EP0626013A1 - RECOMBINANT $g(b)-LACTAMASE USABLE AS CARRIER MOLECULE FOR THE PREPARATION OF IMMUNOGENIC COMPOSITIONS - Google Patents

RECOMBINANT $g(b)-LACTAMASE USABLE AS CARRIER MOLECULE FOR THE PREPARATION OF IMMUNOGENIC COMPOSITIONS

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Publication number
EP0626013A1
EP0626013A1 EP93905393A EP93905393A EP0626013A1 EP 0626013 A1 EP0626013 A1 EP 0626013A1 EP 93905393 A EP93905393 A EP 93905393A EP 93905393 A EP93905393 A EP 93905393A EP 0626013 A1 EP0626013 A1 EP 0626013A1
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EP
European Patent Office
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lactamase
recombinant
sequence
nucleotide sequence
protein
Prior art date
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Withdrawn
Application number
EP93905393A
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German (de)
French (fr)
Inventor
Brigitte Gicquel
Juliano Timm
Joaquim Trias
Colette Duez
Mariagrazia Perilli
Jean Dusart
Jean-Marie Frere
Current Assignee (The listed assignees may be inaccurate. Google has not performed a legal analysis and makes no representation or warranty as to the accuracy of the list.)
Institut Pasteur de Lille
Original Assignee
Institut Pasteur de Lille
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Filing date
Publication date
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Withdrawn legal-status Critical Current

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    • C12N2740/16222New viral proteins or individual genes, new structural or functional aspects of known viral proteins or genes

Definitions

  • Î-lactamase recom-binante usable as a carrier molecule for the preparation of immunogenic compositions.
  • the present application relates to new means for the preparation of immunogenic compositions and preferably protective vaccinating compositions, capable of being in the form of "live vaccines", of particles or molecules which can be administered to humans or animals. .
  • One of the aims of the present invention is to propose means for developing immunogenic compositions capable of triggering in humans or in animals a cellular and / or humoral immune response (by means of antibodies), against antigenic determinants and in particular epitopes characteristic of different pathogens. More generally, the invention proposes new means for triggering or promoting an immune response against any determined epitope for producing antibodies or a cellular immune response, and in particular when the antigenic determinants are of the hapten type and therefore incapable of triggering by themselves. same this immune response. The invention is also of interest in order to promote an immune response capable of being imparted by an antigen, and in particular to increase the level or the protective character thereof.
  • the invention describes in this regard new molecules capable of being used as a vector for the antigenicity of different epitopes, both in immunogenic compositions containing the hybrid (recombinant) molecules thus formed or in live vaccines.
  • Different factors can be decisive in the choice of a molecule, in particular a protein capable of behaving as a carrier protein (also called a vector) in order to confer or improve the immunogenicity of a heterologous epitope compared to to this molecule.
  • account must be taken of the size parameters of the vector protein as such and of its size relative to that of the epitope which it must contain as well as of the size of the epitope as such.
  • the inventors are interested in proteins of the / 3-lactamase family, some of the properties of which have been studied until now in a context different from that of the present invention.
  • 3-lactamases are enzymes divided into different classes, depending on their enzymatic activity on different substrates. They are produced by different organisms and in particular by bacteria, for example bacteria of the type E. coli, Staphylococcus aureus, or by mycobacteria. These enzymes are studied for their capacity to protect bacteria against the lethal effects of antibiotics of the / 3-lactams type, and therefore their capacity to confer on certain bacteria resistance to different antibiotics. It is in this context of studying the resistance of bacteria to antibiotics that several authors have published articles describing the purification of certain ⁇ -lactamases.
  • heterologous epitope is meant here an amino acid sequence characteristic of a protein and in particular of an antigen different from a / 3-lactamase, at the very least different from the / 3-lactamase chosen as carrier molecule.
  • the known properties of different / 3-lactamases such as the fact that they are exported and monomeric, as well as their structural properties are capable of conferring on them numerous advantages for being used as vector carriers of the antigenicity of different epitopes. They have also proved to be interesting in the context of the development of live vaccines.
  • the inventors determined the sequence and the structural organization of the gene and predicted by modeling the three-dimensional structure of the protein / 3- lactamase from a mycobacterium, Mycobacterium fortuitum (hereinafter referred to as M. fortuitum). Knowledge of this gene has made it possible to locate regions capable of containing between nucleotides 395 and 1274 of this sequence.
  • sequences corresponding to the preceding definitions are constituted by the nucleotide sequences cloned in the plasmids contained in the E. coli strains deposited at the C.N.C.M. under the numbers 1-1170 and 1-1171, as well as any nucleotide sequence hybridizing under stringent conditions with these cloned sequences.
  • the sequence shown in FIG. 4 contains the gene coding for M. fortuitum / 3-lactamase, as well as the non-coding parts.
  • the nucleotide sequence of the M. fortuitum / 3-lactamase gene is not the only sequence of interest in the context of the invention; indeed fragments or part of the sequence shown in Figure 4 can be interesting.
  • an advantageous nucleotide sequence in the context of the invention is the nucleotide sequence corresponding to the non-coding 5 'end of the ⁇ -lactamase gene, this sequence containing the expression signals for the gene for this enzyme.
  • This 5 ′ part of the gene sequence can be used for the expression of various nucleotide sequences in cellular hosts of the mycobacteria type. It is suitable for example for the expression in mycobacteria, of / 3-lactamases originating from organisms other than mycobacteria, since it contains expression signals recognized by mycobacteria.
  • fragments of the nucleotide sequence represented in FIG. 4 which can be used in the context of the invention, are the sequences coding for a 8 truncated protein whose overall structure is preserved, compared to the native protein, in particular under conditions such that the expression product of this nucleotide sequence is stable and in particular insensitive to the cellular proteases of the host which produces it and / or possibly the subject to which it is administered.
  • protein stability is meant in particular the possibility of purifying it or the possibility for this protein to be recognized by an antibody.
  • An advantageous nucleotide sequence is a sequence having similarities with the sequence shown in FIG. 4. By similarity is meant in particular the capacity to hybridize under stringent conditions with the sequence of FIG. 4.
  • a probe determined from the coding sequence represented in FIG. 5 with which one wishes to test the hybridization of a determined sequence; this probe is labeled with 32 p (10 6 cpm / ml) and it is brought into contact with the sequence tested for 16 hours at 65 ° C. in a hybridization solution (50% formamide, 5 ⁇ SSPE, sperm DNA salmon 200 ⁇ g / ml and 10 x Denhart).
  • a hybridization solution 50% formamide, 5 ⁇ SSPE, sperm DNA salmon 200 ⁇ g / ml and 10 x Denhart).
  • the membranes on which the hybridization is carried out are then washed twice for 30 minutes with a 1SSC solution, 0.1% SDS at room temperature (20 ° C.) and then washed twice with 0.1SSC, 0.1% SDS. for 30 minutes at
  • a nucleotide sequence of the invention is characterized in that it codes for a protein of the type / 3-lactamase comprising the amino acid chain shown in FIG. 4.
  • the invention further relates to a recombinant nucleotide sequence characterized in that it comprises: a nucleotide sequence corresponding to one of the preceding definitions, coding for a ⁇ -lactamase, modified by at least one heterologous nucleotide sequence coding for a peptide sequence heterologous comprising at least one epitope, the modification being carried out at at least one site allowing, when the recombinant sequence is expressed, the exposure of the epitope to the surface of / 3-lactamase or its accessibility to the solvent, a nucleotide sequence meeting the previous definitions, coding for a truncated ⁇ -lactamase, modified by at least one 10 heterologous nucleotide sequence encoding a heterologous peptide sequence comprising at least one epitope, the modification being carried out at at least one site allowing, when the recombinant sequence is expressed, the exposure of the epitope to the surface of the / 3-lactamase or
  • the exposure at the level of the recombinant protein, of the heterologous epitope corresponds to the accessibility of this epitope to the solvent, in particular to water molecules, or to the availability of this epitope to be presented to antibodies.
  • the nucleotide sequence coding for ⁇ -lactamase or for a truncated / 3-lactamase can be modified by at least one heterologous nucleotide sequence.
  • the size of the heterologous nucleotide sequence does not constitute an a priori limiting parameter, it is possible to envisage inserting several heterologous sequences within the sequence coding for / 3-lactamase or for a truncated ⁇ -lactamase .
  • heterologous sequences comprising at least one epitope and having a size of a few nucleotides may appear advantageous insofar as the problems which may result from a deformation of the modified / 3-lactamase encoded by the 11 recombinant nucleotide sequence of the invention are limited.
  • the hybrid thus formed retains the most important characteristics of its structure, in particular its capacity to be recognized by anti-/ 3-lactamase antibodies and anti-heterologous sequence antibodies, as well as its capacity to be purified.
  • a protein known as stable according to the invention exhibits at least one of the following properties: the enzymatic activity of / 3-lacta ⁇ tase, if necessary modified in intensity, the ability to be recognized by an antibody, in particular an anti-/ 3- antibody lacta ⁇ nase, or an antibody directed against a heterologous epitope which it contains, when it is a question of the recombinant protein or, an insensitivity to degradation by cellular proteases, the possibility of being purified.
  • a first group of heterologous sequences is characterized in that it comprises sequences coding for a peptide or a polypeptide, involved in the virulence of a pathogenic agent or in general for an antigen with protective potential against a 12 factor produced as a result of infection.
  • a sequence characteristic of a pathogenic organism is, for example, a sequence of virus, parasite, bacteria or fungus (for example of the genus Aspergillus).
  • the sequences of bacteria such as M. leprae, M. tuberculosis, M. intracellulare, M.
  • treponemes pertussis toxin, sequences of other microorganisms such as sporozoites and merozoites of plasmodium, sequences of Leishmania or Schistosoma, Shigella, Neisseria, Borrelia, sequences of viruses including the mumps virus, rubella, measles, herpes, influenza, rabies virus, polio, hepatitis, AIDS HIV, HTLV-I, HTLV-II and SIV as well as oncogenic viruses.
  • the nucleic acid sequence to be expressed can also code for an immunogenic sequence such as that of snake or insect venom.
  • an interesting heterologous nucleotide sequence is, for example, a sequence coding for a peptide sequence of a human retrovirus antigen of HIV type, in particular an envelope, gag, nave or pol antigen of an HIV- retrovirus. 1 or HIV-2.
  • an antigen is said to have "protective potential” when it is capable of triggering or promoting a response 13 protective immune system, in particular by production of antibodies or by induction of a cell-mediated immune response, in particular of the CTL type.
  • Such an antigen with protective potential can consist of an epitope or even a hapten insufficient in itself to trigger the immune response.
  • the invention thus allows the preparation of recombinant proteins of interest in particular for the constitution of immunogenic compositions, in which the epitope exposed on the surface of the recombinant protein is characteristic for example of a hormone, or of any substance which it is sought to attenuate or even neutralize the biological effects.
  • a recombinant nucleotide sequence may consist of a nucleotide sequence coding for / 3-lactamase or a truncated ⁇ -lactamase, as described above in which a heterologous sequence coding for the peptide sequence V3 of the envelope antigen would be inserted.
  • a heterologous sequence coding for the peptide sequence V3 of the envelope antigen would be inserted.
  • different HIV-1 variants or a larger sequence of the envelope of an HIV virus This sequence has been described in the publication by K. Javaherian et al. (Proc. Natl. Acad. Sci. USA 8_6: 6768-6772, 1989).
  • the heterologous sequence coding for the V3 peptide sequence is inserted at the BglII site of the sequence coding for ⁇ -lactamase.
  • the invention also relates to a recombinant • cloning and / or expression, replicative or integrative vector characterized in that it is modified, in one of its non-essential sites for its replication or its integration, by a nucleotide sequence recombinant described above. 14
  • the recombinant nucleotide sequence contained in the vector is under the control of the expression promoter of / 3-lactamase corresponding to the sequence.
  • this vector When this vector is modified by the coding sequence alone or by a partial coding sequence for / 3-lactamase, it may also include expression, translation and even secretion signals, of origin different from that of ⁇ - lactamase, chosen according to the host in which one seeks to clone or express this recombinant vector.
  • a plasmid of the invention is the plasmid pACYC184BlaM containing the SphI fragment of the sequence of the / 3-lactamase of M. fortuitum presented in FIG. 4, and which is deposited at the C.N.C.M. (National Collection of Microorganisms, Paris, France) in an E.coli HB101 strain (pACYC184BlaM), under the number 1-1171 deposited on February 11, 1992.
  • the plasmid pACYC184BlaM contains the Sphl / SphI fragment, of about 4.7 kb, of the genomic DNA of M. fortuitum D316 hybridizing with the BlaOl probe. This fragment carries the first 834 bases of the gene coding for a class A / 3-lactamase, as well as its regulatory regions.
  • the culture medium recommended for this strain is an L-Broth medium plus chloramphenicol (30 ⁇ g / ml) and the seeding is carried out on L-Broth medium, the incubation temperature being approximately 37 ° C. with stirring.
  • Another preferred plasmid according to 1 st invention contains the gene of the / 3-lactamase M. fortuitum; he 15 This is the plasmid pIPJ39 contained in a strain of E.coli MC1061 (pIPJ39), deposited at the CNCM on February 11, 1992 under the number 1-1170.
  • Plasmid pIPJ39 contains the approximately 6 kb BamHI / BamIII fragment of the genomic DNA of M. fortuitum FC1 hybridizing with the BlaOl probe. This fragment carries the gene coding for a class A / 3-lactamase, as well as flanking regions.
  • the culture medium recommended for this strain is an L-Broth medium plus ampicillin (100 ⁇ g / ml) and the seeding is carried out with an L-Broth medium and the incubation temperature is approximately 37 ° C. with stirring.
  • the subject of the invention is also a recombinant cellular host, characterized in that it is transformed by a recombinant nucleotide sequence described above or by a recombinant vector above, under conditions allowing the expression of the recombinant nucleotide sequence under the form of a stable fusion protein and its exposure or export to the surface of the host or its secretion into the extracellular medium.
  • Many cellular hosts can be modified by a recombinant nucleotide sequence or a recombinant vector according to the invention.
  • a suitable method for the preparation of recombinant cellular hosts according to the invention is for example 1 electroporation, in accordance with the description of Snapper S. et al (1988, PNAS USA 85: 6985-6991) or the conjugation according for example the technique of Lazraq R. et al (1990, FEMS Microbiol. Lett. 69_: 135-138), or according to the technique of Gormley EP and Davies J. (J. Bacteriol, 173: 6705-6708).
  • mycobacteria will be used when the sequence coding for ⁇ -lactamase is a sequence originating in mycobacterium.
  • the transfer into a strain of mycobacteria of the gene coding for a / 3-lactamase of mycobacterium makes it possible to facilitate the expression of this sequence, insofar as the recognition and expression, and even secretion, signals contained in the ⁇ -lactamase gene are recognized by the host mycobacteria.
  • a strain of Actinomycetes and in particular an avirulent or made avirulent strain can be used, ensuring that the recognition signals are suitable for the expression of the recombinant sequence or of the recombinant vector introduced into the strain. .
  • the invention therefore relates to a strain of BCG, transformed by a recombinant nucleotide sequence or a recombinant vector of the invention allowing exposure to the surface of the cell of a recombinant protein (hybrid protein), under conditions ensuring the exposure of the epitope or epitopes against which one seeks to induce an immune response.
  • a recombinant protein hybrid protein
  • a hybrid protein is said to be exposed when it is extracellular but remains anchored at a point on the surface of the cell that produces it.
  • the nucleotide sequences of the invention will be expressed in such a way that the expression products are secreted outside the cell which produces them and consequently released into the medium. 17
  • cellular hosts are bacteria, a non-virulent E. coli strain, or a non-virulent strain of enterobacterium such as avirulent salmonella, since the recombinant nucleotide sequence or the above recombinant vector , transforming the bacteria, is placed under the control of expression signals recognized by this bacteria.
  • fungi such as Aspergillus.
  • Other systems for the expression of the recombinant ⁇ -lactamase according to the invention can for example be constituted by animal cells, for example insect cells or mammalian cells such as CHO cells.
  • the vectors specific to the insertion of DNA or 1 ⁇ DNC or even RNA into these cells can be viruses, or plasmids.
  • Other systems such as yeast systems such as Saccharomyces Cerevisiae may also be suitable.
  • exposed site is meant a site which allows access or recognition of the heterologous peptide sequence and in particular access to the epitope or epitopes or their recognition, in order to obtain an immune response.
  • An exposed site is 18 either a site on the surface of the protein / 3-lactamase or a site contained in this protein whose epitope remains recognized by the antibodies, for example even when the protein is denatured.
  • the heterologous peptide sequence is inserted upstream of a site normally not exposed on the surface of the ⁇ -lactamase protein, this site being exposed due to the insertion of the heterologous sequence, for example following a folding resulting from interactions between the protein / 3-lactamase and the heterologous sequence.
  • a heterologous peptide sequence is inserted into the M. fortuitum ⁇ -lactamase in the region forming the junction between the ⁇ 2 helix and the ⁇ 3 helix of the ⁇ -lactamase.
  • Other preferred insertion sites are formed by the regions between the ⁇ 2 sheet and the ⁇ 2 helix, between the o: 3 helix and the ⁇ 4 helix or even between the ⁇ 4 sheet and the ⁇ 5 sheet.
  • the heterologous sequence can also be inserted into the C-terminal part of the sequence of ⁇ -lactamase.
  • the location of the ⁇ helices and ⁇ sheets giving them their structure will advantageously be determined, relative to the data obtained for the ⁇ -lactamase from S. aureus.
  • the insertion is carried out in such a way that the heterologous peptide sequence is accessible to the water molecules of the environment.
  • heterologous sequences capable of being inserted into the ⁇ -lactamase or into a truncated ⁇ -lactamase are the sequences which have been described above in the part which relates to the nucleotide sequences. These are, for example, sequences of the HIV retrovirus, in particular sequences of the envelope glycoprotein, the gag, nef or pol proteins, of an HIV-1 or HIV-2 retrovirus. By way of example, mention may be made of the V3 peptide of the HIV-1 envelope.
  • the invention allows the production of recombinant ⁇ -lactamase proteins in which the insertion of the heterologous sequence comprising the epitope is accompanied by a deletion of part of the ⁇ - 20 lactamase.
  • the invention also allows, according to an advantageous embodiment, the insertion of the heterologous sequence without deletion at the level of ⁇ -lactamase.
  • this insertion can be carried out at the C-terminal end of the ⁇ -lactamase, without deletion at the level of the sequence of the latter.
  • the invention also relates to an immunogenic composition characterized in that it comprises a recombinant BCG strain described above, in combination with a pharmaceutical vehicle ent suitable for its administration to humans or animals.
  • Such a composition is capable of constituting a live vaccine. It can be administered by injection or by any other suitable route.
  • Such an immunogenic composition can be used to trigger the immune response, for example to trigger the cellular response and optionally to trigger the production of protective antibodies, or even to contribute to the production of these antibodies in a host to which it is administered.
  • the invention relates not only to the manufacture of vaccinating compositions which can be administered to humans but also to the preparation of compositions for the purposes of vaccination in veterinary medicine.
  • the immunogenic composition of the invention can also be used as a booster composition to stimulate the production of antibodies initiated by the administration of a protein or of another constituent of the pathogenic agent or more generally of The agent against which an immune response is sought.
  • the invention relates to an immunogenic composition characterized in that the strain 21 recombinant it contains as active ingredient is a strain M. bovis type BCG meeting the definitions given above.
  • a particular BCG strain is the avirulent strain of INSTITUT PASTEUR No. 1137P2, used for the commercialized vaccine against tuberculosis.
  • immunogenic compositions of the invention As a pharmaceutical vehicle suitable for the production of the immunogenic compositions of the invention, mention may be made of the physiological excipients that are usually acceptable, in particular neutral or acid excipients and for example magnesium stearate, polyvinyl pyrrolidone or alcohols.
  • This immunogenic composition can also comprise adjuvants of the immune response such as Freund's complete or incomplete adjuvant, aluminum hydroxide, muramyl dipeptide derivatives, a metabolizing oil such as squalene.
  • Another immunogenic composition of the invention is characterized in that it comprises a recombinant protein corresponding to the above definitions, in combination with a pharmaceutical vehicle suitable for its administration.
