ITUB20152648A1 - METHOD OF ANALYSIS OF LABORATORY RESULTS FOR THE COLLECTIVE DETECTION AND REPORTING OF ASYNTHOMATIC HEALTH PROBLEMS - Google Patents
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Description
METODO DI ANALISI DI RISULTATI DI LABORATORIO PER IL RILEVAMENTO COLLETTIVO E LA SEGNALAZIONE DI PROBLEMI DI METHOD OF ANALYSIS OF LABORATORY RESULTS FOR THE COLLECTIVE DETECTION AND REPORTING OF PROBLEMS
SALUTE ASINTOMATICI ASYMPTOMATIC HEALTH
Il presente trovato concerne un metodo di diagnosi in vitro per il rilevamento collettivo finalizzato alla individuazione di pazienti affetti da patologie croniche asintomatiche. The present invention relates to an in vitro diagnosis method for collective detection aimed at identifying patients suffering from asymptomatic chronic diseases.
Studi epidemiologici recenti, approvati dalla comunità scientifica internazionale, mostrano come aumenti progressivamente 1'incidenza delle malattie croniche sulla spesa sanitaria con 1'evidente rischio, in un prossimo futuro, di non riuscire più a sostenere i servizi attuali. Recent epidemiological studies, approved by the international scientific community, show how the incidence of chronic diseases on health expenditure is progressively increasing with the evident risk, in the near future, of not being able to support current services.
E' guindi fortemente sentita 1'esigenza di migliorare le attività di prevenzione cercando di anticipare gli interventi in uno stadio precoce della malattia. The need is therefore strongly felt to improve prevention activities by trying to anticipate interventions at an early stage of the disease.
A titolo di esempio, stime ufficiali indicano che siano affetti da Malattia Renale Cronica un numero di persone compreso tra il 6% e 1'8% della popolazione. By way of example, official estimates indicate that between 6% and 8% of the population are affected by Chronic Kidney Disease.
Tale malattia, così come molte altre patologie asintomatiche, si presenta nelle prime fasi, come noto, senza sintomi apprezzabili per il paziente sfociando poi, almeno nei casi più gravi, nel blocco totale della funzionalità renale con conseguente necessità di un trapianto o della dialisi. This disease, as well as many other asymptomatic pathologies, occurs in the early stages, as is known, without appreciable symptoms for the patient and then leads, at least in the most serious cases, to the total block of renal function with the consequent need for a transplant or dialysis.
Per rilevamento collettivo si intende, nel presente testo, un procedimento diagnostico volto a rilevare il verificarsi di un particolare disturbo medico in una collettività di individui e non in un singolo individuo. By collective detection is meant, in this text, a diagnostic procedure aimed at detecting the occurrence of a particular medical disorder in a community of individuals and not in a single individual.
Oggigiorno, è nota la problematica costituita dai disturbi medici asintomatici che, oltre alla già citata Malattia Renale Cronica, comprende anche i disturbi del fegato, in particolare le epatiti, ma anche certe sofferenze cardiache o diabetiche. Today, the problem of asymptomatic medical disorders is known which, in addition to the aforementioned Chronic Kidney Disease, also includes liver disorders, in particular hepatitis, but also certain cardiac or diabetic sufferings.
Tali disturbi compromettono gradualmente la salute del paziente senza fornire a quest'ultimo segni fisici utili a segnalare lo stato di malattia e senza poter di conseguenza attivare i consueti percorsi diagnostici e terapeutici. These disorders gradually compromise the patient's health without providing the latter with physical signs that are useful to signal the state of illness and consequently without being able to activate the usual diagnostic and therapeutic paths.
A causa di ciò, un paziente affetto da un tale disturbo non è in grado di verificarne la sussistenza, ritardando in tal modo le precauzioni ed i trattamenti che possono rallentarne il peggioramento e contenerne i danni. Because of this, a patient suffering from such a disorder is unable to verify its existence, thus delaying the precautions and treatments that can slow down its deterioration and limit its damage.
Tale tipo di disturbi medici vengono guindi rilevati solo quando compromettono le condizioni di salute del paziente e risultano di impatto particolarmente rilevante sia per 1'individuo che ne è portatore sia per il servizio di assistenza sanitaria, quando previsto. This type of medical disorders are therefore detected only when they compromise the patient's health conditions and have a particularly significant impact both for the individual who carries them and for the health care service, when foreseen.
Infatti, il danno generato nell'organismo dalle mancate cure del disturbo non tempestivamente diagnosticato, causa la necessità di trattamenti successivi maggiormente impegnativi e/o invasivi , e quindi costosi. In fact, the damage generated in the body by the failure to treat the disorder not promptly diagnosed causes the need for more demanding and / or invasive, and therefore expensive, subsequent treatments.
Per ridurre 1'incidenza delle diagnosi tardive di disturbi medici asintomatici oggigiorno sono adottate campagne di sensibilizzazione ed eventualmente campagne di esame collettivo, anche dette di "screening". To reduce the incidence of late diagnoses of asymptomatic medical disorders, awareness campaigns and possibly collective examination campaigns, also known as "screening", are nowadays adopted.
Tuttavia le campagne di sensibilizzazione si dimostrano scarsamente efficaci e richiedono intense attività di comunicazione . However, awareness-raising campaigns are not very effective and require intense communication activities.
Inoltre si caratterizzano per 1'impossibilità di monitorarne e verificarne 1'effettiva efficacia. Furthermore, they are characterized by the impossibility of monitoring and verifying their effective effectiveness.
Le campagne di screening, invece, richiedono un impegno non trascurabile sia al servizio di assistenza medica, che deve organizzarle, sensibilizzare la popolazione a partecipare alla campagna e gestirne gli esiti, sia agli stessi utenti del servizio di assistenza medica che dovranno appositamente sottoporsi ad esami specifici. The screening campaigns, on the other hand, require a not negligible commitment both to the medical assistance service, which must organize them, to sensitize the population to participate in the campaign and manage the results, and to the users of the medical assistance service who will have to undergo specific examinations. specific.
Nonostante tale considerevole impegno negli anni si è riscontrata una percentuale molto bassa di adesione a tali campagne molto probabilmente proprio a causa dell'alto impegno richiesto agli utenti. Despite this considerable commitment over the years, a very low percentage of adherence to these campaigns has been found, most likely due to the high commitment required from users.
Il problema alla base della presente invenzione è quello di ridurre 1'impatto sulle persone e sul sistema di assistenza sanitaria dei disturbi medici asintomatici. Compito principale del presente trovato consiste nel realizzare un metodo che permetta un rilevamento collettivo di patologie asintomatiche e specialmente della malattia renale cronica che ponga soluzione a tale problema risolvendo i lamentati inconvenienti dei metodi tradizionali sopra descritti. Nell'ambito di tale compito è scopo del presente trovato proporre un metodo di rilevamento collettivo delle malattie croniche asintomatiche che permetta di identificare lo stadio della malattia cronica asintomatica per un maggior numero di individui rispetto a guaisiasi tecnica tradizionale, con il minore impatto organizzativo possibile sia per le persone che per il servizio sanitario nazionale. The problem underlying the present invention is that of reducing the impact on people and on the health care system of asymptomatic medical disorders. The main aim of the present invention is to provide a method which allows a collective detection of asymptomatic pathologies and especially of chronic kidney disease which solves this problem by solving the complained drawbacks of the traditional methods described above. Within this aim, the object of the present invention is to propose a method for the collective detection of asymptomatic chronic diseases which allows to identify the stage of the asymptomatic chronic disease for a greater number of individuals compared to traditional techniques, with the lowest possible organizational impact both for people who for the national health service.
Un altro scopo del presente trovato consiste nel realizzare un metodo per il rilevamento collettivo della malattia cronica asintomatica che permetta di fornire una distribuzione geografica del verificarsi delle patologie rilevate e permetta la creazione di mappe per valutare 1'effettiva incidenza sul territorio della malattia. Another object of the present invention is to provide a method for the collective detection of the asymptomatic chronic disease which allows to provide a geographic distribution of the occurrence of the detected pathologies and allows the creation of maps to evaluate the actual incidence of the disease on the territory.
Un altro scopo del presente trovato è guello di controllare 1'evoluzione nel tempo della malattia asintomatica cronica individuata negli individui affetti, e monitorare nel tempo 1'incidenza e la progressione di tali disturbi nella popolazione. Another object of the present invention is to control the evolution over time of the chronic asymptomatic disease identified in affected individuals, and to monitor over time the incidence and progression of such disorders in the population.
