ES2343884T3 - NEW BACTERIAL FITASAS AND PROCEDURE FOR PREPARATION OF SUCH FITASAS. - Google Patents
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Abstract
Polinucleótido aislado que codifica para una fitasa, caracterizado porque se selecciona de entre el grupo constituido por: (a) un polinucleótido aislado que codifica para la fitasa descrita por el identificador de secuencia SEC ID nº 2 (b) un polinucleótido aislado que se hibrida al polinucleótido según (a) en unas condiciones astringentes (c) un polinucleótido aislado que presenta por lo menos 70% de identidad con el polinucleótido según (a) presentando dicha fitasa un pH óptimo de actividad inferior o igual a 4.Isolated polynucleotide encoding a phytase, characterized in that it is selected from the group consisting of: (a) an isolated polynucleotide encoding the phytase described by the sequence identifier SEQ ID No. 2 (b) an isolated polynucleotide that hybridizes to polynucleotide according to (a) under astringent conditions (c) an isolated polynucleotide having at least 70% identity with the polynucleotide according to (a) said phytase having an optimum pH of activity less than or equal to 4.
Description
Nuevas fitasas bacterianas y procedimiento de preparación de dichas fitasas.New bacterial phytases and procedure preparation of said phytases.
La presente invención se refiere a nuevas fitasas de origen bacteriano, así como a sus procedimientos de preparación respectivos. La presente invención se refiere más particularmente a nuevas fitasas procedentes de bacterias del género Acidocella, así como a los polinucleótidos que codifican para estas fitasas. La invención se refiere asimismo a unos vectores que contienen estos polinucleótidos, y a unos organismos hospedantes transformados que expresan dichas fitasas en sus tejidos. La invención se refiere asimismo a nuevos extractos bacterianos que comprenden por lo menos una actividad fitasa.The present invention relates to new phytases of bacterial origin, as well as their respective preparation procedures. The present invention relates more particularly to new phytases from bacteria of the genus Acidocella , as well as to the polynucleotides encoding these phytases. The invention also relates to vectors containing these polynucleotides, and to transformed host organisms that express said phytases in their tissues. The invention also relates to new bacterial extracts comprising at least one phytase activity.
En particular, los extractos bacterianos y las
fitasas de la presente invención están particularmente adaptados a
su utilización en unas composiciones alimenticias destinadas a la
alimentación animal. Esta adaptación está relacionada con sus
propiedades, en particular su actividad en unas condiciones de
temperatura y de pH que corresponden a las condiciones de
preparación de dichas composiciones así como las encontradas en el
sistema digestivo de los
animales.In particular, the bacterial extracts and phytases of the present invention are particularly adapted to their use in food compositions intended for animal feed. This adaptation is related to its properties, in particular its activity under conditions of temperature and pH corresponding to the conditions of preparation of said compositions as well as those found in the digestive system of
animals.
El fósforo es un elemento esencial para la vida de todos los organismos. En particular, es primordial para los criadores de animales de granja asegurarse que sus animales ingieren una cantidad suficiente para optimizar su crecimiento y su desarrollo. La mayoría de los animales de granja son alimentados con unas composiciones alimenticias a base de vegetales. Estos vegetales contienen grandes cantidades de fosfato que almacenan en sus tejidos en forma de un compuesto de reserva, el ácido fítico. Como media, el ácido fítico contiene de 50 a 70% del fósforo presente en las plantas. El ácido fítico está naturalmente movilizado y el fosfato que contiene se libera en la mayoría de los animales de granja, en particular los rumiantes. Sin embargo, el ácido fítico no es metabolizado por los animales monogástricos tales como el cerdo y las aves de corral. En estos animales, el ácido fítico contenido en su ración alimenticia es por lo tanto evacuado con los excrementos, y el criador debe completar dicha ración con fosfato inorgánico con el fin de que sus animales ingieran una cantidad suficiente de fósforo. Esta estrategia genera un sobrecoste para el criador y una contaminación procedente de la emisión en el medioambiente del ácido fítico no asimilado. Esta contaminación es aún más importante en las zonas de cría intensa.Phosphorus is an essential element for life of all organisms. In particular, it is essential for farm animal breeders make sure their animals ingest a sufficient quantity to optimize its growth and its developing. Most farm animals are fed with food compositions based on vegetables. These Vegetables contain large amounts of phosphate that store in its tissues in the form of a reserve compound, phytic acid. On average, phytic acid contains 50 to 70% of phosphorus present in plants. Phytic acid is naturally mobilized and the phosphate it contains is released in most of the farm animals, particularly ruminants. However the phytic acid is not metabolized by monogastric animals such as pig and poultry. In these animals, the phytic acid contained in your food ration is therefore evacuated with excrement, and the breeder must complete said ration with inorganic phosphate so that your animals ingest a sufficient amount of phosphorus. This strategy generates an extra cost for the breeder and pollution from the emission into the environment of the non-assimilated phytic acid. This Pollution is even more important in breeding areas intense
El ácido fítico es conocido asimismo por ser un quelante de elementos nutritivos importantes contenidos en la ración alimenticia, como, por ejemplo, el magnesio, el calcio, el zinc o el hierro. Esta propiedad conduce a una disminución de la calidad nutritiva de la ración alimenticia que da al ácido fítico la propiedad de agente anti-nutricional.Phytic acid is also known to be a chelator of important nutritional elements contained in the food ration, such as magnesium, calcium, zinc or iron This property leads to a decrease in nutritional quality of the food ration that gives phytic acid the property of anti-nutritional agent.
Con el fin de responder a los diferentes inconvenientes relacionados con la ausencia de asimilación del ácido fítico por los animales monogástricos, se ha previsto introducir una enzima, la fitasa, en la ración alimenticia de estos animales de cría. La fitasa hidroliza el ácido fítico liberando inositol y fosfato inorgánico. Unas fitasas y los genes que codifican estas fitasas han sido aislados a partir de numerosos organismos. Las fitasas han sido mayoritariamente aisladas a partir de hongos (Howson y Davis, 1983, Enzyme Microb. Technol. 5, 377-382; Wyss et al., 1999, Appl. Environ. Microbiol., 65(2), 359-366). Entre los hongos que producen una fitasa, se pueden citar los hongos del género Aspergillus, en particular A. ficuum (Ullah y Gibson, 1987, Preparative Biochemistry 17(1), 63-91; Ullah y Dischinger, 1993, Biochem. Biophys. Res. Commun., 192(2), 747-753), A. terreus (Mitchell et al., 1997, Microbiology, 143 (Pt 1), 245-252), A. niger (Dvorakova et al., 1997, Folia Microbiol (Praha), 42(4), 349-352), A. fumigatus (Pasamontes et al., 1997, Appl. Environ. Microbiol., 63(5), 1696-1700), del género Penicillium, en particular P. caseicolum, del género Myceliophtora, en particular M. thermophila (Mitchell et al., 1997, Microbiology, 143 (Pt 1), 245-252), del género Talaromyces, en particular T. thermophilus, del género Neurospora, en particular N. crassa y N. sitophila, del género Thermomyces, en particular T. lanuginosus (Berka et al., 1998, Appl Environ Microbiol. 64(11), 4423-4427), o del género Monascus, en particular M. anka. Asimismo, se han encontrado unas fitasas en unas bacterias. A título de ejemplo, se pueden citar las bacterias de los géneros Bacillus, en particular B. subtilis (Powar y Jagannathan, 1982, J. Bacteriol. 151(3), 102-1108; Shimizu, 1992, Biosci. Biotech. Biocem. 56(8), 1266-1269; Keruvo et al., 1998, Appl. Environ. Microbiol. 64 (6), 2079-2085), Pseudomonas (Cosgrove, 1970, Austral. J. Biol. Sci. 23, 1207-1220), Escherichia, en particular E. coli (Golovan et al., 2000, Can. J. Microbiol. 46, 59-71), Enterobacter (Yoon et al., 1996, Enzyme and microbiol. Technol; 18, 449-454), o Streptomyces. Se han aislado asimismo unas fitasas de levaduras (Dvorakova, 1998, Folia Microbiol. 43(4), 323-338), como las de las levaduras Schwaniiomyces occidentalis y Saccharomyces cerevisiae. Por último, se han encontrado unas fitasas en las plantas, en particular en la soja (Ullah y Gibson, 1988, Arch. Biochem. Biophys., 260(2), 514-20), en el maíz (Maugenest et al., 1997, Biochem J., 322 (Pt 2), 511-7); Maugenest et al., 1999, Plant Mol. Biol., 39(3), 503-14), o en Arabidopsis (Mullaney y Ullah, 1998, Biochem. Biophys. Res. Commun., 251(1), 252-5).In order to respond to the different inconveniences related to the absence of assimilation of phytic acid by monogastric animals, it is planned to introduce an enzyme, phytase, into the food ration of these breeding animals. Phytase hydrolyzes the phytic acid releasing inositol and inorganic phosphate. Phytases and the genes encoding these phytases have been isolated from numerous organisms. Phytases have been mostly isolated from fungi (Howson and Davis, 1983, Enzyme Microb. Technol. 5, 377-382; Wyss et al ., 1999, Appl. Environ. Microbiol., 65 (2), 359-366 ). Among the fungi that produce a phytase, fungi of the genus Aspergillus , in particular A. ficuum (Ullah and Gibson, 1987, Preparative Biochemistry 17 (1), 63-91; Ullah and Dischinger, 1993, Biochem. Biophys. Res. Commun., 192 (2), 747-753), A. terreus (Mitchell et al ., 1997, Microbiology, 143 (Pt 1), 245-252), A. niger (Dvorakova et al ., 1997, Folia Microbiol (Praha), 42 (4), 349-352), A. fumigatus (Pasamontes et al ., 1997, Appl. Environ. Microbiol., 63 (5), 1696-1700), of the genus Penicillium , in particular P. caseicolum , of the genus Myceliophtora , in particular M. thermophila (Mitchell et al ., 1997, Microbiology, 143 (Pt 1), 245-252), of the genus Talaromyces , in particular T. thermophilus , of the genus Neurospora , in particular N. crassa and N. sitophila , of the genus Thermomyces , in particular T. lanuginosus (Berka et al ., 1998, Appl Environ Microbiol. 64 (11), 4423-4427), or of the genus Monascus , in particular M. anka . Also, some phytases have been found in bacteria. By way of example, the bacteria of the Bacillus genera, in particular B. subtilis (Powar and Jagannathan, 1982, J. Bacteriol. 151 (3), 102-1108; Shimizu, 1992, Biosci. Biotech. Biocem. 56 (8), 1266-1269; Keruvo et al ., 1998, Appl. Environ. Microbiol. 64 (6), 2079-2085), Pseudomonas (Cosgrove, 1970, Austral. J. Biol. Sci. 23, 1207- 1220), Escherichia , in particular E. coli (Golovan et al ., 2000, Can. J. Microbiol. 46, 59-71), Enterobacter (Yoon et al ., 1996, Enzyme and microbiol. Technol; 18, 449- 454), or Streptomyces . Yeast phytases have also been isolated (Dvorakova, 1998, Folia Microbiol. 43 (4), 323-338), such as those of Schwaniiomyces occidentalis and Saccharomyces cerevisiae yeasts. Finally, some phytases have been found in plants, particularly in soybeans (Ullah and Gibson, 1988, Arch. Biochem. Biophys., 260 (2), 514-20), in maize (Maugenest et al ., 1997, Biochem J., 322 (Pt 2), 511-7); Maugenest et al ., 1999, Plant Mol. Biol., 39 (3), 503-14), or in Arabidopsis (Mullaney and Ullah, 1998, Biochem. Biophys. Res. Commun., 251 (1), 252-5).
Entre las propiedades que permiten caracterizar las fitasas, se encuentra la constante de Michaelis (Km) frente al ácido fítico, el pH óptimo y la temperatura óptima de actividad, así como la estabilidad de esta actividad a pH y temperaturas determinados. Unos datos relativos a la estructura de las fitasas pueden ser útiles asimismo, tales como el peso molecular (PM), el punto isoeléctrico (pl), o la secuencia peptídica. Para que se puedan utilizar en la alimentación animal, las fitasas deben poseer unas propiedades compatibles con los tratamientos que sufren los alimentos destinados a esta alimentación. En particular, la actividad de las fitasas utilizadas debe mantenerse y si es posible, ser óptima en las condiciones de temperatura y de pH de los procedimientos de preparación de estos alimentos así como en las presentes en el tracto digestivo de los animales que ingieren estos alimentos. Estas obligaciones conducen principalmente a buscar unas fitasas cuya actividad resiste a unas condiciones de temperatura elevada, tales como las utilizadas en los procedimientos de preparación de las composiciones alimenticias, y a unas condiciones de pH ácido, tales como las presentes en el tracto digestivo de los animales de cría.Among the properties that allow characterization the phytases, is the constant of Michaelis (Km) in front of the phytic acid, the optimal pH and the optimal activity temperature, as well as the stability of this activity at pH and temperatures determined. Data related to the structure of phytases they may also be useful, such as molecular weight (PM), isoelectric point (pl), or the peptide sequence. So that can use in animal feed, phytases must possess properties compatible with the treatments suffered by Food intended for this diet. In particular, the activity of the phytases used should be maintained and if it is possible, be optimal in the temperature and pH conditions of the procedures for preparing these foods as well as in present in the digestive tract of animals that ingest these foods. These obligations lead mainly to seek phytases whose activity resists temperature conditions high, such as those used in the procedures of preparation of food compositions, and under conditions of acidic pH, such as those present in the digestive tract of breeding animals
Con el fin de responder a estos criterios, se han buscado unas fitasas en unos organismos, en particular unos microorganismos, que se desarrollan en unos medios cuyas condiciones de temperatura y de pH corresponden a estos criterios. Esta estrategia ha permitido aislar unas fitasas resistentes a unas temperaturas elevadas, tales como, por ejemplo, las descritas en las solicitudes de patente WO 97/305016 o EP 0 684 313, pero también unas fitasas que poseen un bajo Km, tales como, por ejemplo las descritas en la solicitud de patente EP 0 960 934. Otra estrategia consistió en modificar artificialmente la secuencia de fitasas conocidas mediante mutagénesis dirigida con el fin de conferirle unas propiedades interesantes. Esta estrategia se ha descrito en particular en las solicitudes de patente WO 99/48380, EP 0 897 985 y EP 0 897 010.In order to respond to these criteria, it they have looked for some phytases in some organisms, in particular ones microorganisms, which develop in a medium whose conditions of temperature and pH correspond to these criteria. This strategy has allowed to isolate some phytases resistant to some high temperatures, such as, for example, those described in Patent applications WO 97/305016 or EP 0 684 313, but also some phytases that have a low Km, such as, for example, described in patent application EP 0 960 934. Another strategy it consisted of artificially modifying the phytase sequence known by directed mutagenesis in order to confer Interesting properties. This strategy has been described in particular in patent applications WO 99/48380, EP 0 897 985 and EP 0 897 010.
Sólo se han identificado algunas fitasas activas a un bajo pH óptimo. Dichas fitasas han sido identificadas en particular en los hongos, tales como la fitasa de Penicillium caseicolum descrita en la solicitud de patente JP 7067635 y la de Monascus anka descrita en la solicitud de patente WO 98/13480, pero también en las levaduras, como la fitasa de Schwaniiomyces occidentalis descrita en la solicitud de patente EP 699 762. Sin embargo, hasta ahora, ninguna bacteria ha conducido al aislamiento y a la identificación de una fitasa que posee un óptimo de pH bajo, en particular un pH óptimo inferior a 4.Only some active phytases have been identified at a low optimum pH. Such phytases have been identified in particular in fungi, such as the Penicillium caseicolum phytase described in patent application JP 7067635 and that of Monascus anka described in patent application WO 98/13480, but also in yeasts, such as Schwaniiomyces occidentalis phytase described in patent application EP 699 762. However, until now, no bacteria have led to the isolation and identification of a phytase that has a low pH optimum, in particular an optimum pH of less than 4.
Figura 1: Actividad de la fitasa de Acidocella aminolytica ATCC 51361 en función de la temperatura. El valor de 100% de la actividad relativa corresponde a la actividad óptima de la fitasa para una temperatura determinada.Figure 1: Activity of the phytase of Acidocella aminolytica ATCC 51361 as a function of temperature. The value of 100% of the relative activity corresponds to the optimal activity of the phytase for a given temperature.
Figura 2: Actividad de la fitasa de Acidocella aminolytica ATCC 51361 en función del pH. El valor de 100% de la actividad relativa corresponde a la actividad óptima de la fitasa para un pH determinado.Figure 2: Activity of the phytase of Acidocella aminolytica ATCC 51361 as a function of pH. The value of 100% of the relative activity corresponds to the optimal phytase activity for a given pH.
Figura 3: Actividad de la fitasa Acidocella facilis ATCC 35904 en función de la temperatura. El valor de 100% de la actividad relativa corresponde a la actividad óptima de la fitasa para una temperatura determinada.Figure 3: Activity of the phytase Acidocella facilis ATCC 35904 as a function of temperature. The value of 100% of the relative activity corresponds to the optimal activity of the phytase for a given temperature.
Figura 4: Actividad de la fitasa Acidocella facilis ATCC 35904 en función del pH. El valor de 100% de la actividad relativa corresponde a la actividad óptima de la fitasa para un pH determinado.Figure 4: Activity of the phytase Acidocella facilis ATCC 35904 as a function of pH. The value of 100% of the relative activity corresponds to the optimal phytase activity for a given pH.
Figura 5: Actividad de la fitasa contenida en la fracción purificada en el ejemplo 5.5 y codificada por la ORF281 en función de la temperatura. El valor de 100% de la actividad relativa corresponde a la actividad óptima de la fitasa para una temperatura determinada.Figure 5: Phytase activity contained in the fraction purified in example 5.5 and encoded by ORF281 in temperature function. The value of 100% of the relative activity corresponds to the optimal phytase activity for a temperature determined.
Figura 6: Actividad de la fitasa contenida en la fracción purificada en el ejemplo 5.5 y codificada por la ORF281 en función del pH. El valor de 100% de la actividad relativa corresponde a la actividad óptima de la fitasa para un pH dado.Figure 6: Phytase activity contained in the fraction purified in example 5.5 and encoded by ORF281 in pH function The value of 100% of the relative activity corresponds to the optimal phytase activity for a given pH.
La presente invención se refiere a unos polinucleótidos aislados que codifican para una fitasa descrita por el identificador de secuencia SEC ID nº 2. Esta fitasa y los polinucleótidos que la codifican están asimismo caracterizados porque proceden de una cepa bacteriana del género Acidocella.The present invention relates to isolated polynucleotides encoding a phytase described by the sequence identifier SEQ ID No. 2. This phytase and the polynucleotides encoding it are also characterized in that they originate from a bacterial strain of the genus Acidocella .
Según la presente invención, por el término "polinucleótido", se entiende una molécula de ácido nucleico compuesta por una secuencia de bases, natural o artificial, que puede ser de tipo ADN o ARN, preferentemente de tipo ADN, en particular bicatenaria. Cuando dicho polinucleótido es natural, resulta evidente que la invención no cubre este polinucleótido en su entorno natural, sino el mismo polinucleótido aislado y purificado del genoma del organismo vivo en el que se encuentra en el estado natural. Este polinucleótido se puede obtener de manera directa, mediante extracción y purificación, o de manera indirecta mediante copia. Sin embargo, la presente invención comprende dicho polinucleótido cuando se encuentra integrado de manera artificial en el genoma de un organismo vivo diferente de aquél en el que existe en el estado natural, o cuando se reintroduce artificialmente en el organismo vivo del que procede, en uno o varios ejemplares en el genoma de este organismo. Cuando este polinucleótido es una sonda, es generalmente monocatenario.According to the present invention, for the term "polynucleotide" means a nucleic acid molecule composed of a sequence of bases, natural or artificial, that it can be of the DNA or RNA type, preferably of the DNA type, in double-stranded particular. When said polynucleotide is natural, it is clear that the invention does not cover this polynucleotide in its natural environment, but the same isolated polynucleotide and purified from the genome of the living organism in which it is found in the natural state This polynucleotide can be obtained in a manner directly, by extraction and purification, or indirectly by copy However, the present invention comprises said polynucleotide when it is artificially integrated into the genome of a living organism different from that in which it exists in the natural state, or when it is artificially reintroduced into the living organism from which it comes, in one or several specimens in the Genome of this organism. When this polynucleotide is a probe, It is usually single chain.
La invención comprende por lo tanto los polinucleótidos que codifican para la secuencia peptídica de la fitasa descrita por el identificador de secuencia SEC ID nº 2. Es bien conocido por el experto en la materia que esta definición incluye todos los polinucleótidos que, a pesar de que comprenden unas secuencias nucleotídicas diferentes como resultado de la degenerescencia del código genético, codifican para una misma secuencia de aminoácidos, por lo tanto una misma fitasa, la cual está representada por el identificador de secuencia SEC ID nº 2.The invention therefore comprises polynucleotides encoding the peptide sequence of the phytase described by sequence identifier SEQ ID No. 2. It is well known by the person skilled in the art that this definition includes all polynucleotides that, although they comprise a different nucleotide sequences as a result of the degeneracy of the genetic code, code for the same amino acid sequence, therefore the same phytase, which It is represented by the sequence identifier SEQ ID No. 2.
