JP2000500329A

JP2000500329A - Diagnosis and treatment of cancer susceptibility

Info

Publication number: JP2000500329A
Application number: JP9516392A
Authority: JP
Inventors: ケイシュプール，ニーゲル; クリストファーグレイ，イアン
Original assignee: インペリアルキャンサーリサーチテクノロジィリミテッド
Priority date: 1995-10-23
Filing date: 1996-10-22
Publication date: 2000-01-18
Also published as: NO981662L; CN1203633A; BR9611255A; NO981662D0; AU722266B2; CA2232241A1; WO1997015686A1; AU7316196A; EP0859860A1; KR19990067011A; NZ320425A

Abstract

(57)【要約】（ｉ）患者由来の核酸を含む試料を得、次いで（ｉｉ）該核酸を、その領域がマーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ２１５によって定義されたＤＮＡによって境界付けられるヒト第１０染色体の領域と選択的にハイブリダイズできる核酸と接触させる工程を有することを特徴とする癌に対する患者の感受性を判定する方法。その核酸が本明細書で定義された特定のＹＡＣ、ＢＡＣ、ＰＡＣまたはＥＳＴのいずれでもないという条件で、マーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ２１５によって定義されたＤＮＡによって境界付けられるヒト第１０染色体の領域と選択的にハイブリダイズできる核酸。好ましくは該核酸は前立腺腫瘍抑制遺伝子である。 (57) Abstract: (i) obtaining a sample containing nucleic acid from a patient, and then (ii) combining the nucleic acid with a region of human chromosome 10 whose region is bounded by DNA defined by markers D10S541 and D10S215. A method for determining the susceptibility of a patient to cancer, comprising the step of contacting with a nucleic acid capable of selectively hybridizing. Selectively with the region of human chromosome 10 bounded by the DNA defined by markers D10S541 and D10S215, provided that the nucleic acid is not a particular YAC, BAC, PAC or EST as defined herein. A nucleic acid that can hybridize. Preferably, the nucleic acid is a prostate tumor suppressor gene.

Description

【発明の詳細な説明】癌罹病性の診断およびその治療本発明は癌を有するか、または癌に対して罹病性があるかどうかを判定する方法に関し、さらに癌、特に前立腺癌の治療方法に関する。前立腺の癌は、多くの国でもっとも重大な疾病となって来ている。イングランドおよびウェールズでは、最近２０年間にわたりその死亡率は２倍になり、今や男性の癌死亡の第二の原因である(Mortality Statistics: Cause England and W ales．OPCS DH2 19，1993，Her Majesty's Stationery Office)。イングランドおよびウェールズでは、前立腺癌の罹病率は最近１０年間で２８％増加し、今やこの疾病は総癌患者の１２％を占めている(Cancer Statistics: Registrations England and Wales．OPCS MBI No 22,1994,Her Majesty's Stationery Office) 。このような増加や前立腺癌に起因する最近の多くの公的人物の死亡は、この癌に関して何かすべきであることを強調する助けになっている。より広範なスクリーニングの適用が前立腺癌に起因する死亡率を制限し得ると考えられている。現在の前立腺癌のスクリーニングは、直腸指診および前立腺特異的抗体（ＰＳＡ）レベルの測定からなっている。計数的直腸指診としての特異性を欠くこれらの方法は、無視できない検査員間のばらつきを持っており(SmithおよびCatalona （1995）Urology 45，70-74)、またＰＳＡレベルは良性前立腺肥大（ＢＰＨ）、前立腺炎症および他の状況でも上昇する。２２，０００人を越える予測研究、Ph ysiciants Health Studyに属している間に前立腺癌を発病した３６６人で、診断試験としてＰＳＡのかなりの誤りが認められた。ＰＳＡレベルは研究の開始まで保存された血清で測定され、そのレベルの上昇は向こう４年以内に前立腺癌を発症する人の４７％にしか認められなかった(Gannら(1995)JAMA 273，289-294)。従って、現在のスクリーニングでは不十分である。細胞遺伝および対立遺伝子欠失研究は、前立腺癌に関与している可能性のある多くの染色体領域を指摘している。Cannon-AibrightおよびEeles（1995）Nature Genetics 9，336-338（参考文献１）は、ヒト染色体部位３ｐ、７ｑ、８ｐ、９ｑ、１０ｐ、１０ｑ、１１ｐ、１３ｑ、１６ｑ、１７ｐ、１８ｑおよびＹで起こる異型接合性の欠損（ＬＯＨ）研究からの腫瘍抑制前立腺癌感受性遺伝子座の候補領域を考察し、一方、Brothmanら(1990)Cancer Res．50 3795-3803は染色体腕２ｐ、７ｑおよび１０ｑに関与する再配列を伴う、染色体１、２、５およびＹの欠失、並びに７、１４、２０および２２の増加が最も一般的であることを示すヒト前立腺癌における細胞遺伝学的情報を概説した。Gaoら(1994)Oncogene 9，299 9-3003による研究は、前立腺癌において染色体３ｐ、５ｑ、６ｐ、７ｐ、８ｐ、１０ｑ、１１ｐ、１３ｑ、１６ｑ、１７ｐ、１８ｑおよびＸｑのうち少なくとも１つで陽性突然変異誘発表現型が認められることを示し、またMassenkeilら(199 4)Anticancer Res．14(6B)，2785-2790は、種々の前立腺癌試料の８ｐ、１７ｐ、１８ｑでＬＯＨが観察されるが、１４の有益な前立腺癌の１０ｑには欠失は観察されなかったことを示している。Zenklusenら(1994)Cancer Res．54，6370-63 73は、７ｑ３１．１に可能性ある腫瘍抑制遺伝子があることを示している。さらに他の染色体の欠失または異常性を記載した他の報告もある。かくして、ほとんどのヒト染色体の欠失または異常が、ある研究者によってまたは他の研究者によって、前立腺癌に関係付けられてきた。多くの腫瘍が明白な１０ｑ２３−ｑ２５部位の欠失を示し（２、３）、このことはこの領域に腫瘍抑制遺伝子が存在していることを示唆している。Ｍｙｃ腫瘍蛋白質の陰性レギュレーターをコードし、１０ｑ２５に存在するＭｘｉｌが腫瘍抑制遺伝子の候補として報告されており（４）、最近、多数の前立腺腫瘍で潜在的にＭｘｉｌの能力を失わせる突然変異が報告されている。Ｍｘｉｌは前立腺癌のいくつかの場合で対立遺伝子欠失および突然変異を示し、それがこの一般的な悪性疾患の病原論あるいは腫瘍発達の一因であり得ることが結論付けられている（５）。本発明の目的は、癌の診断および癌、特に前立腺癌に対する罹病性を判定するためのよりよい方法を提供すること、かかる方法に有用な核酸を提供すること、さらには前立腺癌に関与する腫瘍抑制遺伝子を提供することである。発明の要約発明者らは、多くの情報を与えてくれる蛍光に基づくマイクロサテライトＣＡリピートマーカーを用いたアレロタイプ分析を用いて詳細なsparming１０ｑ２３ −ｑ２５にまたがる欠失マップを作成し、これにより１０ｑ領域の欠失が腫瘍発達に関与していそうであることをより厳密に定義できた。さらに発明者らは、前立腺腫瘍の進行におけるこの遺伝子の役割を明らかにするために、前立腺腫瘍におけるＭｘｉｌの欠失および突然変異の頻度を評価した。発明者らのデータは欠失を示している圧倒的多数（２２／２３）の腫瘍において削除された１０ｑ２３−ｑ２４境界付近に腫瘍抑制遺伝子（または遺伝子群）が存在することを示す。これに対し、他の１０ｑ２３−ｑ２５領域または全領域の欠失に照らし、Ｍｘｉｌの特異的欠失は１／２３の腫瘍で観察されたに過ぎず、かつ１０ｑ２３−ｑ２４境界におけるマーカーの欠失を伴っていた。さらにＭｘｉｌが関与するマーカー欠失を示すそれらの腫瘍では、全一本鎖コンホメーション多型性（ＳＳＣＰ）分析または直接的なＤＮＡの配列決定によって、Ｍｘｉｌにおけるいずれの突然変異も検出できず、発明者らのデータはＭｘｉｌが発明者らが同定した第１０染色体の領域から２０センチモルガン離れて存在することを示している。発明者らは、１０ｑの欠失を持つ全ての腫瘍が下記に特徴付けられた領域の欠失を持っていることを発見した。本発明の第１の態様は、その核酸が酵母人工染色体（ＹＡＣ）である７４６− Ｈ−８、８２１−Ｄ−２、８３１−Ｅ−５、９２１−Ｆ−８、７３８−Ｂ−１２、７９６−Ｄ−５、８２９−Ｅ−１、６７８−Ｆ−１、８３９−Ｂ−１、７３４ −Ｂ−４、７Ｂ−Ｆ１２、７５７−Ｄ−８、７７３−Ｃ−２、７８７−Ｄ−７、８３１−Ｅ−９、８５５−Ｄ−２、８５５−Ｇ−４、８７６−Ｇ−１１、８９４ −Ｈ−５、９２２−Ｅ−６、９３４−Ｄ−３、９６４−Ａ−８、９６８−Ｅ−６または２４Ｇ−Ａ１０いずれでもなく、かつ、表３ないし２２に記載された発現配列標識（ＥＳＴ）のいずれでもなく、かつ、細菌人工染色体（ＢＡＣ）またはＰ１由来人工染色体（ＰＡＣ）であるＢ２Ｆ２０、Ｐ４０Ｆ１０、Ｐ７２Ｇ８、Ｐ７４Ｎ２、Ｐ２７４Ｄ２１、Ｂ７６Ｉ１０、Ｂ７９Ａ１９、Ｂ７９０１、Ｂ９３Ｆ１２、Ｂ１２２Ｌ２２、Ｐ２０１Ｊ８、Ｐ２０１Ｐ５、Ｐ２０９Ｋ３、Ｐ３１６Ｎ１４、Ｂ４６Ｂ１２、Ｂ６０Ｃ５、Ｂ１４５Ｃ２２、Ｂ１５０Ｋ４、Ｂ１５０Ｎ３、Ｂ１８１Ｆ１５および１８８Ｌ２２のいずれでもないという条件で、マーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ２１５によって定義されたＤＮＡによって境界付けられるヒト染色体１０の領域と選択的にハイブリダイズできる核酸を提供する。Ｄ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ２１５を含む、ヒト第１０染色体上の種々のマーカーの位置は図５に定義されたごときである。発明者らがこれらＥＳＴを示す場合、引用された表で開示されている配列を、より詳細にはそれから該配列が誘導される特異的ｃＤＮＡクローンを意味する。「選択的にハイブリダイズする」とは、その核酸が中度または高度緊縮条件下でハイブリダイズ可能な該第１０染色体ＤＮＡと十分類似した核酸配列を有することを意味する。当該分野で公知のごとくに、核酸ハイブリダイゼーションの緊縮性はその上でハイブリダイゼーションが起こる核酸の長さ、ハイブリダイズする配列の一致の程度のごとき要因、並びに温度、イオン強度および該配列のＣＧまたはＡＴ含量のごとき要因に依存する。該第１０染色体ＤＮＡに選択的にハイブリダイズ可能な核酸は、少なくとも該第１０染色体ＤＮＡと共にその核酸部分にわたり、＞９５％の配列一致を有する核酸、好ましくは＞９８％のもの、より好ましくは＞９９％の配列一致を有するものを含む。公知のごとくに、通常ヒト遺伝子は、例えば、該第１０染色体ＤＮＡとその全長にわたって完全に一致してはいないが、該第１０染色体領域に選択的にハイブリダイズできる核酸であると考えられる、該第１０染色体ＤＮＡ中の遺伝子に由来するｍＲＮＡまたはｃＤＮＡのごときイントロンを含む。選択的ハイブリダイゼーションをもたらす典型的な中度または高度緊縮条件は当該分野で公知であり、例えばMolecular Cloning，a laboratory manual,第二版，Sambr ookら（編），Cold Spring Harbor Laboratory Press，Cold Spring Harbor，NY ，USAに記載されたものがある。核酸がナイロンメンブレンに固定されており、かつそのプローブ核酸が≧５００塩基または塩基対である場合、典型的なハイブリダイゼーション溶液は、６×ＳＳＣ（クエン酸ナトリウム塩水）０．５％ドデジル硫酸ナトリウム（ＳＤＳ）１００μｇ／ｍｌ変性、断片化サケ精子ＤＮＡである。ハイブリダイゼーションは６８℃で行う。固定化された核酸を伴うナイロンメンブレンは１×ＳＳＣ中、あるいは高度緊縮については０．１×ＳＳＣ中６８％で洗浄してよい。２０×ＳＳＣは以下の方法にて調製し得る。８００ｍｌのＨ₂Ｏ中に１７５．３ｇのＮａＣｌおよび８８．２ｇのクエン酸ナトリウムを溶解し、数滴の１０Ｎ −ＮａＯＨｐＨ溶液でｐＨを７．０に調製し、Ｈ₂Ｏで１リットル容量に調節する。アリコートに分割し、オートクレーブにより滅菌する。核酸がナイロンメンブレンに固定化されており、かつそのプローブ核酸が１５ないし５０塩基の間のオリゴヌクレオチドである場合、典型的なハイブリダイゼーション溶液は、３．０Ｍ塩化トリメチルアンモニウム（ＴＭＡＣｌ）０．０１Ｍリン酸ナトリウム（ｐＨ６．８）１ｍｍＥＤＴＡ（ｐＨ７．６）０．５％ＳＤＳ１００μｇ／ｍｌ変性、断片化サケ精子ＤＮＡ０．１％脱脂ドライミルクハイブリダイゼーションの最適温度は、通常、所与の鎖の長さに対するＴ_iより低い５℃が選択される。Ｔ_iはプローブとその標的配列の間で形成されたハイブリッドの不可逆的な融解温度である。Jacobsら(1988)Nucl．Acids Res．16，4 637はＴ_iの決定について考察している。奨励されるハイブリダイゼーション温度は、３ＭＴＭＡＣｌにおける１７量体については４８−５０℃、１９量体については５５−５７℃、および２０量体については５８−６６℃である。また「選択的にハイブリダイズできる核酸」には、下記により詳細に記載するごとくのいずれの公知の増幅系、詳しくはポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）による該第１０染色体の領域由来のＤＮＡを増幅するであろう核酸も含まれる。ＰＣＲ増幅に適当な条件として適当な１×増幅緩衝液中での増幅が挙げられる。１０×増幅緩衝液は、５００ｍＭＫＣｌ、１００ｍＭトリスＣｌ（室温にてｐＨ８．３）、１５ｍＭＭｇＣｌ₂、０．１％ゼラチンである。適宜には、増幅のアニーリング部分は３７℃ないし６０℃の間、好ましくは５０℃である。マーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤＳ１０Ｓ２１５は、例えばGyapayら(1994)Na ture Genetics 7，特集号 No.2，246-339によって記載された１９９３−１９９４年Ｇｅｎｅｔｈｏｎヒト遺伝的連鎖地図に示されている第１０染色体の領域を同定する。前記のＹＡＣはＣＥＰＨメガ−ＹＡＣライブラリーまたはＩＣＩＹＡＣライブラリー（７Ｂ−Ｆ１２および２４Ｇ−Ａ１０）、もしくはHuman Genome Mappi ng Project Resource Centre，Hinxton Hall，Hinxton，Cambridgeshire，CB10 1RQ，UKから全て公的に入手できる。遺伝的連鎖地図上のＹＡＣの位置はCEPH-Ge nethon Quickmapデータベース(Cohenら(1993)Nature 366，698-701)を参照して作成される。前記の発現配列標識（ＥＳＴ）の配列は表３ないし２２に与えられており、これらはGenBank，National Center for Biotechnology Information， National Library of Medicine，Bldg 38A，National Institutes of Health，R ockville Pike，Bethesda，MD 20894，USAから公的に入手できる。下記にさらに詳細に記載するごとくに、本発明の特に好ましい核酸はクローンＩＭＡＧＥ２６４６１１のｃＤＮＡ挿入に対応する遺伝子とハイブリダイズできる核酸である。ＩＭＡＧＥクローン２６４６１１は、Research Genetics，Inc(2130 Memorial Parkway，SW Huntsville，AL 35801，USA)およびAmerican Type Culture Colle ction，Rockville，MD 20852，USA，Genome Systems Inc，8629 Pennell Drive ，St Louis，Missouri，MO 63114，USA; UK-HGMP Resource Centre，Hinxton，C ambridge CB10 1SBなど他のＩＭＡＧＥ供給源から公的に入手できる。該クローンはＥＳＴｓＮ２９３０４およびＮ２０２３８に関する非開示情報で記載されるごとくに得られた（表９および１０参照）。該クローンは修飾ＰｈａｒｍａｃｉａｐＴ７Ｔ３ベクター中にある。名称：ｐＴ７Ｔ３Ｄ−Ｐａｃ（アンピシリン耐性；５０μｇ／ｍｌ）宿主：ＤＨ１０ＢＶタイプ：プラスミドポリリンカー配列：（修飾）ＩＭＡＧＥクローン２６４６１１の挿入断片は図６に与えられている。それらは重複して大きな隣接配列を形成するので、以下のクローンはＩＭＡＧＥクローン２６４６１１と同一の部分である配列を含む。全てのクローンは他の方法が示されでいなければ物理的実在として無償で入手できる。各々のクローンでは、通常５’または３’末端由来のいくつかの配列が下記に記載されるごときプローブを作成するために使用できるＥＳＴとして入手できる。該クローンおよびそれらのＥＳＴはＧｅｎＢａｎｋおよびＥＭＢＬデータベースに一覧化されている。該核酸が、マーカーＤ１０Ｓ５４１およびＡＦＭ３３７ｘｆ９により定義されたＤＮＡによって境界付けられる第１０染色体領域と選択的にハイブリダイズできれば好ましい。マーカーＡＦＭ３３７ｘｆ９の情報はGenethon，1rue de L'In ternationale，91000 Evry，Franceから無償で入手できる。ＡＦＭ３３７ｘｆ９は今ではＤ１０Ｓ１７６５として知られている。該核酸がＹＡＣである７４６−Ｈ−８、８２１−Ｄ−２、８３１−Ｅ−５、９２１−Ｆ−８、７９６−Ｄ−５、８２９−Ｅ−１、８３９−Ｂ−１、７３４−Ｂ −４または２４Ｇ−Ａ１０のいずれかのヒト由来ＤＮＡと選択的にハイブリダイズできれば特に好ましく、該核酸がＹＡＣである７４６−Ｈ−８、９２１−Ｆ− ８、８２１−Ｄ−２、８３１−Ｅ−５、７９６−Ｄ−５、２４Ｇ−Ａ−１０または７３４−Ｂ−４のいずれかのヒト由来ＤＮＡと選択的にハイブリダイズできればなおいっそう好ましい。ＹＡＣは酵母の増殖および維持に必要とされるＤＮＡを含むことが認識されよう。本発明の好ましい核酸は、酵母ＤＮＡのごときＹＡＣに存在するヒト由来ＤＮＡと選択的にハイブリダイズしてＹＡＣの他のＤＮＡとはハイブリダイズしないものである。ＩＭＡＧＥクローン２６４６１１のヒト由来ｃＤＮＡ挿入断片は、少なくともＹＡＣクローン９２１Ｆ８、７４６Ｈ８、８２１Ｄ２、８３１Ｅ５、７９６Ｄ５および２４ＧＡ１０とハイブリダイズする。ＩＭＡＧＥクローン２６４６１１のヒト由来ｃＤＮＡ挿入断片は、少なくともＢＡＣ（細菌人工染色体）クローンであるＢ２Ｆ２０、Ｂ４６Ｂ１２、Ｂ６０Ｃ５、Ｂ１５０Ｋ４、Ｂ１５０Ｎ３、Ｂ１４５Ｃ２２、Ｂ１８１Ｆ１５およびＢ１８８Ｌ２２とハイブリダイズするが、Ｂ７６Ｉ１０、Ｂ７９Ａ１９、Ｂ７９０１、Ｂ９３Ｆ１２およびＢ１２２Ｌ２２とはしない。ＢＡＣクローンはReserch Genetics，2130 Memorial Parkway，SW Huntsville ，AL 35801，USAおよびGenome Systems Inc，8629 Pennell Drive，St Louis，M issouri，MO 63114，USAから公的に入手できる。ＩＭＡＧＥクローン２６４６１１のヒト由来ｃＤＮＡ挿入断片は、少なくともＰＡＣ（Ｐ１由来人工染色体）クローンＰ４０Ｆ１０およびＰ２７４Ｄ２１とハイブリダイズするが、Ｐ７２Ｇ８、Ｐ７４Ｎ２、Ｐ２０１Ｊ８、Ｐ２０１Ｐ５、Ｐ２０９Ｋ３およびＰ３１６Ｎ１４とはしない。ＰＡＣクローンはSanger Centre，Wellcome Trust Genome Campus，Hinxton， Cambridge CB10 1SA，UKから公的に入手できる。本発明の核酸はＲＮＡであるかまたはＤＮＡであってもよいが、ＤＮＡが好ましい。本発明の核酸は二本鎖であるかまたは一本鎖であってもよいが、一本鎖の核酸が好ましい。本発明の核酸は二本鎖ならば１００ｋｂのごとき非常に大きくてもよい。実際には、腫瘍抑制遺伝子のごとき遺伝子がしばしばこの大きさである。しかしながら診断、プロービングまたは増幅の目的のためには、核酸が１００００塩基対（該核酸が二本鎖ならば）または塩基（該核酸が一本鎖ならば）より小さければ好ましく、１０００塩基対または塩基より小さければさらに好ましく、１０ないし１００塩基対または塩基より小さければなお好ましく、１５ないし３０塩基対または塩基より小さければさらにいっそう好ましい。下記にさらに十分に記載されるごとくに、ポリメラーゼ連鎖反応における使用に適当な一本鎖ＤＮＡプライマーが特に好ましい。特に好ましい本発明の核酸はそこからＥＳＴ配列Ｎ２９３０４およびＮ２０２３８が誘導されるクローンＩＭＡＧＥ２６４６１１のｃＤＮＡ挿入断片に対応する遺伝子とハイブリダイズできる核酸である。Ｎ４８０３０およびＮ２０２３８の配列および情報はＧｅｎＢａｎｋおよびＥＭＢＬデータベースに記録されている（表９および１２参照）。また、この遺伝子の断片および変異体、並びにこの遺伝子によってコードされるｍＲＮＡから誘導可能なｃＤＮＡも本発明の好ましい核酸である。発明者らは「ｃＤＮＡ挿入断片クローンＩＭＡＧＥ２６４６１１と対応する遺伝子」により、部分的にコピーされた場合に、該クローン中のｃＤＮＡを産生したｍＲＮＡをコードする遺伝子を意味する。明らかに該遺伝子自身並びにその変異体および断片は、本発明の好ましい核酸である。発明者らは「遺伝子」に、そのイントロンおよびエキソンだけでなく、該イントロンおよびエキソン、特に５’のそれないし５’のほとんどのエキソンに関連し、かつ物理的に近接する調節領域も含める。発明者らは「断片」に、（一本鎖であれ二本鎖であれ）少なくとも１５個のヌクレオチド長の遺伝子のいずれの部分も含めるが、より好ましくは断片少なくとも２０ヌクレオチドの長さでであり、最も好ましくは少なくとも５０ヌクレオチドの長さであり、少なくとも１００ヌクレオチドの長さであってもよく、あるいは５００ヌクレオチドの長さであってもよい。好ましくは該断片は５０ｋｂ以下であり、さらに好ましくは１００ｋｂ以下である。発明者らは特異的には、遺伝子の「変異体」に部分長であれ全長であれ、あるいはｍＲＮＡのスプライス変異体からコピーされたものであれ、特異的にｃＤＮＡを含める。また発明者らは特異的には、遺伝子またはその断片中であろうとｃＤＮＡ中であろうと、天然の遺伝子と比較して（逆位をはじめとする）ヌクレオチド置換、挿入および欠失が存在する核酸を含める。変異体および断片双方ともその意図される目的に従い選択され、プロービング、増幅または診断目的の場合は、一般的に医薬上有用な産物を発現させるという目的の場合より、より短いがより大きい配列一致程度（例えば、少なくとも８０％、９０％、９５％または９９％）が必要とされ、長い断片は所望されるとすれば、一般的に遺伝子コードにおける重複性について優位性が認められる意外の場合に必要とされよう。本発明の核酸がクローンＩＭＡＧＥ２６４６１１のｃＤＮＡ挿入断片に一致する遺伝子部分を増幅するために使用できるオリゴヌクレオチドプライマーであれば好ましい。また、本発明の核酸が該遺伝子の全てまたは一部よりなっており、かつハイブリダイゼーション用プローブとして使用できれば好ましい。ＩＭＡＧＥ２６４６１１のｃＤＮＡ配列は図１に示されている。該遺伝子および該遺伝子から誘導可能なさらなるｃＤＮＡは当該分野で公知の方法を用いて容易に得られる。例えば、さらなるｃＤＮＡは標準法およびプローブとしてＩＭＡＧＥ２６４６１１クローン、もしくは表１ないし１９および図面に与えられている配列から容易に誘導された他のプローブを用いて、前立腺ｃＤＮＡライブラリーから単離することができる。該配列は標準法を用いて容易に決定される。同様に、該遺伝子は、標準法を用いるプローブとしてＩＭＡＧＥ２６４６１１クローン、もしくは表１ないし１９および図面の配列から容易に誘導された他のプローブを用いて、ヒトゲノムＤＮＡライブラリーから単離することができる。前立腺ｃＤＮＡライブラリーは標準的な分子生物学的方法を用いて得てもよいし、あるいはClontech Laboratories，Inc，1020 East Meadow Circle，Palo Al to，California 94303-4230，USAから得てもよい。ＤＮＡライブラリーをスクリーニングし、クローン化ＤＮＡおよび配列決定ＤＮＡを単離および操作する標準法は、Sambrookら(1989)“Molecular cloning，a laboratory manual”，第２版，Sambrookら編，Cold Spring Harbor Press，Co ld Spring Harbor，New Yorkに記載されている。ＩＭＡＧＥクローン２６４６１１または表３ないし２２に示されている核酸配列によってコードされた推定アミノ酸配列を用いて、順々に抗体を作成するために使用できるペプチドを作成してもよい。該抗体を用いてｃＤＮＡ発現ライブラリーをスクリーニングすることもできるし、あるいは該抗体を用いて該遺伝子によってコードされたポリペプチドを単離することもできる。一度該ポリペプチドが単離されると、当該分野で公知の方法を用いてそのＮ−末端配列が得られる。次いで、該アミノ酸配列を用いてｃＤＮＡの５’コーディング領域と対応するオリゴヌクレオチドプローブを設計する。ｃＤＮＡの５’末端が当該分野で公知の技術であるＲＡＣＥ(Rapid Amplifica tion of cDNA Ends; Schaefer（1995）Anal．Biochem．227，255-273)によって単離され得ることが認識されよう。この試み、および関連の試みは、ｍＲＮＡ転写物の５’末端に対して逆に働く、現在公知の５’配列に対するプライマーを用いるｍＲＮＡからの逆転写と、それに続く「未知の」５’末端から開始するためランダムプライマーを用いるＰＣＲを含む。また、ＲＡＣＥに対するｍＲＮＡも、ｍＲＮＡを単離し、５’キャップを除去し、次いで５’末端をアダプター配列に結合させることによって５’末端を得るために使用することができ、続いてＰＣＲは該アダプターに対するあるプライマー、および注目するｃＤＮＡに特異的なあるプライマーを用いる。遺伝子および遺伝子の一部を単離する方法は、出典明示して本明細書の一部と見なすCurrent Protocols in Human Genetics，1996，Dracopoli（編）ら,John WileyおよびSonsに記載されている。１つの有用な方法は「ベクトレット(vector ette)」ＰＣＲである。ベクトレットＰＣＲは新規な遺伝子の同定のために、または遺伝子の配列の一部が既知である場合は付加的配列の同定のために用いることができる。ベクトレット自身は誤対合した中央領域と制限酵素によって切断されたＤＮＡとの連結反応に適した１つの末端を持つ二本鎖の合成ＤＮＡ断片であ(Current Protocols i n Human Genetics 1995(5.9.15-5.9.21参照)並びにValdesら(1994)Proc．Natl． Acad．Sci．USA 91，5377-5381およびAllenら PCR Methods and Applications 4，71-75に記載)。適当なＤＮＡ源に由来する制限断片（通常、ＹＡＣクローンのごとき大きなゲノムＤＮＡ断片）とのベクトレットの連結反応に引き続き、該ベクトレットの誤対合領域由来のプライマーと共に、標的ＤＮＡ由来のプライマーを用いてＰＣＲ増幅が行われる。このベクトレットプライマーはこの誤対合領域の基本鎖と同一の配列を持ち、ゆえにＰＣＲの第１サイクルでアニールする相補的配列を持たない。第１回目の増幅は、プライマー合成は標的ＤＮＡ内のプライマーから起こり得るだけなので一方向的である。これにより第２のＰＣＲサイクルでアニールするベクトレットプライマーのための相補鎖が生産される。第２の、およびそれに続くＰＣＲサイクルでは、双方のプライマーがＤＮＡ合成を開始させることができ、増幅された断片だけが注目する配列を含むという結果になる。この方法は、その遺伝子のためのｃＤＮＡ配列の知見に基づき、遺伝子内のイントロン配列の同定のために用いることができる。（ＹＡＣクローンのごとき）注目する遺伝子を持つゲノムＤＮＡ断片の制限切断および、それに続くベクトレットへのライゲーションの後、ｃＤＮＡ配列からデザインされたプライマーをベクトレットプライマーと共に用いて該遺伝子の特異的断片をＰＣＲ増幅する。エキソン／イントロン境界はこの断片の配列とｃＤＮＡの配列を比較することにより同定できる。この方法をｃＤＮＡクローン２６４６１１由来プライマーと併用してイントロン配列が同定されてきた（図８−１５参照）。同様に、ベクトレットの試みを用いて、公知のｃＤＮＡ配列の５’末端由来プライマーを用いることにより欠けている遺伝子の５’末端を同定し、さらなる５ ’配列データを作成することができる。また「アイランド・レスキュー(Island rescue)」として知られる方法では、ベクトレットを完全に新規な遺伝子配列の同定のために用いることもできる。この試みはＣｐＧが豊富な「島」が哺乳類のゲノム中に存在し、かかる島が遺伝子の５’末端に関与しているという事実を明らかにした。特定の制限酵素は、例えば酵素ＮｏｔＩはＣｐＧ島内を切断する。ゲノムＤＮＡのＮｏｔＩ消化の後、ＮｏｔＩ適合スティッキーエンドを持つベクトレットはその結果得られるサブ断片と結合される。次いで、Ａｌｕ反復エレメント由来のプライマーと共に該ベクトレットプライマーを用いてＰＣＲ増幅を行う。かかるエレメントはヒトゲノム中に頻繁な間隔で生じるので、１以上が注目するＣｐＧ島に近接して存在し、ＰＣＲ産物の生成を助長しているようである。対象として、第２のＰＣＲ反応はベクトレットプライマーを除いて実施される。Ａｌｕ／ベクトレットが開始する反応において生じ、かつ対象に過ぎないＡｌｕにはないいずれの断片も、ＣｐＧ島の一部を示すはずであり、標準法を用いてゲル精製およびコーディング分析をすることができる。ｃＤＮＡクローンＩＭＡＧＥ２６４６１１に対応する遺伝子によってコードされたポリペプチド、すなわち表３ないし２０に示されているヌクレオチド配列は、細胞骨格／細胞外マトリックス相互作用に関与する蛋白質であるポリペプチドテンシン、と同一の配列をいくつか持ち、クラスリン被覆小胞を介した細胞膜への蛋白質輸送に関与する蛋白質であるオーキシリンとの少なくともヌクレオチド配列レベルでの類似性も観察された。また、テンシンとオーキシリンの間の配列の類似性も従前に注目されている。本発明の好ましいヌクレオチドは腫瘍抑制遺伝子もしくはその断片または変異体よりなるものである。該腫瘍抑制遺伝子は前立腺癌、黒色腫、神経膠腫または非Ｈｏｄｇｋｉｎリンパ腫のごとき癌の発生もしくは発達に関与するものである。適宜には、該腫瘍抑制遺伝子は前立腺癌、特に前立腺腺癌の発生もしくは発達に関与する。腫瘍抑制遺伝子もしくはその断片または誘導体よりなる本発明の核酸は、容易に同定され、例えば、該遺伝子は、転写物の減少レベルを同定する目的で前立腺癌および他のガン細胞系統由来のＲＮＡパネルをスクリーニングすることにより同定できる。恐らくそれは複雑な機能と突然変異「ｈｉｔｓ」を無効にするためのいくつかの部位を備えている（腫瘍抑制遺伝子ＢＲＣＡ１、ＲＢの場合のごとくに）ので、その転写物は大きいであろう。交雑種保存は、該遺伝子が基本細胞「ハウスキーピング」機能を持ち、その欠失が増殖制御の欠如と腫瘍形成をもたらしている可能性があることを示している。発明者らは「腫瘍抑制遺伝子」に、その機能もしくは活性のいずれかに欠失またはいくらかの低下が腫瘍形成の一因となり得るいずれの遺伝子も含める。腫瘍における腫瘍抑制遺伝子の全コーディング領域の分析は、該遺伝子が、非腫瘍組織の遺伝子または前立腺癌を持っていない、また前立腺癌にかかりにくい個体の遺伝子と比べて改変されている場合の腫瘍抑制遺伝子であり、かつそれは前立腺癌のごとき癌に関与していることを示している。突然変異分析の適当な方法は、一本鎖コンホメーション多型性（ＳＳＣＰ）分析（もしくはこの方法の変法）および直接的なＤＮＡ配列決定を含む。これらは当業者に公知であり、例えばＳＳＣＰはCurrent Protocols in Human Genetics，1995，7.4.1-7.4.6頁に記載されている。本発明のいずれの腫瘍抑制遺伝子も、（ＩＭＡＧＥクローン２６４６１１と対応する遺伝子として）ほとんど間違いなくイントロンを含み、かつほとんど間違いなく＞０．５ｋｂであり、＞１．０ｋｂである可能性がより高く、１．０ないし５００ｋｂの範囲である可能性が最も高い。ＩＭＡＧＥクローン２６４６１１におけるｃＤＮＡ挿入断片は約１．７ｋｂｐである。本発明のいずれの腫瘍抑制遺伝子も、ほとんど間違いなくそのＤＮＡ配列に多型性を持つ。かくして、（制限断片または酵素的増幅により誘導された断片のごとき）断片および例えば対立遺伝子変異体などの天然変異体のごとき）変異体、またはイン・ビトロ操作によって作成された変異体も本発明の一部をなす。かかる適当な断片はハイブリダイゼーションプローブとして有用な断片、または増幅プライマーとして有用な断片を含む。かかる適当な変異体は、そこで該遺伝子のコーディングセンスが変更されていない変異体、またはそこで該コーディング配列が、コードされたポリペプチド特性を変更するように修飾された変異体を含む。本発明のいすれの腫瘍抑制遺伝子もほとんど間違いなく結局はポリペプチドをコードするが、ＲＮＡ種がポリペプチドをコードしないＲＮＡ種をコードしてもよい。該核酸が腫瘍抑制遺伝子、もしくはその誘導体または断片または変異体の核酸産物からなればより好ましい。かかる核酸は腫瘍抑制遺伝子から転写されたｍＲＮＡを含む。該核酸が腫瘍抑制遺伝子から転写されたｍＲＮＡ由来のｃＤＮＡ（複製ＤＮＡ）であれば特に好ましい。前立腺または前立腺腫瘍組織のごとき選択組織由来のＣＤＮＡのライブラリーは当業者に公知であり、例えばMolecular cloning，a l ab olatory manual（上記）に記載のごとくに当該分野で公知の方法を用いて、適当なｍＲＮＡから調製できる。表３ないし２２に記載されたヌクレオチド配列は、不完全ｃＤＮＡの不完全配列であり、該ｃＤＮＡはそれが関与するか、または選択的にハイブリダイズするｍＲＮＡに由来し、また、その領域が、マーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ２１５により定義されたＤＮＡによって境界付けられるヒト第１０染色体の領域に見られる遺伝子または遺伝子群からほとんど間違いなく転写される。図８ないし１５に示されているヌクレオチド配列は、ＩＭＡＧＥクローン２６４６１１と対応する遺伝子中のイントロン由来配列を含む。さらに詳しくは、発明者らは表３ないし２２並びに図６および８ないし１５のいずれかの配列よりなるポリヌクレオチドが、少なくとも前記したＹＡＣ、ＢＡＣおよびＰＡＣクローンのいずれかとハイブリダイズすることを見出した。かくして、表３ないし２２並びに図６および８ないし１５のヌクレオチド配列は、その領域が、マーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ２１５により定義されたＤＮＡによって境界付けられるヒト第１０染色体の領域中に、さらに詳しくはＹＡＣクローンによって定義されたサブ領域に見られる少なくとも１つの遺伝子のｍＲＮＡ産物を示す。特に好ましい具体例は、その核酸が酵母人工染色体（ＹＡＣ）である７４６−Ｈ−８、８２１− Ｄ−２、８３１−Ｅ−５、９２１−Ｆ−８、７３８−Ｂ−１２、７９６−Ｄ−５、８２９−Ｅ−１、６７８−Ｆ−１、８３９−Ｂ−１、７３４−Ｂ−４、７Ｂ− Ｆ１２、７５７−Ｄ−８、７７３−Ｃ−２、７８７−Ｄ−７、８２９−Ｅ−１、８３１−Ｅ−９、８５５−Ｄ−２、８５５−Ｇ−４、８７６−Ｇ−１１、８９４ −Ｈ−５、９２１−Ｆ−８、９２２−Ｅ−６、９３４−Ｄ−３、９６４−Ａ−８、９６８−Ｅ−６または２４Ｇ−Ａ１０のいずれでもなく、かつ、表３ないし２２に記載されているごときポリヌクレオチドのいずれでもなく、かつ、ＢＡＣまたはＰＡＣであるＢ２Ｆ２０、Ｐ４０Ｆ１０、Ｐ７２Ｇ８、Ｐ７４Ｎ２、Ｐ２７４Ｄ２１、Ｂ７６Ｉ１０、Ｂ７９Ａ１９、Ｂ７９０１、Ｂ９３Ｆ１２、Ｂ１２２Ｌ２２、Ｐ２０１Ｊ８、Ｐ２０１Ｐ５、Ｐ２０９Ｋ３、Ｐ３１６Ｎ１４、４６Ｂ１２、Ｂ６０Ｃ５、Ｂ１４５Ｃ２２、Ｂ１５０Ｋ４、Ｂ１５０Ｎ３、Ｂ１８１Ｆ１５およびＢ１８８Ｌ２２のいずれでもないという条件で、その領域がマーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ２１５により定義されたＤＮＡによって境界付けられるヒト第１０染色体の領域と選択的にハイブリダイズでき、かつ、表３ないし２２並びに図６および８ないし１５のいずれかに記載されたごときヒト由来配列と選択的にハイブリダイズできる核酸を特徴とする。当業者ならば表３ないし２２並びに図６および８ないし１５で示された配列情報を利用することにより、ＩＭＡＧＥクローン２６４６１１と対応する遺伝子または遺伝子群を同定できるということが容易に認識されるであろう。詳しくは、該核酸が、表３ない２２並びに図６および８ないし１５のいずれかの配列がそれに由来するもしくはその断片または変異体である遺伝子または遺伝子群からなっていれば好ましい。また、該核酸が、ｍＲＮＡ転写物の長さの少なくても５０％である全長ｃＤＮＡまたはｃＤＮＡからなっていれば好ましく、その長さの７５％より長ければより好ましく、その長さの９５％より長ければより好ましい。該核酸をサブクローン化することが望ましく、該蛋白質コーデイング配列の全てまたは一部が発現されるならば特に望ましい。通常、該ＤＮＡはプラスミドのごとき発現ベクターに、発現のために適切な配列かつ正しいリーディングフレームで挿入される。かかる制御は通常、該発現ベクターで利用できるが、必要ならば、該ＤＮＡを所望の宿主によって認識される適当な転写および転写調節制御ヌクレオチド配列に連結してもよい。次いでベクター標準法で宿主へ導入する。一般的に、全ての宿主がベクターによって形質転換されるわけではない。従って、形質転換宿主細胞を選択する必要がある。１つの選択法は、抗生物質耐性のごとき形質転換細胞において選択可能な特性に関してコードするＤＮＡ配列を、いずれの必要な制御エレメントと共に発現ベクターに組み込むことを特徴とする。別法として、かかる選択可能な特性のための遺伝子は他のベクター上にあってもよく、それを用いて所望の宿主細胞を同時形質転換する。次いで、本発明の形質転換ＤＮＡによって形質転換された宿主細胞を十分な時間、該ポリペプチドの発現させるために本明細書で開示された方法に関して、当業者に公知の適当な条件の下で培養し、次いでそれらを回復させる。多くの発現系が知られ、これには細菌（例えば、イー・コリ(E.coli)およびバチルス・サティリス(Bacillus subtilis))、酵母（例えば、サッカロミセス・セレビシエ(Saccharomyces cerevisiae))、糸状菌（例えば、アスペルギルス(Aspe rgillus))、植物細胞、動物細胞および昆虫細胞が含まれる。該ベクターが他の非原核細胞種中で発現させるのに用いられるとしても、該ベクターは原核生物における増殖のためのＣｏｌＥ１オリのごとき原核生物レプリコンを含む。また、該ベクターは、それを用いて形質転換したＥ．ｃｏｌｉのごとき細菌宿主細胞中で該遺伝子の発現（転写および翻訳）を指示できる原核生物プロモーターのごとき適当なプロモーターも含む。プロモーターは、ＲＮＡポリメラーゼの結合および起こるべき転写を許容するＤＮＡ配列によって形成された発現調節エレメントである。典型的な細菌宿主と適合するプロモーター配列は、典型的には、本発明のＤＮＡセグメントの挿入に都合のよい制限部位を含むプラスミドベクターで提供される。典型的な原核生物のベクタープラスミドは、Biorad Laboratories(Richmond， CA，USA)から入手できるｐＵＣ１８、ｐＵＣ１９、ｐＢＲ３２２およびｐＢＲ３２９、並びにPharmacia，Piscataway，NJ，USAから入手できるｐＴｒｃ９９ＡおよびｐＫＫ２２３−３である。典型的な哺乳類細胞のベクタープラスミドは、Pharmacia，Piscataway，NJ，U SAから入手できるｐＳＶＬである。このベクターはＳＶ４０後期プロモーターを用いてクローン化遺伝子の発現を駆動し、最も高いレベルの発現がＣＯＳ−１細胞のごときＴ抗原産生細胞で認められている。誘導可能な哺乳類の発現ベクターの例としてｐＭＳＧが挙げられ、これもまた Pharmaciaから入手できる。このベクターは、マウス乳癌ウイルス長末端反復のグルココルチコイド誘導プロモーターを用いてクローン化遺伝子の発現を駆動する。有用な酵母プラスミドベクターはｐＲＳ４０３−４０６およびｐＲＳ４１３− ４１６であり、一般にはStratagene Cloning Systems，La Jolla，CA 92037，US Aから入手できる。プラスミドｐＲＳ４０３、ｐＲＳ４０４、ｐＲＳ４０５およびｐＲＳ４０６はYeast Integratingプラスミド（ＹＩｐ）であり、酵母の選択可能なマーカーＨＩＳ３、ＴＲＰ１、ＬＥＵ２およびＵＲＡ３を組み込んでいる。プラスミドｐＲＳ４１３−４１６はYeast Centromereプラスミド（ＹＣｐ）である。相補的付着末端を介してＤＮＡを実施可能なようにベクターに連結するため、様々な方法が開発されて来た。例えば、相補的ホモポリマートラクト(complemen tary homopolymer tracts)を該ＤＮＡセグメントに加えてベクターＤＮＡに挿入させる。次いで、該ベクターおよびＤＮＡセグメントを相補的ホモポリマー末端間の水素結合により連結して組換えＤＮＡ分子を形成する。１以上の制限部位を含む合成リンカーは、ＤＮＡセグメントをベクターに連結する別法を提供する。先に記載したごとくにエンドヌクレアーゼ制限部位切断によって生じたＤＮＡセグメントを、それらの３’−５’エキソヌクレオ分解活性で突き出た３’−一本鎖末端を除去する酵素である、バクテリオファージＴ４ＤＮＡポリメラーゼまたはイー・コリーＤＮＡポリメラーゼＩで処理し、次いで、それらの重合活性を用いてくぼみのできた３’−末端を満たす。従って、これら活性の併用で平滑末端化ＤＮＡセグメントが生じる。次いで、バクテリオファージＴ４ＤＮＡリガーゼのごとき平滑末端化ＤＮＡ分子の連結を触媒できる酵素の存在下で、平滑末端化セグメントをリンカー分子を超える大きさの分子と共にインキュベートする。かくして、該反応の産物はそれらの末端に重合リンカー配列を持つＤＮＡセグメントである。次いでこれらのＤＮＡセグメントを適当な制限酵素で切断し、該ＤＮＡセグメントの配列と適合する末端を生じる酵素で切断した発現ベクターと連結させる。様々な制限エンンドヌクレアーゼ部位を含む合成リンカーは、International Biotechnologies Inc，New Haven，CN，USAを始めとする多くの供給源から商業的に入手できる。本発明の第１の態様の特に好ましい核酸は、核酸を増幅するのに適当なプライマーよりなる群から選択されるものである。適宜には、該核酸は表３ないし２２並びに図６および８ないし１５のいずれかに記載の核酸、またはその相補体とハイブリダイズするプライマーよりなる群から選択される。該増幅プライマーが遺伝子のイントロンとハイブリダイズすれば特に好ましい。加工された偽遺伝子が存在すれば特に有用である。かくして、該核酸が図６および８ないし１５で与えられた配列、またはその相補体とハイブリダイズするプライマーよりなる群から選択されるならば好ましい。ポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ；Saikiら(1988)Science 239，487-491）での使用に適するプライマーが好ましい。適当なＰＣＲプライマーは以下の特性を持っていてよい。オリゴヌクレオチドの５’末端における配列は、増幅されるべき標的配列と必ずしも一致している必要はないことが公知である。この特徴は「プライマー二量体」と呼ばれる人工産物の形成を誘導し得るので、通常、該ＰＣＲプライマーは、特に３’末端において互いに２塩基より長いいずれの相補的構造も含まない。該２種のプライマーの３’末端がハイブリダイズする場合、それらは「開始鋳型」複合体をを形成し、プライマー伸張の結果「プライマー二量体」と呼ばれる短い二倍性産物が生じる。プライマー中では、分子内二次構造が回避されるはずである。対称的ＰＣＲについては、いずれの塩基の長い伸張も見られない両プライマーに対して、しばしば４０−６０％のＧ＋Ｃ含量が推奨される。ＤＮＡプローブハイブリダイゼーション研究と共に用いられた従来の融解温度計算法は、しばしば所与のプライマーが特異的温度でアニーリングするはずであること、温度を７２℃に上げるとプライマー／鋳型ハイブリッドが未成熟なまま分離するであろうことが予測される。実際には、ＰＣＲプロセスにおいて該ハイブリッドは、一般的に単純Ｔ_m計算法によって予測されるものより、より効果的である。最適なアニーリング温度は経験的に決定され、予測値より高くてもよい。ＴａｑＤＮＡポリメラーゼは３７−５５℃の範囲では活性を持たないので、プライマー伸張はアニーリング工程中に起こり、該ハイブリッドは安定化される。プライマーの濃度は従来の（対称的）ＰＣＲでは等しく、典型的には０．１ないし１μ Ｍの範囲である。いずれの核酸増幅プロトコールをも、ポリメラーゼ連鎖反応、ＱＢレプリカーゼおよびリガーゼ連鎖反応を始めとする本発明の方法で用いることができる。また、Compton（1991）Nature 350，91-92に記載されたごとくに、ＮＡＳＢＡ（増幅に基づく核酸配列）も、いわゆる３ＳＲも用いることができ、またWalkerら(1 992)Nucl．Acids Res．20，1691-1696に記載されたごとくに、ＡＩＤＳ(1993)， Vol 7（付録２）、Ｓ１０８またはＳＤＡ（ストランド置換増幅）を用いることができる。ポリメラーゼ連鎖反応はその簡便性のために特に好ましい。ＰＣＲで本発明の適当な核酸対が用いられる場合、ゲル電気泳動およびエチレンブロマイド染色による産物を検出するのが便利である。ＤＮＡのアガロースケル電気泳動およびエチレンブロマイド染色を用いるＤＮＡ増幅の産物を検出するための別法としては、プローブとして増幅されたＤＮＡとハイブリダイズできる標識オリゴヌクレオチドを用いるのが便利である。該増幅がＰＣＲによる場合、オリゴヌクレオチドプローブは２つのプライマーによって決定されたごときプライマー内配列とハイブリダイズする。該オリゴヌクレオチドは、好ましくは１０ないし５０個のヌクレオチド長の間であり、より好ましくは１５ないし３０個のヌクレオチド長である。該プローブは標準法を用いて³²Ｐ、³³Ｐおよび³⁵Ｓのごとき放射性核種で標識してもよく、または蛍光色素で標識してもよい。該オリゴヌクレオチドプローブが蛍光標識される場合、増幅されたＤＮＡ産物を溶液中で検出してもよい（例えばBalaguerら(1991)「生物発光吸収を用いたポリメラーゼ連鎖反応により得られたＤＮＡ配列の定量」Anal．Biochem．195，105-110およびDilesareら(1993)「自動化ＰＣＲ産物定量のための高感度電気化学発光に基づく検出系」BioTechniques 15，152-157参照）。また、ＰＣＲ産物を、発蛍光団消去剤対を持ち得る、あるいは固形支持体に付着できる、あるいはビオチン標識を持ち得るプローブを用いて検出することができ、または捕捉プローブおよび検出プローブを併用して検出してもよい。発蛍光団消去剤対はＰＣＲ反応（例えばＲＴ−ＰＣＲ）の定量的測定に特に適している。また、適当なプローブを用いた蛍光偏光を用いてＰＣＲ産物を検出してもよい。さらに特に好ましい核酸は、そのプライマーが図６および８ないし１５に示されている配列を参考にして選択できる、ＰＣＲプライマーとして作用するものである。これらのプライマーは、ｃＤＮＡクローンＩＭＡＧＥ２６４６１１と対応する遺伝子に由来するＤＮＡを増幅する際に有用である。これらのプライマーには、制限されるものではないが、図８ないし１５の太字（図面の凡例を参照）で示された配列が含まれる。下流（３’）プライマーは太字で示された配列の逆位相補である。オリゴヌクレオチドプライマーは当該分野で公知の方法、例えば固相ホスホルアミダイト化学を用いて合成できる。本発明の第２の態様は、その領域がマーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ２１５によって定義されたＤＮＡによって境界付けられるヒト第１０染色体の領域と選択的にハイブリダイズでき、さらには検出可能な標識を含む核酸を提供する。発明者らは「検出可能な標識」に、公知の方法を用いて核酸分子に容易に組み込むことができる³²Ｐ、³³Ｐおよび³⁵Ｓのごとき、いずれの都合のよい放射性標識も含め、また核酸に容易に組み込むことができる、いずれの都合のよい蛍光または化学発光標識も含める。さらに「検出可能な標識」なる語には、（ストレプトアビジンに対する結合によって検出できるビオチンのごとき）一方の部分に結合する能力によって検出できる部分、および無色化合物を有色化合物に変換する、あるいはその逆（例えば、アルカリホスファターゼは無色のｏ−リン酸ニトロフェニルを有色のｏ−ニトロフェニルに変換できる）の能力によって検出できる酵素のごとき部分も含まれる。便宜には、該核酸プローブは固定化アッセイにおいて特定の位置を占めると考えられ、固定化アッセイにおけるハイブリダイゼーションの位置を参考にして、該核酸が該ヒト第１０染色体領域とハイブリダイズするかどうかを調べることができる。また、検出可能な標識はTyagiおよびKrame r(1996)Nature Biotechnology 14，303-308に記載されているごとくに、発蛍光団対であってもよい。該核酸が、表３ないし２２に記載されているごとく発現配列標識（ＥＳＴ）、または図８ないし１５に示されているイントロン配列のいずれかにおいてヒト由来配列を含み、さらには検出可能な標識を含んでいれば好ましく、または該核酸が、酵母人工染色体（ＹＡＣ）である９２１−Ｆ−８、７４６−Ｈ−８、８２１ −Ｄ−２、８３１−Ｅ−５、７９６−Ｄ−５、２４Ｇ−Ａ−１０または７３４− Ｂ−４、もしくはＢＡＣクローンであるＢ２Ｆ２０、Ｂ４６Ｂ１２、Ｂ６０Ｃ５、Ｂ１５０Ｋ４、Ｂ１５０Ｎ３、Ｂ１４５Ｃ２２、Ｂ１８１Ｆ１５、Ｂ１８８Ｌ２２、もしくはＰＡＣクローンであるＰ４０Ｆ１０およびＰ２７４Ｄ２１のいずれかにおいてヒト由来配列を含んでいれば好ましい。特に好ましい核酸は、さらに検出可能な標識を含む本発明の第１の態様のものである。本発明の第３の態様は、（ｉ）患者由来の核酸よりなる試料を得、次いで（ｉｉ）該核酸を、その領域がマーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ２１５によって定義されたＤＮＡによって境界付けられるヒト第１０染色体の領域と選択的にハイブリダイズできる核酸と接触させる工程を有することを特徴とする癌に対する患者の罹病性を判定する方法を提供する。本発明はいずれの癌に対する患者の罹病性を判定するにも適するが、罹病性が判定される癌が前立腺癌、黒色腫、神経膠腫または非Ｈｏｄｇｋｉｎリンパ腫であれば好ましい。該方法は前立腺癌に対する患者の罹病性を判定するのに最も適する。従って、少なくとも前立腺癌に対する罹病性の判定については、患者は男性である。ヒト第１０染色体の部分の存在または不在は、本発明の第３、第４および第５の態様の方法によって判定されてよく、また本発明の第３、第４および第５の態様の好ましい具体例において、ヒト第１０染色体の該領域と選択的にハイブリダイズできる核酸は、第１０染色体の該領域の部分の増幅に適した核酸である。本発明の第４の態様は、（ｉ）患者由来の核酸よりなる試料を得、次いで（ｉｉ）該核酸を、その領域がマーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ２１５によって定義されたＤＮＡによって境界付けられるヒト第１０染色体の領域と選択的にハイブリダイズできる核酸と接触させる工程を有することを特徴とする癌患者を診断する方法を提供する。該方法は前立腺癌の腫瘍形成と過形成を見分けるために特に適している。１０ｑの欠失を持つ全ての腫瘍はまた、本明細書で特徴付けられた領域を欠くことも見出されたので、本発明のマーカーおよび（他の染色体上のマーカーを含む）他のマーカーを用いて、様々な診断試験を行うことができる。本発明の第５の態様は、（ｉ）患者由来の核酸よりなる試料を得、次いで（ｉｉ）該核酸を、マーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ２１５によって定義されたＤＮＡがその領域が結合するヒト第１０染色体の領域と選択的にハイブリダイズできる核酸と接触させる工程を有することを特徴とする患者における癌の特定の結果の相対的期待値を予測する方法を提供する。本発明の第３、第４および第５の態様の方法においては、患者由来の核酸を含むいずれの試料でも有用であるが、該試料が前立腺組織、血液、尿または精液よりなる群から選択されるならば好ましい。前立腺組織は標準法を用いて患者から得ることができる。前立腺由来細胞は尿中および血液中に少量認められる。患者由来の核酸を含む試料は前立腺細胞のごとき患者の細胞であるか、または直接患者の細胞に由来するものであれば好ましいが、培養により増殖させた細胞のごとき間接的に患者に由来する試料も本発明の範囲内に含まれる。同様に、患者由来の核酸は患者内に物理的に存在していたものであってよいが、別法として、患者内に物理的に存在していた核酸の複製であってもよい。該腫瘍組織は一次腫瘍からまたは転移腫瘍から採取してよく、特に腫瘍の縁から採取してよい。便宜には、その領域がマーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ２１５によって定義されたＤＮＡによって境界付けられるヒト第１０染色体の領域と選択的にハイブリダイズできる核酸はさらに検出可能な標識を含む。該検出可能な標識は本発明の第２の態様に関して上記標識を含む。前記方法は、癌の危険性を持つ群に属する患者の前症状のスクリーニングのために用いてもよいことが認識されるであろう。例えば、約６０歳より老齢の男性は３５歳より下の男性より前立腺癌の危険性が大きい。同様に、該方法を前立腺癌のごとき腫瘍の病理学上の分類のために用いてもよい。便宜には、本発明の第３、第４および第５の態様の方法において、該選択的ハイブリダイゼーション能を持つ核酸を（検出可能な標識で標識されていてもいなくても）ハイブリダイズ条件の下で患者由来の核酸に接触させる。血液、精液または尿は、その試料が前立腺由来組織または細胞が豊富な患者由来の核酸を含む該試料の供給源であれば好ましい。前立腺細胞を豊富に得ることは、例えば、前立腺特異的抗原（ＰＳＡ）に向けられるもののごとき、前立腺選択性抗体を用いた蛍光活性化セルソーティング（ＦＡＣＳ）のごとき、細胞選別法を用いて達成し得る。また、該試料の供給源としては、固定化パラフィン包埋標本並びに新鮮または凍結組織を始めとする、生検材料および腫瘍試料も含まれる。本発明の第３、第４または第５の方法は、直接的配列決定を始めとする関連領域内の１以上の関連部位におけるＤＮＡ配列決定直接的配列決定、ＰＣＲにより増幅されたエキソンの直接的配列決定、関連領域内の関連部位においてハイブリダイズするように設計されたオリゴヌクレオチドプローブの種々のハイブリダイゼーション（便宜には、この方法は当該分野で公知のいわゆる「チップ」系で、オリゴヌクレオチドプローブを固定化して用いる）、恐らくは関連ＤＮＡ領域の増幅の後、適当な制限酵素での切断に続く変性ゲル電気泳動、Ｓ１ヌクレアーゼ配列分析、恐らくは関連ＤＮＡ領域の増幅に続く非変性ゲル電気泳動、従来のＲＦＬＰ（制限断片長多型性）アッセイ、ヘテロ二本鎖分析、オリゴヌクレオチドを用いた選択ＤＮＡ増幅、染色体インターフェイス染色体の蛍光ｉｎｓｉｔｕハイブリダイゼーション、特異的突然変異に関するＡＲＭＳ−ＰＣＲ(Amplifica tion Refractory Mutation System-PCR)、ハイブリダイズした核酸における誤対合部位での切断（この切断は化学的または酵素的である）、ＳＳＣＰ−本鎖コンホメーション多型性あるいは、ＤＧＧＥ（不連続または変性勾配ゲル電気泳動）、アニーリングされた正常／ＰＣＲ増幅ＤＮＡ突然変異体間における誤対合を検出するための分析、および蛋白質トランケーションアッセイ（突然変異が切断された蛋白質産物に停止コドンを導入するならば、結果としてエキソンの転写および翻訳が起こるであろう）を含み得る。例えば、切断Ｉ酵素を用いて、一次配列における変異から生じる一本鎖ＤＮＡの二次構造における変異を検出するような別の方法も用いてよい。この系はGibcoBRL，Life Technologies，3 Fountain Dr ive，Inchinnan Business Park，Paisley PA4 9RF，Scotlandから商業的に入手できる。突然変異検出の詳細な方法は、”Laboratory Protocols for Mutation Detect ion”1996，Landegren 編 HUGO(Human Genome Organisation)を代表としてOxfor d University Press中に記載されている。ＲＦＬＰがかなり大きい（≧５００ｂｐ）欠失または挿入の検出に用いられるならば好ましい。サザンブロットを本発明のこの方法に用いてもよい。３−４ｂｐの挿入または欠失より大きいが小さな変異を検出するためには、より小さな領域（最大３００ｂｐ）のＰＣＲ増幅が好ましい。増幅された配列をシークエンシングゲル上で分析すると、小さな変異（最小サイズ３−４ｂｐ）を可視化できる。適切なプライマーは本明細書で記載されたごとくに設計される。さらに、サザンブロット分析またはＰＣＲ制限酵素のいずれかを用いて、変異部位を検出し得る。例えば、ゲノムＤＮＡについては、制限酵素消化、ゲル電気泳動、サザンブロッティング、およびハイブリダイゼーション特異的プローブ（本明細書で記載されているごとき領域中でＹＡＣ、ＢＡＣのいずれかか、またはそれらから誘導された適切な断片）である。例えば、ＰＣＲについては、ＤＮＡの増幅、制限酵素消化、臭化エチジウムによるゲル検出、銀染色またはＰＣＲでの放射性ヌクレオチドまたは蛍光プライマーの取り込みである。他の適切な方法としては、特異的な突然変異の結果のための対立遺伝子特異的オリゴヌクレオチド（ＡＳＯ）の開発が挙げられる。同様の方法が前立腺特異的組織のためのＲＮＡおよびｃＤＮＡに用いられる。また該方法には、異型接合性欠損（ＬＯＨ：１つのコピー欠失を示す）の検査、次いで、およびノーザンブロットにおいて、またはＰＣＲによって、もしくはＲＮＡ／ｃＤＮＡにおいてｍＲＮＡを検出できないことによるＲＮＡの機能欠損を探す（他のコピーが不活性を示す）いずれの供給源由来の腫瘍細胞のＬＯＨであっても、血液と比較して診断の手段として有用であり、それは例えば腫瘍が進行したことや、さらに厳しい治療を必要とすることを示す。好ましくは、本発明の第３、第４および第５の態様において、核酸は、その領域がマーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ２１５が結合するヒト第１０染色体の領域に選択的にハイブリダイズできる。さらに好ましくは、該核酸は、ＹＡＣである７４６−Ｈ−８、８２１−Ｄ−２、８３１−Ｅ−５、９２１−Ｆ−８、７９６−Ｄ−５、８２９−Ｅ−１、８３９−Ｂ−１、７３４−Ｂ−４または２４Ｇ −Ａ１０のいずれか１つのヒト由来ＤＮＡに選択的にハイブリダイズすることを特徴とするか、またはそれが可能である。さらになお一層好ましくは、該核酸は、ＹＡＣである８２１−Ｄ−２、８３１−Ｅ−５、７９６−Ｄ−５、２４Ｇ−Ａ −１０または７３４−Ｂ−４のいずれか１つのヒト由来ＤＮＡに選択的にハイブリダイズすることを特徴とするか、またはそれが可能である。該核酸が、ＢＡＣまたはＰＡＣであるＢ２Ｆ２０、Ｐ４０Ｆ１０、Ｐ７２Ｇ８、Ｐ７４Ｎ２、Ｐ２７４Ｄ２１、Ｂ７６Ｉ１０、Ｂ７９Ａ１９、Ｂ７９０１、Ｂ９３Ｆ１２、Ｂ１２２Ｌ２２、Ｐ２０１Ｊ８、Ｐ２０１Ｐ５、Ｐ２０９Ｋ３、Ｐ３１６Ｎ１４、Ｂ４６Ｂ１２、Ｂ６０Ｃ５、Ｂ１４５Ｃ２２、Ｂ１５０Ｋ４、Ｂ１５０Ｎ３、Ｂ１８１Ｆ１５およびＢ１８８Ｌ２２のいずれか１つのヒト由来ＤＮＡに選択的にハイブリダイズすることを特徴とするか、またはそれが可能であるならば好ましい。また該核酸が、マイクロサテライトマーカーＤ１０Ｓ５４１、Ｄ１０Ｓ２１５およびＡＦＭ３３７ｘｆ９（Ｄ１０Ｓ１７６５）に対するプライマーであるならば、好ましい。すなわち、該核酸がクローンＩＭＡＧＥ２６４６１１のｃＤＮＡ挿入断片に対応する遺伝子に選択的にハイブリダイズできるならば特に好ましい。かくして、本発明は、癌を診断するまたは癌に対する感受性を診断する際に、ヒト第１０染色体の当該領域に選択的にハイブリダイズできる核酸の使用を提供する。また、本発明は、ヒト第１０染色体の当該領域の存在または不在、あるいはそこでの突然変異を判定する方法を提供する。好ましくは、選択的にハイブリダイズすることが可能な当該核酸はＤＮＡであり、また好ましくは該核酸は一本鎖である。選択的にハイブリダイズできる該核酸が、核酸が二本鎖である場合には１００００より小さい塩基対を有するか、もしくは核酸が一本鎖である場合には１００００より小さい塩基を有するならば特に好ましく、該核酸が、核酸が二本鎖である場合には１０００よりも小さい塩基対を有するか、もしくは核酸が一本鎖である場合には１０００より小さい塩基を有するならばさらに好ましく、該核酸が、核酸が二本鎖である場合には１０ないし１００までの塩基対を有するか、もしくは核酸が一本鎖である場合には１０ないし１００までの塩基を有するならばよりさらに好ましく、さらに該核酸が、核酸が二本鎖である場合には１５ないし３０までの塩基対を有するか、もしくは核酸が一本鎖である場合には１５ないし３０までの塩基を有するならばさらに一層好ましい。選択的にハイブリダイズできる該核酸が、腫瘍抑制遺伝子またはその断片または変異体を含むか、あるいはそれらに選択的にハイブリダイズする核酸であるならば好ましい。選択的にハイブリダイズできる該核酸が核酸増幅のためのプライマーとして適切であるならば好ましい。適切なプライマーとしては、本発明の第１および第２の態様に関して記載されているものが挙げられる。好ましい具体例には、逆転写酵素ＰＣＲを用いて患者からの血液試料中のマイクロメタスターゼを検出する。血液試料を採取し、該試料中の有核細胞からＲＮＡを調製する。前立腺腫瘍抑制ｍＲＮＡの存在または不在、あるいはその中の突然変異を検出するオリゴヌクレオチドプライマーを用いたＰＣＲ増幅にこれを用いる。これは、正常な細胞が百万よりも多い混合物中で１つの細胞を検出することができる比較的感度の高い方法であり、これらの遺伝子を発現しない正常な血液細胞と混合した循環転移細胞中に存在する前立腺腫瘍抑制ｍＲＮＡ産物を検出することが可能である。その領域がマーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ２１５によって定義されたＤＮＡによって境界付けられる第１０染色体に領域に存在するそれらの遺伝子の遺伝子産物は、循環前立腺細胞を検出する有用なマーカーである。直接血液試料中の細胞のＤＮＡにおける突然変異を探すことによって、または蛋白質トランケーション試験を用いることによって、またはマイクロサテライトマーカーを用いることによって、マイクロメタスターゼを検出することもまた可能であることが評価されるであろう。この場合に、疑わしい腫瘍細胞を血液から精製すべきである。また、選択的にハイブリダイズできる該核酸が、表３ないし２２または図６および８ないし１５に記載されているごときヒト誘導配列であるか、またはそれにハイブリダイズできるのであれば好ましく、便宜には、該核酸は、表３ないし２２または図６および８ないし１５に記載されているごとき配列由来のＤＮＡにハイブリダイズするプライマーよりなる群から選択される。本発明の方法には、マーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ２１５によって定義されたＤＮＡによって境界付けられる第１０染色体の領域における、特に腫瘍抑制遺伝子中の突然変異の検出が含まれる。本発明の方法は、突然変異によって引き起こされた制限酵素切断部位の違いを使用し得る。非変性ゲルを用いて、適当な制限酵素での切断から生じた様々な長さの断片を検出することができる。通常は切断前に、例えばポリメラーゼ連鎖反応（ＰＣＲ）法およびその改変を用いてＤＮＡを増幅する。別法では、第一に１０−１００倍より多いＤＮＡを入手する必要があり、それでもなお制限酵素でＤＮＡを切断した場合にしかアッセイを行えないことがしばしばである。ＤＮＡの増幅は、Saikiら（1988）Science 239，487-491に開示されたごとき確立したＰＣＲ方法によって、またはそれらの開発もしくはリガーゼ連鎖反応のごとき別法によって達成でき、ＱＢレプリカーゼおよび核酸配列に基づく増幅または他の公知の増幅方法、そのいくつかが本明細書に記載されている。「適当な制限酵素」は、野性型配列を認識して切断するが、変異した配列ではしないもの、またはその逆のものである。該制限酵素により認識され切断される配列は（または場合によってはしない）突然変異の結果として存在し得るか、またはＰＣＲ反応中に誤対合したオリゴヌクレオチドを用いて正常なもしくは突然変異対立遺伝子中に導入され得る。該酵素がごくまれにしかＤＮＡを切断しないとすれば、換言すれば、それが配列を認識することがめったにしか起こらないとすれば都合が良い。もう１つの方法で、野性型の遺伝子型または突然変異体の遺伝子型のいずれかに対合する（すなわちハイブリダイズする）が両方とするわけではない一対のＰＣＲプライマーを用いる。増幅ＤＮＡが産生されるかどうかは、次いで野性型または突然変異体の遺伝子型（およびそれゆえの表現型）を示す。しかしながら、この方法は、技術的欠点によると考えられる否定的な結果（すなわち増幅ＤＮＡの不在）に幾分依存している。それゆえそれは信頼性が低く、および／またはさらなる対照実験を必要とする。好ましい方法は、同様のＰＣＲプライマーを用いるが、野性型または変異型配列の一方だけにハイブリダイズすると同時に、野性型または変異型の配列のいずれかに他の方法ではそこにない制限部位を導入する。本発明によって提供される核酸は多くの目的に有用である。ゲノムＤＮＡへのサザンハイブリダイゼーションに、および既に先に議論した点突然変異を検出するためのＲＮアーゼプロテクション法にそれらを用いることができる。該プローブを用いて、ＰＣＲ増幅産物を検出することもできる。またそれらを用いて他の技術を用いる腫瘍抑制遺伝子またはｍＲＮＡによる誤対合を検出することもできる。酵素（例えばＳ１ヌクレアーゼまたはリゾルバーゼ）、化学製品（例えばヒドロキシルアミン、四酸化オスミウムおよびピペリジン）、または全体的に対合したハイブリッドに比べ誤対合したハイブリッドの電気泳動での移動度の変化のいずれかを用いて、誤対合を検出できる。これらの技術は当該分野において公知である。一般的に、あるイントロンに対するプローブも考案されているが、該プローブは腫瘍抑制遺伝子コーディング配列と相補性がある。核酸プローブの全組を用いて、野性型腫瘍抑制遺伝子における欠失または突然変異を検出するためのキットを構成してもよい。該キットは全腫瘍抑制遺伝子へのハイブリダイゼーションを可能にする。該プローブは互いに重複するか、または隣接していてよい。リボプローブをｍＲＮＡによる誤対合を検出するために用いる場合には、それはヒト野性型腫瘍抑制遺伝子のｍＲＮＡと相補性がある。かくして、該リボプローブはアンチ−センスプローブであり、その中ではそれはセンス鎖に対して逆の極性があるので腫瘍抑制遺伝子によってコードされた蛋白質のためのコードを持たない。一般に、該リボプローブは標識され、例えば放射活性で標識されるが、それは当該分野において公知のいかなる方法によっても達成できる。該リボプローブをＤＮＡによる誤対合を検出するために用いる場合には、それはいずれの極性、センスまたはアンチ−センスを持ち得る。また同様に、ＤＮＡプローブを用いて誤対合を検出してもよい。また核酸プローブも、腫瘍抑制遺伝子の変異型対立遺伝子と相補性がある。これらは誤対合よりむしろハイブリダイゼーションに基づいて他の患者で同様の突然変異を検出するのに有用である。上述のごとくに、また該腫瘍抑制遺伝子プローブは、ゲノムＤＮＡへのサザンハイブリダイゼーションに用いて欠失および挿入のごとき染色体全体の変異を検出することもできる。また該プローブを用いて、腫瘍および正常組織から腫瘍抑制遺伝子のｃＤＮＡクローンを選択することもできる。さらに、該プローブを用いて、発現が変化、例えば野性型腫瘍抑制遺伝子の欠失の結果として減少するかどうかを判定するために、組織中の腫瘍抑制遺伝子ｍＲＮＡを検出することもできる。本発明の診断および予後判定の方法に従って、該野性型遺伝子の欠失を検出する。該欠失は挿入、欠損または点突然変異の結果のいずれかによると考えられる。単一の対立遺伝子のみに突然変異が起こる場合には、初期には腫瘍性の状態を呈し得る。しかしながら、両対立遺伝子が突然変異すれば、次いで悪性状態を呈するか、または悪性の可能性が強まること示す。かくして、かかる突然変異の発見は診断および予後の情報の双方を提供する。欠失していない（例えば遺伝子欠失をもたらす染色体への姉妹染色体上にある）腫瘍抑制遺伝子対立遺伝子を挿入、小さな欠失、および点突然変異のごとき他の突然変異についてスクリーニングすることができる。腫瘍組織中で発見されるほとんどの突然変異は、腫瘍抑制遺伝子産物の大きく変化した発現をもたらすものであると信じられている。しかしながら、機能を持たない遺伝子産物をもたらす突然変異もまた、悪性状態または悪性の可能性の増加を導くであろう。（点突然変異、欠失、挿入などのごとき）突然変異の結果は、遺伝子のプロモーターにおけるごとき調節領域中で起こり得、ｍＲＮＡの発現の欠失または減少をもたらす。また、点突然変異は、適切なＲＮＡプロセッシングをなくし、腫瘍抑制遺伝子産物の発現の欠失をもたらす。また、本発明には以下の方法が含まれる。すなわち、切断された遺伝子産物を同定するための腫瘍抑制遺伝子のイン・ビトロでの転写および翻訳、または基質結合のごとき変化した特性、そこで蛋白質の発現が減少／消失している、またはその分布が細胞内またはそれらの表面上で変化している細胞を同定するための組織切片の免疫組織化学、および先に記載したごとき領域中の突然変異の検出に先立つランダムプライマーを用いたＲＴ−ＰＣＲの使用である。本発明の第６の態様は、その領域がマーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ２１５によって定義されるＤＮＡによって境界付けられるヒト第１０染色体の領域の存在または不在、あるいはそこでの突然変異を検出するための系（またはキットの一部と言うこともできる）を提供し、該系は、その領域がマーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ２１５によって定義されるＤＮＡによって境界付けられるヒト第１０染色体の領域に選択的にハイブリダイズできる核酸およびヌクレオチド三リン酸またはデオキシヌクレオチド三リン酸またはそれらの誘導体からなる。その領域がマーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ２１５によって定義されるＤＮＡによって境界付けられるヒト第１０染色体の領域に選択的にハイブリダイズできる好ましい核酸は、本発明の第３、第４、第５の態様での好ましいものと同一である。発明者らは「突然変異」に、挿入、置換および欠失を含める。発明者らは「ヌクレオチド三リン酸またはデオキシヌクレオチド三リン酸またはそれらの誘導体」に、ＡＴＰ、ＧＴＰ、ＣＴＰ、およびＵＴＰ、ｄＡＴＰ、ｄＧＴＰ、ｄＣＴＰ、ＴＴＰのごときいずれの天然に生ずるヌクレオチド三リン酸またはデオキシヌクレオチド三リン酸並びにホスホロチオエート結合を含むもののごとき非天然性誘導体（例えばαＳ誘導体）を含める。有利には、ヌクレオチド三リン酸またはデオキシヌクレオチド三リン酸は放射活性で、例えば³²Ｐ、³³Ｐ、³⁴Ｓなど放射活性で標識されるか、またはそれらの誘導体であるか、あるいは蛍光物質で標識されるか、または化学発光化合物またはジゴキシゲニンで標識される。有利には、デオキシヌクレオチドは、ＰＣＲで使用するための希釈に適切な濃度である。かくして、本発明には、ヒト第１０染色体の当該領域に選択的にハイブリダイズできる核酸を含むキットの一部、および該領域の存在また不在、あるいはそこでの突然変異を検出する手段が含まれる。本発明の第７の態様は、その領域がマーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ２１５によって定義されたＤＮＡによって境界付けられるヒト第１０染色体の領域と選択的にハイブリダイズできる核酸および酵素を修飾する核酸を含むことを特徴とする、その領域がマーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ２１５によって定義されたＤＮＡによって境界付けられるヒト第１０染色体の領域の存在または不在、もしくはそこにおける突然変異を検出する系を提供する。その領域がマーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ２１５によって定義されるＤＮＡによって境界付けられるヒト第１０染色体の領域に選択的にハイブリダイズできる好ましい核酸は、本発明の第３、第４、第５の態様における好ましいものと同一である。発明者らは「突然変異」に、挿入、置換（トランスバージョンを含む）および欠失を含める。発明者らは「酵素を修飾する核酸」に、ＲＮＡまたはＤＮＡ分子を修飾することが可能ないずれの分子をも含める。好ましい酵素は、ＤＮＡポリメラーゼ、ＤＮＡリガーゼ、ポリヌクレオチドキナーゼまたは制限エンドヌクレアーゼよりなる群から選択される。特に好ましい酵素は、ＴａｑＤＮＡポリメラーゼのごとき熱安定性のあるＤＮＡポリメラーゼである。二次構造、例えば誤対合を認識するＣｌｅａｖａｓｅＩのごときヌクレアーゼも有用であり得る。本発明の第８の態様は、本発明の腫瘍抑制遺伝子によってコードされ得るポリペプチドまたはその断片または変異型を提供する。該ポリペプチドは好ましくは、特に前立腺における腫瘍抑制活性を有する、または天然のポリペプチドに特異的である抗体と交差反応する。本発明の第９の態様は、本発明の第８の態様のポリペプチドと特異的に結合できる分子を含む。適宜には、該分子は、該ポリペプチドに対して特異的な相補性決定領域からなる抗体様の分子である。これらの抗原の多くと結合するモノクローナル抗体はすでに公知であるが、いずれの場合においてもモノクローナル抗体技術に関する現在の技術を用いて、ほとんどの抗原に対する抗体を調製できる。抗原−結合部分は抗体の一部（例えばＦａｂ断片）または合成抗体断片（例えば一本鎖Ｆｖ断片［ＳｃＦｖ］）であってもよい。選択した抗原に対する適切なモノクローナル抗体は公知の技術、例えば”Monoclonal Antibodies: A manual of techniques”,H Zola(CRC Press，19 88)および”Monoclonal Hybridoma Antibodies:Techniques and Applications” ,J GR Hurrell(CRC Press，1982)に開示されているものによって調製され得る。キメラ抗体は、Neubergerら(1988，8th International Biotechnology Sympos ium Part2,792-799)によって議論されている。適切に調製した非ヒト抗体を公知の方法、例えばヒト抗体の骨格の中にマウス抗体のＣＤＲ領域を挿入することによって「ヒト化」し得る。本発明のさらなる態様は、（ｉ）患者由来の蛋白質を含む試料を得、次いで（ｉｉ）本発明の第８の態様に記載するポリペプチドの該試料における相対量または大きさを決定すること、または本発明の第８の態様に記載のポリペプチドの、トランケーションまたは機能の欠損があるかどうかを決定する工程よりなる（ａ）癌に対する患者の罹病性を判定し、（ｉ）患者由来の蛋白質を含む試料を得、次いで（ｉｉ）本発明の第８の態様に記載のポリペプチドの該試料にける相対量または大きさを決定する工程よりなる（ｂ）患者における癌を診断し、次いで（ｉ）患者由来の蛋白質を含む試料を得、次いで、（ｉｉ）本発明の第７の態様に記載のポリペプチドの該試料中の相対量を決定する工程よりなる、（ｃ）患者における癌の特定の結果の相対予測を推定する方法を提供する。典型的には、正常な細胞と比較して、癌細胞中の蛋白質は切断されているか、または蛋白質産物の量が減少する。発明者らは「患者由来の」に、患者から直接的に誘導した、または間接的に誘導した試料を含め、例えばイン・ビトロでの転写および翻訳によって患者から単離したＤＮＡから蛋白質を生産してもよい。該試料はいずれの適切な試料であってもよく、生検試料、腫瘍試料（例えば、固定パラフィン包埋におけるものおよび新鮮組織または凍結組織）および腫瘍細胞から剥離した細胞が含まれる。これらの方法はいずれの癌に対する患者の罹病性をも判定するのに適するが、特に前立腺癌、黒色腫、神経膠種または非−Ｈｏｄｇｋｉｎリンパ腫に適する。従って、少なくとも前立腺癌に対する罹病性の判定については、患者は男性である。前立腺癌は特に適切である。便宜には、該ポリペプチドは、本発明の第９の態様で定義された分子を用いて検出される。好ましくは、該分子はポリペプチドに特異的な相補性決定領域からなる抗体様分子である。適宜には、モノクローナル抗体のごとき該分子は、検出可能な標識を含む。適切な検出可能な標識には、¹²⁵Ｉおよび¹³¹Ｉのごとき放射性標識、および診断のイメージングに用いるもののごとき他の放射性核種、並びに抗体のごとき分子に容易に取り込まれ得るいずれの便利な蛍光物質または化学発光標識が含まれる。また、さらに「検出可能な標識」なる語には、（ストレプトアビジンに結合することによって検出できるビオチンのごとき）他の部分に結合する効力によって検出できる部分、および酵素のごとき、無色の化合物を有色の化合物に変換する能力、またはその逆の能力によって検出できる部分（例えばアルカリホスファターゼは無色のｏ−リン酸ニトロフェニルを有色のｏ−ニトロフェノールに変換できる）が含まれる。便宜には、該抗体から当該ポリペプチドの種々のエキソンによりコードされたペプチドが生ずる。これらは、例えば組織切片中で、並びに蛋白質トランケーションアッセイ中で用いて切断された蛋白質を検出することができ、またこれを用いて蛋白質のレベルの変化を検出することもできるる。本発明のさらなる態様は、癌、特に前立腺癌の診断用試薬の製造において、さらには癌治療用薬剤の製造において、その領域がマーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ２１５によって定義されるＤＮＡによって境界付けられるヒト第１０染色体の領域に選択的にハイブリダイズできる核酸の使用を提供する。