ES2314268T3 - Proteina especifica de celulas pancreaticas beta de los islotes de langerhans y sus aplicaciones. - Google Patents
Proteina especifica de celulas pancreaticas beta de los islotes de langerhans y sus aplicaciones. Download PDFInfo
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Abstract
Uso como marcador específico de células beta de los islotes pancreáticos de Langerhans de al menos un polinucleótido aislado o de la proteína correspondiente, elegido de: - los polinucleótidos que comprenden o presentan una de las siguientes secuencias: (a) la secuencia ID SEC Nº 1, (b) un fragmento de la secuencia ID SEC Nº 1 de al menos 15 nucleótidos consecutivos, (c) una secuencia que presenta un porcentaje de identidad de al menos 80% después de alineamiento óptimo con una de las secuencias definidas en (a) o en (b), y (d) una secuencia complementaria, homosentido o antisentido de una de las secuencias definidas en (a), (b) o (c), y - las proteínas codificadas por los polinucleótidos definidos en (a), (b), (c) o (d) anteriores, que comprenden o presentan una de las siguientes secuencias: (e) la secuencia ID SEC Nº 2, (f) un fragmento de la secuencia ID SEC Nº 2 de al menos 15 aminoácidos consecutivos, (g) una secuencia que presenta un porcentaje de identidad de al menos 60% después de alineamiento óptimo con una de las secuencias definidas en (e) o en (f), preferiblemente 80% de identidad, o de forma todavía más preferida 90% de identidad.
Description
Proteína específica de células pancreáticas beta
de los islotes de Langerhans y sus aplicaciones.
La presente invención se refiere a una proteína
llamada ZnT-8, expresada de forma específica en las
células pancreáticas beta de los islotes de Langerhans, al
polinucleótido que codifica dicha proteína que está implicado en la
maduración y la exocitosis de la insulina, así como a sus
aplicaciones, en particular la selección y estudio de células beta,
así como para el cribado de medicamentos activos para la diabetes y
la hiperinsulinemia.
La diabetes es una de las enfermedades más
frecuentes que afecta al 5% de la población de países
industrializados y está en constante aumento en todos los países
del mundo (previsión: 300 millones en 2025, de los cuales 2,4
millones en Francia). Entre las diversas formas de la diabetes, la
diabetes de tipo I o dependiente de insulina afecta a
aproximadamente 500.000 a 1 millón de individuos en los Estados
Unidos y 150.000 en Francia, es decir 0,2 a 0,4% de la población.
Los síntomas característicos comprenden un nivel alto de azúcar en
la sangre y en la orina, una diuresis importante, hambre y sed
intensos así como pérdida de peso.
La diabetes de tipo II no dependiente de
insulina (DNDI), descrita también con el nombre de diabetes
"grasa" o diabetes de la madurez, a menudo aparece alrededor
de la cincuentena. Se trata mediante régimen, toma de medicamentos
por vía oral e insulina, después de algunos años de evolución. Hoy
en día, 2 millones de franceses son tratados con medicamentos
antidiabéticos y/o insulina.
Aunque la diabetes se puede controlar mediante
inyecciones de insulina y aportes controlados de glúcidos, las
complicaciones asociadas a esta patología necesitan actualmente
nuevos procedimientos para su prevención, tratamiento y
diagnóstico.
El páncreas comprende dos estructuras distintas
tanto morfológica como fisiológicamente:
- el páncreas exocrino que produce las enzimas
que intervienen en la digestión (amilasa, lipasa, etc.) y el
bicarbonato sódico;
- el páncreas endocrino que produce las hormonas
que intervienen en el control de la glucosa en la sangre (insulina,
glucagón, somatostatina y polipéptido pancreático).
Las células del páncreas endocrino están
organizadas en microórganos dispersos en el páncreas en forma de
islotes (islotes de Langerhans o islotes pancreáticos). Cada islote
pancreático está compuesto de 4 tipos celulares: las células alfa,
beta, delta y las células PP. Las células alfa están situadas en la
periferia del islote y segregan el glucagón. Las células beta se
encuentran en el centro del islote y son las únicas células capaces
de secretar insulina en respuesta a la glucosa. Las células delta
están en la periferia y segregan la somatostatina. La función de
las células PP es más controvertida (síntesis del polipéptido
pancreático).
La ausencia de modelo celular de estudio de la
célula beta, así como la ausencia de un medio fiable y eficaz de
selección celular adaptado a este tipo de células, frena el estudio
de su funcionamiento y por lo tanto la puesta a punto de nuevos
procedimientos de tratamiento de la diabetes de tipo I y II.
Entre los tratamientos de la diabetes, además de
la administración regular de insulina, una de las vías del control
fisiológico de la glucemia y de la normalización de la glucemia en
los diabéticos, es el paso por la restauración de una secreción de
insulina in vivo a partir de células. Desde este punto de
vista, se han propuesto varias soluciones:
- la obtención de células productoras de
insulina en animales para realizar un xenotransplante;
- la diferenciación in vitro de células
secretoras de insulina a partir de células madre aisladas, con el
objetivo de reimplantarlas [1], con el fin de salvar los problemas
de inmunidad y la necesidad de un tratamiento inmunosupresor del
paciente. Pero la producción de cantidades importantes de células
con bajo coste, productoras de insulina por diferenciación de
células madre, necesita herramientas biomoleculares nuevas, en
particular, útiles para el fenotipificación y la purificación de
las células diferenciadas;
- el transplante de islotes pancreáticos;
recientemente muchos trabajos han tenido por objeto la preparación
de islotes o de células beta pancreáticas con fines terapéuticos. La
primera etapa del transplante es extraer el páncreas del donante en
estado de muerte cerebral. El aislamiento de los islotes empieza por
una digestión enzimática del páncreas mediante una solución de
colagenasa. No todos los transplantes requieren una purificación de
los islotes digeridos. No obstante, hoy en día la mayoría de los
investigadores están de acuerdo en que la purificación de los
islotes es necesaria para un alotransplante [2]. Después los islotes
se transplantan, a razón de una masa suficiente (mínimo 3000
IEQ/kg) por inyección intraportal (IEQ, por sus siglas en inglés
Islet Equivalent, equivalente de
islote).
islote).
No obstante, el aislamiento de islotes o de
células beta pancreáticas necesita medios de selección y de
identificación de células beta, específicos y fiables.
Trabajos previos han intentado poner a punto
procedimientos de marcaje de células beta. Se pueden citar:
- el marcaje por la GFP (proteína verde
fluorescente) que permite un marcaje fluorescente de la célula. El
principal inconveniente de esta técnica es la necesidad de
introducir un gen exógeno o transgén en la célula, que necesita
además el uso de un vector vírico (adenovirus) [1];
- la técnica basada en la autofluorescencia
importante de las células beta [2]. Pero esta técnica carece de
especificidad con respecto al tipo celular;
- la incubación de las células con un
fluorocromo específico del cinc: el Newport Green [3] o la ditizona
[4]. Esta técnica se basa en el contenido importante de cinc de la
célula beta. El cinc es un constituyente importante de los gránulos
de secreción de insulina, y además, tiene una función en el control
de esta secreción [5]. Pero estas técnicas tienen numerosos
inconvenientes: el uso de un producto químico tiene riesgo de
toxicidad respecto a la célula beta y carece de especificidad con
respecto al tipo celular.
\hbox{Además, la ditizona tiene un problema de fotodegradación rápida [6]:}
- se ha puesto de manifiesto de forma indirecta
mediante reconocimiento por un clon de células T (documento WO
91/17186) de un antígeno expresado por las células beta. Los
trabajos iniciales sobre este antígeno no aportaron resultados en
términos de caracterización de la secuencia peptídica, ni en
términos de la selectividad de la célula beta con respecto a los
otros tipos celulares del islote, ni tampoco del páncreas y el
organismo. Trabajos más recientes de los mismos autores muestran
una distribución mucho más grande de este antígeno, que de hecho no
es específico de la célula beta [7];
- la detección del transportador de glucosa
GLUT-2 [15]; pero este transportador no es
específico de las células beta.
Por lo tanto, falta un marcador específico y
fiable de la célula beta de los islotes pancreáticos de
Langerhans.
Uno de los objetivos de la presente invención es
proporcionar dicho marcador.
El islote de Langerhan acumula grandes
cantidades de cinc y por lo tanto necesita un transportador muy
eficaz y muy especializado para acumular este cinc en las vesículas
de secreción [8]. La insulina, producida y almacenada en la célula
beta pancreática, se libera en el medio extracelular por exocitosis
en respuesta a estímulos externos, como una elevación de la
concentración de glucosa. Esta elevación de glucosa provoca una
modificación de la relación ATP/ADP, el cierre de los canales de
potasio y la apertura de los canales de calcio, que provoca la
exocitosis [9].
Se sabe que en presencia de cinc la insulina
puede formar tetrámeros y hexámeros que fijan el cinc con una
relación de insulina:cinc de 4:1 a 6:2, respectivamente. La insulina
se almacena en los gránulos de secreción en forma de un sólido
compuesto de hexámeros unidos a 2 átomos de cinc por hexámero. Las
vesículas contienen cinc en un exceso de 1 a 1,5 veces la cantidad
necesaria para formar los hexámeros de
insulina-cinc. En el transcurso de la exocitosis de
la insulina, las vesículas ricas en insulina se fusionan con la
membrana plasmática de la célula beta y liberan la insulina, pero
también el cinc, a la circulación. El cinc liberado actúa en un
bucle de retrocontrol negativo sobre los canales de potasio,
provocando su activación y la detención de la exocitosis.
En las células de mamíferos, se han clonado y
caracterizado 7 proteínas homólogas que tienen una función de
transportadoras de cinc, denominadas ZnT1, 2, 3, 4, 5, 6 y 7. El
análisis de la estructura primaria de estas proteínas ha permitido
definir un patrón estructural común compuesto de 6 dominios
transmembrana y un bucle intracelular rico en histidina.
ZnT-1 es un transportador ubicuo, localizado en la
membrana plasmática que asegura el eflujo de cinc fuera de la
célula [11]. ZnT-2 permite a la célula tolerar un
exceso de cinc en el medio de cultivo, confiriendo así una
resistencia al cinc por una localización de éste en las vesículas
intracitoplasmáticas ácidas, asegurando así una acumulación del cinc
en la célula muy superior a la normal [12]. ZnT-3 y
ZnT-4 clonadas en el hombre, tienen funciones
similares a ZnT-2. ZnT-3 es
específica de ciertos tejidos y es expresada fuertemente en el
cerebro, en las membranas de las vesículas sinápticas ricas en cinc,
en las fibras musgosas del hipocampo y en los testículos.
ZnT-4 es expresada de forma ubicua, pero se
encuentran niveles más elevados en el cerebro y las células
epiteliales. Este transportador es esencial en el epitelio de
mamífero donde participa en el control del contenido de cinc de la
leche materna. ZnT-5 y ZnT-6 también
son transportadores ubicuos localizados en el aparato de Golgi.
ZnT-7 es un transportador ubicuo, localizado
específicamente en el retículo endoplásmico de las células.
También se ha descrito un polinucleótido que
codifica un polipéptido transportador de cinc llamado NOV2 en la
solicitud internacional WO 02/24733. Dicho polipéptido se expresado
no sólo en el páncreas, sino también en la médula ósea, el
cartílago, la placenta y el riñón. Por consiguiente, debido a su
expresión en varios tejidos, este polipéptido no se puede usar como
marcador específico de las células beta pancreáticas.