Un altro scopo del trovato è guello di evitare procedure socialmente invasive nelle attività di prevenzione della popolazione stessa e poter fornire informazioni determinanti di programmazione sanitaria. Questo compito, nonché guesti ed altri scopi che meglio appariranno nel seguito, sono raggiunti dal Metodo di analisi di risultati di laboratorio per il rilevamento collettivo e la segnalazione di problemi di salute asintomatici secondo la rivendicazione 1 allegata. Another object of the invention is to avoid socially invasive procedures in the prevention activities of the population itself and to be able to provide crucial information for health planning. This aim, as well as the other aims and objects which will become clearer in the following, are achieved by the method of analysis of laboratory results for the collective detection and reporting of asymptomatic health problems according to the attached claim 1.
Caratteristiche di dettaglio del Metodo di analisi di risultati di laboratorio per il rilevamento collettivo e la segnalazione di problemi di salute asintomatici secondo il trovato sono riportate nelle rivendicazioni dipendenti. Detailed characteristics of the Method for analyzing laboratory results for the collective detection and reporting of asymptomatic health problems according to the invention are reported in the dependent claims.
Ulteriori caratteristiche e vantaggi del trovato risulteranno maggiormente dalla descrizione di una forma di esecuzione preferita, ma non esclusiva del Metodo di analisi di risultati di laboratorio per il rilevamento collettivo e la segnalazione di problemi di salute asintomatici secondo il trovato, illustrata a titolo indicativo e non limitativo nelle unite tavole di disegni, in cui: Further characteristics and advantages of the invention will become clearer from the description of a preferred but not exclusive embodiment of the Method for analyzing laboratory results for the collective detection and reporting of asymptomatic health problems according to the invention, illustrated by way of example and not limitative in the joined tables of drawings, in which:
- la figura 1 illustra uno schema della struttura di un sistema al guai e è applicabile il metodo secondo la presente invenzione; Figure 1 illustrates a diagram of the structure of a system to the trouble and the method according to the present invention is applicable;
- la figura 2 illustra lo schema generale del sistema che descrive un esempio dei passi tecnici per ottenere la stadi azione della popolazione analizzata. - Figure 2 illustrates the general scheme of the system which describes an example of the technical steps to obtain the action stage of the analyzed population.
Con particolare riferimento alle figure citate, è globalmente indicato con 10 un Metodo di analisi di risultati di laboratorio per il rilevamento collettivo e la segnalazione di problemi di salute asintomatici e specialmente della malattia renale cronica. With particular reference to the aforementioned figures, the numeral 10 generally indicates a method of analyzing laboratory results for the collective detection and reporting of asymptomatic health problems and especially chronic kidney disease.
Il metodo 10 comprende: Method 10 includes:
una fase di acguisizione il di dati medici A organizzati; a phase of acquiring the medical data A organized;
una fase di elaborazione 12 dei dati medici A acguisiti, secondo almeno un predefinito algoritmo atto a rilevare la sussistenza di un predefinito disturbo medico asintomatico nel paziente al guaie i dati medici A si riferiscono. a processing step 12 of the acquired medical data A, according to at least a predefined algorithm suitable for detecting the existence of a predefined asymptomatic medical disorder in the patient to which the medical data A refers.
I suddetti dati medici A sono organizzati in set di dati B ciascuno riconducibile ad un paziente e comprendente valori, riferiti a tale paziente: The aforementioned medical data A are organized in data sets B each attributable to a patient and including values, referred to that patient:
- di creatinina serica; - of serum creatinine;
- esame delle urine; - urinalysis;
- glicemia; - glycemia;
- albuminuria; - albuminuria;
- proteinuria; - proteinuria;
- colesterolo; - cholesterol;
- trigliceridi, - triglycerides,
- C3, - C3,
- C4, - C4,
- uACR, - uACR,
- uPCR. - uPCR.
Inoltre, i dati medici A comprendono informazioni accessorie comprendenti almeno: In addition, medical data A includes ancillary information including at least:
- la data dell'esame nell'ambito del guale sono stati rilevati i suddetti valori; - the date of the examination in which the aforementioned values were detected;
- un identificativo del soggetto che ha ordinato detto esame; - an identifier of the person who ordered the examination;
un identificativo della tipologia del regime dell'esame. an identifier of the type of exam regime.
La tipologia del regime dell' esame potendo essere regime di ricovero o regime ambulatoriale o regime di pronto soccorso. The type of examination regime may be inpatient or outpatient regime or first aid regime.
Secondo la presente invenzione, la fase di acguisizione 11 presenta una particolare peculiarità nel fatto che in essa sono estratti i dati medici A da banche dati d'origine 100, essendo detti dati medici A precostituiti e conservati nelle banche dati d'origine 100 che sono differenziate e distribuite in strutture preposte a raccogliere e/o a conservare detti dati medici A. According to the present invention, the acquisition step 11 has a particular peculiarity in that the medical data A from original databases 100 are extracted therein, said medical data A being pre-established and stored in the original databases 100 which are differentiated and distributed in structures responsible for collecting and / or storing said medical data A.
La fase di acquisizione 11 è continuativa o programmata a intervalli di tempo. The acquisition phase 11 is continuous or programmed at time intervals.
Vantaggiosamente, la fase di elaborazione 12 comprende almeno una fase di normalizzazione e vaiidazione 13 che comprende: Advantageously, the processing step 12 comprises at least one normalization and pacing step 13 which comprises:
- associare i set di dati B medici A all' identificativo del paziente al quale tale set di dati B medici A si riferisce; detto identificativo comprende preferibilmente il nome, il cognome, la data di nascita, il luogo di nascita, il sesso e preferibilmente il codice fiscale; - associate the B medical data sets A to the identification of the patient to which said B medical data set A refers; said identifier preferably includes the name, surname, date of birth, place of birth, sex and preferably the tax code;
- validare i risultati di laboratorio, tale operazione prevedendo di scartare i valori non significativi o errati e comunque non misurabili, cioè non numerici, espressi in forma testuale, come ad esempio valori come "- " o "CAMPIONE NON PERVENUTO" o "Non determinabile" o similari; - validate the laboratory results, this operation providing for discarding the insignificant or incorrect and in any case non-measurable values, i.e. non-numerical, expressed in textual form, such as values such as "-" or "SAMPLE NOT RECEIVED" or "Not determinable "or similar;
eliminare dall'elenco i pazienti per i quali i dati medici A indicano condizioni di anomalia delete from the list the patients for whom medical data A indicates abnormal conditions
- omogeneizzare i valori suddetti rispetto a medesime unità di misura, selezionando un'unità di misura per ciascun valore da omogeneizzare, secondo un predefinito criterio, per esempio selezionando 1'unità di misura maggiormente ricorrente fra tutti i valori relativi allo stesso dato medico da omogeneizzare; - homogenize the aforementioned values with respect to the same units of measurement, by selecting a unit of measurement for each value to be homogenized, according to a predefined criterion, for example by selecting the most common unit of measurement among all the values relating to the same medical data to be homogenized ;
separare i pazienti cronici, ossia coloro per i quali è già nota una condizione di patologia cronica, da quelli acuti cioè coloro per i quali i valori dei dati medici A mostrano la sussistenza di una patologia cronica; tale separazione permette di distinguere i pazienti già inclusi in un certo regime terapeutico, come ad esempio coloro che sono sottoposti a dialisi, da coloro che risultano essere a rischio di malattia renale cronica e che quindi sono, potenzialmente e inconsapevolmente, affetti da insufficienza renale cronica a vari livelli ; per operare questa separazione in questa fase vengono, a titolo di esempio, selezionati i pazienti i cui dati identificativi sono già compresi in banche dati di pazienti dializzati. separate chronic patients, ie those for whom a condition of chronic pathology is already known, from acute patients, ie those for whom the values of the medical data A show the existence of a chronic pathology; this separation makes it possible to distinguish patients already included in a certain therapeutic regimen, such as those undergoing dialysis, from those who are at risk of chronic kidney disease and who are therefore, potentially and unknowingly, suffering from chronic kidney failure at various levels; to carry out this separation in this phase, by way of example, the patients whose identification data are already included in databases of dialysis patients are selected.
