ES2219899T3 - Compuestos antimicrobios. - Google Patents

Compuestos antimicrobios.

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ES2219899T3 ES98942276T ES98942276T ES2219899T3 ES 2219899 T3 ES2219899 T3 ES 2219899T3 ES 98942276 T ES98942276 T ES 98942276T ES 98942276 T ES98942276 T ES 98942276T ES 2219899 T3 ES2219899 T3 ES 2219899T3
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Craig A. Townsend
James D. Dick
Gary R. Pasternack
Francis P. Kuhajda
Nicole M. Parrish
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Abstract

Un compuesto de fórmula: R -SOn -Z -CO -Y, en la que: R es un grupo alquilo con 62.0 átomos de carbono; Z es un radical seleccionado del grupo que se compone de O. NH, dos de estos radicales acoplados y OCH 2; CH 20; NHCH 2 y CH ZNH; Y se selecciona del grupo que se compone de -NH2-, -OCH2-C6H5, CO-CO-O-CH3, -CO2CH3 y -OCH3; y N es 1 ó 2.

Description

Compuestos antimicrobios.
Antecedentes de la invención Campo de la invención
Esta invención trata de la síntesis y la aplicación in vivo de compuestos que tienen actividad antibiótica frente a microbios que sintetizan ácido micólico, incluido Mycobacterium sp., especialmente las cepas de Mycobacterium resistentes a medicamentos, y del uso de estos compuestos para el tratamiento de cualquier microorganismo o parásito patogénico susceptible.
Revisión de las técnicas relacionadas
La aparición de cepas de Mycobacterium tuberculosis resistentes a múltiples medicamentos (MDR) y de otras micobacterias atípicas que infectan a pacientes inmunocomprometidos (por ejemplo, pacientes con SIDA) hace destacar la necesidad de un desarrollo continuo de antibióticos.
Mycobacterium sp. sintetiza una multitud de lípidos y glucolípidos complejos, únicos de este género, haciendo de estas rutas bioquímicas unas atractivas dianas para el tratamiento farmacológico (Bloch, K., "Control mechanisms for fatty acids synthesis in Mycobacterium smegmatis", Adv. Enzymol. 45:1-84, 1977; Brennan, P.J., and Nikaido, H., "The envelope of mycobacteria", Ann. Rev. Biochem. 64:29-63, 1995). La \beta-cetoacil sintasa (KS) de las sintasas Tipo II de partículas de ácidos grasos o el dominio correspondiente de las sintasas polifuncionales Tipo I de ácidos grasos cataliza la homologación crítica de dos carbonos durante la construcción de la creciente cadena de ácidos grasos. Este proceso generalmente da lugar a ácidos de C_{16} a C_{18} de largo. En la elongación de las cadenas de los ácidos grasos normales, llevada a cabo por ejemplo por las micobacterias, CoA y/o la proteína transportadora de acilo (ACP), tioésteres de estos ácidos, se hacen reaccionar con malonil-CoA para extender considerablemente su longitud hasta 60-90 carbonos. Estos ácidos de elevado peso molecular se conocen en su conjunto como ácidos micólicos.
Los ácidos micólicos son un grupo de ácidos grasos complejos, de cadena larga y ramificada que son vitales para el crecimiento y la supervivencia de las micobacterias. Los ácidos micólicos constituyen el componente mayoritario de la envoltura celular de las micobacterias. Se sabe poco acerca de la naturaleza de las enzimas de biosíntesis implicadas, pero la evidencia sugiere la existencia de alguna similitud con las sintasas convencionales de ácidos grasos (Bloch, 1977; Brennan, y col., 1995). Estas moléculas lipídicas de una longitud poco común forman una capa cerosa de permeabilidad limitada.
La presencia en micobacterias de ácidos grasos concretos modificados con estructuras complejas y bien organizadas constituye una atractiva diana potencial para el diseño de medicamentos (Young, D.B., and Duncan, K., "Prospects for new interventions in the treatment and prevention of mycobaterial disease", Ann. Rev. Microbiol. 49:641-673, 1995). Se ha sugerido que el mecanismo de acción potencial de la isoniacida es la inhibición de la síntesis de ácidos micólicos (Takayama, K., Wang, L., and David, H.L., "Effect of isoniazid on the in vivo mycolic acid synthesis, cell growth, and viability of Mycobacterium tuberculosis", Antimicrob. Agents Chemother., 2:29-35, 1972; Takayama, K., Schnoes, H.K., Armstrong, E.I., and Booyle, R.W., "Site of inhibitory action of isoniazid in the synthesis of mycolic acids in Mycobacterium tuberculosis," J. Lipid Res., 16:308-317, 1975; Quemard A., Dessen A., Sugantino M., Jacobs W.R., Sacchettini J.C., Blanchard J.S., "Binding of catalase peroxide-activated isoniazid to wild-type and mutant Mycobaterium tuberculosis enoyl-ACP reductases," J. Am. Chem. Soc., 118:1561-1562; Baldock C., Rafferty J.B., Sedenikova S.E., Baker P.J., Stuitje A.R., Slabas A.R., Hawkes T.R., Rice D.W. "A mechanism of drug action revealed by structural studies of enoyl reductase," Science, 274:2107-2110, 1996; Quemard A., Sacchettini J.C., Dessen A., Vilcheze C., Bittman R., Jacobs W.R., Blanchard J.S., "Enzymatic characterization of the target for isoniazid in Mycobacterium tuberculosis, Biochemistry," 34:8235-8241, 1993; Msluli, K., D.R. Sherman, M.J. Hickey, B.N. Kreiswirth, S. Morris, C.K. Stover, and C.E. Barry, III, "Biochemical and genetic data suggest that InhA is not the primary target for activated isoniazid in Mycobacterium tuberculosis," J. Infect. Dis., 174:1085-1090, 1996; Dessen A., A. Quemard, J.S. Blanchard, W.R. Jacobs, and J.C. Sacchettini, "Crystal structure and function of the isoniazid target of Mycobacterium tuberculosis," Science, 267:1638-1641, 1995; Banerjee, A., E. Dubnau, A. Quemard, V. Balasubramanian, K.S. Um, T. Wilson, D. Collins, G. deLisle, W.R. Jacobs, Jr., "InhA, a gene encoding a target for isoniazid and ethionamide in Mycobacterium tuberculosis." Science, 263:227-230, 1994). Se espera que este hallazgo estimule la búsqueda de nuevos compuestos que actúen sobre las rutas de síntesis de lípidos de las micobacterias como un acercamiento novedoso para el desarrollo de antibióticos. De forma sorprendente, sin embargo, la biosíntesis de lípidos no se ha explotado para el desarrollo de medicamentos en estos microorganismos. No se han desarrollado medicamentos que inhiban específicamente la síntesis de lípidos en las micobacterias, aparte de la isoniacida, permaneciendo pues una necesidad de nuevos medicamentos para tratar el problema creciente de las micobacterias resistentes a múltiples medicamentos.
