ES2218562T3 - Composicion pesticida que comprende delta-endotoxina de bacillus thurigiensis quimerico cryif y bacillus thurigiensis quimerico cryia(c). - Google Patents

Composicion pesticida que comprende delta-endotoxina de bacillus thurigiensis quimerico cryif y bacillus thurigiensis quimerico cryia(c).

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ES2218562T3 ES95944316T ES95944316T ES2218562T3 ES 2218562 T3 ES2218562 T3 ES 2218562T3 ES 95944316 T ES95944316 T ES 95944316T ES 95944316 T ES95944316 T ES 95944316T ES 2218562 T3 ES2218562 T3 ES 2218562T3
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Abstract

SE DESCRIBEN COMPOSICIONES Y PROCEDIMIENTOS PARA CONTROLAR PLAGAS DE LEPIDOPTEROS. ESTAS COMPOSICIONES INCLUYEN COMBINACIONES SINERGICAS DE LAS DE -ENDOTOXINAS CRYLF QUIMERICA Y CRYLA(C) QUIMERICA DE BACILLUS THURINGIENSIS. SE HA DESCUBIERTO QUE ESTAS COMPOSICIONES MUESTRAN UNA EXCELENTE ACTIVIDAD CONTRA PLAGAS DE LEPIDOPTEROS.

Description

Composición pesticida que comprende \delta-endotoxina de bacillus thurigiensis quimérico CryIF y bacillus thurigiensis quimérico CryIA(c).
Antecedentes de la invención
El microbio del suelo Bacillus thuringiensis (B.t.) es una bacteria gram-positiva formadora de esporas caracterizada por inclusiones cristalinas proteicas paraesporales. Estas inclusiones aparecen a menudo como cristales microscópicos y característicamente formados. Las proteínas pueden ser altamente tóxicas para las plagas y específicas en su actividad tóxica. Se han aislado y secuenciado, en ciertos genes de toxinas de B.t. y los productos basados en DNA recombinante de B.t. se han producido y aprobado para su uso. Además, con el uso de técnicas de ingeniería genética, están en desarrollo nuevos enfoques para administrar estas endotoxinas de B.t. a ambientes agrícolas, incluyendo el uso de plantas genéticamente modificadas con genes de endotoxina para la resistencia a insectos y el uso de células microbianas intactas estabilizadas como portadores de administración de endotoxinas (Gaertner, F.H., L. Kim [1988] TIBTECH 6:S4-S7). Así, los genes de endotoxinas de B.t. aislados están llegando a ser valiosos comercialmente.
Hasta los últimos diez años, el uso comercial de los pesticidas B.t. se ha restringido grandemente a un estrecho grupo de plagas de lepidópteros (orugas). L preparación de esporas y cristales de B. thuringiensis de la subespecie kurstaki se han usado durante muchos años como insecticidas comerciales para plagas de lepidópteros. Por ejemplo, B. thuringiensis de la variedad de kurstaki HD-1 produjeron un cristal llamado \delta-endotoxina el cual es tóxico para las larvas de un número de insectos lepidópteros.
En años recientes, sin embargo, los investigadores han descubierto pesticidas de B.t. con especificidades para un grupo de plagas mucho más amplio. Por ejemplo, otras especies de B.t., a saber israelensis y tenebrionis (a.k.a. B.t. M-7, a.k.a. B.t san diego), se han usado comercialmente para controlar insectos de los órdenes Dípteros y Coleópteros, respectivamente (Gaertner, F.H. [1989] "Cellular Delivery Systems for Insecticidal Proteins: Living and Non-Living Microorganisms", in Controlled Delivery of Crop Protection Agents, R.M. Wilkins, ed., Taylor and Francis, Nueva York y Londres, 1990, páginas 245-255). Véase también Couch, T.L. (1980) "Mosquito Pathogenicity of Bacillus thurigiensis variedad isralelensis", Developments in Industrial Microbiology 20:97-104, Krieg A., A.M. Huger, G.A. Langenbruch, W. Schnetter (1983) Z. Ang. Ent. 96: 500-508, describe Bacillus thurigiensis variedad tenebrionis, la cual según se dice es activa contra dos escarabajos del orden Coleópteros. Son el escarabajo patatero de Colorado, Leptinotarsa decemleneata, y Angelastica alni).
Recientemente, se han identificado nuevas subespecies de B.t., y se han aislado los genes responsables de las proteínas \delta-endotoxina (Höfte, H., H.R. Whiteley [1989] Microbiological Reviews 52(2):242- 255). Höfte y Whiteley clasificaron los genes de las proteínas cristalinas de B.t en 4 clases principales. Las clases fueron CyrI (específicos contra lepidópteros), CryII (específicos para lepidópteros y dípteros), CryIII (específicos para coleópteros) y CryIV (específicos para dípteros). Se ha notificado el descubrimiento de cepas específicamente tóxicas para otras plagas (Feitelson, J.S., J. Payne, L. Kim [1992] Bio/Technology 10:271-275).
La clonación y expresión de un gen de proteína cristalina de B.t. en Eschirichia coli se ha descrito en la literatura publicada (Schnepf, H.E., H.R. Whiteley [1981] Proc. Natl. Acad. Sci. USA 78: 2893-2897). La patente de los Estados Unidos Nº. 4.448.885 y la patente de los Estados Unidos 4.467.036 describen ambas la expresión de una proteína cristalina de B.t. en Escherichia coli. Se han construido genes híbridos de proteínas cristalinas que presentan toxicidad incrementada y muestran un amplio intervalo de hospedadores para una plaga diana. Véanse las patentes de los Estados Unidos Nº^{s}. 5.128.130 y 5.055.294. Las patentes de los Estados Unidos Nº^{s}. 4.797.276 y 4.853.331 describen la cepa de B. thuringiensis san diego (a.k.a. B.t. tenebrionis, a.k.a. M-7), la cual se usó para controlar plagas de coleópteros en varios ambientes. La patente de los Estados Unidos Nº. 4.849.217 describe aislados de B.t. que tiene actividad contra el escarabajo picudo de la alfalfa. La patente de los Estados Unidos Nº. 5.151.363 y la patente de los Estados Unidos Nº. 4.948.734 describen ciertos aislados de B.t. los cuales tiene actividad contra nemátodos.
Como resultado de una búsqueda extensa y de la inversión de recursos, se han distribuido otras patentes para nuevos aislados de B.t. y nuevos usos de aislados conocidos de B.t. Sin embargo, el descubrimiento de nuevos aislados de B.t. y nuevos usos de aislados conocidos de B.t. permanece como una técnica empírica e impredecible.
Una mayoría de las moléculas de proteínas cristalinas de \delta-endotoxina de Bacillus thurigiensis se compone de dos segmentos funcionales. El núcleo de la toxina resistente a proteasas es el primer segmento, y corresponde aproximadamente a la primera mitad de la molécula de proteína. Se conoce la estructura tridimensional de un segmento núcleo de una \delta-endotoxina de B.t. CryIIIA y se propone que todas las toxinas relacionadas tienen la misma estructura general (Li, J., J. Carroll, D.J. Ellar [1991] Nature 353: 815-821). La segunda mitad de la molécula es el segundo segmento. Para los propósitos de esta solicitud, el segundo segmento se referirá en este documento como el "segmento protoxina". Se cree que el segmento protoxina participa en la formación de cristales de toxinas (Arvidson, H., P.E. Dunn, S. Strand, A.I. Aronson [1989] Molecular Microbiology 3: 1533-1534; Choma, C.T., W.K. Suewicz, P.R. Carey, P. Pozsgay, T. Raynor, H. Kaplan [1990] Eur. J. Biochem. 189: 523-527). La molécula completa de toxina de 130 kDa se procesa rápidamente al segmento núcleo mediante proteasas en el intestino del insecto. El segmento protoxina puede así conferir una parcial especificidad de insecto para la toxina limitando la accesibilidad de núcleo al insecto reduciendo el procesamiento de la proteasa de la molécula de toxina (Haider, M.Z., B.H. Knowles, D.J. Ellar [1986] Eur. J. Biochem. 156: 531-540) o reduciendo la solubilidad de la toxina (Aronson, A.I., E.S. Han, W. McGaughey, D. Johnson [1991] Appl. Environ Microbiol. 57: 981-986).
Se han notificado proteínas quiméricas unidas con los dominios toxina entre CryIC y CryIA(b) (Honee, G., D. Convents, J. Van Rie, S. Jansens, M. Perferoen, B. Visser [1991] Mol. Microbiol. 5: 2799-2806); sin embargo, la actividad de estas proteínas quiméricas fue bien mucho menor, o indetectable, cuando se la compara con CryIC en un insecto relevante.
Honee y col.(Honee, G., W. Vriezen, B. Visser [1990] Appl. Environ. Microbiol. 56: 823-825) también han notificado la fabricación de una proteína quimérica de fusión mediante la unión conjunta de dominios de toxina de CryIC y CryIA(b). La proteína resultante tiene un espectro incrementado de actividad equivalente a las actividades combinadas de las toxinas individuales; sin embargo, la actividad de la quimérica no se incrementó hacia ninguno de los insectos diana.
Se encontró que un nucleótido de \beta-exotoxina producido por una cadena particular B.t. actuaba sinérgicamente con las \delta-endotoxinas proteicas en la variedad kurstaki de B.t., para producir actividad incrementada contra la plaga de lepidópteros Spodoptera exigua; véase Moar y col. (1986), J. Econ. Entomol. 79: 1443-1446. La toxicidad incrementada contra las larvas de mosquito tiene lugar con una mezcla de la proteína de 27 kDa y la de 65 o la de 130 kDa de la variedad israelensis de B.t.; véase Chilcott y col. (1988), J. Gen. Microbiology 132: 2551-2558, y Wu y col. (1985), FEBS 190(2): 232-236. Las toxinas CryIVA y CryIVB de la variedad israelensis de B.t. también se han usado conjuntamente; véase Angsuthanasomat y col. (1992), FEMS Microbiol. Lett. 94: 63-68.
Ge y col. (1991), J. Biol. Chem. 266(27): 17954-8, describe toxinas proteicas quiméricas que comprenden CryIA(c) y CryIA(a).
El documento US-A-5128130 describe genes de toxinas de Bacillus thurigiensis efectivos contra plagas de lepidópteros, comprendiendo los genes CryIA(c) y CryIA(b).
Chambers y col. (1991), J. Bacteriol. 173(13): 3.966-76, y el documento WO-A-9116434 describen la identificación y aislamiento del gen CryIF del Bacillus thurigiensis.
Sumario de la invención
De acuerdo con la presente invención, una composición para controlar plagas de lepidópteros comprende una proteína que contiene un núcleo de toxina quimérico CryIF y una proteína que contiene núcleo de toxina quimérico CryIA(c), o células que expresen estas proteínas.
La combinación de proteínas de acuerdo con la invención proporciona una toxicidad inesperadamente incrementada a las plagas de lepidópteros. Se puede lograr un efecto sinérgico combinando, como una mezcla, aislados los cuales cada uno de ellos produce una de las proteínas toxina. Los hospedadores modificados genéticamente para expresar ambas toxinas se pueden usar también para lograr el efecto sinérgico. Los hospedadores recombinantes adecuados incluyen procariotas y eucariotas inferiores, igual que plantas.
