JP2000264897A - Production of 5'-o-tritylnucleosides - Google Patents
Production of 5'-o-tritylnucleosidesInfo
- Publication number
- JP2000264897A JP2000264897A JP11025747A JP2574799A JP2000264897A JP 2000264897 A JP2000264897 A JP 2000264897A JP 11025747 A JP11025747 A JP 11025747A JP 2574799 A JP2574799 A JP 2574799A JP 2000264897 A JP2000264897 A JP 2000264897A
- Authority
- JP
- Japan
- Prior art keywords
- nucleoside
- trityl
- tritylating
- agent
- azole
- Prior art date
- Legal status (The legal status is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the status listed.)
- Granted
Links
Landscapes
- Saccharide Compounds (AREA)
Abstract
Description
【0001】[0001]
【発明が属する技術分野】本発明は、無保護のヌクレオ
シドの5’位を選択的にトリチル化する方法に関するも
のである。TECHNICAL FIELD The present invention relates to a method for selectively tritylating the 5'-position of an unprotected nucleoside.
【0002】[0002]
【従来の技術】現在のDNAなどのオリゴヌクレオチド
の化学合成においては、固相法、液相法いずれにおいて
もホスホロアミダイト法と呼ばれる手法が最も汎用され
ている。このホスホロアミダイト法は、ヌクレオシドの
アミダイトブロックを順次縮合することで目的とする配
列のオリゴヌクレオチドを合成する方法であるが、合成
時の副反応を抑制するためにアミダイトブロックの核酸
塩基部のアミノ基は保護基で保護されたものが通常使用
されていた。2. Description of the Related Art In the current chemical synthesis of oligonucleotides such as DNA, a method called a phosphoramidite method is most widely used in both solid phase and liquid phase methods. The phosphoramidite method is a method of synthesizing an oligonucleotide having a target sequence by sequentially condensing amidite blocks of nucleosides.However, in order to suppress a side reaction during synthesis, the amino acid of the nucleobase portion of the amidite block is synthesized. A group protected with a protecting group was usually used.
【0003】しかし、このような保護基の使用は、保護
基の導入と脱保護の余分な2工程を必要とし、目的とす
るオリゴヌクレオチドの収率低下の1つの原因となって
いることから、必ずしも好ましい方法とはいえない。最
近、このような問題を克服する方法として、アミダイト
ブロックの核酸塩基部のアミノ基を保護基で保護しない
無保護のアミダイトブロックを用いてオリゴヌクレオチ
ドを化学合成する研究が盛んに行われており、大きな成
果をあげつつある。However, the use of such a protecting group requires two extra steps of introduction and deprotection of the protecting group, which is one of the causes of a decrease in the yield of the target oligonucleotide. This is not necessarily the preferred method. Recently, as a method of overcoming such a problem, studies have been actively conducted to chemically synthesize an oligonucleotide using an unprotected amidite block that does not protect the amino group of the nucleobase portion of the amidite block with a protecting group. It is getting big results.
【0004】[0004]
【発明が解決しようとする課題】このような無保護のア
ミダイトブロックを用いたオリゴヌクレオチドの化学合
成法をより現実のものとするためには、対応するヌクレ
オシドのアミダイトブロックおよびアミダイトブロック
調製のためのジメトキシトリチル(DMT)体などのヌ
クレオシドのトリチル体を簡便な手法で効率的に合成す
る必要がある。上述したオリゴヌクレオチドと同様に、
たとえば無保護のヌクレオシドの5’位を選択的にトリ
チル化する方法が開発されれば、無保護のアミダイトブ
ロックも効率的に合成でき、もってオリゴヌクレオチド
を収率よく調製できることが大いに期待される。In order to make a method for chemically synthesizing an oligonucleotide using such an unprotected amidite block more practical, it is necessary to prepare an amidite block of the corresponding nucleoside and an amidite block for preparing the amidite block. It is necessary to efficiently synthesize a trityl form of a nucleoside such as a dimethoxytrityl (DMT) form by a simple method. Like the oligonucleotides described above,
For example, if a method for selectively tritylating the 5'-position of an unprotected nucleoside is developed, it is expected that an unprotected amidite block can be efficiently synthesized, and that an oligonucleotide can be prepared with high yield.
【0005】従来、無保護のヌクレオシドの5’位を選
択的にトリチル化する方法はいくつか報告されているも
のの(J. Am. Chem. Soc., 104, 1316-1319(1982)、J.
Am.Chem. Soc., 85, 3821-3827(1963)、特開平1−30
8294など参照)、いずれの方法も合成手法が複雑で
あったり、合成収率が低かったり、特定のヌクレオシド
にしか適用できなかったり等の問題を有し、すべてのヌ
クレオシドに応用可能で、しかも効率的な方法は報告さ
れていない。特に、グアノシンは無保護の状態で5’位
を選択的にトリチル化するのが難しいヌクレオシドであ
り、一旦2位アミノ基を保護し、5’位をトリチル化し
た後、アミノ基の保護基を脱保護する方法が現時点で最
も実用的で効率的な方法とされている。Heretofore, some methods have been reported for selectively tritylating the 5'-position of unprotected nucleosides (J. Am. Chem. Soc., 104, 1316-1319 (1982);
Am. Chem. Soc., 85, 3821-3827 (1963), JP-A-1-30
8294), all of which have problems such as a complicated synthesis method, a low synthesis yield, and application only to specific nucleosides, and are applicable to all nucleosides, and are efficient. No specific method has been reported. In particular, guanosine is a nucleoside which is difficult to selectively trityl at the 5'-position in an unprotected state, and once protecting the amino group at the 2-position and tritylating the 5'-position, the protecting group for the amino group is removed. Deprotection is currently considered the most practical and efficient method.