Resumen de la invención
Esta invención trata de compuestos novedosos con actividad antimicrobiana, y especialmente una eficacia antimicrobiana frente a las micobacterias resistentes a múltiples medicamentos. Los compuestos conocidos a partir del documento WO 95/19706 incorporan cerulenina o un radical ácido 5-(tetradodecil)-2-furoico.
Este objetivo de la invención se consigue a través de una o más de las siguientes formas de realización. En una forma de realización, esta invención proporciona un compuesto de fórmula: R-SO_{n}-Z-CO-Y, en la que R es preferiblemente un grupo alquilo con 6-20 carbonos; Z es preferiblemente un radical seleccionado de entre -O-, y -NH-, y -OCH_{2}-, -CH_{2}O-, -NHCH_{2}- y -CH_{2}NH-; Y es preferiblemente -NH_{2}, -O-CH_{2}-C_{6}H_{5}, -CO-CO-O-CH_{3}, o -O-CH_{3}; y n es 1 ó 2.
En otra forma de realización, esta invención proporciona un procedimiento para la inhibición del crecimiento de una célula microbiana que sintetiza \beta- hidroxi ácidos grasos \alpha-sustituidos. El procedimiento comprende el tratamiento de la célula con un compuesto de fórmula: R-SO_{n}-Z-CO-Y, tal como ha sido descrita más arriba. Concretamente, las células inhibidas por el compuesto de esta invención son células que sintetizan \beta-hidroxi ácidos grasos \alpha-sustituidos seleccionados dentro del grupo que se compone de ácido corinemicólico, ácido nocárdico y ácido micólico. Preferiblemente, el procedimiento se usa para inhibir el crecimiento de células microbianas seleccionadas dentro del grupo que se compone de corynebacteria, nocardiae, rhodococcus y mycobacteria. Más preferiblemente, el procedimiento se usa para inhibir el crecimiento de células de micobacterias, como Mycobacterium tuberculosis, M. tuberculosis resistente a medicamentos, M. avium intracellulare, M. leprae o M. paratuberculosis.
En otra forma más de realización, esta invención proporciona un procedimiento para tratar una infección por micobacterias mediante la administración a un animal de una composición farmacéutica que contiene un compuesto de fórmula R-SOn-Z-CO-Y, tal como ha sido descrita más arriba.
Los presentes inventores han sintetizado y testado una serie de sulfonas y sulfóxidos con estructuras basadas en los intermedios de la reacción de la \beta-cetoacil sintasa en la síntesis de ácidos grasos. Una serie de estos compuestos han demostrado tener actividad in vitro frente a la cepa virulenta de M. tuberculosis (véase la Tabla 1). Las características deseables encontradas en los compuestos testados incluyeron: potencia, reproducibilidad de los datos de la MIC, facilidad de síntesis y estabilidad química. El uso de los compuestos de esta invención en el tratamiento farmacológico de la tuberculosis resistente a múltiples medicamentos proporcionará un medio para tratar tanto a pacientes que sufran en ese momento la enfermedad activa como a los millones de pacientes potenciales que son portadores de la enfermedad quiescente la cual se puede activar como resultado de una inmunosupresión u otra enfermedad sistémica.
Breve descripción de las figuras
La Figura 1 muestra una representación esquemática de la reacción de la \beta-cetoacil sintasa.
La Figura 2 muestra una cromatografía en capa fina bidimensional de ácidos micólicos extraídos de M. avium-intracellulare (panel de la izquierda) y el mismo extracto tras el tratamiento con n-octanosulfonilacetamida (panel de la derecha).
Las Figuras 3A y 3B muestran fotomicrografías de M. bovis BGC con (B) o sin (A) tratamiento previo con n-octanosulfonilacetamida.