Trabajos previos mencionan un intento de buscar
los genes implicados en el metabolismo del cinc en la célula beta
pancreática. Estos trabajos no han conducido a la prueba de una
proteína o transportador específicos [10].
Los autores de la invención han aislado un
polinucleótido de 1110 pares de bases (ID SEC Nº: 1) que representa
el ADNc que corresponde a un ARNm expresado de forma específica en
el islote de Langerhans, y más en particular en la célula secretora
de insulina o célula beta.
El polinucleótido de la invención codifica una
proteína denominada ZnT-8 (ID SEC Nº: 2), proteína
de 369 aminoácidos correspondiente a una masa molecular calculada
de 40,8 kDa, que presenta una estructura primaria homóloga a la de
las proteínas de la familia ZnT. El gen que codifica dicha proteína
se denomina ZnT-8.
El estudio del potencial transmembrana de la
proteína ZnT-8 completa muestra que tiene 6 dominios
transmembrana (aminoácidos 74-95,
107-126, 141-163,
177-196, 216-240,
246-267), con los extremos N- y
C-terminales situados en el citoplasma. Este
estudio muestra igualmente que la estructura secundaria de esta
proteína presenta 3 bucles de aminoácidos extracelulares
(aminoácidos 96-106, 164-176,
241-245).
Además, la localización de la proteína
ZnT-8 en las vesículas de secreción de la insulina y
sobre la membrana plasmática indican que está implicada en la
acumulación de cinc en las vesículas que contienen insulina y por
lo tanto, tiene una función en la maduración y la exocitosis de la
insulina en las células beta de los islotes pancreáticos de
Langerhans.
La proteína ZnT-8 y el
polinucleótido correspondiente constituyen, por primera vez un
marcador específico y fiable de la célula beta de los islotes
pancreáticos de Langerhans; los usos de este marcador son
principalmente los siguientes:
- selección celular; el marcador permite
considerar una selección y localización selectiva de las células
beta, sin modificación química o biológica de dichas células, en
particular con ayuda de anticuerpos dirigidos contra dicha
proteína.
- modelo de estudio in vitro ; el
marcador se puede usar in vitro para estudiar: (1) la
sobreexpresión del transportador (ZnT-8) en líneas
de células modelo (por ejemplo, insulinoma de rata
INS-1) y el impacto en la secreción de insulina en
respuesta a una estimulación por glucosa, (ii) la sensibilidad de
las células a la muerte celular (apoptosis) inducida por
condiciones de estrés oxidante o la concentración débil o fuerte de
cinc, y (iii) las etapas de diferenciación de células madre en
células secretoras de insulina en respuesta a diferentes
estimulaciones exógenas (factores de crecimiento, extractos
pancreáticos).
- cribado de medicamentos: el marcador
también representa un objetivo farmacológico útil para el cribado
de sustancias capaces de modular la expresión del gen
ZnT-8 y/o la actividad de la proteína
ZnT-8, con uso potencial para el tratamiento de la
diabetes y la hiperinsulinemia.
- diagnóstico de diabetes: el
polinucleótido puede igualmente aplicarse de forma ventajosa en el
procedimiento de diagnóstico de la diabetes en familias que tienen
riesgo, en particular en cuanto que permite detectar mutaciones
observables en el gen ZnT-8 y también
disminuir o suprimir los exámenes aplicados habitualmente.
Por lo tanto, la presente invención tiene como
objeto el uso como marcador específico de células beta de los
islotes pancreáticos de Langerhans, al menos un polinucleótido
aislado de la proteína correspondiente, elegido de:
- los polinucleótidos que comprenden o presentan
una de las siguientes secuencias: (a) la secuencia ID SEC Nº 1, (b)
un fragmento de la secuencia ID SEC Nº 1, de al menos 15 nucleótidos
consecutivos, preferiblemente 20 nucleótidos, todavía más
preferiblemente 25 a 30 nucleótidos, (c) una secuencia que presenta
un porcentaje de identidad de al menos 80% después del alineamiento
óptimo con una de las secuencias definidas en (a) o en (b), y (d)
una secuencia complementaria, homosentido o antisentido de una de
las secuencias definidas en (a), (b) o (c), y
- las proteínas codificadas por los
polinucleótidos definidos en (a), (b), (c) o (d) más arriba, que
comprenden o presentan una de las siguientes secuencias: (e) la
secuencia ID SEC Nº 2, (f) un fragmento de la secuencia ID SEC Nº 2
de al menos 15 aminoácidos consecutivos, (g) una secuencia que
presenta un porcentaje de identidad de al menos 60% después del
alineamiento óptimo con una de las secuencias definidas en (e) o en
(f) o al menos una similitud de 65%, preferiblemente 80% de
identidad o al menos 90% de similitud, o de forma más preferida 90%
de identidad o al menos 95% de similitud.
La invención abarca los usos de la proteína
ZnT-8 y del polinucleótido correspondiente como se
han definido anteriormente.
El polinucleótido definido anteriormente se
puede aislar a partir de células de Langerhans o a partir de bancos
de ADN celular, en particular de bancos de ADN de células
pancreáticas, muy particularmente a partir de un banco de ADN de
células pancreáticas humanas. Preferiblemente, las células usadas
son células de los islotes de Langerhans.
El polinucleótido definido anteriormente también
se puede obtener por una reacción de polimerización en cadena (PCR)
realizada en el ADN total de las células de Langerhans por
RT-PCR realizada en los ARN totales de las células
beta de los islotes pancreáticos de Langerhans o por síntesis
química.
En el sentido de la presente invención se
aplican las siguientes definiciones.
Por polinucleótido se entiende un encadenamiento
preciso de nucleótidos, modificados o no, que consta o no de
nucleótidos no naturales. Así pues, este término abarca cualquier
secuencia que codifique una proteína ZnT-8 o un
fragmento de dicha proteína (ADN genómico, ARNm, ADNc) pero también
los oligonucleótidos, homosentido o antisentido, así como los ARN
interferentes pequeños (ARNip) correspondientes.
Por "ácidos nucleicos o proteínas que
presentan un porcentaje de identidad después de alineamiento óptimo
con una secuencia de referencia" se entiende que se indican los
ácidos nucleicos o las proteínas que presentan, en relación con la
secuencia de referencia, algunas modificaciones como en particular
una deleción, un truncamiento, un alargamiento, una fusión
quimérica y/o una sustitución, en particular puntual, y cuya
secuencia de nucleótidos presenta al menos 80% de identidad y la
secuencia de aminoácidos presenta al menos 65% de identidad después
de alineamiento óptimo con la secuencia de nucleótidos o de
aminoácidos de referencia.
Por "porcentaje de identidad" entre dos
secuencias (ácidos nucleicos o proteínas) se entiende que se indica
un porcentaje de nucleótidos o de restos de aminoácidos idénticos
entre las dos secuencias que se comparan, obtenido después del
mejor alineamiento, siendo este porcentaje puramente estadístico y
estando las diferentes entre las dos secuencias repartidas al azar
y en toda su longitud.
Por "mejor alineamiento" o "alineamiento
óptimo", se entiende que se indica el alineamiento para el cual
el porcentaje de identidad determinado como se describe a
continuación, es el más alto. Las comparaciones entre dos
secuencias de nucleótidos o de aminoácidos se realizan de forma
tradicional: comparando estas secuencias después de haberlas
alineado de forma óptima, realizándose dicha comparación por
segmento o por "ventana de comparación" para identificar y
comparar las regiones locales de similitud de secuencia. El
alineamiento óptimo de secuencias para la comparación se puede
realizar, en particular con ayuda de uno de los siguientes
algoritmos: el algoritmo de homología local de Smith y Waterman
(1981), el algoritmo de homología local de Neddleman y Wunsch
(1970), el procedimiento de investigación de similitud de Pearson y
Lipman (1988), los programas informáticos que usan estos algoritmos
(GAP, BESTFIT, BLAST P, BLAST N, BLASTX, TBLASTX, FASTA y TFASTA en
el Wisconsin Genetics Software Package, (Genetics Computer Group,
575 Science Dr., Madison, WI) o en los servidores de internet, en
particular los de National Center for Biotechnology
Information (http://www.ncbi.nlm.nih.gov), de EMBL
(http://www.embl.org) y del proyecto Ensembl
(http://www.ensembl.org)).
Con el fin de obtener el alineamiento óptimo, se
usa preferiblemente el programa BALST, con la matriz BLOSUM 62. Se
pueden usar igualmente las matrices PAM o PAM250, así como una
matriz de identidad para las secuencias de nucleótidos.
Para obtener una "hibridación específica"
se usan preferiblemente las condiciones de hibridación muy
restrictivas, es decir condiciones de temperatura y de fuerza
iónica elegidas de forma que permitan mantener la hibridación
específica y la selectividad entre los polinucleótidos
complementarios.
A modo de ilustración, condiciones muy
restrictivas de la etapa de hibridación con el fin de definir los
polinucleótidos descritos anteriormente, son ventajosamente las
siguientes: la hibridación ADN-ADN o
ADN-ARN se realiza en dos etapas: (1)
prehibridación a 42ºC durante 3 horas en tampón de fosfato (20 mM pH
7,5) que contiene 5 x SSC (1 x SSC corresponde a una solución de
NaCl 0,15 M + citrato sódico 0, 015 M), formamida al 50%,
dodecilsulfato sódico (SDS) al 7%, 10 x Denhardt's, sulfato de
dextrano al 5% y ADN de esperma de salmón al 1%; (2) hibridación
propiamente dicha durante 20 horas a una temperatura que depende del
tamaño de la sonda (es decir: 42ºC, para una sonda de un tamaño
superior a 100 nucleótidos) seguido de 2 lavados de 20 minutos a
20ºC en 2 x SSC + SDS al 2%, 1 lavado de 20 minutos a 20ºC en 0,1 x
SSC + SDS al 0,1%. El último lavado se lleva a cabo en 0,1 x SSC +
SDS al 0,1% durante 30 minutos a 60ºC, para una sonda de un tamaño
superior a 100 nucleótidos. Las condiciones de hibridación muy
restrictivas descritas anteriormente para una sonda de tamaño
definido pueden ser adaptadas por el experto en la técnica para
sondas de tamaño más grande o más pequeño.
Por "técnicas o procedimientos adecuados"
se entiende aquí que se refiere a técnicas o procedimientos
conocidos y usados habitualmente por el experto en la técnica y que
se exponen en numerosos trabajos, como en particular el titulado
Molecular Cloning. A Laboratory Manual (Sambrook J, Russell DW.
(2000) Cold Spring Harbor Laboratory Press) [13].
El polinucleótido definido en c) presenta un
porcentaje de identidad de al menos 80% después del alineamiento
óptimo con una secuencia como la definida en a) o b),
preferiblemente 90%, de forma más preferible 95%, de forma todavía
más preferible 98%. El polinucleótido definido en c) incluye los
polinucleótidos variantes de la secuencia ID SEC Nº 1, es decir el
conjunto de polinucleótidos correspondientes a las variantes
alélicas, es decir a variaciones individuales de la secuencia ID
SEC Nº 1. Estas secuencias variantes naturales corresponden a
polimorfismos presentes en los mamíferos, en particular en el ser
humano, y en concreto a polimorfismos que pueden conducir a la
aparición de una patología, como por ejemplo la muerte celular de
los islotes de Langerhans y una diabetes.
Igualmente por polinucleótido variante se
entiende que se indica cualquier ARN o ADNc que resulten de una
mutación y/o una variación de un sitio de empalme de la secuencia
genómica cuyo ARNm tiene como ADN complementario el polinucleótido
de la secuencia ID SEC Nº 1.
