ES2637170T3 - Compuestos derivados de aminopiridina como inhibidores de LRRK2 - Google Patents
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Abstract
Un compuesto de Fórmula A**Fórmula** en donde R1 representa triazolilo u oxadizolilo, dicho triazolilo u oxadizolilo puede estar sustituido opcionalmente con 1 grupo R5, X representa N o CH cuando R1 es triazolilo o cuando R1 es oxadiazol X representa CH, R5 representa alquilo C1-C6, cicloalquilo C3-C6 o un anillo heterocíclico de 5-6 miembros con 1 ó 2 heteroátomo(s) seleccionado(s) entre N, O ó S, dicho anillo cicloalquilo o heterocíclico está sustituido opcionalmente con 1 ó 2 alquilos C1-C3 ó 1 ó 2 alcoxi C1-C3, R2, R3 y R4 representan cada uno independientemente hidrógeno, halógeno, alquilo C1-C6, alcoxi C1-C6, O(CH2)nCF3, (CH2)nR6, (C>=O)R6 o (CH2)n(C>=O)R6, n >= 0, 1, 2 ó 3, o R2 y R3 o R3 y R4 pueden formar junto al átomo al que están unidos un anillo heterocíclico bicíclico de 9-10 miembros con 1 ó 2 heteroátomo(s) seleccionado(s) entre N, O ó S, dicho anillo heterocíclico bicíclico puede estar sustituido opcionalmente con 1 ó 2 alquilos C1-C6 ó 1 ó 2 alcoxi C1-C6, R6 representa un anillo heterocíclico de 5-6 miembros con 1, 2 ó 3 heteroátomo(s) seleccionado(s) entre N, O ó S, dicho anillo heterocíclico puede estar sustituido opcionalmente con 1 ó 2 alquilos C1-C3 ó 1 ó 2 alcoxi C1-C3, y las sales farmacéuticamente aceptables de los mismos.
Description
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como con otros adyuvantes o excipientes conocidos de acuerdo a técnicas convencionales, tales como las descritas en Remington: The Science and Practice of Pharmacy, 21ª edición, Mack Publishing Co., 2005. En el presente contexto, “excipiente”, “vehículo”, “diluyente”, “adyuvante” y similares se usan de forma sinónima y se pretende que indiquen lo mismo.
Las composiciones farmacéuticas pueden formularse específicamente para administración a través de cualquier ruta adecuada, tal como ruta oral, rectal, nasal, pulmonar, tópica (que incluye bucal y sublingual), transdérmica, intracisternal, intraperitoneal, vaginal y parenteral (que incluyen subcutánea, intramuscular, intratecal, intravenosa e intradérmica), siendo preferida la ruta oral. Cabe destacar que la ruta preferida dependerá de la condición general y de la edad del sujeto a tratar, de la naturaleza de la afección a tratar y del ingrediente activo elegido.
Las composiciones farmacéuticas para administración oral incluyen formas de dosis sólidas tales como cápsulas, comprimidos, grageas, píldoras, pastillas, polvos y gránulos. Cuando sea apropiado, pueden prepararse con recubrimientos.
Las formas de dosis líquidas para administración oral incluyen disoluciones, emulsiones, suspensiones, jarabes y elixires.
Las composiciones farmacéuticas para administración parenteral incluyen disoluciones, dispersiones, suspensiones
o emulsiones acuosas o no acuosas esterilizadas e inyectables, así como polvos esterilizados para ser reconstituidos en disoluciones o dispersiones esterilizadas inyectables antes de su uso.
Otras formas de administración adecuadas incluyen supositorios, espray, ungüentos, cremas, geles, inhalantes, parches dérmicos, implantes, etc.
De forma conveniente, los compuestos de la invención se administran en una forma de dosis unitaria que contiene dichos compuestos en una cantidad de aproximadamente 0,1 a 500 mg, tal como 10 mg, 50 mg, 100 mg, 150 mg, 200 mg o 250 mg de un compuesto de la presente invención.
Para administración parenteral, se pueden emplear disoluciones del compuesto de la invención en disolución acuosa esterilizada, propilen glicol acuoso, vitamina E acuosa o aceite de sésamo o de cacahuete. Dichas disoluciones acuosas deberían estar tamponadas de forma adecuada si es necesario, y el diluyente líquido deberían hacerse isotónico antes con suficiente salino o glucosa. Las disoluciones acuosas son particularmente adecuadas para la administración intravenosa, intramuscular, subcutánea e intraperitoneal. Los medios acuosos esterilizados empleados se encuentran todos fácilmente disponibles mediante técnicas estándar conocidas por los especialistas en la técnica.
Los vehículos farmacéuticos adecuados incluyen diluyentes o rellenos sólidos inertes, disolución acuosa esterilizada y diversos disolventes orgánicos. Los ejemplos de vehículos sólidos son la lactosa, terra alba, sacarosa, ciclodextrina, talco, gelatina, agar, pectina, acacia, estearato de magnesio, ácido esteárico y éteres de alquilo inferior de celulosa. Los ejemplos de vehículos líquidos son jarabe, aceite de cacahuete, aceite de oliva, fosfolípidos, ácidos grasos, aminas de ácido graso, polioxietileno y agua. Las composiciones farmacéuticas formadas mediante combinación del compuesto de la invención y los vehículos farmacéuticamente aceptables son administradas a continuación fácilmente en una variedad de formas de dosis adecuadas para las rutas de administración descritas.
Las formulaciones de la presente invención adecuadas para administración oral pueden presentarse en forma de unidades discretas, tales como cápsulas o comprimidos, que contienen una cantidad predeterminada del ingrediente activo, y que pueden incluir un excipiente adecuado. Además, las formulaciones disponibles oralmente pueden estar en la forma de un polvo o de gránulos, de una disolución o una suspensión en un líquido acuoso o no acuoso, o de una emulsión líquida de aceite-en-agua o de agua-en-aceite.
Si se usa un vehículo sólido para administración oral, la preparación puede ser un comprimido, p.ej., colocado en una cápsula de gelatina dura en forma de polvo o de partículas, o en forma de pastilla o píldora. La cantidad de vehículo sólido puede variar, pero normalmente estará entre aproximadamente 25 mg y aproximadamente 1 g.
Si se usa un vehículo líquido, la preparación puede estar en la forma de un jarabe, emulsión, cápsula de gelatina blanda o líquido inyectable esterilizado, tal como una suspensión o disolución líquida acuosa o no acuosa.