【0006】[0006]
【課題を解決するための手段】本発明者らは上記問題を
克服するため鋭意研究を重ねた結果、イミダゾリウムメ
タンスルホネートなどの反応促進剤を使用することで、
無保護のヌクレオシドの5’位を選択的にトリチル化す
ることができ、この方法が特定のヌクレオシドに限定さ
れず、すべてのヌクレオシドに応用可能であることを見
いだし、本発明を完成させた。したがって、本発明は、
無保護のヌクレオシドとトリチル化剤を反応させて5’
−O−トリチルヌクレオシド類を製造法する方法であっ
て、反応促進剤としてアゾールの塩類を使用する方法に
関するものである。また、本発明は、無保護のヌクレオ
シドとトリチル化剤を反応させて5’−O−トリチルヌ
クレオシド類を製造法する方法であって、アゾールの塩
類としてイミダゾールのスルホン酸塩とアミン類として
トリアルキルアミンを使用する方法に関するものであ
る。さらに、本発明は、無保護のヌクレオシドとトリチ
ル化剤を反応させて5’−O−トリチルヌクレオシド類
を製造法する方法であって、アゾールの塩類としてイミ
ダゾリウムメタンスルホネートールおよびアミン類とし
てジイソプロピルエチルアミンを使用する方法に関する
ものである。Means for Solving the Problems The present inventors have made intensive studies to overcome the above problems, and as a result, by using a reaction accelerator such as imidazolium methanesulfonate,
The present inventors have found that the 5'-position of the unprotected nucleoside can be selectively tritylated, and that this method is not limited to a particular nucleoside, but is applicable to all nucleosides, thus completing the present invention. Therefore, the present invention
The unprotected nucleoside is reacted with a trityling agent to form 5 ′
The present invention relates to a method for producing -O-trityl nucleosides, which uses azole salts as a reaction accelerator. The present invention also relates to a method for producing 5'-O-trityl nucleosides by reacting an unprotected nucleoside with a tritylating agent, wherein the sulfonate of imidazole as a salt of azole and the trialkyl as an amine. It relates to a method using an amine. Further, the present invention relates to a method for producing 5'-O-trityl nucleosides by reacting an unprotected nucleoside with a tritylating agent, comprising imidazolium methanesulfonateol as an azole salt and diisopropyl as an amine. The present invention relates to a method using ethylamine.
【0007】[0007]
【発明の実施の形態】本発明で対象とするヌクレオシド
は、オリゴヌクレオチドの合成に使用されているもので
あればすべて使用することができ、たとえばグアノシ
ン、アデノシン、シチジン、ウリジンなどのリボヌクレ
オシド、2’−デオキシグアノシン、2’−デオキシア
デノシン、2’−デオキシシチジン、チミジンなどの
2’−デオキシリボヌクレオシド、2’−O−メチルグ
アノシン、2’−O−メチルアデノシン、2’−O−メ
チルシチジン、2’−O−メチルウリジン、2’−O−
メチル−5−メチルウルジン、2’−O−メトキシエチ
ルグアノシン、2’−O−メトキシエチルアデノシン、
2’−O−メトキシエチルシチジン、2’−O−メトキ
シエチルウリジン、2’−O−メトキシエチル−5−メ
チルウルジンなどの2’−O−アルキルリボヌクレオシ
ドなどを例示することができるが、これに限定されるも
のではない。BEST MODE FOR CARRYING OUT THE INVENTION The nucleosides to be used in the present invention can be used as long as they are used for the synthesis of oligonucleotides, for example, ribonucleosides such as guanosine, adenosine, cytidine and uridine. 2'-deoxyribonucleoside such as' -deoxyguanosine, 2'-deoxyadenosine, 2'-deoxycytidine, thymidine, 2'-O-methylguanosine, 2'-O-methyladenosine, 2'-O-methylcytidine, 2'-O-methyluridine, 2'-O-
Methyl-5-methyluridine, 2′-O-methoxyethyl guanosine, 2′-O-methoxyethyl adenosine,
2'-O-methoxyethyl cytidine, 2'-O-methoxyethyl uridine, 2'-O-alkyl ribonucleosides such as 2'-O-methoxyethyl-5-methyluridine and the like can be exemplified. It is not limited.
【0008】トリチル化剤としては、トリチルのハロゲ
ン化物を使用すればよく、具体的には、ジメトキシトリ
チルクロライド、ジメトキシトリチルブロマイド、モノ
メトキシトリチルクロライド、モノメトキシトリチルブ
ロマイド、トリチルクロライド、トリチルブロマイドな
どを例示することができる。As the trityling agent, a trityl halide may be used. Specific examples include dimethoxytrityl chloride, dimethoxytrityl bromide, monomethoxytrityl chloride, monomethoxytrityl bromide, trityl chloride, trityl bromide and the like. can do.
【0009】本発明は、反応促進剤としてはアゾールの
塩類を1種または数種使用することを特徴としている。
そのようなアゾールの塩類としては、イミダゾール、ト
リアゾール、テトラゾールまたはその誘導体あるいは同
族体の塩酸塩、硝酸塩、過塩素酸塩もしくはスルホン酸
塩を例示することができる。具体的には、イミダゾー
ル、ベンズイミダゾール、1−メチルイミダゾール、ト
リアゾールまたはテトラゾールの塩酸塩、硝酸塩、過塩
素酸塩もしくはスルホン酸塩が例示される。The present invention is characterized in that one or more azole salts are used as a reaction accelerator.
Examples of such azole salts include hydrochloride, nitrate, perchlorate and sulfonate of imidazole, triazole, tetrazole and derivatives or homologs thereof. Specifically, hydrochloride, nitrate, perchlorate or sulfonate of imidazole, benzimidazole, 1-methylimidazole, triazole or tetrazole is exemplified.