La presente invención comprende asimismo unos polinucleótidos homólogos de los polinucleótidos descritos anteriormente, codificando dichos polinucleótidos homólogos para unas fitasas homólogas de la fitasa representada por el identificador de secuencia SEC ID nº 2. Por el término "homólogo" se entiende, según la invención, unos polinucleótidos que codifican unas fitasas y cuyas secuencias presentan unas modificaciones con relación a los polinucleótidos que codifican la fitasa representada por el identificador de secuencia SEC ID nº 2. Los polinucleótidos homólogos se caracterizan porque presentan un grado de identidad con los polinucleótidos que codifican la fitasa representada por el identificador de secuencia SEC ID nº 2. El grado de identidad entre dos polinucleótidos homólogos se obtiene mediante la comparación de sus secuencias y se expresa generalmente por un porcentaje de nucleótidos idénticos entre estas secuencias. Este grado de identidad se mide sobre una longitud de secuencia determinada, determinando la más corta de las secuencias comparadas el tamaño de secuencia sobre el cual se mide el grado de identidad de las secuencias homólogas. La invención abarca por lo tanto unos polinucleótidos que presentan una o varias modificaciones de secuencia con relación a los polinucleótidos que codifican la fitasa representada por el identificador de secuencia SEC ID nº 2, y que codifican para unas fitasas cuyas propiedades son equivalentes a las de la fitasa descrita por el identificador de secuencia SEC ID nº 2.The present invention also comprises homologous polynucleotides of the polynucleotides described above, encoding said homologous polynucleotides for some homologous phytases of the phytase represented by the sequence identifier SEQ ID No. 2. By the term "homologous" means, according to the invention, some polynucleotides encoding phytases and whose sequences they have modifications in relation to polynucleotides encoding the phytase represented by the identifier of sequence SEQ ID No. 2. Homologous polynucleotides are characterized because they have a degree of identity with polynucleotides encoding the phytase represented by the sequence identifier SEQ ID No. 2. The degree of identity between Two homologous polynucleotides are obtained by comparing its sequences and is usually expressed by a percentage of identical nucleotides between these sequences. This degree of identity is measured over a given sequence length, determining the shortest of the sequences compared the size of sequence on which the degree of identity of the homologous sequences. The invention therefore encompasses some polynucleotides that have one or more modifications of sequence in relation to polynucleotides encoding phytase represented by the sequence identifier SEQ ID No. 2, and that code for phytases whose properties are equivalent to of the phytase described by the sequence identifier SEQ ID NO. 2.
Mediante la expresión "fitasas equivalentes" o "fitasas con propiedades equivalentes" se entiende esencialmente, según la invención, unas proteínas que poseen una actividad fitasa, independientemente de sus propiedades intrínsecas tales como el Km, el pH óptimo de actividad o la temperatura óptima de actividad. El nivel de actividad fitasa se puede medir mediante cualquier método que permite caracterizar una actividad fitasa. Por fitasa, se entiende una enzima cuya actividad catalítica consiste en hidrolizar el ácido fítico para liberar inositol y fosfato inorgánico. Sin embargo, puesto que la mayoría de las fitasas no realizan una hidrólisis completa del ácido fítico (que comprende 6 fosfatos), la actividad catalítica de una fitasa según la invención puede conducir a la liberación de fosfato inorgánico y de ésteres de fosfato-mioinositol, pudiendo ser dichos ésteres, en función de la capacidad de hidrólisis de la fitasa, unos ésteres de mioinositol mono-, di-, tri-, tetra- o penta-fosfato. A título de ejemplo, la actividad fitasa se puede medir según el método de Shimizu (1992, Biosci. Biotech. Biochem. 56(8), 1266-1269), en particular tal como se ha descrito en el ejemplo 2. Sin embargo, se puede utilizar cualquier método que permite caracterizar una actividad fitasa, o bien mediante la medición de la disminución de la cantidad de sustrato, o bien mediante la medición de la acumulación de los productos procedentes de la reacción enzimática, para medir la actividad fitasa. En particular, unos métodos parecidos, que utilizan por ejemplo otro sustrato u otros agentes reactivos, permiten medir asimismo dicha actividad fitasa.Through the expression "phytases equivalents "or" phytases with equivalent properties "are essentially understands, according to the invention, proteins that they have a phytase activity, regardless of their properties intrinsic such as Km, the optimal activity pH or the optimal activity temperature. The level of phytase activity is can measure by any method that allows to characterize a phytase activity Phytase means an enzyme whose activity catalytic is to hydrolyze phytic acid to release inositol and inorganic phosphate. However, since most of phytases do not perform a complete hydrolysis of phytic acid (comprising 6 phosphates), the catalytic activity of a phytase according to the invention can lead to phosphate release inorganic and phosphate myoinositol esters, said esters may be, depending on the ability of hydrolysis of phytase, mono-, di-, myoinositol esters tri-, tetra- or penta phosphate. As an example, Phytase activity can be measured according to the Shimizu method (1992, Biosci. Biotech. Biochem. 56 (8), 1266-1269), in particular as described in example 2. However, you can use any method that allows characterizing a phytase activity, or by measurement of the decrease in the amount of substrate, or by measuring the accumulation of products coming of the enzymatic reaction, to measure phytase activity. In particular similar methods, which use for example another substrate or other reactive agents, also allow to measure said phytase activity
Las modificaciones de secuencias presentes en los polinucleótidos homólogos pueden ser unas adiciones, deleciones o sustituciones de nucleótidos que pueden ser naturales u obtenidos por las técnicas habituales de mutagénesis. Se sabe que dichos polinucleótidos homólogos, que codifican para unas proteínas de funciones equivalentes, existen naturalmente en los genomas de especies vivas diferentes, e incluso en los genomas de razas, variedades o cepas diferentes. Por consiguiente, resulta por lo tanto fácil para un experto en la materia, a partir de la enseñanza de los polinucleótidos que codifican para la secuencia peptídica representada por el identificador de secuencia SEC ID nº 2 según la invención, aislar dichos polinucleótidos homólogos utilizando unas técnicas bien conocidas de hibridación molecular (Sambrook et al., 1989, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2ª edición, Nolan C. ed., Nueva York: Cold Spring Harbor Laboratory Press).Modifications of sequences present in homologous polynucleotides may be additions, deletions or substitutions of nucleotides that can be natural or obtained by the usual mutagenesis techniques. It is known that said homologous polynucleotides, which code for proteins of equivalent functions, naturally exist in the genomes of different living species, and even in the genomes of different races, varieties or strains. Therefore, it is therefore easy for one skilled in the art, from teaching the polynucleotides encoding the peptide sequence represented by the sequence identifier SEQ ID No. 2 according to the invention, to isolate said homologous polynucleotides using techniques Well-known molecular hybridization (Sambrook et al ., 1989, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd edition, Nolan C. ed., New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press).
La hibridación molecular es una reacción de apareamiento que se efectúa entre unas hebras complementarias de polinucleótidos que presentan un cierto grado de identidad entre sus secuencias nucleotídicas. La hibridación permite por lo tanto, a partir de los polinucleótidos que codifican la fitasa representada por el identificador de secuencia SEC ID nº 2, identificar unos polinucleótidos homólogos de éstos en el genoma de organismos vivos diferentes del que proceden, por ejemplo otras bacterias, en particular otras cepas de Acidocella, y que codifican para unas fitasas con las propiedades equivalentes a la fitasa representada por el identificador de secuencia SEC ID nº 2. Cuanto más fuerte es la identidad de secuencia entre unos polinucleótidos, más posible y fácil resulta la hibridación entre dichos polinucleótidos, y más alta es la probabilidad de que estos polinucleótidos codifiquen para unas proteínas con las propiedades equivalentes. Los métodos que permiten hibridar unos polinucleótidos se describen ampliamente en la bibliografía (Sambrook et al., 1989, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2ª edición, Nolan C. ed., Nueva York: Cold Spring Harbor Laboratory Press) y son bien conocidos por el experto en la materia. Se basan, por ejemplo, en el cribado de un banco genómico o de ADNc creado a partir de un organismo vivo o de un tejido de este organismo. El cribado se lleva a cabo con la ayuda de una sonda constituida por un polinucleótido conocido o un fragmento de éste, con el fin de identificar en estos bancos los polinucleótidos homólogos a dicha sonda que se hibridarán a ésta. Según la invención, la sonda está constituida por un polinucleótido que codifica la fitasa representada por el identificador de secuencia SEC ID nº 2, o un fragmento de éstos. Con el fin de identificar los polinucleótidos sobre los cuales se hibrida la sonda, ésta se marca, por ejemplo con unos elementos radiactivos, tal como el ^{32}P. Se pueden utilizar asimismo unos marcadores no radiactivos comercializados y bien conocidos por el experto en la materia.Molecular hybridization is a mating reaction that takes place between complementary strands of polynucleotides that have a certain degree of identity among their nucleotide sequences. Hybridization therefore allows, from the polynucleotides encoding the phytase represented by the sequence identifier SEQ ID No. 2, to identify homologous polynucleotides of these in the genome of living organisms other than those from, for example, other bacteria, in Particularly other strains of Acidocella , and coding for phytases with the properties equivalent to phytase represented by the sequence identifier SEQ ID No. 2. The stronger the sequence identity between polynucleotides, the more possible and easy hybridization between said polynucleotides, and higher is the probability that these polynucleotides encode proteins with equivalent properties. The methods that allow hybridization of polynucleotides are widely described in the literature (Sambrook et al ., 1989, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd edition, Nolan C. ed., New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press) and are well known by the expert in the field. They are based, for example, on the screening of a genomic or cDNA bank created from a living organism or from a tissue of this organism. The screening is carried out with the help of a probe consisting of a known polynucleotide or a fragment thereof, in order to identify in these banks polynucleotides homologous to said probe that will hybridize to it. According to the invention, the probe is constituted by a polynucleotide encoding the phytase represented by the sequence identifier SEQ ID No. 2, or a fragment thereof. In order to identify the polynucleotides on which the probe hybridizes, it is labeled, for example with radioactive elements, such as 32 P. It is also possible to use commercialized non-radioactive markers well known to those skilled in the art.
La presente invención comprende por lo tanto asimismo unos polinucleótidos capaces de hibridarse de manera selectiva a uno de los polinucleótidos que codifican la fitasa representada por el identificador de secuencia SEC ID nº 2. Se entiende que estos polinucleótidos forman parte de la presente invención sólo si codifican para una fitasa equivalente a la representada por el identificador de secuencia SEC ID nº 2. Mediante la expresión "polinucleótidos capaces de hibridarse de manera selectiva" se entiende por lo tanto, según la invención, los polinucleótidos que, mediante uno de los métodos habituales de hibridación molecular (Sambrook et al., 1989, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2ª edición, Nolan C. ed., Nueva York: Cold Spring Harbor Laboratory Press), se hibridan con una sonda marcada constituida por uno de los polinucleótidos que codifican la fitasa representada por el identificador de secuencia SEC ID nº 2, o un fragmento de éstos, a un nivel superior a la hibridación no específica de dicha sonda con otros polinucleótidos poco homólogos, en particular otros ADNc si los polinucleótidos sondados proceden de un banco de ADNc. El nivel de hibridación se mide gracias a la señal producida por el marcador de la sonda. El nivel de la señal generado por la interacción entre los polinucleótidos capaces de hibridarse de manera selectiva y la sonda es generalmente 10 veces, preferentemente 100 veces más intenso que el generado por la interacción de la sonda con los demás polinucleótidos que generan un "ruido de fondo". La hibridación selectiva se obtiene utilizando unas condiciones de hibridación y de lavado astringentes o muy astringentes (por ejemplo hibridación con un tampón que contiene por lo menos 5 x SSC y 1% de SDS a aproximadamente 50ºC-60ºC, y lavados sucesivos con 0,1% de SDS y disminución progresiva de la concentración en SSC de 2xSSC a 0,4xSSC así como aumento de la temperatura de 20ºC a 50ºC). El experto en la materia sabrá adaptar las condiciones de hibridación, es decir, esencialmente la temperatura y la concentración salina de los tampones utilizados para la etapa de hibridación y la etapa de lavado. Estas condiciones deben ser adaptadas en particular en función del tamaño de la sonda utilizada y del grado de identidad de los polinucleótidos presentes en el banco cribado con esta sonda. La adaptación de las condiciones de hibridación es necesaria con el fin de optimizar la señal generada por las secuencias homólogas que se hibridan, minimizando al mismo tiempo el ruido de fondo.The present invention therefore also comprises polynucleotides capable of selectively hybridizing to one of the polynucleotides encoding the phytase represented by the sequence identifier SEQ ID No. 2. It is understood that these polynucleotides are part of the present invention only if they encode for a phytase equivalent to that represented by the sequence identifier SEQ ID No. 2. By the expression "polynucleotides capable of selectively hybridizing" it is therefore understood, according to the invention, polynucleotides which, by one of the usual methods of Molecular hybridization (Sambrook et al ., 1989, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd edition, Nolan C. ed., New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press), hybridizes with a labeled probe consisting of one of the coding polynucleotides the phytase represented by the sequence identifier SEQ ID No. 2, or a fragment thereof, at a higher level to the non-specific hybridization of said probe with other poorly homologous polynucleotides, in particular other cDNAs if the probed polynucleotides come from a cDNA bank. The level of hybridization is measured thanks to the signal produced by the probe marker. The level of the signal generated by the interaction between the polynucleotides capable of selectively hybridizing and the probe is generally 10 times, preferably 100 times more intense than that generated by the interaction of the probe with the other polynucleotides that generate a "noise of background". Selective hybridization is obtained using astringent or very astringent hybridization and washing conditions (for example hybridization with a buffer containing at least 5 x SSC and 1% SDS at about 50 ° C-60 ° C, and successive washes with 0.1 % of SDS and progressive decrease of the concentration in SSC from 2xSSC to 0.4xSSC as well as temperature increase from 20ºC to 50ºC). The person skilled in the art will know how to adapt the hybridization conditions, that is, essentially the temperature and the salt concentration of the buffers used for the hybridization stage and the washing stage. These conditions must be adapted in particular according to the size of the probe used and the degree of identity of the polynucleotides present in the bank screened with this probe. The adaptation of the hybridization conditions is necessary in order to optimize the signal generated by the homologous sequences that hybridize, while minimizing the background noise.
Los polinucleótidos capaces de hibridarse de manera selectiva a los polinucleótidos según la invención pueden ser aislados a partir de bancos genómicos o de bancos de ADNc producidos, por ejemplo, a partir de cepas bacterianas, en particular de cepas del género Acidocella. El aislamiento de dichos polinucleótidos se puede llevar a cabo mediante las técnicas estándares de hibridación (Sambrook et al., 1989, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2ª edición, Nolan C. ed., Nueva York: Cold Spring Harbor Laboratory Press), utilizando como sonda un polinucleótido que codifica la fitasa representada por el identificador de secuencia SEC ID nº 2, un fragmento de estos polinucleótidos, o un polinucleótido complementario de éstos. Cuando un polinucleótido ha sido aislado por estas técnicas, es necesario determinar su secuencia e identificar las propiedades de la proteína codificada por este polinucleótido, en particular verificar que esta proteína es una fitasa equivalente a la fitasa descrita por el identificador de secuencia SEC ID nº 2.The polynucleotides capable of selectively hybridizing to the polynucleotides according to the invention can be isolated from genomic banks or cDNA banks produced, for example, from bacterial strains, in particular strains of the genus Acidocella . The isolation of said polynucleotides can be carried out by standard hybridization techniques (Sambrook et al ., 1989, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 2nd edition, Nolan C. ed., New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press), using as a probe a polynucleotide encoding the phytase represented by the sequence identifier SEQ ID NO: 2, a fragment of these polynucleotides, or a complementary polynucleotide thereof. When a polynucleotide has been isolated by these techniques, it is necessary to determine its sequence and identify the properties of the protein encoded by this polynucleotide, in particular verify that this protein is a phytase equivalent to the phytase described by the sequence identifier SEQ ID No. 2 .
Las técnicas de hibridación mencionadas anteriormente permiten por lo tanto aislar unos polinucleótidos homólogos de los polinucleótidos que codifican para la fitasa descrita por el identificador de secuencia SEC ID nº 2. Dichos polinucleótidos y las fitasas que codifican, son fácilmente identificables por un experto en la materia del campo de las biotecnologías que domina las técnicas estándares de biología molecular. La invención comprende por lo tanto unos polinucleótidos homólogos de los polinucleótidos que codifican la fitasa descrita por el identificador de secuencia SEC ID nº 2. El grado de identidad de los polinucleótidos homólogos será de por lo menos 70% con relación a los polinucleótidos que codifican la fitasa representada por el identificador de secuencia SEC ID nº 2, preferentemente de por lo menos 80%, más preferentemente de por lo menos 90% y de manera preferida de por lo menos 95%. Los métodos de medición y de identificación del grado de identidad entre unas secuencias son asimismo bien conocidos por el experto en la materia. Se pueden utilizar, por ejemplo, los programas PILEUP, BLAST (en particular Altschul et al., 1993, J. Mol. Evol. 36:290-300; Altschul et al., 1990, J. Mol. Biol. 215:403-10), o BestFit (Wisconsin Sequence Analysis Package, Version 8 for Unix, Genetics Computer Group, University Research Park, 575 Science Drive, Madison, WI 53711, utilizando el algoritmo de Smith y Waterman descrito en Applied Mathematics, 1981, nº 2, 482-489).The hybridization techniques mentioned above therefore allow homologous polynucleotides to be isolated from the polynucleotides encoding the phytase described by the sequence identifier SEQ ID No. 2. Said polynucleotides and the phytases encoding are easily identifiable by one skilled in the art. from the field of biotechnologies that dominates the standard techniques of molecular biology. The invention therefore comprises homologous polynucleotides of the polynucleotides encoding the phytase described by the sequence identifier SEQ ID No. 2. The degree of identity of the homologous polynucleotides will be at least 70% in relation to the polynucleotides encoding the phytase represented by the sequence identifier SEQ ID No. 2, preferably at least 80%, more preferably at least 90% and preferably at least 95%. The methods of measuring and identifying the degree of identity between sequences are also well known to those skilled in the art. For example, the programs PILEUP, BLAST (in particular Altschul et al ., 1993, J. Mol. Evol. 36: 290-300; Altschul et al ., 1990, J. Mol. Biol. 215: 403 can be used -10), or BestFit (Wisconsin Sequence Analysis Package, Version 8 for Unix, Genetics Computer Group, University Research Park, 575 Science Drive, Madison, WI 53711, using the Smith and Waterman algorithm described in Applied Mathematics, 1981, No. 2 , 482-489).
Dichos polinucleótidos homólogos se pueden obtener asimismo de manera artificial mediante las técnicas habituales de mutagénesis.Such homologous polynucleotides can be also obtain artificially using techniques usual mutagenesis.
Un polinucleótido preferido que codifica la fitasa representada por el identificador de secuencia SEC ID nº 2 se representa mediante el identificador de secuencia SEC ID nº 1.A preferred polynucleotide encoding the phytase represented by the sequence identifier SEQ ID No. 2 is represented by the sequence identifier SEQ ID No. 1.
Según un modo particular de realización de la invención, los polinucleótidos que codifican una fitasa descritos anteriormente proceden de una bacteria del género Acidocella.According to a particular embodiment of the invention, the polynucleotides encoding a phytase described above come from a bacterium of the genus Acidocella .
De manera ventajosa, los polinucleótidos según la invención codifican una fitasa cuyo pH óptimo de actividad es inferior o igual a 4. Por pH óptimo de actividad, se entiende el valor de pH al que la actividad de la fitasa según la invención es máxima, siendo esta actividad medida mediante el método mencionado anteriormente y que corresponde a la cantidad de ácido fítico degradado y de fosfato inorgánico producido.Advantageously, the polynucleotides according to the invention encodes a phytase whose optimum activity pH is less than or equal to 4. By optimal activity pH, the pH value at which the activity of the phytase according to the invention is maximum, this activity being measured by the mentioned method above and corresponding to the amount of phytic acid degraded and inorganic phosphate produced.
