EA045862B1 - Бициклические пептидные лиганды, специфичные к нектину-4 - Google Patents

Бициклические пептидные лиганды, специфичные к нектину-4 Download PDF

Info

Publication number
EA045862B1
EA045862B1 EA202190105 EA045862B1 EA 045862 B1 EA045862 B1 EA 045862B1 EA 202190105 EA202190105 EA 202190105 EA 045862 B1 EA045862 B1 EA 045862B1
Authority
EA
Eurasian Patent Office
Prior art keywords
seq
hereinafter referred
harg
referred
ala
Prior art date
Application number
EA202190105
Other languages
English (en)
Inventor
Пол Бесвик
Люхун Чэнь
Джемма Элизабет Мадд
Питер ПАРК
Ритсотен Катерине Ван
Майкл Ригби
Original Assignee
Байсиклтэкс Лимитед
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Байсиклтэкс Лимитед filed Critical Байсиклтэкс Лимитед
Publication of EA045862B1 publication Critical patent/EA045862B1/ru

Links

Description

Область изобретения
Изобретение относится к полипептидам, которые ковалентно связаны с молекулярными каркасами, так что две или более пептидных петли замкнуты между точками присоединения к каркасу. В частности, изобретение относится к пептидам, которые представляют собой высокоаффинные агенты, связывающие нектин-4. Также изобретение относится к конъюгатам лекарственных средств, содержащим указанные пептиды, конъюгированные с одной или несколькими эффекторными и/или функциональными группами, к фармацевтическим композициям, содержащим указанные пептидные лиганды и конъюгаты лекарственных средств, и к применению указанных пептидных лигандов и конъюгатов лекарственных средств для предупреждения, подавления или лечения заболевания или нарушения, опосредуемого нектином-4.
Уровень техники, к которому относится изобретение
Циклические пептиды способны связываться с высокой аффинностью и специфичностью с белковыми мишенями и, таким образом, они являются привлекательным классом молекул для разработки терапевтических средств. В действительности, несколько циклических пептидов уже успешно используется в клинике, например, таких как антибактериальный пептид ванкомицин, иммунодепрессивное лекарственное средство циклоспорин или лекарственное средство против злокачественной опухоли октреотид (Driggers et al. (2008), Nat Rev Drug Discov 7 (7), 608-24). Хорошие связывающие свойства являются результатом относительно большой поверхности взаимодействия между пептидом и мишенью, а также сниженной конформационной гибкости циклических структур. Как правило, макроциклы связываются с поверхностями размером несколько сот квадратных ангстрем, как, например, циклический пептидный антагонист CXCR4 CVX15 (400 А2; Wu et al. (2007), Science 330, 1066-71), циклический пептид с мотивом Arg-Gly-Asp, связывающийся с интегрином α¥β3 (355 А2) (Xiong et al. (2002), Science 296 (5565), 151-5) или циклический пептидный ингибитор упаин-1, связывающийся с активатором плазминогена урокиназного типа (603 A2; Zhao et al. (2007), J Struct Biol 160 (1), 1-10).
Вследствие циклической конфигурации, пептидные макроциклы являются менее гибкими, чем линейные пептиды, что приводит к меньшей потере энтропии при связывании с мишенями и обеспечивает более высокую аффинность связывания. Уменьшенная гибкость также приводит к фиксации специфичных к мишени конформаций, повышая специфичность связывания по сравнению с линейными пептидами. Этот эффект проиллюстрирован с помощью мощного и селективного ингибитора матриксной металлопротеиназы 8 (ММР-8), который утрачивал его селективность относительно других ММР, когда его кольцо раскрывали (Cherney et al. (1998), J Med Chem 41 (11), 1749-51). Благоприятные свойства связывания, которые достигались посредством макроциклизации, являются еще более выраженными в полициклических пептидах, имеющих более одного пептидного кольца, как например, в ванкомицине, низине и актиномицине.
Различные исследовательские команды ранее проводили связывание полипептидов с остатками цистеина с синтетической молекулярной структурой (Kemp and McNamara (1985), J. Org. Chem; Timmerman et al. (2005), ChemBioChem). Meloen и коллеги использовали трис(бромметил)бензол и родственные молекулы для быстрой и количественной кристаллизации множества пептидных петель на синтетических каркасах для структурной имитации белковых поверхностей (Timmerman et al. (2005), ChemBioChem). Описаны способы получения лекарственных соединений-кандидатов, где указанные соединения получают путем связывания цистеинсодержащих полипептидов с молекулярным каркасом, например, таким как ТАТА (1,1',1-(1,3,5-триазинан-1,3,5-триил)трипроп-2-ен-1-он, Heinis et al. Angew Chem, Int Ed. 2014; 53:1602-1606).
Были разработаны комбинаторные подходы на основе фагового дисплея для получения и скрининга крупных библиотек бициклических пептидов против представляющих интерес мишеней (Heinis et al. (2009), Nat Chem Biol 5 (7), 502-7 и WO 2009/098450). В кратком изложении, комбинаторные библиотеки линейных пептидов, содержавших три остатка цистеина и две области из шести случайных аминокислот (Cys-(Xaa)6-Cys-(Xaa)6-Cys), экспонировали на фаге и подвергали циклизации посредством ковалентного связывания боковых цепей цистеина с низкомолекулярным каркасом.
Сущность изобретения
Согласно первому аспекту изобретения предусматривается пептидный лиганд, специфичный к нектину-4, содержащий полипептид, содержащий по меньшей мере три остатка цистеина, разделенных по меньшей мере двумя последовательностями петли, и молекулярный каркас, который образует ковалентные связи с остатками цистеина полипептида, так что на молекулярном каркасе образуется по меньшей мере две полипептидных петли.
Согласно следующему аспекту изобретения, предусматривается конъюгат лекарственного средства, содержащий пептидный лиганд, как определено в настоящем описании, конъюгированный с одной или несколькими эффекторными и/или функциональными группами.
Согласно следующему аспекту изобретения, предусматривается фармацевтическая композиция, содержащая пептидный лиганд или конъюгат лекарственного средства, как определено в настоящем описании, в комбинации с одним или несколькими фармацевтически приемлемыми эксципиентами.
Согласно следующему аспекту изобретения, предусматривается пептидный лиганд или конъюгат лекарственного средства, как определено в настоящем описании, для применения для предупреждения,
- 1 045862 подавления или лечения заболевания или нарушения, опосредуемого нектином-4.
Краткое описание чертежей
Когда они присутствуют на чертежах, планки погрешности соответствуют стандартной ошибке среднего значения (SEM).
Фиг. 1-7: кривые объема опухоли после введения BCY7683, BCY7825, BCY7826, BCY8245, BCY8253, BCY8254 и BCY8255, соответственно, самкам мышей BALB/c nude, имеющим ксенотрансплантат NCI-H292.
Фиг. 8-10: кривые объема опухоли после введения BCY8245, BCY8253 и BCY8255, соответственно, самкам мышей Balb/c nude, имеющим ксенотрансплантат NCI-H292.
Фиг. 11-15: кривые объема опухоли после введения BCY7825, BCY8245, BCY8253, BCY8254 и BCY8255, соответственно, самкам мышей CB17-SCID, имеющим ксенотрансплантат НТ-1376.
Фиг. 16-18: кривые объема опухоли после введения BCY8245, BCY8253 и BCY8255, соответственно, самкам мышей CB17-SCID, имеющим ксенотрансплантат НТ-1376.
Фиг. 19-21: кривые объема опухоли после введения BCY8245, BCY8253 и BCY8255, соответственно, самкам мышей Balb/c nude, имеющим ксенотрансплантат Panc2.13.
Фиг. 22-24: кривые объема опухоли после введения BCY8245, BCY8253 и BCY8255, соответственно, самкам мышей Balb/c nude, имеющим ксенотрансплантат MDA-MB-468.
Фиг. 25-28: кривые объема опухоли после введения BCY8549, BCY8550, BCY8783 и BCY8784, соответственно (с BCY8245 в качестве контроля) самкам мышей BALB/c nude, имеющим ксенотрансплантат NCI-H292.
Фиг. 29: стратегия гейтирования для нейтина-4 в молочной железе (T-47D и MDA-MB-468).
Фиг. 30: стратегия гейтирования для нектина-4 в NCI-H292 и NCI-H322.
Фиг. 31 и 32: стратегия гейтирования для нектина-4 в NCI-H526 и НТ1080, соответственно.
Фиг. 33-37: стратегия гейтирования для нектина-4 при раке мочевого пузыря (НТ1376; фиг. 33), раке молочной железы (MDA-MB-468; фиг. 34), раке ободочной и прямой кишки (НТ-29; фиг. 35А и НСТ116; фиг. 35В), раке легкого (А549; фиг. 36А, NCI-H292; фиг. 36В, NCI-H358; фиг. 36С и NCI-526; фиг. 36D) и раке поджелудочной железы (Panc02.13; фиг. 37), соответственно.
Фиг. 38-41: кривые объема опухоли после введения BCY8242, BCY8245, BCY8253 и BCY8255, соответственно, самкам мышей Balb/c nude, имеющим ксенотрансплантат А549.
Фиг. 42-45: кривые объема опухоли после введения BCY8242, BCY8245, BCY8253 и BCY8255, соответственно, самкам мышей Balb/c nude, имеющим ксенотрансплантат НСТ116.
Фиг. 46-49: кривые объема опухоли после введения BCY8242, BCY8245, BCY8253 и BCY8255, соответственно, самкам мышей CB17-SCID, имеющим ксенотрансплантат НТ-1376.
Фиг. 50-53: кривые объема опухоли после введения BCY8242, BCY8245, BCY8253 и BCY8255, соответственно, самкам мышей Balb/c nude, имеющим ксенотрансплантат MDA-MB-468.
Фиг. 54-57: кривые объема опухоли после введения BCY8242, BCY8245, BCY8253 и BCY8255, соответственно, самкам мышей Balb/c nude, имеющим ксенотрансплантат NCI-H292.
Фиг. 58-59: кривые объема опухоли после введения BCY8245 и BCY8255, соответственно, самкам мышей Balb/c nude, имеющим ксенотрансплантат NCI-H526.
Фиг. 60-63: кривые объема опухоли после введения BCY8242, BCY8245, BCY8253 и BCY8255, соответственно, самкам мышей Balb/c nude, имеющим ксенотрансплантат Panc2.13.
Фиг. 64: кривые объема опухоли после введения BCY8245, BCY8781 или BCY8245 в комбинации с BCY8234 самкам мышей BALB/c nude, имеющим ксенотрансплантат MDA-MB-468.
Фиг. 65: кривые объема опухоли после введения BCY8245 отдельно или BCY8245 в комбинации с BCY8234 самкам мышей BALB/c nude, имеющим ксенотрансплантат MDA-MB-468.
Фиг. 66-71: кривые объема опухоли в ксенотрансплантатах Lu-01-0412, LU-01-0007, CTG-1771, CTG-1171, CTG-1106 и CTG-0896 PDX.
Фиг. 72: эффективность ВТ8009 (т.е. BCY8245) коррелирует с экспрессией в ксенотрансплантатах CDX/PDX. Ксенотрансплантаты с малой/отсутствием экспрессии нектина-4 демонстрируют сниженную скорость роста опухоли. Ксенотрансплантаты, экспрессирующие нектин-4, демонстрируют регрессию опухоли. Модели как PDX, так и CDX включены в этот анализ, величины обобщены из различных отчетов.
Фиг. 73: клетки MDA-MB-468 экспрессируют нектин-4 и демонстрирует пролонгированное удержание ММАЕ в опухоли.
Фиг. 74: HCS - анализ данных на клеточной линии MDA-MB-468.
Подробное описание изобретения
В одном варианте осуществления указанные последовательности петель содержат 3, 6, 7, 8 или 9 аминокислот. В следующем варианте осуществления указанные последовательности петель содержат 3, 6, 7 или 9 аминокислот. В следующем варианте осуществления указанные последовательности петель содержат 3 или 9 аминокислот.
В следующем варианте осуществления указанные последовательности петель содержат три остатка цистеина, разделенных двумя последовательностями петель, одна из которых состоит из 3 аминокислот,
- 2 045862 а другая из которых состоит из 9 аминокислот.
В следующем варианте осуществления указанные последовательности петель содержат три остатка цистеина, разделенных двумя последовательностями петель, одна из которых состоит из 3 аминокислот, а другая из которых состоит из 8 аминокислот.
В следующем варианте осуществления указанные последовательности петель содержат три остатка цистеина, разделенных двумя последовательностями петель, одна из которых состоит из 7 аминокислот, а другая из которых состоит из 3 аминокислот.
В следующем варианте осуществления указанные последовательности петель содержат три остатка цистеина, разделенных двумя последовательностями петель, обе из которых состоят из 6 аминокислот.
В одном варианте осуществления указанный пептидный лиганд содержит аминокислотную последовательность, выбранную из
Ci-P/A/Hyp-F/¥-G/A-Cii-X1-X2-X3-W/l-Nal/2-Nal-S/A-X4-P-I/D/A-W/l-Nal/2-Nal-Ciii (SEQ Ш NO: 38);
Ci-W/A-P-L-D/S-S/D-Y-W-Cii-X5-R-I-Ciii (SEQ ID NO: 39);
Ci-V-T-T-S-Y-D-Cii-F/W-L/V-H/R/T-L-L/G-G/Q/H-Cin (SEQ Ш NO: 40);
С1-Х678-Си-Х910-Хц-Х12-Х1з-Х14-Х15-Х1б-Х17-Сш (SEQ Ш NO: 41); и
Ci-W/A/Y-P/A-L-D/S/A-S/D/P/A-Y-W/l-Nal-Cii-Xs-R/HArg/A-I-Ciii (SEQ ID NO: 42);
где Х1-Х5 обозначают любой аминокислотный остаток, включая модифицированные и неприродные аминокислоты;
Х6 обозначает: Gly; Pro или неприродное производное Pro, выбранное из азетидина (Aze), гидроксипролина (НуР), 4-аминопролина (Pro(4NH)), оксазолидин-4-карбоновой кислоты (Оха), октагидроиндолкарбоновой кислоты (Oic) или 4,4-дифторпролина (4,4-DFP); Ala или неприродное производное Ala, выбранное из аминоизомасляной кислоты (Aib), или саркозин (Sar);
Х7 обозначает: Phe или неприродное производное Phe, выбранное из 3-метилфенилаланина (3MePhe), 4-метилфенилаланина (4MePhe), гомофенилаланина (HPhe), 4,4-бифенилаланина (4,4-ВРА) или 3,4-дигидроксифенилаланина (DOPA); Tyr; или Ala или неприродное производное Ala, выбранное из 1-нафтилаланина (1-Nal), 2-нафтилаланина (2-Nal) или 2-пиридилаланина (2Ра1);
Х8 обозначает: Gly; Ala; Asp; Lys или неприродное производное Lys, выбранное из ацетиллизина (KAc или Lys(Ac)); Phe; Glu; Gln; Leu; Ser; Arg; или цистеиновую кислоту (Cya);
X9 либо отсутствует, либо обозначает: Met или неприродное производное Met, выбранное из метионинсульфона (Met(O2)); Gln или неприродное производное Gln, выбранное из гомоглутамина (HGln); Leu или неприродное производное Leu, выбранное из гомолейцина (HLeu) или норлейцина (Nle); Lys; Ile; трет-бутилаланин (tBuAla); или гомосерин-метил (HSe(Me));
Х10 обозначает: Pro; Lys или неприродное производное Lys, выбранное из ацетиллизина (KAc или Lys(Ac)); Arg или неприродное производное Arg, выбранное из 2-амино-4-гуанидинмасляной кислоты (Agb), гомоаргинина (HArg) или N-метилгомоаргинина; Glu; Ser; Asp; Gln; Ala; гидроксипролин (НуР); или цистеиновую кислоту (Суа);
Х11 обозначает: Asn или неприродное производное Asn, выбранное из N-метиласпарагина; Thr; Asp; Gly; Ser; His; Ala или неприродное производное Ala, выбранное из тиенилаланина (Thi), 2-(1,2,4-триазол1-ил)аланина (1,2,4-TriAz) или бета-(4-тиазолил)аланина (4ThiAz); Lys или цистеиновую кислоту (Суа);
Х12 обозначает: Trp или неприродное производное Trp, выбранное из азатриптофана (AzaTrp), 5фтор^-триптофана (5FTrp) или метилтриптофана (TrpMe); или Ala или неприродное производное Ala, выбранное из 1-найтилаланина (1-Nal) или 2-нафтилаланина (2-Nal);
Х13 обозначает: Ser или неприродное производное Ser, выбранное из гомосерина (HSer); Ala; Asp или Thr;
Х14 обозначает: Trp или неприродное производное Trp, выбранное из азатриптофана (AzaTrp); Ser; Ala или неприродное производное Ala, выбранное из 2-(1,2,4-триазол-1-ил)аланина (1,2,4-TriAz), 1нафтилаланина (1-Nal) или 2-нафтилаланина (2-Nal); Asp; Phe или неприродное производное Phe, выбранное из 3,4-дигидроксифенилаланина (DOPA); Tyr; Thr или неприродное производное Thr, выбранное из N-метилтреонина; тетрагидропиран-4-пропановую кислоту (ТНР(О)); или диоксо-4-тетрагидротиопиранилуксусную кислоту (THP(SO2));
Х15 обозначает Pro или неприродное производное Pro, выбранное из азетидина (Aze), пипеколиновой кислоты (Pip) или оксазолидин-4-карбоновой кислоты (Оха);
Х16 обозначает: Не или неприродное производное Не, выбранное из N-метилизолейцина (NMeIle); Ala или неприродное производное Ala, выбранное из 3-циклогексилаланина (Cha) или циклопропилаланина (Сра); Pro или неприродное производное Pro, выбранное из гидроксипролина (НуР); Asp; Lys; циклопентилглицин (С5А); тетрагидропиран-4-пропановую кислоту (ТНР(О)); или диоксо-4тетрагидротиопиранилуксусную кислоту (THP(SO2));
Х17 обозначает: Trp или неприродное производное Trp, выбранное из азатриптофана (AzaTrp) или 5фтор-Е-триптофана (5FTrp); Phe; Tyr; 1-нафтилаланин (1-Nal); или 2-нафтилаланин (2-Nal);
- 3 045862
Hyp обозначает гидроксипролин, 1-Nal обозначает 1-нафтилаланин, 2-Nal обозначает 2-нафтилаланин, HArg обозначает гомоаргинин и Ci, C11 и С111 обозначает первый, второй и третий остатки цистеина, соответственно, или их фармацевтически приемлемую соль.
В одном варианте осуществления указанные последовательности петель содержат три остатка цистеина, разделенных двумя последовательностями петель, первая из которых состоит из 3 аминокислот, и вторая из которых состоит из 9 аминокислот, и указанный пептидный лиганд содержит аминокислотную последовательность, выбранную из
С1-Х6-Х7-Х8-С11-Х9-Х10-Х11-Х12-Х1з-Х14-Х15-Х16-Х17-С111 (SEQ ID NO: 41), где Х617 являются такими, как определено в настоящем описании.
В одном варианте осуществления Х6 обозначает: Pro или неприродное производное Pro, выбранное из азетидина (Aze), гидроксипролина (НуР), 4-аминопролина (Pro(4NH)), оксазолидин-4-карбоновой кислоты (Оха), октагидроиндолкарбоновой кислоты (Oic) или 4,4-дифторпролина (4,4-DFP). В следующем варианте осуществления Х6 обозначает Pro.