La similitud de una proteína en relación a una
proteína de referencia se aprecia en función del porcentaje de
restos de aminoácidos que son idénticos o que difieren por las
sustituciones conservadoras, cuando se alinean las dos secuencias
de forma que se obtenga la máxima correspondencia entre ellas. En el
sentido de la presente invención, se entiende por sustitución
conservadora, la sustitución de un aminoácido por otro que presenta
propiedades químicas similares (tamaño, carga o polaridad), que en
general no modifica las propiedades funcionales de la proteína.
En la presente invención, una proteína que tiene
una secuencia de aminoácidos que tiene al menos X% de similitud con
una secuencia de referencia, se define como una proteína cuya
secuencia puede incluir hasta 100-X alteraciones no
conservadoras por 100 aminoácidos de la secuencia de referencia. En
el sentido de la presente invención, la expresión alteraciones no
conservadoras incluye deleciones, sustituciones no conservadoras o
inserciones consecutivas o dispersas de aminoácidos en la secuencia
de referencia.
En las proteínas definidas en (g) se incluyen
las proteínas variantes de la secuencia ID SEC Nº 2, es decir las
proteínas variantes codificadas por los polinucleótidos variantes
como se han definido previamente, en particular las proteínas cuya
secuencia de aminoácidos presenta al menos una mutación que
corresponde en concreto a un truncamiento, una deleción, una
sustitución y/o una adición de al menos un resto de aminoácido en
relación a la secuencia ID SEC Nº 2.
De forma preferible, las proteínas variantes
presentan una mutación asociada a la diabetes o a la
hiperinsuli-
nemia.
nemia.
Según un modo de realización ventajoso del uso
según la presente invención, dicho polinucleótido aislado como se
define en (c), es un polinucleótido variante de la secuencia ID SEC
Nº 1, que conlleva una mutación que conduce a una modificación de
la secuencia de aminoácidos de la proteína codificada por la
secuencia ID SEC Nº 1.
Según otro modo de realización ventajoso del uso
según la presente invención, dichos polinucleótidos aislados como
se definen en (b) o en (d) se eligen entre las parejas de cebadores
ID SEC Nº 3 e ID SEC Nº 27 (secuencia complementaria del ID SEC Nº
4) y la pareja de cebadores ID SEC Nº 5 e ID SEC Nº 6.
Según otro modo adicional de realización
ventajoso del uso según la presente invención, dicho polinucleótido
aislado se puede obtener por amplificación con ayuda de la pareja de
cebadores definidos anteriormente.
Según otro modo adicional de realización
ventajoso del uso según la presente invención, dicho polinucleótido
como se define en (d) es un ARN interferente pequeño (ARNip) que por
interacción con los ARNm correspondientes a dicho polinucleótido,
conducirá a su degradación.
Según otro modo adicional de realización
ventajoso del uso según la presente invención, dicha proteína como
se define en (g) es una variante de la secuencia ID SEC Nº 2, que
presenta una mutación asociada a la diabetes o a la
hiperinsulinemia.
Según otro modo adicional de realización
ventajoso del uso según la presente invención, dicho fragmento como
se define en (f) presenta una secuencia elegida entre las secuencias
ID SEC Nº 7, ID SEC Nº 8, ID SEC Nº 9 e ID SEC Nº 10.
La presente invención también tiene por objeto
un polinucleótido como se ha definido anteriormente, con excepción
de:
- los fragmentos de al menos 15 nucleótidos
consecutivos incluidos en las secuencias que tienen los números de
acceso en la base de datos NCBI nº AX526723 (ID SEC Nº 11), nº
AX526725 (ID SEC Nº 12) y nº AX526727 (ID SEC Nº 13),
- los EST que tienen los números de acceso en la
base de datos GenBank BM565129 (ID SEC Nº 14), BM310003 (ID SEC Nº
15), BM875526 (ID SEC Nº 16), BG655918 (ID SEC Nº 17), BQ417284 (ID
SEC Nº 18), BQ267316 (ID SEC Nº 19), BU072134 (ID SEC Nº 20),
BQ267526 (ID SEC Nº 21), BQ270198 (ID SEC Nº 22), BU581447 (ID SEC
Nº 23), BU070173 (ID SEC Nº 24), BQ631692 (ID SEC Nº 25) y BU949895
(ID SEC Nº 26), así como las secuencias que tienen los números de
acceso en la base de datos NCBI AX526723 (ID SEC Nº 11), AX526725
(ID SEC Nº 12) y AX526727 (ID SEC Nº 13).
Los fragmentos según la invención se pueden usar
en concreto como sondas o como cebadores para detectar/amplificar
los polinucleótidos (ARN o ADN genómico) correspondientes al
polinucleótido según la invención en otros organismos.
Preferiblemente, los pares de cebadores que se
pueden usar según la invención son los que corresponden a los pares
definidos por las secuencias ID SEC Nº 3 e ID SEC Nº 4 y por las
secuencias ID SEC Nº 5 e ID SEC Nº 6.
La invención tiene también por objeto los
polinucleótidos que se pueden obtener por amplificación con ayuda
de cebadores como los definidos anteriormente.
Según un modo de realización ventajoso del
polinucleótido según la invención, se trata de un ARN interferente
pequeño que corresponde al polinucleótido definido anteriormente, de
un tamaño inferior a 30 nucleótidos, preferiblemente de un tamaño
comprendido entre 20 y 23 nucleótidos, que por interacción con los
ARNm correspondientes a dicho polinucleótido, conducirá a su
degradación. Estos ARNip se pueden obtener por cualquier
procedimiento conocido para el experto en la técnica, por ejemplo,
por síntesis química o por expresión a partir de un vector.
La invención abarca los oligonucleótidos
homosentido correspondientes a los polinucleótidos de la invención,
que por interacción con proteínas implicadas en la regulación de la
expresión de dicho polinucleótido de la invención, inducirán una
inhibición o una activación de esta expresión.
Las sondas y cebadores según la invención pueden
marcarse de forma directa o indirecta con un compuesto radiactivo o
no radiactivo por procedimientos conocidos para el experto en la
técnica, con el fin de obtener una señal detectable y/o
cuantificable.
El marcaje de cebadores o de sondas según la
invención se realiza con elementos radiactivos o con moléculas no
radiactivas. Entre los isótopos radiactivos usados, se pueden citar
^{32}P, ^{33}P, ^{35}S, ^{3}H o ^{125}I. Las entidades no
radiactivas se seleccionan entre los ligandos tales como la biotina,
avidina, estreptavidina, digoxigenina, haptenos, colorantes,
agentes luminiscentes tales como agentes radioluminiscentes,
quimioluminiscentes, bioluminiscentes, fluorescentes y
fosforecentes.
Los polinucleótidos según la invención se pueden
usar, por lo tanto, como cebador y/o sonda en procedimientos que
aplican concretamente la técnica de la PCR (amplificación en cadena
de la polimerasa) (documento nº 4.683.202). Se pueden usar de forma
ventajosa otras técnicas de amplificación del ácido nucleico
objetivo como alternativa a la PCR. Actualmente existen numerosos
procedimientos que permiten esta amplificación, como por ejemplo,
la técnica de SDA (Strand Displacement Amplification) o
técnica de amplificación por desplazamiento de hebra, la técnica
TAS (Transcription-based Amplification
System, sistema de amplificación basado en transcripción), la
técnica 3SR (Self-Sustained Sequence
Replication, Replicación autosostenida de secuencia), la técnica
NASBA (Nucleic Acid Sequence Based Amplification,
amplificación basada en la secuencia de ácido nucleico), la técnica
TMA (Transcription Mediated Amplification, amplificación
mediada por transcripción), la técnica LCR (Ligase Chain
Reaction, reacción en cadena por la ligasa), la técnica de RCR
(Repair Chain Reaction, reacción de reparación en cadena),
la técnica CPR (Cycling Probe Reaction, reacción de ciclación
con sonda), la técnica de la amplificación por
Q-beta-replicasa. Se puede citar
también la PCR-SSCP que permite detectar mutaciones
puntuales.
Estas técnicas son bien conocidas para el
experto en la técnica.
Como sondas o como cebadores, los diferentes
polinucleótidos de la invención permiten determinar el perfil de
transcripción del gen correspondiente o una alteración eventual de
este perfil en una muestra biológica, poner en evidencia el gen
correspondiente, las variantes alélicas de ese gen o una eventual
alteración funcional de ese gen (cambio sustancial de la actividad
de la proteína codificada por dicho gen) que resulta de una
mutación (inserción, deleción o sustitución) de uno o varios
nucleótidos a nivel de al menos un exón de dicho gen. Dichas
mutaciones incluyen en particular deleciones, inserciones o
sustituciones no conservadoras a nivel de los codones que
corresponden a restos de aminoácidos situados en un dominio esencial
para la actividad biológica de la proteína.
Así pues, la invención tiene por objeto un
procedimiento de determinación del perfil de transcripción del gen
correspondiente al polinucleótido de la invención o de una
alteración de dicho perfil, en una muestra biológica, que comprende
una primera etapa de obtención de los ARN totales a partir de la
muestra biológica, una segunda etapa de poner en contacto dichos
ARN con una sonda marcada constituida por un polinucleótido según
la invención en condiciones adecuadas de hibridación entre los ARN y
la sonda y una tercera etapa de revelado por cualquier medio
adecuado de los híbridos formados.
Según un procedimiento de poner en práctica
dicho procedimiento, la segunda etapa puede ser una etapa de
retrotranscripción y/o amplificación de los transcritos realizados
con ayuda de un par de cebadores como se han descrito previamente,
y la tercera etapa, una etapa de revelado por cualquier medio
adecuado de los ácidos nucleicos amplificados formados.
Dicho procedimiento de determinación del perfil
de transcripción del gen puede conllevar además una etapa de
evaluación de la tasa de transcripción del gen en comparación con
una muestra testigo previamente elegida y opcionalmente el estudio
de su correlación con un fenotipo detectable, como por ejemplo la
tasa de proinsulina convertida en insulina madura, el contenido de
células con insulina, la tasa de insulina secretada en respuesta a
una estimulación por la glucosa, la concentración intracelular o
intravesicular de cinc o también la cantidad de proteína (producto
génico) expresada en la superficie de la célula. Dicha muestra
testigo puede estar constituida, por ejemplo, por una muestra
biológica que presente una transcripción normal o alterada del gen
correspondiente al polinucleótido de la invención, al que se aplica
dicho procedimiento de determinación del perfil de transcripción
del gen en las mismas condiciones.
La invención también tiene por objeto un
procedimiento para poner en evidencia el gen correspondiente al
polinucleótido de la invención o las variantes alélicas de dicho
gen o una alteración funcional de ese gen, en una muestra
biológica, que comprende una primera etapa de obtención por
cualquier medio adecuado del ADN a partir de la muestra biológica,
una segunda etapa de poner en contacto dichos ADN con una sonda
marcada constituida por un polinucleótido según la invención en
condiciones adecuadas de hibridación específica entre los ADN y la
sonda, y una tercera etapa de revelado por cualquier medio adecuado
de los híbridos formados.
Según un modo ventajoso de poner en práctica
dicho procedimiento, la segunda etapa puede ser una etapa de
amplificación realizada con ayuda de un par de cebadores como se han
descrito previamente y la tercera etapa, una etapa de revelado por
cualquier medio adecuado de los ácidos nucleicos amplificados
formados. El procedimiento puede constar opcionalmente de una
cuarta etapa de aislamiento y secuenciación de los ácidos nucleicos
puestos en evidencia.