本発明のなおさらなる態様は、その領域がマーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ２１５によって定義されるＤＮＡが結するヒト第１０染色体の領域に選択的にハイブリダイズできる核酸、患者に挿入する場合には所望により腫瘍抑制分子をコードする核酸を患者に投与する工程からなる癌の治療法を提供する。腫瘍抑制は、（好ましくは前立腺）腫瘍細胞系統をポリペプチドからなる発現ベクターでトランスフェクトし、次いでトランスフェクトされた細胞系統の腫瘍形成特性を異種移植モデル（例えばヌードマウス）中の親系統と比較することによって同定され得る。好ましくは、該方法は前立腺癌の治療用である。さらに好ましくは、該核酸は、これに関して治療遺伝子である腫瘍抑制遺伝子である。野性型腫瘍抑制遺伝子が好ましい。なお一層さらに好ましくは、該核酸は適切な送達系からなる。アデノウィルス由来ベクターは、休止中の、またはゆっくりと分裂している組織細胞中で遺伝子の欠陥を修復するのに適しているが、レトロウイルス由来ベクターは特に迅速に分裂する細胞（例えば腫瘍細胞）を標的とするので、イン・ビボでの癌治療に適する。製造された治療蛋白質の量および製造時間の双方が、遺伝子治療における重要な問題である。その結果、細胞遺伝子の組み込みが可能なウイルスベクター（例えばレトロウイルスベクターの使用）は、反復治療が免疫原性の理由で望ましくない場合には、非組み込み代替物（例えばアデノウイルス由来ベクター）よりもさらに有益であり得る。治療遺伝子を染色体外で維持している場合には、最も高い発現レベルは、ウイルス性プロモーター、例えばラウス肉腫ウイルス長末端反復（Ragotら（1993）N ature 361,647-650;Hydeら（1993）Nature 362,250-255）、およびアデノウイルス主要後期プロモーターを用いて達成されるようである。後者は、肺の上皮中で膀胱繊維症トランスメンブラン・コンダクタンス・レギュレーター経膜伝導度調節（ＣＦＴＲ）遺伝子の発現を首尾よく駆動させるために用いられている（Rose nfeldら（1992）Cell 68，143-155）。これらのプロモーターは広範囲の組織で機能するので、もし特異性を提供するために送達法を修正できなければ細胞種特異的発現を指示するのに適切ではないであろう。しかしながら、体細胞エンハンサー配列を用いて、染色体外の環境で細胞種特異的発現を付与することが可能であらう。遺伝子−ベクター構築物の回収が不可能である場合には、系に自殺遺伝子を添加して、有毒な反応を迅速に中止する必要があろう。単純ヘルペスウイルス・チミジンキナーゼ遺伝子は、細胞に形質導入された場合、それらを薬剤ガンシクロビル(ganciclovir)に感受させ、急速に該細胞を殺す選択を発生させる。種特異性がある同種指向性ウイルスの使用は、遺伝子治療でのベクターとして両種指向性性ウィルスの使用のためにより安全な別法代替物を提供し得る。このアプローチにおいて非ヒト同種指向性ウイルスレセプターのヒトの相同体は、該ウイルスが認識できるようにかかる方法で修飾される。次いで、該修飾されたレセプターは、標的細胞異変レセプターである分子を構築することによって細胞に送達される。該レセプターのその標的の送達に続いて、治療遺伝子を運ぶ遺伝学的に設計された同種指向ウイルスを注入することができ、次いで該標的細胞へのみ組み込まれるであろう。ウイルス由来遺伝子転移ベクターを特異的な細胞のみを認識するように修正することができ、それゆえ前立腺腫瘍細胞のような癌細胞を標的とすることが可能であり得る。同様に、ＰＳＡ遺伝子用のもののような前立腺−特異的プロモーターを用いて、該癌細胞、特に前立腺細胞に対する治療用遺伝子の発現を標的とすることが可能である。本発明のさらなる態様は、本発明の９番目の態様に従って患者に分子を投与する工程を有することを特徴とする癌の治療法を提供し、該分子はさらに細胞毒のある部分からなる。該細胞毒のある部分は、（リシン、適切な薬剤または適切な放射性核種のごとき）直接的には、細胞毒であるか、または（比較的毒性のない前駆薬剤を比較的有毒な薬剤に変換することが可能な酵素（例えばＷＯ８８／０７３７８およびＷＯ９１／１１２０１を参照のこと）のような）間接的に細胞毒であり得る。適宜には、本発明の第９の態様に記載の分子は、抗体であり、好ましくはモノクローナル抗体、またはその断片である。本発明の前記の化合物またはその製剤は、非経口（例えば皮下または筋肉内）注射によって投与されてよいが、好ましくは腫瘍へ投与される。該治療は一回の投与または時間をあけての複数回の投与からなるであろう。本発明の化合物を単独で投与することができるが、１以上の許容される担体とともに、医薬製剤としてそれを提供することが好ましい。該担体（担体類）は、本発明の化合物と適合するという意味で「許容され」なければならず、かつその受容体に対して有害であってはならない。典型的には、該担体は、無菌かつ発熱物質のない水または食塩水であろう。本発明のさらなる態様は、癌治療用薬剤の製造のための、本発明の第９の態様に記載の分子の使用を提供する。診断法および本発明の使用のために、かかる方法で用いられるいずれの核酸も、クローンＩＭＡＧＥ２６４６１１のｃＤＮＡ挿入断片に対応する遺伝子と選択的にハイブリダイズできる核酸であることが特に好ましい。腫瘍抑制遺伝子を使用する本発明の治療法のために、該遺伝子はクローンＩＭＡＧＥ２６４６１１のｃＤＮＡ挿入断片に対応する遺伝子、またはその適切な変異体、例えばｃＤＮＡのごとき切断された形式またはイントロンのない形式であることが特に好ましい。核酸がヒト第１０染色体の当該領域に選択的にハイブリダイズできる腫瘍遺伝子からなる核酸によってコードされ得るポリペプチドは、クローンＩＭＡＧＥ２６４６１１のｃＤＮＡ挿入断片に対応する遺伝子によってコードされ得るポリペプチドであることが特に好ましい。用いた略語：ＳＳＣＰは一本鎖コンホメーションの多型性を示し、ＰＣＲはポリメラーゼ連鎖反応、ＹＡＣは酵母人工染色体を示し、ＣＥＰＨはＣｅｎｔｒｅｄ’ＥｔｕｄｅｄｕＰｏｌｙｍｏｒｐｈｉｓｍｅＨｕｍａｉｎを示す。図面および特定の表の簡単な説明図１はａ．前立腺腫瘍中の１０ｑ２３−ｑ２５におけるマイクロサテライトマーカーでの対立遺伝子の欠失の例を示す。それぞれのピークの下の上側の囲まれた図は、対立遺伝子断片の長さを表す。下側の図は、相対ピークの高さである。主要なピークの左側の「ショルダー」ピークは、ＰＣＲ中のポリメラーゼのずれ (slippage)による。ｂ．マイクロサテライトの不安定性。ＤＮＡ誤対合修理エラー（１０）の結果生じると思われる不安定性は、２１／２４の遺伝子座で１／３７腫瘍中に観察された。断片長はそれぞれのピークの下に示されている。ここに示されている例は恐らくは、２１３ｂｐ対立遺伝子の伸張に関連して２０７ｂｐ対立遺伝子の欠損をもたらす。図２は１０ｑ２３−ｑ２５での対立遺伝子の欠失を示す。腫瘍番号は図４中のものと対応する。イタリック体のマーカー番号は、Ｄ１０Ｓ番号である（７）。「ＡＦＭ」と表示したマーカーはさらにＤ番号が与えられなければならず、全マーカーの名称はＡＦＭａ０５１ｔｂ９、ＡＦＭａ１２４ｗｄ９、ＡＦＭａ０６４ｚａ５、ＡＦＭａ３０１ｅｘ１およびＡＦＭａ２７３ｙｅ１である。また腫瘍８、１６、２４、３０および３１は、全染色体欠失を意味する、第１０染色体のｐ腕上のマーカーＤ１０Ｓ１８９および／またはＤ１０Ｓ５７０での対立遺伝子欠失を示す。より小さな番号は、マーカー間のおよその遺伝子距離をセンチモルガンで示す。マーカーＡＦＭａ１２４ｗｄ９とＤ１０Ｓ５８３間の明確に定義された共通の欠失領域が約９センチモルガン離れて存在する。対照的に、腫瘍１および１１だけがＭｘｉｌを取り巻くマーカーの特異的欠失を示し、両方の場合において、このことがＡＦＭａ１２４ｗｄ９−Ｄ１０Ｓ５８３領域中の対立遺伝子欠失と関連している。図３は前立腺腫瘍中のＭｘｉｌ欠失を示す。腫瘍１および１１中のＭｘｉｌ遺伝子の３’非翻訳領域における（ＡＡＡＡＣ）_n多型性での対立遺伝子欠失の評価は、蛍光に基づく分類によって隣接するマイクロサテライトマーカーの特異的な欠失を示す。それぞれのピークの下の囲まれた番号は、対立遺伝子断片長（上側）および相対ピークの高さ（下側）を表す。腫瘍１はＭｘｉｌの明白な欠失を示し（ピークの高さは５８％減少）、一方、腫瘍１１は、隣接するマイクロサテライトマーカーＡＦＭａ２７３ｙｅ１の欠失を示すにもかかわらず、Ｍｘｉｌの見かけ上の欠失を示さない。表２は１０ｑ２３−ｑ２５欠失に対する前立腺腫瘍の評価の結果を示す。図４（ａ）はＹＡＣクローン並びにマーカーＤ１０Ｓ５４１およびＡＦＭ３３７の位置を示す最小領域の物理的地図であり、図４（ｂ）はＢＡＣおよびＰＡＣクローンの位置を示すさらに詳細な地図である。図５はさらに、多くの情報が得られるＬＯＨデータを示す。表３ないし２２は、ＩＭＡＧＥクローン２６４６１１のｃＤＮＡ挿入断片に対応する遺伝子から誘導した発現配列標識（ＥＳＴ）の配列決定された挿入断片を記載する。図６（配列番号１１）は特に好ましい核酸分子のｃＤＮＡの完全な配列を示す。可能性あるイントロンの位置を示す（ジヌクレオチドの上の「ｓｓ」はスプライス部位を意味する）。下方に３’非翻訳配列がある。図７（配列番号１２）は図６のヌクレオチド配列のある一つのリーディング・フレームにおける翻訳を示す。図８ないし１５（配列番号１３ないし２０）はＩＭＡＧＥクローン２６４６１１に対応する遺伝子由来のエキソンの配列およびフランキング・イントロン配列を示す。コーディング配列は上方にあり、イントロン配列は下方にある。太字がＰＣＲ増幅物である。エキソンは連続番号をつけているが、さらに上流または下流のエキソンが存在してもよく、所与の各々の「エキソン」をより小さなエキソンに分割してもよい。Ｒはプリンである。実施例１：前立腺腫瘍抑制遺伝子の１０ｑ２３−ｑ２４境界への局在材料および方法ＤＮＡの調製。腫瘍および静脈血液の試料を前立腺の経尿道切除を受けている男性から得た。腫瘍組織を正常な組織から顕微解剖し、腫瘍および血液ＤＮＡを従前に記載したごとくに調製した（６）。ＰＣＲ。ＧｅｎｅＡｍｐ９６００サーマルサイクラー（Ｐｅｒｋｉｎ−ＥｌｍｅｒＣｅｔｕｓ）にて、３０ｎｇテンプレートＤＮＡ、１×ＰＣＲ緩衝液（ＢｏｅｈｒｉｎｇｅｒＭａｎｎｈｅｉｍ）、２０ｐｍｏｌプライマー、２０μ ＭｄＮＴＰｓ（ＢｏｅｈｒｉｎｇｅｒＭａｎｎｈｅｉｍ）および１ユニツトのＴａｑポリメラーゼ（ＢｏｅｈｒｉｎｇｅｒＭａｎｎｈｅｉｍ）を含む５０μ ｌの反応液中でＰＣＲを行った。マイクロサテライトＣＡ反復マーカー（７）の増幅のために、該プライマーの１つを蛍光標識（ＪＯＥ、ＦＡＭ、ＨＥＸ、ＴＡＭＲＡ；ＡｐｐｌｉｅｄＢｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）で標識した。９５℃での３分間の高温開始により先行される、９４°で３０秒、５５°で３０秒および７２° で３０秒の３０サイクルで、マイクロサテライト反応混合物を得た。Ｍｘｉｌヘリックス−ループ−ヘリックスおよびロイシンジッパーエキソン（５）の増幅のためにアニーリング温度を５０°に下げ、３’エキソンの増幅のために６０°に上げた。３’エキソン増幅用のプライマー配列は、５’−ＧＡＧＡＴＴＧＡＡＧＴＧＧＡＴＧＴＴＧＡＡＡＧ−３’（配列番号７）（Ａ）および５’−ＡＡＡＴＡＣＡＧＧＴＣＣＴＣＴＧＡＣＣＣ−３’（配列番号８）（Ｂ）であり、３１９または３２４ｂｐ生成物が得られる。（ＣＡＡＡＡ）_nの多型性の蛍光に基づく分類を助けるために、プライマーＡをＦＡＭで標識した。対立遺伝子分類。マイクロサテライト対立遺伝子の大きさおよび異型接合性の欠失を、２５００−ＲＯＸｓｉｚｅｓｔａｎｄａｒｄ（ＡｐｐｌｉｅｄＢｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）の存在下６％変性ポリアクリルアミドゲル中でＰＣＲ産物の大きさを分離することにより、次いで製造業者のガイドラインに従いＧｅｎｅｓｃａｎソフトウェア（ＡｐｐｌｉｅｄＢｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）を実行する３７３ＡＤＮＡシークエンサーを用いて検出することにより決定した。１０マーカーまでは大きさまたは蛍光標識によって区別でき、同時に分類される。得られたデータをＧｅｎｏｔｙｐｅｒソフトウェア（ＡｐｐｌｉｅｄＢｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）を用いて分析した。また、ＬＯＨを検出すること、次いで臭化エチジウムでゲルを染色しおよびＵＶ光源を用いてＰＣＲ産物を可視化することによって、または該産物をナイロンもしくはニトロセルロース膜に転写し、次いで（最初のＰＣＲ増幅でプライマーとして用いた放射性標識したオリゴヌクレオチドのごとき）マーカーＤＮＡ配列由来の放射性プローブとハイブリダイズさせることによって対立遺伝子の欠失を評価することができる。この場合、該フィルターをＸ線フィルムに露出させることによって該ＰＣＲ産物が検出され、次いで対立遺伝子の欠失は肉眼または別法として濃度測定により評価されてよい。ＳＳＣＰ。Ｍｘｉｌイントロンの増幅の後に、１０μｌのＰＣＲ産物を１０μ ｌホルムアミドと混合し、３分間で９０℃まで加熱した。変性生成物を、２５℃ より低い温度を維持するために送風機で冷却しながら２５Ｗで４−６時間６％の非変性ポリアクリルアミドゲル中で泳動させた。ＤＮＡをナイロン膜（ＨｙｂｏｎｄＮ＋；Ａｍｅｒｓｈａｍ）に転写し、ＴｅｒｍｉｎａｌＴｒａｎｓｆｅｒａｓｅ（Ｇｉｂｃｏ−ＢＲＬ）を用いて３２Ｐ−ｄＣＴＰ（Ａｍｅｒｓｈａｍ）で末端標識した後、６８℃で３−４時間両ＰＣＲプライマーとハイブリダイズさせ、２×ＳＳＣ／０．１％ＳＤＳで５−１０分間洗浄後、フィルターを−７０℃ で１−２４時間Ｘ線フィルムに露出させた。ＤＮＡ配列決定。Ｃｅｎｔｒｉｃｏｎ−１００カラム（Ａｍｉｃｏｎ）を通すことによる精製に続き、ＰＣＲ増幅ＭｘｉｌエキソンをＰＲＩＳＭサイクルシークエンシングキット（ＡｐｐｌｉｅｄＢｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）並びに製造業者の指示に従って３７３Ａ回収および分析ソフトウェア（ＡｐｐｌｉｅｄＢｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）を実行する３７３ＡＤＮＡシークエンサーを用いて配列決定した。各々のエキソンを独立したＰＣＲ反応から２度（各々の末端から一度ずつ）配列決定した。配列電気泳動図をＳｅｑｕｅｎｃｅＮａｖｉｇａｔｏｒソフトウェア（ＡｐｐｌｉｅｄＢｉｏｓｙｓｔｅｍｓ）を用いて配列させ、肉眼で比較した。結果種々のおよび組織病理学上のグレードおよび病期の総数３７の前立腺腫瘍（表２）を、１０ｑ２３−ｑ２５をつなぐ２４ＣＡ反復マーカーでの異型接合性の欠損に関して分類した（７）。ＤＮＡの抽出に先立って腫瘍組織を正常な組織から顕微解剖し、次いで、腫瘍マイクロサテライトプロフィルをリンパ球ＤＮＡ由来のものと比較して対立遺伝子欠失を判定した。また、良性の過形成組織の８試料も研究した。正常な組織と比較して２０％より大きい、再生産可能なシグナル還元が観察されれば、発明者らは腫瘍ＤＮＡ試料が対立遺伝子欠失を示すとみなしたが、実際には還元の程度がしばしば非常に大きくなり、ある場合には１００％に近くになった。対立遺伝子欠失の例を図１に示す。総数２３の腫瘍（６２％）が１０ｑ２３−ｑ２５上の１以上のマーカーで対立遺伝子欠失を示した（表２）。これらのうち８つが分類された情報が得られる全てのマーカーで欠失を示し、また、これら８つのうち５つ以上がｐ腕上のマーカーで対立遺伝子欠失を示した。これらのことは、恐らくは不分離を通じて全染色体の不在を示唆する。対立遺伝子欠失データを図２中に要約した。良性の過形成組織試料では欠失は見られなかった。１つの腫瘍が大多数の遺伝子座（２１／２４；図１を参照のこと）でマイクロサテライト不安定性を示したが、恐らくは欠損のあるＤＮＡミスマッチコレクションシステム（１０）による。腫瘍の病期およびグレードと１０ｑの欠失の間に明白な相互関係はなく、１０ｑの欠失は腫瘍の進行中のいかなる時期においても起こり得ることを示唆している。レチノール結合蛋白質４遺伝子（ＲＢＰ４）およびシトクロムＰ４５０ＩＩＣ遺伝子クラスター（ＣＹＰ２Ｃ）の遺伝子座並びに隣接マイクロサテライトマーカーＤ１０Ｓ１８５およびＤ１０Ｓ５７１の双方を持った酵母人工染色体（ＹＡＣ）クローンの同定に続き、これらの遺伝子の欠失地図上の位置を定めた（１１）。該地図は、それぞれ１０ｑ２３−２４および１０ｑ２４．１に細胞遺伝学的に地図作成されたＲＢＰ４およびＣＹＰ２Ｃに近位の共通した欠失領域を明確に表している（１２、１３）（図２）。この領域は、腫瘍３７を除いては発明者らの研究で１０ｑ欠失を示すすべての腫瘍において欠失しており、この領域由来のマーカーについての情報は得られなかった。腫瘍１、３、６、１３、１４および１５は、約９センチモルガン離れたマーカーＡＦＭａ１２４ｗｄ９とＤ１０Ｓ５８３との間の欠失の最小領域を定義する。最近Ｅａｇｌｅらは、少数の前立腺腫瘍の１０ｑ２５でＭｘｉｌ遺伝子中の突然変異を同定し、Ｍｘｉｌは腫瘍サプレッサーとして作用し得るという推測を導いた（１、５）。発明者らはＣＥＰＨｍｅｇａ−ＹＡＣ９３６−ｈ−５および９６６−ｈ−９上にその存在を確認した後に欠失地図上にＭｘｉｌを置くことが可能であり、これはマイクロサテライトマーカーＤ１０Ｓ５９７を持ったＹＡＣと重複していることを示している（１４）。２つの腫瘍、１および１１だけが直ちにＭｘｉｌをフランクするマーカーの特異的な欠失を示し、両場合において、このことはＡＦＭａ１２４ｗｄ９−Ｄ１０Ｓ５８３領域（図２）における対立遺伝子欠失と関連していた。腫瘍の進行におけるＭｘｉｌ欠失の役割をさらに明確にする試みにおいて、発明者らは、個々のエキソンのＰＣＲ増幅、およびそれに続くＳＳＣＰ分析（８）によるＭｘｉｌ突然変異について腫瘍１および１１、並びに全領域で欠失を示しす腫瘍をスクリーニングした（８）。ヘリックス−ループ−ヘリックスおよびロイシンジッパードメインをコードするエキソンのＰＣＲ増幅用のプライマーは、Ｅａｇｌｅら（５）から得られた。最終の３’エキソンの増幅のために、該エキソンの隣接５’末端由来、および３’非翻訳配列内由来プライマーを用いた（４、５）。これらの３対のプライマーはＭｘｉｌの６６％有効範囲を持つコーディング配列を与える。該Ｍｘｉｌ遺伝子の５’末端のゲノム構造はまだ決定されていない。従って発明者らは、ヘリックス−ループ−ヘリックスドメインエキソンに対する５’を分析することができなかった。ＳＳＣＰ分析では、Ｍｘｉｌコーディング配列の３分の２にわたって、いずれの突然変異も検出することができなかった。ＳＳＣＰ分析に加えて、発明者らは前立腺腫瘍で従前に突然変異を示したヘリツクス−ループ−ヘリックスおよびロイシンジッパードメインをコードするそれらのエキソンの配列を直接決定した（５）。またもや突然変異は検出されなかった。発明者らはいずれかのアプローチによる、いずれの腫瘍においても、Ｍｘｉｌ突然変異を検出できなかったが、ＳＳＣＰによって３’非翻訳領域で共通の多型性を検出し、それに続く配列分析が（ＡＡＡＡＣ）_n縦列反復における長さの変異の結果として生じ、２つの対立遺伝子（ＡＡＡＡＣ）₄および（ＡＡＡＡＣ）₅が得られることを示した。全１０ｑ２３−ｑ２５領域の欠失またはＭｘｉｌ付近でのＣＡ反復マーカーにおける対立遺伝子欠失を示す８つの腫瘍（１、８、１１、１６、１７、２１、２３および３０番）は、この多型性のために異型接合性があり、このことがこれらの腫瘍を実際のＭｘｉｌ欠失について評価することを可能にした。また、隣接マーカーの欠失を示す６つの腫瘍（１、８、１６、１７、２３および３０）は、蛍光に基づく分類によって決定されるごときＭｘｉｌの欠失を示した（図３）。これらうちの５つが全１０ｑ２４−ｑ２５領域の欠失を示した（図２）。従って、１０ｑ２３−ｑ２５欠失を示す総数２３の腫瘍から、発明者らは（他の１０ｑ２３−ｑ２５領域または全領域の欠失とは対照的に）Ｍｘｉｌの特異的欠失を示すただ１つの腫瘍（１番）を同定することができ、このことはＡＦＭａ１２４ｗｄ９−Ｄ１０Ｓ５８３の欠失に関連していた。また発明者らは、この多型性を用いて、サイクルシークエンシングによる腫瘍中の突然変異の検出効率における正常組織の混入の効果を決定することができた。Ｍｘｉｌ欠失を示すそれらの腫瘍（腫瘍１、８、１６、１７、２３および３０）において、すぐ隣りの３’非翻訳ＤＮＡを含むエキソン５を配列決定した。欠失対立遺伝子の最大欠失度を示した腫瘍８について、保持された対立遺伝子を明白に同定した。残りの腫瘍からは、該２つの対立遺伝子（示されていない）からの最終生成物を組み合わせた結果として（ＡＡＡＡＣ）_n反復が生じるに次いで、高度に不明瞭な配列データが得られた。従って、サイクルシークエンシングによって検出されたＭｘｉｌの保持コピーにおける小さな欠失または挿入事象の結果として、能力を消失するいずれの突然変異も生じ得ると考えられる。議論ここで表されたデータは、１０ｑ２３−ｑ２４境界、およびさらに明確にはマーカーＡＦＭａ１２４ｗｄ９とＤ１０Ｓ５８３との間、約９センチモルガンにわたる領域における前立腺腫瘍抑制遺伝子（または遺伝子群）の存在を示す。この領域を、適切なマーカーとして情報がない２３番目を有する１０ｑ欠失を示す２３の前立腺腫瘍のうち２２で欠失していた。１０ｑ欠失は前立腺の発癌のいくつかの場合における初期の事象であるかも知れず、欠失は初期の、並びに後期の病期の腫瘍で観測された。換言すれば、１０ｑ欠失は、良性の過形成組織試料では観測されなかった欠失を与えた起源よりもむしろ形成された腫瘍の進行においてより重要であるかもしれない。しかしながら、良性の前立腺過形成と発癌との間の関係は明白ではないといういのが現状であり、かかる病害は悪性疾患への前兆ではない可能性がある。Ｍｘｉｌは前立腺腫瘍で変異誘発されたことを示しているが、各々の腫瘍中の小さい割合の細胞だけがＭｘｉｌ突然変異を有することが判明した（５）。著者らは２つの可能な説明を提供する。第１は、研究された腫瘍は相当量の非腫瘍性組織を含んでいたかも知れないということである。第２は、少数の腫瘍性細胞中にしか、変異したＭｘｉｌ対立遺伝子が存在しないということである。発明者らが、正常な組織の混入が３０％より少なく、１０ｑの欠失の程度が（マイクロサテライト対立遺伝子欠失により算出したごときに、表２を参照のこと）２５％ないし７９％の範囲を示す顕微解剖腫瘍で、Ｍｘｉｌ突然変異を検出できないとすれば、後者はさらにあり得ることだと考えられる。またこのことは、保持されたＭｘｉｌ対立遺伝子の突然変異が欠失対立した遺伝子の欠失後に起こることを意味する。突然変異が検出されない、または少ない割合の腫瘍細胞しか検出されないことを組み合わせた結果は、対立遺伝子欠失データと相まって、前立腺腫瘍の進行におけるＭｘｉｌよりもより重要な意味を持つ１０ｑ２３−ｑ２４に腫瘍抑制遺伝子（または遺伝子群）が存在することを示す。１０ｑ２４−ｑ２５の欠失または再配列は、前立腺癌に限定されず、これはまた黒色腫、神経膠腫および非Ｈｏｄｇｋｉｎｓリンパ腫（１５−２１）で観測されており、これらはいくつかの腫瘍種に関連したこの位置に腫瘍抑制遺伝子または遺伝子群が存在することを示唆している。実施例２：腫痛抑制遺伝子を含むＤＮＡの同定図４および５によって、本明細書中において最小領域を定義するマーカーである、ＡＦＭ１２４とＤ１０Ｓ５８３との間のさらに詳細なマッピングデータが与えられ、該最小領域をさらにＤ１０Ｓ５４１とＤ１０Ｓ２１５との間隔、さらに詳しくは、１ｃＭより短い距離である、Ｄ１０Ｓ５４１とＡＦＭ３３７ｘｆ９との間の間隔に狭めることができる。物理的マッピングデータを以下に要約する。７Ｂ−Ｆ１２および２４Ｇ−Ａ１０以外の全てのこれらのＹＡＣは、ＣＥＰＨメガ−ＹＡＣライブラリーから公的に入手できる。７Ｂ−Ｆ１２および２４Ｇ− Ａ１０はＩＣＩＹＡＣライブラリーから公的に入手できる。これらのライブラリーは双方ともHuman Genome Mapping Project Resource Centre，Hinxton Hall ，Hinxton，Cambridgeshire,CB10 IRQ,UKから公的に入手できる。メガ−ＹＡＣクローンのサイズはＣＥＰＨデータから得られる。ＩＣＩＹＡＣクローンは、発明者らによりサイズ決定された。＋＝ＹＡＣに対して割り当てられたＳＴＳ。ＹＡＣである８２１−Ｄ−２、８３１−Ｅ−５、７９６−Ｄ−５、２４Ｇ−Ａ −１０および７３４−Ｂ−４はさらに詳細にマッピングされ、該領域の大規模な制限地図が得られた（図４を参照）。これは全ての制限部位を含んでいるわけではない。ＹＡＣである８２１−Ｄ−２および８３１−Ｅ−５は同一であり、最小領域（Ｄ１０Ｓ５４１−ＡＦＭ３３７ｘｆ９）にわたっていると思われる。従って、それらは腫瘍制限遺伝子の全てまたは一部を含んでいる。以下の方法を用いて、ＥＳＴ（ＥｘｐｒｅｓｓｅｄＳｅｑｕｅｎｃｅＴａｇ s）を作成し、ゲノム領域に割り当てた。１．注目する組織由来のｃＤＮＡライブラリーを構築する。２．ランダムに個々のクローンを選択し、シングルシークエンシングパスを行い、約２００−３００ｂｐのＤＮＡ配列（１つのＥＳＴ）を得る。３．各々のＥＳＴ由来のプライマーを設計し、分子内断片（発現ＳｅｑｕｅｎｃｅＴａｇｇｅｄＳｉｔｅまたはｅＳＴＳ）をＰＣＲ増幅させる。４．単染色体細胞雑種ＤＮＡ（それぞれが単一のヒト染色体を持っている、ヒト／げっ歯動物細胞雑種由来ＤＮＡ試料のパネル）からＰＣＲ増幅によってＥＳＴを染色体に「結合（Ｂｉｎ）」させる。５．さらに重複するＹＡＣクローンのプールからＰＣＲ増幅により、次いで最終的には個々のＹＡＣに対するＰＣＲ割り当てによってＥＳＴを局在化させる。ＩＭＡＧＥクローン２６４６１１のｃＤＮＡ挿入断片によってコードされたポリペプチドは、クラスリン被覆小胞を介して細胞膜への蛋白質輸送に関係する蛋白質蛋白質である、テンシン(tensin)およびオーキシリン(auxilin)とある類似性を有する。クローンＩＭＡＧＥ２６４６１１のｃＤＮＡ挿入断片に対応する遺伝子は腫瘍抑制遺伝子である。改変した、通常は減少した転写レベルの程度を同定するために、前立腺および他の腫瘍細胞系統由来のＲＮＡのパネルをスクリーニングすることにより、前立腺腫瘍抑制遺伝子または遺伝子群を同定する。該転写物は恐らくは複雑な機能および突然変異の「ｈｉｔｓ」（ＢＲＣＡ１、ＲＢを参照）の能力を失わせるいくつかの部位を有しているであろうから、それは大きいと思われる。交雑種の保存は、遺伝子が基本細胞の「ハウスキーピング」作用を有する良好な指示薬であり、それの欠失は増殖の制御および腫瘍の形成の低下をもたらし得る。該前立腺腫瘍抑制遺伝子ｃＤＮＡは以下のごときに同定される。１つのＹＡＣクローンの一部をプローブとして用いて、放射性標識に次ぐ、直接、前立腺ｃＤＮＡライブラリーをスクリーニングする。（図４の制限地図で印を付けた）最小領域の約７５％にわたる４００ｋｂのＭｌｕ１断片をプローブとして用いる。この断片は、切断に次ぐパルスフィールドゲルから明確に分離可能である。別法として、全２４Ｇ−Ａ１０ＹＡＣがプローブとして用いられる。標準のコロニー／フィルターハイブリダイゼーションアプローチが用いられる。また、適切なＢＡＣまたはＰＡＣクローンを用いてもよい。腫瘍における全コーディング領域の突然変異分析は、該遺伝子が前立腺腫瘍抑制遺伝子であることを示す。これは突然変異のために個々に各々のエキソンを分析することによって行われる。用いられる突然変異分析法は、一本鎖コンホーメーション多型性（ＳＳＣＰ）分析（またはこの技術の改変）および直接ＤＮＡシークエンシングである。該領域内に位置している遺伝子を、ＹＡＣ、ＢＡＣおよびＰＡＣ内に含まれるヒト核酸配列から得られたプローブを持つｃＤＮＡライブラリーのスクリーニングによって、またはエキソントラッピング法によって、またはＹＡＣ、ＢＡＣおよびＰＡＣ内に含まれるヒト核酸配列の配列決定によって同定され、配列決定技術の自動化はこれを定型作業にし、コーディング配列を区別する例えば、ＧＲＡＩＬIIなどのコンピュータープログラムを使用することになる。その結果を、前立腺腫瘍由来の前立腺ＲＮＡまたはｃＤＮＡライブラリーのＲＴ−ＰＣＲによって確認する。該前立腺腫瘍抑制遺伝子または遺伝子群は、正常な前立腺組織中で発現することが判明し、全コーディング領域の突然変異分析は、該遺伝子（群）の発現が正常の前立腺と比較して前立腺腫瘍で変更されており、該遺伝子の産物が蛋白質レベルでトランケートされており、ｍＲＮＡ産物がトランケートされているか、または正常蛋白質と比べてスプライシングが変更されており、その結果異常な蛋白質が生じ、得られた変更された遺伝子によってコードされた蛋白質が組織内で異常な特性または分布を持つ可能性がある。実施例３：核酸の診断上の適用第１０染色体上の特異的領域での染色体の欠失（すなわち１０ｑ２３−ｑ２４境界での腫瘍抑制遺伝子−含有領域）は、欠失を調べるために界面にある細胞で界面蛍光ｉｎｓｉｔｕハイブリダイゼーション（ＦＩＳＨ）を用いて検出する。生検試料由来の細胞をスライドに広げ、細胞膜を透過可能とする。このことによつてｉｎｓｉｔｕハイブリダイゼーションのための試薬が界面染色体を含む細胞に入ることが可能になる。ＢＡＣまたはＰＡＣまたは欠失した領域に特異的な他の適したプローブを、蛍光染料を用いてプローブを標識した後に染色体に対してハイブリダイズさせる。欠失領域を含む染色体はシグナルを示さず、そこで１つの第１０染色体がこの領域から欠失を受けている細胞に由来する染色体は、１つのシグナルのみを示し、２つは示さない。従って、患者からの生検において１０ｑ欠失を検出できる方法を提供する。これらは良性および悪性の過形成との間の腫瘍のグレードの段階の有用な指示薬であり、より積極的な治療体制を着手すべきであることを示し得る。プローブとしての使用に適切なＹＡＣクローンとしては、８２１−Ｄ−２、８３１−Ｅ−５、７９６−Ｄ−５、２４Ｇ−Ａ−１０および７３４−Ｂ−４が挙げられる。注目する領域（物理的な地図を参照）由来のＢＡＣまたはＰＡＣのいずれのクローンを用いもよく、６０Ｃ５および４６Ｂ１２が挙げられる。クローンＩＭＡＧＥ２６４６１１のｃＤＮＡ挿入断片に対応する遺伝子に選択的にハイブリダイズできる核酸を使用することが特に有用である。該遺伝子はそれ自身、またはその適当な大きさの断片は、プローブとして特に適切である。該プローブは、理想的には１０ｋｂと１Ｍｂの間であり、好ましくは６０−２００ｋｂの間である。ＦＩＳＨはBentzら(1994)Leukemia 8(9)，1447-1452に記載されている。（ＢＡＣクローン６０Ｃ５のごとき）ＢＡＣまたはＰＡＣクローンを前立腺組織から単離された細胞核で用いる。凍結組織から細胞核を単離する方法は以下の通りである。凍結組織からの細胞核の抽出（Xiaoら(1995)Am．J．Pathol．147，896-904を応用した）（１）全試料を解凍することなく採取し、凍結組織を２×５×５ｍｍずつにカット。室温で１−３分間解凍。（２）外科用メスの刃の反対を用いて３５ｍｍプラスチックペトリ皿で組織を細かく切り刻む。（３）該皿に０．９％ＮａＣｌｐＨ１．５中の１ｍｌの０．５％ペプシンを添加。１５ｍｌの遠心管に移す。（４）３７℃で１５−３０分間、すなわち、ほとんどの腫瘍の大きな固まりが消えるまで水浴中でインキュベート。（注意かかる時間は腫瘍が解離するのに要する最短時間でなければならない）。５分ごとに攪拌。（５）１４ｍｌのＰＢＳを加え、１５，０００ｒｐｍで５分間遠心分離して細胞核を回収。（６）０．５ｍｌの上清以外は全て吸引により除去。残った上清に細胞核のペレットを再懸濁させる。（７）懸濁液１滴（１０μｌ）を非被覆スライドに塗布。乾燥させて細胞濃度が適当かどうかを決定する前に位相顕微鏡により懸濁液を評価。細胞核が混み合っている場合には、ＰＢＳで懸濁液を希釈。細胞核が希薄である場合には、同じスポットに懸濁液をもう１滴加える。（８）該スライドを風乾。（９）１０％緩衝化ホルマリンに１０分間浸漬。（１０）風乾。（１１）ホットプレート上で５５℃にて２時間燃焼。スライドはこの時点で以下のごとくに保存できる。（７５％、８５％、９５％のエタノール系で各々２分間脱水し、風乾し、スライドを乾燥剤とともに−２０℃で保存し、ＰＢＳ中の残りの核懸濁液を−７０℃で保存。（続くハイブリダイゼーションの質にいかなる影響もなく、それを２度解凍し得る））。（１２）ハイブリダイゼーション前に、ＤＮＡを変性させる必要がある。カバースリップ下７０％ホルムアミド／２×ＳＳＣｐＨ７．０とともに７３℃のホットプレート上に２．５分間スライドを置く。（１３）７０％、９５％および１００％の氷冷エタノール系でそれぞれ３分間脱水し、風乾。ハイブリダイゼーション通常、各々のハイブリダイゼーション事象はスライドの半分を占める。プローブ標識。ＢＡＣまたはＰＡＣクローン（例えば、ＢＡＣクローン６０Ｃ５）を診断プローブとして用いる。全クローンを用いて、標識プローブを作成した。第１０染色体の動原体で配列を認識する市販のクローン、例えばＯｎｃｏｒＤ１０Ｚ１ α−サテライトは、第１０染色体を検出するための対照として用いられる。２つのプローブを、区別できるように異なるように標識する。該プローブは、市販のキット（例えばＢｉｏｎｉｃｋｋｉｔ，ＬｉｆｅＴｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓ）を用いてビオチンまたはジゴキシケニンを用いてニックトランスレーションすることにより標識されるはずである。エッペンドルフ管中で２０ｎｇの標識プローブ＋４μｇＣｏｔ１ＤＮＡ＋２容量エタノールを混合する。２５−３０分間混合物を乾燥する。１１μｌのハイブリダイゼーション混合物（２×ＳＳＣ、５０％ホルムアミド、１０％硫酸デキストラン、１％Ｔｗｅｅｎ２０、ｐＨ７．０）中に再懸濁させる。（同時に２または３のプローブをハイブリダイズしなければならない場合には、１２μｌのハイブリダイゼーション混合物をそれらの間で等分しなければならず（すなわち、２プローブでそれぞれ６μｌのハイブリダイゼーション混合物）、プレアニーリングの段階の後までそれらを一緒にすべきではない）。該プローブを８５℃で５分間変性させる。直ちに数秒間だけ氷上に置く。全ての液体を管の底に行くよう速く回転する。３７℃で３０分間プレアニーリングする（この後に必要であれば２以上のプローブを混合）。プレアニーリングしたプローブをスライドの一方の半分に置き、２２×２２ｍｍのカバースリップで覆う。カバースリップの周りをゴム溶液で封緘する。ハイブリダイゼーション洗浄後（現在の工程は、暗所ですなわち覆いをしたコプリンジャーの中で行われている）。４２℃にて、５０％ホルムアミド、２×ＳＳＣ、ｐＨ７．０中で３×５分。４２℃にて３×５分２×ＳＳＣ、ｐＨ７．０。室温にて１×３分４×ＳＳＣ、０．０５％Ｔｗｅｅｎ２０、ｐＨ７．０（＝ＳＳＣＣＴ）。プローブの検出工程１−ＳＳＣＴＭと共にプレインキュベーションする。２２×５０ｍｍのカバースリップの下、スライド上に１００μｌのＳＳＣＴＭ（＝ＳＳＣＴ＋５％Ｍａｒｖｅｌ＝１０ｍｌｓのＳＳＣＴ＋０．５ｇＭａｒｖｅｌ、固体を除去するため使用前に回転沈降）を置く。３７℃にて１０分間湿潤チャンバー中に置く。ＳＳＣＴ中で３分間洗浄。（注意全ての検出試薬をＳＳＣＴＭで希釈する。）各々の検出工程については、１００μｌの検出試薬を２２×５０ｍｍのカバースリップの下に置き、３７℃で２５−３０分湿潤チャンバー中に置く。各々の工程は次に室温にてＳＳＣＴ中で３×３分洗浄を行う。これらの工程の間、最終工程を除いてコプリンジャーを穏やかに振盪すべきであり、次いでＳＳＣＴ中で１ ×５分洗浄を行い、ＰＢＳ中で２×５分洗浄を行った。次いで、エタノール系（７５％、９５％、１００％で各々２分間）脱水し、風乾する。次いで、対比染色としてＤＡＰＩ４，６−ジアミジノ−２−フェニルインドールを含むサイトフロー(Cytofluor)(UKC ChemLab，Canterbury CT2 7NH，UK)に取り付けた（以下を参照のこと）。二重プローブ検出（２色）工程２は、マウス抗−ジゴキシゲニン(Digoxygenin)ＦＩＴＣ、およびアビジン−テキサスレッド(Avidin-Texas Red)である。工程３は、ウサギ抗−マウスＦＩＴＣ、および抗−アビジン・ビオチン(Avidin Biotin)である。工程４は、抗 −ウサギＦＩＴＣ、アビジン−テキサスレッドである。対比染色は、ＤＡＰＩ（０．１５μｇ／ｍｌ＝５μｌの３０μｌ／ｍｌ保存溶液＋９９５μｌグリセロール（サイトフロー）である。結果正常な前立腺腫瘍細胞では、６０Ｃ５プローブは細胞当たり２シグナル（スポット）を生じる。また、細胞当たり２スポットは第１０染色体の動原体マーカーＤ１０Ｚ１でも見られる。前立腺細胞が、そのプローブの及ぶ領域に欠失を示す６０Ｃ５プローブとのハイブリダイゼーションによって生成したスポットを１つだけ有するか、または全く有しない場合には、該細胞は癌に罹患している。さらに、６０Ｃ５を用いて可視化されたスポットの数が、第１０染色体の動原体マーカーを用いて可視化されたスポットの数よりも少ない場合には、欠失が６０Ｃ５の及ぶ領域中で起こり、該細胞は癌に罹患している。領域内でゲノムクローンを使用して、界面ＦＩＳＨ法を用いることができる。好ましくは、ゲノムＤＮＡは約６０−２００ｋｂである。典型的には、正常な組織は２つのドットを示すが、腫瘍組織は１つのドットを示すかまたは全く示さない、あるいは換言すればいずれの細胞に存在する第１０染色体コピーの数よりも少ないドットを示す。動原体反復配列を用いて、細胞中の第１０染色体の存在を実証される。しかしながら、正常な組織でさえも、１つのシグナル（スポット）だけしか示さない細胞もあるであろう。固体の組織では、典型的には効率は８５％と９５％との間であり、すなわち１００当たり８５−９５の細胞核が２つのシグナルを示す。効率はプローブおよび実験条件の双方に依存するが、経験的にできるだけ最適化できる。影響を受けた組織は、１つのシグナルしか持たない細胞が非常に大きな割合を示す。正常な細胞が混入する試料が存在するので、この割合が１００％に達することはない。それゆえに、これらのアッセイに先立って該細胞の領域を摘出することが望ましい。かくして、要約すると本方法および結果は、（ｉ）患者から組織試料を採取し、組織の影響を受けた領域を摘出／精製し、次いで細胞核を抽出する。（ｉｉ）プローブを検出可能な標識でラベルする。（ｉｉｉ）ハイブリダイズする条件下でプローブを調製した試料と接触させる。（ｉｖ）洗浄によりハイブリダイズしていない過剰のプローブを除去する。（ｖ）ハイブリダイズしたプローブを可視化する。単一の遺伝子座にハイブリダイズしたプローブは、顕微鏡によってシグナル（スポット）として可視化させる。（ｖｉ）影響を受けていない組織では、大多数の細胞が細胞当たり２つのシグナルを示すことがわかる。少数の細胞が、効果のないハイブリダイゼーションによって２つより少ないスポットを示し得る。（ｖｉｉ）影響を受けている組織では、非常に多数の細胞が特定のプローブからの１つのシグナルを示すか、またはシグナルを全く示さないことがわかる。正常な細胞の混入が２つのシグナルを持つと考えられる細胞の割合に影響を及ぼすことが認めらよう。固体腫瘍、神経芽腫のための予後の情報が、関連のないプローブであるが類似したＦＩＳＨ法を用いて、他の研究者によって得られている(Taylorら(1994)Br. J.Cancer 69,445-451)。実施例４：ポリペプチドの検出腫瘍抑制遺伝子産物に向けられたモノクローナル抗体を¹²⁵Ｉで標識する。前立腺の組織試料を調製し、ＳＤＳ−ポリアクリルアミドゲル電気泳動によって蛋白質を分離する。該蛋白質をニトロセルロース膜上にエレクトロブロッティングし、該膜をモノクローナル抗体と共にインキュベートする。腫瘍抑制遺伝子産物の存在を検出する。該産物が存在しないことは前立腺癌に対する罹病性が増加することを示す。実施例５：治療上の適用該腫瘍抑制遺伝子を、適切なレトロウイルスベクターを用いて前立腺癌に対して罹病性を持つ患者に導入する。実施例６：前立腺癌を診断する際のＩＭＡＧＥクローン２６４６１１（およびそれから誘導したプライマーまたはプローブ）の使用クローン２６４６１１（およびそれから誘導したプライマーまたはプローブ）を、ｉｎｓｉｔｕハイブリダイゼーション、ノーザン(Northern)分析（また改変ｍＲＮＡ種プロフィルの検出）または定量的ＲＴ−ＰＣＲによる変更されたｍＲＮＡレベルの検出に用いる。（ｉｎｓｉｔｕハイブリダイゼーション以外の）発現検出法のためには、本質的に純粋な腫瘍組織を用いることが好ましい。ｉｎｓｉｔｕハイブリダイゼーションは固定化組織を用いる。前立腺癌を示す陽性の結果は、癌に罹患していない前立腺組織と比べて発現レベルが変更されていること、または正常な前立腺組織と比べて転写発現のパターンが変更されていることである。また、分析に適切な試料としては、新鮮前立腺組織、前立腺からのまたは転移からの生検針により採集された組織が挙げられる。ＩＭＡＧＥクローン２６４６１１のｃＤＮＡ挿入断片由来のＰＣＲプライマーをＲＴ−ＰＣＲに用い、次いで突然変異検出または蛋白質トランケーションアッセイを行う。前立腺癌を示す結果は、コーディング突然変異、または切断された蛋白質産物の検出である。かくして、この実施例の方法は、前立腺癌の存在を検出するのに有用である。ＩＭＡＧＥ２６４６１１（例えば、図２９ないし３４に示したもの）に対応する遺伝子のイントロン配列に由来するプライマーを用いて、遺伝子エキソンを増幅し、次いで種々の方法（シークエンシング、ＳＳＣＰまたはいずれの形の誤対合検出）によって突然変異を調べるか、または蛋白質トランケーションアッセイに用いられる。適切な試料としては、新鮮前立腺腫瘍組織、血液、尿または精液から回収した前立腺細胞およびパラフィンブロックから回収したＤＮＡが含まれる。この実施例に有用な突然変異を検出するための他の方法としては、ＤＧＧＥ、直接配列決定、誤対合切断、異型接合体分析および化学切断が挙げられる。実施例７：診断の／予後の手段としての異型接合性の欠損（ＬＯＨ）Ｄ１０Ｓ５４１、Ｄ１０Ｓ１７６５（ＡＦＭ３３７ｘｆ９）およびＤ１０Ｓ２１５を用いた異性接合性欠損研究を用いて、Ｄ１０Ｓ５４１−Ｄ１０Ｓ２１５の間隔の欠損を判定する。これらのマーカーは、独特なＤＮＡ配列によってフランクされたタンデムＣＡ反復のブロックからなり、一般的にマイクロサテライトとして知られている。ＣＡ反復の数は、対立遺伝子（異なる染色体の相同体）間の変異を示す。これは、所与の組織中にこれらのマーカーを持つ２つの相同染色体領域を区別するために利用されてよい。（例えば、尿または精液から）生検前立腺ＤＮＡのマイクロサテライトプロフィルを、血液または（例えば、口の洗浄の手段による）頬の細胞から抽出したＤＮＡのものと比較することによって、前立腺組織中のＤ１０Ｓ５４１−Ｄ１０Ｓ２１５の間隔の１つの相同体の欠損が評価できる。この方法は、前立腺の腫瘍性（１つの同族体の欠損）と過形成（欠損なし）とを区別するのに特に有用である。このアプローチの方法論は、実施例１ならびに図１ａで与えられた例および図の凡例中にさらに詳細に記載される。ＰＣＲプライマー配列は以下の通りである。該遺伝子の二重欠失は類似の方法で検出され得る。実施例８：腫瘍抑制遺伝子での突然変異腫瘍由来試料と血液由来試料を比較する、本発明の好ましい核酸における核酸の分析から以下の突然変異が明らかになった。エキソン４（腫瘍２４）中にＴ挿入が存在する。この突然変異はフレームシフトを引き起こし、その結果蛋白質産物への不適当なアミノ酸の組み込みが生じ、続く挿入が起こり、結局はフレーム外の停止コドンと出くわす結果として時機尚早のトランケーションが起こる。（エキソン４の図に記載したイントロンプライマーを用いて）エキソン４のＰＣＲ増幅およびそれに続く標準法を用いたＰＣＲ産物の配列決定に続いて、この突然変異を検出した。表 ^a病期は計数的直腸指診およびボーンスキャンに基づく。^b 世界保健機構(World Health Organization)グレード区分：１．十分に分化２．中程度に分化３．分化に乏しい４．分化の混合^c ＋＝１０ｑ欠失 −＝１０ｑ欠失は検出されずＩＳ＝不安定。カッコ内の数字は、蛍光に基づく分類により判定されたごとくに、対立遺伝子欠失を示すマイクロサテライトマーカーに関するシグナル低下程度の平均を表す。表３遺伝子座ＡＡ００９５１９５１０ｂｐｍＲＮＡＥＳＴ１９９６年７月２９日定義ｚｅ８２ｂ０９．ｒ１Ｓｏａｒｅｓ胎児心臓ＮｂＨＨ１９Ｗホモ・サピエンスｃＤＮＡクローンＳＷ：ＴＥＮＳ＿ＣＨＩＣＫＱ０４２０５テンシン［１］と同一の３６５４６５５’。〔１〕；加入ＡＡ００９５１９ＮＩＤｇ１４７０７１８キーワードＥＳＴ供給源ヒト生物ホモ・サピエンス真核動物(Homo sapiens Eukaryotae)；ミトコンドリア真核生物( mitochondrial eukaryotes)；後生動物(Metazoa)；脊索動物(Chordata)：脊椎動物(Vertebrata)；正獣類(Eutheria)；霊長類(Primates)；狭鼻猿類(Catarrhini) ：ヒト上科(Hominidae)；ヒト(Homo)。参照１（１ないし５１０塩基）著者 H illier，L.，Clark，N.，Dubuque，T.，Elliston，K.，Hawkins,M.，Holman，M. ，Hultman，M.，Kucaba，T.，Le，M.，Lennon，G.，Harra，M.，Parsons，J.，R ifkin，L.，Rohlfing，T.，Soares，M.，Tan，F.，Trevaskis，E.，Water ston ，R.，Williamson，A.，Wohldmann，P.およびWilson，R. 標題 The WashU-Mer ck EST Project 定期刊行物未刊行（１９９５年）注釈連絡先：Wilson R K WashU-Herck EST project Washington University School of Hedicine 4444 Forest Park Parkway，Box 8501，St．Louis，MO 63108 Tel:314 286 1800 Fa x:314 286 1810 Email:est@watson.wustl.edu このクローンはＬＬＮＬを通じて特許使用料無しで入手できる。さらなる情報についてはIMAGE Consortium(info@image.llnl.gov)に連絡のこと。配列プライマー：ｍｏｂ．ＲＥＧＡ＋ＥＴ高級配列停止剤：３３１特性位置決定／定性供給源１．．５１０／生物＝「ホモ・サピエンス」／注記＝「器官：心臓；ベクター；修飾ポリリンカーを持つｐＴ７Ｔ３Ｄ（Pharmacia）；部位１：ＮｏｔＩ；部位２：ＥｃｏＲＩ；第一鎖ｃＤＮＡはＮｏｔＩ−オリゴ（ｄＴ）プライマーを用いて合成し、二本鎖ｃＤＮＡは、サイズを選択し、ＥｃｏＲＩアダプター(P harmacia)に連結し、ＮｏｔＩで切断し、次いで修飾ｐＴ７Ｔ３Ｄ(Pharmacia) ベクターのＮｏｔＩおよびＥｃｏＲＩ部位にクローン化した。ライブラリーはＣｏｔ＝５に対して標準化工程を１回経た。M．Fatima Bonaldoによって構築されたライブラリー。このライブラリーは胎児肺ライブラリー、Ｓｏａｒｅｓ胎児肺ＮｂＨＬ１９Ｗと同一の胎児から構築された。／クローン＝「３６５４６５」／クローンライブラリー＝「Ｓｏａｒｅｓ胎児心臓ＮｂＨＨ１９Ｗ」／性＝「未知」／発育ステージ＝「１９週」／実験室宿主＝「ＤＨ１０Ｂ（アンピシリン耐性）」ｍＲＮＡ＜１．．＞５１０塩基総数５１０１６２ａ９２ｃ１０８ｇ１４３ｔ５他起源ＡＡ００９５１９長さ：５１０１９９６年９月１０日１９：０３タイプ：Ｎチェック：３３８５表４遺伝子座ＡＡ００９５２０４１４ｂｐｍＲＮＡＥＳＴ１９９６年７月２９日定義ｚｅ８２ｂ０９．ｓ１Ｓｏａｒｅｓ胎児心臓ＮｂＨＨ１９Ｗホモ・サピエンスｃＤＮＡクローン３６５４６５３’。加入ＡＡ００９５２０ＮＩＤｇ１４７０７１９キーワードＥＳＴ供給源ヒト生物ホモ・サピエンス真核動物(Homo sapiens Eukaryotae)；ミトコンドリア真核生物(mitochondrial eukaryotes)；後生動物(Metazoa)；脊索動物(Chordata)：脊椎動物(Vertebrata)；正獣類(Eutheria)；霊長類(Primates)；狭鼻猿類(Catarrhini)：ヒト上科(Hominidae)；ヒト(Homo)。参照１（１ないし４１４塩基）著者 Hillier，L.，Clark，N.，Dubuque，T.，Elliston，K.，H awkins,M.，Holman，M.，Hultman，M.，Kucaba，T.，Le，M.，Lennon，G.，Marr a，M.，Parsons，J.，Rifkin，L.，Rohlfing，T.，Soares，M.，Tan，F.，Treva skis，E.，Waterston，R.，Williamson，A.，Wohldmann，P.およびWilson，R．標題The WashU-Merck EST Project 定期刊行物未刊行（１９９５年）注釈連絡先：Wilson RK WashU-Merck EST project Washington University School of Medicine 4444 Forest Park Parkway，Box 8501，St．Louis，MO 63108 Te l:314 286 1800 Fax:314 286 1810 Email:est@watson.wustl.edu このクローンはＬＬＮＬを通じて特許使用料無しで入手できる。さらなる情報についてはIMAGE Consortium(info@image.llnl.gov)に連絡のこと。配列プライマー：ｍｏｂ．ＲＥＧＡ＋ＥＴ高級配列停止剤：３１７特性位置決定／定性供給源１．．４１４／生物＝「ホモ・サピエンス」／注記＝「器官：心臓；ベクター；修飾ポリリンカーを持つｐＴ７Ｔ３Ｄ(Pharmacia)；部位１：ＮｏｔＩ；部位２：ＥｃｏＲＩ；第一鎖ｃＤＮＡはＮｏｔＩ−オリゴ（ｄＴ）プライマーを用いて合成し、二本鎖ｃＤＮＡは、サイズを選択し、ＥｃｏＲＩアダプター(P harmacia)に連結し、ＮｏｔＩで切断し、次いで修飾ｐＴ７Ｔ３Ｄ(Pharmacia)ベクターのＮｏｔＩおよびＥｃｏＲＩ部位にクローン化した。ライブラリーはＣｏｔ＝５に対して標準化工程を１回経た。M．Fatima Bonaldoによって構築されたライブラリー。このライブラリーは胎児肺ライブラリー、Ｓｏａｒｅｓ胎児肺ＮｂＨＬ１９Ｗと同一の胎児から構築された。／クローン＝「３６５４６５」／クローンライブラリー＝「Ｓｏａｒｅｓ胎児心臓ＮｂＨＨ１９Ｗ」／性＝「未知」／発育ステージ＝「１９週」／実験室宿主＝「ＤＨ１０Ｂ（アンピシリン耐性）」ｍＲＮＡ補体（＜１．．＞４１４）塩基総数１０４ａ７１ｃ７２ｇ１６５ｔ２他起源ＡＡ００９５２０長さ：４１４１９９６年９月１０日１９：０５タイプ：Ｎチェック：５３７６表５遺伝子座ＡＡ０１７５６３２４１ｂｐｍＲＮＡＥＳＴ１９９６年８月２日定義ｚｅ３９ｅ０４．ｓ１Ｓｏａｒｅｓ網膜Ｎ２ｂ４ＨＲホモ・サピエンスｃＤＮＡクローン３６１３７４３’。加入ＡＡ０１７５６３ＮＩＤｇ１４７９７１６キーワードＥＳＴ供給源ヒト生物ホモ・サピエンス真核動物(Homo sapiens Eukaryotae)；ミトコンドリア真核生物(mitochondrial eukaryotes)；後生動物(Metazoa)；脊索動物(Chordata)：脊椎動物(Vertebrata)；正獣類(Eutheria)；霊長類(Primates)；狭鼻猿類(Catarrhini)：ヒト上科(Hominidae)；ヒト(Homo)。参照１（１ないし２４１塩基）著者 Hillier，L.，Clark，N.，Dubuque，T.，Elliston，K.，H awkins,M.，Holman，M.，Hultman，M.，Kucaba，T.，Le，M.，Lennon，G.，Marr a，M.，Parsons，J.，Rifkin，L.，Rohlfing，T.，Soares，M.，Tan，F.，Treva skis，E.，Waterston，R.，Williamson，A.，Wohldmann，P.およびWilson，R．標題 The WashU-Merck EST Project 定期刊行物未刊行（１９９５年）注釈連絡先：Wilson RK WashU-Merck EST project Washington University Scho ol of Medicine 4444 Forest Park Parkway，Box 8501，St．Louis，MO 63108 Tel:314 286 1800 Fax:314 286 1810 Email:est@watson.wustl.edu このクローンはＬＬＮＬを通じて特許使用料無しで入手できる。さらなる情報についてはIMAGE Consortium(info@image.llnl.gov)に連絡のこと。逆位可能クローン：ｐｏｌｙＴは認められない配列プライマー：Ａｍｅｒｓｈａｍから− ４０Ｍ１３前方高級配列停止剤：１６６特性位置決定／定性供給源１．．２４１／生物＝「ホモ・サピエンス」／注記＝「器官：目；ベクター；修飾ポリリンカーを持つｐＴ７Ｔ３Ｄ（Pharmacia）；部位１：ＮｏｔＩ：部位２：ＥｃｏＲＩ；第一鎖ｃＤＮＡはＮｏｔＩ−オリゴ（ｄＴ）プライマーを用いて合成し、二本鎖ｃＤＮＡは、サイズを選択し、ＥｃｏＲＩアダプター(P harmacia)に連結し、ＮｏｔＩで切断し、次いで修飾ｐＴ７Ｔ３Ｄ(Pharmacia)ベクターのＮｏｔＩおよびＥｃｏＲＩ部位にクローン化した。網膜は５５歳のコーカシカ人男性から得、次いで全細胞ｐｏｌｙ（Ａ）＋ＲＮＡを摘出後６時間抽出した。該網膜ＲＮＡは厚意によりトロント大学からRoderick R．McInnes M.D.． Ph.D.によって提供された。Bento SoaresおよびM．Fatima Bonaldoによって構築されたライブラリー」／クローン＝「３６１３７４」／クローンライブラリー＝「Ｓｏａｒｅｓ網膜Ｎ２ｂ４ＨＲ」／性＝「男性」／組織種＝「網膜」／発育ステージ＝「５５歳」／実験室宿主＝「ＤＨ１０Ｂ（アンピシリン耐性）」ｍＲＮＡ補体（＜１．．＞２４１）塩基総数３１ａ８４ｃ８２ｇ３７ｔ７他起源ＡＡ０１７５６３長さ：２４１１９９６年９月１０日１９：１２タイプ：Ｎチェック：７６９７表６遺伝子座Ｃ０１０８４８４ｂｐＤＮＡＥＳＴ１９９６年７月１１日定義ＨＵＭＧＳ０００７７４１、Human Gene Signature、３’一方向ｃＤＮＡ配列加入Ｃ０１０８４ＮＩＤｇ１４３３３１４キーワード Gene Signa ture；ＧＳ；ＥＳＴ（発現配列標識）；BodyMap；遺伝子発現。供給源１以上のヒト成体組織。生物ホモ・サピエンス真核動物(Homo sapiens Eukaryotae) ；ミトコンドリア真核生物(mitochondrial eukaryotes)；後生動物(Metazoa)；脊索動物(Chordata)：脊椎動物(Vertebrata)；正獣類(Eutheria)；霊長類(Prima tes)；狭鼻猿類(Catarrhini)：ヒト上科(Hominidae)；ヒト(Homo)。参照１（１ないし８４塩基）著者 Okubo，K．標題 Direct Submission 定期刊行物ＤＤＢＪ／ＥＭＬＢ／ＧｅｎＢａｎｋデータベースへ提出（１９９５年１１月２８日）。Kousaku Okubo,大阪大学分子細胞生物学研究所日本〒５６５大阪府吹田市山田丘１−３（E-mail:kousaku@imcb.osaka-u.ac.jp，Tel:06-877-5111(e x.3315)Fax:06-877-1922）参照２（１ないし８４塩基）著者 Okubo．K．標題ＢｏｄｙＭａｐ；ヒト遺伝子発現データベース定期刊行物未刊行（１９９５年）注記我々は１９９３年以来ＤＤＢＪに対して同一のｃＤＮＡを余分には提出していない。このライブラリー並びに他の３’方向ライブラリーにおけるこの配列を持つクローンの十分な情報については、http://www.imcb.osaka-u. ac.jp/bodymapを参照のこと。また、このＧＳ配列で表されるクローンの配列もそこに示されている。特性位置決定／定性供給源１．．８４／生物＝「ホモ・サピエンス」塩基総数３８ａ１２ｃ１１ｇ２２ｔ１他起源Ｃ０１０８４長さ：８４１９９６年９月１０日１９：１２タイプ：Ｎチェック：５８７６表７遺伝子座Ｈ９２０３８４２７ｂｐｍＲＮＡＥＳＴ１９９５年１１月２９日定義ｙｓ８２ｅ１２．ｒ１ホモ・サピエンスｃＤＮＡクローン２２１３２６５’。加入Ｈ９２０３８ＮＩＤｇ１０８７６１６キーワードＥＳＴ供給源ヒトクローン＝２２１３２６プライマー＝Ｍ１３ＲＰ１ライブラリー＝Ｓｏａｒｅｓ網膜Ｎ２ｂ４ＨＲベクター＝修飾ポリリンカーを持つｐＴ７Ｔ３Ｄ(Pharmacia) 宿主＝ＤＨ１０Ｂ（アンピシリン耐性）Ｒ部位１＝ＮｏｔＩＲ部位２＝ＥｃｏＲＩ第一鎖ｃＤＮＡはーオリゴ（ｄＴ）プライマーを用いて合成し、二本鎖ｃＤＮＡは、サイズを選択し、ＥｃｏＲＩアダプター(P harmacia)に連結し、ＮｏｔＩで切断し、次いで修飾ｐＴ７Ｔ３Ｄ(Pharmacia)ベクターのＮｏｔＩおよびＥｃｏＲＩ部位にクローン化した。網膜は５５歳のコーカシカ人男性から得、次いで全細胞ｐｏｌｙ（Ａ）＋ＲＮＡを摘出後６時間抽出した。該網膜ＲＮＡは厚意によりトロント大学からRoderick R．McInnes M.D.． Ph.D.によって提供された。Bento SoaresおよびM．Fatima Bonaldoによって構築されたライブラリー」生物ホモ・サピエンス真核動物(Homo sapiens Eukary otae)；ミトコンドリア真核生物(mitochondrial eukaryotes)；後生動物(Metazo a)；真正後生動物(Eumetazoa)；左右相称動物(Bilateria)：体腔動物(Coelomata )；新口動物(Deuterostomia)；脊索動物(Chordata)：脊椎動物(Vertebrata)；顎口類(Gnathostomata)；硬骨魚類(Osteichthyes)；肉鰭亜綱(Sarcopterygii)；コアナータ(Choanata)；四足類(Tetrapoda)；羊膜類(Amniota)；哺乳類(Mammalia) ；真獣亜綱(Theria)；正獣類(Eutheria)；霊長類(Primates)；狭鼻猿類(Catarrh ini)：ヒト上科(Hominidae)；ヒト(Homo)。参照１（１ないし４２７塩基）著者 Hillier，L.，Clark，N.，Dubuque，T.，Elliston，K.，Hawkins,M.，Holma n，M.，Hultman，M.，Kucaba，T.，Le，M.，Lennon，G.，Marra，M.，Parsons， J.，Rifkin，L.，Rohlfing，T.，Soares，M.，Tan，F.，Trevaskis，E.，Waters ton，R.，Williamson，A.，Wohldmann，P.およびWilson，R．標題 The WashU-M erck EST Project 定期刊行物未刊行（１９９５年）注記連絡先：Wilson RK WashU-Merck EST project Washington University School of Medicine 4444 Fo rest Park Parkway，Box 8501，St．Louis，MO 63108 Tel:314 286 1800 Fax: 314 286 1810 Email:est@watson.wustl.edu 高級配列停止剤：３３０供給源 IMAGE Consortium，LLNL このクローンはＬＬＮＬを通じて特許使用料無しで入手できる。さらなる情報についてはIMAGE Consortium(info@image.llnl.gov)に連絡のこと。特性位置決定／定性供給源１．．４２７／生物＝「ホモ・サピエンス」／クローン＝「２２１３２６」ｍＲＮＡ＜１．．＞４２７塩基総数１０３ａ７５ｃ１１６ｇ１２９ｔ４他起源Ｈ９２０３８長さ：４２７１９９６年９月１０日１９：０６タイプ：Ｎチェック：６１６８表８遺伝子座Ｈ９２０３９１１７ｂｐｍＲＮＡＥＳＴ１９９５年１１月２９日定義ｙｓ８２ｅ１２．ｓ１ホモ・サピエンスｃＤＮＡクローン２２１３２６３’。加入Ｈ９２０３９ＮＩＤｇ１０８７６１７キーワードＥＳＴ供給源ヒトクローン＝２２１３２６プライマー＝プロメガ−２１ｍ１３ライブラリー＝Ｓｏａｒｅｓ網膜Ｎ２ｂ４ＨＲベクター＝修飾ポリリンカーを持つｐＴ７Ｔ３Ｄ(Pharmacia) 宿主＝ＤＨ１０Ｂ（アンピシリン耐性）Ｒ部位１＝ＮｏｔＩＲ部位２＝ＥｃｏＲＩ第一鎖ｃＤＮＡは−オリゴ（ｄＴ）プライマーを用いて合成し、二本鎖ｃＤＮＡは、サイズを選択し、ＥｃｏＲＩアダプター(P harmacia)に連結し、ＮｏｔＩで切断し、次いで修飾ｐＴ７Ｔ３Ｄ(Pharmacia)ベクターのＮｏｔＩおよびＥｃｏＲＩ部位にクローン化した。網膜は５５歳のコーカシカ人男性から得、次いで全細胞ｐｏｌｙ（Ａ）＋ＲＮＡを摘出後６時間抽出した。該網膜ＲＮＡは厚意によりトロント大学からRoderick R．McInnes M.D.． Ph.D.によって提供された。Bento SoaresおよびM．Fatima Bonaldoによって構築されたライブラリー」生物ホモ・サピエンス真核動物(Homo sapiens Eukary otae)；後生動物(Metazoa)；真正後生動物(Eumetazoa)；左右相称動物(Bilateri a)：体腔動物(Coelomata)；新口動物(Deuterostomia)；脊索動物(Chordata)：脊椎動物(Vertebrata)；顎口類(Gnathostomata)；硬骨魚類(Osteichthyes)；肉鰭亜綱(Sarcopterygii)；コアナータ(Choanata)；四足類(Tetrapoda)；羊膜類(Amn iota)；哺乳類(Mammalia)；真獣亜綱(Theria)；正獣類(Eutheria)；アーコンタ( Arconta)；霊長類(Primates)；狭鼻猿類(Catarrhini)：ヒト上科(Hominidae)；ヒト(Homo)。参照１（１ないし１１７塩基）著者 Hillier，L.，Clark，N.， Dubuque，T.，Elliston，K.，Hawkins，M.，Holman，M.，Hultman，M.，Kucaba ，T.，Le，M.，Lennon，G.，Marra，M.，Parsons，J.，Rifkin，L.，Rohlfing， T.，Soares，M.，Tan，F.，Trevaskis，E.，Waterston，R.，Williamson，A.，W ohldmann，P.およびWilson，R．標題 The WashU-Merck EST Project 定期刊行物未刊行（１９９５年）注記連絡先：Wilson RK WashU-Merck EST project Wa shington University School of Medicine 4444 Forest Park Parkway，Box 850 1，St．Louis，MO 63108 Tel:314 286 1800 Fax:314 286 1810 Email:est@wa tson.wustl.edu 高級配列停止剤：１０４供給源 IMAGE Consortium，LLNL このクローンはＬＬＮＬを通じて特許使用料無しで入手できる。さらなる情報についてはIMAGE Consortium(info@image.llnl.gov)に連絡のこと。可能性ある逆位クローン：ｐｏｌｙ（Ａ）は認められない。特性位置決定／定性供給源１．．１１７／生物＝「ホモ・サピエンス」／クローン＝「２２１３２６」ｍＲＮＡ＜１．．＞１１７塩基総数１６ａ４４ｃ３７ｇ１９ｔ１他起源Ｈ９２０３９長さ：１１７１９９６年９月１０日１９：１２タイプ：Ｎチェック：５５７７表９遺伝子座Ｎ２０２３８３２２ｂｐｍＲＮＡＥＳＴ１９９５年１２月１８日定義ｙｘ４４ｆ０６．ｓ１ホモ・サピエンスｃＤＮＡクローン２６４６１１３’。加入Ｎ２０２３８ＮＩＤｇ１１２５１９３キーワードＥＳＴ供給源ヒトクローン＝２６４６１１プライマー＝ｍ１３ −４０前向きライブラリー＝Ｓｏａｒｅｓメラニン細胞２ＮｂＨＭベクター＝修飾ポリリンカーを持つｐＴ７Ｔ３Ｄ(Pharmacia) 宿主＝ＤＨ１０Ｂ（アンビシリン耐性）Ｒ部位１＝ＮｏｔＩＲ部位２＝ＥｃｏＲＩ雄第一鎖ｃＤＮＡは−オリゴ（ｄＴ）プライマーを用いて合成し、二本鎖ｃＤＮＡは、サイズを選択し、ＥｃｏＲＩアダプター(P harmacia)に連結し、ＮｏｔＩで切断し、次いで修飾ｐＴ７Ｔ３Ｄ(Pharmacia)ベクターのＮｏｔＩおよびＥｃｏＲＩ部位にクローン化した。Bento Soaresおよび M．Fatima Bonaldoによって構築されたライブラリー。正常包皮メラニン細胞由来ＲＮＡ（ＦＳ３７４）は、厚意によりDr.Anthony P.によって提供された。アルビノ。生物ホモ・サピエンス真核動物(Homo sapiens Eukaryotae)；後生動物(Metazoa)；真正後生動物(Eumetazoa)；左右相称動物(Bilateria)：体腔動物(Coelomata)；新口動物(Deuterostomia)；脊索動物(Chordata)：脊椎動物(Ver tebrata)；顎口類(Gnathostomata)；硬骨魚類(Osteichthyes)；肉鰭亜綱(Sarcop terygii)；コアナータ(Choanata)；四足類(Tetrapoda)；羊膜類(Amniota)；哺乳類(Mammalia)；真獣亜綱(Theria)；正獣類(Eutheria)；アーコンタ(Arconta)；霊長類(Primates)；狭鼻猿類(Catarrhini)：ヒト上科(Hominidae)；ヒト(Homo) 。参照１（１ないし３２２塩基）著者 Hillier，L.，Clark，N.，Dubuque，T .，Elliston，K.，Hawkins，M.，Holman，M.，Hultman，M.，Kucaba，T.，Le，M .，Lennon，G.，Marra，M.，Parsons，J.，Rifkin，L.，Rohlfing，T.，Soares ，M.，Tan，F.，Trevaskis，E.，Waterston，R.，Williamson，A.，Wohldmann， P.およびWilson，R．標題 The WashU-Merck EST Project 定期刊行物未刊行（１９９５年）注記連絡先：Wilson RK WashU-Merck EST project Washingt on Univers ity School of Medicine 4444 Forest Park Parkway，Box 8501，St．Louis，MO 63108 Tel:314 286 1800 Fax:314 286 1810 Email:est@watson.wustl.edu 高級配列停止剤：２０９供給源：IMAGE Consortium，LLNL このクローンはＬＬＮＬを通じて特許使用料無しで入手できる。さらなる情報についてはIMAGE Co nsortium(info@image.llnl.gov)に連絡のこと。可能性ある逆位クローン：ｐｏｌｙ（Ａ）は認められない。特性位置決定／定性供給源１．．３２２／生物＝「ホモ・サピエンス」／クローン＝「２６４６１１」ｍＲＮＡ＜１．．＞３２２塩基総数４９ａ１１２ｃ９８ｇ５７ｔ６他起源Ｎ２０２３８長さ：３２２１９９６年９月１０日１９：０７タイプ：Ｎチェック：７２４９表１０遺伝子座Ｎ２９３０４４２７ｂｐｍＲＮＡＥＳＴ１９９６年１月４日記載ｙｘ４４ｆ０６．ｒ１ホモ・サピエンスｃＤＮＡクローン２６４６１１５’。加入Ｎ２９３０４ＮＩＤｇ１１４７５４０キーワードＥＳＴ供給源ヒトクローン＝２６４６１１プライマー＝Ｔ７ライブラリー＝Ｓｏａｒｅｓメラニン細胞２ＮｂＨＭベクター＝修飾ポリリンカーを持つｐＴ７Ｔ３Ｄ(Pharmacia) 宿主＝ＤＨ１０Ｂ（アンビシリン耐性）Ｒ部位１＝ＮｏｔＩＲ部位２＝ＥｃｏＲＩ雄第一鎖ｃＤＮＡは−オリゴ（ｄＴ）プライマーを用いて合成し、二本鎖ｃＤＮＡは、サイズを選択し、ＥｃｏＲＩアダプター(P harmacia)に連結し、ＮｏｔＩで切断し、次いで修飾ｐＴ７Ｔ３(Pharmacia)ベクターのＮｏｔＩおよびＥｃｏＲＩ部位にクローン化した。Bento SoaresおよびM ．Fatima Bonaldoによって構築されたライブラリー。正常包皮メラニン細胞由来ＲＮＡ（ＦＳ３７４）は、厚意によりDr.Anthony P.によって提供された。アルビノ。生物ホモ・サピエンス真核動物(Homo sapiens Eukaryotae)；後生動物(Metazoa)；真正後生動物(Eumetazoa)；左右相称動物(Bilateria)：体腔動物( Coelomata)；新口動物(Deuterostomia)；脊索動物(Chordata)：脊椎動物(Verteb rata)；顎口類(Gnathostomata)；硬骨魚類(Osteichthyes)；肉鰭亜綱(Sarcopter ygii)；コアナータ(Choanata)；四足類(Tetrapoda)；羊膜類(Amniota)；哺乳類( Mammalia)；真獣亜綱(Theria)；正獣類(Eutheria)；アーコンタ(Arconta)；霊長類(Primates)；狭鼻猿類(Catarrhini）：ヒト上科(Hominidae)；ヒト(Homo)。参照１（１ないし４２７塩基）著者 Hillier，L.，Clark，N.，Dubuque，T.，E lliston，K.，Hawkins，M.，Holman，M.，Hultman，M.，Kucaba，T.，Le，M.，L ennon，G.，Marra，M.，Parsons，J.，Rifkin，L.，Rohlfing，T.，Soares，M. ，Tan，F.，Trevaskis，E.，Waterston，R.，Williamson，A.，Wohldmann，P.およびWilson，R．標題 The WashU-Merck EST Project 定期刊行物未刊行（１９９５年）注記連絡先：Wilson RK WashU-Merck EST project Washington U niversity School of Medicine 4444 Forest Park Parkway，Box 8501，St．Lou is，MO 631 08 Tel:314 286 1800 Fax:314 286 1810 Email:est@watson.wustl.edu 高級配列停止剤：３７０供給源：IMAGE Consortium，LLNL このクローンはＬＬＮＬを通じて特許使用料無しで入手できる。さらなる情報についてはIMAGE Consor tium(info@image.llnl.gov)に連絡のこと。可能性ある逆位クローン：ｐｏｌｙ（Ａ）は認められない。特性位置決定／定性供給源１．．４２７／生物＝「ホモ・サピエンス」／クローン＝「２６４６１１」ｍＲＮＡ＜１．．＞４２７塩基総数１１６ａ９０ｃ７９ｇ１４０ｔ２他起源Ｎ２９３０４長さ：４２７１９９６年９月１０日１９：０４タイプ：Ｎチェック：９５０８表１１遺伝子座Ｎ３５３８９４３７ｂｐｍＲＮＡＥＳＴ１９９６年１月１６日定義ｙｙ２３ｅ０３．s１ホモ・サピエンスｃＤＮＡクローン２７２０９２３’。加入Ｎ３５３８９ＮＩＤｇ１１５６５３１キーワードＥＳＴ供給源ヒトクローン＝２７２０９２プライマー＝ｍ１３ −４０前向きライブラリー＝Ｓｏａｒｅｓメラニン細胞２ＮｂＨＭベクター＝修飾ポリリンカーを持つｐＴ７Ｔ３Ｄ(Pharmacia) 宿主＝ＤＨ１０Ｂ（アンピシリン耐性）Ｒ部位１＝ＮｏｔＩＲ部位２＝ＥｃｏＲＩ雄第一鎖ｃＤＮＡは−オリゴ（ｄＴ）プライマーを用いて合成し、二本鎖ｃＤＮＡは、サイズを選択し、ＥｃｏＲＩアダプター(P harmacia)に連結し、ＮｏｔＩで切断し、次いで修飾ｐＴ７Ｔ３Ｄ(Pharmacia)ベクターのＮｏｔＩおよびＥｃｏＲＩ部位にクローン化した。Bento Soaresおよび M．Fatima Bonaldoによって構築されたライブラリー。正常包皮メラニン細胞由来ＲＮＡ（ＦＳ３７４）は、厚意によりDr.Anthony P.によって提供された。」アルビノ。生物ホモ・サピエンス真核動物(Homo sapiens Eukaryotae)；後生動物(Metazoa)；真正後生動物(Eumetazoa)；左右相称動物(Bilateria)：体腔動物(Coelomata)；新口動物(Deuterostomia)；脊索動物(Chordata)：脊椎動物(V ertebrata)；顎口類(Gnathostomata)；硬骨魚類(Osteichthyes)；肉鰭亜綱(Sarc opterygii)；コアナータ(Choanata)；四足類(Tetrapoda)；羊膜類(Amniota)；哺乳類(Mammalia)；真獣亜綱(Theria)；正獣類(Eutheria)；アーコンタ(Arconta) ；霊長類(Primates)；狭鼻猿類(Catarrhini）：ヒト上科(Hominidae)；ヒト(Hom o)。参照１（１ないし４３７塩基）著者 Hillier，L.，Clark，N.，Dubuque ，T.，Elliston，K.，Hawkins，M.，Holman，M.，Hultman，M.，Kucaba，T.，Le ，M.，Lennon，G.，Marra，M.，Parsons，J.，Rifkin，L.，Rohlfing，T.，Soar es，M.，Tan，F.，Trevaskis，E.，Waterston，R.，Williamson，A.，Wohldmann ，P.およびWilson，R．標題 The WashU-Merck EST Project 定期刊行物未刊行（１９９５年）注記連絡先：Wilson RK WashU-Merck EST project Washin gton Univers ity School of Medicine 4444 Forest Park Parkway，Box 8501，St．Louis，MO 63108 Tel:314 286 1800 Fax:314 286 1810 Email:est@watson.wustl.edu 高級配列停止剤：３１１供給源：IMAGE Consortium，LLNL このクローンはＬＬＮＬを通じて特許使用料無しで入手できる。さらなる情報についてはIMAGE Co nsortium(info@image.llnl.gov)に連絡のこと。特性位置決定／定性供給源１．．４３７／生物＝「ホモ・サピエンス」／クローン＝「２７２０９２」ｍＲＮＡ＜１．．＞４３７塩基総数１０８ａ７９ｃ７８ｇ１６６ｔ６他起源Ｎ３５３８９長さ：４３７１９９６年９月１０日１９：０４タイプ：Ｎチェック：９８０３表１２遺伝子座Ｎ４８０３０３７２ｂｐｍＲＮＡＥＳＴ１９９６年２月１４日定義ｙｙ２３ｅ０３．ｒ１ホモ・サピエンスｃＤＮＡクローンＳＷ：ＴＥＮＳ＿ＣＨＩＣＫＱ０４２０５テンシン［１］と同一の２７２０９２５’。加入Ｎ４８０３０ＮＩＤｇ１１８９１９６キーワードＥＳＴ供給源ヒトクローン＝２７２０９２プライマー＝Ｔ７ライブラリー＝Ｓｏａｒｅｓメラニン細胞２ＮｂＨＭベクター＝修飾ポリリンカーを持つｐＴ７Ｔ３Ｄ（アンピシリン耐性）宿主＝ＤＨ１０ＢＲ部位１＝ＮｏｔＩＲ部位２＝ＥｃｏＲＩ雄第一鎖ｃＤＮＡはーオリゴ（ｄＴ）プライマーを用いて合成し、二本鎖ｃＤＮＡは、サイズを選択し、ＥｃｏＲＩアダプター(P harmacia)に連結し、ＮｏｔＩで切断し、次いで修飾ｐＴ７Ｔ３Ｄ(Pharmacia)ベクターのＮｏｔＩおよびＥｃｏＲＩ部位にクローン化した。Bento Soaresおよび M．Fatima Bonaldoによって構築されたライブラリー。正常包皮メラニン細胞由来ＲＮＡ（ＦＳ３７４）は、厚意によりDr.Anthony P.によって提供された。」アルビノ。生物ホモ・サピエンス真核動物(Homo sapiens Eukaryotae)；後生動物(Metazoa)；真正後生動物(Eumetazoa)；左右相称動物(Bilateria)：体腔動物(Coelomata)；新口動物(Deuterostomia)；脊索動物(Chordata)：脊椎動物(V ertebrata)；顎口類(Gnathostomata)；硬骨魚類(Osteichthyes)；肉鰭亜綱(Sarc opterygii)；コアナータ(Choanata)；四足類(Tetrapoda)；羊膜類(Amniota)；哺乳類(Mammalia)；真獣亜綱(Theria)；正獣類(Eutheria)；アーコンタ(Arconta) ；霊長類(Primates)；狭鼻猿類(Catarrhini)：ヒト上科(Hominidae)；ヒト(Homo )。参照１（１ないし３７２塩基）著者 Hillier，L.，Clark，N.，Dubuque， T.，Elliston，K.，Hawkins，M.，Holman，M.，Hultman，M.，Kucaba，T.，Le， M.，Lennon，G.，Marra，M.，Parsons，J.，Rifkin，L.，Rohlfing，T.，Soares ，M.，Tan，F.，Trevaskis，E.，Waterston，R.，Williamson，A.，Wohldmann， P.およびWilson，R．標題 The WashU-Merck EST Project 定期刊行物未刊行（１９９５年）注記連絡先：Wilson RK WashU-Merck EST project Washingt on Univers ity School of Medicine 4444 Forest Park Parkway，Box 8501，St．Louis，MO 63108 Tel:314 286 1800 Fax:314 286 1810 Email:est@watson.wustl.edu 高級配列停止剤：３１１供給源：IMAGE Consortium，LLNL このクローンはＬＬＮＬを通じて特許使用料無しで入手できる。さらなる情報についてはIMAGE Co nsortium(info@image.llnl.gov)に連絡のこと。特性位置決定／定性供給源１．．３７２／生物＝「ホモ・サピエンス」／クローン＝「２７２０９２」ｍＲＮＡ＜１．．＞３７２塩基総数１２２ａ６７ｃ７６ｇ１０１ｔ６他起源Ｎ４８０３０長さ：３７２１９９６年９月１０日１９：０６タイプ：Ｎチェック：６０７１表１３遺伝子座Ｒ０６７６３４７４ｂｐｍＲＮＡＥＳＴ１９９５年４月３日記載ｙｆ１１ｅ０３．ｓ１ホモ・サピエンスｃＤＮＡクローン１２６５５６３’。加入Ｒ０６７６３ＮＩＤｇ７５７３８３キーワードＥＳＴ供給源ヒトクローン＝１２６５５６ライブラリー＝Ｓｏａｒｅｓ胎児肝臓脾臓ＩＮＦＬＳベクター＝修飾ポリリンカーを持つｐＴ７Ｔ３Ｄ(Pharmacia) 宿主＝ＤＨ１０Ｂ（アンピシリン耐性）プライマー＝ＳＰ６Ｒ部位１＝ＰａｃＩＲ部位２＝ＥｃｏＲＩ妊娠２０週齢の雄胎児からの肝臓および脾臓第一鎖ｃＤＮＡはＰａｃＩ−オリゴ（ｄＴ）プライマーを用いて合成し、二本鎖ｃＤＮＡは、サイズを選択し、ＥｃｏＲＩアダプター(P harmacia)に連結し、ＰａｃＩで切断し、次いで修飾ｐＴ７Ｔ３ベクターのＰａｃＩおよびＥｃｏＲＩ部位にクローン化した。１度標準化されたライブラリー。 Bento SoaresおよびM．Fatima Bonaldoによって構築されたライブラリー。生物ホモ・サピエンス真核動物(Homo sapiens Eukaryotae)；後生動物(Metazoa)；脊索動物(Chordata)：脊椎動物(Vertebrata)；顎口類(Gnathostomata)；哺乳類( Mammalia)；正獣類(Eutheria)；霊長類(Primates)；狭鼻猿類(Catarrhini)：ヒト上科(Hominidae)；ヒト(Homo)。参照１（１ないし４７４塩基）著者 Hilli er，L.，Clark，N.，Dubuque，T.，Elliston，K.，Hawkins，M.，Holman，M.，H ultman，M.，Kucaba，T.，Le，M.，Lennon，G.，Marra，M.，Parsons，J.，Rifk in，L.，Rohlfing，T.，Soares，M.，Tan，F.，Trevaskis，E.，Waterston，R. ，Williamson，A.