【0010】このようなアゾールの塩類の中でも、イミ
ダゾールまたはその誘導体のスルホン酸塩が好ましく、
具体的には、イミダゾリウムメタンスルホネート、ベン
ズイミダゾリウムメタンスルホネート、1−メチルイミ
ダゾリウムメタンスルホネート、イミダゾリウムトルエ
ンスルホネート、ベンズイミダゾリウムトルエンスルホ
ネート、1−メチルイミダゾリウムトルエンスルホネー
ト、イミダゾリウムトリフルオロメタンスルホネート、
ベンズイミダゾリウムトリフルオロメタンスルホネー
ト、1−メチルイミダゾリウムトリフルオロメタンスル
ホネート、イミダゾリウムベンゼンスルホネート、ベン
ズイミダゾリウムベンゼンスルホネート、1−メチルイ
ミダゾリウムベンゼンスルホネート等が挙げられる。こ
の中でも、メタンスルホン酸塩、特にイミダゾリウムメ
タンスルホネートが好適である。[0010] Among such azole salts, a sulfonate of imidazole or a derivative thereof is preferable.
Specifically, imidazolium methanesulfonate, benzimidazolium methanesulfonate, 1-methylimidazolium methanesulfonate, imidazolium toluenesulfonate, benzimidazolium toluenesulfonate, 1-methylimidazolium toluenesulfonate, imidazolium trifluoromethanesulfonate,
Examples include benzimidazolium trifluoromethanesulfonate, 1-methylimidazolium trifluoromethanesulfonate, imidazoliumbenzenesulfonate, benzimidazoliumbenzenesulfonate, 1-methylimidazoliumbenzenesulfonate and the like. Of these, methanesulfonate, particularly imidazolium methanesulfonate, is preferred.
【0011】また、アミン類は反応に必須ではないが、
多くの場合、反応が加速され、合成収率が向上すること
があるので、アミン類を1種または数種併用することが
望ましい。併用するアミン類としては、ジイソプロピル
エチルアミン、トリエチルアミンなどのトリアルキルア
ミン類、グアニジン、イミダゾール、1,8−ジアザビ
シクロ〔5,4,0〕ウンデカ−7−エン(DBU)、
1,5−ジアザビシクロ〔4,3,0〕ノナ−5−エン
(DBN)、1,4−ジアザビシクロ〔2,2,2〕オ
クタン(DABCO)などを例示することができ、特に
トリアルキルアミン類、さらに好ましくはジイソプロピ
ルエチルアミンを挙げることができる。Further, amines are not essential for the reaction,
In many cases, the reaction is accelerated and the synthesis yield may be improved. Therefore, it is desirable to use one or more amines in combination. Examples of the amines used in combination include trialkylamines such as diisopropylethylamine and triethylamine, guanidine, imidazole, 1,8-diazabicyclo [5,4,0] undec-7-ene (DBU),
Examples thereof include 1,5-diazabicyclo [4,3,0] non-5-ene (DBN) and 1,4-diazabicyclo [2,2,2] octane (DABCO), and in particular, trialkylamines And more preferably diisopropylethylamine.
【0012】無保護のヌクレオシドの5’位を選択的に
トリチル化する反応は、ジメチルホルムアミド(DM
F)、ホルムアミド、ジメチルアミン、アセトニトリ
ル、ジメチルカーボネート、ピリジンなどの単独または
混合溶媒中、無保護のヌクレオシド1モルに対し、トリ
チル化剤1〜2モル、反応促進剤0.5〜5モル、好ま
しくは1〜3モル、必要によりアミン類0.5〜5モ
ル、好ましくは1〜3モルを用い、反応温度10〜50
℃、好ましくは20〜40℃で1〜50時間程度反応さ
せることにより目的とする5’−O−トリチルヌクレオ
シド類を得ることができる。なお、上記反応は非水条件
下で行うことが好ましく、使用する反応溶媒などは乾燥
させたものを使用するのが望ましい。このようにして得
られた5’−O−トリチルヌクレオシド類はヌクレオシ
ドの通常の方法にて単離精製すればよく、具体的にはシ
リカゲルなどの吸着クロマトグラフィーで精製すればよ
い。The reaction for selectively tritylating the 5'-position of the unprotected nucleoside is carried out by using dimethylformamide (DM
F), in a single or mixed solvent such as formamide, dimethylamine, acetonitrile, dimethyl carbonate, and pyridine, with respect to 1 mol of unprotected nucleoside, 1 to 2 mol of a tritylating agent, 0.5 to 5 mol of a reaction accelerator, preferably Is used in an amount of 1 to 3 mol, and if necessary, 0.5 to 5 mol, preferably 1 to 3 mol of amines.
The desired 5′-O-trityl nucleosides can be obtained by reacting at 1 ° C., preferably 20 to 40 ° C. for about 1 to 50 hours. The above reaction is preferably performed under non-aqueous conditions, and it is preferable to use a dried reaction solvent and the like. The thus obtained 5'-O-trityl nucleosides may be isolated and purified by a usual method of nucleoside, and specifically, may be purified by adsorption chromatography such as silica gel.
【0013】[0013]
【発明の効果】本発明方法は、特定のヌクレオシドに特
異的な方法ではなく、すべてのヌクレオシドに適用可能
であり、しかも後述の実施例に示すように、1段階で7
5%以上の収率でヌクレオシドの5’−位を選択的にト
リチル化することができ、きわめて実用的で汎用性の高
い方法である。The method of the present invention is not a method specific to a specific nucleoside, but is applicable to all nucleosides.
It is a very practical and highly versatile method that can selectively trityl the 5'-position of a nucleoside with a yield of 5% or more.