Este último procedimiento puede permitir también
aislar un alelo del gen correspondiente al polinucleótido de la
invención, asociado a un fenotipo detectable, como por ejemplo, una
variación de la glucemia postprandial, la presencia o no de una
secreción de insulina, la tasa de glucosa en la circulación o la
insulina secretada en respuesta a una estimulación por la glucosa,
y de una forma general a una patología de tipo diabetes de tipo I o
II, o también a una anomalía del metabolismo de cinc. El cinc
excretado en el transcurso de la liberación de insulina actúa en
los canales de potasio responsables por medio de los canales de
calcio, de esta exocitosis. Por lo tanto, hay un bucle de
retrocontrol [14]. El polipéptido de la invención está implicado en
la acumulación del cinc en las vesículas que contienen insulina, y
se encuentra también en el curso de la exocitosis en la membrana
plasmática. Por lo tanto, mutantes de la proteína podrían modificar
la cantidad de cinc presente en las vesículas o la concentración
pericelular de cinc, y por lo tanto modificar el estado de apertura
del canal de potasio, conduciendo siguiendo el efecto de la
mutación a una disminución o un aumento de la excreción de insulina
(diabetes de tipo I o hiperinsulinemia). En este procedimiento
particular, la muestra biológica será una muestra procedente de un
individuo que exprese dicho fenotipo detectable.
Estos procedimientos, en particular los basados
en la búsqueda de mutaciones en el gen, pueden permitir poner de
manifiesto de forma preventiva una predisposición a la diabetes, o
el diagnóstico de la diabetes o de cualquier enfermedad ligada a la
diabetes, o la adaptación en términos de molécula o de posología del
o de los tratamientos antidiabéticos.
La invención tiene igualmente por objeto un
paquete de reactivos para llevar a cabo los procedimientos descritos
previamente, que comprende:
a) al menos una sonda o un par de cebadores
según la invención;
b) los reactivos necesarios para llevar a cabo
una reacción de hibridación entre dicha sonda y/o dichos cebadores
y el ácido nucleico de la muestra biológica que se va a ensayar;
c) los reactivos necesarios para llevar a cabo
una reacción de amplificación;
d) los reactivos necesarios para la detección
y/o dosificación del híbrido formado entre dicha sonda y el ácido
nucleico de la muestra biológica o de los ácidos nucleicos
amplificados formados.
Dichos paquetes de reactivos también pueden
contener controles positivos o negativos con el fin de asegurar la
calidad de los resultados obtenidos. También pueden contener los
reactivos necesarios para preparar ácidos nucleicos a partir de la
muestra biológica.
Otro objeto de la invención es un biochip de ADN
que comprende al menos un polinucleótido según la invención.
Otro objetivo más de la invención es el uso de
un polinucleótido como se ha definido anteriormente para preparar
un biochip de ADN. El experto en la técnica, en función del soporte
seleccionado, sabe elegir la técnica de realización adecuada para
preparar dicho biochip, tal como por ejemplo por depósito de
oligonucleótidos sobre soporte de vidrio o de nailon, sea por
injerto químico o electroquímico de oligonucleótidos.
El polinucleótido de la invención se puede usar
in vitro, como medio de estudio:
a) de la sobreexpresión del transportador
(ZnT-8) en líneas de células modelo (por ejemplo
insulinoma de rata INS-1), y del impacto en la
secreción de insulina como respuesta a una estimulación por
glucosa;
b) de la sensibilidad de las células beta de los
islotes pancreáticos de Langerhans a la muerte celular (apoptosis)
inducida por condiciones de estrés oxidante o de la concentración
alta o baja de cinc;
c) de las etapas de diferenciación de células
madre en células secretoras de insulina en respuesta a diferentes
estimulaciones exógenas (factores de crecimiento, extractos
pancreáticos).
La invención se refiere igualmente a la proteína
codificada por el polinucleótido según la invención.
Por "proteína" se entiende, en el sentido
de la presente invención, que se indica un encadenamiento preciso
de aminoácidos, modificados o no, que constan o no de aminoácidos no
naturales.
La proteína según al invención se obtiene a
partir de una célula beta, por síntesis química, por técnicas de
ADN recombinante, en concreto a partir de un vector de expresión que
comprende un inserto constituido por el polinucleótido como se ha
definido anteriormente.
La invención se refiere también al uso de un
polinucleótido como se ha definido anteriormente, para producir
una proteína ZnT-8 como se ha definido
anteriormente.
La proteína según la presente invención, cuando
se obtiene por síntesis química, se puede obtener por una de las
numerosas vías de síntesis peptídica conocidas, por ejemplo con las
técnicas que aplican fases sólidas o técnicas que usan fases
sólidas parciales, por condensación de fragmentos o por una síntesis
en solución clásica. En este caso, la secuencia de la proteína se
puede modificar con el fin de mejorar su solubilidad, en particular
en disolventes acuosos. Dichas modificaciones son conocidas para el
experto en la técnica, como por ejemplo, la deleción de dominios
hidrófobos o la sustitución de aminoácidos hidrófobos por
aminoácidos hidrófilos.
Preferiblemente, una proteína según la invención
es una proteína que comprende o presenta la secuencia ID SEC Nº 2
(correspondiente a la proteína codificada por el gen
ZnT-8).
La invención tiene también por objeto un
fragmento de la proteína como se ha definido anteriormente,
caracterizado porque se selecciona del grupo constituido por las
secuencias ID SEC Nº7, ID SEC Nº 8, ID SEC Nº 9 e ID SEC Nº 10.
Otro objeto de la invención es un biochip de
proteína que comprende una proteína o un fragmento de proteína como
se ha definido anteriormente.
Otro objeto más de la invención es el uso de una
proteína o de un fragmento de proteína como se ha definido
anteriormente, para preparar un biochip de proteína. Como para los
biochips de ADN, el experto en la técnica, en función del soporte
elegido, sabe elegir la técnica de realización adecuada para
preparar dicho biochip.
La proteína, el fragmento de proteína o el
biochip de proteína como se han definido anteriormente, se pueden
usar para detectar la presencia de anticuerpos dirigidos contra
dichas proteínas, en el suero de un individuo.
La invención se refiere también al uso de la
proteína o el fragmento de proteína como se han definido
anteriormente, para mediciones por métodos inmunoquímicos e
inmunoenzimáticos, así como para la búsqueda de anticuerpos
dirigidos contra la proteína según la invención.
La invención también tiene por objeto un vector
de clonación y/o de expresión, en el que se ha insertado el
polinucleótido de la invención.
Dicho vector puede contener los elementos
necesarios para la expresión y opcionalmente la secreción de la
proteína en una célula huésped.
Dichos vectores constan preferiblemente de: un
promotor, señales de iniciación y de terminación de la traducción,
así como regiones adecuadas de regulación de la transcripción. Se
deben poder mantener de forma estable en la célula y pueden
comprender opcionalmente secuencias que codifican señales
particulares que especifican la secreción de la proteína traducida,
tal como por ejemplo, un promotor fuerte de naturaleza ubicua o un
promotor selectivo de un tipo de célula y/o tejido particular, como
por ejemplo el páncreas. Estas diferentes secuencias de control se
eligen en función del huésped celular usado.
El polinucleótido según la invención se puede
insertar en vectores de replicación autónoma en el seno del huésped
elegido o de vectores integrantes del huésped elegido.
Entre los sistemas de replicación autónoma se
usa preferiblemente, en función de la célula huésped, sistemas de
tipo plasmídico o vírico. Los vectores víricos pueden ser en
concreto adenovirus, retrovirus, lentivirus, poxvirus o virus del
herpes. El experto en la técnica conoce las tecnologías que se
pueden usar para cada uno de estos sistemas.
Cuando se desea la integración de la secuencia
en los cromosomas de la célula huésped, se pueden usar, por
ejemplo, sistemas de tipo plasmídico o vírico; dichos virus son, por
ejemplo, retrovirus o virus asociados a adenovirus (virus
adenoasociado o AAV).
Entre los vectores no víricos, se prefieren los
polinucleótidos desnudos, tales como ADN o ARN desnudos, cromosomas
artificiales de bacterias (BAC, bacterial artificiel
chromosome), cromosomas artificiales de levaduras (YAC,
yeast artificiel chromosome) para la expresión en la
levadura, cromosomas artificiales de ratón (MAC, mouse
artificial chromosome) para la expresión en células murinas y
de forma preferible cromosomas artificiales del hombre (HAC
human artificial chormosome) para la expresión en células
humanas.
Dichos vectores se preparan según los
procedimientos usados habitualmente por el experto en la técnica, y
los vectores recombinantes resultantes se pueden introducir en el
huésped adecuado por procedimientos estándar, tales como por
ejemplo, lipofección, electroporación, choque térmico,
transformación después de permeabilización química de la membrana y
fusión celular.
La invención también tiene por objeto las
células huésped modificadas, en concreto células eucariotas y
procariotas, en las que se ha introducido al menos un
polinucleótido según la invención o al menos un vector según la
invención.
Entre las células que se pueden usar en el
sentido de la presente invención, se pueden citar las células
bacterianas, células de levadura, células animales, en particular
células de mamíferos o también células vegetales. También se pueden
citar células de insectos en las que se pueden usar procedimientos
que aplican, por ejemplo, baculovirus.
La invención también tiene por objeto los
organismos no humanos transgénicos, tales como animales o vegetales
transgénicos, en los que todas o parte de las células contienen el
polinucleótido según la invención o el vector de la invención, en
forma libre o integrada.
Preferiblemente según la invención, los
organismos no humanos transgénicos son los portadores de células que
contienen un polinucleótido según la invención no funcional o
portador de una mutación.
Según la invención, los animales transgénicos
son preferiblemente mamíferos, más preferiblemente roedores, en
particular ratones, ratas o conejos, y suidos, en particular el
cerdo.
Los animales transgénicos se pueden obtener por
cualquier procedimiento conocido para el experto en la técnica, por
ejemplo, por recombinación homóloga en células madre embrionarias,
transferencia de estas células madre a embriones, selección de
quimeras afectadas a nivel de líneas reproductoras y crecimiento de
dichas quimeras.
Las células animales o vegetales transgénicas
según la invención pueden así expresar o sobreexpresar el gen que
codifica la proteína según la invención o su gen homólogo, o
expresar dicho gen en el que se ha introducido la mutación.
Los animales transgénicos se pueden usar, por
ejemplo, como modelos para el estudio de la etiología de la
dia-
betes.
betes.
Los organismos transgénicos según la invención
se pueden usar para la producción de la proteína según la
invención.
La proteína según la invención se puede
purificar según las técnicas conocidas para el experto en la
técnica. Así pues, la proteína se puede purificar a partir de
lisatos y extractos celulares, del líquido sobrenadante del medio
de cultivo, por procedimientos usados individualmente o combinados,
tales como fraccionamiento, procedimientos de cromatografía,
técnicas de inmunoafinidad con ayuda de anticuerpos monoclonales o
policlonales específicos, etc. Preferiblemente, la proteína según
la invención se purifica según un procedimiento que comprende una
primera etapa de separación de las proteínas de membrana por
centrifugación, seguido de una segunda etapa de purificación por
inmunoafinidad según el procedimiento descrito por T.C. Thomas, M.G.
McNamee, (Purification of membrane proteins. Section IX, pp
499-520, en Methods in Enzymology, Guide to Protein
Purification, Editado por M.P. Deutscher, vol 182, Academic press,
New-York, 1990'').
La invención también tiene por objeto un
procedimiento de preparación de la proteína ZnT-8
recombinante, caracterizado porque comprende el cultivo de los
modificados de la presente invención, en concreto las células de
mamífero o células de organismos no humanos transgénicos según la
invención, en condiciones que permiten la expresión de dicha
proteína, y la purificación de dicha proteína recombinante.