Los genes quiméricos CryIF útiles de acuerdo con la presente invención se puede emsamblar, eso sustituye un segmento heterólogo de protoxina para todas o parte de los segmentos protoxina de CryIF. En particular, toda o parte de la región codificante de protoxina de un gen CryIA(b) se puede usar en lugar de toda o parte de la región que codifica la protoxina para una toxina CryIF nativa. De forma similar, un gen quimérico puede construirse en el que la región codificante de toda o parte de la protoxina de una toxina CryIF se sustituye por DNA que codifica toda o parte de la protoxina de un gen quimérico CryIA(c)/CryIA(b). En una realización específica, el gen quimérico CryIA(c)/CryIA(b) es ese que se ha señalado 436 y el cual se describe en el documento US-A-5128130. Este gen se puede obtener del plásmido en P. fluorescens MR436.
El gen quimérico se puede introducir dentro de una amplia variedad de microbios u hospedadores vegetales. Un hospedador transformado expresa el gen quimérico que se puede usar para producir toxinas activas contra lepidópteros. Los hospedadores transformados se pueden usar para producir las toxinas, o, en el caso de una célula vegetal transformada para producir las toxinas, la planta llegará a ser resistente al ataque de los insectos.
La invención proporciona el uso de las toxinas quiméricas, u hospedadores que contienen los genes que codifican las toxinas quiméricas, en procedimientos para controlar las plagas de lepidópteros. La invención proporciona también combinaciones de células tratadas de B.t. sustancialmente intactas, o células recombinantes que expresan los genes y que producen las toxinas de la invención. Las células se pueden tratar también para prolongar la actividad pesticida cuando las células sustancialmente intactas se aplican al ambiente de la plaga diana. Tal tratamiento puede ser por medios químicos o físicos, o por una combinación de medios químicos y físicos, por tanto tiempo como la técnica no afecte deletéreamente las propiedades sinérgicas de los pesticidas, ni disminuya la capacidad celular en proteger a los pesticidas. La célula tratada actúa como un recubrimiento protector para la toxinas del pesticida. Las toxinas llegan a estar disponibles para actuar como tales tras su ingestión por una plaga diana.
Breve descripción de los dibujos
Figura 1 - El sitio BamHI se eliminó de pMYC1050 mediante una reacción de sustitución con la polimerasa Klenow para dar el plásmido MYC1050\DeltaBamHI. Para facilitar el clonaje, un fragmento de DNA NsiI que contiene la mayoría de la fase de lectura abierta de la toxina se clonó en pGEM5. El plásmido resultante se llamó pGEM_{tox}. C = ClaI, H = HindIII.
Figura 2 - El sitio de clonado BamHI o PvuI se introdujo dentro de la toxina de DNA por la técnica de Extensión del Lazo de Splicing (SOE). Los fragmentos de DNA con los sitios nuevos se usan para reemplazar los fragmentos homólogos en pGEM_{tox}. Los plásmidos resultantes son pGEM_{tox}BamHI o pGEM_{tox} PvuI. Las letras de la A a la G entre las flechas corresponden a cebadores de oligonucleótidos en el texto. Las letras sobre las líneas verticales corresponden a sitios de enzimas de restricción. B = BamHI, C = ClaI, H = HindIII, P = PvuI, S = SacI.
Figura 3 - El fragmento de DNA que contiene la mutación BamHI se usó para reemplazar el fragmento homólogo en pGEM_{tox} PvuI. El plásmido resultante que contiene ambos sitios de clonado es pGEM_{tox}BamHIPvuI. Para construir un plásmido de expresión, el fragmento que contiene toxina NsiI se escinde para clonarse dentro del vector de alto número de hospedadores pTJS260. B = BamHI, C = ClaI, H = HindIII, P = PvuI.
Figura 4 - El fragmento que contiene toxina NsiI con los nuevos sitios de restricción se liga al vector que contiene DNA de pMYC1050\DeltabamHI para dar pMYC2244. Un fragmento de DNA derivado de PCR BamHI-PvuI que contiene la toxina CryIF se intercambió por el fragmento equivalente en pMYC2244. La quimera resultante se llamó pMYC2239. B = BamHI, C = ClaI, H = HindIII, N = NsiI, P = PvuI.
Figura 5 - El fragmento pequeño de DNA ApaI de pMYC2047 se sustituyó por la región homóloga de pMYC2239 para dar el plásmido pMYC2244. Esta quimera consta de CryF en la región toxina y CryIA(b) en la protoxina. C = ClaI, H = HindIII, N = NsiI, P = PvuI.
Figura 6 - Cambios silenciosos de codones se introducen dentro de la toxina CryF mediante SOE. El fragmento de DNA de PCR SpeI-KpnI con los cambios se sustituyó por los fragmentos homólogos que contienen toxinas en pMYC2047. El plásmido resultante es pMYC2243. Las letras de la H a la K bajo las flechas corresponden a oligonucleótidos cebadores en la prueba.
Figura 7 - Cambios silenciosos de codones se introducen dentro de pMYC2244 mediante sustitución de los fragmentos homólogos con el pequeño fragmento de DNA ApaI de pMYC2243. El plásmido final es pMYC2523. P = PvuI.
Figura 8 - Una toxina quimérica que contiene la protoxina 436 se construyó sustituyendo una protoxina PvuI-BstEII generada mediante PCR por el fragmento homólogo en pMYC2523. El plásmido final es pMYC2254. Las letras F y M bajo las flechas corresponden a los cebadores de oligonuclótido en el texto.
Figura 9 - Una secuencia de proteína quimérica CryIF/CryIA(b) y sustituciones residuo por residuo. La línea "Cons" muestra una secuencia quimérica CryIF/CryIA(b). Las líneas "Alt" presentan sustituciones residuo por residuo encontradas en la proteína 436, las proteínas variantes CryA(b) y las protoxinas CryIF.
Breve descripción de las secuencias
SEQ ID Nº. 1 es un cebador oligonucleótido "A".
SEQ ID Nº. 2 es un cebador oligonucleótido "B".
SEQ ID Nº. 3 es un cebador oligonucleótido "C".
SEQ ID Nº. 4 es un cebador oligonucleótido "D".
SEQ ID Nº. 5 es un cebador oligonucleótido "E".
SEQ ID Nº. 6 es un cebador oligonucleótido "F".
SEQ ID Nº. 7 es un cebador oligonucleótido "G".
SEQ ID Nº. 8 es un cebador oligonucleótido "L".
SEQ ID Nº. 9 es un cebador oligonucleótido "N".
SEQ ID Nº. 10 es un cebador oligonucleótido "O".
SEQ ID Nº. 11 es un cebador oligonucleótido "H".
SEQ ID Nº. 12 es un cebador oligonucleótido "I".
SEQ ID Nº. 13 es un cebador oligonucleótido "J".
SEQ ID Nº. 14 es un cebador oligonucleótido "K".
SEQ ID Nº. 15 es un cebador oligonucleótido "P".
SEQ ID Nº. 16 es un cebador oligonucleótido "Q".
SEQ ID Nº. 17 es un cebador oligonucleótido "M".
SEQ ID Nº. 18 muestra la secuencia de DNA codificadora de toxina de pMYC2224.
SEQ ID Nº. 19 muestra la secuencia de aminoácidos predicha de la toxina codificada por pMYC2224.
SEQ ID Nº. 20 muestra la secuencia de DNA codificadora de toxina de pMYC2239.
SEQ ID Nº. 21 muestra la secuencia de aminoácidos predicha de la toxina codificada por pMYC2239.
SEQ ID Nº. 22 muestra la secuencia de DNA codificadora de toxina de pMYC2244, la cual codifica una toxina quimérica CryIF/CryIA(b).
SEQ ID Nº. 23 muestra la secuencia de aminoácidos predicha de la toxina quimérica CryIF/CryIA(b) codificada por pMYC2244.
SEQ ID Nº. 24 muestra la secuencia de DNA codificadora de toxina de pMYC2243.
SEQ ID Nº. 25 muestra la secuencia de aminoácidos predicha de la toxina codificada por pMYC2243.
SEQ ID Nº. 26 muestra la secuencia de DNA codificadora de toxina de pMYC2523, la cual codifica una toxina quimérica CryIF/CryIA(b) con un codón usado de nuevo en forma alterada.
SEQ ID Nº. 27 muestra la secuencia de aminoácidos predicha de la toxina codificada por pMYC2523.
SEQ ID Nº. 28 muestra la secuencia de DNA codificadora de toxina de pMYC2554, la cual codifica una toxina quimérica CryIF/436.
SEQ ID Nº. 29 muestra la secuencia de aminoácidos predicha de la toxina codificada por pMYC2554.
SEQ ID Nº. 30 es una secuencia característica de las toxinas crI. Esta secuencia finaliza en el residuo 601 de SEQ ID Nº. 23.
SEQ ID Nº. 31 son los ocho aminoácidos que preceden al aminoácido 1.043 en SEQ ID Nº. 23.
SEQ ID Nº. 32 muestra la secuencia de aminoácidos de una toxina nativa CryIF/CryIA(b).
SEQ ID Nº. 33 muestra la secuencia de aminoácidos de una toxina nativa CryIA(b).
SEQ ID Nº. 34 muestra la secuencia de aminoácidos de una toxina CryIA(c)/CryIA(b).
Descripción detallada de la invención
La invención objeto se ocupa de la mejora inesperada de la actividad pesticida resultante de una combinación de una toxina quimérica CryIF y una toxina quimérica CryIA(c). La combinación ha incrementado sorprendentemente la actividad contra las plagas de lepidópteros. Preparaciones de combinaciones de aislados que producen las dos toxinas quiméricas se pueden usar para practicar la invención objeto. Las células de Pseudomonas fluorescens transformadas con genes de B.t. pueden usarse para practicar la invención objeto. Por ejemplo, una cepa inducible por lactosa de P. fluorescens comprende un gen que codifica una toxina quimérica CryIF/CryIA(b), y P. fluorescens MR436, la cual comprende un gen que codifica una toxina quimérica CryIA(c)/CryIA(b), se puede usar para practicar la invención objeto. Estas dos cepas de Pseudomanas se pueden combinar en una mezcla física que presenta actividad pesticida ventajosamente incrementada. Los genes que codifican las toxinas de la invención pueden usarse para transformar hospedadores adecuados de tal forma que un solo hospedador producirá las dos toxinas que proporcionan el efecto ventajoso.
Las bacterias que albergan plásmidos útiles de acuerdo con la invención objeto son las siguientes:
\newpage
Cultivo Nº. de depósito Nº. de patente de los Estados Unidos
P. fluorescens (pM3, 130-7) NRRL B-18332 5.055.294
P. fluorescens MR436 (pM2, NRRL B-18292 5.128.130
16-11, aka pMYC436)
E. coli NM522 (pMYC1603) NRRL B.18517 5.188.960
Debería entenderse que la disponibilidad de un depósito no constituye una licencia para practicar la invención objeto en la derogación de los derechos de patente garantizados por la acción gubernamental.