  • This composition like the immunogenic composition forming the live vaccine, can be used to trigger the immune response or in the form of a booster composition.
  • Plasmid pACYC184 recombined with an insert of approximately 4.7 kb from the ⁇ lactamase gene
  • Plasmid pIPJ39 recombined with the ⁇ lactamase gene
  • nucleotide sequence is indicated in capital letters and is numbered in the right column.
  • the peptide sequence of ⁇ -lactamase is indicated with the three-letter code under the corresponding nucleotide sequence. The numbering is indicated below the sequence.
  • the nucleotide sequence from ntl to ntl061 was determined from the plasmid pIPJ319.
  • MF Mycobacterium fortuitum SA: Streptomyces albus AU: Staphylococcus aureus
  • the different ⁇ helices and ⁇ sheets are indicated by rectangles. This figure also shows the nucleotide sequence and the position of several restriction sites.
  • the plasmid pAL817 is a derivative of pAL5000 and is described in the publication Ranes et al, J. Bacteriol. 172: 2793-2797 (1990).
  • the cassette containing the kanamycin resistance gene of the transposon Tn903 and the plasmid pSL1180 come from the company Pharmacia.
  • the amplification of the V3 fragment is made from the plasmid pTG5167 supplied by Transgene.
  • the plasmid pIPJ42 is a derivative of pIPJ39 where the BglII / BamHI fragment, corresponding to the promoter and the aminoterminal fragment of the gene coding for the beta-lactamase of Mycobacterium fortui tum FC1, has been replaced by the BglII / BglII fragment of pACYC184 promoter and to the aminoterminal fragment of the gene coding for the beta-lactamase of Mycobacterium fortuitum D316.
  • the plasmid pTG5167 is a derivative of pTG186poly (Guy et al, 1987) where a BglII-EcoRI fragment carrying the gene coding for the GP160 protein of HIV1 / MN has been cloned in the polylinker.
  • Figure 9 Construction of the plasmids pRJ27 and pRJ28
  • the amplification of the gag11 fragment is made from the plasmid pTG2103 supplied by Transgene.
  • the plasmid pTG2103 is a derivative of pTG959 (Guy et al, 1987) where a BglII / EcoRI fragment carrying the gene coding for the P24 protein of HIV1 / LAI has been cloned in the polylinker.
  • the amplification of the Gag fragment p24 is made from the plasmid pTG2103 supplied by Transgene.
  • the amplification of the gene coding for the GP63 protein of Leishmania major is made directly from the chromosome of this parasite.
  • Figure 12 Western type analysis of the expression of the beta-lactamase-V3 polypeptide. The molecular weight markers are indicated to the left of line 1.
  • Lane 1 gpl20 protein
  • lane 2 standard BCG supernatant
  • lane 3 extract of standard BCG
  • lane 4 supernatant of recombinant BCG carrying the plasmid pIPJ64
  • lane 5 extract of recombinant BCG carrying the plasmid pIPJ64.
  • Lane 1 molecular weight markers
  • lane 2 Gag P24 protein
  • lane 3 extract of standard BCG
  • lanes 4 and 5 extracts of recombinant BCG carrying the plasmid pRJ28
  • lanes 6 and 7 extracts of recombinant BCG carrying the plasmid pRJ27.
  • Line 1 extract of standard BCG
  • lane 2 Gag P24 protein
  • lane 3 molecular weight markers
  • lanes 4 and 5 extracts of recombinant BCG carrying the plasmid pRJ33 and pRJ34, respectively.
  • Line 15 Western type analysis of the expression of the beta-lactamase-GP63 polypeptide.
  • Line 1 extract of standard BCG
  • lane 2 molecular weight markers
  • lane 3 extract of recombinant BCG carrying pSAIl.5
  • Figure 16 Proliferative responses of cells extracted from the lymph nodes of mice inoculated with BCG carrying the plasmid pRJ28.
  • mice receive an intradermal injection of 10 7 cfu of BCG-pRJ28, 4 others receive standard BCG 1173P2. After 14 days, the peripheral lymph nodes are removed for the proliferation test.
  • the HIV1-LAI Gag P24 protein is used to induce the proliferation of ganglion cells which have been in contact with the BlaM-V3 fusion protein produced by recombinant BCG. 26 EXPERIMENTAL PART
  • a mycobacterial ⁇ -lactamase was used, for its expression in M. bovis BCG, the expression signals being adapted to the mycobacterial context.
  • a M. fortuitum ⁇ -lactamase was previously purified by Amicosante et al and Fattorili et al from a mutant strain producing this enzyme in large quantities.
  • the N-terminal sequence of ⁇ -lactamase was determined by Amicosante et al:
  • APIDDQLAELERRDNVLIGLYAANLQSGRRITHRPDEMFAMXSTFKGYV X corresponds to an indeterminacy.
  • nucleotides are indicated in capital letters; each oligonucleotide belonging to the family is determined by choosing one of the nucleotides indicated in parentheses.
  • the mixture of these oligonucleotides, called Moligol has been chemically synthesized by incorporating one or other of the nucleotides indicated in parentheses.
  • This research also made it possible to define which sequences coded for a ⁇ -lactamase and the signals necessary for the expression of fusion products with ⁇ -lactamase, in which the ⁇ -lactamase is in stable form, and also the signals necessary for the export, even for the secretion, of the recombinant protein produced in a cellular host.
  • BCG Bacillus Calmette et Guérin
  • BCG Bacillus Calmette et Guérin
  • the present invention has made it possible to demonstrate that the use of a vector protein such as ⁇ -lactamase can promote the cloning and expression in mycobacteria, in particular in BCG, of heterologous antigenic determinants.
  • a vector protein such as ⁇ -lactamase
  • BCG as a cellular host for the expression of ⁇ -lactamase
  • use will be made of an exogenous ⁇ -lactamase compared to those which naturally preexist in BCG, in order to avoid or to minimize the phenomena of recombination.
  • nucleotide sequence represented in FIG. 4 participating in the structure of ⁇ -lactamase, or necessary for its expression in an appropriate cellular host, in particular the sequence between nucleotides 1 and 394 of the sequence of FIG. 4 containing the gene expression signals, the coding sequence contained in the sequence represented in FIG. 4, and comprising the nucleotides 395 to 1274,
  • the second mixture of oligonucleotides consists of oligonucleotides corresponding to the complementary strands of the DNA sequences coding for the C-terminal part of the N-terminal fragment indicated above, that is to say: STFKGYV.
  • One of the mixtures contains oligonucleotides of identical or very similar sequence to the 5 'part of BlaM1
  • the second mixture contains oligonucleotides complementary to the 3' part of BlaMl.
  • These two mixtures are used to synthesize the BlaM1 probe by PCR from the DNA that we have extracted from M. fortuitum FC1 (C. Martin et al, Nature Vol. 345: 739-743, 1990).
  • the BlaMl probe was sequenced ( Figure 1). From this sequence, the oligonucleotide, BlaOl: 5 'CTTGAAGGTCGAGCACATCGCGAACAT3' was synthesized and radioactively labeled in order to use it as a probe to locate in a gene bank of M.
  • fortuitum D316 (Amicosante et al) a clone having a fragment carrying the gene coding for ⁇ -lactamase.
  • This library was constructed by cutting the chromosomal DNA of M. fortuitum D316 by the restriction enzyme SphI and by cloning the fragments at random in the vector pACYC184. The SphI fragments were inserted at the SphI site of pACYC184 and the HB101 strain of E. coli was transformed by this ligation mixture in the presence of calcium chloride. The transforming strains were selected on a LB medium containing 30 ⁇ g / ml of chloramphenicol.
  • the resistant strains obtained were subcultured on solid LB medium containing 25 ⁇ g / ml of tetracycline and only those sensitive to this antibiotic were retained.
  • a transforming clone containing a fragment hybridizing with BlaOl was isolated.
  • This clone contains a plasmid pACYC184 recombinant with an insert of approximately 4.7 kb hybridizing with BlaOl.
  • the restriction map of this plasmid was carried out (FIG. 2) and the region hybridizing with BlaOl was sequenced.
  • the nucleotide sequence is indicated in FIG. 4. The analysis of this sequence shows a reading phase having similarities with other class ⁇ -lactamases. We therefore concluded that it must have been the gene for structure of M.
  • the SphI sequence fragment contains only part of the gene.
  • a BglII-SphI restriction fragment (shown in thick lines in FIG. 2) internal to the gene, called Bla02, was used as probe;
  • the whole gene was cloned from a library of M. fortuitum FC1. This library was constructed by cloning 4 to 10 kb BamHI chromosomal fragments isolated by electrophoresis on an agarose gel and cloned into the BamHI site of the plasmid pUC18 linearized by cleavage at this site and dephosphorylated.
  • the transforming clones were selected on a box of LB medium containing 100 ⁇ g / ml of ampicillin.
  • a transforming clone hybridizing with the Bla02 probe was isolated. It contains a recombinant plasmid carrying an insert of approximately 6 kb hybridizing with the Bla02 probe.
  • the restriction map of this insert was performed (FIG. 3) and the region hybridizing with the probe was sequenced. It contains the C-terminus of the gene ( Figure 4).
  • the two gene fragments obtained from the SphI and BamHI have a common part which allows to reconstitute the whole gene; it is represented in FIG. 4 with the amino acid sequence of the protein deduced from the nucleotide sequence.
  • the amino acid sequence has similarities to the sequences of other known class A ⁇ -lactamases.
  • An alignment of the sequences of the ⁇ -lactamases of M. fortuitum, of S. albus, of S. aureus is proposed in FIG. 5.
  • the position of the different structural patterns, helices and ⁇ sheet determined for the ⁇ -lactamase of S. aureus is indicated on the primary structure of this enzyme in the same figure.
  • the position of the structural motifs is proposed to the FIG. 5.
  • nt648 to nt719 contains a unique BglII site which will be used for the insertion of foreign DNA fragments coding for various epitopes.
  • the insertion of epitopes at the C-terminal position of the protein, ie close to nucleotide 1043, could also be of interest.
  • BlaM gene To analyze the expression of the BlaM gene, it was fused with ⁇ -galactosidase, an enzyme that is easy to measure and whose expression in bacteria is easily spotted on a Petri dish. To do this, a BglII-Pstl fragment of 1598 bp, containing a part of the blaM gene and of the upstream region, was isolated and inserted between the BamHI and Pst1 sites of the plasmid pNM482. The resulting blaM-lacZ fusion was then transferred to an E. coli mycobacterium shuttle vector and this construct was used to electroporate E.coli and M. smegmatis.
  • lacZ gene has been observed only in M. smegmatis. These results show that the cloned region located upstream of the blaM gene is sufficient to induce expression of the gene and that it must therefore contain most of the signals for initiating transcription and translation. These signals are specific for mycobacteria. They can therefore therefore advantageously be used for the expression of any cloned gene under their control, in the form of an operon fusion or a protein fusion.
  • the blaM-lacZ fusion is functional shows that the blaM system can be used for the expression of various heterologous genes or fragments of genes in mycobacteria. Depending on the gene fusions carried out, the resulting fusion proteins may have a cytoplasmic localization, be exported outside the bacteria into the culture medium, or remain anchored to the external membrane. Examples of the use of the Pbla promoter associated with all or part of the gene coding for the beta-lactamase which it controls: expression of antigens or fragments of viral or parasitic antigens and induction of specific immune responses by the BCG expressing the one of these antigens.
  • the Pbla promoter ( ⁇ -lactamase promoter) associated with the gene coding for beta-lactamase has been used to express several viral antigenic motifs of HIV1.
  • the sequences are given in relation to the publication "Hu an retrovirus and AIDS 1991" a compilation and analysis of nucleic acid and aminoacid sequences, edited by Myers G. et al., Published by Theoretical Biology and Physics, Group T-10, Mail Stop K710, Los Alamos National Laboratory, Los Alamos, New Mexico 877545 USA) or Leishmania GP63 antigen.
  • the sequences are given in relation to the publication: Button, LL and Me Master, WR (1988) Molecular cloning of the major surface antigen of Leishmania. J. Exp. 167. 724-729) in M. smegmatis and / or the BCG.
  • V3 antigenic motif of HIV1 strain MN and an env fragment of this same strain were expressed in M. smegmatis and / or BCG.
  • Gag P24 antigen of HIV1 strain LAI as well as a fragment of the latter (Gag11) were expressed in BCG.
  • the major surface protein of Leishmania major and Leishmania infantum GP63 were also expressed by BCG.
  • TTTGGATCCCTCTAGACCCGTCGCCACAATGTGCTTGTCTTATAGTTCCT were synthesized by the company GENSET. They served to amplify the env fragment from the plasmid pTG5167 carrying it and originating from TRANSGENE. ( Figure 8).
  • the amplified fragment carries the BamHI restriction site at its ends. It is cut by the corresponding restriction enzyme and cloned into the plasmid pIPJ42.
  • the recombinant plasmid carrying the fragment coding for the determinant V3 is called pIPJ52.
  • plasmid a cassette containing the origin of replication in mycobacteria (ori myco of pAL5000) and the kanamycin resistance gene of Tn903 was inserted between the SplI and BamHI sites.
  • This cassette is the EcoRV / Hpal fragment isolated from the plasmid pIPJ46 (FIG. 8).
  • the plasmids resulting from the insertion of the EcoRV / Hpal fragment in pIPJ52 in either of the orientations are pIPJ64 and pIPJ65.
  • Plasmids pIPJ64 and pIPJ65 were transferred to M. smegmatis and BCG by electroporation.
  • the fusion polypeptide expressed by the plasmids pIPJ64 and pIPJ65 consists of the insertion of the V3 motif between the propellers 2 and 3 of beta-lactamase. This polypeptide is identified in the culture medium of the strains of M. smegmatis and BCG transformed by the plasmids pIPJ64 and pIPJ65, by Western blot using the monoclonal antibody F5-5 of 1, 'Hybridolab of the Pasteur Institute.
  • AAACTGCAGGGATCCATGGGAAGTGACATAGCA AAACTGCAGGGATCCATGGGAAGTGACATAGCA
  • NG2 CCCTGAAGCTTACTCGGCTCTTAGAGTTTT
  • the amplified fragment carries the PstI and HindIII sites. It is cut by the corresponding enzymes and cloned in the plasmid pIPJ42 between the PstI and HindIII sites. The resulting plasmid is called pRJ20.
  • the Kpnl / Hin dm fragment coding for the beta-lactamase-GaglI fusion was inserted at the Seal site of pRR3 (Ranes, MG, Rauzier, J., Lagranderie, M., Georghiu, M. and Gicquel , B. (1990) Functional analysis of pAL5000, a plasmid from Mycobacterium fortui tum: construction of a "mini" Mycobacterium- escherichia coli shuttle vector. J. Bacteriol. 172. 2793-2797) in both directions. The resulting plasmids were called pRJ27 and pRJ28. Plasmids pRJ27 and pRJ28 were transferred to M. smegmatis and BCG by electroporation.
  • the fusion polypeptide expressed by the plasmids pR 27 and pRJ28 consists of the fusion between an amino-terminal fragment of 24 amino acids of beta-lactamase with the fragment gagll since a stop codon is located at the end of gagll.
  • the beta-lactamase-GagII fusion polypeptide is not found in the culture medium of M. smegmatis or of BCG transformed by pRJ27 and pRJ28, but in the cytoplasm of these bacteria.
  • the fragment coding for the protein GagP24 was inserted at the BglII site of the gene coding for beta-lactamase on the plasmid pIPJ42. To do this, a fragment coding for Gag P24 was synthesized in vitro by PCR from the plasmid pTG2103, originating from TRANSGENE, using the oligonucleotides JGAG1.
  • the amplified fragment carries the BglII and BamHI sites. It is cut by the corresponding enzymes and cloned into the plasmid pIPJ42 between the BglII and BamHI sites. The resulting plasmid is called pRJ22.
  • the cassette containing the origin of replication in mycobacteria (ori yco of pAL5000) and the kanamycin resistance gene of Tn903 was inserted between the SplI and BamHI sites. It is the EcoRV / Hpal fragment isolated from the plasmid pIPJ46 ( Figure 10). These plasmids resulting from the insertion of the EcoRV / Hpal fragment are called pRJ33 and pRJ34.
  • Plasmids pRJ33 and pRJ34 were transferred to M. smegmatis and BCG by electroporation.
  • the fusion polypeptide expressed by the plasmids pRJ33 and pRJ34 consists of an amino-terminal fragment of 60 amino acids of beta-lactamase with the protein GagP24 since a stop codon is located at the end of the Gag P24 gene cloned here.
  • the beta-lacatamase-GagII fusion polypeptide is not found in the culture medium but in the cytoplasm. It is identified by Western blot using the 1113 monoclonal antibody from the Hybridolab of the Institut Pasteur.
  • the GP63 surface antigen of Leishmania infantum and Leishmania major The fragment coding for the GP63 protein lacking the C-terminal transmembrane part was inserted at the BglII site of the gene coding for beta-lactamase on the plasmid pIPJ42. To do this, a fragment coding for the GP63 antigen was synthesized in vitro by PCR. Two GP631 oligonucleotides
  • GCGGGATCCTTATGCATGTGCGCGACGTGAACTGGGGC GCGGGATCCTTATGCATGTGCGCGACGTGAACTGGGGC
  • GP632 CCGAATTCAAGCTTCTACGCCGTGTTGCCGCCGTCCTT
  • the cassette containing the origin of replication in mycobacteria (oriMyco of pAL5000) and the kanamycin resistance gene of Tn903 was inserted between the SplI and BamHI sites.
  • pSA1.5 and pSAI1.5 The plasmids resulting from the insertion of the EcoRV / Hpal fragment in one or the other of the orientations are called pSA1.5 and pSAI1.5.
  • Plasmids pSA1.5 and pSAIl.5 were transferred to M. smegmatis and BCG by electroporation.
  • the fusion polypeptides expressed by these plasmids consist of the fusion between an amino ⁇ terminal fragment of 60 amino acids of beta-lactamase with the protein GP63 deleted from the C-terminal transmembrane part.
  • the beta-lactamase-Protein GP63 fusion polypeptides are as in the case of Gag fusions found in the cytoplasm of M. smegmatis and BCG transformed by the plasmids pSA1.5 and pSAI1.5.

Abstract

La présente invention concerne une séquence nucléotidique, caractérisée en ce qu'elle est choisie parmi l'un des enchaînements nucléotidiques suivants: la séquence du gène codant pour une beta-lactamase, ou toute partie de ce gène, en particulier la séquence comprise entre les nucléotides 1 et 394 contenant les signaux d'expression du gène, ou la séquence codante comprenant les nucléotides 395 à 1274, ou toute séquence hybridant dans des conditions stringentes avec la séquence ci-dessus. Utilisation de la beta-lactamase comme protéine porteuse d'épitopes hétérologues, pour la préparation de compositions vaccinantes.The present invention relates to a nucleotide sequence, characterized in that it is chosen from one of the following nucleotide sequences: the sequence of the gene encoding a beta-lactamase, or any part of this gene, in particular the sequence between nucleotides 1 and 394 containing the expression signals of the gene, or the coding sequence comprising nucleotides 395 to 1274, or any sequence hybridizing under stringent conditions with the above sequence. Use of beta-lactamase as protein carrying heterologous epitopes, for the preparation of vaccine compositions.

Description

î-lactamase recom-binante, utilisable en tant que molécule porteuse pour la préparation de compositions immunogènes. Î-lactamase recom-binante, usable as a carrier molecule for the preparation of immunogenic compositions.
La présente demande a pour objet de nouveaux moyens pour la préparation de compositions immunogènes et de préférence de compositions vaccinantes protectrices, susceptibles de se présenter sous forme de "vaccins vivants", de particules ou de molécules administrables à l'homme ou à l'animal.The present application relates to new means for the preparation of immunogenic compositions and preferably protective vaccinating compositions, capable of being in the form of "live vaccines", of particles or molecules which can be administered to humans or animals. .
