FR2746815A1 - SEQUENCES UPSTREAM OF THE SM 22 GENE, VECTORS CONTAINING THEM AND THEIR THERAPEUTIC USES, ESPECIALLY IN THE TREATMENT OF VASCULAR DISEASES - Google Patents
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Abstract
Description
La présente invention est relative à des séquences en amont d'un gène exprimé dans les cellules du muscle lisse, tel que SM 22, ainsi qu'à des vecteurs les contenant. The present invention relates to sequences upstream of a gene expressed in smooth muscle cells, such as SM 22, as well as to vectors containing them.
Elle a en outre pour objet l'utilisation de ces vecteurs et séquences en thérapeutique, par exemple pour la production de polypeptides actifs localement ou de manière systémique, notamment des polypeptides immunogènes, des polypeptides régulateurs endogènes tels que les cytokines, ou encore pour la production d'ARN d'intérêt thérapeutique, par exemple un ARN anti-sens . De manière particulière, l'invention a pour objet l'utilisation des vecteurs et séquences nucléiques dans le traitement des maladies vasculaires. It further relates to the use of these vectors and sequences in therapy, for example for the production of polypeptides active locally or systemically, in particular immunogenic polypeptides, endogenous regulatory polypeptides such as cytokines, or also for the production RNA of therapeutic interest, for example an antisense RNA. In particular, the invention relates to the use of vectors and nucleic sequences in the treatment of vascular diseases.
L'athérosclérose est une maladie dégénérative des artères associant les lésions de l'artériosclérose et de l'athérome, et combinant ainsi un durcissement des artères et une dégénéréscence graisseuse de leur tunique interne. Atherosclerosis is a degenerative disease of the arteries associating lesions of arteriosclerosis and atheroma, and thus combining a hardening of the arteries and a fatty degeneration of their internal coat.
Cette insuffisance coronarienne est généralement remédiée par une angioplastie coronaire percutanée consistant à introduire dans le réseau artériel coronaire un cathéter muni à son extrémité d'un ballonnet, d'avancer le cathéter jusqu'au niveau de la sténose et de gonfler le ballonnet afin d'écraser la lésion contre la paroi et de rétablir ainsi un calibre coronaire permettant une perfusion myocardique suffisante.This coronary insufficiency is generally remedied by percutaneous coronary angioplasty consisting in introducing into the coronary artery network a catheter provided at its end with a balloon, advancing the catheter to the level of the stenosis and inflating the balloon in order to crush the lesion against the wall and thus restore a coronary caliber allowing sufficient myocardial perfusion.
Cette technique de revascularisation myocardique est très largement utilisée (50 000 interventions par an en
France et 500 000 interventions par an aux Etats-Unis) mais est cependant limitée par la réapparition, dans les mois suivants l'opération, d'une nouvelle lésion au site dilaté, ou resténose, dans environ 30 % des cas.This myocardial revascularization technique is very widely used (50,000 procedures per year in
France and 500,000 operations per year in the United States) but is however limited by the reappearance, in the months following the operation, of a new lesion at the dilated site, or restenosis, in approximately 30% of cases.
Les divers traitements proposes pour traiter ce type de lésions sont résumées dans l'article de FELDMAN et STEG : "Perspective de la thérapie génique de la resténose" (Médecine/Sciences, synthèse 1996, 12, 47-55). The various treatments proposed to treat this type of lesion are summarized in the article by FELDMAN and STEG: "Perspective of gene therapy for restenosis" (Medicine / Sciences, synthesis 1996, 12, 47-55).
Deux mécanismes sont responsables des resténoses l'hyperplasie intimale et le remodelage artériel. Le premier de ces mécanismes, l'hyperplasie intimale est due à la prolifération des cellules musculaires lisses dans l'intima, qui aboutit à la synthèse d'une volumineuse matrice extra cellulaire. Cette activation serait induite par la libération locale de facteurs de croissance, et de cytokines, ainsi que par la suppression de la synthèse de certains peptides endothéliaux antiproliférants. Le second mécanisme, le remodelage artériel, consiste en une réduction du calibre de l'artère sans modification de l'épaisseur de la paroi, et donc sans prolifération de cellules. Two mechanisms are responsible for restenosis of intimal hyperplasia and arterial reshaping. The first of these mechanisms, intimal hyperplasia is due to the proliferation of smooth muscle cells in the intima, which results in the synthesis of a bulky extra cellular matrix. This activation would be induced by the local release of growth factors, and cytokines, as well as by the suppression of the synthesis of certain antiproliferative endothelial peptides. The second mechanism, arterial remodeling, consists in reducing the caliber of the artery without modifying the thickness of the wall, and therefore without proliferation of cells.
Ces auteurs décrivent diverses tentatives destinées à inhiber l'hyperplasie intimale, par thérapie génique, mais dont les résultats se sont révélés peu satisfaisants, pour diverses raisons. L'inéfficacité du transfert est une des raisons généralement invoquée pour expliquer ces résultats. These authors describe various attempts to inhibit intimal hyperplasia, by gene therapy, but the results of which have proved unsatisfactory, for various reasons. The ineffectiveness of the transfer is one of the reasons generally cited to explain these results.
Ce problème a été partiellement résolu par l'utilisation de vecteurs adénoviraux, mais d'autres problèmes sont apparus, liés à l'immunogénicité de ces virus, au risque de recombinaison avec des adénovirus sauvages ou au risque de dissémination de ces vecteurs dans la circulation systémique.This problem was partially solved by the use of adenoviral vectors, but other problems appeared, related to the immunogenicity of these viruses, to the risk of recombination with wild adenoviruses or to the risk of dissemination of these vectors in the circulation. systemic.
Ces auteurs citent l'utilisation de séquences promotrices spécifiques des cellules vasculaires, comme la préproendothéline, ou des complexes adénovirus-ligand, comme constituant des voies de recherche très intéressantes, sans pour autant développer ces aspects. These authors cite the use of specific promoter sequences of vascular cells, such as preproendothelin, or adenovirus-ligand complexes, as constituting very interesting research avenues, without however developing these aspects.
La demande WO 96/05.321 (Rhone Poulenc Rorer S.A.) décrit aussi des adénovirus recombinants défectifs comportant un gène suicide pour le traitement de la resténose. Le gène suicide peut être placé sous le contrôle d'un promoteur actif dans les cellules musculaires lisses vasculaires. Seul le promoteur de l'actinie a du muscle lisse est cité dans le cadre de ce mode de mise en oeuvre. Application WO 96/05/05 (Rhone Poulenc Rorer S.A.) also describes defective recombinant adenoviruses comprising a suicide gene for the treatment of restenosis. The suicide gene can be placed under the control of an active promoter in vascular smooth muscle cells. Only the promoter of smooth muscle actinia is cited in the context of this embodiment.
Aucun exemple d'utilisation d'une telle construction ne vient illustrer cette demande.No example of the use of such a construction illustrates this request.
Les protéines constituant les muscles lisses ont fait l'objet d'études parcellaires. Ainsi, la protéine SM 22, qui constitue un des premiers marqueurs à apparaître lors de la différenciation des cellules de muscles lisses, a été étudiée et la partie codante de son gène a été séquencée chez la souris (SOLWAY et AL, 1995, J. Biol. Chem, 270,22, 13460-13469) et chez le rat (KEMP et AL, 1995, BIOCHEM. J. The proteins constituting smooth muscles have been the subject of fragmented studies. Thus, the protein SM 22, which constitutes one of the first markers to appear during the differentiation of smooth muscle cells, has been studied and the coding part of its gene has been sequenced in mice (SOLWAY et AL, 1995, J. Biol. Chem, 270.22, 13460-13469) and in the rat (KEMP et AL, 1995, BIOCHEM. J.
310,1037-1043).310.1037-1043).
Les séquences du gène de poulet et du gène humain ont aussi été déterminés (Nishida et al, 1991, Biochem. Int., 23,663-668 pour le gène de poulet ; Thweatt et al, 1992,
Biochem. Biophyse. Res. Comm., 187,1-7 pour le gène humain).The sequences of the chicken gene and the human gene have also been determined (Nishida et al, 1991, Biochem. Int., 23,663-668 for the chicken gene; Thweatt et al, 1992,
Biochem. Biophysis. Res. Comm., 187.1-7 for the human gene).
Le gène codant pour la protéine SM 22 alpha chez la souris est composé de cinq exons et comprend 6,2 kb. I1 est présent en une seule copie dans le génome. SOLWAY et al. The gene coding for the protein SM 22 alpha in mice is composed of five exons and comprises 6.2 kb. It is present in a single copy in the genome. SOLWAY et al.
ont montré que les 441 paires de base en amont de la région codante du gène étaient nécessaires et suffisantes pour induire un taux important de transcription d'un gène reporteur, dans des cultures cellulaires primaires d'aortes de rats et dans les lignées A7r5. Ils ont d'autre part mis en évidence que les ARN messagers de ce gène étaient exprimés à des taux importants dans l'aorte, dans l'utérus, dans les poumons et dans l'intestin.showed that the 441 base pairs upstream of the coding region of the gene were necessary and sufficient to induce a high rate of transcription of a reporter gene, in primary cell cultures of rat aortas and in the A7r5 lines. They also demonstrated that the messenger RNAs of this gene were expressed at high levels in the aorta, in the uterus, in the lungs and in the intestine.
XEMP et al (1995, BIOCHEM. J. 310, 1037-1043.) ont cloné et séquencé le fragment de 1,9 kb en amont de la séquence codante du gène SM 22 de rat. Des délétions effectuées dans le fragment ont montré que la région du promoteur comprise entre les nucléotides +65 et -303 étaient plus actives qu'un fragment de 1,5 kb comprenant une partie importante de la région du gène non traduite, ce qui suggérerait la présence de séquences régulatrices à l'extrémité 5' du promoteur. XEMP et al (1995, BIOCHEM. J. 310, 1037-1043.) Cloned and sequenced the 1.9 kb fragment upstream of the coding sequence of the rat SM 22 gene. Deletions in the fragment have shown that the promoter region between nucleotides +65 and -303 were more active than a 1.5 kb fragment comprising a significant part of the region of the untranslated gene, which would suggest the presence of regulatory sequences at the 5 'end of the promoter.
OSBOURN et AL (1995, Gene, 154, 249-253) ont aussi étudié la région 5' en amont du gène SM 22 du rat. Ils ont mis en évidence la présence de deux introns dans cette région. OSBOURN and AL (1995, Gene, 154, 249-253) also studied the 5 'region upstream of the rat SM 22 gene. They highlighted the presence of two introns in this region.
On notera que ces études ont été faites in vitro en utilisant des cultures de cellules primaires de l'aorte, et non in vivo. Or, ces conditions d'expérimentation ne sont pas représentatives de l'activité des gènes dans les cellules de l'organisme. Note that these studies were done in vitro using primary aorta cell cultures, not in vivo. However, these experimental conditions are not representative of the activity of genes in the body's cells.
De plus, les études effectuées sur le gène de la souris ne concernent qu'une région très limitée de la partie non codante du gène située à l'extrémité 5', c'est-à-dire la partie en aval du nucléotide -441. In addition, studies carried out on the mouse gene concern only a very limited region of the non-coding part of the gene located at the 5 ′ end, that is to say the part downstream of the nucleotide -441. .
Le demandeur s'est attaché à identifier in vivo l'activité des diverses régions constituant la région en amont de la séquence codante exprimée du gène de la protéine SM 22. Il s'est d'autre part attaché à déterminer si des modifications dans cette séquence induisait les changements dans l'expression du gène dans les différents tissus. The applicant set out to identify in vivo the activity of the various regions constituting the region upstream of the expressed coding sequence of the gene for the SM 22 protein. It also set out to determine whether any modifications in this sequence induced changes in gene expression in different tissues.
Il a mis en évidence de manière surprenante qu'il était possible , en modifiant la région en 5' du gène de la protéine SM 22 de souris, d'obtenir une expression spécifique d'un gène reporteur dans les muscles lisses des artères et en particulier de l'aorte. He surprisingly demonstrated that it was possible, by modifying the 5 ′ region of the mouse SM 22 protein gene, to obtain a specific expression of a reporter gene in the smooth muscles of the arteries and in particular of the aorta.
La présente invention a donc pour objet une séquence d'ADN caractérisée en ce qu'elle comprend
- un fragment de la séquence en amont de la partie codante du gène de la protéine SM 22, ou dune séquence hybridant dans des conditions fortement stringentes à ladite séquence en amont, ledit fragment étant susceptible d'induire une expression spécifique in vivo de ce gène dans des cellules des artères, et
- une séquence codant pour une protéine, ou un ARN, d'intérêt thérapeutique
L'invention concerne également toute séquence nucléotidique d'origine naturelle ou obtenue par synthèse chimique présentant une homologie avec la séquence SEQID n'l d'au moins 70 *. The present invention therefore relates to a DNA sequence characterized in that it comprises
a fragment of the sequence upstream of the coding part of the gene for the SM 22 protein, or of a sequence hybridizing under highly stringent conditions to said upstream sequence, said fragment being capable of inducing a specific expression in vivo of this gene in artery cells, and
- a sequence coding for a protein, or an RNA, of therapeutic interest
The invention also relates to any nucleotide sequence of natural origin or obtained by chemical synthesis having homology with the sequence SEQID n'l of at least 70 *.
On entend par séquence nucléotidique d'origine naturelle, un fragment d'ADN complémentaire obtenu par transcription inverse de 1'ARN messager cellulaire ou encore un fragment d'ADN génomique obtenu après clivage de 1'ADN cellulaire à l'aide d'enzymes de restriction. The term “nucleotide sequence of natural origin” is intended to mean a fragment of complementary DNA obtained by reverse transcription of cellular messenger RNA or alternatively a fragment of genomic DNA obtained after cleavage of cellular DNA using enzymes. restriction.
On entend par séquence nucléotidique obtenue par synthèse chimique un fragment d'ADN de séquence connue généré par synthèse automatique de polynulcéotides, par exemple à l'aide d'un appareil automatique adapté. By nucleotide sequence obtained by chemical synthesis is meant a DNA fragment of known sequence generated by automatic synthesis of polynulceotides, for example using a suitable automatic device.
Une protéine d'intérêt thérapeutique ou un ARN, est susceptible d'inhiber la croissance des cellules du muscle lisse, d'activer la croissance des cellules endothéliales, de consolider les artères et/ou capable d'induire une réponse immunitaire cellulaire ou humorale. A protein of therapeutic interest, or RNA, is capable of inhibiting the growth of smooth muscle cells, of activating the growth of endothelial cells, of consolidating the arteries and / or capable of inducing a cellular or humoral immune response.
Pour la présente invention, le terme "conditions fortement stringentes" est utilisé dans le sens donné par
Maniatis et al., 1982 (Molecular cloning , A Laboratory
Manual, Cold Spring Harbor Lab. CSH, N.Y. USA ou l'une de ses récentes rééditions. A titre préféré, les conditions d'hybridation sont telles que décrites par Maniatis (édition de 1982). Trois lavages destinés à éliminer les fragments non hybridés sont nécessaires et sont effectués à 65 C en présence de 0,2 SSC et 0,1 % SDS, en l'absence de formamide. For the present invention, the term "strongly stringent conditions" is used in the sense given by
Maniatis et al., 1982 (Molecular cloning, A Laboratory
Manual, Cold Spring Harbor Lab. CSH, NY USA or one of its recent reissues. Preferably, the hybridization conditions are as described by Maniatis (1982 edition). Three washes intended to remove the non-hybridized fragments are necessary and are carried out at 65 ° C. in the presence of 0.2 SSC and 0.1% SDS, in the absence of formamide.
De manière avantageuse, ladite séquence comprend un fragment de la séquence comprise entre les nucléotides -2126 et +4135, dont la séquence SEQ ID n'l est donnée en annexe, ou de la séquence comprise entre les nucléotides -2126 et +65 dont la séquence SEQID n 2 est donnée en annexe. Advantageously, said sequence comprises a fragment of the sequence between nucleotides -2126 and +4135, whose sequence SEQ ID n'l is given in the appendix, or of the sequence between nucleotides -2126 and +65 whose SEQID sequence n 2 is given in the appendix.
Un tel fragment peut en particulier comprendre au moins une partie de la séquence SEQ ID N 3 qui correspond à la partie en amont de l'extrémité 5' de la partie codante comprise entre les nucléotides -2126 et -1340. Une telle séquence SEQ ID N 3 dont la séquence est donnée en annexe constitue un objet de la présente invention. Les séquences
SEQ ID n 2 et SEQ ID n 1 sont comprises respectivement dans les plasmides p2126nlz et p2126INTnlz portées par les souches déposées le 25 mars 1996 auprès de la Collection
Nationale de Culture de Microorganismes de l'institut
Pasteur (CNCM) respectivement sous les n I-1685 et I-1686. Such a fragment can in particular comprise at least part of the sequence SEQ ID N 3 which corresponds to the part upstream of the 5 ′ end of the coding part comprised between the nucleotides -2126 and -1340. Such a sequence SEQ ID N 3, the sequence of which is given in the appendix, constitutes an object of the present invention. The sequences
SEQ ID No. 2 and SEQ ID No. 1 are respectively included in the plasmids p2126nlz and p2126INTnlz carried by the strains deposited on March 25, 1996 with the Collection.