De acuerdo con la invención objeto, se ha descubierto que los productos que comprenden las dos toxinas quiméricas requieren un contenido total de proteínas menor para la aplicación del producto proporcionando así mayor ahorro del usuario. Los insectos que son menos susceptibles a la acción de una única proteína serán afectados más grandemente por la combinación de las toxinas de la invención objeto, dando lugar a un producto que contiene las dos toxinas más eficaz que los productos que contienen una única toxina Adicionalmente, es menos probable que las plagas desarrollen una resistencia rápida frente a un producto que contiene las dos toxinas, que frente a productos que contienen una única toxina.
Las combinaciones de las toxinas descritas en la invención pueden usarse para controlar plagas de lepidópteros. Los lepidópteros adultos, es decir, mariposas y polillas, se alimentan primariamente de néctar de las flores y son unos efectivos efectores de la polinización. Las larvas, es decir, orugas, casi todas se alimentan en las plantas, y muchas son plagas graves. La comida de las orugas sobre o dentro del follaje o en las raíces o tallo de una planta, privando a la planta de nutrientes y a menudo destruyendo la estructura física de soporte de la planta. Adicionalmente, las orugas se alimentan en la fruta, tejidos, y semillas y harina almacenadas, arruinando estos productos para su venta o disminuyendo seriamente su valor. Tal como se usa en el presente documento, la referencia a las plagas de lepidópteros se refiere a varias etapas de la vida de la plaga, incluyendo estados larvarios.
Las toxinas quiméricas de la invención objeto comprenden una parte N-terminal completa del núcleo de la toxina de una toxina de B.t. y, en algún punto pasado el final de la parte toxina, la proteína tiene un transición a una secuencia heteróloga de protoxina. La parte de la toxina N-terminal de una toxina B.t. se refiere en el presente documento como la toxina "núcleo". La transición del segmento heterólogo de la protoxina puede suceder a aproximadamente la unión toxina/protoxina o, como alternativa, una parte de la proteína nativa (que se extiende pasada la parte toxina) puede retenerse con la transición a protoxina heteróloga que sucede más adelante en la proteína. Como un ejemplo, una toxina quimérica de la invención objeto tiene la parte toxina completa de CryIF (aminoácidos 1-601) y una protoxina heteróloga (aminoácidos 602 al extremo C-terminal). En una realización preferida, la parte heteróloga de la protoxina se deriva de una toxina CryIA(b) o una toxina 436.
Una persona experta en esta técnica apreciará que las toxinas B.t., incluso dentro de cierta clase tal como CryIF, variarán en alguna extensión en longitud y la localización precisa de la transición de la parte toxina a la parte protoxina. Típicamente, las toxinas CryIA(b) y CryIF son de aproximadamente 1150 a aproximadamente 1200 aminoácidos de longitud. La transición de la parte toxina a la parte protoxina sucederá típicamente a entre aproximadamente el 50% y aproximadamente el 60% de la longitud total de la proteína. La toxina quimérica de la invención objeto incluirá la total extensión de esta parte N-terminal del núcleo de la toxina. Así, la toxina quimérica comprenderá al menos aproximadamente el 50% de la longitud total de la toxina CryIF B.t. Esto será típicamente al menos 590 aminoácidos. Con respecto a la parte protoxina, la expansión plena de la parte protoxina CryIA(b) se extiende del final de la parte toxina al extremo C-terminal de la molécula. Son los últimos de 100 a 150 aminoácidos aproximadamente los que son más críticos para incluir en la toxina quimérica de la invención objeto. En una toxina quimérica específicamente ejemplificada en el presente documento, al menos se utilizan los aminoácidos del 1043 (de la SEQ ID Nº. 23) al extremo C-terminal de la molécula CryIA(b). El aminoácido 1043 en la SEQ ID Nº. 23 está precedido por la secuencia Tyr Pro Asn Asn Thr Val Thr Cys (SEQ ID Nº. 31). Esta secuencia de aminoácido marca la posición en el segmento protoxina de la molécula más allá de la cual los aminoácidos heterólogos se darán siempre en la toxina quimérica. En otro ejemplo, el péptido que se muestra como SEQ ID Nº. 31 se da en los aminoácidos 1061 a 1068. En este caso, los aminoácidos 1069 al C-terminal son preferiblemente heterólogos (SEQ ID Nº. 29). El péptido mostrado en la SEQ ID Nº. 31 puede encontrarse en las posiciones 1061 a 1068 en la figura 9. Así, es al menos el último aproximadamente del 5 al 10% de la proteína B.t. general, la cual comprendería DNA heterólogo (comparado con la parte N-terminal del núcleo de la toxina CryIF) en la toxina quimérica de la invención objeto. En los ejemplos específicos contenidos en el presente documento, las secuencias heterólogas de la proteína se dan del aminoácido 640 al extremo C-terminal.
Así, una realización preferida de la invención objeto es la toxina quimérica B.t. de aproximadamente 1150 a aproximadamente 1200 aminoácidos en longitud, en la que la toxina quimérica comprende una parte N-terminal del núcleo de la toxina CryIF de al menos entre aproximadamente el 50% y aproximadamente el 60% de una molécula CryIF completa, pero no más de entre aproximadamente el 90 y aproximadamente el 95% de la molécula completa. La toxina quimérica comprende adicionalmente una CryIA(b) o una parte C-termina l de la protoxina 436 la cual comprende al menos aproximadamente del 5 al 10% de la molécula CryIA(b) o la molécula 436. La transición de CryIF a CryIA(b) o secuencia 436 ocurre así dentro del segmento protoxina (o en la unión de los segmentos toxina y protoxina) entre aproximadamente 50% y aproximadamente 95% del recorrido a través de la molécula. En los ejemplos específicos proporcionados en el presente documento, las transiciones de la secuencia CryIF a las secuencias heterólogas de la protoxina tiene lugar antes del final de la secuencia del péptido mostrada en la SEQ ID Nº. 31.
Una realización específica de la invención objeto es la toxina quimérica mostrada en la figura 9. Otras construcciones pueden hacerse y usarse por aquellos expertos en esta técnica que tienen el beneficio de las enseñanzas proporcionadas en el presente documento. El segmento núcleo de la toxina de las proteínas CryI termina característicamente con la secuencia: Val/Leu Tyr/Ile Ile Asp Arg/Lys Ile/Phe Glu Ile/Phe/Leu Ile/Leu/Val Pro/Leu Ala/Val Glu/Thr/Asp (SEQ ID Nº. 30), la cual termina en el residuo 601 de la SEQ ID Nº. 23. Adicionalmente, los segmentos protoxina de las toxinas CryI (el cual sigue al residuo 601) llevan más similitud de secuencia que los propios segmentos toxina. Debido a esta similitud de secuencia, el punto de transición en el segmento protoxina para hacer una proteína quimérica entre la secuencia CryIF y las secuencias CryIA(b) o 436 pueden determinarse fácilmente por alguien experto en la técnica. A partir de estudios de datos con respecto a la proteolisis parcial de los genes CryI, la heterogeneidad y las regiones de aminoácidos menos conservadas se encuentran después de la secuencia protoxina conservada CryI, posiciones 1061-1068 de la figura 9.
Por lo tanto una toxina quimérica de la invención objeto puede comprender la toxina CryF completa y una parte de la protoxina CryIF, en transición a la correspondiente secuencia CryIA(b) o 436 en cualquier posición entre el final del fragmento toxina (como se definió anteriormente en este documento) y el final de la secuencia peptídica mostrada en SEQ ID Nº. 31. Preferiblemente, la secuencia de aminoácidos del extremo C-terminal de la toxina quimérica comprende una secuencia CryIA(b) o una secuencia del gen 436 o un equivalente de una de estas secuencias.
Las toxinas CryIF, y los genes que codifican estas toxinas, se conocen bien en la técnica. Los genes y toxinas CryIF se han descrito, por ejemplo, en Höfte y col. (1986) Eur. J. Biochem. 161:273; Geiser y col. (1986) Gene 48:109; y Haider y col. (1988) Nucleic Acids Res. 16:10927. El técnico experto que tiene el beneficio de las enseñanzas contenidas en el presente documento pudo identificar y usar fácilmente el DNA que codifica la parte N-terminal toxina de una molécula CryIF y la parte protoxina C-terminal de las toxinas CryIA(b).
La figura 9 proporciona ejemplos de sustituciones de aminoácidos que pueden usarse en las toxinas de la invención objeto. También son bien conocidas en la técnica varias mutaciones que pueden hacerse en una secuencia toxina sin cambiar la actividad de una toxina. Además, debido a la degeneración del código genético, una variedad de secuencias de DNA se puede usar para codificar una toxina en particular. Estas secuencias alternativas de DNA y aminoácidos pueden usarse de acuerdo con la invención objeto por una perdona experta en esta técnica.
Las técnicas de sustitución de la protoxina de la invención objeto pueden usarse con otras clases de endotoxinas B.t. para mejorar la expresión de la toxina. La técnica sería más aplicable a otras toxinas B.t. las cuales tienen la secuencia característica que se muestra en la SEQ ID Nº. 30.
Los diagramas de flujo de las figuras 1-8 proporcionan una visión de conjunto general de la construcción de vectores que puede llevarse a cabo de acuerdo a la invención objeto. Los sitios de clonado BamHI y PvuI se pueden introducir dentro de un gen de toxina quimérica CryIA(c)CryIA(b) mediante mutagénesis usando la técnica de PCR de Extensión de Lazo de "Splicing" (SOE) (Horton, R.M., H.D. Hunt, S.N. Ho, J.K. Pullen, L.R. Pease [1989] Gene 77: 61-68) para dar el plásmido pMYC2224. Una región del gen CryIF de un plásmido que contiene CryIF tal como pMYC1260 puede generarse mediante PCR y sustituirse por el fragmento génico BamHI-PvuI CryIA(c)/
\hbox{CryIA(b)}
de pMYC2224. El nuevo plásmido, el cual se designó pMYC2239, constó de un segmento corto de CryIA(c) seguido por CryIF ala unión entre segmentos toxina/protoxina. Así, el segmento protoxina se derivó ahora de
\hbox{CryIA(b)}
(pMYC1050). Un fragmento ApaI derivado del clon CryIF (pMYC2047) se sustituyó por el fragmento ApaI en pMYC2239. El clon resultante (pMYC2244) constó de CryIF de la metionina iniciadora al segmento de unión toxina/protoxina y CryA(b) al final de la región codificante. El clon pMYC2243 se construyó mediante SOE para introducir cambios silenciosos de codones en una región limitada. El fragmento ApaI de pMYC2243 que contiene los cambios silenciosos se sustituyó por el fragmento ApaI en pMYC2244 para dar el clon pMYC2523. El quimérico pMYC2523 mostró un incremento de expresión por encima de pMYC2243, lo cual contiene SECUENCIAS de proteína CryIF sin cambiar.
Una quimera CryIF/436 se puede ensamblar sustituyendo el segmento de la proteína que contiene el fragmento PvuI-BstEII de pMYC2523 con un fragmento equivalente generado por PCR de un plásmido que contiene un gen CryIA(c)/CryIA(b). Un gen tal es el gen 436 (por ejemplo, pMYC467, como se discute en las patentes de los Estados Unidos Nº^{s}. 5.055.294 y 5.169.760. Esta construcción también resulta en una expresión incrementada comparada con la secuencia nativa de la proteína CryIF.
