ES2255112T3 - Inhibicion de apoptosis usando inhibidores de la familia de la enzima convertidora de interleucina 1-beta (ice)/ced-3. - Google Patents

Inhibicion de apoptosis usando inhibidores de la familia de la enzima convertidora de interleucina 1-beta (ice)/ced-3.

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ES2255112T3
ES2255112T3 ES97943323T ES97943323T ES2255112T3 ES 2255112 T3 ES2255112 T3 ES 2255112T3 ES 97943323 T ES97943323 T ES 97943323T ES 97943323 T ES97943323 T ES 97943323T ES 2255112 T3 ES2255112 T3 ES 2255112T3
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Abstract

LA PRESENTE INVENCION SE REFIERE A UNOS PROCEDIMIENTOS PARA INCREMENTAR POBLACIONES DE CELULAS HEMATOPOLETICAS Y PARA PROLONGAR LA SUPERVIVENCIA, CON EL FIN DE PROLONGAR LA VIABILIDAD DE UN ORGANO PARA SU TRASPLANTE Y CON EL FIN DE INCREMENTAR LA BIOPRODUCCION, USANDO INHIBIDORES DE LA FAMILIA (ICE)/CED-3 (ENZIMA DE CONVERSION DEL INTERLEUKINA 1 BE ). SE DAN UNOS EJEMPLOS DE COMPUESTOS UTILES EN ESTOS PROCEDIMIENTOS EN LAS PIEZAS DESCRIPTIVAS DE LA DEMANDA.

Description

Inhibición de apoptosis usando inhibidores de la familia de la enzima convertidora de interleucina 1-\beta (ICE)/CED-3.
Campo de la invención
La presente invención se refiere en general a muerte celular programada y específicamente a métodos para expansión de células hematopoyéticas, para prolongar la viabilidad de un órgano para trasplante y mantener la viabilidad de las líneas celulares utilizadas en la bioproducción empleando inhibidores de la familia de la enzima convertidora de interleucina 1\beta (ICE)/CED-3.
Antecedentes de la invención
La presente invención se refiere en general a muerte celular programada y específicamente a métodos para la expansión de células hematopoyéticas, para prolongar la viabilidad de un órgano para trasplante y mantener la viabilidad de las líneas celulares en la bioproducción empleando inhibidores de la familia de la enzima convertidora de interleucina 1\beta (ICE)/CED-3.
La necrosis y la apoptosis son dos procesos básicos mediante los cuales mueren las células. En la necrosis, la muerte celular usualmente es la consecuencia de una lesión celular. Las células en general se expanden y se lisan, y los contenidos celulares finalmente se derraman hacia el espacio extracelular. En contraste, la apoptosis es una forma de muerte celular en la que se eliminan células simples en medio de tejidos vivos. La apoptosis es responsable de la mayor parte de la muerte celular programada en la remodelación de tejido y de la pérdida de células que acompaña la atrofia de los tejidos adultos tras la retirada de estímulos endocrinos y otros estímulos de crecimiento. Además, se cree que la apoptosis es responsable de la muerte fisiológica de las células en el transcurso de recambio de tejido normal (es decir, homeostasis de tejido) (Kerr, J. F., et al, 1972. Br. J. Cancer 26:239-257; Wyllie, A. H., et al. 1980. Int. Rev. Cytol. 68:251-306).
Los mecanismos efectores de la apoptosis no se entienden completamente, pero finalmente ocurren ciertos cambios nucleares que parecen ser causados por la activación de nucleasas endógenas que escinden cromatina entre los nucleosomas y reducen el contenido de ADN intacto en células apoptóticas. Se ha identificado una cantidad de reguladores de apoptosis. Algunos de ellos ya son familiares, como los proto-oncogenes y los genes oncosupresores, incluyendo c-myc, bcl-2, p53 y ras. Se cree que los productos proto-oncogénicos y las proteínas oncosupresoras controlan la susceptibilidad celular a la apoptosis (Isaacs, J. T. 1994. Curr. Opin. Oncol. 6:82-89). El C-myc puede determinar si las células se proliferan continuamente o ingresan a la apoptosis, dependiendo de la disponibilidad de factores de crecimiento críticos (Bisonnette, R. P., et al. 1994. In Apoptosis II. The Molecular Basis of Apoptosis in Disease. Cold Spring Harbor Laboratory Press). En células cultivadas, la proliferación por lo general se observa en presencia de c-myc y factores de crecimiento, mientras que la apoptosis se observa cuando está presente el c-myc pero no lo están los factores de crecimiento. Otros oncogenes determinados (p. ej., bcl-2) rescatan a las células de la susceptibilidad a la apoptosis. Específicamente, los miembros de la familia del gen bcl-2 pueden actuar para inhibir la muerte celular programada (p. ej., bcl-2, bcl-xL, ced-9) o promover la muerte celular (p. ej., bax, bak, bcl-xS). A su vez, los miembros de la familia ICE/CED-3 pueden promover la muerte celular (p. ej., ICE, CPP32, Ich-1, CED3).
La interleucina 1 ("IL-1") es una proteína pro-inflamatoria e inmunorregulatoria importante que estimula la diferenciación y proliferación de fibroblastos, la producción de prostaglandinas, colagenasa y fosfolipasa por parte de las células sinoviales y condrocitos, la desgranulación de basófilos y eosinófilos y la activación de neutrófilos. Oppenheim, J.H. et al., Immunology Today, 7:45-56 (1986). Como tal, está implicada en la patogenia de enfermedades inflamatorias crónicas y agudas, y autoinmunitarias. La IL-1 es producida predominantemente por los monocitos de la sangre periférica como parte de la respuesta inflamatoria. Mosely, B.S. et al., Proc. Nat. Acad. Sci., 84:4572-4576 (1987); Lonnemann, G. et al., Eur. J. Immunol., 19:1531-1536 (1989).
La IL-1\beta mamífera se sintetiza como un polipéptido precursor de aproximadamente 31.5 kDa (Limjuco, et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 83:3972, 1986). La IL-1\beta precursora es incapaz de unirse a los receptores de IL-1 y es biológicamente inactiva (Mosley, et al., J. Biol. Chem., 262:2941, 1987). La actividad biológica parece depender del procesamiento proteolítico que provoca la conversión de la forma 31.5 kDa precursora a la forma 17.5 kDa madura.
La maduración proteolítica de IL-1\beta precursora humana a IL-1\beta 17 kDa madura surge de la escisión entre Asp^{116} y Ala^{117}. Se ha identificado una endoproteinasa en monocitos humanos, denominada enzima convertidora de interleucina 1\beta (ICE), que es capaz de escindir el precursor de IL-1\beta en Asp^{116}-Ala^{117}, como también en el sitio Asp^{27}-Gly^{28}, y de generar IL-1\beta madura con el término amino apropiado en Ala^{117}. Se ha descubierto que el Asp en la posición 116 es esencial para la escisión, ya que la sustitución de Asp (Kostura, et al., Proc. Natl. Acad. Sci., 86:5227, 1989) u otros aminoácidos (Howard, et al., J. Immunol., 147:2964, 1991) con Ala inhibe este evento de escisión.
La especificidad de sustrato de la ICE humana se ha definido con el uso de péptidos que abarcan el sitio de escisión de la enzima. Dos características de los sustratos peptídicos son esenciales para el reconocimiento catalítico por parte de la enzima. En primer lugar, hay una fuerte preferencia por el ácido aspártico adyacente al sitio de escisión, en el sentido que cualquier sustitución de este residuo en el precursor de IL-1\beta y sustratos peptídicos conduce a una reducción sustancial en el índice de catálisis (Kostura, et al., Proc. Natl. Acad. Sci., 86:5227, 1989; Sleath, et al., J. Biol. Chem., 265:14526, 1990; Howard, et al., J. Immunol., 147:2964, 1991). Existe un requerimiento igualmente riguroso para cuatro aminoácidos hacia la izquierda del sitio de escisión, mientras que la metilamina es suficiente hacia la derecha. El sustrato mínimo para la enzima, AC-Tyr-Val-Ala-Asp-NH-CH_{3}, es un sustrato peptídico particularmente bueno con un Vmax/Km relativo similar a aquel del precursor de IL-1\beta propiamente dicho (Thomberry, et al., Nature. 356:768, 1992).
La ICE es una cisteinil proteinasa según los siguientes criterios: (1) la diazometilcetona AC-Tyr-Val-Ala-Asp-COCHN_{2} es un inhibidor potente, competitivo e irreversible de la enzima, (2) la inactivación de la enzima por parte del acetato de yodo es competitiva con el sustrato, y (3) el Cys catalíticamente activo reacciona selectivamente con [^{14}C] acetato de yodo más de 10 veces más veloz que otras cisteínas o ditiotreitol (Thornberry, et al., Nature, 356:768, 1992).
La ICE está estructural y funcionalmente relacionada con la CED-3 proteasa que funciona como un efector de muerte celular en el ascáride C. elegans (Yuan, et al., Cell, 75:641, 1993). La ICE y CED-3 forman parte de una familia más grande de proteasas (la familia ICE/CED-3) que incluye CPP32, ICH-1, Mch-2, ICE_{rel}II, ICE_{rel}III, Mch-3, Mch4 y Mch-5. Todas estas enzimas son cisteína proteasas que comparten homología significativa en sus sitios activos. También comparten la especificidad para la escisión de sustrato en los enlaces asp-x. Además, cada uno de los miembros de la familia ICE/CED-3 se sintetiza como una pro-enzima que es luego proteolíticamente activada para formar una enzima activa.
Por lo tanto, las patologías en las que los inhibidores de la familia ICE/ced-3 de cisteína proteasas pueden ser útiles como agentes terapéuticos incluyen: enfermedades infecciosas tales como meningitis y salpingitis; choque septicémico, enfermedades respiratorias; cuadros inflamatorios tales como artritis, colangitis, colitis, encefalitis, endocerolitis, hepatitis, pancreatitis y lesión de reperfusión, enfermedades isquémicas tales como infarto de miocardio, apoplejía y nefropatía isquémica; enfermedades inmunitarias tales como hipersensibilidad; enfermedades autoinmunitarias tales como esclerosis múltiple; enfermedades óseas; y determinadas enfermedades neurodegenerativas.
En varios sistemas de cultivo celular, se ha demostrado que la inhibición de miembros de la familia ICE/CED-3 puede inhibir eficazmente la apoptosis. Por ejemplo, el compuesto acetil-DEVD-aldehído inhibió la apoptosis inducida por anti-Fas en una línea celular de linfocitos T (Schlegel, et al., J. Biol. Chem., 271:1841, 1996; Enari, et al., Nature, 380:723, 1996). De modo similar, el acetil-YVAD-aldehído y la acetil-YVAD-clorometilcetona bloquearon la muerte de motoneuronas in vitro e in vivo (Milligan, et al., Neuron, 15:385, 1995). A su vez, el inhibidor de la familia ICE/CED-3 Boc-D-(bencil)clorometilcetona, como así también el crmA previnieron la muerte celular de células epiteliales mamarias que ocurre en ausencia de la matriz extracelular (Boudreau, et al., Science, 267:891,
1995).
Se sabe que el control de la apoptosis puede tener utilidad para tratar la enfermedad. Específicamente, los inhibidores de la familia ICE/CED-3 pueden tener efectos terapéuticos. Por ejemplo, se ha sugerido que la inhibición de ICE puede ser útil en el tratamiento de trastornos inflamatorios (Dolle, et al., J. Med. Chem., 37:563, 1994; Thornberry, et al., Biochemistry, 33:3934, 1994). También se sabe que los inhibidores de los miembros de la familia ICE/CED-3 pueden tener utilidad para tratar enfermedades degenerativas (p. ej., la enfermedad de Alzheimer, enfermedad de Parkinson, esclerosis lateral amiotrófica, enfermedad de Huntington), enfermedad isquémica cardíaca o del sistema nervioso central (es decir, infarto de miocardio y apoplejía) y lesión cerebral traumática, como así también alopecia, sida y hepatopatía inducida por toxinas (Nicholson, Nature Biotechnology 14:297, 1996).
Se han descrito los inhibidores de péptido y peptidilo de la ICE. No obstante, dichos inhibidores típicamente se han caracterizados por propiedades no deseables, tales como absorción oral deficiente, mala estabilidad y metabolismo rápido. Plattner, J.J. y D.W. Norbeck, en Drug Discovery Technologies, C.R Clark and W.H. Moos, Eds. (Ellis Horwood, Chichester, Inglaterra, 1990), pp. 92-126. Estas propiedades no deseables obstaculizaban su desarrollo en fármacos eficaces. Los métodos de la presente invención incluyen bien el uso de miméticos de dipéptidos conformacionalmente restringidos o un reemplazo de indolil péptido N-sustituido. Estos miméticos exhiben propiedades mejoradas en relación con sus contrapartes peptídicas, por ejemplo, absorción y estabilidad metabólica mejoradas que producen una mayor biodisponibilidad.
Sumario
La presente invención se dirige a prevenir la muerte celular programada, inhibiendo la actividad de las proteasas de la familia de la enzima convertidora de interleucina 1\beta (ICE)/CED-3. La presente invención provee nuevos métodos para usar los inhibidores de ICE/CED-3. La presente invención provee un método para usar los inhibidores de ICE/CED-3 para expandir las subpoblaciones de células hematopoyéticas, aumentar la supervivencia de las células, incluyendo los granulocitos, in vitro, para uso en transfusiones celulares, aumentar la supervivencia de distintos órganos y aumentar la bioproducción de células in vitro.
En una primera realización, la invención provee un método in vitro para expandir las poblaciones de células hematopoyéticas o aumentar su supervivencia, incluyendo poner en contacto las células con una cantidad eficaz de un reactivo que suprime la actividad de por lo menos un miembro de la familia ICE/CED-3, inhibiendo así la muerte celular programada de precursores inmaduros y/o células maduras, y expandiendo y/o aumentando la supervivencia de la población de células. Las poblaciones celulares incluidas en el método de la invención incluyen granulocitos, monocitos, eritrocitos, linfocitos y plaquetas.
En otra realización, la invención provee un método in vitro para prolongar la viabilidad de un órgano antes y/o después de un trasplante, que comprende poner en contacto las células de un órgano con una cantidad inhibidora eficaz de un reactivo que suprime la actividad de uno o más miembros de la familia ICE/CED-3, prolongando de este modo la viabilidad del órgano en comparación con un órgano no tratado. Un órgano para trasplante se puede tratar con dicho reactivo bien in vivo, ex vivo o ambos. El órgano puede ser bien un órgano intacto o células aisladas derivadas de un órgano (p. ej., células aisladas de los islotes pancreáticos, neuronas dopaminérgicas aisladas, sangre o células hematopoyéticas).
Incluso en otra realización, la invención provee un método para aumentar la bioproducción in vitro que comprende poner en contacto células hospedantes bioproductoras con un reactivo que suprime la actividad de por lo menos un miembro de la familia ICE/CED-3, aumentando así la supervivencia de dichas células in vitro.
Los compuestos ilustrativos útiles como inhibidores de ICE/CED-3 también se incluyen en la presente. Dichos compuestos y métodos de síntesis se describen en su totalidad en las solicitudes de patente estadounidenses conjuntamente en trámite 08/710.621, presentada el 20/9/96 y 08/767.175, presentada el 16/12/96 y sus respectivas continuaciones en parte.
Breve descripción de los dibujos
La Figura 1 expone la actividad de los compuestos en la Fórmula 3 para inhibir la actividad de las enzimas ICE, CPP32, MCH2, MCH3 y MCH5.
La Figura 2 expone la actividad del Ejemplo 106 para inhibir la actividad de las ICE, CPP32, MCH2 y MCH5.
La Figura 3 muestra los resultados provenientes de los análisis FACS que demuestran el efecto de los inhibidores de ICE/CED-3 sobre la supervivencia de neutrófilos, según lo medido por el contenido de ADN (% hipodiploide).
Descripción detallada de la invención
La presente invención provee métodos para la inhibición de la muerte celular programada, o apoptosis, mediante la inhibición de miembros de la familia ICE/CED-3. Esto incluiría no solamente inhibidores de la actividad enzimática de ICE/CED-3, sino también cualquier método que prevenga específicamente la expresión de genes codificadores de la familia ICE/CED-3. Por lo tanto, el ADN o ARN antisentido comprendido por secuencias nucleotídicas complementarias a los genes miembros de la familia ICE/CED-3 y capaces de inhibir la transcripción y traducción de proteínas relevantes, expresión de formas negativas dominantes de las ICE/CED-3 proteasas (p. ej., mutantes modificados para reemplazar la cisteína del sitio activo con otro aminoácido, como serina o alanina) o los anticuerpos que se unen a los polipéptidos de la familia ICE/CED-3, se encuentran dentro de la presente invención, ya que son inhibidores de molécula pequeña, incluyendo los péptidos.
Los compuestos de la Fórmula 3 a continuación son también útiles en los métodos de la invención:
\vskip1.000000\baselineskip
1
\newpage
en la que:
n es 1 ó 2;
m es 1 ó 2;
A es R^{2}CO-, R^{3}-O-CO- o R^{4}SO_{2}-;
un grupo de la fórmula:
2
en la que:
R^{1} es un átomo de hidrógeno, alquilo o fenilalquilo;
R^{2} es alquilo, cicloalquilo, (cicloalquil)alquilo, fenilo, fenilalquilo, fenilo sustituido, (fenilo sustituido)alquilo, heteroarilo o (heteroaril)alquilo;
R^{3} es alquilo, cicloalquilo, (cicloalquil)alquilo, fenilalquilo o (fenilo sustituido)alquilo;
R^{4} es alquilo, cicloalquilo, (cicloalquil)alquilo, fenilo, fenilalquilo, fenilo sustituido, (fenilo sustituido)alquilo, heteroarilo o (heteroaril)alquilo;
R^{5} es alquilo, cicloalquilo, (cicloalquil)alquilo, fenilo, fenilalquilo, fenilo sustituido, (fenilo sustituido)alquilo, heteroarilo o (heteroaril)alquilo;
R^{6} es alquilo, cicloalquilo, (cicloalquil)alquilo, fenilalquilo o (fenilo sustituido)alquilo;
R^{7} es alquilo, cicloalquilo, (cicloalquil)alquilo, fenilo, fenilalquilo, fenilo sustituido, (fenilo sustituido)alquilo, heteroarilo o (heteroaril)alquilo;
R^{8} es una cadena lateral de aminoácidos seleccionada entre el grupo que consiste en aminoácidos naturales y sintéticos;
B es un átomo de hidrógeno, un átomo de deuterio, alquilo, cicloalquilo, (cicloalquil)alquilo, fenilo, fenilalquilo, fenilo (sustituido), fenilalquilo (sustituido), heteroarilo, (heteroaril)alquilo o halometilo; un grupo de la fórmula
-CH_{2}XR^{9};
en la que R^{9} es fenilo, fenilalquilo, fenilo sustituido, (fenilo sustituido)alquilo, heteroarilo o (heteroaril)alquilo; y X es un átomo de oxígeno o un átomo de azufre;
un grupo de la fórmula:
-CH_{2}-O-CO-(arilo);
un grupo de la fórmula:
-CH_{2}-O-CO-(heteroarilo);
un grupo de la fórmula:
-CH_{2}-O-PO(R^{10})R^{11}
en la que R^{10} y R^{11} se seleccionan independientemente entre un grupo que consiste en alquilo, cicloalquilo, fenilo, fenilo sustituido, fenilalquilo y (fenilo sustituido) alquilo; y sus sales farmacéuticamente aceptables.
Los compuestos de la Fórmula 3 pueden también existir como solvatos e hidratos. Por lo tanto, estos compuestos se pueden cristalizar, por ejemplo, con aguas de hidratación o uno de una cantidad o cualquiera de sus fracciones de moléculas de disolvente de licor madre. Los solvatos e hidratos de dichos compuestos se incluyen dentro del alcance de la presente invención.
Los compuestos de las Fórmulas 1 y 3 de la presente invención se pueden sintetizar usando técnicas convencionales. Ventajosamente, estos compuestos convenientemente se sintetizan a partir de materiales de inicio fácilmente disponibles.
