 1 Da, calculated value 2) 247 Da), even at low pH, there was no evidence of rearrangement in time. Conclusion The presence of the side chains on both sides of the joint site apparently hindered Did not cause rearrangement via the six-membered ring intermediate. The results are summarized in FIG.   The above example illustrates our original natural binding chemistry (Dawson et al. Science).  (1994, 266, 776-779). This is a recent model binding study (Tametal. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 1995, 92, 12485-12489) It was repeated independently in qualitatively identical form. We believe that this original sky Naturally, the peptide bond-formation reaction is carried out by several tandems with full biological activity. Used for chemical synthesis of protein. These include the chemokines IL-8 (Dawson et al. . Science 1994, 266, 776-779), the enzymes HIV-1 protease and burnase ( barnase), a serine protease inhibitor turkey ovomucoid third domain And eglin C and ab / HLH transcription factors. This binding reaction Is based on MaxBrenner (Brenner M. peptides, Proceedings of the Eighth Europeanp eptide Symposium Beyerman, H.C., Ed., North Holland: Amsterdam, 1976; pp1-7 ) And based on the principles published by Wieland (Wieland et al. Liebig). s Ann. Chem. 1953, 583, 129-149). You.                              Experimental protocol Outline   Machine-assisted solid-phase peptide synthesis with custom-modified Performed in Applied Biosystems 430A peptide synthesizer (Schnolzer et al. Int. J. Pept. Protein Res. 1992, 40, 180-193). Reversed phase HPLC was performed on a Vydac C-18 calculation column (5 μm, 0.46 × 15 cm) and a liner using a semi-separation (10 μm, 1.0 × 25 cm) column. Performed on a Rainin HPLC system with UV detection at 214 nm. Chroma The chromatographic separation was performed using buffer B in buffer A (A = 0.1% TFA in water, B = 90% CHThreeThe linear gradient of CN / 10% water containing 0.09% TFA) was 30 Achieved using 1 ml / min (calculated) or 3 ml / min (for semi-separation) for ~ 60 min did. Mass spectra of all peptide segments were obtained from SciexAPI-III Obtained using a spray quadrupole mass spectrometer. The measured mass is About molecular species using MacSpec (Sciex) From experimental m / z values for all observed protonation states. Computational quality The amounts are based on the average isotope composition and are based on the program Mac Promass (MacP roMass) (Terry Lee and Sunil Vemur) i), Beckman Research Institute e), Dualte, CA). All other mass specs Spectrometry is a member of The Scripps Research Institute's Massus Performed at a spectrometry facility.11 H NMR spectra were obtained from Bruker ) Recorded on 250 MHz spectrophotometer, chemical shifts were MeFourSi Sources reported in parts per million low field. Microanalysis is available at The Scripps Research Performed at the institute's X-ray crystallography facility, which is consistent with a calculated value of ± 0.4%. Was. Boc-L-amino acids and HBTU were obtained from Novabiochem (La Jora, California). 4-hydromethylphenylacetami Methyl (PAM) resin and diisopropylethylamine (DIEA) Applied Biosystems (Foster City, Calif) Moltenbenzhydrylamine (MBHA) was obtained from Peniche La Laboratories (Peninsula Laboratories, Inc) (San Carlos, California Lunia). Dimethylformamide (DMF) for synthesis is available from Baker er)TwoClTwoAnd CH for HPLCThreeCN enters from Fisher I did it. Trifluoroacetic acid (TFA) is a halocarbon (New J -Gee). HF was purchased from Matheson Gas. 4 -Methylbenzyl mercaptan was obtained from Lancaster. So All other reagents for Ar or better are Aldrich Chemical   Chemical) or from Fisher.Assembly of synthetic peptide segment chains   Peptides were subjected to in situ neutralization / HBTU activation protocol for Boc chemistry. It was synthesized stepwise by the established solid phase method used (Schnolzer et al. Int. Pept. Protein Res. 1992, 40, 180-193). The protection of the side chains is shown below. Was. Boc-Arg (p-toluenesulfonyl) -OH, Boc-Asn (xanthyl) -OH, Boc- Asp (O-cyclohexyl) -OH, Boc-His (dinitrophenyl) -OH, Boc-Thr Benzyl) -OH and Boc-Tyr (2-bromobenzyloxycarbonyl) -OH. Boc-Gln-O H and Boc-Met-OH were used without side chain protection. The coupling reaction is quantitatively Monitoring by the hydrin assay (Sarinetal, Anal. Biochem., 1981, 117). , 147-157), typically> 99%. After chain assembly is complete, the peptide is Deprotection and at the same time treatment with 5% p-cresol containing HF at 0 ° C. for 5 hours Cleavage from the resin, peptide-αCOSH,-αCONHTwoOr-αCOTwoGot H. Under reduced pressure After removal of HF, the crude peptide wasTwoPrecipitated in O (diethyl ether) And dissolved in HPLC buffer (40-50% B) and lyophilized.Synthesis of peptide- α thioester (1) shown in FIG.   Thioacid peptide is [4- [α- (N-t-Boc-aminoacyl-S) benzyl] phenoxy Acetic acid, DCHA salt (Canne et al. Tetrahedron Lett. 1995, 36, 1217-1220), ( 2.0 equivalents) and aminomethyl-resin (1 equivalent, 10% DIEA in DMF (Al Wash) with HBTU (1.6 eq. Rich) and DIEA (1 equivalent, Aldrich), using DMF (dimethylphos). Loc) in the appropriate Boc-aminoacyl- Synthesized on S-resin. peptide-αCOSC6HThree(3-COTwoH-4-NOTwo) The thioester is Crude peptide-αCOSH (15-20mg) with 6M guanidine.HCl, 0.1M vinegar Sodium acid, produced by dissolution in pH 5.0-6.5, to which 1.5 An equivalent amount of 5,5'-dithio-bis (2-nitrobenzoic acid) was added (Dawson et al. . Science 1994, 266, 776-779). Vortex the mixture briefly and grow 10 minutes later Done. peptide-αCOSC6HThree(3-COTwoH-4-NOTwo) The identity of the ester is It was clearly confirmed by mass spectrometry, which was confirmed by Liu et al. (Tetrahedron Lett. . 1996, 37, 933-936). peptide-αCOSCHTwoC6HFiveThe thioester is Petit-αCOSH (15-20 mg) was added to 6 M guanidine.HCl, 0.1 M sodium acetate. Dissolve in thorium, pH 4.0, and add 10 equivalents of benzyl bromide. (Dawson et al. Science 1994, 266, 776-779). The mixture Vortex briefly and purify after 1 hour. LYRAG-αCOSC6HThree(3-COTwoH-4-NOTwo) ( The measured mass 760 Da, the calculated value 760 Da) was converted to semi-separated HPLC (20-60%). B for 40 minutes) to give a yield of 20-30%. LYRAG-αCOSCHTwoC6HFive( The measured mass 685 Da, the calculated value 685 Da) was analyzed by semi-separation HPLC (15-45% B For 60 minutes) to give a yield of 25-30%. LYRAF-αCOSCHTwoC6HFive(Actual survey 775 Da, calculated 775 Da) by semi-preparative HPLC (60 at 30-60% B). Min) to give a yield of 25-30%. Most of the yield loss is Was due to HPLC recovery.N α (ethanethiol) and N α (oxyethanethiol) peptides shown in FIG. Synthesis of (2)   These peptides were purchased from MBHA (Sigma) or the appropriate Boc-aminoacid. Le-OCHTwoSynthesized on any of -PAM-resin (Sigma). Complete the assembly of the chain, NαThe Boc group was removed with pure TFA (two 1 minute treatments) and 10% DI in DMF After EA neutralization (2 treatments for 1 minute), the peptide was purified by the method of Robey (Robey et al. Anal. . Biochem. 