ES2875853T3 - Method of treating fibrosis - Google Patents
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Abstract
Una composición farmacéutica para uso en el tratamiento de una afección fibrótica, la composición comprende: (a) un péptido o polipéptido administrable que consiste en la secuencia FTTFTVT (SEQ ID NO: 1) y, opcionalmente, en donde el péptido o polipéptido administrable está unido a, o está asociado con, una secuencia de internalización; y (b) un soporte o excipiente farmacéuticamente aceptable.A pharmaceutical composition for use in treating a fibrotic condition, the composition comprises: (a) an administrable peptide or polypeptide consisting of the sequence FTTFTVT (SEQ ID NO: 1) and, optionally, wherein the administrable peptide or polypeptide is linked to, or associated with, an internalizing sequence; and (b) a pharmaceutically acceptable carrier or excipient.
Description
d e s c r ip c ió ndescription
Método de tratar fibrosisMethod of treating fibrosis
CampoCountryside
La presente divulgación está en el campo de la bioquímica y medicina se dirige a métodos y composiciones para aumentar los niveles de la proteína p53, reducir uPA y uPAR y aumentar la expresión de PAI-1, en fibroblastos de pulmón fibrótico (FL) y reducir su proliferación, y para tratar fibrosis pulmonar idiopática (FPI) usando nutlina-3a y péptidos.The present disclosure is in the field of biochemistry and medicine is directed to methods and compositions to increase the levels of the p53 protein, reduce uPA and uPAR and increase the expression of PAI-1, in fibrotic lung fibroblasts (FL) and reduce its proliferation, and to treat idiopathic pulmonary fibrosis (IPF) using nutlin-3a and peptides.
Descripción de Ios antecedentes técnicosDescription of the technical background
La fibrosis pulmonar idiopática (FPI) es una enfermedad del pulmón progresiva y letal mal entendida para la que no existe tratamiento aparte del trasplante de pulmón (Masón DP et al., Ann Thorac Surg 84.í 121-8, 2007). La supervivencia mediana de cinco años después del diagnóstico es menor del 20%. La mayoría de las formas de enfermedades pulmonares intersticiales y otras formas de fibrosis pulmonar se caracterizan por lesiones fibróticas, se produce distorsión progresiva de la arquitectura alveolar y la sustitución con tejidos fibróticos o cicatriciales con exceso de depósito de matriz extracelular (MEC) (American Thoracic Society, Am J Respir Crit Care Med 161:646-664, 2000; Noble PW et al., Clin Chest Med 25:749-758, 2004; Selman M et al., Ann Intern Med 134:136-151,2001). Esto produce disnea progresiva y pérdida de función pulmonar. Una lesión morfológica distintiva es la heterogeneidad espacial y temporal que incorpora áreas de pulmón normal que están directamente adyacentes a áreas de fibrosis completamente establecida, apanalado microscópico, y áreas de fibrosis en evolución que contienen fibroblastos/miofibroblastos en proliferación y que producen colágeno, los denominados “focos fibróticos”.Idiopathic pulmonary fibrosis (IPF) is a poorly understood progressive and fatal lung disease for which there is no treatment other than lung transplantation (Mason DP et al., Ann Thorac Surg 84.í 121-8, 2007). The 5-year median survival after diagnosis is less than 20%. Most forms of interstitial lung diseases and other forms of pulmonary fibrosis are characterized by fibrotic lesions, progressive distortion of the alveolar architecture and replacement with fibrotic or scar tissues with excess deposit of extracellular matrix (ECM) (American Thoracic Society, Am J Respir Crit Care Med 161: 646-664, 2000; Noble PW et al., Clin Chest Med 25: 749-758, 2004; Selman M et al., Ann Intern Med 134: 136-151, 2001) . This produces progressive dyspnea and loss of lung function. A distinctive morphological lesion is the spatial and temporal heterogeneity that incorporates areas of normal lung that are directly adjacent to areas of fully established fibrosis, microscopic honeycombing, and areas of evolving fibrosis that contain proliferating, collagen-producing fibroblasts / myofibroblasts, the so-called "Fibrotic foci".
La FPI es la enfermedad pulmonar intersticial crónica, progresiva y letal más común de etiología desconocida con una incidencia estimada de 40-50 casos por 100.000 individuos en los Estados Unidos. La viabilidad, activación de fibroblastos pulmonares fibróticos (“FL”) (o miofibroblastos), producción y depósito de MEC tipifica los pulmones FPI (Selman M et al., Expert Opin Emerg Drugs 16:341-62, 20l1; Shetty, S et al. Am J Respir Cell Mol Biol i 5:78-87, 1996; Zhu S et al., Am J Physiol: Lung Cell Mot Physiol 297.L97-108, 2009; Suganuma H et al., Thorax 50:984-9,1995; American Thoracic Society, supra; Noble PW et al., supra). IPF is the most common chronic, progressive, and fatal interstitial lung disease of unknown etiology with an estimated incidence of 40-50 cases per 100,000 individuals in the United States. The viability, activation of pulmonary fibrotic fibroblasts ("FL") (or myofibroblasts), production and deposition of ECM typify the IPF lungs (Selman M et al., Expert Opin Emerg Drugs 16: 341-62, 20l1; Shetty, S et al. Am J Respir Cell Mol Biol i 5: 78-87, 1996; Zhu S et al., Am J Physiol: Lung Cell Mot Physiol 297.L97-108, 2009; Suganuma H et al., Thorax 50: 984- 9, 1995; American Thoracic Society, supra; Noble PW et al., Supra).
Trabajó previo por los presentes inventores (y otros) mostró que fibroblastos pulmonares incluyendo fibroblastos FL de los pulmones de pacientes de FPI expresan activador de plasminógeno de tipo uroquinasa (uPA), receptor de uPA (uPAR) e inhibidor 1 del activador de plasminógeno (PAI-1) (Shetty et al., 1996, supra; Shetty S e Idell S. Am J Physiol 274:L871-L882, 1998; Chang W et al., J Biol Chem 285:8i 96-206, 2010). uPA es mitógeno tanto para fibroblastos pulmonares nórmales (NL) como FL, y el proceso implica la unión de uPA a uPAR a través del dominio de factor de crecimiento de uPA (Tkachuk V et al. Clin Exp Pharmacol Physiol 23:759-65, 1996; Padró T et al., J Cell Sci 115.í 961-71, 2002; Shetty S et al., Am J Physiol 268:L972-L982, 1995; Shetty S et al., Antisense Res Dev 5:307-314, 1995). Además, uPA aumenta la expresión de uPAR (Shetty S et al., J Biol Chem 276:24549-56, 2001; Shetty S et al., Am J Respir Cell Mol Biol 30:69-75, 2004). Hace varios años, los presentes inventores describieron que fibroblastos FL de pulmones FPI expresan significativamente más uPA y uPAR, y muestran una mayor tasa de proliferación basal y mediada por uPA que los fibroblastos NL (Shetty et al., 1996, supra; 1998, supra). Otros grupos confirmaron que la expresión de uPAR aumentada por fibroblastos FL de pacientes con FPI contribuye al comportamiento migratorio (Mace KA et al., J Cell Sci 118:2567-77, 2005; Basire A et al., Thromb Haemost 95:678-88, 2006; Zhu, S. et al., 2009, supra Previous work by the present inventors (and others) showed that pulmonary fibroblasts including FL fibroblasts from the lungs of IPF patients express urokinase-type plasminogen activator (uPA), uPA receptor (uPAR), and plasminogen activator inhibitor 1 (PAI). -1) (Shetty et al., 1996, supra; Shetty S and Idell S. Am J Physiol 274: L871-L882, 1998; Chang W et al., J Biol Chem 285: 8i 96-206, 2010). uPA is mitogenic for both normal lung fibroblasts (NL) and FL, and the process involves the binding of uPA to uPAR through the growth factor domain of uPA (Tkachuk V et al. Clin Exp Pharmacol Physiol 23: 759-65, 1996; Padró T et al., J Cell Sci 115.í 961-71, 2002; Shetty S et al., Am J Physiol 268: L972-L982, 1995; Shetty S et al., Antisense Res Dev 5: 307- 314, 1995). Furthermore, uPA increases uPAR expression (Shetty S et al., J Biol Chem 276: 24549-56, 2001; Shetty S et al., Am J Respir Cell Mol Biol 30: 69-75, 2004). Several years ago, the present inventors reported that FPI lung FL fibroblasts express significantly more uPA and uPAR, and show a higher rate of basal and uPA-mediated proliferation than NL fibroblasts (Shetty et al., 1996, supra; 1998, supra ). Other groups confirmed that increased uPAR expression by FL fibroblasts from IPF patients contributes to migratory behavior (Mace KA et al., J Cell Sci 118: 2567-77, 2005; Basire A et al., Thromb Haemost 95: 678- 88, 2006; Zhu, S. et al., 2009, supra
Estudios por el presente inventor y colaboradores encontraron que uPA regula la apoptosis/supervivencia de células epiteliales mediante la regulación de p53 (Shetty S et al., 2005, supra) que controla la expresión recíproca de uPA (Shetty P et al., Am J Resp Cell Mol Biol, 39:364-72 ,2008), su receptor uPAR (Shetty S et al. Mol Cell Biol 27:5607-5618,2o07) y su inhibidor principal PAI-1 (Shetty S et al. J Biol. Chem 283:19570-80, 2008) a nivel postranscripcional e implica una novedosa interacción de señalización de superficie celular entre uPA, uPAR, caveolina-1 ("Cav-1") y p lintegrina (Shetty S et al., 2005, supra). Basado en la apreciación de lo anterior, los presentes inventores concibieron nuevas composiciones y métodos para tratar ALI y sus consecuentes reacciones de remodelación.Studies by the present inventor and co-workers found that uPA regulates epithelial cell apoptosis / survival by regulating p53 (Shetty S et al., 2005, supra) which controls reciprocal expression of uPA (Shetty P et al., Am J Resp Cell Mol Biol, 39: 364-72, 2008), its uPAR receptor (Shetty S et al. Mol Cell Biol 27: 5607-5618,2o07) and its main inhibitor PAI-1 (Shetty S et al. J Biol. Chem 283: 19570-80, 2008) at the post-transcriptional level and involves a novel cell surface signaling interaction between uPA, uPAR, caveolin-1 ("Cav-1") and p-lintegrin (Shetty S et al., 2005, supra) . Based on an appreciation of the foregoing, the present inventors devised new compositions and methods for treating ALI and its consequent remodeling reactions.
Durante la fibrosis del pulmón (término que se usa de forma intercambiable con fibrosis “pulmonar”), la expresión del factor de transcripción p53, conocido fundamentalmente como una proteína supresora de tumores, se suprime severamente en fibroblastos fibróticos que a su vez induce la expresión de uPA y uPAR mientras que la expresión de PAI-1 está significativamente inhibida. La supresión de la expresión de PAI-1 y concurrente inducción de la expresión de uPA y uPAR como consecuencia de la inhibición de la expresión de p53 en fibroblastos fibróticos produce la proliferación de fibroblastos y depósito de MEC, es decir, fibrosis. La interacción aumentada de mdm2 con p53 y posterior ubiquitinación de p53 mediada por mdm2 contribuye a la inhibición de p53 en fibroblastos fibróticos.During lung fibrosis (a term used interchangeably with “pulmonary” fibrosis), the expression of the transcription factor p53, known primarily as a tumor suppressor protein, is severely suppressed in fibrotic fibroblasts which in turn induces expression of uPA and uPAR while the expression of PAI-1 is significantly inhibited. Suppression of PAI-1 expression and concurrent induction of uPA and uPAR expression as a consequence of inhibition of p53 expression in fibrotic fibroblasts results in fibroblast proliferation and ECM deposition, ie, fibrosis. The increased interaction of mdm2 with p53 and subsequent mdm2-mediated ubiquitination of p53 contributes to the inhibition of p53 in fibrotic fibroblasts.
Se ha demostrado una relación recíproca entre las actividades de p53 y NF-kB en células cancerosas, pero hay poca información respecto a interacciones entre p53 y NF-kB en procesos inflamatorios. Liu G et al. (J Immunol. 182:5063-71(2009)) encontraron que neutrófilos y macrófagos que carecen de p53 (p53('/') tienen mayores respuestas a la estimulación con lipopolisacárido (LPS) bacteriano que células p53(+/+), y producen mayores cantidades de citoquinas proinflamatorias, incluyendo TNF-ci, IL-6 y MIP-2, y demostraron actividad de unión a Ad N de NF-kB aumentada. Los ratones p53('/_) son más susceptibles que ratones p53(+/+) a lesión pulmonar aguda (ALI) inducida por LPS. La respuesta aumentada de células p53(+/+) a LPS no implica alteraciones en los sucesos de señalización intracelular asociados con la implicación del receptor de tipo toll TLR4 (por ejemplo, activación de MAP quinasas, fosforilación de IkB-ci o la subunidad p65 de NF-kB, o degradación de IkB-ci. El cultivo de neutrófilos y macrófagos estimulados con LPS con nutlina-3a, atenuó la actividad de unión a ADN de NF-kB y la producción de citoquinas proinflamatorias. El tratamiento de ratones con nutlina-3a redujo la gravedad de ALI inducida por LPS. Los autores concluyeron que p53 regula la actividad de NF-kB en células inflamatorias y sugirieron que la modulación de p53 pueden tener potenciales beneficios terapéuticos en afecciones inflamatorias agudas tal como ALI.A reciprocal relationship between the activities of p53 and NF-kB in cancer cells has been demonstrated, but there is little information regarding interactions between p53 and NF-kB in inflammatory processes. Liu G et al. ( J Immunol. 182: 5063-71 (2009)) found that neutrophils and macrophages lacking p53 (p53 ('/') have greater responses to stimulation with bacterial lipopolysaccharide (LPS) than p53 (+ / +) cells, and they produce higher amounts of pro-inflammatory cytokines, including TNF- ci , IL-6 and MIP-2, and demonstrated binding activity to A d N of NF- k B increased. P53 ('/ _) mice are more susceptible than p53 (+ / +) mice to LPS-induced acute lung injury (ALI). The increased response of p53 (+ / +) cells to LPS does not involve alterations in intracellular signaling events associated with the involvement of the toll-like receptor TLR4 (eg, activation of MAP kinases, phosphorylation of IkB-ci or the p65 subunit of NF-kB, or degradation of IkB-ci. Culture of neutrophils and macrophages stimulated with LPS with nutlin-3a, attenuated the DNA-binding activity of NF-kB and the production of pro-inflammatory cytokines. Treatment of mice with nutlin -3a reduced the severity of LPS-induced ALI The authors concluded that p53 regulates NF-kB activity in inflammatory cells and suggested that modulation of p53 may have potential therapeutic benefits in acute inflammatory conditions such as ALI.
Nutlina (o nutlina-3a) (también abreviada NTL)Nutlina (or nutlin-3a) (also abbreviated NTL)
La estructura química de la molécula 4-2-4,5-dihidro-1H-imidazol-1-piperacin-2-ona (C30H30CI2N4O4) también llamada nutlina o nutlina-3a es como se muestra a continuaciónThe chemical structure of the molecule 4-2-4,5-dihydro-1H-imidazol-1-piperazin-2-one (C30H30CI2N4O4) also called nutlin or nutlin-3a is as shown below
Formula 1Formula 1
NTL es un antagonista de MDM2, que es un activador de p53 y un inductor de apoptosis. MDM2 funciona por unión a la proteína supresora de tumores p53 y regulando negativamente su actividad transcripcional y estabilidad. La inhibición de la interacción MDM-p53 produce la estabilización de p53, parada del ciclo celular y apoptosis. NutIina-3 ha mostrado potencial como un tratamiento de cáncer activando la ruta de p53 en células cancerosas (Tovar, C. et al., Prnc Nati Acad Sci USA 103:1888-1893 (2006); Vassilev, L.T. et al. Science 303844-848 (2004); El-Deiry, W.S. Cáncer J 11:229-236 (1998)).NTL is an antagonist of MDM2, which is an activator of p53 and an inducer of apoptosis. MDM2 works by binding to the tumor suppressor protein p53 and downregulating its transcriptional activity and stability. Inhibition of the MDM-p53 interaction results in stabilization of p53, cell cycle arrest, and apoptosis. NutIin-3 has shown potential as a cancer treatment by activating the p53 pathway in cancer cells (Tovar, C. et al., Prnc Nati Acad Sci USA 103: 1888-1893 (2006); Vassilev, LT et al. Science 303 844-848 (2004); El-Deiry, WS Cancer J 11: 229-236 (1998)).
El documento U.S. 7.893.278 (Haley et al.) divulgo nutIina-3 quiral tanto genérica como específicamente. El documento U.S. 6.734.302 para la nutIina-3 racémica. La patente '278 ensaña un compuesto de la formulaDocument U.S. 7,893,278 (Haley et al.) Disclosed chiral nutIin-3 both generically and specifically. Document U.S. 6,734,302 for racemic nutIin-3. The '278 patent teaches a compound of the formula
Formula 2Formula 2
que se describe adicionalmente más adelante.which is described further below.
Ambas patentes anteriores discuten usos como inhibidores de la interacción Mdm2-p53 y en tratamiento de cáncer. Both of the above patents discuss uses as inhibitors of the Mdm2-p53 interaction and in cancer treatment.
La publicación de patente en EE UU 2011/0301142 (Hutchinson et al.) enseña un método de tratar fibrosis pulmonar idiopática en un mamífero que comprende administrar una cantidad terapéuticamente eficaz de un antagonista del receptor de LPA1 al mamífero. El antagonista puede ser ciertos derivados de imidazol, pero no compuestos de tipo imidazolina tal como NTL.US Patent Publication 2011/0301142 (Hutchinson et al.) Teaches a method of treating idiopathic pulmonary fibrosis in a mammal which comprises administering a therapeutically effective amount of an LPA1 receptor antagonist to the mammal. The antagonist can be certain imidazole derivatives, but not imidazoline-like compounds such as NTL.
El documento U.S. 6.596.744 (Wagle et al.) divulga un método de tratar o mejorar ciertas enfermedades fibroticas con compuestos heterocíclicos, todos los cuales son claramente distintos de NTL. Las enfermedades divulgadas incluyen enfermedades pulmonares fibróticas que tienen como una manifestación hipertrofia fibrótica o fibrosis de tejido pulmonar. Estas enfermedades incluyen fibrosis pulmonar (o enfermedad pulmonar intersticial o fibrosis pulmonar intersticial), fibrosis pulmonar idiopática, el elemento fibrótico de neumoconiosis, sarcoidosis pulmonar, alveolitis fibrosante, el elemento fibrótico o hipertrófico de fibrosis quística, enfermedad pulmonar obstructiva crónica, síndrome de dificultad respiratoria adulta y enfisema.US 6,596,744 (Wagle et al.) Discloses a method of treating or ameliorating certain fibrotic diseases with heterocyclic compounds, all of which are clearly other than NTL. Reported diseases include Fibrotic lung diseases that have as a manifestation fibrotic hypertrophy or fibrosis of lung tissue. These diseases include pulmonary fibrosis (or interstitial lung disease or interstitial pulmonary fibrosis), idiopathic pulmonary fibrosis, the fibrotic element of pneumoconiosis, pulmonary sarcoidosis, fibrosing alveolitis, the fibrotic or hypertrophic element of cystic fibrosis, chronic obstructive pulmonary disease, respiratory distress syndrome adult and emphysema.
Dey et al. en Cell Cycle 6:17, 2178-2185 (2007) describe que se identificaron nutlinas como los primeros antagonistas de Mdm2 de molécula pequeña potentes y específicos que inhiben la interacción p53-MDM2.Dey et al. in Cell Cycle 6:17, 2178-2185 (2007) describes that nutlins were identified as the first potent and specific small molecule Mdm2 antagonists that inhibit the p53-MDM2 interaction.
Ninguno de los documentos anteriores divulga tratar FPI con nutlina-3a.None of the above documents disclose treating IPF with nutlin-3a.
Péptidos derivados de caveolina-1Caveolin-1 Derived Peptides
Los presentes inventores descubrieron que un péptido de 20 residuos DGIWKASFTTFTVTKYWFYR, SEQ ID NO:2) que es el dominio de andamiaje de caveolina-1 (Cav-1; SEQ ID NO:3, mostrado posteriormente) protegía células epiteliales pulmonares (LEC) de apoptosis inducida por bleomicina (“BLM”) in vitro e in vivo y prevenía posterior fibrosis pulmonar atenuando el daño pulmonar epitelial (Shetty et al., permitió la solicitud de patente en EE UU 12/398.757 publicada como documento U.S. 2009-0227515A1 (10 Sept., 20o9).The present inventors discovered that a 20 residue peptide DGIWKASFTTFTVTKYWFYR, SEQ ID NO: 2) which is the scaffold domain of caveolin-1 (Cav-1; SEQ ID NO: 3, shown below) protected pulmonary epithelial cells (LEC) from Bleomycin-induced apoptosis ("BLM") in vitro and in vivo and prevented subsequent pulmonary fibrosis by attenuating epithelial lung damage (Shetty et al., allowed US patent application 12 / 398,757 published as document US 2009-0227515A1 (10 Sept., 20o9).
Los presentes inventores también encontraron un péptido de 17 residuos NYHYLESSMTALYTLGH (SEQ ID NO:4), denominado PP-2, también protegía LEC de apoptosis inducida por BLM in vitro e in vivo y prevenía posterior fibrosis pulmonar atenuando el daño pulmonar epitelial (Shetty et al., supra). The present inventors also found a 17-residue peptide NYHYLESSMTALYTLGH (SEQ ID NO: 4), designated PP-2, also protected LEC from BLM-induced apoptosis in vitro and in vivo and prevented subsequent lung fibrosis by attenuating epithelial lung damage (Shetty et al., supra).
Shetty et al., 2009 (supra) también describe variantes biológicamente activas de sustitución, adición y deleción de estos péptidos, así como multímeros de péptidos y polipéptidos administrables que comprenden los péptidos anteriores, y composiciones farmacéuticas que comprenden los péptidos, variantes y multímeros anteriores. Esas composiciones inhiben apoptosis de células epiteliales de pulmón lesionadas o dañadas y tratar lesión pulmonar aguda y fibrosis pulmonar/FPI consecuente.Shetty et al., 2009 ( supra) also describe biologically active substitution, addition and deletion variants of these peptides, as well as administrable peptide and polypeptide multimers comprising the above peptides, and pharmaceutical compositions comprising the above peptides, variants and multimers . Those compositions inhibit apoptosis of injured or damaged lung epithelial cells and treat acute lung injury and consequent pulmonary fibrosis / IPF.
El documento anterior no identificó un fragmento particular de CSP (divulgado posteriormente como parte de la presente invención) denominado CSP-4, que tiene la secuencia FTTDTVT (SEQ ID NO: 1) y que tiene la actividad biológica de CSP y constituye parte del objeto de la presente invención.The above document did not identify a particular CSP fragment (later disclosed as part of the present invention) called CSP-4, which has the sequence FTTDTVT (SEQ ID NO: 1) and which has the biological activity of CSP and constitutes part of the object of the present invention.
Se divulgan además péptidos derivados de caveolina-1 en el documento WO 2013/184482 A1; E. Tourkina ET AL: "Antifibrotic properties of caveolin-1 scaffolding domain in vitro and in vivo", American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology, vol. 294, no. 5, 18 Enero 2008 (18-01-2008), páginas 843-861; documento US 2009/075875 A1; ARBUZOVA, A. ET AL.: "Membrane Binding of Peptides Containing Both Basic and Aromatic Residues. Experimental Studies with Peptides Corresponding to the Scaffolding Región of Caveolin and the Effector Región of MARCKS", BIOCHEMISTRY, vol. 39, no. 33, 2000, páginas 10330-; WANASKI, S. P. ET AL: "Caveolin Scaffolding Región and the Membrane Binding Región of Src Form Lateral Membrane Domains", BIOCHEMISTRY, vol. 42, no. 1,2003, páginas 42-56; HORTON, M. R. ET AL: "Phase behaviour and the partitioning of caveolin-1 scaffolding domain peptides in model lipid bilayers", JOURNAL OF COLLOID AND INTERFACE SCIENCE, vol. 304, no. 1,2006, páginas 67-76; GUO, C. -J. ET Al .: "Involvement of caveolin-1 in the Jak-Stat signaling pathway and infectious spleen and kidney necrosis virus infection in mandarin fish (Siniperca chuatsi", Mo LECULAR IMMUNOLOGY, vol. 48, no. 8, 2011, páginas 992-1000; DE LA TORRE, B. G. ET AL.: "On choosing the right ether for peptide precipitation after acid cleavage", JOURNAL OF PEPTIDE SCIENCE, vol. 14, no. 3, 2008, páginas 360-363; EPAND, R. M. ET AL.: "Caveolin Scaffolding Región and Cholesterol-rich Domains in Membranes", JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, vol. 345, no. 2, 2004, páginas 339-350; SHETTY, S. K. ET AL.: "Regulation of Airway and Alveolar Epithelial Cell Apoptosis by p53-lnduced Plasminogen Activator lnhibitor-1 during Cigarette Smoke Exposure Injury", AMERICAN JOURNAL OF RESPIRATORY CELL AND MOLECULAR BIOLOGY, vol. 47, no. 4, 2012, páginas 474-83; documento WO 01/11038 A2; o documento WO 2009/111625 A2.Caveolin-1 derived peptides are further disclosed in WO 2013/184482 A1; E. Tourkina ET AL: "Antifibrotic properties of caveolin-1 scaffolding domain in vitro and in vivo", American journal of physiology. Lung cellular and molecular physiology, vol. 294, no. 5, 18 January 2008 (18-01-2008), pages 843-861; US 2009/075875 A1; ARBUZOVA, A. ET AL .: "Membrane Binding of Peptides Containing Both Basic and Aromatic Residues. Experimental Studies with Peptides Corresponding to the Scaffolding Region of Caveolin and the Effector Region of MARCKS", BIOCHEMISTRY, vol. 39, no. 33, 2000, pages 10330-; WANASKI, S. P. ET AL: "Caveolin Scaffolding Region and the Membrane Binding Region of Src Form Lateral Membrane Domains", BIOCHEMISTRY, vol. 42, no. 1,2003, pages 42-56; HORTON, M. R. ET AL: "Phase behavior and the partitioning of caveolin-1 scaffolding domain peptides in model lipid bilayers", JOURNAL OF COLLOID AND INTERFACE SCIENCE, vol. 304, no. 1,2006, pages 67-76; GUO, C. -J. ET Al.: "Involvement of caveolin-1 in the Jak-Stat signaling pathway and infectious spleen and kidney necrosis virus infection in mandarin fish (Siniperca chuatsi", Mo LECULAR IMMUNOLOGY, vol. 48, no. 8, 2011, pages 992- 1000; DE LA TORRE, BG ET AL .: "On choosing the right ether for peptide precipitation after acid cleavage", JOURNAL OF PEPTIDE SCIENCE, vol. 14, no. 3, 2008, pages 360-363; EPAND, RM ET AL .: "Caveolin Scaffolding Region and Cholesterol-rich Domains in Membranes", JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY, vol. 345, no. 2, 2004, pages 339-350; SHETTY, SK ET AL .: "Regulation of Airway and Alveolar Epithelial Cell Apoptosis by p53-Induced Plasminogen Activator Inhibitor-1 during Cigarette Smoke Exposure Injury ", AMERICAN JOURNAL OF RESPIRATORY CELL AND MOLECULAR BIOLOGY, vol. 47, no. 4, 2012, pages 474-83; document WO 01/11038 A2; or document WO 2009/111625 A2.
En vista del mal pronóstico y la falta de enfoques terapéuticos para FPl, hay una necesidad urgente para nuevas intervenciones para revertir o al menos ralentizar la evolución de la enfermedad. Esta brecha terapéutica crítica se aborda mediante la presente invención.In view of the poor prognosis and lack of therapeutic approaches for FPl, there is an urgent need for new interventions to reverse or at least slow the progression of the disease. This critical therapeutic gap is addressed by the present invention.