La invención tiene también por objeto una
proteína, caracterizada porque se puede obtener por uno cualquiera
de los procedimientos de preparación descritos anteriormente.
La proteína obtenida como se ha indicado
anteriormente, se puede presentar tanto en forma glicosilada como
no glicosilada y puede presentar o no la estructura terciaria de la
proteína natural.
Los autores de la invención también han podido
mostrar, mediante un estudio del potencial transmembrana, que la
estructura secundaria de la proteína de la invención presenta 3
bucles de aminoácidos extracelulares (aminoácidos
96-106, 164-176,
241-245) contra los que se pueden producir
anticuerpos monoclonales o policlonales.
La invención tiene también por objeto
anticuerpos mono o policlonales, caracterizados porque son capaces
de reconocer específicamente una proteína según la invención.
Preferiblemente, los anticuerpos reconocen
específicamente la proteína del ID SEC Nº 2, sus fragmentos o las
variantes de dicha proteína, como se han definido anteriormente.
De forma preferida, los anticuerpos según la
invención reconocen específicamente los bucles extracelulares de la
proteína según al invención, que corresponden a los ID SEC Nº 7, ID
SEC Nº 8 e ID SEC Nº 10 (PEP1, PEP2 y PEP4) y/o un bucle
intracelular de la proteína según la invención que corresponde al ID
SEC Nº 9 (PEP3).
Los anticuerpos según la invención son, por
ejemplo, anticuerpos quiméricos, anticuerpos humanizados, fragmentos
Fab o F(ab')2. También pueden presentarse en forma de
inmunoconjugados o de anticuerpos marcados con el fin de obtener
una señal detectable y/o cuantificable.
\newpage
Dichos anticuerpos se pueden obtener
directamente a partir del suero humano, o a partir del suero de
animales inmunizados con las proteínas según la invención, en
concreto las producidas por recombinación genética o por síntesis
peptídica.
Los anticuerpos policlonales específicos se
pueden obtener según los modos de operación habituales. Los
anticuerpos monoclonales específicos se pueden obtener según el
procedimiento clásico de cultivo de hibridomas.
Otro objeto de la invención es un biochip de
proteína que comprende al menos un anticuerpo según la inven-
ción.
ción.
La invención se refiere también al uso de un
anticuerpo según la invención para preparar un biochip de proteína
que comprende dicho anticuerpo. El experto en la técnica sabe en
función del soporte elegido, elegir la técnica de preparación
adecuada para preparar dicho biochip.
La invención también tiene por objeto el uso de
los anticuerpos o de un biochip de anticuerpo según la invención
para detectar y/o purificar una proteína según la invención,
preferiblemente los bucles extracelulares o intracelulares de dicha
proteína, de forma preferida las secuencias correspondientes a los
ID SEC Nº 7 a ID SEC Nº 10.
De forma general, los anticuerpos de la
invención se pueden usar ventajosamente en cualquier situación en
la que deba observarse la expresión de una proteína según la
invención, normal o mutada.
En particular, los anticuerpos monoclonales se
pueden usar para detectar estas proteínas en una muestra biológica.
Constituyen, por lo tanto, un medio de análisis inmunocitoquímico o
inmunohistoquímico de la expresión de proteínas según la invención,
en concreto la proteína de secuencia ID SEC Nº 2, o una de sus
variantes, en cortes de tejidos específicos. En general, para
dichos análisis, los anticuerpos usados se marcan con el fin de que
sean detectables, por ejemplo, con compuestos inmunofluorescentes,
por marcaje con oro o en forma de inmunoconjugados
enzimáticos.
enzimáticos.
En concreto, pueden permitir poner de manifiesto
una expresión anómala de estas proteínas en los tejidos o
extracciones biológicas.
Los autores de la invención también describen un
procedimiento de detección en una muestra biológica de la proteína
ZnT-8, que comprende una primera etapa de poner en
contacto la muestra biológica con un anticuerpo según la invención,
y una segunda etapa de poner de manifiesto por cualquier medio
adecuado el complejo de antígeno-anticuerpo
formado.
La invención también tiene por objeto un paquete
de reactivos que permite llevar a cabo el procedimiento descrito
anteriormente, que comprende:
a) al menos un anticuerpo monoclonal o
policlonal según la invención;
b) los reactivos que permiten la detección del
complejo de antígeno-anticuerpo producido durante la
reacción inmunológica.
Según un modo de realización particular, el
paquete de reactivos comprende opcionalmente reactivos para la
constitución de un medio que permita la reacción inmunológica.
Los anticuerpos según la invención también
pueden usarse para detectar y/o seleccionar islotes de Langerhans,
preferiblemente células beta, a partir de páncreas humano o animal,
en concreto páncreas de ratón, rata, conejo y cerdo. Esta selección
se puede realizar con un equipo de citometría de flujo (FACS) en
relación a las células aisladas. Para los islotes, su marcaje
podría mejorar los procedimientos de separación actuales: separación
por gradiente de densidad con Ficoll, Euro-Ficoll,
Ficoll-diatrizoato sódico o el procedimiento de
elección es un gradiente de albúmina sobre un separador de
células.
Por lo tanto, la invención tiene por objeto un
procedimiento de selección de las células beta de islotes de
Langerhans, que comprende una primera etapa de poner en contacto las
células de una muestra biológica susceptible de contener dichos
islotes y/o células con un anticuerpo según la invención, una
segunda etapa de poner de manifiesto por cualquier medio adecuado
las células marcadas por el anticuerpo y una tercera etapa de
aislamiento por cualquier medio adecuado de las células
marcadas.
Los anticuerpos según la invención se pueden
usar también para seguir el proceso de diferenciación de las
células madre en células beta de los islotes de Langerhans, en
particular humanas o animales, así como para seleccionar las
células que expresan la proteína ZnT-8, en
particular la proteína de la secuencia ID SEC Nº 2 después de
diferenciación.
Por lo tanto, también se describe un
procedimiento para seguir el proceso de diferenciación de células
madre en células del islote pancreático o en células beta, que
comprende una etapa de poner en contacto las células de una muestra
biológica susceptible de contener dichas células madre que se están
diferenciando con un anticuerpo según la invención, una segunda
etapa de poner de manifiesto por cualquier medio adecuado las
células marcadas por el anticuerpo, y una tercera etapa de
visualización por cualquier medio adecuado de las células
marcadas.
Dicho procedimiento puede comprender además, una
etapa complementaria de aislamiento por cualquier medio adecuado,
de las células marcadas.
El polinucleótido, la célula, el organismo
transgénico o el biochip de ADN según la invención, se pueden usar
para el cribado de compuestos químicos o bioquímicos que pueden
interactuar in vitro o in vivo, directa o
indirectamente, con el polinucleótido según la invención y/o modular
la expresión de dicho polinucleótido.
Por lo tanto, la invención tiene por objeto un
procedimiento de cribado de un compuesto químico o bioquímico que
puede interactuar in vitro o in vivo, directa o
indirectamente con el polinucleótido según la invención,
caracterizado porque comprende una primera etapa de poner en
contacto un compuesto químico o bioquímico candidato con el
polinucleótido, célula, organismo no humano transgénico o biochip de
ADN según la invención, y una segunda etapa de detección del
complejo formado entre el compuesto químico o bioquímico candidato y
el polinucleótido, célula, organismo no humano transgénico o el
biochip de ADN según la invención.
La invención también tiene por objeto un
procedimiento de cribado de un compuesto químico o bioquímico que
pueda modular in vitro o in vivo, directa o
indirectamente, la expresión del polinucleótido según la invención,
caracterizado porque comprende una primera etapa de poner en
contacto un compuesto químico o bioquímico candidato con el
polinucleótido, célula, organismo no humano transgénico o biochip de
ADN según la invención, y una segunda etapa de medición por
cualquier medio adecuado de la expresión de dicho
polinucleótido.
La proteína, célula, organismo transgénico o
biochip de proteína según la invención, se pueden usar para el
cribado de compuestos químicos o bioquímicos que puedan interactuar
in vitro o in vivo, directa o indirectamente, con la
proteína según la invención, y/o que puedan modular la expresión o
la actividad de dicha proteína.
Por lo tanto, la invención tiene por objeto un
procedimiento de cribado de un compuesto químico o bioquímico que
pueda interactuar in vitro o in vivo, directa o
indirectamente, con la proteína según la invención, caracterizado
porque comprende una primera etapa de poner en contacto un compuesto
químico o bioquímico candidato con la proteína, célula, organismo
no humano transgénico o biochip de proteína según la invención, y
una segunda etapa de detección del complejo formado entre el
compuesto químico o bioquímico candidato y la proteína, célula,
organismo no humano transgénico o el biochip de proteína según la
invención.
La invención también tiene por objeto un
procedimiento de cribado de un compuesto químico o bioquímico que
pueda modular in vitro o in vivo, directa o
indirectamente, la expresión y/o la actividad de la proteína según
la invención, caracterizado porque comprende una primera etapa de
poner en contacto un compuesto químico o bioquímico candidato con
la proteína, célula, organismo no humano transgénico o biochip de
proteína según la invención, y una segunda etapa de medición por
cualquier medio adecuado de la expresión y/o actividad de dicha
proteína.
La invención también tiene por objeto el
polinucleótido, la proteína, los anticuerpos, los vectores o las
células transformados según la invención, como medicamentos.
El polinucleótido, la proteína, los anticuerpos,
los vectores o las células transformados según la invención, pueden
usarse en la preparación de un medicamento destinado a la prevención
y/o al tratamiento de la diabetes, en particular la asociada con la
presencia de al menos una mutación del gen correspondiente al ID SEC
Nº 1, y/o con una expresión anómala de la proteína correspondiente
al ID SEC Nº 2, o destinado a la prevención y/o al tratamiento de
hiperinsulinemias cuando se observa una expresión, maduración o
secreción anómala del gen de la insulina, o destinado a regular la
maduración y la secreción de la insulina en las células beta o en
células modificadas para la secreción de insulina, o destinado a
regular los fenómenos de apoptosis de las células beta.
Una expresión anómala significa una
sobreexpresión, una subexpresión o la expresión de una proteína
mutada. Una maduración anómala significa una proteolisis ausente o
insuficiente de la proinsulina en insulina o una cocristalización
ausente, insuficiente o demasiado importante de la insulina y el
cinc en las vesículas de secreción intracelulares.
La invención también tiene por objeto el uso de
un polinucleótido, una proteína o un anticuerpo según la invención
para determinar una variabilidad alélica, una mutación, una
deleción, una pérdida de heterocigosis o cualquier anomalía
genética del gen que codifica la proteína según la invención. Se
pueden detectar las mutaciones en la secuencia del gen
ZnT-8 directamente por análisis del ácido
nucleico y de las secuencias según la invención (ADN genómico, ARN
o ADNc), pero también mediante la proteína según la invención. En
particular, el uso de un anticuerpo según la invención que reconoce
un epítopo que lleva una mutación permite diferenciar una proteína
"sana" de una proteína "asociada a una patología".
El experto en la técnica también sabe poner en
práctica las técnicas que permiten el estudio de la alteración de
la expresión de un gen, por ejemplo, por análisis del ARNm, en
particular por transferencia Northern o por RT-PCR
con sondas o cebadores según la invención, o por análisis de la
proteína expresada, en particular por transferencia Western, usando
los anticuerpos según la invención.
