FI119325B - New endoglucanase polypeptides and their preparation and use - Google Patents

New endoglucanase polypeptides and their preparation and use Download PDF

Info

Publication number
FI119325B
FI119325B FI20055692A FI20055692A FI119325B FI 119325 B FI119325 B FI 119325B FI 20055692 A FI20055692 A FI 20055692A FI 20055692 A FI20055692 A FI 20055692A FI 119325 B FI119325 B FI 119325B
Authority
FI
Finland
Prior art keywords
ser
gly
ala
thr
pro
Prior art date
Application number
FI20055692A
Other languages
Finnish (fi)
Swedish (sv)
Other versions
FI20055692A (en
FI20055692A0 (en
Inventor
Liisa Viikari
Matti Siika-Aho
Jari Vehmaanperae
Leena Valtakari
Jarno Kallio
Pentti Ojapalo
Marika Alapuranen
Satu Hooman
Original Assignee
Ab Enzymes Oy
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Ab Enzymes Oy filed Critical Ab Enzymes Oy
Publication of FI20055692A0 publication Critical patent/FI20055692A0/en
Priority to FI20055692A priority Critical patent/FI119325B/en
Priority to ES06830937.6T priority patent/ES2637008T3/en
Priority to BRPI0620318A priority patent/BRPI0620318B1/en
Priority to MX2008008225A priority patent/MX2008008225A/en
Priority to PCT/FI2006/050560 priority patent/WO2007071820A1/en
Priority to CN2006800487923A priority patent/CN101346464B/en
Priority to EP06830937.6A priority patent/EP1969123B1/en
Priority to DK06830937.6T priority patent/DK1969123T3/en
Priority to PE2006001674A priority patent/PE20071180A1/en
Priority to PE2010000986A priority patent/PE20231179A1/en
Publication of FI20055692A publication Critical patent/FI20055692A/en
Application granted granted Critical
Publication of FI119325B publication Critical patent/FI119325B/en

Links

Classifications

    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14Hydrolases (3)
    • C12N9/24Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
    • C12N9/2402Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
    • C12N9/2405Glucanases
    • C12N9/2434Glucanases acting on beta-1,4-glucosidic bonds
    • C12N9/244Endo-1,3(4)-beta-glucanase (3.2.1.6)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C11ANIMAL OR VEGETABLE OILS, FATS, FATTY SUBSTANCES OR WAXES; FATTY ACIDS THEREFROM; DETERGENTS; CANDLES
    • C11DDETERGENT COMPOSITIONS; USE OF SINGLE SUBSTANCES AS DETERGENTS; SOAP OR SOAP-MAKING; RESIN SOAPS; RECOVERY OF GLYCEROL
    • C11D3/00Other compounding ingredients of detergent compositions covered in group C11D1/00
    • C11D3/16Organic compounds
    • C11D3/38Products with no well-defined composition, e.g. natural products
    • C11D3/386Preparations containing enzymes, e.g. protease or amylase
    • C11D3/38645Preparations containing enzymes, e.g. protease or amylase containing cellulase
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/11DNA or RNA fragments; Modified forms thereof; Non-coding nucleic acids having a biological activity
    • C12N15/62DNA sequences coding for fusion proteins
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N15/00Mutation or genetic engineering; DNA or RNA concerning genetic engineering, vectors, e.g. plasmids, or their isolation, preparation or purification; Use of hosts therefor
    • C12N15/09Recombinant DNA-technology
    • C12N15/63Introduction of foreign genetic material using vectors; Vectors; Use of hosts therefor; Regulation of expression
    • C12N15/79Vectors or expression systems specially adapted for eukaryotic hosts
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12NMICROORGANISMS OR ENZYMES; COMPOSITIONS THEREOF; PROPAGATING, PRESERVING, OR MAINTAINING MICROORGANISMS; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING; CULTURE MEDIA
    • C12N9/00Enzymes; Proenzymes; Compositions thereof; Processes for preparing, activating, inhibiting, separating or purifying enzymes
    • C12N9/14Hydrolases (3)
    • C12N9/24Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2)
    • C12N9/2402Hydrolases (3) acting on glycosyl compounds (3.2) hydrolysing O- and S- glycosyl compounds (3.2.1)
    • C12N9/2405Glucanases
    • C12N9/2434Glucanases acting on beta-1,4-glucosidic bonds
    • C12N9/2437Cellulases (3.2.1.4; 3.2.1.74; 3.2.1.91; 3.2.1.150)
    • CCHEMISTRY; METALLURGY
    • C12BIOCHEMISTRY; BEER; SPIRITS; WINE; VINEGAR; MICROBIOLOGY; ENZYMOLOGY; MUTATION OR GENETIC ENGINEERING
    • C12YENZYMES
    • C12Y302/00Hydrolases acting on glycosyl compounds, i.e. glycosylases (3.2)
    • C12Y302/01Glycosidases, i.e. enzymes hydrolysing O- and S-glycosyl compounds (3.2.1)
    • C12Y302/01004Cellulase (3.2.1.4), i.e. endo-1,4-beta-glucanase
    • DTEXTILES; PAPER
    • D06TREATMENT OF TEXTILES OR THE LIKE; LAUNDERING; FLEXIBLE MATERIALS NOT OTHERWISE PROVIDED FOR
    • D06MTREATMENT, NOT PROVIDED FOR ELSEWHERE IN CLASS D06, OF FIBRES, THREADS, YARNS, FABRICS, FEATHERS OR FIBROUS GOODS MADE FROM SUCH MATERIALS
    • D06M16/00Biochemical treatment of fibres, threads, yarns, fabrics, or fibrous goods made from such materials, e.g. enzymatic
    • D06M16/003Biochemical treatment of fibres, threads, yarns, fabrics, or fibrous goods made from such materials, e.g. enzymatic with enzymes or microorganisms
    • DTEXTILES; PAPER
    • D06TREATMENT OF TEXTILES OR THE LIKE; LAUNDERING; FLEXIBLE MATERIALS NOT OTHERWISE PROVIDED FOR
    • D06PDYEING OR PRINTING TEXTILES; DYEING LEATHER, FURS OR SOLID MACROMOLECULAR SUBSTANCES IN ANY FORM
    • D06P5/00Other features in dyeing or printing textiles, or dyeing leather, furs, or solid macromolecular substances in any form
    • D06P5/02After-treatment
    • DTEXTILES; PAPER
    • D21PAPER-MAKING; PRODUCTION OF CELLULOSE
    • D21CPRODUCTION OF CELLULOSE BY REMOVING NON-CELLULOSE SUBSTANCES FROM CELLULOSE-CONTAINING MATERIALS; REGENERATION OF PULPING LIQUORS; APPARATUS THEREFOR
    • D21C5/00Other processes for obtaining cellulose, e.g. cooking cotton linters ; Processes characterised by the choice of cellulose-containing starting materials
    • D21C5/005Treatment of cellulose-containing material with microorganisms or enzymes
    • DTEXTILES; PAPER
    • D21PAPER-MAKING; PRODUCTION OF CELLULOSE
    • D21HPULP COMPOSITIONS; PREPARATION THEREOF NOT COVERED BY SUBCLASSES D21C OR D21D; IMPREGNATING OR COATING OF PAPER; TREATMENT OF FINISHED PAPER NOT COVERED BY CLASS B31 OR SUBCLASS D21G; PAPER NOT OTHERWISE PROVIDED FOR
    • D21H17/00Non-fibrous material added to the pulp, characterised by its constitution; Paper-impregnating material characterised by its constitution
    • D21H17/005Microorganisms or enzymes

Description

119325 ί119325 ί

Uusia endoglukanaasipolypeptidejä ja niiden tuotto ja käyttö Keksinnön alaNovel endoglucanase polypeptides and their production and use Field of the Invention

Esillä oleva keksintö koskee uusia sellulaasientsyymejä, erityisesti uusia endoglukanaaseja, valmisteita ja koostumuksia, jotka sisältävät näitä 5 endoglukanaasientsyymejä, ekspressiovektoreita, isäntäsoluja ja menetelmiä näiden valmistukseen ja sellulaasien, valmisteiden ja koostumusten käyttöä tekstiili-, pesuaine- ja kuitumassa- ja paperiteollisuudessa.The present invention relates to novel cellulase enzymes, in particular novel endoglucanases, preparations and compositions containing these endoglucanase enzymes, expression vectors, host cells and methods for their preparation, and to the use of cellulases, preparations and compositions in the textile, detergent and pulp and paper industries.

Keksinnön taustaBackground of the Invention

Selluloosa on korkeampien kasvien päärakennekomponentti ja 10 esiintyy luonnollisesti melkein puhtaassa muodossa vain puuvillakuidussa. Se varustaa kasvisolut korkealla vetolujuudella auttaen niitä vastustamaan mekaanista kuormitusta ja osmoottista painetta. Selluloosa on β-1,4-sidosten yhdistämien glukoosiosien suoraketjuinen polysakkaridi. Luonnossa selluloosa liitetään yleensä ligniiniin yhdessä hemiselluloosien, kuten ksylaanien ja glu-15 komannaanien, kanssa. Sellulolyyttiset entsyymit hydrolysoivat selluloosaa ja niitä tuotetaan laajassa valikoimassa bakteereja ja sieniä. Sellulaasit ovat teollisesti tärkeitä entsyymejä, joiden nykyinen vuotuinen markkina-arvo on noin 190 miljoonaa US $. Tekstiiliteollisuudessa sellulaaseja käytetään denimin viimeistelyssä muodikkaan kivipestyn ulkomuodon luomiseksi denim-kankaille .·, · 20 biokivipesumenetelmässä ja niitä käytetään myös esimerkiksi poistamaan nuk- • ·· kaa ja ehkäisemään nyppyjen muodostumista puuvillavaatteiden pintaan. Pe- ’**.* suaineteollisuudessa sellulaaseja käytetään värien kirkastamiseksi ja vaattei- • · · den harmaantumisen ja nyppyyntymisen ehkäisemiseksi. Sellulaaseja käyte- :··: : tään edelleen elintarviketeollisuudessa ja eläinten rehun valmistamisessa ja • · : 25 niillä on suuri potentiaali kuitumassa- ja paperiteollisuudessa, esimerkiksi siis- tauksessa värin vapauttamiseksi kuitupinnoista ja vedenpoiston kulumassasta parantamisessa. Sellullaasien teollisten käyttötapojen laaja kirjo on muodosta- :Y: nut kaupallisten sellulaasituotteiden tarpeen, jotka sisältävät erilaisia sellu- • · .***. laasikomponentteja ja toimivat optimaalisesti erilaisilla pH- ja lämpötilaväleillä.Cellulose is a major structural component of higher plants and naturally occurs in almost pure form only in cotton fibers. It provides plant cells with high tensile strength, helping them to resist mechanical loading and osmotic pressure. Cellulose is a linear polysaccharide of glucose linked by β-1,4 bonds. In nature, cellulose is generally incorporated into lignin together with hemicelluloses such as xylans and Glu-15 commandants. Cellulolytic enzymes hydrolyze cellulose and are produced by a wide variety of bacteria and fungi. Cellulases are industrially important enzymes with a current annual market value of approximately US $ 190 million. In the textile industry, cellulases are used in finishing denim to create a fashionable stone-washed appearance on denim fabrics. ·, · 20 in the bi-stone washing method and are also used, for example, to remove linen and to prevent bumps on cotton garments. Cellulases are used in the pE **. * Diluent industry to brighten colors and prevent graying and flaking of clothing. Cellulases are still used: ··: in the food and animal feeds industry and · ·: 25 have great potential in the pulp and paper industry, for example in tamping to decolourize fiber surfaces and improve dewatering wear. The wide spectrum of industrial uses for cellulase has formed: Y need for commercial cellulase products containing various types of cellulose • ·. ***. glass components and work optimally at different pH and temperature ranges.

30 Sellulaasien käytännöllistä käyttöä vaikeuttaa tunnettujen sellu- • * * *·[·* laasikoostumusten luonne, jotka ovat usein entsyymiseoksia, joilla on useita aktiivisuuksia ja substraattispesifisyyksiä. Tästä syystä on pyritty aikaansaa- :*<*: maan sellulaaseja, joilla olisi vain toivotut aktiivisuudet. Kunkin sellulaasin ai- • · ....: nutlaatuiset ominaisuudet tekevät joistakin sellulaaseista sopivampia tiettyihin 35 tarkoituksiin kuin toisista. Entsyymien erotessa toisistaan monin tavoin yksi 2 119325 tärkeimmistä eroista on pH-optimi. Neutraalit sellulaasit ovat aktiivisimpia pH-välillä 6 - 8 ja emäksiset sellulaasit pH-välillä 7,5 -10, kun taas happamat sellulaasit, joiden pH-optimi on pH 4,5 - 5,5, osoittavat erittäin matalia aktii-visuustasoja korkeammissa pH-arvoissa. Neutraalit ja happamat sellulaasit 5 ovat erityisen käyttökelpoisia tekstiiliteollisuudessa. Kankaan käsittelyssä sellulaasit hyökkäävät puuvillakuituja muodostavia selluloosamolekyylien ketjuja vastaan tällä tavoin vaikuttaen kankaan ominaispiirteisiin.The practical use of cellulases is hampered by the nature of the known cellulase * * * * · [· * glass compositions, which are often enzyme mixtures with multiple activities and substrate specificities. For this reason, efforts have been made to: * <*: land cellulases with only the desired activities. The unique properties of each cellulase make some cellulases more suitable for certain purposes than others. When enzymes differ in many ways, one of the 2 119325 major differences is pH optimum. Neutral cellulases are most active at pH 6-8 and alkaline cellulases at pH 7.5-10, while acidic cellulases with a pH optimum of 4.5-5.5 show very low levels of activity at higher pH- values. Neutral and acidic cellulases 5 are particularly useful in the textile industry. In fabric treatment, cellulases attack cotton fiber-forming chains of cellulose molecules in this way, affecting fabric characteristics.

Tekstiiliteollisuudessa "kivipesty” ulkonäkö tai kulunut ulkonäkö ovat olleet denimin tuottajien mielenkiinnon kohteena viime vuosina. Perinteinen kilo vipesu hohkakivillä vähentää kankaan lujuutta ja kuormittaa pesukoneita. Trendi on ollut kohti entsymaattisia denimin viimeistelymenetelmiä ja sellulaasit ovat korvanneet hohkakivet tai niitä käytetään yhdessä hohkakivien kanssa antamaan kankaalle toivottu "kulunut” ulkonäkö. Kontrolloidut entsyymikäsitte-lyt johtavat vaatteiden ja koneiden vähempään vahingoittumiseen ja poistavat 15 kivien hävittämistarpeen.In the textile industry, the "stone-washed" appearance or worn-out appearance has been of interest to denim producers in recent years. worn out ”appearance. Controlled enzyme treatments result in less damage to clothing and machinery and eliminate the need for stone destruction.

Lisäksi tekstiiliteollisuus käyttää sellulaaseja bioviimeistelyssä t.s. luomaan pysyvän parannuksen nyppyyntymisen estoon ja parannetun kestävyyden nyppyyntymistä vastaan, vähennetyllä nukalla selkiytetyn pintarakenteen, paremman tekstiilintunnun, kuten pehmeyden, sileyden ja silkkisemmän 20 tuntuman, parannetun laskeutuvuuden ja tekstiilin kirkkaammat värit ja parannetun kosteuden imeytymisen.In addition, the textile industry uses cellulases in biofinishing, i.e. create a permanent improvement in anti-peeling and improved durability against peeling, a reduced pile clarified texture, a better feel of textiles such as softness, smoothness and silky feel 20, improved descent, and brighter colors and improved moisture absorption.

Denimin käsittelyssä käytetyt sellulaasit jaetaan yleensä kahteen ·*·*: pääryhmään: happamiin ja neutraaleihin sellulaaseihin. Happamat sellulaasit . tyypillisesti toimivat pH:ssa 4,5 - 5,5 ja neutraalit sellulaasit pH-välillä 6-8.The cellulases used for the treatment of denim are generally divided into two main groups: * acidic and neutral cellulases. Acid cellulases. typically operate at pH 4.5 to 5.5 and neutral cellulases at pH 6-8.

: i*. 25 Biokivipesussa käytetyt happamat sellulaasit ovat pääosin peräisin Trichoder- • · J'V ma reeseistä (suvullinen muoto Hypocrea jecorina) ja neutraalit sellulaasit tulit/ levät useista sienistä, mukaan lukien suvut Melanocarpus, Humicola, Myce- *···* liophthora, Fusarium, Acremonium ja Chrysosporium (Haakana ym. 2004).: i *. 25 Acidic cellulases used in biofuel washing are mainly derived from Trichoder • · J'V ma reesees (genus Hypocrea jecorina) and neutral cellulases from various fungi including Melanocarpus, Humicola, Myce-, Fusarium, Fusarium, Acremonium and Chrysosporium (Haakana et al. 2004).

T. reesei -entsyymit sisältävät esim. sellulaaseja glykosidiperheestä 5 (endo- :.v 30 glukanaasi II, EGII), perheestä 7 (sellobiohydrolaasi I, CBHI) ja perheestä 12 ··· (endoglukanaasi III, EGIII; Ward ym. 1993) ja neutraaleja sellulaaseja, useim- :v. min endoglukanaaseja, perheestä 45 ja perheestä 7 (Henrissat, 1991; Henris- .···. sat ja Bairoch, 1993).T. reesei enzymes include, for example, cellulases from the glycoside family 5 (endo-:? 30 glucanase II, EGII), family 7 (cellobiohydrolase I, CBHI) and family 12 ··· (endoglucanase III, EGIII; Ward et al. 1993) and neutral cellulases, most-: v. min. endoglucanases, from family 45 and family 7 (Henrissat, 1991; Henry., ···. sat and Bairoch, 1993).

• ·• ·

Sellulaasit käsittävät katalyyttisen domeenin/ytimen (CD), joka il-: V 35 mentää selluiaasiaktiivisuutta. Katalyyttisen domeenin lisäksi sellulaasimole-kyyti voi käsittää yhden tai useampia selluloosaa sitovia domeeneja (CBD:t), 3 119325 joita kutsutaan myös hiilihydraattia sitoviksi domeeneiksi/moduleiksi (CBD/CBM), jotka voivat sijaita katalyyttisen domeenin joko N- tai C-terminuksessa. CBD:eilla on hiilihydraattia sitovaa aktiivisuutta ja ne välittävät sellulaasin sitoutumisen kiteiseen selluloosaan, mutta niillä on vähän tai ei lainkaan vaikutusta 5 sellulaasientsyymin hydrolyyttiseen aktiivisuuteen liukoisia substraatteja kohtaan. Nämä kaksi domeenia tyypillisesti yhdistyvät joustavan ja erittäin gly-kosyloidun liitosalueen kautta.Cellulases comprise a catalytic domain / core (CD) that expresses cellulase activity. In addition to the catalytic domain, the cellulase molecule may comprise one or more cellulose binding domains (CBDs), also referred to as carbohydrate binding domains / modules (CBD / CBM), which may be located at either the N or C terminus of the catalytic domain. CBDs have carbohydrate binding activity and mediate cellulase binding to crystalline cellulose but have little or no effect on the hydrolytic activity of the cellulase enzyme against soluble substrates. These two domains typically combine via a flexible and highly Gly cosylated linker.

Sellulaasit, jotka hyökkäävät pääosin kuidun pintaa vastaan, ovat erityisen käyttökelpoisia indigo-värillä värjätyn denimin kivipesussa, koska väri 10 sijaitsee kuidun pinnalla. Käytettäessä puuvillakankaiden käsittelemiseksi happamat sellulaasit yleensä vaativat lyhyemmän pesuajan kuin neutraalit sellulaasit. Happamia sellulaaseja käytetään erityisesti bioviimeistelyssä (nyppyyn-tymisen estossa) ja myös denimin käsittelyssä (biokivipesussa).Cellulases, which mainly attack the surface of the fiber, are particularly useful for stone washing of denim-dyed denim because color 10 is located on the surface of the fiber. When used to treat cotton fabrics, acidic cellulases generally require a shorter wash time than neutral cellulases. Acidic cellulases are used particularly in bio-finishing (anti-peeling) and also in denim treatment (bio-stone washing).

Esillä olevan keksinnön yhteydessä endoglukanaasit (EG:t) tarkoit-15 tavat E.C. 3.2.1.4:ksi luokiteltuja entsyymejä ja ovat yksi kolmesta sellulaa-sityypistä, joita yleensä tarvitaan selluloosan biologisessa muuttamisessa glukoosiksi. Endoglukanaasit katkaisevat sisäisiä beta-1,4-glukosidisidoksia, kun sellobiohydrolaasit taas katkaisevat disakkaridisellobioosia selluloosan poly-meeriketjun päästä ja beta-1,4-glukosidaasit hydrolysoivat sellobioosia ja mui-20 ta lyhyitä sello-oligosakkarideja glukoosiksi. Joillakin luonnostaan esiintyvillä endoglukanaaseilla on selluloosaa sitova domeeni (CBD), kun toisilla taas ei ole.In the context of the present invention, endoglucanases (EGs) refer to E.C. 3.2.1.4 are enzymes classified as one of the three cellulase types commonly required for the biological conversion of cellulose to glucose. Endoglucanases cleave internal beta-1,4-glucosidic bonds, while cellobiohydrolases cleave disaccharide cellobiose at the end of the cellulose polymer chain, and beta-1,4-glucosidases hydrolyze cellobiose and other short cello-oligosaccharides to glucose. Some naturally occurring endoglucanases have a cellulose binding domain (CBD) while others do not.

• I• I

Myös endoglukanaaseja käytetään laajasti tekstiili-, pesuaine-, ja . kuitumassa- ja paperiteollisuudessa. Esimerkiksi cel45-perheen endogluka- : .·. 25 naaseja (EG:t perhe 45) kuvataan esimerkiksi US-patentissa 6 001 639, joka • · · 5*V kuvaa entsyymejä, joilla on endoglukanaasiaktiivisuus ja kaksi konservoitunut- • * » ta aminohapposekvenssiä. Käyttöjä tekstiili-, pesuaine- ja kuitumassa- ja pape- • · *···* risovelluksissa käsitellään yleisesti ja lignoselluloosamateriaalin käsitteleminen mainitaan. Julkaisussa WO 2004/053 039 suunnataan endoglukanaasien pe-30 suainesovelluksiin. US-patentti numero 5 958 082 esittää endoglukanaasin, ·«« erityisesti Thiela\ia terrestrisistä, käytön tekstiilisovelluksissa saamaan aikaan twiil-farkkujen kivipestyn tai hangatun ulkonäön. Julkaisu EP 0 495 258 koskee .···. pesuainekoostumuksia, jotka sisältävät Humicola-sellulaasia. US-patentti nu- • · I" mero 5 948 672 kuvaa sellulaasivalmistetta, joka sisältää endoglukanaasia, : V 35 erityisesti Humicolasta, ja sen käyttöä tekstiili- ja kuitumassasovelluksissa.Endoglucanases are also widely used in textiles, detergents, and. in the pulp and paper industry. For example, the endoglucose of the cel45 family: ·. 25 nases (EG family 45) are described, for example, in U.S. Patent No. 6,001,639, which discloses enzymes having endoglucanase activity and two conserved amino acid sequences. Uses in textile, detergent and fiber pulp and paper applications are widely discussed and the treatment of lignocellulosic material is mentioned. WO 2004/053 039 is directed to end-glucanase pe-30 agent applications. U.S. Patent No. 5,958,082 discloses the use of endoglucanase, particularly from Thiela &lt; / RTI &gt; terrestris, in textile applications to provide a stone-washed or scratched appearance of twilight jeans. EP 0 495 258 relates. detergent compositions containing Humicola cellulase. U.S. Patent No. 5,948,672 describes a cellulase preparation containing endoglucanase, especially from Humicola, and its use in textile and fiber pulp applications.

t · 4 119325 EG:t ja EG-rikastetut koostumukset ja konsentraatit ovat myös kaupallisesti saatavilla.t · 4 119325 EGs and EG enriched compositions and concentrates are also commercially available.

Kuitenkin on jatkuva tarve parannetuille sellulaaseille, mukaan lukien endoglukaanaseille, jotka ovat tehokkaampia kankaan käsittelyssä ja muilla 5 aloilla, joissa sellulaaseja perinteisesti käytetään. Etenkin on jatkuva tarve tehokkaammille sellulaaseille menetelmän taloudellisuuden parantamiseksi.However, there is a continuing need for improved cellulases, including endoglucanases, which are more effective in fabric treatment and other areas where cellulases are traditionally used. In particular, there is a continuing need for more efficient cellulases to improve the economics of the process.

Esillä oleva keksintö tähtää tämän tarpeen kohtaamiseen.The present invention aims to meet this need.

Keksinnön lyhyt kuvausBrief Description of the Invention

Esillä olevan keksinnön kohde on saada aikaan uusia endogiu-10 kanaaseja, joilla on parannetut hydrolyyttiset ominaisuudet käyttöön tekstiiliteollisuudessa, erityisesti puuvillan viimeistelyssä, kuten nyyppyyntymisen estossa ja kivipestyssä denimissä, ja käyttöön pesuainekoostumuksissa sekä muilla aloilla. Keksinnön mukaisilla uusilla endoglukanaaseilla on se etu, että ne ovat aktiivisia happamissa ja neutraaleissa pH-arvoissa, niillä on suuresti 15 parannettu teho tekstiilin bioviimeistely- ja biokivipesusovelluksissa ja pesu-ainesovelluksissa. Käytettäessä selluloosaa sisältävien tekstiilimateriaalien käsittelemisessä uudet endoglukanaasit saavat aikaan sileän tuntuman, parannetun ulkomuodon ja pehmeyden sekä pysyvän nyppyyntymisen eston tekstiilille. Keksinnön mukaisten endoglukanaasien parannetun tehokkuuden myötä 20 entsyymien käyttö on huomattavasti taloudellisempaa. Lisäetuja saavutetaan myös entsyymituotteiden logistiikan ja varastoinnin suhteen, kun pienempiä määriä entsyymituotetta tarvitaan. Lisäksi esillä olevan keksinnön mukaiset endoglukanaasit ollessaan happamia toimivat nopeammin tuottaen aika- jaIt is an object of the present invention to provide novel endoglycan channels having improved hydrolytic properties for use in the textile industry, particularly in cotton finishing, such as anti-soiling and stonewashed denim, and for use in detergent compositions and other fields. The novel endoglucanases of the invention have the advantage of being active at acidic and neutral pHs, having a greatly improved potency in Textile bio-finishing and bio-stone washing applications and detergent applications. When used in the treatment of cellulose-containing textile materials, the new endoglucanases provide a smooth feel, improved appearance and softness, and a permanent anti-peeling effect on textiles. Due to the improved efficiency of the endoglucanases of the invention, the use of enzymes is significantly more economical. Additional advantages are also achieved in the logistics and storage of enzyme products when smaller quantities of the enzyme product are required. In addition, the endoglucanases of the present invention, when acidic, act faster to produce times

• Φ I• Φ I

;‘"a kustannustehokkaita käsittelymenettelyjä ja säästöjä varusteissa sekä käsitte- :*V 25 lylaitteistoissa.; '' A cost-effective handling procedures and savings in equipment and conceptual: * V 25 hardware.

• · · ·*;;/ Esillä olevan keksinnön lisäkohteena on saada aikaan polynukleoti- *···: dejä, jotka koodittavat esillä olevan keksinnön mukaisia uusia endoglukanaa- seja ja endoglukanaasifuusioproteiineja.It is a further object of the present invention to provide polynucleotides encoding novel endoglucanases and endoglucanase fusion proteins of the present invention.

:.v Esillä olevan keksinnön lisäkohteena on vielä saada aikaan uusia 30 ekspressioplasmideja tai -vektoreita, jotka sisältävät sellaisia polynukleotideja, jotka ovat käyttökelpoisia esillä olevan keksinnön mukaisten uusien endoglu- • · · 'M' kanaasien tuotantoon, sekä näillä ekspressioplasmideilla transformoituja uusia *·;·* isäntiä.It is a further object of the present invention to provide novel expression plasmids or vectors containing polynucleotides useful for the production of novel endoglu-· · 'M' canases of the present invention and novel * * transformed with these expression plasmids. · * Hosts.

• Esillä olevan keksinnön lisäkohteena on vielä saada aikaan ent- *:**: 35 syymivalmisteita, jotka sisältävät yhtä tai useampia endoglukanaaseja, joilla on parannetut hydrolyyttiset ominaisuudet.It is a further object of the present invention to provide ent- *: **: 35 enzyme preparations containing one or more endoglucanases having improved hydrolytic properties.

5 1193255, 119325

Esillä olevan keksinnön lisäkohteena on vielä saada aikaan ent-syymlvalmisteiden ja endoglukanaasien käyttömenetelmiä tekstiilien viimeistelyyn, erityisesti denimin bioviimeistelyyn ja biokivipesuun.It is a further object of the present invention to provide methods of using enzyme preparations and endoglucanases for the finishing of textiles, in particular denim bio-finishing and bio-stone washing.

Esillä olevan keksinnön lisäkohteena on vielä saada aikaan keinot 5 käyttää keksinnön mukaisia entsyymivalmisteita pesuainekoostumuksissa.It is a further object of the present invention to provide means 5 for using the enzyme preparations of the invention in detergent compositions.

Esillä oleva keksintö koskee endoglukanaasipolypeptidiä, joka käsittää fragmentin, jolla on sellulolyyttistä aktiivisuutta ja joka on valittu ryhmästä, joka koostuu: a) polypeptidistä, joka käsittää aminohapposekvenssin, jolla on vä- 10 hintään 80 % identtisyys sekvenssin nro 2 kanssa; ja b) kohdan a) fragmentista, jolla on sellulolyyttistä aktiivisuutta.The present invention relates to an endoglucanase polypeptide comprising a fragment having cellulolytic activity and selected from the group consisting of: a) a polypeptide comprising at least 80% identity to SEQ ID NO: 2; and b) a fragment of a) having cellulolytic activity.

Esillä oleva keksintö koskee edelleen yllä määriteltyä endoglukanaasipolypeptidiä koodittavaa eristettyä polynukleotidia valittuna ryhmästä, joka koostuu: 15 a) sekvenssin nro 1, sekvenssin nro 16, tai sekvenssin nro 18 mu kaisesta nukleotidisekvenssistä; b) kohdan a) komplementaarisesta juosteesta; c) kohdan a) tai b) mukaisesta vähintään 20 nukleotidiä käsittävästä fragmentista; ja 20 d) sekvenssistä, joka on degeneroitunut geneettisen koodin suhteen missä tahansa kohdassa a), b) tai c) määritellystä sekvenssistä.The present invention further relates to an isolated polynucleotide encoding an endoglucanase polypeptide as defined above selected from the group consisting of: a) a nucleotide sequence of SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 16, or SEQ ID NO: 18; (b) the complementary strand of (a); c) a fragment of at least 20 nucleotides according to a) or b); and d) a sequence degenerate with respect to the genetic code of any one of the sequences defined in a), b) or c).

Esillä oleva keksintö koskee edelleen ekspressiovektoria, joka käsit-:tää yllä määritellyn polynukleotidisekvenssin.The present invention further relates to an expression vector comprising a polynucleotide sequence as defined above.

• .*. Esillä oleva keksintö koskee edelleen uusia keksinnön mukaisilla #·Ι φ : .·. 25 vektoreilla transformoituja isäntiä, erityisesti isäntiä, jotka pystyvät keksinnön |*V mukaisen endoglukanaasin korkeaan ekspressiotasoon.•. *. The present invention still further relates to novel # · Ι Ι:. Hosts transformed with vectors, in particular hosts capable of high expression levels of the endoglucanase of the invention.

• · φ *11.* Esillä oleva keksintö koskee edelleen entsyymivalmistetta, joka si- ***** sältää yhtä tai useampia keksinnön mukaisia endoglukanaasejaThe present invention further relates to an enzyme preparation containing one or more endoglucanases of the invention.

Esillä oleva keksintö koskee edelleen keksinnön mukaisten entsyy- *.v 30 mivalmisteiden käyttömenetelmiä tekstiilien bioviimeistelyyn, erityisesti nyp- ·»· i...: pyyntymisen estoon.The present invention further relates to methods of using the enzyme preparations according to the invention for the biological finishing of textiles, in particular for the inhibition of nymphs.

m .*.*. Esillä oleva keksintö koskee edelleen keksinnön mukaisten entsyy- .··*. mivalmisteiden käyttömenetelmiä tekstiilien viimeistelyyn, erityisesti denimin • · biokivipesuun.m. *. *. The present invention further relates to the enzyme ·· * of the invention. • methods of using finished products for finishing textiles, in particular denim • · stonewashing.

: V 35 Esillä oleva keksintö koskee edelleen keksinnön mukaisten entsyy- mivalmisteiden käyttöä pesuainekoostumuksissa.The present invention further relates to the use of the enzyme preparations of the invention in detergent compositions.

6 1193256, 119325

Piirustusten lyhyt kuvausBrief Description of the Drawings

Kuva 1 havainnollistaa kaaviokuvan ekspressiokaseteista, joita käytettiin Trichoderma reesein protoplastien transformaatiossa keksinnön mukaisten Acramonium thermophilumm sellulaasien tuotantoon. Rekombinanttigeenit 5 olivat T. reesein cbhl/cel7A-promoottorin (cbhl prom) kontrollin alaisia ja transkription terminaatio varmistettiin T. reesein dbhl-terminaattorin (cbhl term) lisäyksellä. amdS-geeni (amdS) sisällytettiin transformanttien valikointia varten.Figure 1 illustrates a schematic representation of the expression cassettes used to transform Trichoderma reesei protoplasts for the production of the Acramonium thermophilumm cellulases of the invention. The recombinant genes were under the control of the T. reesei cbhl / cel7A promoter (cbhl prom) and transcription termination was confirmed by the addition of the T. reesei dbh1 terminator (cbhl term). The amdS gene (amdS) was included for the selection of transformants.

Kuva 2 havainnollistaa heterologisesti tuotetun A. thermophilumin EG_40-sellulaasin pH-riippuvuuden määrittämällä viljelysupernatantista käyt-10 täen CMC:aa substraattina 10 minuutin reaktiossa 50°C:ssa (A). EG_40-sel-lulaasin lämpötilaoptimi määritettiin optimaalisessa pH:ssa (5,5). Reaktio CMC:n ollessa substraattina suoritettiin 60 minuutin ajan. BSA (100pg/ml) lisättiin stabilointiaineena. (B).Figure 2 illustrates the pH dependence of heterologously produced A. thermophilum EG_40 cellulase by assaying the culture supernatant using CMC as a substrate for a 10 minute reaction at 50 ° C (A). The temperature optimum of EG_40 cellulase was determined at optimal pH (5.5). The reaction with CMC as substrate was carried out for 60 minutes. BSA (100 µg / ml) was added as a stabilizer. (B).

Kuva 3 osoittaa keksinnön mukaisen uuden endoglukanaasin bioki-15 vipesuvaikutuksen/hankaustason vertailun tunnetun tekniikan mukaisen EGII-rikastetun konsentraatin kanssa. Biokivipesuvaikutus arvioitiin mittaamalla väri.Figure 3 shows a comparison of the bioavailability / abrasion level of the novel endoglucanase of the invention with the EGII-enriched concentrate of the prior art. The bio-stone wash effect was evaluated by measuring the color.

Kuva 4 osoittaa keksinnön mukaisen uuden endoglukanaasin nyp-pyntymisen esto-ominaisuuksien vertailun tunnetun tekniikan mukaisen EGII-rikastetun konsentraatin kanssa.Figure 4 shows a comparison of the anti-Nyp decay properties of the novel endoglucanase of the invention with the prior art EGII-enriched concentrate.

20 Kuva 5 osoittaa sarjan valokuvia, jotka osoittavat keksinnön mukai sen endoglukanaasin nyppyyntymisen estovaikutuksen.Figure 5 shows a series of photographs showing the anti-pitting effect of the endoglucanase of the invention.

• · • · « • ·#• · • · «• · #

Keksinnön yksityiskohtainen kuvaus • · · . .·. Esillä oleva keksintö perustuu pyrkimyksille löytää edelleen paran- : .·. nettuja sellulaaseja käyttöön tekstiiliteollisuudessa. Yllättäen havaittiin, että • · · j*V 25 aloittaen Acremonium-lajista, uusia endoglukanaaseja voitiin eristää ja rekom-binantteja entsyymejä voitiin tuottaa, joilla endoglukanaaseilla ei ole vain hy-***** väksyttävä lämpötilaprofiili vaan ne osoittavat myös yllättävän suotuisaa nyp pyyntymisen estotehoa ja ovat vähintään neljä kertaa yhtä tehokkaita kuin :.v kaupallinen EG:ia sisältävä valmiste. Lisäksi uudet endoglukanaasit osoittivat *·♦ 30 erinomaisia biokivipesuominaisuuksia verrattuna tunnetun tekniikan mukaisiin .*.*. sellulaaseihin.DETAILED DESCRIPTION OF THE INVENTION • · ·. . ·. The present invention is based on efforts to further improve:. cellulases for use in the textile industry. Surprisingly, it was found that, starting with Acremonium, new endoglucanases could be isolated and recombinant enzymes could be produced that not only have an annoying temperature profile but also exhibit surprisingly favorable napping. and at least four times as effective as: .v commercial EG containing formulation. In addition, the new endoglucanases showed * · ♦ 30 excellent bio-stone washing properties compared to prior art. *. *. cellulases.

• ·• ·

Sen mukaisesti esillä oleva keksintö koskee endoglukanaasipoly- • · '“j peptidiä, joka käsittää fragmentin, jolla on sellolyyttistä aktiivisuutta ja joka on : V valittu ryhmästä, joka koostuu • · 7 119325 a) polypeptidistä, joka käsittää aminohapposekvenssin, jolla on vähintään 80 % identtisyys sekvenssin nro 2 kanssa; b) kohdan a) fragmentista, jolla on sellulolyyttistä aktiivisuutta.Accordingly, the present invention relates to an endoglucanase poly-peptide comprising a fragment having cellolytic activity selected from the group consisting of? 7119325 a) a polypeptide comprising at least 80% amino acid sequence; identity with SEQ ID NO: 2; b) a fragment of a) having cellulolytic activity.

Keksinnön yhdessä edullisessa suoritusmuodossa mainitulla ami- 5 nohapolla on vähintään edullisesti 85 %, edullisemmin 90 %, vielä edullisemmin 95 % ja edullisimmin 98 % identtisyys sekvenssin nro 2 kanssa.In one preferred embodiment of the invention, said amino acid has at least preferably 85%, more preferably 90%, even more preferably 95% and most preferably 98% identity to SEQ ID NO: 2.

Keksinnön edullisessa suoritusmuodossa mainitulla endoglukanaa-silla on sekvenssi nro 2.In a preferred embodiment of the invention, said endoglucanase has SEQ ID NO: 2.

Keksinnön vielä toisessa edullisessa suoritusmuodossa mainitulla 10 endoglukanaasilla on sekvenssin nro 17 tai sekvenssin nro 19 mukainen aminohapposekvenssi.In yet another preferred embodiment of the invention, said endoglucanase has the amino acid sequence of SEQ ID NO: 17 or SEQ ID NO: 19.

Keksinnön vielä toisessa edullisessa suoritusmuodossa polypeptidit ovat saatavissa tai peräisin Acremonium sp.:stä, edullisesti Acremonium ther-mophilumlsta.In yet another preferred embodiment of the invention, the polypeptides are obtainable from or derived from Acremonium sp., Preferably Acremonium thermophilum.