National Culture of Microorganisms of the institute
Pasteur (CNCM) respectively under n I-1685 and I-1686.
L'invention a également pour objet les séquences hybridant dans des conditions de forte stringence avec les séquences
SEQ ID n 1, SEQ ID n 2 et SEQ ID n 3.The subject of the invention is also the sequences hybridizing under conditions of high stringency with the sequences
SEQ ID no 1, SEQ ID no 2 and SEQ ID no 3.
La présente invention n'est néanmoins pas restreinte à des séquences contenant des fragments du gène de souris, mais concerne toute autre séquence de toute autre espèce ayant les mêmes propriétés, à savoir d'induire spécifiquement une expression d'un gène dans les cellules des artères. Ainsi, l'homme du métier pourra avantageusement se référer à l'article de KEMP et AL (1995, précédement cité) qui décrit la séquence en amont du gène de rat de la protéine SM 22. La présente invention couvre aussi toute séquence comprenant des fragments des séquences en amont de gènes de la protéine SM 22, modifiées par exemple par délétion de certaines structures qui conservent des fonctions identiques ou similaires à celles de la séquence complète. The present invention is nevertheless not restricted to sequences containing fragments of the mouse gene, but relates to any other sequence of any other species having the same properties, namely to specifically induce expression of a gene in the cells of arteries. Thus, a person skilled in the art can advantageously refer to the article by KEMP et AL (1995, previously cited) which describes the sequence upstream of the rat gene of the SM 22 protein. The present invention also covers any sequence comprising fragments of the upstream sequences of SM 22 protein genes, modified for example by deletion of certain structures which retain functions identical or similar to those of the complete sequence.
La protéine d'intérêt thérapeutique peut être une protéine induisant la formation d'un composé cytotoxique, telle que la thymidine kinase du virus de l'herpès. Cette protéine présente la particularité de transformer le ganciclovir (Merck Index, référence 4262), un analogue de la guanosine, en un dérivé qui bloque la synthèse de 1'ADN dans les cellules en réplication. L'introduction d'un gène codant pour cette protéine dans les séquences selon la présente invention permet donc de bloquer la prolifération des cellules dans le cas de l'hyperplasie intimale. Une séquence codant la thymidine kinase est notamment décrite par Caruso et Klatzmann (1992, Proc. Natl. Acad. Sci., USA, 89, 182-186). The protein of therapeutic interest can be a protein inducing the formation of a cytotoxic compound, such as the herpes virus thymidine kinase. This protein has the particularity of transforming ganciclovir (Merck Index, reference 4262), an analogue of guanosine, into a derivative which blocks the synthesis of DNA in replicating cells. The introduction of a gene coding for this protein in the sequences according to the present invention therefore makes it possible to block the proliferation of cells in the case of intimal hyperplasia. A sequence encoding thymidine kinase is described in particular by Caruso and Klatzmann (1992, Proc. Natl. Acad. Sci., USA, 89, 182-186).
Ladite protéine d'intérêt thérapeutique peut aussi être une protéine présentant un effet cytostatique, telle que la protéine codée par le gène Rb (Chang et al., 1995, Science, 267, 518-522), ou par le gène eNOS (Hamon et al., 1994,
Circulation, 90, 1357-1362)..Said protein of therapeutic interest can also be a protein exhibiting a cytostatic effect, such as the protein encoded by the Rb gene (Chang et al., 1995, Science, 267, 518-522), or by the eNOS gene (Hamon and al., 1994,
Traffic, 90, 1357-1362).
Elle peut aussi être une protéine présentant une activité lipolytique, telle qu'une lipoprotéine lipase. De telles protéines sont codées par les séquences décrites par
Reyner (1995, Nature Genetics, 10, 28) et Ming Sun Liu (1994, J. Biol. Chem, 269-11417).It can also be a protein exhibiting lipolytic activity, such as a lipoprotein lipase. Such proteins are encoded by the sequences described by
Reyner (1995, Nature Genetics, 10, 28) and Ming Sun Liu (1994, J. Biol. Chem, 269-11417).
Elle peut aussi être un facteur de croissance des cellules endothéliales. Une telle protéine peut être en particulier une interleukine. It can also be a growth factor for endothelial cells. Such a protein can in particular be an interleukin.
Elle peut être une protéine musculaire, telle que la myosine, ou l'actine, ou encore une protéine de structure tissulaire telle que le collagène ou l'élastine. It can be a muscle protein, such as myosin, or actin, or a tissue-structure protein such as collagen or elastin.
Elle peut être une protéine induisant une réponse immunitaire telle que décrite dans la demande WO 90 11092, et en particulier un antigène viral tel que la glycoprotéine gpl20 ou la protéine Nef du VIH (virus de l'immunodeficience humaine). It can be a protein inducing an immune response as described in application WO 90 11092, and in particular a viral antigen such as the glycoprotein gpl20 or the Nef protein of HIV (human immunodeficiency virus).
De manière générale, ladite protéine peut être une ou plusieurs protéines présentant un intérêt thérapeutique ou vaccinal, telles que des protéines d'intérêt immunothérapeutique, par exemple des interleukines, les facteurs de croissance, par exemple les facteurs de croissance des fibroblastes (FGF) ou le NGF (Nerve Growth
Factor), des protéines pouvant induire une réponse immunitaire, que ce soit une immunité humorale, cytotoxique ou cellulaire, ou des protéines permettant de complémenter l'activité d'un gène normalement exprimé chez l'individu à traiter mais qui ne l'est plus, soit par mutation ou délétion de sa séquence.In general, said protein can be one or more proteins of therapeutic or vaccine interest, such as proteins of immunotherapeutic interest, for example interleukins, growth factors, for example fibroblast growth factors (FGF) or NGF (Nerve Growth
Factor), proteins which can induce an immune response, whether humoral, cytotoxic or cellular immunity, or proteins which make it possible to complement the activity of a gene normally expressed in the individual to be treated but which is no longer so , either by mutation or deletion of its sequence.
Cette séquence peut aussi coder pour un ARN d'intérêt thérapeutique. Un tel ARN peut être 1'ARN antisens de la protéine p 53 ou un ARN tel que décrit dans la demande WO 90 11092, déposée par la société VICAL. This sequence can also code for an RNA of therapeutic interest. Such an RNA can be the antisense RNA of the protein p 53 or an RNA as described in application WO 90 11092, filed by the company VICAL.
La présente invention a en outre pour objet des vecteurs caractérisés en ce qu'ils contiennent une séquence selon l'invention, telle que décrite ci-dessus. Un tel vecteur peut contenir tout autre séquence d'ADN nécessaire à l'expression de la protéine, ou de 1'ARN, d'intérêt thérapeutique dans les tissus cibles, et en particulier peut contenir une origine de réplication efficace dans les cellules des artères, en particulier dans les cellules du muscle lisse. The present invention further relates to vectors characterized in that they contain a sequence according to the invention, as described above. Such a vector may contain any other DNA sequence necessary for the expression of the protein, or RNA, of therapeutic interest in the target tissues, and in particular may contain an origin of efficient replication in the artery cells. , especially in smooth muscle cells.
Un tel vecteur peut comprendre des séquences permettant la recombinaison homologue chez l'organisme traité, spécifique du gène à remplacer, lesdites séquences étant placées en amont et en aval de la séquence selon l'invention. Du fait de la présence de telles séquences, le gène non désiré, présent dans l'organisme traité sera remplacé par le gène porté par le vecteur ou la séquence et que l'on désire voir s'exprimer dans l'organisme. Such a vector may comprise sequences allowing homologous recombination in the organism treated, specific for the gene to be replaced, said sequences being placed upstream and downstream of the sequence according to the invention. Due to the presence of such sequences, the unwanted gene present in the treated organism will be replaced by the gene carried by the vector or the sequence which is desired to be expressed in the organism.
Une telle méthode de recombinaison homologue peut être du type de celle décrite par Le Mouellic et al., (1990,
Proc. Nat. Acad. Sci. USA , 87, 4712-4716) ou dans la demande PCT WO 91/06.667.Such a homologous recombination method can be of the type described by Le Mouellic et al., (1990,
Proc. Nat. Acad. Sci. USA, 87, 4712-4716) or in PCT application WO 91 / 06.667.
Un tel vecteur peut être un vecteur dérivé d'un adénovirus. Des adénovirus adaptés à la mise en oeuvre de la présente invention sont en particulier ceux décrits par
FELDMAN et STEG (1996, précédemment cité) ou OHNO et al (1994, Sciences, 265, 781-784) ou encore dans la demande FR 94.03.151 (Institut Pasteur, Inserm). Ces virus sont généralement rejetés par l'individu, du fait de leur trop forte immunogénicité. Néanmoins, des souches de ces virus ont été sélectionnées afin de diminuer leur caractère immunogène. En tout état de cause, ces vecteurs, même présentant une forte immunogénicité, peuvent être utilisés dans le cadre de la présente invention, car les artères sont traitées durant des périodes de temps relativement courtes, de l'ordre de quelques semaines, compatibles avec les temps de rejet des adénovirus par le système immunitaire de l'hôte.Such a vector can be a vector derived from an adenovirus. Adenoviruses suitable for the implementation of the present invention are in particular those described by
FELDMAN and STEG (1996, previously cited) or OHNO et al (1994, Sciences, 265, 781-784) or in application FR 94.03.151 (Institut Pasteur, Inserm). These viruses are generally rejected by the individual, due to their too strong immunogenicity. Nevertheless, strains of these viruses have been selected in order to reduce their immunogenic character. In any event, these vectors, even having a strong immunogenicity, can be used in the context of the present invention, because the arteries are treated for relatively short periods of time, of the order of a few weeks, compatible with the Adenovirus rejection time by the host immune system.
On notera néanmoins que l'introduction des séquences selon la présente invention dans les vecteurs décrits cidessus n'est pas indispensable, et que les cellules des artères peuvent être directement transfectées par de 1'ADN comprenant ces séquences. It should nevertheless be noted that the introduction of the sequences according to the present invention into the vectors described above is not essential, and that the cells of the arteries can be directly transfected with DNA comprising these sequences.
Les séquences nucléiques selon la présente invention peuvent être introduites après couplage covalent de l'acide nucléique avec des composés favorisant leur pénétration dans les cellules ou leur transport vers le noyau, les conjugués résultants étant éventuellement encapsulés dans des microparticules polymères, comme dans la demande internationale WO 94/27238 de Meidsorb Technologies
International. The nucleic acid sequences according to the present invention can be introduced after covalent coupling of the nucleic acid with compounds promoting their penetration into cells or their transport to the nucleus, the resulting conjugates being optionally encapsulated in polymeric microparticles, as in international application WO 94/27238 from Meidsorb Technologies
International.
Selon un autre mode de réalisation, les séquences nucléiques peuvent être incluses dans un système de transfection comprenant des polypeptides favorisant leur pénétration dans les cellules, comme dans la demande internationale WO 95/10534 de Seikagaku Corporation. According to another embodiment, the nucleic sequences can be included in a transfection system comprising polypeptides promoting their penetration into cells, as in international application WO 95/10534 from Seikagaku Corporation.
Ces vecteurs ou séquences peuvent être administrés in situ par tout moyen connu de l'homme du métier. Ainsi, ils peuvent être délivrés in situ à l'aide d'un cathéter à ballonnet recouvert de canaux, tel que décrit par FELDMAN et STEG (1996, précédemment cité). These vectors or sequences can be administered in situ by any means known to those skilled in the art. Thus, they can be delivered in situ using a balloon catheter covered with channels, as described by FELDMAN and STEG (1996, previously cited).
Ils peuvent aussi être administrés au cours d'une opération, ou en dénudant l'aorte. Un autre mode d'administration consiste à introduire un grillage de faible maillage imprégné d'ADN comprenant ces séquences, le long de l'aorte ; tel que décrit par Feldman et al. (1995,
J. Clin. Invest., 95, 2662-2671).They can also be administered during an operation, or by stripping the aorta. Another mode of administration consists in introducing a mesh of small mesh impregnated with DNA comprising these sequences, along the aorta; as described by Feldman et al. (1995,
J. Clin. Invest., 95, 2662-2671).
Ces séquences ou vecteurs peuvent avantageusement être administrés sous la forme d'une composition les contenant, par exemple dans un gel facilitant leur transfection dans les cellules des artères. Un tel gel peut être un complexe de poly-L lysine et de lactose, tel que décrit par MIDOUX (1993, Nucleic Acid Research, 21, n 4, 871-878) ou du poloxamer 407 tel que décrit par PASTORE (1994,
Circulation, 90, I-517). Ils peuvent aussi être mis en solution dans une solution tamponnée ou être associés à des liposomes.These sequences or vectors can advantageously be administered in the form of a composition containing them, for example in a gel facilitating their transfection into the cells of the arteries. Such a gel can be a poly-L lysine and lactose complex, as described by MIDOUX (1993, Nucleic Acid Research, 21, n 4, 871-878) or poloxamer 407 as described by PASTORE (1994,
Traffic, 90, I-517). They can also be dissolved in a buffered solution or be combined with liposomes.
La présente invention est en outre relative à des médicaments contenant de telles séquences, vecteurs ou compositions, ainsi qu'à des compositions pharmaceutiques les contenant en quantités pharmaceutiquement efficaces ainsi que des excipients pharmaceutiquement compatibles. The present invention further relates to medicaments containing such sequences, vectors or compositions, as well as to pharmaceutical compositions containing them in pharmaceutically effective amounts as well as pharmaceutically compatible excipients.
De tels séquences, vecteurs ou compositions peuvent être avantageusement utilisés pour la fabrication de médicaments pour la délivrance au niveau des artères d'un
ADN (ADNc ou ADN génomique) pouvant exprimer notamment un gène codant pour une protéine d'intérêt, pour le traitement des maladies coronariennes, et en particulier pour le traitement de la resténose. Elles peuvent néanmoins être aussi utilisées pour la fabrication d'un médicament pour le traitement de mutations fragilisant les vaisseaux. Un tel médicament pourrait, par exemple, comprendre une séquence ou un vecteur selon l'invention capable d'exprimer un gène codant pour une protéine normale de la desmine ou une protéine d'adhésion du muscle du type CAM.Such sequences, vectors or compositions can be advantageously used for the manufacture of medicaments for the delivery to the arteries of a
DNA (cDNA or genomic DNA) which can express in particular a gene coding for a protein of interest, for the treatment of coronary heart diseases, and in particular for the treatment of restenosis. They can nevertheless also be used for the manufacture of a medicament for the treatment of mutations which weaken the vessels. Such a medicament could, for example, comprise a sequence or a vector according to the invention capable of expressing a gene coding for a normal protein of desmin or a muscle adhesion protein of CAM type.
La présente invention a aussi pour objet des ARN exprimés à partir des séquences et vecteurs objets de la présente invention, et en particulier des ARN messager. The present invention also relates to RNAs expressed from the sequences and vectors which are the subject of the present invention, and in particular messenger RNAs.
La présente invention a aussi pour objet un procédé de criblage de molécules in vitro, en vue de tester leur activité sur les séquences régulatrices du gène codant pour la protéine SM 22. Un tel procédé comprendra, par exemple, une première étape suivant laquelle on transfecte des cellules avec une séquence ou un vecteur selon l'invention, comprenant un gène reporteur placé sous le contrôle de tout ou partie de la séquence du promoteur du gène codant pour la protéine SM 22. Dans une seconde étape, les cellules ainsi transfectées sont incubées en présence de la molécule à tester, puis l'expression du gène reporteur est quantifiée. The present invention also relates to a method for screening molecules in vitro, with a view to testing their activity on the regulatory sequences of the gene coding for the SM protein 22. Such a method will comprise, for example, a first step according to which one transfects cells with a sequence or a vector according to the invention, comprising a reporter gene placed under the control of all or part of the promoter sequence of the gene coding for the SM 22 protein. In a second step, the cells thus transfected are incubated in the presence of the molecule to be tested, then the expression of the reporter gene is quantified.
Les cellules utilisées pour la transfection sont avantageusement des cellules de muscle lisse, en particulier des cellules de l'aorte, soit sous la forme d'une culture primaire, soit sous la forme d'une lignée cellulaire stable. The cells used for the transfection are advantageously smooth muscle cells, in particular aortic cells, either in the form of a primary culture, or in the form of a stable cell line.