Descripción detallada de las formas de realización
Los compuestos sintetizados de acuerdo con esta invención se basan en los intermedios teóricos de los estados de transición de la reacción de la \beta-cetoacil sintasa en la síntesis de ácidos grasos (E.C. 2.3.1.85). La reacción de la \beta-cetoacil sintasa es común en la síntesis de ácidos grasos en procariotas y eucariotas, incluido Mycobacteria. Se vio que la familia de compuestos mostrada en la Tabla 1 era citotóxica para una serie de micobacterias, incluidas las cepas resistentes a medicamentos. En lugar de inhibir la síntesis de ácidos grasos Tipo I/Tipo II en las micobacterias, el Compuesto HIII-50 (III-50) inhibe la síntesis de ácidos micólicos, ácidos grasos especializados que se encuentran concretamente en Mycobacteria sp. Una de las etapas clave en la síntesis de ácidos micólicos es la elongación de los ácidos grasos, la cual emplea la formación de enlaces carbono-carbono similar a la reacción de la \beta-cetoacil sintasa en la síntesis de novo de ácidos grasos. Se cree que estos compuestos actúan en esta etapa crítica para la síntesis de ácido micólico de elongación de ácidos grasos.
Se presume que los estados de transición son bastante similares en todas las reacciones de elongación de dos carbonos basándose en la existencia de evidencias bioquímicas y fundamentos mecánicos (véase la Figura 1) e implican la formación de anión acilo por decarboxilación de malonil-CoA/ACP para dar un nucleófilo (Figura 1, etapa A) que reaccione con la cadena acilo unida por un enlace tioéster para generar un intermedio tetraédrico (Figura 1, etapa B). Se espera que este producto intermedio transitorio desaparezca (Figura 1, etapa C) para aumentar la unidad acilo creciente (RCO-) en dos carbonos. Etapas posteriores reducen el grupo \beta-ceto del derivado ACP/CoA para volver finalmente a la etapa A para volver a empezar el ciclo de extensión de la cadena.
Se puede esperar que los compuestos orgánicos de bajo peso molecular, miméticos potenciales de los intermedios tetraédricos (véase la etapa B), sean inhibidores de este proceso bioquímico, y dichos compuestos están representados por la Fórmula I.
Fórmula IR-SO_{n}-Z-CO-Y,
en la que R es un hidrocarburo, como un grupo alquilo;
\hskip0,8cm
n es 1 ó 2;
\hskip0,8cm
Z es un radical hidrocarburo enlazante que puede contener un heteroátomo; e
\hskip0,8cm
Y es un grupo terminal de un radical hidrocarburo que puede contener uno o más heteroátomos.
En compuestos preferidos de acuerdo con la Fórmula I, R puede ser un grupo alquilo con 6-20 carbonos, preferiblemente 8, 10 ó 12 carbonos, y puede ser saturado o insaturado, ramificado o no ramificado. Z es preferiblemente -NH-CH_{2}-, -CH_{2}-NH-, -O-CH_{2}- o -CH_{2}-O- e Y es preferiblemente -NH_{2}, -O-CH_{2}-C_{6}H_{5}, -CO-O-CH_{3}, -CO-CO-O-CH_{3}o -O-CH_{3}. Entre R y Z hay un átomo de azufre en forma de sulfóxido o sulfona. La sulfona III-50 y los análogos estructurales cercanos de la misma con cadenas laterales alquilo más cortas y más largas, saturadas e insaturadas, así como miméticos alternativos del intermedio tetraédrico de la etapa B están ilustrados, pero no exclusivamente representados, por las estructuras que se muestran en la Tabla 1.
Los compuestos de Fórmula I pueden ser sintetizados por varias rutas incluyendo la alquilación de un mercaptoéster para producir un tioéster (véase, por ejemplo, R. L. Smith et al. J. Med. Chem., 1977, 20:540-547), seguida de una oxidación para dar un sulfóxido o una sulfona y la conversión del éster en una amida con amoniaco o una amina sustituida. Un esquema de una síntesis adecuada se muestra en el Esquema 1 y se ilustra en el Ejemplo 1.
Esquema 1
1
De forma alternativa, una sal de un sulfonato, por ejemplo la sal de sodio, se puede hacer reaccionar con un haloéster para dar una sulfona (es decir, R-SO_{2}-Na^{+} + X-(CH_{2})_{n}-COOR' \rightarrow R-SO_{2}-(CH_{2})_{n}-COOR'; véase, por ejemplo, E. Gipsein, C.G. Willson and H.S. Sachdev, J. Org. Chem., 1980, 45:1486-1489), a la cual se puede añadir amoniaco para dar la amida correspondiente, al igual que anteriormente. Generalmente, X = Cl, Br o I. Una segunda alternativa sería la reacción de una haloamida (X-(CH_{2})_{n}-CONH_{2}) bien con la sal de un sulfonato, como más arriba, bien con un anión tiolato seguido de una oxidación para producir de manera similar la sulfonilamida o la sulfóxido amida (véase, por ejemplo, S. Huening and O. Boes, Liebigs Annalen der Chemie, 1953, 579:23-26). Será evidente para el experto en la materia que el sentido de estas reacciones puede verse invertido de forma que se puede hacer reaccionar un halohidrocarburo con una mercaptoamida o la sal de una sulfenilamida o un sulfeniléster para obtener los mismos productos. Una tercera alternativa sería la reacción de un tiol (R-SH) con un éster o amida de propiolato para formar un éster de sulfanilacrílico seguida de la oxidación para dar el sulfóxido o la sulfona. Por último, se puede hacer reaccionar un halo- o mercaptonitrilo siguiendo los esquemas anteriores para dar tioéteres o sulfonilnitrilos, que pueden ser hidrolizados para dar las amidas. También se contemplan dentro de esta invención los productos de la síntesis a través de otras rutas de síntesis que pudieran ocurrírsele al experto en la materia para producir los compuestos de Fórmula I.
