EA046268B1 - ANTIBODIES CONTAINING ONLY HEAVY CHAINS THAT BIND TO PSMA - Google Patents
ANTIBODIES CONTAINING ONLY HEAVY CHAINS THAT BIND TO PSMA Download PDFInfo
- Publication number
- EA046268B1 EA046268B1 EA202192736 EA046268B1 EA 046268 B1 EA046268 B1 EA 046268B1 EA 202192736 EA202192736 EA 202192736 EA 046268 B1 EA046268 B1 EA 046268B1
- Authority
- EA
- Eurasian Patent Office
- Prior art keywords
- seq
- sequence
- antibody
- cdr2
- cdr3
- Prior art date
Links
- 101000892862 Homo sapiens Glutamate carboxypeptidase 2 Proteins 0.000 title claims description 189
- 102100041003 Glutamate carboxypeptidase 2 Human genes 0.000 title claims description 188
- 229920001481 poly(stearyl methacrylate) Polymers 0.000 title claims description 73
- 230000027455 binding Effects 0.000 claims description 228
- 239000000427 antigen Substances 0.000 claims description 130
- 108091007433 antigens Proteins 0.000 claims description 130
- 102000036639 antigens Human genes 0.000 claims description 130
- 102100035360 Cerebellar degeneration-related antigen 1 Human genes 0.000 claims description 122
- 210000004027 cell Anatomy 0.000 claims description 118
- 101100112922 Candida albicans CDR3 gene Proteins 0.000 claims description 107
- 102100035361 Cerebellar degeneration-related protein 2 Human genes 0.000 claims description 104
- 101000737793 Homo sapiens Cerebellar degeneration-related antigen 1 Proteins 0.000 claims description 104
- 101000737796 Homo sapiens Cerebellar degeneration-related protein 2 Proteins 0.000 claims description 104
- 102000017420 CD3 protein, epsilon/gamma/delta subunit Human genes 0.000 claims description 85
- 108090000765 processed proteins & peptides Proteins 0.000 claims description 76
- 229920001184 polypeptide Polymers 0.000 claims description 74
- 102000004196 processed proteins & peptides Human genes 0.000 claims description 74
- 208000037265 diseases, disorders, signs and symptoms Diseases 0.000 claims description 40
- 238000000034 method Methods 0.000 claims description 35
- 206010028980 Neoplasm Diseases 0.000 claims description 29
- 238000011282 treatment Methods 0.000 claims description 23
- 230000014509 gene expression Effects 0.000 claims description 22
- 241001465754 Metazoa Species 0.000 claims description 20
- FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 4-amino-1-[(2r)-6-amino-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-[[(2r)-2-amino-3-phenylpropanoyl]amino]-3-phenylpropanoyl]amino]-4-methylpentanoyl]amino]hexanoyl]piperidine-4-carboxylic acid Chemical compound C([C@H](C(=O)N[C@H](CC(C)C)C(=O)N[C@H](CCCCN)C(=O)N1CCC(N)(CC1)C(O)=O)NC(=O)[C@H](N)CC=1C=CC=CC=1)C1=CC=CC=C1 FWMNVWWHGCHHJJ-SKKKGAJSSA-N 0.000 claims description 19
- 239000008194 pharmaceutical composition Substances 0.000 claims description 19
- 238000006467 substitution reaction Methods 0.000 claims description 17
- 239000003814 drug Substances 0.000 claims description 13
- 241000699670 Mus sp. Species 0.000 claims description 10
- 206010060862 Prostate cancer Diseases 0.000 claims description 9
- 208000000236 Prostatic Neoplasms Diseases 0.000 claims description 8
- 208000023958 prostate neoplasm Diseases 0.000 claims description 7
- 238000002347 injection Methods 0.000 claims description 6
- 239000007924 injection Substances 0.000 claims description 6
- 210000003819 peripheral blood mononuclear cell Anatomy 0.000 claims description 6
- 230000005764 inhibitory process Effects 0.000 claims description 4
- 230000004614 tumor growth Effects 0.000 claims description 3
- 238000013414 tumor xenograft model Methods 0.000 claims description 3
- 230000008859 change Effects 0.000 claims description 2
- 238000004519 manufacturing process Methods 0.000 claims description 2
- 238000002513 implantation Methods 0.000 claims 3
- 210000003462 vein Anatomy 0.000 claims 2
- 206010061598 Immunodeficiency Diseases 0.000 claims 1
- 206010061309 Neoplasm progression Diseases 0.000 claims 1
- 230000005751 tumor progression Effects 0.000 claims 1
- 210000001744 T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 52
- 108090000623 proteins and genes Proteins 0.000 description 38
- 125000003275 alpha amino acid group Chemical group 0.000 description 36
- 239000000203 mixture Substances 0.000 description 32
- 239000012636 effector Substances 0.000 description 28
- 235000018102 proteins Nutrition 0.000 description 28
- 102000004169 proteins and genes Human genes 0.000 description 28
- 230000006870 function Effects 0.000 description 25
- 235000001014 amino acid Nutrition 0.000 description 23
- 125000002496 methyl group Chemical group [H]C([H])([H])* 0.000 description 23
- 201000010099 disease Diseases 0.000 description 22
- 230000035772 mutation Effects 0.000 description 22
- 210000004881 tumor cell Anatomy 0.000 description 20
- 108060003951 Immunoglobulin Proteins 0.000 description 19
- 102000018358 immunoglobulin Human genes 0.000 description 19
- 238000000684 flow cytometry Methods 0.000 description 18
- 241000700159 Rattus Species 0.000 description 17
- 230000010056 antibody-dependent cellular cytotoxicity Effects 0.000 description 17
- 201000011510 cancer Diseases 0.000 description 16
- 102100021651 SUN domain-containing ossification factor Human genes 0.000 description 15
- 229940024606 amino acid Drugs 0.000 description 15
- 150000001413 amino acids Chemical class 0.000 description 15
- 230000009089 cytolysis Effects 0.000 description 15
- 125000000539 amino acid group Chemical group 0.000 description 14
- 238000003556 assay Methods 0.000 description 14
- 210000002307 prostate Anatomy 0.000 description 14
- 230000001404 mediated effect Effects 0.000 description 13
- 230000001225 therapeutic effect Effects 0.000 description 13
- 230000009261 transgenic effect Effects 0.000 description 12
- 108010087819 Fc receptors Proteins 0.000 description 11
- 102000009109 Fc receptors Human genes 0.000 description 11
- 208000035475 disorder Diseases 0.000 description 11
- 230000000694 effects Effects 0.000 description 11
- 238000011534 incubation Methods 0.000 description 11
- 230000036210 malignancy Effects 0.000 description 11
- 108010047041 Complementarity Determining Regions Proteins 0.000 description 10
- 102000000588 Interleukin-2 Human genes 0.000 description 10
- 108010002350 Interleukin-2 Proteins 0.000 description 10
- 210000002966 serum Anatomy 0.000 description 10
- 230000016396 cytokine production Effects 0.000 description 9
- 230000004071 biological effect Effects 0.000 description 8
- 238000009472 formulation Methods 0.000 description 8
- 102000005962 receptors Human genes 0.000 description 8
- 108020003175 receptors Proteins 0.000 description 8
- 108010019670 Chimeric Antigen Receptors Proteins 0.000 description 7
- 102000004127 Cytokines Human genes 0.000 description 7
- 108090000695 Cytokines Proteins 0.000 description 7
- 108010074328 Interferon-gamma Proteins 0.000 description 7
- 241000124008 Mammalia Species 0.000 description 7
- 238000004458 analytical method Methods 0.000 description 7
- 239000000872 buffer Substances 0.000 description 7
- 238000010790 dilution Methods 0.000 description 7
- 239000012895 dilution Substances 0.000 description 7
- 238000005516 engineering process Methods 0.000 description 7
- 239000012634 fragment Substances 0.000 description 7
- 239000006228 supernatant Substances 0.000 description 7
- NFGXHKASABOEEW-UHFFFAOYSA-N 1-methylethyl 11-methoxy-3,7,11-trimethyl-2,4-dodecadienoate Chemical compound COC(C)(C)CCCC(C)CC=CC(C)=CC(=O)OC(C)C NFGXHKASABOEEW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 6
- 238000002965 ELISA Methods 0.000 description 6
- 230000004540 complement-dependent cytotoxicity Effects 0.000 description 6
- 230000003993 interaction Effects 0.000 description 6
- 230000008685 targeting Effects 0.000 description 6
- 229910052720 vanadium Inorganic materials 0.000 description 6
- 229910052727 yttrium Inorganic materials 0.000 description 6
- 102100037850 Interferon gamma Human genes 0.000 description 5
- 230000006052 T cell proliferation Effects 0.000 description 5
- 238000012575 bio-layer interferometry Methods 0.000 description 5
- 239000000969 carrier Substances 0.000 description 5
- 230000030833 cell death Effects 0.000 description 5
- 239000000539 dimer Substances 0.000 description 5
- 229940079593 drug Drugs 0.000 description 5
- 238000003384 imaging method Methods 0.000 description 5
- 230000003053 immunization Effects 0.000 description 5
- 229940072221 immunoglobulins Drugs 0.000 description 5
- 230000001965 increasing effect Effects 0.000 description 5
- 238000002360 preparation method Methods 0.000 description 5
- 239000000126 substance Substances 0.000 description 5
- 108091007741 Chimeric antigen receptor T cells Proteins 0.000 description 4
- 241000282412 Homo Species 0.000 description 4
- KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N Lysine Natural products NCCCCC(N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 239000004480 active ingredient Substances 0.000 description 4
- 239000013543 active substance Substances 0.000 description 4
- 230000037396 body weight Effects 0.000 description 4
- DEGAKNSWVGKMLS-UHFFFAOYSA-N calcein Chemical compound O1C(=O)C2=CC=CC=C2C21C1=CC(CN(CC(O)=O)CC(O)=O)=C(O)C=C1OC1=C2C=C(CN(CC(O)=O)CC(=O)O)C(O)=C1 DEGAKNSWVGKMLS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 4
- 238000004113 cell culture Methods 0.000 description 4
- 239000003153 chemical reaction reagent Substances 0.000 description 4
- 239000003795 chemical substances by application Substances 0.000 description 4
- 238000012875 competitive assay Methods 0.000 description 4
- 230000000295 complement effect Effects 0.000 description 4
- 238000010494 dissociation reaction Methods 0.000 description 4
- 230000005593 dissociations Effects 0.000 description 4
- 239000003937 drug carrier Substances 0.000 description 4
- 230000036541 health Effects 0.000 description 4
- 230000002209 hydrophobic effect Effects 0.000 description 4
- 230000001900 immune effect Effects 0.000 description 4
- 238000002649 immunization Methods 0.000 description 4
- 230000002147 killing effect Effects 0.000 description 4
- 239000000463 material Substances 0.000 description 4
- 230000004048 modification Effects 0.000 description 4
- 238000012986 modification Methods 0.000 description 4
- 210000001616 monocyte Anatomy 0.000 description 4
- 210000000822 natural killer cell Anatomy 0.000 description 4
- 229960002378 oftasceine Drugs 0.000 description 4
- 239000000546 pharmaceutical excipient Substances 0.000 description 4
- 230000004962 physiological condition Effects 0.000 description 4
- 230000005180 public health Effects 0.000 description 4
- 230000000284 resting effect Effects 0.000 description 4
- 230000009870 specific binding Effects 0.000 description 4
- 238000010186 staining Methods 0.000 description 4
- 238000002560 therapeutic procedure Methods 0.000 description 4
- 239000012103 Alexa Fluor 488 Substances 0.000 description 3
- 239000004475 Arginine Substances 0.000 description 3
- WVDDGKGOMKODPV-UHFFFAOYSA-N Benzyl alcohol Chemical compound OCC1=CC=CC=C1 WVDDGKGOMKODPV-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 241000282832 Camelidae Species 0.000 description 3
- 241000282836 Camelus dromedarius Species 0.000 description 3
- 102000006496 Immunoglobulin Heavy Chains Human genes 0.000 description 3
- 108010019476 Immunoglobulin Heavy Chains Proteins 0.000 description 3
- KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N L-lysine Chemical compound NCCCC[C@H](N)C(O)=O KDXKERNSBIXSRK-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 3
- 241000282838 Lama Species 0.000 description 3
- 239000004472 Lysine Substances 0.000 description 3
- 108091007491 NSP3 Papain-like protease domains Proteins 0.000 description 3
- 241000508269 Psidium Species 0.000 description 3
- 240000004808 Saccharomyces cerevisiae Species 0.000 description 3
- 108091005956 Type II transmembrane proteins Proteins 0.000 description 3
- 108010017070 Zinc Finger Nucleases Proteins 0.000 description 3
- 230000002776 aggregation Effects 0.000 description 3
- 238000004220 aggregation Methods 0.000 description 3
- ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N arginine Natural products OC(=O)C(N)CCCNC(N)=N ODKSFYDXXFIFQN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 3
- 239000011324 bead Substances 0.000 description 3
- 230000008901 benefit Effects 0.000 description 3
- 230000015572 biosynthetic process Effects 0.000 description 3
- 230000006037 cell lysis Effects 0.000 description 3
- 210000001151 cytotoxic T lymphocyte Anatomy 0.000 description 3
- 238000007405 data analysis Methods 0.000 description 3
- 238000012217 deletion Methods 0.000 description 3
- 230000037430 deletion Effects 0.000 description 3
- 239000002552 dosage form Substances 0.000 description 3
- 239000000975 dye Substances 0.000 description 3
- 238000002474 experimental method Methods 0.000 description 3
- -1 framework 2 Proteins 0.000 description 3
- 210000004602 germ cell Anatomy 0.000 description 3
- 238000000338 in vitro Methods 0.000 description 3
- 210000002540 macrophage Anatomy 0.000 description 3
- 239000000178 monomer Substances 0.000 description 3
- 210000000440 neutrophil Anatomy 0.000 description 3
- 108020004707 nucleic acids Proteins 0.000 description 3
- 102000039446 nucleic acids Human genes 0.000 description 3
- 150000007523 nucleic acids Chemical class 0.000 description 3
- 230000004044 response Effects 0.000 description 3
- 239000007787 solid Substances 0.000 description 3
- 239000000243 solution Substances 0.000 description 3
- 241000894007 species Species 0.000 description 3
- 230000002269 spontaneous effect Effects 0.000 description 3
- 239000003381 stabilizer Substances 0.000 description 3
- 238000003860 storage Methods 0.000 description 3
- 238000002198 surface plasmon resonance spectroscopy Methods 0.000 description 3
- 208000024891 symptom Diseases 0.000 description 3
- 229940124597 therapeutic agent Drugs 0.000 description 3
- 210000001519 tissue Anatomy 0.000 description 3
- 231100000331 toxic Toxicity 0.000 description 3
- 230000002588 toxic effect Effects 0.000 description 3
- 229910052721 tungsten Inorganic materials 0.000 description 3
- 235000002198 Annona diversifolia Nutrition 0.000 description 2
- CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N Ascorbic acid Chemical compound OC[C@H](O)[C@H]1OC(=O)C(O)=C1O CIWBSHSKHKDKBQ-JLAZNSOCSA-N 0.000 description 2
- 208000023275 Autoimmune disease Diseases 0.000 description 2
- 108091008875 B cell receptors Proteins 0.000 description 2
- 210000001266 CD8-positive T-lymphocyte Anatomy 0.000 description 2
- 102000000844 Cell Surface Receptors Human genes 0.000 description 2
- 108010001857 Cell Surface Receptors Proteins 0.000 description 2
- 241000251730 Chondrichthyes Species 0.000 description 2
- 102000004860 Dipeptidases Human genes 0.000 description 2
- 108090001081 Dipeptidases Proteins 0.000 description 2
- 102000003779 Dipeptidyl-peptidases and tripeptidyl-peptidases Human genes 0.000 description 2
- 108090000194 Dipeptidyl-peptidases and tripeptidyl-peptidases Proteins 0.000 description 2
- 102000004190 Enzymes Human genes 0.000 description 2
- 108090000790 Enzymes Proteins 0.000 description 2
- DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N Glycine Chemical compound NCC(O)=O DHMQDGOQFOQNFH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 102000004157 Hydrolases Human genes 0.000 description 2
- 108090000604 Hydrolases Proteins 0.000 description 2
- 108010021625 Immunoglobulin Fragments Proteins 0.000 description 2
- 102000008394 Immunoglobulin Fragments Human genes 0.000 description 2
- 108700005091 Immunoglobulin Genes Proteins 0.000 description 2
- 108010067060 Immunoglobulin Variable Region Proteins 0.000 description 2
- 102000017727 Immunoglobulin Variable Region Human genes 0.000 description 2
- 102000008070 Interferon-gamma Human genes 0.000 description 2
- DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N L-asparagine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-REOHCLBHSA-N 0.000 description 2
- 241000699660 Mus musculus Species 0.000 description 2
- 206010029113 Neovascularisation Diseases 0.000 description 2
- 241000283973 Oryctolagus cuniculus Species 0.000 description 2
- 206010057249 Phagocytosis Diseases 0.000 description 2
- ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N Phenol Natural products OC1=CC=CC=C1 ISWSIDIOOBJBQZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000002202 Polyethylene glycol Substances 0.000 description 2
- WCUXLLCKKVVCTQ-UHFFFAOYSA-M Potassium chloride Chemical compound [Cl-].[K+] WCUXLLCKKVVCTQ-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 108010008281 Recombinant Fusion Proteins Proteins 0.000 description 2
- 102000007056 Recombinant Fusion Proteins Human genes 0.000 description 2
- 108010071390 Serum Albumin Proteins 0.000 description 2
- 102000007562 Serum Albumin Human genes 0.000 description 2
- 108010003723 Single-Domain Antibodies Proteins 0.000 description 2
- FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M Sodium chloride Chemical compound [Na+].[Cl-] FAPWRFPIFSIZLT-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 238000002835 absorbance Methods 0.000 description 2
- 239000002253 acid Substances 0.000 description 2
- 230000004913 activation Effects 0.000 description 2
- 239000002671 adjuvant Substances 0.000 description 2
- 238000010171 animal model Methods 0.000 description 2
- 239000000611 antibody drug conjugate Substances 0.000 description 2
- 229940049595 antibody-drug conjugate Drugs 0.000 description 2
- 238000013459 approach Methods 0.000 description 2
- 239000007864 aqueous solution Substances 0.000 description 2
- 239000008135 aqueous vehicle Substances 0.000 description 2
- 210000003719 b-lymphocyte Anatomy 0.000 description 2
- 230000000903 blocking effect Effects 0.000 description 2
- 210000004369 blood Anatomy 0.000 description 2
- 239000008280 blood Substances 0.000 description 2
- 210000004556 brain Anatomy 0.000 description 2
- 210000004899 c-terminal region Anatomy 0.000 description 2
- YCIMNLLNPGFGHC-UHFFFAOYSA-N catechol Chemical compound OC1=CC=CC=C1O YCIMNLLNPGFGHC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000003833 cell viability Effects 0.000 description 2
- 238000012512 characterization method Methods 0.000 description 2
- 230000024203 complement activation Effects 0.000 description 2
- 150000001875 compounds Chemical class 0.000 description 2
- 238000004590 computer program Methods 0.000 description 2
- 239000000562 conjugate Substances 0.000 description 2
- 230000001086 cytosolic effect Effects 0.000 description 2
- 230000003013 cytotoxicity Effects 0.000 description 2
- 231100000135 cytotoxicity Toxicity 0.000 description 2
- 238000002784 cytotoxicity assay Methods 0.000 description 2
- 231100000263 cytotoxicity test Toxicity 0.000 description 2
- 230000006240 deamidation Effects 0.000 description 2
- 238000001514 detection method Methods 0.000 description 2
- 238000011161 development Methods 0.000 description 2
- 238000012377 drug delivery Methods 0.000 description 2
- 210000000981 epithelium Anatomy 0.000 description 2
- 229940014144 folate Drugs 0.000 description 2
- 235000019152 folic acid Nutrition 0.000 description 2
- 239000011724 folic acid Substances 0.000 description 2
- 238000013467 fragmentation Methods 0.000 description 2
- 238000006062 fragmentation reaction Methods 0.000 description 2
- 230000013595 glycosylation Effects 0.000 description 2
- 238000006206 glycosylation reaction Methods 0.000 description 2
- HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N histidine Natural products OC(=O)C(N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 239000000710 homodimer Substances 0.000 description 2
- 210000002865 immune cell Anatomy 0.000 description 2
- 230000028993 immune response Effects 0.000 description 2
- 238000001727 in vivo Methods 0.000 description 2
- 238000006317 isomerization reaction Methods 0.000 description 2
- 210000003734 kidney Anatomy 0.000 description 2
- 231100000518 lethal Toxicity 0.000 description 2
- 230000001665 lethal effect Effects 0.000 description 2
- 210000000265 leukocyte Anatomy 0.000 description 2
- 239000003446 ligand Substances 0.000 description 2
- RLSSMJSEOOYNOY-UHFFFAOYSA-N m-cresol Chemical compound CC1=CC=CC(O)=C1 RLSSMJSEOOYNOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000003211 malignant effect Effects 0.000 description 2
- 210000004962 mammalian cell Anatomy 0.000 description 2
- 239000012528 membrane Substances 0.000 description 2
- 230000001394 metastastic effect Effects 0.000 description 2
- 206010061289 metastatic neoplasm Diseases 0.000 description 2
- 125000001360 methionine group Chemical group N[C@@H](CCSC)C(=O)* 0.000 description 2
- 238000000520 microinjection Methods 0.000 description 2
- 238000002156 mixing Methods 0.000 description 2
- 238000010369 molecular cloning Methods 0.000 description 2
- 230000002018 overexpression Effects 0.000 description 2
- 230000003647 oxidation Effects 0.000 description 2
- 238000007254 oxidation reaction Methods 0.000 description 2
- 230000001717 pathogenic effect Effects 0.000 description 2
- AQIXEPGDORPWBJ-UHFFFAOYSA-N pentan-3-ol Chemical compound CCC(O)CC AQIXEPGDORPWBJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000008782 phagocytosis Effects 0.000 description 2
- 230000000144 pharmacologic effect Effects 0.000 description 2
- 229920001223 polyethylene glycol Polymers 0.000 description 2
- 108091033319 polynucleotide Proteins 0.000 description 2
- 102000040430 polynucleotide Human genes 0.000 description 2
- 239000002157 polynucleotide Substances 0.000 description 2
- 238000012545 processing Methods 0.000 description 2
- 230000000069 prophylactic effect Effects 0.000 description 2
- QELSKZZBTMNZEB-UHFFFAOYSA-N propylparaben Chemical compound CCCOC(=O)C1=CC=C(O)C=C1 QELSKZZBTMNZEB-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000009467 reduction Effects 0.000 description 2
- 230000002829 reductive effect Effects 0.000 description 2
- GHMLBKRAJCXXBS-UHFFFAOYSA-N resorcinol Chemical compound OC1=CC=CC(O)=C1 GHMLBKRAJCXXBS-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000000717 retained effect Effects 0.000 description 2
- 238000012552 review Methods 0.000 description 2
- 210000003079 salivary gland Anatomy 0.000 description 2
- 238000002864 sequence alignment Methods 0.000 description 2
- JUJBNYBVVQSIOU-UHFFFAOYSA-M sodium;4-[2-(4-iodophenyl)-3-(4-nitrophenyl)tetrazol-2-ium-5-yl]benzene-1,3-disulfonate Chemical compound [Na+].C1=CC([N+](=O)[O-])=CC=C1N1[N+](C=2C=CC(I)=CC=2)=NC(C=2C(=CC(=CC=2)S([O-])(=O)=O)S([O-])(=O)=O)=N1 JUJBNYBVVQSIOU-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 2
- 238000010561 standard procedure Methods 0.000 description 2
- 238000007920 subcutaneous administration Methods 0.000 description 2
- KZNICNPSHKQLFF-UHFFFAOYSA-N succinimide Chemical compound O=C1CCC(=O)N1 KZNICNPSHKQLFF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- 230000001988 toxicity Effects 0.000 description 2
- 231100000419 toxicity Toxicity 0.000 description 2
- 238000011830 transgenic mouse model Methods 0.000 description 2
- 210000005166 vasculature Anatomy 0.000 description 2
- 239000013598 vector Substances 0.000 description 2
- 239000003981 vehicle Substances 0.000 description 2
- XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N water Substances O XLYOFNOQVPJJNP-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 2
- HDTRYLNUVZCQOY-UHFFFAOYSA-N α-D-glucopyranosyl-α-D-glucopyranoside Natural products OC1C(O)C(O)C(CO)OC1OC1C(O)C(O)C(O)C(CO)O1 HDTRYLNUVZCQOY-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- CYDQOEWLBCCFJZ-UHFFFAOYSA-N 4-(4-fluorophenyl)oxane-4-carboxylic acid Chemical compound C=1C=C(F)C=CC=1C1(C(=O)O)CCOCC1 CYDQOEWLBCCFJZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- QFVHZQCOUORWEI-UHFFFAOYSA-N 4-[(4-anilino-5-sulfonaphthalen-1-yl)diazenyl]-5-hydroxynaphthalene-2,7-disulfonic acid Chemical compound C=12C(O)=CC(S(O)(=O)=O)=CC2=CC(S(O)(=O)=O)=CC=1N=NC(C1=CC=CC(=C11)S(O)(=O)=O)=CC=C1NC1=CC=CC=C1 QFVHZQCOUORWEI-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 206010069754 Acquired gene mutation Diseases 0.000 description 1
- 241000251468 Actinopterygii Species 0.000 description 1
- 108090000672 Annexin A5 Proteins 0.000 description 1
- 102000004121 Annexin A5 Human genes 0.000 description 1
- 108010032595 Antibody Binding Sites Proteins 0.000 description 1
- DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N Asparagine Natural products OC(=O)C(N)CC(N)=O DCXYFEDJOCDNAF-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L Calcium chloride Chemical compound [Cl-].[Cl-].[Ca+2] UXVMQQNJUSDDNG-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 241000282828 Camelus bactrianus Species 0.000 description 1
- 241000282472 Canis lupus familiaris Species 0.000 description 1
- 241000283707 Capra Species 0.000 description 1
- 241000700199 Cavia porcellus Species 0.000 description 1
- KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K Citrate Chemical compound [O-]C(=O)CC(O)(CC([O-])=O)C([O-])=O KRKNYBCHXYNGOX-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 102000014447 Complement C1q Human genes 0.000 description 1
- 108010078043 Complement C1q Proteins 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N D-Glucitol Natural products OC[C@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-FSIIMWSLSA-N 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N D-Mannitol Chemical compound OC[C@@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-KVTDHHQDSA-N 0.000 description 1
- FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N D-glucitol Chemical compound OC[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@H](O)CO FBPFZTCFMRRESA-JGWLITMVSA-N 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N D-mannopyranose Chemical compound OC[C@H]1OC(O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-QTVWNMPRSA-N 0.000 description 1
- 239000004375 Dextrin Substances 0.000 description 1
- 229920001353 Dextrin Polymers 0.000 description 1
- BWGNESOTFCXPMA-UHFFFAOYSA-N Dihydrogen disulfide Chemical compound SS BWGNESOTFCXPMA-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000017274 Diospyros sandwicensis Nutrition 0.000 description 1
- 206010061818 Disease progression Diseases 0.000 description 1
- KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N EDTA Chemical compound OC(=O)CN(CC(O)=O)CCN(CC(O)=O)CC(O)=O KCXVZYZYPLLWCC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 238000012286 ELISA Assay Methods 0.000 description 1
- 238000008157 ELISA kit Methods 0.000 description 1
- 101710181478 Envelope glycoprotein GP350 Proteins 0.000 description 1
- 241000283086 Equidae Species 0.000 description 1
- 241000282326 Felis catus Species 0.000 description 1
- 101150079449 Folh1 gene Proteins 0.000 description 1
- 108010010803 Gelatin Proteins 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N Glucose Natural products OC[C@H]1OC(O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-GASJEMHNSA-N 0.000 description 1
- 108090000369 Glutamate Carboxypeptidase II Proteins 0.000 description 1
- 239000004471 Glycine Substances 0.000 description 1
- AEMRFAOFKBGASW-UHFFFAOYSA-N Glycolic acid Polymers OCC(O)=O AEMRFAOFKBGASW-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 108091006054 His-tagged proteins Proteins 0.000 description 1
- 102100026120 IgG receptor FcRn large subunit p51 Human genes 0.000 description 1
- 101710177940 IgG receptor FcRn large subunit p51 Proteins 0.000 description 1
- DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M Ilexoside XXIX Chemical class C[C@@H]1CC[C@@]2(CC[C@@]3(C(=CC[C@H]4[C@]3(CC[C@@H]5[C@@]4(CC[C@@H](C5(C)C)OS(=O)(=O)[O-])C)C)[C@@H]2[C@]1(C)O)C)C(=O)O[C@H]6[C@@H]([C@H]([C@@H]([C@H](O6)CO)O)O)O.[Na+] DGAQECJNVWCQMB-PUAWFVPOSA-M 0.000 description 1
- ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P L-argininium(2+) Chemical compound NC(=[NH2+])NCCC[C@H]([NH3+])C(O)=O ODKSFYDXXFIFQN-BYPYZUCNSA-P 0.000 description 1
- ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N L-glutamine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-VKHMYHEASA-N 0.000 description 1
- HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N L-histidine Chemical compound OC(=O)[C@@H](N)CC1=CN=CN1 HNDVDQJCIGZPNO-YFKPBYRVSA-N 0.000 description 1
- FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N L-methionine Chemical compound CSCC[C@H](N)C(O)=O FFEARJCKVFRZRR-BYPYZUCNSA-N 0.000 description 1
- 241000282842 Lama glama Species 0.000 description 1
- 241000282852 Lama guanicoe Species 0.000 description 1
- 229930195725 Mannitol Natural products 0.000 description 1
- 241001529936 Murinae Species 0.000 description 1
- 241000699666 Mus <mouse, genus> Species 0.000 description 1
- 101100058506 Mus musculus Bloc1s5 gene Proteins 0.000 description 1
- 229910019142 PO4 Inorganic materials 0.000 description 1
- 208000037273 Pathologic Processes Diseases 0.000 description 1
- 229920000954 Polyglycolide Polymers 0.000 description 1
- 108010029485 Protein Isoforms Proteins 0.000 description 1
- 102000001708 Protein Isoforms Human genes 0.000 description 1
- 108020004511 Recombinant DNA Proteins 0.000 description 1
- 241000283984 Rodentia Species 0.000 description 1
- 238000012300 Sequence Analysis Methods 0.000 description 1
- VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M Sodium acetate Chemical compound [Na+].CC([O-])=O VMHLLURERBWHNL-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 229930006000 Sucrose Natural products 0.000 description 1
- CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N Sucrose Chemical compound O[C@H]1[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@]1(CO)O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 CZMRCDWAGMRECN-UGDNZRGBSA-N 0.000 description 1
- 108091008874 T cell receptors Proteins 0.000 description 1
- 102000016266 T-Cell Antigen Receptors Human genes 0.000 description 1
- 108700019146 Transgenes Proteins 0.000 description 1
- HDTRYLNUVZCQOY-WSWWMNSNSA-N Trehalose Natural products O[C@@H]1[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H](O)[C@@H](CO)O1 HDTRYLNUVZCQOY-WSWWMNSNSA-N 0.000 description 1
- 241000282830 Tylopoda Species 0.000 description 1
- 241000251539 Vertebrata <Metazoa> Species 0.000 description 1
- 241001416177 Vicugna pacos Species 0.000 description 1
- 241000282840 Vicugna vicugna Species 0.000 description 1
- 208000027418 Wounds and injury Diseases 0.000 description 1
- 230000021736 acetylation Effects 0.000 description 1
- 238000006640 acetylation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000009471 action Effects 0.000 description 1
- 230000010933 acylation Effects 0.000 description 1
- 238000005917 acylation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000001464 adherent effect Effects 0.000 description 1
- 230000000240 adjuvant effect Effects 0.000 description 1
- 238000012382 advanced drug delivery Methods 0.000 description 1
- 230000002411 adverse Effects 0.000 description 1
- 238000003314 affinity selection Methods 0.000 description 1
- 239000000556 agonist Substances 0.000 description 1
- HDTRYLNUVZCQOY-LIZSDCNHSA-N alpha,alpha-trehalose Chemical compound O[C@@H]1[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O[C@@H]1O[C@@H]1[C@H](O)[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](CO)O1 HDTRYLNUVZCQOY-LIZSDCNHSA-N 0.000 description 1
- 230000009435 amidation Effects 0.000 description 1
- 238000007112 amidation reaction Methods 0.000 description 1
- 210000004102 animal cell Anatomy 0.000 description 1
- 239000005557 antagonist Substances 0.000 description 1
- 230000000259 anti-tumor effect Effects 0.000 description 1
- 238000011091 antibody purification Methods 0.000 description 1
- 102000025171 antigen binding proteins Human genes 0.000 description 1
- 108091000831 antigen binding proteins Proteins 0.000 description 1
- 230000000890 antigenic effect Effects 0.000 description 1
- 239000003963 antioxidant agent Substances 0.000 description 1
- 235000006708 antioxidants Nutrition 0.000 description 1
- 229960005070 ascorbic acid Drugs 0.000 description 1
- 235000010323 ascorbic acid Nutrition 0.000 description 1
- 239000011668 ascorbic acid Substances 0.000 description 1
- 229960001230 asparagine Drugs 0.000 description 1
- 235000009582 asparagine Nutrition 0.000 description 1
- 239000012131 assay buffer Substances 0.000 description 1
- 230000001363 autoimmune Effects 0.000 description 1
- 210000003651 basophil Anatomy 0.000 description 1
- 229960000686 benzalkonium chloride Drugs 0.000 description 1
- 229960001950 benzethonium chloride Drugs 0.000 description 1
- UREZNYTWGJKWBI-UHFFFAOYSA-M benzethonium chloride Chemical compound [Cl-].C1=CC(C(C)(C)CC(C)(C)C)=CC=C1OCCOCC[N+](C)(C)CC1=CC=CC=C1 UREZNYTWGJKWBI-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 235000019445 benzyl alcohol Nutrition 0.000 description 1
- CADWTSSKOVRVJC-UHFFFAOYSA-N benzyl(dimethyl)azanium;chloride Chemical compound [Cl-].C[NH+](C)CC1=CC=CC=C1 CADWTSSKOVRVJC-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N beta-D-glucose Chemical compound OC[C@H]1O[C@@H](O)[C@H](O)[C@@H](O)[C@@H]1O WQZGKKKJIJFFOK-VFUOTHLCSA-N 0.000 description 1
- 238000012925 biological evaluation Methods 0.000 description 1
- 230000033228 biological regulation Effects 0.000 description 1
- HUTDDBSSHVOYJR-UHFFFAOYSA-H bis[(2-oxo-1,3,2$l^{5},4$l^{2}-dioxaphosphaplumbetan-2-yl)oxy]lead Chemical compound [Pb+2].[Pb+2].[Pb+2].[O-]P([O-])([O-])=O.[O-]P([O-])([O-])=O HUTDDBSSHVOYJR-UHFFFAOYSA-H 0.000 description 1
- 239000001045 blue dye Substances 0.000 description 1
- 239000007975 buffered saline Substances 0.000 description 1
- 239000006172 buffering agent Substances 0.000 description 1
- LRHPLDYGYMQRHN-UHFFFAOYSA-N butyl alcohol Substances CCCCO LRHPLDYGYMQRHN-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000000484 butyl group Chemical group [H]C([*])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])[H] 0.000 description 1
- BQRGNLJZBFXNCZ-UHFFFAOYSA-N calcein am Chemical compound O1C(=O)C2=CC=CC=C2C21C1=CC(CN(CC(=O)OCOC(C)=O)CC(=O)OCOC(C)=O)=C(OC(C)=O)C=C1OC1=C2C=C(CN(CC(=O)OCOC(C)=O)CC(=O)OCOC(=O)C)C(OC(C)=O)=C1 BQRGNLJZBFXNCZ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000001110 calcium chloride Substances 0.000 description 1
- 229910001628 calcium chloride Inorganic materials 0.000 description 1
- 235000011148 calcium chloride Nutrition 0.000 description 1
- 238000004364 calculation method Methods 0.000 description 1
- 238000011088 calibration curve Methods 0.000 description 1
- 238000000533 capillary isoelectric focusing Methods 0.000 description 1
- 238000005515 capillary zone electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 150000001720 carbohydrates Chemical class 0.000 description 1
- 235000014633 carbohydrates Nutrition 0.000 description 1
- 239000012876 carrier material Substances 0.000 description 1
- 238000005277 cation exchange chromatography Methods 0.000 description 1
- 230000022534 cell killing Effects 0.000 description 1
- 230000004663 cell proliferation Effects 0.000 description 1
- 238000003570 cell viability assay Methods 0.000 description 1
- 230000001413 cellular effect Effects 0.000 description 1
- 239000002738 chelating agent Substances 0.000 description 1
- 229940044683 chemotherapy drug Drugs 0.000 description 1
- 210000004978 chinese hamster ovary cell Anatomy 0.000 description 1
- 230000001149 cognitive effect Effects 0.000 description 1
- 230000004154 complement system Effects 0.000 description 1
- 239000000356 contaminant Substances 0.000 description 1
- 238000007796 conventional method Methods 0.000 description 1
- 238000012258 culturing Methods 0.000 description 1
- HPXRVTGHNJAIIH-UHFFFAOYSA-N cyclohexanol Chemical compound OC1CCCCC1 HPXRVTGHNJAIIH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N cysteine Natural products SCC(N)C(O)=O XUJNEKJLAYXESH-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 235000018417 cysteine Nutrition 0.000 description 1
- 231100000433 cytotoxic Toxicity 0.000 description 1
- 230000001472 cytotoxic effect Effects 0.000 description 1
- 230000006378 damage Effects 0.000 description 1
- 230000003247 decreasing effect Effects 0.000 description 1
- 230000001419 dependent effect Effects 0.000 description 1
- 238000013461 design Methods 0.000 description 1
- 235000019425 dextrin Nutrition 0.000 description 1
- 150000002016 disaccharides Chemical class 0.000 description 1
- 230000005750 disease progression Effects 0.000 description 1
- BFMYDTVEBKDAKJ-UHFFFAOYSA-L disodium;(2',7'-dibromo-3',6'-dioxido-3-oxospiro[2-benzofuran-1,9'-xanthene]-4'-yl)mercury;hydrate Chemical compound O.[Na+].[Na+].O1C(=O)C2=CC=CC=C2C21C1=CC(Br)=C([O-])C([Hg])=C1OC1=C2C=C(Br)C([O-])=C1 BFMYDTVEBKDAKJ-UHFFFAOYSA-L 0.000 description 1
- 238000004090 dissolution Methods 0.000 description 1
- 238000009510 drug design Methods 0.000 description 1
- 238000001962 electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 230000002255 enzymatic effect Effects 0.000 description 1
- 210000003979 eosinophil Anatomy 0.000 description 1
- 230000005284 excitation Effects 0.000 description 1
- 230000007717 exclusion Effects 0.000 description 1
