JP2001008680A - Synthesis of nucleic acid - Google Patents

Synthesis of nucleic acid

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JP2001008680A
JP2001008680A JP11185279A JP18527999A JP2001008680A JP 2001008680 A JP2001008680 A JP 2001008680A JP 11185279 A JP11185279 A JP 11185279A JP 18527999 A JP18527999 A JP 18527999A JP 2001008680 A JP2001008680 A JP 2001008680A
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reaction solution
pcr
nucleic acid
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Koji Sotoike
宏司 外池
Koichi Kojima
浩一 児嶋
Naoyuki Nishimura
直行 西村
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Shimadzu Corp
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Shimadzu Corp
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Abstract

PROBLEM TO BE SOLVED: To attain high-sensitivity detection of infectious extraneous organisms without affection of a variety of organism-originating contaminants, even in the presence of them, by directly adding an animal body fluid to the reaction solution and amplifying the genes of extraneous organisms. SOLUTION: A specimen of animal body fluid, for example, blood, or specimens originating from blood, for example, plasma, serum or the like, is directly added to a reaction solution constituting a gene amplification reaction system that contains polyamine, sulfated polysaccharide, dithiothreitol or the like to amplify the genes of extraneous organisms, for example, DNA virus, RNA virus, retro virus, bacteria, fungi, protozoa, cells and the like, as the reaction solution for gene amplification is adjusted its pH to >=8.2 at 25 deg.C, >=7.4 at 55 deg.C, and/or >=7.1 at 70 deg.C whereby the exotic organisms that is infectious to the host can be simply, promptly and sensitively detected in the presence of a variety of contaminants originating form organisms and synthesizes the objective nucleic acid.

Description

【発明の詳細な説明】DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION

【0001】[0001]

【発明の属する技術分野】本発明は核酸合成法、特に、
ポリメラーゼ連鎖反応(Polymerase Chain Reaction :
以下PCRと略す)法および逆転写酵素−ポリメラーゼ連
鎖反応(Reverse Transcriptase-Polymerase Chain Rea
ction :以下RT-PCRと略す)法による核酸合成法に関す
る。
The present invention relates to a method for synthesizing nucleic acids,
Polymerase Chain Reaction:
The PCR method and the reverse transcriptase-polymerase chain reaction (Reverse Transcriptase-Polymerase Chain Rea)
ction: hereinafter abbreviated as RT-PCR).

【0002】[0002]

【従来の技術】PCR法は、DNA鎖の中の特定の領域をはさ
んで、プライマーを結合させ、DNAポリメラーゼを作用
させて、DNA合成反応を繰り返すことによって、目的のD
NA断片を数十万倍にも増幅できる方法である。PCR法
は、マリス氏らの発明である特開昭61-274697号に述べ
られている。
2. Description of the Related Art In a PCR method, a specific region in a DNA chain is sandwiched, a primer is bound, a DNA polymerase is acted on, and a DNA synthesis reaction is repeated to obtain a target DNA.
This method can amplify NA fragments several hundred thousand times. The PCR method is described in the invention of Maris et al., JP-A-61-274697.

【0003】PCR法は、種々の試料中の核酸の高感度分
析法として使用可能で、特に動物体液由来の試料中の核
酸の分析法に使用できる。従って、PCR法は、微生物に
起因する伝染病や遺伝病やガンの診断等に利用される。
これらの場合、血液、血漿または血清等の血液由来試料
が検査対象に選ばれる場合が多い。
[0003] The PCR method can be used as a highly sensitive method for analyzing nucleic acids in various samples, and particularly for analyzing nucleic acids in samples derived from animal body fluids. Therefore, the PCR method is used for diagnosis of infectious diseases, genetic diseases, and cancer caused by microorganisms.
In these cases, a blood-derived sample such as blood, plasma, or serum is often selected as a test target.

【0004】一方RT−PCR法は、プライマー存在下で、
逆転写酵素(Reverse Transcriptase)を用いてRNAを相補
的なDNA(cDNA)に転換した後に、PCR法でcDNAを増幅する
方法で、微量のRNAでも定量的に解析できるため、今日
最も検出感度の高い解析法の1つとして、RNAを遺伝子と
して保有しているウイルスの検出、mRNAの定量的検出や
塩基配列決定による発現遺伝子の解析、さらにはcDNAの
クローニングによる発現産物の解析等の研究には欠かせ
ないものになっている。
On the other hand, the RT-PCR method uses primers in the presence of
After converting RNA to complementary DNA (cDNA) using reverse transcriptase (PCR) and then amplifying the cDNA by PCR, it is possible to quantitatively analyze even a small amount of RNA. One of the high-level analysis methods is to study viruses that carry RNA as a gene, to analyze expressed genes by quantitative detection of mRNA and sequencing, and to analyze expression products by cloning cDNA. It is indispensable.

【0005】さらにRNAを増幅する方法としては、NASBA
(Nucleic Acid Sequence Based Amplification)法等が
開発されている。本法はRNAからダイレクトに増幅反応
を行うことが出来るため、RNAを鋳型とした研究には適
しており、最近使用されるようになってきた。更に、本
法はPCRのような変性工程を含まないので、熱サイクル
を必要とせず、一定温度で増幅できる特徴を有してい
る。
As a method for further amplifying RNA, NASBA
(Nucleic Acid Sequence Based Amplification) method and the like have been developed. Since this method can perform amplification reaction directly from RNA, it is suitable for research using RNA as a template and has recently been used. Further, since the present method does not include a denaturation step such as PCR, it has a feature that it can be amplified at a constant temperature without a heat cycle.

【0006】しかし前記の核酸合成法は全て酵素反応を
ベースとしているため、生体試料中に存在する色素、た
んぱく、糖類あるいは未知の夾雑物によって反応が強く
阻害されることが広く知られている。
However, since all of the above nucleic acid synthesis methods are based on enzymatic reactions, it is widely known that the reaction is strongly inhibited by dyes, proteins, saccharides or unknown contaminants present in biological samples.

【0007】そこで、前記の核酸合成に先立つて、被験
物から細胞、原虫、真菌、細菌、ウィルス等を分離後、
核酸を抽出する過程が必要となる。その方法として、従
来、酵素、界面活性剤、カオトロピック剤等により生体
試料を処理し、その後、フェノールあるいはフェノール
・クロロホルム等を用いて、核酸を抽出する方法が従来
より使用されている。最近では核酸抽出の過程におい
て、イオン交換樹脂、ガラスフィルター、ガラスビーズ
あるいはタンパク凝集作用を有する試薬等が使用されて
いる。
Therefore, prior to the nucleic acid synthesis, cells, protozoa, fungi, bacteria, viruses and the like are separated from the test substance.
A process for extracting nucleic acids is required. As the method, conventionally, a method of treating a biological sample with an enzyme, a surfactant, a chaotropic agent or the like, and thereafter extracting a nucleic acid using phenol or phenol / chloroform has been conventionally used. Recently, in the process of nucleic acid extraction, ion exchange resins, glass filters, glass beads, reagents having a protein agglutinating action, and the like have been used.