Además de las disposiciones precedentes, la
invención comprende también otras disposiciones que saldrán de la
siguiente descripción, que se refiere a ejemplos para llevar a cabo
la invención, así como a los dibujos adjuntos, en los que:
La Figura 1 ilustra el análisis por
RT-PCR de la expresión tisular del ARN mensajero que
codifica la proteína ZnT-8 (A) por comparación con
la expresión del ARN mensajero ubicuo de la actina (B). 1: Cerebro,
2: Corazón, 3: Riñón, 4: Bazo, 5: Hígado, 6: Colon, 7: Pulmón, 8:
Intestino delgado, 9: Músculo, 10: Estómago, 11: Testículo, 12:
Placenta, 13: Glándulas salivares, 14: Tiroides, 15: Glándulas
suprarrenales, 16: Páncreas, 17: Ovarios, 18: Útero, 19: Próstata,
20: Piel, 21: Leucocitos, 22: Médula ósea, 23: Cerebro fetal, 24:
Hígado fetal. La expresión de dicho ARNm se detecta solo en el
páncreas (pista 16).
La Figura 2 ilustra el análisis por
RT-PCR de la expresión del ARN mensajero que
codifica la proteína ZnT-8, en: una línea de
insulinoma de rata (INS-1, pista 1), islotes
pancreáticos humanos fetales (pista 2) y adultos (pista 3), por
comparación con la línea de células epiteliales (línea Hela). El
ARNm se detecta en la línea de insulinoma de rata y los islotes
pancreáticos adultos y fetales, mientras que no se detecta ningún
transcrito en las células epiteliales (línea Hela). Se utiliza como
control el ARN mensajero de la actina.
La Figura 3 ilustra el análisis por microscopía
de fluorescencia, de la localización de la proteína de fusión
ZnT-8-GFP en células epiteliales
(línea Hela) transfectadas. La fluorescencia se localiza en las
vesículas intracitoplasmáticas, así como al nivel de la membrana
plasmática.
La Figura 4 ilustra el análisis por microscopía
de fluorescencia, de la localización de la proteína de fusión
ZnT-8-GFP en células de insulinoma
de rata (línea INS-1) transfectadas. La
fluorescencia se localiza en vesículas de secreción que indican una
función de ZnT-8 en la maduración y exocitosis de la
insulina.
Los siguientes ejemplos son ilustrativos de la
invención y no la limitan de ninguna forma.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
1
El gen que codifica la proteína
Znt-8, llamado gen Znt-8, se
identificó por bioinformática, por búsqueda de los genes homólogos
a los de la familia ZnT, usando las secuencias del genoma
humano disponibles. El análisis de las secuencias genómicas ha
permitido localizar y definir la organización intrón/exón del gen
Znt-8.
El ADN que codifica ZnT-8 se
amplificó por RT-PCR a partir del ARNm de islotes de
páncreas humano preparados según la técnica de Kenmochi T. y col.
(Pancreas, 2000, 20, 2, 184-90), con ayuda
del par de cebadores (ID SEC Nº 5:
5'-ACTCTAGAATGGAGTTTCTTGAAAGAACGT A e ID SEC Nº 6:
5'-AATCTA GAGTCACAGGGGTCTTCA
CAGA), definido a partir de la secuencia del gen Znt-8.
CAGA), definido a partir de la secuencia del gen Znt-8.
De forma más precisa, los ARN totales se
extrajeron a partir de los islotes, usando el kit "ARN extraction
kit" (Roche) según las instrucciones del fabricante. Los ARN así
obtenidos se dosificaron por medición de la absorbancia a 250 nm y
se conservaron a -80ºC.
La amplificación se realizó usando el kit
"Titan one tube RT-PCR kit" (Roche) según las
instrucciones del fabricante y la pareja de cebadores ID SEC Nº 5 e
ID SEC Nº 6. La transcripción inversa se realizó a 52ºC durante 30
min y después los ADN sintetizados se amplificaron por 30 ciclos (30
s a 94ºC, 30 s a 53ºC, 1 min a 72ºC) y una elongación final de 5
min a 72ºC. Los productos de amplificación se separaron por
electroforesis en gel de agarosa (1,5%) en presencia de bromuro de
etidio y el producto de amplificación de 1123 pares de bases que
comprende la secuencia de ADN que presenta la secuencia ID SEC Nº 1
se purificó con ayuda del kit Nucleic acid purification kit
(QIAGEN), siguiendo las instrucciones del fabricante.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
2
La expresión del ARN mensajero que codifica la
proteína Znt-8 se analizó por PCR con los ADNc
comerciales preparados a partir de diferentes tejidos humanos
usando los siguientes cebadores: ID SEC Nº 3: 5'-GAT
GCT GCC CAC CTC TTA ATT GAC e ID SEC Nº 27: CCA AGA CCA GGA TGG TTT
AGA TGA (secuencia complementaria del ID SEC Nº 4:
5'-TCA TCT TTT CCA TCC TGG TCT TGG). Los cebadores
(ID SEC Nº 3 e ID SEC Nº 27) se eligieron en 2 exones diferentes
para evitar la amplificación de una secuencia genómica. Los tejidos
ensayados son: 1: Cerebro, 2: Corazón, 3: Riñón, 4: Bazo, 5:
Hígado, 6: Colon, 7: Pulmón, 8: Intestino delgado, 9: Músculo, 10:
Estómago, 11: Testículo, 12: Placenta, 13: Glándulas salivares, 14:
Tiroides, 15: Glándulas suprarrenales, 16: Páncreas, 17: Ovario,
18: Útero, 19: Próstata, 20: Piel, 21: Leucocitos sanguíneos, 22:
Médula ósea, 23: Cerebro fetal, 24: Hígado fetal.
De forma más precisa: se mezclaron 2 \mul de
ADNc con los 2 cebadores específicos (1 \muM final) y una mezcla
clásica de PCR (1 unidad de ADN polimerasa Taq, tampón con magnesio
1,5 mM, dNTP 10 mM). La amplificación se realizó mediante 30 ciclos
(30 s a 94ºC, 30 s a 53ºC, 1 min a 72ºC) y una etapa final de
elongación de 5 min a 72ºC. Los productos después se analizaron por
electroforesis en gel de agarosa (1,5%) en presencia de bromuro
de
etidio.
etidio.
Los resultados ilustrados por la figura 1
muestran que, por comparación con el ARN mensajero de la actina
usado como control (figura 1B), el ARNm correspondiente al
polinucleótido de la invención es expresado solamente en las
células del páncreas (pista 16 de la figura 1A) pero no en las
células de los 23 otros tejidos analizados (pistas 1 a 15 y 17 a 24
de la figura 1A).
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
3
El análisis de la expresión del ARN mensajero
que codifica la proteína ZnT-8 se realizó por
RT-PCR a partir de ARN de diferentes tejidos
humanos: islotes pancreáticos humanos adultos y fetales, línea de
insulinoma de rata (INS-1; Asfari M. y col.,
Endocrinology, 1992, 130, 1, 167-78), por
comparación con una línea de células epiteliales humanas (Hela),
usada como control. Se lavaron 10^{6} células dos veces con tampón
de fosfato (PBS) y después se centrifugaron 3 min a 2000 g. Los ARN
totales se extrajeron como se ha descrito en el ejemplo 1 y la
concentración de ARN se ajustó a 1 ng/\mul para
ZnT-8 o 1 pg/\mul para el control de
\beta-actina. Los transcritos se amplificaron y
después los productos de amplificación se analizaron, como se ha
descrito en el ejemplo 2.
Los resultados ilustrados por la figura 2,
muestran que el ARN que codifica la proteína ZnT-8
es expresado en las células de los islotes pancreáticos humanos
fetales y adultos y en una línea de insulinoma de rata
(INS-1), pero no en una línea de células epiteliales
(línea Hela).
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
4
La proteína es la proteína humana, codificada
por el ADNc que corresponde a la secuencia ID SEC Nº 1
(ZnT-8). El producto de la PCR de 1123 pares de
bases obtenido según el ejemplo 1, se hizo digerir con la enzima de
restricción XbaI, y después se clonó en el vector
pcDNA3.1-CT-GFP (Invitrogen), para
dar el vector denominado pZnT-8-GFP
que se verificó por secuenciación.
El vector
pZnT-8-GFP se transfectó de forma
transitoria en una línea de células epiteliales (Hela) y de forma
estable en una línea de insulinoma de rata
(INS-1).
Las células epiteliales HeLa (número ATCC
CCL-2) se cultivaron en medio
Opti-MEM (medio de Eagle modificado, Life
Technologies) complementado con suero de ternero al 5%
descomplementado y glutamina 2 mM. Las células se incubaron a 37ºC
en una atmósfera humidificada enriquecida con CO_{2} al 5%.
Las células INS-1 se cultivaron
en medio RPMI (Life Technologies) complementado con: suero de
ternero fetal (10%),
2-mercaptoetan-1-ol
(50 \muM), piruvato sódico (1 mM), HEPES (10 mM),
L-glutamina (2 mM), penicilina 100 U/ml y
estreptomicina (100 \mug/ml).
Las células cultivadas en las cajas de Petri de
35 mm se transfectaron con el vector
pZnT-8-GFP (1 \mug de ADN por
10^{6} células), usando el reactivo Exgen500 (Euromedex) según las
instrucciones del fabricante. Después de transfección con el vector
pZnT-8-GFP, las células
INS-1 se seleccionaron, se clonaron en el mismo
medio que se añadió previamente de G418 400 \mug/ml, y después se
observó la fluorescencia de los clones con un microscopio invertido
de fluorescencia (Axiovert, Zeiss) usando los siguientes parámetros:
longitud de onda de excitación: 450-490 nm;
longitud de onda de emisión: 520 nm.
La expresión de la proteína de fusión
ZnT-8-GFP en las células Hela, se
analizó 48 horas después de la transfección, por observación de la
fluorescencia como se ha indicado antes para los clones de las
células INS-1 transfectadas de forma estable.
Los resultados ilustrados en la figura 3 (línea
Hela) muestran que la proteína ZnT-8 está localizada
en las vesículas intracitoplasmáticas, así como en la membrana
plasmática; esta localización demuestra que la proteína
ZnT-8 toma la vía de la excreción extracelular y se
encuentra en la superficie de la célula.
Los resultados ilustrados en la figura 4 (línea
INS-1) muestran que la proteína
ZnT-8 está localizada en las vesículas de secreción
de insulina; esta localización indica que ZnT-8 está
implicada en la maduración de la insulina; además, en la medida en
que esta experiencia se realiza en el estado basal (en ausencia de
estimulación por la glucosa) la proteína estará igualmente presente
sobre la membrana plasmática en el curso de la exocitosis de la
insulina, después de estimulación por la glucosa.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
5
El análisis de la secuencia primaria de
ZnT-8 y la predicción de los dominios transmembrana
se realizaron con los programas TMpred
(http://www.ch.embnet.org/software/TMPRED_form.html) y SOSUI
(http://sosui.pro teome.bio.tuat.ac.jp/sosuimenu0.html).