1989, 177, 373-377). Bromoacetic acid ( 2.0 mmol) CHTwoClTwo(2 ml), and DIC (1 mmol, 2 mmol) -Dimethylaminoisopropyl chloride or hydrochloride, Aldrich or Sigma) was added. Activate for 10-15 minutes to form symmetrical anhydride, then mix The mixture was diluted with DMF (2 ml), added to the peptide-resin, and coupled for 30 minutes. I did. The resin is then washed with DMSO and 8a (2M in DMSO) or 8b ( 1M in DMSO) and add bromoacetylated peptide-resin for 8-23 hours Reacted. The peptide was purified without modification after removal from the resin. [(3-COTwoH- 4-NOTwo) -C6HThree-S-SCHTwoCHTwo] -AGPAGD-αCONHTwo(2a) (actual mass 800 Da, calculated Value 800 Da) was purified by semi-preparative HPLC (0-67% B for 60 min). To give 2424%. [HSCHTwoCHTwoO]-GRNTATIMMQRGNFR-αCONHTwo(2b) (actual survey Amount 1827 ± 1 Da, calculated value 1828 Da) by HPLC for semi-separation (15-40% B for 60 minutes) to give a yield of 2525%. [HSCHTwoCHTwoO]-AARHTVHQRH LHG-αCOOH (2b) is replaced with racemic 2-bromopropionic acid in place of bromoacetic acid. The compound was synthesized by the above method using the compound. The resulting crude freeze-dried product is Peptide and bromopropionated peptide (CHTwo= CHCO-ARHTVHQRHLHG-αCO OH, measured mass 1502 ± 1 Da, calculated by removing HBr from 1502 Da). This was a mixture of the resulting peptides. The mixture was purified by semi-preparative HPLC (10-40% B for 60 minutes), [HSCHTwoCHTwoO]-AARHTVHQRHLHG-αCOOH (actual mass 1 595 ± 1 Da, calculated 1596 Da) in a yield of % 10%.S-[(3-carboxy-4-nitro) phenylthio] 2-aminoeta shown in FIG. Synthesis of thiol (8a)   2-aminoethanethiol (1.0 g, 13.0 mmol) and 5,5'-di Thio-bis (2-nitrobenzoic acid) (1.75 g, 4.4 mmol) was added to acetonitrile. Combine with Tril (100 ml) and water (25 ml) and stir at room temperature for 14 hours Was. Dilute the reaction mixture with water (450 ml) and add Waters Delta Prep (Waters Delta Prep) 4000 (Vydac 5.0 × 2.5cm separation C- 18a (1.0 g, 40 g). %). Synthesis of N- (2-bromoethoxy) phthalimide (11) shown in FIG.   N- (2-bromoethoxy) phthalimide (11) was prepared using Bauer and Sureshl (Bauer e). t al. J. Org. Chem. 1963, 28, 1604-1608). N -Hydroxyphthalimide (16.0 g, 98 mmol, Aldrich), trie Tylamine (30 ml, 215 mmol) and 1,2-dibromoethane (35 m 1,406 mmol, Aldrich) in DMF (115 ml) Stirred overnight at warm. The solid was filtered and washed with DMF. Filtrate with water (800m 1), filter the resulting precipitate, dilute in EtOAc (200 ml) 1N HCl (2 × 50 ml), water (1 × 50 ml), saturated NaCl (1 × 50 ml) ) And washed with MgSOFourAnd dried. Volatiles were removed under reduced pressure and the resulting solid Was recrystallized from 95% EtOH to give 11 as a white solid (16.6 g, 6 3%). N- [2- [S- (4-methylbenzyl)] mercapto] ethoxy] lid shown in FIG. Synthesis of Luimide (12)   Bromide 11 (16.6, 62 mmol), 4-methylbenzylmercaptan (8 . 5 ml, 63 mmol) and DBU (9.5 ml, 64 mmol, 1,8-di) Azabicyclo [5.4.0] undec-7-ene, Aldrich was converted to benzene (150 ml) and stirred at room temperature for 8 hours. Filter the solid and wash with benzene The filtrate was washed with 1N HCl (2 × 35 ml), water (1 × 35 ml), saturated NaCl ( 1 × 35 ml), and washed with MgSOFourAnd dried. Volatiles are removed under reduced pressure, The resulting solid was recrystallized from EtOAc / hexane to give 12 as a white solid (14.8 g, 74%). S- (4-methylbenzyl) -2-aminooxyethanethiol (8b) shown in FIG. Synthesis of   S- (4-methylbenzyl) -2-aminooxyethanethiol was converted to Osby (Osby et al. Tetrahedron Lett. 1984, 25, 2093-2096). N- Substituted phthalimide 12 (7.4 g, 23 mmol) was added to isopropanol (203 ml) and water (35 ml).Four(3.5 g, 92 mmol) was added. The mixture was stirred overnight at room temperature. Acetic acid (25 ml) foam Add slowly until standing stops, stopper the flask, and leave at 50 ° C. for 2-3 hours. Heated. Volatiles were removed under reduced pressure and the resulting solution was diluted with 1 N NaOH , Extracted with EtOAc (4 x 50 ml). Saturate the combined EtOAC extract Wash with NaCl (1 × 50 ml) and MgSO 4FourAnd dried. Decompress volatiles And the resulting oil was flash chromatographed (1: 1 hexane: E tOAc) to give 8b as a clear and colorless (3.2 g, 72%) oil Obtained.