Por lo tanto, los compuestos de Fórmula 3 se pueden sintetizar en general combinando un núcleo tricíclico expuesto a continuación en la Fórmula 4:
3
con los residuos de ácido aspártico y glutámico modificados de Fórmulas 5a-d:
4
5
en presencia de agentes de acoplamiento peptídicos convencionales, tales como diciclohexilcarbodiimida (DCC)-1-hidroxibenzotriazol (HOBt), reactivo BOP, pyBOP, TBTU, EEDQ, 1-etil(3,3'-dimetil-1'-aminopropil)carbodiimida (EDAC)-HOBt y similares, tal como se analiza en J. Jones, "Amino Acid and Peptide Synthesis", Steven G. Davis ed., Oxford University Press, Oxford, pp. 25-41 (1992). En la fórmula previamente expuesta, A es un grupo amino protector. El grupo amino protector se elimina luego y la amina resultante se combina con el grupo acilo sustituido de la Fórmula 6:
Fórmula 6
R^{C}-CO-X
o el grupo sulfonilo de Fórmula 7:
Fórmula 7
R^{4}SO_{2}-X.
En las fórmulas anteriores, R^{1} es tal como se definió anteriormente y R^{c} es R^{2}, R^{3} -O, R^{4} o cualquiera de las cadenas laterales que contienen R^{8}, como se definió para el grupo A en la Fórmula 3. Desde ya, dichos restos tendrían cualquier grupo hidroxi, carboxi o amino en la forma protegida como para no interferir con la reacción de acoplamiento (Fórmula 5a-d), la reacción de acilación (Fórmula 4) o la reacción de sulfonación (Fórmula 7). X en las Formulas anteriores representa un grupo saliente fácil para las reacciones de acilación o sulfonación.
En el caso de que la reacción de acoplamiento se lleve a cabo con el amino alcohol de Fórmula 5c, el resto alcohol se debe oxidar al compuesto carbonilo correspondiente antes de la eliminación de los grupos protectores. Los métodos preferidos para la reacción de oxidación incluyen oxidación Swern (cloruro de oxalilo-dimetil sulfóxido, cloruro de metilo a -78ºC seguido de trietilamina; y oxidación Dess-Martin (peryodinano Dess-Martin, t-butanol y cloruro de metileno). Los grupos protectores contenidos en las sub-estructuras de las Fórmula 5a-d y A se eliminan por métodos conocidos en la técnica.
El núcleo tricíclico de Fórmula 3 se sintetiza por métodos conocidos en la técnica. Por ejemplo, véanse D.S. Karanewsky, patente estadounidense No. 5.504.080 expedida el 2 de abril de 1996; J.A. Robl et al., Tetrahedron Letters, 36:1593-1596 (1995); y S. De Lombaert et al., Tetrahedron Letters, 35:7513-7516 (1994)
El ácido aspártico o glutámico modificado para las Fórmulas 5a-d se puede elaborar por métodos conocidos en la técnica. Véanse, por ejemplo, la solicitud de patente europea 519.748; solicitud de patente PCT No. PCT/EP92/02472; solicitud de patente PCT No. PCT/US91/06595; solicitud de patente PCT No. PCT/US91/02339; solicitud de patente europea No. 623.592; solicitud de patente mundial No. WO 93/09135; solicitud de patente PCT No. PCT/US94/08868; solicitud de patente europea No. 623,606; solicitud de patente europea No. 618,223; solicitud de patente europea No. 533.226; solicitud de patente europea No. 528.487; solicitud de patente europea No. 618.233; solicitud de patente PCT No. PCT/ EP92/02472; solicitud de patente mundial No. WO 93/09135; solicitud de patente PCT No. PCT/US93/03589; y solicitud de patente PCT No. PCT/US93/00481.
El grupo acilo de Fórmula 6 y los grupos R^{4}SO_{2} correspondientes también se sintetizan por métodos conocidos en la técnica. Véase, por ejemplo, la patente estadounidense No. 5.504.080, expedida el 2 de abril de 1996. Si bien este grupo se puede elaborar una vez unido al núcleo tricíclico, es preferible que esté intacto antes de unirse al
núcleo.
Una vez que las cadenas laterales de Fórmula 5 y Fórmula 6 o Fórmula 7 están unidas al núcleo tricíclico de Fórmula 3, el experto en la técnica por lo general eliminaría cualquier grupo protector amino, hidroxi o carboxi para aumentar la actividad de la molécula sintetizada.
En la Fórmula 3 anterior, ocurre un grupo de compuestos óptimos cuando n es uno, incluso más cuando B es un átomo de hidrógeno y especialmente cuando R^{3} es un átomo de hidrógeno o un grupo t-butilo. Dentro de este grupo de compuestos se deben destacar aquellos en los que A es un aminoácido natural. Este último grupo de compuestos se denominará en la presente "compuestos 4-oxobutanoicos".
Dentro de este grupo de compuestos 4-oxobutanoicos se encuentra un grupo de compuestos óptimos en los que R^{1} es un grupo metilo, es decir, los compuestos N-metilindol. Una realización de este grupo de compuestos N-metilindol ocurre cuando A es un residuo alanina, valina, leucina, fenilalanina, glicina o prolina. Los compuestos destacados dentro de cada uno de estos grupos de aminoácidos naturales, compuestos de N-metilindol ocurren cuando el N-metilindol no está sustituido en modo alguno, es decir, en los que X, Y y R^{2} son cada uno un átomo de hidrógeno, y óptimamente, cuando R^{3} es un átomo de hidrógeno.
Otro grupo óptimo de compuestos 4-oxobutanoicos consiste en los compuestos de N-bencilindol. Por ejemplo, un grupo de los compuestos de N-bencilindol ocurre cuando A es un residuo alanina. Destacados dentro de este grupo de compuestos de alanina se encuentran aquellos en los que X, Y y R^{2} son cada uno un átomo de hidrógeno, y especialmente en los que R^{3} es un átomo de hidrógeno.
Un grupo óptimo alternativo de los compuestos 4-oxobutanoicos ocurre cuando el sustituyente N del grupo indol es un grupo 1-butenilo. Una realización de este grupo de compuestos de N-(1-butenil)indol ocurre cuando A es un residuo valina, y especialmente cuando X, Y y R^{2} son cada uno un átomo de hidrógeno. Un grupo óptimo de este último grupo de compuestos ocurre cuando R^{3} es un átomo de hidrógeno.
Incluso otro grupo de compuestos 4-oxobutanoicos óptimos ocurre cuando el sustituyente N del anillo indol es un residuo de ácido 2'-acético. Un grupo ilustrativo de los N-(compuestos de ácido acético 2') ocurre cuando A es un residuo alanina. Una realización de este grupo particular de compuestos alanina ocurre cuando X, Y y R^{2} son cada uno un átomo de hidrógeno, y especialmente cuando R^{3} es un átomo de hidrógeno.
Un grupo de compuestos 4-oxobutanoicos, cuando el grupo indol está sustituido en el nitrógeno con ácido 3'-propiónico, es otro ejemplo de la presente invención. Un grupo óptimo de dichos compuestos de N-(ácido propiónico)indol ocurre cuando A es un residuo alanina. Destacados dentro de este grupo de compuestos de alanina se encuentran aquellos en los que X, Y y R^{2} son cada un átomo de hidrógeno y especialmente en los que R^{3} es un átomo de hidrógeno.
Otro grupo óptimo de compuestos de Fórmula 1 ocurre cuando n es uno, e incluso más cuando B es un grupo monofluorometilo. Una realización de estos compuestos monofluorometilo ocurre cuando R^{3} es un átomo de hidrógeno o un grupo t-butilo e incluso más cuando A es un aminoácido natural. Un ejemplo de estos compuestos en el que A es un aminoácido natural ocurre cuando A es un residuo valina. Este último grupo de compuestos valina se denominará en la presente "compuestos 4-oxo-5-(ácido fluoropentanoico)".
Un grupo óptimo de compuestos 4-oxo-5-(ácido fluoropentanoico) ocurre cuando R^{1} es un grupo metilo, en otros términos, los compuestos N-metilindol. Un grupo ilustrativo de dichos compuestos N-metilindol ocurre cuando R^{2} es un grupo metilo y X y Y son cada uno un átomo de hidrógeno, y especialmente cuando R^{3} es un átomo de hidrógeno. Otro grupo ilustrativo de dichos compuestos N-metilindol ocurre cuando R^{2} es un átomo de cloro y X y Y son cada uno un átomo de hidrógeno, y especialmente cuando R^{3} es un átomo de hidrógeno. Un tercer grupo ilustrativo de compuestos N-metilindol ocurre cuando R^{2} es un grupo cloro, X es un grupo 5-fluoro y Y es un átomo de hidrógeno, y especialmente cuando R^{3} es un átomo de hidrógeno.
Otro grupo óptimo de compuestos 4-oxo-5-(ácido fluoro-pentanoico) está conformado por compuestos N-(3'-fenilprop-1-il)indol. Un grupo destacado dentro de esta última clase de compuestos ocurre cuando R^{2}, X y Y son cada uno un átomo de hidrógeno y especialmente cuando R^{3} es un átomo de hidrógeno.
Un tercer grupo óptimo de compuestos 4-oxo-5-(ácido fluoro-pentanoico) tiene un resto N-(carboximetilo o carboximetilo protegido)indol. Una realización de este grupo ocurre cuando R^{2}, X y Y son cada uno un átomo de hidrógeno y especialmente en el que R^{3} es un átomo de hidrógeno y el átomo de nitrógeno del anillo indol está sustituido con un grupo carboximetilo.
Métodos para inhibir la apoptosis
La presente invención provee métodos in vitro para la inhibición de la muerte celular programada o apoptosis, por inhibición de los miembros de la familia ICE/CED-3. La invención provee no solo usos novedosos para inhibidores de la actividad enzimática de ICE/CED-3, sino también cualquier método que prevenga específicamente la expresión de genes codificadores de la familia ICE/CED-3. Por lo tanto, el ADN o ARN antisentido comprendido por secuencias nucleotídicas complementarias a genes de miembros de la familia ICE/CED-3 y capaces de inhibir la transcripción o traducción de proteínas relevantes, expresión de formas negativas dominantes de las ICE/CED-3 proteasas (p. ej., mutantes modificados para reemplazar la cisteína del sitio activo con otro aminoácido, como serina o alanina), o anticuerpos que se unen a polipéptidos de la familia ICE/CED-3, están dentro del alcance de la invención, como inhibidores de molécula pequeña, incluyendo péptidos y especialmente los compuestos presentados en la
presente.
En un primer aspecto, la invención provee un método para expandir las poblaciones de células sanguíneas y hematopoyéticas o prolongar la supervivencia de dichas poblaciones, incluyendo poner en contacto las células ex vivo con una cantidad eficaz de un reactivo que suprime la actividad de uno o más miembros de la familia ICE/CED-3, inhibiendo la muerte celular programada de precursores inmaduros y/o células maduras, expandiendo así la población celular y/o aumentando la supervivencia de la población celular. El término "expansión" o "expandir", tal como se utiliza en la presente, significa aumentar la cantidad de células de una población celular pre-existente. El término "supervivencia" se refiere a mantener la viabilidad de las células, típicamente ex vivo, no obstante, el término tiene como fin incluir también in vivo. La supervivencia puede ocurrir entre unas pocas horas y varios días o más.
El método incluye poner en contacto las células deseadas ex vivo con una cantidad eficaz de un reactivo que suprime la actividad de ICE/CED-3. El término "poner en contacto", tal como se usa en la presente, significa exponer las células al inhibidor o inhibidores de la familia ICE/CED-3, de modo tal que el inhibidor o inhibidores pueda inhibir eficazmente la actividad de ICE/CED-3, inhibiendo de esta manera la apoptosis en las células y permitiendo que las células proliferen y se acumulen. El término "cantidad inhibidora eficaz" significa aquella cantidad de inhibidor de ICE/CED-3 que bloquea eficazmente la actividad enzimática de ICE/CED-3 en células diana intactas. Será obvio que se pueden emplear uno o más inhibidores de la familia ICE/CED-3 simultáneamente en el método de la invención.
Los ejemplos de dichos reactivos se conocen en la técnica e incluyen Cbz-VaLAlaAsp-CH_{2}F, Cbz-ValA-laAsp-CH_{2}OCO(2,6-diCl-C_{6}H_{4}), Cbz-ValAlaAsp-CH_{2}F, éster metílico, Ac-AspValAlaAsp-CH_{2}F. Los compuestos ilustrativos son aquellos de Fórmula 3 tal como se describió anteriormente.
La detección de la actividad de ICE/CED-3 se realiza por métodos convencionales, como un ensayo enzimático para medir la fluorescencia generada por la escisión enzimática de aminometilcumarina (AMC) conjugada con un péptido relevante (p. ej., Ac-DEVD-amc). Dichos ensayos son estándar en la técnica (Armstrong et al., J. Biol. Chem. 271:16850, 1996); Fernandes-Alnemri, et al., Cancer Res., 55:6045, 1995). Además, la inhibición de la actividad de la ICE se puede medir por un bioensayo para IL-1\beta. La actividad de ICE/CED-3 preferentemente se suprime mediante los inhibidores de la familia ICE/CED-3) en por lo menos aproximadamente 75%, y preferentemente aproximadamente 90%.
Las "células" o "población celular" incluyen células precursoras (p. ej., células madre pluripotentes) y/o células maduras diferenciadas. Los ejemplos de células expandidas y/o cuya supervivencia aumenta por el método de la invención incluyen, aunque sin limitarse a ello, granulocitos (p. ej., neutrófilos), monocitos, eritrocitos, linfocitos y plaquetas.
El éxito de la hematopoyesis también se puede detectar midiendo los hematocritos, cifra de leucocitos, incorporación de timidina tritiada al ADN de la médula ósea, peso del bazo, cantidad de unidades formadoras de colonias eritroides o cantidad de unidades formadoras de colonias (linajes formadores de eritroides, granulocitos/macrófagos y megacariocitos) del bazo o la médula ósea, por ejemplo.
Los trastornos hematopoyéticos pueden ocurrir como consecuencia de una enfermedad primaria o como consecuencia de la terapia para otra enfermedad. Por ejemplo, un efecto colateral grave de la radiación o quimioterapia es la mielosupresión. La pancitopenia se puede observar después de un trasplante de médula ósea y la leucopenia profunda se observa a menudo en el sida. Los pacientes con insuficiencia renal crónica que se someten a diálisis a menudo padecen anemia. Los pacientes con sida tratados con AZT, pacientes de cáncer tratados con platino y pacientes anémicos con artritis reumatoidea a menudo requieren transfusiones debido a la anemia y la leucopenia. Se sabe que los distintos factores de crecimiento hematopoyéticos, como la eritropoyetina, los granulocitos o factores estimulantes de colonias de granulocitos, o las citocinas tales como la interleucina 1, estimulan la hematopoyesis y se han utilizado para tratar estas afecciones. No obstante, los tiempos de tratamiento están en general en el orden de semanas, y especialmente para el caso de neutropenias, los pacientes padecen riesgo de infecciones oportunistas. Estas terapias por lo general son bastante costosas, ya que son proteínas producidas en forma recombinante. Por ende, sería ventajoso poder administrar una molécula pequeña, p. ej., un inhibidor de ICE/CED-3, bien sola o en combinación con un factor de crecimiento para acelerar la recuperación hematopoyética. Se sabe que distintas citocinas, incluyendo los factores de crecimiento hematopoyéticos, aumentan la proliferación e inhiben la apoptosis en células diana (Koury and Bondurant, Science, 248:378, 1990; Muta and Krantz, J. Cell Physiol., 156:264, 1993). No obstante, esos agentes actúan situados más arriba del mecanismo celular apoptótico, afectando ese mecanismo sólo indirectamente. La presente invención provee métodos para aumentar la expansión celular inhibiendo directamente el mecanismo apoptótico. La terapia de combinación que comprende administrar un factor de crecimiento hematopoyético junto con los métodos de la presente invención es una realización preferida.
El método de la invención es útil para restaurar la hematopoyesis normal en individuos que necesitan la reconstitución de la médula ósea. La célula madre pluripotente tiene la capacidad única de autorrenovación y el potencial de crecimiento y diferenciación junto con los linajes granulocíticos, monocíticos, eritroides, megacariocíticos y linfoides.
Como apreciará la persona con experiencia en la técnica, las células madre se pueden dirigir a diferenciación como una población de linaje linfoide, mieloide o eritroide por incubación con el factor de crecimiento hematopoyético apropiado o combinación de factores de crecimiento. En consecuencia, el método de la invención incluye además poner en contacto las células con un factor de crecimiento hematopoyético adecuado, además de del inhibidor de ICE/CED-3. Tal como se emplea en la presente, la expresión "un factor de crecimiento hematopoyético adecuado" significa uno o más factores de crecimiento hematopoyéticos conocidos en la técnica para dirigir una célula madre progenitora hacia la población celular deseada de linaje linfoide, granulocítico, monocítico, megacariocítico, mieloide o eritroide. Distintos factores de crecimiento funcionan tanto promoviendo la proliferación de células como inhibiendo la apoptosis; ambas funciones promueven la acumulación de células. Ciertos factores de crecimiento hematopoyético, incluyendo el G-CSF, GM-CSF y eritropoyetina son ejemplos de dichos factores de crecimiento que pueden inhibir la muerte celular programada de sus células diana respectivas, como también estimular la proliferación de esas células. Se ha comprobado clínicamente que estos factores son útiles para promover la repoblación de granulocitos (p. ej., neutrófilos), monocitos y eritrocitos en pacientes. El G-CSF y GM-CSF a menudo se utilizan en pacientes tras quimioterapia o radiación, y la eritropoyetina comúnmente se utiliza en pacientes que se someten a diálisis renal. Otros factores de crecimiento representativos conocidos en la técnica que se pueden utilizar para estos fines son IL-1, IL-6, factor de células madre e IL-3. Los expertos en la técnica conocerán otros factores de crecimiento para estimular la proliferación de linajes hematopoyéticos (véase, por ejemplo, Harrison's Principles of Internal Medicine, Isselbacher, et al., eds., pp 1714-1717, McGraw Hill, 1994).
Los inhibidores de apoptosis, tales como los inhibidores de ICE/CED-3, pueden extender la supervivencia de los precursores de células sanguíneas en la médula ósea como también la supervivencia de las células sanguíneas maduras propiamente dichas. En cuanto a la extensión de la supervivencia de células sanguíneas maduras, esto puede ser particularmente valioso para repoblación de granulocitos después de la quimioterapia y/o radiación (con o sin trasplante de médula ósea). Los granulocitos maduros (específicamente los neutrófilos) duran solo 24 horas en el torrente circulatorio después de lo cual mueren por apoptosis. Los inhibidores de ICE/CED-3 que bloquean la apoptosis y aumentan la supervivencia de neutrófilos aumentarían el índice al cual un paciente normalizaría su cifra de leucocitos. La inhibición de la apoptosis en células precursoras que finalmente dan lugar a poblaciones de células maduras sería sinérgica con los efectos sobre las células maduras.
La invención provee métodos para conservar la viabilidad de los neutrófilos/granulocitos ex vivo para la transfusión subsiguiente a receptores con necesidad de granulocitos adicionales. La vida útil de los granulocitos eliminados de los donantes es limitada y, por lo tanto, es difícil obtener suministros de granulocitos funcionales para transfu-
sión.
Los reactivos de la presente invención son "inhibidores de ICE/CED-3" en el sentido que inhiben la actividad catalítica de los miembros de la familia ICE/CED-3 en un modo reversible o irreversible. El término "irreversible", tal como se utiliza en la presente, significa la formación de un enlace covalente entre el miembro de la familia ICE/CED-3 y el inhibidor. Es posible convertir un inhibidor reversible en un inhibidor irreversible, incorporando un "explosivo" irreversible en lo que de lo contrario sería un inhibidor reversible.
La reversibilidad de la inhibición de ICE/CED-3 es en general una función del grupo electronegativo en la molécula. Cuando el grupo electronegativo es una diazoalquil cetona, la inhibición de la actividad de la ICE es irreversible y el compuesto es un inhibidor irreversible. Cuando el grupo electronegativo es un aldehído, la inhibición de la ICE es reversible y el inhibidor es un inhibidor reversible.
Un compuesto de la invención preferentemente tiene un aldehído, una diazoalquil cetona, una haloalquil cetona o una aciloximetil cetona. Tal como se emplea en la presente en referencia a un grupo electronegativo, "alquilo" se refiere a radicales de cadena lineal o ramificada que tienen 1-3 átomos de carbono, que pueden estar opcionalmente sustituidos. Los grupos alquilo representativos incluyen metilo, etilo, propilo y similares. Opcionalmente, el grupo electronegativo es un aldehído, fluorometil (CH_{2}F) cetona o aciloximetil cetona.