【0008】[0008]

【発明が解決しようとする課題】しかし、これらの方法
を用いて試料中の核酸の精製を行っても、夾雑物の完全
な除去は困難であり、かつ試料中の核酸の回収量が一定
しない場合も多く、このため引き続く核酸合成が、とり
わけ試料中の目的とする核酸の含量が少ない場合には、
うまくできない場合もある。また、これら精製法は操作
が煩雑で時間を要し、また操作中のコンタミネーション
の機会が高い。
However, even when purifying nucleic acids in a sample using these methods, it is difficult to completely remove contaminants, and the amount of nucleic acids recovered in the sample is not constant. Often, therefore, subsequent nucleic acid synthesis, especially when the content of the nucleic acid of interest in the sample is low,
In some cases, it cannot be done well. In addition, these purification methods are complicated and time-consuming, and have a high chance of contamination during the operation.

【0009】さらに、解析する対象核酸がRNAの場合に
は、全ての生体試料中に普遍的に存在するRNA分解酵素
(RNase)による分解の危険性に常にさらされており、精
製の際に迅速なRNase不活性化の処理を行うべきことは
もちろんのこと、精製過程においても、精製後において
も、RNaseが混入しないような厳重な操作や管理が要求
される。
[0009] Further, when the nucleic acid to be analyzed is RNA, an RNase which is ubiquitously present in all biological samples is used.
(RNase) is always exposed to the danger of degradation, and RNase is not contaminated during the purification process or after purification, not to mention the need for rapid RNase inactivation during purification. Such strict operations and management are required.

【0010】従来より血液を直接反応液に添加して、PC
Rを行う試みがなされているが、その場合の鋳型は全て
宿主由来のDNAである。鋳型が宿主由来の場合には、そ
の鋳型量は比較的多く(正常人血液中の白血球の数は1
μlあたりおよそ4,000〜9,000個)、条件(予め試料の
凍結融解を繰り返す、試料の加熱処理を行う、反応液中
の塩濃度を変更する等)によっては、PCRによりDNAを検
出可能段階まで増幅することが可能な場合があるが、普
遍性に乏しい。従ってこのような方法では、宿主試料中
に微量に存在するウイルス、細菌、真菌、原虫または細
胞等の外来生物の遺伝子を検出可能な段階まで増幅する
ことは難しい。まして、予め試料の凍結融解や加熱処理
等の試料中の増幅反応阻害物質を破壊する何らの前処理
も行わずに直接反応液に添加して、試料中に存在する微
量の外来生物の遺伝子を検出可能な段階まで増幅するこ
とは、従来の技術では到底不可能であった。
Conventionally, blood is directly added to a reaction solution to prepare PC.
Attempts have been made to perform R, in which case the template is all DNA from the host. When the template is derived from the host, the amount of the template is relatively large (the number of leukocytes in normal human blood is 1
Depending on the conditions (repeated sample freeze-thaw, heat-treating the sample, changing the salt concentration in the reaction solution, etc.), the DNA can be amplified to a detectable stage by PCR, depending on the conditions (approx. Sometimes it is possible, but lacks universality. Therefore, in such a method, it is difficult to amplify a gene of a foreign organism such as a virus, a bacterium, a fungus, a protozoan or a cell present in a trace amount in a host sample to a detectable stage. Furthermore, by adding to the reaction solution directly without performing any pre-treatment that destroys the amplification reaction inhibitor in the sample such as freeze-thaw or heat treatment of the sample in advance, the trace amount of foreign organism genes present in the sample can be reduced. Amplification to a detectable stage has never been possible with conventional techniques.

【0011】本発明の目的は、遺伝子増幅に対する阻害
物質の作用を抑制して、試料中の核酸を効率よく増幅さ
せる新規な反応液を提供することにより、動物体液を増
幅反応阻害物質を破壊するための何らの前処理なしに反
応液に直接添加し、動物体液中に微量に存在する外来生
物の遺伝子を増幅する方法を提供することにある。
An object of the present invention is to provide a novel reaction solution for efficiently amplifying a nucleic acid in a sample by suppressing the action of an inhibitory substance on gene amplification, thereby destroying an amplification reaction inhibitory substance in an animal body fluid. To directly amplify the gene of a foreign organism present in a minute amount in the body fluid of an animal without adding any pretreatment to the reaction solution.

【0012】[0012]

【課題を解決するための手段】本発明は、動物体液試料
を直接反応液に添加して、宿主試料中に微量に混在する
外来生物の遺伝子を増幅させることを特徴とする。この
場合、動物体液試料を反応液に添加しても、反応液を動
物体液試料に添加してもよく、特に添加の順序を規定し
ない。外来生物とは、宿主に侵入した異種生物あるいは
形質転換細胞で定義付けられ、例えば DNAウイルス、RN
Aウイルス、レトロウイルス等のウイルス、細菌、真
菌、原虫および細胞(悪性新生物を含む様々な細胞)が
該当する。
The present invention is characterized in that an animal body fluid sample is directly added to a reaction solution to amplify a small amount of a foreign organism gene mixed in a host sample. In this case, the animal body fluid sample may be added to the reaction solution, or the reaction solution may be added to the animal body fluid sample, and the order of addition is not particularly defined. A foreign organism is defined as a heterologous organism or transformed cell that has invaded the host, such as a DNA virus or RN.
Viruses such as A virus and retrovirus, bacteria, fungi, protozoa and cells (various cells including malignant neoplasms) are applicable.

【0013】本発明において、遺伝子増幅法にはPCR法
あるいはRT-PCR法が含まれるが、酵素反応を利用して遺
伝子増幅法を行うものであれば、これらに限定されるも
のではない。
In the present invention, the gene amplification method includes a PCR method or an RT-PCR method, but is not limited thereto as long as the gene amplification method is carried out using an enzymatic reaction.

【0014】本発明は、段落番号[0012]記載の特徴
を実現するために、前記試料を添加する反応液のpHを
25℃で8.2以上、好ましくは、8.8〜9.2、55
℃で7.4以上、好ましくは8.0〜8.4及び/又は7
0℃で7.1以上、好ましくは、7.7〜8.1としたこ
とを特徴とする。
According to the present invention, in order to realize the features described in paragraph [0012], the pH of the reaction solution to which the sample is added is adjusted to at least 8.2 at 25 ° C., preferably from 8.8 to 9.2, 55
At 7.4 ° C., preferably 8.0 to 8.4 and / or 7.
It is characterized by being 7.1 or more at 0 ° C., preferably 7.7 to 8.1.

【0015】反応液のpH値は、例えば前記試料が血
液、血漿または血清等の血液由来試料である場合におい
ては、当該反応液中の25℃でのpH値は8.9、55
℃でのpHは8.1 及び/又は70℃でのpHは7.
8付近とすることが好ましい。
For example, when the sample is a blood-derived sample such as blood, plasma or serum, the pH value of the reaction solution at 25 ° C. is 8.9 or 55.
The pH at 8.1C is 8.1 and / or the pH at 70C is 7.
It is preferably around 8.

