EP0939824B1 - Reagenzien und methoden zum nachweis von erkrankungen der brust - Google Patents

Claims (33)

1. Ein Verfahren zur Detektion des Vorhandenseins eines BS106 Zielpolynukleotids in einer Testprobe, das folgendes umfaßt:

   (a) In-Kontakt-Bringen der Testprobe mit mindestens einem BS106-spezifischen Polynukleotid, welches in der Lage ist an das BS106-Zielpolynukleotid zu hybridisieren; und

   (b) Detektieren des Vorhandenseins des BS106-Zielpolynukleotids in der Testprobe, worin das BS106-spezifische Polynukleotid eine Sequenz hat, die gewählt ist aus der Gruppe bestehend aus Sequenzidentifikationsnummer 1, Sequenzidentifikationsnummer 2, Sequenzidentifikationsnummer 3, Sequenzidentifikationsnummer 4, Sequenzidentifikationsnummer 5, und Fragmenten und Komplementen davon, worin die Fragmente Sequenzen aus mindestens 15 Nukleotiden sind, die identisch oder komplementär sind zu einer Region der Sequenzidentifikationsnummer 1, Sequenzidentifikationsnummer 2, Sequenzidentifikationsnummer 3, Sequenzidentifikationsnummer 4, Sequenzidentifikationsnummer 5,
2. Das Verfahren von Anspruch 1, worin das Zielpolynukleotid an eine feste Phase angeheftet wird, bevor Schritt (a) durchgeführt wird.
3. Ein Verfahren zur Detektion von BS106 mRNA in einer Testprobe, das folgendes umfaßt:

   (a) Durchführen einer reversen Transkription mit mindestens einem Primer, um cDNA zu erzeugen;

   (b) Amplifizieren der cDNA, die aus Schritt (a) erhalten wurde, unter Verwendung von BS106-spezifischen Oligonukleotiden, die in der Lage sind, als Sense- und Antisenseprimer der cDNA zu wirken, um ein BS106-Amplikon zu erhalten; und

   (c) Detektieren des Vorhandenseins des BS106-Amplikons in der Testprobe, worin die Oligonukleotide, die in Schritten (a) und (b) verwendet wurden, eine Sequenz haben, die gewählt ist aus der Gruppe bestehend aus Sequenzidentifikationsnummer 1, Sequenzidentifikationsnummer 2, Sequenzidentifikationsnummer 3, Sequenzidentifikationsnummer 4, Sequenzidentifikationsnummer 5, und Fragmenten und Komplementen davon, worin die Fragmente Sequenzen aus mindestens 15 Nukleotiden sind die identisch oder komplementär sind zu einer Region der Sequenzidentifikationsnummer 1, Sequenzidentifikationsnummer 2, Sequenzidentifikationsnummer 3, Sequenzidentifikationsnummer 9, Sequenzidentifikationsnummer 5.
4. Das Verfahren von Anspruch 3, worin die Testprobe mit einer festen Phase reagiert wird, bevor einer der Schritte (a), (b) oder (c) durchgeführt wird.
5. Das Verfahren von Anspruch 3, worin der Detektionsschritt die Verwendung eines detektierbaren Markers umfaßt, der in der Lage ist ein meßbares Signal zu erzeugen.
6. Ein Verfahren zur Detektion eines BS106-Zielpolynukleotids in einer Testprobe, das folgendes umfaßt:

   (a) In-Kontakt-Bringen der Testprobe mit mindestens einem Oligonukleotid, das in der Lage ist als ein Senseprimer für das BS106-Zielpolynukleotid zu wirken, und mit mindestens einem Oligonukleotid, das in der Lage ist als ein Antisenseprimer für das BS106-Zielpolynukleotid zu wirken, und Amplifizieren, um ein Reaktionsprodukt erster Stufe zu erhalten;

   (b) In-Kontakt-Bringen des Reaktionsprodukts erster Stufe mit mindestens einem anderen Oligonukleotid, um ein Reaktionsprodukt zweiter Stufe zu erhalten, unter der Voraussetzung, daß das andere Oligonukleotid 3' zu den Oligonukleotiden angeordnet ist, die in Schritt (a) verwendet wurden, und komplementär ist zu dem Reaktionsprodukt erster Stufe; und