Dans le cas où les cellules sont transfectées par des constructions telles que p2126nlz ou p2126INTnlz, la quantification de la beta-galactosidase produite sera avantageusement effectuée par lecture optique, par exemple en utilisant la trousse de détection commercialisée par
Boehringer sous la référence 1 669 893 (catalogue
Boehringer-Mannheim - Biochemicals , 1996, page 236, béta-Gal Reporter Gene Assay, Chemiluminescent).In the case where the cells are transfected with constructs such as p2126nlz or p2126INTnlz, the quantification of the beta-galactosidase produced will advantageously be carried out by optical reading, for example using the detection kit marketed by
Boehringer under reference 1 669 893 (catalog
Boehringer-Mannheim - Biochemicals, 1996, page 236, beta-Gal Reporter Gene Assay, Chemiluminescent).
Dans un autre mode de réalisation du procédé de criblage in vitro selon l'invention, le gène reporteur est le gène codant pour la luciférase. Dans ce cas, la quantification de l'expression de la luciférase est avantageusement effectuée par chimioluminescence, par exemple au moyen de la trousse de diagnostic commercialisée par Boehringer sous la référence 1 758 241 (catalogue
Boehringer-Mannheim Biochemicals , 1996, Luciferase
Reporter Gene Assay).In another embodiment of the in vitro screening method according to the invention, the reporter gene is the gene coding for luciferase. In this case, the quantification of the expression of luciferase is advantageously carried out by chemiluminescence, for example by means of the diagnostic kit marketed by Boehringer under the reference 1 758 241 (catalog
Boehringer-Mannheim Biochemicals, 1996, Luciferase
Reporter Gene Assay).
La présente invention est aussi relative à des animaux transgéniques et en particulier des souris portant une séquence ou un vecteur tel que défini ci-dessus dans lequel le gène codant pour la protéine d'intérêt thérapeutique est remplacée par un gène reporteur. The present invention also relates to transgenic animals and in particular to mice carrying a sequence or a vector as defined above in which the gene coding for the protein of therapeutic interest is replaced by a reporter gene.
La présente invention est enfin relative à un procédé de détection de mutations de la séquence en amont de la partie codante du gène de la protéine SM22. De telles mutations sont en effet susceptibles de modifier l'expression du gène codant pour la protéine SM22, en particulier diminuer ou même abolir l'expression de ce gène dans les muscles lisses. De telles mutations seraient de nature à entrainer une modification du fonctionnement du muscle lisse, la protéine SM22 étant apparentée à une famille de protéines impliquées dans la régulation de la fixation du calcium, du type calponine (Ayme-Southgate et al, 1989, J. Cell. Biol.). Un tel procédé de détection de mutations peut être avantageusement le procédé objet de la demande de brevet français FR-93 10821. The present invention finally relates to a method for detecting mutations in the sequence upstream of the coding part of the gene for the protein SM22. Such mutations are indeed capable of modifying the expression of the gene coding for the protein SM22, in particular reducing or even abolishing the expression of this gene in smooth muscles. Such mutations would be likely to cause a modification of the smooth muscle functioning, the SM22 protein being related to a family of proteins involved in the regulation of calcium fixation, of the calponin type (Ayme-Southgate et al, 1989, J. Cell. Biol.). Such a mutation detection method can advantageously be the method which is the subject of French patent application FR-93 10821.
De manière complémentaire, des séquences selon l'invention modifiées de telle sorte qu'elles permettent une augmentation de l'expression du gène SM22 font également partie de l'invention. In addition, sequences according to the invention modified so that they allow an increase in the expression of the SM22 gene are also part of the invention.
De telles souris transgéniques peuvent être utilisées pour cribler des molécules pour leur activité sur les séquences régulatrices gène codant pour la protéine SM 22. Such transgenic mice can be used to screen molecules for their activity on the regulatory sequences gene encoding the protein SM 22.
Des molécules peuvent être administrées à des souris, puis après sacrifice, des coupes histologiques sont effectuées afin de mettre en évidence les tissus colorés par le gène reporteur.Molecules can be administered to mice, then after sacrifice, histological sections are made in order to highlight the tissues stained by the reporter gene.
Pour la mise en oeuvre de la présente invention, l'homme du métier pourra avantageusement se référer au manuel suivant : "SAMBROK et al (Molecular cloning, A
Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, New
York, 1989), ou à l'une de ses récentes rééditions.For the implementation of the present invention, a person skilled in the art may advantageously refer to the following manual: "SAMBROK et al (Molecular cloning, A
Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory Press, New
York, 1989), or one of its recent reissues.
La présente invention est illustrée sans pour autant être limitée par les exemples qui suivent
La figure 1 représente la carte de restriction et la structure exon/intron du site SM 22, comprenant la région -2474 à +6030 (par rapport au site d'initiation de la transcription). Les exons sont représentés par des carrés blancs tandis que les flèches indiquent la position des séquences répétées de type B1.The present invention is illustrated without however being limited by the following examples
FIG. 1 represents the restriction map and the exon / intron structure of the SM 22 site, comprising the region -2474 to +6030 (relative to the site of initiation of transcription). The exons are represented by white squares while the arrows indicate the position of the B1 type repeat sequences.
La figure 2 représente l'alignement de trois séquences répétées de type B1, dans lesquelles les échanges de base sont indiquées. FIG. 2 represents the alignment of three repetitive sequences of type B1, in which the basic exchanges are indicated.
La figure 3 est un autoradiogramme illustrant l'identification du site d'initiation de la transcription. Figure 3 is an autoradiogram illustrating the identification of the site of initiation of transcription.
Le puits P correspond à l'amorce utilisée.Well P corresponds to the primer used.
La figure 4 représente la séquence de la région 5' en amont du site d'initiation de la transcription, et de l'exon du gène SM 22. Les sites de fixation des différents facteurs sont indiqués, ainsi que les différentes séquences concensus. Les lignes discontinues indiquent la position des séquences répétées de type B1. FIG. 4 represents the sequence of the 5 ′ region upstream of the transcription initiation site, and of the exon of the SM 22 gene. The sites for attachment of the different factors are indicated, as well as the different concensus sequences. The broken lines indicate the position of the repeated sequences of type B1.
La figure 5 illustre la fabrication du plasmide p352nlz. Figure 5 illustrates the manufacture of the plasmid p352nlz.
La figure 6 illustre la fabrication du plasmide p2126 nlz. FIG. 6 illustrates the manufacture of the plasmid p2126 nlz.
La figure 7 illustre la fabrication du plasmide p2126INTnlz. Figure 7 illustrates the manufacture of the plasmid p2126INTnlz.
Les figures 8A et 8B illustrent l'expression du gène lacZ dans des embryons de souris transgéniques. Les figures 8A, 8B, représentent respectivement des embryons aux stades 12,5 et 15,5 jours. Figures 8A and 8B illustrate the expression of the lacZ gene in transgenic mouse embryos. Figures 8A, 8B show embryos in the 12.5 and 15.5 day stages, respectively.
Les figures 9A à 9D représentent des coupes histologiques d'embryons colorés à l'aide de lacZ. La figure 9A représente une coupe d'un embryon au stade 12,5 jours au niveau du coeur, montrant une coloration intense exclusivement dans le myocarde du ventricule droit (RV) et dans les parois des artères. (abréviations : AA : coude de la quatrième artère aortique ; CA : artère carotidienne ; E : oesophage ; li : ventricule gauche ; PA : partie proximale de l'aorte ; PT : tronc pulmonaire ; RA : atrium droit ; RV : ventricule droit ; T : trachée ; V: veine cardinale droite et gauche). Figures 9A to 9D show histological sections of embryos stained with lacZ. FIG. 9A represents a section of an embryo at the 12.5 day stage at the level of the heart, showing an intense staining exclusively in the myocardium of the right ventricle (RV) and in the walls of the arteries. (abbreviations: AA: elbow of the fourth aortic artery; CA: carotid artery; E: esophagus; li: left ventricle; PA: proximal part of the aorta; PT: pulmonary trunk; RA: right atrium; RV: right ventricle; T: trachea; V: right and left cardinal vein).
La figure 9B représente une coupe à travers la région abdominale d'un embryon au stade 14,5 jours, montrant une coloration des artères ombilicales (UA) et l'absence de marquage des viscères (B: vessie ; D : duodenum ; H : gros intestin ; L: foie ; M : intestin grêle ; ST : estomac). FIG. 9B represents a section through the abdominal region of an embryo at the 14.5 day stage, showing a coloration of the umbilical arteries (AU) and the absence of labeling of the viscera (B: bladder; D: duodenum; H: large intestine; L: liver; M: small intestine; ST: stomach).
La figure 9D est une coupe à travers les segments de la queue au stade 12,5 jours montrant le marquage dans le myotome (my) et l'artère de la queue (a). Figure 9D is a section through the tail segments at the 12.5 day stage showing the labeling in the myotome (my) and the tail artery (a).
La figure 9C est un agrandissement de la partie de la photographie correspondant à l'artère ombilicale au stade de 12,5 jours, montrant un marquage exclusif de la couche musculaire (m) et une absence de marquage de l'endothélium (e). FIG. 9C is an enlargement of the part of the photograph corresponding to the umbilical artery at the 12.5 day stage, showing an exclusive marking of the muscular layer (m) and an absence of marking of the endothelium (e).
Les figures 10A à 10C illustrent l'expression du transgène dans des souris adultes. Figures 10A to 10C illustrate the expression of the transgene in adult mice.
La figure 10A représente une vue de dessus de l'ensemble du coeur montrant un intense marquage de l'aorte (a) et de l'artère pulmonaire (pa) et une absence de marquage de la veine cave (vc). Les figures 10B et 10C sont des coupes à travers la couche de muscle lisse (sm) du colon de l'adulte et d'une artère mésentère adjacente (ma). FIG. 10A represents a top view of the whole of the heart showing an intense marking of the aorta (a) and of the pulmonary artery (pa) and an absence of marking of the vena cava (vc). Figures 10B and 10C are sections through the smooth muscle layer (sm) of the adult colon and an adjacent mesentery artery (ma).
Le marquage de lacZ (figure 10B) montre que l'expression du transgène est restreinte à l'artère, tandis que l'immunofluorescence avec des anticorps SM 22 (figure 10C) met en évidence l'expression du gène SM 22 endogène dans les cellules du muscle lisse aussi bien de l'artère que du colon.The lacZ labeling (FIG. 10B) shows that the expression of the transgene is restricted to the artery, while the immunofluorescence with SM 22 antibodies (FIG. 10C) highlights the expression of the endogenous SM 22 gene in the cells. smooth muscle from both the artery and the colon.
La figure 11 représente un vecteur comportant les régions régulatrices du gène SM 22 et le gène codant la thymidine kinase du virus de l'herpès. FIG. 11 represents a vector comprising the regulatory regions of the SM 22 gene and the gene encoding the thymidine kinase of the herpes virus.
EXEMPLES Matériels et méthodes
1/ Clonaae et caractérisation du gène de la souris SM 22
Environ 106 phages recombinants d'une banque génomique de souris c57/bl construite dans le phage delta-EMBL 3 (fourni par Dr D. Plachov, Münster, Allemagne) ont été criblées en utilisant le fragment BAL I/Eco RV de 890 bp de 1'ADN complémentaire de la protéine de souris SM22
Almendral et al, 1989 ; Exp. Cell Res. 181, 518-530), comme sonde. La sonde a été marquée radioactivement par initiation aléatoire et 1'ADN a été hybridée sur des filtres laissés durant une nuit à 65-C dans un tampon de
Church. Les filtres ont été ensuite lavés dans du 0,2 X
SSC/0,1 % SDS à 65 c et des plaques positives ont été purifiées et homogénéisées par trois recriblages successifs dans des conditions identiques. L'un des clones isolés s'est révélé contenir un locus SM 22 entier. I1 a été ensuite cartographie à l'aide d'enzymes de restriction et sous-cloné. Afin d'éviter des réarrangements durant les procédures de clonage, une analyse par hybridation de type
Southern de 1'ADN génomique de souris et des clones génomiques a été effectuée et les figures de restriction des fragments ont été comparées.EXAMPLES Materials and methods
1 / Clonaae and characterization of the mouse gene SM 22
About 106 recombinant phages from a c57 / bl mouse genomic library constructed in phage delta-EMBL 3 (supplied by Dr D. Plachov, Münster, Germany) were screened using the BAL I / Eco RV fragment of 890 bp from The complementary DNA of the mouse protein SM22
Almendral et al, 1989; Exp. Cell Res. 181, 518-530), as a probe. The probe was radioactively labeled by random initiation and the DNA was hybridized on filters left overnight at 65 ° C in a buffer.
Church. Filters were then washed in 0.2 X
SSC / 0.1% SDS at 65 c and positive plates were purified and homogenized by three successive screenings under identical conditions. One of the isolated clones was found to contain an entire SM 22 locus. It was then mapped using restriction enzymes and subcloned. In order to avoid rearrangements during the cloning procedures, a type hybridization analysis
Southern mouse genomic DNA and genomic clones were performed and restriction figures of the fragments were compared.
La séquence du gène SM 22 a été déterminée sur les deux brins par la méthode de terminaison de chaîne (
Sanger et al, 1977, Proc. Natl. Acad Sci. 74, 5463) en utilisant le kit Sequenase V2.0 (United States Biochemical,
Cleveland, Ohio).The sequence of the SM 22 gene was determined on both strands by the chain termination method (
Sanger et al, 1977, Proc. Natl. Acad Sci. 74, 5463) using the Sequenase V2.0 kit (United States Biochemical,
Cleveland, Ohio).
2. Hvbridation de tvpe Northern extension par amorce, 5'RACE, et analyse de protection par RNAse
De 1'ARN total de lignées cellulaires et de tissu de souris adulte a été isolée par la méthode de Chirgwin et al, (1979, Biochemistry, 18, 5294-5299) modifiés. Pour l'isolement des ARN messager, le kit Oligotex (Quiagen Inc,
Chatsworth, CA) a été utilisé en suivant les instructions du fabricant.2. Hybridization of tvpe Northern extension by primer, 5'RACE, and protection analysis by RNAse
Total RNA from cell lines and adult mouse tissue was isolated by the method of Chirgwin et al, (1979, Biochemistry, 18, 5294-5299) modified. For the isolation of messenger RNAs, the Oligotex kit (Quiagen Inc,
Chatsworth, CA) was used following the manufacturer's instructions.
Les analyses par hybridation de type Northern ont été effectuées en utilisant des gels d'agarose contenant du formaldéhyde et par hybridation capillaire sur des membranes Hybond-N (Amersham Life Science, Little Chalfont,
Royaume Uni) selon les méthodes connus de l'homme du métier.The analyzes by Northern hybridization were carried out using agarose gels containing formaldehyde and by capillary hybridization on Hybond-N membranes (Amersham Life Science, Little Chalfont,
United Kingdom) according to methods known to those skilled in the art.
Pour les analyses par extension d'amorce, un oligonucléotide synthétique de 30 nucléotides (P27N1) complémentaire de la séquence +36 à +65 de 1'ADN complémentaire du gène SM 22 (5'-
AAGGCTTGGTCGTTTGTGGACTGGAAGGAG-3), a été marqué par de la polynucléotide kinase T4. 5 pg d'ARN messager d'utérus de souris ont été hybridés à 55 C avec 1-2 X 105 cpm de sonde purifiée et la réaction d'extension d'amorce a été effectuée en utilisant les procédures de laboratoire connues de l'homme du métier. Les résultats sont analysés par électrophorèse sur des gels de polyacrylamlde dénaturants à 6 %. Une réaction utilisant la même amorce a été chargée dans un puits adjacent afin de permettre une détermination directe du site d'initiation de la transcription.For the primer extension analyzes, a synthetic oligonucleotide of 30 nucleotides (P27N1) complementary to the sequence +36 to +65 of the DNA complementary to the SM 22 gene (5'-
AAGGCTTGGTCGTTTGTGGACTGGAAGGAG-3), was labeled with T4 polynucleotide kinase. 5 µg of mouse uterine messenger RNA was hybridized at 55 ° C with 1-2 X 105 cpm of purified probe and the primer extension reaction was carried out using laboratory procedures known to man of career. The results are analyzed by electrophoresis on 6% denaturing polyacrylamide gels. A reaction using the same primer was loaded into an adjacent well to allow direct determination of the transcription initiation site.
La méthode 5'RACE a été effectuée en utilisant deux oligonucléotides synthétiques antisens de 18 bp correspondant aux bases +112 à +129 (amorce 2) et +162 à +179 (amorce 1) de 1'ADN complémentaire SM 22, tel que decrit en substance par FROHMAN et al, (1988, Proc. Natl. The 5'RACE method was carried out using two synthetic 18 bp antisense oligonucleotides corresponding to the bases +112 to +129 (primer 2) and +162 to +179 (primer 1) of the complementary DNA SM 22, as described in substance by FROHMAN et al, (1988, Proc. Natl.
Acad. Sci, 85, 8998-9002).Acad. Sci, 85, 8998-9002).