- 230000006126 farnesylation Effects 0.000 description 1
- 239000012530 fluid Substances 0.000 description 1
- MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N fluorescein-5-isothiocyanate Chemical compound O1C(=O)C2=CC(N=C=S)=CC=C2C21C1=CC=C(O)C=C1OC1=CC(O)=CC=C21 MHMNJMPURVTYEJ-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 230000004927 fusion Effects 0.000 description 1
- 229940044627 gamma-interferon Drugs 0.000 description 1
- 210000001035 gastrointestinal tract Anatomy 0.000 description 1
- 239000008273 gelatin Substances 0.000 description 1
- 229920000159 gelatin Polymers 0.000 description 1
- 235000019322 gelatine Nutrition 0.000 description 1
- 235000011852 gelatine desserts Nutrition 0.000 description 1
- 230000030279 gene silencing Effects 0.000 description 1
- 230000000762 glandular Effects 0.000 description 1
- 239000008103 glucose Substances 0.000 description 1
- ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N glutamine Natural products OC(=O)C(N)CCC(N)=O ZDXPYRJPNDTMRX-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 125000003630 glycyl group Chemical group [H]N([H])C([H])([H])C(*)=O 0.000 description 1
- 210000003714 granulocyte Anatomy 0.000 description 1
- 229940093915 gynecological organic acid Drugs 0.000 description 1
- 210000003958 hematopoietic stem cell Anatomy 0.000 description 1
- 238000005734 heterodimerization reaction Methods 0.000 description 1
- 210000003630 histaminocyte Anatomy 0.000 description 1
- 229940088597 hormone Drugs 0.000 description 1
- 239000005556 hormone Substances 0.000 description 1
- 102000046689 human FOLH1 Human genes 0.000 description 1
- 210000004408 hybridoma Anatomy 0.000 description 1
- 230000007062 hydrolysis Effects 0.000 description 1
- 238000006460 hydrolysis reaction Methods 0.000 description 1
- 229920001477 hydrophilic polymer Polymers 0.000 description 1
- 238000012506 imaged capillary isoelectric focusing Methods 0.000 description 1
- 230000036737 immune function Effects 0.000 description 1
- 210000000987 immune system Anatomy 0.000 description 1
- 230000002998 immunogenetic effect Effects 0.000 description 1
- 238000009169 immunotherapy Methods 0.000 description 1
- 239000007943 implant Substances 0.000 description 1
- 230000006872 improvement Effects 0.000 description 1
- 238000000099 in vitro assay Methods 0.000 description 1
- 238000011065 in-situ storage Methods 0.000 description 1
- 230000001939 inductive effect Effects 0.000 description 1
- 208000015181 infectious disease Diseases 0.000 description 1
- 238000001802 infusion Methods 0.000 description 1
- 239000004615 ingredient Substances 0.000 description 1
- 208000014674 injury Diseases 0.000 description 1
- 230000010354 integration Effects 0.000 description 1
- 102000006495 integrins Human genes 0.000 description 1
- 108010044426 integrins Proteins 0.000 description 1
- 229960003130 interferon gamma Drugs 0.000 description 1
- 230000004068 intracellular signaling Effects 0.000 description 1
- 238000001990 intravenous administration Methods 0.000 description 1
- 238000010253 intravenous injection Methods 0.000 description 1
- 230000001788 irregular Effects 0.000 description 1
- 238000002372 labelling Methods 0.000 description 1
- 230000000670 limiting effect Effects 0.000 description 1
- 238000012417 linear regression Methods 0.000 description 1
- 239000002502 liposome Substances 0.000 description 1
- 239000007788 liquid Substances 0.000 description 1
- 239000006193 liquid solution Substances 0.000 description 1
- 239000006194 liquid suspension Substances 0.000 description 1
- 231100000053 low toxicity Toxicity 0.000 description 1
- 210000004072 lung Anatomy 0.000 description 1
- 210000004698 lymphocyte Anatomy 0.000 description 1
- 125000003588 lysine group Chemical group [H]N([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])([H])C([H])(N([H])[H])C(*)=O 0.000 description 1
- 239000000594 mannitol Substances 0.000 description 1
- 235000010355 mannitol Nutrition 0.000 description 1
- 238000013507 mapping Methods 0.000 description 1
- 238000004949 mass spectrometry Methods 0.000 description 1
- 238000005259 measurement Methods 0.000 description 1
- 108020004999 messenger RNA Proteins 0.000 description 1
- 229910052751 metal Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000002184 metal Chemical class 0.000 description 1
- 229930182817 methionine Natural products 0.000 description 1
- 239000004292 methyl p-hydroxybenzoate Substances 0.000 description 1
- 235000010270 methyl p-hydroxybenzoate Nutrition 0.000 description 1
- 230000011987 methylation Effects 0.000 description 1
- 238000007069 methylation reaction Methods 0.000 description 1
- 229960002216 methylparaben Drugs 0.000 description 1
- 244000005700 microbiome Species 0.000 description 1
- 239000011859 microparticle Substances 0.000 description 1
- 150000002772 monosaccharides Chemical class 0.000 description 1
- 239000013642 negative control Substances 0.000 description 1
- 230000006780 non-homologous end joining Effects 0.000 description 1
- 230000036963 noncompetitive effect Effects 0.000 description 1
- 239000002736 nonionic surfactant Substances 0.000 description 1
- 231100000252 nontoxic Toxicity 0.000 description 1
- 230000003000 nontoxic effect Effects 0.000 description 1
- 231100000956 nontoxicity Toxicity 0.000 description 1
- 229920002113 octoxynol Polymers 0.000 description 1
- 238000002515 oligonucleotide synthesis Methods 0.000 description 1
- 210000000287 oocyte Anatomy 0.000 description 1
- 150000007524 organic acids Chemical class 0.000 description 1
- 235000005985 organic acids Nutrition 0.000 description 1
- LXCFILQKKLGQFO-UHFFFAOYSA-N p-hydroxybenzoic acid methyl ester Natural products COC(=O)C1=CC=C(O)C=C1 LXCFILQKKLGQFO-UHFFFAOYSA-N 0.000 description 1
- 239000003002 pH adjusting agent Substances 0.000 description 1
- 238000007911 parenteral administration Methods 0.000 description 1
- 244000052769 pathogen Species 0.000 description 1
- 230000001575 pathological effect Effects 0.000 description 1
- 230000009054 pathological process Effects 0.000 description 1
- 230000037361 pathway Effects 0.000 description 1
- 230000000737 periodic effect Effects 0.000 description 1
- 238000002823 phage display Methods 0.000 description 1
- NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K phosphate Chemical compound [O-]P([O-])([O-])=O NBIIXXVUZAFLBC-UHFFFAOYSA-K 0.000 description 1
- 239000010452 phosphate Substances 0.000 description 1
- 230000026731 phosphorylation Effects 0.000 description 1
- 238000006366 phosphorylation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000001766 physiological effect Effects 0.000 description 1
- 229920000747 poly(lactic acid) Polymers 0.000 description 1
- 238000003752 polymerase chain reaction Methods 0.000 description 1
- 239000001267 polyvinylpyrrolidone Substances 0.000 description 1
- 229920000036 polyvinylpyrrolidone Polymers 0.000 description 1
- 235000013855 polyvinylpyrrolidone Nutrition 0.000 description 1
- 231100000683 possible toxicity Toxicity 0.000 description 1
- 239000001103 potassium chloride Substances 0.000 description 1
- 235000011164 potassium chloride Nutrition 0.000 description 1
- 230000003389 potentiating effect Effects 0.000 description 1
- 239000003755 preservative agent Substances 0.000 description 1
- 230000008569 process Effects 0.000 description 1
- 230000002062 proliferating effect Effects 0.000 description 1
- 230000035755 proliferation Effects 0.000 description 1
- 230000002035 prolonged effect Effects 0.000 description 1
- 230000001737 promoting effect Effects 0.000 description 1
- 235000010232 propyl p-hydroxybenzoate Nutrition 0.000 description 1
- 239000004405 propyl p-hydroxybenzoate Substances 0.000 description 1
- 229960003415 propylparaben Drugs 0.000 description 1
- 201000001514 prostate carcinoma Diseases 0.000 description 1
- 238000000159 protein binding assay Methods 0.000 description 1
- 230000000541 pulsatile effect Effects 0.000 description 1
- 238000000746 purification Methods 0.000 description 1
- 230000002285 radioactive effect Effects 0.000 description 1
- 238000002708 random mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 230000009257 reactivity Effects 0.000 description 1
- 238000010188 recombinant method Methods 0.000 description 1
- 230000001105 regulatory effect Effects 0.000 description 1
- 238000011160 research Methods 0.000 description 1
- 125000003607 serino group Chemical group [H]N([H])[C@]([H])(C(=O)[*])C(O[H])([H])[H] 0.000 description 1
- 230000019491 signal transduction Effects 0.000 description 1
- 229910052709 silver Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000004332 silver Substances 0.000 description 1
- 238000002741 site-directed mutagenesis Methods 0.000 description 1
- 238000001542 size-exclusion chromatography Methods 0.000 description 1
- 229940126586 small molecule drug Drugs 0.000 description 1
- 229910052708 sodium Inorganic materials 0.000 description 1
- 239000011734 sodium Substances 0.000 description 1
- 239000001632 sodium acetate Substances 0.000 description 1
- 235000017281 sodium acetate Nutrition 0.000 description 1
- 239000011780 sodium chloride Substances 0.000 description 1
- 235000002639 sodium chloride Nutrition 0.000 description 1
- 238000002415 sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis Methods 0.000 description 1
- 239000001540 sodium lactate Substances 0.000 description 1
- 229940005581 sodium lactate Drugs 0.000 description 1
- 235000011088 sodium lactate Nutrition 0.000 description 1
- 230000037439 somatic mutation Effects 0.000 description 1
- 239000000600 sorbitol Substances 0.000 description 1
- SFVFIFLLYFPGHH-UHFFFAOYSA-M stearalkonium chloride Chemical compound [Cl-].CCCCCCCCCCCCCCCCCC[N+](C)(C)CC1=CC=CC=C1 SFVFIFLLYFPGHH-UHFFFAOYSA-M 0.000 description 1
- 230000001954 sterilising effect Effects 0.000 description 1
- 238000004659 sterilization and disinfection Methods 0.000 description 1
- 229960002317 succinimide Drugs 0.000 description 1
- 239000005720 sucrose Substances 0.000 description 1
- 235000000346 sugar Nutrition 0.000 description 1
- 150000008163 sugars Chemical class 0.000 description 1
- 238000006277 sulfonation reaction Methods 0.000 description 1
- 230000001629 suppression Effects 0.000 description 1
- 239000000725 suspension Substances 0.000 description 1
- 238000013268 sustained release Methods 0.000 description 1
- 239000012730 sustained-release form Substances 0.000 description 1
- 238000011200 topical administration Methods 0.000 description 1
- 238000011269 treatment regimen Methods 0.000 description 1
- 238000011179 visual inspection Methods 0.000 description 1
- 230000003442 weekly effect Effects 0.000 description 1
Description
Перекрестная ссылка на родственные заявкиCross reference to related applications
Данная заявка испрашивает приоритет по предварительной заявке на патент США № 62/830130, поданной 05 апреля 2019 г., описание которой включено в данный документ в полном объеме посредством ссылки.This application claims priority to U.S. Provisional Patent Application No. 62/830,130, filed April 5, 2019, the disclosure of which is incorporated herein by reference in its entirety.
Перечень последовательностейList of sequences
Настоящая заявка содержит перечень последовательностей, который был представлен в электронном виде в формате ASCII и, таким образом, полностью включен в настоящее описание посредством ссылки. Указанная копия в формате ASCII, созданная 09 июля 2020 г., называется TNO-0016-WO_SL.txt и имеет размер 121310 байт.This application contains a sequence listing that has been submitted electronically in ASCII format and is therefore incorporated herein by reference in its entirety. The specified ASCII copy, created on 2020-07-09, is named TNO-0016-WO_SL.txt and is 121310 bytes in size.
Область техникиField of technology
Настоящее изобретение относится к человеческим антителам, содержащим только тяжелые цепи, (например, UniAb™) которые связываются с ПСМА (англ.: PSMA -prostate specific membrane antigen). Данное изобретение также относится к способам получения таких антител, к композициям, включая фармацевтические композиции, содержащие такие антитела, и их применению для лечения расстройств, которые характеризуются экспрессией ПСМА.The present invention relates to human antibodies containing only heavy chains (for example, UniAb™) that bind to PSMA (PSMA -prostate specific membrane antigen). The present invention also relates to methods for producing such antibodies, to compositions, including pharmaceutical compositions, containing such antibodies, and their use for the treatment of disorders that are characterized by the expression of PSMA.
Уровень техникиState of the art
ПСМА.PSMA.
ПСМА, также известный как простатспецифический мембранный антиген и глутаматкарбоксипептидаза II (UniProt Q04609), представляет собой трансмембранный белок типа II, который обладает активностью N-ацетилированной альфа-связанной кислой дипептидазы, фолатгидролазы и дипептидилпептидазы. Он кодируется геном FOLH1 у человека и состоит из цитоплазматического домена из 19 аминокислот, трансмембранной части из 24 аминокислот и внеклеточной части из 707 аминокислот. Белок является ферментативно активным в качестве нековалентного гомодимера. ПСМА экспрессируется в ткани эпителия предстательной железы и его экспрессия усиливается в злокачественном новообразовании предстательной железы и в новой сосудистой сети солидных опухолей. Он также экспрессируется на низких уровнях в нормальных тканях, таких как мозг, почки и слюнные железы, но его избыточная экспрессия в злокачественной ткани предстательной железы делает его привлекательной мишенью для терапевтического лечения злокачественного новообразования предстательной железы. Он также может быть актуален для терапии или визуализации солидных опухолей, учитывая его высокую экспрессию в злокачественных новообразованных сосудах. Моноклональные антитела, конъюгаты антителолекарственное средство и Т-клетки с химерным антигенным рецептором, нацеленные на ПСМА, были описаны в контексте лечения метастатического злокачественного новообразования предстательной железы (Hernandez-Hoyos et al 2016, PMID: 27406985, DiPippo et al 2014, PMID: 25327986, Serganova et al 2016, PMID: 28345023). Кроме того, радионуклидные конъюгаты, специфичные для ПСМА, исследуют в отношении визуализации и лечения злокачественного новообразования предстательной железы (например, Hofman et al., 2018 PMID: 29752180).PSMA, also known as prostate-specific membrane antigen and glutamate carboxypeptidase II (UniProt Q04609), is a type II transmembrane protein that has N-acetylated alpha-linked acid dipeptidase, folate hydrolase, and dipeptidyl peptidase activities. It is encoded by the FOLH1 gene in humans and consists of a cytoplasmic domain of 19 amino acids, a transmembrane portion of 24 amino acids, and an extracellular portion of 707 amino acids. The protein is enzymatically active as a non-covalent homodimer. PSMA is expressed in prostate epithelial tissue and its expression is upregulated in prostate malignancy and in new vasculature of solid tumors. It is also expressed at low levels in normal tissues such as the brain, kidney and salivary glands, but its overexpression in prostate malignancy makes it an attractive target for the therapeutic treatment of prostate malignancy. It may also be relevant for therapy or imaging of solid tumors, given its high expression in malignant neovascularization. Monoclonal antibodies, antibody-drug conjugates and chimeric antigen receptor T cells targeting PSMA have been described in the context of the treatment of metastatic prostate malignancy (Hernandez-Hoyos et al 2016, PMID: 27406985, DiPippo et al 2014, PMID: 25327986, Serganova et al 2016, PMID: 28345023). Additionally, PSMA-specific radionuclide conjugates are being explored for imaging and treatment of prostate malignancy (e.g., Hofman et al., 2018 PMID: 29752180).
Антитела, содержащие только тяжелые цепи.Antibodies containing only heavy chains.
В обычном антителе IgG, ассоциация тяжелой цепи и легкой цепи частично обусловлена гидрофобным взаимодействием между константной областью легкой цепи и константным доменом СН1 тяжелой цепи. В областях тяжелой цепи каркаса 2 (FR2) и каркаса 4 (FR4) имеются дополнительные остатки, которые также способствуют этому гидрофобному взаимодействию между тяжелой и легкой цепями.In a typical IgG antibody, the association of the heavy chain and the light chain is due in part to the hydrophobic interaction between the light chain constant region and the heavy chain CH1 constant domain. There are additional residues in the heavy chain regions of framework 2 (FR2) and framework 4 (FR4) that also contribute to this hydrophobic interaction between the heavy and light chains.
Известно, однако, что сыворотка верблюдовых (подгруппа Tylopoda, которая включает верблюдов, дромадеров и лам) содержит основной тип антител, состоящих исключительно из парных Н-цепей (антитела, содержащие только тяжелые цепи, или UniAb™). UniAb™ Camelidae (Camelus dromedarius, Camelus bactrianus, Lama glama, Lama guanaco, Lama alpaca и Lama vicugna) имеют уникальную структуру, состоящую из одного вариабельного домена (VHH), шарнирной области и двух константных доменов (СН2 и СН3), которые высокогомологичны доменам СН2 и СН3 классических антител. Данные UniAb™ не имеют первого домена константной области (СН1), который присутствует в геноме, но удаляется во время процессинга мРНК. Отсутствие домена СН1 объясняет отсутствие легкой цепи в UniAb™, поскольку этот домен является местом присоединения константного домена легкой цепи. Такие UniAb™ естественным образом эволюционировали для придания антигенсвязывающей специфичности и высокой аффинности тремя CDR из обычных антител, или их фрагментов (Muyldermans, 2001; J Biotechnol 74:277-302; Revets et al., 2005; Expert Opin Biol Ther 5:111-124). Хрящевые рыбы, такие как акулы, также выработали особый тип иммуноглобулина, обозначенный как IgNAR, который лишен легких полипептидных цепей и полностью состоит из тяжелых цепей. Молекулами IgNAR можно манипулировать с помощью молекулярной инженерии для получения вариабельного домена полипептида с одной тяжелой цепью (vNAR) (Nuttall et al. Eur. J. Biochem. 270, 3543-3554 (2003); Nuttall et al. Function and Bioinformatics 55, 187-197 (2004); Dooley et al., Molecular Immunology 40, 25-33 (2003)).It is known, however, that serum from camelids (a subgroup of Tylopoda that includes camels, dromedaries and llamas) contains a major type of antibody consisting entirely of paired H-chains (heavy chain-only antibodies, or UniAb™). UniAb™ Camelidae (Camelus dromedarius, Camelus bactrianus, Lama glama, Lama guanaco, Lama alpaca and Lama vicugna) have a unique structure consisting of one variable domain (VHH), a hinge region and two constant domains (CH2 and CH3), which are highly homologous to the domains CH2 and CH3 of classical antibodies. These UniAbs™ do not have the first constant region domain (CH1), which is present in the genome but is removed during mRNA processing. The absence of the CH1 domain explains the absence of a light chain in UniAb™, since this domain is the attachment site for the light chain constant domain. Such UniAbs™ have naturally evolved to impart antigen-binding specificity and high affinity to three CDRs from conventional antibodies, or fragments thereof (Muyldermans, 2001; J Biotechnol 74:277-302; Revets et al., 2005; Expert Opin Biol Ther 5:111- 124). Cartilaginous fish such as sharks have also developed a special type of immunoglobulin, designated IgNAR, which lacks light polypeptide chains and is composed entirely of heavy chains. IgNAR molecules can be manipulated by molecular engineering to produce a single heavy chain polypeptide variable domain (vNAR) (Nuttall et al. Eur. J. Biochem. 270, 3543-3554 (2003); Nuttall et al. Function and Bioinformatics 55, 187 -197 (2004); Dooley et al., Molecular Immunology 40, 25-33 (2003)).
Способность антител, содержащих только тяжелые цепи, лишенных легкой цепи, связывать антиген была установлена в 1960-х годах (Jaton et al. (1968) Biochemistry, 7, 4185-4195). Тяжелая цепь иммуноглобулина, физически отделенная от легкой цепи, сохранила 80% антигенсвязывающей активности отноThe ability of antibodies containing only heavy chains, lacking a light chain, to bind antigen was established in the 1960s (Jaton et al. (1968) Biochemistry, 7, 4185-4195). The immunoglobulin heavy chain, physically separated from the light chain, retained 80% of the antigen-binding activity relative to
- 1 046268 сительно тетрамерного антитела. Sitia et al. (1990) Cell, 60, 781-790 продемонстрировали, что удаление домена СН1 из перегруппированного гена μ мыши приводит к получению антитела, содержащего только тяжелые цепи, лишенного легкой цепи, в клеточной культуре млекопитающих. Вырабатываемые антитела сохраняли специфичность связывания VH и эффекторные функции.- 1 046268 strongly tetrameric antibody. Sitia et al. (1990) Cell, 60, 781-790 demonstrated that deletion of the CH1 domain from a rearranged mouse μ gene results in a heavy chain-only antibody lacking a light chain in mammalian cell culture. The antibodies produced retained VH binding specificity and effector functions.
Антитела, содержащие только тяжелые цепи, с высокой специфичностью и аффинностью могут создаваться против различных антигенов посредством иммунизации (van der Linden, R.H., et al. Biochim. Biophys. Acta. 1431, 37-46 (1999)), а часть VHH может быть легко клонирована и экспрессирована в дрожжах (Frenken, L.G.J., et al. J. Biotechnol. 78, 11-21 (2000)). Их уровни экспрессии, растворимости и стабильности значительно выше, чем у классических фрагментов F(ab) или Fv (Ghahroudi, M.A. et al. FEBS Lett. 414, 521-526 (1997)).Heavy chain-only antibodies with high specificity and affinity can be generated against various antigens by immunization (van der Linden, R.H., et al. Biochim. Biophys. Acta. 1431, 37-46 (1999)), and the VHH portion can be easily cloned and expressed in yeast (Frenken, L.G.J., et al. J. Biotechnol. 78, 11-21 (2000)). Their levels of expression, solubility and stability are significantly higher than those of the classical F(ab) or Fv fragments (Ghahroudi, M.A. et al. FEBS Lett. 414, 521-526 (1997)).
Мыши, у которых λ (лямбда) локус легкой (Г)-цепи и/или λ и к (каппа) локусы L-цепи были функционально подвергнуты сайленсингу, и антитела, продуцируемые такими мышами, описаны в патентах США № 7541513 и 8367888. Рекомбинантное продуцирование антител, содержащих только тяжелую цепь, у мышей и крыс было описано, например, в WO2006008548; публикации заявки на патент США № 20100122358; Nguyen et al., 2003, Immunology; 109(1), 93-101; Bruggemann et al., Crit. Rev. Immunol; 2006, 26(5):377-90; и Zou et al., 2007, J Exp Med; 204(13): 3271-3283. Получение нокаутных крыс с помощью микроинъекций эмбрионам цинк-пальцевой нуклеазы описано в Geurts et al., 2009, Science, 325(5939):433. Растворимые антитела, содержащие только тяжелые цепи, и трансгенные грызуны, содержащие гетерологичный локус тяжелой цепи, продуцирующий такие антитела, описаны в патентах США № 8883150 и 9365655. Структуры CAR-T, содержащие однодоменные антитела в качестве связывающего (нацеливающего) домена, описаны, например, в Iri-Sofla et al., 2011, Experimental Cell Research 317:2630-2641 и Jamnani et al., 2014, Biochim Biophys Acta, 1840:378-386.Mice in which the λ (lambda) light (G) chain locus and/or λ and k (kappa) L chain loci have been functionally silenced, and the antibodies produced by such mice are described in US Patent Nos. 7,541,513 and 8,367,888. the production of heavy chain-only antibodies in mice and rats has been described, for example, in WO2006008548; publication of US patent application No. 20100122358; Nguyen et al., 2003, Immunology; 109(1), 93-101; Bruggemann et al., Crit. Rev. Immunol; 2006, 26(5):377-90; and Zou et al., 2007, J Exp Med; 204(13): 3271-3283. Generation of knockout rats by embryonic microinjection of zinc finger nuclease is described in Geurts et al., 2009, Science, 325(5939):433. Soluble heavy chain-only antibodies and transgenic rodents containing a heterologous heavy chain locus producing such antibodies are described in US Pat. Nos. 8,883,150 and 9,365,655. CAR-T structures containing single-domain antibodies as the binding (targeting) domain are described, e.g. , in Iri-Sofla et al., 2011, Experimental Cell Research 317:2630–2641 and Jamnani et al., 2014, Biochim Biophys Acta, 1840:378–386.
Сущность изобретенияThe essence of the invention
Аспекты изобретения относятся к антителам, содержащим только тяжелые цепи, включая, но не ограничиваясь, UniAb™, с аффинностью связывания с ПСМА. Дальнейшие аспекты изобретения относятся к способам получения таких антител, композициям, содержащим такие антитела, и их применению для лечения расстройств, которые характеризуются экспрессией ПСМА.Aspects of the invention relate to heavy chain-only antibodies, including, but not limited to, UniAb™, with binding affinity for PSMA. Further aspects of the invention relate to methods for producing such antibodies, compositions containing such antibodies, and their use for the treatment of disorders that are characterized by the expression of PSMA.
В некоторых вариантах осуществления антитело, которое связывается с ПСМА, содержит первую вариабельную область тяжелой цепи, содержащую: (a) CDR1, имеющую две или менее замен в любой из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 1-10; и/или (b) CDR2, имеющую две или менее замен в любой из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 11-17; и/или (с) CDR3, имеющую две или менее замен в любой из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 18-23. В некоторых вариантах осуществления антитело дополнительно содержит вторую вариабельную область тяжелой цепи, содержащую: (a) CDR1, имеющую две или менее замен в любой из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 1-10; и/или (b) CDR2, имеющую две или менее замен в любой из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 11-17; и/или (с) CDR3, имеющую две или менее замен в любой из аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 18-23. В некоторых вариантах осуществления последовательности CDR1, CDR2 и CDR3 присутствуют в человеческом каркасе. В некоторых вариантах осуществления антитело дополнительно содержит последовательность константной области тяжелой цепи в отсутствие последовательности СН1.In some embodiments, an antibody that binds to PSMA comprises a first heavy chain variable region comprising: (a) a CDR1 having two or fewer substitutions in any of the amino acid sequences of SEQ ID NO: 1-10; and/or (b) a CDR2 having two or fewer substitutions in any of the amino acid sequences of SEQ ID NO: 11-17; and/or (c) CDR3 having two or fewer substitutions in any of the amino acid sequences of SEQ ID NO: 18-23. In some embodiments, the antibody further comprises a second heavy chain variable region comprising: (a) a CDR1 having two or fewer substitutions in any of the amino acid sequences of SEQ ID NO: 1-10; and/or (b) a CDR2 having two or fewer substitutions in any of the amino acid sequences of SEQ ID NO: 11-17; and/or (c) CDR3 having two or fewer substitutions in any of the amino acid sequences of SEQ ID NO: 18-23. In some embodiments, the CDR1, CDR2, and CDR3 sequences are present in the human framework. In some embodiments, the antibody further comprises a heavy chain constant region sequence in the absence of a CH1 sequence.
В некоторых вариантах осуществления первая вариабельная область тяжелой цепи антитела содержит: (а) последовательность CDR1, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1-10; и/или (b) последовательность CDR2, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-17; и/или (с) последовательность CDR3, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 18-23.In some embodiments, the first heavy chain variable region of the antibody comprises: (a) a CDR1 sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 1-10; and/or (b) a CDR2 sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 11-17; and/or (c) a CDR3 sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 18-23.
В некоторых вариантах осуществления антитело дополнительно содержит вторую вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит: (а) последовательность CDR1, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1-10; и/или (b) последовательность CDR2, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-17; и/или (с) последовательность CDR3, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1823.In some embodiments, the antibody further comprises a second heavy chain variable region that comprises: (a) a CDR1 sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 1-10; and/or (b) a CDR2 sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 11-17; and/or (c) a CDR3 sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 1823.
В некоторых вариантах осуществления антитело содержит: (а) последовательность CDR1, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1-10; и (b) последовательность CDR2, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 11-17; и (с) последовательность CDR3, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 18-23. В некоторых вариантах осуществления антитело содержит вторую вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит: (а) последовательность CDR1, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1-10; и (b) последовательность CDR2, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO:In some embodiments, the antibody comprises: (a) a CDR1 sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 1-10; and (b) a CDR2 sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 11-17; and (c) a CDR3 sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 18-23. In some embodiments, the antibody comprises a second heavy chain variable region that comprises: (a) a CDR1 sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 1-10; and (b) a CDR2 sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO:
11-17; и (с) последовательность CDR3, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 18-23.11-17; and (c) a CDR3 sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 18-23.
В некоторых вариантах осуществления антитело содержит: (а) последовательность CDR1 с SEQ ID NO: 2, последовательность CDR2 с SEQ ID NO: 11 и последовательность CDR3 с SEQ ID NO: 18; или (b) последовательность CDR1 с SEQ ID NO: 7, последовательность CDR2 с SEQ ID NO: 15 и последовательность CDR3 с SEQ ID NO: 20. В некоторых вариантах осуществления антитело содержит последовательность вариабельной области тяжелой цепи, имеющую по меньшей мере 95% идентичности последоваIn some embodiments, the antibody comprises: (a) a CDR1 sequence of SEQ ID NO: 2, a CDR2 sequence of SEQ ID NO: 11, and a CDR3 sequence of SEQ ID NO: 18; or (b) a CDR1 sequence of SEQ ID NO: 7, a CDR2 sequence of SEQ ID NO: 15, and a CDR3 sequence of SEQ ID NO: 20. In some embodiments, the antibody comprises a heavy chain variable region sequence having at least 95% identity afterbirth
- 2 046268 тельности с любой из последовательностей SEQ ID NO: 24-58. В некоторых вариантах осуществления антитело содержит последовательность вариабельной области тяжелой цепи, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 24-58. В некоторых вариантах осуществления антитело содержит последовательность вариабельной области тяжелой цепи, выбранную из группы, состоящей из: SEQ ID NO: 25 и SEQ ID NO: 38.- 2046268 activity with any of the sequences SEQ ID NO: 24-58. In some embodiments, the antibody comprises a heavy chain variable region sequence selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 24-58. In some embodiments, the antibody comprises a heavy chain variable region sequence selected from the group consisting of: SEQ ID NO: 25 and SEQ ID NO: 38.
В некоторых вариантах осуществления антитело, которое связывается с ПСМА, содержит первую вариабельную область тяжелой цепи, содержащую: (а) последовательность CDR1 формулы:In some embodiments, an antibody that binds to PSMA contains a first heavy chain variable region comprising: (a) a CDR1 sequence of the formula:
G G S I S S X1 X2 Y Х3 (SEQ ID NO: 67), где X представляет собой S или N; Х2 представляет собой S или N; и Х3 представляет собой Y или F; и (b) последовательность CDR2 формулы:GGSISS X1 X 2 Y X 3 (SEQ ID NO: 67), where X is S or N; X 2 represents S or N; and X 3 represents Y or F; and (b) a CDR2 sequence of the formula:
Х4 Х5 X6 S G X7 T (SEQ ID NO: 68), где Х4 представляет собой I или V; X5 представляет собой D или Y; Х6 представляет собой Y или D; и Х7 представляет собой Y или S; и (с) представляет собой CDR3 формулы:X4 X5 X6 SG X7 T (SEQ ID NO: 68), where X4 represents I or V; X 5 represents D or Y; X 6 represents Y or D; and X 7 is Y or S; and (c) is a CDR3 of the formula:
ARHKAATADFDY (SEQ ID NO: 69), в одновалентном или двухвалентном формате.ARHKAATADFDY (SEQ ID NO: 69), in monovalent or divalent format.
В некоторых вариантах осуществления антитела, которое связывается с ПСМА, содержит первую вариабельную область тяжелой цепи, содержащую: (а) последовательность CDR1 формулы:In some embodiments, an antibody that binds to PSMA contains a first heavy chain variable region comprising: (a) a CDR1 sequence of the formula:
G F X1 F Х2 Х3 Y G (SEQ ID NO: 70), где X1 представляет собой S или I, или Т; Х2 представляет собой S или Т, или R, или I; и Х3 представляет собой R или S; и (b) последовательность CDR2 формулы:GF X1 F X 2 X 3 YG (SEQ ID NO: 70), where X 1 represents S or I or T; X 2 represents S or T or R or I; and X 3 represents R or S; and (b) a CDR2 sequence of the formula:
I Х4 Y D G S N Х5 (SEQ ID NO: 71), где Х4 представляет собой W или S; и X5 представляет собой R или K; и (с) последовательность CDR3 формулы:I X4 YDGSN X 5 (SEQ ID NO: 71), where X4 represents W or S; and X 5 represents R or K; and (c) a CDR3 sequence of the formula:
AREPRX6GYYYX7X8SGYX9SLDY (SEQ ID NO: 72), где Х6 представляет собой I или V; Х7 представляет собой Е или D; X8 представляет собой S или Т; и Х9 представляет собой Y или D, в одновалентном или двухвалентном формате.AREPRX6GYYYX7X8SGYX9SLDY (SEQ ID NO: 72), where X6 represents I or V; X 7 represents E or D; X8 represents S or T; and X9 is Y or D, in monovalent or divalent format.
В некоторых вариантах осуществления антитело, связывающее ПСМА, содержит: первую вариабельную область тяжелой цепи, содержащую: (а) последовательность CDR1 формулы:In some embodiments, the PSMA-binding antibody comprises: a first heavy chain variable region comprising: (a) a CDR1 sequence of the formula:
G G S I S S X1 X2 Y Х3 (SEQ ID NO: 67), где X1 представляет собой S или N; Х2 представляет собой S или N; и Х3 представляет собой Y или F; и (b) последовательность CDR2 формулы:GGSISS X1 X 2 Y X 3 (SEQ ID NO: 67), where X 1 represents S or N; X 2 represents S or N; and X 3 represents Y or F; and (b) a CDR2 sequence of the formula:
Х4 Х5 Х6 S G X7 T (SEQ ID NO: 68), где Х4 представляет собой I или V; X5 представляет собой D или Y; Х6 представляет собой Y или D; и Х7 представляет собой Y или S; и (с) представляет собой CDR3 формулы:X4 X5 X6 SG X7 T (SEQ ID NO: 68), where X4 represents I or V; X5 represents D or Y; X6 represents Y or D; and X 7 is Y or S; and (c) is a CDR3 of the formula:
ARHKAATADFDY (SEQ ID NO: 69), и вторую вариабельную область тяжелой цепи, содержащую: (а) последовательность CDR1 формулы:ARHKAATADFDY (SEQ ID NO: 69), and a second heavy chain variable region containing: (a) a CDR1 sequence of the formula:
G F X1 F Х2 Х3 Y G (SEQ ID NO: 70), где X1 представляет собой S или I, или Т; Х2 представляет собой S или Т, или R, или I; и Х3 представляет собой R или S; и (b) последовательность CDR2 формулы:GF X1 F X 2 X 3 YG (SEQ ID NO: 70), where X1 represents S or I or T; X2 represents S or T or R or I; and X3 is R or S; and (b) a CDR2 sequence of the formula:
I Х4 Y D G S N Х5 (SEQ ID NO: 71), где Х4 представляет собой W или S; и X5 представляет собой R или K; и (с) последовательность CDR3 формулы:I X4 YDGSN X 5 (SEQ ID NO: 71), where X 4 represents W or S; and X 5 represents R or K; and (c) a CDR3 sequence of the formula:
AREPRX6GYYYX7X8SGYX9SLDY (SEQ ID NO: 72), где Х6 представляет собой I или V; Х7 представляет собой Е или D; X8 представляет собой S или Т; и Х9 представляет собой Y или D.AREPRX6GYYYX7X8SGYX9SLDY (SEQ ID NO: 72), where X6 represents I or V; X 7 represents E or D; X8 represents S or T; and X9 is Y or D.
В некоторых вариантах осуществления антитело содержит первую и вторую вариабельную область тяжелой цепи, причем первая вариабельная область тяжелой цепи расположена ближе к N-концу относительно второй вариабельной области тяжелой цепи. В некоторых вариантах осуществления первая вариабельная область тяжелой цепи расположена ближе к С-концу относительно второй вариабельной области тяжелой цепи.In some embodiments, the antibody comprises a first and a second heavy chain variable region, wherein the first heavy chain variable region is located proximal to the N-terminus of the second heavy chain variable region. In some embodiments, the first heavy chain variable region is located proximal to the C-terminus of the second heavy chain variable region.