В одном варианте осуществления Х7 обозначает: Phe или неприродное производное Phe, выбранное из 3-метилфенилаланина (3MePhe), 4-метилфенилаланина (4MePhe), гомофенилаланина (HPhe), 4,4бифенилаланина (4,4-ВРА) или 3,4-дигидроксифенилаланина (DOPA); Ala или неприродное производное Ala, выбранное из 1-нафтилаланина (Ι-Nal), 2-нафтилаланина (2-Nal) или 2-пиридилаланина (2Pal). В следующем варианте осуществления Х7 обозначает Phe или 1-нафтилаланин (Ι-Nal). В следующем варианте осуществления Х7 обозначает 1-нафтилаланин (1-Nal).
В одном варианте осуществления Х8 обозначает Asp, Arg, Lys или цистеиновую кислоту (Суа). В следующем варианте осуществления Х8 обозначает D-Asp, D-Arg, D-Lys или D-Cya. В следующем варианте осуществления Х8 обозначает D-Asp.
В одном варианте осуществления Х9 обозначает: Met или неприродное производное Met, выбранное из метионинсульфона (Met(O2)); или Leu или неприродное производное Leu, выбранное из гомолейцина (HLeu) или норлейцина (Nle). В следующем варианте осуществления Х9 обозначает Met или Leu. В следующем варианте осуществления Х9 обозначает Met.
В одном варианте осуществления Х10 обозначает Arg или неприродное производное Arg, выбранное из 2-амино-4-гуанидинмасляной кислоты (Agb), гомоаргинина (HArg) или N-метилгомоаргинина; или цистеиновую кислоту (Суа). В следующем варианте осуществления Х10 обозначает гомоаргинин (HArg) или цистеиновую кислоту (Суа) (такую как D-Cya). В следующем варианте осуществления Х10 обозначает гомоаргинин (HArg). В альтернативном варианте осуществления Х10 обозначает лизин.
В одном варианте осуществления Х11 обозначает: Asn или неприродное производное Asn, выбранное из N-метиласпарагина; Asp или His; или цистеиновую кислоту (Суа). В следующем варианте осуществления Х11 обозначает Asn, Asp, His или цистеиновую кислоту (Суа) (такую как D-Cya). В следующем варианте осуществления Х11 обозначает Asp.
В одном варианте осуществления Х12 обозначает: Trp или неприродное производное Trp, выбранное из азатриптофана (AzaTrp), 5-(|)тор-Г-триптофана (5FTrp) или метилтриптофана (TrpMe). В следующем варианте осуществления Х12 обозначает Trp.
В одном варианте осуществления Х13 обозначает Ser или неприродное производное Ser, выбранное из гомосерина (HSer). В следующем варианте осуществления Х13 обозначает Ser.
В одном варианте осуществления Х14 обозначает Thr или неприродное производное Thr, выбранное из N-метилтреонина. В следующем варианте осуществления Х14 обозначает Thr.
В одном варианте осуществления Х15 обозначает Pro.
В одном варианте осуществления Х16 обозначает: Не или неприродное производное Не, выбранное из N-метилизолейцина (NMelle); или Pro или неприродное производное Pro, выбранное из гидроксипролина (НуР). В следующем варианте осуществления Х16 обозначает: Не; или Pro или неприродное производное Pro, выбранное из гидроксипролина (НуР). В следующем варианте осуществления Х16 обозначает Ile, Pro или гидроксипролина (НуР). В следующем варианте осуществления Х16 обозначает гидроксипролин (НуР).
В одном варианте осуществления Х17 обозначает Trp или неприродное производное Trp, выбранное из азатриптофана (AzaTrp) или 5-фтор-Ь-триптофана (5FTrp). В следующем варианте осуществления Х17 обозначает Trp.
В следующем варианте осуществления указанные последовательности петель содержат три остатка цистеина, разделенных двумя последовательностями петель, первая из которых состоит из 3 аминокислот и вторая из которых состоит из 9 аминокислот, и указанный пептидный лиганд содержит аминокислотную последовательность, выбранную из
Ci-P-X7-X8-Cn-X9-HArg/Lys-Xii-W-S-T-P-Xi6-W-Ciii (SEQ ID NO: 213), где Х7, Х8, Х9, Хц и Х16 являются такими, как определено в настоящем описании.
В следующем варианте осуществления указанные последовательности петель содержат три остатка цистеина, разделенных двумя последовательностями петель, первая из которых состоит из 3 аминокислот и вторая из которых состоит из 9 аминокислот, и указанный пептидный лиганд содержит аминокислотную последовательность, выбранную из
- 4 045862
Ci-P-X7-X8-Ci-X9-HAig-Xii-W-S-T-P-Xi6-W-Cm (SEQ ID NO: 204), где Х7, Х8, Х9, Х11 и Х16 являются такими, как определено в настоящем описании.
В следующем варианте осуществления указанные последовательности петель содержат три остатка цистеина, разделенных двумя последовательностями петель, первая из которых состоит из 3 аминокислот и вторая из которых состоит из 9 аминокислот, и указанный пептидный лиганд содержит аминокислотную последовательность, выбранную из
Ci-P-F/1-Nal-dD/dR-Cii-M/L-HArg/Lys-N/H/D-W-S-T-P-I/P/HyP-W-Ciii (SEQ ID NO: 214).
В следующем варианте осуществления указанные последовательности петель содержат три остатка цистеина, разделенных двумя последовательностями петель, первая из которых состоит из 3 аминокислот и вторая из которых состоит из 9 аминокислот, и указанный пептидный лиганд содержит аминокислотную последовательность, выбранную из
C’l-P-F/1-Nal-dD/dR-C’ll-M/L-HArg-N/H/D-W-S-T-P-I/P/HyP-\V-C’lll (SEQ ID NO: 205).
В одном варианте осуществления указанные последовательности петель содержат три остатка цистеина, разделенных двумя последовательностями петель, первая из которых состоит из 3 аминокислот и вторая из которых состоит из 8 аминокислот, и указанный пептидный лиганд содержит аминокислотную последовательность, выбранную из
С|-Х6-Х7-Х8-Сй-Х10-Х11-Х12-Х1з-Х14-Х15-Х16-Х17-Сш (SEQ ID NO: 206), где Х68 и Х1017 являются такими, как определено в настоящем описании.
В одном варианте осуществления указанные последовательности петель содержат три остатка цистеина, разделенных двумя последовательностями петель, первая из которых состоит из 3 аминокислот и вторая из которых состоит из 8 аминокислот, и указанный пептидный лиганд содержит аминокислотную последовательность, выбранную из
Ci-Р-1-Nal-D/Cya-Cn-M-HArg/Cya-D/Cya-W-S-T-P-HyP-W-Cш (SEQ ID NO: 207).
В одном варианте осуществления указанные последовательности петель содержат три остатка цистеина, разделенных двумя последовательностями петель, первая из которых состоит из 3 аминокислот и вторая из которых состоит из 9 аминокислот, и указанный пептидный лиганд содержит аминокислотную последовательность, выбранную из
Ci-P/A/Hyp-F/Y-G/A-Cii-X1-X2-X3-W/l-Nal/2-Nal-S/A-X4-P-I/D/A-W/l-Nal/2-Nal-Ciii(SEQ ID NO: 38);
где Х1-Х4 обозначает любой аминокислотный остаток, включая модифицированные и неприродные аминокислоты, Hyp обозначает гидроксипролин, 1-Nal обозначает 1-нафтилаланин, 2-Nal обозначает 2нафтилаланин, и Ci, Cii и Ciii обозначают первый, второй и третий остатки цистеина, соответственно, или их фармацевтически приемлемую соль.
В одном варианте осуществления X1 выбран из М, Npg, HLeu, I, Q и Me; где Npg представляет собой геопентилглицин, HLeu представляет собой гомолейцин и Nle представляет собой норлейцин.
В одном варианте осуществления Х2 выбран из K, R, S, D, HArg, K(Ac) и А; где HArg представляет собой гомоаргинин, К(Ас) представляет собой N-ацетиллизин, и А присутствует либо в L-, либо в Dизоформе аланина.
В одном варианте осуществления Х3 выбран из N, D, Н и А; где А присутствует либо в L-, либо в Dизоформе аланина.
В одном варианте осуществления Х4 выбран из W, D, Т и А.
В одном варианте осуществления указанные последовательности петель содержат три остатка цистеина, разделенных двумя последовательностями петель, первая из которых состоит из 7 аминокислот и вторая из которых состоит из 3 аминокислот, и указанный пептидный лиганд содержит аминокислотную последовательность, выбранную из
Ci-W/A/Y-P/A-L-D/S/A-S/D/P/A-Y-W/1-Nal-Cn-X5-R/HArg/A-I-Ciii (SEQ ID NO: 42), где Х5 обозначает любой аминокислотный остаток, 1-Nal обозначает 1-нафтилаланин, HArg обозначает гомоаргинин и Ci, Cii и Ciii обозначают первый, второй и третий остатки цистеина, соответственно, или их фармацевтически приемлемую соль.
В одном варианте осуществления Х5 выбран из A, dA, G, dD, N, Е и P.
В одном варианте осуществления указанные последовательности петель содержат три остатка цистеина, разделенных двумя последовательностями петель, первая из которых состоит из 7 аминокислот и вторая из которых состоит из 3 аминокислот, и указанный пептидный лиганд содержит аминокислотную последовательность, выбранную из
Ci-W/A-P-L-D/S-S/D-Y-W-Cii-X5-R-I-Ciii (SEQ ID NO: 39), где Х5 обозначает любой аминокислотный остаток, и Ci, Cii и Ciii обозначают первый, второй и третий остатки цистеина, соответственно, или их фармацевтически приемлемую соль.
В одном варианте осуществления Х5 выбран из A, G, D и N.
В одном варианте осуществления указанные последовательности петель содержат три остатка цистеина, разделенных двумя последовательностями петель, обе из которых состоят из 6 аминокислот, и указанный пептидный лиганд содержит аминокислотную последовательность, выбранную из
Ci-V-T-T-S-Y-D-Cii-F/W-L/V-H/R/T-L-L/G-G/Q/H-Ciii (SEQ ID NO: 40), где Ci, Cii и Ciii обозначают первый, второй и третий остатки цистеина, соответственно, или их фар
- 5 045862 мацевтически приемлемую соль.
В следующем варианте осуществления пептидный лиганд Ci-P/A/Hyp-F/Y-G/A-Cii-X1-X2-X3-W/1Nal/2-Nal-S/A-X4-P-I/D/A-W/l-Nal/2-Nal-Ciii (SEQ ID NO: 38) содержит аминокислотную последовательность, выбранную из любой из SEQ ID NO: 1-30
CiPFGCiiMKNWSWPIWCiii (SEQ ID NO: 1);
CiPFGCiiMRNWSWPIWCiii (SEQ ID NO: 2);
CiPFGCiiiNpgXNWSWPIWCiii (SEQ ID NO: 3);
CiPFGC^HLeuXNWSWPIWCiii (SEQ ID NO: 4);
CiPFGCiilKNWSWPIWCiii (SEQ ID NO: 5);
CiPFACiiMKNWSWPIWCiii (SEQ ID NO: 6);
CiPFGCiiQKNWSWPIWCiii (SEQ ID NO: 7);
CiPFGCiiMKNWSDPIWCiii (SEQ ID NO: 8);
CiPFGCiiMKNWSWPKl-NaQCiii (SEQ ID NO: 9);
Ci(Hyp)FGCiiMKNWSWPIWCiii (SEQ ID NO: 10);
CiPYGCiiMKNWSWPIWCiii (SEQ ID NO: 11);
CiPFGCiiMSNWSWPIWCiii (SEQ ID NO: 12);
CiPFGCiiMDNWSWPIWCiii (SEQ ID NO: 13);
CiPFGCiiM(HArg)NWSWPIWCiii (SEQ ID NO: 14);
CiPFGCiiMKDWSWPIWCiii (SEQ ID NO: 15);
CiPFGCiiMKHWSWPIWCiii (SEQ ID NO: 16);
CiPFGCiiMKNQ-NaQSWPIWCiii (SEQ ID NO: 17);
CiPFGCiiMKN(2-Nal)SWPIWCiii (SEQ ID NO: 18);
CiPFGCiiMKNWSTPIWCiii (SEQ ID NO: 19);
CiPFGCiiMKNWSWPDWCiii (SEQ ID NO: 20);
CiPFGCiiMKNWSWPI(2-Nal)Ciii (SEQ ID NO: 21);
CiPFGCiiM(HArg)NWSWPIWCiii (SEQ ID NO: 22);
CiPFGCiiM(K(Ac))NWSWPIWCiii (SEQ ID NO: 23);
CiPFGCiiMKNWSAPIWCiii (SEQ ID NO: 24);
CiPFGCiiMKNWSWPAWCiii (SEQ ID NO: 25);
CiAFGCiiMKNWSWPIWCiii (SEQ ID NO: 26);
CiPFGCiiMANWSWPIWCiii (SEQ ID NO: 27);
CiPFGCiiMKAWSWPIWCiii (SEQ ID NO: 28);
CiPFGCiiiNleXNWSWPIWCiii (SEQ ID NO: 29); и
CiPFGCiiMKNWAWPIWCiii (SEQ ID NO: 30);
где Ci, Cii и Ciii обозначают первый, второй и третий остатки цистеина, соответственно, или их фармацевтически приемлемую соль.
В следующем варианте осуществления пептидный лиганд Ci-P/A/Hyp-F/Y-G/A-Cii-X1-X2-X3-W/1Nal/2-Nal-S/A-X4-P-I/D/A-W/l-Nal/2-Nal-Ciii (SEQ ID NO: 38) содержит аминокислотную последовательность, выбранную из
- 6 045862
A-(SEQ Ш NO: 1)-А (далее обозначаемой как 80-09-02-N002 или BCY428);
F1-A-(SQ ID NO: 1)-А (далее обозначаемой как 80-09-02-N006);
Ac-(SEQ ID NO: 1) (далее обозначаемой как 80-09-02-N008 или BCY7390);
Ac-[dD]-(SEQ ID NO: 1) (далее обозначаемой как BCY7606);
A-(SEQ ID NO: 2)-А (далее обозначаемой как 80-09-02-N003 или BCY429);
(l-Nal)A-(SEQ ID NO: 1)-А (далее обозначаемой как 80-09-02-N009 или BCY7420);
(2-Nal)A-(SEQ ID NO: 1)-А (далее обозначаемой как 80-09-02-N010 или BCY7421);
(33DPA)A-(SEQ Ш NO: 1)-А (далее обозначаемой как 80-09-02-N011 или BCY7422); (44BPA)A-(SEQ ID NO: 1)-А (далее обозначаемой как 80-09-02-N012 или BCY7521); Ac-(SEQ Ш NO: 3) (далее обозначаемой как 80-09-02-N017);
Ac-(SEQ Ш NO: 4) (далее обозначаемой как 80-09-02-N018);
Ac-(SQ ID NO: 5) (далее обозначаемой как 80-09-02-N019 или BCY7537);
Ac-(SEQ Ш NO: 6) (далее обозначаемой как 80-09-02-N020);
Ac-(SEQ Ш NO: 7) (далее обозначаемой как 80-09-02-N021 или BCY7539);
Ac-(SEQ Ш NO: 8) (далее обозначаемой как 80-09-02-N022 или BCY7540);
Ac-(SEQ Ш NO: 9) (далее обозначаемой как 80-09-02-N023);
Ac-(pCoF)-(SEQ Ш NO: 1) (далее обозначаемой как 80-09-02-N044);
Ac-(SEQ Ш NO: 10) (далее обозначаемой как 80-09-02-N045);
Ac-(SEQ Ш NO: 11) (далее обозначаемой как 80-09-02-N046 или BCY7657);
Ac-(SEQ Ш NO: 12) (далее обозначаемой как 80-09-02-N047 или BCY7658);
Ac-(SEQ Ш NO: 13) (далее обозначаемой как 80-09-02-N048 или BCY7659);
Ac-(SEQ Ш NO: 14) (далее обозначаемой как 80-09-02-N049);
Ac-(SEQ Ш NO: 15) (далее обозначаемой как 80-09-02-N050 или BCY7661);
SDN-(SEQ ID NO: 15)-А (далее обозначаемой как BCY3387);
Ac-(SEQ Ш NO: 16) (далее обозначаемой как 80-09-02-N051 или BCY7662);
Ac-(SEQ Ш NO: 17) (далее обозначаемой как 80-09-02-N052);
Ac-(SEQ Ш NO: 18) (далее обозначаемой как 80-09-02-N053);
Ac-(SEQ Ш NO: 19) (далее обозначаемой как 80-09-02-N054 или BCY7665);
Ac-(SEQ Ш NO: 20) (далее обозначаемой как 80-09-02-N055 или BCY7666);
Ac-(SEQ Ш NO: 21) (далее обозначаемой как 80-09-02-N056);
A-(SEQ Ш NO: 1)-TNK (далее обозначаемой как 80-09-02-T01-N001 или BCY3385);
A-(SEQ Ш NO: l)-TN(HArg) (далее обозначаемой как 80-09-02-T01-N003 или BCY7281);
A-(SEQ Ш NO: 1)-TN(D-K) (далее обозначаемой как 80-09-02-T01-N004 или BCY7282);
A-(SEQ Ш NO: 22)-TNK (далее обозначаемой как 80-09-02-T01-N005);
A-(SEQ Ш NO: 23)-TNK (далее обозначаемой как 80-09-02-T01-N006);
Ac-(SEQ ID NO: 1)-TNK (далее обозначаемой как 80-09-02-T01-N011 или BCY7391);
A-(SEQ ID NO: 24)-TNK (далее обозначаемой как 80-09-02-T01-N012 или BCY7342);
- 7 045862
A-(SEQ ID NO: 25)-TNK (далее обозначаемой как 80-09-02-T01-N014 или BCY7344);
A-(SEQ ID NO: 1)-ANK (далее обозначаемой как 80-09-02-T01-N016 или BCY7346);
A-(SEQ ГО NO: l)-[dA]NK (далее обозначаемой как BCY7367);
A-(SEQ ГО NO: 1)-ТАК (далее обозначаемой как 80-09-02-T01-N017 или BCY7347);
A-(SEQ ГО NO: l)-T[dA]K (далее обозначаемой как BCY7368);
A-(SEQ ГО NO: 1)-TNA (далее обозначаемой как 80-09-02-T01-N018 или BCY7348);
A-(SEQ ГО NO: l)-TN[dA] (далее обозначаемой как BCY7369);
Ac-[pCoPhe]-(SEQ ID NO: 1) (далее обозначаемой как BCY7656);
A-(SEQ ГО NO: 6)-TNK (далее обозначаемой как 80-09-02-T01-N020 или BCY7354);
A-(SEQ ID NO: 26)-TNK (далее обозначаемой как 80-09-02-T01-N022 или BCY7352);
A-(SEQ ID NO: 27)-TNK (далее обозначаемой как 80-09-02-T01-N026 или BCY7356);
A-(SEQ ID NO: 28)-TNK (далее обозначаемой как 80-09-02-T01-N027 или BCY7357);
A-(SEQ ID NO: 29)-TNK (далее обозначаемой как 80-09-02-T01-N041 или BCY7372);
и
A-(SEQ ID NO: 30)-TNK (далее обозначаемой как 80-09-02-T01-N042 или BCY7424).
В следующем варианте осуществления пептидный лиганд Ci-P/A/Hyp-F/Y-G/A-Cii-X1-X2-X3-W/1Nal/2-Nal-S/A-X4-P-LD/A-W/1-Nal/2-Nal-Ciii (SEQ ID NO: 38) содержит аминокислотную последовательность, выбранную из
A-(SEQ ID NO: 1)-TNK (далее обозначаемой как 80-09-02-T01-N001 или BCY3385);
Ac-(SEQ ГО NO: 1) (далее обозначаемой как 80-09-02-N008 или BCY7390); и
Ac-(SEQ ГО NO: 1)-TNK (далее обозначаемой как 80-09-02-T01-N011 или BCY7391).
