ITFI20120122A1 - MONOCLONAL ANTIBODIES THAT CAN TIE THE E2 VIRAL PROTEIN PREPARATION AND USE. - Google Patents

MONOCLONAL ANTIBODIES THAT CAN TIE THE E2 VIRAL PROTEIN PREPARATION AND USE. Download PDF

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ITFI20120122A1
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IT000122A
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Ester Ascione
Claudio Farina
Antonio Leonardi
Ruvo Menotti
Livio Muscariello
Anna Maria Sandomenico
Luca Sanguigno
Luigi Vitagliano
Original Assignee
Kedrion S P A 50
Univ Napoli Federico Ii
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Description

Anticorpi monoclonali capaci di legare la proteina virale E2 loro preparazione ed uso. Monoclonal antibodies capable of binding the viral protein E2 their preparation and use.

CAMPO DELL’INVENZIONE FIELD OF THE INVENTION

La presente invenzione si riferisce al campo degli anticorpi monoclonali The present invention relates to the field of monoclonal antibodies

Stato del’arte State of the art

Le infezioni da epatite C rappresentano una delle maggiori emergenze sanitarie del XXI secolo. Infatti, si stima che circa 170 milioni di individui nel mondo siano infettati da HCV; inoltre, pazienti cronici hanno un’elevata probabilità di sviluppare cirrosi e cancro epatocellulare; le infezioni da HCV sono anche la prima causa di trapianto di fegato negli USA. Hepatitis C infections represent one of the major health emergencies of the 21st century. In fact, it is estimated that around 170 million individuals worldwide are infected with HCV; in addition, chronic patients have a high probability of developing cirrhosis and hepatocellular cancer; HCV infections are also the leading cause of liver transplantation in the US.

L’HCV è costituito da molteplici genotipi, inoltre una certa eterogeneità è presente anche tra i diversi sottogruppi di genotipi. Ciò comporta una elevata resistenza ai farmaci ed una ovvia corsa all’uso di terapie combinate. HCV is made up of multiple genotypes, and a certain heterogeneity is also present between the different subgroups of genotypes. This leads to high drug resistance and an obvious rush to use combined therapies.

Le attuali cure contro le infezioni da HCV sono a base di lnterferone-α, sia da solo che in combinazione con anti-virali generici come la ribavirina, ma questi trattamenti sono efficaci solo nel 20% e 40% di pazienti, rispettivamente. Current treatments for HCV infections are based on interferon-α, either alone or in combination with generic anti-virals such as ribavirin, but these treatments are only effective in 20% and 40% of patients, respectively.

L’HCV è un virus ad envelope con un genoma a strand positivo di RNA di 9.5 kbasi. Una regione non codificante altamente conservata di 341 coppie di basi è localizzata all’estremità 5’ del genoma virale mentre a valle di tale regione è presente un Open Reading Frame (ORF) che codifica per un polipeptide di circa 3010 amino acidi. Durante la maturazione del virus, tale polipeptide viene processato da un pool di proteasi virali ed endogene generando 10 proteine mature. Tra queste ci sono le due 2 glicoproteine dell’envelope ancorate alla membrana del virus, denominate E1 (oppure gp35) e E2 (oppure gp72), contenenti 5 o 6 ed 11 siti di N-glicosilazione, rispettivamente. HCV is an enveloped virus with a positive strand RNA genome of 9.5 kbases. A highly conserved non-coding region of 341 base pairs is located at the 5 'end of the viral genome while downstream of this region there is an Open Reading Frame (ORF) which encodes a polypeptide of about 3010 amino acids. During the maturation of the virus, this polypeptide is processed by a pool of viral and endogenous proteases generating 10 mature proteins. Among these are the two 2 envelope glycoproteins anchored to the virus membrane, called E1 (or gp35) and E2 (or gp72), containing 5 or 6 and 11 N-glycosylation sites, respectively.

Le proteine dell’envelope E1 and E2 sono responsabili del legame e dell’entrata del virus nelle cellule ospiti, esse rappresentano pertanto targets di elezione di farmaci che bloccano il virus sin dalle prime fasi dell'infezione. Tuttavia, a causa dell’elevata velocità di replicazione in vivo e la natura fortemente error-prone delle RNA polimerasi, l’HCV esibisce una elevatissima variabilità a livello genetico che è particolarmente evidente proprio nelle regioni codificanti le proteine dell’envelope; in particolare, sono state riscontrate due regioni ipervariabili all’N-terminale della proteina E2, note come HVR1 ed HVR2, che sono tra le maggiormente coinvolte nel legame con i recettori sulle cellule ospiti. The proteins of the envelope E1 and E2 are responsible for the binding and entry of the virus into the host cells, they therefore represent targets of choice of drugs that block the virus from the early stages of infection. However, due to the high replication rate in vivo and the highly error-prone nature of the RNA polymerase, HCV exhibits a very high genetic variability that is particularly evident in the regions encoding the envelope proteins; in particular, two hypervariable regions were found at the N-terminus of the E2 protein, known as HVR1 and HVR2, which are among the most involved in binding with receptors on host cells.

E’ stato riportato che una regione immediatamente a valle di HVR1 contiene degli epitopi i cui anticorpi inibiscono molto efficacemente il legame del virus al recettore CD81 [18], In particolare, un epitopo lineare corrispondente ai residui 412-423 e definito dall’anticorpo monoclonale AP33, inibisce l'interazione tra CD81 ed una varietà di genotipi di E2, di dimeri E1-E2 e particelle virus-like. It has been reported that a region immediately downstream of HVR1 contains epitopes whose antibodies very effectively inhibit the binding of the virus to the CD81 receptor [18]. In particular, a linear epitope corresponding to residues 412-423 and defined by the monoclonal antibody AP33 inhibits the interaction between CD81 and a variety of E2 genotypes, E1-E2 dimers and virus-like particles.

I brevetti WO 2006/100449 ed il più recente 20110002926, pubblicato il 6 gennaio 2011, riportano che l’anticorpo monoclonale AP33 e la variante umanizzata, si legano e possono neutralizzare i sei genotipi dell’HCV, quindi l’epitopo 412-423 lineare è chiaramente un target per ligandi anti-HCV ed un immunogeno per la generazione di anticorpi policlonali e monoclonali anti-HCV [Owsianka A, Tarr AW, Juttla VS, Lavillette D, Bartosch B, Cosset FL, Ball JK, Patel AH. Monoclonal Antibody AP33 Defines a Broadly Neutralizing Epitope on thè Hepatitis C Virus E2 Envelope Glycoprotein. 2005, J. Virai. , 79(17): 11095-11104], Patents WO 2006/100449 and the most recent 20110002926, published on January 6, 2011, report that the monoclonal antibody AP33 and the humanized variant, bind and can neutralize the six genotypes of HCV, therefore the linear epitope 412-423 it is clearly a target for anti-HCV ligands and an immunogen for the generation of anti-HCV polyclonal and monoclonal antibodies [Owsianka A, Tarr AW, Juttla VS, Lavillette D, Bartosch B, Cosset FL, Ball JK, Patel AH. Monoclonal Antibody AP33 Defines a Broadly Neutralizing Epitope on the Hepatitis C Virus E2 Envelope Glycoprotein. 2005, J. Virai. , 79 (17): 11095-11104],

Questi brevetti descrivono tuttavia dei monoclonali che riconoscono un epitopo lineare della proteina E2, mentre è stato ipotizzato e riportato che la regione 412-423 o una regione leggermente più breve, potrebbe trovarsi, nella struttura della proteina, in una regione di loop [Yagnik AT, Lahm A, Meola A, Roccasecca RM, Ercole BB, Nicosia A, Tramontano A. A model for thè hepatitis C virus envelope glycoprotein E2. 2000, Proteins, 15;40(3):355-6], However, these patents describe monoclonals that recognize a linear epitope of the E2 protein, while it has been hypothesized and reported that the 412-423 region or a slightly shorter region, could be found, in the protein structure, in a loop region [Yagnik AT , Lahm A, Meola A, Roccasecca RM, Ercole BB, Nicosia A, Tramontano A. A model for the hepatitis C virus envelope glycoprotein E2. 2000, Proteins, 15; 40 (3): 355-6],

E’ evidente quindi, da quanto detto sopra, quanto sarebbe interessante sviluppare anticorpi contro varianti cicliche di questo epitopo per l'ottimizzazione delle proprietà di legame, di neutralizzazione e di specificità degli anticorpi, pur nella sua capacità di cross-reagire con diversi genotipi. It is therefore evident, from the above, how interesting it would be to develop antibodies against cyclic variants of this epitope for the optimization of the binding, neutralization and specificity properties of the antibodies, despite its ability to cross-react with different genotypes.

Sommario dell’invenzione Summary of the invention

L’invenzione si riferisce ad anticorpi monoclonali di origine murina o umana capaci di legare e neutralizzare in varia misura l’entrata nelle cellule del virus dell’HCV e agli antigeni utilizzati per generare gli anticorpi come suddetti. The invention refers to monoclonal antibodies of murine or human origin capable of binding and neutralizing the entry into the cells of the HCV virus to varying degrees and the antigens used to generate the antibodies as above.

Breve descrizione delle Figure Brief description of the Figures

La Figura 1 (A-C) mostra i saggi ELISA di legame tra i peptidi sintetici corrispondenti all’Epitopo ciclico (Peptide I) ed il corrispondente Epitopo lineare (Peptide II lineare) ai Mabs I - VII, rispettivamente. Figure 1 (A-C) shows the ELISA binding assays between the synthetic peptides corresponding to the cyclic epitope (Peptide I) and the corresponding linear epitope (linear Peptide II) to the Mabs I - VII, respectively.

La Figura 2 (A - G) mostra i Sensorgrammi relativi al legame del Peptide I ai Mabs I — VII. Figure 2 (A - G) shows the Sensorgrams related to the binding of Peptide I to Mabs I - VII.

La Figura 3 mostra i Sensorgrammi Biacore relativi al legame del Peptide II lineare agli anticorpi monoclonali I - VII, immobilizzati su biochip. Figure 3 shows the Biacore Sensorgrams related to the binding of linear Peptide II to monoclonal antibodies I - VII, immobilized on biochips.

La Figura 4 (A-G) mostra i sensorgrammi Biacore relativi al legame dei Peptidi ciclici: III Muti, IV Mut2, V Mut3, III Muti, IV Mut2, V Mut3 e VI Mut4 rispettivamente con: il monoclonale II (Mab II),, il monoclonale III (Mab III) ed il monoclonale VI (Mab VI). Figure 4 (A-G) shows the Biacore sensorgrams relating to the binding of the cyclic peptides: III Muti, IV Mut2, V Mut3, III Muti, IV Mut2, V Mut3 and VI Mut4 respectively with: the monoclonal II (Mab II), the monoclonal III (Mab III) and monoclonal VI (Mab VI).

La Figura 5 (A e B) mostra i risultati dell’analisi mediante western blot del riconoscimento di E2 di genotipo 1a e 3 da parte della miscela di anticorpi monoclonali MAb Ι-MAbV II. Figure 5 (A and B) shows the results of the western blot analysis of the recognition of E2 of genotype 1a and 3 by the mixture of monoclonal antibodies MAb Ι-MAbV II.

La Figura 6 (A e B) mostra l’attività neutralizzante degli anticorpi monoclonali sviluppati e del controllo AP33. Figure 6 (A and B) shows the neutralizing activity of the developed monoclonal antibodies and the AP33 control.

La Figura 7 mostra l’attività neutralizzante degli anticorpi monoclonali sviluppati e del controllo AP33. Figure 7 shows the neutralizing activity of the developed monoclonal antibodies and the AP33 control.

La Figura 8 mostra l’attività neutralizzante dei MAb II, MAb VI e MAb VII saggiati in singolo, in combinazione binaria tra loro e tutti assieme. Figure 8 shows the neutralizing activity of MAb II, MAb VI and MAb VII tested in single, in binary combination with each other and all together.

DESCRIZIONE DETTAGLIATA DELL’INVENZIONE DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION

La presente invenzione consente di rispondere alle esigenze suddette rendendo disponibili anticorpi monoclonali contro epitopi derivati dalla proteina E2 del virus dell’epatite C (HCV) ed al loro impiego in applicazioni terapeutiche e diagnostiche. Gli anticorpi monoclonali secondo l’invenzione sono quindi in grado di legare la proteina virale E2 e neutralizzare infezioni da HCV in mammiferi. The present invention allows to meet the aforementioned needs by making available monoclonal antibodies against epitopes derived from the E2 protein of the hepatitis C virus (HCV) and their use in therapeutic and diagnostic applications. The monoclonal antibodies according to the invention are therefore able to bind the viral protein E2 and neutralize HCV infections in mammals.

Gli anticorpi secondo l’invenzione sono di origine murina o umana e sono caratterizzati dal fatto che almeno una delle catene (leggera o pesante) della complementary determining region (CDR) ha sequenza (1) (catena pesante) : AELVRPGGSVKLSCKASGYSFTTYWMNWVKQRPGQGLEWIGMIQPSDSETRLN QKFKDKATLTLDRSSSTVYMQLSSPTSDDSAVYYCARTGRGDAWLTYWGQG oppure sequenza (2) (catena leggera) : [SEQ. ID. No 1] The antibodies according to the invention are of murine or human origin and are characterized by the fact that at least one of the chains (light or heavy) of the complementary determining region (CDR) has sequence (1) (heavy chain): AELVRPGGSVKLSCKASGYSFTTYWMNWVKQRPGQGLEWIGMIQPSDSETRLN QKFKDKYSTLTGDSLTWDQGTLTDQGTLTDQLTWDQGTWDQGTWG ) (light chain): [SEQ. ID. No 1]

PASLAVSLGQRATISYRASKSVSTSGYSYMHWNQQKPGQPPRLLIYLVSNLESG VPARFSGSGSGTDFTLNIHPVEEEDAATYYCQHIRELTRS [SEQ. ID. No 2] e allo stesso tempo, l’altra catena presenta una percentuale di identità compresa fra il 50% ed il 100% con le rispettive sequenze 1 o 2. PASLAVSLGQRATISYRASKSVSTSGYSYMHWNQQKPGQPPRLLIYLVSNLESG VPARFSGSGSGTDFTLNIHPVEEEDAATYYCQHIRELTRS [SEQ. ID. No 2] and at the same time, the other chain has an identity percentage between 50% and 100% with the respective sequences 1 or 2.

La sequenza di aminoacidi è riportata secondo la notazione a singola lettera, nota agli esperti del settore, e si riferisce ad aminoacidi in configurazione L. The amino acid sequence is reported according to the single letter notation, known to those skilled in the art, and refers to amino acids in the L configuration.

In particolare l’anticorpo monoclonale che ha nella CDR la sequenza 1 come catena pesante e la sequenza 2 come catena leggera è definito qui di seguito Mab II. In particular, the monoclonal antibody that has sequence 1 as a heavy chain and sequence 2 as a light chain in the CDR is defined below as Mab II.

Altri esempi di anticorpi monoclonali umani o murini compresi nella presente invenzione in quanto caratterizzati dall’avere le seguenti catene leggere e pesanti come sopra definite, sono: Other examples of human or murine monoclonal antibodies included in the present invention as characterized by having the following light and heavy chains as defined above, are:

Mab V avente Mab V having

catena pesante: heavy chain:

AELVRPGGSVKLSCKASGYSFTTYWMNWVKQRPGQGLEWIGMIQPSDSETRLN QKFKDKATLTLDRSSSTVYMQLSSPTSDDSAVYYCARTGRGDAWLTYWGQG AELVRPGGSVKLSCKASGYSFTTYWMNWVKQRPGQGLEWIGMIQPSDSETRLN QKFKDKATLTLDRSSSTVYMQLSSPTSDDSAVYYCARTGRGDAWLTYWGQG

[SEQ. ID. No 3] [SEQ. ID. No 3]

catena leggera: light chain:

QKFMSTSVGDRVSITCKASQNVRTAVAWYQQKPGQSPKALIYLASNRHTGVPD RFTGSGSGTDFTLTISNVQSEDLAAYFCQQYLNYPRTRSEGGPSWN [SEQ. ID. No 4] QKFMSTSVGDRVSITCKASQNVRTAVAWYQQKPGQSPKALIYLASNRHTGVPD RFTGSGSGTDFTLTISNVQSEDLAAYFCQQYLNYPRTRSEGGPSWN [SEQ. ID. No 4]

Mab VI avente: Mab VI having:

catena pesante: heavy chain:

AELVKPGASVKLSCTASGFNIKDTYMHWIKQRPEQGLEWIGRIAYADGNIKIDPKF QGKATITTVTSSNTAYLQLSSLTSEDTAVYYCAYYGLLFAYWGQG [SEQ. ID. No 5] AELVKPGASVKLSCTASGFNIKDTYMHWIKQRPEQGLEWIGRIAYADGNIKIDPKF QGKATITTVTSSNTAYLQLSSLTSEDTAVYYCAYYGLLFAYWGQG [SEQ. ID. No 5]

catena leggera: light chain:

PASLAVSLGQRATISYRASKSVSTSGYSYMHWNQQKPGQPPRLLIYLVSNLESG VPARFSGSGSGTDFTLNIHPVEEEDAATYYCQHIRELTRS [SEQ. ID. No 6] Mab VI. Nelle successive Tabelle I e II sono riportate le percentuali di identità tra le catene leggere (tabella I) e pesanti (tabella II) degli anticorpi monoclonali Mab II, Mab V e Mab VI. PASLAVSLGQRATISYRASKSVSTSGYSYMHWNQQKPGQPPRLLIYLVSNLESG VPARFSGSGSGTDFTLNIHPVEEEDAATYYCQHIRELTRS [SEQ. ID. No. 6] Mab VI. The following Tables I and II show the percentages of identity between the light (table I) and heavy (table II) chains of the monoclonal antibodies Mab II, Mab V and Mab VI.

Sono riportate come confronto anche le percentuali di identità con l’anticorpo monoclonale AP33. The percentages of identity with the AP33 monoclonal antibody are also reported as a comparison.

TABELLA I TABLE I

Il V VI AP33 The V VI AP33

Il - 55.6 99.0 71.2 On - 55.6 99.0 71.2

V - - 52.6 53.8 V - - 52.6 53.8

VI - - - 71.2 VI - - - 71.2

AP33 - . . . AP33 -. . .

Tabella II Table II

Il V VI AP33 The V VI AP33

Il - 100 56.7 38.2 Il - 100 56.7 38.2

V - - 56.7 38.2 V - - 56.7 38.2

VI - 41.2 VI - 41.2

AP33 AP33

Tali anticorpi sono contraddistinti principalmente per la loro capacità di legare in maniera specifica la proteina E2 del virus dell'HCV. These antibodies are mainly characterized by their ability to specifically bind the E2 protein of the HCV virus.

Le proprietà degli anticorpi monoclonali denominati Mab II, V e VI e caratterizzati dall’avere nelle CDR le sequenze riportate in precedenza, sono descritte in dettaglio negli esempi 1-3. The properties of the monoclonal antibodies called Mab II, V and VI and characterized by having the previously reported sequences in the CDR, are described in detail in examples 1-3.

Le corrispondenti sequenze nucleotidiche delle sequenze aminoacidiche caratterizzanti gli anticorpi suddetti sono riportate di seguito: The corresponding nucleotide sequences of the amino acid sequences characterizing the above antibodies are shown below:

Sequenza nucleotidica 2p - catena pesante del Mab II [SEQ. ID. No. 64] GCTGAGCTGGTGAGGCCTGGAGGTTCAGTGAAGCTGTCCTGCAAGGCGTCT GGCTACTCCTTCACCACCTACTGGATGAACTGGGTGAAGCAGAGGCCTGGAC AAG G C CTT G AGT G G ATT G G C AT G ATT C AGC GTT C C G AT AGT G AAACT AG GTT AAATCAGAAGTTCAAGGACAAGGCCACATTGACTTTAGACAGATCCTCCAGCA CAGTCTACATGCAACTCAGTAGTCCGACATCTGATGACTCTGCGGTCTATTAC TGTGCAAGAACGGGCAGGGGGGACGCTTGGTTAACTTACTGGGGCCAAGG Nucleotide sequence 2p - heavy chain of Mab II [SEQ. ID. No. 64] GCTGAGCTGGTGAGGCCTGGAGGTTCAGTGAAGCTGTCCTGCAAGGCGTCT GGCTACTCCTTCACCACCTACTGGATGAACTGGGTGAAGCAGAGGCCTGGAC AAG G C CTT G AGT G G ATT G G C AT G ATT C AGC GTT C C G AT AGT G AAACT AG GTT AAATCAGAAGTTCAAGGACAAGGCCACATTGACTTTAGACAGATCCTCCAGCA CAGTCTACATGCAACTCAGTAGTCCGACATCTGATGACTCTGCGGTCTATTAC TGTGCAAGAACGGGCAGGGGGGACGCTTGGTTAACTTACTGGGGCCAAGG

Sequenza nucleotidica 2I - catena leggera del Mab II [SEQ. ID No. 65] CCTGCTTCCTTAGCTGTATCTCTGGGGCAGAGGGCCACCATCTCATACAGGG CCAGCAAAAGTGTCAGTACATCTGGCTATAGTTATATGCACTGGAACCAACAG AAACCAGGACAGCCACCCAGACTCCTCATCTATCTTGTATCCAACCTAGAATC TGGGGTCCCTGCCAGGTTCAGTGGCAGTGGGTCTGGGACAGACTTCACCCT CAACATCCATCCTGTGGAGGAGGAGGATGCTGCAACCTATTACTGTCAGCAC ATT AG G G AG CTT AC AC GTT C G GAG Nucleotide sequence 2I - Mab II light chain [SEQ. ID No. 65] CCTGCTTCCTTAGCTGTATCTCTGGGGCAGAGGGCCACCATCTCATACAGGG CCAGCAAAAGTGTCAGTACATCTGGCTATAGTTATATGCACTGGAACCAACAG AAACCAGGACAGCCACCCAGACTCCTCATCTATCTTGTATCCAACCTAGAATC TGGGGTCCCTGCCAGGTTCAGTGGCAGTGGGTCTGGGACAGACTTCACCCT CAACATCCATCCTGTGGAGGAGGAGGATGCTGCAACCTATTACTGTCAGCAC ATT AG G G AG CTT AC AC GTT C G GAG

Sequenza nucleotidica 5a - catena pesante del Mab V [SEQ. ID. No. 66] GCAGAACTTGTGAAGCCAGGGGCCTCAGTCAAGTTGTCCTGCACAGCTTCTG GCTTCAACATTAAAGACACCTATATGCACTGGATAAAGCAGAGGCCTGAACA GGGCCTGGAGTGGATTGGAAGGATTGCTTATGCGGATGGTAATATTAAAATT GACCCGAAGTTCCAGGGCAAGGCCACTATAACAACAGTCACATCTTCCAACA CAGCTTACCTGCAGCTCAGCAGCCTGACATCAGAGGACACTGCCGTCTATTA CTGTGCTTATTACGGCCTCTTATTTGCTTACTGGGGCCAAGGGACTCTGGTT Nucleotide sequence 5a - heavy chain of Mab V [SEQ. ID. No. 66] GCAGAACTTGTGAAGCCAGGGGCCTCAGTCAAGTTGTCCTGCACAGCTTCTG GCTTCAACATTAAAGACACCTATATGCACTGGATAAAGCAGAGGCCTGAACA GGGCCTGGAGTGGATTGGAAGGATTGCTTATGCGGATGGTAATATTAAAATT GACCCGAAGTTCCAGGGCAAGGCCACTATAACAACAGTCACATCTTCCAACA CAGCTTACCTGCAGCTCAGCAGCCTGACATCAGAGGACACTGCCGTCTATTA CTGTGCTTATTACGGCCTCTTATTTGCTTACTGGGGCCAAGGGACTCTGGTT

Sequenza nucleotidica 5b - catena leggera del Mab V [SEQ. ID. No. 67] CCTGCTTCCTTAGCTGTATCTCTGGGGCAGAGGGCCACCATCTCATACAGGG CCAGCAAAAGTGTCAGTACATCTGGCTATAGTTATATGCACTGGAACCAACAG AAACCAGGACAGCCACCCAGACTCCTCATCTATCTTGTATCCAACCTAGAATC TGGGGTCCCTGCCAGGTTCAGTGGCAGTGGGTCTGGGACAGACTTCACCCT CAACATCCATCCTGTGGAGGAGGAGGATGCTGCAACCTATTACTGTCAGCAC ATTAGGGAGCTTACNCGTTCGGANG Nucleotide sequence 5b - Mab V light chain [SEQ. ID. No. 67] CCTGCTTCCTTAGCTGTATCTCTGGGGCAGAGGGCCACCATCTCATACAGGG CCAGCAAAAGTGTCAGTACATCTGGCTATAGTTATATGCACTGGAACCAACAG AAACCAGGACAGCCACCCAGACTCCTCATCTATCTTGTATCCAACCTAGAATC TGGGGTCCCTGCCAGGTTCAGTGGCAGTGGGTCTGGGACAGACTTCACCCT CAACATCCATCCTGTGGAGGAGGAGGATGCTGCAACCTATTACTGTCAGCAC ATTAGGGAGCTTACNCGTTCGGANG

Sequenza nucleotidica 6a - catena pesante del Mab VI [SEQ. ID. No. 68] GCAGAACTTGTGAAGCCAGGGGCCTCAGTCAAGTTGTCCTGCACAGCTTCTG GCTTCAACATTAAAGACACCTATATGCACTGGATAAAGCAGAGGCCTGAACA GGGCCTGGAGTGGATTGGAAGGATTGCTTATGCGGATGGTAATATTAAAATT GACCCGAAGTTCCAGGGCAAGGCCACTATAACAACAGTCACATCTTCCAACA CAGCTTACCTGCAGCTCAGCAGCCTGACATCAGAGGACACTGCCGTCTATTA CTGTGCTTATTACGGCCTCTTATTTGCTTACTGGGGCCAAGGGACTCTGGTT Nucleotide sequence 6a - heavy chain of Mab VI [SEQ. ID. No. 68] GCAGAACTTGTGAAGCCAGGGGCCTCAGTCAAGTTGTCCTGCACAGCTTCTG GCTTCAACATTAAAGACACCTATATGCACTGGATAAAGCAGAGGCCTGAACA GGGCCTGGAGTGGATTGGAAGGATTGCTTATGCGGATGGTAATATTAAAATT GACCCGAAGTTCCAGGGCAAGGCCACTATAACAACAGTCACATCTTCCAACA CAGCTTACCTGCAGCTCAGCAGCCTGACATCAGAGGACACTGCCGTCTATTA CTGTGCTTATTACGGCCTCTTATTTGCTTACTGGGGCCAAGGGACTCTGGTT

Sequenza nucleotidica 6b - catena leggera del Mab VI [SEQ. ID. No. 69] CCTGCTTCCTTAGCTGTATCTCTGGGGCAGAGGGCCACCATCTCATACAGGG CCAGCAAAAGTGTCAGTACATCTGGCTATAGTTATATGCACTGGAACCAACAG AAACCAGGACAGCCACCCAGACTCCTCATCTATCTTGTATCCAACCTAGAATC TGGGGTCCCTGCCAGGTTCAGTGGCAGTGGGTCTGGGACAGACTTCACCCT CAACATCCATCCTGTGGAGGAGGAGGATGCTGCAACCTATTACTGTCAGCAC ATTAGGGAGCTTACNCGTTCGGANG Nucleotide sequence 6b - Mab VI light chain [SEQ. ID. No. 69] CCTGCTTCCTTAGCTGTATCTCTGGGGCAGAGGGCCACCATCTCATACAGGG CCAGCAAAAGTGTCAGTACATCTGGCTATAGTTATATGCACTGGAACCAACAG AAACCAGGACAGCCACCCAGACTCCTCATCTATCTTGTATCCAACCTAGAATC TGGGGTCCCTGCCAGGTTCAGTGGCAGTGGGTCTGGGACAGACTTCACCCT CAACATCCATCCTGTGGAGGAGGAGGATGCTGCAACCTATTACTGTCAGCAC ATTAGGGAGCTTACNCGTTCGGANG

Secondo una ulteriore realizzazione, l'invenzione comprende anche le sequenze suddette opportunamente modificate in modo da ottenere coniugati più stabili in mezzi biologici oppure meno immunogenici oppure più solubili o meno proni all’aggregazione. According to a further embodiment, the invention also includes the aforementioned sequences suitably modified in order to obtain more stable conjugates in biological media or less immunogenic or more soluble or less prone to aggregation.

Tali coniugati possono essere ottenuti attraverso reazioni chimiche o enzimatiche ben note utilizzando sostituenti opportuni e la cui azione sulla molecola è ben nota. Such conjugates can be obtained through well-known chemical or enzymatic reactions using suitable substituents and whose action on the molecule is well known.

Preferibilmente, i derivati o coniugati degli anticorpi oggetto della presente invenzione, sono dei derivati funzionali, intendendo con ciò dei derivati modificati chimicamente o enzimaticamente che, in saggi funzionali, ritengono la stessa funzione biologica - o una funzione biologica simile - dei prodotti non modificati, esibendo per contro una o più delle proprietà appena descritte. Preferably, the derivatives or conjugates of the antibodies object of the present invention are functional derivatives, meaning by this derivatives chemically or enzymatically modified which, in functional assays, retain the same biological function - or a similar biological function - of the unmodified products, on the other hand, exhibiting one or more of the properties just described.

Ad esempio derivati funzionali degli anticorpi descritti possono essere anticorpi di sequenza identica, ma recanti modifiche introdotte mediante reazioni chimiche o enzimatiche di: ammidazione, glicosilazione, carbamoilazione, acilazione (ad esempio acetilazione), solfatazione, fosforilazione, lipidizzazione, peghilazione, biotinilazione, fluoresceinazione. For example, functional derivatives of the described antibodies can be antibodies of identical sequence, but carrying modifications introduced by chemical or enzymatic reactions of: amidation, glycosylation, carbamoylation, acylation (for example acetylation), sulfation, phosphorylation, lipidization, pegylation, biotinylation, fluoresceination.

Altri derivati funzionali con proprietà biologiche simili o identiche a quelle degli anticorpi oggetto della presente invenzione, possono essere originati applicando il metodo di preparazione di “single chains”, abbreviati ScFv, in cui le catene polipeptidiche degli anticorpi originali sono assemblate in una catena unica in modo da ottenere due domini immunoglobulinici che riproducono i domini CH-4 e Other functional derivatives with biological properties similar or identical to those of the antibodies object of the present invention, can be originated by applying the method of preparation of "single chains", abbreviated ScFv, in which the polypeptide chains of the original antibodies are assembled in a single chain in in order to obtain two immunoglobulin domains that reproduce the CH-4 and

CL-4 fusi tra loro, oppure ScFv divalenti e trivalenti oppure ScFv tetravalenti. CL-4 fused together, or divalent and trivalent ScFv or tetravalent ScFv.

ScFv canonici, divalenti, trivalenti e tetravalenti possono essere preparati come prodotti di fusione con altre proteine utilizzando metodi noti. Qualunque proteina o polipeptide può essere impiegato come partner di fusione, ma partners di fusione preferiti non devono avere effetti biologici indesiderati in vivo. Canonical, divalent, trivalent and tetravalent ScFvs can be prepared as fusion products with other proteins using known methods. Any protein or polypeptide can be used as a fusion partner, but preferred fusion partners must not have undesirable biological effects in vivo.

Tali partners di fusione possono essere introdotti sia al C-terminale che all’N-terminale degli ScFv ed opzionalmente un breve segmento polipeptidico può essere introdotto tra le sequenze polipeptidiche degli ScFv e dei partners di fusione. Tali segmenti possono essere opzionalmente delle sequenze di riconoscimento per proteasi endogene; in modo tale, gli ScFv possono essere rimossi in vitro o in vivo dal loro partner di fusione. Esempi di tali segmenti includono, ma non sono limitati a: D-D-D-D-Y (SEQ. ID NO. 75), G-P-R, V-P-R, A-G-G e H-P-F-H-L (SEQ. ID NO. 76), che possono essere idrolizzati da enterochinasi, trombina, ubiquitin cleaving enzyme e renina, rispettivamente (vedi U.S. Patent No. 6,410,707). These fusion partners can be introduced both at the C-terminus and at the N-terminus of the ScFvs and optionally a short polypeptide segment can be introduced between the polypeptide sequences of the ScFvs and the fusion partners. These segments can optionally be recognition sequences for endogenous proteases; in this way, the ScFvs can be removed in vitro or in vivo from their fusion partner. Examples of such segments include, but are not limited to: D-D-D-D-Y (SEQ. ID NO. 75), G-P-R, V-P-R, A-G-G and H-P-F-H-L (SEQ. ID NO. 76), which can be hydrolyzed by enterokinase, thrombin, ubiquitin cleaving enzyme and renin, respectively (see U.S. Patent No. 6,410,707).

Un derivato funzionale modificato chimicamente o enzimaticamente può essere un derivato peghilato degli anticorpi monoclonali o dei relativi ScFv. I composti peghilati possono fornire dei vantaggi aggiuntivi, quali ad esempio, migliore solubilità, maggiore stabilità e maggior tempo di persistenza in circolo e ridotta immunogenicità (vedi U.S. Patent No. 4,179,337). A chemically or enzymatically modified functional derivative can be a pegylated derivative of the monoclonal antibodies or related ScFvs. The pegylated compounds can provide additional advantages, such as, for example, better solubility, greater stability and longer persistence in circulation and reduced immunogenicity (see U.S. Patent No. 4,179,337).

Altre modifiche utili includono, ma non sono limitate, a: copolimeri di etilenglicole/propilenglicole, carbossimetilcellulosa, destrano, polivinil alcool e consimili. Un polimero da impiegare per la derivatizzazione può avere un qualunque peso molecolare e può essere di forma lineare o ramificata. Polimeri di diverso peso molecolare possono essere impiegati in base al profilo terapeutico desiderato, ad esempio la durata in circolo o il tempo di rilascio, oppure una qualunque altra proprietà che ne modifichi le proprietà biologiche. La scelta del polimero e delle sue caratteristiche può dipendere anche dalla facilità di impiego, dal grado o mancanza di immunogenicità o altri effetti noti sulle proprietà terapeutiche dei monoclonali o degli ScFv. Ad esempio il PEG può avere un peso molecolare medio di circa 200, 500, 1000, 1500, 2000, 2500, 3000, 3500, 4000, 4500, 5000, 5500, 6000, 6500, 7000, 7500, 8000, 8500, 9000, 9500, 10,000, 10.500, 11,000, 11,500, 12,000, 12,500, 13,000, 13,500, 14,000, 14,500, 15,000, 15.500, 16,000, 16,500, 17,000, 17,500, 18,000, 18,500, 19,000, 19,500, 20,000, 25.000, 30,000, 35,000, 40,000, 50,000, 55,000, 60,000, 65,000, 70,000, 75,000, 80.000, 85,000, 90,000, 95,000, or 100,000 kDa. Other useful modifications include, but are not limited to: ethylene glycol / propylene glycol copolymers, carboxymethylcellulose, dextran, polyvinyl alcohol and the like. A polymer to be used for derivatization can have any molecular weight and can be linear or branched. Polymers of different molecular weight can be used on the basis of the desired therapeutic profile, for example the duration in circulation or the release time, or any other property that modifies their biological properties. The choice of the polymer and its characteristics may also depend on the ease of use, the degree or lack of immunogenicity or other known effects on the therapeutic properties of monoclonals or ScFvs. For example, the PEG can have an average molecular weight of about 200, 500, 1000, 1500, 2000, 2500, 3000, 3500, 4000, 4500, 5000, 5500, 6000, 6500, 7000, 7500, 8000, 8500, 9000, 9500, 10,000, 10,500, 11,000, 11,500, 12,000, 12,500, 13,000, 13,500, 14,000, 14,500, 15,000, 15,500, 16,000, 16,500, 17,000, 17,500, 18,000, 18,500, 19,000, 19,500, 20,000, 25,000, 30,000, 35,000, 40,000, 50,000, 55,000, 60,000, 65,000, 70,000, 75,000, 80,000, 85,000, 90,000, 95,000, or 100,000 kDa.

Preferibilmente, gli anticorpi monoclonali oggetto della presente invenzione, sono anticorpi monoclonali umani o umanizzati. Preferably, the monoclonal antibodies object of the present invention are human or humanized monoclonal antibodies.

Sono inoltre compresi dalla presente invenzione frammenti degli anticorpi come precedentemente descritti che ritengono le stesse proprietà di legame agli antigeni (frammenti funzionali di anticorpi). Also included by the present invention are fragments of the antibodies as described above which retain the same antigen binding properties (functional antibody fragments).

Esempi di tali frammenti funzionali sono i Fab ed i (Fab)2 o i polipeptidi corrispondenti alle complementarity determining region (CDR) isolate, non considerate nel contesto di un dominio lg-like, che ritengono la stessa capacità, o una capacità simile, di legare gli antigeni, vale a dire la proteina E2 intera oppure suoi frammenti oppure suoi omodimeri oppure eterodimeri delle proteine E1 ed E2. Sono inclusi in questo esempio i polipeptidi sintetici oppure gli stessi ottenuti con la tecnica del DNA ricombinante, di sequenza [SEQ. ID. No 1 - SEQ. ID. No 6]· Examples of such functional fragments are Fabs and (Fab) 2 or polypeptides corresponding to isolated complementarity determining regions (CDR), not considered in the context of an lg-like domain, which consider the same or a similar ability to bind the antigens, i.e. the whole E2 protein or its fragments or its homodimers or heterodimers of the E1 and E2 proteins. Included in this example are synthetic polypeptides or the same ones obtained with the recombinant DNA technique, of sequence [SEQ. ID. No 1 - SEQ. ID. No 6] ·

Tali sequenze, nel contesto degli anticorpi interi, degli ScFv, dei Fab, dei (Fab)2 o altri derivati funzionali ottenuti per via chimica o enzimatica, possono essere convenientemente modificate, utilizzando tecniche di biologia molecolare, sostituendo alcuni residui con residui omologhi dotati di proprietà chimico-fisiche simili. Ad esempio, residui di glutammina possono essere sostituiti da residui di asparagina e viceversa, residui di glutammico con residui di aspartico e viceversa, residui di lisina con residui di arginina o istidina e viceversa, residui di serina con residui di treonina e viceversa, residui aromatici con altri residui aromatici. Analogamente, alcuni residui possono essere rimossi (in numero massimo di 3) oppure inseriti in alcuni punti (in numero massimo di 3) in modo da non alterare la struttura dell’anticorpo in prossimità del CDR, ovvero in modo da alterarla per ottenere varianti a maggiore affinità. These sequences, in the context of whole antibodies, ScFvs, Fabs, (Fab) 2s or other functional derivatives obtained by chemical or enzymatic method, can be conveniently modified, using molecular biology techniques, by replacing some residues with homologous residues with similar physico-chemical properties. For example, glutamine residues can be replaced by asparagine residues and vice versa, glutamic residues with aspartic residues and vice versa, lysine residues with arginine or histidine residues and vice versa, serine residues with threonine residues and vice versa, aromatic residues with other aromatic residues. Similarly, some residues can be removed (in a maximum number of 3) or inserted in some points (in a maximum number of 3) so as not to alter the structure of the antibody in the vicinity of the CDR, or in order to alter it to obtain variants a greater affinity.

Sono parte integrante di questo primo aspetto dell’invenzione, anticorpi monoclonali o loro frammenti o derivati funzionali le cui sequenze della CDR, nel contesto degli anticorpi interi, degli ScFv, dei Fab, dei (Fab)2 o di altri derivati funzionali ottenuti per via chimica o enzimatica, sono identiche per almeno il 50% alle suddette sequenze [SEQ. ID. No 1 - SEQ. ID. No 6], An integral part of this first aspect of the invention are monoclonal antibodies or their fragments or functional derivatives whose CDR sequences, in the context of whole antibodies, ScFv, Fab, (Fab) 2 or other functional derivatives obtained by chemical or enzymatic, are identical for at least 50% to the aforementioned sequences [SEQ. ID. No 1 - SEQ. ID. No 6],

Sono anche parte integrante di questo primo aspetto dell’invenzione, tutte le composizioni contenenti gli anticorpi oggetto di questa invenzione o loro frammenti o derivati funzionali, da soli o in miscele binarie o ternarie, o in generale multiple, in grado di legare e neutralizzare in varia misura l’entrata del virus, o di artefatti sperimentali che ne riproducono l’attività, in sistemi cellulari modello quali, ad esempio, quelli descritti in EP1551960A2. Also an integral part of this first aspect of the invention are all the compositions containing the antibodies object of this invention or their fragments or functional derivatives, alone or in binary or ternary mixtures, or in general multiple, able to bind and neutralize in various measures the entry of the virus, or of experimental artefacts that reproduce its activity, in model cell systems such as, for example, those described in EP1551960A2.

Alternativamente, tali composizioni così descritte sono utilizzate per neutralizzare l’azione del virus anche in modelli animali della malattia recentemente descritti. Preferibilmente, tali composizioni possono contenere almeno un anticorpo oggetto di questa invenzione o un suo derivato o frammento funzionale ed almeno un carrier o un adjuvante o un diluente. Inoltre, tali composizioni possono contenere almeno un anticorpo monoclonale o suoi frammenti funzionali, eventualmente modificati chimicamente o enzimaticamente come descritto. Alternatively, such compositions thus described are used to neutralize the action of the virus also in recently described animal models of the disease. Preferably, such compositions can contain at least one antibody object of this invention or a derivative or functional fragment thereof and at least a carrier or an adjuvant or a diluent. Furthermore, such compositions can contain at least one monoclonal antibody or functional fragments thereof, possibly chemically or enzymatically modified as described.

Gli anticorpi e/o i loro frammenti, modificati e non, e le loro preparazioni appena descritte, sono utilizzabili in molteplici applicazioni correlate con la prevenzione ed il trattamento di infezioni da virus dell’epatite C. The antibodies and / or their fragments, modified or not, and their preparations just described, can be used in many applications related to the prevention and treatment of hepatitis C virus infections.