В некоторых вариантах осуществления антитела, которое связывается с ПСМА, содержит вариабельную область тяжелой цепи, содержащую последовательности CDR1, CDR2 и CDR3 в каркасе VH человека, где последовательности CDR содержат последовательность, имеющую две или менее замен в последовательности CDR, выбранной из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1-23.In some embodiments, an antibody that binds to PSMA comprises a heavy chain variable region comprising CDR1, CDR2, and CDR3 sequences in a human VH framework, wherein the CDR sequences comprise a sequence having two or fewer substitutions in a CDR sequence selected from the group consisting of SEQ ID NO: 1-23.
В некоторых вариантах осуществления антитело, которое связывается с ПСМА, содержит вариабельную область тяжелой цепи, содержащую последовательности CDR1, CDR2 и CDR3 в каркасе VH человека, где последовательности CDR выбраны из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1-23.In some embodiments, an antibody that binds to PSMA comprises a heavy chain variable region comprising CDR1, CDR2, and CDR3 sequences in the human VH framework, wherein the CDR sequences are selected from the group consisting of SEQ ID NOs: 1-23.
В некоторых вариантах осуществления антитела, которое связывается с ПСМА, содержит: вариабельную область тяжелой цепи, содержащую последовательность CDR1 с SEQ ID NO: 2, последовательность CDR2 с SEQ ID NO: 11 и последовательность CDR3 с SEQ ID NO: 18 в каркасе VH человека.In some embodiments, an antibody that binds to PSMA comprises: a heavy chain variable region comprising a CDR1 sequence of SEQ ID NO: 2, a CDR2 sequence of SEQ ID NO: 11, and a CDR3 sequence of SEQ ID NO: 18 in a human VH framework.
В некоторых вариантах осуществления антитело, которое связывается с ПСМА, содержит: вариабельную область тяжелой цепи, содержащую последовательность CDR1 с SEQ ID NO: 2, последовательность CDR2 с SEQ ID NO: 11 и последовательность CDR3 с SEQ ID NO: 18 в каркасе VH человека в одновалентной или двухвалентной конфигурации.In some embodiments, an antibody that binds to PSMA comprises: a heavy chain variable region comprising a CDR1 sequence of SEQ ID NO: 2, a CDR2 sequence of SEQ ID NO: 11, and a CDR3 sequence of SEQ ID NO: 18 in a human VH framework in monovalent or divalent configuration.
- 3 046268- 3 046268
В некоторых вариантах осуществления антитела, которое связывается с ПСМА, содержит: вариабельную область тяжелой цепи, содержащую последовательность CDR1 с SEQ ID NO: 7, последовательность CDR2 с SEQ ID NO: 15 и последовательность CDR3 с SEQ ID NO: 20 в каркасе VH человека.In some embodiments, an antibody that binds to PSMA comprises: a heavy chain variable region comprising a CDR1 sequence of SEQ ID NO: 7, a CDR2 sequence of SEQ ID NO: 15, and a CDR3 sequence of SEQ ID NO: 20 in a human VH framework.
В некоторых вариантах осуществления антитело, которое связывается с ПСМА, содержит: вариабельную область тяжелой цепи, содержащую последовательность CDR1 с SEQ ID NO: 7, последовательность CDR2 с SEQ ID NO: 15 и последовательность CDR3 с SEQ ID NO: 20 в каркасе VH человека в одновалентной или двухвалентной конфигурации.In some embodiments, an antibody that binds to PSMA comprises: a heavy chain variable region comprising a CDR1 sequence of SEQ ID NO: 7, a CDR2 sequence of SEQ ID NO: 15, and a CDR3 sequence of SEQ ID NO: 20 in a human VH framework in monovalent or divalent configuration.
В некоторых вариантах осуществления антитело, которое связывается с ПСМА, содержит: первую вариабельную область тяжелой цепи, содержащую: последовательность CDR1 с SEQ ID NO: 2, последовательность CDR2 с SEQ ID NO: 11 и последовательность CDR3 с SEQ ID NO: 18; и вторую вариабельную область тяжелой цепи, содержащую: последовательность CDR1 с SEQ ID NO: 7, последовательность CDR2 с SEQ ID NO: 15 и последовательность CDR3 с SEQ ID NO: 20 в каркасе VH человека. В некоторых вариантах осуществления антитело содержит первую вариабельную область тяжелой цепи, которая расположена ближе к N-концу относительно второй вариабельной области тяжелой цепи. В некоторых вариантах осуществления первая вариабельная область тяжелой цепи расположена ближе к С-концу относительно второй вариабельной области тяжелой цепи.In some embodiments, an antibody that binds to PSMA comprises: a first heavy chain variable region comprising: a CDR1 sequence of SEQ ID NO: 2, a CDR2 sequence of SEQ ID NO: 11, and a CDR3 sequence of SEQ ID NO: 18; and a second heavy chain variable region comprising: a CDR1 sequence of SEQ ID NO: 7, a CDR2 sequence of SEQ ID NO: 15, and a CDR3 sequence of SEQ ID NO: 20 in the human VH framework. In some embodiments, the antibody comprises a first heavy chain variable region that is located proximal to the N-terminus of the second heavy chain variable region. In some embodiments, the first heavy chain variable region is located proximal to the C-terminus of the second heavy chain variable region.
В некоторых вариантах осуществления антитело является моноспецифическим. В некоторых вариантах осуществления антитело является полиспецифическим. В некоторых вариантах осуществления антитело является биспецифическим. В некоторых вариантах осуществления антитело имеет аффинность связывания с белком CD3 и белком ПСМА. В некоторых вариантах осуществления антитело имеет аффинность связывания с двумя разными эпитопами на одном и том же белке ПСМА. В некоторых вариантах осуществления антитело имеет аффинность связывания с эффекторной клеткой. В некоторых вариантах осуществления антитело имеет аффинность связывания с Т-клеточным антигеном. В некоторых вариантах осуществления антитело имеет аффинность связывания с CD3. В некоторых вариантах осуществления антитело имеет формат CAR-T.In some embodiments, the antibody is monospecific. In some embodiments, the antibody is multispecific. In some embodiments, the antibody is bispecific. In some embodiments, the antibody has binding affinity for the CD3 protein and the PSMA protein. In some embodiments, the antibody has binding affinity to two different epitopes on the same PSMA protein. In some embodiments, the antibody has binding affinity for an effector cell. In some embodiments, the antibody has binding affinity for a T cell antigen. In some embodiments, the antibody has binding affinity for CD3. In some embodiments, the antibody is in CAR-T format.
Аспекты изобретения включают биспецифическое антитело, содержащее: (i) вариабельную область тяжелой цепи, имеющую аффинность связывания с CD3, содержащую последовательность CDR1 с SEQ ID NO: 59, последовательность CDR2 с SEQ ID NO: 60 и последовательность CDR3 с SEQ ID NO: 61 в каркасе VH человека; (ii) вариабельную область легкой цепи, содержащую последовательность CDR1 с SEQ ID NO: 62, последовательность CDR2 с SEQ ID NO: 63 и последовательность CDR3 с SEQ ID NO: 64 в каркасе VL человека; и (ш) антигенсвязывающий домен антитела, содержащего только тяжелые цепи, к ПСМА, содержащий последовательность CDR1 с SEQ ID NO: 2, последовательность CDR2 с SEQ ID NO: 11 и последовательность CDR3 с SEQ ID NO: 18, в каркасе VH человека.Aspects of the invention include a bispecific antibody comprising: (i) a heavy chain variable region having binding affinity for CD3, comprising a CDR1 sequence of SEQ ID NO: 59, a CDR2 sequence of SEQ ID NO: 60, and a CDR3 sequence of SEQ ID NO: 61 in human VH frame; (ii) a light chain variable region containing the CDR1 sequence of SEQ ID NO: 62, the CDR2 sequence of SEQ ID NO: 63 and the CDR3 sequence of SEQ ID NO: 64 in the human VL framework; and (iii) an antigen binding domain of a heavy chain only antibody to PSMA comprising a CDR1 sequence of SEQ ID NO: 2, a CDR2 sequence of SEQ ID NO: 11, and a CDR3 sequence of SEQ ID NO: 18, in a human VH framework.
Аспекты изобретения включают биспецифическое антитело, содержащее: (i) вариабельную область тяжелой цепи, имеющую аффинность связывания с CD3, содержащую последовательность CDR1 с SEQ ID NO: 59, последовательность CDR2 с SEQ ID NO: 60 и последовательность CDR3 с SEQ ID NO: 61 в каркасе VH человека; (ii) вариабельную область легкой цепи, содержащую последовательность CDR1 с SEQ ID NO: 62, последовательность CDR2 с SEQ ID NO: 63 и последовательность CDR3 с SEQ ID NO: 64 в каркасе VL человека; и (iii) антигенсвязывающий домен антитела, содержащего только тяжелые цепи, к ПСМА, содержащий последовательность CDR1 с SEQ ID NO: 2, последовательность CDR2 с SEQ ID NO: 11 и последовательность CDR3 с SEQ ID NO: 18, в каркасе VH человека в одновалентной или двухвалентной конфигурации.Aspects of the invention include a bispecific antibody comprising: (i) a heavy chain variable region having binding affinity for CD3, comprising a CDR1 sequence of SEQ ID NO: 59, a CDR2 sequence of SEQ ID NO: 60, and a CDR3 sequence of SEQ ID NO: 61 in human VH frame; (ii) a light chain variable region containing the CDR1 sequence of SEQ ID NO: 62, the CDR2 sequence of SEQ ID NO: 63 and the CDR3 sequence of SEQ ID NO: 64 in the human VL framework; and (iii) an antigen binding domain of a heavy chain only antibody to PSMA comprising the CDR1 sequence of SEQ ID NO: 2, the CDR2 sequence of SEQ ID NO: 11, and the CDR3 sequence of SEQ ID NO: 18, in a human VH framework in a monovalent or divalent configuration.
Аспекты изобретения включают биспецифическое антитело, содержащее: (i) вариабельную область тяжелой цепи, имеющую аффинность связывания с CD3, содержащую последовательность CDR1 с SEQ ID NO: 59, последовательность CDR2 с SEQ ID NO: 60 и последовательность CDR3 с SEQ ID NO: 61 в каркасе VH человека; (ii) вариабельную область легкой цепи, содержащую последовательность CDR1 с SEQ ID NO: 62, последовательность CDR2 с SEQ ID NO: 63 и последовательность CDR3 с SEQ ID NO: 64 в каркасе VL человека; и (iii) антигенсвязывающий домен антитела, содержащего только тяжелые цепи, к ПСМА, содержащий последовательность CDR1 с SEQ ID NO: 7, последовательность CDR2 с SEQ ID NO: 15 и последовательность CDR3 с SEQ ID NO: 20, в каркасе VH человека.Aspects of the invention include a bispecific antibody comprising: (i) a heavy chain variable region having binding affinity for CD3, comprising a CDR1 sequence of SEQ ID NO: 59, a CDR2 sequence of SEQ ID NO: 60, and a CDR3 sequence of SEQ ID NO: 61 in human VH frame; (ii) a light chain variable region containing the CDR1 sequence of SEQ ID NO: 62, the CDR2 sequence of SEQ ID NO: 63 and the CDR3 sequence of SEQ ID NO: 64 in the human VL framework; and (iii) an antigen binding domain of a heavy chain only antibody to PSMA comprising the CDR1 sequence of SEQ ID NO: 7, the CDR2 sequence of SEQ ID NO: 15, and the CDR3 sequence of SEQ ID NO: 20, in a human VH framework.
Аспекты изобретения включают биспецифическое антитело, содержащее: (i) вариабельную область тяжелой цепи, имеющую аффинность связывания с CD3, содержащую последовательность CDR1 с SEQ ID NO: 59, последовательность CDR2 с SEQ ID NO: 60 и последовательность CDR3 с SEQ ID NO: 61 в каркасе VH человека; (ii) вариабельную область легкой цепи, содержащую последовательность CDR1 с SEQ ID NO: 62, последовательность CDR2 с SEQ ID NO: 63 и последовательность CDR3 с SEQ ID NO: 64 в каркасе VL человека; и (iii) антигенсвязывающий домен антитела, содержащего только тяжелые цепи, к ПСМА, содержащий последовательность CDR1 с SEQ ID NO: 7, последовательность CDR2 с SEQ ID NO: 15 и последовательность CDR3 с SEQ ID NO: 20, в каркасе VH человека в одновалентной или двухвалентной конфигурации.Aspects of the invention include a bispecific antibody comprising: (i) a heavy chain variable region having binding affinity for CD3, comprising a CDR1 sequence of SEQ ID NO: 59, a CDR2 sequence of SEQ ID NO: 60, and a CDR3 sequence of SEQ ID NO: 61 in human VH frame; (ii) a light chain variable region containing the CDR1 sequence of SEQ ID NO: 62, the CDR2 sequence of SEQ ID NO: 63 and the CDR3 sequence of SEQ ID NO: 64 in the human VL framework; and (iii) an antigen binding domain of a heavy chain only antibody to PSMA comprising the CDR1 sequence of SEQ ID NO: 7, the CDR2 sequence of SEQ ID NO: 15 and the CDR3 sequence of SEQ ID NO: 20, in a human VH framework in a monovalent or divalent configuration.
Аспекты изобретения включают полиспецифическое антитело, содержащее: (i) вариабельную область тяжелой цепи, имеющую аффинность связывания с CD3, содержащую последовательность CDR1 с SEQ ID NO: 59, последовательность CDR2 с SEQ ID NO: 60 и последовательность CDR3 с SEQ ID NO:Aspects of the invention include a multispecific antibody comprising: (i) a heavy chain variable region having binding affinity for CD3, comprising a CDR1 sequence of SEQ ID NO: 59, a CDR2 sequence of SEQ ID NO: 60, and a CDR3 sequence of SEQ ID NO:
- 4 046268 в каркасе VH человека; (ii) вариабельную область легкой цепи, содержащую последовательность CDR1 с SEQ ID NO: 62, последовательность CDR2 с SEQ ID NO: 63 и последовательность CDR3 с SEQ ID NO: 64 в каркасе VL человека; и (iii) антигенсвязывающий домен антитела, содержащего только тяжелой цепи, к ПСМА, где антигенсвязывающий домен содержит первую и вторую антигенсвязывающую область в двухвалентной конфигурации, при этом: первая антигенсвязывающая область содержит последовательность CDR1 с SEQ ID NO: 2, последовательность CDR2 с SEQ ID NO: 11 и последовательность CDR3 с SEQ ID NO: 18 в каркасе VH человека; и вторая антигенсвязывающая область содержит последовательность CDR1 с SEQ ID NO: 7, последовательность CDR2 с SEQ ID NO: 15 и последовательность CDR3 с SEQ ID NO: 20 в каркасе VH человека. В определенных вариантах осуществления первая антигенсвязывающая область расположена ближе к N-концу относительно второй антигенсвязывающей области. В определенных других вариантах осуществления первая антигенсвязывающая область расположена ближе к С-концу по сравнению со второй антигенсвязывающей областью.- 4 046268 in human VH frame; (ii) a light chain variable region containing the CDR1 sequence of SEQ ID NO: 62, the CDR2 sequence of SEQ ID NO: 63 and the CDR3 sequence of SEQ ID NO: 64 in the human VL framework; and (iii) an antigen binding domain of a heavy chain only antibody to PSMA, wherein the antigen binding domain comprises a first and a second antigen binding region in a bivalent configuration, wherein: the first antigen binding region comprises a CDR1 sequence of SEQ ID NO: 2, a CDR2 sequence of SEQ ID NO: NO: 11 and the CDR3 sequence of SEQ ID NO: 18 in the human VH framework; and the second antigen binding region comprises a CDR1 sequence of SEQ ID NO: 7, a CDR2 sequence of SEQ ID NO: 15, and a CDR3 sequence of SEQ ID NO: 20 in the human VH framework. In certain embodiments, the first antigen-binding region is located proximal to the N-terminus of the second antigen-binding region. In certain other embodiments, the first antigen-binding region is located closer to the C-terminus compared to the second antigen-binding region.
Аспекты изобретения включают полиспецифические или биспецифические антитела, в которых первая и вторая антигенсвязывающие области антигенсвязывающего домена антитела, содержащего только тяжелые цепи, к ПСМА соединены полипептидным линкером. В некоторых вариантах осуществления полипептидный линкер представляет собой GS-линкер. В некоторых вариантах осуществления GS-линкер состоит из последовательности SEQ ID NO: 73 или SEQ ID NO: 74. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен антитела, содержащего только тяжелые цепи, к ПСМА является монопаратопным и индуцирует меньшую продукцию цитокинов по сравнению с бипаратопным антигенсвязывающим доменом. В некоторых вариантах осуществления антигенсвязывающий домен антитела, содержащего только тяжелые цепи, в ПСМА является монопаратопным и увеличивает количество CD8+ Т-клеток в большей степени, чем бипаратопный антигенсвязывающий домен.Aspects of the invention include polyspecific or bispecific antibodies in which the first and second antigen binding regions of the heavy chain-only antigen binding domain of the anti-PSMA antibody are connected by a polypeptide linker. In some embodiments, the polypeptide linker is a GS linker. In some embodiments, the GS linker consists of the sequence SEQ ID NO: 73 or SEQ ID NO: 74. In some embodiments, the antigen binding domain of the heavy chain only anti-PSMA antibody is monoparatope and induces less cytokine production compared to the biparatope antigen binding domain . In some embodiments, the antigen binding domain of a heavy chain only antibody in PSMA is monoparatope and increases the number of CD8+ T cells to a greater extent than the biparatope antigen binding domain.
В некоторых вариантах осуществления антитело является бипаратопным и имеет повышенную аффинность к ПСМА по сравнению с монопаратопным антителом к ПСМА. В некоторых вариантах осуществления антитело является бипаратопным и имеет повышенную эффекторную функцию по сравнению с монопаратопным антителом к ПСМА.In some embodiments, the antibody is biparatope and has increased affinity for PSMA compared to a monoparatope anti-PSMA antibody. In some embodiments, the antibody is biparatope and has increased effector function compared to a monoparatope anti-PSMA antibody.
Аспекты изобретения относятся к фармацевтическим композициям, содержащим описанное в данном документе антитело.Aspects of the invention relate to pharmaceutical compositions containing an antibody described herein.
Аспекты изобретения относятся к способам лечения расстройства, характеризующегося экспрессией ПСМА, включающим введение субъекту с указанным расстройством антитела или фармацевтической композиции, описанной в данном документе. В определенных других аспектах изобретение относится к применению описанного в данного документе антитела при приготовлении лекарственного препарата для лечения расстройства, характеризующегося экспрессией ПСМА. В еще других аспектах изобретение относится к описанному в данном документе антителу для применения при лечении расстройства, характеризующегося экспрессией ПСМА. В определенных других аспектах изобретение относится к способам лечения, включающим введение нуждающемуся человеку эффективной дозы антитела или фармацевтической композиции, описанной в данном документе. Что касается этих аспектов и в некоторых вариантах осуществления, заболевание представляет собой злокачественное новообразование предстательной железы.Aspects of the invention relate to methods of treating a disorder characterized by the expression of PSMA, comprising administering to a subject with the disorder an antibody or pharmaceutical composition described herein. In certain other aspects, the invention relates to the use of an antibody described herein in the preparation of a medicament for the treatment of a disorder characterized by the expression of PSMA. In yet other aspects, the invention provides an antibody described herein for use in treating a disorder characterized by the expression of PSMA. In certain other aspects, the invention provides methods of treatment comprising administering to a person in need an effective dose of an antibody or pharmaceutical composition described herein. In these aspects, and in some embodiments, the disease is prostate cancer.
Аспекты изобретения относятся к полинуклеотидам, кодирующим описанное в данном документе антитело, векторам, содержащим такие полинуклеотиды, и клеткам, содержащим такие векторы.Aspects of the invention relate to polynucleotides encoding an antibody described herein, vectors containing such polynucleotides, and cells containing such vectors.
Аспекты изобретения относятся к способам получения описанного в данном документе антитела, включающим культивирование описанной в данном документе клетки в условиях, допускающих экспрессию антитела, и выделение антитела из клетки.Aspects of the invention relate to methods for producing an antibody described herein, comprising culturing a cell described herein under conditions allowing expression of the antibody and isolating the antibody from the cell.
Аспекты изобретения относятся к способам получения описанного в данном документе антитела, включающим иммунизацию животного UniRat белком ПСМА и идентификацию последовательностей ПСМА-связывающих антител.Aspects of the invention relate to methods for producing an antibody described herein, including immunizing an animal with UniRat protein PSMA and identifying sequences of PSMA-binding antibodies.
Данные и другие аспекты будут дополнительно объяснены в остальной части описания, включая примеры.These and other aspects will be further explained in the rest of the description, including examples.
Краткое описание графических материаловBrief description of graphic materials
На фиг. 1, панели А-В, представлена серия графиков, демонстрирующих титр сыворотки в зависимости от разведения.In fig. 1, panels A-B, are a series of graphs showing serum titer as a function of dilution.
На фиг. 2, панели А, представлен график, демонстрирующий связывание клеток с ПСМА человека.In fig. 2, Panel A, is a graph showing the binding of cells to human PSMA.
На фиг. 2, панели В, представлен график, демонстрирующий связывание клеток с ПСМА яванского макака.In fig. 2, Panel B, is a graph showing the binding of cells to cynomolgus PSMA.
На фиг. 3 представлен график, демонстрирующий конкуренцию связывания между двумя семействами антител в соответствии с вариантом осуществления изобретения.In fig. 3 is a graph showing binding competition between two families of antibodies in accordance with an embodiment of the invention.
На фиг. 4, панели А, представлен график Скэтчарда, демонстрирующий аффинность связывания с ПСМА, экспрессируемым на клеточной поверхности, биспецифического антитела, имеющего аффинность связывания с CD3 и ПСМА, где плечо к ПСМА является монопаратопным и одновалентным согласно варианту осуществления изобретения.In fig. 4, Panel A, is a Scatchard plot showing the binding affinity to cell surface expressed PSMA of a bispecific antibody having binding affinity to CD3 and PSMA, wherein the PSMA arm is monoparatopic and monovalent, according to an embodiment of the invention.
На фиг. 4, панели В, представлен график Скэтчарда, демонстрирующий аффинность связывания с ПСМА, экспрессируемым на клеточной поверхности, биспецифического антитела, имеющего аффинIn fig. 4, Panel B, is a Scatchard plot showing the binding affinity of a bispecific antibody having the affinity to PSMA expressed on the cell surface
- 5 046268 ность связывания с CD3 и ПСМА, где плечо к ПСМА является бипаратопным согласно варианту осуществления изобретения.- 5 046268 binding to CD3 and PSMA, where the arm to PSMA is biparatopic according to an embodiment of the invention.
На фиг. 5, панели А-С, представлены схематические изображения: анти-CD3 х одновалентного моноспецифического анти-ПСМА антитела (панель А); анти-CD3 х двухвалентное моноспецифическое анти-ПСМА антитело (панель В); и анти-CD3 х двухвалентное бипаратопное анти-ПСМА антитело (панель С) в соответствии с вариантами осуществления изобретения.In fig. 5, panels A-C, show schematic images of: anti-CD3 x monovalent monospecific anti-PSMA antibody (panel A); anti-CD3 x divalent monospecific anti-PSMA antibody (panel B); and anti-CD3 x divalent biparatope anti-PSMA antibody (panel C) in accordance with embodiments of the invention.
На фиг. 6 представлен график, изображающий опосредованный Т-клетками лизис ПСМАположительных клеток с использованием предварительно активированных Т-клеток.In fig. 6 is a graph depicting T cell-mediated lysis of PSMA positive cells using pre-activated T cells.
На фиг. 7 представлен график, изображающий опосредованный Т-клетками лизис ПСМАположительных клеток с использованием нестимулированных Т-клеток.In fig. 7 is a graph depicting T cell mediated lysis of PSMA positive cells using unstimulated T cells.
На фиг. 8 представлен график, изображающий процент специфического лизиса ПСМАотрицательных клеток DU145 в зависимости от концентрации полиспецифических антител в присутствии предварительно активированных Т-клеток.In fig. 8 is a graph depicting the percentage of specific lysis of PSMA-negative DU145 cells as a function of the concentration of polyspecific antibodies in the presence of pre-activated T cells.
На фиг. 9 представлен график, демонстрирующий связывание биспецифических антител к ПСМА х CD3 с положительными и отрицательными по ПСМА клетками.In fig. 9 is a graph showing the binding of anti-PSMA x CD3 bispecific antibodies to PSMA positive and negative cells.
На фиг. 10 представлен график, демонстрирующий опосредованный Т-клетками лизис ПСМАположительных клеток.In fig. 10 is a graph showing T cell-mediated lysis of PSMA positive cells.
На фиг. 11, панели А, представлен график, изображающий пролиферацию Т-клеток в зависимости от концентрации антитела.In fig. 11, Panel A, is a graph depicting T cell proliferation as a function of antibody concentration.
На фиг. 11, панели В, представлен график, изображающий пролиферацию Т-клеток в зависимости от концентрации антитела.In fig. 11, Panel B, is a graph depicting T cell proliferation as a function of antibody concentration.
На фиг. 11, панели С, представлен график, изображающий отношение CD8 к CD4 пролиферированных Т-клеток.In fig. 11, Panel C, is a graph depicting the ratio of CD8 to CD4 proliferated T cells.
На фиг. 11, панели D, представлен график, изображающий отношение CD8 к CD4 пролиферированных Т-клеток.In fig. 11, Panel D, is a graph depicting the ratio of CD8 to CD4 proliferated T cells.
На фиг. 12, панели А, представлен график, изображающий опосредованный Т-клетками лизис ПСМА-положительных клеток в зависимости от концентрации антитела.In fig. 12, Panel A, is a graph depicting T cell-mediated lysis of PSMA-positive cells as a function of antibody concentration.
На фиг. 12, панели В, представлен график, изображающий высвобождение цитокина (ИФН-γ) в зависимости от концентрации антитела.In fig. 12, Panel B, is a graph depicting cytokine (IFN-γ) release as a function of antibody concentration.
На фиг. 12, панели С, представлен график, изображающий высвобождение цитокина (ИЛ-2) в зависимости от концентрации антитела.In fig. 12, Panel C, is a graph depicting cytokine (IL-2) release as a function of antibody concentration.
На фиг. 13 представлен график, изображающий ингибирование роста опухоли 22Rvl в модели ксенотрансплантата опухоли.In fig. 13 is a graph depicting tumor growth inhibition by 22Rvl in a tumor xenograft model.
Подробное описание предпочтительных вариантов осуществленияDetailed Description of Preferred Embodiments
При практической реализации данного изобретения применяют, если не указано иное, стандартные методы молекулярной биологии (включая рекомбинантные методы), микробиологии, клеточной биологии, биохимии и иммунологии, которые известны специалистам в данной области техники. Такие методы полностью описаны в литературе, например, в Molecular Cloning: A Laboratory Manual, second edition (Sambrook et al., 1989); Oligonucleotide Synthesis (M.J. Gait, ed., 1984); Animal Cell Culture (R.I. Freshney, ed., 1987); Methods in Enzymology (Academic Press, Inc.); Current Protocols in Molecular Biology (F.M. Ausubel et al., eds., 1987, and periodic updates); PCR: The Polymerase Chain Reaction, (Mullis et al., ed., 1994); A Practical Guide to Molecular Cloning (Perbal Bernard V., 1988); Phage Display: A Laboratory Manual (Barbas et al., 2001); Harlow, Lane and Harlow, Using Antibodies: A Laboratory Manual: Portable Protocol No. I, Cold Spring Harbor Laboratory (1998); и Harlow and Lane, Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory; (1988).In the practice of this invention, unless otherwise indicated, standard methods of molecular biology (including recombinant methods), microbiology, cell biology, biochemistry and immunology, which are known to specialists in the art, are used. Such methods are fully described in the literature, for example, in Molecular Cloning: A Laboratory Manual, second edition (Sambrook et al., 1989); Oligonucleotide Synthesis (M.J. Gait, ed., 1984); Animal Cell Culture (R.I. Freshney, ed., 1987); Methods in Enzymology (Academic Press, Inc.); Current Protocols in Molecular Biology (F.M. Ausubel et al., eds., 1987, and periodic updates); PCR: The Polymerase Chain Reaction, (Mullis et al., ed., 1994); A Practical Guide to Molecular Cloning (Perbal Bernard V., 1988); Phage Display: A Laboratory Manual (Barbas et al., 2001); Harlow, Lane and Harlow, Using Antibodies: A Laboratory Manual: Portable Protocol No. I, Cold Spring Harbor Laboratory (1998); and Harlow and Lane, Antibodies: A Laboratory Manual, Cold Spring Harbor Laboratory; (1988).
Когда приводится диапазон значений, следует понимать, что данное изобретение охватывает каждое промежуточное значение с точностью до десятого знака нижнего предела, если в контексте явно не указано иное, между верхним и нижним пределом этого диапазона, а также любое другое указанное или промежуточное значение в таком указанном диапазоне. Верхний и нижний пределы данных меньших диапазонов могут быть независимо включены в меньшие диапазоны и также включены в данное изобретение с учетом любого специальным образом исключенного предела в указанном диапазоне. Если указанный диапазон включает один или оба предела, диапазоны, исключающие один или оба этих включенных предела, также включены в данное изобретение.When a range of values is given, it is understood that this invention covers every intermediate value to the tenth decimal place of the lower limit, unless the context clearly indicates otherwise, between the upper and lower limits of that range, as well as any other specified or intermediate value within such specified range. The upper and lower limits of these smaller ranges may be independently included in the smaller ranges and are also included in the present invention, subject to any specially excluded limit within the specified range. If the specified range includes one or both limits, ranges excluding one or both of these included limits are also included in this invention.
Если не указано иное, остатки антител в данном документе нумеруются в соответствии с системой нумерации Kabat (например, Kabat et al., Sequences of Immunological Interest. 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, Md. (1991)).Unless otherwise noted, antibody residues herein are numbered according to the Kabat numbering system (e.g., Kabat et al., Sequences of Immunological Interest. 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, Md. (1991)) .
Для обеспечения полного понимания данного изобретения в нижеследующем подробном описании изложены многочисленные конкретные детали. Однако для специалиста в данной области техники будет очевидно, что настоящее изобретение может применяться на практике и без одной или более указанных конкретных деталей. В других случаях общеизвестные отличительные признаки и процедуры, хорошо известные специалистам в данной области техники, не были описаны во избежание затруднения понимания изобретения.To provide a thorough understanding of the present invention, numerous specific details are set forth in the following detailed description. However, it will be obvious to one skilled in the art that the present invention can be practiced without one or more of the specified specific details. In other cases, well-known features and procedures well known to those skilled in the art have not been described to avoid making the invention difficult to understand.
- 6 046268- 6 046268
Все приведенные в данном документе ссылки, включая патентные заявки и публикации, включены в данный документ посредством ссылки в полном объеме.All references contained herein, including patent applications and publications, are incorporated herein by reference in their entirety.
I. Определения.I. Definitions.
Под термином содержащий подразумевается, что перечисленные элементы требуются для композиции/способа/набора, однако для формирования композиции/способа/набора и тому подобного в рамках формулы изобретения могут быть включены и другие элементы.By "comprising" it is meant that the listed elements are required for the composition/method/kit, however, other elements may be included within the scope of the claims to form the composition/method/kit and the like.
Под термином состоящий по существу из подразумевается ограничение рамок описанной композиции или способа указанными материалами или поэтапными действиями, не оказывающими существенного влияния на основную и новую характеристику(и) объекта изобретения.By the term consisting essentially of is meant the limitation of the described composition or method to specified materials or step-by-step actions that do not significantly affect the main and novel characteristic(s) of the subject matter of the invention.
Под термином состоящий из подразумевается исключение любого элемента, поэтапного действия или ингредиента, не указанного в формуле изобретения, из композиции, способа или набора.The term consisting of means the exclusion of any element, step or ingredient not specified in the claims from the composition, method or kit.
Остатки антител в данном документе нумеруются в соответствии с системой нумерации Kabat и системой нумерации EU. Система нумерации Kabat в общем случае используется для обозначения остатка в вариабельном домене (приблизительно остатки 1-113 тяжелой цепи) (например, Kabat et al., Sequences of Immunological Interest. 5th Ed.Antibody residues in this document are numbered according to the Kabat numbering system and the EU numbering system. The Kabat numbering system is generally used to designate a residue in the variable domain (approximately heavy chain residues 1-113) (eg, Kabat et al., Sequences of Immunological Interest. 5th Ed.
Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, Md. (1991)). Система нумерации EU или индекс EU, как правило, используется для обозначения аминокислотного остатка в константной области тяжелой цепи иммуноглобулина (например, индекс EU, представленный в Kabat et al., ранее). Индекс EU по Kabat относится к нумерации аминокислотных остатков антитела человека IgG1 EU. Если не указано иначе, ссылки на номера остатков в вариабельном домене антител означают нумерацию остатков по системе нумерации Kabat. Если не указано иначе, ссылки на номера остатков в константном домене антител означают нумерацию остатков по системе нумерации EU.Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, Md. (1991)). The EU numbering system or EU index is typically used to designate an amino acid residue in the immunoglobulin heavy chain constant region (eg, EU index presented in Kabat et al., earlier). The Kabat EU index refers to the numbering of amino acid residues of the human IgG1 antibody EU. Unless otherwise indicated, references to residue numbers in the antibody variable domain indicate residue numbering according to the Kabat numbering system. Unless otherwise noted, references to residue numbers in the antibody constant domain indicate residue numbering using the EU numbering system.
Антитела, также называемые иммуноглобулинами, как правило, содержат по меньшей мере одну тяжелую цепь и одну легкую цепь, где N-концевой домен тяжелой и легкой цепей является вариабельным по последовательности, поэтому, как правило, его называют доменом вариабельной области или вариабельным доменом тяжелый цепи (VH) или вариабельным доменом легкой цепи (VL). Эти два домена, как правило, связываются с образованием области специфического связывания, хотя, как будет обсуждаться в данном документе, специфическое связывание также может быть получено с вариабельными последовательностями только тяжелых цепей, а в данной области техники известный и используются различные неприродные конфигурации антител.Antibodies, also called immunoglobulins, typically contain at least one heavy chain and one light chain, where the N-terminal domain of the heavy and light chains is variable in sequence and is therefore generally referred to as a variable region domain or a heavy chain variable domain. (VH) or light chain variable domain (VL). These two domains typically associate to form a specific binding region, although, as will be discussed herein, specific binding can also be achieved with heavy chain variable sequences only, and various non-natural antibody configurations are known and used in the art.
Функциональное или биологически активное антитело или антигенсвязывающая молекула (включая антитела, содержащие только тяжелые цепи, и полиспецифические (например, биспецифические) трехцепочечные антителоподобные молекулы (ТСА, описанные в данном документе), является молекулой, способной оказывать одно или более своих природных активностей действий в структурных, регуляторных, биохимических или биофизических событиях. Например, функциональное антитело или другая связывающая молекула, например, ТСА, может обладать способностью специфически связывать антиген, а связывание может, в свою очередь, вызывать или изменять клеточное или молекулярное событие, такое как передача сигнала или ферментативная активность. Функциональное антитело или другая связывающая молекула, например, ТСА, также может блокировать лигандную активацию рецептора или действовать в качестве агониста или антагониста. Способность антитела или другой связывающей молекулы, например, ТСА, проявлять одну или более своих природных активностей, зависит от нескольких факторов, включая правильный фолдинг и сборку полипептидных цепей.A functional or biologically active antibody or antigen-binding molecule (including heavy chain-only antibodies and multispecific (e.g., bispecific) triple-chain antibody-like molecules (TCA) described herein) is a molecule capable of exerting one or more of its natural activities in structural , regulatory, biochemical or biophysical events. For example, a functional antibody or other binding molecule, such as TCA, may have the ability to specifically bind an antigen, and the binding may in turn cause or alter a cellular or molecular event, such as signal transduction or enzymatic activity. A functional antibody or other binding molecule, such as TCA, can also block ligand activation of a receptor or act as an agonist or antagonist. The ability of an antibody or other binding molecule, such as TCA, to exhibit one or more of its natural activities depends on several factors , including correct folding and assembly of polypeptide chains.
Термин антитело в данном документе используется в самом широком смысле и, в частности, охватывает моноклональные антитела, поликлональные антитела, мономеры, димеры, мультимеры, полиспецифические антитела (например, биспецифические антитела), антитела, содержащие только тяжелые цепи, трехцепочечные антитела, ТСА, одноцепочечный Fv ( scFv), наноантитела и т.д., а также включают фрагменты антител, если они проявляют желаемую биологическую активность (Miller et al (2003) Jour. of Immunology 170:4854-4861). Антитела могут быть мышиными, человеческими, гуманизированными, химерными или полученными из других видов.The term antibody is used herein in its broadest sense and specifically covers monoclonal antibodies, polyclonal antibodies, monomers, dimers, multimers, multispecific antibodies (e.g., bispecific antibodies), heavy chain only antibodies, triple chain antibodies, TCA, single chain Fv (scFv), nanoantibodies, etc., and also include antibody fragments if they exhibit the desired biological activity (Miller et al (2003) Jour. of Immunology 170:4854-4861). Antibodies may be murine, human, humanized, chimeric, or derived from other species.