В настоящем описании в таблице 3 приводятся данные, которые демонстрируют, что пептидные лиганды согласно этому варианту осуществлению демонстрировали хорошие уровни (<100 нМ) связывания с нектином-4 человека, о чем свидетельствуют данные связывания, полученные с использованием SPR.
В следующем варианте осуществления пептидный лиганд Ci-W/A-P-L-D/S-S/D-Y-W-Cii-X5-R-I-Ciii (SEQ ID NO: 39) содержит аминокислотную последовательность, выбранную из любой из SEQ ID NO: 31-34: CiWPLDSYWCiiARICiii (SEQ ID NO: 31);
CiAPLDDYWCiiGRICiii (SEQ ID NO: 32);
CiAPLDDYWCiiDRTCiii (SEQ ID NO: 33); и
CiAPLSDYWCiiNRICiii (SEQ ID NO: 34);
где Ci, Cii и Ciii обозначают первый, второй и третий остатки цистеина, соответственно, или их фармацевтически приемлемую соль.
В следующем варианте осуществления пептидный лиганд Ci-W/A-P-L-D/S-S/D-Y-W-Cii-X5-R-I-Ciii (SEQ ID NO: 39) содержит аминокислотную последовательность, выбранную из
A-(SEQ ГО NO: 31)-А (далее обозначаемой как 80-10-00 или BCY488);
A-(SEQ ГО NO: 32)-А (далее обозначаемой как BCY432);
DDW-(SEQ ГО NO: 32)-А (далее обозначаемой как 80-10-11-Т01 или BCY433);
VDW-(SEQ ГО NO: 33)-А (далее обозначаемой как 80-10-12-Т01 или BCY462);
- 8 045862
QKW-(SEQ Ш NO: 34)-A (далее обозначаемой как 80-10-13-Т01 или BCY3400);
Q[HArg]W-(SEQ ID NO: 34)-A (далее обозначаемой как BCY7278);
Q[K(Ac)]W-(SEQ ID NO: 34)-A (далее обозначаемой как BCY7280);
[Ac]QKW-(SEQ ID NO: 34) (далее обозначаемой как BCY7392);
Q[dK]W-(SEQ ID NO: 34)-A (далее обозначаемой как BCY7426);
Ac-AKW-(SEQ ID NO: 34) (далее обозначаемой как BCY7622);
Ac-QAW-(SEQ ID NO: 34) (далее обозначаемой как BCY7623);
Ac-QKA-(SEQ ID NO: 34) (далее обозначаемой как BCY7624);
Ac-[dA]KW-(SEQ ID NO: 34) (далее обозначаемой как BCY7634);
Ac-Q[dA]W-(SEQ ID NO: 34) (далее обозначаемой как BCY7635);
Ac-QK[dA]-(SEQ ID NO: 34) (далее обозначаемой как BCY7636);
Ac-Q[dD]W-(SEQ ID NO: 34) (далее обозначаемой как BCY7993);
Ac-QK[lNal]-(SEQ ID NO: 34) (далее обозначаемой как BCY7996);
Ac-QK[2Nal]-(SEQ ID NO: 34) (далее обозначаемой как BCY7997); и
Ac-(SEQ ID NO: 34) (далее обозначаемой как BCY8044).
В следующем варианте осуществления пептидный лиганд Ci-W/A-P-L-D/S-S/D-Y-W-Cii-X5-R-I-Ciii (SEQ ID NO: 39) содержит аминокислотную последовательность, выбранную из
[Ac]QKW-(SEQ ID NO: 34) (далее обозначаемой как BCY7392).
В настоящем описании в таблице 3 приводятся данные, которые демонстрируют, что пептидные лиганды согласно этому варианту осуществлению демонстрировали хорошие уровни (<100 нМ) связывания с нектином-4 человека, о чем свидетельствуют данные связывания, полученные с использованием SPR.
В следующем варианте осуществления пептидный лиганд Ci-W/A/Y-P/A-L-D/S/A-S/D/P/A-Y-W/1Nal-Cii-X5-R/HArg/A-I-Ciii (SEQ ID NO: 42) содержит аминокислотную последовательность, выбранную из
CWPLDPYWCGRIC (SEQ ID NO: 43);
CYPLSPYWCERIC (SEQ ID NO: 44);
CWPLDDYWCPRIC (SEQ ID NO: 58);
CAPLSDYWCN[HArg]IC (SEQ ID NO: 65);
CAALSDYWCNRIC (SEQ ID NO: 103);
CAPLADYWCNRIC (SEQ ID NO: 104);
CAPLSAYWCNRIC (SEQ ID NO: 105);
CAPLSDYWCARIC (SEQ ID NO: 106);
CAPLSDYWCNAIC (SEQ ID NO: 107);
CAPL[dA]DYWCNRIC (SEQ ID NO: 108);
CAPLS[dA]YWCNRIC (SEQ ID NO: 109);
CAPLSDYWC[dA]RIC (SEQ ID NO: 110);
CAPLSDY[lNal]CNRIC (SEQ ID NO: 153); и
CAPLSDYWC[dD]RIC (SEQ ID NO: 154).
В следующем варианте осуществления пептидный лиганд Ci-W/A/Y-P/A-L-D/S/A-S/D/P/A-Y-W/1Nal-Cii-X5-R/HArg/A-I-Ciii (SEQ ID NO: 42) содержит аминокислотную последовательность, выбранную из
- 9 045862
A-(SEQ Ш NO: 43)-A (далее обозначаемой как BCY430);
A-(SEQ Ш NO: 44)-А (далее обозначаемой как BCY431);
A-(SEQ Ш NO: 58)-PQA (далее обозначаемой как BCY3401);
QKW-(SEQ Ш NO: 65)-А (далее обозначаемой как BCY7279);
Ac-QKW-(SEQ Ш NO: 103) (далее обозначаемой как BCY7625);
Ac-QKW-(SEQ Ш NO: 104) (далее обозначаемой как BCY7627);
Ac-QKW-(SEQ Ш NO: 105) (далее обозначаемой как BCY7628);
Ac-QKW-(SEQ Ш NO: 106) (далее обозначаемой как BCY7631);
Ac-QKW-(SEQ Ш NO: 107) (далее обозначаемой как BCY7632);
Ac-QKW-(SEQ Ш NO: 108) (далее обозначаемой как BCY7639);
Ac-QKW-(SEQ Ш NO: 109) (далее обозначаемой как BCY7640);
Ac-QKW-(SEQ Ш NO: 110) (далее обозначаемой как BCY7643);
Ac-QKW-(SEQ Ш NO: 153) (далее обозначаемой как BCY7998); и
Ac-QKW-(SEQ Ш NO: 154) (далее обозначаемой как BCY8000).
В следующем варианте осуществления пептидный лиганд Ci-V-T-T-S-Y-D-Cii-F/W-L/V-H/R/T-LL/G-G/Q/H-Ciii (SEQ ID NO: 40) содержит аминокислотную последовательность, выбранную из любой из SEQ ID NO: 35-37
CiVTTSYDCiiFLHLLGCiii (SEQ ID NO: 35);
CiVTTSYDCiiWVRLGQCiii (SEQ ID NO: 36); и
CiVTTSYDCiiWVTLGHCiii (SEQ ID NO: 37);
где Ci, Cii и Ciii обозначают первый, второй и третий остатки цистеина, соответственно, или их фармацевтически приемлемую соль.
В следующем варианте осуществления пептидный лиганд Ci-V-T-T-S-Y-D-Cii-F/W-L/V-H/R/T-LL/G-G/Q/H-Ciii (SEQ ID NO: 40) содержит аминокислотную последовательность, выбранную из
A-(SEQ Ш NO: 35)-А (далее обозначаемой как 80-11-00 или BCY471);
A-(SEQ Ш NO: 36)-А (далее обозначаемой как 80-11-01 или BCY472); и
A-(SEQ Ш NO: 37)-SRF (далее обозначаемой как 80-11-08-Т01 или BCY3406).
В следующем варианте осуществления пептидный лиганд Ci-V-T-T-S-Y-D-Cii-F/W-L/V-H/R/T-LL/G-G/Q/H-Ciii (SEQ ID NO: 40) содержит аминокислотную последовательность, выбранную из:
Ac-(SEQ ID NO: 37)-SRF (далее обозначаемой как BCY7393).
В следующем варианте осуществления пептидный лиганд СгХ678й910-Хп-Х121з-Х14Х15-Х16-Х17-Сш (SEQ ID NO: 41) содержит аминокислотную последовательность, выбранную из
CPFGCMETWSWPIWC (SEQ ID NO: 45);
CPFGCMRGWSWPIWC (SEQ ID NO: 46);
- 10 045862
CPFGCMSGWSWPIWC (SEQ ID NO: 47);
CPFGCMEGWSWPIWC (SEQ ID NO: 48);
CPFGCMEDWSWPIWC (SEQ ID NO: 49);
CPFGCMPGWSWPIWC (SEQ ID NO: 50);
CPFGCMKSWSWPIWC (SEQ ID NO: 51);
CPFGCMKTWSWPIWC (SEQ ID NO: 52);
CPFGCMKGWSWPIWC (SEQ ID NO: 53);
CPFGCQEHWSWPIWC (SEQ ID NO: 54);
CPFGCIKSWSWPIWC (SEQ ID NO: 55);
CPFGCQEDWSWPIWC (SEQ ID NO: 56);
CPFGCMSDWSWPIWC (SEQ ID NO: 57);
CPFGCM[HArg]NWSWPIWC (SEQ ID NO: 59);
CPFGCM[K(Ac)]NWSWPIWC (SEQ ID NO: 60);
CPFGCM[K(Ac)]SWSWPIWC (SEQ ID NO: 61);
CPFGC[Nle]KSWSWPIWC (SEQ ID NO: 62);
CPFGCM[HArg]SWSWPIWC (SEQ ID NO: 63);
CPFGCM[dK]SWSWPIWC (SEQ ID NO: 64);
CP[dA]GCMKNWSWPIWC (SEQ ID NO: 66);
CPF[dA]CMKNWSWPIWC (SEQ ID NO: 67);
CPFGCM[dA]NWSWPIWC (SEQ ID NO: 68);
CPFGCMK[dA]WSWPIWC (SEQ ID NO: 69);
CPFGCMKN[dA]SWPIWC (SEQ ID NO: 70);
CPFGCMKNWSWP[dA]WC (SEQ ID NO: 71);
C[dA]FGCMKNWSWPIWC (SEQ ID NO: 72);
CPFGC[tBuAla]KNWSWPIWC (SEQ ID NO: 73);
CPFGC[HLeu]KNWSWPIWC (SEQ ID NO: 74);
CPFGCMKNWSWPI[lNal]C (SEQ ID NO: 75);
CPF[dD]CM[HArg]NWSWPIWC (SEQ ID NO: 76);
CPF[dA]CM[HArg]NWSWPIWC (SEQ ID NO: 77);
CP[3MePhe]GCMKNWSWPIWC (SEQ ID NO: 78);
CP[4MePhe]GCMKNWSWPIWC (SEQ ID NO: 79);
CP[HPhe]GCMKNWSWPIWC (SEQ ID NO: 80);
CPF[dD]CMKNWSWPIWC (SEQ ID NO: 81);
CPFGC[Hse(Me)]KNWSWPIWC (SEQ ID NO: 82);
CPFGCMKN[AzaTrp]SWPIWC (SEQ ID NO: 83);
CPFGCMKNWSFPIWC (SEQ ID NO: 84);
CPFGCMKNWSYPIWC (SEQ ID NO: 85);
CPFGCMKNWS[lNal]PIWC (SEQ ID NO: 86);
CPFGCMKNWS[2Nal]PIWC (SEQ ID NO: 87);
CPFGCMKNWS[AzaTrp]PIWC (SEQ ID NO: 88);
- 11 045862
CPFGCMKNWSW[Aze]IWC (SEQ Ш NO: 89);
CPFGCMKNWSW[Pip]IWC (SEQ Ш NO: 90);
CPFGCMKNWSWPIFC (SEQ ID NO: 91);
CPFGCMKNWSWPIYC (SEQ ID NO: 92);
CPFGCMKNWSWPI[AzaTrp]C (SEQ ID NO: 93);
CGFGCMKNWSWPIWC (SEQ ID NO: 94);
C[Aze]FGCMKNWSWPIWC (SEQ ID NO: 95);
CPF[K(Ac)]CMKNWSWPIWC (SEQ ID NO: 96);
CPFGCLKNWSWPIWC (SEQ ID NO: 97);
CPFGC[MetO2]KNWSWPIWC (SEQ ID NO: 98);
CPFGCMPNWSWPIWC (SEQ ID NO: 99);
CPFGCMQNWSWPIWC (SEQ ID NO: 100);
CPFGCMKNWSWPPWC (SEQ ID NO: 101);
CP[2Pal]GCMKNWSWPIWC (SEQ ID NO: 102);
CPFGCMKN[lNal]SWPIWC (SEQ ID NO: 111);
CPFGCMKN[2Nal]SWPIWC (SEQ ID NO: 112);
CPFGCMKNWSWPI[2Nal]C (SEQ ID NO: 113);
C[HyP]FGCMKNWSWPIWC (SEQ ID NO: 114);
CPF[dD]CM[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 115);
CPF[dD]CM[HArg][dK]WSTPIWC (SEQ ID NO: 116);
CPF[dD]CM[HArg]NWSTPKWC (SEQ ID NO: 117);
C[Pro(4NH)]F[dD]CM[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 118);
CPF[dD]CMKNWSTPIWC (SEQ ID NO: 119);
CPF[dK]CM[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 120);
CPF[dD]CK[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 121);
CPF[dD]CM[HArg]KWSTPIWC (SEQ ID NO: 122);
C[Oxa]F[dD]CM[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 123);
CPF[dD]CM[HArg][Thi]WSTPIWC (SEQ ID NO: 124);
CPF[dD]CM[HArg][4ThiAz]WSTPIWC (SEQ ID NO: 125);
CPF[dD]CM[HArg][124TriAz]WSTPIWC (SEQ ID NO: 126);
CPF[dD]CM[HArg]NWS[124TriAz]PIWC (SEQ ID NO: 127);
CPF[dD]CM[HArg]NWST[Oxa]IWC (SEQ ID NO: 128);
CP[DOPA][dD]CM[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 129);
CPF[dD]CM[HArg]NWS[DOPA]PIWC (SEQ ID NO: 130);
CPF[dD]CM[HArg]NWS[THP(SO2)]PIWC (SEQ ID NO: 131);
CPF[dD]CM[HArg]NWSTP[THP(SO2)]WC (SEQ ID NO: 132);
CPF[dD]CM[HArg]N[5FTrp]STPIWC (SEQ ID NO: 133);
CPF[dD]CM[HArg]NWSTPI[5FTrp]C (SEQ ID NO: 134);
CPF[dD]CM[HArg]NWS[THP(O)]PIWC (SEQ ID NO: 135);
CPF[dD]CM[HArg]NWSTP[THP(O)]WC (SEQ ID NO: 136);
- 12 045862
C[44DFP]F[dD]CM[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 137);
C[Oic]F[dD]CM[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 138);
CPF[dF]CM[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 139);
CPF[dE]CM[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 140);
CPF[dQ]CM[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 141);
CPF[dL]CM[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 142);
CPF[dS]CM[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 143);
CPF[dD]CM[HArg]NW[HSer]TPIWC (SEQ ID NO: 144);
CPF[dD]CM[HArg]NWSTP[C5A]WC (SEQ ID NO: 145);
CPF[dD]CM[HArg]NWSTP[Cpa]WC (SEQ ID NO: 146);
CPF[dD]CM[HArg]NWSTP[Cha]WC (SEQ ID NO: 147);
CPF[dD]C[HGln][HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 148);
CPF[dD]C[C5A][HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 149);
CPF[dD]CM[HArg]N[Trp(Me)]STPIWC (SEQ ID NO: 150);
CPF[dD][NMeCys]M[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 151);
CPF[dD]C[HArg]NWS[NMeThr]PIWC (SEQ ID NO: 152);
CP[lNal][dD]CM[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 155);
CP[2Nal][dD]CM[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 156);
CP[44BPA][dD]CM[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 157);
CPF[dD]CM[HArg]NWSTPPWC (SEQ ID NO: 158);
CPF[dD]CM[HArg]NWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 159);
CPF[dD]CL[HArg]NWSTPPWC (SEQ ID NO: 160);
CPF[dD]CL[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 161);
CPY[dD]CM[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 162);
C[Aib]F[dD]CM[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 163);
C[Sar]F[dD]CM[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 164);
CPF[dR]CM[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 165);
CPF[dD]CM[HArg]NWSTPKWC (SEQ ID NO: 166);
CP[lNal][dD]CM[HArg]NWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 167);
CP[lNal][dD]CM[HArg]HWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 168):
CP[lNal][dD]CM[HArg]DWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 169);
CP[lNal][dD]CM[HArg]DWSTPIWC (SEQ ID NO: 170);
CP[lNal][dR]CM[HArg]NWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 171);
CP[lNal][dR]CM[HArg]HWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 172);
CPF[dD]CM[NMeHArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 173);
CPF[dD]CM[HArg][NMeAsn]WSTPIWC (SEQ ID NO: 174);
CPF[dD]CM[HArg]NWS[NMeThr]PIWC (SEQ ID NO: 175);
CPF[dD]CM[HArg]NWSTP[NMeIle]WC (SEQ ID NO: 176);
CP[lNal][dD]CM[HArg][Cya]WSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 177);
CP[lNal][dD]CM[Cya]DWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 178);
- 13 045862
CP[lNal][DCya]CM[HArg]DWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 179);
CP[lNal][dD]CM[HArg]DWDTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 180);
CP[2Nal][dD]CM[HArg]DWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 181);
CP[lNal][dD]CM[HArg]DWTTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 182);
CP[lNal][dD]CM[HArg]DW[HSer]TP[HyP]WC (SEQ ID NO: 183);
CP[lNal][dD]CM[HArg]DW[dS]TP[HyP]WC (SEQ ID NO: 184);
CP[lNal][dD]CM[HArg]DWSSP[HyP]WC (SEQ ID NO: 185);
CP[lNal][dD]CM[Agb]DWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 186);
CP[lNal][dD]CMPDWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 187);
CP[lNal][dD]CM[HyP]DWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 188);
CP[lNal][dR]CM[HArg]DWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 189);
CP[lNal][dR]CM[HArg]DWDTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 190);
CP[2Nal][dR]CM[HArg]DWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 191);
CP[lNal][dR]CM[HArg]DWTTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 192);
CP[lNal][dR]CM[HArg]DW[HSer]TP[HyP]WC (SEQ ID NO: 193);
CP[lNal][dR]CM[HArg]DW[dS]TP[HyP]WC (SEQ ID NO: 194);
CP[lNal][dR]CM[HArg]DWSSP[HyP]WC (SEQ ID NO: 195);
CP[lNal][dR]CM[Agb]DWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 196);
CP[lNal][dR]CMPDWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 197);
CP[lNal][dR]CM[HyP]DWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 198);
CP[lNal][dD]CL[HArg]DWSTPIWC (SEQ ID NO: 199);
CP[lNal][dD]CL[HArg]DWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 200);
CP[lNal][dR]CL[HArg]DWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 201);
CP[lNal][dR]CL[HArg]HWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 202);
CP[lNal][dR]CM[HArg]DWSTPIWC (SEQ ID NO: 203);
CP[lNal][DCya]CM[Cya]DWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 208);
CP[lNal][DCya]CM[HArg][Cya]WSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 209);
CP[lNal][dD]CM[Cya][Cya]WSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 210);
CP[lNal][dK]CM[HArg]DWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 211);
CP[lNal][dD]CMKDWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 212);
CP[lNal][dD]CM[HArg]D[dW]STP[HyP][dW]C (SEQ ID NO: 215); и
CPFGCM[HArg]DWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 216).