Los compuestos de acuerdo con la Fórmula I se pueden usar como antibióticos frente a microorganismos que tengan en su pared celular \beta-hidroxi ácidos grasos \alpha-sustituidos, como los ácidos corinemicólicos (por ejemplo, C30), los ácidos nocárdicos (por ejemplo, C50) o los ácidos micólicos (por ejemplo, C90). A menos que se indique lo contrario, el uso del término "ácidos micólicos" en la presente invención hace referencia a cualquiera de esos \beta-hidroxi ácidos grasos \alpha-sustituidos de cadena larga. En concreto, los compuestos de acuerdo con la Fórmula I exhiben una actividad antibiótica frente a corynebacteria, nocardiae, rhodococcus y mycobacteria. Más concretamente, estos compuestos son eficaces frente a Mycobacterium tuberculosis, M. tuberculosis resistente a medicamentos, M. avium intracellulare, M. leprae o M. paratuberculosis.
Los compuestos preferidos de acuerdo con la Fórmula I tendrán una actividad antibiótica sustancial frente a microorganismos susceptibles (véase, por ejemplo, la Tabla 1). La eficacia antibiótica de los compuestos de acuerdo con la Fórmula I puede ser determinada tal como se describe más abajo o mediante el uso de los ensayos descritos en la Patente U.S. No. 5,614,551, la cual se incluye en la presente invención tomándola como referencia. En concreto, la Patente U.S. 5,614,551 describe un índice terapéutico in vitro que se basa en la comparación entre la concentración que inhibe el crecimiento de fibroblastos normales y la concentración mínima inhibitoria para un compuesto dado, y los compuestos preferidos tendrán un índice terapéutico in vitro de al menos 2, más preferiblemente de al menos 5, y más preferiblemente aún de al menos 10.
El tratamiento farmacológico novedoso, usando compuestos de esta invención que son eficaces frente a las tuberculosis resistentes a múltiples medicamentos, ayudarán a tratar tanto a los pacientes que sufren en ese momento la enfermedad activa como a los millones de pacientes potenciales portadores de la enfermedad quiescente, que puede hacerse activa como resultado de una inmunosupresión u otra enfermedad sistémica. Estos medicamentos también serán útiles frente a más "micobacterias atípicas" como M. avium-intracellulare, un patógeno frecuente en el SIDA, y otras especies que son con frecuencia resistentes a medicamentos. Dada la similitud bioquímica entre M. tuberculosis y M. leprae, se espera que estos medicamentos sean eficaces en el tratamiento de la lepra (enfermedad de Hansen). Su uso potencial en ganado u otras aplicaciones veterinarias incluye el tratamiento de infecciones por Mycobacterium paratuberculosis, también conocido como bacilo de Johne, un microorganismo que produce una enteritis crónica en rumiantes (por ejemplo, ganado bovino y ovino), que es invariablemente fatal, y Rhodococcus, otro microorganismo que produce ácidos micólicos así como infecciones respiratorias potencialmente fatales en caballos y pacientes inmunocomprometidos. El tratamiento de pacientes humanos infectados por M. paratuberculosis también se encuentra dentro del alcance de esta invención.
El tratamiento de acuerdo con esta invención implica la administración del compuesto de Fórmula I al sujeto a tratar. Las composiciones farmacéuticas que contienen cualquiera de los compuestos de esta invención se pueden administrar por vía parenteral (subcutánea, intramuscular, intravenosa, intraperitoneal, intrapleural, intravesicular o intratecal), tópica, oral, rectal o nasal o por vía inhalada, según sea necesario en función del medicamento y el vehículo farmacéutico elegido y la enfermedad.
Los compuestos terapéuticos de acuerdo con esta invención se formulan preferiblemente en forma de composiciones farmacéuticas que contienen el compuesto y un vehículo farmacéuticamente aceptable. Las concentraciones del principio activo en los vehículos farmacéuticamente aceptables dependerán de las solubilidades. La dosis empleada en una formulación o aplicación concreta se determinará según los requerimientos de un tipo concreto de enfermedad y las restricciones impuestas por las características y las capacidades de los materiales vehículo. La composición farmacéutica puede contener otros componentes siempre que los otros componentes no reduzcan tanto la eficacia del compuesto de acuerdo con la invención como para que el tratamiento se vea anulado. Los vehículos farmacéuticamente aceptables son bien conocidos y un experto en farmacia puede seleccionar fácilmente vehículos adecuados para vías de administración concretas (véase, por ejemplo, Remington's Pharmaceutical Sciences, Mack Publishing Co., Easton, PA, 1985).
La dosis y la duración del tratamiento dependerán de varios factores, incluyendo el índice terapéutico de los medicamentos, el tipo de enfermedad, la edad del paciente, el peso del paciente, y la tolerancia a la toxicidad. La dosis se elegirá generalmente para alcanzar concentraciones séricas de aproximadamente 1 ng a aproximadamente 100 \mug/ml, generalmente 0,1\mug/ml a 10 \mug/ml. Preferiblemente, los niveles de dosis iniciales se seleccionarán basándose en su capacidad para alcanzar concentraciones ambiente que han demostrado ser eficaces en modelos in vitro y modelos in vivo y en ensayos clínicos, hasta los niveles máximos tolerados. La dosis de un medicamento concreto y la duración del tratamiento en un paciente concreto puede ser determinada por el médico experimentado usando un abordaje farmacológico estándar teniendo en cuenta los factores anteriores. La respuesta al tratamiento puede ser monitorizada mediante el análisis de los niveles en sangre o fluidos corporales del compuesto de acuerdo con esta invención, la determinación de la actividad del compuesto o sus niveles en tejidos relevantes o bien monitorizando el estado de la enfermedad en el paciente. El médico experto ajustará la dosis y la duración del tratamiento basándose en la respuesta al tratamiento revelada por estas determinaciones.