Los comprimidos se pueden preparar mezclando el ingrediente activo con adyuvantes y/o diluyentes ordinarios, seguido de la compresión de la mezcla en una máquina de preparar comprimidos convencional. Los ejemplos de adyuvantes o diluyentes comprenden: almidón de maíz, almidón de patata, talco, estearato de magnesio, gelatina, lactosa, gomas, y similares. Se pueden usar cualesquier otros adyuvantes o aditivos usados habitualmente para dichos propósitos, tal como colorantes, aromatizantes, conservantes, etc., siempre que sean compatibles con los ingredientes activos.
Todas las referencias, que incluyen publicaciones, solicitudes de patente, y patentes, citadas en la presente memoria se incorporan aquí a modo de referencia en su plenitud, y en la misma extensión que si cada referencia fuera citada individual y específicamente, e indicada como incorporada a modo de referencia, y si fuera presentada
en su totalidad en la presente memoria (hasta la máxima extensión permitida por la ley), independientemente de cualquier incorporación proporcionada de forma separada de documentos particulares realizada en cualquier otro sitio de la presente memoria.
El uso de los términos “un”, “una”, y “el”, “la” y referentes similares en el contexto de descripción de la invención,
5 deben considerarse que cubre tanto el singular como el plural, a menos que se indique lo contrario en la presente memoria o que claramente esté en contradicción con el contexto. Por ejemplo, la frase “el compuesto” debe entenderse que se refiere a varios “compuestos” de la invención, o al aspecto particular descrito, a menos que se indique lo contrario.
La descripción en la presente memoria de cualquier aspecto o aspecto de la invención usando términos tales como
10 “que comprende”, “que tiene”, “que incluye” o “que contiene” en referencia a un elemento o elementos, pretende proporcionar soporte a un aspecto similar o a un aspecto de la invención que “consiste en”, “consiste esencialmente en”, o “comprende sustancialmente” dicho elemento o elementos particulares, a menos que se establezca lo contrario o que entre en clara contradicción con el contexto (p.ej., una composición descrita en la presente memoria como que comprende un elemento particular debería entenderse también que describe una composición que
15 consiste en dicho elemento, a menos que se indique lo contrario o que claramente esté en contradicción con el contexto).
RUTAS SINTÉTICAS
Los compuestos de la presente invención de la fórmula general A presentada anteriormente en la presente memoria, en donde R1 a R6 son como se ha definido anteriormente, pueden prepararse mediante los métodos descritos en
20 los siguientes esquemas de reacción y los siguientes ejemplos. En los métodos descritos, es posible hacer uso de variantes o modificaciones, que son por sí mismas conocidas por los químicos especialistas en la técnica o que podrían ser evidentes para la persona especialista en esta técnica. Adicionalmente, otros métodos para preparar compuestos de la invención serán fácilmente evidentes para el especialista en la técnica a la luz de los siguientes esquemas de reacción y ejemplos.
25 Preparación de los compuestos de la invención
Los productos de la invención se pueden preparar mediante los siguientes métodos generales:
a) Hacer reaccionar un compuesto de fórmula II, o una sal del mismo, con un ácido borónico de fórmula III o un correspondiente éster de ácido borónico en un disolvente adecuado tal como una mezcla de dioxano y agua en presencia de un catalizador adecuado tal como tetrakis(trifenilfosfina)paladio y una base adecuada
30 tal como carbonato de dicesio o carbonato potásico a una temperatura adecuada de entre 60ºC y 150ºC. La calefacción se puede realizar en un sistema microondas.
b) En donde R2 y R3 junto con el átomo al que están unidos para formar un compuesto como el mostrado en la fórmula V, los compuestos de la invención se pueden preparar haciendo reaccionar un compuesto de fórmula IV con TFA y trietilsilano a una temperatura adecuada, tal como 0ºC.
c) En donde el grupo R1 es tal como se muestra en la fórmula VI, los compuestos de la invención se pueden preparar eliminando un grupo protector (PG, del inglés “protecting group”) de un compuesto de fórmula VI. Esto utiliza transformaciones químicas estándar conocidas por el especialista en la técnica. Esto incluye tratar un compuesto de fórmula VI, en el que el PG es COOtBu, con un ácido adecuado tal como cloruro de
Alternativamente, la reacción se puede llevar a cabo haciendo reaccionar un compuesto de fórmula XI con una hidrazida de fórmula XII en un disolvente adecuado tal como DMF en presencia de un agente activante tal como HATU en presencia de una base tal como DIPEA a una temperatura adecuada tal como a temperatura ambiente. El producto de esta reacción puede tener un anillo cerrado por atrapamiento con PPh3, DBU y CCl4 en un disolvente adecuado tal como acetonitrilo a una temperatura adecuada tal como a temperatura ambiente.
Los compuestos de fórmula II o las sales de los mismos en donde C = CH y R1 es un [1,2,3]triazol pueden prepararse mediante reacción de un compuesto de fórmula XIII con azida sódica en un disolvente adecuado tal como una mezcla de butanol y agua a una temperatura adecuada tal como a 80ºC, seguido de la adición de un
10 compuesto de fórmula XV y CuI.
La síntesis de compuestos de fórmula IV, VI y XV se puede llevar a cabo tal como se ha descrito anteriormente para a).
Los compuestos de fórmula III en los que R2 o R3 son (CO)R6 se pueden preparar haciendo reaccionar un
15 compuesto de fórmula XIX con R6H en presencia de un agente activante tal como HATU o EDC junto con HOBT en un disolvente adecuado (p.ej., DMF) a una temperatura adecuada (tal como temperatura ambiente (r.t.)). La reacción puede tener lugar en presencia de una base (p.ej., trietilamina).
Los compuestos de fórmula XXI pueden prepararse haciendo reaccionar un compuesto de fórmula II o una sal del
20 mismo mediante los métodos descritos anteriormente para a). Los compuestos de fórmula XXI pueden hidrolizarse usando una base adecuada tal como LiOH en un disolvente tal como una mezcla de dioxano y agua a una temperatura de entre temperatura ambiente y 100ºC para proporcionar compuestos de fórmula XVII.