La presente divulgación constituye una extensión de los anteriores hallazgos del inventor (S. Shetty et al., 2007, 2008 & 2009, supra). Como se describe en las secciones posteriores, p53 regula la expresión de uPA, uPAR y PAl-1. El proceso implica control mediado por MDM2 de la expresión de proteína p53 a nivel postraduccional sin afectar al ARNm de p53. Estas observaciones demuestran un enlace causal entre la expresión de p53 y el sistema fibrinolítico de uPA en reparación fibrótica.This disclosure is an extension of the inventor's previous findings (S. Shetty et al., 2007, 2008 & 2009, supra). As described in subsequent sections, p53 regulates the expression of uPA, uPAR, and PAl-1. The process involves MDM2-mediated control of p53 protein expression at the post-translational level without affecting p53 mRNA. These observations demonstrate a causal link between p53 expression and the uPA fibrinolytic system in fibrotic repair.
CompendioCompendium
La inhibición de la interacción de la proteína p53 con MDM2 usando NTL aumenta p53 y PAl-1 al tiempo que inhibe uPA y uPAR. Estos cambios producen apoptosis de fibroblastos fibróticos e inhibición de la proliferación de fibroblastos fibróticos aislados de Ios pulmones de pacientes con FPI, así como de Ios pulmones de ratones con fibrosis pulmonar acelerada inducida por BLM.Inhibition of the interaction of p53 protein with MDM2 using NTL increases p53 and PAl-1 while inhibiting uPA and uPAR. These changes produce apoptosis of fibrotic fibroblasts and inhibition of fibroblast proliferation. fibrotic cells isolated from the lungs of patients with IPF, as well as from the lungs of mice with BLM-induced accelerated pulmonary fibrosis.
Según la presente invención, NTL inhibe fibrosis pulmonar progresiva y establecida al inducir o aumentar la expresión de p53 en fibroblastos fibróticos. Por tanto, este compuesto es útil para tratar fibrosis pulmonar en un sujeto en necesidad de ello.According to the present invention, NTL inhibits established and progressive pulmonary fibrosis by inducing or increasing the expression of p53 in fibrotic fibroblasts. Therefore, this compound is useful for treating pulmonary fibrosis in a subject in need thereof.
Los presentes inventores concibieron que el control mediado por p53 deteriorado del sistema fibrinolítico de uPA en fibroblastos FL es una base para terapia dirigida de FPI. En fibroblastos FL, la expresión basal de p53 y microARN-34a (miR-34a) están marcadamente suprimidos mientras que Ios niveles de proteínas de la MEC tal como colágeno-l (CoI-I) y a actina de músculo liso (ci-SMA) están aumentados. El tratamiento de fibroblastos FL con el compuesto inhibidor de mdm2 nutlina-3a o CSP-4 aumenta la expresión de p53 y PAI-1 con inhibición recíproca de uPA y uPAR. El tratamiento de fibroblastos FL con nutlina-3a o Cs P-4 también inhibe la producción de MEC. Estos hallazgos preliminares y publicaciones recientes de Ios presentes inventores y colaboradores justifican un enfoque intervencionista para restablecer la interrelación entre p53 y el sistema fibrinolítico de uPA que de otra manera está distorsionada en fibroblastos FL lo que produce fibrosis pulmonar. p53 tiene efectos pleiotrópicos que van más allá del control del sistema fibrinolítico de uPA2 Sin embargo, PAI-1 es el efector posterior de p53 en fibroblastos y otras células.The present inventors envisioned that impaired p53-mediated control of the uPA fibrinolytic system in FL fibroblasts is a basis for targeted IPF therapy. In FL fibroblasts, the basal expression of p53 and microRNA-34a (miR-34a) are markedly suppressed while the levels of ECM proteins such as collagen-I (CoI-I) and smooth muscle actin (ci-SMA) are augmented. Treatment of FL fibroblasts with the mdm2 inhibitor compound nutlin-3a or CSP-4 increases the expression of p53 and PAI-1 with reciprocal inhibition of uPA and uPAR. Treatment of FL fibroblasts with nutlin-3a or Cs P-4 also inhibits ECM production. These preliminary findings and recent publications by the present inventors and co-workers justify an interventional approach to reestablish the interrelation between p53 and the fibrinolytic system of uPA which is otherwise distorted in FL fibroblasts resulting in pulmonary fibrosis. p53 has pleiotropic effects beyond the control of the uPA2 fibrinolytic system. However, PAI-1 is the downstream effector of p53 in fibroblasts and other cells.
De forma importante, el restablecimiento de p53 en fibroblastos FL modula la expresión de uPA, uPAR y PAI-1, viabilidad celular y producción de MEC. El enfoque dirigido a p53-sistema fibrinolítico de uPA en fibroblastos FL se ilustra en la figura 1. p53 induce la transcripción de miR-34a mientras que miR-34a aumenta la acetilación de p53 mediante la inhibición de la histona desacetilasa sirtuina 1 (SIRT1). Esto lleva a la estabilización de la proteína p53 debido a la inhibición de su degradación mediada por mdm2. Sin embargo, en fibroblastos FL, Ios niveles basales de la proteína p53 y miR-34a están marcadamente suprimidos debido a la ubiquitinación aumentada de la proteína p53 por mdm2 y como consecuencia de baja expresión basal de caveolina-1. Esto lleva a inhibición de uPA y uPAR mediada por p53 reducida, o inducción concurrente de PAI-1. Estos cambios contribuyen a la excesiva proliferación de fibroblastos FL y producción de MEC y son revertidos por CSP-4 y nutilina-3a. CSP-4 y nutilina-3a aumentan Ios niveles de p53 inhibiendo la degradación mediada por mdm2 de la proteína p53. El restablecimiento de la expresión de p53 y cambios mediados por p53 en el sistema fibrinolítico de uPA en fibroblastos FL produce atenuación de la viabilidad, y restringe la producción y depósito de MEC. La fibrosis se inhibe en ratones expuestos a BLM con fibrosis pulmonar establecida a través del restablecimiento de Ios niveles de p53 en fibroblastos FL que a su vez suprime las señales de proliferación uPA y uPAR mientras que induce la señal proapoptótica para estas células; PAI-1.Importantly, the reestablishment of p53 in FL fibroblasts modulates uPA, uPAR, and PAI-1 expression, cell viability, and ECM production. The p53-fibrinolytic system targeting approach of uPA in FL fibroblasts is illustrated in Figure 1. p53 induces miR-34a transcription while miR-34a increases p53 acetylation by inhibiting histone deacetylase sirtuin 1 (SIRT1) . This leads to the stabilization of the p53 protein due to the inhibition of its degradation mediated by mdm2. However, in FL fibroblasts, basal levels of p53 and miR-34a protein are markedly suppressed due to increased ubiquitination of p53 protein by mdm2 and as a consequence of low basal expression of caveolin-1. This leads to reduced p53-mediated inhibition of uPA and uPAR, or concurrent induction of PAI-1. These changes contribute to the excessive proliferation of FL fibroblasts and ECM production and are reversed by CSP-4 and nutilin-3a. CSP-4 and nutilin-3a increase p53 levels by inhibiting mdm2-mediated degradation of the p53 protein. Restoration of p53 expression and p53-mediated changes in the uPA fibrinolytic system in FL fibroblasts results in attenuation of viability, and restricts ECM production and deposition. Fibrosis is inhibited in BLM-exposed mice with established pulmonary fibrosis through the restoration of p53 levels in FL fibroblasts which in turn suppresses the uPA and uPAR proliferation signals while inducing the pro-apoptotic signal for these cells; PAI-1.
Los inventores muestran, por primera vez, que Ios cambios mediados por p53 del sistema fibrinolítico de uPA regulan la respuesta profibrótica de fibroblastos pulmonares que son centrales para la patogénesis de la fibrosis pulmonar y que está ruta puede ser objetivo para beneficio terapéutico. A diferencia de Ios fibroblastos NL de pulmones histológicamente “normales”, Ios fibroblastos FL, incluyendo fibroblastos/miofibroblastos de tejidos pulmonares fibróticos, expresan niveles muy bajos de p53, miR-34a y caveolina-1 basales mientras que las expresiones de uPA y uPAR son altas. El tratamiento de fibroblastos FL con CSP-4 o el compuesto de bajo peso molecular nutilina-3a restablece la expresión de p53 y miR-34a, e induce PAI-1. Estos cambios suprimen la expresión de uPA y uPAR e inhiben el depósito de MEC. Estos agentes también revierten la fibrosis pulmonar inducida por BLM y protegen el epitelio pulmonar, lo que demuestra asimismo interrelación entre p53 y la regulación del sistema fibrinolítico. Por tanto, la mitigación mediada por CSP-4 o mediada por nutilina-3a de la fibrosis pulmonar representa enfoques terapéuticos novedosos.The inventors show, for the first time, that p53-mediated changes of the uPA fibrinolytic system regulate the profibrotic response of pulmonary fibroblasts that are central to the pathogenesis of pulmonary fibrosis and that this route may be targeted for therapeutic benefit. Unlike histologically “normal” lung NL fibroblasts, FL fibroblasts, including fibroblasts / myofibroblasts from fibrotic lung tissues, express very low levels of baseline p53, miR-34a, and caveolin-1 whereas uPA and uPAR expressions are high. Treatment of FL fibroblasts with CSP-4 or the low molecular weight compound nutilin-3a restores the expression of p53 and miR-34a, and induces PAI-1. These changes suppress uPA and uPAR expression and inhibit MEC deposition. These agents also reverse BLM-induced pulmonary fibrosis and protect the lung epithelium, also demonstrating an interrelation between p53 and regulation of the fibrinolytic system. Thus, CSP-4-mediated or nutilin-3a-mediated mitigation of pulmonary fibrosis represents novel therapeutic approaches.
Actualmente no hay tratamiento eficaz para revertir la fibrosis pulmonar. La presente divulgación aborda esta brecha importante y proporciona compuestos y métodos novedosos para dirigirse a fibroblastos FL e interrelación entre p53 y el sistema fibrinolítico de uPA para tratar eficazmente la enfermedad pulmonar fibrótica.There is currently no effective treatment to reverse pulmonary fibrosis. The present disclosure addresses this important gap and provides novel compounds and methods for targeting FL fibroblasts and interplay between p53 and the uPA fibrinolytic system to effectively treat fibrotic lung disease.
La invención se define mediante las reivindicaciones adjuntas.The invention is defined by the appended claims.
Específicamente, la presente divulgación se dirige a un método para aumentar Ios niveles de proteína p53, reducir uPA y uPAR y aumentar la expresión de PAI-1 en fibroblastos de pulmón fibrótico (FL), que comprende proporcionar a fibroblastos FL una cantidad eficaz de un compuesto que inhibe la interacción de MDM2 con la proteína p53 y la degradación mediada por MDM2 de p53, en donde el compuesto es:Specifically, the present disclosure is directed to a method of increasing p53 protein levels, reducing uPA and uPAR, and increasing PAI-1 expression in fibrotic lung fibroblasts (FL), which comprises providing FL fibroblasts with an effective amount of a compound that inhibits the interaction of MDM2 with p53 protein and MDM2-mediated degradation of p53, wherein the compound is:
(a) NTL o un análogo cis-imidazolina quiral de NTL que inhibe la interacción MDM2-p53;(a) NTL or a chiral cis-imidazoline analog of NTL that inhibits the MDM2-p53 interaction;
(b) un péptido seleccionado del grupo que consiste en:(b) a peptide selected from the group consisting of:
(i) CSP-4, cuya secuencia es FTTFTVT (SEQ ID NO: 1);(i) CSP-4, the sequence of which is FTTFTVT (SEQ ID NO: 1);
(ii) una variante de adición del péptido CSP-4 variante de adición que no supera 20 aminoácidos de longitud; (iii) un derivado químico covalentemente modificado del péptido CSP-4, o(ii) an addition variant of the CSP-4 addition variant peptide that does not exceed 20 amino acids in length; (iii) a covalently modified chemical derivative of the CSP-4 peptide, or
(c) un multímero peptídico que comprende al menos dos monómeros cada monómero es el péptido CSP-4, la variante o el derivado químico de (b), (c) a peptide multimer comprising at least two monomers each monomer is the CSP-4 peptide, the variant or the chemical derivative of (b),
en donde el análogo de NTL, la variante del péptldo, el derivado químico del péptido o el multímero peptídlco tiene al menos el 20% de la actividad biológica o bioquímica de NTL o el péptido CSP-4 en un ensayo in vitro o in vivo. wherein the NTL analog, peptide variant, peptide chemical derivative, or peptide multimer has at least 20% of the biological or biochemical activity of NTL or the CSP-4 peptide in an in vitro or in vivo assay.
El análogo de NTL, la variante del péptido, el derivado químico del péptido o el multímero peptídico descrito anteriormente o posteriormente tiene la siguiente actividad relativa a la actividad de NTL o CSP-4, respectivamente: al menos aproximadamente el 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, aproximadamente el 95%, 97%, 99%, y cualquier intervalo derivable en los mismos, tal como, por ejemplo, desde aproximadamente el 70% hasta aproximadamente el 80%, y más preferiblemente desde aproximadamente el 81% hasta aproximadamente el 90%; o incluso más preferiblemente, desde aproximadamente el 91% hasta aproximadamente el 99%. Esta actividad relativa se puede basar en cualquier método divulgado en el presente documento o conocido en la técnica para evaluar tal actividad.The NTL analog, peptide variant, peptide chemical derivative, or peptide multimer described above or below has the following activity relative to the activity of NTL or CSP-4, respectively: at least about 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, approximately 95%, 97%, 99%, and any drivable interval therein, such as, by example, from about 70% to about 80%, and more preferably from about 81% to about 90%; or even more preferably, from about 91% to about 99%. This relative activity can be based on any method disclosed herein or known in the art for evaluating such activity.
En una forma de realización preferida del método anterior, el compuesto es NTL. En otra forma de realización, el compuesto es el péptido CSP-4 de SEQ ID NO:1. En otra forma de realización del método, el compuesto es el multímero peptídico, preferiblemente uno que comprende monómeros del péptido CSP-4 (SEQ ID NO: 1).In a preferred embodiment of the above method, the compound is NTL. In another embodiment, the compound is the CSP-4 peptide of SEQ ID NO: 1. In another embodiment of the method, the compound is the peptide multimer, preferably one comprising CSP-4 peptide monomers (SEQ ID NO: 1).
Preferiblemente, en el método anterior que usa un multímero peptídicoPreferably, in the above method using a peptide multimer
(a) el multímero peptídico tiene la fórmula P1n en donde(a) the peptide multimer has the formula P1n where
(i) P1 es el péptido, variante o derivado químico; y(i) P1 is the chemical peptide, variant or derivative; and
(ii) n = 2-5, o(ii) n = 2-5, or
(b) el multímero peptídico tiene la fórmula (P1-Xm)n-P2, en donde(b) the peptide multimer has the formula (P1-Xm) n-P2, where
(i) cada uno de P1 y P2 es, independientemente, el péptido, variante o derivado químico;(i) each of P1 and P2 is, independently, the chemical peptide, variant or derivative;
(ii) cada uno de P1 y P2 es el mismo o diferente péptido, variante o derivado químico;(ii) each of P1 and P2 is the same or different peptide, variant or chemical derivative;
(iii) X es alquilo de C1-C5, alquenilo de C1-C5, alquinilo de C1-C5, poliéter de C1-C5 que contiene hasta 4 átomos de oxígeno;(iii) X is C1-C5 alkyl, C1-C5 alkenyl, C1-C5 alkynyl, C1-C5 polyether containing up to 4 oxygen atoms;
(Iv) m = 0 o 1 ; y(I v ) m = 0 or 1; and
(v) n = 1-7, o(v) n = 1-7, or
(c) el multímero peptídico tiene la fórmula (P1-Glyz)n-P2, en donde:( c ) the peptide multimer has the formula (P1-Glyz) n-P2, where:
(i) cada uno de P1 y P2 es, independientemente, el péptido, variante o derivado,(i) each of P1 and P2 is, independently, the peptide, variant or derivative,
(ii) cada uno de P1 y P2 es el mismo o diferente péptido, variante o derivado;(ii) each of P1 and P2 is the same or different peptide, variant, or derivative;
(iii) z = 0-6; y(iii) z = 0-6; and
(Iv) n = 1-25,(Iv) n = 1-25,
Preferiblemente el multímero tiene al menos el 20% de la actividad biológica del péptido CSP-4 en un ensayo in vitro o in vivo. Preferably the multimer has at least 20% of the biological activity of the CSP-4 peptide in an in vitro or in vivo assay.
También se divulga un método para tratar un sujeto mamífero, preferiblemente un ser humano, que tiene una enfermedad o afección caracterizada por fibrosis pulmonar (es decir, FPI), que comprende administrar al sujeto una cantidad eficaz de un compuesto que, al inhibir la degradación mediada por MDM2 de la proteína p53, aumenta los niveles de proteína de p53, reduce los niveles de uPA y uPAR y aumenta la expresión de PAI-1 en fibroblastos FL. En una forma de realización preferida de este método, el compuesto esAlso disclosed is a method of treating a mammalian subject, preferably a human, having a disease or condition characterized by pulmonary fibrosis (i.e., IPF), which comprises administering to the subject an effective amount of a compound that, by inhibiting degradation MDM2-mediated p53 protein, increases p53 protein levels, reduces uPA and uPAR levels, and increases PAI-1 expression in FL fibroblasts. In a preferred embodiment of this method, the compound is
(a) Nutilina-3a (NTL) o un análogo cis-imidazolina quiral de la misma que inhibe la interacción MDM2-p53;(a) Nutilin-3a (NTL) or a chiral cis-imidazoline analog thereof that inhibits the MDM2-p53 interaction;
(b) un péptido seleccionado del grupo que consiste en:(b) a peptide selected from the group consisting of:
(i) CSP-4, cuya secuencia es Ft TFTVT (SEQ ID NO: 1), la forma de realización de péptido más preferida; (ii) una variante de adición del péptido CSP-4 variante de adición que no supera 20 aminoácidos de longitud; (iii) un derivado químico covalentemente modificado del péptido CSP-4, o(i) CSP-4, the sequence of which is Ft TFTVT (SEQ ID NO: 1), the most preferred peptide embodiment; (ii) an addition variant of the CSP-4 addition variant peptide that does not exceed 20 amino acids in length; (iii) a covalently modified chemical derivative of the CSP-4 peptide, or
(c) un multímero peptídico que comprende al menos dos monómeros cada monómero es el péptido CSP-4, la variante o el derivado químico de (b), lo más preferiblemente un multímero de CSP-4,(c) a peptide multimer comprising at least two monomers each monomer is the CSP-4 peptide, the variant or the chemical derivative of (b), most preferably a CSP-4 multimer,
en donde el análogo, la variante del péptido, el derivado del péptido o el multímero del péptido tiene al menos el 20% de la actividad biológica o bioquímica de NTL o el péptido c SP-4 en un ensayo in vitro o in vivo. wherein the analog, peptide variant, peptide derivative, or peptide multimer has at least 20% of the biological or biochemical activity of NTL or c-peptide SP-4 in an in vitro or in vivo assay.
En este método, el compuesto está preferiblemente en una composición farmacéutica que comprende además un soporte o excipiente farmacéuticamente aceptable. El compuesto es preferiblemente una sal farmacéuticamente aceptable de Nt L, análogo de NTL o compuesto peptídico. En una forma de realización preferida del método, el compuesto es NTL. En otra forma de realización preferida del método, el compuesto es el multímero peptídico, lo más preferiblemente un multímero que comprende monómeros del péptido CSP-4 FTTFTVT (SEQ ID NO: 1).In this method, the compound is preferably in a pharmaceutical composition that further comprises a pharmaceutically acceptable carrier or excipient. The compound is preferably a pharmaceutically acceptable salt of Nt L, NTL analog or peptide compound. In a preferred embodiment of the method, the compound is NTL. In another preferred embodiment of the method, the compound is the peptide multimer, most preferably a multimer comprising CSP-4 FTTFTVT peptide monomers (SEQ ID NO: 1).
La presente divulgación también se dirige a composiciones de materia. En una forma de realización la composición es un péptido que aumenta los niveles de proteína p53, reduce uPA y aumenta la expresión de PAI-1 en fibroblastos FL, preferiblemente seleccionado del grupo que consiste en:The present disclosure is also directed to compositions of matter. In one embodiment the composition is a peptide that increases p53 protein levels, reduces uPA and increases PAI-1 expression in FL fibroblasts, preferably selected from the group consisting of:
(a) un péptido designado CSP-4 cuya secuencia es FTTFTVT (SEQ ID NO: 1), (a) a peptide designated CSP-4 whose sequence is FTTFTVT (SEQ ID NO: 1),
(b) una variante de adición del péptido CSP-4 de hasta aproximadamente 20 aminoácidos de longitud y que no el dominio de andamiaje (CSP) de caveolina-1 (Cav-1) que tiene la secuencia SEQ ID NO: 3;(b) an addition variant of the CSP-4 peptide up to about 20 amino acids in length and not the scaffold domain (CSP) of caveolin-1 (Cav-1) having the sequence SEQ ID NO: 3;
(c) un derivado químico covalentemente modificado del péptido CSP-4 de (a),(c) a covalently modified chemical derivative of the CSP-4 peptide of (a),
(d) un derivado químico covalentemente modificado de la variante de (b),(d) a covalently modified chemical derivative of the variant of (b),
cuya variante o derivado químico tiene al menos el 20% de la actividad biológica o bioquímica del péptido CSP-4 en un ensayo in vitro o in vivo. La variante o derivado químico puede tenerwhose variant or chemical derivative has at least 20% of the biological or biochemical activity of the CSP-4 peptide in an in vitro or in vivo assay. The chemical variant or derivative may have
Una composición preferida es el heptapéptido designado CSP-4, FTTFTVT (SEQ ID NO: 1).A preferred composition is the heptapeptide designated CSP-4, FTTFTVT (SEQ ID NO: 1).
Otra composición es un multímero peptídico que comprende al menos dos monómeros, cada monómero es el péptido CSP-4, la variante o el derivado químico,cuyo multímero :Another composition is a peptide multimer that comprises at least two monomers, each monomer is the CSP-4 peptide, the variant or the chemical derivative, whose multimer:
(a) tiene la fórmula P1n en donde(a) has the formula P1n where
(i) P1 es el péptido, variante o derivado químico como anteriormente, y(i) P1 is the peptide, variant or chemical derivative as above, and
(ii) n = 2-5, o(ii) n = 2-5, or
(b) tiene la fórmula (P1-Xm)n-P2, en donde(b) has the formula (P1-Xm) n-P2, where
(i) cada uno de P1 y P2 es, independientemente, el péptido, variante o derivado químico como anteriormente, (ii) cada uno de P1 y P2 es el mismo o diferente péptido, variante o derivado(i) each of P1 and P2 is, independently, the peptide, variant, or chemical derivative as above, (ii) each of P1 and P2 is the same or different peptide, variant, or derivative
(iii) X es alquilo de C1-C5, alquenilo de C1-C5, alquinilo de C1-C5, poliéter de C1-C5 que contiene hasta 4 átomos de oxígeno;(iii) X is C1-C5 alkyl, C1-C5 alkenyl, C1-C5 alkynyl, C1-C5 polyether containing up to 4 oxygen atoms;
(ív) m = 0 o 1 ; y( iv ) m = 0 or 1; and
(v) n = 1-7,(v) n = 1-7,
(c) tiene la fórmula (P1-Glyz)n-P2, en donde:(c) has the formula (P1-Glyz) n-P2, where:
(i) cada uno de P1 y P2 es, independientemente, el péptido, variante o derivado,(i) each of P1 and P2 is, independently, the peptide, variant or derivative,
(ii) cada uno de P1 y P2 es el mismo o diferente péptido, variante o derivado;(ii) each of P1 and P2 is the same or different peptide, variant, or derivative;
(iii) z = 0-6; y(iii) z = 0-6; and
(ív) n = 1-25,(iv) n = 1-25,
en donde el multímero peptídico tiene al menos el 20% de la actividad biológica del péptido CSP-4 en un ensayo in vitro o in vivo. wherein the peptide multimer has at least 20% of the biological activity of the CSP-4 peptide in an in vitro or in vivo assay.
la siguiente actividad relativa a CSP-4: al menos aproximadamente el 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, aproximadamente el 95%, 97%, 99%, y cualquier intervalo derivable en los mismos, tal como, por ejemplo, desde aproximadamente el 70% hasta aproximadamente el 80%, y más preferiblemente desde aproximadamente el 81% hasta aproximadamente el 90%; o incluso más preferiblemente, desde aproximadamente el 91% hasta aproximadamente el 99%.the following CSP-4 related activity: at least about 20%, 30%, 40%, 50%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, about 95% , 97%, 99%, and any range derivable therein, such as, for example, from about 70% to about 80%, and more preferably from about 81% to about 90%; or even more preferably, from about 91% to about 99%.
También se proporciona una composición farmacéutica antifibrótica que comprende:Also provided is an antifibrotic pharmaceutical composition comprising:
(a) la variante del péptido o el derivado químico anterior; y(a) the above peptide variant or chemical derivative; and
(b) un soporte o excipiente farmacéuticamente aceptable.(b) a pharmaceutically acceptable carrier or excipient.
Lo más preferido es la composición farmacéutica anterior formulada para inyección o instilación pulmonar.Most preferred is the above pharmaceutical composition formulated for injection or pulmonary instillation.
La presente divulgación también se dirige al uso de NTL, el análogo de NTL anterior, el péptido anterior, variante, derivado químico o multímero para uso en aumentar los niveles de proteína p53, reducir uPA y aumentar la expresión de PAI-1 en fibroblastos FL, o en tratar una enfermedad o afección caracterizada como fibrosis pulmonar.The present disclosure is also directed to the use of NTL, the above NTL analog, the above peptide, variant, chemical derivative, or multimer for use in increasing p53 protein levels, reducing uPA, and increasing PAI-1 expression in FL fibroblasts. , or in treating a disease or condition characterized as pulmonary fibrosis.
También se divulga el uso de NTL, el análogo de NTL anterior, el péptido anterior, variante, derivado químico o multímero peptídico como se ha definido anteriormente para la fabricación de un medicamento para uso en tratar un sujeto que tiene una enfermedad o afección caracterizada como fibrosis pulmonar.Also disclosed is the use of NTL, the above NTL analog, the above peptide, variant, chemical derivative or peptide multimer as defined above for the manufacture of a medicament for use in treating a subject having a disease or condition characterized as pulmonary fibrosis.
Breve descripción de los dibujosBrief description of the drawings
La figura 1 es una ilustración esquemática que muestra que la baja expresión basal de p53 y el control perturbado mediado por p53 del sistema fibrinolítico de uPA en fibroblastos de pulmón fibrótico (FL) produce fibrogénesis. Se esbozan los mecanismos de acción y rutas implicadas en FPI y en su tratamiento por los métodos y composiciones de la presente invención.Figure 1 is a schematic illustration showing that low basal p53 expression and disturbed p53-mediated control of the uPA fibrinolytic system in fibrotic lung fibroblasts (FL) produces fibrogenesis. The mechanisms of action and pathways involved in IPF and its treatment by the methods and compositions of the present invention are outlined.