L'un des buts de la présente invention est de proposer des moyens pour élaborer des compositions immunogènes susceptibles de déclencher chez l'homme ou chez l'animal une réponse immunitaire cellulaire et/ou humorale (par l'intermédiaire d'anticorps), contre des déterminants antigénigues et notamment des épitopes caractéristiques de différents agents pathogènes. Plus généralement 1'invention propose de nouveaux moyens pour déclencher ou favoriser une réponse immunitaire contre tout épitope déterminé pour produire des anticorps ou une réponse immunitaire cellulaire, et en particulier lorsque les déterminants antigéniques sont de type haptène et par conséquent incapables de déclencher par eux-mêmes cette réponse immunitaire. L'invention présente également un intérêt en vue de favoriser une réponse immunitaire suceptible d'être conférée par un antigène, et notamment d'en augmenter le niveau ou le caractère protecteur.One of the aims of the present invention is to propose means for developing immunogenic compositions capable of triggering in humans or in animals a cellular and / or humoral immune response (by means of antibodies), against antigenic determinants and in particular epitopes characteristic of different pathogens. More generally, the invention proposes new means for triggering or promoting an immune response against any determined epitope for producing antibodies or a cellular immune response, and in particular when the antigenic determinants are of the hapten type and therefore incapable of triggering by themselves. same this immune response. The invention is also of interest in order to promote an immune response capable of being imparted by an antigen, and in particular to increase the level or the protective character thereof.
L'invention décrit à cet égard de nouvelles molécules susceptibles d'être utilisées comme vecteur de 1'antigénicité de différents épitopes, à la fois dans des compositions immunogènes contenant les molécules hybrides (recombinantes) ainsi formées ou dans des vaccins vivants. Différents facteurs peuvent être déterminants dans le choix d'une molécule, en particulier d'une protéine capable de se comporter comme protéine porteuse (encore appelée vecteur) dans le but de conférer ou d'améliorer 1'immunogénicité d'un épitope hétérologue par rapport à cette molécule. On doit par exemple tenir compte des paramètres de taille de la protéine vecteur en tant que telle et de sa taille par rapport à celle de l'épitope qu'elle doit contenir ainsi que de la taille de 1'épitope en tant que tel. D'autres contraintes pour l'élaboration de vaccins, vivants ou non, faisant intervenir des molécules porteuses, sont par exemple 1'antigénicité de la molécule porteuse, sa toxicité pour un hôte cellulaire dans lequel elle serait produite ou pour le sujet auquel elle serait administrée. Il convient aussi de déterminer les sites potentiels d'insertion pour l'épitope, et de façon tout à fait importante lorsque cette protéine modifiée est utilisée dans le cadre de la préparation d'un vaccin vivant, sa capacité à être exportée voire sécrétée par l'hôte qui la produit, afin d'être accessible au système immunitaire du sujet auquel est administré le vaccin.The invention describes in this regard new molecules capable of being used as a vector for the antigenicity of different epitopes, both in immunogenic compositions containing the hybrid (recombinant) molecules thus formed or in live vaccines. Different factors can be decisive in the choice of a molecule, in particular a protein capable of behaving as a carrier protein (also called a vector) in order to confer or improve the immunogenicity of a heterologous epitope compared to to this molecule. For example, account must be taken of the size parameters of the vector protein as such and of its size relative to that of the epitope which it must contain as well as of the size of the epitope as such. Other constraints for the development of vaccines, living or not, involving carrier molecules, are for example the antigenicity of the carrier molecule, its toxicity for a cellular host in which it would be produced or for the subject to which it would be administered. It is also necessary to determine the potential sites of insertion for the epitope, and in a very important way when this modified protein is used within the framework of the preparation of a live vaccine, its capacity to be exported or even secreted by l host that produces it, in order to be accessible to the immune system of the subject to whom the vaccine is administered.
Dans le cadre de la présente invention, les inventeurs se sont intéressés à des protéines de la famille des /3-lactamases, dont certaines propriétés ont été étudiées jusqu'à présent dans un contexte différent de celui de la présente invention.In the context of the present invention, the inventors are interested in proteins of the / 3-lactamase family, some of the properties of which have been studied until now in a context different from that of the present invention.
Les 3-lactamases sont des enzymes réparties dans différentes classes, en fonction de leur activité enzymatique sur différents substrats. Elles sont produites par différents organismes et en particulier par des bactéries, par exemple des bactéries de type E.coli, Staphylococcus aureus, ou encore par des mycobactéries. Ces enzymes sont étudiées pour leur capacité à protéger des bactéries contre les effets létaux des antibiotiques du type /3-lactams, et donc leur capacité à conférer à certaines bactéries la résistance à différents antibiotiques. C'est dans ce contexte d'étude de la résistance de bactéries aux antibiotiques que plusieurs auteurs ont publié des articles décrivant la purification de certaines β- lactamases.3-lactamases are enzymes divided into different classes, depending on their enzymatic activity on different substrates. They are produced by different organisms and in particular by bacteria, for example bacteria of the type E. coli, Staphylococcus aureus, or by mycobacteria. These enzymes are studied for their capacity to protect bacteria against the lethal effects of antibiotics of the / 3-lactams type, and therefore their capacity to confer on certain bacteria resistance to different antibiotics. It is in this context of studying the resistance of bacteria to antibiotics that several authors have published articles describing the purification of certain β-lactamases.
Par exemple Choubey et al ont publié des résultats décrivant la purification jusqu'à l'homogénéité d'une 3-lactamase de Mycobacterium smegmatis (Microbiology, 1986, Vol.1 :171-175) . D'autres auteurs ont publié des données relatives à la caractérisation de la β- lactamase produite dans une souche de Mycobacterium fortuitum (J. Amicosante et al, Biochem. J., 1990, 271:729-734 ; L. Fattorili et al, Antimicrobial Agents and Chemotherapy, Septembre 1991, p. 1760-1764) . Dans cette seconde publication, les auteurs rappellent que les β- lactamases ont été décrites comme étant des enzymes périplasmiques chez les bactéries Gra - négatives. Chez les Grain-positives, puisqu'il existe une unique membrane cellulaire, ces enzymes sont exportées à la surface ou relarguées dans le milieu. Certaines sont retrouvées en grande quantité dans le milieu de culture, d'autres sont ancrées à la membrane bactérienne.Ces enzymes présentent un large spectre d'activité.For example, Choubey et al have published results describing the purification to the homogeneity of a 3-lactamase from Mycobacterium smegmatis (Microbiology, 1986, Vol. 1: 171-175). Other authors have published data relating to the characterization of the β-lactamase produced in a strain of Mycobacterium fortuitum (J. Amicosante et al, Biochem. J., 1990, 271: 729-734; L. Fattorili et al, Antimicrobial Agents and Chemotherapy, September 1991, p. 1760-1764). In this second publication, the authors recall that β-lactamases have been described as periplasmic enzymes in Gra-negative bacteria. In Grain-positive, since there is a single cell membrane, these enzymes are exported to the surface or released into the environment. Some are found in large quantities in the culture medium, others are anchored to the bacterial membrane. These enzymes have a wide spectrum of activity.
Le relargage de cette enzyme par les bactéries qui la produisent, serait donc lié en partie à des facteurs d'environnement ou à des facteurs propres à la physiologie de la cellule productrice ou encore à des déterminants structuraux de la /3-lactamase.The release of this enzyme by the bacteria that produce it, would therefore be partly linked to environmental factors or factors specific to the physiology of the producer cell or structural determinants of / 3-lactamase.
Malgré les caractéristiques connues des β- lactamases, d'intervenir dans la résistance à certains antibiotiques, et en dépit du fait que le mode d'expression et notamment la possibilité de sécrétion de cette protéine par la cellule qui la produit n'étaient pas totalement caractérisés, les inventeurs se sont intéressés à la capacité de cette enzyme de se comporter comme un vecteur de 1'antigénicité d'un épitope qui lui serait hétérologue.Despite the known characteristics of β-lactamases, to intervene in the resistance to certain antibiotics, and despite the fact that the mode of expression and in particular the possibility of secretion of this protein by the cell which produces it were not completely characterized, the inventors were interested in the capacity of this enzyme to behave as a vector for the antigenicity of an epitope which would be heterologous to it.
Par épitope hétérologue on entend ici une séquence d'acides aminés caractéristique d'une protéine et notamment d'un antigène différent d'une /3-lactamase, à tout le moins différent de la /3-lactamase choisie comme molécule porteuse.By heterologous epitope is meant here an amino acid sequence characteristic of a protein and in particular of an antigen different from a / 3-lactamase, at the very least different from the / 3-lactamase chosen as carrier molecule.
Selon les inventeurs les propriétés connues de différentes /3-lactamases, telles que le fait qu'elles sont exportées et monomériques, ainsi que leurs propriétés structurales sont susceptibles de leur conférer de nombreux avantages pour être utilisées comme protéines vectrices de 1'antigénicité de différents épitopes. Elles se sont en outre révélées intéressantes dans le cadre de l'élaboration de vaccins vivants. Dans le but de définir les conditions à respecter pour la construction de protéines recombinantes à partir de la /3-lactamase, les inventeurs ont déterminé la séquence et 1 'organisation structurale du gène et prédit par modélisation la structure tridimensionnelle de la protéine /3-lactamase d'une mycobactérie, Mycobacterium fortuitum (désignée dans la suite M. fortuitum) . La connaissance de ce gène a permis de localiser des régions propres à contenir compris entre les nucleotides 395 et 1274 de cette séquence.According to the inventors, the known properties of different / 3-lactamases, such as the fact that they are exported and monomeric, as well as their structural properties are capable of conferring on them numerous advantages for being used as vector carriers of the antigenicity of different epitopes. They have also proved to be interesting in the context of the development of live vaccines. In order to define the conditions to be observed for the construction of recombinant proteins from / 3-lactamase, the inventors determined the sequence and the structural organization of the gene and predicted by modeling the three-dimensional structure of the protein / 3- lactamase from a mycobacterium, Mycobacterium fortuitum (hereinafter referred to as M. fortuitum). Knowledge of this gene has made it possible to locate regions capable of containing between nucleotides 395 and 1274 of this sequence.
Avantageusement, des séquences répondant aux définitions précédentes, sont constituées par les enchaînements nucléotidiques clones dans les plasmides contenus dans les souches E.coli déposées à la C.N.C.M. sous les numéros 1-1170 et 1-1171, ainsi que toute séquence nucléotidique hybridant dans des conditions stringentes avec ces enchaînements clones.Advantageously, sequences corresponding to the preceding definitions, are constituted by the nucleotide sequences cloned in the plasmids contained in the E. coli strains deposited at the C.N.C.M. under the numbers 1-1170 and 1-1171, as well as any nucleotide sequence hybridizing under stringent conditions with these cloned sequences.
La séquence représentée à la figure 4 contient le gène codant pour la /3-lactamase de M. fortuitum, ainsi que les parties non codantes. La séquence nucléotidique du gène de la /3-lactamase de M. fortuitum n'est pas la seule séquence intéressante dans le cadre de 1 ' invention ; en effet des fragments ou partie de l'enchaînement représenté à la figure 4 peuvent être intéressants.The sequence shown in FIG. 4 contains the gene coding for M. fortuitum / 3-lactamase, as well as the non-coding parts. The nucleotide sequence of the M. fortuitum / 3-lactamase gene is not the only sequence of interest in the context of the invention; indeed fragments or part of the sequence shown in Figure 4 can be interesting.
En particulier une séquence nucléotidique avantageuse dans le cadre de 1 ' invention est la séquence nucléotidique correspondant à l'extrémité 5' non codante du gène de la /3-lactamase, cette séquence contenant les signaux d'expression du gène de cette enzyme. Cette partie 5' de la séquence du gène peut être utilisée pour l'expression de séquences nucléotidiques variées dans des hôtes cellulaires de type mycobactéries. Elle convient par exemple pour l'expression dans des mycobactéries, de /3-lactamases issues d'organismes différents des mycobactéries, puisqu'elle contient des signaux d'expression reconnus par les mycobactéries.In particular, an advantageous nucleotide sequence in the context of the invention is the nucleotide sequence corresponding to the non-coding 5 'end of the β-lactamase gene, this sequence containing the expression signals for the gene for this enzyme. This 5 ′ part of the gene sequence can be used for the expression of various nucleotide sequences in cellular hosts of the mycobacteria type. It is suitable for example for the expression in mycobacteria, of / 3-lactamases originating from organisms other than mycobacteria, since it contains expression signals recognized by mycobacteria.
D'autres fragments de la séquence nucléotidique représentée à la figure 4, utilisables dans le cadre de l'invention, sont les séquences codant pour une 8 protéine tronquée dont la structure globale est préservée, par rapport à la protéine native, en particulier dans des conditions telles que le produit d'expression de cette séquence nucléotidique est stable et notamment insensible aux protéases cellulaires de l'hôte qui le produit et/ou éventuellement du sujet auquel il est administré.Other fragments of the nucleotide sequence represented in FIG. 4, which can be used in the context of the invention, are the sequences coding for a 8 truncated protein whose overall structure is preserved, compared to the native protein, in particular under conditions such that the expression product of this nucleotide sequence is stable and in particular insensitive to the cellular proteases of the host which produces it and / or possibly the subject to which it is administered.
Par stabilité de la protéine on entend notamment la possibilité de la purifier ou la possibilité pour cette protéine d'être reconnue par un anticorps.By protein stability is meant in particular the possibility of purifying it or the possibility for this protein to be recognized by an antibody.
Une séquence nucléotidique avantageuse est une séquence présentant des similitudes avec l'enchaînement représenté à la figure 4. Par similitude, on entend notamment la capacité d'hybrider dans des conditions stringentes avec la séquence de la figure 4.An advantageous nucleotide sequence is a sequence having similarities with the sequence shown in FIG. 4. By similarity is meant in particular the capacity to hybridize under stringent conditions with the sequence of FIG. 4.
Pour déterminer si une séquence nucléotidique est capable d'hybrider dans des conditions stringentes avec la séquence codante contenue dans 1'enchaînement représenté à la figure 4, on peut mettre en oeuvre le test suivant :To determine whether a nucleotide sequence is capable of hybridizing under stringent conditions with the coding sequence contained in the sequence represented in FIG. 4, the following test can be carried out:
On utilise par exemple une sonde déterminée à partir de 1 'enchaînement codant représenté à la figure 5 avec lequel on souhaite tester l'hybridation d'une séquence déterminée; cette sonde est marquée au 32p (106 cpm/ml) et on la met en contact avec la séquence testée pendant 16 heures à 65°C dans une solution d'hybridation (formamide 50%, 5 x SSPE, DNA de sperme de saumon 200 μg/ml et 10 x Denhart) . Les membranes sur lesquelles est réalisée l'hybridation sont ensuite lavées deux fois pendant 30 minutes avec une solution 1SSC, 0,1% SDS à te érature ambiante (20°C) puis lavées deux fois avec 0,1SSC, 0,1% SDS pendant 30 minutes à One uses for example a probe determined from the coding sequence represented in FIG. 5 with which one wishes to test the hybridization of a determined sequence; this probe is labeled with 32 p (10 6 cpm / ml) and it is brought into contact with the sequence tested for 16 hours at 65 ° C. in a hybridization solution (50% formamide, 5 × SSPE, sperm DNA salmon 200 μg / ml and 10 x Denhart). The membranes on which the hybridization is carried out are then washed twice for 30 minutes with a 1SSC solution, 0.1% SDS at room temperature (20 ° C.) and then washed twice with 0.1SSC, 0.1% SDS. for 30 minutes at
0,1 x SSC :0.1 x SSC:
NaCl : 15 mMNaCl: 15 mM
Na3 citrate : 0,1%Na 3 citrate: 0.1%
Selon une autre définition, une séquence nucléotidique de 1'invention est caractérisée en ce qu'elle code pour une protéine de type /3-lactamase comprenant l'enchaînement d'acides aminés représenté à la figure 4.According to another definition, a nucleotide sequence of the invention is characterized in that it codes for a protein of the type / 3-lactamase comprising the amino acid chain shown in FIG. 4.
L'invention concerne par ailleurs une séquence nucléotidique recombinante caractérisée en ce qu'elle comprend : une séquence nucléotidique répondant à l'une des définitions précédentes, codant pour une β- lactamase, modifiée par au moins un enchaînement nucléotidique hétérologue codant pour une séquence peptidique hétérologue comprenant au moins un épitope, la modification étant réalisée en au moins un site permettant, lorsque la séquence recombinante est exprimée, l'exposition de l'épitope à la surface de la /3-lactamase ou son accessibilité au solvant, une séquence nucléotidique répondant aux définitions précédentes, codant pour une β- lactamase tronquée, modifiée par au moins un 10 enchaînement nucléotidique hétérologue codant pour une séquence peptidique hétérologue comprenant au moins un épitope, la modification étant réalisée en au moins un site permettant, lorsque la séquence recombinante est exprimée, l'exposition de l'épitope à la surface de la /3-lactamase ou son accessibilité au solvant, et la protéine hybride exprimée conservant les caractéristiques structurales essentielles de la /3-lactamase native, en particulier celles qui lui confèrent sa reconnaissance par des anticorps dirigés contre le ou les épitopes, ou sa stabilité, lorsqu'elle est recombinée.The invention further relates to a recombinant nucleotide sequence characterized in that it comprises: a nucleotide sequence corresponding to one of the preceding definitions, coding for a β-lactamase, modified by at least one heterologous nucleotide sequence coding for a peptide sequence heterologous comprising at least one epitope, the modification being carried out at at least one site allowing, when the recombinant sequence is expressed, the exposure of the epitope to the surface of / 3-lactamase or its accessibility to the solvent, a nucleotide sequence meeting the previous definitions, coding for a truncated β-lactamase, modified by at least one 10 heterologous nucleotide sequence encoding a heterologous peptide sequence comprising at least one epitope, the modification being carried out at at least one site allowing, when the recombinant sequence is expressed, the exposure of the epitope to the surface of the / 3-lactamase or its accessibility to the solvent, and the expressed hybrid protein retaining the essential structural characteristics of the native / 3-lactamase, in particular those which give it its recognition by antibodies directed against the epitope (s), or its stability, when it is recombined.
L'exposition au niveau de la protéine recombinante, de l'épitope hétérologue, correspond à l'accessibilité de cet épitope au solvant, en particulier aux molécules d'eau, ou à la disponibilité de cet épitope pour être présenté à des anticorps.The exposure at the level of the recombinant protein, of the heterologous epitope, corresponds to the accessibility of this epitope to the solvent, in particular to water molecules, or to the availability of this epitope to be presented to antibodies.
Selon la définition donnée dans le paragraphe précédent, la séquence nucléotidique codant pour la β- lactamase ou pour une /3-lactamase tronquée, peut être modifiée par au moins un enchaînement nucléotidique hétérologue. En effet de même que la taille de 1 *enchaînement nucléotidique hétérologue ne constitue pas un paramètre limitant a priori, on peut envisager d'insérer plusieurs séquences hétérologues au sein de la séquence codant pour la /3-lactamase ou pour une β- lactamase tronquée.According to the definition given in the preceding paragraph, the nucleotide sequence coding for β-lactamase or for a truncated / 3-lactamase, can be modified by at least one heterologous nucleotide sequence. In fact, just as the size of the heterologous nucleotide sequence does not constitute an a priori limiting parameter, it is possible to envisage inserting several heterologous sequences within the sequence coding for / 3-lactamase or for a truncated β-lactamase .
L'insertion de séquences hétérologues comprenant au moins un épitope et présentant une taille de quelques nucleotides peut paraître avantageuse dans la mesure où les problèmes pouvant résulter d'une déformation de la /3-lactamase modifiée codée par la 11 séquence nucléotidique recombinante de l'invention, sont limités. Cependant il est possible d'insérer en un ou plusieurs sites de la séquence nucléotidique codant pour la /3-lactamase, des enchaînements nucléotidiques hétérologues de séquences plus longues, dès lors qu'ils codent pour une séquence peptidique dont l'épitope ou les épitopes seront exposés à la surface de la protéine recombinante formée ou accessibles au solvant. De préférence l'hybride ainsi formé conserve les caractéristiques les plus importantes de sa structure, notamment sa capacité à être reconnu par des anticorps anti-/3-lactamase et des anticorps anti-séquence hétérologue, ainsi que sa capacité à être purifié.The insertion of heterologous sequences comprising at least one epitope and having a size of a few nucleotides may appear advantageous insofar as the problems which may result from a deformation of the modified / 3-lactamase encoded by the 11 recombinant nucleotide sequence of the invention are limited. However, it is possible to insert, at one or more sites of the nucleotide sequence coding for / 3-lactamase, heterologous nucleotide sequences of longer sequences, as soon as they code for a peptide sequence including the epitope or the epitopes will be exposed on the surface of the recombinant protein formed or accessible to the solvent. Preferably, the hybrid thus formed retains the most important characteristics of its structure, in particular its capacity to be recognized by anti-/ 3-lactamase antibodies and anti-heterologous sequence antibodies, as well as its capacity to be purified.