В следующем варианте осуществления пептидный лиганд Ci-X6-X7-X8-Cii-X9-X10-X11-X12-X13-X14X15-X16-X17-Ciii (SEQ ID NO: 41) содержит аминокислотную последовательность, выбранную из
CP[1Nal][dD]CM[HArg]DWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 169).
В одном варианте осуществления пептидный лиганд по изобретению представляет собой пептидный лиганд, отличный от аминокислотной последовательности CP[1Nal][dD]CM[HArg]DWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 169).
В следующем варианте осуществления пептидный лиганд Ci-X6-X7-X8-Cii-X9-X10-X11-X12-X13-X14X15-X16-X17-Ciii (SEQ ID NO: 41) содержит аминокислотную последовательность, выбранную из
- 14 045862
DDA-(SEQ Ш NO: 45)-A (далее обозначаемой как BCY3386);
DTA-(SEQ ID NO: 46)-A (далее обозначаемой как BCY3388);
DSE-(SEQ ID NO: 47)-A (далее обозначаемой как BCY3389);
HDA-(SEQ ID NO: 48)-A (далее обозначаемой как BCY3390);
MDT-(SEQ ID NO: 49)-A (далее обозначаемой как BCY3391);
DPG-(SEQ ID NO: 50)-A (далее обозначаемой как BCY3392);
HDS-(SEQ ID NO: 51)-A (далее обозначаемой как BCY3393); (D-H)DS-(SEQ ID NO: 51)-A (далее обозначаемой как BCY7272);
A-(SEQ ID NO: 52)-TDK (далее обозначаемой как BCY3394);
A-(SEQ ID NO: 53)-LKD (далее обозначаемой как BCY3395);
A-(SEQ ID NO: 54)-TTA (далее обозначаемой как BCY3396);
A-(SEQ ID NO: 55)-QME (далее обозначаемой как BCY3397);
A-(SEQ ID NO: 56)-LSE (далее обозначаемой как BCY3398);
A-(SEQ ID NO: 57)-STD (далее обозначаемой как BCY3399);
A-(SEQ ID NO: 59)-TNK (далее обозначаемой как BCY7265);
Ac-(SEQ ID NO: 59) (далее обозначаемой как BCY7660);
A-(SEQ ID NO: 60)-TNK (далее обозначаемой как BCY7266);
Ac-(SEQ ID NO: 60) (далее обозначаемой как BCY7616);
HDS-(SEQ ID NO: 61)-A (далее обозначаемой как BCY7273);
HDS-(SEQ ID NO: 62)-A (далее обозначаемой как BCY7274);
HDS-(SEQ ID NO: 63)-A (далее обозначаемой как BCY7275);
HDS-(SEQ ID NO: 64)-A (далее обозначаемой как BCY7276);
A-(SEQ ID NO: 66)-TNK (далее обозначаемой как BCY7349);
A-(SEQ ID NO: 67)-TNK (далее обозначаемой как BCY7350);
Ac-(SEQ ID NO: 67) (далее обозначаемой как BCY7538);
A-(SEQ ID NO: 68)-TNK (далее обозначаемой как BCY7359);
A-(SEQ ГО NO: 69)-TNK (далее обозначаемой как BCY7360);
A-(SEQ ГО NO: 70)-TNK (далее обозначаемой как BCY7361);
A-(SEQ ГО NO: 71)-TNK (далее обозначаемой как BCY7365);
A-(SEQ ГО NO: 72)-TNK (далее обозначаемой как BCY7370);
Ac-(SEQ ГО NO: 73) (далее обозначаемой как BCY7535);
Ac-(SEQ ГО NO: 74) (далее обозначаемой как BCY7536);
Ac-(SEQ ГО NO: 75) (далее обозначаемой как BCY7541); [B-Ala][Sar5]-(SEQ ГО NO: 76) (далее обозначаемой как BCY7556);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ ГО NO: 76) (далее обозначаемой KaKBCY7558);
[B-Ala][Sar5]-(SEQ ГО NO: 77) (далее обозначаемой как BCY7557); Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ ГО NO: 77) (далее обозначаемой KaKBCY7559); Ac-(SEQ ГО NO: 78) (далее обозначаемой как BCY7580);
- 15 045862
Ac-(SEQ Ш NO: 79) (далее обозначаемой как BCY7581);
Ac-(SEQ Ш NO: 80) (далее обозначаемой как BCY7582);
Ac-(SEQ ГО NO: 81) (далее обозначаемой как BCY7584);
Ac-(SEQ Ш NO: 82) (далее обозначаемой как BCY7585);
Ac-(SEQ Ш NO: 83) (далее обозначаемой как BCY7588);
Ac-(SEQ Ш NO: 84) (далее обозначаемой как BCY7589);
Ac-(SEQ Ш NO: 85) (далее обозначаемой как BCY7590);
Ac-(SEQ Ш NO: 86) (далее обозначаемой как BCY7591);
Ac-(SEQ Ш NO: 87) (далее обозначаемой как BCY7592);
Ac-(SEQ Ш NO: 88) (далее обозначаемой как BCY7593);
Ac-(SEQ Ш NO: 89) (далее обозначаемой как BCY7594);
Ac-(SEQ Ш NO: 90) (далее обозначаемой как BCY7595);
Ac-(SEQ Ш NO: 91) (далее обозначаемой как BCY7596);
Ac-(SEQ Ш NO: 92) (далее обозначаемой как BCY7597);
Ac-(SEQ Ш NO: 93) (далее обозначаемой как BCY7598);
Ac-(SEQ Ш NO: 94) (далее обозначаемой как BCY7607);
Ac-(SEQ Ш NO: 95) (далее обозначаемой как BCY7608);
Ac-(SEQ Ш NO: 96) (далее обозначаемой как BCY7611);
Ac-(SEQ Ш NO: 97) (далее обозначаемой как BCY7612);
Ac-(SEQ Ш NO: 98) (далее обозначаемой как BCY7613);
Ac-(SEQ Ш NO: 99) (далее обозначаемой как BCY7614);
Ac-(SEQ Ш NO: 100) (далее обозначаемой как BCY7615);
Ac-(SEQ Ш NO: 101) (далее обозначаемой как BCY7618);
Ac-(SEQ Ш NO: 102) (далее обозначаемой как BCY7620);
Ac-(SEQ Ш NO: 111) (далее обозначаемой как BCY7663);
Ac-(SEQ Ш NO: 112) (далее обозначаемой как BCY7664);
Ac-(SEQ ГО NO: 113) (далее обозначаемой как BCY7667);
Ac-(SEQ Ш NO: 114) (далее обозначаемой как BCY7668);
Ac-(SEQ Ш NO: 115) (далее обозначаемой как BCY7765);
(SEQ Ш NO: 115) (далее обозначаемой как BCY7793);
(MeO-dPEG12)(SEQ ID NO: 115) (далее обозначаемой как BCY8087);
(карбоксифлуоресцеин)(8Е0 ID NO: 115) (далее обозначаемой как BCY8208);
(PEG3)(PEG3)(SEQ ГО NO: 115) (далее обозначаемой как BCY7815);
(MeO-dPEG12)(PEG3)(PEG3)(SEQ ID NO: 115) (далее обозначаемой как BCY8094);
Ac-DDD-(SEQ ГО NO: 115) (далее обозначаемой как BCY8028);
Ac-[dD][dD][dD]-(SEQ ГО NO: 115) (далее обозначаемой как BCY8029);
[B-Ala][Sarl0]-(SEQ ID NO: 115) (далее обозначаемой как BCY7814);
Ac-(SEQ ГО NO: 116) (далее обозначаемой как BCY7816);
Ac-(SEQ ГО NO: 116) (MeO-dPEG12), связанной с D-Lys6 (далее обозначаемой как BCY8084);
- 16 045862
Ac-(SEQ Ш NO: 117) (далее обозначаемой как BCY7817);
Ac-(SEQ Ш NO: 118) (далее обозначаемой как BCY7818;
Ac-(SEQ ID NO: 118) (MeO-dPEG12), связанной c Pro(4NH)l (далее обозначаемой как BCY8086);
Ac-(SEQ Ш NO: 119) (далее обозначаемой как BCY7819;
Ac-(SEQ ID NO: 119) (MeO-dPEG12), связанной c Lys5 (далее обозначаемой как BCY8088);
Ac-(SEQ Ш NO: 120) (далее обозначаемой как BCY7820;
Ac-(SEQ Ш NO: 120) (MeO-dPEG12), связанной с D-Lys3 (далее обозначаемой как BCY8089);
Ac-(SEQ Ш NO: 121) (далее обозначаемой как BCY7821);
Ac-(SEQ ID NO: 121) (MeO-dPEG12), связанной c Lys4 (далее обозначаемой как BCY8090);
Ac-(SEQ Ш NO: 122) (далее обозначаемой как BCY7822);
Ac-(SEQ ID NO: 122) (MeO-dPEG12), связанной c Lys6 (далее обозначаемой как BCY8091);
Ac-(SEQ Ш NO: 123) (далее обозначаемой как BCY7876);
Ac-(SEQ Ш NO: 124) (далее обозначаемой как BCY7877);
Ac-(SEQ Ш NO: 125) (далее обозначаемой как BCY7879);
Ac-(SEQ Ш NO: 126) (далее обозначаемой как BCY7881);
Ac-(SEQ Ш NO: 127) (далее обозначаемой как BCY7883);
Ac-(SEQ Ш NO: 128) (далее обозначаемой как BCY7884);
Ac-(SEQ Ш NO: 129) (далее обозначаемой как BCY7886);
Ac-(SEQ Ш NO: 130) (далее обозначаемой как BCY7887);
Ac-(SEQ Ш NO: 131) (далее обозначаемой как BCY7889);
Ac-(SEQ Ш NO: 132) (далее обозначаемой как BCY7890);
Ac-(SEQ Ш NO: 133) (далее обозначаемой как BCY7891);
Ac-(SEQ Ш NO: 134) (далее обозначаемой как BCY7892);
Ac-(SEQ Ш NO: 135) (далее обозначаемой как BCY7894);
Ac-(SEQ Ш NO: 136) (далее обозначаемой как BCY7895);
Ac-(SEQ Ш NO: 137) (далее обозначаемой как BCY7896);
Ac-(SEQ Ш NO: 138) (далее обозначаемой как BCY7897);
Ac-(SEQ Ш NO: 139) (далее обозначаемой как BCY7902);
Ac-(SEQ Ш NO: 140) (далее обозначаемой как BCY7903);
Ac-(SEQ Ш NO: 141) (далее обозначаемой как BCY7904);
Ac-(SEQ Ш NO: 142) (далее обозначаемой как BCY7906);
Ac-(SEQ Ш NO: 143) (далее обозначаемой как BCY7907);
Ac-(SEQ Ш NO: 144) (далее обозначаемой как BCY7908);
Ac-(SEQ Ш NO: 145) (далее обозначаемой как BCY7911);
Ac-(SEQ Ш NO: 146) (далее обозначаемой как BCY7912);
- 17 045862
Ac-(SEQ Ш NO: 147) (далее обозначаемой как BCY7913);
Ac-(SEQ Ш NO: 148) (далее обозначаемой как BCY7914);
Ac-(SEQ Ш NO: 149) (далее обозначаемой как BCY7915);
Ac-(SEQ Ш NO: 150) (далее обозначаемой как BCY7916);
Ac-(SEQ Ш NO: 151) (далее обозначаемой как BCY7973);
Ac-(SEQ Ш NO: 152) (далее обозначаемой как BCY7979);
Ac-(SEQ Ш NO: 155) (далее обозначаемой как BCY8030);
Ac-(SEQ Ш NO: 156) (далее обозначаемой как BCY8031);
Ac-(SEQ Ш NO: 157) (далее обозначаемой как BCY8032);
Ac-(SEQ Ш NO: 158) (далее обозначаемой как BCY8036);
Ac-(SEQ Ш NO: 159) (далее обозначаемой как BCY8037);
Ac-(SEQ Ш NO: 160) (далее обозначаемой как BCY8038);
Ac-(SEQ Ш NO: 161) (далее обозначаемой как BCY8039);
Ac-(SEQ Ш NO: 162) (далее обозначаемой как BCY8040);
Ac-(SEQ Ш NO: 163) (далее обозначаемой как BCY8041);
Ac-(SEQ Ш NO: 164) (далее обозначаемой как BCY8042);
Ac-(SEQ Ш NO: 165) (далее обозначаемой как BCY8042);
Ac-(SEQ Ш NO: 166) (далее обозначаемой как BCY8085);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ Ш NO: 167) (далее обозначаемой какВСУ8120);
Ac-(SEQ Ш NO: 167) (далее обозначаемой как BCY8124);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ Ш NO: 168) (далее обозначаемой какВСУ8121);
Ac-(SEQ Ш NO: 168) (далее обозначаемой как BCY8125);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ Ш NO: 169) (далее обозначаемой какВСУ8122);
Ac-(SEQ Ш NO: 169) (далее обозначаемой как BCY8126);
(SEQ Ш NO: 169) (далее обозначаемой как BCY8116);
Флуоресцеин-(8Е(3 Ш NO: 169) (далее обозначаемой как BCY8205);
[B-Ala][SarlO]-(SEQ ID NO: 169) (далее обозначаемой как BCY8234);
[PYA][B-Ala][SarlO]-(SEQ ID NO: 169) (далее обозначаемой как BCY8846);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ Ш NO: 170) (далее обозначаемой какВСУ8123);
Ac-(SEQ Ш NO: 170) (далее обозначаемой как BCY8127);
(SEQ Ш NO: 170) (далее обозначаемой как BCY8206);
Ac-(SEQ Ш NO: 171) (далее обозначаемой как BCY8128);
(SEQ Ш NO: 171) (далее обозначаемой как BCY8207);
[B-Ala][SarlO]-(SEQ ID NO: 171) (далее обозначаемой как BCY8232);
Ac-(SEQ Ш NO: 172) (далее обозначаемой как BCY8129);
Ac-(SEQ Ш NO: 173) (далее обозначаемой как BCY8153);
Ac-(SEQ Ш NO: 174) (далее обозначаемой как BCY8154);
Ac-(SEQ Ш NO: 175) (далее обозначаемой как BCY8157);
Ac-(SEQ Ш NO: 176) (далее обозначаемой как BCY8158);
Ac-(SEQ Ш NO: 177) (далее обозначаемой как BCY8161);
- 18 045862
Ac-[B-Ala][SarlO]-(SEQ Ш NO: 177) (далее обозначаемой как BCY8278);
Ac-(SEQ Ш NO: 178) (далее обозначаемой как BCY8162);
Ac-[B-Ala][SarlO]-(SEQ Ш NO: 178) (далее обозначаемой как BCY8277);
Ac-(SEQ Ш NO: 179) (далее обозначаемой как BCY8163);
Ac-[B-Ala][SarlO]-(SEQ Ш NO: 179) (далее обозначаемой как BCY8276);
[B-Ala][SarlO]-(SEQ ID NO: 179) (далее обозначаемой как BCY8269);
Ac-(SEQ Ш NO: 180) (далее обозначаемой как BCY8174);
Ac-(SEQ Ш NO: 181) (далее обозначаемой как BCY8175);
Ac-(SEQ Ш NO: 182) (далее обозначаемой как BCY8176);
Ac-(SEQ Ш NO: 183) (далее обозначаемой как BCY8177);
Ac-(SEQ Ш NO: 184) (далее обозначаемой как BCY8178);
Ac-(SEQ Ш NO: 185) (далее обозначаемой как BCY8180);
Ac-(SEQ Ш NO: 186) (далее обозначаемой как BCY8181);
Ac-(SEQ Ш NO: 187) (далее обозначаемой как BCY8182);
Ac-(SEQ Ш NO: 188) (далее обозначаемой как BCY8183);
Ac-(SEQ Ш NO: 189) (далее обозначаемой как BCY8184);
[B-Ala][SarlO]-(SEQ ID NO: 189) (далее обозначаемой как BCY8235);
Ac-(SEQ Ш NO: 190) (далее обозначаемой как BCY8185);
Ac-(SEQ Ш NO: 191) (далее обозначаемой как BCY8186);
Ac-(SEQ Ш NO: 192) (далее обозначаемой как BCY8187);
Ac-(SEQ Ш NO: 193) (далее обозначаемой как BCY8188);
Ac-(SEQ Ш NO: 194) (далее обозначаемой как BCY8189);
Ac-(SEQ Ш NO: 195) (далее обозначаемой как BCY8191);
Ac-(SEQ Ш NO: 196) (далее обозначаемой как BCY8192);
Ac-(SEQ Ш NO: 197) (далее обозначаемой как BCY8193);
Ac-(SEQ Ш NO: 198) (далее обозначаемой как BCY8194);
Ac-(SEQ Ш NO: 199) (далее обозначаемой как BCY8211);
Ac-(SEQ Ш NO: 200) (далее обозначаемой как BCY8212);
Ac-(SEQ Ш NO: 201) (далее обозначаемой как BCY8213);
Ac-(SEQ Ш NO: 202) (далее обозначаемой как BCY8214);
[B-Ala][Sarl0]-(SEQ ID NO: 202) (далее обозначаемой как BCY8231);
Ac-(SEQ Ш NO: 203) (далее обозначаемой как BCY8215);
Ac-[B-Ala][SarlO]-(SEQ Ш NO: 208) (далее обозначаемой как BCY8279);
Ac-[B-Ala][SarlO]-(SEQ Ш NO: 209) (далее обозначаемой как BCY8280);
[B-Ala][Sarl0]-(SEQ ID NO: 209) (далее обозначаемой как BCY8273);
Ac-[B-Ala][SarlO]-(SEQ Ш NO: 210) (далее обозначаемой как BCY8281);
Ac-(SEQ Ш NO: 211) (далее обозначаемой как BCY8831);
[B-Ala][Sarl0]-(SEQ ID NO: 212) (далее обозначаемой как BCY8238);
(SEQ Ш NO: 215) (далее обозначаемой как BCY11415);
[PYA][B-Ala][SarlO]-(SEQ ID NO: 215) (далее обозначаемой как BCY11942); и (SEQ Ш NO: 216) (далее обозначаемой как BCY11414).
В следующем варианте осуществления пептидный лиганд Ci-X6-X7-X8-Cii-X9-X10-X11-X12-X13-X14X15-X16-X17-Ciii (SEQ ID NO: 41) содержит аминокислотную последовательность, выбранную из
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ Ш NO: 169) (далее обозначаемой KaKBCY8122);
Ac-(SEQ ID NO: 169) (далее обозначаемой как BCY8126);
(SEQ ID NO: 169) (далее обозначаемой как BCY8116);
Флуоресцеин-(8ЕР Ш NO: 169) (далее обозначаемой как BCY8205); и
[B-Ala][Sarl0]-(SEQ ID NO: 169) (далее обозначаемой как BCY8234).
В одном варианте осуществления пептидный лиганд по изобретению представляет собой пептидный лиганд, отличный от аминокислотной последовательности
- 19 045862
[B-Ala][SarlO]-(SEQ ID NO: 1) (далее обозначаемой как BCY8234);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ ID NO: 1) (далее обозначаемой какВСУ8122);
Ac-(SEQ ID NO: 1) (далее обозначаемой как BCY8126);
(SEQ ID NO: 1) (далее обозначаемой как BCY8116);
Флуоресцеин-(8Е(3 ID NO: 1) (далее обозначаемой как BCY8205); и
[PYA][B-Ala][SarlO]-(SEQ ID NO: 1) (далее обозначаемой как BCY8846).
В следующем варианте осуществления пептидный лиганд Ci-X6-X7-X8-Cii-X9-X10-X11-X12-X13-X14Х151617ш (SEQ ID NO: 41) содержит аминокислотную последовательность, выбранную из [B-Ala][Sar10]-(SEQ ID NO: 169) (далее обозначаемой как BCY8234).