Figuras 2A-2I. Focos fibróticos en pulmones FPI demuestran expresión dism inuida de p53 en fibroblastos FL. Las secciones pulmonares de pacientes de FPI y sujetos “normales” control se tiñeron para H&E (Fig. 2A), vimentina (Fig. 2B), tricromo (Fig. 2C), p53 (Fig. 2D), PAI-1 (Fig. 2E), Kí-67 (Fig. 2F), inmunofluorescencia para PAI y SP-C (Fig. 2G) o p53 y SP-C (Fig. 2H) o p53 y PAI-1 (Fig. 21). Se muestra un ejemplo representativo (n = 5 muestras de pulmón f p i). Figures 2A-2I. Fibrotic foci in lungs FPI inuida show decs expression of p53 in fibroblasts FL. Lung sections from IPF patients and "normal" control subjects were stained for H&E (Fig. 2A), vimentin (Fig. 2B), trichrome (Fig. 2C), p53 (Fig. 2D), PAI-1 (Fig. 2E), Kí-67 (Fig. 2F), immunofluorescence for PAI and SP-C (Fig. 2G) or p53 and SP-C (Fig. 2H) or p53 and PAI-1 (Fig. 21). A representative example is shown (n = 5 fpi lung samples).
Figuras 3A-3B. Caveolina-1, p53 y PAI-1 están dism inuidas y uPA está aumentada en fibroblastos FL (FPI) humanos de pulmones FPI está asociada con coI-I aumentada e inhibición de miR-34a. (Fig. 3A) Lisados celulares de fibroblastos de pulmón normal (NL) y FL se inmunotransfirieron para cambios en las proteínas. La figura ilustra los resultados típicos de fibroblastos NL (n = 10 líneas celulares) y fibroblastos FL (n = 18 líneas celulares). (Fig. 3B) Se ensayó ARN total de fibroblastos NL (n = 3) y FL (n = 4) para expresión de miR-34a por PCR en tiempo real. Se muestran transferencia tipo Northern de ARN de muestras representativas usando una sonda antisentido marcada con 32P para miR-34a y el control de carga ARNnp (U6) en la parte inferior de la barra.Figures 3A-3B. Caveolin-1, p53 and PAI-1 are decreased and uPA is increased in human lung fibroblasts FL (IPF) IPF is associated with increased coI-I and inhibition of miR-34a. (Fig. 3A) Cell lysates from normal lung (NL) and FL fibroblasts were immunoblotted for changes in proteins. The figure illustrates typical results for NL fibroblasts (n = 10 cell lines) and FL fibroblasts (n = 18 cell lines). (Fig. 3B) Total RNA from fibroblasts NL (n = 3) and FL (n = 4) was assayed for miR-34a expression by real-time PCR. Northern blots of RNA from representative samples are shown using a 32P-labeled antisense probe for miR-34a and the npRNA loading control (U6) at the bottom of the bar.
Figuras 4A-4B. Expresión dispar de Ios ARNm de uPA, uPAR y PAI-1 por fibroblastos de pulmones FPI y “ normales” . Se ensayó ARN total aislado de tejidos pulmonares de sujetos “normales” y pacientes con FPI (Fig. 4A) o de fibroblastos NL (n = 6) y FL (n = 8) (Fig. 4B) para ARNm de uPA, pA|-1 y coI-I por Pc R en tiempo real cuantitativa ((RT-PCR) y normalizada a Ios niveles correspondientes de ARNm de p-actina.Figures 4A-4B. Ios dispar expression of uPA mRNA, uPAR and PAI-1 by fibroblasts lungs FPI and "normal". Total RNA isolated from lung tissues of "normal" subjects and patients with IPF (Fig. 4A) or from fibroblasts NL (n = 6) and FL (n = 8) (Fig. 4B) for uPA mRNA, pA | -1 and coI-I by Pc R in quantitative real time ((RT-PCR) and normalized to the corresponding levels of p-actin mRNA.
Figuras 5A-5D. Expresión diferencial de uPA y PAI-1 por fibroblastos FL frente a NL de ratones. Los fibroblastos FL aislados de Ios pulmones de ratones 21 días después de lesión con BLM o fibroblastos NL de ratones control expuestos a solución salina intranasal se describen en otro sitio (Basnhary et al., 2012, supra). Los lisados de fibroblastos NL y FL se inmunotransfirieron para cambios en la expresión de proteínas p53, uPA, PAI-1 y coI-I (Fig. 5A). Se ensayó ARN total extraído de tejidos pulmonares de ratón (Fig. 5B) o de fibroblastos NL y FL (n = 6) (Fig. 5C) de Ios tejidos pulmonares de ratones con fibrosis inducida por BLM o ratones control (solución salina) para ARNm de uPA, PAI-1 y colágeno-l (CoI-I) por PCR en tiempo real cuantitativa. Los fibroblastos NL y FL de ratones se cultivaron en placas de 12 pocilios en medio DMEM. Después de tres días Ios fibroblastos se contaron para determinar la velocidad de proliferación (Fig. 5D).Figures 5A-5D. Differential expression of uPA and PAI-1 by FL fibroblasts versus NL from mice. FL fibroblasts isolated from mouse lungs 21 days after injury with BLM or NL fibroblasts from control mice exposed to intranasal saline are described elsewhere (Basnhary et al., 2012, supra). Fibroblast lysates NL and FL were immunoblotted for changes in the expression of p53, uPA, PAI-1 and coI-I proteins (Fig. 5A). Total RNA extracted from mouse lung tissues (Fig. 5B) or from NL and FL fibroblasts (n = 6) (Fig. 5C) from lung tissues of mice with BLM-induced fibrosis or control mice (saline) was assayed for UPA, PAI-1 and collagen-I (CoI-I) mRNA by quantitative real-time PCR. Mouse NL and FL fibroblasts were grown in 12-well plates in DMEM medium. After three days the fibroblasts were counted to determine the proliferation rate (Fig. 5D).
Figuras 6A-6D. CSP (CSP4) aumenta la expresión de p53 mediante la inducción de miR-34a en fibroblastos FL (FPI). (Fig. 6A) Se trataron fibroblastos NL y FL (n = 3) con PBS, CSP-4 (CSP) o péptido control (CP). Se analizó el ARN para miR-34a por PCR en tiempo real. (Fig. 6B) Se trataron fibroblastos FL con PBS o CSP o CP con o sin miR-34a antisentido (miR-34a-AS) o pre-miR-34a o miARN control (miR-Ctr). Se inmunotransfierieron medios acondicionados (CM) para PAl-1 y lisados (CL) para p53 y p-actina. (Fig. 6C) Se trataron fibroblastos FL con PBS o CSP o CP en presencia o ausencia de miR-34a-AS o pre-miR-34a o miR-Ctr. Se analizó ARN para cambios de miR-34a por PCR en tiempo real. (Fig. 6D) Se hicieron una serie de deleciones solapantes en CSP y estos péptidos se usaron para tratar fibroblastos FL con. Se evaluaron después cambios en p53, uPA, PAl-1 y coI-I para identificar Ios aminoácidos mínimos requeridos para Ios efectos de CSp.Figures 6A-6D. CSP (CSP4) increases p53 expression by inducing miR-34a in FL fibroblasts (FPI). (Fig. 6A) NL and FL fibroblasts (n = 3) were treated with PBS, CSP-4 (CSP) or control peptide (CP). RNA for miR-34a was analyzed by real-time PCR. (Fig. 6B) FL fibroblasts were treated with PBS or CSP or CP with or without antisense miR-34a (miR-34a-AS) or pre-miR-34a or control miRNA (miR-Ctr). Conditioned media (CM) for PAl-1 and lysates (CL) for p53 and p-actin were immunoblotted. (Fig. 6C) FL fibroblasts were treated with PBS or CSP or CP in the presence or absence of miR-34a-AS or pre-miR-34a or miR-Ctr. RNA was analyzed for miR-34a changes by real-time PCR. (Fig. 6D) A series of overlapping deletions were made in CSP and these peptides were used to treat FL fibroblasts with. Changes in p53, uPA, PAl-1 and coI-I were then evaluated to identify the minimum amino acids required for the effects of CSp.
Figuras 7A-7B. Degradación de proteínas p53 mediada por mdm2 aumentada en fibroblastos FL (FPI). (Fig. 7A) Lisados de fibroblastos NL y FL (n = 3) se inmunotransfierieron para p53, mdm2 y p-actina. (Fig. 7B) Lisados de fibroblastos NL y FL se inmunoprecipitaron (IP) con anticuerpo anti-mdm2 e inmunotransfirieron (IB) para la proteína p53 asociada.Figures 7A-7B. Increased mdm2-mediated p53 protein degradation in FL fibroblasts (IPF). (Fig. 7A) NL and FL fibroblast lysates (n = 3) were immunoblotted for p53, mdm2 and p-actin. (Fig. 7B) NL and FL fibroblast lysates were immunoprecipitated (IP) with anti-mdm2 antibody and immunoblotted (IB) for the associated p53 protein.
Figuras 8A-8C. Papel de la interrelación p53-sistema fib rino lítico en inhibición mediada por nutlina-3a (NTL) o CSP-4 de la expresión de coI-I en fibroblastos FL (FPI). (Fig. 8A) Se expusieron fibroblastos FL a PBS, nutlina-3a (10 mM), CSP-4 (10 nM) o péptido control (CP) durante 48 horas. Los lisados celulares se inmunotranfirieron para la expresión de CoI-I, PAl-1, p53, uPA y p-actina. (Fig. 8B) Fibroblastos FL cultivados en placas de 12 pocilios en medio DMEM se expusieron a vehículo (PBS) o nutlina-3a, CSP-4 o CP. Después de 3 d, las células se separaron y contaron. (Fig. 8C) Se transdujeron fibroblastos FL con vector de adenovirus vacío solo (Ad-EV) o vector Ad que expresa p53 (Ad-p53), PAl-1 (Ad-PAI-1) o caveolina-1 (Ad-Cav-1). Después de 48 h, Ios lisados celulares se inmunotransfirieron para CoI-I, PAl-1, p53, upA y p-actina.Figures 8A-8C. Role of the p53-fibrino lytic system interrelation in nutlin-3a (NTL) or CSP-4 mediated inhibition of coI-I expression in FL fibroblasts (FPI). (Fig. 8A) FL fibroblasts were exposed to PBS, nutlin-3a (10 mM), CSP-4 (10 nM), or control peptide (CP) for 48 hours. Cell lysates were immunoblotted for the expression of CoI-I, PAl-1, p53, uPA, and p-actin. (Fig. 8B) FL fibroblasts grown in 12-well plates in DMEM medium were exposed to vehicle (PBS) or nutlin-3a, CSP-4 or CP. After 3 d, the cells were separated and counted. (Fig. 8C) FL fibroblasts were transduced with either empty adenovirus vector alone (Ad-EV) or Ad vector expressing p53 (Ad-p53), PAl-1 (Ad-PAI-1) or caveolin-1 (Ad-Cav -1). After 48 h, the cell lysates were immunoblotted for CoI-I, PAl-1, p53, upA and p-actin.
Figuras 9A-9B. Papel de la interrelación p53-sistema fib rino lítico en la inducción de la expresión de coI-I en fibroblastos NL. Fibroblastos NL aislados de pulmones humanos histológicamente “normales” se trataron con ARNhc de p53 en vector lentivírico para inhibir la expresión basal de p53. Se trataron células control con ARNhc no específico (Ctr). (Fig. 9A): Muestras de medios acondicionados se inmunotransfirieron para PAl-1, uPA, y coI-I soluble mientras que se ensayaron lisados celulares para p53, (a-SMA) y p-actina. (Fig. 8B): se analizó ARN total aislado de fibroblastos Nl tratados con ARNhc control o de p53 para cambios en la expresión del ARNm de uPA, PAl-1, coI-I y p-actina por PCR en tiempo real cuantitativa.Figures 9A-9B. Role of the p53-fibrino lytic system interrelation in the induction of coI-I expression in NL fibroblasts. NL fibroblasts isolated from histologically "normal" human lungs were treated with p53 shRNA in lentiviral vector to inhibit basal p53 expression. Control cells were treated with non-specific shRNA (Ctr). (Fig. 9A): Conditioned media samples were immunoblotted for PAl-1, uPA, and soluble coI-I while cell lysates were assayed for p53, (a-SMA) and p-actin. (Fig. 8B): Total RNA isolated from Nl fibroblasts treated with control or p53 shRNA was analyzed for changes in mRNA expression of uPA, PAl-1, coI-I and p-actin by quantitative real-time PCR.
Figuras 10A-10D. Nutlina-3a (NTL) inhibe la fibrosis pulmonar en ratones tratados con BLM. Los ratones se expusieron a BLM durante 14 d para inducir fibrosis pulmonar. Se usaron ratones tratados con solución salina como controles de fibrosis. Después de 14 d, Ios ratones expuestos a BLM fueron inyectados IV con vehículo o nutlina-3a (10 mg/kg de peso corporal) (Zhang F et al. Drug Metab Dispos 39.í 5-21, 2011) para determinar si nutlina-3a inhibía fibrosis pulmonar establecida. El día 21 después de la lesión con BLM, Ios ratones se sometieron TAC para evaluar la extensión de la fibrosis (Fig. 10A). Se muestra un ejemplo representativo (n = 9). (Fig. 10B) Se midieron la distensibilidad y resistencia pulmonar en Ios mismos ratones usando el sistema Flexivent para evaluar la mejora en la función pulmonar después del tratamiento con nutlina-3a (n = 9). (Fig. 10C) Se sometieron secciones pulmonares a tinción tricrómica para evaluar la arquitectura pulmonar y depósito de colágeno como una indicación de fibrosis pulmonar. (Fig. 10D) Se analizaron homogenizados de pulmones enteros para contenido en colágeno total (hidroxiprolina) y desmosina como una evaluación independiente de cambios en la MEC. Figures 10A-10D. Nutlin-3a (NTL) inhibits pulmonary fibrosis in BLM-treated mice. Mice were exposed to BLM for 14 d to induce pulmonary fibrosis. Saline-treated mice were used as fibrosis controls. After 14 d, BLM-exposed mice were injected IV with vehicle or nutlin-3a (10 mg / kg body weight) (Zhang F et al. Drug Metab Dispos 39.i 5-21, 2011) to determine whether nutlin -3a inhibited established pulmonary fibrosis. On day 21 after BLM injury, mice underwent CT to assess the extent of fibrosis (Fig. 10A). A representative example is shown (n = 9). (Fig. 10B) Lung compliance and resistance were measured in the same mice using the Flexivent system to assess improvement in lung function after nutlin-3a treatment (n = 9). (Fig. 10C) Pulmonary sections were subjected to trichrome staining to assess lung architecture and collagen deposition as an indication of pulmonary fibrosis. (Fig. 10D) Whole lung homogenates were analyzed for total collagen (hydroxyproline) and desmosine content as an independent assessment of changes in ECM.
Figuras 11A-11D. CSP-4 inhibe fibrosis pulmonar establecida y mejora la función pulmonar. Se expusieron ratones a BLM para inducir fibrosis pulmonar. Después de 14 d, Ios ratones fueron inyectados IV con vehículo o 1,5 mg/kg de peso corporal de CSP-4 o péptido control (“CP”) de secuencia mezclada. El día 21 después de la lesión con BLM, Ios ratones se sometieron t Ac para evaluar la extensión de la fibrosis (Fig. 11A). Se muestra un ejemplo representativo (n = 9). (Fig. 11B): Se midieron Ios volúmenes pulmonares en Ios mismos ratones (n = 9) usando rendiciones de TAC cuantitativas. (Fig. 11C): Se sometieron secciones pulmonares a tinción tricrómica y tinción de H&E (no mostrado) para evaluar el depósito de colágeno como un indicador de fibrosis pulmonar. (Fig. 11D) Análisis de homogenizados de pulmón entero para contenido de hidroxiprolina total.Figures 11A-11D. CSP-4 inhibits established pulmonary fibrosis and improves lung function. Mice were challenged with BLM to induce pulmonary fibrosis. After 14 d, the mice were injected IV with vehicle or 1.5 mg / kg body weight of CSP-4 or mixed sequence control peptide ("CP"). On day 21 after BLM injury, the mice underwent t Ac to assess the extent of fibrosis (Fig. 11A). A representative example is shown (n = 9). (Fig. 11B): Lung volumes were measured in the same mice (n = 9) using quantitative CT renditions. (Fig. 11C): Lung sections were subjected to trichrome staining and H&E staining (not shown) to evaluate collagen deposition as an indicator of pulmonary fibrosis. (Fig. 11D) Analysis of whole lung homogenates for total hydroxyproline content.
Figuras 12A-12C. CSP-4 o nutlina-3a (NTL) inhibe la proliferación de fibroblastos FL. Se expusieron ratones a BLM para inducir fibrosis pulmonar significativa o a solución salina (controles de fibrosis). 14 d después, Ios ratones expuestos a BLM se trataron con CSP-4, CP o nutlina-3a (véanse las figuras 10A0D/11A-D). (Fig. 12A): Se sometieron secciones pulmonares (d21 después de la lesión con BLM) a inmunohistoquímica (IHC) para Ki-67 para evaluar la proliferación. Se muestra un ejemplo representativo (n = 9). Se aislaron fibroblastos de Ios pulmones de ratones expuestos a solución salina, BLM o BML+nutlina-3a (como se describe en la figura 11A) se ensayaron Ios cambios en la expresión de proteínas coI-I, p53 y posteriores uPA y PAI-1 por inmunotransferencia (Fig. 12B); y ARNm por RT-PCR cuantitativa (Fig. 12C).Figures 12A-12C. CSP-4 or nutlin-3a (NTL) inhibits the proliferation of FL fibroblasts. Mice were challenged with BLM to induce significant pulmonary fibrosis or with saline (fibrosis controls). 14 d later, BLM challenged mice were treated with CSP-4, CP or nutlin-3a (see Figures 10A0D / 11A-D). (Fig. 12A): Lung sections (d21 after BLM injury) were subjected to immunohistochemistry (IHC) for Ki-67 to assess proliferation. A representative example is shown (n = 9). Fibroblasts were isolated from the lungs of mice exposed to saline, BLM or BML + nutlin-3a (as described in Figure 11A). Changes in the expression of proteins coI-I, p53 and later uPA and PAI-1 were tested. by immunoblotting (Fig. 12B); and mRNA by quantitative RT-PCR (Fig. 12C).
Figura 13. Inhibición de fibrosis pulmonar inducida por BLM por tratamiento ex vivo de tejidos pulmonares de ratones WT con CSP-4 o nutlina-3a (NTL). Se expusieron ratones a BLM intranasal durante 21 d para inducir fibrosis pulmonar. Estos ratones (n = 3) se sacrificaron, Ios pulmones se extirparon, cortaron en trozos pequeños y se colocaron en placas de cultivo con medio DMEM que contenía suero bovino fetal al 10%. Las muestras de tejido se trataron posteriormente con CSP-4 (10 nM), péptido control (CP) y nutlina-3a (NTL) (10 |jM) durante 72 h. Se prepararon medios acondicionados y lisados de tejido y se analizaron para cambios en coI-I, a-SMA y p-actina por inmunotransferencia.Figure 13. Inhibition of BLM-induced pulmonary fibrosis by ex vivo treatment of lung tissues of WT mice with CSP-4 or nutlin-3a (NTL). Mice were exposed to intranasal BLM for 21 d to induce pulmonary fibrosis. These mice (n = 3) were sacrificed, the lungs were excised, cut into small pieces, and plated with DMEM medium containing 10% fetal calf serum. The tissue samples were subsequently treated with CSP-4 (10 nM), control peptide (CP) and nutlin-3a (NTL) (10 µM) for 72 h. Conditioned media and tissue lysates were prepared and analyzed for changes in coI-I, α-SMA, and p-actin by immunoblotting.
Descripción de formas de realización preferidasDescription of preferred embodiments
Los presentes inventores descubrieron que la expresión basal de la proteína “supresora de tumores”, p53 y el inhibidor-1 del activador de plasminógeno (PAI-1) están marcadamente reducidas en fibroblastos FL obtenidos de Ios pulmones de pacientes de f P i. Esto también es cierto para ratones con fibrosis pulmonar acelerada inducida por BLM, un modelo aceptado de FPI humana. p53 regula la expresión de componentes principales del sistema fibrinolítico de uPA (uPA, uPAR y PAI-1). Sin embargo, no está claro cómo Ios cambios en Ios niveles de estas proteínas contribuyen a la patogénesis de la fibrosis pulmonar, y si el restablecimiento del modo normal de la interrelación p53-sistema fibrinolítico de uPA mitiga la fibrosis pulmonar.The present inventors found that the basal expression of the "tumor suppressor" protein, p53 and plasminogen activator inhibitor-1 (PAI-1) are markedly reduced in FL fibroblasts obtained from the lungs of f P i patients. This is also true for mice with BLM-induced accelerated pulmonary fibrosis, an accepted model of human IPF. p53 regulates the expression of major components of the uPA fibrinolytic system (uPA, uPAR, and PAI-1). However, it is not clear how changes in the levels of these proteins contribute to the pathogenesis of pulmonary fibrosis, and whether the restoration of the normal mode of the p53-fibrinolytic system interface of uPA mitigates pulmonary fibrosis.
Según la presente invención, la expresión aumentada de uPA y uPAR, y una inhibición concurrente de PAI-1 debido a una falta de expresión de p53 en fibroblastos FL son críticas para el desarrollo de fibrosis pulmonar. La inducción de la expresión de p53, y el restablecimiento de la interrelación p53-sistema fibrinolítico de uPA mediante la reducción de uPA mediada por p53, y un aumento concurrente en la expresión de PAI-1 en fibroblastos FL, mitiga la FPI y es la base para tratar esta enfermedad con NTL.According to the present invention, increased expression of uPA and uPAR, and a concurrent inhibition of PAI-1 due to a lack of expression of p53 in FL fibroblasts are critical for the development of pulmonary fibrosis. Induction of p53 expression, and reestablishment of the p53-uPA fibrinolytic system interplay through p53-mediated reduction of uPA, and a concurrent increase in PAI-1 expression in FL fibroblasts, mitigates IPF and is the basis for treating this disease with NTL.
A diferencia de Ios fibroblastos de pulmón normal (“NL”), Ios fibroblastos obtenidos de pulmones de pacientes con FPI (fibroblastos “FL”) o de ratones con fibrosis pulmonar inducida por BLM expresan p53 mínima. Además, Ios fibroblastos FL producen niveles bajos de PAI-1, mientras que la expresión de uPA y uPAR están marcadamente elevadas. Unlike normal lung ("NL") fibroblasts, fibroblasts obtained from the lungs of IPF patients ("FL" fibroblasts) or BLM-induced pulmonary fibrosis mice express minimal p53. Furthermore, FL fibroblasts produce low levels of PAI-1, while the expression of uPA and uPAR are markedly elevated.
La presente invención se dirige a Ios tres componentes principales (uPA, uPAR y PAI-1) del sistema fibrinolítico de uPA de una manera global y coordinada. Dirigirse al mismo tiempo a Ios tres componentes principales del sistema fibrinolítico de uPA mediante el restablecimiento de la expresión de p53 en fibroblastos FL mitiga la fibrosis.The present invention addresses the three main components (uPA, uPAR and PAI-1) of the uPA fibrinolytic system in a coordinated and comprehensive manner. Targeting all three major components of the uPA fibrinolytic system at the same time by restoring p53 expression in FL fibroblasts mitigates fibrosis.
Según esto, este tratamiento afecta principalmente a fibroblastos FL y tejido pulmonar aislado de pacientes con FPI ex vivo e in vivo. Estos cambios se observaron en un modelo de ratón con fibrosis pulmonar establecida en el que se definieron Ios intermediarios y mediadores posteriores de Ios efectos beneficiosos de nutlina-3a.Accordingly, this treatment mainly affects FL fibroblasts and lung tissue isolated from IPF patients ex vivo and in vivo. These changes were observed in a mouse model with established pulmonary fibrosis in which the intermediates and subsequent mediators of the beneficial effects of nutlin-3a were defined.
Nutlina-3aNutlina-3a
Los compuestos útiles en el método de la presente divulgación incluyen nutlina-3a (también denominada nutlina y NTL) que es 4-2-4,5-dihidro-1H-imidazol-1-piperacin-2-ona (C30H30CI2N4O4) Compounds useful in the method of the present disclosure include nutlin-3a (also called nutlin and NTL) which is 4-2-4,5-dihydro-1H-imidazol-1-piperazin-2-one (C30H30CI2N4O4)
Este compuesto se describe en el documento U.S. 7.893.278 (Haley et al). También son útiles en la presente divulgación un género más amplio de análogos cis-imidazolina quirales de NTL que comparten la propiedad de inhibir las interacciones MDM2-p53. Por análogos de NTL se pretende el género de moléculas divulgadas en la patente '278, y caracterizados por la fórmula 2 a continuación.This compound is described in US 7,893,278 (Haley et al). Also useful in the present disclosure are a broader genus of chiral cis-imidazoline analogs of NTL that share the property of inhibiting MDM2-p53 interactions. By NTL analogs is intended the genus of molecules disclosed in the '278 patent, and characterized by formula 2 below.
Fórmula 2Formula 2
en la quein which
R se selecciona de anillos de 5 y 6 miembros saturados o insaturados que contienen al menos un heteroátomo; el heteroátomo puede ser S, N u O. El anillo puede estar sustituido con un grupo alquilo inferior alquilo que puede estar además sustituido con al menos uno de -C=O-Ri , -SO2CH3, o -CH2C=OCH3, R is selected from saturated or unsaturated 5- and 6-membered rings containing at least one heteroatom; the heteroatom can be S, N or O. The ring can be substituted with a lower alkyl group which can be further substituted with at least one of -C = OR i , -SO2CH3, or -CH2C = OCH3,
Ri se selecciona del grupo consistente en H, -NH2, -N-alquilo inferior, alquilo inferior sustituido con un hidroxi, alquilo inferior sustituido con -NH2, y un anillo saturado de 5 o 6 miembros que contiene al menos un heteroátomo (S, N u O); R i is selected from the group consisting of H, -NH2, -N-lower alkyl, hydroxy-substituted lower alkyl, -NH2-substituted lower alkyl, and a saturated 5- or 6-membered ring containing at least one heteroatom (S , N or O);
X i y X2 se seleccionan independientemente del grupo consistente en H, alcoxi inferior, -CH2OCH3, -CH2OCH2CH3, -OCH2CF3 y -OCH2CH2F,X i and X2 are independently selected from the group consisting of H, lower alkoxy, -CH2OCH3, -CH2OCH2CH3, -OCH2CF3, and -OCH2CH2F,
Y i e Y2 se seleccionan cada uno independientemente del grupo consistente en -Cl, -Br, -NO2, -C=N, y -C=CH, y Y i and Y2 are each independently selected from the group consisting of -Cl, -Br, -NO2, -C = N, and -C = CH, and
la estequiometría absoluta en la posición 4 y 5 del anillo de imidazolina es S y R, respectivamente.the absolute stoichiometry at position 4 and 5 of the imidazoline ring is S and R, respectively.
Otros compuestos que se consideran análogos de NTL son compuestos de fórmula 2 en donde R es piperacinilo sustituido con al menos un grupo seleccionado de alquilo inferior, cicloalquilo, -C=ORi , -N-alquilo inferior, -SO2CH3, =0, -CH2C=OCH3, o piperidinilo sustituido con al menos un grupo seleccionado de alquilo de C1-C3, alcoxi de C1-C2, -C=0CH3, -S02CH3'-C=0, -OH, -CH2NH2, -C=0CH2NH2, -C=0CH20H, -C=0CH(0H)CH20H, -CH2CH(0H)CH20H, -C=0 N(CH2)2, -C=0 NH2, y -C=0 N(CH3)CH3, -N(CH3)CH3, pirrolidinilo y piperadinilo.Other compounds that are considered NTL analogs are compounds of formula 2 where R is piperazinyl substituted with at least one group selected from lower alkyl, cycloalkyl, -C = OR i , -N-lower alkyl, -SO2CH3, = 0, - CH2C = OCH3, or piperidinyl substituted with at least one group selected from C1-C3 alkyl, C1-C2 alkoxy, -C = 0CH3, -S02CH3'-C = 0, -OH, -CH2NH2, -C = 0CH2NH2, -C = 0CH20H, -C = 0CH (0H) CH20H, -CH2CH (0H) CH20H, -C = 0 N (CH2) 2, -C = 0 NH2, and -C = 0 N (CH3) CH3, -N (CH3) CH3, pyrrolidinyl and piperadinyl.