Experimental:
Métodos generales: Se registraron espectros de RMN de 1H a 400 MHz en un instrumento de RM Varian 400 a T=298,15 K o a 400 MHz 5 en un instrumento Varian vnmrs. Para la preparación se usaron disolventes deuterados (CDCl3, DMSO-d6, CD3OD).
Se usó tetrametilsilano como patrón de referencia interno. Los valores de los desplazamientos químicos se expresan en valores de ppm respecto al tetrametilsilano, a menos que se indique lo contrario. Método A UPLC-MS Waters Acquity
10 -(gestor de disolventes binario, gestor de recolección, PDA, ELSD, gestor de muestras + organizador, SQD) -Duración 1,15 minutos -Tipo de columna: Acquity UPLC BEH C18 1,7 µm; 2,1 x 50 mm -Temperatura de columna: 60ºC -PDA: 254 nm
15 -Temperatura des-solvatación: 350ºC -Fuente de iones: ESCI +/-Temperatura de fuente: 150ºC -Caudal de make-up: 0,5 mL/min. EtOH -Caudal: 1,2 mL/min
20 -Disolventes:
A: Agua que contiene un 0,1% de ácido fórmico
B: Acetonitrilo que contiene un 5% de agua y un 0,1% de ácido fórmico
Gradiente: Tiempo, minutos %B Curva 0,00 10,0 6 1,00 99,9 6 1,01 10,0 6 1,15 10,0 6
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A una disolución de ácido piridin-2-amino-3-carboxílico (2,05 g, 81,1 mmol) en AcOH (250 mL) se añadió bromo (11,0 mL, 199,2 mmol) a RT. La mezcla de reacción se agitó durante 18 h a RT. Tras completarse la reacción, se evaporó el disolvente completamente a presión reducida, se filtró, se lavó con dietil éter (3 x 75 mL) para dar lugar al compuesto del título en forma de sólido amarillo.
Rendimiento: 50,0 g (92,6%)
RMN de 1H (DMSO-d6, 400 MHz, TMS) δ: 11,7 (3H, br, s), 8,33 (1H, s), 8,20 (1H, s).
5-Bromo-3-(5-ciclopropil-[1,3,4]oxadiazol-2-il)-piridin-2-ilamina:
Se agitó durante 18 h a 65ºC una disolución de ácido 2-amino-5-bromo-nicotínico (300 mg, 1,38 mmol) e hidrazida de ácido ciclopropanocarboxílico (300 mg, 3,0 mmol) en POCl3 (30,0 mL). La mezcla de reacción se destiló a presión reducida para obtener un residuo, que se enfrió a 0 ºC mediante la adición de agua con hielo y neutralizando con una disolución saturada de NaHCO3 (100 mL). La capa acuosa se extrajo con acetato de etilo. La capa de acetato de etilo se separó, se secó sobre Na2SO4 anhidro y se evaporó para dar lugar a 370 mg de 5-bromo-3-(5-ciclopropil[1,3,4]oxadiazol-2-il)-piridin-2-ilamina sin purificar. El compuesto sin purificar se purificó mediante cromatografía en columna usando gel de sílice (con una malla de 100-200). La columna se eluyó con EtOAc al 15% en éter de petróleo para producir el compuesto del título en forma de sólido amarillo pálido, que se usó sin ninguna purificación adicional.
Rendimiento: 300 mg (Rendimiento: 81%)
5-Bromo-3-(5-isopropil-[1,3,4]oxadiazol-2-il)-piridin-2-ilamina:
A una disolución de ácido 2-amino-5-bromo-nicotínico (1,0 g, 4,60 mmol) en POCl3 (20 mL) se le añadió hidrazida de ácido isobutírico (705 mg, 6,912 mmol) a RT. La temperatura de reacción se elevó lentamente hasta 100 ºC y se agitó durante 18 h. Se evaporó el disolvente a presión reducida, el residuo se alcalinizó con una disolución de bicarbonato sódico saturada fría (50 mL), se extrajo con acetato de etilo (3 X 50 mL), la capa orgánica se lavó con salmuera, se secó sobre sulfato sódico anhidro y se concentró a presión reducida. El compuesto sin purificar se purificó mediante cromatografía de columna usando gel de sílice de malla 100-200. La columna se eluyó con EtOAc al 40% en éter de petróleo para producir el compuesto del título en forma de sólido amarillo.
Rendimiento: 650 mg (50%)
RMN de 1H (DMSO-d6, 400 MHz, TMS) δ: 8,28-8,27 (1H, d); 8,18-8,17 (1H, d), 7,45 (2H, br, s), 3,32-3,24 (1H, m), 1,38-1,37 (6H, d).
3-(5-Ciclopropil-[1,3,4]oxadiazol-2-il)-5-(1-metil-1H-indol-5-il)-piridin-2-ilamina:
A una disolución de 5-bromo-3-(5-ciclopropil-[1,3,4]oxadiazol-2-il)-piridin-2-ilamina (500 mg, 1,77 mmol) en dioxano (15,0 mL) y agua (5,0 mL) se añadió K2CO3 (730 mg, 5,31 mmol) y ácido N-metilindol-5-borónico (140 mg, 1,95 mmol) en un tubo sellado. La mezcla de reacción se desgasificó con argón durante 20 minutos, a continuación se
Se añadió trietilamina (5,30 mL, 38,0 mmol), HOBt (3,96 g, 28,5 mmol) y EDC·HCl (5,47 g, 28,5 mmol) a una disolución de ácido (4-yodo-fenil)-acético (5,0 g, 19,0 mmol) en DMF (100 mL) y se agitó. Transcurridos 5 minutos se añadió morfolina (2,0 mL, 22,9 mmol) a RT. La mezcla de reacción se agitó a RT durante 16 h. La mezcla de reacción se vertió en agua con hielo (50 mL) y el sólido obtenido se filtró, se secó para obtener 3,92 g (Rendimiento: 62,1 %) del compuesto del título en forma de sólido blanco.
RMN de 1H (DMSO-d6, 400 MHz, TMS) δ: 7,66-7,64 (2H, d), 7,04-7,02 (2H, d), 3,68 (2H, s), 3,54-3,42 (8H, m).