15 Tässä kuvataan myös endoglukanaasifuusioproteiinia, joka käsittää aminohapposekvenssin, joka on johdettu polypeptidistä, joka käsittää aminohapposekvenssin, jolla on vähintään 68 % identtisyys sekvenssin nro 4 kanssa, liitettynä selluloosaa sitovaan domeeniin (CBD). Edullisesti sillä on vähintään 70 %, edullisesti 75 %, edullisemmin 80 %, vielä edullisemmin 85 %, vielä 20 edullisemmin 90 % ja edullisimmin 95 % identtisyys sekvenssin nro 4 kanssa. Edullisesti mainittu fuusioproteiini käsittää lisäksi liitosalueen. Edullisesti mai-:\j nittu fuusioproteiini käsittää sekvenssin nro 4 mukaisen aminohapposekvenssi·: sin liitettynä CBD:hen, joka on johdettu polypeptidistä, joka käsittää aminohap- . posekvenssin, jolla on sekvenssi nro 2. Vielä edullisesti mainitulla endoglu- 25 kanaasifuusioproteiinilla on sekvenssi nro 21.Also described herein is an endoglucanase fusion protein comprising an amino acid sequence derived from a polypeptide comprising an amino acid sequence having at least 68% identity to SEQ ID NO: 4 linked to a cellulose binding domain (CBD). Preferably it has at least 70%, preferably 75%, more preferably 80%, even more preferably 85%, still more preferably 90% and most preferably 95% identity to SEQ ID NO: 4. Preferably, said fusion protein further comprises a fusion region. Preferably, said fusion protein comprises the amino acid sequence of SEQ ID NO: 4 linked to a CBD derived from a polypeptide comprising an amino acid. a further sequence of SEQ ID NO: 2. More preferably, said endoglucanase fusion protein has SEQ ID NO: 21.

• * · j‘V Esillä oleva keksintö koskee edelleen eristettyä polynukleotidia, joka koodittaa yllä määritellyn endoglukanaasipolypeptidin.The present invention further relates to an isolated polynucleotide encoding an endoglucanase polypeptide as defined above.

***** Nimenomaan keksinnön yhdessä suoritusmuodossa eristetyllä po- lynukleotidillä on nukleotidisekvenssi valittuna ryhmästä, joka koostuu: v.: 30 a) sekvenssin nro 1, sekvenssin nro 16, tai sekvenssin nro 18 mu- ··· kaisesta nukleotidisekvenssistä; .*.*. b) kohdan a) komplementaarisesta juosteesta; ,*··. c) kohdan a) tai b) mukaisesta vähintään 20 nukleotidiä käsittävästä • « "V fragmentista; ja : V 35 d) sekvenssistä, joka on degeneroitunut geneettisen koodin suhteen missä tahansa kohdassa a), b) tai c) määritellystä sekvenssistä.***** In one embodiment of the invention, the isolated polynucleotide has a nucleotide sequence selected from the group consisting of: v. A) a nucleotide sequence according to SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 16, or SEQ ID NO: 18; . *. *. (b) the complementary strand of (a); * ··. c) a V fragment of at least 20 nucleotides according to a) or b); and: V 35 d) a sequence degenerate with the genetic code of any of the sequences defined in a), b) or c).

8 1193258 119325

Esillä oleva keksintö koskee edelleen ekspressiovektoria, joka käsittää yllä määritellyn polynukleotidlsekvenssin.The present invention further relates to an expression vector comprising a polynucleotide sequence as defined above.

Esillä oleva keksintö koskee edelleen uusia keksinnön mukaisilla vektoreilla transformoituja isäntiä, erityisesti isäntiä, jotka pystyvät keksinnön 5 mukaisen endoglukanaasin korkeaan ekspressiotasoon. Keksinnön edullisen suoritusmuodon mukaisesti entsyymit ovat saatavissa Acremonium thermophi-lum -kannasta ALK04245, joka on talletettu numerolla CBS 116240.The present invention further relates to novel hosts transformed with the vectors of the invention, in particular hosts capable of high levels of expression of the endoglucanase of the invention. According to a preferred embodiment of the invention, the enzymes are available from Acremonium thermophilum strain ALK04245, which is deposited under accession number CBS 116240.

Esillä oleva keksintö koskee edelleen entsyymivalmistetta, joka sisältää yhtä tai useampia keksinnön mukaisia endoglukanaaseja.The present invention further relates to an enzyme preparation containing one or more endoglucanases of the invention.

10 Esillä oleva keksintö koskee edelleen keksinnön mukaisten entsyy- mivalmisteiden käyttömenetelmiä tekstiilien bioviimeistelyyn, erityisesti nyp-pyyntymisen estoon.The present invention further relates to methods of using the enzyme preparations of the invention for the biological finishing of textiles, in particular for inhibiting nyp-catching.

Esillä oleva keksintö koskee edelleen keksinnön mukaisten entsyy-mivalmisteiden käyttömenetelmiä tekstiilien viimeistelyyn, erityisesti denimin 15 kivipesuun.The present invention further relates to methods of using the enzyme preparations of the invention for finishing textiles, in particular denim 15 for stone washing.

Esillä oleva keksintö koskee edelleen keksinnön mukaisten entsyy-mivalmisteiden käyttöä pesuainekoostumuksissa.The present invention further relates to the use of the enzyme preparations of the invention in detergent compositions.

Keksinnön mukaiset endoglukanaasiproteiinivalmisteet ovat erityisen käyttökelpoisia tekstiili- ja pesuaineteollisuudessa. Ne ovat erityisen käyt-20 tökelpoisia tekstiiliteollisuudessa kankaiden tai vaatteiden bioviimeistelyyn, esim. nyppyyntymisen estoon, nukkaantumisen estoon, värin kirkastamiseen, karkeuden vähentämiseen, erilaisten viimeistelyjen luomiseen (esimerkiksi :*:*· ’persikkamainen’, ’kulutettu’, ’hiekkapesty’ tai 'vanha ulkonäkö’-vaikutus) ja . .*. lankojen bioviimeistelyyn, esimerkiksi pörröisyyden vähentämiseen ja sileyden : .·, 25 parantamiseen. Lisäkäytöt sisältävät käytön pesuainekoostumuksissa kankaan * · t hoito-ominaisuuksien parantamiseksi nyppyyntymisen estolla, harmaantumi- » · » sen estolla, värin kirkastamisella ja pehmentämisellä ja tekstiilien puhdistus- • · '*··* vaikutuksen parantamiseksi esimerkiksi lian poistamiseksi. Lisäkäytöt edelleen sisältävät käytön denimin biokivipesussa.The endoglucanase protein formulations of the invention are particularly useful in the textile and detergent industry. They are particularly useful in the textile industry for bio-finishing fabrics or garments, such as anti-peeling, anti-linting, color brightening, reducing roughness, creating various finishes (for example: *: * · 'peachy', 'worn', 'sand' or ' old appearance) and. . *. biofinishing of yarns, eg to reduce fluffiness and improve smoothness:. Additional uses include use in detergent compositions to improve the fabric's treatment properties by anti-peeling, anti-graying, color brightening and softening, and to improve the cleaning effect of textiles, for example to remove dirt. Additional uses still include use in denim bio-stone washing.

v.: 30 Puuvillakankaassa nukka (mikrokuidut) nousee näkyviin pinnasta ja ··· !...: voi kietoutua yhteen käsittelyn aikana siten muodostaen nyppyjä. Entsyymit :v. heikentävät mikrokuituja, jotka nousevat ylös pinnasta, ja käsittelyn leikkaus- voimat sitten poistavat ne (Nierstrasz ja Warmoeskerken, 2003). Kuten esillä • · olevassa yhteydessä käytetään ilmaisu ’’bioviimeistely” (kutsuttu myös nyp-: V 35 pyyntymisen estoksi, nukkaantumisen estoksi tai biokiillotukseksi) viittaa ent-*:**ί syymien käyttöön selluloosakuitujen kontrolloidussa hydrolyysissä kankaan tai 9 119325 langan pinnan modifioimiseksi tavalla, joka ehkäisee pysyvästi nyppyyntymis-tä, parantaa kankaan tuntua, kuten pehmeyttä ja sileyttä, selkeyttää pintarakennetta vähentämällä nukkaantumista, mikä johtaa värien kirkastumiseen, parantaa kankaan laskeutuvuutta, parantaa kosteuden imeytymistä, mikä voi 5 parantaa myös värjäytyvyyttä. Sellulaasientsyymejä käytetään selluloosaa sisältävien tekstiilimateriaalien, kuten puuvillan, pellavan, rämin, juutin, viskoosin, modaalikuitujen, lyocellin ja kupron tai niiden sekoitusten, käsittelyyn tai viimeistelyyn.v .: 30 In cotton fabric, the lint (microfibres) emerges from the surface and ···! ...: can be wound together during processing to form bumps. Enzymes: v. weaken the microfibers that rise up from the surface and are then removed by the shear forces of the treatment (Nierstrasz and Warmoeskerken, 2003). As used in the present context, the term "biofinishing" (also called nip-: V 35 catch inhibition, antifouling, or biopolishing) refers to the use of enzymes in the controlled hydrolysis of cellulosic fibers to modify the surface of a fabric or 9 119325 yarn, which permanently prevents peeling, improves fabric feel such as softness and smoothness, clarifies surface structure by reducing lint, resulting in color clarification, improves fabric settling, improves moisture absorption, which can also improve dyeing. Cellulase enzymes are used for the treatment or finishing of cellulose-containing textile materials such as cotton, flax, jute, jute, viscose, modal fibers, lyocell and cupro, or mixtures thereof.

Kuten esillä olevassa yhteydessä käytetään ilmaisu kankaan tai 10 vaatteen ”biokivipesu” tarkoittaa entsyymien käyttöä hohkakivien sijasta tai lisäksi kankaan tai vaatteen, erityisesti denimin, käsittelyyn.As used herein, the term "bio-stone washing" of a fabric or garment refers to the use of enzymes instead of pumice stones, or in addition to the treatment of the fabric or garment, especially denim.

Kuten esillä olevassa yhteydessä käytetään ilmaisu "takaisinvärjäy-tyminen” viittaa vapautuneen värin taipumukseen kerrostua uudelleen kangas-kuitujen pinnalle.As used herein, the term "back dyeing" refers to the tendency of the released color to re-deposit on the surface of the fabric fibers.

15 Kuten esillä olevassa yhteydessä käytetään ilmaisu ” pesuaine” viit taa puhdistusaineeseen, joka voi sisältää pinta-aktiivisia aineita (anionisia, io-nittomia, kationisia tai amfolyyttisiä surfaktantteja), täyteaineita ja muita valinnaisia ainesosia, kuten uudelleenkerrostumista estäviä ja likaa suspensoivia aineita, optisia kirkasteita, valkaisuaineita, värejä ja pigmenttejä ja hydrolaase-20 ja. Pesuaineiden sisältöjen sopiva listaus annetaan US-patentissa nro 5 433 750, surfaktanttien sopiva listaus annetaan US-patentissa nro 3 664 961.15 As used herein, the term "detergent" refers to a cleaning agent that may contain surfactants (anionic, nonionic, cationic, or ampholytic surfactants), fillers, and other optional ingredients such as anti-redeposition and soil suspending agents, optical brighteners. , bleaches, dyes and pigments and hydrolase-20 and. Suitable listing of detergent contents is given in U.S. Patent No. 5,433,750, and suitable listing of surfactants is given in U.S. Patent No. 3,664,961.

Endoglukanaasin biologinen aktiivisuus on sen katalyyttinen aktiivi-.·*:·! suus ja/tai sen kyky sitoa selluloosamateriaalia. Endoglukaanasin sellulolyytti- nen aktiivisuus on sen hydrolyyttinen aktiivisuus.The biological activity of endoglucanase is its catalytic activity. · *: ·! and / or its ability to bind cellulosic material. The cellulolytic activity of endoglucanase is its hydrolytic activity.

• · « .**: 25 Kuten esillä olevassa yhteydessä käytetään ilmaisu "Acremonium ϊ*γ sp.” viittaa filamenttihomesukuun, jolla on kannan CBS 116240 ominaispiirteet.• · «. **: 25 As used herein, the term" Acremonium ϊ * γ sp. "Refers to a filamentous genus having the characteristics of CBS 116240.

• · · : Kuten esillä olevassa yhteydessä käytetään ’’polynukleotidi” viittaa molempiin RNA:han ja DNA:han ja se voi olla yksijuosteinen tai kaksijuostei-nen. Polynukleotidi voi myös olla mainittujen polynukleotidien fragmentti, joka :V: 30 käsittää vähintään 20 nukleotidiä, esim. vähintään 25, 30 tai 40 nukleotidiä.· · ·: As used in the present context, a “polynucleotide” refers to both RNA and DNA and may be single-stranded or double-stranded. The polynucleotide may also be a fragment of said polynucleotides comprising: V: 30 at least 20 nucleotides, e.g. at least 25, 30 or 40 nucleotides.

Keksinnön yhden suoritusmuodon mukaisesti sen pituus on vähintään 100, .Λ, 200 tai 300 nukleotidiä. Edelleen polynukleotidi voidaan degeneroida geneetti- sen koodin seurauksena joksikin yllä määritellyistä sekvensseistä. Tämä tar- • · **;*' koittaa, että eri kodonit voivat koodittaa samaa aminohappoa.According to one embodiment of the invention, it has a length of at least 100 µm, 200 or 300 nucleotides. Further, the polynucleotide may be degenerate as a result of the genetic code into one of the sequences defined above. This means that different codons can encode the same amino acid.

:***: 35 Uudet polypeptidit voivat myös olla mainittujen polypeptidien va- ·;··· hantteja. "Variantti" voi olla polypeptidi, joka esiintyy luonnostaan, esim. alleeli- 10 119325 sena varianttina saman kannan, lajin tai suvun sisällä, tai se on voitu degeneroida mutageneesillä. Se voi käsittää aminohapposubstituutioita, -delee-tioita tai -insertioita, mutta se edelleen toimii oleellisesti samalla tavalla yllä määritellyille entsyymeille t.s. se käsittää fragmentin, jolla on sellulolyyttistä ak-5 tiivisuutta.: ***: 35 The novel polypeptides may also be variants of said polypeptides. A "variant" may be a polypeptide that occurs naturally, eg, as an allelic variant within the same strain, species, or genus, or may be degenerate by mutagenesis. It may comprise amino acid substitutions, deletions, or insertions, but it still functions in substantially the same way for the enzymes defined above, i.e. it comprises a fragment having cellulolytic activity.

Ekspressiovektori on kloonausplasmidi tai -vektori, joka pystyy ilmentämään DNA:ta, joka koodittaa keksinnön mukaisia endoglukanaaseja ja endoglukanaasifuusioproteiineja transformaation toivottuun isäntään jälkeen. Kun sieniperäistä isäntää käytetään, mielenkiinnon kohteena oleva geeni edul-10 lisesti välitetään sieniperäiseen isäntään osana kloonaus- tai ekspressiokulje-tinta, joka integroituu sieniperäiseen kromosomiin tai sallii mielenkiinnon kohteena olevan geenin integroitua isäntäkromosomiin, tai itsenäisesti replikoitu-vana plasmidina. Sekvenssit, jotka ovat kloonauskuljettimen tai ekspressiokul-jettimen osia, voidaan myös integroida mainittuun DNA:han integraatioproses-15 sin aikana. Lisäksi sienessä ekspressiovektori tai sen osat voidaan kohdentaa ennalta määrättyihin kohtiin.The expression vector is a cloning plasmid or vector capable of expressing DNA encoding the endoglucanases and endoglucanase fusion proteins of the invention after transformation into the desired host. When the fungal host is used, the gene of interest is preferably transmitted to the fungal host as part of a cloning or expression vehicle that integrates with the fungal chromosome or allows the gene of interest to be integrated into the host chromosome, or independently replicated. Sequences that are part of a cloning transporter or expression transporter may also be integrated into said DNA during the integration process. In addition, the expression vector or portions thereof in the sponge may be targeted at predetermined sites.

DNA, joka koodittaa keksinnön mukaisia endoglukanaaseja ja en-doglukanaasifuusioproteiineja, asetetaan myös edullisesti vektorin (joka integroituu mielenkiinnon kohteena olevan geenin kanssa) välittämien tiettyjen kont-20 rollisekvenssien, kuten promoottorisekvenssien, kontrollin alaiseksi (ts. leikka-uskelpoisesti näihin liitettynä). Vaihtoehtoisesti kontrollisekvenssit voivat olla niitä, jotka ovat insertiokohdassa.The DNA encoding the endoglucanases of the invention and the en-doglucanase fusion proteins are also preferably placed under the control (i.e., cleaved) of certain control sequences mediated by a vector (which integrates with the gene of interest), such as promoter sequences. Alternatively, the control sequences may be those at the insertion site.

m ·m ·

Ekspressiovektorin ekspressiota kontrolloivat sekvenssit tulevat • · * vaihtelemaan riippuen siitä, onko vektori suunniteltu ilmentämän tiettyä geeniä • · * 25 prokaryootti- vai eukaryootti-isännässä (esimerkiksi sukkulavektori voi välittää !*Y geenin bakteeriperäisten isäntien valintaan). Ekspressiota kontrolloivat sek- • · · : venssit voivat sisältää transkriptionaalisia säätelyelementtejä, kuten promootto- reita, vahvistaja-elementtejä ja transkriptionaalisia terminaatiosekvenssejä ja/tai translationaalisia säätelyelementtejä, kuten translationaalisia aloitus- ja i.v 30 terminaatiokohtia.The sequences controlling expression of the expression vector will vary depending on whether the vector is designed to express a particular gene in a prokaryotic or eukaryotic host (for example, the shuttle vector may transmit the! Y gene for selection of bacterial hosts). Expression-controlling sequences may include transcriptional regulatory elements such as promoters, enhancer elements and transcriptional termination sequences and / or translational regulatory elements such as translational start and i.v. 30 termination sites.

Polynukleotidimolekyylin, kuten DNA:n, sanotaan "pystyvän ilmen-tämään” polypeptidiä, jos se sisältää ekspressiota kontrolloivia sekvenssejä, jotka sisältävät transkriptionaalista säätelyinformaatiota, ja tällaiset sekvenssit 'γ* on "leikkauskelpoisesti liitetty" nukleotidisekvenssiin, joka koodittaa polypepti- j’\: 35 diä.A polynucleotide molecule, such as DNA, is said to be "capable of expressing" a polypeptide if it contains expression control sequences containing transcriptional regulatory information, and such sequences' γ * are 'operably linked' to the nucleotide sequence encoding the polypeptide: slide.

• · u 119325• · u 119325

Leikkauskelpoinen sidos on sidos, jossa sekvenssi yhdistetään sää-telysekvenssiin (tai sekvensseihin) sillä tavoin, että sekvenssin ekspressio asetetaan säätelysekvenssin vaikutuksen tai kontrollin alaiseksi. Kahden DNA-sek-venssin (kuten promoottorialueen sekvenssi liitettynä sekvenssiä koodittavan 5 proteiinin 5’-päähän) sanotaan olevan leikkauskelpoisesti liitettyjä, jos promoottorin toiminta johtaa transkriptioon.A cleavable linkage is a linkage in which a sequence is linked to a control sequence (or sequences) in such a way that expression of the sequence is placed under the control or control of a regulatory sequence. Two DNA sequences (such as the promoter region sequence fused to the 5 'end of the 5 protein encoding the sequence) are said to be operably linked if the promoter function leads to transcription.

Keksinnön mukaiset vektorit voivat edelleen käsittää muita leikkauskelpoisesti liitettyjä säätelyelementtejä kuten vahvistaja-sekvenssejä.The vectors of the invention may further comprise other operably linked regulatory elements, such as enhancer sequences.

Edullisessa suoritusmuodossa kostruoidaan geneettisesti stabiileja 10 transformantteja, joiden avulla keksinnön mukaisia endoglukanaaseja ja endo-giukanaasifuusioproteiineja koodittava DNA integroidaan isäntäkromosomiin transformaatiolla vektorin kanssa, joka suojaa sekvenssejä, jotka edistävät mainitun vektorin integraatiota kromosomiin.In a preferred embodiment, genetically stable transformants are coprostrated to integrate the DNA encoding the endoglucanases and endogenucanase fusion proteins of the invention into a host chromosome by transformation with a vector that protects sequences that promote integration of said vector into the chromosome.

Solut, joilla on keksinnön mukaisia endoglukanaaseja tai endoglu-15 kanaasifuusioproteiineja koodittava DNA stabiilisti kromosomiinsa integroituna, valitaan myös lisäämällä yksi tai useampia homologisia tai heterologisia mark-kereita, jotka sallivat ekspressiovektorin kromosomissa sisältävien isäntäsolu-jen valinnan, esimerkiksi markkeri voi saada aikaan biosidiresistenssin, esim. resistenssin antibiootteja tai raskasmetalleja, kuten kuparia vastaan, tai mark-20 kereita, jotka täydentävät auksotrofista mutaatiota isäntäkromosomissa tms. Valittavissa oleva markkerigeeni voi joko olla suoraan liitetty ilmennettävään ;\j DNA-geenisekvenssiin tai tuodaan samaan soluun yhteistransformaatiolla.Cells having DNA encoding the endoglucanases or endoglu-15 channelase fusion proteins of the invention stably integrated into their chromosome are also selected by the addition of one or more homologous or heterologous markers that allow selection of host cells containing the expression vector, e.g., markers. antibiotics of resistance or heavy metals such as copper, or mark-20 bodies that complement the auxotrophic mutation in the host chromosome, etc. The selectable marker gene can either be directly linked to the expressed DNA gene sequence or introduced into the same cell by co-transformation.

Kun konstrukti(t) sisältävä keksinnön mukainen vektori tai DNA-sekvenssi valmistetaan ilmentämistä varten, DNA-konstruktit tuodaan tarkoi- • · · 25 tuksenmukaiseen isäntäsoluun millä tahansa useista sopivista tavoista, mu- :*Y kaan lukien alalla tunnetun mukaisella transformaatiolla. Vektorin tuomisen jäi- • · · :;j(: keen vastaanottajasoluja kasvatetaan valikoivassa väliaineessa, joka valitsee :···: transformoidut solut kasvamaan.When the vector or DNA sequence of the invention containing the construct (s) is prepared for expression, the DNA constructs are introduced into the appropriate host cell by any of a variety of suitable means, including by transformation known in the art. Receiving cells for vector introduction are cultured in a selective medium that selects: ···: transformed cells for growth.

Sopivia isäntäsysteemejä ekspressioon ja tuotantoon ovat esimerkiksi v.i 30 sieniperäiselle Trichoderma-\sänr\äWe kehitetty tuotantosysteemi (EP 244 234) tai Aspergillus-tuotantosysteemi, kuten A. oryzae tai A. niger (WO 9 708 325 ja WO 9 533 386, US-patentit nro 5 843 745, nro 5 770 418) tai Fusariumille ke- M hitetty tuotantosysteemi, kuten F. oxysporumille (Malardier ym., 1989). Baktee- • * **;·* reille kehitettyjä sopivia tuotantosysteemejä ovat Bacillukselle kehitetty tuotan- 35 tosysteemi, esimerkiksi B. subtiileille, tai E. solille tai aktinomysete Streptomy-*:**: cesille. Hiivoille kehitettyjä sopivia tuotantosysteemejä ovat Saccharomycesille, 12 119325Suitable host systems for expression and production include, for example, a production system for the fungal Trichoderma system (EP 244 234) or an Aspergillus production system such as A. oryzae or A. niger (WO 9 708 325 and WO 9 533 386). No. 5,843,745, No. 5,770,418) or a production system developed for Fusarium, such as F. oxysporum (Malardier et al., 1989). Suitable production systems for bacteria are the production system developed for Bacillus, for example, B. subtiles, or E. Sol or actinomycete Streptomy - *: **. Suitable production systems for yeasts are for Saccharomyces, 12 119325

Shlzosaccharomycesille tai Pichia pastorisille kehitetyt systeemit. Tuotantosysteemit joissakin muissa mikrobeissa tai nisäkässoluissa tai kasveissa ovat myös mahdollisia.Systems developed for Shlzosaccharomyces or Pichia pastoris. Production systems in some other microbes or in mammalian cells or plants are also possible.

Kloonatun/kloonattujen geenisekvenssi(e)n ekspressio johtaa toivo-5 tun proteiinin tuotantoon tai tämän proteiinin fragmentin tuotantoon. Tämä ekspressio voi tapahtua jatkuvalla tavalla transformoiduissa soluissa tai kontrolloidulla tavalla.Expression of the cloned / cloned gene sequence (s) results in the production of a hoped-for protein or a fragment of that protein. This expression may be in a continuous manner in transformed cells or in a controlled manner.

Fragmenttien ymmärretään olevan polypeptidi- tai nukleiinihappo-molekyylien osia, jotka ovat riittävän pitkiä omaamaan haluttuja entsymaattisia 10 ominaisuuksia tai koodittamaan haluttuja endoglukanaaseja tai endoglu-kanaasifuusiproteiineja tai niiden biologisesti aktiivista fragmenttia. Termi ’’johdannainen” tarkoittaa tässä yhteydessä, että näiden molekyylien nukleotidise-kvenssit eroavat yllä kuvattujen nukleiinihappomolekyylien sekvensseistä yhdessä tai useammissa kohdissa ja ovat erittäin homologisia mainittujen sek-15 venssien kanssa.Fragments are understood to be portions of polypeptide or nucleic acid molecules long enough to have the desired enzymatic properties or to encode the desired endoglucanases or endoglucanase fusion proteins or a biologically active fragment thereof. The term &quot; derivative &quot; as used herein means that the nucleotide sequences of these molecules differ from the sequences of the above described nucleic acid molecules at one or more sites and are highly homologous to said sequences.

Kuten esillä olevassa yhteydessä käytetään termi "identtisyys” viittaa globaaliin identtisyyteen kahden aminohapposekvenssin välillä verrattuna toisiinsa ensimmäisestä vastaavan geenin koodittamasta aminohaposta viimeiseen aminohappoon saakka. Täyspitkien sekvenssien identtisyys mitataan 20 käyttämällä Needleman-Wunschin globaalia llnjausohjelmaa EMBOSS-ohjel-mapaketissa (European Molecular Biology Open Software Suite; Rice ym. 2000), ·*·,: versio 3.0.0, seuraavilla parametreillä: EMBLOSUM62, gap penalty 10.0, ex- tend penalty 0.5. Algoritmi kuvataan julkaisussa Needleman ja Wunsch (1970). Alan ammattimies on tietoinen siitä tosiasiasta, että Needleman-Wunschin ai- • · · 25 goritmia käyttäen saadut tulokset ovat vertailukelpoisia vain, kun linjataan sek- !*Y venssin vastaavia domeeneja. Sen tähden esim. sellulaasisekvenssien, jotka * » · :;γ sisältävät CBD:n tai signaalisekvenssin vertailua sekvenssien kanssa, joista :···: nämä elementit puuttuvat, ei voida tehdä.As used herein, the term "identity" refers to a global identity between two amino acid sequences relative to each other from the first amino acid encoded by the corresponding gene to the last amino acid. Rice et al., 2000), · * ·,: version 3.0.0, with the following parameters: EMBLOSUM62, gap penalty 10.0, intrinsic penalty 0.5 The algorithm is described by Needleman and Wunsch (1970). The results obtained using the -Wunsch ai · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · 25 gormitory are only comparable when aligning the corresponding domains of the Sequence. of which: ···: these elements are missing , can't be done.

Selluloosamateriaalin hydrolysoimiseen käyttökelpoiset sellulolyytti- • · v.: 30 set entsyymit ovat saatavissa tai peräisin Acremonium sp.:stä, edullisesti A.Cellulolytic enzymes useful for hydrolysis of cellulosic material are available from or derived from Acremonium sp., Preferably A.

thermophilumista. ” Saatavissa” tai "peräisin” tarkoittaa, että ne voidaan saada .·*·. mainituista lajeista, mutta se ei sulje pois mahdollisuutta saada ne muista läh- • · · M' teistä. Toisin sanoen ne voivat olla peräisin mistä tahansa organismeista, mu- **:** kaan lukien kasveista. Edullisesti ne ovat peräisin mikro-organismeista, esim.thermophilum. “Available” or “derived from” means that they can be obtained. · * ·. From the species mentioned, but does not exclude the possibility of obtaining them from other sources. • · · M. In other words, they may be derived from any **: ** including plants Preferably they are derived from microorganisms, e.g.

j*35 bakteereista tai sienistä. Bakteerit voivat olla esimerkiksi suvusta, joka valitaan *:**: Bacilluksesta, Azospirillumista ja Streptomycesistä. Edullisemmin entsyymi on 13 119325 peräisin sienistä (mukaan lukien filamettihomeesta ja hiivoista), esimerkiksi suvusta, joka valitaan ryhmästä, joka koostuu Thermoascuksesta, Acremoniu-mista, Chaetomiumista, Achaetomiumista, Aspergilluksesta, Botrytisista, Chry-sosporiumista, Collybiasta, Fomesista, Fusariumista, Humicolasta, Hypocreas-5 ta, Lentinuksesta, Melanocarpuksesta, Myceliophthorasta, Myriococcumista, Neurosporasta, Penicilliumista, Phanerochaetesta, Phlebiasta, Pleurotuksesta, Podosporasta, Polyporuksesta, Rhizoctoniasta, Scytalidiumista, Pycnoporuk-sesta, Trametasista ja Trichodermasta.j * 35 bacteria or fungi. The bacteria may be, for example, from the genus selected from *: **: Bacillus, Azospirillum and Streptomyces. More preferably, the enzyme is 13,119,325 derived from fungi (including filamentous fungi and yeasts), for example, a family selected from the group consisting of Thermoascus, Acremonium, Chaetomium, Achaetomium, Aspergillus, Botrytis, Chry-sosporium, Fly, Hypocreas-5, Lentinus, Melanocarpus, Myceliophthora, Myriococcus, Neurospora, Penicillium, Phanerochaete, Phlebia, Pleurotus, Podospora, Polypore, Rhizoctonia, Scytalidium, Pycnoporetus and Tyc.

Kuten esillä olevassa yhteydessä käytetään ilmaisut "entsyymival-10 miste”, ’’sellulaasivalmiste” ja "endoglukanaasivalmiste” viittaavat mihin tahansa entsyymituotteeseen, joka sisältää vähintään yhtä keksinnön mukaista en-doglukanaasia tai endoglukanaasifuusioproteiinia. Siten tällainen entsyymi-valmiste voi olla käytetty viljelyväliaine tai suodos, joka sisältää yhtä tai useampia endoglukanaaseja tai endoglukanaasifuusioproteiineja tai yhtä tai use-15 ampia endoglukanaaseja tai endoglukanaasifuusloproteiineja ja muita entsyymejä, eristettyä endoglukanaasia tai endoglukanaasifuusioproteiinia tai yhden tai useampien endogiukanaasien tai endoglukanaasifuusioproteiinien seosta tai yhden tai useampien endogiukanaasien tai endoglukanaasifuusioproteiinien ja yhden tai useampien muiden entsyymien seosta. Endoglukanaasiaktiivisuu-20 den lisäksi tällainen valmiste voi sisältää lisäaineita, kuten stabilointiaineita, puskureita, säilöntäaineita, surfaktantteja ja/tai viljelyväliaineen komponentteja.As used herein, the terms "enzyme protein", "" cellulase preparation "and" endoglucanase preparation "refer to any enzyme product containing at least one endo-glucanase or endoglucanase fusion protein of the invention. Thus, such an enzyme preparation may be a culture medium or a filtrate containing one or more endoglucanases or endoglucanase fusion proteins or one or more endoglucanases or single endoglucanases, a mixture of endoglycanases or endoglucanase fusion proteins and one or more other enzymes. In addition to endoglucanase activity, such a preparation may contain additives such as stabilizers, buffers, preservatives, surfactants, and / or culture medium components.

:*·.· Edulliset lisäaineet ovat sellaisia, joita tavallisesti käytetään entsyymivalmis- · teissä, jotka on tarkoitettu sovellukseen, jossa entsyymivalmistetta käytetään. Entsyymivalmiste voi olla nesteen, jauheen tai rakeiden muodossa.Preferred additives are those commonly used in enzyme preparations for the application in which the enzyme preparation is used. The enzyme preparation may be in the form of a liquid, powder or granules.

• * · 25 ’’Kulutetulla viljelyväliaineella” tässä tarkoitetaan isännän viljelyvä- !·*.* liainetta, joka käsittää tuotetut entsyymit. Edullisesti isäntäsolut erotetaan mai- • · :|: nitusta väliaineesta tuotannon jälkeen.* * 25 '' Consumed culture medium '' as used herein refers to a culture medium of a host comprising the enzymes produced. Preferably, the host cells are separated from said medium after production.

'···* Entsyymivalmiste voi käsittää yhtä tai useampia esillä olevan kek sinnön mukaisia endoglukanaaseja, tai muita sellulaasientsyymejä tai endoglu-v 30 kanaasifuusioproteiineja yhdessä yhden tai useampien esillä olevan keksinnön mukaisten endogiukanaasien kanssa. Esimerkiksi endoglukanaaseja, joilla on ,v, erilaisia ominaisuuksia, voidaan yhdistää entsyymivalmisteen tekemiseksi, joka • « · on käyttökelpoisempi erilaisiin olosuhteisiin.The enzyme preparation may comprise one or more endoglucanases of the present invention, or other cellulase enzymes or endoglucan canase fusion proteins in combination with one or more endoglycanases of the present invention. For example, endoglucanases having, v, different properties can be combined to make an enzyme preparation which is more useful under different conditions.

**:*' Keksinnön mukaisten entsyymivalmisteiden aikaansaamiseksi isän- : *.! 35 tiä, joilla on toivotut ominaisuudet, (nimittäin isäntiä, jotka pystyvät ilmentä- ·:··: mään taloudellisesti toteuttamiskelpoisia määriä keksinnön mukaisia endoglu- 14 119325 kanaaseja tai endoglukanaasifuusioproteiineja) viljellään sopivissa olosuhteissa, toivotut entsyymit erittyvät isännistä viljelyväliaineeseen ja entsyymivalmis-te otetaan talteen mainitusta viljelyväliaineesta alalla tunnetuilla menetelmillä.**: * 'To provide the enzyme preparations of the invention, the host: *.! 35 strains having the desired properties (namely, hosts capable of expressing economically feasible amounts of the endoglucanase enzymes or endoglucanase fusion proteins of the invention) are cultured under appropriate conditions, secreted into the desired enzymes said culture medium by methods known in the art.

Entsyymivalmiste voi käsittää endoglukanaasin lisäksi yhtä tai use-5 ampia muita entsyymejä, jotka voivat olla esimerkiksi amylaaseja, lipaaseja, proteaaseja, pektinaaseja ja/tai oksidaaseja, kuten lakkaaseja ja peroksidaa-seja. Vaihtoehtoisesti esillä olevan keksinnön mukaisilla endoglukanaaseilla käsittelyä ennen, sen aikana tai sen jälkeen voidaan suorittaa toinen entsyymi-käsittely. Entsyymikäsittely voi käsittää esimerkiksi yhden tai useampia amy-10 laasikäsittelyjä, yhden tai useampia sellulaasikäsittelyjä ja/tai yhden tai useampia peroksidaasi- ja/tai lakkaasikäsittelyjä. Se, mitä muita entsyymejä sisällytetään entsyymivalmisteeseen tai käytetään entsyymikäsittelyssä, riippuu sovelluksesta.The enzyme preparation may comprise, in addition to endoglucanase, one or more ampoules of other enzymes which may be, for example, amylases, lipases, proteases, pectinases and / or oxidases such as laccases and peroxidases. Alternatively, a second enzyme treatment may be performed before, during or after treatment with the endoglucanases of the present invention. For example, the enzyme treatment may comprise one or more Amy-10 glass treatments, one or more cellulase treatments and / or one or more peroxidase and / or laccase treatments. What other enzymes are included in the enzyme preparation or used in the enzyme treatment depends on the application.

Entsyymivalmiste voi olla viljelyväliaine, jossa on tai ei ole natiiveja 15 tai transformoituja isäntäsoluja, tai se otetaan talteen edellä mainitusta soveltamalla alalla hyvin tunnettuja menetelmiä. Kuitenkin koska keksinnön mukaiset endoglukanaasit eritetään viljelyväliaineeseen ja ne näyttävät aktiivisuutta sellulolyyttisen liuoksen ympäröivissä olosuhteissa, on keksinnön etu, että keksinnön mukaisia entsyymivalmisteita voidaan käyttää suoraan hyväksi viljely-20 väliaineesta ilman jatkopuhdistusta. Niin toivottaessa tällaisia valmisteita voidaan pakastekuivata tai entsyymiaktiivisuutta voidaan muulla tavoin väkevöidä ja/tai stabiloida varastointia varten. Keksinnön mukaiset entsyymivalmisteet • · ovat hyvin taloudellisia hankkia ja käyttää, koska (1) entsyymit voidaan käyttää raakamuodossa; spesifisten entsyymien eristäminen viljelyväliaineesta on tar-The enzyme preparation may be a culture medium with or without native or transformed host cells or may be recovered from the above using methods well known in the art. However, since the endoglucanases of the invention are secreted into the culture medium and exhibit activity under the ambient conditions of the cellulolytic solution, it is an advantage of the invention that the enzyme preparations of the invention can be directly utilized from the culture medium without further purification. If desired, such formulations may be freeze-dried or the enzyme activity may otherwise be concentrated and / or stabilized for storage. The enzyme preparations of the invention are · very economical to obtain and use because (1) the enzymes can be used in their raw form; isolation of specific enzymes from the culture medium is necessary.

* Φ I* Φ I

25 peetonta ja (2) koska entsyymit eritetään viljelyväliaineeseen, vain viljelyväliai-!‘V ne täytyy ottaa talteen toivottujen entsyymivalmisteiden aikaansaamiseksi; ei :;j,: ole tarvetta uuttaa entsyymiä isännistä. Edullisesti isäntä tällaiseen tuotan- *···* toon on Trichoderma, ja erityisesti T. reesei.And (2) because the enzymes are secreted into the culture medium, only the culture medium must be recovered in order to obtain the desired enzyme preparations; no:; j ,: no need to extract the enzyme from the hosts. Preferably, the host for such production is Trichoderma, and in particular T. reesei.

Keksinnön mukaiset entsyymivalmisteet voidaan saada aikaan nes- • · v 30 temäisinä tai kiintoaineina, esimerkiksi kuivatussa jauhe- tai rae- tai nestemäi-sessä muodossa, erityisesti pölyämättöminä rakeina tai stabiloituna nesteenä .v. tai entsyymivalmiste voidaan muutoin väkevöidä tai stabiloida varastointia tai • · · käyttöä varten. Ajatellaan, että entsyymivalmisteet, jotka sisältävät yhtä tai *:*' useampia keksinnön mukaisia sellulaaseja, voidaan edelleen rikastaa tai niistä ·· · • V 35 voidaan osittain tai täysin poistaa spesifiset entsyymiaktiivisuudet niin, että ne *:*·: tyydyttävät spesifisten käyttötarkoitusten vaatimukset erilaisissa sovelluksissa, 15 1 1 9325 esim. tekstiiliteollisuudessa. Isännän ja erityisesti sieni-isännän erittämien entsyymiaktiivisuuksien seos voidaan valita edulliseksi erityisessä teollisessa sovelluksessa, esimerkiksi bioviimeistelyssä ja biokivipesussa.The enzyme preparations of the invention may be provided in liquid or solid form, for example, in dried powder or granular or liquid form, in particular in the form of dust-free granules or stabilized liquid. or the enzyme preparation may otherwise be concentrated or stabilized for storage or use. It is contemplated that enzyme preparations containing one or *: * 'more of the cellulases of the invention may be further enriched or deprived of specific enzyme activities, so that they *: * ·: satisfy the requirements for specific uses in a variety of applications. applications, 15 1 1 9325 eg in the textile industry. A mixture of enzyme activities secreted by the host, and in particular by the fungal host, can be selected to be advantageous in a specific industrial application, such as bio-finishing and bio-stone washing.