También son preferidos compuestos de fórmula 2 en donde el grupo X I en posición orto se selecciona de alcoxi inferior, -OCH2CF3 y -OCH2CH2F, y el grupo X2 en la posición para es alcoxi inferior. Aún son más preferidos compuestos en donde el grupo X I en la posición orto se selecciona de etoxi, isopropoxi, -OCH2CF3 y -OCH2CH2F, y el grupo X2 en la posición para se selecciona de metoxi y etoxi.Also preferred are compounds of formula 2 wherein the group X I in the ortho position is selected from lower alkoxy, -OCH2CF3 and -OCH2CH2F, and the group X2 in the para position is lower alkoxy. Still more preferred are compounds wherein the group X I in the ortho position is selected from ethoxy, isopropoxy, -OCH2CF3 and -OCH2CH2F, and the group X2 in the para position is selected from methoxy and ethoxy.
Más preferidos son compuestos de fórmula 2 en donde R se selecciona del piperacinilo y piperacinilo sustituido. Tales compuestos son, por ejemplo: 1-{4-[(4S,5R)-4,5-Bis-(4-cloro-fenil)-2-(2-isopropoxi-4-metoxi-fenil)-4,5-dihidro-imidazol-1carbonil]-piperacin-1-il}-etanona; 4-[(4S,5R)-4,5-Bis-(4-cloro-fenil)-2-(2-isopropoxi-4metoxi-fenil)-4,5-dihidroimidazol-1-carbonil]piperacin-2-ona; [(4S,5R)-4,5-Bis-(4-cloro-fenil)-2-(2-isopropoxi-4-5-metoxi-fenil)-4,5-dihidroimidazol-1-il]-(4-pirrolidin-1-il-piperidin-1-il)-metanona; 4-[(4S,5R)-4,5-Bis-(4-cloro-fenil)-2-(2-etoxi-fenil)-4,5-dihidro im¡dazol-1-carbon¡l]-piperac¡n-2ona; 1-{4-[(45,5R)-4,5-B¡s-(4-cloro-fen¡l)-2-(2-etox¡fen¡l)-4,5-d¡h¡dro-¡m¡dazol-1-carbonil]-piperac¡n-1-¡l}-etanona; 2-{4-[(45,5R)-4,5-B¡s-(4-doro-fen¡l)-2-(2-etox¡fen¡l)-4,5-d¡h¡dro-¡m¡dazoM-carbon¡l]-piperadn-1-¡l}-1-morfolin-4-¡l-etanona; [(4S,5R)-4,5-B¡s-(4-cloro-fen¡l)-2-(2-etox¡-fen¡l)4,5-d¡h¡dro-¡m¡dazol-1-¡lH4-(2-metanesulfonilet¡l)-piperadn-1-¡l]-metanona; y [(4S,5R)-4,5-B¡s-(4-cloro-fen¡l)-2-(2-¡sopropox¡-4-metox¡-fen¡l)-4,5-dih¡dro-¡m¡dazol-1-¡l]-(4-met¡l-p¡peradn-1-il)-metanona.More preferred are compounds of formula 2 wherein R is selected from piperazinyl and substituted piperazinyl. Such compounds are, for example: 1- {4 - [(4S, 5R) -4,5-Bis- (4-chloro-phenyl) -2- (2-isopropoxy-4-methoxy-phenyl) -4.5 -dihydro-imidazol-1carbonyl] -piperazin-1-yl} -ethanone; 4 - [(4S, 5R) -4,5-Bis- (4-chloro-phenyl) -2- (2-isopropoxy-4-methoxy-phenyl) -4,5-dihydroimidazole-1-carbonyl] piperazin-2-one ; [(4S, 5R) -4,5-Bis- (4-chloro-phenyl) -2- (2-isopropoxy-4-5-methoxy-phenyl) -4,5-dihydroimidazol-1-yl] - (4 -pyrrolidin-1-yl-piperidin-1-yl) -methanone; 4 - [(4S, 5R) -4,5-Bis- (4-chloro-phenyl) -2- (2-ethoxy-phenyl) -4,5-dihydro imidazole-1-carbonyl] -piperac ¡N-2one; 1- {4 - [(45.5R) -4,5-B¡s- (4-chloro-phen¡l) -2- (2-ethoxyphen¡l) -4,5-d¡h¡ dro-dazole-1-carbonyl] -piperazin-1-l} -ethanone; 2- {4 - [(45.5R) -4,5-B¡s- (4-doro-phen¡l) -2- (2-ethoxyphen¡l) -4,5-d¡h¡ dro-m¡dazoM-carbon¡l] -piperadn-1-¡l} -1-morpholin-4-¡l-ethanone; [(4S, 5R) -4,5-B¡s- (4-chloro-phen¡l) -2- (2-ethox¡-phen¡l) 4,5-d¡h¡dro-¡m¡ dazol-1-¡lH4- (2-methanesulfonylethyl) -piperadn-1-¡l] -methanone; and [(4S, 5R) -4,5-B¡s- (4-chloro-phen¡l) -2- (2-¡sopropox¡-4-methox¡-phen¡l) -4,5-dih ¡Dro-¡midazol-1-¡l] - (4-methylp¡peradn-1-yl) -methanone.
La síntesis de todas estas moléculas se conoce en la técnica, alguna de las cuales se describe en la patente '278. The synthesis of all of these molecules is known in the art, some of which are described in the '278 patent.
Péptidos derivados de la secuencia Cav-1Peptides derived from the Cav-1 sequence
El dominio o péptido de andamiaje de caveolina-1 (Cav-1) (también denominado CSD o CSP) interfiere con la interacción de Cav-1 con las quinasas Src y mimetiza el efecto combinado de uPA y anticuerpo anti-p1-intergrina como se discute en más detalle posteriormente. La Cav-1 humana nativa tiene una longitud de 178 aminoácidos y un peso molecular de 22 kDa. La secuencia de aminoácidos de Cav-1 se muestra a continuación (SEQ ID NO: 3).The caveolin-1 scaffold domain or peptide (Cav-1) (also referred to as CSD or CSP) interferes with the interaction of Cav-1 with Src kinases and mimics the combined effect of uPA and anti-p1-interggrin antibody as shown. discussed in more detail later. Native human Cav-1 is 178 amino acids long and has a molecular weight of 22 kDa. The amino acid sequence of Cav-1 is shown below (SEQ ID NO: 3).
1 M5GGKYVDSEGHLYTVPIREQGNIYKPNNK AMADELSEKQ VYDAHTKEID LVNRDPKHLN 61 DDWKIDFED VIAEPEGTHS FDGIWKASFT TFTVTKYWFY RLLSALFGIP MALIWGIYFA 121 ILSFLHIWAV VPCIKSFLIE IQCISRVYSI YVHTVCDPLF EAVGKIFSNV RINLQKEI1 M5GGKYVDSEGHLYTVPIREQGNIYKPNNK AMADELSEKQ VYDAHTKEID LVNRDPKHLN 61 DDWKIDFED VIAEPEGTHS FDGIWKASFT TFTVTKYWFY RLLSALFGIP MALIWGIYFAIE ILVCISIYFLTVVCISIYFA 121 ILVCISIHTVVKSWCDSIYFA ILSFLCIHVTVVKSWCDSIYFA IIFLCIHVTVVKSWCDSIYFA IIFFILCIHVKSVKSWCDSIYFA 121
CSP es el péptido de 20 residuos subrayado anteriormente, y tiene la secuencia GIWKASFTTFTVTKYWFYR (SEQ ID NO:2). El péptido preferido de la presente invención, designado CSP-4 es el fragmento FTTFTVT (SEQ ID NO: 1) de CSP y se muestra con doble subrayado en la secuencia de Cav-1. CSP-4 tiene las actividades mostradas en los ejemplos y figuras, posteriormente, y afecta cómo p53 regula la viabilidad de LEC a través del control coordinado de la expresión de uPA, uPAR (hacia arriba) y PAI-1 (hacia abajo) y por este presunto mecanismo protege las LEC o epitelio pulmonar in vivo de apoptosis y bloquea la fibrosis que resulta de ALI.CSP is the 20 residue peptide underlined above, and has the sequence GIWKASFTTFTVTKYWFYR (SEQ ID NO: 2). The preferred peptide of the present invention, designated CSP-4 is the FTTFTVT (SEQ ID NO: 1) fragment of CSP and is shown with double underlining in the Cav-1 sequence. CSP-4 has the activities shown in the examples and figures, below, and affects how p53 regulates LEC viability through coordinated control of uPA, uPAR (up) and PAI-1 (down) expression and by this presumed mechanism protects ECLs or lung epithelium in vivo from apoptosis and blocks fibrosis resulting from ALI.
En estudios divulgados en el presente documento, un péptido control para CSP-4, que se denomina “CP” es un péptido mezclado con la misma composición de aminoácidos que el CSP mayor (SEQ ID NO: 2), pero tiene una secuencia diferente: WGIDKAFFTTSTVTYKWFRY (SEQ ID NO:5).In studies disclosed herein, a control peptide for CSP-4, which is called "CP" is a mixed peptide with the same amino acid composition as the major CSP (SEQ ID NO: 2), but has a different sequence: WGIDKAFFTTSTVTYKWFRY (SEQ ID NO: 5).
Se pueden hacer modificaciones y cambios en la estructura de CSP-4, y crear moléculas con características similares o de otra manera deseables. Tales derivados funcionales o derivados biológicamente activos (términos que se usan de forma intercambiable) están abarcados en la presente divulgación.Modifications and changes can be made to the structure of CSP-4, and create molecules with similar or otherwise desirable characteristics. Such functional derivatives or biologically active derivatives (terms used interchangeably) are encompassed in the present disclosure.
Los derivados funcionales preferidos son variantes de adición y oligómeros/multímeros peptídicos, y similares. Preferred functional derivatives are addition variants and peptide oligomers / multimers, and the like.
Estos se pueden generar sintéticamente, pero también por producción recombinante, y ensayar para las propiedades de unión o actividad biológica de CSP-4. Una manera preferida de medir la actividad de la variante es en un ensayo de unión competitiva en donde la capacidad de la variante del péptido para competir con la unión de caveolina soluble, tal como una que está marcada detectablemente, con uPAR soluble (“suPAR”).These can be generated synthetically, but also by recombinant production, and tested for the binding properties or biological activity of CSP-4. A preferred way to measure variant activity is in a competitive binding assay where the ability of the peptide variant to compete for soluble caveolin binding, such as one that is detectably labeled, with soluble uPAR ("suPAR" ).
Se entiende que distintos derivados de CSP-4 y polipéptidos más largos que comprenden CSP-4 se pueden hacer fácilmente según la invención, ya sea por métodos químicos (sintéticos) o por medios recombinantes (preferido para polipéptidos más largos).It is understood that various derivatives of CSP-4 and longer polypeptides comprising CSP-4 can be readily made according to the invention, either by chemical (synthetic) methods or by recombinant means (preferred for longer polypeptides).
Están incluidos en la definición de variantes funcionales de CSP-4 adición que preferiblemente comprende 1-5 aminoácidos adicionales en cualquier extremo o en ambos extremos. En otras formas de realización (que se pretende que sea distinta de multímeros peptídicos discutidos posteriormente), se pueden añadir más residuos adicionales, hasta aproximadamente 20 residuos. En la variante de adición de CSP-4, los residuos adicionales N-terminal a, y/o C-terminal a SEQ ID NO: 1 (el péptido central CSP-4) puede incluir algunos de esos en el orden en que se producen en la secuencia nativa en Cav-1 (SEQ ID NO: 4. Sin embargo, la variante de adición no puede ser SEQ ID NO: 3. Alternativamente, se pueden añadir otros aminoácidos en cualquier extremo de SEQ ID NO: 1, con el entendimiento de que la variante de adición mantiene la actividad biológica y actividad de unión de CSP-4 (al menos el 20% de la actividad, o preferiblemente más, como se muestra posteriormente).Included in the definition of functional variants of CSP-4 are addition which preferably comprises 1-5 additional amino acids at either end or both ends. In other embodiments (which are intended to be distinct from peptide multimers discussed below), more additional residues can be added, up to about 20 residues. In the CSP-4 addition variant, additional residues N-terminal to, and / or C-terminal to SEQ ID NO: 1 (the core CSP-4 peptide) may include some of those in the order in which they occur. in the native sequence in Cav-1 (SEQ ID NO: 4. However, the addition variant cannot be SEQ ID NO: 3. Alternatively, other amino acids can be added at either end of SEQ ID NO: 1, with the understanding that the spiked variant maintains the biological activity and binding activity of CSP-4 (at least 20% of the activity, or preferably more, as shown below).
Las variantes de sustitución preferidas de CSP-4 es sustituciones conservadoras en las que 1, 2 o 3 residuos se han sustituido por un residuo diferente. Para una descripción detallada de química y estructura de proteínas, véase, Schultz G.E. et al., Principies of Prntein Structure, Springer-Verlag, Nueva York, 1979, y Creighton, T.E., Proteins: Structure and Molecular Properties, 2a ed., W.H. Freeman & Co., San Francisco, 1993. Las sustituciones conservadoras y se definen en el presente documento como intercambios en uno de los siguientes grupos:Preferred substitution variants of CSP-4 are conservative substitutions in which 1, 2, or 3 residues have been replaced by a different residue. For a detailed description of protein chemistry and structure, see, Schultz GE et al., Principles of Prntein Structure, Springer-Verlag, New York, 1979, and Creighton, TE, Proteins: Structure and Molecular Properties, 2nd ed., WH Freeman & Co., San Francisco, 1993. Conservative substitutions and are defined herein as exchanges in one of the following groups:
Phe se puede sustituir por un residuo aromático grande: Tyr, Trp.Phe can be replaced by a large aromatic residue: Tyr, Trp.
Thr se puede sustituir por residuos alifáticos pequeños, no polares o ligeramente polares: por ejemplo, Ala, Ser o Gly. Thr can be replaced by small, nonpolar or slightly polar aliphatic residues: eg Ala, Ser or Gly.
Val se puede sustituir por residuos alifáticos grandes, no polares: Met, Leu, lie, Cys.Val can be replaced by large, nonpolar aliphatic residues: Met, Leu, lie, Cys.
Incluso cuando es difícil predecir el efecto exacto de una sustitución antes de hacerla, un experto en la materia apreciará que el efecto se puede evaluar por ensayos de cribado rutinarios, preferiblemente los ensayos biológicos y bioquímicos descritos en el presente documento. La actividad de un lisado celular o polipéptido o variante peptídica purificada se criba en un ensayo de cribado adecuado para la característica deseada.Even when it is difficult to predict the exact effect of a substitution before making it, one of skill in the art will appreciate that the effect can be evaluated by routine screening tests, preferably the biological and biochemical tests described herein. The activity of a purified cell lysate or polypeptide or peptide variant is screened in a suitable screening assay for the desired trait.
Además de los 20 L-aminoácidos “estándar”, D-aminoácidos o aminoácidos no estándar, modificados o inusuales que están bien definidos en la técnica también se contemplan para uso en la presente invención. Estos incluyen, por ejemplo, incluyen p-alanina (p-Ala) y otros ^-aminoácidos tal como ácido 3-aminopropiónico, ácido 2,3-diaminopropiónico (Dpr), ácido 4-aminobutírico y así; ácido a-aminoisobutírico (Aib); ácido £-aminohexanoico (Aha); ácido 6-aminovalérico (Ava); N-metilglicina o sarcosina (MeGly); ornitina (Orn); citrulina (Cit); t-butilalanina (t-BuA); tbutilglicina (t-BuG); N-metilisoleucina (Melle); fenilglicina (Phg); norleucina (Nle); 4-clorofenilalanina (Phe(4-Cl)); 2-fluorofenilalanina (Phe(2-F)); 3-fluorofenilalanina (Phe(3-F)); 4-fluorofenilalanina (Phe(4-F)); penicilamina (Pen); ácido 1,2,3,4-tetrahidroisoquinolina-3-carboxílico (Tic); homoarginina (hArg); N-acetil lisina (AcLys); ácido 2,4-diaminobutírico (Dbu); ácido 2,4-diaminobutírico (Dab); p-aminofenilalanina (Phe(pNH2)); N-metil valina (MeVal); homocisteína (hCys), homofenilalanina (hPhe) y homoserina (hSer); hidroxiprolina (Hyp), homoprolina (hPro), aminoácidos N-metilados y peptoides (glicinas N-sustituidas).In addition to the 20 "standard" L-amino acids, D-amino acids or non-standard, modified or unusual amino acids that are well defined in the art are also contemplated for use in the present invention. These include, for example, include p-alanine (p-Ala) and other ^ -amino acids such as 3-aminopropionic acid, 2,3-diaminopropionic acid (Dpr), 4-aminobutyric acid and so on; α-aminoisobutyric acid (Aib); £ -aminohexanoic acid (Aha); 6-aminovaleric acid (Ava); N-methylglycine or sarcosine (MeGly); ornithine (Orn); citrulline (Cit); t-butylalanine (t-BuA); t-butylglycine (t-BuG); N-methylisoleucine (Melle); phenylglycine (Phg); norleucine (Nle); 4-chlorophenylalanine (Phe (4-Cl)); 2-fluorophenylalanine (Phe (2-F)); 3-fluorophenylalanine (Phe (3-F)); 4-fluorophenylalanine (Phe (4-F)); penicillamine (Pen); 1,2,3,4-tetrahydroisoquinoline-3-carboxylic acid (Tic); homoarginine (hArg); N-acetyl lysine (AcLys); 2,4-diaminobutyric acid (Dbu); 2,4-diaminobutyric acid (Dab); p-aminophenylalanine (Phe (pNH2)); N-methyl valine (MeVal); homocysteine (hCys), homophenylalanine (hPhe) and homoserine (hSer); hydroxyproline (Hyp), homoproline (hPro), N-methylated amino acids and peptoids (N-substituted glycines).
Se pueden diseñar otros compuestos por diseño de fármacos racional para funcionar de una manera similar a CSP-4. El fin del diseño de fármacos racional es producir análogos estructurales de compuestos biológicamente activos. Al crear tales análogos, es posible producir fármacos que sean más activos o más estables que las moléculas naturales (es decir, péptidos), menor susceptibilidad a alteraciones que afectan funciones. Un enfoque es generar una estructura tridimensional de CSP-4, por ejemplo, por RMN o cristalografía de rayos X, modelado por ordenador o mediante una combinación. Un enfoque alternativo es sustituir aleatoriamente grupos funcionales en la secuencia de CSP-4, y determinar el efecto en la función.Other compounds can be engineered by rational drug design to function in a similar manner to CSP-4. The goal of rational drug design is to produce structural analogs of biologically active compounds. By creating such analogs, it is possible to produce drugs that are more active or more stable than natural molecules (ie, peptides), less susceptible to alterations that affect functions. One approach is to generate a three-dimensional structure of CSP-4, for example, by NMR or X-ray crystallography, computer modeling, or by a combination. An alternative approach is to randomly substitute functional groups in the CSP-4 sequence, and determine the effect on function.
Además, un derivado biológicamente activo tiene la actividad de CSP-4 en un ensayo in vitro o in vivo de unión o de actividad biológica, tal como los ensayos descritos en el presente documento. Preferiblemente, el polipéptido inhibe o previene apoptosis de LEC inducida por BLM in vitro o in vivo con actividad al menos aproximadamente el 20% de la actividad de CSP-4, o al menos aproximadamente el 30%, 40%, 50%, 60%, 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, aproximadamente el 95%, 97%, 99%, y cualquier intervalo derivable en los mismos, tal como, por ejemplo, desde aproximadamente el 70% hasta aproximadamente el 80%, y más preferiblemente desde aproximadamente el 81% hasta aproximadamente el 90%; o incluso más preferiblemente, desde aproximadamente el 91% hasta aproximadamente el 99%. El derivado puede tener el 100% o incluso mayor actividad que CSP-4.Furthermore, a biologically active derivative has CSP-4 activity in an in vitro or in vivo binding or biological activity assay, such as the assays described herein. Preferably, the polypeptide inhibits or prevents apoptosis of BLM-induced SLE in vitro or in vivo with activity at least about 20% of CSP-4 activity, or at least about 30%, 40%, 50%, 60% , 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, about 95%, 97%, 99%, and any differentiable range therein, such as, for example, from about 70% to about 80%, and more preferably from about 81% to about 90%; or even more preferably, from about 91% to about 99%. The derivative can have 100% or even higher activity than CSP-4.
El péptido puede estar protegido en su extremos N o C con un grupo acilo (abreviado “Ac”) y un amido (abreviado “Am”), respectivamente, por ejemplo, acetilo (CH3CO-) en el extremo N y amido (-NH2) en el extremo C. Se contempla una amplia gama de funciones de protección N-terminal, preferiblemente en una unión al grupo amino terminal, por ejemplo, formilo;The peptide may be protected at its N- or C-termini with an acyl group (abbreviated "Ac") and an amido (abbreviated "Am"), respectively, for example, acetyl (CH3CO-) at the N-terminus and amido (-NH2 ) at the C-terminus. A wide range of N-terminal protecting functions are contemplated, preferably at a linkage to the terminal amino group, eg, formyl;
alcanoilo, que tiene de 1 a 10 átomos de carbono, tal como acetilo, propionilo, butirilo;alkanoyl, having 1 to 10 carbon atoms, such as acetyl, propionyl, butyryl;
alquenoilo, que tiene de 1 a 10 átomos de carbono, tal como hex-3-enoilo;alkenoyl, having 1 to 10 carbon atoms, such as hex-3-enoyl;
alquinoilo, que tiene de 1 a 10 átomos de carbono, tal como hex-5-inoilo;alkynoyl, having 1 to 10 carbon atoms, such as hex-5-ynoyl;
aroilo, tal como benzoilo o 1 -naftoilo;aroyl, such as benzoyl or 1 -naphthoyl;
heteroaroilo, tal como 3-pirroilo o 4-quinoloilo;heteroaroyl, such as 3-pyrroyl or 4-quinoloyl;
alquilsulfonilo, tal como metanosulfonilo;alkylsulfonyl, such as methanesulfonyl;
ariisulfonilo, tal como bencenosulfonilo o sulfanililo;ariisulfonyl, such as benzenesulfonyl or sulfanilyl;
heteroarilsulfonilo, tal como piridina-4-sulfonilo;heteroarylsulfonyl, such as pyridine-4-sulfonyl;
alcanoilo sustituido, que tiene de 1 a 10 átomos de carbono, tal como 4-aminobutirilo;substituted alkanoyl, having 1 to 10 carbon atoms, such as 4-aminobutyryl;
alquenoilo sustituido, que tiene de 1 a 10 átomos de carbono, tal como 6-hidroxi-hex-3-enoilo;substituted alkenoyl, having 1 to 10 carbon atoms, such as 6-hydroxy-hex-3-enoyl;
alquinoilo sustituido, que tiene de 1 a 10 átomos de carbono, tal como 3-hidroxi-hex-5-inoilo;substituted alkynoyl, having 1 to 10 carbon atoms, such as 3-hydroxy-hex-5-ynoyl;
aroilo sustituido, tal como 4-clorobenzoilo o 8-hidroxi-naft-2-oilo;substituted aroyl, such as 4-chlorobenzoyl or 8-hydroxy-naphth-2-oyl;
heteroaroilo sustituido, tal como 2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahidro-3-metil-quinazolin-6-oilo;substituted heteroaroyl, such as 2,4-dioxo-1,2,3,4-tetrahydro-3-methyl-quinazolin-6-oyl;
alquilsulfonilo sustituido, tal como 2-aminoetanosulfonilo;substituted alkylsulfonyl, such as 2-aminoethanesulfonyl;
ariisulfonilo sustituido, tal como 5-dimetilamino-1-naftalenosulfonilo;substituted ariisulfonyl, such as 5-dimethylamino-1-naphthalenesulfonyl;
heteroarilsulfonilo sustituido, tal como 1 -metoxi-6-isoquinolinesulfonilo;substituted heteroarylsulfonyl, such as 1-methoxy-6-isoquinolininesulfonyl;
carbamoilo o tiocarbamoilo;carbamoyl or thiocarbamoyl;
carbamoilo sustituido (R'-NH-CO) o tiocarbamoilo sustituido (R'-NH-CS) en donde R' es alquilo, alquenilo, alquinilo, arilo, heteroarilo, alquilo sustituido, alquenilo sustituido, alquinilo sustituido, arilo sustituido, o heteroarilo sustituido; carbamoilo sustituido (R'-NH-CO) y tiocarbamoilo sustituido (R'-NH-CS) en donde R' es alcanoilo, alquenoilo, alquinoilo, aroilo, heteroaroilo, alcanoilo sustituido, alquenoilo sustituido, alquinoilo sustituido, aroilo sustituido o heteroaroilo sustituido, todos como se han definido anteriormente.substituted carbamoyl (R'-NH-CO) or substituted thiocarbamoyl (R'-NH-CS) where R 'is alkyl, alkenyl, alkynyl, aryl, heteroaryl, substituted alkyl, substituted alkenyl, substituted alkynyl, substituted aryl, or heteroaryl replaced; substituted carbamoyl (R'-NH-CO) and substituted thiocarbamoyl (R'-NH-CS) where R 'is alkanoyl, alkenyl, alkynoyl, aroyl, heteroaroyl, substituted alkanoyl, substituted alkenoyl, substituted alkynoyl, substituted aroyl or substituted heteroaroyl , all as defined above.