La proteína ZnT-8 completa tiene
6 dominios transmembrana predichos (aminoácidos
74-95, 107-126,
141-163, 177-196,
216-240, 246-267), estando situados
los extremos C y N terminales en el citoplasma.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
6
Los péptidos correspondientes a los epítopos que
presentan las secuencias ID SEC Nº 7: PEP1: HIAGSLAVVT
DAAHLL; ID SEC Nº 8: PEP2: CERLLYPDYQIQATV; ID SEC Nº 9: PEP3: CLGHNHKEVQANASVR, ID SEC Nº 10: PEP4: YFKPEYKIADPIC se sintetizaron en fase sólida, según el procedimiento descrito originalmente por Merrifield y col. (J. Am. Chem. Soc., 1964, 85: 2149-) (1964), se purificaron y se conjugaron con una proteína transportadora (por ejemplo, albúmina). Los péptidos conjugados se inyectaron en conejos según el siguiente protocolo de inmunización:
DAAHLL; ID SEC Nº 8: PEP2: CERLLYPDYQIQATV; ID SEC Nº 9: PEP3: CLGHNHKEVQANASVR, ID SEC Nº 10: PEP4: YFKPEYKIADPIC se sintetizaron en fase sólida, según el procedimiento descrito originalmente por Merrifield y col. (J. Am. Chem. Soc., 1964, 85: 2149-) (1964), se purificaron y se conjugaron con una proteína transportadora (por ejemplo, albúmina). Los péptidos conjugados se inyectaron en conejos según el siguiente protocolo de inmunización:
D0: primera inmunización; D14: segunda
inmunización; D28: tercera inmunización; D38: verificación de la
especificidad; D56: cuarta inmunización; D66 y D80: recuperación
del suero. El suero se puede usar directamente o después de
purificación en columna de proteína A con una elución en medio
ácido. Estas operaciones fueron realizadas por la sociedad
Eurogentec SA, Bélgica.
\vskip1.000000\baselineskip
Ejemplo
7
El anticuerpo se purifica por cromatografía de
afinidad en una columna de proteína G (Pharmacia). La columna (1
ml) se equilibra con un tampón de fosfato sódico 10 mM, NaCl 0,15 M,
pH 7,4, se carga con 5 ml de suero, y después se lava con 20 ml del
mismo tampón para eluir las proteínas no fijadas. El anticuerpo
después se desengancha con una solución de glicina, HCl 0,1 M, ph
2,5, y después se neutraliza con 40 \mul de tampón de Tris HCl 2
M, pH 10,0.
Se diluyen 2 mg de anticuerpo en 1 ml de tampón
de fosfato, pH 8,0. Se prepara extemporáneamente una solución de
NGS-FITC (SIGMA; 1 mg/ml en DMSO). Se mezclan 75
\mul de la solución de NHS-FITC con la solución de
anticuerpo y después la mezcla se incuba a temperatura ambiente
durante 45 minutos. El anticuerpo marcado se purifica en columna
PD-10 (PHARMACIA) de la siguiente forma: la columna
se lava con 30 ml de PBS, se carga con 1 ml de la solución de
anticuerpo marcado que se va a purificar, después con 5 ml de PBS y
después se recogen fracciones de 2 ml; se conserva la segunda
fracción que contiene el anticuerpo marcado.
\vskip1.000000\baselineskip
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Esta lista de referencias citadas por el autor
de la solicitud es sólo para la conveniencia del lector y no forma
parte del documento de patente europea. Aunque se ha tenido mucho
cuidado al recopilar las referencias, no se pueden excluir errores
u omisiones y la OEP rechaza cualquier responsabilidad en este
aspecto.
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<110> COMMISSARIAT A L'ENERGIE
ATOMIQUE/UNIVERSITE JOSEPH FOURIER
{}\hskip1cm SEVE, Michel
{}\hskip1cm FAVIER, Alain
\vskip0.400000\baselineskip
<120> Proteína específica de células
pancreáticas beta de los islotes de Langerhans y sus
aplicaciones
\vskip0.400000\baselineskip
<130> CGA263S85
\vskip0.400000\baselineskip
<160> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<170> PatentIn version 3.3
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 1
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 1110
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 1
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip0,7cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 2
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 369
\vskip0.400000\baselineskip
<212> PRT
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 2
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\hskip0,7cm
\hskip0,7cm
\vskip1.000000\baselineskip
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<210> 3
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<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
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<213> Artificial
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<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador
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<400> 3
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\hskip0,7cm
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<210>4
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<211> 24
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<212>ADN
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<213> Artificial
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<220>
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<223> Cebador
\newpage
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<400> 4
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<210> 5
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<211> 31
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<212> ADN
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<213> Artificial
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<220>
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<223> Cebador
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<400> 5
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<210> 6
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<211> 28
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<212> ADN
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<213> Artificial
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<220>
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<223> Cebador
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<400> 6
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<210> 7
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<211> 16
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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<400> 7
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<210> 8
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<211> 15
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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<400> 8
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<210> 9
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<211> 16
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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<400> 9
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<210> 10
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<211> 13
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<212> PRT
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<213> Homo sapiens
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<400> 10
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\hskip0,8cm
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<210> 11
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<211> 1431
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
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<213> sin identificar
\newpage
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<400> 11
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\hskip0,7cm
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<210> 12
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<211> 1623
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<212> ADN
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<213> sin identificar
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 12
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\hskip0,7cm
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<210> 13
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<212> ADN
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<213> sin identificar
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<400> 13
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\vskip1.000000\baselineskip
\hskip0,7cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 14
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 592
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> misc_feature
\vskip0.400000\baselineskip
<222>(591)..(591)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n es a, c, g, o t
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 14
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip0,7cm
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\vskip1.000000\baselineskip
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<210> 15
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 523
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<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 15
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\vskip1.000000\baselineskip
\hskip0,7cm
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<210> 16
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<211> 557
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 16
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\hskip0,7cm
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\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 17
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 596
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<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 17
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\hskip0,7cm
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<210> 18
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<211> 544
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 18
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\hskip0,7cm
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<210> 19
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<211> 555
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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<400>19
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\hskip0,7cm
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<210> 20
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<211> 618
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<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 20
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\vskip1.000000\baselineskip
\hskip0,7cm
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\vskip0.400000\baselineskip
<210> 21
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<211> 554
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
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<213> Homo sapiens
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 21
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\vskip1.000000\baselineskip
\hskip0,7cm
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\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 22
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 535
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 22
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip0,7cm
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\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 23
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 474
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 23
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip0,7cm
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 572
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<221> misc_feature
\vskip0.400000\baselineskip
<222> (29)..(29)
\vskip0.400000\baselineskip
<223> n es a, c, g, o t
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 24
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip0,7cm
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\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 25
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 443
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<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 25
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip0,7cm
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\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 26
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 554
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Homo sapiens
\newpage
\vskip0.400000\baselineskip
<400> 26
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\vskip1.000000\baselineskip
\hskip0,8cm
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\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
<210> 27
\vskip0.400000\baselineskip
<211> 24
\vskip0.400000\baselineskip
<212> ADN
\vskip0.400000\baselineskip
<213> Artificial
\vskip0.400000\baselineskip
<220>
\vskip0.400000\baselineskip
<223> Cebador
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\vskip0.400000\baselineskip
<400> 27
\vskip1.000000\baselineskip
\hskip0,8cm
Claims (38)
1. Uso como marcador específico de células beta
de los islotes pancreáticos de Langerhans de al menos un
polinucleótido aislado o de la proteína correspondiente, elegido
de:
- los polinucleótidos que comprenden o presentan
una de las siguientes secuencias: (a) la secuencia ID SEC Nº 1, (b)
un fragmento de la secuencia ID SEC Nº 1 de al menos 15 nucleótidos
consecutivos, (c) una secuencia que presenta un porcentaje de
identidad de al menos 80% después de alineamiento óptimo con una de
las secuencias definidas en (a) o en (b), y (d) una secuencia
complementaria, homosentido o antisentido de una de las secuencias
definidas en (a), (b) o (c), y
- las proteínas codificadas por los
polinucleótidos definidos en (a), (b), (c) o (d) anteriores, que
comprenden o presentan una de las siguientes secuencias: (e) la
secuencia ID SEC Nº 2, (f) un fragmento de la secuencia ID SEC Nº 2
de al menos 15 aminoácidos consecutivos, (g) una secuencia que
presenta un porcentaje de identidad de al menos 60% después de
alineamiento óptimo con una de las secuencias definidas en (e) o en
(f), preferiblemente 80% de identidad, o de forma todavía más
preferida 90% de identidad.
2. Uso según la reivindicación 1,
caracterizado porque dicho polinucleótido aislado como se
define en c), es un polinucleótido variante de la secuencia ID SEC
Nº 1 que consta de una mutación que conduce a una modificación de
la secuencia de aminoácidos de la proteína codificada por la
secuencia ID SEC Nº 1.
3. Uso según la reivindicación 1,
caracterizado porque dicho polinucleótido aislado como se
define en b) o en d) se elige entre la pareja de
\hbox{cebadores ID SEC Nº 3 e ID SEC Nº 27 y la pareja de cebadores ID SEC Nº 5 e ID SEC Nº 6.}
4. Uso según la reivindicación 1,
caracterizado porque dicho polinucleótido aislado se puede
obtener por amplificación con ayuda de la pareja de cebadores
definidos en la reivindicación 3.
5. Uso según la reivindicación 1,
caracterizado porque dicho polinucleótido como se define en
(d) es un ARN interferente pequeño (ARNip) que por interacción con
los ARNm correspondientes a dicho polinucleótido, conducirá a su
degradación.
6. Uso según la reivindicación 1,
caracterizado porque dicha proteína como se define en (g) es
una variante de la secuencia del ID SEC Nº 2 que presenta una
mutación asociada a la diabetes o a la hiperinsulinemia.
7. Uso según la reivindicación 1,
caracterizado porque dicho fragmento como se define en (f)
presenta una secuencia elegida de las secuencias ID SEC Nº 7, ID
SEC Nº 8, ID SEC Nº 9 e ID SEC Nº 10.
8. Polinucleótido aislado, caracterizado
porque se puede usar según la reivindicación 1, y porque comprende
o presenta una secuencia elegida de:
(a) la secuencia ID SEC Nº 1,
(b) un fragmento de la secuencia ID SEC Nº 1 de
al menos 20 nucleótidos consecutivos,
(c) una secuencia complementaria, homosentido o
antisentido de una de las secuencias definidas en (a) o (b),
excepto los fragmentos de al menos
15 nucleótidos consecutivos incluidos en las secuencias que tienen
los números de acceso en la base de datos NCBI nº AX526723 (ID SEC
Nº 11), nº AX526725 (ID SEC Nº 12) y nº AX526727 (ID SEC Nº 13),
las secuencias EST que tienen los números de acceso en la base de
datos GenBank BM565129 (ID SEC Nº 14), BM310003 (ID SEC Nº 15),
BM875526 (ID SEC Nº 16), BG655918 (ID SEC Nº 17), BQ417284 (ID SEC
Nº 18), BQ267316 (ID SEC Nº 19), BU072134 (ID SEC Nº 20), BQ267526
(ID SEC Nº 21), BQ270198 (ID SEC Nº 22), BU581447 (ID SEC Nº 23),
BU070173 (ID SEC Nº 24), BQ631692 (ID SEC Nº 25) y BU949895 (ID SEC
Nº 26) así como las secuencias que tienen los números de acceso en
la base de datos NCBI AX526723 (ID SEC Nº 11), AX526725 (ID SEC Nº
12) y AX526727 (ID SEC Nº
13).
9. Sonda para detectar, identificar o dosificar
los ácidos nucleicos correspondientes a los polinucleótidos como se
definen en la reivindicación 1, caracterizada porque está
constituida por un polinucleótido según la reivindicación 8.
10. Pajera de cebadores para la amplificación de
ácidos nucleicos que se pueden usar según la reivindicación 1,
caracterizados porque se elige de las parejas de cebadores
como se definen en la reivindicación 3.
11. Polinucleótido aislado que se puede usar
según la reivindicación 1, que se puede obtener por amplificación
con ayuda de los cebadores según la reivindicación 10.