Según un modo particular de realización de la invención, los polinucleótidos según la invención codifican una fitasa que posee las propiedades siguientes:According to a particular embodiment of the invention, the polynucleotides according to the invention encode a phytase that has the following properties:
- (a)(to)
- temperatura óptima = 70ºCoptimum temperature = 70ºC
- (b)(b)
- pH óptimo = 4pH optimal = 4
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
Según otro modo particular de realización de la invención, los polinucleótidos según la invención codifican una fitasa que posee las propiedades siguientes:According to another particular embodiment of the invention, the polynucleotides according to the invention encode a phytase that has the following properties:
- (a)(to)
- temperatura óptima = 60ºCoptimum temperature = 60ºC
- (b)(b)
- pH óptimo = 3,5pH optimal = 3.5
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
Preferentemente, los polinucleótidos según la invención codifican una fitasa que procede de una cepa bacteriana de la especie Acidocella aminolytica, en particular la cepa A. aminolytica ATCC 51361, o de una cepa bacteriana de la especie de Acidocella facilis, en particular la cepa A. facilis ATCC 35904.Preferably, the polynucleotides according to the invention encode a phytase that comes from a bacterial strain of the Acidocella aminolytica species, in particular strain A. aminolytica ATCC 51361 , or from a bacterial strain of the Acidocella facilis species, in particular strain A. Facilitate ATCC 35904.
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La presente invención describe asimismo unos fragmentos de los polinucleótidos descritos anteriormente. El término "fragmento" designa en particular un fragmento de por lo menos 20 nucleótidos, en particular de por lo menos 50 nucleótidos, y preferentemente de por lo menos 100 nucleótidos. Dichos fragmentos se designan generalmente oligonucleótidos. Pueden servir de sondas de hibridación para identificar unos polinucleótidos homólogos, o de cebadores para identificar y amplificar dichos polinucleótidos homólogos mediante la técnica de PCR ("Polymerase Chain Reaction" tal como se ha descrito en Ausubel et al., (1987) Current Protocols in Molecular Biology, edit., John Wiley & Sons, Sección 6.3-6.4.The present invention also describes fragments of the polynucleotides described above. The term "fragment" designates in particular a fragment of at least 20 nucleotides, in particular of at least 50 nucleotides, and preferably of at least 100 nucleotides. Such fragments are generally designated oligonucleotides. They can serve as hybridization probes to identify homologous polynucleotides, or primers to identify and amplify said homologous polynucleotides by the PCR technique ("Polymerase Chain Reaction" as described in Ausubel et al ., (1987) Current Protocols in Molecular Biology, edit., John Wiley & Sons, Section 6.3-6.4.
El término fragmento designa asimismo unos fragmentos de los polinucleótidos según la invención que codifican un fragmento de la fitasa representada por el identificador de secuencia SEC ID nº 2, o un fragmento de una fitasa homóloga o equivalente de la fitasa representada por el identificador de secuencia SEC ID nº 2.The term fragment also designates fragments of the polynucleotides according to the invention encoding a fragment of the phytase represented by the identifier of sequence SEQ ID No. 2, or a fragment of a homologous phytase or phytase equivalent represented by the identifier of sequence SEQ ID No. 2.
La presente invención se refiere asimismo a unos polinucleótidos que comprenden por lo menos uno de los polinucleótidos tales como los descritos anteriormente.The present invention also relates to some polynucleotides comprising at least one of the polynucleotides such as those described above.
Todos los polinucleótidos descritos anteriormente codifican o bien la fitasa representada por el identificador de secuencia SEC ID nº 2, o bien una fitasa homóloga, o bien un fragmento activo de estas fitasas. En consecuencia, la invención se extiende por lo tanto a todas las fitasas codificadas por el conjunto de estos polinucleótidos. Esta definición incluye por lo tanto la fitasa representada por el identificador de secuencia SEC ID nº 2, las fitasas homólogas de esta fitasa, y los fragmentos activos de estas fitasas.All polynucleotides described previously encoded or else the phytase represented by the sequence identifier SEQ ID No. 2, or a homologous phytase, or an active fragment of these phytases. Consequently, the invention thus extends to all encoded phytases by the set of these polynucleotides. This definition includes therefore the phytase represented by the identifier of sequence SEQ ID No. 2, the homologous phytases of this phytase, and the active fragments of these phytases.
Según un modo preferido de realización de la invención, la fitasa es una proteína que comprende por lo menos la secuencia peptídica descrita por el identificador de secuencia SEC ID nº 2. De manera preferida, la fitasa representada por la secuencia peptídica descrita por el identificador de secuencia SEC ID nº 2 hidroliza 5 de los 6 fosfatos presentes sobre una molécula de ácido fítico.According to a preferred embodiment of the invention, phytase is a protein that comprises at least the peptide sequence described by the SEC sequence identifier ID No. 2. Preferably, the phytase represented by the peptide sequence described by the SEC sequence identifier ID No. 2 hydrolyzes 5 of the 6 phosphates present on a molecule of phytic acid.
La invención comprende por lo tanto asimismo las fitasas homólogas de la fitasa representada por el identificador de secuencia SEC ID nº 2. Mediante la expresión "fitasas homólogas" se entiende, según la invención, las fitasas cuyas secuencias presentan unas modificaciones con relación a la fitasa representada por el identificador de secuencia SEC ID nº 2. Al igual que los polinucleótidos homólogos, las fitasas homólogas son unas fitasas cuyas secuencias peptídicas presentan un cierto grado de identidad, grado de identidad que está generalmente expresado por un porcentaje de aminoácidos idénticos. La invención abarca por lo tanto unas fitasas que presentan una o varias modificaciones de secuencia con relación a la fitasa representada por el identificador de secuencia SEC ID nº 2, y cuyas propiedades son equivalentes a las de la fitasa descrita por el identificador de secuencia SEC ID nº 2. Estas modificaciones pueden ser unas adiciones, deleciones o sustituciones de aminoácidos que pueden ser naturales u obtenidas mediante las técnicas habituales de mutagénesis. El grado de identidad de las fitasas homólogas será de por lo menos 70% con relación a la fitasa representada por el identificador de secuencia SEC ID nº 2, preferentemente de por lo menos 80%, más preferentemente de por lo menos 90%, y de manera preferida de por lo menos 95%. Los métodos de medición y de identificación del grado de identidad entre secuencias son bien conocidos por el experto en la materia. Se pueden utilizar, por ejemplo, los programas PILEUP, BLAST (en particular Altschul et al., 1993, J. Mol. Evol. 36:290-300; Altschul et al., 1990, J. Mol. Biol. 215:403-10), o BestFit (Wisconsin Sequence Analysis Package, Version 8 for Unix, Genetics Computer Group, University Research Park, 575 Science Drive, Madison, WI 53711, utilizando el algoritmo de Smith y Waterman descrito en Applied Mathematics, 1981, nº 2, 482-489).The invention therefore also includes the homologous phytases of the phytase represented by the sequence identifier SEQ ID No. 2. The term "homologous phytases" means, according to the invention, the phytases whose sequences have modifications in relation to the phytase represented by the sequence identifier SEQ ID NO. 2. Like homologous polynucleotides, homologous phytases are phytases whose peptide sequences have a certain degree of identity, degree of identity that is generally expressed by a percentage of identical amino acids. The invention therefore encompasses phytases that have one or several sequence modifications in relation to the phytase represented by the sequence identifier SEQ ID No. 2, and whose properties are equivalent to those of the phytase described by the sequence identifier SEQ ID No. 2. These modifications may be additions, deletions or substitutions of amino acids that can be natural or obtained by the usual mutagenesis techniques. The degree of identity of the homologous phytases will be at least 70% in relation to the phytase represented by the sequence identifier SEQ ID No. 2, preferably at least 80%, more preferably at least 90%, and of preferred manner of at least 95%. The methods of measuring and identifying the degree of identity between sequences are well known to those skilled in the art. For example, the programs PILEUP, BLAST (in particular Altschul et al ., 1993, J. Mol. Evol. 36: 290-300; Altschul et al ., 1990, J. Mol. Biol. 215: 403 can be used -10), or BestFit (Wisconsin Sequence Analysis Package, Version 8 for Unix, Genetics Computer Group, University Research Park, 575 Science Drive, Madison, WI 53711, using the Smith and Waterman algorithm described in Applied Mathematics, 1981, No. 2 , 482-489).
Según un modo particular de realización de la invención, la fitasa según la invención procede de una bacteria del género Acidocella.According to a particular embodiment of the invention, the phytase according to the invention comes from a bacterium of the genus Acidocella .
De manera ventajosa, la fitasa según la invención tiene un pH óptimo de actividad inferior o igual a 4. Por pH óptimo de actividad, se entiende el valor de pH al que la actividad de la fitasa según la invención es máxima, siendo esta actividad medida mediante el método mencionado anteriormente y que corresponde a la cantidad de ácido fítico degradado y de fosfato inorgánico producido.Advantageously, the phytase according to the invention has an optimal activity pH less than or equal to 4. By Optimum pH of activity, the pH value at which the phytase activity according to the invention is maximum, this being activity measured by the method mentioned above and that corresponds to the amount of degraded phytic acid and phosphate inorganic produced.
Según un modo particular de realización de la invención, la fitasa posee las propiedades siguientes:According to a particular embodiment of the invention, phytase has the following properties:
- (a)(to)
- temperatura óptima = 70ºCoptimum temperature = 70ºC
- (b)(b)
- pH óptimo = 4pH optimal = 4
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
Según otro modo particular de realización de la invención, la fitasa posee las propiedades siguientes:According to another particular embodiment of the invention, phytase has the following properties:
- (a)(to)
- temperatura óptima = 60ºCoptimum temperature = 60ºC
- (b)(b)
- pH óptimo = 3,5pH optimal = 3.5
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
Según otro modo particular de realización de la invención, la fitasa según la invención procede de una cepa bacteriana de la especie Acidocella aminolytica, en particular la cepa A. aminolytica ATCC 51361, o de una cepa bacteriana de la especie de Acidocella facilis, en particular la cepa A. facilis ATCC 35904.According to another particular embodiment of the invention, the phytase according to the invention comes from a bacterial strain of the Acidocella aminolytica species, in particular the A. aminolytica strain ATCC 51361 , or from a bacterial strain of the Acidocella facilis species, in particular strain A. facilis ATCC 35904.
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Se describen asimismo unos fragmentos de la fitasa representada por el identificador de secuencia SEC ID nº 2 y los fragmentos de las fitasas homólogas. Por fragmento, se entiende esencialmente un fragmento biológicamente activo, es decir, un fragmento que posee una actividad fitasa equivalente a la de la fitasa completa tal como se ha medido mediante el ensayo descrito en el ejemplo 2, o un ensayo parecido.Fragments of the phytase represented by the sequence identifier SEQ ID No. 2 and the fragments of the homologous phytases. By fragment, it is understood essentially a biologically active fragment, that is, a fragment that has a phytase activity equivalent to that of the complete phytase as measured by the test described in Example 2, or a similar essay.
La presente invención se refiere asimismo a un gen quimérico que comprende por lo menos, unidos entre sí de manera operativa, un promotor funcional en un organismo hospedante, un polinucleótido que codifica una fitasa según la invención, y un elemento terminador funcional en este mismo organismo hospedante. Los diferentes elementos que un gen quimérico puede contener son, por un lado, unos elementos reguladores de la transcripción, de la traducción y de la maduración de las proteínas, tales como un promotor, una secuencia que codifica para un péptido señal o un péptido de tránsito, o un elemento terminador que constituye una señal de poliadenilación y, por otro lado, un polinucleótido que codifica para una proteína. La expresión "unidos entre sí de manera operativa" significa que dichos elementos del gen quimérico están unidos entre sí de manera que el funcionamiento de uno de estos elementos está afectado por el de otro. A título de ejemplo, un promotor está unido de manera operativa a una secuencia codificante cuando es capaz de afectar a la expresión de dicha secuencia codificante. La construcción del gen quimérico según la invención y el ensamblaje de sus diferentes elementos se realiza mediante la utilización de técnicas bien conocidas por el experto en la materia, en particular las descritas en Sambrook et al. (1989, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Nolan C. ed., Nueva York: Cold Spring Harbor Laboratory Press). La selección de los elementos reguladores que constituyen el gen quimérico depende esencialmente del organismo hospedante en el que deben funcionar, y el experto en la materia es capaz de seleccionar unos elementos reguladores funcionales en un organismo hospedante determinado. Por "funcionales", se entiende capaces de funcionar en un organismo hospedante determinado.The present invention also relates to a chimeric gene comprising at least, operatively linked together, a functional promoter in a host organism, a polynucleotide encoding a phytase according to the invention, and a functional terminating element in this same organism. host The different elements that a chimeric gene can contain are, on the one hand, regulatory elements for the transcription, translation and maturation of proteins, such as a promoter, a sequence that codes for a signal peptide or a peptide of transit, or a terminating element that constitutes a polyadenylation signal and, on the other hand, a polynucleotide encoding a protein. The term "operatively linked together" means that said elements of the chimeric gene are linked together so that the functioning of one of these elements is affected by that of another. By way of example, a promoter is operatively linked to a coding sequence when it is capable of affecting the expression of said coding sequence. The construction of the chimeric gene according to the invention and the assembly of its different elements is carried out by using techniques well known to those skilled in the art, in particular those described in Sambrook et al . (1989, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Nolan C. ed., New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press). The selection of the regulatory elements that constitute the chimeric gene depends essentially on the host organism in which they must function, and the person skilled in the art is able to select functional regulatory elements in a given host organism. By "functional", it is understood as capable of functioning in a specific host organism.
Los promotores que puede contener el gen quimérico según la invención son o bien constitutivos, o bien inducibles. A título de ejemplo, los promotores utilizados para la expresión en unas bacterias se podrán seleccionar de entre los promotores citados a continuación. Para la expresión en Escherichia coli, se pueden citar los promotores lac, trp, Ipp, phoA, recA, araBAD, proU, cst-1, tetA, cadA, nar, tac, trc, Ipp-lac, Psyn, cspA, PL, PL-9G-50, PR-PL, T7, \lambdaPL-PT7, T3-lac, T5-lac, T4 gen 32, nprM-lac, VHb, proteína A (Makrides, 1996, Microbiol. Rev. 60:512-538; Current Opinions in Biotechnology, 1996, 7; Weickert et al., 1996, Current Opinions in Biotechnology 7: 494-499) o también el promotor P_{trp} (WO 99/64607). Para la expresión en las bacterias Gram positivas tales como las Corinebacterias o Streptomyces, se pueden citar los promotores P_{tipA} (Holmes et al., 1993, EMBO J. 12:3183-3191) o PS1, PS2 (FR 91/09870) o los descritos en la solicitud EP 0 629 699 A2. Para la expresión en las levaduras y en los hongos, se pueden citar los promotores P_{LAC4} de K. lactis (Van den Berg et al., 1990, Bio/Technology 8:135-139) o P_{pgk} de K. lactis (solicitud de patente FR 91/05294), tef1 o cbh 1 de Trichoderma (WO 94/04673), his, csl, apf de Penicillium (WO 00/68401), gla de Aspergillus (Gwynne et al., 1987, Bio/Technology 5: 713-719).The promoters that the chimeric gene according to the invention may contain are either constitutive or inducible. By way of example, promoters used for expression in bacteria may be selected from among the promoters cited below. For expression in Escherichia coli , the promoters lac, trp, Ipp, phoA, recA, araBAD, proU, cst-1, tetA, cadA, nar, tac, trc, Ipp-lac , P syn, cspA , P can be cited L , P L-9G-50 , P R-PL , T 7 , λ L -PT7, T3- lac , T5- lac , T4 gene 32, nprM-lac , HBV, protein A (Makrides, 1996, Microbiol. Rev. 60: 512-538; Current Opinions in Biotechnology, 1996, 7; Weickert et al ., 1996, Current Opinions in Biotechnology 7: 494-499) or also the P trp promoter (WO 99/64607). For expression in Gram positive bacteria such as Corinebacteria or Streptomyces , the P_A promoters (Holmes et al ., 1993, EMBO J. 12: 3183-3191) or PS1, PS2 (FR 91/09870) ) or those described in application EP 0 629 699 A2. For expression in yeasts and fungi, mention can be made of the P_ACAC4 promoters of K. lactis (Van den Berg et al ., 1990, Bio / Technology 8: 135-139) or P_pgk of K . lactis (patent application FR 91/05294), tef1 or cbh 1 of Trichoderma (WO 94/04673), his, csl, apf of Penicillium (WO 00/68401), Aspergillus gla (Gwynne et al ., 1987, Bio / Technology 5: 713-719).
El gen quimérico puede comprender asimismo una secuencia de direccionamiento subcelular, que codifica un péptido señal o un péptido de tránsito. Dicha secuencia, situada corriente arriba o corriente abajo del polinucleótido que codifica para la fitasa, permite dirigir dicha fitasa de manera específica a un compartimento celular del organismo hospedante, o dirigir su secreción en el espacio extracelular. Por ejemplo, el gen quimérico puede comprender una secuencia que codifica un péptido señal o un péptido de tránsito que permite dirigir la fitasa hacia un compartimento particular del citoplasma como las mitocondrias, los plastos, el retículo endoplásmico o las vacuolas. De manera preferida, la secuencia de direccionamiento codifica un péptido señal que dirige la fitasa al apoplasto o la matriz celular.The chimeric gene may also comprise a subcellular targeting sequence, which encodes a peptide signal or a transit peptide. This sequence, located current up or downstream of the polynucleotide encoding the phytase, allows to direct said phytase specifically to a cellular compartment of the host organism, or direct its secretion in the extracellular space. For example, the chimeric gene may comprise a sequence encoding a signal peptide or a transit peptide that allows the phytase to be directed towards a particular compartment of the cytoplasm such as mitochondria, the plastids, endoplasmic reticulum or vacuoles. By way of preferred, the addressing sequence encodes a peptide signal that directs phytase to apoplast or cell matrix.
Según un modo de realización, el péptido de tránsito puede ser una señal de direccionamiento cloroplástico, vacuolar o mitocrondial, el cual se escinde a continuación en los cloroplastos, las vacuolas o las mitocondrias. Dichos péptidos se describen ampliamente en la bibliografía: Neuhaus y Rodgers, 1998, Plant Molecular Biology 38: 127-144; péptido de tránsito del EPSPS descrito en la patente US nº 5.188.642; péptido de tránsito de la pequeña sub-unidad de la ribulosa-biscarboxilasa/oxigenasa (EP 189 707).According to one embodiment, the peptide of transit can be a chloroplastic addressing signal, vacuolar or mitochondial, which is then cleaved in the chloroplasts, vacuoles or mitochondria. These peptides are described extensively in the literature: Neuhaus and Rodgers, 1998, Plant Molecular Biology 38: 127-144; peptide of EPSPS transit described in US Patent No. 5,188,642; peptide transit of the small sub-unit of the Ribulose biscarboxylase / oxygenase (EP 189 707).
Según otro modo de realización, el péptido de tránsito puede estar constituido por un péptido señal de direccionamiento al periplasmo bacteriano como los de los genes pac (Schumacher et al., 1986, Nucl. Acids. Res. 14:5713-5727), ompA (Bowden y Georgiou, 1990, J. Biol. Chem. 265: 16761-16766), phoA (Chang et al., 1986, Gene 44: 121-124), o por un péptido de anclaje en la superficie de la bacteria como los de los genes PS1 y PS2 (FR 91/09870).According to another embodiment, the transit peptide may be constituted by a signal peptide targeting the bacterial periplasm such as those of the pac genes (Schumacher et al ., 1986, Nucl. Acids. Res. 14: 5713-5727), ompA (Bowden and Georgiou, 1990, J. Biol. Chem. 265: 16761-16766), phoA (Chang et al ., 1986, Gene 44: 121-124), or by an anchor peptide on the surface of the bacterium as those of the PS1 and PS2 genes (FR 91/09870).
Los péptidos de tránsito pueden ser o bien simples, o bien dobles. Los péptidos de tránsito dobles están eventualmente separados por una secuencia intermedia. A título de ejemplo de péptido de tránsito cloroplástico, se puede citar un péptido de tránsito doble que comprende, en el sentido de la transcripción, una secuencia que codifica para un péptido de tránsito de un gen vegetal que codifica para una enzima de localización plastidial, una parte de secuencia de la parte madura N-terminal de un gen vegetal que codifica para una enzima de localización plastidial, y después una secuencia que codifica para un segundo péptido de tránsito de un gen vegetal que codifica para una enzima de localización plastidial. Dichos péptidos de tránsito cloroplástico dobles se describen, por ejemplo, en la solicitud de patente EP 0 508 909.The transit peptides can be either single or double. The double transit peptides are eventually separated by an intermediate sequence. By way of example of a chloroplast transit peptide, one can cite a double transit peptide comprising, in the sense of the transcription, a sequence that codes for a peptide of transit of a plant gene that codes for an enzyme of plastidial location, a sequence part of the mature part N-terminal of a plant gene that codes for a plastidial localization enzyme, and then a sequence that encodes for a second transit peptide of a plant gene that encodes for a plastidial localization enzyme. Such peptides Double chloroplastic transit are described, for example, in the patent application EP 0 508 909.