Genes y toxinas. Los genes y las toxinas útiles de acuerdo con la invención objeto incluyen no sólo las longitudes totales de las secuencias descritas sino también fragmentos de estas secuencias, variantes, mutantes, y proteínas de fusión las cuales retienen la característica actividad pesticida de las toxinas específicamente ejemplificadas aquí. Del modo en que se usan en el presente documento, los términos "variantes" o "variaciones" de genes se refieren a las secuencias de nucleótidos las cuales codifican las mismas toxinas o las cuales codifican toxinas equivalentes que tienen actividad pesticida. Como se usa en el presente documento, el término "toxinas equivalentes" se refiere a toxinas que tienen la misma o esencialmente la misma actividad biológica contra las plagas diana como las toxinas reivindicadas.
Será patente para una persona experta en esta técnica que los genes que codifican toxinas activas se pueden identificar y obtener a través de varios medios. Los genes específicos de porciones génicas ejemplificadas en el presente documento pueden obtenerse de los aislados depositados en un depósito de cultivos como se describió anteriormente en este documento. Estos genes, o partes o variantes de los mismos, pueden también construirse sintéticamente, por ejemplo, mediante el uso de un sintetizador de genes. Las variaciones de los genes pueden construirse fácilmente usando técnicas estándar para hacer mutaciones puntuales. También, fragmentos de estos genes pueden hacerse usando endonucleasas comercialmente disponibles o exonucleasas de acuerdo con procedimientos estándar. Por ejemplo, las enzimas tales como Bal31 o de mutagénesis dirigida específica de sitio pueden usarse para escindir sistemáticamente nucleótidos de los extremos de estos genes. También, los genes que codifican fragmentos activos pueden obtenerse usando una variedad de enzimas de restricción. Las proteasas pueden usarse para obtener directamente fragmentos activos de estas toxinas.
Los fragmentos y equivalentes que retienen la actividad pesticida de las toxinas ejemplificadas estarían dentro de la panorámica de la invención objeto. También, debido a la redundancia del código genético una variedad de diferentes secuencias de DNA pueden codificar las secuencias de aminoácidos descritas en el presente documento. Está claramente dentro de la habilidad de una persona preparada en la técnica crear estas secuencias de DNA alternativas que codifican las mismas, o esencialmente las mismas, toxinas. Estas secuencias variantes de DNA están dentro de la panorámica de la presente invención. Como se usa en el presente documento, la referencia a "esencialmente la misma" secuencia se refiere a secuencias que tienen sustituciones, deleciones, adiciones o inserciones de aminoácidos que no afectan materialmente la actividad pesticida. Los fragmentos que retienen la actividad pesticida también están incluidos en esta definición.
Un procedimiento adicional para identificar las toxinas y partes génicas útiles de acuerdo con la invención objeto es a través del uso de las sondas de oligonucleótidos. Las sondas son secuencias de nucleótidos detectables. Estas secuencias pueden ser detectables en virtud de una apropiada marca o pueden hacerse inherentemente fluorescentes como se describe en la solicitud internacional Nº. WO93/16094. Como se conoce bien en la técnica, si la molécula sonda y la muestra de ácidos nucleicos hibridan formando un fuerte enlace entre las dos moléculas, se puede asumir razonablemente que la sonda y la muestra tienen homología sustancial. Preferiblemente, la hibridación se dirige bajo condiciones estrictas mediante técnicas bien conocidas en la técnica, como se describe, por ejemplo, en Keller, G.H., M.M. Manak (1987) DNA Probes, Stockton Press, Nueva York, NY., páginas 169-170. La detección de la sonda proporciona un medio para determinar de una forma conocida si ha ocurrido la hibridación. Así, un análisis de la sonda proporciona un procedimiento rápido para identificar genes que codifican toxinas de la invención objeto. Los segmentos de nucleótido que se usan como sondas de acuerdo a la invención pueden sintetizarse usando sintetizadores de DNA y procedimientos estándar. Estas secuencias de nucleótidos se pueden usar también como cebadores de PCR para amplificar los genes de la invención objeto.
Ciertas toxinas de la invención objeto se han ejemplificado específicamente en el presente documento. A partir de que estas toxinas son meramente ejemplos de las toxinas de la invención objeto, sería fácilmente patente que la invención objeto comprende toxinas variantes o equivalentes (y secuencias nucleotídicas que codifican para toxinas equivalentes) que tienen la misma o similar actividad pesticida de la toxina ejemplificada. Las toxinas equivalentes tendrán homología de aminoácidos con una toxina ejemplificada. Esta homología de aminoácidos será típicamente mayor del 75%, preferiblemente será mayor del 90%, y más preferiblemente será mayor del 95%. La homología aminoacídica será mayor en regiones críticas de la toxina la cual da cuenta de la actividad biológica o está implicada en la determinación de la configuración tridimensional que en última instancia es responsable de la actividad biológica. A este respecto, ciertas sustituciones de aminoácidos son aceptables y pueden esperarse si estas sustituciones están en regiones que no son críticas para la actividad o son sustituciones de aminoácidos conservadoras las cuales no afectan la configuración tridimensional de la molécula. Por ejemplo, los aminoácidos se pueden situar en las siguientes clases: no polares, polares no cargados, básicos, y ácidos. Las sustituciones conservadoras por las cuales un aminoácido de una clase es reemplazado con otro aminoácido del mismo tipo caen dentro de la panorámica de la invención sujeto siempre que la sustitución no altere materialmente la actividad biológica del compuesto. La tabla 1 proporciona un listado de ejemplos de aminoácidos pertenecientes a cada clase.
TABLA 1
Clase de aminoácido Ejemplos de aminoácidos
No polares Ala, Val, Leu, Ile, Pro, Met, Phe, Trp
Polares no cargados Gly, Ser, Thr, Cys, Tyr, Asn, Gln
Ácidos Asp, Glu
Básicos Lys, Arg, His
En algunos ejemplos, se pueden hacer también sustituciones no conservadoras. El factor crítico es que esas sustituciones no deben significar quitar valor a la actividad biológica de la toxina.
Hospedadores recombinantes. Los genes que codifican las toxinas de la invención objeto pueden introducirse dentro de una amplia variedad de hospedadores microbianos o vegetales. La expresión del gen de la toxina da como resultado, directa o indirectamente, en la producción intracelular y mantenimiento del pesticida. La transferencia por conjugación y la transferencia recombinante se pueden usar para crear una cepa de B.t. que expresa ambas toxinas de la invención objeto. Otros organismos hospedadores pueden transformarse también con uno o ambos de los genes toxina usados después para lograr el efecto sinérgico. Con los hospedadores microbianos adecuados, por ejemplo, Pseudomonas, los microbios se pueden aplicar al sitio de la plaga, donde proliferarán y serán ingeridos. El resultado es el control de la plaga. Alternativamente, el microbio que hospeda el gen de la toxina puede tratarse bajo condiciones que prolonguen la actividad de la toxina y estabilicen la célula. La célula tratada, la cual retiene la actividad tóxica, se puede aplicar después al ambiente de la plaga diana.
Donde la toxina B.t. se introduce por medio de un vector adecuado en un hospedador microbiano, y dicho hospedador se aplica al ambiente en un estado vivo, es esencial que ciertos microbios hospedadores se usen. Se seleccionan hospedadores microbianos que son conocidos por ocupar la "fitosfera" (filoplano, filosfera, rizosfera y/o rizoplano) de uno o más cultivos de interés. Estos microorganismos se seleccionan de tal forma que son capaces de competir exitosamente en el ambiente particular (cultivo y otros hábitats de insectos) con los microorganismos de tipo salvaje, proporcionar mantenimiento y expresión estables de los genes que expresan el pesticida polipeptídico, y, deseablemente, proporcionar protección mejorada del pesticida de la degradación e inactivación medioambientales.
Un gran número de microorganismos son conocidos por habitar el filoplano (la superficie de las hojas de las plantas) y/o la rizosfera (el suelo que rodea las raíces de una planta) de una amplia variedad de cultivos importantes. Estos microorganismos incluyen bacterias, algas, y hongos. De particular interés son los microorganismos, tales como bacterias, por ejemplo, los géneros Pseudomonas, Erwinia, Serratia, Klebsiella, Xanthomonas, Streptomyces, Rhizobium, Rhodopseudomonas, Methylophilius, Agrobacterium Acetobacter, Lactobacillus, Arthrobacter, Azotobacter, Leuconostoc, y Alcaligenes; hongos, particularmente bacterias, por ejemplo, los géneros Sacharomyces, Cryptococcus, Kuyveromyces, Sporobolomyces, Rhodotorula, y Aureobasidium. De particular interés son especies bacterianas de la fitosfera tales como Pseudomonas syringae, Pseudomonas fluorescens, Serratia marcescens, Acetobacter xylinum, Agrobacterium tumefaciens, Rhodopseudomonas spheroides, Xanthomonas campestris, Rhizobium melioti, Alcaligenes entrophus, y Azotobacter vinlandii; y especies bacterianas de la fistosfera tales como Rhodotorula rubra, R. glutinis, R. marina, R. aurantiaca, Cryptococcus albidus, C. diffluens, C. laurentii, Saccharomyces rosei, S. pretoriensis, S. cerevisiae, Sporobolomyces roseus, S. odorus, Kluiveromyces veronae, y Aureobasidium pollulans. De particular interés son los microorganismos pigmentados.
Una amplia variedad de caminos están disponibles para introducir un gen de B.t. que codifica una toxina dentro de un microorganismo hospedador bajo condiciones que permiten el mantenimiento estable y la expresión del gen. Estos procedimientos son bien conocidos por aquellos expertos en la técnica y se describen, por ejemplo, en la patente de los Estados Unidos Nº. 5135.867, la cual se incorpora en el presente documento mediante referencia.
Tratamiento de células. Bacillus thuringiensis o células recombinantes que expresan las toxinas de B.t. pueden tratarse para prolongar la actividad de la toxina y estabilizar la célula. La microcápsula de pesticida que se forma comprende la toxina de B.t. o toxinas dentro de una estructura celular que se ha estabilizado y protegerá la toxina cuando la microcápsula se aplica al ambiente de la plaga diana. Las células hospedadoras adecuadas pueden incluir bien procariotas o bien eucariotas, estando normalmente limitadas a aquellas células las cuales no producen sustancias tóxicas para los organismos superiores, tales como mamíferos. Sin embargo, los organismos que producen sustancias tóxicas para organismos superiores se pueden usar, donde las sustancias tóxicas son inestables o el nivel de aplicación es lo suficientemente bajo como para permitir cualquier posibilidad de toxicidad para un hospedador mamífero. Como hospedadores, los procariotas y los eucariotas inferiores, tales como hongos, serán de particular interés.
La célula estará usualmente intacta y estará sustancialmente en la forma proliferativa cuando se trate, más que en una forma espora, aunque en algunos casos se pueden emplear esporas.