12. Polinucleótido según la reivindicación 8,
caracterizado porque se trata de un ARN interferente pequeño
correspondiente al polinucleótido como se define en la
reivindicación 1, que por interacción con los ARNm correspondientes
a dicho polinucleótido, conducirá a su degradación.
13. Procedimiento de determinación del perfil de
transcripción del gen correspondiente al polinucleótido según la
reivindicación 8 o la reivindicación 11, o de una alteración de
dicho perfil, en una muestra biológica, que comprende una primera
etapa de obtención por cualquier medio adecuado de los ARN a partir
de la muestra biológica, una segunda etapa de poner en contacto
dichos ARN con una sonda marcada constituida por un polinucleótido
según una cualquiera de las reivindicaciones 8, 9 u 11 en las
condiciones de hibridación adecuadas entre los ARN y la sonda, y
una tercera etapa de revelado por cualquier medio adecuado de los
híbridos formados.
14. Procedimiento según la reivindicación 13, en
la que la segunda etapa es una etapa de retrotranscripción y/o de
amplificación de los transcritos, realizada con ayuda de una pareja
de cebadores según la reivindicación 10, y la tercera etapa es una
etapa de revelado por cualquier medio adecuado de los ácidos
nucleicos amplificados.
15. Procedimiento según una cualquiera de las
reivindicaciones 13 ó 14, caracterizado porque consta además
de una etapa de evaluación de la tasa de transcripción del gen por
comparación con un testigo previamente elegido.
16. Procedimiento para poner de manifiesto el
gen correspondiente al polinucleótido según la reivindicación 8 o
la reivindicación 11, o las variantes alélicas de dicho gen o una
alteración funcional de este gen, en una muestra biológica, que
comprende una primera etapa de obtención por cualquier medio
adecuado del ADN a partir de la muestra biológica, una segunda
etapa de poner en contacto dichos ADN con una sonda marcada
constituida por un polinucleótido según una cualquiera de las
reivindicaciones 8, 9 u 11, en las condiciones adecuadas de
hibridación entre los ADN y la sonda, y una tercera etapa de
revelado por cualquier medio adecuado de los híbridos
formados.
formados.
17. Procedimiento según la reivindicación 16, en
la que la segunda etapa es una etapa de amplificación realizada con
ayuda de una pareja de cebadores según la reivindicación 10, y la
tercera etapa es una etapa de revelado por cualquier medio adecuado
de los ácidos nucleicos amplificados formados.
18. Procedimiento según una cualquiera de las
reivindicaciones 16 ó 17, caracterizado porque consta además
de una etapa de aislamiento y de secuenciación de los ácidos
nucleicos puestos de manifiesto.
19. Paquete de reactivos para llevar a cabo los
procedimientos según una cualquiera de las reivindicaciones 13 a
18, que comprende:
a) al menos una sonda según la reivindicación 9
y/o una pareja de cebadores según la reivindicación 10;
b) los reactivos necesarios para llevar a cabo
una reacción de hibridación entre dicha sonda y/o dichos cebadores
y el ácido nucleico de la muestra biológica;
c) los reactivos necesarios para llevar a cabo
una reacción de amplificación;
d) los reactivos necesarios para detectar y/o
dosificar el híbrido formado entre dicha sonda y el ácido nucleico
de la muestra biológica o de los ácidos nucleicos amplificados
formados.
20. Biochip de ADN que comprende al menos un
polinucleótido según la reivindicación 8 o la reivindicación
11.
21. Uso de un polinucleótido según la
reivindicación 8 o la reivindicación 11, para preparar un biochip de
ADN.
22. Uso in vitro del polinucleótido según
una cualquiera de las reivindicaciones 8, 11 ó 12, como medio de
estudio:
a) de la sobreexpresión del transportador
codificado por el polinucleótido según la reivindicación 8 o la
reivindicación 11, en las líneas de células modelo, y del impacto en
la secreción de insulina en respuesta a una estimulación por la
glucosa;
b) de la sensibilidad de las células beta de los
islotes pancreáticos de Langerhans a la muerte celular (apoptosis)
inducida por condiciones de estrés oxidante o la concentración débil
o fuerte de cinc;
c) de las etapas de diferenciación de las
células madre en células secretoras de insulina en respuesta a
diferentes estimulaciones exógenas.
23. Vector de clonación y/o de expresión,
caracterizado porque comprende un inserto constituido por un
polinucleótido según una cualquiera de las reivindicaciones 8, 11 ó
12.
24. Célula modificada por un polinucleótido
según una cualquiera de las reivindicaciones 8, 11 ó 12, o un
vector según la reivindicación 23.
25. Organismos no humanos transgénicos,
caracterizados porque todas o parte de sus células contienen
un polinucleótido según una cualquiera de las reivindicaciones 8,
11 ó 12, o un vector según la reivindicación 23, en forma libre o
integrada.
26. Uso de una célula modificada según la
reivindicación 24, o de un organismo no humano transgénico según la
reivindicación 25, para la producción de una proteína o de un
fragmento de proteína codificado por un polinucleótido según la
reivindicación 8 o la reivindicación 11, elegido de las secuencias
ID SEC Nº 7, ID SEC Nº 8, ID SEC Nº 9 e ID SEC Nº 10.
27. Procedimiento de preparación de una proteína
o de un fragmento de proteína codificada por un polinucleótido
según la reivindicación 8 o la reivindicación 11, o elegida de las
secuencias ID SEC Nº 7, ID SEC Nº 8, ID SEC Nº 9 e ID SEC Nº 10,
caracterizado porque comprende el cultivo de células
modificadas según la reivindicación 24, en concreto células de
mamífero, o células de organismos no humanos transgénicos como se
definen en la reivindicación 25, en las condiciones que permiten la
expresión de dicha proteína y la purificación de dicha proteína
recombinante.
28. Uso de un anticuerpo mono o policlonal
específico de la proteína de ID SEC Nº 2, para detectar y/o
seleccionar islotes de Langerhans o células beta.
29. Uso de un anticuerpo mono o policlonal
específico de la proteína de ID SEC Nº 2, para analizar la
diferenciación de células madre en células de islote pancreático,
preferiblemente en células beta.
30. Procedimiento de selección de células beta
de los islotes de Langerhans, que comprende una primera etapa de
poner en contacto las células de una muestra biológica que puede
contener dichos islotes y/o células con un anticuerpo mono o
policlonal específico de la proteína de ID SEC Nº 2, una segunda
etapa de poner de manifiesto por cualquier medio adecuado las
células marcadas por el anticuerpo, y una tercera etapa de
aislamiento por cualquier medio adecuado de las células
marcadas.
31. Procedimiento de análisis de la
diferenciación de células madre en células de islote pancreático o
en células beta, que comprende una etapa de poner en contacto las
células de una muestra biológica que puede contener dichas células
madre en el proceso de diferenciación con un anticuerpo mono o
policlonal específico de la proteína de ID SEC Nº 2, una segunda
etapa de poner de manifiesto por cualquier medio adecuado las
células marcadas por el anticuerpo y una tercera etapa de
visualización por cualquier medio adecuado de las células
marcadas.
32. Procedimiento según la reivindicación 31,
que comprende además una etapa complementaria de aislar por
cualquier medio adecuado las células marcadas.
33. Procedimiento de cribado de un compuesto
químico o bioquímico que pueda interactuar in vitro o in
vivo, directa o indirectamente con el polinucleótido según una
cualquiera de las reivindicaciones 8 u 11, caracterizado
porque comprende una primera etapa de poner en contacto un compuesto
químico o bioquímico candidato con un polinucleótido según una
cualquiera de las reivindicaciones 8 u 11 o una célula según la
reivindicación 24 o un organismo no humano transgénico según la
reivindicación 25, o un biochip de ADN según la reivindicación 20,
y una segunda etapa de detección del complejo formado entre el
compuesto químico o bioquímico candidato y el polinucleótido o la
célula o el organismo no humano transgénico o el biochip de ADN.
34. Procedimiento de cribado de un compuesto
químico o bioquímico que puede modular in vitro o in
vivo, directa o indirectamente la expresión del polinucleótido
según una cualquiera de las reivindicaciones 8 u 11,
caracterizado porque comprende una primera etapa de poner en
contacto un compuesto químico o bioquímico candidato con un
polinucleótido según una cualquiera de las reivindicaciones 8 u 11 o
una célula según la reivindicación 24 o un organismo no humano
transgénico según la reivindicación 25, o un biochip de ADN según
la reivindicación 20, y una segunda etapa de medición por cualquier
medio adecuado de la expresión del polinucleótido según una
cualquiera de las reivindicaciones 8 u 11.
35. Procedimiento de cribado de un compuesto
químico o bioquímico que puede tener uso potencial para el
tratamiento de la diabetes y de la hiperinsulinemia,
caracterizado porque comprende una primera etapa de poner en
contacto un compuesto químico o bioquímico candidato con una
proteína o un fragmento de proteína codificada por un
polinucleótido según la reivindicación 8 o la reivindicación 11, o
elegido de las secuencias ID SEC Nº 7, ID SEC Nº 8, ID SEC Nº 9 e
ID SEC Nº 10, o una célula según la reivindicación 24 o un organismo
no humano transgénico según la reivindicación 25, y una segunda
etapa de detección del complejo formado entre el compuesto químico
o bioquímico candidato y la proteína o la célula o el organismo no
humano transgénico.
36. Medicamento que comprende un producto
elegido de los polinucleótidos según una cualquiera de las
reivindicaciones 8, 11 ó 12, las proteínas o fragmentos de proteína
codificadas por un polinucleótido según la reivindicación 8 o la
reivindicación 11, los polipéptidos de secuencias ID SEC Nº 7, ID
SEC Nº 8, ID SEC Nº 9 e ID SEC Nº 10, los anticuerpos específicos
de la proteína de ID SEC Nº 2, los vectores según la reivindicación
23 y las células modificadas según la reivindicación 24.
37. Uso de un producto elegido de: los
polinucleótidos según una cualquiera de las reivindicaciones 8, 11
ó 12, las proteínas o fragmentos de proteína codificadas por un
polinucleótido según la reivindicación 8 o la reivindicación 11,
los polipéptidos de secuencias ID SEC Nº 7, ID SEC Nº 8, ID SEC Nº 9
e ID SEC Nº 10, los anticuerpos específicos de la proteína de ID
SEC Nº 2, los vectores según la reivindicación 23 y las células
modificadas según la reivindicación 24, para preparar un medicamento
dirigido a la prevención y/o al tratamiento de la diabetes, en
particular a la asociada con la presencia de al menos una mutación
del gen correspondiente al ID SEC Nº 1, y/o una expresión anómala
de la proteína correspondiente al ID SEC Nº 2, o dirigido a la
prevención y/o al tratamiento de hiperinsulinemias cuando se
observa una expresión, una maduración o una secreción anómalas del
gen de la insulina o dirigido a regular la maduración y/o la
secreción de insulina en las células beta o en las células
modificadas en vista de una secreción de insulina, o dirigido a
regular los fenómenos de apoptosis de células beta.
38. Uso de un producto elegido de: los
polinucleótidos según una cualquiera de las reivindicaciones 8, 11
ó 12, las proteínas o fragmentos de proteína codificadas por un
polinucleótido según la reivindicación 8 o la reivindicación 11,
los polipéptidos de secuencias ID SEC Nº 7, ID SEC Nº 8, ID SEC Nº 9
e ID SEC Nº 10, los anticuerpos específicos de la proteína de ID
SEC Nº 2, para determinar una variabilidad alélica, una mutación,
una deleción, una pérdida de heterocigosis o cualquier anomalía del
gen que codifica dicha proteína.
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