【0016】また本発明は、段落番号[0012]記載の
特徴を実現するために、試料中の目的とする遺伝子を増
幅する核酸合成法において、遺伝子増幅反応液にポリア
ミンを添加することを特徴とする。ここでポリアミン
は、試料に加えてから、遺伝子増幅反応液に添加して
も、遺伝子増幅反応液に直接添加してもよい。また、ポ
リアミンは、遺伝子増幅反応液に均一に入っていない状
態(たとえば試料にポリアミンを加えて、この試料を反
応液に攪拌せずに添加した場合など)でも同様の効果が
ある。また、ポリアミンは1種でも数種を組み合わせて
もよい。
Further, the present invention provides a nucleic acid synthesis method for amplifying a target gene in a sample, wherein a polyamine is added to a gene amplification reaction solution in order to realize the features described in paragraph [0012]. I do. Here, the polyamine may be added to the sample and then added to the gene amplification reaction solution, or may be added directly to the gene amplification reaction solution. The same effect can be obtained even when the polyamine is not uniformly contained in the gene amplification reaction solution (for example, when a polyamine is added to a sample and the sample is added to the reaction solution without stirring). The polyamine may be used alone or in combination of several kinds.

【0017】段落番号[0016]記載のポリアミンと
は、第一級もしくは第二級アミノ基を二つ以上もつ炭化
水素の総称である。ある種のポリアミンは、生体内に存
在しており、タンパク質や核酸合成の盛んな組織に多く
含まれており、多様な生理的作用を有しているが、本発
明におけるポリアミンの作用にはかかる作用が必ずしも
要求されるわけではなく、第一級もしくは第二級アミノ
基を二つ以上一分子内に有する炭化水素であれば特に限
定される物ではない。
The polyamine described in paragraph [0016] is a general term for hydrocarbons having two or more primary or secondary amino groups. Certain types of polyamines are present in vivo, are contained in a large amount of proteins and nucleic acid-synthesizing tissues, and have various physiological effects. The action is not necessarily required, and there is no particular limitation as long as the hydrocarbon has two or more primary or secondary amino groups in one molecule.

【0018】具体的には、例えばその分子内にアミノ基
を2個含有する直鎖のポリアミン(エチレンジアミン、
トリメチレンジアミン、プトレスシン)、アミノ基を3
個含有する直鎖のポリアミン(スペルミジン、ジエチレ
ントリアミン)、アミノ基を4個含有する直鎖のポリア
ミン(スペルミン、トリエチレンテトラミン)、アミノ
基を5個含有する直鎖のポリアミン(テトラエチレンペ
ンタミン)、アミノ基を6個含有する直鎖のポリアミン
(ペンタエチレンヘキサミン)、環状の構造を有してい
るポリアミン(1,4−ビス(3−アミノプロピル)−
ピペラジン、1−(2−アミノエチル)ピペラジン、1
−(2−アミノエチル)ピペリジン、1,4,10,1
3−テトラオキサ−7,16−ディアザサイクロオクタ
デカンおよびトリス(2−アミノエチル)アミン)等が
挙げられる。
Specifically, for example, a linear polyamine containing two amino groups in its molecule (ethylenediamine,
Trimethylenediamine, putrescine), amino group 3
Linear polyamines containing four amino groups (spermidine, diethylenetriamine), linear polyamines containing four amino groups (spermine, triethylenetetramine), linear polyamines containing five amino groups (tetraethylenepentamine), Linear polyamine containing 6 amino groups (pentaethylenehexamine), polyamine having a cyclic structure (1,4-bis (3-aminopropyl)-
Piperazine, 1- (2-aminoethyl) piperazine, 1
-(2-aminoethyl) piperidine, 1,4,10,1
3-tetraoxa-7,16-diazacyclooctadecane and tris (2-aminoethyl) amine).

【0019】また、ポリアミンの添加量(濃度)は、ポ
リアミンの種類や試料の種類、濃度等により異なるが、
分子内に含有するアミノ基が少ないほど高濃度で、アミ
ノ基が多いほど低濃度で効果を発揮する。例えば、アミ
ノ基を2個含有するエチレンジアミンでは8mM程度の濃度
が好ましいが、アミノ基を5個以上含有するテトラエチ
レンペンタミンやペンタエチレンヘキサミンでは4mM以
上の濃度では逆に増幅反応を阻害し、2mM以下の濃度が
好ましい。
The addition amount (concentration) of the polyamine varies depending on the type of the polyamine, the type of the sample, the concentration, etc.
The effect is exhibited at a higher concentration when the amino group contained in the molecule is smaller, and at a lower concentration when the amino group is contained more. For example, ethylenediamine containing two amino groups preferably has a concentration of about 8 mM, but tetraethylenepentamine or pentaethylenehexamine containing 5 or more amino groups inhibits the amplification reaction at a concentration of 4 mM or more, and 2 mM The following concentrations are preferred:

【0020】また本発明は、段落番号[0012]記載の
特徴を実現するために、試料中の目的とする遺伝子を増
幅する核酸合成法において、遺伝子増幅反応液に硫酸化
多糖を添加することを特徴とする。ここで、硫酸化多糖
は、試料に加えてから、遺伝子増幅反応液に添加して
も、遺伝子増幅反応液に直接添加してもよい。また、硫
酸化多糖は、遺伝子増幅反応液に均一に入っていない状
態(たとえば試料に硫酸化多糖を加えて、この試料を反
応液に攪拌せずに添加した場合など)でも同様の効果が
ある。また、硫酸化多糖は1種でも数種を組み合わせて
もよい。
The present invention also provides a nucleic acid synthesis method for amplifying a target gene in a sample, wherein the sulfated polysaccharide is added to a gene amplification reaction solution in order to realize the feature described in paragraph [0012]. Features. Here, the sulfated polysaccharide may be added to the sample and then added to the gene amplification reaction solution, or may be added directly to the gene amplification reaction solution. Further, the sulfated polysaccharide has the same effect even when it is not uniformly contained in the gene amplification reaction solution (for example, when the sulfated polysaccharide is added to the sample and the sample is added to the reaction solution without stirring). . The sulfated polysaccharide may be one kind or a combination of several kinds.

【0021】本発明において、硫酸化多糖としては、ヘ
パリンおよびその塩、デキストランサルフェイトおよび
その塩が好ましいが、これに限定されず、例えば、へパ
ラン硫酸、コンドロイチン硫酸、デルマタン硫酸、フノ
ラン、硫酸化アガロース、カラギーナン、ポルフィラ
ン、フコイダン、硫酸化カードランなどを用いることが
出来る。
In the present invention, as the sulfated polysaccharide, heparin and a salt thereof, dextran sulfate and a salt thereof are preferable, but not limited thereto. For example, heparan sulfate, chondroitin sulfate, dermatan sulfate, funolane, sulfated Agarose, carrageenan, porphyran, fucoidan, sulfated curdlan, and the like can be used.