Alcune delle applicazioni sono: Some of the applications are:

Immunizzazione passiva di mammiferi sani o infettati con virus FICV Prevenzione della ricorrenza di infezioni di FICV in fegati non infetti da FICV trapiantati in pazienti con infezioni croniche da FICV Passive immunization of healthy or FICV infected mammals Prevention of recurrence of FICV infections in non-FICV infected livers transplanted to patients with chronic FICV infections

Prevenzione di infezioni da FICV in mammiferi non infettati da FICV. Prevention of FICV infections in non-FICV infected mammals.

Prevenzione di infezioni da FICV in mammiferi non infetti da FICV dopo contatto accidentale con aghi infetti da FICV Prevention of FICV infections in non-FICV infected mammals after accidental contact with FICV infected needles

Prevenzione della trasmissione di infezioni di FICV durante la gravidanza e/o la nascita da madri infettate da FICV ai nascituri. Prevention of transmission of FICV infections during pregnancy and / or birth from FICV infected mothers to unborn children.

Trattamento di infezioni da HCV in mammiferi infetti. Treatment of HCV infections in infected mammals.

In ognuna delle applicazioni sopra elencate, i trattamenti con anticorpi neutralizzanti o loro frammenti o derivati funzionali o composizioni descritti in questa invenzione, possono essere ulteriormente combinati con qualunque altro farmaco o terapia noti, dotati di proprietà terapeutiche contro ITHCV; resta beninteso che tale combinazione può avvenire con diverse modalità, ad esempio: Somministrazione simultanea. In each of the applications listed above, the treatments with neutralizing antibodies or their fragments or functional derivatives or compositions described in this invention can be further combined with any other known drug or therapy, endowed with therapeutic properties against ITHCV; it is understood that this combination can take place in different ways, for example: Simultaneous administration.

Somministrazione di miscele pre-costituite. Administration of pre-made mixtures.

Somministrazione di farmaci o terapie anti-HCV noti e successiva somministrazione di molecole o composizioni oggetto della presente invenzione. Somministrazione di molecole o composizioni oggetto della presente invenzione e successiva somministrazione di farmaci o terapie anti-HCV noti. Administration of known anti-HCV drugs or therapies and subsequent administration of molecules or compositions object of the present invention. Administration of molecules or compositions object of the present invention and subsequent administration of known anti-HCV drugs or therapies.

Resta beninteso che i mammiferi includono esseri umani. It goes without saying that mammals include humans.

Inoltre gli anticorpi monoclonali descritti o loro frammenti o derivati funzionali come sopra descritti possono essere utilizzati in metodi analitici per identificare nuovi composti capaci di neutralizzare l'infezione da HCV. Furthermore, the described monoclonal antibodies or their fragments or functional derivatives as described above can be used in analytical methods to identify new compounds capable of neutralizing HCV infection.

Tali metodi includono i seguenti steps: These methods include the following steps:

- mettere a punto le condizioni per un saggio di interazione tra gli anticorpi neutralizzanti o loro derivati o frammenti funzionali descritti in questa invenzione e la proteina E2 o sue varianti o suoi frammenti. - setting up the conditions for an interaction assay between the neutralizing antibodies or their derivatives or functional fragments described in this invention and the E2 protein or its variants or fragments.

- aggiungere il composto di cui si vuole valutare le potenziali proprietà neutralizzanti dell’attività dell’ HCV, prima, dopo o contestualmente al contatto tra gli anticorpi o loro frammenti o derivati funzionali oggetto della presente invenzione e la proteina E2 o sue varianti o suoi frammenti - add the compound for which you want to evaluate the potential neutralizing properties of the HCV activity, before, after or simultaneously with the contact between the antibodies or their fragments or functional derivatives object of the present invention and the E2 protein or its variants or fragments

- misurare il legame degli anticorpi o dei loro frammenti o derivati funzionali con la proteina E2 o suoi frammenti o sue varianti - measure the binding of antibodies or their functional fragments or derivatives with the E2 protein or its fragments or variants

- determinare nello step (iii) se il composto addizionato nello step (ii) è in grado di interferire con il legame degli anticorpi o loro frammenti o derivati funzionali con la proteina E2. - determine in step (iii) if the compound added in step (ii) is able to interfere with the binding of antibodies or their fragments or functional derivatives with the E2 protein.

- confermare l’attività neutralizzante delle molecole selezionate in un saggio di neutralizzazione dell’HCV. - confirm the neutralizing activity of the selected molecules in a HCV neutralization assay.

Ovviamente gli anticorpi e/o i loro frammenti o derivati funzionali come sopra descritti possono essere utilizzati come controlli positivi nel metodo precedentemente descritto per determinare le proprietà neutralizzanti di nuovi composti. Obviously the antibodies and / or their fragments or functional derivatives as described above can be used as positive controls in the previously described method for determining the neutralizing properties of new compounds.

Alternativamente, possono essere impiegate composizioni contenenti almeno un anticorpo o un suo frammento o derivato funzionale ed almeno un carrier o un adjuvante o un diluente. Alternatively, compositions containing at least one antibody or a functional fragment or derivative thereof and at least one carrier or adjuvant or diluent can be used.

Inoltre gli anticorpi monoclonali anti-HCV o loro frammenti o derivati funzionali, possono essere utilizzati in kit diagnostici per identificare e quantificare la proteina E2 e sue varianti in campioni biologici. Furthermore, the anti-HCV monoclonal antibodies or their fragments or functional derivatives, can be used in diagnostic kits to identify and quantify the E2 protein and its variants in biological samples.

Gli anticorpi monoclonali anti-HCV, ed i loro frammenti o derivati funzionali come sopra descritti possono essere preparati e purificati con tecniche note. The anti-HCV monoclonal antibodies, and their functional fragments or derivatives as described above can be prepared and purified with known techniques.

Un metodo di preparazione e purificazione dei Mab II, V e VI è riportato nell’esempio 2. A method of preparation and purification of Mab II, V and VI is shown in example 2.

In particolare, tale metodo include i seguenti steps: In particular, this method includes the following steps:

(i) ottenimento di preparazioni grezze di anticorpi, o di loro frammenti funzionali mediante colture dei corrispondenti ibridomi, espressione ricombinante o mediante sintesi chimica; (i) obtaining crude preparations of antibodies, or their functional fragments by culturing the corresponding hybridomas, recombinant expression or by chemical synthesis;

(ii) eventuale ottenimento di loro derivati funzionali mediante reazioni chimiche o enzimatiche; (ii) possible obtaining of their functional derivatives by chemical or enzymatic reactions;

(iii) purificazione di tali anticorpi, di loro frammenti funzionali o di loro derivati ottenuti in (i) e (ii) come descritto nell’ esempio 2. (iii) purification of these antibodies, their functional fragments or their derivatives obtained in (i) and (ii) as described in example 2.

Sono un ulteriore aspetto della presente invenzione gli antigeni utilizzati per generare gli anticorpi come sopra descritti. A further aspect of the present invention are the antigens used to generate the antibodies as described above.

L’epitopo principale di tali antigeni è rappresentato dalla sequenza di aminoacidi che corrisponde alla regione 412 - 422 della proteina E2 (QLINTNGSWHI) [SEQ.ID. 77] o alle sue varianti in cui alle due estremità sono aggiunti due altri residui che permettono di generare strutture cicliche aventi lo stesso numero di atomi o un numero di atomi pari a: The main epitope of these antigens is represented by the amino acid sequence that corresponds to the 412 - 422 region of the E2 protein (QLINTNGSWHI) [SEQ.ID. 77] or its variants in which two other residues are added at the two ends that allow to generate cyclic structures having the same number of atoms or a number of atoms equal to:

N - i oppure N+i, con N = numero di atomi presenti nella struttura come sopra definita (41 atomi) in cui detti residui aggiunti sono due cisteine ed i varia da 1 a 10 ed in cui al C-terminale e all’N-terminale sono eventualmente inseriti due residui di lisina. N - i or N + i, with N = number of atoms present in the structure as defined above (41 atoms) in which said added residues are two cysteines and i varies from 1 to 10 and in which at the C-terminus and at the N - two lysine residues are possibly inserted at the end.

Un esempio di detti residui sono due cisteine, come detto una per parte, unite da un ponte disolfurico in modo da generare una struttura ciclica. An example of said residues are two cysteines, one on each side, joined by a disulfide bridge so as to generate a cyclic structure.

L’eventuale aggiunta delle due lisine serve per aumentare la solubilità della molecola e soprattutto per favorire la coniugazione a proteine carrier, quali la KLH, utilizzate per stimolare la risposta anticorpale nella fase di immunizzazione di animali. The possible addition of the two lysines serves to increase the solubility of the molecule and above all to promote conjugation to carrier proteins, such as KLH, used to stimulate the antibody response in the immunization phase of animals.

Un esempio di epitopo (qui di seguito Epitopo 1) secondo l’invenzione ha quindi sequenza: An example of an epitope (hereinafter Epitope 1) according to the invention therefore has a sequence:

KKCQLINTNGSWHIC [SEQ. ID. No. 7] KKCQLINTNGSWHIC [SEQ. ID. No. 7]

La sequenza di aminoacidi è riportata secondo la notazione a singola lettera, nota agli esperti del settore, e si riferisce ad aminoacidi in configurazione L. The amino acid sequence is reported according to the single letter notation, known to those skilled in the art, and refers to amino acids in the L configuration.

Tale sequenza può essere ridotta rimuovendo aminoacidi daN’N-terminale e/o dal C-terminale in modo da ottenere nuovi epitopi di dimensioni minori, fino ad un minimo di 5 aminoacidi. This sequence can be reduced by removing amino acids from the N-terminus and / or from the C-terminus in order to obtain new epitopes of smaller size, down to a minimum of 5 amino acids.

Questo aspetto, relativamente all’Epitopo 1, è riferita alla sequenza inclusa all'interno dei due residui di cisteine. This aspect, in relation to Epitope 1, refers to the sequence included within the two cysteine residues.

Sono parte integrante di questo quarto aspetto della presente invenzione, altri epitopi ottenuti sostituendo la sequenza inclusa tra le due cisteine con una delle sequenze di aminoacidi indicate di seguito e corrispondenti a diversi isolati genetici dello stesso virus: Other epitopes obtained by replacing the sequence included between the two cysteines with one of the following amino acid sequences corresponding to different genetic isolates of the same virus are an integral part of this fourth aspect of the present invention:

QLINTNGSWH [SEQ. ID. No. 8] QLINTNGSWH [SEQ. ID. No. 8]

QLINTDGSWH [SEQ. ID. No. 9] QLINTDGSWH [SEQ. ID. No. 9]

QLVNTNGSWH [SEQ. ID. No. 10] QLVNTNGSWH [SEQ. ID. No. 10]

QLMNTNGSWH [SEQ. ID. No. 11] QLMNTNGSWH [SEQ. ID. No. 11]

QLISTNGSWH [SEQ. ID. No. 12] QLISTNGSWH [SEQ. ID. No. 12]

QLINSNGSWH [SEQ. ID. No. 13] QLINSNGSWH [SEQ. ID. No. 13]

QLINTSGSWH [SEQ. ID. No. 14] QLINTSGSWH [SEQ. ID. No. 14]

ELINTNGSWH [SEQ. ID. No. 15] ELINTNGSWH [SEQ. ID. No. 15]

RLINTNGSWH [SEQ. ID. No. 16] RLINTNGSWH [SEQ. ID. No. 16]

HLINTNGSWH [SEQ. ID. No. 17] KLINTNGSWH [SEQ. ID. No. 18] YLINTNGSWH [SEQ. ID. No. 19] SLINTNGSWH [SEQ. ID. No. 20] NLINTNGSWH [SEQ. ID. No. 21] GLINTNGSWH [SEQ. ID. No. 22] QLINTGGSWH [SEQ. ID. No. 23] QLINTNGGWH [SEQ. ID. No. 24] QLTNTNGSWH [SEQ. ID. No. 25] QLMNTNGSWH [SEQ. ID. No. 26] QLIDTNGSWH [SEQ. ID. No. 27] QLIYTNGSWH [SEQ. ID. No. 28] QLIRTNGSWH [SEQ. ID. No. 29] QLIHTNGSWH [SEQ. ID. No. 30] QLIKTNGSWH [SEQ. ID. No. 31] QLIYTNGSWH [SEQ. ID. No. 32] QLINANGSWH [SEQ. ID. No. 33] QLINTDGSWH [SEQ. ID. No. 34] ELINSNGSWH [SEQ. ID. No. 35] ELVNTSGSWH [SEQ. ID. No. 36] HLVNSNGSWH [SEQ. ID. No. 37] NLVNTNGSWH [SEQ. ID. No. 38] KLINSNGSWH [SEQ. ID. No. 39] RLINSNGSWH [SEQ. ID. No. 40] RLVNTNGSWH [SEQ. ID. No. 41] SLINSNGSWH [SEQ. ID. No. 42] NLIKTNGSWH [SEQ. ID. No. 43] HLVNSNGSWH [SEQ. ID. No. 44] QFVNTNGSWH [SEQ. ID. No. 45] QLVKTNGSWH [SEQ. ID. No. 46] QLVNKNGSWH [SEQ. ID. No. 47] QLVNANGSWH [SEQ. ID. No. 48] QLVNTSGSWH [SEQ. ID. No. 49] QLVNTNGRWH [SEQ. ID. No. 50] QLMYTNGSWH [SEQ. ID. No. 51] QLVNSNGSWH [SEQ. ID. No. 52] QLVNKNGSWH [SEQ. ID. No. 53] QLVNRNGSWH [SEQ. ID. No. 54] QLVNTDGSWH [SEQ. ID. No. 55] QLINSNXSWH [SEQ. ID. No. 56] DOVE x = HLINTNGSWH [SEQ. ID. No. 17] KLINTNGSWH [SEQ. ID. No. 18] YLINTNGSWH [SEQ. ID. No. 19] SLINTNGSWH [SEQ. ID. No. 20] NLINTNGSWH [SEQ. ID. No. 21] GLINTNGSWH [SEQ. ID. No. 22] QLINTGGSWH [SEQ. ID. No. 23] QLINTNGGWH [SEQ. ID. No. 24] QLTNTNGSWH [SEQ. ID. No. 25] QLMNTNGSWH [SEQ. ID. No. 26] QLIDTNGSWH [SEQ. ID. No. 27] QLIYTNGSWH [SEQ. ID. No. 28] QLIRTNGSWH [SEQ. ID. No. 29] QLIHTNGSWH [SEQ. ID. No. 30] QLIKTNGSWH [SEQ. ID. No. 31] QLIYTNGSWH [SEQ. ID. No. 32] QLINANGSWH [SEQ. ID. No. 33] QLINTDGSWH [SEQ. ID. No. 34] ELINSNGSWH [SEQ. ID. No. 35] ELVNTSGSWH [SEQ. ID. No. 36] HLVNSNGSWH [SEQ. ID. No. 37] NLVNTNGSWH [SEQ. ID. No. 38] KLINSNGSWH [SEQ. ID. No. 39] RLINSNGSWH [SEQ. ID. No. 40] RLVNTNGSWH [SEQ. ID. No. 41] SLINSNGSWH [SEQ. ID. No. 42] NLIKTNGSWH [SEQ. ID. No. 43] HLVNSNGSWH [SEQ. ID. No. 44] QFVNTNGSWH [SEQ. ID. No. 45] QLVKTNGSWH [SEQ. ID. No. 46] QLVNKNGSWH [SEQ. ID. No. 47] QLVNANGSWH [SEQ. ID. No. 48] QLVNTSGSWH [SEQ. ID. No. 49] QLVNTNGRWH [SEQ. ID. No. 50] QLMYTNGSWH [SEQ. ID. No. 51] QLVNSNGSWH [SEQ. ID. No. 52] QLVNKNGSWH [SEQ. ID. No. 53] QLVNRNGSWH [SEQ. ID. No. 54] QLVNTDGSWH [SEQ. ID. No. 55] QLINSNXSWH [SEQ. ID. No. 56] WHERE x =

Glicina o Serina Glycine or Serine

QLVNASGSWH [SEQ. ID. No. 57] QLVKTEGNWH [SEQ. ID. No. 58] QLVHANGSWH [SEQ. ID. No. 59] QLVNSHGSWH [SEQ. ID. No. 60] QLVNSNGSRH [SEQ. ID. No. 61] QLVHSNGSWH [SEQ. ID. No. 62] QLIKNGSSWH [SEQ. ID. No. 63] QLVNASGSWH [SEQ. ID. No. 57] QLVKTEGNWH [SEQ. ID. No. 58] QLVHANGSWH [SEQ. ID. No. 59] QLVNSHGSWH [SEQ. ID. No. 60] QLVNSNGSRH [SEQ. ID. No. 61] QLVHSNGSWH [SEQ. ID. No. 62] QLIKNGSSWH [SEQ. ID. No. 63]

Come detto sopra, le varianti dell’Epitopo 1 come sopra indicate, possono essere preparate ed impiegate anche omettendo le due lisine presenti aN’N-terminale. Sono parte integrante di questo aspetto della presente invenzione, epitopi in cui gli aminoacidi dell’ Epitopo 1 possono essere in configurazione D. Alternativamente, le stesse molecole peptidiche possono essere generate nella forma retro oppure retro-inverso, poiché è noto che anticorpi contro un peptide parente, sono in grado di riconoscere anche le varianti con gli aminoacidi in configurazione D, e le varianti retro e retro-inverse. As mentioned above, the variants of Epitope 1 as indicated above, can also be prepared and used by omitting the two lysines present at N-terminus. An integral part of this aspect of the present invention are epitopes in which the amino acids of Epitope 1 can be in configuration D. Alternatively, the same peptide molecules can be generated in the retro or retro-reverse form, since it is known that antibodies against a peptide relative, they are also able to recognize the variants with amino acids in the D configuration, and the retro and retro-inverse variants.

Qui di seguito vengono riportati alcuni esempi realizzativi della presente invenzione Some embodiment examples of the present invention are reported below

ESEMPIO 1 : EXAMPLE 1:

Design e preparazione di immunogeni ciclici e lineari per la preparazione di Mabs conformazionali anti-E2. Design and preparation of cyclic and linear immunogens for the preparation of conformational anti-E2 Mabs.

Gli antigeni di superficie sono stati progettati sulla base di un epitopo noto della proteina E2 di HCV. Tale epitopo corrisponde alla regione 412-419, sequenza QLINTNGS (SEQ. ID NO. 78) [Pei Zhang, Charles G. Wu, Kathleen Mihalik, Maria Luisa Virata-Theimer, Mei-ying W. Yu, Harvey J. Alter, and Stephen M. Feinstone. The surface antigens were designed on the basis of a known epitope of the HCV E2 protein. This epitope corresponds to region 412-419, sequence QLINTNGS (SEQ. ID NO. 78) [Pei Zhang, Charles G. Wu, Kathleen Mihalik, Maria Luisa Virata-Theimer, Mei-ying W. Yu, Harvey J. Alter, and Stephen M. Feinstone.

Hepatitis C virus epitope-specific neutralizing antibodies in Igs prepared from human plasma”. PNAS, May 15, 2007, voi. 104, no. 20, 8449-8454], contro cui sono stati già preparati e sviluppati anticorpi ad alta capacità neutralizzante. Hepatitis C virus epitope-specific neutralizing antibodies in Igs prepared from human plasma ". PNAS, May 15, 2007, vol. 104, no. 20, 8449-8454], against which antibodies with high neutralizing capacity have already been prepared and developed.

Per ottenere degli anticorpi ancora più specifici e possibilmente a maggiore affinità, è stata ideata e progettata una struttura ciclica contenente questa regione aminoacidica e che riproduce una porzione esposta e ripiegata della proteina. Sulla base di un modello teorico di E2 descritto in referenza [Yagnik AT, Lahm A, Meda A, Roccasecca RM, Ercole BB, Nicosia A, Tramontano A. A model for thè hepatitis C virus envelope glycoprotein E2. 2000, Proteins, 15;40(3):355-6.]. To obtain even more specific and possibly higher affinity antibodies, a cyclic structure containing this amino acid region and reproducing an exposed and folded portion of the protein was devised and designed. Based on a theoretical model of E2 described in reference [Yagnik AT, Lahm A, Meda A, Roccasecca RM, Ercole BB, Nicosia A, Tramontano A. A model for the hepatitis C virus envelope glycoprotein E2. 2000, Proteins, 15; 40 (3): 355-6.].

Considerando la variabilità della risposta anticorpale, è possibile isolare cloni che riconoscono selettivamente conformazioni diverse del peptide, pertanto, testando molteplici cloni, prima come binders del peptide e successivamente in saggi di neutralizzazione, è possibile identificare agenti neutralizzanti dell’ infezione da HCV che riconoscano selettivamente una struttura tridimensionale della proteina e che siano quindi più specifici, selettivi e affini. Considering the variability of the antibody response, it is possible to isolate clones that selectively recognize different conformations of the peptide, therefore, by testing multiple clones, first as peptide binders and subsequently in neutralization assays, it is possible to identify neutralizing agents of HCV infection that selectively recognize a three-dimensional structure of the protein and that they are therefore more specific, selective and related.

Allo scopo di studiare il sito di legame degli anticorpi all’antigene, sono stati progettati l’epitopo 1, di sequenza [SEQ. ID. No. 7], la sua variante metilata e 4 mutanti come indicato in Tabella III. In order to study the binding site of antibodies to the antigen, epitope 1, of sequence [SEQ. ID. No. 7], its methylated variant and 4 mutants as indicated in Table III.

TABELLA III TABLE III

Sintesi chimica degli antigeni Chemical synthesis of antigens

Le sintesi sono state eseguite utilizzando un sintetizzatore SYRO I acquistato dalla ditta Multisyntech (Germania). I reagenti per la sintesi del peptide in fase solida (resina, amino acidi protetti con Fmoc ed agenti condensanti), sono stati acquistati dalle ditte Inbios (Napoli), GL Biochem (Shangai, Cina) e NovaBiochem (Laufelfingen, Svizzera). I solventi per la sintesi, dimetilformammide (DMF), diclorometano (DCM), isopropanolo (Iso-Pro) ed etere (Et20) sono stati acquistati dalla ditta DelChimica (Napoli) e dalla Sigma-Aldrich (Milano). La piperidina (PIP), utilizzata per rimuovere il gruppo Fmoc, l’acido trifluoroacetico (TFA) ed il triisopropilsilano (TIS) utilizzati per il distacco dei peptidi dalla resina sono stati acquistati dalla ditta Sigma-Aldrich (Milano). L’acetonitrile (ACN) impiegato per le analisi e le purificazioni HPLC, è stato acquistato dalla Sigma-Aldrich (Milano). Le colonne a fase inversa analitiche e preparative, per l’analisi e la purificazione dei peptidi sono state acquistate dalla ditta Phenomenex (Bologna). I sistemi cromatografici preparativi sono prodotti della Shimadzu (Milano). Il sistema LC-MS per la caratterizzazione dei peptidi grezzi e purificati è un prodotto ThermoFisher (Milano). The syntheses were performed using a SYRO I synthesizer purchased from Multisyntech (Germany). The reagents for the solid phase peptide synthesis (resin, amino acids protected with Fmoc and condensing agents), were purchased from the companies Inbios (Naples), GL Biochem (Shanghai, China) and NovaBiochem (Laufelfingen, Switzerland). The solvents for the synthesis, dimethylformamide (DMF), dichloromethane (DCM), isopropanol (Iso-Pro) and ether (Et20) were purchased from the company DelChimica (Naples) and from Sigma-Aldrich (Milan). Piperidine (PIP), used to remove the Fmoc group, trifluoroacetic acid (TFA) and triisopropylsilane (TIS) used for the detachment of peptides from the resin, were purchased from the Sigma-Aldrich company (Milan). Acetonitrile (ACN) used for HPLC analyzes and purifications was purchased from Sigma-Aldrich (Milan). The analytical and preparative reverse phase columns for the analysis and purification of peptides were purchased from the company Phenomenex (Bologna). The preparatory chromatographic systems are produced by Shimadzu (Milan). The LC-MS system for the characterization of crude and purified peptides is a ThermoFisher product (Milan).

I peptidi sono stati preparati per sintesi chimica mediante tecnica in fase solida su una resina RINK AMIDE che consente di avere peptidi ammidati al C-terminale. Le sintesi sono state eseguite su una scala di 50 μmoli per ogni peptide. Le reazioni di condensazione tra gli aminoacidi sono state eseguite per 25 minuti a temperatura ambiente, impiegando HATU e DIPEA (HATU: 2-(1 H-7-Azabenzotriazol-1 -yl)--1 , 1 ,3,3-tetramethyl uronium hexafluorophosphate Methanaminium; DIPEA: Ν,Ν-Diisopropylethylamine) utilizzando un eccesso di aminoacido di 10 (500 μmoli). Le reazioni di deprotezione del gruppo Fmoc sono state condotte per 10 minuti a temperatura ambiente, utilizzando soluzioni al 30% di PIP in DMF. Le resine ottenute alla fine della sintesi sono state lavate manualmente con DMF (3 volte, 1 mL), con DCM (3 volte, 1 mL), con Iso-Pro (3 volte, 1 mL) e con Et20 (5 volte, 1 mL). Le resine sono state seccate sotto vuoto e trattate con una miscela di TFA:H20:TIS (3 mL per circa 100 mg di resina) per 5 ore a temperatura ambiente. I prodotti ottenuti nelle soluzioni acide sono stati precipitati per aggiunta di etere etilico freddo, separati per centrifugazione e liofilizzati da una soluzione al 50% di H20/ACN. I prodotti grezzi sono stati caratterizzati mediante LC-MS in termini di purezza e peso molecolare (PUREZZE MEDIE STIMATE CIRCA 65%). The peptides were prepared by chemical synthesis by means of a solid phase technique on a RINK AMIDE resin which allows to have amidated peptides at the C-terminus. The syntheses were performed on a scale of 50 μmol for each peptide. The condensation reactions between the amino acids were performed for 25 minutes at room temperature, using HATU and DIPEA (HATU: 2- (1 H-7-Azabenzotriazol-1 -yl) - 1, 1, 3,3-tetramethyl uronium hexafluorophosphate Methanaminium; DIPEA: Ν, Ν-Diisopropylethylamine) using an amino acid excess of 10 (500 μmol). Deprotection reactions of the Fmoc group were carried out for 10 minutes at room temperature, using 30% solutions of PIP in DMF. The resins obtained at the end of the synthesis were washed manually with DMF (3 times, 1 mL), with DCM (3 times, 1 mL), with Iso-Pro (3 times, 1 mL) and with Et20 (5 times, 1 mL) mL). The resins were dried under vacuum and treated with a mixture of TFA: H20: TIS (3 mL for approximately 100 mg of resin) for 5 hours at room temperature. The products obtained in the acid solutions were precipitated by addition of cold ethyl ether, separated by centrifugation and freeze-dried from a 50% solution of H20 / ACN. The crude products were characterized by LC-MS in terms of purity and molecular weight (ESTIMATED AVERAGE PURITY ABOUT 65%).

I pesi teorici e sperimentali sono riportati nella successiva Tabella IV. The theoretical and experimental weights are shown in the following Table IV.

Tabella IV Table IV

Coniugazione a KLH e BSA mediante glutaraldeide Conjugation to KLH and BSA by glutaraldehyde

La coniugazione a KLH (Keyhole Limpet Hemocyanin) è stata condotta soltanto con il Peptide I, riportato in Tabella III e IV. Conjugation to KLH (Keyhole Limpet Hemocyanin) was carried out only with Peptide I, reported in Tables III and IV.

Per la coniugazione: For conjugation:

0.5 mg di peptide sono stati sciolti in 0.5 mL di tampone fosfato 50 mM, pH 7.0. La soluzione è stata mescolata con una soluzione di KLH (prodotto SIGMA H7017, Milano), 1.5 mg in 0.5 mL di tampone fosfato, pH 7.0 ed infine sono stati aggiunti 0.5 mL di soluzione di glutaraldeide allo 0.2% in acqua (Sigma-Aldrich, Milano). La miscela è stata lasciata in incubazione per 2 ore a temperatura ambiente, poi è stato aggiunto 1 mL di soluzione di glieina 1 M in tampone fosfato, lasciando reagire ancora per 1 ora a temperatura ambiente. La soluzione è stata infine dializzata 2 volte contro tampone fosfato 50 mM pH 7.0 ed infine liofilizzato. 0.5 mg of peptide was dissolved in 0.5 mL of 50 mM phosphate buffer, pH 7.0. The solution was mixed with a solution of KLH (product SIGMA H7017, Milan), 1.5 mg in 0.5 mL of phosphate buffer, pH 7.0 and finally 0.5 mL of 0.2% glutaraldehyde solution in water (Sigma-Aldrich, Milan). The mixture was incubated for 2 hours at room temperature, then 1 mL of 1 M glyein solution in phosphate buffer was added, allowing it to react for another 1 hour at room temperature. The solution was finally dialyzed twice against 50 mM phosphate buffer pH 7.0 and finally lyophilized.

In parallelo, nelle stesse condizioni, è stata eseguita la coniugazione del Peptide I alla BSA (Albumina Serica Bovina, Sigma-Aldrich, Milano). In parallel, under the same conditions, the conjugation of Peptide I to BSA was performed (Albumin Serica Bovina, Sigma-Aldrich, Milan).

Preparazione del Peptide II lineare metilato (vedere Tabella IV). Preparation of methylated linear Peptide II (see Table IV).

Il peptide lineare di partenza è stato metilato in soluzione sui gruppi tiolici delle cisteine per avere una molecola stabile in soluzione durante la fase di testing dei monoclonali e allo stesso tempo, modificata il meno possibile. The starting linear peptide was methylated in solution on the thiol groups of the cysteines to have a stable molecule in solution during the testing phase of the monoclonals and at the same time, modified as little as possible.

La reazione di metilazione è stata condotta su 3 mg di peptide grezzo (circa 1.7 pmoli, circa 3.4 pmoli di gruppi SH) sciolti in 500 pL di ACN contenente 1% DIPEA. Alla soluzione sono stati aggiunti 100 pL di una soluzione di Ioduro di Metile (CH3I, Sigma-Aldrich, Milano) in ACN al 10% v/v (10 mg, circa 170 pmoli) lasciando reagire per 1 minuto a temperatura ambiente. La reazione è stata bloccata raffreddando in ghiaccio e successivamente aggiungendo 100 pL di H20/TFA 9:1. The methylation reaction was carried out on 3 mg of crude peptide (about 1.7 pmoles, about 3.4 pmoles of SH groups) dissolved in 500 µL of ACN containing 1% DIPEA. 100 µL of a solution of Methyl Iodide (CH3I, Sigma-Aldrich, Milan) in ACN at 10% v / v (10 mg, about 170 pmoles) was added to the solution and left to react for 1 minute at room temperature. The reaction was stopped by cooling on ice and then adding 100 µL of H20 / TFA 9: 1.

Dopo aver evaporato i solventi, il prodotto è stato ripreso in 2 mL di H20/ACN 9:1, 0.1%TFA ed è stato purificato mediante HPLC su colonna a fase inversa, ottenendo dopo purificazione, circa 1.5 mg di prodotto purificato. L’avvenuta metilazione è stata verificata mediante analisi LC-MS di un’aliquota di campione purificato. After evaporating the solvents, the product was taken up in 2 mL of H20 / ACN 9: 1, 0.1% TFA and was purified by HPLC on a reverse phase column, obtaining after purification about 1.5 mg of purified product. The methylation occurred was verified by LC-MS analysis of an aliquot of purified sample.

ESEMPIO 2: EXAMPLE 2:

Immunizzazione dei topi e generazione degli anticorpi monoclonali. Immunization of mice and generation of monoclonal antibodies.

Immunizzazione Immunization

Per la produzione degli anticorpi monoclonali, è stato utilizzato come antigene il Peptide I coniugato con KLH. Come adiuvante è stato utilizzato il TiterMax Gold Adjuvant (Sigma) che garantisce una attivazione ottimale della immunità innata, evento indispensabile per ottenere una migliore produzione di anticorpi. Particolare attenzione è stata posta nel miscelare l’adiuvante con il peptide per creare un’emulsione perfetta. A questo scopo 500 pl_ di adiuvante sono stati caricati in una siringa e 500 μΙ_ di antigene alla concentrazione di 4 mg/mL in tampone PBS (fosfato 50 mM, NaCI 150 mM), sono stati caricati in una seconda siringa. Utilizzando un raccordo a tre vie è stato miscelato l’adiuvante con l’antigene, facendo attenzione che la fase acquosa (antigene) entrasse nella fase oleosa (adiuvante) e non viceversa. L’operazione di miscelazione è proseguita fino a quando l’emulsione non è diventata omogenea. L’emulsione finale così ottenuta è stata utilizzata per immunizzare topi del ceppo Balb/c ottenuti dalla Jackson Lab. Sono stati utilizzati 3 topi di sesso femminile di 5 settimane di età. Ogni topo è stato immunizzato con 50 uL di emulsione (contenente 100 pg di immunogeno) per via sottocutanea, iniettando 25 pL in due diversi siti (tempo(T) = 0). Il giorno precedente all’immunizzazione sono stati prelevati dalla vena caudale circa 250 pL di sangue in modo da avere a disposizione il siero pre-immune per ogni topo, utilizzato in tutte le fasi successive come controllo. Dopo trenta giorni (T = 30) dalla prima immunizzazione i topi sono stati nuovamente immunizzati con 50 pL di emulsione antigene-anticorpo (contenenti 100 pg di immunogeno) per via sottocutanea, iniettando 25 pL in due diversi siti. Al giorno 40, i topi sono stati nuovamente immunizzati con 100 pg di immunogeno emulsionato con l’adiuvante, per via sottocutanea. Dopo altri 20 giorni (T=60) è stato effettato un nuovo prelievo di sangue dalla vena caudale ed è stata determinata la concentrazione di anticorpi diretti contro il Peptide I mediante ELISA. I due topi che hanno mostrano il titolo anticorpale più elevato, sono stati sacrificati e splenectomizzati. For the production of monoclonal antibodies, Peptide I conjugated with KLH was used as the antigen. The TiterMax Gold Adjuvant (Sigma) was used as an adjuvant, which guarantees optimal activation of innate immunity, an essential event to obtain a better production of antibodies. Particular attention was paid to mixing the adjuvant with the peptide to create a perfect emulsion. For this purpose 500 μl of adjuvant were loaded into a syringe and 500 μΙ_ of antigen at a concentration of 4 mg / mL in PBS buffer (50 mM phosphate, 150 mM NaCl), were loaded into a second syringe. Using a three-way connection, the adjuvant was mixed with the antigen, making sure that the aqueous phase (antigen) entered the oily phase (adjuvant) and not vice versa. The mixing operation continued until the emulsion became homogeneous. The final emulsion thus obtained was used to immunize mice of the Balb / c strain obtained by the Jackson Lab. 3 female mice of 5 weeks of age were used. Each mouse was immunized with 50 µL of emulsion (containing 100 µg of immunogen) subcutaneously, injecting 25 µL at two different sites (time (T) = 0). The day before the immunization, about 250 pL of blood were taken from the caudal vein in order to have the pre-immune serum available for each mouse, used in all subsequent phases as a control. Thirty days (T = 30) from the first immunization, the mice were again immunized with 50 μL of antigen-antibody emulsion (containing 100 μg of immunogen) subcutaneously, injecting 25 μL in two different sites. On day 40, the mice were again immunized with 100 µg of immunogen emulsified with the adjuvant, subcutaneously. After another 20 days (T = 60) a new blood sample was taken from the tail vein and the concentration of antibodies directed against Peptide I was determined by ELISA. The two mice showing the highest antibody titer were sacrificed and splenectomized.

SAGGI ELISA WISE ELISA

Nei saggi ELISA sono stati utilizzati come antigene il Peptide I o il Peptide II lineare, coniugati con BSA. Questo permette di dosare gli anticorpi effettivamente prodotti contro il Peptide I, evitando l’interferenza degli anticorpi anti-KLH. In the ELISA assays, Peptide I or linear Peptide II, conjugated with BSA, were used as antigen. This allows to measure the antibodies actually produced against Peptide I, avoiding the interference of anti-KLH antibodies.

A questo scopo, soluzioni di Peptide I (100 μl_), coniugato a BSA e sciolto in PBS, ad una concentrazione di 1 μg/mL, sono state incubate in una piastra da 96 pozzetti per ELISA (Immunoplate, NUNC). Dopo una notte a 4°C, le piastre sono state lavate per tre volte con 200 pL di una soluzione di PBS-Tween 1% (Fluka, Milano), per eliminare l'eccesso di reagenti. I pozzetti sono stati saturati con BSA, incubando con 200 pL di una soluzione di BSA (Sigma-Aldrich, Milano) al 3% (peso/volume) in PBS, per due ore a temperatura ambiente. Le piastre sono state lavate per tre volte con 200 pL di PBS-Tween 1%. Nei pozzetti sono state dispensate soluzioni, a diluizioni scalari, del siero immune e del siero pre-immune di ogni topo. Le diluizioni (1:100; 1:1000; 1:5000; 1:10000; 1:100000) sono state preparate diluendo il siero in PBS. Le piastre sono state incubate per 1 ora in camera umida a temperatura ambiente. Al termine dell'incubazione le piastre sono state lavate tre volte con 200 pL di PBS-Tween 1%, ed è stata aggiunta una soluzione contenente un anticorpo secondario coniugato con Perossidasi che riconosce in maniera specifica le immunoglobuline G di topo (Biorad, Milano) ad una diluizione di 1:1000. Dopo l'incubazione dell'anticorpo per un’ora a temperatura ambiente in camera umida, le piastre sono state lavate per tre volte con 200 pL di PBS-Tween 1%. La rivelazione è stata eseguita aggiungendo 100 pL di una soluzione di substrato della perossidasi ABTS (acido 2,2'-azino-bis(3-etilbenzotiazolin-6-sulfonico, Sigma-Aldrich, Milano) e leggendo l’assorbanza a 415 nm. Il titolo anticorpale è stato definito sufficiente per valori del rapporto OD siero immune/ OD siero pre-immune superiori a 3 per diluizioni di almeno 1 :10000. Per determinare la presenza di anticorpi diretti contro il Peptide I nel sovranatante degli ibridomi, è stata seguita la stessa procedura, ma utilizzando 50 pL del terreno di coltura degli ibridomi, invece del siero degli animali. Sono stati valutati positivi i terreni di coltura contenenti anticorpi in grado di legare soltanto il Peptide I e non il Peptide II lineare. For this purpose, solutions of Peptide I (100 μl_), conjugated to BSA and dissolved in PBS, at a concentration of 1 μg / mL, were incubated in a 96-well ELISA plate (Immunoplate, NUNC). After one night at 4 ° C, the plates were washed three times with 200 µL of a 1% PBS-Tween solution (Fluka, Milan), to remove excess reagents. The wells were saturated with BSA, incubating with 200 µL of a solution of BSA (Sigma-Aldrich, Milan) at 3% (weight / volume) in PBS, for two hours at room temperature. The plates were washed three times with 200 µL of 1% PBS-Tween. Solutions, in scalar dilutions, of the immune serum and the pre-immune serum of each mouse were dispensed into the wells. The dilutions (1: 100; 1: 1000; 1: 5000; 1: 10000; 1: 100000) were prepared by diluting the serum in PBS. The plates were incubated for 1 hour in a humid chamber at room temperature. At the end of the incubation the plates were washed three times with 200 µL of 1% PBS-Tween, and a solution containing a secondary antibody conjugated with peroxidase that specifically recognizes mouse immunoglobulin G was added (Biorad, Milan) at a dilution of 1: 1000. After incubating the antibody for one hour at room temperature in a humid chamber, the plates were washed three times with 200 µL of 1% PBS-Tween. The detection was performed by adding 100 µL of an ABTS peroxidase substrate solution (2,2'-azino-bis acid (3-ethylbenzothiazolin-6-sulfonic, Sigma-Aldrich, Milan) and reading the absorbance at 415 nm. The antibody titer was defined sufficient for values of the immune serum OD / pre-immune serum OD ratio greater than 3 for dilutions of at least 1: 10000. To determine the presence of antibodies directed against Peptide I in the supernatant of the hybridomas, it was followed the same procedure, but using 50 µL of hybridoma culture medium instead of animal serum Culture media containing antibodies capable of binding only Peptide I and not linear Peptide II were evaluated positive.

FUSIONE CELLULE DI MIELOMA-SPLENOCITI. FUSION OF MYELOMA CELLS-SPLENOCYTES.

I due topi che hanno mostrato il migliore titolo anticorpale sono stati sacrificati mediante dislocazione cervicale. E’ stata prelevata la milza che è stata disposta in un tubo Falcon da 50 mL contenente 10 mL di terreno RPMI-GM (la cui composizione è riportata nella sezione sottostante), preriscaldato a 37°C. La milza è stata trasferita in una piastra da 100 mm contenente 10 mL di terreno ed è stata disgregata utilizzando un setaccio cellulare (BD-Falcon, Milano). La soluzione contenente gli splenociti è stata centrifugata a 800 rpm per 5 minuti a temperatura ambiente. Al termine della centrifugazione il sovranatante è stato allontanato e le cellule sono state risospese in 5 mL di terreno RPMI-GM e contate. Per effettuare il conteggio sono state preparate le seguenti diluizioni: The two mice that showed the best antibody titer were sacrificed by cervical dislocation. The spleen was taken and placed in a 50 mL Falcon tube containing 10 mL of RPMI-GM medium (the composition of which is shown in the section below), preheated to 37 ° C. The spleen was transferred to a 100 mm plate containing 10 mL of medium and was disrupted using a cell sieve (BD-Falcon, Milan). The solution containing the splenocytes was centrifuged at 800 rpm for 5 minutes at room temperature. At the end of the centrifugation the supernatant was removed and the cells were resuspended in 5 mL of RPMI-GM medium and counted. To carry out the count, the following dilutions were prepared:

0.1 mL di splenociti 0.9 mL di PBS (diluizione 1:10); 0.1 mL of splenocytes 0.9 mL of PBS (dilution 1:10);

0.1 mL di splenociti diluiti 1:10 0.9 mL di PBS (diluizione 1:100). 0.1 mL of splenocytes diluted 1:10 0.9 mL of PBS (dilution 1: 100).

Per il conteggio delle cellule sono stati prelevati 10 μL delle diverse diluizioni di splenociti e sono stati aggiunti 10 pL del colorante Tripan blue allo 0.4% (Sigma-Aldrich, Milano) per escludere dal conteggio le cellule morte. For the counting of the cells, 10 μL of the different dilutions of splenocytes were taken and 10 μL of the 0.4% Tripan blue dye (Sigma-Aldrich, Milan) was added to exclude dead cells from the count.

Per effettuare la fusione tra gli splenociti e le cellule di mieloma SP2/0 (ATCC), è stato utilizzato un numero di cellule di mieloma pari a 1/5 degli splenociti, risospese in 10 mL di RPMI-GM. Le cellule di mieloma sono state aggiunte agli splenociti, poi sono stati aggiunti 15 mL di RPMI-GM (volume finale 30 mL). Le cellule sono state centrifugate a 600 rpm per 5 minuti, a temperatura ambiente. Il sovranatante è stato eliminato ed il pellet di cellule è stato risospeso in 1 mL di RPMI-GM contenente PEG 1300-1600 (Hybri-Max, Sigma-Aldrich, Milano) e 75 pL di DMSO (Sigma-Aldrich, Milano). Il pellet di cellule è stato disgregato delicatamente con la punta di una pipetta e sono stati quindi aggiunti lentamente 9 mL di RPMI-GM addizionato con 10% FBS (Foetal Bovine Serum, Sigma-Aldrich, Milano), avendo cura di mescolare continuamente la sospensione cellulare. Le cellule sono state centrifugate a 500 rpm per 7 minuti a temperatura ambiente ed il pellet è stato risospeso in 200 mL di terreno di selezione RPMI-HAT (Sigma-Aldrich, Milano). Le cellule sono state piastrate in 20 piastre da 96 pozzetti e lasciate in incubatore per almeno 10 giorni. A number of myeloma cells equal to 1/5 of the splenocytes resuspended in 10 mL of RPMI-GM was used to fuse the splenocytes and SP2 / 0 myeloma cells (ATCC). Myeloma cells were added to the splenocytes, then 15 mL of RPMI-GM (final volume 30 mL) was added. The cells were centrifuged at 600 rpm for 5 minutes, at room temperature. The supernatant was removed and the cell pellet was resuspended in 1 mL of RPMI-GM containing PEG 1300-1600 (Hybri-Max, Sigma-Aldrich, Milan) and 75 µL of DMSO (Sigma-Aldrich, Milan). The cell pellet was gently disrupted with the tip of a pipette and 9 mL of RPMI-GM added with 10% FBS (Foetal Bovine Serum, Sigma-Aldrich, Milan) was then slowly added, taking care to continuously mix the suspension. cell phone. The cells were centrifuged at 500 rpm for 7 minutes at room temperature and the pellet was resuspended in 200 mL of RPMI-HAT selection medium (Sigma-Aldrich, Milan). The cells were plated in 20 96-well plates and left in the incubator for at least 10 days.

Dopo circa due settimane il terreno di coltura delle cellule è stato testato per la presenza di anticorpi diretti contro il Peptide I, mediante saggi ELISA, utilizzando come controllo il Peptide II lineare. In seguito a questo screening sono stati isolati 30 cloni che davano un rapporto nel segnale tra Peptide l/Peptide II lineare di almeno 5. A titolo esemplificativo sono riportati in Tabella V i valori ottenuti per alcuni cloni. After approximately two weeks the cell culture medium was tested for the presence of antibodies directed against Peptide I, by means of ELISA assays, using linear Peptide II as a control. Following this screening, 30 clones were isolated which gave a signal ratio between Peptide 1 / Peptide II linear of at least 5. By way of example, the values obtained for some clones are reported in Table V.

Tabella V Table V

I 30 cloni selezionati sono stati isolati e sub clonati. In seguito a questo passaggio, 8 cloni hanno perso produttività e i restanti 22, sono stati sottoposti ad un procedimento di stabilizzazione. The 30 selected clones were isolated and sub-cloned. Following this step, 8 clones lost productivity and the remaining 22 were subjected to a stabilization process.

TERRENI DI COLTURA UTILIZZATI PER LA PREPARAZIONE DEGLI ANTICORPI MONOCLONALI CULTURE MEDIA USED FOR THE PREPARATION OF MONOCLONAL ANTIBODIES

Terreno per il mantenimento delle cellule di mieloma: Medium for the maintenance of myeloma cells:

RPMI 1640 (Sigma-Aldrich, Milano). RPMI 1640 (Sigma-Aldrich, Milan).

Foetal Bovine Serum (FBS) 10% (Sigma-Aldrich, Milano). Foetal Bovine Serum (FBS) 10% (Sigma-Aldrich, Milan).

Penicillina-streptomicina-glutammina (PSG) 1% (Sigma-Aldrich, Milano). Penicillin-streptomycin-glutamine (PSG) 1% (Sigma-Aldrich, Milan).

RPMI-GM RPMI-GM

RPMI 1640 (Sigma-Aldrich, Milano) RPMI 1640 (Sigma-Aldrich, Milan)

Aminoacidi non essenziali (NEAA) 1% (Sigma-Aldrich, Milano) Non-essential amino acids (NEAA) 1% (Sigma-Aldrich, Milan)

Terreno per la fusione mieloma/splenociti Medium for myeloma / splenocyte fusion

RPMI 1640 (Sigma-Aldrich, Milano) RPMI 1640 (Sigma-Aldrich, Milan)

FBS 15% FBS 15%

Ipoxantina-amminoipterina-timina (HAT) 2% Hypoxanthine-aminoipterine-thymine (HAT) 2%

PSG 1 % PSG 1%

Hybridoma enhnacing supplement (HES) 10% Hybridoma enhnacing supplement (HES) 10%

Terreno per la selezione dei cloni RPMI-HAT Medium for the selection of RPMI-HAT clones

RPMI 1640 (Sigma-Aldrich, Milano) RPMI 1640 (Sigma-Aldrich, Milan)

FBS 15% FBS 15%

HAT 2% HAT 2%

PSG 1 % PSG 1%

STABILIZZAZIONE DEI CLONI STABILIZATION OF CLONES

Per stabilizzare i cloni sono stati effettuati tre cicli sequenziali di clonaggio per diluizione limite. I cloni sono stati diluiti a 3 cellule per mL e 20 mL di questa diluizione sono stati piastrati in due piastre da 96 pozzetti (100 pL/pozzetto = 0.3 cellule/pozzetto). Le cellule sono state lasciate in incubatore per due settimane e poi nuovamente analizzate mediante saggi ELISA per la loro capacità di produrre anticorpi anti-Peptide I. I sovranatanti con elevato titolo anticorpale sono stati isolati e nuovamente clonati per diluizione limite. To stabilize the clones, three sequential cycles of limiting dilution cloning were performed. The clones were diluted to 3 cells per mL and 20 mL of this dilution was plated in two 96-well plates (100 µL / well = 0.3 cells / well). The cells were left in the incubator for two weeks and then re-analyzed by ELISA assays for their ability to produce anti-Peptide I antibodies. The supernatants with high antibody titer were isolated and re-cloned by limit dilution.

Questa procedura è stata ripetuta per tre volte, saggiando sempre mediante ELISA la produttività dei singoli cloni. In seguito a questa procedura sono stati selezionati ed espansi 7 cloni che sono stati denominati: This procedure was repeated three times, always testing the productivity of the single clones by means of ELISA. Following this procedure, 7 clones were selected and expanded and named:

E2-I, E2-II, E2-III, E2-IV, E2-V, E2-VI, E2-VII oppure semplicemente anticorpi o Mab l-VII. E2-I, E2-II, E2-III, E2-IV, E2-V, E2-VI, E2-VII or simply antibodies or Mab l-VII.

SCREENING E SELEZIONE DI CLONI SCREENING AND SELECTION OF CLONES

I cloni producenti anticorpi in grado di riconoscere solo l’antigene ciclico, Peptide I, sono stati preselezionati, identificati mediante saggi ELISA in cui sono stati saggiati sia il Peptide I che il Peptide II lineare. I dati ottenuti sono riportati nelle successive Figura 1A-C, in cui sono stati saggiati i monoclonali con una serie di controlli. Nella Figura 1A, sono riportati dati ELISA di legame dose-risposta al Peptide I non coniugato, immobilizzato sulla piastra alla concentrazione di 0.5 pg/mL e concentrazioni crescenti di anticorpi monoclonali II, III, IV e V non purificati, nell’intervallo di concentrazioni tra 0 e 7 nM. Come controllo sono stati immobilizzati anche il Peptide II lineare non coniugato ed un coniugato di BSA. The antibody-producing clones capable of recognizing only the cyclic antigen, Peptide I, were preselected, identified by ELISA assays in which both Peptide I and linear Peptide II were tested. The data obtained are reported in the following Figures 1A-C, in which the monoclonals were tested with a series of controls. In Figure 1A, ELISA data of dose-response binding to unconjugated Peptide I immobilized on the plate at a concentration of 0.5 pg / mL and increasing concentrations of unpurified monoclonal antibodies II, III, IV and V, over the concentration range between 0 and 7 nM. Unconjugated linear Peptide II and a BSA conjugate were also immobilized as a control.

Quest’ultimo reagente serve ad escludere un riconoscimento eventuale dei monoclonali con la glutaraldeide. Come si può osservare nella Figura 1 A, i 4 anticorpi legano con andamento dose-risposta il Peptide I, con saturazione raggiunta già alla concentrazione di circa 1.3 nM, mentre non si osserva legame con la variante lineare, né tantomeno alla BSA coniugata. The latter reagent serves to exclude any possible recognition of monoclonals with glutaraldehyde. As can be seen in Figure 1 A, the 4 antibodies bind Peptide I with a dose-response trend, with saturation already reached at a concentration of about 1.3 nM, while no binding is observed with the linear variant, nor with the conjugated BSA.

In Figura 1B, è riportato invece un saggio ELISA dose-risposta con il Peptide I immobilizzato alla concentrazione di 0.5 pg/mL e concentrazioni crescenti di tutti e 7 gli anticorpi l-VII, non purificati a concentrazioni tra 0 e circa 3.3 nM. Anche in questo caso si osserva un andamento dose-risposta del segnale, con saturazione raggiunta alla concentrazione di circa 1.7 nM. Anche in questo saggio è riportato il controllo con il Peptide II lineare, con il quale non si osserva legame. Infine nella Figura 1C è riportato il risultato ottenuto da un saggio ELISA dose-risposta eseguito ancora con 0.5 pg/mL di peptide immobilizzato e concentrazioni crescenti di Mab l-VII purificati (0 - 3.5 nML In Figure 1B, on the other hand, a dose-response ELISA assay is shown with immobilized Peptide I at a concentration of 0.5 pg / mL and increasing concentrations of all 7 antibodies I-VII, not purified at concentrations between 0 and about 3.3 nM. Also in this case a dose-response trend of the signal is observed, with saturation reached at a concentration of about 1.7 nM. Also in this assay the control with linear Peptide II is reported, with which no binding is observed. Finally, Figure 1C shows the result obtained from a dose-response ELISA assay again performed with 0.5 pg / mL of immobilized peptide and increasing concentrations of purified Mab l-VII (0 - 3.5 nML

Come mostrato, si osserva ancora un andamento dose-risposta con saturazione raggiunta alla concentrazione ancora di circa 1.7 nM. Dall’analisi di queste curve sono state estrapolate dei valori di KD, determinati come la concentrazione di anticorpo che produce un segnale pari alla metà del segnale di saturazione. As shown, a dose-response trend is still observed with saturation reached at the concentration still about 1.7 nM. From the analysis of these curves, KD values were extrapolated, determined as the antibody concentration that produces a signal equal to half of the saturation signal.

I valori sono riportati nella successiva Tabella VI. The values are shown in the following Table VI.

CARATTERIZZAZIONE SPR DEI CLONI PRESCELTI E ANALISI COMPARATIVA DEGLI ANTIGENI MUTATI SPR CHARACTERIZATION OF SELECTED CLONES AND COMPARATIVE ANALYSIS OF MUTED ANTIGENS

La caratterizzazione SPR (Surface Plasmon Resonance) è stata condotta utilizzando uno strumento Biacore 3000 (GE Healthcare, Milano) e biochip di tipo CM5 della stessa ditta. The SPR (Surface Plasmon Resonance) characterization was carried out using a Biacore 3000 instrument (GE Healthcare, Milan) and CM5 type biochip from the same company.

I 7 anticopri selezionati sono stati immobilizzati covalentemente sulla superficie del biochip utilizzando una chimica EDC/NHS [Ethyl-3-(3-dimethylaminopropyl) carbodiimide/ (N-Hydroxy-succinimide, GE Healthcare, Milano], seguendo le istruzione del produttore [GE Healthcare, Milano], L’immobilizzazione è stata eseguita con soluzioni anticorpo alla concentrazione di 5.0 pg/mL, ottenendo per tutti un livello di immobilizzazione compreso tra 6500 e 8000 RU (Resonance Units). Come controllo negativo è stata immobilizzata su un canale di riferimento una IgG scorrelata (Ig policlonale umana purificata) alla stessa concentrazione e quindi con lo stesso livello di immobilizzazione. I saggi di legame sono stati condotti ad un flusso di 30 pL/min per 2 minuti in HBS, iniettando soluzioni di Peptide I a concentrazioni crescenti tra 6,25 nM e 5 pM, valore oltre cui le curve vanno a saturazione). La rigenerazione è stata eseguita con NaOH 50 mM, iniettata per 10 sec. The 7 selected antibodies were covalently immobilized on the surface of the biochip using an EDC / NHS chemistry [Ethyl-3- (3-dimethylaminopropyl) carbodiimide / (N-Hydroxy-succinimide, GE Healthcare, Milan], following the manufacturer's instructions [GE Healthcare, Milan], Immobilization was performed with antibody solutions at a concentration of 5.0 pg / mL, obtaining for all an immobilization level between 6500 and 8000 RU (Resonance Units). As a negative control it was immobilized on a channel of reference an uncorrelated IgG (purified human polyclonal Ig) at the same concentration and therefore with the same level of immobilization. The binding assays were carried out at a flow of 30 pL / min for 2 minutes in HBS, by injecting Peptide I solutions at concentrations increasing between 6.25 nM and 5 pM, value beyond which the curves reach saturation). Regeneration was performed with 50 mM NaOH, injected for 10 sec.

Le KDsono state calcolate impiegando il software BiaEvaluation, vers. 4.1 (GE Healthcare, Milano), implementato nel software dello strumento. Il calcolo è stato eseguito determinando per ogni singolo esperimento le Kone le koffe ottenendo le KDdal rapporto Koff/kon.I valori sono stati poi mediati per tutte le concentrazioni. Nelle Figure 2A-G sono riportati i sensorgrammi ottenuti dopo elaborazione e sottrazione delle curve di riferimento. Negli Insets, sono riportati anche i grafici di RUmax vs concentrazione che attestazione che il legame è dose-risposta e saturabile. The KDs were calculated using the BiaEvaluation software, vers. 4.1 (GE Healthcare, Milan), implemented in the instrument software. The calculation was performed by determining the Kone and koffe for each single experiment, obtaining the KD from the Koff / kon ratio. The values were then averaged for all concentrations. Figures 2A-G show the sensorgrams obtained after processing and subtracting the reference curves. In the Insets, the graphs of RUmax vs concentration are also shown, attesting that the link is dose-response and saturable.

Nella Tabella VII, sono invece riportate le KDdeterminate mediante l’analisi SPR paragonate alle KDrelative agli stessi anticorpi determinati con il metodo ELISA. Si osserva una certa discrepanza tra i valori ottenuti con i due metodi. Si ritiene tuttavia siano molto più accurati valori determinati mediante tecnica SPR. Table VII, on the other hand, shows the KDs determined by the SPR analysis compared to the KDs relating to the same antibodies determined by the ELISA method. A certain discrepancy is observed between the values obtained with the two methods. However, it is believed that values determined by the SPR technique are much more accurate.

Tabella VII Table VII

Per verificare la specificità dei monoclonali per la variante ciclica, sono stati eseguiti esperimenti SPR di legame con il Peptide II lineare alla concentrazione di 1.0 μΜ sugli anticorpi monoclonali Mab l-VII. Le curve ottenute sono riportate nella Figure 3 e, come evidente, non è osservabile alcun riconoscimento tra il Peptide II lineare ed i monoclonali. To verify the specificity of the monoclonals for the cyclic variant, SPR binding experiments with linear Peptide II at a concentration of 1.0 μΜ were performed on the monoclonal antibodies Mab l-VII. The curves obtained are shown in Figure 3 and, as evident, no recognition between the linear Peptide II and the monoclonals can be observed.

Per valutare ulteriormente la specificità del riconoscimento degli anticorpi con il Peptide I, sono stati condotti esperimenti di legame tra gli anticorpi monoclonali II e VI ed i Peptidi lll-VI riportati nella Tabella III. Gli esperimenti sono stati condotti nelle stesse condizioni impiegate per l’analisi del Peptide I e del Peptide II lineare (flusso 30 uL/min, temperatura 25°C). I peptidi sono stati valutati a concentrazioni variabili nei vari esperimenti (riportate nelle figure e nelle relative legende), ma comprese tra 125 nM e 5000 nM. To further evaluate the specificity of antibody recognition with Peptide I, binding experiments were performed between monoclonal antibodies II and VI and the Peptides III-VI reported in Table III. The experiments were conducted under the same conditions used for the analysis of Peptide I and linear Peptide II (flow 30 uL / min, temperature 25 ° C). The peptides were evaluated at variable concentrations in the various experiments (shown in the figures and related legends), but between 125 nM and 5000 nM.

Sensorgrammi esemplificativi riferiti al legame dei Peptidi III, IV e V con i Mab II e Mab VI, sono riportati nelle Figure 4A-G, mentre nelle Tabelle Villa e Vlllb sono riportati i valori di KD determinati per tutti i peptidi. Example sensorgrams referring to the binding of Peptides III, IV and V with Mab II and Mab VI, are reported in Figures 4A-G, while in Tables Villa and Vlllb the KD values determined for all peptides are reported.

Tabella Villa Villa table

Tabella Vlllb Table Vlllb

I dati di legame ottenuti suggeriscono che: The binding data obtained suggest that:

- l’anticorpo monoclonale II e non lega l’antigene ciclico in prossimità degli aminoacidi NTN, ma riconosce residui in prossimità del ponte disolfurico, in particolare i residui QLI e GSWHI (SEQ ID NO. 81). - the monoclonal antibody II and does not bind the cyclic antigen in the vicinity of the NTN amino acids, but recognizes residues in the vicinity of the disulfide bridge, in particular the QLI and GSWHI residues (SEQ ID NO. 81).

- l’anticorpo VII, riconosce con elevata specificità gli aminoacidi WHI ed in parte anche GS. - antibody VII, recognizes the WHI amino acids and in part also GS with high specificity.

L’analisi dei mutanti permette di escludere che vi sia un riconoscimento non specifico delle porzioni di molecola prossime al ponte disolfurico oppure alle due lisine N-terminali. The analysis of the mutants makes it possible to exclude that there is a non-specific recognition of the portions of the molecule close to the disulfide bridge or to the two N-terminal lysines.

ESEMPIO 3: EXAMPLE 3:

VALUTAZIONE DEL RICONOSCIMENTO DELLA PROTEINA E2 DI HCV E ATTIVITÀ NEUTRALIZZANTE TEST DI NEUTRALIZZAZIONE EVALUATION OF RECOGNITION OF HCV PROTEIN E2 AND NEUTRALIZING ACTIVITY NEUTRALIZATION TEST

Linee cellulari e propagazione Cell lines and propagation

La linea cellulare 293T, cellule epiteliali renali embrionali umane trasformate con l’antigene T del Simian Virus 40 (SV40), è stata mantenuta in terreno DMEM Hi-Glucose (Dulbecco’s Modified Eagle’s Medium Hi Glucose, Sigma-Aldrich, Milano) addizionato con FBS (Gibco, Invitrogen, Carlsbad, CA) al 10% inattivato a 56°C per 30 minuti, L-glutammina 2 mM (Sigma-Aldrich), penicillina 1000U/mL (Sigma-Aldrich), streptomicina (Sigma-Aldrich) 100 pg/mL, 1% aminoacidi non essenziali (Sigma-Aldrich). Cell line 293T, human embryonic kidney epithelial cells transformed with Simian Virus 40 (SV40) T antigen, was maintained in DMEM Hi-Glucose medium (Dulbecco's Modified Eagle's Medium Hi Glucose, Sigma-Aldrich, Milan) added with FBS (Gibco, Invitrogen, Carlsbad, CA) 10% inactivated at 56 ° C for 30 minutes, L-glutamine 2 mM (Sigma-Aldrich), penicillin 1000U / mL (Sigma-Aldrich), streptomycin (Sigma-Aldrich) 100 pg / mL, 1% non-essential amino acids (Sigma-Aldrich).

La linea cellulare HuH-7, cellule di epato-carcinoma umano suscettibili all’ingresso delle pseudoparticelle HCV, sono state mantenute in coltura in terreno DMEM (Dulbecco’s Modified Eagle’s Medium, Sigma-Aldrich) addizionato di FBS (EuroClone Ltd., Torquay, UK) al 10%, inattivato a 56°C per 30 minuti, L-glutammina 2mM (Sigma-Aldrich), penicillina 1000U/mL (Sigma-Aldrich), streptomicina (Sigma-Aldrich) 100 pg/mL, 1% aminoacidi non essenziali (Sigma-Aldrich). The HuH-7 cell line, human hepato-carcinoma cells susceptible to entry of HCV pseudoparticles, were cultured in DMEM medium (Dulbecco's Modified Eagle's Medium, Sigma-Aldrich) supplemented with FBS (EuroClone Ltd., Torquay, UK ) at 10%, inactivated at 56 ° C for 30 minutes, 2mM L-glutamine (Sigma-Aldrich), penicillin 1000U / mL (Sigma-Aldrich), streptomycin (Sigma-Aldrich) 100 pg / mL, 1% non-essential amino acids (Sigma-Aldrich).

Le cellule sono state mantenute in coltura in fiasche T75 (BD Falcon, Bedford, MA, USA) in un incubatone per colture cellulari (Sanyo Incubatoi", Japan) a 37°C e 5% C02.Cells were cultured in T75 flasks (BD Falcon, Bedford, MA, USA) in a cell culture incubator (Sanyo Incubatoi ", Japan) at 37 ° C and 5% C02.

Quando giunte a confluenza, le cellule sono state lavate con 4 mL di PBS e trattate con Tripsina/EDTA (Lonza, Walkersville, MD, USA) per 5 minuti a 37°C. La tripsina è stata quindi inattivata con 5 mL di terreno completo e le cellule sono state centrifugate per 5 minuti a 400g. Una volta scartato il sovranatante, le cellule sono state risospese in 10 mL di terreno completo e contate in una camerina Burker. Si è quindi proceduto alla semina in T75 di 3x10<6>cellule 293T o 1,5x10<6>HuH-7. When confluent, the cells were washed with 4 mL of PBS and treated with Trypsin / EDTA (Lonza, Walkersville, MD, USA) for 5 minutes at 37 ° C. The trypsin was then inactivated with 5 mL of complete medium and the cells were centrifuged for 5 minutes at 400g. Once the supernatant was discarded, the cells were resuspended in 10 mL of complete medium and counted in a Burker chamber. 3x10 <6> 293T or 1.5x10 <6> HuH-7 cells were then seeded in T75.

PLASMIDI PER PRODUZIONE PSEUDOPARTICELLE HCV E VSV-G DI CONTROLLO PLASMIDES FOR HCV AND VSV-G CONTROL PSEUDOPARTICLE PRODUCTION

Per produrre particelle con vettore derivato da virus deirimmunodeficienza felina (FIV), pseudotipizzate con E1-E2 ed esprimenti GFP come gene reporter, sono stati utilizzati dei costrutti FlV-derivati prodotti presso la struttura del Centro Retrovirus dell’Università di Pisa. I costrutti si basano su un sistema split component nel quale vengono usati tre costrutti: packaging, denominato pAenvI (derivante dal p34TF10, un clone molecolare di FIV contenente l’intero genoma dell’isolato Petaluma); vettore, indicato con la sigla LAW-GFP e veicolante GFP come gene reporter;, e tre costrutti envelope utilizzati in modo alternativo. Il primo, pE1E2gen1a, contenente le sequenze codificanti per le proteine di superficie E1 ed E2 di HCV genotipo 1 a, il secondo, pE1E2gen3a, contenente le sequenze codificanti per E1 ed E2 di genotipo 3a, ed il terzo chiamato pVSV-G codificante la proteina G del virus della stomatite vescicolare (VSV-G). I costrutti plasmidici esprimenti E1/E2 di genotipo 1a e 3a sono stati prodotti a partire da isolati clinici HCV utilizzando come sorgente plasma da sangue periferico. Il clonaggio di E1/E2 da RNA di HCV estratto da plasma è stato eseguito come descritto da Cosset e collaboratori (Bartosch et al., J. Exp. Med. 197: 633-642, 2003). Le particelle virali FlV-derivate pseudotipizzate con E1-E2 di genotipo 1a o 3a sono state denominate FIV- E1E2/1a e FIV-E1E2/3a mentre quelle pseudotipizzate con la proteina G, FIV-VSV. FlV-derived constructs produced at the Retrovirus Center of the University of Pisa were used to produce particles with vector derived from feline immunodeficiency virus (FIV), pseudotyped with E1-E2 and expressing GFP as a reporter gene. The constructs are based on a split component system in which three constructs are used: packaging, called pAenvI (deriving from p34TF10, a molecular clone of FIV containing the entire genome of the Petaluma isolate); vector, indicated with the acronym LAW-GFP and carrier GFP as reporter gene ;, and three envelope constructs used in an alternative way. The first, pE1E2gen1a, containing the sequences coding for the surface proteins E1 and E2 of HCV genotype 1 a, the second, pE1E2gen3a, containing the sequences coding for E1 and E2 of genotype 3a, and the third called pVSV-G encoding the protein G of vesicular stomatitis virus (VSV-G). Plasmid constructs expressing E1 / E2 of genotype 1a and 3a were produced starting from HCV clinical isolates using plasma from peripheral blood as a source. Cloning of E1 / E2 from plasma extracted HCV RNA was performed as described by Cosset et al. (Bartosch et al., J. Exp. Med. 197: 633-642, 2003). The FlV-derived viral particles pseudotyped with E1-E2 of genotype 1a or 3a were named FIV-E1E2 / 1a and FIV-E1E2 / 3a while those pseudotyped with the G protein, FIV-VSV.

I plasmidi sono stati trasformati in cellule batteriche MAX Efficiency Stbl Cells (Invitrogen, Milano) mediante shock termico a 42°C per 45 secondi. Le cellule trasformate sono state quindi incubate in ghiaccio per 2 minuti, addizionate con terreno SOC ed incubate per 1 ora in agitazione a 37°C. In seguito le cellule sono state pellettate a 3000 rpm per 5 minuti, risospese in 100 pi di Luria Broth (LB, triptone 10 g/l, estratto di lievito 5 g/l, NaCI 10 g/l, [Sigma-Aldrich]) e seminate con un ansa sterile in piaste Petri contenenti LB agar 1 ,5% (Sigma-Aldrich) ed ampollina 50 pg/mL (Sigma-Aldrich, Milano). Le piastre sono state incubate overnight a 37°C. Il giorno seguente è stata effettuata una reazione polimerasica a catena di screening sulle colonie. Una colonia positiva per ciascun vettore è stata cresciuta overnight in 250 mL di LB (Sigma-Aldrich) ed ampollina 50 pg/mL (Sigma-Aldrich). Il giorno seguente, di ciascun vettore è stata prelevata un’aliquota di 800 pi per ottenere uno stock addizionando glicerolo (150 pi) e conservando a -80°C. La crescita batterica è stata utilizzata per effettuare una estrazione Maxi di DNA plasmidico (Pure Yield Plasmid Maxiprep System, Promega Corporation, Madison, Wl, USA). Il DNA estratto è stato in seguito quantificato mediante lettura spettrofotometrica alla lunghezza d’onda di 260 nm ed un’aliquota è stata corsa su gel di agarosio all’1 % per verificarne l’integrità. The plasmids were transformed into MAX Efficiency Stbl Cells (Invitrogen, Milan) bacterial cells by thermal shock at 42 ° C for 45 seconds. The transformed cells were then incubated on ice for 2 minutes, added with SOC medium and incubated for 1 hour under shaking at 37 ° C. The cells were then pelleted at 3000 rpm for 5 minutes, resuspended in 100 µl of Luria Broth (LB, tryptone 10 g / l, yeast extract 5 g / l, NaCI 10 g / l, [Sigma-Aldrich]) and seeded with a sterile loop in Petri dishes containing 1.5% LB agar (Sigma-Aldrich) and 50 pg / mL ampulla (Sigma-Aldrich, Milan). The plates were incubated overnight at 37 ° C. A polymase chain reaction was performed on the colonies the following day. A positive colony for each vector was grown overnight in 250 mL of LB (Sigma-Aldrich) and 50 pg / mL ampulla (Sigma-Aldrich). The following day, an aliquot of 800 µl was taken from each vector to obtain a stock by adding glycerol (150 µl) and stored at -80 ° C. Bacterial growth was used to perform a Maxi plasmid DNA extraction (Pure Yield Plasmid Maxiprep System, Promega Corporation, Madison, Wl, USA). The extracted DNA was subsequently quantified by spectrophotometric reading at a wavelength of 260 nm and an aliquot was run on 1% agarose gel to verify its integrity.

PRODUZIONE ED ANALISI FUNZIONALE DELLE PSEUDOPARTICELLE HCV E VSV-G DI CONTROLLO. PRODUCTION AND FUNCTIONAL ANALYSIS OF HCV AND VSV-G CONTROL PSEUDOPARTICLES.

Le pseudoparticelle sono state prodotte in cellule HEK293T. Ventiquattro ore prima della trasfezione, 3x1 0<6>cellule sono state seminate in piastre Petri da 10 cm (BD Biosciences, Milano). Il giorno seguente le cellule sono state trasfettate con 20 pg di costrutto vettore LAW-GFP, 10 pg di costrutto di packaging pAenvl e 5 pg di costrutto envelope (pE1 E2gen1a, pE1 E2gen3a o VSV-G). Per la trasfezione, è stato utilizzando il polimero polietilenimmina 10 μΜ (PEI, Sigma-Aldrich); brevemente, il DNA è stato mescolato con una soluzione di NaCI 150 mM fino ad un volume di 700 pi; allo stesso modo 100 pL di PEI sono stati portati a 700 pL con NaCI 150 mM. Le due soluzioni sono state mescolate ed incubate a temperatura ambiente per 15 minuti in seguito ai quali la nuova soluzione è stata delicatamente aliquotata sulle cellule. Prima di procedere alla trasfezione, il terreno presente sulle cellule è stato sostituito con 5 mL di DMEM Hi-Glucose contenente L-glutammina 2 mM, mentre 6 ore dopo la trasfezione il terreno è stato sostituito con 10 ml_ di DMEM Hi-GIu completo. The pseudoparticles were produced in HEK293T cells. Twenty-four hours prior to transfection, 3x1 0 <6> cells were seeded in 10 cm Petri dishes (BD Biosciences, Milan). The following day the cells were transfected with 20µg of LAW-GFP vector construct, 10µg of pAenvl packaging construct and 5µg of envelope construct (pE1 E2gen1a, pE1 E2gen3a or VSV-G). For transfection, 10 μΜ polyethyleneimine polymer (PEI, Sigma-Aldrich) was used; briefly, the DNA was mixed with a 150 mM NaCl solution up to a volume of 700 µl; in the same way 100 µL of PEI was brought to 700 µL with 150 mM NaCl. The two solutions were mixed and incubated at room temperature for 15 minutes after which the new solution was gently aliquoted on the cells. Before proceeding to transfection, the medium present on the cells was replaced with 5 mL of DMEM Hi-Glucose containing 2 mM L-glutamine, while 6 hours after transfection the medium was replaced with 10 ml_ of complete Hi-GIu DMEM.

Il sovranatante contenente le particelle vettore è stato collezionato a 48 ore dalla trasfezione, chiarificato a 1800 RPM per 10 minuti a temperatura ambiente e quindi conservato in aliquote a -80°C fino al suo utilizzo. The supernatant containing the carrier particles was collected 48 hours after transfection, clarified at 1800 RPM for 10 minutes at room temperature and then stored in aliquots at -80 ° C until its use.

Per verificare l'efficacia di trasduzione delle pseudoparticelle prodotte, sono state seminate 2x10<4>HuH-7 nelle multiwell da 48 pozzetti. Il giorno seguente, ogni pozzetto di cellule è stato trasdotto con 200 pi di vettore, in modo da testare le tre diverse preparazioni di pseudoparticelle. A sei ore dalla trasduzione, il terreno contenente le pseudoparticelle è stato sostituito con 200 μΙ_ di DMEM completo. A 48 ore dalla trasduzione, i pozzetti sono stati lavati con 200 μΙ_ di PBS, trattati con 100 μΙ_ di tripsina/EDTA (Lonza, Walkersville, MD, USA) ed incubati per 5 minuti a 37°C. Le cellule sono state quindi addizionate con 150 μΙ di DMEM completo e ciascun pozzetto è stato collezionato in un provetta da FACS (Sarsted, Verona). La lettura dei campioni per la valutazione della fluorescenza è stata effettuata con un citofluorimetro modello FACScan (BD Biosciences) e l’analisi dei campioni con il software CelIQuest (BD Biosciences). L’efficienza del test è stata valutata come percentuale di cellule GFP-positive, rispetto ad un controllo negativo di cellule non trasdotte. To verify the transduction efficacy of the produced pseudoparticles, 2x10 <4> HuH-7 were sown in 48-well multiwells. The following day, each well of cells was transduced with 200 µl of vector in order to test the three different pseudoparticle preparations. Six hours after transduction, the medium containing the pseudoparticles was replaced with 200 μΙ_ of complete DMEM. 48 hours after transduction, the wells were washed with 200 μΙ_ of PBS, treated with 100 μΙ_ of trypsin / EDTA (Lonza, Walkersville, MD, USA) and incubated for 5 minutes at 37 ° C. The cells were then spiked with 150 μΙ of complete DMEM and each well was collected in a tube from FACS (Sarsted, Verona). The reading of the samples for the evaluation of the fluorescence was carried out with a FACScan model flow cytometer (BD Biosciences) and the analysis of the samples with the CelIQuest software (BD Biosciences). The efficiency of the test was evaluated as a percentage of GFP-positive cells, compared to a negative control of non-transduced cells.

ANTICORPI ANTI-PROTEINA E2 DI HCV HCV ANTI-PROTEIN E2 ANTIBODIES

Gli anticorpi sono stati conservati a -20°C. All’occorrenza essi sono stati scongelati e sono state preparate due aliquote per ciascun anticorpo, utilizzando PBS come diluente, corrispondenti alle diluizioni 10 pg/mL e 100 pg/mL. Le aliquote sono state congelate a -20°C fino al loro utilizzo. The antibodies were stored at -20 ° C. If necessary, they were thawed and two aliquots were prepared for each antibody, using PBS as diluent, corresponding to 10 pg / mL and 100 pg / mL dilutions. Aliquots were frozen at -20 ° C until used.

Analisi in western blot per riconoscimento della proteina anti-E2 di HCV genotipo 1a e 3 Western blot analysis for recognition of HCV genotype 1a and 3 anti-E2 protein

Per valutare l’effettivo legame degli anticorpi anti-HCV alla proteina E2 è stato effettuato un western blot su cellule trasfettate e sui vettori pseudotipizzati generati dalle stesse. Cellule HEK293T trasfettate, come descritto sopra, con costrutti LAW-GFP, packaging pAenvl ed envelope (pE1E2gen1a, pE1E2gen3a o VSV-G), sono state lisate a 2 giorni dalla trasfezione ed il surnatante contenente le particelle vettore raccolto per l’analisi in western blot. La lisi delle cellule è avvenuta per incubazione a freddo per 1 ora in lieve agitazione nel seguente buffer di lisi: 50 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCI, 1 %Triton, 1 mM EDTA, 0.1% protease inhibitor, 5 mg/mL MG123 proteasome inhibitor [Merck, Milan, Italy]). Dopo chiarificazione dei detriti cellulari per centrifugazione a 6000g per 15 minuti a 4°C, il lisato cellulare è stato congelato in aliquote a -20°C fino all’uso. Il surnatante (10 ml_) è stato ultracentrifugato a 70000 g a 4°C per 2 ore (ultracentrifuga Beckman L-70) e risospeso in 50 pl_ di buffer di lisi (10 mM Tris, 2 mM EDTA, 0.15 mM NaCI, 0.5% Nonidet P-40). Il lisato cellulare alle concentrazioni di 60 e 600 pg di proteine totali ed il virus risospeso nel buffer di lisi sono stati addizionati con 20 pl_ del colorante SDS sample buffer 2X (0.5 M Tris HCI pH 6.8, 10% glicerolo, 10% SDS, 0.05% β-mercaptoetanolo, 0.05% blu di bromo fenolo). I campioni così preparati sono stati bolliti 7 minuti e la metà è stata caricata su gel di acrilamide/bis-acrilamide al 10% costituito da uno stacking gel (30% Acrilamide/Bis Solution 29:1 [Bio-Rad Italy, Milano]; 0.5 mM Tris HCI pH 6.8, 10% SDS, 10% APS, 10% TEMED) ed un resolving gel (30% Acrilamide/Bis Solution 29:1, 1.5 mM Tris HCI pH 8.8, 10% SDS, 10% APS, 10% TEMED ). La corsa è stata effettuata in tampone di corsa 1X (25 mM Tris, 0.1% SDS, 1.44% glieina, pH 9.0) ad una differenza di potenziale di 80-100 volt per 1-2 ore. To assess the effective binding of the anti-HCV antibodies to the E2 protein, a western blot was carried out on transfected cells and on the pseudotyped vectors generated by them. HEK293T cells transfected, as described above, with LAW-GFP constructs, pAenvl packaging and envelope (pE1E2gen1a, pE1E2gen3a or VSV-G), were lysed 2 days after transfection and the supernatant containing the vector particles collected for western analysis blot. Cell lysis took place by cold incubation for 1 hour under gentle agitation in the following lysis buffer: 50 mM Tris pH 7.5, 150 mM NaCI, 1% Triton, 1 mM EDTA, 0.1% protease inhibitor, 5 mg / mL MG123 proteasome inhibitor [Merck, Milan, Italy]). After clarification of the cell debris by centrifugation at 6000g for 15 minutes at 4 ° C, the cell lysate was frozen in aliquots at -20 ° C until use. The supernatant (10 ml_) was ultracentrifuged at 70,000 g at 4 ° C for 2 hours (Beckman L-70 ultracentrifuge) and resuspended in 50 μl of lysis buffer (10 mM Tris, 2 mM EDTA, 0.15 mM NaCI, 0.5% Nonidet P-40). The cell lysate at concentrations of 60 and 600 µg of total proteins and the virus resuspended in the lysis buffer were added with 20 µl of the dye SDS sample buffer 2X (0.5 M Tris HCI pH 6.8, 10% glycerol, 10% SDS, 0.05 % β-mercaptoethanol, 0.05% bromine phenol blue). The samples thus prepared were boiled for 7 minutes and half were loaded on a 10% acrylamide / bis-acrylamide gel consisting of a stacking gel (30% Acrilamide / Bis Solution 29: 1 [Bio-Rad Italy, Milan]; 0.5 mM Tris HCI pH 6.8, 10% SDS, 10% APS, 10% TEMED) and a resolving gel (30% Acrylamide / Bis Solution 29: 1, 1.5 mM Tris HCI pH 8.8, 10% SDS, 10% APS, 10 % TEMED). The run was performed in 1X running buffer (25 mM Tris, 0.1% SDS, 1.44% gliin, pH 9.0) at a potential difference of 80-100 volts for 1-2 hours.

Il trasferimento delle proteine cellulari e virali sulle membrane di nitrocellulosa (GE Healthcare) è stato effettuato in presenza del buffer di trasferimento (0.3% Tris, 1.44% glieina, 20% metanolo) ad una differenza di potenziale di 100 volt per 90 minuti. The transfer of cellular and viral proteins onto nitrocellulose membranes (GE Healthcare) was carried out in the presence of the transfer buffer (0.3% Tris, 1.44% gliin, 20% methanol) at a potential difference of 100 volts for 90 minutes.

In seguito è stato effettuato il blocking incubando le membrane con 1x PBS, 0.05% di Tween-20 (PBS-T), 3% skim-milk al 3%, a temperatura ambiente, overnight in blanda agitazione. Il giorno seguente, dopo 3 lavaggi con PBS-T/skim-milk, le membrane sono state ibridate con la miscela degli anticorpi anti-E2 usati nelle stesse proporzioni e diluiti 1:500 in PBS-T/skim-milk aN’1%. Dopo 90 minuti sono stati effettuati 3 lavaggi con PBS-T per togliere l’anticorpo non legato ed è stato aggiunto l’anticorpo secondario anti-mouse coniugato con l’enzima perossidasi diluito 1:1000 in PBS-T/ skim-milk allo 0.5%. La rivelazione delle bande è stata effettuata con il kit Horseradish Peroxidase Conjugate Substrate Kit (Bio-Rad). Come controllo positivo, utilizzato nel valutare l’espressione di E2 nelle cellule trasfettate, è stato usato l’anticorpo monoclonale AP33, fornito dal Dr. Arvind Patel (MRC Virology Unit, Institute of Virology, University of Glasgow), diretto contro un epitopo di E2 lineare e altamente conservato tra i vari genotipi HCV [Owsianka, A., A. W. Tarr, V. S. Juttla, D. Lavillette, B. Bartosch, F.-L. Cosset, J. K. Ball, and A. H. Patel. 2005. Monoclonal antibody AP33 defines a broadly neutralizing epitope on thè hepatitis C virus E2 envelope glycoprotein. J. Virol. 79:11095-11104], Subsequently, the blocking was carried out by incubating the membranes with 1x PBS, 0.05% Tween-20 (PBS-T), 3% skim-milk at 3%, at room temperature, overnight under gentle agitation. The following day, after 3 washes with PBS-T / skim-milk, the membranes were hybridized with the mixture of anti-E2 antibodies used in the same proportions and diluted 1: 500 in PBS-T / skim-milk at 1% . After 90 minutes, 3 washes with PBS-T were carried out to remove the unbound antibody and the secondary anti-mouse antibody conjugated with the enzyme peroxidase diluted 1: 1000 in PBS-T / skim-milk at 0.5 was added. %. The detection of the bands was performed with the Horseradish Peroxidase Conjugate Substrate Kit (Bio-Rad). The monoclonal antibody AP33, provided by Dr. Arvind Patel (MRC Virology Unit, Institute of Virology, University of Glasgow), directed against an epitope of Linear and highly conserved E2 among the various HCV genotypes [Owsianka, A., A. W. Tarr, V. S. Juttla, D. Lavillette, B. Bartosch, F.-L. Cosset, J. K. Ball, and A. H. Patel. 2005. Monoclonal antibody AP33 defines a broadly neutralizing epitope on the hepatitis C virus E2 envelope glycoprotein. J. Virol. 79: 11095-11104],

Saggio di Neutralizzazione Neutralization test

Ciascun anticorpo è stato testato secondo due diverse concentrazioni 0,5 pg/mL e 5 pg/mL. Inoltre, per ciascun anticorpo testato sono stati seminati tre pozzetti per effettuare una prova in triplicato. Come controllo positivo, è stato utilizzato l’anticorpo monoclonale AP33 che riconosce un epitopo lineare in E2 parzialmente sovrapponibile con l’epitopo presente nel Peptide I. Per una più diretta comparazione dell’attività neutralizzante, anche AP33 è stato utilizzato alla concentrazione di 0,5 pg/mL e 5 pg/mL. Each antibody was tested at two different concentrations 0.5 pg / mL and 5 pg / mL. In addition, three wells were seeded for each antibody tested to perform a triplicate test. As a positive control, the monoclonal antibody AP33 was used which recognizes a linear epitope in E2 partially overlapping with the epitope present in Peptide I. For a more direct comparison of the neutralizing activity, also AP33 was used at the concentration of 0, 5 pg / mL and 5 pg / mL.

Nel saggio sono state quindi effettuate le seguenti prove: The following tests were then carried out in the assay:

- le sole cellule (Kc) per determinare un eventuale background di fluorescenza (in triplicato) - the cells only (Kc) to determine a possible fluorescence background (in triplicate)

- cellule trasdotte con solo virus (Kv) per valutare l'efficienza di trasduzione (in triplicato) - cells transduced with virus only (Kv) to evaluate the transduction efficiency (in triplicate)

- cellule incubate con il virus e AP33 (0,5 pg/mL e 5,0 pg/mL - cells incubated with the virus and AP33 (0.5 pg / mL and 5.0 pg / mL

per testare l'efficienza della neutralizzazione (in triplicato). to test the efficiency of neutralization (in triplicate).

- cellule incubate con il virus e ciascun anticorpo (0,5 pg/mL e 5,0 pg/mL, per valutare l’efficienza della neutralizzazione (in triplicato). - cells incubated with the virus and each antibody (0.5 pg / mL and 5.0 pg / mL, to evaluate the efficiency of neutralization (in triplicate).

Ciascuna prova è stata effettuata utilizzando sia le particelle pseudotipizzate con VSV-G (come controllo positivo di trasduzione delle cellule), che con E1E2 di genotipo 1a e di genotipo 3a per valutare l’efficacia di neutralizzazione degli anticorpi testati contro questi due diversi genotipi. Each test was carried out using both the particles pseudotyped with VSV-G (as a positive control for cell transduction), and with E1E2 of genotype 1a and genotype 3a to evaluate the neutralization efficacy of the antibodies tested against these two different genotypes.

Per il saggio di neutralizzazione sono state seminate 2x10<4>HuH-7 nelle multiwell da 48 pozzetti. È stata seminata una multiwell per ciascuna preparazione di vettore utilizzata. For the neutralization assay 2x10 <4> HuH-7 were seeded in 48-well multiwells. One multiwell was seeded for each vector preparation used.

Il giorno seguente alla semina delle cellule, è stato allestito il saggio di neutralizzazione: per ciascun pozzetto di cellule seminate, 200 μl_ di ciascun vettore (FIV- E1E2/1a, FIV-E1E2/3a, FIV-E1E2/VSV-G) sono stati incubati in tubini eppendorf con 10 pi di anticorpo prediluito alle diluizioni 10 g/ml_ e 100 g/ml_ per ottenere i campioni in cui gli anticorpi hanno una concentrazione rispettivamente di 0,5 μg/mL e 5 μg/mL. Dopo un’ora di incubazione dei campioni a 37°C, è stato eliminato il terreno dalle cellule e questo è stato sostituito con la miscela di pseudoparticelle ed anticorpi. Le multiwell sono state quindi incubate a 37°C e 5% C02per 6 ore. The day following cell seeding, the neutralization assay was set up: for each well of seeded cells, 200 μl_ of each vector (FIV-E1E2 / 1a, FIV-E1E2 / 3a, FIV-E1E2 / VSV-G) are were incubated in eppendorf tubes with 10 µl of prediluted antibody at 10 g / ml_ and 100 g / ml_ dilutions to obtain samples in which the antibodies have a concentration of 0.5 μg / mL and 5 μg / mL, respectively. After one hour of incubation of the samples at 37 ° C, the medium was removed from the cells and this was replaced with the mixture of pseudoparticles and antibodies. The multiwells were then incubated at 37 ° C and 5% CO2 for 6 hours.

Trascorso questo tempo, la miscela sulle cellule è stata eliminata ed è stata sostituita con 500 pL di terreno DMEM completo. After this time, the mixture on the cells was removed and replaced with 500 µL of complete DMEM medium.

Dopo 48 ore i pozzetti sono stati lavati con 200 pL di PBS, trattati con 100 pL di tripsina/EDTA (Lonza, Walkersville, MD, USA) ed incubati per 5 minuti a 37°C. Le cellule sono state quindi addizionate con 150 pi di DMEM completo e ciascun pozzetto è stato collezionato in un provetta da FACS (Sarsted). After 48 hours the wells were washed with 200 µL of PBS, treated with 100 µL of trypsin / EDTA (Lonza, Walkersville, MD, USA) and incubated for 5 minutes at 37 ° C. The cells were then spiked with 150 µl of complete DMEM and each well was collected in a FACS (Sarsted) tube.

La lettura dei campioni per la valutazione della fluorescenza è stata effettuata con un citofluorimetro modello FACScan (BD Biosciences) e l’analisi dei campioni con il software CelIQuest (BD Biosciences) per valutare la diminuzione del numero di cellule fluorescenti pre-incubate con i campioni di anticorpi rispetto ai controlli (Kc e Kv) . La capacità neutralizzante del campione è stata espressa come percentuale di riduzione dell’entry. Il 40% di riduzione di infettività viene considerato come cut-off per attività neutralizzante. Reading of the samples for fluorescence assessment was performed with a model FACScan flow cytometer (BD Biosciences) and analysis of the samples with CelIQuest software (BD Biosciences) to evaluate the decrease in the number of fluorescent cells pre-incubated with the samples of antibodies compared to controls (Kc and Kv). The neutralizing capacity of the sample was expressed as a percentage of entry reduction. The 40% reduction in infectivity is considered as a cut-off for neutralizing activity.

Gli anticorpi monoclonali, purificati e risospesi in buffer Tris-Glicina, a pH 7.0, sono stati saggiati per capacità di riduzione dell’infettività contro particelle pseudotipizzate con E1/E2 di HCV genotipo 1a e 3a ai quali appartengono oltre il 70% degli isolati HCV circolanti in Italia, Europa e America del Nord. In tutti i test, come controllo negativo, sono state usate particelle pseudotipizzate con VSV-G che utilizza come recettore un fosfolipide presente in modo ubiquitario nelle membrane citoplasmatiche. Un’eventuale, significativa riduzione di infettività contro particelle pseudotipizzate con VSV-G implicherebbe che gli anticorpi monoclonali anti-E2 si legano di fatto in porzioni diverse della particella o comunque impediscono il processo di infezione per meccanismi non dipendenti dal blocco dell’Interazione tra la proteina E2 di HCV ed i recettori cellulari (neutralizzazione aspecifica). Come controllo positivo nei vari test di neutralizzazione è stato usato l’anticorpo monoclonale AP33 in grado di neutralizzare un ampio spettro di isolati HCV da genotipi diversi e in un elevato range di concentrazioni [Owsianka, A., A. W. Tarr, V. S. Juttla, D. Lavillette, B. Bartosch, F.-L. Cosset, J. K. Ball, and A. H. Patel. 2005. Monoclonal antibody AP33 defines a broadly neutralizing epitope on thè hepatitis C virus E2 envelope glycoprotein. J. Virol. 79:11095-11104], Monoclonal antibodies, purified and resuspended in Tris-Glycine buffer, at pH 7.0, were tested for their ability to reduce infectivity against E1 / E2 pseudotyped particles of HCV genotype 1a and 3a to which more than 70% of the HCV isolates belong. circulating in Italy, Europe and North America. In all tests, pseudotyped particles with VSV-G using a phospholipid ubiquitously present in cytoplasmic membranes as a receptor were used as a negative control. Any significant reduction in infectivity against VSV-G pseudotyped particles would imply that the anti-E2 monoclonal antibodies actually bind in different portions of the particle or in any case prevent the infection process for mechanisms not dependent on the blocking of the Interaction between the HCV E2 protein and cell receptors (non-specific neutralization). The AP33 monoclonal antibody was used as a positive control in the various neutralization tests, capable of neutralizing a broad spectrum of HCV isolates from different genotypes and in a high range of concentrations [Owsianka, A., A. W. Tarr, V. S. Juttla, D. Lavillette, B. Bartosch, F.-L. Cosset, J. K. Ball, and A. H. Patel. 2005. Monoclonal antibody AP33 defines a broadly neutralizing epitope on the hepatitis C virus E2 envelope glycoprotein. J. Virol. 79: 11095-11104],

ANALISI DEL RICONOSCIMENTO DI HCV E2 DI GENOTIPO 1a E 3 CON WESTERN BLOT ANALYSIS OF THE RECOGNITION OF HCV E2 OF GENOTYPE 1a AND 3 WITH WESTERN BLOT

L’analisi è stata condotta sulle cellule trasfettate e lisate e su virioni pseudotipizzati purificati come descritto sopra. In Figura 5A è riportata l’analisi dell’espressione di E2 nelle cellule trasfettate. Non conoscendo il livello di espressione della proteina, a causa dell’elevata glicosilazione e della presenza di più forme (precursori e prodotto finito variamente glicosilato), il lisato cellulare trasfettato con i costrutti vettori, packaging ed E1/E2 di genotipi la e 3, è stato seminato alla concentrazione di 600 e 60 μg di proteine totali e saggiato con AP33 e la miscela di MAbl-MAbVII. Come si vede in Figura 5A e nonostante E2 si presenti piuttosto sfumata a seguito, probabilmente, dei diversi pattern di glicosilazione[Owsianka, A., A. W. Tarr, V. S. Juttla, D. Lavillette, B. Bartosch, F.-L. Cosset, J. K. Ball, and A. H. Patel. 2005. Monoclonal antibody AP33 defines a broadly neutralizing epitope on thè hepatitis C virus E2 envelope glycoprotein. J. Virol. 79:11095-11104] la miscela di anticorpi monoclonali anti-E2 MAbl-MAbVII riconosce la proteina di genotipo 1a e 3 praticamente come AP33 l’anticorpo monoclonale che, come detto sopra, riconosce un epitopo lineare di E2 altamente conservato tra i genotipi di HCV. Analogamente, la miscela di MAbl-MAbVII riconosce in modo specifico le glicoproteine E2 di genotipo 1a e 3 sulle particelle virali pseudotipizzate generate dalle cellule trasfettate e purificate. La banda di peso maggiore è la glicoproteina E1/E2 presente come forma immatura che viene scissa nelle E1 ed E2 durante il processo di maturazione, fase finale del ciclo replicativo virale che avviene a livello extracellulare non o parzialmente glicosilata. E’ importante sottolineare infine che la miscela di monoclonali non riconosce affatto la VSV-G che ha dimensioni di poco superiori a 50 KDa (Figura 5B). Questo risultato dimostra quindi che gli anticorpi monoclonali anti-E2 sviluppati riconoscono in modo specifico la glicoproteina di HCV di genotipo 1a e 3. The analysis was conducted on transfected and lysed cells and purified pseudotyped virions as described above. Figure 5A shows the analysis of the expression of E2 in the transfected cells. Not knowing the expression level of the protein, due to the high glycosylation and the presence of multiple forms (precursors and variously glycosylated finished product), the cell lysate transfected with the carrier, packaging and E1 / E2 constructs of genotypes la and 3, it was seeded at a concentration of 600 and 60 μg of total protein and tested with AP33 and the MAbl-MAbVII mixture. As can be seen in Figure 5A and despite the fact that E2 appears rather blurred as a result, probably, of the different patterns of glycosylation [Owsianka, A., A. W. Tarr, V. S. Juttla, D. Lavillette, B. Bartosch, F.-L. Cosset, J. K. Ball, and A. H. Patel. 2005. Monoclonal antibody AP33 defines a broadly neutralizing epitope on the hepatitis C virus E2 envelope glycoprotein. J. Virol. 79: 11095-11104] the anti-E2 MAbl-MAbVII monoclonal antibody mixture recognizes the genotype 1a and 3 protein practically as AP33 the monoclonal antibody which, as mentioned above, recognizes a highly conserved linear epitope of E2 among the genotypes of HCV. Similarly, the MAbl-MAbVII mixture specifically recognizes genotype 1a and 3 E2 glycoproteins on pseudotyped viral particles generated from transfected and purified cells. The heavier weight band is glycoprotein E1 / E2 present as immature form which is split into E1 and E2 during the maturation process, the final phase of the viral replication cycle which occurs at an extracellular level not or partially glycosylated. Finally, it is important to underline that the monoclonal mixture does not recognize VSV-G at all, which has dimensions of just over 50 KDa (Figure 5B). This result therefore demonstrates that the developed anti-E2 monoclonal antibodies specifically recognize genotype 1a and 3 HCV glycoprotein.

ANALISI DELL’ATTIVITÀ NEUTRALIZZANTE DEGLI ANTICORPI MONOCLONALI ANTI-E2 ANALYSIS OF THE NEUTRALIZING ACTIVITY OF MONOCLONAL ANTI-E2 ANTIBODIES

I test sono stati ripetuti quattro volte in tempi e con preparazioni virali diverse e hanno dato risultati molto simili. In generale tutti gli anticorpi monoclonali prodotti presentano un’attività neutralizzante contro particelle pseudotipizzate con VSV-G nulla o inferiore al 10%. L’attività neutralizzante mostrata da tutti gli anticorpi è quindi altamente specifica. L’attività inoltre diminuisce, come atteso, in modo proporzionale alla diminuzione della concentrazione degli anticorpi e con scalarità molto simile a quella del controllo positivo AP33. In Figura 6A, sono riportati i dati di neutralizzazione, da uno degli esperimenti condotti, per tutti i 7 anticorpi monoclonali, comparati all’anticorpo AP33, alle concentrazioni di 0,5 pg/mL e 5,0 pg/mL, mentre in Figura 6B sono riportati i dati ottenuti utilizzando particelle pseudotipizzate con VSV-G di controllo. The tests were repeated four times at different times and with different viral preparations and gave very similar results. In general, all monoclonal antibodies produced have neutralizing activity against pseudotyped particles with VSV-G zero or less than 10%. The neutralizing activity shown by all antibodies is therefore highly specific. The activity also decreases, as expected, in proportion to the decrease in the concentration of antibodies and with scaling very similar to that of the positive control AP33. Figure 6A shows the neutralization data, from one of the experiments conducted, for all 7 monoclonal antibodies, compared to the AP33 antibody, at concentrations of 0.5 pg / mL and 5.0 pg / mL, while in Figure 6B shows the data obtained using pseudotyped particles with control VSV-G.

Per quanto riguarda gli anti-E2, gli anticorpi che presentano maggiore attività neutralizzante sono MAb II, MAb VI e MAbVII che riducono l’infettività delle particelle pseudotipizzate con E1/E2 di genotipo 1a del 40 e del 30% circa utilizzando rispettivamente 5,0 e 0,5 pg/mL di anticorpo nel saggio. Questa attività neutralizzante è del tutto sovrapponibile a quella mostrata da AP33 ed è considerata clinicamente significativa [Keck ZY, Machida K, Lai MM, Ball JK, Patel AH, Foung SK. Therapeutic control of hepatitis C virus: thè role of neutralizing monoclonal antibodies.Curr Top Microbiol Immunol. 2008;317:1-38, Stamataki Z, Grove J, Balie P, McKeating JA. Hepatitis C virus entry and neutralization. Clin Liver Dis 2008;12:693-712], Gli altri anticorpi presentano invece attività più modeste che si aggirano intorno al 30% alla concentrazione di 5,0 pg/mL. Gli anticorpi anti-E2 sono stati quindi saggiati contro il genotipo 3a (Figura 7), utilizzando pseudoparticelle pseudotipizzate con E1/E2 clonato da un isolato di questo genotipo. I MAb I, MAb III, MAb IV e MAb V presentano modesta attività neutralizzante anche verso questo genotipo. Per quanto riguarda invece i MAb II, MAb VI e MAb VII, il primo e l’ultimo mantengono le buone performance anche verso questo genotipo che invece non risulta neutralizzato dal MAb VI, probabilmente a seguito di una differenza aminoacidica del genotipo 3a rispetto al Peptide I utilizzato per la produzione degli anticorpi. Sulla base di questi risultati, i MAb II, MAb VI e MAb VII sono stati usati in combinazione binaria tra loro e tutti assieme. Per una migliore comparazione con quanto potrebbe verificarsi in vivo, nel caso venissero usati in ambito terapeutico, la concentrazione totale degli anticorpi presente nel saggio è rimasta 0,5 e 5,0 μg/mL. Quindi nel caso della combinazione tra due anticorpi la concentrazione del singolo MAb è dimezzata. E’ ridotta invece ad un terzo nella combinazione dei tre anticorpi messi insieme. Indipendentemente dall’associazione utilizzata non è stato osservato alcun incremento dell’attività neutralizzante rispetto agli stessi anticorpi saggiati in singolo (Figura 8). Anzi, la combinazione dei tre anticorpi ne riduce sensibilmente l’efficacia, facendo così pensare ad un possibile competizione o ingombro sterico tra gli anticorpi per il legame all’epitopo. As for the anti-E2, the antibodies showing the greatest neutralizing activity are MAb II, MAb VI and MAbVII which reduce the infectivity of the pseudotyped particles with E1 / E2 of genotype 1a by about 40 and 30% using 5.0 respectively. and 0.5 pg / mL of antibody in the assay. This neutralizing activity is completely superimposable to that shown by AP33 and is considered clinically significant [Keck ZY, Machida K, Lai MM, Ball JK, Patel AH, Foung SK. Therapeutic control of hepatitis C virus: the role of neutralizing monoclonal antibodies Curr Top Microbiol Immunol. 2008; 317: 1-38, Stamataki Z, Grove J, Balie P, McKeating JA. Hepatitis C virus entry and neutralization. Clin Liver Dis 2008; 12: 693-712], The other antibodies instead have more modest activities that are around 30% at a concentration of 5.0 pg / mL. Anti-E2 antibodies were then tested against genotype 3a (Figure 7), using pseudotypic E1 / E2 pseudoparticles cloned from an isolate of this genotype. MAb I, MAb III, MAb IV and MAb V show modest neutralizing activity also towards this genotype. As for the MAb II, MAb VI and MAb VII, the first and the last maintain the good performances also towards this genotype which instead is not neutralized by the MAb VI, probably following an amino acidic difference of the genotype 3a compared to the Peptide I used for the production of antibodies. Based on these results, MAb II, MAb VI and MAb VII were used in binary combination with each other and all together. For a better comparison with what could occur in vivo, if they were used in the therapeutic setting, the total concentration of antibodies present in the assay remained 0.5 and 5.0 μg / mL. So in the case of the combination between two antibodies the concentration of the single MAb is halved. Instead, it is reduced to a third in the combination of the three antibodies put together. Regardless of the association used, no increase in neutralizing activity was observed compared to the same antibodies tested individually (Figure 8). Indeed, the combination of the three antibodies significantly reduces their effectiveness, thus suggesting a possible competition or steric hindrance between the antibodies for binding to the epitope.

Claims (19)

Rivendicazioni 1. Anticorpi monoclonali di origine murina o umana caratterizzati dal fatto che almeno una delle catene, leggera o pesante, della loro complementary determining region CDR ha sequenza (catena pesante): AELVRPGGSVKLSCKASGYSFTTYWMNWVKQRPGQGLEWIGMIQPSDSETRLN QKFKDKATLTLDRSSSTVYMQLSSPTSDDSAVYYCARTGRGDAWLTYWGQG [SEQ. ID. No 1] o sequenza (catena leggera) : PASLAVSLGQRATISYRASKSVSTSGYSYMHWNQQKPGQPPRLLIYLVSNLESG VPARFSGSGSGTDFTLNIHPVEEEDAATYYCQHIRELTRS [SEQ. ID. No 2] e allo stesso tempo, l’altra catena presenta una percentuale di identità compresa fra il 50% ed il 100% con le rispettive sequenze [SEQ. ID. No 1] e [SEQ. ID. No 2] o loro frammenti funzionali. Claims 1. Monoclonal antibodies of murine or human origin characterized by the fact that at least one of the chains, light or heavy, of their complementary determining region CDR has a sequence (heavy chain): AELVRPGGSVKLSCKASGYSFTTYWMNWVKQRPGQGLEWIGMIQPSDSETRLN QKFKDKATLTLDRSSSTVYMQLSSPTSDDSAVYYCARTGRGDAWLTYWGQG [SEQ. ID. No 1] o sequence (light chain): PASLAVSLGQRATISYRASKSVSTSGYSYMHWNQQKPGQPPRLLIYLVSNLESG VPARFSGSGSGTDFTLNIHPVEEEDAATYYCQHIRELTRS [SEQ. ID. No 2] and at the same time, the other chain has an identity percentage between 50% and 100% with the respective sequences [SEQ. ID. No 1] and [SEQ. ID. No 2] or their functional fragments. 2. Anticorpi monoclonali secondo la rivendicazione 1 caratterizzati dal fatto che le catene pesante e leggera nella CDR hanno le seguenti sequenze: a) AELVRPGGSVKLSCKASGYSFTTYWMNWVKQRPGQGLEWIGMIQPSDSETRLN QKFKDKATLTLDRSSSTVYMQLSSPTSDDSAVYYCARTGRGDAWLTYWGQG [SEQ. ID. No 1] e PASLAVSLGQRATISYRASKSVSTSGYSYMHWNQQKPGQPPRLLIYLVSNLESG VPARFSGSGSGTDFTLNIHPVEEEDAATYYCQHIRELTRS [SEQ. ID. No 2] b) AELVRPGGSVKLSCKASGYSFTTYWMNWVKQRPGQGLEWIGMIQPSDSETRLN QKFKDKATLTLDRSSSTVYMQLSSPTSDDSAVYYCARTGRGDAWLTYWGQG [SEQ. ID. No 3] e QKFMSTSVGDRVSITCKASQNVRTAVAWYQQKPGQSPKALIYLASNRHTGVPD RFTGSGSGTDFTLTISNVQSEDLAAYFCQQYLNYPRTRSEGGPSWN [SEQ. ID. No 4] c) AELVKPGASVKLSCTASGFNIKDTYMHWIKQRPEQGLEWIGRIAYADGNIKIDPKF QGKATITTVTSSNTAYLQLSSLTSEDTAVYYCAYYGLLFAYWGQG [SEQ. ID. No 5] e PASLAVSLGQRATISYRASKSVSTSGYSYMHWNQQKPGQPPRLLIYLVSNLESG VPARFSGSGSGTDFTLNIHPVEEEDAATYYCQHIRELTRS [SEQ. ID. No 6] 2. Monoclonal antibodies according to claim 1 characterized in that the heavy and light chains in the CDR have the following sequences: a) AELVRPGGSVKLSCKASGYSFTTYWMNWVKQRPGQGLEWIGMIQPSDSETRLN QKFKDKATLTLDRSSSTVYMQLSSPTSDDSAVYYCARTGRGDAWLTYWGQG [SEQ. ID. No 1] and PASLAVSLGQRATISYRASKSVSTSGYSYMHWNQQKPGQPPRLLIYLVSNLESG VPARFSGSGSGTDFTLNIHPVEEEDAATYYCQHIRELTRS [SEQ. ID. No 2] b) AELVRPGGSVKLSCKASGYSFTTYWMNWVKQRPGQGLEWIGMIQPSDSETRLN QKFKDKATLTLDRSSSTVYMQLSSPTSDDSAVYYCARTGRGDAWLTYWGQG [SEQ. ID. No 3] and QKFMSTSVGDRVSITCKASQNVRTAVAWYQQKPGQSPKALIYLASNRHTGVPD RFTGSGSGTDFTLTISNVQSEDLAAYFCQQYLNYPRTRSEGGPSWN [SEQ. ID. No 4] c) AELVKPGASVKLSCTASGFNIKDTYMHWIKQRPEQGLEWIGRIAYADGNIKIDPKF QGKATITTVTSSNTAYLQLSSLTSEDTAVYYCAYYGLLFAYWGQG [SEQ. ID. No 5] and PASLAVSLGQRATISYRASKSVSTSGYSYMHWNQQKPGQPPRLLIYLVSNLESG VPARFSGSGSGTDFTLNIHPVEEEDAATYYCQHIRELTRS [SEQ. ID. No 6] 3. Anticorpi secondo la rivendicazione 2 in cui le corrispondenti sequenze nucleotidiche delle sequenze aminoacidiche sono: a) [SEQ. ID. 64] GCTGAGCTGGTGAGGCCTGGAGGTTCAGTGAAGCTGTCCTGCAAGGCGTCT GGCTACTCCTTCACCACCTACTGGATGAACTGGGTGAAGCAGAGGCCTGGAC AAGGCCTTGAGTGGATTGGCATGATTCAGCGTTCCGATAGTGAAACTAGGTT AAATCAGAAGTTCAAGGACAAGGCCACATTGACTTTAGACAGATCCTCCAGCA CAGTCT ACATGCAACT CAGT AGT CCG ACAT CTG ATG ACT CTGCGGTCT ATT AC TGTGCAAGAACGGGCAGGGGGGACGCTTGGTTAACTTACTGGGGCCAAGG e [SEQ. ID. 65] CCTGCTTCCTTAGCTGTATCTCTGGGGCAGAGGGCCACCATCTCATACAGGG CCAGCAAAAGT GTCAGT ACAT CTGGCT AT AGTT AT AT GC ACT GG AACCAACAG AAACCAGG AC AGCCACCCAG ACTCCT CAT CT AT CTTGT AT CCAACCT AG AAT C TGGGGTCCCTGCCAGGTTCAGTGGCAGTGGGTCTGGGACAGACTTCACCCT CAACATCCATCCTGTGGAGGAGGAGGATGCTGCAACCTATTACTGTCAGCAC ATT AGGG AGCTT ACACGTT CGGAG b) [SEQ. ID. 66] GCAGAACTTGTGAAGCCAGGGGCCTCAGTCAAGTTGTCCTGCACAGCTTCTG GCTT CAACATT AAAG ACACCT AT ATGCACTGG AT AAAGCAG AGGCCT G AACA GGGCCTGGAGTGGATTGGAAGGATTGCTTATGCGGATGGTAATATTAAAATT GACCCGAAGTTCCAGGGCAAGGCCACTATAACAACAGTCACATCTTCCAACA C AG CTT ACCTG C AG CT C AGC AG CCT G AC AT C AG AG G AC ACT G CCGTCT ATT A CTG TG CTT ATT ACGGCCTCTTATTTGCTTACTGGGGCCAAGGGACTCTGGTT e [SEQ. ID. 67] CCTGCTTCCTTAGCTGTATCTCTGGGGCAGAGGGCCACCATCTCATACAGGG CCAGCAAAAGT GTCAGT AC AT CTGGCT AT AGTT AT AT GC ACT GG AACCAACAG AAACCAGG AC AGCCACCCAG ACTCCT CAT CT AT CTTGT AT CCAACCT AG AAT C TGGGGTCCCTGCCAGGTTCAGTGGCAGTGGGTCTGGGACAGACTTCACCCT CAACATCCATCCTGTGGAGGAGGAGGATGCTGCAACCTATTACTGTCAGCAC ATTAGGGAGCTTACNCGTTCGGANG c) [SEQ. ID. 68] GCAGAACTTGTGAAGCCAGGGGCCTCAGTCAAGTTGTCCTGCACAGCTTCTG GCTT CAACATT AAAG ACACCT AT ATGCACTGG AT AAAGCAG AGGCCT G AACA GGGCCTGGAGTGGATTGGAAGGATTGCTTATGCGGATGGTAATATTAAAATT GACCCGAAGTTCCAGGGCAAGGCCACTATAACAACAGTCACATCTTCCAACA C AG CTT ACCTG C AG CT C AGC AG CCT G AC AT C AG AG G AC ACT G CCGTCT ATT A CTG TG CTT ATT ACGGCCTCTTATTTGCTTACTGGGGCCAAGGGACTCTGGTT e [SEQ. ID. 69] CCTGCTTCCTTAGCTGTATCTCTGGGGCAGAGGGCCACCATCTCATACAGGG CCAGCAAAAGT GTCAGT AC AT CTGGCT AT AGTT AT AT GC ACT GG AACCAACAG AAACCAGG AC AGCCACCCAG ACTCCT CAT CT AT CTTGT AT CCAACCT AG AAT C TGGGGTCCCTGCCAGGTTCAGTGGCAGTGGGTCTGGGACAGACTTCACCCT CAACATCCATCCTGTGGAGGAGGAGGATGCTGCAACCTATTACTGTCAGCAC ATTAGGGAGCTTACNCGTTCGGANG 3. Antibodies according to claim 2 wherein the corresponding nucleotide sequences of the amino acid sequences are: a) [SEQ. ID. 64] GCTGAGCTGGTGAGGCCTGGAGGTTCAGTGAAGCTGTCCTGCAAGGCGTCT GGCTACTCCTTCACCACCTACTGGATGAACTGGGTGAAGCAGAGGCCTGGAC AAGGCCTTGAGTGGATTGGCATGATTCAGCGTTCCGATAGTGAAACTAGGTT AAATCAGAAGTTCAAGGACAAGGCCACATTGACTTTAGACAGATCCTCCAGCA CAGTCT ACATGCAACT CAGT AGT CCG ACAT CTG ATG ACT CTGCGGTCT ATT AC TGTGCAAGAACGGGCAGGGGGGACGCTTGGTTAACTTACTGGGGCCAAGG And [SEQ. ID. 65] CCTGCTTCCTTAGCTGTATCTCTGGGGCAGAGGGCCACCATCTCATACAGGG CCAGCAAAAGT GTCAGT ACAT CTGGCT AT AGTT AT AT GC ACT GG AACCAACAG AAACCAGG AC AGCCACCCAG ACTCCT CAT CT AT CTTGT AT CCAACCT AG AAT C TGGGGTCCCTGCCAGGTTCAGTGGCAGTGGGTCTGGGACAGACTTCACCCT CAACATCCATCCTGTGGAGGAGGAGGATGCTGCAACCTATTACTGTCAGCAC ATT AGGG AGCTT ACACGTT CGGAG b) [SEQ. ID. 66] GCAGAACTTGTGAAGCCAGGGGCCTCAGTCAAGTTGTCCTGCACAGCTTCTG GCTT CAACATT AAAG ACACCT AT ATGCACTGG AT AAAGCAG AGGCCT G AACA GGGCCTGGAGTGGATTGGAAGGATTGCTTATGCGGATGGTAATATTAAAATT GACCCGAAGTTCCAGGGCAAGGCCACTATAACAACAGTCACATCTTCCAACA C AG CTT ACCTG C AG CT C AGC AG CCT G AC AT C AG AG G AC ACT G CCGTCT ATT A CTG TG CTT ATT ACGGCCTCTTATTTGCTTACTGGGGCCAAGGGACTCTGGTT And [SEQ. ID. 67] CCTGCTTCCTTAGCTGTATCTCTGGGGCAGAGGGCCACCATCTCATACAGGG CCAGCAAAAGT GTCAGT AC AT CTGGCT AT AGTT AT AT GC ACT GG AACCAACAG AAACCAGG AC AGCCACCCAG ACTCCT CAT CT AT CTTGT AT CCAACCT AG AAT C TGGGGTCCCTGCCAGGTTCAGTGGCAGTGGGTCTGGGACAGACTTCACCCT CAACATCCATCCTGTGGAGGAGGAGGATGCTGCAACCTATTACTGTCAGCAC ATTAGGGAGCTTACNCGTTCGGANG c) [SEQ. ID. 68] GCAGAACTTGTGAAGCCAGGGGCCTCAGTCAAGTTGTCCTGCACAGCTTCTG GCTT CAACATT AAAG ACACCT AT ATGCACTGG AT AAAGCAG AGGCCT G AACA GGGCCTGGAGTGGATTGGAAGGATTGCTTATGCGGATGGTAATATTAAAATT GACCCGAAGTTCCAGGGCAAGGCCACTATAACAACAGTCACATCTTCCAACA C AG CTT ACCTG C AG CT C AGC AG CCT G AC AT C AG AG G AC ACT G CCGTCT ATT A CTG TG CTT ATT ACGGCCTCTTATTTGCTTACTGGGGCCAAGGGACTCTGGTT e [SEQ. ID. 69] CCTGCTTCCTTAGCTGTATCTCTGGGGCAGAGGGCCACCATCTCATACAGGG CCAGCAAAAGT GTCAGT AC AT CTGGCT AT AGTT AT AT GC ACT GG AACCAACAG AAACCAGG AC AGCCACCCAG ACTCCT CAT CT AT CTTGT AT CCAACCT AG AAT C TGGGGTCCCTGCCAGGTTCAGTGGCAGTGGGTCTGGGACAGACTTCACCCT CAACATCCATCCTGTGGAGGAGGAGGATGCTGCAACCTATTACTGTCAGCAC ATTAGGGAGCTTACNCGTTCGGANG 4. Anticorpi secondo la rivendicazione 1 - 3 in cui dette sequenze sono opportunamente modificate chimicamente o enzimaticamente mediante reazioni chimiche o enzimatiche di: ammidazione, glicosilazione, carbamoilazione, acilazione (ad esempio acetilazione), solfatazione, fosforilazione, lipidizzazione, peghilazione, biotinilazione. 4. Antibodies according to claim 1 - 3 wherein said sequences are suitably chemically or enzymatically modified by chemical or enzymatic reactions of: amidation, glycosylation, carbamoylation, acylation (for example acetylation), sulfation, phosphorylation, lipidization, pegylation, biotinylation. 5. Anticopri secondo le rivendicazioni 1 - 3 in cui le catene polipeptidiche degli anticorpi originali sono assemblate in una catena unica in modo da ottenere due domini immunoglobulinici che riproducono i domini CH-4 e CL-4 fusi tra loro, oppure ScFv divalenti e trivalenti oppure ScFv tetravalenti. 5. Anticopres according to claims 1 - 3 wherein the polypeptide chains of the original antibodies are assembled in a single chain so as to obtain two immunoglobulin domains which reproduce the CH-4 and CL-4 domains fused together, or divalent and trivalent ScFv or tetravalent ScFv. 6. Anticorpi secondo la rivendicazione 5 in cui detti ScFv canonici, divalenti, trivalenti e tetravalenti sono prodotti di fusione con altre proteine introdotte sia al C-terminale che all’N-terminale degli ScFv eventualmente inserendo tra le sequenze polipeptidiche degli ScFv e dei partners di fusione un segmento polipeptidico. 6. Antibodies according to claim 5 in which said canonical, divalent, trivalent and tetravalent ScFvs are fusion products with other proteins introduced both at the C-terminus and at the N-terminus of the ScFvs possibly inserting between the polypeptide sequences of the ScFvs and partners of fusion a polypeptide segment. 7. Anticorpi secondo la rivendicazione 6 in cui detti segmeni polipeptidici sono sequenze di riconoscimento per proteasi endogene. 7. Antibodies according to claim 6 wherein said polypeptide segments are recognition sequences for endogenous proteases. 8. Anticorpi secondo la rivendicazione 7 in cui dette sequenze di riconoscimento per proteasi endogene sono scelte fra: D-D-D-D-Y(SEQ ID NO.75), G-P-R, V-P-R, A-G-G e H-P-F-H-L(SEQ ID NO. 76). 8. Antibodies according to claim 7 wherein said recognition sequences for endogenous proteases are selected from: D-D-D-D-Y (SEQ ID NO.75), G-P-R, V-P-R, A-G-G and H-P-F-H-L (SEQ ID NO. 76). 9. Uso di anticorpi secondo le rivendicazioni 1 - 7 in composizioni capaci di legare e neutralizzare in varia misura l’entrata nelle cellule del virus dell’FICV. 9. Use of antibodies according to claims 1 - 7 in compositions capable of binding and neutralizing to varying degrees the entry into the cells of the FICV virus. 10 Uso secondo la rivendicazione 9 per la immunizzazione passiva di mammiferi sani o infettati con virus FICV, la prevenzione della ricorrenza di infezioni di FICV in fegati non infetti da FICV trapiantati in pazienti con infezioni croniche da FICV, prevenzione di infezioni da FICV in mammiferi non infettati da FICV, trattamento di infezioni da FICV in mammiferi infetti eventualmente in combinazione con altro farmaci dotati di proprietà terapeutiche contro l’FHCV. 10 Use according to claim 9 for passive immunization of healthy or FICV infected mammals, prevention of recurrence of FICV infections in non-FICV-infected livers transplanted in patients with chronic FICV infections, prevention of FICV infections in non-FICV infected with FICV, treatment of FICV infections in infected mammals possibly in combination with other drugs with therapeutic properties against FHCV. 11. Uso degli anticorpi secondo la rivendicazione 10 in metodi analitici per identificare nuovi composti capaci di neutralizzare l’infezione da FICV o come controlli positivi nei metodi per determinare le proprietà neutralizzanti di nuovi composti. 11. Use of antibodies according to claim 10 in analytical methods to identify new compounds capable of neutralizing FICV infection or as positive controls in methods for determining the neutralizing properties of new compounds. 12. Composizioni contenenti almeno un anticorpo o un suo frammento o derivato funzionale ed almeno un carrier o un adjuvante o un diluente. 12. Compositions containing at least one antibody or a functional fragment or derivative thereof and at least one carrier or adjuvant or diluent. 13. Kit diagnostici per identificare e quantificare la proteina E2 e sue varianti in campioni biologici comprendenti anticorpi secondo le rivendicazioni 1 - 7. 13. Diagnostic kits for identifying and quantifying the E2 protein and its variants in biological samples comprising antibodies according to claims 1 - 7. 14. Epitopo costituito dalla sequenza di aminoacidi che corrisponde alla regione 412 - 422 della proteina E2 (QLINTNGSWFII (SEQ ID NO. 78)) o alle sue varianti in cui alle due estremità sono aggiunti due altri residui che permettono di generare strutture cicliche aventi lo stesso numero di atomi o un numero di atomi pari a: N-i oppure N+i, con N = 41 , ovvero numero di atomi presenti nella struttura in cui detti residui sono due cisteine ed i varia da 1 a 10 ed in cui al C-terminale e all’N-terminale sono eventualmente inseriti due residui di lisina. 14. Epitope consisting of the sequence of amino acids that corresponds to the 412 - 422 region of the E2 protein (QLINTNGSWFII (SEQ ID NO. 78)) or to its variants in which two other residues are added to the two ends which allow to generate cyclic structures having the same number of atoms or a number of atoms equal to: N-i or N + i, with N = 41, or number of atoms present in the structure in which said residues are two cysteines and i varies from 1 to 10 and in which the C- two lysine residues are eventually added to the terminal and to the N-terminal. 15. Epitopo secondo la rivendicazione 14 in cui detti residui sono due cisteine, come detto una per parte, unite da un ponte disolforico in modo da generare una struttura ciclica. 15. Epitope according to claim 14 wherein said residues are two cysteines, one on each side, joined by a disulfuric bridge so as to generate a cyclic structure. 16. Epitopo secondo la rivendicazione 15 avente sequenza: KKCQLINTNGSWHIC [SEQ. ID. No. 7] 16. Epitope according to claim 15 having sequence: KKCQLINTNGSWHIC [SEQ. ID. No. 7] 17. Epitopo secondo la rivendicazione 14 in cui detta sequenza inclusa è una sequenza nota corrispondente ai diversi isolati genetici dello stesso virus. 17. Epitope according to claim 14 wherein said included sequence is a known sequence corresponding to the different genetic isolates of the same virus. 18. Epitopi secondo la rivendicazione 17 in cui gli aminoacidi sono essere in configurazione D, retro oppure retro-inverso. 18. Epitopes according to claim 17 wherein the amino acids are either in D, retro or retro-reverse configuration. 19. Uso egli epitopi secondo le rivendicazioni 13 - 17 per la produzione degli anticorpi secondo le rivendicazioni 1 - 8.19. Use of the epitopes according to claims 13 - 17 for the production of the antibodies according to claims 1 - 8.
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