El tratamiento de la célula microbiana, por ejemplo un microbio que contiene el gen o genes de la toxina B.t., puede ser por medios físicos o químicos, o por una combinación de medios químicos y/o físicos, mientras que la técnica no afecte deletéreamente las propiedades de la toxina, ni disminuya la capacidad celular de proteger la toxina. Ejemplos de reactivos químicos son los compuestos halogenantes, particularmente los halógenos de número atómico 17-80. Más particularmente, el yodo puede ser usado bajo condiciones moderadas y durante el tiempo suficiente para conseguir los resultados deseados. Otras técnicas adecuadas incluyen el tratamiento con aldehídos, tales como glutaraldehído, antiinfectivos, tales como cloruro de cefiran y cloruro de cetilpiridinium, alcoholes, tales como isopropil y etanol; varios fijadores histológicos, tales como Lugol de yodo, fijador de Bouin's, varios ácidos y el fijador de Helly (véase: Humason, Gretchen L., Animal Tissue Techniques, W.H. Freeman and Company, 1967); o una combinación de agentes físicos (calor) y químicos que preservan y prolongan la actividad de la toxina producida en la célula cuando la célula se administra al ambiente del hospedador. Ejemplos de medios físicos son radiaciones de longitud de onda corta tales como radiación-gamma y radiación-X, congelación, irradiación ultravioleta, liofilización, y similares. Los procedimientos para el tratamiento de células microbianas se discuten en las patentes de los Estados Unidos Nº^{s}. 4.695.455 y 4.695.462, las cuales se incorporan en el presente documento por referencia.
Las células generalmente tendrán una estabilidad estructural la cual aumentará la resistencia a las afecciones ambientales. Donde el pesticida está en una proforma, el procedimiento de tratamiento de la célula se selecciona de tal forma que no inhiba el procesamiento de la proforma a la forma madura del pesticida por el patógeno de la plaga diana. Por ejemplo, el formaldehído entrecruzará las proteínas y podría inhibir el procesamiento de la proforma de un pesticida polipeptídico. El procedimiento del tratamiento retendrá al menos una parte sustancial de la biodisponibilidad o bioactividad de la toxina.
Características de particular interés al seleccionar una célula hospedadora para los propósitos de la producción, incluyen facilidad de introducir el gen o genes de B.t. en el hospedador, disponibilidad de sistemas de expresión, eficiencia de expresión, estabilidad del pesticida en el hospedador, y la presencia de capacidades genéticas auxiliares. Características de particular interés para usar una microcápsula de pesticida incluyen cualidades protectoras para el pesticida, tales como paredes celulares delgadas, pigmentación, y empaquetamiento intracelular o formación de cuerpos de inclusión; supervivencia en ambientes acuosos; falta de toxicidad para los mamíferos; atractivo para las plagas para su ingestión; facilidad de matar y fijar sin dañar la toxina, y similares. Otras consideraciones incluyen facilidad de formulación y manipulación, aspectos económicos, estabilidad de almacenamiento, y similares.
Crecimiento de las células. Las células huésped que contienen el gen o genes insecticidas B.t. pueden crecerse en cualquier medio de nutrientes conveniente, donde las construcciones de DNA proporcionan una ventaja selectiva, proporcionando, para un medio selectivo, que sustancialmente todas o todas las células retengan el gen de B.t. Estas células pueden también cosecharse de acuerdo con los medios convencionales. Alternativamente, las células pueden tratarse antes de cosecharse.
Las células B.t. que producen las toxinas de la invención pueden cultivarse usando medios estándar de la técnica y técnicas de fermentación. Tras la terminación del ciclo de fermentación, las bacterias se pueden cosechar separando primero esporas y cristales del caldo de fermentación por medios bien conocidos en la técnica. Las esporas de B.t. y los cristales recuperados se pueden formular en un polvo humedecible, líquido concentrado, gránulos u otras formulaciones por la adición de tensioactivos, dispersantes, vehículos inertes, y otros componentes para facilitar la manipulación y aplicación para plagas particulares diana. Estas formulaciones y aplicación de procedimientos son bien conocidas en la técnica.
Formulaciones. Los gránulos cebo formulados contienen un atrayente y esporas, cristales, y toxinas de los aislados de B.t., o microbios recombinantes que comprenden los genes obtenibles de los aislados de B.t. descritos en el presente documento se pueden aplicar al suelo. Los productos formulados pueden aplicarse también como un recubrimiento de semillas o tratamiento de la raíz o tratamiento total de la planta en los estados finales del ciclo de cultivo. Los tratamientos de las plantas y del suelo de las células B.t. se pueden emplear como polvos humedecibles, gránulos o polvos, mezclando con varios materiales inertes, tales como minerales inorgánicos (filosilicatos, carbonatos, sulfatos, fosfatos, y similares) o materiales botánicos (mazorcas pulverizadas, vainas de arroz, cáscaras de nuez, u similares). Las formulaciones pueden incluir coadyuvantes pegajosos pulverizados, agentes estabilizadores, otras aditivos de pesticidas, o tensioactivos. Las formulaciones líquidas pueden ser de base acuosa o no acuosos y emplearse como espumas, geles, suspensiones, concentrados emulsificadores, o similares. Los ingredientes pueden incluir agentes reológicos, tensioactivos, emulsificadores, dispersantes, o polímeros.
Como se apreciará por una persona experta en la técnica, las concentración de pesticidas variará ampliamente dependiendo de la naturaleza de la formulación particular, particularmente si es un concentrado o si se usa directamente. El pesticida estará presente en al menos un 1% en peso y pueden ser el 100% en peso. Las formulaciones en seco tendrán de aproximadamente 1-95% en peso del pesticida mientras que las formulaciones líquidas serán generalmente de aproximadamente el 1-60% en peso de los sólidos en la fase líquida. Las formulaciones generalmente tendrán de aproximadamente 10^{2} a aproximadamente 10^{4} células/mg. Estas formulaciones se administrarán a aproximadamente 50 mg (líquidos o en seco) a 1 kg o más por hectárea.
Las formulaciones se pueden aplicar al ambiente de los lepidópteros, por ejemplo, follaje o suelo, mediante pulverización, espolvoreamiento, rociado, o similares.
Materiales y procedimientos
La cromatografía en columna NACS (Bethesda Research Labs, Gaithersburg, MD) se usó para la purificación de DNA electroeluído. Se lleva a cabo de acuerdo con las instrucciones del fabricante, excepto en que las tampones se modificaron a 0,5X TBE/2,0 M de NaCl para la unión, y 0,5X TBE/2,0 M NaCl para la elución.
El marcado aleatorio del cebado de DNA con \alpha-[^{32}P]dATP se hizo con un kit (Boehringer-Mannheim Biochemicals, Indianápolis, IN) de acuerdo con las indicaciones del fabricante.
La purificación de gel se refiere a la aplicación secuencial de la electroforesis en gel de agarosa-TBE, electroelución, y cromatografía en columna NACS para la purificación de los fragmentos de DNA seleccionados, procedimientos los cuales son bien conocidos en la técnica.
La reacción en cadena de la polimerasa (PCR) se hizo durante 25 ciclos de un ciclador termal de Perkin Elmer (Norwalk, CT) con los siguientes parámetros de ciclo: 94ºC durante 1 minuto, 37ºC durante 2 minutos, 72ºC durante 3 minutos (cada ciclo a 72ºC tiene una extensión temporal de 5 segundos). El producto de la PCR del DNA fue la proteasa K tratada para mejorar la eficacia de la clonación (Crowe, J.S., Cooper, H.J., Smith, M.A., Sims, M.J., Parker, D., Gewert, D. [1991] Nucl. Acid. Res. 19:184).
Los oligodeoxiribonucleótidos (oligonucleótidos) se sintetizaron en un sintetizador de DNA de Applied Biosistems (Foster City, CA) modelo 1381A. La purificación se hizo con columnas Nensorb (New England Nuclear-Dupont, Wilmington, DE) si fue necesario, de acuerdo con las instrucciones del fabricante.
La electroporación de Pseudomonas fluorescens se hizo con células en fase de crecimiento logarítmico en medio LB (caldo-L) a 30ºC en un agitador rotatorio. Las células se lavaron entonces de 2 a 3 veces con agua helada estéril destilada y concentrada a 0,03x de su volumen de partida en agua destilada. El DNA en 1-20 \mul se mezcló con 50-300 \mul de células. Los parámetros seleccionados para el Biorad Gene Pulser (Bio-Rad, Richmond, CA) fueron 100 ohmios, 25 microfaradios, y 2,25 kilovoltios en una cubeta con un espacio entre electrodos de 0,2 cm. Siguiendo a la electroporación, se añadió un mililitro de LB y las células se mantuvieron en hielo durante al menos 2 minutos. Las células se incubaron después durante entre 2 horas y toda una noche a 30ºC sin agitación.
La expresión de la toxina de B.t. en P. fluorescens se hizo en el medio recomendado que se encuentra en el Manual of Methods for General Bacteriology (P.Gerhardt y col., 1981, American Society for Microbiology, Washington, D.C). El glicerol se sustituyó por la glucosa. La receta se hizo con agua del grifo y el pH se ajustó a 7,2. Los matraces de semillas se hicieron a partir de medio LB. Las siguientes recetas se aplicaron:
Medio base (para 1 litro)
glicerol 65 g
(NH_{4})_{2}SO_{4} 1,0 g
Na_{2}HPO_{4} 5,24 g
KH_{2}PO_{4} 2,77 g
Extracto de levadura 5,0 g
Ácidos casamino 1,0 g
Metales 44 (para 100 ml)
EDTA 250 mg
ZnSO_{4}\cdot7H_{2}O 1095 mg
FeSO_{4}\cdot7H_{2}O 500 mg
MnSO_{4}\cdot7H_{2}O 154 mg
CuSO_{4}\cdot7H_{2}O 39,2 mg
Co(NO_{3})_{2}\cdot6H_{2}O 24,8 mg
Na_{2}B_{4}O_{7}\cdot10H_{2}O 17,7 mg
Añadir una pocas gotas de H_{2}SO_{4}6 N para retardar la precipitación.
Mezcla mineral de Huntner (para 1 litro)
Ácido nitriloacético (disuelto en y neutralizado con KOH) 10 g
MgSO_{4}\cdot7H_{2}O 14,45 g
CaCl_{2}\cdot2H_{2}O 3,33 g
(NH_{4})Mo_{7}O_{24}\cdot4H_{2}O 9,25 g
FeSO_{4}\cdot7H_{2}O 99 mg
Metales 44 50 ml
pH ajustado a 6,6-6,8
En la inoculación para el análisis de la expresión de la toxina de B.t., se añadieron 4 ml de la mezcla mineral de Huntner por 200 ml de caldo de cultivo. A los matraces se les dio un inóculo de un 2%, en volumen, de un cultivo que duró toda una noche. Se dejó crecer a los cultivos durante 24 horas a 32ºC a \geq 200 rpm. En este punto, se indujeron con 0,75 mM de IPTG y se suplementaron con 2 g de extracto de levaduras. Los geles proteicos se corrieron con muestras recogidas a 48 y 72 horas. La proteína de 130 kDa se cuantificó mediante densitometría láser.