，Wohldmann，P.およびWilson，R．標題 The WashU-Merck ES T Project 定期刊行物未刊行（１９９５年）注記連絡先：Wilson RK Was hU-Merck EST project Washington University School of Medicine 4444 Fores t Park Parkway，Box 8501，St．Louis，MO 63108 Tel:314 286 1800 Fax:314 286 1810 Email:est@watson.wustl.edu 高級配列停止剤：１０８供給源：I MAGE Consortium，LLNL このクローンはＬＬＮＬを通じて特許使用料無しで入手できる。さらなる情報についてはIMAGE Consortium(info@image.llnl.gov)に連絡のこと。特性位置決定／定性供給源１．．４７４／生物＝「ホモ・サピエンス」／クローン＝「１２６５５６」塩基総数１０８ａ８１ｃ８９ｇ１９０ｔ６他起源Ｒ０６７６３長さ：４７４１９９６年９月１０日１９：０４タイプ：Ｎチェック：６７８９表１４遺伝子座Ｒ０６８１４４２９ｂｐｍＲＮＡＥＳＴ１９９５年４月３日記載ｙｆ１１ｅ０３．ｒ１ホモ・サピエンスｃＤＮＡクローン１２６５５６５’。加入Ｒ０６８１４ＮＩＤｇ７５７４３４キーワードＥＳＴ供給源ヒトクローン＝１２６５５６ライブラリー＝Ｓｏａｒｅｓ胎児肝臓脾臓ＩＮＦＬＳベクター＝修飾ポリリンカーを持つｐＴ７Ｔ３Ｄ(Pharmacia) 宿主＝ＤＨ１０Ｂ（アンピシリン耐性）プライマー＝Ｍ１３ＲＰ１Ｒ部位１＝ＰａｃＩＲ部位２＝ＥｃｏＲＩ妊娠２０週齢の雄胎児からの肝臓および脾臓第一鎖ｃＤＮＡはＰａｃＩ−オリゴ（ｄＴ）プライマーを用いて合成し、二本鎖ｃＤＮＡは、ＥｃｏＲＩアダプター(Pharmacia)に連結し、ＰａｃＩで切断し、次いで修飾ｐＴ７Ｔ３ベクターのＰａｃＩおよびＥｃｏＲＩ部位にクローン化した。１度標準化されたライブラリー。Bento SoaresおよびM．Fatima Bonaldoによって構築されたライブラリー。生物ホモ・サピエンス真核動物(Homo sapiens Eukaryotae)；後生動物(Metazoa)；脊索動物(Chord ata)：脊椎動物(Vertebrata)；顎口類(Gnathostomata)；哺乳類(Hammalia)；正獣類(Eutheria)；霊長類(Primates)；狭鼻猿類(Catarrhini)：ヒト上科(Hominid ae)；ヒト(Homo)。参照１（１ないし４２９塩基）著者 Hillier，L.，Clark ，N.，Dubuque，T.，Elliston，K.，Hawkins，M.，Holman，M.，Hultman，M.，K ucaba，T.，Le，M.，Lennon，G.，Marra，M.，Parsons，J.，Rifkin，L.，Rohlf ing，T.，Soares，M.，Tan，F.，Trevaskis，E.，Waterston，R.，Williamson， A.，Wohldmann，P.およびWilson，R．標題 The WashU-Merck EST Project 定期刊行物未刊行（１９９５年）注記連絡先：Wilson RK WashU-Merck EST project Washington University School of Medicine 4444 Forest Park Parkwa y，Box 8501，St．Louis，MO 63108 Tel:314 286 1800 Fax:314 286 1810 Em ail:est@watson.wustl.edu 高級配列停止剤：３０７供給源：IMAGE Consorti um，LLNL このクローンはＬＬＮＬを通じて特許使用料無しで入手できる。さらなる情報についてはIMAGE Consortium(info@image.llnl.gov)に連絡のこと。特性位置決定／定性供給源１．．４２９／生物＝「ホモ・サピエンス」／クローン＝「１２６５５６」塩基総数１１４ａ７３ｃ６５ｇ１７６ｔ１他起源Ｒ０６８１４長さ：４２９１９９６年９月１０日１９：１６タイプ：Ｎチェック：８８９表１５遺伝子座Ｒ２９４５７２２４ｂｐｍＲＮＡＥＳＴ１９９５年４月２５日記載Ｆ１−５７８Ｄ２２週齢ヒト胎児肝臓ホモ・サピエンスｃＤＮＡクローンＦ１−５７８Ｄ５’。加入Ｒ２９４５７ＮＩＤｇ１５１１８６５キーワードＥＳＴ供給源ヒト生物ホモ・サピエンス真核動物(Homo sapiens Eukaryotae)；ミトコンドリア真核生物(mitochondrial eukaryotes)；後生動物(Metazoa)；脊索動物(Chordata)：脊椎動物(Vertebrata)；正獣類(Euth eria)；霊長類(Primates)；狭鼻猿類(Catarrhini)：ヒト上科(Hominidae)；ヒト (Homo)。参照１（１ないし２２４塩基）著者 Choi，S．S.，Yun，J.W.，Choi ，E．K.，Cho，Y．G.，Sung，Y.C.およびShin，H．-S．標題 Construction of a gene expression profile of a human fetal liver by single-pass cDNA seq uencing 定期刊行物未刊行（１９９５年）注記連絡先：Hee-Sup Shin De velopmental Genetics Pohang Institute of Science & Tecnology San31．Hyoj adong Pohang,790-784 Republic of Korea Tel:562-279-2291 Fax:562-279-2199 Email:shinhs@vision.postech.ac.kr Ｓｅｑプライマー：Ｔ３プライマー特性位置決定／定性供給源１．．２２４／生物＝「ホモ・サピエンス」／注記＝「ベクター：ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔII ＳＫ（−）；部位１：ＥｃｏＲＩ；部位２：ＸｈｏＩ；ｃＤＮＡライブラリーはプライマー化オリゴ−ｄＴによって作成され、次いで５’ＥｘｏＲＩ−ＸｈｏＩ３’部位の間で指向的にクローン化された。」／クローン＝「Ｆ１−５７８Ｄ」／クローンライブラリー＝「２２週齢ヒト胎児肝臓ｃＤＮＡライブラリー」／実験室宿主＝「ＸＬ１− ｂｌｕｅＭＲＦ’」ｍＲＮＡ＜１．．＞２２４塩基総数４５ａ７８ｃ６７ｇ３４ｔ起源Ｒ２９４５７長さ：２２４１９９６年９月１０日１９：１１タイプ：Ｎチェック：１０４６表１６遺伝子座Ｔ０５１５７２６６ｂｐｍＲＮＡＥＳＴ１９９３年６月３０日記載ＥＳＴ０３０４５ホモ・サピエンスｃＤＮＡクローンＨＦＢＣＳ４２。加入Ｔ０５１５７ＮＩＤｇ３１６３０９キーワードＥＳＴ供給源ヒトクローン＝ＨＦＢＣＳ４２ライブラリー＝胎児脳？（ｃａｔ＃９３６２０６）ベクター＝ＬａｍｂｄａＺＡＰ−II ブライマー＝Ｍ１３−２１１７−１８週妊娠、雌；オリゴ−ｄＴ＋ランダムプライムドｃＤＮＡ合成；ＬａｍｂｄａＺＡＰ−IIベクター、１．０ｋｂ平均挿入サイズ。生物ホモ・サピエンス真核動物(Homo sapiens Eukaryotae)；動物界(Animalia)；脊索動物(Ch ordata)：脊椎動物(Vertebrata)；哺乳類(Mammalia)；獣亜綱(Theria)；正獣類( Eutheria)；ハプローヒニ(Haplorhihi)；狭鼻猿類(Catarrhini)：ヒト上科(Homi nidae)。参照１（１ないし２６６塩基）著者 Adams，M．D.，Kerlavage，A． R.，Fields，C.およびVenter，J．C．標題３４００発現配列標識は、ヒト脳由来転写物の多様性を識別する定期刊行物 Nature Genet．4，256-267(1993) 注記連絡先：Adams,MD The Institute for Genomic Reserch 932 Cloper Road ，Gaithersburg，MD 20878 Tel:3018699056 Fax:3018699423 Email:mdadams@ti gr.org．特性位置決定／定性供給源１．．２６６／生物＝「ホモ・サピエンス」／クローン＝「ＨＦＢＣＳ４２」塩基総数９５ａ４４ｃ５７ｇ６９ｔ１他起源Ｔ０５１５７長さ：２６６１９９６年９月１０日１９：０６タイプ：Ｎチェック：４３９８表１７遺伝子座Ｔ６０２１４３６９ｂｐｍＲＮＡＥＳＴ１９９５年２月９日記載ｙｃ２２ｃ０７．ｒ１ホモ・サピエンスｃＤＮＡクローン８１４２０５’。加入Ｔ６０２１４ＮＩＤｇ６６２０５１キーワードＥＳＴ供給源ヒトクローン＝８１４２０ライブラリー＝Ｓｔｒａｔａｇｅｎｅ肺（＃９３７２１０）ベクター＝ｐＢｌｕｅｓｃｒｉｐｔＳＫ− 宿主＝ＳＯＬＲ細胞（カナマイシン耐性）プライマー＝Ｍ１３ＲＰ１Ｒ部位１＝ＥｃｏＲＩＲ部位２＝ＸｈｏＩ７２歳男性からの正常肺組織一方向的にクローン化。プライマー：オリゴｄＴ平均挿入サイズ：．１．０ｋｂ；Ｕｎｉ−ＺＡＰＸＲベクター：５’アダプター配列：３’アダプター配列：生物ホモ・サピエンス真核動物(Homo sapiens Eukaryotae)；後生動物(Meta zoa)；脊索動物(Chordata)：脊椎動物(Vertebrata)；顎口類(Gnathostomata)；哺乳類(Mammalia)；正獣類(Eutheria)；霊長類(Primates)；狭鼻猿類(Catarrhin i)：ヒト上科(Hominidae)；ヒト(Homo)。参照１（１ないし３９６塩基）著者 Hillier，L.，Clark，N.，Dubuque，T.，Elliston，K.，Hawkins，M.，Holman ，M.，Hultman，M.，Kucaba，T.，Le，M.，Lennon，G.，Marra，M.，Parsons，J .，Rifkin，L.，Rohlfing，T.，Soares，M.，Tan，F.，Trevaskis，E.，Waterst on，R.，Williamson，A.，Wohldmann，P.およびWilson，R．標題 The WashU-Me rck EST Project 定期刊行物未刊行（１９９５年）注記連絡先：Wilson RK WashU-Merck EST project Washington University School of Medicine 4444 Forest Park Parkway，Box 8501，St．Louis，MO 63108 Tel:314 286 1800 F ax:314 286 1810 Email:est@watson.wustl.edu 高級配列停止剤：２４２供給源：IMAGE Consortium，LLNL このクローンはＬＬＮＬを通じて特許使用料無しで入手できる。さらなる情報についてはIMAGE Consortium(info@image.llnl.g ov)に連絡のこと。特性位置決定／定性供給源１．．３９６／生物＝「ホモ・サピエンス」／クローン＝「８１４２０」塩基総数１１９ａ７５ｃ７４ｇ１２６ｔ２他起源Ｔ６０２１４長さ：３９６１９９６年９月１０日１９：０７タイプ：Ｎチェック：５１３４表１８遺伝子座Ｗ２３６５６４５１ｂｐｍＲＮＡＥＳＴ１９９５年５月６日記載ｚｂ４６ｃ０５．ｒ１Ｓｏａｒｅｓ胎児肺ＮｂＨＬ１９Ｗホモ・サピエンスｃＤＮＡクローン３０６６３２５’。加入Ｗ２３６５６ＮＩＤｇ１３００４７１キーワードＥＳＴ供給源ヒト生物ホモ・サピエンス真核動物(Homo sapiens Eukaryotae)；ミトコンドリア真核生物(mitochondrial eukaryotes)；後生動物(Metazoa)；脊索動物(Chordata)：脊椎動物(Vertebrata) ；正獣類(Eutheria)；霊長類(Primates)；狭鼻猿類(Catarrhini)：ヒト上科(Hom inidae)；ヒト(Homo)。参照１（１ないし４５１塩基）著者 Hillier，L.，Cl ark，N.，Dubuque，T.，Elliston，K.，Hawkins，M.，Holman，M.，Hultman，M. ，Kucaba，T.，Le，M.，Lennon，G.，Marra，M.，Parsons，J.，Rifkin，L.，Ro hlfing，T.，Soares，M.，Tan，F.，Trevaskis，E.，Waterston，R.，Williamso n，A.，Wohldmann，P.およびWilson，R．標題 The WashU-Merck EST Project 定期刊行物未刊行（１９９５年）注記連絡先：Wilson RK WashU-Merck ES T project Washington University School of Medicine 4444 Forest Park Park way，Box 8501，St．Louis，MO 63108 Tel:314 286 1800 Fax:314 286 1810 Email:est@watson.wustl.edu このクローンはＬＬＮＬを通じて特許使用料無しで入手できる。さらなる情報についてはIMAGE Consortium(info@image.llnl.gov )に連絡のこと。Ｓｅｑプライマー：ｍｏｂ．ＲＥＧＡ＋ＥＴ高級配列停止剤：２４０特性位置決定／定性供給源１．．４５１／生物＝「ホモ・サピエンス」／ノート＝「オルガン？：肺；ベクター：修飾ポリリンカーを持つｐＴ７Ｔ３Ｄ(Pharmacia)；部位１：ＮｏｔＩ；部位２：ＥｃｏＲＩ：第一鎖ｃＤＮＡはＮｏｔＩ−オリゴ（ｄＴ）プライマーを用いて合成し、二本鎖ｃＤＮＡは、サイズを選択し、ＥｃｏＲＩアダプター(P harmacia)に連結し、ＮｏｔＩで切断し、次いで修飾ｐＴ７Ｔ３ベクター(Pharma cia)のＮｏｔＩおよびＥｃｏＲＩ部位にクローン化した。Ｃｏｔ＝５に１度標準化されたライブラリー。Bento SoaresおよびM．Fatima Bonaldoによって構築されたラィブラリー。このライブラリーは胎児肺ライブラリー、Ｓｏａｒｅｓ胎児心臓ＮｂＨＨ１９Ｗと同一の胎児から構築された。」／クローン＝「３０６６３２」／クローンライブラリー＝「Ｓｏａｒｅｓ胎児肺ＮｂＨＬ１９Ｗ」／発育ステージ＝「１９週」／実験室宿主＝「ＤＨ１０Ｂ（アンピシリン酎性）」ｍＲＮＡ＜１．．＞４５１塩基総数１４８ａ７６ｃ８２ｇ１４１ｔ４他起源Ｗ２３６５６長さ：４５１１９９６年９月１０日１９：１０タイプ：Ｎチェック：６９６１表１９遺伝子座Ｗ２７５３３９０２ｂｐｍＲＮＡＥＳＴ１９９６年５月８日定義ランダムにホモ・サピエンスｃＤＮＡサブライブラリーを合成開始する３２ｂ２ヒト網膜ｃＤＮＡ。加入Ｗ２７５３３ＮＩＤｇ１３０７３３７キーワードＥＳＴ供給源ヒト。生物ホモ・サピエンス真核動物(Homo sa piens Eukaryotae)；ミトコンドリア真核生物(mitochondrial eukaryotes)；後生動物(Metazoa)；脊索動物(Chordata)：脊椎動物(Vertebrata)；正獣類(Euther ia)；霊長類(Primates)；狭鼻猿類(Catarrhini)：ヒト上科(Hominidae)；ヒト(H omo)。参照１（１ないし９０２塩基）著者 Macke，J.，Smallwood，P.およびNathans，J．標題成体ヒト網膜ｃＤＮＡ定期刊行物未刊行（１９９６年）注記連絡先：Dr．Jeremy Nathans Dr.Jeremy Nathans，Dept．of Molec ular Biology and Genetics Johns Hopkins School of Medicine 725 North Wo lfe Street，Baltimore，MD 21205 Tel:410 9554 678 Fax:410 614 0827 Ema il:jeremy_nathans@qmail.bs.jhu.edu このライブラリー由来のクローンは入手できない。ＰＣＲプライマー前向き：後ろ向き：配列プライマー：特性位置決定／定性供給源１．．９０２／生物＝「ホモ・サピエンス」／注記＝「器官：目；ベクター：ラムダｇｔ１０；部位１：ＥｃｏＲＩ；部位２：ＥｃｏＲＩ；配列決定に用いられたライブラリーは、ヒト網膜ｃＤＮＡライブラリー由来のサブライブラリーである。網膜ｃＤＮＡライブラリーＤＮＡ由来の挿入断片を単離し、ランダムにプライマー合成し、ＰＣＲ増幅し、サイズ選択し、次いでラムダｇｔ１０へクローン化した。個々のプラークを配置し、ＰＣＲ増幅のための鋳型として用い、次いでこれらのＰＣＲ産物を配列決定のために用いた。」／性＝「混合（男性および女性）」／組織種＝「網膜」／発育ステージ＝「成人」／実験室宿主＝「Ｅ．ｃｏｌｉＫ８９２株」ｍＲＮＡ＜１．．＞９０２塩基総数１２４ａ１１０ｃ１１７ｇ１３１ｔ４２０他起源Ｗ２７５３３長さ：９０２１９９６年９月１０日１９：０５タイプ：Ｎチェック：２２４表２０遺伝子座Ｗ３０６８４６０１ｂｐｍＲＮＡＥＳＴ１９９６年５月９日定義ｚｂ７７ｂ１１．r1 Ｓｏａｒｅｓ老化繊維芽細胞ＮｂＨＳＦホモ・サピエンスｃＤＮＡクローン３０９５９７５’。加入Ｗ３０６８４ＮＩＤｇ１３１１８７０キーワードＥＳＴ供給源ヒト。生物ホモ・サピエンス真核動物(Homo sapiens Eukaryotae)；ミトコンドリア真核生物(mitochondria l eukaryotes)；後生動物(Metazoa)；脊索動物(Chordata)：脊椎動物(Vertebrat a)；正獣類(Eutheria)；霊長類(Primates)；狭鼻猿類(Catarrhini)：ヒト上科(H ominidae)；ヒト(Homo)。参照１（１ないし６０１塩基）著者 Hillier，L. ，Clark，N.，Dubuque，T.，Elliston，K.，Hawkins，M.，Holman，M.，Hultman ，M.，Kucaba，T.，Le，M.，Lennon，G.，Marra，M.，Parsons，J.，Rifkin，L. ，Rohlfing，T.，Soares，M.，Tan，F.，Trevaskis，E.，Waterston，R.，Willi amson，A.，Wohldmann，P.およびWilson，R．標題 The WashU-Merck EST Proje ct 定期刊行物未刊行（１９９５年）注記連絡先：Wilson RK WashU-Merc k EST project Washington University School of Medicine 4444 Forest Park Parkway，Box 8501，St．Louis，MO 63108 Tel:314 286 1800 Fax:314 286 18 10 Email:est@watson.wustl.edu このクローンはＬＬＮＬを通じて特許使用料無しで入手できる。さらなる情報についてはIMAGE Consortium(info@image.llnl .gov)に連絡のこと。配列プライマー：ｍｏｂ．ＲＥＧＡ＋ＥＴ高級配列停止剤：４６３。特性位置決定／定性供給源１．．６０１／生物＝「ホモ・サピエンス」／注記＝「ベクター：修飾ポリリンカーを持つｐＴ７Ｔ３Ｄ(P harmacia) Ｖタイプ：ファージミド；部位１：ＮｏｔＩ；部位２：ＥｃｏＲＩ；二本鎖ｃＤＮＡは、サイズを選択し、ＥｃｏＲＩアダプター(Pharmacia)に連結し、ＮｏｔＩで切断し、次いで修飾ｐＴ７Ｔ３Ｄ(Pharmacia)ベクターのＮｏｔＩおよびＥｃｏＲＩ部位にクローン化した。ライブラリーはＣｏｔ＝５に対して標準化工程を１回経た。Bento SoaresおよびM．Fatima Bonaldoによって構築されたライブラリー。」／クローン＝「３０９５９７」／クローンライブラリー＝「Ｓｏａｒｅｓ老化繊維芽細胞ＮｂＨＳＦ」実験室宿主＝「ＤＨ１０Ｂ（アンピシリン耐性）」ｍＲＮＡ＜１．．＞６０１塩基総数１７６ａ１０５ｃ１２２ｇ１９７ｔ１他起源Ｗ３０６８４長さ：６０１１９９６年９月１０日１９：１３タイプ：Ｎチェック：２３２０表２１遺伝子座Ｗ８１０２６４５３ｂｐｍＲＮＡＥＳＴ１９９６年６月２６日定義ｚｄ８４ａ０７．ｒ１Ｓｏａｒｅｓ胎児心臓ＮｂＨＨ１９Ｗホモ・サピエンスｃＤＮＡクローン３４７３１６５’。加入Ｗ８１０２６ＮＩＤｇ１３９２０６０キーワードＥＳＴ供給源ヒト。生物ホモ・サピエンス真核動物(Homo sapiens Eukaryotae)；ミトコンドリア真核生物(mitoch ondrial eukaryotes)；後生動物(Metazoa)；脊索動物(Chordata)：脊椎動物(Ver tebrata)；正獣類(Eutheria)；霊長類(Primates)；狭鼻猿類(Catarrhini)：ヒト上科(Hominidae)；ヒト(Homo)。参照１（１ないし４５３塩基）著者 Hilli er，L.，Clark，N.，Dubuque，T.，Elliston，K.，Hawkins，M.，Holman，M.，H ultman，M.，Kucaba，T.，Le，M.，Lennon，G.，Marra，M.，Parsons，J.，Rifk in，L.，Rohlfing，T.，Soares，M.，Tan，F.，Trevaskis，E.，Waterston，R. ，Williamson，A.，Wohldmann，P.およびWilson，R．標題 The WashU-Merck ES T Project 定期刊行物未刊行（１９９５年）注記連絡先：Wilson RK Was hU-Merck EST project Washington University School of Medicine 4444 Fores t Park Parkway，Box 8501，St．Louis，MO 63108 Tel:314 286 1800 Fax:314 286 1810 Email:est@watson.wustl.edu このクローンはＬＬＮＬを通じて特許使用料無しで入手できる。さらなる情報についてはIMAGE Consortium（info@i mage.llnl.gov)に連絡のこと。配列プライマー：moｂ．ＲＥＧＡ＋ＥＴ高級配列停止剤：３９２。特性位置決定／定性供給源１．．４５３／生物＝「ホモ・サピエンス」／注記＝「器官：心臓；ベクター：修飾ポリリンカーを持つｐＴ７Ｔ３Ｄ(Pharmacia)；部位１：ＮｏｔＩ；部位２：ＥｃｏＲＩ；第一鎖ｃＤＮＡはＮｏｔＩ−オリゴ（ｄＴ）プライマーを用いて合成し、二本鎖ｃＤＮＡは、サイズを選択し、ＥｃｏＲＩアダプター(P harmacia)に連結し、ＮｏｔＩで切断し、次いで修飾ｐＴ７Ｔ３Ｄ(Pharmacia)ベクターのＮｏｔＩおよびＥｃｏＲＩ部位にクローン化した。ライブラリーはＣｏｔ＝５に対して標準化工程を１回経た。Bento SoaresおよびM．Fatima Bonaldo によって構築されたライブラリー。このライブラリーは、胎児肺ライブラリーであるＳｏａｒｅｓ胎児肺ＮｂＨＬ１９Ｗと同様の胎児から構築された。」／クローン＝「３４７３１６」／クローンライブラリー＝「Ｓｏａｒｅｓ胎見心臓ＮｂＨＨ１９Ｗ」実験室宿主＝「ＤＨ１０Ｂ（アンピシリン耐性）」ｍＲＮＡ補体＜１．．＞４５３塩基総数１９０ａ７７ｃ７９ｇ１０６ｔ１他起源Ｗ８１０２６長さ：４５３１９９６年９月１０日１９：０３タイプ：Ｎチェック：２９５３表２２遺伝子座Ｗ８１０６２４２９ｂｐｍＲＮＡＥＳＴ１９９６年６月２６日定義ｚｄ８４ａ０７．ｓ１Ｓｏａｒｅｓ胎児心臓ＮｂＨＨ１９Ｗホモ・サピエンスｃＤＮＡクローン３４７３１６３’。加入Ｗ８１０６２ＮＩＤｇ１３９２１１４キーワードＥＳＴ供給源ヒト。生物ホモ・サピエンス真核動物(Homo sapiens Eukaryotae)；ミトコンドリア真核生物(mitoch ondrial eukaryotes)；後生動物(Metazoa)；脊索動物(Chordata)：脊椎動物(Ver tebrata)；正獣類(Eutheria)；霊長類(Primates)；狭鼻猿類(Catarrhini)：ヒト上科(Hominidae)；ヒト(Homo)。参照１（１ないし４２９塩基）著者 Hilli er，L.，Clark，N.，Dubuque，T.，Elliston，K.，Hawkins，M.，Holman，M.，H ultman，M.，Kucaba，T.，Le，M.，Lennon，G.，Marra，M.，Parsons，J.，Rifk in，L.，Rohlfing，T.，Soares，M.，Tan，F.，Trevaskis，E.，Waterston，R. ，Williamson，A.，Wohldmann，P.およびWilson，R．標題 The WashU-Merck ES T Project 定期刊行物未刊行（１９９５年）注記連絡先：Wilson RK Was hU-Merck EST project Washington University School of Medicine 4444 Fores t Park Parkway，Box 8501，St．Louis，MO 63108 Tel:314 286 1800 Fax:314 286 1810 Email:est@watson.wustl.edu このクローンはＬＬＮＬを通じて特許使用料無しで入手できる。さらなる情報についてはIMAGE Consortium(info@im age.llnl.gov)に連絡のこと。配列プライマー：ｍｏｂ．ＲＥＧＡ＋ＥＴ高級配列停止剤：３２４。特性位置決定／定性供給源１．．４２９／生物＝「ホモ・サピエンス」／注記＝「器官：心臓；ベクター：修飾ポリリンカーを持つｐＴ７Ｔ３Ｄ(Pharmacia)；部位１：ＮｏｔＩ；部位２：ＥｃｏＲＩ；第一鎖ｃＤＮＡはＮｏｔＩ−オリゴ（ｄＴ）プライマーを用いて合成し、二本鎖ｃＤＮＡは、サイズを選択し、ＥｃｏＲＩアダプター(P harmacia)に連結し、ＮｏｔＩで切断し、次いで修飾ｐＴ７Ｔ３Ｄ(Pharmacia)ベクターのＮｏｔＩおよびＥｃｏＲＩ部位にクローン化した。ライブラリーはＣｏｔ＝５に対して標準化工程を１回経た。Bento SoaresおよびM．Fatima Bonaldo によって構築されたライブラリー。このライブラリーは、胎児肺ライブラリーであるＳｏａｒｅｓ胎児肺ＮｂＨＬ１９Ｗと同様の胎児から構築された。」／クローン＝「３４７３１６」／クローンライブラリー＝「Ｓｏａｒｅｓ胎児心臓ＮｂＨＨ１９Ｗ」実験室宿主＝「ＤＨ１０Ｂ（アンピシリン耐性）」ｍＲＮＡ補体＜１．．＞４２９塩基総数１０５ａ８３ｃ７７ｇ１６１ｔ３他起源Ｗ８１０６２長さ：４２９１９９６年９月１０日１９：０５タイプ：Ｎチェック：７３５９引用文献 DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION Diagnosis and treatment of cancer susceptibility The present invention relates to a method for determining whether a subject has cancer or is susceptible to cancer. The present invention relates to a method of treating cancer, in particular prostate cancer. Prostate cancer has become the most serious disease in many countries. Inglan De and Wales have doubled their mortality rate over the last two decades and are now Mortality Statistics: Cause England and W ales. OPCS DH2 19, 1993, Her Majesty's Stationery Office). England And in Wales, the incidence of prostate cancer has increased by 28% in the last decade and is now The disease accounts for 12% of all cancer patients (Cancer Statistics: Registrations England and Wales. (OPCS MBI No 22,1994, Her Majesty's Stationery Office) . The recent deaths of many public figures due to this increase and prostate cancer have It helps to emphasize what should be done about. Broader script It is believed that the application of training can limit mortality due to prostate cancer. Current prostate cancer screening includes digital rectal exam and prostate-specific antibodies (PS A) It consists of level measurement. These lack specificity as a digital rectal exam Method has considerable non-negligible inter-inspector variability (Smith and Catalona (1995) Urology 45, 70-74), and PSA levels were benign prostatic hyperplasia (BPH), It is also elevated in prostate inflammation and other situations. Ph: over 22,000 predictive studies 366 diagnosed with prostate cancer while in the ysiciants Health Study As a test, significant errors in PSA were found. PSA level until start of study Measured in stored serum, elevated levels will develop prostate cancer within the next four years It was found in only 47% of affected individuals (Gann et al. (1995) JAMA 273, 289-294). Therefore, current screening is not sufficient. Cytogenetic and allelic deletion studies may be involved in prostate cancer It points to many chromosomal regions. Cannon-Aibright and Eeles (1995) Nature Genetics 9, 336-338 (Reference 1) describes human chromosomal sites 3p, 7q, 8p, 9 q, 10p, 10q, 11p, 13q, 16q, 17p, 18q and Y Of tumor suppressor prostate cancer susceptibility loci from heterozygous deficiency (LOH) studies The complement region is considered, while Brothman et al. (1990) Cancer Res. 50 3795-3803 is the chromosome arm Of chromosomes 1, 2, 5 and Y with rearrangements involving 2p, 7q and 10q Deletions and increases in 7, 14, 20, and 22 indicate that the increase is most common. The cytogenetic information in prostate cancer was reviewed. Gao et al. (1994) Oncogene 9, 299 Studies with 9-3003 show that chromosomes 3p, 5q, 6p, 7p, 8p, At least one of 10q, 11p, 13q, 16q, 17p, 18q and Xq One showed a positive mutagenic phenotype and was also reported by Massenkeil et al. 4) Anticancer Res. 14 (6B), 2785-2790 shows 8p and 17p of various prostate cancer samples. , 18q show LOH, but 10q of 14 beneficial prostate cancers show no deletion It was not detected. Zenklusen et al. (1994) Cancer Res. 54, 6370-63 73 indicates that 7q31.1 has a potential tumor suppressor gene. Further Other reports have described other chromosomal deletions or abnormalities. Thus, most human chromosome deletions or abnormalities have been ruled out by some researchers. Or by other researchers, has been linked to prostate cancer. Many tumors show a clear deletion at the 10q23-q25 site (2,3), Indicates that a tumor suppressor gene is present in this region. Myc tumor Mxil, which encodes a negative regulator of the protein and is present at 10q25, It has been reported as a candidate for a suppressor gene (4), and has recently been implicated in many prostate tumors. Mutations that cause the loss of ability of Mxil have been reported. Mxil for prostate cancer In some cases exhibit allelic deletions and mutations, It is concluded that it may contribute to the pathogenesis of malignant disease or tumor development (5). An object of the present invention is to diagnose cancer and determine the susceptibility to cancer, especially prostate cancer. Providing better methods for providing nucleic acids useful in such methods, Another object is to provide a tumor suppressor gene involved in prostate cancer.Summary of the Invention The present inventors have developed a fluorescence-based microsatellite CA that provides much information. Detailed spamming 10q23 using allelotype analysis using repeat markers Create a deletion map spanning -q25, which allows deletion of the 10q region to Could be more rigorously defined as likely to be involved. In addition, the inventors To elucidate the role of this gene in the development of prostate tumors, The frequency of Mxil deletions and mutations in E. coli was assessed. Our data show that in the overwhelming majority (22/23) of tumors showing deletions Tumor suppressor gene (or gene group) near the 10q23-q24 boundary deleted by Indicates that there is. On the other hand, other 10q23-q25 regions or all regions Specific deletion of Mxil was only observed in 1/23 tumors And the deletion of the marker at the 10q23-q24 boundary. In addition, in those tumors that show marker deletions involving Mxil, all single-stranded By conformational polymorphism (SSCP) analysis or direct DNA sequencing. As a result, none of the mutations in Mxil could be detected and our data indicate that il is 20 centiMorgans away from the region of chromosome 10 identified by the inventors. It indicates that there is. We found that all tumors with a 10q deletion It was found to have deletions in the characterized region. In a first aspect of the present invention, the nucleic acid is 746-yeast artificial chromosome (YAC). H-8, 821-D-2, 831-E-5, 921-F-8, 738-B-12 796-D-5, 829-E-1, 678-F-1, 839-B-1, 734. -B-4, 7B-F12, 757-D-8, 773-C-2, 787-D-7, 831-E-9, 855-D-2, 855-G-4, 876-G-11, 894 -H-5, 922-E-6, 934-D-3, 964-A-8, 968-E-6 Or 24G-A10, and the expression described in Tables 3-22 Neither of the sequence tags (ESTs), and the bacterial artificial chromosome (BAC) or B2F20, P40F10, P72G8, which are P1-derived artificial chromosomes (PAC), P74N2, P274D21, B76I10, B79A19, B7901, B9 3F12, B122L22, P201J8, P201P5, P209K3, P3 16N14, B46B12, B60C5, B145C22, B150K4, B1 50N3, not B181F15 or 188L22, Ma By the DNA defined by the markers D10S541 and D10S215 Provide nucleic acids that can selectively hybridize to the region of human chromosome 10 to be bound Offer. Various markers on human chromosome 10, including D10S541 and D10S215 The positions of the markers are as defined in FIG. We show these ESTs In some cases, the sequences disclosed in the cited tables are derived, more particularly from which the sequences are derived. Means the specific cDNA clone to be derived. “Selectively hybridizes” means that the nucleic acid is under moderate or high stringency conditions. Has a nucleic acid sequence sufficiently similar to the chromosome 10 DNA capable of hybridizing with Means that. As is known in the art, nucleic acid hybridization The shrinkage is the length of the nucleic acid on which hybridization occurs, Factors such as the degree of sequence identity, as well as temperature, ionic strength and CG of the sequence. Or it depends on factors such as AT content. The nucleic acid capable of selectively hybridizing to the chromosome 10 DNA is at least the nucleic acid. Has> 95% sequence identity over its nucleic acid portion along with chromosome 10 DNA Nucleic acids, preferably> 98%, more preferably> 99% sequence identity Including things. As is known, the human gene is usually, for example, the chromosome 10 DN. A is not completely identical to A over its entire length, but is selected in the chromosome 10 region. In the chromosome 10 DNA, which is considered to be a nucleic acid capable of hybridizing Includes introns such as mRNA or cDNA derived from the gene. Selective Typical moderate or high stringency conditions resulting in hybridization are known in the art. For example, Molecular Cloning, a laboratory manual, 2nd edition, Sambr ook et al. (eds.), Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY , USA. The nucleic acid is immobilized on a nylon membrane, and the probe nucleic acid is ≧ 50. When zero bases or base pairs, a typical hybridization solution is 6 x SSC (sodium citrate salt water) 0.5% sodium dodecyl sulfate (SDS) 100 μg / ml denatured, fragmented salmon sperm DNA It is. Hybridization is performed at 68 ° C. Nylon mesh with immobilized nucleic acid Embrene is 68% in 1 x SSC or 0.1 x SSC for high stringency May be washed. 20 × SSC can be prepared by the following method. 800ml of H_Two175 in O Dissolve 3 g of NaCl and 88.2 g of sodium citrate and add a few drops of 10N -Adjust the pH to 7.0 with NaOH pH solution,_TwoAdjust to 1 liter volume with O You. Divide into aliquots and sterilize by autoclaving. The nucleic acid is immobilized on a nylon membrane, and the probe nucleic acid is Typical oligonucleotides are between 50 and 50 bases of oligonucleotide Solution solution 3.0M trimethylammonium chloride (TMACl) 0.01M sodium phosphate (pH 6.8) 1mm EDTA (pH 7.6) 0.5% SDS 100 μg / ml denatured, fragmented salmon sperm DNA 0.1% skim dry milk The optimal temperature for hybridization is usually the T_iYo 5 ° C. is selected. T_iIs the high formed between the probe and its target sequence. The irreversible melting temperature of the brid. Jacobs et al. (1988) Nucl. Acids Res. 16,4 637 is T_iWe consider the decision. Recommended hybridization temperature Are 48-50 ° C for the 17-mer in 3M TMACl and 19-mer for the 17-mer. 55-57 ° C for the 20-mer and 58-66 ° C for the 20-mer. Also, the "selectively hybridizable nucleic acid" is described in more detail below. Any known amplification system, specifically the polymerase chain reaction (PCR) Also included are nucleic acids that will amplify DNA from the chromosome 10 region. PC Suitable conditions for R amplification include amplification in a suitable 1 × amplification buffer. The 10 × amplification buffer was 500 mM KCl, 100 mM Tris Cl (at room temperature). pH 8.3), 15 mM MgCl_Two, 0.1% gelatin. Optionally, the annealing portion of the amplification is between 37 ° C and 60 ° C, preferably 5 ° C. 0 ° C. Markers D10S541 and DS10S215 are described, for example, in Gyapay et al. (1994) Na Nature Genetics 7, 1993-199 described by Special Issue No. 2, 246-339. The region of chromosome 10 shown in the 4-year Genethon Human Genetic Linkage Map Identify. The YAC is a CEPH mega-YAC library or an ICI YAC library. Bully (7B-F12 and 24G-A10) or Human Genome Mappi ng Project Resource Centre, Hinxton Hall, Hinxton, Cambridgeshire, CB10 All publicly available from 1RQ, UK. The position of YAC on the genetic linkage map is CEPH-Ge With reference to the nethon Quickmap database (Cohen et al. (1993) Nature 366, 698-701) Created. The sequences of the above expressed sequence tags (ESTs) are given in Tables 3 to 22. These are GenBank, National Center for Biotechnology Information, National Library of Medicine, Bldg 38A, National Institutes of Health, R Publicly available from ockville Pike, Bethesda, MD 20894, USA. Further below As described in detail, a particularly preferred nucleic acid of the invention is clone IMAGE26. 4611 is a nucleic acid that can hybridize with a gene corresponding to the cDNA insertion of 4611. IMAGE clone 264611 was obtained from Research Genetics, Inc (2130 Memorial Parkway, SW Huntsville, AL 35801, USA) and American Type Culture Colle ction, Rockville, MD 20852, USA, Genome Systems Inc, 8629 Pennell Drive , St Louis, Missouri, MO 63114, USA; UK-HGMP Resource Centre, Hinxton, C Publicly available from other IMAGE sources, such as the ambridge CB10 1SB. The claw Is described in non-disclosed information about ESTs N29304 and N20238. (See Tables 9 and 10). The clone is a modified Pharmac Located in the iapT7T3 vector. Name: pT7T3D-Pac (ampicillin resistance; 50 μg / ml) Host: DH10B V type: Plasmid Polylinker sequence: (modified) The insert of IMAGE clone 264611 is provided in FIG. Since they overlap to form large flanking sequences, the following clones were It contains a sequence that is identical to E clone 264611. All clones are other If no method is indicated, it can be obtained free of charge as a physical entity. Each clone Now, several sequences, usually from the 5 'or 3' end, are described below. Available as an EST that can be used to make probes. The clones and their ESTs are available from the GenBank and EMBL databases. Listed in the list. The nucleic acid is defined by markers D10S541 and AFM337xf9. Selectively hybridized to the chromosome 10 region bounded by the DNA It is preferable if you can. Information on marker AFM337xf9 can be found in Genethon, 1rue de L'In Available for free from ternationale, 91000 Evry, France. AFM337xf9 Is now known as D10S1765. 746-H-8, 821-D-2, 831-E-5, 9 wherein the nucleic acid is YAC 21-F-8, 796-D-5, 829-E-1, 839-B-1, 732-B -4 or 24G-A10 selectively hybridizes with human-derived DNA 746-H-8, 921-F-, wherein the nucleic acid is YAC. 8, 821-D-2, 831-E-5, 796-D-5, 24G-A-10 or Can selectively hybridize with any human-derived DNA of 732-B-4. Even more preferred. YAC is the DNA required for yeast growth and maintenance Will be recognized. Preferred nucleic acids of the invention are YA, such as yeast DNA. C selectively hybridizes with human-derived DNA present in C. Are those that do not hybridize. The human-derived cDNA insert of IMAGE clone 264611 has at least YAC clones 921F8, 746H8, 821D2, 831E5, 796D5 And 24GA10. The human-derived cDNA insert of IMAGE clone 264611 has at least BAC (Bacterial artificial chromosome) clones B2F20, B46B12, B60C 5, B150K4, B150N3, B145C22, B181F15 and B1 Hybridizes with 88L22, but B76110, B79A19, B7901 , B93F12 and B122L22. BAC clones are from Research Genetics, 2130 Memorial Parkway, SW Huntsville , AL 35801, USA and Genome Systems Inc, 8629 Pennell Drive, St Louis, M Publicly available from issouri, MO 63114, USA. The human-derived cDNA insert of IMAGE clone 264611 has at least PAC (P1-derived artificial chromosome) clones P40F10 and P274D21 and C It hybridizes, but P72G8, P74N2, P201J8, P201P5, Not P209K3 and P316N14. PAC clones are available at Sanger Centre, Wellcome Trust Genome Campus, Hinxton, Publicly available from Cambridge CB10 1SA, UK. The nucleic acids of the invention may be RNA or DNA, but DNA is preferred. New The nucleic acids of the invention may be double-stranded or single-stranded, but may be single-stranded. Nucleic acids are preferred. The nucleic acids of the invention can be very large, such as 100 kb if double stranded. Actual In some cases, genes such as tumor suppressor genes are often of this size. But For diagnostic, probing or amplification purposes, the nucleic acid must be 10,000 base pairs ( It is preferably smaller than the nucleic acid (if the nucleic acid is double-stranded) or the base (if the nucleic acid is single-stranded). More preferably, less than 1000 base pairs or bases, more preferably 10 to More preferably less than 100 base pairs or bases, up to 15 to 30 base pairs. Or smaller than the base. Described more fully below As such, single-stranded DNA primers suitable for use in the polymerase chain reaction Is particularly preferred. Particularly preferred nucleic acids of the invention are those from which the EST sequences N29304 and N202 38 corresponds to the cDNA insert of clone IMAGE264611 from which Is a nucleic acid that can hybridize with a gene. N48030 and N20238 Sequences and information are recorded in GenBank and EMBL databases. (See Tables 9 and 12). In addition, fragments and variants of this gene, and CDNAs derivable from mRNA encoded by the gene are also preferred in the present invention. Nucleic acid. The inventors have described "cDNA insert fragment clone IMAGE264611. And the gene corresponding to the cD in the clone when partially copied It means a gene encoding mRNA that produced NA. Obviously the gene itself and its variants and fragments are the preferred nucleic acids of the invention. It is. We have added to a "gene" not only its introns and exons, Said introns and exons, especially those of the 5 'to most of the 5' exons And a regulatory region that is physically adjacent. We include in a "fragment" at least 15 nucleotides (either single-stranded or double-stranded). Include any portion of the nucleotide length gene, but more preferably at least Are also 20 nucleotides in length, most preferably at least 50 nucleotides. Length, and may be at least 100 nucleotides long, or May be 500 nucleotides in length. Preferably the fragment is 50 kb or less And more preferably 100 kb or less. We specifically have a "variant" of a gene, whether in partial or full length Or copied from a splice variant of mRNA. A is included. We also specifically propose that c, whether in a gene or a fragment thereof, Nucleotide (including inversion) compared to the native gene, whether in DNA Include nucleic acids where there are ptide substitutions, insertions and deletions. Both variants and fragments Selected according to its intended purpose, for probing, amplification or diagnostic purposes Are generally shorter but for the purpose of expressing a pharmaceutically useful product. Greater degree of sequence identity (eg, at least 80%, 90%, 95% or 9 9%), and if longer fragments are desired, they are generally included in the genetic code. It may be needed in cases where there is surprising advantage over redundancy. The nucleic acid of the invention corresponds to the cDNA insert of clone IMAGE264611. Oligonucleotide primers that can be used to amplify Is preferred. Further, the nucleic acid of the present invention comprises all or a part of the gene, and It is preferable that the probe can be used as a probe for redidation. The cDNA sequence of IMAGE 264611 is shown in FIG. The gene and additional cDNA derivable from the gene are known in the art. It is easily obtained using the method. For example, additional cDNA can be obtained using standard methods and protocols. IMAGE 264611 clone, or Tables 1 to 19 and drawings Prostate cD using other probes readily derived from the sequences given in It can be isolated from NA libraries. The sequence is easily determined using standard methods. Is determined. Similarly, the gene was IMAGE26 as a probe using standard methods. 4611 clones, or easily derived from the sequences in Tables 1-19 and Figures. Can be isolated from human genomic DNA libraries using other probes it can. Prostate cDNA library may be obtained using standard molecular biology methods Or Clontech Laboratories, Inc, 1020 East Meadow Circle, Palo Al to, California 94303-4230, USA. Screening of DNA library, cloned DNA and sequencing D Standard methods for isolating and manipulating NA are described in Sambrook et al. (1989) “Molecular cloning, a. laboratory manual, 2nd edition, edited by Sambrook et al., Cold Spring Harbor Press, Co. ld Spring Harbor, New York. IMAGE clone 264611 or the nucleic acid sequence shown in Tables 3 to 22 To generate antibodies in sequence using the deduced amino acid sequence encoded by the sequence May be made. CDNA expression library using the antibody Can be screened, or the antibody can be used to screen for the gene. Thus, the encoded polypeptide can be isolated. Once the polypeptide Is isolated, its N-terminal sequence is obtained using methods known in the art. Then, using the amino acid sequence, an cDNA corresponding to the 5 'coding region of the cDNA is prepared. Design a lignonucleotide probe. The 5 'end of the cDNA is RACE (Rapid Amplifica) which is a technique known in the art. tion of cDNA Ends; Schaefer (1995) Anal. Biochem. 227, 255-273) It will be appreciated that it can be isolated. This and related attempts have been Using primers for the currently known 5 'sequence, which works in reverse for the 5' end of the To reverse transcription from an existing mRNA followed by an "unknown" 5 'end Includes PCR using random primers. Also, mRNA for RACE , MRNA is removed, the 5 'cap is removed, and the 5' end is replaced with an adapter sequence. To obtain the 5 'end, followed by CR is specific for certain primers for the adapter and the cDNA of interest Use certain primers. Methods for isolating genes and parts of genes are hereby incorporated by reference. Current Protocols in Human Genetics, 1996, Dracopoli (ed.) Et al., John It is described in Wiley and Sons. One useful method is "vectoret (vector ette) "PCR. Vectorette PCR is used to identify new genes or to determine the sequence of a gene. If the part is known, it can be used for the identification of additional sequences. Vectre The kit itself is not capable of linking the mismatched central region with the DNA cut by the restriction enzyme. It is a double-stranded synthetic DNA fragment with one suitable end (Current Protocols i n Human Genetics 1995 (5. 9. 15-5. 9. 