Термин антитело может относиться к полноразмерной тяжелой цепи, полноразмерной легкой цепи, интактной молекуле иммуноглобулина; или иммунологически активной части любого из этих полипептидов, то есть к полипептиду, который содержит антигенсвязывающий сайт, который иммуноспецифически связывает антиген представляющей интерес мишени или ее часть, причем такие мишени включают, но не ограничиваются ими, раковые клетки или клетки, которые вырабатывают аутоиммунные антитела, связанные с аутоиммунным заболеванием. Описанный в данном документе иммуноглобулин может быть любого типа (например, IgG, IgE, IgM, IgD и IgA), класса (например, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1 и IgA2) или подкласса молекулы иммуноглобулина, включая сконструированные подклассы с измененными Fc-частями, которые обеспечивают снижение или усиление активности эффекторных клеток. Легкие цепи рассматриваемых антител могут быть легкими цепями каппа (V-каппа) или легкими цепями лямбда (V-лямбда). Иммуноглобулины могут быть получены из любых видов. В одном аспекте иммуноглобулин имеет преимущественно человеческое происхождение.The term antibody can refer to a full-length heavy chain, a full-length light chain, an intact immunoglobulin molecule; or an immunologically active portion of any of these polypeptides, that is, a polypeptide that contains an antigen-binding site that immunospecifically binds an antigen of a target of interest or a portion thereof, such targets including, but not limited to, cancer cells or cells that produce autoimmune antibodies, associated with an autoimmune disease. The immunoglobulin described herein can be of any type (eg, IgG, IgE, IgM, IgD and IgA), class (eg, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1 and IgA2) or subclass of the immunoglobulin molecule, including engineered subclasses with altered Fc -parts that provide a decrease or increase in the activity of effector cells. The light chains of the antibodies in question may be kappa light chains (V-kappa) or lambda light chains (V-lambda). Immunoglobulins can be obtained from any species. In one aspect, the immunoglobulin is predominantly of human origin.
Термин моноклональное антитело в данном документе относится к антителу, полученному из популяции в значительной степени однородных антител, то есть отдельные антитела в составе популяцииThe term monoclonal antibody as used herein refers to an antibody derived from a population of largely homogeneous antibodies, that is, individual antibodies within a population
- 7 046268 являются идентичными, за исключением мутаций, происходящих по естественным причинам, которые могут присутствовать в небольших количествах. Моноклональные антитела являются высокоспецифичными и направлены против одного антигенного сайта. Кроме того, в отличие от препаратов обычных (поликлональных) антител, которые обычно включают разные антитела, направленные против разных детерминант (эпитопов), каждое моноклональное антитело направлено против одиночной детерминанты на антигене. Моноклональные антитела в соответствии с данным изобретением могут быть получены гибридомным методом, впервые описанным Kohler et al. (1975) Nature 256:495, также могут быть получены, например, способами получения рекомбинантного белка (см., например, патент США № 4816567).- 7 046268 are identical except for mutations occurring due to natural causes, which may be present in small quantities. Monoclonal antibodies are highly specific and directed against a single antigenic site. Additionally, unlike conventional (polyclonal) antibody preparations, which typically include different antibodies directed against different determinants (epitopes), each monoclonal antibody is directed against a single determinant on an antigen. Monoclonal antibodies in accordance with this invention can be obtained by the hybridoma method first described by Kohler et al. (1975) Nature 256:495, can also be obtained, for example, by methods for producing a recombinant protein (see, for example, US patent No. 4816567).
Термин вариабельный, в контексте данного документа, в связи с антителами относится к тому факту, что последовательности некоторых частей вариабельных доменов антитела сильно различаются у разных антител и вносят вклад в связывание и специфичность каждого конкретного антитела по отношению к его конкретному антигену. В то же время вариабельность не является равномерно распределенной по вариабельным доменам антител. Она сосредоточена в трех сегментах вариабельных доменов как легкой, так и тяжелой цепи, называемых гипервариабельными областями. Более консервативные фрагменты вариабельных доменов называются каркасными областями (FR). Вариабельные домены нативных легких и тяжелых цепей содержат по четыре FR, преимущественно принимающих конфигурацию Р-листа и соединенных тремя гипервариабельными областями, образующими петли, соединяющие структуры Р-типа, а в некоторых случаях, являющиеся их частью. Гипервариабельные области каждой цепи объединены друг с другом в непосредственной близости при помощи FR и, вместе с гипервариабельными областями другой цепи, участвуют в образовании антигенсвязывающего сайта антител (см. Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD (1991)). Константные домены не принимают непосредственного участия в связывании антитела с антигеном, однако проявляют различные эффекторные функции, например, участие антитела в антителозависимой клеточно-опосредованной цитотоксичности (АЗКЦ).The term variable, as used herein in connection with antibodies, refers to the fact that the sequences of certain portions of the variable domains of an antibody vary widely between antibodies and contribute to the binding and specificity of each particular antibody for its particular antigen. At the same time, variability is not evenly distributed across the variable domains of antibodies. It is concentrated in three segments of variable domains of both the light and heavy chains, called hypervariable regions. The more conserved portions of the variable domains are called framework regions (FR). The variable domains of the native light and heavy chains each contain four FRs, predominantly adopting a P-sheet configuration and connected by three hypervariable regions that form loops connecting P-type structures, and in some cases, being part of them. The hypervariable regions of each chain are linked to each other in close proximity by FR and, together with the hypervariable regions of the other chain, participate in the formation of the antigen-binding site of antibodies (see Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service , National Institutes of Health, Bethesda, MD (1991)). Constant domains are not directly involved in the binding of antibodies to antigens, but exhibit various effector functions, for example, the participation of antibodies in antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity (ADCC).
Термин гипервариабельная область при применении в данном документе, относится к аминокислотным остаткам антитела, которые отвечают за связывание антигена. Гипервариабельная область, как правило, содержит аминокислотные остатки из определяющей комплементарность области или CDR (например, остатки 31-35 (H1), 50-65 (Н2) и 95-102 (Н3) в вариабельном домене тяжелой цепи; Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD. (1991)) и/или остатки из остатков гипервариабельной петли 26-32 (H1), 53-55 (Н2) и 96-101 (Н3) в вариабельном домене тяжелой цепи; Chothia and Lesk J. Mol. Biol. 196:901-917 (1987)). В некоторых вариантах осуществления CDR означает определяющую комплементарность область антитела, как определено в Lefranc, MP et al., IMGT, the international ImMunoGeneTics database, Nucleic Acids Res., 27:209-212 (1999). Остатки каркасной области или FR представляют собой остатки вариабельного домена, отличные от остатков гипервариабельной области/CDR, как определено в данном документе.The term hypervariable region as used herein refers to the amino acid residues of an antibody that are responsible for antigen binding. The hypervariable region typically contains amino acid residues from the complementarity determining region or CDR (for example, residues 31-35 (H1), 50-65 (H2) and 95-102 (H3) in the heavy chain variable domain; Kabat et al., Sequences of Proteins of Immunological Interest, 5th Ed. Public Health Service, National Institutes of Health, Bethesda, MD. (1991)) and/or residues from hypervariable loop residues 26-32 (H1), 53-55 (H2) and 96 -101 (H3) in the heavy chain variable domain; Chothia and Lesk J. Mol. Biol. 196:901-917 (1987)). In some embodiments, CDR means the complementarity determining region of an antibody, as defined in Lefranc, MP et al., IMGT, the international ImMunoGeneTics database, Nucleic Acids Res., 27:209-212 (1999). Framework region residues or FRs are variable domain residues other than hypervariable region/CDR residues as defined herein.
Примерные обозначения CDR показаны в данном документе, однако специалист в данной области техники поймет, что обычно используется ряд определений CDR, включая определение Kabat (см. Zhao et al. A germline knowledge based computational approach for determining antibody complementarity determining regions. Mol Immunol. 2010; 47:694-700), которое основано на изменчивости последовательности и является наиболее часто используемым. Определение Chothia основано на расположении областей структурных петель (Chothia et al. Conformations of immunoglobulin hypervariable regions. Nature. 1989; 342:877-883). Представляющие интерес альтернативные определения CDR включают, без ограничения, те, которые раскрыты Honegger, Yet another numbering scheme for immunoglobulin variable domains: an automatic modeling and analysis tool. J Mol Biol. 2001;309:657-670; Ofran et al. Automated identification of complementarity determining regions (CDRs) reveals peculiar characteristics of CDRs and B-cell epitopes. J Immunol. 2008; 181:6230-6235; Almagro Identification of differences in the specificity-determining residues of antibodies that recognize antigens of different size: implications for the rational design of antibody repertoires. J Mol Recognit. 2004; 17:132-143; и Padlanet al. Identification of specificity-determining residues in antibodies. Faseb J. 1995; 9:133-139, содержание каждого из которых включено в данный документ в полном объеме посредством ссылки.Exemplary CDR designations are shown herein, however, one skilled in the art will appreciate that a number of CDR definitions are commonly used, including the Kabat definition (see Zhao et al. A germline knowledge based computational approach for determining antibody complementarity determining regions. Mol Immunol. 2010 ; 47:694-700), which is based on sequence variability and is the most commonly used. The definition of Chothia is based on the location of the structural loop regions (Chothia et al. Conformations of immunoglobulin hypervariable regions. Nature. 1989; 342:877-883). Alternative CDR definitions of interest include, but are not limited to, those disclosed by Honegger, Yet another numbering scheme for immunoglobulin variable domains: an automatic modeling and analysis tool. J Mol Biol. 2001;309:657-670; Ofran et al. Automated identification of complementarity determining regions (CDRs) reveals peculiar characteristics of CDRs and B-cell epitopes. J Immunol. 2008; 181:6230-6235; Almagro Identification of differences in the specificity-determining residues of antibodies that recognize antigens of different size: implications for the rational design of antibody repertoires. J Mol Recognit. 2004; 17:132-143; and Padlanet al. Identification of specificity-determining residues in antibodies. Faseb J. 1995; 9:133-139, the contents of each of which are incorporated herein in their entirety by reference.
Термины антитело, содержащее только тяжелые цепи и антитело, состоящее из тяжелых цепей используются в данном документе взаимозаменяемо и относятся в самом широком смысле к антителам или одной или более частям антитела, например, одному или более плечам антитела, в которых отсутствует легкая цепь обычного антитела. Термины, в частности, включают, без ограничения, гомодимерные антитела, содержащие антигенсвязывающий домен VH и константные домены СН2 и СН3, в отсутствие домена СН1; функциональные (антигенсвязывающие) варианты таких антител, растворимые варианты VH, Ig-NAR, содержащие гомодимер одного вариабельного домена (V-NAR) и пяти С-подобных константных доменов (C-NAR), и их функциональные фрагменты; и растворимые однодоменные антитела (sUniDab™). В одном варианте осуществления антитело, содержащее только тяжелые цепи, состоит из антигенсвязывающего домена вариабельной области, состоящего из каркаса 1, CDR1, каркаса 2, CDR2, каркаса 3, CDR3 и каркаса 4. В другом варианте осуществления антитело, содержащее только тяжелыеThe terms heavy chain-only antibody and heavy chain antibody are used interchangeably herein and refer in the broadest sense to antibodies or one or more portions of an antibody, such as one or more arms of an antibody, that lack the light chain of a conventional antibody. The terms include, but are not limited to, homodimeric antibodies containing a VH antigen binding domain and CH2 and CH3 constant domains, in the absence of a CH1 domain; functional (antigen-binding) variants of such antibodies, soluble variants of VH, Ig-NAR containing a homodimer of one variable domain (V-NAR) and five C-like constant domains (C-NAR), and their functional fragments; and soluble single domain antibodies (sUniDab™). In one embodiment, the heavy chain only antibody consists of a variable region antigen binding domain consisting of framework 1, CDR1, framework 2, CDR2, framework 3, CDR3, and framework 4. In another embodiment, the heavy chain only antibody
- 8 046268 цепи, состоит из антигенсвязывающего домена, по меньшей мере части шарнирной области и доменов СН2, и СН3. В еще одном варианте осуществления антитело, содержащее только тяжелые цепи, состоит из антигенсвязывающего домена по меньшей мере части шарнирной области и домена СН2. В дополнительном варианте осуществления антитело, содержащее только тяжелые цепи, состоит из антигенсвязывающего домена, по меньшей мере части шарнирной области и домена СН3. Антитела, содержащие только тяжелые цепи, у которых домен СН2 и/или СН3 укорочен, также включены в данный документ. В другом варианте осуществления тяжелая цепь состоит из антигенсвязывающего домена и по меньшей мере одного домена СН (CH1, СН2, СН3 или СН4), но без шарнирной области. Антитело, содержащее только тяжелые цепи, может быть в форме димера, в котором две тяжелые цепи дисульфидно связаны друг с другом, ковалентно или нековалентно связаны друг с другом. Антитело, содержащее только тяжелые цепи, может принадлежать к подклассу IgG, но также в данном документе включены антитела, относящиеся к другим подклассам, таким как подкласс IgM, IgA, IgD и IgE. В конкретном варианте осуществления антитело, содержащее только тяжелые цепи, имеет подтип IgG1, IgG2, IgG3 или IgG4, в частности подтип IgG1. В одном варианте осуществления антитела, содержащие только тяжелые цепи, в данном документе используются в качестве связывающего (нацеливающего) домена химерного антигенного рецептора (CAR). Определение, в частности, включает антитела человека, содержащие только тяжелые цепи, называемые UniAb™, продуцируемые трансгенными крысами с иммуноглобулином человека (UniRat™). Вариабельные области (VH) UniAb™ называют UniDab™, и являются универсальными строительными блоками, которые могут быть связаны с областями Fc или сывороточным альбумином для разработки новых терапевтических средств с полиспецифичностью, повышенной эффективностью и увеличенным периодом полужизни. Поскольку гомодимерные UniAb™ лишены легкой цепи и, следовательно, домена VL, антиген распознается одним единственным доменом, то есть вариабельным доменом тяжелой цепи антитела, содержащего только тяжелые цепи, (VH или VHH).- 8 046268 chain, consists of an antigen binding domain, at least part of the hinge region and the CH2 and CH3 domains. In yet another embodiment, the heavy chain-only antibody consists of an antigen binding domain of at least a portion of a hinge region and a CH2 domain. In a further embodiment, the heavy chain-only antibody consists of an antigen binding domain, at least a portion of a hinge region, and a CH3 domain. Antibodies containing only heavy chains in which the CH2 and/or CH3 domain is truncated are also included herein. In another embodiment, the heavy chain consists of an antigen binding domain and at least one CH domain (CH1, CH2, CH3 or CH4), but without a hinge region. The heavy chain-only antibody may be in the form of a dimer in which the two heavy chains are disulfide-linked to each other, covalently linked, or non-covalently linked to each other. An antibody containing only heavy chains may belong to the IgG subclass, but antibodies belonging to other subclasses such as the IgM, IgA, IgD and IgE subclass are also included herein. In a specific embodiment, the heavy chain-only antibody is of the IgG1, IgG2, IgG3, or IgG4 subtype, particularly the IgG1 subtype. In one embodiment, heavy chain-only antibodies are used herein as the binding (targeting) domain of a chimeric antigen receptor (CAR). The definition specifically includes heavy chain-only human antibodies called UniAb™ produced by human immunoglobulin transgenic rats (UniRat™). The variable regions (VH) of UniAb™ are called UniDab™, and are versatile building blocks that can be coupled to Fc regions or serum albumin to develop new therapeutics with polyspecificity, increased potency and extended half-life. Because homodimeric UniAbs lack a light chain and therefore a VL domain, the antigen is recognized by a single domain, that is, the heavy chain variable domain of a heavy chain-only antibody (VH or VHH).
Используемый в данном документе термин интактная цепь антитела представляет собой цепь, содержащую полноразмерную вариабельную область и полноразмерную константную область (Fc). Интактное стандартное антитело содержит интактную легкую цепь и интактную тяжелую цепь, а также константный домен легкой цепи (CL) и константные домены тяжелой цепи, СН1, шарнир, СН2 и СН3 для секретируемого IgG. Другие изотипы, такие как IgM или IgA, могут иметь разные домены СН. Константные домены могут представлять собой константные домены нативной последовательности (например, константные домены человеческой нативной последовательности) или их варианты аминокислотной последовательности. Интактное антитело может иметь одну или более эффекторных функций, которые относятся к той биологической активности, которая присуща константной области Fc (области Fc с нативной последовательностью или области Fc с вариантной аминокислотной последовательностью) антитела. Примеры эффекторных функций антитела включают связывание C1q; комплементзависимую цитотоксичность; связывание с Fc-рецептором; антителозависимую клеточно-опосредованная цитотоксичность (АЗКЦ); фагоцитоз; и снижение количества рецепторов клеточной поверхности. Варианты константной области включают те, которые изменяют эффекторный профиль, связывание с Fc-рецепторами и т.п.As used herein, the term intact antibody chain is a chain comprising a full-length variable region and a full-length constant region (Fc). The intact standard antibody contains an intact light chain and an intact heavy chain, as well as a light chain constant domain (CL) and heavy chain constant domains, CH1, hinge, CH2 and CH3 for secreted IgG. Other isotypes, such as IgM or IgA, may have different CH domains. The constant domains may be native sequence constant domains (eg, human native sequence constant domains) or amino acid sequence variants thereof. An intact antibody may have one or more effector functions that relate to those biological activities that are inherent in the constant Fc region (native sequence Fc region or variant amino acid sequence Fc region) of the antibody. Examples of antibody effector functions include C1q binding; complement-dependent cytotoxicity; Fc receptor binding; antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity (ADCC); phagocytosis; and a decrease in the number of cell surface receptors. Constant region variants include those that alter the effector profile, Fc receptor binding, and the like.
В зависимости от аминокислотной последовательности Fc (константного домена) их тяжелых цепей, антитела и различные антигенсвязывающие белки могут быть определены в разные классы. Существует пять основных классов областей Fc тяжелой цепи: IgA, IgD, IgE, IgG и IgM, и некоторые из них могут быть дополнительно разделены на подклассы (изотипы), например, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA, и IgA2. Константные домены Fc, которые соответствуют различным классам антител, могут обозначаться как а, δ, ε, γ и μ, соответственно. Структуры субъединиц и трехмерные конфигурации различных классов иммуноглобулинов хорошо известны. Формы Ig включают шарнирные модификации или бесшарнирные формы (Roux et al (1998) J. Immunol. 161:4083-4090; Lund et al (2000) Eur. J. Biochem. 267:7246-7256; US 2005/0048572; US 2004/0229310). Легкие цепи антител от любых вида позвоночных можно отнести к одному из двух типов, называемых к (каппа) и λ (лямбда), на основании аминокислотных последовательностей их константных доменов. Антитела в соответствии с вариантами осуществления изобретения могут содержать последовательности легкой каппа-цепи или последовательности легкой лямбда-цепи.Depending on the amino acid sequence of the Fc (constant domain) of their heavy chains, antibodies and various antigen-binding proteins can be classified into different classes. There are five main classes of heavy chain Fc regions: IgA, IgD, IgE, IgG, and IgM, and some of these can be further divided into subclasses (isotypes), such as IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA, and IgA2. Fc constant domains, which correspond to different classes of antibodies, can be designated as a, δ, ε, γ and μ, respectively. The subunit structures and three-dimensional configurations of the various classes of immunoglobulins are well known. Ig forms include hinged modifications or hingeless forms (Roux et al (1998) J. Immunol. 161:4083-4090; Lund et al (2000) Eur. J. Biochem. 267:7246-7256; US 2005/0048572; US 2004 /0229310). Antibody light chains from any vertebrate species can be classified into one of two types, called k (kappa) and λ (lambda), based on the amino acid sequences of their constant domains. Antibodies in accordance with embodiments of the invention may contain kappa light chain sequences or lambda light chain sequences.
Функциональная область Fc обладает эффекторной функцией области Fc с нативной последовательностью. Неограничивающие примеры эффекторных функций включают связывание C1q; КЗЦ; связывание с Fc-рецептором; АЗКЦ; АЗКФ; снижение количества рецепторов на поверхности клетки (например, В-клеточного рецептора) и т.д. Такие эффекторные функции, как правило, требуют, чтобы область Fc взаимодействовала с рецептором, например, рецепторами FcyRI; FcyRIIA; FcyRIIBI; FcyRIIB2; FcyRIIIA; FcyRIIIB, и рецептором FcRn с низкой аффинностью; и могут быть оценены с помощью различных анализов, известных в данной области техники. Мертвый или подвергнутый сайленсингу Fc представляет собой Fc, который был мутирован для сохранения активности в отношении, например, продления периода полужизни в сыворотке, но который не активирует высокоаффинный Fc-рецептор или который имеет сниженную аффинность к Fc-рецептору.The functional Fc region has the effector function of the native sequence Fc region. Non-limiting examples of effector functions include C1q binding; KZTs; Fc receptor binding; AZKTS; AZKF; reduction in the number of receptors on the cell surface (for example, B-cell receptor), etc. Such effector functions typically require the Fc region to interact with a receptor, such as FcyRI receptors; FcyRIIA; FcyRIIBI; FcyRIIB2; FcyRIIIA; FcyRIIIB, and the low affinity receptor FcRn; and can be assessed using various assays known in the art. A dead or silenced Fc is an Fc that has been mutated to retain activity for, for example, prolonging serum half-life, but that does not activate the high affinity Fc receptor or that has reduced affinity for the Fc receptor.
Область Fc с нативной последовательностью содержит аминокислотную последовательность,The native sequence Fc region contains the amino acid sequence
- 9 046268 идентичную аминокислотной последовательности области Fc, встречающейся в природе. Человеческие области Fc с нативной последовательностью включают, например, область Fc человеческого IgG1 с нативной последовательностью (не-А- и А-аллотипы); область Fc человеческого IgG2 с нативной последовательностью; область Fc человеческого IgG3 с нативной последовательностью; и область Fc человеческого IgG4 с нативной последовательностью, а также их природные варианты.- 9 046268 identical to the amino acid sequence of the Fc region found in nature. Human native sequence Fc regions include, for example, the native sequence human IgG1 Fc region (non-A and A allotypes); native sequence human IgG2 Fc region; native sequence human IgG3 Fc region; and the native sequence human IgG4 Fc region, as well as naturally occurring variants thereof.
Вариант области Fc содержит аминокислотную последовательность, которая отличается от последовательности области Fc с нативной последовательностью в силу по меньшей мере одной модификации аминокислоты, предпочтительно одной или более аминокислотных замен. Предпочтительно вариант области Fc имеет по меньшей мере одну аминокислотную замену по сравнению с областью Fc с нативной последовательностью или с областью Fc исходного полипептида, например, от около одной до около десяти аминокислотных замен, и предпочтительно от около одной до около пяти аминокислотных замен в области Fc с нативной последовательностью или в области Fc исходного полипептида. Вариант области Fc в данном документе предпочтительно будет обладать по меньшей мере около 80% гомологией с областью Fc с нативной последовательностью и/или с областью Fc исходного полипептида, и наиболее предпочтительно по меньшей мере около 90% гомологии с ними, более предпочтительно по меньшей мере около 95 % гомологии с ним.The variant Fc region contains an amino acid sequence that differs from the native sequence Fc region sequence due to at least one amino acid modification, preferably one or more amino acid substitutions. Preferably, the variant Fc region has at least one amino acid substitution relative to the native sequence Fc region or the Fc region of the parent polypeptide, for example, from about one to about ten amino acid substitutions, and preferably from about one to about five amino acid substitutions in the Fc region with the native sequence or in the Fc region of the original polypeptide. The variant Fc region herein will preferably have at least about 80% homology to the native sequence Fc region and/or the Fc region of the parent polypeptide, and most preferably at least about 90% homology thereto, more preferably at least about 95% homology with it.
Варианты последовательностей Fc могут содержать три аминокислотные замены в области СН2 для снижения связывания FcyRI в положениях 234, 235, и 237 согласно индексу EU (см. Duncan et al., (1988) Nature 332:563). Две аминокислотные замены в сайте связывания комплемента C1q в положениях 330 и 331 согласно индексу EU снижают фиксацию комплемента (см. Tao et al., J. Exp. Med. 178:661 (1993) и Canfield and Morrison, J. Exp. Med. 173:1483 (1991)). Замена на остатки человеческого IgG1 или IgG2 в положениях 233-236 и остатки IgG4 в положениях 327, 330 и 331 значительно снижает АЗКЦ и КЗЦ (см., например, Armour K.L. et al., 1999 Eur J Immunol. 29(8):2613-24; и Shields R.L. et al., 2001. J Biol Chem. 276(9):6591-604). Аминокислотная последовательность Fc IgG4 человека (UniProtKB № P01861) представлена в данном документе как SEQ ID NO: 76. Подвергнутый сайленсингу IgG1 описан, например, в Boesch, A.W., et al., Highly parallel characterization of IgG Fc binding interactions. MAbs, 2014. 6(4): p. 915-27, описание которого полностью включено в данный документ посредством ссылки.Fc sequence variants may contain three amino acid substitutions in the CH2 region to reduce FcyRI binding at positions 234, 235, and 237 according to the EU index (see Duncan et al., (1988) Nature 332:563). Two amino acid substitutions in the C1q complement fixation site at EU index positions 330 and 331 reduce complement fixation (see Tao et al., J. Exp. Med. 178:661 (1993) and Canfield and Morrison, J. Exp. Med. 173:1483 (1991)). Substitution with human IgG1 or IgG2 residues at positions 233-236 and IgG4 residues at positions 327, 330 and 331 significantly reduces ADCC and CCZ (see, for example, Armor K.L. et al., 1999 Eur J Immunol. 29(8):2613 -24; and Shields R.L. et al., 2001. J Biol Chem. 276(9):6591-604). The amino acid sequence of human IgG4 Fc (UniProtKB No. P01861) is provided herein as SEQ ID NO: 76. Silenced IgG1 is described, for example, in Boesch, A.W., et al., Highly parallel characterization of IgG Fc binding interactions. MAbs, 2014. 6(4): p. 915-27, the description of which is incorporated herein by reference in its entirety.
Возможны и другие варианты Fc, включая, без ограничения, вариант, в котором удалена область, способная образовывать дисульфидную связь, или в котором удалены определенные аминокислотные остатки на N-конце нативного Fc, или остаток метионина добавлен к нему. Таким образом, в некоторых вариантах осуществления одна или более Fc-частей антитела могут содержать одну или более мутаций в шарнирной области для устранения дисульфидной связи. В еще одном варианте осуществления шарнирная область Fc может быть удалена полностью. В еще одном варианте осуществления антитело может содержать вариант Fc.Other Fc variants are possible, including, but not limited to, one in which the region capable of forming a disulfide bond is deleted, or in which certain amino acid residues at the N-terminus of the native Fc are deleted, or a methionine residue is added thereto. Thus, in some embodiments, one or more Fc portions of an antibody may contain one or more mutations in the hinge region to eliminate a disulfide bond. In yet another embodiment, the hinge region Fc may be removed completely. In yet another embodiment, the antibody may contain an Fc variant.
Кроме того, вариант Fc может быть сконструирован для удаления или существенного снижения эффекторных функций путем замены (мутации), удаления или добавления аминокислотных остатков для осуществления связывания комплемента или связывания Fc-рецептора. Например, без ограничения, делеция может происходить в сайте связывания комплемента, таком как сайт связывания C1q. Способы получения таких производных последовательностей Fc-фрагмента иммуноглобулина описаны в международных патентных публикациях №№ WO 97/34631 и WO 96/32478. Кроме того, Fc-домен может быть модифицирован фосфорилированием, сульфированием, ацилированием, гликозилированием, метилированием, фарнезилированием, ацетилированием, амидированием и т.п.In addition, the Fc variant can be engineered to remove or substantially reduce effector functions by substituting, deleting, or adding amino acid residues to effect complement fixation or Fc receptor binding. For example, without limitation, the deletion may occur at a complement binding site such as the C1q binding site. Methods for obtaining such derivative immunoglobulin Fc sequences are described in international patent publications Nos. WO 97/34631 and WO 96/32478. In addition, the Fc domain can be modified by phosphorylation, sulfonation, acylation, glycosylation, methylation, farnesylation, acetylation, amidation, and the like.
В некоторых вариантах осуществления антитело содержит вариантную последовательность домена СН3 IgG4 человека, содержащую мутацию T366W, которая необязательно может называться в данном документе последовательностью выступа СН3 IgG4. В некоторых вариантах осуществления антитело содержит вариантную последовательность домена СН3 IgG4 человека, содержащую мутацию T366S, мутацию L368A и мутацию Y407V, которая необязательно может называться в данном документе последовательностью впадины СН3 IgG4. Описанные в данном документе мутации IgG4 СН3 можно использовать любым подходящим способом, чтобы поместить выступ в константную область первой тяжелой цепи первого мономера в димере антитела и впадину в константной области второй тяжелой цепи второго мономера в димере антитела, способствуя тем самым правильному спариванию (гетеродимеризации) желаемой пары полипептидных субъединиц тяжелой цепи в антителе.In some embodiments, the antibody comprises a variant human IgG4 CH3 domain sequence containing the T366W mutation, which may optionally be referred to herein as an IgG4 CH3 overhang sequence. In some embodiments, the antibody comprises a variant human IgG4 CH3 domain sequence comprising a T366S mutation, an L368A mutation, and a Y407V mutation, which may optionally be referred to herein as an IgG4 CH3 domain sequence. The IgG4 CH3 mutations described herein can be used in any suitable manner to place a knob in the first heavy chain constant region of a first monomer in an antibody dimer and a trough in the second heavy chain constant region of a second monomer in an antibody dimer, thereby promoting proper pairing (heterodimerization) of the desired pairs of heavy chain polypeptide subunits in an antibody.
В некоторых вариантах осуществления антитело содержит полипептидную субъединицу тяжелой цепи, содержащую вариантную область Fc IgG4 человека, содержащую мутацию S228P, мутацию F234A, мутацию L235A и мутацию T366W (выступ). В некоторых вариантах осуществления антитело содержит полипептидную субъединицу тяжелой цепи, содержащую вариантную область Fc IgG4 человека, содержащую мутацию S228P, мутацию F234A, мутацию L235A, мутацию T366S, мутацию L368A и мутацию Y407V (впадина).In some embodiments, the antibody comprises a heavy chain polypeptide subunit comprising a human IgG4 variant Fc region containing the S228P mutation, the F234A mutation, the L235A mutation, and the T366W (overhang) mutation. In some embodiments, the antibody comprises a heavy chain polypeptide subunit comprising a variant human IgG4 Fc region comprising the S228P mutation, the F234A mutation, the L235A mutation, the T366S mutation, the L368A mutation, and the Y407V (hollow) mutation.
Термин антитело, содержащее область Fc относится к антителу, которое содержит область Fc. Сконцевой лизин (остаток 447 в соответствии с системой нумерации EU) области Fc может быть удален, например, во время очистки антитела или путем конструирования рекомбинантной нуклеиновой кислоты, кодирующей антитело.The term antibody containing an Fc region refers to an antibody that contains an Fc region. The terminal lysine (residue 447 according to the EU numbering system) of the Fc region can be removed, for example, during antibody purification or by constructing a recombinant nucleic acid encoding the antibody.
Соответственно, антитело, имеющее область Fc согласно данному изобретению, может включатьAccordingly, an antibody having an Fc region according to this invention may include
- 10 046268 антитело с или без K447.- 10 046268 antibody with or without K447.
Аспекты изобретения включают антитела, содержащие вариабельную область только тяжелой цепи, в одновалентной или двухвалентной конфигурации. Используемый в данном документе термин одновалентная конфигурация, используемый в отношении домена вариабельной области только тяжелой цепи, означает, что присутствует только один домен вариабельной области только тяжелой цепи, имеющий единственный сайт связывания (см. фиг. 5, панель А, правое плечо антитела). Напротив, термин двухвалентная конфигурация, используемый в отношении домена вариабельной области только тяжелой цепи, означает, что присутствуют два домена вариабельной области только тяжелой цепи (каждый из которых имеет один сайт связывания) и соединены линкерной последовательностью (см. фиг. 5, панели В и С, правые плечи антител). Неограничивающие примеры линкерных последовательностей дополнительно обсуждаются в данном документе и включают, без ограничения, последовательности GS-линкеров различной длины. Когда вариабельная область только тяжелой цепи имеет двухвалентную конфигурацию, каждый из двух доменов вариабельной области только тяжелой цепи может иметь аффинность связывания с одним и тем же антигеном или с разными антигенами (например, с разными эпитопами на одном и том же белке; с двумя разными белками и т.д.). Однако, если специально не указано иное, вариабельная область только тяжелой цепи, обозначенная как находящаяся в двухвалентной конфигурации, как предполагается, содержит два идентичных домена вариабельной области только тяжелой цепи, соединенные линкерной последовательностью, при этом каждая из двух идентичных доменов вариабельных областей только тяжелой цепи, обладают аффинностью связывания с одним и тем же целевым антиге ном.Aspects of the invention include antibodies containing only the heavy chain variable region, in a monovalent or divalent configuration. As used herein, the term monovalent configuration when used in relation to a heavy chain only variable region domain means that there is only one heavy chain only variable region domain having a single binding site (see FIG. 5, panel A, right arm of the antibody). In contrast, the term bivalent configuration as used in relation to a heavy chain only variable region domain means that two heavy chain only variable region domains are present (each having a single binding site) and are connected by a linker sequence (see FIG. 5, panels B and C, right arms of antibodies). Non-limiting examples of linker sequences are further discussed herein and include, without limitation, GS linker sequences of various lengths. When the heavy chain only variable region has a bivalent configuration, each of the two heavy chain variable region domains may have binding affinity for the same antigen or for different antigens (e.g., different epitopes on the same protein; two different proteins etc.). However, unless specifically stated otherwise, a heavy chain only variable region designated as being in a divalent configuration is intended to comprise two identical heavy chain only variable region domains connected by a linker sequence, each of the two identical heavy chain only variable region domains , have binding affinity to the same target antigen.
Аспекты изобретения включают антитела, имеющие полиспецифические конфигурации, которые включают, без ограничения, биспецифические, триспецифические и т.д. Большое разнообразие способов и конфигураций белков известно и используется для получения биспецифических моноклональных антител (бсмкАт), триспецифических антител, и т.п.Aspects of the invention include antibodies having multispecific configurations, which include, but are not limited to, bispecific, trispecific, etc. A wide variety of methods and protein configurations are known and used to produce bispecific monoclonal antibodies (bsmAbs), trispecific antibodies, and the like.
Были разработаны различные способы получения поливалентных искусственных антител путем рекомбинантного слияния вариабельных доменов двух или более антител. В некоторых вариантах осуществления первый и второй антигенсвязывающий домен на полипептиде соединены полипептидным линкером. Одним неограничивающим примером такого полипептидного линкера является GS-линкер, имеющий аминокислотную последовательность из четырех остатков глицина, за которыми следует один остаток серина, и в котором последовательность повторяется п раз, где п представляет собой целое число от 1 до около 10, например, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, или 9 (SEQ ID NO: 94). Неограничивающие примеры таких линкеров включают GGGGS (SEQ ID NO: 73) (n=1) и GGGGSGGGGS (SEQ ID NO: 74 (n=2). Также можно использовать другие подходящие линкеры, которые описаны, например, в Chen et al., Adv Drug Deliv Rev. 2013 October 15; 65 (10): 1357-69, описание которого полностью включено в данный документ по средством ссылки.Various methods have been developed for producing multivalent artificial antibodies by recombinantly fusing the variable domains of two or more antibodies. In some embodiments, the first and second antigen binding domains on the polypeptide are connected by a polypeptide linker. One non-limiting example of such a polypeptide linker is a GS linker having an amino acid sequence of four glycine residues followed by one serine residue, and in which the sequence is repeated n times, where n is an integer from 1 to about 10, for example, 2. 3, 4, 5, 6, 7, 8, or 9 (SEQ ID NO: 94). Non-limiting examples of such linkers include GGGGS (SEQ ID NO: 73) (n=1) and GGGGSGGGGS (SEQ ID NO: 74 (n=2). Other suitable linkers can also be used, as described, for example, in Chen et al. Adv Drug Deliv Rev. 2013 October 15;65(10):1357-69, the disclosure of which is incorporated herein by reference in its entirety.
Термин трехцепочечная антителоподобная молекула или ТСА используется в данном документе для обозначения антителоподобных молекул, включающих, состоящих по существу или состоящих из трех полипептидных субъединиц, две из которых содержат, состоят по существу из или состоят из одной тяжелой и одной легкой цепи моноклонального антитела, или функциональных антигенсвязывающих фрагментов таких цепей антитела, содержащих антигенсвязывающую область и по меньшей мере один домен СН. Данная пара тяжелая цепь / легкая цепь обладает специфичностью связывания в отношении первого антигена. Третья полипептидная субъединица включает, состоит по существу из или состоит из антитела, содержащего только тяжелые цепи, содержащего Fc-часть, содержащую домены СН2 и/или СН3, и/или СН4, в отсутствие домена СН1, и один или более антигенсвязывающих доменов (например, два антигенсвязывающих домена), который связывает эпитоп второго антигена или другой эпитоп пер вого антигена, причем такой связывающий домен получен из или имеет идентичность последовательности с вариабельной областью тяжелой или легкой цепи антитела. Части такой вариабельной области могут кодироваться сегментами гена VH и/или VL, сегментами гена D и JH, или сегментами гена JL. Вариабельная область может кодироваться реаранжированными генными сегментами VHDJH, VLDJH, VHJL илиThe term triple-chain antibody-like molecule or TCA is used herein to refer to antibody-like molecules comprising, consisting essentially of, or consisting of three polypeptide subunits, two of which contain, consist essentially of, or consist of one heavy and one light chain of a monoclonal antibody, or functional antigen-binding fragments of such antibody chains containing an antigen-binding region and at least one CH domain. This heavy chain/light chain pair has binding specificity for the first antigen. The third polypeptide subunit includes, consists essentially of, or consists of a heavy chain-only antibody containing an Fc portion containing CH2 and/or CH3 and/or CH4 domains, in the absence of a CH1 domain, and one or more antigen binding domains (eg , two antigen-binding domains) that binds an epitope of a second antigen or another epitope of a first antigen, wherein such binding domain is derived from or has sequence identity with a heavy or light chain variable region of an antibody. Portions of such a variable region may be encoded by VH and/or VL gene segments, D and JH gene segments, or JL gene segments. The variable region may be encoded by rearranged gene segments V H DJ H , V L DJ H , V H J L or
VLJL.VLJL.
