FR3068363A1 - USE OF SARCOCYSTIDAE STRAINS IN THE PREVENTION OF INFECTIOUS DISEASES OF POULTRY - Google Patents

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Mehdi Ellouze
Fanny Boursin
Marie-Noëlle MEVELEC
Thi Kim Chi NGUYEN
Didier Roy
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Abstract

La présente invention concerne Souche mutante de Sarcocystidae dans laquelle la fonction de la protéine MIC1 et la fonction de la protéine MIC3 sont supprimées, pour son utilisation dans la prévention de maladies infectieuses chez la volaille.The present invention relates to a mutant strain of Sarcocystidae in which the function of the MIC1 protein and the function of the MIC3 protein are suppressed, for its use in the prevention of infectious diseases in poultry.

Description

UTILISATION DE SOUCHES DE SARCOCYSTIDAE DANS LA PREVENTION DEUSE OF SARCOCYSTIDAE STRAINS IN THE PREVENTION OF

MALADIES INFECTIEUSES DE LA VOLAILLEINFECTIOUS DISEASES OF POULTRY

La présente invention concerne l’utilisation de souches atténuées de parasites pour la prévention et le traitement de pathologies chez la volaille et notamment chez le jeune oiseau des espèces granivores telles que la poule domestique, la dinde et la pintade.The present invention relates to the use of attenuated strains of parasites for the prevention and treatment of pathologies in poultry and in particular in young birds of grain-eating species such as domestic hen, turkey and guinea fowl.

Les Apicomplexes sont des parasites majoritairement intracellulaires obligatoires qui possèdent un cycle de vie pouvant faire intervenir plusieurs hôtes. Le phylum de ces parasites se subdivise en plusieurs familles.Apicomplexa are predominantly obligate intracellular parasites that have a life cycle that can involve several hosts. The phylum of these parasites is subdivided into several families.

Toxoplasma gondii (T gondii) appartient à la famille des Sarcocystidae. Le chat, hôte définitif, excrète le parasite dans l’environnement sous forme d’oocystes. Les hôtes intermédiaires (i.e. l’ensemble des homéothermes) et définitif peuvent s’infecter en ingérant des oocystes présents sur les aliments. Le parasite se transforme alors en tachyzoïtes qui se disséminent dans l’organisme et qui, sous la pression du système immunitaire, s’enkystent avec un tropisme préférentiel pour le système nerveux central, la rétine ou les muscles. L’ingestion de tissus enkystés est la deuxième cause de contamination des hôtes définitifs et intermédiaires. Les souches de T gondii sont classées en fonction de leur degré de virulence in vivo : les souches de type I (i.e. la souche RH) sont hautement virulentes alors que les souches de type II (i.e. les souches ME49, 76K ou Pru) et III (i.e. les souches CEP ou M7741) sont moins virulentes et établissent généralement des infections chroniques. Par ailleurs, de nombreuses souches atypiques non rattachables aux trois premiers types sont identifiées notamment en Afrique et en Amérique du Sud (Howe & Sibley, 1995, J. Infect. Dis., 172(6) : 1561-6 ; Rajendran et al., 2012, Infect. Genet Evol, 12(2) : 359-68). Récemment, une souche vivante atténuée de Toxoplasma gondii, le parasite responsable de la toxoplasmose a été mise au point par invalidation de deux gènes codant pour les protéines TgMICl et TgMIC3 (Cérède et al., 2005, J. Exp. Med., 201(3) : 453-63). Cette souche, dénommée Toxo tgmicf3 KO génère une réponse immunitaire forte et spécifique contre Toxoplasma gondii et permet de prévenir les effets d’une infection ultérieure chez la souris (Ismael et al., 2006, J. Infect. Dis., 194(8) : 1176-83) et chez la brebis (Mévelec et al., 2010, Vet. Res., 41(4) :49).Toxoplasma gondii (T gondii) belongs to the family of Sarcocystidae. The cat, the final host, excretes the parasite into the environment in the form of oocysts. Intermediate (i.e. all homeotherms) and final hosts can become infected by ingesting oocysts present on food. The parasite then turns into tachyzoites which spread throughout the body and which, under pressure from the immune system, become encysted with a preferential tropism for the central nervous system, the retina or the muscles. Ingestion of encysted tissue is the second cause of contamination of final and intermediate hosts. The strains of T gondii are classified according to their degree of virulence in vivo: the type I strains (ie the RH strain) are highly virulent while the type II strains (ie the ME49, 76K or Pru strains) and III (ie the CEP or M7741 strains) are less virulent and generally establish chronic infections. In addition, many atypical strains not traceable to the first three types are identified, especially in Africa and South America (Howe & Sibley, 1995, J. Infect. Dis., 172 (6): 1561-6; Rajendran et al. , 2012, Infect. Genet Evol, 12 (2): 359-68). Recently, a live attenuated strain of Toxoplasma gondii, the parasite responsible for toxoplasmosis, was developed by knocking out two genes coding for the proteins TgMICl and TgMIC3 (Cérède et al., 2005, J. Exp. Med., 201 ( 3): 453-63). This strain, called Toxo tgmicf3 KO, generates a strong and specific immune response against Toxoplasma gondii and makes it possible to prevent the effects of a subsequent infection in mice (Ismael et al., 2006, J. Infect. Dis., 194 (8) : 1176-83) and in sheep (Mévelec et al., 2010, Vet. Res., 41 (4): 49).

Neospora caninum (N. caninum) est un parasite intracellulaire, responsable de la néosporose. Il appartient également à la famille des Sarcocystidae. Le cycle de vie de Neospora caninum est très proche de celui de T. gondii avec deux phases distinctes : une phase sexuée chez l’hôte final (i.e. les canidés et le chien en particulier) qui conduit à la production d’oocystes éliminés dans les fèces et une phase asexuée chez un hôte intermédiaire (i.e. les ovins, les caprins, les bovins, les équidés, etc...) qui conduit à la production de tachyzoïtes puis de kystes contenant les bradyzoïtes.Neospora caninum (N. caninum) is an intracellular parasite responsible for neosporosis. It also belongs to the family of Sarcocystidae. The life cycle of Neospora caninum is very close to that of T. gondii with two distinct phases: a sexual phase in the final host (ie canids and dogs in particular) which leads to the production of oocysts eliminated in the faeces and an asexual phase in an intermediate host (ie sheep, goats, cattle, horses, etc.) which leads to the production of tachyzoites and then cysts containing bradyzoites.

Plus récemment, il a été obtenu une souche vivante atténuée de Neospora caninum, la souche Neo ncmicl-3 KO, qui a été invalidée pour les gènes ncmicl et ncmic3 par recombinaison homologue. Il a été montré que cette souche mutante possède des propriétés infectieuses et immunogènes conférant aux mammifères une protection vaccinale vis-à-vis des effets délétères de la néosporose.More recently, a live attenuated strain of Neospora caninum has been obtained, the Neo ncmicl-3 KO strain, which has been invalidated for the ncmicl and ncmic3 genes by homologous recombination. This mutant strain has been shown to have infectious and immunogenic properties which give mammals vaccine protection against the deleterious effects of neosporosis.

Toxoplasma gondii et Neospora caninum ont en commun un processus spécifique d’invasion des cellules hôtes en plusieurs étapes conduisant à la formation d’une vacuole parasitophore dans laquelle le parasite se multiplie et se développe.Toxoplasma gondii and Neospora caninum have in common a specific process of invasion of host cells in several stages leading to the formation of a parasitophore vacuole in which the parasite multiplies and develops.

Les propriétés immunostimulantes de T. gondii sont connues depuis de nombreuses années et récemment, de nouvelles études ont confirmé l’intérêt d’utiliser T. gondii comme immunostimulant et ont apporté des éléments de réponse sur les mécanismes impliqués. Chez la souris, une infection par T. gondii ou une stimulation avec un extrait parasitaire procure une résistance à une infection par Listeria monocytogenes (Neal et Knoll, 2014, PLoS,Pathog., 10(6) : el004203) par le virus de la grippe H5N1 (O’Brien et al., 2011, J. Virol., 85(17) : 8680-8), ou à une malaria cérébrale due à Plasmodium berghei (Settles et al., 2014, Infect. Immun., 82(3) : 1343-53). Dans le cas de Plasmodium berghei, l’effet observé dépend de l’IL-12 et la protection serait potentiellement liée à la production précoce d’IFN-γ (Settles et al., 2014). Dans le cas du virus de la grippe, l’effet observé dépend de l’IFN- γ produit par les cellules NK activées par l’extrait parasitaire. Enfin, pour Lysteria monocytogenes, l’administration de la profiline de T. gondii avant ou après infection par Lysteria monocytogenes reproduit l’effet protecteur. Cette protection, dépendante du TLR11, de l’IFNγ, mais indépendante de l’IL-12 implique les monocytes inflammatoires recrutés sur le site d’infection fortement induit par la profiline (Neal et al., 2014).The immunostimulatory properties of T. gondii have been known for many years and recently, new studies have confirmed the interest in using T. gondii as an immunostimulant and have provided answers on the mechanisms involved. In mice, infection with T. gondii or stimulation with a parasitic extract provides resistance to infection by Listeria monocytogenes (Neal and Knoll, 2014, PLoS, Pathog., 10 (6): el004203) by the H5N1 flu (O'Brien et al., 2011, J. Virol., 85 (17): 8680-8), or cerebral malaria caused by Plasmodium berghei (Settles et al., 2014, Infect. Immun., 82 (3): 1343-53). In the case of Plasmodium berghei, the effect observed depends on IL-12 and protection is potentially linked to the early production of IFN-γ (Settles et al., 2014). In the case of the influenza virus, the effect observed depends on the IFN-γ produced by the NK cells activated by the parasite extract. Finally, for Lysteria monocytogenes, the administration of T. gondii profilin before or after infection with Lysteria monocytogenes reproduces the protective effect. This protection, dependent on TLR11, on IFNγ, but independent of IL-12, involves inflammatory monocytes recruited at the site of infection strongly induced by profilin (Neal et al., 2014).

Une souche de T. gondii, non réplicative (cps) a également été utilisée dans des traitements contre des tumeurs (Baird et al., 2013, Cancer Res., 73(13) : 3842-51 ; Baird et al., 2013, J. Immunol., 190(1) :469-78 ; Sanders et al., 2015, Oncoimmunology, 5(4) : el 104447). Le parasite vivant en activant le système immunitaire inné, rompt l’immunosuppression ce qui conduit à une réactivation de l’immunité adaptative spécifique de la tumeur, cependant quelques différences existent dans les cellules et les mécanismes impliqués.A non-replicative (gps) strain of T. gondii has also been used in the treatment of tumors (Baird et al., 2013, Cancer Res., 73 (13): 3842-51; Baird et al., 2013, J. Immunol., 190 (1): 469-78; Sanders et al., 2015, Oncoimmunology, 5 (4): el 104447). The living parasite by activating the innate immune system, disrupts immunosuppression which leads to a reactivation of the tumor-specific adaptive immunity, however some differences exist in the cells and the mechanisms involved.

Une dizaine d’effecteurs jouent un rôle dans la régulation de la réponse de la cellule hôte suite à une infection par T. gondii.About ten factors play a role in regulating the response of the host cell following infection with T. gondii.

La protéine R0P16 compte parmi les modulateurs de la réponse immunitaire de l’hôte les mieux étudiés (Saeij et al., 2007, Nature, 445(7126) : 324-7. Cette protéine de rhoptries est une protéine kinase qui interagit avec la cascade de signalisation JAK/STAT en phosphorylant STAT3 via la Tyr 705 et STAT6 via la Tyr 641 et conférant ainsi au parasite un rôle de suppresseur de l’inflammation et de contrôle de l’infection par la cellule hôte. Dans les parasites type I, II et III, ROP16 est capable de phosphoryler STAT3 et STAT6 mais c’est seulement sous sa forme de type I et III qu’elle maintient de manière constitutive et durable, la phospohorylation des STATs 3 et 6 (Saeij et al., 2007, Yamamoto et al., 2009, J. Exp. Med., 206(12): 2747-60). L’effet immunosuppresseur de ROP16 a notamment été démontré sur une lignée de macrophages murins raw264.7 infectée avec différentes souches de Toxoplasma gondii (type I, II, III, II ROP16 ΚΙ, II ROP16KI-NLS déficient). Une diminution de la sécrétion d’IL-12p40 au bout de 24 heures est observée lorsque les raw264.7 sont infectées avec les souches exprimant ROPI61. (Saeij et al., 2007). Par ailleurs, in vivo, chez la souris inoculée par voie intra-péritonéale avec une souche de type I ROPI61KO, une augmentation de la réplication du parasite dans le foie, la rate, les poumons et le cerveau comparé à une souche de type IWT est observée (Butcher et al., 2011, PLoS Pathogen, 7(9). : e1002236)The protein R0P16 is one of the best studied modulators of the host immune response (Saeij et al., 2007, Nature, 445 (7126): 324-7. This rhoptin protein is a protein kinase that interacts with the cascade signaling JAK / STAT by phosphorylating STAT3 via Tyr 705 and STAT6 via Tyr 641 and thus conferring on the parasite a role of suppressor of inflammation and control of the infection by the host cell. In parasites type I, II and III, ROP16 is capable of phosphorylating STAT3 and STAT6 but it is only in its type I and III form that it maintains in a constitutive and lasting manner, the phospohorylation of STATs 3 and 6 (Saeij et al., 2007, Yamamoto et al., 2009, J. Exp. Med., 206 (12): 2747-60) The immunosuppressive effect of ROP16 was notably demonstrated on a line of raw264.7 murine macrophages infected with different strains of Toxoplasma gondii ( type I, II, III, II ROP16 ΚΙ, II ROP16KI-NLS deficient) A decrease in the secretion of IL-12p40 after 24 hours is observed when the raw264.7 are infected with the strains expressing ROPI61. (Saeij et al., 2007). Furthermore, in vivo, in mice inoculated intraperitoneally with a type I strain ROPI61KO, an increase in the replication of the parasite in the liver, spleen, lungs and brain compared to a type IWT strain is observed (Butcher et al., 2011, PLoS Pathogen, 7 (9).: e1002236)

La protéine de granule GRAI5 est également une protéine capable de modifier la réponse de l’hôte. La forme GRAI5 de type II (GRA15n) présente une protéine de 635 acides aminés contrairement à la souche de type I qui présente une protéine tronquée de 312 acides aminés due à une mutation de la séquence codante qui a engendré un codon stop prématuré (Rosowski et al., 2011, J. Exp. Med., 208(1) :195-212). Seule GRA15n permet l’activation de la voie de signalisation de NF-κΒ indépendamment des voies MyD88 et Trif (Rosowski et al., 2011) et permet une activation classique des macrophages en Ml qui expriment des cytokines pro-inflammatoires comme IL-12/23p40, l’IL-6 et d’autres costimulateurs, CD40 et CD8 ; permettant alors l’établissement d’une réponse de type Thl protectrice de l’hôte infecté (Jensen et al., 2011, CellHostMicrobe, 9(6) :462-83).GRAI5 granule protein is also a protein capable of modifying the host response. The GRAI5 type II form (GRA15n) has a protein of 635 amino acids unlike the type I strain which has a truncated protein of 312 amino acids due to a mutation in the coding sequence which has produced a premature stop codon (Rosowski and al., 2011, J. Exp. Med., 208 (1): 195-212). Only GRA15n allows activation of the NF-κΒ signaling pathway independently of the MyD88 and Trif pathways (Rosowski et al., 2011) and allows classic activation of macrophages in Ml which express pro-inflammatory cytokines such as IL-12 / 23p40, IL-6 and other costimulators, CD40 and CD8; thus allowing the establishment of a protective Th1 response of the infected host (Jensen et al., 2011, CellHostMicrobe, 9 (6): 462-83).

En synergie avec GRA15n, ROPI61 activerait également STAT5 pour moduler l’expression des gènes de la cellule hôte : Jensen et son équipe (2013) par le biais de l’utilisation d’une variété de parasites transgéniques et KO, ont démontré que GRA15n et ROPI61 permettent de limiter la réplication du parasite dans les intestins d’une souris infectée oralement et améliorent la résistance à l’infection des macrophages stimulés par le TNFa et l’IFN-γ. Ces mécanismes semblent être indépendants de STAT3 et STAT6, mais dépendants de STAT5.ROP16 induit une phosphorylation durable de STAT5 ainsi que sa translocation nucléaire (Jensen et al., 2013 ,Infect. Immun., 81(6) : 2156-67).In synergy with GRA15n, ROPI61 would also activate STAT5 to modulate the expression of genes in the host cell: Jensen and his team (2013) through the use of a variety of transgenic parasites and KO, have demonstrated that GRA15n and ROPI61 limit the replication of the parasite in the intestines of an orally infected mouse and improve the resistance to infection of macrophages stimulated by TNFa and IFN-γ. These mechanisms seem to be independent of STAT3 and STAT6, but dependent on STAT5.ROP16 induces a lasting phosphorylation of STAT5 as well as its nuclear translocation (Jensen et al., 2013, Infect. Immun., 81 (6): 2156-67).

De manière surprenante, les inventeurs ont trouvé que la suppression de la fonction des deux protéines MIC3 et MIC1, dans une souche de Sarcocystidae, conduit à une souche mutante qui possède des propriétés infectieuses et immunogènes conférant aux oiseaux et notamment aux volailles une protection vaccinale vis-à-vis des effets de maladies infectieuses.Surprisingly, the inventors have found that the suppression of the function of the two proteins MIC3 and MIC1, in a strain of Sarcocystidae, leads to a mutant strain which has infectious and immunogenic properties conferring on birds and in particular poultry a vaccine protection vis -to the effects of infectious diseases.

La présente invention a donc pour objet une souche mutante de Sarcocystidae dans laquelle la fonction de la protéine MIC1 et la fonction de la protéine MIC3 sont supprimées, pour son utilisation dans la prévention de maladies infectieuses chez la volaille, ladite souche mutante de Sarcocystidae étant formulée pour une administration in ovo ou chez un poussin âgé de 0 à 72 heures.The present invention therefore relates to a mutant strain of Sarcocystidae in which the function of the protein MIC1 and the function of the protein MIC3 are suppressed, for its use in the prevention of infectious diseases in poultry, said mutant strain of Sarcocystidae being formulated for administration in ovo or in a chick 0 to 72 hours old.

Le terme « volaille » désigne les poules, dindes, pintades, canards, oies, cailles, pigeons, faisans, perdrix, les autruches, les nandous, les émeus et les kiwis élevés ou détenus en captivité en vue de leur reproduction, de la production de viande ou d'œufs de consommation ou de la fourniture de gibier de repeuplement.The term “poultry” designates hens, turkeys, guinea fowl, ducks, geese, quail, pigeons, pheasants, partridges, ostriches, rheas, emus and kiwis bred or kept in captivity for the purpose of their reproduction, production meat or eggs for consumption or the supply of restocking game.

Selon la présente invention, la souche mutante de Sarcocystidae peut être administrée in ovo, c’est-à-dire soit dans le liquide amiotique, soit dans l’embryon, après la ponte de l’œuf.According to the present invention, the mutant strain of Sarcocystidae can be administered in ovo, that is to say either in the amotic fluid or in the embryo, after the laying of the egg.

Le développement d’un œuf fécondé commence, par division cellulaire, dès qu’il traverse l’oviducte de la volaille qui va le pondre. Lorsque la volaille pond l’œuf, l’embryon se refroidit et le développement est suspendu.The development of a fertilized egg begins, by cell division, as soon as it crosses the oviduct of the poultry which is going to lay it. When poultry lays the egg, the embryo cools and development is halted.

Le développement de l’embryon commence quand la température de l’œuf dépasse 26,6 °C.The development of the embryo begins when the temperature of the egg exceeds 26.6 ° C.

Selon la présente invention, la souche mutante de Sarcocystidae peut également être administrée chez un poussin.According to the present invention, the mutant strain of Sarcocystidae can also be administered to a chick.

Le terme « poussin » selon la présente invention désigne toute volaille âgée de 0 à 72 heures et non encore nourries. Toutefois les canards de Barbarie (Cairina moschata) ou leurs croisements peuvent être nourris.The term "chick" according to the present invention designates any poultry aged from 0 to 72 hours and not yet fed. However Muscovy ducks (Cairina moschata) or their crosses can be fed.

L’utilisation des souches mutantes de Sarcocystidae selon la présente invention par ces modes d’administration, va permettre de prévenir les maladies infectieuses chez la volaille au cours de son développement et tout au long de sa vie.The use of the mutant strains of Sarcocystidae according to the present invention by these methods of administration will make it possible to prevent infectious diseases in poultry during its development and throughout its life.

Au sens de l’invention, on entend par « maladie infectieuse », une maladie provoquée par un agent infectieux choisi parmi : un virus, un parasite ou une bactérie.For the purposes of the invention, the term "infectious disease" means a disease caused by an infectious agent chosen from: a virus, a parasite or a bacterium.

La présente invention a également pour objet une souche mutante de Sarcocystidae dans laquelle la fonction de la protéine MIC1 et la fonction de la protéine MIC3 sont supprimées, pour son utilisation dans la prévention de maladies infectieuses chez la volaille, ladite maladie infectieuse étant une maladie d’origine virale.The present invention also relates to a mutant strain of Sarcocystidae in which the function of the MIC1 protein and the function of the MIC3 protein are suppressed, for its use in the prevention of infectious diseases in poultry, said infectious disease being a disease of 'viral origin.

La maladie d’origine virale est une maladie causée par un virus qui peut être :Viral disease is a disease caused by a virus which can be:

- un myxovirus, en particulier le virus Influenza, ou- a myxovirus, in particular the Influenza virus, or

- un coronavirus, en particulier le virus de la bronchite infectieuse aviaire, ou- a coronavirus, in particular the avian infectious bronchitis virus, or

- un reovirus, en particulier du virus de l’arthrite virale du poulet, ou- a reovirus, in particular the chicken viral arthritis virus, or

- un picomavirus, en particulier le virus de l’hépatite du caneton,- a picomavirus, in particular the duckling hepatitis virus,

- un herpesvirus, en particulier le virus de la maladie de Mareck,- a herpes virus, in particular the Mareck's disease virus,

- un adénovirus, en particulier le virus de l’entérite hémorragique de la dinde.- an adenovirus, in particular the turkey hemorrhagic enteritis virus.

Selon un mode de réalisation particulier, la présente invention concerne également une souche mutante de Sarcocystidae dans laquelle la fonction de la protéine MIC1 et la fonction de la protéine MIC3 sont supprimées, pour son utilisation dans la prévention de maladies infectieuses chez la volaille, ladite maladie infectieuse étant une maladie d’origine virale, le virus pouvant appartenir aux groupes suivant :According to a particular embodiment, the present invention also relates to a mutant strain of Sarcocystidae in which the function of the MIC1 protein and the function of the MIC3 protein are suppressed, for its use in the prevention of infectious diseases in poultry, said disease infectious being a disease of viral origin, the virus possibly belonging to the following groups:

• Groupe I, II de la classification de Baltimore comprenant les virus dont le génome est constitué d’ADN susceptible d’infecter un poussin, en particulier un virus naturel appartenant à la famille des Herpesviridae, et plus particulièrement le virus de la maladie Marek chez la poule domestique, • Groupe III, IV et V de la classification de Baltimore comprenant les virus dont le génome est constitué d’ARN simple brin ou double brin et qui sont susceptibles d’affecter un poussin, en particulier des virus appartenant à la famille des Orthomyxoviridae et plus particulièrement les virus Influenza aviaires.• Group I, II of the Baltimore classification comprising viruses whose genome consists of DNA capable of infecting a chick, in particular a natural virus belonging to the family of Herpesviridae, and more particularly the Marek disease virus in the domestic hen, • Group III, IV and V of the Baltimore classification comprising viruses whose genome consists of single-stranded or double-stranded RNA and which are capable of affecting a chick, in particular viruses belonging to the family Orthomyxoviridae and more particularly avian influenza viruses.

• Groupe VI de la classification de Baltimore comprenant les virus à ARN requérant une rétrotranscription en ADN pour la multiplication virale et susceptibles d’infecter un poussin, en particulier les virus de la famille des Retroviridae, • Groupe VII de la classification de Baltimore comprenant les virus à ADN requérant une rétrotranscription en ARN pour la multiplication virale et susceptibles d’infecter un poussin, en particulier les virus de la famille des Hepadnaviridae, et plus particulièrement le virus de l’hépatite du canard de Pékin (DHBV).• Group VI of the Baltimore classification comprising RNA viruses requiring DNA back-transcription for viral multiplication and capable of infecting a chick, in particular viruses of the family Retroviridae, • Group VII of the Baltimore classification comprising DNA virus requiring retrotranscription into RNA for viral multiplication and capable of infecting a chick, in particular the viruses of the family Hepadnaviridae, and more particularly the Peking duck hepatitis virus (DHBV).

Dans un mode de réalisation particulier, la présente invention a également pour objet une souche mutante de Sarcocystidae dans laquelle la fonction de la protéine MIC1 et la fonction de la protéine MIC3 sont supprimées, pour son utilisation dans la prévention de maladies d’origine virale chez la volaille, ladite maladie d’origine virale étant la grippe aviaire.In a particular embodiment, the present invention also relates to a mutant strain of Sarcocystidae in which the function of the MIC1 protein and the function of the MIC3 protein are suppressed, for its use in the prevention of diseases of viral origin in poultry, said viral illness being avian influenza.

La présente invention a également pour objet une souche mutante de Sarcocystidae dans laquelle la fonction de la protéine MIC1 et la fonction de la protéine MIC3 sont supprimées, pour son utilisation dans la prévention de maladies infectieuses chez la volaille, ladite maladie infectieuse étant une maladie d’origine bactérienne.The present invention also relates to a mutant strain of Sarcocystidae in which the function of the MIC1 protein and the function of the MIC3 protein are suppressed, for its use in the prevention of infectious diseases in poultry, said infectious disease being a disease of of bacterial origin.

La maladie d’origine bactérienne est une maladie causée par une bactérie des genres:Bacterial disease is a disease caused by bacteria of the genera:

Escherichia spp., en particulier l’espèce Escherichia coliEscherichia spp., In particular Escherichia coli

Clostridium spp. en particulier l’espèce ClostridiumperfringensClostridium spp. in particular Clostridiumperfringens

- Mycoplasma spp., en particulier l’espèce Mycoplasma gallisepticum,- Mycoplasma spp., In particular the species Mycoplasma gallisepticum,

Salmonella spp., en particulier l’espèce Salmonella pullorum, responsable de la salmonellose aviaire.Salmonella spp., In particular the species Salmonella pullorum, responsible for avian salmonellosis.

Pasteurella spp., en particulier l’espèce Pasteurella multocidaPasteurella spp., In particular the species Pasteurella multocida

Ornithobacterium spp., en particulier l’espèce Ornithobacterium rhinotrachealeOrnithobacterium spp., In particular the species Ornithobacterium rhinotracheale

Selon un mode de réalisation particulier, la présente invention concerne également une souche mutante de Sarcocystidae dans laquelle la fonction de la protéine MIC1 et la fonction de la protéine MIC3 sont supprimées, pour son utilisation dans la prévention de maladies infectieuses chez la volaille, ladite maladie infectieuse étant une maladie d’origine bactérienne (ou causée par une toxine provenant d’une bactérie), ladite bactérie pouvant appartenir aux groupes suivant :According to a particular embodiment, the present invention also relates to a mutant strain of Sarcocystidae in which the function of the MIC1 protein and the function of the MIC3 protein are suppressed, for its use in the prevention of infectious diseases in poultry, said disease infectious being a disease of bacterial origin (or caused by a toxin originating from a bacterium), said bacterium being able to belong to the following groups:

• Des Coques GRAM positif qui sont susceptibles d’affecter un poussin directement ou par l’un de ces sous-produits, , en particulier des bactéries appartenant au genre Staphylococcus, Streptococcus ou Enteroccoccus ;• GRAM positive shells which are likely to affect a chick directly or through one of these by-products, in particular bacteria belonging to the genus Staphylococcus, Streptococcus or Enteroccoccus;

• Des Coques GRAM négatif qui sont susceptibles d’affecter un poussin directement ou par l’un de ces sous-produits, en particulier des bactéries appartenant au genre Neisseria ;• GRAM negative shells which are likely to affect a chick directly or through one of these by-products, in particular bacteria belonging to the genus Neisseria;

• Des bacilles GRAM positif qui sont susceptibles d’affecter un poussin directement ou par l’un de ces sous-produits, en particulier des bactéries appartenant au genre Listeria, Erysipelothryx, Corynebacterium ou Bacillus ;• GRAM positive bacilli which are likely to affect a chick directly or through one of these by-products, in particular bacteria belonging to the genus Listeria, Erysipelothryx, Corynebacterium or Bacillus;

• Des bacilles GRAM négatif qui sont susceptibles d’affecter un poussin directement ou par l’un de ces sous-produits, en particulier des bactéries appartenant à la famille des Enterobacteriacae. Pseudomonaceae, Vibrionaceae ou appartenant aux genres Escherichia, Brucella, Haemophilus, Pasteurella, Bordetella, Légionella, Ornithobacterium ou Salmonella ;• GRAM negative bacilli which can affect a chick directly or through one of these by-products, in particular bacteria belonging to the Enterobacteriacae family. Pseudomonaceae, Vibrionaceae or belonging to the genera Escherichia, Brucella, Haemophilus, Pasteurella, Bordetella, Légionella, Ornithobacterium or Salmonella;

• Des bactéries de forme spiralées GRAM positives ou négatives qui sont susceptibles d’affecter un poussin directement ou par l’un de ces sous-produits, en particulier des bactéries appartenant au genre Treponema, Leptospira ou Borrelia ;• Positive or negative GRAM spiral-shaped bacteria which may affect a chick directly or through one of these by-products, in particular bacteria belonging to the genus Treponema, Leptospira or Borrelia;

• Des bactéries de type mycoplasme qui sont susceptibles d’affecter un poussin directement ou par l’un de ces sous-produits, en particulier des bactéries appartenant au genre Mycoplasma et Ureaplasma ;• Mycoplasma type bacteria which are capable of affecting a chick directly or through one of these by-products, in particular bacteria belonging to the genera Mycoplasma and Ureaplasma;

• Des bactéries non sus-mentionnées ayant la capacité d’envahir une cellule de poussin, en particulier des bactéries appartenant au genre Chlamydia, Rickettsia ou Micobacterium.• Bacteria not mentioned above having the capacity to invade a chick cell, in particular bacteria belonging to the genus Chlamydia, Rickettsia or Micobacterium.

Salmonella Enteritidis est responsable de toxi-infections alimentaires et de gastro-entérites. L’Homme s’infecte par l’intermédiaire de viandes de volailles ou d’œufs contaminés. La poule domestique est l’un des plus importants vecteurs de salmonelles. Elle s’infecte par voie orale. La bactérie colonise ensuite le tube digestif et peut s’implanter durablement dans les ovaires au cours d’une phase transitoire de dissémination systémique.Salmonella Enteritidis is responsible for foodborne illness and gastroenteritis. People get infected through contaminated poultry meat or eggs. The domestic hen is one of the most important vectors of salmonella. It is infected orally. The bacteria then colonize the digestive tract and can be permanently implanted in the ovaries during a transient phase of systemic dissemination.

Le portage long terme dans le tube digestif, notamment dans les cæca, est responsable de la contamination des viandes lors de l’abattage et de la contamination de la coquille d’œuf lors du passage par le cloaque. Le portage des salmonelles dans les ovaires peut être responsable du transfert vertical des salmonelles à l’intérieur de l’œuf. Ce mode de contamination est moins fréquent mais potentiellement plus dangereux car il est difficilement détectable et il n’y a pas de mesure corrective possible.Long-term babywearing in the digestive tract, especially in cæca, is responsible for the contamination of meat during slaughter and the contamination of the eggshell during passage through the cloaca. Carrying salmonella into the ovaries may be responsible for the vertical transfer of salmonella into the egg. This mode of contamination is less frequent but potentially more dangerous because it is difficult to detect and there is no possible corrective measure.

Dans un mode de réalisation particulier, la présente invention a également pour objet une souche mutante de Sarcocystidae dans laquelle la fonction de la protéine MIC1 et la fonction de la protéine MIC3 sont supprimées, pour son utilisation dans la prévention de maladies d’origine bactérienne chez la volaille, ladite maladie d’origine bactérienne étant la salmonellose aviaire.In a particular embodiment, the present invention also relates to a mutant strain of Sarcocystidae in which the function of the MIC1 protein and the function of the MIC3 protein are suppressed, for its use in the prevention of diseases of bacterial origin in poultry, said disease of bacterial origin being avian salmonellosis.

La présente invention a également pour objet une souche mutante de Sarcocystidae dans laquelle la fonction de la protéine MIC1 et la fonction de la protéine MIC3 sont supprimées, pour son utilisation dans la prévention de maladies infectieuses chez la volaille, ladite maladie infectieuse étant une maladie d’origine parasitaire.The present invention also relates to a mutant strain of Sarcocystidae in which the function of the MIC1 protein and the function of the MIC3 protein are suppressed, for its use in the prevention of infectious diseases in poultry, said infectious disease being a disease of parasitic origin.

La maladie d’origine parasitaire est une maladie causée par un parasite qui peut être :Parasitic disease is a disease caused by a parasite which can be:

Eimeria spp., en particulier l’espèce Eimeria acervulina responsable de la coccidioseEimeria spp., In particular the species Eimeria acervulina responsible for coccidiosis

- Echinuria spp., en particulier l’espèce Echimiria uncinata responsable de la spirurose- Echinuria spp., In particular the species Echimiria uncinata responsible for spirurosis

Trichostrongylus spp. en particulier l’espèce Trichostrongylus tenuisTrichostrongylus spp. in particular the species Trichostrongylus tenuis

Ascaris spp., en particulier 1 ’espèce Ascaridia galliAscaris spp., In particular 1 species Ascaridia galli

Cestoda spp. en particulier l’espèce Choanotaenia infundibulumCestoda spp. in particular the Choanotaenia infundibulum species

Leishmania spp., en particulier Γespèce Leishmania infantum.Leishmania spp., In particular the species Leishmania infantum.

Selon un mode de réalisation particulier, la présente invention concerne également une souche mutante de Sarcocystidae dans laquelle la fonction de la protéine MIC1 et la fonction de la protéine MIC3 sont supprimées, pour son utilisation dans la prévention de maladies infectieuses chez la volaille, ladite maladie infectieuse étant une maladie d’origine parasitaire, ledit parasite pouvant appartenir aux groupes suivant :According to a particular embodiment, the present invention also relates to a mutant strain of Sarcocystidae in which the function of the MIC1 protein and the function of the MIC3 protein are suppressed, for its use in the prevention of infectious diseases in poultry, said disease infectious being a disease of parasitic origin, said parasite possibly belonging to the following groups:

• Protozoaires susceptibles d’affecter directement un poussin, en particulier des protozoaires appartenant à l’embranchement des sporozoaires, Rhizoflagellés, des ciliés ou appartenant aux genres Encephalitozoon, Enterocytozoon ou blastocystis ;• Protozoa likely to directly affect a chick, in particular protozoa belonging to the sporozoan, Rhizoflagellate, ciliate or belonging to the genera Encephalitozoon, Enterocytozoon or blastocystis;

• Némathelminthes susceptibles d’affecter directement un poussin, en particulier des Némathelminthes appartenant au genre Trichuris, Ascaris, Anisakis, Necator, Strongyloïdes, Toxocara, Ancylostoma, Trichinella, Loa, Onchocerca, Wichereria, ou Enterobius ;• Nemathelminths likely to directly affect a chick, in particular Nemathelminths belonging to the genus Trichuris, Ascaris, Anisakis, Necator, Strongyloïdes, Toxocara, Ancylostoma, Trichinella, Loa, Onchocerca, Wichereria, or Enterobius;

• Plathelminthes susceptibles d’affecter directement un poussin, en particulier des Plathelminthes appartenant au genre Fasciola, Paragonimus, Opisthorchis, Sasciolopsis, Dicrocoelium, Clonorchis, Taenia, Diphyllobothrium, Echinococcus, Multiceps, Hymenolepsis et Shistosoma ;• Plathelminths likely to directly affect a chick, in particular Plathelminths belonging to the genus Fasciola, Paragonimus, Opisthorchis, Sasciolopsis, Dicrocoelium, Clonorchis, Taenia, Diphyllobothrium, Echinococcus, Multiceps, Hymenolepsis and Shistosoma;

• Arthropodes susceptibles d’être responsable d’une affection ou de la vectorisation d’un agent infectieux vis-à-vis un poussin, en particulier des arthropodes appartenant à l’ordre des Anoploures des hétéroptères, des Shiphonaptères, des Diptères, des Brachycères ou des Acariens.• Arthropods likely to be responsible for a disease or vectorization of an infectious agent vis-à-vis a chick, in particular arthropods belonging to the order of Anoploures of heteroptera, Shiphonaptera, Diptera, Brachycera or Mites.

Les parasites du genre Eimeria sont responsables de coccidioses aviaires et de pertes économiques importantes dans les élevages avicoles. Ils ont un tropisme intestinal, allant du duodénum aux caeca et induisent des diarrhées plus ou moins sévères. Par exemple, Eimeria tenella est faiblement prévalent et fortement virulent. Ce parasite affecte les caeca et induit une entérite nécrotique hémorragique chez le poulet, responsable de taux de morbidité et de mortalité très important. A l’inverse, Eimeria acervulina envahit le duodénum et provoque une entérite modérée. Il est responsable d’une mortalité inférieure à 10% et d’une morbidité modérée qui se traduit par une perte de poids dans les élevages de poulet de chair industriels entre 1 et 3 semaines post-éclosion. Cette perte de poids peut être responsable d’un déclassement des carcasses et de pertes économiques importantes.Parasites of the genus Eimeria are responsible for avian coccidiosis and significant economic losses in poultry farming. They have intestinal tropism, ranging from the duodenum to the caeca and induce more or less severe diarrhea. For example, Eimeria tenella is weakly prevalent and highly virulent. This parasite affects caeca and induces necrotic haemorrhagic enteritis in chicken, responsible for very high morbidity and mortality rates. Conversely, Eimeria acervulina invades the duodenum and causes moderate enteritis. It is responsible for mortality below 10% and moderate morbidity which results in weight loss in industrial broiler farms between 1 and 3 weeks post-hatching. This weight loss can be responsible for a downgrading of carcasses and significant economic losses.

Dans un mode de réalisation particulier, la présente invention a également pour objet une souche mutante de Sarcocystidae dans laquelle la fonction de la protéine MIC1 et la fonction de la protéine MIC3 sont supprimées, pour son utilisation dans la prévention de maladies d’origine parasitaire chez la volaille, ladite maladie d’origine parasitaire étant la coccidiose.In a particular embodiment, the present invention also relates to a mutant strain of Sarcocystidae in which the function of the MIC1 protein and the function of the MIC3 protein are suppressed, for its use in the prevention of diseases of parasitic origin in poultry, said parasitic disease being coccidiosis.

La famille des Sarcocystidae, dans les Apicomplexes, comprend notamment les genres Toxoplasma spp. et Neospora spp., qui renferment notamment respectivement les espèces Toxoplasma gondii et Neospora caninum.The family of Sarcocystidae, in the Apicomplexes, includes in particular the genera Toxoplasma spp. and Neospora spp., which include the species Toxoplasma gondii and Neospora caninum, respectively.

Dans une mode de réalisation particulier, la présente invention a également pour objet une souche mutante de Sarcocystidae dans laquelle la fonction de la protéine MIC1 et la fonction de la protéine MIC3 sont supprimées, pour son utilisation dans la prévention de maladies d’origine infectieuse chez la volaille, ladite souche mutante étant une souche de Toxoplasma spp., en particulier de Toxoplasma gondii.In a particular embodiment, the present invention also relates to a mutant strain of Sarcocystidae in which the function of the MIC1 protein and the function of the MIC3 protein are suppressed, for its use in the prevention of diseases of infectious origin in poultry, said mutant strain being a strain of Toxoplasma spp., in particular of Toxoplasma gondii.

Dans un mode de réalisation particulier, la présente invention a également pour objet une souche mutante de Sarcocystidae dans laquelle la fonction de la protéine MIC1 et la fonction de la protéine MIC3 sont supprimées, pour son utilisation dans la prévention de maladies d’origine infectieuse chez la volaille, ladite souche mutante étant une souche de Neospora spp., en particulier de Neospora caninum.In a particular embodiment, the present invention also relates to a mutant strain of Sarcocystidae in which the function of the MIC1 protein and the function of the MIC3 protein are suppressed, for its use in the prevention of diseases of infectious origin in poultry, said mutant strain being a strain of Neospora spp., in particular of Neospora caninum.

Dans les souches utilisées dans la présente invention, la fonction des protéines MIC1 et MIC3 a été supprimée.In the strains used in the present invention, the function of the proteins MIC1 and MIC3 has been suppressed.

Les protéines sont les effecteurs de l’activité cellulaire. La suppression de la fonction d’une protéine peut résulter de son absence de biosynthèse ou de sa non fonctionnalité. L’origine de ce dysfonctionnement peut être liée à des perturbations survenant lors de la transcription du gène codant la protéine, lors de sa traduction ou encore survenir lors de processus de maturation de la protéine (modifications post-traductionelles). La délétion du gène explique également qu’aucune protéine ne puisse être synthétisée.Proteins are the effectors of cellular activity. The suppression of the function of a protein can result from its lack of biosynthesis or its non-functionality. The origin of this dysfunction can be linked to disturbances occurring during the transcription of the gene encoding the protein, during its translation or even occurring during the process of maturation of the protein (post-translational modifications). The deletion of the gene also explains why no protein can be synthesized.

Les protéines MIC1 et MIC3 sont des protéines des micronèmes, organelles sécrétoires des Apicomplexes qui jouent un rôle central dans la reconnaissance et l’adhésion aux cellules hôtes. Elles sont respectivement codées par les gènes miel et mic3.The MIC1 and MIC3 proteins are proteins of micronemes, secretory organelles of Apicomplexes which play a central role in recognition and adhesion to host cells. They are respectively coded by the honey and mic3 genes.

Dans la présente invention, on entend par « la fonction de la protéine MIC1 est supprimée », soit l’absence de l’expression de la protéine MIC1, soit l’expression d’une protéine MIC1 non fonctionnelle, par exemple l’expression d’une protéine ne possédant pas la fonction de la protéine MIC1 et ayant une certaine identité de séquence en acides aminés avec celle de la protéine MIC1.In the present invention, the term “the function of the MIC1 protein is suppressed” means either the absence of expression of the MIC1 protein, or the expression of a non-functional MIC1 protein, for example the expression of a protein not having the function of the MIC1 protein and having a certain amino acid sequence identity with that of the MIC1 protein.

On entend par « la fonction de la protéine MIC3 est supprimée », soit l’absence de l’expression de MIC3, soit l’expression d’une protéine MIC3 non fonctionnelle, par exemple une protéine ne possédant pas la fonction de la protéine MIC3 et ayant une certaine identité de séquence en acides aminés avec celle de la protéine MIC3.The expression “the function of the MIC3 protein is suppressed” means either the absence of the expression of MIC3 or the expression of a non-functional MIC3 protein, for example a protein lacking the function of the MIC3 protein. and having a certain amino acid sequence identity with that of the MIC3 protein.

L’absence de l’expression de la protéine MIC1 et de la protéine MIC3 peut résulter de la délétion de la totalité des gènes miel et mic3 codant respectivement pour les protéines MIC1 et MIC3, ou de sa région codante, ou d’une mutation, d’une délétion ou d’une insertion d’un ou plusieurs nucléotides dans la région codante des gènes miel et mic3 entraînant l’absence d’expression des protéines ou des protéines avec peu d’identité de séquence en acides aminés avec les protéines MIC1 et MIC3, ou d’un dysfonctionnement de la région promotrice ou de la région régulatrice en cis ou en trans des gènes miel et mic3, ou d’un dysfonctionnement d’un ou plusieurs facteurs de transcription susceptibles de se lier à ladite région promotrice, ou d’un dysfonctionnement de la traduction de l’ARN messager, ou de quelques modifications épigénétiques bien connues de l’homme de l’art.The absence of the expression of the MIC1 protein and of the MIC3 protein can result from the deletion of all of the honey and mic3 genes coding respectively for the MIC1 and MIC3 proteins, or from its coding region, or from a mutation, deletion or insertion of one or more nucleotides in the coding region of the honey and mic3 genes resulting in the absence of expression of proteins or proteins with little amino acid sequence identity with the MIC1 proteins and MIC3, or a dysfunction of the promoter region or of the cis or trans regulatory region of the honey and mic3 genes, or of a dysfunction of one or more transcription factors capable of binding to said promoter region, or a dysfunction in the translation of messenger RNA, or some epigenetic modifications well known to those skilled in the art.

Ainsi, la fonction d’une protéine peut être supprimée par l’inhibition de l’expression des gènes.Thus, the function of a protein can be suppressed by inhibiting the expression of genes.

On entend par « inhibition de l’expression des gènes miel et mie3 », tous les mécanismes qui perturbent la transcription des gènes miel et mic3 en un ARN messager ou tous les mécanismes qui perturbent la traduction des ARN messager en protéines MIC1 etThe expression “inhibition of the expression of the honey and mie3 genes” means all the mechanisms which disturb the transcription of the honey and mic3 genes into a messenger RNA or all the mechanisms which disturb the translation of the messenger RNA into proteins MIC1 and

MIC3, ces deux étapes étant nécessaires à la synthèse d’une protéine MIC1 et MIC3 fonctionnelle.MIC3, these two steps being necessary for the synthesis of a functional MIC1 and MIC3 protein.

Une protéine MIC1 non fonctionnelle ou une protéine MIC3 non fonctionnelle est une protéine qui ne possède pas la capacité de reconnaître les cellules hôtes ou qui ne permet pas l’adhésion du parasite audites cellules hôtes. Une protéine non fonctionnelle peut résulter d’une délétion ou d’une insertion d’un ou plusieurs acides aminés ou du décalage du cadre de lecture. Dans ce cas de figure, la modification de l’acide nucléique de la région codante ne bloque pas le mécanisme d’expression de la protéine qui peut éventuellement conserver une certaine identité de séquence en acides aminés avec celle de la protéine MIC1 ou celle de la protéine MIC3, mais change le cadre de lecture de l'ARNm correspondant lors de la traduction de la protéine. La non fonctionnalité de la protéine MIC3 et de la protéine MIC1, peut également être la conséquence de modifications post-traductionnelles inopérantes ou insuffisantes (i.e. glycosylation, isoprénylation, phosphorylation, sulfatation, amidation, acétylation, alkylation, etc) et qui lui permettaient d’assurer sa fonction.A non-functional MIC1 protein or a non-functional MIC3 protein is a protein that does not have the ability to recognize host cells or that does not allow adhesion of the parasite to said host cells. A non-functional protein can result from a deletion or insertion of one or more amino acids or from a shift in the reading frame. In this case, the modification of the nucleic acid of the coding region does not block the expression mechanism of the protein which can possibly retain a certain amino acid sequence identity with that of the MIC1 protein or that of the MIC1 protein. protein MIC3, but changes the reading frame of the corresponding mRNA during the translation of the protein. The non-functionality of the MIC3 protein and of the MIC1 protein, can also be the consequence of inoperative or insufficient post-translational modifications (ie glycosylation, isoprenylation, phosphorylation, sulfation, amidation, acetylation, alkylation, etc.) and which enabled it to perform its function.

La fonction des protéines MIC3 et MIC1, peut également être supprimée de manière indirecte, notamment en altérant ou en supprimant l’expression d’une ou plusieurs autres protéines (notamment d’autres adhésines) qui se lient aux protéines MIC3 et MIC1, pour former un complexe fonctionnel. La déstructuration d’un tel complexe entraîne une perte de fonction des protéines MIC3 et MIC1.The function of the proteins MIC3 and MIC1, can also be suppressed indirectly, in particular by altering or suppressing the expression of one or more other proteins (in particular other adhesins) which bind to the proteins MIC3 and MIC1, to form a functional complex. The destructuring of such a complex leads to a loss of function of the proteins MIC3 and MIC1.

La fonction d’une protéine peut être supprimée par :The function of a protein can be suppressed by:

- une mutation, une délétion ou une insertion d’un ou plusieurs nucléotides dans la séquence nucléotidique du gène codant pour ladite protéine, ou- a mutation, a deletion or an insertion of one or more nucleotides in the nucleotide sequence of the gene coding for said protein, or

- la délétion totale du gène codant pour ladite protéine, ou- the total deletion of the gene coding for said protein, or

- la délétion totale ou partielle de la région promotrice et/ou la délétion totale ou partielle de la séquence codante, outhe total or partial deletion of the promoter region and / or the total or partial deletion of the coding sequence, or

- une déstabilisation de l’ARN messager résultant de la transcription du gène codant pour ladite protéine, ou- destabilization of the messenger RNA resulting from the transcription of the gene coding for said protein, or

- une inhibition de la traduction de l’ARN messager du gène codant pour ladite protéine.- an inhibition of the translation of the messenger RNA of the gene coding for said protein.

Par « mutation d’un ou plusieurs nucléotides », on entend la substitution, permutation ou le remplacement d'un ou plusieurs nucléotides d'une séquence nucléotidique par un ou plusieurs nucléotides non présents dans la séquence sauvage. Par séquence sauvage, on désigne la séquence nucléotidique trouvée à l’état naturel dans la souche sauvage du parasite. La séquence sauvage est par définition dépourvue de toute intervention humaine par le biais du génie génétique.By "mutation of one or more nucleotides" is meant the substitution, permutation or replacement of one or more nucleotides of a nucleotide sequence with one or more nucleotides not present in the wild-type sequence. The term wild sequence denotes the nucleotide sequence found in the natural state in the wild strain of the parasite. The wild sequence is by definition devoid of any human intervention through genetic engineering.

Par « délétion d’un ou plusieurs nucléotides », on entend la suppression d'un ou plusieurs nucléotides d’une séquence nucléotidique."Deletion of one or more nucleotides" means the deletion of one or more nucleotides from a nucleotide sequence.

Par « insertion d’un ou plusieurs nucléotides », on entend l'addition, l’ajout ou l’intégration d'un ou plusieurs nucléotides dans une séquence nucléotidique.By "insertion of one or more nucleotides" is meant the addition, addition or integration of one or more nucleotides into a nucleotide sequence.

La mutation, la délétion ou l'insertion d'un ou plusieurs nucléotides peut avoir lieu à l'intérieur d'un ou plusieurs exons du gène correspondant et modifier par conséquent la région codante dudit gène, ou bien avoir lieu à l'intérieur d'un ou plusieurs introns et modifier le site d'épissage d'un intron concerné. Cette modification du site d'épissage change par conséquent le cadre de lecture de l'ARNm et aboutit à la traduction d’une nouvelle protéine dont la séquence en acides aminés diffère de la séquence de la protéine dite sauvage.The mutation, deletion or insertion of one or more nucleotides can take place inside one or more exons of the corresponding gene and consequently modify the coding region of said gene, or else take place inside d '' one or more introns and modify the splicing site of an intron concerned. This modification of the splicing site consequently changes the reading framework of the mRNA and results in the translation of a new protein whose amino acid sequence differs from the sequence of the so-called wild protein.

On entend par « délétion totale du gène », la délétion de la séquence codante entière (introns et exons), la délétion de la région promotrice et la délétion des régions transcrites non traduites 5’ et 3’, dites 5’ et 3’UTR, le terme «gène» désignant la région promotrice (également appelée promoteur), la séquence codante et les régions 5’ et 3’ UTR.The term “total gene deletion” is understood to mean the deletion of the entire coding sequence (introns and exons), the deletion of the promoter region and the deletion of the 5 'and 3' untranscribed transcribed regions, called 5 'and 3'UTR , the term "gene" designating the promoter region (also called promoter), the coding sequence and the 5 'and 3' UTR regions.

On entend par « délétion totale de la région promotrice », la suppression de la séquence promotrice totale c’est-à-dire la suppression de la séquence nucléotidique située en amont de la région 5’ UTR transcrite non traduite qui sert de boîtier de régulation de l’expression d’un gène.The term “total deletion of the promoter region” is understood to mean the suppression of the total promoter sequence, that is to say the deletion of the nucleotide sequence located upstream of the 5 'untranscribed transcribed UTR region which serves as a regulatory unit. of gene expression.

La délétion partielle de la région promotrice ou la délétion partielle de la séquence codante correspond à une délétion partielle du gène.The partial deletion of the promoter region or the partial deletion of the coding sequence corresponds to a partial deletion of the gene.

Par délétion partielle de la séquence codante on entend la suppression d’une partie des exons de la séquence codante, suffisante pour altérer la fonction de la protéine exprimée, ou la suppression d’une partie des introns entraînant une altération de l’épissage.By partial deletion of the coding sequence is meant the deletion of part of the exons from the coding sequence, sufficient to alter the function of the expressed protein, or the deletion of part of the introns resulting in an alteration of splicing.

On entend par « délétion partielle de la région promotrice », la suppression d’une partie de la séquence promotrice c’est-à-dire d’une partie de la séquence nucléotidique située en amont de la région 5’ UTR transcrite non traduite qui sert de boîtier de régulation de l’expression d’un gène.The term "partial deletion of the promoter region" means the deletion of part of the promoter sequence, that is to say of part of the nucleotide sequence located upstream of the 5 'UTR region transcribed untranslated which serves as a regulator of gene expression.