Los compuestos de la presente invención se elaboran mediante técnicas que en general corresponden a métodos conocidos y obvios para el experto en la técnica. Véase, p. ej.,Kettner, et al., Arch, Biochem, Biophys., 162:56, 1974; patentes estadounidenses Nos. 4.582.821; 4.644.055; Kettner, et al. Arch, Biochem, Biophys, 165:739, 1974; Dakin and West, J. Biol. Chem., 78:91, 1928; Rasnick, D., Anal. Biochem., 149:461, 1985; Revesz, L., Tetrahedron Lett., 35:9693, 1994. Los compuestos de indolilo dipeptídicos y tricíclicos ilustrativos se proveen en la presente.
Los compuestos que tienen un grupo saliente electronegativo no fluoro, haloalquil cetona preferentemente se sintetizan de acuerdo con el procedimiento de Kettner. Un péptido o aminoácido bloqueado con N se hace reaccionar con N-metilmorfolina y un alquil no fluoro, haloformato para generar un anhídrido ácido peptídico. El anhídrido se hace luego reaccionar con un diazoalcano en un disolvente inerte, aprotónico para formar una diazometano cetona peptídica. La diazometano cetona se hace luego reaccionar con una disolución anhidra de HCl, HBr o Hl para producir el aminoácido o péptido deseado de haloalquil cetona C-terminal bloqueado con N.
Los compuestos que tienen un grupo saliente electronegativo de fluorometilo preferentemente se sintetizan por el procedimiento de Revesz. Se hace reaccionar un aminoácido o péptido bloqueado con N con t-butil (3-amino-4-hidroxi-5-fluoro) pentanoato en presencia de un agente de acoplamiento peptídico estándar tal como diciclohexilcarbodiimida-hidroxi-benztriazol. El producto resultante se oxida a la cetona correspondiente bien por oxidación Dess-Martin o Severn. Finalmente, la desprotección del éster t-butílico con ácido trifluoroacético produce el ácido carboxílico correspondiente.
Los compuestos que tienen un grupo saliente electronegativo fluoroalquil cetona se pueden extender en la dirección del término N, eliminando el grupo bloqueante N-terminal y acoplando el compuesto desprotegido con otros aminoácidos protegidos. Bodanszky, The Practice of Peptide Synthesis, Springer-Verlag, Berlin, 1984. Alternativamente, los compuestos desprotegidos se acilan para producir compuestos que tienen un grupo protector acetilo N-terminal. Stewart, et al., Solid Phase Peptide Synthesis, Pierce Chemical Co., ockford, III., 1984.
En otra realización, la invención provee un método para prolongar la viabilidad de un órgano, que comprende poner en contacto las células de un órgano para trasplante con una cantidad inhibidora eficaz de un reactivo que suprime la actividad de la enzima convertidora de interleucina 1\beta (ICE)/CED-3, prolongando de este modo la viabilidad del órgano en comparación con un órgano no tratado. El término "órgano" incluye órganos multicelulares intactos tales como riñón, hígado o corazón; suspensiones celulares derivadas de órganos multicelulares (p. ej., células de los islotes pancreáticos en neuronas dopaminérgicas); como así también suspensiones de células sanguíneas o células precursoras hematopoyéticas. Preferentemente, se trata un órgano ex vivo con el fin de conservar el órgano para el trasplante. El término "prolongar" significa que un órgano para trasplante se conserva por tratamiento, usando el método de la invención, en comparación con un órgano similar que no ha sido tratado con un inhibidor de ICE/CED-3. Si bien no se desea estar influenciados por una teoría en particular, se cree que poner en contacto las células de un órgano para trasplante con un inhibidor de ICE/CED-3 inhibe la muerte celular programada, conservando así el órgano y prolongando la viabilidad.
El método de la invención incluye el tratamiento del receptor antes y después del trasplante con órganos bañados con inhibidor de ICE/CED-3 o genéticamente alterados para inhibir la apoptosis de las células orgánicas del donante y, opcionalmente, un agente inmunosupresor.
La presente invención incluye la expansión o supervivencia ex vivo de células hematopoyéticas, que es útil para una variedad de usos clínicos, incluyendo la terapia génica, aumento del trasplante de médula ósea y reemplazo de trasplante de médula ósea. Por ende, el uso de un inhibidor del mecanismo apoptótico, tal como un inhibidor de la familia ICE/CED-3, para promover la expansión y/o supervivencia ex vivo de poblaciones de granulocitos, eritrocitos, linfocitos y o plaquetas, constituye un método útil. Por ejemplo, se puede agregar un inhibidor o inhibidores de ICE/CED-3) a un cultivo hístico de células aisladas de un sujeto o transfectar las células con un vector de expresión que contiene un polinucleótido codificador de un inhibidor operable de ICE/CED-3, p. ej., antisentido, a dichas células.
El método de la invención posee utilidad terapéutica. Por ejemplo, una suspensión de células madre hematopoyéticas pluripotentes (HSC), obtenida por métodos estándar de la técnica, se puede tratar con el método de la invención y utilizarse para llevar a cabo la reconstitución hematopoyética de un receptor. Como tratamiento ex vivo,por ejemplo, las células madre pluripotentes enriquecidas del receptor (reconstitución autóloga) o derivadas de un individuo que no sea el receptor (reconstitución no autóloga) se pueden expandir y utilizar en el tratamiento o la prevención de distintas enfermedades o trastornos, tales como anemias, malignidades, trastornos autoinmunitarios y distintas alteraciones y deficiencias, cuyos repertorios celulares hematopoyéticos se han reducido, como en receptores tratados con distintos agentes quimioterapéuticos o radiológicos, o receptores con sida. Otros usos terapéuticos de las composiciones de la invención se conocen en la técnica. El tratamiento de las células trasplantadas puede ser tanto ex vivo como, tras el trasplante, in vivo.
Un ejemplo del modo en el que se puede aplicar la invención a órganos de donantes no autólogos para receptores humanos es el siguiente: comenzando una semana antes del trasplante, al receptor se le puede administrar ciclofosfamida para reducir el potencial de respuestas inmunológicas evocadas. Poco después (1-3 días) se puede iniciar una dosis inmunosupresora de ciclosporina o FK506 antes del trasplante para aumentar la aceptación del injerto. Inmediatamente antes del trasplante, al donante se le puede administrar un inhibidor de ICE/CED-3, antes de la extirpación del órgano. Tras la extirpación antes del trasplante, el órgano del donante se lava abundantemente con una disolución que contiene por lo menos un inhibidor de ICE/CED-3, p. ej., una fluoroalquil cetona peptídica. Después del trasplante, mediante técnicas quirúrgicas convencionales, por lo general se mantiene al paciente bajo inmunosupresión de rutina usando ciclosporina o FK506, ciclofosfamida y esteroides y, opcionalmente, el inhibidor o inhibidores de ICE/ CED-3. En base a los signos y síntomas clínicos relacionados con la respuesta inmunitaria, se reduce la dosis de varios de los inmunosupresores.
Un agente inmunosupresor utilizado durante el trasplante es un agente tal como Ciclosporina A (CsA), no obstante, se pueden utilizar otros agentes que causan inmunosupresión, como rapamicina, desoxispergualina y FK506 u otros equivalentes funcionales de estos compuestos. La CsA preferentemente se administra por inyección en una dosis inmunosupresora. La duración del tratamiento con CsA puede variar de aproximadamente 2 a aproximadamente 20 días.
Para aumentar la supervivencia del órgano antes del trasplante, el inhibidor de la familia ICE/CED-3 se puede administrar por adición al fluido utilizado para perfundir el órgano extirpado. Si el inhibidor de ICE/CED-3 se administrará también al donante antes de la extirpación del órgano, el inhibidor o inhibidores de ICE/CED-3 se administrarán por cualquier medio adecuado, incluyendo la administración parenteral, subcutánea, intrapulmonar e intranasal. Las infusiones parenterales incluyen administración intramuscular, intravenosa, intra-arterial o intraperitoneal.
Se ha de entender que se puede trasplantar cualquier órgano de cualquier especie. El método de la invención es útil para conservar órganos que se utilizarán para trasplantes de la misma especie, tales como receptores humanos y otros donantes humanos (aloinjertos y autoinjertos) o a receptores humanos de otras especies tales como ovejas, cerdos o primates no humanos (xenoinjertos), por ejemplo. Dichos tejidos para trasplante incluyen, aunque sin limitarse a ello, corazón, hígado, riñón, pulmón, páncreas, islotes pancreáticos, tejido cerebral, cornea, hueso, intestino, piel y células hematopoyéticas El ser humano es el receptor preferido.
Con el fin de determinar la cantidad de inhibidor de ICE/CED-3 que se administrará al donante, p. ej., cerdo, y la cantidad de inhibidor de ICE/CED-3 con que se tratará el órgano que se ha de trasplantar, se administra un compuesto de modo tal que su concentración en la vasculatura sea por lo menos tan alta como aquella necesaria para la inhibición de la apoptosis en un modelo de cultivo celular. Se conoce en la técnica una variedad de modelos de cultivos celulares (p. ej., Armstrong et al., supra; Schlegel, et al., supra; Boudreau, et al., supra). Al órgano del donante, y opcionalmente al donante, se le administra un inhibidor de ICE con el fin de reducir la apoptosis por tanto como aproximadamente 10% de la apoptosis normal observada en el órgano del donante. Por lo tanto, tal como se emplea en la presente, la expresión cantidad "inhibidora de apoptosis" se refiere a aquella cantidad de inhibidor de ICE que inhibe la actividad de la ICE y/o la apoptosis en aproximadamente 75%, y preferentemente aproximadamente 90%.
Método para aumentar la bioprodución
Incluso en otra realización, la invención provee un método para aumentar la supervivencia de las células cultivadas in vitro para utilidades que no son un trasplante. Por ejemplo, la inhibición de la muerte celular programada se usa para mejorar los procesos de bioproducción. Por ejemplo, en la producción de proteínas recombinantes, las producciones pueden estar limitadas por la muerte celular apoptótica de células hospedantes cultivadas. Por lo tanto, el tratamiento de células hospedantes con inhibidores de ICE/CED-3, o el uso de células hospedantes que expresan secuencias de ADN o ARN antisentido complementarias a ICE/CED-3 y capaces de inhibir la transcripción o traducción de miembros de la familia ICE/CED-3 o que expresan genes codificadores de los inhibidores de la familia ICE/CED-3, aumentarían la bioproducción, permitiendo que las células sobrevivan por un tiempo más prolongado y produzcan y/o segreguen un producto deseado por más tiempo, provocando una producción mayor de producto. La capacidad de prevenir la muerte celular programada puede hacer posible que las células vivan independientemente de los factores de crecimiento normalmente requeridos, reduciendo el costo de los complementos del medio de
cultivo.
Con el fin de demostrar la utilidad en la bioproducción, una línea celular que produce naturalmente un producto útil (p. ej., una citocina) o una línea celular genéticamente modificada para expresar un producto útil (p. ej., células COS o CHO que expresan establemente eritropoyetina humana recombinante, hormona de crecimiento o G-CSF) se pone en contacto con el inhibidor de ICE/CED-3 durante la fermentación. La eficacia del inhibidor de ICE/CED-3 en la bioproducción se puede medir de varias maneras 1) determinando el porcentaje de células apoptóticas en el cultivo en diferentes puntos de tiempo; 2) determinando la vida útil del cultivo con respecto a la producción del producto deseado; 3) midiendo el rendimiento del producto por gramo de células o por volumen de cultivo; 4) midiendo la pureza final del producto.
Los métodos para aumentar la eficacia o productividad total de la bioproducción son útiles porque reducen los costos de producir un producto natural o recombinante. La fermentación de células mamíferas se limita disminuyendo la viabilidad celular con el tiempo. Se ha demostrado que la muerte celular durante la fermentación es apoptótica, por lo tanto los inhibidores de la apoptosis aumentarán la viabilidad celular durante la bioproducción. Los medios de crecimiento utilizados para la bioproducción a menudo son sin suero enriquecidos con factores de crecimiento para aumentar la viabilidad celular. El enriquecimiento con inhibidores de ICE/CED-3 de la presente invención está diseñado para reemplazar o aumentar dichos aditivos.
Composiciones farmacéuticas
Las composiciones farmacéuticas de la presente invención comprenden cualquiera de los compuestos de la presente invención, y sus sales farmacéuticamente aceptables, con cualquier excipiente, adyuvante o vehículo farmacéuticamente aceptable (en adelante denominados colectivamente "excipientes farmacéuticamente aceptables"). Los excipientes, adyuvantes y vehículos farmacéuticamente aceptables que se pueden utilizar en las composiciones de la presente invención incluyen, aunque sin limitarse a ello, alúmina, estearato de aluminio, lecitina, proteínas del suero tales como albúmina de suero humana; sustancias tampón tales como los distintos fosfatos, glicina, ácido sórbico, sorbato de potasio, mezclas de glicérido parciales de ácidos grasos vegetales saturados; agua, sales o electrólitos, tales como protamina sulfato, fosfato de hidrógeno disódico, fosfato de hidrógeno de potasio, cloruro de sodio y sales de zinc; sílice coloidal, trisilicato de magnesio, polivinilpirrolidona, sustancias a base de celulosa, polietilenglicol, carboximetilcelulosa de sodio, poliarilatos, ceras, polímeros de bloque polietileno-polioxipropileno, grasa de lana y polietilenglicol, y similares.
Las composiciones farmacéuticas de la presente invención se pueden administrar en forma oral, parenteral, por pulverización para inhalación, tópica, rectal, nasal, bucal, vaginal o por un reservorio implantado. Se prefieren las administraciones oral y parenteral. El término "parenteral", tal como se usa en la presente, incluye las técnicas de inyección subcutánea, intracutánea, intravenosa, intramuscular, intra-articular, intrasinovial, intraesternal, intratecal, intralesional e intracraneal o técnicas de infusión.
Las composiciones farmacéuticas pueden ser en la forma de una preparación inyectable estéril, por ejemplo, como una suspensión acuosa u oleaginosa inyectable estéril. Esta suspensión se puede formular de acuerdo con técnicas conocidas en el campo, que utilizan agentes adecuados de dispersión o humectación (por ejemplo, Tween 80) y agentes de suspensión. La preparación inyectable estéril también puede ser una disolución o suspensión inyectable estéril en un diluyente o disolvente no tóxico parenteralmente aceptable, por ejemplo, una disolución en 1,3-butandiol. Entre los vehículos y disolventes aceptables que se pueden emplear se encuentran manitol, agua, disolución de Ringer y disolución isotónica de cloruro de sodio. Además, convenientemente se emplean aceites estériles y fijos como un medio disolvente o de suspensión. Para este fin, se puede emplear cualquier aceite fijo insípido, incluyendo mono o diglicéridos sintéticos. Los ácidos grasos, tales como ácido oleico y sus derivados de glicérido, son útiles en la preparación de inyectables, ya que son aceites naturales farmacéuticamente aceptables, como aceite de oliva o aceite de ricino, especialmente en sus versiones polioxietiladas. Estas disoluciones o suspensiones oleosas también pueden contener un dispersante o diluyente de alcohol de cadena larga.
Las composiciones farmacéuticas de la presente invención se pueden administrar en forma oral en cualquier forma de dosificación oralmente aceptable que incluye, aunque sin limitarse a ello, cápsulas, comprimidos y suspensiones y disoluciones acuosas. En el caso de comprimidos para uso oral, los excipientes que normalmente se utilizan incluyen lactosa y almidón de maíz. Típicamente, también se añaden agentes lubricantes, como estearato de magnesio. Para administración oral en forma de cápsulas, los diluyentes útiles incluyen lactosa y almidón de maíz seco. Cuando se administran suspensiones acuosas en forma oral, el ingrediente activo se combina con agentes emulsionantes y de suspensión. Si se desea, se pueden añadir ciertos agentes edulcorantes y/o saborizantes y/o colorantes.
Las composiciones farmacéuticas de la presente invención también se pueden administrar en la forma de supositorios para administración rectal. Estas composiciones se pueden preparar mezclando un compuesto de la presente invención con un excipiente no irritante adecuado que es sólido a temperatura ambiente pero líquido a temperatura rectal. Dichos materiales incluyen, aunque sin limitarse a ello, manteca de cacao, cera de abeja y polietilenglicoles.
La administración tópica de las composiciones farmacéuticas de la presente invención es especialmente útil cuando el tratamiento deseado implica áreas u órganos fácilmente accesibles para aplicación tópica. Para aplicación tópica a la piel, la composición farmacéutica debería formularse con un ungüento adecuado que contenga los componentes activos suspendidos o disueltos en un excipientes. Los excipientes para administración tópica de los compuestos de la presente invención incluyen, aunque sin limitarse a ello, aceite mineral, vaselina líquida, vaselina blanca, compuestos de propilenglicol, polioxietileno, polioxipropileno, cera emulsionante y agua. Alternativamente, la composición farmacéutica se puede formular con una loción o crema adecuada que contenga el compuesto activo suspendido o disuelto en un excipiente. Los excipientes adecuados incluyen, aunque sin limitarse a ello, aceite mineral, sorbitan monoestearato, polisorbato 60, cera de ésteres cetílicos, alcohol de cetearilo, 2-octildodecanol, alcohol bencílico y agua. Las composiciones farmacéuticas de la presente invención también se pueden aplicar tópicamente a la parte inferior del tubo digestivo por formulación de un supositorio rectal o en una formulación en enema adecuada. Los parches transdérmicos para aplicación tópica están también incluidos dentro de la presente invención.
Las composiciones farmacéuticas de la presente invención se pueden administrar por aerosol nasal o inhalación. Dichas composiciones se preparan de acuerdo con técnicas conocidas en el campo de formulación farmacéutica y se pueden preparar como disoluciones en disolución salina, empleando alcohol bencílico u otros conservantes adecuados, promotores de absorción para aumentar la biodisponibilidad, fluorocarbonos y/u otros agentes solubilizantes o dispersantes conocidos en la técnica.
Los compuestos de la presente invención se pueden utilizar en combinación bien con agentes antiinflamatorios convencionales o con inhibidores de metaloproteasa de matriz, inhibidores de lipoxigenasa y antagonistas de citocinas que no sean IL-1\beta.
Cuando los compuestos de la presente invención se administran en terapias de combinación con otros agentes, se pueden administrar secuencial o concurrentemente al paciente. Alternativamente, las composiciones farmacéuticas de acuerdo con la invención pueden estar comprendidas por una combinación de un compuesto de Fórmula 1 ó 3, u otros inhibidores de ICE tal como se describe en la presente, y otro agente terapéutico o profiláctico ya mencionado.
Los estados patológicos que se pueden tratar o prevenir mediante las composiciones farmacéuticas de la presente incluyen, aunque sin limitarse a ello, enfermedades inflamatorias, enfermedades autoinmunitarias y enfermedades neurodegenerativas, como así también la inhibición de apoptosis indeseada implicada en lesiones isquémicas, tales como lesión isquémica al corazón (p. ej., infarto de miocardio), cerebro (p. ej., apoplejía) y riñón (p. ej., nefropatía isquémica). Como consecuencia de su capacidad para inhibir la apoptosis, las presentes composiciones farmacéuticas son también útiles para la repoblación de células hematopoyéticas de un paciente tras una quimioterapia. Los métodos para administrar una cantidad eficaz de las composiciones farmacéuticas anteriormente mencionadas a mamíferos, también denominados pacientes en la presente, que necesitan dicho tratamiento (es decir, aquellos que padecen enfermedades inflamatorias, enfermedades autoinmunitarias, enfermedades neurodegenerativas y para la repoblación de células hematopoyéticas en pacientes con cáncer que se han sometido a quimioterapia), son otro aspecto de la presente invención. Finalmente, como otra consecuencia de su capacidad para inhibir la apoptosis, las composiciones farmacéuticas de la invención se pueden utilizar en un método para prolongar la viabilidad de órganos que se han de utilizar en trasplantes.