В следующем варианте осуществления пептидный лиганд СгХ^Х^Х^Сц-Х^Х^-Хп-Х^-Хо-ХнХ15-Х16-Х17-Сш (SEQ ID NO: 41) содержит аминокислотную последовательность, выбранную из
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ Ш NO: 77) (далее обозначаемой какВСУ7559);
Ac-(SEQ Ш NO: 101) (далее обозначаемой как BCY7618);
Ac-(SEQ Ш NO: 115) (далее обозначаемой как BCY7765);
(SEQ Ш NO: 115) (далее обозначаемой как BCY7793);
Ac-(SEQ Ш NO: 155) (далее обозначаемой как BCY8030);
Ac-(SEQ Ш NO: 160) (далее обозначаемой как BCY8038);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ Ш NO: 167) (далее обозначаемой какВСУ8120);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ Ш NO: 168) (далее обозначаемой какВСУ8121);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ Ш NO: 169) (далее обозначаемой какВСУ8122);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ Ш NO: 170) (далее обозначаемой какВСУ8123);
Ac-(SEQ Ш NO: 167) (далее обозначаемой как BCY8124);
Ac-(SEQ Ш NO: 168) (далее обозначаемой как BCY8125);
Ac-(SEQ Ш NO: 169) (далее обозначаемой как BCY8126);
Ac-(SEQ Ш NO: 170) (далее обозначаемой как BCY8127);
Ac-(SEQ Ш NO: 171) (далее обозначаемой как BCY8128);
Ac-(SEQ Ш NO: 172) (далее обозначаемой как BCY8129);
Ac-(SEQ Ш NO: 177) (далее обозначаемой как BCY8161);
Ac-(SEQ Ш NO: 178) (далее обозначаемой как BCY8162);
Ac-(SEQ Ш NO: 179) (далее обозначаемой как BCY8163);
Ac-(SEQ Ш NO: 187) (далее обозначаемой как BCY8182);
Ac-(SEQ Ш NO: 188) (далее обозначаемой как BCY8183);
Ac-(SEQ Ш NO: 189) (далее обозначаемой как BCY8184);
Ac-(SEQ ГО NO: 196) (далее обозначаемой как BCY8192);
Ac-(SEQ ГО NO: 197) (далее обозначаемой как BCY8193);
Ac-(SEQ ГО NO: 198) (далее обозначаемой как BCY8194);
Ac-(SEQ ГО NO: 199) (далее обозначаемой как BCY8211);
Ac-(SEQ ГО NO: 200) (далее обозначаемой как BCY8212);
Ac-(SEQ ГО NO: 201) (далее обозначаемой как BCY8213);
Ac-(SEQ ГО NO: 202) (далее обозначаемой как BCY8214);
Ac-(SEQ ГО NO: 203) (далее обозначаемой как BCY8215);
Ac-[B-Ala][SarlO]-(SEQ ГО NO: 179) (далее обозначаемой как BCY8276);
Ac-[B-Ala][SarlO]-(SEQ ГО NO: 178) (далее обозначаемой как BCY8277);
Ac-[B-Ala][SarlO]-(SEQ ГО NO: 177) (далее обозначаемой как BCY8278);
Ac-[B-Ala][SarlO]-(SEQ ГО NO: 208) (далее обозначаемой как BCY8279);
Ac-[B-Ala][SarlO]-(SEQ ГО NO: 209) (далее обозначаемой как BCY8280); и
Ac-[B-Ala][SarlO]-(SEQ ГО NO: 210) (далее обозначаемой как BCY8281).
В настоящем описании в табл. 3 приводятся данные, которые демонстрируют, что пептидные лиганды согласно этому варианту осуществлению демонстрировали хорошие уровни (<100 нМ) связывания с нектином-4 человека, о чем свидетельствуют данные связывания, полученные с использованием SPR.
В следующем варианте осуществления пептидный лиганд СгХ^Х^Хз-Сй-Х^Х^-Хп-Хп-Хв-Хм
- 20 045862
X15-X16-X17-Ciii (SEQ ID NO: 41) содержит аминокислотную последовательность, выбранную из
Ac-(SEQ Ш NO: 155) (далее обозначаемой как BCY8030);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ Ш NO: 167) (далее обозначаемой какВСУ8120);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ Ш NO: 168) (далее обозначаемой какВСУ8121);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ Ш NO: 169) (далее обозначаемой какВСУ8122);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ Ш NO: 170) (далее обозначаемой какВСУ8123);
Ac-(SEQ Ш NO: 167) (далее обозначаемой как BCY8124);
Ac-(SEQ Ш NO: 168) (далее обозначаемой как BCY8125);
Ac-(SEQ Ш NO: 169) (далее обозначаемой как BCY8126);
Ac-(SEQ Ш NO: 170) (далее обозначаемой как BCY8127);
Ac-(SEQ Ш NO: 171) (далее обозначаемой как BCY8128);
Ac-(SEQ Ш NO: 172) (далее обозначаемой как BCY8129);
Ac-(SEQ Ш NO: 177) (далее обозначаемой как BCY8161);
Ac-(SEQ Ш NO: 178) (далее обозначаемой как BCY8162);
Ac-(SEQ Ш NO: 179) (далее обозначаемой как BCY8163);
Ac-(SEQ Ш NO: 187) (далее обозначаемой как BCY8182);
Ac-(SEQ Ш NO: 188) (далее обозначаемой как BCY8183);
Ac-(SEQ Ш NO: 189) (далее обозначаемой как BCY8184);
Ac-(SEQ Ш NO: 196) (далее обозначаемой как BCY8192);
Ac-(SEQ Ш NO: 197) (далее обозначаемой как BCY8193);
Ac-(SEQ Ш NO: 198) (далее обозначаемой как BCY8194);
Ac-(SEQ Ш NO: 199) (далее обозначаемой как BCY8211);
Ac-(SEQ Ш NO: 200) (далее обозначаемой как BCY8212);
Ac-(SEQ Ш NO: 201) (далее обозначаемой как BCY8213);
Ac-(SEQ Ш NO: 202) (далее обозначаемой как BCY8214);
Ac-(SEQ Ш NO: 203) (далее обозначаемой как BCY8215);
Ac-[B-Ala][SarlO]-(SEQ Ш NO: 179) (далее обозначаемой как BCY8276);
Ac-[B-Ala][SarlO]-(SEQ Ш NO: 178) (далее обозначаемой как BCY8277);
Ac-[B-Ala][SarlO]-(SEQ Ш NO: 177) (далее обозначаемой как BCY8278);
Ac-[B-Ala][SarlO]-(SEQ Ш NO: 208) (далее обозначаемой как BCY8279);
Ac-[B-Ala][SarlO]-(SEQ Ш NO: 209) (далее обозначаемой как BCY8280); и Ac-[B-Ala][SarlO]-(SEQ Ш NO: 210) (далее обозначаемой как BCY8281).
В настоящем описании в табл. 3 приводятся данные, которые демонстрируют, что пептидные лиганды согласно этому варианту осуществлению демонстрировали хорошие уровни (<10 нМ) связывания с нектином-4 человека, о чем свидетельствуют данные связывания, полученные с использованием SPR.
В одном варианте осуществления пептидный лиганд содержит аминокислотную последовательность, выбранную из
- 21 045862
A-(SEQ Ш NO: 1)-А (далее обозначаемой как 80-09-02-N002 или BCY428);
F1-A-(SQ ID NO: 1)-А (далее обозначаемой как 80-09-02-N006);
Ac-(SEQ ID NO: 1) (далее обозначаемой как 80-09-02-N008 или BCY7390);
Ac-[dD]-(SEQ ID NO: 1) (далее обозначаемой как BCY7606);
A-(SEQ ID NO: 2)-А (далее обозначаемой как 80-09-02-N003 или BCY429);
(l-Nal)A-(SEQ ID NO: 1)-А (далее обозначаемой как 80-09-02-N009 или BCY7420);
(2-Nal)A-(SEQ ID NO: 1)-А (далее обозначаемой как 80-09-02-N010 или BCY7421);
(33DPA)A-(SEQ Ш NO: 1)-А (далее обозначаемой как 80-09-02-N011 или BCY7422); (44BPA)A-(SEQ ID NO: 1)-А (далее обозначаемой как 80-09-02-N012 или BCY7521); Ac-(SEQ Ш NO: 3) (далее обозначаемой как 80-09-02-N017);
Ac-(SEQ Ш NO: 4) (далее обозначаемой как 80-09-02-N018);
Ac-(SQ ID NO: 5) (далее обозначаемой как 80-09-02-N019 или BCY7537);
Ac-(SEQ Ш NO: 6) (далее обозначаемой как 80-09-02-N020);
Ac-(SEQ Ш NO: 7) (далее обозначаемой как 80-09-02-N021 или BCY7539);
Ac-(SEQ Ш NO: 8) (далее обозначаемой как 80-09-02-N022 или BCY7540);
Ac-(SEQ Ш NO: 9) (далее обозначаемой как 80-09-02-N023);
- 22 045862
Ac-(pCoF)-(SEQ Ш NO: 1) (далее обозначаемой как 80-09-02-N044);
Ac-(SEQ Ш NO: 10) (далее обозначаемой как 80-09-02-N045);
Ac-(SEQ Ш NO: 11) (далее обозначаемой как 80-09-02-N046 или BCY7657);
Ac-(SEQ Ш NO: 12) (далее обозначаемой как 80-09-02-N047 или BCY7658);
Ac-(SEQ Ш NO: 13) (далее обозначаемой как 80-09-02-N048 или BCY7659);
Ac-(SEQ Ш NO: 14) (далее обозначаемой как 80-09-02-N049);
Ac-(SEQ Ш NO: 15) (далее обозначаемой как 80-09-02-N050 или BCY7661);
SDN-(SEQ ID NO: 15)-А (далее обозначаемой как BCY3387);
Ac-(SEQ ID NO: 16) (далее обозначаемой как 80-09-02-N051 или BCY7662);
Ac-(SEQ Ш NO: 17) (далее обозначаемой как 80-09-02-N052);
Ac-(SEQ Ш NO: 18) (далее обозначаемой как 80-09-02-N053);
Ac-(SEQ Ш NO: 19) (далее обозначаемой как 80-09-02-N054 или BCY7665);
Ac-(SEQ Ш NO: 20) (далее обозначаемой как 80-09-02-N055 или BCY7666);
Ac-(SEQ Ш NO: 21) (далее обозначаемой как 80-09-02-N056);
A-(SEQ Ш NO: 1)-TNK (далее обозначаемой как 80-09-02-T01-N001 или BCY3385);
A-(SEQ Ш NO: l)-TN(HArg) (далее обозначаемой как 80-09-02-T01-N003 или BCY7281);
A-(SEQ Ш NO: 1)-TN(D-K) (далее обозначаемой как 80-09-02-T01-N004 или BCY7282);
A-(SEQ Ш NO: 22)-TNK (далее обозначаемой как 80-09-02-T01-N005);
A-(SEQ Ш NO: 23)-TNK (далее обозначаемой как 80-09-02-T01-N006);
Ac-(SEQ ID NO: 1)-TNK (далее обозначаемой как 80-09-02-T01-N011 или BCY7391);
A-(SEQ ID NO: 24)-TNK (далее обозначаемой как 80-09-02-T01-N012 или BCY7342);
A-(SEQ ID NO: 25)-TNK (далее обозначаемой как 80-09-02-T01-N014 или BCY7344);
A-(SEQ ID NO: 1)-ANK (далее обозначаемой как 80-09-02-T01-N016 или BCY7346);
A-(SEQ Ш NO: l)-[dA]NK (далее обозначаемой как BCY7367);
A-(SEQ Ш NO: 1)-ТАК (далее обозначаемой как 80-09-02-T01-N017 или BCY7347);
A-(SEQ ID NO: l)-T[dA]K (далее обозначаемой как BCY7368);
A-(SEQ Ш NO: 1)-TNA (далее обозначаемой как 80-09-02-T01-N018 или BCY7348);
A-(SEQ Ш NO: l)-TN[dA] (далее обозначаемой как BCY7369);
Ac-[pCoPhe]-(SEQ ID NO: 1) (далее обозначаемой как BCY7656);
A-(SEQ Ш NO: 6)-TNK (далее обозначаемой как 80-09-02-T01-N020 или BCY7354);
A-(SEQ ID NO: 26)-TNK (далее обозначаемой как 80-09-02-T01-N022 или BCY7352);
A-(SEQ ID NO: 27)-TNK (далее обозначаемой как 80-09-02-T01-N026 или BCY7356);
A-(SEQ ID NO: 28)-TNK (далее обозначаемой как 80-09-02-T01-N027 или BCY7357);
A-(SEQ ID NO: 29)-TNK (далее обозначаемой как 80-09-02-T01-N041 или BCY7372);
A-(SEQ ID NO: 30)-TNK (далее обозначаемой как 80-09-02-T01-N042 или BCY7424);
A-(SEQ Ш NO: 31)-А (далее обозначаемой как 80-10-00 или BCY488);
A-(SEQ Ш NO: 32)-А (далее обозначаемой как BCY432);
DDW-(SEQ Ш NO: 32)-А (далее обозначаемой как 80-10-11-Т01 или BCY433);
- 23 045862
VDW-(SEQ Ш NO: 33)-A (далее обозначаемой как 80-10-12-Т01 или BCY462);
QKW-(SEQ Ш NO: 34)-А (далее обозначаемой как 80-10-13-Т01 или BCY3400);
Q[HArg]W-(SEQ ID NO: 34)-А (далее обозначаемой как BCY7278);
Q[K(Ac)]W-(SEQ Ш NO: 34)-А (далее обозначаемой как BCY7280);
[Ac]QKW-(SEQ ID NO: 34) (далее обозначаемой как BCY7392);
Q[dK]W-(SEQ ID NO: 34)-А (далее обозначаемой как BCY7426);
Ac-AKW-(SEQ ID NO: 34) (далее обозначаемой как BCY7622);
Ac-QAW-(SEQ Ш NO: 34) (далее обозначаемой как BCY7623);
Ac-QKA-(SEQ ID NO: 34) (далее обозначаемой как BCY7624);
Ac-[dA]KW-(SEQ ID NO: 34) (далее обозначаемой как BCY7634);
Ac-Q[dA]W-(SEQ ID NO: 34) (далее обозначаемой как BCY7635);
Ac-QK[dA]-(SEQ ID NO: 34) (далее обозначаемой как BCY7636);
Ac-Q[dD]W-(SEQ ID NO: 34) (далее обозначаемой как BCY7993);
Ac-QK[lNal]-(SEQ ID NO: 34) (далее обозначаемой как BCY7996);
Ac-QK[2Nal]-(SEQ ID NO: 34) (далее обозначаемой как BCY7997);
Ac-(SEQ Ш NO: 34) (далее обозначаемой как BCY8044);
A-(SEQ Ш NO: 43)-А (далее обозначаемой как BCY430);
A-(SEQ Ш NO: 44)-А (далее обозначаемой как BCY431);
A-(SEQ Ш NO: 58)-PQA (далее обозначаемой как BCY3401);
QKW-(SEQ Ш NO: 65)-А (далее обозначаемой как BCY7279);
Ac-QKW-(SEQ Ш NO: 103) (далее обозначаемой как BCY7625);
Ac-QKW-(SEQ ID NO: 104) (далее обозначаемой как BCY7627);
Ac-QKW-(SEQ Ш NO: 105) (далее обозначаемой как BCY7628);
Ac-QKW-(SEQ Ш NO: 106) (далее обозначаемой как BCY7631);
Ac-QKW-(SEQ Ш NO: 107) (далее обозначаемой как BCY7632);
Ac-QKW-(SEQ Ш NO: 108) (далее обозначаемой как BCY7639);
Ac-QKW-(SEQ Ш NO: 109) (далее обозначаемой как BCY7640);
Ac-QKW-(SEQ ID NO: 110) (далее обозначаемой как BCY7643);
Ac-QKW-(SEQ Ш NO: 153) (далее обозначаемой как BCY7998);
Ac-QKW-(SEQ Ш NO: 154) (далее обозначаемой как BCY8000);
A-(SEQ Ш NO: 35)-А (далее обозначаемой как 80-11-00 или BCY471);
A-(SEQ Ш NO: 36)-А (далее обозначаемой как 80-11-01 или BCY472);
A-(SEQ Ш NO: 37)-SRF (далее обозначаемой как 80-11-08-Т01 или BCY3406);
Ac-(SEQ Ш NO: 37)-SRF (далее обозначаемой KaKBCY7393);
DDA-(SEQ ID NO: 45)-A (далее обозначаемой как BCY3386);
DTA-(SEQ ID NO: 46)-A (далее обозначаемой как BCY3388);
DSE-(SEQ ID NO: 47)-A (далее обозначаемой как BCY3389);
HDA-(SEQ ID NO: 48)-A (далее обозначаемой как BCY3390);
MDT-(SEQ ID NO: 49)-A (далее обозначаемой как BCY3391);
DPG-(SEQ ID NO: 50)-A (далее обозначаемой как BCY3392);
- 24 045862
HDS-(SEQ ID NO: 51)-A (далее обозначаемой как BCY3393); (D-H)DS-(SEQ ID NO: 51)-A (далее обозначаемой как BCY7272);
A-(SEQ ID NO: 52)-TDK (далее обозначаемой как BCY3394);
A-(SEQ ID NO: 53)-LKD (далее обозначаемой как BCY3395);
A-(SEQ ID NO: 54)-TTA (далее обозначаемой как BCY3396);
A-(SEQ ID NO: 55)-QME (далее обозначаемой как BCY3397);
A-(SEQ ID NO: 56)-LSE (далее обозначаемой как BCY3398);
A-(SEQ ID NO: 57)-STD (далее обозначаемой как BCY3399);
A-(SEQ ID NO: 59)-TNK (далее обозначаемой как BCY7265);
Ac-(SEQ ID NO: 59) (далее обозначаемой как BCY7660);
A-(SEQ ID NO: 60)-TNK (далее обозначаемой как BCY7266);
Ac-(SEQ ID NO: 60) (далее обозначаемой как BCY7616);
HDS-(SEQ ID NO: 61)-A (далее обозначаемой как BCY7273);
HDS-(SEQ ID NO: 62)-A (далее обозначаемой как BCY7274);
HDS-(SEQ ID NO: 63)-A (далее обозначаемой как BCY7275);
HDS-(SEQ ID NO: 64)-A (далее обозначаемой как BCY7276);
A-(SEQ ID NO: 66)-TNK (далее обозначаемой как BCY7349);
A-(SEQ ID NO: 67)-TNK (далее обозначаемой как BCY7350);
Ac-(SEQ ID NO: 67) (далее обозначаемой как BCY7538);
A-(SEQ ID NO: 68)-TNK (далее обозначаемой как BCY7359);
A-(SEQ ID NO: 69)-TNK (далее обозначаемой как BCY7360);
A-(SEQ ID NO: 70)-TNK (далее обозначаемой как BCY7361);
A-(SEQ ID NO: 71)-TNK (далее обозначаемой как BCY7365);
A-(SEQ ID NO: 72)-TNK (далее обозначаемой как BCY7370);
Ac-(SEQ ID NO: 73) (далее обозначаемой как BCY7535);
Ac-(SEQ ID NO: 74) (далее обозначаемой как BCY7536);
Ac-(SEQ ID NO: 75) (далее обозначаемой как BCY7541);
[B-Ala][Sar5]-(SEQ ID NO: 76) (далее обозначаемой как BCY7556);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ ID NO: 76) (далее обозначаемой какВСУ7558);
[B-Ala][Sar5]-(SEQ ID NO: 77) (далее обозначаемой как BCY7557);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ ГО NO: 77) (далее обозначаемой какВСУ7559);
Ac-(SEQ ГО NO: 78) (далее обозначаемой как BCY7580);
Ac-(SEQ ID NO: 79) (далее обозначаемой как BCY7581);
Ac-(SEQ ГО NO: 80) (далее обозначаемой как BCY7582);
Ac-(SEQ ГО NO: 81) (далее обозначаемой как BCY7584);
Ac-(SEQ ID NO: 82) (далее обозначаемой как BCY7585);
Ac-(SEQ ГО NO: 83) (далее обозначаемой как BCY7588);
Ac-(SEQ ГО NO: 84) (далее обозначаемой как BCY7589);
Ac-(SEQ ID NO: 85) (далее обозначаемой как BCY7590);