21) and Valdes et al. (1994) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91, 5377-5381 and Allen et al. PCR Methods and Applications 4, 71-75). Restriction fragments derived from an appropriate DNA source (usually a YAC clone Subsequent to the ligation reaction of the vectorette with a large genomic DNA fragment such as A primer from the target DNA, together with a primer from the mismatched region of the vectorette PCR amplification is performed using This vectorette primer is Phase that has the same sequence as the base strand of the region and thus anneals in the first cycle of PCR Has no complementary sequence. In the first amplification, primer synthesis was performed using primers in the target DNA. It's one-way because it can only happen from an imer. Thereby, the second PCR size A complementary strand is produced for the vectorette primer that anneals in the circle. Second During and subsequent PCR cycles, both primers initiate DNA synthesis. And only the amplified fragment contains the sequence of interest. You. This method is based on knowledge of the cDNA sequence for the gene, and Can be used for the identification of antronic sequences. (Like a YAC clone) Restriction cleavage of the genomic DNA fragment containing the gene of interest followed by vectorization After ligation to the kit, primers designed from the cDNA sequence The PCR is used to amplify a specific fragment of the gene in combination with a cullet primer. D The exon / intron boundary is determined by comparing the sequence of this fragment with the sequence of the cDNA. Can be identified. Use this method with primers derived from cDNA clone 264611 Intron sequences have been identified (see FIGS. 8-15). Similarly, using the vectorette approach, a probe derived from the 5 'end of a known cDNA sequence. The 5 'end of the missing gene was identified by using 'Array data can be created. Also known as "Island rescue" Vectrets can also be used for the identification of completely novel gene sequences. This Reported that CpG-rich "islands" existed in mammalian genomes, Revealed the fact that it was involved in the 5 'end. Certain restriction enzymes, for example, In this case, the enzyme NotI cuts inside the CpG island. After NotI digestion of genomic DNA, N Vectrets with an otI compatible sticky end are the resulting sub-fragments Combined with Next, the vector together with a primer derived from the Alu repeat element was used. PCR amplification is performed using let primers. Such elements are found in the human genome To Since it occurs at frequent intervals, one or more are in close proximity to the CpG island of interest, It appears to be promoting product formation. As a target, the second PCR reaction is vector The procedure is performed except for let primer. Alu / Vectret initiated reaction Any fragment not found in Alu, which is the only object of interest, is one of the CpG islands. Should be used for gel purification and coding analysis using standard methods. Can be. Coded by gene corresponding to cDNA clone IMAGE264611 The resulting polypeptide, ie, the nucleotide sequence shown in Tables 3-20, , Polypeptides that are proteins involved in cytoskeleton / extracellular matrix interactions Has several identical sequences to tensin, and to cell membranes via clathrin-coated vesicles At least nucleotides with auxillin, a protein involved in protein transport Similarity at the sequence level was also observed. Also, the sequence between tensin and auxillin The similarity of has also been noticed before. Preferred nucleotides of the invention are tumor suppressor genes or fragments or mutations thereof. It consists of a body. The tumor suppressor gene may be prostate cancer, melanoma, glioma or It is involved in the development or development of cancer such as non-Hodgkin's lymphoma . Optionally, said tumor suppressor gene is a gene encoding or developing prostate cancer, especially prostate adenocarcinoma. Involved in. The nucleic acid of the present invention comprising a tumor suppressor gene or a fragment or derivative thereof can be easily prepared. For example, the gene has been identified in prostate glands for the purpose of identifying reduced levels of transcripts. By screening RNA panels from cancer and other cancer cell lines Can be identified. Probably because it overrides complex functions and mutations "hits" (For tumor suppressor genes BRCA1 and RB) So the transcript will be large. Hybrid storage means that the gene is Has a "housekeeping" function, the deletion of which leads to a lack of growth control and tumorigenesis It indicates that there is a possibility that The inventors have found that a "tumor suppressor gene" lacks either its function or activity. Or include any genes for which some reduction may contribute to tumor formation. Analysis of the entire coding region of a tumor suppressor gene in a tumor indicates that the gene Does not have tumor tissue genes or prostate cancer and is less prone to prostate cancer A tumor suppressor gene when modified relative to the gene of the individual, and It indicates that it is involved in cancer such as prostate cancer. Suitable for mutation analysis The method is based on single-stranded conformational polymorphism (SSCP) analysis (or a modification of this method). Method) and direct DNA sequencing. These are known to those skilled in the art, For example, SSCP stands for Current Protocols in Human Genetics, 1995, 7. Four. 1-7. Four. Noted on page 6 It is listed. Any of the tumor suppressor genes of the present invention (compared to IMAGE clone 264611) Arguably contains introns and almost always I> 0. 5 kb and> 1. 0 kb is more likely. Not 0 It is most likely in the range of 500 kb. IMAGE clone 264611 In about 1., the cDNA insert is about 1. 7 kbp. Any tumor suppression of the present invention Genes also arguably have polymorphisms in their DNA sequences. Thus, (system Fragments, such as restriction fragments or fragments derived by enzymatic amplification Natural mutants such as gene mutants) or mutants The mutants thus formed also form part of the present invention. Such suitable fragments are hybridized Fragment useful as a hybridization probe or useful as an amplification primer including. Such a suitable mutant would then have the coding sense of the gene altered. The mutant polypeptide, or the coding sequence in which the coding sequence is Includes variants that have been modified to alter the tide properties. Any tumor suppressor gene of the present invention will almost certainly end up with a polypeptide Encodes, but encodes an RNA species that does not encode a polypeptide Good. The nucleic acid is a tumor suppressor gene, or a derivative or fragment or a variant thereof. More preferably, it consists of a product. Such a nucleic acid is a mR transcribed from a tumor suppressor gene. NA. CDNA derived from mRNA whose nucleic acid is transcribed from a tumor suppressor gene (replicated DNA ) Is particularly preferred. From a selected tissue, such as prostate or prostate tumor tissue Libraries of cDNA are known to those skilled in the art, for example, Molecular cloning, al. ab olatory manual (above) using appropriate methods known in the art. Can be prepared from various mRNAs. The nucleotide sequences set forth in Tables 3 through 22 correspond to incomplete sequences of incomplete cDNA. Sequence, wherein the cDNA is involved or selectively hybridizes It is derived from mRNA and its regions are identified by markers D10S541 and D10S. Region of human chromosome 10 bounded by DNA defined by H.215 Is almost certainly transcribed from the gene or genes found in Fig. 8 The nucleotide sequence shown in FIG. 15 corresponds to IMAGE clone 264611. Contains intron-derived sequences in the corresponding gene. More specifically, the inventors 3 to 22 and a polynucleic acid comprising the sequence of any of FIGS. 6 and 8 to 15. Leotide is at least one of the YAC, BAC and PAC clones described above. And found that it hybridized. Thus, Tables 3 through 22 and FIG. And the nucleotide sequence of 8 to 15 has the region whose marker D10S54 1 and human DNA bounded by the DNA defined by D10S215 Within the region of chromosome 10, more specifically, the sub- 2 shows mRNA products of at least one gene found in the region. Particularly preferred tool Examples are 746-H-8,821- whose nucleic acid is a yeast artificial chromosome (YAC). D-2, 831-E-5, 921-F-8, 738-B-12, 796-D-5 829-E-1, 678-F-1, 839-B-1, 732-B-4, 7B- F12, 757-D-8, 773-C-2, 787-D-7, 829-E-1, 831-E-9, 855-D-2, 855-G-4, 876-G-11, 894 -H-5, 921-F-8, 922-E-6, 934-D-3, 964-A-8 968-E-6 or 24G-A10, and Tables 3 and 2 2 is not any of the polynucleotides as described in Or PAC B2F20, P40F10, P72G8, P74N2, P27 4D21, B76I10, B79A19, B7901, B93F12, B122 L22, P201J8, P201P5, P209K3, P316N14, 46B 12, B60C5, B145C22, B150K4, B150N3, B181F 15 and B188L22, provided that the region is a marker D Bounded by DNA as defined by 10S541 and D10S215 And can selectively hybridize to the region of human chromosome 10 22 and human-derived sequences as described in any of FIGS. 6 and 8 to 15 And a nucleic acid capable of selectively hybridizing with the above. Those skilled in the art will appreciate the sequence information shown in Tables 3-22 and FIGS. 6 and 8-15. By using the information, the gene corresponding to IMAGE clone 264611 can be obtained. It will be readily recognized that a group of genes can be identified. Specifically, the nucleic acid is selected from the group consisting of 22 shown in Table 3 and any one of FIGS. A gene or heredity from which the sequence is derived or is a fragment or variant thereof It is preferable that it is composed of child groups. Also, the nucleic acid has a reduced length of the mRNA transcript. Preferably, it is composed of at least 50% of full-length cDNA or cDNA. More preferably greater than 75% of its length, more preferably greater than 95% of its length preferable. Preferably, the nucleic acid is subcloned, and the entirety of the protein coding sequence is It is particularly desirable if all or part is expressed. Usually, the DNA is placed in an expression vector, such as a plasmid, suitable for expression. Rows are inserted with the correct reading frame. Such control is usually performed by the expression vector. The DNA is recognized by the desired host, if necessary. It may be linked to the appropriate transcriptional and transcriptional regulatory control nucleotide sequences. Then baek The cells are introduced into the host using standard methods. Generally, all hosts are transformed by the vector. It is not replaced. Therefore, it is necessary to select a transformed host cell. One Selection methods are based on selectable properties in transformed cells such as antibiotic resistance. Expression vector together with any necessary control elements It is characterized by being incorporated into Alternatively, genetics for such selectable traits The offspring may be on another vector and used to co-transform the desired host cells. Replace. Then, the host cell transformed with the transforming DNA of the present invention is In the context of the methods disclosed herein for expressing the polypeptide, Cultivate under appropriate conditions known to the vendor and then allow them to recover. Many expression systems are known, including bacteria (e.g., E. coli). coli) Bacillus subtilis), yeast (eg, Saccharomyces cerevisiae) Saccharomyces cerevisiae), filamentous fungi (for example, Aspergillus (Aspe rgillus)), plant cells, animal cells and insect cells. Even if the vector is used to express in other non-prokaryotic cell types, A prokaryotic replica such as a ColE1 cage for propagation in prokaryotes Including kon. In addition, the vector was used to transform E. coli transformed with the vector. Escherichia coli Sometimes a prokaryote capable of directing the expression (transcription and translation) of the gene in a bacterial host cell Suitable promoters such as promoters are also included. Promoter allows RNA polymerase binding and transcription to occur An expression control element formed by a DNA sequence. With a typical bacterial host A compatible promoter sequence is typically used to insert the DNA segment of the present invention. It is provided in a plasmid vector containing convenient restriction sites. Typical prokaryotic vector plasmids are available from Biorad Laboratories (Richmond, PUC18, pUC19, pBR322 and pBR3 available from CA, USA) 29 and pTrc99A available from Pharmacia, Piscataway, NJ, USA And pKK223-3. A typical mammalian cell vector plasmid is Pharmacia, Piscataway, NJ, U. PSVL available from SA. This vector contains the SV40 late promoter. To drive the expression of the cloned gene, with the highest level of expression being expressed in COS-1 cells. It is found in T antigen producing cells such as vesicles. An example of an inducible mammalian expression vector is pMSG, which is also Available from Pharmacia. This vector contains the mouse mammary tumor virus long terminal repeat. Drive expression of cloned genes using glucocorticoid-inducible promoter You. Useful yeast plasmid vectors are pRS403-406 and pRS413- 416, generally Stratagene Cloning Systems, La Jolla, CA 92037, US Available from A. Plasmids pRS403, pRS404, pRS405 and And pRS406 is a yeast integrating plasmid (YIp) and is used for yeast selection. Incorporates possible markers HIS3, TRP1, LEU2 and URA3 . Step Rasmid pRS413-416 is the yeast centromere plasmid (YCp) . To operably link the DNA to the vector via complementary cohesive ends, Various methods have been developed. For example, complementary homopolymer tracts (complemen tary homopolymer tracts) to the DNA segment and insert into the vector DNA Let it. The vector and DNA segment are then ligated to complementary homopolymer ends. Ligation by hydrogen bonds between them to form a recombinant DNA molecule. Synthetic linkers containing one or more restriction sites link the DNA segment to the vector Provide alternatives to As described above, cleavage of endonuclease restriction sites The resulting DNA segments are converted to their 3'-5 'exonucleolytic activity. Bacteriophage T4D, an enzyme that removes the 3'-single-stranded end protruding from Treatment with NA polymerase or E. coli DNA polymerase I; Fill the recessed 3'-end using their polymerization activity. Thus, a blunt-ended DNA segment results from a combination of these activities. Then Ligation of blunt-ended DNA molecules such as bacteriophage T4 DNA ligase In the presence of a catalysable enzyme, the blunt-ended segment is larger than the linker molecule. Incubate with the molecule. Thus, the products of the reaction are at their ends It is a DNA segment having a polymerization linker sequence. Then these DNA segments Cut with an appropriate restriction enzyme to generate an end compatible with the sequence of the DNA segment. Ligation is performed with the expression vector cut with the enzyme. Synthetic linkers containing various restriction endonuclease sites are available from International Commercial from many sources, including Biotechnologies Inc, New Haven, CN, USA Available. Particularly preferred nucleic acids of the first aspect of the invention are those primers suitable for amplifying nucleic acids. Is selected from the group consisting of Optionally, the nucleic acids are listed in Tables 3-22. And the nucleic acid according to any of FIGS. It is selected from the group consisting of primers that hybridize. It is particularly preferred if the amplification primer hybridizes to a gene intron. . It is particularly useful if a processed pseudogene is present. Thus, the nucleic acid is And a sequence that hybridizes with the sequence given in 8 to 15, or its complement. La It is preferred if it is selected from the group consisting of immers. Polymerase chain reaction (PCR; Saiki et al. (1988) Science 239, 487-491) Primers suitable for use are preferred. Suitable PCR primers have the following characteristics: May be. The sequence at the 5 'end of the oligonucleotide must be the target sequence to be amplified. It is known that they do not have to match. This feature can induce the formation of an artifact called a "primer dimer" Usually, the PCR primers are longer than two bases of each other, especially at the 3 'end. It does not include the complementary structure of the displacement. The 3 'ends of the two primers are hybridized If they do, they form a "starting template" complex and the primer extension results in a A short diploid product results, called a "limer dimer." In primers, intramolecular secondary structures should be avoided. For symmetric PCR For both primers, no long extension of either base was observed. For example, a G + C content of 40-60% is recommended. DNA probe hybridization Conventional melting temperature calculations used in conjunction with primer studies often involve Should anneal at a specific temperature, increasing the temperature to 72 ° C It is expected that the immer / template hybrid will separate while still immature. In practice, in a PCR process, the hybrid generally has a simple T_mCalculation method Is more effective than expected by The optimal annealing temperature is determined empirically and may be higher than expected. Ta Since qDNA polymerase has no activity in the range of 37-55 ° C, -Elongation occurs during the annealing step and the hybrid is stabilized. ply The concentration of the mer is equal in conventional (symmetric) PCR, typically 0.1 to 1 μm. M range. All nucleic acid amplification protocols use polymerase chain reaction, QB replica It can be used in the methods of the invention, including the zease and ligase chain reactions. Ma As described in Compton (1991) Nature 350, 91-92, NASBA Width-based nucleic acid sequences) or the so-called 3SR can be used, and Walker et al. 992) Nucl. Acids Res. As described in 20, 1691-1696, AIDS (1993), Using Vol 7 (Appendix 2), S108 or SDA (Strand Displacement Amplification) Can be. The polymerase chain reaction is particularly preferred for its simplicity. If the appropriate nucleic acid pair of the invention is used in PCR, gel electrophoresis and It is convenient to detect the product by immunoglobulin staining. Agarose scale of DNA The products of DNA amplification using electrophoresis and ethylene bromide staining An alternative is to hybridize with the amplified DNA as a probe. It is convenient to use labeled oligonucleotides. When the amplification is by PCR, Oligonucleotide probes are primers as determined by two primers. Hybridizes with the sequence in the immer. The oligonucleotide is preferably 10 Between 50 and 50 nucleotides in length, more preferably between 15 and 30 Nucleotide length. The probe is prepared using standard methods³²P,³³P and³⁵S Sometimes it may be labeled with a radionuclide or with a fluorescent dye. The oligo If the nucleotide probe is fluorescently labeled, the amplified DNA product (Eg, Balaguer et al. (1991) "Polymerase using bioluminescence absorption"). Quantification of DNA Sequences Obtained by Chain Reaction "Anal. Biochem. 195, 105-110 and And Dilesare et al. (1993) "Based on sensitive electrochemiluminescence for automated PCR product quantification. Detection system ", BioTechniques 15, 152-157). Alternatively, the PCR product can have a fluorophore quencher pair or be attached to a solid support. Can be detected using probes that can be attached or have a biotin label. Or by using a combination of a capture probe and a detection probe. Fluorophore quencher pairs are particularly suitable for quantitative measurement of PCR reactions (eg, RT-PCR). are doing. In addition, the PCR product is detected using fluorescence polarization using an appropriate probe. You may. More particularly preferred nucleic acids are those whose primers are shown in FIGS. 6 and 8-15. That act as PCR primers that can be selected with reference to the sequence is there. These primers correspond to the cDNA clone IMAGE264611. It is useful when amplifying DNA derived from a gene to be expressed. These primers Is, but is not limited to, in bold type in FIGS. The indicated sequence is included. The downstream (3 ') primer is the reverse of the sequence shown in bold Complementary. Oligonucleotide primers can be prepared by methods known in the art, such as solid phase phosphorylation. It can be synthesized using amidite chemistry. The second aspect of the present invention provides that the region is a marker D10S541 and D10S2 Region of human chromosome 10 bounded by DNA defined by 15 Providing a nucleic acid that can selectively hybridize to and further comprises a detectable label. . The inventors have readily incorporated "detectable labels" into nucleic acid molecules using known methods. Can be embedded³²P,³³P and³⁵Any convenient radioactive marker, such as S Any convenient fluorescent or fluorescent light that can be easily incorporated into nucleic acids, including Or a chemiluminescent label. In addition, the term “detectable label” includes (strep (Such as biotin, which can be detected by binding to toavidin) Converts colorless compounds into moieties that can be detected by the ability to combine, and colorless compounds Or vice versa (for example, alkaline phosphatase is a colorless o-nitrophosphate Phenyl to o-nitrophenyl). Parts such as enzymes are also included. Conveniently, the nucleic acid probe is used in an immobilization assay. And occupy a specific position, and is used for hybridization in immobilization assays. The nucleic acid hybridizes with the human chromosome 10 region with reference to the position of the You can find out if you want to. Also, detectable labels are Tyagi and Krame r (1996) Fluorescence emission as described in Nature Biotechnology 14, 303-308. It may be a group. The nucleic acid is an expressed sequence tag (EST) as described in Tables 3 to 22, Or human-derived in any of the intron sequences shown in FIGS. It is preferred that the nucleic acid comprises a native sequence and further comprises a detectable label, or the nucleic acid Are yeast artificial chromosomes (YAC) 921-F-8, 746-H-8, 821 -D-2, 831-E-5, 796-D-5, 24G-A-10 or 732- B-4 or BAC clones B2F20, B46B12, B60C5 , B150K4, B150N3, B145C22, B181F15, B188L 22, or PAC clones P40F10 and P274D21 Among them, it is preferable to include a human-derived sequence. Particularly preferred nucleic acids are those of the first aspect of the invention, further comprising a detectable label. It is. A third aspect of the present invention provides a method comprising: (i) obtaining a sample consisting of a nucleic acid from a patient; i) the nucleic acid is mutated by its markers D10S541 and D10S215; Region of human chromosome 10 bounded by DNA defined as Having a step of contacting with a hybridizable nucleic acid. Methods for determining the susceptibility of a patient. The present invention is suitable for determining the susceptibility of a patient to any cancer, The cancer that is determined is prostate cancer, melanoma, glioma, or non-Hodgkin's lymphoma It is preferable if there is. The method is most suitable for determining a patient's susceptibility to prostate cancer. I do. Therefore, at least for the determination of susceptibility to prostate cancer, patients Sex. The presence or absence of a portion of human chromosome 10 is determined by the third, fourth and fifth aspects of the present invention. And the third, fourth and fifth aspects of the present invention. In certain preferred embodiments, the hybridizer selectively hybridizes with the region of human chromosome 10. The nucleic acid that can be amplified is a nucleic acid suitable for amplifying a portion of the region on chromosome 10. A fourth aspect of the present invention provides a method comprising: (i) obtaining a sample consisting of a nucleic acid from a patient; i) the nucleic acid is mutated by its markers D10S541 and D10S215; Region of human chromosome 10 bounded by DNA defined as Contacting a hybridizable nucleic acid with a cancer patient Provide a method of diagnosing. The method is particularly suitable for discriminating between prostate cancer tumorigenesis and hyperplasia. 10 All tumors with a deletion of q also lack the region characterized herein. Since they have been found, the markers of the invention and other (including markers on other chromosomes) Various diagnostic tests can be performed using the marker. A fifth aspect of the present invention provides (i) obtaining a sample consisting of nucleic acid from a patient, and then (i) i) the nucleic acid is defined by markers D10S541 and D10S215 DNA selectively hybridizes with the region of human chromosome 10 to which the region binds. Identifying cancer in a patient, comprising the step of contacting the nucleic acid with Provide a method for predicting the relative expected value of the result of In the methods of the third, fourth and fifth aspects of the present invention, the method comprises nucleic acid from a patient. Although any sample is useful, the sample may be prostate tissue, blood, urine or semen. It is preferred if selected from the group consisting of: Prostate tissue from patients using standard methods Obtainable. Prostate-derived cells are found in small amounts in urine and blood. patient The sample containing the nucleic acid from the patient may be patient cells, such as prostate cells, or directly It is preferable that the cells are derived from the cells of the subject, but the cells Samples derived from patients indirectly are also included within the scope of the present invention. Similarly, from the patient The nucleic acid of the patient may be physically present in the patient, but, alternatively, It may be a copy of a nucleic acid that was physically present within. Is the tumor tissue a primary tumor Or from a metastatic tumor, especially from the edge of the tumor. For convenience, the region is marked by markers D10S541 and D10S215. Selectively to the region of human chromosome 10 bounded by the defined DNA The nucleic acids that can be hybridized further include a detectable label. The detectable label is a book The label according to the second aspect of the present invention is included. The method comprises screening for pre-symptomatic patients belonging to a group at risk for cancer. It will be appreciated that it may be used for For example, men older than about 60 Are at greater risk of prostate cancer than men under 35. Similarly, the method It may be used for the pathological classification of tumors such as cancer. Conveniently, in the method of the third, fourth and fifth aspects of the invention, the selective ha Nucleic acids capable of hybridization (whether or not labeled with a detectable label (At least) contacting the nucleic acid from the patient under hybridizing conditions. Blood, semen or urine from patients whose samples are rich in prostate-derived tissue or cells A source of the sample containing the original nucleic acid is preferred. Getting abundant prostate cells Can be used for prostate selection, such as those directed to prostate specific antigen (PSA). Cell sorting, such as fluorescence activated cell sorting (FACS) using selective antibodies Method. The source of the sample was immobilized paraffin-embedded Includes specimens and biopsies and tumor samples, including fresh or frozen tissue You. The third, fourth or fifth method of the present invention relates to related areas including direct sequencing. DNA sequencing at one or more relevant sites in the region Direct sequencing, by PCR Direct sequencing of amplified exons, hybridization at relevant sites within relevant regions Various Hybridizations of Oligonucleotide Probes Designed to Soy (For convenience, this method is a so-called "chip" system known in the art, Oligonucleotide probes are immobilized and used). After amplification, denaturing gel electrophoresis followed by cleavage with appropriate restriction enzymes, S1 nuclease Sequence analysis, presumably amplification of the relevant DNA region followed by non-denaturing gel electrophoresis, conventional R FLP (restriction fragment length polymorphism) assay, heteroduplex analysis, oligonucleotide DNA amplification using chromosome, fluorescence in situ of chromosome interface chromosome Hybridization, ARMS-PCR for specific mutations (Amplifica tion Refractory Mutation System-PCR), mismatches in hybridized nucleic acids Cleavage at the join site (this cleavage may be chemical or enzymatic), the SSCP-strand Homeotic polymorphism or DGGE (discontinuous or denaturing gradient gel electrophoresis) Detects mismatches between annealed normal / PCR amplified DNA mutants Analysis, and protein truncation assays (mutations are truncated). Introducing a stop codon into selected protein products will result in exon transcription and And translation will occur). For example, using the cleavage I enzyme, the primary sequence Such as detecting mutations in the secondary structure of single-stranded DNA resulting from mutations in Other methods may be used. This system is GibcoBRL, Life Technologies, 3 Fountain Dr ive, commercially available from Inchinnan Business Park, Paisley PA49RF, Scotland it can. The detailed method of mutation detection is described in “Laboratory Protocols for Mutation Detect ion ”1996, edited by Landegren Oxfor on behalf of HUGO (Human Genome Organization) d Described in the University Press. RFLP is used to detect very large (≧ 500 bp) deletions or insertions Is preferred. Southern blots may be used in this method of the invention. To detect mutations that are larger but smaller than a 3-4 bp insertion or deletion, PCR amplification of smaller regions (up to 300 bp) is preferred. Amplify the sequence When analyzed on a sequencing gel, small mutations (minimum size 3-4 bp) Can be visualized. Suitable primers are designed as described herein. In addition, using either Southern blot analysis or PCR restriction enzymes, The site can be detected. For example, for genomic DNA, restriction enzyme digestion, gel electrophoresis, Southern blot And hybridization-specific probes (described herein). YAC, BAC, or derived therefrom in a region such as Appropriate fragment). For example, for PCR, DNA amplification, restriction enzyme digestion, ethidium bromide Nucleotide or fluorescent primers by gel detection, silver staining or PCR It is the incorporation of Other suitable methods include allele specific for the consequences of specific mutations The development of oligonucleotides (ASO) is mentioned. Similar method is prostate specific Used for RNA and cDNA for tissues. The method also includes testing for heterozygous defects (LOH: indicates one copy deletion). Or then and in a Northern blot, or by PCR, or RNA deficiency due to inability to detect mRNA in RNA / cDNA LOH of tumor cells from any source (other copies show inactivity) However, it is useful as a diagnostic tool compared to blood, because Indicates that the patient has performed or requires more rigorous treatment. Preferably, in the third, fourth and fifth aspects of the invention, the nucleic acid is Human chromosome 10 to which the markers D10S541 and D10S215 bind Can selectively hybridize to the region. More preferably, the nucleic acid is YAC 746-H-8, 821-D-2, 831-E-5, 921-F-8, 7 96-D-5, 829-E-1, 839-B-1, 732-B-4 or 24G -Selectively hybridizing to any one of the human-derived DNAs of A10 Features or is possible. Still more preferably, the nucleic acid is , YACs 821-D-2, 831-E-5, 796-D-5, 24G-A -10 or 732-B-4, selectively hybridized to human-derived DNA Re It is characterized or capable of soy. B2F20, P40F10, P72G8, wherein the nucleic acid is BAC or PAC , P74N2, P274D21, B76I10, B79A19, B7901, B 93F12, B122L22, P201J8, P201P5, P209K3, P 316N14, B46B12, B60C5, B145C22, B150K4, B 150N3, B181F15 and B188L22. Characterized by, or capable of selectively hybridizing to NA. Is preferred. The nucleic acid is a microsatellite marker D10S541, D10S215. And primers for AFM337xf9 (D10S1765) Is preferred. That is, The nucleic acid corresponds to the cDNA insert of clone IMAGE 264611. It is particularly preferred if it can selectively hybridize to the gene. Thus, the present invention provides a method of diagnosing cancer or susceptibility to cancer, Provided is the use of a nucleic acid that can selectively hybridize to the relevant region of human chromosome 10. I do. The present invention also relates to the presence or absence of the region on human chromosome 10, or the presence or absence of the region. A method for determining the mutation is provided. Preferably, the nucleic acid capable of selectively hybridizing is DNA. And preferably the nucleic acid is single-stranded. The nucleic acid that can selectively hybridize is 100 when the nucleic acid is double-stranded. Has less than 00 base pairs or 100 if the nucleic acid is single stranded It is particularly preferred if the nucleic acid is less than 00, and the nucleic acid is double stranded. Have less than 1000 base pairs, or the nucleic acid is single-stranded. In some cases, it is more preferred if the nucleic acid has less than 1000 bases. If the nucleic acid is double-stranded, it may have from 10 to 100 base pairs, or Is better if the nucleic acid is single-stranded and has from 10 to 100 bases. More preferably, the nucleic acid is 15 to 30 when the nucleic acid is double-stranded. Up to 15 to 30 when the nucleic acid is single-stranded It is even more preferred to have up to a base. The nucleic acid that can selectively hybridize is a tumor suppressor gene or a fragment or Are nucleic acids that contain variants or selectively hybridize to them. It is preferable. The nucleic acid capable of selectively hybridizing is suitable as a primer for nucleic acid amplification. It is preferable if it is off. Suitable primers include the first and second primers of the present invention. And those described with respect to the above embodiments. In a preferred embodiment, reverse transcriptase PCR is used to determine the size of a sample in a blood sample from a patient. Chrometasidase is detected. A blood sample is collected and RNs are collected from nucleated cells in the sample. Prepare A. Presence or absence of prostate tumor suppressor mRNA, or sudden Use this for PCR amplification using oligonucleotide primers to detect mutations I have. This means that normal cells can detect one cell in a mixture of more than one million. Is a relatively sensitive method that does not express these genes. Detects prostate tumor suppressor mRNA products in circulating metastatic cells mixed with liquid cells It is possible to The regions are marked with markers D10S541 and D10S21. Present in a region on chromosome 10 bounded by the DNA defined by 5 Gene products of those genes are useful markers to detect circulating prostate cells It is. By looking for mutations in the DNA of the cells directly in the blood sample, or By using protein truncation test or microsatellite It is also possible to detect micrometastase by using a marker. Will be evaluated. In this case, suspicious tumor cells are removed from the blood Should be purified. The nucleic acids that can be selectively hybridized are shown in Tables 3 to 22 or FIG. Or a human derived sequence as described in Preferably, the nucleic acid can be hybridized. For convenience, the nucleic acid is shown in Tables 3 and 2. 