Las enfermedades inflamatorias que se pueden tratar o prevenir incluyen, por ejemplo, choque septicémico, septicemia y síndrome disneico agudo del adulto. Las enfermedades autoinmunitarias diana incluyen, por ejemplo, artritis reumatoidea, lupus eritematoso sistémico, escleroderma, tiroiditis crónica, enfermedad de Graves, gastritis autoinmunitaria, diabetes mellitus insulino dependiente, anemia hemolítica autoinmunitaria, neutropenia autoinmunitaria, trombocitopenia, hepatitis activa crónica, miastenia grave y esclerosis múltiple. Las neurodegenerativas diana descritas en la presente invención también se pueden utilizar para promover la cicatrización de heridas. Las enfermedades diana asociadas con apoptosis perjudicial, en otros términos, aquellas asociadas con lesión isquémica, incluyen infarto de miocardio, apoplejía y nefropatía isquémica.
La expresión "cantidad eficaz" se refiere a niveles de dosificación en el orden de aproximadamente 0,05 miligramos a aproximadamente 140 miligramos por kilogramo de peso corporal por día para uso en el tratamiento de las afecciones anteriormente indicadas (típicamente aproximadamente 2,5 miligramos a aproximadamente 7 gramos por paciente por día). Por ejemplo, la inflamación se puede tratar eficazmente por administración de aproximadamente 0,01 a 50 miligramos del compuesto por kilogramo de peso corporal por día (aproximadamente 0,5 miligramos a aproximadamente 3,5 gramos por paciente por día).
La cantidad de los compuestos de Fórmula 1, 3 u otros inhibidores de ICE/ced-3 que se puede combinar con los materiales excipientes para producir una forma de dosificación única variará dependiendo del hospedante tratado y del modo de administración particular. Por ejemplo, una formulación para administración oral a seres humanos puede contener entre 0,5 miligramos y 5 gramos de un compuesto de Fórmula 1 combinado con una cantidad apropiada y conveniente de un excipiente farmacéuticamente aceptable puede variar entre aproximadamente 5 y aproximadamente 95 por ciento de la composición total. Las formas unitarias de dosificación en general contendrán entre aproximadamente 1 miligramo y aproximadamente 500 miligramos de un compuesto activo de Fórmula 1, 3 u otros inhibidores de ICE/ced-3.
Se ha de entender, no obstante, que la "cantidad eficaz" específica para cualquier paciente particular dependerá de una variedad de factores que incluyen la actividad del compuesto específico empleado, la edad, el peso corporal, la salud general, el sexo, la dieta, el tiempo de administración, la ruta de administración, el índice de excreción, la combinación de fármacos y la gravedad de la enfermedad particular del paciente que se someta a prevención o terapia.
Si bien la presente invención se concentra en el uso de los compuestos descritos en la presente para inhibir ICE/CED-3 proteasas y para prevenir la apoptosis, los compuestos de la presente invención se pueden utilizar también como agentes inhibidores para otras cisteína proteasas.
Los compuestos de la presente invención son también útiles como reactivos comerciales que se unen en forma eficaz a la familia ICE/ced-3 de cisteína proteasa u otras cisteína proteasas. Como reactivos comerciales, los compuestos de la presente invención, y sus derivados, se pueden usar para bloquear la proteólisis de un péptido diana o se pueden derivar para unirse a una resina estable como un sustrato unido para aplicaciones de cromatografía de afinidad. Éstos y otros usos que caracterizan a los inhibidores de cisteína proteasa comercial serán obvios para la persona con experiencia ordinaria en la técnica.
Los siguientes ejemplos tienen como fin ilustrar la invención. Si bien son los que típicamente se podrían utilizar, alternativamente podrán emplearse otros procedimientos conocidos por los expertos en la técnica.
En los siguientes Ejemplos, se obtuvieron espectros de RMN de protones a 300 MHZ; los desplazamientos químicos se citan a campo más abajo a partir de tetrametilsilano interno.
Ejemplo 1 Ensayos para inhibición de la actividad de la familia de ICE/ced-3 proteasa A. Determinación de valores IC_{50}
Se llevaron a cabo ensayos enzimáticos de fluorescencia que detectan la actividad de los compuestos de Fórmula 1, utilizando enzimas ICE y cpp32 recombinantes, esencialmente de acuerdo con Thornberry et al. (Nature, 356:768:774 (1992)) y Nicholson et al. (Nature, 376:37-43 (1995)) respectivamente, (incorporados a la presente por referencia) en placas de microtitulación de 96 pocillos. El sustrato para estos ensayos fue Acetil-Tyr-Val-Ala-Asp-amino-4-metilcumarina (AMC) para el ensayo de ICE y Acetil-Asp-Glu-Val-Asp-amino-4-metilcumarina para los ensayos de cpp32 y Mch5. Las reacciones enzimáticas tuvieron lugar en tampón ICE (HEPES 25 mM, EDTA I mM, 0,1% CHAPS, 10% sacarosa, pH 7,5) que contenía DTT 2 mM a temperatura ambiente por duplicado. Los ensayos se llevaron a cabo mezclando los siguientes componentes:
50 \mul bien de ICE, Mch2, Mch5 o cpp32 (concentraciones de 18,8, 38, 8,1 y 0,153 nM, respectivamente) o enzima Mch3 (1 unidad) en tampón ICE que contenía DTT bien 8,0 (ICE, Mch2, Mch3, cpp32) o 20 (Mch5) mM;
50 \mul bien del compuesto de Fórmula 1 o tampón ICE (control); y 100 \mul de sustrato 20 \muM.
La enzima y el compuesto de Fórmula 1 que se han de ensayar se pre-incubaron en los pocillos de la placa de microtitulación durante 30 minutos a temperatura ambiente antes de la adición del sustrato para iniciar la reacción. La formación de producto AMC fluorescente se vigiló durante una hora a temperatura ambiente, midiendo la emisión de fluorescencia a 460 nm, usando una longitud de onda de excitación de 360 nm. Se promedió el cambio en fluorescencia en los pocillos duplicados (control) y se trazaron los valores medio como una función de la concentración del inhibidor para determinar la concentración del inhibidor que produce 50% de inhibición (IC_{50}). Los resultados se exponen en las Tablas 1 y 4 (Figuras 1 y 4).
El compuesto de referencia para este ensayo fue Cbz-ValAlaAsp-H y los valores se denotan en las Tablas 1 y 4 como "Referencia".
B. Determinación de la constante de disociación K_{i} y la constante del índice irreversible k_{3} para inhibidores irreversibles
Para la inhibición irreversible de una enzima proteasa de la familia ICE/ced-3 con un inhibidor irreversible competitivo; usando el modelo representado por las siguientes fórmulas:
6
La formación de producto en tiempo t se puede expresar como:
7
en la que E, I, EI y E-I denotan la enzima activa, el inhibidor, el complejo inhibidor-enzima no covalente y el aducto inhibidor-enzima no covalente, respectivamente. El valor K_{i} es la constante de disociación total de las etapas de unión reversible, y k_{3} es la constante del índice irreversible. Los valores [S] y K_{s} son la concentración de sustrato y la constante de disociación del sustrato unido a la enzima, respectivamente.
Las ecuaciones anteriores se utilizaron para determinar los valores K_{i} y k_{3} de un inhibidor determinado unido a la proteasa de la familia ICE/ced-3. Por lo tanto, se realizó un ensayo continuo durante sesenta minutos en distintas concentraciones del inhibidor y el sustrato. El ensayo se formuló esencialmente del mismo modo anteriormente descrito para generar los datos de la Tabla 1, excepto que la reacción se inició añadiendo la enzima a la mezcla de sustrato e inhibidor. Los valores Ki y k_{3} se obtuvieron simulando la formación de producto AMC como una función del tiempo de acuerdo con la Ecuación 1. Los resultados de este segundo ensayo se exponen a continuación en las Tablas 2, 3 y 5 (Figuras 2, 3 y 5).
El compuesto de referencia para este ensayo fue Cbz-ValAlaAsp-CH_{2}F y los valores se denotan en las Tablas 2, 3 y 5 como "Referencia".
Ejemplo 76
8
Semicarbazona de éster terc-butílico del ácido (2S-cis)-[5-benciloxicarbonilamino-1,2,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)amino]-4-oxo-butanoico 1. Preparación de ácido (2S-cis)-5-benciloxicarbonilamino-1,2,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carboxílico, éster etílico
A una disolución de ácido (2S-cis)-5-amino-1,2,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carboxílico, éster etílico (0,437 g, 1,73 mmol, preparada como se describe en Tetrahedron Letters 36, pp. 1593-1596 (1995) y en la patente estadounidense 5.504.080 (2 de abril de 1996)) en cloruro de metileno (4 ml), agitando a 0ºC, se le añadieron bencil cloroformato (0,370 ml, 2,6 mmol) y trietilamina (0,724 ml, 5,2 mmol), y la mezcla resultante se agitó bajo nitrógeno durante 45 minutos. La reacción se enfrió rápidamente con agua, luego se dividió entre acetato de etilo y 5% disolución de bisulfato de potasio acuoso. La capa acuosa se extrajo dos veces con acetato de etilo, luego se lavaron las capas orgánicas combinadas con disolución saturada de cloruro de sodio, se secaron sobre sulfato de sodio y se evaporaron hasta secarse. La purificación del producto bruto por cromatografía "flash" sobre gel de sílice (gel de sílice marca S/P 60\ring{A}, malla 230-400 ASTM) eluyendo con acetato de etilo-hexano (2:1) produjo 0,558 g (68%) de producto bruto. La trituración con acetato de etilo-hexano (1:4) produjo 0,480 g del compuesto del título como un sólido blanco; p.f: 139-140ºC. TLC (acetato de etilo-hexano, 2:1): Rf=0,6; ^{1}H-RMN (300 MHz, CDCl_{3}): \delta 7,35-7,30 (m, 5H), 7,02-6,94 (m, 3H), 6,17 (d, J=5,4 Hz, 1H), 4,15 (q, J=7,1 Hz, 2H), 3,46 (dd, J=11,0, 16,7 Hz, 1H), 3,29 (m, 1H), 3,10 (d, J=116,5, 2H), 2,35 (m, 1H), 2,16 (m, 1H), 1,23 (t, J=7,2 Hz, 3H).
2. Preparación de ácido (2S-cis)-5-benciloxicarbonilamino-1,2,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carboxílico
A una disolución de ácido (2S-cis)-5-benciloxicarbonilamino-1,2,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carboxílico, éster etílico, (0,428 g, 1,05 mmol) en 1,4-dioxano (7,5 ml) y agua (2,5 ml) se le añadió hidróxido de litio acuoso 1M (1,6 ml, 1,6 mmol) y la mezcla resultante se agitó a temperatura ambiente bajo nitrógeno durante 30 minutos. La mezcla de reacción se acidificó hasta pH 3 con una disolución de cloruro de sodio y bisulfato de potasio acuoso al 5%. La capa acuosa se extrajo dos veces con acetato de etilo, y las capas orgánicas combinadas se secaron sobre sulfato de sodio y se evaporaron hasta secarse para producir 0,395 g (99%) del compuesto del título como un sólido blanco fino; p.f: 188-189ºC. TLC (cloruro de metileno-metanol-ácido acético, 9:1:1): Rf=0,55; ^{1}H-RMN (300 MHz, CDCl_{3}) \delta 7,34-7,26 (m, 5H), 7,07-6,97 (m, 3H), 6,08 (d, J=5,7 Hz, 1H), 5,25 (dd, J=3,2, 9,8 Hz, 1H), 5,10 (s, 2H), 4,30 (m, 1H), 3,36 (m, 1H), 3,26 (m, 2H), 3,06 (d, J=12,0 Hz, 1H), 2,36 (m, 1H), 2,09 (m, 1H).
3. Preparación de \beta-(éster terc-butílico) de N-(benciloxicarbonil)-L-(N'-metil-N'-metoxi)aspartamida
A una disolución de ácido N-(benciloxicarbonil)-L-aspártico-\beta-éster(terc-butílico) (14,65 g, 45,3 mmol, Bachem) en CH_{2}Cl_{2} (150 ml) a 0ºC (baño de hielo), bajo una atmósfera de nitrógeno, se le añadió hidrato de 1-hidroxibenzotriazol (7,29 g, 47,6 mmol, Aldrich) seguido de hidrocloruro de 1-etil-3-(3',3'-dimetil-1'-aminopropil)carbodiimida (9,55 g, 49,8 mmol, Sigma). Después de agitar a 0ºC durante 15 min., se añadieron hidrocloruro de N,O-dimetilhidroxilamina (5,10 g, 52,3 mmol, Aldrich) y N-metilmorfolina (5,8 ml, 53 mmol, Aldrich). La mezcla se dejó calentar hasta temperatura ambiente durante 3 horas, luego se agitó a temperatura ambiente durante 16 horas. La disolución se concentró al vacío y el residuo se dividió entre acetato de etilo-5% KHSO_{4} (200 ml cada uno). La fase orgánica se lavó a su vez con 5% KHSO_{4}, disoluciones de bicarbonato de sodio saturado y cloruro de sodio saturado; se secó sobre sulfato de sodio anhidro y se evaporó hasta un aceite. El aceite se cristalizó a partir de hexano para producir el producto del título (16,10 g, 97% rendimiento) como un sólido blanco, cristalino y esponjoso. TLC (acetato de etilo), mancha simple (UV y PMA): Rf=0,37.
Un procedimiento similar al anterior, comenzando con 29,3 g de \beta-éster(terc-butílico) del ácido N-(benciloxicarbo-
nil)-L-aspártico (escalado al doble) produjo 31,18 g (94% de rendimiento) del producto del título.
4. Preparación de éster \beta-(terc-butílico) de semicarbazona del ácido N-(benciloxicarbonil)-L-aspártico
Una disolución de \beta-(éster terc-butílico) de N-(benciloxicarbonil)-L-(N'-metil-N'-metoxi)aspartamida (15,50 g, 42,3 mmol) en éter anhidro (400 ml) a 0ºC (baño de hielo), bajo una atmósfera de nitrógeno, se añadió gota a gota a una disolución 1,0 M de LiAlH_{4} en éter (22,0 ml, 22,0 mmol, Aldrich) a un índice tal como para mantener la temperatura de la disolución de reacción entre 0-5ºC (tiempo de adición 15-20 min). Después de completar la adición del reactivo de hidruro de aluminio y litio, la mezcla se agitó a 0-5ºC durante 1 h, luego se enfrió rápidamente por la adición gota a gota de disolución KHSO_{4} 0,3 N (100 ml). La mezcla resultante se transfirió a un embudo separador añadiendo suficiente disolución al 5% de KHSO_{4} (75 ml) para disolver los sólidos. La fase orgánica concentrada se separó y los lavados acuosos combinados se extrajeron con éter (100 ml). Los extractos de éter combinados se lavaron con disolución de NaCl saturada, se secaron sobre sulfato de sodio anhidro y se concentraron in vacuo con calentamiento mínimo. TLC (acetato de etilo): mancha veteada (UV y PMA) Rf=0,48. TLC (metanol/cloruro de metileno, 1:9) mancha importante (UV y PMA): Rf=0,75.
El aldehído bruto se absorbió inmediatamente en etanol acuoso (45 ml de agua/105 ml de alcohol), se dispuso en un baño de hielo y se trató con acetato de sodio (3,82 g, 46,6 mmol) e hidrocloruro de semicarbazida (5,20 g, 46,6 mmol, Aldrich). La mezcla se agitó a 0ºC (baño de hielo) bajo una atmósfera de nitrógeno durante 3 h, se dejó calentar hasta temperatura ambiente y se agitó durante toda la noche (16 h). La mayor parte del etanol se eliminó al vacío y el residuo se dividió entre acetato de etilo y agua (100 ml de cada uno). La fase orgánica se lavó en secuencias con disoluciones al 5% de KHSO_{4}, bicarbonato sódico saturado y cloruro de sodio saturado; se secó sobre sulfato de sodio anhidro y se evaporó hasta secarse. El producto bruto de esta reacción se combinó con aquel de dos procedimientos similares, comenzando con 15,40 g y 4,625 g de \beta-(éster terc-butílico) de N-(benciloxicarbonil)-L-(N'-metil-N'-metoxi)aspartamida (total: 35,525 g, 97 mmol) y estos productos combinados se purificaron por cromatografía flash sobre gel de sílice, eluyendo con acetona/cloruro de metileno (3:7), luego metanol-acetona-cloruro de metileno (0,5:3:7) para obtener el producto del título puro (27,73 g, 78,5%) como una espuma incolora. TLC (MeOH-CH_{2}Cl_{2}, 1:9): mancha simple (UV y PMA), Rf=0,51.
5. Preparación de éster \beta-(terc-butílico) de semicarbazona del ácido L-aspártico. Sal de p-toluensulfonato
A una disolución de éster \beta-(terc-butílico) de semicarbazona del ácido N-(benciloxicarbonil)-L-aspártico (13,84 g, 38,0 mmol) en etanol absoluto (250 ml) se le añadió 10% Pd/C (1,50 g, Aldrich) y la mezcla resultante se agitó bajo atmósfera de hidrógeno (balón) hasta que la TLC (metanol/cloruro de metileno, 1:9) indicó el consumo completo del material de inicio (60 min). Observación: Es importante seguir de cerca esta reacción, ya que el producto se puede hiperreducir. La mezcla se filtró a través de Celite y se evaporó hasta un aceite. El aceite se enjuagó con cloruro de metileno (2 x 75 ml), luego con cloruro de metileno/tolueno (1:1, 75 ml) para obtener la amina bruta como un sólido cristalino blanco. TLC (EtOAc-piridina-AcOH-H_{2}O; 60:20:5:10) mancha simple (UV y PMA) Rf=0,24. Observación: En este sistema de TLC, cualquier producto hiperrreducido aparecerá inmediatamente debajo del producto deseado, Rf=0,18 (PMA solamente).
La amina bruta se absorbió en CH_{3}CN (60 ml) y se trató con una disolución de ácido p-toluensulfónico monohidratado (7,22 g, 38,0 mmol) en acetonitrilo (60 ml). Se recogió el precipitado cristalino, se lavó con acetonitrilo y éter y se secó al aire para producir el compuesto del título (13,95 g, 92% rendimiento) como un sólido cristalino blanco.
La pureza óptica de este material se controló por conversión a la amida Mosher correspondiente [1,05 equiv cloruro de (R)-(-)-\alpha-metoxi-\alpha-(trifluorometil)fenilacetilo, 2,1 equivalentes de i-Pr_{2}NEt en CH_{2}Cl_{2}, temperatura ambiente, 30 min]. El producto deseado tiene un doblete a 7,13 ppm (1H, d, J=2.4 Hz, CH=N) mientras que la señal correspondiente para su diastereómero es a 7,07 ppm. La pureza óptica del compuesto del título obtenida a partir del procedimiento anterior es típicamente > 95:5.
6. Semicarbazona de éster terc-butílico del ácido (2S-cis)-[5-benciloxicarbonilamino-1,2,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)amino]-4-oxo-butanoico
A una disolución de ácido (2S-cis)-5-benciloxicarbonilamino-1,2,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carboxílico (0,375 g, 0,989 mmol) en cloruro de metileno (7 ml), agitando a 0ºC bajo nitrógeno, se le añadió hidrato de 1-hidroxibenzotriazol (0,182 g, 1,19 mmol) e hidrocloruro de 1-etil-3-(3',3'-dimetil-1'-aminopropil)carbodiimida (0,284 g, 1,48 mmol). Después de 15 minutos, se añadieron \beta-éster (terc-butílico) de semicarbazona de ácido L-aspártico, sal de p-toluensulfonato (0,386 g, 0,989 mmol) y N-metilmorfolina (0,163 ml, 1,48 mmol) y la mezcla de reacción resultante se dejó llevar hasta temperatura ambiente dentro de 1 hora. Después de agitar durante toda la noche, la mezcla de reacción se diluyó con acetato de etilo y se lavó sucesivamente con disoluciones al 5% de bisulfato de potasio y cloruro de sodio saturado; se secó sobre sulfato de sodio y se evaporó hasta secarse. La purificación del producto bruto por cromatografía flash sobre gel de sílice (gel de sílice marca S/P 60\ring{A}, malla 230-400 ASTM), eluyendo con 2% metanol-cloruro de metileno, produjo 0,463 g (79%) del compuesto del título como una espuma blanca. TLC (cloruro de metileno-metanol, 9:1): Rf=0,5. ^{1}H-RMN (300 MHz, CDCl_{3}): \delta 8,42 (s, 1H), 7,82 (d, J=8,1 Hz, 1H), 7,32 (m, 5H), 7,07 (m, 3H), 5,94 (d, J=6,3 Hz, 1H), 5,26 (d, J=9 Hz, 1H), 5,10 (s, 2H), 4,82 (m, 1H), 4,35 (m, 1H), 3,56 (d, J=18 Hz, 1H), 3,27 (m, 2H), 3,07 (m, 1H), 2,64 (dd, J=4,7, 15,8 Hz, 1H), 2,44 (dd, J=6,6, 15,9 Hz, 2H), 2,22 (m, 1H), 1,30 (s, 9H). Espectro de masas: m/z 593 (M+H).