【0022】硫酸化多糖の添加量(濃度)は、硫酸化多
糖の種類や試料の種類、濃度等により異なるが、用いる
試料が血液由来、硫酸化多糖がヘパリンの場合は遺伝子
増幅反応液中に0.4〜25μg/ml添加するのが好ましい。
また試料が血液由来、硫酸化多糖がデキストランサルフ
ェイトの場合は遺伝子増幅反応液中に0.05〜8μg/ml添
加するのが好ましい。
The addition amount (concentration) of the sulfated polysaccharide varies depending on the type of the sulfated polysaccharide, the type of the sample, the concentration, and the like. It is preferable to add 0.4 to 25 μg / ml.
When the sample is derived from blood and the sulfated polysaccharide is dextran sulfate, it is preferable to add 0.05 to 8 μg / ml to the gene amplification reaction solution.

【0023】また本発明は、段落番号[0012]記載の
特徴を実現するために、試料中の目的とする遺伝子を増
幅する核酸合成法において、遺伝子増幅反応液にDTTを
添加することを特徴とする。ここで、DTTは、試料に加
えてから、遺伝子増幅反応液に添加しても、遺伝子増幅
反応液に直接添加してもよい。また、DTTは、遺伝子増
幅反応液に均一に入っていない状態(たとえば試料にDT
Tを加えて、この試料を反応液に攪拌せずに添加した場
合など)でも同様の効果がある。
Further, the present invention provides a nucleic acid synthesis method for amplifying a target gene in a sample, wherein DTT is added to a gene amplification reaction solution in order to realize the feature described in paragraph [0012]. I do. Here, DTT may be added to the sample and then added to the gene amplification reaction solution, or may be added directly to the gene amplification reaction solution. Also, DTT is in a state where it is not uniformly contained in the gene amplification reaction solution (for example, DT
The same effect can be obtained when T is added and this sample is added to the reaction solution without stirring.

【0024】DTTは遺伝子増幅反応液中に0.1mM以上、
好ましくは0.25〜2mM添加するのがよい。
DTT is 0.1 mM or more in the gene amplification reaction solution,
Preferably, 0.25 to 2 mM is added.

【0025】本発明において、動物体液試料には血液、
血漿または血清等の血液由来試料、唾液、髄液、尿、乳
が含まれるが、これらに限定されるものではない。
In the present invention, animal body fluid samples include blood,
Examples include, but are not limited to, blood-derived samples such as plasma or serum, saliva, cerebrospinal fluid, urine, and milk.

【0026】PCR反応液は、通常、pH緩衝液並びにMgC
l2、KCl等の塩類、プライマー、デオキシリボヌクレオ
チド類及び耐熱性ポリメラーゼを含むものである。ま
た、上記の塩類は適宜他の塩類に変更して使用されてい
る。また、ゼラチン、アルブミン等のタンパク、ジメチ
ルスルホキシド、界面活性剤等種々の物質が添加される
場合がある。
The PCR reaction solution is usually a pH buffer solution and MgC
l 2, salts KCl or the like, is intended to include primers, deoxyribonucleotides and a thermostable polymerase. In addition, the above-mentioned salts are appropriately used after being changed to other salts. In addition, various substances such as gelatin, proteins such as albumin, dimethyl sulfoxide, and surfactants may be added.

【0027】RT反応液は、通常、pH緩衝液並びにMgC
l2、KCl等の塩類、DTT、プライマー、デオキシリボヌク
レオチド類、RNaseインヒビター及び逆転写酵素を含む
ものである。また、上記の塩類は適宜他の塩類に変更し
て使用されている。また、ゼラチン、アルブミン等のタ
ンパク、界面活性剤等種々の物質が添加される場合があ
る。
The RT reaction solution is usually a pH buffer solution and MgC
l 2 , salts such as KCl, DTT, primers, deoxyribonucleotides, RNase inhibitors and reverse transcriptase. In addition, the above-mentioned salts are appropriately used after being changed to other salts. Various substances such as gelatin, proteins such as albumin, and surfactants may be added.

【0028】RT-PCRはRT反応の産物の1部をPCR反応液に
添加して実行すること(Two tube-Twostep)、RT反応の産
物にPCR反応用試薬を添加して実行すること(One tube-T
wo step)、あるいは予めRT-PCR反応に必要な全ての試薬
を準備しておき、RT反応とPCRを連続して実行すること
(One tube-One step)も可能である。
RT-PCR is performed by adding a part of the product of the RT reaction to a PCR reaction solution (Two tube-Twostep), and by adding a PCR reaction reagent to the product of the RT reaction (One Tube). tube-T
wo step) or prepare all the necessary reagents for the RT-PCR reaction in advance, and execute the RT reaction and PCR continuously.
(One tube-One step) is also possible.

【0029】pH緩衝液は、トリス(ヒドロキシメチル)
アミノメタンと塩酸、硝酸、硫酸等の鉱酸の組合せであ
り、鉱酸の中で望ましいものは塩酸である。また、トリ
シン、CAPSO(3ーNーCyclohexylamino −2 −hydroxyprop
anesulfonic acid )あるいはCHES(2ー(Cyclohexylami
no )ethanesulfonic acid )と苛性ソーダ、苛性カリ
との組み合わせによるpH緩衝液等種々のpH緩衝液が使用
され得る。pH調整された緩衝液は、遺伝子増幅反応液の
中で10mMから100mMの間の濃度で使用されることが多
い。
The pH buffer is tris (hydroxymethyl)
A combination of aminomethane and a mineral acid such as hydrochloric acid, nitric acid, sulfuric acid, etc., and a desirable mineral acid is hydrochloric acid. In addition, Tricine, CAPSO (3-N-Cyclohexylamino-2-hydroxyprop
anesulfonic acid) or CHES (2- (Cyclohexylami
No) Various pH buffers such as a pH buffer obtained by combining ethanesulfonic acid) with caustic soda and caustic potash can be used. The pH-adjusted buffer is often used at a concentration between 10 mM and 100 mM in the gene amplification reaction solution.

【0030】プライマーは、cDNA合成や核酸増幅の際の
合成開始点として働くオリゴヌクレオチドをいう。プラ
イマーは一本鎖であることが望ましいが、二本鎖も使用
できる。もし、プライマーが二本鎖の場合には、反応に
先立って一本鎖にすることが望ましい。プライマーは、
公知の方法により合成することができるし、また、生物
界から単離することもできる。
A primer refers to an oligonucleotide that acts as a synthesis starting point in cDNA synthesis or nucleic acid amplification. The primer is preferably single-stranded, but double-stranded may be used. If the primer is double-stranded, it is desirable to make it single-stranded before the reaction. The primer is
It can be synthesized by a known method, or can be isolated from the living world.