4-[2-(4-Yodo-fenil)-etil]-morfolina:
10 Se añadió BF3·Et2O (6,43 g, 45,3 mmol) a una disolución de 2-(4-yodo-fenil)-1-morfolin-4-il-etanona (3,0 g, 9,06 mmol) en THF (75 mL) a 0 ºC, se agitó durante 30 minutos, a continuación se añadió NaBH4 (1,72 g, 45,3 mmol) a 0 ºC. La mezcla de reacción se calentó lentamente hasta RT. Transcurridas 16 h la mezcla de reacción se enfrió a 0 ºC, se detuvo la reacción vertiendo agua con hielo, se extrajo con EtOAc (2 x 100 mL). La capa orgánica se lavó con disolución de salmuera (50 mL), se secó sobre Na2SO4 anhidro y se evaporó el disolvente a presión reducida. El
15 compuesto sin purificar se purificó mediante cromatografía en columna usando gel de sílice de malla 100-200, se eluyó con EtOAc al 20-30% en éter de petróleo para dar lugar a 1,56 g (Rendimiento: 54,3%) del compuesto del título en forma de sólido amarillo.
RMN de 1H (DMSO-d6, 400 MHz, TMS) δ: 7,64-7,62 (2H, d), 7,07-7,05 (2H, d), 4,11-4,07 (2H, q), 3,58 (4H, br, s), 2,67 (2H, br, s), 2,46 (4H, br, s).
20 4-{2-[4-(4,4,5,5-Tetrametil-[1,3,2]dioxaborolan-2-il)-fenil]-etil}-morfolina:
A una disolución de 4-[2-(4-yodo-fenil)-etil]-morfolina (250 mg, 0,78 mmol) y 4,4,5,5,4’,4’,5’,5’-octametil[2,2’]bi[[1,3,2]dioxaborlanil] (240 mg, 0,94 mmol) en DMSO (15,0 mL) se añadió KOAc (191 mg, 1,95 mmol) a RT. Se purgó N2 a través de la mezcla de reacción durante 10 minutos. A continuación se añadió Pd(dppf)Cl2·DCM (31,8 25 mg, 0,039 mmol) y a través de la mezcla de reacción se purgó N2 durante 10 minutos y se agitó a 100 ºC durante 16
h. La mezcla de reacción se enfrió a RT, se diluyó con EtOAc (50 mL) y se lavó con agua (50 mL). La capa orgánica se lavó con disolución de salmuera (50 mL), se secó sobre Na2SO4 anhidro y se evaporó el disolvente a presión reducida. El compuesto sin purificar se purificó mediante cromatografía en columna usando gel de sílice de malla
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A una disolución de 5-bromo-3-(1-isopropil-1H-[1,2,3]triazol-4-il)-piridin-2-ilamina (300 mg, 1,06 mmol) y ácido (3metoxi-4-(metoxicarbonil)fenil)borónico (245 mg, 1,16 mmol) en 1,4-dioxano (10,0 mL)/agua (5,0 mL) se añadió Cs2CO3 (1,0 g, 3,18 mmol) a temperatura ambiente. La mezcla de reacción se desgasificó con argón durante 30 minutos. A continuación se añadió Pd(PPh3)4 (61 mg, 0,05 mmol) y se dejó agitar a 120 ºC durante 30 minutos en CEM microondas. La mezcla de reacción se enfrió a RT, se diluyó con EtOAc (50 mL) y se lavó con agua (50 mL). La capa acuosa se neutralizó con HCl 1N, se extrajo con DCM (2 x 50 mL), se lavó con disolución salina (20 mL), se secó sobre Na2SO4 anhidro y se evaporó el disolvente a presión reducida. El compuesto sin purificar se lavó con dietil éter para dar lugar a 260 mg (rendimiento: 69,33%) del compuesto del título en forma de sólido amarillo pálido.
RMN de 1H (DMSO-d6, 400 MHz, TMS) δ: 12,50 (1H, s), 8,93 (1H, s), 8,44-8,43 (1H, d), 8,26-8,25 (1H, d), 7,74-7,72 (1H, d), 7,36-7,29 (2H, m), 7,24 (2H, s), 4,94-4,87 (1H, m), 3,93 (3H, s), 1,58 (3H, s), 1,57 (3H, s).
Condiciones de LCMS:
- Columna
- : BEH C18 (2,1x50mm); 1,7µ
- Fase-M. A
- : TFA al 0,05% en TFA
- Fase-M. B
- : ACN
- T/%B
- : 0/3, 0,3/3, 1/35, 2/98, 3,8/98, 3,9/3, 4/3
- Caudal
- : 0,6 mL/min
- Diluyente
- : ACN+H2O
- Pureza
- : 87,26 %
tR = 1,24 min, m/z = 354,48 [M+H]+
[5-[6-amino-5-(1-isopropiltriazol-4-il)-3-piridil]-2-fluoro-fenil]-morfolino-metanona:
A una disolución de 5-bromo-3-(1-isopropil-1H-[1,2,3]triazol-4-il)-piridin-2-ilamina (200 mg, 0,70 mmol) y ácido (4fluoro-3-(morfolin-4-carbonil)fenil)borónico (197 mg, 0,77 mmol) en 1,4-dioxano (10,0 mL)/agua (5,0 mL) se añadió Cs2CO3 (690 mg, 2,12 mmol) a temperatura ambiente. La mezcla de reacción se desgasificó con argón durante 30 minutos. A continuación se añadió Pd(PPh3)4 (40 mg, 0,035 mmol) y se dejó agitar a 110 ºC durante 30 minutos en CEM microondas. La mezcla de reacción se enfrió a RT, se diluyó con EtOAc (50 mL) y se lavó con agua (50 mL). La capa orgánica se lavó con disolución salina (20 mL), se secó sobre Na2SO4 anhidro y se evaporó el disolvente a presión reducida. El compuesto sin purificar se purificó mediante cromatografía en columna usando gel de sílice de malla 100-200. La columna se eluyó con MeOH al 5% en DCM para producir 210 mg (rendimiento: 72,41%) del compuesto del título en forma de sólido amarillo pálido.
RMN de 1H (DMSO-d6, 400 MHz, TMS) δ: 8,93 (1H, s), 8,34-8,33 (1H, d), 8,21-8,20 (1H, d), 7,84-7,80 (1H, m), 7,737,70 (1H, m), 7,18 (2H, s), 7,39-7,35 (1H, t), 7,16 (2H, s), 4,91-4,88 (1H, m), 3,67 (4H, br), 3,56 (2H, br), 3,28 (2H, br), 1,58 (3H, s), 1,56 (3H, s).