Par « déstabilisation de l’ARN messager », on entend une diminution de sa durée de demi-vie, c’est-à-dire de la période de temps pendant laquelle un ARN messager est disponible pour permettre sa traduction en une protéine. La stabilisation des ARN messagers est assurée par des éléments cis (les séquences 5’ et 3’ UTR bordant les séquences codantes d’un gène) et des éléments trans, notamment des protéines capables de se lier aux éléments cis. La durée de demi-vie d’un ARN messager peut varier en réponse à divers stimuli tels que des facteurs environnementaux, des facteurs de croissance ou des hormones. Une modification, réalisée in vitro par génie génétique, des séquences nucléotidiques des éléments cis est susceptible de modifier la durée de demi-vie de l’ARN messager.By "destabilization of the messenger RNA" is meant a reduction in its half-life, that is to say the period of time during which a messenger RNA is available to allow its translation into a protein. The stabilization of messenger RNAs is ensured by cis elements (the 5 ’and 3’ UTR sequences bordering the coding sequences of a gene) and trans elements, in particular proteins capable of binding to the cis elements. The half-life of a messenger RNA can vary in response to various stimuli such as environmental factors, growth factors or hormones. A modification, carried out in vitro by genetic engineering, of the nucleotide sequences of the cis elements is capable of modifying the half-life of messenger RNA.

Par « inhibition de la traduction de l’ARN messager d’un gène », on entend le blocage de la traduction de l'ARN messager en la protéine lui correspondant. Dans ce cas de figure, l'ARN messager d'un gène est présent dans la cellule, alors que la protéine lui correspondant est absente. L'inhibition de la traduction de l'ARN messager d'un gène peut résulter du dysfonctionnement d’un élément de la machinerie traductionnelle, notamment des ribosomes, des ARNs ribosomiques (ARNr) ou des ARNs de transfert (ARNt), ou des aminoacyl-ARNt synthétases.By "inhibiting the translation of the messenger RNA of a gene" is meant blocking the translation of the messenger RNA into the corresponding protein. In this case, the messenger RNA of a gene is present in the cell, while the corresponding protein is absent. The inhibition of the translation of the messenger RNA of a gene can result from the dysfunction of an element of the translational machinery, in particular ribosomes, ribosomal RNAs (rRNA) or transfer RNAs (tRNA), or aminoacyl -RNA synthetases.

La présente invention porte également sur une souche mutante de Sarcocystidae dans laquelle la fonction de la protéine MIC1 et la fonction de la protéine MIC3 sont supprimées, pour son utilisation dans la prévention de maladies d’origine infectieuse chez la volaille, dans laquelle la fonction de la protéine MIC3 est supprimée par :The present invention also relates to a mutant strain of Sarcocystidae in which the function of the MIC1 protein and the function of the MIC3 protein are suppressed, for its use in the prevention of diseases of infectious origin in poultry, in which the function of the MIC3 protein is deleted by:

- une mutation, une délétion ou une insertion d’un ou plusieurs nucléotides dans la séquence nucléotidique du gène mic3 codant pour la protéine MIC3 ou- a mutation, a deletion or an insertion of one or more nucleotides in the nucleotide sequence of the mic3 gene coding for the MIC3 protein or

- la délétion totale du gène mic3, ou- the total deletion of the mic3 gene, or

- la délétion totale ou partielle de la région promotrice et/ou la délétion totale ou partielle de la séquence codante du gène mic3, outhe total or partial deletion of the promoter region and / or the total or partial deletion of the coding sequence of the mic3 gene, or

- une déstabilisation de l’ARN messager résultant de la transcription du gène mic3 ou- a destabilization of the messenger RNA resulting from the transcription of the mic3 gene or

- une inhibition de la traduction de l’ARN messager du gène mic3 et la fonction de la protéine MIC1 est supprimée par :- inhibition of the translation of the messenger RNA of the mic3 gene and the function of the MIC1 protein is suppressed by:

- une mutation, une délétion ou une insertion d’un ou plusieurs nucléotides dans la séquence nucléotidique du gène miel codant pour la protéine MIC1 ou- a mutation, deletion or insertion of one or more nucleotides in the nucleotide sequence of the honey gene coding for the MIC1 protein or

- la délétion totale du gène miel, ou- the total deletion of the honey gene, or

- la délétion totale ou partielle de la région promotrice et/ou la délétion totale ou partielle de la séquence codante du gène miel, ou- the total or partial deletion of the promoter region and / or the total or partial deletion of the coding sequence of the honey gene, or

- une déstabilisation de l’ARN messager résultant de la transcription du gène miel ou- destabilization of the messenger RNA resulting from the transcription of the honey gene or

- une inhibition de la traduction de l’ARN messager du gène miel.- inhibition of the translation of the messenger RNA of the honey gene.

Dans un mode particulier de réalisation, la présente invention concerne une souche mutante de Sarcocystidae dans laquelle la fonction de la protéine MIC1 et la fonction de la protéine MIC3 sont supprimées, pour son utilisation dans la prévention de maladies d’origine infectieuse chez la volaille, ladite souche comprenant une délétion totale des gènes miel et mic 3.In a particular embodiment, the present invention relates to a mutant strain of Sarcocystidae in which the function of the MIC1 protein and the function of the MIC3 protein are suppressed, for its use in the prevention of diseases of infectious origin in poultry, said strain comprising a total deletion of the honey and mic 3 genes.

Dans un mode particulier de réalisation, la présente invention concerne une souche mutante de Sarcocystidae, ladite souche mutante étant une souche mutante de Toxoplasma spp., dans laquelle la fonction de la protéine MIC1 et la fonction de la protéine MIC3 sont supprimées, pour son utilisation dans la prévention de maladies d’origine infectieuse chez la volaille, dans laquelle la fonction de la protéine R0P16I est également supprimée et/ou ladite souche comprend au moins un acide nucléique codant pour la protéine GRA15II ainsi que les moyens nécessaire à l’expression de ladite protéine.In a particular embodiment, the present invention relates to a mutant strain of Sarcocystidae, said mutant strain being a mutant strain of Toxoplasma spp., In which the function of the MIC1 protein and the function of the MIC3 protein are deleted, for its use in the prevention of diseases of infectious origin in poultry, in which the function of the protein R0P16I is also suppressed and / or said strain comprises at least one nucleic acid coding for the protein GRA15II as well as the means necessary for the expression of said protein.

L’expression «moyens nécessaire à l'expression» d'une protéine (le terme protéine étant utilisé pour toute molécule d’acides aminés, telle que protéine, protéine de fusion, fragment de protéine, peptide, polyprotéine, polypeptide,...) s’entend de tout moyen qui permet d'obtenir la protéine, notamment un promoteur, un terminateur de transcription, une origine de réplication et de préférence un marqueur de sélection. Les moyens nécessaires à l'expression d'un peptide sont liés de façon opérationnelle à la séquence d'acides nucléiques codant ledit peptide (d'intérêt).The expression "means necessary for the expression" of a protein (the term protein being used for any amino acid molecule, such as protein, fusion protein, protein fragment, peptide, polyprotein, polypeptide, ... ) means any means which makes it possible to obtain the protein, in particular a promoter, a transcription terminator, an origin of replication and preferably a selection marker. The means necessary for the expression of a peptide are operably linked to the nucleic acid sequence encoding said peptide (of interest).

Les moyens nécessaires à l'expression d'un peptide peuvent être des moyens homologues, c'est-à-dire inclus dans le génome du vecteur utilisé, ou bien être hétérologues. Dans ce dernier cas, lesdits moyens sont clonés avec le peptide d'intérêt à exprimer.The means necessary for the expression of a peptide can be homologous means, that is to say included in the genome of the vector used, or else be heterologous. In the latter case, said means are cloned with the peptide of interest to be expressed.

La présente invention porte également sur une souche mutante de Sarcocystidae, ladite souche mutante étant une souche mutante de Toxoplasma spp., dans laquelle la fonction de la protéine MIC1 et la fonction de la protéine MIC3 sont supprimées, pour son utilisation dans la prévention de maladies d’origine infectieuse chez la volaille, et dans laquelle la fonction de la protéine R0P16I codée par le gène roplôl, est supprimée par :The present invention also relates to a mutant strain of Sarcocystidae, said mutant strain being a mutant strain of Toxoplasma spp., In which the function of the MIC1 protein and the function of the MIC3 protein are suppressed, for its use in the prevention of diseases of infectious origin in poultry, and in which the function of the protein R0P16I coded by the roplôl gene, is suppressed by:

- une mutation, une délétion ou une insertion d’un ou plusieurs nucléotides dans la séquence nucléotidique du gène roplôl codant pour la protéine R0P16I ou- a mutation, deletion or insertion of one or more nucleotides in the nucleotide sequence of the roplôl gene coding for the protein R0P16I or

- la délétion totale du gène roplôl, ou- the total deletion of the roplôl gene, or

- la délétion totale ou partielle de la région promotrice et/ou la délétion totale ou partielle de la séquence codante du gène roplôl, ou- the total or partial deletion of the promoter region and / or the total or partial deletion of the coding sequence of the roplôl gene, or

- une déstabilisation de l’ARN messager résultant de la transcription du gène roplôl ou- a destabilization of the messenger RNA resulting from the transcription of the roplôl gene or

- une inhibition de la traduction de l’ARN messager du gène roplôl.- inhibition of the translation of the messenger RNA of the roplôl gene.

La présente invention porte également sur une souche mutante de Sarcocystidae, ladite souche mutante étant une souche mutante de Toxoplasma spp., dans laquelle la fonction de la protéine MIC1 et la fonction de la protéine MIC3 sont supprimées, pour son utilisation dans la prévention de maladies d’origine infectieuse chez la volaille, et dans laquelle ladite souche comprend au moins un acide nucléique codant pour la protéine GRA15II ainsi que les moyens nécessaire à l’expression de ladite protéine.The present invention also relates to a mutant strain of Sarcocystidae, said mutant strain being a mutant strain of Toxoplasma spp., In which the function of the MIC1 protein and the function of the MIC3 protein are suppressed, for its use in the prevention of diseases of infectious origin in poultry, and in which said strain comprises at least one nucleic acid coding for the protein GRA15II as well as the means necessary for the expression of said protein.

Dans un mode de réalisation particulier, la présente invention concerne une souche mutante de Sarcocystidae, ladite souche mutante étant une souche mutante de Toxoplasma spp., dans laquelle la fonction de la protéine MIC1 et la fonction de la protéine MIC3 sont supprimées, pour son utilisation dans la prévention de maladies d’origine infectieuse chez la volaille, dans laquelle la fonction de la protéine R0P16I codée par le gène roplôl, est également supprimée et ladite souche comprend au moins un acide nucléique codant pour la protéine GRA15II ainsi que les moyens nécessaire à l’expression de ladite protéine.In a particular embodiment, the present invention relates to a mutant strain of Sarcocystidae, said mutant strain being a mutant strain of Toxoplasma spp., In which the function of the MIC1 protein and the function of the MIC3 protein are deleted, for its use in the prevention of diseases of infectious origin in poultry, in which the function of the protein R0P16I coded by the roplôl gene, is also suppressed and said strain comprises at least one nucleic acid coding for the protein GRA15II as well as the means necessary for expression of said protein.

Dans un mode de réalisation particulier, la présente invention concerne une souche mutante de Sarcocystidae, ladite souche mutante étant une souche mutante de Toxoplasma spp., dans laquelle la fonction de la protéine MIC1 et la fonction de la protéine MIC3 sont supprimées, pour son utilisation dans la prévention de maladies d’origine infectieuse chez la volaille, dans laquelle la fonction de la protéine R0P16I codée par le gène roplôl, est également supprimée et ladite souche comprend au moins un acide nucléique codant pour la protéine GRA15II, ainsi que les moyens nécessaire à l’expression de ladite protéine, à un locus différent du locus dudit gène roplôl.In a particular embodiment, the present invention relates to a mutant strain of Sarcocystidae, said mutant strain being a mutant strain of Toxoplasma spp., In which the function of the MIC1 protein and the function of the MIC3 protein are deleted, for its use in the prevention of diseases of infectious origin in poultry, in which the function of the protein R0P16I coded by the roplôl gene, is also suppressed and said strain comprises at least one nucleic acid coding for the protein GRA15II, as well as the means necessary to the expression of said protein, at a locus different from the locus of said roplôl gene.

Lorsqu’un gène hétérologue à la souche initiale est introduit dans le génome de ladite souche par recombinaison, cette recombinaison peut être aléatoire ou ciblée de manière à contrôler l’endroit du génome où sera inséré ledit gène.When a gene heterologous to the initial strain is introduced into the genome of said strain by recombination, this recombination may be random or targeted so as to control the place of the genome where said gene will be inserted.

Le terme « locus » défini un emplacement physique précis et invariable sur un chromosome . Au sens de la présente demande, un locus défini un endroit du chromosome où se situe un gène.The term "locus" defines a precise and invariable physical location on a chromosome. Within the meaning of the present application, a locus defines a place on the chromosome where a gene is located.

Ainsi, un gène hétérologue peut être inséré de manière aléatoire et ainsi à un locus différent d’un gène connu, ou il peut être inséré de manière ciblée au locus d’un gène connu, qui pourra voir été préalablement délété.Thus, a heterologous gene can be inserted randomly and thus at a locus different from a known gene, or it can be inserted in a targeted manner at the locus of a known gene, which may have been previously deleted.

Dans un mode de réalisation particulier, la présente invention concerne une souche mutante de Sarcocystidae, ladite souche mutante étant une souche mutante de Toxoplasma spp., dans laquelle la fonction de la protéine MIC1 et la fonction de la protéine MIC3 sont supprimées, pour son utilisation dans la prévention de maladies d’origine infectieuse chez la volaille, dans laquelle la fonction de la protéine ROP16I codée par le gène roplôl, est également supprimée et ladite souche comprend au moins un acide nucléique codant pour la protéine GRA15II, ainsi que les moyens nécessaire à l’expression de ladite protéine, au locus dudit gène roplôl.In a particular embodiment, the present invention relates to a mutant strain of Sarcocystidae, said mutant strain being a mutant strain of Toxoplasma spp., In which the function of the MIC1 protein and the function of the MIC3 protein are deleted, for its use in the prevention of diseases of infectious origin in poultry, in which the function of the protein ROP16I coded by the roplôl gene, is also suppressed and said strain comprises at least one nucleic acid coding for the protein GRA15II, as well as the means necessary to the expression of said protein, to the locus of said roplôl gene.

La présente invention concerne également une souche mutante de Sarcocystidae dans laquelle la fonction de la protéine MIC1 et la fonction de la protéine MIC3 sont supprimées, pour son utilisation dans la prévention de maladies d’origine infectieuse chez la volaille, ladite souche mutante étant une souche mutante de Toxoplasma gondii dans laquelle la fonction de la protéine MIC3 est supprimée par une délétion totale du gène mic3 et la fonction de la protéine MIC1 est supprimée par une délétion totale du gène miel.The present invention also relates to a mutant strain of Sarcocystidae in which the function of the MIC1 protein and the function of the MIC3 protein are suppressed, for its use in the prevention of diseases of infectious origin in poultry, said mutant strain being a strain mutant of Toxoplasma gondii in which the function of the MIC3 protein is suppressed by a total deletion of the mic3 gene and the function of the MIC1 protein is suppressed by a total deletion of the honey gene.

La présente invention concerne également une souche mutante de Sarcocystidae dans laquelle la fonction de la protéine MIC1 et la fonction de la protéine MIC3 sont supprimées, pour son utilisation dans la prévention de maladies d’origine infectieuse chez la volaille, ladite souche mutante étant une souche mutante de Toxoplasma gondii dans laquelle la fonction de la protéine MIC3 est supprimée par une délétion totale du gène mic3, la fonction de la protéine MIC1 est supprimée par une délétion totale du gène miel, et ladite souche comprend au moins un acide nucléique codant pour la protéine GRA15II, ainsi que les moyens nécessaire à l’expression de ladite protéine, à un locus différent du locus du gène roplôl codant pour la protéine ROP 161.The present invention also relates to a mutant strain of Sarcocystidae in which the function of the MIC1 protein and the function of the MIC3 protein are suppressed, for its use in the prevention of diseases of infectious origin in poultry, said mutant strain being a strain mutant of Toxoplasma gondii in which the function of the MIC3 protein is suppressed by a total deletion of the mic3 gene, the function of the MIC1 protein is suppressed by a total deletion of the honey gene, and said strain comprises at least one nucleic acid encoding the GRA15II protein, as well as the means necessary for the expression of said protein, at a locus different from the locus of the roplôl gene coding for the protein ROP 161.

La présente invention concerne également une souche mutante de Sarcocystidae dans laquelle la fonction de la protéine MIC1 et la fonction de la protéine MIC3 sont supprimées, pour son utilisation dans la prévention de maladies d’origine infectieuse chez la volaille, ladite souche mutante étant une souche mutante de Toxoplasma gondii dans laquelle la fonction de la protéine MIC3 est supprimée par une délétion totale du gène mic3, la fonction de la protéine MIC1 est supprimée par une délétion totale du gène miel, la fonction de la protéine ROP 161 codée par le gène rop 161 est supprimée par une délétion totale dudit gène rop 161.The present invention also relates to a mutant strain of Sarcocystidae in which the function of the MIC1 protein and the function of the MIC3 protein are suppressed, for its use in the prevention of diseases of infectious origin in poultry, said mutant strain being a strain mutant of Toxoplasma gondii in which the function of the MIC3 protein is suppressed by a total deletion of the mic3 gene, the function of the MIC1 protein is suppressed by a total deletion of the honey gene, the function of the protein ROP 161 encoded by the rop gene 161 is deleted by a total deletion of said rop 161 gene.

La présente invention concerne également une souche mutante de Sarcocystidae dans laquelle la fonction de la protéine MIC1 et la fonction de la protéine MIC3 sont supprimées, pour son utilisation dans la prévention de maladies d’origine infectieuse chez la volaille, ladite souche mutante étant une souche mutante de Toxoplasma gondii, dans laquelle la fonction de la protéine MIC3 est supprimée par une délétion totale du gène mic3, la fonction de la protéine MIC1 est supprimée par une délétion totale du gène miel, la fonction de la protéine ROP 161 codée par le gène rop 161 est supprimée par une délétion totale dudit gène roplôl et ladite souche comprend au moins un acide nucléique codant pour la protéine GRA15II, ainsi que les moyens nécessaire à l’expression de ladite protéine.The present invention also relates to a mutant strain of Sarcocystidae in which the function of the MIC1 protein and the function of the MIC3 protein are suppressed, for its use in the prevention of diseases of infectious origin in poultry, said mutant strain being a strain mutant of Toxoplasma gondii, in which the function of the MIC3 protein is suppressed by a total deletion of the mic3 gene, the function of the MIC1 protein is suppressed by a total deletion of the honey gene, the function of the ROP 161 protein encoded by the gene rop 161 is deleted by a total deletion of said roplôl gene and said strain comprises at least one nucleic acid coding for the GRA15II protein, as well as the means necessary for the expression of said protein.

La présente invention concerne également une souche mutante de Sarcocystidae dans laquelle la fonction de la protéine MIC1 et la fonction de la protéine MIC3 sont supprimées, pour son utilisation dans la prévention de maladies d’origine infectieuse chez la volaille, ladite souche mutante étant une souche mutante de Toxoplasma gondii dans laquelle la fonction de la protéine MIC3 est supprimée par une délétion totale du gène mic3, la fonction de la protéine MIC1 est supprimée par une délétion totale du gène miel, la fonction de la protéine ROP 161 codée par le gène roplôl est supprimée par une délétion totale dudit gène roplôl et ladite souche comprend au moins un acide nucléique codant pour la protéine GRA15II, ainsi que les moyens nécessaire à l’expression de ladite protéine, à un locus différent du locus dudit gène roplôl.The present invention also relates to a mutant strain of Sarcocystidae in which the function of the MIC1 protein and the function of the MIC3 protein are suppressed, for its use in the prevention of diseases of infectious origin in poultry, said mutant strain being a strain mutant of Toxoplasma gondii in which the function of the MIC3 protein is suppressed by a total deletion of the mic3 gene, the function of the MIC1 protein is suppressed by a total deletion of the honey gene, the function of the protein ROP 161 encoded by the roplôl gene is deleted by a complete deletion of said roplôl gene and said strain comprises at least one nucleic acid coding for the GRA15II protein, as well as the means necessary for the expression of said protein, at a locus different from the locus of said roplôl gene.

La présente invention concerne également une souche mutante de Sarcocystidae dans laquelle la fonction de la protéine MIC1 et la fonction de la protéine MIC3 sont supprimées, pour son utilisation dans la prévention de maladies d’origine infectieuse chez la volaille, ladite souche mutante étant une souche mutante de Toxoplasma gondii, dans laquelle la fonction de la protéine MIC3 est supprimée par une délétion totale du gène mic3, la fonction de la protéine MIC1 est supprimée par une délétion totale du gène miel, la fonction de la protéine R0P16I codée par le gène roplôl est supprimée par une délétion totale dudit gène roplôl et ladite souche comprend au moins un acide nucléique codant pour la protéine GRA15II, ainsi que les moyens nécessaire à l’expression de ladite protéine, au locus dudit gène roplôl.The present invention also relates to a mutant strain of Sarcocystidae in which the function of the MIC1 protein and the function of the MIC3 protein are suppressed, for its use in the prevention of diseases of infectious origin in poultry, said mutant strain being a strain mutant of Toxoplasma gondii, in which the function of the MIC3 protein is suppressed by a total deletion of the mic3 gene, the function of the MIC1 protein is suppressed by a total deletion of the honey gene, the function of the protein R0P16I encoded by the roplôl gene is deleted by a complete deletion of said roplôl gene and said strain comprises at least one nucleic acid coding for the GRA15II protein, as well as the means necessary for the expression of said protein, at the locus of said roplôl gene.

La présente invention concerne également une souche mutante de Sarcocystidae dans laquelle la fonction de la protéine MIC1 et la fonction de la protéine MIC3 sont supprimées, pour son utilisation dans la prévention de maladies d’origine infectieuse chez la volaille ladite souche mutante étant une souche mutante de Neospora caninum dans laquelle la fonction de la protéine MIC3 est supprimée par une délétion totale du gène mic3 et la fonction de la protéine MIC1 est supprimée par une délétion totale du gène miel.The present invention also relates to a mutant strain of Sarcocystidae in which the function of the MIC1 protein and the function of the MIC3 protein are suppressed, for its use in the prevention of diseases of infectious origin in poultry, said mutant strain being a mutant strain of Neospora caninum in which the function of the MIC3 protein is suppressed by a total deletion of the mic3 gene and the function of the MIC1 protein is suppressed by a total deletion of the honey gene.

La présente invention concerne également une souche mutante de Sarcocystidae, ladite souche mutante étant une souche mutante de Toxoplasma gondii, dans laquelle la fonction de la protéine MIC1, la fonction de la protéine MIC 3 sont supprimées, et dans laquelle la fonction de la protéine R0P16I est également supprimée et/ou ladite souche comprend un acide nucléique codant pour la protéine GRA15II ainsi que les moyens nécessaire à l’expression de ladite protéine.The present invention also relates to a mutant strain of Sarcocystidae, said mutant strain being a mutant strain of Toxoplasma gondii, in which the function of the protein MIC1, the function of the protein MIC 3 are deleted, and in which the function of the protein R0P16I is also deleted and / or said strain comprises a nucleic acid coding for the protein GRA15II as well as the means necessary for the expression of said protein.

La présente invention concerne également une souche mutante de Sarcocystidae, ladite souche mutante étant une souche mutante de Toxoplasma gondii, dans laquelle la fonction de la protéine MIC1, la fonction de la protéine MIC 3 et la fonction de la protéine R0P16I sont supprimées.The present invention also relates to a mutant strain of Sarcocystidae, said mutant strain being a mutant strain of Toxoplasma gondii, in which the function of the MIC1 protein, the function of the MIC 3 protein and the function of the R0P16I protein are deleted.

La présente invention concerne également une souche mutante de Sarcocystidae, ladite souche mutante étant une souche mutante de Toxoplasma gondii, dans laquelle la fonction de la protéine MIC1, la fonction de la protéine MIC 3 sont supprimées, et ladite souche comprend un acide nucléique codant pour la protéine GRA15II, ainsi que les moyens nécessaire à l’expression de ladite protéine, à un locus différent du locus dudit gène roplôl codant pour la protéine ROP16I.The present invention also relates to a mutant strain of Sarcocystidae, said mutant strain being a mutant strain of Toxoplasma gondii, in which the function of the MIC1 protein, the function of the MIC 3 protein are deleted, and said strain comprises a nucleic acid encoding the GRA15II protein, as well as the means necessary for the expression of said protein, at a locus different from the locus of said roplôl gene coding for the protein ROP16I.

La présente invention concerne également une souche mutante de Sarcocystidae, ladite souche mutante étant une souche mutante de Toxoplasma gondii, dans laquelle la fonction de la protéine MIC1, la fonction de la protéine MIC 3 et la fonction de la protéine ROP16I codée par le gène roplôl sont supprimées et ladite souche comprend un acide nucléique codant pour la protéine GRA15II, ainsi que les moyens nécessaire à l’expression de ladite protéine, à un locus différent du locus dudit gène roplôl.The present invention also relates to a mutant strain of Sarcocystidae, said mutant strain being a mutant strain of Toxoplasma gondii, in which the function of the protein MIC1, the function of the protein MIC 3 and the function of the protein ROP16I encoded by the roplôl gene are deleted and said strain comprises a nucleic acid coding for the GRA15II protein, as well as the means necessary for the expression of said protein, at a locus different from the locus of said roplôl gene.

La présente invention concerne également une souche mutante dans laquelle ladite souche de Sarcocystidae est une souche de Toxoplasma spp., en particulier une souche de Toxoplasma gondii.The present invention also relates to a mutant strain in which said strain of Sarcocystidae is a strain of Toxoplasma spp., In particular a strain of Toxoplasma gondii.

La présente invention concerne également une souche mutante dans laquelle ladite souche de Sarcocystidae est une souche de Neospora spp., en particulier une souche de Neospora caninum.The present invention also relates to a mutant strain in which said strain of Sarcocystidae is a strain of Neospora spp., In particular a strain of Neospora caninum.

La présente invention concerne également une souche mutante de Sarcocystidae, ladite souche mutante de Sarcocystidae étant une souche mutante de Toxoplasma gondii dans laquelle la fonction de la protéine MIC3 est supprimée par :The present invention also relates to a mutant strain of Sarcocystidae, said mutant strain of Sarcocystidae being a mutant strain of Toxoplasma gondii in which the function of the MIC3 protein is suppressed by:

une mutation, une délétion ou une insertion d’un ou plusieurs nucléotides dans la séquence nucléotidique du gène mic3 codant pour la protéine MIC3 ou la délétion totale du gène mic3, ou la délétion totale ou partielle de la région promotrice et/ou la délétion totale ou partielle de la séquence codante du gène mic3, oua mutation, a deletion or an insertion of one or more nucleotides in the nucleotide sequence of the mic3 gene coding for the MIC3 protein or the total deletion of the mic3 gene, or the total or partial deletion of the promoter region and / or the total deletion or partial of the coding sequence of the mic3 gene, or

- une déstabilisation de l’ARN messager résultant de la transcription du gène mic3, ou- destabilization of the messenger RNA resulting from the transcription of the mic3 gene, or

- une inhibition de la traduction de l’ARN messager du gène mic3 la fonction de la protéine MIC1 est supprimée par :- inhibition of the translation of the messenger RNA of the mic3 gene, the function of the MIC1 protein is suppressed by:

- une mutation, une délétion ou une insertion d’un ou plusieurs nucléotides dans la séquence nucléotidique du gène miel codant pour la protéine MIC1, ou- a mutation, deletion or insertion of one or more nucleotides in the nucleotide sequence of the honey gene coding for the MIC1 protein, or

- la délétion totale du gène miel, ou- the total deletion of the honey gene, or

- la délétion totale ou partielle de la région promotrice et/ou la délétion totale ou partielle de la séquence codante du gène miel, ou- the total or partial deletion of the promoter region and / or the total or partial deletion of the coding sequence of the honey gene, or

- une déstabilisation de l’ARN messager résultant de la transcription du gène miel, ou- destabilization of the messenger RNA resulting from the transcription of the honey gene, or

- une inhibition de la traduction de l’ARN messager du gène miel, et dans laquelle la fonction de la protéine R0P16I est supprimée par :- an inhibition of the translation of the messenger RNA of the honey gene, and in which the function of the protein R0P16I is suppressed by:

- une mutation, une délétion ou une insertion d’un ou plusieurs nucléotides dans la séquence nucléotidique du gène roplôl codant pour la protéine R0P16I, ou- a mutation, deletion or insertion of one or more nucleotides in the nucleotide sequence of the roplôl gene coding for the protein R0P16I, or

- la délétion totale du gène roplôl, ou- the total deletion of the roplôl gene, or

- la délétion totale ou partielle de la région promotrice et/ou la délétion totale ou partielle de la séquence codante du gène roplôl, ou- the total or partial deletion of the promoter region and / or the total or partial deletion of the coding sequence of the roplôl gene, or

- une déstabilisation de l’ARN messager résultant de la transcription du gène roplôl, ou- a destabilization of the messenger RNA resulting from the transcription of the roplôl gene, or

- une inhibition de la traduction de l’ARN messager du gène roplôl et/ou ladite souche comprend un acide nucléique codant pour la protéine GRA15II, ainsi que les moyens nécessaire à l’expression de ladite protéine.an inhibition of the translation of the messenger RNA of the roplôl gene and / or said strain comprises a nucleic acid coding for the GRA15II protein, as well as the means necessary for the expression of said protein.

La présente invention concerne également une souche mutante de Sarcocystidae, ladite souche mutante de Sarcocystidae étant une souche mutante de Toxoplasma gondii dans laquelle la fonction de la protéine MIC3 est supprimée par une délétion totale du gène mic3 la fonction de la protéine MIC1 est supprimée par une délétion totale du gène miel et la fonction de la protéine R0P16I est supprimée par une délétion totale du gène roplôl.The present invention also relates to a mutant strain of Sarcocystidae, said mutant strain of Sarcocystidae being a mutant strain of Toxoplasma gondii in which the function of the MIC3 protein is suppressed by a total deletion of the mic3 gene the function of the MIC1 protein is suppressed by a total deletion of the honey gene and the function of the protein R0P16I is suppressed by a total deletion of the roplôl gene.

La présente invention concerne également une souche mutante de Sarcocystidae, ladite souche mutante de Sarcocystidae étant une souche mutante de Toxoplasma gondii dans laquelle la fonction de la protéine MIC3 est supprimée par délétion totale du gène mic3 la fonction de la protéine MIC1 est supprimée par délétion totale du gène miel et ladite souche comprend un acide nucléique codant pour la protéine GRA15II, ainsi que les moyens nécessaire à l’expression de ladite protéine.The present invention also relates to a mutant strain of Sarcocystidae, said mutant strain of Sarcocystidae being a mutant strain of Toxoplasma gondii in which the function of the MIC3 protein is suppressed by total deletion of the mic3 gene the function of the MIC1 protein is suppressed by total deletion of the honey gene and said strain comprises a nucleic acid coding for the protein GRA15II, as well as the means necessary for the expression of said protein.

La présente invention concerne également une souche mutante de Sarcocystidae, ladite souche mutante de Sarcocystidae étant une souche mutante de Toxoplasma gondii dans laquelle la fonction de la protéine MIC3 est supprimée par délétion totale du gène mic3 la fonction de la protéine MIC1 est supprimée par délétion totale du gène miel la fonction de la protéine R0P16I est supprimée par délétion totale du gène roplôl et ladite souche comprend un acide nucléique codant pour la protéine GRA15II, ainsi que les moyens nécessaire à l’expression de ladite protéine, à un locus différent du locus dudit gène roplôl codant pour la protéine R0P16I.The present invention also relates to a mutant strain of Sarcocystidae, said mutant strain of Sarcocystidae being a mutant strain of Toxoplasma gondii in which the function of the MIC3 protein is suppressed by total deletion of the mic3 gene the function of the MIC1 protein is suppressed by total deletion of the honey gene the function of the protein R0P16I is suppressed by total deletion of the roplôl gene and said strain comprises a nucleic acid coding for the protein GRA15II, as well as the means necessary for the expression of said protein, at a locus different from the locus of said roplôl gene coding for the protein R0P16I.

La présente invention concerne également une composition pharmaceutique comprenant au moins l’une des souches mutantes de Sarcocystidae telle que définie ci-dessus.The present invention also relates to a pharmaceutical composition comprising at least one of the mutant strains of Sarcocystidae as defined above.

La présente invention concerne également une composition comprenant au moins l’une des souches mutantes de Sarcocystidae telle que définie ci-dessus, pour son utilisation comme médicament.The present invention also relates to a composition comprising at least one of the mutant strains of Sarcocystidae as defined above, for its use as a medicament.

DESCRIPTIONS DES FIGURESDESCRIPTIONS OF FIGURES

Figure 1-A : cette figure est une représentation schématique du plasmide pTgMIC3-K0-CATGFP loxP. Ce plasmide de 9 931 paires de bases comprend le gène de sélection codant pour la protéine chimérique CAT-GFP placé sous le contrôle du promoteur de Ι’α-tubuline de Toxoplasma gondii pour permettre l’expression du gène dans le parasite. Cette cassette de sélection est encadrée par deux sites loxP identiques de même orientation, ajoutés par PCR. De part et d’autre de la cassette ont été insérées les régions homologues flanquant le gène tgmic3.Figure 1-A: this figure is a schematic representation of the plasmid pTgMIC3-K0-CATGFP loxP. This 9,931 base pair plasmid comprises the selection gene encoding the chimeric protein CAT-GFP placed under the control of the opl’α-tubulin promoter of Toxoplasma gondii to allow expression of the gene in the parasite. This selection cassette is surrounded by two identical loxP sites of the same orientation, added by PCR. On either side of the cassette were inserted the homologous regions flanking the tgmic3 gene.

Figure 1-B : cette figure est une représentation schématique du plasmide pTgMICl-KO-CATGFP loxN. Ce plasmide de 10 285 paires de bases comprend le gène de sélection codant pour la protéine chimérique CAT-GFP placé sous le contrôle du promoteur de Ι’α-tubuline de Toxoplasma gondii pour permettre l’expression du gène dans le parasite. Cette cassette de sélection est encadrée par deux sites loxN identiques de même orientation, ajoutés par PCR. De part et d’autre de la cassette ont été insérées les régions homologues flanquant le gène tgmicl.Figure 1-B: this figure is a schematic representation of the plasmid pTgMICl-KO-CATGFP loxN. This 10,285 base pair plasmid comprises the selection gene coding for the chimeric protein CAT-GFP placed under the control of the asma’α-tubulin promoter of Toxoplasma gondii to allow expression of the gene in the parasite. This selection cassette is surrounded by two identical loxN sites of the same orientation, added by PCR. On either side of the cassette were inserted the homologous regions flanking the tgmicl gene.

Figure 1-C : cette figure est une représentation schématique du plasmide pTSAGl- Cre recombinase. Ce plasmide de 4 694 paires de bases comprend le gène codant pour la protéine CRE-Recombinase placé sous le contrôle du promoteur du gène sagl de Toxoplasma gondii pour permettre l’expression du gène dans le parasite. En aval du gène codant la Cre Recombinase, la séquence 3’UTR du gène sagl de Toxoplasma gondii est insérée pour stabiliser l’ARNm codant la protéine Cre Recombinase.Figure 1-C: this figure is a schematic representation of the plasmid pTSAG1-Cre recombinase. This 4,694 base pair plasmid includes the gene encoding the CRE-Recombinase protein placed under the control of the promoter of the Toxoplasma gondii sag1 gene to allow expression of the gene in the parasite. Downstream of the gene encoding Cre Recombinase, the 3’UTR sequence of the sagl gene of Toxoplasma gondii is inserted to stabilize the mRNA encoding the Cre Recombinase protein.

Figure 2-A : cette figure illustre les 4 étapes pour obtenir la souche Toxo tgmicl-3 KO 2G. La première étape de recombinaison homologue permet l’intégration du gène codant pour l’enzyme CAT-GFP au locus du gène mic3. Une sélection par le chloramphénicol permet d’amplifier la souche simple mutante Toxo tgmic3 KO. Dans une seconde étape, le gène codant pour la protéine CAT-GFP est supprimé par action de la Cre Recombinase. La troisième étape permet l’intégration du gène codant pour l’enzyme CAT-GFP au locus du gène miel. Une sélection par le chloramphénicol permet d’amplifier la souche simple mutanteFigure 2-A: this figure illustrates the 4 steps to obtain the Toxo tgmicl-3 KO 2G strain. The first stage of homologous recombination allows the integration of the gene coding for the enzyme CAT-GFP at the locus of the mic3 gene. Selection by chloramphenicol makes it possible to amplify the single mutant strain Toxo tgmic3 KO. In a second step, the gene coding for the CAT-GFP protein is deleted by the action of Cre Recombinase. The third step allows the integration of the gene encoding the enzyme CAT-GFP into the locus of the honey gene. Selection with chloramphenicol amplifies the single mutant strain

Toxo tgmicl-3 KO. Enfin, dans une dernière étape, le gène codant pour la protéine CAT-GFP est supprimé par action de la Cre Recombinase.Toxo tgmicl-3 KO. Finally, in a last step, the gene coding for the CAT-GFP protein is deleted by the action of Cre Recombinase.

Figure 2-B : cette figure représente les profils électrophorétiques des produits PCR obtenus respectivement avec la souche sauvage RH de Toxoplasma gondii, la souche Toxo tgmiedKO, la souche Toxo tgmied KO 2G, la souche Toxo tgmic7-3 KO et la souche finale Toxo tgmicl-3 KO 2G en utilisant les jeux d’amorces des PCR du Tableau 3.Figure 2-B: this figure represents the electrophoretic profiles of the PCR products obtained respectively with the wild RH strain of Toxoplasma gondii, the Toxo tgmiedKO strain, the Toxo tgmied KO 2G strain, the Toxo tgmic7-3 KO strain and the final Toxo tgmicl strain -3 KO 2G using the PCR primer sets in Table 3.

Figure 2-C : cette figure représente les résultats des séquençages obtenus sur la souche Toxo tgmicl-3 KO 2G et confirme que les gènes miel et mie 3 ont été supprimés et remplacés respectivement par des cicatrices LoxN et LoxP.Figure 2-C: this figure represents the results of the sequencing obtained on the Toxo tgmicl-3 KO 2G strain and confirms that the honey and mie 3 genes have been deleted and replaced respectively by LoxN and LoxP scars.

Figure 2-D : cette figure illustre la position des amorces nucléiques utilisées dans la présente invention pour détecter la présence des trois gènes tgmic3, tgmicl, cat-gfp dans les souches sauvages et/ou des souches mutantes de Toxo tgmic3 KO et/ou Toxo tgmic3 KO 2G et/ou Toxo tgmicl-3 KO et/ou Toxo tgmicl-3 KO 2G de Toxoplasma gondii. Les chiffres représentent la numérotation des séquences d’amorces (SEQ ID NO :x) définies dans la présente demande.Figure 2-D: This figure illustrates the position of the nucleic primers used in the present invention to detect the presence of the three genes tgmic3, tgmicl, cat-gfp in wild strains and / or mutant strains of Toxo tgmic3 KO and / or Toxo tgmic3 KO 2G and / or Toxo tgmicl-3 KO and / or Toxo tgmicl-3 KO 2G of Toxoplasma gondii. The figures represent the numbering of the primer sequences (SEQ ID NO: x) defined in the present application.

Figure 3 A et B : cette figure illustre l’analyse par immunofluorescence de la détection des protéines MIC1, MIC3 ou CAT-GFP obtenus respectivement avec la souche sauvage RH de Toxoplasma gondii, la souche Toxo tgmicJ KO, la souche Toxo tgmied KO 2G, la souche Toxo tgmic7-3 KO et la souche Toxo tgmic7-3 KO 2G en utilisant un anticorps spécifiquement dirigé contre la protéine MIC1 (figure 3 A), MIC3 (figure 3B) ou directement avec les propriétés fluorescentes intrinsèques de la protéine CAT-GFP.FIG. 3 A and B: this figure illustrates the analysis by immunofluorescence of the detection of the proteins MIC1, MIC3 or CAT-GFP obtained respectively with the wild RH strain of Toxoplasma gondii, the Toxo tgmicJ KO strain, the Toxo tgmied KO 2G strain, the Toxo tgmic7-3 KO strain and the Toxo tgmic7-3 KO 2G strain using an antibody specifically directed against the protein MIC1 (FIG. 3 A), MIC3 (FIG. 3B) or directly with the intrinsic fluorescent properties of the protein CAT-GFP .

Figure 4: cette figure est une représentation schématique du plasmide pTgROP16-KO-CATtdTomato. Ce plasmide de 9 443 paires de bases comprend le gène de sélection codant pour la protéine chimérique CAT-tdTomato placé sous le contrôle du promoteur de Τα-tubuline de Toxoplasma gondii pour permettre l’expression du gène dans le parasite. De part et d’autre de la cassette ont été insérées les régions homologues flanquant le gène tgroplô.Figure 4: this figure is a schematic representation of the plasmid pTgROP16-KO-CATtdTomato. This 9,443 base pair plasmid comprises the selection gene encoding the chimeric protein CAT-tdTomato placed under the control of the Toxoplasma gondii Τα-tubulin promoter to allow expression of the gene in the parasite. On either side of the cassette were inserted the homologous regions flanking the tgroplô gene.

Figure 5-A cette figure illustre l’étape pour obtenir la souche Toxo tgmicl-3 KO 2G roplôKO. Cette étape de recombinaison homologue permet l’intégration du gène codant pour l’enzyme CAT-tdTomato au locus du gène roplô. Une sélection par le chloramphénicol permet d’amplifier la souche simple mutante Toxo tgmicl-3 KO 2G roplôKO.Figure 5-In this figure illustrates the step to obtain the Toxo tgmicl-3 KO 2G roplôKO strain. This homologous recombination step allows the integration of the gene coding for the enzyme CAT-tdTomato at the locus of the roplô gene. Selection by chloramphenicol makes it possible to amplify the simple mutant strain Toxo tgmicl-3 KO 2G roplôKO.

Figure 5-B : cette figure représente les profils électrophorétiques des produits PCR obtenus respectivement avec la souche Toxo tgmicl-3 KO 2G et la souche Toxo tgmic3 KO 2G et la souche Toxo tgmicl-3 KO - 2G / ROP 16 KO en utilisant les jeux d’amorces des PCR du Tableau 6.Figure 5-B: this figure represents the electrophoretic profiles of the PCR products obtained respectively with the Toxo tgmicl-3 KO 2G strain and the Toxo tgmic3 KO 2G strain and the Toxo tgmicl-3 KO - 2G / ROP 16 KO strain using the sets PCR table primers from Table 6.

Figure 5-C : cette figure illustre la position des amorces nucléiques utilisées dans la présente invention pour détecter la présence des deux gènes tgroplô et cat-tdtomato dans la souche sauvage et/ou la souche mutante de Toxo tgmicl-3 KO roplô KO de Toxoplasma gondii. Les chiffres représentent la numérotation des séquences d’amorces (SEQ ID NO :x) définies dans la présente demande.Figure 5-C: this figure illustrates the position of the nucleic primers used in the present invention to detect the presence of the two genes tgroplô and cat-tdtomato in the wild strain and / or the mutant strain of Toxo tgmicl-3 KO roplô KO of Toxoplasma gondii. The figures represent the numbering of the primer sequences (SEQ ID NO: x) defined in the present application.

Figure 6 : cette figure représente le plasmide pT230-2G GRA15n. Ce plasmide de 8108 paires de bases comprend le gène de sélection Ble placé sous le contrôle du promoteur de Γαtubuline de Toxoplasma gondii pour permettre l’expression d’une protéine permettant la résistance à la phléomycine. En aval de cette cassette a été intégré la cassette d’expression permettant de coder la protéine Gral5HAII.Figure 6: this figure represents the plasmid pT230-2G GRA15n. This 8108 base pair plasmid comprises the Ble selection gene under the control of the tubαtubulin promoter from Toxoplasma gondii to allow the expression of a protein for resistance to phleomycin. Downstream of this cassette was integrated the expression cassette for coding the Gral5HAII protein.

Figure 7-A : cette figure représente les profils électrophorétiques des produits PCR obtenus respectivement avec les souches Toxo tgmicl-3 KO 2G, Toxo tgmicl-3 KO 2G GRA15n Kl et la souche sauvage ME49, en utilisant les jeux d’amorces des PCR du Tableau 9.Figure 7-A: this figure represents the electrophoretic profiles of the PCR products obtained respectively with the strains Toxo tgmicl-3 KO 2G, Toxo tgmicl-3 KO 2G GRA15n Kl and the wild strain ME49, using the sets of primers of the PCR of the Table 9.

Figure 7-B : cette figure illustre la position des amorces nucléiques utilisées dans la présente invention pour détecter la présence des gènes gra!5 et gra!5II dans les souches Toxo tgmicl3 KO 2G, Toxo tgmicl-3 KO 2G GRA15n Kl et la souche sauvage ME49 (type II) de Toxoplasmagondii. Les chiffres représentent la numérotation des séquences d’amorces (SEQ ID NO :x) définies dans la présente demande.Figure 7-B: this figure illustrates the position of the nucleic primers used in the present invention to detect the presence of the genes gra! 5 and gra! 5II in the strains Toxo tgmicl3 KO 2G, Toxo tgmicl-3 KO 2G GRA15n Kl and the strain wild ME49 (type II) of Toxoplasmagondii. The figures represent the numbering of the primer sequences (SEQ ID NO: x) defined in the present application.

Figure 8 : cette figure illustre l’analyse par immunofluorescence de la détection de la protéine GRA I5 (via le tag HA) obtenu respectivement avec les souches Toxo tgmicl-3 KO 2G et Toxo tgmicl-3 KO 2G GRA15n Kl.Figure 8: this figure illustrates the immunofluorescence analysis of the detection of the GRA I5 protein (via the HA tag) obtained respectively with the strains Toxo tgmicl-3 KO 2G and Toxo tgmicl-3 KO 2G GRA15 n Kl.

Figure 9 : cette figure représente les profils électrophorétiques des produits PCR obtenus respectivement avec les souches Toxo tgmicl-3 KO 2G, Toxo tgmicl-3 KO 2G roplôKOFigure 9: this figure represents the electrophoretic profiles of the PCR products obtained respectively with the strains Toxo tgmicl-3 KO 2G, Toxo tgmicl-3 KO 2G roplôKO

GRA15n Kl et la souche sauvage ME49, en utilisant les jeux d’amorces des PCR du TableauGRA15n Kl and wild strain ME49, using the PCR primer sets from Table

9.9.

Figure 10 : cette figure illustre l’analyse par immunofluorescence de la détection de la protéine GRA15 (via le tag HA) obtenu respectivement avec les souches Toxo tgmicl3 KO 2G, Toxo tgmicl-3 KO 2G roplôKO et Toxo tgmicl-3 KO 2G roplôKO GRA15n Kl.Figure 10: this figure illustrates the immunofluorescence analysis of the detection of the GRA15 protein (via the HA tag) obtained respectively with the strains Toxo tgmicl3 KO 2G, Toxo tgmicl-3 KO 2G roplôKO and Toxo tgmicl-3 KO 2G roplôKO GRA15 n Kl.

Figure 11 : cette figure est une représentation schématique du plasmide pTgRoplôKOGral5IIKI-CAT-GFP lox2272. Ce plasmide de 12721 paires de bases comprend le gène de sélection codant pour la protéine chimérique CAT-GFP placé sous le contrôle du promoteur de Τα-tubuline de Toxoplasma gondii pour permettre l’expression du gène dans le parasite. Cette cassette de sélection est encadrée par deux sites lox2272 identiques de même orientation, ajoutés par PCR. En aval de cette cassette a été intégré la cassette d’expression permettant de coder la protéine Gral5HAII. Puis de part et d’autre de ces cassettes ont été insérées les régions homologues flanquant le gène tgroplô.Figure 11: this figure is a schematic representation of the plasmid pTgRoplôKOGral5IIKI-CAT-GFP lox2272. This 12,721 base pair plasmid comprises the selection gene encoding the chimeric protein CAT-GFP placed under the control of the Toxoplasma gondii Τα-tubulin promoter to allow expression of the gene in the parasite. This selection cassette is surrounded by two identical lox2272 sites of the same orientation, added by PCR. Downstream of this cassette was integrated the expression cassette for coding the Gral5HAII protein. Then on either side of these cassettes were inserted the homologous regions flanking the tgroplô gene.

Figure 12-A : cette figure illustre les 2 étapes pour obtenir la souche Toxo tgmicl-3 KO roplô KO GRA15II KI-2G. La première étape de recombinaison homologue permet l’intégration du gène codant pour l’enzyme CAT-GFP et le gène gralSIIHA au locus du gène roplô. Une sélection par le chloramphénicol permet d’amplifier la souche mutante Toxo tgmicl-3 KO roplô KO GRA15II Kl. Dans une seconde étape, le gène codant pour la protéine CAT-GFP est supprimé par action de la Cre Recombinase pour obtenir la souche Toxo tgmicl-3 KO roplô KO GRA15IIKI-2G.Figure 12-A: this figure illustrates the 2 steps to obtain the Toxo tgmicl-3 KO roplô KO GRA15II KI-2G strain. The first step in homologous recombination allows the integration of the gene coding for the enzyme CAT-GFP and the gralSIIHA gene at the locus of the roplô gene. Selection by chloramphenicol makes it possible to amplify the mutant strain Toxo tgmicl-3 KO roplô KO GRA15II Kl. In a second step, the gene coding for the CAT-GFP protein is deleted by the action of Cre Recombinase to obtain the Toxo tgmicl-3 KO roplô KO GRA15IIKI-2G strain.

Figure 12- B : cette figure représente les profils électrophorétiques des produits PCR obtenus respectivement avec les souches Toxo tgmicl-3 KO 2G, Toxo tgmicl-3 KO roplô KO GRA15II Kl et Toxo tgmicl-3 KO roplô KO GRA15II Kl 2GFigure 12- B: this figure represents the electrophoretic profiles of the PCR products obtained respectively with the strains Toxo tgmicl-3 KO 2G, Toxo tgmicl-3 KO roplô KO GRA15II Kl and Toxo tgmicl-3 KO roplô KO GRA15II Kl 2G

Figure 12-C : cette figure illustre la position des amorces nucléiques utilisées dans la présente invention pour détecter la présence des trois gènes tgroplô, gralSII, cat-gfp dans les souches sauvages et/ou des souches mutantes de Toxo tgmicl-3 KO roplô KO Gral5II Kl de Toxoplasmagondii. Les chiffres représentent la numérotation des séquences d’amorces (SEQ ID NO :x) définies dans la présente demande.Figure 12-C: this figure illustrates the position of the nucleic primers used in the present invention to detect the presence of the three genes tgroplô, gralSII, cat-gfp in wild strains and / or mutant strains of Toxo tgmicl-3 KO roplô KO Gral5II Kl of Toxoplasmagondii. The figures represent the numbering of the primer sequences (SEQ ID NO: x) defined in the present application.

Figure 12-D : cette figure représente les résultats des séquençages obtenus sur la souche Toxo tgmicl-3 KO roplô KO GRA15II Kl 2G et confirme que les gènes roplô et cat-gfp ont été supprimés et remplacés par la cicatrice Lox2272 et le gène gralSHAII.Figure 12-D: this figure represents the results of the sequencing obtained on the Toxo tgmicl-3 KO roplô KO GRA15II Kl 2G strain and confirms that the roplô and cat-gfp genes have been deleted and replaced by the scar Lox2272 and the gralSHAII gene.

Figure 13 : cette figure illustre l’analyse par immunofluorescence de la détection de la protéine GRA15 (via le tag HA) obtenu respectivement avec les souches Toxo tgmicl-3 KO roplô KO GRA15II Kl et Toxo tgmicl-3 KO roplô KO GRA15II KI-2G en utilisant un anticorps spécifiquement dirigé contre le tag HA. Cette figure illustre également la suppression de la cassette CATGFP avec la disparition de la fluorescence GFP pour la souche Toxo tgmicl-3 KO roplô KO GRA15IIKI-2G.Figure 13: this figure illustrates the immunofluorescence analysis of the detection of the GRA15 protein (via the HA tag) obtained respectively with the strains Toxo tgmicl-3 KO roplô KO GRA15II Kl and Toxo tgmicl-3 KO roplô KO GRA15II KI-2G using an antibody specifically directed against the HA tag. This figure also illustrates the deletion of the CATGFP cassette with the disappearance of the GFP fluorescence for the Toxo tgmicl-3 KO roplô KO GRA15IIKI-2G strain.

Figure 14-A : cette figure est une représentation schématique du plasmide pNcMIC3-K0CAT-GFP loxN. Ce plasmide de 10063 paires de bases comprend le gène de sélection codant pour la protéine chimérique CAT-GFP placé sous le contrôle du promoteur de Ι’α-tubuline de Toxoplasma gondii pour permettre l’expression du gène dans le parasite. Cette cassette de sélection est encadrée par deux sites loxN identiques de même orientation, ajoutés par PCR. De part et d’autre de la cassette ont été insérées les régions homologues flanquant le gène ncmic 3.Figure 14-A: this figure is a schematic representation of the plasmid pNcMIC3-K0CAT-GFP loxN. This 10,063 base pair plasmid includes the selection gene encoding the chimeric protein CAT-GFP placed under the control of the Toxoplasma gondii Ι’-tubulin promoter to allow expression of the gene in the parasite. This selection cassette is surrounded by two identical loxN sites of the same orientation, added by PCR. On either side of the cassette were inserted the homologous regions flanking the ncmic 3 gene.