   (c) Detektieren des Reaktionsprodukts zweiter Stufe als ein Anzeichen für das Vorhandensein des Zielpolynukleotids, worin die Oligonukleotide, die in Schritten (a) und (b) verwendet wurden, eine Sequenz haben, die gewählt ist aus der Gruppe bestehend aus Sequenzidentifikationsnummer 1, Sequenzidentifikationsnummer 2, Sequenzidentifikationsnummer 3, Sequenzidentifikationsnummer 4, Sequenzidentifikationsnummer 5, und Fragmenten und Komplementen davon, worin die Fragmente Sequenzen aus mindestens 15 Nukleotiden sind, die identisch oder komplementär sind zu einer Region der Sequenzidentifikationsnummer 1, Sequenzidentifikationsnummer 2, Sequenzidentifikationsnummer 3, Sequenzidentifikationsnummer 4, Sequenzidentifikationsnummer 5.
7. Das Verfahren von Anspruch 6, worin die Testprobe mit einer festen Phase reagiert wird, bevor einer der Schritte (a), (b) oder (c) durchgeführt wird.
8. Das Verfahren von Anspruch 6, worin der Detektionsschritt die Verwendung eines detektierbaren Markers umfaßt, der in der Lage ist ein meßbares Signal zu erzeugen.
9. Das Verfahren von Anspruch 8, worin der detektierbare Marker mit einer festen Phase reagiert wird.
10. Ein gereinigtes Polynukleotid mit einer Sequenz, die gewählt ist aus der Gruppe bestehend aus Sequenzidentifikationsnummer 1, Sequenzidentifikationsnummer 2, Sequenzidentifikationsnummer 3, Sequenzidentifikationsnummer 4, Sequenzidentifikationsnummer 5, und Fragmenten und Komplementen davon, worin die Fragmente Sequenzen mit einer Länge von 15 bis 50 Nukleotiden sind, die identisch oder komplementär sind zu einer Region der Sequenzidentifikationsnummer 1, Sequenzidentifikationsnummer 2, Sequenzidentifikationsnummer 3, Sequenzidentifikationsnummer 4, Sequenzidentifikationsnummer 5.
11. Ein Testkit, der nützlich ist zur Detektion von BS106-Polynukleotiden in einer Testprobe, welcher einen Behälter umfaßt, der mindestens ein Polynukleotid gemäß Anspruch 10 enthält.
12. Das gereinigte Polynukleotid von Anspruch 10, worin das Polynukleotid durch rekombinante Techniken oder synthetische Techniken erzeugt wird.
13. Das gereinigte Polynukleotid von Anspruch 10, worin das Polynukleotid eine Sequenz umfaßt, die mindestens ein Epitop kodiert.
14. Ein rekombinantes Expressionssystem, das eine Nukleinsäuresequenz umfaßt, die einen offenen Leserahmen einschließt, der operativ an eine Kontrollsequenz geknüpft ist, die mit einem gewünschten Wirt kompatibel ist, worin die Nukleinsäuresequenz eine Sequenz hat, die gewählt ist aus der Gruppe bestehend aus Sequenzidentifikationsnummer 1, Sequenzidentifikationsnummer 2, Sequenzidentifikationsnummer 3, Sequenzidentifikationsnummer 4, Sequenzidentifikationsnummer 5 und Komplementen davon.
15. Eine isolierte Zelle, die mit dem rekombinanten Expressionssystem von Anspruch 14 transfiziert wurde.
16. Ein Polypeptid, das eine Aminosäuresequenz hat, die gewählt ist aus der Gruppe bestehend aus Sequenzidentifikationsnummer 16, Sequenzidentifikationsnummer 17, Sequenzidentifikationsnummer 18, Sequenzidentifikationsnummer 19, Sequenzidentifikationsnummer 20.
17. Das Polypeptid von Anspruch 16, worin das Polypeptid durch rekombinante Techniken oder synthetische Techniken hergestellt wird.
18. Ein Antikörper, welcher spezifisch an mindestens ein BS106-Epitop bindet, worin das BS106-Epitop gewählt ist aus der Gruppe bestehend aus Sequenzidentifikationsnummer 16, Sequenzidentifikationsnummer 17, Sequenzidentifikationsnummer 18, Sequenzidentifikationsnummer 19, Sequenzidentifikationsnummer 20.
19. Ein Assaykit zur Bestimmung des Vorhandenseins eines BS106-Antigens oder Antikörpers in einer Testprobe, der einen Behälter umfaßt, der ein Polypeptid gemäß Anspruch 16 enthält.
20. Der Assaykit von Anspruch 19, worin das Polypeptid an eine feste Phase angeheftet ist.
21. Ein Verfahren zur Herstellung eines Polypeptids, das mindestens ein Epitop umfaßt, wobei das Verfahren das Inkubieren von Wirtszellen umfaßt, die mit einem Expressionsvektor transfiziert wurden, der eine Polynukleotidsequenz enthält, die ein Polypeptid kodiert, worin das Polypeptid eine Aminosäuresequenz umfaßt, die gewählt ist aus der Gruppe bestehend aus Sequenzidentifikationsnummer 16, Sequenzidentifikationsnummer 17, Sequenzidentifikationsnummer 18, Sequenzidentifikationsnummer 19, Sequenzidentifikationsnummer 20.
22. Ein Verfahren zur Detektion eines BS106-Antigens in einer Testprobe, von der vermutet wird, daß sie das BS106-Antigen enthält, das folgendes umfaßt:

    (a) In-Kontakt-Bringen der Testprobe mit einem Antikörper, welcher spezifisch an mindestens ein Epitop eines BS106-Antigens bindet, das gewählt ist aus der Gruppe bestehend aus Sequenzidentifikationsnummer 16, Sequenzidentifikationsnummer 17, Sequenzidentifikationsnummer 18, Sequenzidentifikationsnummer 19, Sequenzidentifikationsnummer 20, worin das In-Kontakt-Bringen für einen Zeitraum und unter Bedingungen ausgeführt wird, die ausreichend sind für die Bildung von Antikörper/Antigenkomplexen; und

    (b) Detektieren des Vorhandenseins der Komplexe als ein Anzeichen für das Vorhandensein des Antigens.
23. Das Verfahren von Anspruch 22, worin der Antikörper an eine feste Phase angeheftet wird.
24. Ein Verfahren zur Detektion des Vorhandenseins von Antikörpern, die spezifisch sind für ein BS106-Antigen, in einer Testprobe, von der vermutet wird, daß sie die Antikörper enthält, wobei das Verfahren folgendes umfaßt:

    (a) In-Kontakt-Bringen der Testprobe mit einem Polypeptid, worin das Polypeptid mindestens ein BS106-Epitop enthält, das eine Sequenz hat, die gewählt ist aus der Gruppe bestehend aus Sequenzidentifikationsnummer 16, Sequenzidentifikationsnummer 17, Sequenzidentifikationsnummer 18, Sequenzidentifikationsnummer 19, Sequenzidentifikationsnummer 20, und worin weiter das In-Kontakt-Bringen für einen Zeitraum und unter Bedingungen ausgeführt wird, die ausreichend sind, um die Bildung von Antigen/Antikörperkomplexen zu erlauben; und

    (b) Detektieren der Komplexe.
25. Das Verfahren von Anspruch 24, worin das Polypeptid an eine feste Phase angeheftet ist.
26. Eine isolierte Zelle, die mit einer Nukleinsäuresequenz transfiziert wurde, die mindestens ein Epitop kodiert, worin die Nukleinsäuresequenz gewählt ist aus der Gruppe bestehend aus Sequenzidentifikationsnummer 1, Sequenzidentifikationsnummer 2, Sequenzidentifikationsnummer 3, Sequenzidentifikationsnummer 4, Sequenzidentifikationsnummer 5, und Komplementen davon.
27. Verwendung eines isolierten immunogenen Polypeptids zur Herstellung von Antikörpern zur Verwendung in in vitro BS106 Antigen-Detektionsverfahren, worin die Antikörper spezifisch an BS106-Antigen binden, wobei die Verwendung das Verabreichen des immunogenen Polypeptids an ein nicht-menschliches Säugetier einschließt, worin das immunogene Polypeptid mindestens ein BS106-Epitop umfaßt, und gewählt ist aus der Gruppe bestehend aus Sequenzidentifikationsnummer 16, Sequenzidentifikationsnummer 17, Sequenzidentifikationsnummer 18, Sequenzidentifikationsnummer 19, Sequenzidentifikationsnummer 20.
28. Verwendung eines Plasmids, das eine Sequenz umfaßt, die mindestens ein BS106-Epitop kodiert, abgeleitet von einem Polypeptid, das eine Aminosäuresequenz hat, die gewählt ist aus der Gruppe bestehend aus Sequenzidentifikationsnummer 16, Sequenzidentifikationsnummer 17, Sequenzidentifikationsnummer 18, Sequenzidentifikationsnummer 19, Sequenzidentifikationsnummer 20, zur Herstellung eines Produkts zur Erzeugung von Antikörpern zur Verwendung in in vitro BS106-Antigen-Detektionsverfahren, worin die Antikörper spezifisch an BS106-Antigen binden, wobei die Verwendung das Verabreichen des Produkts an ein nicht-menschliches Säugetier einschließt.
29. Eine Zusammensetzung aus einem Material, das ein Polynukleotid gemäß Anspruch 11 umfaßt.
30. Eine Zusammensetzung aus Material, das ein Polypeptid umfaßt, das mindestens ein Epitop gemäß Anspruch 17 enthält.
31. Der Testkit von Anspruch 11 oder 19, der weiter einen Behälter mit Geräten umfaßt, die zur Probensammlung nützlich sind, worin die Geräte gewählt sind aus der Gruppe bestehend aus Lanzetten, Saugpapier, Stoff, Tupfern und Bechern.
32. Ein Gen, welches für ein Protein kodiert, das die Aminosäuresequenz von Sequenzidentifikationsnummer 16 umfaßt.
33. Ein Gen, das DNA mit der Sequenz von Sequenzidentifikationsnummer 4 oder Sequenzidentifikationsnummer 5 umfaßt.

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