Ac-(SEQ ГО NO: 86) (далее обозначаемой как BCY7591);
- 25 045862
Ac-(SEQ Ш NO: 87) (далее обозначаемой как BCY7592);
Ac-(SEQ Ш NO: 88) (далее обозначаемой как BCY7593);
Ac-(SEQ Ш NO: 89) (далее обозначаемой как BCY7594);
Ac-(SEQ Ш NO: 90) (далее обозначаемой как BCY7595);
Ac-(SEQ ГО NO: 91) (далее обозначаемой как BCY7596);
Ac-(SEQ ГО NO: 92) (далее обозначаемой как BCY7597);
Ac-(SEQ ГО NO: 93) (далее обозначаемой как BCY7598);
Ac-(SEQ ГО NO: 94) (далее обозначаемой как BCY7607);
Ac-(SEQ ГО NO: 95) (далее обозначаемой как BCY7608);
Ac-(SEQ ГО NO: 96) (далее обозначаемой как BCY7611);
Ac-(SEQ ГО NO: 97) (далее обозначаемой как BCY7612);
Ac-(SEQ ГО NO: 98) (далее обозначаемой как BCY7613);
Ac-(SEQ ГО NO: 99) (далее обозначаемой как BCY7614);
Ac-(SEQ ГО NO: 100) (далее обозначаемой как BCY7615);
Ac-(SEQ ГО NO: 101) (далее обозначаемой как BCY7618);
Ac-(SEQ ГО NO: 102) (далее обозначаемой как BCY7620);
Ac-(SEQ ГО NO: 111) (далее обозначаемой как BCY7663);
Ac-(SEQ ГО NO: 112) (далее обозначаемой как BCY7664);
Ac-(SEQ ГО NO: 113) (далее обозначаемой как BCY7667);
Ac-(SEQ ГО NO: 114) (далее обозначаемой как BCY7668);
Ac-(SEQ ГО NO: 115) (далее обозначаемой как BCY7765);
(SEQ ГО NO: 115) (далее обозначаемой как BCY7793);
(MeO-dPEG12)(SEQ ID NO: 115) (далее обозначаемой как BCY8087);
(Карбоксифлуоресцеин)(8Е(3 ГО NO: 115) (далее обозначаемой как BCY8208);
(PEG3)(PEG3)(SEQ ГО NO: 115) (далее обозначаемой как BCY7815);
(MeO-dPEG12)(PEG3)(PEG3)(SEQ ID NO: 115) (далее обозначаемой как BCY8094);
Ac-DDD-(SEQ ГО NO: 115) (далее обозначаемой как BCY8028);
Ac-[dD][dD][dD]-(SEQ ГО NO: 115) (далее обозначаемой как BCY8029);
[B-Ala][Sarl0]-(SEQ ID NO: 115) (далее обозначаемой как BCY7814);
Ac-(SEQ ГО NO: 116) (далее обозначаемой как BCY7816);
Ac-(SEQ ГО NO: 116) (MeO-dPEG12), связанной с D-Lys6 (далее обозначаемой как BCY8084);
Ac-(SEQ ГО NO: 117) (далее обозначаемой как BCY7817);
Ac-(SEQ ГО NO: 118) (далее обозначаемой как BCY7818;
Ac-(SEQ ID NO: 118) (MeO-dPEG12), связанной c Pro(4NH)l (далее обозначаемой как BCY8086);
Ac-(SEQ ГО NO: 119) (далее обозначаемой как BCY7819;
Ac-(SEQ ID NO: 119) (MeO-dPEG12), связанной c Lys5 (далее обозначаемой как BCY8088);
Ac-(SEQ ГО NO: 120) (далее обозначаемой как BCY7820;
- 26 045862
Ac-(SEQ Ш NO: 120) (MeO-dPEG12), связанной c D-Lys3 (далее обозначаемой как BCY8089);
Ac-(SEQ Ш NO: 121) (далее обозначаемой как BCY7821);
Ac-(SEQ ID NO: 121) (MeO-dPEG12), связанной c Lys4 (далее обозначаемой как BCY8090);
Ac-(SEQ Ш NO: 122) (далее обозначаемой как BCY7822);
Ac-(SEQ ID NO: 122) (MeO-dPEG12), связанной c Lys6 (далее обозначаемой как BCY8091);
Ac-(SEQ Ш NO: 123) (далее обозначаемой как BCY7876);
Ac-(SEQ Ш NO: 124) (далее обозначаемой как BCY7877);
Ac-(SEQ Ш NO: 125) (далее обозначаемой как BCY7879);
Ac-(SEQ Ш NO: 126) (далее обозначаемой как BCY7881);
Ac-(SEQ Ш NO: 127) (далее обозначаемой как BCY7883);
Ac-(SEQ Ш NO: 128) (далее обозначаемой как BCY7884);
Ac-(SEQ Ш NO: 129) (далее обозначаемой как BCY7886);
Ac-(SEQ Ш NO: 130) (далее обозначаемой как BCY7887);
Ac-(SEQ Ш NO: 131) (далее обозначаемой как BCY7889);
Ac-(SEQ Ш NO: 132) (далее обозначаемой как BCY7890);
Ac-(SEQ Ш NO: 133) (далее обозначаемой как BCY7891);
Ac-(SEQ Ш NO: 134) (далее обозначаемой как BCY7892);
Ac-(SEQ Ш NO: 135) (далее обозначаемой как BCY7894);
Ac-(SEQ Ш NO: 136) (далее обозначаемой как BCY7895);
Ac-(SEQ Ш NO: 137) (далее обозначаемой как BCY7896);
Ac-(SEQ Ш NO: 138) (далее обозначаемой как BCY7897);
Ac-(SEQ Ш NO: 139) (далее обозначаемой как BCY7902);
Ac-(SEQ Ш NO: 140) (далее обозначаемой как BCY7903);
Ac-(SEQ Ш NO: 141) (далее обозначаемой как BCY7904);
Ac-(SEQ Ш NO: 142) (далее обозначаемой как BCY7906);
Ac-(SEQ Ш NO: 143) (далее обозначаемой как BCY7907);
Ac-(SEQ Ш NO: 144) (далее обозначаемой как BCY7908);
Ac-(SEQ Ш NO: 145) (далее обозначаемой как BCY7911);
Ac-(SEQ Ш NO: 146) (далее обозначаемой как BCY7912);
Ac-(SEQ Ш NO: 147) (далее обозначаемой как BCY7913);
Ac-(SEQ Ш NO: 148) (далее обозначаемой как BCY7914);
Ac-(SEQ Ш NO: 149) (далее обозначаемой как BCY7915);
Ac-(SEQ Ш NO: 150) (далее обозначаемой как BCY7916);
Ac-(SEQ Ш NO: 151) (далее обозначаемой как BCY7973);
Ac-(SEQ Ш NO: 152) (далее обозначаемой как BCY7979);
Ac-(SEQ Ш NO: 155) (далее обозначаемой как BCY8030);
Ac-(SEQ Ш NO: 156) (далее обозначаемой как BCY8031);
- 27 045862
Ac-(SEQ Ш NO: 157) (далее обозначаемой как BCY8032);
Ac-(SEQ Ш NO: 158) (далее обозначаемой как BCY8036);
Ac-(SEQ Ш NO: 159) (далее обозначаемой как BCY8037);
Ac-(SEQ Ш NO: 160) (далее обозначаемой как BCY8038);
Ac-(SEQ Ш NO: 161) (далее обозначаемой как BCY8039);
Ac-(SEQ Ш NO: 162) (далее обозначаемой как BCY8040);
Ac-(SEQ Ш NO: 163) (далее обозначаемой как BCY8041);
Ac-(SEQ Ш NO: 164) (далее обозначаемой как BCY8042);
Ac-(SEQ Ш NO: 165) (далее обозначаемой как BCY8042);
Ac-(SEQ Ш NO: 166) (далее обозначаемой как BCY8085);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ Ш NO: 167) (далее обозначаемой какВСУ8120);
Ac-(SEQ Ш NO: 167) (далее обозначаемой как BCY8124);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ Ш NO: 168) (далее обозначаемой какВСУ8121);
Ac-(SEQ Ш NO: 168) (далее обозначаемой как BCY8125);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ Ш NO: 169) (далее обозначаемой какВСУ8122);
Ac-(SEQ Ш NO: 169) (далее обозначаемой как BCY8126);
(SEQ Ш NO: 169) (далее обозначаемой как BCY8116);
Флуоресцеин-(8Е(3 Ш NO: 169) (далее обозначаемой как BCY8205);
[B-Ala][SarlO]-(SEQ ID NO: 169) (далее обозначаемой как BCY8234);
[PYA][B-Ala][SarlO]-(SEQ ID NO: 169) (далее обозначаемой как BCY8846 Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ Ш NO: 170) (далее обозначаемой какВСУ8123);
Ac-(SEQ Ш NO: 170) (далее обозначаемой как BCY8127);
(SEQ Ш NO: 170) (далее обозначаемой как BCY8206);
Ac-(SEQ Ш NO: 171) (далее обозначаемой как BCY8128);
(SEQ Ш NO: 171) (далее обозначаемой как BCY8207);
[B-Ala][Sarl0]-(SEQ ID NO: 171) (далее обозначаемой как BCY8232);
Ac-(SEQ Ш NO: 172) (далее обозначаемой как BCY8129);
Ac-(SEQ Ш NO: 173) (далее обозначаемой как BCY8153);
Ac-(SEQ Ш NO: 174) (далее обозначаемой как BCY8154);
Ac-(SEQ Ш NO: 175) (далее обозначаемой как BCY8157);
Ac-(SEQ Ш NO: 176) (далее обозначаемой как BCY8158);
Ac-(SEQ Ш NO: 177) (далее обозначаемой как BCY8161);
Ac-[B-Ala][SarlO]-(SEQ Ш NO: 177) (далее обозначаемой как BCY8278);
Ac-(SEQ Ш NO: 178) (далее обозначаемой как BCY8162);
Ac-[B-Ala][SarlO]-(SEQ Ш NO: 178) (далее обозначаемой как BCY8277);
Ac-(SEQ Ш NO: 179) (далее обозначаемой как BCY8163);
Ac-[B-Ala][SarlO]-(SEQ Ш NO: 179) (далее обозначаемой как BCY8276);
[B-Ala][Sarl0]-(SEQ ID NO: 179) (далее обозначаемой как BCY8269);
Ac-(SEQ Ш NO: 180) (далее обозначаемой как BCY8174);
Ac-(SEQ Ш NO: 181) (далее обозначаемой как BCY8175);
- 28 045862
Ac-(SEQ Ш NO: 182) (далее обозначаемой как BCY8176);
Ac-(SEQ Ш NO: 183) (далее обозначаемой как BCY8177);
Ac-(SEQ Ш NO: 184) (далее обозначаемой как BCY8178);
Ac-(SEQ Ш NO: 185) (далее обозначаемой как BCY8180);
Ac-(SEQ Ш NO: 186) (далее обозначаемой как BCY8181);
Ac-(SEQ Ш NO: 187) (далее обозначаемой как BCY8182);
Ac-(SEQ Ш NO: 188) (далее обозначаемой как BCY8183);
Ac-(SEQ Ш NO: 189) (далее обозначаемой как BCY8184);
[B-Ala][SarlO]-(SEQ ID NO: 189) (далее обозначаемой как BCY8235);
Ac-(SEQ Ш NO: 190) (далее обозначаемой как BCY8185);
Ac-(SEQ Ш NO: 191) (далее обозначаемой как BCY8186);
Ac-(SEQ Ш NO: 192) (далее обозначаемой как BCY8187);
Ac-(SEQ Ш NO: 193) (далее обозначаемой как BCY8188);
Ac-(SEQ Ш NO: 194) (далее обозначаемой как BCY8189);
Ac-(SEQ Ш NO: 195) (далее обозначаемой как BCY8191);
Ac-(SEQ Ш NO: 196) (далее обозначаемой как BCY8192);
Ac-(SEQ Ш NO: 197) (далее обозначаемой как BCY8193);
Ac-(SEQ Ш NO: 198) (далее обозначаемой как BCY8194);
Ac-(SEQ Ш NO: 199) (далее обозначаемой как BCY8211);
Ac-(SEQ Ш NO: 200) (далее обозначаемой как BCY8212);
Ac-(SEQ Ш NO: 201) (далее обозначаемой как BCY8213);
Ac-(SEQ Ш NO: 202) (далее обозначаемой как BCY8214);
[B-Ala][Sarl0]-(SEQ ID NO: 202) (далее обозначаемой как BCY8231);
Ac-(SEQ Ш NO: 203) (далее обозначаемой как BCY8215);
Ac-[B-Ala][SarlO]-(SEQ Ш NO: 208) (далее обозначаемой как BCY8279);
Ac-[B-Ala][SarlO]-(SEQ Ш NO: 209) (далее обозначаемой как BCY8280);
[B-Ala][Sarl0]-(SEQ ID NO: 209) (далее обозначаемой как BCY8273);
Ac-[B-Ala][SarlO]-(SEQ Ш NO: 210) (далее обозначаемой как BCY8281);
Ac-(SEQ Ш NO: 211) (далее обозначаемой как BCY8831);
[B-Ala][Sarl0]-(SEQ ID NO: 212) (далее обозначаемой как BCY8238);
(SEQ Ш NO: 215) (далее обозначаемой как BCY11415);
[PYA][B-Ala][SarlO]-(SEQ ID NO: 215) (далее обозначаемой как BCY11942); и (SEQ Ш NO: 216) (далее обозначаемой как BCY11414).
В следующем варианте осуществления пептидный лиганд содержит аминокислотную последовательность, выбранную из
A-(SEQ Ш NO: 1)-TNK (далее обозначаемой как 80-09-02-T01-N001 или BCY3385);
Ac-(SEQ Ш NO: 1) (далее обозначаемой как 80-09-02-N008 или BCY7390);
Ac-(SEQ ID NO: 1)-TNK (далее обозначаемой как 80-09-02-T01-N011 или BCY7391);
[Ac]QKW-(SEQ ID NO: 34) (далее обозначаемой как BCY7392);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ Ш NO: 77) (далее обозначаемой KaKBCY7559);
- 29 045862
Ac-(SEQ Ш NO: 101) (далее обозначаемой как BCY7618);
Ac-(SEQ Ш NO: 115) (далее обозначаемой как BCY7765);
(SEQ Ш NO: 115) (далее обозначаемой как BCY7793);
Ac-(SEQ Ш NO: 155) (далее обозначаемой как BCY8030);
Ac-(SEQ Ш NO: 160) (далее обозначаемой как BCY8038);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ Ш NO: 167) (далее обозначаемой KaKBCY8120);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ Ш NO: 168) (далее обозначаемой KaKBCY8121);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ Ш NO: 169) (далее обозначаемой KaKBCY8122);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ Ш NO: 170) (далее обозначаемой KaKBCY8123);
Ac-(SEQ Ш NO: 167) (далее обозначаемой как BCY8124);
Ac-(SEQ Ш NO: 168) (далее обозначаемой как BCY8125);
Ac-(SEQ Ш NO: 169) (далее обозначаемой как BCY8126);
Ac-(SEQ Ш NO: 170) (далее обозначаемой как BCY8127);
Ac-(SEQ Ш NO: 171) (далее обозначаемой как BCY8128);
Ac-(SEQ Ш NO: 172) (далее обозначаемой как BCY8129);
Ac-(SEQ Ш NO: 177) (далее обозначаемой как BCY8161);
Ac-(SEQ Ш NO: 178) (далее обозначаемой как BCY8162);
Ac-(SEQ Ш NO: 179) (далее обозначаемой как BCY8163);
Ac-(SEQ Ш NO: 187) (далее обозначаемой как BCY8182);
Ac-(SEQ Ш NO: 188) (далее обозначаемой как BCY8183);
Ac-(SEQ Ш NO: 189) (далее обозначаемой как BCY8184);
Ac-(SEQ Ш NO: 196) (далее обозначаемой как BCY8192);
Ac-(SEQ Ш NO: 197) (далее обозначаемой как BCY8193);
Ac-(SEQ Ш NO: 198) (далее обозначаемой как BCY8194);
Ac-(SEQ Ш NO: 199) (далее обозначаемой как BCY8211);
Ac-(SEQ Ш NO: 200) (далее обозначаемой как BCY8212);
Ac-(SEQ Ш NO: 201) (далее обозначаемой как BCY8213);
Ac-(SEQ Ш NO: 202) (далее обозначаемой как BCY8214);
Ac-(SEQ Ш NO: 203) (далее обозначаемой как BCY8215);
Ac-[B-Ala][SarlO]-(SEQ Ш NO: 179) (далее обозначаемой как BCY8276);
Ac-[B-Ala][SarlO]-(SEQ Ш NO: 178) (далее обозначаемой как BCY8277);
Ac-[B-Ala][SarlO]-(SEQ Ш NO: 177) (далее обозначаемой как BCY8278);
Ac-[B-Ala][SarlO]-(SEQ Ш NO: 208) (далее обозначаемой как BCY8279);
Ac-[B-Ala][SarlO]-(SEQ Ш NO: 209) (далее обозначаемой как BCY8280); и
Ac-[B-Ala][SarlO]-(SEQ Ш NO: 210) (далее обозначаемой как BCY8281).
В настоящем описании в табл. 3 приводятся данные, которые демонстрируют, что пептидные лиганды согласно этому варианту осуществлению демонстрировали хорошие уровни (<100 нМ) связывания с нектином-4 человека, о чем свидетельствуют данные связывания, полученные с использованием SPR.
В следующем варианте осуществления пептидный лиганд содержит аминокислотную последовательность, выбранную из
- 30 045862
Ac-(SEQ Ш NO: 155) (далее обозначаемой как BCY8030);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ Ш NO: 167) (далее обозначаемой какВСУ8120);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ Ш NO: 168) (далее обозначаемой какВСУ8121);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ Ш NO: 169) (далее обозначаемой какВСУ8122);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ Ш NO: 170) (далее обозначаемой какВСУ8123);
Ac-(SEQ Ш NO: 167) (далее обозначаемой как BCY8124);
Ac-(SEQ Ш NO: 168) (далее обозначаемой как BCY8125);
Ac-(SEQ Ш NO: 169) (далее обозначаемой как BCY8126);
Ac-(SEQ Ш NO: 170) (далее обозначаемой как BCY8127);
Ac-(SEQ Ш NO: 171) (далее обозначаемой как BCY8128);
Ac-(SEQ Ш NO: 172) (далее обозначаемой как BCY8129);
Ac-(SEQ Ш NO: 177) (далее обозначаемой как BCY8161);
Ac-(SEQ Ш NO: 178) (далее обозначаемой как BCY8162);
Ac-(SEQ ГО NO: 179) (далее обозначаемой как BCY8163);
Ac-(SEQ ГО NO: 187) (далее обозначаемой как BCY8182);
Ac-(SEQ ГО NO: 188) (далее обозначаемой как BCY8183);
Ac-(SEQ ГО NO: 189) (далее обозначаемой как BCY8184);
Ac-(SEQ ГО NO: 196) (далее обозначаемой как BCY8192);
Ac-(SEQ ГО NO: 197) (далее обозначаемой как BCY8193);
Ac-(SEQ ГО NO: 198) (далее обозначаемой как BCY8194);
Ac-(SEQ ГО NO: 199) (далее обозначаемой как BCY8211);
Ac-(SEQ ГО NO: 200) (далее обозначаемой как BCY8212);
Ac-(SEQ ГО NO: 201) (далее обозначаемой как BCY8213);
Ac-(SEQ ГО NO: 202) (далее обозначаемой как BCY8214);
Ac-(SEQ ГО NO: 203) (далее обозначаемой как BCY8215);
Ac-[B-Ala][SarlO]-(SEQ ГО NO: 179) (далее обозначаемой как BCY8276);
Ac-[B-Ala][SarlO]-(SEQ ID NO: 178) (далее обозначаемой как BCY8277);
Ac-[B-Ala][SarlO]-(SEQ ГО NO: 177) (далее обозначаемой как BCY8278);
Ac-[B-Ala][SarlO]-(SEQ ГО NO: 208) (далее обозначаемой как BCY8279);
Ac-[B-Ala][SarlO]-(SEQ ГО NO: 209) (далее обозначаемой как BCY8280); и
Ac-[B-Ala][SarlO]-(SEQ ГО NO: 210) (далее обозначаемой как BCY8281).