Figure 14-B : cette figure est une représentation schématique du plasmide pNcMICl-KOCAT-GFP loxP. Ce plasmide de 10069 paires de bases comprend le gène de sélection codant pour la protéine chimérique CAT-GFP placé sous le contrôle du promoteur de Ι’α-tubuline de Toxoplasma gondii pour permettre l’expression du gène dans le parasite. Cette cassette de sélection est encadrée par deux sites loxP identiques de même orientation, ajoutés par PCR. De part et d’autre de la cassette ont été insérées les régions homologues flanquant le gène ncmicl.Figure 14-B: this figure is a schematic representation of the plasmid pNcMICl-KOCAT-GFP loxP. This 10069 base pair plasmid comprises the selection gene encoding the chimeric protein CAT-GFP placed under the control of the opl’α-tubulin promoter of Toxoplasma gondii to allow expression of the gene in the parasite. This selection cassette is surrounded by two identical loxP sites of the same orientation, added by PCR. On either side of the cassette were inserted the homologous regions flanking the ncmicl gene.

Figure 15-A : cette figure illustre les 4 étapes pour obtenir la souche Neo ncmicl-3 KO 2G. La première étape de recombinaison homologue permet l’intégration du gène codant pour l’enzyme CAT-GFP au locus du gène mic3. Une sélection par le chloramphénicol permet d’amplifier la souche simple mutante Neo ncmic3 KO. Dans une seconde étape, le gène codant pour la protéine CAT-GFP est supprimé par action de la Cre Recombinase. La troisième étape permet l’intégration du gène codant pour l’enzyme CAT-GFP au locus du gène miel. Une sélection par le chloramphénicol permet d’amplifier la souche simple mutante Neo ncmicl-3 KO. Enfin, dans une dernière étape, le gène codant pour la protéine CAT-GFP est supprimé par action de la Cre Recombinase.Figure 15-A: this figure illustrates the 4 steps to obtain the Neo ncmicl-3 KO 2G strain. The first stage of homologous recombination allows the integration of the gene coding for the enzyme CAT-GFP at the locus of the mic3 gene. Selection by chloramphenicol makes it possible to amplify the single mutant strain Neo ncmic3 KO. In a second step, the gene coding for the CAT-GFP protein is deleted by the action of Cre Recombinase. The third step allows the integration of the gene encoding the enzyme CAT-GFP into the locus of the honey gene. Selection by chloramphenicol makes it possible to amplify the single mutant strain Neo ncmicl-3 KO. Finally, in a last step, the gene coding for the CAT-GFP protein is deleted by the action of Cre Recombinase.

Figure 15-B : cette figure illustre la position des amorces nucléiques utilisées dans la présente invention pour détecter la présence des trois gènes ncmic3, ncmicl, cat-gfp dans les souches sauvages et/ou des souches mutantes de Neo ncmic3 KO et/ou Neo ncmic3 KO 2G et/ou Neo ncmicl-3 KO et/ou Neo ncmicl-3 KO 2G de Neospora caninum. Les chiffres représentent la numérotation des séquences d’amorces (SEQ ID NO :x) définies dans la présente demande.Figure 15-B: this figure illustrates the position of the nucleic primers used in the present invention to detect the presence of the three genes ncmic3, ncmicl, cat-gfp in wild strains and / or mutant strains of Neo ncmic3 KO and / or Neo ncmic3 KO 2G and / or Neo ncmicl-3 KO and / or Neo ncmicl-3 KO 2G of Neospora caninum. The figures represent the numbering of the primer sequences (SEQ ID NO: x) defined in the present application.

Figure 15-C: cette figure représente les profils électrophorétiques des produits PCR obtenus respectivement avec la souche sauvage NC-1 de Neospora caninum, la souche Neo ncmic3 KO, la souche Neo ncmic3 KO 2G, la souche Neo ncmicl-3 KO et la souche Neo ncmicl-3 KO 2G en utilisant les jeux d’amorces des PCR du Tableau 16.Figure 15-C: this figure represents the electrophoretic profiles of the PCR products obtained respectively with the wild strain NC-1 of Neospora caninum, the strain Neo ncmic3 KO, the strain Neo ncmic3 KO 2G, the strain Neo ncmicl-3 KO and the strain Neo ncmicl-3 KO 2G using the PCR primer sets in Table 16.

Figure 15-D : cette figure représente les résultats des séquençages obtenus sur la souche Neo ncmicl-3 KO 2G et confirme que les gènes miel et mic3 ont été supprimés et remplacés respectivement par des cicatrices LoxP et LoxN.Figure 15-D: this figure represents the results of the sequencing obtained on the Neo ncmicl-3 KO 2G strain and confirms that the honey and mic3 genes have been deleted and replaced respectively by LoxP and LoxN scars.

Figure 16-A : cette figure illustre l’analyse par immunofluorescence de la détection de la protéine MIC3 obtenue respectivement avec la souche sauvage NC-1 de Neospora caninum et souche Neo ncmicl-3 KO 2G en utilisant un anticorps spécifiquement dirigé contre la protéine MIC3.Figure 16-A: this figure illustrates the immunofluorescence analysis of the detection of the MIC3 protein obtained respectively with the wild strain NC-1 of Neospora caninum and Neo strain ncmicl-3 KO 2G using an antibody specifically directed against the MIC3 protein .

Figure 16-B : cette figure illustre l’analyse par immunofluorescence de la détection de la protéine CATGFP obtenue respectivement avec la souche sauvage NC-1 de Neospora caninum et les souches mutantes de Neospora caninum en utilisant la fluorescence intrinsèque de la protéine CATGFP. Cette figure permet de mettre en évidence la présence de la protéine CATGFP ou l’absence de la protéine CATGFP suite à l’action de la Cre Recombinase.Figure 16-B: this figure illustrates the immunofluorescence analysis of the detection of the CATGFP protein obtained respectively with the wild strain NC-1 of Neospora caninum and the mutant strains of Neospora caninum using the intrinsic fluorescence of the CATGFP protein. This figure highlights the presence of the CATGFP protein or the absence of the CATGFP protein following the action of Cre Recombinase.

Figure 17 : cette figure illustre la croissance des poussins entre J4 et J27 après immunisation (A-B) par voie in ovo à dose de ΙΟ3, 104 ou 105 tachyzoïtes par animal inoculé soit dans le liquide amniotique (A) soit dans l’embryon (B). (C) Immunostimulation effectuée par voie sous-cutanée à 1 jour d’âge à la dose de ΙΟ4, 105 ou 106 tachyzoïtes par animal. (D-F) Analyse statistique correspondante. ANOVA deux voies avec test post-hoc de Dunnett. Les animaux ayant été sacrifiés en série, le nombre d’animaux restant par groupe est indiqué au-dessus des courbes. Moyenne +/- SEM.Figure 17: this figure illustrates the growth of chicks between D4 and D27 after immunization (AB) by in ovo route at a dose of ΙΟ 3 , 10 4 or 10 5 tachyzoites per animal inoculated either in the amniotic fluid (A) or in the embryo (B). (C) Immunostimulation performed subcutaneously at 1 day of age at a dose of ΙΟ 4 , 10 5 or 10 6 tachyzoites per animal. (DF) Corresponding statistical analysis. Two-way ANOVA with Dunnett post-hoc test. The animals having been sacrificed in series, the number of animals remaining per group is indicated above the curves. Average +/- SEM.

Figure 18 : cette figure illustre le titre en anticorps dirigés contre Toxo-KO+ 2G après immunisation (A-B) par voie in ovo à dose de ΙΟ3, 104 ou 105 tachyzoïtes par animal inoculé soit dans le liquide amniotique (A) soit dans l’embryon (B). (C) Immunostimulation effectuée par voie sous-cutanée à 1 jour d’âge à la dose de ΙΟ4, 105 ou 106 tachyzoïtes par animal. (D-F)Figure 18: this figure illustrates the titer of antibodies directed against Toxo-KO + 2G after immunization (AB) by in ovo route at a dose of ΙΟ 3 , 10 4 or 10 5 tachyzoites per animal inoculated either in the amniotic fluid (A) or in the embryo (B). (C) Immunostimulation performed subcutaneously at 1 day of age at a dose of ΙΟ 4 , 10 5 or 10 6 tachyzoites per animal. (DF)

Analyse statistique correspondante. ANOVA deux voies avec test post-hoc de Bonferroni.Corresponding statistical analysis. Two-way ANOVA with post-hoc Bonferroni test.

N=5 par groupe. Moyenne +/- SEM.N = 5 per group. Average +/- SEM.

Figure 19 : cette figure illustre le Poids et le gain quotidien moyen des animaux. A-B Poids des animaux infectés à J14 ou non infectés au moment de l’abattage. C-D Poids des animaux sacrifiés à J35, infectés à J7 à gauche ou infectés à J14 à droite. E-F Gain quotidien moyen des animaux sacrifiés à J35, infectés à J7 à gauche ou infectés à J14 à droite. ANOVA deux voies avec test Tukey post-hoc. Les analyses statistiques complètes sont disponibles en Annexe page 16. n=9-12 par groupe.Figure 19: this figure illustrates the Weight and the average daily gain of the animals. A-B Weight of animals infected on D14 or not infected at the time of slaughter. C-D Weight of animals sacrificed on D35, infected on D7 on the left or infected on D14 on the right. E-F Average daily gain of animals sacrificed on D35, infected on D7 on the left or infected on D14 on the right. Two-way ANOVA with post-hoc Tukey test. Complete statistical analyzes are available in the Appendix on page 16. n = 9-12 per group.

Figure 20 : cette figure illustre le score de lésion macroscopique intestinal mesuré sept jours après infection par Eimeria acervulina. Résultats obtenus pour les groupes infectés à 7 jours ou à 14 jours de vie. Un test de fréquence (χ2) a été utilisé pour comparer les groupes. Il n’y a pas de différence significative entre les animaux immunostimulés et les animaux contrôles. N=15-18/groupe.Figure 20: this figure illustrates the score for gross intestinal lesion measured seven days after infection with Eimeria acervulina. Results obtained for groups infected at 7 days or 14 days of life. A frequency test (χ2) was used to compare the groups. There is no significant difference between the immunostimulated animals and the control animals. N = 15-18 / group.

Figure 21A : cette figure illustre l’Expression des IgY dirigés contre Toxoplasma gondii mesurée dans le sérum des poulets sacrifiés à J21 (infectés à J14) et à J35 (infectés à J7 et J14). Aucun titre en anticorps n’a pu être déterminé chez les animaux infectés à J7 et sacrifiés à J14 (données non représentées). ANOVA deux voies avec test post-hoc de Tukey. n=918/groupe.Figure 21A: This figure illustrates the expression of IgY directed against Toxoplasma gondii measured in the serum of chickens sacrificed on D21 (infected on D14) and on D35 (infected on D7 and D14). No antibody titer could be determined in animals infected on D7 and sacrificed on D14 (data not shown). Two-way ANOVA with post-hoc Tukey test. n = 918 / group.

Figure 21B : cette figure illustre l’Expression des IgY dirigés contre Toxoplasma gondii mesurée dans le sérum des poulets sacrifiés à J35. Les animaux ont été immunostimulés avec 103 ou 105 tachyzoïtes de la souche Toxo tgmicl-3 KO roplôKO gral5II Kl. Du DMEM (Dulbecco’s modified eagle’s medium) a été utilisé comme contrôle. Les animaux ensuite été infectés ou non par 2.105 oocystes d’Eimeria acervulina à J7 ou à J14 post immunostimulation. ANOVA deux voies avec test post-hoc de Tukey. n=9- 12/groupe.Figure 21B: this figure illustrates the expression of IgY directed against Toxoplasma gondii measured in the serum of chickens sacrificed on D35. The animals were immunostimulated with 10 3 or 10 5 tachyzoites of the Toxo tgmicl-3 KO roplôKO gral5II Kl strain. DMEM (Dulbecco's modified eagle's medium) was used as a control. The animals were then infected or not with 2.10 5 oocysts of Eimeria acervulina on D7 or D14 post immunostimulation. Two-way ANOVA with post-hoc Tukey test. n = 9-12 / group.

Figure 22 : cette figure illustre la Prise de poids des poulets immunostimulés avec des tachyzoïtes frais (A-B) ou lyophilisés (C-D). (A-B) Immunostimulation effectuée à J1 à la dose de 105 tachyzoïtes (sc), le DMEM (Dulbecco’s modified eagle’s medium) seul a été utilisé comme contrôle. (C-D) Immunostimulation effectuée à J1 à la dose de 107 tachyzoïtes (sc), la solution F4 a été utilisée comme contrôle. Animaux infectés 7 jours postFigure 22: this figure illustrates the weight gain of chickens immunostimulated with fresh (AB) or freeze-dried (CD) tachyzoites. (AB) Immunostimulation performed on D1 at a dose of 10 5 tachyzoites (sc), DMEM (Dulbecco's modified eagle's medium) alone was used as a control. (CD) Immunostimulation performed on D1 at a dose of 10 7 tachyzoites (sc), the F4 solution was used as a control. Animals infected 7 days post

Immunostimulation (A et C) ou 14 jours post-immunostimulation (B et D) par 2.27.104 bactéries de souche Salmonella Enteritidis par voie orale. Les animaux ont été sacrifiés en série, le nombre d’animaux restant par groupe est représenté sous les courbes. Moyenne +/SEM. Les écarts sont plus petits que les caractères représentant les points de courbe et ne sont donc pas toujours visible. ANOVA deux voies avec test Tukey post-hoc. Ns p value > 0,05 ; ** p value < 0,001 ; *** p value < 0,0005 ; **** p value < 0,0001.Immunostimulation (A and C) or 14 days post-immunostimulation (B and D) with 2.27.10 4 bacteria of strain Salmonella Enteritidis by the oral route. The animals were sacrificed in series, the number of animals remaining per group is shown under the curves. Average + / SEM. The differences are smaller than the characters representing the curve points and are therefore not always visible. Two-way ANOVA with post-hoc Tukey test. Ns p value>0.05; ** p value <0.001; *** p value <0.0005; **** p value <0.0001.

Figure 23 : cette figure représente le portage des salmonelles dans les cæca de poulets immunostimulés avec des tachyzoïtes frais (A-B) ou lyophilisés (C-D). (A-B)Figure 23: this figure represents the carrying of salmonella in the caes of immunostimulated chickens with fresh (A-B) or freeze-dried (C-D) tachyzoites. (A-B)

Immunostimulation effectuée à J1 à la dose de 105 tachyzoïtes (sc), le DMEM seul a été utilisé comme contrôle. (C-D) Immunostimulation effectuée à J1 à la dose de 107 tachyzoïtes lyophilisés (sc), la solution F4 a été utilisée comme contrôle. Animaux infectés 7 jours post-immunostimulation (A et C) ou 14 jours post-immunostimulation (B et D) par 2.27.104 Salmonella Enteritidis par voie orale. Les données ont été transformées par la fonction logarithme avant analyse statistique et représentation graphique. Moyenne +/- SEM. Lorsque le nombre de dimension excède 2, une ANOVA deux voies avec un test post-hoc de Bonferroni a été réalisée. Dans le cas contraire, le test de t student a été employé, ns p value > 0,05 ; ** p value < 0,001 ; *** p value < 0,0005 ; **** p value < 0,0001.Immunostimulation performed on D1 at a dose of 10 5 tachyzoites (sc), DMEM alone was used as a control. (CD) Immunostimulation carried out on D1 at the dose of 10 7 lyophilized tachyzoites (sc), the F4 solution was used as a control. Animals infected 7 days post-immunostimulation (A and C) or 14 days post-immunostimulation (B and D) with 2.27.10 4 Salmonella Enteritidis orally. The data were transformed by the logarithm function before statistical analysis and graphical representation. Average +/- SEM. When the number of dimensions exceeds 2, a two-way ANOVA with a post-hoc Bonferroni test was performed. Otherwise, the t student test was used, ns p value>0.05; ** p value <0.001; *** p value <0.0005; **** p value <0.0001.

Figure 24 : Titre en anticorps mesuré en ELISA à partir de sérum provenant de poulets immunostimulés avec des tachyzoïtes frais (A-B) ou lyophilisés (C-D). (A-B) Immunostimulation effectuée à un jour d’âge à la dose de 105 tachyzoïtes (sc), le DMEM seul a été utilisé comme contrôle. (C-D) Immunostimulation effectuée à un jour d’âge à la dose de 107 tachyzoïtes (sc), la solution F4 a été utilisée comme contrôle. Animaux infectés 7 jours post-immunostimulation (A et C) ou 14 jours post-immunostimulation (B et D) par 2.27.104 bactéries de souche Salmonella Enteritidis par voie orale. Moyenne +/- SEM. Lorsque le nombre de dimension excède 2, une ANOVA deux voies avec un test post-hoc de Bonferroni a été réalisé. Dans le cas contraire, le test de t student a été employé, ns p value > 0,05 ; ** p value < 0,001 ; *** p value < 0,0005 ; **** p value < 0,0001.Figure 24: Antibody titer measured in ELISA from serum from immunostimulated chickens with fresh (AB) or lyophilized (CD) tachyzoites. (AB) Immunostimulation performed at one day of age at a dose of 10 5 tachyzoites (sc), DMEM alone was used as a control. (CD) Immunostimulation performed at one day of age at a dose of 10 7 tachyzoites (sc), the F4 solution was used as a control. Animals infected 7 days post-immunostimulation (A and C) or 14 days post-immunostimulation (B and D) with 2.27.10 4 bacteria of strain Salmonella Enteritidis orally. Average +/- SEM. When the number of dimensions exceeds 2, a two-way ANOVA with a post-hoc Bonferroni test was performed. Otherwise, the t student test was used, ns p value>0.05; ** p value <0.001; *** p value <0.0005; **** p value <0.0001.

Figure 25 : Effet de Timmunostimulation par Toxo-KO+ 2G sur la charge virale. Titres viraux mesurés par RT-qPCR dans les poumons, les sécrétions orotrachéales et dans les reins de poulets infectés à J6, J13 ou J20 par le virus H7N1 par voie intratrachéale (Dose représentée sur le graphique). Au préalable de cette infection, les animaux ont été immunisés par ToxoKO+ 2G à 1 jour d’âge (105 tachyzoïtes par animal, 100pL, s.c.) ou ont été inoculés par une solution contrôle (100pL de DMEM, s.c.). Les valeurs des titres viraux ont été converties par la fonction logarithme avant la représentation graphique et avant les calculs statistiques.Figure 25: Effect of immunostimulation by Toxo-KO + 2G on viral load. Viral titers measured by RT-qPCR in the lungs, orotracheal secretions and in the kidneys of chickens infected on D6, D13 or D20 by the H7N1 virus intratracheally (Dose shown in the graph). Prior to this infection, the animals were immunized with ToxoKO + 2G at 1 day of age (10 5 tachyzoites per animal, 100 μL, sc) or were inoculated with a control solution (100 μL of DMEM, sc). The values of the viral titles were converted by the logarithm function before the graphic representation and before the statistical calculations.

Moyenne +/- SEM. ANOVA deux voies avec test post-hoc de Sidack post-hoc. ns p value >Average +/- SEM. Two-way ANOVA with post-hoc Sidack post-hoc test. ns p value>

0,05 ; * p<0.05. EID50 : eggs infectious doses 50.0.05; * p <0.05. EID50: eggs infectious doses 50.

Figure 26 : Expression des ARNm de l’IFN-beta (A) et de MDA5 (B) dans le parenchyme pulmonaire de poulet préalablement immunostimulés à J1 ou ayant reçus une dose contrôle (DMEM). Les poulets ont été infectés à J6, J13 et J20 par le virus H7N1 ou ont reçus une dose contrôle (PBS). Ils ont été sacrifiés respectivement à J10, J17 et J23 pour effectuer les analyses. n=6 par groupe, moyenne +/- SEM.Figure 26: Expression of IFN-beta (A) and MDA5 (B) mRNAs in chicken lung parenchyma previously immunostimulated on D1 or having received a control dose (DMEM). The chickens were infected on D6, D13 and D20 with the H7N1 virus or received a control dose (PBS). They were sacrificed respectively on D10, D17 and D23 to carry out the analyzes. n = 6 per group, average +/- SEM.

Exemple 1 : Construction de la souche Toxo Tgmicl-3 KO - 2G (notée Toxo KO 2G)Example 1: Construction of the Toxo Tgmicl-3 KO - 2G strain (denoted Toxo KO 2G)

L’haploïdie du génome de Toxoplasma gondii lors de la phase proliférative permet l’invalidation d’un gène en une seule recombinaison homologue.The haploidy of the Toxoplasma gondii genome during the proliferative phase allows the invalidation of a gene in a single homologous recombination.

Culture des parasitesCulture of parasites

Tous les tachyzoïtes de la souche de Toxoplasma gondii utilisés ont été produits en fibroblastes humains (HFF Hs27 ATCC CRL-1634)) cultivés en milieu minimal de Dulbecco (DMEM) supplémenté par 10% de sérum de veau fœtal (SVF), 2mM glutamine, 100 U/mL de pénicilline et 100 U/mL de streptomycine. Ils ont été récoltés après lyse mécanique des cellules hôtes par 3 passages en seringue 25G.All the tachyzoites of the Toxoplasma gondii strain used were produced in human fibroblasts (HFF Hs27 ATCC CRL-1634)) cultured in minimal medium from Dulbecco (DMEM) supplemented with 10% fetal calf serum (SVF), 2mM glutamine, 100 U / mL of penicillin and 100 U / mL of streptomycin. They were harvested after mechanical lysis of the host cells by 3 passages in 25G syringe.

Construction des plasmides • Plasmide pTgMIC3-KO-CAT-GFP loxPConstruction of plasmids • pTgMIC3-KO-CAT-GFP loxP plasmid

Le plasmide pTgMIC3-KO-CAT-GFP Lox P SEQ ID NO : 34 (Figure IA) a été construit pour supprimer le gène codant la protéine TgMIC3 de Toxoplasma gondii (référence ATCC : souche RH Pra310) par recombinaison homologue.The plasmid pTgMIC3-KO-CAT-GFP Lox P SEQ ID NO: 34 (Figure IA) was constructed to suppress the gene coding for the protein TgMIC3 of Toxoplasma gondii (ATCC reference: RH strain Pra310) by homologous recombination.

Le plasmide pTgMic3K0-CAT-GFP loxP SEQ ID NO : 34 contient une cassette de sélection CAT-GFP SEQ ID NO : 6 comprenant un gène de sélection cat-gfp SEQ ID NO : 2 codant pour une protéine de fusion CAT-GFP permettant à la fois la résistance au chloramphénicol (CAT) et une fluorescence verte (GFP : Green Fluorescent Protein), sous le contrôle du promoteur de Ι’α-tubuline de Toxoplasma gondii SEQ ID NO : 3. En aval du gène cat-gfp SEQ ID NO :2, la séquence 3’UTR du gène sagl de Toxoplasma gondii SEQ ID NO : 4 est insérée. La SEQ ID NO :6 a été amplifiée à partir du plasmide pT230 CAT-GFP SEQ ID NO : 9 en utilisant les amorces SEQ ID NO : 35 et SEQ ID NO : 36 qui permettent l’ajout des sites loxP (SEQ ID NO : 12) et des sites de restrictions HindlII et Spel. La séquence nucléotidique amplifiée par PCR (2389 pb) a ensuite été cloné dans le plasmide pT230TUB Ble SEQ ID NO : 37 par digestion enzymatique avec les enzymes de restriction HindlII et Spel. Le plasmide obtenu est dénommé pCATGFP loxP SEQ ID NO : 38.The plasmid pTgMic3K0-CAT-GFP loxP SEQ ID NO: 34 contains a selection cassette CAT-GFP SEQ ID NO: 6 comprising a selection gene cat-gfp SEQ ID NO: 2 coding for a fusion protein CAT-GFP allowing both chloramphenicol resistance (CAT) and green fluorescence (GFP: Green Fluorescent Protein), under the control of the Tox'α-tubulin promoter of Toxoplasma gondii SEQ ID NO: 3. Downstream of the cat-gfp gene SEQ ID NO: 2, the 3'UTR sequence of the Toxoplasma gondii sagl gene SEQ ID NO: 4 is inserted. SEQ ID NO: 6 was amplified from plasmid pT230 CAT-GFP SEQ ID NO: 9 using the primers SEQ ID NO: 35 and SEQ ID NO: 36 which allow the addition of loxP sites (SEQ ID NO: 12) and HindlII and Spel restriction sites. The nucleotide sequence amplified by PCR (2389 bp) was then cloned into the plasmid pT230TUB Ble SEQ ID NO: 37 by enzymatic digestion with the restriction enzymes HindIII and Spel. The plasmid obtained is called pCATGFP loxP SEQ ID NO: 38.

La région 3’HR du gène Tgmic3 SEQ ID NO : 39 a été obtenu par la double digestion enzymatique du plasmide pmic3KO-2 SEQ ID NO : 40 avec les enzymes de restriction Kpnl et HindlII (2145pb), puis cloné dans le plasmide pCATGFP loxP SEQ ID NO : 38 digéré par Kpnl et HindlII (5238pb). Le plasmide obtenu est dénommé p3’UTRmic3-CATGFP loxP SEQIDNO : 41.The 3'HR region of the Tgmic3 gene SEQ ID NO: 39 was obtained by double enzymatic digestion of the plasmid pmic3KO-2 SEQ ID NO: 40 with the restriction enzymes Kpnl and HindlII (2145pb), then cloned into the plasmid pCATGFP loxP SEQ ID NO: 38 digested with Kpnl and HindIII (5238pb). The plasmid obtained is called p3'UTRmic3-CATGFP loxP SEQIDNO: 41.

La région 5’HR du gène Tgmic3 SEQ ID NO : 42 a été amplifiée par PCR à partir de l’ADN génomique de la souche RH de T gondii. Pour l’amplification, les amorces SEQ ID NO : 43 et SEQ ID NO : 44 permettent l’amplification de la région 5’UTR du gène Tgmic3 et la création de deux sites de restrictions (2568pb / sites Spel et Xbal). Ces sites de restrictions ont été utilisés pour cloner le fragment 5HR digéré par Spel et Xbal (2548pb) dans le plasmide p3’UTRmic3-CATGFP loxP SEQ ID NO : 38 en aval de la cassette de sélection CAT-GFP SEQ ID NO : 6 au niveau du site Spel du plasmide précédemment décrit (7383pb) pour obtenir le plasmide pTgMic3KO-CAT-GFP loxP SEQ ID NO : 34.The 5’HR region of the Tgmic3 gene SEQ ID NO: 42 was amplified by PCR from the genomic DNA of the RH strain of T gondii. For amplification, the primers SEQ ID NO: 43 and SEQ ID NO: 44 allow the amplification of the 5’UTR region of the Tgmic3 gene and the creation of two restriction sites (2568pb / Spel and Xbal sites). These restriction sites were used to clone the 5HR fragment digested with Spel and Xbal (2548bp) into the plasmid p3'UTRmic3-CATGFP loxP SEQ ID NO: 38 downstream of the selection cassette CAT-GFP SEQ ID NO: 6 to level of the Spel site of the plasmid previously described (7383 bp) to obtain the plasmid pTgMic3KO-CAT-GFP loxP SEQ ID NO: 34.

Les séquences des amorces figurent dans le Tableau 1 ci-après.The sequences of the primers are shown in Table 1 below.

Tableau 1 : Séquences des amorces utilisées pour la construction du plasmide pTgMIC3-KOCAT-GFP loxP .Table 1: Sequences of the primers used for the construction of the plasmid pTgMIC3-KOCAT-GFP loxP.

Construction duplasmidepTgmic3KO CAT-GFPloxP Construction duplasmidepTgmic3KO CAT-GFPloxP SEQ ID NO : 35 SEQ ID NO: 35 GCGGC’C A AGCTT. 1T AA CTTCGTA TAA TGTA TGCTA TA CGA GCGGC’C A AGCTT. 1T AA CTTCGTA TAA TGTA TGCTA TA CGA HindlII. loxP HindIII. loxP AGrL4rGATATGCATGTCCGCgttcgtgaaatctctgatcaagcgg AGrL4rGATATGCATGTCCGCgttcgtgaaatctctgatcaagcgg SEQ ID NO : 36 SEQ ID NO: 36 cgacgcacgctgtcactcaacttgctGCTAGA4CL4GrGGATCCArA4 CTTCGTA TAGCA TACA TTATACGAAGTTA TCCCTCGG cgacgcacgctgtcactcaacttgctGCTAGA4CL4GrGGATCCArA4 CTTCGTA TAGCA TACA TTATACGAAGTTA TCCCTCGG Spel, Bam HI. loxP Spel, Bam HI. loxP SEQ ID NO : 43 SEQ ID NO: 43 GGGATCCACTAGTTTACGTATCGCGACTAGCAGCAAG TTGAGTGACAGCG GGGATCCACTAGTTTACGTATCGCGACTAGCAGCAAG TTGAGTGACAGCG BamHI, Spel, SnaBI, NruI BamHI, Spel, SnaBI, NruI SEQ ID NO : 44 SEQ ID NO: 44 GCTGCAGTCTAGAGATATCCACGTGGAATTCCTCTTGG GAAGAACAAT GCTGCAGTCTAGAGATATCCACGTGGAATTCCTCTTGG GAAGAACAAT PstI, Xbal, EcoRV Pmll PstI, Xbal, EcoRV Pmll

• Plasmide pTgMIC 1 -KO-CAT-GFP loxN• pTgMIC 1 -KO-CAT-GFP loxN plasmid

Le plasmide pTgMIC 1-KO-CAT-GFP loxN SEQ ID NO : 45 (Figure 1-B) a été construit pour supprimer le gène codant la protéine TgMICl de Toxoplasma gondii par recombinaison homologue.The plasmid pTgMIC 1-KO-CAT-GFP loxN SEQ ID NO: 45 (Figure 1-B) was constructed to suppress the gene coding for the protein TgMIC1 of Toxoplasma gondii by homologous recombination.

Le plasmide pTgMiclKO-CAT-GFP loxN SEQ ID NO : 45 contient une cassette de sélection CAT-GFP SEQ ID NO : 6 comprenant le gène de sélection cat-gfp SEQ ID NO : 2 codant pour la protéine de fusion CAT-GFP permettant à la fois la résistance au chloramphénicol (CAT) et une fluorescence verte (GFP : Green Fluorescent Protein), sous le contrôle du promoteur de Ι’α-tubuline de Toxoplasma gondii SEQ ID NO : 3. En aval du gène cat-gfp SEQ ID NO :2, la séquence 3’UTR du gène sagl de Toxoplasmagondii SEQ ID NO : 4 a été insérée.The plasmid pTgMiclKO-CAT-GFP loxN SEQ ID NO: 45 contains a selection cassette CAT-GFP SEQ ID NO: 6 comprising the selection gene cat-gfp SEQ ID NO: 2 coding for the fusion protein CAT-GFP allowing both chloramphenicol resistance (CAT) and green fluorescence (GFP: Green Fluorescent Protein), under the control of the Tox'α-tubulin promoter of Toxoplasma gondii SEQ ID NO: 3. Downstream of the cat-gfp gene SEQ ID NO: 2, the 3'UTR sequence of the Toxoplasmagondii SEQ ID NO: 4 sag1 gene has been inserted.

La SEQ ID NO :6 a été amplifiée à partir du plasmide pT230 CAT-GFP SEQ ID NO : 9 en utilisant les amorces SEQ ID NO : 46 et SEQ ID NO : 47 qui permettent l’ajout des sites loxN (SEQ ID NO : 5) et des sites de restrictions Clal et Xbal. La séquence nucléotidique amplifiée par PCR a ensuite été cloné dans le plasmide pNcMic3K0-DHFR SEQ ID NO : 10 digéré par Clal et Xbal (7715 pb) par digestion enzymatique avec les enzymes de restriction Clal et Xbal.SEQ ID NO: 6 was amplified from the plasmid pT230 CAT-GFP SEQ ID NO: 9 using the primers SEQ ID NO: 46 and SEQ ID NO: 47 which allow the addition of loxN sites (SEQ ID NO: 5) and Clal and Xbal restriction sites. The PCR-amplified nucleotide sequence was then cloned into the plasmid pNcMic3K0-DHFR SEQ ID NO: 10 digested with Clal and Xbal (7715 bp) by enzymatic digestion with the restriction enzymes Clal and Xbal.

Le plasmide obtenu est dénommé pNCmic3KO CATGFP LoxN SEQ ID NO : 48.The plasmid obtained is called pNCmic3KO CATGFP LoxN SEQ ID NO: 48.

Le fragment 5HR tgmicl SEQ ID NO : 49 a été amplifié par PCR avec les amorces SEQ ID NO : 50 et SEQ ID NO : 51 (2364pb), les sites de restriction Kpnl et Clal ont été ajoutés par PCR. Le fragment amplifié est digéré par les enzymes de restriction Kpnl et Clal (2337pb) et cloné dans le plasmide pNCmic3KO CATGFP LoxN SEQ ID NO : 48 (voir exemple 6 pour l’obtention du plasmide pNCmic3KO CATGFP LoxN) digéré par Kpnl et Clal (7740pb) pour remplacer le fragment 5HR ncmic3 (fragment digéré par Kpnl et Clal). Le plasmide obtenu est dénommé pTgmiclKO5HR-NCmic3KO3HR CATGFP LoxN SEQ ID NO : 111The 5HR tgmicl SEQ ID NO: 49 fragment was amplified by PCR with the primers SEQ ID NO: 50 and SEQ ID NO: 51 (2364pb), the restriction sites Kpn1 and ClaI were added by PCR. The amplified fragment is digested with the restriction enzymes Kpnl and Clal (2337pb) and cloned into the plasmid pNCmic3KO CATGFP LoxN SEQ ID NO: 48 (see example 6 for obtaining the plasmid pNCmic3KO CATGFP LoxN) digested with Kpnl and Clal (7740pb ) to replace the 5HR ncmic3 fragment (fragment digested with Kpnl and ClaI). The plasmid obtained is called pTgmiclKO5HR-NCmic3KO3HR CATGFP LoxN SEQ ID NO: 111

Puis le fragment 3HR tgmicl SEQ ID NO : 52 a été amplifié par PCR avec les amorces SEQ ID NO : 53 et SEQ ID NO : 54 (2750pb), les sites de restriction Xbal et Notl ont été ajoutés par PCR. Le fragment amplifié est digéré par les enzymes de restriction Xbal et Notl (2720 pb) puis cloné dans le plasmide pTgmiclKO5HR-NCmic3KO3HR CATGFP LoxN SEQ ID NO : 11 ldigéré par les enzymes de restriction Xbal et Notl (7565 pb) pour remplacer le fragment 3HR ncmic3 (fragment digéré par Xbal et Notl).Le plasmide obtenu est dénommé pTgmiclKO CAT-GFP LoxN SEQ ID NO : 45Then the 3HR fragment tgmicl SEQ ID NO: 52 was amplified by PCR with the primers SEQ ID NO: 53 and SEQ ID NO: 54 (2750bp), the restriction sites Xbal and NotI were added by PCR. The amplified fragment is digested with the restriction enzymes Xbal and Notl (2720 bp) then cloned into the plasmid pTgmiclKO5HR-NCmic3KO3HR CATGFP LoxN SEQ ID NO: 11 l digested by the restriction enzymes Xbal and Notl (7565 bp) to replace the fragment 3HR ncmic3 (fragment digested with Xbal and NotI). The plasmid obtained is called pTgmiclKO CAT-GFP LoxN SEQ ID NO: 45

Les amorces utilisées pour les PCR sont détaillées dans le tableau 2 ci-dessous.The primers used for the PCRs are detailed in Table 2 below.

Tableau 2 : Amorces permettant la construction du plasmide pTgmic3KO CAT-GFP loxPTable 2: Primers allowing the construction of the plasmid pTgmic3KO CAT-GFP loxP

Construction duplasmidepTgmic3KO CAT-GFPloxP Construction duplasmidepTgmic3KO CAT-GFPloxP SEQ ID NO : 46 SEQ ID NO: 46 TCCGCTCTCAGAGAATCGATGAAGCTTATAACTTCGTA TAGTATACCTTATACGAAGTTATGATATGCATGTCCGCG TCCGCTCTCAGAGAATCGATGAAGCTTATAACTTCGTA TAGTATACCTTATACGAAGTTATGATATGCATGTCCGCG Clal LoxN Clal LoxN TTCGTGAAATCTC TTCGTGAAATCTC SEQ ID NO : 47 SEQ ID NO: 47 ATACGTAAACTTCTAGATCCATAACTTCGTATAAGGTA TACTATACGAAGTTATCCCTCGGGGGGGCAAGAATTGT ATACGTAAACTTCTAGATCCATAACTTCGTATAAGGTA TACTATACGAAGTTATCCCTCGGGGGGGCAAGAATTGT Xbal loxN Xbal loxN GTTAACCGGTTCGA GTTAACCGGTTCGA SEQ ID NO : 50 SEQ ID NO: 50 GTAGCAAGGTACCACAAGCTAAAGAAACTAGTGCCTCT TCTAAA GTAGCAAGGTACCACAAGCTAAAGAAACTAGTGCCTCT TCTAAA 5HR tgmiclFor Kpnl 5HR tgmiclFor Kpnl SEQ ID NO : 51 SEQ ID NO: 51 TAAACGGGCTGATCGATGCAGGTAAATTCTATAGCCGG GT TAAACGGGCTGATCGATGCAGGTAAATTCTATAGCCGG GT 5HR tgmicl Rev Clal 5HR tgmicl Rev Clal SEQ ID NO : 53 SEQ ID NO: 53 TAAACGGGCTGATCGATGCAGGTAAATTCTATAGCCGG GT TAAACGGGCTGATCGATGCAGGTAAATTCTATAGCCGG GT 3HR tgmiclFor Xbal 3HR tgmiclFor Xbal SEQ ID NO : 54 SEQ ID NO: 54 AAAAACTCGGTGGCGGCCGCATAAAGAAGAGCAAGGA AAA AAAAACTCGGTGGCGGCCGCATAAAGAAGAGCAAGGA AAA 3 HR tgmicl rev Notl 3 HR tgmicl rev Notl

• Plasmide pTSAGl- Cre Recombinase• pTSAGl- Cre Recombinase Plasmid

Le plasmide pT-SAGl-Cre-Recombinase SEQ ID NO : 15 a été construit pour exprimer de manière transitoire dans le parasite Toxoplasma gondii et ses dérivés modifiés génétiquement le gène codant la protéine Cre Recombinase dérivée du bactériophage PI (Brecht et al., 1999, même référence que précédemment).The plasmid pT-SAG1-Cre-Recombinase SEQ ID NO: 15 was constructed to transiently express in the parasite Toxoplasma gondii and its genetically modified derivatives the gene encoding the Cre Recombinase protein derived from bacteriophage PI (Brecht et al., 1999 , same reference as above).

Le plasmide pT-SAGl-Cre-Recombinase SEQ ID NO : 15 dérive du plasmide pUC18 (plasmide commercial) qui contient une cassette d’expression de la Cre Recombinase du bactériophage PI. Dans le plasmide pT-SAGl-Cre-Recombinase SEQ ID NO : 15, le gène codant la Cre Recombinase SEQ ID NO :16, est placé sous la dépendance du promoteur du gène sagl de Toxoplasma gondii SEQ ID NO :17, ce qui permet l’expression de la protéine Cre Recombinase dans les parasites Toxoplasma gondii transfectés. En aval du gène codant la Cre Recombinase SEQ ID NO :16, la séquence 3’UTR du gène sagl de Toxoplasma gondii SEQ ID NO :4 est insérée. Cette séquence a pour objectif de stabiliser l’ARNm codant la protéine Cre Recombinase.The plasmid pT-SAG1-Cre-Recombinase SEQ ID NO: 15 is derived from the plasmid pUC18 (commercial plasmid) which contains an expression cassette for the Cre Recombinase of bacteriophage PI. In the plasmid pT-SAG1-Cre-Recombinase SEQ ID NO: 15, the gene encoding Cre Recombinase SEQ ID NO: 16 is placed under the control of the promoter of the sagl gene of Toxoplasma gondii SEQ ID NO: 17, which allows expression of the Cre Recombinase protein in the transfected Toxoplasma gondii parasites. Downstream of the gene encoding Cre Recombinase SEQ ID NO: 16, the 3’UTR sequence of the sagl gene of Toxoplasma gondii SEQ ID NO: 4 is inserted. The objective of this sequence is to stabilize the mRNA encoding the Cre Recombinase protein.

L’absence de cassette de sélection spécifique ne permet pas une intégration stable du matériel génétique transfecté mais seulement une expression transitoire de la Cre Recombinase.The absence of a specific selection cassette does not allow stable integration of the transfected genetic material but only a transient expression of Cre Recombinase.

Construction de la souche Toxo Tgmicl-3 KO - 2GConstruction of the Toxo Tgmicl-3 KO - 2G strain

La construction de la souche vivante atténuée de seconde génération, dénommée Toxo tgmicl-3 KO - 2G, est faite en 4 étapes distinctes (Figure 2-A) :The construction of the second generation attenuated living strain, called Toxo tgmicl-3 KO - 2G, is done in 4 distinct steps (Figure 2-A):

1. Délétion par recombinaison homologue du gène Tgmic3 et son remplacement par la cassette de sélection CAT-GFP SEQ ID NO :6 encadrée par des séquences LoxP SEQ IDNO :12.1. Deletion by homologous recombination of the Tgmic3 gene and its replacement by the selection cassette CAT-GFP SEQ ID NO: 6 framed by LoxP sequences SEQ IDNO: 12.

Pour obtenir cette souche, la souche sauvage de Toxoplasma gondii RH (référence ATCC : PRA-310) est électroporée avec le plasmide pTgMIC3-KO-CAT-GFP loxP SEQ ID NO :34. 20 pg de plasmide purifié puis linéarisé par Kpnl sont ajoutés à 107 parasites mis en suspension dans le milieu d’électroporation CYTOMIX contenant de l’ATP (3 mM) et du Glutathion (3 mM) (Van den Hoff et al., Nucleic Acid Research, Jun 11 ; 20(11):2902), et Télectroporation a été réalisée en cuvette d’écart 4 mm, dans un volume de 800 pL sur un appareil BioRad (Paramètres : 2000V, 50 ohms, 25 pF, avec deux chocs électriques). Après électroporation, les tachyzoïtes sont déposés sur une monocouche de cellules HFF en culture. Pour la sélection des mutants, le milieu de culture est remplacé et supplémenté par l’agent de sélection (chloramphénicol 20 μΜ), 24 heures après l’électroporation. 10 à 15 jours après sélection, les parasites sont sous-clonés en plaque 96 puits sur une monocouche de cellules HFF et les clones d’intérêt sont identifiés par PCR après avoir effectué une extraction d’ADN génomique au DNAzol des clones d’intérêt. La souche obtenue est dénommée Toxo tgmic3 KO.To obtain this strain, the wild strain of Toxoplasma gondii RH (reference ATCC: PRA-310) is electroporated with the plasmid pTgMIC3-KO-CAT-GFP loxP SEQ ID NO: 34. 20 μg of plasmid purified then linearized with Kpnl are added to 10 7 parasites suspended in the CYTOMIX electroporation medium containing ATP (3 mM) and Glutathione (3 mM) (Van den Hoff et al., Nucleic Acid Research, Jun 11; 20 (11): 2902), and Telectroporation was carried out in a 4 mm gap cuvette, in a volume of 800 pL on a BioRad device (Parameters: 2000V, 50 ohms, 25 pF, with two electric shock). After electroporation, the tachyzoites are deposited on a monolayer of HFF cells in culture. For the selection of mutants, the culture medium is replaced and supplemented with the selection agent (chloramphenicol 20 μΜ), 24 hours after electroporation. 10 to 15 days after selection, the parasites are subcloned into a 96-well plate on a monolayer of HFF cells and the clones of interest are identified by PCR after having carried out an extraction of genomic DNA with DNAzol from the clones of interest. The strain obtained is called Toxo tgmic3 KO.

Dans cette souche, le gène mic3 a été délété et remplacé par la cassette de sélection CATGFP SEQ ID NO :6. Ainsi, la séquence théorique au locus du gène mic3 délété contenant la cassette de sélection CATGFP est la SEQ ID NO : 103. Le gène miel n’étant pas délété, la séquence du gène miel SEQ ID NO : 108 est présente dans le génome de la souche.In this strain, the mic3 gene was deleted and replaced by the selection cassette CATGFP SEQ ID NO: 6. Thus, the theoretical sequence at the locus of the deleted mic3 gene containing the CATGFP selection cassette is SEQ ID NO: 103. Since the honey gene is not deleted, the sequence of the honey gene SEQ ID NO: 108 is present in the genome of strain.

2. Suppression de la cassette de sélection SEQ ID NO :6: la souche Toxo tgmic3 KO obtenue est électroporée avec le plasmide pT-SAGl-CRE-Recombinase SEQ ID NO :15.2. Deletion of the selection cassette SEQ ID NO: 6: the Toxo tgmic3 KO strain obtained is electroporated with the plasmid pT-SAG1-CRE-Recombinase SEQ ID NO: 15.

L’enzyme exprimée transitoirement va permettre l’excision de la cassette de sélection CAT-GFP SEQ ID NO :6. Le protocole d’électroporation est similaire au protocole précédent. Après électroporation, les tachyzoïtes sont déposés sur une monocouche de cellules HFF en culture. Après 2 à 7 jours de culture, les parasites sont sous-clonés en plaque 96 puits sur une monocouche de cellules HFF et les clones d’intérêt sont identifiés par PCR après avoir effectué une extraction d’ADN génomique au DNAzol des clones d’intérêt. La souche obtenue est dénommée Toxo tgmic3 KO - 2G.The transiently expressed enzyme will allow excision of the selection cassette CAT-GFP SEQ ID NO: 6. The electroporation protocol is similar to the previous protocol. After electroporation, the tachyzoites are deposited on a monolayer of HFF cells in culture. After 2 to 7 days of culture, the parasites are subcloned into a 96-well plate on a monolayer of HFF cells and the clones of interest are identified by PCR after having carried out an extraction of genomic DNA with DNAzol from the clones of interest . The strain obtained is called Toxo tgmic3 KO - 2G.

3. Dans cette souche, le gène mic3 a été délété et la cassette de sélection CATGFP SEQ ID NO :6 a été excisé. Ainsi, la séquence théorique au locus du gène mic3 délété contenant un seul site lox P SEQ ID NO : 12, est la SEQ ID NO : 19. Le gène miel n’étant pas délété, la séquence du gène miel SEQ ID NO : 108 est présente dans le génome de la souche. Délétion par recombinaison homologue du gène tgmicl et son remplacement par la cassette de sélection CAT-GFP SEQ ID NO :6 encadrée par des séquences Lox N SEQ ID NO :5. Pour obtenir cette souche, la souche Toxo tgmic3 KO - 2G est électroporée avec le plasmide pTgMICl-KO-CAT-GFP lox N SEQ ID NO :45 linéarisé par Pcil, selon le protocole précédemment décrit. Après électroporation, les tachyzoïtes sont déposés sur une monocouche de cellules HFF en culture. Pour la sélection des mutants, le milieu de culture est remplacé et supplémenté par l’agent de sélection (chloramphénicol 20 μΜ), 24 heures après l’électroporation.3. In this strain, the mic3 gene was deleted and the CATGFP SEQ ID NO: 6 selection cassette was excised. Thus, the theoretical sequence at the locus of the deleted mic3 gene containing a single lox P site SEQ ID NO: 12, is SEQ ID NO: 19. The honey gene not being deleted, the sequence of the honey gene SEQ ID NO: 108 is present in the genome of the strain. Deletion by homologous recombination of the tgmicl gene and its replacement by the selection cassette CAT-GFP SEQ ID NO: 6 framed by Lox N sequences SEQ ID NO: 5. To obtain this strain, the Toxo tgmic3 KO - 2G strain is electroporated with the plasmid pTgMICl-KO-CAT-GFP lox N SEQ ID NO: 45 linearized by Pcil, according to the protocol previously described. After electroporation, the tachyzoites are deposited on a monolayer of HFF cells in culture. For the selection of the mutants, the culture medium is replaced and supplemented with the selection agent (chloramphenicol 20 μΜ), 24 hours after the electroporation.

à 15 jours après sélection, les parasites sont sous-clonés en plaque 96 puits sur une monocouche de cellules HFF et les clones d’intérêt sont identifiés par PCR après avoir effectué une extraction d’ADN génomique des clones d’intérêt. La souche obtenue est dénommée Toxo tgmicl-3 KO.15 days after selection, the parasites are subcloned into a 96-well plate on a monolayer of HFF cells and the clones of interest are identified by PCR after having carried out an extraction of genomic DNA from the clones of interest. The strain obtained is called Toxo tgmicl-3 KO.

4. Dans cette souche, le gène mic3 a été délété et la cassette de sélection CATGFP SEQ ID NO :6 a été excisé. Ainsi, la séquence théorique au locus du gène mic3 délété contenant un seul site lox P SEQ ID NO : 12, est la SEQ ID NO : 19.4. In this strain, the mic3 gene was deleted and the selection cassette CATGFP SEQ ID NO: 6 was excised. Thus, the theoretical sequence at the locus of the deleted mic3 gene containing a single lox P site SEQ ID NO: 12, is SEQ ID NO: 19.

Dans cette souche, le gène miel a été délété et remplacé par la cassette de sélection CATGFP SEQ ID NO :6. Ainsi, la séquence théorique au locus du gène miel délété contenant la cassette de sélection CATGFP est la SEQ ID NO : 104.In this strain, the honey gene was deleted and replaced by the selection cassette CATGFP SEQ ID NO: 6. Thus, the theoretical sequence at the locus of the deleted honey gene containing the CATGFP selection cassette is SEQ ID NO: 104.

5. Suppression de la cassette de sélection SEQ ID NO :6: la souche Toxo tgmicl-3 KO obtenue est électroporée avec le plasmide pT-SAGl-CRE-Recombinase SEQ ID NO :15. L’enzyme exprimée transitoirement va permettre l’excision de la cassette de sélection CAT-GFP SEQ ID NO :6. Après électroporation, les tachyzoïtes sont déposés sur une monocouche de cellules HFF en culture. Après 2 à 7 jours de culture, les parasites sont sous-clonés en plaque 96 puits sur une monocouche de cellules HFF et les clones d’intérêt sont identifiés par PCR après avoir effectué une extraction d’ADN génomique au DNAzol des clones d’intérêt. La souche obtenue est dénommée Toxo tgmicl-3 KO - 2G.5. Deletion of the selection cassette SEQ ID NO: 6: the Toxo tgmicl-3 KO strain obtained is electroporated with the plasmid pT-SAG1-CRE-Recombinase SEQ ID NO: 15. The transiently expressed enzyme will allow excision of the selection cassette CAT-GFP SEQ ID NO: 6. After electroporation, the tachyzoites are deposited on a monolayer of HFF cells in culture. After 2 to 7 days of culture, the parasites are subcloned into a 96-well plate on a monolayer of HFF cells and the clones of interest are identified by PCR after having carried out an extraction of genomic DNA with DNAzol from the clones of interest . The strain obtained is called Toxo tgmicl-3 KO - 2G.

Dans cette souche, le gène mic3 a été délété et la cassette de sélection CATGFP SEQ ID NO :6 a été excisé. Ainsi, la séquence théorique au locus du gène mic3 délété contenant un seul site lox P SEQ ID NO : 12, est la SEQ ID NO : 19.In this strain, the mic3 gene was deleted and the CATGFP SEQ ID NO: 6 selection cassette was excised. Thus, the theoretical sequence at the locus of the deleted mic3 gene containing a single lox P site SEQ ID NO: 12, is SEQ ID NO: 19.

Dans cette souche, le gène miel a été délété et la cassette de sélection CATGFP SEQ ID NO :6 a été excisé. Ainsi, la séquence théorique au locus du gène miel délété contenant un seul site lox N SEQ ID NO : 5, est la SEQ ID NO : 92.In this strain, the honey gene was deleted and the CATGFP SEQ ID NO: 6 selection cassette was excised. Thus, the theoretical sequence at the locus of the deleted honey gene containing a single lox site N SEQ ID NO: 5, is SEQ ID NO: 92.

Validation de la souche Toxo tgmicl-3 KO - 2G par PCRValidation of the Toxo tgmicl-3 KO - 2G strain by PCR

Pour valider la souche Toxo tgmicl-3 KO - 2G des analyses PCR sont effectuées à partir de l’ADN génomique extrait au DNAzol à partir d’un culot parasitaire constitué de 107 parasites. Les amorces utilisées pour les PCR sont décrites dans la Figure 2-D et sont détaillées dans le Tableau 3 ci-dessous. Les produits PCR sont analysés par électrophorèse sur gel d’agarose (Figure 2-B). Leur taille attendue et leur taille observée sont également décrites dans leTo validate the Toxo tgmicl-3 KO - 2G strain, PCR analyzes are carried out using genomic DNA extracted with DNAzol from a parasitic pellet consisting of 10 7 parasites. The primers used for the PCRs are described in Figure 2-D and are detailed in Table 3 below. The PCR products are analyzed by electrophoresis on agarose gel (Figure 2-B). Their expected size and their observed size are also described in the

Tableau 4 ci-dessous. Pour plus de clarté sur la figure 2-B, seules les 3 étapes de la réalisation sont représentées (tgmic3, tgmic3K0 CATGFP et tgmic3K0 loxP (2G) ou tgmicl, tgmiclKOTable 4 below. For clarity on the figure 2-B, only the 3 stages of the realization are represented (tgmic3, tgmic3K0 CATGFP and tgmic3K0 loxP (2G) or tgmicl, tgmiclKO

CATGFP et tgmiclKO loxN(2G)), les résultats obtenus sont conformes aux tailles attendues.CATGFP and tgmiclKO loxN (2G)), the results obtained are in accordance with the expected sizes.