En vue des analyses de protection par la RNase, un fragment obtenu par PCR de 417 bp comprenant la région -352 à +65 du gène du SM 22 a été fabriqué et cloné par la méthode des bouts collants dans le site HinC II du vecteur pBluescript SK+. La séquence du fragment obtenu par PCR a été vérifiée. Afin de générer une sonde ARN antisens marquée radioactivement, la construction a été linéarisée avec Sph I à la position -203 du gène SM 22 et transcrite avec de la RNA polymerase T7 en présence de 32p-CTp, La sonde (3 X 105 cpm) a été hybridée avec 5 pg d'ARN messager d'utérus de souris à 42-C durant une nuit. Après hybridation, les échantillons ont été incubés avec des
RNases A et T (1 heure à 37 C), précipités, et analysés comme décrits pour l'analyse par extension d'amorce.For RNase protection analyzes, a fragment obtained by PCR of 417 bp comprising the region -352 to +65 of the SM 22 gene was manufactured and cloned by the sticky ends method in the HinC II site of the vector pBluescript. SK +. The sequence of the fragment obtained by PCR was verified. In order to generate a radioactive labeled antisense RNA probe, the construction was linearized with Sph I at position -203 of the SM 22 gene and transcribed with T7 RNA polymerase in the presence of 32p-CTp, The probe (3 X 105 cpm) was hybridized with 5 pg of mouse uterine messenger RNA at 42-C overnight. After hybridization, the samples were incubated with
RNases A and T (1 hour at 37 ° C.), precipitated, and analyzed as described for the analysis by primer extension.
3. Culture cellulaire et transfection
Les lignées cellulaires NIH 3T3, 10T1/2 et 8/47 ont été cultivées dans du DMEM (Life Technologies, Inc, Vienne,
Autriche) complémentées avec 10 % de sérum de foetus de veau (Hyclone Inc.,Etats-Unis) à 37 C, dans une atmosphère de Co2 à 7%.3. Cell culture and transfection
The NIH 3T3, 10T1 / 2 and 8/47 cell lines were cultured in DMEM (Life Technologies, Inc, Vienna,
Austria) supplemented with 10% fetal calf serum (Hyclone Inc., United States) at 37 C, in an atmosphere of Co2 at 7%.
Pour les expériences de transfection, des cellules confluentes ont été étalées, repiquées dans des boites de
Petri de 6 cm, et laissées croître jusqu'à obtenir approximativement une confluence de 75 % avant ajout du mélange de transfection.For the transfection experiments, confluent cells were spread out, subcultured in boxes of
6 cm Petri dish, and allowed to grow until approximately 75% confluence is obtained before adding the transfection mixture.
Les transfections ont été effectuees en utilisant le réactif Lipofectamine commercialisé par Life Technologies
Inc..The transfections were carried out using the reagent Lipofectamine marketed by Life Technologies
Inc ..
En résumé 24 pg de Lipofectamine ont été ajoutés à 6 yg de plasmide portant le gène reporteur superenroulé et 2 g de PCMVss gal comme témoin interne. Après ajout de 3 ml de
DMEM, le cocktail de transfection a été ajouté aux cellules. Au bout de 6 heures, ce mélange a été remplacé avec du milieu de croissance contenant 10 % de sérum et à nouveau changé au bout de 12 heures. L'expression du produit du gène reporteur a été analysée après 24 heures.In summary, 24 μg of Lipofectamine were added to 6 μg of plasmid carrying the superwound reporter gene and 2 g of PCMVss gal as an internal control. After adding 3 ml of
DMEM, the transfection cocktail was added to the cells. After 6 hours, this mixture was replaced with growth medium containing 10% serum and changed again after 12 hours. The expression of the reporter gene product was analyzed after 24 hours.
Pour les expériences de stimulation par le sérum, des cellules transfectées ont été placées dans du DMEM contenant 20 % de sérum, 24 heures avant d'être récoltées.For the serum stimulation experiments, transfected cells were placed in DMEM containing 20% serum, 24 hours before being harvested.
4. Dosage de la CAT et de la B-aalactosidase
Les cellules ont été prélevées sur des boîtes de pétri avec un racloir à cellules, centrifugées, resuspendues dans 150 l de tampon Z (100 mM de phosphate de sodium, pH 7,5, lmM MgCl2, 10 nM KC1, 50 nMss - mercaptoethanol) et lysées par trois cycles de congélation/décongélation. Les débris ont été éliminés par centrifugation à basse vitesse et l'activité de la ss-galactosidase a été déterminée à partir de 2 à 20 ul de surnageant selon les procédés connus de l'homme du métier. Pour la détermination de l'activité CAT selon GORMAN et al (1982 ), de 10 à 100 yl de lysat ont été utilisés. Afin de tenir compte des variations dans l'efficacité de transfection, l'activité CAT a été normalisée avec l'activité égal.4. Determination of CAT and B-aalactosidase
The cells were removed from petri dishes with a cell scraper, centrifuged, resuspended in 150 l of buffer Z (100 mM sodium phosphate, pH 7.5, lmM MgCl2, 10 nM KC1, 50 nMss - mercaptoethanol) and lysed by three freeze / thaw cycles. The debris was removed by low speed centrifugation and the activity of ss-galactosidase was determined from 2 to 20 µl of supernatant according to methods known to those skilled in the art. For the determination of the CAT activity according to GORMAN et al (1982), 10 to 100 μl of lysate were used. In order to account for variations in transfection efficiency, CAT activity was normalized with equal activity.
5. Production des souris transséniques
Des inserts des plasmides pnlz2126 et p2126INTnlz, déposés auprès de la CNCM respectivement sous les n-I-1685 et n-I-1686, ont été isolés par digestion avec Sal I/Pme I, suivie d'une électrophorèse sur gel, puis d'une purification utilisant le kit Geneclean (Bio 101, la Jolla,
CA) puis resuspendus dans 10 mM de Tris Hcl pH 7,5, 0,25mM
EDTA. Les animaux transgéniques ont été produits comme décrits précédemment par LI et al (1993, Development, 177/3, 947-959). 5. Production of transgenic mice
Inserts of the plasmids pnlz2126 and p2126INTnlz, deposited with the CNCM respectively under nI-1685 and nI-1686, were isolated by digestion with Sal I / Pme I, followed by gel electrophoresis, then purification using the Geneclean kit (Bio 101, la Jolla,
CA) then resuspended in 10 mM Tris Hcl pH 7.5, 0.25 mM
EDTA. Transgenic animals were produced as previously described by LI et al (1993, Development, 177/3, 947-959).
Des souris portant le transgène ont été identifiées par
PCR et hybridation de type Southern en utilisant une sonde
ADN. La construction pnlz2126 a permis d'obtenir trois animaux positifs sur 17 souris, deux d'entre elles transmettant et exprimant cette construction.Mice carrying the transgene have been identified by
PCR and Southern hybridization using a probe
DNA. Construction pnlz2126 made it possible to obtain three positive animals on 17 mice, two of them transmitting and expressing this construction.
Pour la construction p2126INTnlz deux animaux positifs sur les 28 testés ont été obtenus et à nouveau un seul exprime et transmet cette construction. For the construction p2126INTnlz two positive animals out of the 28 tested were obtained and again only one expresses and transmits this construction.
Les souris transgéniques ont été retro-croisées avec des souris c57/bl et les colorations histochimiques ont été effectuées avec des souris hémizygotes pour le transgène. The transgenic mice were backcrossed with c57 / bl mice and the histochemical stains were carried out with hemizygous mice for the transgene.
6. Colorations histochimiaues
Des embryons entiers ou des tissus d'adultes ont été fixés durant 15 à 30 minutes à 4 C dans du formaldéhyde à 1 % dans du tampon A (100 mM de phosphate de sodium , pH 7,3,2 mM Mgcl2, 0,18 de sodium de deoxycholate, et 0,2 8
NP-40). Après rinçage, les spécimens ont été colorés durant une nuit à 30 C dans du tampon A contenant 1 mg/ml de X gal (Sigma, St Louis, Missouri), 5 mM de ferrocyanure de potassium, 5mM de ferricyanure de potassium, et 20 mM de
Tris-Cl pH 7,3. Les échantillons colorés ont alors été rincés, déshydratés à l'aide de concentrations croissantes d'éthanol, clarifiés dans du xylène, et enrobés dans de la paraffine. Les coupes histologiques ont été effectuées avec une épaisseur de 7 à 10 ym et à nouveau colorées avec de l'hématoxline d'Ehrlich et de l'éosine. Les embryons ont d'autre part pu être à nouveau clarifiés à l'aide d'un mélange d'alcool benzylique et de benzoate de benzyle.6. Histochemical stains
Whole embryos or adult tissues were fixed for 15 to 30 minutes at 4 ° C in 1% formaldehyde in buffer A (100 mM sodium phosphate, pH 7.3.2 mM Mgcl2, 0.18 deoxycholate sodium, and 0.2 8
NP-40). After rinsing, the specimens were stained overnight at 30 ° C in buffer A containing 1 mg / ml of X gal (Sigma, St Louis, Missouri), 5 mM potassium ferrocyanide, 5 mM potassium ferricyanide, and 20 mM of
Tris-Cl pH 7.3. The colored samples were then rinsed, dried with increasing concentrations of ethanol, clarified in xylene, and coated in paraffin. The histological sections were made with a thickness of 7 to 10 μm and again stained with Ehrlich hematoxline and eosin. The embryos could also be clarified again using a mixture of benzyl alcohol and benzyl benzoate.
Pour l'immunohistocoloration, les tissus de souris ont été fixes dans 3 * de paraformaldéhyde dans du tampon PBS à 4 C durant 3 heures, puis enrobés dans un milieu Tissue-Tek (Reichert-Jung, Vienne) et sectionnes sur un cryo-microtome à des épaisseurs de 5 à 10 pm. Les coupes sélectionnées ont été montées et colorées en utilisant un anticorps monoclonal dirigé à l'encontre de la SM 22 (Duband et al, 1993, Differentiations, 55, 1-11), à une dilution 1/30 ainsi qu'en utilisant un anticorps secondaire marqué Cy3 (Biological Detection Systems, USA). Les coupes ont été examinées à l'aide d'un microscope à fluorescence. For immunohistocoloration, the tissues of mice were fixed in 3 * of paraformaldehyde in PBS buffer at 4 ° C. for 3 hours, then coated in Tissue-Tek medium (Reichert-Jung, Vienna) and sectioned on a cryo-microtome at thicknesses of 5 to 10 µm. The selected sections were mounted and stained using a monoclonal antibody directed against SM 22 (Duband et al, 1993, Differentiations, 55, 1-11), at a 1/30 dilution as well as using a secondary antibody labeled Cy3 (Biological Detection Systems, USA). The sections were examined using a fluorescence microscope.
Exemple 1 Caractérisation du locus SM 22
Le criblage par hybridation de la banque génomique de souris a conduit à l'isolement de trois clones se recouvrant, contenant le gène complet de la SM 22. Une carte de restriction, qui est partiellement reproduite sur la figure 1 a été établie et les exons ont été localisés par hybridation à l'aide de sondes oligonucléotidiques synthétiques.Example 1 Characterization of the SM 22 locus
Screening by hybridization of the mouse genomic library led to the isolation of three overlapping clones containing the complete SM 22 gene. A restriction map, which is partially reproduced in FIG. 1, has been established and the exons were localized by hybridization using synthetic oligonucleotide probes.
Les régions présentant un intérêt ont été sous clonées et séquencées. The regions of interest have been subcloned and sequenced.
La séquence a été déterminée entre les positions -2474 et +110 en aval du site de polyadenylation et a été comparée dans la banque de données EMBL. Le gène couvre 5923 bp à partir du site de début de la transcription jusqu'au site de polyadenylation et la séquence codante est partagée en 5 exons (figure 1). Toutes les frontières exonintron correspondent à des séquences consensus. The sequence was determined between positions -2474 and +110 downstream of the polyadenylation site and was compared in the EMBL database. The gene covers 5923 bp from the start of transcription site to the polyadenylation site and the coding sequence is divided into 5 exons (Figure 1). All exonintron boundaries correspond to consensus sequences.
Le premier exon contient seulement une séquence leader en 5' et le codon de départ de la transcription est donc localisé dans le second exon séparé du site de départ de la transcription par plus de 4kbp de séquence d'intron. The first exon contains only a 5 'leader sequence and the transcription start codon is therefore located in the second exon separated from the transcription start site by more than 4 kbp of intron sequence.
Deux signaux de polyadénylation potentiels ont été localisés au position 5905 et 5913 et plusieurs régions TGT placées en aval du site de polyadénylation, prennent vraisemblablement part dans la terminaison de la transcription. Two potential polyadenylation signals have been located at positions 5905 and 5913 and several TGT regions placed downstream of the polyadenylation site, presumably take part in the termination of transcription.
L'analyse de la séquence révèle de plus la présence de trois séquences répétées (figure 2) qui présentent des homologies importantes avec les éléments répétés de type
B1, dont certains sont transcrits par la RNA polymérase III et codent pour des ARN 5S. On notera que toutes les séquences répétées sont dans une orientation inverse par rapport au locus SM 22.The analysis of the sequence also reveals the presence of three repeated sequences (FIG. 2) which have significant homologies with the repeated elements of the type
B1, some of which are transcribed by RNA polymerase III and code for 5S RNA. It will be noted that all the repeated sequences are in an opposite orientation relative to the locus SM 22.
Le site de départ de la transcription a été cartographiée par analyse par extension d'amorce (figure 3). Un oligonucléotide antisens complémentaire de l'extrémité 3' de l'exon 1 conduit à l'obtention de quatre produits d'extension qui diffèrent seulement par une paire de bases (bp) en longueur, le plus long d'entre eux étant de 65 bp. Le produit de la transcription démarre donc avec un G, 77bp en amont du codon d'initiation de la transcription. The transcription start site was mapped by primer extension analysis (Figure 3). An antisense oligonucleotide complementary to the 3 'end of exon 1 leads to the production of four extension products which differ only in base pair (bp) in length, the longest being 65 bp. The transcription product therefore starts with a G, 77bp upstream of the transcription initiation codon.
Les produits d'extension les plus courts ont été vraisemblablement causés par une terminaison prématurée de l'extension de l'amorce dûe à des modifications (capping) à extrémité 5' de 1'ARN messager. The shortest extension products were thought to be caused by premature termination of primer extension due to capping at the 5 'end of the messenger RNA.
Ces résultats ont été confirmés par l'analyse par protection par la RNAse , qui conduit à un fragment protégé de 65bp et par le clonage et le séquençage du produit d'extension dérivé d'une réaction indépendante avec une amorce antisens située dans le second exon du gène. These results were confirmed by the RNAse protection analysis, which leads to a protected fragment of 65bp and by the cloning and sequencing of the extension product derived from an independent reaction with an antisense primer located in the second exon. of the gene.
Ces résultats sont en accord avec ceux de Solway et al (1995 précédemment cité). Des différences de séquences mineures entre ces deux résultats sont vraisemblablement dues à des variations alléliques entre les différentes souches de souris. These results are in agreement with those of Solway et al (1995 previously cited). Differences in minor sequences between these two results are probably due to allelic variations between the different strains of mice.
La séquence TTTAAA en position -28bp (figure 4) est en relation étroite avec la séquence TATAAA et a vraisemblablement la fonction d'une boîte TATA. L'analyse par ordinateur de la séquence en 5' révèle la présence de plusieurs sites potentiels de liaison pour des facteurs ainsi que pour des éléments qui sont connus comme contribuant à la regulation de la transcription de gène musculaires (figure 4). Au total 11 boîtes de type E (CANNTG), quatre motifs du type Mef-2/rSRF (YTAWAAATAR), quatre éléments de liaison SRF potentiels (CC(A/T)6GG), cinq sites de liaision AP-2 (CCCMNSSS) et cinq motifs SP1 (GGGCGG) ont été localisés. Enfin, un élément similaire au motif TGT3-3, récemment identifié comme site de liaison d'un facteur nucléaire du muscle lisse et comme contribuant à la régulation de la transcription de l'actine alpha du muscle lisse, a été localisé (figure 4). The TTTAAA sequence in position -28bp (Figure 4) is closely related to the TATAAA sequence and probably has the function of a TATA box. Computer analysis of the 5 'sequence reveals the presence of several potential binding sites for factors as well as for elements which are known to contribute to the regulation of muscle gene transcription (Figure 4). A total of 11 E-type boxes (CANNTG), four Mef-2 / rSRF-type patterns (YTAWAAATAR), four potential SRF linkers (CC (A / T) 6GG), five AP-2 link sites (CCCMNSSS) and five SP1 motifs (GGGCGG) have been located. Finally, an element similar to the motif TGT3-3, recently identified as a binding site for a nuclear factor of smooth muscle and as contributing to the regulation of transcription of the alpha actin of smooth muscle, has been located (FIG. 4). .