Le condizioni di anomalia sopra dette vantaggiosamente possono essere identificate: The anomaly conditions mentioned above can advantageously be identified:
da un valore anomalo rilevato dall'esame che risulterebbe plausibile anche non in presenza di una cronicità come, ad esempio, nel caso pazienti molto anziani, selezionabili in base alla data di nascita;o dati medici A sono stati acquisiti in un particolare regime come, a puro titolo di esempio, in regime di pronto soccorso; ossia dati per i quali la tipologia del regime dell'esame corrisponde al regime di pronto soccorso; from an anomalous value detected by the examination that would be plausible even in the presence of a chronic condition such as, for example, in the case of very elderly patients, selectable based on the date of birth; or medical data A have been acquired in a particular regimen such as, purely by way of example, in the emergency room; ie data for which the type of examination regime corresponds to the first aid regime;
- e/o da dati medici A errati o che non comprendono un dato relativo ad almeno una delle informazioni accessorie sopra dette; - and / or from medical data A that are incorrect or that do not include a data relating to at least one of the ancillary information mentioned above;
- e/o da dati medici A che comprendono almeno un valore che è numerico e misurabile ma non plausibile nel merito dell'esame in considerazione, come ad esempio valori pari a zero o negativi o esterni ad intervalli predefiniti. - and / or from medical data A which include at least one value that is numerical and measurable but implausible in the merits of the examination under consideration, such as values equal to zero or negative or external to predefined intervals.
Vantaggiosamente, 1'algoritmo predefinito impiegato in detta fase di elaborazione 12 è 1'algoritmo noto con 1'acronimo CKD, che è già consolidato e validato scientificamente ed è specificamente atto a rilevare lo stadio della malattia renale cronica di un paziente, come verrà meglio descritto in seguito. Advantageously, the predefined algorithm used in said processing step 12 is the algorithm known with the acronym CKD, which is already scientifically consolidated and validated and is specifically adapted to detect the stage of a patient's chronic kidney disease, as will be better. described below.
Vantaggiosamente, la fase di elaborazione 12 comprende inoltre: Advantageously, the processing step 12 further comprises:
- una fase di formazione di un rapporto 14 contenente 1'elenco C dei possibili pazienti affetti da una patologia cronica asintomatica e specialmente da malattia renale cronica; - a phase of forming a report 14 containing the list C of possible patients affected by an asymptomatic chronic pathology and especially by chronic kidney disease;
- e/o una fase di realizzazione di una presentazione grafica 15 della distribuzione geografica D delle persone che sono state rilevate affette da una patologia cronica asintomatica e specialmente da malattia renale cronica; - and / or a phase of making a graphic presentation 15 of the geographical distribution D of the persons who have been found to be affected by an asymptomatic chronic disease and especially by chronic kidney disease;
e/o una fase di notifica 16 diretta alle persone identificate come affette da patologia cronica asintomatica e specialmente da malattia renale cronica o al medico di medicina generale che le ha in cura, dei dati medici A acquisiti, in base ai guali è stata rilevata la malattia renale cronica. and / or a notification phase 16 directed to people identified as suffering from asymptomatic chronic disease and especially chronic kidney disease or to the general practitioner who is treating them, of the medical data A acquired, based on which the chronic kidney disease.
Il metodo 10, guindi, presenta una particolare peculiarità nel fatto che i dati medici A vengono acguisiti da banche dati d'origine attraverso il caricamento di files di dati medici A estratti da ciascuna banca dati, all'interno di una base di dati 200 strutturata come di seguito più ampiamente descritto. Method 10, therefore, has a particular peculiarity in the fact that medical data A is acquired from original databases by uploading files of medical data A extracted from each database, within a structured database 200 as more fully described below.
La struttura dei dati che permette il funzionamento del presente trovato verrà descritta in dettaglio in seguito. The data structure that allows the operation of the present invention will be described in detail below.
Il caricamento dei file contenenti i dati medici A viene preferibilmente preceduto dalle fasi di normalizzazione e di vai idazione descritte in precedenza. The loading of the files containing the medical data A is preferably preceded by the normalization and progression steps described above.
In particolare, i dati medici A comprendono dati di laboratorio precostituiti , specialmente ottenuti da analisi in vitro e conservati in banche dati d'origine 100 le guali sono differenziate e distribuite in strutture preposte a raccogliere e/o conservare detti dati medici A. In particular, medical data A includes pre-established laboratory data, especially obtained from in vitro analyzes and stored in original databases 100 which are differentiated and distributed in structures responsible for collecting and / or storing said medical data A.
In altre parole il metodo secondo la presente invenzione prevede un consolidamento dei dati medici A secondo le seguenti fasi in successione: In other words, the method according to the present invention provides for a consolidation of the medical data A according to the following stages in succession:
- la fase di acguisizione 11 che prevede 1'estrazione dei dati degli esami necessari dalle banche dati di origine secondo un tracciato record concordato con il soggetto proprietario della banca dati d'origine secondo un modalità che, a titolo d'esempio, può essere di accesso diretto alla base dati, di condivisione di file di dati, mediante servizi web, o mediante middleware di integrazione, etc; - the acquisition phase 11 which provides for the extraction of the data of the necessary examinations from the source databases according to a record layout agreed with the owner of the source database according to a method that, by way of example, can be direct access to the database, for sharing data files, through web services, or through integration middleware, etc;
- la fase di elaborazione 12 che vantaggiosamente comprende attività di normalizzazione e validazione, come più sopra descritte; - the processing step 12 which advantageously comprises normalization and validation activities, as described above;
- una fase di caricamento dei dati sulla base dati, nell'ambito della fase di elaborazione 12, con elaborazione degli indicatori sulla base dell'algoritmo CKD; - a step of loading the data on the database, as part of the processing step 12, with processing of the indicators on the basis of the CKD algorithm;
- una fase di presentazione, opzionale, che prevede 1'accesso e/o la presentazione dei dati preferibilmente organizzati in una lista di pazienti, preferibilmente con una presentazione grafica della distribuzione dei dati e sistema di notifica. - an optional presentation phase, which provides for the access and / or presentation of the data preferably organized in a list of patients, preferably with a graphic presentation of the data distribution and notification system.
Il metodo secondo la presente invenzione prevede preferibilmente 1'acguisizione, 1'elaborazione e la presentazione dei dati medici A in tempi differiti e non in tempo reale. The method according to the present invention preferably provides for the acquisition, processing and presentation of the medical data A in deferred times and not in real time.
Infatti la possibilità di ottenere 1'esecuzione del presente metodo in tempo reale presenta le seguenti problematiche che rendono preferibile 1'applicazione in tempi differiti: In fact, the possibility of obtaining the execution of the present method in real time presents the following problems which make the application in deferred times preferable:
- 1'integrazione attraverso un accesso diretto ai dati di laboratorio potrebbe non essere sempre praticabile, in guanto potrebbe essere necessaria un'autorizzazione specifica da parte del fornitore della banca dati per permettere 1'accesso diretto ai dati dell'applicazione stessa; - integration through direct access to laboratory data may not always be feasible, as specific authorization from the database provider may be required to allow direct access to application data;
- la vaiidazione e normalizzazione dei dati e la loro elaborazione in tempo reale avrebbe un costo computazionale tale da rendere non fruibile in maniera soddisfacente lo strumento; - data processing and normalization and their processing in real time would have a computational cost such as to make the tool unusable in a satisfactory manner;
- il numero dei dati da elaborare potrebbe avere una dimensione nell'ordine di centinaia di migliaia di record e questo potrebbe interferire , rallentandole , con le normali operazioni. - the number of data to be processed could have a size in the order of hundreds of thousands of records and this could interfere, slowing them down, with normal operations.
Come più sopra già anticipato, la fase di elaborazione 12 prevede 1'impiego dell' algoritmo noto come CKD-EPI (versione 2009) che consiste in una formula nota in letteratura ed ampiamente utilizzata per la grande accuratezza dei risultati ottenibili . As already mentioned above, the processing step 12 provides for the use of the algorithm known as CKD-EPI (2009 version) which consists of a formula known in the literature and widely used for the great accuracy of the results that can be obtained.
E ' ormai dimostrato che per la determinazione della velocità di filtrazione glomerulare (VFG) , sono più affidabili i calcoli di stima mediante apposite formule , rispetto all'esecuzione della CIearane e della Creatinina . It has now been demonstrated that for the determination of the glomerular filtration rate (GFG), the estimation calculations using specific formulas are more reliable than the execution of CIearane and Creatinine.