Generalmente, las composiciones descritas más arriba se combinarán o se usarán junto con o coordinadas con una o más sustancias terapéuticas adicionales, por ejemplo, otros medicamentos usados en la actualidad en el tratamiento de la tuberculosis. El compuesto de Fórmula I, o una combinación sinérgica de inhibidores, se administrará por supuesto en un nivel (basándose en la dosis y la duración del tratamiento) por debajo del nivel que mataría al animal que se está tratando. Preferiblemente, la administración se hará a un nivel que no dañará de forma irreversible los órganos vitales, o que no llevará a una disminución permanente de la función hepática, la función renal, la función cardiopulmonar, la función gastrointestinal, la función genitourinaria, la función integumentaria, la función musculoesquelética o la función neurológica. Por otro lado, no se excluye necesariamente la administración de inhibidores a un nivel que mata algunas células que serán posteriormente regeneradas (por ejemplo, las células endometriales).
Ejemplos Ejemplo 1 Síntesis de sulfonilamidas substituidas
Para ilustrar el procedimiento de síntesis mostrado en el Esquema 1, se llevó a cabo la síntesis de 25 g de III-50.
n-octiltioacetato de metilo
En un matraz de fondo redondo de 1L se puso bromuro de octilo (50,21 g, 0,26 mol), tioglicoato de metilo (22,35 ml, 26,53 g, 0,25 mol) y potasio carbonato (34,5 g, 0,25 mol). Se añadieron a esta mezcla 350 ml de acetona y la suspensión se llevó a reflujo durante 48 h. Tras enfriarse a temperatura ambiente, la mezcla de la reacción se filtró con la ayuda de acetona. El filtrado se evaporó bajo presión reducida y el residuo así obtenido se purificó por destilación bajo presión reducida. Se recogió la fracción destilada a 118-121ºC / 3,8 mmHg. Rendimiento: 48 g; 88%.
IR (puro): 2924, 1736, 1435, 1278, 1133, 1011 cm^{1}.
RMN ^{1}H (CDCl_{3}): \delta 3,64 (s, 3H), 3,13 (s, 2H), 2,52 (t, 2H, J= 7,2 Hz), 1,47 (m, 2H), 1,2-1,4 (m, 10H), 0,88 (t, 3H, J= 6,8 Hz).
RMN ^{13}C (CDCl_{3}): \delta 13,9, 22,5, 28,6, 29,0, 29,02, 31,6, 32,5, 33,3, 52,1, 171,0.
n-Octanosulfonilacetato de metilo
En un matraz de fondo redondo de tres bocas de 3 L (equipado con un agitador mecánico) se pusieron, de forma secuencial, heptamolibdato de amonio tetrahidrato (56 g, 0,045 mol), n-octiltioacetato de metilo (40 g, 0,183 mol) y 1,5 L de alcohol absoluto (Schultz, HS, Freyermuth, HB, and Buc, SR, J. Org. Chem., 28:1140-1142, 1963). La solución agitada enérgicamente se enfrió a 0ºC y a esta solución enfriada se añadieron 104 ml de una solución de peróxido de hidrógeno al 30% (0,732 mol) a lo largo de un periodo de 1 h. Se dejó que la mezcla de la reacción se calentara hasta la temperatura ambiente a lo largo de un periodo de 2 h y se agitó de nuevo durante 24 h más; en este momento la cromatografía en capa fina sobre sílice mostró la desaparición completa del material de partida. La mezcla de la reacción se filtró y el filtrado se evaporó bajo presión reducida. El residuo así obtenido se disolvió en acetato de etilo (1 L) y se lavó con agua (100 ml \times 2) y con una solución salina (100 ml). La fase orgánica se secó sobre MgSO_{4} anhidro y, tras filtrar los solventes, se evaporó bajo presión reducida para obtener la sulfona en forma de sólido ceroso, 36 g, 78%. El producto aparecía como puro (>95%) por RMN y se sometió a la siguiente reacción sin más purificaciones.
IR (puro): 2919, 2848, 1743, 1460, 1437, 1329, 1278, 1137, 1108, 1010, 912, 723 cm^{-1}.
RMN ^{1}H (CDCl_{3}): \delta 3,96 (s, 2H), 3,79 (s, 3H), 3,21 (t, 3H, J = 8 Hz), 1,80 (m, 2H), 1,20-1,45 (m, 10H), 0,81 (t, 3H, J= 6,7 Hz).
RMN ^{13}C (CDCl_{3}): \delta 13,9, 21,7, 22,4, 28,2, 28,7, 28,8, 31,5, 53,1, 53,4, 57,0, 163,4.
n-Octanosulfonilacetamida
Una solución de n-octanosulfonilacetato de metilo (35 g, 0,143 mol) en 350 ml de metanol anhidro se agitó magnéticamente a temperatura ambiente. A esta solución se añadieron 24 ml de hidróxido de amonio acuoso (27%, 6,48 g, 0,185 mol) gota a gota a lo largo de un periodo de 30 minutos. La solución se agitó durante 24 h y el precipitado blanco formado se filtró. El sólido se recristalizó a partir de acetato de etilo caliente para obtener la acetamida III-50 requerida en forma de sólido cristalino, punto de fusión 140-142ºC, 33 g, 97,6%.