La función de protección C-terminal puede ser un enlace amida o éster con el carboxilo terminal. Las funciones de protección que proporcionan un enlace amida se designan como NR1R2 en donde R1 y R2 se pueden extraer independientemente del siguiente grupo: hidrogeno; The C-terminal protecting function can be an amide or ester bond with the terminal carboxyl. Protective functions that provide an amide bond are designated as NR1R2 where R1 and R2 can be independently extracted from the following group: hydrogen;
alquilo, que preferiblemente tiene de 1 a 10 átomos de carbono, tal como metilo, etilo, isopropilo;alkyl, preferably having 1 to 10 carbon atoms, such as methyl, ethyl, isopropyl;
alquenilo, que preferiblemente tiene de 1 a 10 átomos de carbono, tal como prop-2-enilo;alkenyl, preferably having 1 to 10 carbon atoms, such as prop-2-enyl;
alquinilo, que preferiblemente tiene de 1 a 10 átomos de carbono, tal como prop-2-inilo;alkynyl, preferably having 1 to 10 carbon atoms, such as prop-2-ynyl;
alquilo sustituido que tiene de 1 a 10 átomos de carbono, tal como hidroxialquilo, alcoxialquilo, mercaptoalquilo, alquiltioalquilo, halogenoalquilo, cianoalquilo, aminoalquilo, alquilaminoalquilo, dialquilaminoalquilo, alcanoilalquilo, carboxialquilo, carbamoilalquilo;substituted alkyl having 1 to 10 carbon atoms, such as hydroxyalkyl, alkoxyalkyl, mercaptoalkyl, alkylthioalkyl, haloalkyl, cyanoalkyl, aminoalkyl, alkylaminoalkyl, dialkylaminoalkyl, alkanoylalkyl, carboxyalkyl, carbamoylalkyl;
alquenilo sustituido que tiene de 1 a 10 átomos de carbono, tal como hidroxialquenilo, alcoxialquenilo, mercaptoalquenilo, alquiltioalquenilo, halogenoalquenilo, cianoalquenilo, aminoalquenilo, alquilaminoalquenilo, dialquilaminoalquenilo, alcanoilalquenilo, carboxialquenilo, carbamoilalquenilo;Substituted alkenyl having 1 to 10 carbon atoms, such as hydroxyalkenyl, alkoxyalkenyl, mercaptoalkenyl, alkylthioalkenyl, haloalkenyl, cyanoalkenyl, aminoalkenyl, alkylaminoalkenyl, dialkylaminoalkenyl, alkanoylalkenyl, carboxyalkenyl, alkanoylalkenyl, carboxyalkenyl;
alquinilo sustituido que tiene de 1 a 10 átomos de carbono, tal como hidroxialquinilo, alcoxialquinilo, mercaptoalquinilo, alquiltioalquinilo, halogenoalquinilo, cianoalquinilo, aminoalquinilo, alquilaminoalquinilo, dialquilaminoalquinilo, alcanoilalquinilo, carboxialquinilo, carbamoilalquinilo;substituted alkynyl having 1 to 10 carbon atoms, such as hydroxyalkynyl, alkoxyalkynyl, mercaptoalkynyl, alkylthioalkynyl, haloalkynyl, cyanoalkynyl, aminoalkynyl, alkylaminoalkynyl, dialkylaminoalkynyl, alkanoylalkynyl, carboxyalkynyl, carbamoylalkynyl;
aroilalquilo que tiene hasta 10 átomos de carbono, tal como fenacilo o 2-benzoiletilo;aroylalkyl having up to 10 carbon atoms, such as phenacyl or 2-benzoylethyl;
arilo, tal como fenilo o 1-naftilo;aryl, such as phenyl or 1-naphthyl;
heteroarilo, tal como 4-quinolilo;heteroaryl, such as 4-quinolyl;
alcanoilo que tiene de 1 a 10 átomos de carbono, tal como acetilo o butirilo;alkanoyl having 1 to 10 carbon atoms, such as acetyl or butyryl;
aroilo, tal como benzoilo;aroyl, such as benzoyl;
heteroaroilo, tal como 3-quinoloilo;heteroaroyl, such as 3-quinoloyl;
OR' o NR'R" donde R' y R" son independientemente hidrogeno, alquilo, arilo, heteroarilo, acilo, aroilo, sulfonoilo, sulfinilo, o SO2-R"' o SO-R"' donde R"' es alquilo, arilo, heteroarilo, alquenilo o alquinilo sustituido o sin sustituir. OR 'or NR'R "where R' and R" are independently hydrogen, alkyl, aryl, heteroaryl, acyl, aroyl, sulfonoyl, sulfinyl, or SO2-R "' or SO-R"' where R "'is alkyl, substituted or unsubstituted aryl, heteroaryl, alkenyl, or alkynyl.
Las funciones de protección que proporcionan un enlace éster se designan como OR, en donde R puede ser: alcoxi; ariloxi; heteroariloxi; aralquiloxi; heteroaralquiloxi; alcoxi sustituido; ariloxi sustituido; heteroariloxi sustituido; aralquiloxi sustituido; o heteroaralquiloxi sustituido.Protective functions that provide an ester bond are designated as OR, where R can be: alkoxy; aryloxy; heteroaryloxy; aralkyloxy; heteroaralkyloxy; substituted alkoxy; substituted aryloxy; substituted heteroaryloxy; substituted aralkyloxy; or substituted heteroaralkyloxy.
Las funciones de protección N-terminal o C-terminal, o ambas, pueden ser de tal estructura que la molécula protegida funciona como un profármaco (un derivado farmacológicamente inactivo de la molécula de fármaco parental) que experimenta transformación espontánea o enzimática en el cuerpo con el fin de liberar el fármaco activo y que tienen propiedades de administración mejoradas sobre la molécula de fármaco parental (Bundgaard H, Ed: Design of Prodrugs, Elsevier, Ámsterdam, 1985).The N-terminal or C-terminal protective functions, or both, can be of such a structure that the protected molecule functions as a prodrug (a pharmacologically inactive derivative of the parent drug molecule) that undergoes spontaneous or enzymatic transformation in the body with in order to release the active drug and having improved delivery properties on the parent drug molecule (Bundgaard H, Ed: Design of Prodrugs, Elsevier, Amsterdam, 1985).
La elección juiciosa de grupos de protección permite la adición de otras actividades en el péptido. Por ejemplo, la presencia de un grupo sulfhidrilo unido a la protección N- o C-terminal permitirá la conjugación del péptido derivatizado a otras moléculas.The judicious choice of protecting groups allows the addition of other activities on the peptide. For example, the presence of a sulfhydryl group attached to the N- or C-terminal protection will allow conjugation of the derivatized peptide to other molecules.
Derivados químicos de CSP-4Chemical derivatives of CSP-4
Además de los grupos protectores descritos anteriormente que se consideran “derivados químicos” de CSP-4, Ios derivados químicos preferidos de CSP-4 pueden contener fracciones químicas adicionales no normalmente una parte de una proteína o péptido que se pueden introducir en CSP-4 o una variante de adición de CSP-4 por medios conocidos para constituir el derivado químico como se define en el presente documento. Las modificaciones covalentes de Ios péptidos se incluyen en el ámbito de esta invención. Tales fracciones derivatizadas pueden mejorar la solubilidad, absorción, semivida biológica, y similares. Las fracciones capaces de mediar tales efectos se divulgan, por ejemplo, en Gennaro, AR, Remington: The Science and Practice of Pharmacy, Lippincott Williams & Wilkins Publishers; 21a Ed, 2005 (o la última edición).In addition to the protecting groups described above that are considered "chemical derivatives" of CSP-4, preferred chemical derivatives of CSP-4 may contain additional chemical moieties not normally a part of a protein or peptide that can be introduced into CSP-4 or a variant of addition of CSP-4 by known means to constitute the chemical derivative as defined herein. Covalent modifications of peptides are included within the scope of this invention. Such derivatized fractions can improve solubility, absorption, biological half-life, and the like. Fractions capable of mediating such effects are disclosed, for example, in Gennaro, AR, Remington: The Science and Practice of Pharmacy, Lippincott Williams & Wilkins Publishers; 21st Ed, 2005 (or latest edition).
Tales modificaciones se pueden introducir en la molécula haciendo reaccionar residuos de aminoácidos objetivo del péptido con un agente de derivación orgánico que es capaz de reaccionar con cadenas laterales o residuos terminales seleccionados. Otra modificación es la ciclación del péptido - que en general se logra añadiendo residuos de Cys terminales que se pueden unir a través de un enlace disulfuro para generar un péptido cíclico. Alternativa, se añade una Lys (K) entrecruzable en un extremo y un GIu (E) en el otro extremo.Such modifications can be introduced into the molecule by reacting target amino acid residues of the peptide with an organic derivatizing agent that is capable of reacting with selected side chains or terminal residues. Another modification is peptide cyclization - which is generally accomplished by adding terminal Cys residues that can be attached via a disulfide bond to generate a cyclic peptide. Alternatively, a cross-linkable Lys (K) is added at one end and a GIu (E) at the other end.
Los residuos cisteinilo (añadidos, por ejemplo, para fines de ciclación) lo más comúnmente se hacen reaccionar con a-haloacetatos (y aminas correspondientes) para dar derivados carboximetilo o carboxiamidometilo. Los residuos cisteinilo también se derivatizan por reacción con bromotrifluoroacetona, ácido a-bromo-p-(5-imidozoil)propiónico, fosfato de cloroacetilo, N-alquilmaleimidas, disulfuro de 3-nitro-2-piridilo, disulfuro de metil-2-piridilo, pcloromercuribenzoato, 2-cloromercuri-4-nitro-fenol, o cloro-7-nitrobenzo-2-oxa-1,3-diazol.Cysteinyl residues (added, eg, for cyclization purposes) are most commonly reacted with α-haloacetates (and corresponding amines) to give carboxymethyl or carboxyamidomethyl derivatives. Cysteinyl residues are also derivatized by reaction with bromotrifluoroacetone, α-bromo-p- (5-imidozoyl) propionic acid, chloroacetyl phosphate, N-alkylmaleimides, 3-nitro-2-pyridyl disulfide, methyl-2-pyridyl disulfide , p-chloromercuribenzoate, 2-chloromercuri-4-nitro-phenol, or chloro-7-nitrobenzo-2-oxa-1,3-diazole.
Los residuos de lisinilo añadidos (por ejemplo, para ciclación) y el residuo amino terminal se pueden derivatizar con anhídridos de ácido succínico u otros ácidos carboxílicos. La derivatización con un anhídrido carboxílico cíclico tiene el efecto de revertir la carga de Ios residuos lisinilo. Otros reactivos adecuados para derivatizar residuos que contienen amino incluyen imidoésteres tal como picolinimidato de metilo; fosfato de piridoxal; piridoxal; cloroborohidruro; ácido trinitrobencenosulfónico; O-metilisourea; 2,4-pentaodiona; y reacción catalizada por transaminasa con glioxilato. The added lysinyl residues (eg, for cyclization) and the amino terminal residue can be derivatized with succinic acid anhydrides or other carboxylic acids. Derivatization with a cyclic carboxylic anhydride has the effect of reversing the charge on lysinyl residues. Other suitable reagents for derivatizing amino-containing residues include imidoesters such as methyl picolinimidate; pyridoxal phosphate; pyridoxal; chloroborohydride; trinitrobenzenesulfonic acid; O-methylisourea; 2,4-pentaodione; and transaminase catalyzed reaction with glyoxylate.
La derivatización con agentes bifuncionales es útil para entrecruzar el péptido u oligómero o multímero a una matriz soporte insoluble en agua u otro soporte macromolecular. Los agentes de entrecruzamiento comúnmente usados incluyen 1,1-bis(diazoacet¡l)-2-fen¡letano, glutaraldehído, ásteres de N-hidroxisuccinimida, ásteres con ácido 4-azidosalicíclico, imidoásteres homobifuncionales, incluyendo ásteres de disuccinimidilo tal como 3,3'-dit¡ob¡s(sucdnim¡d¡l propionato), y maleimidas bifuncionales tal como bis-N-maleimido-1,8-octano. Los agentes de derivatización tal como metil-3-[(p-az¡dofen¡l)d¡t¡o]prop¡o¡midato dan intermedios fotoactivables que son capaces de formar entrecruzamiento en presencia de luz. Alternativamente, las matrices insolubles en agua reactivas tal como hidratos de carbono activados con bromuro de cianógeno y los sustratos reactivos descritos en las patentes en EE UU 3.969.287, 3.691.016, 4.195.128, 4.247.642, 4.229.537, y 4.330.44o se emplean para inmovilización de proteínas. Derivatization with bifunctional agents is useful for crosslinking the peptide or oligomer or multimer to a water insoluble support matrix or other macromolecular support. Commonly used crosslinking agents include 1,1-bis (diazoacetyl) -2-phenylethane, glutaraldehyde, N-hydroxysuccinimide esters, 4-azidosalicyclic acid esters, homobifunctional imidoasters, including disuccinimidyl esters such as 3,3'-dithiob S (sucdnimidl propionate), and bifunctional maleimides such as bis-N-maleimido-1,8-octane. Derivatizing agents such as methyl-3 - [(p-azidophenil) ditio] propimidate give photoactivatable intermediates that are capable of crosslinking in the presence of light. Alternatively, reactive water insoluble matrices such as cyanogen bromide activated carbohydrates and reactive substrates described in US Patents 3,969,287, 3,691,016, 4,195,128, 4,247,642, 4,229,537, and 4.330.44o are used for protein immobilization.
Otras modificaciones incluyen hidroxilación de lisina, fosforilación de los grupos hidroxilo de residuos de treonilo, metilación de los grupos a-amino de las cadenas laterales de las cadenas de residuos de lisina (añadidos) (Creighton, supra), acetilación de la amina N-terminal y, en algunos casos, amidación de los grupos carboxilo C-terminal. Tambián se incluyen páptidos en donde uno o más D-aminoácidos se sustituyen por uno o más L-aminoácidos.Other modifications include hydroxylation of lysine, phosphorylation of the hydroxyl groups of threonyl residues, methylation of the a-amino groups of the side chains of the chains of lysine residues (added) (Creighton, supra), acetylation of the amine N- terminal and, in some cases, amidation of the C-terminal carboxyl groups. Also included are peptides where one or more D-amino acids are replaced by one or more L-amino acids.
Páptidos multimáricos u oligomáricosMultimaric or oligomaric peptides
La presente divulgación tambián incluye páptidos más largos construidos a partir de unidades repetitivas de CSP-4 o un derivado funcional del mismo que tiene la actividad antiapoptótica y protectora de CSP-4. La unidad de páptido de tal multímero es FTTFTVT (SEQ Id NO: 1). Las variantes de adición de este páptido que pueden ser la “unidad” del multímero preferiblemente incluyen desde 1-4 aminoácidos adicionales.The present disclosure also includes longer peptides constructed from CSP-4 repeating units or a functional derivative thereof that has the anti-apoptotic and protective activity of CSP-4. The peptide unit of such a multimer is FTTFTVT (SEQ Id NO: 1). Addition variants of this peptide that can be the "unit" of the multimer preferably include from 1-4 additional amino acids.
Un multímero peptídico puede comprender diferentes combinaciones de monómeros peptídicos (que puede incluir uno o ambos de SEQ ID NO: 1 o variantes de adición del mismo o una forma químicamente derivatizada del páptido. Tales páptidos oligomáricos o multimáricos se pueden hacer por síntesis química o por tácnicas de ADN recombinante como se discute en el presente documento. Cuando se producen por síntesis química, los oligómeros preferiblemente tienen de 2-5 repeticiones de una secuencia peptídica central, y el número total de aminoácidos en el multímero no debe superar aproximadamente 160 residuos, preferiblemente no más de 100 residuos (o sus equivalentes, cuando incluyen enlazadores o espaciadores).A peptide multimer can comprise different combinations of peptide monomers (which can include one or both of SEQ ID NO: 1 or addition variants thereof or a chemically derivatized form of the peptide. Such oligomaric or multimaric peptides can be made by chemical synthesis or by recombinant DNA techniques as discussed herein. When produced by chemical synthesis, oligomers preferably have 2-5 repeats of a core peptide sequence, and the total number of amino acids in the multimer should not exceed about 160 residues, preferably no more than 100 residues (or their equivalents, when they include linkers or spacers).
Un multímero peptídico químico sintático preferido tiene la fórmulaA preferred synthetic chemical peptide multimer has the formula
P1nP1n
en donde el páptido central P1 es SEQ ID NO: 1, y en donde n = 2-5, y en donde el páptido central solo o en forma oligo- o multimárica tiene la actividad biológica de Cs P-4 como se divulga en el presente documento en un bioensayo in vitro o in vivo de tal actividad.wherein the core peptide P1 is SEQ ID NO: 1, and where n = 2-5, and where the core peptide alone or in oligo- or multimalar form has the biological activity of Cs P-4 as disclosed in the present document in an in vitro or in vivo bioassay of such activity.
En otra forma de realización, un multímero peptídico químico sintático preferido tiene la fórmulaIn another embodiment, a preferred synthetic chemical peptide multimer has the formula
(P1-Xm)n-P2(P1-X m ) n -P2
P1 y P2 son los páptidos centrales descritos anteriormente, incluyendo variantes adicionales, en dondeP1 and P2 are the core peptides described above, including additional variants, where
(a) P1 y P2 pueden ser iguales o diferentes; además, cada aparición de P1 en el multímero puede ser un páptido diferente (o variante)(a) P1 and P2 can be the same or different; furthermore, each occurrence of P1 in the multimer may be a different (or variant) peptide
(b) X es un espaciador que comprende o consiste en(b) X is a spacer comprising or consisting of
(i) una cadena orgánica corta, preferiblemente alquilo de C1-C5, alquenilo de C1-C5, alquinilo de C1-C5, poliáter de C1-C5 que contiene hasta 4 átomos de oxígeno, en donde m = 0 o 1 y n = 1-7; o (i) a short organic chain, preferably C1-C5 alkyl, C1-C5 alkenyl, C1-C5 alkynyl, C1-C5 polyether containing up to 4 oxygen atoms, where m = 0 or 1 and n = 1 -7; or
(¡i) Glyz en donde z = 1-6,(¡I) Glyz where z = 1-6,
y en donde el páptido central solo o en forma oligo- o multimárica tiene la actividad biológica de CSP-4 como se divulga en el presente documento en un bioensayo in vitro o in vivo de tal actividad.and wherein the core peptide alone or in oligo- or multimalar form has the biological activity of CSP-4 as disclosed herein in an in vitro or in vivo bioassay of such activity.
Cuando se produce de forma recombinante, un espaciador preferido es Glyz como se describe anteriormente, donde z = 1-6, y los multímeros pueden tener tantas repeticiones de la secuencia peptídica central como el sistema de expresión permita, por ejemplo, de dos hasta aproximadamente 25 repeticiones. Un multímero peptídico recombinantemente producido preferido tiene la fórmula:When produced recombinantly, a preferred spacer is Glyz as described above, where z = 1-6, and multimers can have as many repeats of the core peptide sequence as the expression system allows, for example, from two to about 25 repetitions. A preferred recombinantly produced peptide multimer has the formula:
(P1-Glyz)n-P2(P1-Glyz) n-P2
en dondewhere
(a) P1 y P2 son, independientemente, SEQ ID NO: 1 o 3 o una variante de adición o forma derivatizada de los mismos, en donde P1 y P2 pueden ser iguales o diferentes; además, cada aparición de P1 en el multímero puede ser un páptido diferente (o variante)(a) P1 and P2 are, independently, SEQ ID NO: 1 or 3 or an addition variant or derivatized form thereof, wherein P1 and P2 may be the same or different; furthermore, each occurrence of P1 in the multimer may be a different (or variant) peptide
en donde where
n = 1-25 y z = 0-6; (Ios intervalos preferidos de n Incluyen n = 1-5, 1-10, 1-15 o 1-20) y en donde el péptido central solo o en forma multimérica tiene la actividad biológica de CSP-4 como se divulga en el presente documento en un bioensayo in vitro o in vivo de tal actividad.n = 1-25 and z = 0-6; ( Preferred ranges of n include n = 1-5, 1-10, 1-15, or 1-20) and wherein the core peptide alone or in multimeric form has the biological activity of CSP-4 as disclosed herein. document in an in vitro or in vivo bioassay of such activity.
En Ios presentes multímeros peptídicos, P1o P2 es preferiblemente SEQ ID NO: 1 o una variante de adición o derivado químico del mismo. El multímero está opcionalmente protegido. Se entiende que tales multímeros pueden estar construidos de cualquiera de Ios péptidos o variantes descritos en el presente documento. También se entiende que el multímero peptídico debe ser diferente de SEQ ID NO: 3 (es decir, no Cav-1 humana nativa y es preferiblemente no un homólogo de Cav-1 de mamífero nativa). Ios present peptide, P1 or P2 multimers is preferably SEQ ID NO: 1 or a variant or chemical derivative of adding the same. The multimer is optionally protected. It is understood that such multimers may be built from any of Ios peptides or variants described herein. It is also understood that the peptide multimer must be different from SEQ ID NO: 3 (ie, not native human Cav-1 and is preferably not a native mammalian Cav-1 homolog).
PeptidomiméticosPeptidomimetics
También se divulga un compuesto peptidomimético que mimetiza Ios efectos biológicos de CSP-4. Un agente peptidomimético puede ser un péptido no natural o un agente no peptídico que recrea las propiedades estereoespaciales de Ios elementos de unión de CSP-4 de modo que tiene la actividad de unión y actividad biológica de CSP-4. Similar a un péptido CSP-4 biológicamente activo, multímero peptídico, un peptidomimético tendrá una cara de unión (que interacciona con cualquier ligando al que se une CSP-4) y una cara de no unión. De nuevo, similar a CSP-4, la cara de no unión de un peptidomimético contendrá grupos funcionales que se pueden modificar por acoplamiento de varias fracciones terapéuticas sin modificar la cara de unión del peptidomimético. Una forma de realización preferida de un peptidomimético contendría una anilina en la cara de no unión de la molécula. El grupo NH2 de una anilina tiene un pKa ~ 4,5 y podría por tanto modificarse por cualquier reactivo selectivo de NH2 sin modificar ningún grupo funcional NH2 en la cara de unión del peptidomimético. Otros peptidomiméticos pueden no tener ningún grupo funcional NH2 en su cara de unión y, por tanto, cualquier NH2, sin consideración por el pKa se podrían mostrar en la cara de no unión como un sitio para conjugación. Además, otros grupos funcionales modificables, tal como -SH y -COOH se podrían incorporar en la cara de no unión de un peptidomimético como un sitio de conjugación. También se podría incorporar directamente una fracción terapéutica durante la síntesis de un peptidomimético y preferentemente mostrarse en la cara de no unión de la molécula.A peptidomimetic compound that mimics biological effects Ios CSP-4 is also disclosed. A peptidomimetic agent may be a non - natural peptide or non - peptide agent that recreates estereoespaciales properties Ios connecting elements 4 so-CSP having binding activity and biological activity of CSP-4. Similar to a biologically active CSP-4 peptide, peptide multimer, a peptidomimetic will have a binding face (which interacts with any ligand to which CSP-4 binds) and a non-binding face. Again, similar to CSP-4, the non-binding side of a peptidomimetic will contain functional groups that can be modified by coupling various therapeutic moieties without modifying the binding side of the peptidomimetic. A preferred embodiment of a peptidomimetic would contain an aniline on the non-binding side of the molecule. The NH2 group of an aniline has a pKa ~ 4.5 and could therefore be modified by any NH2 selective reagent without modifying any NH2 functional group on the peptidomimetic bonding face. Other peptidomimetics may have no NH2 functional group on their binding side and thus any NH2, regardless of pKa could show up on the non-binding side as a site for conjugation. In addition, other modifiable functional groups, such as -SH and -COOH could be incorporated into the non-binding side of a peptidomimetic as a conjugation site. A therapeutic moiety could also be directly incorporated during the synthesis of a peptidomimetic and preferably displayed on the non-binding side of the molecule.
Se divulgan además compuestos que retienen características peptídicas parciales. Por ejemplo, cualquier enlace proteolíticamente inestable en un péptido de la invención se podría sustituir selectivamente por un elemento no peptídico tal como un isóstero (N-metilación; D-aminoácido) o un enlace peptídico reducido mientras que el resto de la molécula retine su naturaleza peptídica.Compounds that retain partial peptide characteristics are further disclosed. For example, any proteolytically unstable bond in a peptide of the invention could be selectively substituted for a non-peptidic element such as an isosterone (N-methylation; D-amino acid) or a reduced peptide bond while the rest of the molecule reflects its nature. peptide.
Se han descrito compuestos peptidomiméticos, ya sean agonistas, sustratos o inhibidores, para un número de péptidos/polipéptidos bioactivos tal como péptidos opioides, VIP, trombina, proteasa de VIH, etc. Los métodos para diseñar y preparar compuestos peptidomiméticos se conocen en la técnica (Hruby, VJ, Biopolymers 33:1073-1082 (1993); Wiley, RA et al., Med. Res. Rev. 13:327-384 (1993); Moore et al., Adv. in Pharmacol 33:91-141 (1995); Giannis et al., Adv. in Drug Res. 29:1-78 (1997). Se describen ciertos miméticos que mimetizan la estructura secundaria en Johnson et al., En: Biotechnology and Pharmacy, Pezzuto et al., Chapman y Hall (Eds.), NY, 1993. Estos métodos se usan para hacer peptidomiméticos que poseen al menos la capacidad y especificidad de unión del péptido CSP-4 y preferiblemente también poseen la actividad biológica. El conocimiento de química de péptidos y química orgánica general disponible para Ios expertos en la materia es suficiente, en vista de la presente divulgación, para diseñar y sintetizar tales compuestos.Peptidomimetic compounds, whether agonists, substrates or inhibitors, have been described for a number of bioactive peptides / polypeptides such as opioid peptides, VIP, thrombin, HIV protease, etc. Methods for designing and preparing peptidomimetic compounds are known in the art (Hruby, VJ, Biopolymers 33: 1073-1082 (1993); Wiley, RA et to the, Med Res Rev. 13:... 327-384 (1993); Moore et al., Adv. In Pharmacol 33: 91-141 (1995); Giannis et al., Adv. In Drug Res. 29: 1-78 (1997) Certain mimetics that mimic secondary structure are described in Johnson et al. al., In: Biotechnology and Pharmacy, Pezzuto et al., Chapman and Hall (Eds.), NY, 1993. These methods are used to make peptidomimetics that possess at least the binding capacity and specificity of the CSP-4 peptide and preferably also possess biological activity. knowledge of peptide chemistry and organic chemistry generally available to experts in the art Ios is sufficient, in view of this disclosure, to design and synthesize such compounds.
Por ejemplo, tales peptidomiméticos se han identificado por inspección de la estructura tridimensional de un péptido de la invención libre o unido en complejo con un ligando (por ejemplo, uPAR soluble o un fragmento del mismo). Alternativamente, la estructura de un péptido de la invención unido a su ligando se puede obtener por las técnicas de espectroscopia de resonancia magnética nuclear. Un mayor conocimiento de la estereoquímica de la interacción del péptido con su ligando o receptor permitirá el diseño racional de tales agentes peptidomiméticos. La estructura de un péptido o polipéptido de la invención en ausencia de ligando también podría proporcionar un andamiaje para el diseño de moléculas miméticas.For example, such peptidomimetics have been identified by inspection of the three-dimensional structure of a free or complexed peptide of the invention with a ligand (eg, soluble uPAR or a fragment thereof). Alternatively, the structure of a peptide of the invention bound to its ligand can be obtained by nuclear magnetic resonance spectroscopy techniques. A better understanding of the stereochemistry of the interaction of the peptide with its ligand or receptor will allow the rational design of such peptidomimetic agents. The structure of a peptide or polypeptide of the invention in the absence of ligand could also provide a scaffold for the design of mimetic molecules.
Péptidos administrablesAdministered peptides
Una forma de realización de la divulgación comprende un método de introducir el péptido de la invención en células animales, tal como células humanas. Las composiciones útiles para este método, denominadas péptidos o polipéptidos “administrables” o “administrables a células” o “dirigidos a células” comprenden un péptido biológicamente activo según la invención, preferiblemente CSP-4, o un derivado funcional del mismo, o un multímero peptídico del mismo, que tiene unido al mismo o está asociado con, un componente adicional que sirve como una “secuencia de internalización” o sistema de administración celular. El término “asociado con” puede incluir químicamente unido o acoplado a, sea por enlace covalente u otros o fuerzas, o combinado con, como en una mezcla. Como se usa en el presente documento, “administración” se refiere a internalizar un péptido/polipéptido en una célula. Las moléculas de administración contempladas en el presente documento incluyen péptidos/polipéptidos usados por otros para realizar entrada celular. Véase, por ejemplo, Morris et al., Nature Biotechnology, 19:1173-6, 2001). Una estrategia preferida es como sigue: un péptido inhibidor de apoptosis (“biológicamente activo”) de la invención se une a o mezcla con un péptido especialmente diseñado que facilita su entrada en células, preferiblemente células humanas. Este sistema de administración no requiere que el péptido de administración esté fusionado o químicamente acoplado al péptido o polipéptido biológicamente activo (aunque se prefiere), ni el péptido o polipéptido biológicamente activo se tiene que desnaturalizar antes del proceso de administración o internalización. Una desventaja de sistemas de administración anteriores es el requisito para desnaturalización de la proteína de “carga” antes de la administración y posterior restauración intracelular. Estas formas de realización se basan en enfoques conocidos para fomentar la translocación de proteínas a células.One embodiment of the disclosure comprises a method of introducing the peptide of the invention into animal cells, such as human cells. Compositions useful for this method, called "administrable" or "administrable to cells" or "cell-targeted" peptides or polypeptides comprise a biologically active peptide according to the invention, preferably CSP-4, or a functional derivative thereof, or a multimer. peptide thereof, having attached thereto or associated with, an additional component that serves as an "internalizing sequence" or cellular delivery system. The term "associated with" can include chemically bonded or coupled to, either by covalent or other bonding or forces, or combined with, as in a mixture. As used herein, "delivery" refers to internalizing a peptide / polypeptide into a cell. Delivery molecules contemplated herein include peptides / polypeptides used by others to effect cellular entry. See, for example, Morris et al., Nature Biotechnology, 19: 1173-6, 2001). A preferred strategy is as follows: an apoptosis inhibitor ("biologically active") peptide of the invention is bound to or mixed with a specially designed peptide that facilitates its entry into cells, preferably human cells. This system of Administration does not require that the delivery peptide be fused or chemically coupled to the biologically active peptide or polypeptide (although preferred), nor does the biologically active peptide or polypeptide have to be denatured prior to the process of administration or internalization. A disadvantage of prior delivery systems is the requirement for denaturation of the "cargo" protein prior to administration and subsequent intracellular restoration. These embodiments are based on known approaches to promote protein translocation to cells.