【0014】[0014]
【実施例】以下、実施例を示し、本発明を具体的に説明
するが、これにより本発明は何等限定されるものではな
い。 実施例1 (1)イミダゾリウムメタンスルホネートの調製 イミダゾール(34.0g,0.499mol)を塩化
メチレン(500ml)に溶解し、この溶液に0℃にて
メタンスルホン酸(48.0g,32.4ml,0.4
99mol)を滴下した。析出した結晶をろ取し、塩化
メチレン(100ml)で洗浄し、イミダゾリウムメタ
ンスルホネート(IMS)を無色結晶として得た(8
1.1g,0.494mol,収率99%)。EXAMPLES Hereinafter, the present invention will be described specifically with reference to Examples, but the present invention is not limited thereto. Example 1 (1) Preparation of imidazolium methanesulfonate Imidazole (34.0 g, 0.499 mol) was dissolved in methylene chloride (500 ml), and methanesulfonic acid (48.0 g, 32.4 ml) was added to this solution at 0 ° C. , 0.4
99 mol) was added dropwise. The precipitated crystals were collected by filtration and washed with methylene chloride (100 ml) to give imidazolium methanesulfonate (IMS) as colorless crystals (8).
1.1 g, 0.494 mol, yield 99%).
【0015】融点:184〜186℃ IR(KBr、cm-1):3140,1589,146
0,1437,1339, 11941 H−NMR(DMSO−d6、ppm):2.49
(s,3H),7.62(s, 2H),9.03
(s,1H)13 C−NMR(DMSO−d6、ppm):40.1,
119.7,134.8Melting point: 184-186 ° C IR (KBr, cm -1 ): 3140, 1589, 146
0, 1437, 1339, 1194 1 H-NMR (DMSO-d 6 , ppm): 2.49
(S, 3H), 7.62 (s, 2H), 9.03
(S, 1H) 13 C- NMR (DMSO-d 6, ppm): 40.1,
119.7, 134.8
【0016】(2)5’−位の選択的なジメトキシトリ
チル化法 デオキシリボヌクレオシド(40.0mmol)、IM
S(13.1g,80.0mmol)、ジイソプロピル
エチルアミン(10.3g,13.9ml,80.0m
mol)をDMF(ドライ)(100ml)に懸濁し、
更に、p,p’−ジメトキトリチルクロライド(13.
6g,40.0mmol)を数回に分けて加え、2時間
室温にて撹拌した。得られた均一な反応溶液を水(3.
00リットル)にあけ、沈澱をろ取した。この沈澱をシ
リカゲルカラムクロマトグラフィーにより精製し、5’
−O−(p,p’−ジメトキシトリチル)−2’−デオ
キシリボヌクレオシドを得た。得られた化合物の収率、
スペクトルデータは以下のとおりである。(2) Method for selective dimethoxytritylation at 5'-position Deoxyribonucleoside (40.0 mmol), IM
S (13.1 g, 80.0 mmol), diisopropylethylamine (10.3 g, 13.9 ml, 80.0 m)
mol) is suspended in DMF (dry) (100 ml),
Further, p, p'-dimethoxytrityl chloride (13.
6g, 40.0 mmol) was added in several portions, and the mixture was stirred at room temperature for 2 hours. The obtained homogeneous reaction solution was mixed with water (3.
00 liters) and the precipitate was collected by filtration. This precipitate was purified by silica gel column chromatography, and 5 ′
-O- (p, p'-dimethoxytrityl) -2'-deoxyribonucleoside was obtained. Yield of the obtained compound,
The spectrum data is as follows.
【0017】5’−O−(p,p’−ジメトキシトリチ
ル)−2’−デオキシアデノシン 性状:無色アモルファス状固体 収率:79%1 H−NMR(CDCl3、ppm):2.22(br
s,1H),2.53(ddd,1H,J=13.4,
4.0,6.3Hz),2.78(ddd,1H,J=
13.4,6.0,6.3Hz,H−2”),3.40
(dd,2H,J=1.6,4.4Hz),3.76
(s,6H),4.16(dt,1H,J=3.9,
4.4Hz),4.67(ddd,1H,J=6.0,
4.0,3.9Hz),5.98(brs,2H),
6.44(t,1H,J=6.3Hz),6.78
(d,4H,J=9.3Hz),7.16−7.39
(m,9H),7.96(s,1H),8.26(s,
1H)5'-O- (p, p'-dimethoxytrityl) -2'-deoxyadenosine Property: colorless amorphous solid Yield: 79% 1 H-NMR (CDCl 3 , ppm): 2.22 (br)
s, 1H), 2.53 (ddd, 1H, J = 13.4,
4.0, 6.3 Hz), 2.78 (ddd, 1H, J =
13.4, 6.0, 6.3 Hz, H-2 "), 3.40
(Dd, 2H, J = 1.6, 4.4 Hz), 3.76
(S, 6H), 4.16 (dt, 1H, J = 3.9,
4.4 Hz), 4.67 (ddd, 1H, J = 6.0,
4.0, 3.9 Hz), 5.98 (brs, 2H),
6.44 (t, 1H, J = 6.3 Hz), 6.78
(D, 4H, J = 9.3 Hz), 7.16-7.39
(M, 9H), 7.96 (s, 1H), 8.26 (s,
1H)
【0018】5’−O−(p,p’−ジメトキシトリチ
ル)−2’−デオキシシチジン 性状:無色粉体 収率:76%1 H−NMR(CDCl3、ppm):2.01−2.1
0(m,1H),2.39−2.48(m,1H),
3.22−3.34(m,2H),3.63(s,6
H),3.86−3.91(m,1H),4.32−
4.38(m,1H),5.41(d,1H,J=6.