IR (puro): 3386, 2920, 1659, 1420, 1315, 1286, 1129 cm^{-1}.
RMN ^{1}H (CDCl_{3}): \delta 6,56 (br s, 1H, NH), 5,69 (br s, 1H, NH), 3,86 (s, 2H), 3,14 (app 1:1:1 triplete, J app = 8,0 Hz, 2H), 2,16 (m, 2H), 1,1-1,3 (m, 12H), 0,86 (t, J = 7,1 Hz, 3H).
RMN ^{13}C (CD_{3}COCD_{3}): \delta 14,7, 22,9, 23,6, 29,4, 30,1, 30,15, 30,8, 32,8, 54,0, 164,8.
HRMS se calculó para C_{10}H_{25}N_{2}O_{3}S (M+NH_{4}^{-}) 253,1586, hallada 253,1587.
Ejemplo 2 Síntesis de sulfonilamidas sustituidas
Para ilustrar los procedimientos de síntesis mostrados en el Esquema 2 más abajo, se llevaron a cabo las síntesis de los siguientes compuestos: I-31 y I-89.
Esquema 2
2
Ester de metilo del ácido (E/Z)-3-decilsulfanil-acrílico (1)
Se añadió trietilamina (0,5 ml, 3,6 mmol) gota a gota a una solución de decanotiol (2,5 ml, 12,1 mmol) y propiolato de metilo (4,3 ml, 48,3 mmol) en diclorometano (20 ml). La solución se agitó a temperatura ambiente durante 20 minutos bajo una atmósfera de argón, tras lo cual se diluyó con agua (60 ml) y se extrajo con diclorometano (3 \times 60 ml). La fase orgánica se lavó con agua (2 \times 60 ml), con una solución salina (60 ml), se secó sobre sulfato de magnesio anhidro, y se concentró al vacío. La purificación por cromatografía ultrarrápida (gel de sílice, acetato de etilo: hexanos 1:49) produjo un aceite transparente (3,06 g, 98%) en forma de una mezcla de isómeros (E:Z, 6:1), que se sometió a la siguiente etapa.
Isómero E: IR (puro, cm^{-1}): 2920, 2848, 1712, 1580, 1460, 1430, 1300, 1255, 1215, 1160, 1041, 1015, 945, 827, 715, 697.
RMN ^{1}H (CDCl_{3}): \delta 0,88 (t, 3H, J = 6,7Hz), 1, 26 (bs, 12H), 1,40 (m, 2H), 1,67 (quint, 2H, J = 7,3 Hz), 2,78 (t, 2H, J = 7,4 Hz), 3,72 (s, 3H), 5,74 (d, 1H, J = 15,2 Hz), 7,70 (d, 1H, J = 15,2).
Isómero Z: IR (puro, cm^{-1}): 2920, 2848, 1712, 1580, 1460, 1430, 1300, 1255, 1215, 1160, 1041, 1015, 945, 827, 715, 697.
RMN ^{1}H (CDCl_{3}): \delta 0,88 (t, 3H, J = 6,7 Hz), 0,9-1,9 (app. s y varios m, 16H), 2,77 (t, 2H, J = 7,4 Hz), 3,75 (s, 3H), 5,85 (d, 1H, J = 10,2 Hz), 7,10 (d, 1H, J = 10,2 Hz).
Ester de metilo del ácido (E)-3-decilsulfanil-acrílico (2)
El compuesto 1 (0,50 g, 1,93 mmol) se disolvió en metanol (8,0 ml) y se enfrió hasta 0ºC, se añadió a una solución de oxona (1,84 g, 6,0 mmol) en agua (8,0 ml, 49,5%) a 0ºC y se agitó durante 4 h a temperatura ambiente. La reacción se diluyó entonces con agua (60 ml) y se extrajo con cloroformo (3 \times 60 ml). El extracto orgánico se lavó con agua (2 \times 60 ml), con una solución salina (60 ml), se secó sobre sulfato de magnesio anhidro y se concentró al vacío. La purificación por cromatografía ultrarrápida (gel de sílice, acetato de etilo:hexanos 1:1) produjo unos cristales blancos (0,53 g, 93%) en forma de mezcla de isómeros (E:Z, 6:1). La purificación por TLC preparativa (acetato de etilo:hexanos 1:1) dio lugar al compuesto 2 en forma de cristales blancos.
Punto de fusión 62-63ºC; IR (CH_{2}Cl_{2}, cm^{-1}): 3060, 2950, 2920, 2845, 1730, 1470, 1435, 1280, 1230, 1165, 1130, 995, 965, 815, 765, 690, 573.
RMN ^{1}H (CDCl_{3}): \delta 0,88 (t, 3H, J = 6,7Hz), 1,27 (bs, 12H), 1,43 (m, 2H), 1,80 (sym. m, 2H), 3,05 (sym. m, 2H) 3,86 (s, 3H), 6,88 (d, 1H, J = 15,3 Hz), 7,34 (d, 1H, J = 15,3 Hz). Calculada para C_{14}H_{26}O_{4}S: C, 57,90, H, 9,02, S, 11,04. Hallada: C, 57,94, H, 9,12, S, 11,16.