В соединении, связывающем ТСА, используется антитело, содержащее только тяжелые цепи, или антитело, состоящее из тяжелых цепей, или полипептид, содержащий только тяжелые цепи, которые, как используется в данном документе, означают одноцепочечное антитело, содержащее константные области тяжелой цепи СН2 и/или СН3, и/или СН4, но без домена СН1. В одном варианте осуществления антитело, содержащее только тяжелые цепи, состоит из антигенсвязывающего домена, по меньшей мере части шарнирной области и доменов СН2, и СН3. В другом варианте осуществления антитело, содержащее только тяжелые цепи, состоит из антигенсвязывающего домена, по меньшей мере части шарнирной области и домена СН2. В дополнительном варианте осуществления антитело, содержащее только тяжелые цепи, состоит из антигенсвязывающего домена, по меньшей мере части шарнирной области и домена СН3.The TCA binding compound uses a heavy chain only antibody or a heavy chain only antibody or a heavy chain only polypeptide, which as used herein means a single chain antibody containing the heavy chain constant regions CH2 and/ or CH3 and/or CH4, but without the CH1 domain. In one embodiment, the heavy chain-only antibody consists of an antigen binding domain, at least a portion of a hinge region, and CH2 and CH3 domains. In another embodiment, the heavy chain-only antibody consists of an antigen binding domain, at least a portion of a hinge region, and a CH2 domain. In a further embodiment, the heavy chain-only antibody consists of an antigen binding domain, at least a portion of a hinge region, and a CH3 domain.
Антитела, содержащие только тяжелые цепи, у которых домен СН2 и/или СН3 укорочен, также включены в данный документ. В другом варианте осуществления тяжелая цепь состоит из антигенсвязывающего домена и по меньшей мере одного домена СН (СН1, СН2, СН3 или СН4), но без шарнирнойAntibodies containing only heavy chains in which the CH2 and/or CH3 domain is truncated are also included herein. In another embodiment, the heavy chain consists of an antigen binding domain and at least one CH domain (CH1, CH2, CH3 or CH4), but without a hinge
- 11 046268 области. Антитело, содержащее только тяжелые цепи, может быть в форме димера, в котором две тяжелые цепи связаны дисульфидной связью, другие в противном случае ковалентно или нековалентно связаны друг с другом, и может необязательно включать асимметричную поверхность взаимодействия между одним или более доменами СН, чтобы облегчить правильное спаривание между полипептидными цепями. Антитело из тяжелых цепей может принадлежать к подклассу IgG, но сюда также включены антитела, принадлежащие к другим подклассам, таким как подкласс IgM, IgA, IgD и IgE. В конкретном варианте осуществления антитело, содержащее только тяжелые цепи, относится к подтипу IgG1, IgG2, IgG3 или IgG4, в частности подтипу IgG1 или подтипу IgG4. Неограничивающие примеры соединения, связывающего ТСА, описаны, например, в WO2017/223111 и WO2018/052503, описания которых полностью включены в данный документ посредством ссылки.- 11 046268 region. The heavy chain-only antibody may be in the form of a dimer in which two heavy chains are linked by a disulfide bond, the others otherwise covalently or non-covalently linked to each other, and may optionally include an asymmetric interaction surface between one or more CH domains to facilitate correct pairing between polypeptide chains. The heavy chain antibody may belong to the IgG subclass, but antibodies belonging to other subclasses such as the IgM, IgA, IgD and IgE subclass are also included. In a specific embodiment, the heavy chain-only antibody is of the IgG1, IgG2, IgG3, or IgG4 subtype, particularly the IgG1 subtype or the IgG4 subtype. Non-limiting examples of a TCA binding compound are described, for example, in WO2017/223111 and WO2018/052503, the disclosures of which are incorporated herein by reference in their entirety.
Антитела, состоящий только из тяжелых цепей составляют около четверти антител IgG, продуцируемых животными семейства верблюдовых, например, верблюдами и ламами (Hamers-Casterman С., et al. Nature. 363, 446-448 (1993)). Эти антитела образованы двумя тяжелыми цепями, но лишены легких цепей. Как следствие, вариабельный участок связывания антигена называется доменом VHH, и он представляет собой наименьший естественный, интактный антигенсвязывающий сайт, имеющий длину всего около 120 аминокислот (Desmyter, A., et al. J. Biol. Chem. 276, 26285-26290 (2001)). Антитела, содержащие только тяжелые цепи, с высокой специфичностью и аффинностью могут создаваться против различных антигенов посредством иммунизации (van der Linden, R.H., et al. Biochim. Biophys. Acta. 1431, 37-46 (1999)), а часть VHH может быть легко клонирована и экспрессирована в дрожжах (Frenken, L.G.J., et al. J. Biotechnol. 78, 11-21 (2000)). Их уровни экспрессии, растворимости и стабильности значительно выше, чем у классических фрагментов F(ab) или Fv (Ghahroudi, M.A. et al. FEBS Lett. 414, 521-526 (1997)). Также было показано, что у акул есть один VH-подобный домен в своих антителах, называемый VNAR. (Nuttall et al. Eur. J. Biochem. 270, 3543-3554 (2003); Nuttall et al. Function and Bioinformatics 55, 187-197 (2004); Dooley et al., Molecular Immunology 40, 25-33 (2003)).Heavy chain-only antibodies account for about a quarter of the IgG antibodies produced by camelids, such as camels and llamas (Hamers-Casterman C., et al. Nature. 363, 446-448 (1993)). These antibodies are formed by two heavy chains but lack light chains. As a consequence, the variable antigen binding site is called the VHH domain, and it is the smallest natural, intact antigen binding site, being only about 120 amino acids in length (Desmyter, A., et al. J. Biol. Chem. 276, 26285-26290 (2001 )). Heavy chain-only antibodies with high specificity and affinity can be generated against various antigens by immunization (van der Linden, R.H., et al. Biochim. Biophys. Acta. 1431, 37-46 (1999)), and the VHH portion can be easily cloned and expressed in yeast (Frenken, L.G.J., et al. J. Biotechnol. 78, 11-21 (2000)). Their levels of expression, solubility and stability are significantly higher than those of the classical F(ab) or Fv fragments (Ghahroudi, M.A. et al. FEBS Lett. 414, 521-526 (1997)). Sharks have also been shown to have one VH-like domain in their antibodies, called VNAR. (Nuttall et al. Eur. J. Biochem. 270, 3543-3554 (2003); Nuttall et al. Function and Bioinformatics 55, 187-197 (2004); Dooley et al., Molecular Immunology 40, 25-33 (2003 )).
Используемый в данном документе термин ПСМА относится к трансмембранному белку типа II, который обладает активностью N-ацетилированной альфа-связанной кислой дипептидазы, фолатгидролазы и дипептидилпептидазы. Термин ПСМА включает белок ПСМА человека и любого отличного от человека вида животных и, в частности, включает ПСМА человека, а также ПСМА отличных от человека млекопитающих.As used herein, the term PSMA refers to a type II transmembrane protein that has N-acetylated alpha-linked acid dipeptidase, folate hydrolase and dipeptidyl peptidase activities. The term PSMA includes the PSMA protein of humans and any non-human animal species, and particularly includes human PSMA as well as non-human mammalian PSMA.
Используемый в данном документе термин ПСМА человека включает любые варианты, изоформы и видовые гомологи ПСМА человека (UniProt Q04609), независимо от его источника или способа получения. Таким образом, ПСМА человека включает ПСМА человека, естественно экспрессируемый клетками, и ПСМА, экспрессируемый на клетках, трансфицированных геном ПСМА человека.As used herein, the term human PSMA includes any variants, isoforms and species homologues of human PSMA (UniProt Q04609), regardless of its source or method of preparation. Thus, human PSMA includes human PSMA naturally expressed by cells and PSMA expressed on cells transfected with the human PSMA gene.
Термины антитело, содержащее только тяжелые цепи, к ПСМА, антитело, состоящее только из тяжелых цепей, к ПСМА, анти-ПСМА антитело, содержащее только тяжелые цепи и антитело к ПСМА, состоящее только из тяжелых цепей используются в данном документе взаимозаменяемо для обозначения антитела, содержащего только тяжелые цепи, как определено выше, для иммуноспецифического связывания с ПСМА, включая ПСМА человека, как определено выше. Определение включает, без ограничения, человеческие антитела, содержащие только тяжелые цепи, продуцируемые трансгенными животными, такими как трансгенные крысы или трансгенные мыши, экспрессирующие иммуноглобулин человека, включая UniRat™, продуцирующие человеческие антитела UniAb™ к ПСМА, как определено выше.The terms anti-PSMA heavy-chain-only antibody, anti-PSMA heavy-chain-only antibody, anti-PSMA heavy-chain-only antibody, and anti-PSMA heavy-chain-only antibody are used interchangeably herein to refer to an antibody that containing only heavy chains, as defined above, for immunospecific binding to PSMA, including human PSMA, as defined above. The definition includes, without limitation, human heavy chain-only antibodies produced by transgenic animals such as transgenic rats or transgenic mice expressing human immunoglobulin, including UniRat™ producing human anti-PSMA UniAb™ antibodies as defined above.
Процент (%) идентичности аминокислотных последовательностей относительно эталонной полипептидной последовательности определяется как процентная доля аминокислотных остатков в кандидатной последовательности, которые являются идентичными с аминокислотными остатками в эталонной полипептидной последовательности, после выравнивания последовательностей и внесения, в случае необходимости, гэпов для достижения максимальной идентичности последовательностей, но без учета каких-либо консервативных замен как части идентичности последовательностей. Выравнивание с целью определения процента идентичности аминокислотных последовательностей может осуществляться различными способами, которые известны специалистам в данной области техники, например, с использованием общедоступных компьютерных программ, таких как программные обеспечения BLAST, BLAST2, ALIGN или Megalign (DNASTAR). Специалисты в данной области техники могут определить соответствующие параметры для выравнивания последовательностей, включая любые алгоритмы, необходимые для достижения максимального выравнивания по всей длине сравниваемых последовательностей. Однако для целей данного изобретения значения % идентичности аминокислотных последовательностей генерируются с использованием компьютерной программы сравнения последовательностей ALIGN-2.Percentage (%) identity of amino acid sequences relative to a reference polypeptide sequence is defined as the percentage of amino acid residues in a candidate sequence that are identical to the amino acid residues in the reference polypeptide sequence, after sequence alignment and the introduction of gaps, if necessary, to achieve maximum sequence identity, but without considering any conservative substitutions as part of sequence identity. Alignment to determine percent amino acid sequence identity can be accomplished in a variety of ways known to those skilled in the art, for example, using publicly available computer programs such as BLAST, BLAST2, ALIGN, or Megalign (DNASTAR) software. Those skilled in the art can determine appropriate parameters for sequence alignment, including any algorithms necessary to achieve maximum alignment over the entire length of the sequences being compared. However, for the purposes of this invention, % amino acid sequence identity values are generated using the ALIGN-2 sequence comparison computer program.
Выделенным антителом является такое, которое было идентифицировано и отделено и/или извлечено из компонента его естественной среды. Загрязняющий компонент естественного окружения представляет собой вещества, которые влияют на диагностическое или терапевтическое применение антитела, и могут включать ферменты, гормоны и другие белковые или небелковые растворенные вещества. В предпочтительных вариантах осуществления антитело будет очищено (1) до более 95 мас.% антитела, как определено методом Лоури, и наиболее предпочтительно более 99 мас.%, (2) до степени, достаточAn isolated antibody is one that has been identified and separated and/or extracted from a component of its natural environment. Contaminants in the natural environment are substances that interfere with the diagnostic or therapeutic use of the antibody and may include enzymes, hormones, and other protein or non-protein solutes. In preferred embodiments, the antibody will be purified (1) to greater than 95 wt.% antibody, as determined by the Lowry method, and most preferably greater than 99 wt.%, (2) to a degree sufficient
- 12 046268 ной для получения по меньшей мере 15 остатков N-концевой или внутренней аминокислотной последовательности, используя секвенатор с вращающимся стаканом, или (3) до гомогенности путем ДСНПААГ-электрофореза в восстанавливающих или невосстанавливающих условиях с использованием красителя Кумасси синего или, предпочтительнее, красителя на основе серебра. Выделенное антитело включает антитело in situ в рекомбинантных клетках, поскольку по меньшей мере один компонент естественной среды антитела будет отсутствовать. Обычно, однако, выделенное антитело будет получено с помощью по меньшей мере одного этапа очистки.- 12 046268 to obtain at least 15 residues of the N-terminal or internal amino acid sequence using a spin-beaker sequencer, or (3) to homogeneity by DSNPAAG electrophoresis under reducing or non-reducing conditions using Coomassie blue dye or, preferably, dye based on silver. The isolated antibody includes the antibody in situ in the recombinant cells, since at least one component of the antibody's natural environment will be absent. Typically, however, the isolated antibody will be obtained through at least one purification step.
Антитела по изобретению включают полиспецифические антитела. Полиспецифические антитела имеют более чем одну специфичность связывания. Термин полиспецифический, в частности, включает биспецифический и триспецифический, а также аффинность независимого специфического связывания высшего порядка, такую как полиэпитопная специфичность высшего порядка, а также тетравалентные антитела и фрагменты антител. Термины полиспецифическое антитело, полиспецифическое антитело, содержащее только тяжелые цепи, полиспецифическое антитело, состоящее только из тяжелых цепей и полиспецифическое UniAb™ используются в данном документе в самом широком смысле и охватывают все антитела с более чем одной специфичностью связывания. Полиспецифические антитела, содержащие только тяжелые цепи, к ПСМА по настоящему изобретению, в частности, включают антитела, иммуноспецифически связывающиеся с двумя или более неперекрывающимися эпитопами на белке ПСМА, таком как ПСМА человека (т.е. двухвалентные и бипаратопные). Полиспецифические антитела, содержащие только тяжелые цепи, к ПСМА согласно настоящему изобретению также конкретно включают антитела, иммуноспецифически связывающиеся с эпитопом белка ПСМА, таким как ПСМА человека, и эпитопом другого белка, такого как, например, белок CD3, такой как CD3 человека (т.е. двухвалентные и бипаратопные). Полиспецифические антитела, содержащие только тяжелые цепи, к ПСМА по настоящему изобретению также конкретно включают антитела, иммуноспецифически связывающиеся с двумя или более неперекрывающимися или частично перекрывающимися эпитопами на белке ПСМА, таком как белок ПСМА человека, и с эпитопом на другом белке, таком как, например, белок CD3, такой как белок CD3 человека (т.е. трехвалентный и бипаратопный).Antibodies of the invention include multispecific antibodies. Polyspecific antibodies have more than one binding specificity. The term multispecific specifically includes bispecific and trispecific, as well as higher order independent specific binding affinity, such as higher order polyepitope specificity, as well as tetravalent antibodies and antibody fragments. The terms polyspecific antibody, polyspecific heavy chain antibody, polyspecific heavy chain only antibody, and polyspecific UniAb™ are used herein in the broadest sense to cover all antibodies with more than one binding specificity. Polyspecific heavy chain-only antibodies to PSMA of the present invention particularly include antibodies that immunospecifically bind to two or more non-overlapping epitopes on a PSMA protein, such as human PSMA (ie, bivalent and biparatopic). Polyspecific heavy chain-only antibodies to PSMA of the present invention also specifically include antibodies that immunospecifically bind to an epitope of a PSMA protein, such as human PSMA, and an epitope of another protein, such as, for example, a CD3 protein, such as human CD3 (i.e. e. divalent and biparatopic). Polyspecific heavy chain-only antibodies to PSMA of the present invention also specifically include antibodies that immunospecifically bind to two or more non-overlapping or partially overlapping epitopes on a PSMA protein, such as human PSMA protein, and an epitope on another protein, such as, for example , CD3 protein, such as human CD3 protein (ie, trivalent and biparatope).
Антитела согласно изобретению включают моноспецифические антитела, имеющие одну специфичность связывания. Моноспецифические антитела, в частности, включают антитела, обладающие одной специфичностью связывания, а также антитела, содержащие более одной единицы связывания, имеющие одинаковую специфичность связывания. Термины моноспецифическое антитело, моноспецифическое антитело, содержащее только тяжелые цепи, моноспецифическое антитело, состоящее из тяжелых цепей и моноспецифическое UniAb™ используются в данном документе в самом широком смысле и охватывают все антитела с одной специфичностью связывания. Моноспецифические антитела, содержащие только тяжелые цепи, к ПСМА по настоящему изобретению, в частности, включают антитела, иммуноспецифически связывающиеся с одним эпитопом на белке ПСМА, таким как ПСМА человека (одновалентный и моноспецифический). Моноспецифические антитела, содержащие только тяжелые цепи, к ПСМА по настоящему изобретению также конкретно включают антитела, имеющие более одной связывающей единицы (например, поливалентные антитела), иммуноспецифически связывающиеся с эпитопом на белке ПСМА, таком как ПСМА человека. Например, моноспецифическое антитело в соответствии с вариантами осуществления изобретения может содержать вариабельную область тяжелой цепи, содержащую два антигенсвязывающих домена, где каждый антигенсвязывающий домен связывается с одним и тем же эпитопом на белке ПСМА (т.е. двухвалентным и моноспецифическим).Antibodies of the invention include monospecific antibodies having one binding specificity. Monospecific antibodies specifically include antibodies having a single binding specificity, as well as antibodies containing more than one binding unit having the same binding specificity. The terms monospecific antibody, monospecific heavy chain only antibody, monospecific heavy chain antibody, and monospecific UniAb™ are used herein in the broadest sense to cover all antibodies with a single binding specificity. The monospecific heavy chain only antibodies to PSMA of the present invention particularly include antibodies that immunospecifically bind to a single epitope on a PSMA protein, such as human PSMA (monovalent and monospecific). Monospecific heavy chain-only antibodies to PSMA of the present invention also specifically include antibodies having more than one binding unit (eg, multivalent antibodies) that immunospecifically bind to an epitope on a PSMA protein, such as human PSMA. For example, a monospecific antibody in accordance with embodiments of the invention may comprise a heavy chain variable region comprising two antigen binding domains, where each antigen binding domain binds to the same epitope on the PSMA protein (ie, bivalent and monospecific).
Эпитоп представляет собой участок на поверхности молекулы антигена, с которым связывается одна молекула антитела. Обычно антиген имеет несколько или много разных эпитопов и вступает в реакцию со многими различными антителами. Термин, в частности, включает линейные эпитопы и конформационные эпитопы.An epitope is a region on the surface of an antigen molecule to which one antibody molecule binds. Typically an antigen has several or many different epitopes and reacts with many different antibodies. The term specifically includes linear epitopes and conformational epitopes.
Эпитопное картирование представляет собой процесс идентификации сайтов связывания или эпитопов антител на их целевых антигенах. Эпитопы антител могут быть линейными или конформационными эпитопами. Линейные эпитопы образованы непрерывной последовательностью аминокислот в белке. Конформационные эпитопы образуются из аминокислот, которые являются прерывистыми в последовательности белка, но которые объединяются при сворачивании белка в его трехмерную структуру.Epitope mapping is the process of identifying antibody binding sites or epitopes on their target antigens. Antibody epitopes can be linear or conformational epitopes. Linear epitopes are formed by a continuous sequence of amino acids in a protein. Conformational epitopes are formed from amino acids that are discontinuous in the sequence of a protein, but which come together when the protein folds into its three-dimensional structure.
Термин полиэпитопная специфичность относится к способности специфически связываться с двумя или более различными эпитопами на одной или разных мишенях. Как отмечалось выше, настоящее изобретение, в частности, включает антитела, содержащие только тяжелые цепи, к ПСМА с полиэпитопной специфичностью, то есть антитела, содержащие только тяжелые цепи, к ПСМА, связывающиеся с одним или более неперекрывающимися эпитопами на белке ПСМА, таком как ПСМА человека; и антитела, содержащие только тяжелые цепи, к ПСМА, связывающиеся с одним или более эпитопами на белке ПСМА и с эпитопом на другом белке, таком как, например, белок CD3. Термин неперекрывающийся эпитоп(ы) или неконкурентный эпитоп(ы) антигена определяется в данном документе как означающий эпитоп(ы), которые распознаются одним членом пары антигенспецифических антител, но не другим членом. Пары антител или антигенсвязывающие области, нацеленные на один и тот же антигенThe term polyepitope specificity refers to the ability to specifically bind to two or more different epitopes on the same or different targets. As noted above, the present invention particularly includes heavy chain only anti-PSMA antibodies with polyepitope specificity, that is, heavy chain only anti-PSMA antibodies that bind to one or more non-overlapping epitopes on a PSMA protein, such as PSMA person; and heavy chain-only antibodies to PSMA that bind to one or more epitopes on the PSMA protein and to an epitope on another protein, such as, for example, the CD3 protein. The term non-overlapping epitope(s) or non-competitive epitope(s) of an antigen is defined herein to mean epitope(s) that are recognized by one member of an antigen-specific antibody pair but not by the other member. Pairs of antibodies or antigen-binding regions targeting the same antigen
- 13 046268 на полиспецифическом антителе, распознающие неперекрывающиеся эпитопы, не конкурируют за связывание с этим антигеном и способны одновременно связывать этот антиген.- 13 046268 on a polyspecific antibody that recognizes non-overlapping epitopes, does not compete for binding to this antigen and is capable of simultaneously binding this antigen.
Антитело связывает по существу тот же эпитоп, что и эталонное антитело, когда два антитела распознают идентичные или стерически перекрывающиеся эпитопы. Наиболее широко используемыми и быстрыми способами для определения того, связываются ли два эпитопа с идентичными или стерически перекрывающимися эпитопами, являются анализы конкурентного связывания, которые могут быть сконфигурированы во всем количестве различных форматов с использованием либо меченого антигена, либо меченого антитела. Обычно антиген иммобилизуют в 96-луночном планшете, и способность немеченых антител блокировать связывание меченых антител измеряют с использованием радиоактивных или ферментных меток.An antibody binds substantially the same epitope as a reference antibody when the two antibodies recognize identical or sterically overlapping epitopes. The most widely used and rapid methods for determining whether two epitopes bind to identical or sterically overlapping epitopes are competitive binding assays, which can be configured in a number of different formats using either a labeled antigen or a labeled antibody. Typically, the antigen is immobilized in a 96-well plate, and the ability of unlabeled antibodies to block the binding of labeled antibodies is measured using radioactive or enzyme labels.
Термин валентный, в контексте данного документа, относится к указанному количеству сайтов связывания в молекуле антитела.The term valence, as used herein, refers to the specified number of binding sites in an antibody molecule.
Моновалентное антитело имеет один сайт связывания. Таким образом, одновалентное антитело также является моноспецифическим.A monovalent antibody has one binding site. Thus, a monovalent antibody is also monospecific.
Поливалентное антитело имеет два или более сайтов связывания. Таким образом, термины двухвалентный, трехвалентный и четырехвалентный относятся к наличию двух сайтов связывания, трех сайтов связывания и четырех сайтов связывания, соответственно. Таким образом, биспецифическое антитело по изобретению является по меньшей мере двухвалентным и может быть трехвалентным, четырехвалентным или иным образом многовалентным. Двухвалентное антитело в соответствии с вариантами осуществления изобретения может иметь два сайта связывания с одним и тем же эпитопом (т.е. двухвалентное, монопаратопное) или с двумя разными эпитопами (т.е. двухвалентное, бипаратопное).A polyvalent antibody has two or more binding sites. Thus, the terms divalent, trivalent and tetravalent refer to the presence of two binding sites, three binding sites and four binding sites, respectively. Thus, the bispecific antibody of the invention is at least bivalent and may be trivalent, tetravalent, or otherwise multivalent. A divalent antibody in accordance with embodiments of the invention may have two binding sites to the same epitope (ie, divalent, monoparatope) or to two different epitopes (ie, divalent, biparatope).
Известно большое разнообразие способов и конфигураций белка и используется для получения биспецифических моноклональных антител (бсмкАт), триспецифических антител и тому подобного.A wide variety of methods and protein configurations are known and are used to produce bispecific monoclonal antibodies (bsmAbs), trispecific antibodies and the like.
Термин биспецифическая трехцепочечная антителоподобная молекула или ТСА используется в данном документе для обозначения антителоподобных молекул, включающих, состоящих по существу или состоящих из трех полипептидных субъединиц, две из которых содержат, состоят по существу из или состоят из одной тяжелой цепи и одной легкой цепи моноклонального антитела, или функциональных антигенсвязывающих фрагментов таких цепей антитела, содержащих антигенсвязывающую область и по меньшей мере один домен СН. Данная пара тяжелая цепь / легкая цепь обладает специфичностью связывания в отношении первого антигена. Третья полипептидная субъединица содержит, состоит по существу или состоит из антитела, содержащего только тяжелые цепи, содержащего Fc-часть, содержащий домены СН2 и/или СН3, и/или СН4, в отсутствие домена СН1, и антигенсвязывающий домен, который связывает эпитоп второго антигена или другой эпитоп первого антигена, причем такой связывающий домен происходит из или имеет идентичность последовательности с вариабельной областью тяжелой или легкой цепи антитела. Части такой вариабельной области могут кодироваться сегментами гена VH и/или VL, сегментами гена D и JH, или сегментами гена JL. Вариабельная область может кодироваться реаранжированными генными сегментами VHDJH, VLDJH, VHJL или VLJL. В белке ТСА используется антитело, содержащее только тяжелые цепи, как определено выше.The term bispecific three-chain antibody-like molecule or TCA is used herein to refer to antibody-like molecules comprising, consisting essentially of, or consisting of three polypeptide subunits, two of which contain, consist essentially of, or consist of one heavy chain and one light chain of a monoclonal antibody, or functional antigen-binding fragments of such antibody chains containing an antigen-binding region and at least one CH domain. This heavy chain/light chain pair has binding specificity for the first antigen. The third polypeptide subunit contains, consists essentially of or consists of a heavy chain-only antibody containing an Fc portion containing CH2 and/or CH3 and/or CH4 domains, in the absence of a CH1 domain, and an antigen binding domain that binds an epitope of a second antigen or another epitope of the first antigen, wherein such binding domain is derived from or has sequence identity with the heavy or light chain variable region of the antibody. Portions of such a variable region may be encoded by VH and/or VL gene segments, D and JH gene segments, or JL gene segments. The variable region may be encoded by rearranged VHDJH, VLDJH, VHJL or VLJL gene segments. The TCA protein uses a heavy chain-only antibody as defined above.
Термин химерный антигенный рецептор или CAR используется в данном описании в самом широком смысле для обозначения сконструированного рецептора, который прививает желаемую специфичность связывания (например, антигенсвязывающую область моноклонального антитела или другого лиганда) к охватывающему мембрану и внутриклеточному сигнальному доменам. Как правило, рецептор используется для прививки специфичности моноклонального антитела Т-клетке для создания химерных антигенных рецепторов (CAR). (J Natl Cancer Inst, 2015; 108(7):dvj439; and Jackson et al., Nature Reviews Clinical Oncology, 2016; 13:370-383). CAR-Т-клетки представляют собой Т-клетки, которые были генетически модифицированы для продукции искусственного Т-клеточного рецептора для применения в иммунотерапии. В одном варианте осуществления CAR-T-клетка означает терапевтическую Т-клетку, экспрессирующую трансген, кодирующий один или более химерных антигенных рецепторов, состоящих минимально из внеклеточного домена, трансмембранного домена и по меньшей мере одного цитозольного домена.The term chimeric antigen receptor or CAR is used herein in its broadest sense to refer to an engineered receptor that grafts the desired binding specificity (eg, the antigen binding region of a monoclonal antibody or other ligand) to membrane spanning and intracellular signaling domains. Typically, the receptor is used to graft the specificity of a monoclonal antibody onto a T cell to create chimeric antigen receptors (CARs). (J Natl Cancer Inst, 2015; 108(7):dvj439; and Jackson et al., Nature Reviews Clinical Oncology, 2016; 13:370-383). CAR T cells are T cells that have been genetically modified to produce an artificial T cell receptor for use in immunotherapy. In one embodiment, a CAR-T cell means a therapeutic T cell expressing a transgene encoding one or more chimeric antigen receptors consisting minimally of an extracellular domain, a transmembrane domain, and at least one cytosolic domain.
Термин человеческое антитело используется в данном документе для включения антител, имеющих вариабельные и константные области, полученные из последовательностей иммуноглобулинов зародышевой линии человека. Человеческие антитела по данному документу могут включать аминокислотные остатки, которые не кодируются последовательностями иммуноглобулина зародышевой линии человека, например, мутации, введенные с помощью случайного или сайт-специфического мутагенеза in vitro или с помощью соматической мутации in vivo. Термин человеческое антитело, в частности, включает антитела, содержащие только тяжелые цепи, имеющие последовательности вариабельной области тяжелой цепи человека, продуцируемые трансгенными животными, такими как трансгенные крысы или мыши, в частности UniAb™, продуцируемые UniRat™, как определено выше.The term human antibody is used herein to include antibodies having variable and constant regions derived from human germline immunoglobulin sequences. Human antibodies herein may include amino acid residues that are not encoded by human germline immunoglobulin sequences, for example, mutations introduced by random or site-directed mutagenesis in vitro or by somatic mutation in vivo. The term human antibody specifically includes heavy chain-only antibodies having human heavy chain variable region sequences produced by transgenic animals such as transgenic rats or mice, particularly UniAb™ produced by UniRat™ as defined above.
Под химерным антителом или химерным иммуноглобулином подразумевается молекула иммуноглобулина, содержащая аминокислотные последовательности по меньшей мере из двух разных локусов Ig, например, трансгенное антитело, содержащее часть, кодируемую локусом Ig человека, и часть,By chimeric antibody or chimeric immunoglobulin is meant an immunoglobulin molecule containing amino acid sequences from at least two different Ig loci, for example, a transgenic antibody containing a portion encoded by the human Ig locus and a portion
- 14 046268 кодируемую локусом Ig крысы. Химерные антитела включают трансгенные антитела с нечеловеческими областями Fc или искусственными областями Fc, и человеческие идиотипы. Такие иммуноглобулины могут быть выделены из животных согласно изобретению, которые были сконструированы для получения таких химерных антител.- 14 046268 encoded by the rat Ig locus. Chimeric antibodies include transgenic antibodies with non-human Fc regions or artificial Fc regions, and human idiotypes. Such immunoglobulins can be isolated from animals according to the invention that have been engineered to produce such chimeric antibodies.
Используемый в данном документе термин эффекторная клетка относится к иммунной клетке, которая участвует в эффекторной фазе иммунного ответа, в отличие от когнитивной и активационной фаз иммунного ответа. Некоторые эффекторные клетки экспрессируют специфические Fc-рецепторы и выполняют специфические иммунные функции. В некоторых вариантах осуществления эффекторная клетка, такая как естественная клетка-киллер, способна индуцировать антителозависимую клеточную цитотоксичность (АЗКЦ). Например, моноциты и макрофаги, которые экспрессируют FcR, участвуют в специфическом уничтожении клеток-мишеней и презентации антигенов другим компонентам иммунной системы или связывании с клетками, которые презентуют антигены. В некоторых вариантах осуществления эффекторная клетка может фагоцитировать антиген-мишень или клетку-мишень.As used herein, the term effector cell refers to an immune cell that participates in the effector phase of an immune response, as opposed to the cognitive and activation phases of an immune response. Some effector cells express specific Fc receptors and perform specific immune functions. In some embodiments, an effector cell, such as a natural killer cell, is capable of inducing antibody-dependent cellular cytotoxicity (ADCC). For example, monocytes and macrophages that express FcRs are involved in the specific killing of target cells and the presentation of antigens to other components of the immune system or binding to cells that present antigens. In some embodiments, the effector cell may phagocytose the target antigen or target cell.
Эффекторные клетки человека представляют собой лейкоциты, которые экспрессируют рецепторы, такие как Т-клеточные рецепторы или FcR, и выполняют эффекторные функции. Предпочтительно, такие клетки экспрессируют по меньшей мере FcyRIII и осуществляют эффекторную функцию АЗКЦ. Примеры лейкоцитов человека, которые опосредуют АЗКЦ, включают, естественные клетки-киллеры (NK), моноциты, цитотоксические Т-клетки и нейтрофилы; причем NK-клетки являются предпочтительными. Эффекторные клетки могут быть выделены из нативного источника, например, из крови или МКПК, как описано в данном документе.Human effector cells are white blood cells that express receptors, such as T-cell receptors or FcRs, and perform effector functions. Preferably, such cells express at least FcyRIII and exert ADCC effector function. Examples of human leukocytes that mediate ADCC include natural killer (NK) cells, monocytes, cytotoxic T cells and neutrophils; with NK cells being preferred. Effector cells can be isolated from a native source, such as blood or PBMC, as described herein.
Термин иммунная клетка используется в данном документе в самом широком смысле, включая, без ограничения, клетки миелоидного или лимфоидного происхождения, например лимфоциты (такие как В-клетки и Т-клетки, включая цитолитические Т-клетки (ЦТЛ)), клетки-киллеры, естественные клетки-киллеры (NK), макрофаги, моноциты, эозинофилы, полиморфно-ядерные клетки, такие как нейтрофилы, гранулоциты, тучные клетки и базофилы.The term immune cell is used herein in its broadest sense, including, but not limited to, cells of myeloid or lymphoid origin, such as lymphocytes (such as B cells and T cells, including cytolytic T cells (CTLs)), killer cells, natural killer (NK) cells, macrophages, monocytes, eosinophils, polymorphonuclear cells such as neutrophils, granulocytes, mast cells and basophils.
Эффекторные функции антитела относятся к той биологической активности, которая относится к области Fc (нативной последовательности области Fc или варианта аминокислотной последовательности области Fc) антитела. Примеры эффекторных функций антитела включают связывание C1q; комплементзависимую цитотоксичность (КЗЦ); связывание с рецептором Fc; антителозависимую клеточноопосредованную цитотоксичность (АЗКЦ); фагоцитоз; снижение экспрессии рецепторов поверхности клетки, (например, В-клеточный рецептор, BCR) и т.д.The effector functions of an antibody refer to those biological activities that are attributable to the Fc region (native Fc region sequence or variant amino acid sequence of the Fc region) of the antibody. Examples of antibody effector functions include C1q binding; complement-dependent cytotoxicity (CDC); Fc receptor binding; antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity (ADCC); phagocytosis; decreased expression of cell surface receptors (eg B cell receptor, BCR), etc.
Антителозависимая клеточно-опосредованная цитотоксичность и АЗКЦ соответствуют опосредованной клетками реакции, в которой неспецифические цитотоксические клетки, которые экспрессируют рецепторы Fc (FcR) (например, естественные клетки-киллеры (NK), нейтрофилы и макрофаги), распознают связанное антитело на целевой клетке и, таким образом, приводят к лизису клетки-мишени. Первичные клетки, опосредующие АЗКЦ, естественные клетки-киллеры, экспрессируют только FcyRIII, тогда как моноциты экспрессируют FcyRI, FcyRII и FcyRIII. Экспрессия FcR на гемопоэтических клетках приведена в таблице 3 на с. 464 в Ravetch and Kinet, Annu. Rev. Immunol 9:457-92 (1991). Для оценки активности АЗКЦ представляющей интерес молекулы может быть проведен анализ АЗКЦ in vitro, описанный в патенте США № 5500362 или 5821337. Эффекторные клетки, пригодные для такого анализа, включают мононуклеарные клетки периферической крови (МКПК) и естественные клетки-киллеры (NK). В качестве альтернативы или дополнения, АЗКЦ-активность молекулы, представляющей интерес, можно оценить in vivo, например, в животной модели, например, согласно описанию в публикации dynes et al.. PNAS (USA) 95:652-656 (1998).Antibody-dependent cell-mediated cytotoxicity and ADCC correspond to a cell-mediated response in which nonspecific cytotoxic cells that express Fc receptors (FcR) (eg, natural killer (NK) cells, neutrophils, and macrophages) recognize bound antibody on the target cell and thus thus lead to lysis of the target cell. The primary cells that mediate ADCC, natural killer cells, express only FcyRIII, whereas monocytes express FcyRI, FcyRII, and FcyRIII. FcR expression on hematopoietic cells is shown in Table 3 on p. 464 in Ravetch and Kinet, Annu. Rev. Immunol 9:457-92 (1991). To evaluate the ADCC activity of a molecule of interest, an in vitro ADCC assay can be performed, as described in US Pat. No. 5,500,362 or 5,821,337. Effector cells suitable for such assays include peripheral blood mononuclear cells (PBMCs) and natural killer (NK) cells. Alternatively or in addition, the ADCC activity of a molecule of interest can be assessed in vivo, for example, in an animal model, for example, as described in Dynes et al., PNAS (USA) 95:652-656 (1998).
Комплементзависимая цитотоксичность или КЗЦ относится к способности молекулы лизировать мишень в присутствии комплемента. Путь активации комплемента инициируется связыванием первого компонента системы комплемента (C1q) с молекулой (например, антителом), образующей комплекс с распознаваемым антигеном. Для оценки активации комплемента, может быть выполнен анализ КЗЦ, например, как описано в Gazzano-Santoro et al., J. Immunol. Methods 202:163 (1996).Complement-dependent cytotoxicity or CDC refers to the ability of a molecule to lyse a target in the presence of complement. The complement activation pathway is initiated by the binding of the first component of the complement system (C1q) to a molecule (eg, antibody) that forms a complex with the antigen being recognized. To assess complement activation, a CDC assay can be performed, for example, as described in Gazzano-Santoro et al., J. Immunol. Methods 202:163 (1996).