Le tre principali formule per il calcolo del VFG sono quella di Cockroft-Gault , quella derivata dallo studio MDRD (Modification of Diet in Renai Disease ), specie nella versione semplificata (sMDRD) e la formula CKD-EPI (Chronic Kidney Disease Epidemiology Collaboration) che , elaborata nel 2009, è attualmente la più utilizzata per la maggiore accuratezza specie negli alti valori di VFG. The three main formulas for calculating the GF are the Cockroft-Gault one, the one derived from the MDRD (Modification of Diet in Renai Disease) study, especially in the simplified version (sMDRD) and the CKD-EPI (Chronic Kidney Disease Epidemiology Collaboration) formula. which, developed in 2009, is currently the most used due to its greater accuracy, especially in the high values of VFG.
Il peso e 1'altezza, che sono indispensabili per la formula di Cockroft-Gault , non lo sono per le formule sMDRD e per la CKD-EPI.Per questo 1'utilizzo delle basi dati legate ai Laboratori Analisi è perfettamente aderente . The weight and height, which are indispensable for the Cockroft-Gault formula, are not essential for the sMDRD formulas and for the CKD-EPI. For this reason the use of the databases linked to the Analysis Laboratories is perfectly consistent.
La creatininemia (V.N. 0,7-1,3 mg/di) da sola, non è un parametro affidabile per la misura della funzione renale. Essa, infatti, in quanto prodotta dai muscoli ed eliminata dal rene, cresce al crescere delle masse muscolari. Pertanto, un valore di 1,2 mg/di, espressione di una normale funzione renale in un soggetto con masse muscolari particolarmente sviluppate, può al contrario "mascherare" una franca insufficienza renale in un soggetto con scarsa massa muscolare. Inoltre, soprattutto nelle fasi iniziali dell'insufficienza renale, a piccoli aumenti del valore di creatininemia corrispondono importanti diminuzioni del volume del filtrato glomerulare (VFG). Per questi motivi, la valutazione della funzione renale non può basarsi solo sulla creatininemia, ma è necessario determinare il VFG. Blood creatinine (V.N. 0.7-1.3 mg / day) alone is not a reliable parameter for measuring renal function. In fact, as it is produced by the muscles and eliminated by the kidney, it grows as the muscle masses grow. Therefore, a value of 1.2 mg / day, expression of a normal renal function in a subject with particularly developed muscle mass, can on the contrary "mask" an outright renal insufficiency in a subject with low muscle mass. Furthermore, especially in the initial stages of renal insufficiency, small increases in the creatinine level correspond to significant decreases in the volume of glomerular filtrate (GFR). For these reasons, assessment of renal function cannot be based on creatinine alone, but GFR must be determined.
Il metodo tradizionale di diagnosi in vitro della malattia renale cronica prevede il calcolo della CIearanee della Creatinina, ed è basato sul dosaggio delle creatinina piasmatica e della creatinina urinaria delle 24 ore e determinata dalla formula: The traditional method of in vitro diagnosis of chronic kidney disease involves the calculation of the CIearanee of Creatinine, and is based on the 24-hour dosage of piasmatic creatinine and urinary creatinine and determined by the formula:
Creatinina Clearance (o Velocita di Filtrazione Glomerulare - VFG) = Creatininuria (mg/di) x Diuresi delle 24ore / Creatininemia x 1440 Creatinine Clearance (or Glomerular Filtration Rate - VFG) = Creatinuria (mg / day) x 24 hour diuresis / Creatininemia x 1440
Il limite della affidabilità del valore della clearance misurata in laboratorio risiede nell'alta probabilità di un errore pre-analitico da parte del paziente, inadeguata raccolta delle urine delle 24 ore, approssimativa determinazione del volume urinario. The limit of the reliability of the clearance value measured in the laboratory lies in the high probability of a pre-analytical error by the patient, inadequate 24-hour urine collection, approximate determination of the urinary volume.
Quando non è possibile o risulta poco affidabile la raccolta delle urine delle 24 ore da parte del paziente, o comunque per verificare 1'affidabilità della clearance misurata in laboratorio, è opportuno ricorrere al calcolo delle clearance tramite la formula di Cockroft Gault: When the 24-hour urine collection by the patient is not possible or unreliable, or in any case to verify the reliability of the clearance measured in the laboratory, it is advisable to use the calculation of the clearance using the Cockroft Gault formula:
Uomini VFG = (140-età) x peso ideale (kg) / (72 x Creatininemia) GFR men = (140-age) x ideal weight (kg) / (72 x Creatininemia)
Donne VFG = idem x 0,85 VFG women = ditto x 0.85
Nella formula sopra riportata è specificato "peso ideale", che è calcolato con la formula peso ideale = BMI ideale per quadrato dell'altezza in metri, in quanto in soggetti magri od obesi la mancanza/eccesso di grasso determina un errore di stima. In the above formula it is specified "ideal weight", which is calculated with the formula ideal weight = ideal BMI per square of the height in meters, since in thin or obese subjects the lack / excess of fat determines an estimate error.
Nei soggetti di peso normale può essere invece utilizzato il peso reale. In subjects of normal weight, real weight can be used instead.
Sia per la clearance misurata in laboratorio, sia per la clearance calcolata tramite la formula di Cockroft, è opportuno, per una stima più corretta, normalizzare il valore a 1,73 mq di superficie corporea: For both the clearance measured in the laboratory and the clearance calculated using the Cockroft formula, it is advisable, for a more correct estimate, to normalize the value to 1.73 square meters of body surface:
VFG normalizzata = VFG x 1,73 / Sup. Corp. del paziente. Normalized GFR = GFR x 1.73 / Sup. Corp. of the patient.
Esiste un'altra formula per il calcolo della clearance (MDRD), più semplice rispetto al Cockroft, in quanto non vi compaiono il peso e 1'età, ed è già rapportata a 1,73 mq di superficie corporea: There is another formula for the calculation of clearance (MDRD), simpler than the Cockroft, as the weight and age do not appear, and is already related to 1.73 square meters of body surface:
Formula MDRD semplificata Simplified MDRD formula
VFG = 186 x Creat-1,154 x età-0.203 x K1 x K2 VFG = 186 x Creat-1,154 x age-0.203 x K1 x K2
K1: razza bianca = 1,00; razza nera = 1,21 K1: white race = 1.00; black race = 1.21
K2: maschio = 1,00; femmina = 0,742 K2: male = 1.00; female = 0.742
La MDRD semplificata (sMDRD) è una formula affidabile, a parte gravide ed anziani, perché non è influenzata dai dati antropometrici e dalla variabilità della massa muscolare o lipidica. Simplified MDRD (sMDRD) is a reliable formula, apart from pregnant and elderly people, because it is not influenced by anthropometric data and by the variability of muscle or fat mass.
Inoltre, il VFG calcolato è già rapportato alla superficie corporea, quindi non richiede altri calcoli. Nel 2009 è stata sviluppata una evoluzione della formula sMDRD: la formula CKD-EPI (Chronic Kidney Disease Epidemiology Collaboration) che sembra essere più accurata della sMDRD specialmente per valori di Filtrato Glomerulare elevati. Furthermore, the calculated GFR is already related to the body surface, so it does not require other calculations. In 2009 an evolution of the sMDRD formula was developed: the CKD-EPI (Chronic Kidney Disease Epidemiology Collaboration) formula which appears to be more accurate than sMDRD especially for high Glomerular Filtrate values.
Formula CKD-EPI: CKD-EPI formula:
VFG = 141 X min(Cre/Den,1)alfa X max(Cre/Den,1)-1.209 X 0.993Età X 1.018 [se femmina] X 1.159 [se di colore] dove Cre = Creatinina sierica, VFG = 141 X min (Cre / Den, 1) alpha X max (Cre / Den, 1) -1.209 X 0.993 Age X 1.018 [if female] X 1.159 [if colored] where Cre = serum creatinine,
Den = 0,9 se maschio e 0,7 se femmina, Den = 0.9 if male and 0.7 if female,
alfa = -0,329 se femmina e -0,411 se maschio, alpha = -0.329 if female and -0.411 if male,
min indica il valore più basso fra Cre/Den ed 1 e max indica il valore più alto fra Cre/Den e 1. min indicates the lowest value between Cre / Den and 1 and max indicates the highest value between Cre / Den and 1.