Propiolamida (3)
Se añadió propiolato de metilo (2,0 ml, 22,5 mmol) a amoniaco líquido a -78ºC y se agitó durante 2 horas. La evaporación a temperatura ambiente dio lugar al compuesto 3 en forma de cristales blancos (1,46 g, 94%).
Punto de fusión 58-61ºC (lit.[5], 61-62ºC); RMN ^{1}H (D_{2}O) \delta 3,50 (s, 1H), 4,43 (bs, 2H).
(E/Z)-3-decilsulfanil-propionamida (4)
se añadió trietilamina (0,5 ml, 3,6 mmol) gota a gota a una solución de decanotiol (1,36 ml, 6,56 mmol) y propiolamida (1,80 g, 26,1 mmol) en diclorometano (20 ml). La solución se agitó a temperatura ambiente durante 20 min. bajo una atmósfera de argón, tras lo cual se diluyó con agua (60 ml) y se extrajo con diclorometano (3 \times 60 ml). La fase orgánica se lavó con agua (2 \times 60 ml), con una solución salina (60 ml), se secó sobre sulfato de magnesio anhidro y se concentró al vacío. La purificación por cromatografía ultrarrápida (gel de sílice, acetato de etilo:hexanos 3:1) dio lugar al compuesto 4 en forma de cristales blancos (1,45 g, 91%) como una mezcla de isómeros (E:Z; 1:10), la cual se sometió a la siguiente etapa.
Mezcla de isómeros: punto de fusión 65-70ºC; IR (CH_{2}Cl_{2}, cm^{-1}): 3400, 3330, 3280, 3200, 2920, 2840, 1725, 1650, 1570, 1460, 1400, 1300, 1190, 770.
Isómero E: RMN ^{1}H (CDCl_{3}) \delta 0,89 (t, 3H, J = 6,8 Hz), 1, 27 (bs, 12 H), 1,41 (m, 2H), 1,70 (m, 2H), 2,74 (t, 2H, J = 7,5 Hz), 5,4 (bs, 2H, NH_{2}), 5,82 (d, 1H, J = 10,1 Hz), 6,95 (d, 1H, J = 10,1 Hz).
(E)-3-decilsulfonil-propionamida (5)
El compuesto 4 (0,50 g, 2,05 mmol) se disolvió en metanol (8,0 ml), se enfrió hasta 0ºC y se añadió a una solución de oxona (1,84 g, 6,0 mmol) en agua (8,0 ml, 49,5%) a 0ºC y se agitó durante 4 h a temperatura ambiente. La solución se diluyó entonces con agua (60 ml) y se extrajo con cloroformo (3 \times 60 ml). El extracto orgánico se lavó con agua (2 \times 60 ml), con una solución salina (60 ml), se secó sobre sulfato de magnesio y se concentró al vacío. La purificación por cromatografía ultrarrápida (gel de sílice, acetato de etilo:hexanos 17:3) dio lugar al compuesto 5 en forma de cristales blancos (0,52 g, 92%) como una mezcla de isómeros (E:Z, 6:1). La purificación por TLC preparativa (acetato de etilo:hexanos 3:1) dio lugar al compuesto 5 en forma de cristales blancos.
Punto de fusión 148-149ºC; IR (CHCl_{3}, cm^{-1}): 3390, 3140, 3060, 2920, 2840, 1700, 1615, 1455, 1395, 1320, 1130, 960, 814.
RMN ^{1}H (CDCl_{3}) \delta 0,089 (t, 3H, J = 6,8 Hz), 1,27 (bs, 12H), 1,43 (m, 2H), 1,80 (m, 2H), 3,05 (sym. m, 2H) 5,67 (bs, 1H, NH), 5,85 (bs, 1H, NH), 6,94 (d, 1H, J = 14,8 Hz), 7,35 (d, 1H, J = 14,8 Hz).
Calculada para C_{13}H_{25}NO_{3}S: C, 56,70, H, 9,15, N, 5,09, S, 11,64. Hallada: C, 56,78, H, 9,16, N, 5,04, S, 11,76.
Ejemplo 3 Actividad in vitro de las sulfonas y sulfóxidos frente a las micobacterias
Se testaron varios compuestos tal como está descrito en la Patente U.S. No. 5,614,551 para determinar las concentraciones mínimas inhibitorias (MIC) de los compuestos frente a MTB (M. tuberculosis cepa H37Rv) resistente a medicamentos, M. avium-intracellular y M. bovis BCG. Los resultados se muestran en la Tabla 1. Las curvas de dosis-respuesta para el compuesto llamado III-50 han mostrado una MIC de 6,5 \mug/ml frente a la cepa virulenta de M. tuberculosis, H37Rv, y de 6,25 \mug/ml frente a M. Boris BCG. Las curvas de dosis-respuesta para el compuesto designado S-I-73 han mostrado una MIC de 3,12 \mug/ml frente a MTB y de 12,50 \mug/ml frente a M. avium-intracellular. Las pruebas que usaban un compuesto de acuerdo con la Fórmula I con R = C_{8}H_{17}, Z = NH e Y = -CO-O-CH_{3} frente a M. tuberculosis, H37Rv, mostraron una MIC de 12,5 \mug/ml.