В настоящем описании в табл. 3 приводятся данные, которые демонстрируют, что пептидные лиганды согласно этому варианту осуществлению демонстрировали хорошие уровни (<10 нМ) связывания с нектином-4 человека, о чем свидетельствуют данные связывания, полученные с использованием SPR.
В альтернативном варианте осуществления пептидный лиганд содержит аминокислотную последовательность, выбранную из:
[B-Ala][Sar5]-(SEQ ГО NO: 76) (далее обозначаемой как BCY7556);
[B-Ala][SarlO]-(SEQ ID NO: 115) (далее обозначаемой как BCY7814);
[B-Ala][SarlO]-(SEQ ID NO: 169) (далее обозначаемой как BCY8234);
[B-Ala][SarlO]-(SEQ ID NO: 202) (далее обозначаемой как BCY8231);
[B-Ala][SarlO]-(SEQ ID NO: 171) (далее обозначаемой как BCY8232);
[B-Ala][SarlO]-(SEQ ID NO: 189) (далее обозначаемой как BCY8235);
Ac-(SEQ ГО NO: 211) (далее обозначаемой как BCY8831);
[B-Ala][SarlO]-(SEQ ID NO: 179) (далее обозначаемой как BCY8269); и
[B-Ala][SarlO]-(SEQ ID NO: 209) (далее обозначаемой как BCY8273).
В настоящем описании в табл. 4 приводятся данные, которые демонстрируют, что пептидные лиганды согласно этому варианту осуществлению демонстрировали хорошие уровни (<100 нМ) связывания с нектином-4 человека, о чем свидетельствуют данные связывания, полученные с использованием SPR.
В следующем варианте осуществления пептидный лиганд содержит аминокислотную последовательность, выбранную из
- 31 045862
[B-Ala][SarlO]-(SEQ ID NO: 169) (далее обозначаемой как BCY8234);
[B-Ala][SarlO]-(SEQ ID NO: 202) (далее обозначаемой как BCY8231);
[B-Ala][SarlO]-(SEQ ID NO: 171) (далее обозначаемой как BCY8232);
[B-Ala][SarlO]-(SEQ ID NO: 189) (далее обозначаемой как BCY8235);
Ac-(SEQ ID NO: 211) (далее обозначаемой как BCY8831);
[B-Ala][SarlO]-(SEQ ID NO: 179) (далее обозначаемой как BCY8269); и
[B-Ala][SarlO]-(SEQ ID NO: 209) (далее обозначаемой как BCY8273).
В настоящем описании в табл. 3 приводятся данные, которые демонстрируют, что пептидные лиганды согласно этому варианту осуществлению демонстрировали хорошие уровни (<10 нМ) связывания с нектином-4 человека, о чем свидетельствуют данные связывания, полученные с использованием SPR.
Если не определено иначе, все технические и научные термины, используемые в настоящем описании, обладают тем же значением, которое обычно подразумевают специалисты в данной области, например, в области пептидной химии, культивирования клеток и фагового дисплея, химии нуклеиновых кислот и биохимии. Используют стандартные технологии молекулярной биологии, способы генетики и биохимические способы (см. Sambrook et al, Molecular Cloning: A Laboratory Manual, 3rd ed., 2001, Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY; Ausubel et al., Short Protocols in Molecular Biology (1999) 4th ed., John Wiley & Sons, Inc.), которые включены в настоящее описание в качестве ссылок.
Номенклатура.
Нумерация.
При указании на положения аминокислотных остатков в пептидах по изобретению остатки цистеина (Ci, Cii и Ciii) исключены из нумерации, поскольку они являются инвариантными, и, таким образом, нумерация аминокислотных остатков в пептидах по изобретению является такой, как указано ниже:
Ci-P1-F2-G3-Cii-M4-K5-N6-W7-S8-W9-P10-I11-W12-Ciii (SEQ ID NO: 1).
Для целей настоящего описания принимается, что все бициклические пептиды циклизованы с помощью ТВМВ (1,3,5-трис(бромметил)бензол) или 1,1',1-(1,3,5-триазинан-1,3,5-тритил)трипроп-2-ен-1она (ТАТА) с образованием трехзамещенной структуры. Циклизация посредством ТВМВ и ТАТА происходит по Ci, Cii и Ciii.
Молекулярный формат.
N- или С-концевые удлинения к бициклической центральной последовательности добавлены с левой или с правой стороны от последовательности, отделенные дефисом. Например, N-концевая хвостовая часть eAla-Sar10-Ala обозначается следующим образом:
eAla-Sar10-A-(SEQ ID NO: X).
Инвертированные пептидные последовательности.
С учетом описания в Nair et al (2003) J Immunol 170(3), 1362-1373, предусматривается, что пептидные последовательности, описанные в настоящем описании, также могут быть применимыми в их ретроинвертированной форме. Например, последовательность переворачивается (т.е. N-конец становится Сконцом и наоборот) и их стереохимия аналогично также переворачивается (т.е. D-аминокислоты становятся L-аминокислотами и наоборот).
Пептидные лиганды.
Пептидный лиганд, как указано в настоящем описании, относится к пептиду, ковалентно связанному с молекулярным каркасом. Как правило, такие пептиды содержит две или более реакционноспособных групп (т.е. остатков цистеина), которые способны образовывать ковалентные связи с каркасом, и последовательность, которая замыкается между указанными реакционноспособными группами, называется последовательностью петли, поскольку она формирует петлю, когда пептид связан с каркасом. В данном случае, пептиды содержат по меньшей мере три остатка цистеина (обозначаемых в настоящем описании как Ci, Cii и Ciii), и образуют по меньшей мере две петли на каркасе.
Преимущества пептидных лигандов.
Определенные бициклические пептиды по настоящему изобретению имеют ряд преимущественных свойств, которые позволяют рассматривать их в качестве подходящих подобных лекарственному средству молекул для инъекционного, ингаляционного, глазного, перорального или местного введения. Такие преимущественные свойства включают следующее.
Видовая перекрестная реактивность. Это является типичным требованием для доклинической фармакодинамики и фармакокинетической оценки;
устойчивость к действию протеаз. Бициклические пептидные лиганды в идеальном случае должны демонстрировать устойчивость к протеазам плазмы, эпителиальным (заякоренным на мембране) протеазам, желудочным и кишечным протеазам, поверхностным протеазам легких, внутриклеточным протеазам и т.п. Стабильность к протеазам должна сохраняться между различными видами, чтобы основные бициклические кандидаты можно было разработать в моделях на животных, а также с уверенностью вводить человеку;
желаемый профиль растворимости. Он является функцией соотношения заряженных и гидрофиль
- 32 045862 ных против гидрофобных остатков и внутри/межмолекулярного образования Н-связей, которое является важным для целей составления и всасывания;
оптимальное время полужизни в плазме. В зависимости от клинического показания и режима лечения может потребоваться разработка бициклического пептида для кратковременного воздействия в условиях контроля острого состояния или разработка бициклического пептида с усиленным удержанием в кровотоке и, таким образом, являющегося оптимальным для контроля более хронических болезненных состояний. Другими факторами, определяющими желаемое время полужизни в плазме, являются необходимость в длительной максимальной терапевтической эффективности против сопутствующей токсикологии вследствие длительного воздействия средства; и селективность. Определенные пептидные лиганды по изобретению демонстрируют высокую селективность относительно других нектинов.
Фармацевтически приемлемые соли.
Будет понятно, что солевые формы входят в объем изобретения и указание на пептидные лиганды включает солевые формы указанных лигандов.
Соли по настоящему изобретению можно синтезировать из исходного соединения, которое содержит основную или кислотную часть, общепринятыми химическими способами, такими как способы, описанные в Pharmaceutical Salts: Properties, Selection, and Use, P. Heinrich Stahl (Editor), Camille G. Wermuth (Editor), ISBN: 3-90639-026-8, Hardcover, 388 pages, August 2002. Как правило, такие соли можно получать путем реакции форм свободной кислоты или основания этих соединений с соответствующим основанием или кислотой в воде или органическом растворителе, или в их смеси.
Кислотно-аддитивные соли (моно- или дисоли) могут быть образованы с широким диапазоном кислот, как неорганических, так и органических. Примеры кислотно-аддитивных солей включают моноили дисоли, образованные с кислотой, выбранной из группы, состоящей из уксусной, 2,2дихлоруксусной, адипиновой, альгиновой, аскорбиновой (например, L-аскорбиновой), L-аспарагиновой, бензолсульфоновой, бензойной, 4-ацетамидобензойной, бутановой, (+) камфорной, камфор-сульфоновой, (+)-(^)-камфор-10-сульфоновой, каприновой, капроновой, каприловой, коричной, лимонной, цикламовой, додецилсерной, этан-1,2-дисульфоновой, этансульфоновой, 2-гидроксиэтансульфоновой, муравьиной, фумаровой, галактаровой, гентизиновой, глюкогептоновой, D-глюконовой, глюкуроновой (например, D-глюкуроновой), глутаминовой (например, L-глутаминовой), α-оксоглутаровой, гликолевой, гиппуровой, галогенводородной (например, бромистоводородной, хлористоводородной, йодистоводородной), изотионовой, молочной (например, (+)-Ь-молочной, (±)-DL-молочной), лактобионовой, малеиновой, яблочной, (-)-Ь-яблочной, малоновой, (±)-DL-миндальной, метансульфоновой, нафталин-2сульфоновой, нафталин-1,5-дисульфоновой, 1-гидрокси-2-нафтойной, никотиновой, азотной, олеиновой, оротовой, щавелевой, пальмитиновой, памовой, фосфорной, пропионовой, пировиноградной, Lпироглутаминовой, салициловой, 4-аминосалициловой, себациновой, стеариновой, янтарной, серной, дигалловой, (+)-Ь-виннокаменной, тиоциановой, п-толуолсульфоновой, ундециленовой и валериановой кислот, а также ацилированных аминокислот и катионообменных смол.
Одна конкретная группа солей состоит из солей, образованных из уксусной, хлористоводородной, йодистоводородной, фосфорной, азотной, серной, лимонной, молочной, янтарной, малеиновой, яблочной, изотионовой, фумаровой, бензолсульфоновой, толуолсульфоновой, серной, метансульфоновой (мезилат), этансульфоновой, нафталинсульфоновой, валериановой, пропионовой, бутановой, малоновой, глюкуроновой и лактобионовой кислот. Одной конкретной солью является гидрохлорид. Другой конкретной солью является ацетат.
Если соединение является анионным или имеет функциональную группу, которая может быть анионной (например, -СООН может представлять собой -СОО'), тогда соль может быть образована с органическим или неорганическим основанием с образованием подходящего катиона. Примеры подходящих неорганических катионов включают, но не ограничиваются ими, ионы щелочных металлов, такие как Li+, Na+ и K+, катионы щелочноземельных металлов, такие как Са2+ и Mg2+, и другие катионы, такие как Al3+ или Zn+. Примеры походящих органических катионов включают, но не ограничиваются ими, ион аммония (т.е. NH4+) и замещенные ионы аммония (например, NH3R+, NH2R2+, NHR3+, NR+). Примерами некоторых подходящих замещенных ионов аммония являются ионы, образованные из: метиламина, этиламина, диэтиламина, пропиламина, дициклогексиламина, триэтиламина, бутиламина, этилендиамина, этаноламина, диэтаноламина, пиперазина, бензиламина, фенилбензиламина, холина, меглумина и трометамина, а также аминокислоты, такие как лизин и аргинин. Примером распространенного четвертичного иона аммония является N(CH3)4 +.
Когда пептиды по изобретению содержат функциональную аминогруппу, они могут образовывать четвертичные соли аммония, например путем реакции с алкилирующим агентом в соответствии со способами, известными специалисту в данной области. Такие четвертичные соединения аммония входят в объем изобретения.
Модифицированные производные.
Будет понятно, что модифицированные производные пептидных лигандов, как определено в на
- 33 045862 стоящем описании, входят в объем настоящего изобретения. Примеры таких подходящих модифицированных производных включают одну или несколько модификаций, выбранных из: N-концевых и/или Сконцевых модификаций; замены одного или нескольких аминокислотных остатков одним или несколькими неприродными аминокислотными остатками (такой как замена одного или нескольких полярных аминокислотных остатков одной или несколькими изостерическими или изоэлектронными аминокислотами; замена одного или нескольких неполярных аминокислотных остатков другими неприродными изостерическими или изоэлектронными аминокислотами); присоединения спейсерной группы; замены одного или нескольких подверженных окислению аминокислотных остатков одним или несколькими устойчивыми к окислению аминокислотными остатками; замены одного или нескольких аминокислотных остатков аланином, замены одного или нескольких остатков L-аминокислот одним или несколькими остатками D-аминокислот; N-алкилирования одной или нескольких амидных связей в бициклическом пептидном лиганде; замены одной или нескольких пептидных связей суррогатной связью; модификации длины пептидного остова; замены водорода на альфа-углероде одного или нескольких аминокислотных остатков другой химической группой, модификации аминокислот, таких как цистеин, лизин, глутамат/аспартат и тирозин, подходящим амином, тиолом, карбоновой кислотой и реагирующими с фенолом реагентами для функционализации указанных аминокислот, и внесения или замены на аминокислоты, которые вносят ортогональные реакционно-способные группы, которые пригодны для функционализации, например, содержащие азидные или алкиновые группы аминокислоты, которые позволяют функционализацию посредством содержащих алкин или азид частей, соответственно.
В одном варианте осуществления модифицированное производное включает N-концевую и/или Сконцевую модификацию. В следующем варианте осуществления, где модифицированное производное включает N-концевую модификацию с использованием подходящей реагирующей с амино химической группы, и/или С-концевую модификацию с использованием подходящей реагирующей с карбокси химической группы. В следующем варианте осуществления указанная N-концевая или С-концевая модификация включает присоединение эффекторной группы, включая, но не ограничиваясь ими, цитотоксическое средство, радиохелатор или хромофор.
В следующем варианте осуществления модифицированное производное содержит N-концевую модификацию. В следующем варианте осуществления N-концевая модификация включает N-концевую ацетильную группу. В этом варианте осуществления N-концевая группа цистеина (группа, обозначаемая в настоящем описании как Ci) кэппируется уксусным ангидридом или другими подходящими реагентами в ходе пептидного синтеза, что приводит к молекуле, которая является ацетилированной на N-конце. Этот вариант осуществления обеспечивает преимущество удаления потенциальной точки распознавания для аминопептидаз и устраняет возможность деградации бициклического пептида.
В альтернативном варианте осуществления N-концевая модификация включает присоединение молекулярной спейсерной группы, которая облегчает конъюгацию эффекторных групп и сохранение эффективности бициклического пептида в отношении его мишени.
В следующем варианте осуществления модифицированное производное содержит С-коневую модификацию. В следующем варианте осуществления С-концевая модификация включает амидную группу. В этом варианте осуществления С-концевую группу цистеина (группа, обозначаемая в настоящем описании как Ciii) синтезируют в качестве амида в ходе пептидного синтеза, что приводит к молекуле с Сконцевым амидированием. Этот вариант осуществления обеспечивает преимущество удаления потенциальной точки распознавания карбоксипептидазой и снижает потенциал к протеолитической деградации бициклического пептида.
В одном варианте осуществления модифицированное производное содержит замену одного или нескольких аминокислотных остатков на один или несколько неприродных аминокислотных остатков.
Альтернативно можно использовать неприродные аминокислоты, имеющие ограниченные боковые цепи аминокислот, так что происходит конформационное и пространственное препятствование протеолитическому гидролизу ближайшей пептидной связи. В частности, это касается аналогов пролина, объемных боковых цепей, Са-двухзамещенных производных (например, аминоизомасляная кислота, Ab), и циклоаминокислот, причем простым производным является аминоциклопропилкарбоновая кислота.
В одном варианте осуществления модифицированное производное включает присоединение спейсерной группы. В следующем варианте осуществления модифицированное производное включает присоединение спейсерной группы к N-концевому цистеину (Ci) и/или С-концевому цистеину (Ciii).
В одном варианте осуществления модифицированное производное содержит замену одного или нескольких подверженных окислению аминокислотных остатков на один или несколько устойчивых к окислению аминокислотных остатков. В следующем варианте осуществления модифицированное производное содержит замену остатка триптофана на остаток нафтилаланина или аланина. Этот вариант осуществления обеспечивает преимущество улучшения профиля фармацевтической стабильности полученного бициклического пептидного лиганда.
В одном варианте осуществления модифицированное производное содержит замену одного или нескольких заряженных аминокислотных остатков на один или несколько гидрофобных аминокислотных остатков. В альтернативном варианте осуществления модифицированное производное содержит замену
- 34 045862 одного или нескольких гидрофобных аминокислотных остатков на один или несколько заряженных аминокислотных остатков. Правильный баланс между заряженными и гидрофобными остатками является важной характеристикой бициклических пептидных лигандов. Например, гидрофобные аминокислотные остатки влияют на степень связывания белками плазмы, и, таким образом, на концентрацию свободной доступной фракции в плазме, в то время как заряженные аминокислотные остатки (в частности, аргинин) могут влиять на взаимодействие пептида с фосфолипидными мембранами на поверхностях клеток. Комбинация этих двух типов может влиять на время полужизни, объем распределения и экспозицию пептидного лекарственного средства, и может быть модифицирована в зависимости от клинического конечного результата. Кроме того, правильное комбинирование и количество заряженных против гидрофобных аминокислотных остатков может снижать раздражение в области инъекции (если пептидное лекарственное средство вводят подкожно).
В одном варианте осуществления модифицированное производное содержит замену одного или нескольких остатков L-аминокислот на один или несколько остатков D-аминокислот. Полагают, что этот вариант осуществления увеличит протеолитическую стабильность посредством пространственного препятствования и вследствие склонности D-аминокислот к стабилизации конформаций Р-изгибов (Tugyi et al. (2005) PNAS, 102(2), 413-418).
В одном варианте осуществления модифицированное производное включает удаление каких-либо аминокислотных остатков и замену на аланин. Этот вариант осуществления обеспечивает преимущество устранения потенциального участка(ов) протеолитической атаки.
Следует отметить, что каждая из вышеупомянутых модификаций служит для намеренного повышения эффективности или стабильности пептида. Дальнейшее повышение эффективности на основе модификаций может быть достигнуто посредством следующих механизмов:
включение гидрофобных частей, которые имеют гидрофобный эффект и обеспечивают более низкие константы скорости диссоциации, так чтобы достигалась более высокая аффинность;
включение заряженных групп, которые осуществляют ионные взаимодействия дальнего действия, что приводит к более быстрым константам скорости ассоциации и к более высокой аффинности (см., например, Schreiber et al, Rapid, electrostatically assisted association of proteins (1996), Nature Struct. Biol. 3, 427-31); и включение дополнительного ограничения в пептид, например, посредством надлежащего ограничения боковых цепей аминокислот, так что снижение энтропии является минимальным при связывании мишени, ограничения торсионных углов основной цепи, так что снижение энтропии является минимальным при связывании мишени, и внесения дополнительных циклизаций в молекулу по идентичным причинам (для обзора см. Gentilucci et al, Curr. Pharmaceutical Design, (2010), 16, 3185-203, и Nestor et al, Curr. Medicinal Chem (2009), 16, 4399-418).