8Hz),6.10(t,1H,J=5.9Hz),
6.64−6.69(m,5H),7.05−7.24
(m,11H),7.75(d,1H,J=7.3H
z)5'-O- (p, p'-dimethoxytrityl) -2'-deoxycytidine Properties: colorless powder Yield: 76% 1 H-NMR (CDCl 3 , ppm): 2.01-2. 1
0 (m, 1H), 2.39-2.48 (m, 1H),
3.22-3.34 (m, 2H), 3.63 (s, 6
H), 3.86-3.91 (m, 1H), 4.32-
4.38 (m, 1H), 5.41 (d, 1H, J = 6.
8Hz), 6.10 (t, 1H, J = 5.9Hz),
6.64-6.69 (m, 5H), 7.05-7.24
(M, 11H), 7.75 (d, 1H, J = 7.3H
z)
【0019】5’−O−(p,p’−ジメトキシトリチ
ル)−2’−デオキシグアノシン 性状:無色針状 収率:78% 融点:190−191℃1 H−NMR(DMSO−d6、ppm):2.22−
2.31(m,1H),2.57−2.67(m,1
H),3.09−3.15(m,2H),3.71
(s,6H),3.87−3.91(m,1H),4.
32−4.35(m,1H),5.28(d,1H,J
=4.4Hz),6.12(dd,1H,J=6.3,
6.8Hz),6.42(brs,2H),6.81
(dd,4H,J=6.8,8.8Hz),7.17−
7.34(m,9H),7.76(s,1H),10.
58(brs,1H)[0019] 5'-O- (p, p'- dimethoxytrityl) -2'-deoxyguanosine Property: colorless needles Yield: 78% mp: 190-191 ℃ 1 H-NMR ( DMSO-d 6, ppm ): 2.22-
2.31 (m, 1H), 2.57-2.67 (m, 1
H), 3.09-3.15 (m, 2H), 3.71.
(S, 6H), 3.87-3.91 (m, 1H), 4.
32-4.35 (m, 1H), 5.28 (d, 1H, J
= 4.4 Hz), 6.12 (dd, 1H, J = 6.3,
6.8 Hz), 6.42 (brs, 2H), 6.81
(Dd, 4H, J = 6.8, 8.8 Hz), 7.17−
7.34 (m, 9H), 7.76 (s, 1H), 10.
58 (brs, 1H)
【0020】5’−O−(p,p’−ジメトキシトリチ
ル)−2’−デオキシチミジン 性状:無色アモルファス状固体 収率:82%1 H−NMR(CDCl3、ppm):2.12−2.1
9(m,1H),2.24−2.29(m,1H),
2.57(brs,1H),3.20−3.33(m,
2H),3.63(s,6H),3.90−3.99
(m,1H),4.32−4.38(m,1H),6.
27(t,1H,J=7.3Hz),6.68(d,4
H,J=8.8Hz),7.08−7.26(m,10
H),7.43(s,1H),8.79−8.98(b
rs,1H)5'-O- (p, p'-dimethoxytrityl) -2'-deoxythymidine Properties: colorless amorphous solid Yield: 82% 1 H-NMR (CDCl 3 , ppm): 2.12-2 .1
9 (m, 1H), 2.24-2.29 (m, 1H),
2.57 (brs, 1H), 3.20-3.33 (m,
2H), 3.63 (s, 6H), 3.90-3.99.
(M, 1H), 4.32-4.38 (m, 1H), 6.
27 (t, 1H, J = 7.3 Hz), 6.68 (d, 4
H, J = 8.8 Hz), 7.08-7.26 (m, 10
H), 7.43 (s, 1H), 8.79-8.98 (b
rs, 1H)
【0021】(3)5’−位の選択的なモノメトキシト
リチル化法 前記(2)のジメトキシトリチル化法において、p,
p’−ジメトキトリチルクロライドの代わりにp−メト
キシトリチルクロライド(40.0mmol)を用い
て、同様に反応させて5’−O−(p−メトキシトリチ
ル)−2’−デオキシリボヌクレオシドを得た。得られ
た化合物の収率、スペクトルデータは以下のとおりであ
る。(3) Method for selective monomethoxytritylation at the 5′-position In the dimethoxytritylation method of the above (2), p,
Using p-methoxytrityl chloride (40.0 mmol) instead of p'-dimethoxytrityl chloride, the same reaction was performed to obtain 5'-O- (p-methoxytrityl) -2'-deoxyribonucleoside. The yield and spectrum data of the obtained compound are as follows.
【0022】5’−O−(p−メトキシトリチル)−
2’−デオキシアデノシン 性状:無色アモルファス状固体 収率:76%1 H−NMR(CDCl3、ppm):2.21(br
s,1H),2.48−2.54(m,1H),2.6
3−2.81(m,1H),3.40(dd,2H,J
=1.5,4.4Hz),3.77(s,3H),4.
14(dt,1H,J=3.9,4.5Hz),4.5
5−4.78(m,1H),5.91(brs,2
H),6.46(t,1H,J=6.3Hz),6.7
8(d,2H,J=9.1Hz),7.16−7.39
(m,12H),7.96(s,1H),8.26
(s,1H)5'-O- (p-methoxytrityl)-
2′-Deoxyadenosine Properties: colorless amorphous solid Yield: 76% 1 H-NMR (CDCl 3 , ppm): 2.21 (br
s, 1H), 2.48-2.54 (m, 1H), 2.6
3-2.81 (m, 1H), 3.40 (dd, 2H, J
= 1.5, 4.4 Hz), 3.77 (s, 3H), 4.
14 (dt, 1H, J = 3.9, 4.5 Hz), 4.5
5-4.78 (m, 1H), 5.91 (brs, 2
H), 6.46 (t, 1H, J = 6.3 Hz), 6.7.