2 or DNA derived from the sequence as described in FIGS. 6 and 8-15. It is selected from the group consisting of primers that hybridize. The method of the invention is defined by the markers D10S541 and D10S215. Tumors, especially in the region of chromosome 10 bounded by defined DNA Includes detection of mutations in the suppressor gene. The method of the present invention eliminates differences in restriction enzyme cleavage sites caused by mutations. Can be used. Using non-denaturing gels, various lengths resulting from digestion with appropriate restriction enzymes Fragments can be detected. Usually before cleavage, e.g. polymerase chain reaction The DNA is amplified using the reaction (PCR) method and its modification. Alternatively, first one It is necessary to obtain 0-100 fold more DNA, and still obtain D Often, assays can only be performed if the NA has been cleaved. DNA amplification is described in Saiki et al. (1988) Science 239, 487-491. By established PCR methods or by their development or ligase chain reaction Other methods such as amplification based on QB replicase and nucleic acid sequences can be used. Or some other known amplification methods, some of which are described herein. "Appropriate restriction enzymes" recognize and cleave the wild-type sequence, but Not, or vice versa. Recognized and cleaved by the restriction enzyme The sequence may or may not be present as a result of mutation (or Normal or sudden, using mismatched oligonucleotides during the PCR reaction It can be introduced into a mutant allele. The enzyme only rarely cuts DNA So, in other words, that it rarely happens to recognize a sequence It would be convenient. Alternatively, either the wild-type or mutant genotype Pair (ie, hybridize) but not both Use CR primer. Whether amplified DNA is produced is then determined by the wild-type Or the genotype (and hence the phenotype) of the mutant. However, This method has negative consequences (i.e., amplified DNA In the absence of a). Therefore it is unreliable and / or Requires additional control experiments. Preferred methods use similar PCR primers, but with the wild-type or mutant Hybridizes to only one of the columns, and either wild-type or mutant Other methods introduce restriction sites that are not otherwise there. The nucleic acids provided by the present invention are useful for many purposes. To genomic DNA Detect point mutations for Southern hybridizations and already discussed above Can be used in RNase protection methods for The plow The PCR amplification product can also be detected using the probe. You can also use them to Technology to detect mismatches due to tumor suppressor genes or mRNA You. Enzymes (eg, S1 nuclease or resolvenase), chemical products (eg, human Droxylamine, osmium tetroxide and piperidine), or totally paired Of the change in mobility during electrophoresis of the mismatched hybrid compared to the hybrid Either one can be used to detect a mismatch. These techniques are known in the art It is. In general, a probe for a certain intron has been devised. The lobe is complementary to the tumor suppressor gene coding sequence. Complete set of nucleic acid probes To detect deletions or mutations in the wild-type tumor suppressor gene A kit may be configured. The kit is capable of hybridizing to all tumor suppressor genes. Enable The probes may overlap or be adjacent to each other. When riboprobes are used to detect mRNA mismatch, Is complementary to the mRNA of the human wild-type tumor suppressor gene. Thus, the ribopro The probe is an anti-sense probe in which it is the opposite to the sense strand. Because of its polarity, it has a code for the protein encoded by the tumor suppressor gene. Not. Generally, the riboprobe is labeled, e.g., radioactively, It can be achieved by any method known in the art. The ribopro If the probe is used to detect DNA mismatches, Can have sex, sense or anti-sense. Similarly, use a DNA probe. To detect a mismatch. Nucleic acid probes are also complementary to mutant alleles of tumor suppressor genes. This They found similar bumps in other patients based on hybridization rather than mismatch. It is useful for detecting mutations. As described above, the tumor suppressor gene Are used for Southern hybridization to genomic DNA. It is also possible to detect mutations in the entire chromosome at the time of insertion. Also using this probe Also selects tumor suppressor cDNA clones from tumor and normal tissues it can. Furthermore, using the probe, expression is changed, for example, wild-type tumor suppressor gene. Tumor suppressors in tissues to determine if reduction as a result of offspring Gene mRNA can also be detected. According to the method for diagnosis and prognosis of the present invention, the deletion of the wild-type gene is detected. You. The deletion may be due to either an insertion, deletion or the result of a point mutation . If a mutation occurs in only a single allele, the neoplastic condition is initially established. Can be presented. However, if both alleles are mutated, then they will exhibit a malignant state. Or indicate that the potential for malignancy increases. Thus, the occurrence of such a mutation Look provides both diagnostic and prognostic information. Not deleted (eg gene deletion Insert a tumor suppressor allele (on the sister chromosome) into the chromosome that causes loss For other mutations such as, small deletions, and point mutations can do. Most mutations found in tumor tissue are It is believed to result in greatly altered expression of the gene product. However However, mutations that result in a non-functional gene product may also result in a malignant condition or Will lead to an increased likelihood of malignancy. (Such as point mutation, deletion, insertion, etc.) Mutation consequences can occur in regulatory regions, such as in a gene's promoter. , Resulting in a loss or decrease in mRNA expression. Also, point mutations can be made with the appropriate R Eliminates NA processing, resulting in loss of expression of tumor suppressor gene products. Further, the present invention includes the following method. That is, the cleaved gene product is In vitro transcription and translation of tumor suppressor genes or substrates to identify Altered properties, such as binding, where protein expression is reduced / disappeared, or A set to identify cells whose distribution is changing within or on their surface Prior to immunohistochemistry of tissue sections and detection of mutations in regions as described above The use of RT-PCR with random primers. In a sixth aspect of the present invention, the region comprises the markers D10S541 and D10S2. Region of human chromosome 10 bounded by DNA defined by 15 Systems (or kits) to detect the presence or absence of, or mutations in, The system comprises a marker D10S Bounded by DNA defined by 541 and D10S215 Nucleic acids and nucleotides that can selectively hybridize to regions of human chromosome 10 Consisting of dotriphosphate or deoxynucleotide triphosphate or derivatives thereof . The region is defined by markers D10S541 and D10S215 Selectively hybridizes to the region of human chromosome 10 bounded by DNA Preferred nucleic acids that can be used are those preferred in the third, fourth and fifth aspects of the invention. Are the same. We include insertions, substitutions and deletions in "mutations". The inventors argue that "nucleotide triphosphate or deoxynucleotide triphosphate or Are ATP, GTP, CTP, and UTP, dATP, d Any naturally occurring nucleotide triphosphate such as GTP, dCTP, TTP Or containing deoxynucleotide triphosphate and phosphorothioate linkages And non-natural derivatives (eg, αS derivatives). Advantageously, the nucleotide triphosphate or deoxynucleotide triphosphate is radioactive Active, for example³²P,³³P,³⁴Labeled with radioactivity such as S Derivatives or labeled with fluorescent substances or chemiluminescent compounds or Is labeled with digoxigenin. Advantageously, the deoxynucleotide is at a concentration suitable for dilution for use in PCR. Degrees. Thus, the present invention provides a method for selectively hybridizing to this region of human chromosome 10. Part of the kit containing the nucleic acid that can be Means for detecting mutations at In a seventh aspect of the present invention, the region comprises the markers D10S541 and D10S2 Region of human chromosome 10 bounded by DNA defined by 15 And nucleic acids that modify enzymes. The region of interest is defined by markers D10S541 and D10S215. Presence or absence of a region of human chromosome 10 bounded by defined DNA A system is provided for detecting mutations in or at the same time. The area is a marker Bounded by DNA defined by D10S541 and D10S215 Preferred nuclei that can selectively hybridize to the region of human chromosome 10 to be attached Acids are the same as preferred in the third, fourth and fifth aspects of the invention. We include "mutations" with insertions, substitutions (including transversions) and Include the deletion. The present inventors have defined that “nucleic acid that modifies an enzyme” can modify an RNA or DNA molecule. Include any molecule capable of Preferred enzymes are DNA polymerase, DNA ligase, polynucleotide key. Or a restriction endonuclease. Especially preferred The enzyme is a thermostable DNA polymerase such as Taq DNA polymerase. It is Ze. Secondary structures, such as Cleavase I which recognizes mismatches Clease may also be useful. An eighth aspect of the present invention relates to a polypeptide which can be encoded by the tumor suppressor gene of the present invention. A peptide or fragment or variant thereof is provided. The polypeptide is preferably Has tumor suppressor activity, especially in the prostate, or specific for natural polypeptides Cross-reacts with the target antibody. A ninth aspect of the present invention relates to a polypeptide capable of specifically binding to the polypeptide of the eighth aspect of the present invention. Including molecules that can cut. Optionally, the molecule has specific complementarity to the polypeptide. An antibody-like molecule consisting of a determinant region. Monoclonal antibodies that bind to many of these antigens are already known, but In the event of deviation, the current technology for monoclonal antibody technology will be used to Antibodies to most antigens can be prepared. The antigen-binding portion is part of an antibody (eg, Fab fragment) or a synthetic antibody fragment (eg, a single-chain Fv fragment [ScFv]). You may. Suitable monoclonal antibodies against the selected antigen are known in the art, e.g., “Monoclonal Antibodies: A manual of techniques”, H Zola (CRC Press, 19 88) and “Monoclonal Hybridoma Antibodies: Techniques and Applications” , J GR Hurrell (CRC Press, 1982). Chimeric antibodies were produced by Neuberger et al. (1988, 8th International Biotechnology Sympos). ium Part2, 792-799). Appropriately prepared non-human antibodies can be prepared by known methods, e.g. It may be "humanized" by inserting the CDR regions of the antibody. A further aspect of the invention provides (i) obtaining a sample containing protein from a patient, ii) the relative amount of the polypeptide according to the eighth aspect of the invention in said sample or Is determining the size or of the polypeptide according to the eighth aspect of the present invention, Determining whether there is truncation or loss of function (a ) Determining the susceptibility of the patient to cancer, (i) obtaining a sample containing protein from the patient, Then (ii) the relative amount of the polypeptide according to the eighth aspect of the invention in said sample. Or (b) diagnosing cancer in the patient comprising the step of determining the size, and then ( i) obtaining a sample containing the protein from the patient, and then (ii) following the seventh aspect of the invention (C) determining the relative amount of the described polypeptide in said sample. Methods are provided for estimating the relative prediction of a particular outcome of cancer in cancer. Typically, compared to normal cells, proteins in cancer cells are truncated, Or the amount of protein product is reduced. We refer to “derived from the patient” as being directly derived from the patient or indirectly derived from the patient. Derived from a patient, for example, by transcription and translation in vitro, including derived samples. Protein may be produced from the isolated DNA. The sample may be any suitable sample. Biopsy samples, tumor samples (eg, in fixed paraffin embedding and And fresh or frozen tissue) and cells detached from tumor cells. While these methods are suitable for determining a patient's susceptibility to any cancer, Particularly suitable for prostate cancer, melanoma, glial or non-Hodgkin lymphoma. Therefore, at least for the determination of susceptibility to prostate cancer, patients are male. You. Prostate cancer is particularly appropriate. Conveniently, the polypeptide is prepared using the molecule defined in the ninth aspect of the invention. Is detected. Preferably, the molecule comprises a complementarity determining region specific for the polypeptide. Antibody-like molecule. Optionally, the molecule, such as a monoclonal antibody, is detected. Includes possible signs. Suitable detectable labels include:¹²⁵I and¹³¹Radiation like I Radioactive labels and other radionuclides, such as those used for diagnostic imaging, and Any convenient fluorescent substance or chemistry that can be easily incorporated into molecules such as antibodies A luminescent label is included. In addition, the term “detectable label” includes (strep Binds to other moieties (such as biotin, which can be detected by binding to toavidin) Colors compounds that can be detected by their combined potency and colorless compounds such as enzymes Moieties that can be detected by the ability to convert to a compound or vice versa (eg, Alkaline phosphatase converts colorless o-nitrophenyl phosphate to colored o-nitro Which can be converted to phenol). Conveniently, the antibody was encoded by various exons of the polypeptide. A peptide results. These can be found, for example, in tissue sections, as well as protein truncations. The cleaved protein can be detected and used in It can also detect changes in protein levels. A further aspect of the invention is the manufacture of a diagnostic reagent for cancer, especially prostate cancer. Further, in the production of a drug for treating cancer, the region is identified by the marker D10S541 and Human 10th stain bounded by DNA defined by D10S215 Provided is the use of a nucleic acid capable of selectively hybridizing to a region of a chromosome. A still further aspect of the present invention provides that the region comprises the markers D10S541 and D1 Selective for the region of human chromosome 10 to which the DNA defined by OS215 binds Nucleic acids that can hybridize to tumors and, if inserted into a patient, optionally tumor suppressor molecules A method for treating cancer, comprising the step of administering a nucleic acid encoding to a patient. Tumor suppression The present invention relates to a method for transforming a (preferably prostate) tumor cell line into an expression vector comprising a polypeptide. Characteristics of transfected and then transfected cell lines By comparing the parental strain in a xenograft model (eg, nude mouse). Can be determined. Preferably, the method is for the treatment of prostate cancer. More preferably, the nucleic acid is , In this regard, a therapeutic gene is a tumor suppressor gene. Wild-type tumor suppressor gene preferable. Still more preferably, the nucleic acid comprises a suitable delivery system. Adenovirus-derived vectors can be used in dormant or slowly dividing pairs. Suitable for repairing genetic defects in woven cells, but Because they target particularly rapidly dividing cells (eg, tumor cells), Suitable for cancer treatment in Bo. Both the amount and time of therapeutic protein produced are important in gene therapy Problem. As a result, viral vectors (eg, For example, the use of retroviral vectors) is desirable for repeated treatments because of immunogenicity. In the absence of a non-integrating alternative (eg, an adenovirus-derived vector) It can be even more beneficial. If the therapeutic gene is maintained extrachromosomally, the highest expression level Russ promoter, such as the Rous sarcoma virus long terminal repeat (Ragot et al. (1993) N Nature 361,647-650; Hyde et al. (1993) Nature 362,250-255), and adenovirus It appears to be achieved using a major late promoter. The latter in the lung epithelium Bladder fibrosis transmembrane conductance regulator transmembrane conductivity control Has been used to successfully drive the expression of the nodal (CFTR) gene (Rose nfeld et al. (1992) Cell 68, 143-155). These promoters are found in a wide range of tissues Function, so if the delivery method cannot be modified to provide specificity, It would not be appropriate to indicate heterologous expression. However, somatic cell enhancement Cell sequence-specific expression in an extrachromosomal environment wash. If recovery of the gene-vector construct is not possible, add a suicide gene to the system. In addition, toxic reactions may need to be discontinued promptly. Herpes simplex virus The midin kinase gene, when transduced into cells, Sensitive to the building (ganciclovir), which gives rise to the option of rapidly killing the cells. The use of species-specific homotropic viruses has been used as a vector in gene therapy. Alternative safer alternatives may be provided for the use of amphotropic viruses. this In the approach, a human homolog of the non-human allotrope virus receptor is The virus is modified in such a way that it can be recognized. Then, the modified The scepter is activated on cells by building molecules that are Delivered. Genetics carrying a therapeutic gene following delivery of its target to the receptor A specifically designed allotrophic virus can be injected and then injected into the target cells. Only will be incorporated. Modify the viral gene transfer vector to recognize only specific cells And therefore can target cancer cells such as prostate tumor cells Can be Similarly, a prostate-specific promoter, such as for the PSA gene To target the expression of therapeutic genes to the cancer cells, especially prostate cells. It is possible to A further aspect of the invention relates to administering a molecule to a patient according to the ninth aspect of the invention. A method of treating cancer, comprising the steps of: It consists of a part. Certain portions of the cytotoxin include (lysine, a suitable drug or a suitable Directly cytotoxic (such as a radionuclide) or (relatively non-toxic) Enzymes capable of converting precursor drugs to relatively toxic drugs (eg WO 88 / Indirectly (e.g., see US Pat. No. 07378 and WO 91/11201). It may be a vesicle. Optionally, the molecule according to the ninth aspect of the invention is an antibody, preferably a monoclonal antibody. A clonal antibody, or a fragment thereof. The compound of the present invention or a preparation thereof may be parenterally (eg, subcutaneously or intramuscularly). It may be administered by injection, but is preferably administered to the tumor. The treatment is one time It may consist of administration or multiple administrations at intervals. The compounds of the present invention can be administered alone, but with one or more acceptable carriers. Both preferably provide it as a pharmaceutical formulation. The carrier (carriers) Must be "acceptable" in the sense of being compatible with the compounds of the present invention and Must not be harmful to receptors. Typically, the carrier is sterile and pyrogenic. It may be water or saline without any substance. A further aspect of the present invention is directed to a ninth aspect of the present invention for the manufacture of a medicament for treating cancer. Provides the use of a molecule as described in For diagnostic methods and the use of the present invention, any nucleic acid used in such a method may be used. , Gene corresponding to cDNA insert of clone IMAGE 264611 and selection It is particularly preferable that the nucleic acid be capable of specifically hybridizing. For a therapy of the invention using a tumor suppressor gene, the gene may be cloned IM A gene corresponding to the cDNA insert of AGE 264611, or its appropriate Mutants, for example in truncated form such as cDNA or in intronless form It is particularly preferred that there is. The nucleic acid selectively hybridizes to that region of human chromosome 10 A polypeptide that can be encoded by a nucleic acid comprising a resizable oncogene is And the gene corresponding to the cDNA insert of clone IMAGE 264611. Particularly preferred is a polypeptide that can be encoded by Abbreviations used: SSCP indicates single stranded conformation polymorphism, PCR indicates Limerase chain reaction, YAC indicates yeast artificial chromosome, CEPH indicates Center d'Etude du Polymorphisme Human.Brief description of drawings and specific tables FIG. Microsatellite markers at 10q23-q25 in prostate tumors 2 shows an example of deletion of an allele in a protein. Upper box below each peak The figure shows the length of the allele fragment. The lower panel is the relative peak height. The “shoulder” peak to the left of the main peak is the shift in polymerase during PCR. (slippage). b. Microsatellite instability. DNA mismatch repair error -The instability likely to result from (10) is 1/3 at 21/24 loci Observed in 7 tumors. Fragment lengths are shown below each peak. here The example shown is probably 207 bp associated with the 213 bp allele extension. This results in allelic loss. FIG. 2 shows the deletion of the allele at 10q23-q25. The tumor number is shown in FIG. Corresponds to the one. The marker number in italics is the D10S number (7). Markers marked "AFM" must be given a further D number and all markers The names of the manufacturers are AFMa051tb9, AFMa124wd9, AFMa064 za5, AFMa301ex1 and AFMa273ye1. Also tumor 8 , 16,24,30 and 31 represent the entire chromosome deletion, p on chromosome 10 arm Allelic deletion at the upper markers D10S189 and / or D10S570 Is shown. Lower numbers indicate the approximate gene distance between markers in centiMorgan Indicated by Well defined marker between markers AFMa124wd9 and D10S583 Common deletion regions are about 9 centimorgans apart. In contrast, tumor 1 and Only 11 shows a specific deletion of the marker surrounding Mxil, in both cases This indicates that the allele deletion in the AFMa124wd9-D10S583 region Is related to FIG. 3 shows Mxil deletion in prostate tumor. Mxil remains in tumors 1 and 11 (AAAAC) in the 3 'untranslated region of the gene_nEvaluation of allelic deletions in polymorphisms The titer is the specificity of adjacent microsatellite markers by fluorescence-based classification. A large deletion. The number enclosed under each peak is the length of the allele fragment (top Side) and the relative peak height (bottom). Tumor 1 has apparent deletion of Mxil (Peak height reduced by 58%), while tumor 11 Despite showing the deletion of the light marker AFMa273ye1, Mxil No apparent deletion. Table 2 shows the results of evaluating prostate tumors for 10q23-q25 deletion. FIG. 4 (a) shows the YAC clone and markers D10S541 and AFM33. FIG. 4B is a physical map of a minimum area showing the position of No. 7 and FIG. 4 is a more detailed map showing the location of clones. FIG. 5 further shows LOH data from which more information can be obtained. Tables 3 to 22 show the cDNA inserts of IMAGE clone 264611. The sequenced insert of the expressed sequence tag (EST) derived from the corresponding gene Describe. FIG. 6 (SEQ ID NO: 11) shows the complete sequence of the cDNA for a particularly preferred nucleic acid molecule. . Indicates possible intron locations ("ss" above dinucleotide indicates splat Chair part). Below is the 3 'untranslated sequence. FIG. 7 (SEQ ID NO: 12) shows one reading sequence of the nucleotide sequence of FIG. 2 shows a translation in a frame. 8 to 15 (SEQ ID NOS: 13 to 20) show the IMAGE clone 26461. Exon sequence and flanking intron sequence from gene corresponding to 1 Is shown. The coding sequence is above and the intron sequence is below. Bold PCR amplification product. Exons are numbered sequentially, but further upstream or below Exons in the stream may be present, each given "exon" being a smaller exo It may be divided into parts. R is a purine.Example 1 Localization of Prostate Tumor Suppressor Gene to 10q23-q24 Boundary Materials and methods Preparation of DNA. Prostate transurethral resection for tumor and venous blood samples Obtained from men. Microdissect tumor tissue from normal tissue and remove tumor and blood DNA Prepared as previously described (6). PCR. GeneAmp 9600 Thermal Cycler (Perkin-El) 30 ng template DNA, 1 × PCR buffer (mer Cetus) Boehringer Mannheim), 20 pmol primer, 20μ M dNTPs (Boehringer Mannheim) and one unit 50 μl with Taq polymerase (Boehringer Mannheim) PCR was performed in 1 l of the reaction solution. Of microsatellite CA repeat marker (7) For amplification, one of the primers was fluorescently labeled (JOE, FAM, HEX, TA MRA; Applied Biosystems). 3 minutes at 95 ° C 30 seconds at 94 °, 30 seconds at 55 ° and 72 °, preceded by a hot start between In 30 cycles of 30 seconds, a microsatellite reaction mixture was obtained. Mxilhe Amplification of Rix-Loop-Helix and Leucine Zipper Exon (5) Temperature to 50 ° for amplification of 3 'exons Raised. The primer sequence for amplifying 3 'exon is 5'-GAGATTGAAG TGGATGTTGAAAG-3 '(SEQ ID NO: 7) (A) and 5'-AAAT ACAGGTCCTCTCGACCC-3 '(SEQ ID NO: 8) (B); Or a 324 bp product is obtained. (CAAAAA)_nBased on polymorphism fluorescence Primer A was labeled with FAM to aid classification. Allele classification. Microsatellite allele size and heterozygosity The deletion was made in 2500-ROX size standard (Applied Bi of the PCR products in a 6% denaturing polyacrylamide gel in the presence of By separating the size, then follow the manufacturer's guidelines Genes Run can software (Applied Biosystems) 37 Determined by detection using a 3A DNA sequencer. 10 marker Can be distinguished by size or fluorescent label, and are classified at the same time. Got Transfer the data to Genotyper software (Applied Biosystem) ms). Also, detecting the LOH, then staining the gel with ethidium bromide and By visualizing the PCR product using a V light source or Alternatively, transfer to a nitrocellulose membrane and then (primers in the first PCR amplification DNA sequence, such as a radiolabeled oligonucleotide used as a marker) Allele deletion by hybridization with radioactive probes Can be evaluated. In this case, the filter should be exposed to X-ray film. The PCR product is detected, and then the deletion of the allele is May be evaluated by concentration measurement. SSCP. After amplification of the Mxil intron, 10 μl of PCR product was added to 10 μl mixed with 1 formamide and heated to 90 ° C. for 3 minutes. The denatured product is kept at 25 ° C. 6% for 4-6 hours at 25 W while cooling with a blower to maintain lower temperature Run in a non-denaturing polyacrylamide gel. DNA is transferred to a nylon membrane (Hybo nd N +; Amersham), and Terminal Transfer 32P-dCTP (Amersham) using ase (Gibco-BRL) And then hybridized with both PCR primers at 68 ° C for 3-4 hours. After washing with 2xSSC / 0.1% SDS for 5-10 minutes, the filter was For 1 to 24 hours. DNA sequencing. Pass through Centricon-100 column (Amicon) Following purification by PCR, the PCR amplified Mxil exons were Quenching kits (Applied Biosystems) and manufacturers 373A Recovery and Analysis Software (Applied Bio) sy were sequenced using a 373A DNA sequencer performing the . Each exon was distributed twice (once from each end) from independent PCR reactions. Column decided. Sequence electrophoretograms are analyzed using Sequence Navigator software. Arrays using Applied Biosystems and compare visually did. result A total of 37 prostate tumors of various and histopathological grades and stages (Table 2) lack of heterozygosity at the 24CA repeat marker connecting 10q23-q25 Classified for loss (7). Prior to DNA extraction, remove tumor tissue from normal tissue Microdissected and then tumor microsatellite profiles were derived from lymphocyte DNA Allele deletions were determined relative to those of 8 samples of benign hyperplastic tissue Also studied. Reproducible signal return greater than 20% compared to normal tissue If the original is observed, we consider the tumor DNA sample to show allelic deletions. However, in practice the degree of reduction is often very large, in some cases 100% Close to. An example of an allelic deletion is shown in FIG. 23 total tumors (62%) Showed an allelic deletion at one or more markers on 10q23-q25 (Table 2). . Eight of these show deletions at all markers for which classified information is obtained, In addition, 5 or more of these 8 showed an allelic deletion at a marker on the p arm. . These suggest the absence of all chromosomes, presumably through nonsegregation. Rivalry The gene deletion data is summarized in FIG. No deletions found in benign hyperplastic tissue samples won. One tumor has a large number of loci (21/24; see FIG. 1) DNA mismatches that showed icrosatellite instability but were probably defective Depends on the collection system (10). Tumor stage and grade and 10q deletion There is no apparent correlation between the 10q deletions at any time during tumor progression. Suggest that it can happen. Retinol binding protein 4 gene (RBP4) and cytochrome P450 IIC Gene cluster (CYP2C) locus and adjacent microsatellite mer A yeast artificial chromosome (YA) having both cars D10S185 and D10S571 C) Following the identification of the clones, the locations of these genes on the deletion map were determined (11). ). The maps are cytogenetic at 10q23-24 and 10q24.1, respectively. On earth The common deletion region proximal to RBP4 and CYP2C that has been drawn is clearly shown. (12, 13) (FIG. 2). This region is the area of our study except for tumor 37. Deletion in all tumors that show a 10q deletion, No information about the car was available. Tumors 1, 3, 6, 13, 14 and 15 Are markers AFMa124wd9 and D10S583 about 9 centiMorgans apart. Define the minimal region of the deletion between Recently, Eagle et al. Reported that a small number of prostate tumors had a 10q25 mutation in the Mxil gene. Identification of mutations led to speculation that Mxil could act as a tumor suppressor. (1, 5). We have CEPH mega-YAC 936-h-5 and Placing Mxil on the deletion map after confirming its presence on 966-h-9 Yes, this is a YAC with microsatellite marker D10S597. (14). Only two tumors, 1 and 11 are direct A specific deletion of the marker flanking Mxil is shown, in both cases, This is due to the allele in the AFMa124wd9-D10S583 region (FIG. 2). Associated with gene deletion. In an attempt to further clarify the role of Mxil deletion in tumor progression, We reported that PCR amplification of individual exons followed by SSCP analysis (8) Shows deletions in tumors 1 and 11 and all regions for Mxil mutation by Tumors were screened (8). Helix-loop-helix and b Primers for PCR amplification of the exon encoding the isin zipper domain are: Obtained from Eagle et al. (5). For amplification of the final 3 'exon, Primers from the 5 'end adjacent to the son and from within the 3' untranslated sequence were used (4 5). These three pairs of primers have a codei of 66% coverage of Mxil. Give a mapping array. The genomic structure of the 5 'end of the Mxil gene has yet to be determined Not in. Accordingly, we have found that helix-loop-helix domain exons Could not be analyzed. In the SSCP analysis, Mxil No mutations can be detected over two thirds of the coding sequence. won. In addition to the SSCP analysis, the inventors reported that helicopters that previously showed mutations in prostate tumors It encoding the Tux-loop-helix and leucine zipper domains The sequence of these exons was determined directly (5). Again no mutation detected Was. We have identified Mxi in any tumor by either approach. l mutation could not be detected, but multiple mutations common in the 3 'untranslated region Detection of typology followed by sequence analysis (AAAAC)_nOf length in tandem iteration Resulting from mutation, two alleles (AAAAC)_FourAnd (AAAAC )_FiveWas obtained. Deletion of the entire 10q23-q25 region or Mxil Eight tumors showing allelic deletions in the nearby CA repeat marker (1,8, Nos. 11, 16, 17, 21, 23 and 30) are heterozygous due to this polymorphism And that these tumors are evaluated for actual Mxil deficiency Enabled. In addition, six tumors (1, 8, 16, 1) showing deletion of adjacent markers 7, 23 and 30) are Mxil as determined by fluorescence-based classification. (Fig. 3). Five of these are deletions of the entire 10q24-q25 region (FIG. 2). Thus, from a total of 23 tumors showing a 10q23-q25 deletion, The inventors (as opposed to deleting the other 10q23-q25 region or the entire region) Only one tumor (No. 1) showing a specific deletion of Mxil could be identified, This was related to the deletion of AFMa124wd9-D10S583. We also used this polymorphism to generate tumors by cycle sequencing. The effect of normal tissue contamination on the efficiency of mutation detection in yeast . Those tumors showing Mxil deletion (tumors 1, 8, 16, 17, 23 and 30 In), exon 5 containing the immediately adjacent 3 'untranslated DNA was sequenced. Lack of For the tumor 8 that showed the greatest degree of deletion of the allele, the retained allele was identified. Identified as white. From the remaining tumor, the two alleles (not shown) (AAAAC) as a result of combining the final products of_nAfter the repetition occurs And highly ambiguous sequence data was obtained. Therefore, for cycle sequencing Thus, the consequence of a small deletion or insertion event in the detected retained copy of Mxil. As a result, it is believed that any mutation that results in loss of capacity can occur. Discussion The data presented here represent the 10q23-q24 boundary, and more specifically About 9 centiMorgan between the car AFMa124wd9 and 2 shows the presence of a prostate tumor suppressor gene (or genes) in the barrel region. this The region shows a 10q deletion with the 23rd position with no information as a suitable marker 2 22 of 3 prostate tumors were deleted. 10q deletion may cause some prostate carcinogenesis In some cases, this may be an early event, and the deletion may be an early or late disease. Stage tumors. In other words, the 10q deletion is more likely in benign hyperplastic tissue samples. In the progression of the formed tumor, rather than the origin of the unobserved deletion Might be more important. However, between benign prostate hyperplasia and carcinogenesis The relationship is not clear at present, and such diseases are a precursor to malignant disease. May not be. Mxil indicates that it was mutagenized in prostate tumors, but in each tumor Only a small percentage of cells were found to have the Mxil mutation (5). Author Provide two possible explanations. First, the studied tumors have significant non-neoplastic It may have included an organization. Second, in a small number of neoplastic cells Only that there is no mutated Mxil allele. Inventors However, normal tissue contamination was less than 30% and the degree of 10q deletion was (microsa See Table 2 as calculated by telite allele deletion) 25% Suppose that the Mxil mutation cannot be detected in a microdissected tumor with a range of 79%. If so, the latter is more likely. This was also held Meaning that mutation of the Mxil allele occurs after deletion of the deleted allele. To taste. No mutations detected or only a small percentage of tumor cells Combined with the allele deletion data, Tumor suppression to 10q23-q24, which has more significant significance than Mxil in progression Indicates that a gene (or group of genes) is present. The deletion or rearrangement of 10q24-q25 is not limited to prostate cancer, Melanoma, glioma and non-Hodgkins lymphoma (15-21) Which are associated with several tumor types and have tumor suppressor genes or Suggests that a group of genes exists.Example 2: Identification of DNA containing tumor suppressor gene According to FIGS. 4 and 5, the marker defining the minimum region in the present specification is shown. More detailed mapping data between AFM 124 and D10S583 The minimum area is further defined as the distance between D10S541 and D10S215, Specifically, D10S541 and AFM337xf9, which are distances shorter than 1 cM, Can be reduced to an interval between. The physical mapping data is summarized below. All these YACs except 7B-F12 and 24G-A10 have CEPH Publicly available from the Mega-YAC library. 