Tableau 3 : liste des amorces utilisées pour la validation des souches.Table 3: list of primers used for validating the strains.

Amorce bait Séquence Sequence Tgmic3 (mixl) Tgmic3 (mixl) 5 5 TgMIC3 For TgMIC3 For SEQ ID NO 61 : CCTCCGATGTGACTTTTGGT SEQ ID NO 61: CCTCCGATGTGACTTTTGGT 6 6 TgMIC3 Rev TgMIC3 Rev SEQ ID NO 62 : GATCCTCGGAGCAAGTCAAC SEQ ID NO 62: GATCCTCGGAGCAAGTCAAC Validation KO 5’Tgmic3 (mix2) 5'Tgmic3 KO validation (Mix2) 13 13 CN58 CN58 SEQ ID NO 63 :ATACGAAGGGATTCGACGTG SEQ ID NO 63: ATACGAAGGGATTCGACGTG j j ORF CATGFP R ORF CATGFP R SEQ ID NO 25 : CCGTTTGGTGGATGTCTTCT SEQ ID NO 25: CCGTTTGGTGGATGTCTTCT Validation KO 3 ’Tgmic3 (mix3) Validation KO 3 ’Tgmic3 (mix3) k k ORF CATGFP F ORF CATGFP F SEQ ID NO 26 :GCATCGACTTCAAGGAGGAC SEQ ID NO 26: GCATCGACTTCAAGGAGGAC 14 14 HR Mic3 RL HR Mic3 RL SEQ ID NO 64 ATATGCGGATGAGTGCTCGAATT SEQ ID NO 64 ATATGCGGATGAGTGCTCGAATT Cicatrice Tgmic3 (mix4) Scar Tgmic3 (mix4) 9 9 Tgmic3 loxN F Tgmic3 loxN F SEQ ID NO 65 : GTGTGGAGACTTTTTACTTCGTGTTAC SEQ ID NO 65: GTGTGGAGACTTTTTACTTCGTGTTAC 10 10 Tgmic3 loxN R Tgmic3 loxN R SEQ ID NO 66 : CCTCCGATGTGACTTTTGGT SEQ ID NO 66: CCTCCGATGTGACTTTTGGT Tgmicl (mix5) Tgmicl (Mix5) 3 3 TgMICl For TgMICl For SEQ ID NO 55 : ATGCGCGCTATAAAGAATCG SEQ ID NO 55: ATGCGCGCTATAAAGAATCG 4 4 TgMICIRev TgMICIRev SEQ ID NO 56 : AGAAACAACGCCTGGCCCAT SEQ ID NO 56: AGAAACAACGCCTGGCCCAT Validation KO 5’Tgmicl (mix6) 5'Tgmicl KO validation (Mix6) 11 11 tgmiclKO integF tgmiclKO integF SEQ ID NO 57 :GTGCGATGACGTGGCTTCTCTATCATGTGT SEQ ID NO 57: GTGCGATGACGTGGCTTCTCTATCATGTGT j j ORF CATGFP R ORF CATGFP R SEQ ID NO 25 : CCGTTTGGTGGATGTCTTCT SEQ ID NO 25: CCGTTTGGTGGATGTCTTCT Validation KO 3 ’Tgmicl (mix7) Validation KO 3 ’Tgmicl (Mix 7) k k ORF CATGFP F ORF CATGFP F SEQ ID NO 26 :GCATCGACTTCAAGGAGGAC SEQ ID NO 26: GCATCGACTTCAAGGAGGAC 12 12 tgmiclKO integR tgmiclKO integR SEQ ID NO 58 :GATTCGCTTCGTCACTTCTGGTACGGATGC SEQ ID NO 58: GATTCGCTTCGTCACTTCTGGTACGGATGC Cicatrice Tgmicl (mix8) Tgmicl scar (mix8) 7 7 Tgmic 1 loxN F Tgmic 1 loxN F SEQ ID NO 59 : CCCGTCTAGCAAGACCTCAA SEQ ID NO 59: CCCGTCTAGCAAGACCTCAA 8 8 Tgmic 1 loxN R Tgmic 1 loxN R SEQ ID NO 60 : TCGGTGCTGCTCAGTAATTG SEQ ID NO 60: TCGGTGCTGCTCAGTAATTG

Tableau 4 : Taille attendue des amplicons (en paires de base) des différentes PCR de validation de la construction des souches KO de Toxoplasma gondiiTable 4: Expected size of the amplicons (in base pairs) of the different PCRs for validation of the construction of the KO strains of Toxoplasma gondii

RH HR Toxo tgmic3 KO Toxo tgmic3 KO Toxo tgmic3 KO -2G Toxo tgmic3 KO -2G Toxo tgmicl-3 KO Toxo tgmicl-3 KO Toxo tgmicl-3 KO - 2G Toxo tgmicl-3 KO - 2G Tgmic3 (mixl) Tgmic3 (mixl) 808 808 - - - - - - - - Validation KO 5’Tgmic3(mix2) KO validation 5'Tgmic3 (mix2) 3253 3253 Validation KO 3 ’Tgmic3 (mix3) Validation KO 3 ’Tgmic3 (Mix3) 3309 3309 Cicatrice Tgmic3 (mix4) Scar Tgmic3 (mix4) 1596 1596 2525 2525 226 226 226 226 226 226 Tgmic l(mix5) Tgmic l (mix5) 608 608 608 608 608 608 - - - - Validation KO 5’Tgmicl (mix6) 5'Tgmicl KO validation (Mix6) 3040 3040 Validation KO 3’Tgmicl (mix7) 3'Tgmicl KO validation (Mix 7) 3593 3593 Cicatrice Tgmicl(mix8) Tgmicl scar (mix8) 4198 4198 4198 4198 4198 4198 3129 3129 830 830

Les électrophorèses des produits PCR réalisés avec les amorces 5 SEQ ID NO :61 et 6 SEQ ID NO : 62 (mix 1) permettent de mettre en évidence une bande à 808 paires de bases pour la souche RH, conformément à la taille de bande attendue et confirmant la présence du gène Tgmic 3 dans cette souche. Cette bande n’est pas détectée dans les souches Toxo tgmic3 KO, Toxo tgmic3 KO - 2G, Toxo tgmicl-3 KO et Toxo tgmicl-3 KO - 2G confirmant la suppression du gène dans ces souches.The electrophoresis of the PCR products carried out with the primers 5 SEQ ID NO: 61 and 6 SEQ ID NO: 62 (mix 1) make it possible to demonstrate a band at 808 base pairs for the RH strain, in accordance with the expected band size and confirming the presence of the Tgmic 3 gene in this strain. This band is not detected in the Toxo tgmic3 KO, Toxo tgmic3 KO - 2G, Toxo tgmicl-3 KO and Toxo tgmicl-3 KO - 2G strains confirming the suppression of the gene in these strains.

Les électrophorèses des produits PCR réalisés avec les amorces 13 SEQ ID NO :63 et j SEQ ID NO :25, et les amorces k SEQ ID NO :26 et 14 SEQ ID NO :64 (mix 2 et 3) permettent de mettre en évidence respectivement une bande à 3253 et 3537 paires de bases pour la souche Toxo tgmic3 KO, conformément à la taille de bande attendue et confirmant la présence du gène de sélection cat-gfp SEQ ID NO :2 dans cette souche à la place du gène Tgmic3 SEQ ID NO :107. Cette bande n’est pas détectée dans les souches RH, Toxo tgmic3 KO - 2G, Toxo tgmicl-3 KO et Toxo tgmicl-3 KO - 2G confirmant l’absence du gène de sélection cat-gfp SEQ ID NO :2 au locus Tgmic 3 dans ces souches.The electrophoresis of the PCR products carried out with the primers 13 SEQ ID NO: 63 and j SEQ ID NO: 25, and the primers k SEQ ID NO: 26 and 14 SEQ ID NO: 64 (mix 2 and 3) make it possible to highlight respectively a band at 3253 and 3537 base pairs for the strain Toxo tgmic3 KO, in accordance with the expected band size and confirming the presence of the selection gene cat-gfp SEQ ID NO: 2 in this strain in place of the gene Tgmic3 SEQ ID NO: 107. This band is not detected in the RH, Toxo tgmic3 KO - 2G, Toxo tgmicl-3 KO and Toxo tgmicl-3 KO - 2G strains confirming the absence of the selection gene cat-gfp SEQ ID NO: 2 at the Tgmic locus 3 in these strains.

Les électrophorèses des produits PCR réalisés avec les amorces 9 SEQ ID NO :65 et 10 SEQ ID NO :66 (mix 4) permettent de mettre en évidence différentes bandes conformément à la taille de bande attendue. Une bande à 1596 paires de bases pour la souche RH, confirme la présence du gène Tgmic3 SEQ ID NO :107 dans cette souche. Une bande de 2525 paires de bases est mise en évidence pour la souche Toxo tgmic3 KO confirmant la présence de la cassette de sélection CATGFP SEQ ID NO :6 à la place du gène Tgmic3. Enfin une bande de 226 paires de bases est mise en évidence pour les souches Toxo tgmic3 KO - 2G, Toxo tgmicl-3 KO et Toxo tgmicl-3 KO - 2G confirmant la suppression du gène de sélection catgfp SEQ ID NO :2 dans ces souches, laissant une cicatrice loxP SEQ ID NO :12 dans le génome.The electrophoresis of the PCR products carried out with the primers 9 SEQ ID NO: 65 and 10 SEQ ID NO: 66 (mix 4) make it possible to highlight different bands in accordance with the expected band size. A band at 1596 base pairs for the RH strain confirms the presence of the Tgmic3 gene SEQ ID NO: 107 in this strain. A band of 2525 base pairs is demonstrated for the Toxo tgmic3 KO strain confirming the presence of the selection cassette CATGFP SEQ ID NO: 6 in place of the Tgmic3 gene. Finally, a band of 226 base pairs is highlighted for the strains Toxo tgmic3 KO - 2G, Toxo tgmicl-3 KO and Toxo tgmicl-3 KO - 2G confirming the deletion of the selection gene catgfp SEQ ID NO: 2 in these strains , leaving a loxP scar SEQ ID NO: 12 in the genome.

Les électrophorèses des produits PCR réalisés avec les amorces 3 SEQ ID NO :55 et 4 SEQ ID NO :56 (mix 5) permettent de mettre en évidence une bande à 608 paires de bases pour les souches RH, Toxo tgmic3 KO et Toxo tgmic3 KO - 2G, conformément aux tailles de bandes attendues et confirmant la présence du gène Tgmicl SEQ ID NO : 108 dans ces souches. Ces bandes ne sont pas détectées dans les souches Toxo tgmicl-3 KO et Toxo tgmicl-3 KO - 2G confirmant la suppression du gène dans ces souches.The electrophoreses of the PCR products carried out with the primers 3 SEQ ID NO: 55 and 4 SEQ ID NO: 56 (mix 5) make it possible to demonstrate a band at 608 base pairs for the RH, Toxo tgmic3 KO and Toxo tgmic3 KO strains - 2G, in accordance with the expected band sizes and confirming the presence of the Tgmicl SEQ ID NO: 108 gene in these strains. These bands are not detected in the Toxo tgmicl-3 KO and Toxo tgmicl-3 KO - 2G strains confirming the suppression of the gene in these strains.

Les électrophorèses des produits PCR réalisés avec les amorces 11 SEQ ID NO :57 et j SEQ ID NO :25, et les amorces k SEQ ID NO :26 et 12 SEQ ID NO :58 (mix 6 et 7) permettent de mettre en évidence respectivement une bande à 3040 et 3593 paires de bases pour la souche Toxo tgmicl-3 KO, conformément à la taille de bande attendue et confirmant la présence du gène de sélection cat-gfp SEQ ID NO :2 dans cette souche à la place du gène tgmic3 SEQ ID NO :107. Cette bande n’est pas détectée dans les souches sauvage RH de T. gondii (référence ATCC : PRA-310), Toxo tgmic3 KO, Toxo tgmic3 KO - 2G, et Toxo tgmicl-3 KO - 2G confirmant l’absence du gène de sélection cat-gfp SEQ ID NO :2 au locus Tgmicl dans ces souches.The electrophoresis of the PCR products carried out with the primers 11 SEQ ID NO: 57 and j SEQ ID NO: 25, and the primers k SEQ ID NO: 26 and 12 SEQ ID NO: 58 (mix 6 and 7) make it possible to highlight respectively a band at 3040 and 3593 base pairs for the strain Toxo tgmicl-3 KO, in accordance with the expected band size and confirming the presence of the selection gene cat-gfp SEQ ID NO: 2 in this strain in place of the gene tgmic3 SEQ ID NO: 107. This band is not detected in wild RH strains of T. gondii (ATCC reference: PRA-310), Toxo tgmic3 KO, Toxo tgmic3 KO - 2G, and Toxo tgmicl-3 KO - 2G confirming the absence of the gene. cat-gfp selection SEQ ID NO: 2 at the Tgmicl locus in these strains.

Les électrophorèses des produits PCR réalisés avec les amorces 7 SEQ ID NO :59 et 8 SEQ ID NO :60 (mix 8) permettent de mettre en évidence différentes bandes conformément à la taille de bande attendue. Une bande à 4198 paires de bases pour les souches RH, Toxo tgmic3 KO et Toxo tgmic3 KO - 2G confirme la présence du gène Tgmicl SEQ ID NO : 108 dans ces souches. Une bande de 3129 paires de bases est mise en évidence pour la souche Toxo tgmicl-3 KO confirmant la présence de la cassette de sélection CATGFP SEQ ID NO :6 à la place du gène Tgmicl. Enfin une bande de 830 paires de bases est mise en évidence pour la souche Toxo tgmicl-3 KO - 2G confirmant la suppression du gène de sélection cat-gfp SEQ ID NO :2 dans cette souche, laissant une cicatrice loxN SEQ ID NO :5 dans le génome.The electrophoresis of the PCR products carried out with the primers 7 SEQ ID NO: 59 and 8 SEQ ID NO: 60 (mix 8) make it possible to highlight different bands in accordance with the expected band size. A band at 4198 base pairs for the RH, Toxo tgmic3 KO and Toxo tgmic3 KO - 2G strains confirms the presence of the Tgmicl SEQ ID NO: 108 gene in these strains. A band of 3129 base pairs is demonstrated for the Toxo tgmicl-3 KO strain confirming the presence of the selection cassette CATGFP SEQ ID NO: 6 in place of the Tgmicl gene. Finally, a band of 830 base pairs is demonstrated for the Toxo tgmicl-3 KO - 2G strain confirming the suppression of the selection gene cat-gfp SEQ ID NO: 2 in this strain, leaving a loxN scar SEQ ID NO: 5 in the genome.

Les produits PCR « cicatrice » (mix 4 et 8) ont été séquencés et les séquençages ont confirmés que :The “scar” PCR products (mix 4 and 8) were sequenced and the sequencing confirmed that:

• le gène Tgmic3 SEQ ID NO :107 a été supprimé et que la cassette de sélection CATGFP SEQ ID NO :6 a bien été supprimée par action de la Cre-Recombinase laissant une cicatrice LoxP SEQ ID NO :12 conforme à la séquence attendue (Figure 2-C).• the Tgmic3 SEQ ID NO: 107 gene has been deleted and the CATGFP SEQ ID NO: 6 selection cassette has been deleted by action of Cre-Recombinase leaving a LoxP scar SEQ ID NO: 12 in accordance with the expected sequence ( Figure 2-C).

• le gène Tgmicl SEQ ID NO : 108 a été supprimé et que la cassette de sélection CATGFP SEQ ID NO :6 a bien été supprimée par action de la CRE-Recombinase laissant une cicatrice LoxN SEQ ID NO :5 conforme à la séquence attendue (Figure 2-C).• the Tgmicl SEQ ID NO: 108 gene has been deleted and the CATGFP SEQ ID NO: 6 selection cassette has been deleted by CRE-Recombinase action leaving a LoxN SEQ ID NO: 5 scar conforming to the expected sequence ( Figure 2-C).

Validation de la souche Toxo tgmicl-3 KO - 2Gpar immunofluorescenceValidation of the Toxo tgmicl-3 KO - 2G strain by immunofluorescence

Les tachyzoïtes sont cultivés 24h sur lamelles en verre recouvertes d’une monocouche de cellules HFF. Les cellules infectées ont été lavés 2 fois en PB SIX, et fixés par du formaldéhyde 4% pendant 30 min. Après 3 lavages en PBS1X, les cellules HFF infectées ont été perméabilisées avec 0,1% de Triton X-100 dans du PBS1X pendant 5 min. Après lavages au PBS IX, une étape de saturation est effectuée avec une solution de PBS 1X/SVF 10% pendant 30 min. Les cellules ont ensuite été incubées avec l'anticorps primaire dilué dans 2% SVF pendant 1 heure, lavées 3 fois au PBS1X puis incubées avec un anticorps secondaire dilué dans une solution de PBS/SVF 2% pendant 1 heure. Après 2 lavages au PBSIX, les lamelles en verre sont montés sur lame avec de l’Immu-Mount™ et observés au microscope à fluorescence.The tachyzoites are cultured for 24 hours on glass coverslips coated with a monolayer of HFF cells. The infected cells were washed twice in PB SIX, and fixed with 4% formaldehyde for 30 min. After 3 washes in PBS1X, the infected HFF cells were permeabilized with 0.1% Triton X-100 in PBS1X for 5 min. After washing with PBS IX, a saturation step is carried out with a solution of PBS 1X / 10% SVF for 30 min. The cells were then incubated with the primary antibody diluted in 2% FCS for 1 hour, washed 3 times with PBS1X then incubated with secondary antibody diluted in a solution of PBS / SVF 2% for 1 hour. After 2 washes with PBSIX, the glass slides are mounted on a slide with Immu-Mount ™ and observed under a fluorescence microscope.

L’anticorps primaire Tgmic3 utilisé est un anticorps qui permet de détecter l’expression de la protéine TgMIC3 SEQ ID NO : 121 dans le parasite (anticorps de lapin anti-mic3 : rnAb antiMIC3 s3) et l’anticorps secondaire commercial utilisé est l’Alexa fluor® 594 chèvre anti-lapin (Life technologies réf. A-l 1012).The primary antibody Tgmic3 used is an antibody which makes it possible to detect the expression of the protein TgMIC3 SEQ ID NO: 121 in the parasite (rabbit anti-mic3 antibody: rnAb antiMIC3 s3) and the commercial secondary antibody used is Alexa fluor® 594 anti-rabbit goat (Life technologies ref. Al 1012).

L’anticorps primaire Tgmicl utilisé est un anticorps qui permet de détecter l’expression de la protéine TgMfCl SEQ ID NO : 122 dans le parasite (anticorps de souris anti-miel : mAb anti-MfCl T104F8E12) et l’anticorps secondaire commercial utilisé est l’Alexa fluor® 594 chèvre anti-souris, Life technologies réf. A-l 1005).The primary antibody Tgmicl used is an antibody which makes it possible to detect the expression of the protein TgMfCl SEQ ID NO: 122 in the parasite (mouse anti-honey antibody: anti-MfCl mAb T104F8E12) and the commercial secondary antibody used is the Alexa fluor® 594 goat anti-mouse, Life technologies ref. A-l 1005).

Les résultats montrent qu'aucune fluorescence n’est détectable au pôle apical du parasite révélant l’absence des protéines MfCl et MÎC3 dans des tachyzoïtes Toxo tgmicl-3 KO - 2G alors qu'une fluorescence au pôle apical du parasite de la souche sauvage démontre 1’ expression des protéines MfCl et MÎC3 (Figures 3 A et 3B).The results show that no fluorescence is detectable at the apical pole of the parasite revealing the absence of the proteins MfCl and MÎC3 in tachyzoites Toxo tgmicl-3 KO - 2G whereas fluorescence at the apical pole of the parasite of the wild strain demonstrates Expression of the proteins MfCl and MÎC3 (Figures 3 A and 3B).

Les résultats montrent que les parasites expriment une fluorescente verte reflétant l’expression de la protéine CATGFP SEQ ID NO : 120 suite à la réalisation des délétions de gènes (Toxo tgmic3 KO et Toxo tgmicl-3 KO) alors qu’après action de la Cre recombinase, les souches Toxo tgmic3 KO - 2G et Toxo tgmicl-3 KO - 2G ne sont plus fluorescentes (suppression de de la cassette CATGFP) (Figures 3A et 3B).The results show that the parasites express a green fluorescent reflecting the expression of the protein CATGFP SEQ ID NO: 120 following the completion of gene deletions (Toxo tgmic3 KO and Toxo tgmicl-3 KO) while after action of Cre recombinase, the strains Toxo tgmic3 KO - 2G and Toxo tgmicl-3 KO - 2G are no longer fluorescent (deletion of the CATGFP cassette) (Figures 3A and 3B).

Exemple 2 : Construction de la souche Toxo Tgmicl-3 KO - 2G / ROP 16 KO (notée Toxo Rop 16)Example 2: Construction of the Toxo Tgmicl-3 KO - 2G / ROP 16 KO strain (denoted Toxo Rop 16)

L’haploïdie du génome de Toxoplasma gondii lors de la phase proliférative permet l’invalidation d’un gène en une seule recombinaison homologue.The haploidy of the Toxoplasma gondii genome during the proliferative phase allows the invalidation of a gene in a single homologous recombination.

Culture des parasitesCulture of parasites

Tous les tachyzoïtes de la souche de Toxoplasma gondii utilisés ont été produits en fibroblastes humains (HFF Hs27 ATCC CRL-1634)) cultivés en milieu minimal de Dulbecco (DMEM) supplémenté par 10% de sérum de veau fœtal (SVF), 2mM glutamine, 100 U/mL de pénicilline et 100 U/mL de streptomycine. Ils ont été récoltés après lyse mécanique des cellules hôtes par 3 passages en seringue 25G.All the tachyzoites of the Toxoplasma gondii strain used were produced in human fibroblasts (HFF Hs27 ATCC CRL-1634)) cultured in minimal medium from Dulbecco (DMEM) supplemented with 10% fetal calf serum (SVF), 2mM glutamine, 100 U / mL of penicillin and 100 U / mL of streptomycin. They were harvested after mechanical lysis of the host cells by 3 passages in 25G syringe.

Construction du plasmideConstruction of the plasmid

Le plasmide pTgROP16-KO-CAT-tdTomato SEQ ID NO :73 (Figure 4) a été construit pour supprimer le gène codant la protéine TgROP16 de Toxoplasma gondii par recombinaison homologue.Plasmid pTgROP16-KO-CAT-tdTomato SEQ ID NO: 73 (Figure 4) was constructed to suppress the gene encoding the TgROP16 protein of Toxoplasma gondii by homologous recombination.

Le plasmide pTgROP16-KO-CAT-tdTomato SEQ ID NO :73 dérive du plasmide pNcMIC3KO-CAT-GFP lox N SEQ ID NO :1. Le gène tdTomato SEQ ID NO : 128 a été amplifiée par PCR avec les amorces AGD F-AvrIIdTomato SEQ ID NO :129et AGD RdTomatoBglII SEQ ID NO : 130 (1459 pb) à partir du fragment synthétisé SEQ ID NO : 12131 cloné dans le plasmide commercial pRSET-B SEQ ID NO : 132. Après digestion par les enzymes Avril et BglII (1439pb), le gène a ensuite été cloné dans le plasmide pGEMT SEQ ID NO : 133 (référence commerciale pGEM®-T Vector - Promega) puis amplifié. Le plasmide a ensuite été digéré par Avril et BglII et cloné au niveau des sites Avril et BglII du plasmide pNcMIC3-KO-CAT-GFP lox N SEQ ID NO :1. La nouvelle cassette de sélection cattdTomato SEQ ID NO : 125 codant pour la protéine chimérique CAT/tdTOMATO SEQ ID NO : 141 permettant à la fois la résistance au chloramphénicol et une fluorescence rouge, est placée sous la dépendance du promoteur de Ι’α-tubuline de Toxoplasma gondii SEQ ID NO :3. En aval de la cassette CAT tdTOMATO SEQ ID NO : 125, la séquence 3’UTR du gène sagl de Toxoplasma gondii est insérée SEQ ID NO :4. Cette séquence a pour objectif de stabiliser l’ARNm codant la protéine de fusion CAT tdTOMATO.The plasmid pTgROP16-KO-CAT-tdTomato SEQ ID NO: 73 is derived from the plasmid pNcMIC3KO-CAT-GFP lox N SEQ ID NO: 1. The tdTomato SEQ ID NO: 128 gene was amplified by PCR with the primers AGD F-AvrIIdTomato SEQ ID NO: 129 and AGD RdTomatoBglII SEQ ID NO: 130 (1459 bp) from the synthesized fragment SEQ ID NO: 12131 cloned into the plasmid commercial pRSET-B SEQ ID NO: 132. After digestion with the enzymes Avril and BglII (1439pb), the gene was then cloned into the plasmid pGEMT SEQ ID NO: 133 (commercial reference pGEM®-T Vector - Promega) and then amplified . The plasmid was then digested with Avril and BglII and cloned at the Avril and BglII sites of the plasmid pNcMIC3-KO-CAT-GFP lox N SEQ ID NO: 1. The new selection cassette cattdTomato SEQ ID NO: 125 coding for the chimeric protein CAT / tdTOMATO SEQ ID NO: 141 allowing both resistance to chloramphenicol and red fluorescence, is placed under the control of the promoter of Ι'α-tubulin of Toxoplasma gondii SEQ ID NO: 3. Downstream from the CAT tdTOMATO SEQ ID NO: 125 cassette, the 3’UTR sequence of the Toxoplasma gondii sagl gene is inserted SEQ ID NO: 4. The objective of this sequence is to stabilize the mRNA encoding the CAT fusion protein tdTOMATO.

La région non codante amont flanquant le gène tgroplô SEQ ID NO : 134 (1899 pb) est amplifiée par PCR à partir de l’ADN génomique de T gondii avec les amorces AGD-F5'ROP16KpnI SEQ ID NO : 135 et AGD-R-5'ROP16BclI SEQ ID NO : 136 puis est intégrée après digestion par les enzymes Kpnl et Bell (1885pb) dans le plasmide en amont de la cassette de sélection CAT-tdTomato SEQ ID NO : 125 au niveau des sites restrictions Kpnl et Bell.The upstream non-coding region flanking the tgroplô gene SEQ ID NO: 134 (1899 bp) is amplified by PCR from the genomic DNA of T gondii with the primers AGD-F5'ROP16KpnI SEQ ID NO: 135 and AGD-R- 5'ROP16BclI SEQ ID NO: 136 then is integrated after digestion with the enzymes Kpnl and Bell (1885pb) in the plasmid upstream of the selection cassette CAT-tdTomato SEQ ID NO: 125 at the restriction sites Kpnl and Bell.

La région non codante aval flanquant le gène tgroplô SEQ ID NO : 137 (1790 pdb) est amplifiée par PCR à partir de l’ADN génomique de T. gondii ûnqc, les amorces AGD-F3'HpaIROP16 SEQ ID NO : 138 et AGD-R-3'ROP16NotI SEQ ID NO : 134 puis est intégrée après digestion par les enzymes Hpal et Notl (1782pb) dans le plasmide en aval de la cassette de sélection CAT-tdTomato SEQ ID NO : 125 au niveau des sites de restriction Hpal et Notl. Les amorces utilisées pour la construction de ce plasmide sont répertoriées dans le tableau 5 ci-dessous.The downstream non-coding region flanking the tgroplô gene SEQ ID NO: 137 (1790 bpd) is amplified by PCR from the genomic DNA of T. gondii ûnqc, the primers AGD-F3'HpaIROP16 SEQ ID NO: 138 and AGD- R-3'ROP16NotI SEQ ID NO: 134 then is integrated after digestion with the enzymes Hpal and NotI (1782pb) in the plasmid downstream of the selection cassette CAT-tdTomato SEQ ID NO: 125 at the restriction sites Hpal and NOTL. The primers used for the construction of this plasmid are listed in Table 5 below.

Le plasmide obtenu est appelé pTgROP16-KO-CAT-tdTomato SEQ ID NO :73.The plasmid obtained is called pTgROP16-KO-CAT-tdTomato SEQ ID NO: 73.

Tableau 5 : Amorces utilisées pour la construction du plasmide pTgroplô KO CATtdTomatoTable 5: Primers used for the construction of the plasmid pTgroplô KO CATtdTomato

Construction duplasmidepTgroplôKO CAT-tdTomatoConstruction duplasmidepTgroplôKO CAT-tdTomato

AGD-F- 5'ROP16KpnI AGD-F 5'ROP16KpnI SEQ ID NO: 135 GGGGTACCCCAGAAACCAGGTGTTGTT SEQ ID NO: 135 GGGGTACCCCAGAAACCAGGTGTTGTT AGD-R5'ROP16BclI AGD-R5'ROP16BclI SEQ ID NO: 136 GCTGATCAATAACTTCGTATAAAGTATCCTATACGA AGTTATCCAGTGGTGCATTGACAAA SEQ ID NO: 136 GCTGATCAATAACTTCGTATAAAGTATCCTATACGA AGTTATCCAGTGGTGCATTGACAAA AGD-F- 3'HpaIROP16 AGD-F 3'HpaIROP16 SEQ ID NO: 138 CCGGTTAACACAATTCTTGCCCCCCCGAGGGATAACT TCGTATAGTATACCTTATACGAAGTTATGAACTCCC GAAATTCGTCAA SEQ ID NO: 138 CCGGTTAACACAATTCTTGCCCCCCCGAGGGATAACT TCGTATAGTATACCTTATACGAAGTTATGAACTCCC GAAATTCGTCAA AGD-R3'ROP16NotI AGD-R3'ROP16NotI SEQ ID NO: 139 ATAAGAATGCGGCCGCAGATTTTGCTTGGCGTCACT SEQ ID NO: 139 ATAAGAATGCGGCCGCAGATTTTGCTTGGCGTCACT AGD F- AvrlIdTomato AGD F- AvrlIdTomato SEQIDNO :129 TTATATTCGCCCTAGGATGGTGA SEQIDNO: 129 TTATATTCGCCCTAGGATGGTGA AGD RdTomatoBglII AGD RdTomatoBglII SEQIDNO: 130 AGAGCTCGAGATCTGATTACTTGTACAGC SEQIDNO: 130 AGAGCTCGAGATCTGATTACTTGTACAGC

Construction de la souche Toxo tgmicl-3 KO - 2G roplô KOConstruction of the Toxo tgmicl-3 KO - 2G roplô KO strain

La construction de la souche vivante atténuée, dénommée Toxo tgmicl-3 KO - 2G / ROP 16 KO est obtenue par la délétion par recombinaison homologue du gène tgroplô SEQ ID NO : 140 et son remplacement par la cassette de sélection CAT-tdTomato SEQ ID NO : 125.The construction of the attenuated living strain, called Toxo tgmicl-3 KO - 2G / ROP 16 KO is obtained by deletion by homologous recombination of the tgroplô SEQ ID NO: 140 gene and its replacement by the selection cassette CAT-tdTomato SEQ ID NO : 125.

Pour obtenir cette souche, la souche Toxo tgmicl-3 KO - 2G, telle qu’obtenue à TExemple l,est électroporée avec le plasmide pTgROP16-KO-CAT-tdTomato SEQ ID NO :73. 50 pg de plasmide purifiés puis linéarisés par SacII sont ajoutés à 107 parasites mis en suspension dans le milieu d’électroporation CYTOMIX contenant de l’ATP (3 mM) et du Glutathion (3 mM) préparé selon le protocole de Van den Hoff et al., (van den Hoff MJ, Moorman AF, Lamers WH. Electroporation in 'intracellular' buffer increases cell survival, Nucleic Acid Research, 1992 Jun 11 ; 20(11):2902), et Télectroporation a été réalisée en cuvette d’écart 4 mm, dans un volume de 800 pL sur un appareil BioRad (Paramètres : 2000V, 50 ohms, 25 pF, avec deux chocs électriques). Après électroporation, les tachyzoïtes sont déposés sur une monocouche de cellules HFF en culture. Pour la sélection des mutants, le milieu de culture est remplacé et supplémenté par l’agent de sélection (chloramphénicol 20 μΜ), 24h après l’électroporation. 10 à 15 jours après sélection, les parasites sont sous-clonés en plaque 96 puits et les clones d’intérêt sont identifiés par PCR. La souche obtenue est dénommée Toxo tgmicl-3 KO - 2G / ROP 16 KO.To obtain this strain, the Toxo tgmicl-3 KO-2G strain, as obtained in Example 1, is electroporated with the plasmid pTgROP16-KO-CAT-tdTomato SEQ ID NO: 73. 50 μg of plasmid purified then linearized by SacII are added to 10 7 parasites suspended in the CYTOMIX electroporation medium containing ATP (3 mM) and Glutathione (3 mM) prepared according to the Van den Hoff protocol and al., (van den Hoff MJ, Moorman AF, Lamers WH. Electroporation in 'intracellular' buffer increases cell survival, Nucleic Acid Research, 1992 Jun 11; 20 (11): 2902), and Telectroporation was carried out in a cuvette gap 4 mm, in a volume of 800 pL on a BioRad device (Parameters: 2000V, 50 ohms, 25 pF, with two electric shocks). After electroporation, the tachyzoites are deposited on a monolayer of HFF cells in culture. For the selection of the mutants, the culture medium is replaced and supplemented with the selection agent (chloramphenicol 20 μΜ), 24 hours after the electroporation. 10 to 15 days after selection, the parasites are subcloned into a 96-well plate and the clones of interest are identified by PCR. The strain obtained is called Toxo tgmicl-3 KO - 2G / ROP 16 KO.

Validation de la souche Toxo tgmicl-3 KO - 2G roplô KO par PCRValidation of the Toxo tgmicl-3 KO - 2G roplô KO strain by PCR

L’ADN génomique des souches Toxo tgmicl-3 KO - 2G et Toxo tgmicl-3 KO - 2G roplô KO a été purifié par extraction au DNAzol puis différentes PCR ont été réalisés pour vérifier la délétion spécifique du gène roplô SEQ ID NO : 140 (Figure 5-B). Les analyses par électrophorèse sur gel d’agarose confirme l’absence du gène roplô et son remplacement par la cassette de sélection cat-tdTomato SEQ ID NO : 125.The genomic DNA of the Toxo tgmicl-3 KO - 2G and Toxo tgmicl-3 KO - 2G strains roplô KO was purified by extraction with DNAzol then different PCRs were carried out to verify the specific deletion of the roplô gene SEQ ID NO: 140 ( Figure 5-B). Agarose gel electrophoresis analyzes confirm the absence of the roplô gene and its replacement by the selection cassette cat-tdTomato SEQ ID NO: 125.

Pour valider la souche Toxo tgmicl-3 KO - 2G roplô KO des analyses PCR sont effectuées à partir de l’ADN génomique extrait au DNAzol à partir d’un culot parasitaire constitué de 107 parasites. Les amorces utilisées pour les PCR sont décrites dans la Figure 5-C et sont détaillées dans le Tableau 6 ci-dessous. Les produits PCR sont analysés par électrophorèse sur gel d’agarose (Figure 5-B). Leur taille attendue et leur taille observée sont également décrites dans le Tableau 7 ci-dessous.To validate the Toxo tgmicl-3 KO - 2G roplô KO strain, PCR analyzes are carried out using genomic DNA extracted with DNAzol from a parasitic pellet consisting of 10 7 parasites. The primers used for the PCRs are described in Figure 5-C and are detailed in Table 6 below. The PCR products are analyzed by electrophoresis on agarose gel (Figure 5-B). Their expected size and their observed size are also described in Table 7 below.

Tableau 6 : liste des amorces utilisées pour la validation de la souche Toxo tgmicl-3 KO 2G roplô KOTable 6: list of primers used for the validation of the Toxo tgmicl-3 KO 2G roplô KO strain

Amorce bait Séquence Sequence Tgroplô (mixl) Tgroplô (mixl) Rgl Rgl AGD rop 16CDS F AGD rop 16CDS F SEQ Π) NO: 83 GTTTGAGGAAGCGCAAAAAG SEQ Π) NO: 83 GTTTGAGGAAGCGCAAAAAG Rg2 Rg2 AGD rop 16CDS R AGD rop 16CDS R SEQ ID NO: 84 TGCTGTGATTTCGCAAGTTC SEQ ID NO: 84 TGCTGTGATTTCGCAAGTTC Validation KO en amont (mix2) Upstream KO validation (mix2) Rg3 Rg3 Rop 16KOvalid5Fl Rop 16KOvalid5Fl SEQ ID NO: 85 ACCCCCTGACCCCITGTCTG SEQ ID NO: 85 ACCCCCTGACCCCITGTCTG Rg4 Rg4 Amont ropl6R Upstream ropl6R SEQ ID NO: 86 TCGTCGTGGTATTCACTCCA SEQ ID NO: 86 TCGTCGTGGTATTCACTCCA Validation KO en aval (mix3) Downstream KO validation (mix3) RI RI Aval rop 16F Downstream 16F SEQ ID NO: 142 ACATGGCCGTCATCAAAGA SEQ ID NO: 142 ACATGGCCGTCATCAAAGA Rg6 rg6 Aval ropl6R Downstream ropl6R SEQ ID NO: 88 AAAACGAATGCGAAGGAAGA SEQ ID NO: 88 AAAACGAATGCGAAGGAAGA

Tableau 7 : Taille attendue des amplicons (en paires de base) des différentes PCR de validation de la construction de la souche Toxo tgmicl-3 KO - 2G roplô KOTable 7: Expected size of amplicons (in base pairs) of the different PCRs for validation of the construction of the Toxo tgmicl-3 KO - 2G roplô KO strain

Toxo tgmicl-3 KO - 2G Toxo tgmicl-3 KO - 2G Toxo tgmicl-3 KO - 2G roplô KO Toxo tgmicl-3 KO - 2G roplô KO Tgroplô (mixl) Tgroplô (mixl) 1682 1682 - - Validation KO 5’Tgropl6 (mix2) 5'Tgropl6 KO validation (Mix2) 2759 2759 Validation KO 3’ Tgroplô (mix 3) Validation KO 3 ’Tgroplô (mix 3) 3317 3317

Les électrophorèses des produits PCR réalisés avec les amorces rgl SEQ ID NO: 83 et rg2 SEQ ID NO: 84 (mix 1) permettent de mettre en évidence une bande à 1682 paires de bases pour la souche Toxo tgmicl-3 KO - 2G, conformément à la taille de bande attendue et confirmant la présence du gène Tgroplô dans cette souche. Cette bande n’est pas détectée dans la souche Toxo tgmicl-3 KO - 2G roplô KO confirmant la suppression du gène dans cette souche.The electrophoreses of the PCR products carried out with the primers rgl SEQ ID NO: 83 and rg2 SEQ ID NO: 84 (mix 1) make it possible to demonstrate a band at 1682 base pairs for the strain Toxo tgmicl-3 KO - 2G, in accordance at the expected band size and confirming the presence of the Tgroplô gene in this strain. This band is not detected in the Toxo tgmicl-3 KO - 2G roplô KO strain confirming the suppression of the gene in this strain.

Les électrophorèses des produits PCR réalisés avec les amorces rg3 SEQ ID NO: 85 et rg4 SEQ ID NO: 86 (mix 2) permettent de mettre en évidence une bande à 2759 paires de bases pour la souche Toxo tgmicl-3 KO - 2G roplô KO, conformément à la taille des bandes attendues et confirmant la suppression du gène Tgroplô dans cette souche et l’insertion du gène de sélection CATtdTomato à la place du gène Tgroplô. Cette bande n’est pas détectée dans la souche Toxo tgmicl-3 KO - 2G.The electrophoresis of the PCR products carried out with the primers rg3 SEQ ID NO: 85 and rg4 SEQ ID NO: 86 (mix 2) make it possible to demonstrate a band at 2759 base pairs for the strain Toxo tgmicl-3 KO - 2G roplô KO , in accordance with the size of the expected bands and confirming the suppression of the Tgroplô gene in this strain and the insertion of the selection gene CATtdTomato in place of the Tgroplô gene. This band is not detected in the Toxo tgmicl-3 KO - 2G strain.

Les électrophorèses des produits PCR réalisés avec les amorces RI SEQ ID NO: 142 et rg6 SEQ ID NO: 88 (mix 3) permettent de mettre en évidence une bande à 3317 paires de bases pour la souche Toxo tgmicl-3 KO - 2G roplô KO, conformément à la taille des bandes attendues et confirmant la suppression du gène Tgroplô dans cette souche et l’insertion du gène CATtdTomato à la place du gène Tgroplô. Cette bande n’est pas détectée dans la souche Toxo tgmicl-3 KO - 2G.The electrophoresis of the PCR products carried out with the primers RI SEQ ID NO: 142 and rg6 SEQ ID NO: 88 (mix 3) make it possible to demonstrate a band at 3317 base pairs for the strain Toxo tgmicl-3 KO - 2G roplô KO , in accordance with the size of the expected bands and confirming the suppression of the Tgroplô gene in this strain and the insertion of the CATtdTomato gene in place of the Tgroplô gene. This band is not detected in the Toxo tgmicl-3 KO - 2G strain.

Exemple 3 : Construction de la souche Toxo Tgmicl-3 KO Gral5II Kl (notée Toxo Gral5 Kl)Example 3: Construction of the Toxo Tgmicl-3 KO Gral5II Kl strain (noted Toxo Gral5 Kl)

Culture des parasitesCulture of parasites

Tous les tachyzoïtes de la souche de Toxoplasma gondii utilisés ont été produits en fibroblastes humains (HFF Hs27 ATCC CRL-1634)) cultivés en milieu minimal de Dulbecco (DMEM) supplémenté par 10% de sérum de veau fœtal (SVF), 2mM glutamine, 100 U/mL de pénicilline et 100 U/mL de streptomycine. Ils ont été récoltés après lyse mécanique des cellules hôtes par 3 passages en seringue 25G.All the tachyzoites of the Toxoplasma gondii strain used were produced in human fibroblasts (HFF Hs27 ATCC CRL-1634)) cultured in minimal medium from Dulbecco (DMEM) supplemented with 10% fetal calf serum (SVF), 2mM glutamine, 100 U / mL of penicillin and 100 U / mL of streptomycin. They were harvested after mechanical lysis of the host cells by 3 passages in 25G syringe.

Construction duplasmide pT230-2G GRA15n (Figure 6)Construction duplasmid pT230-2G GRA15n (Figure 6)

La construction du plasmide pT230-2G GRA15n SEQ ID NO :76 a été élaborée à partir du plasmide pT230 2G SEQ ID NO : 143 issu du plasmide pT230-TUB5/BLE SEQ ID NO :37. Le promoteur du gène gral5n SEQ ID NO :71, ainsi que la séquence codante de gral5n SEQ ID NO : 144 ont été amplifiés à partir de l’ADNg de la souche ME49 par PCR nichée (PCR 1 puis 2) incluant un tag HA en 3’ SEQ ID NO :72 pour faciliter la localisation.The construction of the plasmid pT230-2G GRA15n SEQ ID NO: 76 was developed from the plasmid pT230 2G SEQ ID NO: 143 derived from the plasmid pT230-TUB5 / BLE SEQ ID NO: 37. The promoter of the gral5n SEQ ID NO: 71 gene, as well as the coding sequence of gral5n SEQ ID NO: 144 were amplified from the gDNA of the ME49 strain by nested PCR (PCR 1 then 2) including an HA tag in 3 'SEQ ID NO: 72 to facilitate localization.

Une première PCR SEQ ID NO : 145 (PCR 1 : 4202 paires de bases) avec les amorces For0GRA15 SEQ ID NO :146 et rev4GRA15 SEQ ID NO :147 sur l’ADNg de la souche ME49 permet une amplification du locus gral5II. Une seconde PCR SEQ ID NO : 143 (PCR2 : 3882 paires de bases) avec les amorces F GRAI5 BamHl Spel SEQ ID NO :149 et R GRAI5 HAtag SEQ ID NO : 150 sur la PCR 1 SEQ ID NO : 145 permet une amplification du promoteur SEQ ID NO :71 et de la phase codante de gral5II SEQ ID NO :144 couplé à un tagHA SEQ ID NO :72. Cette seconde PCR SEQ ID NO : 148 a été insérée par digestion enzymatique (BamHl et bout franc) dans le plasmide pT230 2G SEQ ID NO : 143 digéré par BamHl et Pmel (4470 pb). Le plasmide pT230 2G GRA15n SEQ ID NO :76 ainsi obtenu contient également une cassette ble SEQ ID NO : 151 permettant de coder une protéine BLE SEQ ID NO : 152 permettant une résistance à la phléomycine . Les amorces utilisées pour la construction de ce plasmide sont répertoriées dans le tableau 8 ci-dessous.A first PCR SEQ ID NO: 145 (PCR 1: 4202 base pairs) with the primers For0GRA15 SEQ ID NO: 146 and rev4GRA15 SEQ ID NO: 147 on the gDNA of the strain ME49 allows amplification of the gral5II locus. A second PCR SEQ ID NO: 143 (PCR2: 3882 base pairs) with the primers F GRAI5 BamHl Spel SEQ ID NO: 149 and R GRAI5 HAtag SEQ ID NO: 150 on PCR 1 SEQ ID NO: 145 allows amplification of the promoter SEQ ID NO: 71 and of the coding phase of gral5II SEQ ID NO: 144 coupled to a tagHA SEQ ID NO: 72. This second PCR SEQ ID NO: 148 was inserted by enzymatic digestion (BamHI and blunt end) in the plasmid pT230 2G SEQ ID NO: 143 digested with BamHI and Pmel (4470 bp). The plasmid pT230 2G GRA15n SEQ ID NO: 76 thus obtained also contains a ble cassette SEQ ID NO: 151 making it possible to code a BLE protein SEQ ID NO: 152 allowing resistance to phleomycin. The primers used for the construction of this plasmid are listed in Table 8 below.

Tableau 8 : Construction du plasmidepT230 2G Gral5IITable 8: Construction of the plasmid pT230 2G Gral5II

For0GRA15 For0GRA15 SEQ ID NO :146 GAACTGCGTCGTCGTGAGTA SEQ ID NO: 146 GAACTGCGTCGTCGTGAGTA PCR 1 PCR 1 rev4GRA15 rev4GRA15 SEQ ID NO : 147 TGCCAATTGAGTCGTCTCTTC SEQ ID NO: 147 TGCCAATTGAGTCGTCTCTTC F GRA15 F GRA15 SEQIDNO :149 SEQIDNO: 149 BamHl Spel BamHl Spel GGATCCACTAGTTGACTGCCACGTGTAGTATCC SEQIDNO :150 TTACGCTAGTCCGGGACGTCGTACGGGTATGGAG GGATCCACTAGTTGACTGCCACGTGTAGTATCC SEQIDNO: 150 TTACGCTAGTCCGGGACGTCGTACGGGTATGGAG PCR 2 PCR 2 RGRA15 HAtag RGRA15 HAtag TTACCGCTGATTGTGT TTACCGCTGATTGTGT

Construction de la souche Toxo Tgmicl-3 KO - 2G GRA15n Kl pg de plasmide pT230-2G GRA15n SEQ ID NO :76 purifiés puis linéarisés par Apal ont été ajoutés à 107 parasites de la souche Toxo tgmic7-3 KO 2G (obtenue à l’exemple 1) mis en suspension dans le milieu d’électroporation CYTOMIX contenant de l’ATP (3 mM) et du Glutathion (3 mM) préparé selon le protocole de Van den Hoff étal., précédemment référencé, et l’électroporation a été réalisée en cuvette d’écart 4 mm, dans un volume de 800 pL sur un appareil BioRad (Paramètres : 2000V, 50 ohms, 25 pF, avec deux chocs électriques). Après électroporation, les tachyzoïtes ont été déposés sur une monocouche de cellules HFF en culture. Pour la sélection des mutants, le milieu de culture est remplacé et supplémenté par l’agent de sélection (phléomycine 20 pM), 24h après l’électroporation. 10 à 15 jours après sélection, les parasites sont sous-clonés en plaque 96 puits et les clones d’intérêt sont identifiés par PCR. La souche obtenue est dénommée Toxo tgmicl-3 KO - 2G GRA15IIKI.Construction of the Toxo Tgmicl-3 KO - 2G GRA15n Kl pg plasmid pT230-2G GRA15n SEQ ID NO: 76 strain purified then linearized by Apal were added to 10 7 parasites of the Toxo tgmic7-3 KO 2G strain (obtained at 1 'example 1) suspended in the CYTOMIX electroporation medium containing ATP (3 mM) and Glutathione (3 mM) prepared according to the protocol of Van den Hoff et al., previously referenced, and the electroporation was performed in a 4 mm gap cuvette, in a volume of 800 pL on a BioRad device (Parameters: 2000V, 50 ohms, 25 pF, with two electric shocks). After electroporation, the tachyzoites were deposited on a monolayer of HFF cells in culture. For the selection of mutants, the culture medium is replaced and supplemented with the selection agent (phleomycin 20 pM), 24 hours after electroporation. 10 to 15 days after selection, the parasites are subcloned into a 96-well plate and the clones of interest are identified by PCR. The strain obtained is called Toxo tgmicl-3 KO - 2G GRA15IIKI.

Validation de la souche Toxo tgmicl-3 KO - 2G GRA15KIpar PCRValidation of the Toxo tgmicl-3 KO - 2G GRA15KI strain by PCR

Pour valider la souche Toxo tgmicl-3 KO - 2G GRA15KI des analyses PCR sont effectuées à partir de l’ADN génomique extrait au DNAzol à partir d’un culot parasitaire constitué de 107 parasites. Les amorces utilisées pour les PCR sont décrites dans la Figure 7-B et sont détaillées dans le Tableau 9 ci-dessous. Les produits PCR sont analysés par électrophorèse sur gel d’agarose (Figure 7-A). Leur taille attendue et leur taille observée sont également décrites dans le Tableau 10 ci-dessous. La taille attendue de la PCR avec les amorces AGD F GRA15I/II SEQ ID NO : 109 et AGD R GRA15I/II SEQ ID NO : 110 (Tableau 9) permet de distinguer la présence de la séquence codant pour GRA15n SEQ ID NO :144 (308 pb) et celle de GRA15i endogène SEQ ID NO : 153 (560pb).To validate the Toxo tgmicl-3 KO - 2G GRA15KI strain, PCR analyzes are carried out using genomic DNA extracted with DNAzol from a parasitic pellet consisting of 10 7 parasites. The primers used for the PCRs are described in Figure 7-B and are detailed in Table 9 below. The PCR products are analyzed by electrophoresis on agarose gel (Figure 7-A). Their expected size and their observed size are also described in Table 10 below. The expected size of the PCR with the primers AGD F GRA15I / II SEQ ID NO: 109 and AGD R GRA15I / II SEQ ID NO: 110 (Table 9) makes it possible to distinguish the presence of the sequence coding for GRA15n SEQ ID NO: 144 (308 bp) and that of endogenous GRA15i SEQ ID NO: 153 (560 bp).

Tableau 9 : Amorces utilisées pour les PCR de validation de souches Toxo tgmicl-3 KO 2GGRA15KITable 9: Primers used for the PCRs for validation of Toxo tgmicl-3 KO 2GGRA15KI strains

PCR validation de souches Toxo tgmicl-3 KO - 2G GRA15KI PCR validation of strains Toxo tgmicl-3 KO - 2G GRA15KI AGD F GRA15I/II AGD F GRA15I / II SEQ ID NO : 109 GTGCAAAGCCAACTTCCACT SEQ ID NO: 109 GTGCAAAGCCAACTTCCACT PCR3 PCR3 AGD R GRA15I/II AGD R GRA15I / II SEQ ID NO : 110 GGACCTGGATCAGAGATCGT SEQ ID NO: 110 GGACCTGGATCAGAGATCGT

Tableau 10 : Taille attendue des amplicons (en paires de base) des différentes PCR de validation de la construction des souches KO de Toxoplasma gondiiTable 10: Expected size of the amplicons (in base pairs) of the different PCRs for validating the construction of the KO strains of Toxoplasma gondii

Toxo tgmicl-3 KO - 2G Toxo tgmicl-3 KO - 2G Toxo tgmicl-3 KO - 2G GRA15KI Toxo tgmicl-3 KO - 2G GRA15KI PCR3 PCR3 560 560 560/308 560/308

Les électrophorèses des produits PCR réalisés avec les amorces AGD F GRA15I/II SEQ ID NO :109 et AGD R GRA15I/II SEQ ID NO : 110 (Tableau 9) permettent de mettre en évidence respectivement une bande à 560 et 308 paires de bases pour la souche Toxo tgmicl3 KO - 2G GRA15KI alors qu’une seule bande à 560 paires de bases pour la souche Toxo tgmicl-3 KO - 2G, ce qui confirme l’insertion de plasmide pT230-2G GRA15n SEQ ID NO :76 dans la souche Toxo tgmicl-3 KO - 2G GRA15KI.The electrophoresis of the PCR products carried out with the primers AGD F GRA15I / II SEQ ID NO: 109 and AGD R GRA15I / II SEQ ID NO: 110 (Table 9) make it possible to highlight a band at 560 and 308 base pairs respectively. the Toxo tgmicl3 KO - 2G GRA15KI strain while a single band at 560 base pairs for the Toxo tgmicl-3 KO - 2G strain, which confirms the insertion of plasmid pT230-2G GRA15n SEQ ID NO: 76 into the strain Toxo tgmicl-3 KO - 2G GRA15KI.