Une protéine dite stable selon 1 ' invention présente au moins une des propriétés suivantes : l'activité enzymatique de la /3-lactaπtase, les cas échéant modifiée en intensité, la capacité à être reconnue par un anticorps notamment un anticorps anti-/3-lactaιnase, ou un anticorps dirigé contre un épitope hétérologue qu'elle contient, lorsqu'il s'agit de la protéine recombinante ou, une insensibilité à la dégradation par les protéases cellulaires, la possibilité d'être purifiée.A protein known as stable according to the invention exhibits at least one of the following properties: the enzymatic activity of / 3-lactaπtase, if necessary modified in intensity, the ability to be recognized by an antibody, in particular an anti-/ 3- antibody lactaιnase, or an antibody directed against a heterologous epitope which it contains, when it is a question of the recombinant protein or, an insensitivity to degradation by cellular proteases, the possibility of being purified.
Différents enchaînements nucléotidiques hétérologues peuvent être choisis pour réaliser les séquences nucléotidiques recombinantes de l'invention. Un premier groupe d'enchaînements hétérologues est caractérisé en ce qu'il comprend des séquences codant pour un peptide ou un polypeptide, impliqué dans la virulence d'un agent pathogène ou de façon générale pour un antigène à potentiel protecteur contre un 12 facteur produit à la suite d'une infection. A cet égard une séquence caractéristique d'un organisme pathogène est par exemple une séquence de virus, de parasite, de bactérie ou de champignon (par exemple du genre Aspergillus) . En particulier on citera dans le cadre de la présente invention les séquences de bactéries telles que M. leprae, M. tuberculosis, M. intracellulare, M. africanum, M. avium, les bacilles responsables de la diphtérie, du tétanos, Salmonella, certains tréponèmes, la toxine de pertussis, des séquences d'autres microorganismes tels que les sporozoïtes et les mérozoïtes de plasmodium, les séquences de Leishmania ou Schistosoma, de Shigella, de Neisseria, de Borrelia, des séquences de virus notamment le virus des oreillons, de la rubéole, de la rougeole, de l'herpès, d'influenza, le virus de la rage, de la polio, de l'hépatite, du SIDA HIV, HTLV-I, HTLV-II et SIV ainsi que des virus oncogènes.Different heterologous nucleotide sequences can be chosen to produce the recombinant nucleotide sequences of the invention. A first group of heterologous sequences is characterized in that it comprises sequences coding for a peptide or a polypeptide, involved in the virulence of a pathogenic agent or in general for an antigen with protective potential against a 12 factor produced as a result of infection. In this regard, a sequence characteristic of a pathogenic organism is, for example, a sequence of virus, parasite, bacteria or fungus (for example of the genus Aspergillus). In particular, in the context of the present invention, the sequences of bacteria such as M. leprae, M. tuberculosis, M. intracellulare, M. africanum, M. avium, the bacilli responsible for diphtheria, tetanus, Salmonella, will be cited. treponemes, pertussis toxin, sequences of other microorganisms such as sporozoites and merozoites of plasmodium, sequences of Leishmania or Schistosoma, Shigella, Neisseria, Borrelia, sequences of viruses including the mumps virus, rubella, measles, herpes, influenza, rabies virus, polio, hepatitis, AIDS HIV, HTLV-I, HTLV-II and SIV as well as oncogenic viruses.
La séquence d'acide nucléique à exprimer peut aussi coder pour une séquence immunogène telle que celle de venin de serpent ou d'insecte.The nucleic acid sequence to be expressed can also code for an immunogenic sequence such as that of snake or insect venom.
A titre d'exemple un enchaînement nucléotidique hétérologue intéressant est par exemple un enchaînement codant pour une séquence peptidique d'un antigène de rétrovirus humain de type HIV, notamment un antigène d'enveloppe, de gag, nef ou pol d'un rétrovirus HIV-1 ou HIV-2.By way of example, an interesting heterologous nucleotide sequence is, for example, a sequence coding for a peptide sequence of a human retrovirus antigen of HIV type, in particular an envelope, gag, nave or pol antigen of an HIV- retrovirus. 1 or HIV-2.
D'autres séquences intéressantes sont les séquences immunogènes de mycobactéries, en particulier les protéines ou les fragments des protéines correspondant à des gènes impliqués dans la virulence et des antigènes à potentiel protecteur. Un antigène est dit à "potentiel protecteur" lorsqu'il est susceptible de déclencher ou de favoriser une réponse 13 immunitaire protectrice, en particulier par production d'anticorps ou par induction d'une réponse immunitaire à médiation cellulaire, en particulier de type CTL. Un tel antigène à potentiel protecteur peut être constitué par un épitope voire un haptène insuffisant en soi pour déclencher la réponse immunitaire.Other interesting sequences are the immunogenic sequences of mycobacteria, in particular proteins or fragments of proteins corresponding to genes involved in virulence and antigens with protective potential. An antigen is said to have "protective potential" when it is capable of triggering or promoting a response 13 protective immune system, in particular by production of antibodies or by induction of a cell-mediated immune response, in particular of the CTL type. Such an antigen with protective potential can consist of an epitope or even a hapten insufficient in itself to trigger the immune response.
L'invention permet ainsi la préparation de protéines recombinantes intéressantes notamment pour la constitution de compositions immunogènes, dans lesquelles l'épitope exposé à la surface de la protéine recombinante est caractéristique par exemple d'une hormone, ou de toute substance dont on cherche à atténuer, voire neutraliser les effets biologiques.The invention thus allows the preparation of recombinant proteins of interest in particular for the constitution of immunogenic compositions, in which the epitope exposed on the surface of the recombinant protein is characteristic for example of a hormone, or of any substance which it is sought to attenuate or even neutralize the biological effects.
Avantageusement une séquence nucléotidique recombinante peut être constituée par une séquence nucléotidique codant pour la /3-lactamase ou une β- lactamase tronquée, telle que décrite précédemment dans laquelle serait inséré un enchaînement hétérologue codant pour la séquence peptidique V3 de l'antigène d'enveloppe des différents variants HIV-1 ou une séquence de plus grande taille de l'enveloppe d'un virus HIV. Cette séquence a été décrite dans la publication de K. Javaherian et al. (Proc. Natl. Acad. Sci. USA 8_6:6768-6772, 1989). Avantageusement, l'enchaînement hétérologue codant pour la séquence peptidique V3 est inséré au site BglII de la séquence codant pour la β-lactamase.Advantageously, a recombinant nucleotide sequence may consist of a nucleotide sequence coding for / 3-lactamase or a truncated β-lactamase, as described above in which a heterologous sequence coding for the peptide sequence V3 of the envelope antigen would be inserted. different HIV-1 variants or a larger sequence of the envelope of an HIV virus. This sequence has been described in the publication by K. Javaherian et al. (Proc. Natl. Acad. Sci. USA 8_6: 6768-6772, 1989). Advantageously, the heterologous sequence coding for the V3 peptide sequence is inserted at the BglII site of the sequence coding for β-lactamase.
L'invention vise également un vecteur recombinant • de clonage et/ou d'expression, réplicatif ou intégratif caractérisé en ce qu'il est modifié, en l'un de ses sites non essentiels pour sa replication ou son intégration, par une séquence nucléotidique recombinante ci-dessus décrite. 14The invention also relates to a recombinant • cloning and / or expression, replicative or integrative vector characterized in that it is modified, in one of its non-essential sites for its replication or its integration, by a nucleotide sequence recombinant described above. 14
De façon intéressante, la séquence nucléotidique recombinante contenue dans le vecteur est sous le contrôle du promoteur d'expression de la /3-lactamase correspondant à la séquence.Interestingly, the recombinant nucleotide sequence contained in the vector is under the control of the expression promoter of / 3-lactamase corresponding to the sequence.
Lorsque ce vecteur est modifié par la seule séquence codante ou par une séquence codante partielle de la /3-lactamase, il peut comprendre également des signaux d'expression, de traduction et voire de sécrétion, d'origine différente de celle de la β- lactamase, choisis en fonction de l'hôte dans lequel on cherche à cloner ou à exprimer ce vecteur recombinant.When this vector is modified by the coding sequence alone or by a partial coding sequence for / 3-lactamase, it may also include expression, translation and even secretion signals, of origin different from that of β- lactamase, chosen according to the host in which one seeks to clone or express this recombinant vector.
A titre d'exemple de vecteur pour la préparation de vecteurs recombinants selon l'invention, on peut citer les plas ides, les pliages ou les transposons.By way of example of a vector for the preparation of recombinant vectors according to the invention, mention may be made of plasids, folds or transposons.
En particulier un plasmide de l'invention est le plas ide pACYC184BlaM contenant le fragment SphI de l'enchaînement de la /3-lactamase de M. fortuitum présenté à la figure 4, et qui est déposé à la C.N.C.M. (Collection Nationale des Microorganismes, Paris, France) dans une souche E.coli HB101(pACYC184BlaM) , sous le numéro 1-1171 déposée le 11 Février 1992.In particular, a plasmid of the invention is the plasmid pACYC184BlaM containing the SphI fragment of the sequence of the / 3-lactamase of M. fortuitum presented in FIG. 4, and which is deposited at the C.N.C.M. (National Collection of Microorganisms, Paris, France) in an E.coli HB101 strain (pACYC184BlaM), under the number 1-1171 deposited on February 11, 1992.
La plasmide pACYC184BlaM contient le fragment Sphl/SphI, d'environ 4,7 kb, de 1'ADN génomique de M. fortuitum D316 hybridant avec la sonde BlaOl. Ce fragment porte les 834 premières bases du gène codant pour une /3-lactamase de classe A, ainsi que ses régions régulatrices.The plasmid pACYC184BlaM contains the Sphl / SphI fragment, of about 4.7 kb, of the genomic DNA of M. fortuitum D316 hybridizing with the BlaOl probe. This fragment carries the first 834 bases of the gene coding for a class A / 3-lactamase, as well as its regulatory regions.
Le milieu de culture préconisé pour cette souche est un milieu L-Broth plus chloramphénicol (30μg/ml) et l'ensemencement est effectué sur milieu L-Broth, la température d'incubation étant d'environ 37°C sous agitation.The culture medium recommended for this strain is an L-Broth medium plus chloramphenicol (30 μg / ml) and the seeding is carried out on L-Broth medium, the incubation temperature being approximately 37 ° C. with stirring.
Un autre plasmide préféré selon 1rinvention contient le gène de la /3-lactamase de M. fortuitum ; il 15 s'agit du plasmide pIPJ39 contenu dans une souche de E.coli MC1061(pIPJ39) , déposée à la C.N.C.M. le 11 Février 1992 sous le numéro 1-1170.Another preferred plasmid according to 1 st invention contains the gene of the / 3-lactamase M. fortuitum; he 15 This is the plasmid pIPJ39 contained in a strain of E.coli MC1061 (pIPJ39), deposited at the CNCM on February 11, 1992 under the number 1-1170.
Le plasmide pIPJ39 contient le fragment BamHI/BamIII, d'environ 6 kb, de 1'ADN génomique de M. fortuitum FC1 hybridant avec la sonde BlaOl. Ce fragment porte le gène codant pour une /3-lactamase de classe A, ainsi que des régions flanquantes.Plasmid pIPJ39 contains the approximately 6 kb BamHI / BamIII fragment of the genomic DNA of M. fortuitum FC1 hybridizing with the BlaOl probe. This fragment carries the gene coding for a class A / 3-lactamase, as well as flanking regions.
Le milieu de culture préconisé pour cette souche est un milieu L-Broth plus ampicilline (lOOμg/ml) et l'ensemencement est effectué avec un milieu L-Broth et la température d'incubation est d'environ 37°C sous agitation.The culture medium recommended for this strain is an L-Broth medium plus ampicillin (100 μg / ml) and the seeding is carried out with an L-Broth medium and the incubation temperature is approximately 37 ° C. with stirring.
L'invention a encore pour objet un hôte cellulaire recombinant caractérisé en ce qu'il est transformé par une séquence nucléotidique recombinante décrite ci- dessus ou par un vecteur recombinant ci-dessus, dans des conditions permettant l'expression de la séquence nucléotidique recombinante sous la forme d'une protéine de fusion stable et son exposition ou son exportation, à la surface de l'hôte ou sa sécrétion dans le milieu extracellulaire.The subject of the invention is also a recombinant cellular host, characterized in that it is transformed by a recombinant nucleotide sequence described above or by a recombinant vector above, under conditions allowing the expression of the recombinant nucleotide sequence under the form of a stable fusion protein and its exposure or export to the surface of the host or its secretion into the extracellular medium.
De nombreux hôtes cellulaires peuvent être modifiés par une séquence nucléotidique recombinante ou un vecteur recombinant selon l'invention.Many cellular hosts can be modified by a recombinant nucleotide sequence or a recombinant vector according to the invention.
Un procédé adapté pour la préparation d'hôtes cellulaires recombinants selon l'invention est par exemple 1 'électroporation, conformément à la description de Snapper S. et al (1988, PNAS USA 85: 6985-6991) ou la conjugaison selon par exemple la technique de Lazraq R. et al (1990, FEMS Microbiol. Lett. 69_: 135-138) , ou selon la technique de Gormley E.P. et Davies J. (J. Bacteriol, 173:6705-6708) . 16A suitable method for the preparation of recombinant cellular hosts according to the invention is for example 1 electroporation, in accordance with the description of Snapper S. et al (1988, PNAS USA 85: 6985-6991) or the conjugation according for example the technique of Lazraq R. et al (1990, FEMS Microbiol. Lett. 69_: 135-138), or according to the technique of Gormley EP and Davies J. (J. Bacteriol, 173: 6705-6708). 16
Avantageusement on aura recours à des mycobactéries lorsque la séquence codant pour la β- lactamase est une séquence originaire de mycobactérie- En effet dans ce cas le transfert dans une souche de mycobactéries du gène codant pour une /3-lactamase de mycobactérie permet de faciliter l'expression de cette séquence, dans la mesure où les signaux de reconnaissance et d'expression, voire de sécrétion contenus dans le gène de la /3-lactamase sont reconnus par les mycobactéries hôtes. De façon générale on pourra avoir recours à une souche d'Actinomycètes et en particulier une souche avirulente ou rendue avirulente, en s'assurant que les signaux de reconnaissance sont appropriés pour l'expression de la séquence recombinante ou du vecteur recombinant introduit dans la souche.Advantageously, mycobacteria will be used when the sequence coding for β-lactamase is a sequence originating in mycobacterium. In fact in this case the transfer into a strain of mycobacteria of the gene coding for a / 3-lactamase of mycobacterium makes it possible to facilitate the expression of this sequence, insofar as the recognition and expression, and even secretion, signals contained in the β-lactamase gene are recognized by the host mycobacteria. In general, a strain of Actinomycetes and in particular an avirulent or made avirulent strain can be used, ensuring that the recognition signals are suitable for the expression of the recombinant sequence or of the recombinant vector introduced into the strain. .
De façon particulièrement préférée pour la réalisation de l'invention, on aura recours à la souche BCG. L'invention concerne donc une souche de BCG, transformée par une séquence nucléotidique recombinante ou un vecteur recombinant de l'invention permettant l'exposition à la surface de la cellule d'une protéine recombinante (protéine hybride) , dans des conditions assurant l'exposition de l'épitope ou des épitopes contre lesquels on cherche à induire une réponse immunitaire.Particularly preferably for carrying out the invention, use will be made of the BCG strain. The invention therefore relates to a strain of BCG, transformed by a recombinant nucleotide sequence or a recombinant vector of the invention allowing exposure to the surface of the cell of a recombinant protein (hybrid protein), under conditions ensuring the exposure of the epitope or epitopes against which one seeks to induce an immune response.
Une protéine hybride est dite exposée lorsqu'elle est extracellulaire mais qu'elle demeure ancrée en un point de la surface de la cellule qui la produit. De façon particulièrement intéressante on exprimera les séquences nucléotidiques de 1' invention de telle façon que les produits d'expression soient sécrétés à 1 'extérieur de la cellule qui les produit et par conséquent libérés dans le milieu. 17A hybrid protein is said to be exposed when it is extracellular but remains anchored at a point on the surface of the cell that produces it. Particularly advantageously, the nucleotide sequences of the invention will be expressed in such a way that the expression products are secreted outside the cell which produces them and consequently released into the medium. 17
D'autres hôtes cellulaires selon l'invention sont des bactéries, une souche E.coli non virulente, ou une souche non virulente d'entérobactérie telle qu'une salmonelle avirulente, dès lors que la séquence nucléotidique recombinante ou le vecteur recombinant ci-dessus, transformant la bactérie, est placé sous le contrôle de signaux d'expression reconnus par cette bactérie.Other cellular hosts according to the invention are bacteria, a non-virulent E. coli strain, or a non-virulent strain of enterobacterium such as avirulent salmonella, since the recombinant nucleotide sequence or the above recombinant vector , transforming the bacteria, is placed under the control of expression signals recognized by this bacteria.
D'autres icroorganismes intéressants sont par exemple des champignons tels que les Aspergillus.Other interesting icroorganisms are for example fungi such as Aspergillus.
Dans le cas de l'utilisation à titre d'hôte cellulaire, de cellules procaryotes ou eucaryotes n'appartenant pas au groupe des mycobactéries, on aura recours à l'utilisation de signaux d'expression reconnaissables par la cellule hôte, afin d'obtenir l'expression voire la sécrétion de la protéine recombinante contenant la /3-lactamase ou une β- lactamase tronquée ainsi que la séquence peptidique hétérologue.In the case of the use as a cellular host, of prokaryotic or eukaryotic cells not belonging to the group of mycobacteria, recourse will be had to the use of expression signals recognizable by the host cell, in order to obtain the expression or even the secretion of the recombinant protein containing the / 3-lactamase or a truncated β-lactamase as well as the heterologous peptide sequence.
D'autres systèmes pour l'expression de la β- lactamase recombinante selon l'invention peuvent être par exemple constitués par des cellules animales, par exemple des cellules d'insectes ou des cellules de mammifères comme des cell;ules CHO. Dans ce cas les vecteurs propres à l'insertion de l'ADN ou de 1ΑDNC ou encore de l'ARN dans ces cellules peuvent être des virus, ou des plasmides. D'autres systèmes tels que les systèmes de levures comme Saccharomyces Cerevisiae peuvent être également appropriés.Other systems for the expression of the recombinant β-lactamase according to the invention can for example be constituted by animal cells, for example insect cells or mammalian cells such as CHO cells. In this case, the vectors specific to the insertion of DNA or 1ΑDNC or even RNA into these cells can be viruses, or plasmids. Other systems such as yeast systems such as Saccharomyces Cerevisiae may also be suitable.
Par site exposé on entend un site qui permet l'accès ou la reconnaissance de la séquence peptidique hétérologue et en particulier l'accès à l'épitope ou aux épitopes ou leur reconnaissance, dans le but d'obtenir une réponse immunitaire. Un site exposé est 18 soit un site se trouvant à la surface de la protéine /3-lactamase soit un site contenu dans cette protéine dont l'épitope reste reconnu par les anticorps, par exemple même quand la protéine est dénaturée.By exposed site is meant a site which allows access or recognition of the heterologous peptide sequence and in particular access to the epitope or epitopes or their recognition, in order to obtain an immune response. An exposed site is 18 either a site on the surface of the protein / 3-lactamase or a site contained in this protein whose epitope remains recognized by the antibodies, for example even when the protein is denatured.
A titre d'exemple on peut mentionner la possibilité selon laquelle la séquence peptidique hétérologue est insérée en amont d'un site normalement non exposé à la surface de la protéine β-lactamase, ce site se trouvant exposé du fait de 1' insertion de la séquence hétérologue, par exemple à la suite d'un repliement résultant d'interactions entre la protéine /3-lactamase et la séquence hétérologue. En choisissant le site d'insertion dans la protéine /3-lactamase, on aura avantage à sélectionner des sites qui permettent de conserver la structure globale de la protéine et par conséquent sa stabilité.By way of example, it is possible to mention the possibility that the heterologous peptide sequence is inserted upstream of a site normally not exposed on the surface of the β-lactamase protein, this site being exposed due to the insertion of the heterologous sequence, for example following a folding resulting from interactions between the protein / 3-lactamase and the heterologous sequence. By choosing the site of insertion into the protein / 3-lactamase, it will be advantageous to select sites which make it possible to conserve the overall structure of the protein and therefore its stability.