Exemple 2
Clonaae et construction de plasmides recombinants pour la création de souris transeénicues
1/ Fabrication de Dnlz
Le plasmide pGEM7 (Promega Inc., Madison, Wi) a été digéré avec Nae I/Bsp 120I. L'extrémité sortante Bsp 1201 du vecteur a été remplie avec l'enzyme de Klenow, et le plasmide a été refermé en présence d'un linker Sal I de 10 pb. Le fragment lacZ de pGEM 7 a donc été délété, un site
Sal I introduit, et un site Bsp 120I restauré.Example 2
Clonaae and construction of recombinant plasmids for the creation of transgenic mice
1 / Dnlz manufacturing
Plasmid pGEM7 (Promega Inc., Madison, Wi) was digested with Nae I / Bsp 120I. The outgoing end Bsp 1201 of the vector was filled with the Klenow enzyme, and the plasmid was closed in the presence of a 10 bp Sal I linker. The lacZ fragment of pGEM 7 has therefore been deleted, a site
Sal I introduced, and a restored Bsp 120I site.
Un site Pme I a été introduit par insertion d'un linker
Pme I avec des extrémités simple-brin sortantes Nsi I, dans le site Nsi I de la construction.An SME site was introduced by insertion of a linker
Sme I with Nsi I outgoing single-stranded ends, in the Nsi I construction site.
Finalement, le gène lacZ couplé au signal de localisation nucléaire a été isolé à partir de pDes2.2nlz (LI et al, 1993, précédemment cité) avec Hind III et Sac I donnant deux fragments du gène rapporteur. Finally, the lacZ gene coupled to the nuclear localization signal was isolated from pDes2.2nlz (LI et al, 1993, previously cited) with Hind III and Sac I giving two fragments of the reporter gene.
Les deux fragments ont été insérés entre les sites Hind
III et Sac I du vecteur pGEM7 modifié et vérifies pour leur orientation. Cette procédure donne le vecteur pnlz sans promoteur.The two fragments were inserted between the Hind sites
III and Sac I of the modified pGEM7 vector and verify for their orientation. This procedure gives the promoter-free pnlz vector.
2/ Fabrication de D352nlz
La figure 5 illustre la fabrication de ce plasmide.2 / Manufacture of D352nlz
Figure 5 illustrates the manufacture of this plasmid.
Un fragment PCR de 417 pb couvrant la region -352 à +65 du gène SM 22 a été produit et inséré dans le site Hinc II rendu bout-franc du vecteur pBluescriptSK+. La séquence du fragment PCR a été vérifiée. Le fragment est récupéré par les sites Xba I et Xho I et inséré dans le plasmide pBLCAT 3 dans les sites correspondants, générant le recombinant p352CAT. Pour créer p352nlz, le fragment Xba I/XhoI de p352CAT a été inséré dans les sites correspondants de pnlz. A PCR fragment of 417 bp covering the region -352 to +65 of the SM 22 gene was produced and inserted into the Hinc II site blunted from the vector pBluescriptSK +. The sequence of the PCR fragment has been verified. The fragment is recovered by the Xba I and Xho I sites and inserted into the plasmid pBLCAT 3 in the corresponding sites, generating the recombinant p352CAT. To create p352nlz, the Xba I / XhoI fragment of p352CAT was inserted into the corresponding sites of pnlz.
3/ Fabrication de D2126nlz
Pour créer p2126nlz, un fragment Bsp 120I/Sph I de 1,9 kb recouvrant la région -2126 à -206 du locus SM 22 a été inséré dans les sites respectifs de p352nlz. Ce plasmide a été déposé le 25 mars 1996 auprès de la CNCM sous le n I1685. Sa fabrication est illustrée par la figure 6.3 / Manufacture of D2126nlz
To create p2126nlz, a 1.9 kb Bsp 120I / Sph I fragment covering the region -2126 to -206 of the SM 22 locus was inserted into the respective sites of p352nlz. This plasmid was deposited on March 25, 1996 with the CNCM under the number I1685. Its manufacture is illustrated in Figure 6.
4/ Fabrication de D2126INTnlz
La fabrication de ce plasmide est illustrée par la figure 7.4 / Manufacture of D2126INTnlz
The manufacture of this plasmid is illustrated in FIG. 7.
Un fragment Bsp 120I/Hind III de 5,8 kb recouvrant la région -2126 à +3651 du locus SM 22 a été inséré dans les sites correspondants de pnlz, donnant pINt-nlz. Ensuite un fragment PCR de 496 pb de la base +3648 à +4143 du locus SM 22 a été généré en utilisant une amorce en amont et une amorce en aval conçue pour introduire un site Hind III en position 4135-4140. Ce produit de PCR a été digéré avec
Hind III et lié dans le site Hind III de pINT-nlz pour donner p2126INT-nlz. La construction p2126INT-nlz contient donc 2126 paires de bases de la région en 5' du début de transcription, le premier exon, le premier intron entier et 15 paires de bases du deuxième exon avec les quatre dernières paires de bases mutées de CATG en GCTT pour éliminer le codon d'initiation de traduction et introduire un site Hind III comme mentionné ci-dessus. Ce plasmide a été déposé le 25 mars 1996 auprès de la CNCM sous le n-I- 1686. Sa fabrication est illustrée par la figure 7.A 5.8 kb Bsp 120I / Hind III fragment covering the region -2126 to +3651 of the SM 22 locus was inserted into the corresponding sites of pnlz, giving pINt-nlz. Then a 496 bp PCR fragment from the base +3648 to +4143 of the SM 22 locus was generated using a primer upstream and a primer downstream designed to introduce a Hind III site at position 4135-4140. This PCR product was digested with
Hind III and linked into the Hind III site of pINT-nlz to give p2126INT-nlz. Construction p2126INT-nlz therefore contains 2126 base pairs from the region 5 'from the start of transcription, the first exon, the first whole intron and 15 base pairs from the second exon with the last four base pairs mutated from CATG to GCTT to remove the translation initiation codon and introduce a Hind III site as mentioned above. This plasmid was deposited on March 25, 1996 with the CNCM under nI-1686. Its manufacture is illustrated in FIG. 7.
Exemple 3 : Expression des constructions dans les animaux transceniaues
Deux constructions utilisant le gène reporteur lacZ avec signal de localisation nucléaire du virus SV 40 ont été fabriquées, comme décrit dans l'exemple 2.EXAMPLE 3 Expression of Constructions in Transcenia Animals
Two constructs using the lacZ reporter gene with nuclear localization signal of the SV 40 virus were manufactured, as described in example 2.
La première construction, p2126nlz contient 2126 bp de la région en amont et le premier exon (65 bp). La seconde construction p2126INTnlz est identique à la première à l'exception de l'addition du premier intron et des premières 12bp du second exon. The first construction, p2126nlz contains 2126 bp from the upstream region and the first exon (65 bp). The second construction p2126INTnlz is identical to the first except for the addition of the first intron and the first 12bp of the second exon.
Comme indiqué dans la partie Matériel et Méthodes, chacune des constructions a donné naissance à au moins une souris transgénique exprimant le gène reporteur. As indicated in the Materials and Methods section, each of the constructs gave rise to at least one transgenic mouse expressing the reporter gene.
Les embryons obtenus de 12,5 à 15,5 jours après le coit (dpc) ont été colorés de manière à mettre en évidence l'activité égal. Les expressions des deux constructions sont identiques, à tous les stades observés, bien que p2126INTnlz donne une coloration un petit peu plus intense. The embryos obtained from 12.5 to 15.5 days after coitus (dpc) were stained so as to demonstrate equal activity. The expressions of the two constructions are identical, at all the stages observed, although p2126INTnlz gives a slightly more intense coloration.
L'expression a été détectée en premier lieu au jour 8,5 dans la région du coeur de l'embryon et dans les vaisseaux de l'enveloppe cardiaque. Au jour 9,5, l'expression de lacZ dans le coeur augmente et est confinée au ventricule droit, aux artères. Expression was first detected on day 8.5 in the heart region of the embryo and in the vessels of the cardiac envelope. On day 9.5, the expression of lacZ in the heart increases and is confined to the right ventricle, to the arteries.
Entre 12,5 et 15,5 jours une ségrégation du marquage en fonction des régions devient évident, le marquage étant confiné au ventricule droit (figures 8A et 8B). Les coupes montrent que l'expression a lieu dans le myocarde du ventricule droit, avec des marquages mineurs dans le ventricule gauche et dans l'adrium droit (figure 9A). Between 12.5 and 15.5 days a segregation of the marking according to the regions becomes obvious, the marking being confined to the right ventricle (Figures 8A and 8B). The sections show that expression takes place in the myocardium of the right ventricle, with minor markings in the left ventricle and in the right adrium (FIG. 9A).
Cette expression dans le coeur est seulement transitoire, et n'apparaît pas chez l'adulte. Elle est vraisemblablement inhibée dans les phases tardives du développement des foetus. L'expression précoce est aussi observée dans les segments du rostre à partir de 9,5 jours qui s'étend aux segments caudaux à 10,5 jours, et atteint des niveaux importants & 11,5 jours. This expression in the heart is only transient, and does not appear in adults. It is likely to be inhibited in the late stages of fetal development. Early expression is also observed in the segments of the rostrum from 9.5 days which extends to the caudal segments at 10.5 days, and reaches significant levels & 11.5 days.
L'expression diminue à partir de 12,5 jours dans les segments du rostre (figure 8B) et finalement n'est plus détectable à 14,5 jours (figure 10E). The expression decreases from 12.5 days in the rostrum segments (Figure 8B) and finally is no longer detectable at 14.5 days (Figure 10E).
Les coupes montrent que l'expression du transgène est restreinte à la région myotomale des segments (figure 9 D). The sections show that the expression of the transgene is restricted to the myotomal region of the segments (FIG. 9D).
La plus grande partie de l'expression a lieu dans le système vasculaire de l'embyron en développement. A partir de 9,5 jours, l'expression est détectée dans l'aorte dorsale. A 10,5 jours, la coloration de l'aorte dorsale et des coudes aortiques augmente et à 11,5 jours, l'expression lacZ est clairement visible dans l'aorte dorsale, les coudes aortiques, les artères iliaques, les artères ombilicales, les artères de la carotide et dans les vaisseaux majeurs de la tête. Most of the expression takes place in the vascular system of the developing embryo. From 9.5 days, the expression is detected in the dorsal aorta. At 10.5 days, the coloring of the dorsal aorta and aortic elbows increases and at 11.5 days, the lacZ expression is clearly visible in the dorsal aorta, aortic elbows, iliac arteries, umbilical arteries, the carotid arteries and in the major vessels of the head.
L'expression du transgène dans les vaisseaux augmente à partir de 12,5 jours, date à laquelle les vaisseaux intercostaux peuvent être facilement vus (Figure 8A). The expression of the transgene in the vessels increases from 12.5 days, when the intercostal vessels can be easily seen (Figure 8A).
A 15,5 jours (figure 8B), lacZ est présent dans les vaisseaux majeurs, incluant ceux des membres et de la queue, et la coloration du tronc pulmonaire devient visible. L'expression dans le système vasculaire persiste chez l'adulte et est clairement visible dans l'aorte, dans le tronc pulmonaire et dans l'artère pulmonaire droite (figure 10A), ainsi que dans les vaisseaux des intestins (figure 10B), dans la vessie et dans l'utérus. At 15.5 days (Figure 8B), lacZ is present in the major vessels, including those of the limbs and tail, and the coloration of the pulmonary trunk becomes visible. Expression in the vascular system persists in adults and is clearly visible in the aorta, in the pulmonary trunk and in the right pulmonary artery (Figure 10A), as well as in the vessels of the intestines (Figure 10B), the bladder and into the uterus.
Des coupes histologiques révèlent mieux les différences dans l'expression du transgène dans les artères et dans les veines. La section de l'embryon à 12,5 jours (figure 9A) montre un niveau d'expression très élevée dans les couches musculaires des artères de la carotide, de la quatrième artère du coude de l'aorte, du tronc pulmonaire proximal et de la partie proximale de l'aorte ascendante, tandis que les parties gauche et droite des veines cardinales antérieures restent non colorées. L'absence d'expression du transgène dans les veines musculaires ressort à l'évidence des coupes du ductus venosus, ainsi que des veines portales et ombilicales. La même situation est observée chez l'adulte, où l'expression ne peut jamais être détectée dans les veines caves (figure 10A) ni dans les veines pulmonaires. Histological sections better reveal the differences in the expression of the transgene in the arteries and in the veins. The section of the embryo at 12.5 days (FIG. 9A) shows a very high level of expression in the muscular layers of the arteries of the carotid artery, of the fourth artery of the elbow of the aorta, of the proximal pulmonary trunk and of the proximal part of the ascending aorta, while the left and right parts of the anterior cardinal veins remain uncolored. The absence of expression of the transgene in the muscular veins is evident from the sections of the ductus venosus, as well as from the portal and umbilical veins. The same situation is observed in adults, where expression can never be detected in the cava veins (Figure 10A) or in the pulmonary veins.
Ces observations mettent en évidence des différences qui n'avaient jusqu'alors pas été mises en évidence entre les couches de muscles lisses des artères et des veines. These observations highlight differences that had not previously been demonstrated between the smooth muscle layers of the arteries and veins.
D'autres vues des artères montrent que l'expression est restreinte à la couche de muscles et est absente de l'endothelium (figure 9C).Other views of the arteries show that expression is restricted to the muscle layer and is absent from the endothelium (Figure 9C).
I1 est de plus évident, au vu de l'ensemble des observations (figures 8A, 8B), que l'expression du transgène est absente des muscles lisses des viscères. Ceci est inattendu, car le gène SM 22 endogène est supposé être exprimé dans les tissus musculaires lisses vasculaires et des viscères. Dans les coupes histologiques de la région abdominale d'embryon à 14,5 jours, les couches de muscles de l'estomac, de l'intestin et de la vessie en développement sont facilement reconnaissables (figure 9C). It is moreover evident, in the light of all the observations (FIGS. 8A, 8B), that the expression of the transgene is absent from the smooth muscles of the viscera. This is unexpected because the endogenous SM 22 gene is thought to be expressed in vascular smooth muscle tissue and viscera. In histological sections of the abdominal region of the embryo at 14.5 days, the layers of muscles of the developing stomach, intestine and bladder are easily recognizable (Figure 9C).
L'expression du transgène dans cette région est clairement détectée dans les artères ombilicales, mais pas dans les couches de muscles des viscères de l'estomac, du duodenum, de l'intestin grêle et du gros intestin, et de la vessie, où aucune expression lacZ n'est observée. En outre, aucune expression n'est observée dans l'oesophage et dans la trachée (figure 9A), ainsi que dans les bronches du poumon.The expression of the transgene in this region is clearly detected in the umbilical arteries, but not in the muscle layers of the viscera of the stomach, duodenum, small and large intestine, and bladder, where none lacZ expression is not observed. Furthermore, no expression is observed in the esophagus and in the trachea (FIG. 9A), as well as in the bronchi of the lung.
La coloration du tissu musculaire de l'adulte donne essentiellement les mêmes résultats. La figure 10B montre que l'expression du transgène est absente dans les muscles du colon, alors que le vaisseau mésentère est très fortement coloré par lacZ. Par contre, la coloration par immunofluorescence de la coupe d'une région intestinale similaire montre que la protéine SM 22 endogène est présente dans les deux tissus (figure 10C). L'absence d'expression du transgène dans les muscles lisses des viscères de l'adulte est de plus confirmée par des colorations de l'oesophage, de la trachée, de la vessie, du canal déférent et de l'utérus pour l'activité égal. En aucun cas, il ne peut être détectée une expression Jugal dans les couches musculaires de ces tissus. The coloring of adult muscle tissue gives essentially the same results. FIG. 10B shows that the expression of the transgene is absent in the muscles of the colon, while the mesentery vessel is very strongly stained by lacZ. On the other hand, immunofluorescence staining of the section of a similar intestinal region shows that the endogenous SM 22 protein is present in both tissues (FIG. 10C). The absence of expression of the transgene in the smooth muscles of the viscera of the adult is further confirmed by staining of the esophagus, trachea, bladder, vas deferens and the uterus for activity. equal. In no case can a Jugal expression be detected in the muscle layers of these tissues.
Curieusement, une coloration importante est observée dans le cytoplasme des cellules épithéliales du lumen du canal déférent et dans l'épithélium des conduits rénaux. Curiously, a significant coloration is observed in the cytoplasm of the epithelial cells of the lumen of the vas deferens and in the epithelium of the renal ducts.
Ceci est vraisemblablement dû à une activité galactosidase endogène, la coloration étant aussi visible dans les animaux non transgèniques témoins.This is probably due to an endogenous galactosidase activity, the coloration being also visible in the non-transgenic control animals.
Exemple 4 - Fabrication d'une construction comportant des régions régulatrices du gène SM 22 et le gène codant la thvmidine kinase du virus de l'herpès (SM 22 INT-TK). Example 4 - Manufacture of a construct comprising regulatory regions of the SM 22 gene and the gene encoding the herpesvirus thvmidine kinase (SM 22 INT-TK).