Keksinnön mukaiset entsyymivalmisteet voidaan säätää tyydyttä-5 mään spesifisten tarpeiden vaatimukset erilaisissa sovelluksissa tekstiili-, pesuaine- tai kuitumassa- ja paperiteollisuudessa.The enzyme preparations of the invention can be adjusted to meet specific needs in a variety of applications in the textile, detergent, or pulp and paper industries.

Sekoituksia voidaan valmistaa muiden makromolekyylien, joita kaikkia ei välttämättä tuoteta samassa isännässä, (esimerkiksi muiden entsyymien, kuten endoglukanaasien, amylaasien, lipaasien, proteaasien, pektinaasien ja/tai 10 oksidaasien, kuten lakkaasien ja peroksidaasien) tai kemikaalien kanssa, jotka voivat lisätä tehoa, stabiiliutta tai toivotun entsyymivalmisteen puskurointia. Pölyämättömät rakeet voidaan pinnoittaa. Nestemäisiä entsyymivalmisteita voidaan stabiloida lisäämällä polyolia, kuten propyleeniglykolia, sokeria tai sokeri-alkoholia, maitohappoa tai boorihappoa tai natriumkloridia vakiintuneiden me-15 netelmien mukaisesti.Mixtures may be prepared with other macromolecules which may not all be produced in the same host (for example, other enzymes such as endoglucanases, amylases, lipases, proteases, pectinases and / or oxidases such as laccases and peroxidases) or chemicals which may increase potency. or buffering the desired enzyme preparation. Dust-free granules can be coated. Liquid enzyme preparations may be stabilized by the addition of a polyol such as propylene glycol, sugar or sugar alcohol, lactic acid or boric acid, or sodium chloride according to established methods.

Keksinnön mukaisten entsyymien suojattuja muotoja voidaan valmistaa, kuten julkaisussa EP 238 216 kuvataan.Protected forms of the enzymes of the invention may be prepared as described in EP 238 216.

Keksinnön mukaiset entsyymivalmisteet voivat sisältää surfaktantte-ja, jotka voivat olla anionisia, ionittomia, kationisia, amfoteerisia tai näiden 20 tyyppien seos, erityisesti kun niitä käytetään pesuainekoostumuksena. Käyttökelpoisia pesuainekoostumuksia kuvataan esim. julkaisussa WO 94/07 998, :*·.· US-patenteissa nro 5 443 750 ja nro 3 664 961.The enzyme preparations of the invention may contain surfactants which may be anionic, nonionic, cationic, amphoteric or a mixture of these types, especially when used as a detergent composition. Useful detergent compositions are described, for example, in WO 94/07998, U.S. Patent Nos. 5,443,750 and 3,664,961.

• ·• ·

Vaadittaessa toivottu entsyymi voidaan edelleen puhdistaa tavan-omaisten olosuhteiden mukaisesti, kuten uutolla, saostuksella, kromatografial- • · · 25 la, affiniteettikromatografialla, elektroforeesilla tai muilla sellaisilla.If desired, the desired enzyme may be further purified under conventional conditions such as extraction, precipitation, chromatography, affinity chromatography, electrophoresis, or the like.

**'.* Tämän keksinnön mukaiset entsyymivalmisteet ovat erityisen käyt- Φ m · :;j.: tökelpoisia tekstiiliteollisuudessa, edullisesti bioviimeistelyssä ja biokivipesus- • · *—* sa, tai pesuaineteollisuudessa. Muita käyttökelpoisia alueita on kuitumassa- ja paperiteollisuudessa.** '. * The enzyme preparations of the present invention are particularly useful in the textile industry, preferably in bio-finishing and bio-stone washing, or in the detergent industry. Other useful areas are in the pulp and paper industry.

• · :.v 30 "Bioviimeistely” viittaa entsyymien käyttöön selluloosakuitujen kontit]: rolloidussa hydrolyysissä kankaan tai langan pinnan modifioimiseksi tavalla, ,v. joka ehkäisee pysyvästi nyppyyntymistä, parantaa kankaan tuntua, kuten peh- • · · meyttä ja sileyttä, selkeyttää pintarakennetta vähentämällä nukkaantumista, **:** mikä johtaa värien kirkastumiseen, parantaa kankaan laskeutuvuutta, parantaa j *.» 35 kosteuden imeytymistä ja mikä voi parantaa myös värjäytyvyyttä.• ·: .v 30 “Biofinishing” refers to the use of enzymes in cellulosic fiber containers]: in roll hydrolysis to modify the surface of a fabric or yarn in a manner that v. Permanently prevents purring, improves fabric feel such as softness and smoothness by reducing surface structure linting, **: ** which results in color clarification, improves fabric settling, improves moisture absorption, and can also improve dyeing.

119325119325

Entsymaattinen nyppyyntymisen esto voidaan suorittaa missä tahansa vaiheessa tekstiilin märkäkäsittelyn aikana, edullisesti liisterin poiston ja valkaisun jälkeen. Entsymaattinen menetelmä vaatii varusteen, jolla on riittävät leikkausvoimat ja sekoitus, kuten suutinhaspelikoneen tai pesukoneen (Nierst-5 rasz V.A. ja Warmoeskerken 2003).The enzymatic anti-peeling may be carried out at any stage during the wet treatment of the textile, preferably after removal of the peel and bleaching. The enzymatic process requires equipment with adequate shear forces and mixing, such as a nozzle-gaming machine or washing machine (Nierst-5 rasz V.A. and Warmoeskerken 2003).

Bioviimeistely suoritetaan tyypillisesti pH:ssa noin 4,0 - 6,0. Reaktion lämpötila voi vaihdella noin 30 - 70 °C ja se on edullisesti 50 - 60 °C. Liuos-suhde (nesteen tilavuuden suhde kankaan painoa kohti) voi vaihdella noin 3:1 -20:1, edullisesti 5:1 -10:1. Käsittelyaika on yleensä 15-90 min, edulli-10 sesti 30 - 60 min. Entsyymiannos riippuu suuresti kankaiden, koneiden, pro-sessiolosuhteiden tyypistä (pH, lämpötila, liuossuhde, käsittelyaika, denim-kuorma, prosessin mittakaava) ja entsyymivalmisteen tyypistä ja muusta sellaisesta. Alan ammattimies pystyy määrittelemään sopivat annokset ja olosuhteet.Biofinishing is typically performed at a pH of about 4.0 to about 6.0. The reaction temperature may range from about 30 to 70 ° C, and is preferably from 50 to 60 ° C. The solution ratio (volume to volume ratio of liquid to fabric weight) may range from about 3: 1 to about 20: 1, preferably from 5: 1 to about 10: 1. The treatment time is generally 15 to 90 min, preferably 10 to 30 min. The dosage of enzyme depends greatly on the type of fabrics, machines, process conditions (pH, temperature, solution ratio, treatment time, denim load, process scale) and the type of enzyme preparation and the like. Appropriate dosages and conditions will be apparent to those skilled in the art.

15 Keksinnön mukaiset endoglukanaasit ovat erityisen käyttökelpoisia tekstiiliteollisuudessa kankaiden tai vaatteiden bioviimeistelyyn, esim. nyppyyntymisen estoon, nukkaantumisen estoon, värin kirkastamiseen, karkeuden vähentämiseen, erilaisten viimeistelyjen luomiseen (esimerkiksi ’persikkamainen’, ’kulutettu’, ’hiekkapesty’ tai ’vanha ulkonäkö’-vaikutus) ja lankojen bioviimeiste-20 lyyn (esimerkiksi pörröisyyden vähentämiseen ja sileyden parantamiseen). Esillä olevan keksinnön mukaisia endoglukanaaseja ja tässä kuvattujen endo-glukanaasifuusioproteiineja voidaan käyttää bioviimeistelyssä happamissa ja .*·*. neutraaleissa olosuhteissa.The endoglucanases of the invention are particularly useful in the textile industry for the biological finishing of fabrics or garments, e.g., for peeling, linting, color clarification, roughness reduction, various finishes (e.g., "peach-like", "worn out" or "sand") ) and biofinishing yarns (for example, to reduce fluffiness and improve smoothness). The endoglucanases of the present invention and the endo-glucanase fusion proteins described herein can be used in biofinishing in acidic and. under neutral conditions.

* . .·. Esillä olevan keksinnön mukaiset endoglukanaasit ja tässä kuvatut 25 endoglukanaasifuusioproteiinit ovat käyttökelpoisia pesuainekoostumuksissa • · 9 j*V kankaan hoito-ominaisuuksien parantamiseksi nyppyyntymisen estolla, har- ;;:V maantumisen estolla, värin kirkastamisella ja pehmentämisellä, ja tekstiilien • · ***** puhdistusvaikutuksen parantamiseksi esimerkiksi lian poistamiseksi.*. . ·. The endoglucanases of the present invention and the endoglucanase fusion proteins described herein are useful in detergent compositions for improving the fabric care properties of anti-peeling, graying, color brightening and softening, and textiles. for example, to remove dirt.

Kivipesussa on kolme vaihetta: liisterin poisto, hankaaminen ja jälki- \v 30 käsittely. Ensimmäinen vaihe, liisterin poistoprosessi on normaalisti farkkujen \.,t ensimmäinen märkäkäsittely ja tarkoittaa tärkkelyksen tai muiden liistereiden .*!*. poistamista, joita yleensä käytetään loimilangoille niiden vaurioitumisen ehkäi- .*·*, semiseksi kutomisprosessin aikana. Alfa-amylaaseja käytetään tärkkelyspoh- • · "* jäisen liisterin poistamiseksi parannetun ja yhdenmukaisen märkäkäsittelyn ai- · : V 35 kaansaamiseksi. Liisterin poiston jälkeen farkkuja huuhdellaan normaalisti ve-"**: della tai jatketaan suoraan hankaamisvaiheella.There are three steps to stonewashing: removing the glue, rubbing it and finishing. The first step, the peeling process, is normally the first wet treatment of jeans \., T and means starch or other peeling. *! *. removal, which is commonly used for warp yarns to prevent their damage. * · *, during the weaving process. Alpha-amylases are used to remove starch-based paste to obtain an improved and uniform wet-treatment time: V 35. After removal of the paste, the jeans are normally rinsed with water or continued directly with the rubbing step.

17 1 1 932517 1 1 9325

Toinen vaihe, hankaaminen, voidaan suorittaa entsyymeillä tai hoh-kakivillä tai molemmilla. Kaikissa tapauksissa mekaanista toimintaa tarvitaan värin poistamiseksi ja käsittely yleensä suoritetaan pesukoneissa, kuten rum-pupesukoneissa. Termi "kulunut” tarkoittaa tässä denim-kankaan ulkomuotoa, 5 kun sitä on käsitelty sellulaasientsyymeillä tai kivillä tai molemmilla. Epätasaisen värin poiston seurauksena värjättyjen alueiden ja alueiden, joilta väri on poistettu, välillä on kontrasteja. Synonyymisiä ilmaisuja ovat "kivipesty ulkonäkö” tai "kulutettu ulkonäkö”. Entsymaattisessa kivipesussa tai biokivipesussa hankaaminen hohkakivillä eliminoidaan täysin tai osittain ja sellulaasi lisätään 10 Indigo-värin hankaamisen helpottamiseksi kuidun pinnasta. Sellulaasikäsittely voidaan tehdä käyttäen neutraaleja tai happamia sellulaaseja tai molempia.The second step, abrasion, can be performed with enzymes or hoh-quartz or both. In all cases, mechanical action is required to decolorize and treatment is generally performed on washing machines such as rum bean machines. The term "worn" herein refers to the appearance of the denim fabric when treated with cellulase enzymes or stones or both. As a result of uneven discoloration, there is a contrast between the dyed areas and the dyed areas. Synonyms are "stone-washed appearance" or "worn" appearance. ”In enzymatic stonewashing or biofuel washing, pumice rubbing is completely or partially eliminated and cellulase is added to facilitate the abrasion of Indigo dye from the surface of the fiber. Cellulase treatment can be done using neutral or acidic cellulases or both.

Hankaamista seuraa yleensä kolmas vaihe, jälkikäsittely, joka sisältää pesu-ja huuhteluvaiheita, joiden aikana pesuaineita, optisia valkaisuaineita tai pehmennysaineita voidaan käyttää. Entsymaattisen käsittelyn jälkeen reak-15 tio täytyy pysäyttää käsiteltyjen materiaalien vaurioitumisen ehkäisemiseksi, esimerkiksi lämpötila- ja/tai pH-inaktivoinnilla jälkimmäisen käsittäessä huolellisen huuhtelemisen ja/tai pesuaineen poispesun. Tämä varmistaa, että kuidun mekaaninen voima ei enempää vaarannu entsyymin jatkuvalla läsnäololla.The abrasion is usually followed by a third step, a post-treatment, which includes the washing and rinsing steps, during which detergents, optical brighteners or emollients can be used. After enzymatic treatment, the reaction must be stopped to prevent damage to the treated materials, for example by inactivation of temperature and / or pH, the latter comprising careful rinsing and / or washing of detergent. This ensures that the mechanical strength of the fiber is no longer compromised by the continuous presence of the enzyme.

"Denimillä” tarkoitetaan tämän keksinnön yhteydessä denim-kan-20 gasta, yleensä denim-vaatteita, erityisesti farkkuja. Edullisesti denim on indigo-värjättyä denimiä. Denim voidaan myös käsitellä indigolla, indigon johdannai-silla tai denim käsitellään indigolla yhdessä joidenkin muiden värien kanssa, ·’·'· esimerkiksi indigovärjätty denim rikkiväripohjalla."Denim", as used herein, refers to denim fabric, generally denim, especially denim. Denim is preferably an indigo dyed denim. Denim can also be treated with indigo, indigo derivatives, or denim treated with some other colors, · '·' · For example an indigo dyed with a sulfur base.

. .·. Käsittely sellulaas(e)illa voi täysin korvata käsittelyn hohkakivillä ·*]·. 25 (esimerkiksi 1 kg kaupallista entsyymiä vastaa 100 kg kiviä). Kuitenkin sellu- • · · j*V laasikäsittely voidaan yhdistää hohkakivikäsittelyyn, kun on toivottua tuottaa ::i.! voimakkaasti kulunut viimeistely. Persikkamainen vaikutus, jossa luodaan hie- •" · *··** no kerros pinnasta ulostyöntyviä karvoja, saavutetaan myös pesulla, jossa yh distetään neutraaleja sellulaaseja hohkakivien kanssa. Tämän keksinnön mu-ν'.'’ 30 kaiset sellulaasit ovat erityisen käyttökelpoisia kulutetun ulkonäön saamiseksi aikaan ja takaisinvärjäytymisen minimoimiseksi biokivipesussa.. . ·. Treatment with cellulase (s) can completely replace the treatment with pumice stone. 25 (for example, 1 kg of commercial enzyme equals 100 kg of stones). However, the pulp • · · j * V treatment can be combined with the pumice treatment when it is desired to produce :: i.! heavily worn finish. The peach-like effect of creating a thin layer of hairs protruding from the surface is also achieved by washing combining neutral cellulases with pumice stones. The cellulases of this invention are particularly useful for a worn-out appearance. and minimize back discoloration in biofuel washing.

.v. Biokivipesu suoritetaan tyypillisesti pH:ssa noin 3,0 - 8,0 ja edulli- ,i··, sesti pH:ssa 4,0 - 6,0. Reaktion lämpötila voi vaihdella noin 30 - 70 °C ja on • · T edullisesti välillä 50 - 60 °C. Liuossuhde (nesteen tilavuuden suhde kankaan.V. Typically, biofuel washing is carried out at a pH of about 3.0 to about 8.0, and preferably at a pH of about 4.0 to about 6.0. The reaction temperature may range from about 30 ° C to about 70 ° C and is preferably about 50 ° C to about 60 ° C. Solution ratio (volume ratio of liquid to fabric

·· I·· I

ί V 35 painoa kohti) voi vaihdella noin 3:1 -20:1, edullisesti 5:1 -10:1. Käsittelyaika *"*! voi vaihdella välillä 15 min - 90 min ja edullisesti 30 min - 60 min. Täytyy koros- 18 119325 taa, että entsyymiannos riippuu suuresti kankaiden, koneiden, prosessiolosuh-teiden tyypistä (pH, lämpötila, liuossuhde, käsittelyaika, denim-kuorma, prosessin mittakaava) ja entsyymivalmisteen tyypistä ja muusta sellaisesta. Niin toivottaessa hohkakiviä voidaan käyttää yhdessä endoglukanaasien tai endo-5 glukanaasifuusioproteiinien kanssa. Vaadittu entsyymiannos tulee tällöin olemaan merkittävästi alhaisempi. Alan ammattimies pystyy määrittelemään sopivat annokset ja olosuhteet.ß V 35 per weight) may range from about 3: 1 to about 20: 1, preferably 5: 1 to about 10: 1. The treatment time * "*! May vary from 15 min to 90 min and preferably from 30 min to 60 min. It must be emphasized that the enzyme dose is highly dependent on the type of fabrics, machines, process conditions (pH, temperature, solution ratio, treatment time, denim). load, process scale) and the type of enzyme preparation and the like. If so desired, pumice stones may be used in combination with endoglucanases or endo-5 glucanase fusion proteins, and the required enzyme dose will then be substantially lower.

Tekstiilimateriaali, joka käsitellään keksinnön mukaisilla entsyymi-valmisteilla, voidaan valmistaa luonnollisesta selluloosasta, joka sisältää kuitu-10 ja, tai keinotekoisesta selluloosasta, joka sisältää kuituja, tai niiden seoksista. Esimerkkejä luonnollisista selluloosakuiduista ovat puuvilla, palttina, hamppu, juutti ja rami. Esimerkkejä keinotekoisista selluloosakuiduista ovat viskoosi, selluloosa-asetaatti, selluloosatriasetaatti, rayon, kupro ja lyocell. Yllä mainittuja selluloosakuituja voidaan käyttää myös synteettisten kuitujen, kuten polyes-15 teri-, polyamidi- tai akryylikuitujen, sekoituksina. Tekstiilimateriaali voi olla lanka tai neulottu tai kudottu tai millä tahansa muulla keinoin muodostettu.The textile material to be treated with the enzyme preparations of the invention may be made from natural cellulose containing fiber 10, or artificial cellulose containing fibers, or mixtures thereof. Examples of natural cellulosic fibers are cotton, plain, hemp, jute and ram. Examples of artificial cellulose fibers include viscose, cellulose acetate, cellulose triacetate, rayon, cupro and lyocell. The above-mentioned cellulosic fibers can also be used as blends of synthetic fibers, such as polyester-15 terry, polyamide or acrylic fibers. The textile material may be yarn or knitted or woven, or otherwise formed.

Keksinnön mukaiset endoglukanaasit ja tässä kuvatut endogluka-naasifuusioproteiinit paitsi, että ovat erityisen käyttökelpoisia kankaiden käsittelyyn, ovat käyttökelpoisia tavallisesti millä tahansa alueella, joka vaatii sellu-20 laasiaktiivisuutta.The endoglucanases of the invention and the endoglucanase fusion proteins described herein, besides being particularly useful for treating fabrics, are generally useful in any region that requires cellulase activity.

Kuitumassa- ja paperiteollisuudessa sellulaaseja voidaan käyttää :\j esimerkiksi erilaisten kierrätettyjen papereiden ja kartonkien, joilla on neutraali ·*·*· tai emäksinen pH, värin poistossa tai kuidun modifioimisessa, kuidun laadun . .·, parantamisessa tai vedenpoiston lisäämisessä paperin valmistuksessa. Muut ·*]*. 25 esimerkit sisältävät painopastan sakeuttamisaineen ja ylimääräisen värin pois- # · · |*V tamisen tekstiilin painamisen jälkeen ja käsittelynä eläinrehulle. Esimerkiksi jos V.: aiottu sovellus on mekaanisen kuitumassan lujuuden parantaminen, silloin • · *···’ keksinnön mukaiset entsyymivalmisteet voivat saada aikaan yhtä tai useampia näistä proteiineista niin, että ne lisäävät tai helpottavat selluloosakuitujen ky-v.: 30 kyä sitoutua yhteen. Samalla tavoin kuitumassan jalostuksen sovelluksessa keksinnön mukaiset endoglukanaasit ja endoglukanaasifuusioproteiinivalmis-,v. teet voivat saada aikaan yhtä tai useampia näistä proteiineista tasolla, joka li- sää tai helpottaa tällaista turpoamista.In the pulp and paper industry, cellulases can be used: for example, for fiber removal of various recycled papers and boards having a neutral · * · * · or alkaline pH, or for fiber modification. ·, Improving or adding dewatering to paper production. Other · *] *. The examples include removal of printing paste thickener and excess dye after · · · · · · Textile printing and processing for animal feed. For example, if V: the intended application is to improve the strength of the mechanical pulp, then the enzyme preparations of the invention can provide one or more of these proteins by increasing or facilitating the binding capacity of cellulosic fibers. Similarly, in the application of fiber pulp processing, the endoglucanases of the invention and the endoglucanase fusion protein prepared, v. The teas can provide one or more of these proteins at a level that increases or facilitates such swelling.

• i V Keksinnön mukaiset endoglukanaasit ja tässä myös kuvatut endo- ·· · : V 35 glukanaasifuusioproteiinit saavat aikaan odottamattomia etuja, kun niitä käyte-*!“: tään tekstiiliteollisuudessa ja erityisesti bioviimeistelyssä, kuten nyppyyntymi- 19 119325 sen estossa, ja kivipesussa. Keksinnön mukaiset endoglukanaasit ja kuvatut endoglukanaasifuusioproteiinit ovat huomattavasti tehokkaampia kuin tunnetun tekniikan mukaiset sellulaasit. Bioviimeistelyssä vähintään neljä kertaa matalampia annoksia voitiin käyttää. Toisin sanoen korkeampi teho saavutetaan 5 käyttämällä esillä olevan keksinnön mukaisia endoglukanaaseja ja endoglu-kanaasifuusioproteiineja. Nyppyyntymisen estossa keksinnön endoglukanaasit ja mainitut endoglukanaasifuusioproteiinit olivat tehokkaampia ja tuottivat stabiilin sileän pinnan.The endoglucanases of the invention and the endo- ·· ·: V 35 glucanase fusion proteins also described herein provide unexpected advantages when used in the textile industry and especially in bio-finishing such as anti-pitting and stone washing. The endoglucanases of the invention and the described endoglucanase fusion proteins are significantly more effective than the cellulases of the prior art. At least four times lower doses could be used in bio-finishing. In other words, higher potency is achieved using the endoglucanases and endoglucanase fusion proteins of the present invention. In the prevention of clumping, the endoglucanases of the invention and said endoglucanase fusion proteins were more effective and produced a stable smooth surface.

Keksintö kuvataan yksityiskohtaisemmin seuraavissa esimerkeissä, 10 joiden ei tulkita kaventavan keksinnön suoja-alaa vaan ainoastaan selventävän keksinnön käyttöä.The invention will be described in more detail in the following examples, which are not to be construed as limiting the scope of the invention but merely for clarifying the use of the invention.

Esimerkki 1. Acremonlum thermophilum ALK04245:n viljelyExample 1. Cultivation of Acremonlum thermophilum ALK04245

Acremonium thermophilum -kanta ALK04245 kasvatettiin 2-litran bioreaktorissa (Braun Biostat® B, Braun, Melsungen, Saksa) seuraavassa vä-15 naineessa, g/l: Solka Floc -selluloosaa 40, maissijauhotta 15, käytettyä mäskiä 5, kauran ja vehnän ksylaania 3, johanneksenleipäpuujauhetta 3, (NH4)2S04:a 5 ja KH2P04:a 5. pH-väli oli 5,2 ± 0,2 (NH3/H2S04), ilmastus 1 vvm, sekoitus 300 - 600 rpm, vaahdonestokontrolli Struktolilla® ja lämpötila 42 °C. Viljelyaika oli 4 päivää. Viljelyn jälkeen solut ja muut kiintoaineet kerättiin sentrifugoinnilla 20 ja supernatantti otettiin talteen.Acremonium thermophilum strain ALK04245 was grown in a 2-liter bioreactor (Braun Biostat® B, Braun, Melsungen, Germany) in the following woman, g / l: Solka Floc cellulose 40, cornmeal 15, used mash 5, oat and wheat xylan 3 , locust bean powder 3, (NH 4) 2 SO 4 5 and KH 2 PO 4 5. pH range 5.2 ± 0.2 (NH 3 / H 2 SO 4), aeration 1 vm, mixing 300-600 rpm, antifoam control with Struktol® and temperature 42 ° C. The culture time was 4 days. After culture, cells and other solids were harvested by centrifugation and the supernatant was collected.

• * » i «• * »i«

Esimerkki 2. Endoglukanaasin puhdistus Acremonium thermophilum v : ALK04245:sta • · · ’···* Esimerkissä 1 kuvatulla tavalla kasvatetun Acremonium therrmophi- : lum ALK04245:n viljelysupernatanttia inkuboitiin 70 °C:ssa 24 tunnin ajan, jon- » · : 25 ka jälkeen se väkevöitiin ultrasuodatuksella. Puhdas endoglukanaasi saatiin peräkkäisellä puhdistuksella hydrofobisella vuorovaikutus- ja kationinvaihto-kromatografialla ja seuraavalla geelisuodatuksella. Puhdistuksen aikana kerät-tyjen fraktioiden endoglukanaasiaktiivisuus määritettiin käyttäen karboksime- • · .···. tyyliselluloosaa (CMC) substraattina (IUPAC:n menettelyn 1987 mukaisesti).EXAMPLE 2. Purification of Endoglucanase from Acremonium thermophilum v: ALK04245 The culture supernatant of Acremonium therrmophi- lum ALK04245 grown as described in Example 1 was incubated at 70 ° C for 24 hours. after that it was concentrated by ultrafiltration. Pure endoglucanase was obtained by sequential purification by hydrophobic interaction and cation exchange chromatography and subsequent gel filtration. The endoglucanase activity of the fractions collected during purification was determined using carboxymethyl. stylized cellulose (CMC) as a substrate (according to IUPAC Procedure 1987).

\\ 30 VäkevÖity viljelysupematantti pantiin HiPrep 16/10 Butyyli FF hydro- v*: fobiseen vuorovaikutuspylvääseen (GE Healthcare), joka oli tasapainotettu 20 mM kaliumfosfaattipuskurilla, pH 6,0, joka sisälsi 1 M (NH4)2S04. Sitoutu- :v. neet proteiinit eluoitiin lineaarisella gradientilla yiäpuskurista 5 mM kaliumfos- taattiin, pH 6,0. Fraktiot kerättiin ja endoglukanaasiaktiivisuus määritettiin, ku- 20 119325 ten yllä kuvataan. Endoglukanaasiaktiivisuus eluoitui leveällä johtokykyalueella 120-15 mS/cm.The concentrated culture supernatant was placed on a HiPrep 16/10 Butyl FF hydro v *: phobic interaction column (GE Healthcare) equilibrated in 20 mM potassium phosphate buffer, pH 6.0 containing 1 M (NH 4) 2 SO 4. Commitment: v. These proteins were eluted with a linear gradient from yeast buffer to 5 mM potassium phosphate, pH 6.0. Fractions were collected and endoglucanase activity was determined as described above. Endoglucanase activity eluted over a wide conductivity range of 120-15 mS / cm.

Yhdistetyt fraktiot pantiin HiTrap SP XL kationinvaihtopylvääseen (GE Healthcare), joka oli tasapainotettu 8 mM natriumasetaatilla, pH 4,5. Si-5 toutuneet proteiinit eluoitiin lineaarisella gradientilla 0 - 0,25 M NaCI:a tasapai-notuspuskurissa. Proteiinit, joilla oli endoglukanaasiaktiivisuutta, eluoituivat johtokykyalueella 3-7 mS/cm. Kationinvaihtokromatografia toistettiin ja proteiini-eluaatti väkevöitiin pakastekuivauksella.The combined fractions were loaded on a HiTrap SP XL cation exchange column (GE Healthcare) equilibrated with 8 mM sodium acetate, pH 4.5. Si-5-bound proteins were eluted with a linear gradient of 0-0.25 M NaCl in equilibration buffer. Proteins with endoglucanase activity eluted at a conductivity range of 3-7 mS / cm. Cation exchange chromatography was repeated and the protein eluate was concentrated by freeze-drying.

Liuotettu näyte ladattiin Superdex 75 HR10/30 geelisuodatuspyl-10 väälle (Pharmacia), joka oli tasapainotettu 20 mM natriumfosfaattipuskurilla, pH 7,0, joka sisälsi 0,15 M NaCI:a. Pääproteiinifraktio eluoitui pylväästä 13,3 ml:n retentiotilavuudella. Proteiinieluaatti oli puhdas SDS-polyakryyliamidigeelielek-troforeesilla pääteltynä ja molekyylipainon arvioitiin olevan 40 kDa. Puhdistetun proteiinin spesifisen aktiivisuuden, joka nimettiin Acremonium thermophi-15 iumvn EG_40:ksi tai At EG_40:ksi (sekvenssi numero 2), 50 °C:ssa määritettiin olevan 450 nkat/mg (IUPAC:n menettelyn 1987 mukaisesti, yläpuolella, käyttäen CMC:aa substraattina).The dissolved sample was loaded onto Superdex 75 HR10 / 30 gel filtration column 10 (Pharmacia) equilibrated with 20 mM sodium phosphate buffer, pH 7.0 containing 0.15 M NaCl. The main protein fraction eluted from the column with a retention volume of 13.3 ml. The protein eluate was pure as determined by SDS-polyacrylamide gel electrophoresis and the molecular weight was estimated to be 40 kDa. The specific activity of the purified protein, designated Acremonium thermophi-15 iumvn EG_40 or At EG_40 (SEQ ID NO: 2), at 50 ° C was determined to be 450 nkat / mg (according to IUPAC Procedure 1987) using CMC: aa as a substrate).

Puhdistetun endoglukanaasin terminen stabiilius määritettiin erilaisissa lämpötiloissa. Reaktio suoritettiin 0,1 mg/mi BSA.a ollessa läsnä pH:ssa 20 5,0 60 minuutin ajan käyttäen CMC:aa substraattina. At EG_40 oli stabiili 80 °C:seen saakka. T. teesein referenssientsyymit EGI (Cel7B) ja EGH (Cel5A) :\j säilyttivät 100 % aktiivisuudestaan 60 °C:seen ja 65 °C:seen saakka mainitus- sa järjestyksessä.The thermal stability of the purified endoglucanase was determined at various temperatures. The reaction was performed in the presence of 0.1 mg / ml BSA at pH 20 5.0 for 60 min using CMC as substrate. At EG_40 was stable up to 80 ° C. The reference enzymes EGI (Cel7B) and EGH (Cel5A): t. Teesei retained 100% of their activity up to 60 ° C and 65 ° C, respectively.

. ,\ Sisäiseen aminohapposekvensointiin puhdistettu Acremonium ther- ·"·, 25 mophilum ALK04245:n EG_40-proteiini (sekvenssi nro 2) alkyloitiin ensin ja • · · |1V digestoitiin tryptisiksi peptideiksi. Kehitetyistä peptideistä poistettiin suolat ja *::7 erotettiin osittain nanonestekromatografialla (käänteisfaasi). Sisäiset peptidit • « *···' sekvensoitiin sähkösumutusionisaatiolla yhdistettynä tandem-massaspektro metriin (ESI-MS/MS) käyttäen Q-TOF1-laitetta (Waters Micromass®). Niin saa- v.: 30 dut sisäiset peptidisekvenssit listataan taulukossa 1.. , \ The purified Acremonium ther- · "·, 25 mophilum ALK04245 EG_40 protein (SEQ ID NO: 2) was first alkylated and digested into tryptic peptides. The generated peptides were desalted and * :: 7 partially separated. internal peptides • «* ··· 'was sequenced by electrospray ionization combined with a tandem mass spectrometer (ESI-MS / MS) using a Q-TOF1 (Waters Micromass®) .Available: 30 dut internal peptide sequences are listed in the table. 1.

·· • · * · ··· • · • · · » 1 « • · IM • 1 • «·· • · * · ··· • · · · »1« • · IM • 1 • «

• M• M

M · • · · • · • · 21 119325M · • · · • • • 21 119325

Taulukko 1. Acremonium thermophilumin EG_40-sellulaasista määritetyt sisäiset peptidisekvenssit _Peptidi__Sekvenssi__Sekvenssi nroTable 1. Internal peptide sequences determined from Acremonium thermophilum EG_40 cellulase _Peptide__S SEQ ID NO:

Peptidi 1__QSCSSFPAPLKPGCQWR__5_Peptide 1__QSCSSFPAPLKPGCQWR__5_

Peptidi 2__YALTFNSGPVAGK__6_Peptide 2__YALTFNSGPVAGK__6_

Peptidi 3__VQPSELTSR__7_Peptide 3__VQPSELTSR__7_

Peptidi 4__NQPVFSCSADWQR__8_Peptide 4__NQPVFSCSADWQR__8_

Peptidi 5__YWDCCKPSCGWPGK__9_Peptide 5__YWDCCKPSCGWPGK__9_

Peptidi 6 PTFT 10Peptide 6 PTFT 10

Esimerkki 3. Acremonium thermophilumin (ALK04245) ce/45A- ja ce/45B-geenien kloonaus 5 Molekyylibiologian perusmentelmiä käytettiin DNA:n (plasmidit, DNA- fragmentit) eristämisessä ja entsyymikäsittelyissä, E. colin transfromaatioissa jne. Käytetyt perusmenetelmät kuvataan molekyylibiologian peruskäsikirjoissa, esim. Sambrook, J., ym., 1989 ja Sambrook J. ja Russell, D. W., 2001.Example 3. Cloning of the ce / 45A and ce / 45B genes of Acremonium thermophilum (ALK04245) The basic methods of molecular biology were used to isolate DNA (plasmids, DNA fragments) and enzyme treatments, E. coli transformations, etc. The basic methods used are described in molecular biology. Sambrook, J., et al., 1989 and Sambrook J. and Russell, DW, 2001.

Acremonium thermophilum ALK04245:n genominen kirjasto konst- 10 ruoitiin Lambda DASH®II 'vektorissa (Stratagene, USA) valmistajan ohjeiden mukaisesti. Readerin ja Brodan, 1985, menetelmällä eristetty knomosomaalinen DNA digestoitiin osittain Sau3A:\\a. Digestoitu DNA fraktioitiin koon mukaan agaroosigeelillä ja valitun kokoiset fragmentit (noin 5-23 kb) eristettiin, defos- .·.·! foryloitiin ja ligoitiin BamHI-digestoituun lambda-vektorikäisvarsiin. Ligaatio- • · · *. 15 seos pakattiin käyttäen Gigapack III Gold -pakkausuutteita valmistajan ohjei- den mukaisesti (Stratagene, USA). Genomisen kirjaston tiitteri oli 3,7 x 105 pfu/ml j·*· ja vahvistetun kirjaston oli 4,2 x 108 pfu/ml.The genomic library of Acremonium thermophilum ALK04245 was constructed in the Lambda DASH®II 'vector (Stratagene, USA) according to the manufacturer's instructions. Knomosomal DNA isolated by the method of Reader and Brodan, 1985 was partially digested with Sau3A. The digested DNA was size-fractionated on an agarose gel and fragments of the selected size (about 5-23 kb) were isolated, defos-. was lyophilized and ligated into BamHI digested lambda vector dwarf arms. Liga- • · · *. The mixture was packaged using Gigapack III Gold packaging extracts according to the manufacturer's instructions (Stratagene, USA). The titer of the genomic library was 3.7 x 10 5 pfu / ml and the amplified library was 4.2 x 10 8 pfu / ml.

ί.ί: Sisäisellä peptidisekvenssillä puhdistetusta Acremonium thermophi- ··· lumin EG_40-sellulaasista, joka oli saatu kuten kuvataan esimerkissä 2, oli 20 homologiaa glykosyylihydrolaasiperheen 45 sellulaasien kanssa, kuten Thiela- :V: via terrestrisin endoglukanaasin (GenBankin talletusnumero CQ827970) ja :***· Melanocarpus aibomycesin Cel45A-sellulaasin (GenBankin talletusnumero • ·· AJ515703) kanssa. Koettimen vahvistamiseksi A. thermophilumin EG 40:tä e e · koodittavan geenin (ce/45A; sekvenssi nro 1) seulomiseksi genomisesta kir-*·;·’ 25 jastosta suunniteltiin degeneroituja alukkeita taulukossa 1 (esimerkki 2) listat- tujen peptidisekvenssien perusteella. Peptidien järjestys proteiinisekvenssis-····: sä ja alukkeiden vastaava sense- ja antisense-luonne johdettiin vertailusta homologisen M. aibomycesin Cel45A-sekvenssin kanssa. Sense-aluke 22 119325 (TAYTGGGAYTGYTGYAARCC, sekvenssi nro 11) perustuu peptidin 5 (sekvenssi nro 9) aminohappoihin 1 - 6 ja antisense-aluke (RTTRTCNGCRTTYTGRAACCA, sekvenssi nro 12) perustuu homologisen M. albomycesin Cel45A-proteiinin peptidisekvenssiin (WFQNADN; sekvenssi nro 13). PCR-reaktioseokset sisälsi-5 vät 50 mM Tris-HCI:a, pH 9,0,15 mM (NH^SO^a, 0,1 % Triton X-100:a, 1,5 mM MgCl2:a, 0,1 mM dNTP:ejä, 0,5 pg kutakin aluketta, 1 yksikön Dynazyme EXT DNA-polymeraasia (Finnzymes, Suomi) ja likimäärin 0,5 pg Acremoniumin ge-nomista DNA:ta. PCR-reaktioiden olosuhteet olivat seuraavat: 5 minuutin alku-denaturaatio 95 °C:ssa, jota seurasi 30 1 minuutin sykliä 95 °C:ssa, 1 minuutin 10 alukkeiden kiinnittymisvaihe 50 - 60 °C:ssa, 2 min alukkeiden pidentymisvaihe 72 °C:ssa ja lopullinen pidentymisvaihe 72 °C:ssa 10 minuutin ajan. Pidennys-tuotteet tarkastettiin agaroosigeelillä.ί.ί: The internal peptide sequence purified Acremonium thermophi ··· Lumin EG_40 cellulase obtained as described in Example 2 had 20 homologies to glycosyl hydrolase family 45 cellulases such as Thiela-: V: via terrestris endoglucanase (GenBank82). *** · Cel45A Cellulase (GenBank Accession No. · ·· AJ515703) from Melanocarpus aibomyces. To amplify the probe to screen for the gene encoding A. thermophilum EG 40 ee · (ce / 45A; SEQ ID NO: 1), degenerate primers were designed based on the peptide sequences listed in Table 1 (Example 2). The order of the peptides in the protein sequence ···· and the corresponding sense and antisense character of the primers were deduced from the comparison with the homologous Cel45A sequence of M. aibomyces. Sense primer 22 119325 (TAYTGGGAYTGYTGYAARCC, SEQ ID NO: 11) is based on amino acids 1-6 of peptide 5 (SEQ ID NO: 9) and the antisense primer (RTTRTCNGCRTTYTGRAACCA, SEQ ID NO: 12) is based on the homologous M. albomycesin CelinN peptide W45N peptide; ). The PCR reaction mixtures contained 50 mM Tris-HCl, pH 9.0.15 mM (NH 4 SO 2, 0.1% Triton X-100, 1.5 mM MgCl 2, 1 mM dNTPs, 0.5 pg each primer, 1 unit Dynazyme EXT DNA polymerase (Finnzymes, Finland) and approximately 0.5 pg Acremonium genomic DNA The conditions for the PCR reactions were as follows: denaturation at 95 ° C followed by 30 1 minute cycles at 95 ° C, 1 minute 10 primer attachment step at 50-60 ° C, 2 minute primer extension step at 72 ° C, and final elongation step at 72 ° C 10 The extension products were screened on an agarose gel.