Según un modo de realización, el péptido de tránsito puede estar compuesto por diferentes elementos que permiten aumentar el índice de proteína de interés segregada en el medio. Se puede así citar la asociación de una proteína portadora y de un sitio de escisión proteolítico fusionado con la proteína de interés (US nº 6.130.063).According to one embodiment, the peptide of transit can be composed of different elements that allow increase the protein index of segregated interest in the medium. Be it can thus cite the association of a carrier protein and a Proteolytic cleavage site fused with the protein of interest (US 6,130,063).
Según la invención, el gen quimérico puede comprender asimismo otras secuencias de regulación, que se sitúan entre el promotor y la secuencia codificante, tales como unos activadores de transcripción (enhancer).According to the invention, the chimeric gene may also comprise other regulation sequences, which are located between the promoter and the coding sequence, such as transcription activators ( enhancer ).
La presente invención se refiere asimismo a un vector de clonación y/o de expresión que comprende un gen quimérico según la invención. El vector según la invención es útil para transformar un organismo hospedante y expresar en éste una fitasa. Este vector puede ser un plásmido, un cósmido, un bacteriófago o un virus. De manera preferida, el vector de transformación según la invención es un plásmido. De manera general, las principales cualidades de este vector deben ser una capacidad para mantenerse y para autoreplicarse en las células del organismo hospedante, en particular gracias a la presencia de un origen de replicación, y para expresar una fitasa. Con el objetivo de una transformación estable de un organismo hospedante, el vector puede integrarse asimismo en el genoma. Su composición puede limitarse entonces a los elementos necesarios para la síntesis de la fitasa en estos hospedantes. La elección de dicho vector así como las técnicas de inserción en éste del gen quimérico según la invención se describen ampliamente en Sambrook et al. (1989, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Nolan C. ed., Nueva York: Cold Spring Harbor Laboratory Press), y forman parte de los conocimientos generales del experto en la materia. De manera ventajosa, el vector utilizado en la presente invención contiene asimismo, además del gen quimérico según la invención, un gen quimérico que codifica un marcador de selección. Este marcador de selección permite seleccionar los organismos hospedantes efectivamente transformados, es decir, los que han incorporado el vector. Según un modo particular de realización de la invención, el organismo hospedante a transformar es una planta o un hongo. Entre los marcadores de selección que se pueden utilizar, se pueden citar unos marcadores que contienen unos genes de resistencia a los antibióticos o a los fungicidas tales como, por ejemplo, el gen de la higromicina fosfotransferasa (Gritz et al., 1983, Gene 25:179-188; Punt et al., 1987; Gene, 56: 117-24), el de la estreptotricina acetiltransferasa, el que codifica para un polipéptido que confiere una resistencia a la fleomicina, el de la beta-tubulina mutada que confiere la resistencia al benomil (Gold et al., 1994, Gene 142: 225-30), o el de la bialafos-acetiltransferasa (Avalos et al., 1989, Curr Genet, 16:369-72). Otros marcadores pueden ser unos genes que complementan una auxotrofia tales como los genes pyrA, pyrB, pyrG, pyr4 (Buxton y Radford, 1983, Mol. Gen. Genet. 190: 403-405), arg4, argB (Berse et al., 1983, Gene 25: 109-117), trpC (Goosen et al., 1989, Mol Gen Genet, 219:282-88), el gen de la molibdopterina sintasa (Appleyard et al., 1998, J Biol Chem 273: 14869-76; Unkles et al., 1999; J Biol Chem, 274:19286-93), o el de la acetamidasa (Beri y Turner, 1987, Curr Genet, 11:639-41). Otra categoría de marcadores de selección está constituida por unos genes de tolerancia a los herbicidas tales como el gen bar (White et al., NAR 18:1062, 1990) para la tolerancia al bialafos, el gen EPSPS (US nº 5.188.642) para la tolerancia al glifosato, el gen HPPD (WO 96/38567) para la tolerancia a los isoxazoles, o también el gen de la glifosato oxidorreductasa (US nº 5.463.175). Se pueden citar asimismo unos genes que codifican para unas enzimas fácilmente identificables tales como la enzima GUS, unos genes que codifican para unos pigmentos o unas enzimas que regulan la preparación de pigmentos en las células transformadas. Dichos genes marcadores de selección se describen en particular en las solicitudes de patente WO 91/02071, WO 95/06128, WO 96/38567, y WO 97/04103.The present invention also relates to a cloning and / or expression vector comprising a chimeric gene according to the invention. The vector according to the invention is useful for transforming a host organism and expressing a phytase therein. This vector can be a plasmid, a cosmid, a bacteriophage or a virus. Preferably, the transformation vector according to the invention is a plasmid. In general, the main qualities of this vector must be an ability to maintain and self-replicate in the cells of the host organism, in particular thanks to the presence of an origin of replication, and to express a phytase. With the aim of a stable transformation of a host organism, the vector can also be integrated into the genome. Its composition can then be limited to the elements necessary for the synthesis of phytase in these hosts. The choice of said vector as well as the techniques of insertion therein of the chimeric gene according to the invention are described extensively in Sambrook et al . (1989, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, Nolan C. ed., New York: Cold Spring Harbor Laboratory Press), and are part of the general knowledge of the subject matter expert. Advantageously, the vector used in the present invention also contains, in addition to the chimeric gene according to the invention, a chimeric gene encoding a selection marker. This selection marker allows to select the effectively transformed host organisms, that is, those that have incorporated the vector. According to a particular embodiment of the invention, the host organism to be transformed is a plant or fungus. Among the selection markers that can be used, mention may be made of markers containing antibiotic or fungicide resistance genes such as, for example, the hygromycin phosphotransferase gene (Gritz et al ., 1983, Gene 25: 179-188; Punt et al ., 1987; Gene, 56: 117-24), that of streptotricine acetyltransferase, which codes for a polypeptide that confers a resistance to fleomycin, that of the mutated beta-tubulin that confers Benomyl resistance (Gold et al ., 1994, Gene 142: 225-30), or that of bialaphos-acetyltransferase (Avalos et al ., 1989, Curr Genet, 16: 369-72). Other markers may be genes that complement an auxotrophy such as the pyrA, pyrB, pyrG, pyr4 genes (Buxton and Radford, 1983, Mol. Gen. Genet. 190: 403-405), arg4, argB (Berse et al ., 1983, Gene 25: 109-117), trpC (Goosen et al ., 1989, Mol Gen Genet, 219: 282-88), the molybdopterin synthase gene (Appleyard et al ., 1998, J Biol Chem 273: 14869 -76; Unkles et al ., 1999; J Biol Chem, 274: 19286-93), or that of acetamidase (Beri and Turner, 1987, Curr Genet, 11: 639-41). Another category of selection markers consists of herbicide tolerance genes such as the bar gene (White et al ., NAR 18: 1062, 1990) for bialaphic tolerance, the EPSPS gene (US No. 5,188,642) for glyphosate tolerance, the HPPD gene (WO 96/38567) for isoxazole tolerance, or also the glyphosate oxidoreductase gene (US No. 5,463,175). Mention may also be made of genes encoding easily identifiable enzymes such as the GUS enzyme, genes encoding pigments or enzymes that regulate the preparation of pigments in transformed cells. Such selection marker genes are described in particular in patent applications WO 91/02071, WO 95/06128, WO 96/38567, and WO 97/04103.
La presente invención se refiere asimismo a unos organismos hospedantes transformados, que contienen por lo menos un gen quimérico según la invención o bien integrado en su genoma, o bien soportado sobre un elemento genético extra-cromosómico, por ejemplo un plásmido. Por organismo hospedante, se entiende cualquier organismo mono o pluricelular, inferior o superior, en el que puede ser introducido el gen quimérico según la invención, para la preparación de una fitasa según la invención. De manera preferida, el organismo hospedante es un microorganismo, en particular un hongo, por ejemplo de los géneros Penicillium, Aspergillus, Chrysosporium, o Trichoderma, una bacteria, por ejemplo del género Escherichia, en particular E. coli, del género Corynebacterium o del género Streptomyces, una levadura, en particular de los géneros Saccharomyces, Kluyveromyces, o Pichia, un baculovirus, o unas células vegetales. El organismo hospedante puede ser asimismo una planta o una parte de planta.The present invention also relates to transformed host organisms, which contain at least one chimeric gene according to the invention either integrated into its genome, or supported on an extra-chromosomal genetic element, for example a plasmid. By "host organism" is meant any mono or multicellular organism, lower or higher, into which the chimeric gene according to the invention can be introduced, for the preparation of a phytase according to the invention. Preferably, the host organism is a microorganism, in particular a fungus, for example of the genera Penicillium, Aspergillus, Chrysosporium , or Trichoderma , a bacterium, for example of the genus Escherichia , in particular E. coli , of the genus Corynebacterium or genus Streptomyces , a yeast, in particular of the genera Saccharomyces, Kluyveromyces , or Pichia , a baculovirus, or plant cells. The host organism can also be a plant or a part of the plant.
Mediante la expresión "organismo hospedante transformado", se entiende un organismo hospedante que ha incorporado en su genoma, o en un elemento genético extra-cromosómico, por ejemplo un plásmido, por lo menos un gen quimérico según la invención, y produce por consiguiente una fitasa en sus tejidos, o en un medio de cultivo. Para obtener los organismos hospedantes según la invención, el experto en la materia puede utilizar uno de los numerosos métodos de transformación conocidos.Through the expression "host organism transformed "means a host organism that has incorporated into its genome, or a genetic element extra-chromosomal, for example a plasmid, so less a chimeric gene according to the invention, and produces by consequently a phytase in their tissues, or in a culture medium. In order to obtain the host organisms according to the invention, the subject matter expert can use one of the numerous methods of known transformation.
Uno de estos métodos consiste en poner las células o tejidos de los organismos hospedantes a transformar en presencia de polietilenglicol (PEG) y de los vectores de la invención (Chang y Cohen, 1979, Mol. Gen. Genet 168(1), 111-115; Mercenier y Chassy, 1988, Biochimie 70(4), 503-517). La electroporación es otro método que consiste en someter las células o tejidos a transformar y los vectores de la invención a un campo eléctrico (Andreason y Evans, 1988, Biotechniques 6(7), 650-660; Shigekawa y Dower, 1989, Aust. J. Biotechnol. 3(1), 56-62). Otro método consiste en inyectar directamente los vectores en las células o en los tejidos mediante microinyección (Gordon y Ruddle, 1985, Gene 33(2), 121-136). De manera ventajosa, se podrá utilizar el método denominado de "biolístico". Consiste en bombardear unas células o unos tejidos con unas partículas sobre las cuales se adsorben los vectores de la invención (Bruce et al., 1989, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86(24), 9692-9696; Klein et al., 1992, Biotechnology 10(3), 286-291; patente US nº 4.945.050).One of these methods consists in placing the cells or tissues of the host organisms to be transformed in the presence of polyethylene glycol (PEG) and of the vectors of the invention (Chang and Cohen, 1979, Mol. Gen. Genet 168 (1), 111- 115; Mercenier and Chassy, 1988, Biochimie 70 (4), 503-517). Electroporation is another method that involves subjecting the cells or tissues to be transformed and the vectors of the invention to an electric field (Andreason and Evans, 1988, Biotechniques 6 (7), 650-660; Shigekawa and Dower, 1989, Aust. J. Biotechnol. 3 (1), 56-62). Another method is to directly inject vectors into cells or tissues by microinjection (Gordon and Ruddle, 1985, Gene 33 (2), 121-136). Advantageously, the so-called "biolistic" method may be used. It consists of bombarding cells or tissues with particles on which the vectors of the invention are adsorbed (Bruce et al ., 1989, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86 (24), 9692-9696; Klein et al ., 1992, Biotechnology 10 (3), 286-291; US Patent No. 4,945,050).
Varios métodos de transformación de bacterias se describen en la bibliografía para Escherichia coli y otras bacterias Gram negativas (Ausubel et al., 1995, Current Protocols in Molecular Biology, John Willey and Sons, New York; Inoue et al., 1990, Gene 96: 23-28; Chung et al., 1989, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86: 2172-2175). Se puede utilizar asimismo la conjugación (Cameron et al., 1989, J. Bacteriol., 171: 547-557). Para las bacterias Gram positivas se puede utilizar la electroporación así como la transformación de protoplastos, en particular para las bacterias del género Streptomyces (Bonamy et al., 1990, FEMS Microbio. Lett 66: 263-270; Hopwood et al., 1985, Genetic Manipulation of Streptomyces: A Laboratory Manual. John Innes Foundation, Norwich).Several methods of bacterial transformation are described in the literature for Escherichia coli and other Gram negative bacteria (Ausubel et al ., 1995, Current Protocols in Molecular Biology, John Willey and Sons, New York; Inoue et al ., 1990, Gene 96 : 23-28; Chung et al ., 1989, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86: 2172-2175). The conjugation can also be used (Cameron et al ., 1989, J. Bacteriol., 171: 547-557). For Gram positive bacteria, electroporation and protoplast transformation can be used, in particular for Streptomyces genus bacteria (Bonamy et al ., 1990, FEMS Microbio. Lett 66: 263-270; Hopwood et al ., 1985, Genetic Manipulation of Streptomyces: A Laboratory Manual. John Innes Foundation, Norwich).
Varios métodos de transformación de hongos se describen asimismo en la bibliografía (Talbot, 2001, Molecular and cellular biology of filamentous fungi, Oxford University Press, Nueva York). La transformación de protoplastos con PEG se describe para Aspergillus en el documento EP 0 260 762, y una adaptación de este método a la especie Penicillium funiculosum en el documento WO 00/36120. Se conoce asimismo la transformación mediante integración asistida de enzima de restricción o REMI (Sanchez et al., 1998, Mol. Gen. Genet. 258; 89-94), así como la transformación de protoplastos con la ayuda de bacterias del género Agrobacterium (de Groot et al., 1998, Nature Biotechnology 16: 839-842). Unas técnicas de transformación de levaduras han sido descritas asimismo en la bibliografía, en particular en Ausubel et al. (1995, Current Protocols in Molecular Biology, John Willey and Sons, Nueva York) y Van den Berg et al. (1990, Bio/Technology 8: 135-139).Several methods of fungal transformation are also described in the literature (Talbot, 2001, Molecular and cellular biology of filamentous fungi, Oxford University Press, New York). The transformation of protoplasts with PEG is described for Aspergillus in EP 0 260 762, and an adaptation of this method to the Penicillium funiculosum species in WO 00/36120. Transformation through assisted integration of restriction enzyme or REMI is also known (Sanchez et al ., 1998, Mol. Gen. Genet. 258; 89-94), as well as the transformation of protoplasts with the help of bacteria of the genus Agrobacterium ( de Groot et al ., 1998, Nature Biotechnology 16: 839-842). Yeast transformation techniques have also been described in the literature, in particular in Ausubel et al . (1995, Current Protocols in Molecular Biology, John Willey and Sons, New York) and Van den Berg et al . (1990, Bio / Technology 8: 135-139).
En el caso particular en el que el organismo hospedante a transformar es de origen vegetal, la transformación de células o de tejidos vegetales se puede llevar a cabo preferentemente con la ayuda de bacterias del género Agrobacterium, preferentemente mediante la infección de las células o de los tejidos de dichas plantas por A. tumefaciens (Knopf, 1979, Subcell. Biochem. 6, 143-173; Shaw et al., 1983, Gene 23(3):315-330) o A. rhizogenes (Bevan y Chilton, 1982, Annu. Rev. Genet. 16:357-384; Tepfer y Casse-Delbart, 1987, Microbiol. Sci. 4(1), 24-28). De manera preferida, la transformación de células o de tejidos vegetales por Agrobacterium tumefaciens se lleva a cabo según el protocolo descrito por Ishida et al. (1996, Nat. Biotechnol. 14(6), 745-750). El experto en la materia seleccionará el método apropiado en función de la naturaleza de los organismos hospedantes a transformar.In the particular case in which the host organism to be transformed is of plant origin, the transformation of cells or plant tissues can be carried out preferably with the help of bacteria of the genus Agrobacterium , preferably by infection of the cells or cells. tissues of these plants by A. tumefaciens (Knopf, 1979, Subcell. Biochem. 6, 143-173; Shaw et al ., 1983, Gene 23 (3): 315-330) or A. rhizogenes (Bevan and Chilton, 1982 , Annu. Rev. Genet. 16: 357-384; Tepfer and Casse-Delbart, 1987, Microbiol. Sci. 4 (1), 24-28). Preferably, the transformation of plant cells or tissues by Agrobacterium tumefaciens is carried out according to the protocol described by Ishida et al . (1996, Nat. Biotechnol. 14 (6), 745-750). The person skilled in the art will select the appropriate method based on the nature of the host organisms to be transformed.
La presente invención se refiere asimismo a un nuevo extracto bacteriano que comprende por lo menos una actividad fitasa, caracterizado porque procede de una bacteria del género Acidocella. Por extracto bacteriano, se entiende según la presente invención, una fracción soluble en agua o en una disolución acuosa, procediendo dicha fracción de la trituración de bacterias y de la separación mediante centrifugación de los constituyentes bacterianos así liberados en fracción sólida y en fracción líquida, comprendiendo la fracción líquida el conjunto de los constituyentes bacterianos solubles. La actividad fitasa corresponde a la cantidad de ácido fítico degradado y se mide generalmente mediante la cuantificación del fosfato inorgánico liberado por la reacción enzimática. En particular, la actividad fitasa se mide según el método de Shimizu (1992, Biosci. Biotech, Biochem. 56(8), 1266-1269), en particular tal como se ha descrito en el ejemplo 2 siguiente. Sin embargo, se puede utilizar cualquier método que permite caracterizar una actividad fitasa, o bien mediante la medición de la disminución de la cantidad de sustrato, o bien mediante la medición de la acumulación de los productos procedentes de la reacción enzimática, para medir la actividad fitasa del extracto bacteriano según la invención.The present invention also relates to a new bacterial extract comprising at least one phytase activity, characterized in that it is derived from a bacterium of the genus Acidocella . By bacterial extract, it is understood according to the present invention, a fraction soluble in water or in an aqueous solution, said fraction proceeding from the trituration of bacteria and the separation by centrifugation of the bacterial constituents thus released in solid fraction and in liquid fraction, the liquid fraction comprising all the soluble bacterial constituents. The phytase activity corresponds to the amount of degraded phytic acid and is generally measured by quantifying the inorganic phosphate released by the enzymatic reaction. In particular, phytase activity is measured according to the method of Shimizu (1992, Biosci. Biotech, Biochem. 56 (8), 1266-1269), in particular as described in example 2 below. However, any method that characterizes a phytase activity can be used, either by measuring the decrease in the amount of substrate, or by measuring the accumulation of products from the enzymatic reaction, to measure the activity phytase of the bacterial extract according to the invention.
El extracto bacteriano según la invención se caracteriza porque procede de una bacteria del género Acidocella. Las características de las bacterias agrupadas en el género Acidocella se describen en Kishimoto et al. (1995, System. Appl. Microbiol. 18, 85-91).The bacterial extract according to the invention is characterized in that it comes from a bacterium of the genus Acidocella . The characteristics of the bacteria grouped in the genus Acidocella are described in Kishimoto et al . (1995, System. Appl. Microbiol. 18, 85-91).
Preferentemente, el extracto bacteriano según la invención expresa una actividad fitasa cuyo pH óptimo de actividad es inferior o igual a 4. El pH óptimo de actividad corresponde al pH al que la actividad fitasa medida en el extracto bacteriano según la invención es máxima.Preferably, the bacterial extract according to the invention expresses a phytase activity whose optimum activity pH is less than or equal to 4. The optimal activity pH corresponds to the pH to which the phytase activity measured in the bacterial extract according to the invention is maximum.
Según un modo particular de realización de la invención, el extracto bacteriano comprende una actividad fitasa que posee las propiedades siguientes:According to a particular embodiment of the invention, the bacterial extract comprises a phytase activity that It has the following properties:
- (a)(to)
- temperatura óptima = 70ºCoptimum temperature = 70ºC
- (b)(b)
- pH óptimo = 4pH optimal = 4
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Según otro modo particular de realización de la invención, el extracto bacteriano comprende una actividad fitasa que posee las propiedades siguientes:According to another particular embodiment of the invention, the bacterial extract comprises a phytase activity that It has the following properties:
- (a)(to)
- temperatura óptima = 60ºCoptimum temperature = 60ºC
- (b)(b)
- pH óptimo = 3,5pH optimal = 3.5
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
Por temperatura óptima y pH óptimo, se entiende la temperatura y el pH a los que la actividad fitasa medida en el extracto bacteriano según la invención es máxima.By optimum temperature and optimum pH, it is understood the temperature and pH at which the phytase activity measured in the Bacterial extract according to the invention is maximum.
Según otro modo particular de realización de la invención, el extracto bacteriano según la invención procede de una cepa bacteriana de la especie Acidocella aminolytica, en particular la cepa A. aminolytica ATCC 51361, o de una cepa bacteriana de la especie de Acidocella facilis, en particular la cepa A. facilis ATCC 35904.According to another particular embodiment of the invention, the bacterial extract according to the invention is derived from a bacterial strain of the Acidocella aminolytica species, in particular the A. aminolytica strain ATCC 51361 , or from a bacterial strain of the Acidocella facilis species, in particular strain A. facilis ATCC 35904.
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La presente invención se refiere asimismo a un procedimiento de preparación de dicho extracto bacteriano. Este procedimiento se caracteriza porque comprende las etapas siguientes:The present invention also relates to a method of preparing said bacterial extract. This procedure is characterized because it comprises the stages following:
- (a)(to)
- cultivar una cepa bacteriana del género Acidocella grow a bacterial strain of the genus Acidocella
- (b)(b)
- concentrar las bacterias cultivadas en la etapa (a)concentrate cultured bacteria on the stage
- (c)(C)
- triturar las bacterias aisladas en la etapa (b)crush the bacteria isolated in the stage (b)
- (d)(d)
- centrifugar el triturado obtenido en la etapa (c)centrifuge the crushing obtained in the stage (c)
- (e)(and)
- recuperar el sobrenadante que posee la actividad fitasa procedente de la etapa (d)recover the supernatant that has the phytase activity from stage (d)
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Según el presente procedimiento, una cepa bacteriana del género Acidocella se cultiva en un medio de cultivo apropiado que permite que las bacterias se multipliquen, y cuyo pH se ajusta a las condiciones de pH del medio natural en el que se desarrolla dicha cepa bacteriana. Numerosos medios de cultivo para bacterias se describen en la bibliografía, y el experto en la materia sabrá seleccionarlos y adaptar sus condiciones de pH. A título de ejemplo, un medio de cultivo para bacterias acidófilas, en particular del género Acidocella se describe en Kishimoto et al., 1995, System. Appl. Microbiol. 18, 85-91).According to the present process, a bacterial strain of the genus Acidocella is grown in an appropriate culture medium that allows the bacteria to multiply, and whose pH is adjusted to the pH conditions of the natural environment in which said bacterial strain develops. Numerous culture media for bacteria are described in the literature, and the person skilled in the art will know how to select them and adapt their pH conditions. By way of example, a culture medium for acidophilic bacteria, in particular of the genus Acidocella is described in Kishimoto et al ., 1995, System. Appl. Microbiol 18, 85-91).
Después del cultivo, las bacterias obtenidas se concentran. La concentración de las bacterias se puede llevar a cabo mediante numerosos medios, en particular mediante centrifugación o mediante filtración. Después de la concentración, las bacterias se trituran. La trituración de las bacterias consiste en romper las células bacterianas. Se puede llevar a cabo mediante diferentes medios conocidos por el experto en la materia. Preferentemente, la trituración se lleva a cabo mediante la exposición de las bacterias a un campo de ultrasonidos. El triturado bacteriano se centrifuga a continuación con el fin de separar los desechos celulares no solubles, y después recuperar el sobrenadante de centrifugación que comprende los elementos celulares solubles, y en particular unas enzimas que expresan una actividad fitasa.After cultivation, the bacteria obtained are concentrate. The concentration of bacteria can lead to carried out by numerous means, in particular by centrifugation or by filtration. After the concentration, The bacteria are crushed. The crushing of bacteria consists in breaking bacterial cells. It can be carried out by different means known to the person skilled in the art. Preferably, the crushing is carried out by exposure of bacteria to an ultrasound field. Crushing bacterial is then centrifuged in order to separate the non-soluble cellular debris, and then recover the supernatant of centrifugation comprising the soluble cellular elements, and in particular enzymes that express a phytase activity.
Según un modo particular de realización de la invención, la cepa bacteriana utilizada en el procedimiento según la invención es una cepa bacteriana de la especie Acidocella aminolytica, en particular la cepa A. aminolytica ATCC 51361, o una cepa bacteriana de la especie de Acidocella facilis, en particular la cepa A. facilis ATCC 35904.According to a particular embodiment of the invention, the bacterial strain used in the process according to the invention is a bacterial strain of the Acidocella aminolytica species, in particular the A. aminolytica strain ATCC 51361 , or a bacterial strain of the Acidocella facilis species , in particular strain A. facilis ATCC 35904.
La presente invención se refiere asimismo a un procedimiento de preparación de la fitasa según la invención. Según un modo de realización de la invención, este procedimiento se caracteriza porque comprende las etapas siguientes:The present invention also relates to a Phytase preparation process according to the invention. According An embodiment of the invention, this procedure is It characterizes because it comprises the following stages:
- (a)(to)
- cultivar una cepa bacteriana del género Acidocella grow a bacterial strain of the genus Acidocella
- (b)(b)
- concentrar las bacterias cultivadas en la etapa (a)concentrate cultured bacteria on the stage
- (c)(C)
- triturar las bacterias aisladas en la etapa (b)crush the bacteria isolated in the stage (b)
- (d)(d)
- centrifugar el triturado obtenido en la etapa (c)centrifuge the crushing obtained in the stage (c)
- (e)(and)
- recuperar el sobrenadante que posee la actividad fitasa procedente de la etapa (d)recover the supernatant that has the phytase activity from stage (d)
- (f)(F)
- purificar la fitasa a partir del sobrenadante recuperado en la etapa (e)purify phytase from supernatant recovered in step (e)
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
Las etapas (a) a (e) de este procedimiento son comunes con las etapas (a) a (e) del procedimiento de preparación de un extracto bacteriano descrito anteriormente. La etapa (f) del presente procedimiento de preparación de una fitasa según la invención consiste en purificar la fitasa a partir del sobrenadante recuperado en la etapa (e). La purificación de la fitasa se puede llevar a cabo mediante cualquier técnica de separación de las proteínas, en particular las técnicas de electroforesis y de cromatografía bien conocidas por el experto en la materia. Con el fin de conseguir una fitasa purificada, el experto en la materia sabrá utilizar el método de medición de la actividad fitasa mencionada anteriormente para identificar la o las fracciones de purificación que contienen dicha fitasa.The steps (a) to (e) of this procedure are common with steps (a) to (e) of the procedure for preparing a bacterial extract described above. Stage (f) of present procedure for preparing a phytase according to the invention consists in purifying phytase from the supernatant recovered in step (e). The phytase purification can be carry out by any technique of separation of proteins, in particular electrophoresis and Chromatography well known to the person skilled in the art. With the in order to get a purified phytase, the person skilled in the art you will know how to use the phytase activity measurement method mentioned above to identify the fraction (s) of purification containing said phytase.
Preferentemente, la cepa bacteriana utilizada en el procedimiento según la invención es una cepa bacteriana de la especie Acidocella aminolytica, en particular la cepa A. aminolytica ATCC 51361, o una cepa bacteriana de la especie de Acidocella facilis, en particular la cepa A. facilis ATCC 35904.Preferably, the bacterial strain used in the process according to the invention is a bacterial strain of the Acidocella aminolytica species, in particular the A. aminolytica strain ATCC 51361 , or a bacterial strain of the Acidocella facilis species, in particular the A. facilis strain ATCC 35904.
Según otro modo de realización de la invención, en particular cuando la fitasa según la invención es segregada en el medio de cultivo, este procedimiento se caracteriza porque comprende las etapas siguientes:According to another embodiment of the invention, in particular when the phytase according to the invention is secreted in the culture medium, this procedure is characterized in that it comprises the following stages:
- (a)(to)
- cultivar una cepa bacteriana del género Acidocella grow a bacterial strain of the genus Acidocella
- (b)(b)
- recuperar el medio de cultivo mediante la eliminación de las bacteriasrecover the culture medium by the elimination of bacteria
- (c)(C)
- purificar la fitasa a partir del medio de cultivo recuperado en la etapa (d)purify phytase from the medium of crop recovered in step (d)
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Según este procedimiento, la etapa de recuperación del medio de cultivo por eliminación de las bacterias se puede llevar a cabo mediante cualquier método de separación de fracciones sólidas comprendidas en una fracción líquida. En particular, la filtración y la centrifugación son unos medios adaptados a la realización de esta etapa.According to this procedure, the stage of recovery of the culture medium by elimination of the bacteria can be carried out by any method of separation of solid fractions comprised in a liquid fraction. In In particular, filtration and centrifugation are a means adapted to the realization of this stage.
Según otro modo de realización de la invención, el procedimiento de preparación de la fitasa según la invención utiliza un organismo hospedante transformado según la invención, y se caracteriza porque comprende las etapas siguientes:According to another embodiment of the invention, the phytase preparation process according to the invention uses a transformed host organism according to the invention, and It is characterized in that it comprises the following stages:
- (a)(to)
- cultivar un organismo hospedante transformado según la invencióncultivate a host organism transformed according to the invention
- (b)(b)
- concentrar el organismo hospedante cultivado en la etapa (a)concentrate the host organism cultivated in stage (a)
- (c)(C)
- triturar el organismo hospedante transformado aislado en la etapa (b)crush the host organism isolated transform in stage (b)
- (d)(d)
- centrifugar el triturado obtenido en la etapa (c)centrifuge the crushing obtained in the stage (c)
- (e)(and)
- recuperar el sobrenadante que posee la actividad fitasa procedente de la etapa (d)recover the supernatant that has the phytase activity from stage (d)
- (f)(F)
- purificar la fitasa a partir del sobrenadante recuperado en la etapa (e)purify phytase from supernatant recovered in step (e)
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La etapa (f) del presente procedimiento de preparación de una fitasa según este modo de realización de la invención consiste en purificar la fitasa a partir del sobrenadante recuperado en la etapa (e). La purificación de la fitasa se puede llevar a cabo mediante cualquier técnica de separación de las proteínas, en particular las técnicas de electroforesis y de cromatografía bien conocidas por el experto en la materia. Con el fin de conseguir una fitasa purificada, el experto en la materia sabrá utilizar el método de medición de la actividad fitasa mencionada anteriormente para identificar la o las fracciones de purificación que contienen dicha fitasa.Step (f) of the present procedure of preparation of a phytase according to this embodiment of the invention consists in purifying phytase from the supernatant recovered in step (e). The phytase purification can be carry out by any technique of separation of proteins, in particular electrophoresis and Chromatography well known to the person skilled in the art. With the in order to get a purified phytase, the person skilled in the art you will know how to use the phytase activity measurement method mentioned above to identify the fraction (s) of purification containing said phytase.
Preferentemente, el organismo hospedante transformado utilizado en este procedimiento es un microorganismo. En particular dicho microorganismo puede ser un hongo, por ejemplo de los géneros Penicillium, Aspergillus, Chrysosporium, o Trichoderma, una bacteria, por ejemplo del género Escherichia, en particular E. coli, del género Corynebacterium o del género Streptomyces, una levadura, en particular de los géneros Saccharomyces, Kluyveromyces, o Pichia, un baculovirus, o unas células vegetales.Preferably, the transformed host organism used in this process is a microorganism. In particular, said microorganism can be a fungus, for example of the genera Penicillium, Aspergillus, Chrysosporium , or Trichoderma , a bacterium, for example of the genus Escherichia , in particular E. coli , of the genus Corynebacterium or of the genus Streptomyces , a yeast, in particular of the genera Saccharomyces, Kluyveromyces , or Pichia , a baculovirus, or plant cells.
Según otro modo de realización de la invención, en particular cuando la fitasa según la invención es segregada en un medio de cultivo, este procedimiento se caracteriza porque comprende las etapas siguientes:According to another embodiment of the invention, in particular when the phytase according to the invention is secreted in a culture medium, this procedure is characterized in that it comprises the following stages:
- a)to)
- cultivar un organismo hospedante transformado según la invencióncultivate a host organism transformed according to the invention
- b)b)
- recuperar el medio de cultivo mediante la eliminación de dicho organismo hospedante transformadorecover the culture medium by the elimination of said transformed host organism
- c)C)
- purificar la fitasa a partir del medio de cultivo recuperado en la etapa (e).purify phytase from the medium of culture recovered in step (e).
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Según este procedimiento, la etapa de recuperación del medio de cultivo por eliminación del organismo hospedante transformado se puede realizar mediante cualquier medio de separación de fracciones sólidas comprendidas en una fracción líquida. En particular, la filtración y la centrifugación son unos medios adaptados a la realización de esta etapa.According to this procedure, the stage of recovery of the culture medium by elimination of the organism transformed host can be performed by any means of separation of solid fractions comprised in a fraction liquid In particular, filtration and centrifugation are about means adapted to the realization of this stage.
La presente invención se refiere asimismo a unas composiciones enzimáticas que comprenden por lo menos una fitasa según la invención. Según un modo de realización particular, la composición enzimática según la invención comprende un extracto bacteriano según la invención.The present invention also relates to Enzymatic compositions comprising at least one phytase according to the invention. According to a particular embodiment, the Enzymatic composition according to the invention comprises an extract bacterial according to the invention.
Mediante la expresión "composición enzimática", se entiende una composición que comprende por lo menos una fitasa según la invención, fitasa que está asociada a unos adyuvantes diversos que favorecen su estabilidad y su conservación. La composición enzimática según la invención puede estar en forma líquida, encontrándose entonces dicha composición y la fitasa que contiene en una disolución acuosa, o en forma sólida, encontrándose entonces dicha composición y la fitasa que contiene liofilizadas en forma de polvo.Through the expression "composition enzymatic "means a composition comprising less a phytase according to the invention, phytase that is associated with various adjuvants that favor its stability and its conservation. The enzymatic composition according to the invention can be in liquid form, then said composition and the phytase it contains in an aqueous solution, or in solid form, meeting said composition and the phytase it contains lyophilized in powder form.
Según un modo particular de realización de la invención, la composición enzimática comprende, además de la fitasa según la invención, por lo menos una enzima adicional. Esta enzima adicional puede o bien poseer una actividad fitasa, o bien poseer una actividad distinta de la actividad fitasa. En el caso en el que esta enzima adicional posee una actividad fitasa, dicha actividad fitasa es preferentemente diferente y complementaria de la actividad fitasa de la fitasa según la invención. En el caso en el que esta enzima adicional posee una actividad diferente de la actividad fitasa, ésta puede, por ejemplo, poseer una actividad xilanasa, celulasa, \beta-glucanasa, ácido ferúlico estearasa, pululanasa, amidasa, fosfatasa o mananasa.According to a particular embodiment of the invention, the enzymatic composition comprises, in addition to phytase according to the invention, at least one additional enzyme. This enzyme additional may either possess a phytase activity, or possess an activity other than phytase activity. In the case where this additional enzyme has a phytase activity, said activity phytase is preferably different and complementary to the phytase activity of phytase according to the invention. In the case in the that this additional enzyme has a different activity from the phytase activity, this may, for example, have an activity xylanase, cellulase, β-glucanase, acid Ferulic esterase, pululanase, amidase, phosphatase or mannanase.
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De manera preferida, dichas composiciones enzimáticas están destinadas a ser incorporadas en unos alimentos para animales de cría, en particular unos animales monogástricos, preferentemente cerdos o aves de corral.Preferably, said compositions enzymatic are intended to be incorporated into foods for farmed animals, particularly monogastric animals, preferably pigs or poultry.
La presente invención se refiere asimismo a una composición alimenticia que comprende por lo menos una fitasa según la invención.The present invention also relates to a food composition comprising at least one phytase according to the invention.
Mediante la expresión "composición alimenticia" se entiende esencialmente un alimento destinado a los animales de cría, en particular a los animales monogástricos, preferentemente los cerdos o las aves de corral. Una composición alimenticia según la invención es idealmente un alimento destinado a los animales de cría adicionado con una composición enzimática según la invención. La composición alimenticia según la invención es, por lo tanto, un alimento para animales de cría al que se adiciona por lo menos una composición enzimática según la invención, siendo dicho alimento y dicha composición enzimática mezclados de manera que se obtiene dicha composición alimenticia.Through the expression "composition food "is essentially understood as a food intended for breeding animals, particularly monogastric animals, preferably pigs or poultry. A composition food according to the invention is ideally a food intended for breeding animals added with an enzymatic composition according to the invention. The food composition according to the invention It is, therefore, a food for farmed animals add at least one enzyme composition according to the invention, said food and said enzymatic composition being mixed so that said composition is obtained food
Según un modo particular de realización de la invención, dichas composiciones alimenticias comprenden por lo menos un organismo hospedante transformado según la invención. Según otro modo particular de realización de la invención, dichas composiciones alimenticias comprenden por lo menos una bacteria del género Acidocella. De manera preferida, la bacteria del género Acidocella es una bacteria de la especie Acidocella aminolytica, en particular la cepa A. aminolytica ATCC 51361, o una bacteria de la especie Acidocella facilis, en particular la cepa A. facilis ATCC 35904.According to a particular embodiment of the invention, said food compositions comprise at least one transformed host organism according to the invention. According to another particular embodiment of the invention, said food compositions comprise at least one bacterium of the genus Acidocella . Preferably, the bacterium of the genus Acidocella is a bacterium of the species Acidocella aminolytica , in particular the strain A. aminolytica ATCC 51361 , or a bacterium of the species Acidocella facilis , in particular the strain A. facilis ATCC 35904.
La invención se refiere asimismo a unas composiciones alimenticias que comprenden por lo menos un extracto bacteriano o una fitasa según la invención.The invention also relates to some food compositions comprising at least one extract bacterial or a phytase according to the invention.
Ventajosamente, las composiciones alimenticias según la invención están destinadas a ser utilizadas en la alimentación de los animales monogástricos. Según un modo particular de realización de la invención, dichas composiciones alimenticias están destinadas a la alimentación de los cerdos. Según otro modo particular de realización de la invención, dichas composiciones alimenticias están destinadas a la alimentación de las aves de corral.Advantageously, the food compositions according to the invention are intended to be used in the feeding of monogastric animals. According to a particular way of embodiment of the invention, said food compositions They are intended for feeding pigs. According to another way particular embodiment of the invention, said compositions foodstuffs are intended for feeding the birds of corral.
La presente invención tiene asimismo por objeto un procedimiento de preparación de una composición alimenticia tal como se ha descrito anteriormente.The present invention also has as its object a process for preparing such a food composition as described above.
Según un modo particular de realización de la invención, dicho procedimiento consiste en cultivar un organismo hospedante según la invención o una bacteria del género Acidocella, en concentrar dichos organismos hospedantes o dichas bacterias mediante cualquier procedimiento de concentración conocido por el experto en la materia, en particular la filtración o la centrifugación, y después en incorporar dichos organismos hospedantes o dichas bacterias concentrados en una composición alimenticia. De manera preferida, cuando el procedimiento según la invención utiliza una bacteria del género Acidocella, ésta es una bacteria de la especie Acidocella aminolytica, en particular la cepa A. aminolytica ATCC 51361, o una bacteria de la especie Acidocella facilis, en particular la cepa A. facilis ATCC 35904.According to a particular embodiment of the invention, said method consists in culturing a host organism according to the invention or a bacterium of the genus Acidocella , in concentrating said host organisms or said bacteria by any concentration procedure known to those skilled in the art, in particular filtration or centrifugation, and then incorporating said host organisms or said concentrated bacteria in a food composition. Preferably, when the method according to the invention uses a bacterium of the genus Acidocella , this is a bacterium of the species Acidocella aminolytica , in particular the strain A. aminolytica ATCC 51361 , or a bacterium of the species Acidocella facilis , in particular the strain A. Facilis ATCC 35904.
Según otro modo particular de realización de la invención, dicho procedimiento consiste en aislar un extracto bacteriano según la invención mediante el procedimiento de preparación de dicho extracto tal como se ha descrito anteriormente, y después en incorporar el sobrenadante producido en la etapa (e) de dicho procedimiento en una composición alimenticia.According to another particular embodiment of the invention, said method consists in isolating an extract bacterial according to the invention by the method of preparation of said extract as described previously, and then to incorporate the supernatant produced in step (e) of said process in a composition food
Según otro modo particular de realización de la invención, dicho procedimiento consiste en preparar una fitasa según la invención mediante uno de los procedimientos de preparación de dicha fitasa tales como se han descrito anteriormente, y después en incorporar dicha fitasa producida en una composición alimenticia.According to another particular embodiment of the invention, said process consists in preparing a phytase according to the invention by one of the preparation procedures of said phytase as described above, and then in incorporating said phytase produced in a composition food
La presente invención se refiere asimismo a un procedimiento para aumentar la asimilación del fosfato inorgánico contenido en la fitasa de los alimentos a base de vegetales para los animales monogástricos, caracterizado porque se incorpora una fitasa o una composición enzimática según la invención en la alimentación de dichos animales. De manera preferida, dicho procedimiento se caracteriza porque se alimenta a dichos animales monogástricos con una composición alimenticia según la invención.The present invention also relates to a procedure to increase the assimilation of inorganic phosphate phytase content of plant-based foods for monogastric animals, characterized in that a phytase or an enzymatic composition according to the invention in the feeding of these animals. Preferably, said procedure is characterized because said animals are fed monogastric with a food composition according to the invention.
La invención se refiere asimismo a un procedimiento para disminuir la adición de fósforo en la alimentación de los animales monogástricos, caracterizado porque se alimenta a dichos animales con una composición alimenticia según la invención.The invention also relates to a procedure to decrease the addition of phosphorus in the feeding of monogastric animals, characterized in that feed these animals with a food composition according to the invention.
La invención se refiere asimismo a un procedimiento para disminuir las emisiones de fósforo procedentes de la alimentación de los animales monogástricos, caracterizado porque se alimenta a dichos animales con una composición alimenticia según la invención.The invention also relates to a procedure to reduce phosphorus emissions from the feeding of monogastric animals, characterized in that said animals are fed a food composition according to the invention.
Los ejemplos siguientes permiten ilustrar la presente invención, sin limitar por ello su alcance.The following examples allow to illustrate the present invention, without limiting its scope.
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Las bacterias del género Acidocella son unas bacterias acidófilas de Gram negativo, que se desarrollan en unos medios a pH ácido. A título de ejemplo, las bacterias de las cepas A. aminolytica ATCC 51361 y A. facilis ATCC 35904 se pueden utilizar para realizar la presente invención. Estas bacterias pueden ser cultivadas según un método similar. En particular, se cultivan en condiciones aeróbicas a 30ºC y pH 4 en un medio compuesto por peptona y por glucosa. Un medio de cultivo se describe por ejemplo en Kishimoto y Tano (1987, J. Gen. Appl. Microbiol. 33, 11-25). El medio utilizado para la expresión de la fitasa está exento de fosfato inorgánico, y suplementado con fitato (0,4%) y en CaCl_{2} (2,2 g/l). Acidocella genus bacteria are Gram negative acidophilic bacteria, which develop in acidic pH media. By way of example, the bacteria of strains A. aminolytica ATCC 51361 and A. facilis ATCC 35904 can be used to carry out the present invention. These bacteria can be grown according to a similar method. In particular, they are grown under aerobic conditions at 30 ° C and pH 4 in a medium composed of peptone and glucose. A culture medium is described for example in Kishimoto and Tano (1987, J. Gen. Appl. Microbiol. 33, 11-25). The medium used for phytase expression is free of inorganic phosphate, and supplemented with phytate (0.4%) and in CaCl2 (2.2 g / l).
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La medición de la actividad fitasa se lleva a cabo en medio líquido. Se efectúa sobre unas muestras de cultivo bacteriano o sobre unos extractos bacterianos según la invención, o sobre unas fitasas según la invención. Se basa en el método de Shimizu (1992, Biosci. Biotech. Biochem. 56(8), 1266-1269). El principio de este método consiste en medir la cantidad de fosfato inorgánico liberado durante la reacción enzimática de la fitasa con su sustrato (disolución de fitato de sodio al 1%). La cantidad de fosfato inorgánico liberado se mide mediante la reacción de éste con un agente reactivo cromógeno (1 volumen de sulfato de hierro al 10,8%, mezclado extemporáneamente con 4 volúmenes de amonio molibdato 0,012M H_{2}SO_{4}). Esta reacción conduce, en medio muy ácido, a la formación de un complejo de fosfomolibdato coloreado (en presencia de Fe^{2+}), y la cantidad de complejo formado se cuantifica mediante la medición con el espectrofotómetro de la absorbancia a 700 nm de la disolución coloreada generada.The measurement of phytase activity is taken to out in liquid medium. It is carried out on culture samples bacterial or on bacterial extracts according to the invention, or on phytases according to the invention. It is based on the method of Shimizu (1992, Biosci. Biotech. Biochem. 56 (8), 1266-1269). The principle of this method consists in measure the amount of inorganic phosphate released during the reaction enzyme of phytase with its substrate (phytate solution of 1% sodium). The amount of inorganic phosphate released is measured by reacting it with a chromogenic reactive agent (1 volume of 10.8% iron sulfate, mixed extemporaneously with 4 volumes of 0.012M H 2 SO 4 ammonium molybdate). This reaction leads, in very acidic medium, to the formation of a complex of colored phosphomolibdate (in the presence of Fe 2+), and the amount of complex formed is quantified by measuring with the spectrophotometer of the absorbance at 700 nm of the solution colored generated.
Dos reacciones distintas permiten la medición de la actividad: una primera medición se efectúa en el momento de la puesta en contacto de la muestra con el sustrato (tiempo T0) y una segunda después de 60 minutos de incubación (tiempo T60). La variación de la absorbancia entre los tiempos T0 y T60 (contra los blancos respectivos constituidos por tampón en lugar de la muestra) es proporcional a la cantidad de fosfato inorgánico liberado durante la reacción enzimática.Two different reactions allow the measurement of the activity: a first measurement is made at the time of contact of the sample with the substrate (time T0) and a second after 60 minutes of incubation (time T60). The variation of absorbance between times T0 and T60 (against respective targets constituted by buffer instead of the sample) is proportional to the amount of inorganic phosphate released during The enzymatic reaction.
Se realiza una gama patrón de referencia mezclando 250 \mul de disolución de KH_{2}PO_{4} a las concentraciones de 0,1 mM, 0,5 mM, 1 mM, 2 mM y 4 mM en el tampón deseado con 250 \mul de TCA y revelando mediante 450 \mul de agente reactivo cromógeno. Una unidad enzimática se define como la cantidad de enzima que libera un micromol de fosfato inorgánico por minuto (a temperatura y pH determinados).A reference standard range is made mixing 250 µl of KH2PO4 solution at concentrations of 0.1 mM, 0.5 mM, 1 mM, 2 mM and 4 mM in the buffer desired with 250 µl of TCA and revealing by 450 µl of chromogenic reactive agent. An enzymatic unit is defined as the amount of enzyme that releases an inorganic phosphate micromol by minute (at certain temperature and pH).
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Después del cultivo, las bacterias del género Acidocella se concentran mediante centrifugación durante 15 minutos a 5.000 g y 4ºC. El sobrenadante se elimina y las bacterias así concentradas se resuspenden a continuación en un tampón formiato (100 mM)-CaCl_{2} (1 mM) a pH 3,5 de manera que se concentran aproximadamente 100 veces con relación a su concentración inicial en el medio de cultivo. Las bacterias concentradas se trituran a continuación con la ayuda de un aparato "Cell disrupter" (Cell-d) utilizado a razón de dos pasadas en un flujo de una presión de 2,5 kbar. Los triturados bacterianos se centrifugan a continuación durante 15 minutos a 5.000 g y 4ºC y el sobrenadante, que constituye el extracto bacteriano se recupera, y se mide su actividad fitasa.After cultivation, the bacteria of the genus Acidocella are concentrated by centrifugation for 15 minutes at 5,000 g and 4 ° C. The supernatant is removed and the bacteria thus concentrated are then resuspended in a formate buffer (100 mM) -CaCl2 (1 mM) at pH 3.5 so that they are concentrated approximately 100 times relative to their initial concentration in The culture medium. The concentrated bacteria are then crushed with the aid of a "Cell disrupter" (Cell-d) apparatus used at the rate of two passes in a flow of a pressure of 2.5 kbar. Bacterial shreds are then centrifuged for 15 minutes at 5,000 g and 4 ° C and the supernatant, which constitutes the bacterial extract is recovered, and its phytase activity is measured.
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La actividad de las fitasas según la invención ha sido determinada a diferentes temperaturas. Los resultados de estas mediciones se presentan para las bacterias Acidocella aminolytica ATCC 51361 (figura 1), y Acidocella facilis ATCC 35904 (figura 3). Las temperaturas óptimas de actividad son de 70ºC y 60ºC respectivamente para las bacterias Acidocella aminolytica ATCC 51361 y Acidocella facilis ATCC 35904.The activity of the phytases according to the invention has been determined at different temperatures. The results of these measurements are presented for the bacteria Acidocella aminolytica ATCC 51361 (figure 1), and Acidocella facilis ATCC 35904 (figure 3). Optimum activity temperatures are 70 ° C and 60 ° C respectively for the Acidocella aminolytica ATCC 51361 and Acidocella facilis ATCC 35904 bacteria .
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La actividad de las fitasas según la invención ha sido determinada a diferentes pH. Los resultados de estas mediciones se presentan para las bacterias Acidocella aminolytica ATCC 51361 (figura 2), y Acidocella facilis ATCC 35904 (figura 4). Los pH óptimos de actividad son de 4 y 3,5 respectivamente para las bacterias Acidocella aminolytica ATCC 51361 y Acidocella facilis ATCC 35904.The activity of the phytases according to the invention has been determined at different pH. The results of these measurements are presented for the bacteria Acidocella aminolytica ATCC 51361 (figure 2), and Acidocella facilis ATCC 35904 (figure 4). The optimal activity pH is 4 and 3.5 respectively for the Acidocella aminolytica ATCC 51361 and Acidocella facilis ATCC 35904 bacteria .
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Las células de una cepa bacteriana del género Acidocella se centrifugan y después se lavan 3 veces en tampón MES pH 6,5 (25 mM) que contiene 1 mM de CaCl_{2} con el fin de eliminar el fitato del medio y el fosfato inorgánico (acumulado durante el crecimiento). La suspensión celular así obtenida se rompe después mediante "Cell disrupter" (1,5 kbar) y después se reduce el pH hasta 5,5 (mediante la adición de ácido clorhídrico al 3,7%).The cells of a bacterial strain of the genus Acidocella are centrifuged and then washed 3 times in MES buffer pH 6.5 (25 mM) containing 1 mM CaCl2 in order to remove phytate from the medium and inorganic phosphate (accumulated during growth). The cell suspension thus obtained is then broken by "Cell disrupter" (1.5 kbar) and then the pH is reduced to 5.5 (by adding 3.7% hydrochloric acid).
El extracto así obtenido se centrifuga a 20.000 g durante 1 hora. El sobrenadante se filtra a continuación sobre una membrana de 0,45 \mum de porosidad.The extract thus obtained is centrifuged at 20,000 g for 1 hour. The supernatant is then filtered on a 0.45 µm porosity membrane.
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El sobrenadante se pasa sobre una columna de tipo POROS 20 HQ (4,6/100 mm: 1,7 ml de gel). La elución se lleva a cabo con un tampón MES pH 5,5 (25 mM) 1 mM de CaCl_{2}, 1M de NaCl. La actividad fitasa (50% de la actividad inyectada) se encuentra en la fracción del volumen muerto.The supernatant is passed on a column of 20 HQ POROS type (4.6 / 100 mm: 1.7 ml gel). Elution takes conducted with a 1 mM pH 5.5 (25 mM) MES buffer of CaCl2, 1M of NaCl The phytase activity (50% of the injected activity) is found in the fraction of the dead volume.
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La fracción recuperada al final de la cromatografía de intercambio de aniones se lleva a 1,5 M (NH_{4})_{2}SO_{4}. Esta disolución se deposita entonces sobre una columna de tipo POROS 20 HP2 (HQ 4,6/100 mm: 1,7 ml de gel) previamente equilibrada con un tampón MES pH 5,5 (25 mM), 1 mM de CaCl_{2}, 1,5 M de (NH_{4})_{2}SO_{4}. Las proteínas se eluyen a continuación mediante un gradiente de 1,5 a 0 M de (NH_{4})_{2}SO_{4} en 20 volúmenes de columna.The fraction recovered at the end of the Anion exchange chromatography takes 1.5 M (NH 4) 2 SO 4. This solution is deposited then on a column of type POROS 20 HP2 (HQ 4.6 / 100 mm: 1.7 ml of gel) previously equilibrated with a MES buffer pH 5.5 (25 mM), 1 mM of CaCl 2, 1.5 M of (NH 4) 2 SO 4. The proteins are then eluted by a gradient of 1.5 at 0 M of (NH 4) 2 SO 4 in 20 volumes of column.
La actividad fitasa se eluye a 0,95 M de (NH_{4})_{2}SO_{4} en 3 fracciones de 2 ml. Estas fracciones se reúnen y después se dializan contra 5 litros de tampón MES pH 5,5 (20 mM), 1 mM de CaCl_{2} a 4ºC durante una noche.Phytase activity is eluted at 0.95 M of (NH 4) 2 SO 4 in 3 fractions of 2 ml. These fractions are collected and then dialyzed against 5 liters of buffer MES pH 5.5 (20 mM), 1 mM CaCl 2 at 4 ° C overnight.
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La disolución dializada se inyecta sobre una columna de tipo POROS 20 HS (4,6/100 mm: 1,7 ml de gel) previamente equilibrada con un tampón MES pH 5,5 (20 mM), 1 mM de CaCl_{2}. Las proteínas se eluyen mediante un gradiente NaCl de 0 a 1 M en 20 volúmenes de columnas.The dialyzed solution is injected onto a POROS 20 HS type column (4.6 / 100 mm: 1.7 ml gel) previously equilibrated with a MES buffer pH 5.5 (20 mM), 1 mM CaCl2. The proteins are eluted by a 0 to 1 M NaCl gradient in 20 column volumes
La proteína con actividad fitasa se eluye a una concentración en NaCl de 0,35 M.Protein with phytase activity elutes at a NaCl concentration of 0.35 M.
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Las fracciones obtenidas durante la etapa anterior han sido reunidas, concentradas y depositadas sobre una columna SUPEROSE 12 HR 10/30 (24 ml, Pharmacia®) previamente equilibrada con un tampón MES pH 5,5 (25 mM), 1 mM de CaCl_{2}, 0,1 M de NaCl. Las proteínas han sido eluidas con 24 ml del tampón a un caudal de 0,5 ml/minuto. Se han recogido unas fracciones de 0,5 ml. La actividad fitasa se detecta en tres fracciones entre 14 y 15 ml de tampón de elución (tabla 1).The fractions obtained during the stage previous have been gathered, concentrated and deposited on a SUPEROSE 12 HR 10/30 column (24 ml, Pharmacia®) previously equilibrated with a MES buffer pH 5.5 (25 mM), 1 mM CaCl2, 0.1 M NaCl. Proteins have been eluted with 24 ml of buffer a a flow rate of 0.5 ml / minute. 0.5 fractions have been collected ml. Phytase activity is detected in three fractions between 14 and 15 ml of elution buffer (table 1).
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Las tres fracciones que presentan una actividad fitasa han sido concentradas y depositadas sobre un gel SDS-PAGE de 14,4%. Este gel revela una banda principal de aproximadamente 63 kDa.The three fractions that present an activity phytase have been concentrated and deposited on a gel SDS-PAGE of 14.4%. This gel reveals a band main of approximately 63 kDa.
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La banda de interés (a aproximadamente 63 kDa) ha sido cortada directamente sobre el gel de poliacrilamida. El colorante contenido en el gel se retira parcialmente mediante 2 lavados en 50% de acetonitrilo/50 mM de Tris-HCl pH 8,6. La proteína, en gel de poliacrilamida, se digiere en 400 \mul de tampón Tris-HCl 50 mM pH 8,6/0,03% de SDS a 35ºC durante 18 horas en presencia de 0,4 \mug de endolisina-C (Sequencing grade de Roche).The band of interest (at approximately 63 kDa) It has been cut directly on the polyacrylamide gel. He dye contained in the gel is partially removed by 2 50% acetonitrile / 50 mM Tris-HCl pH washes 8.6. The protein, in polyacrylamide gel, is digested in 400 µl of 50 mM Tris-HCl buffer pH 8.6 / 0.03% SDS at 35 ° C for 18 hours in the presence of 0.4 µg of endolysin-C (Roche's Sequencing grade).
Los péptidos obtenidos se separan mediante HPLC sobre una columna en línea de DEAE-C18 de 2,1 mm de diámetro. El gradiente de separación es un gradiente de 2 a 45% de acetonitrilo/TFA al 0,1%.The obtained peptides are separated by HPLC on a 2.1 mm DEAE-C18 in-line column diameter. The separation gradient is a gradient of 2 to 45% of acetonitrile / 0.1% TFA.
Cuatro péptidos han sido purificados, y después secuenciados mediante el método de Edman con la ayuda de un secuenciador Applied Biosystems 473A.Four peptides have been purified, and then sequenced using the Edman method with the help of a Applied Biosystems 473A sequencer.
En base a las secuencias de los péptidos internos, se han sintetizados varios oligonucleótidos degenerados con el fin de amplificar por PCR un fragmento del gen de interés.Based on the peptide sequences internal, several degenerate oligonucleotides have been synthesized in order to amplify by PCR a fragment of the gene from interest.
- Oligo 10:Oligo 10:
- ATDATDATNGCNGTRTTYTTATDATDATNGCNGTRTTYTT
- Oligo 12:Oligo 12:
- TCRTCRTASGTGATGATGATSGCSGTRTTYTTTCRTCRTASGTGATGATGATSGCSGTRTTYTT
- Oligo 22:Oligo 22:
- AARATGGARGGNCARAAYATHGGAARATGGARGGNCARAAYATHGG
- Oligo 23:Oligo 23:
- ATGGAAGGCCAGAAYATCGGCGAATGGAAGGCCAGAAYATCGGCGA
- Oligo 25:Oligo 25:
- ATCGGCGAYCTBCTBAAYGCCAAATCGGCGAYCTBCTBAAYGCCAA
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Se han ensayado unas combinaciones de cebadores Oligo 10 y Oligo 12 con los tres cebadores Oligo 22, 23 y 25, y el par de cebadores Oligo 12 y Oligo 22 ha permitido aislar el fragmento de 500 pb a partir del ADN genómico de una cepa del género Acidocella. Después de la purificación, se ha secuenciado este fragmento de ADN.Combinations of Oligo 10 and Oligo 12 primers have been tested with the three Oligo 22, 23 and 25 primers, and the pair of Oligo 12 and Oligo 22 primers has allowed the 500 bp fragment to be isolated from the genomic DNA of a strain of Acidocella genus. After purification, this DNA fragment has been sequenced.
El análisis de esta secuencia ha permitido demostrar en este fragmento una secuencia nucleica que codifica para el péptido 1, lo que sugiere que el producto PCR secuenciado corresponde efectivamente a la proteína de interés que ha sido objeto de la microsecuenciación.The analysis of this sequence has allowed demonstrate in this fragment a nucleic sequence that codes for peptide 1, which suggests that the sequenced PCR product corresponds effectively to the protein of interest that has been object of microsequencing.
En base a la secuencia obtenida a partir del producto PCR de aproximadamente 500 pb, se han definido nuevos cebadores Oligo 29 y Oligo 30 con el fin de disponer de un juego de cebadores específicos no degenerados del gen de interés.Based on the sequence obtained from PCR product of approximately 500 bp, new ones have been defined primers Oligo 29 and Oligo 30 in order to have a set of specific non-degenerated primers of the gene of interest.
- Oligo 29:Oligo 29:
- TTCATGGGTGGCTTCGATCTTCATGGGTGGCTTCGATC
- Oligo 30:Oligo 30:
- GCTGCCGCATCAGGAAGTTGGCTGCCGCATCAGGAAGTTG
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El producto PCR de aproximadamente 500 pb obtenido mediante amplificación con los cebadores Oligo 12 y Oligo 22 se ha utilizado como sonda en unos experimentos de transferencia Southern.The PCR product of approximately 500 bp obtained by amplification with primers Oligo 12 and Oligo 22 has been used as a probe in transfer experiments Southern
Con el fin de marcar la sonda, se han marcado 10 ng de producto PCR mediante "random priming" con la ayuda del kit Labelling Q-BIOgene.In order to mark the probe, 10 have been marked ng of PCR product by "random priming" with the help of Labelling kit Q-BIOgene.
Se han digerido 10 \mug de ADN genómico respectivamente por EcoRI, SacII o BamHI y después se han depositado sobre un gel de agarosa al 1%. Después de la migración, el ADN ha sido transferido por capilaridad sobre una membrana de nylon (BIODYNE® Plus membrane, Pall Gelman).10 µg of genomic DNA have been digested respectively by Eco RI, Sac II or Bam HI and then deposited on a 1% agarose gel. After migration, the DNA has been transferred by capillary over a nylon membrane (BIODYNE® Plus membrane, Pall Gelman).
Se ha efectuado una pre-hibridación durante 4 h a 60ºC con un tampón 5x SSC, 5x Dehardt, 1% de SDS, 100 \mug/ml de ADN desnaturalizado de pescado.It has made a pre-hybridization for 4 h at 60 ° C with a 5x buffer SSC, 5x Dehardt, 1% SDS, 100 µg / ml denatured DNA from fish.
La hibridación se lleva a cabo a continuación durante 16 h a 60ºC con un tampón que contiene 10 ml de tampón de pre-hibridación y 10 ng de la sonda a 4,08 10^{8} cpm/\mug (recuento con contador de centelleos en seco, es decir, en ausencia de centelleo).Hybridization is carried out below. for 16 h at 60 ° C with a buffer containing 10 ml of buffer pre-hybridization and 10 ng of the probe at 4.08-108 cpm / \ mug (count with dry scintillation counter, i.e. in the absence of scintillation).