Condiciones de LCMS:
Columna : XBRIDGE-C18 (4,6x75mm); 3,5µ
5
10
15
- Fase-M. A
- : 0,1% de HCOOH (ac.)
- Fase-M. B
- : 0,1% de HCOOH (en ACN)
- T/%B
- : 0/5, 0,5/5, 2/98, 8/98, 8,1/5
- Caudal
- : 1,0 mL/min
- Diluyente
- : ACN+H2O
- Pureza
- : 98,61 %
tR = 1,67 min, m/z = 411,2 [M+H]+
Ácido 4-(6-amino-5-(1-isopropil-1H-1,2,3-triazol-4-il)piridin-3-il)-2-metilbenzoico:
Se añadió Cs2CO3 (1,03 g, 3,18 mmol) a una disolución de 5-bromo-3-(1-isopropil-1H-[1,2,3]triazol-4-il)-piridin-2ilamina (300 mg, 1,06 mmol) y ácido (4-(metoxicarbonil)-3-metilfenil)borónico (247 mg, 1,27 mmol) en dioxano: agua (10 mL: 5 mL), se desgasificó la mezcla de reacción durante 10 minutos con nitrógeno. A continuación se añadió Pd(PPh3)4 (61 mg, 0,053 mmol), se desgasificó la mezcla de reacción durante otros 10 minutos adicionales con nitrógeno, se calentó la mezcla de reacción a 120 ºC en microondas durante 1h. Se añadió LiOH (222 mg, 5,30 mmol) a la mezcla de reacción y se calentó a 100 ºC durante 3 h. A continuación se diluyó con agua (50 mL) y se extrajo con acetato de etilo (2 x 30 mL). La capa acuosa se acidificó con HCl 2 N, se ajustó el pH a 6 y se extrajo con acetato de etilo (2 x 30 mL). Se secó sobre Na2SO4 y se concentró a presión reducida para dar lugar a 210 mg (Rendimiento: 58,65 %) del compuesto del título en forma de sólido blanco.
RMN de 1H (DMSO-d6, 400 MHz, TMS) δ: 8,95 (1H, s), 8,40-8,39 (1H, d), 8,26 (1H, d), 7,89-7,87 (1H, d), 7,63-7,60 (2H, m), 7,22 (2H, br, s), 4,94-4,87 (1H, m), 2,60 (3H, s), 1,58-1,56 (6H, d, J = 6,8 Hz).
Condiciones de LCMS:
- Columna
- : BEH C18 (2,1x50mm); 1,7µ
- Fase-M. A
- : 0,1% de HCOOH en H2O
- Fase-M. B
- : ACN
- T/%B
- : 0,0/3, 0,2/3, 1/35, 2/98, 3,85/98, 3,9/3, 4/3
- Caudal
- : 0,6 mL/min
- Diluyente
- : ACN+H2O
- Pureza
- : 95,76 %
tR = 1,17 min, m/z = 338,2 [M+H]+
Compuestos de la invención
1: 5-(1H-Indol-5-il)-3-(5-isopropil-[1,3,4]oxadiazol-2-il)-piridin-2-ilamina:
A una disolución de 5-bromo-3-(5-isopropil-[1,3,4]oxadiazol-2-il)-piridin-2-ilamina (250 mg, 0,883 mmol) en dioxano (15 mL) y agua (7 mL) se añadió K2CO3 (365 mg, 2,649 mmol), ácido indol-5-borónico (156 mg, 0,971 mmol) en un tubo sellado. La mezcla de reacción se desgasificó mediante N2 durante 20 minutos, después se añadió Pd(PPh3)4 (102 mg, 0,088 mmol) y se agitó durante 18 h a 100 ºC. Se añadió agua (20 mL) y se extrajo con acetato de etilo (3
A una disolución de 5-(3-metoxifenil)-3-[5-(4-piperidil)-1,3,4-oxadiazol-2-il]piridin-2-amina (150 mg, 0,42 mmol) en THF (20 mL) se añadió NaH al 60% (25,0 mg, 0,64 mmol) a 0 ºC y la mezcla de reacción se agitó a 0 ºC durante 10 minutos. A continuación se añadió MeI (54,5 mg, 0,38 mmol) a 0 ºC y se agitó la mezcla de reacción a 0 ºC durante
5 2 h. La mezcla de reacción se vertió en agua con hielo (30 mL), se extrajo con acetato de etilo (3 X 20 mL), la capa orgánica se lavó con salmuera, se secó sobre sulfato sódico anhidro y se concentró a presión reducida. El producto sin purificar se purificó mediante TLC preparativa para dar lugar al compuesto del título en forma de sólido amarillo.
Rendimiento: 30 mg (Rendimiento: 19,3 %)
RMN de 1H (DMSO-d6, 400 MHz, TMS) δ: 8,59-8,58 (1H, d), 8,27-8,26 (1H, d), 7,42-7,36 (3H, m), 7,24-7,20 (2H, m),
10 6,94-6,91 (1H, dd), 3,83 (3H, s), 3,45-3,36 (3H, m), 3,11-2,96 (2H, m), 2,70 (3H, s), 2,35-2,28 (2H, m), 2,16-1,98 (2H, m).
LC-MS: m/z = 366,1 (MH+), tR = 0,35, método A.
9: 3-(1-Isopropil-1H-[1,2,3]triazol-4-il)-5-(1-metil-1H-indol-5-il)-piridin-2-ilamina:
15 A una disolución de 5-bromo-3-(1-isopropil-1H-[1,2,3]triazol-4-il)-piridin-2-ilamina (200 mg, 0,708 mmol) y ácido Nmetilindol-5-borónico (124 mg, 0,708 mmol) en 1,4-dioxano (6,0 mL)/agua (3,0 mL) se añadió K2CO3 (293 mg, 2,126 mmol) a temperatura ambiente. La mezcla de reacción se purgó con argón durante 30 minutos. A continuación se añadió Pd(PPh3)4 (41 mg, 0,035 mmol) y la mezcla se dejó agitar a 100 ºC durante 16 h. La mezcla de reacción se enfrió a RT, se diluyó con EtOAc (20 mL) y se lavó con agua (20 mL). La capa orgánica se lavó con disolución salina
20 (20 mL), se secó sobre Na2SO4 anhidro y se evaporó el disolvente a presión reducida para dar lugar al compuesto sin purificar. El compuesto sin purificar se purificó mediante cromatografía en columna usando gel de sílice de malla 100-200. La columna se eluyó con EtOAc al 80% en éter de petróleo para dar lugar al compuesto del título en forma de sólido amarillo pálido.