Les connaissances acquises par les inventeurs sur la séquence du gène de la /3-lactamase de M. fortuitum leur ont permis de localiser les différentes régions du type hélices α et feuillets β responsables de la conformation tridimensionnelle de cette protéine. .En conséquence les inventeurs ont été en mesure de déterminer à l'aide de la structure tridimensionnelle de la /3-lactamase de S. aureus et de S. albus G, quels pouvaient être les domaines appropriés pour 1' insertion de séquences peptidiques hétérologues, évitant 1'altération de la structure de la protéine native dans des conditions qui auraient nui à son intérêt en tant que molécule porteuse. Ainsi les inventeurs ont établi la possibilité d'insérer de préférence les séquences peptidiques hétérologues dans un domaine d'une β- lactamase en dehors des régions structurées en hélices α ou en feuillet β . 19The knowledge acquired by the inventors on the sequence of the M. fortuitum / 3-lactamase gene enabled them to locate the different regions of the α-helix and β-sheet type responsible for the three-dimensional conformation of this protein. Consequently, the inventors were able to determine, using the three-dimensional structure of the / 3-lactamase from S. aureus and from S. albus G, which could be the suitable domains for the insertion of heterologous peptide sequences. , avoiding alteration of the structure of the native protein under conditions which would have adversely affected its usefulness as a carrier molecule. Thus, the inventors have established the possibility of preferably inserting heterologous peptide sequences in a domain of a β-lactamase outside the regions structured in α helices or in β sheets. 19
A titre préféré une séquence peptidique hétérologue est insérée dans la β-lactamase de M. fortuitum dans la région formant la jonction entre l'hélice α2 et l'hélice α3 de la β-lactamase.As a preference, a heterologous peptide sequence is inserted into the M. fortuitum β-lactamase in the region forming the junction between the α2 helix and the α3 helix of the β-lactamase.
D'autres sites d'insertion préférés sont constitués par les régions comprises entre le feuillet β2 et l'hélice α2, entre l'hélice o:3 et l'hélice α4 ou encore entre le feuillet β4 et le feuillet β5.Other preferred insertion sites are formed by the regions between the β2 sheet and the α2 helix, between the o: 3 helix and the α4 helix or even between the β4 sheet and the β5 sheet.
Selon un mode de réalisation avantageux de l'invention, la séquence hétérologue peut également être insérée dans la partie C-terminale de la séquence de la β-lactamase.According to an advantageous embodiment of the invention, the heterologous sequence can also be inserted into the C-terminal part of the sequence of β-lactamase.
Pour la préparation de protéines recombinantes faisant intervenir des β-lactamases d'origine différente, on déterminera avantageusement la localisation des hélices α et feuillets β leur conférant leur structure, par rapport aux données obtenues pour la β-lactamase de S. aureus.For the preparation of recombinant proteins involving β-lactamases of different origin, the location of the α helices and β sheets giving them their structure will advantageously be determined, relative to the data obtained for the β-lactamase from S. aureus.
De préférence l'insertion est réalisée de telle façon que la séquence peptidique hétérologue soit accessible aux molécules d'eau de l'environnement.Preferably, the insertion is carried out in such a way that the heterologous peptide sequence is accessible to the water molecules of the environment.
Les séquences hétérologues susceptibles d'être insérées dans la β-lactamase ou dans une β-lactamase tronquée sont les séquences qui ont été décrites plus haut dans la partie qui concerne les séquences nucléotidiques. Il s'agit par exemple de séquences du rétrovirus HIV, en particulier de séquences de la glycoprotéine d'enveloppe, des protéines gag, nef ou pol, d'un rétrovirus HIV-1 ou HIV-2. A titre d'exemple on citera le peptide V3 de l'enveloppe de HIV-1.The heterologous sequences capable of being inserted into the β-lactamase or into a truncated β-lactamase are the sequences which have been described above in the part which relates to the nucleotide sequences. These are, for example, sequences of the HIV retrovirus, in particular sequences of the envelope glycoprotein, the gag, nef or pol proteins, of an HIV-1 or HIV-2 retrovirus. By way of example, mention may be made of the V3 peptide of the HIV-1 envelope.
L'invention permet la réalisation de protéines β- lactamase recombinantes dans lesquelles 1 ' insertion de la séquence hétérologue comportant l'épitope s'accompagne d'une délétion d'une partie de la β- 20 lactamase. L'invention permet aussi selon un mode de réalisation avantageux, l'insertion de la séquence hétérologue sans délétion au niveau de la β-lactamase.The invention allows the production of recombinant β-lactamase proteins in which the insertion of the heterologous sequence comprising the epitope is accompanied by a deletion of part of the β- 20 lactamase. The invention also allows, according to an advantageous embodiment, the insertion of the heterologous sequence without deletion at the level of β-lactamase.
Par exemple, cette insertion peut être réalisée à l'extrémité C-terminale de la β-lactamase, sans délétion au niveau de la séquence de cette dernière.For example, this insertion can be carried out at the C-terminal end of the β-lactamase, without deletion at the level of the sequence of the latter.
L'invention a aussi pour objet une composition immunogène caractérisée en ce qu'elle comprend une souche BCG recombinante décrite ci-dessus, en combinaison avec un véhicule pharmaceutique ent approprié pour son administration à 1'homme ou à 1'animal.The invention also relates to an immunogenic composition characterized in that it comprises a recombinant BCG strain described above, in combination with a pharmaceutical vehicle ent suitable for its administration to humans or animals.
Une telle composition est susceptible de constituer un vaccin vivant. Elle peut être administrée par voie d'injection ou par toute autre voie adaptée. Une telle composition immunogène peut être utilisée pour déclencher la réponse immunitaire, par exemple pour déclencher la réponse cellulaire et éventuellement pour déclencher la production d'anticorps protecteurs, ou encore pour contribuer à la production de ces anticorps chez un hôte auquel elle est administrée. L'invention vise non seulement la fabrication de compositions vaccinantes administrables à l'homme mais également la préparation de compositions à des fins de vaccination en médecine vétérinaire.Such a composition is capable of constituting a live vaccine. It can be administered by injection or by any other suitable route. Such an immunogenic composition can be used to trigger the immune response, for example to trigger the cellular response and optionally to trigger the production of protective antibodies, or even to contribute to the production of these antibodies in a host to which it is administered. The invention relates not only to the manufacture of vaccinating compositions which can be administered to humans but also to the preparation of compositions for the purposes of vaccination in veterinary medicine.
La composition immunogène de l'invention peut aussi être utilisée à titre de composition de rappel pour stimuler la production d'anticorps initiée par 1'administration d'une protéine ou d'un autre constituant de 1'agent pathogène ou de façon plus générale de 1'agent contre lequel on recherche une réponse immunitaire.The immunogenic composition of the invention can also be used as a booster composition to stimulate the production of antibodies initiated by the administration of a protein or of another constituent of the pathogenic agent or more generally of The agent against which an immune response is sought.
A titre préféré 1'invention concerne une composition immunogène caractérisée en ce que la souche 21 recombinante qu'elle contient à titre de principe actif est une souche M. bovis de type BCG répondant aux définitions précédemment données. Une souche BCG particulière est la souche avirulente de l'INSTITUT PASTEUR n° 1137P2, utilisée pour le vaccin commercialisé contre la tuberculose.Preferably, the invention relates to an immunogenic composition characterized in that the strain 21 recombinant it contains as active ingredient is a strain M. bovis type BCG meeting the definitions given above. A particular BCG strain is the avirulent strain of INSTITUT PASTEUR No. 1137P2, used for the commercialized vaccine against tuberculosis.
A titre de véhicule pharmaceutique approprié pour la réalisation des compositions immunogènes de l'invention, on peut citer les excipients physiologique ent acceptables habituellement utilisés, notamment les excipients neutres ou acides et par exemple le stéarate de magnésium, la polyvinyle pyrrolidone ou les alcools. Cette composition immunogène peut également comprendre des adjuvants de la réponse immunitaire tels que l'adjuvant complet ou incomplet de Freund, l'hydroxyde d'aluminium, des dérivés de muramyl dipeptide, une huile métabolisante comme le squalène.As a pharmaceutical vehicle suitable for the production of the immunogenic compositions of the invention, mention may be made of the physiological excipients that are usually acceptable, in particular neutral or acid excipients and for example magnesium stearate, polyvinyl pyrrolidone or alcohols. This immunogenic composition can also comprise adjuvants of the immune response such as Freund's complete or incomplete adjuvant, aluminum hydroxide, muramyl dipeptide derivatives, a metabolizing oil such as squalene.
Dans le cas de l'utilisation d'un vaccin vivant, les doses habituelles pour la vaccination avec le BCG pourront être utilisées.If a live vaccine is used, the usual doses for BCG vaccination may be used.
Une autre composition immunogène de l'invention est caractérisée en ce qu'elle comprend une protéine recombinante répondant aux définitions ci-dessus, en combinaison avec un véhicule pharmaceutique approprié pour son administration. Cette composition, comme la composition immunogène formant le vaccin vivant, peut être utilisée pour déclencher la réponse immunitaire ou sous forme de composition de rappel.Another immunogenic composition of the invention is characterized in that it comprises a recombinant protein corresponding to the above definitions, in combination with a pharmaceutical vehicle suitable for its administration. This composition, like the immunogenic composition forming the live vaccine, can be used to trigger the immune response or in the form of a booster composition.
D'autres avantages et caractéristiques de 1' invention apparaissent dans les exemples qui suivent et dans les figures qui sont décrites ci-dessous. 22 LEGENDE DES FIGURESOther advantages and characteristics of the invention appear in the examples which follow and in the figures which are described below. 22 LEGEND OF FIGURES
Figure 1 :Figure 1 :
Séquence nucléotidique de la sonde BlaMlBlotMl nucleotide sequence
Figure 2 :Figure 2:
Plasmide pACYC184 recombiné avec un insérât d'environ 4,7 kb du gène de la β lactamase,Plasmid pACYC184 recombined with an insert of approximately 4.7 kb from the β lactamase gene,
Figure 3 :Figure 3:
Plasmide pIPJ39 recombiné avec le gène de la β lactamase,Plasmid pIPJ39 recombined with the β lactamase gene,
Figure 4 :Figure 4:
Séquence de la région génétigue portant le gène codant pour la β-lactamase de M. fortuitum.Sequence of the genetic region carrying the gene coding for M. fortuitum β-lactamase.
La séquence nucléotidique est indiquée en lettres capitales et est numérotée dans la colonne de droite. La séquence peptidique de la β-lactamase est indiquée avec le code à trois lettres sous la séquence nucléotidique lui correspondant. La numérotation est indiquée sous la séquence.The nucleotide sequence is indicated in capital letters and is numbered in the right column. The peptide sequence of β-lactamase is indicated with the three-letter code under the corresponding nucleotide sequence. The numbering is indicated below the sequence.
La séquence nuléotidique de ntl à ntl061 a été déterminée à partir du plasmide pIPJ319.The nucleotide sequence from ntl to ntl061 was determined from the plasmid pIPJ319.
Figure 5 :Figure 5:
MF : Mycobacterium fortuitum SA : Streptomyces albus AU : Staphylococcus aureusMF: Mycobacterium fortuitum SA: Streptomyces albus AU: Staphylococcus aureus
La position des insertions à effectuer est indiquée par des traits pointillés.The position of the insertions to be made is indicated by dotted lines.
La position des hélices a et β est indiquée sous la séquence de S. aureus. 23The position of the a and β helices is indicated under the sequence of S. aureus. 23
Les prédictions de structure de M. fortuitum sont indiquées au dessus de sa séquence.The structural predictions of M. fortuitum are given above its sequence.
Figure 6 :Figure 6:
Position des motifs structuraux prédits pour la β- lactamase de M. fortuitumPosition of predicted structural motifs for M. fortuitum β-lactamase
Les différentes hélices α et feullets β sont indiqués par des rectangles. Sur cette figure sont également indiquées la séquence nucléotidique et la position de plusieurs sites de restriction.The different α helices and β sheets are indicated by rectangles. This figure also shows the nucleotide sequence and the position of several restriction sites.
Figure 7 - Construction du plasmide pIPJ46Figure 7 - Construction of the plasmid pIPJ46
Le plasmide pAL817 est un dérivé de pAL5000 et est décrit dans la publication Ranes et al, J. Bacteriol. 172 : 2793-2797 (1990) . La cassette contenant le gène de résistance à la kanamycine du transposon Tn903 et le plasmide pSL1180 proviennent de la Société Pharmacia.The plasmid pAL817 is a derivative of pAL5000 and is described in the publication Ranes et al, J. Bacteriol. 172: 2793-2797 (1990). The cassette containing the kanamycin resistance gene of the transposon Tn903 and the plasmid pSL1180 come from the company Pharmacia.
Figure 8 - Construction des plasmides pIPJ64 et pIPJ65Figure 8 - Construction of plasmids pIPJ64 and pIPJ65
L'amplification du fragment V3 est faite à partir du plasmide pTG5167 fourni par Transgene. Le plasmide pIPJ42 est un dérivé de pIPJ39 où le fragment BglII/BamHI, correspondant au promoteur et au fragment aminoterminal du gène codant pour la beta-lactamase de Mycobacterium fortui tum FC1, a été remplacé par le fragment BglII/BglII de pACYC184, correspondant au promoteur et au fragment aminoterminal du gène codant pour la beta-lactamase de Mycobacterium fortuitum D316. Le plasmide pTG5167 est un dérivé de pTG186poly (Guy et al, 1987) où un fragment BglII-EcoRI portant le gène codant pour la protéine GP160 de HIVl/MN a été clone dans le polylinker. 24 Figure 9 - Construction des plasmides pRJ27 et pRJ28The amplification of the V3 fragment is made from the plasmid pTG5167 supplied by Transgene. The plasmid pIPJ42 is a derivative of pIPJ39 where the BglII / BamHI fragment, corresponding to the promoter and the aminoterminal fragment of the gene coding for the beta-lactamase of Mycobacterium fortui tum FC1, has been replaced by the BglII / BglII fragment of pACYC184 promoter and to the aminoterminal fragment of the gene coding for the beta-lactamase of Mycobacterium fortuitum D316. The plasmid pTG5167 is a derivative of pTG186poly (Guy et al, 1987) where a BglII-EcoRI fragment carrying the gene coding for the GP160 protein of HIV1 / MN has been cloned in the polylinker. 24 Figure 9 - Construction of the plasmids pRJ27 and pRJ28
L'amplification du fragment gagll est faite à partir du plasmide pTG2103 fournis par Transgene. Le plasmide pTG2103 est un dérivé de pTG959 (Guy et al, 1987) où un fragment BglII/EcoRI portant le gène codant pour la protéine P24 de HIVl/LAI a été clone dans le polylinker.The amplification of the gag11 fragment is made from the plasmid pTG2103 supplied by Transgene. The plasmid pTG2103 is a derivative of pTG959 (Guy et al, 1987) where a BglII / EcoRI fragment carrying the gene coding for the P24 protein of HIV1 / LAI has been cloned in the polylinker.
Figure 10 - Construction des plasmides pRJ33 et pRJ34Figure 10 - Construction of plasmids pRJ33 and pRJ34
L'amplification du fragment Gag p24 est faite à partir du plasmide pTG2103 fourni par Transgene.The amplification of the Gag fragment p24 is made from the plasmid pTG2103 supplied by Transgene.
Figure 11 - Construction des plasmides pSA1.5 et pSAIl.5Figure 11 - Construction of plasmids pSA1.5 and pSAIl.5
L'amplification du gène codant pour la protéine GP63 de Leishmania major est faite directement à partir du chromosome de ce parasite.The amplification of the gene coding for the GP63 protein of Leishmania major is made directly from the chromosome of this parasite.
Figure 12 - Analyse du type Western de l'expression du polypeptide beta-lactamase-V3. Les marqueurs de poids moléculaires sont indiqués à gauche de la ligne 1.Figure 12 - Western type analysis of the expression of the beta-lactamase-V3 polypeptide. The molecular weight markers are indicated to the left of line 1.
Ligne 1 : protéine gpl20 ; ligne 2 : surnageant de BCG standard ; ligne 3 : extrait de BCG standard ; ligne 4 : surnageant de BCG recombinant portant le plasmide pIPJ64 ; ligne 5 : extrait de BCG recombinant portant le plasmide pIPJ64.Lane 1: gpl20 protein; lane 2: standard BCG supernatant; lane 3: extract of standard BCG; lane 4: supernatant of recombinant BCG carrying the plasmid pIPJ64; lane 5: extract of recombinant BCG carrying the plasmid pIPJ64.
Figure 13 - Analyse du type Western de l'expression du polypeptide beta-lactamase-GaglI 25Figure 13 - Western type analysis of beta-lactamase-GaglI polypeptide expression 25
Ligne 1 : marqueurs de poids moléculaire ; ligne 2 : protéine Gag P24 ; ligne 3 : extrait de BCG standard ; lignes 4 et 5 : extraits de BCG recombinants portant le plasmide pRJ28 ; lignes 6 et 7 : extraits de BCG recombinants portant le plasmide pRJ27.Lane 1: molecular weight markers; lane 2: Gag P24 protein; lane 3: extract of standard BCG; lanes 4 and 5: extracts of recombinant BCG carrying the plasmid pRJ28; lanes 6 and 7: extracts of recombinant BCG carrying the plasmid pRJ27.
Figure 14 - Analyse du type Western de l'expression du polypeptide beta-lactamase-Gag P24Figure 14 - Western type analysis of the expression of the beta-lactamase-Gag P24 polypeptide
Ligne 1 : extrait de BCG standard ; ligne 2 : protéine Gag P24 ; ligne 3 : marqueurs de poids moléculaire ; lignes 4 et 5 : extraits de BCG recombinants portant le plasmide pRJ33 et pRJ34, respectivement.Line 1: extract of standard BCG; lane 2: Gag P24 protein; lane 3: molecular weight markers; lanes 4 and 5: extracts of recombinant BCG carrying the plasmid pRJ33 and pRJ34, respectively.
Ligne 15 - Analyse du type Western de l'expression du polypeptide beta-lactamase-GP63.Line 15 - Western type analysis of the expression of the beta-lactamase-GP63 polypeptide.
Ligne 1 : extrait de BCG standard ; ligne 2 : marqueurs de poids moléculaire ; ligne 3 : extrait de BCG recombinant portant pSAIl.5Line 1: extract of standard BCG; lane 2: molecular weight markers; lane 3: extract of recombinant BCG carrying pSAIl.5
Figure 16 - Réponses prolifératives des cellules extraites des ganglions lymphatiques des souris inoculées avec le BCG portant le plasmide pRJ28.Figure 16 - Proliferative responses of cells extracted from the lymph nodes of mice inoculated with BCG carrying the plasmid pRJ28.
4 souris Balb/c reçoivent une injection intradermique de 107 cfu de BCG-pRJ28, 4 autres reçoivent du BCG 1173P2 standard. Après 14 jours, les ganglions lymphatiques périphériques sont prélevés pour le test de prolifération.4 Balb / c mice receive an intradermal injection of 10 7 cfu of BCG-pRJ28, 4 others receive standard BCG 1173P2. After 14 days, the peripheral lymph nodes are removed for the proliferation test.
La protéine Gag P24 de HIVl-LAI est utilisée pour induire la prolifération des cellules ganglionaires qui ont été en contact avec la protéine de fusion BlaM-V3 produite par le BCG recombinant. 26 PARTIE EXERIMENTALEThe HIV1-LAI Gag P24 protein is used to induce the proliferation of ganglion cells which have been in contact with the BlaM-V3 fusion protein produced by recombinant BCG. 26 EXPERIMENTAL PART
Dans l'exemple qui suit on a utilisé une β- lactamase mycobactérienne, en vue de son expression dans M. bovis BCG, les signaux d'expression étant adaptés au contexte mycobactérien.In the example which follows, a mycobacterial β-lactamase was used, for its expression in M. bovis BCG, the expression signals being adapted to the mycobacterial context.