In accordo con la presente invenzione, la fase di acquisizione 11 è preferibilmente programmata a intervalli di tempo flessibili in modo da potersi accordare alle esigenze della struttura operativa presso cui il presente trovato viene installato. In accordance with the present invention, the acquisition step 11 is preferably programmed at flexible time intervals so as to be able to match the needs of the operating structure in which the present invention is installed.
Tale acquisizione viene regolata dalle funzioni periodiche di programmazione dei processi, tipica dei moderni sistemi operativi. This acquisition is regulated by the periodic programming functions of the processes, typical of modern operating systems.
A titolo di esempio, per un sistema Unix (o Linux) sono stati realizzati appositi cron script che permettono 1'attivazione programmata delle attività descritte nelle fasi di acquisizione , elaborazione e presentazione sopra descritte. By way of example, for a Unix (or Linux) system, specific cron scripts have been created that allow the scheduled activation of the activities described in the acquisition, processing and presentation phases described above.
Attraverso il metodo in accordo con la presente invenzione sarà possibile superare qualsiasi complessità organizzativa imposta dall'effettuare complesse campagne di screening per un disturbo asintomatico come quello rappresentato dalla malattia renale cronica. Through the method in accordance with the present invention it will be possible to overcome any organizational complexity imposed by carrying out complex screening campaigns for an asymptomatic disorder such as that represented by chronic kidney disease.
Infatti, 1'acquisizione e 1'elaborazione di dati medici A derivanti da analisi mediche in vitro, secondo la presente invenzione , è effettuata direttamente da banche dati di centri medici, di analisi, ospedali e altri enti presso i quali la popolazione abbia effettuato analisi mediche in vitro o presso quelli preposti a conservare gli esiti di tali analisi. In fact, the acquisition and processing of medical data A deriving from in vitro medical analyzes, according to the present invention, is carried out directly from databases of medical centers, analysis centers, hospitals and other entities where the population has carried out analyzes. in vitro medical centers or those in charge of storing the results of such analyzes.
In altre parole, secondo la presente invenzione, 1'acquisizione di dati medici A risultanti da analisi in vitro precostituite in occasioni di visite o controlli aventi fine medico il più disparato, permette di mappare ad ampio spettro 1'incidenza sulla popolazione delle malattie croniche asintomatiche e, in particolare, della malattia renale cronica , senza sostenere la complessità tecnica ed organizzativa delle campagna di screening e con una efficacia largamente maggiore rispetto a quest'ultima. In other words, according to the present invention, the acquisition of medical data A resulting from pre-established in vitro analyzes on occasions of visits or checks having the most disparate medical purpose, allows to map the incidence on the population of asymptomatic chronic diseases on a broad spectrum. and, in particular, of chronic kidney disease, without sustaining the technical and organizational complexity of the screening campaign and with a far greater efficacy than the latter.
Preferibilmente, la fase di acquisizione 11 comprende una fase di estrazione dei dati di laboratorio dalle banche dati d'origine 100 sulla base di criteri predefiniti e necessari al contesto applicativo. Preferably, the acquisition step 11 comprises a step of extracting the laboratory data from the original databases 100 on the basis of predefined criteria necessary for the application context.
Tuttavia il presente trovato permette , attraverso specifiche modalità descritte in seguito, di acquisire i suindicati dati medici A dalle banche dati di origine direttamente nella base di dati 200. However, the present invention allows, through specific methods described below, to acquire the aforementioned medical data A from the original databases directly into the database 200.
I dati medici A necessari per 1'individuazione della patologia asintomatica cronica dipendono strettamente dal contesto applicativo per cui a seconda della patologia indagata vengono presi in considerazione set di dati medici A differenti e strutturati per consentire la diagnosi della specifica patologia asintomatica da diagnosticare. The medical data A necessary for the identification of the chronic asymptomatic pathology strictly depend on the application context for which, depending on the pathology investigated, different and structured medical data sets A are taken into consideration to allow the diagnosis of the specific asymptomatic pathology to be diagnosed.
Nel caso di applicazione del metodo secondo la presente invenzione alla diagnosi in vitro della Malattia Renale, il set di dati B medici A ed informazioni preso in considerazione è rappresentato dall'elenco precedentemente esposto. In the case of application of the method according to the present invention to the in vitro diagnosis of Renal Disease, the set of medical data B A and information taken into consideration is represented by the list previously exposed.
La fase di acquisizione di dati medici A nella base di dati 200 può avvenire attraverso una delle seguenti modalità: The medical data acquisition phase A in the database 200 can take place in one of the following ways:
- caricamento di dati da file di testo sequenziali nel formato standard; - loading of data from sequential text files in the standard format;
- accesso diretto da parte di applicazioni terze, o attraverso apposite procedure di allineamento, a tabelle che permettono il trasferimento dei dati medici A alla base di dati 200; - direct access by third-party applications, or through special alignment procedures, to tables that allow the transfer of medical data A to the database 200;
- attraverso specifici servizi web (web-services) che permettono il trasferimento via rete di dei dati medici A dalle banche dati di origine alla base di dati 200. - through specific web services (web-services) that allow the transfer via network of medical data A from the original databases to the database 200.
La fase di acquisizione 11 vantaggiosamente comprende una fase di trasformazione e selezione dei dati medici A atta ad eliminare dati duplicati e scartare dati non elaborabili. The acquisition step 11 advantageously comprises a step of transformation and selection of the medical data A suitable for eliminating duplicate data and discarding data that cannot be processed.
Inoltre, la fase di acquisizione 11 preferibilmente comprende una fase di omogeneizzazione dei dati medici A, atta ad associare ad un singolo parametro quei dati, tra loro concettualmente equivalenti, acquisiti da differenti banche dati d' origine 100, nelle quali possono essere codificati in modi diversi. Furthermore, the acquisition step 11 preferably comprises a step of homogenization of the medical data A, suitable for associating to a single parameter those data, which are conceptually equivalent, acquired from different original databases 100, in which they can be coded in ways different.
La fase di acquisizione 11 vantaggiosamente prevede 1'applicazione di opportune procedure di trasformazione e omogeneizzazione attraverso 1'utilizzo di un apposito strumento di elaborazione comunemente noto come ETL, acronimo della dicitura inglese "Extract Transform Load". The acquisition step 11 advantageously provides for the application of suitable transformation and homogenization procedures through the use of a suitable processing tool commonly known as ETL, acronym for the English term "Extract Transform Load".
Il programma per elaboratore noto con il nome commerciale Pentaho, citato a puro titolo di esempio, offre una piattaforma applicativa dotata di strumenti preconfezionati, tra i quali una componente per gestire la fase di ETL, che rende tale processo più efficiente e più facile da sottoporre a manutenzione. The computer program known under the trade name Pentaho, quoted purely by way of example, offers an application platform equipped with pre-packaged tools, including a component to manage the ETL phase, which makes this process more efficient and easier to submit. maintenance.
In particolare Pentaho permette di modellare graficamente il processo di estrazione, trasformazione e caricamento dei dati nella base di dati 200 rendendo il processo facilmente modificabile in funzione di sopravvenute esigenze contingenti. In particular, Pentaho makes it possible to graphically model the process of extracting, transforming and loading the data into the database 200, making the process easily modifiable according to contingent needs.
Tali esigenze potrebbero nascere, a puro titolo di esempio, per inserire ulteriori informazioni nella base dati quali : differenti esami di laboratorio, informazioni personali aggiuntive per arricchire il contesto informativo, ad esempio a fini di indagini epidemiologiche o socio-sanitarie. Such needs could arise, purely by way of example, to enter further information in the database such as: different laboratory tests, additional personal information to enrich the information context, for example for the purpose of epidemiological or socio-health investigations.
Il sistema si collega alle differenti banche dati mantenendo come driver di collegamento univoco un set di informazioni che identificano in maniera unica il paziente nelle differenti basi di dati, in particolare vantaggiosamente sono considerati fondamentali i dati relativi a Nome, Cognome, Data Nascita e Codice Fiscale. The system connects to the different databases keeping as a unique connection driver a set of information that uniquely identifies the patient in the different databases, in particular the data relating to Name, Surname, Date of Birth and Tax Code are considered fundamental. .
Il sistema è inoltre in grado di eliminare ambiguità dovute ad identificativi differenti associati per errore al medesimo soggetto, secondo regole di controllo del set di dati B che permettano accorpamenti automatici di pazienti. The system is also able to eliminate ambiguities due to different identifiers associated by mistake with the same subject, according to control rules of the data set B that allow automatic groupings of patients.