Validation de la souche Toxo tgmicl-3 KO - 2G GRA15KIpar immunofluorescenceValidation of the Toxo tgmicl-3 KO - 2G GRA15KI strain by immunofluorescence

Les tachyzoïtes sont cultivés 24h sur lamelles en verre recouvertes d’une monocouche de cellules HFF. Les cellules infectées ont été lavés 2 fois en PB SIX, et fixés par du formaldéhyde 4% pendant 30 min. Après 3 lavages en PBS1X, les cellules HFF infectées ont été perméabilisées avec 0,1% de Triton X-100 dans du PBS1X pendant 5 min. Après 3 lavages au PBS IX, une étape de saturation est effectuée avec une solution de PBS 1X/SVF 10% pendant 30 min. Les cellules ont ensuite été incubées avec l'anticorps primaire dilué dans 2% SVF pendant 1 heure, lavées 3 fois au PBS1X puis incubées avec un anticorps secondaire dilué dans une solution de PBS/SVF 2% pendant 1 heure. Après 2 lavages au PBSIX, les lamelles en verre sont montés sur lame avec de l’Immu-Mount™ et observés au microscope à fluorescence.The tachyzoites are cultured for 24 hours on glass coverslips coated with a monolayer of HFF cells. The infected cells were washed twice in PB SIX, and fixed with 4% formaldehyde for 30 min. After 3 washes in PBS1X, the infected HFF cells were permeabilized with 0.1% Triton X-100 in PBS1X for 5 min. After 3 washes with PBS IX, a saturation step is carried out with a solution of PBS 1X / SVF 10% for 30 min. The cells were then incubated with the primary antibody diluted in 2% FCS for 1 hour, washed 3 times with PBS1X then incubated with secondary antibody diluted in a solution of PBS / SVF 2% for 1 hour. After 2 washes with PBSIX, the glass slides are mounted on a slide with Immu-Mount ™ and observed under a fluorescence microscope.

L’anticorps primaire utilisé est l’anticorps de souris anti-HA qui permet de détecter l’expression de la protéine GRA15n-HA SEQ ID NO : 123 dans le parasite. L’anticorps secondaire est l’anticorps secondaire commercial : Alexa fluor® 594 chèvre anti lapin (Life Technologies A-11012). Les anticorps sont dilués au 1/1000 dans du PBS SVF 2%.The primary antibody used is the anti-HA mouse antibody which detects the expression of the GRA15n-HA protein SEQ ID NO: 123 in the parasite. The secondary antibody is the commercial secondary antibody: Alexa fluor® 594 goat anti rabbit (Life Technologies A-11012). The antibodies are diluted 1/1000 in PBS SVF 2%.

Pour la souche sauvage Toxo tgmicl-3 KO 2G, aucune fluorescence verte n’est observée au pôle apical du parasite révélant ainsi l’absence de la protéine GRA15n-HA. Au contraire, pour la souche Toxo tgmicl-3 KO - 2G GRA15KI, une fluorescence verte est observé démontrant l’expression de la protéine GRA15n-HA (figure 8).For the wild strain Toxo tgmicl-3 KO 2G, no green fluorescence is observed at the apical pole of the parasite thus revealing the absence of the protein GRA15n-HA. On the contrary, for the Toxo tgmicl-3 KO - 2G GRA15KI strain, a green fluorescence is observed demonstrating the expression of the GRA15n-HA protein (FIG. 8).

Exemple 4 : Construction de la souche Toxo tgmicl-3 KO roplôKO Gral5II Kl (notée Toxo KO+)Example 4: Construction of the Toxo tgmicl-3 KO roplôKO Gral5II Kl strain (denoted Toxo KO +)

Culture des parasitesCulture of parasites

Tous les tachyzoïtes de la souche de Toxoplasma gondii utilisés ont été produits en fibroblastes humains (HFF Hs27 ATCC CRL-1634)) cultivés en milieu minimal de Dulbecco (DMEM) supplémenté par 10% de sérum de veau fœtal (SVF), 2mM glutamine, 100 U/mL de pénicilline et 100 U/mL de streptomycine. Ils ont été récoltés après lyse mécanique des cellules hôtes par 3 passages en seringue 25G.All the tachyzoites of the Toxoplasma gondii strain used were produced in human fibroblasts (HFF Hs27 ATCC CRL-1634)) cultured in minimal medium from Dulbecco (DMEM) supplemented with 10% fetal calf serum (SVF), 2mM glutamine, 100 U / mL of penicillin and 100 U / mL of streptomycin. They were harvested after mechanical lysis of the host cells by 3 passages in 25G syringe.

Construction duplasmide pT230-2G GRA15n SEQ ID NO : 76 (Figure 6)Construction of plasmid pT230-2G GRA15n SEQ ID NO: 76 (Figure 6)

Voir Exemple 3, page 45See Example 3, page 45

Construction de la souche Toxo tgmicl-3 KO - 2G roplô KO GRA15n Kl (: ToxoKO +) pg de plasmide pT230-2G GRA15n SEQ ID NO :76 purifiés puis linéarisés par Apal ont été ajoutés à 107 parasites de la souche Toxo tgmic7-3 KO 2G rop 16 KO (obtenue à l’exemple 2) mis en suspension dans le milieu d’électroporation CYTOMIX contenant de l’ATP (3 mM) et du Glutathion (3 mM) préparé selon le protocole de Van den Hoff étal., précédemment référencé, et l’électroporation a été réalisée en cuvette d’écart 4 mm, dans un volume de 800 pL sur un appareil BioRad (Paramètres : 2000V, 50 ohms, 25 pF, avec deux chocs électriques). Après électroporation, les tachyzoïtes ont été déposés sur une monocouche de cellules HFF en culture. Pour la sélection des mutants, le milieu de culture est remplacé et supplémenté par l’agent de sélection (phléomycine 20 pM), 24h après l’électroporation. 10 à 15 jours après sélection, les parasites sont sous-clonés en plaque 96 puits et les clones d’intérêt sont identifiés par PCR. La souche obtenue est dénommée Toxo tgmicl-3 KO roplôKO - 2G GRA15IIKI.Construction of the Toxo tgmicl-3 KO - 2G roplô KO GRA15n Kl (: ToxoKO +) pg plasmid pT230-2G GRA15n SEQ ID NO: 76 strain purified then linearized by Apal were added to 10 7 parasites of the Toxo tgmic7- strain 3 KO 2G rop 16 KO (obtained in Example 2) suspended in the CYTOMIX electroporation medium containing ATP (3 mM) and Glutathione (3 mM) prepared according to the protocol of Van den Hoff et al. , previously referenced, and the electroporation was carried out in a 4 mm gap cuvette, in a volume of 800 pL on a BioRad device (Parameters: 2000V, 50 ohms, 25 pF, with two electric shocks). After electroporation, the tachyzoites were deposited on a monolayer of HFF cells in culture. For the selection of mutants, the culture medium is replaced and supplemented with the selection agent (phleomycin 20 pM), 24 hours after electroporation. 10 to 15 days after selection, the parasites are subcloned into a 96-well plate and the clones of interest are identified by PCR. The strain obtained is called Toxo tgmicl-3 KO roplôKO - 2G GRA15IIKI.

Validation de la souche Toxo tgmicl-3 KO - 2G rop 16 KO GRA15π Kl par PCRValidation of the Toxo tgmicl-3 KO - 2G rop 16 KO GRA15π Kl strain by PCR

Pour valider la souche Toxo tgmicl-3 KO - 2G rop 16 KO GRA15n Kl des analyses PCR sont effectuées à partir de l’ADN génomique extrait au DNAzol à partir d’un culot parasitaire constitué de 107 parasites. Les amorces utilisées pour les PCR sont décrites dans la Figure 12B et sont détaillées dans le Tableau 9 ci-dessous. Les produits PCR sont analysés par électrophorèse sur gel d’agarose (Figure 9). Leur taille attendue et leur taille observée sont également décrites dans le Tableau 10 ci-dessous. La taille attendue de la PCR avec les amorces AGD F GRA15I/II SEQ ID NO :109 et AGD R GRA15I/II SEQ ID NO : 110 (Tableau 9) permet de distinguer la présence de la séquence codant pour GRA15n SEQ ID NO :144 (308 pb) et celle de GRA15i endogène SEQ ID NO : 153 (560pb).To validate the Toxo tgmicl-3 KO - 2G rop 16 KO GRA15n Kl strain, PCR analyzes are carried out using genomic DNA extracted with DNAzol from a parasitic pellet consisting of 10 7 parasites. The primers used for the PCRs are described in Figure 12B and are detailed in Table 9 below. The PCR products are analyzed by agarose gel electrophoresis (Figure 9). Their expected size and their observed size are also described in Table 10 below. The expected size of the PCR with the primers AGD F GRA15I / II SEQ ID NO: 109 and AGD R GRA15I / II SEQ ID NO: 110 (Table 9) makes it possible to distinguish the presence of the sequence coding for GRA15n SEQ ID NO: 144 (308 bp) and that of endogenous GRA15i SEQ ID NO: 153 (560 bp).

Les électrophorèses des produits PCR réalisés avec les amorces AGD F GRA15I/II SEQ ID NO :109 et AGD R GRA15I/II SEQ ID NO : 110 (Tableau 9) permettent de mettre en évidence respectivement une bande à 560 et 308 paires de bases pour la souche Toxo tgmicl 3 KO - 2G rop 16 KO GRA15n Kl alors qu’une seule bande à 560 paires de bases pour la souche Toxo tgmicl-3 KO - 2G, ce qui confirme l’insertion de plasmide pT230-2G GRA15n SEQ ID NO :76 dans la souche Toxo tgmicl-3 KO - 2G roplô KO GRA15n Kl.The electrophoresis of the PCR products carried out with the primers AGD F GRA15I / II SEQ ID NO: 109 and AGD R GRA15I / II SEQ ID NO: 110 (Table 9) make it possible to highlight a band at 560 and 308 base pairs respectively. the Toxo tgmicl 3 KO - 2G rop 16 KO GRA15n Kl strain while a single band at 560 base pairs for the Toxo tgmicl-3 KO - 2G strain, which confirms the insertion of plasmid pT230-2G GRA15n SEQ ID NO : 76 in the Toxo tgmicl-3 KO - 2G roplô KO GRA15n Kl strain.

Validation de la souche Toxo tgmicl-3 KO - 2G rop 16 KO GRA15II Kl par immunofluorescenceValidation of the Toxo tgmicl-3 KO - 2G rop 16 KO GRA15II Kl strain by immunofluorescence

Les tachyzoïtes sont cultivés 24h sur lamelles en verre recouvertes d’une monocouche de cellules HFF. Les cellules infectées ont été lavés 2 fois en PB SIX, et fixés par du formaldéhyde 4% pendant 30 min. Après 3 lavages en PBS1X, les cellules HFF infectées ont été perméabilisées avec 0,1% de Triton X-100 dans du PBS1X pendant 5 min. Après 3 lavages au PBS IX, une étape de saturation est effectuée avec une solution de PBS 1X/SVF 10% pendant 30 min. Les cellules ont ensuite été incubées avec l'anticorps primaire dilué dans 2% SVF pendant 1 heure, lavées 3 fois au PBS1X puis incubées avec un anticorps secondaire dilué dans une solution de PBS/SVF 2% pendant 1 heure. Après 2 lavages au PBSIX, les lamelles en verre sont montés sur lame avec de l’Immu-Mount™ et observés au microscope à fluorescence.The tachyzoites are cultured for 24 hours on glass coverslips coated with a monolayer of HFF cells. The infected cells were washed twice in PB SIX, and fixed with 4% formaldehyde for 30 min. After 3 washes in PBS1X, the infected HFF cells were permeabilized with 0.1% Triton X-100 in PBS1X for 5 min. After 3 washes with PBS IX, a saturation step is carried out with a solution of PBS 1X / SVF 10% for 30 min. The cells were then incubated with the primary antibody diluted in 2% FCS for 1 hour, washed 3 times with PBS1X then incubated with secondary antibody diluted in a solution of PBS / SVF 2% for 1 hour. After 2 washes with PBSIX, the glass slides are mounted on a slide with Immu-Mount ™ and observed under a fluorescence microscope.

L’anticorps primaire utilisé est l’anticorps de souris anti-HA qui permet de détecter l’expression de la protéine GRA15n-HA SEQ ID NO : 123 dans le parasite. L’anticorps secondaire est l’anticorps secondaire commercial : Alexa fluor® 594 chèvre anti lapin (Life Technologies A-l 1012). Les anticorps sont dilués au 1/1000 dans du PBS SVF 2%.The primary antibody used is the anti-HA mouse antibody which detects the expression of the GRA15n-HA protein SEQ ID NO: 123 in the parasite. The secondary antibody is the commercial secondary antibody: Alexa fluor® 594 goat anti rabbit (Life Technologies A-l 1012). The antibodies are diluted 1/1000 in PBS SVF 2%.

Pour la souche sauvage Toxo tgmicl-3 KO 2G, aucune fluorescence verte n’est observée au pôle apical du parasite révélant ainsi l’absence de la protéine GRA15n-HA. Au contraire, pour la souche Toxo tgmicl-3 KO - 2G roplô KO GRA15II Kl, une fluorescence verte est observé démontrant l’expression de la protéine GRA15n-HA (figure 10).For the wild strain Toxo tgmicl-3 KO 2G, no green fluorescence is observed at the apical pole of the parasite thus revealing the absence of the protein GRA15n-HA. On the contrary, for the Toxo tgmicl-3 KO - 2G roplô KO GRA15II Kl strain, a green fluorescence is observed demonstrating the expression of the GRA15n-HA protein (FIG. 10).

Exemple 5 : Construction de la souche Toxo Tgmicl-3 KO roplô KO Gral5II Kl (notée ToxoKO+ 2G).Example 5: Construction of the Toxo Tgmicl-3 KO roplô KO Gral5II Kl strain (noted ToxoKO + 2G).

L’haploïdie du génome de Toxoplasma gondii lors de la phase proliférative permet l’invalidation d’un gène en une seule recombinaison homologue.The haploidy of the Toxoplasma gondii genome during the proliferative phase allows the invalidation of a gene in a single homologous recombination.

Culture des parasitesCulture of parasites

Tous les tachyzoïtes de la souche de Toxoplasma gondii utilisés ont été produits en fibroblastes humains (HFF Hs27 ATCC CRL-1634)) cultivés en milieu minimal de Dulbecco (DMEM) supplémenté par 10% de sérum de veau fœtal (SVF), 2mM glutamine, 100 U/mL de pénicilline et 100 U/mL de streptomycine. Ils ont été récoltés après lyse mécanique des cellules hôtes par 3 passages en seringue 25G.All the tachyzoites of the Toxoplasma gondii strain used were produced in human fibroblasts (HFF Hs27 ATCC CRL-1634)) cultured in minimal medium from Dulbecco (DMEM) supplemented with 10% fetal calf serum (SVF), 2mM glutamine, 100 U / mL of penicillin and 100 U / mL of streptomycin. They were harvested after mechanical lysis of the host cells by 3 passages in 25G syringe.

Construction du plasmideConstruction of the plasmid

Le plasmide pTgRopl6KO-Gral5nKI-CAT-GFP lox2272 SEQ ID NO: 67 (Figure 11) contient la cassette de sélection CAT-GFP SEQ ID NO : 6 comprenant le gène de sélection cat-gfp SEQ ID NO : 2, codant pour la protéine de fusion CAT-GFP conférant une résistance au chloramphénicol (CAT) et une fluorescence verte (GFP), sous le contrôle du promoteur de Ι’α-tubuline de Toxoplasma gondii SEQ ID NO : 3 pour permettre l’expression du gène dans le parasite. En aval du gène de sélection SEQ ID NO : 2, la séquence 3’UTR du gène sagl de Toxoplasma gondii SEQ ID NO : 4 est insérée. Cette séquence a pour objectif de stabiliser l’ARNm codant la protéine de fusion CAT-GFP.The plasmid pTgRopl6KO-Gral5 n KI-CAT-GFP lox2272 SEQ ID NO: 67 (Figure 11) contains the selection cassette CAT-GFP SEQ ID NO: 6 comprising the selection gene cat-gfp SEQ ID NO: 2, coding for the fusion protein CAT-GFP conferring resistance to chloramphenicol (CAT) and green fluorescence (GFP), under the control of the promoter of Ι'α-tubulin of Toxoplasma gondii SEQ ID NO: 3 to allow the expression of the gene in the parasite. Downstream of the selection gene SEQ ID NO: 2, the 3'UTR sequence of the sagl gene of Toxoplasma gondii SEQ ID NO: 4 is inserted. The aim of this sequence is to stabilize the mRNA encoding the CAT-GFP fusion protein.

La cassette de sélection SEQ ID NO : 6 est encadrée par deux sites Lox2272 SEQ ID NO : 68, sites de reconnaissance spécifiquement reconnus par la Cre Recombinase et qui seront utilisés ultérieurement pour supprimer la cassette de sélection CAT-GFP.The SEQ ID NO: 6 selection cassette is surrounded by two Lox2272 SEQ ID NO: 68 sites, recognition sites specifically recognized by Cre Recombinase and which will be used subsequently to delete the CAT-GFP selection cassette.

En aval du deuxième site Lox2272, une cassette d’expression du gène gral5n SEQ ID NO : 69 a été cloné. Cette cassette d’expression est constituée du promoteur de gral5n amplifié à partir de 1‘ ADN génomique de la souche ME49 et du gène gral5n SEQ ID NO : 70 amplifié à partir de l‘ADN génomique de la souche ME49, incluant un tag HA en 3’ SEQ ID NO : 72 pour faciliter la localisation et de la séquence 3’UTR du gène sagl de T. gondii SEQ ID NO :4 amplifié à partir de l’ADN génomique de la souche RH. Ce plasmide permet donc la réalisation simultanée d’un mutant roplôKO lox2272 CATGFP lox2272 et l’insertion de gral5IIHA au locus roplô.Downstream of the second Lox2272 site, an expression cassette for the gral5n gene SEQ ID NO: 69 was cloned. This expression cassette consists of the gral5n promoter amplified from the genomic DNA of the strain ME49 and the gral5n gene SEQ ID NO: 70 amplified from the genomic DNA of the strain ME49, including an HA tag in 3 'SEQ ID NO: 72 to facilitate the localization and the 3'UTR sequence of the sagl gene of T. gondii SEQ ID NO: 4 amplified from the genomic DNA of the RH strain. This plasmid therefore allows the simultaneous production of a roplôKO mutant lox2272 CATGFP lox2272 and the insertion of gral5IIHA at the roplô locus.

Le plasmide pTgROP16-KO-CAT-tdTomato SEQ ID NO : 73 contient une cassette CATtdTomato SEQ ID NO : 125 encadrée par une séquence 5’HR du gène Tgroplô SEQ ID NO : 99 et une séquence 3’HR du gène Tgroplô SEQ ID NO : 100.The plasmid pTgROP16-KO-CAT-tdTomato SEQ ID NO: 73 contains a cassette CATtdTomato SEQ ID NO: 125 framed by a 5'HR sequence of the Tgroplô SEQ ID NO: 99 gene and a 3'HR sequence of the Tgroplô SEQ ID NO gene : 100.

Le clonage a été fait à partir du plasmide pTgROP16-KO-CAT-tdTomato SEQ ID NO : 73 digéré par les enzymes SphI et Agel (6073pb). Ce clonage a nécessité 4 PCR indépendantes.Cloning was carried out from the plasmid pTgROP16-KO-CAT-tdTomato SEQ ID NO: 73 digested with the enzymes SphI and Agel (6073bp). This cloning required 4 independent PCRs.

La première PCR a permis l’amplification à partir du plasmide pCATGFP lox P SEQ ID NO : 38, d’une cassette de sélection CAT-GFP SEQ ID NO : 6 comportant le promoteur aTubuline, le gène de sélection cat-gfp et la région 3’UTR de sagl de T. gondii, avec ajout du site lox2272 SEQ ID NO : 68 avec les amorces tub F Agel SEQ ID NO : 74 et 3 UTR lox2272 R SEQ ID NO : 75 (2090pb).The first PCR enabled the amplification, from the plasmid pCATGFP lox P SEQ ID NO: 38, of a selection cassette CAT-GFP SEQ ID NO: 6 comprising the promoter aTubulin, the selection gene cat-gfp and the region 3 'UTR of T. gondii sagl, with addition of the site lox2272 SEQ ID NO: 68 with the tubers F Agel SEQ ID NO: 74 and 3 UTR lox2272 R SEQ ID NO: 75 (2090bp).

La deuxième PCR a permis l’amplification à partir du plasmide pT230 2G gral5II SEQ ID NO :76, du promoteur gral5II SEQ ID NO : 71 avec ajout en 5’ du site lox2272 SEQ ID NO : 68 avec les amorces pGral5 F lox2272 SEQ ID NO : 77 et P Gral5 R SEQ ID NO : 78 (I975pb).The second PCR allowed the amplification from the plasmid pT230 2G gral5II SEQ ID NO: 76, of the promoter gral5II SEQ ID NO: 71 with addition in 5 ′ of the site lox2272 SEQ ID NO: 68 with the primers pGral5 F lox2272 SEQ ID NO: 77 and P Gral5 R SEQ ID NO: 78 (I975pb).

La troisième PCR a permis l’amplification à partir du plasmide pT230 2G gral5II SEQ ID NO :76, du gène gral5II HA avec le 3’UTR de sagl SEQ ID NO : 79 (2092 pb) avec les amorces Gral5F SEQ ID NO 126 et UTR sagl roplô R SEQ ID NO 127.The third PCR allowed amplification from the plasmid pT230 2G gral5II SEQ ID NO: 76, of the gral5II HA gene with the 3'UTR of sagl SEQ ID NO: 79 (2092 bp) with the primers Gral5F SEQ ID NO 126 and UTR sagl roplô R SEQ ID NO 127.

La dernière PCR a permis l’amplification d’une partie de 3’Ropl6 SEQ ID NO : 80 avec les amorces Ropl6F SEQ ID NO : 81 et Ropl6R SphI SEQ ID NO : 82 (570pb) sur le plasmide pTgroplôKO CAT-tdTomato SEQ ID NO : 73 comme matrice.The last PCR allowed the amplification of part of 3'Ropl6 SEQ ID NO: 80 with the primers Ropl6F SEQ ID NO: 81 and Ropl6R SphI SEQ ID NO: 82 (570pb) on the plasmid pTgroplôKO CAT-tdTomato SEQ ID NO: 73 as a matrix.

Les amorces utilisées pour la construction de ce plasmide sont répertoriées dans le tableau 11 ci-dessous.The primers used for the construction of this plasmid are listed in Table 11 below.

Tableau 11 : Amorces utilisées pour la construction du plasmide pT230 2G Gral5IITable 11: Primers used for the construction of the plasmid pT230 2G Gral5II

tub F Agel tub F Agel SEQ ID NO : 74 : GTGATCCTGGTTGGACCGGT SEQ ID NO: 74: GTGATCCTGGTTGGACCGGT 3 UTR lox2272 R 3 UTR lox2272 R SEQ ID NO : 75 : ATAACTTCGTATAAAGTATCCTATACGAAGTTATCGGTTCGACTAGAACAACTG SEQ ID NO: 75: ATAACTTCGTATAAAGTATCCTATACGAAGTTATCGGTTCGACTAGAACAACTG pGral5 F lox2272 pGral5 F lox2272 SEQ ID NO : 77 : CTTTATACGAAGTTATGGATCCACTAGTTGACTGCC SEQ ID NO: 77: CTTTATACGAAGTTATGGATCCACTAGTTGACTGCC PGral5R PGral5R SEQ ID NO : 78 : GTCACCATTGTTGAATGC SEQ ID NO: 78: GTCACCATTGTTGAATGC Gral5F Gral5F SEQ ID NO 126 : GCATTCAACAATGGTGAC SEQ ID NO 126: GCATTCAACAATGGTGAC UTR sagl ropl6 R UTR sagl ropl6 R SEQ ID NO 127 : CGAATTTCGGGAGTTCTCGGGGGGGCAAGAATTGTG SEQ ID NO 127: CGAATTTCGGGAGTTCTCGGGGGGGCAAGAATTGTG Ropl6F Ropl6F SEQ ID NO : 81 : GAACTCCCGAAATTCGTCAA SEQ ID NO: 81: GAACTCCCGAAATTCGTCAA Ropl6R SphI Ropl6R SphI SEQ ID NO : 82 :AATACACGCGACCGCATGC SEQ ID NO: 82: AATACACGCGACCGCATGC

Les 4 fragments de PCR amplifiés ont été directement clonés dans le vecteur pTgroplô KO CAT-tdTomato SEQ ID NO : 73 digéré par Agel et SphI grâce à au kit In-Fusion® de Ozyme (In-Fusion® HD Cloning Kit - Clonetech). La technologie de clonage In-Fusion® permet le clonage en une étape sans purification ou digestion d’un ou de plusieurs produits de PCR dans un vecteur linéarisé. Des extrémités complémentaires aux extrémités des fragments adjacents sont ajoutées par PCR. La réaction se fait selon les recommandations du constructeur. Le plasmide obtenu est dénommé pTgRopl6KO-Gral5nKI-CAT-GFP lox2272 SEQ ID NO : 67. Le plasmide dénommé pTgRopl6KO-Gral5nKI-CAT-GFP lox2272 SEQ ID NO : 67 contient donc une cassette CAT- GFP SEQ ID NO : 6 et une cassette d’expression de gralSHAII SEQ ID NO : 69 , encadrées par une séquence 5’HR du gène Tgroplô SEQ ID NO : 99 et une séquence 3’HR du gène Tgroplô SEQ ID NO : 100.The 4 amplified PCR fragments were directly cloned into the vector pTgroplô KO CAT-tdTomato SEQ ID NO: 73 digested with Agel and SphI using the In-Fusion® kit from Ozyme (In-Fusion® HD Cloning Kit - Clonetech). In-Fusion® cloning technology allows one-step cloning without purification or digestion of one or more PCR products in a linearized vector. Ends complementary to the ends of the adjacent fragments are added by PCR. The reaction is done according to the manufacturer's recommendations. The plasmid obtained is called pTgRopl6KO-Gral5nKI-CAT-GFP lox2272 SEQ ID NO: 67. The plasmid called pTgRopl6KO-Gral5 n KI-CAT-GFP lox2272 SEQ ID NO: 67 therefore contains a cassette CAT-GFP SEQ ID NO: 6 and a gralSHAII SEQ ID NO: 69 expression cassette, framed by a 5'HR sequence of the Tgroplô SEQ ID NO: 99 gene and a 3'HR sequence of the Tgroplô SEQ ID NO: 100 gene.

Construction de la souche Toxo tgmicl-3 KO rop!6 KO Gral5II Kl -2GConstruction of the Toxo tgmicl-3 KO rop! 6 KO Gral5II Kl -2G strain

La construction de la souche vivante atténuée de seconde génération, dénommée Toxo tgmicl-3 KO ropl6 KO Gral5II Kl -2G, est faite en 2 étapes distinctes (figure 12-A):The construction of the second generation attenuated living strain, called Toxo tgmicl-3 KO ropl6 KO Gral5II Kl -2G, is done in 2 distinct stages (figure 12-A):

1. Délétion par recombinaison homologue du gène roplô et son remplacement par la cassette de sélection CAT-GFP SEQ ID NO : 6 encadrée par des séquences Lox2272 SEQ ID NO : 38 et la cassette gral5IISEQ ID NO :69.1. Deletion by homologous recombination of the roplô gene and its replacement by the selection cassette CAT-GFP SEQ ID NO: 6 framed by sequences Lox2272 SEQ ID NO: 38 and the cassette gral5IISEQ ID NO: 69.

Pour obtenir cette souche, la souche Toxo tgmic3 KO - 2G est électroporée avec le plasmide pTgRopl6KO-Gral5nKI-CAT-GFP lox 2272 SEQ ID NO : 67 (20 pg ) linéarisé par Pcil, selon le protocole précédemment décrit. Après électroporation, les tachyzoïtes sont déposés sur une monocouche de cellules HFF en culture. Pour la sélection des mutants, le milieu de culture est remplacé et supplémenté par l’agent de sélection (chloramphénicol 20 pM), 24 heures après l’électroporation. 10 à 15 jours après sélection, les parasites sont sous-clonés en plaque 96 puits sur une monocouche de cellules HFF et les clones d’intérêt sont identifiés par PCR après avoir effectué une extraction d’ADN génomique des clones d’intérêt. La souche obtenue est dénommée Toxo tgmicl-3 KO roplô KO Gral5II Kl.To obtain this strain, the Toxo tgmic3 KO-2G strain is electroporated with the plasmid pTgRopl6KO-Gral5 n KI-CAT-GFP lox 2272 SEQ ID NO: 67 (20 pg) linearized by Pcil, according to the protocol previously described. After electroporation, the tachyzoites are deposited on a monolayer of HFF cells in culture. For the selection of the mutants, the culture medium is replaced and supplemented with the selection agent (chloramphenicol 20 pM), 24 hours after the electroporation. 10 to 15 days after selection, the parasites are subcloned into a 96-well plate on a monolayer of HFF cells and the clones of interest are identified by PCR after having carried out an extraction of genomic DNA from the clones of interest. The strain obtained is called Toxo tgmicl-3 KO roplô KO Gral5II Kl.

Dans cette souche, le gène roplô a été délété et remplacé par la cassette de sélection CATGFP SEQ ID NO :6 et la cassette d’expression de gra!5HAII SEQ ID NO :69 . Ainsi, la séquence théorique au locus du gène roplô délété contenant la cassette de sélection CATGFP et la cassette d’expression de gral5HAII est la SEQ ID NO : 112.In this strain, the roplô gene was deleted and replaced by the selection cassette CATGFP SEQ ID NO: 6 and the expression cassette for gra! 5HAII SEQ ID NO: 69. Thus, the theoretical sequence at the locus of the deleted roplô gene containing the CATGFP selection cassette and the gral5HAII expression cassette is SEQ ID NO: 112.

Dans cette souche, le gène mie 3 a été délété et la cassette de sélection CATGFP SEQ ID NO :6 a été excisé. Ainsi, la séquence théorique au locus du gène mic3 délété contenant un seul site lox P SEQ ID NO : 12, est la SEQ ID NO : 19.In this strain, the mie 3 gene was deleted and the selection cassette CATGFP SEQ ID NO: 6 was excised. Thus, the theoretical sequence at the locus of the deleted mic3 gene containing a single lox P site SEQ ID NO: 12, is SEQ ID NO: 19.

Dans cette souche, le gène miel a été délété et la cassette de sélection CATGFP SEQ ID NO :6 a été excisé. Ainsi, la séquence théorique au locus du gène miel délété contenant un seul site lox N SEQ ID NO : 5, est la SEQ ID NO : 92.In this strain, the honey gene was deleted and the CATGFP SEQ ID NO: 6 selection cassette was excised. Thus, the theoretical sequence at the locus of the deleted honey gene containing a single lox site N SEQ ID NO: 5, is SEQ ID NO: 92.

2. Suppression de la cassette de sélection: la souche Toxo tgmicl-3 KO roplô KO Gral5II Kl obtenue est électroporée avec le plasmide pT-SAGl-CRE-Recombinase SEQ ID NO : 15 (Figure 1-C). L’enzyme exprimée transitoirement va permettre l’excision de la cassette de sélection CAT-GFP. Après électroporation, les tachyzoïtes sont déposés sur une monocouche de cellules HFF en culture. Après 2 à 7 jours de culture, les parasites sont sous-clonés en plaque 96 puits sur une monocouche de cellules HFF et les clones d’intérêt sont identifiés par PCR après avoir effectué une extraction d’ADN génomique au DNAzol des clones d’intérêt. La souche obtenue est dénommée Toxo tgmicl-3 KO roplô KO Gral5II Kl -2G.2. Deletion of the selection cassette: the Toxo tgmicl-3 KO roplô KO Gral5II Kl strain obtained is electroporated with the plasmid pT-SAG1-CRE-Recombinase SEQ ID NO: 15 (Figure 1-C). The transiently expressed enzyme will allow excision of the CAT-GFP selection cassette. After electroporation, the tachyzoites are deposited on a monolayer of HFF cells in culture. After 2 to 7 days of culture, the parasites are subcloned into a 96-well plate on a monolayer of HFF cells and the clones of interest are identified by PCR after having carried out an extraction of genomic DNA with DNAzol from the clones of interest . The strain obtained is called Toxo tgmicl-3 KO roplô KO Gral5II Kl -2G.

Dans cette souche, le gène roplô a été délété et remplacé par la cassette d’expression de gral5HAII SEQ ID NO :69 et la cassette de sélection CATGFP SEQ ID NO :6 a été excisé. Ainsi, la séquence théorique au locus du gène roplô délété contenant la cassette un seul site lox 2272 SEQ ID NO : 68 et la cassette d’expression de gral5HAII est la SEQ ID NO : 93.In this strain, the roplô gene was deleted and replaced by the gral5HAII SEQ ID NO: 69 expression cassette and the CATGFP SEQ ID NO: 6 selection cassette was excised. Thus, the theoretical sequence at the locus of the deleted roplô gene containing the cassette with a single site lox 2272 SEQ ID NO: 68 and the expression cassette for gral5HAII is SEQ ID NO: 93.

Dans cette souche, le gène mic3 a été délété et la cassette de sélection CATGFP SEQ ID NO :6 a été excisé. Ainsi, la séquence théorique au locus du gène mic3 délété contenant un seul site lox P SEQ ID NO : 12, est la SEQ ID NO : 19.In this strain, the mic3 gene was deleted and the CATGFP SEQ ID NO: 6 selection cassette was excised. Thus, the theoretical sequence at the locus of the deleted mic3 gene containing a single lox P site SEQ ID NO: 12, is SEQ ID NO: 19.

Dans cette souche, le gène miel a été délété et la cassette de sélection CATGFP SEQ ID NO :6 a été excisé. Ainsi, la séquence théorique au locus du gène miel délété contenant un seul site lox N SEQ ID NO : 5, est la SEQ ID NO : 92.In this strain, the honey gene was deleted and the CATGFP SEQ ID NO: 6 selection cassette was excised. Thus, the theoretical sequence at the locus of the deleted honey gene containing a single lox site N SEQ ID NO: 5, is SEQ ID NO: 92.

Validation de la souche Toxo tgmicl-3 KO roplô KO Gral5II Kl -2G par PCRValidation of the Toxo tgmicl-3 KO roplô KO Gral5II Kl -2G strain by PCR

Pour valider la souche Toxo tgmicl-3 KO roplô KO Gral5II Kl 2G des analyses PCR sont effectuées à partir de l’ADN génomique extrait au DNAzol à partir d’un culot parasitaire constitué de 107 parasites. Les amorces utilisées pour les PCR sont décrites dans la Figure 1 ΙΟ et sont détaillées dans le Tableau 12 ci-dessous. Les produits PCR sont analysés par électrophorèse sur gel d’agarose (Figure 12-C). Leur taille attendue et leur taille observée sont également décrites dans le Tableau 13 ci-dessous.To validate the Toxo tgmicl-3 KO roplô KO Gral5II Kl 2G strain, PCR analyzes are carried out using genomic DNA extracted with DNAzol from a parasitic pellet consisting of 10 7 parasites. The primers used for the PCRs are described in Figure 1 ΙΟ and are detailed in Table 12 below. The PCR products are analyzed by electrophoresis on agarose gel (Figure 12-C). Their expected size and their observed size are also described in Table 13 below.

Tableau 12 : liste des amorces utilisées pour la validation de la souche Toxo tgmicl-3 KO roplôKO Gral5IIKI 2G.Table 12: list of primers used for the validation of the Toxo tgmicl-3 KO roplôKO Gral5IIKI 2G strain.

Amorce F Primer F Séquence Sequence Tgroplô (mixl) Tgroplô (mixl) Rgl Rgl AGD rop 16CDS F AGD rop 16CDS F SEQ ID NO: 83 GTTTGAGGAAGCGCAAAAAG SEQ ID NO: 83 GTTTGAGGAAGCGCAAAAAG Rg2 Rg2 AGD rop 16CDS R AGD rop 16CDS R SEQ ID NO: 84 TGCTGTGATTTCGCAAGTTC SEQ ID NO: 84 TGCTGTGATTTCGCAAGTTC Validation KO en amont (mix2) Upstream KO validation (mix2) Rg3 Rg3 Rop 16KO valid 5F1 Rop 16KO valid 5F1 SEQ ID NO: 85 ACCCCCTGACCCCTTGTCTG SEQ ID NO: 85 ACCCCCTGACCCCTTGTCTG Rg4 Rg4 Amont ropl6R Upstream ropl6R SEQ ID NO: 86 TCGTCGTGGTATTCACTCCA SEQ ID NO: 86 TCGTCGTGGTATTCACTCCA Validation KO en aval (mix3) Downstream KO validation (mix3) Rg5 Rg5 Gral5 qPCR 2F Gral5 qPCR 2F SEQ ID NO: 87 CACGTACACAACCCATCTCG SEQ ID NO: 87 CACGTACACAACCCATCTCG Rg6 rg6 Aval ropl6R Downstream ropl6R SEQ ID NO: 88 AAAACGAATGCGAAGGAAGA SEQ ID NO: 88 AAAACGAATGCGAAGGAAGA Cicatrice roplôKO gral5 loxP (mix4) RoplôKO gral5 loxP scar (mix4) Rg7 Rg7 cicroplô loxF cicroplô loxF SEQ ID NO: 89 CAGTACCAGCCACGTTAGCA SEQ ID NO: 89 CAGTACCAGCCACGTTAGCA Rg8 Kg8 cicroplô loxGraR cicroplô loxGraR SEQ ID NO: 90 CAAGCAATCTGTGGCAAAAA SEQ ID NO: 90 CAAGCAATCTGTGGCAAAAA Gral5I/II (mix5) Gral5I / II (mix5) Gral5I/IIF Gral5I / IIF SEQ ID NO: 109 GTGCAAAGCCAACTTCCACT SEQ ID NO: 109 GTGCAAAGCCAACTTCCACT Gral5I/IIF Gral5I / IIF SEQ ID NO: 110 GGACCTGGATCAGAGATCGT SEQ ID NO: 110 GGACCTGGATCAGAGATCGT

Tableau 13 : Taille attendue des amplicons (en paires de base) des différentes PCR de validation de la construction de la souche Toxo tgmicl-3 KO rop 16 KO Gral5II Kl 2GTable 13: Expected size of amplicons (in base pairs) of the different PCRs for validation of the construction of the Toxo tgmicl-3 KO rop 16 KO Gral5II Kl 2G strain

Toxo tgmicl-3 KO - 2G Toxo tgmicl-3 KO - 2G Toxo tgmicl-3 KO roplô KO Gral5IIKI Toxo tgmicl-3 KO roplô KO Gral5IIKI Toxo tgmicl-3 KO roplôKO Gral5IIKI 2G Toxo tgmicl-3 KO roplôKO Gral5IIKI 2G Tgroplô (mixl) Tgroplô (mixl) 1682 1682 - - - - Validation KO 5’Tgropl6 (mix2) 5'Tgropl6 KO validation (mix2) - - 2759 2759 - - ValidationKO 3’ Tgroplô (mix3) ValidationKO 3 ’Tgroplô (mix3) - - 2870 2870 2870 2870 Cicatrice roplôKO gral51oxP (mix4) RoplôKO gral51oxP scar (Mix4) 2550 2550 321 321 Gral5I/II (mix5) Gral5I / II (mix5) 560 560 560 et 308 560 and 308 560 et 308 560 and 308

Les électrophorèses des produits PCR réalisés avec les amorces rgl SEQ ID NO: 83 et rg2 SEQ ID NO: 84 (mix 1) permettent de mettre en évidence une bande à 1682 paires de bases pour la souche Toxo tgmicl-3 KO - 2G, conformément à la taille de bande attendue et confirmant la présence du gène Tgroplô dans cette souche. Cette bande n’est pas détectée dans les souches Toxo tgmicl-3 KO rop 16 KO Gral5II Kl et Toxo tgmicl-3 KO rop 16 KO Gral5II Kl -2G confirmant la suppression du gène dans ces souches.The electrophoreses of the PCR products carried out with the primers rgl SEQ ID NO: 83 and rg2 SEQ ID NO: 84 (mix 1) make it possible to demonstrate a band at 1682 base pairs for the strain Toxo tgmicl-3 KO - 2G, in accordance at the expected band size and confirming the presence of the Tgroplô gene in this strain. This band is not detected in the Toxo tgmicl-3 KO rop 16 KO Gral5II Kl and Toxo tgmicl-3 KO rop 16 KO Gral5II Kl -2G strains confirming the suppression of the gene in these strains.

Les électrophorèses des produits PCR réalisés avec les amorces rg3 SEQ ID NO: 85et rg4 SEQ ID NO: 86 (mix 2) permettent de mettre en évidence une bande à 2759 paires de bases pour la souche Toxo tgmicl-3 KO rop 16 KO Gral5II Kl, conformément à la taille des bandes attendues et confirmant la suppression du gène Tgroplô dans cette souche et l’insertion du gène de sélection CATGFP et gral5II à la place du gène Tgroplô. Cette bande n’est pas détectée dans les souches Toxo tgmicl-3 KO - 2G et Toxo tgmicl-3 KO roplô KO Gral5II Kl -2G.The electrophoresis of the PCR products carried out with the primers rg3 SEQ ID NO: 85 and rg4 SEQ ID NO: 86 (mix 2) make it possible to demonstrate a band at 2759 base pairs for the strain Toxo tgmicl-3 KO rop 16 KO Gral5II Kl , in accordance with the size of the expected bands and confirming the suppression of the Tgroplô gene in this strain and the insertion of the selection gene CATGFP and gral5II in place of the Tgroplô gene. This band is not detected in the Toxo tgmicl-3 KO - 2G and Toxo tgmicl-3 KO roplô KO Gral5II Kl -2G strains.

Les électrophorèses des produits PCR réalisés avec les amorces rg5 SEQ ID NO: 87 et rg6 SEQ ID NO: 88 (mix 3) permettent de mettre en évidence une bande à 2870 paires de bases pour les souches Toxo tgmicl-3 KO rop 16 KO Gral5II Kl et Toxo tgmicl-3 KO rop 16 KO Gral5II Kl -2G, conformément à la taille des bandes attendues et confirmant la suppression du gène Tgroplô dans cette souche et l’insertion du gène gral5II à la place du gène Tgroplô. Cette bande n’est pas détectée dans la souche Toxo tgmicl-3 KO - 2G.The electrophoresis of the PCR products carried out with the primers rg5 SEQ ID NO: 87 and rg6 SEQ ID NO: 88 (mix 3) make it possible to demonstrate a band at 2870 base pairs for the strains Toxo tgmicl-3 KO rop 16 KO Gral5II Kl and Toxo tgmicl-3 KO rop 16 KO Gral5II Kl -2G, in accordance with the size of the expected bands and confirming the suppression of the Tgroplô gene in this strain and the insertion of the gral5II gene in place of the Tgroplô gene. This band is not detected in the Toxo tgmicl-3 KO - 2G strain.

Les électrophorèses des produits PCR réalisés avec les amorces rg7 SEQ ID NO: 89 et rg8 SEQ ID NO: 90 (mix 4) permettent de mettre en évidence une bande de 2550 paires de bases pour la souche Toxo tgmicl-3 KO roplô KO Gral5II Kl confirmant la présence de la cassette de sélection CATGFP SEQ ID NO : 6 à la place du gène Tgroplô. Enfin une bande de 321 paires de bases est mise en évidence pour la souche Toxo tgmicl-3 KO roplô KO Gral5II Kl -2G confirmant la suppression du gène de sélection cat-gfp SEQ ID NO : 2 dans cette souche, laissant une cicatrice lox2272 SEQ ID NO : 68 dans le génome. Aucune bande n’est pas détectée dans la souche Toxo tgmicl-3 KO - 2G.The electrophoresis of the PCR products carried out with the primers rg7 SEQ ID NO: 89 and rg8 SEQ ID NO: 90 (mix 4) make it possible to demonstrate a band of 2550 base pairs for the strain Toxo tgmicl-3 KO roplô KO Gral5II Kl confirming the presence of the selection cassette CATGFP SEQ ID NO: 6 in place of the Tgroplô gene. Finally, a band of 321 base pairs is demonstrated for the Toxo tgmicl-3 KO roplô KO Gral5II Kl -2G strain confirming the suppression of the selection gene cat-gfp SEQ ID NO: 2 in this strain, leaving a scar lox2272 SEQ ID NO: 68 in the genome. No band was detected in the Toxo tgmicl-3 KO - 2G strain.

Le produit PCR « cicatrice » obtenue pour la souche Toxo tgmicl-3 KO roplô KO Gral5II Kl -2G (321 paires de bases) a été séquencé et les séquençages ont confirmés que :The “scar” PCR product obtained for the Toxo tgmicl-3 KO roplô KO Gral5II Kl -2G (321 base pairs) strain was sequenced and the sequencing confirmed that:

• le gène Tgroplô a été supprimé et que la cassette de sélection CAT-GFP SEQ ID NO : 6 a bien été supprimée par action de la Cre-Recombinase laissant une cicatrice Lox2272 SEQ ID NO : 68 conforme à la séquence attendue (Figure 12-D).• the Tgroplô gene has been deleted and the CAT-GFP SEQ ID NO: 6 selection cassette has been deleted by action of Cre-Recombinase leaving a scar Lox2272 SEQ ID NO: 68 in accordance with the expected sequence (Figure 12- D).

Les électrophorèses des produits PCR réalisés avec les amorces SEQ ID NO: 109 et SEQ ID NO: 110 (mix 5) permettent de mettre en évidence une bande à 560 paires de bases pour les souches Toxo tgmicl-3 KO - 2G, conformément à la taille de bande attendue et confirmant la présence du gène TggralS dans cette souche. Une bande supplémentaire à 308 paires de bases est détectée dans les souches Toxo tgmicl-3 KO roplô KO Gral5II Kl et Toxo tgmicl-3 KO roplô KO Gral5II Kl -2G confirmant la présence du gène gralSHAII dans ces souches.The electrophoreses of the PCR products carried out with the primers SEQ ID NO: 109 and SEQ ID NO: 110 (mix 5) make it possible to demonstrate a band at 560 base pairs for the strains Toxo tgmicl-3 KO - 2G, in accordance with the expected band size confirming the presence of the TggralS gene in this strain. An additional band at 308 base pairs is detected in the strains Toxo tgmicl-3 KO roplô KO Gral5II Kl and Toxo tgmicl-3 KO roplô KO Gral5II Kl -2G confirming the presence of the gralSHAII gene in these strains.

Validation de la souche Toxo tgmicl-3 KO roplô KO Gral5II Kl -2G par immunofluorescenceValidation of the Toxo tgmicl-3 KO roplô KO Gral5II Kl -2G strain by immunofluorescence

Les tachyzoïtes sont cultivés 24h sur lamelles en verre recouvertes d’une monocouche de cellules HFF. Les cellules infectées ont été lavés 2 fois en PB SIX, et fixés par du formaldéhyde 4% pendant 30 min. Après 3 lavages en PBS1X, les cellules HFF infectées ont été perméabilisées avec 0,1% de Triton X-100 dans du PBS1X pendant 5 min. Après 3 lavages au PBS IX, une étape de saturation est effectuée avec une solution de PBS 1X/SVF 10% pendant 30 min. Les cellules ont ensuite été incubées avec l'anticorps primaire dilué dans 2% SVF pendant 1 heure, lavées 3 fois au PBS1X puis incubées avec un anticorps secondaire dilué dans une solution de PBS/SVF 2% pendant 1 heure. Après 2 lavages au PBSIX, les lamelles en verre sont montés sur lame avec de l’Immu-Mount™ et observés au microscope à fluorescence.The tachyzoites are cultured for 24 hours on glass coverslips coated with a monolayer of HFF cells. The infected cells were washed twice in PB SIX, and fixed with 4% formaldehyde for 30 min. After 3 washes in PBS1X, the infected HFF cells were permeabilized with 0.1% Triton X-100 in PBS1X for 5 min. After 3 washes with PBS IX, a saturation step is carried out with a solution of PBS 1X / SVF 10% for 30 min. The cells were then incubated with the primary antibody diluted in 2% FCS for 1 hour, washed 3 times with PBS1X then incubated with secondary antibody diluted in a solution of PBS / SVF 2% for 1 hour. After 2 washes with PBSIX, the glass slides are mounted on a slide with Immu-Mount ™ and observed under a fluorescence microscope.

L’anticorps primaire utilisé est l’anticorps de souris anti-HA qui permet de détecter l’expression de la protéine GRA15n-HA SEQ ID NO : 123 dans le parasite. L’anticorps secondaire est l’anticorps secondaire commercial : Alexa fluor® 594 chèvre anti lapin (LifeThe primary antibody used is the anti-HA mouse antibody which detects the expression of the GRA15n-HA protein SEQ ID NO: 123 in the parasite. The secondary antibody is the commercial secondary antibody: Alexa fluor® 594 goat anti rabbit (Life

Technologies A-11012). Les anticorps sont dilués au 1/1000 dans du PBS SVF 2%.Technologies A-11012). The antibodies are diluted 1/1000 in PBS SVF 2%.

Pour la souche sauvage Toxo tgmicl-3 KO 2G, aucune fluorescence rouge n’est observé au pôle apical du parasite révélant ainsi l’absence de la protéine GRA15n-HA. Au contraire, pour la souche Toxo tgmicl-3 KO roplô KO gral5II Kl, une fluorescence rouge est observé démontrant la protéine GRA15n-HA. La souche Toxo tgmicl-3 KO roplô KO gral5II Kl exprime une fluorescente verte reflétant l’expression de la protéine CATGFP SEQ ID NO : 120 alors qu’après action de la Cre recombinase, la souche Toxo tgmicl-3 KO roplô KO gra!5II Kl lox2272 n’est plus fluorescente (Figure 13).For the wild strain Toxo tgmicl-3 KO 2G, no red fluorescence is observed at the apical pole of the parasite thus revealing the absence of the protein GRA15n-HA. On the contrary, for the Toxo tgmicl-3 KO roplô KO gral5II Kl strain, a red fluorescence is observed demonstrating the GRA15n-HA protein. The Toxo tgmicl-3 KO roplô KO gral5II Kl strain expresses a green fluorescent reflecting the expression of the CATGFP protein SEQ ID NO: 120 whereas after action of Cre recombinase, the Toxo tgmicl-3 KO roplô KO gra! 5II strain Kl lox2272 is no longer fluorescent (Figure 13).

Exemple 6 : Construction de la souche Neo ncmicl-3 KO - 2G (notée Neo KO 2G)Example 6: Construction of the Neo ncmicl-3 KO - 2G strain (noted Neo KO 2G)

L’haploïdie du génome de Neospora caninum lors de la phase proliférative permet l’invalidation d’un gène en une seule recombinaison homologue.The haploidy of the genome of Neospora caninum during the proliferative phase allows the invalidation of a gene in a single homologous recombination.

Culture des parasitesCulture of parasites

Tous les tachyzoïtes de la souche de Neospora caninum utilisés ont été produits en fibroblastes humains (HFF Hs27 ATCC CRL-1634)) cultivés en milieu minimal de Dulbecco (DMEM) supplémenté par 10% de sérum de veau fœtal (SVF), 2mM glutamine, 100 U/mL de pénicilline et 100 U/mL de streptomycine. Ils ont été récoltés après lyse mécanique des cellules hôtes par 3 passages en seringue 25G.All the tachyzoites of the Neospora caninum strain used were produced in human fibroblasts (HFF Hs27 ATCC CRL-1634)) cultured in minimal medium from Dulbecco (DMEM) supplemented with 10% fetal calf serum (SVF), 2mM glutamine, 100 U / mL of penicillin and 100 U / mL of streptomycin. They were harvested after mechanical lysis of the host cells by 3 passages in 25G syringe.

Construction des plasmides • Plasmide pNcMIC3-KO-CAT-GFP loxNConstruction of the plasmids • Plasmid pNcMIC3-KO-CAT-GFP loxN

Le plasmide pNcMic3KO-CAT-GFP loxN SEQ ID NO : 1 contient une cassette de sélection CAT-GFP SEQ ID NO :6 comprenant le gène de sélection cat-gfp SEQ ID NO : 2 codant pour la protéine de fusion CAT-GFP permettant à la fois la résistance au chloramphénicol (CAT) et une fluorescence verte (GFP : Green Fluorescent Protein), sous le contrôle du promoteur de Ι’α-tubuline de Toxoplasma gondii SEQ ID NO :3 pour permettre l’expression du gène dans le parasite. En aval du gène cat-gfp SEQ ID :2, la séquence 3’UTR du gène sagl de Toxoplasma gondii SEQ ID NO : 4 est insérée. Cette séquence a pour objectif de stabiliser l’ARNm codant la protéine de fusion CAT/GFP. Cette cassette de sélection SEQ ID NO :6 est encadrée par deux sites loxN SEQ ID NO :5 identiques de même orientation.The plasmid pNcMic3KO-CAT-GFP loxN SEQ ID NO: 1 contains a selection cassette CAT-GFP SEQ ID NO: 6 comprising the selection gene cat-gfp SEQ ID NO: 2 coding for the fusion protein CAT-GFP allowing both chloramphenicol resistance (CAT) and green fluorescence (GFP: Green Fluorescent Protein), under the control of the opl'α-tubulin promoter from Toxoplasma gondii SEQ ID NO: 3 to allow expression of the gene in the parasite . Downstream of the cat-gfp gene SEQ ID: 2, the 3’UTR sequence of the sagl gene of Toxoplasma gondii SEQ ID NO: 4 is inserted. The objective of this sequence is to stabilize the mRNA encoding the CAT / GFP fusion protein. This SEQ ID NO: 6 selection cassette is surrounded by two identical loxN SEQ ID NO: 5 sites with the same orientation.