Rendimiento: 160 mg (69,5 %).
25 RMN de 1H (DMSO-d6, 400 MHz, TMS) δ: 8,96 (1H, s), 8,31-8,30 (1H, d), 8,21-8,20 (1H, d), 7,82 (1H, s), 7,51-7,45 (2H, m), 7,34-7,33 (1H, d), 6,96 (2H, br), 6,46-6,45 (1H, d), 4,94-4,85 (1H, m), 1,58 (3H, s), 1,56 (3H, s).
LC-MS: m/z = 333,15 (MH+), tR = 0,57, método A.
10: 3-(1-Isopropil-1H-[1,2,3]triazol-4-il)-5-(1-metil-2,3-dihidro-1H-indol-5-il)-piridin-2-ilamina:
5
10
20
25
A una disolución de 5-bromo-3-(1-isopropil-1H-[1,2,3]triazol-4-il)-piridin-2-ilamina (500 mg, 1,77 mmol) y 4-[4(4,4,5,5-tetrametil-[1,3,2]dioxaborolan-2-il)-bencil]-morfolina (537 mg, 1,77 mmol) en etilen gliclol dimetil éter (6,0 mL)/agua (4,0 mL) se añadió Cs2CO3 (1,15 g, 3,54 mmol) a temperatura ambiente. La mezcla de reacción se purgó con argón durante 30 minutos. A continuación se añadió Pd(dppf)Cl2·DCM (72,2 mg, 0,08 mmol) y se dejó agitar a 140 ºC durante 6h en microondas. Transcurridas 6 h, la mezcla de reacción se enfrió a RT, se diluyó con EtOAc (50 mL) y se lavó con agua (50 mL). La capa orgánica se lavó con disolución salina (50 mL), se secó sobre Na2SO4 anhidro y el disolvente se evaporó a presión reducida para dar lugar al producto sin purificar. El compuesto sin purificar se purificó mediante cromatografía en columna usando gel de sílice de malla 100-200. La columna se eluyó con MeOH al 5-95% en DCM para dar lugar al compuesto del título en forma de sólido marrón.
Rendimiento: 72 mg (10,7%)
RMN de 1H (DMSO-d6, 400 MHz, TMS) δ: 8,94 (1H, s), 8,31 (1H, s), 8,20 (1H, d), 7,65-7,63 (2H, d), 7,38-7,36 (2H, d), 7,10 (2H, br s), 4,93-4,86 (1H, m), 3,58 (4H, s), 3,49 (2H, s), 2,37 (4H, m), 1,57-1,56 (6H, d).
LC-MS: m/z = 379,1 (MH+), tR = 0,3, método A.
13: 3-(1-Isopropil-1H-[1,2,3]triazol-4-il)-5-(4-morfolin-4-il-fenil)-piridin-2-ilamina:
A una disolución de 5-bromo-3-(1-isopropil-1H-[1,2,3]triazol-4-il)-piridin-2-ilamina (100 mg, 0,35 mmol) y 4-[4(4,4,5,5-tetrametil-[1,3,2]dioxaborolan-2-il)-fenil]-morforlina (88 mg, 0,42 mmol) en 1,4-dioxano (7,0 mL)/agua (3,0 mL) se añadió Cs2CO3 (227 mg, 0,70 mmol) a temperatura ambiente. La mezcla de reacción se purgó con argón durante 30 minutos. A continuación se añadió Pd(PPh3)4 (20,2 mg, 0,017 mmol) y se dejó agitando a 100 ºC durante 16 h. La mezcla de reacción se enfrió a RT, se diluyó con EtOAc (50 mL) y se lavó con agua (50 mL). La capa orgánica se lavó con disolución salina (50 mL), se secó sobre Na2SO4 anhidro y el disolvente se evaporó a presión reducida para dar lugar al compuesto sin purificar. El compuesto sin purificar se purificó mediante cromatografía en columna usando gel de sílice de malla 100-200. El compuesto se eluyó con MeOH al 3-97% en DCM para dar lugar al compuesto del título en forma de sólido amarillo.
Rendimiento: 45 mg (34,8%)
RMN de 1H (DMSO-d6, 400 MHz, TMS) δ: 8,92 (1H, s), 8,25 (1H, d), 8,13 (1H, d), 7,57-7,54 (2H, d), 7,02-7,00 (2H, d), 6,97 (2H, br s), 4,92-4,85 (1H, m), 3,77-3,74 (4H, t), 3,15-3,12 (4H, t), 1,57-1,56 (6H, d).
LC-MS: m/z = 365,2 (MH+), tR = 0,47, método A.
14: 3-(1-Isopropil-1H-[1,2,3]triazol-4-il)-5-[4-(2-morfolin-4-il-etil)-fenil]-piridin-2-ilamina:
A una disolución de 4-{2-[4-(4,4,5,5-tetrametil-[1,3,2]dioxaborolan-2-il)-fenil]-etil}-morfolina (se puede preparar como se describe en la patente US2002026052) (101 mg, 0,31 mmol) y 5-bromo-3-(1-isopropil-1H-[1,2,3]triazol-4-il)-piridin2-ilamina (90 mg, 0,31 mmol) en 1,4-dioxano (7,0 mL)/agua (3,0 mL) se añadió Cs2CO3 (251 mg, 0,70 mmol) a RT. Se purgó N2 a través de la mezcla de reacción durante 10 minutos. Se añadió Pd(PPh3)4 (18 mg, 0,015 mmol) y se purgó N2 a través de la mezcla de reacción durante 10 minutos y se agitó a 100 ºC durante 16 h. La mezcla de reacción se enfrió a RT, se diluyó con EtOAc (50 mL) y se lavó con agua (50 mL). La capa orgánica se lavó con disolución salina (50 mL), se secó sobre Na2SO4 anhidro y el disolvente se evaporó a presión reducida para dar lugar al compuesto sin purificar (GVK-B1319-120A1). El compuesto sin purificar se purificó mediante cromatografía en columna usando gel de sílice de malla 100-200 y se eluyó con MeOH al 2-3% en DCM para dar lugar a 65 mg de
A una disolución de [5-[6-amino-5-(1-isopropiltriazol-4-il)-3-piridil]-2-fluoro-fenil]-morfolino-metanona (150 mg, 0,365 mmol) en THF (10,0 mL) se añadió BF3·Et2O (0,25 mL, 1,827 mmol) a 0 ºC y se agitó durante 30 minutos. Transcurridos 30 minutos, se añadió NaBH4 (69 mg, 1,827 mmol) a 0 ºC y se agitó a temperatura ambiente durante
5 18 h. Tras enfriar a 0 ºC, se detuvo la reacción con MeOH (2 mL) y se calentó a reflujo durante 6 h. La mezcla de reacción se diluyó con EtOAc (20 mL), se lavó con agua (20 mL), se secó sobre Na2SO4 anhidro y el disolvente se evaporó a presión reducida. El compuesto sin purificar se purificó mediante cromatografía en columna usando gel de sílice de malla 100-200. La columna se eluyó con MeOH al 5% en DCM para dar lugar a 60 mg (rendimiento: 41,66%) del compuesto del título en forma de sólido blanco.