Le fragment HIV-LTR (-167, + 80) est délété du plasmide pLTR-TK par digestion Hind III dont les extrémités sont rendues bout franc avec l'enzyme de Klenow, suivie d'une digestion Xho I. Le plasmide refermé en insérant un linker contenant les sites XhoI en 5', les sites Hind III et Bsp 120I dans l'ordre 5'- > 3' et une extrémité 3' bout franc pour donner le vecteur p-TK. Un fragment Bsp 120I/Hind III de 5,8 kb recouvrant la région -2126 à + 3648 du locus SM 22 est inséré dans p-TK pour obtenir SM 22 INT
TK.The HIV-LTR fragment (-167, + 80) is deleted from the plasmid pLTR-TK by Hind III digestion, the ends of which are made blunt with Klenow enzyme, followed by Xho I digestion. The plasmid closed by inserting a linker containing the XhoI sites in 5 ', the Hind III and Bsp 120I sites in the order 5'->3' and a 3 'blunt end to give the vector p-TK. A 5.8 kb Bsp 120I / Hind III fragment covering the region -2126 to + 3648 of the SM 22 locus is inserted into p-TK to obtain SM 22 INT
TK.
Cette construction est schématiquement représentée sur la figure 11. This construction is schematically represented in FIG. 11.
LISTE DE SEQUENCES (1) INFORMATIONS GENERALES:
(i) DEPOSANT:
(A) NOM: INSTITUT PASTEUR
(B) RUE: 28 RUE DU DOCTEUR ROUX
(C) VILLE: PARIS
(E) PAYS: FRANCE
(F) CODE POSTAL: 75015
(A) NOM: UNIVERSITE PARIS 7
(B) RUE: 1 PLACE JUSSIEU
(C) VILLE: PARIS
(E) PAYS: FRANCE
(F) CODE POSTAL: 75005
(ii) TITRE DE L' INVENTION: SEQUENCES EN AMONT DU GENE SM22
(iii) NOMBRE DE SEQUENCES: 3
(iv) FORME DECHIFFRABLE PAR ORDINATEUR:
(A) TYPE DE SUPPORT: Floppy disk
(B) ORDINATEUR: IBM PC compatible
(C) SYSTEME D' EXPLOITATION: PC-DOS/MS-DOS
(D) LOGICIEL: PatentIn Release +1.0, Version #1.30 (OEB)
INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO; I:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 6261 paires duc bases
(B) TYPE : nucléotide
(C) NOMBRE DE BRINS : double
(D) CONFIGURATION : linéaire
(ti) TYPE DE MOLECULE : ADN (génomique)
(iii) HYPOTHETIQUE:NON
(vi) ORIGINE
(A) ORGANISME: SOURIS
TCTAGAGGCC ACGGAACGGT GCCAAGCACA CAGTCCCTTT TGCCTCTTTC
ACGGGAGCAG
GAGTCCCAGT GCCTGTCGTG GAAAGGGAGG AACATGCCAG GTCCCTGTGT
GTCCTTGGCC
CTGTCTCACC AAAGGACTCA GGGCTGGTTT CTGAGTTTCC GTCCAGTATT
TAGCCAAGTC
CTGTGTTAGT CACGTAGGCC TAAGAGCCTT GGCGTTTACG GAGTCACCCA
GCTCTGGCCC
CTGGCATTCT GGTCCTTGGC GTTTACAGAG TCACCCAGCT CCAGGCCCCT
GGCACTTTGG
TACTTGGTTG CCCTTCACTC CACCAGGTCC ATTCCAGATG CCAAGAGTGG
GCCCCAGGAA
TGTGTTTCCT TCTCTCCACC ATGTTTTTAT AGCTCTTGGG CTGGGAGAAG
AGGCGGGTCT
GGGTCTTTGT TTCTGAGCTT TGTTCTATGT TCCTCCATGC TACGGTTGCA
ATTGTTTTCT
ATGAACGAGT ACATTCAATA AAGACAACCA GACCTGGGAT TTGGGGTCTT
ACTGATGTGT
TGGGAGGTGC AGGAGCCTCC GTGTCCCATT TATTTTGGCC TTCCCGTCTC
GTTTCTGTGC
GTGGCTACAT TGGGAATGAC CTTCCTTGAT CCCACCAAGC CACCCATTGA
TTCTGTAAAC
AtGTGACCCT TGCTCCAAGC ATTGCTTACA GGAGCAGGAT ACTGAAAGTG
TGTCTGTGCC
CTCTCCTGAT AACCCCTCCC TTCAGCAGGC ACACAGCACC TGACTACCCA
CCACGTATGT
AAACGTCAGT ATCCTTTCCA GCCAGCTCTG CAGATGGGTG TCCAGGCTGT
GCATGATGCA
CCTCAAGTGG GCAGAGCTTG CAGGCCAAGG TTTTAAAGGC TGTTCAGGAA
TGGATGGCAA
GCAGGATCTA AGAGGAGGGG GGGTTGTTGT TGTTTGGGGG GGGGGTGGTT
TTGGTTTGTT
TTTTTTGAGA CAGGGTTTCT CTGTGTGGCC CTGGCCCTCC TGGAACCCAC TCTGTAGACC
AGGCTGGCCT TGAACTCAGA AATCTGCCTG CCTCTGCCTC CCGAGTGCTG
GGATTAAAGG
CGTGTGCCCA TCGAGGAGGG AGATTTTATT TAGATTATAA AAAGGACGGG
ATTTGGGGAA
TCCTGTCTAG TGAATTCAGG ACGTAATCAG TGGCTGGGAA GCAAGAGCTC
TAGAGGAGCT
CCAGCTTATT ATGACCCTTC CTTCAGATGC CACAAGGAGG TGCTGGAGTT
CTATGCACCA
ATAGCTTAAA CCAGCCAGGC TGGCTGTAGT GGATTGAGCG TCTGAGGCTG
CACCTCTCTG
GCCTGCAGCC AGTTCTGGGT GAGACTGACC CTGCCTGAGG GTTCTCTCCT
TCCCTCTCTC
TACTCCTTCC TCCCTCTCCC TCTCCCTCTC TCTGTTTCCT GAGGTTTCCA
GAATTGGGGA
TGGGACTCAG AGACACCACT AAAGCCTTAC CTTTTAAGAA GTTGCATTCA
GTGAGTGTGT
GAGACATAGC ACAGATAGGG GCAGAGGAGA GCTGGTTCTG TCTCCACTGT GlliGGTCTT
GGGTACTGAA CTCAGACCAT CAGGTGTGAT AGCAGTTGTC TTTAACCCTA
ACCCTGAGCC
TGTCTCACCT GTCCCTTCCC AAGACCACTG AAGCTAGGTG CAAGATAAGT
GGGGACCCTT
TCTGAGGTGG TAGGATCTTT CACGATAAGG ACTATTTTGA AGGGAGGGAG
GGTGACACTG
TCCTAGTCCT CTTACCCTAG TGTCTCCAGC CTTGCCAGGC CTTAAACATC
CGCCCATTGT
CACCGCTCTA GAAGGGGCCA CCCTTGACTT GCTGCTAAAC AAGGCACTCC
CTAGAGAAGA
TACCATACCT GTGGGCAGGA TGACCCATGT TCTGCCATGC ACTTGGTAGC
CTTGGAAAGG
CCACTTTGAA CCTCAATTTT CTCAACTGTT AAATGGAGTG GTAACTGCTA
TCTCATAATA
AAGGGGAAGG TGAGGAAGGC GTTTGGATAG TGCCTGGTTG CGGCCAGGCT
GCAGTCAAGA
CTAGTTCCCA CCAACTCGAT TTTAAAGCCT TGCAAGAAGG TGGCTTGTTT
GTCCCTTGCA
GGTTCCTTTG CTCGGGCCAA ACTCTAGAAT GCCTCCCCCT TTCTTTCTCA
TTGAAGAGCA
GACCCAAGTC CGGGTAACAA GGAAGGGTTT CAGGGTCCTG CCCATAAAAG
GTTTTTCCCG
GCCGCCCTCA GCACCGCCCC GCCCCGACCC CCGCAGCATC TCCAAAGCAT
GCAGAGAATG
TCTCCGGCTG CCCCCGACAG ACTGCTCCAA CTTGGTGTCT TTCCCCAAAT
ATGGAGCCTG
TGTGGAGTGA GTGGGGCGGC CCGGGGTGGT GAGCCAAGCA GACTTCCATG
GGCAGGGAGG
GGCGCCACGG GGCGGCAGAG GGGTGACATC ACTGCCTAGG CGGCCTTTAA
ACCCCTCACC
CAGCCGGCGC CCCGGCCCGT CTGCCCCAGC CCAGACACCG AAGCTACTCT
CCTTCCAGTC
CACAAACGAC CAAGCCTTGT AAGTGCAAGT CATGGGAGCA GAAGGGCTGT
GGGCTCAATT
AGATCCCCTA GTCTCTTCTA GTTTGCTGGG TGGAATTGGG TCCCTAGAGA
CCATTCTCTG
TGTTAGACAA AAAGTCTGGG TTAAAATGCC TAGGATGATT TGACTGGGGC
AAAAGAATAA
ATGQGGTGAG AGGGAGGCTC AAATTCAGTC ACTGTCCCAC CCATAGGTGT
ATGGGCTATG
TGTTAGGCCC AAAGAGGTGA CAAATGAGGC CAAGGGAACA ACTCCATCTT
TGGATCTCCA
AGAAGGTGAG GGGCTAAGTT CTGGAAAGCA GTGACCCACT GATGGTCCCC
AGGGCTAATG
CAACTCGGGG GAGCCAGGAG GTAGCCCCCT CAGGCAGTGG AGGACTAAAG
ATCTTATTTT
TTGTAGCGCT AGGGATCAAA CCCCAGGGCG CTATGTGTGG CAGGCATGTG
CTCCATCTAC
CACAGAAGTT TAATCCTTCA GACTAGCCTG GGATAGGGCC TGCTTTTTCT
TTCCTTTTCT
CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTTT
CTTTCCTTTT
CTCTCTTTCA CTCTCTCTTT CTAATTTCTT TTTCTTTTTT TCTTTCTTTT CTTTAGACAG
GGTTTCTCTG TGTAGCCCTG GCTGTTCTGG AACTCACTCT TTAGACCAGG
CTGGCCTCGA
ATCTCAGAAA TCTACCTGCC TCTGCCTCCC AAGTGCTGGG ATTAAAGGCG
TGTGCCACCA
CTGCCCAGCT AAGGTTTGCT TTTTGATGGC AGCTTGGTCC AGTTTGAAAG
TAGGAGGTCA
GTCCACTGTA GGCAGATAGG TGACAGGTGG CAGATAGGTG ACAGATAGGT
GACAGGTGGA
GGAGCTTTGG AACTGGGACT GGACAGCCCT GGGACCCTGT TCCTCCCAAA
GGGTCTTGGT GGTTCCCCTT GGGGCTCTCT MAGGATGTC AGTGGGCTGT TGCCACATCT
ATATAAGAGG
ACTAGTCTrC TGGAATTTAG GTGTGATCTC TCAGGGATGC AGAAATGCTC
ACCCTTACTG
TCATTTTATG GGCTGAGGTA CCACAGGCAG ATATACCCTG GTCTGCTTGT
TGTCCAGGGT
CTCTGCTACA TGGAGGCCCC TTTCCACAGC CTAACCTCTC TACCTGCTGA
CAGGAGGGCT
GGATGGCCAC AGGCATCCAA CGTGCGCATC ATGCAGGTGT TTTGCGTTGG
AGCTTTTGTC
TAGAAATACC CTGGTGGGCT GCCAAACCAC CACCCATATC CCTCTCTCCT
CTCTGCTGCC
TCTAAGATGA CAGCTTGATT TTTCTTATAG TGATTTTTTT TTTTGGTTTT GTTTTTTTGT
TTGTTTTAAG TTAGCATACA AAGTAATACA TTTCATCATG GCATTTGGAC
ATACATATAT
ATTTTATTTG CTCTCCTGGC CTCTTCTCAA AGAGACTTCT CTGGAcTTTC
TTGTATTTTT
GGTTGTGAGC CTAGCCTTTA ACGGCTGAGC CATCTCTCCA GCCCTTCTTT
GGACTTTCTA
CTTCATACTT CCCACCAGTC TGGGAAGAAG GGCACATGGA ATCTTGAGAG
CATGACCTGA
CCCAGACCTG ACAGATGTCA AGGCTGCAGT GTATGCTCTT GTTCGTACGG
CTTGTTCTTA
GTCCTGCAGT TCAGAACTTT CTGGAGACTG AGAAGTGCAT GTGAGGACAC
TCTCCTCCCA
TCTTTTCCTC TAGTGGCTAG TGATGTTTGG TTTTTTGTTT TGAGACAGGG TTICTCTGTA
TAGCCCTAGC TATCCTGGAA CTCACTTTGT AGATCAGGCT GGCCTCCAAC
TCAGAAATCT
GCCTGCCTCT GCCTCCCGAG TGCTGGGACT AAAGGCGTGC GCCACCACTG
TCCAGTCAGG
AGTAGAAGGA AACTGTAAGG TGCTTGAGAC AGGCTGAGTA GAGGCTAGGA GGAAGGGGCA
CCGCAGTCAC CGGCTCCATG ACTCTGTGAC WTGTGGTT CCTTGTCGCA
GCGGTTCCTG
GTGGTGGTGG TGGTCGGGGG TTGGGGGGAG GGGGCAGGCC ACACAGTGGG
GTGTGGGAGG
GAATAGCTGT TGACAACTTC CCAACAGAAA CCAGGCTTTT GAGTCCTCCA
GGGTAGCTTG
AGAGGGTACT CAGAAAGCCG TGTCCATGTC CCCTTTCCTT CACCTCAGGG
AAGTAAGTTG
CCTATAGGGT TGTCATTTCA ATGAGGTCTT CTGGTTATTC TGTTTTTCTC TCAATGTTGG
TGTTGGGCTC AGGGAATGCT TTGGAGAAGG TGGTGGGAAC TGGAGAAGGG
AAGATCAGTT
TACTGTGTAA ACTCACTGGT TAAAGTACCC CCTCCCTTCC ACCCTGCAAT
ACACACACAC
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACCCCATCTC GAAGAGCTCT ATTAAGCTCC
AGGTGCACTG TAGTTCACAG ACTGCATCTT CCAGGTTTGC TCCCACTTCA <RTI ID=32.