Questo processo avviene attraverso 1'identificazione univoca del paziente, fra quelli considerati, i cui dati risultino uguali rispetto a preferibilmente almeno tre parametri che vantaggiosamente consistono in: codice fiscale, cognome, nome e data di nascita. This process takes place through the univocal identification of the patient, among those considered, whose data are the same with respect to preferably at least three parameters which advantageously consist of: tax code, surname, name and date of birth.
A titolo esemplificativo immaginiamo che il sig. Mario Rossi con un certo codice fiscale (CF) ed una specifica residenza si presenti, nel tempo, in diverse strutture per esami di laboratorio. In una struttura vengono registrati solo il Cognome, il CF e la data di nascita, in un'altra tutto meno il CF e nella terza una qualsiasi altra combinazione . Questo porterebbe un qualsiasi sistema a considerare il sig. Rossi come tre persone distinte . Tuttavia è fondamentale, per le finalità descritte in precedenza, riuscire ad identificare correttamente il sig.Rossi e attribuire allo stesso tre set di esami differenti normalizzando, se il caso, i risultati su una predefinita unità di misura. By way of example, let's imagine that Mr. Mario Rossi with a certain tax code (CF) and a specific residence occurs, over time, in different facilities for laboratory tests. In one structure only the surname, the tax code and the date of birth are recorded, in another all but the tax code and in the third any other combination. This would lead any system to consider Mr. Rossi as three distinct people. However, it is essential, for the purposes described above, to be able to correctly identify Mr. Rossi and to attribute to him three different sets of exams, normalizing, if necessary, the results on a predefined unit of measurement.
Il metodo secondo il presente trovato, attraverso 1'identificazione del paziente in base ai 3 dei parametri indicati in precedenza, garantisce la ragionevole certezza di accorpare i pazienti univoci escludendo le omonimie. The method according to the present invention, through the identification of the patient on the basis of the 3 parameters indicated above, guarantees the reasonable certainty of grouping the univocal patients, excluding the homonyms.
Una volta identificato il singolo record, viene effettuata 1'individuazione dell'ultimo esame disponibile, in ordine di data, che contenga i dati medici A necessari e sufficienti per procedere alla stadiazione. Once the single record has been identified, the last available exam is identified, in order of date, which contains the medical data A necessary and sufficient to proceed with staging.
La prima ricerca effettuata, nel caso specifico della Malattia Renale Cronica, riguarda la presenza nella banca dati di almeno un valore di Creatinina serica associata al paziente, 1'ultimo valore presente genera automaticamente una stadiazione del paziente secondo la valutazione della funzione renale con la formula tradizionale CKD ERI descritta in precedenza. The first research carried out, in the specific case of Chronic Kidney Disease, concerns the presence in the database of at least one value of serum creatinine associated with the patient, the last value present automatically generates a staging of the patient according to the evaluation of renal function with the formula traditional CKD ERI described above.
Una volta identificata la presenza di tale valore, viene ricercato, estratto e acquisito il set completo delle informazioni relative all'esame delle urine, glicernia, albuminuria, proteinuria, colesterolo, trigliceridi, C3, C4, uACR, uPCR, Hb Glicata oltre che le informazioni associate al profilo di esami quali Data dell'analisi, Ente che effettua la Richiesta (Reparto Ospedaliero, Professionista Sanitario e similari) e Tipologia della prestazione erogata (Regime di ricovero o ambulatoriale). Once the presence of this value has been identified, the complete set of information relating to urinalysis, glycernia, albuminuria, proteinuria, cholesterol, triglycerides, C3, C4, uACR, uPCR, Hb Glycate is searched, extracted and acquired as well as information associated with the examination profile such as Date of the analysis, Body making the Request (Hospital Department, Healthcare Professional and similar) and Type of service provided (Inpatient or outpatient regime).
Lo stesso processo viene ripetuto sui dati acguisiti da tutte le banche dati di origine per ricostruire 1'intera storia clinica del paziente individuato, andando a ricercare, negli esami meno recenti, profili che contengano parte o tutti i risultati degli esami relativi a creatinina serica, esame delle urine, glicernia, albuminuria, proteinuria, colesterolo, trigliceridi, C3, C4, uACR, uPCR, Hb Glicata corredate delle informazioni relative a Data dell'analisi, Ente richiedente e Tipologia di prestazione. The same process is repeated on the data acquired from all the source databases to reconstruct the entire clinical history of the patient identified, searching, in the oldest exams, for profiles that contain part or all of the results of the serum creatinine tests, urinalysis, glycernia, albuminuria, proteinuria, cholesterol, triglycerides, C3, C4, uACR, uPCR, Hb Glycate accompanied by information relating to the date of the analysis, the requesting institution and the type of service.
I processi concatenati sopra descritti sono ripetuti su tutte le banche dati collegate al sistema per ogni singolo paziente identificato come univoco. The concatenated processes described above are repeated on all the databases connected to the system for each individual patient identified as unique.
Come anticipato in precedenza in via più generale, la fase di acguisizione 11 prevede 1'estrazione, la trasformazione ed il caricamento dei dati (in inglese Extract Transform Load o ETL e nel seguito per brevità indicate con tale acronimo) secondo procedure specifiche, ad esempio attraverso la suddetta piattaforma di Pentaho, nello specifico tramite la sua componente di Data Integration, nota con il nome Kettle. As previously anticipated in a more general way, the acquisition phase 11 provides for the extraction, transformation and loading of data (in English Extract Transform Load or ETL and hereinafter for brevity indicated with this acronym) according to specific procedures, for example through the aforementioned Pentaho platform, specifically through its Data Integration component, known as Kettle.
II processo di ETL vantaggiosamente prevede due passi: The ETL process advantageously involves two steps:
- creazione di ogni singolo passo operativo (un esempio di passo potrebbe essere ad esempio 1'accesso alla sorgente banca dati d'origine oppure 1'operazione di scarto dei valori non significativi o errati e comunque non misurabili degli esami selezionati quali "- " o "Non determinabile") ; - creation of each single operational step (an example of a step could be, for example, access to the source database or the operation of discarding the insignificant or incorrect and in any case not measurable values of the selected exams such as "-" or "Not determinable");
- collegamento dei singoli passi operativi tra di loro, in modo da implementare tutto o in parte il processo di ETL che va dall'estrazione dei dati al caricamento sulla base di dati 200 a seguito delle fasi di vaiidazione e normalizzazione; i passi all'interno del processo possono essere avviati sequenzialmente o in parallelo, a seconda dell'esistenza o meno di interdipendenze logiche tra di loro. - linking of the single operational steps to each other, in order to implement all or part of the ETL process which goes from data extraction to loading on the database 200 following the steps of grading and normalization; the steps within the process can be initiated sequentially or in parallel, depending on whether or not there are logical interdependencies between them.
Allo scopo di semplificare il coordinamento delle operazioni già descritte, il processo completo è stato scomposto in fase di design in un insieme di sottoprocessi logicamente affini dal punto di vista funzionale. In order to simplify the coordination of the operations already described, the complete process was broken down during the design phase into a set of logically similar sub-processes from the functional point of view.
A titolo di esempio un sottoprocesso può includere 1'insieme delle operazioni di accesso e estrazione dei dati dalle banche dati di origine congiuntamente ad una prima fase di scarto degli esami nulli o non validi oppure il sottoprocesso relativo a tutte le vaiidazioni e al successivo caricamento dei dati medici A oppure il sottoprocesso che prevede 1'insieme dei filtri secondo una o più regole quali ad esempio 1'età del paziente. Ad ulteriore titolo di esempio, qualora i dati provengano da banche dati di origine distinte, cioè da più di una sola banca dati di origine, potrebbero essere definiti appositi sottoprocessi di estrazione dati per ogni sorgente banca dati di origine durante il guai e i dati vengono uniformati , ad esempio riparametrati e trasformati per omogeneizzarne 1'unità di misura, in modo da rendere confrontabili risultati di uno stesso paziente ottenuti presso laboratori di analisi diversi, dato che spesso sono elaborati con metodiche differenti ed espressi con unità di misura differenti . By way of example, a sub-process can include the set of operations for accessing and extracting data from the source databases together with a first phase of rejecting the null or invalid examinations or the sub-process relating to all the validations and the subsequent loading of the medical data A or the sub-process which provides for the set of filters according to one or more rules such as for example the age of the patient. As a further example, if the data comes from distinct source databases, i.e. from more than one source database, specific data extraction sub-processes could be defined for each source database source during the trouble and the data are standardized , for example reparameterized and transformed to homogenize the unit of measurement, so as to make comparable results of the same patient obtained in different analysis laboratories, since they are often processed with different methods and expressed with different units of measurement.
Tale scomposizione in sottoprocessi agevola la prima fase di accesso, estrazione e normalizzazione dei dati da sorgenti eterogenee , rendendone modulare e flessibile la gestione (ad esempio date xl, x2, xn, xn+1 ,... banche dati di origine, se ad un dato momento si deciderà di escludere il caricamento di dati provenienti dalla sorgente xn, basterà eliminare dal processo il sottoprocesso che gestisce 1'estrazione da xn) . This breakdown into sub-processes facilitates the first phase of access, extraction and normalization of data from heterogeneous sources, making management modular and flexible (for example dates xl, x2, xn, xn + 1, ... source databases, if for at a given moment it will be decided to exclude the loading of data coming from the source xn, it will be enough to eliminate from the process the sub-process that manages the extraction from xn).
Il flusso di ETL è stato implementato in modo tale da ottenere le seguenti funzionalità : The ETL flow has been implemented in such a way as to obtain the following functionalities:
- eseguire un caricamento iniziale volto ad alimentare la base di dati 200 con i dati provenienti dalle banche dati di origine alla data corrente ; - performing an initial loading aimed at feeding the database 200 with the data coming from the source databases at the current date;
- poter essere lanciato manualmente in gualungue momento successivo per aggiornare la base di dati 200,ad esempio attraverso strumenti nativi di Pentaho o comandi custom; - being able to be launched manually at the next moment to update the database 200, for example through native Pentaho tools or custom commands;
- poter essere inserito in una pianificazione che ne preveda 1'attivazione automatica a precisi intervalli temporali , per esempio sia attraverso strumenti nativi di Pentaho che attraverso una implementazione dedicata di componenti di pianificazione; - be able to be included in a schedule that provides for its automatic activation at specific time intervals, for example both through native Pentaho tools and through a dedicated implementation of planning components;
- poter prevedere 1'esecuzione ripetuta del processo di elaborazione su uno stesso set di dati B senza creare inconsistenze. Ad esempio, a fronte di un errore della fase di ETL che ne blocchi il processo in una fase intermedia, sia prevista la possibilità di rilanciare il processo sullo stesso set di dati B una volta corretto il problema rilevato, senza però compromettere la consistenza della base dati riprocessando elementi già correttamente elaborati); - being able to foresee the repeated execution of the processing process on the same data set B without creating inconsistencies. For example, in the event of an error in the ETL phase that blocks the process in an intermediate phase, it is possible to relaunch the process on the same data set B once the detected problem has been corrected, without however compromising the consistency of the base. data by reprocessing elements already correctly processed);
- comprendere un registro delle attività svolte che ne evidenzi, ad esempio, gli errori rilevati e la natura di questi ultimi durante il processo; tale registro deve essere mantenuto nel tempo attraverso un apposito supporto di memorizzazione, ad esempio una tabella sulla base dati o un file testuale, e reso consultabile. - include a register of the activities carried out which highlights, for example, the errors found and the nature of the latter during the process; this register must be kept over time through a special storage medium, for example a table on the database or a text file, and made available for consultation.
In accordo con il metodo secondo la presente invenzione, quindi, una volta terminato il processo di ETL, vantaggiosamente si prevede di memorizzare la data di ultima esecuzione relativa ad ogni singoio sottoprocesso eseguito in modo da poter adottare il caricamento dei dati in modalità incrementale, come meglio descritto in seguito. In accordance with the method according to the present invention, therefore, once the ETL process is finished, it is advantageously provided to store the date of the last execution relating to each single sub-process executed so as to be able to load the data in incremental mode, as better described below.
Le informazioni relative alla data di ultima esecuzione vengono preferibilmente memorizzate su una apposita tabella oppure su un qualunque altro supporto fisico che possa mantenerle invariate nel tempo, ad esempio su file di testo o xml , così che alla successiva elaborazione sia possibile prendere in considerazione tale dato come riferimento per 1'avvio in modalità incrementale. The information relating to the date of the last execution is preferably stored on a special table or on any other physical support that can keep it unchanged over time, for example on a text or xml file, so that at subsequent processing it is possible to take this data into consideration. as a reference for starting in incremental mode.
In particolare, la procedura di acquisizione di tipo incrementale ricerca solo dati non già archiviati anche per pazienti per i quali sono già presenti dati medici A nella base di dati 200 in modo tale da garantire la possibilità di ottenere una costruzione della storia clinica più aggiornata dei pazienti, sia per coloro i quali non erano già presenti dati medici A nella base di dati 200, sia per i pazienti per i quali erano già presenti dati. In particular, the incremental acquisition procedure searches only data not already archived even for patients for whom medical data A is already present in the database 200 in order to guarantee the possibility of obtaining a construction of the most updated clinical history of patients, both for those who did not already have medical data A in the database 200, and for patients for whom data were already present.
Per fare ciò, secondo il presente metodo, sono elaborati i dati relativi ai pazienti e gli esami caricati o aggiornati solo in riferimento alla data dell'ultima elaborazione effettuata. To do this, according to this method, the data relating to patients and the exams loaded or updated are processed only with reference to the date of the last processing carried out.
Vantaggiosamente, il presente metodo, comprende una fase di archiviazione dei dati medici A elaborati in detta fase di elaborazione 12, detta fase di archiviazione prevedendo il salvataggio dei dati medici A e delle corrispondenti informazioni amministrative una volta che sono stati normalizzati e certificati secondo le modalità in precedenza descritte. Advantageously, the present method comprises a step for archiving the medical data A processed in said processing step 12, said archiving step providing for the saving of the medical data A and the corresponding administrative information once they have been normalized and certified according to the procedures previously described.
Nel contesto applicativo della Malattia Renale Cronica preferibilmente vengono elaborati i dati secondo un approccio multidimensionale. In the application context of Chronic Kidney Disease, the data are preferably processed according to a multidimensional approach.
Per approccio multidimensionale si intende che i dati medici A acquisiti rappresentano "fatti" ossia il cuore del contenuto informativo del sistema. By multidimensional approach we mean that the medical data A acquired represent "facts" that is the heart of the information content of the system.
Tale contenuto informativo può essere analizzato aggregando i dati medici A sulla base di uno o più parametri di interesse, guali ad esempio il sesso oppure la fascia di età. This information content can be analyzed by aggregating the medical data A on the basis of one or more parameters of interest, such as sex or age group.
Tali parametri sono definiti "dimensioni" e la possibilità di sezionare i fatti sulla base di più dimensioni contemporaneamente ne caratterizzano 1'aspetto multidimensionale, adesempio tutti i pazienti con GFR x di sesso maschile compresi in una fascia di età 35-50 anni. These parameters are defined as "dimensions" and the possibility of dissecting facts on the basis of several dimensions at the same time characterize the multidimensional aspect, for example all male patients with GFR x included in an age group of 35-50 years.
La base di dati 200, secondo la presente invenzione può essere strutturata secondo tre diversi approcci: The database 200, according to the present invention can be structured according to three different approaches:
MOLAP acronimo della dicitura inglese Multidimensional On-Line Analytical Processing: tale approccio prevedendo la memorizzazione dei dati su strutture multidimensionali , dette cubi OLAP; tale strumento implementa in anticipo le aggregazione dei dati secondo le dimensioni, mantenendole in memoria, consentendo prestazioni elevatissime anche su una numerosità di dati di diversi milioni; di contro però tale sistema consuma molte risorse e risulta essere meno flessibile. MOLAP acronym for Multidimensional On-Line Analytical Processing: this approach involves storing data on multidimensional structures, called OLAP cubes; this tool implements the aggregation of data according to the dimensions in advance, keeping them in memory, allowing very high performances even on a number of data of several millions; on the other hand, however, this system consumes a lot of resources and is less flexible.
- ROLAP acronimo della dicitura inglese Relational On-Line Analytical Processing: tale approccio utilizzando un una base di dati 200 relazionale per la rappresentazione dei dati multidimensionali; tale strumento è sicuramente più semplice da implementare ma al crescere delle dimensioni del contenuto informativo, calcolando le aggregazioni dei dati in tempo reale, presenta difetti nel mantenimento di elevate prestazionidi accesso; - ROLAP acronym of the English word Relational On-Line Analytical Processing: this approach using a relational database 200 for the representation of multidimensional data; this tool is certainly easier to implement but as the size of the information content grows, calculating the aggregations of data in real time, it presents defects in maintaining high access performance;
- HOLAP acronimo della dicitura inglese Hybrid On-Line Analytical Processing : tale approccio essendo misto fra i due sopracitati , in cui i dati di dettaglio sono raccolti nel relazionale mentre quelli aggregati vengono mantenuti sul server HOLAP. - HOLAP acronym of the English term Hybrid On-Line Analytical Processing: this approach being mixed between the two aforementioned, in which the detailed data are collected in the relational while the aggregated ones are kept on the HOLAP server.
L'approccio adottato in una forma di attuazione preferita del metodo secondo la presente invenzione , è 1'approccio di tipo HOLAP, quale è ad esempio quello offerto dalla piattaforma Pentaho tramite la sua componente Mondrian . The approach adopted in a preferred embodiment of the method according to the present invention is the HOLAP type approach, such as for example that offered by the Pentaho platform through its Mondrian component.
Tale scelta è stata preferita in quanto la gestione ibrida della base dati prevede 1'implementazione di quest' ultima attraverso una semplice, ben nota e ben consolidata struttura di banca dati di tipo relazionale ; allo stesso tempo però il caricamento in aree di memoria ad accesso più veloce di parte o tutta la base di dati 200 all'avvio del sistema permette sia 1'aggregazione che 1'accesso al dettaglio singolo del contenuto informativo performance con prestazioni più elevate . This choice was preferred since the hybrid management of the database provides for the implementation of the latter through a simple, well-known and well-established relational database structure; at the same time, however, loading part or all of the database 200 into memory areas with faster access at system start-up allows both aggregation and access to the single detail of the performance information content with higher performance.
La citata banca dati è costruita secondo la modalità cosiddetta a Stella, nel seguente modo: The aforementioned database is built according to the so-called Star mode, as follows:
- tabelle dette dei "fatti" contenenti una serie di valori misurabili , ad esempio un valore numerico compreso nei dati medici A o 1'eGFR calcolato, collegati ai singoli eventi , quali ad esempio gli episodi clinici oppure i risultati di laboratorio; - tables known as "facts" containing a series of measurable values, for example a numerical value included in the medical data A or the calculated eGFR, linked to individual events, such as for example clinical episodes or laboratory results;
- tabelle contenenti le "dimensioni" che rappresentano i parametri a cui sono correlati i singoli fatti, ad esempio per dimensione temporale, per età, per sesso, etc. - tables containing the "dimensions" that represent the parameters to which the single facts are related, for example by temporal dimension, by age, by sex, etc.
Tali tabelle sono configurate in modo tale che i collegamenti logici tra le tabelle stesse siano minimizzati attraverso la ripetizione dei dati in esse contenute e 1'aggregazione delle informazioni in appositi campi calcolati. These tables are configured in such a way that the logical connections between the tables themselves are minimized through the repetition of the data contained therein and the aggregation of information in specific calculated fields.
In guesta architettura a Stella le tabelle dei fatti rappresentano il centro stella mentre i punti stella sono rappresentati dalle tabelle delle dimensioni. In this star architecture the fact tables represent the star center while the star points are represented by the dimension tables.
Come sopra anticipato, la fase di acguisizione 11 vantaggiosamente comprende una fase di caricamento dei dati in tabelle di una banca dati di immagazzinamento, in modo incrementale. As anticipated above, the acquisition step 11 advantageously comprises a step of loading the data into tables of a storage database, incrementally.
In altre parole, la fase di acguisizione 11 integra i dati medici A contenuti in una banca dati di immagazzinamento con i dati medici A che nel tempo vengono ulteriormente acguisiti, in modo continuativo o programmato, dalle banche dati di origine. In other words, the acquisition step 11 integrates the medical data A contained in a storage database with the medical data A which over time are further acquired, in a continuous or programmed manner, from the original databases.
In una forma preferita ma non esclusiva della presente invenzione, la fase di elaborazione 12 comprende una valutazione della funzione renale mediante il calcolo della velocità di filtrazione glomerulare effettuato secondo una metodologia a scelta tra: Creatinina Clearance, formula di Cockroft-Gault , formula MDRD semplificata e formula Chronic Kidney Disease Epidemiology Collaboration. In a preferred but not exclusive form of the present invention, the processing step 12 comprises an evaluation of the renal function by calculating the glomerular filtration rate carried out according to a methodology chosen from: Creatinine Clearance, Cockroft-Gault formula, simplified MDRD formula and formula Chronic Kidney Disease Epidemiology Collaboration.
Come già esposto, la metodologia preferita è la formula Chronic Kidney Disease Epidemiology Collaboration del 2012. As already stated, the preferred methodology is the 2012 Chronic Kidney Disease Epidemiology Collaboration formula.
In seconda istanza, in una forma preferita ma non esclusiva della presente invenzione, la fase di elaborazione 12 comprende una valutazione della funzione renale residua associata alla valutazione dell'albuminuria secondo le indicazioni derivate dall'uso della tabella di stadiazione Prognosis of CKD by GFR and Albuminuria Categories: KDIGO 2012 Secondly, in a preferred but not exclusive form of the present invention, the processing step 12 comprises an assessment of the residual renal function associated with the assessment of albuminuria according to the indications derived from the use of the staging table Prognosis of CKD by GFR and Albuminuria Categories: KDIGO 2012
Il trovato così concepito è suscettibile di numerose modifiche e varianti, tutte rientranti nell'ambito di tutela delle rivendicazioni allegate. The invention thus conceived is susceptible of numerous modifications and variations, all of which are within the scope of the protection of the attached claims.
Inoltre, tutti i dettagli potranno essere sostituiti da altri elementi tecnicamente equivalenti. Furthermore, all the details can be replaced by other technically equivalent elements.
Ove le caratteristiche e le tecniche menzionate nelle seguenti rivendicazioni siano seguite da segni o numeri di riferimento, tali segni o numeri di riferimento sono stati apposti con il solo scopo di aumentare 1'intelligibilità delle rivendicazioni stesse e, di conseguenza, essi non costituiscono in alcun modo limitazione all'interpretazione di ciascun elemento identificato, a titolo puramente di esempio, da tali segni o numeri di riferimento. Where the characteristics and techniques mentioned in the following claims are followed by reference marks or numbers, these reference marks or numbers have been affixed with the sole purpose of increasing the intelligibility of the claims themselves and, consequently, they do not constitute in any way way limitation to the interpretation of each element identified, purely by way of example, by such signs or reference numbers.
Claims (9)
Priority Applications (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| ITUB2015A002648A ITUB20152648A1 (en) | 2015-07-30 | 2015-07-30 | METHOD OF ANALYSIS OF LABORATORY RESULTS FOR THE COLLECTIVE DETECTION AND REPORTING OF ASYNTHOMATIC HEALTH PROBLEMS |
Applications Claiming Priority (1)
| Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
|---|---|---|---|
| ITUB2015A002648A ITUB20152648A1 (en) | 2015-07-30 | 2015-07-30 | METHOD OF ANALYSIS OF LABORATORY RESULTS FOR THE COLLECTIVE DETECTION AND REPORTING OF ASYNTHOMATIC HEALTH PROBLEMS |
Publications (1)
| Publication Number | Publication Date |
|---|---|
| ITUB20152648A1 true ITUB20152648A1 (en) | 2017-01-30 |
Family
ID=54364551
Family Applications (1)
| Application Number | Title | Priority Date | Filing Date |
|---|---|---|---|
| ITUB2015A002648A ITUB20152648A1 (en) | 2015-07-30 | 2015-07-30 | METHOD OF ANALYSIS OF LABORATORY RESULTS FOR THE COLLECTIVE DETECTION AND REPORTING OF ASYNTHOMATIC HEALTH PROBLEMS |
Country Status (1)
| Country | Link |
|---|---|
| IT (1) | ITUB20152648A1 (en) |
Citations (3)
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-
2015
- 2015-07-30 IT ITUB2015A002648A patent/ITUB20152648A1/en unknown
Patent Citations (3)
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