Los siguientes son ejemplos los cuales ilustran los procedimientos, incluyendo el mejor modo, para llevar a la práctica la invención. Estos ejemplos no deberían interpretarse como limitantes. Todos los porcentajes son en peso y todas las proporciones de la mezcla disolvente son en volumen a menos que se indique lo contrario.
Ejemplo 1 Modificación del vector de expresión mediante la extensión del lazo de "splicing" (SOE)
Un vector de clonación se puede construir tomando como base pTJS260, un plásmido de amplio rango de hospedadores derivado de RSF1010 (pTJS260 se puede obtener del doctor Donald Helinski, U.C. San Diego). Un ejemplo del sistema usado en la construcción del vector se puede encontrar en la solicitud de patente EPO 0471564. Un gen de CryA(c)CryA(b), referido en el presente documento como el gen y la toxina 436, se describe en la patente de los Estados Unidos Nº. 5.055.294. Un plásmido designado pMYC1050 contiene el gen 436. El pMYC1050 se construyó por reclonación del gen de la toxina y el promotor de pM3.130-7 (descrito en la patente de los Estados Unidos Nº. 5.055.294) dentro de un vector basado en pTJS260 (descrito en la patente de los Estados Unidos Nº. 5.169.760) por procedimientos bien conocidos en la técnica. En particular, el promotor de pM3.130-7 y el gen de la toxina se pueden obtener como un fragmento de BamHI a NdeI y situarse dentro del plásmido pMYC467 reemplazando un fragmento unido por los mismos sitios (BamHI cerca de la base 12100 y NdeI cerca de la base 8000).
El vector mejorado contiene idealmente un único sitio de clonación de BamHI. El sitio BamHI del plásmido, localizado cadena arriba del promotor tac(Ptac), se puede eliminar mediante despunte con Klenow y religamiento (figura 1). La ausencia del sitio se puede confirmar mediante digestión con enzimas de restricción. Un plásmido producido de acuerdo con este procedimiento se llamó pMYC1050\DeltaBamHI. La construcción puede tener ahora un sitio BamHI añadido al plásmido mediante mutagénesis SOE. La mutagénesis SOE se podrá facilitar subclonando un fragmento de DNA NsiI que contiene toxina dentro del vector más pequeño pGEM5 (Promega Corp., Madison, WI) el cual usa el gen de resistencia a ampicilina (bla) como un marcador de selección (figura 1). El fragmento puede estar orientado por digestión de restricción. Un plásmido producido de acuerdo con este procedimiento se llamó pGEMtox.
El DNA en la región codificadora de la toxina puede mutarse mediante la técnica de SOE mediada por PCR para introducir sitios de clonado de enzimas de restricción como se muestra en la figura 2. Los oligonucleótidos útiles como cebadores se muestran a continuación:
"A"(SEQ ID Nº. 1)
5' GCATACTAGTAGGAGATTTCCATGGATAACAATCCGAAC 3'
"B"(SEQ ID Nº. 2)
5' GGATCCGCTTCCCAGTCT 3'
"C"(SEQ ID Nº. 3)
5' AGAGAGTGGGAAGCGGATCCTACTAATCC 3'
"D"(SEQ ID Nº. 4)
5' TGGATACTCGATCGATATGATAATCCGT 3'
"E"(SEQ ID Nº. 5)
5' TAATAAAGAGCTCCTATGT 3'
"F"(SEQ ID Nº. 6)
5' TATCATATCGATCGATCGAGTATCCAATTTAG 3'
"G"(SEQ ID Nº. 7)
5' GTCACATAGCCAGCTGGT 3'
El DNA pMYC1050 se usó como la plantilla para la amplificación de PCR usando los grupos de cebadores A/B, C/D, E/D, y F/G. Los fragmentos anticipados de DNA se llamaron AB, CD, ED, y FG. Los DNA amplificados se purificaron mediante gel de electroforesis de agarosa-TBE, electroelución, y cromatografía en columna NACS, procedimientos todos bien conocidos en la técnica. Los DNA plantilla purificados se usaron en un segundo grupo de reacciones de PCR. Los fragmentos AB y CD se mezclaron y amplificaron con los cebadores A y D. En una reacción separada, los fragmentos ED y FG se mezclaron y amplificaron con los cebadores E y G. El DNA amplificado se resolvió mediante electroforesis en gel de agarosa-TBE y los fragmentos con el correspondiente incremento en tamaño se escindieron, electroeluyeron, y purificaron sobre columnas NCAS por medios bien conocidos en la técnica. Los fragmentos de DNA se llaman AD o EG por referencia.
Los fragmentos de DNA AD o EG con los nuevos sitios de enzimas de restricción se incorporaron dentro del DNA que contiene toxina por varios procedimientos de subclonado (figuras 2 y 3). pGEMtox se digirió con ClaI o HindIII. El DNA conteniendo vector se purificó mediante gel. El fragmento de DNA se digirió con ClaI y se ligó al vector de DNA pGEMtox digerido con HindIII. La cepa de E. coli NM522 se transformó con mezclas de ligazón. Las construcciones correctamente ensambladas se identificaron por digestión con enzimas de restricción del plásmido de DNA de colonias aisladas. El plásmido con el nuevo sitio BamHI se llamó pGEMtox BamHI. El plásmido con el nuevo sitio PvuI se llamó pGEMtox PvuI. El fragmento ClaI que contiene el sitio BamHI del plásmido pGEMtox BamHI se ligó al fragmento ClaI fosfatado que contiene el vector de pGEMtox PvuI. La cepa de E. coli NM522 se transformó con mezclas de ligazón. Las construcciones correctamente ensambladas se identificaron por análisis con PCR con el grupo de cebadores C/D, y por la digestión de restricción. El plásmido con ambos sitios de enzimas restricción nuevos se llamó pGEMtox BamHI/PvuI.
Un vector de expresión completo se ensambló con un inserto de pGEMtox BamHI/PvuI y un vector de pMYC1050\Delta
BamHI (figuras 3 y 4). Se preparó un inserto purificado por gel a partir de pGEMtox BamHI/PvuI mediante digestión con NsiI, y digestión con ScaI (para eliminar el vector contaminante). Se ligó al vector purificado mediante gel digerido con NsiI que contiene DNA de pMYC1050\DeltaBamHI. La cepa de E. coli NM522 se transformó con mezclas de ligazón, y las mezclas de transformación se plaquearon en agar con medio LB conteniendo tetraciclina a 12 \mug/ml. Las colonias que contienen el inserto NsiI se identificaron por hibridación de colonia y autorradiografía. Los insertos se orientaron mediante PCR, usando el primer grupo de cebadores A/D, los cuales rellenan un sitio de clonación de NsiI, y la electroforesis en gel de agarosa-TBE. El plásmido ensamblado correctamente se llama pMYC2224. Las secuencias de DNA y proteicas de la toxina se encuentran en las SEQ ID Nº^{s}. 18 y 19, respectivamente. Una cepa de P. fluorescens inducible por lactosa se sometió a electroporación con DNA plasmídico correctamente ensamblado. Las mezclas de transformación se plaquearon en agar con medio LB conteniendo tetraciclina a 20 \mug/ml. El plásmido de DNA se preparó a partir de P. fluorescens para su uso en los subsiguientes experimento de clonaje.
Ejemplo 2 Subclonado de la región hipervariable de CryF dentro de pMYC2224
Un fragmento de DNA que contiene la región hipervariable de Cry(pMYC1260) se intercambió por el fragmento de DNA BamHI-PvuI conteniendo toxina de pYC2224 (figura 4). Dado que la secuencia codificante contiene un sitio BamHI preexistente, se escogió Bg/II para clonar. Las 4 bases salientes de BamHI y Bg/II son compatibles, permitiendo la ligazón mientras eliminaron varios sitios de la unión. Fue necesario sintetizar un nuevo primer para PCR:
"L" (SEQ ID Nº. 8)
5' GAGTGGAACAGATCTTAATAATGCACAATAAGG 3'
Un fragmento de DNA que contiene toxina se generó con cebadores L/D en el pMYC2160 plantilla. El DNA se digirió con BglII y PvuI para subclonarse. Partiendo de que el locus tetAR contiene múltiples sitios PvuI, es necesario aislar el vector que contiene DNA en dos fragmentos separados. Para obtener el primer fragmento, se digirió pMYC2224 con BamHI x BstEII, y el fragmento grande de DNA que contiene las funciones de locus-rep Ptac-tetAR se purificó mediante gel. Para obtener el segundo fragmento, se digirió pMYC2224 con BstEII x PvuI, y el fragmento de DNA que contiene el módulo vector-protoxina se purificó mediante gel. Se creó y usó una ligazón de tres piezas para la transformación de E. coli NM522. Los plásmidos, correctos en general, se identificaron por un análisis mediante PCR y electroforesis en gel de agarosa-TBE, usando el primer grupo N/O, el cual rellena el empalme de fusión de BamH/BglII.
"N" (promotor tac) (SEQ ID Nº. 9)
5'TTAATCATCGGCTCGTA 3'
"O" (SEQ ID Nº. 10)
5' ACTCGATCGATATGATA(GA)TCCGT 3'
El plásmido correcto se llamó pMYC2239. Consiste en CryIA(c) en el aminoterminal, CryIF hasta el empalme toxina/protoxina, y CryIA(c) a través del segmento protoxina. La toxina de DNA y las secuencias de proteínas están en SEQ ID Nº^{s}. 20 y 21, respectivamente.
Ejemplo 3 Construcción de los plásmidos de expresión de P. fluorescens pMYC1260 y pMYC2047
El gen clonado de la toxina CryIF se puede modificar por la expresión de P. fluorescens en el siguiente camino:
1. Un plásmido que contiene las secuencias de terminación pKK223-3 rrnB en el vector derivado de pTJS260 (doctor Donald Helinski, U.C. San Diego) puede fabricarse ligando el fragmento BamHI-ScaI que contiene el promotor Ptac y el terminador rrnB de pKK223-3 (Pharmacia, vector E. coli) dentro del BamHI al fragmento vector de pMYC1197 (descrito en el documento EP 0 417 564) despuntado por KpnI. El plásmido ensamblado se recupera a continuación de la transformación de E. coli y crece bajo selección con tetraciclina.
2. Un plásmido que contiene el gen de la toxina promovida por Ptac puede hacerse ligando el fragmento NdeI- Nde-I que contiene el gen (con los extremos despuntados usando DNA polimerara y dNTPs) de la toxina de aproximadamente 3800 pares de bases de pMYC1603 (partiendo de NRRL B-18517) dentro de los sitios despuntados por EcoRI y HindIII de pKK223-3. El plásmido de la toxina CryIF promovida por Ptac puede recuperarse tras la transformación de E. coli, crecimiento bajo selección con ampicilina, y rastreo de plásmidos con insertos en la orientación adecuada para la expresión del promotor Ptac mediante técnicas bien conocidas en la técnica.
3. La toxina CryIF promovida por Ptac puede ensamblarse dentro del vector derivado de pTJS260 en una ligazón de tres piezas usando el fragmento de 2,4 kb de DNA que tiene extremos BamHI y ApaI del plásmido pTJS260, el fragmento de ApaI a HindIII de 8,5 kb que contiene la región de replicación del plásmido de la etapa I mencionada anteriormente en este documento, y un fragmento de HindIII al fragmento parcial BamHI que contiene el promotor Ptac y el gen CryIF de la toxina de la etapa 2 mencionada anteriormente en este documento.