CTCCATGCTC ACACAATTTT TCTCTCAACC AATGACCTCT CAGAAGCAGG
GGTTGGTTTG
CAAAATTCTT CAGATACCTC AACAGATGGC ATCCCACTCA GGCTATCCCT GCTGACTAGG
TCTGGCTCCA GCCCTGACTG TATCTACCCA GGGACCTACC TGCCTGCTTT
GCTCCTATAG
CCTTCCTCCG TGTCTGGGTC CCCAGAGAGC TGCCGGCATA GGCCTTTGAG
GCAACAGCTG
GCATACAGGC CAGGCTTCCC ATGCTCTGGC TAGCAGATTC TCTGCCCTGG
AGGACTTTGA
CTGCATGGTT TCTCTCACTG CTGCAACAGT CAGAGCTGGC CCACACGGGC ACAACAGCGC
ACTTCCATCT GGGTCTCCCT GAGAATGCCG CTGTTTTCTG AGAACCCTTG
GACTCTGGTG
GCTTTATCAG GTCTTTTTGT CAGCTGCGCT TTGGGGGATG AACTTTGCTC
TTCTGGCTTC
TGGGTCAGAG GGTAAAGATT TGGTGGCAAC CGGTAGCTAG AGAAAGATAG
CTACTGGCTG
AATTTGGAGG ACATGGCTTC TGGAAAACCT CTCTAGTGCT TTTCTGGCTA
GTCTTGGCAA
AGTAAAAATG CTCTGATAGC CAGCCCGGGT GATGCAGGGC TTCCTGTTCG AGGCCTTTCT
GTACAAAATT AGTGAGACAT TGCCTCAAAA CTATGAAACA AGCCAGACTC
TGTTGAAGCA
CGCCTTTAAT CCCAGCACTC AGGAGGCTGA AGCAGGCAAG ATCTCTGTTA
GTTGGAGGCC
AGTCTACAGG AAAGTTCTAC AACAGCAGAG GCCAGACAGT GCAACCCTTT
CTGGGGGTGT
GGGGGAGGAA AACCCAACAA AAACACAAAC TATAAAACAA AGAGAAGGCC
GAGGACAAAG
CTTAGCAATG CATACTTCCC TTTCTATGTG AAGCCCTGGG CTCCACCAGT
ACTGCAGAAA
GAAGCAAGCA ATGAGGGACA GGAGGTTGGC TCTAGGCCCA GGGGTTGTCA AAATAGTCCA
CAGGCCAAAG GCAGCCTGAT GTCTGTTTTT ATAAACAAAA TTTTATTGGC ACACATTGGT
TATGTATCAG CTAGGCTATT TTCATTACAA TAGAGGCCAT ATGGTCTGTA
AAGTCTAAAA
TATTTACTCT GCTGTTTTAC ATAAAAAGTT GACAGACTCT TGCTCTAGAC
TGACAAATAT
CTAAGACCTT GTTTTCTGAG GTTCAAGTTT CAGAGGGGTC TCTGCAGCAA
GTGGGTAAAG
CTGGTCTAGG TCATGCTATG ATGTCTAGGG TCCCCTCAGA GTGGAAGGCC
TGCTTAGCAC
AAATGAAGTA AAGTAACTTG CTGGCTCTTT GTTCTTTTCT CCACACTCTA
TACTTTAGCT
CTGCCTCAACATG (2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 2:
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 2190 paires de bases
(B) TYPE: nucleotide
(C) NOMBRE DE BRINS: double
(D) CONFIGURATION: linéaire
(ii) TYPE DE MOLECULE: ADN (génomique)
(iii) HYPOTHETIQUE: NON
(vi) ORIGINE:
(A) ORGANISME: SOURIS
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID NO:2
GGGCCCCAGG AATGTGTTTC CTTCTCTCCA CCATGTTTTT ATAGCTCTTG GGCTGGGAGA 60
AGAGGCGGGT CTGGGTCTTT GTTTCTGAGC TTTGTTCTAT GTTCCTCCAT GCTACGGTTG 120
CAATTGTTTT CTATGAACGA GTACATTCAA TAAAGACAAC CAGACCTGGG ATTTGGGGTC 180
TTACTGATGT GTTGGGAGGT GCAGGAGCCT CCGTGTCCCA TTTATTTTGG CCTTCCCGTC 240
TCGTTTCTGT GCGTGGCTAC ATTGGGAATG ACCTTCCTTG ATCCCACCAA GCCACCCATT 300
GATTCTGTAA ACATGTGACC CTTGCTCCAA GCATTGCTTA CAGGAGCAGG ATACTGAAAG 360
TGTGTCTGTG CCCTCTCCTG ATAACCCCTC CCTTCAGCAG GCACACAGCA CCTGACTACC 420
CACCACGTAT GTAAACGTCA GTATCCTTTC CAGCCAGCTC TGCAGATGGG TGTCCAGGCT 480
GTGCATGATG CACCTCAAGT GGGCAGAGCT TGCAGGCCAA GGTTTTAAAG GCTGTTCAGG 540
AATGGATGGC AAGCAGGATC TAAGAGGAGG GGGGGTTGTT GTTGTTTGGG GGGGGGGTGG 600 TTTTGGTTTG TTTTTTTTGA GACAGGGTTT CTCTGTGTGG CCCTGGCCCT CCTGGAACCC 660
ACTCTGTAGA CCAGGCTGGC CTTGAACTCA GAAATCTGCC TGCCTCTGCC TCCCGAGTGC 720
TGGGATTAAA GGCGTGTGCC CATCGAGGAG GGAGATTTTA TTTAGATTAT AAAAAGGACG 780
GGATTTGGGG AATCCTGTCT AGTGAATTCA GGACGTAATC AGTGGCTGGG AAGCAAGAGC 840
TCTAGAGGAG CTCCAGCTTA TTATGACCCT TCCTTCAGAT GCCACAAGGA GGTGCTGGAG 900
TTCTATGCAC CAATAGCTTA AACCAGCCAG GCTGGCTGTA GTGGATTGAG CGTCTGAGGC 960
TGCACCTCTC TGGCCTGCAG CCAGTTCTGG GTGAGACTGA CCCTGCCTGA GGGTTCTCTC 1020
CTTCCCTCTC TCTACTCCTT CCTCCCTCTC CCTCTCCCTC TCTCTGTTTC CTGAGGTTTC 1080 CAGAATTGGG GATGGGACTC AGAGACACCA CTAAAGCCTT ACCTTTTAAG AAGTTGCATT 1140
CAGTGAGTGT GTGAGACATA GCACAGATAG GGGCAGAGGA GAGCTGGTTC TGTCTCCACT 1200
GTGTTTGGTC TTGGGTACTG AACTCAGACC ATCAGGTGTG ATAGCAGTTG TCTTTAACCC 1260
TAACCCTGAG CCTGTCTCAC CTGTCCCTTC CCAAGACCAC TGAAGCTAGG TGCAAGATAA 1320
GTGGGGACCC TTTCTGAGGT GGTAGGATCT TTCACGATAA GGACTATTTT GAAGGGAGGG 1380
AGGGTGACAC TGTCCTAGTC CTCTTACCCT AGTGTCTCCA GCCTTGCCAG GCCTTAAACA 1440
TCCGCCCATT GTCACCGCTC TAGAAGGGGC CACCCTTGAC TTGCTGCTAA ACAAGGCACT 1500
CCCTAGAGAA GATACCATAC CTGTGGGCAG GATGACCCAT GTTCTGCCAT GCACTTGGTA 1560
GCCTTGGAAA GGCCACTTTG AACCTCAATT TTCTCAACTG TTAAATGGAG TGGTAACTGC 1620
TATCTCATAA TAAAGGGGAA CGTGAGGAAG GCGTTTGGAT AGTGCCTGGT TGCGGCCAGG 1680
CTGCAGTCAA GACTAGTTCC CACCAACTCG ATTTTAAAGC CTTGCAAGAA GGTGGCTTGT 1740
TTGTCCCTTG CAGGTTCCTT TGCTCGGGCC AAACTCTAGA ATGCCTCCCC CTTTCTTTCT 1800
CATTGAAGAG CAGACCCAAG TCCGGGTAAC AAGGAAGGGT TTCAGGGTCC TGCCCATAAA 1860
AGGTTTTTCC CGGCCGCCCT CAGCACCGCC CCGCCCCGAC CCCCGCAGCA TCTCCAAAGC 1920
ATGCAGAGAA TGTCTCCGGC TGCCCCCGAC AGACTGCTCC AACTTGGTGT CTTTCCCCAA 1980
ATATGGAGCC TGTGTGGAGT GAGTGGGGCG GCCCGGGGTG GTGAGCCAAG CAGACTTCCA 2040
TGGGCAGGGA GGGGCGCCAC GGGGCGGCAG AGGGGTGACA TCACTGCCTA GGCGGCCTTT 2100
AAACCCCTCA CCCAGCCGGC GCCCCGGCCC GTCTGCCCCA GCCCAGACAC CGAAGCTACT 2160
CTCCTTCCAG TCCACAAACG ACCAAGCCTT 2190 (2) INFORMATIONS POUR LA SEQ ID NO: 3
(i) CARACTERISTIQUES DE LA SEQUENCE:
(A) LONGUEUR: 785 paires de bases
(B) TYPE: nucléotide
(C) NOMBRE DE BRINS: double
(D) CONFIGURATION: linéaire
(ii) TYPE DE MOLECULE: ADN ( gnomique)
(iii) HYPOTHETIQUE: NON
(vi) ORIGINE:
(A) ORGANISME: SOURIS
(xi) DESCRIPTION DE LA SEQUENCE: SEQ ID No:3:
GGGCCCCAGG AATGTGTTTC CTTCTCTCCA CCATGTTTTT ATAGCTCTTG GGCTGGGAGA 60
AGAGGCGGGT CTGGGTCTTT GTTTCTGAGC TTTGTTCTAT GTTCCTCCAT GCTACGGTTG 120
CAATTGTTTT CTATGAACGA GTACATTCAA TAAAGACAAC CAGACCTGGG ATTTGGGGTC 180
TTACTGATGT GTTGGGAGGT GCAGGAGCCT CCGTGTCCCA TTTATTTTGG CCTTCCCGTC 240
TCGTTTCTGT GCGTGGCTAC ATTGGGAATG ACCTTCCTTG ATCCCACCAA GCCACCCATT 300
GATTCTGTAA ACATGTGACC CTTGCTCCAA GCATTGCTTA CAGGAGCAGG ATACTGAAAG 360
TGTGTCTGTG CCCTCTCCTG ATAACCCCTC CCTTCAGCAG GCACACAGCA CCTGACTACC 420
CACCACGTAT GTAAACGTCA GTATCCTTTC CAGCCAGCTC TGCAGATGGG TGTCCAGGCT 480
GTGCATGATG CACCTCAAGT GGGCAGAGCT TGCAGGCCAA GGTTTTAAAG GCTGTTCAGG 540
AATGGATGGC AAGCAGGATC TAAGAGGAGG GGGGGTTGTT GTTGTTTGGG GGGGGGGTGG 600 TTTTGGTTTG TTTTTTTTGA GACAGGGTTT CTCTGTGTGG CCCTGGCCCT CCTGGAACCC 660
ACTCTGTAGA CCAGGCTGGC CTTGAACTCA GAAATCTGCC TGCCTCTGCC TCCCGAGTGC 720
TGGGATTAAA GGCGTGTGCC CATCGAGGAG GGAGATTTTA TTTAGATTAT AAAAAGGACG 780 WATT: 785
References
Almendral, J.M., Santaren, J.F., Perern, J., Zerial, M. and Brnvo, R. (1989). Expression, cloning and cDNA scquence of a fibroblast serum-regulated gene encoding a putative actinassociated protcin (p27). Exp. Cell Res., 181, 518-530.LIST OF SEQUENCES (1) GENERAL INFORMATION:
(i) DEPOSITOR:
(A) NAME: INSTITUT PASTEUR
(B) STREET: 28 RUE DU DOCTEUR ROUX
(C) CITY: PARIS
(E) COUNTRY: FRANCE
(F) POSTAL CODE: 75015
(A) NAME: PARIS 7 UNIVERSITY
(B) STREET: 1 PLACE JUSSIEU
(C) CITY: PARIS
(E) COUNTRY: FRANCE
(F) POSTAL CODE: 75005
(ii) TITLE OF THE INVENTION: SEQUENCES UPSTREAM OF THE SM22 GENE
(iii) NUMBER OF SEQUENCES: 3
(iv) COMPUTER-DETACHABLE FORM:
(A) TYPE OF SUPPORT: Floppy disk
(B) COMPUTER: IBM PC compatible
(C) OPERATING SYSTEM: PC-DOS / MS-DOS
(D) SOFTWARE: PatentIn Release +1.0, Version # 1.30 (EPO)
INFORMATION FOR SEQ ID NO; I:
(i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
(A) LENGTH: 6261 pairs of bases
(B) TYPE: nucleotide
(C) NUMBER OF STRANDS: double
(D) CONFIGURATION: linear
(ti) TYPE OF MOLECULE: DNA (genomics)
(iii) HYPOTHETIC: NO
(vi) ORIGIN
(A) ORGANIZATION: MOUSE
TCTAGAGGCC ACGGAACGGT GCCAAGCACA CAGTCCCTTT TGCCTCTTTC
ACGGGAGCAG
GAGTCCCAGT GCCTGTCGTG GAAAGGGAGG AACATGCCAG GTCCCTGTGT
GTCCTTGGCC
CTGTCTCACC AAAGGACTCA GGGCTGGTTT CTGAGTTTCC GTCCAGTATT
TAGCCAAGTC
CTGTGTTAGT CACGTAGGCC TAAGAGCCTT GGCGTTTACG GAGTCACCCA
GCTCTGGCCC
CTGGCATTCT GGTCCTTGGC GTTTACAGAG TCACCCAGCT CCAGGCCCCT
GGCACTTTGG
TACTTGGTTG CCCTTCACTC CACCAGGTCC ATTCCAGATG CCAAGAGTGG
GCCCCAGGAA
TGTGTTTCCT TCTCTCCACC ATGTTTTTAT AGCTCTTGGG CTGGGAGAAG
AGGCGGGTCT
GGGTCTTTGT TTCTGAGCTT TGTTCTATGT TCCTCCATGC TACGGTTGCA
ATTGTTTTCT
ATGAACGAGT ACATTCAATA AAGACAACCA GACCTGGGAT TTGGGGTCTT
ACTGATGTGT
TGGGAGGTGC AGGAGCCTCC GTGTCCCATT TATTTTGGCC TTCCCGTCTC
GTTTCTGTGC
GTGGCTACAT TGGGAATGAC CTTCCTTGAT CCCACCAAGC CACCCATTGA
TTCTGTAAAC
AtGTGACCCT TGCTCCAAGC ATTGCTTACA GGAGCAGGAT ACTGAAAGTG
TGTCTGTGCC
CTCTCCTGAT AACCCCTCCC TTCAGCAGGC ACACAGCACC TGACTACCCA
CCACGTATGT
AAACGTCAGT ATCCTTTCCA GCCAGCTCTG CAGATGGGTG TCCAGGCTGT
GCATGATGCA
CCTCAAGTGG GCAGAGCTTG CAGGCCAAGG TTTTAAAGGC TGTTCAGGAA
TGGATGGCAA
GCAGGATCTA AGAGGAGGGG GGGTTGTTGT TGTTTGGGGG GGGGGTGGTT
TTGGTTTGTT
TTTTTTGAGA CAGGGTTTCT CTGTGTGGCC CTGGCCCTCC TGGAACCCAC TCTGTAGACC
AGGCTGGCCT TGAACTCAGA AATCTGCCTG CCTCTGCCTC CCGAGTGCTG
GGATTAAAGG
CGTGTGCCCA TCGAGGAGGG AGATTTTATT TAGATTATAA AAAGGACGGG
ATTTGGGGAA
TCCTGTCTAG TGAATTCAGG ACGTAATCAG TGGCTGGGAA GCAAGAGCTC
TAGAGGAGCT
CCAGCTTATT ATGACCCTTC CTTCAGATGC CACAAGGAGG TGCTGGAGTT
CTATGCACCA
ATAGCTTAAA CCAGCCAGGC TGGCTGTAGT GGATTGAGCG TCTGAGGCTG
CACCTCTCTG
GCCTGCAGCC AGTTCTGGGT GAGACTGACC CTGCCTGAGG GTTCTCTCCT
TCCCTCTCTC
TACTCCTTCC TCCCTCTCCC TCTCCCTCTC TCTGTTTCCT GAGGTTTCCA
GAATTGGGGA
TGGGACTCAG AGACACCACT AAAGCCTTAC CTTTTAAGAA GTTGCATTCA
GTGAGTGTGT
GAGACATAGC ACAGATAGGG GCAGAGGAGA GCTGGTTCTG TCTCCACTGT GlliGGTCTT
GGGTACTGAA CTCAGACCAT CAGGTGTGAT AGCAGTTGTC TTTAACCCTA
ACCCTGAGCC
TGTCTCACCT GTCCCTTCCC AAGACCACTG AAGCTAGGTG CAAGATAAGT
GGGGACCCTT
TCTGAGGTGG TAGGATCTTT CACGATAAGG ACTATTTTGA AGGGAGGGAG
GGTGACACTG
TCCTAGTCCT CTTACCCTAG TGTCTCCAGC CTTGCCAGGC CTTAAACATC
CGCCCATTGT
CACCGCTCTA GAAGGGGCCA CCCTTGACTT GCTGCTAAAC AAGGCACTCC
CTAGAGAAGA
TACCATACCT GTGGGCAGGA TGACCCATGT TCTGCCATGC ACTTGGTAGC
CTTGGAAAGG
CCACTTTGAA CCTCAATTTT CTCAACTGTT AAATGGAGTG GTAACTGCTA
TCTCATAATA
AAGGGGAAGG TGAGGAAGGC GTTTGGATAG TGCCTGGTTG CGGCCAGGCT
GCAGTCAAGA