───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (72)発明者 ミュアー トム ダブリュー アメリカ合衆国 ニューヨーク州 10021 ニューヨーク イースト シックスティ サード ストリート 500 アパートメン ト 15ビー (72)発明者 ドーソン フィリップ イー アメリカ合衆国 カリフォルニア州 91030 サウス パサディナ リンドン ストリート 1302―#11 (72)発明者 バーク スティーヴン ジェイ アメリカ合衆国 カリフォルニア州 92037 サン ディエゴ カミニト ディ ア 7944―#1 (72)発明者 カンヌ リン アメリカ合衆国 カリフォルニア州 94044 パシフィカ クレスピ ドライヴ 1103────────────────────────────────────────────────── ─── Continuation of front page    (72) Inventor Muir Tom W             United States of America New York 10021               New York East Sixty             Third Street 500 Apartment             To 15 Be (72) Inventor Dawson Philip E             United States California             91030 South Pasadena Lyndon             Street 1302-# 11 (72) Inventor Burke Steven Jay             United States California             92037 San Diego Caminito Di             Oh 7944-# 1 (72) Inventor Cannes Lin             United States California             94044 Pacifica Crespi Drive               1103

Claims (1)

【特許請求の範囲】 1.第一のオリゴペプチドと第二のオリゴペプチドとを末端と末端で結合し、オ リゴペプチド生成物を製造する方法であって、 工程A:第一及び第二のオリゴペプチドを、触媒性チオールを含む反応溶液中 で混合する工程であって、第一のオリゴペプチドはC末端チオエステルを有する C末端残基を含み、第二のオリゴペプチドは非酸化スルフヒドリル部分を有する N末端補助官能基を有するN末端残基を含み、N末端残基がグリシンでない場合 、C末端残基はグリシンであり、C末端残基がグリシンでない場合、N末端残基 はグリシンである工程、 工程B:N末端補助官能基の非酸化スルフヒドリル部分とC末端チオエステル とを縮合し、第一及び第二のオリゴペプチドがアミノチオエステル結合で結合し ている中間体オリゴペプチドを製造する工程、及び、 工程C:工程Bの中間体オリゴペプチドのアミノチオエステル結合を転位し、 第一及び第二のオリゴペプチドがN結合補助官能基で結合しているオリゴペプチ ド生成物を製造する工程、 を含むことを特徴とする方法。 2.触媒性チオールが、ベンジルメルカプタン及びチオフェノールからなる群よ り選ばれる、請求項1に記載の方法。 3.N末端補助官能基がN−α−(CH2)N−SH(式中、1≦n≦3である )である、請求項2に記載の方法。 4.追加の工程である、 工程D:N末端補助官能基を、工程Cのオリゴペプチド生成物から、還元剤を 用いて除去し、天然ペプチド結合を生成する工程、 を含む、請求項2に記載の方法。 5.N末端補助官能基がN−α−O−(CH2)N−SH(式中、1≦n≦2で ある)である、請求項4に記載の方法。 6.還元剤が亜鉛である、請求項5に記載の方法。 7.C末端チオエステルを含む第一のオリゴペプチドセグメント、 非酸化スルフヒドリル部分を有するN末端補助官能基を含む第二のオリゴペプ チドセグメント、及び、 C末端チオエステルと補助官能基の非酸化スルフヒドリル基とを結合するアミ ノチオエステル結合、 を含むオリゴペプチド中間体であって、アミノチオエステル結合単位が自発的に 分子内転位して、該第一及び第二のオリゴペプチドセグメントを末端と末端で結 合するアミド結合を形成することを特徴とする中間体。 8.2つのペプチド配列、例えばアミノ末端ペプチド配列とカルボキシル末端配 列とを結合する結合単位であって、 第一のアミノ酸残基(aa1)、第二のアミノ酸残基(aa2)並びに第一及び第 二のアミノ酸残基の間の分解された結合、 を含み、第一のアミノ酸残基はバックボーンカルボニル基、例えば(aa1− CO−)を有し、 第二のアミノ酸残基は、バックボーンアミノ基、例えば(−NR−aa2)(式 中、Rは、α−O−(CH2)N−SH及びα−(CH2)N−SH(式中、1≦ n≦2である)からなる群より選ばれる)を有し、 第一のアミノ酸残基中のカルボニル基は、第二のアミノ酸残基を、第二のアミ ノ酸の補助部分のスルフヒドリル基で、第一のアミノ酸へ結合する単結合を有し 、 第一及び第二のアミノ酸残基の間の分解された結合は、以下の式: (aa1−CO)−S−(CH2)N−X−(N−aa2)(式中、1≦n≦2であ り、Xは酸素及びメチレンからなる群より選ばれる) で示され、 ジペプチドの第一のアミノ酸残基(aa1)は、アミノ末端ペプチド配列を有 するペプチド結合の形成に使用可能であり、ジペプチドの第二のアミノ酸残基( aa2)は、カルボキシル末端ペプチド配列を有するペプチド結合の形成に使用可 能であり、これによりアミノ末端ペプチド配列とカルボキシル末端ペプチド配列 とを分解された結合で結合することを特徴とする結合単位。[Claims] 1. A method for producing an oligopeptide product by linking a first oligopeptide and a second oligopeptide end-to-end, wherein step A: the first and second oligopeptides comprise a catalytic thiol Mixing in a reaction solution, wherein the first oligopeptide includes a C-terminal residue having a C-terminal thioester and the second oligopeptide has an N-terminal auxiliary functional group having a non-oxidized sulfhydryl moiety. If the N-terminal residue is not