Kaksi PCR-tuotetta saatiin Acremoniumin PCR-reaktiosta. Noin 0,6 kb:n (sekvenssi nro 14) ja 0,8 kb:n (sekvenssi nro 15) DNA-fragmentit eris-15 tettiin agaroosigeeliltä ja kloonattiin pCR4-TOPO®TA-vektoriin (Invitrogen, USA), mikä johti plasmideihin pALK1710 ja pALK1711 mainitussa järjestyksessä. Kloonatut PCR-tuotteet karakterisoitiin sekvensoinnilla ja suorittamalla Southern-blottaushybridisaatioita (kuten alla kuvataan) useilla restriktioent-syymeillä digestoidulle genomiselle Acremoniumin DNA:Ile. Kahdella fragmen-20 tiliä voimakkaissa pesuolosuhteissa saadut hydridisaatiokuviot viittaavat siihen, että kaksi otaksuttua endoglukanaasigeeniä voitiin seuloa Acremoniumin :*·.· genomisesta kirjastosta. Molempien PCR-tuotteiden johdetuilla aminohap- • · posekvensseillä on homologiaa useisiin glykosyylihydrolaasiperheen 45 jul-kaistuihin endoglukanaasisekvensseihin (BLAST-ohjelma, National Center for • · · ;"Ιφ 25 Biotechnology Information; Altschul ym. 1990).Two PCR products were obtained from the Acremonium PCR reaction. DNA fragments of approximately 0.6 kb (SEQ ID NO: 14) and 0.8 kb (SEQ ID NO: 15) were isolated from an agarose gel and cloned into the pCR4-TOPO®TA vector (Invitrogen, USA), resulting in plasmids. pALK1710 and pALK1711, respectively. The cloned PCR products were characterized by sequencing and performing Southern blot hybridization (as described below) on genomic Acremonium DNA digested with several restriction enzymes. Hydrogenation patterns obtained with two fragmen-20 accounts under strong washing conditions suggest that two putative endoglucanase genes could be screened from the Acremonium: * ·. · Genomic library. The deduced amino acid sequences of both PCR products have homology to several published endoglucanase sequences of the glycosyl hydrolase family (BLAST program, National Center for Biotechnology Information; Altschul et al. 1990).

i".: Insertti plasmidista pALK1710ja pALK1711 eristettiin restriktioent- • · · syymidigestiolla ja leimattiin digoksigeniinillä valmistajan ohjeiden mukaisesti *···* (Roche, Saksa). Noin 1 - 2 x 105 plakkia vahvistetusta Acremoniumin genomi sesta kirjastosta siirrettiin nitroselluloosasuodattimille ja seulottiin hybridissä- • · 30 tiolla käyttäen digoksigeniini-leimattuja inserttejä. Hybridisaation lämpötila oli 68 °C ja suodattimet pestiin 2x5 minuuttia huoneenlämmössä käyttäen .·!*. 2xSSC-0,1 % SDS ja seuraavaksi 2x15 minuuttia 68 °C:ssa käyttäen • · · I.*. 0,1 x SSC - 0,1 % SDS. Useita positiivisia plakkeja saatiin, joista viisi vahvasti '*:** hybridisoituvaa plakkia puhdistettiin molemmista seulonnoista. Faagi-DNAt j*V 35 eristettiin ja analysoitiin Southern-blottaushybridisaatiolla. Koettimiin hybridisoi-*:·*: tuvat faagi-DNA:iden restriktiofragmentit subkloonattiin pBluescript II KS+ -vek- 23 119325 toriin (Stratagene, USA) ja olennaiset osat sekvensoitiin. Molemmissa tapauksissa subkloonattu faagifragmentti sisältää mielenkiinnon kohteena olevan täyspitkän geenin.i ".: Insert from plasmid pALK1710 and pALK1711 were isolated by restriction enzyme digestion and labeled with digoxigenin according to the manufacturer's instructions * ··· * (Roche, Germany). Approximately 1-2x105 plaques from the amplified Acremonium genomic library were transferred to a nitrocellulose filter and Hybridization temperature was 68 ° C and the filters were washed 2x5 minutes at room temperature using 2xSSC-0.1% SDS followed by 2x15 minutes at 68 ° C. 0.1 x SSC - 0.1% SDS Several positive plaques were obtained, of which five highly hybridizing plaques were purified from both screens Phage DNA j * V 35 was isolated and analyzed by Southern blot hybridization. *: · *: Restriction fragments of phage DNAs were subcloned into pBluescript II KS + vector 23 119325 (Stratagene, USA) and the essential parts In both cases, the subcloned phage fragment contains the full-length gene of interest.

Taulukko 2 vetää yhteen tiedot endoglukanaasigeenien seulontaan 5 käytetyistä koettimista, faagiklooneista, joista geenit eristettiin, valituita restrik-tiofragmenteista, jotka sisältävät täyspitkät geenit promoottori- ja terminaattori-alueineen, plasmidien nimet, jotka sisältävät subkloonatut faagifragmentit, ja talletusnumerot Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH -viljelmäkokoelmassa (DSM) E. coli -kannoille, jotka kantavat näitä 10 plasmideja. Talletukset tehtiin Budapestin sopimuksen alaisena 13.5.2005.Table 2 summarizes data from probes used for screening endoglucanase genes, selected phage clones containing restriction fragments containing full-length genes with their promoter and terminator regions, plasmid names containing subcloned fusion fragments, culture collection (DSM) for E. coli strains carrying these 10 plasmids. The deposits were made under the Budapest Treaty on 13 May 2005.

Taulukko 2. Endoglukanaasigeenien kloonaukseen käytetyt koettimet, valitut faagikloonit ja subkloonit, plasmidinimet ja vastaava E. coli-kantojen talletusnumeroTable 2. Probes used for cloning endoglucanase genes, selected phage clones and subclones, plasmid names and corresponding accession number for E. coli strains

Geeni Genominen Seulonnassa Faagiklooni Subkloonattu Plasmidi E. colin kirjasto käytetty koe- fragmentti talletin tusnu- _______meroGene Genomic Screening Phage Clone Subcloned Plasmid E. coli Library Used Test Fragment Depository _______mero

At A. thermo- pALK1710 P24 5,5 kb Smal pALK1908 DSMAt A. thermo- pALK1710 P24 5.5 kb Smal pALK1908 DSM

ce/45A philum 17324 __ALKQ4245______ce / 45A philum 17324 __ALKQ4245______

: At A. thermo- pALK1711 P41 6,0kbX/?ol pALK1904 DSM: At A. thermo- pALK1711 P41 6,0kbX /? Ol pALK1904 DSM

ce/45B philum 17323 __ALKQ4245_______ce / 45B philum 17323 __ALKQ4245_______

• · · > 11 II I I I ............- -lM I . ... 1 I• · ·> 11 II I I I ............- -lM I. ... 1 I

• · * • · * • · • * · |·γ 15 Kahden geenin, jotka on nimetty At ce/45A:ksi (sekvenssi nro 1) ja > » tΓ 15 The two genes named Atce / 45A (SEQ ID NO: 1) and> »t

At ce/45B (sekvenssi nro 3), olennaiset tiedot vedetään yhteen taulukossa 3 ja vastaavien johdettujen proteiinisekvenssien, At EG_40 (sekvenssi nro 2) ja At EG_40_like (sekvenssi nro 4), olennaiset tiedot taulukossa 4. Puhdistetun :V: Acremoniumm EG_40-endoglukanaasin peptidisekvenssit havaittiin kloonatun 20 geenin vastaavassa johdetussa aminohapposekvenssissä varmentaen, että tarkoituksenmukainen geeni kloonattiin.At ce / 45B (SEQ ID NO: 3), the relevant data are summarized in Table 3 and the relevant data for the respective derived protein sequences, At EG_40 (SEQ ID NO: 2) and At EG_40_like (SEQ ID NO: 4), are as follows: Purified: V: Acremoniumm EG_40 endoglucanase peptide sequences were detected in the corresponding deduced amino acid sequence of the cloned 20 gene, confirming that the appropriate gene was cloned.

Täyspitkä At ce/45A-geeni (sekvenssi nro 1) on 1076 bp pitkä, kah- • · **:’* den 59 bp:n ja 123 bp:n intronin katkaisema ja koodittaa 297 aminohapon po- ; lypeptidiä At EG_40 (sekvenssi nro 2). Otaksuttu signaalipeptidin katkaisukoh- *:**: 25 ta on Ala21:n jälkeen ja kypsän proteiinin N-terminus alkaa Leu22:lla kypsän 24 119325 proteiinin (joka sisältää CBD:n) käsittäessä sekvenssin nro 2 mukaiset aminohapot 22 - 297. EG_40-sellulaasilla on C-terminaalinen yhdenmukainen selluloosaa sitova domeeni, joka koostuu täyspitkän polypeptidin aminohapoista Lys265 - Leu297. Ennustetulla kypsällä proteiinilla signaalipeptidin katkaisun 5 jälkeen on molekyylipaino ja pl 28625 Da ja 4,79 mainitussa järjestyksessä (ennuste tehty käyttäen Compute pl/MW-työkalua ExPASy-palvelimella, Gas-teiger ym., 2003). Proteiinilla on kaksi otaksuttua N-glykosylaatiokohtaa N-X-S/T (ennustettu käyttäen NetNGIyc 1,0 -ohjelmaa, Gupta ym., 2004).The full-length Ate / 45A gene (SEQ ID NO: 1) is 1076 bp long, cleaved by two 59 bp and 123 bp introns and encodes a 297 amino acid po; lipid At EG_40 (SEQ ID NO: 2). The putative signal peptide cleavage site *: ** is after Ala21 and the mature protein N-Terminus starts with Leu22 with the mature 24 119325 protein (containing CBD) comprising the amino acids 22-297 of SEQ ID NO: 2. is a C-terminal consistent cellulose binding domain consisting of the full length polypeptide amino acids Lys265 - Leu297. The predicted mature protein after signal peptide cleavage 5 has a molecular weight and a pI of 28625 Da and 4.79, respectively (prediction made using the Compute pI / MW tool on the ExPASy server, Gas-claimser et al., 2003). The protein has two putative N-glycosylation sites N-X-S / T (predicted using NetNGIyc 1.0, Gupta et al., 2004).

Vastaavasti täyspitkä at ce/45B-geeni (sekvenssi nro 3) on 1013 bp 10 pitkä, kahden 155 bp:n ja 102 bp:n intronin katkaisema ja koodittaa 251 aminohapon polypeptidiä At EG_40_like (sekvenssi nro 4). Otaksuttu signaalipeptidin katkaisukohta on Ala20:n jälkeen ja kypsän proteiinin N-terminus alkaa Gln21:llä, kypsän proteiinin käsittäessä sekvenssin nro 4 mukaiset aminohapot 21 · 251. EG_40_like sellulaasilla ei ole C-terminaalista yhdenmukaista sellu-15 loosaa sitovaa domeenia. Ennustetulla kypsällä proteiinilla signaalipeptidin katkaisun jälkeen on molekyylipaino ja pl 23972 Da ja 6,11 mainitussa järjestyksessä (ennuste tehty käyttäen Compute pl/MW-työkalua ExPASy-palve-limella, Gasteiger ym., 2003). Proteiinilla on kaksi otaksuttua N-glykosylaatiokohtaa N-X-S/T (ennustettu käyttäen NetNGIyc 1,0 -ohjelmaa, Gupta ym., 20 2004).Similarly, the full-length at ce / 45B gene (SEQ ID NO: 3) is 1013 bp 10 long, cut by two 155 bp and 102 bp introns, and encodes the 251 amino acid polypeptide At EG_40_like (SEQ ID NO: 4). The putative signal peptide is cleaved after Ala20 and the mature protein has an N-Terminus starting with Gln21, the mature protein comprising amino acids 21 · 251 of SEQ ID NO: 4. EG_40_like cellulase does not have a C-terminal uniform cellulose binding site. The predicted mature protein after cleavage of the signal peptide has a molecular weight and a pI of 23972 Da and 6.11, respectively (prediction made using the Compute pI / MW tool on the ExPASy server, Gasteiger et al., 2003). The protein has two putative N-glycosylation sites N-X-S / T (predicted using NetNGIyc 1.0, Gupta et al., 20 2004).

. . Taulukko 3. Acremonium thermophilum ALK04245:stä eristettyjen endo- .1 2 3 4./ glukanaasigeenien yhteenveto • · • · · • n- _ :es1s Endogluka- Pituus intro- Koodittava Intronien Intronien Sekvenssi : naasigeeni neiden kans- alue (bp) määrä pituus nro sa (bp) (b (bp) ·1· 1 (a • · · \ • · ^5 _ _ __. . Table 3. Summary of endo- .1 2 3 4. / glucanase genes isolated from Acremonium thermophilum ALK04245 • · • · · • n- _: es1s Endoglucan-Length intro- Coding of Introns Introns Sequence: number of naase genes (bp) length no sa (bp) {b (bp) · 1 · 1 (a • · · \ • · ^ 5 _ _ __

At ce/45A 1076__891 2__59,123 1_At ce / 45A 1076__891 2__59,123 1_

At ce/45B 1013 753 2 155, 3 • · · 102 • · 11 *·;·1 (a STOP-kodoni mukaan luettuna : V: (b STOP-kodonia lukuun ottamatta ··· • » • · ··· · · 2 • « « 3 • « 4 • · « 5 • · 25 119325 s Fi I i* g w s S s ro «S ^ S X s « .2 E UJ rt ¢2 C 3 m s 0 CO C CM Tf £ S- TO 04 Φ* __________^ V 3 ► S li c c og d > -½ ό ® to S E, g ^ H j2 iS oAt ce / 45B 1013 753 2,155, 3 • · · 102 • · 11 * ·; · 1 (including a STOP codon: V: (b except for STOP codon · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · 2 • «« 3 • «4 • ·« 5 • · 25 119325 s Fi I i * gws S s ro «S ^ SX s« .2 E UJ rt ¢ 2 C 3 ms 0 CO C CM Tf £ S-. TO 04 Φ * __________ ^ V 3 ► S li cc og d> -½ ό ® to SE, g ^ H j2 iS o

Φ — 2 -O « >. TOΦ - 2 -O «>. TO

«3 TOTO,, Cm^To.«3 TOTO ,, Cm ^ To.

€ "3 © c & 3 >· ! s 1 “iiä 1 £ * g fe ? t a j» O » ·* <M__« ® & Ä ! a -ξ- § Er g | f€ «3 © c & 3> ·! S 1« iiä 1 £ * g fe? T a j »O» · * <M__ «® & Ä! A -ξ- § Er g | f

> 3 3 Λ E, F fc O> 3 3 Λ E, F fc O

g «-Sm .S o Tg «-Sm .S o T

S © .3 *3 c CO © O a TO « — ro 0 .1ϋ> _ o '55 § e to .© F c t— g c ^ i g> r: .s 78 Q .g o g IU o ^ J O f, öS © .3 * 3 c CO © O a TO «- ro 0 .1ϋ> _ o '55 § e to. © F c t— g c ^ i g> r: .s 78 Q .g o g IU o ^ J O f, ö

Ji---TO g C -S ZShe --- TO g C -S Z

Tri ^ TO P ^ W C ·£Tri ^ TO P ^ W C · £

TO 5 3 — TO s ~ ZTO 5 3 - TO s ~ Z

0 £ © 5 TO -p0 £ © 5 TO -p

TJ 3 O 'P (H £ CTJ 3 O 'P {H £ C

c s ~ -g =to c © ©c s ~ -g = to c © ©

© IS =© :g 9 f P φ I© IS = ©: g 9 f P φ I

g I w ? in CM °- Φ Φ to §·g I w? in CM ° - Φ Φ to § ·

© TO . E CM CO ^ Ä 3 JS© TO. E CM CO ^ Ä 3 JS

3 g TO TO CD 05 > iS <3 C ™ 1 lss_s_s | ΐ .- & | g s »Il s 1 •S. σ «15 o 3 c 3 «= 2 Ä | c lii -1 ©“TO IS © *· S 11 *' £ f ^ n ° ^ ···* 9 o i 2 iu ^ s g i ><; · · Jr f— p 'JS v < * J t/)_ -r (O 5 ^3 g TO TO CD 05> iS <3 C ™ 1 lss_s_s | ΐ .- & | g s »Il s 1 • S. σ «15 o 3 c 3« = 2 Ä | c lii -1 © "TO IS © * · S 11 * '£ f ^ n ° ^ ··· * 9 o i 2 iu ^ s g i> <; · · Jr f— p 'JS v <* J t /) _ -r {O 5 ^

• ^ n w r ^ :(0 O• ^ n w r ^: {0 O

::: ^ is ©ro ~ =55 © ^ .. -c Si C; w jc © $ o£ ·** Q_ CO “ T- O © -X C ä ;= ©::: ^ is © ro ~ = 55 © ^ .. -c Si C; w jc © $ o £ · ** Q_ CO «T- O © -X C ä; = ©

···* o iOZ CM CM e φ Q _ φ (O Z··· * o iOZ CM CM e φ Q _ φ {O Z

.**·. ε---> > -σ S' .TO ^ TO ^ *···* fc © ^TOC^COOw'o « 5* 3|Ι·|885έ :Y: i 2 2" “ i ; EJ^ :.: 1 I =2 JS a c! i II S S 1 f 1 !· 1 f g 3 :·!·! I « ----llillsl-8 i‘": 'Ί 8 ._ JiS|MfiSäÖ|. ** ·. ε --->> -σ S '.TO ^ TO ^ * ··· * fc © ^ TOC ^ COOw'o «5 * 3 | Ι · | 885έ: Y: i 2 2" "i; EJ ^: .: 1 I = 2 JS ac! I II SS 1 f 1! · 1 fg 3: ·! ·! I «---- llillsl-8 i '":' Ί 8 ._ JiS | MfiSäÖ |

"· ^ g . :i — & $ £ 0.0. ro 3 I"· ^ G .: i - & $ £ 0.0. Ro 3 I

o > -x -2 o o » .g © r.o> -x -2 o o ».g © r.

: ·· ·:··: 3 5 8* § o o ro o. 15 © TO ro -o ro UJ Lii > TO > ^ ro ro c ro +- +- ^ .s' ro: ·· ·: ··: 3 5 8 * § o o ro o. 15 © TO ro -o ro UJ Lii> TO> ^ ro ro c ro + - + - ^ .s' ro

I— c LLI c < < Z S o. EI— c LLI c <<Z S o. E

26 119325 A. thermophilumin EG_40 ja EG_40Jike-sellulaasien johdetut pro-teiinisekvenssit ovat samanlaisia kuin glykosyylihydrolaasiperheen 45 sellulaa-sit (taulukko 5). EG_40/Cel45A:lle ja EG_40_like/Cel45B:lle havaitut lähimmät sekvenssihomologiat olivat Thieiavia terrestrisin (GenBankin talletusnumero 5 CQ827970) ja Myceliophthora thermophilan (GenBankin talletusnumero AR094305) endoglukanaasisekvenssit mainitussa järjestyksessä. Linjaukset suoritettiin käyttäen EMBOSS-ohjelmapaketin Needle-ohjelmaa.119325 The derived protein sequences of A. thermophilum EG_40 and EG_40Jike cellulases are similar to the 45 cellulases of the glycosyl hydrolase family (Table 5). The closest sequence homologies observed for EG_40 / Cel45A and EG_40_like / Cel45B were the endoglucanase sequences in Thieiavia terrestris (GenBank accession number 5 CQ827970) and Myceliophthora thermophila (GenBank accession number AR094305). The alignment was performed using the Needle program of the EMBOSS program package.

Taulukko 5. Acremonium thermophilumin EG_40 ja EG40_like-sellu-laasien johdettujen proteiinisekvenssien vertailu homologisten vas-10 tineidensa kanssaTable 5. Comparison of Derived Protein Sequences of Acremonium thermophilum EG_40 and EG40_like Cellulases with Their Homologous Antibodies

Organismi, entsyymi ja talletusnumero__Identtisyys (%)Organism, enzyme and deposit number__Identity (%)

Acremonium thermophilumin EG_40Acremonium thermophilumin EG_40

Thielavia terrestisin EG45, CQ827970 77,3Thielavia terrestisin EG45, CQ827970 77.3

Melanocarpus albomycesin Cel45, AJ515703 75,3Melanocarpus albomycesin Cel45, AJ515703 75.3

Neurospora orassa, hypoteettinen XMJ324477 68,9Neurospora in the spindle, hypothetical XMJ324477 68.9

Humicola grisea var thermoidea, EGL3, AB003107 67,5Humicola grisea var thermoidea, EGL3, AB003107 67.5

Humicola insolensin EG5, A23635 67,3Humicola insolensin EG5, A23635 67.3

Myceliophtora thermophilan perhe 45, AR094305 57,9Myceliophtora thermophila family 45, AR094305 57.9

Acremonium thermophilumin EG_40Jike__53,7Acremonium thermophilumin EG_40Jike__53.7

Acremonium thermophilumin EG_40Jike :·**: Myceliophtora thermophilan perhe 45, AR094305 66,9 : Magnaporthe grisean 70-15 hypoteettinen, XM_363402 61,9Acremonium thermophilumin EG_40Jike: · **: Myceliophtora thermophila family 45, AR094305 66.9: Magnaporthe grisean 70-15 hypothetical, XM_363402 61.9

Thielavia terrestisin EG45, CQ827970 56,8 : Acremonium thermophilumin EG_40 53,7 • ·*: Melanocarpus albomycesin Cel45, AJ515703 52,8 ·«· · 1 • ♦ ***** Esimerkki 4. Acremonium thermophilunmn EG_40 ja EG_40_like-sellu- laasien tuotanto Trichoderma reeseissä • ♦ • · ·Thielavia terrestisin EG45, CQ827970 56.8: Acremonium thermophilumin EG_40 53.7 • · *: Melanocarpus albomycesin Cel45, AJ515703 52.8 · · 1 1 ***** Example 4. Acremonium thermophilunmn EG_40 and EG_40_like-cellulose. glass production in Trichoderma reesees • ♦ • · ·

Ekspressioplasmidit konstruoitiin rekombinanttien A. thermophilumin :···: EG 40/Cel45A ja EG 40 like/Cel45B-sellulaasien tuotantoon. Molemmat 15 geenit (ce/45A tai ce/45B) mukaan lukien niiden omat signaalisekvenssit sulau- • · .***. tettiin tarkalleen T. reesein cbhf-promoottoriin (ceI7A) PCR:lla (taulukko 6).Expression plasmids were constructed for the production of recombinant A. thermophilumin: ···: EG 40 / Cel45A and EG 40 like / Cel45B cellulases. Both 15 genes (ce / 45A or ce / 45B) including their own signal sequences are fused. was precisely inserted into the T. reesei cbhf promoter (ce17A) by PCR (Table 6).

./.* cb/7 f-promoottori, cb/ji-terminaattori ja amdS-markkerigeeni sisällytettiin, ku- « · · : ·[ ten kuvataan julkaisussa Paloheimo ym. 2003 yläpuolella. Lineaarinen eks- pressiokasetti (kuva 1) eristettiin vektorirungosta restriktioentsyymidigestiolla, 27 119325 transformoitiin T. reesein A96:een ja transformantit valittiin asetamidilla ainoana typen lähteenä. Isäntäkannalta puuttuu neljä endogeenistä pääsellulaasia: CBHI/Cel7A, CBHII/Cel6A, EGI/Cel7B ja EGII/Cel5A. Transformaatiot suoritettiin julkaisun Penttilä ym.,1987, mukaisesti niiden modifikaatioiden kanssa, jot-5 ka kuvataan julkaisussa Karhunen ym.,1993. Transformantit puhdistettiin valin-tamaljoilla yksittäisten konidioiden kautta, ennen kuin ne idätettiin perunauu-teagarilla../.* cb / 7 f promoter, cb / j terminator and amdS marker gene were included as described in Paloheimo et al., 2003. The linear expression cassette (Figure 1) was isolated from the vector backbone by restriction enzyme digestion, 27119325 were transformed into T. reesei A96 and the transformants were selected with acetamide as the sole nitrogen source. The host strain lacks four endogenous master cellulases: CBHI / Cel7A, CBHII / Cel6A, EGI / Cel7B and EGII / Cel5A. Transformations were performed according to Penttilä et al., 1987, with modifications as described in Karhunen et al., 1993. Transformants were purified on a selection of plates through individual conidia before being sprouted with potato extract.

Taulukko 6. Acremonium thermophilumin EG40 ja EG40_like-sellulaasien tuotantoon Trichoderma reeseissä konstruoidut ekspressiokasetit. Eks-10 pressiokasettien kaaviomainen rakenne kuvataan kuvassa 1Table 6. Expression cassettes constructed for production of Acremonium thermophilum EG40 and EG40_like cellulases in Trichoderma reese. The schematic structure of the Eks-10 press cartridges is illustrated in Figure 1

Endoglukanaasi Ekspressioplasmidi Ekspressiokasetin Heterologinen ___koko(a__terminaattori(bEndoglucanase Expression Plasmid Expression Cassette Heterologic ___ size (a__terminator (b

At EG_40 pALK1920 10,9kbNotl 156 bp ____(HindUl)At EG_40 pALK1920 10.9kbNotl 156 bp ____ (HindUl)

At EG_40_like pALK1921 8,6 kb EcoRI 282 bp (Sspl) (a Ekspressiokasetti T. reesei-transformaatioon eristettiin vektorirungosta EcoRI - tai /Vofl-digestiolla (b Nukleotidien määrä kloonatun geenin, joka sisällytetään ekspressiokasettiin, STOP-kodonin jälkeen ilmaistaan. Restriktiokohdat geenin, jota käytettiin eks-. . 15 pressiokasetin konstruktiossa, 3’-alueella ilmaistaan suluissa i « « * ·· • · ··· V : Transformanttien endoglukanaasituotanto analysoitiin ravistelijoissa kasvatettavien pulloviijelmien (50 ml) viljelysupematanteista. Transformantteja kasvatettiin 7 päivän ajan kompleksisessa sellulaasin ilmentymistä indusoivas- : 20 sa väliaineessa (Joutsjoki ym. 1993), joka oli puskuroitu 5-prosenttisella :***; Kh^PCMIa pH:ssa 5,5. Rekombinantin proteiinin entsyymiaktiivisuus mitattiin ·*♦ viljelysupematantista pelkistettyjen sokerien vapautumisena karboksimetyyli-selluloosasta (2 % CMC) 50 °C:ssa 50 mM sitraattipuskurissa pH:ssa 4,8 • · · oleellisesti kuten kuvataan julkaisuissa Bailey, M. J. ja Nevalainen, K. M. H., *Γ* 25 1981; Haakana, H., ym., 2004. Rekombinantin proteiinin tuotanto detektoitiin • ♦ v myös viljelysupematantista SDS-polyakryyliamidigeelielektroforeesilla. EG_40- :]]]: spesifiset polyklonaaliset vasta-aineet tuotettiin kaneissa (Helsingin yliopisto, •v, Suomi). EG_40-sellulaasin ekspressio todennettiin Westem-blottausanalyysilla • · ‘ anti-EG_40-vasta-aineilla käyttäen ProtoBlot Western blot AP -systeemiä (Pro- • ♦ 28 119325 mega). Valittujen transformanttien genotyypit analysoitiin Southem-blottauk-sella käyttäen ekspressiokasettia koettimena.At EG_40_like pALK1921 8.6 kb EcoRI 282 bp (Sspl) (a) The expression cassette for T. reesei transformation was isolated from the vector backbone by Eco RI or / Vof1 digestion (b Nucleotides after the STOP codon of the cloned gene included in the expression cassette. used in the ex 15 constructs of the press cassette, in the 3 'region is indicated in brackets i «« * ·· • · ··· V: The endoglucanase production of transformants was analyzed from culture supernatants of flask flasks (50 ml) grown in shakers for 7 days in complex cellulase expression. - in 20 media (Joutsjoki et al. 1993) buffered with 5%: ***; H 2 O PCMI at pH 5.5 The enzymatic activity of the recombinant protein was measured by the release of reduced sugars from the culture supernatant from carboxymethyl cellulose (2%). CMC) at 50 ° C in 50 mM citrate buffer pH 4.8 · · · substantially k uten are described in Bailey, M. J. and Nevalainen, K. M. H., * Γ * 1981; Haakana, H., et al., 2004. Recombinant protein production was also detected from culture supernatant by SDS-polyacrylamide gel electrophoresis. EG_40-:]]]: specific polyclonal antibodies were produced in rabbits (University of Helsinki, • v, Finland). EG_40 cellulase expression was verified by Westem blot analysis with anti-EG_40 antibodies using the ProtoBlot Western blot AP system (Pro-♦ 28 119325 mega). Genotypes of selected transformants were analyzed by Southem blotting using an expression cassette as a probe.

Heterologisesti tuotettujen EG_40/Cel45A ja EG_40_like/Cel45B-sellulaasien pH-optimi määritettiin universaalissa Mcllvainen puskurissa pH-5 välillä 4,0 - 8,0 käyttäen CMC:aa substraattina. Kuten osoitetaan kuvassa 2A, EG_40/Cel45A-sellulaasin pH-väli on suhteellisen leveä (4,5 - 6,0), optimin ollessa pH 5,5. EG_40_like/Cel45B:n pH-optimin määritettiin olevan pH 5,0 - 5,5. Optimilämpötilan EG_40/Cel45A- ja EG_40_like/Cel45B-sellulaasien entsyymiaktiivisuudelle määritettiin olevan 75 - 80 °C ja 60 °C mainitussa järjestyk-10 sessä (Kuva 2B). Heterologisesti tuotetun EG_40/Cel45A-sellulaasin terminen stabiilius on verrattavissa puhdistetun proteiinin stabiiliuuteen.The pH optimum of the heterologously produced EG_40 / Cel45A and EG_40_like / Cel45B cellulases was determined in Universal Mcllvane buffer pH-5 between 4.0 and 8.0 using CMC as substrate. As shown in Figure 2A, the pH range of EG_40 / Cel45A cellulase is relatively wide (4.5 to 6.0) with optimum pH 5.5. The pH optimum of EG_40_like / Cel45B was determined to be pH 5.0-5.5. The optimum temperature for the enzyme activity of EG_40 / Cel45A and EG_40_like / Cel45B cellulases was determined to be 75-80 ° C and 60 ° C in said order (Figure 2B). The thermal stability of the heterologously produced EG_40 / Cel45A cellulase is comparable to that of the purified protein.

Valittuja transformantteja RF6118 (At EG_40) ja RF6071 (At EG_40_like) viljeltiin 2-litran bioreaktorissa neljän päivän ajan (28 °C, pH 4,2), materiaalin saamiseksi sovellustesteihin (katso esimerkit 7-10).Selected transformants RF6118 (At EG_40) and RF6071 (At EG_40_like) were cultured in a 2-liter bioreactor for four days (28 ° C, pH 4.2) to obtain material for application tests (see Examples 7-10).

15 Esimerkki 5. Acremonium thermophilumin ALK04245:n EG_40-sellu-laasien, joista puuttuu selluloosaa sitova domeeni tai selluloosaa sitova domeeni ynnä liitosalue, tuotantoExample 5. Production of EG_40 cellulases of Acremonium thermophilum ALK04245 lacking a cellulose binding domain or a cellulose binding domain and a junction region

Acremonium thermophilumin ALK04245:n EG_40-sellulaasien, joista puuttuu selluloosaa sitova domeeni (CBD), At cel45A_CBDIess, tai CBD yn-20 nä liitosalue, At cel45A_linkerCBDIess, tuottamiseksi tehdään kaksi ce/45A-deleetiokonstruktia; ensimmäisestä puuttuu alue, joka koodittaa CBD:a ja toi- .·:*! sesta lisäksi puuttuu liitosalue katalyyttisen ytimen ja selluloosaa sitovan do- * · * meenin välillä.Two ce / 45A deletion constructs are made to produce EG_40 cellulases of Acremonium thermophilum ALK04245 lacking the cellulose binding domain (CBD), At cel45A_CBDIess, or CBD yn-20 junction region, At cel45A_linkerCBDIess; the former lacks the area encoding the CBD and the function ·: *! it also lacks a linking region between the catalytic core and the cellulose binding domain.

• · · .*“ Molekyylibiologian perusmenetelmiä käytetään, kuten kuvataan esi- • · · ;,:t: 25 merkissä 3. ce/45A-geenin 3’-pää vahvistetaan PCR:lla. Antisense-aluke suun- ··· · nitellaan jättämään ottamatta lukuun CBD:n tai liitos+CBD-alueen tuotteesta ja PCR-tuote ligoidaan ce/45A-geenin 5’-fragmenttiin täyspitkien geenien muodostamiseksi uudelleen (sekvenssit nro 16 ja 18 mainitussa järjestyksessä). :V: Ekspressioplasmideja A. thermophilumin EG_40/Cel45A-sellulaasin CBDIess- :***: 30 ja linkerCBDIess-versioiden tuotantoon konstruoidaan ja rekombinantit proteii- nit (sekvenssit nro 17 ja 19 mainitussa järjestyksessä) tuotetaan Trichoder- *„;* massa, kuten kuvataan esimerkissä 4.• · ·. * “Basic methods of molecular biology are used as described in the precursors: 25 at 3. The 3 'end of the ce / 45A gene is confirmed by PCR. The antisense primer is designed to exclude a CBD or splice + CBD region product and the PCR product is ligated to the 5 'fragment of the ce / 45A gene to rebuild full-length genes (SEQ ID NOs: 16 and 18, respectively). . : V: The expression plasmids for the production of A. thermophilum EG_40 / Cel45A cellulase CBDIess: ***: 30 and linkerCBDIess variants are constructed and recombinant proteins (SEQ ID NOs: 17 and 19, respectively) are produced in Trichoderase *, such as is described in Example 4.

• · • · M» ·» Φ · * • · • · • · 29 119325• · • · M »·» Φ · * • · • • • • 29 119325

Esimerkki 6. Rekombinantin Acremonium thermophilum ALK04245:n EG_40_like+CBD-fuusioproteiinin tuotantoExample 6. Production of recombinant Acremonium thermophilum ALK04245 EG_40_like + CBD fusion protein

Rekombinantin Acremonium thermophilum ALK04245:n EG_40_like+CBD-fuusioproteiinin (sekvenssi nro 21) tuottamiseksi 5 EG_40/Cel45A-sellulaasin selluloosaa sitova domeeni (CBD) liitetään EG_40Jike-sel Iulaasiin. Konstrukti sisältää EG_40_liken katalyyttisen domee-nin (täyspitkän polypeptidin aminohapot 1 - 242) liitettynä EG_40-sellulaasin liitosalueeseen ja CBD:hen (täyspitkän polypeptidin aminohapot 235 - 297).To produce the EG_40_like + CBD fusion protein of recombinant Acremonium thermophilum ALK04245 (SEQ ID NO: 21), the cellulose binding domain (CBD) of EG_40 / Cel45A cellulase is ligated to EG_40Jike-seluase. The construct contains the catalytic domain of EG_40_like (amino acids 1-242 of the full length polypeptide) linked to the EG_40 cellulase junction region and CBD (amino acids 235-297 of the full length polypeptide).

Molekyylibiologian perusmenetelmiä käytetään, kuten kuvataan 10 esimerkissä 3. Ensin ainutlaatuinen A/rul-restriktiokohta lähellä EG_40_like-sekvenssin C-terminaalista päätä tuodaan PCR:lla. Tämä mahdollistaa minkä tahansa tylppäpäisen DNA:n suoran fuusion EG_40_like-polypeptidin aminohapon S242 jälkeen. EG_40:tä koodittavan geenin (ce/45A) liitos+CBD-alue vahvistettiin PCR:lla ja sen restriktiofragmentti ligoidaan ce/45B-geeniin 15 (S242:n jälkeen) At ce/45B_ce/45AliitosCBD:n (sekvenssi nro 20) luomiseksi.Basic molecular biology techniques are used as described in Example 3. First, a unique A / rul restriction site near the C-terminal end of the EG_40_like sequence is introduced by PCR. This allows direct fusion of any blunt-ended DNA after the amino acid S242 of the EG_40_like polypeptide. The + CBD region of the EG_40 coding gene (ce / 45A) was confirmed by PCR and its restriction fragment was ligated into the ce / 45B gene 15 (after S242) to generate At ce / 45B_ce / 45A splice CBD (SEQ ID NO: 20).

Ekspressioplasmidi EG_40_likeCBD-sellulaasin tuotantoon konstruoidaan ja rekombinantti proteiini (sekvenssi nro 21) tuotetaan Trichodermassa, kuten kuvataan esimerkissä 4.The expression plasmid EG_40_likeCBD for cellulase production is constructed and the recombinant protein (SEQ ID NO: 21) is produced in Trichoderma as described in Example 4.

Esimerkki 7. EG_40-sellulaasivalmisteen teho denimin viimeistelyssä eri 20 lämpötiloissaExample 7. Efficacy of EG_40 cellulase preparation in denim finishing at various temperatures

Acremonium thermophilumin EG_40-sellulaasia kannasta RF6118, • · joka tuotettiin käyttäen Trichoderma reeseitä isäntänä, kuten kuvataan esimer- . ,·. kissa 4, testattiin sen kyvyn suhteen luoda samanlainen kulunut ulkonäkö, joka • « · ' :**.·, hankitaan hohkakivillä denimin kivipesussa eri lämpötiloissa. Kaupallista • · · |‘V 25 EGII-rikastettua valmistetta, joka tuotettiin käyttäen Trichodermaa isäntänä V.: (US 5 874 293) ja joka on tehokas denimin viimeistelyssä, käytettiin vertai- *·*·* luun 50 °C:ssa.Acremonium thermophilum EG_40 cellulase from strain RF6118, produced using Trichoderma reese as host, as described in Ex. ·. cat 4, was tested for its ability to create a similar worn appearance that • «· ': **. ·, obtained by pumice stone washing in denim at different temperatures. A commercial V 25 EGII-enriched preparation produced using Trichoderma as host V .: (US 5,874,293), which is effective in denim finishing, was used for comparative bone at 50 ° C.

Indigo-värjätystä denim-twillistä tehtyjä farkkuja käytettiin testimate- • » v.: naalina liisterin poiston ECOSTONE A200-alfa-amylaasilla jälkeen. Sellulaasi- 30 käsittelyt suoritettiin Electroluxin Wascator FOM 71 CLS -pesulakoneella tau-lukossa 7 kuvatuissa olosuhteissa.Jeans made from Indigo-stained denim twill were used as a test mockup after removal of the adhesive with ECOSTONE A200 alpha-amylase. Cellulase treatments were performed on an Electrolux Wascator FOM 71 CLS washing machine under the conditions described in Table 7.

• · · 'V' EGII-rikastettua stabiloitua entsyymikonsentraattia annosteltiin V* 0,23 %:na kankaan painosta, joka on tyypillinen annos valmisteelle teollisissa : V sovelluksissa. Väkevöity ja stabiloitu EG_40-valmiste, joka saatiin pilottifer- *:**: 35 mentaatiosta, annosteltiin 0,18 %:na. Kun lasketaan [proteiinina] proteiinipitoi- 30 119325 suuden suhteen, annokset olivat noin 0,20 mg ja 0,035 mg grammaa kangasta kohti käyttäen Bio-Rad Protein Assay Dye Reagentia (BioRad, Hercules, CA, USA) ja naudan gammaglobuliinia standardina. Sellulaasientsyymi inaktivoitiin vedenpoiston jälkeen nostamalla pH yli 11:n 5 g:n NaOH:a lisäyksen kautta 5 (10 min, 40 °C) ja huuhtelemalla kolme kertaa. Farkut kuivattiin kuivausrum-mussa.• '·' V 'EGII-enriched stabilized enzyme concentrate was dosed at V * 0.23% by weight of fabric, a typical dose formulation for industrial: V applications. The concentrated and stabilized EG_40 preparation obtained from pilot *: **: 35 mentions was dosed at 0.18%. When calculated as [protein] relative to the protein content, the doses were about 0.20 mg and 0.035 mg per gram of fabric using Bio-Rad Protein Assay Dye Reagent (BioRad, Hercules, CA, USA) and bovine gamma globulin as standard. After dehydration, the cellulase enzyme was inactivated by raising the pH above 11 with 5 g of NaOH by the addition of 5 (10 min, 40 ° C) and rinsing three times. The jeans were dried in a tumble dryer.