CTAGTTCCCA CCAACTCGAT TTTAAAGCCT TGCAAGAAGG TGGCTTGTTT
GTCCCTTGCA
GGTTCCTTTG CTCGGGCCAA ACTCTAGAAT GCCTCCCCCT TTCTTTCTCA
TTGAAGAGCA
GACCCAAGTC CGGGTAACAA GGAAGGGTTT CAGGGTCCTG CCCATAAAAG
GTTTTTCCCG
GCCGCCCTCA GCACCGCCCC GCCCCGACCC CCGCAGCATC TCCAAAGCAT
GCAGAGAATG
TCTCCGGCTG CCCCCGACAG ACTGCTCCAA CTTGGTGTCT TTCCCCAAAT
ATGGAGCCTG
TGTGGAGTGA GTGGGGCGGC CCGGGGTGGT GAGCCAAGCA GACTTCCATG
GGCAGGGAGG
GGCGCCACGG GGCGGCAGAG GGGTGACATC ACTGCCTAGG CGGCCTTTAA
ACCCCTCACC
CAGCCGGCGC CCCGGCCCGT CTGCCCCAGC CCAGACACCG AAGCTACTCT
CCTTCCAGTC
CACAAACGAC CAAGCCTTGT AAGTGCAAGT CATGGGAGCA GAAGGGCTGT
GGGCTCAATT
AGATCCCCTA GTCTCTTCTA GTTTGCTGGG TGGAATTGGG TCCCTAGAGA
CCATTCTCTG
TGTTAGACAA AAAGTCTGGG TTAAAATGCC TAGGATGATT TGACTGGGGC
AAAAGAATAA
ATGQGGTGAG AGGGAGGCTC AAATTCAGTC ACTGTCCCAC CCATAGGTGT
ATGGGCTATG
TGTTAGGCCC AAAGAGGTGA CAAATGAGGC CAAGGGAACA ACTCCATCTT
TGGATCTCCA
AGAAGGTGAG GGGCTAAGTT CTGGAAAGCA GTGACCCACT GATGGTCCCC
AGGGCTAATG
CAACTCGGGG GAGCCAGGAG GTAGCCCCCT CAGGCAGTGG AGGACTAAAG
ATCTTATTTT
TTGTAGCGCT AGGGATCAAA CCCCAGGGCG CTATGTGTGG CAGGCATGTG
CTCCATCTAC
CACAGAAGTT TAATCCTTCA GACTAGCCTG GGATAGGGCC TGCTTTTTCT
TTCCTTTTCT
CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTCT CTCTCTCTTTTT
CTTTCCTTTT
CTCTCTTTCA CTCTCTCTTT CTAATTTCTT TTTCTTTTTT TCTTTCTTTT CTTTAGACAG
GGTTTCTCTG TGTAGCCCTG GCTGTTCTGG AACTCACTCT TTAGACCAGG
CTGGCCTCGA
ATCTCAGAAA TCTACCTGCC TCTGCCTCCC AAGTGCTGGG ATTAAAGGCG
TGTGCCACCA
CTGCCCAGCT AAGGTTTGCT TTTTGATGGC AGCTTGGTCC AGTTTGAAAG
TAGGAGGTCA
GTCCACTGTA GGCAGATAGG TGACAGGTGG CAGATAGGTG ACAGATAGGT
GACAGGTGGA
GGAGCTTTGG AACTGGGACT GGACAGCCCT GGGACCCTGT TCCTCCCAAA
GGGTCTTGGT GGTTCCCCTT GGGGCTCTCT MAGGATGTC AGTGGGCTGT TGCCACATCT
ATATAAGAGG
ACTAGTCTrC TGGAATTTAG GTGTGATCTC TCAGGGATGC AGAAATGCTC
ACCCTTACTG
TCATTTTATG GGCTGAGGTA CCACAGGCAG ATATACCCTG GTCTGCTTGT
TGTCCAGGGT
CTCTGCTACA TGGAGGCCCC TTTCCACAGC CTAACCTCTC TACCTGCTGA
CAGGAGGGCT
GGATGGCCAC AGGCATCCAA CGTGCGCATC ATGCAGGTGT TTTGCGTTGG
AGCTTTTGTC
TAGAAATACC CTGGTGGGCT GCCAAACCAC CACCCATATC CCTCTCTCCT
CTCTGCTGCC
TCTAAGATGA CAGCTTGATT TTTCTTATAG TGATTTTTTT TTTTGGTTTT GTTTTTTTGT
TTGTTTTAAG TTAGCATACA AAGTAATACA TTTCATCATG GCATTTGGAC
ATACATATAT
ATTTTATTTG CTCTCCTGGC CTCTTCTCAA AGAGACTTCT CTGGAcTTTC
TTGTATTTTT
GGTTGTGAGC CTAGCCTTTA ACGGCTGAGC CATCTCTCCA GCCCTTCTTT
GGACTTTCTA
CTTCATACTT CCCACCAGTC TGGGAAGAAG GGCACATGGA ATCTTGAGAG
CATGACCTGA
CCCAGACCTG ACAGATGTCA AGGCTGCAGT GTATGCTCTT GTTCGTACGG
CTTGTTCTTA
GTCCTGCAGT TCAGAACTTT CTGGAGACTG AGAAGTGCAT GTGAGGACAC
TCTCCTCCCA
TCTTTTCCTC TAGTGGCTAG TGATGTTTGG TTTTTTGTTT TGAGACAGGG TTICTCTGTA
TAGCCCTAGC TATCCTGGAA CTCACTTTGT AGATCAGGCT GGCCTCCAAC
TCAGAAATCT
GCCTGCCTCT GCCTCCCGAG TGCTGGGACT AAAGGCGTGC GCCACCACTG
TCCAGTCAGG
AGTAGAAGGA AACTGTAAGG TGCTTGAGAC AGGCTGAGTA GAGGCTAGGA GGAAGGGGCA
CCGCAGTCAC CGGCTCCATG ACTCTGTGAC WTGTGGTT CCTTGTCGCA
GCGGTTCCTG
GTGGTGGTGG TGGTCGGGGG TTGGGGGGAG GGGGCAGGCC ACACAGTGGG
GTGTGGGAGG
GAATAGCTGT TGACAACTTC CCAACAGAAA CCAGGCTTTT GAGTCCTCCA
GGGTAGCTTG
AGAGGGTACT CAGAAAGCCG TGTCCATGTC CCCTTTCCTT CACCTCAGGG
AAGTAAGTTG
CCTATAGGGT TGTCATTTCA ATGAGGTCTT CTGGTTATTC TGTTTTTCTC TCAATGTTGG
TGTTGGGCTC AGGGAATGCT TTGGAGAAGG TGGTGGGAAC TGGAGAAGGG
AAGATCAGTT
TACTGTGTAA ACTCACTGGT TAAAGTACCC CCTCCCTTCC ACCCTGCAAT
ACACACACAC
ACACACACAC ACACACACAC ACACACACAC ACCCCATCTC GAAGAGCTCT ATTAAGCTCC
AGGTGCACTG TAGTTCACAG ACTGCATCTT CCAGGTTTGC TCCCACTTCA <RTI ID = 32.
CTCCATGCTC ACACAATTTT TCTCTCAACC AATGACCTCT CAGAAGCAGG
GGTTGGTTTG
CAAAATTCTT CAGATACCTC AACAGATGGC ATCCCACTCA GGCTATCCCT GCTGACTAGG
TCTGGCTCCA GCCCTGACTG TATCTACCCA GGGACCTACC TGCCTGCTTT
GCTCCTATAG
CCTTCCTCCG TGTCTGGGTC CCCAGAGAGAGC TGCCGGCATA GGCCTTTGAG
GCAACAGCTG
GCATACAGGC CAGGCTTCCC ATGCTCTGGC TAGCAGATTC TCTGCCCTGG
AGGACTTTGA
CTGCATGGTT TCTCTCACTG CTGCAACAGT CAGAGCTGGC CCACACGGGC ACAACAGCGC
ACTTCCATCT GGGTCTCCCT GAGAATGCCG CTGTTTTCTG AGAACCCTTG
GACTCTGGTG
GCTTTATCAG GTCTTTTTGT CAGCTGCGCT TTGGGGGATG AACTTTGCTC
TTCTGGCTTC
TGGGTCAGAG GGTAAAGATT TGGTGGCAAC CGGTAGCTAG AGAAAGATAG
CTACTGGCTG
AATTTGGAGG ACATGGCTTC TGGAAAACCT CTCTAGTGCT TTTCTGGCTA
GTCTTGGCAA
AGTAAAAATG CTCTGATAGC CAGCCCGGGT GATGCAGGGC TTCCTGTTCG AGGCCTTTCT
GTACAAAATT AGTGAGACAT TGCCTCAAAA CTATGAAACA AGCCAGACTC
TGTTGAAGCA
CGCCTTTAAT CCCAGCACTC AGGAGGCTGA AGCAGGCAAG ATCTCTGTTA
GTTGGAGGCC
AGTCTACAGG AAAGTTCTAC AACAGCAGAG GCCAGACAGT GCAACCCTTT
CTGGGGGTGT
GGGGGAGGAA AACCCAACAA AAACACAAAC TATAAAACAA AGAGAAGGCC
GAGGACAAAG
CTTAGCAATG CATACTTCCC TTTCTATGTG AAGCCCTGGG CTCCACCAGT
ACTGCAGAAA
GAAGCAAGCA ATGAGGGACA GGAGGTTGGC TCTAGGCCCA GGGGTTGTCA AAATAGTCCA
CAGGCCAAAG GCAGCCTGAT GTCTGTTTTT ATAAACAAAA TTTTATTGGC ACACATTGGT
TATGTATCAG CTAGGCTATT TTCATTACAA TAGAGGCCAT ATGGTCTGTA
AAGTCTAAAA
TATTTACTCT GCTGTTTTAC ATAAAAAGTT GACAGACTCT TGCTCTAGAC
TGACAAATAT
CTAAGACCTT GTTTTCTGAG GTTCAAGTTT CAGAGGGGTC TCTGCAGCAA
GTGGGTAAAG
CTGGTCTAGG TCATGCTATG ATGTCTAGGG TCCCCTCAGA GTGGAAGGCC
TGCTTAGCAC
AAATGAAGTA AAGTAACTTG CTGGCTCTTT GTTCTTTTCT CCACACTCTA
TACTTTAGCT
CTGCCTCAACATG (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 2:
(i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
(A) LENGTH: 2190 base pairs
(B) TYPE: nucleotide
(C) NUMBER OF STRANDS: double
(D) CONFIGURATION: linear
(ii) TYPE OF MOLECULE: DNA (genomics)
(iii) HYPOTHETIC: NO
(vi) ORIGIN:
(A) ORGANIZATION: MOUSE
(xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID NO: 2
GGGCCCCAGG AATGTGTTTC CTTCTCTCCA CCATGTTTTT ATAGCTCTTG GGCTGGGAGA 60
AGAGGCGGGT CTGGGTCTTT GTTTCTGAGC TTTGTTCTAT GTTCCTCCAT GCTACGGTTG 120
CAATTGTTTT CTATGAACGA GTACATTCAA TAAAGACAAC CAGACCTGGG ATTTGGGGTC 180
TTACTGATGT GTTGGGAGGT GCAGGAGCCT CCGTGTCCCA TTTATTTTGG CCTTCCCGTC 240
TCGTTTCTGT GCGTGGCTAC ATTGGGAATG ACCTTCCTTG ATCCCACCAA GCCACCCATT 300
GATTCTGTAA ACATGTGACC CTTGCTCCAA GCATTGCTTA CAGGAGCAGG ATACTGAAAG 360
TGTGTCTGTG CCCTCTCCTG ATAACCCCTC CCTTCAGCAG GCACACAGCA CCTGACTACC 420
CACCACGTAT GTAAACGTCA GTATCCTTTC CAGCCAGCTC TGCAGATGGG TGTCCAGGCT 480
GTGCATGATG CACCTCAAGT GGGCAGAGCT TGCAGGCCAA GGTTTTAAAG GCTGTTCAGG 540
AATGGATGGC AAGCAGGATC TAAGAGGAGG GGGGGTTGTT GTTGTTTGGG GGGGGGGTGG 600 TTTTGGTTTG TTTTTTTTGA GACAGGGTTT CTCTGTGTGG CCCTGGCCCT CCTGGAACCC 660
ACTCTGTAGA CCAGGCTGGC CTTGAACTCA GAAATCTGCC TGCCTCTGCC TCCCGAGTGC 720
TGGGATTAAA GGCGTGTGCC CATCGAGGAG GGAGATTTTA TTTAGATTAT AAAAAGGACG 780
GGATTTGGGG AATCCTGTCT AGTGAATTCA GGACGTAATC AGTGGCTGGG AAGCAAGAGC 840
TCTAGAGGAG CTCCAGCTTA TTATGACCCT TCCTTCAGAT GCCACAAGGA GGTGCTGGAG 900
TTCTATGCAC CAATAGCTTA AACCAGCCAG GCTGGCTGTA GTGGATTGAG CGTCTGAGGC 960
TGCACCTCTC TGGCCTGCAG CCAGTTCTGG GTGAGACTGA CCCTGCCTGA GGGTTCTCTC 1020
CTTCCCTCTC TCTACTCCTT CCTCCCTCTC CCTCTCCCTC TCTCTGTTTC CTGAGGTTTC 1080 CAGAATTGGG GATGGGACTC AGAGACACCA CTAAAGCCTT ACCTTTTAAG AAGTTGCATT 1140
CAGTGAGTGT GTGAGACATA GCACAGATAG GGGCAGAGGA GAGCTGGTTC TGTCTCCACT 1200
GTGTTTGGTC TTGGGTACTG AACTCAGACC ATCAGGTGTG ATAGCAGTTG TCTTTAACCC 1260
TAACCCTGAG CCTGTCTCAC CTGTCCCTTC CCAAGACCAC TGAAGCTAGG TGCAAGATAA 1320
GTGGGGACCC TTTCTGAGGT GGTAGGATCT TTCACGATAA GGACTATTTT GAAGGGAGGG 1380
AGGGTGACAC TGTCCTAGTC CTCTTACCCT AGTGTCTCCA GCCTTGCCAG GCCTTAAACA 1440
TCCGCCCATT GTCACCGCTC TAGAAGGGGC CACCCTTGAC TTGCTGCTAA ACAAGGCACT 1500
CCCTAGAGAA GATACCATAC CTGTGGGCAG GATGACCCAT GTTCTGCCAT GCACTTGGTA 1560
GCCTTGGAAA GGCCACTTTG AACCTCAATT TTCTCAACTG TTAAATGGAG TGGTAACTGC 1620
TATCTCATAA TAAAGGGGAA CGTGAGGAAG GCGTTTGGAT AGTGCCTGGT TGCGGCCAGG 1680
CTGCAGTCAA GACTAGTTCC CACCAACTCG ATTTTAAAGC CTTGCAAGAA GGTGGCTTGT 1740
TTGTCCCTTG CAGGTTCCTT TGCTCGGGCC AAACTCTAGA ATGCCTCCCC CTTTCTTTCT 1800
CATTGAAGAG CAGACCCAAG TCCGGGTAAC AAGGAAGGGT TTCAGGGTCC TGCCCATAAA 1860
AGGTTTTTCC CGGCCGCCCT CAGCACCGCC CCGCCCCGAC CCCCGCAGCA TCTCCAAAGC 1920
ATGCAGAGAA TGTCTCCGGC TGCCCCCGAC AGACTGCTCC AACTTGGTGT CTTTCCCCAA 1980
ATATGGAGCC TGTGTGGAGT GAGTGGGGCG GCCCGGGGTG GTGAGCCAAG CAGACTTCCA 2040
TGGGCAGGGA GGGGCGCCAC GGGGCGGCAG AGGGGTGACA TCACTGCCTA GGCGGCCTTT 2100
AAACCCCTCA CCCAGCCGGC GCCCCGGCCC GTCTGCCCCA GCCCAGACAC CGAAGCTACT 2160
CTCCTTCCAG TCCACAAACG ACCAAGCCTT 2190 (2) INFORMATION FOR SEQ ID NO: 3
(i) CHARACTERISTICS OF THE SEQUENCE:
(A) LENGTH: 785 base pairs
(B) TYPE: nucleotide
(C) NUMBER OF STRANDS: double
(D) CONFIGURATION: linear
(ii) TYPE OF MOLECULE: DNA (genomic)
(iii) HYPOTHETIC: NO
(vi) ORIGIN:
(A) ORGANIZATION: MOUSE
(xi) DESCRIPTION OF THE SEQUENCE: SEQ ID No: 3:
GGGCCCCAGG AATGTGTTTC CTTCTCTCCA CCATGTTTTT ATAGCTCTTG GGCTGGGAGA 60
AGAGGCGGGT CTGGGTCTTT GTTTCTGAGC TTTGTTCTAT GTTCCTCCAT GCTACGGTTG 120
CAATTGTTTT CTATGAACGA GTACATTCAA TAAAGACAAC CAGACCTGGG ATTTGGGGTC 180
TTACTGATGT GTTGGGAGGT GCAGGAGCCT CCGTGTCCCA TTTATTTTGG CCTTCCCGTC 240
TCGTTTCTGT GCGTGGCTAC ATTGGGAATG ACCTTCCTTG ATCCCACCAA GCCACCCATT 300
GATTCTGTAA ACATGTGACC CTTGCTCCAA GCATTGCTTA CAGGAGCAGG ATACTGAAAG 360
TGTGTCTGTG CCCTCTCCTG ATAACCCCTC CCTTCAGCAG GCACACAGCA CCTGACTACC 420
CACCACGTAT GTAAACGTCA GTATCCTTTC CAGCCAGCTC TGCAGATGGG TGTCCAGGCT 480
GTGCATGATG CACCTCAAGT GGGCAGAGCT TGCAGGCCAA GGTTTTAAAG GCTGTTCAGG 540
AATGGATGGC AAGCAGGATC TAAGAGGAGG GGGGGTTGTT GTTGTTTGGG GGGGGGGTGG 600 TTTTGGTTTG TTTTTTTTGA GACAGGGTTT CTCTGTGTGG CCCTGGCCCT CCTGGAACCC 660
ACTCTGTAGA CCAGGCTGGC CTTGAACTCA GAAATCTGCC TGCCTCTGCC TCCCGAGTGC 720
TGGGATTAAA GGCGTGTGCC CATCGAGGAG GGAGATTTTA TTTAGATTAT AAAAAGGACG 780 WATT: 785
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