Un tipo de péptido/polipéptido de “administración” que fomenta la translocación/internalización incluye la proteína TAT de VIH (Frankel, AD et al., Cell 55:1189-93 (1998), y la tercera hélice a del homeodominio de Antennapedia (Derossi et al., J. Biol. Chem. 269:10444-50 (1994); Lindgren, M et al., Trends Pharm. Scí. 21:99-103 (2000); Lindgren et al., Bioconjug Chem. (2000); Maniti O et al., PLoS ONE 5e15819 (2010). El último péptido, también conocido como "penetratina" es un péptido de 16 aminoácidos con la secuencia de tipo salvaje Rq IKIWFQNRRMKWKK (SEQ ID NO:6) o dos análogos/variantes designadas W48F (RQIKIFFQNRRMKWKK, SEQ ID NO:7) y W56F (RQIKIWFQNRRMKFKK, SEQ ID NO:8) (Christiaens B et al., Eur Biochem 2002, 269:2918-2926). Otra variante con ambas de las mutaciones anteriores es RQIKIFFQNRRMKFKK (SEQ ID NO:9). Transportano, un péptido que penetra en células es un péptido de 27 aminoácidos de longitud que contiene 12 aminoácidos funcionales del extremo N del neuropéptido galanina unido por un residuo de Lys añadido a la secuencia de mastoparán (Pooga, M et al., FASEB J. One type of "delivery" peptide / polypeptide that promotes translocation / internalization includes the HIV TAT protein (Frankel, AD et al., Cell 55: 1189-93 (1998), and the third a-helix of the Antennapedia homeodomain ( Derossi et al., J. Biol. Chem. 269: 10444-50 (1994); Lindgren, M et al., Trends Pharm. Scí. 21: 99-103 (2000); Lindgren et al., Bioconjug Chem. ( 2000); Maniti O et al., PLoS ONE 5e15819 (2010). The latter peptide, also known as "penetratin" is a 16 amino acid peptide with the wild-type sequence Rq IKIWFQNRRMKWKK (SEQ ID NO: 6) or two analogs / variants designated W48F (RQIKIFFQNRRMKWKK, SEQ ID NO: 7) and W56F (RQIKIWFQNRRMKFKK, SEQ ID NO: 8) (Christiaens B et al., Eur Biochem 2002, 269: 2918-2926). Another variant with both of the above mutations en RQIKIFFQNRRMKFKK (SEQ ID NO: 9). Transportan, a cell-penetrating peptide is a 27 amino acid long peptide containing 12 functional amino acids from the N-terminus of the neuropeptide galanin linked by a Lys residue added to the mastoparan sequence (Pooga, M et al., FASEB J.
12:67-77 (1998)). La secuencia de transportano es GWTLNSAGYLLGKINLKALAALAKKIL (SEQ ID NO:10). Se describen análogos de penetratina y transportano por Lindgren et al., Bioconjug Chem. 2000.12: 67-77 (1998)). The transportan sequence is GWTLNSAGYLLGKINLKALAALAKKIL (SEQ ID NO: 10). Penetratin and transportan analogs are described by Lindgren et al., Bioconjug Chem. 2000.
Otra (familia de) proteína incluye VP22, una proteína del virus del herpes simple que tiene la notable propiedad de transporte intracelular y distribuye una proteína a muchas células circundantes (Elliott, G et al., 1997, Cell 88:223-33; O'Hare et al., Patente en EE u U 6.017.735). Por ejemplo, VP22 unida a p53 (Phelan, A. et al., 1998, Nat Biotechnol 16:440-3) o timidina quinasa (Dilber, MS et al., 1999, Gene Then 6:12-21) facilita la propagación de proteínas unidas a las células circundantes in vitro. También son útiles homólogos de VP22 en otros herpesvirus, tal como la proteína del virus aviar de la enfermedad de Marek (MDV) UL49, que comparte homología con VP22 de HSV-1 (Koptidesova et al., 1995, Arch Virol. 140 :355-62) y se ha mostrado que es capaz de transporte intracelular después de la aplicación exógena (Dorange et al., 2000, J Gen Virol. 81:2219). Todas estas proteínas comparten la propiedad de propagación intercelular que proporciona un enfoque para aumentar la absorción celular de péptidos, variantes y multímeros de esta invención.Another (family of) protein includes VP22, a herpes simplex virus protein that has the remarkable property of intracellular transport and distributes a protein to many surrounding cells (Elliott, G et al., 1997, Cell 88: 223-33; O 'Hare et al., US Patent 6,017,735). For example, VP22 bound to p53 (Phelan, A. et al., 1998, Nat Biotechnol 16: 440-3) or thymidine kinase (Dilber, MS et al., 1999, Gene Then 6: 12-21) facilitates propagation of proteins bound to surrounding cells in vitro. Also useful are homologs of VP22 in other herpesviruses, such as the avian Marek's disease virus (MDV) protein UL49, which shares homology with VP22 of HSV-1 (Koptidesova et al., 1995, Arch Virol. 140 : 355 -62) and has been shown to be capable of intracellular transport after exogenous application (Dorange et al., 2000, J Gen Virol. 81: 2219). All of these proteins share the property of intercellular propagation that provides an approach to increasing cellular uptake of peptides, variants, and multimers of this invention.
También se incluyen “derivados funcionales” de las proteínas y péptidos anteriores de propagación intracelular o “administración” “administración” o “internalización” tales como TAT de VIH o VP22 que incluyen variantes de sustitución de aminoácidos homólogos, fragmentos o derivados químicos, términos que son en el presente documento para los péptidos biológicamente activos. Un derivado funcional retiene actividad cuantificable de translocación o propagación intercelular (de tipo VP22) que fomenta la entrada del polipéptido deseado, que fomenta la utilidad del presente péptido biológicamente activo, por ejemplo, para terapia. “Derivados funcionales” abarca variantes (preferiblemente variantes de sustitución conservadora) y fragmentos independientemente de si los términos se usan en enlazante o la alternativa.Also included are "functional derivatives" of the above intracellularly propagating or "delivery" proteins and peptides "delivery" or "internalization" such as HIV TAT or VP22 that include homologous amino acid substitution variants, chemical fragments or derivatives, terms that they are herein for biologically active peptides. A functional derivative retains quantifiable intercellular translocation or propagation activity (VP22 type) that encourages entry of the desired polypeptide, which promotes the utility of the present biologically active peptide, eg, for therapy. "Functional derivatives" encompass variants (preferably conservative substitution variants) and fragments regardless of whether the terms are used in linker or alternative.
Puesto que se dice que las anteriores proteínas de transporte funcionan mejor cuando están conjugadas o unidas de otra manera al péptido que transportan, tal como CSP-4 o una variante o multímero del mismo, hay un número de desventajas al usarlas. Se describe un polipéptido de administración más eficaz que se puede mezclar con el péptido biológicamente activo y no necesita estar unido químicamente para su acción en Morris et al., supra, como “Pep-1” que tiene la secuencia de aminoácidos anfipática KeTWWETw Wt EWSQPKKKRKV (SEQ ID NO:11). Pep -1 consiste en tres dominios:Since the above transport proteins are said to work best when conjugated or otherwise bound to the peptide they transport, such as CSP-4 or a variant or multimer thereof, there are a number of disadvantages to using them. A more efficient delivery polypeptide that can be mixed with the biologically active peptide and does not need to be chemically linked for action is described in Morris et al., Supra, as "Pep-1" having the amphipathic amino acid sequence KeTWWETw Wt EWSQPKKKRKV (SEQ ID NO: 11). Pep -1 consists of three domains:
(1) un motivo hidrofóbico rico en Trp que contiene cinco residuos de Trp KETWWETWWTEW (residuos 1-12 de SEQ ID NO: 11, anterior). Este motivo es deseable, o requerido, para dirigirse eficazmente a la membrana celular y para entrar en interacciones hidrofóbicas con proteínas;(1) a Trp-rich hydrophobic motif containing five KETWWETWWTEW Trp residues (residues 1-12 of SEQ ID NO: 11, above). This motif is desirable, or required, to effectively target the cell membrane and to enter into hydrophobic interactions with proteins;
(2) un dominio hidrofílico rico en Lys KKKRKV (Ios 6 residuos C-terminales de SEQ ID NO: 11) que deriva de la secuencia de localización nuclear del antígeno T grande del virus SV40, y mejora la administración intracelular y solubilidad del péptido; y(2) a hydrophilic domain rich in Lys KKKRKV (the 6 C-terminal residues of SEQ ID NO: 11) which is derived from the nuclear localization sequence of the large T antigen of the SV40 virus, and improves intracellular delivery and solubility of the peptide; and
(3) un “dominio” espaciador SQP (3 residuos internos de SEQ ID NO: 12) que y separa Ios dos dominios activos anteriores e incluye una Pro que mejora la flexibilidad e integridad de Ios dominios tanto hidrofóbico como hidrofílico.(3) an SQP spacer "domain" (3 internal residues of SEQ ID NO: 12) that and separates the two previous active domains and includes a Pro that improves the flexibility and integrity of both hydrophobic and hydrophilic domains.
Según esto, otra forma de realización de la divulgación es un péptido o polipéptido administrable que comprende CSP-4 o un derivado funcional del mismo como se ha descrito anteriormente, y una molécula o fracción de administración o translocación unida al mismo o asociada con el mismo. La molécula de administración puede ser un péptido o polipéptido, por ejemplo,Accordingly, another embodiment of the disclosure is an administrable peptide or polypeptide comprising CSP-4 or a functional derivative thereof as described above, and a molecule or delivery or translocation fraction bound thereto or associated therewith. . The delivery molecule can be a peptide or polypeptide, for example,
(a) proteína TAT de VIH o un derivado translocacionalmente activo de la misma,(a) HIV TAT protein or a translocationally active derivative thereof,
(b) penetratina que tiene la secuencia Rq IKIWFQNRRMKWKK (SEQ ID NO:8),(b) penetratin having the sequence Rq IKIWFQNRRMKWKK (SEQ ID NO: 8),
(c) una variante de penetratina W48F que tiene la secuencia RQIKIFFQNRRMKWKK (SEQ ID NO:7)(c) a W48F penetratin variant having the sequence RQIKIFFQNRRMKWKK (SEQ ID NO: 7)
(d) una variante de penetratina W56F que tiene la secuencia RQIKIWFQNRRMKFKK (s EQ ID NO:13) (d) a W56F penetratin variant having the sequence RQIKIWFQNRRMKFKK (s EQ ID NO: 13)
(e) una variante de penetratina que tiene la secuencia RQIKIWFQNRRMKFKK (SEQ ID NO:16) (f) transportano que tiene la secuencia GWTLNSAGYLLGKINLKALAALAKKIL (SEQ ID NO:10)(e) a penetratin variant having the sequence RQIKIWFQNRRMKFKK (SEQ ID NO: 16) (f) transportan having the sequence GWTLNSAGYLLGKINLKALAALAKKIL (SEQ ID NO: 10)
(g) proteína VP22 del virus del herpes simple o un homólogo translocacionalmente activo de la misma de un herpesvirus diferente tal como la proteína de MDV UL49; o(g) VP22 protein from herpes simplex virus or a translocationally active homolog thereof from a different herpesvirus such as MDV UL49 protein; or
(h) Pep-1 que tiene la secuencia KETWWETWWTEWSQPKKKRKV (SEQ ID NO:9).(h) Pep-1 having the sequence KETWWETWWTEWSQPKKKRKV (SEQ ID NO: 9).
Cuando una fracción de administración, tal como los péptidos y proteínas discutidos anteriormente, se conjuga o fusiona al péptido biológicamente activo de la invención, se prefiere que la fracción de administración está N-terminal respecto al péptido biológicamente activo.When a delivery moiety, such as the peptides and proteins discussed above, is conjugated or fused to the biologically active peptide of the invention, it is preferred that the delivery moiety is N-terminal to the biologically active peptide.
Ensayo in vitro de composiciones In vitro assay of compositions
Los compuestos de esta invención se ensayan para su actividad biológica, por ejemplo, actividad antifibrótica, su capacidad de afectar la expresión de los ARNm de uPA, uPAR y PAI-1, inhibir la proliferación de fibroblastos de pulmón, etc., usando cualquiera de los ensayos descritos y/o ejemplificados en el presente documento u otros bien conocidos en la técnica.The compounds of this invention are tested for their biological activity, eg, antifibrotic activity, their ability to affect the expression of uPA, uPAR and PAI-1 mRNAs, inhibit the proliferation of lung fibroblasts, etc., using any of the assays described and / or exemplified herein or others well known in the art.
Ensayo in vivo de composiciones In vivo testing of compositions
La capacidad de un compuesto (tal como análogos de NTL o variantes o derivados o multímeros peptídicos de CSP-4 para inhibir fibrosis pulmonar en ratones tratados con BLM es un ensayo preferido para evaluar la actividad funcional del compuesto. También se pueden usar otros ensayos conocidos en técnica que miden el mismo tipo de actividad. The ability of a compound (such as NTL analogs or variants or derivatives or peptide multimers of CSP-4 to inhibit pulmonary fibrosis in BLM-treated mice is a preferred assay to assess the functional activity of the compound. Other known assays can also be used in technique that measure the same type of activity.
Método de prevenir o tratar lesión pulmonar o fibrosisMethod of preventing or treating lung injury or fibrosis
Los compuestos y composiciones descritos en el presente documento se usan en un método para inhibir la interacción de MDM2 con la proteína p53 in vitro o in vivo, y para tratar enfermedades o afecciones asociadas con ALI y fibrosis pulmonar/FPI.The compounds and compositions described herein are used in a method for inhibiting the interaction of MDM2 with the p53 protein in vitro or in vivo, and for treating diseases or conditions associated with ALI and pulmonary fibrosis / IPF.
Composiciones farmacéuticas y terapéuticas y su administraciónPharmaceutical and therapeutic compositions and their administration
Los compuestos que se pueden emplear en las composiciones farmacéuticas de la divulgación incluyen NTL, y todos los compuestos peptídicos descritos anteriormente, así como las sales farmacéuticamente aceptables de estos compuestos. “Sal farmacéuticamente aceptable” se refiere a sales de adición ácida o sales de adición de base convencionales que retienen la eficacia biológica y propiedades de los compuestos de la presente invención y se forman de ácidos orgánicos o inorgánicos no tóxicos adecuado o bases orgánicas o inorgánicas. Las sales de adición ácida de muestra incluyen las derivadas de ácidos inorgánicos tal como ácido clorhídrico, ácido bromhídrico, ácido yodhídrico, ácido sulfúrico, ácido sulfámico, ácido fosfórico y ácido nítrico, y las derivadas de ácidos orgánicos tal como ácido p-toluenosulfónico, ácido salicílico, ácido metanosulfónico, ácido oxálico, ácido succínico, ácido cítrico, ácido málico, ácido láctico, ácido fumárico, y similares. Las sales de adición de base de muestra incluyen las derivadas de hidróxidos de amonio, potasio, sodio y amonio cuaternario, tal como, por ejemplo, hidróxido de tetrametilamonio. La modificación química de un compuesto farmacéutico (es decir, fármaco) a una sal es una técnica bien conocida para los químicos farmacéuticos para obtener estabilidad física y química, higroscopicidad, fluidez y solubilidad mejoradas de compuestos. Véase, por ejemplo, H. Ansel et al., Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems (6a Ed. 1995) en las pp. 196 y 1456-1457.Compounds that can be employed in the pharmaceutical compositions of the disclosure include NTL, and all of the peptide compounds described above, as well as the pharmaceutically acceptable salts of these compounds. "Pharmaceutically acceptable salt" refers to conventional acid addition salts or base addition salts that retain the biological efficacy and properties of the compounds of the present invention and are formed from suitable non-toxic inorganic or organic acids or inorganic or organic bases. Sample acid addition salts include those derived from inorganic acids such as hydrochloric acid, hydrobromic acid, hydroiodic acid, sulfuric acid, sulfamic acid, phosphoric acid, and nitric acid, and those derived from organic acids such as p-toluenesulfonic acid, acid salicylic, methanesulfonic acid, oxalic acid, succinic acid, citric acid, malic acid, lactic acid, fumaric acid, and the like. Sample base addition salts include those derived from ammonium, potassium, sodium and quaternary ammonium hydroxides, such as, for example, tetramethylammonium hydroxide. Chemical modification of a pharmaceutical compound (ie, drug) to a salt is a well-known technique for pharmaceutical chemists to obtain improved physical and chemical stability, hygroscopicity, fluidity, and solubility of compounds. See, for example, H. Ansel et al., Pharmaceutical Dosage Forms and Drug Delivery Systems (6th Ed. 1995) at pp. 196 and 1456-1457.
Como se ha afirmado anteriormente, los compuestos de la invención poseen la capacidad para inhibir la interacción de MDM2 con la proteína p53 y se aprovechan en el tratamiento de lesión pulmonar aguda y, en particular, fibrosis pulmonar.As stated above, the compounds of the invention possess the ability to inhibit the interaction of MDM2 with the p53 protein and are used in the treatment of acute lung injury and, in particular, pulmonary fibrosis.
Los compuestos de la invención, así como las sales farmacéuticamente aceptables de los mismos, se pueden incorporar en formas farmacéuticas convenientes, tal como cápsulas, obleas impregnadas, comprimidos o preferiblemente, preparaciones inyectables. Se pueden emplear soportes farmacéuticamente aceptables sólidos o líquidos. “Farmacéuticamente aceptable”, tal como soporte, excipiente, etc. farmacéuticamente aceptable significa farmacológicamente aceptable y sustancialmente no tóxico para el sujeto al que se administra el compuesto particular. The compounds of the invention, as well as the pharmaceutically acceptable salts thereof, can be incorporated into convenient dosage forms, such as capsules, impregnated wafers, tablets, or preferably, injectable preparations. Solid or liquid pharmaceutically acceptable carriers can be used. "Pharmaceutically acceptable", such as a carrier, excipient, etc. "pharmaceutically acceptable" means pharmacologically acceptable and substantially non-toxic to the subject to whom the particular compound is administered.
Los soportes sólidos incluyen almidón, lactosa, sulfato de calcio dihidrato, arcilla blanca, sacarosa, talco, gelatina, agar, pectina, goma arábiga, estearato de magnesio y ácido esteárico. Los soportes líquidos incluyen jarabe, aceite de cacahuete, aceite de oliva, solución salina, agua, dextrosa, glicerol y similares. De forma similar, el soporte o diluyente puede incluir cualquier material de liberación prolongada, tal como monoestearato de glicerilo o diestearato de glicerilo, solo o con una cera. Cuando se usa un soporte líquido, la preparación puede estar en forma de un jarabe, un elixir, emulsión, cápsula de gelatina blanda, líquido inyectable estéril (por ejemplo, una solución), tal como una ampolla, o una suspensión líquida acuosa o no acuosa. Se puede encontrar un resumen de tales composiciones farmacéuticas, por ejemplo, en Gennaro, AR, Remington: The Science and Practice of Pharmacy, Lippincott Williams & Wilkins Publishers; 2 ia Ed, 2005 (o la última edición). Solid supports include starch, lactose, calcium sulfate dihydrate, white clay, sucrose, talc, gelatin, agar, pectin, acacia, magnesium stearate, and stearic acid. Liquid carriers include syrup, peanut oil, olive oil, saline, water, dextrose, glycerol, and the like. Similarly, the carrier or diluent can include any sustained release material, such as glyceryl monostearate or glyceryl distearate, alone or with a wax. When a liquid carrier is used, the preparation may be in the form of a syrup, an elixir, an emulsion, a soft gelatin capsule, a sterile injectable liquid (for example, a solution), such as an ampoule, or an aqueous or non-aqueous liquid suspension. watery. A summary of such pharmaceutical compositions can be found, for example, in Gennaro, AR, Remington: The Science and Practice of Pharmacy, Lippincott Williams & Wilkins Publishers; 2 ia Ed, 2005 ( or latest edition).
Las preparaciones farmacéuticas se hacen según técnicas convencionales de química farmacéutica que implican etapas como mezclado, granulación y compresión, cuando es necesario para formas de comprimido, o mezclar, rellenar y disolver los ingredientes, según sea apropiado, para dar los productos deseados para la administración oral, parenteral, tópica, transdérmica, intravaginal, intrapenil, intranasal, intrabronquial, intracraneal, intraocular, intraauricular y rectal. Las composiciones farmacéuticas también pueden contener cantidades minoritarias de sustancias auxiliares no tóxicas tal como agentes humectantes o emulsionantes, agentes reguladores de pH y así sucesivamente.Pharmaceutical preparations are made according to conventional techniques of pharmaceutical chemistry involving steps such as mixing, granulation and compression, when necessary for tablet forms, or mixing, filling and dissolving the ingredients, as appropriate, to give the desired products for administration. oral, parenteral, topical, transdermal, intravaginal, intrapenile, intranasal, intrabronchial, intracranial, intraocular, intra-atrial and rectal. The pharmaceutical compositions may also contain minor amounts of non-toxic auxiliary substances such as wetting or emulsifying agents, pH regulating agents, and so on.
La presente invención se puede usar en el tratamiento de cualquiera de un número de géneros y especies animales, y son igualmente aplicables en la práctica de medicina humana o veterinaria. Por tanto, las composiciones farmacéuticas se pueden usar para tratar animales domésticos y comerciales, incluyendo aves y más preferiblemente mamíferos, lo más preferiblemente seres humanos.The present invention can be used in the treatment of any of a number of animal genera and species, and are equally applicable in the practice of human or veterinary medicine. Thus, the pharmaceutical compositions can be used to treat domestic and commercial animals, including birds and more preferably mammals, most preferably humans.
El término “administración sistémica” se refiere a administración de una composición o agente tal como NTL o Ios péptidos descritos en el presente documento, de una forma que produce la introducción de la composición en el sistema circulatorio del sujeto o permite de otra manera su propagación a lo largo del cuerpo, tal como inyección o infusión intravenosa (í.v .). Administración “regional” se refiere a la administración a un espacio anatómico específico, y algo más limitado, tal como instilación en el pulmón, la ruta preferida, o intrapleural, intraperitoneal, intratecal, subdural o a un órgano específico. Otros ejemplos incluyen intranasal, que es una ruta que corresponde a instilación en Ios pulmones, intrabronquial, intraauricular o intraocular, etc. El término “administración local” se refiere a la administración de una composición o fármaco en un espacio anatómico limitado, o circunscrito, tal como inyecciones subcutáneas (s.c.), inyecciones intramusculares (i.m.). Un experto en la materia entendería que la administración local o la administración regional con frecuencia también producen entrada de una composición en el sistema circulatorio, es decir, de modo que s.c. o i.m. también pueden ser rutas para la administración sistémica. Se pueden preparar preparaciones instilables, inyectables o infusibles en formas convencionales, ya sea como soluciones o suspensiones, formas sólidas adecuadas para solución o suspensión en líquido antes de la inyección o infusión, o como emulsiones. Aunque las rutas regionales preferidas de administración son en Ios pulmones, la composición farmacéutica se puede administrar por vía sistémica o tópica o transdérmica ya sea por separado de, o al mismo tiempo que, instilación en Ios pulmones.The term "systemic administration" refers to administration of a composition or agent such as NTL or the peptides described herein, in a way that causes introduction of the composition into the subject's circulatory system or otherwise allows its spread. throughout the body, such as intravenous (IV) injection or infusion. "Regional" administration refers to administration to a specific, and somewhat more limited, anatomical space, such as instillation into the lung, the preferred route, or intrapleural, intraperitoneal, intrathecal, subdural, or to a specific organ. Other examples include intranasal, which is a route that corresponds to instillation into the lungs, intrabronchial, intra-atrial, or intraocular, etc. The term "local administration" refers to the administration of a composition or drug in a limited, or circumscribed anatomical space, such as subcutaneous injections (s.c.), intramuscular injections (i.m.). One skilled in the art would understand that the local administration or the regional administration often also produce input of a composition into the circulatory system, that is, so that s.c. or i.m. they can also be routes for systemic administration. Instilable, injectable or infusible preparations can be prepared in conventional forms, either as solutions or suspensions, solid forms suitable for solution or suspension in liquid prior to injection or infusion, or as emulsions. Although the preferred regional routes of administration are to the lungs, the pharmaceutical composition can be administered systemically or topically or transdermally either separately from, or concurrently with, instillation into the lungs.
Otros soportes farmacéuticamente aceptables para composiciones de la presente invención son liposomas, composiciones farmacéuticas en las que el polipéptido activo está contenido ya sea dispersado o diversamente presente en corpúsculos que consisten en capas concéntricas acuosas adherentes a capas lipídicas. El polipéptido activo está preferiblemente presente en la capa acuosa y en la capa lipídica, dentro o fuera, o, en cualquier caso, en el sistema no homogéneo en general conocido como una suspensión liposómica. La capa hidrofóbica, o capa lipídica, en general, pero no exclusivamente, comprende fosfolípidos tal como lecitina y esfingomielina, esteroides tal como colesterol, sustancias tensioactivas más o menos iónicas tal como dicetilfosfato, estearilamina o ácido fosfatídico, y/u otros materiales de una naturaleza hidrofóbica. Los expertos en la materia apreciarán otras formas de realización adecuadas de las presente formulaciones liposómicas.Other pharmaceutically acceptable carriers for compositions of the present invention are liposomes, pharmaceutical compositions in which the active polypeptide is contained either dispersed or variously present in corpuscles consisting of concentric aqueous layers adherent to lipid layers. The active polypeptide is preferably present in the aqueous layer and in the lipid layer, inside or outside, or, in any case, in the generally non-homogeneous system known as a liposomal suspension. The hydrophobic layer, or lipid layer, in general, but not exclusively, comprises phospholipids such as lecithin and sphingomyelin, steroids such as cholesterol, more or less ionic surfactants such as dicetyl phosphate, stearylamine or phosphatidic acid, and / or other materials of a hydrophobic nature. Those skilled in the art will appreciate other suitable embodiments of the present liposomal formulations.
La dosis terapéutica administrada es una cantidad que es terapéuticamente eficaz, como saben o es fácilmente determinable por Ios expertos en la materia. La dosis también depende de la edad, salud, y peso del receptor, tipo de tratamiento(s) concurrente(s), si hay alguno, la frecuencia del tratamiento, y la naturaleza del efecto deseado.The therapeutic dose administered is an amount that is therapeutically effective, as is known or is readily determinable by those skilled in the art. The dose also depends on the age, health, and weight of the recipient, type of concurrent treatment (s), if any, the frequency of treatment, and the nature of the effect desired.