7B-F12 and 24G- A10 is publicly available from the ICI YAC library. These libraries Lee is the Human Genome Mapping Project Resource Center, Hinxton Hall , Hinxton, Cambridgeshire, CB10 IRQ, UK. Mega-YAC The size of the clone is obtained from the CEPH data. The ICI YAC clone is Sized by the inventors. + = STS assigned to YAC. YACs 821-D-2, 831-E-5, 796-D-5, 24G-A -10 and 732-B-4 are mapped in more detail, and a large A restriction map was obtained (see FIG. 4). This includes all restriction sites There is no. The YACs 821-D-2 and 831-E-5 are identical and It seems to extend over the region (D10S541-AFM337xf9). Follow Thus, they contain all or part of the tumor restriction gene. Using the following method, an EST (Expressed Sequence Tag) s) was created and assigned to a genomic region. 1. Construct a cDNA library from the tissue of interest. 2. Individually select individual clones and run a single sequencing pass To obtain a DNA sequence of about 200-300 bp (one EST). 3. Primers derived from each EST were designed, and an intramolecular fragment (expression Sequen) was designed. ce Tagged Site or eSTS). 4. Monosomal cellular hybrid DNA (humans each having a single human chromosome, G / panel of DNA samples derived from rodent cell hybrids) by PCR amplification T is "binned" to the chromosome. 5. Further PCR amplification from a pool of overlapping YAC clones was then performed. Finally, the ESTs are localized by PCR assignment to individual YACs. The plasmid encoded by the cDNA insert of IMAGE clone 264611 Repeptides are proteins involved in the transport of proteins to cell membranes via clathrin-coated vesicles. Some similarities to the white matter proteins tensin and auxilin sex Having. Genetics corresponding to the cDNA insert of clone IMAGE264611 Offspring are tumor suppressor genes. To identify the extent of altered, usually reduced, transcription levels, the prostate and By screening panels of RNA from other tumor cell lines, Identify gland tumor suppressor genes or genes. The transcript is probably a complex function and And the ability to mutate "hits" (see BRCA1, RB) It seems to be large because it will have some sites. Preserving hybrids Is a good indicator that genes have a "housekeeping" effect on basic cells , Its deletion can result in controlled growth and reduced tumor formation. The prostate tumor The tumor suppressor gene cDNA is identified as follows. A portion of one YAC clone was used as a probe to direct Screening a prostate cDNA library. (Marked on the restriction map in Fig. 4) The 400 kb Mlu1 fragment spanning about 75% of the minimal area (marked with Used. This fragment can be clearly separated from the pulsed field gel following cutting It is. Alternatively, the entire 24G-A10 YAC is used as a probe. A standard colony / filter hybridization approach is used. Also, an appropriate BAC or PAC clone may be used. Mutation analysis of the entire coding region in the tumor indicates that the gene Indicates that the gene is a regulatory gene. This separates each exon individually for mutation. This is done by analyzing. The mutation analysis used is a single-stranded conformation. Polymorphism (SSCP) analysis (or a modification of this technique) and direct DNA fragmentation Queuing. Genes located within the region are included in YAC, BAC and PAC Screening cDNA libraries with probes derived from human nucleic acid sequences Or by the exon trapping method, or by YAC, BAC or And sequencing of human nucleic acid sequences contained within PACs. Automation of the art makes this a routine task and distinguishes coding sequences, eg GRA A computer program such as ILII will be used. The result RT-PCR of a prostate RNA or cDNA library from a prostate tumor Confirm. The prostate tumor suppressor gene or genes may be expressed in normal prostate tissue. Mutation analysis of the entire coding region revealed that the expression of the gene (group) was correct. It is altered in prostate tumors compared to normal prostate, and the product of the gene is Truncated at the bell and the mRNA product is truncated or Or altered splicing compared to normal protein, resulting in abnormal protein Quality occurs and the protein encoded by the resulting altered gene is altered in the tissue. May have common characteristics or distribution.Example 3: Diagnostic applications of nucleic acids Chromosome deletion at a specific region on chromosome 10 (i.e., 10q23-q24 Tumor suppressor gene-containing region at the border) Detection using interface fluorescence in situ hybridization (FISH) . The cells from the biopsy sample are spread on a slide and allowed to penetrate the cell membrane. To this Thus, reagents for in situ hybridization include interfacial chromosomes It is possible to enter cells. Specific to BAC or PAC or deleted region Other suitable probes are labeled to the chromosomes after labeling them with a fluorescent dye. And hybridize. Chromosomes containing the deleted region show no signal, where Chromosomes from cells in which one chromosome 10 has been deleted from this region are: Only one signal is shown and two are not. Therefore, in a biopsy from a patient A method is provided that can detect a 10q deletion. These include benign and malignant hyperplasia Useful indicator of tumor grade stage between, embarking on a more aggressive treatment regime May indicate that it should. YAC clones suitable for use as probes include 821-D-2,8 31-E-5, 796-D-5, 24G-A-10 and 732-B-4. Can be Either BAC or PAC derived from the area of interest (see physical map) A loan may be used, including 60C5 and 46B12. Select for gene corresponding to cDNA insert of clone IMAGE264611 It is particularly useful to use nucleic acids that can specifically hybridize. The gene is As such, or appropriately sized fragments thereof, are particularly suitable as probes. The probe is ideally between 10 kb and 1 Mb, preferably 60-2 00 kb. FISH is described in Bentz et al. (1994) Leukemia 8 (9), 1447-1452. BAC or PAC clones (such as BAC clone 60C5) Used in cell nuclei isolated from tissue. The method for isolating cell nuclei from frozen tissue is as follows. It is on the street. Extraction of cell nuclei from frozen tissues (see Xiao et al. (1995) Am. J. Pathol. 147, 896-904). Used) (1) Collect all samples without thawing, and freeze the tissue in 2 × 5 × 5 mm increments. To Thaw for 1-3 minutes at room temperature. (2) Use a scalpel blade opposite to a 35mm Finely chop the tissue in a plastic Petri dish. (3) Place 0.9% NaCl on the dish Add 1 ml of 0.5% pepsin in pH 1.5. Transfer to a 15 ml centrifuge tube. ( 4) 15-30 minutes at 37 ° C., ie, the large mass of most tumors disappears Incubate in a water bath until complete. (The time it takes takes the tumor to dissociate Must be the shortest). Stir every 5 minutes. (5) Add 14 ml of PBS Then, the cells were centrifuged at 15,000 rpm for 5 minutes to collect the cell nuclei. (6) 0.5 ml All but the supernatant was removed by suction. Resuspend cell nuclei pellet in remaining supernatant You. (7) One drop (10 μl) of the suspension was applied to an uncoated slide. Dry and concentrate cells Evaluate the suspension by phase microscopy before determining if the degree is appropriate. Cell nuclei are crowded If appropriate, dilute suspension with PBS. If the cell nucleus is dilute, Add another drop of the suspension to the same spot. (8) Air dry the slide. (9) 10% Immerse in buffered formalin for 10 minutes. (10) Air drying. (11) On a hot plate Burn for 2 hours at 55 ° C. Slides can now be saved as follows: (7 Dehydrate with 5%, 85%, and 95% ethanol systems for 2 minutes each, air-dry, and slide. Store at -20 ° C with desiccant and store remaining nuclear suspension in PBS at -70 ° C . (Thaw it twice without any effect on the quality of subsequent hybridization obtain)). (12) It is necessary to denature DNA before hybridization. You. With 70% formamide / 2 × SSC pH 7.0 under coverslip Place slides on a hot plate at 73 ° C. for 2.5 minutes. (13) 70%, 95 Dehydrate each with 3% and 100% ice-cold ethanol system for 3 minutes and air dry. Hybridization Usually, each hybridization event occupies half of the slide. Plow Sign. Diagnose BAC or PAC clones (eg, BAC clone 60C5) Used as a disconnection probe. Labeled probes were made using all clones. First Commercial clones that recognize the sequence in the centromere of chromosome 0, such as Oncor D10 Z1 α-satellite is used as a control to detect chromosome 10 . The two probes are labeled differently so that they can be distinguished. The probe is Commercially available kits (eg, Bionickkit, Life Technology) es) to nick translation using biotin or digoxikenin Should be labeled. 20 ng label in Eppendorf tube Mix probe + 4 μg Cot1 DNA + 2 volumes ethanol. 25-30 Dry the mixture for minutes. 11 μl of hybridization mixture (2 × SSC , 50% formamide, 10% dextran sulfate, 1% Tween 20, pH 7.0). (Simultaneously hybridize 2 or 3 probes If necessary, add 12 μl of the hybridization mixture to (Ie, 6 μl of each hive with 2 probes) Redidation mixture), bringing them together until after the pre-annealing stage Should not). The probe is denatured at 85 ° C. for 5 minutes. Immediately place on ice for a few seconds. all Spin quickly to get the liquid to the bottom of the tube. Pre-annealing at 37 ° C for 30 minutes (Followed by mixing two or more probes if necessary). Pre-annealed Place lobe on one half of slide and cover with 22x22 mm coverslip . Seal around the coverslip with a rubber solution. After hybridization washing (The current process is performed in the dark, ie in a covered coplin jar ). At 42 ° C., 3 × 5 minutes in 50% formamide, 2 × SSC, pH 7.0. 4 3 × 5 minutes at 2 ° C. 2 × SSC, pH 7.0. 1 × 3 minutes at room temperature 4 × SSC, 0.05% Tween 20, pH 7.0 (= SSCCT). Probe detection Step 1-Pre-incubate with SSCTM. 22 × 50mm mosquito 100 μl SSCTM (= SSCT + 5%) on the slide under the burslip Marvel = 10 mls SSCT + 0.5 g Marvel, removing solids Settle down before use). Place in humid chamber at 37 ° C. for 10 minutes . Wash in SSCT for 3 minutes. (Note: Dilute all detection reagents with SSCTM. ) For each detection step, cover 100 μl of detection reagent with 22 × 50 mm Place under slip and place in humid chamber at 37 ° C. for 25-30 minutes. Each work The step is then followed by a 3 × 3 minute wash in SSCT at room temperature. During these steps, The Coplin jar should be gently shaken except in the Washing was performed for 5 minutes, and then 2 × 5 minutes in PBS. Then, the ethanol system ( Dehydrate (75%, 95%, 100% for 2 minutes each) and air dry. Then, counterstaining Containing DAPI 4,6-diamidino-2-phenylindole as (Cytofluor) (UKC ChemLab, Canterbury CT27NH, UK) See). Double probe detection (2 colors) Step 2 comprises mouse anti-digoxygenin FITC and avidi -Texas Red (Avidin-Texas Red). Step 3 consists of rabbit anti-mouse F ITC, and anti-avidin biotin. Step 4 is anti- -Rabbit FITC, Avidin-Texas Red. Counterstaining was performed using DAPI ( 0.15 μg / ml = 5 μl of 30 μl / ml stock solution + 995 μl glycerol (Site flow). result In normal prostate tumor cells, the 60C5 probe provides 2 signals (cells) per cell. ). Also, two spots per cell are centromere markers on chromosome 10. It is also found in D10Z1. Prostate cells show deletion in area covered by probe One spot generated by hybridization with the 60C5 probe If they have only or no cells, the cell is afflicted with cancer. Further In addition, the number of spots visualized using 60C5 If less than the number of spots visualized with the Kerr, the deletion is 60C5 And the cells are afflicted with cancer. Using genomic clones within the region, the interface FISH method can be used. Preferably, the genomic DNA is about 60-200 kb. Typically, a normal pair The weave shows two dots, while the tumor tissue shows one dot or none. Or, in other words, more than the number of chromosome 10 copies present in any cell. Indicates fewer dots. Using centromere repeats to determine the presence of chromosome 10 in cells Proven. However, even in normal tissue, one signal (spot) Some cells will show only For solid tissues, the efficiency is typically 85 % And 95%, that is, 85-95 cell nuclei per 100 are two Indicates a signal. Efficiency depends on both probe and experimental conditions, but is empirical. Can be optimized as much as possible. Affected tissues are cells with only one signal Indicates a very large proportion. Since some samples are mixed with normal cells, The sum does not reach 100%. Therefore, prior to these assays, It is desirable to remove an area of the cell. Thus, in summary, the method and results include: (i) obtaining a tissue sample from a patient; The affected area of the tissue is excised / purified and the cell nuclei are then extracted. (Ii) Label the probe with a detectable label. (Iii) Conditions for hybridizing The probe is brought into contact with the prepared sample in step. (Iv) hybridizing by washing Remove any excess probe that is not present. (V) Visible hybridized probe Become Probes that hybridize to a single locus are signaled by microscopy. Visualize as a null (spot). (Vi) In unaffected organizations, It can be seen that the majority of cells show two signals per cell. A small number of cells Ineffective hybridization can show less than 2 spots . (Vii) In the affected tissue, a very large number of cells are specific probes It can be seen that they show one signal or none at all. Correct Normal cell contamination affects the proportion of cells thought to have two signals This It will be recognized. Prognostic information for solid tumors, neuroblastomas, similar but unrelated probes Have been obtained by other researchers using the modified FISH method (Taylor et al. (1994) Br. J. Cancer 69, 445-451).Example 4: Detection of polypeptide Monoclonal antibodies directed against tumor suppressor gene products¹²⁵Label with I. Previous A gonad tissue sample was prepared and subjected to SDS-polyacrylamide gel electrophoresis. Isolate white matter. Electroblotting the protein on nitrocellulose membrane And incubating the membrane with the monoclonal antibody. Detect the presence of the tumor suppressor gene product. Absence of the product indicates prostate cancer Indicates increased susceptibility to the disease.Example 5: Therapeutic application The tumor suppressor gene is used for prostate cancer using an appropriate retroviral vector. To patients with susceptibility.Example 6: IMAGE clone 264611 (and its use in diagnosing prostate cancer) Primers or probes derived therefrom) Clone 264611 (and primers or probes derived therefrom) Was used for in situ hybridization, Northern analysis (also modified). Modified mRNA species profile) or altered m by quantitative RT-PCR Used for detection of RNA level. (Other than in situ hybridization) ) For expression detection methods, it is preferred to use essentially pure tumor tissue. i n situ hybridization uses immobilized tissue. Yang showing prostate cancer Sexual results indicate altered levels of expression compared to prostate tissue without cancer. Or altered pattern of transcriptional expression compared to normal prostate tissue That is. Samples suitable for analysis include fresh prostate tissue, Or a tissue collected by a biopsy needle from a metastasis. PCR primers derived from the cDNA insert of IMAGE clone 264611 For RT-PCR, followed by mutation detection or protein truncation. Do Say. Results indicating prostate cancer were coding mutations, or truncated Detection of protein products. Thus, the method of this embodiment is useful for detecting the presence of prostate cancer. Supports IMAGE 264611 (eg, those shown in FIGS. 29-34) Gene exons using primers derived from the intron sequence of the gene Amplification and then various methods (sequencing, SSCP or any form of error) Check for mutations by pairing detection) or use a protein truncation assay. Used for i. Suitable samples include fresh prostate tumor tissue, blood, urine or sperm. Contains prostate cells recovered from fluid and DNA recovered from paraffin blocks It is. Other methods for detecting mutations useful in this example include DGGE, These include direct sequencing, mismatched cleavage, heterozygous analysis and chemical cleavage.Example 7: Heterozygous deficiency (LOH) as a diagnostic / prognostic tool D10S541, D10S1765 (AFM337xf9) and D10S2 Using the heterozygosity deficiency study with D15S541-D10S215 Determine missing intervals. These markers are tandem CAs flanked by unique DNA sequences. Consists of repeating blocks, commonly known as microsatellites. C The number of A repeats indicates a mutation between alleles (homologs of different chromosomes). this is, To distinguish between two homologous chromosomal regions with these markers in a given tissue May be used. Microscopy of biopsy prostate DNA (eg, from urine or semen) The terite profile can be transferred to blood or cheek cells (eg, by means of mouth washing). D10S5 in prostate tissue by comparison with that of DNA extracted from The loss of one homolog at the 41-D10S215 interval can be assessed. This method is useful for prostate neoplasia (deletion of one homolog) and hyperplasia (no defect). It is particularly useful for distinguishing The methodology of this approach is described in Example 1 and the examples and figures given in FIG. Are described in more detail in the legend. The PCR primer sequences are as follows. Double deletions of the gene can be detected in a similar manner.Example 8: Mutation in tumor suppressor gene Nucleic acids in preferred nucleic acids of the invention comparing tumor-derived and blood-derived samples Analysis revealed the following mutations: There is a T insertion in exon 4 (tumor 24). This mutation is Cause the incorporation of inappropriate amino acids into the protein product, Subsequent insertions occur, eventually resulting in an out-of-frame stop codon resulting in occasional Early truncation occurs. PC of exon 4 (using the intron primers described in the figure for exon 4) Following the R amplification and subsequent sequencing of the PCR product using standard methods, Mutations were detected.table ^aStage is based on digital rectal exam and bone scan.^b World Health Organization grade classification: 1. Fully differentiated 2 . Moderate differentiation 3. Poor differentiation 4. Mixed differentiation^c + = 10q deletion-= 10q deletion not detected IS = unstable. Number in parentheses The letter indicates the allele deletion as determined by fluorescence-based classification. It represents the average of the degree of signal decrease for the closatellite marker. Table 3 Locus AA009519 510 bp mRNA EST July 1996 Month 29 definition ze82b09. r1 Soares fetal heart NbHH19W Homo sapiens cDNA clone SW: TENS_CHICK Q042 05 365465 5 'identical to tensin [1]. [1]; Subscription AA0095 19 NID g1470718 Keywords EST source human organism e Homo sapiens Eukaryotae; mitochondrial eukaryote ( mitochondrial eukaryotes); Metazoa; Chordata: Spinal motion Vertebrata; Eutheria; Primates; Nasal monkeys (Catarrhini) : Human superfamily (Hominidae); human (Homo). Reference 1 (1 to 510 bases) Author H illier, L., Clark, N., Dubuque, T., Elliston, K., Hawkins, M., Holman, M. , Hultman, M., Kucaba, T., Le, M., Lennon, G., Harra, M., Parsons, J., R ifkin, L., Rohlfing, T., Soares, M., Tan, F., Trevasskis, E., Waterston , R., Williamson, A., Wohldmann, P. and Wilson, R. The WashU-Mer ck EST Project Periodicals Unpublished (1995) Comments Contact: Wilson R K WashU-Herck EST project Washington University School of Hedicine 4444 Forest Park Parkway, Box 8501, St. Louis, MO 63108 Tel: 314 286 1800 Fa x: 314 286 1810 Email: est@watson.wustl.edu This clone is available through LLNL without royalty. Further information Please contact the IMAGE Consortium (info@image.llnl.gov) for details. Sequence ply Ma: mob. REGA + ET Higher-order sequence terminator: 331 Sex Source 1. . 510 / organism = "Homo sapiens" / note = "organ: Heart; vector; pT7T3D with modified polylinker (Pharmacia); site 1 : NotI; Site 2: EcoRI; First strand cDNA is NotI-oligo (dT) PrimerThe double-stranded cDNA is selected for size, and EcoRI adapter (P harmacia), cut with NotI, and then modify pT7T3D (Pharmacia) It was cloned into the NotI and EcoRI sites of the vector. Library is C One standardization step was performed for ot = 5. M. Built by Fatima Bonaldo Library. This library is a fetal lung library, Soares fetal lung Constructed from the same fetus as NbHL19W. / Clone = “365465” / Clone library = "Soares fetal heart NbHH19W" / sex = " Unknown / developmental stage = “19 weeks” / lab host = “DH10B (ampic Phosphorus resistance) "mRNA <1. . > 510 total number of bases 510 162a 92c 108 g 143 t 5 et al. Origin AA009519 Length: 510 199 September 10, 2006 19:03 Type: N Check: 3385 Table 4 Locus AA0095520 414 bp mRNA EST July 1996 29th definition ze82b09. s1 Soares fetal heart NbHH19W Mo sapiens cDNA clone 365465 3 '. Join AA009520 NID g1470719 Keywords EST supply Source human organism Homo sapiens Eukaryotae; mito Chondria eukaryotes (mitochondrial eukaryotes); metazoa (Metazoa); Object (Chordata): Vertebrate (Vertebrata); Orthodox (Eutheria); Primates (Primates); Catarrhini: human superfamily (Hominidae); human (Homo). Reference 1 (1 to Author: Hillier, L., Clark, N., Dubuque, T., Elliston, K., H awkins, M., Holman, M., Hultman, M., Kucaba, T., Le, M., Lennon, G., Marr a, M., Parsons, J., Rifkin, L., Rohlfing, T., Soares, M., Tan, F., Treva skis, E., Waterston, R., Williamson, A., Wohldmann, P. and Wilson, R. Title The WashU-Merck EST Project Periodical Unpublished (1995) Comments Contact: Wilson RK WashU-Merck EST project Washington University School of Medicine 4444 Forest Park Parkway, Box 8501, St. Louis, MO 63108 Te l: 314 286 1800 Fax: 314 286 1810 Email: est@watson.wustl.edu This clone is available through LLNL without royalty. Further information Please contact the IMAGE Consortium (info@image.llnl.gov) for details. Sequence ply Ma: mob. REGA + ET Higher-order sequence terminator: 317 Properties Positioning / fixing Source 1. . 414 / organism = "Homo sapiens" / note = "organ: heart Vector; pT7T3D with modified polylinker (Pharmacia); site 1: N otI; Site 2: EcoRI; First strand cDNA is NotI-oligo (dT) plasmid. Immer The double-stranded cDNA is selected for size, and EcoRI adapter (P harmacia), cut with NotI, and then modified pT7T3D (Pharmacia) Cloned into the NotI and EcoRI sites of the vector. Library is Co One standardization step was performed for t = 5. M. Built by Fatima Bonaldo Library. This library is a fetal lung library, Soares fetal lung N Constructed from the same fetus as bHL19W. / Clone = "365465" / Clone library = “Soares fetal heart NbHH19W” / sex = “not yet Intellect ”/ development stage =“ 19 weeks ”/ laboratory host =“ DH10B (ampicilli) MRNA Complement (<1... 414) Total Bases 104a 71 c 72 g 165 t 2 etc. Origin AA009520 Length: 414 199 September 10, 2006 19:05 Type: N Check: 5376 Table 5 Locus AA017563 241 bp mRNA EST August 1996 2nd definition ze39e04. s1 Soares Retina N2b4HR Homo Sapi Ens cDNA clone 361374 3 '. Join AA017563 NID g14779716 Keywords EST supply Source human organism Homo sapiens Eukaryotae; mito Chondria eukaryotes (mitochondrial eukaryotes); metazoa (Metazoa); Object (Chordata): Vertebrate (Vertebrata); Orthodox (Eutheria); Primates (Primates); Catarrhini: human superfamily (Hominidae); human (Homo). Reference 1 (1 to Author: Hillier, L., Clark, N., Dubuque, T., Elliston, K., H awkins, M., Holman, M., Hultman, M., Kucaba, T., Le, M., Lennon, G., Marr a, M., Parsons, J., Rifkin, L., Rohlfing, T., Soares, M., Tan, F., Treva skis, E., Waterston, R., Williamson, A., Wohldmann, P. and Wilson, R. Title The WashU-Merck EST Project Periodicals Unpublished (1995) Notes Contact: Wilson RK WashU-Merck EST project Washington University Scho ol of Medicine 4444 Forest Park Parkway, Box 8501, St. Louis, MO 63108 Tel: 314 286 1800 Fax: 314 286 1810 Email: est@watson.wustl.edu This clone is available through LLNL without royalty. Further information Please contact the IMAGE Consortium (info@image.llnl.gov) for details. Inversion possible Loan: polyT is not recognized Sequence primer: from Amersham 40M13 Forward Higher Order Terminator: 166 Properties Location / Qualitative Source 1 . . 241 / organism = “Homo sapiens” / note = “organ: eye; vector; PT7T3D (Pharmacia) with modified polylinker; Site 1: NotI: Site 2: EcoRI; first strand cDNA is NotI-oligo (dT) primer The double-stranded cDNA is selected for size, and EcoRI adapter (P harmacia), cut with NotI, and then modified pT7T3D (Pharmacia) Cloned into the NotI and EcoRI sites of the vector. The retina is 55 years old Obtained from a Kashika male and then extracted for 6 hours after removal of total cell poly (A) + RNA did. The retinal RNA was kindly provided by the University of Toronto at Roderick R. McInnes M.D .. Contributed by Ph.D. Bento Soares and M.S. Built by Fatima Bonaldo Library / clone = "361374" / clone library ー = “Soares retina N2b4HR” / sex = “male” / tissue type = “retina” / Development stage = "55 years old" / Laboratory host = "DH10B (ampicillin resistant) Sex) "mRNA complement (<1 ..> 241) total number of bases 31a 84c 8 2g 37t 7 et al. Origin AA017563 Length: 241 September 1996 10th 19:12 Type: N Check: 7697 Table 6 Locus C01084 84 bp DNA EST July 11, 1996 Definition HUMGS0007741, Human Gene Signature, 3 'Unidirectional cDNA Sequence Accession C01084NID g14333314 Keywords Gene Signa GS; EST (expression sequence marker); BodyMap; gene expression. Source 1 or more Adult human tissue. Biology Homo sapiens Eukaryotae Mitochondrial eukaryotes; metazoa; Notochord (Chordata): Vertebrate (Vertebrata); Orthodox (Eutheria); Primate (Prima) tes); Catarrhini: Hominidae; Human (Homo). Reference 1 (1 Or 84 bases) Author Okubo, K .; Title Direct Submission Periodical Submitted to DDBJ / EMLB / GenBank database (November 2, 1995) 8th). Kousaku Okubo, Institute for Molecular and Cellular Biology, Osaka University Japan 565 Osaka, Japan 1-3 Yamadaoka, Suita City (E-mail: kousaku@imcb.osaka-u.ac.jp, Tel: 06-877-5111 (e x.3315) Fax: 06-877-1922) Reference 2 (1 to 84 bases) Author Okubo. K. Mark Title BodyMap; Human Gene Expression Database Periodical Unpublished (19 (1995) Note We have extra identical cDNAs for DDBJ since 1993 Have not submitted. In this library and other 3 'direction libraries For more information on clones with this sequence, see http: //www.imcb.osaka-u. See ac.jp/bodymap. Also, the sequence of the clone represented by this GS sequence is Is shown there. Characteristics Positioning / Qualitative Sources 1. . 84 / organism = "Homo sapiens" Total number of bases 38a 12c 11g 22t 1 etc. Source C01084 Length: 84 September 10, 1996 19:12 Type: N Check: 5876 Table 7 Locus H92038 427 bp mRNA EST November 2, 1995 9th Definition ys82e12. r1 Homo sapiens cDNA clone 221 326 5 '. Join H92038 NID g1087616 Keywords EST source Human clone = 221326 Primer = M13RP1 Bully = Soares retina N2b4HR Vector = with modified polylinker pT7T3D (Pharmacia) host = DH10B (ampicillin resistance) R site 1 = NotIR site 2 = EcoRI first strand cDNA-oligo (dT) primer ー The double-stranded cDNA is selected for size, and EcoRI adapter (P harmacia), cut with NotI, and then modified pT7T3D (Pharmacia) Cloned into the NotI and EcoRI sites of the vector. The retina is 55 years old Obtained from a Kashika male and then extracted for 6 hours after removal of total cell poly (A) + RNA did. The retinal RNA was kindly provided by the University of Toronto at Roderick R. McInnes M.D .. Contributed by Ph.D. Bento Soares and M.S. Built by Fatima Bonaldo Library "Biology Homo sapiens Eukary otae); mitochondrial eukaryotes; metazoans (Metazo a); Authentic Metazoa (Eumetazoa); Bilateral (Bilateria): Coelomata ); Deuterostomia; Chordata: Vertebrate; Jaw Mouths (Gnathostomata); Teleosts (Osteichthyes); Subcarina (Sarcopterygii); Anata (Choanata); Tetrapods (Tetrapoda); Amniotes (Amniota); Mammals (Mammalia) ; Theria; Eutheria; Primates; Nasal monkeys (Catarrh) ini): Human superfamily (Hominidae); human (Homo). Reference 1 (1 to 427 bases) Hillier, L., Clark, N., Dubuque, T., Elliston, K., Hawkins, M., Holma n, M., Hultman, M., Kucaba, T., Le, M., Lennon, G., Marra, M., Parsons, J., Rifkin, L., Rohlfing, T., Soares, M., Tan, F., Trevaskis, E., Waters ton, R., Williamson, A., Wohldmann, P. and Wilson, R. Title The WashU-M erck EST Project Periodicals Unpublished (1995) Notes Contact: Wilson RK WashU-Merck EST project Washington University School of Medicine 4444 Fo rest Park Parkway, Box 8501, St. Louis, MO 63108 Tel: 314 286 1800 Fax: 314 286 1810 Email: est@watson.wustl.edu High-grade sequence terminator: 330 IMAGE Consortium, LLNL This clone is available through LLNL without royalty. I can do it. For more information contact IMAGE Consortium at info@image.llnl.gov Contact me. Characteristics Positioning / qualification Source 1. . 427 / organism = "homo Sapiens "/ clone =" 221326 "mRNA <1. . > 427 Total number of bases 103a 75c 116g 129t 4 and others Origin H92038 Length: 427 September 10, 1996 19:06 Type: N Check: 6168 Table 8 Locus H92039 117 bp mRNA EST November 2, 1995 9th Definition ys82e12. s1 Homo sapiens cDNA clone 221 326 3 '. Join H92039 NID g1087617 Keywords EST source Human clone = 221326 Primer = Promega-21m 13 library = Soares retina N2b4HR vector = modified poly PT7T3D (Pharmacia) host with anchor = DH10B (ampicillin resistance ) R site 1 = NotI R site 2 = EcoRI First strand cDNA is -oligo (d T) Primer The double-stranded cDNA is selected for size, and EcoRI adapter (P harmacia), cut with NotI, and then modified pT7T3D (Pharmacia) Cloned into the NotI and EcoRI sites of the vector. The retina is 55 years old Obtained from a Kashika male and then extracted for 6 hours after removal of total cell poly (A) + RNA did. The retinal RNA was kindly provided by the University of Toronto at Roderick R. McInnes M.D .. Contributed by Ph.D. Bento Soares and M.S. Built by Fatima Bonaldo Library "Biology Homo sapiens Eukary otae); Metazoa; Metazoa; Eumetazoa; Bilateri a): Coelomata; Coelomata; Deuterostomia; Chordata: Spinal Vertebrates; Gnathostomata; Teleosts (Osteichthyes); Meat fins Subarctic (Sarcopterygii); Choanata; Tetrapoda; Amniotes (Amn) iota); mammals (Mammalia); eutheria (Eutheria); Arconta); Primates; Catarrhini: Hominidae; Human (Homo). Reference 1 (1 to 117 bases) Author Hillier, L., Clark, N., Dubuque, T., Elliston, K., Hawkins, M., Holman, M., Hultman, M., Kucaba , T., Le, M., Lennon, G., Marra, M., Parsons, J., Rifkin, L., Rohlfing, T., Soares, M., Tan, F., Trevaskis, E., Waterston, R., Williamson, A., W ohldmann, P. and Wilson, R .; Title The WashU-Merck EST Project Periodical publication object Unpublished (1995) Note Contact: Wilson RK WashU-Merck EST project Wa shington University School of Medicine 4444 Forest Park Parkway, Box 850 1, St. Louis, MO 63108 Tel: 314 286 1800 Fax: 314 286 1810 Email: est @ wa tson.wustl.edu High-grade sequence terminator: 104 Source IMAGE Consortium, LLNL This clone is available through LLNL without royalty. For more information Contact the IMAGE Consortium (info@image.llnl.gov) for more information. Possible Inverted clone: poly (A) is not observed. Characteristics Positioning / qualitative supply Source 1. . 117 / organism = “Homo sapiens” / clone = “221326” MRNA <1. . > 117 total bases 16a 44c 37g 19t 1 Other Origin H92039 Length: 117 September 10, 1996 19: 1 2 Type: N Check: 5577 Table 9 Locus N20238 322 bp mRNA EST December 1, 1995 8th Definition yx44f06. s1 Homo sapiens cDNA clone 264 611 3 '. Join N20238 NID g1125193 Keywords EST source Human clone = 264611 Primer = m13 -40 Orientation library = Soares melanocyte 2NbHM vector = modification PT7T3D (Pharmacia) host with polylinker = DH10B (Ambicil R site 1 = NotI R site 2 = EcoRI male First strand cDNA is -E Rigo (dT) primer The double-stranded cDNA is selected for size, and EcoRI adapter (P harmacia), cut with NotI, and then modified pT7T3D (Pharmacia) Cloned into the NotI and EcoRI sites of the vector. Bento Soares and M. Library built by Fatima Bonaldo. Normal foreskin melanocyte Original RNA (FS374) was kindly provided by Dr. Anthony P. A Rubino. Biology Homo sapiens eukaryote (Homo sapiens Eukaryotae); Animal (Metazoa); True metazoan (Eumetazoa); Bilateral animal (Bilateria): Body cavity Object (Coelomata); Deuterostomia; Chordata: Vertebrate (Ver Tebrata); Gnathostomata; Teleost fish (Osteichthyes); terygii); Choanata; tetrapods (Tetrapoda); amniotes (Amniota); Genus (Mammalia); genus Subclass (Theria); eutheria (Eutheria); Arconta; Primates; Catarrhini; Hominidae; Human (Homo) . Reference 1 (1 to 322 bases) Author Hillier, L., Clark, N., Dubuque, T ., Elliston, K., Hawkins, M., Holman, M., Hultman, M., Kucaba, T., Le, M ., Lennon, G., Marra, M., Parsons, J., Rifkin, L., Rohlfing, T., Soares , M., Tan, F., Trevasskis, E., Waterston, R., Williamson, A., Wohldmann, P. and Wilson, R .; Title The WashU-Merck EST Project Periodicals Unpublished (1995) Note Contact: Wilson RK WashU-Merck EST project Washingt on Univers ity School of Medicine 4444 Forest Park Parkway, Box 8501, St. Louis, MO 63108 Tel: 314 286 1800 Fax: 314 286 1810 Email: est@watson.wustl.edu Higher-order sequence terminator: 209 Source: IMAGE Consortium, LLNL Available through the LNL without royalty. For more information see IMAGE Co Contact nsortium (info@image.llnl.gov). Possible inversion clone: p poly (A) is not recognized. Characteristics Positioning / qualification Source 1. . 322 / Organism = "Homo sapiens" / Clone = "264611" mRNA < 1. . > 322 total bases 49a 112c 98g 57t 6 etc. N20238 Length: 322 September 10, 1996 19:07 Type: N Check: 7249 Table 10 Locus N29304 427 bp mRNA EST January 4, 1996 Description yx44f06. r1 Homo sapiens cDNA clone 264611 5 '. Join N29304 NID g1147540 Keywords ES T source Human clone = 264611 Primer = T7 Library = S oares melanocyte 2NbHM vector = pT with modified polylinker 7T3D (Pharmacia) Host = DH10B (Ambicillin resistance) R site 1 = No tIR site 2 = EcoRI male First strand cDNA is -oligo (dT) primer The double-stranded cDNA is selected for size, and EcoRI adapter (P harmacia), cut with NotI, and then modify pT7T3 (Pharmacia) vector At the NotI and EcoRI sites. Bento Soares and M . Library built by Fatima Bonaldo. Derived from normal foreskin melanocytes RNA (FS374) was kindly provided by Dr. Anthony P. Al Vino. Biology Homo sapiens eukaryote (Homo sapiens Eukaryotae); Object (Metazoa); True metazoan (Eumetazoa); Bilateral animal (Bilateria): Body animal ( Coelomata); Deuterostomia; Chordata: Vertebrate (Verteb) rata); Gnathostomata; Teleost fish (Osteichthyes); ygii); Choanata; tetrapods (Tetrapoda); amniotes (Amniota); mammals ( Mammalia); Substrate of the Beast (Theria); Eutheria (Eutheria); Arconta; Primates; Catarrhini: Hominidae; Human (Homo). three Reference 1 (1 to 427 bases) Author Hillier, L., Clark, N., Dubuque, T., E lliston, K., Hawkins, M., Holman, M., Hultman, M., Kucaba, T., Le, M., L ennon, G., Marra, M., Parsons, J., Rifkin, L., Rohlfing, T., Soares, M. , Tan, F., Trevaskis, E., Waterston, R., Williamson, A., Wohldmann, P. And Wilson, R .; Title The WashU-Merck EST Project Periodical Unpublished (1 Note: Contact: Wilson RK WashU-Merck EST project Washington U niversity School of Medicine 4444 Forest Park Parkway, Box 8501, St. Lou is, MO 631 08 Tel: 314 286 1800 Fax: 314 286 1810 Email: est@watson.wustl.edu Luxury Sequence terminator: 370 Source: IMAGE Consortium, LLNL This clone is LLN Available through L without royalty fees. For more information see IMAGE Consor Contact tium (info@image.llnl.gov). Possible inversion clone: pol y (A) is not observed. Characteristics Positioning / qualification Source 1. . 