Biokivipesuvaikutus/hankaustaso arvioitiin mittaamalla väri heijas-tussuhdearvoina Minolta CM 2500-spektrofotometrillä käyttäen L*a*b*-väriava-ruuskoordinaatteja (valolaji D65/2°). Väri denimin oikealta ja nurjalta puolelta 10 mitattiin liisterin poiston jälkeen (ts. ennen sellulaasikäsittelyä) ja sellulaasikä-sittelyn jälkeen. Kukin mittausarvo denimin oikealta puolelta oli likimäärin 40 mittauksen keskiarvo. Kaksi paria farkkuja käytettiin kussakin testissä ja lopullinen tulos oli niiden keskiarvo. Tulokset osoitetaan taulukoissa 8 ja kuvassa 3.The bio-stone wash effect / abrasion level was evaluated by measuring the color reflectance values on a Minolta CM 2500 spectrophotometer using L * a * b * color space coordinates (light type D65 / 2 °). The color of the right and wrong sides of the denim 10 was measured after the removal of the adhesive (i.e. before the cellulase treatment) and after the cellulase treatment. Each measured value on the right side of the denim was approximately the average of 40 measurements. Two pairs of jeans were used in each test and the final result was their mean. The results are shown in Tables 8 and Figure 3.

Taulukko 7. Sellulaasikäsittelyissä käytetyt testiolosuhteet/prosessi-15 parametritTable 7. Test Conditions / Process-15 Parameters Used for Cellulase Treatments

Prosessiparametri__Prosessiparametri__

Denim-kuorma__1,3-1,4 kg_Denim load__1.3-1.4 kg_

Vesi__19 litraa_ pH-kontrolli (pH 5-5,3)__5 ml etikkahappoa (80 %)_ . , Aika__45 min_ Lämpötila__40, 50,60 tai 70 °C_ *·*/ Sellulaasiannos_I 0,18 % tai 0,23 % kankaan painosta • t · • * · ··· • · • · · • · · IM · • · • · · • · ·Water 19 liters_ pH control (pH 5-5.3) __ 5 ml acetic acid (80%) _. , Time__45 min_ Temperature__40, 50.60 or 70 ° C_ * · * / Cellulose Dose_I 0.18% or 0.23% by weight of fabric • · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · ·

Ml · IM • · • * " · · · • * • · « • · · • · ·** • · • ·Ml · IM • • • * “· · · • • • • • • • • • • • • ••••

Ml • * • · · * · · • · • · • · * * « · » »Ml • * • · · * · • • • • • * * «·» »

M IM I

• I · • * • · «e··· • · 31 119325 _c 0 Ϊ» in *• I · • * • · «e ··· • · 31 119325 _c 0 Ϊ» in *

C:ff 3*00)0« -QC: ff 3 * 00) 0 «-Q

*’ -S “ «H - t. + —I := s q T- » m - -------^ φ jjj £ tD t (Ο O “ ~ to N. « cm « c •IS r-" to" to' N·' N·' g ^ c -O T V T -7 r φ |S φ------i 8 ui c a "5 :re oo to o to o I « % *J 8 5 £ 3 Ei -9.* '-S "« H - t. + —I: = sq T- »m - ------- ^ φ jjj £ tD t {Ο O" ~ to N. «cm« c • IS r- "to 'to' N · 'N ·' g ^ c -OTVT -7 r φ | S φ ------ i 8 ui ca" 5: re oo to o to o I «% * J 8 5 £ 3 No -9.

I -------g =5 35 = *2 N t O CM tO ^ c ra in in -M- cm ο 2 ϋ 3 4 m" in in in -m-" > O — * T- T- T— 1— 1— S M JO I I I I I Q) * * ,«------.8I ------- g = 5 35 = * 2 N t O CM tO ^ c ra in in -M- cm ο 2 ϋ 3 4 m "in in -m-"> O - * T- T - T— 1—1— SM JO IIIIIQ) * *, «------. 8

C > TOC> TO

IS e φ PIS e φ P

S φ ΐ< -rj- oo »— o « = ~ C yj CM 00 CM, O T-_ * ° C :(8 * CM T- N CM CM —1 C UJjd J CM CM CM CM CM · —_______to _ w S It tf\ Έ aS φ ΐ <-rj- oo »- o« = ~ C yj CM 00 CM, O T-_ * ° C: {8 * CM T- N CM CM —1 C UJjd J CM CM CM CM CM · —_______ to _ w S It tf \ Έ a

r Or O

Φ AΦ A

I % CI% C

>» E 10 = =2 0 ooooo § φ -Jo in s to m ^ ^ !2 5 .·.: ^ - = £ \ ·: $ .E -* g .*:·. w ö ο) η λ m in m _ * . £ 2 g) |8 cm o o o o g ::: s o. c σ ooooo φ ... ·ο-------% ::: E -2> »E 10 = = 2 0 ooooo § φ -Jo in s to m ^ ^! 2 5. ·.: ^ - = £ \ ·: $ .E - * g. *: ·. w ö ο) η λ m in m _ *. £ 2 g) | 8 cm o o o o g ::: s o. c σ ooooo φ ... · ο -------% ::: E -2

=2 w V J= 2 w V J

• · · *r 0 < m• · · * r 0 <m

© c o s ® ® ® ® I© c o s ® ® ® ® I

*..·* s ^ SS o' o o' o' o' ·;= φ-------= φ to V> s ® ® ® ® > • · · “ >1 ' ' ^ ffl ... e tO t— t— t— t— ·* C <0 CD CD CD (Ο π (0 -fc= LL U_ LL LL -g *...* > = CU {£. CU CC & %, £ C c c c t i* .. · * s ^ SS o 'oo' o 'o' ·; = φ ------- = φ to V> s ® ® ® ®> • · · "> 1 '' ^ ffl ... . e tO t— t— t— t— · * C <0 CD CD CD {Ο π (0 -fc = LL U_LL LL -g * ... *> = CU {£. CU CC &%, £ C cccti

:.: ο I ^ s is s 15 .e i I:.: ο I ^ s is s 15 .e i I

: : iuE 2ccccSc5a T triS ΐίΦωΦΦ^Μη :·:·. o i ssssssS3 : ·: si siiiiits *:**: 3 >* Yoooo Ec~ re c 000(50^¾ I— LU 111 lii LU Lli 111 CO^io 119325 32:: iuE 2ccccSc5a T triS ΐίΦωΦΦ ^ Μη: ·: ·. o i ssssssS3: ·: si siiiiits *: **: 3> * Yoooo Ec ~ re c 000 {50 ^ ¾ I— LU 111 lii LU Lli 111 CO ^ io 119325 32

Tulokset taulukossa 8 ja kuvassa 3 osoittavat, että EG_40:n kivi-pesuvaikutus oli erittäin hyvä matalalla annosvälillä. Kannalla RF6118 samanlainen hankaustaso (vaaleus L1 2) verrattuna EGII-rikastettuun valmisteeseen saatiin 50 °C:ssa 6 kertaa matalammalla määrällä proteiinia.The results in Table 8 and Figure 3 show that the stone-washing effect of EG_40 was very good at a low dose interval. For strain RF6118, a similar level of abrasion (brightness L12) was obtained at 50 ° C with a 6-fold lower protein content compared to the EGII-enriched preparation.

5 Esimerkki 8. EGII-rikastetun entsyymivalmisteen pesutehon tehostaminen EG_40-sellulaasilla denimin viimeistelyssä EGII-rikastettu valmiste tehostettiin EG_40-valmisteella (kuten esimerkissä 7) ja tehostettua valmistetta verrattiin EGII-rikastettuun valmisteeseen denimin biokivipesussa. Denim ja testisysteemi biokivipesulle olivat esi-10 merkin 7 kaltaiset lukuun ottamatta lämpötilaa, joka oli 50 °C. Myös sellulaasi-käsittelyn vaikutus arvioitiin kuten esimerkissä 7. Entsyymivalmisteet annosteltiin 3-5 grammana, mikä johti 0,22 - 0,38 %:iin kankaan painosta (taulukko 9).Example 8. Enhancement of the Washing Effect of EGII-Enzyme Enzyme Preparation on EG_40 Cellulase in Denim Enhancement The EGII-enriched preparation was enhanced with EG_40 (as in Example 7) and the enhanced preparation was compared to EGII-enriched preparation in denim biofilm washing. The denim and the test system for biofuel washing were similar to the pre-10 brands 7 except at 50 ° C. The effect of the cellulase treatment was also evaluated as in Example 7. Enzyme preparations were dosed at 3-5 grams, resulting in 0.22-0.38% fabric weight (Table 9).

Tulokset taulukossa 9 ja kuvassa 4 osoittavat, että EG_40:tä voidaan myös käyttää EGII-rikastetun valmisteen hankausvaikutuksen parantami-15 seksi. EGII-rikastetulla valmisteella yksinään samanlaisia vaaleustasoja kuin ne, jotka saadaan seoksella, joka sisältää 70 % EGII-rikastettua konsentraattia ja 30 % EG_40-sellulaasikonsentraattia, ei voitu saada edes lisätyllä annoksella.The results in Table 9 and Figure 4 show that EG_40 can also be used to improve the abrasion effect of an EGII-enriched preparation. The EGII-enriched preparation alone had similar levels of brightness to those obtained with a mixture of 70% EGII-enriched concentrate and 30% EG_40 cellulase concentrate, even with the added dose.

• · • · · ·· • · • · · • · 1 • t · * * 1 1 • · · * · · • · • · · • · · • ·· · • · • 1 1 • · · *·» · • · • · * · • · · • 1 • · · • · · • · ··♦ • · • · ··· • · • · 1 • · · • · • · · · • · »·· ♦ 2 « • 1 1 • · • · 33 119325· · · · 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 »• · * * 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 ♦ 2 «• 1 1 • · • · 33 119325

I Γί I I I I II Γί I I I I I

φ Φ ^ 3φ Φ ^ 3

φ — ΤΑ TO :φ P s '•", JSφ - ΤΑ TO: φ P s '•', JS

Jc ra (λ t ®. o * 3 > = O) S r O) B ------Jc ra (λ t ®. O * 3> = O) S r O) B ------.

•M• M

ε pε p

« H«H

.3 >> !5 οκ o id ifl > 3 m cd tj- m ε '£ 1 i'-* N·’ Is-' ® <2 T- T- «- t-.3 >>! 5 οκ o id ifl> 3 m cd tj- m ε '£ 1 i' - * N · 'Is-' ® <2 T- T- «- t-

~ :(9 β I I I I~: {9 β I I I I

O ^_____ 3 := a 8s.O ^ _____ 3: = a 8s.

C (0 cC (0 c

5 3 m CM 00 T- CO5 3 m CM 00 T- CO

Φ = _2 h- o co o ~ ,5 5 1, r" Ο (Ί* CM1 0 CO :2, —I co co co co c ------Φ = _2 h- o co o ~, 5 5 1, r «Ο {Ί * CM1 0 CO: 2, —I co co co co - ------

•MW• MW

ε a^w e « .A N N CO M- ^ to τ(· ίο in s C {§ uo in in uiε a ^ w e «.A N N CO M- ^ to τ {· ίο in s C {§ uo in in ui

s 3 ~ Λ Y V V Ts 3 ~ Λ Y V V T

Φ — -O_____ .-ts φ :ra 3 to w .> c !5 e φ 3 * φ C cm M1 o co 2 ra c φ co cm cm t- w Φ 111 iS ll ^ CM1 cm' cm" 2 1 s j= vg Φ n as ^ . . >10 c • · · 1 o —· o *·" 2 C V· 03 CO CO CM *Φ - -O _____.-Ts φ: ra 3 to w.> C! 5 e φ 3 * φ C cm M1 o co 2 ra c φ co cm cm t- w Φ 111 iS ll ^ CM1 cm 'cm "2 1 sj = vg Φ n as ^..> 10 c • · · 1 o - · o * · „2 CV · 03 CO CO CM *

··· C 5 CO CM CO CM _Q··· C 5 CO CM CO CM _Q

: ©' < δ © o o o +: © '<δ © o o o +

Ul « ·.:.1 ra c . . “· O» 3 ::: ra 3 :.:: = <0 <0 • · 3 0 r • · · *a f ϊΐ\Ul «·.:. 1 ra c. . “· O» 3 ::: ra 3:. :: = <0 <0 • · 3 0 r • · · * a f ϊΐ \

• · 1 β> 5 ^ S• · 1 β> 5 ^ S

... · 3* g co, c :1": |Sc ^ uo co rr co c *..·* :(Q------- tn v :5 --0--° c T C 0^0^ 0 ·· 7K to jg o O ♦ : : : 2 £ 11««·? :***: m 3 c £ äS äS § » 3 $ $ o o ra 2... · 3 * g co, c: 1 ": | Sc ^ uo co rr co c * .. · *: (Q ------- tn v: 5 --0-- ° c TC 0 ^ 0 ^ 0 ·· 7K to jg o O ♦::: 2 £ 11 «« ·?: ***: m 3 c £ äS äS § »3 $ $ oo ra 2

·*·*· 9 φ 2 5 S n N fi I· * · * · 9 φ 2 5 S n N fi I

... O(0'= jc jc o Ö C 5 • * «ora E 33®ä>'rä« • ®> v 5 iö.ffiooCo)... O (0 '= jc jc o Ö C 5 • * «ora E 33®ä>' rä« • ®> v 5 iö.ffiooCo)

"··· o = '1 IS IS Jn Tn ® TO'··· o =' 1 IS IS Jn Tn ® TO

:.· jc o c ra ra o o ro c 3 « JT = = = = 3^ ra E c O ϋ O O ili H 3 IXl UJ UJ Ui LU TO -Ω 119325 34:. · Jc o c ra ra o o ro c 3 «JT = = = = 3 ^ ra E c O ϋ O O ili H 3 IXl UJ UJ Ui LU TO -Ω 119325 34

Esimerkki 9. EG_40_like-sellulaasivalmisteen teho denimin viimeistelyssäExample 9. Efficacy of EG_40_like cellulase preparation in denim finishing

Trichoderma reeseitä isäntänä käyttäen, kuten kuvataan esimerkissä 4, tuotettua EG_40_like-fermentaationestettä kannasta RF6071 verrattiin 5 EGII-rikastettuun konsentraattiin denimin biokivipesussa. Denim ja testisys-teemi biokivipesulle olivat esimerkin 7 kaltaiset lukuun ottamatta lämpötilaa, joka oli 60 °C, ja denimin määrää, joka tasoitettiin 1430 g:ksi lisäpalalla erilaista denimiä, jota ei sisällytetty mittauksiin. Myös sellulaasikäsittelyn vaikutus arvioitiin kuten esimerkissä 7.The EG_40_like fermentation fluid produced from Trichoderma reese as a host as described in Example 4 was compared to 5 EGII-enriched concentrates in denim biofilm washing. The denim and the test system for biofuel washing were similar to Example 7 except for the temperature of 60 ° C and the amount of denim equalized to 1430 g with an additional piece of denim not included in the measurements. The effect of the cellulase treatment was also evaluated as in Example 7.

10 Tulokset taulukossa 10 osoittavat, että EG_40_liken hankaustaso saatiin vähemmällä takaislnvärjäytymisellä (indigovärin uudelleenkerrostumi-sella) denimin nurjalle puolelle. Erityisesti taskujen vaaleus oli korkeampi ja ne olivat vähemmän sinisiä.The results in Table 10 show that the abrasion level of EG_40_like was obtained with less back dyeing (indigo dye repainting) on the wrong side of the denim. In particular, the pockets had a higher brightness and were less blue.

• i • · · • · · • · • · · • · · • · · • · · • * · ···• i · · · · · · · · · · ···················································

• I• I

• · · • » » f • Φ • · · • * ·• · · • »» f • Φ • · · * *

Ml · • · · • · • · • •f • · • · · • · · • · ··* • · • · • · · * · • · · I I I • ·Ml · • • • • • • • • • • • • • • I I I • •

Ml • · • · «M 1 • · · • · · • « • · 35 119325 ' c £ ® 40 c > w c — .® 5 *g i ° CO i Y Y °. °° ® + B « v v y t t 9 * ® c § , i S- 1j cm wMl • · • · «M 1 • · · • · · •« • · 35 119325 'c £ ® 40 c> w c - .® 5 * g i ° CO i Y Y °. °° ® + B «v v y t t 9 * ® c §, i S- 1j cm w

C JS _ |A OO) «CMCC JS _ | A OO) «CMC

« TK co 3 “> 9. ® cm" g ξ* -S nT nT Y ^ 9 T i C w (0 C c —* > o c TE CD O) O) 00 O »- S £ COCO CON. CM a 1] ö "7 . N-' νΓ t—" T-" CO CO" ' X (/) V ^ t- r- r- ^ T- "«TK co 3«> 9. ® cm «g ξ * -S nT nT Y ^ 9 T i C w (0 C c - *> oc TE CD O) O) 00 O» - S £ COCO CON. CM a 1] ö "7. N- 'νΓ t— "T-" CO CO "' X (/) V ^ t- r- r- ^ T-"

5 :(Q pQ I I ii I I CD5: {Q pQ I I ii I I CD

C ‘35 0 CO <0 _ -2C '35 0 CO <0 _ -2

0) CO c CO0) CO c CO

ii 5 S σ>σ> -m- ro T- 5 Ö = S oo h- cm co ^ > fm 0) 3 ^ r- h** CD ^ 9: .£ (/) :55, j η η ττ coo® c ----------.£2 .= eg C tr Φ -- O CO = T3 (A CM CM tJ- N- 00 ΙΛ » c % , <o'«o n. ®- Ύ ®- -1 I· 1 SsYY ^ dii 5 S σ> σ> -m- ro T- 5 Ö = S oo h- cm co ^> fm 0) 3 ^ r- h ** CD ^ 9:. £ (/): 55, j η η ττ coo® c ----------. £ 2. = eg C tr Φ - O CO = T3 {A CM CM tJ- N- 00 ΙΛ »c%, <o '« o n. ® - Ύ ®— -1 I · 1 SsYY ^ d

φ ~ Dφ ~ D

** φ :(0 D** φ: (0 D

W ® >* SW ®> * S

:<S c Φ 5 : * Φ C 00¾ CM CM CO m ·. ·: W C '5 N. CO CM CO Tt o > ... = C :<0 * CO CO CD 05 If) CO r- ::: ® uj ,* j cm cm o- m- h- h- ~ . ® ¢3 *.:.* Ξ .2 c % • · Js c « Ώ • * · (Q IHP ^ ·*: <S c Φ 5: * Φ C 00¾ CM CM CO m ·. ·: WC '5 N. CO CM CO Tt o> ... = C: <0 * CO CO CD 05 If) CO r- ::: ® uj, * j cm cm o- m- h- h- ~ . ® ¢ 3 *.:. * Ξ .2 c% • · Js c «Ώ • * · {Q IHP ^ · *

··· : > '$ O) « if) ΙΛ If) CO···:> '$ O) «if) ΙΛ If) CO

:.·. φ CM O) CM O) CM O) = :.: : 3 2 ® g n q « o co o ® ... =. Q.eraoooooo-« « · I \Ti % ^ -g Ö* 2 ^ 03 ^O) ^ O) 5 m c 8 « 8 9 § 9 i5 ·· (0 % T- T- T— 1“ T— T- "5 •«« (0 __________-¾ : : m ® ··· ii T- T- T- (0 • y ω N. N- N. co:. ·. φ CM O) CM O) CM O) =:.:: 3 2 ® g n q «o co o ® ... =. Q.eraoooooo- «« · I \ Ti% ^ -g Ö * 2 ^ 03 ^ O) ^ O) 5 mc 8 «8 9 § 9 i5 ·· (0% T- T- T— 1« T— T - "5 •« «{0 __________- ¾:: m ® ··· ii T- T- T- {0 • y ω N. N- N. co

.*.*. 0 £ O O O. *. *. 0 £ O O O

... O (/) CO CD CO C... O (/) CO CD CO C

* * CD = LL U_ LL — • · . E CC 3 Qio 0£ 3 ...* o = .. . β .. ts . ¢3 ej* * CD = LL U_ LL - • ·. E CC 3 Qio 0 £ 3 ... * o = ... β .. ts. ¢ 3 ej

— tiS = ® ω = φ ω φ ω UJ- tiS = ® ω = φ ω φ ω UJ

:*.*. o gj Έ §~®§=® ^ w =co • .V S fc ! “ O 3 — (5 .. CD 5s: *. *. o gj Έ § ~ ®§ = ® ^ w = co • .V S fc! "O 3 - (5 .. CD 5s

Ji 3 c _0~ αθ~3θ^ ®C0 ····*: = 1 S i « 'ί, I 5 I £ ? ®i = ^(ίϋ3(5ϋβϋθΦ^ l-E lii OLUlUZLLILUI-UJlU^rt 36 119325Ji 3 c _0 ~ αθ ~ 3θ ^ ®C0 ···· *: = 1 S i «'ί, I 5 I £? ®i = ^ {ίϋ3 (5ϋβϋθΦ ^ l-E lii OLUlUZLLILUI-UJlU ^ rt 36 119325

Esimerkki 10. EG_40:n ja EG_40:llä tehostetun EGII-rikastetun valmisteen teho bioviimeistelyssä (nyppyyntymisen estossa) Väkevöidyn RF6118 EG_40-valmisteen kykyä ja EG_40.llä tehostetun EGII-rikastetun valmisteen kykyä puuvillaisten neulevaatteiden nyppyyntymisen estossa verrattiin kaupalliseen EGII-rikastettuun valmisteeseen, jota tyypillisesti käytetään bioviimeistelyformulaatioissa. Sellulaasikäsittelyt suoritettiin Electroluxin Wascator FOM 71 CLS -pesulakoneella taulukossa 11 kuvatuissa olosuhteissa.Example 10. Efficacy of EG_40 and EG_40 Enhanced EGII Enriched Preparation in Biofinishing (Anti-Peeling) used in bio finishing formulations. Cellulase treatments were performed on an Electrolux Wascator FOM 71 CLS washing machine under the conditions described in Table 11.

Matalan laadun sinisten poolokauluksisten neulepaitojen, joilla oli nukkainen pinta, kahdenlaisia palasia, jotka oli tehty 100 % jersey-pohjaisesta puuvillakankaasta tai resorista, joka oli tehty 95 % puuvillaa ja 5 % elastaania, käytettiin testimateriaalina täytemateriaalin kanssa. Näytteitä ensin esipestiin 10 minuutin ajan 60 °C:ssa 1 ml/l surfaktantteja/kostutusaineita kanssa (San-doclean PCJ Sandos and Imacol CN.Itä Clariantista) ja huuhdeltiin 3 kertaa. Tämän jälkeen puuvillaneuleita käsiteltiin sellulaasilla 60 °C:ssa 60 minuutin ajan samojen tekstiiliapuaineiden, joita käytettiin esipesussa, ollessa läsnä. Entsyymi inaktivoitiin kuten kuvataan esimerkissä 7 lukuun ottamatta lämpötilaa, joka oli 60 °C emäksisen huuhtelun aikana, ja neulevaatteiden palasia huuhdeltiin kolme kertaa ja kuivattiin kuivausrummussa.Two types of low quality blue polo collar knit shirts with fluffy surface made of 100% jersey-based cotton fabric or elastic made from 95% cotton and 5% spandex were used as test material with padding. Samples were first pre-washed for 10 minutes at 60 ° C with 1 ml / L surfactants / wetting agents (San-doclean PCJ Sandos and Imacol CN from Clariant) and rinsed 3 times. The cotton needles were then treated with cellulase at 60 ° C for 60 minutes in the presence of the same textile auxiliaries used for prewash. The enzyme was inactivated as described in Example 7, except at a temperature of 60 ° C during alkaline rinsing, and pieces of knitwear were rinsed three times and dried in a tumble dryer.

Taulukko 11. Bioviimelstelykäslttelyissä käytetyt testiolosuhteet/proses- • · siparametrit • *Table 11. Test Conditions / Process Parameters Used in Bio-Finishing Treatments • ·

• # Μ ........IMI Il I II IW II·· III I — MH• # Μ ........ IMI Il I II IW II ·· III I - MH

]·ϊ·: Prosessiparametri__ : Kangaskuorma__1,0 kg_ : Vesi__15 litraa_] · Ϊ ·: Process Parameter__: Fabric Load__1.0 kg_: Water__15 liters_

Sandoclean PCJ and Imacol CN__1 ml/l_Sandoclean PCJ and Imacol CN__1 ml / l_

Puskuri/pH-kontrolli (pH 5-5,3)__noin 3 ml etikkahappoa (80 %)Buffer / pH control (pH 5-5.3) __ about 3 ml acetic acid (80%)

Aika 60 min • Λ ' ............................. - I m mm—Time 60 min • Λ '............................. - I m mm—

·***· Lämpötila 60 °C· *** · Temperature at 60 ° C

··· ' " ' ’""" /.e Sellulaasiannos_0,04 % - 0,63 % kankaan painosta • · ♦ • · • · · ♦ · • · ♦ ♦♦ ·· · • · · • ♦ • · ····· • · 37 119325··· '"'" "" /.e Cellulose Dose_0.04% - 0.63% by weight of fabric • ·•••••••••••••••••••••••••• ···· • · 37 119325

Selluiaasikäsittelyn vaikutus arvioitiin visuaalisesti paljaalla silmällä ja luupilla. Esipestyä näytettä Ilman entsyymiä käytettiin kontrollina. Tulokset osoitetaan taulukossa 12 ja makro-objektiivilla otetut digitaalikamerakuvat osoitetaan kuvassa 5.The effect of the cellulase treatment was assessed visually with the naked eye and magnifying glass. Prewashed sample Without enzyme was used as a control. The results are shown in Table 12 and the digital camera images taken with the macro lens are shown in Figure 5.

EG_40-valmisteella ja EG_40:llä tehostetulla EGII-rikastetulla valmisteella oli erinomaiset nyppyyntymisen esto-ominaisuudet verrattuna kaupalliseen EGII-rikastettuun valmisteeseen, jota käytettiin tälle entsyymikonsent-raatille tyypillisellä annosteluvälillä bioviimeistelysovelluksessa. EG_40-valmis-teella vähintään 8 kertaa matalampaa annosta ja EGII-rikastettu-EG_40-seok-sella vähintään 4 kertaa matalampia annoksia voitiin käyttää kuin EGII-valmis-teella, jotta saatiin samanlainen vaikutus,EG_40 and EG_40-enhanced EGII-enriched preparation had excellent anti-peeling properties compared to the commercial EGII-enriched formulation used in the typical dosing interval for this enzyme concentrate in a biofinishing application. EG_40 at least 8 times lower dose and EGII-enriched EG_40 at least 4 times lower doses than EGII to achieve similar effect,

Proteiinitasot bioreaktorin viljelysupernatanteissa ovat jonkin verran matalampia RF6118-kannalla kuin EGII-rikastetun valmisteen Trichodarma-tuottajakannalla, kun analysoidaan käytetyn proteiinin määrityskokeella. Tästä huolimatta EG_40-viljelyväliaine on tilavuuden suhteen vähintään 4-6 kertaa tehokkaampaa bioviimeistelyssä.Protein levels in bioreactor culture supernatants are somewhat lower for the RF6118 strain than for the Trichodarma producer strain of the EGII-enriched preparation when analyzed by the assay for the protein used. Nevertheless, the culture medium EG_40 is at least 4-6 times more volumetric in bio-finishing.

• t • · · • ·· * * • ·· * * * • · « · « » i » ·*· • · * ♦ * • · · ·»· · • · · • · » M* · • · · • · • · • · · • · I * · * · · • · • » · • · • · ··· • · • · · « * « • · • · * • · • · ··· ·« · « « · • · • « *··*« * · 119325 38• t • · · · * · · · M «M M M M M M M M M M M M M M M M * M M · * • * I * · * · · • • • • • • • • · · · · · · · · · · · · · · · · · · · ··· · «« · • · • «* ·· *« * · 119325 38

Taulukko 12. Bioviimeistelykäsittelyjen tulokset EG_40- ja EG_40:llä tehostetuilla EGII-rikastetuilla valmisteilla verrattuna EGII-rlkastettuun yksinään.Table 12. Results of bio-finishing treatments with EG_40- and EG_40-enhanced EGII-enriched preparations as compared to EGII-enriched alone.

Näyte Annos Annos, Nyppyyntymisen Proteiinia g % owf*’ estovaikutusb) mg/g kan- _____gasta EGII-rikastettu konsent- 6,3 0,63 +++++ 0,55 raatti_____ EGII-rikastettu konsent- 3,2 0,32 +++ 0,27 raatti_____ EGII-rikastettu+EG_40- 3,2 0,32 +++++ 0,21 seos 70 % + 13 %_____ EGII-rikastettu+EG_40- 1,6 0,16 +++++ 0,10 seos 70 % + 13 %_____ EGII-rikastettu+EG_40- 0,8 0,08 +++ 0,052 seos 70 % + 13 %_____ EG40 konsentraatti, 1,6 0,16 +++++ 0,050 RF6118_____ EG_40 konsentraatti, 0,8 0,08 +++++ 0,025 RF6118_____ ·*·,· EG_40 konsentraatti, 0,4 0,04 +++ 0,012 RF6118______ , Vain esipesty, ilman - • « * entsyymiä • · * .Sample Dose Dose, Anti-Bumping Protein g% owf * 'b) mg / g Carrier EGII-Enriched Concentrate 6.3 0.63 +++++ 0.55 Radium_____ EGII-Enriched Concentrate 3.2 0.32 +++ 0.27 carat_____ EGII enriched + EG_40- 3.2 0.32 +++++ 0.21 mixture 70% + 13% _____ EGII enriched + EG_40-1.6 0.16 ++++ + 0.10 mixture 70% + 13% _____ EGII enriched + EG_40-0.8 0.08 +++ 0.052 mixture 70% + 13% _____ EG40 concentrate, 1.6 0.16 +++++ 0.050 RF6118_____ EG_40 Concentrate, 0.8 0.08 +++++ 0.025 RF6118_____ · * ·, · EG_40 Concentrate, 0.4 0.04 +++ 0.012 RF6118______, Prewashed only, - • «* enzyme • · *.

|*V kankaan painosta ::i.: b) +++++ Erinomainen nyppyyntymisen estovaikutus, visuaalisesti erittäin siisti • e *···* pinta +++ Hyvä nyppyyntymisen estovaikutus, visuaalisesti suhteellisen siisti pinta \v - Tiheä pinnan nukkaantuminen/ ja tai vakava nyppyyntyminen • •t e · • « ·· « • ♦ • · e • · » t ··· ♦ · • ♦ e·· » M · • * · • · • · • · 39 119325| * V by weight of fabric :: i .: b) +++++ Excellent anti-peeling effect, visually very clean • e * ··· * surface +++ Good anti-peeling effect, visually relatively clean surface \ v - Dense surface peeling / and or severe nausea • • te ·••••••••••••••••••••••••••••••••••••••••••••••••• 39

Lista talletetuista organismeistaList of deposited organisms

Acremonium thermophilum ALK04245 talletettiin talletuslaitoksessa Centralbureau Voor Schimmelcultures at Upsalalaan 8, 3584 CT, Ultrecht, Alankomaat (CBS) syyskuun 20. 2004 numerolla CBS 116240.Acremonium thermophilum ALK04245 was deposited with Centralbureau Voor Schimmelcultures at Uppsalaala 8, 3584 CT, Ultrecht, The Netherlands (CBS) on September 20, 2004 under the number CBS 116240.

Escherichia coli, joka sisälsi plasmidin pALK1908, talletettiin talletuslaitoksessa Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH (DSM), Mascheroder Weg 1 b, D-38124 Braunschweig, Saksa toukokuun 13.2005 numerolla DSM 17324.Escherichia coli containing plasmid pALK1908 was deposited with the Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH (DSM), Mascheroder Weg 1b, D-38124 Braunschweig, Germany, May 13, 2005 under DSM 17324.

Escherichia coli, joka sisälsi plasmidin pALK1904, talletettiin talletuslaitoksessa Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH (DSM), Mascheroder Weg 1 b, D-38124 Braunschweig, Saksa toukokuun 13. 2005 numerolla DSM 17323.Escherichia coli containing plasmid pALK1904 was deposited with the Deutsche Sammlung von Mikroorganismen und Zellkulturen GmbH (DSM), Mascheroder Weg 1b, D-38124 Braunschweig, Germany, May 13, 2005 under DSM 17323.

• ·• ·

• « I• «I

• »· • · ··1 * « 1 • · · • · · • · · »1· • t • · · • · · *·» · • 1 • I · t · ·• »· • · · · 1 *« 1 • · · • · · · 1 »• • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • • · · · 1

Ml · • · 1 • · · • · · • » • · · • ♦ · • » ··· « · • 1 • · • «Ml · • · 1 • • • • • • • • • •••••••••••••••••••••

• I• I

• · · • · • · » • · • · ··· ·« · « · · • · • 1 40 119325• • • • • • • • • • · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · today · Article today

ViitteetReferences

Altschul SF, W Gish, W Miller, EW Myers ja DJ Lipman. 1990. Basic local alignment search tool. J. Mol. Biol. 215:403-410.Altschul SF, W Gish, W Miller, EW Myers and DJ Lipman. 1990. Basic local alignment search tool. J. Mol. Biol. 215: 403-410.

Bailey MJ ja KMH Nevalainen 1981. Induction, isolation and testing of stable Trichoderma reesei mutants with improved production of solubilizing cellulase. Enz Microbiol Technol. 3:153-157.Bailey MJ and KMH Nevalainen 1981. Induction, isolation and testing of stable Trichoderma reesei Mutants with improved production of solubilizing cellulase. Enz Microbiol Technol. 3: 153-157.

Bendtsen JD, H Nielsen, G von Heijne ja S Brunak. 2004. Improved prediction of signal peptides: SignalP 3.0. J. Mol.Biol. 340:783-795.Bendtsen JD, H Nielsen, G von Heijne and S Brunak. 2004. Improved Prediction of Signal Peptides: SignalP 3.0. J. Mol. 340: 783-795.

Gasteiger, E, A Gattiker, C Hoogland, I Ivanyi, RD Appel ja A Bai-roch. 2003. ExPASy: the proteiomics server for in-depth protein knowledge and analysis. Nucleic Acids Res. 31:3784-3788.Gasteiger, E, A Gattiker, C Hoogland, I Ivanyi, RD Appel and A Bai-Roch. 2003. ExPASy: The Proteomics Server for In-depth Protein Knowledge and Analysis. Nucleic Acids Res. 31: 3784-3788.

Gupta, R., E. Jung ja S. Brunak. 2004. Prediction of N-glycosylation sites in human proteins, Valmisteilla. www.cbs.dtu.dk/services/NetNGIyc/Gupta, R., E. Jung, and S. Brunak. 2004. Prediction of N-glycosylation Sites in Human Proteins, Under Preparation. www.cbs.dtu.dk/services/NetNGIyc/

Nierstrasz V.A. ja Warmoeskerken M.M.C.G. (2003) Process engineering and industrial enzyme applications. Kirjassa: Textile processing with enzymes. A.Cavaco-Paulo ja G.M.GObitz (toim.) Woodhead Publishing Ltd, Cambridge, s. 120-157.Nierstras V.A. and Warmoeskerken M.M.C.G. (2003) Process engineering and industrial enzyme applications. In: Textile processing with enzymes. A.Cavaco-Paulo and G.M. Gobitz (Eds.) Woodhead Publishing Ltd, Cambridge, pp. 120-157.

Haakana H, A Mlettinen-Oinonen, V Joutsjoki, A Mäntylä, P Suominen ja J Vehmaanperä. 2004. Cloning of cellulase genes from Melanocarpus albomyces and their efficient expression in Trichoderma reesei. Enz Microbiol : Technol. 34:159-167.Haakana H, A Mlettinen-Oinonen, V Joutsjoki, A Mäntylä, P Suominen and J Vehmaanperä. 2004. Cloning of cellulase genes from Melanocarpus albomyces and their efficient expression in Trichoderma reesei. Enz Microbiol: Technol. 34: 159-167.

• tt .1:*! Henrissat B. (1991) A classification of glycosyl hydrolases based on • · « amino acid sequence similarities. Biochem. J. 280:309-316.• tt .1: *! Henrissat B. (1991) A classification of glycosyl hydrolases based on • · «amino acid sequence similarities. Biochem. J. 280: 309-316.

/:/ Henrissat B. ja Bairoch A. (1993) New families in the classification • · · of glycosyl hydrolases based on amino acid sequence similarities. Biochem. J./: / Henrissat B. and Bairoch A. (1993) New families in the classification of glycosyl hydrolases based on amino acid sequence similarities. Biochem. J.

ί.ί : 293: 781-788.ί.ί: 293: 781-788.

• ··• ··

Henrissat B. ja Bairoch A. (1996). Updating the sequence-based classification of glycosyl hydrolases. Biochem. J. 316: 695-696 :V: IUPAC (International Union of Pure and Applied Chemistry) (1987).Henrissat B. and Bairoch A. (1996). Updating the sequence-based classification of glycosyl hydrolases. Biochem. J. 316: 695-696: V: IUPAC (International Union of Pure and Applied Chemistry) (1987).

:***: Measurement of cellulase activities. Pure and Appi. Chem. 59:257-268.: ***: Measurement of cellulase activities. Pure and Appl. Chem. 59: 257-268.

··« Λ Joutsjoki, W, TK Torkkeli ja KMH Nevalainen. 1993. Transforma-·· «Λ Joutsjoki, W, TK Torkkeli and KMH Nevalainen. 1993. Transforma-

’// tion of Trichoderma reesei with the Hormoconis resinae glucoamylase P'// of Trichoderma reesei with the Hormoconis resinae glucoamylase P

• · (gamP) gene: production of a heterologous glucoamylase by Trichoderma :1·1: reesei. Curr. Genet. 24:223-228.• · (gamP) gene: production of a heterologous glucoamylase by Trichoderma: 1 · 1: reesei. Curr. Genet. 24: 223-228.

• 1 41 119325• 1 41 119325

Karhunen T, A Mäntylä, KMH Nevalainen ja PL Suominen. 1993. High frequency one-step gene replacement in Trichoderma reesei. I. Endoglu-canase I overproduction. Mol. Gen. Genet. 241:515-522.Karhunen T, A Mäntylä, KMH Nevalainen and PL Suominen. 1993. High frequency single-step gene replacement in Trichoderma reesei. I. Endoglu-canase I overproduction. Mol. Gen. Genet. 241: 515-522.

Lowry OH, NJ Roseborough, AL Farr ja RJ Randall. 1951. Protein measurement with the Folin phenol reagent. J. Biol Chem 193: 265-275.Lowry OH, NJ Roseborough, AL Farr and RJ Randall. 1951. Protein measurement with the Folin phenol reagent. J. Biol Chem 193: 265-275.

Malardier L, Daboussi MJ , Julien J, Roussel F, Scazzocchio C ja Brygoo Y. 1989. Cloning of the nitrate reductase gene (niaD) of Aspergillus nidulans and its use for transformation of Fusarium oxysporum. Gene 15:147-156.Malardier L, Daboussi MJ, Julien J, Roussel F, Scazzocchio C and Brygoo Y. 1989. Cloning of the nitrate reductase gene (niaD) of Aspergillus nidulans and its use for the transformation of Fusarium oxysporum. Gene 15: 147-156.