El plásmido que expresa de la toxina CryIF derivada de pTJS260 resultante (pMYC1260) se pueden introducir dentro de P. fluorescens por lectroporación.
4. pMYC2047 puede construirse ligando un fragmento de SpeI a KpnI obtenido por PCR de una plantilla CryIF adecuada con cebadores H y K, seguido de digestión con SpeI y KpnI y purificación en gel, un fragmento de ApaI a SpeI de alrededor de 2600 pared de bases a partir de pMYC1197 que contiene el promotor Ptac. La expresión correcta de los plásmidos de la toxina CryIF se determinó por la digestión con enzimas de restricción de los plásmidos seguidos por electroporación dentro de Pseudomonas fluorescens.
Ejemplo 4 Construcción de una quimera CryIF/CryIA(b)
El segmento CryIA(c) en el extremo aminoterminal se puede reemplazar mediante la secuencia codificante de CryIF mediante un simple, sencillo intercambio (figura 5). Tanto el locus tetAR como la secuencia codificante CryIF contiene un sitio ApaI. Un pequeño fragmento ApaI contiene una parte de los genes tetAR y el extremo aminoterminal de CryIF se puede aislar a partir de pMYC2047 y ligarse al fragmento grande ApaI que contiene un vector de pMYC2239. Una cepa de de P. fluorescens inducible por lactosa puede someterse a electroporación con la mezcla de ligazón y plaqueado en medio LB con agar que contiene tetraciclina a 20 \mug/ml. Las cepas inducibles por lactosa se conocen por aquellos expertos en la técnica y se describen, por ejemplo, en la patente de los Estados Unidos Nº. 5.169.760. La correcta orientación del fragmento ApaI reconstituye la resistencia a tetraciclina. Un clon producido de esta manera muestra ser generalmente correcto por digestión con enzimas de restricción, y se llamó pMY2244. La secuencia de DNA de la toxina se muestra en SEQ ID Nº. 22, y la secuencia proteica predecida se mostró en SEQ ID Nº. 23.
Ejemplo 5 Construcción de un reprocesamiento limitado de codón de CryIF
El uso del codón en Pseudomonas spp. favorece G o C en la posición balanceante de los tripletes codones, como se determinó por análisis de genes en las librerías de secuencias del GenBank/EMBL. Una región limitada del gen CryIF se reprocesó mediante SOE para incorporar los cambios en las posiciones balanceantes que son silentes (figura 6). Los oligos usados se muestran a continuación:
"H" (SEQ ID Nº. 11)
5' GGACTAGTAAAAAGGAGATAACCATGGAAAATAATATTCAAAATC 3'
"I" (SEQ ID Nº. 12)
5' TCCAGCGGCAGGCGGCCGGTGCTGCTGCGTTCTTCGTTCAGTATTTCTACTTCAGGATTATTTAAAC 3'
"J" (SEQ ID Nº. 13)
5' AACGCAGCAACCGGCCGCCTGCCGCTGGACATCAGCCTGAGCCTTACACGTTTCCTTTTGAGTGAA 3'
"K" (SEQ ID Nº. 14)
5' CATCAAAGGTACCTGGT 3'
Dos reacciones separadas de PCR se hicieron sobre una plantilla pMYC2047 con los grupos de cebadores H/I o J/K. Los fragmentos de DNA amplificados se llamaron HI o JK. Una segunda reacción de PCR se dispuso mezclando fragmentos HI y JK y amplificando con el grupo de cebadores H/K. El DNA SOE mayor se purificó mediante gel y digirió con SpeI x KpnI. Una ligazón de tres piezas se dispuso con el locus de DNA SpeI-ApaI Ptac-tetAR, el módulo vector del DNA de la protoxina entre ApaI-KpnI, y el DNA amplificado con PCR entre SpeI-KpnI. Una cepa inducible por lactosa de P. fluorescens puede someterse a electroporación con la mezcla de ligazón. Los clones correctos en general, pueden identificarse por análisis con PCR usando el grupo de cebadores P/Q y la electroforesis en gel de agarosa-TBE. El oligo P (SEQ ID Nº. 15) se diseñó para discriminar entre el gen de tipo salvaje y el gen con codón reprocesado.
"P" (SEQ ID Nº. 15)
5' TGCCGCTGGACATCAGCCTGAG 3'
"Q" (SEQ ID Nº. 16)
5' TCTAGAGCGGCCGCTTATAC(CT)CGATCGATATGATA(GA)TCCGT 3'
El plásmido completo se llamó pMYC2243. La secuencia de DNA de la toxina se muestra en SEQ ID Nº. 24. La secuencia de la proteína toxina se predice que es invariable, y se muestra en SEQ ID Nº. 25.
Ejemplo 6 Construcción de la quimera CryIF/CryIA(b) que contiene el reprocesamiento limitado de codón
La construcción se ensambló (figura 7) usando la misma estrategia de intercambio del fragmento ApaI como se describió para pMYC2244 (CryIF/CryIA(b)) anteriormente en este documento. El pequeño fragmento de DNA del locus de la toxina-tetAR se purificó mediante gel a partir de pMYC2243. El mayor fragmento ApaI vector del módulo de protoxina se purificó mediante gel a partir de pMYC2244. El plásmido completo se llamó pMYC2523. El DNA predicho y las secuencias de proteína están en SEQ ID Nº^{s}. 26 y 27, respectivamente.
Ejemplo 7 Expresión comparativa de toxinas de pMYC2244 y pMYC2523
La expresión de toxinas en P. fluorescens se analizó como se describe anteriormente en este documento. A 24 y 48 horas tras la inducción, la cepa que contiene pMYC2523 produjo más toxina que la cepa que contiene pMYC2244. La actividad específica de toxina en Spodoptera exigua fue estadísticamente invariable.
Ejemplo 8 Construcción de la quimera CryIF/436 que contiene el reprocesamiento limitado de codón
Un segundo tipo de toxina quimérica se ensambló sustituyendo el módulo de la protoxina 436 por la protoxina CryIA(b) en pMYC2523 figura 8). La secuencia de la protoxina 436 consta de la secuencia CryIA(c) excepto en zonas muy próximas el extremo C-terminal (véanse las patentes de los Estados Unidos Nº^{s}. 5.128.130 y 5.169.760, incorporadas en el presente documento mediante referencias en su totalidad). El DNA de la protoxina para su clonación se generó por PCR con el grupo de cebadores F/M usando un plásmido tal como pMYC467 (patente de los Estados Unidos Nº. 5.169.760) como una plantilla:
"M" (SEQ ID Nº. 17)
5' AGGCTTCCATAGACCTTGTGCG 3'
El DNA obtenido mediante PCR se sometió a digestión con PvuI x BstEII. Se dispuso una ligazón de tres piezas con el DNA de la toxina SpeI-PvuI de pMYC2523, el vector de DNA SpeI-BstEII de pMYC2523, y el DNA módulo de DNA de la protoxina PvuI-BstEII PCR. Una cepa inducible por lactosa de P. fluorescens se sometió a electoporación con la mezcla de ligazón. Los plásmidos correctos en general, se identificaron mediante PCR con el grupo de cebadores F/G y rastreo de incrementos pequeños en tamaño mediante electroforesis en gel de agarosa-TBE. La construcción se llamó pMYC2254. El DNA y las secuencias de proteínas predecidas se encuentran en SEQ ID Nº^{s}. 28 y 29, respectivamente.
Ejemplo 9 Expresión comparativa de toxinas de pMYC2243 y pMYC2254
La expresión de toxinas en P. fluorescens se analizó y describió anteriormente en este documento. La expresión de toxinas de pMYC2254 se mejoró sobre la expresión de pMYC2243.
Ejemplo 10 Análisis de sinergia entre la toxina quimérica CryIF y la toxina quimérica CryIA(c) contra el gusano del grano, Heliothis zea
Veinticuatro Heliothis zea en su primer instar larvario se expusieron a dieta de agar que contenía varias concentraciones de toxina. A los 7 días tras el tratamiento, los ensayos se graduaron por inhibición del crecimiento. Las larvas se inhibieron si la muda del primer al segundo instar se inhibió. Los cálculos para estimar el factor de sinergia (SF) y la actividad esperada (E[exp]) se muestran a continuación.
SF = E(obs)/E(exp)
donde,
SF = factor de sinergia
E(obs) = mortalidad observada
E(exp) = mortalidad esperada
E(exp) = a + b - (ab/100)
donde,
a = actividad del compuesto A
b = actividad del compuesto B
TABLA 2
% de Inhibición
CryIF/CryA(b) CryIA(c)/CryA(b) 1:1 mezcla de las dos toxinas quiméricas
Tasa \mug toxina/ A b E(exp) E(obs) SF
g de dieta
50,0 - - - - 50 78 1,6
25,0 13 23 22 62 2,8
12,5 9 14 22 31 1,4
6,25 9 14 - - - - - -
Un SF mayor que 1 indica sinergia (Levy, Y., Benderly, Y. Cohen, U. Gisi, D. Bassard [1986] Bulletin OEPP/
EPPO Bulletin 16: 651-657).
Abbott, W.S. (1925) J. Economic Entomology 18: 265-267.
Ejemplo 11 Análisis de la sinergia entre la toxina quimérica CryIF y la toxina quimérica CryIA(c) contra el contra el gusano del grano, Heliothis zea
Veinticuatro Heliothis zea en su primer instar larvario se expusieron a dieta de agar que contenía varias concentraciones de toxina. A los 7 días tras el tratamiento, los ensayos se graduaron por inhibición del crecimiento. Las larvas se inhibieron si la muda del primer al segundo instar se inhibió. Las dosis requeridas para inhibir el 50% de las poblaciones (ED_{50}) se estimularon usando técnicas de análisis estándar de probit. Los cálculos para estimar el factor de sinergia (SF) y las dosis efectivas esperadas se muestran a continuación:
SF = ED(exp)/ED(obs)
donde,
ED(exp) = dosis efectiva esperada de una muestra
ED(obs) = dosis efectiva observada de una muestra
ED(exp) = (a + b)/a/ED_{A} + b/ED_{B}
donde,
a = proporción de un compuesto A en la mezcla
b = proporción de un compuesto B en la mezcla
ED_{A} y ED_{B}= dosis igualmente efectivas de A y B en la mezcla.
TABLA 3
ED(obs) ED(exp)
Tratamiento (\mug toxina/g dieta) SF
CryIA(c)/CryIA(b) (A) 36 - - - -
CryIF/CryIA(b) (B) 135 - - - -
A:B (1:1) 21 57 2,6
A:B (3:1) 14 44 3,1
A:B (1:3) 35 80 2,3
Un SF mayor que 1 indica sinergia (Levy y col. [1986], supra).
[CITE para el procedimiento Wadley]
(1) INFORMACIÓN GENERAL:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
SOLICITANTE:
Nombre del solicitante: MYCOGEN CORPORATION
Domicilio: 5501 Oberlin Drive
Ciudad: San Diego.