glycine, the C-terminal residue is glycine; if the C-terminal residue is not glycine, the N-terminal residue is glycine. Step B: N-terminal auxiliary functional group To produce an intermediate oligopeptide in which the first and second oligopeptides are linked by an aminothioester bond And C) transposing the aminothioester bond of the intermediate oligopeptide of step B to produce an oligopeptide product in which the first and second oligopeptides are linked by an N-linked auxiliary functional group. A method comprising: 2. The method of claim 1, wherein the catalytic thiol is selected from the group consisting of benzyl mercaptan and thiophenol. 3. N-terminal auxiliary functional group N-α- (CH 2) N -SH ( wherein a 1 ≦ n ≦ 3) a method according to claim 2. 4. 3. The additional step of claim 2, comprising: step D: removing the N-terminal auxiliary functional group from the oligopeptide product of step C using a reducing agent to form a natural peptide bond. Method. 5. N-terminal auxiliary functional group N-α-O- (CH 2 ) N-SH ( wherein 1 is ≦ n ≦ 2) is a method of claim 4. 6. The method of claim 5, wherein the reducing agent is zinc. 7. A first oligopeptide segment comprising a C-terminal thioester, a second oligopeptide segment comprising an N-terminal auxiliary functional group having a non-oxidized sulfhydryl moiety, and combining the C-terminal thioester with a non-oxidized sulfhydryl group of the auxiliary functional group An oligopeptide intermediate comprising an aminothioester linkage, wherein the aminothioester linkage unit spontaneously translocates to form an amide linkage that connects the first and second oligopeptide segments end-to-end. An intermediate, characterized in that: 8. A linking unit linking two peptide sequences, for example, an amino-terminal peptide sequence and a carboxyl-terminal sequence, comprising a first amino acid residue (aa 1 ), a second amino acid residue (aa 2 ) and a first amino acid residue (aa 2 ). A first amino acid residue having a backbone carbonyl group, such as (aa 1 -CO-); and a second amino acid residue having a backbone carbonyl group. amino groups, for example (-NR-aa 2) (wherein, R is a α-O- (CH 2) n -SH and α- (CH 2) n-SH ( wherein, 1 ≦ n ≦ 2 Wherein the carbonyl group in the first amino acid residue binds the second amino acid residue to the first amino acid with a sulfhydryl group of an auxiliary part of the second amino acid. Between the first and second amino acid residues Decomposition binding, the following formula: (aa 1 -CO) -S- ( CH 2) N-X- (N-aa 2) ( wherein a 1 ≦ n ≦ 2, X is oxygen and methylene The first amino acid residue (aa 1 ) of the dipeptide can be used to form a peptide bond having an amino-terminal peptide sequence, and the second amino acid residue (aa aa 2 ) is a bonding unit which can be used for forming a peptide bond having a carboxyl-terminal peptide sequence, and thereby bonds the amino-terminal peptide sequence and the carboxyl-terminal peptide sequence with a decomposed bond.
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