Une β-lactamase de M. fortuitum a été précédemment purifiée par Amicosante et al et Fattorili et al à partir d'une souche mutante produisant cette enzyme en quantité importante. La séquence N-terminale de la β- lactamase a été déterminée par Amicosante et al :A M. fortuitum β-lactamase was previously purified by Amicosante et al and Fattorili et al from a mutant strain producing this enzyme in large quantities. The N-terminal sequence of β-lactamase was determined by Amicosante et al:
APIDDQLAELERRDNVLIGLYAANLQSGRRITHRPDEMFAMXSTFKGYV X correspond à une indétermination.APIDDQLAELERRDNVLIGLYAANLQSGRRITHRPDEMFAMXSTFKGYV X corresponds to an indeterminacy.
Afin d'isoler le gène codant pour cette protéine, une sonde ADN, BlaMl correspondant au fragment de gène codant pour cette partie N-terminale de la protéine a été synthétisée par PCR. Pour cela, deux mélanges d'oligonucléotides ont été synthétisés en utilisant la dégénérescence du code génétique, et l'utilisation préférentielle des codons chez les mycobactéries (J. Dale et A. Pakti, Molecular Biology of the Mycobacteria, Surrey University Press, Guilford, U , 1990, p. 173-198) . La séquence en acides aminés APIDDQ est donc vraisemblablement codée par une famille de séquences d'ADN dont la formule est indiquée par le consensus suivant :In order to isolate the gene coding for this protein, a DNA probe, BlaM1 corresponding to the gene fragment coding for this N-terminal part of the protein was synthesized by PCR. For this, two mixtures of oligonucleotides were synthesized using the degeneration of the genetic code, and the preferential use of codons in mycobacteria (J. Dale and A. Pakti, Molecular Biology of the Mycobacteria, Surrey University Press, Guilford, U, 1990, p. 173-198). The amino acid sequence APIDDQ is therefore probably encoded by a family of DNA sequences whose formula is indicated by the following consensus:
5' GC(CθUG) CC(GouC) ATC GA(CouT) GA(COUT) CAG 3'5 'GC (CθUG) CC (GouC) ATC GA (CouT) GA (COUT) CAG 3'
Les nucleotides sont indiqués en lettres capitales ; chaque oligonucléotide appartenant à la famille est déterminé en choisissant l'un des nucleotides indiqués entre parenthèses. Le mélange de ces oligonucléotides, appelé Moligol a été synthétisé chimiquement en incorporant 1 'un ou 1'autre des nucleotides indiqués entre parenthèses. Nous avons une séquence nucléotidique hétérologue codant pour un peptide ou un polypeptide porteur d'au moins un épitope contre lequel on cherche à obtenir une réponse immunitaire et d'envisager la préparation de protéines recombinantes. Ces recherches ont en outre permis de définir quelles étaient les séquences codant pour une β-lactamase et les signaux nécessaires à l'expression de produits de fusion avec la β-lactamase, dans lesquels la β-lactamase est sous forme stable, et également les signaux nécessaires à l'exportation voire à la sécrétion, de la protéine recombinante produite chez un hôte cellulaire.The nucleotides are indicated in capital letters; each oligonucleotide belonging to the family is determined by choosing one of the nucleotides indicated in parentheses. The mixture of these oligonucleotides, called Moligol, has been chemically synthesized by incorporating one or other of the nucleotides indicated in parentheses. We have a heterologous nucleotide sequence coding for a peptide or a polypeptide carrying at least one epitope against which it is sought to obtain an immune response and to envisage the preparation of recombinant proteins. This research also made it possible to define which sequences coded for a β-lactamase and the signals necessary for the expression of fusion products with β-lactamase, in which the β-lactamase is in stable form, and also the signals necessary for the export, even for the secretion, of the recombinant protein produced in a cellular host.
En outre l'obtention de la séquence du gène de la β-lactamase de M. fortuitum permet de prévoir l'utilisation d'autres β-lactamases de structure comparable, en particulier au niveau de leur structure tridimensionnelle, pour réaliser des protéines recombinantes dans le cadre de l'invention.In addition, obtaining the sequence of the M. fortuitum β-lactamase gene makes it possible to provide for the use of other β-lactamases of comparable structure, in particular at the level of their three-dimensional structure, for producing recombinant proteins in the scope of the invention.
Dans le cadre de l'application particulière de ces protéines recombinantes à l'élaboration de vaccins vivants, les inventeurs se sont intéressés à des mycobactéries. Un candidat intéressant pour le développement de tels vaccins est la mycobactérie M. bovis BCG (le Bacille de Calmette et Guérin) , aussi désignée par la suite BCG, utilisée jusqu'à présent comme vaccin pour protéger contre la tuberculose. BCG est une bactérie avirulente, qui présente un tropisme pour les macrophages et est capable d'induire à la fois une réponse cellulaire B, T et CTL (par les lymphocytes T cytotoxiques) de forte amplitude. Sa paroi cellulaire fonctionne comme un adjuvant très efficace et une seule inoculation peut déclencher une immunité de longue durée. La présente invention a permis de mettre en évidence que l'utilisation d'une protéine vecteur telle que la β-lactamase peut favoriser le clonage et l'expression chez des mycobactéries, en particulier chez le BCG, de déterminants antigéniques hétérologues. Avantageusement, dans le cas de l'utilisation de BCG comme hôte cellulaire pour l'expression de la β- lactamase, on aura recours à une β-lactamase exogène par rapport à celles qui préexistent naturellement dans le BCG, et ce afin d'éviter ou de minimiser les phénomènes de recombinaison.In the context of the specific application of these recombinant proteins to the development of live vaccines, the inventors have taken an interest in mycobacteria. An interesting candidate for the development of such vaccines is the mycobacterium M. bovis BCG (Bacillus Calmette et Guérin), also referred to hereinafter as BCG, used until now as a vaccine to protect against tuberculosis. BCG is an avirulent bacterium, which presents a tropism for macrophages and is capable of inducing at the same time a cellular response B, T and CTL (by cytotoxic T lymphocytes) of high amplitude. Its cell wall functions as a very effective adjuvant and a single inoculation can trigger long-lasting immunity. The present invention has made it possible to demonstrate that the use of a vector protein such as β-lactamase can promote the cloning and expression in mycobacteria, in particular in BCG, of heterologous antigenic determinants. Advantageously, in the case of the use of BCG as a cellular host for the expression of β-lactamase, use will be made of an exogenous β-lactamase compared to those which naturally preexist in BCG, in order to avoid or to minimize the phenomena of recombination.
L'invention concerne donc une séquence nucléotidique caractérisée en ce qu'elle est choisie parmi l'un des enchaînements nucléotidiques suivants :The invention therefore relates to a nucleotide sequence characterized in that it is chosen from one of the following nucleotide sequences:
- la séquence du gène codant pour une β-lactamase, comprenant 1'enchaînement représenté à la figure 4,the sequence of the gene coding for a β-lactamase, comprising the sequence represented in FIG. 4,
- toute partie de 1'enchaînement nucléotidique représenté à la figure 4, participant à la structure de la β-lactamase, ou nécessaire à son expression dans un hôte cellulaire approprié, en particulier la séquence comprise entre les nucleotides 1 et 394 de l'enchaînement de la figure 4 contenant les signaux d'expression du gène, la séquence codante contenue dans l'enchaînement représenté à la figure 4, et comprenant les nucleotides 395 à 1274,- any part of the nucleotide sequence represented in FIG. 4, participating in the structure of β-lactamase, or necessary for its expression in an appropriate cellular host, in particular the sequence between nucleotides 1 and 394 of the sequence of FIG. 4 containing the gene expression signals, the coding sequence contained in the sequence represented in FIG. 4, and comprising the nucleotides 395 to 1274,
- toute séquence hybridant dans des conditions stringentes avec 1'enchaînement de la figure 4 et notamment avec 1'enchaînement compris entre les nucleotides 1 et 394 ou avec l'enchaînement utilisé le synthétiseur d'oligonucléotides Cyclone (Biosearch USA) .- any sequence hybridizing under stringent conditions with the sequence of FIG. 4 and in particular with the sequence comprised between nucleotides 1 and 394 or with the sequence used the Cyclone oligonucleotide synthesizer (Biosearch USA).
Le deuxième mélange d'oligonucléotides, appelé Moligo2 est constitué d'oligonucléotides correspondant aux brins complémentaires des séquences d'ADN codant pour la partie C-terminale du fragment N-terminal indiqué ci-dessus, c'est à dire : STFKGYV.The second mixture of oligonucleotides, called Moligo2, consists of oligonucleotides corresponding to the complementary strands of the DNA sequences coding for the C-terminal part of the N-terminal fragment indicated above, that is to say: STFKGYV.
Avec la même nomenclature que ci-dessus, les oligonucléotides constituant le mélange Moligo2 répondent au consensus :With the same nomenclature as above, the oligonucleotides constituting the Moligo2 mixture respond to the consensus:
5'AG(CθUG) TG(COUG) AAG TTC CC(GOUA) AT(AouG) CA(GouC)3 '5'AG (CθUG) TG (COUG) AAG TTC CC (GOUA) AT (AouG) CA (GouC) 3 '
L'un des mélanges contient des oligonucléotides de séquence identique ou très similaire à la partie 5' de BlaMl, le deuxième mélange contient des oligonucléotides complémentaires de la partie 3 ' de BlaMl. Ces deux mélanges sont utilisés pour synthétiser par PCR la sonde BlaMl à partir de l'ADN que nous avons extrait de M. fortuitum FC1 (C. Martin et al, Nature Vol. 345:739-743, 1990). La sonde BlaMl a été séquencée (figure 1) . A partir de cette séquence 1 ' oligonucléotide, BlaOl: 5 ' CTTGAAGGTCGAGCACATCGCGAACAT3 ' a été synthétisé et marqué radioactivement afin de l'utiliser comme sonde pour repérer dans une banque de gène de M. fortuitum D316 (Amicosante et al) un clone possédant un fragment portant le gène codant pour la β-lactamase. Cette banque a été construite en coupant l'ADN chromosomique de M. fortuitum D316 par l'enzyme de restriction SphI et en clonant les fragments au hasard dans le vecteur pACYC184. Les fragments SphI ont été insérés au site SphI de pACYC184 et la souche HB101 de E.coli a été transformée par ce mélange de ligation en présence de chlorure de calcium. Les souches transformantes ont été sélectionnées sur boîte de milieu LB contenant 30μg/ml de chloramphénicol. Les souches résistantes obtenues ont été repiquées sur le milieu LB solide contenant 25μg/ml de tétracycline et seules celles sensibles à cet antibiotique ont été retenues. Un clone transformant contenant un fragment hybridant avec BlaOl a été isolé. Ce clone contient un plasmide pACYC184 recombinant avec un insert d'environ 4,7 kb hybridant avec BlaOl. La carte de restriction de ce plasmide a été effectuée (figure 2) et la région hybridant avec BlaOl a été séquencée. La séquence nucléotidique est indiquée à la figure 4. L'analyse de cette séquence montre une phase de lecture possédant des similarités avec d'autres β-lactamases de classe A. Nous en avons donc conclu qu'il devait s'agir du gène de structure de la β-lactamase de M. fortuitum. Le fragment SphI séquence ne contient qu'une partie du gène. Un fragment de restriction BglII-SphI (représenté en trait épais sur la figure 2) interne au gène, appelé Bla02 a été utilisé comme sonde ; 1'ensemble du gène a été clone à partir d'une banque de M. fortuitum FC1. Cette banque a été construite en clonant des fragments chromosomiques BamHI de 4 à 10 kb isolés par électrophorèse sur gel d'agarose et clones dans le site BamHI du plasmide pUC18 linéarisé par coupure à ce site et déphosphorylé. Les clones transformants ont été sélectionnés sur boîte de milieu LB contenant lOOμg/ml d'ampicilline. Un clone transformant hybridant avec la sonde Bla02 a été isolé. Il contient un plasmide recombinant portant un insert d'environ 6 kb hybridant avec la sonde Bla02. La carte de restriction de cet insert a été effectuée (figure 3) et la région hybridant avec la sonde a été séquencée. Elle contient l'extrémité C-terminale du gène (figure 4) . Les deux fragments de gènes obtenus à partir des banques SphI et BamHI ont une partie commune qui permet de reconstituer l'ensemble du gène ; il est représenté à la figure 4 avec la séquence en acides aminés de la protéine déduite de la séquence nucléotidique. La séquence en acides aminés possède des similarités avec les séquences des autres β-lactamases de classe A connues. Un alignement des séquences des β-lactamases de M. fortuitum, de S. albus, de S. aureus est proposé à la figure 5. La position des différents motifs structuraux, hélices et feuillet β déterminés pour la β-lactamase de S. aureus est indiquée sur la structure primaire de cette enzyme sur la même figure. D'après les similarités entre la structure primaire de la β- lacta ase de M. fortuitum que nous venons de déduire du gène dont nous venons de déterminer la structure, et celle de S. aureus, la position des motifs structuraux est proposée à la figure 5. Sur la figure 6, les motifs structuraux de la β-lactamase de M. fortuitum ainsi que la séquence nucléotidique du gène sont aussi représentés. Une région formant la jonction entre l'hélice 2 et l'hélice α3 devrait correspondre à une région étendue à 1'intérieur de laquelle des épitopes pourront être introduits sans modifier la structure générale de la protéine. Le fragment du gène codant pour cette région, nt648 à nt719 contient un site BglII unique qui sera utilisé pour l'insertion de fragments d'ADN étrangers codant pour divers épitopes. Trois autres régions paraissent intéressantes pour l'insertion d'épitopes : la région nt585 à nt613, permettant une insertion entre le feuillet β2 et l'hélice α2, la région nt744 à nt748, permettant une insertion entre les hélices α3 et 4, et ntll52 à ntll67 qui permettront l'insertion d'épitopes entre les feuillets β4 et β5. L'insertion d'épitopes en position C-terminale de la protéine, c'est à dire proche du nucleotide 1043 pourrait être aussi intéressante.One of the mixtures contains oligonucleotides of identical or very similar sequence to the 5 'part of BlaM1, the second mixture contains oligonucleotides complementary to the 3' part of BlaMl. These two mixtures are used to synthesize the BlaM1 probe by PCR from the DNA that we have extracted from M. fortuitum FC1 (C. Martin et al, Nature Vol. 345: 739-743, 1990). The BlaMl probe was sequenced (Figure 1). From this sequence, the oligonucleotide, BlaOl: 5 'CTTGAAGGTCGAGCACATCGCGAACAT3' was synthesized and radioactively labeled in order to use it as a probe to locate in a gene bank of M. fortuitum D316 (Amicosante et al) a clone having a fragment carrying the gene coding for β-lactamase. This library was constructed by cutting the chromosomal DNA of M. fortuitum D316 by the restriction enzyme SphI and by cloning the fragments at random in the vector pACYC184. The SphI fragments were inserted at the SphI site of pACYC184 and the HB101 strain of E. coli was transformed by this ligation mixture in the presence of calcium chloride. The transforming strains were selected on a LB medium containing 30 μg / ml of chloramphenicol. The resistant strains obtained were subcultured on solid LB medium containing 25 μg / ml of tetracycline and only those sensitive to this antibiotic were retained. A transforming clone containing a fragment hybridizing with BlaOl was isolated. This clone contains a plasmid pACYC184 recombinant with an insert of approximately 4.7 kb hybridizing with BlaOl. The restriction map of this plasmid was carried out (FIG. 2) and the region hybridizing with BlaOl was sequenced. The nucleotide sequence is indicated in FIG. 4. The analysis of this sequence shows a reading phase having similarities with other class β-lactamases. We therefore concluded that it must have been the gene for structure of M. fortuitum β-lactamase. The SphI sequence fragment contains only part of the gene. A BglII-SphI restriction fragment (shown in thick lines in FIG. 2) internal to the gene, called Bla02, was used as probe; The whole gene was cloned from a library of M. fortuitum FC1. This library was constructed by cloning 4 to 10 kb BamHI chromosomal fragments isolated by electrophoresis on an agarose gel and cloned into the BamHI site of the plasmid pUC18 linearized by cleavage at this site and dephosphorylated. The transforming clones were selected on a box of LB medium containing 100 μg / ml of ampicillin. A transforming clone hybridizing with the Bla02 probe was isolated. It contains a recombinant plasmid carrying an insert of approximately 6 kb hybridizing with the Bla02 probe. The restriction map of this insert was performed (FIG. 3) and the region hybridizing with the probe was sequenced. It contains the C-terminus of the gene (Figure 4). The two gene fragments obtained from the SphI and BamHI have a common part which allows to reconstitute the whole gene; it is represented in FIG. 4 with the amino acid sequence of the protein deduced from the nucleotide sequence. The amino acid sequence has similarities to the sequences of other known class A β-lactamases. An alignment of the sequences of the β-lactamases of M. fortuitum, of S. albus, of S. aureus is proposed in FIG. 5. The position of the different structural patterns, helices and β sheet determined for the β-lactamase of S. aureus is indicated on the primary structure of this enzyme in the same figure. According to the similarities between the primary structure of the β-lacta ase of M. fortuitum which we have just deduced from the gene whose structure we have just determined, and that of S. aureus, the position of the structural motifs is proposed to the FIG. 5. In FIG. 6, the structural motifs of the M. fortuitum β-lactamase as well as the nucleotide sequence of the gene are also shown. A region forming the junction between helix 2 and the α3 helix should correspond to an extended region inside which epitopes can be introduced without modifying the general structure of the protein. The fragment of the gene coding for this region, nt648 to nt719 contains a unique BglII site which will be used for the insertion of foreign DNA fragments coding for various epitopes. Three other regions appear interesting for the insertion of epitopes: the region nt585 to nt613, allowing an insertion between the sheet β2 and the helix α2, the region nt744 to nt748, allowing an insertion between the helices α3 and 4, and ntll52 to ntll67 which will allow the insertion of epitopes between the β4 and β5 sheets. The insertion of epitopes at the C-terminal position of the protein, ie close to nucleotide 1043, could also be of interest.
Pour analyser l'expression du gène BlaM, celui-ci a été fusioné avec la β-galactosidase, une enzyme facile à doser et dont l'expression chez les bactéries est facilement repérable sur boîte de Pétri. Pour ce faire, un fragment BglII-Pstl de 1598 pb, contenant une partie du gène blaM et de la région en amont, a été isolé et inséré entre les sites BamHI et Pstl du plasmide pNM482. La fusion blaM-lacZ résultante a ensuite été transférée à un vecteur navette E.coli- mycobactérie et cette construction a été utilisée pour transformer par électroporation E.coli et M. smegmatis.To analyze the expression of the BlaM gene, it was fused with β-galactosidase, an enzyme that is easy to measure and whose expression in bacteria is easily spotted on a Petri dish. To do this, a BglII-Pstl fragment of 1598 bp, containing a part of the blaM gene and of the upstream region, was isolated and inserted between the BamHI and Pst1 sites of the plasmid pNM482. The resulting blaM-lacZ fusion was then transferred to an E. coli mycobacterium shuttle vector and this construct was used to electroporate E.coli and M. smegmatis.
L'expression du gène lacZ a été observée uniquement chez M. smegmatis. Ces résultast montrent que la région clonée située en amont du gène blaM est suffisante pour induire l'expression du gène et qu'elle doit par conséquent contenir la plupart des signaux d'initiation de la transcription et de la traduction. Ces signaux sont spécifiques des mycobactéries. Ils pourront donc de ce fait avantageusement être utilisés pour l'expression de tout gène clone sous leur contrôle, sous forme de fusion d'opéron ou de fusion de protéine.The expression of the lacZ gene has been observed only in M. smegmatis. These results show that the cloned region located upstream of the blaM gene is sufficient to induce expression of the gene and that it must therefore contain most of the signals for initiating transcription and translation. These signals are specific for mycobacteria. They can therefore therefore advantageously be used for the expression of any cloned gene under their control, in the form of an operon fusion or a protein fusion.