Estado/provincia: California
País: Estados Unidos.
Código postal/zip: 92121
Número de teléfono: (619) 453-8030 \hskip0.5cm Número de fax: (619) 453-6991
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TÍTULO DE LA INVENCIÓN: Composiciones novedosas de pesticidas
\vskip0.800000\baselineskip
(iii)
NÚMERO DE SECUENCIAS: 34
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
DOMICILIO POSTAL:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
CONSIGNATARIO: David R. Saliwanchik
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
CALLE: 2421 N.W. calle 41ª, suite A-1
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CIUDAD: Gainesville
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
ESTADO: FL
\vskip0.500000\baselineskip
(E)
PAÍS: Estados Unidos
\vskip0.500000\baselineskip
(F)
ZIP: 32606
\vskip0.800000\baselineskip
(v)
FORMA LEGIBLE POR COMPUTADOR:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
MEDIO TIPO: disquete
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
ORDENADOR: IBM PC compatible
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
SISTEMA OPERATIVO: PC-DOS/MS-DOS
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
SOFTWARE: patentin, release #1.0, versión #1.25
\vskip0.800000\baselineskip
(vi)
DATOS DE LA PRESENTE SOLICITUD:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NÚMERO DE SOLICITUD: US
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
FECHA PRESENTACION:
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
CLASIFICACIÓN:
\vskip0.800000\baselineskip
(viii)
INFORMACIÓN SOBRE ABOGADO/AGENTE:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
NOMBRE: Saliwanchik, David R.
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
NÚMERO DE REGISTRO. 31.794
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
REFERENCIA/Nº EXPEDIENTE: MA86
\vskip0.800000\baselineskip
(ix)
INFORMACIÓN DE TELECOMUNICACIONES:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
TELÉFONO: 904-375-8100
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TELEFAX: 904-372-5800
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº. 1:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 39 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
ENCADENAMIENTO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (sintético)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID Nº.:1:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GCATACTAGT AGGAGATTTC CATGGATAAC AATCCGAAC
\hfill
39
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº.: 2:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 18 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
ENCADENAMIENTO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (sintético)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID Nº.:2:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GGATCCGCTT CCCAGTCT
\hfill
18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº.: 3:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 29 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
ENCADENAMIENTO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (sintético)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID Nº.:3:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
AGAGAGTGGG AAGCGGATCC TACTAATCC
\hfill
29
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº.: 4:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 28 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
ENCADENAMIENTO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (sintético)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID Nº.:4:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
TGGATACTCG ATCGATATGA TAATCCGT
\hfill
28
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº.: 5:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 18 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
ENCADENAMIENTO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (sintético)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID Nº.:5:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
TAATAAGAGC TCCTATGT
\hfill
18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº.: 6:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 28 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
ENCADENAMIENTO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (sintético)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID Nº.:6:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
TATCATATCG ATCGAGTATC CAATTTAG
\hfill
28
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº.: 7:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 18 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
ENCADENAMIENTO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (sintético)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID Nº.:7:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GTCACATAGC CAGCTGGT
\hfill
18
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº.: 8:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 36 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
ENCADENAMIENTO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (sintético)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID Nº.:8:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GAGTGGGAAG CAGATCTTAA TTATGCACAA TTAAGG
\hfill
36
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº.: 9:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 17 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
ENCADENAMIENTO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (sintético)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID Nº.:9:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
TTAATCATCG GCTCGTA
\hfill
17
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº.:10:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 23 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
ENCADENAMIENTO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (sintético)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID Nº.:10:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
ACTCGATCGA TATGATARTC CGT
\hfill
23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº.: 11:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 45 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
ENCADENAMIENTO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (sintético)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID Nº.:11:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
GGACTAGTAA AAAGGAGATA ACCATGGAAA ATAATATTA AAATC
\hfill
45
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº.: 12:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 64 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
ENCADENAMIENTO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (sintético)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID Nº.:12:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
TCCAGCGGCA GGCGGCCGGT GCTGCGTTCT TCGTTCAGTA TTCTA
\hfill
60
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CTTC AGGATTATTTAAAC
\hfill
64
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº.: 13:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 65 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
ENCADENAMIENTO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (sintético)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID Nº.:13:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
AACGCAGCAC CGGCCGCCTG CCGCTGGACA TCAGCCTGAG CCTTA
\hfill
60
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CACGT TTCCTTTTGA GTGAA
\hfill
65
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº.: 14:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 17 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
ENCADENAMIENTO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (sintético)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID Nº.:14:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
CATCAAAGGT ACCTGGT
\hfill
17
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº.: 15:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 22 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
ENCADENAMIENTO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (sintético)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID Nº.:15:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
TGCCGCTGGA CATCAGCCTG AG
\hfill
22
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº.: 16:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 41 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
ENCADENAMIENTO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (sintético)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID Nº.: 16:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
TCTAGAGAGCGG CCGCTTATAC YCGATCGATA TGATARTCCG T
\hfill
41
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº.: 17:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 24 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
ENCADENAMIENTO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (sintético)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID Nº.:17:
\vskip1.000000\baselineskip
\vskip0.400000\baselineskip
\hskip-.1em\dddseqskip
AGGCTTCCAT AGATACCTTG TGCG
\hfill
24
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº.: 18
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 3465 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
ENCADENAMIENTO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID Nº.: 18:
\vskip1.000000\baselineskip
1
2
3
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº.: 19:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1155 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
ENCADENAMIENTO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID Nº.: 19:
\vskip1.000000\baselineskip
4
5
6
7
8
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº.: 20:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 3450 bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
ENCADENAMIENTO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID Nº.: 20:
\vskip1.000000\baselineskip
9
10
11
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº.: 21:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1150 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
ENCADENAMIENTO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID Nº.: 21:
12
13
14
15
16
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº.: 22:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 3444 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
ENCADENAMIENTO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID Nº.: 22:
\vskip1.000000\baselineskip
17
18
19
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº.: 23:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1148 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
ENCADENAMIENTO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID Nº.: 23:
20
21
22
23
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº.: 24:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 3522 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
ENCADENAMIENTO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID Nº.: 24:
24
25
26
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº.: 25:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1174 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
ENCADENAMIENTO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID Nº.: 25:
\vskip1.000000\baselineskip
27
28
29
30
31
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº.: 26:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 3444 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
ENCADENAMIENTO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID Nº.: 26:
\vskip1.000000\baselineskip
32
33
34
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº.: 27:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1148 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
ENCADENAMIENTO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID Nº.: 27:
35
36
37
38
39
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº.: 28:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 3522 pares de bases
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: ácido nucleico
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
ENCADENAMIENTO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: DNA (genómico)
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID Nº.: 28:
\vskip1.000000\baselineskip
40
41
42
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº.: 29:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1174 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
ENCADENAMIENTO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID Nº.: 29:
43
44
45
46
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº.: 30:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 12 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
ENCADENAMIENTO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID Nº.: 30:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Xaa Xaa Ile Asp Xaa Xaa Glu Xaa Xaa Xaa Xaa Xaa}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº.: 31:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 8 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
ENCADENAMIENTO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: péptido
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID Nº.: 31:
\vskip1.000000\baselineskip
\sa{Tyr Pro Asn Asn Thr Val Thr Cys}
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº.: 32:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1174 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
ENCADENAMIENTO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID Nº.: 32:
\vskip1.000000\baselineskip
47
48
49
50
51
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº.: 33:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1155 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
ENCADENAMIENTO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID Nº.: 33:
52
53
54
55
\vskip1.000000\baselineskip
(2) INFORMACIÓN PARA LA SEQ ID Nº.: 34:
\vskip0.800000\baselineskip
(i)
CARACTERÍSTICAS DE SECUENCIA:
\vskip0.500000\baselineskip
(A)
LONGITUD: 1182 aminoácidos
\vskip0.500000\baselineskip
(B)
TIPO: aminoácido
\vskip0.500000\baselineskip
(C)
ENCADENAMIENTO: simple
\vskip0.500000\baselineskip
(D)
TOPOLOGÍA: lineal
\vskip0.800000\baselineskip
(ii)
TIPO DE MOLÉCULA: proteína
\vskip0.800000\baselineskip
(xi)
DESCRIPCIÓN DE SECUENCIA: SEQ ID Nº.: 34:
56
57
58
59

Claims (10)

1. Una composición para controlar las plagas de lepidópteros, que comprende una proteína que contiene una toxina núcleo quimérica CryIF y una proteína que contiene una toxina núcleo quimérica CryIA(c), o células que expresen estas proteínas.
2. La composición de acuerdo con la reivindicación 1, en la que la proteína que contiene una toxina núcleo quimérica CryIF comprende una parte de proteína núcleo CryIF N-terminal y una parte C-terminal heteróloga de toxina de una toxina CryIA(b) o de una toxina quimérica CryIA(b)/CryIA(c).
3. La composición de acuerdo con la reivindicación 2, en la que la proteína que contiene una toxina núcleo quimérica CryIF tiene de 1150 a 1200 aminoácidos, la secuencia núcleo N-terminal de CryIF tiene de 590 a 1100 aminoácidos y la parte protoxina de CryIA(b) o CryIA(c)/CryIA(b) comprender de al menos 100 aminoácidos en el extremo C-terminal de dicha proteína.
4. La composición de acuerdo con la reivindicación 3, en la que la transición de la parte de toxina núcleo CryIF N-terminal a la parte protoxina heteróloga ocurre después de la SEQ ID Nº. 30 y antes del final de la SEQ ID Nº. 31.
5. La composición de acuerdo con la reivindicación 4, en la que la parte de toxina núcleo comprende aproximadamente los primeros 601 aminoácidos de una toxina CryIF, y la parte C-terminal protoxina comprende la secuencia de aminoácidos de CryIA(b) o CryIA(c)/ CryIA(b) que sigue a la SEQ ID Nº. 31.
6. La composición de acuerdo con la reivindicación 4, en la que la proteína que contiene la toxina núcleo comprende esencialmente la SEQ ID Nº. 23, SEQ ID Nº. 29, o la secuencia que se muestra en la figura 9.
7. La composición de acuerdo con cualquier reivindicación precedente en la que la proteína que contiene una toxina núcleo quimérica CryIA(c) comprende esencialmente la SEQ ID Nº. 34.
8. Células que expresan ambas proteínas definidas en cualquiera de las reivindicaciones 1 a 7.
9. Células de acuerdo con la reivindicación 8, las cuales expresan la SEQ ID Nº. 23 o la SEQ ID Nº. 29, y también la SEQ ID Nº. 34.
10. Un procedimiento para controlar las plagas de lepidópteros, que comprende poner en contacto a las plagas o su ambiente con una composición de acuerdo con cualquiera de las reivindicaciones 1 a 7, o células de acuerdo con la reivindicación 8 o la reivindicación 9.
ES95944316T 1994-12-06 1995-12-04 Composicion pesticida que comprende delta-endotoxina de bacillus thurigiensis quimerico cryif y bacillus thurigiensis quimerico cryia(c). Expired - Lifetime ES2218562T3 (es)

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