8 (d, 2H, J = 9.1 Hz), 7.16-7.39
(M, 12H), 7.96 (s, 1H), 8.26
(S, 1H)
【0023】5’−O−(p−メトキシトリチル)−
2’−デオキシシチジン 性状:無色アモルファス状固体 収率:75%1 H−NMR(CDCl3、ppm):2.05−2.1
3(m,1H),2.33−2.49(m,1H),
3.21−3.36(m,2H),3.61(s,3
H),3.85−3.90(m,1H),4.38−
4.45(m,1H),5.44(d,1H,J=6.
7Hz),6.10(t,1H,J=5.9Hz),
6.64−6.69(m,3H),7.05−7.24
(m,14H),7.75(d,1H,J=6.7H
z)5'-O- (p-methoxytrityl)-
2'-Deoxycytidine Properties: colorless amorphous solid Yield: 75% 1 H-NMR (CDCl 3 , ppm): 2.05-2.1
3 (m, 1H), 2.33-2.49 (m, 1H),
3.21-3.36 (m, 2H), 3.61 (s, 3
H), 3.85-3.90 (m, 1H), 4.38-
4.45 (m, 1H), 5.44 (d, 1H, J = 6.
7 Hz), 6.10 (t, 1H, J = 5.9 Hz),
6.64-6.69 (m, 3H), 7.05-7.24
(M, 14H), 7.75 (d, 1H, J = 6.7H
z)
【0024】5’−O−(p−メトキシトリチル)−
2’−デオキシグアノシン 性状:無色アモルファス状固体 収率:76%1 H−NMR(DMSO−d6、ppm):2.20−
2.30(m,1H),2.54−2.63(m,1
H),3.12−3.18(m,2H),3.75
(s,3H),3.89−4.01(m,1H),4.
33−4.42(m,1H),5.24−5.35
(m,1H),6.06−6.18(m,1H),6.
42(brs,2H),6.81(d,2H,J=8.
8Hz),7.17−7.34(m,12H),7.7
8(s,1H),10.73(brs,1H)5'-O- (p-methoxytrityl)-
2'-Deoxyguanosine Property: colorless amorphous solid Yield: 76% 1 H-NMR (DMSO-d 6 , ppm): 2.20-
2.30 (m, 1H), 2.54-2.63 (m, 1H)
H), 3.12-3.18 (m, 2H), 3.75
(S, 3H), 3.89-4.01 (m, 1H), 4.
33-4.42 (m, 1H), 5.24-5.35
(M, 1H), 6.06-6.18 (m, 1H), 6.
42 (brs, 2H), 6.81 (d, 2H, J = 8.
8 Hz), 7.17-7.34 (m, 12H), 7.7
8 (s, 1H), 10.73 (brs, 1H)
【0025】5’−O−(p−メトキシトリチル)−
2’−デオキシチミジン 性状:無色アモルファス状固体 収率:81%1 H−NMR(DMSO−d6、ppm):2.13−
2.20(m,1H),2.21−2.28(m,1
H),2.56(brs,1H),3.15−3.31
(m,2H),3.61(s,3H),3.85−3.
98(m,1H),4.35−4.44(m,1H),
6.25(t,1H,J=7.2Hz),6.65
(d,2H,J=8.8Hz),7.08−7.26
(m,13H),7.46(s,1H),8.69−
8.91(brs,1H)5'-O- (p-methoxytrityl)-
2'-Deoxythymidine Property: colorless amorphous solid Yield: 81% 1 H-NMR (DMSO-d 6 , ppm): 2.13
2.20 (m, 1H), 2.21-2.28 (m, 1
H), 2.56 (brs, 1H), 3.15-3.31
(M, 2H), 3.61 (s, 3H), 3.85-3.
98 (m, 1H), 4.35-4.44 (m, 1H),
6.25 (t, 1H, J = 7.2 Hz), 6.65
(D, 2H, J = 8.8 Hz), 7.08-7.26
(M, 13H), 7.46 (s, 1H), 8.69-
8.91 (brs, 1H)
【0026】(4)5’−位の選択的なトリチル化法 前記(2)のジメトキシトリチル化法において、p,
p’−ジメトキシトリチルクロライドの代わりにトリチ
ルクロライド(40.0mmol)を用いて、同様に反
応させて5’−O−トリチル−2’−デオキシリボヌク
レオシドを得た。得られた化合物の収率、スペクトルデ
ータは以下のとおりである。(4) Method for selective tritylation at the 5'-position In the dimethoxytritylation method of the above (2), p,
The same reaction was carried out using trityl chloride (40.0 mmol) instead of p'-dimethoxytrityl chloride to obtain 5'-O-trityl-2'-deoxyribonucleoside. The yield and spectrum data of the obtained compound are as follows.
【0027】5’−O−トリチル−2’−デオキシアデ
ノシン 性状:無色アモルファス状固体 収率:78%1 H−NMR(CDCl3、ppm):2.23(br
s,1H),2.31−2.48(m,1H),2.6
1−2.80(m,1H),3.44(dd,2H,J
=1.5,4.4Hz),4.14(dt,1H,J=
3.8,4.4Hz),4.51−4.76(m,1
H),5.90(brs,2H),6.46(t,1
H,J=6.2Hz),6.78(d,2H,J=8.
9Hz),7.14−7.28(m,15H),7.9
1(s,1H),8.24(s,1H)5'-O-trityl-2'-deoxyadenosine Property: colorless amorphous solid Yield: 78% 1 H-NMR (CDCl 3 , ppm): 2.23 (br)
s, 1H), 2.31-2.48 (m, 1H), 2.6.
1-2.80 (m, 1H), 3.44 (dd, 2H, J
= 1.5, 4.4 Hz), 4.14 (dt, 1H, J =
3.8, 4.4 Hz), 4.51-4.76 (m, 1
H), 5.90 (brs, 2H), 6.46 (t, 1
H, J = 6.2 Hz), 6.78 (d, 2H, J = 8.