427 / raw Product = “Homo sapiens” / clone = “264611” mRNA <1. . > 427 total bases 116a 90c 79g 140t 2 etc. Origin N 29304 Length: 427 September 10, 1996 19:04 Type: N Check: 9508Table 11 Locus N35389 437 bp mRNA EST January 16, 1996 Day definition yy23e03. s1 Homo sapiens cDNA clone 272 092 3 '. Join N35389 NID g11556531 Keywords EST source Human clone = 272092 Primer = m13-40 Orientation library = Soares melanocyte 2NbHM vector = modification PT7T3D (Pharmacia) host with polylinker = DH10B (ampicilli R site 1 = NotI R site 2 = EcoRI male First strand cDNA is -E Rigo (dT) primer The double-stranded cDNA is selected for size, and EcoRI adapter (P harmacia), cut with NotI, and then modified pT7T3D (Pharmacia) Cloned into the NotI and EcoRI sites of the vector. Bento Soares and M. Library built by Fatima Bonaldo. Normal foreskin melanocyte Original RNA (FS374) was kindly provided by Dr. Anthony P. " albino. Biology Homo sapiens Eukaryotae; later Live animal (Metazoa); True metazoa (Eumetazoa); Bilateral animal (Bilateria): Body cavity Animals (Coelomata); Neomata (Deuterostomia); Chordata (Chordata): Vertebrate (V ertebrata); Gnathostomata; Teleost fish (Osteichthyes); opterygii); Choanata; tetrapods (Tetrapoda); amniotes (Amniota); Milks (Mammalia); Eutheria (Eutheria); Arconta Primates; Catarrhini: Hominidae; humans (Hom) o). Reference 1 (1 to 437 bases) Author Hillier, L., Clark, N., Dubuque , T., Elliston, K., Hawkins, M., Holman, M., Hultman, M., Kucaba, T., Le , M., Lennon, G., Marra, M., Parsons, J., Rifkin, L., Rohlfing, T., Soar es, M., Tan, F., Trevaskis, E., Waterston, R., Williamson, A., Wohldmann , P. and Wilson, R .; Title The WashU-Merck EST Project Periodical Unpublished Line (1995) Notes Contact: Wilson RK WashU-Merck EST project Washin gton Univers ity School of Medicine 4444 Forest Park Parkway, Box 8501, St. Louis, MO 63108 Tel: 314 286 1800 Fax: 314 286 1810 Email: est@watson.wustl.edu High-grade sequence terminator: 311 Source: IMAGE Consortium, LLNL Available through the LNL without royalty. For more information see IMAGE Co Contact nsortium (info@image.llnl.gov). Characteristics Positioning / qualitative supply Source 1. . 437 / organism = “Homo sapiens” / clone = “272092” MRNA <1. . > 437 total bases 108a 79c 78g 16 6t 6 etc. Origin N35389 Length: 437 September 10, 1996 19 : 04 Type: N Check: 9803 Table 12 Locus N48030 372 bp mRNA EST February 14, 1996 Day definition yy23e03. r1 Homo sapiens cDNA clone SW : 272092 identical to TENS_CHICK Q04205 Tensin [1] 5 '. Join N48030 NID g1189196 Keyword EST provider Source Human clone = 272092 Primer = T7 Library = Soa res melanocyte 2NbHM vector = pT7T3 with modified polylinker D (ampicillin resistance) Host = DH10B R site 1 = NotIR site 2 = E coRI male first strand cDNA-oligo (dT) primer The double-stranded cDNA is selected for size, and EcoRI adapter (P harmacia), cut with NotI, and then modified pT7T3D (Pharmacia) Cloned into the NotI and EcoRI sites of the vector. Bento Soares and M. Library built by Fatima Bonaldo. Normal foreskin melanocyte Original RNA (FS374) was kindly provided by Dr. Anthony P. " albino. Biology Homo sapiens Eukaryotae; later Live animal (Metazoa); True metazoa (Eumetazoa); Bilateral animal (Bilateria): Body cavity Animals (Coelomata); Neomata (Deuterostomia); Chordata (Chordata): Vertebrate (V ertebrata); Gnathostomata; Teleost fish (Osteichthyes); opterygii); Choanata; tetrapods (Tetrapoda); amniotes (Amniota); Milks (Mammalia); Eutheria (Eutheria); Arconta Primates; Catarrhini; Hominidae; humans (Homo). ). Reference 1 (1 to 372 bases) Author Hillier, L., Clark, N., Dubuque, T., Elliston, K., Hawkins, M., Holman, M., Hultman, M., Kucaba, T., Le, M., Lennon, G., Marra, M., Parsons, J., Rifkin, L., Rohlfing, T., Soares , M., Tan, F., Trevasskis, E., Waterston, R., Williamson, A., Wohldmann, P. and Wilson, R .; Title The WashU-Merck EST Project Periodicals Unpublished (1995) Note Contact: Wilson RK WashU-Merck EST project Washingt on Univers ity School of Medicine 4444 Forest Park Parkway, Box 8501, St. Louis, MO 63108 Tel: 314 286 1800 Fax: 314 286 1810 Email: est@watson.wustl.edu High-grade sequence terminator: 311 Source: IMAGE Consortium, LLNL Available through the LNL without royalty. For more information see IMAGE Co Contact nsortium (info@image.llnl.gov). Characteristics Positioning / qualitative supply Source 1. . 372 / organism = “Homo sapiens” / clone = “272092” MRNA <1. . > 372 total bases 122a 67c 76g 10 1t 6 et al. Origin N48030 Length: 372 September 10, 1996 19 : 06 Type: N Check: 6071 Table 13 Locus R06763 474 bp mRNA EST April 3, 1995 Description yf11e03. s1 Homo sapiens cDNA clone 126556 3 '. Join R06763 NID g775383 Keyword EST Source Human clone = 126556 Library = Soares fetal liver spleen Viscera INFLS vector = pT7T3D with modified polylinker (Pharmacia) Host = DH10B (ampicillin resistance) Primer = SP6 R site 1 = P acIR site 2 = EcoRI Liver and spleen from a 20-week-old male fetus The first strand cDNA is a PacI-oligo (dT) primer The double-stranded cDNA is selected for size, and EcoRI adapter (P harmacia), cut with PacI, and then use the modified pT7T3 vector Pa It was cloned into the cI and EcoRI sites. Library once standardized. Bento Soares and M.S. Library built by Fatima Bonaldo. Raw Homo sapiens Eukaryotae; Metazoa; Notochord (Chordata): Vertebrate (Vertebrata); Mammalia (Gnathostomata); Mammal ( Mammalia); Eutheria; Primates; Catarrhini: baboons Hominidae; human (Homo). Reference 1 (1 to 474 bases) Author Hilli er, L., Clark, N., Dubuque, T., Elliston, K., Hawkins, M., Holman, M., H ultman, M., Kucaba, T., Le, M., Lennon, G., Marra, M., Parsons, J., Rifk in, L., Rohlfing, T., Soares, M., Tan, F., Trevasskis, E., Waterston, R. Williamson, A., Wohldmann, P. and Wilson, R .; Title The WashU-Merck ES T Project Periodicals Unpublished (1995) Notes Contact: Wilson RK Was hU-Merck EST project Washington University School of Medicine 4444 Fores t Park Parkway, Box 8501, St. Louis, MO 63108 Tel: 314 286 1800 Fax: 314 286 1810 Email: est@watson.wustl.edu High-grade sequence terminator: 108 Source: I MAGE Consortium, LLNL This clone is available at LLNL without royalty. I can do it. For more information contact IMAGE Consortium at info@image.llnl.gov Contact When. Characteristics Positioning / qualification Source 1. . 474 / organism = "Homo sapien / Clone = “126556” bases total number 108a 81c 89g 190t 6 and others Origin R06763 Length: 474 September 10, 1996 19:04 Type: N Check: 6789 Table 14 Locus R06814 429 bp mRNA EST April 3, 1995 Description yf11e03. r1 Homo sapiens cDNA clone 126556 5 '. Join R06814 NID g575434 Keywords EST Source Human clone = 126556 Library = Soares fetal liver spleen Viscera INFLS vector = pT7T3D with modified polylinker (Pharmacia) Host = DH10B (ampicillin resistance) Primer = M13RP1 R site 1 = PacI R site 2 = EcoRI Liver from male fetus at 20 weeks of gestation and Spleen 1st strand cDNA is PacI-oligo (dT) primer The double-stranded cDNA was ligated to EcoRI adapter (Pharmacia). Cleavage with PacI, followed by PacI and Eco of the modified pT7T3 vector. It was cloned into the RI site. Library once standardized. Bento Soares and And M. Library built by Fatima Bonaldo. Biology Homo Sapier Eukaryote (Homo sapiens Eukaryotae); metazoa (Metazoa); chordates (Chord) ata): Vertebrate (Vertebrata); Mammalia (Gnathostomata); Mammal (Hammalia); Positive Eutheria; Primates; Catarrhini: Hominid ae); human (Homo). Reference 1 (1 to 429 bases) Author Hillier, L., Clark , N., Dubuque, T., Elliston, K., Hawkins, M., Holman, M., Hultman, M., K ucaba, T., Le, M., Lennon, G., Marra, M., Parsons, J., Rifkin, L., Rohlf ing, T., Soares, M., Tan, F., Trevasskis, E., Waterston, R., Williamson, A., Wohldmann, P. and Wilson, R.A. Title The WashU-Merck EST Project Periodicals Unpublished (1995) Notes Contact: Wilson RK WashU-Merck EST project Washington University School of Medicine 4444 Forest Park Parkwa y, Box 8501, St. Louis, MO 63108 Tel: 314 286 1800 Fax: 314 286 1810 Em ail: est@watson.wustl.edu High-grade sequence terminator: 307 Source: IMAGE Consorti um, LLNL This clone is available through LLNL without royalty. Further Contact the IMAGE Consortium (info@image.llnl.gov) for more information. Characteristics Positioning Constant / qualitative Source 1. . 429 / organism = "Homo sapiens" / clone = "126556" Total number of bases 114a 73c 65g 176t 1 etc. Source R06814 Length: 429 September 10, 1996 19:16 Type : N Check: 889 Table 15 Locus R29457 224 bp mRNA EST April 25, 1995 F1-578D 22-week-old human fetal liver Homo sapiens cDNA Loan F1-578D 5 '. Join R29457 NID g151186 5 Keywords EST source Human organism Homo sapiens eukaryote (Homo sapiens Eukaryotae); mitochondrial eukaryotes; Metazoa; Chordata: Vertebrates; Euthus (Euth) prim); Primates; Catarrhini: Hominidae; human (Homo). Reference 1 (1 to 224 bases) Author Choi, S .; S., Yun, J.W., Choi , E .; K., Cho, Y. G., Sung, Y.C. and Shin, H.C. -S. Title Construction of a gene expression profile of a human fetal liver by single-pass cDNA seq uencing Periodicals Unpublished (1995) Notes Contact: Hee-Sup Shin De velopmental Genetics Pohang Institute of Science & Tecnology San31. Hyoj adong Pohang, 790-784 Republic of Korea Tel: 562-279-2291 Fax: 562-279-2199 Email: shinhs@vision.postech.ac.kr Seq primer: T3 primer Sex Location / qualitative Source 1. . 224 / organism = "Homo sapiens" / Note = "Vector: pBluescript II SK (-); Site 1: EcoR I; Site 2: XhoI; cDNA library was primer-primed oligo-dT And then directionally closes between the 5'ExoRI-XhoI3 'sites. Has been implemented. / Clone = “F1-578D” / clone library = "22-week-old human fetal liver cDNA library" / laboratory host = "XL1- blue MRF '"mRNA <1. . > 224 total bases 45a 78 c 67g 34t Origin R29457 Length: 224 September 10, 1996 Date 19:11 Type: N Check: 1046 Table 16 Locus T05157 266 bp mRNA EST June 30, 1993 EST03045 Homo sapiens cDNA clone HFBCS42 . Join T05157 NID g316309 Keywords EST source Human clone = HFBCS42 Library = fetal brain? (Cat # 936 206) Vector = Lambda ZAP-II Primer = M13-21 1 7-18 weeks pregnant, female; oligo-dT + random primed cDNA synthesis; Lam bdaZAP-II vector, 1.0 kb average insert size. Biology Homo sa Piens Eukaryote (Homo sapiens Eukaryotae); Animalia (Animalia); Chordate (Ch ordata): Vertebrates (Vertebrata); Mammals (Mammalia); Eutheria); Haplorhihi; Catarrhini: Homi (Homi) nidae). Reference 1 (1 to 266 bases) Author Adams, M .; D., Kerlavage, A. R., Fields, C. and Venter, J. et al. C. Title 3400 expressed sequence tag is human brain Nature Genet. Identifies the diversity of native transcripts 4, 256-267 (1993) Note Contact: Adams, MD The Institute for Genomic Research 932 Cloper Road , Gaithersburg, MD 20878 Tel: 3018699056 Fax: 3018699423 Email: mdadams @ ti gr.org. Characteristics Positioning / qualification Source 1. . 266 / organism = "Homo Sapi Ence "/ clone =" HFBCS42 "total number of bases 95a 44c 57 g 69t 1 et al. Origin T05157 Length: 266 September 10, 1996 19:06 Type: N Check: 4398Table 17 Locus T60214 369 bp mRNA EST February 9, 1995 Description yc22c07. r1 Homo sapiens cDNA clone 81420 5 '. Join T60214 NID g662051 Keyword EST Source Human clone = 81420 Library = Stratagene lung ( # 937210) Vector = pBluescript SK-host = SOL R cell (kanamycin resistance) Primer = M13RP1 R site 1 = EcoR IR site 2 = Normal lung tissue from XhoI 72 year old man Unidirectionally cloned . Primer: oligo dT Average insert size:. 1.0 kb; Uni-ZA P XR Vector: 5 'adapter sequence: 3 'adapter sequence: Biology Homo sapiens eukaryote (Homo sapiens Eukaryotae); Metazoa (Meta zoa); Chordata: Vertebrate; Vertebrate; Gnathostomata; Mammals; mammals; Eutheria; primates; nasal monkeys (Catarrhin) i): Human superfamily (Hominidae); human (Homo). Reference 1 (1 to 396 bases) Author Hillier, L., Clark, N., Dubuque, T., Elliston, K., Hawkins, M., Holman , M., Hultman, M., Kucaba, T., Le, M., Lennon, G., Marra, M., Parsons, J ., Rifkin, L., Rohlfing, T., Soares, M., Tan, F., Trevaskis, E., Waterst on, R., Williamson, A., Wohldmann, P. and Wilson, R. Title The WashU-Me rck EST Project Periodicals Unpublished (1995) Notes Contact: Wilson RK WashU-Merck EST project Washington University School of Medicine 4444 Forest Park Parkway, Box 8501, St. Louis, MO 63108 Tel: 314 286 1800 F ax: 314 286 1810 Email: est@watson.wustl.edu High-grade sequence terminator: 242 provided Source: IMAGE Consortium, LLNL This clone is royalty free through LLNL Available at See the IMAGE Consortium (info@image.llnl.g ov). Characteristics Positioning / qualification Source 1. . 396 / organism = " Homo Sapi Ence "/ clone =" 81420 "bases total 119a 75c 74g 126t 2 etc. Origin T60214 Length: 396 September 10, 1996 19:07 Type: N Check: 5134 Table 18 Locus W23656 451 bp mRNA EST May 6, 1995 Description zb46c05. r1 Soares Fetal Lung NbHL19W Homo Sapi Ens cDNA clone 306632 5 '. Join W23656 NID g1300471 Keywords EST source human organism Homo sapiens Eukaryote (Homo sapiens Eukaryotae); mitochondrial eukaryote (mitochondrial eukaryotes); Metazoa; Chordata: Vertebrate ; Eutheria; Primates; Catarrhini: Human Superfamily (Hom) inidae); human (Homo). Reference 1 (1-451 bases) Author Hillier, L., Cl ark, N., Dubuque, T., Elliston, K., Hawkins, M., Holman, M., Hultman, M. , Kucaba, T., Le, M., Lennon, G., Marra, M., Parsons, J., Rifkin, L., Ro hlfing, T., Soares, M., Tan, F., Trevasskis, E., Waterston, R., Williamso n, A., Wohldmann, P. and Wilson, R .; Title The WashU-Merck EST Project Periodicals Unpublished (1995) Notes Contact: Wilson RK WashU-Merck ES T project Washington University School of Medicine 4444 Forest Park Park way, Box 8501, St. Louis, MO 63108 Tel: 314 286 1800 Fax: 314 286 1810 Email: est@watson.wustl.edu This clone is royalty free through LLNL Available at See the IMAGE Consortium (info@image.llnl.gov for more information) Contact). Seq primer: mob. REGA + ET high-end array stop Agent: 240 Properties Location / Qualitative Source 1. . 451 / organism = "homo sa Piens "/ Note =" Organ ?: Lung; Vector: With modified polylinker Site pT7T3D (Pharmacia); site 1: NotI; site 2: EcoRI: first Strand cDNA is NotI-oligo (dT) primer The double-stranded cDNA is selected for size, and EcoRI adapter (P harmacia), cut with NotI, and then modify the modified pT7T3 vector (Pharma cia) at the NotI and EcoRI sites. Once every Cot = 5 Library. Bento Soares and M.S. Built by Fatima Bonaldo Re Library. This library is a fetal lung library, Soares fetal heart Constructed from the same fetus as gut NbHH19W. / Clone = "30663" 2 "/ Clone library =" Soares fetal lung NbHL19W "/ copy Growth stage = "19 weeks" / Laboratory host = "DH10B (ampicillin shochu)" mRNA <1. . > 451 total bases 148a 76c 82g 141 t4 et al. Origin W23656 Length: 451 September 10, 1996 19: 10 Type: N Check: 6961Table 19 Locus W27533 902 bp mRNA EST May 8, 1996 Definition Start random synthesis of Homo sapiens cDNA sublibrary 32b2 human retinal cDNA. Join W27533 NID g1307337 Keywords EST source human. Biology Homo sapiens eukaryote (Homo sa piens Eukaryotae); mitochondrial eukaryotes; later Raw Animals (Metazoa); Chorddata (Chordata): Vertebrate (Vertebrata); Orthodox (Euther) ia); Primates; Nasal monkeys (Catarrhini): Hominidae; human (H omo). Reference 1 (1 to 902 bases) Authors Macke, J., Smallwood, P. and And Nathans, J.M. Title Adult human retinal cDNA Periodical Unpublished (1996 Year) Note Contact: Dr. Jeremy Nathans Dr. Jeremy Nathans, Dept. of Molec ular Biology and Genetics Johns Hopkins School of Medicine 725 North Wo lfe Street, Baltimore, MD 21205 Tel: 410 9554 678 Fax: 410 614 0827 Ema il: jeremy_nathans@qmail.bs.jhu.edu Get clones from this library Can not. PCR primer Positive: Backwards: Sequence primer: Characteristics Positioning / qualification Source 1. . 902 / organism = "Homo sapiens" / Note = “Organ: eye; Vector: Lambda gt10; Site 1: EcoRI; Site 2: EcoRI; The library used for sequencing was a human retinal cDNA library. This is a sublibrary derived from the library. Derived from retinal cDNA library DNA Of the insert, random primer synthesis, PCR amplification and size selection And then cloned into lambda gt10. Placing individual plaques and PCR Used as template for amplification, then use these PCR products for sequencing Was. "/ Sex =" mixed (male and female) "/ tissue type =" retina "/ developmental stage Page = “adult” / lab host = “E. Coli K892 strain” mRNA <1 . . > 902 total bases 124a 110c 117g 131t 420 etc. Origin W27533 Length: 902 September 10, 1996 19:05 TA Ip: N Check: 224 Table 20 Locus W30684 601 bp mRNA EST May 9, 1996 Definition zb77b11. r1 Soares senescent fibroblast NbHSF homo-sa Piens cDNA clone 309597 5 '. Join W30684NID g131870 Keywords EST source Human. Biology Homo Sapien Eukaryote (Homo sapiens Eukaryotae); mitochondrial eukaryote (mitochondria l eukaryotes); Metazoa; Chordata: Vertebrate a); Eutheria; Primates; Catarrhini: Human Superfamily (H ominidae); human (Homo). Reference 1 (1 to 601 bases) Author Hillier, L. , Clark, N., Dubuque, T., Elliston, K., Hawkins, M., Holman, M., Hultman , M., Kucaba, T., Le, M., Lennon, G., Marra, M., Parsons, J., Rifkin, L. , Rohlfing, T., Soares, M., Tan, F., Trevasskis, E., Waterston, R., Willi Amson, A., Wohldmann, P. and Wilson, R.A. Title The WashU-Merck EST Proje ct Periodicals Unpublished (1995) Notes Contact: Wilson RK WashU-Merc k EST project Washington University School of Medicine 4444 Forest Park Parkway, Box 8501, St. Louis, MO 63108 Tel: 314 286 1800 Fax: 314 286 18 10 Email: est@watson.wustl.edu This clone is licensed through LLNL. Available without. See the IMAGE Consortium (info@image.llnl .gov). Sequence primer: mob. REGA + ET high-grade array stop Stopping agent: 463. Characteristics Positioning / qualification Source 1. . 601 / organism = "homo ・ Sapiens ”/ Note =“ Vector: pT7T3D (P with modified polylinker) harmacia) V type: phagemid; site 1: NotI; site 2: EcoRI ; Double stranded cDNA, select size and ligate to EcoRI adapter (Pharmacia) And cut with NotI and then Not of the modified pT7T3D (Pharmacia) vector. It was cloned into I and EcoRI sites. Library for Cot = 5 One standardization step was performed. Bento Soares and M.S. Built by Fatima Bonaldo Library. / Clone = “309597” / clone library ー = “S oaes senescent fibroblast NbHSF "Laboratory host =" DH10B (Ampisi Phosphorus resistance) "mRNA <1. . > 601 total bases 176a 105c 122g 197t 1 etc. Origin W30684 Length: 601 September 1996 March 10 19:13 Type: N Check: 2320 Table 21 Locus W81026 453 bp mRNA EST June 26, 1996 Date Definition zd84a07. r1 Soares fetal heart NbHH19W homo -Sapiens cDNA clone 347316 5 '. Join W81026 N ID g1392060 Keywords EST source Human. Biology Homo sa Piens eukaryote (Homo sapiens Eukaryotae); mitochondrial eukaryote (mitoch ondrial eukaryotes); Metazoa; Metadata; Chordata: Vertebrate (Ver.) tebrata); Eutheria; Primates; Catarrhini: human Superfamily (Hominidae); Human (Homo). Reference 1 (1-453 bases) Author Hilli er, L., Clark, N., Dubuque, T., Elliston, K., Hawkins, M., Holman, M., H ultman, M., Kucaba, T., Le, M., Lennon, G., Marra, M., Parsons, J., Rifk in, L., Rohlfing, T., Soares, M., Tan, F., Trevasskis, E., Waterston, R. Williamson, A., Wohldmann, P. and Wilson, R .; Title The WashU-Merck ES T Project Periodicals Unpublished (1995) Notes Contact: Wilson RK Was hU-Merck EST project Washington University School of Medicine 4444 Fores t Park Parkway, Box 8501, St. Louis, MO 63108 Tel: 314 286 1800 Fax: 314 286 1810 Email: est@watson.wustl.edu This clone is available through LLNL. Available without royalties. See the IMAGE Consortium (info @ i Contact mage.llnl.gov). Sequence primer: mob. REGA + ET luxury Sequence terminator: 392. Characteristics Positioning / qualification Source 1. . 453 / creature = "Homo sapiens" / note = "organ: heart; vector: modified polylinker Having pT7T3D (Pharmacia); site 1: NotI; site 2: EcoRI; Strand cDNA is NotI-oligo (dT) primer The double-stranded cDNA is selected for size, and EcoRI adapter (P harmacia), cut with NotI, and then modified pT7T3D (Pharmacia) Cloned into the NotI and EcoRI sites of the vector. Library is Co One standardization step was performed for t = 5. Bento Soares and M.S. Fatima Bonaldo To The library thus constructed. This library is a fetal lung library Soares fetal lung was constructed from a fetus similar to NbHL19W. " /Black = "347316" / clone library = "Soares fetal heart N" bHH19W "Laboratory host =" DH10B (ampicillin resistance) "mRNA Complement <1. . > 453 total bases 190a 77c 79g 106t 1 and others Origin W81026 Length: 453 September 10, 1996 19:03 Type: N Check: 2953 Table 22 Locus W81062 429 bp mRNA EST June 26, 1996 Date Definition zd84a07. s1 Soares fetal heart NbHH19W homo -Sapiens cDNA clone 347316 3 '. Join W81062 N ID g1392114 Keywords EST source Human. Biology Homo sa Piens eukaryote (Homo sapiens Eukaryotae); mitochondrial eukaryote (mitoch ondrial eukaryotes); Metazoa; Metadata; Chordata: Vertebrate (Ver.) tebrata); Eutheria; Primates; Catarrhini: human Superfamily (Hominidae); Human (Homo). Reference 1 (1 to 429 bases) Author Hilli er, L., Clark, N., Dubuque, T., Elliston, K., Hawkins, M., Holman, M., H ultman, M., Kucaba, T., Le, M., Lennon, G., Marra, M., Parsons, J., Rifk in, L., Rohlfing, T., Soares, M., Tan, F., Trevasskis, E., Waterston, R. Williamson, A., Wohldmann, P. and Wilson, R .; Title The WashU-Merck ES T Project Periodicals Unpublished (1995) Notes Contact: Wilson RK Was hU-Merck EST project Washington University School of Medicine 4444 Fores t Park Parkway, Box 8501, St. Louis, MO 63108 Tel: 314 286 1800 Fax: 314 286 1810 Email: est@watson.wustl.edu This clone is available through LLNL. Available without royalties. See the IMAGE Consortium (info @ im age.llnl.gov). Sequence primer: mob. REGA + ET High Class terminator: 324. Characteristics Positioning / qualification Source 1. . 429 / creature = "Homo sapiens" / note = "organ: heart; vector: modified polylinker PT7T3D (Pharmacia) with; Site 1: NotI; Site 2: EcoRI; Single-stranded cDNA is NotI-oligo (dT) primer The double-stranded cDNA is selected for size, and EcoRI adapter (P harmacia), cut with NotI, and then modified pT7T3D (Pharmacia) Cloned into the NotI and EcoRI sites of the vector. Library is Co One standardization step was performed for t = 5. Bento Soares and M.S. Fatima Bonaldo To The library thus constructed. This library is a fetal lung library Soares fetal lung was constructed from a fetus similar to NbHL19W. " /Black Clone = "347316" / clone library = "Soares fetal heart N bHH19W "Laboratory host =" DH10B (ampicillin resistance) "mRNA Complement <1. . > 429 total bases 105a 83c 77g 161t 3 and others Origin W81062 Length: 429 September 10, 1996 19:05 Type: N Check: 7359 References

【手続補正書】【提出日】１９９８年６月１５日（１９９８．６．１５）【補正内容】特許請求の範囲１．その核酸が酵母大工染色体（ＹＡＣ）７４６−Ｈ−８、８２１−Ｄ−２、８３１−Ｅ−５、９２１−Ｆ−８、７３８−Ｂ−１２、７９６−Ｄ−５、８２９ −Ｅ−１、６７８−Ｆ−１、８３９−Ｂ−１、７３４−Ｂ−４、７Ｂ−Ｆ１２、７５７−Ｄ−８、７７３−Ｃ−２、７８７−Ｄ−７、８３１−Ｅ−９、８５５− Ｄ−２、８５５−Ｇ−４、８７６−Ｇ−１１、８９４−Ｈ−５、９２２−Ｅ−６、９３４−Ｄ−３、９６４−Ａ−８、９６８−Ｅ−６または２４Ｇ−Ａ１０のいずれでもなく、かつ、表３ないし２２に記載されているごとき発現配列標識（ＥＳＴ）のいずれでもなく、かつ、細菌人工染色体（ＢＡＣ）またはＰ１由来人工染色体（ＰＡＣ）Ｂ２Ｆ２０、Ｐ４０Ｆ１０、Ｐ７２Ｇ８、Ｐ７４Ｎ２、Ｐ２７４Ｄ２１、Ｂ７６Ｉ１０、Ｂ７９Ａ１９、Ｂ７９０１、Ｂ９３Ｆ１２、Ｂ１２２Ｌ２２、Ｐ２０１Ｊ８、Ｐ２０１Ｐ５、Ｐ２０９Ｋ３、Ｐ３１６Ｎ１４、Ｂ４６Ｂ１２、Ｂ６０Ｃ５、Ｂ１４５Ｃ２２、Ｂ１５０Ｋ４、Ｂ１５０Ｎ３、Ｂ１８１Ｆ１５およびＢ１８８Ｌ２２のいずれでもないという条件で、その領域がマーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ２１５により定義されたＤＮＡによって境界付けられるヒト第１０染色体の領域と、またはＩＭＡＧＥクローン２６４６１１のヒトＤＮＡ配列と、あるいはその配列が図６に示されている核酸かその相補体と選択的にハイブリダイズできることを特徴とする単離された核酸。２．マーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ１７６５により定義されたＤＮＡによって境界付けられるヒト第１０染色体の領域と選択的にハイブリダイズできる請求項１記載の単離された核酸。３．酵母人工染色体（ＹＡＣ）７４６−Ｈ−８、８２１−Ｄ−２、８３１−Ｅ −５、９２１−Ｆ−８、７９６−Ｄ−５、８２９−Ｅ−１、８３９−Ｂ−１、７３４−Ｂ−４または２４Ｇ−Ａ１０のいずれかか、もしくはＢＡＣまたはＰＡＣＢ２Ｆ２０、Ｐ４０Ｆ１０、Ｐ７２Ｇ８、Ｐ７４Ｎ２、Ｐ２７４Ｄ２１、Ｂ７６Ｉ１０、Ｂ７９Ａ１９、Ｂ７９０１、Ｂ９３Ｆ１２、Ｂ１２２Ｌ２２、Ｐ２０１Ｊ８、Ｐ２０１Ｐ５、Ｐ２０９Ｋ３、Ｐ３１６Ｎ１４、Ｂ４６Ｂ１２、Ｂ６０Ｃ５、Ｂ１４５Ｃ２２、Ｂ１５０Ｋ４、Ｂ１５０Ｎ３、Ｂ１８１Ｆ１５およびＢ１８８Ｌ２２のいずれかのヒト由来ＤＮＡと選択的にハイブリダイズできる請求項１または請求項２記載の単離された核酸。４．該ＹＡＣが９２１−Ｆ−８、７４６−Ｈ−８、８２１−Ｄ−２、８３１− Ｅ−５、７９６−Ｄ−５、２４Ｇ−Ａ−１０および７３４−Ｂ−４のいずれかであるか、もしくは該ＢＡＣがＢ２Ｆ２０、Ｐ４６Ｂ１２、Ｂ６０Ｃ５、Ｂ１５０Ｋ４、Ｂ１５０Ｎ３、Ｂ１４５Ｃ２２、Ｂ１８１Ｆ１５およびＢ１８８Ｌ２２のいずれかであるか、または該ＰＡＣがＰ４０Ｆ１０およびＰ２７４Ｄ２１のいずれかである請求項３記載の単離された核酸。５．ＩＭＡＧＥクローン２６４６１１のｃＤＮＡ挿入断片もしくは該遺伝子の断片または変異体に対応する遺伝子を含む請求項１から４のいずれか１項記載の単離された核酸。６．請求項５で定義されたごとき遺伝子と選択的にハイブリダイズできる請求項１記載の単離された核酸。７．該核酸がＤＮＡである請求項１から６のいずれか１項記載の単離された核酸。８．該核酸が一本鎖である請求項１から７のいずれか１項記載の単離された核酸。９．該核酸が二本鎖である場合には、該核酸が１００００より小さい塩基対を、有する、または該核酸が一本鎖である場合には、該核酸が１００００より小さい塩基を有する請求項１から８のいずれか１項記載の単離された核酸。１０．該核酸が二本鎖である場合には、該核酸が１０００より小さい塩基対を、有する、または該核酸か一本鎖である場合には、該核酸が１０００より小さい塩基を有する請求項１から９のいずれか１項記載の単離された核酸。１１．該核酸が二本鎖である場合には、該核酸が１０ないし１００までの塩基対を有する、または該核酸が一本鎖である場合には、該核酸が１０ないし１００までの塩基を有する請求項１から１０のいずれか１項記載の単離された核酸。１２．該核酸が二本鎖である場合には、該核酸が１５ないし３０までの塩基対を有する、または該核酸が一本鎖である場合には、該核酸が１５ないし３０までの塩基を有する請求項１から１１のいずれか１項記載の単離された核酸。１３．腫瘍抑制遺伝子もしくはその断片または変異体を含む請求項１記載の単離された核酸。１４．腫瘍抑制遺伝子もしくはその誘導体または断片または変異体の産物を含む、その領域がマーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ２１５によって定義されたＤＮＡによって境界付けられるヒト第１０染色体の領域と選択的にハイブリダイズできることを特徴とする単離された核酸。１５．クローンＩＭＡＧＥ２６４６１１のｃＤＮＡ挿入断片もしくは該遺伝子の断片または変異体と対応する遺伝子を含む請求項１３記載の単離された核酸。１６．請求項１５で定義されたごとき遺伝子と選択的にハイブリダイズできる請求項１３または１４記載の単離された核酸。１７．該核酸がｃＤＮＡである請求項１３記載の単離された核酸。１８．腫瘍抑制活性を示すポリペプチドをコードする請求項１から４のいずれか１項記載の単離された核酸。１９．該ポリペプチドがＩＭＡＧＥクローン２６４６１１にコードされるポリペプチド配列を含む請求項１８記載の単離された核酸。２０．該ポリペプチドが表３から２２のいずれか一つに記載されるクローンのいずれか一つにコードされるポリペプチド配列を含む請求項１８記載の単離された核酸。２１．該ポリペプチドが酵母人工染色体（ＹＡＣ）７４６−Ｈ−８、８２１− Ｄ−２、８３１−Ｅ−５、９２１−Ｆ−８、７３８−Ｂ−１２、７９６−Ｄ−５、８２９−Ｅ−１、６７８−Ｆ−１、８３９−Ｂ−１、７３４−Ｂ−４、７Ｂ− Ｆ１２、７５７−Ｄ−８、７７３−Ｃ−２、７８７−Ｄ−７、８３１−Ｅ−９、８５５−Ｄ−２、８５５−Ｇ−４、８７６−Ｇ−１１、８９４−Ｈ−５、９２２ −Ｅ−６、９３４−Ｄ−３、９６４−Ａ−８、９６８−Ｅ−６または２４Ｇ−Ａ１０のいずれか一つ、または、細菌人工染色体（ＢＡＣ）またはＰ１由来人工染色体（ＰＡＣ）Ｂ２Ｆ２０、Ｐ４０Ｆ１０、Ｐ７２Ｇ８、Ｐ７４Ｎ２、Ｐ２７４Ｄ２１、Ｂ７６Ｉ１０、Ｂ７９Ａ１９、Ｂ７９０１、Ｂ９３Ｆ１２、Ｂ１２２Ｌ２２、Ｐ２０１Ｊ８、Ｐ２０１Ｐ５、Ｐ２０９Ｋ３、Ｐ３１６Ｎ１４、Ｂ４６Ｂ１２、Ｂ６０Ｃ５、Ｂ１４５Ｃ２２、Ｂ１５０Ｋ４、Ｂ１５０Ｎ３、Ｂ１８１Ｆ１５およびＢ１８８Ｌ２２のいずれか一つにコードされるポリペプチド配列を含む請求項１８記載の単離された核酸配列。２２．該ポリペプチドが図８から１５のいずれか一つにコードされるポリペプチドを含む請求項１８記載の単離された核酸配列。２３．その領域がマーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ２１５によって定義されたＤＮＡによって境界付けられるト第１０染色体の領域と選択的にハイブリダイズでき、検出可能な標識をさらに含むことを特徴とする単離された核酸。２４．該核酸が表３ないし２２に記載されたごとき発現配列標識（ＥＳＴ）または図８ないし１５のイントロン配列のいずれかにおいて、ヒト由来配列を含む請求項２３記載の単離された核酸。２５．該核酸がクローンＩＭＡＧＥ２６４６１１のｃＤＮＡ挿入断片もしくは該遺伝子の断片または変異体と対応する遺伝子を含む請求項２３記載の単離された核酸。２６．請求項２５で定義されたごとき遺伝子と選択的にハイブリダイズできる請求項２３記載の単離された核酸。２７．表３ないし２２に記載されたごとき発現配列標識（ＥＳＴ）または図８ないし１５のイントロン配列のいずれかにおいて、ヒト由来配列と選択的にハイブリダイズできる請求項１記載の単離された核酸。２８．それから発現配列標識（ＥＳＴ）が誘導される遺伝子、もしくは該イントロン配列もしくはその断片または変異体を含む遺伝子を含む請求項２７記載の単離された核酸。２９．ＤＮＡの増幅に適し、かつ、請求項２４で定義されたごとき発現配列標識（ＥＳＴ）またはイントロン配列とハイブリダイズするプライマーの群から選択される請求項１記載の単離された核酸。３０．腫瘍抑制活性を示すポリペプチドをコードする核酸を含む哺乳動物細胞内への導入のためのベクターで、該核酸はヒト第１０染色体の領域内に含まれる配列を含み、上記領域はマーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ２１５によって定義されたＤＮＡによって境界づけられることを特徴とするベクター。３１．第１０染色体の該領域がＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ１７６５によって定義されたＤＮＡによって境界づけられることを特徴とする請求項３０記載のベクター。３２．腫瘍抑制活性を示すポリペプチドをコードする核酸を含む哺乳動物細胞内への導入のためのベクターで、該ポリペプチドが酵母人工染色体（ＹＡＣ）７４６−Ｈ−８、８２１−Ｄ−２、８３１−Ｅ−５、９２１−Ｆ−８、７３８−Ｂ −１２、７９６−Ｄ−５、８２９−Ｅ−１、６７８−Ｆ−１、８３９−Ｂ−１、７３４−Ｂ−４、７Ｂ−Ｆ１２、７５７−Ｄ−８、７７３−Ｃ−２、７８７−Ｄ −７、８３１−Ｅ−９、８５５−Ｄ−２、８５５−Ｇ−４、８７６−Ｇ−１１、８９４−Ｈ−５、９２２−Ｅ−６、９３４−Ｄ−３、９６４−Ａ−８、９６８− Ｅ−６または２４Ｇ−Ａ１０のいずれか一つ、または、細菌人工染色体（ＢＡＣ）またはＰ１由来人工染色体（ＰＡＣ）Ｂ２Ｆ２０、Ｐ４０Ｆ１０、Ｐ７２Ｇ８、Ｐ７４Ｎ２、Ｐ２７４Ｄ２１、Ｂ７６Ｉ１０、Ｂ７９Ａ１９、Ｂ７９０１、Ｂ９３Ｆ１２、Ｂ１２２Ｌ２２、Ｐ２０１Ｊ８、Ｐ２０１Ｐ５、Ｐ２０９Ｋ３、Ｐ３１６Ｎ１４、Ｂ４６Ｂ１２、Ｂ６０Ｃ５、Ｂ１４５Ｃ２２、Ｂ１５０Ｋ４、Ｂ１５０Ｎ３、Ｂ１８１Ｆ１５およびＢ１８８Ｌ２２のいずれか一つにコードされるポリペプチド配列を含むことを特徴とするベクター。３３．腫瘍抑制活性を示すポリペプチドをコードする核酸を含む哺乳動物細胞内への導入のためのベクターで、該ポリペプチドが表３から２２のいずれか一つに記述される、またはＩＭＡＧＥクローン２６４６１１に記述されるクローンのいずれか一つに含まれる核酸配列を含む核酸によってコードされることを特徴とするベクター。３４．腫瘍抑制活性を示すポリペプチドをコードする核酸を含む哺乳動物細胞内への導入のためのベクターで、上記ポリペプチドが図７に示されているまたはその変異体あるいは断片であることを特徴とするベクター。３５．該ポリペプチドが図７のアミノ酸１６３から５６５であることを特徴とする請求項３４記載のベクター。３６．発現ベクターであることを特徴とする請求項３０から３５のいずれか１項記載のベクター。３７．クローニングベクターであることを特徴とする請求項３０から３５のいずれか１項記載のベクター。３８．請求項３０から３５のいずれか１項に定義される核酸を含む発現ベクター。３９．該ベクターが非ウイルス性であること得お特徴とする請求項３０から３８のいずれか１項記載のベクター。４０．該ベクターがウイルス性であることを特徴とする請求項３０から３８のいずれか１項記載のベクター。４１．該ベクターがアデノウイルスである請求項４０記載のベクター。４２．請求項３０から４１のいずれか１項のベクターを含む細胞。４３．（ｉ）患者由来の核酸を含む試料を得、次いで（ｉｉ）該核酸を、その領域がマーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ２１５またはその突然変異体対立遺伝子によって定義されたＤＮＡによって境界付けられる第１０染色体の領域と、またはＩＭＡＧＥクローン２６４６１１のヒトＤＮＡ配列と、あるいはその配列が図６に示されている核酸かその突然変異体対立遺伝子かその相補体と選択的にハイブリダイズできる核酸と接触させる工程を有することを特徴とする癌に対する患者の感受性を判定する方法。４４．（ｉ）患者由来の核酸を含む試料を得、次いで（ｉｉ）該核酸を、その領域がマーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ２１５またはその突然変異体対立遺伝子によって定義されたＤＮＡによって境界付けられるヒト第１０染色体の領域と、またはＩＭＡＧＥクローン２６４６１１のヒトＤＮＡ配列と、あるいはその配列が図６に示されている核酸かその突然変異体対立遺伝子かその相補体と選択的にハイブリダイズできる核酸と接触させる工程を有することを特徴とする患者の癌を診断する方法。４５．（ｉ）患者由来の核酸を含む試料を得、次いで（ｉｉ）該核酸を、その領域がマーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ２１５またはその突然変異体対立遺伝子によって定義されたＤＮＡによって境界付けられる第１０染色体の領域と、またはＩＭＡＧＥクローン２６４６１１のヒトＤＮＡ配列と、あるいはその配列が図６に示されている核酸かその突然変異体対立遺伝子かその相補体と選択的にハイブリダイズできる核酸と接触させる工程を有することを特徴とする患者の癌の特定の結果の相対予測を推定する方法。４６．該癌が前立腺癌である請求頂４３から４５のいずれか１項記載の方法。４７．該試料が前立腺組織、血液、精液または尿よりなる群から選択される請求項４３ないし４６いずれか１項記載の方法。４８．その領域がマーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ２１５によって定義されたＤＮＡによって境界付けられるヒト第１０染色体の領域と、またはＩＭＡＧＥクローン２６４６１１のヒトＤＮＡ配列と、あるいはその配列が図６に示されている核酸かその突然変異体対立遺伝子かその相補体と選択的にハイブリダイズできる核酸がさらに検出可能な標識を含む請求項４３ないし４７いずれか１項記載の方法。４９．該核酸が、その領域がマーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ１７６５によって定義されたＤＮＡによって境界付けられる結合するヒト第１０染色体の領域と選択的にハイブリダイズできる請求項４３ないし４８いずれか１項記載の方法。５０．該核酸が、酵母人工染色体（ＹＡＣ）７４６−Ｈ−８、８２１−Ｄ−２、８３１−Ｅ−５、９２１−Ｆ−８、７９６−Ｄ−５、８２９−Ｅ−１、８３９ −Ｂ−１、７３４−Ｂ−４または２４Ｇ−Ａ１０のいずれかか、もしくはＢＡＣまたはＰＡＣＢ２Ｆ２０、Ｐ４０Ｆ１０、Ｐ７２Ｇ８、Ｐ７４Ｎ２、Ｐ２７４Ｄ２１、Ｂ７６Ｉ１０、Ｂ７９Ａ１９、Ｂ７９０１、Ｂ９３Ｆ１２、Ｂ１２２Ｌ２２、Ｐ２０１Ｊ８、Ｐ２０１Ｐ５、Ｐ２０９Ｋ３、Ｐ３１６Ｎ１４、Ｂ４６Ｂ１２、Ｂ６０Ｃ５、Ｂ１４５Ｃ２２、Ｂ１５０Ｋ４、Ｂ１５０Ｎ３、Ｂ１８１Ｆ１５およびＢ１８８Ｌ２２のいずれかのヒト由来ＤＮＡと選択的にハイブリダイズできる請求項４９記載の方法。５１．該ＹＡＣが９２１−Ｆ−８、７４６−Ｈ−８、８２１−Ｄ−２、８３１ −Ｅ−５、７９６−Ｄ−５、２４Ｇ−Ａ−１０または７３４−Ｂ−４のいずれかか、もしくは該ＢＡＣまたはＰＡＣＢ２Ｆ２０、Ｐ４０Ｆ１０、Ｐ７２Ｇ８、Ｐ７４Ｎ２、Ｐ２７４Ｄ２１、Ｂ７６Ｉ１０、Ｂ７９Ａ１９、Ｂ７９０１、Ｂ９３Ｆ１２、Ｂ１２２Ｌ２２、Ｐ２０１Ｊ８、Ｐ２０１Ｐ５、Ｐ２０９Ｋ３、Ｐ３１６Ｎ１４、Ｐ４６Ｂ１２、Ｂ６０Ｃ５、Ｂ１４５Ｃ２２、Ｂ１５０Ｋ４、Ｂ１５０Ｎ３、Ｂ１８１Ｆ１５およびＢ１８８Ｌ２２のいずれかである請求項５０記載の方法。５２．該核酸がＩＭＡＧＥクローン２６４６１１のｃＤＮＡ挿入断片もしくは該遺伝子の断片または変異体と対応する遺伝子を含む請求項４９記載の方法。５３．該核酸が請求項５２で定義された遺伝子と選択的にハイブリダイズできる請求項４９記載の方法。５４．該核酸がＤＮＡである請求項４９記載の方法。５５．該核酸が一本鎖である請求項４９記載の方法。５６．該核酸が二本鎖の場合には、該核酸が１００００より小さい塩基対を有する、または該核酸が一本鎖の場合には、１００００より小さい塩基を有する請求項４９記載の方法。５７．該核酸が二本鎖の場合には、該核酸が１０００より小さい塩基対を有する、または該核酸が一本鎖の場合には、１０００より小さい塩基を有する請求項４９記載の方法。５８．該核酸が二本鎖の場合には、該核酸が１０ないし１００までの塩基対を、有する、または該核酸が一本鎖の場合には、１０ないし１００までの塩基を有する請求項４９記載の方法。５９．該核酸が二本鎖の場合には、該核酸が１５ないし３０までの塩基対を有する、または該核酸が一本鎖の場合には、１５ないし３０までの塩基を有する請求項４９記載の方法。６０．該核酸が腫瘍抑制遺伝子もしくはその断片または変異体を含む請求項４９記載の方法。６１．該核酸が表３ないし２２に記載されたごとき発現配列標識（ＥＳＴ）、または図８ないし１５に記載されたごときイントロン配列のいずれかにおけるヒト由来配列であるか、もしくはそれらとハイブリダイズできる請求項４９記載の方法。６２．該核酸が、発現配列標識（ＥＳＴ）または請求項２４に定義されたごときイントロン配列からＤＮＡを増幅するのに適したプライマーよりなる群から選択される請求項６１記載の方法。６３．その領域がマーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ２１５またはその突然変異体対立遺伝子によって定義されたＤＮＡによって境界付けられる第１０染色体の領域と、またはＩＭＡＧＥクローン２６４６１１のヒトＤＮＡ配列と、あるいはその配列が図６に示されている核酸かその突然変異体対立遺伝子かその相補体と選択的にハイブリダイズできる核酸およびヌクレオシド三リン酸もしくはデオキシヌクレオチド三リン酸またはその誘導体を含むことを特徴とする、その領域がマーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ２１５によって定義されたＤＮＡによって境界付けられるヒト第１０染色体の領域の存在または不在、もしくはそこにおける突然変異を検出する系。６４．該ヌクレオシド三リン酸もしくはデオキシヌクレオチド三リン酸が検出可能なように標識され、好ましくは放射活性で標識される請求項６３記載の系。６５．その領域がマーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ２１５またはその突然変異体対立遺伝子によって定義されたＤＮＡによって境界付けられる第１０染色体の領域と、またはＩＭＡＧＥクローン２６４６１１のヒトＤＮＡ配列と、あるいはその配列が図６に示されている核酸かその突然変異体対立遺云子かその相補体と選択的にハイブリダイズできる核酸および酵素を修飾する核酸を含むことを特徴とする、その領域がマーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ２１５によって定義されたＤＮＡによって境界付けられるヒト第１０染色体の領域の存在または不在、もしくはそこにおける突然変異を検出する系。６６．酵素を修飾する核酸がＤＮＡポリメラーゼ、ＤＮＡリガーゼ、ポリヌクレオチドキナーゼ、制限エンドヌクレアーゼまたはヌクレアーゼよりなる群より選択される請求項６５記載の系。６７．請求項１３ないし２２のいずれか１項記載の核酸によってコードされ得る腫瘍抑制活性を示すことを特徴とする組み換えポリペプチド。６８．請求項３０から４２のいずれか１項のベクターを含む細胞内で発現される組換えポリペプチド。６９．請求項６７記載のポリペプチドと結合できることを特徴とする分子。７０．（ｉ）患者由来の蛋白質を含む試料を得、次いで（ｉｉ）請求項６７に記載のポリペプチドの該試料中の相対量、もしくは請求項６７に記載のポリペプチドの切断、すなわち機能の欠損が存在するかどうかを判定する工程を有することを特徴とする癌に対する患者の感受性を判定する方法。７１．（ｉ）患者由来の蛋白質を含む試料を得、次いで（ｉｉ）請求項６７に記載のポリペプチドの該試料中の相対量、もしくは請求項６７に記載のポリペプチドの切断、すなわち機能の欠損が存在するかどうかを判定する工程を有することを特徴とする患者における癌を診断する方法。７２．（ｉ）患者由来の蛋白質を含む試料を得、次いで（ｉｉ）請求項６７に記載のポリペプチドの該試料中の相対量、もしくは請求項６７に記載のポリペプチドの切断、すなわち機能の欠損が存在するかどうかを判定する工程を有することを特徴とする患者における癌の特定の結果の相対予測を推定する方法。７３．該癌が前立腺癌である請求項７０ないし７２いずれか１項記載の方法。７４．請求項６７記載のポリペプチドが請求項６９記載の分子によって検出される請求項７０ないし７２いずれか１項記載の方法。７５．該試料が前立腺組織、血液、尿または精液よりなる群から選択される請求項７０ないし７４いずれか１項記載の方法。７６．該分子が検出可能な標識を含む請求項７４記載の方法。７７．癌を診断するための試薬の製造における、または癌を治療するための薬剤の製造における、その領域がマーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ２１５またはその突然変異体対立遺伝子によって定義されたＤＮＡによって境界付けられる第１０染色体の領域と、またはＩＭＡＧＥクローン２６４６１１のヒトＤＮＡ配列と、あるいはその配列が図６に示されている核酸かその相補体と、または請求項３０から３５のいずれか１項に定義されるような核酸かベクターと選択的にハイブリダイズできる核酸の使用。７８．その領域がマーカーＤ１０Ｓ５４１およびＤ１０Ｓ２１５によって定義されたＤＮＡによって境界付けられるヒト第１０染色体の領域と、または請求項３０から４２のいずれか１頂に定義されるような核酸かベクターと、選択的にハイブリダイズできる核酸を患者に投与する工程を有することを特徴とする癌治療法。７９．該核酸が腫瘍抑制遺伝子もしくはその断片または誘導体である請求項７８記載の方法。８０．該核酸がウイルス性ベクターを含む請求項７８または７９記載の方法。８１．該癌が前立腺癌である請求項７８記載の方法。８２．さらに細胞毒性部分を含む請求項６９記載の分子を患者に投与する工程を有することを特徴とする癌治療法。８３．癌を治療するための薬剤の製造において、該分子がさらに細胞毒性部分を含む請求項６９記載の分子の使用。８４．（ｉ）その組織由来の核酸を含む試料を得、次いで（ｉｉ）該核酸のマイクロサテライトプロフィルと対照（同系接合の）組織のそれと比較し、該マイクロサテライトがＤ１０Ｓ５４１−Ｄ１０Ｓ２１５間を参照して選択される工程を有することを特徴とする組織試料における異型接合性の欠損を判定する方法。８５．腫瘍細胞に請求項１８から２２のいずれか１項のポリペプチドを投与することを含む腫瘍細胞成長の抑制法で、該ポリペプチドが腫瘍細胞に入ることを特徴とする方法。８６．腫瘍細胞に請求項６７から６８のいずれか１項のポリペプチドを投与することを含む腫瘍細胞成長の抑制法で、該ポリペプチドが腫瘍細胞に入ることを特徴とする方法。８７．該ポリペプチドが非ウイルス性ベクター内にパッケージされることを特徴とする請求項８５の方法。８８．該ポリペプチドがウイルス性ベクター内にパッケージされることを特徴とする請求項８５の方法。８９．該ウイルス性ベクターがアデノウイルスであることを特徴とする請求項８８の方法。９０．治療される患者に上記核酸を輸送するための系をさらに含む請求項３０または３２から３４のいずれか１項に定義される核酸。９１．請求項３０または３２から３４のいずれか１項に定義される核酸、および製薬学的に許容できるキャリアーを含む製薬学的処方。９２．図７に与えられるアミノ酸配列またはその断片あるいは変異体を持つポリペプチド。９３．ＤＮＡを増幅するためのプライマーで、該プライマーは図８から１５のいずれか一つに示される配列から由来する、またはその相補体であることを特徴とするプライマー。 [Procedural amendment] [Date of submission] June 15, 1998 (1998.6.15) [Content of amendment] Claims 1. The nucleic acid is yeast carpenter chromosome (YAC) 746-H-8, 821-D-2, 831-E-5, 921-F-8, 738-B-12, 796-D-5, 829-E-1. 678-F-1, 839-B-1, 732-B-4, 7B-F12, 757-D-8, 773-C-2, 787-D-7, 831-E-9, 855-D Any of -2, 855-G-4, 876-G-11, 894-H-5, 922-E-6, 934-D-3, 964-A-8, 968-E-6 or 24G-A10 Neither is the expression sequence tag (EST) as described in Tables 3 to 22, and is a bacterial artificial chromosome (BAC) or a P1-derived artificial chromosome (PAC) B2F20, P40F10, P72G8, P74N2 , P2 74D21, B76I 0, B79A19, B7901, B93F12, B12 2L22, P201J8, P201P5, P209K3, P316N14, B46B12, B60C5, B145C22, B150K4, B150N3, B18, 1F15 and B188L22, and the S, D1, S2, and D15 areas 1 and 15 have the D, S1 and D2, S15, S2, D15, S2, D15, S2, and S15, D15, S15, and S1D15 and S15, S15 and S2, D15, S2, D15, S2, D15, and S15, S15 and S2, D15, S2, D15, S15, and S1 regions D1, S2, D15, and S15, respectively, by using a marker D1 and S15. The region of human chromosome 10 bounded by the defined DNA, or the human DNA sequence of IMAGE clone 264611 , or the ability of that sequence to selectively hybridize with the nucleic acid shown in FIG. 6 or its complement. An isolated nucleic acid characterized by: 2. 2. The isolated nucleic acid of claim 1, which is capable of selectively hybridizing to a region of human chromosome 10 bounded by DNA defined by markers D10S541 and D10S1765. 