【0031】耐熱性ポリメラーゼは、プライマー付加に
よる核酸を合成する耐熱性にすぐれたポリメラーゼを意
味する。適切な耐熱性ポリメラーゼとしては、Thermus
aquaticus由来のTaq DNAポリメラーゼ、Thermus thermo
philus由来のTth DNAポリメラーゼ、Pyrococcus由来のK
OD、PfuあるいはPwoDNAポリメラーゼ、あるいは前記
の耐熱性ポリメラーゼの混合等があるが、これらにのみ
限定されるものではない。なおTth DNAポリメラーゼはR
T活性も有しているため、RT-PCRをOne tube-One stepで
行うときに、1種類の酵素で賄うことが出来る特徴を有
している。
The thermostable polymerase means a polymerase having a high thermostability for synthesizing a nucleic acid by adding a primer. Suitable thermostable polymerases include Thermus
aquaticus-derived Taq DNA polymerase, Thermus thermo
Tth DNA polymerase from philus, K from Pyrococcus
Examples include, but are not limited to, OD, Pfu or Pwo DNA polymerase, or a mixture of the aforementioned thermostable polymerases. Tth DNA polymerase is R
Since it also has T activity, it has the characteristic that it can be covered by one type of enzyme when RT-PCR is performed in one tube-one step.

【0032】逆転写酵素は、RNAをcDNAに逆転写出来る
酵素を意味する。逆転写酵素としては、Rous associate
d virus(RAV)やAvian myeloblastosis virus(AMV)等の
トリのレトロウイルス由来の逆転写酵素、Moloney muri
ne leukemia virus(MMLV)等のマウスのレトロウイルス
(MMLV)由来の逆転写酵素あるは前記のTth DNAポリメラ
ーゼ等があるが、これらにのみ限定されるものではな
い。
Reverse transcriptase refers to an enzyme that can reverse transcribe RNA into cDNA. As a reverse transcriptase, Rous associate
d virus (RAV) and Avian myeloblastosis virus (AMV) such as avian retrovirus-derived reverse transcriptase, Moloney muri
Mouse retroviruses such as ne leukemia virus (MMLV)
(MMLV) -derived reverse transcriptase or the aforementioned Tth DNA polymerase, but is not limited thereto.

【0033】本発明のRT反応には、トリのレトロウイル
ス由来、特にAMV由来の逆転写酵素を使用するのが好ま
しい。
In the RT reaction of the present invention, it is preferable to use a reverse transcriptase derived from avian retrovirus, particularly from AMV.

【0034】本発明の核酸合成法の手順は、通常使用さ
れる反応液より高いpHを有した反応液を使用して、かつ
ポリアミン、硫酸化多糖 、DTTを1種またはそれ以上を
組み合わせた成分を添加する以外、通常の方法と何ら変
わらない。すなわち、RT反応においては選択したプライ
マーと逆転写酵素に適した反応温度で、30分〜1時間程
度の反応を行う。PCRにおいては、先ず、DNAを熱変性に
より、1本鎖のDNAにする(ディナチュレーション工
程)。次に増幅させたい領域を挟むプライマーをハイブ
リダイズさせる(アニーリング工程)。次に4種類のデ
オキシリボヌクレオチド類(dATP, dGTP, dCTP, dTTP)の
共存下にDNAポリメラーゼを作用させ、プライマーの
伸長反応を行う(ポリメライゼーション工程)。
The procedure of the nucleic acid synthesis method of the present invention uses a reaction solution having a pH higher than that of a commonly used reaction solution, and a component obtained by combining one or more of polyamine, sulfated polysaccharide and DTT. It is no different from the usual method except for adding. That is, in the RT reaction, the reaction is performed at a reaction temperature suitable for the selected primer and reverse transcriptase for about 30 minutes to 1 hour. In PCR, first, the DNA is denatured into single-stranded DNA by heat denaturation (dinaturation step). Next, primers sandwiching the region to be amplified are hybridized (annealing step). Next, a DNA polymerase is allowed to act in the presence of four types of deoxyribonucleotides (dATP, dGTP, dCTP, dTTP) to perform a primer extension reaction (polymerization step).

【0035】[0035]

【実施例】以下の実施例は本発明を説明するものである
が、いかなる意味においても本発明を限定的に解釈する
ための意味を有するものではない。
The following examples illustrate the invention but are not meant to limit the invention in any way.

【0036】[実験例1]本例は、B型肝炎ウイルス(HBV)
感染者の血漿を正常人血漿で段階希釈したものを、直
接、今回完成した反応液に添加してPCRを行ったもので
ある。実験はB型肝炎ウイルス感染者の血漿を正常人血
漿で100倍希釈したもの(凝集価:100titer/ml)を出発
点として、正常人血漿で2倍段階希釈したものを50μlの
反応液当たり1μl添加してPCRを行った。
[Experimental Example 1] In this example, hepatitis B virus (HBV)
PCR was performed by serially diluting the plasma of an infected person with normal human plasma and then directly adding it to the reaction solution completed this time. In the experiment, starting from a plasma of a person infected with hepatitis B virus 100-fold diluted with normal human plasma (agglutination value: 100 titer / ml), a 2-fold serial dilution of normal human plasma was performed at 1 μl per 50 μl reaction solution. PCR was performed with addition.

【0037】PCRのプライマーはHBVのS遺伝子領域に位
置するplus鎖の塩基配列を持つオリゴヌクレオチド(HBV
pF)及びminus 鎖の塩基配列をもつオリゴヌクレオチド
(HBVpR)であり、宝酒造株式会社より販売されており、
配列は次の通りである。この2種類のプライマーを用い
たPCRの結果、432bp の増幅産物を得ることができる。 HBVpF: 5' GGACTTCTCTCAATTTTCTAGGG 3'(配列番号:
1) HBVpR: 5' CAAATGGCACTAGTAAACTGAGC 3'(配列番号:
2)
PCR primers are oligonucleotides (HBVV) having a base sequence of the plus strand located in the S gene region of HBV.
oligonucleotides with pF) and minus strand base sequences
(HBVpR), sold by Takara Shuzo Co., Ltd.
The sequence is as follows: As a result of PCR using these two primers, an amplification product of 432 bp can be obtained. HBVpF: 5 'GGACTTCTCTCAATTTTCTAGGG 3' (SEQ ID NO:
1) HBVpR: 5 'CAAATGGCACTAGTAAACTGAGC 3' (SEQ ID NO:
2)

【0038】PCR反応液には、10mMTris-HCl, 50mMKCl,
1.5mMMgCl2, 200μMのdATP, dCTP, dGTPおよびdTTP, 各
0.4μMのプライマー, 1.25units/50μl のTaq DNA ポリ
メラーゼ(TaKaRa Taq: Takara shuzo, Kyoto, Japan)
にポリアミン、硫酸化多糖およびDTTを添加した反応液
(pH8.9)を使用した。
The PCR reaction solution contained 10 mM Tris-HCl, 50 mM KCl,
1.5mMMgCl 2, 200μM of dATP, dCTP, dGTP and dTTP, each
0.4 μM primer, 1.25 units / 50 μl Taq DNA polymerase (TaKaRa Taq: Takara shuzo, Kyoto, Japan)
Reaction solution containing polyamine, sulfated polysaccharide and DTT
(pH 8.9) was used.

【0039】PCRは、94℃、4.5分のプレヒーティン
グの後、94℃ 30秒間、60℃ 1分間、72℃ 1分間の条
件で40サイクル、最後に72℃ 7分間のポリメライゼー
ションを行った。PCR終了後、反応液5μlを用いて、2.
5%アガロースを含む、0.5μg/ml臭化エチジウム添加TA
E(40mM Tris-acetate, 1mM EDTA)液中で電気泳動を行い
検出した。
In the PCR, after preheating at 94 ° C for 4.5 minutes, 40 cycles of 94 ° C for 30 seconds, 60 ° C for 1 minute and 72 ° C for 1 minute were performed, and finally, polymerization at 72 ° C for 7 minutes was performed. . After completion of PCR, use 5 μl of the reaction solution, and
TA with 0.5 μg / ml ethidium bromide containing 5% agarose
Electrophoresis was performed in an E (40 mM Tris-acetate, 1 mM EDTA) solution and detected.

【0040】B型肝炎ウイルス感染者の血漿を正常人血
漿で100倍希釈したもの(凝集価:100titer/ml)を出発
点として、正常人血漿で2倍段階希釈したものを50μlの
反応液当たり1μl添加してPCRを行ったときの増幅産物
の電気泳動図を図1に示す。
Starting from a plasma of a person infected with hepatitis B virus 100-fold diluted with normal human plasma (agglutination value: 100 titer / ml), a 2-fold serially diluted plasma of normal human was used per 50 μl reaction solution. FIG. 1 shows an electrophoretogram of the amplification product when PCR was carried out with 1 μl added.

【0041】図中Mはサイズマーカー(HincIIで切断し
た250ng のφ X174-RF DNA)、1は希釈なし、2は2倍
希釈、以下3は4倍、4は8倍、5は16倍、6は32倍、7は64
倍、8は128倍希釈、9は正常人血漿添加、10は試料無添
加でPCRを行ったときの結果を示したものである。
In the figure, M is a size marker (250 ng of φX174-RF DNA cut with HincII), 1 is no dilution, 2 is 2-fold diluted, 3 is 4-fold, 4 is 8-fold, 5 is 16-fold, 6 is 32 times, 7 is 64
1: 8, 128-fold dilution, 9: normal human plasma added, 10: the results when PCR was performed with no sample added.

【0042】以上の結果から、 B型肝炎ウイルス感染者
の血漿(凝集価:10,000titer/ml)を正常人血漿で1,60
0倍希釈したもの(図1、レーン5)をPCRに使用した場合
にも、HBV特異的なPCR産物が得られたことが示されてい
る。
From the above results, the plasma (agglutination value: 10,000 titer / ml) of the hepatitis B virus infected person was converted to 1,60 normal human plasma.
It shows that HBV-specific PCR products were also obtained when the 0-fold dilution (FIG. 1, lane 5) was used for PCR.

【0043】以上のことは、本方法を使用することによ
り、血漿中の微量なHBVが検出可能になることを示して
いる。
The above shows that the use of this method makes it possible to detect trace amounts of HBV in plasma.

【0044】[実験例2]本例は、B型肝炎ウイルス(HBV)
感染者の血漿を正常人血清で段階希釈したものを、直
接、今回完成した反応液に添加してPCRを行ったもので
ある。実験は実験例1と同一のB型肝炎ウイルス感染者の
血漿を正常人血漿で100倍希釈したもの(凝集価:100ti
ter/ml)を出発点として、正常人血清で2倍段階希釈し
たものを50μlの反応液当たり1μl添加してPCRを行っ
た。
[Experimental Example 2] This example shows that the hepatitis B virus (HBV)
PCR was performed by serially diluting the plasma of an infected person with normal human serum and then directly adding it to the completed reaction solution. In the experiment, the same hepatitis B virus-infected plasma as in Experimental Example 1 was diluted 100-fold with normal human plasma (agglutination value: 100 ti).
(ter / ml) as a starting point, PCR was performed by adding 1 μl of a serially diluted 2-fold with normal human serum per 50 μl reaction solution.

【0045】PCRのプライマー、PCR反応液、PCRおよび
電気泳動の条件は全て実験例1と同様のものを使用し
た。
The same PCR primers, PCR reaction solution, PCR and electrophoresis conditions as in Experimental Example 1 were used.

【0046】B型肝炎ウイルス感染者の血漿を正常人血
漿で100倍希釈したもの(凝集価:100titer/ml)を出発
点として、正常人血清で2倍段階希釈したものを50μlの
反応液当たり1μl添加してPCRを行ったときの増幅産物
の電気泳動図を図2に示す。
Starting from a plasma of a person infected with hepatitis B virus 100-fold diluted with normal human plasma (agglutination value: 100 titer / ml), a 2-fold serial dilution with normal human serum was performed per 50 μl of reaction solution. FIG. 2 shows an electrophoretogram of the amplification product when PCR was performed with 1 μl added.

【0047】図中Mはサイズマーカー(HincIIで切断し
た250ng のφ X174-RF DNA)、1は希釈なし、2は2倍
希釈、以下3は4倍、4は8倍、5は16倍、6は32倍、7は64
倍、8は128倍希釈、9は256倍希釈、10は正常人血清添
加、11は試料無添加でPCRを行ったときの結果を示した
ものである。
In the figure, M is a size marker (250 ng of φ X174-RF DNA cut with HincII), 1 is not diluted, 2 is 2-fold diluted, 3 is 4-fold, 4 is 8-fold, 5 is 16-fold, 6 is 32 times, 7 is 64
1: 8, 128-fold dilution, 9: 256-fold dilution, 10: normal human serum added, 11: the results when PCR was performed without sample addition.

【0048】以上の結果から、 B型肝炎ウイルス感染者
の血漿(凝集価:10,000titer/ml)を正常人血清で1,60
0倍希釈したもの(図2、レーン5)をPCRに使用した場合
にも、HBV特異的なPCR産物が得られたことが示されてい
る。
From the above results, it was found that the plasma (agglutination value: 10,000 titer / ml) of the hepatitis B virus infected person was 1,60
It shows that HBV-specific PCR products were also obtained when the 0-fold dilution (FIG. 2, lane 5) was used for PCR.

【0049】以上のことは、本方法を使用することによ
り、血清中の微量なHBVが検出可能になることを示して
いる。
The above shows that the use of this method makes it possible to detect trace amounts of HBV in serum.

【0050】[実験例3]本例は、外来生物のモデルとし
て、マウス血液をヒト血液で段階希釈したものを直接、
今回完成した反応液に添加してマウスベータアクチンRN
Aに特異的なプライマーを使用してRT-PCRを行ったもの
である。実験はマウス血液をヒト血液で10倍段階希釈し
たものを50μlの反応液当たり2μl添加してRT-PCRを行
った。
[Experimental Example 3] In this example, as a model of an exotic organism, mouse blood serially diluted with human blood was directly used.
Add mouse beta actin RN to the reaction solution completed this time
RT-PCR was performed using primers specific to A. In the experiment, RT-PCR was performed by adding 2 μl of mouse blood obtained by serially diluting 10-fold with human blood per 50 μl reaction solution.

【0051】RT反応のプライマーはマウスベータアクチ
ンRNAに相補的な塩基配列を持つオリゴヌクレオチド(BA
R1)を使用し、続いて行うPCRでは、BAR1より上流の領域
に相補的な塩基配列を持つオリゴヌクレオチド(BAR2)お
よびRT反応で合成されたcDNAに相補的な塩基配列を持つ
オリゴヌクレオチド(BAF)を追加して行った。なお、 RT
-PCRでの、RNA由来産物とDNA由来産物を識別するため
に、 BAFプライマーとBAR1およびBAR2プライマー間にイ
ントロンを挟むように設計した。従って、本実験のRT-P
CRにおけるRNA由来の産物は331bpであり、DNA由来の産
物は約800bpである。使用したプライマー配列は次の通
りである。 BAF : 5' CCCTGAAGTACCCCATTGAA 3'(配列番号:3) BAR1: 5' GCAGGATGGCGTGA 3'(配列番号:4) BAR2: 5' AGGATGGCGTGAGGGAGA 3'(配列番号:5)
The primer for the RT reaction was an oligonucleotide (BA) having a nucleotide sequence complementary to mouse beta actin RNA.
R1) and subsequent PCR, oligonucleotides having a nucleotide sequence complementary to the region upstream of BAR1 (BAR2) and oligonucleotides having a nucleotide sequence complementary to the cDNA synthesized by the RT reaction (BAF ) Was added. Note that RT
-In order to distinguish between RNA-derived products and DNA-derived products in PCR, an intron was designed between the BAF primer and the BAR1 and BAR2 primers. Therefore, the RT-P
The product from RNA in CR is 331 bp and the product from DNA is about 800 bp. The primer sequences used are as follows. BAF: 5 'CCCTGAAGTACCCCATTGAA 3' (SEQ ID NO: 3) BAR1: 5 'GCAGGATGGCGTGA 3' (SEQ ID NO: 4) BAR2: 5 'AGGATGGCGTGAGGGAGA 3' (SEQ ID NO: 5)

【0052】RT反応液には、10mMTris-HCl, 35mMKCl,
1.5mMMgCl2, 200μMのdATP, dCTP, dGTPおよびdTTP, 2m
M DTT, 0.4μMのBAR1プライマー, 50units/50μlのRibo
nuclease Inhibitor(Takara shuzo), 5units/50μl
のAMV XL逆転写酵素(Takara shuzo)にポリアミン、硫
酸化多糖を添加した反応液(pH8.9)を使用した。
The RT reaction solution contained 10 mM Tris-HCl, 35 mM KCl,
1.5mMMgCl2, 200μM dATP, dCTP, dGTP and dTTP, 2m
M DTT, 0.4μM BAR1 primer, 50units / 50μl Ribo
nuclease Inhibitor (Takara shuzo), 5units / 50μl
A reaction solution (pH 8.9) obtained by adding polyamine and sulfated polysaccharide to AMV XL reverse transcriptase (Takara shuzo) was used.

【0053】RT反応に続くPCR反応は、前記RT反応液に
各0.4μMのBAR2プライマー、 BAFプライマーおよび1.25
units/50μlのTaq DNA ポリメラーゼ(TaKaRa Taq: Ta
karashuzo)を添加して行った。
The PCR reaction following the RT reaction was performed by adding 0.4 μM of each of the BAR2 primer, BAF primer and 1.25
units / 50μl Taq DNA polymerase (TaKaRa Taq: Ta
karashuzo).

【0054】RT反応は55℃、30分間行い、反応後95℃、
5分間処理し、逆転写酵素を不活化した。
The RT reaction was performed at 55 ° C. for 30 minutes.
Treatment was performed for 5 minutes to inactivate reverse transcriptase.

【0055】前記操作終了後、BAR2プライマー、BAFプ
ライマーおよびTaq DNA ポリメラーゼを添加してPCRを
行った。PCRは、94℃ 30秒間、62℃ 1分間、72℃ 1
分間の条件で40サイクル、最後に72℃ 7分間のポリメ
ライゼーションを行った。PCR終了後、反応液5μlを用
いて、2.5%アガロースを含む、0.5μg/ml臭化エチジウ
ム添加TAE液中で電気泳動を行い検出した。
After the above operation, PCR was performed by adding BAR2 primer, BAF primer and Taq DNA polymerase. PCR was performed at 94 ° C for 30 seconds, 62 ° C for 1 minute, 72 ° C for 1 minute.
Polymerization was performed at 40 ° C. for 40 minutes, and finally at 72 ° C. for 7 minutes. After completion of the PCR, 5 μl of the reaction solution was subjected to electrophoresis in a TAE solution containing 2.5% agarose and supplemented with 0.5 μg / ml ethidium bromide for detection.

【0056】マウス血液をヒト血液で10倍段階希釈した
ものを50μlの反応液当たり2μl添加してPCRを行った
ときの増幅産物の電気泳動図を図3に示す。
FIG. 3 shows an electrophoretogram of an amplification product when PCR was carried out by adding 2 μl of 50 μl reaction solution obtained by serially diluting mouse blood with human blood to 10-fold dilutions.

【0057】図3(a)は逆転写酵素存在下でRT反応を行
った後、PCRを行った結果を示す。また、図3(b)は逆転
写酵素不在下でRT反応を行った後、PCRを行ったコント
ロール実験の結果を示す。
FIG. 3 (a) shows the result of PCR after RT reaction in the presence of reverse transcriptase. FIG. 3 (b) shows the results of a control experiment in which an RT reaction was performed in the absence of reverse transcriptase followed by PCR.

【0058】図中Mはサイズマーカー(HincIIで切断し
た250ng のφ X174-RF DNA)、1,6は10、2,7は100倍希
釈、3,8は1,000倍希釈、4,9は10,000倍希釈、5,10はヒ
ト血液のみの添加でRT-PCRを行ったときの結果を示した
ものである。
In the figure, M is a size marker (250 ng of φ X174-RF DNA cut with HincII), 1,6 is 10, 100 dilutions for 2,7, 1,000 dilutions for 3,8, 10,000 for 4,9. Double dilutions, 5, and 10 show the results when RT-PCR was performed with the addition of human blood only.

【0059】以上の結果から、 マウス血液をヒト血液
で10,000倍希釈したもの(図3レーン4,9)においても、
逆転写酵素添加でRT-PCRを行ったときにのみ、マウスベ
ータアクチンRNAに特異的な増幅産物が得られたことが
示されている(図中矢印)。
From the above results, the mouse blood diluted 10,000 times with human blood (lanes 4 and 9 in FIG. 3) also showed that
It is shown that an amplification product specific to mouse beta actin RNA was obtained only when RT-PCR was performed with the addition of reverse transcriptase (arrow in the figure).

【0060】計算上10,000倍希釈したマウス血液2μlに
は、1個程度のマウス白血球しか存在していないことか
ら、本方法を使用することにより、血液中の宿主以外の
微量なRNAが検出可能になることを示している。
Since only about 1 mouse leukocyte is present in 2 μl of a 10,000-fold diluted mouse blood, the use of this method makes it possible to detect trace RNA other than the host in the blood. It has become.