10 RMN de 1H (DMSO-d6, 400 MHz, TMS) δ: 8,90 (1H, s), 8,278-8,273 (1H, d), 8,16-8,15 (1H, d), 7,66-7,62 (2H, m), 7,28-7,23 (1H, t), 7,09 (2H, s), 4,91-4,88 (1H, m), 3,57 (6H, br), 2,42 (4H, br), 1,58 (3H, s), 1,56 (3H, s).
LC-MS: m/z = 397,1 (MH+), tR = 0,33, método A.
20: [4-[6-amino-5-(1-isopropiltriazol-4-il)-3-piridil]-2-metil-fenil]-morfolino-metanona:
15 Se añadió HATU (336 mg, 0,88 mmol) y DIPEA (0,30 mL, 1,77 mmol) a una disolución de ácido 4-(6-amino-5-(1isopropil-1H-1,2,3-triazol-4-il)piridin-3-il)-2-metilbenzoico (200 mg, 0,59 mmol) en DMF (10,0 mL) a temperatura ambiente, transcurridos 5 minutos se añadió morfolina (0,06 mL, 0,71 mmol), se agitó a RT durante 18 h. La mezcla de reacción se vertió en agua con hielo, se extrajo con EtOAc (2 x 50 mL). La capa orgánica se lavó con disolución salina (20 mL), se secó sobre Na2SO4 y el disolvente se evaporó a presión reducida. El producto sin purificar se
20 purificó lavando con éter para dar lugar a 148 mg (Rendimiento: 61,4 %) del compuesto del título en forma de sólido blanco.
RMN de 1H (DMSO-d6, 400 MHz, TMS) δ: 8,94 (1H, s), 8,34-8,33 (1H, d), 8,22-8,21 (1H, d), 7,60 (1H, s), 7,57-7,55 (1H, d), 7,25-7,23 (1H, d, J = 8,0 Hz), 7,14 (2H, br, s), 4,93-4,86 (1H, m), 3,66 (4H, s), 3,51 (2H, br, s), 3,18 (2H, br, s), 2,30 (3H, s), 1,58-1,56 (6H, d, J = 6,8 Hz).
25 LC-MS: m/z = 407,1 (MH+), tR = 0,42, método A.
21: 3-(1-Isopropiltriazol-4-il)-5-[3-metil-4-(morfolinometil)fenil]piridin-2-amina:
5
10
15
20
25
Se añadió BH3·DMS en THF (2M) (1,17 mL, 2,34 mmol) a una disolución de [4-[6-amino-5-(1-isopropiltriazol-4-il)-3piridil]-2-cloro-fenil]-morfolino-metanona (200 mg, 0,46 mmol) en THF (10,0 mL) a 0 ºC, a continuación la mezcla se calentó a 70 ºC durante 4 h. La mezcla de reacción se enfrió a 0 ºC, se añadió MeOH (5,0 mL) a la mezcla de reacción, se calentó a 70 ºC durante 6 h. La mezcla de reacción se diluyó con agua (50 mL) y se extrajo con acetato de etilo (2x 30 mL). Las capas orgánicas combinadas se secaron sobre Na2SO4 y se concentraron a presión reducida. El producto sin purificar se purificó mediante columna de sílice (malla de 100-200) eluído con MeOH al 2% en DCM para dar lugar a 131 mg (Rendimiento: 67,7 %) del compuesto del título en forma de sólido blanco.
RMN de 1H (DMSO-d6, 400 MHz, TMS) δ: 8,94 (1H, s), 8,35-8,34 (1H, d), 8,22 (1H, d), 7,76 (1H, d), 7,66-7,64 (1H, dd), 7,54-7,52 (1H, d), 7,18 (2H, br, s), 4,93-4,86 (1H, m), 3,59 (6H, s), 2,44 (4H, s), 1,58-1,56 (6H, d).
Condiciones de LCMS:
- Columna
- : BEH C18 (2,1x50mm); 1,7µ
- Fase-M. A
- : Acetato de Amonio 5 mM en H2O
- Fase-M. B
- : ACN
- T/%B
- : 0/03, 1,5/45, 2,5/45, 3,2/95, 4,7/95, 5/03
- Caudal
- : 0,4 mL/min
- Diluyente
- : MeOH
- Pureza
- : 95,01 %
tR = 2,90 min, m/z = 413,2 [M+H]+
24: 3-(1-Isopropiltriazol-4-il)-5-[3-(morfolinometil)fenil]piridin-2-amina:
Se añadió Cs2CO3 (858 mg, 2,64 mmol) a una disolución de ácido (3-(morfolinometil)fenil)borónico (250 mg, 0,88 mmol) y 5-bromo-3-(1-isopropil-1H-[1,2,3]triazol-4-il)-piridin-2-ilamina (215 mg, 0,97 mmol) en dioxano: agua (8 mL: 4 mL) se desgasificó la mezcla de reacción durante 10 minutos con nitrógeno. A continuación se añadió Pd(PPh3)4 (50 mg, 0,044 mmol), se desgasificó la mezcla de reacción durante otros 10 minutos con nitrógeno, la mezcla de reacción se calentó a 120 ºC en microondas durante 1 h. La mezcla de reacción se diluyó con agua (50 mL) y se extrajo con acetato de etilo (2x 30 mL). Las capas orgánicas combinadas se secaron sobre Na2SO4 y se concentraron a presión reducida. El producto sin purificar se purificó mediante columna de sílice (malla de 100-200) eluído con acetato de etilo al 80-90% en éter de petróleo para dar lugar a 195 mg (Rendimiento: 58,13 %) del compuesto del título en forma de sólido amarillo pálido. El producto se convirtió en su sal de HCl usando HCl en éter (2M) para dar lugar a 202 mg en forma de sólido amarillo pálido.