3. Yeast Artificial Chromosome (YAC) 746-H-8, 821-D-2, 831-E-5, 921-F-8, 796-D-5, 829-E-1, 839-B-1, 732 Either B-4 or 24G-A10, or BAC or PAC B2F20, P40F10, P72G8, P74N2, P274D21, B761110, B79A19, B7901, B93F12, B122L22, P201J8, P201P5, P209K3, P316B12B60 The isolated nucleic acid according to claim 1 or 2, wherein the nucleic acid can selectively hybridize with any of human-derived DNAs of C5, B145C22, B150K4, B150N3, B181F15 and B188L22. 4. Whether the YAC is 921-F-8, 746-H-8, 821-D-2, 831-E-5, 796-D-5, 24G-A-10, or 732-B-4 or the BAC is B2F20, P46B12, B60C5, B150 K4 , B150N3, B145C22, B181F15 and either a either a B188L22, or isolated nucleic acid of claim 3 wherein said PAC is either P40F10 and P274D21 . 5. The isolated nucleic acid according to any one of claims 1 to 4, comprising a gene corresponding to a cDNA insert of IMAGE clone 264611 or a fragment or a mutant of the gene. 6. An isolated nucleic acid according to claim 1, which is capable of selectively hybridizing with a gene as defined in claim 5. 7. The isolated nucleic acid according to any one of claims 1 to 6, wherein the nucleic acid is DNA. 8. The isolated nucleic acid according to any one of claims 1 to 7, wherein the nucleic acid is single-stranded. 9. The method according to claim 1, wherein the nucleic acid has less than 10,000 base pairs when the nucleic acid is double-stranded, or the nucleic acid has less than 10,000 base pairs when the nucleic acid is single-stranded. 9. The isolated nucleic acid according to any one of 8 above. 10. The method according to claim 1, wherein the nucleic acid has less than 1000 base pairs when the nucleic acid is double-stranded, or has less than 1000 base pairs when the nucleic acid is single-stranded. 10. The isolated nucleic acid according to any one of 9 above. 11. If the nucleic acid is double-stranded, the nucleic acid has from 10 to 100 base pairs, or if the nucleic acid is single-stranded, the nucleic acid has from 10 to 100 bases. Item 11. The isolated nucleic acid according to any one of items 1 to 10. 12. If the nucleic acid is double-stranded, the nucleic acid has from 15 to 30 base pairs, or if the nucleic acid is single-stranded, the nucleic acid has from 15 to 30 bases. Item 12. The isolated nucleic acid according to any one of items 1 to 11. 13. Tumor suppressor gene or isolated nucleic acid of claim 1, wherein the fragments or variants thereof. 14． Including products of tumor suppressor gene or derivative or fragment thereof or variant, a single that its area is equal to or capable of selectively hybridizing to a defined human chromosome 10 in the region bounded by DNA by markers D10S541 and D10S215 Isolated nucleic acids. 15. 14. The isolated nucleic acid of claim 13, which comprises a gene corresponding to the cDNA insert of clone IMAGE264611 or a fragment or variant of said gene. 16. An isolated nucleic acid according to claim 13 or 14, which is capable of selectively hybridizing with a gene as defined in claim 15. 17． 14. The isolated nucleic acid according to claim 13, wherein said nucleic acid is cDNA. 18. The isolated nucleic acid according to any one of claims 1 to 4, which encodes a polypeptide exhibiting a tumor-suppressing activity . 19. 20. The isolated nucleic acid of claim 18, wherein said polypeptide comprises a polypeptide sequence encoded by IMAGE clone 264611 . 20. 20. The isolated nucleic acid of claim 18, wherein said polypeptide comprises a polypeptide sequence encoded by any one of the clones set forth in any of Tables 3 to 22 . 21. The polypeptide is a yeast artificial chromosome (YAC) 746-H-8, 821-D-2 , 831-E-5 , 921-F-8 , 738-B-12, 796-D-5 , 829-E-. 1,678-F-1,839-B-1,734-B-4,7B- F12,757-D-8,773-C-2,787-D-7,831-E- 9,855- D-2,855-G-4,876- G-11,894-H-5,922 -E-6,934-D-3,964-A-8,968-E-6 or 24G-A 10 one of, or bacterial artificial chromosome (BAC) or P1-derived artificial chromosome (PAC) B2F20, P40F10, P72G8 , P74N2, P27 4D21, B76I10, B79A19, B7901, B93F12, B122 L22, P201J8, 201P5, P209K3, P316N14, B46 B12 , B60C5, B145C22, B150K4, B150N3, B181 F15 and isolated nucleic acid sequence of claim 18 comprising a polypeptide sequence encoded by any one of B188L22. 22. The polypeptide isolated nucleic acid sequence of claim 18 further comprising a polypeptide encoded by any one of FIG 15. 23 . An isolated nucleic acid, the region of which is selectively hybridizable to a region of chromosome 10 bounded by DNA defined by markers D10S541 and D10S215, and further comprising a detectable label. 24 . 24. The isolated nucleic acid of claim 23, wherein said nucleic acid comprises a human-derived sequence in either an expressed sequence tag (EST) as set forth in Tables 3 to 22 or the intron sequences of FIGS. 25 . The isolated nucleic acid of claim 23 comprising a gene nucleic acid corresponds to a fragment or variant of cDNA insert or the gene clones IMAGE264611. 26 . 24. The isolated nucleic acid of claim 23, which is capable of selectively hybridizing with a gene as defined in claim 25 . 27 . 2. The isolated nucleic acid of claim 1, which is capable of selectively hybridizing to a human-derived sequence in either an expressed sequence tag (EST) as set forth in Tables 3-22 or the intron sequence of Figures 8-15. 28 . 28. The isolated nucleic acid of claim 27 , comprising a gene from which an expression sequence marker (EST) is derived, or a gene comprising said intron sequence or a fragment or variant thereof. 29 . 25. The isolated nucleic acid of claim 1, wherein the isolated nucleic acid is suitable for amplification of DNA and is selected from the group of primers that hybridize to an expression sequence tag (EST) or an intron sequence as defined in claim 24 . 30. A vector for introduction into a mammalian cell containing a nucleic acid encoding a polypeptide exhibiting a tumor-suppressing activity , wherein the nucleic acid comprises a sequence contained within a region of human chromosome 10 , wherein the region comprises markers D10S541 and D10S215. vector characterized in that it is bounded by defined DNA by. 31. The vector of claim 30, wherein the region of chromosome 10 is characterized in that it is bounded by DNA defined by the D10S541 and D10S1765. 32. A vector for introduction into a mammalian cell containing a nucleic acid encoding a polypeptide exhibiting a tumor-suppressing activity , wherein the polypeptide is a yeast artificial chromosome (YAC) 746-H-8, 821-D-2, 831 -E-5, 921-F-8, 738-B- 12, 796-D-5, 829-E-1, 678-F -1, 839- B-1, 732-B-4, 7B-F12 , 757-D-8, 773-C-2, 787-D-7, 831-E-9, 855-D-2, 855- G-4, 876-G-11, 894-H-5, 922. Any one of -E- 6, 934-D-3, 964-A-8, 968- E-6 or 24G-A10, or a bacterial artificial chromosome (BAC ) or a P1-derived artificial chromosome (PAC) B2F20; P40F10, P72G 8, P74N2, P27 D21, B76I10, B79A19, B7901, B93F12, B122L22, P201J8, P201P5, P209K3, P316N14, B46B12, B60C5, B145C22, B150K4, B150N3, B181F15 and characterized in that it comprises a polypeptide sequence encoded by any one of B188L22 Vector. 33. A vector for introduction into a mammalian cell containing a nucleic acid encoding a polypeptide exhibiting a tumor suppressor activity , wherein the polypeptide is described in any one of Tables 3 to 22 or described in IMAGE clone 264611. A vector characterized by being encoded by a nucleic acid comprising a nucleic acid sequence contained in any one of the clones obtained . 34. A vector for introduction into a mammalian cell containing a nucleic acid encoding a polypeptide exhibiting a tumor-suppressing activity, wherein the polypeptide is shown in FIG. 7 or a mutant or fragment thereof. vector. 35. 35. The vector of claim 34, wherein said polypeptide is from amino acids 163 to 565 of FIG . 36. The vector according to any one of claims 30 to 35, which is an expression vector . 37. The vector of claim 30 to 35 Neu Zureka 1 wherein which is a cloning vector. 38. Expression vector comprising a nucleic acid as defined in any one of claims 30 to 35. 39. The vector according to any one of claims 30 to 38, wherein the vector is non-viral . 40. 39. The vector according to any one of claims 30 to 38, wherein the vector is viral . 41. 41. The vector according to claim 40, wherein said vector is an adenovirus. 42. A cell comprising the vector of any one of claims 30 to 41. 43 . (I) obtaining a sample containing nucleic acid from a patient, then (ii) the nucleic acid, the region of chromosome 10 bounded by DNA defined was or markers D10S541 and D10S215 by the mutant allele a region, or a human DNA sequence of the IMAGE clone 264611 or the step of contacting a nucleic acid whose sequence is capable of selectively hybridising to the nucleic acid or its mutant allelic or its complement shown in Figure 6 A method for determining a patient's susceptibility to cancer, characterized by having 44 . (I) obtaining a sample containing nucleic acid from a patient, then (ii) the nucleic acid, its area was or markers D10S541 and D10S215 human chromosome 10 bounded by DNA defined by the mutant allele Or the human DNA sequence of IMAGE clone 264611 , or a nucleic acid whose sequence can selectively hybridize to the nucleic acid shown in FIG. 6 or its mutant allele or its complement. A method of diagnosing cancer in a patient, comprising: 45 . (I) obtaining a sample containing nucleic acid from a patient, then (ii) the nucleic acid, the region of chromosome 10 bounded by DNA defined was or markers D10S541 and D10S215 by the mutant allele a region, or a human DNA sequence of the IMAGE clone 264611 or the step of contacting a nucleic acid whose sequence is capable of selectively hybridising to the nucleic acid or its mutant allelic or its complement shown in Figure 6 A method of estimating a relative prediction of a particular outcome of cancer in a patient, characterized in that the method comprises: 46 . 46. The method according to any one of claims 43 to 45, wherein the cancer is prostate cancer. 47 . Sample is prostate tissue, blood, 請 Motomeko 43 to 46 method according to any one selected from the group consisting of semen or urine. 48 . The region of human chromosome 10 whose region is bounded by the DNA defined by markers D10S541 and D10S215, or the human DNA sequence of IMA GE clone 264611, or the nucleic acid whose sequence is shown in FIG. 48. The method of any one of claims 43 to 47 , wherein the nucleic acid that can selectively hybridize to a mutant allele or its complement further comprises a detectable label. 49 . 49. The method of any one of claims 43 to 48 , wherein said nucleic acid is selectively hybridizable to a region of human chromosome 10 to which its region is bounded by DNA defined by markers D10S541 and D10S1765 . 50 . The nucleic acid is a yeast artificial chromosome (YAC) 746-H-8, 821-D-2, 831-E-5, 921-F-8, 796-D-5, 829-E-1, 839-B-. Either 1,734-B-4 or 24G-A10, or BAC or PAC B2F20, P40F10, P72G8, P74N2, P274 D21, B76I10, B79A19, B7901, B93F12, B122L 22, P201J8, P201P5, P209K3, P316N14. 50. The method according to claim 49, which is capable of selectively hybridizing to any of the human-derived DNAs of B46B12, B60C5, B145C22, B150K4, B150N3, B181F15 and B188L22. 51 . The YAC is any of 921-F-8, 746-H-8, 821-D-2, 831-E-5, 796-D-5, 24G-A-10 or 732-B-4, or The BAC or PAC B2F20, P40F10, P72G8, P74N2, P274D21, B76I10, B79A19, B7901, B9 3F12, B122L22, P201J8, P201P5, P209K3, P316N14, P46B12, B60B5, B145B18B18B15B22 51. The method of claim 50 , wherein 52 . 50. The method of claim 49, wherein the nucleic acid comprises a gene corresponding to a cDNA insert of IMAGE clone 264611 or a fragment or variant of the gene. 53 . 50. The method of claim 49 , wherein said nucleic acid is selectively hybridizable with a gene as defined in claim 52 . 54 . 50. The method according to claim 49 , wherein said nucleic acid is DNA. 55 . 50. The method according to claim 49 , wherein said nucleic acid is single-stranded. 56 . 50. The method of claim 49 , wherein said nucleic acid has less than 10,000 base pairs when said nucleic acid is double-stranded, or less than 10,000 base pairs when said nucleic acid is single-stranded. 57 . 50. The method of claim 49 , wherein the nucleic acid has less than 1000 base pairs when the nucleic acid is double stranded, or has less than 1000 base pairs when the nucleic acid is single stranded. 58 . 50. The method according to claim 49 , wherein the nucleic acid has from 10 to 100 base pairs when the nucleic acid is double-stranded, or 10 to 100 bases when the nucleic acid is single-stranded. Method. 59 . 50. The method according to claim 49 , wherein the nucleic acid has from 15 to 30 base pairs when the nucleic acid is double-stranded, or has from 15 to 30 base pairs when the nucleic acid is single-stranded. . 60 . The method according to claim 4 9, wherein said nucleic acid comprises a tumor suppressor gene or fragment or variant thereof. 61 . The nucleic acid is a human-derived sequence in any of the expressed sequence tags (ESTs) as described in Tables 3 to 22, or the intron sequences as described in FIGS. 8 to 15, or can hybridize thereto. 49. The method according to 49 . 62 . 62. The method of claim 61 , wherein said nucleic acid is selected from the group consisting of an expression sequence tag (EST) or a primer suitable for amplifying DNA from an intron sequence as defined in claim 24 . 63 . And the region of chromosome 10 bounded by DNA defined by the markers D10S541 and D10S215 or a mutation thereof allele region, or a human DNA sequence of the IMAGE clone 264611, Oh Rui its sequence in FIG. 6 characterized in that it comprises a nucleic acid or its mutant alleles or the phase complement and capable of selectively hybridizing nucleic acid and nucleoside triphosphates or deoxynucleoside triphosphates or derivatives thereof shown, is that region A system for detecting the presence or absence of, or a mutation in, the region of human chromosome 10 bounded by the DNA defined by markers D10S541 and D10S215. 64 . 64. The system of claim 63, wherein said nucleoside triphosphate or deoxynucleotide triphosphate is detectably labeled, preferably radioactively labeled. 65 . And the region of chromosome 10 bounded by DNA defined by the markers D10S541 and D10S215 or a mutation thereof allele region, or a human DNA sequence of the IMAGE clone 264611, Oh Rui its sequence in FIG. 6 characterized in that it comprises a nucleic acid modifying the nucleic acid and enzyme or the indicated or nucleic acid mutant thereof conflict Nokounko and its phase complement capable of selectively hybridising, define the region by the marker D10S541 and D10S215 A system for detecting the presence or absence of, or a mutation in, a region of human chromosome 10 bounded by isolated DNA. 66 . 66. The system of claim 65 , wherein the nucleic acid modifying the enzyme is selected from the group consisting of DNA polymerase, DNA ligase, polynucleotide kinase, restriction endonuclease or nuclease. 67 . A recombinant polypeptide exhibiting a tumor-suppressing activity that can be encoded by the nucleic acid according to any one of claims 13 to 22 . 68. Any recombinant polypeptide that will be expressed in cells containing one of the vector of claims 30 42. 69 . A molecule capable of binding to the polypeptide of claim 67 . 70 . (I) obtaining a sample containing the protein from the patient, and then (ii) detecting the relative amount of the polypeptide of claim 67 in the sample or the cleavage of the polypeptide of claim 67 , ie, loss of function. A method of determining the susceptibility of a patient to cancer, comprising the step of determining whether or not it is present. 71 . (I) obtaining a sample containing the protein from the patient, and then (ii) detecting the relative amount of the polypeptide of claim 67 in the sample or the cleavage of the polypeptide of claim 67 , ie, loss of function. A method of diagnosing cancer in a patient, comprising the step of determining whether it is present. 72 . (I) obtaining a sample containing the protein from the patient, and then (ii) detecting the relative amount of the polypeptide of claim 67 in the sample or the cleavage of the polypeptide of claim 67 , ie, loss of function. A method of estimating a relative prediction of a particular outcome of cancer in a patient, comprising determining whether it is present. 73 . 73. The method according to any one of claims 70 to 72 , wherein the cancer is prostate cancer. 74 . 73. The method of any one of claims 70 to 72 , wherein the polypeptide of claim 67 is detected by a molecule of claim 69 . 75 . 75. The method of any one of claims 70 to 74 , wherein said sample is selected from the group consisting of prostate tissue, blood, urine or semen. 76 . 75. The method of claim 74 , wherein said molecule comprises a detectable label. 77 . In the manufacture of a reagent for diagnosing cancer, or in the manufacture of a medicament for the treatment of cancer, second is that area was or markers D10S541 and D10S215 bounded by DNA defined by the mutant allele 10 chromosome regions, or the human DNA sequence of the IMAGE clone 264611, or that its sequence is as defined in any one of the nucleic acid or its complement shown in Figure 6, or from 請 Motomeko 30 35 The use of nucleic acids that can selectively hybridize with various nucleic acids or vectors . 78 . 43. Selectively hybridizes with a region of human chromosome 10 whose region is bounded by DNA defined by markers D10S541 and D10S215, or with a nucleic acid or vector as defined at any one of claims 30 to 42. A method for treating cancer, which comprises the step of administering a nucleic acid that can be soyed to a patient. 79 . The method of claim 7 8, wherein said nucleic acid is a tumor suppressor gene or fragment or derivative thereof. 80 . 80. The method of claim 78 or 79 , wherein said nucleic acid comprises a viral vector. 81 . 79. The method of claim 78 , wherein said cancer is prostate cancer. 82 . 70. A method for treating cancer, comprising the step of administering the molecule of claim 69 further comprising a cytotoxic moiety to the patient. 83 . 70. Use of a molecule according to claim 69 , wherein said molecule further comprises a cytotoxic moiety in the manufacture of a medicament for treating cancer. 84 . (I) obtaining a sample containing nucleic acid from the tissue, and then (ii) comparing the microsatellite profile of the nucleic acid with that of a control (homozygous) tissue, wherein the microsatellite is selected with reference to D10S541-D10S215 A method for determining heterozygous deficiency in a tissue sample, comprising the step of: 85. In method of inhibiting tumor cell growth comprising that you administering any one of the polypeptides of claims 18 22 in tumor cells, wherein the said polypeptide into the tumor cells. 86. In method of inhibiting tumor cell growth comprising that you administering any one of the polypeptide of claims 67 68 in tumor cells, wherein the said polypeptide into the tumor cells. 87. The method of claim 85 to feature that the polypeptide is packaged in non-viral vectors. 88. 86. The method of claim 85, wherein said polypeptide is packaged in a viral vector . 89. 89. The method of claim 88, wherein said viral vector is an adenovirus . 90. 35. The nucleic acid as defined in any one of claims 30 or 32 to 34, further comprising a system for delivering said nucleic acid to a patient to be treated . 91. The nucleic acid as defined in any one of claims 30 or 32 to 34, a pharmaceutical formulation comprising and pharmaceutically acceptable carrier. 92. Amino acid sequence or polypeptide with a fragment or variant thereof is given in Figure 7. 93. A primer for amplifying DNA, wherein the primer is derived from the sequence shown in any one of FIGS. 8 to 15 or a complement thereof .

───────────────────────────────────────────────────── フロントページの続き (51)Int.Cl.⁷ 識別記号ＦＩテーマコート゛(参考）Ｃ１２Ｎ 5/10 Ｃ１２Ｎ 5/00 ＢＣ１２Ｑ 1/68 Ａ６１Ｋ 37/02 (81)指定国ＥＰ(ＡＴ，ＢＥ，ＣＨ，ＤＥ，ＤＫ，ＥＳ，ＦＩ，ＦＲ，ＧＢ，ＧＲ，ＩＥ，ＩＴ，ＬＵ，ＭＣ，ＮＬ，ＰＴ，ＳＥ)，ＯＡ(ＢＦ，ＢＪ，ＣＦ，ＣＧ，ＣＩ，ＣＭ，ＧＡ，ＧＮ，ＭＬ，ＭＲ，ＮＥ，ＳＮ，ＴＤ，ＴＧ)，ＡＰ(ＫＥ，ＬＳ，ＭＷ，ＳＤ，ＳＺ，ＵＧ)，ＵＡ(ＡＭ，ＡＺ，ＢＹ，ＫＧ，ＫＺ，ＭＤ，ＲＵ，ＴＪ，ＴＭ)，ＡＬ，ＡＭ，ＡＴ，ＡＵ，ＡＺ，ＢＡ，ＢＢ，ＢＧ，ＢＲ，ＢＹ，ＣＡ，ＣＨ，ＣＮ，ＣＵ，ＣＺ，ＤＥ，ＤＫ，ＥＥ，ＥＳ，ＦＩ，ＧＢ，ＧＥ，ＨＵ，ＩＬ，ＩＳ，ＪＰ，ＫＥ，ＫＧ，ＫＰ，ＫＲ，ＫＺ，ＬＣ，ＬＫ，ＬＲ，ＬＳ，ＬＴ，ＬＵ，ＬＶ，ＭＤ，ＭＧ，ＭＫ，ＭＮ，ＭＷ，ＭＸ，ＮＯ，ＮＺ，ＰＬ，ＰＴ，ＲＯ，ＲＵ，ＳＤ，ＳＥ，ＳＧ，ＳＩ，ＳＫ，ＴＪ，ＴＭ，ＴＲ，ＴＴ，ＵＡ，ＵＧ，ＵＳ，ＵＺ，ＶＮ (72)発明者グレイ，イアンクリストファーイギリス国ＳＥ16 １ＥＥロンドンロザーハイズプリンスリージェントコート６──────────────────────────────────────────────────続き Continued on the front page (51) Int.Cl. ⁷ Identification symbol FI Theme coat ゛ (Reference) C12N 5/10 C12N 5/00 B C12Q 1/68 A61K 37/02 (81) Designated countries EP (AT, BE) , CH, DE, DK, ES, FI, FR, GB, GR, IE, IT, LU, MC, NL, PT, SE), OA (BF, BJ, CF, CG, CI, CM, GA, GN) , ML, MR, NE, SN, TD, TG), AP (KE, LS, MW, SD, SZ, UG), UA (AM, AZ, BY, KG, KZ, MD, RU, TJ, TM) , AL, AM, AT, AU, AZ, BA, BB, BG, BR, BY, CA, CH, CN, CU, CZ, DE, DK, EE, ES, FI, GB, GE, HU, IL, IS, JP, KE, KG, KP, KR, KZ, LC, LK, LR, LS, LT, LU, LV, MD, MG, MK, MN, MW, MX, NO, NZ, PL , PT, RO, RU, SD, SE, SG, SI, SK, TJ, TM, TR, TT, UA, UG, US, UZ, VN (72) Inventor Gray, Ian Christopher United Kingdom SE16 1EE London Rotherhise Prince Regent Court 6

Claims

[Claims] 1. The nucleic acid is a yeast artificial chromosome (YAC) 746-H-8, 821-D-2, 831-E-5, 921-F-8, 738-B-12, 796-D-5, 829 -E-1, 678-F-1, 839-B-1, 732-B-4, 7B-F12, 757-D-8, 773-C-2, 787-D-7, 831-E-9, 855- D-2, 855-G-4, 876-G-11, 894-H-5, 922-E-6 934-D-3, 964-A-8, 968-E-6 or 24G-A10. There is no deviation and the expression sequence tag (E ST) and a bacterial artificial chromosome (BAC) or a P1-derived artificial chromosome Chromosome (PAC) B2F20, P40F10, P72G8, P74N2, P2 74D21, B76I10, B79A19, B7901, B93F12, B12 2L22, P201J8, P201P5, P209K3, P316N14, B4 6B12, B60C5, B145C22, B150K4, B150N3, B18 The region is marked as long as it is neither 1F15 nor B188L22. Bounded by DNA defined by cars D10S541 and D10S215 Selectively hybridizes with the region of human chromosome 10 to be attached Nucleic acid. 2. DNA defined by markers D10S541 and D10S1765 Can selectively hybridize with the region of human chromosome 10 bounded by The nucleic acid according to claim 1. 3. Yeast artificial chromosome (YAC) 746-H-8, 821-D-2, 831-E -5,921-F-8,796-D-5,829-E-1,839-B-1,7 Either 34-B-4 or 24G-A10, or BAC or PAC B2F20, P40F10, P72G8, P74N2, P274D21, B7 6I10, B79A19, B7901, B93F12, B122L22, P20 1J8, P201P5, P209K3, P316N14, B46B12, B60 C5, B145C22, B150K4, B150N3, B181F15 and B 188L22 that can selectively hybridize with any human-derived DNA The nucleic acid according to claim 1 or 2. 4. The YAC is 921-F-8, 746-H-8, 821-D-2, 831- Any of E-5, 796-D-5, 24G-A-10 and 732-B-4 Is present or the BAC is B2F20, P46B12, B60C5, B150 K4, B150N3, B145C22, B181F15 and B188L22 Or the PAC is any of P40F10 and P274D21 The nucleic acid according to claim 3, which is selected from the group consisting of: 5. The cDNA insert of IMAGE clone 264611 or the gene The method according to any one of claims 1 to 4, comprising a gene corresponding to the fragment or the mutant. Nucleic acids. 6. Claims that can selectively hybridize with genes as defined in claim 5. Item 7. The nucleic acid according to Item 1. 7. The nucleic acid according to any one of claims 1 to 6, wherein the nucleic acid is DNA. 8. The nucleic acid according to any one of claims 1 to 7, wherein the nucleic acid is single-stranded. 9. When the nucleic acid is double-stranded, the nucleic acid has a base pair of less than 10,000. , Having, or when the nucleic acid is single-stranded, the nucleic acid is less than 10,000 The nucleic acid according to any one of claims 1 to 8, having a base. 10. When the nucleic acid is double-stranded, the nucleic acid has less than 1000 base pairs. , Or when the nucleic acid is single-stranded, the nucleic acid is less than 1000 The nucleic acid according to any one of claims 1 to 9, which has a base. 11. When the nucleic acid is double-stranded, the nucleic acid may have up to 10 to 100 bases. When the nucleic acid has a pair or is single-stranded, the nucleic acid is 10 to 100 The nucleic acid according to any one of claims 1 to 10, wherein the nucleic acid has up to bases. 12. If the nucleic acid is double-stranded, the nucleic acid may have up to 15 to 30 base pairs. Or, if the nucleic acid is single-stranded, the nucleic acid is from 15 to 30 The nucleic acid according to any one of claims 1 to 11, which has the following base: 13. 2. The nucleus according to claim 1, comprising a tumor suppressor gene or a fragment or variant thereof. acid. 14． Including the product of a tumor suppressor gene or a derivative or fragment or variant thereof That region is defined by markers D10S541 and D10S215. Hybridizing selectively to the region of human chromosome 10 bounded by the DNA A nucleic acid characterized in that the nucleic acid can be diluted. 15. CDNA insert of clone IMAGE264611 or its gene 14. The nucleic acid according to claim 13, comprising a gene corresponding to the fragment or the mutant of the above. 16. It can selectively hybridize with a gene as defined in claim 15. The nucleic acid according to claim 13 or 14. 17． 14. The nucleic acid according to claim 13, wherein said nucleic acid is cDNA. 18. The region is defined by markers D10S541 and D10S215 And selectively hybridizes to the region of chromosome 10 bounded by the Nucleic acid characterized in that it further comprises a soyable, detectable label. 19. The nucleic acid may be expressed in an expression sequence tag (EST) as described in Tables 3 to 22. Or a human-derived sequence in any of the intron sequences of FIGS. 19. The nucleic acid according to claim 18. 20. The nucleic acid is the cDNA insert of clone IMAGE264611 or 19. The nucleic acid according to claim 18, comprising a gene corresponding to a fragment or mutant of the gene. 21. Can selectively hybridize with a gene as defined in claim 20 19. The nucleic acid according to claim 18. 22. An expression sequence tag (EST) as described in Tables 3 to 22 or FIG. And any of the 15 intron sequences selectively The nucleic acid according to claim 1, which can be hybridized. 23. A gene from which an expression sequence marker (EST) is derived, or 23. The method according to claim 22, which comprises a gene containing a tron sequence or a fragment or variant thereof. Nucleic acids. 24. An expressed sequence marker suitable for DNA amplification and as defined in claim 19 Selected from the group of primers that hybridize with the EST or intron sequence The nucleic acid of claim 1, which is selected. 25. (I) obtaining a sample containing nucleic acid from the patient, (Ii) the nucleic acids whose regions correspond to the markers D10S541 and D10S215; Selectively with the region of chromosome 10 bounded by the DNA thus defined Having a step of contacting with a hybridizable nucleic acid. To determine the susceptibility of a patient. 26. (I) obtaining a sample containing nucleic acid from the patient, (Ii) the nucleic acids whose regions correspond to the markers D10S541 and D10S215; Region and selection of human chromosome 10 bounded by the defined DNA Patient having a step of contacting with a nucleic acid capable of specifically hybridizing To diagnose cancer in children. 27. (I) obtaining a sample containing nucleic acid from the patient, (Ii) the nucleic acids whose regions correspond to the markers D10S541 and D10S215; Selectively with the region of chromosome 10 bounded by the DNA thus defined Contacting a hybridizable nucleic acid with cancer To estimate the relative prediction of a particular result in 28. 29. The method according to claim 25, 26 or 28, wherein said cancer is prostate cancer. 29. The sample is selected from the group consisting of prostate tissue, blood, semen or urine. 29. The method according to any one of claims 25 to 28. 30. The region is defined by markers D10S541 and D10S215 Selectively hybridizes with the region of human chromosome 10 bounded by the isolated DNA 30. Any of claims 25 to 29 wherein the nucleic acid that can be redised further comprises a detectable label. Or the method of claim 1. 31. The nucleic acid has the region whose marker is D10S541 and AFM337xf. Binding human chromosome 10 bounded by DNA defined by 9 31. The method according to claim 25, which can selectively hybridize with a region. the method of. 32. The nucleic acid is a yeast artificial chromosome (YAC) 746-H-8, 821-D-2. , 831-E-5, 921-F-8, 796-D-5, 829-E-1, 839. Any of B-1, 732-B-4 or 24G-A10, or BAC Or PAC B2F20, P40F10, P72G8, P74N2, P274 D 21, B76I10, B79A19, B7901, B93F12, B122L2 2, P201J8, P201P5, P209K3, P316N14, B46B1 2, B60C5, B145C22, B150K4, B150N3, B181F1 5 and B188L22 selectively hybridized with human-derived DNA 32. The method according to claim 31, which is capable. 33. The YAC is 921-F-8, 746-H-8, 821-D-2, 831 Any one of -E-5, 796-D-5, 24G-A-10 or 732-B-4 Or the BAC or PAC B2F20, P40F10, P72G8, P74N2, P274D21, B76I10, B79A19, B7901, B9 3F12, B122L22, P201J8, P201P5, P209K3, P3 16N14, P46B12, B60C5, B145C22, B150K4, B1 33. Any of 50N3, B181F15 and B188L22. The method described. 34. The nucleic acid is a cDNA insert of IMAGE clone 264611 or 32. The method of claim 31, comprising a gene corresponding to a fragment or variant of said gene. 35. The nucleic acid can selectively hybridize with the gene defined in claim 34. 32. The method according to claim 31, wherein 36. The method according to claim 31, wherein the nucleic acid is DNA. 37. The method according to claim 31, wherein the nucleic acid is single-stranded. 38. If the nucleic acid is double-stranded, the nucleic acid has less than 10,000 base pairs. Or, if the nucleic acid is single-stranded, has less than 10,000 bases. 32. The method of claim 31. 39. If the nucleic acid is double-stranded, the nucleic acid has less than 1000 base pairs Or has less than 1000 bases when the nucleic acid is single-stranded. 31. The method according to 31. 40. When the nucleic acid is double-stranded, the nucleic acid has 10 to 100 base pairs. , Or when the nucleic acid is single-stranded, have from 10 to 100 bases. 32. The method of claim 31, wherein the method comprises: 41. If the nucleic acid is double-stranded, it has from 15 to 30 base pairs. Or, if the nucleic acid is single-stranded, has 15 to 30 bases. 32. The method of claim 31. 42. 4. The nucleic acid of claim 3, wherein the nucleic acid comprises a tumor suppressor gene or a fragment or variant thereof. The method of claim 1. 43. An expressed sequence tag (EST) as described in Tables 3 to 22; Or humans in any of the intron sequences as described in FIGS. 32. The method according to claim 31, wherein the sequence is Method. 44. The nucleic acid may be expressed sequence tag (EST) or as defined in claim 19. Selected from the group consisting of primers suitable for amplifying DNA from intron sequences. 44. The method of claim 43, wherein said method is selected. 45. The region is defined by markers D10S541 and D10S215 Selectively hybridizes with the region of human chromosome 10 bounded by the isolated DNA Redisable nucleic acids and nucleoside triphosphates or deoxynucleotides Characterized by containing triphosphate or a derivative thereof, wherein the region is a marker D10. Bounded by the DNA defined by S541 and D10S215 The presence or absence of a region of human chromosome 10 or a mutation therein. The system to detect. 46. The nucleoside triphosphate or deoxynucleotide triphosphate is detected 46. The system of claim 45, wherein the system is labeled as possible, preferably radioactively. 47. The region is defined by markers D10S541 and D10S215 Selectively hybridizes with the region of human chromosome 10 bounded by the isolated DNA A nucleic acid that modifies an enzyme and a nucleic acid that modifies an enzyme. The region is defined by the DNA defined by markers D10S541 and D10S215. The presence or absence of the region of human chromosome 10 bounded thereby, or A system for detecting mutations in. 48. Enzyme-modifying nucleic acid is DNA polymerase, DNA ligase, polynuclease Reotide kinase, restriction endonuclease or nuclease 48. The system of claim 47, which is selected. 49. 18. It may be encoded by the nucleic acid according to any one of claims 13 to 17. Polypeptide. 50. A molecule capable of binding to the polypeptide according to claim 49. 51. (I) obtaining a sample containing the protein from the patient, (Ii) the relative amount of the polypeptide of claim 49 in said sample, or Cleavage of the polypeptide described in 49, that is, whether or not there is a loss of function. Determining the sensitivity of the patient to cancer. 52. (I) obtaining a sample containing the protein from the patient, (Ii) the relative amount of the polypeptide of claim 49 in said sample, or Cleavage of the polypeptide described in 49, that is, whether or not there is a loss of function. A method of diagnosing cancer in a patient, comprising the step of determining. 53. (I) obtaining a sample containing the protein from the patient, (Ii) the relative amount of the polypeptide of claim 49 in said sample, or Cleavage of the polypeptide described in 49, that is, whether or not there is a loss of function. Determining the relative prediction of a particular outcome of cancer in a patient characterized by the step of determining How to estimate. 54. 54. The method according to any one of claims 51 to 53, wherein the cancer is prostate cancer. 55. A polypeptide according to claim 49 is detected by a molecule according to claim 50. 54. The method of any one of claims 51 to 53. 56. The sample is selected from the group consisting of prostate tissue, blood, urine or semen. 56. The method according to any one of claims 51 to 55. 57. 56. The method of claim 55, wherein said molecule comprises a detectable label. 58. Drugs in the manufacture of reagents for diagnosing cancer or for treating cancer In the manufacture of the agent, the region or markers D10S541 and D10S215 Region and selection of human chromosome 10 bounded by the defined DNA Use of nucleic acids that can hybridize specifically. 59. The region is defined by markers D10S541 and D10S215 Selectively hybridizes with the region of human chromosome 10 bounded by the isolated DNA A method for treating cancer, comprising the step of administering a nucleic acid that can be redistributed to a patient. 60. The nucleic acid is a tumor suppressor gene or a fragment or derivative thereof. 9. The method according to 9. 61. 61. The method of claim 59 or 60, wherein said nucleic acid comprises a viral vector. 62. 60. The method according to claim 59, wherein said cancer is prostate cancer. 63. 51. The step of administering a molecule of claim 50 further comprising a cytotoxic moiety to the patient. A cancer treatment method comprising: 64. In the manufacture of a medicament for treating cancer, the molecule may further comprise a cytotoxic moiety. 51. Use of a molecule according to claim 50 comprising: 65. (I) obtaining a sample containing nucleic acid from the tissue, and then (ii) masking the nucleic acid. Compare the icro-satellite profile to that of control (homozygous) tissue and Steps in which closatellites are selected with reference to the area between D10S541 and D10S215 A method for determining heterozygous deficiency in a tissue sample, comprising: