GR1005463B - Μεθοδος για την αναλυση με φασματομετρια μαζας των φυσικα ευρισκομενων πεπτιδιων και του μικρου μοριακου βαρους πρωτεϊνων σε στερεα βιολογικα υλικα και κυτταρα - Google Patents

Μεθοδος για την αναλυση με φασματομετρια μαζας των φυσικα ευρισκομενων πεπτιδιων και του μικρου μοριακου βαρους πρωτεϊνων σε στερεα βιολογικα υλικα και κυτταρα

Info

Publication number
GR1005463B
GR1005463B GR20060100080A GR20060100080A GR1005463B GR 1005463 B GR1005463 B GR 1005463B GR 20060100080 A GR20060100080 A GR 20060100080A GR 20060100080 A GR20060100080 A GR 20060100080A GR 1005463 B GR1005463 B GR 1005463B
Authority
GR
Greece
Prior art keywords
nop
naturally occurring
molecular weight
solid biological
small molecular
Prior art date
Application number
GR20060100080A
Other languages
English (en)
Inventor
Γεωργιος Τσαγκαρης
Κωνσταντινος Βουγας
Original Assignee
Ιδρυμα Ιατροβιολογικων Ερευνων Ακαδημιας Αθηνων (40%)
Τσαγκαρης (51%) Γεωργιος
Βουγας (9%) Κωνσταντινος
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Ιδρυμα Ιατροβιολογικων Ερευνων Ακαδημιας Αθηνων (40%), Τσαγκαρης (51%) Γεωργιος, Βουγας (9%) Κωνσταντινος filed Critical Ιδρυμα Ιατροβιολογικων Ερευνων Ακαδημιας Αθηνων (40%)
Priority to GR20060100080A priority Critical patent/GR1005463B/el
Priority to EP07386003A priority patent/EP1835288A1/en
Publication of GR1005463B publication Critical patent/GR1005463B/el

Links

Classifications

    • G—PHYSICS
    • G01—MEASURING; TESTING
    • G01N—INVESTIGATING OR ANALYSING MATERIALS BY DETERMINING THEIR CHEMICAL OR PHYSICAL PROPERTIES
    • G01N33/00—Investigating or analysing materials by specific methods not covered by groups G01N1/00 - G01N31/00
    • G01N33/48—Biological material, e.g. blood, urine; Haemocytometers
    • G01N33/50—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing
    • G01N33/68—Chemical analysis of biological material, e.g. blood, urine; Testing involving biospecific ligand binding methods; Immunological testing involving proteins, peptides or amino acids
    • G01N33/6803—General methods of protein analysis not limited to specific proteins or families of proteins
    • G01N33/6848—Methods of protein analysis involving mass spectrometry
    • G01N33/6851—Methods of protein analysis involving laser desorption ionisation mass spectrometry

Landscapes

  • Life Sciences & Earth Sciences (AREA)
  • Health & Medical Sciences (AREA)
  • Engineering & Computer Science (AREA)
  • Molecular Biology (AREA)
  • Physics & Mathematics (AREA)
  • Bioinformatics & Cheminformatics (AREA)
  • Bioinformatics & Computational Biology (AREA)
  • Hematology (AREA)
  • Spectroscopy & Molecular Physics (AREA)
  • Chemical & Material Sciences (AREA)
  • Urology & Nephrology (AREA)
  • Biomedical Technology (AREA)
  • Immunology (AREA)
  • Optics & Photonics (AREA)
  • Medicinal Chemistry (AREA)
  • Biotechnology (AREA)
  • Microbiology (AREA)
  • Proteomics, Peptides & Aminoacids (AREA)
  • Biophysics (AREA)
  • Food Science & Technology (AREA)
  • Cell Biology (AREA)
  • Analytical Chemistry (AREA)
  • Biochemistry (AREA)
  • General Health & Medical Sciences (AREA)
  • General Physics & Mathematics (AREA)
  • Pathology (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Other Investigation Or Analysis Of Materials By Electrical Means (AREA)

Abstract

Αναπτύχθηκε μία μέθοδος για τον διαχωρισμό και την ταυτοποίηση με φασματογραφία μάζας των φυσικά ευρισκόμενων πεπτιδίων και των μικρού μοριακού βάρους πρωτεϊνών (naturally occurring peptides and small proteins, NOP/SP) των στερεών βιολογικών υλικών ως αυθύπαρκτα μόρια.Ο διαχωρισμός των πρωτεϊνικών μορίων με βάρος μικρότερο από 10KDa επιτυγχάνεται με την ανάμιξη και ομογενοποίηση του στερεού βιολογικού υλικούσε υδατικό διάλυμα ακετονιτριλίου 50 τοις εκατό που περιέχει επίσης και 0,1τοις εκατό τριφθοροοξεικό οξύ.Εν αντιθέσει με τις εν χρήσει μεθόδους , η παρούσα μέθοδος δεν περιλαμβάνει ιδιαίτερα πολύμπλοκα και χρονοβόρα στάδια κατεργασίας (κλασμάτωσης, χρωματογραφίας, υπερδιήθησης κ.ά.), λόγω δε της δυνατότητας ανάλυσης των NOP/SP με φασματομετρία μάζας MALDI-TOF που παρέχει, είναι ταχεία, επιδέχεται αυτοματοποίησης και ποσοτικοποίησης ,γεγονότα που την καθιστούν υψηλής παραγωγικότητας(high throughput) και κατάλληλη για την εφαρμογή της στη διάγνωση παθολογικών καταστάσεων είτε μέσωανάλυσης ενός ή περισσότερων NOP/SP ως εξειδικευμένων βιολογικών δεικτών είτε μέσω της σύγκρισης φυσιολογικών και παθολογικών πρωτεϊνικών προτύπων προφίλ.
GR20060100080A 2006-02-09 2006-02-09 Μεθοδος για την αναλυση με φασματομετρια μαζας των φυσικα ευρισκομενων πεπτιδιων και του μικρου μοριακου βαρους πρωτεϊνων σε στερεα βιολογικα υλικα και κυτταρα GR1005463B (el)