Métodos terapéuticosTherapeutic methods
Los métodos de esta divulgación se pueden usar para tratar fibrosis pulmonar o FPI en un sujeto en necesidad de ello. El término “tratar” se define en sentido amplio para incluir, al menos lo siguiente: inhibir, reducir, mejorar, prevenir, reducir la aparición o recaída, incluyendo la frecuencia y/o tiempo a la recaída, o la gravedad de Ios síntomas de la enfermedad o afección que se trata o previene. Esto se puede producir como resultado de inhibir la muerte celular epitelial, inhibir la proliferación de fibroblastos, cualquiera de Ios otros mecanismos biológicos o bioquímicos divulgados en el presente documento que se asocia con o responsable de FPI.The methods of this disclosure can be used to treat pulmonary fibrosis or IPF in a subject in need thereof. The term "treat" is broadly defined to include at least the following: inhibit, reduce, ameliorate, prevent, reduce the occurrence or relapse, including the frequency and / or time to relapse, or the severity of the symptoms of the disease or condition being treated or prevented. This can occur as a result of inhibiting epithelial cell death, inhibiting fibroblast proliferation, any of the other biological or biochemical mechanisms disclosed herein that are associated with or responsible for IPF.
La NTL, análogo de NTL, o péptido o derivado peptídico o sal farmacéuticamente aceptable del mismo preferiblemente se administra en forma de una composición farmacéutica como se ha descrito anteriormente.The NTL, NTL analog, or peptide or peptide derivative or pharmaceutically acceptable salt thereof is preferably administered in the form of a pharmaceutical composition as described above.
Las dosis del compuesto preferiblemente incluyen formas posológicas farmacéuticas que comprenden una cantidad eficaz de la NTL o péptido. La forma farmacéutica se refiere a unidades físicamente discretas adecuadas como dosis unitarias para un sujeto mamífero; cada unidad contiene una cantidad predeterminada de material activo calculado para producir el efecto terapéutico deseado, en asociación con el soporte farmacéutico requerido. La especificación de las formas farmacéuticas de la invención está dictada por y depende directamente de (a) las características únicas del material activo y el efecto terapéutico particular que se va a alcanzar, y (b) las limitaciones inherentes en la técnica de composición de tal compuesto activo para el tratamiento de, y sensibilidad de, sujetos individuales. Doses of the compound preferably include pharmaceutical dosage forms comprising an effective amount of the NTL or peptide. The dosage form refers to physically discrete units suitable as unit doses for a mammalian subject; each unit contains a predetermined quantity of active material calculated to produce the desired therapeutic effect, in association with the required pharmaceutical carrier. The specification of the pharmaceutical forms of the invention is dictated by and depends directly on (a) the unique characteristics of the active material and the particular therapeutic effect to be achieved, and (b) the limitations inherent in the technique of composition of such active compound for the treatment of, and sensitivity of, individual subjects.
Mediante una cantidad eficaz se quiere decir una cantidad suficiente para alcanzar una concentración regional o concentración de estado estacionario in vivo que produce una reducción cuantificable en cualquier parámetro relevante de la enfermedad.By an effective amount is meant an amount sufficient to achieve a regional concentration or steady state concentration in vivo that produces a measurable reduction in any relevant disease parameter.
La cantidad de compuesto activo que se va a administrar depende de la NTL, análogo de NTL, péptido o derivado del mismo seleccionado, la enfermedad o afección precisa, la vía de administración, la salud y peso del receptor, la existencia de otro tratamiento concurrente, si hay alguno, la frecuencia del tratamiento, la naturaleza del efecto deseado, y el Juicio del experto.The amount of active compound to be administered depends on the selected NTL, NTL analog, peptide or derivative thereof, the precise disease or condition, the route of administration, the health and weight of the recipient, the existence of other concurrent treatment. , if any, the frequency of treatment, the nature of the effect desired, and the expert judgment.
Una dosis individual preferida, dada una vez al día para tratar un sujeto, preferiblemente un mamífero, más preferiblemente un ser humano que padece o es susceptible a FPI resultante de la misma es entre aproximadamente 0,2 mg/kg y aproximadamente 250 mg/kg, preferiblemente es entre aproximadamente 10 mg/kg y aproximadamente 50 mg/kg, por ejemplo, mediante instilación (por inhalación). Tal dosis se puede administrar a diario desde donde sea desde aproximadamente 3 días a una o más semanas. También es posible la administración crónica, aunque puede ser necesario ajustar la dosis hacia abajo como se entiende bien en la técnica. Los intervalos anteriores son, sin embargo, indicativos, ya que el número de variables en una pauta de tratamiento individual es grande, y se esperan desplazamientos considerables de estos valores preferidos.A preferred individual dose, given once daily to treat a subject, preferably a mammal, more preferably a human suffering from or susceptible to IPF resulting therefrom is between about 0.2 mg / kg and about 250 mg / kg. , preferably it is between about 10 mg / kg and about 50 mg / kg, for example, by instillation (by inhalation). Such a dose can be administered daily from anywhere from about 3 days to one or more weeks. Chronic administration is also possible, although it may be necessary to adjust the dose downward as is well understood in the art. The above ranges are, however, indicative, as the number of variables in an individual treatment regimen is large, and considerable shifts from these preferred values are expected.
Para la administración continua, por ejemplo, mediante un sistema de bomba tal como una bomba osmótica que se usó en algunos de los experimentos descritos posteriormente, una dosis total durante un tiempo de aproximadamente 1-2 semanas está preferiblemente en el intervalo de 1 mg/kg a 1 g/kg, preferiblemente 20-300 mg/kg, más preferiblemente 50-200 mg/kg. Después de tal pauta de dosis continua, la concentración total del compuesto activo está preferiblemente en el intervalo de aproximadamente 0,5 a aproximadamente 50 |jM, preferiblemente de aproximadamente 1 a aproximadamente 10 |jM.For continuous administration, for example by a pump system such as an osmotic pump that was used in some of the experiments described below, a total dose over a time of about 1-2 weeks is preferably in the range of 1 mg / kg to 1 g / kg, preferably 20-300 mg / kg, more preferably 50-200 mg / kg. After such continuous dose regimen, the total concentration of the active compound is preferably in the range of about 0.5 to about 50 | j M, preferably about 1 to about 10 | j M.
Una concentración eficaz del compuesto activo para inhibir o prevenir inhibir apoptosis in vitro está en el intervalo de aproximadamente 0,5 nM a aproximadamente 100 nM, más preferiblemente de aproximadamente 2 nM a aproximadamente 20 nM. Las dosis eficaces e intervalos de dosis óptimos se pueden determinar in vitro usando los métodos descritos en el presente documento.An effective concentration of the active compound to inhibit or prevent inhibiting apoptosis in vitro is in the range of about 0.5 nM to about 100 nM, more preferably about 2 nM to about 20 nM. Optimal effective doses and dose ranges can be determined in vitro using the methods described herein.
e j e m p l o ie j e m p l o i
Expresión de p53 en fibroblastos FL disminuida en focos fibróticos de pulmones FPIExpression of p53 in FL fibroblasts decreased in fibrotic foci of IPF lungs
La tinción de secciones de pulmón de pacientes de FPI y sujetos “normales” control con varios reactivos, incluyendo inmunohistoquímica (IHC) (véase, las figuras 2A-2I) reveló que los tejidos FPI muestran focos fibróticos que son densos con MEC. Los fibroblastos FL dispersados en los focos ricos en vimentina mostraron tinción mínima para antígenos p53 y PAI-1. Sin embargo, la tinción de inmunofluorescencia para SP-C, PAI-1, p53 y caspasa-3 activa (no mostrado) demostró que células alveolares de tipo II (ATII) que rodean los focos fibróticos muestran tinción elevada para antígenos p53 y Pa I-1, y son positivas para caspasa-3 activa, lo que indica apoptosis de células ATII circundantes. Los resultados de iHc revelan que las células ATII que encierran los focos fibróticos mueren continuamente debido a expresión aumentada de p53 y PAI-1. Estas heridas se sustituyen por fibroblastos activados que muestran tinción de p53 y PAI-1 basal mínima, y elevada de Ki-67 lo que indica proliferación debido a la supresión de la expresión de p53 y PAI-1.Staining of lung sections from IPF patients and "normal" control subjects with various reagents, including immunohistochemistry (IHC) (see, Figures 2A-2I) revealed that IPF tissues show fibrotic foci that are dense with ECM. The FL fibroblasts dispersed in the vimentin-rich foci showed minimal staining for p53 and PAI-1 antigens. However, immunofluorescence staining for SP-C, PAI-1, p53, and active caspase-3 (not shown) demonstrated that type II alveolar cells (ATII) surrounding fibrotic foci show elevated staining for p53 and Pa I antigens. -1, and are positive for active caspase-3, indicating apoptosis of surrounding ATII cells. The iHc results reveal that the ATII cells that enclose the fibrotic foci continually die due to increased expression of p53 and PAI-1. These wounds are replaced by activated fibroblasts showing minimal basal p53 and PAI-1 staining, and elevated Ki-67 staining, indicating proliferation due to suppression of p53 and PAI-1 expression.
e j e m p l o IIe j e m p l o II
Caveolina-1, p53 y PAI-1 disminuidas y uPA aumentada en fibroblastos FL humanos de pulmones FPICaveolin-1, p53 and PAI-1 decreased and uPA increased in human FL fibroblasts from IPF lungs
Se inmunotransfirieron lisados celulares de fibroblastos NL y FL para revelar cambios en las proteínas y miARN. Véase las figuras 3A-3B. La expresión de miR-34a basal era significativamente menor en fibroblastos FL lo que indica que la expresión reducida de p53 y cambios consecuentes en la interrelación p53-sistema fibrinolítico de uPA contribuía a fibrogénesis. Tales cambios se asocian con col-I aumentada e inhibición de miR-34a. Los resultados mostraron además que aumentos en la transcripción de miR-34a inducida por p53 o estabilización de p53 en fibroblastos FL humanos mediada por miR-34a puede mitigar la fibrosis pulmonar.NL and FL fibroblast cell lysates were immunoblotted to reveal changes in proteins and miRNAs. See Figures 3A-3B. Baseline miR-34a expression was significantly lower in FL fibroblasts indicating that reduced p53 expression and consequent changes in the p53-uPA fibrinolytic system interface contributed to fibrogenesis. Such changes are associated with increased chol-I and inhibition of miR-34a. The results further showed that miR-34a-mediated increases in miR-34a transcription induced by p53 or stabilization of p53 in human FL fibroblasts can mitigate pulmonary fibrosis.
e j e m p l o IIIe j e m p l o III
Expresión dispar de los ARNm de uPA, PAI-1 y col-I por fibroblastos de pulmones FPI y “normales”Uneven expression of uPA, PAI-1, and col-I mRNAs by FPI and "normal" lung fibroblasts
Se ensayó ARN total aislado de tejidos pulmonares de sujetos “normales” y pacientes con FPI o de NL para ARNm de uPA, PAI-1 y col-I por RT-PCR cuantitativa y se normalizó a los niveles correspondientes del ARNm de p-actina. Los resultados se muestran en las figuras 4A-4B.Total RNA isolated from lung tissues of "normal" subjects and IPF or NL patients was assayed for uPA, PAI-1 and col-I mRNA by quantitative RT-PCR and normalized to corresponding levels of p-actin mRNA. . The results are shown in Figures 4A-4B.
La expresión del ARNm de col-I y PAI-1 aumentó significativamente en tejidos de pulmones FPI mientras que el ARNm de uPA se redujo. De forma interesante, a diferencia de los tejidos de pulmones FPI, el ARNm de col-I y uPA y menor nivel de la expresión del ARNm de PAI-1 se encontraron en fibroblastos FL comparado con fibroblastos NL. La proteína y el ARNm de uPAR también están elevados en fibroblastos FL. El PAI-1 elevado en los tejidos pulmonares es atribuible a expresión aumentada de PAI-1 por células epiteliales pulmonares o macrófagos más que fibroblastos FL (FPI). Esto es consistente con la expresión aumentada de proteínas coI-I, uPA y uPAR y PAI-1 reducida en fibroblastos FL de pulmones FPI (véase la figura 3A).The expression of col-I and PAI-1 mRNA was significantly increased in FPI lung tissues while uPA mRNA was decreased. Interestingly, unlike FPI lung tissues, the mRNA of col-I and uPA and lower level of PAI-1 mRNA expression was found in FL fibroblasts compared to NL fibroblasts. UPAR protein and mRNA are also elevated in FL fibroblasts. Elevated PAI-1 in lung tissues is attributable to increased expression of PAI-1 by lung epithelial cells or macrophages rather than FL fibroblasts (IPF). This is consistent with the increased expression of coI-I, uPA and uPAR proteins and reduced PAI-1 in FPI lung FL fibroblasts (see Figure 3A).
e j e m p l o ive j e m p l o iv
Expresión diferencial de uPA y PAI-1 por fibroblastos FL frente a NL de ratonesDifferential expression of uPA and PAI-1 by FL fibroblasts versus NL from mice
Se aislaron fibroblastos FL de Ios pulmones de ratones 21 días después de lesión con BLM o fibroblastos NL de ratones control expuestos a solución salina intranasal como se describe en otro lugar26. Los lisados de fibroblastos NL y FL se inmunotransfirieron paraFL fibroblasts were isolated from mouse lungs 21 days after BLM injury or NL fibroblasts from control mice exposed to intranasal saline as described elsewhere26. Fibroblast lysates NL and FL were immunoblotted to
Se detectaron cambios en la expresión de proteínas p53, uPA, PAI-1 y coI-I por inmunotransferencia de lisados celulares de fibroblastos NL y FL (Figs. 5A-5D). Se extrajo ARN total de tejidos de pulmones de ratón fibroblastos NL y FL de tejidos de pulmón de ratones con fibrosis inducida por BLM o control (tratados con solución salina) y se ensayaron para ARNm de uPA, PAI-1 y CoI-I. Se compararon las tasas proliferativas de fibroblastos NL y f L de ratones. Consistente con fibroblastos FL (FPI) de pulmones FPI2, la tasa basal de proliferación de fibroblastos Fl (BLM) murinos era significativamente mayor que la de fibroblastos NL (de ratones tratados con solución salina). p53 inhibía la transcripción génica de uPA, al mismo tiempo se unía al promotor de PAI-1 y aumentaba la transcripción del ARNm de PAI-133-34 p53 también inhibía la expresión de uPA y uPAR mediante la desestabilización de sus transcritos al tiempo que estabiliza el transcrito de PAI-123’35. Por último, la inhibición de uPA o uPAR aumenta la expresión de p53 y posterior inducción de PAI-1 mediada por p53, aumentando de esta manera la senescencia celular y apoptosis. Se concluyó que la regulación mediada por p53 del sistema fibrinolítico de uPA a niveles transcripcional y postranscripcional está comprometida en fibroblastos FL debido a la falta de expresión de p53. Esto lleva a uPA y uPAR aumentadas e inhibición de PAI-1 en estas células.Changes in the expression of p53, uPA, PAI-1 and coI-I proteins were detected by immunoblotting of NL and FL fibroblast cell lysates (Figs. 5A-5D). Total RNA was extracted from mouse lung tissues with NL and FL fibroblasts from lung tissues of BLM-induced or control (saline-treated) mice with mRNA and assayed for uPA, PAI-1 and CoI-I mRNA. The proliferative rates of mouse NL and f L fibroblasts were compared. Consistent with FL fibroblasts (FPI) from FPI2 lungs, the basal proliferation rate of murine Fl fibroblasts (BLM) was significantly higher than that of NL fibroblasts (from saline-treated mice). p53 inhibited uPA gene transcription, at the same time bound to the PAI-1 promoter and increased transcription of PAI-133-34 mRNA p53 also inhibited uPA and uPAR expression by destabilizing their transcripts while stabilizing the PAI-123'35 transcript. Finally, the inhibition of uPA or uPAR increases the expression of p53 and subsequent induction of PAI-1 mediated by p53, thus increasing cell senescence and apoptosis. It was concluded that p53-mediated regulation of the uPA fibrinolytic system at transcriptional and post-transcriptional levels is compromised in FL fibroblasts due to lack of p53 expression. This leads to increased uPA and uPAR and inhibition of PAI-1 in these cells.
e j e m p l o ve j e m p l o v
CSP aumenta la expresión de p53 a través de la inducción de miR-34a en fibroblastos FL(FPI)CSP increases p53 expression through induction of miR-34a in FL fibroblasts (IPF)
Se trataron fibroblastos NL y FL con PBS, CSP o CP y se analizó el ARN para miR-34a por PCR en tiempo real. Además, se cultivaron fibroblastos FL en presencia de PBS o CSP o CP con o sin miR-34a antisentido (miR-34a AS) o pre-miR-34a (o miARN control. Se inmunotransfirió medio acondicionado (CM) de estos cultivos para PAI-1 y se inmunotransfirieron lisados celulares (CL) para p53. En un experimento, Ios fibroblastos FL se trataron con PBS o Cs P o CP en presencia o ausencia de miR-34a AS, pre-miR-34a o miR control. Se analizó ARN para cambios en miR-34a por PCR en tiempo real. Los resultados aparecen en las figuras 6A-6C.Fibroblasts NL and FL were treated with PBS, CSP or CP and RNA for miR-34a was analyzed by real-time PCR. Furthermore, FL fibroblasts were cultured in the presence of PBS or CSP or CP with or without antisense miR-34a (miR-34a AS) or pre-miR-34a (or control miRNA. Conditioned medium (CM) of these cultures was immunoblotted for PAI -1 and cell lysates (CL) were immunoblotted for p53. In one experiment, FL fibroblasts were treated with PBS or Cs P or CP in the presence or absence of miR-34a AS, pre-miR-34a or control miR. RNA for changes in miR-34a by real-time PCR Results appear in Figures 6A-6C.
Se hicieron una serie de deleciones solapantes en CSP y estos fragmentos peptídicos se ensayaron en fibroblastos FL para cambios en p53, uPA, PAI-1 y coI-I (Fig. 6D).A series of overlapping deletions were made in CSP and these peptide fragments were assayed in FL fibroblasts for changes in p53, uPA, PAI-1 and coI-I (Fig. 6D).
CSP aumentó significativamente la expresión de miR-34a y p53 en fibroblastos FL, pero no NL. La inducción de p53 por CSP estaba mimetizada por la expresión de pre-miR-34a solo y abolida por inhibición de miR-34a por miR-34a AS. Esto indicaba que la inducción de p53 se produce mediante estabilización mediada por miR-34a.CSP significantly increased miR-34a and p53 expression in FL fibroblasts, but not NL. Induction of p53 by CSP was mimicked by expression of pre-miR-34a alone and abolished by inhibition of miR-34a by miR-34a AS. This indicated that the induction of p53 occurs by miR-34a mediated stabilization.
El análisis de deleción del 20mero CSP reveló que un fragmento interno de 7 aminoácidos, llamado CSP-4 y que tiene la secuencia FTTFTVT (SEQ ID NO: 1) tenía la actividad del péptido de longitud completa. Esto apoya la conclusión de que el efecto beneficioso de CSP-4 en fibroblastos FL o ratones con fibrosis pulmonar establecida (véase las figuras 11A-11D), implica control de la expresión de p53 y miR-34a.Deletion analysis of the 20mer CSP revealed that an internal 7 amino acid fragment, called CSP-4 and having the sequence FTTFTVT (SEQ ID NO: 1) had the full length peptide activity. This supports the conclusion that the beneficial effect of CSP-4 in FL fibroblasts or mice with established pulmonary fibrosis (see Figures 11A-11D), involves control of p53 and miR-34a expression.
e j e m p l o vie j e m p l o vi
Degradación aumentada mediada por mdm2 de proteínas p53 en fibroblastos FL(FPI)Increased mdm2-mediated degradation of p53 proteins in FL fibroblasts (IPF)
Lisados de fibroblastos NL y FL se inmunotransfirieron para p53 y mdm2, o se inmunoprecipitaron con anticuerpo antimdm2 e inmunotransfirieron (IB) para la proteína p53 asociada. Los resultados mostraron interacción mdm2-p53 robusta en fibroblastos NL que estaban ausentes en fibroblastos FL (véase las figuras 7A-7B) a pesar de niveles elevados de mdm2 en Ios fibroblastos FL. Por tanto, la degradación aumentada mediada por mdm2 de la proteína p53 contribuía a la marcada supresión de Ios niveles basales de p53 en fibroblastos FL, lo que apoya el uso de las intervenciones terapéuticas divulgadas en el presente documento para dirigirse a la interacción de mdm2 y p53. Fibroblast lysates NL and FL were immunoblotted for p53 and mdm2, or immunoprecipitated with anti-imdm2 antibody and immunoblotted (IB) for the associated p53 protein. The results showed robust mdm2-p53 interaction in NL fibroblasts that were absent in FL fibroblasts (see Figures 7A-7B) despite elevated levels of mdm2 in FL fibroblasts. Thus, the increased mdm2-mediated degradation of the p53 protein contributed to the marked suppression of basal p53 levels in FL fibroblasts, supporting the use of the therapeutic interventions disclosed herein to target the interaction of mdm2 and p53.
e j e m p l o viie j e m p l o vii
Inhibición mediada por nutlina-3a (NTL) o CSP-4 de la expresión de coI-I en fibroblastos FL(FPI): Papel de la interrelación p53-sistema fibrinolítico Nutlin-3a (NTL) or CSP-4-mediated inhibition of coI-I expression in FL fibroblasts (FPI): Role of the p53-fibrinolytic system interrelation
Se expusieron fibroblastos FL a PBS (control), nutlina-3a (10 mM), CSP-4 (10 nM) o CP durante 48 horas. Se inmunotransfirieron lisados para la expresión de CoI-I, PAI-1, p53 y uPA. Los resultados se muestran en las figuras 8A-8B. Se expusieron FL cultivados a vehículo (PBS), o nutlina-3a, CSP-4 o CP y se contaron para evaluar la proliferación. Los resultados mostraron que tanto nutlina-3a como CSP-4 inhibieron la proliferación de fibroblastos FL. El proceso implica inducción de la expresión de p53 y PAI-1 e inhibición concurrente de uPA.FL fibroblasts were exposed to PBS (control), nutlin-3a (10 mM), CSP-4 (10 nM) or CP for 48 hours. Lysates were immunoblotted for the expression of CoI-I, PAI-1, p53 and uPA. The results are shown in Figures 8A-8B. Cultured FLs were exposed to vehicle (PBS), or nutlin-3a, CSP-4 or CP and counted to assess proliferation. The results showed that both nutlin-3a and CSP-4 inhibited the proliferation of FL fibroblasts. The process involves induction of the expression of p53 and PAI-1 and concurrent inhibition of uPA.
En otro experimento (resultados en la figura 8C), se transdujeron fibroblastos FL con vector de adenovirus que expresa p53, PAI-1 o caveolina-1 o controles de vector apropiados y se cultivaron durante 2 días momento en que se Ios lisados celulares se inmunotransfirieron para CoI-I, p53, PAI-1 y uPA. La transducción de fibroblastos FL de pulmones FPI con Ad-Cav-1 indujo p53 y PAI-1 mientras que inhibía la expresión de uPA y coI-I. Los efectos de nutlina-3a o CSP-4 en fibroblastos FL estaban mimetizados al expresar p53 o PAI-1 o caveolina-1 solas. Por tanto, la inducción mediada por p53 de PAI-1 y la inhibición de la expresión de uPA contribuyen a la inhibición de coI-I. De forma interesante, el tratamiento de fibroblastos FL de Ios pulmones de pacientes de FPI o ratones tratados con BLM con proteína PAI-1 recombinante fracasó para inducir apoptosis o senescencia (no mostrado) mientras que PAI-1 elevada exógena inducía apoptosis de células ATII tanto in vitro como in vivo. La resistencia de fibroblastos f L a PAI-1 exógena permitiría que estas células prosperaran en medios ricos en proteínas PAI-1 de pulmones de FPI o dañados con BLM. In another experiment (results in Figure 8C), FL fibroblasts were transduced with adenovirus vector expressing p53, PAI-1, or caveolin-1 or appropriate vector controls and cultured for 2 days when the cell lysates were immunoblotted. for CoI-I, p53, PAI-1 and uPA. Transduction of FPI lung FL fibroblasts with Ad-Cav-1 induced p53 and PAI-1 while inhibiting the expression of uPA and coI-I. The effects of nutlin-3a or CSP-4 on FL fibroblasts were mimicked by expressing p53 or PAI-1 or caveolin-1 alone. Thus, p53-mediated induction of PAI-1 and inhibition of uPA expression contribute to the inhibition of coI-I. Interestingly, treatment of FL fibroblasts from the lungs of IPF patients or BLM-treated mice with recombinant PAI-1 protein failed to induce apoptosis or senescence (not shown) while exogenous elevated PAI-1 induced apoptosis of both ATII cells. in vitro and in vivo. The resistance of f L fibroblasts to exogenous PAI-1 would allow these cells to thrive in media rich in PAI-1 proteins from IPF or BLM-damaged lungs.
e j e m p l o v iiie j e m p l o v iii
Papel de la interrelación p53-sistema fibrinolítico en la inducción de la expresión de coI-I en fibroblastos NLRole of the p53-fibrinolytic system interrelation in the induction of coI-I expression in NL fibroblasts
Se transfectaron fibroblastos NL de pulmones humanos histológicamente “normales”2 con un vector de lentivirus que porta ARNhc de p53 para inhibir la expresión basal de p53. Se trataron similarmente células controles con un ARNhc no específico. Se inmunotransfirió medio acondicionado de Ios cultivos para PAI-1, uPA y coI-I soluble, y se ensayaron lisados celulares para p53 y ci-SMA. Se analizó ARN total aislado de estos fibroblastos para cambios en la expresión del ARNm de uPA, pA|-1 y coI-I por RT-PCR cuantitativa. Los resultados (en las figuras 9A-9B) muestran que la inhibición de la expresión de p53 en fibroblastos NL aumentó uPA, coI-I y ci-SMA, pero inhibió PAI-1. Esto apoya el vínculo descrito aquí entre cambios mediados por p53 en el sistema de uPa y fibrogénesis.Histologically "normal" human lung NL fibroblasts 2 were transfected with a lentivirus vector bearing p53 shRNA to inhibit basal p53 expression. Control cells were similarly treated with a non-specific shRNA. Culture-conditioned medium was immunoblotted for PAI-1, uPA, and soluble coI-I, and cell lysates were assayed for p53 and ci-SMA. Total RNA isolated from these fibroblasts was analyzed for changes in mRNA expression of uPA, pA | -1 and coI-I by quantitative RT-PCR. The results (in Figures 9A-9B) show that inhibition of p53 expression in NL fibroblasts increased uPA, coI-I and ci-SMA, but inhibited PAI-1. This supports the link described here between p53-mediated changes in the uPa system and fibrogenesis.
e j e m p l o ixe j e m p l o ix
Nutlina-3a inhibe fibrosis pulmonar en ratones tratados con BLMNutlin-3a inhibits pulmonary fibrosis in BLM-treated mice
Ratones expuestos a BLM (o solución salina en controles) durante 14 d para inducir fibrosis pulmonar se inyectaron IV con nutlina-3a (10 mg/kg de peso corporal)35 o un control vehículo para determinar y el efecto en fibrosis pulmonar establecida se examinó. La fibrosis se evaluó por TAC y la función pulmonar (distensibilidad y resistencia) se midieron usando el sistema Flexivent. Se sometieron secciones pulmonares a tinción tricrómica y tinción de H&E (la última no mostrada) para evaluar la arquitectura pulmonar y depósito de colágeno como una indicación de fibrosis. Por último, se analizaron homogenizados de pulmones enteros para contenido total en colágeno (hidroxiprolina) y desmosina26,36 como una evaluación independiente de cambios en la MEC. Los resultados (Fig. 10-10D) de todos Ios ensayos anteriores indicaban un efecto beneficioso de nutlina-3a en fibrosis pulmonar. La administración oral de nutlina-3a 14 días después de la lesión de BLM inhibió asimismo la fibrosis pulmonar en ratonesMice exposed to BLM (or saline in controls) for 14 d to induce pulmonary fibrosis were injected IV with nutlin-3a (10 mg / kg body weight) 35 or a vehicle control to determine and the effect on established pulmonary fibrosis was examined. . Fibrosis was assessed by CT and lung function (compliance and resistance) were measured using the Flexivent system. Pulmonary sections were subjected to trichrome staining and H&E staining (the latter not shown) to assess lung architecture and collagen deposition as an indication of fibrosis. Finally, whole lung homogenates were analyzed for total collagen (hydroxyproline) and desmosine26,36 content as an independent evaluation of changes in ECM. The results (Fig. 10-10D) of all the previous trials indicated a beneficial effect of nutlin-3a in pulmonary fibrosis. Oral administration of nutlin-3a 14 days after BLM injury also inhibited pulmonary fibrosis in mice.
e j e m p l o xe j e m p l o x
El péptido CSP-4 inhibe fibrosis pulmonar establecida y mejora la función pulmonarCSP-4 peptide inhibits established lung fibrosis and improves lung function
Se expusieron ratones a BLM para inducir fibrosis pulmonar. Después de 14 d, Ios ratones se inyectaron IV con vehículo o 1,5 mg/kg de peso corporal deMice were challenged with BLM to induce pulmonary fibrosis. After 14 d, the mice were injected IV with vehicle or 1.5 mg / kg of body weight of
CSP-4 (SEQ ID NO: 1) o péptido control (secuencia mezclada de Ios mismos aminoácidos; CP, SEQ ID NO: 5)) a 1,5 mg/kg de peso corporal o vehículo se inyectó IV en ratones expuestos a BLM 14 días antes. Una semana después, Ios ratones se ensayaron por TAC para evaluar fibrosis pulmonar. Se midió el volumen pulmonar en Ios mismos ratones usando rendiciones de TAC cuantitativa. Se sometieron secciones pulmonares a tinción (tricrómica y H&E para evaluar el depósito de colágeno como un indicador de fibrosis pulmonar. Se analizaron homogenizados de pulmones enteros para contenido total de hidroxiprolina y desmosina (la última no mostrada). Los resultados están en las figuras 11A-11D. Todos Ios ensayos mostraron que CSP-4 inhibía la fibrosis pulmonar inducida por BLM. Consistente con Ios efectos in vitro de tanto CSP como CSP-4 en fibroblastos FL de pulmones FPI (véase la figura 6D), CSP-4 ejercía un efecto beneficioso in vivo contra fibrosis pulmonar establecida, mimetizando Ios efectos beneficiosos del péptido de longitud completa, CSP (SEQ ID NO: 3).CSP-4 (SEQ ID NO: 1) or control peptide (mixed sequence of the same amino acids; CP, SEQ ID NO: 5)) at 1.5 mg / kg body weight or vehicle was injected IV into BLM-challenged mice 14 days before. One week later, the mice were tested by CT for pulmonary fibrosis. Lung volume was measured in the same mice using quantitative CT renderings. Lung sections were subjected to staining (trichrome and H&E to assess collagen deposition as an indicator of pulmonary fibrosis. Whole lung homogenates were analyzed for total hydroxyproline and desmosine content (the latter not shown). Results are in Figures 11A -11D. All tests showed that CSP-4 inhibited BLM-induced pulmonary fibrosis. Consistent with the in vitro effects of both CSP and CSP-4 on FL fibroblasts from FPI lungs (see Figure 6D), CSP-4 exerted a In vivo beneficial effect against established pulmonary fibrosis, mimicking the beneficial effects of the full-length peptide, CSP (SEQ ID NO: 3).