Le fait que la fusion blaM-lacZ est fonctionnelle montre que la système blaM pourra être utilisé pour 1'expression de divers gènes ou fragments de gènes hétérologues chez les mycobactéries. Suivant les fusions de gènes réalisées, les protéines fusion résultantes pourront avoir une localisation cytoplasmique, être exportées à l'extérieur de la bactérie dans le milieu de culture, ou rester ancrées à la membrane externe. Exemples d'utilisation du promoteur Pbla associé à tout ou partie du gène codant pour la beta-lactamase qu'il contrôle : expression d'antigènes ou de fragments d'antigènes viraux ou parasitaires et induction de réponses immunitaires spécifiques par le BCG exprimant l'un de ces antigènes.The fact that the blaM-lacZ fusion is functional shows that the blaM system can be used for the expression of various heterologous genes or fragments of genes in mycobacteria. Depending on the gene fusions carried out, the resulting fusion proteins may have a cytoplasmic localization, be exported outside the bacteria into the culture medium, or remain anchored to the external membrane. Examples of the use of the Pbla promoter associated with all or part of the gene coding for the beta-lactamase which it controls: expression of antigens or fragments of viral or parasitic antigens and induction of specific immune responses by the BCG expressing the one of these antigens.
Le promoteur Pbla (promoteur de la β-lactamase) associé au gène codant pour la beta-lactamase a été utilisé pour exprimer plusieurs motifs antigéniques viraux de HIV1. (Les séquences sont données par rapport à la publication "Hu an rétrovirus and AIDS 1991" a compilation and analysis of nucleic acid and aminoacid séquences, edited by Myers G. et al., published by Theoretical Biology and Physics, Group T-10, Mail Stop K710, Los Alamos National Laboratory, Los Alamos, New Mexico 877545 USA) ou l'antigène GP63 de Leishmania . (Les séquences sont données par rapport à la publication : Button, L.L. and Me Master, W.R. (1988) Molecular cloning of the major surface antigen of Leishmania . J. Exp. 167. 724-729) dans M. smegmatis et/ou le BCG.The Pbla promoter (β-lactamase promoter) associated with the gene coding for beta-lactamase has been used to express several viral antigenic motifs of HIV1. (The sequences are given in relation to the publication "Hu an retrovirus and AIDS 1991" a compilation and analysis of nucleic acid and aminoacid sequences, edited by Myers G. et al., Published by Theoretical Biology and Physics, Group T-10, Mail Stop K710, Los Alamos National Laboratory, Los Alamos, New Mexico 877545 USA) or Leishmania GP63 antigen. (The sequences are given in relation to the publication: Button, LL and Me Master, WR (1988) Molecular cloning of the major surface antigen of Leishmania. J. Exp. 167. 724-729) in M. smegmatis and / or the BCG.
Le motif antigénique V3 de HIV1 souche MN et un fragment de env de cette même souche ont été exprimés dans M. smegmatis et/ou le BCG.The V3 antigenic motif of HIV1 strain MN and an env fragment of this same strain were expressed in M. smegmatis and / or BCG.
L'antigène Gag P24 de HIV1 souche LAI ainsi qu'un fragment de ce dernier (Gagll) ont été exprimés dans le BCG. La protéine majeure de surface de Leishmania major et de Leishmania infantum GP63 ont été également exprimés par le BCG.The Gag P24 antigen of HIV1 strain LAI as well as a fragment of the latter (Gag11) were expressed in BCG. The major surface protein of Leishmania major and Leishmania infantum GP63 were also expressed by BCG.
Seuls sont rapportés les résultats des réponses immunitaires dirigées contre Gag dans le cas de 1'expression du fragment Gagll. Une réponse cellulaire spécifique a été observée.Only the results of the immune responses directed against Gag in the case of Expression of the Gag11 fragment. A specific cellular response has been observed.
1) Le fragment du gène env codant pour le déterminant V3 de l'acide aminé 303 à l'acide aminé 338 (HIV souche MN) a été inséré au site BglII du gène codant pour la beta-lactamase sur le plasmide pIPJ42. Pour ce faire, un fragment codant pour ce déterminant a été synthétisé par PCR. Deux oligonucléotides V3I1) The fragment of the env gene coding for the determinant V3 of amino acid 303 to amino acid 338 (HIV strain MN) was inserted at the BglII site of the gene coding for beta-lactamase on the plasmid pIPJ42. To do this, a fragment coding for this determinant was synthesized by PCR. Two V3I oligonucleotides
(ATTGGATCCTGGTACCCGAGGAGTGTACAAGACCCAACTACAATAA) et V3II(ATTGGATCCTGGTACCCGAGGAGTGTACAAGACCCAACTACAATAA) and V3II
(TTTGGATCCCTCTAGACCCGTCGCCACAATGTGCTTGTCTTATAGTTCCT) ont été synthétisés par la société GENSET. Ils ont servi à amplifier le fragment de env à partir du plasmide pTG5167 le portant et provenant de TRANSGENE. (Figure 8) . Le fragment amplifié porte le site de restriction BamHI à ses extrémités. Il est coupé par 1'enzyme de restriction correspondante et clone dans le plasmide pIPJ42. Le plasmide recombinant portant le fragment codant pour le déterminant V3 s 'appelle pIPJ52. Dans ce plasmide, une cassette contenant l'origine de replication chez les mycobactéries (ori myco de pAL5000) et le gène de résistance à la kanamycine de Tn903 a été insérée entre les sites SplI et BamHI. Cette cassette est le fragment EcoRV/Hpal isolé du plasmide pIPJ46 (figure 8) . les plasmides résultants de 1'insertion du fragment EcoRV/Hpal dans pIPJ52 dans l'une ou l'autre des orientations sont pIPJ64 et pIPJ65.(TTTGGATCCCTCTAGACCCGTCGCCACAATGTGCTTGTCTTATAGTTCCT) were synthesized by the company GENSET. They served to amplify the env fragment from the plasmid pTG5167 carrying it and originating from TRANSGENE. (Figure 8). The amplified fragment carries the BamHI restriction site at its ends. It is cut by the corresponding restriction enzyme and cloned into the plasmid pIPJ42. The recombinant plasmid carrying the fragment coding for the determinant V3 is called pIPJ52. In this plasmid, a cassette containing the origin of replication in mycobacteria (ori myco of pAL5000) and the kanamycin resistance gene of Tn903 was inserted between the SplI and BamHI sites. This cassette is the EcoRV / Hpal fragment isolated from the plasmid pIPJ46 (FIG. 8). the plasmids resulting from the insertion of the EcoRV / Hpal fragment in pIPJ52 in either of the orientations are pIPJ64 and pIPJ65.
Les plasmides pIPJ64 et pIPJ65 ont été transférés dans M. smegmatis et le BCG par électroporation. Le polypeptide fusion exprimé par les plasmides pIPJ64 et pIPJ65 consiste en 1 ' insertion du motif V3 entre les hélices 2 et 3 de la beta-lactamase. Ce polypeptide est repéré dans le milieu de culture des souches de M . smegmatis et de BCG transformées par les plasmides pIPJ64 et pIPJ65, par Western blot en utilisant l'anticorps monoclonal F5-5 de 1,'Hybridolab de 1'Institut Pasteur.Plasmids pIPJ64 and pIPJ65 were transferred to M. smegmatis and BCG by electroporation. The fusion polypeptide expressed by the plasmids pIPJ64 and pIPJ65 consists of the insertion of the V3 motif between the propellers 2 and 3 of beta-lactamase. This polypeptide is identified in the culture medium of the strains of M. smegmatis and BCG transformed by the plasmids pIPJ64 and pIPJ65, by Western blot using the monoclonal antibody F5-5 of 1, 'Hybridolab of the Pasteur Institute.
2) Le fragment du gène codant pour la partie de Gag (HIV1 souche LAI) de l'acide aminé 233 à l'acide aminé 307 (Gagll) a été inséré au site PstI du gène codant pour la beta-lactamase sur le plasmide pIPJ42. Pour ce faire, un fragment contenant la partie du gène gag codant pour Gagll a été synthétisée in vitro par PCR. Deux oligonucléotides NG12) The fragment of the gene coding for the part of Gag (HIV1 strain LAI) from amino acid 233 to amino acid 307 (Gagll) was inserted at the PstI site of the gene coding for beta-lactamase on the plasmid pIPJ42 . To do this, a fragment containing the part of the gag gene coding for Gag11 was synthesized in vitro by PCR. Two NG1 oligonucleotides
(AAACTGCAGGGATCCATGGGAAGTGACATAGCA) et NG2 (CCCTGAAGCTTACTCGGCTCTTAGAGTTTT) ont été synthétisés sur un synthétiseur d'ADN CYCLONE. Ils ont servi à amplifier le fragment codant pour Gagll à partir du plasmide pTG2103 le portant et provenant de TRANSGENE. Le fragment amplifié porte les sites PstI et HindIII. Il est coupé par les enzymes correspondantes et clone dans le plasmide pIPJ42 entre les sites PstI et HindIII. Le plasmide résultant s'appelle pRJ20. A partir de ce plasmide, le fragment Kpnl/Hin dm codant pour la fusion beta-lactamase-GaglI a été inséré au site Seal de pRR3 (Ranes, M. G., Rauzier, J., Lagranderie, M., Georghiu, M. and Gicquel, B. (1990) Functional analysis of pAL5000, a plasmid from Mycobacterium fortui tum : construction of a"mini" Mycobacterium- escherichia coli shuttle vector. J. Bacteriol . 172. 2793-2797) dans les deux orientations. Les plasmides résultant ont été appelés pRJ27 et pRJ28. Les plasmides pRJ27 et pRJ28 ont été transférés dans M. smegmatis et le BCG par électroporation.(AAACTGCAGGGATCCATGGGAAGTGACATAGCA) and NG2 (CCCTGAAGCTTACTCGGCTCTTAGAGTTTT) were synthesized on a CYCLONE DNA synthesizer. They were used to amplify the fragment coding for Gag11 from the plasmid pTG2103 carrying it and originating from TRANSGENE. The amplified fragment carries the PstI and HindIII sites. It is cut by the corresponding enzymes and cloned in the plasmid pIPJ42 between the PstI and HindIII sites. The resulting plasmid is called pRJ20. From this plasmid, the Kpnl / Hin dm fragment coding for the beta-lactamase-GaglI fusion was inserted at the Seal site of pRR3 (Ranes, MG, Rauzier, J., Lagranderie, M., Georghiu, M. and Gicquel , B. (1990) Functional analysis of pAL5000, a plasmid from Mycobacterium fortui tum: construction of a "mini" Mycobacterium- escherichia coli shuttle vector. J. Bacteriol. 172. 2793-2797) in both directions. The resulting plasmids were called pRJ27 and pRJ28. Plasmids pRJ27 and pRJ28 were transferred to M. smegmatis and BCG by electroporation.
Le polypeptide fusion exprimé par les plasmides pR 27 et pRJ28 consiste en la fusion entre un fragment aminoterminal de 24 aminoacides de la beta-lactamase avec le fragment gagll puisqu'un codon stop se situe à l'extrémité de gagll. Le polypeptide fusion beta- lactamase-GaglI n'est pas retrouvé dans le milieu de culture de M. smegmatis ou du BCG transformés par pRJ27 et pRJ28, mais dans le cytoplasme de ces bactéries. Il est repéré par western blot dans les extraits bactériens (réalisé selon Winter, N. , Lagranderie, M., Rauzier, J. , Ti m, J. , Lecrec, C. , Guy, B. , Kieny, M.P., Gheorghiu, M., Gicquel, B. (1991) Expression of heterologous gènes in Mycobacterium bovis BCG : induction of a cellular response against HIV1 Nef protein. Gène 190, 47-54) en utilisant l'anticorps monoclonal 1542 de l'Hybridolab de l'Institut Pasteur.The fusion polypeptide expressed by the plasmids pR 27 and pRJ28 consists of the fusion between an amino-terminal fragment of 24 amino acids of beta-lactamase with the fragment gagll since a stop codon is located at the end of gagll. The beta-lactamase-GagII fusion polypeptide is not found in the culture medium of M. smegmatis or of BCG transformed by pRJ27 and pRJ28, but in the cytoplasm of these bacteria. It is identified by western blot in the bacterial extracts (produced according to Winter, N., Lagranderie, M., Rauzier, J., Ti m, J., Lecrec, C., Guy, B., Kieny, MP, Gheorghiu, M., Gicquel, B. (1991) Expression of heterologous genes in Mycobacterium bovis BCG: induction of a cellular response against HIV1 Nef protein. Gene 190, 47-54) using the monoclonal antibody 1542 of Hybridolab Pastor Institute.
Après inoculation de souris Balb/c par le BCG exprimant la fusion beta-lactamase-GaglI, une réponse immunitaire de type cellulaire dirigée contre Gag a été observée en utilisant des tests de prolifération de cellules des ganglions lymphatiques après stimulation par la protéine Gag P24. Le protocole utilisé est semblable à celui décrit par Winter et al. Les détails sont indiqués dans la figure 13.After inoculation of Balb / c mice with BCG expressing the beta-lactamase-GaglI fusion, a cell-type immune response directed against Gag was observed using tests of proliferation of lymph node cells after stimulation with the protein Gag P24. The protocol used is similar to that described by Winter et al. Details are shown in Figure 13.
Il est probable qu'il s'agisse de lymphocytes T(CD4) et T(CD8)It is likely to be T (CD4) and T (CD8) lymphocytes
3) La protéine Gag P24 de HIV1 souche LAI.3) The Gag P24 protein of HIV1 strain LAI.
Le fragment codant pour la protéine GagP24 a été inséré au site BglII du gène codant pour la beta-lactamase sur le plasmide pIPJ42. Pour ce faire, un fragment codant pour Gag P24 a été synthétisé in vitro par PCR à partir du plasmide pTG2103, provenant de TRANSGENE, à l'aide des oligonucléotides JGAG1.The fragment coding for the protein GagP24 was inserted at the BglII site of the gene coding for beta-lactamase on the plasmid pIPJ42. To do this, a fragment coding for Gag P24 was synthesized in vitro by PCR from the plasmid pTG2103, originating from TRANSGENE, using the oligonucleotides JGAG1.
(CGAATTCAGATCTCAACTTTAAATGCATGGGTA) et EML5 (GTTCGAATTCTCACAAACTCTTGC) , synthétisés, au préalable, sur un synthétiseur CYCLONE. Le fragment amplifié porte les sites BglII et BamHI. Il est coupé par les enzymes correspondants et clone dans le plasmide pIPJ42 entre les sites BglII et BamHI. Le plasmide résultant s'appelle pRJ22. Comme dans le cas de la construction des plasmides pIPJ64 et pIPJ65, la cassette contenant l'origine de replication chez les mycobactéries (ori yco de pAL5000) et le gène de résistance à la kanamycine de Tn903 a été insérée entre les sites SplI et BamHI. C'est le fragment EcoRV/Hpal isolé du plasmide pIPJ46 (Figure 10) . Ces plasmides résultant de l'insertion du fragment EcoRV/Hpal s'appellent pRJ33 et pRJ34.(CGAATTCAGATCTCAACTTTAAATGCATGGGTA) and EML5 (GTTCGAATTCTCACAAACTCTTGC), previously synthesized on a CYCLONE synthesizer. The amplified fragment carries the BglII and BamHI sites. It is cut by the corresponding enzymes and cloned into the plasmid pIPJ42 between the BglII and BamHI sites. The resulting plasmid is called pRJ22. As in the case of the construction of the plasmids pIPJ64 and pIPJ65, the cassette containing the origin of replication in mycobacteria (ori yco of pAL5000) and the kanamycin resistance gene of Tn903 was inserted between the SplI and BamHI sites. It is the EcoRV / Hpal fragment isolated from the plasmid pIPJ46 (Figure 10). These plasmids resulting from the insertion of the EcoRV / Hpal fragment are called pRJ33 and pRJ34.
Les plasmides pRJ33 et pRJ34 ont été transférés dans M . smegmatis et le BCG par électroporation. Le polypeptide fusion exprimé par les plasmides pRJ33 et pRJ34 consiste en un fragment aminoterminal de 60 aminoacides de la beta-lactamase avec la protéine GagP24 puisqu'un codon stop se situe à l'extrémité du gène Gag P24 clone ici. D'une façon analogue à la fusion beta-lactamase-GaglI, le polypeptide fusion beta-lacatamase-Gag P24 n'est pas retrouvé dans le milieu de culture mais dans le cytoplasme. Il est repéré par Western blot en utilisant l'anticorps monoclonal 1113 de l'Hybridolab de l'Institut Pasteur.Plasmids pRJ33 and pRJ34 were transferred to M. smegmatis and BCG by electroporation. The fusion polypeptide expressed by the plasmids pRJ33 and pRJ34 consists of an amino-terminal fragment of 60 amino acids of beta-lactamase with the protein GagP24 since a stop codon is located at the end of the Gag P24 gene cloned here. Analogously to the beta-lactamase-GagII fusion, the beta-lacatamase-Gag P24 fusion polypeptide is not found in the culture medium but in the cytoplasm. It is identified by Western blot using the 1113 monoclonal antibody from the Hybridolab of the Institut Pasteur.
4) L'antigène de surface GP63 de Leishmania infantum et Leishmania major . Le fragment codant pour la protéine GP63 dépourvue de la partie C-terminale transmembranaire a été inséré au site BglII du gène codant pour la beta-lactamase sur le plasmide pIPJ42. Pour ce faire, un fragment codant pour l'antigène GP63 a été synthétisé in vitro par PCR. Deux oligonucléotides GP6314) The GP63 surface antigen of Leishmania infantum and Leishmania major. The fragment coding for the GP63 protein lacking the C-terminal transmembrane part was inserted at the BglII site of the gene coding for beta-lactamase on the plasmid pIPJ42. To do this, a fragment coding for the GP63 antigen was synthesized in vitro by PCR. Two GP631 oligonucleotides
(GCGGGATCCTTATGCATGTGCGCGACGTGAACTGGGGC) et GP632 (CCGAATTCAAGCTTCTACGCCGTGTTGCCGCCGTCCTT) ont servi à amplifier ce fragment à partir de l'ADN chromosomique des souches de Leishmania infantum et Leishmania major. Les extrémités des fragments amplifiés possèdent les sites BamH et HindIII. Ils sont coupés par les enzymes correspondants et insérés entre les sites BglII et HindIII de pIPJ42. Le plasmide résultant s'appelle pLMl.5.(GCGGGATCCTTATGCATGTGCGCGACGTGAACTGGGGC) and GP632 (CCGAATTCAAGCTTCTACGCCGTGTTGCCGCCGTCCTT) were used to amplify this fragment from the chromosomal DNA of the strains of Leishmania infantum and Leishmania major. The ends of the amplified fragments have the BamH and HindIII sites. They are cut by the corresponding enzymes and inserted between the BglII and HindIII sites of pIPJ42. The resulting plasmid is called pLMl.5.
Comme dans le cas de la construction des plasmides pIPJ64 et pIPJ65, la cassette contenant 1'origine de replication chez les mycobactéries (oriMyco de pAL5000) et le gène de résistance à la kanamycine de Tn903 a été insérée entre les sites SplI et BamHI.As in the case of the construction of the plasmids pIPJ64 and pIPJ65, the cassette containing the origin of replication in mycobacteria (oriMyco of pAL5000) and the kanamycin resistance gene of Tn903 was inserted between the SplI and BamHI sites.
C'est le fragment EcoRV/Hpal isolé du plasmide pIPJ46 (Figure il) .It is the EcoRV / Hpal fragment isolated from the plasmid pIPJ46 (FIG. 11).
Les plasmides résultant de 1 ' insertion du fragment EcoRV/Hpal dans 1 'une ou 1 'autre des orientations s'appellent pSA1.5 et pSAI1.5.The plasmids resulting from the insertion of the EcoRV / Hpal fragment in one or the other of the orientations are called pSA1.5 and pSAI1.5.