Pour obtenir ce plasmide, la cassette de sélection CAT-GFP SEQ ID NO :6 a été amplifiée par PCR sur le plasmide pT230 CAT-GFP SEQ ID NO :9 avec les amorces cat-gfp LoxN For SEQ ID NO :7 et catgfp loxN rev SEQ ID NO :8 (2380pb), digérée par les enzymes de restriction Clal et Xbal (2348 pb) et clonée dans le plasmide pNcMic3K0-DHFR SEQ ID NO :10 digéré par Clal et Xbal (7715 pb).To obtain this plasmid, the selection cassette CAT-GFP SEQ ID NO: 6 was amplified by PCR on the plasmid pT230 CAT-GFP SEQ ID NO: 9 with the primers cat-gfp LoxN For SEQ ID NO: 7 and catgfp loxN rev SEQ ID NO: 8 (2380 bp), digested with the restriction enzymes Clal and Xbal (2348 bp) and cloned into the plasmid pNcMic3K0-DHFR SEQ ID NO: 10 digested with Clal and Xbal (7715 bp).

Le plasmide alors obtenu est le plasmide pNcMic3KO-CAT-GFP loxN SEQ ID NO : 1.The plasmid then obtained is the plasmid pNcMic3KO-CAT-GFP loxN SEQ ID NO: 1.

Les séquences des amorces figurent dans le Tableau 14 ci-dessous. Le plasmide pNcMic3K0CAT-GFP loxN contient donc une cassette CAT-GFP SEQ ID NO :6 encadrée par une séquence 5’HR du gène Ncmic3 SEQ ID NO : 98 et une séquence 3’HR du gène Ncmic3 SEQ ID NO : 97.The primer sequences are shown in Table 14 below. The plasmid pNcMic3K0CAT-GFP loxN therefore contains a CAT-GFP cassette SEQ ID NO: 6 framed by a 5’HR sequence of the Ncmic3 SEQ ID NO: 98 gene and a 3’HR sequence of the Ncmic3 SEQ ID NO: 97 gene.

Tableau 14 : liste des amorces utilisées pour la construction du plasmide pNcMIC3-K0CAT-GFP loxN catgfp loxN For catgfp loxN revTable 14: list of primers used for the construction of the plasmid pNcMIC3-K0CAT-GFP loxN catgfp loxN For catgfp loxN rev

SEQ ID NO : 7SEQ ID NO: 7

TCCGCTCTCAGAGAATCGATGAAGCTTATAACTTCGTATAGTTCCGCTCTCAGAGAATCGATGAAGCTTATAACTTCGTATAGT

ATACCTTATACGAAGTTATGATATGCATGTCCGCGTTCGTGAATACCTTATACGAAGTTATGATATGCATGTCCGCGTTCGTGA

AATCTC Clal LoxNAATCTC Clal LoxN

SEQ ID NO :8SEQ ID NO: 8

ATACGTAAACTTCTAGATCCATAACTTCGTATAAGGTATACT xbaI loxN ATACGAAGTTATCCCTCGGGGGGGCAAGAATTGTGTTAACCGATACGTAAACTTCTAGATCCATAACTTCGTATAAGGTATACT xbaI loxN ATACGAAGTTATCCCTCGGGGGGGCAAGAATTGTGTTAACCG

GTTCGA • Plasmide pNcMIC 1 -KO-CAT-GFP loxGTTCGA • pNcMIC 1 Plasmid -KO-CAT-GFP lox

Le plasmide pNcMiclKO-CAT-GFP loxP SEQ ID NO : 11 contient une cassette de sélection CAT-GFP SEQ ID NO : 6 comprenant le gène de sélection cat-gfp SEQ ID NO : 2 codant pour une protéine de fusion CAT-GFP permettant à la fois la résistance au chloramphénicol (CAT) et une fluorescence verte (GFP : Green Fluorescent Protein), sous le contrôle du promoteur de Ι’α-tubuline de Toxoplasma gondii SEQ ID NO : 3 pour permettre l’expression du gène dans le parasite. En aval de la séquence codant CAT-GFP, la séquence 3’UTR du gène sagl de Toxoplasma gondii SEQ ID NO : 4 est insérée. Cette séquence a pour objectif de stabiliser l’ARNm codant la protéine de fusion CAT/GFP. Cette cassette de sélection SEQThe plasmid pNcMiclKO-CAT-GFP loxP SEQ ID NO: 11 contains a selection cassette CAT-GFP SEQ ID NO: 6 comprising the selection gene cat-gfp SEQ ID NO: 2 coding for a fusion protein CAT-GFP allowing both chloramphenicol resistance (CAT) and green fluorescence (GFP: Green Fluorescent Protein), under the control of the opl'α-tubulin promoter from Toxoplasma gondii SEQ ID NO: 3 to allow expression of the gene in the parasite . Downstream of the CAT-GFP coding sequence, the 3’UTR sequence of the Toxoplasma gondii SEQ ID NO: 4 sagl gene is inserted. The objective of this sequence is to stabilize the mRNA encoding the CAT / GFP fusion protein. This SEQ selection cassette

ID NO :6 est encadrée par deux sites loxP SEQ ID NO : 12 identiques de même orientation.ID NO: 6 is surrounded by two identical loxP SEQ ID NO: 12 sites with the same orientation.

Pour obtenir ce plasmide, la cassette de sélection CAT-GFP SEQ ID NO :6 a été amplifiée par PCR sur le plasmide pT230 CAT-GFP SEQ ID NO :9 avec les amorces CN10 SEQ ID NO :13 et CN11 SEQ ID NO :14 permettant l’ajout des sites loxP SEQ ID NO :12 (2394 pb), digérée par les enzymes de restriction HindlII et BamHI (2339 pb) et clonée dans le plasmide pT230-ble SEQ ID NO : 37 digéré par HindlII et BamHI (293 lpb). Le plasmide alors obtenu est le plasmide pT230 CAT-GFP loxP SEQ ID NO : 113.To obtain this plasmid, the selection cassette CAT-GFP SEQ ID NO: 6 was amplified by PCR on the plasmid pT230 CAT-GFP SEQ ID NO: 9 with the primers CN10 SEQ ID NO: 13 and CN11 SEQ ID NO: 14 allowing the addition of the loxP sites SEQ ID NO: 12 (2394 bp), digested with the restriction enzymes HindIII and BamHI (2339 bp) and cloned into the plasmid pT230-ble SEQ ID NO: 37 digested with HindIII and BamHI (293 lpb). The plasmid then obtained is the plasmid pT230 CAT-GFP loxP SEQ ID NO: 113.

La région 3 HR du gène ncmicl a été amplifiée par PCR à partir de l’ADN génomique de la souche NC-1 de Neospora caninum. Pour l’amplification, les amorces 3 HR NCmicl F Kpnl et 3 HR NCmicl R HindlII (SEQ ID NO: 114 et SEQ ID NO:115) permettent l’amplification de la région 3 HR du gène ncmicl et la création de deux sites de restrictions qui ont été utilisés pour cloner le fragment 3HR en amont de la cassette de sélection CAT-GFP dans le pT230 CAT-GFP loxP SEQ ID NO : 113. Le plasmide obtenu est dénommé pNcmicl-3HR CATGFP loxP SEQ ID NO : 118.The 3 HR region of the ncmicl gene was amplified by PCR from the genomic DNA of the NC-1 strain of Neospora caninum. For amplification, the primers 3 HR NCmicl F Kpnl and 3 HR NCmicl R HindlII (SEQ ID NO: 114 and SEQ ID NO: 115) allow the amplification of the 3 HR region of the ncmicl gene and the creation of two sites of restrictions which were used to clone the 3HR fragment upstream of the CAT-GFP selection cassette into pT230 CAT-GFP loxP SEQ ID NO: 113. The plasmid obtained is called pNcmicl-3HR CATGFP loxP SEQ ID NO: 118.

La région 5 HR du gène ncmicl a été amplifiée par PCR à partir de l’ADN génomique de la souche NC-1 de Neospora caninum. Pour l’amplification, les amorces 5 HR NCmicl F BamHI et 5 HR NCmicl R Notl (SEQ ID NO: 116 et SEQ ID NO: 117) permettent l’amplification de la région 5’UTR du gène ncmicl et la création de deux sites de restrictions qui ont été utilisés pour cloner le fragment 5HR en aval de la cassette de sélection CAT-GFP dans le plasmide pNcmicl-3HR CATGFP loxP SEQ ID NO : 118 (BamHI -Notl).The 5 HR region of the ncmicl gene was amplified by PCR from the genomic DNA of the NC-1 strain of Neospora caninum. For amplification, the primers 5 HR NCmicl F BamHI and 5 HR NCmicl R Notl (SEQ ID NO: 116 and SEQ ID NO: 117) allow the amplification of the 5'UTR region of the ncmicl gene and the creation of two sites. restrictions which were used to clone the 5HR fragment downstream of the CAT-GFP selection cassette into the plasmid pNcmicl-3HR CATGFP loxP SEQ ID NO: 118 (BamHI -Notl).

Le plasmide alors obtenu est le plasmide pNcMiclKO-CAT-GFP loxP SEQ ID NO : 11. Le plasmide pNcMiclKO-CAT-GFP loxP contient donc une cassette CAT-GFP SEQ ID NO :6 encadrée par une séquence 5’HR du gène Ncmicl SEQ ID NO : 96 et une séquence 3’HR du gène Ncmicl SEQ ID NO : 95.The plasmid then obtained is the plasmid pNcMiclKO-CAT-GFP loxP SEQ ID NO: 11. The plasmid pNcMiclKO-CAT-GFP loxP therefore contains a CAT-GFP cassette SEQ ID NO: 6 framed by a 5′HR sequence of the Ncmicl SEQ gene ID NO: 96 and a 3'HR sequence of the Ncmicl gene SEQ ID NO: 95.

Les séquences des amorces figurent dans le Tableau 15 ci-dessous.The primer sequences are shown in Table 15 below.

Tableau 15 : liste des amorces utilisées pour la construction du plasmide pNcmicl KOTable 15: List of primers used for the construction of the plasmid pNcmicl KO

CATGFP loxPCATGFP loxP

Construction duplasmidepNcmicl KO CATGFPloxPConstruction duplasmidepNcmicl KO CATGFPloxP

CN10 CN10 SEQIDNO : 13 GCGGCCAAGCTT4 TAA CTTCGTA TAA TGTA TGCTA TA CG A . IG77H7GATATGCATGTCCGCgttcgtgaaatctctgatcaagcgg SEQIDNO: 13 GCGGCCAAGCTT4 TAA CTTCGTA TAA TGTA TGCTA TA CG A . IG77H7GATATGCATGTCCGCgttcgtgaaatctctgatcaagcgg HindlII. IoxP HindIII. loxP CN11 CN11 SEQ ID NO : 14 cgacgcacgctgtcactcaacttgctGCT AGA4 CTA 67 GG ATCC 1 TAA CTTCGTA TAGCA TACA TTATACGAAGTTA /CCCTCGGGGG GGCAAGAATT SEQ ID NO: 14 cgacgcacgctgtcactcaacttgctGCT AGA4 CTA 67 GG ATCC 1 TAA CTTCGTA TAGCA TACA TTATACGAAGTTA / CCCTCGGGGG GGCAAGAATT Spel, BamHI, loxP Spel, BamHI, loxP 3 HR Kpnl 3 HR KpnI NCmicl NCmicl F F SEQIDNO: 114 CGCGGTACCAGGCAGAAGTAAAGAAGGTTCCTC SEQIDNO: 114 CGCGGTACCAGGCAGAAGTAAAGAAGGTTCCTC Kpnl KpnI 3 HR HindlII 3 HR HindIII NCmicl NCmicl R R SEQIDNO: 115 CGCAAGCTTTGATCACGCAAGAAAAGAAGC SEQIDNO: 115 CGCAAGCTTTGATCACGCAAGAAAAGAAGC HindlII HindIII 5 HR BamHI 5 HR Bam NCmicl NCmicl F F SEQIDNO: 116 CGCGGATCCCATTTGTAGATACGGTTGCACAC SEQIDNO: 116 CGCGGATCCCATTTGTAGATACGGTTGCACAC BamHI Bam 5 HR Notl 5 HR NOTL NCmicl NCmicl R R SEQIDNO: 117 CGCGCGGCCGCACATTCAGACGGCAGAACTCTG SEQIDNO: 117 CGCGCGGCCGCACATTCAGACGGCAGAACTCTG Notl NOTL

• Plasmide pTSAGl- Cre Recombinase• pTSAGl- Cre Recombinase Plasmid

Le plasmide pT-SAGl-Cre-Recombinase SEQ ID NO :15 a été construit pour exprimer de manière transitoire dans le parasite Toxoplasma gondii et ses dérivés modifiés génétiquement le gène codant la protéine Cre Recombinase dérivée du bactériophage PI (Brecht et al., 1999, même référence que précédemment).The plasmid pT-SAG1-Cre-Recombinase SEQ ID NO: 15 was constructed to transiently express in the parasite Toxoplasma gondii and its genetically modified derivatives the gene encoding the Cre Recombinase protein derived from bacteriophage PI (Brecht et al., 1999 , same reference as above).

Le plasmide pT-SAGl-Cre-Recombinase SEQ ID NO :15 dérive du plasmide pUC18 (plasmide commercial).qui contient une cassette d’expression de la Cre Recombinase du bactériophage PI.The plasmid pT-SAG1-Cre-Recombinase SEQ ID NO: 15 is derived from the plasmid pUC18 (commercial plasmid), which contains an expression cassette for the Cre Recombinase from bacteriophage PI.

Dans le plasmide pT-SAGl-Cre-Recombinase SEQ ID NO : 15, le gène codant la Cre Recombinase SEQ ID NO :16 est placé sous la dépendance du promoteur du gène sagl de Toxoplasma gondii SEQ ID NO : 17, ce qui permet l’expression de la protéine Cre Recombinase dans les parasites Toxoplasma gondii transfectés. En aval du gène codant la Cre Recombinase, la séquence 3’UTR du gène sagl de Toxoplasma gondii SEQ ID NO :4 est insérée. Cette séquence a pour objectif de stabiliser l’ARNm codant la protéine Cre Recombinase.In the plasmid pT-SAG1-Cre-Recombinase SEQ ID NO: 15, the gene encoding Cre Recombinase SEQ ID NO: 16 is placed under the control of the promoter of the sagl gene of Toxoplasma gondii SEQ ID NO: 17, which allows the expression of the Cre Recombinase protein in transfected Toxoplasma gondii parasites. Downstream of the gene encoding Cre Recombinase, the 3’UTR sequence of the Toxoplasma gondii sagl gene SEQ ID NO: 4 is inserted. The objective of this sequence is to stabilize the mRNA encoding the Cre Recombinase protein.

L’absence de cassette de sélection spécifique ne permet pas une intégration stable du matériel génétique transfecté mais seulement une expression transitoire de la Cre Recombinase.The absence of a specific selection cassette does not allow stable integration of the transfected genetic material but only a transient expression of Cre Recombinase.

Construction de la souche Neo ncmicl-3 KO - 2GConstruction of the Neo ncmicl-3 KO - 2G strain

La construction de la souche vivante atténuée de seconde génération, dénommée Neo ncrnic/3 KO - 2G, est faite en 4 étapes distinctes :The construction of the second generation attenuated living strain, called Neo ncrnic / 3 KO - 2G, is done in 4 distinct stages:

1. Délétion par recombinaison homologue du gène Ncmic3 et son remplacement par la cassette de sélection CAT-GFP SEQ ID NO :6 encadrée par des séquences LoxN SEQ IDNO :5.1. Deletion by homologous recombination of the Ncmic3 gene and its replacement by the selection cassette CAT-GFP SEQ ID NO: 6 framed by sequences LoxN SEQ IDNO: 5.

Pour obtenir cette souche, la souche sauvage NC-1 de Neospora caninum est électroporée avec le plasmide pNcMIC3-KO-CAT-GFP lox N SEQ ID NO :1. 20 pg de plasmide purifié puis linéarisé par Kpnl sont ajoutés à 107 parasites mis en suspension dans le milieu d’électroporation CYTOMIX contenant de l’ATP (3 mM) et du Glutathion (3 mM) (Van den Hoff étal., Nucleic Acid Research, Junll; 20(11):2902), et l’électroporation a été réalisée en cuvette d’écart 4 mm, dans un volume de 800 pL sur un appareil BioRad (Paramètres : 2000V, 50 ohms, 25 pF, avec deux chocs électriques). Après électroporation, les tachyzoïtes sont déposés sur une monocouche de cellules HFF en culture. Pour la sélection des mutants, le milieu de culture est remplacé et supplémenté par l’agent de sélection (chloramphénicol 20 pM), 24 heures après Télectroporation. 10 à 15 jours après sélection, les parasites sont sousclonés en plaque 96 puits sur une monocouche de cellules HFF et les clones d’intérêt sont identifiés par PCR après avoir effectué une extraction d’ADN génomique au DNAzol des clones d’intérêt. La souche obtenue est dénommée Neo ncmic3 KO.To obtain this strain, the wild strain NC-1 of Neospora caninum is electroporated with the plasmid pNcMIC3-KO-CAT-GFP lox N SEQ ID NO: 1. 20 μg of plasmid purified then linearized with Kpnl are added to 10 7 parasites suspended in the CYTOMIX electroporation medium containing ATP (3 mM) and Glutathione (3 mM) (Van den Hoff et al., Nucleic Acid Research, Junll; 20 (11): 2902), and electroporation was carried out in a 4 mm gap cuvette, in a volume of 800 pL on a BioRad device (Parameters: 2000V, 50 ohms, 25 pF, with two electric shock). After electroporation, the tachyzoites are deposited on a monolayer of HFF cells in culture. For the selection of the mutants, the culture medium is replaced and supplemented with the selection agent (chloramphenicol 20 pM), 24 hours after Telectroporation. 10 to 15 days after selection, the parasites are subcloned in a 96-well plate on a monolayer of HFF cells and the clones of interest are identified by PCR after having carried out an extraction of genomic DNA with DNAzol from the clones of interest. The strain obtained is called Neo ncmic3 KO.

Dans cette souche, le gène mic3 a été délété et remplacé par la cassette de sélection CATGFP SEQ ID NO :6. Ainsi, la séquence théorique au locus du gène mic3 délété contenant la cassette de sélection CATGFP est la SEQ ID NO : 101. Le gène miel n’étant pas délété, la séquence du gène miel SEQ ID NO :106 est présente dans le génome de la souche.In this strain, the mic3 gene was deleted and replaced by the selection cassette CATGFP SEQ ID NO: 6. Thus, the theoretical sequence at the locus of the deleted mic3 gene containing the CATGFP selection cassette is SEQ ID NO: 101. Since the honey gene is not deleted, the sequence of the honey gene SEQ ID NO: 106 is present in the genome of strain.

2. Suppression de la cassette de sélection SEQ ID NO :6 : la souche Neo ncmic3 KO obtenue est électroporée avec le plasmide pT-SAGl-CRE-Recombinase SEQ ID NO :15.2. Deletion of the selection cassette SEQ ID NO: 6: the Neo ncmic3 KO strain obtained is electroporated with the plasmid pT-SAG1-CRE-Recombinase SEQ ID NO: 15.

L’enzyme exprimée transitoirement va permettre l’excision de la cassette de sélection CAT-GFP SEQ ID NO :6. Le protocole d’électroporation est similaire au protocole précédent. Après électroporation, les tachyzoïtes sont déposés sur une monocouche de cellules HFF en culture. Après 2 à 7 jours de culture, les parasites sont sous-clonés en plaque 96 puits sur une monocouche de cellules HFF et les clones d’intérêt sont identifiés par PCR après avoir effectué une extraction d’ADN génomique au DNAzol des clones d’intérêt. La souche obtenue est dénommée Neo ttcmic3 KO - 2G.The transiently expressed enzyme will allow excision of the selection cassette CAT-GFP SEQ ID NO: 6. The electroporation protocol is similar to the previous protocol. After electroporation, the tachyzoites are deposited on a monolayer of HFF cells in culture. After 2 to 7 days of culture, the parasites are subcloned into a 96-well plate on a monolayer of HFF cells and the clones of interest are identified by PCR after having carried out an extraction of genomic DNA with DNAzol from the clones of interest . The strain obtained is called Neo ttcmic3 KO - 2G.

Dans cette souche, le gène mic3 a été délété et la cassette de sélection CATGFP SEQ ID NO :6 a été excisé. Ainsi, la séquence théorique au locus du gène mic3 délété contenant un seul site lox P SEQ ID NO : 12, est la SEQ ID NO : 18. Le gène miel n’étant pas délété, la séquence du gène miel SEQ ID NO :106 est présente dans le génome de la souche.In this strain, the mic3 gene was deleted and the CATGFP SEQ ID NO: 6 selection cassette was excised. Thus, the theoretical sequence at the locus of the deleted mic3 gene containing a single lox P site SEQ ID NO: 12, is SEQ ID NO: 18. The honey gene not being deleted, the sequence of the honey gene SEQ ID NO: 106 is present in the genome of the strain.

3. Délétion par recombinaison homologue du gène ncmicl et son remplacement par la cassette de sélection CAT-GFP SEQ ID NO :6 encadrée par des séquences LoxP SEQ IDNO :12.3. Deletion by homologous recombination of the ncmicl gene and its replacement by the selection cassette CAT-GFP SEQ ID NO: 6 framed by LoxP sequences SEQ IDNO: 12.

Pour obtenir cette souche, la souche Neo ncmic3 KO - 2G est électroporée avec le plasmide pNcMICl-KO-CAT-GFP lox P SEQ ID NO :11 linéarisé par Kpnl, selon le protocole précédemment décrit. Après électroporation, les tachyzoïtes sont déposés sur une monocouche de cellules HFF en culture. Pour la sélection des mutants, le milieu de culture est remplacé et supplémenté par l’agent de sélection (chloramphénicol 20 μΜ), 24 heures après l’électroporation. 10 à 15 jours après sélection, les parasites sont sous-clonés en plaque 96 puits sur une monocouche de cellules HFF et les clones d’intérêt sont identifiés par PCR après avoir effectué une extraction d’ADN génomique des clones d’intérêt. La souche obtenue est dénommée Neo ncmicl-3 KOTo obtain this strain, the Neo ncmic3 KO-2G strain is electroporated with the plasmid pNcMICl-KO-CAT-GFP lox P SEQ ID NO: 11 linearized by Kpnl, according to the protocol previously described. After electroporation, the tachyzoites are deposited on a monolayer of HFF cells in culture. For the selection of the mutants, the culture medium is replaced and supplemented with the selection agent (chloramphenicol 20 μΜ), 24 hours after the electroporation. 10 to 15 days after selection, the parasites are subcloned into a 96-well plate on a monolayer of HFF cells and the clones of interest are identified by PCR after having carried out an extraction of genomic DNA from the clones of interest. The strain obtained is called Neo ncmicl-3 KO

Dans cette souche, le gène mic3 a été délété et la cassette de sélection CATGFP SEQ ID NO :6 a été excisé. Ainsi, la séquence théorique au locus du gène mic3 délété contenant un seul site lox P SEQ ID NO : 12, est la SEQ ID NO : 18. Dans cette souche, le gène miel a été délété et remplacé par la cassette de sélection CATGFP SEQ ID NO :6. Ainsi, la séquence théorique au locus du gène miel délété contenant la cassette de sélection CATGFP est la SEQ ID NO : 102.In this strain, the mic3 gene was deleted and the CATGFP SEQ ID NO: 6 selection cassette was excised. Thus, the theoretical sequence at the locus of the deleted mic3 gene containing a single lox P site SEQ ID NO: 12, is SEQ ID NO: 18. In this strain, the honey gene has been deleted and replaced by the selection cassette CATGFP SEQ ID NO: 6. Thus, the theoretical sequence at the locus of the deleted honey gene containing the CATGFP selection cassette is SEQ ID NO: 102.

4. Suppression de la cassette de sélection SEQ ID NO :6 : la souche Neo Ncmicl-3 KO obtenue est électroporée avec le plasmide pT-SAGl-CRE-Recombinase SEQ ID4. Deletion of the selection cassette SEQ ID NO: 6: the Neo Ncmicl-3 KO strain obtained is electroporated with the plasmid pT-SAG1-CRE-Recombinase SEQ ID

NO :15.NO: 15.

L’enzyme exprimée transitoirement va permettre l’excision de la cassette de sélection CAT-GFP SEQ ID NO :6. Après électroporation, les tachyzoïtes sont déposés sur une monocouche de cellules HFF en culture. Après 2 à 7 jours de culture, les parasites sont sous-clonés en plaque 96 puits sur une monocouche de cellules HFF et les clones d’intérêt sont identifiés par PCR après avoir effectué une extraction d’ADN génomique au DNAzol des clones d’intérêt. La souche obtenue est dénommée Neo ncmicl-3 KO - 2G.The transiently expressed enzyme will allow excision of the selection cassette CAT-GFP SEQ ID NO: 6. After electroporation, the tachyzoites are deposited on a monolayer of HFF cells in culture. After 2 to 7 days of culture, the parasites are subcloned into a 96-well plate on a monolayer of HFF cells and the clones of interest are identified by PCR after having carried out an extraction of genomic DNA with DNAzol from the clones of interest . The strain obtained is called Neo ncmicl-3 KO - 2G.

Dans cette souche, le gène mic3 a été délété et la cassette de sélection CATGFP SEQ ID NO :6 a été excisé. Ainsi, la séquence théorique au locus du gène mic3 délété contenant un seul site lox P SEQ ID NO : 12, est la SEQ ID NO : 18.In this strain, the mic3 gene was deleted and the CATGFP SEQ ID NO: 6 selection cassette was excised. Thus, the theoretical sequence at the locus of the deleted mic3 gene containing a single lox P site SEQ ID NO: 12, is SEQ ID NO: 18.

Dans cette souche, le gène miel a été délété et la cassette de sélection CATGFP SEQ ID NO :6 a été excisé. Ainsi, la séquence théorique au locus du gène miel délété contenant un seul site lox P SEQ ID NO : 12, est la SEQ ID NO : 91.In this strain, the honey gene was deleted and the CATGFP SEQ ID NO: 6 selection cassette was excised. Thus, the theoretical sequence at the locus of the deleted honey gene containing a single lox P site SEQ ID NO: 12, is SEQ ID NO: 91.

Validation de la souche Neo ncmicl-3 KO - 2G par PCRValidation of the Neo ncmicl-3 KO - 2G strain by PCR

Pour valider la souche Neo ncmicl-3 KO - 2G des analyses PCR sont effectuées à partir de l’ADN génomique extrait au DNAzol à partir d’un culot parasitaire constitué de 107 parasites. Les amorces utilisées pour les PCR sont décrites dans la Figure 15-B et sont détaillées dans le Tableau 16 ci-dessous. Les produits PCR sont analysés par électrophorèse sur gel d’agarose (Figure 15-C). Leur taille attendue et leur taille observée sont également décrites dans le Tableau 17 ci-dessous. Pour plus de clarté sur la figure 15-C, seules les 3 étapes de la réalisation sont représentées (ncmic3, ncmic3K0 CATGFP et ncmic3K0 loxN (2G) ou ncmicl, ncmiclKO CATGFP et ncmiclKO loxP(2G)), les résultats obtenus sont conformes aux tailles attenduesTo validate the Neo ncmicl-3 KO - 2G strain, PCR analyzes are carried out using genomic DNA extracted with DNAzol from a parasitic pellet consisting of 10 7 parasites. The primers used for the PCRs are described in Figure 15-B and are detailed in Table 16 below. The PCR products are analyzed by agarose gel electrophoresis (Figure 15-C). Their expected size and their observed size are also described in Table 17 below. For clarity in Figure 15-C, only the 3 stages of production are shown (ncmic3, ncmic3K0 CATGFP and ncmic3K0 loxN (2G) or ncmicl, ncmiclKO CATGFP and ncmiclKO loxP (2G)), the results obtained are in accordance with expected sizes

Tableau 16 : liste des amorces utilisées pour la validation des souches.Table 16: list of primers used for validating the strains.

Amorce bait Séquence Sequence Ncmic3 (mixl) Ncmic3 (mixl) C VS Ne mic3 F Do mic3 F SEQ ID NO :22 TTTCCCTTCTAAACACAGTCG SEQ ID NO: 22 TTTCCCTTCTAAACACAGTCG d d Ne mic3 R Do mic3 R SEQ ID NO :23 CCTTCAGTGGTTCTCCATGAGT SEQ ID NO: 23 CCTTCAGTGGTTCTCCATGAGT Validation KO 5’Ncmic3(mix2) KO validation 5'Ncmic3 (mix2) i i Integ NCmic3 F Integ NCmic3 F SEQ ID NO :24 GAAAGTGTCAGTGGTAGAGACTGC SEQ ID NO: 24 GAAAGTGTCAGTGGTAGAGACTGC j j ORF CATGFP R ORF CATGFP R SEQ ID NO :25 CCGTTTGGTGGATGTCTTCT SEQ ID NO: 25 CCGTTTGGTGGATGTCTTCT Validation KO 3’Ncmic3 (mix3) KO validation 3’Ncmic3 (mix3) k k ORF CATGFP F ORF CATGFP F SEQ ID NO :26 GCATCGACTTCAAGGAGGAC SEQ ID NO: 26 GCATCGACTTCAAGGAGGAC 1 1 Integ NCmic3 R Integ NCmic3 R SEQ ID NO :27 TGTTTACAGGTGATCCAGAAAAGG SEQ ID NO: 27 TGTTTACAGGTGATCCAGAAAAGG Cicatrice Ncmic3(mix4) Scar Ncmic3 (mix4) g g AF3 AF3 SEQ ID NO :32 GTCATCGACCGCCGGAACTAGTAGT SEQ ID NO: 32 GTCATCGACCGCCGGAACTAGTAGT h h AF4 AF4 SEQ ID NO : 33 GCAGAGGTTCTGCGTATCTAACACGG SEQ ID NO: 33 GCAGAGGTTCTGCGTATCTAACACGG Ncmicl (mix5) Ncmicl (mix5) a at Ne mic 1 F Do mic 1 F SEQ ID NO :20 ACCCGGAGAATTATCGCCTA SEQ ID NO: 20 ACCCGGAGAATTATCGCCTA b b Ne mic 1 R Do mic 1 R SEQ ID NO :21 TTCTCCAGGCACTCACCT SEQ ID NO: 21 TTCTCCAGGCACTCACCT Validation KO 5’Ncmicl(mix6) KO validation 5'Ncmicl (mix6) m m Integ NCmicl F Integ NCmicl F SEQ ID NO :28 CCGAGCAAGTTAGCAAGTCC SEQ ID NO: 28 CCGAGCAAGTTAGCAAGTCC j j ORF CATGFP R ORF CATGFP R SEQ ID NO :25 CCGTTTGGTGGATGTCTTCT SEQ ID NO: 25 CCGTTTGGTGGATGTCTTCT Validation KO 3’Ncmicl(mix7) KO validation 3'Ncmicl (Mix 7) k k ORF CATGFP F ORF CATGFP F SEQ ID NO :26 GCATCGACTTCAAGGAGGAC SEQ ID NO: 26 GCATCGACTTCAAGGAGGAC n not Integ NCmicl R Integ NCmicl R SEQ ID NO :29 CTTGTCCGTCACATCGTTTG SEQ ID NO: 29 CTTGTCCGTCACATCGTTTG Cicatrice Ncmicl (mix8) Scar Ncmicl (mix8) e e ncmiclcrelox F B ncmiclcrelox F B SEQ ID NO :30 GGCGACATACTGCATTGGAT SEQ ID NO: 30 GGCGACATACTGCATTGGAT f f ncmiclcreloxRB ncmiclcreloxRB SEQ ID NO :31 GATCGGAGTCTGTCCCTCAA SEQ ID NO: 31 GATCGGAGTCTGTCCCTCAA

Tableau 17 : Taille attendue des amplicons (en paires de base) des différentes PCR de validation de la construction des souches KO de Neospora caninumTable 17: Expected size of the amplicons (in base pairs) of the different PCRs for validation of the construction of the KO strains of Neospora caninum

NC-1 NC-1 Neo mic3 KO Neo mic3 KO Neo ncmic3 KO loxN Neo ncmic3 KO loxN Neo ncmicl- 3 KO loxP Neo ncmicl- 3 KB loxP Neo ncmicl-3 KO 2G Neo ncmicl-3 KO 2G Ncmic3 (mixl) Ncmic3 (mixl) 850 850 - - - - - - - - Validation KO 5’Ncmic3(mix2) KO validation 5'Ncmic3 (mix2) 2960 2960 Validation KO 3’Ncmic3 (mix3) 3'Ncmic3 KO validation (Mix3) 3668 3668 Cicatrice Ncmic3 (mix4) Ncmic3 scar (mix4) 2163 2163 2575 2575 276 276 276 276 276 276 Ncmicl (mix5) Ncmicl (mix5) 701 701 701 701 701 701 - - - - Validation KO 5’Ncmicl (mix6) 5'Ncmicl KO validation (Mix6) 3359 3359 Validation KO 3’Ncmicl (mix7) 3'Ncmicl KO validation (Mix 7) 3421 3421 Cicatrice Ncmicl (mix8) Ncmicl scar (mix8) 3161 3161 3161 3161 3161 3161 2560 2560 261 261

Les électrophorèses des produits PCR réalisés avec les amorces c SEQ ID NO :22 et d SEQ ID NO :23 (mix 1) permettent de mettre en évidence une bande à 850 paires de bases pour la souche NC-1, conformément à la taille de bande attendue et confirmant la présence du gène Ncmic3 SEQ ID NO : 105 dans cette souche. Cette bande n’est pas détectée dans les souches Neo Ncmic3 KO, Neo Ncmic3 KO - 2G, Neo Ncmicl-3 KO et Neo 7Vcmicl-3 KO - 2G confirmant la suppression du gène dans ces souches.The electrophoreses of the PCR products produced with the primers c SEQ ID NO: 22 and d SEQ ID NO: 23 (mix 1) make it possible to demonstrate a band at 850 base pairs for the strain NC-1, in accordance with the size of expected band confirming the presence of the Ncmic3 gene SEQ ID NO: 105 in this strain. This band is not detected in the Neo Ncmic3 KO, Neo Ncmic3 KO - 2G, Neo Ncmicl-3 KO and Neo 7Vcmicl-3 KO - 2G strains confirming the suppression of the gene in these strains.

Les électrophorèses des produits PCR réalisés avec les amorces i SEQ ID NO :24 et j SEQ ID NO :25 et les amorces k SEQ ID NO :26 et 1 SEQ ID NO :27 (mix Ncmic3) permettent de mettre en évidence respectivement une bande à 2960 et 3668 paires de bases pour la souche Neo Ncmic3 KO, conformément à la taille de bande attendue et confirmant la présence du gène de sélection cat-gfp dans cette souche à la place du gène Ncmic3. Cette bande n’est pas détectée dans les souches NC-1, Neo Ncmic3 KO - 2G, Neo Ncmicl-3 KO et Neo Acmicl-3 KO - 2G confirmant l’absence du gène de sélection cat-gfp SEQ ID NO :2 au locus Ncmic 3 dans ces souches.The electrophoresis of the PCR products carried out with the primers i SEQ ID NO: 24 and j SEQ ID NO: 25 and the primers k SEQ ID NO: 26 and 1 SEQ ID NO: 27 (mix Ncmic3) respectively make it possible to highlight a band at 2960 and 3668 base pairs for the Neo Ncmic3 KO strain, in accordance with the expected band size and confirming the presence of the cat-gfp selection gene in this strain in place of the Ncmic3 gene. This band is not detected in the NC-1, Neo Ncmic3 KO - 2G, Neo Ncmicl-3 KO and Neo Acmicl-3 KO - 2G strains confirming the absence of the selection gene cat-gfp SEQ ID NO: 2 at Ncmic 3 locus in these strains.

Les électrophorèses des produits PCR réalisés avec les amorces amorces g SEQ ID NO :32 et h SEQ ID NO :33 (cicatrice Ncmic3) permettent de mettre en évidence différentes bandes conformément à la taille de bande attendue. Une bande à 2163 paires de bases pour la souche NC-1, confirme la présence du gène Ncmic3 SEQ ID NO : 105 dans cette souche. Une bande de 2575 paires de bases est mise en évidence pour la souche Neo Ncmic3 KO confirmant la présence de la cassette de sélection CATGFP SEQ ID NO :6 à la place du gène Ncmic3. Enfin une bande de 276 paires de bases est mise en évidence pour les souches Neo Ncmic3 KO - 2G Neo Ncmicl-3 KO et Neo Acmicl-3 KO - 2G confirmant la suppression du gène de sélection cat-gfp SEQ ID NO :2 dans ces souches, laissant une cicatrice loxN SEQ ID NO :5 dans le génome.The electrophoresis of the PCR products carried out with the primers primers g SEQ ID NO: 32 and h SEQ ID NO: 33 (scar Ncmic3) make it possible to highlight different bands in accordance with the expected band size. A band at 2163 base pairs for the strain NC-1, confirms the presence of the gene Ncmic3 SEQ ID NO: 105 in this strain. A band of 2575 base pairs is demonstrated for the Neo Ncmic3 KO strain confirming the presence of the selection cassette CATGFP SEQ ID NO: 6 in place of the Ncmic3 gene. Finally, a band of 276 base pairs is demonstrated for the Neo Ncmic3 KO - 2G strains Neo Ncmicl-3 KO and Neo Acmicl-3 KO - 2G confirming the deletion of the selection gene cat-gfp SEQ ID NO: 2 in these strains, leaving a loxN scar SEQ ID NO: 5 in the genome.

Les électrophorèses des produits PCR réalisés avec les amorces a SEQ ID NO :20 et b SEQ ID NO :21 (mix Ncmicl) permettent de mettre en évidence une bande à 644 paires de bases pour les souches NC-1, Neo Ncmic3 KO, Neo Ncmic3 KO - 2G, conformément aux tailles de bandes attendues et confirmant la présence du gène Ncmicl SEQ ID NO :106 dans ces souches. Ces bandes ne sont pas détectées dans les souches Neo Ncmicl-3 KO et Neo Acmicl-3 KO - 2G confirmant la suppression du gène dans ces souches.The electrophoresis of the PCR products carried out with the primers a SEQ ID NO: 20 and b SEQ ID NO: 21 (mix Ncmicl) make it possible to demonstrate a band at 644 base pairs for the strains NC-1, Neo Ncmic3 KO, Neo Ncmic3 KO - 2G, in accordance with the expected band sizes and confirming the presence of the Ncmicl SEQ ID NO: 106 gene in these strains. These bands are not detected in the Neo Ncmicl-3 KO and Neo Acmicl-3 KO - 2G strains confirming the suppression of the gene in these strains.

Les électrophorèses des produits PCR réalisés avec les amorces m SEQ ID NO :28 et j SEQ ID NO :25 et les amorces k SEQ ID NO :26 et n SEQ ID NO :29 (mix Ncmicl) permettent de mettre en évidence respectivement une bande à 3359 et 3421 paires de bases pour la souche Neo Ncmicl-3 KO, conformément à la taille de bande attendue et confirmant la présence du gène de sélection cat-gfp SEQ ID NO :2 dans cette souche à la place du gène Ncmicl. Cette bande n’est pas détectée dans les souches sauvage NC-1 de N. caninum, Neo Ncmic3 KO, Neo Ncmic3 KO - 2G, et Neo Ncmicl-3 KO - 2G confirmant l’absence du gène de sélection at-gfp SEQ ID NO :2 au locus Ncmic 1 dans ces souches.The electrophoresis of the PCR products carried out with the primers m SEQ ID NO: 28 and j SEQ ID NO: 25 and the primers k SEQ ID NO: 26 and n SEQ ID NO: 29 (mix Ncmicl) respectively make it possible to highlight a band at 3359 and 3421 base pairs for the Neo Ncmicl-3 KO strain, in accordance with the expected band size and confirming the presence of the cat-gfp selection gene SEQ ID NO: 2 in this strain in place of the Ncmicl gene. This band is not detected in wild-type NC-1 strains of N. caninum, Neo Ncmic3 KO, Neo Ncmic3 KO - 2G, and Neo Ncmicl-3 KO - 2G confirming the absence of the selection gene at-gfp SEQ ID NO: 2 at locus Ncmic 1 in these strains.

Les électrophorèses des produits PCR réalisés avec les amorces SEQ ID NO :30 et f SEQ ID NO :31 (cicatrice Ncmicl) permettent de mettre en évidence différentes bandes conformément à la taille de bande attendue. Une bande à 2182 paires de bases pour les souches NC-1, Neo Ncmic3 KO, Neo Ncmic3 KO - 2G confirme la présence du gène Ncmicl dans ces souches. Une bande de 2560 paires de bases est mise en évidence pour la souche Neo Ncmicl-3 KO confirmant la présence de la cassette de sélection CATGFP SEQ ID NO :6 à la place du gène Ncmicl. Enfin une bande de 261 paires de bases est mise en évidence pour la souche Neo Ncmicl-3 KO - 2G confirmant la suppression du gène de sélection cat-gfp SEQ ID NO :2 dans cette souche, laissant une cicatrice loxP SEQ ID NO : 12 dans le génome.The electrophoresis of the PCR products carried out with the primers SEQ ID NO: 30 and f SEQ ID NO: 31 (scar Ncmicl) make it possible to highlight different bands in accordance with the expected band size. A band at 2182 base pairs for the strains NC-1, Neo Ncmic3 KO, Neo Ncmic3 KO - 2G confirms the presence of the Ncmicl gene in these strains. A band of 2560 base pairs is demonstrated for the Neo Ncmicl-3 KO strain confirming the presence of the selection cassette CATGFP SEQ ID NO: 6 in place of the Ncmicl gene. Finally a band of 261 base pairs is demonstrated for the Neo Ncmicl-3 KO - 2G strain confirming the suppression of the selection gene cat-gfp SEQ ID NO: 2 in this strain, leaving a loxP scar SEQ ID NO: 12 in the genome.

Les produits PCR « cicatrice » (mix 4 et 8) ont été séquencés et les séquençages ont confirmés que :The “scar” PCR products (mix 4 and 8) were sequenced and the sequencing confirmed that:

• le gène ncmic3 SEQ ID NO : 105 a été supprimé et que la cassette de sélection CATGFP SEQ ID NO :6 a bien été supprimée par action de la Cre-Recombinase laissant une cicatrice LoxN SEQ ID NO :5 conforme à la séquence attendue (Figure 15-D).• the ncmic3 gene SEQ ID NO: 105 has been deleted and the selection cassette CATGFP SEQ ID NO: 6 has been deleted by action of Cre-Recombinase leaving a LoxN scar SEQ ID NO: 5 in accordance with the expected sequence ( Figure 15-D).

• le gène ncmicl SEQ ID NO :106 a été supprimé et que la cassette de sélection CATGFP SEQ ID NO :6 a bien été supprimée par action de la Cre-Recombinase laissant une cicatrice LoxP SEQ ID NO :12 conforme à la séquence attendue (Figure 15-D).• the ncmicl SEQ ID NO: 106 gene has been deleted and the CATGFP SEQ ID NO: 6 selection cassette has been deleted by action of Cre-Recombinase leaving a LoxP scar SEQ ID NO: 12 in accordance with the expected sequence ( Figure 15-D).

Validation de la souche Neo ncmicl-3 KO - 2Gpar immunofluorescenceValidation of the Neo ncmicl-3 KO - 2G strain by immunofluorescence

Les tachyzoïtes cultivés 24h sur lamelles en verre recouvertes d’une monocouche de cellules HFF. Les cellules infectées ont été lavés 2 fois en PBSIX, et fixés par du formaldéhyde 4% pendant 30 min. Après 3 lavages en PBS1X, les cellules HFF infectées ont été perméabilisées avec 0,1% de Triton X-100 dans du PBSIX pendant 5 min. Après 3 lavages au PBS IX, une étape de saturation est effectuée avec une solution de PBS 1X/SVF 10% pendant 30 min.. Les cellules ont ensuite été incubées avec l'anticorps primaire dilué dans 2% SVF pendant 1 heure, lavées 3 fois au PBS1X puis incubées avec un anticorps secondaire dilué dans une solution de PBS/SVF 2% pendant 1 heure. Après 2 lavages au PBS1X, les lamelles en verre sont montés sur lame avec de l’Immu-Mount™ et observés au microscope à fluorescence.The tachyzoites cultivated 24 hours on glass coverslips coated with a monolayer of HFF cells. The infected cells were washed twice with PBSIX, and fixed with 4% formaldehyde for 30 min. After 3 washes in PBS1X, the infected HFF cells were permeabilized with 0.1% Triton X-100 in PBSIX for 5 min. After 3 washes with PBS IX, a saturation step is carried out with a solution of PBS 1X / SVF 10% for 30 min. The cells were then incubated with the primary antibody diluted in 2% SVF for 1 hour, washed 3 times with PBS1X then incubated with a secondary antibody diluted in a solution of PBS / SVF 2% for 1 hour. After 2 washes with PBS1X, the glass slides are mounted on a slide with Immu-Mount ™ and observed under the fluorescence microscope.

L’anticorps primaire Tgmic3 permet une reconnaissance de la protéine Ncmic3, il permet de détecter l’expression de la protéine NcMIC3 SEQ ID NO : 118 dans le parasite (anticorps de lapin anti-mic3 : rnAb anti-MIC3 s3) et l’anticorps secondaire commercial utilisé est l’Alexa fluor® 594 chèvre anti-lapin (Life technologies réf. A-l 1012).The primary antibody Tgmic3 allows recognition of the protein Ncmic3, it makes it possible to detect the expression of the protein NcMIC3 SEQ ID NO: 118 in the parasite (rabbit anti-mic3 antibody: rnAb anti-MIC3 s3) and the antibody secondary commercial used is Alexa fluor® 594 anti-rabbit goat (Life technologies ref. Al 1012).

Les résultats montrent qu'aucune fluorescence n’est détectable au pôle apical du parasite révélant l’absence des protéines MIC3 (Figure 16-A).The results show that no fluorescence is detectable at the apical pole of the parasite revealing the absence of the MIC3 proteins (Figure 16-A).

L’anticorps primaire Tgmicl ne permet pas une reconnaissance de la protéine NcMICl SEQ IDNO : 119.The primary antibody Tgmicl does not allow recognition of the protein NcMICl SEQ IDNO: 119.

Les résultats montrent que les parasites expriment une fluorescente verte reflétant l’expression de la protéine CATGFP SEQ ID NO : 120 suite à la réalisation des délétions de gènes (Neo ncmic3 KO et Neo ncmicl-3 KO) alors qu’après action de la Cre recombinase, les souches Neo ncmic3 KO - 2G et Neo ncmicl-3 KO - 2G ne sont plus fluorescentes (suppression de de la cassette CATGFP SEQ ID NO :6) (Figure 16-B).The results show that the parasites express a green fluorescent reflecting the expression of the protein CATGFP SEQ ID NO: 120 following the completion of gene deletions (Neo ncmic3 KO and Neo ncmicl-3 KO) while after action of Cre recombinase, the Neo ncmic3 KO - 2G and Neo ncmicl-3 KO - 2G strains are no longer fluorescent (deletion of the CATGFP cassette SEQ ID NO: 6) (Figure 16-B).

Exemple 7 : Immunostimulation ex vivo de macrophages aviaires primaires ou sous lignées de macrophage de type HD11Example 7 Immunostimulation Ex Vivo of Primary Avian Macrophages or Under HD11 Type Macrophage Lines

L’objectif de cette expérimentation est de définir quel est le potentiel d’activation de cellules immunitaires de poulet par chacune de ces souches sous la forme vivante, inactivée ou d’extrait total.The objective of this experiment is to define what is the activation potential of chicken immune cells by each of these strains in the living, inactivated or total extract form.

Matériel et méthodesMaterial and methods

Cellules primaires de pouletChicken primary cells

Les splénocytes sont isolés à partir de rate de poulet de statut SPF (exempt d’agents pathogènes spécifiques) fournies directement par la plateforme d’expérimentation animale de l’INRA (PFIE, Nouzilly, France). Brièvement, les rates sont broyées sur un tamis cellulaire de porosité de 100 pm (CellStrainer, Becton Dickinson, France). Les cellules immunitaires sont isolées par gradient de densité en respectant les consignes du fabriquant (Histopaque 1119, Sigma). Elles sont ensuite lavées à trois reprises dans du milieu de culture, comptées en cytométrie en flux et diluées à 2 .106 cellules vivantes par millilitre dans du milieu de culture. Les cellules primaires de poulet sont cultivées en milieu RPMI additionné de 12% de sérum de poule (Référence commerciale 16110082, Life Technology), de 2mM glutamine, 100 U/mL de pénicilline et 100 U/mL de streptomycine.The splenocytes are isolated from chicken spleen with SPF status (free of specific pathogens) supplied directly by the INRA animal testing platform (PFIE, Nouzilly, France). Briefly, the spleens are ground on a cell sieve with a porosity of 100 μm (CellStrainer, Becton Dickinson, France). The immune cells are isolated by density gradient in accordance with the manufacturer's instructions (Histopaque 1119, Sigma). They are then washed three times in culture medium, counted in flow cytometry and diluted to 2.10 6 live cells per milliliter in culture medium. The primary chicken cells are cultured in RPMI medium supplemented with 12% hen serum (Commercial reference 16110082, Life Technology), 2mM glutamine, 100 U / mL of penicillin and 100 U / mL of streptomycin.

Les macrophages primaires de poulet sont isolés à partir de 10 mL de sang de poulet. Après dilution au tiers, le sang dilué est déposé sur un gradient de densité de 1119 (Histopaque 1119, Sigma) et centrifugé à 1200g pendant 30 minutes sans frein. L’anneau de cellules mononuclées est récupéré, lavé à trois reprises dans du milieu de culture. Les cellules immunitaires sont quantifiées en cytométrie en flux et la concentration cellulaire sera ajusté à 5.106 cellules vivantes par millilitre. Elles sont réparties à raison de 200 pL par puits dans une plaque 96 puits à fond plat (Flacon, Corning) et maintenues trois heures à 37°C. Les cellules non adhérentes sont lavées à trois reprises dans du PBS (tampon phosphate salin, 70011036, ThermoFisher Scientific). Chaque puits est complété par 200 pL de milieu de culture frais. Après 48 heures supplémentaires d’incubation à 37°C, les cellules non adhérentes et notamment les débris plaquettaires sont éliminés par deux lavages en PBS. La pureté est mesurée en cytométrie en flux en comptant le nombre de cellules portant l’antigène membranaire KUL1 (ab25441, Abcam), les macrophages obtenus dans cette expérience sont à un niveau de pureté supérieure ou égale à 92%. La lignée de macrophage de poulet HD11 est cultivée dans du milieu DMEM (11885-084, Thermofisher scientific) auquel est ajouté 5% de sérum de veau fœtal décomplémenté et 5% de sérum de poule 2mM glutamine, 100 U/mL de pénicilline et 100 U/mL de streptomycine.Primary chicken macrophages are isolated from 10 mL of chicken blood. After dilution to a third, the diluted blood is deposited on a density gradient of 1119 (Histopaque 1119, Sigma) and centrifuged at 1200g for 30 minutes without brake. The ring of mononuclear cells is recovered, washed three times in culture medium. The immune cells are quantified by flow cytometry and the cell concentration will be adjusted to 5.10 6 living cells per milliliter. They are distributed at the rate of 200 μL per well in a 96-well plate with a flat bottom (bottle, Corning) and maintained for three hours at 37 ° C. Non-adherent cells are washed three times in PBS (phosphate buffered saline, 70011036, ThermoFisher Scientific). Each well is completed with 200 μL of fresh culture medium. After an additional 48 hours of incubation at 37 ° C., the non-adherent cells and in particular the platelet debris are eliminated by two washes in PBS. Purity is measured by flow cytometry by counting the number of cells carrying the membrane antigen KUL1 (ab25441, Abcam), the macrophages obtained in this experiment are at a level of purity greater than or equal to 92%. The HD11 chicken macrophage line is cultivated in DMEM medium (11885-084, Thermofisher scientific) to which is added 5% of decomplemented fetal calf serum and 5% of 2mM glutamine hen serum, 100 U / ml of penicillin and 100 U / mL streptomycin.