Después, se han realizado varias fases de lavado:Afterwards, several phases of washed:
- 2 lavados: 2x SCC + 0,1% SDS durante 3 minutos a 20ºC2 washes: 2x SCC + 0.1% SDS for 3 minutes at 20 ° C
- 2 lavados: 0,5x SCC + 0,1% SDS durante 3 minutos a 20ºC2 washes: 0.5x SCC + 0.1% SDS for 3 minutes at 20 ° C
- 2 lavados: 0,4x SCC + 0,1% SDS durante 15 minutos a 50ºC2 washes: 0.4x SCC + 0.1% SDS for 15 minutes at 50 ° C
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El gel ha sido revelado sobre película después de una exposición de 24 h a -80ºC.The gel has been revealed on film after of a 24 h exposure at -80 ° C.
Estos experimentos han permitido mostrar que SacII corta en la porción del gen utilizada como sonda, pero que no existe ningún sitio EcoRI ni BamHI en esta secuencia. Las digestiones EcoRI y BamHI liberan respectivamente un fragmento de aproximadamente 4 kb y un fragmento de tamaño superior a 9 kb sobre los cuales se hibrida la secuencia diana.These experiments have allowed to show that Sac II cuts in the portion of the gene used as a probe, but that there is no Eco RI or Bam HI site in this sequence. The Eco RI and Bam HI digestions respectively release a fragment of approximately 4 kb and a fragment larger than 9 kb on which the target sequence is hybridized.
Sabiendo, en base a estudios bioquímicos, que la proteína de interés debe ser codificada por un gen de aproximadamente 1,6 kb, se ha construido un banco de ADN genómico por digestión total EcoRI.Knowing, based on biochemical studies, that the protein of interest must be encoded by a gene of approximately 1.6 kb, a genomic DNA bank has been constructed by total Eco RI digestion.
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Aproximadamente 30 \mug de ADN genómico de una cepa del género Acidocella han sido digeridos por EcoRI. Después de la migración sobre gel de agarosa al 0,7%, los fragmentos cuyo tamaño está comprendido entre 3 y 4 kb han sido purificados con la ayuda del kit QIAEX II gel extraction kit (Qiagen) y desalados (microbio spin 6, Biorad). Se han purificado asimismo los fragmentos cuyo tamaño está comprendido entre 2,5 y 3 kb así como aquéllos cuyo tamaño está comprendido entre 4 y 5 kb.Approximately 30 µg of genomic DNA from a strain of the genus Acidocella have been digested by Eco RI. After migration on 0.7% agarose gel, fragments whose size is between 3 and 4 kb have been purified with the help of the QIAEX II gel extraction kit (Qiagen) and desalted (microbe spin 6, Biorad) . Fragments whose size is between 2.5 and 3 kb have been purified as well as those whose size is between 4 and 5 kb.
Los fragmentos purificados han sido insertados en un vector pBlueScript KS (II+) con la ayuda de la T4 DNA ligase (QBIOgene). Los productos de la ligación realizada con los fragmentos cuyo tamaño está comprendido entre 3 y 4 kb han sido utilizados para transformar la cepa MC 1061 de E. coli mediante electroporación. Después de la transformación, las células se recogen en SOC (2% de triptona, 0,5% de extracto de levadura, 0,05% de NaCl, 2,5 mM de KCl, 10 mM de MgCl_{2}, 20 mM de glucosa) y se disponen durante 1 hora a 37ºC antes de ser extendidas sobre un medio LB suplementado con ampicilina (100 \mug/ml). Las cajas de Petri se incuban entonces durante una noche a 37ºC.The purified fragments have been inserted into a pBlueScript KS (II +) vector with the help of the T4 DNA ligase (QBIOgene). The products of the ligation made with the fragments whose size is between 3 and 4 kb have been used to transform E. coli strain MC 1061 by electroporation. After transformation, the cells are collected in SOC (2% tryptone, 0.5% yeast extract, 0.05% NaCl, 2.5 mM KCl, 10 mM MgCl2, 20 mM glucose) and are placed for 1 hour at 37 ° C before being spread on an LB medium supplemented with ampicillin (100 µg / ml). The Petri dishes are then incubated overnight at 37 ° C.
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Se han cribado entonces 383 colonias distintas mediante PCR utilizando el juego de cebadores Oligo 29 y Oligo 39.383 different colonies have been screened by PCR using the Oligo 29 and Oligo primer set 39.
De estos clones, 4 han permitido la obtención de un producto PCR de aproximadamente 400 pb. Dos de los clones que permiten la amplificación de un fragmento de tamaño esperado se han utilizado para realizar una mini-preparación de plásmido (con la ayuda del kit Qiagen).Of these clones, 4 have allowed obtaining a PCR product of approximately 400 bp. Two of the clones that allow amplification of a fragment of expected size have used to perform a mini-preparation of plasmid (with the help of the Qiagen kit).
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Los dos plásmidos identificados han sido digeridos por EcoRI y EcoRV. La secuenciación de sus insertos ha mostrado que estos dos plásmidos tenían el mismo inserto. El análisis de las secuencias ha permitido demostrar una fase abierta de lectura de 1.665 pb que corresponde a una proteína de 554 aminoácidos. Además, las secuencias que codifican los 4 péptidos internos secuenciados en el ejemplo 6 han sido encontradas en esta fase de lectura.The two identified plasmids have been digested by Eco RI and Eco RV. Sequencing of their inserts has shown that these two plasmids had the same insert. Sequence analysis has allowed to demonstrate an open reading phase of 1,665 bp corresponding to a 554 amino acid protein. In addition, the sequences encoding the 4 internal peptides sequenced in example 6 have been found in this reading phase.
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La secuencia que contiene la fase abierta de lectura (denominada ORF281) identificada en el inserto genómico clonado en el ejemplo 7 ha sido amplificada por PCR con los oligonucleótidos 5'ORF281 y 3'ORF281.The sequence that contains the open phase of reading (called ORF281) identified in the genomic insert cloned in example 7 has been amplified by PCR with the 5'ORF281 and 3'ORF281 oligonucleotides.
- 5'ORF2815'ORF281
- 5' TAA CGA TAA \underline{CAT \ ATG} AAT ATC CGC CGG GCT CT 3'5 'TAA CGA TAA \ underline {CAT \ ATG} AAT ATC CGC CGG GCT CT 3 '
- 3'ORF2813'ORF281
- 5' ATA TCT GAT \underline{AAG \ CTT} TTA TTC GGC GTG CGC GGC 3'5 'ATA TCT GAT \ underline {AAG \ CTT} TTA TTC GGC GTG CGC GGC 3 '
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El producto PCR ha sido purificado y digerido por las enzimas de restricción NdeI e HindIII y después sub-clonado en el vector pETCm digerido por las mismas enzimas. El vector obtenido se denomina pETCm281. El inserto ORF281 ha sido secuenciado con el fin de verificar que la secuencia clonada es idéntica a la determinada a partir de los insertos genómicos previamente clonados.The PCR product has been purified and digested by the restriction enzymes Nde I and Hind III and then sub-cloned into the pETCm vector digested by the same enzymes. The vector obtained is called pETCm281. The ORF281 insert has been sequenced in order to verify that the cloned sequence is identical to that determined from the previously cloned genomic inserts.
El vector pETCm comprende un gen de resistencia al cloramfenicol. Su utilización, y por lo tanto la de la resistencia al cloramfenicol como marcador de selección, permite la expresión in vivo en una cepa de E. coli resistente a la kanamicina: la cepa BL21 appA (fitasa-).The pETCm vector comprises a chloramphenicol resistance gene. Its use, and therefore that of chloramphenicol resistance as a selection marker, allows expression in vivo in a strain of E. coli resistant to kanamycin: strain BL21 appA (phytase-).
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Se han realizado unos ensayos de expresión in vivo en la cepa E. coli BL21 appA. Esta cepa ya no expresa ninguna fitasa endógena debido a una inserción de un gen de resistencia a la kanamicina en el gen appA que codifica para la fitasa de E. coli. Un vector de control ha sido preparado asimismo con el gen TEM que codifica la \beta-lactamasa de E. coli. El gen TEM ha sido clonado asimismo en el vector pETCm, y el vector obtenido ha sido denominado pETCmTEM. In vivo expression assays have been performed in the E. coli BL21 appA strain. This strain no longer expresses any endogenous phytase due to an insertion of a kanamycin resistance gene into the appA gene that codes for E. coli phytase. A control vector has also been prepared with the TEM gene encoding E. coli β-lactamase. The TEM gene has also been cloned into the pETCm vector, and the vector obtained has been called pETCmTEM.
La cepa de E. coli BL21 appA ha sido transformada por los vectores pETCmTEM o pETCm281. Se han seleccionado unas colonias aisladas sobre medio LB adicionado con 60 mg/l de kanamicina y con 20 mg/l de cloramfenicol. Una colonia de cada tipo ha sido cultivada en un medio LB adicionado con kanamicina y con cloramfenicol a las mismas concentraciones. Estos cultivos han sido utilizados para preparar unas reservas gliceroladas (un volumen de células para un volumen de glicerol de 40%) a partir de las cuales se inoculan los cultivos destinados a realizar los ensayos de expresión. Estas reservas gliceroladas se conservan a -80ºC.The E. coli BL21 appA strain has been transformed by the pETCmTEM or pETCm281 vectors. Isolated colonies on LB medium added with 60 mg / l of kanamycin and with 20 mg / l of chloramphenicol have been selected. A colony of each type has been grown in an LB medium added with kanamycin and with chloramphenicol at the same concentrations. These cultures have been used to prepare glycerol reserves (a volume of cells for a volume of glycerol of 40%) from which the cultures destined to perform the expression tests are inoculated. These glycerol reserves are stored at -80 ° C.
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La cepa E. coli BL21 appA pETCm281 ha sido cultivada en medio M98 (medio Terrific Broth modificado (con glucosa) que contiene, para 1 litro, 12 g de Bacto Tryptone, 24 g de extracto de levadura, 9,4 g de K_{2}HPO_{4}, y 2,2 g de KH_{2}PO_{4}, pH 7,2, autoclavado, a los que se añaden 20 ml de glucosa (50%) por litro de media antes de la utilización) en paralelo con la cepa E. coli BL21 appA pETCmTEM. La expresión se induce mediante la adición de 0,25 mM de IPTG, y se realiza a dos temperaturas: 30 y 37ºC. E. coli strain BL21 appA pETCm281 has been grown in M98 medium (modified Terrific Broth medium (with glucose) containing, for 1 liter, 12 g of Bacto Tryptone, 24 g of yeast extract, 9.4 g of K_ { 2} HPO4, and 2.2 g of KH2PO4, pH 7.2, autoclaved, to which 20 ml of glucose (50%) are added per liter on average before use ) in parallel with strain E. coli BL21 appA pETCmTEM. Expression is induced by the addition of 0.25 mM of IPTG, and is carried out at two temperatures: 30 and 37 ° C.
Después de 3 horas de inducción, los cultivos se centrifugan. La actividad fitasa se determina sobre cada residuo resuspendido en tampón formiato para alcanzar una concentración final de 5 mg/ml de células secas. No se ha encontrado ninguna actividad para la cepa que contiene pETCm281 así como la cepa que contiene pETCmTEM, sean cuales sean las condiciones de cultivo.After 3 hours of induction, the cultures are centrifuge Phytase activity is determined on each residue resuspended in formate buffer to reach a concentration final 5 mg / ml dry cells. None found activity for the strain that contains pETCm281 as well as the strain that Contains pETCmTEM, whatever the culture conditions.
Unas alícuotas de residuos de los cultivos inducidos y no inducidos que contienen pETCm281 han sido tratadas entonces con ultrasonidos y después centrifugadas. El sobrenadante representa la fracción de las proteínas solubles y el residuo las proteínas insolubles.Aliquots of crop residues Induced and uninduced containing pETCm281 have been treated then with ultrasound and then centrifuged. The supernatant represents the fraction of soluble proteins and the residue insoluble proteins
Estas dos fracciones han sido depositadas sobre gel desnaturalizante SDS-PAGE.These two fractions have been deposited on SDS-PAGE denaturing gel.
Aparece claramente una banda proteica de PM 63 kDa en la fracción insoluble de la cepa E. coli BL21 appA pETCm281 inducida con el IPTG. No se encuentra ninguna banda correspondiente en el control negativo no inducido. La ORF281 está por lo tanto bien expresada en E. coli. Sin embargo, la proteína correspondiente es insoluble y aparentemente inactiva en esta forma.A protein band of PM 63 kDa clearly appears in the insoluble fraction of E. coli strain BL21 appA pETCm281 induced with the IPTG. No corresponding band is found in the uninduced negative control. ORF281 is therefore well expressed in E. coli . However, the corresponding protein is insoluble and apparently inactive in this way.
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Se ha realizado una serie de etapas que tienen como objetivo solubilizar y después renaturalizar la proteína codificada por ORF281 con el fin de determinar si esta proteína posee o no una actividad fitasa.There have been a series of stages that have as a goal to solubilize and then renaturalize the protein encoded by ORF281 in order to determine if this protein owns a phytase activity or not
La cepa E. coli BL21 appA pETCm281 se cultiva en medio M98 y después se induce con 0,25 mM de IPTG cuando la DO a 600 nm alcanza 0,4. Después de 3 horas de inducción, el cultivo se centrifuga (DO final alrededor de 1). El residuo se recoge en tampón Tris-HCl 20 mM, pH 8,0 a razón de 4 ml para 100 ml de cultivo. Las células se tratan con ultrasonidos a 4ºC: 4 ciclos de 10 segundos a una potencia de 500 Vatios. La DO_{600} pasa de 14 a 3. La suspensión se centrifuga a continuación durante 10 minutos a 16.000 g, y después se elimina el sobrenadante. E. coli strain BL21 appA pETCm281 is grown in M98 medium and then induced with 0.25 mM of IPTG when the OD at 600 nm reaches 0.4. After 3 hours of induction, the culture is centrifuged (final OD about 1). The residue is taken up in 20 mM Tris-HCl buffer, pH 8.0 at a rate of 4 ml for 100 ml of culture. The cells are treated with ultrasound at 4 ° C: 4 cycles of 10 seconds at a power of 500 Watts. The OD 600 goes from 14 to 3. The suspension is then centrifuged for 10 minutes at 16,000 g, and then the supernatant is removed.
El residuo se resuspende en 5 ml para 100 ml de cultivo de tampón de solubilización: Tris-HCl 20 mM pH 8, urea 8M, NaCl 0,5 M, 2-mercaptoetanol 1 mM. La suspensión se trata con ultrasonidos a razón de 4 ciclos de 10 segundos a una potencia de 500 Vatios, y después se agita durante 1 hora a temperatura ambiente. Después, se dializan 30 ml de esta suspensión a 4ºC durante 16 horas contra 3 litros de tampón de renaturalización. MES 25 mM pH 6,5, 0,5 M NaCl, 1 mM Mercaptoetanol (Cutt-off 10 kDa). Se realiza una segunda diálisis contra 3 litros de tampón de renaturalización MES 25 mM pH 5,5, 0,5 M NaCl, 1 mM Mercaptoetanol (Cutt-off 10 kDa) durante 5 horas. Después, la suspensión se centrifuga durante 10 minutos a 16.000 g y se conserva a 4ºC antes de la dosificación enzimática.The residue is resuspended in 5 ml for 100 ml of solubilization buffer culture: 20 mM Tris-HCl pH 8, 8M urea, 0.5M NaCl, 1mM 2-mercaptoethanol. The suspension is treated with ultrasound at a rate of 4 cycles of 10 seconds at a power of 500 watts, and then stir for 1 Hour at room temperature. Then, 30 ml of this is dialyzed suspension at 4 ° C for 16 hours against 3 liters of buffer renaturation 25 mM MES pH 6.5, 0.5 M NaCl, 1 mM Mercaptoethanol (Cut-off 10 kDa). A second dialysis is performed against 3 liters of 25 mM MES renaturation buffer pH 5.5, 0.5 M NaCl, 1 mM Mercaptoethanol (Cut-off 10 kDa) for 5 hours Then, the suspension is centrifuged for 10 minutes at 16,000 g and stored at 4 ° C before dosing enzymatic
El mismo protocolo de cultivo, de solubilización y de renaturalización ha sido aplicado a la cepa E. coli BL21 appA pETCmTEM.The same culture, solubilization and renaturation protocol has been applied to strain E. coli BL21 appA pETCmTEM.
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Las suspensiones de las proteínas renaturalizadas producidas por las cepas E. coli BL21 appA pETCm281 y pETCmTEM han sido concentradas 10 veces sobre Nanosep^{TM} 10K Omega (Pall). La actividad fitasa se mide sobre estas disoluciones concentradas según un protocolo estándar (a pH 3,5). Este ensayo se ha realizado por duplicado.The suspensions of the renatured proteins produced by the E. coli BL21 appA strains pETCm281 and pETCmTEM have been concentrated 10 times on Nanosep ™ 10K Omega (Pall). Phytase activity is measured on these concentrated solutions according to a standard protocol (at pH 3.5). This test has been performed in duplicate.
Sólo se detecta una actividad fitasa en la cepa E. coli BL21 appA pETCm281. Esta actividad se confirma mediante una dosificación pMUF. Utilizando este método fluorométrico, no se detecta ninguna actividad en la cepa E. coli BL21 appA pETCmTEM, a pesar de que esta dosificación es cinco veces más sensible que el método colorimétrico utilizado generalmente.Only one phytase activity is detected in E. coli strain BL21 appA pETCm281. This activity is confirmed by a pMUF dosage. Using this fluorometric method, no activity is detected in E. coli strain BL21 appA pETCmTEM, although this dosage is five times more sensitive than the usual colorimetric method.
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La fracción resolubilizada de los cuerpos de inclusión de la cepa E. coli BL21 appA pETCm281 ha sido depositada sobre una columna POROS 20 HS (4,6/100 mm: 1,7 ml de gel) previamente equilibrada con un tampón 20 mM MES pH 5,5, 1 mM de CaCl_{2}. Las proteínas se eluyen mediante un gradiente NaCl de 0 a 1 M en 20 volúmenes de columnas.The resolubilized fraction of the inclusion bodies of the E. coli BL21 appA pETCm281 strain has been deposited on a POROS 20 HS column (4.6 / 100 mm: 1.7 ml gel) previously equilibrated with a 20 mM MES pH buffer 5.5, 1 mM of CaCl2. The proteins are eluted by a NaCl gradient from 0 to 1 M in 20 column volumes.
La actividad fitasa se eluye a una concentración en NaCl de 0,35 M. Este resultado es en todos los puntos idéntico al obtenido en el ejemplo 5.4. con la fitasa nativa.Phytase activity elutes at a concentration in 0.35 M NaCl. This result is at all points identical to obtained in example 5.4. With the native phytase.
En paralelo, un extracto total (proteínas solubles e insolubles) de E. coli BL21 appA pETCmTEM ha sido depositado sobre la misma columna, y las proteínas han sido eluidas en las mismas condiciones. No se ha podido detectar ninguna actividad fitasa en las fracciones eluidas entre 0,15 y 0,45 M NaCl.In parallel, a total extract (soluble and insoluble proteins) of E. coli BL21 appA pETCmTEM has been deposited on the same column, and the proteins have been eluted under the same conditions. No phytase activity could be detected in fractions eluted between 0.15 and 0.45 M NaCl.
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La fracción que presenta una actividad fitasa, procedente de la columna intercambiadora de cationes, ha sido depositada sobre un gel SDS-PAGE (10% de acrilamida) después de la concentración de un factor 10 sobre Nanosep^{TM}. En el mismo gel, se ha depositado asimismo un lisado de células (inducidas con el IPTG) de E. coli BL21 appA pETCm281 y E. coli BL21 appA pETCmTEM.The fraction that has a phytase activity, originating from the cation exchange column, has been deposited on an SDS-PAGE gel (10% acrylamide) after the concentration of a factor 10 on Nanosep ™. In the same gel, a cell lysate (induced with IPTG) of E. coli BL21 appA pETCm281 and E. coli BL21 appA pETCmTEM has also been deposited.
Aparece también claramente que sólo el lisado de E. coli BL21 appA pETCm281 contiene una banda de PM 63 kDa. En la fracción purificada sobre columna y que presenta una actividad fitasa, una banda de PM 61-63 kDa está presente y es mayoritaria.It also appears clearly that only the E. coli BL21 appA pETCm281 lysate contains a 63 kDa PM band. In the purified fraction on a column and presenting a phytase activity, a band of PM 61-63 kDa is present and is the majority.
Estos resultados muestran por lo tanto, después de la sub-clonación en E. coli BL21 appA, que la ORF281 codifica bien para una fitasa.These results show, therefore, after sub-cloning in E. coli BL21 appA , that ORF281 encodes well for a phytase.