Ejemplo 77
9
Semicarbazona del ácido (2-cis)-[5-benciloxicarbonilamino-1,2,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico
A una disolución de semicarbazona de éster terc-butílico del ácido (2S-cis)-[5-benciloxicarbonilamino-1,2,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)amino]-4-oxo-butanoico (0,214 g, 0,362 mmol) en cloruro de metileno (1,5 ml) se le añadió anisol (0,5 ml, 4,34 mmol) seguido de ácido trifluoroacético (0,75 ml). Después de agitar a temperatura ambiente bajo nitrógeno durante 2 horas, la mezcla de reacción se diluyó con cloruro de metileno y se evaporó, luego se enjuagó dos veces con cloruro de metileno para producir el compuesto del título (0,195 g). TLC (cloruro de metileno-metanol, 95:5),
Rf=0.2. ^{1}H-RMN (300 MHz, CDCl_{3}) \delta 9,77 (bs, 1H), 8,32 (d, J=12 Hz, 1H), 8,12 (d, J-7,8 Hz, 1H), 7,31-7,27 (m, 5H) 7,13-7,04 (m, 3H), 6,64 (m, 1H) 5,32 (d, J=9,9 Hz, 1H), 5,12 (s, 2H), 4,86 (m, 1H), 4,41 (m, 1H), 3,56 (d, J=15 Hz, 1H), 3,25 (m, 2H), 3,10 (m, 2H), 2,64 (m, 2H), 2,28 (m, 2H).
Ejemplo 78
10
Ácido (2S-cis)-5-[benciloxicarbonilamino-1,2,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico
Se trató semicarbazona del ácido (2-cis)-[5-benciloxicarbonilamino-1,2,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico (0,195 g, 0,36 mmol) con una disolución 3:1:1 de metanol-ácido acético-37% formaldehído (2 ml) y la mezcla resultante se agitó bajo nitrógeno durante 1,5 h. La mezcla de reacción se diluyó con agua, se eliminó el metanol por evaporación, luego el resto de la mezcla se liofilizó. La purificación del producto bruto por cromatografía flash sobre gel de fase inversa (gel MCI, CHP-20P, 75-150 micrómetros), eluyendo con un gradiente 10%-80% metanol-agua, produjo 0,073 g, (42%) del compuesto del título como un sólido blanco después de la liofilización; p.f. 101-104ºC. TLC (cloruro de metileno-metanol-ácido acético, 97:2,5:0,5) Rf=0,45. ^{1}H-RMN (300 MHz, CDCl_{3}) \delta 7,45 (m, 1H), 7,30 (s, 5H), 7,07 (d, J=3,3 Hz, 1H), 7,00 (d, J=4,8 Hz, 2H), 6,12 (m, 1H), 5,17 (d, J=9,6 Hz, 1H), 5,07 (s, 2H), 4,49 (m, 1H), 4,28 (m, 1H), 3,46 (d, J=9,9 Hz, 1H), 3,30-3,12 (m, 2H), 3,04-2,99 (m, 1H), 2,83-2,76 (m, 1H), 2,46-2,33 (m, 2H), 2,03 (bs, 1H). Espectro de masas: m/z 480 (M+H).
Ejemplo 79
11
Semicarbazona de éster terc-butílico del ácido (2S-cis)-[5-amino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil])-amino]-4-oxo-butanoico
Se añadió paladio al 10% sobre carbono (0,180 g) a una disolución de semicarbazona de éster terc-butílico del ácido (2S-cis)-[5-benciloxicarbonilamino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico (0,308 g, 0,520 mmol) en metanol (27 ml) y la mezcla resultante se hidrogenó usando un balón de hidrógeno (1 atm, TA) durante 18 horas. La mezcla se filtró a través de Celite, se evaporó hasta secarse, luego se enjuagó dos veces con tolueno para producir el compuesto del título como un sólido blanquecino (0,215 g). TLC (cloruro de metileno-metanol, 9:1) Rf=0,15. ^{1}H-RMN (300 MHz, CDCl_{3}) \delta 8,53 (s, 1H), 7,89 (d, J=7,6 Hz, 1H), 7,13 (m, 3H), 5,21 (dd, J=2,3, 10,14 Hz, 1H), 4,82 (m, 1H), 3,52 (m, 1H), 3,24 (dd, J=10,3, 16,3 Hz, 1H), 3,03 (m, 2H), 2,62 y 2,42 (AB, dd, J=4,2, 7,1, 15,7 Hz, 2H), 2,19 (m, 1H), 1,32 (s, 9H).
Ejemplo 80
12
Semicarbazona de éster terc-butílico del ácido (2S-cis)-[5-(N-acetil-(S)-aspartil-b-éster terc-butílico)amino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico
A una disolución de ácido N-acetil aspártico, éster \beta-terc-butílico (0,120 g, 0,517 mmol) en cloruro de metileno (1,5 ml), agitando a 0ºC bajo nitrógeno, se le añadió hidrato de 1-hidroxibenzotriazol (0,086 g, 0,564 mmol) e hidrocloruro de 1-(3-dimetilaminopropil)-3-etilcarbodiimida (0,135 g, 0,705 mmol). Después de 15 minutos, se añadió una disolución de semicarbazona de éster terc-butílico del ácido (25-cis)-[5-amino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico (0,213 g, 0,47 mmol) en cloruro de metileno (2 ml) y la reacción se dejó llevar hasta temperatura ambiente durante 1 hora. Después de agitar durante toda la noche, la mezcla de reacción se diluyó con acetato de etilo y se lavó sucesivamente con disoluciones al 5% de bisulfato de sodio y cloruro de sodio saturado; se secó (sulfato de sodio) y evaporó hasta secarse. La purificación del producto bruto por cromatografía flash sobre gel de sílice (gel de sílice marca S/P 60\ring{A}, malla 230-400 ASTM), eluyendo con 5% luego 10% metanol-cloruro de metileno, produjo 0,126 g (41%) del compuesto del título como un sólido blanco. TLC (cloruro de metileno-metanol, 9:1) Rf=0,4. ^{1}H-RMN (300 MHz, CDCl_{3}) \delta 9,63 (s, 1H), 8,32 (d, J=7,8 Hz, 1H), 7,82 (d, J=,6,6 Hz, 1H), 7,53 (d, J=4,8 Hz, 1H), 7,09 (m, 1H), 7,00 (m, 2H), 5,18 (d, J= 8,1 Hz, 1H), 4,86 (m, 1H), 4,39 (m, 1H), 3,01 (m, 1H), 2,92 (dd, J= 4,2, 14,7 Hz, 1H) 2,68 (d, J=12,3 Hz, 1H), 2,52 (m, 2H), 2,51 (m, 2H), 2,03 (s,3H), 1,39 (s,,9H), 1,24 (s, 9H).
Ejemplo 81
13
Semicarbazona de ácido (2S-cis)-[5-(N-acetil-(S)-aspartil)amino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico
A una disolución de semicarbazona de éster terc-butílico del ácido (2S-cis)-[5-(N-acetil-(S)-aspartil-b-éster terc-butílico)amino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico (0,117 g,
0,178 mmol) en cloruro de metileno (1 ml) se le añadió anisol (0,5 ml), seguido de ácido trifluoroacético (1 ml). Después de agitar a temperatura ambiente bajo nitrógeno durante 2 horas, la mezcla de reacción se diluyó con cloruro de metileno y se evaporó, luego se enjuagó dos veces con cloruro de metileno para producir el compuesto del título (0,099 g). TLC (cloruro de metileno-metanol-ácido acético, 13:6:1 ) Rf=0,2. Espectro de masas: m/z 560 (M+H).
Ejemplo 82
14
Ácido (2S-cis)-[5-(N-acetil-(S)-aspartil)amino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico
Se trató semicarbazona del ácido (2S-cis)-[5-(N-acetil-(S)-aspartil)amino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico (0,097 g, 0,177 mmol) con una disolución 3:1:1 de metanol-ácido acético-37% formaldehído (2 ml) y la mezcla resultante se agitó bajo nitrógeno durante 1,5 h. La mezcla de reacción se diluyó luego con agua, se eliminó el metanol por evaporación, luego se liofilizó el resto de la mezcla. La purificación del producto bruto por cromatografía flash sobre gel de fase inversa (gel MCI, CHP-20P, 75-150 micrómetros), eluyendo con un gradiente 10%-80% metanol-agua, produjo 0,050 g (56%) del compuesto del título como un sólido blanco después de la liofilización; p.f. 160-175ºC (dec). TLC (cloruro de metileno-metanol-ácido acético, 13:6:1) Rf=0,3. Espectro de masas: m/z 503 (M+H).
Ejemplo 83
15
Semicarbazona de éster terc-butílico del ácido (2S-cis)-[5-succinilamino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico
A una disolución de semicarbazona de éster terc-butílico del ácido (2S-cis)-[5-amino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico (0,197 g, 0,435 mmol) en cloruro de metileno (6 ml), agitando a 0ºC bajo nitrógeno, se le añadió anhídrido succínico (0,057 g, 0,566 mmol), seguido de piridina (0,052 ml, 0,653 mmol). Después de agitar a temperatura ambiente bajo nitrógeno durante 3 horas, la mezcla de reacción se diluyó con acetato de etilo y se lavó sucesivamente con disoluciones al 5% de bisulfato de potasio y cloruro de sodio saturado; se secó (sulfato de sodio) y evaporó hasta secarse. La purificación del producto bruto por cromatografía flash sobre gel de sílice (gel de sílice marca S/P 60\ring{A}, malla 230-400 ASTM), eluyendo con 10% metanol-cloruro de metileno, luego 80:19:1 cloruro de metileno-metanol-ácido acético, produjo 0,216 g (88%) del compuesto del título como un sólido blanco. TLC (cloruro de metileno-metanol-ácido acético, 8:1:1) Rf=0,5. Espectro de masas: m/z 557 (M-H).
Ejemplo 84
16
Semicarbazona de ácido (2S-cis)-[5-succinilamino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico
A una disolución de semicarbazona de éster terc-butílico del ácido (2S-cis)-[5-succinilamino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-exoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico (0,191 g, 0,342 mmol) en cloruro de metileno (1 ml) se le añadió anisol (0,5 ml), seguido de ácido trifluoroacético (1 ml). Después de agitar a temperatura ambiente bajo nitrógeno durante 2 horas, la mezcla de reacción se diluyó con cloruro de metileno y se evaporó, luego se enjuagó dos veces con cloruro de metileno para producir el compuesto del título (0,210 g). TLC (cloruro de metileno-metanol-ácido acético, 8:1:1) Rf=0,4. Espectro de masas m/z 503 (M+H).
Ejemplo 85
17
Ácido (2S-cis)-[5-succinilamino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico
Se trató semicarbazona de ácido (2S-cis)-[5-succinilamino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico (0,208 g, aproximadamente 0,342 mmol) con una disolución 3:1:1 de metanol-ácido acético-37% formaldehído (3 ml), y la mezcla resultante se agitó bajo nitrógeno durante 1,5 h. La mezcla de reacción se diluyó luego con agua, se eliminó el metanol por evaporación, luego el resto de la mezcla se liofilizó. La purificación del producto bruto por cromatografía flash sobre gel de fase inversa (gel MCI, CHP-20P, 75-150 micrómetros), eluyendo con un gradiente 10%-80% metanol-agua, produjo 0,064 g (42%) del compuesto del título como un sólido blanco después de la liofilización; p.f: 145-160ºC (dec). TLC (cloruro de metileno-metanol-ácido acético, 8:1:1) Rf=0,45. Espectro de masas: m/z 446 (M+H).
Ejemplo 86
18
Semicarbazona de éster terc-butílico del ácido (2S-cis)-[5-(-N-benciloxicarbonil-(S)-aspartil-b-éster terc-butílico)amino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino [3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico
A una disolución de éster N-benciloxicarbonil-(S)-aspartil-\beta-terc-butílico (0,169 g, 0,521 mmol) en cloruro de metileno (1,5 ml), agitando a 0ºC bajo nitrógeno, se le añadió hidrato de 1-hidroxibenzotriazol (0,087 g, 0,569 mmol) e hidrocloruro de 1-(3-dimetilaminopropil)-3-etilcarbodiimida (0,136 g, 0,711 mmol). Después de 15 minutos, se añadió una disolución de semicarbazona de éster terc-butílico del ácido (2S-cis)-[5-amino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico (0,217 g, 0,474 mmol) en cloruro de metileno (2 ml) y la reacción se dejó llevar hasta temperatura ambiente dentro de 1 hora. Después de agitar durante toda la noche, la mezcla de reacción se diluyó con acetato de etilo y se lavó sucesivamente con disoluciones al 5% de bisulfato de potasio y cloruro de sodio saturado; se secó (sulfato de sodio) y se evaporó hasta secarse. La purificación del producto bruto por cromatografía flash sobre gel de sílice (gel de sílice marca S/P 60\ring{A}, malla 230-400 ASTM), eluyendo con 2%, luego 5% metanol-cloruro de metileno, produjo 0,244 g (67%) del compuesto del título como un sólido blanquecino. TLC (cloruro de metileno-metanol, 9:1) Rf=0,55. ^{1}H-RMN (300 MHz, CDCl_{3}) \delta 9,13 (s, 1H), 7,85 (d, J= 6 Hz, 1H), 7,56 (d, J= 5,7 Hz, 1H) 7,23 (m, 5H), 7,08 (m, 1H), 7,00 (m, 2H), 5,13 (m, 3H) 4,77 (m, 1H), 4,62 (m, 1H), 4,43 (m, 1H), 3,60 (d, J= 16 Hz, 1H), 3,22 (m, 2H), 2,98 (m, 1H), 2,83 (d, J= 15,3 Hz, 1H), 2,65 y 2,36 (AB, dd, J= 4,2, 7,7, 16,9 Hz, 2H), 2,42 (m,1H), 2,10 (m, 1H), 1,35 (s, 9H), 1,24 (s, 9H).
Ejemplo 87
19
Semicarbazona de ácido (2S-cis)-[5-(N-benciloxicarbonil-(S)-aspartil)amino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico
A una disolución de semicarbazona de éster terc-butílico del ácido (2S-cis)-[5-(N-benciloxicarbonil-(S)-aspartil-b-éster terc-butílico)amino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxobutanoico (0,217 g, 0,289 mmol) en cloruro de metileno (1 ml) se le añadió anisol (0,5 ml) seguido de ácido trifluoroacético (1 ml). Después de agitar a temperatura ambiente bajo nitrógeno durante 3 horas, la mezcla de reacción se diluyó con cloruro de metileno y se evaporó, luego se enjuagó dos veces con cloruro de metileno para producir el compuesto del título (0,193 g). TLC (cloruro de metileno-metanol, 9:1) Rf=0,35. Espectro de masas: m/z 652 (M+H).
Ejemplo 88
20
Ácido (2S-cis)-[5-(N-benciloxicarbonil-(S)-aspartil)amino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico
Se trató semicarbazona de ácido (2S-cis)-[5-(N-benciloxicarbonil-(S)-aspartil)amino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino)-4-oxo-butanoico (0,191 g, 0,29 mmol) con una disolución 3:1:1 de metanol-ácido acético-37% formaldehído (2 ml) y la mezcla resultante se agitó bajo nitrógeno durante 2 horas. La mezcla de reacción se diluyó luego con agua, se eliminó el metanol por evaporación, luego el resto de la mezcla se liofilizó. La purificación del producto bruto por cromatografía flash sobre gel de fase inversa (gel MCI, CHP-20P, 75-150 micrómetros), eluyendo con un gradiente 10%-80% metanol-agua, produjo 0,111 g (64%) del compuesto del título como un sólido blanco después de la liofilización; p.f. 140-144ºC (dec.). TLC (cloruro de metileno-metanol, 9:1) Rf=0,4. Espectro de masas: m/z 593 (M-H).
Ejemplo 89
21
Semicarbazona de éster terc-butílico del ácido (2S-cis)-[5-dihidrocinamilamino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico
A una disolución de ácido dihidrocinámico (0,169 g, 0,521 mmol) en cloruro de metileno (1,5 ml), agitando a 0ºC bajo nitrógeno, se le añadió hidrato de 1-hidroxibenzotriazol (0,088 g, 0,576 mmol) e hidrocloruro de 1-(3-dimetilaminopropil)-3-etilcarbodiimida (0,127 g, 0,665 mmol). Después de 15 minutos, se añadió una disolución de semicarbazona de éster terc-butílico del ácido (2S-cis)-[5-amino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico (0,203 g, 0,443 mmol) en cloruro de metileno (2 ml), y la reacción se dejó llevar hasta temperatura ambiente dentro de 1 hora. Después de agitar durante toda la noche, la mezcla de reacción se diluyó con acetato de etilo y se lavó sucesivamente con disoluciones al 5% de bisulfato de potasio y cloruro de sodio saturado; se secó (sulfato de sodio) y se evaporó hasta secarse. La purificación del producto bruto por cromatografía flash sobre gel de sílice (gel de sílice marca S/P 60\ring{A}, malla 230-400 ASTM), eluyendo con 2, luego 5% metanol-cloruro de metileno, produjo 0,208 g (79%) del compuesto del título como un sólido blanquecino. TLC (cloruro de metileno-metanol, 9:1) Rf=0.7. ^{1}H-RMN (300 MHz, CDCl_{3}) \delta 8,82 (s, 1H), 7,72 (d, J= 8,1 Hz, 1H), 7,19 (m, 5H), 7,06 (m, 1H), 7,01 (m, 2H), 6,76 (d, J=6,3, 1H), 5,23 (d, J= 8,4 Hz, 1H0, 4,84 (m, 1H), 4,50 (m, 1H), 3,48 (m, 1H), 3,26 (m, 2H), 3,05 (m, 1H), 2,94 (m, 2H), 2,53 (m,4H), 2,28 (m, 1H), 2,06 (m, 1H), 1,29 (s, 9H). Espectro de masas: m/z 591 (M+H).
Ejemplo 90
22
Semicarbazona de ácido (2S-cis)-[5-dihidrocinamilamino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico
A una disolución de semicarbazona de éster terc-butílico del ácido (2S-cis)-[5-dihidrocinamilamino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico (0,189 g, 0,320 mmol) en cloruro de metileno (1 ml) se le añadió anisol (0,5 ml) seguido de ácido trifluoroacético (1 ml). Después de agitar a temperatura ambiente bajo nitrógeno durante 3 horas, la mezcla de reacción se diluyó con cloruro de metileno y se evaporó, luego se enjuagó dos veces con cloruro de metileno para obtener el compuesto del título (0,183 g). TLC(cloruro de metileno-metanol, 9:1) Rf=0,25. Espectro de masas: m/z 535 (M+H).
Ejemplo 91
23
Ácido (2S-cis)-[5-dihidrocinamilamino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico
Se trató semicarbazona de ácido (2S-cis)-[5-dihidrocinamilamino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico (0,181 g, aproximadamente 0,320 mmol) con una disolución 3:1:1 de meta-
nol-ácido acético-37% formaldehído (2 ml) y la mezcla resultante se agitó bajo nitrógeno durante 4 horas. La mezcla de reacción se diluyó luego con agua, se eliminó el metanol por evaporación, luego el resto de la mezcla se liofilizó. La purificación del producto bruto por cromatografía flash sobre gel de fase reversa (gel MCI, CHP-20P, 75-150 micrómetros), eluyendo con un gradiente 10%-80% metanol-agua, produjo 0,075 g (47%) del compuesto del título como un sólido blanco después de la liofilización; p.f. 78-81ºC. TLC (cloruro de metileno-metanol, 9:1) Rf=0,45. ^{1}H-RMN (300 MHz, DMSO d_{6}): \delta 8,58 (m, 1H), 8,30 (d, J= 7,5 Hz, 1H), 7,24 (m, 5H), 7,08 (m, 2H), 6,99 (m, 1H), 5,04 (d, J=9,3 Hz, 1H), 4,39 (m, 1H), 4,19 (m, 1H), 3,46 (m, 1H), 3,05 (m, 2H), 2,93 (d, J= 16,8 Hz, 2H), 2,83 (m, 2H), 2,00 (d, J= 5,1 Hz, 2H). Espectro de masas: m/z 478 (M+H).