Production de parasites dérivés de Toxoplasma gondii et de Neospora caninumProduction of parasites derived from Toxoplasma gondii and Neospora caninum

Les souches Toxo-KO+ , Toxo tgmic 1-3 KO 2G, Toxo KO+2G, Neo ncmic 1-3 KO 2G, Toxoplasma gondii RH et Neospora caninum NCI sont entretenues par passages successifs sur une lignée de fibroblastes de prépuce humain (HFF) cultivées dans du milieu DMEM auquel est ajouté 10% de sérum de veau fœtal (SVF), 2mM glutamine, 100 U/mL de pénicilline et 100 U/mL de streptomycine. Les tachyzoïtes extra-cellulaires obtenus après trois jours de culture sont utilisés dans cette étude. Ils sont concentrés et lavés par centrifugation à 900 g pendant 5 minutes à température ambiante. Après remise en suspension dans une solution de DMEM, les tachyzoïtes sont comptés en cytométrie en flux et leur viabilité est évaluée par la proportion du nombre de tachyzoïtes n’incorporant pas l’Iodure de Propidium (P4864-10mL, Sigma-Aldrich) par rapport au nombre de tachyzoïtes total. La viabilité des tachyzoïtes utilisés dans cette expérience est supérieure à 85% lors de l’utilisation de tachyzoïtes frais.The Toxo-KO +, Toxo tgmic 1-3 KO 2G, Toxo KO + 2G, Neo ncmic 1-3 KO 2G, Toxoplasma gondii RH and Neospora caninum NCI strains are maintained by successive passages on a line of human foreskin fibroblasts (HFF) cultured in DMEM medium to which 10% fetal calf serum (FCS), 2 mM glutamine, 100 U / ml of penicillin and 100 U / ml of streptomycin are added. The extra-cellular tachyzoites obtained after three days of culture are used in this study. They are concentrated and washed by centrifugation at 900 g for 5 minutes at room temperature. After resuspension in a DMEM solution, the tachyzoites are counted by flow cytometry and their viability is evaluated by the proportion of the number of tachyzoites not incorporating propidium iodide (P4864-10mL, Sigma-Aldrich) relative to the total number of tachyzoites. The viability of the tachyzoites used in this experiment is greater than 85% when using fresh tachyzoites.

Production des parasites inactivésProduction of inactivated parasites

Pour produire les parasites inactivés pour chacune des souches, 109 tachyzoïtes sont produits et centrifugés à 900 g pendant 5 minutes. Ils sont remis en suspension dans une solution de PBS complémentée avec 4% de formaldéhyde (Référence commerciale 252549, Sigma) et sont laissés 30 minutes à 4°C. Après quatre lavages avec du PBS, les parasites inactivés sont recomptés en cellule de Malassez et ajustés à 109 parasites par millilitre.To produce the inactivated parasites for each of the strains, 10 9 tachyzoites are produced and centrifuged at 900 g for 5 minutes. They are resuspended in a PBS solution supplemented with 4% formaldehyde (Commercial reference 252549, Sigma) and are left for 30 minutes at 4 ° C. After four washes with PBS, the inactivated parasites are recounted in the Malassez cell and adjusted to 10 9 parasites per milliliter.

Production des extraits totauxProduction of total extracts

Pour produire les extraits totaux pour chacune des lignées, 109 parasites sont produits et centrifugés à 900 g pendant 5 minutes. Ils sont remis en suspension dans de l’eau distillée dépourvue d’endotoxine (Référence commerciale 10977035, Gibco). La lyse cellulaire est effectuée par deux périodes de sonication de 10 minutes à 60W dans la glace. Les débris non solubles sont filtrés sur une membrane PVDF (polyflurorure de vinylidène) de 45 pm faible absorbance et stérile (SLHV033RS, Merck-Millipore). La quantité de protéines totales extraites est quantifiée selon la méthode BCA (dosage par l’acide bicinchronique) en respectant les consignes du fabriquant (Référence commerciale Sigma B-9643 et C-2284). Les différents extraits produits à partir des différentes souches sont standardisés à 1 mg/mL et conservés à -80°C.To produce the total extracts for each of the lines, 10 9 parasites are produced and centrifuged at 900 g for 5 minutes. They are resuspended in distilled water devoid of endotoxin (Commercial reference 10977035, Gibco). Cell lysis is carried out by two sonication periods of 10 minutes at 60W in ice. The insoluble debris is filtered on a PVDF (polyvinylidene fluoride) membrane of 45 μm low absorbance and sterile (SLHV033RS, Merck-Millipore). The quantity of total proteins extracted is quantified according to the BCA method (assay with bicinchronic acid) in accordance with the manufacturer's instructions (Commercial reference Sigma B-9643 and C-2284). The different extracts produced from the different strains are standardized to 1 mg / mL and stored at -80 ° C.

Stimulation cellulaireCell stimulation

Pour chacune des souches et des types cellulaires étudiés, les cellules sont stimulées 4h et 24h par les extraits totaux de chacune des souches produites, par les tachyzoïtes inactivés pour chacune des souches et par des tachyzoïtes frais aux doses indiquées.For each of the strains and cell types studied, the cells are stimulated for 4 hours and 24 hours by the total extracts from each of the strains produced, by the tachyzoites inactivated for each of the strains and by fresh tachyzoites at the doses indicated.

Extraction des ARN messagers et transcription inverseExtraction of messenger RNAs and reverse transcription

Après 4 ou 24 heures de stimulation, les cellules sont lysées avec le tampon de lyse cellulaireAfter 4 or 24 hours of stimulation, the cells are lysed with the cell lysis buffer

RLT+ (Qiagen), contenant une forte concentration en guanidine isothiocycanate, et les ARN messagers sont extraits en respectant strictement la procédure du Kit RNeasy micro kit plus (74034, Qiagen). Les ARNm sont quantifiés par spectrophotométrie (Nanodrop™) et dilués en eau distillée RNAse/DNAse free à une concentration de 200 ng/pL.RLT + (Qiagen), containing a high concentration of guanidine isothiocycanate, and the messenger RNAs are extracted by strictly respecting the procedure of the RNeasy micro kit plus Kit (74034, Qiagen). The mRNAs are quantified by spectrophotometry (Nanodrop ™) and diluted in RNAse / DNAse free distilled water at a concentration of 200 ng / pL.

Les ADN complémentaires sont produits en respectant les consignes du kit iScript™ Reverse Transcription Supermix (1708841, Bio-Rad) et à partir de 2 pg d’ARN messager.Complementary DNAs are produced by following the instructions in the iScript ™ Reverse Transcription Supermix kit (1708841, Bio-Rad) and from 2 pg of messenger RNA.

Mesure de l'expression cytokinaireMeasurement of cytokinary expression

L’expression de l’IL-8, l’IL-Ιβ, l’IL-6, LITAF, l’IFN-γ, l’IFN-α, l’IL-12 et la GAPDH est mesurée en RT-qPCR en respectant la méthode préconisée par le fabriquant (SsoAdvanced™ Universal SYBR® Green Supermix , 1725270, Bio-Rad). Les conditions de PCR, les primers (amorces) sont décrits dans le tableau 18 ci-dessous. L’expression de chacune des cytokines est rapportée à l’expression de la GAPDH en utilisant la méthode des courbes standard.The expression of IL-8, IL-Ιβ, IL-6, LITAF, IFN-γ, IFN-α, IL-12 and GAPDH is measured in RT-qPCR respecting the method recommended by the manufacturer (SsoAdvanced ™ Universal SYBR® Green Supermix, 1725270, Bio-Rad). The PCR conditions, the primers (primers) are described in Table 18 below. The expression of each of the cytokines is related to the expression of GAPDH using the standard curve method.

Tableau 18 : Description des amorces et conditions de PCRTable 18: Description of primers and PCR conditions

Gène Uncomfortable Primer sens Primer meaning Primer anti-sens Anti-sense primer Hybridation Hybridization GAPDH GAPDH SEQIDNO : 154 GAGATGGTGAAAGTCGGAGTC SEQIDNO: 154 GAGATGGTGAAAGTCGGAGTC SEQ ID NO : 155TTTCCCGTTCTCAGCCTTGAC SEQ ID NO: 155TTTCCCGTTCTCAGCCTTGAC 60°C 60 ° C IL12B IL12B SEQIDNO : 156 TACTTTCCTTTGCTGCCCTTCT SEQIDNO: 156 TACTTTCCTTTGCTGCCCTTCT SEQIDNO : 157 TGGTGTCTCATCGTTCCACT SEQIDNO: 157 TGGTGTCTCATCGTTCCACT 60°C 60 ° C IFN- gamma IFN- gamma SEQIDNO : 158 CTGAAGAACTGGACAGAGAGAAA SEQIDNO: 158 CTGAAGAACTGGACAGAGAGAAA SEQ ID NO : 15 9GTTTGATGTGCGGCTTTGACT SEQ ID NO: 15 9GTTTGATGTGCGGCTTTGACT 60°C 60 ° C LITAF LITAF SEQIDNO : 160 CTGTGTATGTGCAGCAACCC SEQIDNO: 160 CTGTGTATGTGCAGCAACCC SEQIDNO : 161 AACAACCAGCTATGCACCCCA SEQIDNO: 161 AACAACCAGCTATGCACCCCA 60°C 60 ° C IFNalpha IFNalpha SEQIDNO : 162 CCTTGCTCCTTAACGACA SEQIDNO: 162 CCTTGCTCCTTAACGACA SEQ ID NO : 163 CGCTGAGGATACTAGAAGAGGT SEQ ID NO: 163 CGCTGAGGATACTAGAAGAGGT 58°C 58 ° C IL-lbeta IL-lbeta SEQ ID NO : 164CTTCCTCCAGCCAGAAAGT SEQ ID NO: 164CTTCCTCCAGCCAGAAAGT SEQ ID NO : 165 CAGCGTTGTAGCCCTTGAT SEQ ID NO: 165 CAGCGTTGTAGCCCTTGAT 60°C 60 ° C IL-6 IL-6 SEQIDNO : 166 CAACCTCAACCTGCCCAA SEQIDNO: 166 CAACCTCAACCTGCCCAA SEQIDNO : 167 GGAGAGCTTCCTCAGGCATT SEQIDNO: 167 GGAGAGCTTCCTCAGGCATT 53°C 53 ° C IL-8 IL-8 SEQ ID NO : 168CTGAGGTGCCAGTGCATTAG SEQ ID NO: 168CTGAGGTGCCAGTGCATTAG SEQ ID NO : 169AGC ACACCTCTCTTCCATCC SEQ ID NO: 169AGC ACACCTCTCTTCCATCC 58°C 58 ° C IL-12a IL-12a SEQ ID NO : 170AAGACCTGAAAACCTACAAGGC SEQ ID NO: 170AAGACCTGAAAACCTACAAGGC SEQIDNO : 171 GGCTTGCATCATGTCATCAA SEQIDNO: 171 GGCTTGCATCATGTCATCAA 60°C 60 ° C

Analyse statistiqueStatistical analysis

Les analyses statistiques ont été calculées à l’aide du logiciel GraphPad Prism 7. UneThe statistical analyzes were calculated using GraphPad Prism 7 software.

ANOVA deux voies suivie d’un test post-hoc de Tukey ou de Bonferroni a été utilisée pour effectuer les comparaisons multiples en prenant en compte l’appariement des données, la durée de stimulation et le type de stimulation.Two-way ANOVA followed by a post-hoc Tukey or Bonferroni test was used to perform the multiple comparisons taking into account data matching, duration of stimulation and type of stimulation.

RésultatsResults

Expression de cytokines pro-inflammatoiresExpression of pro-inflammatory cytokines

L’expression de l’IL-8, l’IL-6, l’ZL-Ιβ et l’IFN-α reflète une réponse inflammatoire active, telle que classiquement observée lors d’une infection bactérienne, virale ou parasitaire. L’expression de ces cytokines est forte dans les cellules primaires après une stimulation de type PMA/Ionomycine utilisée ici comme contrôle positif dans les macrophages. La lignée HD 11 bien que réceptive aux stimuli pro-inflammatoires n’exprime pas ces cytokines à un haut niveau.The expression of IL-8, IL-6, ZL-Ιβ and IFN-α reflects an active inflammatory response, as conventionally observed during a bacterial, viral or parasitic infection. The expression of these cytokines is strong in primary cells after stimulation of the PMA / Ionomycin type used here as a positive control in macrophages. The HD 11 line, although receptive to pro-inflammatory stimuli, does not express these cytokines at a high level.

L’expression de chacune de ces cytokines est respectivement plus forte après stimulation par les souches vivantes de Toxo-KO+ et Toxo-KO+ 2G , telles qu’obtenues respectivement aux exemples 4 et 5, en regard des stimulations effectuées avec les souches, Toxo tgmicl-3 KO 2G, Toxoplasma gondii RH, Neospora caninum NCI et Neo ncmicl-3 KO 2G. ces différences d’expression de cytokines pro-inflammatoire entre les groupes sont plus faibles lorsque les souches sont testées sous la forme d’extraits totaux ou de parasites inactivés.The expression of each of these cytokines is respectively stronger after stimulation with the living strains of Toxo-KO + and Toxo-KO + 2G, as obtained respectively in Examples 4 and 5, compared with the stimulations carried out with the strains, Toxo tgmicl -3 KO 2G, Toxoplasma gondii RH, Neospora caninum NCI and Neo ncmicl-3 KO 2G. these differences in expression of proinflammatory cytokines between groups are smaller when the strains are tested in the form of total extracts or inactivated parasites.

Expression de cytokines pro-cytotoxiquesExpression of pro-cytotoxic cytokines

Les parasites du genre Apicomplexa, comme Toxoplasma spp. et Neospora spp., sont des parasites intracellulaires obligatoires. La réponse cytotoxique est directement en lien avec la production d’IFN-γ et d’IL-12 c’est pourquoi le niveau d’expression de ces deux cytokines a également été quantifié pour comparer la capacité d’activation du système immunitaire de chacune des souches dérivées de Toxoplasma gondii ou de Neospora caninumParasites of the genus Apicomplexa, such as Toxoplasma spp. and Neospora spp., are obligate intracellular parasites. The cytotoxic response is directly related to the production of IFN-γ and IL-12, which is why the level of expression of these two cytokines was also quantified to compare the activation capacity of the immune system of each. strains derived from Toxoplasma gondii or Neospora caninum

L’expression de l’IFN-γ et de l’ZL-12 est très augmentée par une stimulation avec de la PMA/Ionomycine qui est utilisée ici comme contrôle positif. Le niveau d’expression d’IL-12 et d’IFN-γ par les splénocytes est également élevé. En revanche, les macrophages primaires etThe expression of IFN-γ and ZL-12 is greatly increased by stimulation with PMA / Ionomycin which is used here as a positive control. The level of expression of IL-12 and IFN-γ by splenocytes is also high. In contrast, primary macrophages and

HD11 produisent peu d’IFN-γ et sont plus enclins à produire de l’IL-12.HD11 produce little IFN-γ and are more prone to produce IL-12.

Ces deux cytokines sont exprimées dans une forte mesure en réponse à une stimulation par des parasites vivants des souches Toxo-KO+ et Toxo-KO+ 2G, telles qu’obtenues respectivement aux exemples 4 et 5. Dans une moindre mesure, l’expression de ces deux cytokines est augmentée par rapport à la condition contrôle après une stimulation par les autres souches dérivées de Toxoplasma gondii et Neospora caninum, y compris les souches sauvages.These two cytokines are expressed to a large extent in response to stimulation by living parasites of the Toxo-KO + and Toxo-KO + 2G strains, as obtained respectively in Examples 4 and 5. To a lesser extent, the expression of these two cytokines is increased compared to the control condition after stimulation with other strains derived from Toxoplasma gondii and Neospora caninum, including wild strains.

Comme pour l’expression des cytokines pro-inflammatoires, la différence d’expression de l’IFN-γ et de l’IL-12 est diminuée lorsque la stimulation est effectuée avec des parasites inactivés et dans une plus forte mesure avec les extraits totaux de parasites. Néanmoins, l’expression est sensiblement plus forte en réponse à une stimulation par les souches ToxoKO+ et Toxo-KO+ 2G par rapport à une stimulation par les autres souches.As for the expression of pro-inflammatory cytokines, the difference in expression of IFN-γ and IL-12 is reduced when stimulation is carried out with inactivated parasites and to a greater extent with total extracts parasites. However, the expression is significantly stronger in response to stimulation by the ToxoKO + and Toxo-KO + 2G strains compared to stimulation by the other strains.

ConclusionConclusion

L’effet de chacune des souches sur l’activation de la réponse immunitaire est évaluée in vitro et sous la forme de tachyzoïtes vivants, de tachyzoïtes inactivés ou d’extraits totaux de parasites. Les résultats mettent en évidence une augmentation significative de l’expression des cytokines pro-inflammatoires et des cytokines favorisant la réponse cytotoxique après une stimulation par les souches Toxo-KO+ et Toxo-KO+ 2G. Cependant, chacune des souches est exploitable pour moduler l’activité du système immunitaire, soit fortement avec les souches Toxo-KO+ et Toxo-KO+ 2G, soit plus modérément avec les autres souches.The effect of each strain on the activation of the immune response is evaluated in vitro and in the form of live tachyzoites, inactivated tachyzoites or total extracts of parasites. The results show a significant increase in the expression of pro-inflammatory cytokines and cytokines promoting the cytotoxic response after stimulation with the Toxo-KO + and Toxo-KO + 2G strains. However, each of the strains can be used to modulate the activity of the immune system, either strongly with the Toxo-KO + and Toxo-KO + 2G strains, or more moderately with the other strains.

Exemple 8 : Innocuité de la souche Toxo tgmicl-3 KO rop!6 KO Gral5II Kl (notée Toxo KO +2G) inoculée par voie sous-cutanée au poussin d’un jourEXAMPLE 8 Safety of the Toxo tgmicl-3 KO rop! 6 KO Gral5II Kl strain (denoted Toxo KO + 2G) inoculated subcutaneously with the day-old chick

L’objectif de l’expérimentation est de valider l’innocuité de la souche Toxo KO +2G, telle qu’obtenue à l’exemple 5, chez la volaille nouveau-né et de vérifier que la souche Toxo KO +2G induit une réponse immunitaire.The objective of the experiment is to validate the safety of the Toxo KO + 2G strain, as obtained in Example 5, in newborn poultry and to verify that the Toxo KO + 2G strain induces a response. immune.

Matériel et méthodeMaterial and method

Production de parasites Toxo KO +2GToxo KO + 2G parasite production

La souche mutante de Toxoplasma gondii Toxo KO +2G, obtenue à l’exemple 5, est entretenue par passages successifs sur une lignée de fibroblastes de prépuce humain (HFF) cultivées dans du milieu DMEM auquel est ajouté du sérum de veau fœtal 10%, 2mM glutamine, 100 U/mL de pénicilline et 100 U/mL de streptomycine.The mutant strain of Toxoplasma gondii Toxo KO + 2G, obtained in Example 5, is maintained by successive passages on a line of human foreskin fibroblasts (HFF) cultured in DMEM medium to which is added 10% fetal calf serum, 2mM glutamine, 100 U / mL of penicillin and 100 U / mL of streptomycin.

AnimauxAnimals

Cent poussins de 1 jour ont été inclus dans l’étude.One hundred 1-day-old chicks were included in the study.

Les poussins ont été divisés en 4 lots distincts:The chicks were divided into 4 separate lots:

o Lot A : composé de 25 poussins immunostimulés avec 1.103 tachyzoïtes de la souche Toxo KO +2G à un jour d’âge, o Lot B : composé de 25 poussins immunostimulés avec 1.104 tachyzoïtes de la souche Toxo KO +2G à un jour d’âge, o Lot C : composé de 25 poussins immunostimulés avec 1.105 tachyzoïtes de la souche Toxo KO +2G à un jour d’âge, o Lot D : composé de 25 poussins contrôle inoculés avec du PBS à un jour d’âge.o Lot A: composed of 25 immunostimulated chicks with 1.10 3 tachyzoites of the Toxo KO + 2G strain at one day of age, o Lot B: composed of 25 immunostimulated chicks with 1.10 4 tachyzoites of the Toxo KO + 2G strain at one day of age, o Lot C: composed of 25 immunostimulated chicks with 1.10 5 tachyzoites of the Toxo KO + 2G strain at one day of age, o Lot D: composed of 25 control chicks inoculated with PBS at one day of age .

L’ensemble des injections ont été réalisés par voie sous-cutanée à la base du cou dans un volume de 100pL.All of the injections were made subcutaneously at the base of the neck in a volume of 100 µL.

L’ensemble des animaux est sacrifié 28 jours après le début de l’expérimentation.All the animals are sacrificed 28 days after the start of the experiment.

RésultatsResults

Aucun signe clinique n’a été observé au cours de l’expérimentation et le gain de poids des poussins immunostimulés est globalement similaire au gain de poids des poussins contrôles, quel que soit la dose d’immunostimulant.No clinical signs were observed during the experiment and the weight gain of the immunostimulated chicks is generally similar to the weight gain of the control chicks, regardless of the dose of immunostimulant.

Exemple 9 : Innocuité de la souche Toxo tgmicl-3 KO rop!6 KO Gral5II Kl (notée Toxo KO + 2G) inoculée par voie sous-cutanée au poussin d’un jour ou par voie in ovo dans le liquide amniotique ou dans l’embryonEXAMPLE 9 Safety of the Toxo tgmicl-3 KO rop! 6 KO Gral5II Kl strain (denoted Toxo KO + 2G) inoculated subcutaneously with the day-old chick or by in ovo route in the amniotic fluid or in the embryo

L’objectif de l’expérimentation est de valider l’innocuité de la souche Toxo KO +2G chez le poulet de chair, telle qu’obtenue à l’exemple 5, chez la volaille nouveau-né et de vérifier que la souche Toxo KO +2G induit une réponse immunitaire après inoculation par voie in-ovo ou sous-cutanée.The objective of the experiment is to validate the safety of the Toxo KO + 2G strain in broiler chicken, as obtained in Example 5, in newborn poultry and to verify that the Toxo KO strain + 2G induces an immune response after inoculation by the in-ovo or subcutaneous route.

Matériel et méthodesMaterial and methods

Production de parasites Toxo KO + 2GToxo KO + 2G parasite production

La souche mutante de Toxoplasma gondii Toxo KO + 2G, telle qu’obtenue à l’exemple 5, est entretenue par passage successifs sur une lignée de fibroblastes de prépuce humain (HFF) cultivées dans du milieu DMEM auquel est ajouté du sérum de veau fœtal 10%, 2mM glutamine, 100 U/mL de pénicilline et 100 U/mL de streptomycine.The mutant strain of Toxoplasma gondii Toxo KO + 2G, as obtained in Example 5, is maintained by successive passage over a line of human foreskin fibroblasts (HFF) cultivated in DMEM medium to which fetal calf serum is added. 10%, 2mM glutamine, 100 U / mL of penicillin and 100 U / mL of streptomycin.

AnimauxAnimals

Trois-cents poussins ont été inclus dans l’étude.Three hundred chicks were included in the study.

Les poussins ont été divisés en 12 lots distincts :The chicks were divided into 12 separate lots:

o Lot A : composé de 25 poussins immunostimulés avec 1.103 tachyzoïtes de la souche Toxo KO + 2G par voie in ovo trois jours avant éclosion (liquide amniotique), o Lot B : composé de 25 poussins immunostimulés avec 1.104 tachyzoïtes de la souche Toxo KO + 2G par voie in ovo trois jours avant éclosion (liquide amniotique), o Lot C : composé de 25 poussins immunostimulés avec 1.105 tachyzoïtes de la souche Toxo KO + 2G par voie in ovo trois jours avant éclosion (liquide amniotique), o Lot D : composé de 25 poussins immunostimulés avec 1.103 tachyzoïtes de la souche Toxo KO + 2G par voie in ovo deux jours avant éclosion (embryon), o Lot E : composé de 25 poussins immunostimulés avec 1.104 tachyzoïtes de la soucheo Lot A: composed of 25 immunostimulated chicks with 1.10 3 tachyzoites of the Toxo KO + 2G strain by in ovo route three days before hatching (amniotic fluid), o Lot B: composed of 25 immunostimulated chicks with 1.10 4 tachyzoites of the Toxo strain KO + 2G by in ovo route three days before hatching (amniotic fluid), o Lot C: composed of 25 immunostimulated chicks with 1.10 5 tachyzoites of the Toxo KO + 2G route by in ovo route three days before hatching (amniotic fluid), o Lot D: composed of 25 immunostimulated chicks with 1.10 3 tachyzoites of the Toxo KO + 2G strain by in ovo route two days before hatching (embryo), o Lot E: composed of 25 immunostimulated chicks with 1.10 4 tachyzoites of the strain

Toxo KO + 2G par voie in ovo deux jours avant éclosion (embryon), o Lot F : composé de 25 poussins immunostimulés avec 1.105 tachyzoïtes de la soucheToxo KO + 2G by in ovo route two days before hatching (embryo), o Lot F: composed of 25 immunostimulated chicks with 1.10 5 tachyzoites of the strain

Toxo KO + 2G par voie in ovo deux jours avant éclosion (embryon), o Lot G : composé de 25 poussins immunostimulés avec 1.104 tachyzoïtes de la soucheToxo KO + 2G by in ovo route two days before hatching (embryo), o Lot G: composed of 25 immunostimulated chicks with 1.10 4 tachyzoites of the strain

Toxo KO + 2G par voie sous-cutanée une journée après éclosion, o Lot H : composé de 25 poussins immunostimulés avec 1.105 tachyzoïtes de la souche Toxo KO + 2G par voie sous-cutanée une journée après éclosion o Lot I : composé de 25 poussins immunostimulés avec 1.106 tachyzoïtes de la souche Toxo KO + 2G par voie sous-cutanée une journée après éclosion.Toxo KO + 2G subcutaneously one day after hatching, o Lot H: composed of 25 chicks immunostimulated with 1.10 5 tachyzoites of the Toxo KO + 2G strain subcutaneously one day after hatching o Lot I: composed of 25 immunostimulated chicks with 1.10 6 tachyzoites of the Toxo KO + 2G strain subcutaneously one day after hatching.

o Lot J : composé de 25 poussins contrôle inoculés avec 50 pL de DMEM par voie in ovo trois jours avant éclosion (liquide amniotique),, o Lot K : composé de 25 poussins contrôle inoculés avec 50 pL de DMEM par voie in ovo deux jours avant éclosion (embryon), o Lot L : composé de 25 poussins contrôle inoculés avec 200 pL de DMEM par voie sous-cutanée une journée après éclosion.o Lot J: composed of 25 control chicks inoculated with 50 pL of DMEM by in ovo route three days before hatching (amniotic fluid), o Lot K: composed of 25 control chicks inoculated with 50 pL of DMEM by in ovo route two days before hatching (embryo), o Lot L: composed of 25 control chicks inoculated with 200 μL of DMEM subcutaneously one day after hatching.

Chaque semaine, 5 animaux par groupe sont sacrifiés pour étudier la cinétique d’apparition des anticorps.Each week, 5 animals per group are sacrificed to study the kinetics of appearance of antibodies.

RésultatsResults

Effet clinique et mortalitéClinical effect and mortality

Quel que soit la dose et la voie d’inoculation testée, aucune mortalité ou effet clinique spécifique n’a été observé en comparaison avec les groupes contrôles respectifs. Après autopsie, aucune évidence de lésion aiguë ou chronique n’a été observée sur les animaux sacrifiés entre 2 et 27 jours post-immunostimulation, soit pendant toute la durée de l’expérimentation. Ces résultats suggèrent l’absence d’un effet toxique majeur de ToxoKO+ 2G lorsqu’utilisé à des doses comprises entre 103 et 105 tachyzoïtes par animal injectés in ovo ou entre 104 et 106 tachyzoïtes par animal injectés par voie sous-cutanée.Whatever the dose and the route of inoculation tested, no mortality or specific clinical effect was observed in comparison with the respective control groups. After autopsy, no evidence of acute or chronic lesion was observed in animals sacrificed between 2 and 27 days post-immunostimulation, that is, throughout the duration of the experiment. These results suggest the absence of a major toxic effect of ToxoKO + 2G when used at doses between 10 3 and 10 5 tachyzoites per animal injected in ovo or between 10 4 and 10 6 tachyzoites per animal injected subcutaneously .

Croissance des animauxAnimal growth

La croissance des animaux contrôles, ayant reçu seulement du DMEM (groupe J, K, L) par voie in ovo ou sous-cutanée est conforme aux attentes et similaire entre les trois groupes testés ce qui suggère une bonne homogénéité des conditions d’élevage entre les différentes unités de confinement.The growth of the control animals, having received only DMEM (group J, K, L) by in ovo or subcutaneous route is in line with expectations and similar between the three groups tested, which suggests a good homogeneity of the breeding conditions between the various containment units.

La moyenne du poids des animaux au moment de l’abattage dans les groupes immunostimulés est significativement inférieure aux moyennes observées dans les groupes contrôles respectifs (figures 17 A-C). Cette diminution du poids est observée de manière intermittente entre JT 1 et J27 quel que soit la dose employée. De plus, pour une même voie d’inoculation, les différences de moyennes de poids au cours de l’expérimentation sont faibles ce qui suggère que la dose aurait un impact mineur sur la perte de poids induite par Toxo-KO+ 2G. De la même manière, la voie d’inoculation n’influence pas ou peu ce profil différentiel de croissance.The mean weight of the animals at the time of slaughter in the immunostimulated groups is significantly lower than the means observed in the respective control groups (Figures 17 A-C). This decrease in weight is observed intermittently between DT 1 and D27 regardless of the dose used. In addition, for the same route of inoculation, the differences in mean weight during the experiment are small, which suggests that the dose would have a minor impact on the weight loss induced by Toxo-KO + 2G. Similarly, the route of inoculation has little or no influence on this differential growth profile.

Pris dans leurs ensembles, ces résultats suggèrent que Toxo-KO+ 2G induit une diminution faible mais significative du poids des animaux quel que soit la voie d’inoculation et la dose testée.Taken as a whole, these results suggest that Toxo-KO + 2G induces a small but significant reduction in the weight of the animals whatever the route of inoculation and the dose tested.

Influence sur la réponse immunitaireInfluence on the immune response

L’effet de Toxo-KO+ 2G sur l’activation de la réponse immunitaire a été évalué par la quantification de la réponse humorale dirigée contre Toxo-KO+ 2G (figures 18 A-C). La présence d’anticorps anti-Toxo-KO+ 2G reflète une activation nécessairement aboutie du système immunitaire. La production d’anticorps spécifique ne peut apparaître qu’après une activation de cellules du système immunitaire innée, comme certaines cellules présentatrices d‘antigène, des lymphocytes T CD4 helper et une activation puis une maturation des lymphocytes B. Ces derniers pour produire des anticorps de type IgY (IgG chez le poulet) ont nécessairement commuté de classe et ont donc ainsi été pleinement activés.The effect of Toxo-KO + 2G on the activation of the immune response was evaluated by the quantification of the humoral response directed against Toxo-KO + 2G (Figures 18 A-C). The presence of anti-Toxo-KO + 2G antibodies reflects a necessarily successful activation of the immune system. The production of specific antibodies can only appear after activation of cells of the innate immune system, such as certain antigen-presenting cells, CD4 helper T lymphocytes and activation and then maturation of B lymphocytes. The latter to produce antibodies IgY type (IgG in chicken) necessarily switched class and were therefore fully activated.

Les anticorps de sous classe IgY dirigés contre Toxo-KO+ 2G sont exprimés dès 20 jours post-éclosion quel que soit les groupes immunostimulés considérés. A J28, on observe un effet dose dépendant clair et significatif, démontrant qu’une dose faible active moins fortement le système immunitaire qu’une dose forte (figures 18 A-C). Le titre maximal en anticorps a été observé dans le groupe immunostimulé par voie sous-cutanée à dose de 106 tachyzoïtes par animal. Néanmoins, à dose égale, les titres en anticorps dans les groupes immunisés par voie sous-cutanée sont globalement plus faibles que ceux observés dans les groupes immunisés par voie in ovo (figures 18 A-C). L’immunisation par voie in ovo dans le liquide amniotique montre une meilleure efficacité sur l’activation de la réponse immunitaire, notamment à dose de 105 tachyzoïtes par animal (figures 18 A-C). Ces résultats montrent que l’inoculation de Toxo-KO+ 2G induit une activation dose dépendante de la réponse immunitaire quel que soit la voie d’inoculation testée.Antibodies of the IgY subclass directed against Toxo-KO + 2G are expressed from 20 days post-hatching whatever the immunostimulated groups considered. On D28, a clear and significant dose dependent effect is observed, demonstrating that a weak dose activates the immune system less strongly than a strong dose (FIGS. 18 AC). The maximum antibody titer was observed in the immunostimulated subcutaneous group at a dose of 10 6 tachyzoites per animal. Nevertheless, at equal dose, the antibody titers in the groups immunized by subcutaneous route are overall lower than those observed in the groups immunized by in ovo route (FIGS. 18 AC). Immunization by the ovo route in amniotic fluid shows better efficacy in activating the immune response, in particular at a dose of 10 5 tachyzoites per animal (FIGS. 18 AC). These results show that the inoculation of Toxo-KO + 2G induces a dose-dependent activation of the immune response whatever the route of inoculation tested.

ConclusionConclusion

L’effet d’une inoculation par voie in ovo ou sous-cutanée de Toxo-KO+ 2G a été évalué chez le poulet. De manière dose dépendante, un effet activateur de la réponse immunitaire de Toxo-KO+ 2G a été mis en évidence quel que soit les voies d’inoculation testées. Aux différentes doses et voies d’inoculation testées, une faible diminution de la croissance a été observée après immunostimulation. Cette diminution du poids ne s’accompagne pas d’une toxicité aiguë ou chronique visible macroscopiquement sur l’animal vivant ou après autopsie.The effect of an in ovo or subcutaneous inoculation with Toxo-KO + 2G has been evaluated in chicken. In a dose-dependent manner, an activating effect on the immune response of Toxo-KO + 2G was demonstrated regardless of the inoculation routes tested. At the various doses and inoculation routes tested, a slight decrease in growth was observed after immunostimulation. This reduction in weight is not accompanied by acute or chronic toxicity visible macroscopically on the live animal or after autopsy.

Pris ensemble, ces résultats montrent que l’inoculation de Toxo-KO+ 2G active la réponse immunitaire et que la dose maximale admissible en l’absence de manifestation clinique apparente est de 106 tachyzoïtes par animal.Taken together, these results show that the inoculation of Toxo-KO + 2G activates the immune response and that the maximum admissible dose in the absence of any apparent clinical manifestation is 10 6 tachyzoites per animal.

Exemple 10 : Efficacité de la souche Toxo tgmicl-3 KO roplô KO Gral5II Kl (notée Toxo KO + 2G) dans la prévention de la coccidiose aviaireEXAMPLE 10 Efficacy of the Toxo tgmicl-3 KO roplô KO Gral5II Kl strain (denoted Toxo KO + 2G) in the prevention of avian coccidiosis

Matériel et méthodeMaterial and method

Production de parasites Toxo KO+ 2GToxo KO + 2G parasite production

La souche mutante de Toxo KO+ 2G telle qu’obtenue à l’exemple 5est entretenue par passage successifs sur une lignée de fibroblastes de prépuce humain (HFF) cultivées dans du milieu DMEM auquel est ajouté du sérum de veau fœtal 10%, 2mM glutamine, lOOU/mL de pénicilline et lOOU/mL de streptomycine. Les tachyzoïtes ont été concentrés et lavés par centrifugation à 900G pendant 5 minutes à température ambiante. Après remise en suspension dans une solution de DMEM, ils ont été comptés en cellule de Malassez et dilués soit à 1.104, soit à 1.106 tachyzoïtes par millilitre. Leur viabilité a été évalué en cytométrie en flux (MACS Quant 10, Miltenyi) et a été calculée comme étant la fréquence du nombre de tachyzoïtes n’incorporant pas Tiodure de propidium (référence commerciale P4864-10ML, Sigma79The mutant strain of Toxo KO + 2G as obtained in Example 5 is maintained by successive passage over a line of human foreskin fibroblasts (HFF) cultivated in DMEM medium to which is added 10% fetal calf serum, 2mM glutamine, lOOU / mL penicillin and lOOU / mL streptomycin. The tachyzoites were concentrated and washed by centrifugation at 900 G for 5 minutes at room temperature. After resuspension in a DMEM solution, they were counted in a Malassez cell and diluted either to 1.10 4 or to 1.10 6 tachyzoites per milliliter. Their viability was assessed by flow cytometry (MACS Quant 10, Miltenyi) and was calculated as the frequency of the number of tachyzoites not incorporating propidium iodide (commercial reference P4864-10ML, Sigma79

Aldrich) par rapport au nombre de tachyzoïtes total. La viabilité des tachyzoïtes est supérieure à 82%.Aldrich) relative to the total number of tachyzoites. The viability of the tachyzoites is greater than 82%.

Production d’Eimeria acervulinaProduction of Eimeria acervulina

La souche d’Eimeria acervulina utilisée dans cette étude provient d’un élevage Français. Les parasites ont été amplifiés par des passages successifs sur des poulets SPF (Exempt d’agents pathogènes spécifiques) Les oocystes d’E. acervulina ont été purifiés à partir de fèces provenant de poulets infectés 5 jours auparavant.The strain of Eimeria acervulina used in this study comes from a French farm. The parasites were amplified by successive passages on chickens SPF (Free of specific pathogens) Oocysts of E. acervulina were purified from faeces from infected chickens 5 days ago.

Comme décrit dans de précédents travaux (Cloning and expression of cDNA encoding an Eimeria acervulina 70 kDa sporozoite protein which is related to the 70 kDa heat-shock protein family. Laurent F. et al., Mol Biochem Parasitol. 1994 Aug;66(2):349-52) (Effects of whole wheat feeding on the development of coccidian infection in broiler chickens. Gabriel I, et al., Poult Sci. 2003 Nov;82(l 1):1668-76), la purification fait intervenir un processus de flottaison dans une solution de sulfate de magnésium, des lavages dans l’eau et une décontamination à l’eau de javel. Après purification les oocystes sont conservés dans une solution de PBS stérile à 4°C. Les animaux ont été inoculés per os avec 2.105 oocystes sporulés préalablement dilués dans 0.5mL d’eau de boisson stérile.As described in previous work (Cloning and expression of cDNA encoding an Eimeria acervulina 70 kDa sporozoite protein which is related to the 70 kDa heat-shock protein family. Laurent F. et al., Mol Biochem Parasitol. 1994 Aug; 66 (2 ): 349-52) (Effects of whole wheat feeding on the development of coccidian infection in broiler chickens. Gabriel I, et al., Poult Sci. 2003 Nov; 82 (l 1): 1668-76), the purification involves a process of flotation in a solution of magnesium sulfate, washes in water and decontamination with bleach. After purification, the oocysts are stored in a sterile PBS solution at 4 ° C. The animals were inoculated per os with 2.10 5 sporulated oocysts previously diluted in 0.5 ml of sterile drinking water.

AnimauxAnimals

263 poussins de race ROSS PM3 de 1 jour ont été acheté au couvoir Boyé-accouvage (La Boissière-en-Gâtine, France). Les animaux ont été hébergés dans une salle de confinement de classe II263 1-day-old ROSS PM3 chicks were purchased from the Boyé-accouvage hatchery (La Boissière-en-Gâtine, France). The animals were housed in a class II containment room

Les animaux ont ensuite été répartis dans différents groupes présentés dans le tableau 19 cidessous. Au jour 1 de l’expérimentation, les poussins ont été immunostimulés par 1(P (Dose 1) ou 10$ (Dose 2) tachyzoïtes de Toxo KO+ 2Gfrais administrés par voie sous-cutanée. Les animaux contrôles ont reçu un volume équivalent de DMEM. A 7 ou 14 jours post éclosion, les animaux ont été infectés par 2.10^ oocystes d’Eimeria acervulina per os. Une solution d’eau de boisson stérile a été administrée aux groupes contrôles.The animals were then divided into different groups presented in Table 19 below. On day 1 of the experiment, the chicks were immunostimulated by 1 (P (Dose 1) or 10 $ (Dose 2) tachyzoites of Toxo KO + 2G Fees administered subcutaneously The control animals received an equivalent volume of DMEM At 7 or 14 days after hatching, the animals were infected with 2 × 10 oocysts of Eimeria acervulina per os. A solution of sterile drinking water was administered to the control groups.

Tableau 19 : Répartition des animaux et description des groupesTable 19: Distribution of animals and description of the groups

Nom du groupe Name of the group A AT B B C VS D D E E F F G G H H I I Immunostimulation immunostimulatory ”” "" Dose 1 Dose 1 Dose 2 Dose 2 ”” "" Dose 1 Dose 1 Dose 2 Dose 2 ”” "" Dose 1 Dose 1 Dose 2 Dose 2 Infection Infection ““ "" ““ "" ““ "" Infection E. acervulina J7 E. acervulina infection J7 Infection E. acervulina J14 E. acervulina infection J14 Nombre d’animaux n= Number of animals n = 22 22 22 22 22 22 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 25 Sacrifice J14 Sacrifice J14 6 6 6 6 6 6 15 15 15 15 15 15 Sacrifice J21 Sacrifice J21 6 6 6 6 6 6 15 15 15 15 15 15 Sacrifice J35 Sacrifice J35 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10 10

Le poids de chaque individu a été mesuré trois fois par semaine. Une semaine après chaque temps d’infection, J7 ou J14, 15 à 18 animaux par groupe ont été sacrifiés et un score macroscopique de lésion des anses duodénales a été attribué.The weight of each individual was measured three times a week. One week after each infection time, D7 or D14, 15 to 18 animals per group were sacrificed and a macroscopic score for lesion of the duodenal handles was assigned.

RésultatsResults

Prise de poidsWeight gain

Une diminution de la prise de poids des animaux non-immunostimulés de 24.20% et 36.33% a été observés après infection par Eimeria acervulina à J7 ou à J14 respectivement ( *, p < 0.05, figure 19).A decrease in weight gain in non-immunostimulated animals by 24.20% and 36.33% was observed after infection with Eimeria acervulina on D7 or D14 respectively (*, p <0.05, Figure 19).

Pour les animaux infectés à J7, l’immunostimulation à 103 ou 105 tachyzoïtes/animal a un effet modéré et non statistiquement significatif sur la perte de poids induite par Eimeria acervulina (ns, p > 0.05, figure 19) et sur la vitesse de croissance des animaux (p>0.05, figure 19 E).For animals infected on D7, immunostimulation at 10 3 or 10 5 tachyzoites / animal has a moderate and not statistically significant effect on the weight loss induced by Eimeria acervulina (ns, p> 0.05, FIG. 19) and on the speed growth rate of animals (p> 0.05, Figure 19E).

Pour les animaux infectés à J14 à la dose 103 tachyzoïtes par animal, une augmentation non significative du poids, atteignant 13.5% à J35, a été observée (ns, p > 0.05, figure 19 D) par rapport au groupe contrôle (DMEM). Les animaux immunostimulés à la dose de 105 ont présenté une forte augmentation significative du poids à partir de J28 (*, p < 0.05, figure 19 D), atteignant 29.4% d’augmentation à J35 (****, p < 0.001, figure 19 D) par rapport aux animaux contrôles infectés. Une différence significative de poids et de croissance est clairement observable à J35 entre les groupes. En effet, à J35, le poids des animaux immunostimulés à 105 tachyzoïtes est augmenté significativement de 13.78% par rapport à celui des animaux immunostimulés à 103 tachyzoïtes (*, p < 0.05).For the animals infected on D14 at the dose 10 3 tachyzoites per animal, a non-significant increase in weight, reaching 13.5% on D35, was observed (ns, p> 0.05, FIG. 19 D) compared to the control group (DMEM) . The immunostimulated animals at a dose of 10 5 showed a significant significant increase in weight from D28 (*, p <0.05, FIG. 19 D), reaching a 29.4% increase on D35 (****, p <0.001 , Figure 19 D) compared to infected control animals. A significant difference in weight and growth is clearly observable at D35 between the groups. Indeed, at D35, the weight of animals immunostimulated with 10 5 tachyzoites is significantly increased by 13.78% compared to that of animals immunostimulated with 10 3 tachyzoites (*, p <0.05).

La perte de poids enregistrée dans le groupe immunostimulé à 105 tachyzoïtes est seulement de 17.46%, soit une efficacité relative de 51.9%. Dès J21, cette amélioration clinique s’accompagne d’une augmentation significative du gain quotidien moyen qui est plus directement lié à l’état général de l’animal (figure 19 E-F). L’infection à J14 a provoqué une perte de gain quotidien moyen de 54.60% à J30 en l’absence d’immunostimulation et de seulement de 22.05% chez les animaux immunostimulés, soit une efficacité relative de 59.60% (données non présentées). Ces données montrent un meilleur état clinique des animaux immunostimulés par rapport aux animaux contrôles.The weight loss recorded in the immunostimulated 10 5 tachyzoite group is only 17.46%, or a relative efficiency of 51.9%. As of D21, this clinical improvement is accompanied by a significant increase in the average daily gain which is more directly linked to the general condition of the animal (Figure 19 EF). Infection on D14 caused an average daily gain loss of 54.60% on D30 in the absence of immunostimulation and only 22.05% in immunostimulated animals, ie a relative efficacy of 59.60% (data not shown). These data show a better clinical state of the immunostimulated animals compared to the control animals.

Score de lésionsLesion score

Sur la figure 20 est représenté le score de lésion obtenu pour chacun des groupes. La sévérité lésionnelle de l’infection semble supérieure chez les animaux infectés à J14 vis-à-vis des animaux infectés à J7. Aux deux doses testées et aux deux temps testés, il n’y a pas de différence significative entre les groupes immunostimulés et contrôles (figure 20).In Figure 20 is shown the injury score obtained for each of the groups. The lesional severity of the infection appears to be higher in animals infected on D14 compared to animals infected on D7. At the two doses tested and at the two times tested, there was no significant difference between the immunostimulated and control groups (FIG. 20).

Analyse de la réponse immunitaireImmune response analysis

L’objectif d’une immunostimulation est d’introduire un biais dans la réponse naturelle de l’organisme hôte pour maximiser une réponse de type inflammatoire, humorale ou cellulaire dirigée contre un agent infectieux tierce, ici, Eimeria acervulina.The objective of immunostimulation is to introduce a bias into the natural response of the host organism to maximize an inflammatory, humoral or cellular response directed against a third infectious agent, here, Eimeria acervulina.

La réponse humorale dirigée contre Eimeria acervulina (tachyzoïtes) a été estimée par le dosage des anticorps de sous-classe IgY (IgG) dans le sérum. Les anticorps de type IgY antiEimeria sont détectables à partir 28 jours post-infection. Les titres obtenus chez les animaux préservés jusqu’à J35 sont présentés figure 21. Aucune différence entre les groupes n’a été observée chez les animaux infectés à J7. De plus, le titre en anticorps chez les animaux infectés à J14 n’est pas augmenté par l’immunostimulation. L’efficacité du produit n’est donc pas liée à une réponse de type humorale.The humoral response directed against Eimeria acervulina (tachyzoites) was estimated by the assay of antibodies of subclass IgY (IgG) in the serum. Antibodies of the IgY antiEimeria type are detectable from 28 days post-infection. The titers obtained in the animals preserved until D35 are presented in FIG. 21. No difference between the groups was observed in the animals infected on D7. In addition, the antibody titer in animals infected on D14 is not increased by immunostimulation. The effectiveness of the product is therefore not linked to a humoral response.

La réponse immunitaire dirigée contre Toxo KO+ 2Ga été évaluée pour confirmer une activation d’une réponse immunitaire induite par l’administration de la dose immunostimulante. Comme attendu, les titres en anticorps sont presque nuis avant J21. Pour les animaux sacrifiés à J21 et à J35 on observe une production d’anticorps dépendant de la dose et de la durée post-Immunostimulation (figure 21). Cet effet dose et le titre en anticorps dirigés contre Toxo KO+ 2G ne sont pas pas être affectés par l’inoculation d’Eimeria acervulina.The immune response against Toxo KO + 2G has been evaluated to confirm an activation of an immune response induced by the administration of the immunostimulatory dose. As expected, the antibody titers are almost damaged before D21. For the animals sacrificed on D21 and D35, the production of antibodies depends on the dose and on the duration of post-immunostimulation (FIG. 21). This dose effect and the antibody titer directed against Toxo KO + 2G are not affected by inoculation with Eimeria acervulina.

ConclusionConclusion

Le but de cette expérimentation était de vérifier si une immunostimulation de poussin à l’âge de 1 jour permettait d’améliorer l’état clinique et la performance des animaux soumis à une infection expérimentale par Eimeria acervulina, un des agents de la coccidiose aviaire pris ici comme exemple d’agent parasitaire. Les résultats ont clairement mis en évidence une réduction significative et forte de la perte de poids observés lors d’un épisode expérimental de coccidiose aviaire. La stratégie par immunostimulation n’étant pas spécifique d’un pathogène donné, des résultats similaires peuvent être obtenus avec la souche Toxo-KO+ 2G vis-à-vis d’autres agents parasitaires.The aim of this experiment was to verify whether immunostimulation of chicks at 1 day of age made it possible to improve the clinical condition and performance of animals subjected to an experimental infection with Eimeria acervulina, one of the agents of avian coccidiosis taken here as an example of a parasitic agent. The results clearly demonstrated a significant and significant reduction in weight loss observed during an experimental episode of avian coccidiosis. Since the immunostimulation strategy is not specific to a given pathogen, similar results can be obtained with the Toxo-KO + 2G strain vis-à-vis other parasitic agents.

Exemple 11 : Efficacité de la souche Toxo tgmicl-3 KO roplôKO Gral5IIKI (notée Toxo KO +2G) vis-à-vis de du portage de Salmonella enteritidis chez la pouleEXAMPLE 11 Efficacy of the Toxo tgmicl-3 KO strain roplôKO Gral5IIKI (denoted Toxo KO + 2G) with regard to the carrying of Salmonella enteritidis in hens

L’objectif de cette expérimentation est de déterminer si l’immunostimulation par la souche Toxo KO +2G permet de limiter le portage intestinal et la dissémination systémique de Salmonella enteritidis chez la poule.The objective of this experiment is to determine whether immunostimulation with the Toxo KO + 2G strain makes it possible to limit intestinal carriage and the systemic spread of Salmonella enteritidis in chickens.

Matériel et méthodeMaterial and method

Production de parasites Toxo KO +2GToxo KO + 2G parasite production

La souche Toxo KO +2G, obtenue à l’exemple 5, est entretenue par passages successifs sur une lignée de fibroblastes de prépuce humain (HFF) cultivées dans du milieu DMEM auquel est ajouté du sérum de veau fœtal décomplémenté 10%, 2mM glutamine, 100 U/mL de pénicilline et 100 U/mL de streptomycine.Les tachyzoïtes ont été concentrés et lavés par centrifugation à 900 g pendant 5 minutes à température ambiante. Après remise en suspension dans une solution de DMEM, ils ont été comptés en cellule de Malassez et dilués à 1.106 tachyzoïtes par millilitre. Leur viabilité a été évalué en cytométrie en flux (MACS Quant 10, Miltenyi) et a été calculée comme étant la fréquence du nombre de tachyzoïtes n’incorporant pas l’Iodure de Propidium (P4864-10ML, Sigma-Aldrich) par rapport au nombre de tachyzoïtes total. La viabilité des tachyzoïtes utilisés dans cette expérience est de 87.2% pour la tachyzoïtes utilisés en frais et 86.3% pour la tachyzoïtes destinés à la lyophilisation.The Toxo KO + 2G strain, obtained in Example 5, is maintained by successive passages on a line of human foreskin fibroblasts (HFF) cultivated in DMEM medium to which is added 10% decomplemented fetal calf serum, 2mM glutamine, 100 U / mL of penicillin and 100 U / mL of streptomycin. The tachyzoites were concentrated and washed by centrifugation at 900 g for 5 minutes at room temperature. After resuspension in a DMEM solution, they were counted in a Malassez cell and diluted to 1.10 6 tachyzoites per milliliter. Their viability was evaluated by flow cytometry (MACS Quant 10, Miltenyi) and was calculated as the frequency of the number of tachyzoites not incorporating Propidium iodide (P4864-10ML, Sigma-Aldrich) compared to the number of total tachyzoites. The viability of the tachyzoites used in this experiment is 87.2% for the tachyzoites used fresh and 86.3% for the tachyzoites intended for lyophilization.

Une fois la lyophilisation terminée, les vials ont été bouchés sous vide, avant d’être remise à pression atmosphérique. Les vials ont ensuite été scellés via l’ajout d’une capsule en aluminium, puis conservés à +4°C jusqu’au jour des immunisations.After freeze-drying, the vials were sealed in vacuo before being returned to atmospheric pressure. The vials were then sealed via the addition of an aluminum capsule, then stored at + 4 ° C until the day of immunizations.

Production de la souche bactérienne de Salmonella enteritidisProduction of the bacterial strain of Salmonella enteritidis

Les animaux ont été infectés avec 2.27xl04 CFU (Colony Forming Unit) de Salmonella enteritidis souche 775 résistante à 20 pg/mL d’acide nalidixic et à 500 pg/mL de streptomycine. Cette souche est issue d’une mutation spontanée de la souche LA5 résistante seulement à l’acide nalidixic (Allen-Vercoe et al.,1997, FEMS Microbiol Lett. 153:33). Elle a été cultivée in vitro, amplifiée et cryopréservée à -80°C (Lot du 28 janvier 2016, INRA Nouzilly).The animals were infected with 2.27 × 10 4 CFU (Colony Forming Unit) of Salmonella enteritidis strain 775 resistant to 20 pg / ml of nalidixic acid and to 500 pg / ml of streptomycin. This strain is the result of a spontaneous mutation of the LA5 strain resistant only to nalidixic acid (Allen-Vercoe et al., 1997, FEMS Microbiol Lett. 153: 33). It was cultured in vitro, amplified and cryopreserved at -80 ° C (Lot of January 28, 2016, INRA Nouzilly).

AnimauxAnimals

Au total 170 poussins nouveau nés de race White leghom PA12 sont inclus dans l’étude et hébergés dans une salle de confinement de classe II.A total of 170 newborn White leghom PA12 chicks are included in the study and housed in a class II containment room.

Les poussins ont été identifiés individuellement et répartis aléatoirement en 8 groupes. Le nombre d’animaux par groupe, les temps de sacrifice et les caractéristiques propres à chacun de ces groupes sont représentés dans le tableau 20 ci-dessous. Ce même jour, les animaux ont été immunostimulés à 105 tachyzoïtes frais ou 107 tachyzoïtes lyophilisés dans un volume de 100pL de DMEM injectés par voie sous-cutanée. Le jour 14 de l’expérimentation, à 7 ou 14 jours d’âge, les animaux ont été inoculés au niveau du jabot (per os) avec 200pL de solution contenant 2.27xl04 CFU de Salmonella enteritidis. Ils ont ensuite été suivis de 1 à 4 semaines post-infection, et sacrifiés en cinétique à différents temps, comme décrit dans le tableau ci-dessous.The chicks were identified individually and randomized into 8 groups. The number of animals per group, the sacrifice times and the characteristics specific to each of these groups are shown in Table 20 below. On the same day, the animals were immunostimulated with 10 5 fresh tachyzoites or 10 7 lyophilized tachyzoites in a volume of 100 μl of DMEM injected subcutaneously. On day 14 of the experiment, at 7 or 14 days of age, the animals were inoculated at the level of the crop (per os) with 200 μl of solution containing 2.27 × 10 4 CFU of Salmonella enteritidis. They were then followed for 1 to 4 weeks post-infection, and sacrificed in kinetics at different times, as described in the table below.

Tableau 20 : Répartition des animaux, traitement et description des groupesTable 20: Distribution of animals, treatment and description of the groups

Frais s.c. Fees s.c. Frais s.c. Fees s.c. Lyoph s.c. Lyoph s.c. Lyoph s.c. Lyoph s.c. Nom du groupe Name of the group A AT B B C VS D D E E F F G G H H Jour 1 Day 1 DMEM DMEM Toxo- KO+ 2G Toxo- KO + 2G F4 F4 Toxo- KO+ 2G Toxo- KO + 2G Jour 7 Day 7 DMEM DMEM Toxo- KO+ 2G Toxo- KO + 2G F4 F4 Toxo- KO+ 2G Toxo- KO + 2G Jour 14 Day 14 Infection Salmonella Salmonella infection Sacrifice J22 Sacrifice J22 10 10 10 10 5 5 5 5 Sacrifice J29 Sacrifice J29 10 10 10 10 10 10 10 10 5 5 5 5 Sacrifice J36 Sacrifice J36 10 10 10 10 10 10 10 10 Sacrifice J43 Sacrifice J43 10 10 10 10 5 5 5 5 Sacrifice J48 Sacrifice J48 10 10 10 10

Aux temps indiqués, les animaux ont été euthanasiés. Les caeca ont été prélevés en condition stérile. Le sang a été prélevé par voie intracardiaque pour obtention de sérum par la suite. Les caeca ont été isolés de manière stérile et pesés individuellement. Après broyage, les matrices sont diluées en série dans du PBS et étalés sur des plaques Salmonella/Shigella agar (SS medium) contenant 500pg/mL de streptomycine. Après une incubation sur la nuit à 37°C, les colonies ont été comptées et le dénombrement a été rapporté au poids de l’organe pour déterminer la valeur de CFU par gramme d’organe.At the times indicated, the animals were euthanized. The caeca were removed under sterile conditions. The blood was drawn intracardiacly to obtain serum thereafter. The caeca were sterile isolated and weighed individually. After grinding, the matrices are diluted in series in PBS and spread on Salmonella / Shigella agar plates (SS medium) containing 500 μg / ml of streptomycin. After an overnight incubation at 37 ° C, the colonies were counted and the count was related to the weight of the organ to determine the value of CFU per gram of organ.

RésultatsResults

Mortalité et signes cliniquesMortality and clinical signs

L’infection par Salmonella enteritidis et l’immunostimulation par la souche Toxo tgmicl-3Salmonella enteritidis infection and immunostimulation with the Toxo tgmicl-3 strain

KO rop 16 KO gral5n Kl n’ont pas induit de toxicité, de signe clinique majeur ou de mortalité spécifique chez les poulets.KO rop 16 KO gral5n Kl did not induce toxicity, major clinical sign or specific mortality in chickens.

Le poids de chaque animal a été mesuré une fois par semaine, jusqu’à l’euthanasie et a été représenté dans la figures 22 A-D. Les animaux immunostimulés 7 jours avant l’infection avec des parasites frais (groupe D) ont un poids et une croissance similaire aux animaux contrôles du même groupe (groupe C). Dans les autres cas, une différence faible mais significative de poids est observée entre les animaux contrôles (DMEM ou F4) et les animaux immunostimulés (Frais ou Lyophilisé), notamment lorsque l’infection est effectuée 14 jours après l’immunostimulation (figures 22 B-D). Dans une moindre mesure, cette différence est retrouvée chez les animaux infectés avec des parasites frais ou lyophilisés par rapport à la condition contrôle, lorsque l’infection a eu lieu 7 jours après l’immunostimulation (figure 22.C). Pris dans leurs ensembles, les groupes immunostimulés ont un poids égal ou supérieur au poids retrouvé chez les animaux non immunostimulés démontrant l’absence d’effet néfaste ou un effet positif sur la croissance des animaux infectés par SE.The weight of each animal was measured once a week until euthanasia and was shown in Figures 22 A-D. Animals immunostimulated 7 days before infection with fresh parasites (group D) have a similar weight and growth to control animals of the same group (group C). In the other cases, a small but significant difference in weight is observed between the control animals (DMEM or F4) and the immunostimulated animals (Fresh or Lyophilized), in particular when the infection is carried out 14 days after the immunostimulation (Figures 22 BD ). To a lesser extent, this difference is found in animals infected with fresh or freeze-dried parasites compared to the control condition, when the infection took place 7 days after immunostimulation (Figure 22.C). Taken as a whole, the immunostimulated groups have a weight equal to or greater than the weight found in non-immunostimulated animals demonstrating the absence of a harmful effect or a positive effect on the growth of animals infected with ES.

Portage de Salmonella dans les caecaPortage of Salmonella in caeca

Le portage chronique dans l’intestin est le critère principal de l’étude. Il modélise le risque de contamination d’origine fécale des viandes et des œufs. Le portage des salmonelles a été étudié 1, 2, 3 et 4 semaines post-infection sur des groupes immunostimulés en frais ou en lyophilisé et sur les groupes contrôles correspondant (figure 23). Une semaine après infection, aucune différence significative n’a été mise en évidence entre les groupes immunostimulés ou contrôles, que ce soit avec une Immunostimulation avec des tachyzoïtes frais ou lyophilisés (figures 23 A-C). A l’inverse, une diminution significative de 96 à 99.9% du nombre de salmonelles par gram d’organe a été observée dans les groupes immunostimulés (Frais ou Lyophilisés, groupes B, D, F, H) par rapport aux groupes contrôles (DMEM ou F4, groupes A, C, E, G) de la seconde à la quatrième semaine post-infection.Chronic carriage in the intestine is the primary endpoint of the study. It models the risk of contamination from faecal origin in meats and eggs. The carriage of salmonella was studied 1, 2, 3 and 4 weeks post-infection on immunostimulated groups in fresh or freeze-dried form and on the corresponding control groups (FIG. 23). One week after infection, no significant difference was demonstrated between the immunostimulated or control groups, whether with an Immunostimulation with fresh or lyophilized tachyzoites (Figures 23 A-C). Conversely, a significant decrease from 96 to 99.9% in the number of salmonella per gram of organ was observed in the immunostimulated groups (Fresh or Freeze-dried, groups B, D, F, H) compared to the control groups (DMEM or F4, groups A, C, E, G) from the second to the fourth week post-infection.

Titrage des anticorps dirigés contre Toxo KO +2GTitration of antibodies to Toxo KO + 2G

Les titres sériques en anticorps de type IgY dirigés contre Toxo KO +2G ont été mesurés par ELISA sur les sera prélevés le jour des autopsies. Les titrages sont représentés figure 23. Une nette différence est observable entre les groupes contrôles (DMEM) et les groupes immunostimulés avec des parasites frais, à partir de la troisième semaine post-Immunostimulation (figures 23 A-B), démontrant une réponse immunitaire dirigée contre la souche administrée en frais. A l’inverse, le titre en anticorps est très faible ou nul, lorsque la souche est administrée sous la forme lyophilisée. Ainsi, aucune différence significative n’est observable entre les groupes contrôles F4 et les groupes immunostimulés avec des tachyzoïtes lyophilisés (figures 23 C-D).The serum titers of IgY type antibodies directed against Toxo KO + 2G were measured by ELISA on the sera taken on the day of the autopsies. The titrations are represented in FIG. 23. A clear difference can be observed between the control groups (DMEM) and the immunostimulated groups with fresh parasites, from the third week post-immunostimulation (FIGS. 23 AB), demonstrating an immune response directed against strain administered fresh. Conversely, the antibody titer is very low or zero, when the strain is administered in the lyophilized form. Thus, no significant difference is observable between the F4 control groups and the groups immunostimulated with lyophilized tachyzoites (FIGS. 23 C-D).

ConclusionConclusion

Dans cette expérimentation, le potentiel de la souche Toxo KO +2G comme agent préventif permettant de réduire le portage des salmonelles a été testé chez le poulet. Quelle que soit la formulation utilisée, en frais ou en lyophilisé, l’administration de la souche Toxo KO +2G limite significativement le portage de salmonelle entre 96 et 99.9% ce dans les caeca. La stratégie par immunostimulation n’étant pas spécifique d’un pathogène donné, des résultats similaires peuvent être obtenus avec la souche Toxo-KO+ 2G vis-à-vis d’autres agents bactériens..In this experiment, the potential of the Toxo KO + 2G strain as a preventive agent to reduce the carry of salmonella was tested in chicken. Whatever the formulation used, fresh or freeze-dried, the administration of the Toxo KO + 2G strain significantly limits the carrying of salmonella between 96 and 99.9% in caeca. Since the immunostimulation strategy is not specific to a given pathogen, similar results can be obtained with the Toxo-KO + 2G strain vis-à-vis other bacterial agents.

Exemple 12 : Efficacité de la souche Toxo tgmicl-3 KO roplô KO Gral5II Kl (notée Toxo KO+ 2G) dans la prévention de la grippe aviaireExample 12 Effectiveness of the Toxo tgmicl-3 KO roplô KO Gral5II Kl strain (noted Toxo KO + 2G) in preventing avian influenza

L’objectif de cette expérimentation est de déterminer si l’immunostimulation par la souche Toxo-KO+ 2G telle qu’obtenue à l’exemple 5, permet de limiter la sévérité d’une infection expérimentale par le virus Influenza H7N1 chez la poule domestique.The objective of this experiment is to determine whether immunostimulation with the Toxo-KO + 2G strain as obtained in example 5 makes it possible to limit the severity of an experimental infection with the Influenza H7N1 virus in domestic hens.

Matériel et méthodeMaterial and method

Production de parasites Toxo KO+ 2GToxo KO + 2G parasite production

La souche Toxo KO+ 2G est entretenue par passages successifs sur une lignée de fibroblastes de prépuce humain (HFF) cultivés dans du milieu DMEM auquel est ajouté 10% de sérum de veau fœtal décomplémenté, 2mM glutamine, 100 U/mL de pénicilline et 100 U/mL de streptomycine. Les tachyzoïtes ont été concentrés et lavés par centrifugation à 900 g pendant 5 minutes à température ambiante. Après remise en suspension dans une solution de DMEM, ils ont été comptés en cellule de Malassez et dilués à 1.106 tachyzoïtes par millilitre. Leur viabilité a été évaluée en cytométrie en flux (MACS Quant 10, Miltenyi) et a été calculée comme étant la fréquence du nombre de tachyzoïtes n’incorporant pas l’Iodure de Propidium (P4864-10ML, Sigma-Aldrich) par rapport au nombre de tachyzoïtes total. La viabilité des tachyzoïtes utilisés dans cette expérience était de 82.7%.The Toxo KO + 2G strain is maintained by successive passages on a line of human foreskin fibroblasts (HFF) cultivated in DMEM medium to which is added 10% of decomplemented fetal calf serum, 2mM glutamine, 100 U / ml of penicillin and 100 U / mL streptomycin. The tachyzoites were concentrated and washed by centrifugation at 900 g for 5 minutes at room temperature. After resuspension in a DMEM solution, they were counted in a Malassez cell and diluted to 1.10 6 tachyzoites per milliliter. Their viability was assessed by flow cytometry (MACS Quant 10, Miltenyi) and was calculated as the frequency of the number of tachyzoites not incorporating Propidium iodide (P4864-10ML, Sigma-Aldrich) compared to the number of total tachyzoites. The viability of the tachyzoites used in this experiment was 82.7%.

Production des inocula d’Influenza H7N1Production of H7N1 Inocula

La souche virale H7N1 utilisée dans cette expérience dérive de l’épidémie de 1999 de grippe aviaire dans le nord de l’Italie (A/Turkey/Italy/977/1999). En dépit de sa classification parmi les souches “Low pathogenic”, il est admis qu’elle est de virulence modérée chez la poule domestique, notamment dans la lignée B13 de poule pondeuse (Délétion of the C-terminal ESEV domain of NSI does not affect the réplication of a low-pathogenic avian influenza virus H7N1 in ducks and chickens. Soubies SM, et al., J Gen Virol. 2013 Jan;94(Pt 1):50-8. doi: 10.1099/vir.0.045153-0 - PMID: 23052391) (Length variations in the NA stalk of an H7N1 influenza virus hâve opposite effects on viral excrétion in chickens and ducks.The H7N1 viral strain used in this experiment was derived from the 1999 avian flu epidemic in northern Italy (A / Turkey / Italy / 977/1999). Despite its classification among the “Low pathogenic” strains, it is admitted that it is of moderate virulence in the domestic hen, in particular in the B13 laying hen line (Deletion of the C-terminal ESEV domain of NSI does not affect the replication of a low-pathogenic avian influenza virus H7N1 in ducks and chickens. Soubies SM, et al., J Gen Virol. 2013 Jan; 94 (Pt 1): 50-8. doi: 10.1099 / vir.0.045153-0 - PMID: 23052391) (Length variations in the NA stalk of an H7N1 influenza virus hâve opposite effects on viral excrétion in chickens and ducks.

Hoffmann TW, et al., J Virol. 2012 Jan;86(l):584-8. doi: 10.1128/JVI.05474-11. PMID:Hoffmann TW, et al., J Virol. 2012 Jan; 86 (l): 584-8. doi: 10.1128 / JVI.05474-11. PMID:

22013034), (Soubies et al, J. Gen. Virol, 2013 ; Hoffmann et al., J. Virol, 2012 ).22013034), (Soubies et al, J. Gen. Virol, 2013; Hoffmann et al., J. Virol, 2012).

Les lots utilisés pour l’infection ont été préparés par passages successifs sur œufs embryonnés de poulet comme décrit par Brauer en 2015 (Influenza virus propagation in embryonated chicken eggs. Brauer et al., J Vis Exp. 2015 Mar 19;(97). doi: 10.3791/52421). Ils ont ensuite été titrés par la méthode de Reed décrite en 1938 (Reed et al., Am. J. Epidemiol., 1938). Le titrage est calculé comme étant la dose requise pour infecter 50% d’œufs embryonnés de poulet (EID50).The batches used for the infection were prepared by successive passages on embryonated chicken eggs as described by Brauer in 2015 (Influenza virus propagation in embryonated chicken eggs. Brauer et al., J Vis Exp. 2015 Mar 19; (97). doi: 10.3791 / 52421). They were then titrated by the Reed method described in 1938 (Reed et al., Am. J. Epidemiol., 1938). The titration is calculated as the dose required to infect 50% of embryonated chicken eggs (EID50).

AnimauxAnimals

Au total 96 poussins nouveau nés de race White leghorn PA12 sont inclus dans l’étude. Ils ont été hébergés en isolateur afin de préserver le statut SPF.A total of 96 newborn White leghorn PA12 chicks were included in the study. They were housed in an isolator in order to preserve the SPF status.

Le lendemain de leurs arrivées, les animaux ont été identifiés individuellement. Ils ont ensuite été immunostimulés par voie sous-cutanée à la dose de 105 tachyzoïtes frais de Toxo-KO+ 2G mis en suspension dans un volume de 100pL de DMEM. Un volume similaire de DMEM a été utilisé pour les animaux des groupes non-immunostimulés. Conformément à la description standard du modèle, après 20 jours post-éclosion, une série d’animaux a été transférée dans un isolateur de confinement de catégorie 3. Ils ont ensuite été infectés par le virus influenza de type H7N1 par voie intra-trachéale à la dose de 2.105 EID50. Une inoculation PBS a été utilisée comme contrôle. Les animaux ont ensuite été suivis pendant 4 jours, euthanasiés, puis autopsiés. Pour mesurer si l’effet est dépendant de l’âge ou de la durée postimmunostimulation, des groupes d’animaux supplémentaires ont également été infectés à 6 et 13 jours post-éclosion.The day after their arrival, the animals were identified individually. They were then immunostimulated subcutaneously at a dose of 10 5 fresh tachyzoites of Toxo-KO + 2G suspended in a volume of 100 μl of DMEM. A similar volume of DMEM was used for animals from the non-immunostimulated groups. In accordance with the standard description of the model, after 20 days post-hatching, a series of animals was transferred to a category 3 containment isolator. They were then infected with the influenza virus type H7N1 intratracheally. the dose of 2.10 5 EID50. PBS inoculation was used as a control. The animals were then followed for 4 days, euthanized, then autopsied. To measure whether the effect is dependent on age or postimmunostimulation duration, additional groups of animals were also infected at 6 and 13 days post-hatch.

La répartition des animaux, les temps de sacrifice et les caractéristiques propres à chacun de ces groupes sont représentés dans le tableau 21.The distribution of animals, the times of sacrifice and the characteristics specific to each of these groups are shown in Table 21.

Tableau 21 : Répartition des animaux, traitement et description des groupesTable 21: Distribution of animals, treatment and description of the groups

Nom du groupe Name of the group Nombre d’animaux n= Number of animals n = Immunostimulation immunostimulatory Infection Infection Jour de l'infection Day of infection Jour du sacrifice Sacrifice day A AT 6 6 - - - - D6 D6 D10 D10 B B 6 6 - - LD LD C VS 6 6 - - HD HD I I 6 6 105 tachyzoïtes10 5 tachyzoites - - J J 6 6 105 tachyzoïtes10 5 tachyzoites LD LD K K 6 6 105 tachyzoïtes10 5 tachyzoites HD HD D D 6 6 - - - - D13 D13 D17 D17 E E 6 6 - - LD LD F F 6 6 - - HD HD L The 6 6 105 tachyzoïtes10 5 tachyzoites - - M M 6 6 105 tachyzoïtes10 5 tachyzoites LD LD N NOT 6 6 105 tachyzoïtes10 5 tachyzoites HD HD G G 6 6 - - - - D20 D20 D24 D24 H H 6 6 - - LD LD 0 0 6 6 105 tachyzoïtes10 5 tachyzoites - - P P 6 6 105 tachyzoïtes10 5 tachyzoites LD LD

Quatre jours après infection, un prélèvement de 200pL de sang a été réalisé dans le sinus occipital et le sérum a été préparé. Lors de l’autopsie, toutes lésions macroscopiques présentes sur les organes vitaux ont été relevées. Trois échantillons de poumons ont été prélevés pour l’analyse histopathologique pulmonaire. Deux échantillons de 50 mg environ ont été prélevés dans les parenchymes pulmonaires et rénaux.Four days after infection, a 200 μL blood sample was taken from the occipital sinus and the serum was prepared. During the autopsy, all gross lesions present on the vital organs were noted. Three lung samples were taken for histopathological pulmonary analysis. Two samples of approximately 50 mg were taken from the pulmonary and renal parenchyma.

Les échantillons provenant des écouvillons oro-pharyngés ont été remis en suspension dans lmL de PBS. L’ARNv a été extrait en respectant les consignes du kit QiaAmp Viral RNA mini kit (Qiagen) à partir de 140pL de suspension cellulaire.The samples from the oropharyngeal swabs were resuspended in 1 ml PBS. The vRNA was extracted in accordance with the instructions of the QiaAmp Viral RNA mini kit (Qiagen) from 140 μL of cell suspension.

Pour les échantillons provenant de la rate et du rein, 50mg de tissus ont été transférés dans lmL de PBS et dissociés mécaniquement en utilisant un broyeur (Retsch). Les ARNs totaux ont été extraits selon Tappendix D du protocole de référence du kit RNEasy Mini Kit plus (Qiagen).For samples from the spleen and kidney, 50 mg of tissue were transferred into 1 ml of PBS and mechanically dissociated using a grinder (Retsch). The total RNAs were extracted according to Tappendix D from the reference protocol of the RNEasy Mini Kit plus kit (Qiagen).

La quantification des ARNv du segment M du génome ont été dosés par RT-qPCR une seule étape respectant les consignes du kit « Superscript III platine SYBR green » ( Bio-Rad ). Les échantillons ont été analysés en triplicat sur un thermocyleur Chromo-5 (Bio-Rad). La séquence des paires d'amorces ciblant le segment M ainsi que les conditions de qRT-PCR ont été décrites précédemment (A genetically engineered waterfowl influenza virus with a délétion in the stalk of the neuraminidase has increased virulence for chickens. Munier S. et al., J Virol. 2010 Jan;84(2):940-52. doi: 10.1128/JVI.01581-09).The quantification of the mRNAs of the M segment of the genome were assayed by RT-qPCR in a single step respecting the instructions of the kit “Superscript III platinum SYBR green” (Bio-Rad). The samples were analyzed in triplicate on a Chromo-5 thermocyler (Bio-Rad). The sequence of the primer pairs targeting the M segment as well as the qRT-PCR conditions have been described previously (A genetically engineered waterfowl influenza virus with a deletion in the stalk of the neuraminidase has increased virulence for chickens. Munier S. et al ., J Virol. 2010 Jan; 84 (2): 940-52. Doi: 10.1128 / JVI.01581-09).

Dosage des cytokines pro-inflammatoiresAssay of pro-inflammatory cytokines

Les cytokines pro-inflammatoires ont été dosées par RT-qPCR deux étapes à partir des ARNs préalablement extraits de la rate et du rein. Brièvement, les ARNs ont été retrotranscrits à partir d’amorce poly-T par la mMLV-RT (Invitrogen) en respectant les consignes du fabriquant. L’expression des cytokines a été mesurée par qPCR selon les recommandations du fournisseur (Bio-Rad). Le détail des amorces, des cycles de PCR sont décrites pour chaque cible étudiée dans le tableau 18.The pro-inflammatory cytokines were assayed by RT-qPCR two steps from RNAs previously extracted from the spleen and the kidney. Briefly, the RNAs were transcribed from the poly-T primer by mMLV-RT (Invitrogen) in accordance with the manufacturer's instructions. Cytokine expression was measured by qPCR according to the supplier's recommendations (Bio-Rad). The details of the primers and of the PCR cycles are described for each target studied in Table 18.

RésultatsResults

Signes cliniques et mortalitéClinical signs and mortality

L’état général des animaux a été suivi depuis l’éclosion jusqu’au sacrifice. Aucun animal n’a présenté un affaiblissement de l’état général ou une perte de poids jusqu’au moment de l’infection par le virus H7N1.The general condition of the animals was monitored from hatching to sacrifice. No animal has shown any impairment or loss of weight until the time of infection with the H7N1 virus.

Au trois âges d’infection, J6, J13 et J20, les animaux ont été infectés par le virus H7N1 et ont été suivis pendant 4 jours (Tableau 22). Les animaux des groupes contrôles ont été inoculés avec un volume équivalent de PBS. Il n’a pas été observé chez ces derniers de signes cliniques ou de mortalité.At the three infection ages, D6, D13 and D20, the animals were infected with the H7N1 virus and were followed for 4 days (Table 22). The animals in the control groups were inoculated with an equivalent volume of PBS. There were no clinical signs or mortality in the latter.

Dans les groupes non-immunostimulés, l’infection à 20 jours d’âge à la dose de 5.105 EID50 a induit une mortalité compatible aux attentes du modèle, soit environ de 67% (Tableau 22). Néanmoins, il n’a pas été observée de différence significative de mortalité entre les groupes immunostimulés et non-immunostimulés (Tableau 22).In the non-immunostimulated groups, infection at 20 days of age at a dose of 5.10 5 EID50 induced a mortality compatible with the expectations of the model, ie approximately 67% (Table 22). However, no significant difference in mortality was observed between the immunostimulated and non-immunostimulated groups (Table 22).

Aux autres âges d’infection, à J6 et J13, aucune donnée de sensibilité des animaux vis-à-vis du virus H7N1 n’était disponible au préalable à cette expérience. C’est pourquoi deux doses d’infection ont été testées. Les animaux infectés à J6 ont été inoculés à la dose de 2.105 EID50 et 2,5.106 EID50 de virus H7N1. Pour les deux doses testées, le niveau acceptable de sévérité du modèle n’était pas atteint et aucune mortalité n’a été observée (Tableau 22). Les animaux infectés à J13 ont été inoculés aux doses de de 2.105 EID50 et 1,25.107 EID50 de virus H7N1. Pour les animaux infectés à faible dose, une mortalité de 50% a été observé dans les groupes immunostimulés et non-immunostimulés. De manière surprenante, les animaux infectés à une dose 50 fois supérieure ont présentés des signes cliniques moins importants. Dans ces groupes la mortalité est restée nulle quel que soit le statut d’immunisation des animaux (Tableau 22).At other ages of infection, on D6 and D13, no data on the sensitivity of the animals towards the H7N1 virus was available before this experiment. This is why two doses of infection were tested. The animals infected on D6 were inoculated at the dose of 2.10 5 EID50 and 2.5.10 6 EID50 of H7N1 virus. For the two doses tested, the acceptable level of severity of the model was not reached and no mortality was observed (Table 22). The animals infected on D13 were inoculated at doses of 2.10 5 EID50 and 1.25.10 7 EID50 of H7N1 virus. For low dose infected animals, 50% mortality was observed in the immunostimulated and non-immunostimulated groups. Surprisingly, animals infected at a dose 50 times higher showed less significant clinical signs. In these groups mortality remained zero regardless of the animals' immunization status (Table 22).

Tableau 22 : Mortalité des animaux post-infection par le virus H7N1Table 22: Mortality of animals post-infection with the H7N1 virus

J6 J6 J13 J13 J20 J20 Non immunostimulés Not immunostimulated 105 tachyzoïtes10 5 tachyzoites Non immunostimulés Not immunostimulated 105 tachyzoïtes10 5 tachyzoites Non immunostimulés Not immunostimulated 105 tachyzoïtes10 5 tachyzoites Infection à faible dose Low dose infection Vivants Living 6 6 6 6 3 3 3 3 4 4 4 4 Morts dead 0 0 0 0 3 3 3 3 2 2 2 2 Survie (%) Survival (%) 100% 100% 100% 100% 50% 50% 50% 50% 67% 67% 67% 67% Infection à forte dose High dose infection Vivants Living 6 6 6 6 6 6 6 6 Morts dead 0 0 0 0 0 0 0 0 Survie (%) Survival (%) 100% 100% 100% 100% 100% 100% 100% 100%

Les objectifs de modélisation de la grippe aviaire, en termes de mortalité et d’apparition de signe clinique ont été atteints lorsque le virus a été inoculé chez des animaux de 13 et 20 jours à la dose faible. En revanche, une infection plus précoce ou une infection à plus forte dose n’ont pas induit de mortalité et de signes cliniques majeurs démontrant une modélisation partielle de la grippe aviaire et une meilleure résistance des jeunes animaux. Or, cette résistance n’est pas toujours associée à une meilleure élimination du virus. Les titres viraux ont donc été déterminés chez tous les animaux quel que soit l’âge d’infection.The modeling objectives for avian influenza, in terms of mortality and the appearance of clinical signs, were achieved when the virus was inoculated in 13 and 20 day old animals at the low dose. On the other hand, an earlier infection or a higher dose infection did not induce mortality and major clinical signs demonstrating partial modeling of avian influenza and better resistance in young animals. However, this resistance is not always associated with better elimination of the virus. Viral titers were therefore determined in all animals regardless of the age of infection.

Titres virauxViral titles

Les titres viraux ont été estimés chez tous les animaux par RT-qPCR dans l’organe cible de l’infection, le poumon, dans les excrétions orotrachéales et à un niveau systémique dans le parenchyme rénal (figure 25). Le virus n’a pas pu être détecté dans les groupes contrôles non infectés (données non présentées).Viral titers were estimated in all animals by RT-qPCR in the target organ of the infection, the lung, in orotracheal excretions and at a systemic level in the renal parenchyma (Figure 25). The virus could not be detected in the uninfected control groups (data not shown).

Dans les groupes infectés à J6 et J13, aucune différence majeure ou significative n’a été observée entre les animaux immunostimulés et non-immunostimulés à faible dose (figuresIn the groups infected on D6 and D13, no major or significant difference was observed between immunostimulated and non-immunostimulated animals at low doses (figures

25A-B). Pour ces mêmes temps d’infection, les titres viraux n’ont pas été augmentés par une augmentation de la dose d’infection. Assez curieusement, ils sont plutôt diminués. Pour les animaux infectés à J13 à forte dose, malgré le niveau d’infection plus faible, le titre viral dans les groupes immunostimulés semble légèrement inférieure à celui présent dans les groupes non-immunostimulés. Cependant, en raison du nombre d’animaux par groupe, il n’est pas possible de déterminer si cette différence est biologiquement significative ou si elle dérive d’une observation aléatoire.25A-B). For these same infection times, viral titers were not increased by an increase in the dose of infection. Oddly enough, they are rather reduced. For animals infected on D13 at high doses, despite the lower level of infection, the viral titer in the immunostimulated groups seems slightly lower than that present in the non-immunostimulated groups. However, due to the number of animals per group, it is not possible to determine whether this difference is biologically significant or whether it is derived from random observation.

Pour les animaux infectés à J20, on observe une nette et significative diminution du titre viral dans les excrétions orotrachéales dans les groupes immunostimulés par rapport au groupe contrôle non-immunostimulé. Cette diminution s’exprime par un nombre d’animaux excrétant le virus plus faible, ainsi que par une diminution quantitative du titre virale chez les animaux non-immunostimulés. Dans ces groupes, une diminution de la charge virale de plus de 92% est observée dans tous les organes testés (figure 25C). La diminution des titres viraux dans les poumons et les reins corrobore donc ces observations dans les écouvillons et confortent l’hypothèse d’un effet protecteur de l’immunostimulation sur la charge virale de poulets infectés à J20.For the animals infected on D20, a clear and significant decrease in the viral titer is observed in the orotracheal excretions in the immunostimulated groups compared to the non-immunostimulated control group. This decrease is expressed by a lower number of animals shedding the virus, as well as by a quantitative decrease in viral titer in non-immunostimulated animals. In these groups, a decrease in viral load of more than 92% is observed in all the organs tested (Figure 25C). The decrease in viral titers in the lungs and kidneys therefore corroborates these observations in the swabs and supports the hypothesis of a protective effect of immunostimulation on the viral load of chickens infected on D20.

Induction d’une réponse IFN-βpar Toxo-KO+ 2GInduction of an IFN-β response by Toxo-KO + 2G

Dans le contexte de la grippe aviaire, une immunostimulation a pour objectif de préparer le système immunitaire innée pour améliorer la détection du virus, de limiter la sensibilité des cellules hôtes ou finalement pour mieux lutter contre l’infection. Lors d’une infection MDA5 identifie des ARN viraux et signalise la présence du danger. La cytokine IFN-/3 est un acteur majeur de cette signalisation. Elle active les cellules cibles en induisant l’expression d’une batterie de gènes impliqués dans la réponse antivirale.In the context of avian influenza, the aim of immunostimulation is to prepare the innate immune system to improve detection of the virus, to limit the sensitivity of host cells or ultimately to better fight the infection. During an MDA5 infection identifies viral RNAs and signals the presence of the danger. The cytokine IFN- / 3 is a major player in this signaling. It activates target cells by inducing the expression of a battery of genes involved in the antiviral response.

L’expression de FIFN-/3 et de MDA5 a été évaluée dans le tissu pulmonaire de tous les animaux inclus dans l’étude. L’expression de FIFN-/3 chez les animaux immunostimulés est fortement induite à J17 en l’absence d’infection. Quel que soit l’âge des animaux, l’infection par le virus H7N1 semble induire l’expression de l’IFN-beta (figures 26A et 26B). Cette expression induite de FIFN-/3 semble être maximisée par l’immunostimulation. Ainsi, à J10 et à J23, l’expression de l’IFN-beta chez les animaux uniquement infectés par le virus H7N1 est relativement faible et l’immunostimulation semble augmenter l’expression de cette cytokine (figures 26A et 26B). A J17, l’infection par H7N1 augmente déjà très fortement l’expression de MDA5. Dans ce cas, l’immunostimulation l’altère pas l’expression du récepteur. Celui-ci était même déjà induit par la seule immunostimulation en l’absence d’infection.The expression of FIFN- / 3 and MDA5 was assessed in the lung tissue of all animals included in the study. The expression of FIFN- / 3 in immunostimulated animals is strongly induced on D17 in the absence of infection. Regardless of the age of the animals, infection with the H7N1 virus appears to induce the expression of IFN-beta (Figures 26A and 26B). This induced expression of FIFN- / 3 appears to be maximized by immunostimulation. Thus, at D10 and D23, the expression of IFN-beta in animals only infected with the H7N1 virus is relatively weak and the immunostimulation seems to increase the expression of this cytokine (FIGS. 26A and 26B). At D17, infection with H7N1 already greatly increases the expression of MDA5. In this case, immunostimulation does not alter the expression of the receptor. This was even already induced by immunostimulation alone in the absence of infection.

Le même profil de réponse est observé pour l’expression du récepteur MDA5. Toxo-KO+ 2G induit une expression à J17 en l’absence d’infection (figures 26A et 26B). De plus, l’expression de MDA5 est maximisée par l’immunostimulation dès J10 et à J23 chez les animaux infectés par le virus H7N1 (figures 26A et 26B).The same response profile is observed for the expression of the MDA5 receptor. Toxo-KO + 2G induces expression on D17 in the absence of infection (Figures 26A and 26B). In addition, the expression of MDA5 is maximized by immunostimulation from D10 and D23 in animals infected with the H7N1 virus (FIGS. 26A and 26B).

L’immunostimulation par l’injection à JT de Toxo-KO+ 2G semble activer le système immunitaire et favoriser une réponse antivirale innée dépendante de 1’ IFN-/3.Immunostimulation with JT injection of Toxo-KO + 2G appears to activate the immune system and promote an innate antiviral response dependent on 1 ’IFN- / 3.

ConclusionConclusion

L’objectif de cette expérimentation était de tester si une immunostimulation avec Toxo-KO+ 2G pouvait renforcer l’immunité des poulets et les aider à lutter contre une infection expérimentale avec la souche influenza H7N1 aviaire. Cette souche est fréquemment utilisée comme modèle d’infection standard. Elle présente l’avantage d’être modérément virulente, d’induire 50% de mortalité chez le poulet et de permettre d’étudier l’efficacité d’une solution thérapeutique. L’objectif d’une prophylaxie dirigée contre la grippe aviaire n’est pas nécessairement d’empêcher un effet clinique individuel, comme la mortalité, mais bien de limiter au maximum la dissémination du virus et donc de diminuer le titre viral dans les excrétions de l’animal. Une infection à J20 avec 5.105 EID50 de virus inoculé par voie intratrachéale induit une mortalité de 67% dans les groupes contrôles. Dans ces conditions, une différence significative de charge virale a été mesurée entre les groupes contrôles et immunostimulés. L’importance de cette différence est renforcée par la présence après immunostimulation d’une réponse TIFN-Z>, acteur clé de la réponse antivirale. Dans leur ensemble, ces résultats suggèrent que Toxo-KO+ 2G a une action protectrice vis-à-vis du virus influenza aviaire H7N1, même si cette protection ne semble être effective qu’à partir de J20 et qu’il n’a pas été possible de mettre en évidence une différence significative de mortalité.The objective of this experiment was to test whether immunostimulation with Toxo-KO + 2G could strengthen the immunity of chickens and help them to fight against an experimental infection with the avian H7N1 strain. This strain is frequently used as a standard infection model. It has the advantage of being moderately virulent, of inducing 50% mortality in chicken and of making it possible to study the effectiveness of a therapeutic solution. The aim of prophylaxis against avian influenza is not necessarily to prevent an individual clinical effect, such as mortality, but rather to limit the spread of the virus as much as possible and therefore to reduce the viral titer in the excretions of the virus. the animal. Infection on D20 with 5.10 5 EID50 of virus inoculated by the intratracheal route induces a mortality of 67% in the control groups. Under these conditions, a significant difference in viral load was measured between the control and immunostimulated groups. The importance of this difference is reinforced by the presence after immunostimulation of a TIFN-Z> response, a key player in the antiviral response. Taken together, these results suggest that Toxo-KO + 2G has a protective action against the avian influenza virus H7N1, even if this protection does not seem to be effective until D20 and that it has not been possible to highlight a significant difference in mortality.

La stratégie par immunostimulation n’étant pas spécifique d’un pathogène donné, des résultats similaires peuvent être obtenus avec la souche Toxo-KO+ 2G vis-à-vis d’autres agents viraux.Since the immunostimulation strategy is not specific to a given pathogen, similar results can be obtained with the Toxo-KO + 2G strain vis-à-vis other viral agents.

Claims (12)

REVENDICATIONS 1. Souche mutante de Sarcocystidae dans laquelle la fonction de la protéine MIC 1 et la fonction de la protéine MIC3 sont supprimées, pour son utilisation dans la prévention de maladies infectieuses chez la volaille ;1. Mutant strain of Sarcocystidae in which the function of the protein MIC 1 and the function of the protein MIC3 are suppressed, for its use in the prevention of infectious diseases in poultry; ladite fonction de la protéine MIC3 étant supprimée par :said function of the MIC3 protein being suppressed by: une mutation, une délétion ou une insertion d’un ou plusieurs nucléotides dans la séquence nucléotidique du gène mic3 codant pour la protéine MIC3, ou la délétion totale du gène mic3, ou la délétion totale ou partielle de la région promotrice et/ou la délétion totale ou partielle de la séquence codante du gène mic3, ou une déstabilisation de l’ARN messager résultant de la transcription du gène mic3, ou une inhibition de la traduction de l’ARN messager du gène mic 3 ;a mutation, a deletion or an insertion of one or more nucleotides in the nucleotide sequence of the mic3 gene coding for the MIC3 protein, or the total deletion of the mic3 gene, or the total or partial deletion of the promoter region and / or the deletion total or partial coding sequence of the mic3 gene, or a destabilization of the messenger RNA resulting from the transcription of the mic3 gene, or an inhibition of the translation of the messenger RNA of the mic 3 gene; et ladite fonction de la protéine MIC1 étant supprimée par :and said function of the MIC1 protein being suppressed by: une mutation, une délétion ou une insertion d’un ou plusieurs nucléotides dans la séquence nucléotidique du gène miel codant pour la protéine MIC1, ou la délétion totale du gène miel, ou la délétion totale ou partielle de la région promotrice et/ou la délétion totale ou partielle de la séquence codante du gène miel, oua mutation, a deletion or an insertion of one or more nucleotides in the nucleotide sequence of the honey gene coding for the MIC1 protein, or the total deletion of the honey gene, or the total or partial deletion of the promoter region and / or the deletion total or partial of the coding sequence of the honey gene, or - une déstabilisation de l’ARN messager résultant de la transcription du gène miel, ou une inhibition de la traduction de l’ARN messager du gène miel.- a destabilization of the messenger RNA resulting from the transcription of the honey gene, or an inhibition of the translation of the messenger RNA of the honey gene. 2. Souche mutante de Sarcocystidae dans laquelle la fonction de la protéine MIC 1 et la fonction de la protéine MIC3 sont supprimées, pour son utilisation selon la revendication 1, ladite souche mutante de Sarcocystidae étant formulée pour une administration in ovo ou chez un poussin de volaille âgé de 0 à 72h.2. Mutant strain of Sarcocystidae in which the function of the protein MIC 1 and the function of the protein MIC3 are suppressed, for its use according to claim 1, said mutant strain of Sarcocystidae being formulated for administration in ovo or in a chick of poultry aged 0 to 72 hours. 3. Souche mutante de Sarcocystidae dans laquelle la fonction de la protéine MIC1 et la fonction de la protéine MIC3 sont supprimées, pour son utilisation selon la revendication 1 ou 2, ladite maladie infectieuse étant une maladie d’origine virale ou une maladie d’origine bactérienne ou une maladie d’origine parasitaire.3. Mutant strain of Sarcocystidae in which the function of the MIC1 protein and the function of the MIC3 protein are suppressed, for its use according to claim 1 or 2, said infectious disease being a disease of viral origin or a disease of origin bacterial or parasitic disease. 4. Souche mutante de Sarcocystidae dans laquelle la fonction de la protéine MIC 1 et la fonction de la protéine MIC3 sont supprimées, pour son utilisation selon l’une des revendications 1 à 3, ladite maladie infectieuse étant une maladie d’origine virale, en particulier la grippe aviaire, ou une maladie d’origine bactérienne, en particulier la salmonellose, ou une maladie d’origine parasitaire, en particulier la coccidiose.4. Mutant strain of Sarcocystidae in which the function of the protein MIC 1 and the function of the protein MIC3 are suppressed, for its use according to one of claims 1 to 3, said infectious disease being a disease of viral origin, in in particular avian flu, or a disease of bacterial origin, in particular salmonellosis, or a disease of parasitic origin, in particular coccidiosis. 5. Souche mutante de Sarcocystidae dans laquelle la fonction de la protéine MIC1 et la fonction de la protéine MIC3 sont supprimées, pour son utilisation selon l’une des revendications 1 à 4, ladite souche mutante étant une souche de Toxoplasma spp., en particulier de Toxoplasma gondii.5. Mutant strain of Sarcocystidae in which the function of the protein MIC1 and the function of the protein MIC3 are suppressed, for its use according to one of claims 1 to 4, said mutant strain being a strain of Toxoplasma spp., In particular of Toxoplasma gondii. 6. Souche mutante de Sarcocystidae dans laquelle la fonction de la protéine MIC1 et la fonction de la protéine MIC3 sont supprimées, pour son utilisation selon l’une des revendications 1 à 4, ladite souche mutante étant une souche de Neospora spp., en particulier de Neospora caninum.6. Mutant strain of Sarcocystidae in which the function of the MIC1 protein and the function of the MIC3 protein are suppressed, for its use according to one of claims 1 to 4, said mutant strain being a strain of Neospora spp., In particular of Neospora caninum. 7. Souche mutante de Sarcocystidae dans laquelle la fonction de la protéine MIC1 et la fonction de la protéine MIC3 sont supprimées, pour son utilisation selon l’une des revendications 1 à 5, dans laquelle ladite souche mutante est une souche mutante de Toxoplasma spp., et dans laquelle la fonction de la protéine ROP 161 codée par le gène ropl 61 est supprimée et/ou ladite souche comprend au moins un acide nucléique codant pour la protéine GRA15II ainsi que les moyens nécessaires à l’expression de ladite protéine, ladite fonction de la protéine ROP 161 étant supprimée par :7. Mutant strain of Sarcocystidae in which the function of the MIC1 protein and the function of the MIC3 protein are suppressed, for its use according to one of claims 1 to 5, wherein said mutant strain is a mutant strain of Toxoplasma spp. , and in which the function of the protein ROP 161 coded by the ropl 61 gene is deleted and / or said strain comprises at least one nucleic acid coding for the protein GRA15II as well as the means necessary for the expression of said protein, said function ROP 161 protein being deleted by: - une mutation, une délétion ou une insertion d’un ou plusieurs nucléotides dans la séquence nucléotidique du gène roplôl codant pour la protéine ROP 161, ou- a mutation, deletion or insertion of one or more nucleotides in the nucleotide sequence of the roplôl gene coding for the protein ROP 161, or - la délétion totale du gène roplôl, ou- the total deletion of the roplôl gene, or - la délétion totale ou partielle de la région promotrice et/ou la délétion totale ou partielle de la séquence codante du gène roplôl, ou , - une déstabilisation de l’ARN messager résultant de la transcription du gène roplôZ,ou- total or partial deletion of the promoter region and / or total or partial deletion of the coding sequence of the roplôl gene, or, - destabilization of the messenger RNA resulting from transcription of the roplôZ gene, or - une inhibition de la traduction de l’ARN messager du gène roplôl.- inhibition of the translation of the messenger RNA of the roplôl gene. 8. Souche mutante de Sarcocystidae dans laquelle la fonction de la protéine MIC 1 et la fonction de la protéine MIC3 sont supprimées, pour son utilisation selon l’une des revendications 1 à 5, ladite souche mutante étant une souche mutante de Toxoplasma gondii dans laquelle la fonction de la protéine MIC3 est supprimée par une délétion totale du gène mic 3 et la fonction de la protéine MIC1 est supprimée par une délétion totale du gène miel.8. Mutant strain of Sarcocystidae in which the function of the protein MIC 1 and the function of the protein MIC3 are suppressed, for its use according to one of claims 1 to 5, said mutant strain being a mutant strain of Toxoplasma gondii in which the function of the MIC3 protein is suppressed by a total deletion of the mic 3 gene and the function of the MIC1 protein is suppressed by a total deletion of the honey gene. 9. Souche mutante de Sarcocystidae dans laquelle la fonction de la protéine MIC 1 et la fonction de la protéine MIC3 sont supprimées, pour son utilisation selon la revendication 7, ladite souche mutante étant choisie parmi :9. Mutant strain of Sarcocystidae in which the function of the protein MIC 1 and the function of the protein MIC3 are suppressed, for its use according to claim 7, said mutant strain being chosen from: - une souche mutante de Toxoplasma gondii dans laquelle la fonction de la protéine MIC3 est supprimée par une délétion totale du gène mic3, la fonction de la protéine MIC1 est supprimée par une délétion totale du gène miel, ladite souche comprend un acide nucléique codant pour la protéine GRA15II ainsi que les moyens nécessaires à l’expression de ladite protéine,a mutant strain of Toxoplasma gondii in which the function of the MIC3 protein is suppressed by a total deletion of the mic3 gene, the function of the MIC1 protein is suppressed by a total deletion of the honey gene, said strain comprises a nucleic acid encoding the GRA15II protein as well as the means necessary for the expression of said protein, - une souche mutante de Toxoplasma gondii dans laquelle la fonction de la protéine MIC3 est supprimée par une délétion totale du gène mic3, la fonction de la protéine MIC1 est supprimée par une délétion totale du gène miel, la fonction de la protéine ROP161 codée par le gène roplôlest supprimée par une délétion totale dudit gène roplôl,- a mutant strain of Toxoplasma gondii in which the function of the MIC3 protein is suppressed by a total deletion of the mic3 gene, the function of the MIC1 protein is suppressed by a total deletion of the honey gene, the function of the ROP161 protein encoded by the roplôlest gene suppressed by a complete deletion of said roplôl gene, - une souche mutante de Toxoplasma gondii dans laquelle la fonction de la protéine MIC3 est supprimée par une délétion totale du gène mic3, la fonction de la protéine MIC1 est supprimée par une délétion totale du gène miel, la fonction de la protéine ROP16I codée par le gène roplôl est supprimée par une délétion totale dudit gène roplôl et ladite souche comprend un acide nucléique codant pour la protéine GRA15II ainsi que les moyens nécessaires à l’expression de ladite protéine.- a mutant strain of Toxoplasma gondii in which the function of the MIC3 protein is suppressed by a total deletion of the mic3 gene, the function of the MIC1 protein is suppressed by a total deletion of the honey gene, the function of the ROP16I protein encoded by the roplôl gene is deleted by a total deletion of said roplôl gene and said strain comprises a nucleic acid coding for the GRA15II protein as well as the means necessary for the expression of said protein. 10. Souche mutante de Sarcocystidae dans laquelle la fonction de la protéine MIC1 et la fonction de la protéine MIC3 sont supprimées, pour son utilisation selon l’une des revendications 1 à 4 et 6, ladite souche mutante étant une souche de Neospora caninum dans laquelle la fonction de la protéine MIC3 est supprimée par une délétion totale du gène mic 3 et la fonction de la protéine MIC1 est supprimée par une délétion totale du gène miel.10. Mutant strain of Sarcocystidae in which the function of the protein MIC1 and the function of the protein MIC3 are suppressed, for its use according to one of claims 1 to 4 and 6, said mutant strain being a strain of Neospora caninum in which the function of the MIC3 protein is suppressed by a total deletion of the mic 3 gene and the function of the MIC1 protein is suppressed by a total deletion of the honey gene. 11. Souche mutante de Sarcocystidae dans laquelle ladite souche mutante est une souche mutante de Toxoplasma gondii, dans laquelle la fonction de la protéine MIC1, la fonction de la protéine MIC 3 sont supprimées, et la fonction de la protéine ROP161 codée par le gène roplôl est supprimée et/ou ladite souche comprend un acide nucléique codant pour la protéine GRA15II ainsi que les moyens nécessaires à l’expression de ladite protéine, dans laquelle la fonction de la protéine MIC3 est supprimée par :11. Mutant strain of Sarcocystidae in which said mutant strain is a mutant strain of Toxoplasma gondii, in which the function of the protein MIC1, the function of the protein MIC 3 are deleted, and the function of the protein ROP161 encoded by the roplôl gene is deleted and / or said strain comprises a nucleic acid coding for the GRA15II protein as well as the means necessary for the expression of said protein, in which the function of the MIC3 protein is deleted by: - une mutation, une délétion ou une insertion d’un ou plusieurs nucléotides dans la séquence nucléotidique du gène mic 3 codant pour la protéine MIC3, ou la délétion totale du gène mic3, ou la délétion totale ou partielle de la région promotrice et/ou la délétion totale ou partielle de la séquence codante du gène mic3, oua mutation, a deletion or an insertion of one or more nucleotides in the nucleotide sequence of the mic 3 gene coding for the MIC3 protein, or the total deletion of the mic3 gene, or the total or partial deletion of the promoter region and / or the total or partial deletion of the coding sequence of the mic3 gene, or - une déstabilisation de l’ARN messager résultant de la transcription du gène mic3, ou- destabilization of the messenger RNA resulting from the transcription of the mic3 gene, or - une inhibition de la traduction de l’ARN messager du gène mic 3 ;- inhibition of the translation of the messenger RNA of the mic 3 gene; et la fonction de la protéine MIC1 est supprimée par :and the function of the MIC1 protein is suppressed by: - une mutation, une délétion ou une insertion d’un ou plusieurs nucléotides dans la séquence nucléotidique du gène miel codant pour la protéine MIC1, ou la délétion totale du gène miel, ou la délétion totale ou partielle de la région promotrice et/ou la délétion totale ou partielle de la séquence codante du gène miel, oua mutation, a deletion or an insertion of one or more nucleotides in the nucleotide sequence of the honey gene coding for the MIC1 protein, or the total deletion of the honey gene, or the total or partial deletion of the promoter region and / or the total or partial deletion of the coding sequence of the honey gene, or - une déstabilisation de l’ARN messager résultant de la transcription du gène miel, ou- destabilization of the messenger RNA resulting from the transcription of the honey gene, or - une inhibition de la traduction de l’ARN messager du gène miel ;- inhibition of the translation of the messenger RNA of the honey gene; et dans laquelle la fonction de la protéine ROP 161 est supprimée par :and in which the function of the protein ROP 161 is suppressed by: - une mutation, une délétion ou une insertion d’un ou plusieurs nucléotides dans la séquence nucléotidique du gène roplôl codant pour la protéine ROP16I, ou- a mutation, deletion or insertion of one or more nucleotides in the nucleotide sequence of the roplôl gene coding for the protein ROP16I, or - la délétion totale du gène roplôl, ou- the total deletion of the roplôl gene, or - la délétion totale ou partielle de la région promotrice et/ou la délétion totale ou partielle de la séquence codante du gène roplôl, ou- the total or partial deletion of the promoter region and / or the total or partial deletion of the coding sequence of the roplôl gene, or - une déstabilisation de l’ARN messager résultant de la transcription du gène roplôl, ou- a destabilization of the messenger RNA resulting from the transcription of the roplôl gene, or - une inhibition de la traduction de l’ARN messager du gène roplôl.- inhibition of the translation of the messenger RNA of the roplôl gene. notamment ladite souche étant une souche de Toxoplasma gondii dans laquelle la fonction de la protéine MIC3 est supprimée par délétion totale du gène mic3, la fonction de la protéine MIC1 est supprimée par délétion totale du gène miel, et la fonction de la protéine ROP16I est supprimée par délétion totale du gène roplôl et ladite souche comprend un acide nucléique codant pour la protéine GRA15II, ainsi que les moyens nécessaires à l’expression de ladite protéine.in particular said strain being a Toxoplasma gondii strain in which the function of the MIC3 protein is suppressed by total deletion of the mic3 gene, the function of the MIC1 protein is suppressed by total deletion of the honey gene, and the function of the ROP16I protein is suppressed by total deletion of the roplôl gene and said strain comprises a nucleic acid coding for the GRA15II protein, as well as the means necessary for the expression of said protein. 12. Composition comprenant au moins l’une des souches mutantes de Sarcocystidae selon la revendication 11, pour son utilisation comme médicament.12. Composition comprising at least one of the mutant strains of Sarcocystidae according to claim 11, for its use as a medicament.
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