9 Hz), 7.14-7.28 (m, 15H), 7.9
1 (s, 1H), 8.24 (s, 1H)
【0028】5’−O−トリチル−2’−デオキシシチ
ジン 性状:無色アモルファス状固体 収率:79%1 H−NMR(CDCl3、ppm):2.08−2.1
4(m,1H),2.37−2.45(m,1H),
3.24−3.33(m,2H),3.87−3.93
(m,1H),4.33−4.41(m,1H),5.
44(d,1H,J=6.7Hz),6.10(t,1
H,J=5.8Hz),6.59−6.67(m,1
H),7.04−7.18(m,16H),7.74
(d,1H,J=7.3Hz)5'-O-trityl-2'-deoxycytidine Properties: colorless amorphous solid Yield: 79% 1 H-NMR (CDCl 3 , ppm): 2.08-2.1
4 (m, 1H), 2.37-2.45 (m, 1H),
3.24-3.33 (m, 2H), 3.87-3.93
(M, 1H), 4.33-4.41 (m, 1H), 5.
44 (d, 1H, J = 6.7 Hz), 6.10 (t, 1
H, J = 5.8 Hz), 6.59-6.67 (m, 1
H), 7.04-7.18 (m, 16H), 7.74
(D, 1H, J = 7.3 Hz)
【0029】5’−O−トリチル−2’−デオキシグア
ノシン 性状:無色アモルファス状固体 収率:76%1 H−NMR(DMSO−d6、ppm):2.18−
2.28(m,1H),2.55−2.64(m,1
H),3.11−3.18(m,2H),3.88−
3.98(m,1H),4.35−4.42(m,1
H),5.23(d,1H,J=4.5Hz),6.1
2(t,1H,J=6.4Hz),6.55(brs,
2H),7.12−7.26(m,15H),7.81
(s,1H),10.31(brs,1H)元素分析:
C29H27N5O4として 計算値:C68.36, H5.34, N13.74 実測値:C68.50, H5.28, N13.775'-O-trityl-2'-deoxyguanosine Property: colorless amorphous solid Yield: 76% 1 H-NMR (DMSO-d 6 , ppm): 2.18-
2.28 (m, 1H), 2.55-2.64 (m, 1
H), 3.11-3.18 (m, 2H), 3.88-
3.98 (m, 1H), 4.35-4.42 (m, 1
H), 5.23 (d, 1H, J = 4.5 Hz), 6.1.
2 (t, 1H, J = 6.4 Hz), 6.55 (brs,
2H), 7.12-7.26 (m, 15H), 7.81
(S, 1H), 10.31 (brs, 1H) Elemental analysis:
Calcd C 29 H 27 N 5 O 4 : C68.36, H5.34, N13.74 Found: C68.50, H5.28, N13.77
【0030】5’−O−トリチル−2’−デオキシチミ
ジン 性状:無色アモルファス状固体 収率:80%1 H−NMR(DMSO−d6、ppm):2.11−
2.19(m,1H),2.26−2.32(m,1
H),2.55(brs,1H),3.21−3.37
(m,2H),3.87−3.93(m,1H),4.
35−4.43(m,1H),6.34(t,1H,J
=6.7Hz),7.08−7.23(m,16H),
7.42(s,1H),8.75−8.92(brs,
1H)5'-O-trityl-2'-deoxythymidine Properties: colorless amorphous solid Yield: 80% 1 H-NMR (DMSO-d 6 , ppm): 2.11
2.19 (m, 1H), 2.26-2.32 (m, 1
H), 2.55 (brs, 1H), 3.21-3.37.
(M, 2H), 3.87-3.93 (m, 1H), 4.
35-4.43 (m, 1H), 6.34 (t, 1H, J
= 6.7 Hz), 7.08-7.23 (m, 16H),
7.42 (s, 1H), 8.75-8.92 (brs,
1H)
Claims (7)
反応させて5’−O−トリチルヌクレオシド類を製造法
する方法であって、反応促進剤としてアゾールの塩類を
使用する方法。1. A method for producing 5′-O-trityl nucleosides by reacting an unprotected nucleoside with a trityling agent, wherein azole salts are used as a reaction accelerator.
ゾール、テトラゾールまたはその誘導体あるいは同族体
の塩酸塩、硝酸塩、過塩素酸塩もしくはスルホン酸塩で
ある、請求項1記載の方法。2. The method according to claim 1, wherein the salt of the azole is imidazole, triazole, tetrazole or a derivative thereof or a homolog thereof, such as hydrochloride, nitrate, perchlorate or sulfonate.
請求項1記載の方法。3. An amine is used in combination with the reaction accelerator.
The method of claim 1.
キシリボヌクレオシドまたは2’−O−アルキルリボヌ
クレオシドである、請求項1記載の方法。4. The method according to claim 1, wherein the nucleoside is a ribonucleoside, a deoxyribonucleoside or a 2′-O-alkyl ribonucleoside.
である、請求項1記載の方法。5. The method of claim 1, wherein the trityling agent is a trityl halide.
反応させて5’−O−トリチルヌクレオシド類を製造法
する方法であって、アゾールの塩類としてイミダゾール
のスルホン酸塩とアミン類としてトリアルキルアミンを
使用する方法。6. A method for producing 5′-O-trityl nucleosides by reacting an unprotected nucleoside with a tritylating agent, comprising a sulfonate of imidazole as an azole salt and a trialkylamine as an amine. How to use.
反応させて5’−O−トリチルヌクレオシド類を製造法
する方法であって、アゾールの塩類としてイミダゾリウ
ムメタンスルホネートールおよびアミン類としてジイソ
プロピルエチルアミンを使用する方法。7. A method for producing 5′-O-trityl nucleosides by reacting an unprotected nucleoside with a trityling agent, comprising imidazolium methanesulfonateol as an azole salt and diisopropylethylamine as an amine How to use.