Ejemplo 92
24
Semicarbazona de éster terc-butílico del ácido (2S-cis)-[5-acetilamino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico
A una disolución de semicarbazona de éster terc-butílico del ácido (2S-cis)-[5-amino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico (0,222 g, 0,490 mmol) en piridina (3 ml), a temperatura ambiente bajo nitrógeno, se le añadió anhídrido acético (0,07 ml, 0,735 mmol). Después de agitar durante toda la noche, la mezcla de reacción se diluyó con cloruro de metileno y se evaporó para producir una espuma. Esto se absorbió en acetato de etilo y se lavó sucesivamente con disoluciones al 5% de bisulfato de potasio y cloruro de sodio saturado; se secó (sulfato de sodio) y se evaporó hasta secarse para producir 0,130 g (53%) del compuesto del título como un sólido blanquecino. TLC (cloruro de metileno-metanol, 9:1) Rf=0,55. ^{1}H-RMN (300 MHz, CDCl_{3}): \delta 8,75 (s, 1H), 7,75 (d, J= 8,4 Hz, 1H), 7,08 (m, 1H), 7,01 (m, 2H), 6,87 (d, J=6,3 Hz, 1H), 5,25 (d, J= 8,1 Hz, 1H), 4,84 (m, 1H), 4,52 (m, 1H), 3,50 (m, 1H), 3,28 (m, 2H), 3,02 (m, 1H), 2,55 y 2,46 (AB, dd, J= 4,2, 7,1, 15,7 Hz, 2H), 2,36 (m, 1H), 2,18 (m, 1H), 2,02 (s, 3H), 1,31 (s, 9H).
Ejemplo 93
25
Semicarbazona de ácido (2S-cis)-[5-acetilamino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico
A una disolución de semicarbazona de éster terc-butílico del ácido (2S-cis)-[5-acetilamino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico (0,112 g, 0,224 mmol) en cloruro de metileno (1 ml) se le añadió anisol (0,5 ml) seguido de ácido trifluoroacético (1 ml). Después de agitar a temperatura ambiente bajo nitrógeno durante 2,5 horas, la mezcla de reacción se diluyó con cloruro de metileno y se evaporó, luego se enjuagó dos veces con cloruro de metileno para producir el compuesto del título (0,117 g). TLC (cloruro de metileno-metanol, 9:1) Rf=0,15. Espectro de masas: m/z 445 (M+H).
Ejemplo 94
26
Ácido (2S-cis)-[5-acetilamino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico
Se trató semicarbazona de ácido (25-cis)-[5-acetilamino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico (0,115 g, aproximadamente 0,224 mmol) con una disolución 3:1:1 de metanol-ácido acético-37% formaldehído (2 ml) y la mezcla resultante se agitó bajo nitrógeno durante 5 horas. La mezcla de reacción se diluyó con agua, se eliminó el metanol por evaporación, luego el resto de la mezcla se liofilizó. La purificación del producto bruto por cromatografía flash sobre gel de fase inversa (gel MCI, CHP-20P, 75-150 micrómetros), eluyendo con un gradiente 10%-80% metanol-agua, produjo 0,044 g (51%) del compuesto del título como un sólido blanco después de la liofilización; p.f. 210-215ºC (dec). TLC (cloruro de metileno-metanol-ácido acético, 44:5:1) Rf=0,45. Espectro de masas: m/z 388 (M+H).
Ejemplo 95
27
Semicarbazona de éster terc-butílico del ácido (2S-cis)-[5-(1-naftoil)amino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico
A una disolución de ácido 1-naftoico (0,072 g, 0,417 mmol) en cloruro de metileno (1,5 ml), agitando a 0ºC bajo nitrógeno, se le añadió hidrato de 1-hidroxibenzotriazol (0,077 g, 0,501 mmol) e hidrocloruro de 1-(3-dimetilaminopropil)-3-etil-carbodiimida (0,120 g, 0,626 mmol). Después de 15 minutos, se añadió una disolución de semicarbazona de éster terc-butílico del ácido (2S-cis)-[5-amino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico (0,189 g, 0,147 mmol) en cloruro de metileno (2 ml) y la mezcla de reacción se dejó llevar hasta temperatura ambiente dentro de 1 hora. Después de agitar durante un total de 5 horas, la mezcla de reacción se diluyó con acetato de etilo y se lavó sucesivamente con disoluciones al 5% de bisulfato de potasio y cloruro de sodio saturado, se secó (sulfato de sodio) y se evaporó hasta secarse. La purificación del producto bruto por cromatografía flash sobre gel de sílice (gel de sílice marca S/P 60\ring{A}, malla 230-400 ASTM), eluyendo con 5% metanol-cloruro de metileno, produjo 0,168 g (66%) del compuesto del título como un sólido blanquecino; p.f. 103-105ºC (dec.). TLC (cloruro de metileno-metanol, 9:1) Rf=0,6. Espectro de masas: m/z 613 (M+H). ^{1}H-RMN (300 MHz, CDCl_{3}) \delta 9,09 (bs, 1H), 8,38 (d, J=8,4 Hz, 1H), 7,82-7,93 (m, 3H), 7,70 (d, J=6,3 Hz, 1H), 7,45-7,58 (m, 3H), 7,37 (d, J=6,6 Hz, 1H), 7,06-7,15 (m, 4H), 5,30 (d, J= 8,4 Hz, 1H), 4,80-4,85 (m, 2H), 3,57 (d, J= 3,6 Hz, 1H), 3,30-3,45 (m, 2H), 3,16 (m, 1H), 2,59-2,65 (m, 2H), 2,27-2,49 (m, 2H), 1,29 (s, 9H).
Ejemplo 96
28
Semicarbazona de ácido (2S-cis)-[5-(1-naftoil)amino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico
A una disolución de semicarbazona de éster terc-butílico del ácido (2S-cis)-[5-(1-naftoil)amino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico (0,106 g, 0,173 mmol) en cloruro de metileno (1 ml) se le añadió anisol (0,5 ml) seguido de ácido trifluoroacético (1 ml). Después de agitar a temperatura ambiente bajo nitrógeno durante 3 horas, la mezcla de reacción se diluyó con cloruro de metileno y se evaporó, luego se enjuagó dos veces con cloruro de metileno para producir el compuesto del título (0,110 g). TLC (cloruro de metileno-metanol, 9:1) Rf=0,3.
Ejemplo 97
29
Ácido (2S-cis)-[5-(1-naftoil)-amino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico
Se trató semicarbazona de ácido (2S-cis)-[5-(1-naftoil)amino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico (0,110 g, aproximadamente 0,173 mmol) con una disolución 3:1:1 de meta-
nol-ácido acético-37% formaldehído (3 ml) y la mezcla resultante se agitó bajo nitrógeno durante 5 horas. La mezcla de reacción se diluyó luego con agua, se eliminó el metanol por evaporación, luego el resto de la mezcla se liofilizó. La purificación del producto bruto por cromatografía flash sobre gel de sílice (gel de sílice marca S/P 60\ring{A}, malla 230-400 ASTM), eluyendo con un gradiente 5%-20% metanol-cloruro de metileno, produjo 0,076 g (86%) del compuesto del título como un sólido blanco; p.f. 202-203ºC (dec). TLC (cloruro de metileno-metanol-ácido acético, 20:1:1) Rf=0,3. Espectro de masas: m/z 498 (M-H). ^{1}H-RMN (300 MHz, CDCl_{3}) \delta 9,38 (bs, 1H), 8,94 (m, 1H), 8,56 (m, 1H), 8,36 (m, 1H), 7,94-8,02 (m, 2H), 7,68 (d, J=6,9 Hz, 1H), 7,51-7,59 (m, 3H), 7,07-7,13 (m, 2H), 6,97 (m, 1H), 5,20 (d, J= 10,5, 1Hz), 4,67 (m, 1H), 4,15 (m, 1H), 3,49 (m, 1H), 2,95-3,23 (m, 2H), 2,53 (m, 1H), 2,22-2,34 (m, 2H).
Ejemplo 98
30
Semicarbazona de éster terc-butílico del ácido (2S-cis)-[5-benzoilamino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico
A una disolución de semicarbazona de éster terc-butílico del ácido (2S-cis)-[5-amino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico (0,121 g, 0,264 mmol) en cloruro de metileno (2,5 ml), agitando a 0ºC bajo nitrógeno, se le añadió trietilamina (0,055 ml, 0,396 mmol), seguida de cloruro de benzoilo (0,037 ml, 0,317 mmol). Después de agitar a temperatura ambiente bajo nitrógeno durante 1 hora, la mezcla de reacción se diluyó con acetato de etilo y se lavó sucesivamente con disoluciones al 5% de bisulfato de potasio, bicarbonato de sodio saturado y cloruro de sodio saturado; se secó (sulfato de sodio) y se evaporó hasta secarse. La purificación del producto bruto por cromatografía flash sobre gel de sílice (gel de sílice marca S/P 60\ring{A}, malla 230-400 ASTM), eluyendo con 10% hexano-acetato de etilo, 100% acetato de etilo, luego 10% metanol-acetato de etilo, produjo 0,073 g (49%) del compuesto del título como un sólido blanquecino. TLC (cloruro de metileno-metanol, 9:1) Rf=0,7. Espectro de masas: m/z 563 (M+H). ^{1}H-RMN (300 MHz, CDCl_{3}): \delta 8,61 (bs, 1H), 7,83-7,86 (m, 2H), 7,47-7,53 (m,3H), 7,06-7,12 (m, 3H), 5,30 (dd, J= 2,2, 7,8 Hz, 1H), 4,89 (m, 1H), 4,72 (m, 1H), 3,60 (d, J= 16,5 Hz, 1H), 3,36 (m, H), 3,19 (m, 1H), 2,69 (dd, J= 4,4, 11,7 Hz, 1H), 2,52 (m, 1H), 2,29 (m, 1H), 1,34 (s, 9H).
Ejemplo 99
31
Semicarbazona de ácido (2S-cis)-[5-benzoilamino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico
A una disolución de semicarbazona de éster terc-butílico del ácido (2S-cis)-[5-benzoilamino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico (0,064 g, 0,114 mmol) en cloruro de metileno (1 ml) se le añadió anisol (0,5 ml), seguido de ácido trifluoroacético (1 ml). Después de agitar a temperatura ambiente bajo nitrógeno durante 2,5 horas, la mezcla de reacción se diluyó con acetato de etilo y se evaporó para producir el compuesto del título (0,070 g). TLC (cloruro de metileno-metanol, 4:1) Rf=0,4. Espectro de masas: m/z 507 (M+H).
Ejemplo 100
32
Ácido (2S-cis)-[5-benzoilamino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-bu-tanoico
Se trató semicarbazona de ácido (2S-cis)-[5-benzoilamino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-bi]indol-2-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico (0,070 g, aproximadamente 0,114 mmol) con una disolución 3:1:1 de metanol-ácido acético-37% formaldehído (3 ml), y la mezcla resultante se agitó bajo nitrógeno durante 3,5 horas. La mezcla de reacción se diluyó luego con agua, se eliminó el metanol por evaporación, luego se liofilizó el resto de la mezcla. La purificación del producto bruto por cromatografía flash sobre gel de sílice (gel de sílice marca S/P 60\ring{A}, malla 230-400 ASTM), eluyendo con 10 y 20% de metanol-cloruro de metileno, produjo 0,042 g (82%) del compuesto del título como un sólido blanco; p.f. 204-205ºC (dec). TLC (cloruro de metileno-metanol, 4:1) Rf=0,4. Espectro de masas: m/z 448 (M-H). ^{1}H-RMN (300 MHz, DMSO-d_{6}) \delta 8,84 (m, 1H), 8,53 (m, 1H), 7,91-7,95 (m, 2H), 7,46-7,58 (m, 3H), 7,11 (m, 2H), 6,99 (t, J=7,3 Hz, 1H), 5,14 (d, 10,2 Hz, 1H), 4,62 (m, 1H), 4,23 (m, 1H), 3,48 (m, 1H), 3,12-3,18 (m, 2H), 2,99 (m, 1H), 2,58 (m, 1H), 2,12-2,46 (m, 3H).
Ejemplo 101
33
Semicarbazona de éster terc-butílico del ácido (3R,S-cis)-6-benciloxicarbonilamino-5-oxo-2,3,4,5,6,7,8-hexahidro-1H-azepino[3,2,1-hi]quinolina-3-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico 1. Preparación de éster metílico del ácido (3R,S-cis)-6-benciloxicarbonilamino-5-oxo-2,3,4,5,6,7,8-hexahidro-1H-azepino[3,2,1-hi]quinolina-3-carboxílico
A una disolución de ácido (3R,S-cis)-6-amino-5-oxo-2,3,4,5,6,7,8-hexahidro-1H-azepino[3,2,1-hi]quinolina-3-carboxílico, éster metílico (0,570 g, 2,1 mmol, preparada tal como se describe en Tetrahderon Letters 36, pp. 1593-1596 (1995) y en la patente estadounidense 5.504.080 (2 de abril de 1996)) en cloruro de metileno (6 ml), agitando a 0ºC, se le añadió cloroformato de bencilo (0,6 ml, 4,2 mmol) y trietilamina (1,2 ml, 8,4 mmol), y la mezcla resultante se agitó bajo nitrógeno durante 30 minutos. La reacción se enfrió rápidamente con agua, luego se dividió entre acetato de etilo y disolución al 5% de bisulfato de potasio acuoso. La capa acuosa se extrajo dos veces con acetato de etilo, luego las capas orgánicas combinadas se lavaron con disolución de cloruro de sodio saturado, se secaron (sulfato de sodio) y se evaporaron hasta secarse. La purificación del producto bruto por cromatografía flash sobre gel de sílice (gel de sílice marca S/P 60\ring{A}, malla 230-400 ASTM), eluyendo con acetato de etilo-hexano (2:1), produjo 0,643 g (76%) del compuesto del título como una espuma blanca. TLC (cloruro de metileno-metanol, 95:5) Rf=0,8. ^{1}H-RMN (300 MHz, CDCl_{3}) \delta 7,36-7,25 (m, 5H), 7,13-7,02 (m, 3H), 5,67 (d, J=7,8 Hz, 1H), 5,02 (t, J=9,15, 18,3 Hz, 2H), 4,34 (m, 1H), 3,70 (s, 3H), 3,16 (m, 1H), 2,69-2,56 (m, 5H), 2,06 (m, 1H). Espectro de masas: m/z 408 (M+H).
2. Preparación de ácido (3R,S-cis-6-benciloxicarbonilamino-5-oxo-2,3,4,5,6,7,8-hexahidro-1H-azepino[3,2,1-hi]quinolina-3-carboxílico
A una disolución de ácido (3R,S-cis)-6-benciloxicarbonilamino-5-oxo-2,3,4,5,6,7,8-hexahidro-1H-azepino[3,2,1-hi] quinolina-3-carboxílico, éster metílico (0,622 g, 1,53 mmol) en 1,4-dioxano (10,5 ml) y agua (3,5 ml) se le añadió hidróxido de litio acuoso 1M (2,3 ml, 2,3 mmol), y la mezcla resultante se agitó a temperatura ambiente bajo nitrógeno durante 1 hora. La mezcla de reacción se acidificó hasta aproximadamente pH 2 con una disolución al 5% de bisulfato de potasio acuoso, luego se dividió entre acetato de etilo y disolución de cloruro de sodio saturado. La capa acuosa se extrajo dos veces con acetato de etilo, y las capas orgánicas combinadas se secaron (sulfato de sodio) y se evaporaron para producir 0,670 g del compuesto del título. TLC (cloruro de metileno-metanol-ácido acético, 32:1:1) Rf=0,35. ^{1}H-RMN (300 MHz, CDCl_{3}): \delta 7,38-7,28 (m, 5H), 7,13-7,04 (m, 3H), 5,72 (d, J=8,1 Hz, 1H), 5,03 (s, 2H), 4,35 (m, 1H), 3,77-3,67(m, 5H), 3,10 (m, 1H), 2,72-2,52 (m, 5H), 2,07 (m, 1H), 1,70 (m, 1H).
3. Semicarbazona de éster terc-butílico del ácido (3R,S-cis)-6-benciloxicarbonilamino-5-oxo-2,3,4,5,6,7,8-hexahidro-1H-azepino[3,2,1-hi]quinolina-3-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico
A una disolución de ácido (3R,S-cis)-6-benciloxicarbonilamino-5-oxo-2,3,4,5,6,7,8-hexahidro-1H-azepino[3,2,1-hi] quinolina-3-carboxílico (0,604 g, 1,5 mmol) en cloruro de metileno (12 ml), agitando a 0ºC bajo nitrógeno, se le añadió hidrato de 1-hidroxibenzotriazol (0,282 g, 1,8 mmol) e hidrocloruro de 1-(3-dimetilaminopropil)-3-etilcarbodiimida (0,442 g, 3 mmol). Después de 15 minutos, se añadieron éster \beta-terc-butílico de carbazona de ácido L-aspártico, sal de p-toluensulfonato (0,60 g, 1,5 mmol) y N-metilmorfolina (0,25 ml, 3 mmol), y la mezcla se dejó llevar hasta temperatura ambiente dentro de 1 hora. Después de agitar una hora adicional, la mezcla de reacción se diluyó con acetato de etilo y se lavó sucesivamente con disoluciones al 5% de bisulfato de sodio y cloruro de sodio saturado; se secó (sulfato de sodio) y se evaporó hasta secarse. La purificación del producto bruto por cromatografía flash sobre gel de sílice (gel de sílice marca S/P 60\ring{A}, malla 230-400 ASTM), eluyendo con 10% metanol-cloruro de metileno, produjo 0,523 g (56%) del compuesto del título como una espuma blanca. TLC (cloruro de metileno-metanol, 9:1) Rf=0,65. ^{1}H-RMN (300 MHz, CDCl_{3}): \delta 9,89 (m, 1H), 7,72 (m, 1H), 7,92 (d, J=9 Hz, 1H), 7,65 (d, J=8,1 Hz, 1H), 7,32-7,28 (m, 5H), 7,12 (s, 1H), 7,07 (d, J=5,7 Hz, 2H), 6,03 (d, J=7,5 Hz, 1H), 5,84 (d, J=8,1 Hz, 1H), 5,03 (s, 2H), 5,01 (m, 1H) 4,80 (m, 1H), 4,31 (m, 1H), 2,98 (m, 1H), 2,75-2,41 (m, 7H), 2,12 (m, 1H), 1,77 (m, 1H), 1,39 (s, 9H).
Ejemplo 102
34
Semicarbazona de ácido (3R,S-cis)-6-benciloxicarbonilamino-5-oxo-2,3,4,5,6,7,8-hexahidro-1H-azepino[3,2,1-hi]quinolina-3-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico
A una disolución de semicarbazona de éster terc-butílico del ácido (3R,S-cis)-6-benciloxicarbonilamino-5-oxo-2,3,4,5,6,7,8-hexahidro-1H-azepino[3,2,1-hi] quinolina-3-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico (0,200 g, 0,33 mmol) en cloruro de metileno (1 ml) se le añadió anisol (0,5 ml, 4,62 mmol), seguido de ácido trifluoroacético (1 ml). Después de agitar a temperatura ambiente bajo nitrógeno durante 1,5 h, la mezcla de reacción se diluyó con cloruro de metileno y se evaporó, luego se azeotropó dos veces con cloruro de metileno para producir el compuesto del título (0,248 g). TLC (cloruro de metileno-metanol-ácido acético, 8:1:1) Rf=0,2. Espectro de masas: m/z 549 [M-H]^{-}.