Les plasmides pSA1.5 et pSAIl.5 ont été transférés dans M. smegmatis et le BCG par électroporation. Les polypeptides fusion exprimés par ces plasmides consistent en la fusion entre un fragment amino¬ terminal de 60 aminoacides de la beta-lactamase avec la protéine GP63 délétée de la partie C-terminale transmembranaire. Les polypeptides fusion beta- lactamase-Protéine GP63 sont comme dans le cas des fusions avec Gag retrouvés dans le cytoplasme de M . smegmatis et du BCG transformés par les plasmides pSA1.5 et pSAI1.5. Ils sont repérés par un anticorps monoclonal dirigé contre la protéine GP63 purifiée à partir d'extraits d'une souche de E. coli recombinante exprimant cette protéine. Cet anticorps monoclonal a été décrit par Hand an, L. Button, et R.W. McMaster [(1990) Leishmania major ; Production of recombinant gp63, its antigernicity and immunogenicity in mice Exp. Parasitol. 70, 427-435] (Figure 15). Plasmids pSA1.5 and pSAIl.5 were transferred to M. smegmatis and BCG by electroporation. The fusion polypeptides expressed by these plasmids consist of the fusion between an amino¬ terminal fragment of 60 amino acids of beta-lactamase with the protein GP63 deleted from the C-terminal transmembrane part. The beta-lactamase-Protein GP63 fusion polypeptides are as in the case of Gag fusions found in the cytoplasm of M. smegmatis and BCG transformed by the plasmids pSA1.5 and pSAI1.5. They are identified by a monoclonal antibody directed against the protein GP63 purified from extracts of a recombinant E. coli strain expressing this protein. This monoclonal antibody has been described by Hand an, L. Button, and RW McMaster [(1990) Leishmania major; Production of recombinant gp63, its antigernicity and immunogenicity in mice Exp. Parasitol. 70, 427-435] (Figure 15).

Claims

R E V E N D I C A T I O N S
1. Séquence nucléotidique, caractérisée en ce qu'elle est choisie parmi l'un des enchaînements nucléotidiques suivants :1. Nucleotide sequence, characterized in that it is chosen from one of the following nucleotide sequences:
- la séquence du gène codant pour une β-lactamase, comprenant 1'enchaînement représenté à la figure 4,the sequence of the gene coding for a β-lactamase, comprising the sequence represented in FIG. 4,
- toute partie de 1'enchaînement nucléotidique représenté à la figure 4, participant à la structure de la β-lactamase, ou nécessaire à son expression dans un hôte cellulaire approprié, en particulier la séguence comprise entre les nucleotides 1 et 394 de l'enchaînement de la figure 4 contenant les signaux d'expression du gène,- any part of the nucleotide sequence represented in FIG. 4, participating in the structure of β-lactamase, or necessary for its expression in an appropriate cellular host, in particular the sequence between nucleotides 1 and 394 of the sequence in FIG. 4 containing the gene expression signals,
- la séquence codante contenue dans 1'enchaînement représenté à la figure 4, et comprenant les nucleotides 395 à 1274,the coding sequence contained in the sequence represented in FIG. 4, and comprising nucleotides 395 to 1274,
- toute séquence hybridant dans des conditions stringentes avec 1'enchaînement de la figure 4 et notamment avec 1 'enchaînement compris e^htre les nucleotides 1 et 394, ou avec l'enchaînement compris entre les nucleotides 395 et 1274 de cette séquence.any sequence hybridizing under stringent conditions with the sequence of FIG. 4 and in particular with the sequence included between nucleotides 1 and 394, or with the sequence included between nucleotides 395 and 1274 of this sequence.
2. Séquence nucléotidique, caractérisée en ce qu'elle code pour une protéine de type β-lactamase comprenant l'enchaînement d'acides aminés représenté à la figure 4.2. Nucleotide sequence, characterized in that it codes for a protein of the β-lactamase type comprising the chain of amino acids represented in FIG. 4.
3. Séquence nucléotidique recombinante, caractérisée en ce qu'elle comprend :3. Recombinant nucleotide sequence, characterized in that it comprises:
- une séquence nucléotidique selon l'une quelconque des revendications 1 à 2 codant pour la β- lactamase, modifiée par au moins un enchaînement nucléotidique hétérologue codant pour une séquence peptidique hétérologue comprenant au moins un épitope, la modification étant réalisée en au moins un site permettant, lorsque la séquence recombinante est exprimée, l'exposition de l'épitope à la surface de la β-lactamase, ou son accessibilité au solvant, une séquence nucléotidique selon l'une quelconque des revendications 1 ou 2, codant pour une β- lactamase tronquée, modifiée par au moins un enchaînement nucléotidique hétérologue codant pour une séquence peptidique hétérologue comprenant au moins un épitope, la modification étant réalisée en au moins un site permettant, lorsque la séquence recombinante est exprimée, l'exposition de l'épitope à la surface de la β-lactamase ou son accessibilité au solvant, et la protéine hybride exprimée conservant les caractéristiques structurales essentielles de la β-lactamase native, en particulier celles qui lui confèrent sa stabilité, notamment sa reconnaissance par des anticorps.- A nucleotide sequence according to any one of claims 1 to 2 coding for β-lactamase, modified by at least one sequence heterologous nucleotide encoding a heterologous peptide sequence comprising at least one epitope, the modification being carried out at at least one site allowing, when the recombinant sequence is expressed, the exposure of the epitope to the surface of β-lactamase, or its accessibility to the solvent, a nucleotide sequence according to any one of claims 1 or 2, coding for a truncated β-lactamase, modified by at least one heterologous nucleotide sequence coding for a heterologous peptide sequence comprising at least one epitope, the modification being carried out at least one site allowing, when the recombinant sequence is expressed, the exposure of the epitope to the surface of β-lactamase or its accessibility to the solvent, and the expressed hybrid protein retaining the essential structural characteristics of β-lactamase native, in particular those which give it its stability, in particular its recognition growth by antibodies.
4. Séquence nucléotidique recombinante selon la revendication 3, caractérisée en ce que l'enchaînement nucléotidique hétérologue gu'elle contient code pour une séquence peptidique impliquée dans la virulence d'un agent pathogène, ou pour un antigène à potentiel protecteur.4. Recombinant nucleotide sequence according to claim 3, characterized in that the heterologous nucleotide sequence which contains code for a peptide sequence involved in the virulence of a pathogenic agent, or for an antigen with protective potential.
5. Séquence nucléotidique recombinante selon l'une quelconque des revendications 3 ou 4, caractérisée en ce que l'enchaînement nucléotidique hétérologue qu'elle contient code pour une séquence peptidique d'un antigène d'un rétrovirus humain de type HIV, notamment un antigène d'enveloppe, de gag, nef, ou pol, d'un rétro virus HIV-1 ou HIV-2.5. Recombinant nucleotide sequence according to any one of claims 3 or 4, characterized in that the heterologous nucleotide sequence which it contains codes for a peptide sequence of an antigen of a human retrovirus of HIV type, in particular an envelope, gag, nave, or pol antigen of an HIV-1 or HIV-2 retro virus.
6. Séquence nucléotidique recombinante selon l'une quelconque des revendications 3 à 5, caractérisée en ce que 1'enchaînement nucléotidique hétérologue qu'elle contient code pour la séquence peptidique V3 de 1'antigène d'enveloppe de HIV-1.6. Recombinant nucleotide sequence according to any one of claims 3 to 5, characterized in that the heterologous nucleotide sequence which it contains codes for the peptide sequence V3 of the HIV-1 envelope antigen.
7. Vecteur recombinant de clonage et/ou d'expression, caractérisé en ce qu'il est modifié par l'un de ses sites non essentiels pour sa replication ou son intégration, par une séquence nucléotidique selon l'une quelconque des revendications 1 à 6.7. Recombinant cloning and / or expression vector, characterized in that it is modified by one of its non-essential sites for its replication or its integration, by a nucleotide sequence according to any one of claims 1 to 6.
8. Vecteur recombinant selon la revendication 7, caractérisé en ce que la séquence nucléotidique qu'il contient est placée sous le contrôle du promoteur du gène de la β-lactamase dont est issue la susdite séquence nucléotidique.8. Recombinant vector according to claim 7, characterized in that the nucleotide sequence which it contains is placed under the control of the promoter of the β-lactamase gene from which the abovementioned nucleotide sequence originates.
9. Vecteur recombinant selon la revendication 7 ou 8, caractérisé en ce qu'il s'agit d'un plasmide, d'un phage ou d'un transposon.9. Recombinant vector according to claim 7 or 8, characterized in that it is a plasmid, a phage or a transposon.
10. Vecteur recombinant selon l'une quelconque des revendications 7 à 9, caractérisé en ce qu'il s'agit du plasmide pACYC184 BlaM contenant le fragment SphI de l'enchaînement représenté à la figure 4, contenu dans une souche de E.coli déposée à la C.N.C.M. le 11 Février 1992 sous le numéro 1-1171.10. Recombinant vector according to any one of claims 7 to 9, characterized in that it is the plasmid pACYC184 BlaM containing the SphI fragment of the sequence represented in FIG. 4, contained in a strain of E. coli filed with the CNCM on February 11, 1992 under number 1-1171.
11. Vecteur recombinant selon l'une quelconque des revendications 7 à 9, caractérisé en ce qu'il s'agit du plasmide pIPJ39, contenant le gène de la β-lactamase de M. fortuitum, ce plasmide étant contenu dans une souche de E.coli déposée à la C.N.C.M. le 11 Février 1992 sous le numéro 1-1170. 11. Recombinant vector according to any one of claims 7 to 9, characterized in that it is the plasmid pIPJ39, containing the gene for the β-lactamase of M. fortuitum, this plasmid being contained in a strain of E .coli deposited at the CNCM on February 11, 1992 under the number 1-1170.
12. Hôte cellulaire recombinant, caractérisé en ce qu'il est transformé par une séquence nucléotidique selon l'une quelconque des revendications 1 à 6 ou par un vecteur recombinant selon l'une quelconque des revendications 7 à 11, dans des conditions permettant l'expression de la séquence nucléotidique recombinante sous la forme d'une protéine de fusion stable ou de préférence son exportation à la surface de l'hôte ou sa sécrétion dans le milieu.12. Recombinant cell host, characterized in that it is transformed by a nucleotide sequence according to any one of claims 1 to 6 or by a recombinant vector according to any one of claims 7 to 11, under conditions allowing expression of the recombinant nucleotide sequence in the form of a stable fusion protein or preferably its export to the surface of the host or its secretion into the medium.
13. Hôte cellulaire selon la revendication 12, caractérisé en ce qu'il s'agit d'une souche d'Actinomycète, de préférence d'une souche de mycobactérie, avirulente ou rendue avirulente.13. Cell host according to claim 12, characterized in that it is a strain of Actinomycete, preferably a strain of mycobacterium, avirulent or rendered avirulent.
14. Hôte cellulaire recombinant selon la revendication 13, caractérisé en ce qu'il s'agit de M. bovis BCG.14. Recombinant cell host according to claim 13, characterized in that it is M. bovis BCG.
15. Hôte cellulaire recombinant selon la revendication 12, caractérisé en ce gu'il s'agit d'une bactérie, par exemple d'une souche E.coli non virulente, ou d'une souche non virulente d'entérobactérie telle qu'une salmonelle avirulente, dès lors que la séquence nucléotidique recombinante ou le vecteur recombinant selon l'une quelconque des revendications 3 à 11, qu'elle contient, est placé sous le contrôle de signaux d'expression reconnus par cette bactérie.15. Recombinant cell host according to claim 12, characterized in that it is a bacterium, for example of a non-virulent E. coli strain, or of a non-virulent strain of enterobacterium such as Avirulent salmonella, since the recombinant nucleotide sequence or the recombinant vector according to any one of Claims 3 to 11, which it contains, is placed under the control of expression signals recognized by this bacterium.
16. Hôte cellulaire recombinant selon la revendication 12, caractérisé en ce qu'il s'agit d'un champignon, par exemple du genre Aspergillus dès lors gue la séquence nucléotidique recombinante ou le vecteur recombinant selon l'une quelconque des revendications 3 à 11, qu'elle contient, est placé sous le contrôle de signaux d'expression reconnus par ce champignon.16. Recombinant cell host according to claim 12, characterized in that it is a fungus, for example of the genus Aspergillus therefore guue the recombinant nucleotide sequence or the recombinant vector according to any one of claims 3 to 11 , which it contains, is placed under the control of expression signals recognized by this fungus.
17. Protéine recombinante, caractérisée en ce qu'il s'agit d'une β-lactamase codée par une séquence nucléotidique selon l'une quelconque des revendications 1 ou 2 modifiée en un site exposé, par au moins une séquence peptidique hétérologue comportant au moins un épitope antigénique dans des conditions telles que la protéine recombinante est capable d'induire une réponse immunitaire contre le (les) polypeptide(s) hétérologue(s) chez l'animal ou chez l'homme.17. Recombinant protein, characterized in that it is a β-lactamase encoded by a nucleotide sequence according to any one of the claims 1 or 2 modified at an exposed site, by at least one heterologous peptide sequence comprising at least one antigenic epitope under conditions such that the recombinant protein is capable of inducing an immune response against the heterologous polypeptide (s) ) in animals or humans.
18. Protéine recombinante selon la revendication 17, caractérisée en ce que la structure de la β-lactamase est essentiellement conservée, de telle sorte que la protéine recombinante est stable, et en particulier qu'elle est insensible aux protéases cellulaires.18. Recombinant protein according to claim 17, characterized in that the structure of β-lactamase is essentially conserved, so that the recombinant protein is stable, and in particular that it is insensitive to cellular proteases.
19. Protéine selon l'une quelconque des revendications 17 ou 18, caractérisée en ce que la β-lactamase est une β-lactamase de classe A.19. Protein according to any one of claims 17 or 18, characterized in that the β-lactamase is a class A β-lactamase.
20. Protéine recombinante selon la revendication 1 ou la revendication 2, caractérisée en ce que la β- lactamase est celle de M. fortuitum.20. Recombinant protein according to claim 1 or claim 2, characterized in that the β-lactamase is that of M. fortuitum.
21. Protéine recombinante selon l'une quelconque des revendications 17 à 20, caractérisée en ce que la β- lactamase est sous forme active.21. Recombinant protein according to any one of claims 17 to 20, characterized in that the β-lactamase is in active form.
22. Protéine β-lactamase recombinante selon l'une quelconque des revendications 17 à 21, caractérisée en ce que la séquence peptidique hétérologue qu'elle contient, est accessible au solvant.22. Recombinant β-lactamase protein according to any one of claims 17 to 21, characterized in that the heterologous peptide sequence which it contains, is accessible to the solvent.
23. Protéine β-lactamase recombinante selon l'une quelconque des revendications 17 à 21, caractérisée en ce qu'elle contient au moins une séquence peptidique hétérologue comportant au moins un épitope, inséré au niveau d'un site présent dans une région de la β- lactamase en dehors des régions structurées en hélices α ou en feuillets β.23. Recombinant β-lactamase protein according to any one of claims 17 to 21, characterized in that it contains at least one heterologous peptide sequence comprising at least one epitope, inserted at a site present in a region of the β- lactamase outside regions structured in α helices or β sheets.
24. Protéine β-lactamase recombinante selon l'une quelconque des revendications 17 à 23, caractérisée en ce qu'elle contient au moins une séquence peptidique hétérologue comportant au moins un épitope inséré dans la région formant la jonction entre l'hélice 2 et l'hélice c-3 de la β-lactamase.24. Recombinant β-lactamase protein according to any one of claims 17 to 23, characterized in that it contains at least one peptide sequence heterologous comprising at least one epitope inserted in the region forming the junction between helix 2 and helix c-3 of β-lactamase.
25. Protéine β-lactamase recombinante selon l'une quelconque des revendications 17 à 23, caractérisée en ce qu'elle contient au moins une séquence peptidique hétérologue comportant au moins un épitope inséré dans la région formant la jonction entre l'hélice α3 et l'hélice α4 de la β-lactamase.25. Recombinant β-lactamase protein according to any one of claims 17 to 23, characterized in that it contains at least one heterologous peptide sequence comprising at least one epitope inserted in the region forming the junction between the α3 helix and l α4 helix of β-lactamase.
26. Protéine β-lactamase recombinante selon l'une quelconque des revendications 17 à 23, caractérisée en ce qu'elle contient au moins une séquence peptidique hétérologue comportant au moins un épitope inséré dans la région formant la jonction entre le feuillet β4 et le feuillet β5 de la β-lactamase.26. Recombinant β-lactamase protein according to any one of claims 17 to 23, characterized in that it contains at least one heterologous peptide sequence comprising at least one epitope inserted in the region forming the junction between the β4 sheet and the sheet. β5 of β-lactamase.
27. Protéine β-lactamase recombinante selon l'une quelconque des revendications 17 à 23, caractérisée en ce qu'elle contient au moins une séquence peptidique hétérologue comportant au moins un épitope inséré dans la région exposée de la séquence C-terminale de la β- lactamase.27. Recombinant β-lactamase protein according to any one of claims 17 to 23, characterized in that it contains at least one heterologous peptide sequence comprising at least one epitope inserted in the exposed region of the C-terminal sequence of β - lactamase.
28. Protéine β-lactamase recombinante selon l'une quelconque des revendications 17 à 27, caractérisée en ce qu'elle contient à titre de séquence peptidique hétérologue, une séquence peptidique du rétrovirus HIV, en particulier une séquence de la glycoprotéine d'enveloppe, ou des protéines gag, nef, pol, d'un rétrovirus HIV-1 ou HIV-2.28. Recombinant β-lactamase protein according to any one of claims 17 to 27, characterized in that it contains, as heterologous peptide sequence, a peptide sequence of the HIV retrovirus, in particular a sequence of the envelope glycoprotein, or gag, nef, pol proteins of an HIV-1 or HIV-2 retrovirus.
29. Protéine β-lactamase recombinante selon l'une quelconque des revendications 17 à 27, caractérisée en ce qu'elle contient à titre de séquence peptidique hétérologue, le peptide V3 de l'enveloppe de HIV-1, de préférence inséré en son site BgpII. 29. Recombinant β-lactamase protein according to any one of claims 17 to 27, characterized in that it contains, as heterologous peptide sequence, the peptide V3 of the HIV-1 envelope, preferably inserted at its site BgpII.
30. Composition immunogène, caractérisée en ce qu'elle comprend un hôte cellulaire recombinant, avirulent selon l'une quelconque des revendications 12 à 16 et un véhicule pharmaceutique approprié pour 1'administration.30. Immunogenic composition, characterized in that it comprises a recombinant, avirulent cell host according to any one of claims 12 to 16 and a pharmaceutical vehicle suitable for administration.
31. Composition immunogène selon la revendication 30, caractérisée en ce qu'elle comprend une souche recombinante M. bovis BCG, en combinaison avec un véhicule pharmaceutiquement approprié pour 1'administration.31. Immunogenic composition according to claim 30, characterized in that it comprises a recombinant strain M. bovis BCG, in combination with a pharmaceutically suitable vehicle for administration.
32. Composition immunogène, caractérisée en ce qu'elle comprend une protéine recombinante selon l'une quelconque des revendications 17 à 29, en combinaison avec un véhicule pharmaceutique approprié pour 1'administration.32. Immunogenic composition, characterized in that it comprises a recombinant protein according to any one of claims 17 to 29, in combination with a pharmaceutical vehicle suitable for administration.
33. Séquence nucléotidique recombinante selon l'une quelconque des revendications 3 à 6, caractérisée en ce que la séquence nucléotidique hétérologue est insérée dans une région comprise entre les hélices α et les feuillets β de la séguence de la β-lactamase représentée à la figure 6.33. Recombinant nucleotide sequence according to any one of claims 3 to 6, characterized in that the heterologous nucleotide sequence is inserted in a region between the α helices and the β sheets of the sequence of the β-lactamase represented in the figure 6.
34. Séquence nucléotidique recombinante selon la revendication 33, caractérisée en ce que le site d'insertion est contenu dans une région de la séquence de la figure 6 choisie parmi : la région entre le feuillet β2 et l'hélice α2 correspondant aux nucleotides 585 à 613, la région entre les hélices α2 et α3, correspondant aux nucleotides 648 à 719, en particulier le site BglII, la région entre les hélices α3 et α4 correspondant aux nucleotides 744 à 748, - la région entre les feuillets β4 et β5 correspondant aux nucleotides 1152 à 1167. 34. Recombinant nucleotide sequence according to claim 33, characterized in that the insertion site is contained in a region of the sequence of FIG. 6 chosen from: the region between the β2 sheet and the α2 helix corresponding to nucleotides 585 to 613, the region between the helices α2 and α3, corresponding to nucleotides 648 to 719, in particular the BglII site, the region between the helices α3 and α4 corresponding to nucleotides 744 to 748, - the region between the sheets β4 and β5 corresponding to nucleotides 1152 to 1167.
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