Needleman S. ja Wunsch C. (1970) A general method applicable to the search for similarities in the amino acid sequence of two proteins. Journal of Molecular Biology 48, 443-453.Needleman, S. and Wunsch, C. (1970) A general method applicable to the search for similarities in the amino acid sequence of two proteins. Journal of Molecular Biology 48, 443-453.

Nielsen H., J. Engelbrecht, S. Brunak ja G. von Heijne. 1997. Identification of prokaryotic and eukaryotic signal peptides and prediction of their cleavage sites. Prat. Engineering 10:1-6.Nielsen H., J. Engelbrecht, S. Brunak and G. von Heijne. 1997. Identification of prokaryotic and eukaryotic signal Peptides and Prediction of their cleavage sites. Prat. Engineering 10: 1-6.

Nierstrasz V.A. and Warmoeskerken M.M.C.G. (2003) Process engineering and industrial enzyme applications. Kirjassa: Textile processing with enzymes. A.Cavaco-Paulo ja G.M.Giibitz (toim.) Woodhead Publishing Ltd, Cambridge, s.120-157.Nierstras V.A. and Warmoeskerken M.M.C.G. (2003) Process engineering and industrial enzyme applications. In: Textile processing with enzymes. A.Cavaco-Paulo and G.M.Giibitz (eds.) Woodhead Publishing Ltd, Cambridge, pp.120-157.

Paloheimo M, A Mäntylä, J Kallio ja P Suominen. 2003. High-yield production of a bacterial xylanase in the filamentous fungus Trichoderma :\i reesei requires a carrier polypeptide with an intact domain structure. Appi. Env.Paloheimo M, A Mäntylä, J Kallio and P Suominen. 2003. High-yield production of a bacterial xylanase in the filamentous fungus Trichoderma: \ i reesei requires a carrier polypeptide with an intact domain structure. Appl. Env.

Microbiol. 69:7073-7082.Microbiol. 69: 7073-7082.

. .*. Penttilä M, H Nevalainen, M Rättö, E Salminen ja J Knowles. 25 * · ' 1987. A versatile transformation system for the cellulolytic filamentous fungus • ® * "Y Trichoderma reesei. Gene 61:155-164.. . *. Penttilä M, H Nevalainen, M Rättö, E Salminen and J Knowles. 25 * · '1987. A versatile Transformation system for cellulolytic filamentous fungus • ® *' Y Trichoderma reesei. Gene 61: 155-164.

• · φ Y.: Raeder U ja P Broda. 1985. Rapid preparation of DNA from filamen- ***** tous fungi. Lett. Appi. Microbiol. 1:17-20.• · φ Y .: Raeder U and P Broda. 1985. Rapid preparation of DNA from filamen- ***** tous fungi. Lett. Appl. Microbiol. 1: 17-20.

Rice P, Longden I ja Bleasby A. (2000). EMBOSS: The European \v 30 Molecular Biology Open Software Suite. Trends in Genetics ϊ]γ 16:276-277.Rice P, Longden I and Bleasby A. (2000). EMBOSS: The European \ v 30 Molecular Biology Open Software Suite. Trends in Genetics ϊ] γ 16: 276-277.

j\\ Sambrook J, EF Fritsch ja T Maniatis. 1989. Molecular cloning, a ,*··. laboratory manual. Cold Spring Harbor Laboratory, New York, US.j \\ Sambrook J, EF Fritsch and T Maniatis. 1989. Molecular Cloning, a, * ··. laboratory manual. Cold Spring Harbor Laboratory, New York, US.

• · Y Sambrook J ja DW Russell. 2001. Molecular cloning, a laboratory ·· · : ’.*· manual. Cold Spring Harbor Laboratory, New York, US.• · Y Sambrook J and DW Russell. 2001. Molecular Cloning, a Laboratory ·· ·: '. * · Manual. Cold Spring Harbor Laboratory, New York, US.

• · 119325 42• · 119325 42

Ward M, Shan W, Dauberman J, Weiss G, Larenas E, Bower B, Rey M, Clarkson K ja Bott R. (1993) Cloning, sequence and preliminary structural analysis of a small, high pi endoglucanase (EGIII) from Trichoderma reesei. Proceedings of the second TRICEL symposium on TRICHODERMA REESEI CELLULASES AND OTHER HYDROLASES, Espoo, Suomi, 1993, toim. P. Suominen ja T. Reinikainen. Foundation for Biotechnical and Industrial Fermentation Research 8 (1993): 153-158.Ward M, Shan W, Dauberman J, Weiss G, Larenas E, Bower B, Rey M, Clarkson K, and Bott R. (1993) Cloning, sequence and preliminary structural analysis of a small, high endoglucanase (EGIII) from Trichoderma reesei . Proceedings of the Second TRICEL Symposium on TRICHODERMA REESEI CELLULASES AND OTHER HYDROLASES, Espoo, Finland, 1993, ed. P. Suominen and T. Reinikainen. Foundation for Biotechnical and Industrial Fermentation Research 8 (1993): 153-158.

* · • · » • ·· • » ·♦· • ♦ * • · · • · * • · · «·· • · • · · • · · ♦ ·· · • · • · · • · ♦ ··♦ « • · · • · • · ··· • · • · · • ♦ · • » ··♦ • * • · ·«· • · • · · • · * • · ·»« • · • · ♦ ·· ·· · ♦ · · • · • · • · 119325* • »• · ·» »♦ ♦ ♦ ♦« «« «« «· · · · ♦ • · • • • · · · ♦ ♦ ♦ ♦ ♦ ♦ ♦ ♦ ♦ ♦ ♦ ♦ ♦ ♦ ·· ·· · ♦ · · · · · · · 119325

2052060FI.ST25.txt SEQUENCE LISTING2052060EN.ST25.txt SEQUENCE LISTING

<110> AB Enzymes GmbH <120> Novel enzymes <130> 2052060FI<110> AB Enzymes GmbH <120> Novel Enzymes <130> 2052060FI

<160> 21 <170> Patentin version 3.1 <210> 1 <211> 2334<160> 21 <170> Patent Version 3.1 <210> 1 <211> 2334

<212> DNA<212> DNA

<213> Acremonium thermophilum <220> <221> misc_feature <222> C13)..C13) <223> n tarkoittaa a, t, c, tai g • · · ♦ ft* • ft «<· • · ·<213> Acremonium thermophilum <220> <221> misc_feature <222> C13) .. C13) <223> n means a, t, c, or g • · · ♦ ft * • ft «<· • · ·

• · · A(. A• · · A {. A

• <220>• <220>

:··:·: <221> CDS: ··: ·: <221> CDS

• · |*! 1 <222> (715)..(797) » » · !·' · <223> • i* • · • · · <220> • · • ft · *·'·* <221> intron ··· ft · *·;·* <222> (798)..(856) sV: <223> ft· ft • · • ft • ft* • <220> ft ft• · | *! 1 <222> (715) .. (797) »» ·! · '· <223> • i * • · • · · <220> • · • ft · * ·' · * <221> intron ··· ft · * ·; · * <222> (798) .. (856) sV: <223> ft · ft • · • ft • ft * • <220> ft ft.

....: <221> CDS....: <221> CDS

ft ft page 1ft ft page 1

2052060FI.ST25.tXt 1 1 O 7 O ET2052060EN.ST25.tXt 1 1 O 7 O ET

<222> (857)..(1105) ' Ι70έϊ) <22B> <220> <221> intron <222> (1106)..(1228) <223> <220><222> (857) .. (1105) 'Ι70έϊ) <22B> <220> <221> intron <222> (1106) .. (1228) <223> <220>

<221> CDS<221> CDS

<222> (1229)..(1787) <223> <400> 1 tctgtctctt gtntcagaac agatctcctg gcggcctgct ttgccggtcc gaattgcgat 60 cgatgcaacg tcgattgcat acgagctaag cccgtctcgt gataaccgca aggggtcttc 120 cgagtttctg tctgcgaccc aggcattttc cgatttgtgt gcggggaccc aactgtcttc 180 tggggagtac ctggtgacaa aagcacagat aaacagatgg atgacggtat tgctgtgata 240 tcgccgtggc gctgaatcct ttctcttcgc taccaagata tttattcccc gttgtgaaat 300 cttctattca gcccatccca tccggcaaca cgcatctgct tttcgttccg gcattccgat 360 acctggttcc tggagtgcct accgagcctc gcttcctggg atcgggcgtt gcaccccgcc 420 •\! aaaccctatg ccccaaacgg tacggacaag gatgccggac cccggttttg tccagaaagg 480 ;1·’· ttgcattcct acccacctcg ctggagccac aacatgcaga tcaccgcccg agggaggaca 540 : tgtgtggtgc agggacgttg gcaactctgc tgtgtctgaa gtatatgagg ccgatggttc 600 ··· ·2· tccttgcaca aagcagagaa tggagtagcc agctcctcct caccagagtc gcctttgcag 660 ·»· · • ·1· cgtctcggca ttgcaggctc cccatcgtca gcatttcact tctcagcaac gaac atg 717 ·2· · Met : : 1 ·»· cgc tee tea ccc ttt etc cgc gca get ctg get gee get ctg eet ctg 765<222> (1229) .. (1787) <223> <400> 1 tctgtctctt gtntcagaac agatctcctg gcggcctgct ttgccggtcc gaattgcgat 60 cgatgcaacg tcgattgcat acgagctaag cccgtctcgt gataaccgca aggggtcttc 120 cgagtttctg tctgcgaccc aggcattttc cgatttgtgt gcggggaccc aactgtcttc 180 tggggagtac ctggtgacaa aagcacagat aaacagatgg atgacggtat tgctgtgata 240 tcgccgtggc gctgaatcct ttctcttcgc taccaagata tttattcccc gttgtgaaat 300 cttctattca gcccatccca tccggcaaca cgcatctgct tttcgttccg gcattccgat 360 acctggttcc tggagtgcct accgagcctc gcttcctggg atcgggcgtt gcaccccgcc! aaaccctatg ccccaaacgg tacggacaag gatgccggac cccggttttg tccagaaagg 480; 1 · '· ttgcattcct acccacctcg ctggagccac aacatgcaga tcaccgcccg agggaggaca 540 tgtgtggtgc agggacgttg gcaactctgc tgtgtctgaa gtatatgagg ccgatggttc 600 · · · · · 2 tccttgcaca aagcagagaa tggagtagcc agctcctcct caccagagtc gcctttgcag 660 · »· · · • 1 · cgtctcggca ttgcaggctc cccatcgtca gcatttcact tctcagcaac gaac atm 717 · 2 · · Met:: 1 · »· cgc tee tea ccc ttt etc cgc gca get ctg get gee get ctg eet ctg 765

Arg Ser Ser Pro Phe Leu Arg Ala Ala Leu Ala Ala Ala Leu Pro Leu •Y: 5 10 15 • · ·3· age gee cat gee etc gac gga aag teg aeg ag gtatgccaat cctcgtacct 817 ··· Ser Ala His Ala Leu Asp Gly Lys Ser Thr Arg Λ 20 25 • · · ♦ · · !·> ctgccctctg tagaaacaag tgaccgactg caaagacag a tae tgg gac tgc tgc 872 t ! Tyr Trp Asp Cys Cys I 30 2 · • · · 3 * ·’ aag ccg tee tgc ggc tgg ccg gga aag gee teg gtg aac cag ccc gtc 920 ····♦ Lys Pro Ser Cys Gly Trp Pro Gly Lys Ala Ser val Asn Gin Pro val * 1 35 40 45 page 2 2052060Fl.ST25.txt 119325 ttc teg tgc teg gee gac tgg cag egc ate age gac ttc aac geg aag 968Arg Ser Ser Pro Phe Leu Arg Ala Ala Leu Ala Ala Ala Leu Pro Leu • Y: 5 10 15 • · · 3 · age gee cat gee etc gac gga aag teg time ag gtatgccaat cctcgtacct 817 ··· Ser Ala His Ala Leu Asp Gly Lys Ser Thr Arg Λ 20 25 • · · ♦ · ·! ·> Ctgccctctg tagaaacaag tgaccgactg caaagacag a tae tgg gac tgc tgc 872 t! Tyr Trp Asp Cys Cys I 30 2 · • · · 3 * · 'aag ccg tee tgc ggc tgg ccg gga aag gee teg gtg aac cag ccc gtc 920 ···· ♦ Lys Pro Ser Cys Gly Trp Pro Gly Lys Ala Ser val. Asn Gin Pro val * 1 35 40 45 page 2 2052060Fl.ST25.txt 119325 ttc teg tgc teg gee gac tgg cag egc ate age gac ttc aac geg aag 968

Phe ser cys ser Ala Asp Trp Gin Arg lie Ser Asp Phe Asn Ala Lys 50 55 60 65 teg ggc tgc gac gga ggc tee gee tae teg tgc gee gac cag aeg ccc 1016Phe ser cys ser Ala Asp Trp Gin Arg lie Ser Asp Phe Asn Ala Lys 50 55 60 65 teg ggc tgc gac gga ggc tee gee tae teg tgc gee gac cag time ccc 1016

Ser Gly Cys Asp Gly Gly Ser Ala Tyr Ser Cys Ala Asp Gin Thr Pro 70 75 80 tgg geg gtc aac gac aac ttc teg tae ggc ttc gca gee aeg gee ate 1064Ser Gly Cys Asp Gly Gly Ser Ala Tyr Ser Cys Ala Asp Gin Thr Pro 70 75 80 tgg geg gtc aac gac aac ttc teg tae ggc ttc gca gee aeg gee ate 1064

Trp Ala val Asn Asp Asn Phe ser Tyr Gly Phe Ala Ala Thr Ala lie 85 90 95 gee ggc ggc tee gag tee age tgg tgc tgc gee tgc tat gc 1105Trp Ala val Asn Asp Asn Phe ser Tyr Gly Phe Ala Ala Thr Ala lie 85 90 95 gee ggc ggc tee gag tee age tgg tgc tgc gee tgc tat gc 1105

Ala Gly Gly Ser Glu Ser Ser Trp cys Cys Ala Cys Tyr Ala 100 105 110 gtgagttctc tgcaagccgc ttcccacccc cgctttctgt gcaggccgct tcccccctac 1165 ccacccactt cccccccccc gcctctgtga tcgggcatcc gagetaagtt gcgtgtcgtc 1225 cag a etc acc ttc aac teg ggc ccc gtc geg ggc aag ace atg gtg gtg 1274Ala Gly Glu Gly Ser Ser Ser Trp cys Cys Ala Cys Tyr Ala 100 105 110 gtgagttctc tgcaagccgc ttcccacccc cgctttctgt gcaggccgct tcccccctac 1165 ccacccactt cccccccccc gcctctgtga tcgggcatcc gagetaagtt 1225 gcgtgtcgtc a cag acc ttc aac etc teg gtc ccc ggc ggc aag GEG ace atg gtg gtg 1274

Leu Thr Phe Asn Ser Gly Pro val Ala Gly Lys Thr Met Val Val 115 120 125 cag teg acc age acc ggc ggc gac ctg ggc age aac cag ttc gac etc 1322Leu Thr Phe Asn Ser Gly Pro val Ala Gly Lys Thr Met Val Val 115 120 125 cag teg acc age acc ggc ggc gac ctg ggc age aac cag ttc gac etc 1322

Gin ser Thr ser Thr Gly Gly Asp Leu Gly Ser Asn Gin Phe Asp Leu 130 135 140 gee ate ccc ggc ggc ggc gtg ggc ate ttc aac ggc tgc gee tee cag 1370Gin ser Thr ser Thr Gly Gly Asp Leu Gly Ser Asn Gin Phe Asp Leu 130 135 140 gee ate ccc ggc ggc ggc gtg ggc ate ttc aac ggc tgc gee tee cag 1370

Ala lie pro Gly Gly Gly val Gly lie Phe Asn Gly Cys Ala Ser Gin 145 150 155 ttc ggc ggc etc ccc ggc gee cag tae ggc ggc ate age gac ege age 1418Ala lie pro Gly Gly Gly val Gly lie Phe Asn Gly Cys Ala Ser Gin 145 150 155 ttc ggc ggc etc ccc ggc gee cag tae ggc ggc ate age gac ege age 1418

Phe Gly Gly Leu Pro Gly Ala Gin Tyr Gly Gly lie Ser Asp Arg Ser 160 165 170 cag tgc teg tee ttc ccc geg ccg etc cag ccg ggc tgc cag tgg ege 1466Phe Gly Gly Leu Pro Gly Ala Gin Tyr Gly Gly lie Ser Asp Arg Ser 160 165 170 cag tgc teg tee ttc ccc geg ccg etc cag ccg ggc tgc cag tgg ege 1466

Gin Cys Ser Ser Phe Pro Ala Pro Leu Gin Pro Gly Cys Gin Trp Arg 175 180 185 190 .·. : ttc gac tgg ttc cag aac gee gac aac ccc acc ttc acc ttc cag ege 1514 *. *: Phe Asp Trp Phe Gin Asn Ala Asp Asn pro Thr Phe Thr Phe Gin Arg 195 200 205 • « · . gtg cag tgc ccg tee gag etc aeg tee ege aeg ggc tgt aag ege gac 1562 val Gin Cys Pro Ser Glu Leu Thr Ser Arg Thr Gly Cys Lys Arg Asp : 210 215 220 • · · ··· · : .*. gac gac gee age tat ccc gtc ttc aac ccg cct age ggt ggc tee ccc 1610 :.: : Asp Asp Ala Ser Tyr Pro val Phe Asn Pro Pro ser Gly Gly Ser Pro 225 230 235 • • · · age acc acc age acc acc acc age tee ccg tee ggt ccc aeg ggc aac 1658 ser Thr Thr ser Thr Thr Thr Ser ser Pro Ser Gly Pro Thr Gly Asn 240 245 250 • · · • · .***. cct cct gga ggc ggt ggc tgc act gee cag aag tgg gee cag tgc ggc 1706 ... Pro Pro Gly Gly Gly Gly cys Thr Ala Gin Lys Trp Ala Gin Cys Gly 255 260 265 270 * * * • · · 99c act 99c ttc ac9 99c tgc acc acc tgc gtc teg ggc acc acc tgc 1754 : : Gly Thr Gly Phe Thr Gly Cys Thr Thr Cys Val ser Gly Thr Thr Cys :* 275 280 285 • · · • * · : .* cag gtg cag aac cag tgg tat tee cag tgt ctg tgagcgggag ggttgttggg 1807 ....: Gin Val Gin Asn Gin Trp Tyr Ser Gin Cys Leu * * 290 295Gin Cys Ser Ser Phe Pro Ala Pro Leu Gin Pro Gly Cys Gin Trp Arg 175 180 185 190. ·. : ttc gac tgg ttc cag aac gee gac aac ccc acc ttc acc ttc cag ege 1514 *. *: Phe Asp Trp Phe Gin Asn Ala Asp Asn pro Thr Phe Thr Phe Gin Arg 195 200 205 • «·. gtg cag tgc ccg tee gag etc time tee ege time ggc tgt aag ege gac 1562 val Gin Cys Pro Ser Glu Leu Thr Ser Arg Thr Gly Cys Lys Arg Asp: 210 215 220 • · · ··· ·:. *. gac gac gee age tat ccc gtc ttc aac ccg cct age ggt ggc tee ccc 1610:.::: Asp Asp Ala Ser Tyr Pro val Phe Asn Pro Pro ser Gly Gly Ser Pro 225 230 235 • • · · age acc acc age acc acc. acc age tee ccg tee ggt ccc aeg ggc aac 1658 ser Thr Thr ser Thr Thr Thr Ser ser Pro Ser Gly Pro Thr Gly Asn 240 245 250 • · · • ·. ***. cct cct gga ggc ggt ggc tgc act gee cag aag tgg gee cag tgc ggc 1706 ... Pro Pro Gly Gly Gly Gly cys Thr Ala Gin Lys Trp Ala Gin Cys Gly 255 260 265 270 * * * • · · 99c act 99c ttc ac9 99c tgc acc acc tgc gtc teg ggc acc acc tgc 1754:: Gly Thr Gly Phe Thr Gly Cys Thr Thr Cys Val ser Gly Thr Thr Cys: * 275 280 285 • · · • * ·:. * cag gtg cag aac cag tgg tat tee cag tgt ctg tgagcgggag ggttgttggg 1807 ....: Gin Val Gin Asn Gin Trp Tyr Ser Gin Cys Leu * * 290 295

Page 3 119325 2052060FI.ST25.txt gtccgtttcc ctagggctga ggctgacgtg aactgggtcc tcttgtccgc cccatcacgg 1867 gttcgtattc gcgcgcttag ggagaggagg atgcagtttg agggggccac attttgaggg 1927 ggacgcagtc tggggtcgaa gcttgtcggt tagggctgcc gtgacgtggt agagcagatg 1987 ggaccaagtg cggagctagg caggtgggtg gttgtggtgg tggcttacct tctgtaacgc 2047 aatggcatct catctcactc gcctgctccc tgattggtgg ctctgttcgg cctggcgctt 2107 tttgggaccg ctggctggaa tggattgctc cggaacgcca ggttgagctg ggctggcgcg 2167 agtagattgg ccgctccgag ctgcaaccat aataaaattt tcggaccctg taagccgcac 2227 ccgaccaggt ctccattggc ggacatgcac gacgtccttc gcaggcacgg cctgcccgcc 2287 tctgatcacc cgcagttttc gtaccgtcag accagataca agccccg 2334 <210> 2 <211> 297Page 3 119325 2052060FI.ST25.txt gtccgtttcc ctagggctga ggctgacgtg aactgggtcc tcttgtccgc cccatcacgg 1867 gttcgtattc gcgcgcttag ggagaggagg atgcagtttg agggggccac attttgaggg 1927 ggacgcagtc tggggtcgaa gcttgtcggt tagggctgcc gtgacgtggt agagcagatg 1987 ggaccaagtg cggagctagg caggtgggtg gttgtggtgg tggcttacct tctgtaacgc 2047 aatggcatct catctcactc gcctgctccc tgattggtgg ctctgttcgg cctggcgctt 2107 tttgggaccg ctggctggaa tggattgctc cggaacgcca ggttgagctg ggctggcgcg 2167 agtagattgg ccgctccgag ctgcaaccat aataaaattt tcggaccctg taagccgcac 2227 ccgaccaggt ctccattggc ggacatgcac gacgtccttc gcaggcacgg cctgcccgcc 2287 tctgatcacc cgcagttcc gagtccgccc

<212> PRT<212> PRT

<213> Acremonium thermophilum <220> <221> misc_feature <222> (13)..(13) <223> n tarkoittaa a, t, c, tai g <400> 2<213> Acremonium thermophilum <220> <221> misc_feature <222> (13) .. (13) <223> n means a, t, c, or g <400> 2

Met Arg Ser Ser Pro Phe Leu Arg Ala Ala Leu Ala Ala Ala Leu Pro : 1 5 10 15 • ·· • · • · · *.1 1 Leu Ser Ala His Ala Leu Asp Gly Lys Ser Thr Arg Tyr Trp Asp Cys . 20 25 30 • · · * · · • 1 :.: : cys Lys Pro Ser Cys Gly Trp Pro Gly Lys Ala Ser val Asn Gin Pro : .·. 35 40 45 • · 1 ··· · ***· :...1 val Phe Ser Cys Ser Ala Asp Trp Gin Arg lie Ser Asp Phe Asn Ala 50 55 60 • · :.V Lys ser Gly Cys Asp Gly Gly Ser Ala Tyr Ser Cys Ala Asp Gin Thr .···. 65 70 75 80 * · ···Met Arg Ser Ser Pro Phe Leu Arg Ala Ala Leu Ala Ala Ala Leu Pro: 1 5 10 15 • ·· • · • · * .1 1 Leu Ser Ala His Ala Leu Asp Gly Lys Ser Thr Arg Tyr Trp Asp Cys. 20 25 30 • · · * · · • 1:.::: Cys Lys Pro Ser Cys Gly Trp Pro Gly Lys Ala Ser val Asn Gin Pro:. ·. 35 40 45 • · 1 ··· · *** ·: ... 1 hr Phe Ser Cys Ser Ala Asp Trp Gin Arg lie Ser Asp Phe Asn Ala 50 55 60 • ·: .V Lys ser Gly Cys Asp Gly Gly Ser Ala Tyr Ser Cys Ala Asp Gin Thr. ···. 65 70 75 80 * · ···

Pro Trp Ala val Asn Asp Asn Phe Ser Tyr Gly Phe Ala Ala Thr Ala :.: 85 90 95 • · « · ···Pro Trp Ala val Asn Asp Asn Phe Ser Tyr Gly Phe Ala Ala Thr Ala:.: 85 90 95 • · «· ···

Ile Ala Gly Gly Ser Glu Ser Ser Trp Cys Cys Ala Cys Tyr Ala Leu : .1 100 105 110Ile Ala Gly Gly Ser Glu Ser Ser Trp Cys Cys Ala Cys Tyr Ala Leu: .1 100 105 110

Page 4 · 1 1 9325 2052060FI.ST25.txtPage 4 · 1 1 9325 2052060EN.ST25.txt

Thr phe Asn ser Gly val Ala Gly Lys Thr Mat vai val Gin Sen 115 120 125Thr Phe Asn ser Gly val Ala Gly Lys Thr Mat or val Gin Sen 115 120 125

Thr ser Thr Glv Gly Asp Leu Gly Ser Asn Gin Phe Asp Leu Ala lie 130 135 140 pro Glv Glv Glv val Gly lie Phe Asn Gly Cys Ala ser Gin Phe Gly 145 150 155 160Thr ser Thr Glv Gly Asp Leu Gly Ser Asn Gin Phe Asp Leu Ala lie 130 135 140 pro Glv Glv Glv val Gly lie Phe Asn Gly Cys Ala ser Gin Phe Gly 145 150 155 160

Glv Leu Pro Glv Ala Gin Tyr Gly Gly lie Ser Asp Arg ser Gin Cys y y 165 170 175Glv Leu Pro Glv Ala Gin Tyr Gly Gly lie Ser Asp Arg ser Gin Cys y y 165 170 175

Ser Ser Phe Pro Ala Pro Leu Gin Pro Gly Cys Gin Trp Arg Phe Asp 180 185 190Ser Ser Phe Pro Ala Pro Leu Gin Pro Gly Cys Gin Trp Arg Phe Asp 180 185 190

TrD Phe Gin Asn Ala Asp Asn Pro Thr phe Thr Phe Gin Arg Val Gin 195 200 205TrD Phe Gin Asn Area Asp Asn Pro Thr Phe Thr Phe Gin Arg Val Gin 195 200 205

Cys Pro Ser Glu Leu Thr Ser Arg Thr Gly Cys Lys Arg Asp Asp Asp 210 215 220Cys Pro Ser Glu Leu Thr Ser Arg Thr Gly Cys Lys Arg Asp Asp Asp 210 215 220

Ala Ser Tyr Pro val Phe Asn Pro Pro Ser Gly Gly Ser Pro Ser Thr 225 230 235 240Ala Ser Tyr Pro val Phe Asn Pro Pro Ser Gly Gly Ser Pro Ser Thr 225 230 235 240

Thr Ser Thr Thr Thr Ser Ser Pro Ser Gly Pro Thr Gly Asn Pro Pro 245 250 255Thr Ser Thr Thr Thr Ser Ser Pro Ser Gly Pro Thr Gly Asn Pro Pro 245 250 255

Gly Gly Gly Gly Cys Thr Ala Gin Lys Trp Ala Gin cys Gly Gly Thr 260 265 270Gly Gly Gly Gly Cys Thr Ala Gin Lys Trp Ala Gin cys Gly Gly Thr 260 265 270

Gly Phe Thr Gly Cys Thr Thr Cys Val Ser Gly Thr Thr Cys Gin val .·. : 275 280 285 • · · • · • # · V * Gin Asn Gin Trp Tyr Ser Gin Cys Leu , 290 295 • · · ·*# :.:: <2io> 3 • · :.: : <2ii> 2033 ···Gly Phe Thr Gly Cys Thr Thr Cys Val Ser Gly Thr Thr Cys Gin h ·. : 275 280 285 • · · • · • # · V * Gin Asn Gin Trp Tyr Ser Gin Cys Leu, 290 295 • · · · * #:. :: <2io> 3 • ·:.:: <2ii> 2033 · · ·

<212> DNA<212> DNA

<213> Acremonium thermophilum • · • · · • · · • φ ··· Σ...: <220> <22i> cds • · <222> (259)..(702) • ·· :·*.·. <223> • · • · • ·<213> Acremonium thermophilum • · • · · · · · φ ··· Σ ...: <220> <22i> cds • · <222> (259) .. (702) • ··: · *. ·. <223> • · • · • ·

Page 5 <220> 2052060FI.ST25.txt 119325 <221> Intron <222> (703)..(857) <223> <220> <221> CDS <222> (858)..(888) <223> <220> <221> intron <222> (889)..(990) <223> <220>Page 5 <220> 2052060EN.ST25.txt 119325 <221> Intron <222> (703) .. (857) <223> <220> <221> CDS <222> (858) .. (888) <223> <220> <221> intron <222> (889) .. (990) <223> <220>

<221> CDS<221> CDS

<222> (991)..(1268) <223> <400> 3 ctcgaggaga ggaaccgagt ttgaaagatg ctatatatcg atagactacc ggcgtcgcct 60 • · cgccctgtcc gctctcttgc attccccctg ttgatgagac gagacaaaat tcctggttag 120 . aaaagatccg tcgccgagat ttcaccagtg gtaagtcccg agaattggtc attcgacgtt 180 ··· : .*. caatatgagt gtcaaagcta tgggtcctaa caaagaagga agcaagagct ttaaagagac 240 ··· · : .*. agaataacag cagcaaag atg cgt etc cca eta ccg act ctg etc gee etc 291 S·· : Met Arg Leu Pro Leu Pro Thr Leu Leu Ala Leu .*··. 15 10 • · »·· ttg ccc tae tac etc gaa gtg tec get cag ggg gca tec gga ace ggc 339<222> (991) .. (1268) <223> <400> 3 ctcgaggaga ggaaccgagt ttgaaagatg ctatatatcg atagactacc ggcgtcgcct 60 • · cgccctgtcc gctctcttgc attccccctg ttgatgagac gagacaaaat 120. aaaagatccg tcgccgagat ttcaccagtg gtaagtcccg agaattggtc attcgacgtt 180 ···:. *. caatatgagt gtcaaagcta tgggtcctaa caaagaagga agcaagagct ttaaagagac 240 ··· ·:. *. agaataacag cagcaaag atm cgt etc cca eta ccg act ctg etc gee etc 291 S ··: Met Arg Leu Pro Leu Pro Thr Leu Leu Ala Leu. * ··. 15 10 • · »·· ttg ccc tae tac etc gaa gtg tec get cag ggg gca tec gga ace ggc 339

Leu Pro Tyr Tyr Leu Glu val Ser Ala Gin Gly Ala Ser Gly Thr Gly 15 20 25 • · · • * aeg aca aca cgt tac tgg gat tgc tgc aag ccg age tgc geg tgg cct 387 *···* Thr Thr Thr Arg Tyr Trp Asp Cys Cys Lys Pro Ser Cys Ala Trp Pro 30 35 40 • · · • · t ctg aag ggc aat teg ccc age ccg gtg cag act tgc gac aag aat gac 435 : : Leu Lys Gly Asn Ser pro Ser pro val Gin Thr cys Asp Lys Asn Asp T 45 50 55 · * : *.: agg ccg ctg aac gat ggg gga aac acc aag tcc ggc tgc gac aac ggt 483 ...,: Arg pro Leu Asn Asp Gly Gly Asn Thr Lys Ser Gly Cys Asp Asn Gly * * 60 65 70 75Leu Pro Tyr Tyr Leu Glu val Ser Ala Gin Gly Ala Ser Gly Thr Gly 15 20 25 • · · • * aeg aca aca cgt tac tgg gat tgc tgc aag ccg age tgc geg tgg cct 387 * ··· * Thr Thr Thr Arg Tyr Trp Asp Cys Cys Lys Pro Ser Cys Ala Trp Pro 30 35 40 • · · • · t ctg aag ggc aat teg ccc age ccg gtg cag act tgc gac aag aat gac 435:: Leu Lys Gly Asn Ser pro Ser pro val Gin Thr cys Asp Lys Asn Asp T 45 50 55 · *: *: agg ccg ctg aac gat ggg gga aac acc aag tcc ggc tgc gac aac ggt 483 ...,:: Arg pro Leu Asn Asp Gly Gly Asn Thr Lys Ser Gly Cys Asp Asn Gly * * 60 65 70 75

Page 6 2052060FI.ST25.txt 119325 ggc gag gcc ttc atg tgc tea tee cag agt ccc tgg gee gtc aat gag 531Page 6 2052060EN.ST25.txt 119325 ggc gag gcc ttc recover tgc tea tee cag agt ccc tgg gee gtc aat gag 531

Gly Gly Ala Phe Met Cys Ser Ser Gin ser Pro Trp Ala val Asn Glu 80 85 90 ace ace age tae ggc tgg gca gcc gtt cgt ate gcc ggc agt ace gag 579Gly Gly Ala Phe Met Cys Ser Ser Gin ser Pro Trp Ala val Asn Glu 80 85 90 ace ace age tae ggc tgg gca gcc gtt cgt ate gcc ggc agt ace gag 579

Thr Thr Ser Tyr Gly Trp Ala Ala Val Arg lie Ala Gly ser Thr Glu 95 100 105 teg gcc tgg tgc tgt gcc tgc tae gag etc acc ttc acc agt ggg ccc 627Thr Thr Ser Tyr Gly Trp Ala Ala Val Arg lie Ala Gly ser Thr Glu 95 100 105 teg gcc tgg tgc tgt gcc tgc tae gag etc acc ttc acc agt ggg ccc 627

Ser Ala Trp Cys Cys Ala cys Tyr Glu Leu Thr Phe Thr Ser Gly Pro 110 115 120 gtc agt gga aag aag etc ata gtc cag gcc aeg aac act ggt gga gac 675Ser Ala Trp Cys Cys Ala cys Tyr Glu Leu Thr Phe Thr Ser Gly Pro 110 115 120 gtc agt gga aag aag etc ata gtc cag gcc aeg aac act ggt gga gac 675

Val Ser Gly Lys Lys Leu lie Val Gin Ala Thr Asn Thr Gly Gly Asp 125 130 135 ett ggg age aac cac ttt gac ett geg gtatgtgggg tttttctttc 722Val Ser Gly Lys Lys Leu lie Val Gin Ala Thr Asn Thr Gly Gly Asp 125 130 135 ett ggg age aac cac ttt gac ett geg gtatgtgggg tttttctttc 722

Leu Gly Ser Asn His Phe Asp Leu Ala 140 145 ttcatcatcg ctctcaccat ggattcctcg gcgcaaggac caagattgag aagcgtcaat 782 gccgggttgg acacgggagc cgggatagga acacagaggc cgtttaagac cgtcagctga 842 cagcagagca attag att ccc gga ggt ggt gtt ggt cag tee aat g 888 lie Pro Gly Gly Gly val Gly Gin Ser Asn 150 155 gtaggttcct tccctgaagt accggcaaca gcctgtgcgt tgctgtatac cccttttaat 948 catagcatct tcctgctgga tacaagccaa cccattttct ag ct tgc aeg aac 1001Leu Gly Ser Asn His Phe Asp Leu Ala 140 145 ttcatcatcg ctctcaccat ggattcctcg gcgcaaggac caagattgag aagcgtcaat 782 gccgggttgg acacgggagc cgggatagga gcag gag gag gag gag 155 gtaggttcct tccctgaagt accggcaaca gcctgtgcgt tgctgtatac cccttttaat 948 catagcatct tcctgctgga tacaagccaa cccattttct ag ct tgc aeg aac 1001

Ala Cys Thr Asn 160 cag tat ggt geg ccc ccg aac ggc tgg ggc gac agg tat ggt ggc gtg 1049Ala Cys Thr Asn 160 cag tat ggt geg ccc ccg aac ggc tgg ggc gac agg tat ggt ggc gtg 1049

Gin Tyr Gly Ala Pro Pro Asn Gly Trp Gly Asp Arg Tyr Gly Gly val 165 170 175 cac teg egg age gac tgc gac age ttc ccc geg geg etc aag gcc ggc 1097Gin Tyr Gly Ala Pro Pro Asn Gly Trp Gly Asp Arg Tyr Gly Gly val 165 170 175 cac teg egg age gac tgc gac age ttc ccc geg geg etc aag gcc ggc 1097

His ser Arg Ser Asp Cys Asp Ser Phe pro Ala Ala Leu Lys Ala Gly 180 185 190 • · tgc tae tgg ega ttc gac tgg ttc cag ggc gcc gac aac ccg tee gtg 1145 • ' Cys Tyr Trp Arg Phe Asp Trp Phe Gin Gly Ala Asp Asn Pro Ser val : ;·; 195 200 205 210 • · · • ·*. age ttc aaa cag gta gcc tgc ccg gca gcc ate aca get aag age ggc 1193 ... : ser Phe Lys Gin val Ala Cys Pro Ala Ala lie Thr Ala Lys Ser Gly • j‘; 215 220 225 »·· « .***. tgt act ege cag aac gat gcc ate aac gag act ccg act ggg ccc age 1241 ··· Cys Thr Arg Gin Asn Asp Ala lie Asn Glu Thr Pro Thr Gly Pro Ser 230 235 240 ·’·*· act gtg eet acc tae acc geg tea ggc tgaaagtcgg ctggggcacc 1288 • · Thr vaT Pro Thr Tyr Thr Ala Ser Gly :**·. 245 250 *·· y.' attgcccagg tgatggttgg gcatgtgtta gtctcactca ccagggacat ttgtcgcgac 1348 • · · ctgatcatag gcgccagggg agttgaaagg ggttgccgta egagaagaca ttttgtcgcc 1408 • · *·* gtcttactcc cagccacttc tgtacatatt caatgacatt acatagcccg caaatatgtt 1468 • « · ϊ ·* catatatcgt ggccgcccaa accgccccgg tttgettagg ctggagctga agtggctcgc 1528 ·*··· cgatggctgt caaaggcagt eggaatatte ctcgttgctt cggcaacacg gtagctgctt 1588His ser Arg Ser Asp Cys Asp Ser Phe pro Ala Ala Leu Lys Ala Gly 180 185 190 • · tgc tae tgg nor ttc gac tgg ttc cag ggc gcc gac aac ccg tee gtg 1145 • 'Cys Tyr Trp Arg Phe Asp Trp Phe Gin Gly Ala Asp Asn Pro Ser val:; ·; 195 200 205 210 • · · • · *. age ttc aaa cag gta gcc tgc ccg gca gcc ate aca get aag age ggc 1193 ...: ser Phe Lys Gin val Ala Cys Pro Ala Ala lie Thr Ala Lys Ser Gly • j '; 215 220 225 »··«. ***. tgt act ege cag aac gat gcc ate aac gag act ccg act ggg ccc age 1241 ··· Cys Thr Arg Gin Asn Asp Ala lie Asn Glu Thr Pro Thr Gly Pro Ser 230 235 240 · '· * · act gtg eet acc tae acc geg tea ggc tgaaagtcgg ctggggcacc 1288 • · Thr vaT Pro Thr Tyr Thr Ala Ser Gly: ** ·. 245,250 * ·· y. ' attgcccagg tgatggttgg gcatgtgtta gtctcactca ccagggacat ttgtcgcgac 1348 • · · ctgatcatag gcgccagggg agttgaaagg ggttgccgta egagaagaca ttttgtcgcc 1408 • · * · * gtcttactcc cagccacttc tgtacatatt caatgacatt acatagcccg caaatatgtt 1468 • «ϊ · · * catatatcgt ggccgcccaa accgccccgg tttgettagg ctggagctga agtggctcgc 1528 · · · · * cgatggctgt caaaggcagt eggaatatte ctcgttgctt cggcaacacg gtagctgctt 1588