Ejemplo 103
35
Ácido (3R,S-cis)-6-benciloxicarbonilamino-5-oxo-2,3,4,5,6,7,8-hexahidro-1H-azepino[3,2,1-hi]quinolina-3-carbo-nil)-amino]-4-oxo-butanoico
Se trató semicarbazona de ácido (3R,S-cis)-6-benciloxicarbonilamino-5-oxo-2,3,4,5,6,7,8-hexahidro-1H-azepino[3,2,1-hi]quinolina-3-carbonil)-amino]-4-oxo-butanoico (0,245 g, aproximadamente 0,33 mmol) con una disolución 3:1:1 de metanol-ácido acético-37% formaldehído (3 ml) y la mezcla resultante se agitó bajo nitrógeno durante 1,5 h. La mezcla de reacción se diluyó con agua, se eliminó el metanol por evaporación, luego se liofilizó el resto de la mezcla. La purificación del producto bruto por cromatografía flash sobre gel de fase inversa (gel MCI, CHP-20P, 75-150 micrómetros), eluyendo con un gradiente 10%-80% metanol-agua, produjo 0,090 g (60%) del compuesto del título como un sólido blanco después de la liofilización; p.f. 120-123ºC (dec). TLC (cloruro de metileno-metanol-ácido acético, 32:1:1) Rf=0,45. ^{1}H-RMN (300 MHz, DMSO d_{6}): \delta 8,67 (m, 1H), 7,79 (m, 1H), 7,57 (m, 1H), 7,37-7,27 (m, 5H), 7,17-7,08 (m, 3H), 5,44 (m, 1H), 4,95 (s, 2H), 4,70 (m, 1H), 4,07 (m, 1H), 3,92 (m, 1H), 3,16 (m, 1H), 2,98 (m, 1H), 2,75-2,41 (m, 7H), 2,25 (m, 1H), 2,11 (m, 1H), 1,29 (m, 1H). Espectro de masas: m/z 492 [M-H]^{-}.
Ejemplo 104
36
Éster terc-butílico del ácido 3{(2S-cis)-[5-benciloxicarbonilamino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]}-5-fluoro-4-hidroxi-pentanoico
A una disolución de ácido (2S-cis)-5-benciloxicarbonilamino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carboxílico (0,373 g, 0,98 mmol) en cloruro de metileno (3 ml), agitando a 0ºC bajo nitrógeno, se le añadió hidrato de 1-hidroxibenzotriazol (0,151 g, 0,98 mmol) e hidrocloruro de 1-(3-dimetilaminopropil)-3-etilcarbodiimida (0,283 g, 1,47 mmol). Después de 15 minutos, se añadió ácido 3-amino-4-hidroxi-5-fluoropentanoico, éster terc-butílico (0,204 g, 0,98 mmol, preparado tal como se describe en Tetrahedron Letters 35, pp. 9693-9696 (1994)), y la mezcla se dejó llevar hasta temperatura ambiente dentro de 1 hora. Después de agitar durante toda la noche, la mezcla de reacción se diluyó con acetato de etilo y se lavó sucesivamente con disoluciones al 5% de bisulfato de potasio y cloruro de sodio saturado; se secó (sulfato de sodio) y se evaporó hasta secarse. La purificación del producto bruto por cromatografía flash sobre gel de sílice (gel de sílice marca S/P 60\ring{A}, malla 230-400 ASTM), eluyendo con 2% metanol-cloruro de metileno, produjo 0,383 g (68%) del compuesto del título como una espuma blanca. TLC (cloruro de metileno-metanol, 9:1) Rf=0,6. ^{1}H-RMN (300 MHz, CDCl_{3}): \delta 7,45-7,31 (m, 5H), 7,08-7,01 (m, 3H), 6,10 (m, 1H), 5,26 (m, 1H), 5,12 (s, 2H), 4,52 (m, 1H), 4,38-4,30 (m, 2H), 4,21-4,19 (m, 2H), 4,03-3,95 (m, 2H), 3,43-3,20 (m, 4H), 3,13 (m, 2H), 2,62-2,50 (m, 2H), 2,42 (m, 1H), 1,42 (s, 4H), 1,32 (s, 5H). Espectro de masas: m/z 570 (M+H).
Ejemplo 105
37
Éster terc-butílico del ácido 3{(2S-cis)-[5-benciloxicarbonilamino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]}-5-fluoro-4-oxo-pentanoico
A una disolución de éster terc-butílico del ácido 3 {(2S-cis)-[5-benciloxicarbonilamino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]}-5-fluoro-4-hidroxi-pentanoico (0,114 g, 0,20 mmol) en metil sulfóxido (1,3 ml) se le añadió peryodinano Dess-Martin (0,228 g). Después de agitar a temperatura ambiente bajo nitrógeno durante 2 horas, se añadió una porción adicional de peryodinano Dess-Martin (0,135 g) y 2,5 horas más tarde una tercera porción (0,10 g). La mezcla de reacción se diluyó con acetato de etilo y se lavó dos veces con agua y disolución de cloruro de sodio saturado; se secó (sulfato de sodio) y se evaporó hasta secarse. La purificación del producto bruto por cromatografía flash sobre gel de sílice (gel de sílice marca S/P 60\ring{A}, malla 230-400 ASTM), eluyendo con 1/1 acetato de etilo-hexanos, proporcionó 0,076 g (67%) del compuesto del título como una espuma blanca. TLC (acetato de etilo-hexanos, 1:1) Rf=0,6. ^{1}H-RMN (300 MHz, CDCl_{3}): \delta 7,58 (d, J = 8,4 Hz, 1H), 7,34-7,30 (m, 5H), 7,07-6,99 (m, 3H), 6,06 (m, 1H), 5,23 (d, J = 12,3 Hz, 1H), 5,12 (s, 2H), 4,53 (d, J = 13,2 Hz, 1H), 4,77 (d, J = 9,9 Hz, 2H), 4,32 (m, 1H), 3,44 (dd, J = 5, 8,4 Hz, 1H), 3,32-3,21 (m, 2H), 3,06 (m, 1H), 2,9 (m, 1H), 2,62 (m, 1H), 2,41 (m, 1H), 2,17 (m, 1H), 1,39 (s, 4H), 1,29 (s, 5H).
Ejemplo 106
38
Ácido 3{(2S-cis)-[5-benciloxicarbonilamino-1,2,3,4,5,6,-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-ami-no]}-5-fluoro-4-oxo-pentanoico
A una disolución de éster terc-butílico del ácido 3{(2S-cis)-[5-benciloxicarbonilamino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil)-amino]}-5-fluoro-4-oxo-pentanoico (0,063 g, 0,111 mmol) en cloruro de metileno (1,0 ml) se le añadió anisol (0,5 ml), seguido de ácido trifluoroacético (1,0 ml). Después de agitar a temperatura ambiente bajo nitrógeno durante 2 horas, la mezcla de reacción se diluyó con cloruro de metileno y se evaporó, luego se enjuagó dos veces con cloruro de metileno. El residuo bruto se trituró con éter etílico para producir 0,030 g del producto del título como un sólido blanco; p.f. 106-107ºC (dec). TLC (cloruro de metileno-metanol-ácido acético, 32:1:1) Rf=0,3. ^{1}H-RMN (300 MHz, CDCl_{3}): \delta 7,61 (m, 1H), 7,32 (s, 5H), 7, 1 (d, J = 4 Hz, 1H), 7,03 (d, J = 4 Hz, 2H), 6,17 (m, 1H), 5,22 (m, 1H), 5,10 (s, 2H), 4,75-4,70 (m, 2H), 4,32 (m, 1H), 3,5 (m, 1H), 3,31-3,15 (m, 2H), 3,03 (m, 1H), 2,93 (m, 1H), 2,69 (m, 1H), 2,36 (m, 1H), 2,12 (m, 1H). Espectro de masas: m/z 512 (M+H).
Ejemplo 107
39
Ácido 3-[(2S-cis)-[5-benciloxicarbonilamino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil]ami-no]-5-bromo-4-oxo-pentanoico, éster terc-butílico
A una disolución de ácido (2S-cis)-5-benciloxicarbonilamino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carboxílico (0,302 g, 0,797 mmol) en cloruro de metileno (5,5 ml), agitando a 0ºC bajo nitrógeno, se le añadió hidrato de 1-hidroxibenzotriazol (0,146 g, 0,96 mmol) e hidrocloruro de 1-(3-dimetilaminopropil)-3-etilcarbodiimida (0,230 g, 1,2 mmol). Después de 15 minutos, se añadió ácido aspártico, \alpha-metilo, hidrocloruro de diéster \beta-terc-butílico (0,191 g, 0,797 mmol) seguido de N-metilmorfolina (0,13 ml, 1,2 mmol) y la mezcla se dejó alcanzar temperatura ambiente dentro de 1 hora. Después de agitar durante toda la noche, la mezcla de reacción se diluyó con acetato de etilo y se lavó sucesivamente con disoluciones al 5% de bisulfato de potasio y cloruro de sodio saturado; se secó (sulfato de sodio) y se evaporó hasta secarse. La purificación del producto bruto por cromatografía flash sobre gel de sílice (gel de sílice marca S/P 60\ring{A}, malla 230-400 ASTM), eluyendo con acetato de etilo-hexano (1:1), produjo 0,350 g (78%) de ácido N-[(2S-cis)-[5-benciloxi-carbonilamino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil]aspártico, \alpha-metilo, diéster \beta-terc-butílico como un sólido blanco. TLC (cloruro de metileno-metanol, 9:1) R_{f}=0,8. p.f. 147-148ºC(dec.).^{1}H-RMN (300 MHz, CDCl_{3}): \delta 7,48 (d, J=7,5 Hz, 1H), 7,34-7,29 (m, 5H), 7,07 (m, 1H), 7,03-6,96 (m, 2H), 6,15 (d, J=5,7 Hz, 1H), 5,28 (d, J=7,8 Hz 1H), 5,11 (s, 2H), 4,72 (m, 1H), 4,32 (m, 1H), 3,74 (s, 3H), 3,49 (d, J=16,5 Hz, 1H), 3,31-3,20 (m, 2H), 3,05 (m, 1H), 2,72 (ABX, dd, J=4,65, 15, 64,5 Hz, 2H), 2,43 (m, 1H), 2,15 (m, 1H), 1,30 (s, 9H).
A una disolución del producto anterior (0,330 g, 0,585 mmol) en 1,4-dioxano (4,5 ml) y agua (1,5 ml) se le añadió hidróxido de litio acuoso 1M (0,7 ml, 0,702 mmol) y la mezcla resultante se agitó a temperatura ambiente bajo nitrógeno durante 30 minutos. La mezcla de reacción se acidificó hasta pH 3 con una disolución de HCl 0,1N, luego se dividió entre acetato de etilo y disolución saturada de cloruro de sodio. La capa acuosa se extrajo dos veces con acetato de etilo, y las capas orgánicas combinadas se secaron (sulfato de sodio) y evaporaron para producir 0,275 g (85%) de ácido N-[(2S-cis)-[5-benciloxicarbonilamino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil]]aspártico, éster \beta-terc-butílico como una espuma blanca. TLC (cloruro de metileno-metanol, 9:1): R_{f}=0,25. ^{1}H-RMN (300 MHz, CDCl_{3}): \delta 7,57 (d, J=7,8 Hz, 1H), d7,35-7,29 (m, 5H), 7,08 (m, 1H), 7,03-6,98 (m, 2H), 6,24 (d, J=6 Hz, 1H), 5,28 (d, J=5,1 Hz 1H), 5,11 (s, 2H), 4,73 (m, 1H), 4,35 (m, 1H), 3,48 (d, J=16,8 Hz, 1H), 3,36-3,20 (m, 2H), 3,07 (m, 1H), 2,76 (ABX, dd, J=4,8, 18, 66 Hz, 2H), 2,40 (m, 1H), 2,19 (m, 1H), 1,33 (s, 9H).
A una disolución del producto anterior (0,262 g, 0,475 mmol) en tetrahidrofurano (3,0 ml), agitando a -10ºC bajo nitrógeno, se le añadió N-metilmorfolina (0,114 ml, 1,05 mmol) seguida de la adición gota a gota de isobutil cloroformato (0,107 ml, 0,81 mmol). Después de 40 minutos, la mezcla de reacción se filtró, las sales se lavaron con THF seco y el filtrado se enfrió hasta 0ºC. Esto se trató con una disolución etérea recién preparada de diazometano (exceso). Después de agitar la mezcla a 0ºC durante 30 minutos, se añadió gota a gota una mezcla de ácido bromhídrico (48% en peso, disolución acuosa)/ácido acético (1,3 ml, 1/1). Después de agitar durante otros 10 minutos, la mezcla de reacción se diluyó con acetato de etilo, luego se lavó sucesivamente con disoluciones de bicarbonato de sodio saturado y cloruro de sodio saturado; se secó (sulfato de sodio) y se evaporó hasta secarse. La purificación del producto bruto por cromatografía flash sobre gel de sílice (gel de sílice marca S/P 60\ring{A}, malla 230-400 ASTM), eluyendo con acetato de etilo-hexano (1:1), produjo 0,200 g (67%) del compuesto del título como una espuma blanca. TLC (acetato de etilo-hexano, 1:1): R_{f}=0,7. ^{1}H-RMN (300 MHz, CDCl_{3}): \delta 7,71 (d, J=9 Hz, 1H), d7,35-7,30 (m, 5H), 7,09 (m, 1H), 7,04-7,02 (m, 2H), 6,1 (d, J=5,4 Hz, 1H), 5,28 (d, J=7,2 Hz 1H), 5,12 (s, 2H), 4,89 (dd, J=4,5, 15 Hz 1H), 4,35 (m, 1H), 4,16 (s, 2H), 3,50-3,21(m, 3H), 3,06 (m, 1H), 2,76 (ABX, dd, J=4,65, 18, 103 Hz, 2H), 2,37 (m, 1H), 2,15 (m, 1H), 1,27 (s, 9H). Espectro de masas: m/z 626/628 (M-H).
Ejemplo 108
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Ácido 3-[(2S-cis)-[5-benciloxicarbonilamino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil]ami-no]-5-(difenilfosfinil)oxi-4-oxo-pentanoico, éster terc-butílico
A una disolución de ácido 3-[(2S-cis)-[5-benciloxicarbonilamino-1,2,3,4,5,5,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil]amino]-5-bromo-4-oxo-pentanoico, éster terc-butílico (0,069 g, 0,110 mmol) en N,N-dimetilformamida (1,0 ml) se le añadió fluoruro de potasio (0,029 g, 0,495 mmol), seguido de ácido difenilfosfínico (0,029 g, 0,139 mmol). Después de agitar a temperatura ambiente bajo nitrógeno durante 48 horas, la mezcla de reacción se diluyó con acetato de etilo, luego se lavó sucesivamente con disolución de bicarbonato de sodio diluida y luego con agua; se secó (sulfato de sodio) y se evaporó hasta secarse. La purificación del producto bruto por cromatografía flash sobre gel de sílice (gel de sílice marca S/P 60\ring{A}, malla 230-400 ASTM), eluyendo con acetato de etilo-hexano (1:1), produjo 0,048 g (59%) del compuesto del título como un aceite claro. TLC (acetato de etilo-hexano, 2:1): R_{f}=0,3. ^{1}H-RMN (300 MHz, CDCl_{3}): \delta 7,89-7,80 (m, 4H), 7,52-7,30 (m, 11H), 7,06 (m, 1H), 7,01-6,96 (m, 2H), 6,45 (m, 1H), 5,21 (m, 1H), 5,13 (s, 2H), 4,96 (dd, J=8,3, 18 Hz, 1H), 4,78-4,70 (m, 2H), 4,35 (m, 1H), 3,35-3,23 (m, 3H), 3,05 (m, 1H), 2,76 (ABX, dd, J=4,65, 18, 103 Hz, 2H), 2,43(m, 1H), 2,18 (m, 1H), 1,33 (s, 9H).
Ejemplo 109
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41
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Ácido 3-[(2S-cis)-[5-benciloxicarbonilamino-amino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxozepino[3,2,1-,hi]indol-2-carbonil]amino]-5-(difenilfosfinil)oxi-4-oxo-pentanoico
A una disolución de ácido 3-[(2S-cis)-[5-benciloxicarbonilamino-1,2,3,4,5,6,7-hexahidro-4-oxoazepino[3,2,1-hi]indol-2-carbonil]amino]-5-(difenilfosfinil)oxi-4-oxo-pentanoico, éster terc-butílico (0,040 g, 0,054 mmol) en cloruro de metileno (1,0 ml) se le añadió anisol (0,5 ml), seguido de ácido trifluoroacético (1,0 ml). Después de agitar a temperatura ambiente bajo nitrógeno durante 30 minutos, la mezcla de reacción se diluyó con cloruro de metileno y se evaporó, luego se azeotropó dos veces con cloruro de metileno. El residuo bruto se trituró con éter etílico para producir 0,030 g del producto del título como un sólido blanco; p.f. 109-111ºC (dec). TLC (cloruro de metileno-metanol, 9:1): R_{f}=0,4. ^{1}H-RMN (300 Mhz, CDCl_{3}): \delta 7,87-7,66 (m, 4H), 7,60-7,28 (m, 11H), 7,05-6,95 (m, 3H), 6,84 (m, 1H), 5,12(s, 2H), 5,05 (m, 1H), 4,58 (m, 1H), 4,42-4,15 (m, 4H), 3,35-3,10 (m, 4H), 3,05 (m, 1H), 2,76 (m, 1H), 2,56 (m, 1H), 2,37(m, 1H), 2,13 (m, 1H), 1,93 (bs, 1H). Espectro de masas: m/z 710 (M+H).
Ejemplo 110 Materiales y métodos para evaluar los efectos de los inhibidores de ICE/CED-3 sobre granulocitos y neutrófilos Aislamiento de neutrófilos
Se extrajo sangre completa anticoagulada con ácido, citrato y dextrosa (ACD) con una relación de 1:5 ACD a sangre (\sim100 ml).
Usando recipientes plásticos de polipropileno, se aíslan los neutrófilos de la siguiente manera:
se añaden 30 ml de sangre completa a tubos centrífugos de polipropileno de 50 ml, que contienen 15 ml de 6% dextrano (en disolución salina). Se deja sedimentar la sangre durante aproximadamente 1 hora a temperatura ambiente.
La capa turbia festucina se recoge de la parte superior de los cilindros en tubos cónicos de polipropileno de 50 ml. Las células sanguíneas se sedimentan por centrifugación a 240 xg (centrifugador Sorvall a 1200 rpm) durante 12 min. a 4ºC con el freno en el ajuste bajo.
El sobrenadante se aspira y el sedimento combinado se resuspende en 40-50 ml de PBS frío (sin Ca, Mg), y se centrifuga a 240 xg (centrifugador Sorvall a 1200 rpm) durante 6 min. a 4ºC con el freno en el ajuste alto.
El sobrenadante se aspira y el sedimento se resuspende en 12 ml de agua fría especial para cultivos celulares. La suspensión se tituló moderadamente con una pipeta durante 30 segundos, luego se añaden 4 ml de KCl 0,6 M frío. (Llevado hasta 50 ml con PBS frío (sin Ca, Mg)) y luego se centrifuga a 300xg (centrifugador Sorvall a 1400 rpm) durante 6 min. a 4ºC con el freno en el ajuste alto.
Lo anterior se repite una vez.
El sobrenadante se aspiró y las células se resuspendieron en 2,5 ml de PBS frío (sin Ca, Mg). La suspensión celular se estratificó en 3 ml de Ficoll-Hypaque en un tubo de polipropileno cónico de 15 ml y se centrifugó a 400 xg (centrifugador Sorvall a 1900 rpm) durante 30 min. a 4ºC con el freno en el ajuste bajo.
La suspensión aspirada bajó hacia el sedimento de neutrófilos. El sedimento se resuspendió en PBS frío (sin Ca, Mg) y se transfirió a un tubo cónico de 50 ml, se llevó hasta 50 ml con PBS frío (sin Ca, Mg) y se centrifugó a 300 xg (centrifugador Sorvall a 1400 rpm) durante 6 min. a 4ºC con el freno en el ajuste alto.
Se aspiró el sobrenadante y el sedimento se resuspendió en 50 ml de PBS frío (sin Ca, Mg) y se centrifugó a 300 xg (centrifugador Sorvall a 1400 rpm) durante 6 min. a 4ºC con el freno en el ajuste alto.
Se aspiró el sobrenadante y el sedimento de neutrófilos se resuspendió en 4,0 ml de PBS frío (sin Ca, Mg) sobre hielo. Se diluyeron 10 ml de la suspensión de neutrófilos con 990 ml de Azul Trypan (1:100) y las células se contaron usando un hemacitómetro. Se determinaron la cantidad y viabilidad de las células.