Аффинность связывания относится к силе суммарного количества нековалентных взаимодействий между одним сайтом связывания молекулы (например, антителом) и ее связывающим партнером (например, антигеном). Если не указано иное, используемый в данном документе термин аффинность связывания относится к действительной аффинности связывания, которая отражает взаимодействие в соотношении 1:1 между членами связывающей пары (например, антителом и антигеном). Аффинность молекулы X к ее партнеру Y в целом можно выразить константой диссоциации (Kd). Аффинность может быть измерена общепринятыми способами, известными в данной области техники. Низкоаффинные антитела обычно связывают антиген медленно и склонны легко диссоциировать, тогда как высокоаффинные антитела, как правило, связывают антиген быстрее и имеют тенденцию оставаться связанными.Binding affinity refers to the strength of the total number of noncovalent interactions between one binding site of a molecule (eg, antibody) and its binding partner (eg, antigen). Unless otherwise specified, the term binding affinity as used herein refers to the actual binding affinity, which reflects the 1:1 interaction between members of a binding pair (eg, antibody and antigen). The affinity of a molecule X for its partner Y can generally be expressed by the dissociation constant (Kd). Affinity can be measured by conventional methods known in the art. Low-affinity antibodies tend to bind antigen slowly and tend to dissociate easily, whereas high-affinity antibodies tend to bind antigen more quickly and tend to remain bound.
Используемый в данном документе термин Kd или значение Kd относится к константе диссоциации, определенной методом интерферометрии BioLayer, с использованием прибора Octet QK384 (Fortebio Inc., Menlo Park, СА) в режиме кинетики. Например, сенсоры с антителом к Fc мыши загружаютAs used herein, the term Kd or Kd value refers to the dissociation constant determined by BioLayer interferometry using an Octet QK384 instrument (Fortebio Inc., Menlo Park, Calif.) in kinetics mode. For example, sensors with anti-mouse Fc antibody are loaded
- 15 046268 со слитым Fc-антигеном мыши и затем погружают в лунки, содержащие антитела, для измерения зависимых от концентрации скоростей (kon). Скорости диссоциации антител (koff) измеряют на последней стадии, когда сенсоры погружают в лунки, содержащие только буфер. Kd представляет собой соотношение koff/kon (подробнее см. Conception, J., et al., Comb Chem High Throughput Screen, 12(8), 791-800, 2009).- 15 046268 with a mouse Fc fusion antigen and then dipped into wells containing antibodies to measure concentration-dependent rates (kon). Antibody dissociation rates (koff) are measured at the last stage, when the sensors are immersed in wells containing only buffer. Kd is the koff/kon ratio (for details, see Conception, J., et al., Comb Chem High Throughput Screen, 12(8), 791-800, 2009).
Термины лечение, лечить и тому подобное используются в данном документе для обозначения достижения желаемого фармакологического и/или физиологического эффекта. Эффект может быть профилактическим с точки зрения полного или частичного предотвращения заболевания или его симптомов и/или может быть терапевтическим с точки зрения частичного или полного излечения заболевания и/или неблагоприятного явления, связанного с этим заболеванием. Используемый в данном документе термин лечение охватывает любое лечение заболевания у млекопитающего и включает: (а) предотвращение появления заболевания у субъекта, который может быть предрасположен к заболеванию, но у которого это заболевание еще не диагностировано; (b) подавление заболевания, то есть прекращение его развития; или (с) облегчение заболевания, т.е. вызывание регресса заболевания. Терапевтический агент может быть введен до, во время или после начала заболевания или травмы. Лечение продолжающегося заболевания, при котором лечение стабилизирует или уменьшает нежелательные клинические симптомы пациента, представляет особый интерес. Такое лечение желательно проводить до полной потери функции в пораженных тканях. Терапия у субъекта может быть проведена во время симптоматической стадии заболевания, и в некоторых случаях после симптоматической стадии заболевания.The terms treatment, treat, and the like are used herein to denote the achievement of a desired pharmacological and/or physiological effect. The effect may be prophylactic in terms of completely or partially preventing a disease or its symptoms and/or may be therapeutic in terms of partially or completely curing a disease and/or an adverse event associated with that disease. As used herein, the term treatment encompasses any treatment of a disease in a mammal and includes: (a) preventing the onset of the disease in a subject who may be susceptible to the disease but has not yet been diagnosed with the disease; (b) suppression of the disease, that is, stopping its development; or (c) alleviation of the disease, i.e. causing regression of the disease. The therapeutic agent may be administered before, during, or after the onset of the disease or injury. Treatment of ongoing disease, in which the treatment stabilizes or reduces the patient's adverse clinical symptoms, is of particular interest. It is advisable to carry out such treatment until complete loss of function in the affected tissues. Therapy may be administered to a subject during the symptomatic stage of the disease, and in some cases after the symptomatic stage of the disease.
Термин терапевтически эффективное количество означает количество активного агента, которое необходимо для придания терапевтического эффекта у субъекта. Например, терапевтически эффективное количество представляет собой количество, которое вызывает, ослабляет или иным образом вызывает улучшение патологических симптомов, прогрессирования заболевания или физиологических состояний, связанных с заболеванием, или которое повышает устойчивость к расстройству.The term therapeutically effective amount means the amount of active agent that is necessary to impart a therapeutic effect in a subject. For example, a therapeutically effective amount is an amount that causes, attenuates, or otherwise causes an improvement in pathological symptoms, disease progression, or physiological conditions associated with a disease, or that increases resistance to a disorder.
Используемый в данном документе термин злокачественное новообразование предстательной железы относится к злокачественной опухоли железистого происхождения в предстательной железе.As used herein, the term prostate malignancy refers to a malignant tumor of glandular origin in the prostate gland.
Термин характеризуется экспрессией ПСМА в широком смысле относится к любому заболеванию или расстройству, при котором экспрессия ПСМА связана или вовлечена в один или более патологических процессов, которые характерны для данного заболевания или расстройства. Такие расстройства включают, но не ограничиваются ими, злокачественное новообразование предстательной железы.The term characterized by PSMA expression broadly refers to any disease or disorder in which the expression of PSMA is associated with or involved in one or more pathological processes that are characteristic of the disease or disorder. Such disorders include, but are not limited to, prostate cancer.
Термины субъект, индивидуум и пациент используются в данном документе взаимозаменяемо для обозначения млекопитающего, которого оценивают на предмет лечения и/или которое подвергается лечению. В одном варианте осуществления млекопитающее является человеком. Термины субъект, индивидуум и пациент охватывают, без ограничения, индивидуумов, имеющих злокачественное новообразование, индивидуумов с аутоиммунными заболеваниями, патогенными инфекциями и тому подобное. Субъектами могут быть люди, но также могут быть и другие млекопитающие, в частности те млекопитающие, которые могут быть использованы в качестве лабораторных моделей заболеваний человека, например, мышь, крыса и т.д.The terms subject, individual, and patient are used interchangeably herein to refer to a mammal being evaluated for treatment and/or undergoing treatment. In one embodiment, the mammal is human. The terms subject, individual and patient include, without limitation, individuals with cancer, individuals with autoimmune diseases, pathogenic infections and the like. Subjects may be humans, but may also be other mammals, particularly those mammals that can be used as laboratory models of human disease, such as mice, rats, etc.
Термин фармацевтический состав относится к составу, который находится в такой форме, чтобы обеспечить биологическую активность активного ингредиента, чтобы быть эффективным, и который не содержит каких-либо дополнительных компонентов, которые являются неприемлемо токсичными для субъекта, которому будет вводиться состав. Такие составы являются стерильными. Фармацевтически приемлемые эксципиенты (носители, адьюванты) являются таковыми, которые резонно могут вводиться субъекту-млекопитающему и обеспечивать эффективную дозу используемого активного ингредиента.The term pharmaceutical formulation refers to a formulation that is in such a form as to provide the biological activity of the active ingredient to be effective and that does not contain any additional components that are unacceptably toxic to the subject to whom the formulation will be administered. Such compositions are sterile. Pharmaceutically acceptable excipients (carriers, adjuvants) are those that can reasonably be administered to a mammalian subject and provide an effective dose of the active ingredient used.
Стерильная композиция является асептической или свободной от, или практически не содержит любых живых микроорганизмов и их спор. Замороженная композиция является композицией при температуре ниже 0°С.The sterile composition is aseptic or free from, or substantially free from, any living microorganisms and their spores. A frozen composition is a composition at a temperature below 0°C.
Стабильная композиция является таковой, в которой белок практически полностью сохраняет свою физическую стабильность и/или химическую стабильность и/или биологическую активность во время хранения. Предпочтительно, композиция практически полностью сохраняет свою физическую или химическую стабильность, а также свою биологическую активность. Период хранения в общем выбран на основании срока годности состава. Разнообразные техники для измерения стабильности белка известны в данной области техники и рассмотрены, например, в Peptide and Protein Drug Delivery, 247-301. Vincent Lee Ed., Marcel Dekker, Inc., New York, N.Y., Pubs. (1991) и Jones. A. Adv. Drug Delivery Rev. 10: 2990) (1993). Стабильность может быть измерена при выбранной температуре для выбранного периода времени. Стабильность может быть оценена качественно и/или количественно различными способами, включая оценку образования агрегатов (например, с использованием эксклюзионной хроматографии, путем измерения мутности и/или путем визуального контроля); путем оценки гетерогенности заряда с помощью катионообменной хроматографии, капиллярного изоэлектрического фокусирования с детектированием непосредственно в капилляре (icIEF) или электрофореза в капиллярной зоне; анализ Nконцевой или С-концевой последовательности; масс-спектрометрический анализ; анализ методом электрофореза в полиакриламидном геле с додецилсульфатом натрия для сравнения восстановленного и инA stable composition is one in which the protein retains substantially all of its physical stability and/or chemical stability and/or biological activity during storage. Preferably, the composition retains substantially all of its physical or chemical stability as well as its biological activity. The storage period is generally selected based on the shelf life of the formulation. A variety of techniques for measuring protein stability are known in the art and are discussed, for example, in Peptide and Protein Drug Delivery, 247-301. Vincent Lee Ed., Marcel Dekker, Inc., New York, N.Y., Pubs. (1991) and Jones. A. Adv. Drug Delivery Rev. 10: 2990) (1993). Stability can be measured at a selected temperature for a selected period of time. Stability can be assessed qualitatively and/or quantitatively in a variety of ways, including assessing the formation of aggregates (eg, using size exclusion chromatography, by measuring turbidity and/or by visual inspection); by assessing charge heterogeneity using cation exchange chromatography, capillary isoelectric focusing with in-capillary detection (icIEF), or capillary zone electrophoresis; N-terminal or C-terminal sequence analysis; mass spectrometric analysis; analysis by sodium dodecyl sulfate polyacrylamide gel electrophoresis to compare reduced and injected
- 16 046268 тактного антитела; анализ пептидной карты (например, триптический или LYS-C); оценку биологической активности или антигенсвязывающей функции антитела; и т.п. Нестабильность может включать в себя одно или более из следующего: агрегация, дезамидирование (например, дезамидирование Asn), окисление (например, окисление Met), изомеризация (например, изомеризация Asp), отсечение / гидролиз / фрагментация (например, фрагментация шарнирной области), образование сукцинимида, неспаренный цистеин(ы), удлинение N-конца, обработка С-конца, различия гликозилирования, и т.п.- 16 046268 tact antibody; peptide map analysis (eg tryptic or LYS-C); assessing the biological activity or antigen-binding function of the antibody; and so on. Instability may include one or more of the following: aggregation, deamidation (e.g. Asn deamidation), oxidation (e.g. Met oxidation), isomerization (e.g. Asp isomerization), truncation/hydrolysis/fragmentation (e.g. hinge region fragmentation), succinimide formation, unpaired cysteine(s), N-terminal extension, C-terminal processing, glycosylation differences, etc.
II. Подробное описание.II. Detailed description.
Антитела к ПСМА.Antibodies to PSMA.
Настоящее изобретение относится к семейству близкородственных антител, которые связываются с ПСМА человека. Антитела этого семейства содержат набор последовательностей CDR, как определено в данном документе и показано в табл. 1, и проиллюстрированы предложенными последовательностями вариабельной области тяжелой цепи (VH) SEQ ID NO: 24-54, приведенными в таблице 2. Семейство антител обеспечивает ряд преимуществ, которые благоприятствуют применению их в качестве клинического(их) терапевтического(их) агента(ов). Антитела включают членов с диапазоном аффинностей связывания, позволяющих выбирать конкретную последовательность с желаемой аффинностью связывания.The present invention relates to a family of closely related antibodies that bind to human PSMA. Antibodies of this family contain a set of CDR sequences as defined herein and shown in table. 1, and are illustrated by the proposed heavy chain variable region (VH) sequences of SEQ ID NO: 24-54 shown in Table 2. The family of antibodies provides a number of advantages that favor their use as clinical therapeutic agent(s). . Antibodies include members with a range of binding affinities allowing the selection of a particular sequence with the desired binding affinity.
Таблица 1Table 1
Уникальные аминокислотные последовательности CDR антитела, содержащего только тяжелые цепи, к ПСМАUnique amino acid sequences of the CDR of a heavy chain-only antibody to PSMA
Таблица 2table 2
Аминокислотные последовательности вариабельного домена антитела, содержащего только тяжелые цепи, к ПСМАAmino acid sequences of the variable domain of an antibody containing only heavy chains to PSMA
- 17 046268- 17 046268
- 18 046268- 18 046268
Подходящее антитело может быть выбрано из представленных в данном документе антител для разработки и терапевтического или другого применения, включая, без ограничения, применение в качестве биспецифического, например, как показано на фиг. 5, панелях А-С, или триспецифического антитела или части структуры CAR-T. На фиг. 5 панели А-С представлены иллюстрации полиспецифических антител к CD3 х ПСМА, где домен к ПСМА является одновалентным и моноспецифическим, двухвалентным и моноспецифическим или двухвалентным и биспецифическим (бипаратопным). Домен к CD3 содержит домен СН1 и спарен с легкой цепью, в то время как домены к ПСМА получены из антител, состоящих только из тяжелых цепей, и не содержат домен СН1 и не взаимодействуют с легкой цепью. В некоторых вариантах осуществления две тяжелые цепи разделяют с использованием, например, технологии выступы-во-впадины. Ссылаясь на антитела, изображенные на фиг. 5, на панели А показано биспецифическое антитело к CD3 х ПСМА, в котором связывающее плечо к ПСМА является одновалентным и моноспецифическим, а антигенсвязывающий домен плеча к ПСМА находится в одновалентной конфигурации, что означает, что присутствует только один антигенсвязывающий домен. На панели В изображено биспецифическое антитело CD3 х ПСМА, в котором связывающее плечо к ПСМА является двухвалентным и моноспецифическим, а антигенсвязывающий домен плеча к ПСМА находится в двухвалентной конфигурации, что означает, что есть два идентичных антигенсвязывающих домена, размещенных в тандеме. На панели С изображено биспецифическое антитело к CD3 х ПСМА, в котором связывающее плечо к ПСМА является двухвалентным и бипаратопным, а антигенсвязывающие домены плеча к ПСМА находятся в двухвалентной конфигурации.A suitable antibody may be selected from those provided herein for development and therapeutic or other use, including, without limitation, use as a bispecific, for example, as shown in FIG. 5, panels A-C, or a trispecific antibody or part of a CAR-T structure. In fig. Panels 5 A-C show illustrations of polyspecific antibodies to CD3 x PSMA, where the anti-PSMA domain is monovalent and monospecific, bivalent and monospecific, or bivalent and bispecific (biparatope). The anti-CD3 domain contains a CH1 domain and is paired with the light chain, while the anti-PSMA domains are derived from heavy chain-only antibodies and do not contain a CH1 domain and do not interact with the light chain. In some embodiments, the two heavy chains are separated using, for example, a ridge-to-valve technology. Referring to the antibodies depicted in FIG. 5, Panel A shows an anti-CD3 x PSMA bispecific antibody in which the anti-PSMA binding arm is monovalent and monospecific, and the antigen binding domain of the anti-PSMA arm is in a monovalent configuration, meaning that only one antigen binding domain is present. Panel B shows a CD3 x PSMA bispecific antibody in which the anti-PSMA binding arm is bivalent and monospecific, and the anti-PSMA arm antigen-binding domain is in a bivalent configuration, meaning that there are two identical antigen-binding domains arranged in tandem. Panel C depicts an anti-CD3 x PSMA bispecific antibody in which the anti-PSMA binding arm is bivalent and biparatopic and the antigen-binding domains of the anti-PSMA arm are in a divalent configuration.
Определение аффинности к белку-кандидату может быть выполнено с использованием способов, известных в данной области техники, таких как измерения Biacore. Члены семейства антител могут иметь аффинность к ПСМА с Kd, равным от около 10-6 до около 10’11, включая, без ограничения: от около 10-6 до около 10-10; от около 10-6 до около 10-9; от около 10-6 до около 10-8; от около 10-8 до около 10’11; от около 10-8 до около 10-10; от около 10-8 до около 10-9; от около 10-9 до около 10-11; от около 10-9 до около 10-10; или любому значению в этих диапазонах. Выбор аффинности может быть подтвержден при помощи биологической оценки в отношении модуляции, например, блокирования, биологической активности ПСМА, включая анализы in vitro, доклинические модели и клинические исследования, а также оценку потенциальной токсичности.Determination of affinity for a candidate protein can be performed using methods known in the art, such as Biacore measurements. Members of the antibody family may have an affinity for PSMA with a Kd of from about 10 -6 to about 10' 11 , including, but not limited to: from about 10 -6 to about 10 - 10 ; from about 10 -6 to about 10 -9 ; from about 10 -6 to about 10 -8 ; from about 10 -8 to about 10'11; from about 10 -8 to about 10-10 ; from about 10 -8 to about 10 -9 ; from about 10 -9 to about 10 -11 ; from about 10 -9 to about 10-10 ; or any value in these ranges. Affinity selection can be supported by biological evaluation for modulation, e.g. blocking, of PSMA biological activity, including in vitro assays, preclinical models and clinical studies, as well as assessment of potential toxicity.
Члены семьи антител, описанные в данном документе, не являются перекрестно-реактивными с белком ПСМА яванского макака, но могут быть сконструированными для обеспечения перекрестной-реактивности с белком ПСМА яванского макака или белками ПСМА других видов животных, при необходимости.Members of the antibody family described herein are not cross-reactive with cynomolgus PSMA protein, but can be designed to be cross-reactive with cynomolgus PSMA protein or PSMA proteins of other animal species, if desired.
Семейство ПСМА-специфических антител в данном документе включает домен VH, содержащий последовательности CDR1, CDR2 и CDR3 в каркасе VH человека. Последовательности CDR могут бытьThe family of PSMA-specific antibodies herein includes the VH domain containing the CDR1, CDR2 and CDR3 sequences in the human VH framework. CDR sequences can be
- 19 046268 расположены, например, в области около аминокислотных остатков 26-33; 51-58; и 97-116 для CDR1, CDR2 и CDR3, соответственно, предоставленных иллюстративных последовательностей вариабельной области, указанных в SEQ ID NO: 24-58. Специалисту в данной области техники должно быть понятно, что последовательности CDR могут находиться в других положениях, если выбрана другая каркасная последовательность, хотя, как правило, порядок последовательностей остается неизменным.- 19 046268 are located, for example, in the region around amino acid residues 26-33; 51-58; and 97-116 for CDR1, CDR2 and CDR3, respectively, of the provided exemplary variable region sequences set forth in SEQ ID NOs: 24-58. One skilled in the art will appreciate that the CDR sequences may be in other positions if a different framework sequence is selected, although generally the order of the sequences remains the same.
Последовательности CDR1, CDR2, и CDR3 антител к ПСМА по данному изобретению могут охватываться следующими структурными формулами, где X обозначает вариабельную аминокислоту, которая может представлять собой вариабельную аминокислоту, как указано ниже.The CDR1, CDR2, and CDR3 sequences of the anti-PSMA antibodies of the present invention may be covered by the following structural formulas, wherein X represents a variable amino acid, which may be a variable amino acid as defined below.
CDR1CDR1
G G S I S S X1 X2 Y Х3 (SEQ ID NO: 67) где X1 представляет собой S или N;GGSISSX 1 X 2 Y X 3 (SEQ ID NO: 67) where X 1 represents S or N;
Х2 представляет собой S или N; иX 2 represents S or N; And
Х3 представляет собой Y или F; иX 3 represents Y or F; And
CDR2CDR2
Х4 Х5 X, S G X7 T (SEQ ID NO: 68) где Х4 представляет собой I или V;X 4 X 5 X, SGX 7 T (SEQ ID NO: 68) where X 4 represents I or V;
Х5 представляет собой D или Y;X 5 represents D or Y;
Х6 представляет собой Y или D; иX 6 represents Y or D; And
Х7 представляет собой Y или S; иX 7 represents Y or S; And
CDR3CDR3
ARHKAATADFDY (SEQ ID NO: 69).ARHKAATADFDY (SEQ ID NO: 69).
Последовательности CDR1, CDR2, и CDR3 антител к ПСМА по данному изобретению могут охватываться следующими структурными формулами, где X обозначает вариабельную аминокислоту, которая может представлять собой вариабельную аминокислоту, как указано ниже.The CDR1, CDR2, and CDR3 sequences of the anti-PSMA antibodies of the present invention may be covered by the following structural formulas, wherein X represents a variable amino acid, which may be a variable amino acid as defined below.
CDR1CDR1
G F X1 F Х2 Х3 Y G (SEQ ID NO: 70) где X1 представляет собой S или I, или Т;GFX 1 F X 2 X 3 YG (SEQ ID NO: 70) where X 1 represents S or I or T;
Х2 представляет собой S или Т, или R, или I; иX 2 represents S or T or R or I; And
Х3 представляет собой R или S; иX 3 represents R or S; And
CDR2CDR2
I Х4 Y D G S N Х5 (SEQ ID NO: 71) где Х4 представляет собой W или S; иI X 4 YDGSN X 5 (SEQ ID NO: 71) where X 4 represents W or S; And
Х5 представляет собой R или K; иX 5 represents R or K; And
CDR3CDR3
AREPRX6GYYYX7X8SGYX9SLDY (SEQ ID NO: 72) где Х6 представляет собой I или V;AREPRX6GYYYX7X8SGYX9SLDY (SEQ ID NO: 72) where X 6 represents I or V;
Х7 представляет собой Е или D;X 7 represents E or D;
Х8 представляет собой S или Т; иX 8 represents S or T; And
Х9 представляет собой Y или D.X9 represents Y or D.
Типичные последовательности CDR1, CDR2 и CDR3 показаны в табл. 1 и 3.Representative sequences of CDR1, CDR2 and CDR3 are shown in Table. 1 and 3.
- 20 046268- 20 046268
Таблица 3Table 3
Аминокислотные последовательности CDR1, CDR2 и CDR3 антитела, содержащего только тяжелые цепи, к ПСМАAmino acid sequences of CDR1, CDR2 and CDR3 of a heavy chain-only antibody to PSMA
- 21 046268- 21 046268
В некоторых вариантах осуществления антитело к ПСМА содержит последовательность CDR1 любой из SEQ ID NO: 1-10. В конкретном варианте осуществления последовательность CDR1 представляет собой SEQ ID NO: 2 или 7.In some embodiments, the anti-PSMA antibody comprises a CDR1 sequence of any of SEQ ID NO: 1-10. In a specific embodiment, the CDR1 sequence is SEQ ID NO: 2 or 7.
В некоторых вариантах осуществления антитело к ПСМА содержит последовательность CDR2 с любой из SEQ ID NO: 11-17. В конкретном варианте осуществления последовательность CDR2 представляет собой SEQ ID NO: 11 или 15.In some embodiments, the anti-PSMA antibody comprises a CDR2 sequence with any of SEQ ID NOs: 11-17. In a specific embodiment, the CDR2 sequence is SEQ ID NO: 11 or 15.
В некоторых вариантах осуществления антитело к ПСМА содержит последовательность CDR3 с любой из SEQ ID NO: 18-23. В конкретном варианте осуществления последовательность CDR3 представляет собой SEQ ID NO: 18 или 20.In some embodiments, the anti-PSMA antibody comprises a CDR3 sequence with any of SEQ ID NOs: 18-23. In a specific embodiment, the CDR3 sequence is SEQ ID NO: 18 or 20.
В дополнительном варианте осуществления антитело, содержащее только тяжелые цепи, к ПСМА содержит последовательность CDR1 с SEQ ID NO: 2; последовательность CDR2 с SEQ ID NO: 11; и последовательность CDR3 с SEQ ID NO: 18.In a further embodiment, the anti-PSMA heavy chain antibody comprises the CDR1 sequence of SEQ ID NO: 2; CDR2 sequence with SEQ ID NO: 11; and the CDR3 sequence of SEQ ID NO: 18.
В дополнительном варианте осуществления антитело к ПСМА содержит последовательность CDR1 с SEQ ID NO: 7; последовательность CDR2 с SEQ ID NO: 15; и последовательность CDR3 с SEQ ID NO: 20.In a further embodiment, the anti-PSMA antibody comprises the CDR1 sequence of SEQ ID NO: 7; CDR2 sequence with SEQ ID NO: 15; and the CDR3 sequence of SEQ ID NO: 20.
В дополнительном варианте осуществления антитело к ПСМА содержит любую из аминокислотных последовательностей вариабельной области тяжелой цепи с SEQ ID NO: 24-58 (табл. 2).In a further embodiment, the anti-PSMA antibody comprises any of the heavy chain variable region amino acid sequences of SEQ ID NO: 24-58 (Table 2).
В еще одном варианте осуществления антитело к ПСМА содержит последовательность вариабельной области тяжелой цепи с SEQ ID NO: 25.In yet another embodiment, the anti-PSMA antibody comprises a heavy chain variable region sequence of SEQ ID NO: 25.
В еще одном варианте осуществления антитело к ПСМА содержит последовательность вариабельной области тяжелой цепи с SEQ ID NO: 38.In yet another embodiment, the anti-PSMA antibody comprises the heavy chain variable region sequence of SEQ ID NO: 38.
В некоторых вариантах осуществления последовательность CDR в антителе к ПСМА по изобретению содержит одну или две аминокислотные замены относительно последовательности CDR1, CDR2 и/или CDR3 или набора последовательностей CDR1, CDR2 и CDR3 в любой из SEQ ID NO: 1-23 (табл. 1).In some embodiments, the CDR sequence in the anti-PSMA antibody of the invention contains one or two amino acid substitutions relative to the CDR1, CDR2 and/or CDR3 sequence or the set of CDR1, CDR2 and CDR3 sequences in any of SEQ ID NO: 1-23 (Table 1) .
В некоторых вариантах осуществления антитело к ПСМА предпочтительно содержит вариабельный домен тяжелой цепи (VH), в котором последовательность CDR3 имеет более или равную 80%, например, по меньшей мере 85%, по меньшей мере 90%, по меньшей мере 95%, или по меньшей мере 99% идентичность последовательности на аминокислотном уровне с последовательностью CDR3 любого из антител, чьи последовательности CDR3 представлены в табл. 1, и связывается с ПСМА.In some embodiments, the anti-PSMA antibody preferably comprises a heavy chain variable domain (VH) in which the CDR3 sequence is greater than or equal to 80%, such as at least 85%, at least 90%, at least 95%, or at least 99% sequence identity at the amino acid level with the CDR3 sequence of any of the antibodies whose CDR3 sequences are presented in table. 1, and binds to PSMA.
В некоторых вариантах осуществления антитело к ПСМА предпочтительно содержит вариабельный домен тяжелой цепи (VH), в котором полный набор CDR 1, 2 и 3 (объединенный) имеет более или равную восьмидесяти пяти процентам (85%) идентичность последовательности на аминокислотном уровне с CDR 1, 2 и 3 (объединенный) антител, чьи последовательности CDR представлены в таблице 1, и связывается с ПСМА.In some embodiments, the anti-PSMA antibody preferably comprises a heavy chain variable domain (VH) in which the full set of CDRs 1, 2, and 3 (combined) has greater than or equal to eighty-five percent (85%) sequence identity at the amino acid level with CDR 1. 2 and 3 (combined) antibodies, whose CDR sequences are presented in Table 1, and bind to PSMA.
В некоторых вариантах осуществления антитело к ПСМА предпочтительно содержит вариабельный домен тяжелой цепи (VH), в котором полный набор CDR 1, 2 и 3 (объединенный) имеет более или равную восьмидесяти пяти процентам (85%) идентичность последовательности на аминокислотном уровне с CDR 1, 2 и 3 (объединенных) антител, чьи последовательности CDR представлены в таблице 3, и связывается с ПСМА.In some embodiments, the anti-PSMA antibody preferably comprises a heavy chain variable domain (VH) in which the full set of CDRs 1, 2, and 3 (combined) has greater than or equal to eighty-five percent (85%) sequence identity at the amino acid level with CDR 1. 2 and 3 (combined) antibodies, whose CDR sequences are presented in Table 3, and bind to PSMA.
В некоторых вариантах осуществления антитело к ПСМА содержит последовательность вариабельной области тяжелой цепи с по меньшей мере около 80% идентичности, по меньшей мере 85% идентичности, по меньшей мере 90% идентичности, по меньшей мере 95% идентичности, по меньшей мере 98% идентичности или по меньшей мере 99% идентичности с любой из последовательностей вариабельной области тяжелой цепи SEQ ID NO: 24-58 (показано в табл. 2) и связывается с ПСМА.In some embodiments, the anti-PSMA antibody comprises a heavy chain variable region sequence with at least about 80% identity, at least 85% identity, at least 90% identity, at least 95% identity, at least 98% identity, or at least 99% identity with any of the heavy chain variable region sequences of SEQ ID NO: 24-58 (shown in Table 2) and binds to PSMA.
- 22 046268- 22 046268
В некоторых вариантах осуществления представлены биспецифические или полиспецифические антитела, которые могут иметь любую из конфигураций, обсуждаемых в данном документе, включая, без ограничения, биспецифическую трехцепочечную антителоподобную молекулу (ТСА). В некоторых вариантах осуществления полиспецифическое антитело может содержать по меньшей мере одну вариабельную область тяжелой цепи, обладающую специфичностью связывания в отношении ПСМА, и по меньшей мере одну вариабельную область тяжелой цепи, имеющую специфичность связывания в отношении белка, отличного от ПСМА. В некоторых вариантах осуществления полиспецифическое антитело может содержать вариабельную область тяжелой цепи, содержащую по меньшей мере два антигенсвязывающих домена, где каждый из антигенсвязывающих доменов имеет специфичность связывания в отношении ПСМА. В некоторых вариантах осуществления полиспецифическое антитело может содержать пару тяжелая цепь / легкая цепь, которая имеет специфичность связывания в отношении первого антигена (например, CD3), и тяжелую цепь из антитела, содержащего только тяжелые цепи. В некоторых вариантах осуществления тяжелая цепь антитела, содержащего только тяжелые цепи, содержит Fc-часть, содержащую домены СН2 и/или СН3 и/или СН4, в отсутствие домена СН1. В одном конкретном варианте осуществления биспецифическое антитело содержит пару тяжелая цепь / легкая цепь, которая имеет специфичность связывания в отношении антигена на эффекторной клетке (например, белок CD3 на Тклетке), и тяжелую цепь из антитела, содержащего только тяжелые цепи, содержащего антигенсвязывающий домен, имеющий специфичность связывания в отношении ПСМА.In some embodiments, bispecific or polyspecific antibodies are provided, which may have any of the configurations discussed herein, including, without limitation, a bispecific triple chain antibody (TCA) molecule. In some embodiments, a multispecific antibody may comprise at least one heavy chain variable region having a binding specificity for PSMA and at least one heavy chain variable region having a binding specificity for a protein other than PSMA. In some embodiments, the polyspecific antibody may comprise a heavy chain variable region comprising at least two antigen binding domains, wherein each of the antigen binding domains has a binding specificity for PSMA. In some embodiments, a polyspecific antibody may comprise a heavy chain/light chain pair that has binding specificity for a first antigen (eg, CD3) and a heavy chain from a heavy chain-only antibody. In some embodiments, the heavy chain of a heavy chain-only antibody comprises an Fc portion comprising CH2 and/or CH3 and/or CH4 domains, in the absence of a CH1 domain. In one specific embodiment, a bispecific antibody comprises a heavy chain/light chain pair that has binding specificity for an antigen on an effector cell (e.g., CD3 protein on a T cell), and a heavy chain from a heavy chain-only antibody comprising an antigen binding domain having binding specificity for PSMA.
В некоторых вариантах осуществления полиспецифическое антитело содержит CD3-связывающий домен VH, который спарен с вариабельным доменом легкой цепи. В определенных вариантах осуществления легкая цепь представляет собой фиксированную легкую цепь. В некоторых вариантах осуществления CD3-связывающий домен VH содержит последовательность CDR1 с SEQ ID NO: 59, последовательность CDR2 с SEQ ID NO: 60 и последовательность CDR3 с SEQ ID NO: 61 в каркасе VH человека. В некоторых вариантах осуществления фиксированная легкая цепь содержит последовательность CDR1 с SEQ ID NO: 62, последовательность CDR2 с SEQ ID NO: 63 и последовательность CDR3 с SEQ ID NO: 64 в каркасе VL человека. Вместе CD3-связывающий домен VH и вариабельный домен легкой цепи имеет аффинность связывания в отношении CD3. В некоторых вариантах осуществления CD3-связывающий домен VH содержит последовательность вариабельной области тяжелой цепи с SEQ ID NO: 65. В некоторых вариантах осуществления CD3-связывающий домен VH содержит последовательность, имеющую по меньшей мере около 80%, по меньшей мере около 85%, по меньшей мере около 90%, по меньшей мере около 95% или по меньшей мере около 99% идентичности с последовательностью вариабельной области тяжелой цепи с SEQ ID NO: 65. В некоторых вариантах осуществления фиксированная легкая цепь содержит последовательность вариабельной области легкой цепи с SEQ ID NO: 66. В некоторых вариантах осуществления фиксированная легкая цепь содержит последовательность, имеющую по меньшей мере около 80%, по меньшей мере около 85%, по меньшей мере около 90%, по меньшей мере около 95% или по меньшей мере около 99% идентичности с последовательностью вариабельной области тяжелой цепи с SEQ ID NO: 66.In some embodiments, the multispecific antibody comprises a CD3 binding VH domain that is paired with a light chain variable domain. In certain embodiments, the light chain is a fixed light chain. In some embodiments, the CD3 binding domain of the VH comprises a CDR1 sequence of SEQ ID NO: 59, a CDR2 sequence of SEQ ID NO: 60, and a CDR3 sequence of SEQ ID NO: 61 in the human VH backbone. In some embodiments, the fixed light chain comprises a CDR1 sequence of SEQ ID NO: 62, a CDR2 sequence of SEQ ID NO: 63, and a CDR3 sequence of SEQ ID NO: 64 in the human VL backbone. Together, the CD3 binding VH domain and the light chain variable domain have binding affinity for CD3. In some embodiments, the VH CD3 binding domain comprises a heavy chain variable region sequence of SEQ ID NO: 65. In some embodiments, the VH CD3 binding domain comprises a sequence having at least about 80%, at least about 85%, of at least about 90%, at least about 95%, or at least about 99% identity to the heavy chain variable region sequence of SEQ ID NO: 65. In some embodiments, the fixed light chain comprises the light chain variable region sequence of SEQ ID NO: : 66. In some embodiments, the fixed light chain comprises a sequence having at least about 80%, at least about 85%, at least about 90%, at least about 95%, or at least about 99% identity with the heavy chain variable region sequence of SEQ ID NO: 66.
Полиспецифические антитела, содержащие описанный выше CD3-связывающий домен VH и вариабельный домен легкой цепи, обладают полезными свойствами, например, как описано в опубликованной публикации заявки РСТ № WO2018/052503, описание которой полностью включено в данный документ посредством ссылки. Любые из описанных в данном документе полиспецифических антител и антигенсвязывающих доменов, имеющих аффинность связывания в отношении ПСМА, могут быть объединены с CD3-связывающими доменами и фиксированными доменами легкой цепи, описанными в данном документе (см., например, табл. 4 и табл. 5), как а также дополнительные последовательности, такие как представленные в табл. 6 и табл. 7, для создания полиспецифических антител, имеющих аффинность связывания в отношении одной или более эпитопов ПСМА, а также в отношении CD3.Multispecific antibodies containing the CD3 binding VH domain and light chain variable domain described above have useful properties, for example, as described in PCT Application Publication No. WO2018/052503, the disclosure of which is incorporated herein by reference in its entirety. Any of the polyspecific antibodies and antigen binding domains described herein having binding affinity for PSMA can be combined with the CD3 binding domains and fixed light chain domains described herein (see, for example, Table 4 and Table 5 ), as well as additional sequences such as those presented in Table. 6 and table. 7, to generate multispecific antibodies having binding affinity for one or more PSMA epitopes as well as CD3.