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El péptido CSP-4 y nutlina-3a inhiben la proliferación de fibroblastos FL CSP-4 peptide and nutlin-3a inhibit FL fibroblast proliferation
Ratones expuestos a BLM 14 días antes se trataron con CSP-4 o su control (CP) o nutlina-3a IV (como en Ios ejemplos IX y X). Siete días después se obtuvieron secciones pulmonares y se sometieron a IHC para Ki-67 para evaluar proliferación celular (véase la figura 12A). La tinción aumentada para antígenos ki-67 observada en secciones pulmonares de ratones fibróticos se reducía significativamente por el tratamiento con nutlina-3a o CSP-4. Se ensayaron fibroblastos aislados de Ios pulmones de estos animales (como se describe en el ejemplo X) para Ios cambios en la expresión de proteínas coI-I, p53 y posteriores uPA y PAI-1 por inmunotransferencia y ARNm por RT-PCR cuantitativa (véase las figuras 12B-12C). Los fibroblastos FL de ratones con fibrosis inducida por BLM establecida mostraron expresión aumentada de ARNm y proteínas uPA y coI-I comparados con fibroblastos NL de ratones sin lesión pulmonar. Estas células también mostraron expresión mínima de p53 y PAI-1. Sin embargo, en fibroblastos de ratones tratados con nutlina-3a, la expresión de proteína y ARNm de uPA y coI-I estaban significativamente suprimidas. Estos cambios estaban asociados con marcada inducción de proteína p53, y expresión de proteína y ARNm de PAI-1, Io que indica que el restablecimiento de la interrelación p53-sistema fibrinolítico mitiga la fibrosis.Mice exposed to BLM 14 days before were treated with CSP-4 or its control (CP) or nutlin-3a IV (as in examples IX and X). Seven days later lung sections were obtained and subjected to IHC for Ki-67 to assess cell proliferation (see Figure 12A). The increased staining for ki-67 antigens observed in lung sections from fibrotic mice was significantly reduced by treatment with nutlin-3a or CSP-4. Fibroblasts isolated from the lungs of these animals (as described in Example X) were assayed for changes in the expression of proteins co I-I, p53 and later uPA and PAI-1 by immunoblotting and mRNA by quantitative RT-PCR (see Figures 12B-12C). FL fibroblasts from mice with established BLM-induced fibrosis showed increased expression of uPA and coI-I mRNA and proteins compared to NL fibroblasts from mice without lung injury. These cells also showed minimal expression of p53 and PAI-1. However, in fibroblasts from mice treated with nutlin-3a, the protein and mRNA expression of uPA and coI-I were significantly suppressed. These changes were associated with marked induction of p53 protein, and expression of PAI-1 protein and mRNA, indicating that the reestablishment of the p53-fibrinolytic system interplay mitigates fibrosis.
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Inhibición de cambios fibróticos por tratamiento ex vivo con CSP-4 o nutlina-3aInhibition of fibrotic changes by ex vivo treatment with CSP-4 or nutlin-3a
Se expusieron ratones a BLM intranasal durante 21 d para inducir fibrosis pulmonar, se sacrificaron y sus pulmones se extirparon y cortaron y en trozos pequeños y se colocaron en medio de cultivo. Estas muestras de tejido se trataron después de ello con péptido CSP-4 lO nN, péptido control (CP) o nutlina-3a durante 72 h. Medio acondicionado y lisados de tejido se y analizaron para cambios en coI-I y a-SMA por inmunotransferencia. Los resultados (Fig. 13) mostraron que el tratamiento de explantes de tejido pulmonar fibrótico con CSP-4 o nutlina-3a inhibía la fibrosis ex vivo. El péptido CSP de longitud completa dio inhibición similar de coI-I y a-SMA (resultados no mostrados). Se espera que nutlina-3a y CSP-4 actúen de forma similar para afectar tejidos de pulmones FPI humanos ex vivo. Los datos más recientes de Ios presentes inventores y artículos recientes (por ejemplo, Bhandary et al. supra), fuertemente apoyan la concepción de que Ios cambios posteriores mediados por p53 en uPA y PAI-1 regulan la viabilidad de fibroblastos f l .Mice were exposed to intranasal BLM for 21 d to induce pulmonary fibrosis, sacrificed, and their lungs were excised and cut into small pieces and placed in culture medium. These tissue samples were thereafter treated with 10 nN CSP-4 peptide, control peptide (CP), or nutlin-3a for 72 h. Conditioned medium and tissue lysates were and analyzed for changes in coI-I and α-SMA by immunoblotting. The results (Fig. 13) showed that treatment of fibrotic lung tissue explants with CSP-4 or nutlin-3a inhibited fibrosis ex vivo. The full length CSP peptide gave similar inhibition of coI-I and α-SMA (results not shown). Nutlin-3a and CSP-4 are expected to act similarly to affect human IPF lung tissues ex vivo. The most recent data from the present inventors and recent articles (eg, Bhandary et al. Supra), strongly support the view that p53-mediated downstream changes in uPA and PAI-1 regulate fl fibroblast viability.
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La expresión de p53 en fibroblastos FL y la inversión posterior de sistema fibrinolítico de uPA mitiga fibrosis pulmonar in vivo Expression of p53 in FL fibroblasts and subsequent reversal of uPA fibrinolytic system mitigates pulmonary fibrosis in vivo
Los resultados descritos en el presente documento y en otros sitios (Bhandary YP et al., Am J Physiol: Lung Cell Mot Physiol 3O2:L463-473, 2012 ; Shetty SK et al., Am J Respir Cell Mol Biol 47:474-83, 2012) muestran que inyecciones IP o IV con CSP o CSP-4 (Fig. 11A-11D), o administración IV u oral de nutlina-3a en ratones de tipo salvaje (WT) (Fig. 1OA-1OD) empezando 14 d después de BLM mitiga la fibrosis pulmonar establecida. Por tanto, la degradación mediada por mdm2 de la proteína p53 y la pérdida de la posterior interrelación p53-sistema de uPA aumenta la viabilidad de Ios fibroblastos FL y la producción de MEC in vivo, lo que produce la destrucción de la arquitectura pulmonar y pérdida de la función pulmonar. Puesto que Ios pacientes con frecuencia presentan en el momento del diagnóstico fases avanzadas de FPI, Ios mecanismos por Ios que nutlina-3a y CSP-4 inhiben la fibrosis pulmonar establecida se evalúan las dianas posteriores de nutlina-3a y CSP-4 se identifican. Estos estudios utilizan tejidos pulmonares de pacientes de FPI y ratones con fibrosis pulmonar avanzada debido a lesión pulmonar por BLM. La contribución y la especificidad de la interrelación p53-sistema de uPA se confirmarán usando ratones deficientes en uPA, uPAR, PAI-1 y p53. The results described herein and elsewhere (Bhandary YP et al., Am J Physiol: Lung Cell Mot Physiol 3O2: L463-473, 2012; Shetty SK et al., Am J Respir Cell Mol Biol 47: 474- 83, 2012) show that IP or IV injections with CSP or CSP-4 (Fig. 11A-11D), or IV or oral administration of nutlin-3a in wild-type (WT) mice (Fig. 1OA-1OD) starting 14 d after BLM mitigates established pulmonary fibrosis. Therefore, the mdm2-mediated degradation of the p53 protein and the loss of the subsequent p53-uPA system interrelation increases FL fibroblast viability and ECM production in vivo, leading to destruction of lung architecture and loss. of lung function. Since patients frequently present advanced stages of IPF at diagnosis, the mechanisms by which nutlin-3a and CSP-4 inhibit established pulmonary fibrosis, subsequent targets of nutlin-3a and CSP-4 are identified. These studies use lung tissues from IPF patients and mice with advanced pulmonary fibrosis due to BLM lung injury. The contribution and specificity of the p53-uPA system interplay will be confirmed using mice deficient in uPA, uPAR, PAI-1 and p53.
A. Determinación de Ios efectos del tratamiento de nutlina-3a y CSP-4 en fibrosis usando tejidos FL(FPI) ex vivo A. Determination of the effects of nutlin-3a and CSP-4 treatment in fibrosis using FL tissues (IPF) ex vivo
Se tratan tejidos pulmonares FL recién disecados de pacientes de FPI con nutlina-3a (10 |jM) o CSP-4 (10 nM) durante 3 a 7 días (véase la figura 13). Los tejidos pulmonares se homogenizan y ensayan para cambios en la MEC (hidroxiprolina y desmosina). Los controles incluyen tejidos de pulmón fibrótico (FL) de pacientes de FPI tratados con vehículo o péptido control, CP, o tejidos pulmonares sin tratar mantenidos en medio de cultivo. Otros controles incluyen tejidos NL extirpados de pulmones histológicamente “normales”. Los pulmones de pacientes de-identificados (“normal” y FPI) que no eran adecuados para trasplante y donados para investigación médica se obtienen a través de IIAM (Edison, NJ) y el NDRI (Filadelfia, PA) y se usan para estudios ex vivo. Se aíslan fibroblastos de estos tejidos y se analizan cambios en la expresión de p53, uPA, uPAR y PAI-1, producción de MEC y viabilidad. También se miden cambios en la velocidad de síntesis de MEC. Los explantes de tejido FL de pacientes con FPI tienen síntesis elevada de MEC cuando se comparan con Ios niveles de expresión en secciones de tejidos NL de sujetos control. Sin embargo, Ios explantes de pulmón FL tratados con nutlina-3a o CSP-4 muestran velocidades sintéticas de MEC significativamente reducidas cuando se comparan con Ios que permanecen sin tratar o expuestos a vehículo solo o CP. Los fibroblastos aislados de explantes de FPI tratados con nutlina-3a o CSP-4 muestran niveles elevados de expresión de p53, miR-34a y PAI-1 y reducidos de uPA y uPAr. La fosforilación de Akt y la expresión del ARNm y proteína de PDGFR-p también están reducidos en fibroblastos de explantes de FPI tratados con nutlina-3a o CSP-4. La velocidad de proliferación y producción de MEC de estos fibroblastos son significativamente menores que fibroblastos FL de controles sin tratar o tratados con vehículo o CP, pero comparables a la de Ios fibroblastos aislados de tejidos NL. Freshly dissected FL lung tissues from IPF patients are treated with nutlin-3a (10 µM) or CSP-4 (10 nM) for 3 to 7 days (see Figure 13). Pulmonary tissues are homogenized and tested for changes in ECM (hydroxyproline and desmosine). Controls include fibrotic lung tissues (FL) from IPF patients treated with vehicle or control peptide, CP, or untreated lung tissues maintained in culture medium. Other controls include NL tissues excised from histologically "normal" lungs. The lungs of de-identified patients (“normal” and IPF) that were not suitable for transplantation and donated for medical research are obtained through IIAM (Edison, NJ) and the NDRI (Philadelphia, PA) and are used for ex studies. alive. Fibroblasts are isolated from these tissues and changes in p53, uPA, uPAR, and PAI-1 expression, ECM production, and viability are analyzed. Changes in the rate of ECM synthesis are also measured. FL tissue explants from IPF patients have elevated ECM synthesis when compared to expression levels in NL tissue sections from control subjects. However, FL lung explants treated with nutlin-3a or CSP-4 show significantly reduced MEC synthetic rates when compared to those that remain untreated or exposed to vehicle alone or CP. Fibroblasts isolated from FPI explants treated with nutlin-3a or CSP-4 show high levels of expression of p53, miR-34a and PAI-1 and reduced levels of uPA and uPAr. Akt phosphorylation and PDGFR-p mRNA and protein expression are also reduced in fibroblasts from FPI explants treated with nutlin-3a or CSP-4. The proliferation rate and ECM production of these fibroblasts are significantly lower than FL fibroblasts from untreated controls or treated with vehicle or CP, but comparable to fibroblasts isolated from NL tissues.
B. Papel de p53 y m¡R-34a en el control de fibrosis pulmonarB. Role of p53 and m¡R-34a in the control of pulmonary fibrosis
Basado en los resultados anteriores, se predice que la falta de expresión de p53 y m¡R-34a por fibroblastos FL contribuye a la fibrosis pulmonar y que el restablecimiento de la expresión basal de p53 por nutlina-3a o CSP-4 mediante la inducción de m¡R-34a mitiga la fibrosis pulmonar. Puesto que la fibrosis pulmonar máxima se produce entre los días 14-28 después de la lesión con BLM (Bhandary YP et al., Am J Physiol: Lung Cell Mol Physlol 302:L463-473, 2012; Bhandary y P et al.,. Regulation of alveolar epithelial injury and lung fibrosis by p53-mediated changes in urokinase and plasminogen activator inhibitor-1. Am J Pathol (enviado)) pre-m¡R-34a se expresa en fibroblastos pulmonares de ratón por inyección IV de lentivirus (LV) que contiene promotor de colágeno proa2(l) con pre-m¡R-34a a los 14 y 21 días después de la lesión pulmonar con BLM. La fibrosis pulmonar se evalúa 28 días después. El papel de m¡R-34a en la mitigación mediada por nutlina-3a o CSP-4 de fibrosis pulmonar se confirma por expresión de Lv de m¡R-34a-AS en fibroblastos usando el promotor proa2(l) en pulmones fibróticos.Based on the above results, the lack of expression of p53 and m¡R-34a by FL fibroblasts is predicted to contribute to pulmonary fibrosis and that the reestablishment of basal expression of p53 by nutlin-3a or CSP-4 through the induction of MR-34a mitigates pulmonary fibrosis. Since maximum pulmonary fibrosis occurs between days 14-28 after BLM injury (Bhandary YP et al., Am J Physiol: Lung Cell Mol Physlol 302: L463-473, 2012; Bhandary and P et al., . Regulation of alveolar epithelial injury and lung fibrosis by p53-mediated changes in urokinase and plasminogen activator inhibitor-1. Am J Pathol ( submitted)) pre-m¡R-34a is expressed in mouse lung fibroblasts by IV injection of lentivirus ( LV) containing proa2 (l) collagen promoter with pre-m¡R-34a at 14 and 21 days after BLM lung injury. Pulmonary fibrosis is evaluated 28 days later. The role of m¡R-34a in nutlin-3a or CSP-4 mediated mitigation of pulmonary fibrosis is confirmed by expression of Lv of m¡R-34a-AS in fibroblasts using the proa2 (l) promoter in fibrotic lungs.
El papel de p53 en los efectos beneficiosos contra la fibrosis pulmonar se confirma directamente al expresar p53 en fibroblastos pulmonares de ratones con fibrosis establecida usando LV o Ad-p53 que contiene promotor de colágeno proa(l) con o sin inhibición de m¡R-34a. Se evalúan fibrosis pulmonar y expresión de m¡R-34a, por ejemplo, 28 días después de la lesión con BLM. Alternativamente o, además, la expresión de p53 se inhibe usando LV ARNhc en ratones WT con fibrosis pulmonar inducida por BLM o el uso de ratones deficientes en p53 con fibrosis pulmonar establecida (Davis DW et al., J Exp Med 192:857-869, 2000). Estos ratones se exponen después a nutlina-3a o CSP-4, por ejemplo, 14 y 21 d después de la lesión con BLM. Se exponen ratones control con fibrosis pulmonar a ARNhc no específico o ratones WT sin exposición y tratados con nutlina-3a o CSP-4. Los ratones se ensayan para fibrosis pulmonar y expresión de m¡R-34a, por ejemplo, 28 días después del inicio de la lesión con BLM. La contribución de la interrelación p53-sistema de uPA se confirma exponiendo ratones WT y deficientes en p53, uPA, uPAr y PAI-1 a BLM durante 14-21 d para inducir fibrosis pulmonar, alterar la expresión de m¡R-34a en fibroblastos como se ha descrito anteriormente, y ensayar los efectos sobre fibrosis, por ejemplo, el día 28 después de la lesión con BLM.The role of p53 in the beneficial effects against pulmonary fibrosis is directly confirmed by expressing p53 in lung fibroblasts of mice with established fibrosis using LV or Ad-p53 containing collagen promoter proa (I) with or without inhibition of m¡R- 34a. Pulmonary fibrosis and m¡R-34a expression are assessed, eg, 28 days after BLM injury. Alternatively or in addition, p53 expression is inhibited using LV shRNA in WT mice with BLM-induced lung fibrosis or using p53-deficient mice with established lung fibrosis (Davis DW et al., J Exp Med 192: 857-869 , 2000). These mice are then challenged with nutlin-3a or CSP-4, eg, 14 and 21 d after BLM injury. Control mice with pulmonary fibrosis are challenged with non-specific shRNA or WT mice without challenge and treated with nutlin-3a or CSP-4. Mice are tested for pulmonary fibrosis and m¡R-34a expression, eg, 28 days after onset of BLM injury. The contribution of the p53-uPA system interrelation is confirmed by exposing WT and p53, uPA, uPAr and PAI-1 deficient mice to BLM for 14-21 d to induce pulmonary fibrosis, alter the expression of m¡R-34a in fibroblasts as described above, and testing for effects on fibrosis, eg, on day 28 post injury with BLM.
C. El restablecimiento de la expresión de p53 y posterior interrelación p53-sistema fibrinolítico de uPA por nutlina-3a 0 CSP-4 inhibe fibrosis pulmonarC. Restoration of p53 expression and subsequent p53-uPA fibrinolytic system interrelation by nutlin-3a or CSP-4 inhibits pulmonary fibrosis
La contribución de la interrelación p53-sistema fibrinolítico de uPA en la mitigación de fibrosis pulmonar por nutlina-3a y CSP-4 en ratones se confirma aislando fibroblastos de estos ratones, por ejemplo, 28 d después de la lesión por BLM. Estas células se ensayan para cambios en la expresión de p53, uPA, uPa R y PAI-1 y producción de MEC. Se espera encontrar que fibroblastos FL aislados de los pulmones de ratones con lesión por BLM mostrarán uPA y uPAR, viabilidad y producción de MEC elevados. Estos fibroblastos FL muestran expresión de p53 y PAI-1 mínima en comparación con fibroblastos NL de pulmones sin lesionar. Sin embargo, los fibroblastos de los pulmones de ratones con fibrosis inducida por BLM expuestos a nutlina-3a o CSP-4 muestran p53 elevada. Estas células son menos proliferativas con producción mínima de MEC. La expresión de uPA y uPAR se reduce mientras PAI-1 aumenta comparado con fibroblastos FL obtenidos de ratones lesionados con BLM. Los niveles de uPA, uPAR y PAI-1 en los fibroblastos pulmonares de ratones tratados con BLM nutlina-3a o BLM CSP-4 son comparables a fibroblastos NL aislados de ratones sin lesionar.The contribution of the p53-uPA fibrinolytic system interplay in mitigating lung fibrosis by nutlin-3a and CSP-4 in mice is confirmed by isolating fibroblasts from these mice, eg, 28 d after BLM injury. These cells are tested for changes in the expression of p53, uPA, uPa R and PAI-1 and production of ECM. It is expected to find that FL fibroblasts isolated from the lungs of BLM-injured mice will show elevated uPA and uPAR, viability and production of MEC. These FL fibroblasts show minimal p53 and PAI-1 expression compared to uninjured NL lung fibroblasts. However, fibroblasts from the lungs of mice with BLM-induced fibrosis exposed to nutlin-3a or CSP-4 show elevated p53. These cells are less proliferative with minimal ECM production. The expression of uPA and uPAR is reduced while PAI-1 increases compared to FL fibroblasts obtained from BLM-injured mice. The levels of uPA, uPAR, and PAI-1 in lung fibroblasts from mice treated with BLM nutlin-3a or BLM CSP-4 are comparable to NL fibroblasts isolated from uninjured mice.
Para confirmar la implicación de la interrelación p53-sistema de uPA, fibroblastos FL extraídos de pulmones de ratones lesionados con BLM se transducen con Ad-p53. Los fibroblastos de pulmones lesionados con BLM expuestos a nutlina-3a o CSP-4 son controles positivos mientras que los expuestos a CP o Ad-EV son controles negativos. Las células se ensayan para cambios en uPA, uPAR y PAI-1.To confirm the involvement of the p53-uPA system interplay, FL fibroblasts extracted from the lungs of BLM-injured mice are transduced with Ad-p53. BLM-injured lung fibroblasts exposed to nutlin-3a or CSP-4 are positive controls while those exposed to CP or Ad-EV are negative controls. Cells are tested for changes in uPA, uPAR, and PAI-1.
La transducción de Ad-p53 o el tratamiento con nutlina-3a o CSP-4 aumenta la expresión de PAI-1 e inhibe la de uPA y uPAR. Estas células suprimen la producción de MEC y una velocidad de proliferación comparada con fibroblastos FL expuestos a CP o Ad-Ev. Los fibroblastos FL de ratones BLM expresan niveles marcadamente bajos de caveolina-1 y la expresión de caveolina-1 mitiga el exceso de producción de MEC. Por tanto, los fibroblastos Fl se transducen con Ad-Cav-1 para ver si p53 y cambios posteriores mediados por p53 en el sistema fibrinolítico de uPA, MEC y viabilidad celular se reducen comparado con los tratados con Ad-Ev.Ad-p53 transduction or treatment with nutlin-3a or CSP-4 increases the expression of PAI-1 and inhibits that of uPA and uPAR. These cells suppress ECM production and proliferation rate compared to FL fibroblasts exposed to CP or Ad-Ev. FL fibroblasts from BLM mice express markedly low levels of caveolin-1 and expression of caveolin-1 mitigates excess ECM production. Therefore, Fl fibroblasts are transduced with Ad-Cav-1 to see if p53 and subsequent p53-mediated changes in the uPA fibrinolytic system, ECM and cell viability are reduced compared to those treated with Ad-Ev.
D. Papel de nutlina-3a o CSP-4 en la inhibición de la fosforilación de Akt en mitigación de fibrosis pulmonar D. Role of nutlin-3a or CSP-4 in inhibiting Akt phosphorylation in mitigation of pulmonary fibrosis
Los fibroblastos FL muestran elevada fosforilación de Akt y expresión de PDGFR-p que proporciona señales de supervivencia (Stambolic V et al. Mol Cell 8:317-25, 2001; L¡ J et al. J Environ Pathol ToxícoI Oncol 23:253-66, 2004; Hoyle GW et al. Am J Pathol 154:1763-75, 1999; Meinecke AK et al. Blood 14:119 :5931-42, 2012) Además, p53 aumenta la expresión de PTEN (Stambolic et al., supra; Mayo LD, et al. J Blot Chem 277:5484-89, 2002) e inhibe PDGFR-p (Widau RC et al., Mol Cell Biol 32:4270-82, 2012; Thornton JD et al., Cell Cycle 4:1316-9, 2005) mientras PAI-1 inhibe la fosforilación de Akt (Shetty SK et al., 2012, supra; Stambolic et al., supra, Malinowsky K et al. Transí Oncol 5:98-104, 2012). La transducción de fibroblastos FL con Ad-Cav-1 inhibe la fosforilación de Akt a través de actividad PTEN aumentada (Tourkina E et al. Open Rheumatol J. 6:116-22, 2012; Wang XM et al. J Exp Med 203:2895-906, 2006; Xia H et al. Am J Pathol 176:2626-37, 2010). FL fibroblasts show high Akt phosphorylation and PDGFR-p expression that provides survival signals (Stambolic V et al. Mol Cell 8: 317-25, 2001; L, J et al. J Environ Pathol Toxic Oncol 23: 253- 66, 2004; Hoyle GW et al. Am J Pathol 154: 1763-75, 1999; Meinecke AK et al. Blood 14: 119 : 5931-42, 2012) In addition, p53 increases the expression of PTEN (Stambolic et al., supra; Mayo LD, et al. J Blot Chem 277: 5484-89, 2002) and inhibits PDGFR-p (Widau RC et al., Mol Cell Biol 32: 4270-82, 2012; Thornton JD et al., Cell Cycle 4: 1316-9, 2005) while PAI-1 inhibits Akt phosphorylation (Shetty SK et al., 2012, supra; Stambolic et al., Supra, Malinowsky K et al. Transí Oncol 5: 98-104, 2012) . Transduction of FL fibroblasts with Ad-Cav-1 inhibits Akt phosphorylation through increased PTEN activity (Tourkina E et al. Open Rheumatol J. 6: 116-22, 2012; Wang XM et al. J Exp Med 203: 2895-906, 2006; Xia H et al. Am J Pathol 176: 2626-37, 2010).
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