Condiciones para el cultivo de neutrófilos
El medio de cultivo fue el siguiente:
(RPMI 1640; 10% FBS; Hepes 10 mM; L-glutamina 0,2 mM; 25 U/ml penicilina; y 25 mg/ml estreptomicina)
El mantenimiento de los neutrófilos purificados se llevó a cabo bajo las siguientes condiciones: (5 x 10^{6} células/ml en el medio de cultivo anteriormente mencionado; placas de poliestireno de 96 pocillos con fondo redondo; 250 ml/pocillo; y 37ºC, 5% CO_{2}/95% incubadora con humidificador de aire) (Liles et al., Blood 119 (1995) 3181-3188).
Análisis de núcleos hipodiploides por citometría de flujo
Disolución hipotónica de fluorocromo
(50 mg/ml de yoduro de propidio (catálogo Sigma #P4170); 0,1% Triton X-100; y 0,1% citrato de sodio).
Los neutrófilos se sedimentaron a 4ºC y se aspiró el sobrenadante.
Los neutrófilos se resuspendieron en disolución hipotónica de fluorocromo a una densidad de 5 x 10^{6} células/ml. Se evaluó la fluorescencia del yoduro de propidio de los núcleos individuales en FL2 y se midió en una escala logarítmica, controlando los parámetros físicos en dispersión hacia adelante y lateral para excluir residuos celulares.
Se recogieron por lo menos 10.000 eventos por muestra, y los resultados se evaluaron en relación con una población de neutrófilos no apoptóticos (Liles et al., Blood 119 (1995) 3181-3188).
Explosión respiratoria en neutrófilos aislados medida por quimioluminiscencia
Se extrajo sangre completa anticoagulada con ácido, citrato y dextrosa (ACD) en una relación de 1:5 ACD a sangre (150 ml).
Los neutrófilos se aislaron tal como se describió anteriormente.
Se preparó zymosan opsonizado suspendiendo 125 mg de partículas de zymosan en 25 ml de suero humano combinado(5 mg/ml) e incubando durante 20 minutos a 37ºC. Se centrifugó la suspensión y se resuspendieron las partículas en 7 ml de PBS (18 mg/ml) y se almacenaron en hielo hasta su uso (vórtex antes de pipetar).
Se prepararon 50 ml de una disolución 250 mM de Lucigenin (MW 510,5) disolviendo 6,4 mg del sólido en 50 ml de PBS-G (+ Ca, Mg). 10 ml de PBS-G (+ Ca, Mg) a los pocillos en una placa blanca de 96 pocillos.
Se añadieron 50 ml de la disolución 250 mM de Lucigenin a los pocillos en una placa blanca de 96 pocillos.
Las preparaciones celulares se obtuvieron a partir de cultivo celular (concentración en tiempo cero = 5,0 x 10^{6} células/ml) con PBS-G (+ Ca, Mg).
Se suspendieron 20 ml de la suspensión de neutrófilos en los pocillos apropiados y la placa se incubó a 37ºC durante tres minutos. Se añadieron 10 ml del zymosan opsonizado a los pocillos.
Se leyó la placa en un luminómetro (Labsystems Luminoskan, Needham Heights, MA) durante 14 min. a 37ºC en el modo cinético y los resultados se registraron usando el programa DeltaSoft.
Ensayo de sangre completa
Se utilizaron los siguientes reactivos:
anticuerpo monoclonal anti-CD32-FITC obtenido de Pharmingen.
Disolución lisante (10X Stock: 89,9 g NH4Cl;
10,0 g KHCO;
0,37 g EDTA tetrasódico;
se disuelve en 1 litro de dH_{2}O. Se ajusta hasta pH 7,3. Se almacena a 4ºC en una botella bien cerrada.
Se diluye 1:10 con dH_{2}O antes del uso).
(DPBS sin calcio ni magnesio obtenido de Irivine Scientific.
2% suero bovino fetal en DPBS almacenado a 4ºC.
50 mg/ml yoduro de propidio en DPBS estéril filtrado y almacenado a 4ºC).
Se siguió el siguiente protocolo:
muestra de sangre de 200 ml/2,8 ml 1X disolución de lisis en un tubo cónico de polipropileno de 15 ml. Se tapa e invierte para mezclar.
Se deja a temperatura ambiente durante 3-5 minutos.
Se centrifuga en un aparato Sorvall a 1200 rpm durante 5 minutos a 4ºC.
Se aspira el sobrenadante. Se resuspende el sedimento en 200 ml/muestra 2% FBS/DPBS. Se añaden 20 ml/muestra anti-CD32-FITC. Se incuba durante 30 minutos en hielo en la oscuridad.
Se añaden 5 ml/muestra DPBS. Se centrifuga a 1000 rpm durante 5 minutos a 4ºC. Se aspira el sobrenadante. Se resuspende el sedimento en 1 ml/muestra 2% FBS/DPBS. Se añaden 3 ml/muestra 95% EtOH enfriado con hielo gota a gota mientras se agita en vórtex moderadamente.
Se incuban las muestras en hielo en la oscuridad durante 30 minutos. Se centrifuga a 1000 rpm durante 5 minutos a 4ºC.
Se resuspende cada muestra en 50 \mul 5 mg/ml RN'asa. Se transfiere la muestra a 900 ml/muestra 50 mg/ml yoduro de propidio en tubos de poliestireno Falcon 12 x 75 mm. Se incuba en hielo durante 30 minutos. Se analizan las muestras por citometría de flujo (láser argón) para fluorescencia y dispersión hacia adelante y lateral.
Ejemplo 111 Aumento de la supervivencia de neutrófilos/granulocitos por aplicación ex-vivo de los inhibidores de ICE/ced-3
La presente invención provee métodos para aumentar la supervivencia ex vivo de neutrófilos/granulocitos. Para establecer la capacidad de los compuestos para conservar los granulocitos en cultivo, los compuestos se probaron en una cantidad de ensayos in vitro. Un modelo común a probar para efectos sobre la supervivencia de granulocitos consiste en separar los granulocitos de sangre completa fresca, cultivar las células a 37ºC y probar las células para su naturaleza hipodiploide nuclear en intervalos de 24 horas (como se describió en el Ejemplo 110). La presencia de ADN hipodiploide es una medida de apoptosis y se determina usando una mancha de yoduro de propidio vía citometría de flujo. Los compuesto de la presente invención se incubaron con los granulocitos en cultivo, se midieron sus efectos sobre la supervivencia de los granulocitos y se calculó un IC_{50}. En la Figura 6, el inhibidor de caspasa zVADfmk, preparado tal como se describe en Tetrahedron Letter, 35 9693-9696 (1994), tuvo un efecto débil sobre el aumento de la supervivencia de los granulocitos a las 48 horas, mientras que el ejemplo 106 de la presente invención tuvo un IC_{50} < 5 mM y, por lo tanto, es un inhibidor potente de la muerte de los granulocitos.
Ejemplo 112 Aumento de la supervivencia del producto de aféresis por aplicación de los inhibidores de ICE/ced-3
La aféresis (leucoféresis) de donantes de sangre se puede realizar para obtener una población de células enriquecida en granulocitos. Estas células se transfunden luego a un receptor que necesita granulocitos adicionales. Este producto de aféresis tiene una vida útil corta, y los estándares actuales (American Association of Blood Banks, Standard for Blood Banks and Transfusion Services, Ed. 17, 1996) exigen la conservación a 20-24ºC durante un máximo de 24 horas. Se recomienda que la transfusión tenga lugar dentro de las 6 horas, en la medida de lo posible.
Los compuestos ilustrativos tal como se describe en la presente invención se pueden utilizar para prolongar el tiempo de conservación de los productos de aféresis. Para uso en el escenario de la aféresis, el compuesto se puede formular en un disolvente compatible, como dimetil sulfóxido (DMSO). El compuesto se puede almacenar en un vial y pre-añadirse a la bolsa de aféresis o inyectarse a la línea de aféresis de un donante durante el procedimiento de extracción. El compuesto de concentración final eficaz podría estar en el intervalo de 1-25 \muM. El producto de leucoféresis, que contiene el inhibidor de ICE/ced-3, se infunde luego al receptor después de la conservación. Pueden ser posibles muchas condiciones de conservación, por ejemplo, la conservación puede ser a temperatura ambiente durante un máximo de una semana después de la extracción.
Ejemplo 113 Reconstitución de médula ósea/recuperación de células hematopoyéticas
Con el fin de demostrar la utilidad para acelerar la reconstitución de células hematopoyéticas, los compuestos se probaron en varios modelos animales. Un modelo común para destruir las células hematopoyéticas consiste en irradiación letal o sub-letal de ratones, en la que los ratones están expuestos a rayos X, usualmente generados a partir de una fuente de ^{137}Cesio. En el caso de la irradiación sub-letal, se pueden determinar distintos criterios de valoración que miden la hematopoyesis en diferentes momentos posteriores a la irradiación, con el fin de vigilar la recuperación. Los compuestos de la presente invención se administran a animales después de la irradiación sub-letal y se miden sus efectos sobre la recuperación. Los criterios de valoración pueden incluir: cifra de leucocitos, hematocritos, incorporación de timidina tritiada al ADN de médula ósea, peso del bazo, cantidad de unidades formadoras de colonias eritroides o cantidad de unidades formadoras de colonias (linajes formadores de eritroides, granulocitos/macrófagos y megacariocitos) del bazo o la médula ósea del húmero o fémur. En algunos casos, los animales se pueden también mielosuprimir por inyección de agentes quimioterapéuticos, como carboplatino. Los compuestos que han sido eficaces en estos modelos, si bien actúan vía mecanismos diferentes, incluyen trombopoyetina, Photofrin, hemo, interleucina 1 y tetraclorodecaóxido, entre otros.
Los modelos de irradiación letal también se pueden utilizar para probar la eficacia, aunque estos modelos en general incluyen trasplante de médula ósea para rescatar a los animales. Estos experimentos en general se realizan en ratones, aunque no exclusivamente. Para trasplantes singeneicos, se puede medir entonces el tiempo para el injerto, usando los mismos criterios de valoración ya mencionados. Los injertos de células progenitoras humanas también se puede medir usando ratones SCID-hu como los receptores con métodos similares a los ya mencionados, después de establecer primero el origen humano de las células hematopoyéticas. En estos caso, los compuestos de la presente invención se administran a animales receptores al momento del trasplante de la médula ósea. Las células de la médula ósea también se pueden tratar con compuestos inhibidores de la familia ICE/CED-3 antes del trasplante.

Claims (7)

1. Un método para expandir o aumentar la supervivencia de una población celular humana, que comprende poner en contacto las células, ex vivo, con una cantidad inhibidora eficaz de un inhibidor de proteasa que suprime la actividad de por lo menos un miembro de la familia de la enzima convertidora de la interleucina 1\beta (ICE)/CED-3, inhibiendo la apoptosis en la población celular, expandiendo o aumentando de este modo la supervivencia de la población celular, en el que el inhibidor de proteasa es un compuesto de fórmula 3:
42
en la que:
n es 1 ó 2;
m es 1 ó 2;
A es R^{2}CO-, R^{3}-O-CO- o R^{4}SO_{2}-;
un grupo de la fórmula:
43
en la que:
R^{1} es un átomo de hidrógeno, alquilo o fenilalquilo;
R^{2} es alquilo, cicloalquilo, (cicloalquil)alquilo, fenilo, fenilalquilo, fenilo sustituido, (fenilo sustituido)alquilo, heteroarilo o (heteroaril)alquilo;
R^{3} es alquilo, cicloalquilo, (cicloalquil)alquilo, fenilalquilo o (fenilo sustituido)alquilo;
R^{4} es alquilo, cicloalquilo, (cicloalquil)alquilo, fenilo, fenilalquilo, fenilo sustituido, (fenilo sustituido)alquilo, heteroarilo o (heteroaril)alquilo;
R^{5} es alquilo, cicloalquilo, (cicloalquil)alquilo, fenilo, fenilalquilo, fenilo sustituido, (fenilo sustituido)alquilo, heteroarilo o (heteroaril)alquilo;
R^{6} es alquilo, cicloalquilo, (cicloalquil)alquilo, fenilalquilo o (fenilo sustituido)alquilo;
R^{7} es alquilo, cicloalquilo, (cicloalquil)alquilo, fenilo, fenilalquilo; fenilo sustituido, (fenilo sustituido)alquilo, heteroarilo o (heteroaril)alquilo;
R^{8} es una cadena lateral de aminoácidos seleccionada entre el grupo que consiste en aminoácidos naturales y sintéticos;
B es un átomo de hidrógeno, un átomo de deuterio, alquilo, cicloalquilo, (cicloalquil)alquilo, fenilo, fenilalquilo, fenilo sustituido, (fenilo sustituido)alquilo, heteroarilo, (heteroaril)alquilo o halometilo;
un grupo de la fórmula:
-CH_{2}XR^{9};
en la que R^{9} es fenilo, fenilo sustituido, fenilalquilo, (fenilo sustituido)alquilo, heteroarilo o (heteroaril)alquilo; y X es un átomo de oxígeno o un átomo de azufre;
un grupo de la fórmula:
-CH_{2}-O-CO-(arilo);
un grupo de la fórmula:
-CH_{2}- O-CO-(heteroarilo);
un grupo de la fórmula:
-CH_{2}-O-PO(R^{10})R^{11}
en la que R^{10} y R^{11} se seleccionan independientemente entre un grupo que consiste en alquilo, cicloalquilo, fenilo, fenilo sustituido, fenilalquilo y (fenilo sustituido) alquilo; y sus sales farmacéuticamente aceptables.
2. Un método para aumentar la bioproducción in vitro,que comprende poner en contacto células hospedantes que producen un producto de interés con un inhibidor de proteasa que suprime la actividad de por lo menos un miembro de la familia ICE/CED-3, aumentando así la supervivencia de las células in vitro, en el que el inhibidor de proteasa es un compuesto de fórmula 3:
44
en la que:
n es 1 ó 2;
m es 1 ó 2;
A es R^{2}CO-, R^{3}-O-CO- o R^{4}SO_{2}-;
un grupo de la fórmula:
45
en la que:
R^{1} es un átomo de hidrógeno, alquilo o fenilalquilo;
R^{2} es alquilo, cicloalquilo, (cicloalquil)alquilo, fenilo, fenilalquilo, fenilo sustituido, (fenilo sustituido)alquilo, heteroarilo o (heteroaril)alquilo;
R^{3} es alquilo, cicloalquilo, (cicloalquil)alquilo, fenilalquilo o (fenilo sustituido)alquilo;
R^{4} es alquilo, cicloalquilo, (cicloalquil)alquilo, fenilo, fenilalquilo, fenilo sustituido, (fenilo sustituido)alquilo, heteroarilo o (heteroaril)alquilo;
R^{5} es alquilo, cicloalquilo, (cicloalquil)alquilo, fenilo, fenilalquilo, fenilo sustituido, (fenilo sustituido)alquilo, heteroarilo o (heteroaril)alquilo;
R^{6} es alquilo, cicloalquilo, (cicloalquil)alquilo, fenilalquilo o (fenilo sustituido)alquilo;
R^{7} es alquilo, cicloalquilo, (cicloalquil)alquilo, fenilo, fenilalquilo; fenilo sustituido, (fenilo sustituido)alquilo, heteroarilo o (heteroaril)alquilo;
R^{8} es una cadena lateral de aminoácidos seleccionada entre el grupo que consiste en aminoácidos naturales y sintéticos;
B es un átomo de hidrógeno, un átomo de deuterio, alquilo, cicloalquilo, (cicloalquil)alquilo, fenilo, fenilalquilo, fenilo sustituido, (fenilo sustituido)alquilo, heteroarilo, (heteroaril)alquilo o halometilo;
un grupo de la fórmula:
-CH_{2}XR^{9};
en la que R^{9} es fenilo, fenilo sustituido, fenilalquilo, (fenilo sustituido)alquilo, heteroarilo o (heteroaril)alquilo; y X es un átomo de oxígeno o azufre; un grupo de la fórmula:
-CH_{2}-O-CO-(arilo);
un grupo de la fórmula:
CH_{2}-O-CO-(heteroarilo);
un grupo de la fórmula:
-CH_{2}-O-PO(R^{10})R^{11}
\newpage
en la que R^{10} y R^{11} se seleccionan independientemente entre un grupo que consiste en alquilo, cicloalquilo, fenilo, fenilo sustituido, fenilalquilo y (fenilo sustituido) alquilo; y sus sales farmacéuticamente aceptables.
3. Un inhibidor de proteasa que suprime la actividad de por lo menos un miembro de la familia de la enzima convertidora de la interleucina 1\beta (ICE)/CED-3 para uso en un método para expandir o aumentar la supervivencia de una población celular humana, que comprende poner en contacto las células con una cantidad inhibidora eficaz del inhibidor de proteasa que inhibe la apoptosis en la población celular, expandiendo o aumentando de este modo la supervivencia de la población celular, en el que el inhibidor de proteasa es un compuesto de fórmula 3:
46
n es 1 ó 2;
m es 1 ó 2;
A es R^{2}CO-, R^{3}-O-CO- o R^{4}SO_{2}-;
un grupo de la fórmula:
47
en la que:
R^{1} es un átomo de hidrógeno, alquilo o fenilalquilo;
R^{2} es alquilo, cicloalquilo, (cicloalquil)alquilo, fenilo, fenilalquilo, fenilo sustituido, (fenilo sustituido)alquilo, heteroarilo o (heteroaril)alquilo;
R^{3} es alquilo, cicloalquilo, (cicloalquil)alquilo, fenilalquilo o (fenilo sustituido)alquilo;
R^{4} es alquilo, cicloalquilo, (cicloalquil)alquilo, fenilo, fenilalquilo, fenilo sustituido, (fenilo sustituido)alquilo, heteroarilo o (heteroaril)alquilo;
R^{5} es alquilo, cicloalquilo, (cicloalquil)alquilo, fenilo, fenilalquilo, fenilo sustituido, (fenilo sustituido)alquilo, heteroarilo o (heteroaril)alquilo;
R^{6} es alquilo, cicloalquilo, (cicloalquil)alquilo, fenilalquilo o (fenilo sustituido)alquilo;
R^{7} es alquilo, cicloalquilo, (cicloalquil)alquilo, fenilo, fenilalquilo, fenilo sustituido, (fenilo sustituido)alquilo, heteroarilo o (heteroaril)alquilo;
R^{8} es una cadena latera de aminoácido seleccionada entre el grupo que consiste en aminoácidos naturales y sintéticos;
B es un átomo de hidrógeno, un átomo de deuterio, alquilo, cicloalquilo, (cicloalquil)alquilo, fenilo, fenilalquilo, fenilo sustituido, (fenilo sustituido)alquilo, heteroarilo, (heteroaril)alquilo o halometilo; un grupo de la fórmula:
-CH_{2}XR^{9};
en la que R^{9} es fenilo, fenilo sustituido, fenilalquilo, (fenilo sustituido)alquilo, heteroarilo o (heteroaril)alquilo; y X es un átomo de oxígeno o azufre; un grupo de la fórmula:
-CH_{2}-O-CO-(arilo);
un grupo de la fórmula:
-CH_{2}-O-CO-(heteroarilo);
un grupo de la fórmula:
-CH_{2}-O-PO(R^{10})R^{11}
en la que R^{10} y R^{11} se seleccionan independientemente entre un grupo que consiste en alquilo, cicloalquilo, fenilo, fenilo sustituido, fenilalquilo y (fenilo sustituido) alquilo; y sus sales farmacéuticamente aceptables.
4. El método de acuerdo con la reivindicación 1 o el inhibidor de proteasa de acuerdo con la reivindicación 3, en el que las células son células diferenciadas.
5. El método de acuerdo con la reivindicación 1 o el inhibidor de proteasa de acuerdo con la reivindicación 3, en el que las células son células precursoras.
6. El método de acuerdo con la reivindicación 1 o el inhibidor de acuerdo con la reivindicación 3, en el que las células se seleccionan entre el grupo que consiste en granulocitos, monocitos, eritrocitos, linfocitos y plaquetas.
7. El método de acuerdo con la reivindicación 1 o el inhibidor de proteasa de acuerdo con la reivindicación 3, en el que el método además comprende poner en contacto las células con un factor de crecimiento.
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