Ejemplo 4 III-50 inhibe la síntesis de ácido micólico a través de una diana diferente de la de la isoniacida
En una serie de experimentos de marcaje metabólico, se estudió la actividad de diversas rutas metabólicas de lípidos en presencia y ausencia de III-50 utilizando cromatografía en capa fina bidimensional y cuantificación con fósforo. Las placas de TLC se salpicaron con metanolisados de ácidos de micobacterias y se revelaron en la primera dirección con éter de petróleo (bp 60-80ºC) : acetona (95:5, v/v, 3 veces) y en la segunda dirección con tolueno : acetona (97:3, v/v, una sola vez). Las abreviaturas en la Figura 2 significan: Ori = origen; A = \alpha-micolato; B = cetomicolato; y C = \omega-micolato. El panel de la izquierda muestra metanolisados de ácidos de cultivos control de M. avium-intracellulare. El panel de la derecha muestra metanolisados de ácidos de cultivos de M. avium-intracellulare tratados con 12,5 \mug/ml de n-octanosulfonilacetamida (III-50).
Mientras que se observaron alteraciones cualitativas y cuantitativas menores en varias especies de lípidos, el efecto más profundo se observó en la síntesis de ácido micólico. Las reproducciones del revelado con fósforo (Figura 2) demuestran que, en presencia de III-50, los ácidos micólicos son indetectables en M. avium-intracellulare y se encuentra significativamente reducidos en M. bovis BCG. Y aún más importante, mientras que se cree que la inhibición de la síntesis de ácido micólico es el mecanismo de acción de la isoniacida (Takayama y col., 1972 & 1975; Quemard, y col., 1993 & 1996; y Baldock, y col.), III-50 inhibe tanto el crecimiento de M. avium-intracellulare, el cual suele ser resistente a la isoniacida (>2,5 \mug/ml), como el de M. tuberculosis resistente a isoniacida (INH) (>0,4 \mug/ml). De este modo, aunque tanto la isoniacida como III-50 inhiben la síntesis de ácido micólico, la diana enzimática de III-50 dentro de la ruta de síntesis de ácido micólico parece ser diferente de la de la isoniacida.
La inhibición de la síntesis de ácido micólico lleva a la alteración de la pared celular de las micobacterias. La Figura 3 muestra micrografías electrónicas que representan la división celular de M. bovis BCG en presencia (Panel A) y ausencia (Panel B) de III-50. Nótese, en el control, las paredes celulares y el septo bien desarrollados a medida que se divide la bacteria. Por el contrario, en presencia de III-50, se produce una interrupción de la pared celular probablemente como resultado de la inhibición de la síntesis de ácido micólico.
TABLA 1 Actividad In Vitro de las Sulfonas y Sulfóxidos frente a M.tuberculosis
3

Claims (10)

1. Un compuesto de fórmula:
R-SO_{n}-Z-CO-Y,
en la que:
R
es un grupo alquilo con 6-20 átomos de carbono;
Z
es un radical seleccionado del grupo que se compone de -O-, -NH-, dos de estos radicales acoplados y -OCH_{2}-, -CH_{2}O-, -NHCH_{2} y -CH_{2}NH-;
Y
se selecciona del grupo que se compone de -NH_{2}-, -OCH_{2}-C_{6}H_{5}, CO-CO-O-CH_{3}, -CO_{2}CH_{3} y -OCH_{3}; y
N
es 1 ó 2.
2. Un compuesto de acuerdo con la reivindicación 1, en el que R es un grupo alquilo ramificado.
3. Un compuesto de acuerdo con la reivindicación 1 o la reivindicación 2, en el que R es un grupo alquilo con 8, 10 ó 12 átomos de carbono.
4. El uso de un compuesto de fórmula:
R-SO_{n}-Z-CO-Y,
en la que:
R
es un grupo alquilo con 6-20 átomos de carbono;
Z
es un radical seleccionado del grupo que se compone de -CH_{2}-, -O-, -NH-, dos de estos radicales acoplados y -CH=CH-;
Y
se selecciona del grupo que se compone de -NH_{2}-, -OCH_{2}-C_{6}H_{5}, -CO-CO-O-CH_{3}, -CO_{2}CH_{3} y -OCH_{3};y
N
es 1 ó 2.
en la preparación de un medicamento para inhibir el crecimiento de una célula microbiana, en el que la célula sintetiza \beta-hidroxi ácidos grasos \alpha-sustituidos.
5. Uso de acuerdo con la reivindicación 4, en el que el \beta-hidroxi ácido graso \alpha-sustituido se selecciona del grupo que se compone de ácido corinemicólico, ácido nocárdico y ácido micólico.
6. Uso de acuerdo con la reivindicación 4 o la reivindicación 5, en el que la célula microbiana se selecciona del grupo que se compone de corynebacteria, nocardiae, rhodococcus y mycobacteria.
7. Uso de acuerdo con la reivindicación 6, en el que la micobacteria es Mycobacterium tuberculosis, M. tuberculosis resistente a medicamentos, M. avium intracellulare, M. leprae o M. paratuberculosis.
8. Un compuesto de fórmula:
R-SO_{n}-Z-CO-Y,
en la que:
R
es un grupo n-alquilo de 10 átomos de carbono;
Z
es -CH_{2}-;
Y
es -NH_{2}-CH_{2}CH_{2}OH; y
N
es 2.
9. El uso de un compuesto de fórmula:
R-SO_{n}-Z-CO-Y,
en la que:
R
es un grupo n-alquilo de 10 átomos de carbono;
Z
es -CH_{2}-;
Y
es -NH_{2}-CH_{2}CH_{2}OH; y
N
es 2.
en la preparación de un medicamento para inhibir el crecimiento de una célula microbiana, en el que la célula sintetiza \beta-hidroxi ácidos grasos \alpha-sustituidos.
10. Un compuesto de acuerdo con la reivindicación 1 o la reivindicación 8, para su uso como tratamiento.
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