Таблица 4Table 4
Аминокислотные последовательности CDR1, CDR2, CDR3 тяжелых и легких цепей к CD3Amino acid sequences of CDR1, CDR2, CDR3 of heavy and light chains to CD3
Таблица 5Table 5
Аминокислотные последовательности вариабельных областей тяжелой и легкой цепи к CD3Amino acid sequences of CD3 heavy and light chain variable regions
- 23 046268- 23 046268
Таблица 6Table 6
Последовательности областей Fc человеческих IgG1 и IgG4Sequences of the Fc regions of human IgG1 and IgG4
Таблица 7Table 7
Дополнительные последовательностиAdditional Sequences
- 24 046268- 24 046268
- 25 046268- 25 046268
- 26 046268- 26 046268
В некоторых вариантах осуществления представлены биспецифические или полиспецифические антитела, которые могут иметь любую из конфигураций, обсуждаемых в данном документе, включая, без ограничения, биспецифическую трехцепочечную антителоподобную молекулу (ТСА). В некоторых вариантах осуществления биспецифическое антитело может содержать по меньшей мере одну вариабельную область тяжелой цепи, обладающую специфичностью связывания в отношении ПСМА и по меньшей мере одну вариабельную область тяжелой цепи, имеющую специфичность связывания в отношении белка, отличного от ПСМА. В некоторых вариантах осуществления биспецифическое антитело может содержать пару тяжелая цепь/легкая цепь, которая обладает специфичностью связывания в отношении первого антигена, и тяжелую цепь из антитела, содержащего только тяжелые цепи, содержащего Fc-часть, содержащую СН2 и/или СН3 и/или домены СН4, в отсутствие домена СН1, и антигенсвязывающего домена, который связывает эпитоп второго антигена или другой эпитоп первого антигена. В одном конкретном варианте осуществления биспецифическое антитело содержит пару тяжелая цепь/легкая цепь, которая имеет специфичность связывания в отношении антигена на эффекторной клетке (например, белок CD3 на Т-клетке), и тяжелую цепь из антитела, содержащего только тяжелые цепи, содержащего антигенсвязывающий домен, имеющий специфичность связывания в отношении ПСМА.In some embodiments, bispecific or polyspecific antibodies are provided, which may have any of the configurations discussed herein, including, without limitation, a bispecific triple chain antibody (TCA) molecule. In some embodiments, a bispecific antibody may comprise at least one heavy chain variable region having binding specificity for PSMA and at least one heavy chain variable region having binding specificity for a protein other than PSMA. In some embodiments, a bispecific antibody may comprise a heavy chain/light chain pair that has binding specificity for a first antigen, and a heavy chain from a heavy chain-only antibody comprising an Fc portion comprising CH2 and/or CH3 domains CH4, in the absence of a CH1 domain, and an antigen binding domain that binds an epitope of a second antigen or another epitope of a first antigen. In one specific embodiment, the bispecific antibody comprises a heavy chain/light chain pair that has binding specificity for an antigen on an effector cell (e.g., CD3 protein on a T cell), and a heavy chain from a heavy chain-only antibody containing an antigen binding domain , having binding specificity for PSMA.
В некоторых вариантах осуществления, когда антитело по изобретению представляет собой биспецифическое антитело, одно плечо антитела (один связывающий фрагмент или одна связывающая единица) является специфичным в отношении ПСМА человека, в то время как другое плечо может быть специфичным в отношении клеток-мишеней, ассоциированных с опухолью антигенов, нацеливающих антигенов, например, интегринов и т.д., антигенов патогенов, белков контрольных точек и т.п. Клеткимишени, в частности, включают раковые клетки, включая, без ограничения, клетки солидных опухолей, например, опухолей предстательной железы, как обсуждается ниже. В некоторых вариантах осуществления одно плечо антитела (один связывающий фрагмент или одна связывающая единица) является специфичным в отношении ПСМА человека, тогда как другое плечо является специфичным в отношении CD3.In some embodiments, when the antibody of the invention is a bispecific antibody, one arm of the antibody (one binding fragment or one binding unit) is specific for human PSMA, while the other arm may be specific for target cells associated with tumor antigens, targeting antigens such as integrins, etc., pathogen antigens, checkpoint proteins, etc. Target cells specifically include cancer cells, including, but not limited to, solid tumor cells, such as prostate tumors, as discussed below. In some embodiments, one arm of the antibody (one binding fragment or one binding unit) is specific for human PSMA, while the other arm is specific for CD3.
В некоторых вариантах осуществления антитело содержит полипептид легкой цепи к CD3, содержащий последовательность SEQ ID NO: 66, связанную с последовательностью SEQ ID NO: 79, полипептид тяжелой цепи к CD3, содержащий последовательность любой из SEQ ID NO: 80, 81, 82, 83, 84 или 85, и полипептид тяжелой цепи к ПСМА, содержащий последовательность любой из SEQ ID NO: 24-58, в одновалентной или двухвалентной конфигурации, связанную с последовательностью любой из SEQ ID NO: 75, 76, 77, 78, 84 или 85. Эти последовательности можно комбинировать различными способами для получения биспецифического антитела желаемого подкласса IgG, например, IgG1, IgG4, подвергнутого сайленсингу IgG1, подвергнутого сайленсингу IgG4. В одном предпочтительном варианте осуществления антитело представляет собой ТСА, содержащую первый полипептид, содержащий SEQ ID NO: 86, второй полипептид, содержащий SEQ ID NO: 87, и третий полипептид, содержащий SEQ ID NO: 88, 89, 90, 91, 92 или 93. В одном предпочтительном варианте осуществления антитело представляет собой ТСА, состоящую из первого полипептида, состоящего из SEQ ID NO: 86, второго полипептида, состоящего из SEQ ID NO: 87, и третьего полипептида, состоящего из SEQ ID NO: 88, 89, 90, 91, 92 или 93.In some embodiments, the antibody comprises an anti-CD3 light chain polypeptide comprising the sequence of SEQ ID NO: 66 linked to the sequence of SEQ ID NO: 79, an anti-CD3 heavy chain polypeptide comprising the sequence of any of SEQ ID NO: 80, 81, 82, 83 , 84 or 85, and an anti-PSMA heavy chain polypeptide containing the sequence of any of SEQ ID NOs: 24-58, in a monovalent or divalent configuration, linked to the sequence of any of SEQ ID NOs: 75, 76, 77, 78, 84 or 85 These sequences can be combined in various ways to produce a bispecific antibody of the desired IgG subclass, eg IgG1, IgG4, IgG1-silenced, IgG4-silenced. In one preferred embodiment, the antibody is a TCA comprising a first polypeptide comprising SEQ ID NO: 86, a second polypeptide comprising SEQ ID NO: 87, and a third polypeptide comprising SEQ ID NO: 88, 89, 90, 91, 92, or 93. In one preferred embodiment, the antibody is a TCA consisting of a first polypeptide consisting of SEQ ID NO: 86, a second polypeptide consisting of SEQ ID NO: 87, and a third polypeptide consisting of SEQ ID NO: 88, 89. 90, 91, 92 or 93.
В объем изобретения входят различные форматы полиспецифических антител, включая, без ограничения, одноцепочечные полипептиды, двухцепочечные полипептиды, трехцепочечные полипептиды, четырехцепочечные полипептиды и их кратные им полипептиды. Полиспецифические антитела в данном документе, в частности, включают полиспецифические (например, биспецифические) Т-клеточные антитела, связывающиеся с ПСМА и CD3 (антитела к ПСМА х CD3). Такие антитела вызывают сильное опосредованное Т-клетками уничтожение клеток, экспрессирующих ПСМА.The invention includes various formats of multispecific antibodies, including, without limitation, single chain polypeptides, double chain polypeptides, triple chain polypeptides, quadruple chain polypeptides and polypeptides thereof. Polyspecific antibodies herein specifically include polyspecific (eg, bispecific) T cell antibodies that bind to PSMA and CD3 (anti-PSMA x CD3). Such antibodies cause potent T cell-mediated killing of cells expressing PSMA.
- 27 046268- 27 046268
Получение антител к ПСМА.Obtaining antibodies to PSMA.
Антитела по настоящему изобретению можно получить способами, известными в данной области техники. В предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения антитела продуцируются трансгенными животными, включая трансгенных мышей и крыс, предпочтительно крыс, у которых гены эндогенных иммуноглобулинов нокаутированы или отключены. В предпочтительном варианте осуществления антитела, содержащие только тяжелые цепи, согласно данному изобретению продуцируются в UniRat™. У UniRat™ гены эндогенного иммуноглобулина подвергнуты сайленсингу, и используется транслокус тяжелой цепи иммуноглобулина человека для экспрессии разнообразного, оптимизированного естественным образом репертуара полностью человеческих HCAb. В то время как эндогенные локусы иммуноглобулина у крыс могут быть нокаутированы или подвергнуты сайленсингу с использованием различных технологий, в UniRat™ для инактивации эндогенного J-локуса тяжелой цепи крысы, локуса Ск легкой цепи и локуса Ολ легкой цепи была использована технология с использованием (эндо)нуклеазы с цинковыми пальцами (ZNF). Конструкции ZNF для микроинъекций в ооциты могут продуцировать нокаутные (KO) по IgH и IgL линии. Подробнее см., например, Geurts et al., 2009, Science 325:433. Characterization of Ig heavy chain knockout rats has been reported by Menoret et al., 2010, Eur. J. Immunol. 40:2932-2941. Преимущества технологии ZNF заключаются в том, что негомологичное соединение концов для сайленсинга гена или локуса посредством делеций до нескольких т.п.н. также может обеспечивать сайт-мишень для гомологичной интеграции (Cui et al., 2011, Nat Biotechnol 29:64-67). Человеческие антитела, содержащие только тяжелые цепи, продуцируемые в UniRat™, называются UniAb™ и могут связывать эпитопы, которые нельзя атаковать с помощью обычных антител. Их высокая специфичность, аффинность и небольшой размер делают их идеальными для моно- и полиспецифических применений.Antibodies of the present invention can be obtained by methods known in the art. In a preferred embodiment of the present invention, the antibodies are produced by transgenic animals, including transgenic mice and rats, preferably rats in which the endogenous immunoglobulin genes are knocked out or disabled. In a preferred embodiment, the heavy chain only antibodies of the present invention are produced in UniRat™. UniRat™ silences endogenous immunoglobulin genes and utilizes the human immunoglobulin heavy chain translocus to express a diverse, naturally optimized repertoire of fully human HCAbs. While endogenous immunoglobulin loci in rats can be knocked out or silenced using a variety of technologies, UniRat™ used (endo) technology to inactivate the endogenous rat heavy chain J locus, light chain K locus, and light chain Ολ locus. Zinc finger nucleases (ZNFs). ZNF constructs for microinjection into oocytes can produce IgH and IgL knockout (KO) lines. For more details see, for example, Geurts et al., 2009, Science 325:433. Characterization of Ig heavy chain knockout rats has been reported by Menoret et al., 2010, Eur. J. Immunol. 40:2932–2941. The advantages of ZNF technology are that non-homologous end joining to silence a gene or locus through deletions up to several kb. may also provide a target site for homologous integration (Cui et al., 2011, Nat Biotechnol 29:64-67). Human antibodies containing only the heavy chains produced in UniRat™ are called UniAb™ and can bind epitopes that cannot be attacked by conventional antibodies. Their high specificity, affinity and small size make them ideal for mono- and polyspecific applications.
В дополнение к UniAb™, в частности, в данный документ включены антитела, содержащие только тяжелые цепи, лишенные верблюжьего каркаса и мутаций VHH, и их функциональные области VH. Такие антитела, содержащие только тяжелые цепи, могут, например, быть продуцированы у трансгенных крыс или мышей, которые содержат локусы генов, полностью состоящих только из тяжелых цепей человека, как описано, например, в WO2006/008548, но и у других трансгенных млекопитающих, таких как кролик, морская свинка, также можно использовать крыс, причем предпочтительны крысы и мыши. Антитела, содержащие только тяжелые цепи, включая их функциональные фрагменты VHH или VH, также могут быть получены с помощью технологии рекомбинантной ДНК путем экспрессии кодирующей нуклеиновой кислоты в подходящем эукариотическом или прокариотическом хозяине, включая, например, клетки млекопитающих (например, клетки СНО), Е. coli или дрожжи.In addition to UniAb™, specifically included herein are antibodies containing only heavy chains free of the camel backbone and VHH mutations and their functional VH regions. Such heavy chain-only antibodies can, for example, be produced in transgenic rats or mice that contain gene loci consisting entirely of human heavy chains, as described, for example, in WO2006/008548, but also in other transgenic mammals, such as rabbit, guinea pig, rats can also be used, with rats and mice being preferred. Antibodies containing only heavy chains, including functional VHH or VH fragments thereof, can also be produced using recombinant DNA technology by expressing the encoding nucleic acid in a suitable eukaryotic or prokaryotic host, including, for example, mammalian cells (eg, CHO cells), E coli or yeast.
Домены антител, содержащих только тяжелые цепи, сочетают в себе преимущества антител и низкомолекулярные лекарственные средства: могут быть одновалентными или многовалентными; обладают низкой токсичностью; и экономически эффективны в производстве. Из-за их небольшого размера эти домены просты в применении, включая пероральное или местное введение, характеризуются высокой стабильностью, включая стабильность в желудочно-кишечном тракте; и их период полужизни может быть адаптирован к желаемому применению или показаниям. Кроме того, домены VH и VHH HCAb могут быть получены экономически эффективным способом.Heavy chain-only antibody domains combine the benefits of antibodies and small molecule drugs: can be monovalent or multivalent; have low toxicity; and are cost effective to produce. Due to their small size, these domains are easy to administer, including oral or topical administration, and are characterized by high stability, including stability in the gastrointestinal tract; and their half-life can be tailored to the desired use or indication. In addition, the VH and VHH domains of HCAbs can be produced in a cost-effective manner.
В конкретном варианте осуществления антитела, содержащие только тяжелые цепи, согласно данному изобретению, включая UniAb™, имеют нативный аминокислотный остаток в первом положении области FR4 (аминокислотное положение 101 согласно системе нумерации Kabat), замещенный другим аминокислотным остатком, который способен разрушать экспонированный на поверхности гидрофобный участок, содержащий или связанный с нативным аминокислотным остатком в этом положении. Такие гидрофобные участки, как правило, скрыты на поверхности взаимодействия с константной областью легкой цепи антитела, но становятся доступными на поверхности в HCAb и, по меньшей мере частично, служат для нежелательной агрегации и ассоциации легкой цепи HCAb. Замещенный аминокислотный остаток предпочтительно является заряженным и более предпочтительно положительно заряженным, например, лизином (Lys, K), аргинином (Arg, R) или гистидином (His, H), предпочтительно аргинином (R). В предпочтительном варианте осуществления антитела, содержащие только тяжелые цепи, полученные от трансгенных животных, содержат мутацию Trp в Arg в положении 101. Получаемые в результате HCAb предпочтительно обладают высокой аффинностью связывания с антигеном и растворимостью в физиологических условиях в отсутствие агрегации.In a specific embodiment, the heavy chain only antibodies of the present invention, including UniAb™, have a native amino acid residue at the first position of the FR4 region (amino acid position 101 according to the Kabat numbering system) replaced by another amino acid residue that is capable of disrupting the surface exposed hydrophobic a region containing or linked to a native amino acid residue at that position. Such hydrophobic regions are typically buried at the surface interacting with the antibody light chain constant region but become surface accessible in the HCAb and, at least in part, serve to promote undesired aggregation and association of the HCAb light chain. The substituted amino acid residue is preferably charged and more preferably positively charged, for example lysine (Lys, K), arginine (Arg, R) or histidine (His, H), preferably arginine (R). In a preferred embodiment, heavy chain only antibodies obtained from transgenic animals contain a Trp to Arg mutation at position 101. The resulting HCAbs preferably have high antigen binding affinity and solubility under physiological conditions in the absence of aggregation.
В рамках настоящего изобретения были идентифицированы человеческие антитела IgG, содержащие только тяжелые цепи, к ПСМА с уникальными последовательностями от животных UniRat™ (UniAb™), которые связываются с ПСМА человека в анализах белков и связывания клеток на основе ИФА. Идентифицированные последовательности вариабельной области тяжелой цепи (VH) положительны в отношении связывания белка ПСМА человека и/или связывания с ПСМА+ клетками, и все они отрицательны в отношении связывания с клетками, которые не экспрессируют ПСМА; см., например, табл. 8.The present invention has identified human heavy chain-only IgG antibodies to PSMA with unique sequences from animal UniRat™ (UniAb™) that bind to human PSMA in ELISA-based protein and cell binding assays. The variable heavy chain (VH) sequences identified are positive for human PSMA protein binding and/or binding to PSMA+ cells, and all are negative for binding to cells that do not express PSMA; see, for example, table. 8.
Антитела, содержащие только тяжелые цепи, которые связываются с неперекрывающимися эпитопами на белке ПСМА, например, UniAb™, можно идентифицировать с помощью анализов конкурентноHeavy chain-only antibodies that bind to non-overlapping epitopes on the PSMA protein, such as UniAb™, can be identified using competitive assays
- 28 046268 го связывания, таких как иммуноферментные анализы (ИФА) или анализы конкурентного связывания на основе проточной цитометрии. Например, можно использовать конкуренцию между известными антителами, связывающимися с антигеном-мишенью, и представляющим интерес антителом. Используя этот подход, можно разделить набор антител на те, которые конкурируют с эталонным антителом, и те, которые не конкурируют. Неконкурирующие антитела идентифицируются как связывающиеся с отдельным эпитопом, который не перекрывается с эпитопом, связанным эталонным антителом. Часто одно антитело иммобилизуют, антиген связывается, а второе, меченое (например, биотинилированное) антитело тестируют в анализе на основе ИФА на способность связывать захваченный антиген. Это также можно сделать с помощью платформ для поверхностного плазмонного резонанса (НИР), включая ProteOn XPR36 (BioRad, Inc), Biacore 2000 и Biacore T200 (GE Healthcare Life Sciences) и системе визуализации для НИР МХ96 (Ibis technologies BV), a также на других платформах для биослойной интерферометрии, таких как Octet Red384 и Octet HTX (ForteBio, Pall Inc). Для получения дополнительных сведений см. Примеры в данном документе.- 28 046268 binding, such as enzyme-linked immunosorbent assays (ELISAs) or flow cytometry-based competitive binding assays. For example, competition between known antibodies that bind to a target antigen and the antibody of interest can be used. Using this approach, it is possible to separate a set of antibodies into those that compete with the reference antibody and those that do not. Non-competing antibodies are identified as binding to a distinct epitope that does not overlap with the epitope bound by the reference antibody. Often, one antibody is immobilized, the antigen is bound, and a second, labeled (eg, biotinylated) antibody is tested in an ELISA assay for its ability to bind the captured antigen. This can also be done using surface plasmon resonance (SPR) platforms including ProteOn XPR36 (BioRad, Inc), Biacore 2000 and Biacore T200 (GE Healthcare Life Sciences) and the SPR MX96 imaging system (Ibis technologies BV), as well as other biolayer interferometry platforms such as Octet Red384 and Octet HTX (ForteBio, Pall Inc). For more information, see the examples in this document.
Как правило, антитело конкурирует с эталонным антителом, если оно вызывает примерно 15100% снижение связывания эталонного антитела с антигеном-мишенью, как определено стандартными методами, например, с помощью анализов конкурентного связывания, описанных выше. В различных вариантах осуществления относительное ингибирование составляет по меньшей мере около 15%, по меньшей мере около 20%, по меньшей мере около 25%, по меньшей мере около 30%, по меньшей мере около 35%, по меньшей мере около 40%, по меньшей мере около 45%, по меньшей мере около 50%, по меньшей мере около 55%, по меньшей мере около 60%, по меньшей мере около 65%, по меньшей мере около 70%, по меньшей мере около 75%, по меньшей мере около 80%, по меньшей мере около 85%, по меньшей мере около 90%, по меньшей мере около 95% или выше.Typically, an antibody competes with a reference antibody if it causes approximately 15-100% reduction in binding of the reference antibody to the target antigen, as determined by standard methods, such as the competitive binding assays described above. In various embodiments, the relative inhibition is at least about 15%, at least about 20%, at least about 25%, at least about 30%, at least about 35%, at least about 40%, at least about 45%, at least about 50%, at least about 55%, at least about 60%, at least about 65%, at least about 70%, at least about 75%, at least at least about 80%, at least about 85%, at least about 90%, at least about 95% or higher.
Фармацевтические композиции, применение и способы леченияPharmaceutical compositions, uses and methods of treatment
Другим аспектом данного изобретения является предложение фармацевтических композиций, содержащих одно или более антител по настоящему изобретению в смеси с подходящим фармацевтически приемлемым носителем. Фармацевтически приемлемые носители, используемые в данном документе, например, но не ограничиваются ими, адъюванты, твердые носители, вода, буферы или другие носители, используемые в данной области для хранения терапевтических компонентов или их комбинаций.Another aspect of the present invention is to provide pharmaceutical compositions containing one or more antibodies of the present invention in admixture with a suitable pharmaceutically acceptable carrier. Pharmaceutically acceptable carriers used herein include, for example, but are not limited to, adjuvants, solid carriers, water, buffers, or other carriers used in the art for storing therapeutic components or combinations thereof.
В одном варианте осуществления фармацевтическая композиция содержит антитело, содержащее только тяжелые цепи, (например, UniAb™), которое связывается с НСМА. В другом варианте осуществления фармацевтическая композиция содержит полиспецифическое (включая биспецифическое) антитело, содержащее только тяжелые цепи, (например, UniAb™) со специфичностью связывания в отношении двух или более неперекрывающихся эпитопов на белке НСМА. В предпочтительном варианте осуществления фармацевтическая композиция содержит полиспецифическое (включая биспецифическое и ТСА) антитело, содержащее только тяжелые цепи, (например, UniAb™) со специфичностью связывания с НСМА и со специфичностью связывания с мишенью связывания на эффекторной клетке (например, мишенью связывания на Т-клетке, такой как, например, белок CD3 на Т-клетке).In one embodiment, the pharmaceutical composition contains a heavy chain-only antibody (eg, UniAb™) that binds to HCMA. In another embodiment, the pharmaceutical composition contains a multispecific (including bispecific) heavy chain-only antibody (eg, UniAb™) with binding specificity for two or more non-overlapping epitopes on the HCMA protein. In a preferred embodiment, the pharmaceutical composition contains a multispecific (including bispecific and TCA) heavy chain-only antibody (eg, UniAb™) with binding specificity for HCMA and with binding specificity for a binding target on an effector cell (eg, a binding target on T- cell, such as the CD3 protein on a T cell).
Фармацевтические композиции антител, используемые в соответствии с настоящим изобретением, получают для хранения путем смешивания белков, имеющих желаемую степень чистоты, с необязательными фармацевтически приемлемыми носителями, эксципиентами или стабилизаторами (см., например, Remington's Pharmaceutical Sciences 16th edition, Osol, A. Ed. (1980)), например, в виде лиофилизированных составов или водных растворов. Нриемлемые носители, эксципиенты или стабилизаторы являются нетоксичными для реципиентов при используемых дозировках и концентрациях и включают в себя буферы, такие как фосфат, цитрат и другие органические кислоты; антиоксиданты, включая аскорбиновую кислоту и метионин; консерванты (такие как хлорид октадецилдиметилбензиламмония; хлорид гексаметония; хлорид бензалкония, хлорид бензетония; фенол, бутиловый или бензиловый спирт; алкилпарабены, такие как метил или пропилпарабен; катехол; резорцинол; циклогексанол; 3-пентанол; и м-крезол); низкомолекулярные (менее около 10 остатков) полипептиды; белки, такие как сывороточный альбумин, желатин или иммуноглобулины; гидрофильные полимеры, такие как поливинилпирролидон; аминокислоты, такие как глицин, глутамин, аспарагин, гистидин, аргинин или лизин; моносахариды, дисахариды и другие углеводы, включая глюкозу, маннозу или декстрины; хелатообразующие агенты, такие как ЭДТА; сахара, такие как сахароза, маннит, трегалоза или сорбит; солеобразующие противоионы, такие как натрий; комплексы металлов (например, комплексы Zn-белок); и/или неионные поверхностно-активные вещества, такие как TWEEN™, PLURONICS™ или полиэтиленгликоль (НЭГ).Pharmaceutical compositions of antibodies used in accordance with the present invention are prepared for storage by mixing proteins having the desired degree of purity with optional pharmaceutically acceptable carriers, excipients or stabilizers (see, for example, Remington's Pharmaceutical Sciences 16th edition, Osol, A. Ed. (1980)), for example, in the form of lyophilized formulations or aqueous solutions. Acceptable carriers, excipients or stabilizers are non-toxic to recipients at the dosages and concentrations used and include buffers such as phosphate, citrate and other organic acids; antioxidants including ascorbic acid and methionine; preservatives (such as octadecyldimethylbenzylammonium chloride; hexamethonium chloride; benzalkonium chloride, benzethonium chloride; phenol, butyl or benzyl alcohol; alkylparabens such as methyl or propylparaben; catechol; resorcinol; cyclohexanol; 3-pentanol; and m-cresol); low molecular weight (less than about 10 residues) polypeptides; proteins such as serum albumin, gelatin or immunoglobulins; hydrophilic polymers such as polyvinylpyrrolidone; amino acids such as glycine, glutamine, asparagine, histidine, arginine or lysine; monosaccharides, disaccharides and other carbohydrates, including glucose, mannose or dextrins; chelating agents such as EDTA; sugars such as sucrose, mannitol, trehalose or sorbitol; salt-forming counterions such as sodium; metal complexes (eg Zn-protein complexes); and/or non-ionic surfactants such as TWEEN™, PLURONICS™ or polyethylene glycol (PEG).
Фармацевтические композиции для парентерального введения предпочтительно стерильны и по существу изотоничны и произведены согласно условиям правил производства и контроля качества лекарственных средств (GMP). Фармацевтические композиции могут быть предложены в единичной дозированной форме (например, дозировка для единичного введения). Состав зависит от выбранного пути введения. Антитела описанные в данном документе могут вводиться посредством внутривенной инъекции или инфузии, или подкожно. Для инъекционного введения, антитела описанные в данном документе могут быть составлены в водных растворах, предпочтительно в физиологически-совместимых буферахPharmaceutical compositions for parenteral administration are preferably sterile and substantially isotonic and manufactured under GMP conditions. The pharmaceutical compositions may be provided in unit dosage form (eg, unit dosage). The composition depends on the chosen route of administration. The antibodies described herein can be administered by intravenous injection or infusion, or subcutaneously. For injection administration, the antibodies described herein can be formulated in aqueous solutions, preferably in physiologically compatible buffers
- 29 046268 для уменьшения дискомфорта в месте инъекции. Раствор может содержать носители, вспомогательные вещества или стабилизаторы как описано выше. В качестве альтернативы, антитела могут быть лиофилизированы для смешивания с подходящим носителем, например, стерильной апирогенной водой, перед использованием.- 29 046268 to reduce discomfort at the injection site. The solution may contain carriers, auxiliaries or stabilizers as described above. Alternatively, the antibodies can be lyophilized for mixing with a suitable vehicle, such as sterile pyrogen-free water, before use.
Составы антител описаны, например, в патенте США № 9034324. Подобные составы могут быть использованы для антител, содержащих только тяжелые цепи, включая UniAb™, по данному изобретению. Составы антител для подкожного введения описаны, например, в патентах US20160355591 и US20160166689.Antibody formulations are described, for example, in US Pat. No. 9,034,324. Similar formulations may be used for heavy chain-only antibodies, including UniAb™, of the present invention. Antibody formulations for subcutaneous administration are described, for example, in patents US20160355591 and US20160166689.
Способы применения.Methods of application.
Антитела к ПСМА и фармацевтические композиции, описанные в данном документе, можно применять для лечения заболеваний и патологических состояний, характеризующихся экспрессией ПСМА, включая, без ограничения, патологические состояния и заболевания, описанные далее в данном документе.The anti-PSMA antibodies and pharmaceutical compositions described herein can be used to treat diseases and conditions characterized by expression of PSMA, including, without limitation, the conditions and diseases described later herein.
ПСМА представляет собой трансмембранный белок типа II, который экспрессируется в ткани эпителия предстательной железы и его экспрессия усиливается в злокачественном новообразовании предстательной железы и в новой сосудистой сети солидных опухолей. Он также экспрессируется на низких уровнях в нормальных тканях, таких как мозг, почки и слюнные железы, но его избыточная экспрессия в злокачественной ткани предстательной железы делает его привлекательной мишенью для терапевтического лечения злокачественного новообразования предстательной железы. Он также может быть актуален для терапии или визуализации солидных опухолей, учитывая его высокую экспрессию в злокачественных новообразованных сосудах. Моноклональные антитела, конъюгаты антитело-лекарственное средство и Т-клетки с химерным антигенным рецептором, нацеленные на ПСМА, были описаны для лечения метастатического злокачественного новообразования предстательной железы (Hernandez-Hoyos et al., 2016, PMID: 27406985, DiPippo et al., 2014, PMID: 25327986, Serganova et al., 2016, PMID: 28345023). Кроме того, радионуклидные конъюгаты, специфичные для ПСМА, исследуют в отношении визуализации и лечения злокачественного новообразования предстательной железы (например, Hofman et al., 2018 PMID: 29752180).PSMA is a type II transmembrane protein that is expressed in prostate epithelial tissue and its expression is upregulated in prostate malignancy and in new vasculature of solid tumors. It is also expressed at low levels in normal tissues such as the brain, kidney and salivary glands, but its overexpression in prostate malignancy makes it an attractive target for the therapeutic treatment of prostate malignancy. It may also be relevant for therapy or imaging of solid tumors, given its high expression in malignant neovascularization. Monoclonal antibodies, antibody-drug conjugates, and chimeric antigen receptor T cells targeting PSMA have been described for the treatment of metastatic prostate malignancy (Hernandez-Hoyos et al., 2016, PMID: 27406985, DiPippo et al., 2014 , PMID: 25327986, Serganova et al., 2016, PMID: 28345023). Additionally, PSMA-specific radionuclide conjugates are being explored for imaging and treatment of prostate malignancy (e.g., Hofman et al., 2018 PMID: 29752180).
В одном аспекте указанные в данном документе антитела к ПСМА (например, UniAb™) и фармацевтические композиции могут быть использованы для лечения расстройств, характеризующихся экспрессией ПСМА, включая, без ограничения, злокачественное новообразование предстательной железы и солидные опухоли.In one aspect, anti-PSMA antibodies (eg, UniAb™) and pharmaceutical compositions provided herein can be used to treat disorders characterized by PSMA expression, including, but not limited to, prostate cancer and solid tumors.
Эффективные дозы композиций согласно данному изобретению для лечения заболевания варьируются в зависимости от многих различных факторов, включая способы введения, место назначения, физиологическое состояние пациента, является ли пациент человеком или животным, вводятся ли другие лекарственные препараты, и является ли лечение профилактическим или терапевтическим. Обычно пациентом является человек, но млекопитающие, отличные от человека, также могут поддаваться лечению, например, домашние животные, такие как собаки, кошки, лошади и т.д., лабораторные млекопитающие, такие как кролики, мыши, крысы и т.д., и тому подобное. Для оптимизации безопасности и эффективности можно подбирать лекарственные дозировки.Effective dosages of the compositions of this invention for treating a disease vary depending on many different factors, including routes of administration, destination, physiological condition of the patient, whether the patient is human or animal, whether other drugs are administered, and whether the treatment is prophylactic or therapeutic. Typically the patient is a human, but non-human mammals may also be treated, such as domestic animals such as dogs, cats, horses, etc., laboratory mammals such as rabbits, mice, rats, etc. , etc. Drug dosages can be adjusted to optimize safety and effectiveness.
Уровни дозировки могут быть легко определены обычным квалифицированным врачом и могут быть изменены при необходимости, например, при необходимости изменения реакции субъекта на терапию. Количество действующего вещества, которое можно комбинировать с материалами носителя для получения единичной лекарственной формы, варьируется в зависимости от хозяина, который поддается лечению, и конкретного способа введения. Стандартные лекарственные формы обычно содержат от около 1 мг до около 500 мг действующего вещества.Dosage levels can be readily determined by a person of ordinary skill in the art and may be adjusted as necessary, for example, to change the subject's response to therapy. The amount of active ingredient that can be combined with carrier materials to form a unit dosage form varies depending on the host being treated and the particular route of administration. Unit dosage forms typically contain from about 1 mg to about 500 mg of active ingredient.
В некоторых вариантах осуществления терапевтическая дозировка агента может составлять от около 0,0001 до 100 мг/кг и более обычно от 0,01 до 5 мг/кг от массы тела хозяина. Например, дозировка может составлять 1 мг/кг массы тела или 10 мг/кг массы тела или в пределах 1-10 мг/кг. Иллюстративный режим лечения включает введение один раз каждые две недели или один раз в месяц или один раз каждые 3-6 месяцев. Терапевтические вещества по настоящему изобретению обычно вводят несколько раз. Интервалы между однократными дозами могут быть еженедельными, ежемесячными или ежегодными. Интервалы также могут быть нерегулярными, на что указывает измерение уровня терапевтического вещества в крови пациента. Альтернативно, терапевтические вещества по настоящему изобретению можно вводить в виде композиции с замедленным высвобождением, и в этом случае требуется менее частое введение. Дозировка и частота варьируются в зависимости от периода полужизни полипептида у пациента.In some embodiments, the therapeutic dosage of the agent may be from about 0.0001 to 100 mg/kg, and more typically from 0.01 to 5 mg/kg, based on the body weight of the host. For example, the dosage may be 1 mg/kg body weight or 10 mg/kg body weight, or in the range of 1-10 mg/kg. An exemplary treatment regimen includes administration once every two weeks or once a month or once every 3-6 months. The therapeutic agents of the present invention are typically administered multiple times. The intervals between single doses may be weekly, monthly or annual. The intervals may also be irregular, as indicated by measuring the level of the therapeutic substance in the patient's blood. Alternatively, the therapeutic agents of the present invention may be administered as a sustained release composition, in which case less frequent administration is required. Dosage and frequency vary depending on the half-life of the polypeptide in the patient.
Как правило, композиции готовят в виде инъекционных препаратов, либо в виде жидких растворов, либо суспензий; также могут быть получены твердые формы, подходящие для растворения или суспендирования в жидких носителях перед инъекцией. Фармацевтические композиции описанные в данном документе подходят для внутривенного или подкожного введения, непосредственно или после восстановления из твердой (т.е., лиофилизированной) композиции. Препарат также может быть эмульгирован или инкапсулирован в липосомы или микрочастицы, такие как полилактид, полигликолид или сополиTypically, the compositions are prepared as injectable preparations, either as liquid solutions or suspensions; Solid forms suitable for dissolution or suspension in liquid vehicles prior to injection may also be prepared. The pharmaceutical compositions described herein are suitable for intravenous or subcutaneous administration, directly or after reconstitution from a solid (ie, lyophilized) composition. The drug may also be emulsified or encapsulated in liposomes or microparticles such as polylactide, polyglycolide or copoly
- 30 046268 мер, для усиления адъювантного эффекта, как описано выше. Langer, Science 249: 1527, 1990 и Hanes, Advanced Drug Delivery Reviews 28: 97-119, 1997. Агенты согласно данному изобретению можно вводить в форме депо-инъекции или препарата имплантата, который может быть составлен таким образом, чтобы обеспечить длительное или пульсирующее высвобождение действующего вещества. Фармацевтические композиции, как правило, составлены как стерильные, практически изотонические и полностью соответствующие всем нормам Правил производства и контроля качества лекарственных средств (GMP) Управления по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.- 30 046268 measures to enhance the adjuvant effect, as described above. Langer, Science 249: 1527, 1990 and Hanes, Advanced Drug Delivery Reviews 28: 97-119, 1997. The agents of this invention can be administered in the form of a depot injection or implant preparation, which can be formulated to provide prolonged or pulsatile release of the active substance. Pharmaceutical compositions are generally formulated to be sterile, substantially isotonic, and fully compliant with all US Food and Drug Administration (GMP) regulations.
Токсичность антител и структур антител, описанных в данном документе, может быть определена стандартными фармацевтическими процедурами на клеточных культурах или экспериментальных животных, например, путем определения LD50 (доза, летальная для 50% популяции) или LD100 (доза, летальная для 100% популяции). Соотношение доз между токсическим и терапевтическим эффектом является терапевтическим показателем. Данные, полученные из этих анализов клеточных культур и исследований на животных, могут быть использованы при составлении диапазона доз, который не токсичен для применения у людей. Дозировка антител, описанных в данном документе, предпочтительно находится в диапазоне циркулирующих концентраций, которые включают эффективную дозу с небольшой токсичностью или без нее. Дозировка может варьироваться в пределах данного диапазона в зависимости от используемой дозы и используемого пути введения. Точный состав, способ введения и дозировка могут быть выбраны индивидуально врачом с учетом состояния пациента.The toxicity of the antibodies and antibody structures described herein can be determined by standard pharmaceutical procedures in cell cultures or experimental animals, for example, by determining the LD50 (dose lethal to 50% of a population) or LD100 (dose lethal to 100% of a population). The dose ratio between toxic and therapeutic effects is the therapeutic indicator. Data obtained from these cell culture assays and animal studies can be used to develop dosage ranges that are not toxic for use in humans. The dosage of the antibodies described herein is preferably within a range of circulating concentrations that include an effective dose with little or no toxicity. The dosage may vary within this range depending on the dose used and the route of administration used. The exact composition, route of administration and dosage can be selected individually by the doctor, taking into account the patient’s condition.
Композиции для введения обычно содержат антитело или другой абляционный агент, растворенный в фармацевтически приемлемом носителе, предпочтительно в водном носителе. Могут быть использованы различные водные носители, например, забуференный солевой раствор и тому подобное. Данные растворы являются стерильными и, как правило, не содержат нежелательных веществ. Данные композиции могут быть стерилизованы обычными, хорошо известными способами стерилизации. Композиции могут содержать фармацевтически приемлемые вспомогательные вещества, необходимые для приближения их к физиологическим условиям, такие как регулирующие рН агенты и буферные агенты, регулирующие токсичность агенты и тому подобное, например ацетат натрия, хлорид натрия, хлорид калия, хлорид кальция, лактат натрия и тому подобное. Концентрация активного агента в данных составах может варьироваться в широких пределах и будет выбираться в основном на основе объемов жидкости, вязкости, массы тела и тому подобного в соответствии с конкретным выбранным способом введения и потребностями пациента (например, Remington's Pharmaceutical Science (15th ed., 1980) и Goodman & Gillman, The Pharmacological Basis of Therapeutics (Hardman et al, eds., 1996)).Compositions for administration typically contain an antibody or other ablative agent dissolved in a pharmaceutically acceptable carrier, preferably an aqueous vehicle. Various aqueous vehicles can be used, for example, buffered saline and the like. These solutions are sterile and generally free of unwanted substances. These compositions can be sterilized by conventional, well known sterilization methods. The compositions may contain pharmaceutically acceptable excipients necessary to approximate physiological conditions, such as pH adjusting agents and buffering agents, toxicity adjusting agents and the like, for example sodium acetate, sodium chloride, potassium chloride, calcium chloride, sodium lactate and the like . The concentration of active agent in these formulations can vary widely and will be selected based primarily on fluid volumes, viscosity, body weight, and the like, in accordance with the particular route of administration chosen and the needs of the patient (eg, Remington's Pharmaceutical Science (15th ed., 1980) ) and Goodman & Gillman, The Pharmacological Basis of Therapeutics (Hardman et al, eds., 1996)).