Page 7 2052060FI.ST25.txt 119325 gaaccgtacc cagcattaga acaccccccg ccgagggctt gctacgtcaa tggcggggtc 1648 tccaacccct gcgcggcaca aaaccaacca cgccctcgtc ttttatgatg tcctcgctca 1708 aacgtcccgt gacgacactc cgctcatggt ctggtcctct gatgtagaag gggtaggtca 1768 gccgatggtc gtcaccgtcg tcaatgcttc cctcaagctt cttgcggcct ttatcctcca 1828 actcttccca catgagaact ccatctttcc gccttttcac aaagccactg ccctccttgt 1888 caagggccaa aaaccaacgc cgctgatgaa tgcttccgat cgtgtttgac gcgcccgggg 1948 tatgcatttg gttcggcgca cttttttcgt cctccagctc ccttaactcc cgttccatct 2008 gagagggtga ctcgtctact cgact 2033 <210> 4 <211> 251Page 7 2052060FI.ST25.txt 119,325 gaaccgtacc cagcattaga acaccccccg ccgagggctt gctacgtcaa tggcggggtc 1648 tccaacccct gcgcggcaca aaaccaacca cgccctcgtc ttttatgatg tcctcgctca 1708 aacgtcccgt gacgacactc cgctcatggt ctggtcctct gatgtagaag gggtaggtca 1768 gccgatggtc gtcaccgtcg tcaatgcttc cctcaagctt cttgcggcct ttatcctcca 1828 actcttccca catgagaact ccatctttcc gccttttcac aaagccactg ccctccttgt 1888 caagggccaa aaaccaacgc cgctgatgaa tgcttccgat cgtgtttgac gcgcccgggg 1948 tatgcatttg gttcggcgca cttttttcgt cctccagctc ccttaactcc cgttccatct 2008 gagagggtga ctcgtctact cgact 2033 <210> 4 <211> 251

<212> PRT<212> PRT

<213> Acremonium thermophilum <400> 4<213> Acremonium thermophilum <400> 4

Met Arg Leu Pro Leu Pro Thr Leu Leu Ala Leu Leu Pro Tyr Tyr Leu 15 10 15Met Arg Leu Pro Leu Pro Thr Leu Leu Area Leu Leu Pro Tyr Tyr Leu 15 10 15

Glu val Ser Ala Gin Gly Ala Ser Gly Thr Gly Thr Thr Thr Arg Tyr 20 25 30Glu val Ser Ala Gin Gly Ala Ser Gly Thr Gly Thr Thr Thr Arg Tyr 20 25 30

Trp Asp Cys Cys Lys Pro ser Cys Ala Trp Pro Leu Lys Gly Asn Ser 35 40 45 • · V*: pro ser pro val Gin Thr Cys Asp Lys Asn Asp Arg Pro Leu Asn Asp 50 55 60 * · · :.ϊ.: Gly Gly Asn Thr Lys Ser Gly Cys Asp Asn Gly Gly Gly Ala Phe Met : .·. 65 70 75 80 • t · »·« · • · :.: : cys ser Ser Gin Ser Pro Trp Ala Val Asn Glu Thr Thr Ser Tyr Gly 85 90 95 • · ···Trp Asp Cys Cys Lys Pro ser Cys Ala Trp Pro Leu Lys Gly Asn Ser 35 40 45 • · V *: pro ser pro val Gin Thr Cys Asp Lys Asn Asp Arg Pro Leu Asn Asp 50 55 60 * · ·: .ϊ. : Gly Gly Asn Thr Lys Ser Gly Cys Asp Asn Gly Gly Gly Ala Phe Met:. ·. 65 70 75 80 • t · »·« · •:.:: Cys ser Ser Gin Ser Pro Trp Ala Val Asn Glu Thr Thr Ser Tyr Gly 85 90 95 • · ···

Trp Ala Ala val Arg lie Ala Gly ser Thr Glu Ser Ala Trp Cys Cys 100 105 HOTrp Ala Ala val Arg lie Ala Gly ser Thr Glu Ser Ala Trp Cys Cys 100 105 HO

* · » • * • · ·* · »• * • · ·

Ala cys Tyr Glu Leu Thr Phe Thr ser Gly Pro val ser Gly Lys Lys 115 120 i25 * I · • t * • · :***: Leu lie val Gin Ala Thr Asn Thr Gly Gly Asp Leu Gly Ser Asn His *;* 130 135 140 e· · : *t:Ala cys Tyr Glu Leu Thr Phe Thr ser Gly Pro val ser Gly Lys Lys 115 120 i25 * I · • t * • ·: ***: Leu lie val Gin Ala Thr Asn Thr Gly Gly Asp Leu Gly Ser Asn His *; * 130 135 140 e · ·: * t:

Phe Asp Leu Ala lie pro Gly Gly Gly val Gly Gin Ser Asn Ala cys • · 145 150 155 lb0 page 8 2052060Fl.ST25.txt 119325Phe Asp Leu Ala lie pro Gly Gly Gly val Gly Gin Ser Asn Ala cys • · 145 150 155 lb0 page 8 2052060Fl.ST25.txt 119325

Thr Asn Gin Tyr Gly Ala Pro Pro Asn Gly Trp Gly Asp Arg Tyr Gly 165 170 175Thr Asn Gin Tyr Gly Ala Pro Pro Asn Gly Trp Gly Asp Arg Tyr Gly 165 170 175

Gly val His Ser Arg Ser Asp Cys Asp Ser Phe Pro Ala Ala Leu Lys 180 185 190Gly val His Ser Arg Ser Asp Cys Asp Ser Phe Pro Ala Ala Leu Lys 180 185 190

Ala Gly Cys Tyr Trp Arg Phe Asp Trp Phe Gin Gly Ala Asp Asn Pro 195 200 205Ala Gly Cys Tyr Trp Arg Phe Asp Trp Phe Gin Gly Ala Asp Asn Pro 195 200 205

Ser Val Ser Phe Lys Gin val Ala Cys pro Ala Ala lie Thr Ala Lys 210 215 220Ser Val Ser Phe Lys Gin Val Ala Cys pro Ala Ala lie Thr Ala Lys 210 215 220

Ser Gly Cys Thr Arg Gin Asn Asp Ala lie Asn Glu Thr Pro Thr Gly 225 230 235 240Ser Gly Cys Thr Arg Gin Asn Asp Ala lie Asn Glu Thr Pro Thr Gly 225 230 235 240

Pro Ser Thr Val Pro Thr Tyr Thr Ala Ser Gly 245 250 <210> 5 <211> 17Pro Ser Thr Val Pro Thr Tyr Thr Ala Ser Gly 245 250 <210> 5 <211> 17

<212> PRT<212> PRT

<213> Acremonium thermophilum <400> 5<213> Acremonium thermophilum <400> 5

Gin Ser Cys Ser Ser Phe Pro Ala pro Leu Lys Pro Gly Cys Gin Trp 15 10 15 **. : • · Arg • ♦ · ♦ · · :·ί·: <210> 6 • * *·· ϊ <211> 13 • ·Gin Ser Cys Ser Ser Phe Pro Ala pro Leu Lys Pro Gly Cys Gin Trp 15 10 15 **. : • · Arg • ♦ · ♦ · ·: · ί ·: <210> 6 • * * ·· ϊ <211> 13 • ·

ϊ·· ί <212> PRTϊ ·· ί <212> PRT

·#« • · *···* <213> Acremonium thermophilum t » !*V <400> 6· # «• · * ··· * <213> Acremonium thermophilum t»! * V <400> 6

• M• M

• « jyr Ala Leu Thr Phe Asn Ser Gly Pro val Ala Gly Lys 15 10 * · · • · · • » <2io> 7 :·!·. <2ΐι> ίο • « • · ....· <212> prt • ·• «jyr Ala Leu Thr Phe Asn Ser Gly Pro val Ala Gly Lys 15 10 * · · • · • • <2io> 7: ·! ·. <2ΐι> ίο • «• · .... · <212> prt • ·

Page 9 2052060FI.ST25.txt 1 1 9325 <213> Acremonium thermophilum <400> 7Page 9 2052060EN.ST25.txt 1 1 9325 <213> Acremonium thermophilum <400> 7

Val Gin Cys pro Ser Glu Leu Thr Ser Arg 1 5 10Val Gin Cys pro Ser Glu Leu Thr Ser Arg 1 5 10

<210> 8 <211> 13 <212> PRT<210> 8 <211> 13 <212> PRT

<213> Acremonium thermophilum <400> 8<213> Acremonium thermophilum <400> 8

Asn Gin pro val Phe Ser Cys Ser Ala Asp Trp Gin Arg 1 5 10 <210> 9 <211> 14Asn Gin pro val Phe Ser Cys Ser Ala Asp Trp Gin Arg 1 5 10 <210> 9 <211> 14

<212> PRT<212> PRT

<213> Acremonium thermophilum <400> 9<213> Acremonium thermophilum <400> 9

Tyr Trp Asp Cys Cys Lys pro Ser Cys Gly Trp Pro Gly Lys 15 10 • · Y*: <2ΐο> ίο «** V 1 <211> 4Tyr Trp Asp Cys Cys Lys pro Ser Cys Gly Trp Pro Gly Lys 15 10 • · Y *: <2ΐο> ίο «** V 1 <211> 4

<212> PRT<212> PRT

* · • * · ί·! ! <213> Acremonium thermophilum * · • · · • · · ··· · #·· <400> 10* · • * · ί ·! ! <213> Acremonium thermophilum * · • · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · ›

Pro Thr Phe Thr • · 1 * ψ · 1 • * · • · ··· <210> 11 :Y: <2ii> 20 • · <212> dna • ♦ · <213> Artificial Sequence • * • · ·*··· • «Pro Thr Phe Thr • · 1 * ψ · 1 • * · • · ··· <210> 11: Y: <2ii> 20 • · <212> dna • ♦ · <213> Artificial Sequence • * • · · * ··· • «

Page 10 <220> 2052060FI.ST25.txt 119325 <223> aluke <220> <221> misc_feature <222> (3)..(3) <223> y tarkoittaa c tai t <220> <221> misc_feature <222> (9)..(9) <223> y tarkoittaa c tai t <220> <221> misc_feature <222> (12)..(12) <223> y tarkoittaa c tai t <220> <221> misc_feature <222> (15)..(15) <223> r tarkoittaa a tai g • » • · · • · · « · • ·· : <400> 11 . .*. taytgggayt gytgyaarcc 20 ·*· • · : <2io> 12 • · ·*.: : <2ii> 2i ··· • *Page 10 <220> 2052060EN.ST25.txt 119325 <223> primer <220> <221> misc_feature <222> (3) .. (3) <223> y means c or t <220> <221> misc_feature <222 > (9) .. (9) <223> y means c or t <220> <221> misc_feature <222> (12) .. (12) <223> y means c or t <220> <221> misc_feature <222> (15) .. (15) <223> r stands for a or g • »• · · • · · · · ·:: <400> 11. . *. taytgggayt gytgyaarcc 20 · * · • ·: <2io> 12 • · · * .:: <2ii> 2i ··· • *

*·*·* <212> DNA* · * · * <212> DNA

<213> Artificial Sequence • · * · · • · * • · • · · ?—: <220> :V: <223> aluke <220> • * * <221> mi sc_feature • · <222> (1)..(1) ·<213> Artificial Sequence • · * · · • · * • · • ·? -: <220>: V: <223> primer <220> • * * <221> mi sc_feature • · <222> (1) .. (1) ·

Page 11 119325 2052060FI.ST25.txt <223> r tarkoittaa a tai g <220> <221> misc_feature <222> (4)..(4) <223> r tarkoittaa a tai g <220> <221> misc_feature <222> ¢7)..(7) <223> n tarkoittaa a, t, c tai g <220> <221> misc_feature <222> (10)..CIO) <223> r tarkoittaa a tai g <220> <221> misc_feature <222> C13). -C13) <223> y tarkoittaa c tai t • · ♦ · · • ·· • · M· • » « *·* * <220> • · · '·*·* <221> misc_feature • · Ϊ <222> C16) .. C16) • · • > « ··· · <223> r tarkoittaa a tai g »·· • * • · *·· <400> 12 .*.*· rttrtcngcr ttytgraacc a 21 * · ·»« :···: <210> 13 ϊ'ί'ϊ <211> 7 Ψ «Page 11 119325 2052060EN.ST25.txt <223> r means a or g <220> <221> misc_feature <222> (4) .. (4) <223> r means a or g <220> <221> misc_feature < 222> ¢ 7) .. (7) <223> n means a, t, c or g <220> <221> misc_feature <222> (10) ..CIO) <223> r means a or g <220> <221> misc_feature <222> C13). -C13) <223> y means c or t • · ♦ · · · · · · M · • »« * · * * <220> • · · '· * · * <221> misc_feature • · Ϊ <222 > C16) .. C16) • · •> «··· · <223> r means a or g» ·· • * • * * · · <400> 12. *. * · Rttrtcngcr ttytgraacc a 21 * · · »«: ···: <210> 13 ϊ'ί'ϊ <211> 7 Ψ «

i"': <212> PRTi "': <212> PRT

Ϊ*.·. <213> Melanocarpus albomyces • · · page 12 2052060FI.ST25.txt 119325 <400> 13Ϊ *. ·. <213> Melanocarpus albomyces • · · page 12 2052060EN.ST25.txt 119325 <400> 13

Trp Phe Gin Asn Ala Asp Asn 1 5 <210> 14Trp Phe Gin Asn Ala Asp Asn 1 5 <210> 14

<211> 636 <212> DNA<211> 636 <212> DNA

<213> Acremonium thermophilum <400> 14 tactgggatt gttgcaagcc gtcctgcggc tggccgggaa aggcctcggt gaaccagccc 60 gtcttctcgt gctcggccga ctggcagcgc atcagcgact tcaacgcgaa gtcgggctgc 120 gacggaggct ccgcctactc gtgcgccgac cagacgccct gggcggtcaa cgacaacttc 180 tcgtacggct tcgcagccac ggccatcgcc ggcggctccg agtccagctg gtgctgcgcc 240 tgctatgcgt gagttctctg caagccgctt cccacccccg ctttctgtgc aggccgcttc 300 ccccctaccc acccacttcc ccccccccgc ctctgtgatc gggcatccga gctaagttgc 360 gtgtcgtcca gactcacctt caactcgggc cccgtcgcgg gcaagaccat ggtggtgcag 420 tcgaccagca ccggcggcga cctgggcagc aaccagttcg acctcgccat ccccggcggc 480 ggcgtgggca tcttcaacgg ctgcgcctcc cagttcggcg gcctccccgg cgcccagtac 540 ggcggcatca gcgaccgcag ccagtgctcg tccttccccg cgccgctcca gccgggctgc 600 cagtggcgct tcgactggtt ccagaacgcg gataat 636 <210> 15 • · <211> 786 ···<213> Acremonium thermophilum <400> 14 tactgggatt gttgcaagcc gtcctgcggc tggccgggaa aggcctcggt gaaccagccc 60 gtcttctcgt gctcggccga ctggcagcgc atcagcgact tcaacgcgaa gtcgggctgc 120 gacggaggct ccgcctactc gtgcgccgac cagacgccct gggcggtcaa cgacaacttc 180 tcgtacggct tcgcagccac ggccatcgcc ggcggctccg agtccagctg gtgctgcgcc 240 tgctatgcgt gagttctctg caagccgctt cccacccccg ctttctgtgc aggccgcttc 300 ccccctaccc acccacttcc ccccccccgc ctctgtgatc gggcatccga gctaagttgc 360 gtgtcgtcca gactcacctt caactcgggc cccgtcgcgg gcaagaccat ggtggtgcag 420 tcgaccagca ccggcggcga cctgggcagc aaccagttcg acctcgccat ccccggcggc 480 ggcgtgggca tcttcaacgg ctgcgcctcc cagttcggcg gcctccccgg cgcccagtac 540 ggcggcatca gcgaccgcag ccagtgctcg tccttccccg cgccgctcca gccgggctgc 600 cagtggcgct tcgactggtt ccagaacgcg GATAAT 636 <210> 15 • · <211> 786 · · ·

:·: J <212> DNA: ·: J <212> DNA

:·ί.Σ <213> Acremonium thermophilum • · • · · φ · · ··· · • · i·: i <400> 15 tactgggatt gttgcaagcc gagctgcgcg tggcctctga agggcaattc gcccagcccg 60 • · · gtgcagactt gcgacaagaa tgacaggccg ctgaacgatg ggggaaacac caagtccggc 120 tgcgacaacg gtggcggggc cttcatgtgc tcatcccaga gtccctgggc cgtcaatgag 180 • · .***. accaccagct acggctgggc agccgttcgt atcgccggca gtaccgagtc ggcctggtgc 240 ··· tgtgcctgct acgagctcac cttcaccagt gggcccgtca gtggaaagaa gctcatagtc 300 • · · • · · caggccacga acactggtgg agaccttggg agcaaccact ttgaccttgc ggtatgtggg 360 • · *** gtttttcttt cttcatcatc gctctcacca tggattcctc ggcgcaagga ccaagattga 420 • · · • * · • ·* gaagcgtcaa tgccgggttg gacacgggag ccgggatagg aacacagagg ccgtttaaga 480 ‘ * ccgtcagctg acagcaggag caattagatt cccggaggtg gtgttggtca gttcaatggt 540 page 13 2052060FI.ST25.txt 119325 aggttccttc cctgaagtac cggcaacagc ctgtgcgttg ctgtataccc cttttaatca 600 tagcatcttc ctgctggata caagccaacc cattttctag cttgcacgaa ccagtatggt 660 gcgcccccga acggctgggg cgacaggtat ggtggcgtgc actcgcggag cgactgcgac 720 agcttccccg cggcgctcaa ggccggctgc tactggcgat tcgactggtt tcaaaacgcc 780 gacaac 786 <210> 16 <211> 994: · Ί.Σ <213> Acremonium thermophilum • · • · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · 60 · 60 120 120aaaa gtggcggggc cttcatgtgc tcatcccaga gtccctgggc cgtcaatgag 180 • ·. ***. accaccagct acggctgggc agccgttcgt atcgccggca gtaccgagtc ggcctggtgc 240 ··· tgtgcctgct acgagctcac cttcaccagt gggcccgtca gtggaaagaa gctcatagtc 300 • • · · · · caggccacga acactggtgg agaccttggg agcaaccact ttgaccttgc ggtatgtggg 360 • · *** gtttttcttt cttcatcatc gctctcacca tggattcctc ggcgcaagga ccaagattga 420 • • · · · • · * * gaagcgtcaa tgccgggttg gacacgggag ccgggatagg aacacagagg ccgtttaaga 480 '* ccgtcagctg acagcaggag caattagatt cccggaggtg gtgttggtca gttcaatggt 540 119 325 Page 13 2052060FI.ST25.txt aggttccttc cctgaagtac cggcaacagc ctgtgcgttg ctgtataccc cttttaatca 600 tagcatcttc ctgctggata caagccaacc cattttctag cttgcacgaa ccagtatggt 660 gcgcccccga acggctgggg cgacaggtat ggtggcgtgc actcgcggag cgactgcgac 720 agcttccccg cggcgctcaa ggccggctgc tactggcgat tcgactggtt tcaaaacgcc 780 gacaac 786 <210> 16 <211> 994

<212> DNA<212> DNA

<213> Acremonium thermophilum <220> <221> CDS <222> (13)..(95) <223> <220> <221> intron <222> (96)..(154) <223> <220> • · ·<213> Acremonium thermophilum <220> <221> CDS <222> (13) .. (95) <223> <220> <221> intron <222> (96) .. (154) <223> <220> • · ·

V : <221> CDSA: <221> CDS

<222> (155)..(403) • · i·: : <223> • · • · * • * · • · · · • · * :···** <220> <221> intron • · :·**·: <222> (404)..(526) • · * !···: <22 3> • · * · · • · · <220> ···<222> (155) .. (403) • · i ·:: <223> • · • · * • * · • · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · · : · ** ·: <222> (404) .. (526) • · *! ···: <22 3> • · * · · · · <220> ···

<221> CDS<221> CDS

• · <222> (527)..(986) page 14 • · <223> 119325 2052060FI.ST25.txt <400> 16 ggactgcgca tc atg cgc tcc tea ccc ttt etc ege gca get ctg get gee 51• · <222> (527) .. (986) page 14 • · <223> 119325 2052060EN.ST25.txt <400> 16 ggactgcgca tc recover cgc tcc tea ccc ttt etc ege gca get ctg get gee 51

Met Arg Ser Ser Pro Phe Leu Arg Ala Ala Leu Ala Ala 15 10 get ctg cct ctg age gee cat gee etc gac gga aag teg aeg ag 95Met Arg Ser Ser Pro Phe Leu Arg Ala Ala Leu Ala Ala 15 10 get ctg cct ctg age gee cat gee etc gac gga aag teg time ag 95

Ala Leu Pro Leu Ser Ala His Ala Leu Asp Gly Lys Ser Thr Arg 15 20 25 gtatgccaat cctcgtacct ctgccctctg tagaaacaag tgaccgactg caaagacag 154 a tae tgg gac tgc tgc aag eeg tec tgc ggc tgg gee gga aag gee teg 203Ala Leu Pro Leu Ser Ala His Ala Leu Asp Gly Lys Ser Thr Arg 15 20 25 gtatgccaat cctcgtacct ctgccctctg tagaaacaag tgaccgactg caaagacag 154 a tae tgg gac tgc tgc aag eeg tec tgc ggc tgg gee tegga

Tyr Trp Asp Cys Cys Lys Pro Ser cys Gly Trp Ala Gly Lys Ala Ser 30 35 40 gtg aac cag ccc gtc ttc teg tgc teg gee gac tgg cag cgc ate age 251 val Asn Gin Pro Val Phe Ser Cys Ser Ala Asp Trp Gin Arg lie ser 45 50 55 60 gac ttc aac geg aag teg ggc tgc gac gga ggc tec gee tae teg tgc 299Tyr Trp Asp Cys Cys Lys Pro Ser cys Gly Trp Ala Gly Lys Ala Ser 30 35 40 gtg aac cag ccc gtc ttc teg tgc teg gee gac tgg cag cgc ate age 251 h Asn Gin Pro Val Phe Ser Cys Ser Ala Asp Trp Gin Arg lie ser 45 50 55 60 gac ttc aac geg aag teg ggc tgc gac gga ggc tec gee tae teg tgc 299

Asp Phe Asn Ala Lys Ser Gly cys Asp Gly Gly Ser Ala Tyr Ser Cys 65 70 75 gee gac cag aeg ccc tgg geg gtc aac gac aac ttc teg tae ggc ttc 347Asp Phe Asn Ala Lys Ser Gly cys Asp Gly Gly Ser Ala Tyr Ser Cys 65 70 75 gee gac cag aeg ccc tgg geg gtc aac gac aac ttc teg tae ggc ttc 347

Ala Asp Gin Thr Pro Trp Ala Val Asn Asp Asn Phe Ser Tyr Gly Phe 80 85 90 gca gee aeg gee ate gee ggc ggc tec gag tec age tgg tgc tgc gee 395Ala Asp Gin Thr Pro Trp Ala Val Asn Asp Asn Phe Ser Tyr Gly Phe 80 85 90 gca gee aeg gee ate gee ggc ggc tec gag tec age tgg tgc tgc gee 395

Ala Ala Thr Ala lie Ala Gly Gly Ser Glu Ser Ser Trp Cys Cys Ala 95 100 105 tgc tat gc gtgagttctc tgcaagccgc ttcccacccc cgctttctgt 443 cys Tyr Ala 110 gcaggccgct tcccccctac ccacccactt cccccccccc gcctctgtga tcgggcatcc 503 gagetaagtt gcgtgtcgtc cag a etc ace ttc aac teg ggc ccc gtc geg 554 ’· : Leu Thr Phe Asn Ser Gly Pro val Ala 115 120 • · · ; ·*. ggc aag ace atg gtg gtg cag teg acc age ace ggc ggc gac ctg ggc 602 '···* Gly Lys Thr Met Val val Gin ser Thr ser Thr Gly Gly Asp Leu Gly • 125 130 135 • · · · • .*. age aac cag ttc gac etc gee ate ccc ggc ggc ggc gtg ggc ate ttc 650 ... : ser Asn Gin Phe Asp Leu Ala lie pro Gly Gly Gly Val Gly lie Phe 140 145 150 • · · aac ggc tgc gee tec cag ttc ggc ggc etc ccc ggc gee cag tae ggc 698Ala Ala Thr Ala lie Ala Gly Gly Ser Glu Ser Ser Trp Cys Cys Ala 95 100 105 TGC TAT GC gtgagttctc tgcaagccgc ttcccacccc cgctttctgt 443 cys Tyr Ala 110 gcaggccgct tcccccctac ccacccactt cccccccccc gcctctgtga tcgggcatcc 503 gagetaagtt gcgtgtcgtc CAG a etc ace ttc aac teg ggc ccc gtc May 554 '·: Leu Thr Phe Asn Ser Gly Pro val Ala 115 120 • · ·; · *. ggc aag ace reverse gtg gtg cag teg acc age ace ggc ggc gac ctg ggc 602 '··· * Gly Lys Thr Met Val val Gin ser Thr ser Thr Gly Gly Asp Leu Gly • 125 130 135 • · · ·. *. age aac cag ttc gac etc gee ate ccc ggc ggc ggc gtg ggc ate ttc 650 ...: ser Asn Gin Phe Asp Leu Ala lie pro Gly Gly Gly Val Gly lie Phe 140 145 150 • · · aac ggc tgc gee tec cag ttc ggc ggc etc ccc ggc gee cag tae ggc 698

Asn Gly Cys Ala Ser Gin Phe Gly Gly Leu Pro Gly Ala Gin Tyr Gly 155 160 165 • · :***: 99C ate age gac cgc age cag tgc teg tec ttc ccc geg ccg etc cag 746 ··· Gly lie Ser Asp Arg Ser Gin cys Ser Ser Phe Pro Ala Pro Leu Gin 170 175 180 • * » • · * M ccg ggc tgc cag tgg cgc ttc gac tgg ttc cag aac gee gac aac ccc 794 ·.,.· Pro Gly Cys Gin Trp Arg Phe Asp Trp Phe Gin Asn Ala Asp Asn Pro . 185 190 195 200 *· · 1 * : ·* acc ttc acc ttc cag cgc gtg cag tgc ccg tec gag etc aeg tec cgc 842 ....: Thr Phe Thr Phe Gin Arg val Gin Cys pro Ser Glu Leu Thr Ser Arg * * 205 210 215Asn Gly Cys Ala Ser Gin Phe Gly Gly Leu Pro Gly Ala Gin Tyr Gly 155 160 165 • ·: ***: 99C ate age gac cgc age cag tgc teg tec ttc ccc geg ccg etc cag 746 ··· Gly lie Ser Asp Arg Ser Gin cys Ser Ser Phe Pro Ala Pro Leu Gin 170 175 180 • * »• · * M ccg ggc tgc cag tgg cgc ttc gac tgg ttc cag aac gee gac aac ccc 794 ·.,. · Pro Gly Cys Gin Trp Arg Phe Asp Trp Phe Gin Asn Ala Asp Asn Pro. 185 190 195 200 * · · 1 *: · * acc ttc acc ttc cag cgc gtg cag tgc ccg tec gag etc aeg tec cgc 842 ....: Thr Phe Thr Phe Gin Arg val Gin Cys pro Ser Glu Leu Thr Ser Arg * * 205 210 215

Page 15 2052060FI.ST25.txt 119325 acg ggc tgt aag cgc gac gac gac gcc age tat ccc gtc ttc aac ccg 890Page 15 2052060EN.ST25.txt 119325 acg ggc tgt aag cgc gac gac gac gcc age tat ccc gtc ttc aac ccg 890

Thr Gly Cys Lys Arg Asp Asp Asp Ala Ser Tyr Pro Val Phe Asn Pro 220 225 230 cct age ggt ggc tee ccc age ace acc age ace ace ace age tee ccg 938Thr Gly Cys Lys Arg Asp Asp Asp Asp Ala Ser Tyr Pro Val Phe Asn Pro 220 225 230 cct age ggt ggc tee ccc age ace acc age ace ace ace age tee ccg 938

Pro Ser Gly Gly Ser Pro Ser Thr Thr Ser Thr Thr Thr Ser ser Pro 235 240 245 tee ggt ccc aeg ggc aac cct cct gga ggc ggt ggc tgc act gcc cag 986Pro Ser Gly Gly Ser Pro Ser Thr Thr Ser Thr Thr Thr Ser Ser Pro 235 240 245 tee ggt ccc time ggc aac cct cct gga ggc ggt ggc tgc act gcc cag 986

Ser Gly pro Thr Gly Asn Pro Pro Gly Gly Gly Gly cys Thr Ala Gin 250 255 260 tgactgca 994 <210> 17 <211> 264Ser Gly pro Thr Gly Asn Pro Pro Gly Gly Gly Gly cys Thr Ala Gin 250 255 260 tgactgca 994 <210> 17 <211> 264

<212> PRT<212> PRT

<213> Acremonium thermophilum <400> 17<213> Acremonium thermophilum <400> 17

Met Arg Ser Ser Pro Phe Leu Arg Ala Ala Leu Ala Ala Ala Leu Pro 15 10 15Met Arg Ser Ser Pro Phe Leu Arla Area Leu Area Area Area Leu Pro 15 10 15

Leu Ser Ala His Ala Leu Asp Gly Lys ser Thr Arg Tyr Trp Asp Cys 20 25 30Leu Ser Ala His Ala Leu Asp Gly Lys ser Thr Arg Tyr Trp Asp Cys 20 25 30

Cys Lys Pro Ser cys Gly Trp Ala Gly Lys Ala Ser val Asn Gin pro 35 40 45 val Phe ser cys ser Ala Asp Trp Gin Arg lie ser Asp Phe Asn Ala : 50 55 60 • *· • · *·« *·* * Lvs ser Gly cys Asp Gly Gly ser Ala Tyr ser Cys Ala Asp Gin Thr . 65 70 75 80 • · · • · ® · :.: : pro jrn Ala val Asn Asp Asn Phe Ser Tyr Gly Phe Ala Ala Thr Ala : .·. 85 90 95 • · *#· t #·Cys Lys Pro Ser cys Gly Trp Ala Gly Lys Ala Ser val Asn Gin pro 35 40 45 hrs Phe ser cys ser Ala Asp Trp Gin Arg lie ser Asp Phe Asn Ala: 50 55 60 • * · • · * · «* · * * Lvs ser Gly cys Asp Gly Gly ser Ala Tyr ser Cys Ala Asp Gin Thr. 65 70 75 80 • · · • · ® ·:.:: Pro jrn Ala val Asn Asp Asn Phe Ser Tyr Gly Phe Ala Ala Thr Ala:. ·. 85 90 95 • · * # · t # ·

Tip Ala Gly Gly ser Glu Ser ser Trp Cys Cys Ala Cys Tyr Ala Leu 100 105 110 • * *.V Thr Phe Asn Ser Gly Pro Val Ala Gly Lys Thr Met val val Gin Ser .···. 115 120 125 • · • * · :Y: Thr Ser Thr Gly Gly Asp Leu Gly Ser Asn Gin Phe Asp Leu Ala lie 130 135 140 • · • · ··* :*!*. Pro Gly Gly Gly Val Gly lie Phe Asn Gly Cys Ala ser Gin Phe Gly : .* 145 150 155 l°uTip Ala Gly Gly ser Glu Ser ser Trp Cys Cys Ala Cys Tyr Ala Leu 100 105 110 • * * .V Thr Phe Asn Ser Gly Pro Val Ala Gly Lys Thr Met val val Gin Ser. ···. 115 120 125 • · • * ·: Y: Thr Ser Thr Gly Gly Asp Leu Gly Ser Asn Gin Phe Asp Leu Ala lie 130 135 140 • · • · ·· *: *! *. Pro Gly Gly Gly Val Gly lie Phe Asn Gly Cys Ala ser Gin Phe Gly:. * 145 150 155 l ° u

Page 16 • · 119325 2052060FI.ST25.txtPage 16 • · 119325 2052060EN.ST25.txt

Gly Leu Pro Gly Ala Gin Tyr Gly Gly lie Ser Asp Arg Ser Gin Cys 165 170 175Gly Leu Pro Gly Alla Gin Tyr Gly Gly lie Ser Asp Arg Ser Gin Cys 165 170 175

Ser Ser Phe Pro Ala Pro Leu Gin Pro Gly Cys Gin Trp Arg Phe Asp 180 185 190Ser Ser Phe Pro Ala Pro Leu Gin Pro Gly Cys Gin Trp Arg Phe Asp 180 185 190

Trp Phe Gin Asn Ala Asp Asn Pro Thr Phe Thr Phe Gin Arg val Gin 195 200 205Trp Phe Gin Asn Lower Asp Asn Pro Thr Phe Thr Phe Gin Arg val Gin 195 200 205

Cys Pro Ser Glu Leu Thr Ser Arg Thr Gly Cys Lys Arg Asp Asp Asp 210 215 220Cys Pro Ser Glu Leu Thr Ser Arg Thr Gly Cys Lys Arg Asp Asp Asp 210 215 220

Ala Ser Tyr Pro Val Phe Asn pro Pro Ser Gly Gly Ser Pro Ser 240 225 230 235Ala Ser Tyr Pro Val Phe Asn pro Pro Ser Gly Gly Ser Pro Ser 240 225 230 235

Thr Ser Thr Thr Thr Ser Ser Pro Ser Gly Pr0 T^r G^y ASn 255 ΡΓ° 245 250Thr Ser Thr Thr Thr Ser Ser Pro Ser Gly Pr0 T ^ r G ^ y ASn 255 ΡΓ ° 245 250

Gly Gly Gly Gly Cys Thr Ala Gin 260 <210> 18 <211> 907Gly Gly Gly Gly Cys Thr Ala Gin 260 <210> 18 <211> 907

<212> DNA<212> DNA

<213> Acremonium thermophilum <220><213> Acremonium thermophilum <220>

<221> CDS<221> CDS

• ♦ ::y <222> (13) .. (95) • · · '·* ‘ <223> • · · • t I • · • · :·· ϊ <220> • · • · · ··· · <221> intron *···* <222> (96)..(154) <22 3> • »• ♦ :: y <222> (13) .. (95) • · · '· *' <223> • · · • t I • · • ·: ·· ϊ <220> • · • · · ··· · · <221> intron * ··· * <222> (96) .. (154) <22 3> • »

I · II · I

• * I • · ··» <220>• * I • · ·· »<220>

<221> CDS<221> CDS

O <222> (155)..(403) :v. <223> * · • · • ·O <222> (155) .. (403): v. <223> * · • · • ·

Page 17 <220> 2052060Fl.ST25.txt 119325 <221> Intron <222> (404)..(526) <223> <220>Page 17 <220> 2052060Fl.ST25.txt 119325 <221> Intron <222> (404) .. (526) <223> <220>

<221> CDS<221> CDS

<222> (527)..(899) <223> <400> 18 ggactgcgca tc atg cgc tcc tea ccc ttt etc ege gca get ctg get gee 51<222> (527) .. (899) <223> <400> 18 ggactgcgca tc recover cgc tcc tea ccc ttt etc ege gca get ctg get gee 51

Met Arg Ser Ser Pro Phe Leu Arg Ala Ala Leu Ala Ala 1 5 10 get ctg cct ctg age gee cat gee etc gac gga aag teg aeg ag 95Met Arg Ser Ser Pro Phe Leu Arg Ala Leu Ala Ala 1 5 10 get ctg cct ctg age gee cat gee etc gac gga aag teg time ag 95

Ala Leu Pro Leu Ser Ala His Ala Leu Asp Gly Lys Ser Thr Arg 15 20 25 gtatgccaat cctcgtacct ctgccctctg tagaaacaag tgacegactg caaagacag 154 a tae tgg gac tgc tgc aag eeg tec tgc ggc tgg gee gga aag gee teg 203Ala Leu Pro Leu Ser Ala His Ala Leu Asp Gly Lys Ser Thr Arg 15 20 25 gtatgccaat cctcgtacct ctgccctctg tagaaacaag tgacegactg caaagacag 154 a tae tgg gac tgc tgc aag eeg tec tgc ggc tgg gee gga aga

Tyr Trp Asp Cys Cys Lys Pro Ser Cys Gly Trp Ala Gly Lys Ala Ser 30 35 40 gtg aac cag ccc gtc ttc teg tgc teg gee gac tgg cag ege ate age 251 val Asn Gin Pro Val Phe Ser Cys ser Ala Asp Trp Gin Arg lie Ser 45 50 55 60 gac ttc aac geg aag teg ggc tgc gac gga ggc tec gee tae teg tgc 299Tyr Trp Asp Cys Cys Lys Pro Ser Cys Gly Trp Ala Gly Lys Ala Ser 30 35 40 gtg aac cag ccc gtc ttc teg tgc teg gee gac tgg cag ege ate age 251 h Asn Gin Pro Val Phe Ser Cys ser Ala Asp Trp Gin Arg lie Ser 45 50 55 60 gac ttc aac geg aag teg ggc tgc gac gga ggc tec gee tae teg tgc 299

Asp Phe Asn Ala Lys Ser Gly Cys Asp Gly Gly Ser Ala Tyr Ser Cys 65 70 75 • · ·*·*· gee gac cag aeg ccc tgg geg gtc aac gac aac ttc teg tae ggc ttc 347 • Ala Asp Gin Thr Pro Trp Ala Val Asn Asp Asn Phe Ser Tyr Gly Phe : 80 85 90 *·· • ·': gca gee aeg gee ate gee ggc ggc tec gag tec age tgg tgc tgc gee 395 ··· * Ala Ala Thr Ala lie Ala Gly Gly Ser Glu Ser Ser Trp Cys Cys Ala j95 loo 105 *·· · .***« tgc tat gc gtgagttctc tgcaagccgc ttcccacccc cgctttctgt 443 ··· Cys Tyr Ala 110 •V. gcaggccgct tcccccctac ccacccactt cccccccccc gcctctgtga tcgggcatcc 503 • · ·***. gagetaagtt gcgtgtcgtc cag a etc acc ttc aac teg ggc ccc gtc geg 554 ··· Leu Thr Phe Asn Ser Gly Pro val Ala ,..., 115 120 • · · ,··· ggc aag acc atg gtg gtg cag teg acc age acc ggc ggc gac ctg ggc 602 *...· Gly Lys Thr Met Val Val Gin Ser Thr Ser Thr Gly Gly Asp Leu Gly • 125 130 135 • · · • · · J ·* age aac cag ttc gac etc gee ate ccc ggc ggc ggc gtg ggc ate ttc 650 ·.·.: Ser Asn Gin Phe Asp Leu Ala lie Pro Gly Gly Gly Val Gly lie Phe 140 145 150Asp Phe Asn Ala Lys Ser Gly Cys Asp Gly Gly Ser Ala Tyr Ser Cys 65 70 75 • · · * · * · gee gac cag aeg ccc tgg geg gtc aac gac aac ttc teg tae ggc ttc 347 • Ala Asp Gin Thr Pro Trp Ala Val Asn Asp Asn Phe Ser Tyr Gly Phe: 80 85 90 * ·· • · ': gca gee aeg gee ate gee ggc ggc tec gag tec age tgg tgc tgc gee 395 ··· * Ala Ala Thr Ala lie Ala Gly Gly Ser Glu Ser Ser Trp Cys Cys Ala j95 loo 105 * ·· ·. *** «tgc tat gc gtgagttctc tgcaagccgc ttcccacccc cgctttctgt 443 ··· Cys Tyr Ala 110 • V. gcaggccgct tcccccctac ccacccactt cccccccccc gcctctgtga tcgggcatcc 503 • · · ***. gagetaagtt gcgtgtcgtc cag a etc acc ttc aac teg ggc ccc gtc May 554 ··· Leu Thr Phe Asn Ser Gly Pro val Ala, ..., 115 120 • · ·, ··· ggc aag acc recover gtg gtg cag teg acc age acc ggc ggc gac ctg ggc 602 * ... · Gly Lys Thr Met Val Val Gin Ser Thr Ser Thr Gly Gly Asp Leu Gly • 125 130 135 • · · • · · J · * age aac cag ttc gac etc gee ate ccc ggc ggc ggc gtg ggc ate ttc 650 ·. ·:: Ser Asn Gin Phe Asp Leu Alla Pro Pro Gly Gly Gly Val Gly lie Phe 140 145 150