Priority Applications (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
GR20060100080A GR1005463B (el) 2006-02-09 2006-02-09 Μεθοδος για την αναλυση με φασματομετρια μαζας των φυσικα ευρισκομενων πεπτιδιων και του μικρου μοριακου βαρους πρωτεϊνων σε στερεα βιολογικα υλικα και κυτταρα
EP07386003A EP1835288A1 (en) 2006-02-09 2007-02-06 Method for the analysis of naturally occuring peptides and small proteins in cells and solid biological materials using mass spectrometry

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
GR20060100080A GR1005463B (el) 2006-02-09 2006-02-09 Μεθοδος για την αναλυση με φασματομετρια μαζας των φυσικα ευρισκομενων πεπτιδιων και του μικρου μοριακου βαρους πρωτεϊνων σε στερεα βιολογικα υλικα και κυτταρα

Publications (1)

Publication Number Publication Date
GR1005463B true GR1005463B (el) 2007-03-12

Family

ID=38265730

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
GR20060100080A GR1005463B (el) 2006-02-09 2006-02-09 Μεθοδος για την αναλυση με φασματομετρια μαζας των φυσικα ευρισκομενων πεπτιδιων και του μικρου μοριακου βαρους πρωτεϊνων σε στερεα βιολογικα υλικα και κυτταρα

Country Status (2)

Country Link
EP (1) EP1835288A1 (el)
GR (1) GR1005463B (el)

Family Cites Families (2)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
ATE236930T1 (de) * 1997-08-25 2003-04-15 Suntory Ltd Wespe pompilid neuropeptide
BR0200690A (pt) * 2002-03-04 2004-03-23 Embrapa Pesquisa Agropecuaria Método para detecção de proteinas de origem em misturas complexas

Also Published As

Publication number Publication date
EP1835288A1 (en) 2007-09-19

Similar Documents

Publication Publication Date Title
Gevaert et al. Stable isotopic labeling in proteomics
US10753905B2 (en) Isotopically-labeled proteome standards
Shinde et al. Imprinted polymers displaying high affinity for sulfated protein fragments
MacCoss et al. Quantitative MS for proteomics: teaching a new dog old tricks
US8945861B2 (en) Methods for isotopically labeling biomolecules using mammalian cell-free extracts
Zheng et al. Mechanistic study of CBT-Cys click reaction and its application for identifying bioactive N-terminal cysteine peptides in amniotic fluid
JP2007127631A (ja) 定量的プロテオミクスに適用可能な多重荷電されたペプチドの選択的分離方法
PL1889070T3 (pl) Sposób określania stężenia asymetrycznej dimetyloargininy (ADMA)
Wither et al. Mass spectrometry‐based bottom‐up proteomics: Sample preparation, LC‐MS/MS analysis, and database query strategies
CN104483374B (zh) 一种用maldi‑tof‑tof质谱对蛋白质n端序列进行从头测序的方法和试剂盒
GR1005304B (el) Μεθοδος για την αναλυση με φασματομετρια μαζας των φυσικα ευρισκομενων πεπτιδιων και των μικρου μοριακου βαρους πρωτεϊνων σε βιολογικα υγρα
Pan et al. N-terminal labeling of peptides by trypsin-catalyzed ligation for quantitative proteomics.
Modzel et al. A synthesis of new, bi-labeled peptides for quantitative proteomics
GR1005463B (el) Μεθοδος για την αναλυση με φασματομετρια μαζας των φυσικα ευρισκομενων πεπτιδιων και του μικρου μοριακου βαρους πρωτεϊνων σε στερεα βιολογικα υλικα και κυτταρα
US20070134802A1 (en) Ionization modifier for mass spectrometry
WO2008125957A3 (en) Method for identification and relative quantification of cellular proteins
Li et al. A rapid and efficient method for N-termini analysis in short-lived proteins
US9377468B2 (en) Ion mobility mass spectrometry tags for quantitative applications and methods thereof
Park et al. Liquid chromatography–tandem mass spectrometry to determine the stability of collagen pentapeptide (KTTKS) in rat skin
Pop et al. Evaluation of rapigest efficacy for the digestion of proteins from cell cultures and heart tissue
Zhang et al. Efficient and Selective Chemical Labeling of Electrochemically Generated Peptides Based on Spirolactone Chemistry
Carreira et al. Indirect ultrasonication for protein quantification and peptide mass mapping through mass spectrometry-based techniques
Van Damme et al. Protein processing characterized by a gel-free proteomics approach
Lopes et al. A proposed EPR approach to evaluating agonist binding site of a peptide receptor
Simon Labeling yeast peptides with the iTRAQ reagent

Legal Events

Date Code Title Description
PG Patent granted