Также в объем изобретения входят наборы, содержащие активные агенты и их составы, изобретения и инструкции по применению. Набор может дополнительно содержать по меньшей мере один дополнительный компонент, например, химиотерапевтический препарат и др. Наборы, как правило, включают этикетку, указывающую на предполагаемое применение содержимого набора. Используемый в данном документе термин этикетка включает любые письменные или записанные материалы, поставляемые в наборе или вместе с ним, или иным образом сопровождающие набор.Also included within the scope of the invention are kits containing active agents and their compositions, inventions and instructions for use. The kit may further contain at least one additional component, for example, a chemotherapy drug, etc. Kits typically include a label indicating the intended use of the contents of the kit. As used herein, the term label includes any written or recorded materials supplied in or with the kit or otherwise accompanying the kit.
Теперь, когда изобретение полностью описано, для специалиста в данной области техники будет очевидно, что различные изменения и модификации могут быть сделаны без отклонения от сущности или объема изобретения.Now that the invention has been fully described, it will be apparent to one skilled in the art that various changes and modifications may be made without departing from the spirit or scope of the invention.
ПримерыExamples
Материалы и способы.Materials and methods.
Пример 1. Иммунизация UniRat™ рекомбинантным человеческим ПСМА.Example 1: Immunization of UniRat™ with recombinant human PSMA.
Двенадцать животных UniRat™ иммунизировали рекомбинантным человеческим белком ПСМА, слитым с His-меткой (R&D Systems, кат. №: 4234-ZN). Животных иммунизировали дважды в неделю в течение восьми недель. После 35-дневного курса иммунизации у крыс собирали сыворотку для определения титров в сыворотке.Twelve UniRat™ animals were immunized with recombinant human PSMA protein fused to a His tag (R&D Systems, Cat. No: 4234-ZN). Animals were immunized twice a week for eight weeks. After a 35-day course of immunization, serum was collected from rats to determine serum titers.
Результаты для титров в сыворотке.Results for serum titers.
Сводная информация о титрах в сыворотке приведена на фиг. 1, панелях А-В. На графиках, изображенных на фиг. 1, панелях А-В, каждая линия представляет отдельное животное. На легендах графиков показан идентификационный номер каждого отдельного животного. Связывающую активность для серии разведений сыворотки по 12 точкам тестировали с помощью ИФА против белка ПСМА человека с Hisметкой и нецелевого белка с His-меткой. Среди этой группы животных наблюдали ряд уровней реактивности сыворотки с белком ПСМА человека. Не наблюдали сывороточного ответа на нецелевой белок с His-меткой.A summary of serum titers is shown in Fig. 1, panels A-B. In the graphs shown in Fig. 1, panels A-B, each line represents a different animal. The legends of the graphs show the identification number of each individual animal. Binding activity for a 12-point serum dilution series was tested by ELISA against the His-tagged human PSMA protein and the His-tagged nontarget protein. A range of levels of serum reactivity with human PSMA protein were observed among this group of animals. No serum response to the non-target His-tagged protein was observed.
Пример 2. Анализ методом проточной цитометрии связывания с положительными и отрицательными по ПСМА клетками UniAb™ к ПСМА.Example 2: Flow cytometry analysis of anti-PSMA UniAb™ binding to PSMA positive and negative cells.
Связывание с ПСМА-положительными клетками оценивали с помощью проточной цитометрии (Guava easyCyte 8HT, EMD Millipore) с использованием линии клеток LNCaP (АТСС: CRL-1740), линии клеток 22Rv1 (ATCC CRL-2505), линии клеток РС3 (АТСС CRL-1435), стабильно трансфицированной для экспрессии ПСМА человека, или линии клеток DU-145 (АТСС НТВ-81). Вкратце, 50000 клетокBinding to PSMA-positive cells was assessed by flow cytometry (Guava easyCyte 8HT, EMD Millipore) using the LNCaP cell line (ATCC: CRL-1740), 22Rv1 cell line (ATCC CRL-2505), PC3 cell line (ATCC CRL-1435 ), stably transfected to express human PSMA, or the DU-145 cell line (ATCC NTV-81). Briefly, 50,000 cells
- 31 046268 мишеней окрашивали серией разведений очищенного UniAb™ в течение 30 минут при 4°С. После инкубации клетки дважды промывали буфером для проточной цитометрии (1X PBS, 1 % БСА, 0,1 % NaN3) и окрашивали козьим F(ab')2 антителом к человеческому IgG, конъюгированным с R-фикоэритрином (РЕ) (Southern Biotech, кат. № 2042-09) для обнаружения связанных с клетками антител. После 20-минутной инкубации при 4°С клетки дважды промывали буфером для проточной цитометрии и измеряли среднюю интенсивность флуоресценции (СИФ) с помощью проточной цитометрии. СИФ клеток, окрашенных только вторичным антителом, использовали для определения фонового сигнала, а связывание каждого антитела преобразовывали в значение кратности превышения фонового сигнала. Связывание с положительными по ПСМА яванского макака определяли с использованием того же протокола со следующими модификациями: клетки-мишени были получены из клеток Freestyle 293-F (ThermoFisher R79007), транзиентно трансфицированных для экспрессии внеклеточного домена ПСМА яванского макака. В некоторых экспериментах значения ЕС50 рассчитывали с помощью GraphPad Prism 7.- 31 046268 targets were stained with a series of dilutions of purified UniAb™ for 30 minutes at 4°C. After incubation, cells were washed twice with flow cytometry buffer (1X PBS, 1% BSA, 0.1% NaN 3 ) and stained with goat F(ab')2 anti-human IgG antibody conjugated to R-phycoerythrin (PE) (Southern Biotech, Cat. No. 2042-09) for the detection of cell-bound antibodies. After 20 min incubation at 4°C, cells were washed twice with flow cytometry buffer and mean fluorescence intensity (MFI) was measured by flow cytometry. The SIF of cells stained with the secondary antibody alone was used to determine the background signal, and the binding of each antibody was converted to a fold value above the background signal. Binding to cynomolgus PSMA-positive cells was determined using the same protocol with the following modifications: target cells were derived from Freestyle 293-F cells (ThermoFisher R79007) transiently transfected to express the extracellular domain of cynomolgus PSMA. In some experiments, EC50 values were calculated using GraphPad Prism 7.
В табл. 8 приведена активность связывания с мишенью нескольких антител, содержащих только тяжелые цепи, к ПСМА (HCAb), описанных в данном документе. В столбце 1 показан ID клона HCAb. В столбце 2 показано связывание с клетками LNCaP, измеренное виде кратности превышения фонового сигнала СИФ.In table 8 shows the target binding activity of several heavy chain only anti-PSMA antibodies (HCAbs) described herein. Column 1 shows the HCAb clone ID. Column 2 shows binding to LNCaP cells, measured as fold above background CIF signal.
Таблица 8Table 8
Связывание с линией клеток, экспрессирующих ПСМАBinding to a cell line expressing PSMA
Различия в связывании с ПСМА яванского макака, как показано на фиг. 2, панели А и В, подтверждает различие в эпитопе ПСМА человека, распознаваемом HCAb 346181 и 345497.Differences in cynomolgus PSMA binding as shown in FIG. 2, panels A and B, confirms the difference in the human PSMA epitope recognized by HCAbs 346181 and 345497.
Пример 3. Связывание рекомбинантных белков с помощью биослойной интерферометрии (BLI).Example 3. Binding of recombinant proteins using biolayer interferometry (BLI).
Используя биослойную интерферометрию, оценивали конкуренцию за связывание между двумя семействами антител, членами которых являются клон ID 345497 и клон ID 346181. Анализ методом эпитоп-специфической сортировки антиген-антитело выполняли на Octet QK-384 (ForteBio). Вкратце, сенсоры для захвата пентагистидиновой последовательности (HIS1K) (Пента-HIS, описанные как SEQ ID NO: 95) использовали для иммобилизации антигена - рекомбинантного человеческого ПСМА (R&D Systems, кат. №: 4234-ZN) в течение 120 секунд. После определения базового уровня сенсоры погружали в растворы, содержащие антитело 1 (325867), на 300 с, а другой базовый уровень устанавливали в течениеUsing biolayer interferometry, binding competition between two families of antibodies, whose members are clone ID 345497 and clone ID 346181, was assessed. Epitope-specific antigen-antibody sorting analysis was performed on an Octet QK-384 (ForteBio). Briefly, pentagistidine sequence (HIS1K) sensors (Penta-HIS, described as SEQ ID NO: 95) were used to immobilize recombinant human PSMA antigen (R&D Systems, cat. no: 4234-ZN) for 120 seconds. After determining the baseline level, the sensors were immersed in solutions containing antibody 1 (325867) for 300 s, and another baseline level was established within
- 32 046268 секунд. Затем сенсоры погружали в лунки, содержащие либо антитело 1 в качестве положительного контроля для блокирования, либо антитело 2 (325920). Скорости ассоциации и диссоциации измеряли в течение 300 и 600 секунд, соответственно. Анализ данных выполняли с помощью Octet Data Analysis HT v11.0 (ForteBio). Как показано на фиг. 3, 325920 связывает белок ПСМА, предварительно связанный с антителом 325867, что свидетельствует о том, что эти два антитела распознают неперекрывающиеся эпитопы на ПСМА. Сдвиг сигнала связывания выражается в нанометрах.- 32 046268 seconds. The sensors were then dipped into wells containing either Antibody 1 as a positive blocking control or Antibody 2 (325920). Association and dissociation rates were measured for 300 and 600 seconds, respectively. Data analysis was performed using Octet Data Analysis HT v11.0 (ForteBio). As shown in FIG. 3, 325920 binds PSMA protein prebound to antibody 325867, indicating that the two antibodies recognize non-overlapping epitopes on PSMA. The binding signal shift is expressed in nanometers.
Пример 4. Композиция бипаратопных и двухвалентных антител к ПСМА.Example 4. Composition of biparatopic and divalent antibodies to PSMA.
Как показано в табл. 9, клон ID 350123 состоит из последовательности клона ID 346181, связанной с последовательностью клона ID 345497 через мостиковую последовательность GGGGSGGGGS (SEQ ID NO: 74). Клон ID 350122 состоит из двух повторов клона ID 346181, соединенных одной и той же линкерной последовательностью. Клон ID 350123 является бипаратопным, поскольку он состоит из двух доменов к ПСМА, распознающих разные эпитопы на ПСМА. Клон ID 350122 является двухвалентным, но не бипаратопным, поскольку он состоит из одного и того же домена к ПСМА в тандеме. Схематические иллюстрации различных антител к ПСМА х CD3 показаны на фиг. 5, панели А-С.As shown in table. 9, clone ID 350123 consists of the sequence of clone ID 346181 linked to the sequence of clone ID 345497 via the bridging sequence GGGGSGGGGS (SEQ ID NO: 74). Clone ID 350122 consists of two repeats of clone ID 346181 connected by the same linker sequence. Clone ID 350123 is biparatopic because it consists of two PSMA domains that recognize different epitopes on PSMA. Clone ID 350122 is bivalent but not biparatope because it consists of the same PSMA domain in tandem. Schematic illustrations of various anti-PSMA x CD3 antibodies are shown in FIG. 5, panels A-C.
Таблица 9Table 9
Описание аминокислотной последовательности бипаратопных и двухвалентных антител к ПСМАDescription of the amino acid sequence of biparatopic and divalent antibodies to PSMA
Пример 5. Определение аффинности к ПСМА человека, экспрессируемому на клеточной поверхности.Example 5: Determination of affinity for human PSMA expressed on the cell surface.
Аффинность к ПСМА клеточной поверхности определяли при помощи анализа Скэтчарда с использованием линии клеток карциномы предстательной железы человека 22Rv1. Сначала полиспецифические антитела к ПСМА х CD3 были помечены Alexa Fluor 488 с использованием набора Alexa Fluor 488 5-SDP Ester (ThermoFisher A30052). Связывание с 22Rvl затем оценивали с помощью проточной цитометрии (Guava easyCyte 8НТ, EMD Millipore). Вкратце, 100000 клеток-мишеней окрашивали серией разведений полиспецифических антител, меченных Alexa Fluor 488, в течение 1 ч при 4°С. После инкубации клетки дважды промывали буфером для проточной цитометрии и измеряли среднюю интенсивность флуоресценции с помощью проточной цитометрии.Affinity for cell surface PSMA was determined by Scatchard assay using the human prostate carcinoma cell line 22Rv1. First, anti-PSMA x CD3 polyspecific antibodies were labeled with Alexa Fluor 488 using the Alexa Fluor 488 5-SDP Ester kit (ThermoFisher A30052). Binding to 22Rvl was then assessed by flow cytometry (Guava easyCyte 8HT, EMD Millipore). Briefly, 100,000 target cells were stained with a dilution series of Alexa Fluor 488-labeled polyspecific antibodies for 1 h at 4°C. After incubation, cells were washed twice with flow cytometry buffer, and mean fluorescence intensity was measured by flow cytometry.
Чтобы получить стандартную кривую для расчета молекул эквивалентного растворимого флуорохрома (MESF), совокупности шариков с MESF от Bangs Lab Quantum Alex Fluor 488 с 1 по 4 объединяли в одной пробирке и запускали на Guava easyCyte 8HT. Пустые шарики анализировали в отдельной пробирке. СИФ каждой совокупности шариков измеряли в FITC-канале. Линейная регрессия Log10 (СИФ) против Log10 (MESF) была построена с использованием GraphPad Prism 7.To obtain a standard curve for calculating equivalent soluble fluorochrome (MESF) molecules, Bangs Lab Quantum Alex Fluor 488 MESF bead populations 1 to 4 were combined in one tube and run on a Guava easyCyte 8HT. Empty beads were analyzed in a separate tube. The SIF of each set of beads was measured in the FITC channel. Linear regression of Log10 (LIF) versus Log10 (MESF) was constructed using GraphPad Prism 7.
СИФ каждого экспериментального образца интерполировали на калибровочную кривую, и MESF определяли для каждого образца. Затем рассчитывали среднее количество антител, связанных на клетку (ABC), путем деления среднего MESF на степень мечения (DOL) антитела. Число ABC умножали на концентрацию клеток, чтобы определить общую концентрацию связанного антитела. Концентрацию свободных антител рассчитывали путем вычитания концентрации связанных антител из окрашивающей концентрации (начальная доза). Концентрация свободных антител была построена против концентрации связанных антител в GraphPad Prism 7. Полученный график был аппроксимирован к нелинейной регрессии, функции связывания, специфичной для одного сайта, для определения аффинности, как показано на фиг. 4, панели А и В.The MIF of each experimental sample was interpolated onto the calibration curve, and the MESF was determined for each sample. The average number of antibodies bound per cell (ABC) was then calculated by dividing the average MESF by the degree of labeling (DOL) of the antibody. The ABC number was multiplied by the cell concentration to determine the total concentration of bound antibody. The concentration of free antibodies was calculated by subtracting the concentration of bound antibodies from the staining concentration (initial dose). The concentration of free antibodies was plotted against the concentration of bound antibodies in GraphPad Prism 7. The resulting plot was fitted to a nonlinear regression, single site-specific binding function to determine affinity, as shown in FIG. 4, panels A and B.
Пример 6. Опосредованное полиспецифическим антителом уничтожение ПСМА-положительных клеток опухоли предстательной железы посредством перенаправления Т-клеток.Example 6: Multispecific Antibody-Mediated Killing of PSMA-Positive Prostate Tumor Cells via T-Cell Redirection.
Анализы с использованием покоящихся Т-клеток.Assays using resting T cells.
Клетки-мишени высевали из расчета 15000 клеток на лунку в 96-луночный планшет и культивировали в течение ночи при 37°С. После инкубации увеличивающиеся количества полиспецифического антитела добавляли вместе с покоящимися Т-клетками человека при соотношении эффекторных клеток к клеткам-мишеням 10:1 и инкубировали в течение дополнительных 48 или 72 ч при 37°С (48 ч для анализов с клетками LNCaP, MDA-PCa-2b и PC3-PSMA и 72 часа для анализов с клетками 22Rv1). Гибель клеток измеряли с использованием реагента для пролиферации клеток WST-1 (Sigma кат. №: 11644807001) или при помощи проточной цитометрии. В некоторых экспериментах небольшой образец каждого супернатанта собирали после инкубации, но до анализа жизнеспособности клеток-мишеней, и сохраняли для анализа продукции цитокинов. Когда жизнеспособность клеток анализировали с помощью реагента WST-1, исходный реагент добавляли в каждую лунку в разведении 1:10 и инкубировали в течение 90 мин при 37°С. Затем измеряли оптическую плотность при 450 нм (эталонная длина волны 690 нм) и рассчитывали процент специфического лизиса.Target cells were seeded at 15,000 cells per well in a 96-well plate and cultured overnight at 37°C. After incubation, increasing amounts of polyspecific antibody were added along with resting human T cells at a ratio of effector cells to target cells of 10:1 and incubated for an additional 48 or 72 hours at 37°C (48 hours for assays with LNCaP, MDA-PCa cells -2b and PC3-PSMA and 72 hours for assays with 22Rv1 cells). Cell death was measured using cell proliferation reagent WST-1 (Sigma cat. no: 11644807001) or by flow cytometry. In some experiments, a small sample of each supernatant was collected after incubation but before target cell viability assays and stored for analysis of cytokine production. When cell viability was assayed using WST-1 reagent, the stock reagent was added to each well at a 1:10 dilution and incubated for 90 min at 37°C. The absorbance was then measured at 450 nm (reference wavelength 690 nm) and the percentage of specific lysis was calculated.
Если жизнеспособность клеток-мишеней анализировали с помощью проточной цитометрии, то клетки-мишени метили перед началом анализа мембранным красителем DiR (ThermoFisher D12731). После инкубации с Т-клетками и антителами супернатанты либо сохраняли для анализа цитокинов, либоIf target cell viability was analyzed by flow cytometry, the target cells were labeled with DiR membrane dye (ThermoFisher D12731) before analysis. After incubation with T cells and antibodies, supernatants were either saved for cytokine analysis or
- 33 046268 утилизировали. Затем лунки промывали один раз для сбора мертвых клеток опухоли и Т-клеток, которые переносили в планшет для проточной цитометрии. Оставшиеся прикрепленные клетки опухоли обрабатывали трипсином и затем добавляли в соответствующие лунки планшета для проточной цитометрии. Реагент аннексин-V использовали для окрашивания мертвых клеток, и проводили проточную цитометрию (BD FACSCelesta) для количественного определения процента мертвых опухолевых клеток в каждом образце, гейтируемых по окрашиванию DiR. Лунки, содержащие необработанные клетки-мишени, использовали для нормализации спонтанной гибели клеток. В некоторых экспериментах использовали антитело отрицательного контроля, состоящее из того же нацеленного на CD3 плеча, что и в полиспецифических молекулах к ПСМА х CD3, но заменой нацеленного на опухоль плеча на VH, специфичную к белку gp120 ВИЧ.- 33 046268 disposed of. The wells were then washed once to collect dead tumor cells and T cells, which were transferred to a flow cytometry plate. The remaining adherent tumor cells were trypsinized and then added to the appropriate wells of the flow cytometry plate. Annexin-V reagent was used to stain dead cells, and flow cytometry (BD FACSCelesta) was performed to quantify the percentage of dead tumor cells in each sample gated by DiR staining. Wells containing untreated target cells were used to normalize spontaneous cell death. Some experiments used a negative control antibody consisting of the same CD3-targeting arm as in the PSMA x CD3 polyspecific molecules, but replacing the tumor-targeting arm with a VH specific for the HIV gp120 protein.
На фиг. 7 показан опосредованный Т-клетками лизис ПСМА-положительных клеток с использованием нестимулированных Т-клеток. Нестимулированные человеческие Т-клетки инкубировали с клетками, экспрессирующими ПСМА (LNCaP), и различными концентрациями полиспецифических антител. Бипаратопное антитело к ПСМА х CD3 (350123xCD3) превзошло монопаратопное антитело к ПСМА х CD3 (346181xCD3).In fig. 7 shows T cell-mediated lysis of PSMA-positive cells using unstimulated T cells. Unstimulated human T cells were incubated with cells expressing PSMA (LNCaP) and various concentrations of polyspecific antibodies. The biparatope anti-PSMA x CD3 antibody (350123xCD3) was superior to the monoparatope anti-PSMA x CD3 antibody (346181xCD3).
Анализы с использованием предварительно активированных Т-клеток.Assays using preactivated T cells.
Пан-Т-клетки человека предварительно активировали связанными с планшетом ОКТ3 и ИЛ-2 в течение трех дней с последующим дополнительным днем инкубации со свежим ИЛ-2. Клетки-мишени трипсинизировали, нагружали кальцеином-АМ (ThermoFisher C3100MP), смешивали с активированными Т-клетками до соотношения Е:Т 20:1 и добавляли в лунки 96-луночного планшета. Добавляли серии разведений различных полиспецифических антител с последующей инкубацией в течение 4 ч при 37°С. Затем супернатанты переносили в черные 96-луночные планшеты и измеряли оптическую плотность при 480 нм / 520 нм возбуждения/испускания для количественного определения высвобождения кальцеина. Клетки-мишени, инкубированные без Т-клеток, использовали для нормализации спонтанного высвобождения кальцеина интактными клетками опухоли. Добавление 2% Тритона-Х в контрольные лунки, содержащие клетки-мишени, позволило рассчитать сигнал кальцеина, соответствующий максимальному лизису клеток. Используя это значение, каждая экспериментальная лунка была представлена в виде процента максимального лизиса клеток. Анализ данных проводили с использованием GraphPad Prism 7.Human pan-T cells were preactivated with plate-bound OKT3 and IL-2 for three days, followed by an additional day of incubation with fresh IL-2. Target cells were trypsinized, loaded with calcein-AM (ThermoFisher C3100MP), mixed with activated T cells to an E:T ratio of 20:1, and added to the wells of a 96-well plate. A series of dilutions of various polyspecific antibodies were added, followed by incubation for 4 hours at 37°C. The supernatants were then transferred to black 96-well plates and absorbance was measured at 480 nm/520 nm excitation/emission to quantify calcein release. Target cells incubated without T cells were used to normalize the spontaneous release of calcein by intact tumor cells. The addition of 2% Triton-X to control wells containing target cells allowed calculation of the calcein signal corresponding to maximum cell lysis. Using this value, each experimental well was reported as the percentage of maximum cell lysis. Data analysis was performed using GraphPad Prism 7.
На фиг. 6 показан опосредованный Т-клетками лизис ПСМА-положительных клеток с использованием предварительно активированных Т-клеток. Предварительно активированные Т-клетки человека инкубировали с клетками, экспрессирующими ПСМА человека, (LNCaP) и различными концентрациями полиспецифических антител. Гибель опухолевых клеток измеряли по высвобождению кальцеина и нормализовали по спонтанному высвобождению опухолевых клеток в отсутствие Т-клеток. Бипаратопное антитело к ПСМА х CD3 (350123xCD3) превзошло оба монопаратопных антитела к ПСМА х CD3.In fig. 6 shows T cell-mediated lysis of PSMA-positive cells using pre-activated T cells. Pre-activated human T cells were incubated with human PSMA-expressing cells (LNCaP) and various concentrations of polyspecific antibodies. Tumor cell death was measured by calcein release and normalized by spontaneous tumor cell release in the absence of T cells. The biparatope anti-PSMA x CD3 antibody (350123xCD3) outperformed both monoparatope anti-PSMA x CD3 antibodies.
На фиг. 8 показано, что полиспецифические антитела не лизируют ПСМА-отрицательные клетки. Предварительно активированные человеческие Т-клетки инкубировали с ПСМА-отрицательными клетками злокачественного новообразования предстательной железы (DU145) и различными концентрациями полиспецифических антител. Ни одно из протестированных антител не привело к лизису этих клеток.In fig. Figure 8 shows that polyspecific antibodies do not lyse PSMA-negative cells. Pre-activated human T cells were incubated with PSMA-negative prostate cancer cells (DU145) and various concentrations of polyspecific antibodies. None of the antibodies tested resulted in lysis of these cells.
На фиг. 9 показано связывание полиспецифических антител к ПСМА х CD3 с положительными и отрицательными по ПСМА клетками. Полиспецифические антитела к ПСМА х CD3 демонстрируют связывание с ПСМА-положительными клетками опухоли предстательной железы (22Rv1), но не связываются с ПСМА-отрицательными клетками опухоли предстательной железы (DU145). Бипаратопная молекула (350123) показала самое сильное связывание с клеткой-мишенью.In fig. Figure 9 shows the binding of polyspecific antibodies to PSMA x CD3 to PSMA positive and negative cells. Anti-PSMA x CD3 polyspecific antibodies show binding to PSMA-positive prostate tumor cells (22Rv1) but do not bind to PSMA-negative prostate tumor cells (DU145). The biparatope molecule (350123) showed the strongest binding to the target cell.
На фиг. 10 показан опосредованный Т-клетками лизис ПСМА-положительных клеток. Данные на фиг. 10 демонстрирует, что связывание с ПСМА через два разных эпитопа приводит к увеличению гибели клеток по сравнению с двухвалентной, но моноспецифической версией антитела.In fig. 10 shows T cell-mediated lysis of PSMA-positive cells. Data in Fig. 10 demonstrates that binding to PSMA via two different epitopes results in increased cell death compared to the bivalent but monospecific version of the antibody.
Пример 7. Монопаратопное биспецифическое антитело к ПСМА х CD3 индуцирует меньшую продукцию цитокинов, чем бипаратопное полиспецифическое антитело к ПСМА х CD3Example 7. Monoparatopic bispecific antibody to PSMA x CD3 induces less cytokine production than biparatopic polyspecific antibody to PSMA x CD3
Продукцию цитокинов анализировали в анализах цитотоксичности опухоли с покоящимися Тклетками. Дизайн этих анализов подробно описан в другом месте данного документа. Супернатанты собирали после завершения анализов (после 72 часов инкубации для анализов с использованием клеток 22Rv1, 48 часов для всех других линий клеток). Наборы для ИФА использовали для обнаружения ИЛ-2 (Biolegend 431804) и ИФН-γ (Biolegend 430104) в соответствии с протоколом производителя. Экспериментальные супернатанты разбавляли перед анализом на основе ИФА так, чтобы уровни цитокинов попадали в линейную часть стандартной кривой, поставляемой с каждым набором. В некоторых случаях цитокины не могли быть обнаружены в экспериментальных лунках, и значения были указаны как меньшие или равные нижнему пределу количественного определения для анализа.Cytokine production was analyzed in tumor cytotoxicity assays with resting T cells. The design of these assays is described in detail elsewhere in this document. Supernatants were collected upon completion of assays (after 72 h of incubation for assays using 22Rv1 cells, 48 h for all other cell lines). ELISA kits were used to detect IL-2 (Biolegend 431804) and IFN-γ (Biolegend 430104) according to the manufacturer's protocol. Experimental supernatants were diluted prior to ELISA analysis so that cytokine levels fell within the linear portion of the standard curve provided with each kit. In some cases, cytokines could not be detected in experimental wells and values were reported as less than or equal to the lower limit of quantitation for the assay.
На фиг. 12, панели А-С, показан опосредованный Т-клетками лизис ПСМА-положительных клеток и сравнение с продукцией цитокинов. Полиспецифические антитела к ПСМА х CD3 индуцируют опосредованный Т-клетками лизис ПСМА-положительной линии клеток злокачественного новообразования предстательной железы LNCaP. Бипаратопная молекула (350123) стимулировала более сильное уничтожение опухолевых клеток по сравнению с монопаратопной молекулой (346181), но также вызывала выIn fig. 12, panels A-C, shows T cell-mediated lysis of PSMA-positive cells and comparison with cytokine production. Anti-PSMA x CD3 polyspecific antibodies induce T-cell-mediated lysis of the PSMA-positive prostate cancer cell line LNCaP. The biparatope molecule (350123) stimulated greater tumor cell killing compared to the monoparatope molecule (346181), but also caused
- 34 046268 работку более высоких уровней цитокинов, гамма-интерферона (ИФН-γ) и интерлейкина 2 (ИЛ-2), как показано на фиг. 12, панели В и панели С.- 34 046268 work of higher levels of cytokines, gamma interferon (IFN-γ) and interleukin 2 (IL-2), as shown in Fig. 12, panels B and panels C.
В табл. 10 показан опосредованный Т-клетками лизис и продукция цитокинов против четырех линий ПСМА-положительных клеток опухоли предстательной железы. Полиспецифические антитела к ПСМА х CD3 тестировали в анализах цитотоксичности опухолевых клеток in vitro с использованием нестимулированных Т-клеток и серии доз антитела против панели из четырех линий ПСМАположительных клеток опухоли. Через 72 часа (22Rv1) или 48 часов (MDA-PCa-2b, LNCAP, PC3-PSMA) рассчитывали процент гибели клеток опухоли и регистрировали с помощью ЕС50, а также если достигали наивысшего процента уничтожения. Супернатанты из этих экспериментальных лунок собирали и анализировали с помощью ИФА на цитокины, гамма-интерферон (ИФН-γ) или интерлейкин-2 (ИЛ-2). Монопаратопная молекула (3461881) индуцировала приблизительно эквивалентные уровни противоопухолевой цитотоксичности в отношении всех четырех тестируемых линий клеток по сравнению с бипаратопной молекулой, но имела более высокие ЕС50 в отношении продукции цитокинов и в большинстве случаев стимулировала более низкие уровни максимальной продукции цитокинов.In table 10 shows T cell-mediated lysis and cytokine production against four PSMA-positive prostate tumor cell lines. Anti-PSMA x CD3 polyspecific antibodies were tested in in vitro tumor cell cytotoxicity assays using unstimulated T cells and a series of antibody doses against a panel of four PSMA-positive tumor cell lines. After 72 hours (22Rv1) or 48 hours (MDA-PCa-2b, LNCAP, PC3-PSMA), the percentage of tumor cell death was calculated and recorded using EC50, and if the highest percentage of killing was achieved. Supernatants from these experimental wells were collected and analyzed by ELISA for cytokines, interferon gamma (IFN-γ), or interleukin-2 (IL-2). The monoparatope molecule (3461881) induced approximately equivalent levels of antitumor cytotoxicity in all four cell lines tested compared to the biparatope molecule, but had higher EC50s for cytokine production and in most cases stimulated lower levels of maximal cytokine production.
Таблица 10Table 10
Т-клеточный лизис и продукция цитокинов против четырех линий ПСМА-положительных клеток опухоли предстательной железыT cell lysis and cytokine production against four PSMA-positive prostate tumor cell lines
Пример 8. Полиспецифические антитела к ПСМА х CD3 индуцируют пролиферацию Т-клеток.Example 8. Polyspecific antibodies to PSMA x CD3 induce proliferation of T cells.
ПСМА-положительные клетки опухоли высевали из расчета 25000 клеток на лунку в 96-луночный планшет и культивировали в течение ночи при 37°С. Пан-Т-клетки человека, выделенные из покоящихся МКПК (Miltenyi 130-096-535), метили красителем CFSE для отслеживания линии дифференцировки в соответствии с инструкциями производителя (ThermoFisher C34554). Затем в лунки, содержащие клетки опухоли, добавляли 100000 меченых пан-Т-клеток с последующей серией разведений антител и инкубировали при 37°С, 8% CO2. После 5 дней инкубации клетки осторожно перемешивали и переносили в планшет для проточной цитометрии. Клетки осаждали и супернатант удаляли с последующим окрашиванием анти-CD8, конъюгированным с АРС, (Biolegend 301049), и анти-CD4, конъюгированным с РЕ, (Biolegend 317410), в течение 20 мин на льду. Затем клетки промывали и ресуспендировали в буфере для проточной цитометрии для анализа (BD FACSCelesta). Клетки гейтировали по прямому и боковому рассеянию, а также по экспрессии CD4 или CD8. Процент Т-клеток, которые пролиферировали, на что указывает положительное окрашивание CD4 или CD8 и низкий или отрицательный сигнал CFSE, рассчитывали для всей популяции Т-клеток, а также для субпопуляций CD4 и CD8. Данные проточной цитометрии анализировали с помощью FlowJo и наносили на график в GraphPad Prism 7.PSMA-positive tumor cells were seeded at 25,000 cells per well in a 96-well plate and cultured overnight at 37°C. Human pan T cells isolated from resting PBMCs (Miltenyi 130-096-535) were labeled with CFSE lineage tracing dye according to the manufacturer's instructions (ThermoFisher C34554). 100,000 labeled pan-T cells were then added to wells containing tumor cells, followed by a series of antibody dilutions, and incubated at 37°C, 8% CO2. After 5 days of incubation, cells were gently mixed and transferred to a flow cytometry plate. Cells were pelleted and the supernatant was removed, followed by staining with APC-conjugated anti-CD8 (Biolegend 301049) and PE-conjugated anti-CD4 (Biolegend 317410) for 20 min on ice. Cells were then washed and resuspended in flow cytometry assay buffer (BD FACSCelesta). Cells were gated for forward and side scatter and CD4 or CD8 expression. The percentage of T cells that proliferated, as indicated by positive CD4 or CD8 staining and low or negative CFSE signal, was calculated for the entire T cell population and for the CD4 and CD8 subsets. Flow cytometry data were analyzed using FlowJo and plotted in GraphPad Prism 7.
На фиг. 11, панели A-D, показано, что полиспецифические антитела к ПСМА х CD3 стимулировали пролиферацию Т-клеток в присутствии ПСМА-положительных клеток опухоли, и что монопаратопные биспецифические антитела к ПСМА предпочтительно активируют CD3 Т-клетки. Полиспецифические антитела инкубировали вместе с клетками опухоли, экспрессирующими ПСМА, и Т-клетками, меченными красителем CFSE для отслеживания линии дифференцировки. После 5 дней инкубации пролиферацию Т-клеток и состав пролиферированных Т-клеток (CD8+ и CD4+) анализировали с помощью проточной цитометрии. На панелях А и В показана общая пролиферация Т-клеток, тогда как на панелях С и D показано соотношение CD8+ и CD4+ Т-клеток в лунках с пролиферацией. Пунктирная горизонтальная линия демонстрирует соотношение CD8: CD4 нестимулированных Т-клеток и составляет приблизительно 1:2 (фактическое значение = 0,64). Монопаратопное биспецифическое антитело к ПСМА х CD3 (346181) предпочтительно активирует CD8 Т-клетки (соотношение CD8:CD4 после экспансии около 2:1), тогда как бипаратопное полиспецифическое антитело к ПСМА х CD3 (350123) в меньшей степени активирует CD8+ Т-клетки (соотношение CD8:CD4 составляет около 1:1).In fig. 11, panels A-D, show that polyspecific anti-PSMA x CD3 antibodies stimulated T cell proliferation in the presence of PSMA-positive tumor cells, and that monoparatopic bispecific anti-PSMA antibodies preferentially activated CD3 T cells. Polyspecific antibodies were incubated with PSMA-expressing tumor cells and CFSE-labeled T cells to trace lineage. After 5 days of incubation, T cell proliferation and the composition of proliferated T cells (CD8+ and CD4+) were analyzed by flow cytometry. Panels A and B show total T cell proliferation, while panels C and D show the ratio of CD8+ to CD4+ T cells in proliferating wells. The dashed horizontal line represents the CD8:CD4 ratio of unstimulated T cells and is approximately 1:2 (actual value = 0.64). The monoparatope bispecific anti-PSMA x CD3 antibody (346181) preferentially activates CD8 T cells (CD8:CD4 ratio after expansion is about 2:1), whereas the biparatope polyspecific anti-PSMA x CD3 antibody (350123) activates CD8+ T cells to a lesser extent ( the CD8:CD4 ratio is about 1:1).
--
Claims (34)
Applications Claiming Priority (1)
Application Number | Priority Date | Filing Date | Title |
---|---|---|---|
US62/830,130 | 2019-04-05 |
Publications (1)
Publication Number | Publication Date |
---|---|
EA046268B1 true EA046268B1 (en) | 2024-02-21 |
Family
ID=
Similar Documents
Publication | Publication Date | Title |
---|---|---|
US20220195068A1 (en) | Heavy chain antibodies binding to psma | |
CN112351997B (en) | Heavy chain antibodies that bind CD19 | |
AU2022259766B2 (en) | Multispecific heavy chain antibodies with modified heavy chain constant regions | |
CA3214992A1 (en) | Multispecific heavy chain antibodies with modified heavy chain constant regions | |
US20240117063A1 (en) | Anti-cd20 antibodies and car-t structures | |
US20240002498A1 (en) | Heavy chain antibodies binding to folate receptor alpha | |
CA3211138A1 (en) | Anti-psma antibodies and car-t structures | |
CA3211142A1 (en) | Anti-muc1-c antibodies and car-t structures | |
US20240131074A1 (en) | Anti-psma antibodies and car-t structures | |
EA046268B1 (en) | ANTIBODIES CONTAINING ONLY HEAVY CHAINS THAT BIND TO PSMA |