RMN de 1H (DMSO-d6, 400 MHz, TMS) δ: 11,60 (1H, br, s), 9,51 (1H, s), 9,04 (1H, s), 8,54 (3H, br, s), 8,37 (1H, s), 7,89-7,88 (1H, d), 7,60-7,52 (2H, m), 4,99-4,92 (1H, m), 4,44 (2H, s), 3,93 (4H, s), 3,23 (2H, s), 3,16 (2H, br, s), 1,601,58 (6H, d).
LC-MS: m/z = 379,5 (MH+), tR = 0,36, método A.
25: [3-[6-Amino-5-(1-isopropiltriazol-4-il)-3-piridil]fenil]-morfolino-metanona:
5
10
20
25
30
A una disolución de 5-bromo-3-(5-ciclopropil-[1,3,4]oxadiazol-2-il)-piridin-2-ilamina (400 mg; 1,42 mmol) en dioxano (10 mL) y agua (6 mL) se añadió K2CO3 (587 mg; 4,26 mmol), ácido (3-(morfolinometil)fenil)borónico (348 mg; 1,56 mmol) en un tubo sellado. La mezcla de reacción se desgasificó con argón durante 30 minutos, a continuación se añadió Pd(PPh3)4 (82,0 mg; 0,07 mmol) a la mezcla de reacción. La mezcla de reacción se agitó durante 18 h a 100 ºC. La mezcla de reacción se diluyó con agua (50 mL), se extrajo con acetato de etilo (2 X 50 mL) y la capa orgánica se lavó con salmuera, se secó sobre sulfato sódico anhidro y se concentró a presión reducida. El compuesto sin purificar se purificó mediante cromatografía en columna usando gel de sílice de malla 100-200 y se eluyó con acetato de etilo al 100 %, y se purificó adicionalmente mediante lavado con cloroformo al 30 % en hexano para dar lugar a 90 mg (Rendimiento: 16,7 %) del compuesto del título, en forma de un sólido de color amarillo.
RMN de 1H (DMSO-d6, 400 MHz, TMS) δ: 8,52-8,51 (1H, d), 8,20-8,19 (1H, d), 7,58-7,54 (2H, m), 7,43-7,39 (1H, t), 7,35 (2H, s), 7,31-7,28 (1H, d), 3,59-3,54 (6H, m), 2,40-2,30 (5H, m), 1,20-1,15 (4H, m).
- Condiciones de LCMS:
- Columna
- : BEH C18 (2,1x50 mm); 1,7 µ
- Fase-M. A
- : NH4OAc 5 mM en H2O
- Fase-M. B
- : ACN
- T/%B
- : 0/03, 1,5/45, 2,5/45, 3,2/95, 4,7/95, 5/03
- Caudal
- : 0,4 mL/min
- Diluyente
- : MeOH
- Temp. Tubo de deriva
- : 55 ºC
- Presión gas
- : 2,07 bar (30 psi)
- Temp. nebulizador
- : 65%
- Ganancia
- : 500
- Pureza
- : 97,21 %
tR = 2,10 min, m/z = 378,2 [M+H]+
30: 2-[4-[6-Amino-5-(1-isopropiltriazol-4-il)-3-piridil]fenil]-1-morfolino-etanona:
A una disolución de 1-morfolin-4-il-2-[4-(4,4,5,5-tetrametil-[1,3,2]dioxaborolan-2-il)-fenil]-etanona (129 mg, 0,39 mmol) y 5-bromo-3-(1-isopropil-1H-[1,2,3]triazol-4-il)-piridin-2-ilamina (100 mg, 0,35 mmol) en 1,4-dioxano (6,0 mL)/agua (4,0 mL) se añadió Cs2CO3 (284 mg, 0,87 mmol) a temperatura ambiente. Se purgó N2 a través de la mezcla de reacción durante 10 minutos. Se añadió Pd(PPh3)4 (20 mg, 0,017 mmol) y a través de la mezcla de reacción se purgó N2 durante 10 minutos y se agitó a 100 ºC durante 16 h. La mezcla de reacción se enfrió a RT, se diluyó con EtOAc (50 mL) y se lavó con agua (50 mL). La capa orgánica se lavó con disolución salina (50 mL), se secó sobre Na2SO4 anhidro y se evaporó el disolvente a presión reducida. El compuesto sin purificar mediante cromatografía en columna usando gel de sílice de malla 100-200 y se eluyó con MeOH al 2-3% en DCM para dar lugar a 40 mg (rendimiento: 27,7%) del compuesto del título en forma de semisólido marrón. El producto se convirtió en su sal de HCl usando HCl 2M en éter para producir 42 mg de un sólido blanquecino.
RMN de 1H (DMSO-d6, 400 MHz, TMS) δ: 9,20 (1H, s), 8,71-8,70 (1H, d), 8,40-8,39 (1H, d), 7,73-7,71 (2H, d), 7,387,36 (2H, d), 4,99-4,92 (1H, m), 3,79 (2H, s), 3,56-3,45 (8H, m), 1,59-1,58 (6H, d).
LC-MS: m/z = 407,1 (MH+), tR = 0,42, método A.
Ensayo de actividad de quinasa de LRRK2 natural y G2019S.
La actividad de quinasa de LRRK2 se mide usando un ensayo de actividad de quinasa LanthaScreen disponible en Invitrogen (Life Technologies Corporation). El ensayo es un ensayo de transferencia de energía de resonancia fluorescente resuelto en el tiempo (TR-FRET) homogéneo que mide la fosforilación de un sustrato de péptido marcado con fluoresceína (fluoresceína-LRRKtide, Fluoresceína-GAGRLGRDKYKTLROIRO) (SEQ ID NO 1) como
- Ejemplo nº:
- LRRK2 G2019S LRRK2 WT
- IC50 (nM)
- IC50 (nM)
- 19
- 880 1000
- 20
- 110 99
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