Priority Applications (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP02574799A JP4420360B2 (en) | 1999-01-14 | 1999-02-03 | Process for producing 5'-O-trityl nucleosides |
Applications Claiming Priority (3)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
JP11-7094 | 1999-01-14 | ||
JP709499 | 1999-01-14 | ||
JP02574799A JP4420360B2 (en) | 1999-01-14 | 1999-02-03 | Process for producing 5'-O-trityl nucleosides |
Publications (2)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
JP2000264897A true JP2000264897A (en) | 2000-09-26 |
JP4420360B2 JP4420360B2 (en) | 2010-02-24 |
Family
ID=26341354
Family Applications (1)
Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
---|---|---|---|
JP02574799A Expired - Fee Related JP4420360B2 (en) | 1999-01-14 | 1999-02-03 | Process for producing 5'-O-trityl nucleosides |
Country Status (1)
Country | Link |
---|---|
JP (1) | JP4420360B2 (en) |
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
WO2005021571A1 (en) * | 2003-08-29 | 2005-03-10 | Mitsui Chemicals, Inc. | Method for producing n4-benzoylcytidine derivative |
US6875860B2 (en) | 2001-05-15 | 2005-04-05 | Mitsui Chemicals, Inc. | Method for purifying 5′ -protected thymidines and novel derivatives thereof |
-
1999
- 1999-02-03 JP JP02574799A patent/JP4420360B2/en not_active Expired - Fee Related
Cited By (2)
Publication number | Priority date | Publication date | Assignee | Title |
---|---|---|---|---|
US6875860B2 (en) | 2001-05-15 | 2005-04-05 | Mitsui Chemicals, Inc. | Method for purifying 5′ -protected thymidines and novel derivatives thereof |
WO2005021571A1 (en) * | 2003-08-29 | 2005-03-10 | Mitsui Chemicals, Inc. | Method for producing n4-benzoylcytidine derivative |
Also Published As
Publication number | Publication date |
---|---|
JP4420360B2 (en) | 2010-02-24 |
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
ES2830784T3 (en) | Process for the preparation of gemcitabine- [phenyl (benzoxy-L-alanyl)] phosphate | |
CN112533892B (en) | Alkoxyphenyl derivative, nucleoside protector, nucleotide protector, method for producing oligonucleotide, and method for removing substituent | |
JP6889180B2 (en) | Diastereoselective synthesis of phosphate derivatives and gemcitabine prodrug NUC-1031 | |
JP2006248949A (en) | Nucleoside derivative, nucleotide derivative and manufacturing method thereof | |
AU2005320374A1 (en) | Method for the preparation of 2'-deoxy-2',2'-difluorocytidine | |
JP4700693B2 (en) | Method for producing 2'-deoxy-2 ', 2'-difluorocytidine | |
JP6263645B2 (en) | Synthesis method of clofarabine | |
AU2022291626A1 (en) | Improved process for preparing imetelstat | |
EP4180442A1 (en) | Method for producing nucleic acid oligomer | |
JP4420360B2 (en) | Process for producing 5'-O-trityl nucleosides | |
EP4098655A1 (en) | Method for producing nucleic acid oligomer | |
EP4097117B1 (en) | Process of preparing nucleic acid oligomer | |
EP4130018A1 (en) | Method for producing nucleic acid oligomer | |
JP6853265B2 (en) | Compounds and Synthetic Methods for 5- (N-Protected-Tryptaminocarboxyamide) -2'-Deoxyuridine Phosphoramidite for Incorporation into Nucleic Acids | |
US7671191B2 (en) | Methods for preparing 2-alkynyladenosine derivatives | |
JP5091126B2 (en) | Process for the preparation of α-anomer enriched 2-deoxy-2,2-difluoro-D-ribofuranosyl sulfonate and its use for preparing β-nucleosides | |
US6894158B2 (en) | Methods of producing phosphitylated compounds | |
JP7452549B2 (en) | Phosphoramidite activator | |
JP2003002895A (en) | Method for synthesizing nucleic acid | |
WO2024019137A1 (en) | Production method of oligonucleotide | |
JP2003513101A (en) | Nucleoside derivative having a photosensitive protecting group | |
ITMI971211A1 (en) | PRODUCTION FOR THE PREPARATION OF A DESOXYURIDINE DERIVATIVE | |
JP4174895B2 (en) | Nucleoside derivatives and their production | |
JP2019119739A (en) | Method for producing nucleoside derivative | |
JP5105404B2 (en) | 8-substituted guanosine derivatives having hydrogen-bonding substituents and oligonucleotides containing the same |
Legal Events
Date | Code | Title | Description |
---|---|---|---|
A621 | Written request for application examination |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A621 Effective date: 20050408 |
|
A131 | Notification of reasons for refusal |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A131 Effective date: 20081222 |
|
A521 | Written amendment |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A523 Effective date: 20090210 |
|
TRDD | Decision of grant or rejection written | ||
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 Effective date: 20091126 |
|
A01 | Written decision to grant a patent or to grant a registration (utility model) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A01 |
|
A61 | First payment of annual fees (during grant procedure) |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: A61 Effective date: 20091127 |
|
FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20121211 Year of fee payment: 3 |
|
R150 | Certificate of patent or registration of utility model |
Free format text: JAPANESE INTERMEDIATE CODE: R150 |
|
FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20121211 Year of fee payment: 3 |
|
FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20121211 Year of fee payment: 3 |
|
FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20121211 Year of fee payment: 3 |
|
FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20131211 Year of fee payment: 4 |
|
FPAY | Renewal fee payment (event date is renewal date of database) |
Free format text: PAYMENT UNTIL: 20131211 Year of fee payment: 4 |
|
LAPS | Cancellation because of no payment of annual fees |