Page 18 2052060FI.ST25.txt 119325 aac ggc tgc gcc tcc cag ttc ggc ggc etc ccc ggc gee cag tae ggc 698Page 18 2052060EN.ST25.txt 119325 aac ggc tgc gcc tcc cag ttc ggc ggc etc ccc ggc gee cag tae ggc 698

Asn Gly Cys Ala Ser Gin Phe Gly Gly Leu Pro Gly Ala Gin Tyr Gly 155 160 165 ggc ate age gac ege age cag tgc teg tec ttc ccc geg ccg etc cag 746Asn Gly Cys Ala Ser Gin Phe Gly Gly Leu Pro Gly Ala Gin Tyr Gly 155 160 165 ggc ate age gac ege age cag tgc teg tec ttc ccc geg ccg etc cag 746

Gly lie Ser Asp Arg Ser Gin Cys Ser ser phe Pro Ala Pro Leu Gin 170 175 180 ccg ggc tgc cag tgg ege ttc gac tgg ttc cag aac gcc gac aac ccc 794Gly lie Ser Asp Arg Ser Gin Cys Ser ser Phe Pro Ala Pro Leu Gin 170 175 180 ccg ggc tgc cag tgg ege ttc gac tgg ttc cag aac gcc gac aac ccc 794

Pro Gly Cys Gin Trp Arg Phe Asp Trp Phe Gin Asn Ala Asp Asn Pro 185 190 195 200 acc ttc acc ttc cag ege gtg cag tgc ccg tec gag etc aeg tec ege 842Pro Gly Cys Gin Trp Arg Phe Asp Trp Phe Gin Asn Ala Asp Asn Pro 185 190 195 200 acc ttc acc ttc cag ege gtg cag tgc ccg tec gag etc time tec ege 842

Thr Phe Thr Phe Gin Arg val Gin cys Pro Ser Glu Leu Thr Ser Arg 205 210 215 aeg ggc tgt aag ege gac gac gac gcc age tat ccc gtc ttc aac ccg 890Thr Phe Thr Phe Gin Arg val Gin cys Pro Ser Glu Leu Thr Ser Arg 205 210 215 aeg ggc tgt aag ege gac gac gac gcc age tat ccc gtc ttc aac ccg 890

Thr Gly Cys Lys Arg Asp Asp Asp Ala Ser Tyr Pro val Phe Asn Pro 220 225 230 cct age ggt tgactgca 907Thr Gly Cys Lys Arg Asp Asp Asp Asp Ala Ser Tyr Pro val Phe Asn Pro 220 225 230 cct age ggt tgactgca 907

Pro Ser Gly 235 <210> 19 <211> 235Pro Ser Gly 235 <210> 19 <211> 235

<212> PRT<212> PRT

<213> Acremonium thermophilum <400> 19<213> Acremonium thermophilum <400> 19

Met Arg ser Ser Pro Phe Leu Arg Ala Ala Leu Ala Ala Ala Leu Pro 15 10 15 • · :·**·: Leu Ser Ala His Ala Leu Asp Gly Lys Ser Thr Arg Tyr Trp Asp Cys 20 25 30 • * · *"·* Cvs Lys Pro Ser Cys Gly Trp Ala Gly Lys Ala Ser val Asn Gin Pro : 35 40 45 • « · ··* · • · · val Phe ser Cys Ser Ala Asp Trp Gin Arg lie Ser Asp Phe Asn Ala .**\ 50 55 60 • · ♦ *·Met Arg ser Ser Pro Phe Leu Arg Alla Leu Alla Alla Alla Leu Pro 15 10 15 • ·: · ** ·: Leu Ser Alla His Alla Leu Asp Gly Lys Ser Thr Arg Tyr Trp Asp Cys 20 25 30 • * · * "· * Cvs Lys Pro Ser Cys Gly Trp Ala Gly Lys Ala Ser val Asn Gin Pro: 35 40 45 •« · ·· * · • · · val Phe ser Cys Ser Ala Asp Trp Gin Arg lie Ser Asp Phe Asn Ala. ** \ 50 55 60 • · ♦ * ·

Lys Ser Gly Cys Asp Gly Gly ser Ala Tyr Ser Cys Ala Asp Gin Thr 65 70 75 80 • · • I* • f ***** Pro ttd Ala Val Asn Asp Asn Phe Ser Tyr Gly Phe Ala Ala Thr Ala 85 90 95 • · · • * · • · ;’**: He Ala Gly Gly Ser Glu Ser Ser Trp Cys cys Ala Cys Tyr Ala Leu *" 100 105 no ·· · « * · • · ....: Thr Phe Asn Ser Gly Pro val Ala Gly Lys Thr Met val val Gin ser • · US 120 125Lys Ser Gly Cys Asp Gly Gly ser Ala Tyr Ser Cys Ala Asp Gin Thr 65 70 75 80 • · • I * • f ***** Pro ttd Ala Val Asn Asp Asn Phe Ser Tyr Gly Phe Ala Thr Ala 85 90 95 • · · • * · • ·; '**: He Ala Gly Gly Ser Glu Ser Ser Trp Cys cys Ala Cys Tyr Ala Leu * "100 105 no ·· ·« * · • · ....: Thr Phe Asn Ser Gly Pro val Ala Gly Lys Thr Met val val Gin ser • · US 120 125

Page 19 2052060FI.ST25.txt 1 1 9325Page 19 2052060EN.ST25.txt 1 1 9325

Thr ser Thr Gly Gly Asp Leu Gly ser Asn Gin Phe Asp Leu Ala lie 130 135 140 pro Gly Gly Gly Val Gly lie Phe Asn Gly Cys Ala Ser Gin Phe Gly 145 150 155 160Thr ser Thr Gly Gly Asp Leu Gly ser Asn Gin Phe Asp Leu Ala lie 130 135 140 pro Gly Gly Gly Val Gly lie Phe Asn Gly Cys Ala Ser Gin Phe Gly 145 150 155 160

Gly Leu Pro Gly Ala Gin Tyr Gly Gly lie Ser Asp Arg Ser Gin Cys 165 170 175 ser Ser Phe Pro Ala Pro Leu Gin Pro Gly Cys Gin Trp Arg Phe Asp 180 185 190Gly Leu Pro Gly Ala Gin Tyr Gly Gly lie Ser Asp Arg Ser Gin Cys 165 170 175 ser Ser Phe Pro Ala Pro Leu Gin Pro Gly Cys Gin Trp Arg Phe Asp 180 185 190

Trp Phe Gin Asn Ala Asp Asn Pro Thr Phe Thr Phe Gin Arg val Gin 195 200 205Trp Phe Gin Asn Lower Asp Asn Pro Thr Phe Thr Phe Gin Arg val Gin 195 200 205

Cys pro Ser Glu Leu Thr Ser Arg Thr Gly Cys Lys Arg Asp Asp Asp 210 215 220Cys pro Ser Glu Leu Thr Ser Arg Thr Gly Cys Lys Arg Asp Asp Asp 210 215 220

Ala Ser Tyr pro val Phe Asn Pro Pro Ser Gly 225 230 235 <210> 20 <211> 1175Ala Ser Tyr pro val Phe Asn Pro Pro Ser Gly 225 230 235 <210> 20 <211> 1175

<212> DNA<212> DNA

<213> Acremoni urn thermophilum <220> • · * 9 ·<213> Acremoni urn thermophilum <220> • · * 9 ·

• · <221> CDS• · <221> CDS

··· !·**4: <222> CD (444) • · · ··· <223> • · • · I « * · ·*· · * <220> ··· • « *···* <221> intron <222> (445)..(599) • · · • t · • « <223> *·· e · • I ·** *X! <220> ·*····! · ** 4: <222> CD (444) • · · ··· <223> • · • · I «* · · * · · * <220> ··· •« * ··· * <221> intron <222> (445) .. (599) • · · • t · • «<223> * ·· e · • I · ** * X! <220> · * ·

!...: <221> CDS! ...: <221> CDS

•V. <222> (600)..(630) • · ···♦· <223>• V. <222> (600) .. (630) • · ··· ♦ · <223>

Page 20 <220> 119325 2052060FI.ST25.txt <221> intron <222> (631)..(732) <223> <220>Page 20 <220> 119325 2052060EN.ST25.txt <221> intron <222> (631) .. (732) <223> <220>

<22l> CDS<22l> CDS

<222> (733)..(1172) <223> <400> 20 atg cgt etc cca eta ccg act ctg etc gee etc ttg ccc tae tae etc 48<222> (733) .. (1172) <223> <400> 20 atm cgt etc cca eta ccg act ctg etc gee etc ttg ccc tae tae etc 48

Met Arg Leu Pro Leu Pro Thr Leu Leu Ala Leu Leu Pro Tyr Tyr Leu 15 10 15 gaa gtg tee get cag ggg gca tee gga ace ggc aeg aca aea cgt tae 96Met Arg Leu Pro Leu Pro Thr Leu Leu Area Leu Leu Pro Tyr Tyr Leu 15 10 15 gaa gtg tee get cag ggg gca tee gga ace ggc time aca aea cgt tae 96

Glu val Ser Ala Gin Gly Ala Ser Gly Thr Gly Thr Thr Thr Arg Tyr 20 25 30 tgg gat tgc tgc aag ccg age tgc geg tgg cct ctg aag ggc aat teg 144Glu val Ser Ala Gin Gly Ala Ser Gly Thr Gly Thr Thr Thr Arg Tyr 20 25 30 tgg gat tgc tgc aag ccg age tgc geg tgg cct ctg aag ggc aat teg 144

Trp Asp Cys Cys Lys Pro Ser Cys Ala Trp Pro Leu Lys Gly Asn Ser 35 40 45 ccc age ccg gtg cag act tgc gac aag aat gac agg ccg ctg aac gat 192Trp Asp Cys Cys Lys Pro Ser Cys Ala Trp Pro Leu Lys Gly Asn Ser 35 40 45 ccc age ccg gtg cag act tgc gac aag aat gac agg ccg ctg aac gat 192

Pro Ser Pro val Gin Thr Cys Asp Lys Asn Asp Arg Pro Leu Asn Asp 50 55 60 ggg gga aac acc aag tee ggc tgc gac aac ggt ggc ggg gee ttc atg 240Pro Ser Pro val Gin Thr Cys Asp Lys Asn Asp Arg Pro Leu Asn Asp 50 55 60 ggg gga aac acc aag tee ggc tgc gac aac ggt ggc ggg gee ttc atm 240

Gly Gly Asn Thr Lys Ser Gly cys Asp Asn Gly Gly Gly Ala Phe Met 65 70 75 80 • · ·***· tgc tea tee cag agt ccc tgg gee gtc aat gag acc acc age tae ggc 288 * Cys Ser Ser Gin Ser Pro Trp Ala Val Asn Glu Thr Thr ser Tyr Gly ; ;*: 85 90 95 ·*· Ϊ tgg gca gee gtt cgt ate gee ggc agt acc gag teg gee tgg tgc tgt 336 *·· ’ Trp Ala Ala Val Arg lie Ala Gly Ser Thr Glu Ser Ala Trp Cys Cys : :*j 100 105 no ··# · ·’**· gee tgc tae gag etc acc ttc acc agt ggg ccc gtc agt gga aag aag 384 ··· Ala Cys Tyr Glu Leu Thr Phe Thr Ser Gly Pro Val ser Gly Lys Lys 115 120 125 etc ata gtc cag gee aeg aac act ggt gga gac ett ggg age aac cac 432 * · Leu lie val Gin Ala Thr Asn Thr Gly Gly Asp Leu Gly Ser Asn His : : 130 135 140 * a· ,«*·. ttt gac ett geg gtatgtgggg tttttctttc ttcatcatcg ctctcaccat 484 V,· Phe Asp Leu Ala . 145 • ♦ ggattcctcg gcgcaaggac caagattgag aagcgtcaat gccgggttgg acacgggagc 544 • · · * \ cgggatagga acacagaggc cgtttaagac cgtcagctga cagcagagca attag att 602 ··.«: lieGly Gly Asn Thr Lys Ser Gly cys Asp Asn Gly Gly Gly Ala Phe Met 65 70 75 80 • · · *** · tgc tea tee cag agt ccc tgg gee gtc aat gag acc acc age tae ggc 288 * Cys Ser Ser Gin Ser Pro Trp Ala Val Asn Glu Thr Thr ser Tyr Gly; ; *: 85 90 95 · * · Ϊ tgg gca gee gtt cgt ate gee ggc agt acc gag teg gee tgg tgc tgt 336 * ·· 'Trp Ala Ala Val Arg lie Ala Gly Ser Thr Glu Ser Ala Trp Cys Cys:: * j 100 105 no ·· # · · '** · gee tgc tae gag etc acc ttc acc agt ggg ccc gtc agt gga aag aag 384 ··· Ala Cys Tyr Glu Leu Thr Phe Thr Ser Gly Pro Val ser Gly Lys Lys 115 120 125 etc ata gtc cag gee aeg aac act ggt gga gac ett ggg age aac cac 432 * · Leu lie val Gin Ala Thr Asn Thr Gly Gly Asp Leu Gly Ser Asn His:: 130 135 140 * a ·, «* ·. ttt gac ett geg gtatgtgggg tttttctttc ttcatcatcg ctctcaccat 484 V, · Phe Asp Leu Ala. 145 • ♦ ggattcctcg gcgcaaggac caagattgag aagcgtcaat gccgggttgg acacgggagc 544 • · · * \ cgggatagga acacagaggc cgtttaagac cgtcagctga cagcagagca attag att 602 ··. «: Lie

Page 21 2052060FI.ST25.txtPage 21 2052060EN.ST25.txt

1 1 9 λ 9 R1 1 9 λ 9 R

ccc gga ggt ggt gtt ggt cag tee aat g gtaggttcct tccctgaagt 650ccc gga ggt ggt gtt ggt cag tee aat g gtaggttcct tccctgaagt 650

Pro Gly Gly Gly vai Gly Gin Ser Asn 150 155 accggcaaca gcctgtgcgt tgctgtatac cccttttaat catagcatct tcctgctgga 710 tacaagccaa cccattttct ag et tgc acg aac cag tat ggt gcg ccc eeg 761Pro Gly Gly Gly or Gly Gin Ser Asn 150 155 accggcaaca gcctgtgcgt tgctgtatac cccttttaat catagcatct tcctgctgga 710 tacaagccaa cccattttct ag et tgc acg aac cag tat ggt gcg ccc eeg 761

Ala Cys Thr Asn Gin Tyr Gly Ala Pro Pro 160 165 aac ggc tgg ggc gae agg tat ggt ggc gtg cac teg egg age gae tgc 809Ala Cys Thr Asn Gin Tyr Gly Ala Pro Pro 160 165 aac ggc tgg ggc gae agg tat ggt ggc gtg cac teg egg age gae tgc 809

Asn Gly Trp Gly Asp Arg Tyr Gly Gly vai Hi s Ser Arg Ser Asp Cys 170 175 180 gae age ttc ccc gcg gcg etc aag gee ggc tgc tae tgg cga ttc gae 857Asn Gly Trp Gly Asp Arg Tyr Gly Gly or Hi s Ser Arg Ser Asp Cys 170 175 180 gae age ttc ccc gcg gcg etc aag gee ggc tgc tae tgg cga ttc gae 857

Asp Ser Phe Pro Ala Ala Leu Lys Ala Gly Cys Tyr Trp Arg Phe Asp 185 190 195 200 tgg ttc cag ggc gee gae aac eeg tee gtg age ttc aaa cag gta gee 905Asp Ser Phe Pro Ala Ala Leu Lys Ala Gly Cys Tyr Trp Arg Phe Asp 185 190 195 200 tgg ttc cag ggc gee gae aac eeg tee gtg age ttc aaa cag gta gee 905

Trp phe Gin Gly Ala Asp Asn Pro Ser Vai Ser Phe Lys Gin vai Ala 205 210 215 tgc eeg gca gee ate aca get aag age ggc tgt act cgc cag aac gat 953Trp Phe Gin Gly Ala Asp Asn Pro Ser Or Ser Phe Lys Gin Or Ala 205 210 215 tgc eeg gca gee ate aca get aag age ggc tgt act cgc cag aac gat 953

Cys Pro Ala Ala Ile Thr Ala Lys Ser Gly Cys Thr Arg Gin Asn Asp 220 225 230 gee ate aac gag act eeg act ggg ccc age ggt ggc tee ccc age acc 1001Cys Pro Ala Ala Ile Thr Ala Lys Ser Gly Cys Thr Arg Gin Asn Asp 220 225 230 gee ate aac gag act eeg act ggg ccc age ggt ggc tee ccc age acc 1001

Ala Ile Asn Glu Thr Pro Thr Gly Pro Ser Gly Gly Ser Pro Ser Thr 235 240 245 acc age acc acc acc age tee eeg tee ggt ccc acg ggc aac eet eet 1049Ala Ile Asn Glu Thr Pro Thr Gly Pro Ser Gly Gly Ser Pro Ser Thr 235 240 245 acc age acc acc acc age tee eeg tee ggt ccc acg ggc aac eet eet 1049

Thr ser Thr Thr Thr Ser Ser Pro Ser Gly Pro Thr Gly Asn Pro Pro 250 255 260 gga ggc ggt ggc tgc act gee cag aag tgg gee cag tgc ggc ggc act 1097Thr ser Thr Thr Thr Ser Ser Pro Ser Gly Pro Thr Gly Asn Pro Pro 250 255 260 gga ggc ggt ggc tgc act gee cag aag tgg gee cag tgc ggc ggc act 1097

Gly Gly Gly Gly Cys Thr Ala Gin Lys Trp Ala Gin Cys Gly Gly Thr 265 270 275 280 ggc ttc acg ggc tgc acc acc tgc gtc tcg ggc acc acc tgc cag gtg 1145 , . Gly Phe Thr Gly Cys Thr Thr Cys Vai Ser Gly Thr Thr cys Gin Vai : ·.: 285 290 295 • · cag aac cag tgg tat tee cag tgt ctg tga 1175 * Gin Asn Gin Trp Tyr ser Gin cys Leu ! ; : 300 305 f*· e · • » t :,i : <210> 21 • · * * · !;;t! <2ii> 305 • · **··* <212> prt . , <213> Aeremonium thermophilum • e » • i « • · ·*· • · *·:** <400> 21 • ‘,V Met Arg Leu pro Leu Pro Thr Leu Leu Ala Leu Leu Pro Tyr Tyr Leu .·*·. 1 5 10 15 • · ·«· j*·*· Glu vai ser Ala Gin Gly Ala ser Gly Thr Gly Thr Thr Thr Aro Tvr * *, 20 25 30 y yGly Gly Gly Gly Gly Cys Thr Ala Gin Lys Trp Ala Gin Cys Gly Gly Thr 265 270 275 280 ggc ttc acg ggc tgc acc acc tgc gtc tcg ggc acc acc tgc cag gtg 1145 ,. Gly Phe Thr Gly Cys Thr Thr Cys Vai Ser Gly Thr Thr cys Gin Vai: ·: 285 290 295 • · cag aac cag tgg tat tee cag tgt ctg tga 1175 * Gin Asn Gin Trp Tyr ser Gin cys Leu! ; : 300 305 f * · e · • »t:, i: <210> 21 • · * * ·! ;; t! <2ii> 305 • · ** ·· * <212> prt. , <213> Aeremonium thermophilum • e »• i« • · · * · • * *: ** <400> 21 • ', V Met Arg Leu pro Leu Pro Thr Leu Leu Alla Leu Pro Tyr Tyr Leu. · * ·. 1 5 10 15 • · · «· j * · * · Glu or ser Ala Gin Gly Ala ser Gly Thr Thr Thr Thr Aro Tvr * *, 20 25 30 y y

• I• I

Page 22 119325 2052060FI.ST25.txtPage 22 119325 2052060EN.ST25.txt

Trp Asp Cys Cys Lys Pro Ser cys Ala Trp Pro Leu Lys Gly Asn Ser 35 40 45 pro Ser Pro val Gin Thr cys Asp Lys Asn Asp Arg Pro Leu Asn Asp 50 55 60Trp Asp Cys Cys Lys Pro Ser cys Lower Trp Pro Leu Lys Gly Asn Ser 35 40 45 pro Ser Pro val Gin Thr cys Asp Lys Asn Asp Arg Pro Leu Asn Asp 50 55 60

Gly Gly Asn Thr Lys ser Gly cys Asp Asn Gly Gly Gly Ala Phe Met 65 70 75 80Gly Gly Asn Thr Lys ser Gly cys Asp Asn Gly Gly Gly Ala Phe Met 65 70 75 80

Cys Ser Ser Gin Ser Pro Trp Ala val Asn Glu Thr Thr Ser Tyr Gly 85 90 95Cys Ser Ser Gin Ser Pro Trp Ala val Asn Glu Thr Thr Ser Tyr Gly 85 90 95

Trp Ala Ala Val Arg lie Ala Gly Ser Thr Glu Ser Ala Trp cys Cys 100 105 110Trp Ala Ala Val Arg lie Ala Gly Ser Thr Glu Ser Ala Trp cys Cys 100 105 110

Ala Cys Tyr Glu Leu Thr Phe Thr Ser Gly Pro Val Ser Gly Lys Lys 115 120 125Ala Cys Tyr Glu Leu Thr Phe Thr Ser Gly Pro Val Ser Gly Lys Lys 115 120 125

Leu lie Val Gin Ala Thr Asn Thr Gly Gly Asp Leu Gly Ser Asn His 130 135 140 phe Asp Leu Ala lie Pro Gly Gly Gly val Gly 01° Ser Asn Ala Cys 145 150 155 160Leu lie Val Gin Ala Thr Asn Thr Gly Gly Asp Leu Gly Ser Asn His 130 135 140 Phe Asp Leu Ala lie Pro Gly Gly Gly val Gly 01 ° Ser Asn Ala Cys 145 150 155 160

Thr Asn Gin Tyr Gly Ala Pro Pro Asn Gly Trp Gly Asp Arg Tyr Gly 165 170 175Thr Asn Gin Tyr Gly Ala Pro Pro Asn Gly Trp Gly Asp Arg Tyr Gly 165 170 175

Gly val His Ser Arg ser Asp Cys Asp Ser Phe Pro Ala Ala Leu Lys 180 185 190Gly val His Ser Arg ser Asp Cys Asp Ser Phe Pro Ala Ala Leu Lys 180 185 190

Ala Gly Cys Tyr Trp Arg Phe Asp Trp Phe Gin Gly Ala Asp Asn Pro .·. : 195 200 205 • ·· • · '·* * ser val ser Phe Lys Gin val Ala cys Pro Ala Ala lie Thr Ala Lys . 210 215 220 • · · ·«· • · :.: ϊ ser Gly cys Thr Arg Gin Asn Asp Ala lie Asn Glu Thr Pro Thr Gly : 225 230 235 • « · «·· * *···* pro Ser Gly Gly Ser Pro Ser Thr Thr Ser Thr Thr Thr Ser ser Pro 245 250 :.V ser Gly Pro Thr Gly Asn Pro Pro Gly Gly Gly Gly Cys Thr Ala GinAla Gly Cys Tyr Trp Arg Phe Asp Trp Phe Gin Gly Ala Asp Asn Pro. ·. : 195 200 205 • ·· • · '· * * ser val ser Phe Lys Gin val Ala cys Pro Ala Ala lie Thr Ala Lys. 210 215 220 • · · · «· •:.: Ϊ ser Gly cys Thr Arg Gin Asn Asp Ala lie Asn Glu Thr Pro Thr Gly: 225 230 235 •« · «·· * * ··· * pro Ser Gly Gly Ser Pro Ser Thr Thr Ser Thr Thr Ser Ser Pro 245 250: .V ser Gly Pro Thr Gly Asn Pro Pro Gly Gly Gly Gly Cys Thr Ala Gin

···. 260 265 4/U···. 260 265 4 / U

• * ··· :Yi lvs Trp Ala Gin Cys Gly Gly Thr Gly Phe Thr Gly Cys Thr Thr Cys * * y 275 280 • · • · ♦·*·. val Ser Gly Thr Thr cys Gin Val Gin Asn Gin Trp Tyr Ser Gin cys Ϊ .* 290 295 « ·• * ···: Yi lvs Trp Ala Gin Cys Gly Gly Thr Gly Phe Thr Gly Cys Thr Thr Cys * * y 275 280 • · • · ♦ · * ·. val Ser Gly Thr Thr cys Gin Val Gin Asn Gin Trp Tyr Ser Gin cys Ϊ. * 290 295 «·

Page 23 119325 2052060FI.ST25.txtPage 23 119325 2052060EN.ST25.txt

Leu 305 • · • · · « ft· ft · »·· « ft · ft ft · ft « • 1 · • · · • •ft • · • · ft • · · ·1» « • · ft · · • « ( ··· · • •ft « 1 ft · ft·· » · ft ft 1 • ft 1 ft ft • ft· ft · ft · • ft· • ft ft • ft · ft · · ft ft page 24 ft1 • · ft · • •ft ft • ft ft ϊ ·: • ·Leu 305 • · • · «« ft · ft · »··« ft · ft ft · ft «• 1 · • · • • ft • • • ft · · ft. «(··· · • • ft« 1 ft · ft ·· »· ft ft 1 • ft 1 ft ft • ft · ft · ft · • ft ft • ft · ft · · ft ft page 24 ft1 • · ft · • • ft ft • ft ft ϊ ·: • ·

Claims (21)

1. Endoglukanaspolypeptid, kännetecknad avatt den innehäller ett fragment som har cellulolytisk aktivitet och som valts bland gruppen 5 som bestär av: (a) en polypeptid som innehäller en aminosyrasekvens, som till ät-minstone 80 % är identisk med sekvens nr 2; och (b) ett fragment av a) med cellulolytisk aktivitet.An endoglucanase polypeptide, characterized in that it contains a fragment having cellulolytic activity and selected from the group consisting of: (a) a polypeptide containing an amino acid sequence which is at least 80% identical to sequence # 2; and (b) a fragment of a) having cellulolytic activity. 2. Endoglukanaspolypeptid enligt patentkrav 1, känneteck-10 n a d av att dess aminosyrasekvens är ätminstone 85 %, förträdesvis 90 %, fördelaktigare 95 % ja mest fördelaktigt 98 % identisk med sekvens nr 2.2. Endoglucanase polypeptide according to claim 1, characterized in that its amino acid sequence is at least 85%, preferably 90%, more advantageous 95%, and most advantageously 98% identical to sequence # 2. 3. Endoglukanaspolypeptid enligt patentkrav 1, kännetecknad av att den har en aminosyrasekvens i enlighet med sekvens nr 2.Endoglucanase polypeptide according to claim 1, characterized in that it has an amino acid sequence according to sequence # 2. 4. Endoglukanaspolypeptid enligt patentkrav 1, känneteck-15 n a d av att fragmentet har en aminosyrasekvens enligt sekvens nr 17 eller sekvens nr 19.The endoglucanase polypeptide of claim 1, characterized in that the fragment has an amino acid sequence of sequence # 17 or sequence # 19. 5. Endoglukanaspolypeptid enligt patentkrav 1, kännetecknad av att den kan erhallas ur eller härstammar frän Acremonium sp., före-trädesvis Acremonium thermophilum.5. Endoglucanase polypeptide according to claim 1, characterized in that it can be obtained from or derived from Acremonium sp., Preferably Acremonium thermophilum. 6. Endoglukanaspolypeptid enligt patentkrav 5, känneteck- : n a d av att Acremonium sp. är CBS 116240. *· *ί ΓThe endoglucanase polypeptide of claim 5, characterized in that Acremonium sp. is CBS 116240. * · * ί Γ 7. Isolerad polynukleotid, kännetecknad avatt den kodar en • * · endoglukanaspolypeptid enligt nagot av patentkraven 1 - 6.An isolated polynucleotide, characterized in that it encodes an endoglucanase polypeptide according to any one of claims 1 to 6. • · · .*" 8. Isolerad polynukleotid enligt patentkrav 7, kännetecknad !*Y 25 av att den har en nukleotidsekvens som valts bland gruppen bestäende av: • · · (a) en sekvens enligt sekvens nr 1, sekvens nr 16 eller sekvens nr 18, (b) en komplementär sträng av (a) :V: (c) ett fragment innehallande minst 20 nukleotider av (a) eller (b); :***: 30 och • · · (d) en sekvens som är degenererad till följd av den genetiska koden i förhällande till i (a), (b) eller (c) definierad sekvens.An isolated polynucleotide according to claim 7, characterized in that it has a nucleotide sequence selected from the group consisting of: • · · (a) a sequence according to sequence # 1, sequence # 16 or sequence No. 18, (b) a complementary strand of (a): V: (c) a fragment containing at least 20 nucleotides of (a) or (b); ***: 30 and (d) a sequence which is degenerate as a result of the genetic code in relation to (a), (b) or (c) defined sequence. • · *.··* 9. Expressionsvektor, kännetecknad avatt den innehäller en :***: polynukleotidsekvens som kodar en endoglukanaspolypeptid enligt nägot av ·:··· 35 patentkraven 1 - 6. 119325 47The expression vector, characterized in that it contains a: ***: polynucleotide sequence encoding an endoglucanase polypeptide according to any of the claims: ··· 35 claims 1 - 6. 10. Värdcell, kännetecknad avatt den innehäller en expres-sionsvektor enligt patentkrav 9.A host cell, characterized in that it contains an expression vector according to claim 9. 11. Värdcell enligt patentkrav 10, kännetecknad avatt den härstammarfrän en svamp. 5Host cell according to claim 10, characterized in that it is derived from a fungus. 5 12. Värdcell enligt patentkrav 11,kännetecknad avatt den är Trichoderma reesei.Host cell according to claim 11, characterized in that it is Trichoderma reesei. 13. Förfarande för framställning av en endoglukanaspolypeptid enligt nägotavpatentkraven 1 -6, kännetecknat avattförfarandetomfattar ett steg där man odlar en värdcell enligt nägot av patentkraven 10-12.A method for producing an endoglucanase polypeptide according to the claims patent claims 1-6, characterized by the abatement process comprising a step of growing a host cell according to any of claims 10-12. 14. Enzympreparat, kännetecknat avattdet innehäller en en doglukanaspolypeptid enligt nägot av patentkraven 1-6.Enzyme preparation, characterized in that it contains a doglucanase polypeptide according to any one of claims 1-6. 15. Förfarande för biostentvätt, kännetecknat avatt förfarandet omfattar ett steg där man tillför en endoglukanaspolypeptid enligt nägot av patentkraven 1-6, eller ett preparat enligt patentkrav 14 tili ett tyg eller klä- 15 desplagg som innehäller bomull, säsom denim.A method of biostate washing, characterized by the method comprising a step of adding an endoglucanase polypeptide according to any one of claims 1-6, or a preparation according to claim 14 to a fabric or garment containing cotton, such as denim. 16. Förfarande för biofinishing, kännetecknat avatt förfarande omfattar ett steg där man tillför en endoglukanaspolypeptid enligt nägot av patentkraven 1-6, eller ett preparat enligt patentkrav 14 tili ett textilmaterial säsom tyger, kläder eller träd.A method for biofinishing, characterized by the process comprising a step of adding an endoglucanase polypeptide according to any of claims 1-6, or a preparation according to claim 14 to a textile material such as fabrics, clothing or trees. 17. Tvättmedelskomposition, kännetecknad avatt den inne häller en endoglukanaspolypeptid enligt nägot av patentkraven 1-6, eller ett preparat enligt patentkrav 14 och hjälpmedel, säsom ytaktiva ämnen, surfak-tanter, blekmedel eller fyllnadsmedel.A detergent composition, characterized in that it contains an endoglucanase polypeptide according to any one of claims 1-6, or a preparation according to claim 14 and auxiliaries, such as surfactants, surfactants, bleaches or fillers. . 18. Förfarande för att behandla textilmaterial som innehäller cellulo- • · * : 25 safiber, kännetecknat av att man i förfarandet bringar textilmaterialet i • · · j* V kontakt med en tvättmedelskomposition enligt patentkrav 17.. A method for treating textile material containing cellulose safer, characterized in that in the method, the textile material is brought into contact with a detergent composition according to claim 17. 19. Förfarande för att behandla en ur trä härledd massa eller fiber, • · ***·’ kännetecknat av att förfarande omfattar ett steg där man tillsätter en en doglukanaspolypeptid enligt nägot av patentkraven 1-6, eller ett preparat en- \v 30 ligt patentkrav 14 i en ur trä härledd eller mekanisk massa eller sekundärfiber. ··»A method of treating a wood-derived pulp or fiber, characterized in that the method comprises a step of adding a doglucanase polypeptide according to any of claims 1-6, or a preparation according to claim 1. Claim 14 in a wood-derived or mechanical pulp or secondary fiber. ·· " 20. Förfarande för att förbättra kvaliteten i djurfoder, kanne- tecknat av att man i förfarandet behandlar växtmaterial med en endogluka- .·*·. naspolypeptid enligt nägot av patentkraven 1 - 6 eller med ett preparat enligt • · "* patentkrav 14. ·· · ϊ V 3520. A method for improving the quality of animal feed, characterized in that the plant material is treated with an endoglucose in the process. nasal polypeptide according to any of claims 1-6 or with a preparation according to claim 14. ·· · ϊ V 35 21. Escherichia co//-stam med deponeringsnummer DSM 17324. * • ·21. Escherichia co // - strain with deposit number DSM 17324. * • ·
FI20055692A 2005-12-22 2005-12-22 New endoglucanase polypeptides and their preparation and use FI119325B (en)

Priority Applications (10)

Application Number Priority Date Filing Date Title
FI20055692A FI119325B (en) 2005-12-22 2005-12-22 New endoglucanase polypeptides and their preparation and use
PCT/FI2006/050560 WO2007071820A1 (en) 2005-12-22 2006-12-15 Novel enzymes
BRPI0620318A BRPI0620318B1 (en) 2005-12-22 2006-12-15 endoglycanase fusion protein, isolated polynucleotide, expression vector, trichoderma reesei host cell, enzyme preparation, detergent composition, escherichia coli strain, and processes for producing an endoglycanase polypeptide, for bioassay, for biofinishing, for textile processing containing cellulosic fiber, for treating pulp or wood-derived fiber, and for improving feed quality
MX2008008225A MX2008008225A (en) 2005-12-22 2006-12-15 Novel enzymes.
ES06830937.6T ES2637008T3 (en) 2005-12-22 2006-12-15 New enzymes
CN2006800487923A CN101346464B (en) 2005-12-22 2006-12-15 Novel enzymes
EP06830937.6A EP1969123B1 (en) 2005-12-22 2006-12-15 Novel enzymes
DK06830937.6T DK1969123T3 (en) 2005-12-22 2006-12-15 Hitherto UNKNOWN ENZYMS
PE2006001674A PE20071180A1 (en) 2005-12-22 2006-12-21 COMPOSITION THAT INCLUDES ENZYMES WITH CELLULOLYTIC ACTIVITY
PE2010000986A PE20231179A1 (en) 2005-12-22 2006-12-21 NEW ENZYMES

Applications Claiming Priority (2)

Application Number Priority Date Filing Date Title
FI20055692 2005-12-22
FI20055692A FI119325B (en) 2005-12-22 2005-12-22 New endoglucanase polypeptides and their preparation and use

Publications (3)

Publication Number Publication Date
FI20055692A0 FI20055692A0 (en) 2005-12-22
FI20055692A FI20055692A (en) 2007-06-23
FI119325B true FI119325B (en) 2008-10-15

Family

ID=35510770

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
FI20055692A FI119325B (en) 2005-12-22 2005-12-22 New endoglucanase polypeptides and their preparation and use

Country Status (2)

Country Link
CN (1) CN101346464B (en)
FI (1) FI119325B (en)

Families Citing this family (8)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN101906406B (en) * 2010-06-24 2012-10-17 复旦大学 Difunctional enzyme with endoglucanase/xylanase and preparation method and application thereof
CN102363748B (en) * 2011-09-30 2012-11-07 中国科学院南海海洋研究所 New fungus Acremonium sp. DPZ-SYz-2-3 for high efficiency cellulose degradation and application thereof
CN103923933B (en) * 2014-04-28 2016-09-14 江苏大学 The reconstruction method of cellulase body gene and the cellulase of acquisition
FI127093B (en) * 2014-10-27 2017-11-15 Ab Enzymes Oy Fungal endoglucanase variants, preparation and use thereof
CN108823188B (en) * 2018-06-15 2020-12-08 华中科技大学 Endoglucanase, and coding gene and application thereof
EP3653705A1 (en) * 2018-11-13 2020-05-20 AB Enzymes Oy Fungal cellulase variants with improved stability
EP3653706A1 (en) * 2018-11-13 2020-05-20 AB Enzymes Oy Fusion protein
US20220204956A1 (en) * 2020-12-22 2022-06-30 Fornia Biosolutions, Inc. Additional Endoglucanase Variants and Methods

Family Cites Families (5)

* Cited by examiner, † Cited by third party
Publication number Priority date Publication date Assignee Title
CN1182451A (en) * 1995-03-17 1998-05-20 诺沃挪第克公司 Novel endoglucanases
CN100362100C (en) * 1996-09-17 2008-01-16 诺沃奇梅兹有限公司 Cellulase variants
DK1117808T3 (en) * 1998-10-06 2005-04-25 Mark Aaron Emalfarb Transformational system before comparing the area of filamentous fungal hosts: In the chrysosporium
CN100436586C (en) * 2000-05-22 2008-11-26 明治制果株式会社 Endoglucanase NCE5 and cellulase preparations contg. same
BRPI0317124B1 (en) * 2002-12-11 2016-05-17 Novozymes As detergent composition and processes for washing a fabric and a hard surface

Also Published As

Publication number Publication date
FI20055692A (en) 2007-06-23
CN101346464B (en) 2012-06-20
CN101346464A (en) 2009-01-14
FI20055692A0 (en) 2005-12-22

Similar Documents

Publication Publication Date Title
EP1969123B1 (en) Novel enzymes
US7256032B2 (en) Enzymes
EP1874927B1 (en) Improved cellulases
FI122029B (en) Fungal endoglucanases, their production and use
EP2007884B1 (en) Cellulase fusion proteins and their use
FI122028B (en) Endoglucanases derived from fungi, their preparation and use
FI119325B (en) New endoglucanase polypeptides and their preparation and use
US7741093B2 (en) Cellulases and their uses
US7361487B2 (en) Enzyme fusion proteins and their use
EP1799816B1 (en) Novel laccase enzyme and use thereof
FI118340B (en) New cellulase fusion protein comprises a cellulase core, and a linker and/or cellulose-binding domain (CBD), useful in textile industry, e.g. biostoning or biofinishing, or as detergent composition or as enzyme preparation
FI119434B (en) Enzyme fusion proteins and their use

Legal Events

Date Code Title Description
FG Patent granted

Ref document number: 119325

Country of ref document: FI