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La actividad de la fitasa contenida en la fracción purificada en el ejemplo 5.5 y codificada por la ORF281 se ha determinado a diferentes temperaturas. Los resultados de estas mediciones se presentan en la figura 5. La temperatura óptima de actividad medida es de 60ºC. La dosificación ha sido realizada a pH 3.The phytase activity contained in the fraction purified in example 5.5 and encoded by ORF281 is It has determined at different temperatures. The results of these measurements are presented in figure 5. The optimum temperature of measured activity is 60 ° C. The dosage has been carried out at pH 3.
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La actividad de la fitasa contenida en la fracción purificada en el ejemplo 5.5 y codificada por la ORF281 se ha determinado asimismo a diferentes pH. Los resultados de estas mediciones se presentan en la figura 5. El pH óptimo de actividad es de 3,5. La dosificación se ha realizado a 60ºC con la sucesión de tampones siguientes: Glicina-HCl (para los pH de 2 a 2,5), Formiato (pH de 2,5 a 4), Acetato (pH de 4 a 5), y MES (pH de 5 a 6).The phytase activity contained in the fraction purified in example 5.5 and encoded by ORF281 is It has also determined at different pH. The results of these measurements are presented in figure 5. The optimal activity pH is of 3.5 The dosage has been carried out at 60 ° C with the succession of following buffers: Glycine-HCl (for pH 2 to 2.5), Formate (pH 2.5 to 4), Acetate (pH 4 to 5), and MONTH (pH of 5 to 6).
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La secuencia que contiene la fase abierta de lectura identificada en el fragmento genómico clonado en el ejemplo 7 ha sido utilizada como sonda para buscar unas secuencias homólogas entre los microorganismos de los géneros Acidocella y Acidiphilium.The sequence containing the open reading phase identified in the cloned genomic fragment in Example 7 has been used as a probe to search for homologous sequences between microorganisms of the Acidocella and Acidiphilium genera.
Las cepas ensayadas pertenecen a las especies Acidocella aminolytica, Acidocella facilis, Acidiphilium angustrum, y Acidiphilium multivorum.The strains tested belong to the species Acidocella aminolytica, Acidocella facilis, Acidiphilium angustrum , and Acidiphilium multivorum .
Se han marcado 10 ng de producto PCR purificado mediante "random priming" con la ayuda del kit Labelling Q-BlOgene. Se han digerido 10 \mug de ADN genómico de las diferentes cepas a ensayar respectivamente mediante EcoRI o EcoRV y después se han depositado sobre dos geles de agarosa 1%. Después de la migración, se ha transferido el ADN por capilaridad sobre dos membranas de nylon (BIODYNE® Plus membrane, Pall Gelman).10 ng of purified PCR product have been labeled by "random priming" with the aid of the Labelling Q-BlOgene kit. 10 µg of genomic DNA from the different strains to be tested respectively by Eco RI or Eco RV have been digested and then deposited on two 1% agarose gels. After migration, the DNA has been transferred by capillarity onto two nylon membranes (BIODYNE® Plus membrane, Pall Gelman).
Se ha llevado a cabo una pre-hibridación durante 4 h a 60ºC con un tampón 5x SSC, 5x Dehardt, 1% SDS, 100 \mug/ml de ADN desnaturalizado de pescado.It has carried out a pre-hybridization for 4 h at 60 ° C with a 5x buffer SSC, 5x Dehardt, 1% SDS, 100 µg / ml denatured DNA from fish.
La hibridación se realiza a continuación durante 16 h a 60ºC con un tampón que contiene 10 ml de tampón de pre-hibridación y 10 ng de la sonda a respectivamente 7.10^{8} y 9.10^{8} cpm/\mug para la membrana 1 (EcoRI) y la membrana 2 (EcoRV) (recuento con contador de centelleos en seco, es decir, en ausencia de centelleo).Hybridization is then performed during 16 h at 60 ° C with a buffer containing 10 ml of buffer pre-hybridization and 10 ng of the probe a respectively 7.10 8 and 9.10 8 cpm / mug for the membrane 1 (EcoRI) and membrane 2 (EcoRV) (count with counter dry scintillation, that is, in the absence of scintillation).
Se han realizado a continuación varias fases de lavado:Several phases of washed:
- 2 lavados: 2x SCC + 0,1% SDS durante 3 minutos a 20ºC2 washes: 2x SCC + 0.1% SDS for 3 minutes at 20 ° C
- 2 lavados: 0,5x SCC + 0,1% SDS durante 3 minutos a 20ºC2 washes: 0.5x SCC + 0.1% SDS for 3 minutes at 20 ° C
- 2 lavados: 0,4x SCC + 0,1% SDS durante 15 minutos a 50ºC2 washes: 0.4x SCC + 0.1% SDS for 15 minutes at 50 ° C
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Las membranas han sido reveladas sobre película después de una exposición de 65 h a -80ºC.The membranes have been revealed on film after an exposure of 65 h at -80 ° C.
No se ha observado ninguna diferencia significativa entre las dos autorradiografías.No difference has been observed significant between the two autoradiographs.
Los resultados muestran la presencia, en todas las cepas del género Acidocella ensayadas, de una hibridación selectiva de la sonda que contiene la fase abierta de lectura identificada en el ejemplo 7. Estos resultados sugieren que existe una homología de secuencia significativa entre unos genes de bacterias del género Acidocella y la fase abierta de lectura identificada que codifica para una fitasa. Además, sugieren en gran medida que estos genes codifican asimismo para unas fitasas.The results show the presence, in all strains of the genus Acidocella tested, of a selective hybridization of the probe containing the open reading phase identified in example 7. These results suggest that there is a significant sequence homology between bacteria genes of the genus Acidocella and the open reading phase that codes for a phytase. In addition, they strongly suggest that these genes also code for phytases.
A la inversa, no se ha obtenido ninguna hibridación con la sonda en el seno de los microorganismos del género Acidiphilum. Esta observación está de acuerdo con la ausencia de detección de una actividad fitasa mediante unos métodos microbiológicos en los microorganismos de este género.Conversely, no hybridization has been obtained with the probe within the microorganisms of the Acidiphilum genus. This observation is in agreement with the absence of detection of a phytase activity by microbiological methods in microorganisms of this genus.
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<110> Aventis Animal Nutrition SA<110> Aventis Animal Nutrition SA
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<120> Nuevas fitasas bacterianas y procedimiento de producción de estas fitasas<120> New bacterial phytases and production process of these phytases
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<130> PM 00080<130> PM 00080
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<140><140>
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<141><141>
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<150> FR 0014448<150> FR 0014448
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<151> 2000-11-10<151> 2000-11-10
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<160> 11<160> 11
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<170> PatentIn Ver. 2.1<170> PatentIn Ver. 2.1
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<210> 1<210> 1
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<211> 1665<211> 1665
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<212> ADN<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<213> g. Acidocella <213> g. Acidocella
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<220><220>
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<221> CDS<221> CDS
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<222> (1)..(1665)<222> (1) .. (1665)
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<400> 1<400> 1
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<210> 2<210> 2
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<211> 554<211> 554
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<212> PRT<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<213> g. Acidocella <213> g. Acidocella
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<400> 2<400> 2
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<210> 3<210> 3
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<211> 20<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<212> ADN<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<213> Secuencia artificial<213> Artificial sequence
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<220><220>
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<223> Descripción de la secuencia artificial: Oligo10<223> Sequence description artificial: Oligo10
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<400> 3<400> 3
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipatdatdatng cngtrttytt
\hfill20
\ hskip-.1em \ dddseqskipatdatdatng cngtrttytt
\ hfilltwenty
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<210> 4<210> 4
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<211> 32<211> 32
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<212> ADN<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<213> Secuencia artificial<213> Artificial sequence
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<220><220>
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<223> Descripción de la secuencia artificial: Oligo12<223> Sequence description artificial: Oligo12
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<400> 4<400> 4
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskiptcrtcrtasg tgatgatgat sgcsgtrtty tt
\hfill32
\ hskip-.1em \ dddseqskiptcrtcrtasg tgatgatgat sgcsgtrtty tt
\ hfill32
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<210> 5<210> 5
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<211> 23<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<212> ADN<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<213> Secuencia artificial<213> Artificial sequence
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<220><220>
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<223> Descripción de la secuencia artificial: Oligo22<223> Sequence description artificial: Oligo22
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<400> 5<400> 5
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipaaratggarg gncaraayat hgg
\hfill23
\ hskip-.1em \ dddseqskipaaratggarg gncaraayat hgg
\ hfill2. 3
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<210> 6<210> 6
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<211> 23<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<212> ADN<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<213> Secuencia artificial<213> Artificial sequence
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<220><220>
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<223> Descripción de la secuencia artificial: Oligo23<223> Sequence description artificial: Oligo23
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<400> 6<400> 6
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipatggaaggcc agaayatcgg cga
\hfill23
\ hskip-.1em \ dddseqskipatggaaggcc agaayatcgg cga
\ hfill2. 3
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<210> 7<210> 7
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<211> 23<211> 23
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<212> ADN<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<213> Secuencia artificial<213> Artificial sequence
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<220><220>
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<223> Descripción de la secuencia artificial: Oligo 25<223> Sequence description artificial: Oligo 25
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<400> 7<400> 7
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipatcggcgayc tbctbaaygc caa
\hfill23
\ hskip-.1em \ dddseqskipatcggcgayc tbctbaaygc caa
\ hfill2. 3
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<210> 8<210> 8
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<211> 19<211> 19
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<212> ADN<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<213> Secuencia artificial<213> Artificial sequence
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<220><220>
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<223> Descripción de la secuencia artificial: Oligo29<223> Sequence description artificial: Oligo29
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<400> 8<400> 8
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipttcatgggtg gcttcgatc
\hfill19
\ hskip-.1em \ dddseqskipttcatgggtg gcttcgatc
\ hfill19
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<210> 9<210> 9
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<211> 20<211> 20
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<212> ADN<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<213> Secuencia artificial<213> Artificial sequence
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<220><220>
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<223> Descripción de la secuencia artificial: Oligo30<223> Sequence description artificial: Oligo30
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<400> 9<400> 9
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipgctgccgcat caggaagttg
\hfill20
\ hskip-.1em \ dddseqskipgctgccgcat caggaagttg
\ hfilltwenty
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<210> 10<210> 10
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<211> 32<211> 32
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<212> ADN<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<213> Secuencia artificial<213> Artificial sequence
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<220><220>
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<223> Descripción de la secuencia artificial: 5'ORF281<223> Sequence description artificial: 5'ORF281
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<400> 10<400> 10
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskiptaacgataac atatgaatat ccgccgggct ct
\hfill32
\ hskip-.1em \ dddseqskiptaacgataac atatgaatat ccgccgggct ct
\ hfill32
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<210> 11<210> 11
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<211> 33<211> 33
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<212> ADN<212> DNA
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<213> Secuencia artificial<213> Artificial sequence
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<220><220>
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<223> Descripción de la secuencia artificial: 3'ORF281<223> Sequence description artificial: 3'ORF281
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
<400> 11<400> 11
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip\ vskip0.400000 \ baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskipatatctgata agcttttatt cggcgtgcgc ggc
\hfill33
\ hskip-.1em \ dddseqskipatatctgata agcttttatt cggcgtgcgc ggc
\ hfill33
Claims (47)
- (a)(to)
- un polinucleótido aislado que codifica para la fitasa descrita por el identificador de secuencia SEC ID nº 2a isolated polynucleotide encoding the phytase described by the sequence identifier SEQ ID No. 2
- (b)(b)
- un polinucleótido aislado que se hibrida al polinucleótido según (a) en unas condiciones astringentesa isolated polynucleotide that hybridizes to the polynucleotide according to (a) in astringent conditions
- (c)(C)
- un polinucleótido aislado que presenta por lo menos 70% de identidad con el polinucleótido según (a)a isolated polynucleotide that has at least 70% identity with the polynucleotide according to (a)
- presentando dicha fitasa un pH óptimo de actividad inferior o igual a 4.presenting said phytase an optimum pH of activity less than or equal to Four.
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
- (a)(to)
- la fitasa representada por el identificador de secuencia SEC ID nº 2the phytase represented by sequence identifier SEQ ID NO. 2
- (b)(b)
- una fitasa que presenta por lo menos 70% de identidad con la fitasa según (a)a phytase that has at least 70% identity with phytase according to
- (c)(C)
- un fragmento biológicamente activo de una fitasa según (a) o (b).a biologically active fragment of a phytase according to (a) or (b).
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
- (a)(to)
- un promotor funcional en un organismo hospedantea functional promoter in a host organism
- (b)(b)
- un polinucleótido según una de las reivindicaciones 1 a 4a polynucleotide according to one of claims 1 to 4
- (c)(C)
- un elemento terminador funcional en un organismo hospedante.a functional terminating element in a host organism.
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
- (a)(to)
- temperatura óptima = 70ºCoptimum temperature = 70ºC
- (b)(b)
- pH óptimo = 4.pH optimal = 4.
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
- (a)(to)
- temperatura óptima = 60ºCoptimum temperature = 60ºC
- (b)(b)
- pH óptimo = 3,5.pH optimal = 3.5.
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
- (a)(to)
- cultivar una cepa bacteriana del género Acidocella grow a bacterial strain of the genus Acidocella
- (b)(b)
- concentrar las bacterias cultivadas en la etapa (a)concentrate cultured bacteria on the stage
- (c)(C)
- triturar las bacterias aisladas en la etapa (b)crush the bacteria isolated in the stage (b)
- (d)(d)
- centrifugar el triturado obtenido en la etapa (c)centrifuge the crushing obtained in the stage (c)
- (e)(and)
- recuperar el sobrenadante que posee la actividad fitasa procedente de la etapa (d).recover the supernatant that has the phytase activity from stage (d).
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
- (a)(to)
- cultivar una cepa bacteriana del género Acidocella grow a bacterial strain of the genus Acidocella
- (b)(b)
- concentrar las bacterias cultivadas en la etapa (a)concentrate cultured bacteria on the stage
- (c)(C)
- triturar las bacterias aisladas en la etapa (b)crush the bacteria isolated in the stage (b)
- (d)(d)
- centrifugar el triturado obtenido en la etapa (c)centrifuge the crushing obtained in the stage (c)
- (e)(and)
- recuperar el sobrenadante que posee la actividad fitasa procedente de la etapa (d)recover the supernatant that has the phytase activity from stage (d)
- (f)(F)
- purificar la fitasa a partir del sobrenadante recuperado en la etapa (e).purify phytase from supernatant recovered in step (e).
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
- (a)(to)
- cultivar una cepa bacteriana del género Acidocella grow a bacterial strain of the genus Acidocella
- (b)(b)
- recuperar el medio de cultivo mediante eliminación de las bacteriasrecover the culture medium by bacteria removal
- (c)(C)
- purificar la fitasa a partir del medio de cultivo recuperado en la etapa (d).purify phytase from the medium of culture recovered in step (d).
\newpage\ newpage
- (a)(to)
- cultivar un organismo hospedante transformado según una de las reivindicaciones 12 a 18cultivate a host organism transformed according to one of claims 12 to 18
- (b)(b)
- concentrar el organismo hospedante cultivado en la etapa (a)concentrate the host organism cultivated in stage (a)
- (c)(C)
- triturar el organismo hospedante transformado aislado en la etapa (b)crush the host organism isolated transform in stage (b)
- (d)(d)
- centrifugar el triturado obtenido en la etapa (c)centrifuge the crushing obtained in the stage (c)
- (e)(and)
- recuperar el sobrenadante que posee la actividad fitasa procedente de la etapa (d)recover the supernatant that has the phytase activity from stage (d)
- (f)(F)
- purificar la fitasa a partir del sobrenadante recuperado en la etapa (e).purify phytase from supernatant recovered in step (e).
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
- (a)(to)
- cultivar un organismo hospedante transformado según una de las reivindicaciones 12 a 18cultivate a host organism transformed according to one of claims 12 to 18
- (b)(b)
- recuperar el medio de cultivo mediante la eliminación de dicho organismo hospedante transformadorecover the culture medium by the elimination of said transformed host organism
- (c)(C)
- purificar la fitasa a partir del medio de cultivo recuperado en la etapa (b).purify phytase from the medium of culture recovered in step (b).
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
- (a)(to)
- cultivar un organismo hospedante según una de las reivindicaciones 12 a 18cultivate a host organism according to one of claims 12 to 18
- (b)(b)
- concentrar el organismo hospedante cultivado en la etapa (a)concentrate the host organism cultivated in stage (a)
- (c)(C)
- incorporar el organismo hospedante aislado en la etapa (b) en dicha composición alimenticia.incorporate the host organism isolated in step (b) in said food composition.
\newpage\ newpage
- (a)(to)
- cultivar una cepa bacteriana del género Acidocella grow a bacterial strain of the genus Acidocella
- (b)(b)
- concentrar las bacterias cultivadas en la etapa (a)concentrate cultured bacteria on the stage
- (c)(C)
- incorporar las bacterias aisladas en la etapa (b) en dicha composición alimenticia.incorporate isolated bacteria into step (b) in said food composition.
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
- (a)(to)
- cultivar una cepa bacteriana del género Acidocella grow a bacterial strain of the genus Acidocella
- (b)(b)
- concentrar las bacterias cultivadas en la etapa (a)concentrate cultured bacteria on the stage
- (c)(C)
- triturar las bacterias aisladas en la etapa (b)crush the bacteria isolated in the stage (b)
- (d)(d)
- centrifugar el triturado obtenido en la etapa (c)centrifuge the crushing obtained in the stage (c)
- (e)(and)
- recuperar el sobrenadante que posee la actividad fitasa procedente de la etapa (d)recover the supernatant that has the phytase activity from stage (d)
- (f)(F)
- incorporar el sobrenadante recuperado en la etapa (e) en dicha composición alimenticia.incorporate the recovered supernatant in step (e) in said food composition.
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
- (a)(to)
- cultivar una cepa bacteriana del género Acidocella grow a bacterial strain of the genus Acidocella
- (b)(b)
- concentrar las bacterias cultivadas en la etapa (a)concentrate cultured bacteria on the stage
- (c)(C)
- triturar las bacterias aisladas en la etapa (b)crush the bacteria isolated in the stage (b)
- (d)(d)
- centrifugar el triturado obtenido en la etapa (c)centrifuge the crushing obtained in the stage (c)
- (e)(and)
- recuperar el sobrenadante que posee la actividad fitasa procedente de la etapa (d)recover the supernatant that has the phytase activity from stage (d)
- (f)(F)
- purificar la fitasa a partir del sobrenadante recuperado en la etapa (e)purify phytase from supernatant recovered in step (e)
- (g)(g)
- incorporar la fitasa purificada en la etapa (f) en dicha composición alimenticia.incorporate purified phytase into the step (f) in said food composition.
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
- (a)(to)
- cultivar una cepa bacteriana del género Acidocella grow a bacterial strain of the genus Acidocella
- (b)(b)
- recuperar el medio de cultivo mediante la eliminación de las bacteriasrecover the culture medium by the elimination of bacteria
- (c)(C)
- purificar la fitasa a partir del medio de cultivo recuperado en la etapa (b)purify phytase from the medium of crop recovered in stage (b)
- (d)(d)
- incorporar la fitasa purificada en la etapa (c) en dicha composición alimenticia.incorporate purified phytase into the step (c) in said food composition.
\vskip1.000000\baselineskip\ vskip1.000000 \ baselineskip
- (a)(to)
- cultivar un organismo hospedante transformado según una de las reivindicaciones 12 a 18cultivate a host organism transformed according to one of claims 12 to 18
- (b)(b)
- concentrar el organismo hospedante transformado cultivado en la etapa (a)concentrate the host organism transformed grown in stage (a)
- (c)(C)
- triturar el organismo hospedante transformado aislado en la etapa (b)crush the host organism isolated transform in stage (b)
- (d)(d)
- centrifugar el triturado obtenido en la etapa (c)centrifuge the crushing obtained in the stage (c)
- (e)(and)
- recuperar el sobrenadante que posee la actividad fitasa procedente de la etapa (d)recover the supernatant that has the phytase activity from stage (d)
- (f)(F)
- purificar la fitasa a partir del sobrenadante recuperado en la etapa (e)purify phytase from supernatant recovered in step (e)
- (g)(g)
- incorporar la fitasa purificada en la etapa (f) en dicha composición alimenticia.incorporate purified phytase into the step (f) in said food composition.
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- (a)(to)
- cultivar un organismo hospedante transformado según una de las reivindicaciones 12 a 18cultivate a host organism transformed according to one of claims 12 to 18
- (b)(b)
- recuperar el medio de cultivo mediante la eliminación de dicho organismo hospedante transformadorecover the culture medium by the elimination of said transformed host organism
- (c)(C)
- purificar la fitasa a partir del medio de cultivo recuperado en la etapa (b)purify phytase from the medium of crop recovered in stage (b)
- (d)(d)
- incorporar la fitasa purificada en la etapa (c) en dicha composición alimenticia.incorporate purified phytase into the step (c) in said food composition.
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