【0061】[0061]

【発明の効果】本発明により、動物体液試料を直接反応
液に添加して、宿主試料中に微量に混在する外来生物の
遺伝子を増幅することが可能となった。従って、本発明
を使用することにより、動物体液中に潜むB型肝炎ウイ
ルス(HBV)やヘルペスウイルス等のDNAウイルス、C型肝
炎ウイルス(HCV)等のRNAウイルス、エイズウイルス(HI
V)等のレトロウイルス等を、動物体液試料からの直接遺
伝子増幅法により、簡便、迅速かつ高感度に検出するこ
とが可能となった。さらに本方法は、動物体液中に潜
む、真菌、原虫はもとより、宿主細胞とはもはや別物と
なってしまった癌細胞等の変異細胞の検出にも応用可能
と考えられる。
Industrial Applicability According to the present invention, it has become possible to directly add a sample of an animal body fluid to a reaction solution to amplify a gene of a foreign organism which is present in a trace amount in a host sample. Therefore, by using the present invention, DNA viruses such as hepatitis B virus (HBV) and herpes virus lurking in animal body fluids, RNA viruses such as hepatitis C virus (HCV), AIDS virus (HI
Retroviruses such as V) can be detected simply, quickly and with high sensitivity by a direct gene amplification method from animal body fluid samples. Further, it is considered that the present method can be applied to detection of mutant cells such as cancer cells and the like, which have become different from host cells, as well as fungi and protozoa lurking in animal body fluids.

【0062】[0062]

【配列表】[Sequence list]

<110>shimadzu corp. <120>Method for synthesis of nucleic acids <130>K0990604 <160>4 <210>1 <211>23 <212>DNA <213>Artificial Sequence <400>1 GGACTTCTCTCAATTTTCTAGGG <210>2 <211>23 <212>DNA <213>Artificial Sequence <400>2 CAAATGGCACTAGTAAACTGAGC <210>3 <211>20 <212>DNA <213>Artificial Sequence <400>3 CCCTGAAGTACCCCATTGAA <210>4 <211>20 <212>DNA <213>Artificial Sequence <400>4 GCAGGATGGCGTGA <110> shimadzu corp. <120> Method for synthesis of nucleic acids <130> K0990604 <160> 4 <210> 1 <211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 1 GGACTTCTCTCAATTTTCTAGGG <210> 2 < 211> 23 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 2 CAAATGGCACTAGTAAACTGAGC <210> 3 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 3 CCCTGAAGTACCCCATTGAA <210> 4 <211> 20 <212> DNA <213> Artificial Sequence <400> 4 GCAGGATGGCGTGA

【図面の簡単な説明】[Brief description of the drawings]

【図1】図1は、実験例1で増幅されたDNAを検出する
ために用いたゲル電気泳動の泳動図である。
FIG. 1 is an electrophoretogram of gel electrophoresis used to detect DNA amplified in Experimental Example 1.

【図2】図2は、実験例2で増幅されたDNAを検出する
ために用いたゲル電気泳動の泳動図である。
FIG. 2 is an electrophoretogram of gel electrophoresis used to detect DNA amplified in Experimental Example 2.

【図3】図3は、実験例3で増幅されたRNAを検出する
ために用いたゲル電気泳動の泳動図である。
FIG. 3 is an electrophoretogram of gel electrophoresis used to detect RNA amplified in Experimental Example 3.

───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (72)発明者 西村 直行 京都市中京区西ノ京桑原町1番地 株式会 社島津製作所内 Fターム(参考) 4B024 AA13 AA14 AA20 BA80 CA01 CA09 CA11 HA12 HA19 4B063 QA01 QA07 QA13 QA18 QQ03 QQ42 QQ52 QQ58 QR08 QR22 QR32 QR42 QR43 QR53 QR62 QS08 QS16 QS20 QS25 QS34 QS39  ────────────────────────────────────────────────── ─── Continuing from the front page (72) Inventor Naoyuki Nishimura 1 Nishinokyo Kuwabaracho, Nakagyo-ku, Kyoto F-term in Shimadzu Corporation (Reference) 4B024 AA13 AA14 AA20 BA80 CA01 CA09 CA11 HA12 HA19 4B063 QA01 QA07 QA13 QA18 QQ03 QQ42 QQ52 QQ58 QR08 QR22 QR32 QR42 QR43 QR53 QR62 QS08 QS16 QS20 QS25 QS34 QS39

Claims (7)

【特許請求の範囲】[Claims] 【請求項1】 動物体液試料を直接反応液に添加して、
外来生物の遺伝子を増幅することを特徴とする核酸合成
法。
1. An animal body fluid sample is directly added to a reaction solution,
A nucleic acid synthesis method comprising amplifying a gene of a foreign organism.
【請求項2】 前記試料を血液、血漿または血清等の血
液由来試料としたことを特徴とする請求項1記載の核酸
合成法。
2. The method according to claim 1, wherein the sample is a blood-derived sample such as blood, plasma or serum.
【請求項3】外来生物をDNAウイルス、RNAウイルス、レ
トロウイルス等のウイルス、細菌、真菌、原虫および細
胞(悪性新生物を含む様々な細胞)としたことを特徴と
する請求項1記載の核酸合成法。
3. The nucleic acid according to claim 1, wherein the foreign organism is a virus such as a DNA virus, an RNA virus, or a retrovirus, a bacterium, a fungus, a protozoan or a cell (various cells including a malignant neoplasm). Synthetic method.
【請求項4】前記の遺伝子増幅用の反応液の25℃にお
けるpHを8.2以上、55℃におけるpHを7.4以
上及び/又は70℃におけるpHを7.1以上としたこ
とを特徴とする請求項1記載の核酸合成法。
4. The reaction solution for gene amplification wherein the pH at 25 ° C. is 8.2 or more, the pH at 55 ° C. is 7.4 or more, and / or the pH at 70 ° C. is 7.1 or more. The nucleic acid synthesis method according to claim 1, wherein
【請求項5】前記の遺伝子増幅反応系内にポリアミンを
添加することを特徴とする請求項1記載の核酸合成法。
5. The method according to claim 1, wherein a polyamine is added to the gene amplification reaction system.
【請求項6】前記の遺伝子増幅反応系内に硫酸化多糖
(sulfated polysaccharide)およびその塩(以下総称
して硫酸化多糖と称する)を添加することを特徴とする
請求項1記載の核酸合成法。
6. The nucleic acid synthesis method according to claim 1, wherein a sulfated polysaccharide and a salt thereof (hereinafter collectively referred to as a sulfated polysaccharide) are added to the gene amplification reaction system. .
【請求項7】前記の遺伝子増幅反応系内にジチオスレト
ール(dithiothreitol:略称DTT)を添加することを特徴
とする請求項1記載の核酸合成法。
7. The nucleic acid synthesis method according to claim 1, wherein dithiothreitol (abbreviation: DTT) is added to the gene amplification reaction system.
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