Изотопные варианты.
Настоящее изобретение относится ко всем фармацевтически приемлемым (радио)изотопно меченным пептидным лигандам по изобретению, где один или несколько атомов заменены атомами, имеющими то же атомное число, но атомную массу или массовое число, отличные от атомной массы или массового числа, встречающихся в природе, и к пептидным лигандам по изобретению, к которым присоединены металл-хелатирующие группы (называемые эффекторными), которые способны удерживать соответствующие (радио)изотопы, и к пептидным лигандам по изобретению, где определенные функциональные группы ковалентно заменены соответствующими (радио)изотопами или изотопно меченными функциональными группами.
Примеры изотопов, пригодных для включения в пептидные лиганды по изобретению, включают изотопы водорода, такие как 2Н (D) и 3Н (Т), углерода, такие как 11C, 13C и 14C, хлора, такие как 36Cl, фтора, такие как 18F, йода, такие как 123I,125I и 131I, азота, такие как 13N и 15N, кислорода, такие как 15О, 17О и 18О, фосфора, такие как 32Р, серы, такие как 35S, меди, такие как 64Cu, галлия, такие как 67Ga или 68Ga, иттрия, такие как 90Y, и лютеция, такие как 177Lu, и висмута, такие как 213Bi.
Определенные изотопно меченные пептидные лиганды по изобретению, например, пептидные лиганды, включающие радиоактивный изотоп, являются пригодными в исследованиях распределения лекарственных средств и/или субстратов в тканях и для клинической оцени наличия и/или отсутствия мишени нектина-4 на пораженных заболеванием тканях. Пептидные лиганды по изобретению, кроме того, могут иметь ценные диагностические свойства, поскольку их можно использовать для детекции или идентификации образования комплекса между меченым соединением и другими молекулами, пептидами, белками, ферментами или рецепторами. В способах детекции или идентификации могут использоваться соединения, которые мечены агентами для мечения, такими как радиоизотопы, ферменты, флуоресцентные вещества, люминесцентные вещества (например, люминол, производные люминола, люциферин, экворин и люцифераза) и т.д. Особенно пригодными для этой цели являются радиоактивные изотопы тритий, т.е. 3Н (Т), и углерода-14, т.е. 14С, ввиду их простоты включения и доступных средств детекции.
Замена на более тяжелые изотопы, такие как дейтерий, т.е. 2Н (D), может обеспечить определенные терапевтические преимущества в результате большей метаболической стабильности, например увели
- 35 045862 ченного времени полужизни in vivo или снижения требуемых дозировок, и, таким образом, она может быть предпочтительной в некоторых обстоятельствах.
Замена на позитронно-активные изотопы, такие как C. 18F, 15O и 13N, может быть полезной в исследованиях с использованием позитронно-эмиссионой томографии (PET) для изучения занятости мишени.
Изотопно меченные соединения пептидных лигандов по изобретению, главным образом, можно получать общепринятыми способами, известными специалистам в данной области, или посредством процессов, аналогичных процессам, описанным в прилагаемых примерах, с использованием подходящего изотопно меченного реагента вместо немеченого реагента, используемого ранее.
Молекулярный каркас.
В одном варианте осуществления молекулярный каркас содержит неароматический молекулярный каркас. Упоминание в настоящем описании неароматического молекулярного каркаса относится к любому молекулярному каркасу, как определено в настоящем описании, который не содержит ароматическую (т.е. ненасыщенную) карбоциклическую или гетероциклическую кольцевую систему.
Подходящие примеры неароматический молекулярных каркасов описаны в Heinis et al (2014) Angewandte Chemie, International Edition 53(6) 1602-1606.
Как отмечалось в вышеуказанных документах, молекулярный каркас может представлять собой низкомолекулярное соединение, такое как низкомолекулярное органическое соединение.
В одном варианте осуществления молекулярный каркас может представлять собой макромолекулу. В одном варианте осуществления молекулярный каркас представляет собой макромолекулу, состоящую из аминокислот, нуклеотидов или углеводов.
В одном варианте осуществления молекулярный каркас содержит реакционноспособные группы, которые способны реагировать с функциональной группой(ами) полипептида, образуя ковалентные связи.
Молекулярный каркас может содержать химические группы, которые образуют связь с пептидом, такие как амины, тиолы, спирты, кетоны, альдегиды, нитрилы, карбоновые кислоты, сложные эфиры, алкены, алкины, азиды, ангидриды, сукцинимиды, малеинимиды, алкилгалогениды и ацилгалогениды.
Примером αβ-ненасыщенного карбонилсодержащего соединения является 1,1',1-(1,3,5-триазинан1,3,5-тритил)трипроп-2-ен-1-он (TAtA) (Angewandte Chemie, International Edition (2014), 53(6), 16021606).
Эффекторные и функциональные группы.
В соответствии со следующим аспектом изобретения предусматривается конъюгат лекарственного средства, содержащий пептидный лиганд, как определено в настоящем описании, конъюгированный с одной или несколькими эффекторными и/или функциональными группами.
Эффекторные и/или функциональные группы могут быть присоединены, например, к N- и/или Сконцам полипептида, к аминокислоте в полипептиде или к молекулярному каркасу.
Подходящие эффекторные группы включают антитела и их части или фрагменты. Например, эффекторная группа может включать константную область легкой цепи (CL) антитела, домен СН1 тяжелой цепи антитела, домен СН2 тяжелой цепи антитела, домен СН3 тяжелой цепи антитела или любую их комбинацию, в дополнение к одному или нескольким доменам константной области. Эффекторная группа также может содержать шарнирную область антитела (такую как область, обычно находящаяся между доменами СН1 и СН2 молекулы IgG).
В следующем варианте осуществления этого аспекта изобретения эффекторная группа в соответствии с настоящим изобретением представляет собой Fc-область молекулы IgG. Преимущественно, конструкция пептидный лиганд-эффекторная группа в соответствии с настоящим изобретением содержит или состоит из слитой конструкции пептидный лиганд-Fc, имеющей время полужизни te, составляющее сутки или более, двое суток или более, 3 суток или более, 4 суток или более, 5 суток или более, 6 суток или более или 7 суток или более. Наиболее преимущественно, пептидный лиганд в соответствии с настоящим изобретением содержит или состоит из слитой конструкции пептидный лиганд-Fc, имеющей время полужизни, составляющее сутки или более.
Функциональные группы включают, главным образом, связывающие группы, лекарственные средства, реакционноспособные группы для присоединения других структур, функциональные группы, которые способствуют захвату макроциклических пептидов в клетки и т.п.
Способность пептидов проникать в клетки позволит пептидам против внутриклеточных мишеней быть эффективными. Мишени, доступные для пептидов, обладающих способностью проникать в клетки, включают факторы транскрипции, внутриклеточные сигнальные молекулы, такие как тирозинкиназы, и молекулы, вовлеченные в апоптотический путь. Функциональные группы, которые позволяют проникновение в клетки, включают пептиды или химические группы, которые могут быть присоединены либо к пептиду, либо к молекулярному каркасу. Пептиды, такие как пептиды, происходящие из VP22, Tat ВИЧ, белка гомеобокса Drosophila (Antennapedia), описаны, например, в Chen and Harrison, Biochemical Society Transactions (2007) Volume 35, part 4, p821; Gupta et al. in Advanced Drug Discovery Reviews (2004) Volume 57 9637. Примеры коротких пептидов, для которых показано, что они являются эффективными в отно
- 36 045862 шении переноса через плазматические мембраны, включают пептид пенетратин из 16 аминокислот из белка Drosophila Antennapedia (Derossi et al (1994) J Biol. Chem. Volume 269 p10444), модельный амфипатический пептид из 18 аминокислот (Oehlke et al (1998) Biochim Biophys Acts Volume 1414 p127) и аргинин-богатые области белка ТАТ ВИЧ. Непептидные подходы включают применение низкомолекулярных миметиков или SMOC, которые могут быть без труда присоединены к биомолекулам (Okuyama et al (2007) Nature Methods Volume 4 p153). Другие химические стратегии для присоединения групп гуанидиния к молекулам также повышают проникновение в клетки (Elson-Scwab et al (2007) J Biol Chem Volume 282 p13585). Низкомолекулярные соединения, такие как стероиды, можно добавлять к молекулярному каркасу для повышения поглощения клетками.
Один из классов функциональных групп, которые могут быть присоединены к пептидным лигандам, включает антитела и их связывающие фрагменты, такие как Fab, Fv или однодоменные фрагменты. В частности, можно использовать антитела, которые связываются с белками, способными увеличивать время полужизни пептидного лиганда in vivo.
В одном варианте осуществления структура пептидный лиганд-эффекторная группа по изобретению имеет время полужизни te, выбранное из группы, состоящей из: 12 ч или более, 24 ч или более, 2 суток или более, 3 суток или более, 4 суток или более, 5 суток или более, 6 суток или более, 7 суток или более, 8 суток или более, 9 суток или более, 10 суток или более, 11 суток или более, 12 суток или более, 13 суток или более, 14 суток или более, 15 суток или более или 20 суток или более. Преимущественно структура пептидный лиганд-эффекторная группа или композиция по изобретению имеет время полужизни te в диапазоне от 12 до 60 ч. В следующем варианте осуществления она имеет время полужизни te, составляющее сутки или более. В следующем варианте осуществления оно находится в диапазоне от 12 до 26 ч.
В одном конкретном варианте осуществления изобретения функциональная группа выбрана из хелатора металлов, который пригоден для образования комплекса с радиоизотопами металлов, имеющими медицинское значение.
Возможные эффекторные группы также включают ферменты, например, такие как карбоксипептидаза G2, для применения в терапии фермент/пролекарство, где пептидный лиганд заменяет антитела в ADEPT.
В одном конкретном варианте осуществления изобретения функциональная группа выбрана из лекарственного средства, такого как цитотоксическое средство для терапии злокачественной опухоли. Подходящие примеры включают: алкилирующие средства, такие как цисплатин и карбоплатин, а также оксалиплатин, мехлорэтамин, циклофосфамид, хлорамбуцил, ифосфамид; антиметаболиты, включая аналоги пуринов азатиоприн и меркаптопурин или аналоги пиримидинов; растительные алкалоиды и терпеноиды, вклчающие алкалоиды барвинка, такие как винкристин, винбластин, винорелбин и виндезин; подофиллотоксин и его производные этопозид и тенипозид; таксаны, включая паклитаксел, первоначально известный как таксол; ингибиторы топоизомеразы, включая камптотецины: иринотекан и топотекан, и ингибиторы типа II, включая амсакрин, этопозид, этопозида фосфат и тенипозид. Следующие средства могут включать противоопухолевые антибиотики, которые включают иммунодепрессант дактиномицин (который используют для трансплантации почек), доксорубицин, эпирубицин, блеомицин, калихеамицины и другие.
В одном конкретном варианте осуществления изобретения цитотоксическое средство выбрано из майтанзиноидов (таких как DM1) или монометилауристатинов (таких как ММАЕ).
DM1 представляет собой цитотоксическое средство, которое представляет собой тиолсодержащее производное майтанзина и имеет следующую структру:
В настоящем описании в табл. 4 представлены данные, которые демонстрируют эффекты пептидного лиганда, конъюгированного с токсином, содержащим DM1.
Монометилауристатин Е (ММАЕ) представляет собой синтетическое антинеопластическое средство и имеет следующую структуру:
- 37 045862
В настоящем описании в табл. 4 представлены данные, которые демонстрируют эффекты пептидных лигандов, конъюгированных с токсином, содержащим ММАЕ.
В еще одном дополнительно конкретном варианте осуществления изобретения цитотоксическое средство выбрано из монометилауристатина Е (ММАЕ).
В одном варианте осуществления цитотоксическое средство связано с бициклическим пептидом расщепляемой связью, такой как дисульфидная связь или чувствительная к действию протеаз связь. В следующем варианте осуществления группы, соседние с дисульфидной связью, модифицируют для контроля препятствования дисульфидной связи и посредством этого скорости расщепления и сопутствующего высвобождения цитотоксического средства.
В опубликованной работе показана возможность модификации чувствительности дисульфидной связи к восстановлению путем внесения пространственного препятствования с любой стороны дисульфидной связи (Kellogg et al (2011) Bioconjugate Chemistry, 22, 717). Более высокая степень пространственного препятствования снижает скорость восстановления посредством внутриклеточного глутатиона, а также внеклеточных (системных) восстановителей, вследствие чего происходит уменьшение простоты, с которой токсины высвобождается, как внутри, так и снаружи клетки. Таким образом, выбор оптимальной стабильности дисульфида в кровотоке (которая минимизирует нежелательные побочные эффекты токсина) против эффективного высвобождения во внутриклеточной среде (которое максимизирует терапевтический эффект) может быть достигнут путем тщательного выбора степени препятствования с каждой из сторон от дисульфидной связи.
Препятствование с любой из сторон дисульфидной связи модулируют посредством внесения одной или нескольких метальных групп либо на нацеливающей структуре (в данном случае, бициклическом пептиде), либо на стороне токсина молекулярной конструкции.
В одном варианте осуществления цитотоксическое средство и линкер выбраны из любых комбинаций из тех, что описаны в WO 2016/067035 (цитотоксические средства и их линкеры включены в настоящее описание в качестве ссылок).
В одном варианте осуществления линкер между указанным цитотоксическим средством и указанным бициклическим пептидом содержит один или несколько аминокислотным остатков. Примеры подходящих аминокислотных остатков в качестве подходящих линкеров включают Ala, Cit, Lys, Trp и Val.
В одном варианте осуществления цитотоксическое средство выбрано из ММАЕ и указанный конъюгат лекарственного средства, кроме того, содержит линкер, выбранный из: -PABC-Cit-Val-глутарилаили -РАВС-циклобутил-Ala-Cit-eAla-, где РАВС означает п-аминобензилкарбамат. Полные детали, касающиеся циклобутилсодержащего линкера, могут быть найдены в Wei et al (2018) J. Med. Chem. 61, 9891000. В следующем варианте осуществления цитотоксическое средство выбрано из ММАЕ и линкер представляет собой -PABC-Cit-Val-глутарил-.
В альтернативном варианте осуществления цитотоксическое средство представляет собой DM1 и указанный конъюгат лекарственного средства, кроме того, содержит линкер, который представляет собой -SPDB-(SO3H)-, где SPDB означает N-сукцинимидил 3-(2-пиридилдитио)пропионат.
В одном варианте осуществления цитотоксическое средство представляет собой ММАЕ, бициклический пептид выбран из BCY7556, как определено в настоящем описании, и линкер выбран из -PABCCit-Val-глутарила-. Этот BDC известен в настоящем описании как BCY7683. В настоящем описании приводятся данные, которые демонстрируют превосходное связывание BCY7683 с нектином-4 человека в анализе связывания с использованием SPR, как показано в табл. 4. Этот BDC также продемонстрировал хорошую противоопухолевую активность в модели немелкоклеточного рака легкого, как показано в примере 1.
В альтернативном варианте осуществления цитотоксическое средство представляет собой ММАЕ, бициклический пептид выбран из BCY7814, как определено в настоящем описании, и линкер выбран из PABC-Cit-Val-глутарила-. Этот BDC известен в настоящем описании как BCY7825. В настоящем описании приводятся данные, которые демонстрируют превосходное связывание BCY7825 с нектином-4 человека в анализе связывания с использованием SPR, как показано в табл. 4. Этот BDC также продемонстрировал хорошую противоопухолевую активность в модели немелкоклеточного рака легкого, как показано в примере 1, и в модели рака мочевого пузыря, как показано в примере 2.
В альтернативном варианте осуществления цитотоксическое средство представляет собой DM1, бициклический пептид выбран из BCY7814, как определено в настоящем описании, и линкер выбран из
- 38 045862
SPDB-(SO3H)-. Этот BDC известен в настоящем описании как BCY7826. В настоящем описании приводятся данные, которые демонстрируют превосходное связывание BCY7826 с нектином-4 человека в анализе связывания с использованием SPR, как показано в табл. 4. Этот BDC также продемонстрировал хорошую противоопухолевую активность в модели немелкоклеточного рака легкого, как показано в примере 1.
В альтернативном варианте осуществления цитотоксическое средство представляет собой ММАЕ, бициклической пептид выбран из BCY8234, как определено в настоящем описании, и линкер выбран из PABC-Cit-Val-глутарила-. Этот BDC известен в настоящем описании как BCY8245 и схематично изображается как:
HKJ .10 [SEQU/j
I |,.Ν-Ο '.КО 159/
BCY8245 и также может быть более детально изображен как
BCY8245
В настоящем описании представлены данные, которые демонстрируют превосходное связывание BCY8245 с нектином-4 человека в анализе связывания посредством SPR, как показано в табл. 4. Этот BDC также продемонстрировал хорошую противоопухолевую активность в модели немелкоклеточного рака легкого, как показано в примере 1, в модели рака мочевого пузыря, как показано в примере 2, в модели рака поджелудочной железы, как показано в примере 3, и в модели рака молочной железы, как показано в примере 4.
В альтернативном варианте осуществления цитотоксическое средство представляет собой ММАЕ, бициклический пептид выбран из BCY8231, как определено в настоящем описании, и линкер выбран из PABC-Cit-Val-глутарила. Этот BDC известен в настоящем описании как BCY8253. В настоящем описании приводятся данные, которые демонстрируют превосходное связывание BCY8253 с нектином-4 человека в анализе связывания с использованием SPR, как показано в табл. 4. Этот BDC также продемонстрировал хорошую противоопухолевую активность в модели немелкоклеточного рака легкого, как показано в примере 1, в модели рака мочевого пузыря, как показано в примере 2, в модели рака поджелудочной железы, как показано в примере 3, и в модели рака молочной железы, как показано в примере 4.
В альтернативном варианте осуществления цитотоксическое средство представляет собой ММАЕ, бициклический пептид выбран из BCY8232, как определено в настоящем описании, и линкер выбран из PABC-Cit-Val-глутарила-. Этот BDC известен в настоящем описании как BCY8254. В настоящем описании приводятся данные, которые демонстрируют превосходное связывание BCY8254 с нектином-4 человека в анализе связывания с использованием SPR, как показано в табл. 4. Этот BDC также продемонстрировал хорошую противоопухолевую активность в модели немелкоклеточного рака легкого, как показано в примере 1, и в модели рака мочевого пузыря, как показано в примере 2.
В альтернативном варианте осуществления цитотоксическое средство представляет собой ММАЕ, бициклический пептид выбран из BCY8235, как определено в настоящем описании, и линкер выбран из PABC-Cit-Val-глутарила. Этот BDC известен в настоящем описании как BCY8255. В настоящем описании приводятся данные, которые демонстрируют превосходное связывание BCY8255 с нектином-4 человека в анализе связывания с использованием SPR, как показано в табл. 4. Этот BDC также продемонстрировал хорошую противоопухолевую активность в модели немелкоклеточного рака легкого, как показано в примере 1, в модели рака мочевого пузыря, как показано в примере 2, в модели рака поджелудочной железы, как показано в примере 3, и в модели рака молочной железы, как показано в примере 4.
В альтернативном варианте осуществления цитотоксическое средство представляет собой ММАЕ, бициклический пептид выбран из BCY8234, как определено в настоящем описании, и линкер выбран из РАВС-циклобутил-(В-А1а)-. Этот BDC известен в настоящем описании как BCY8549. В настоящем опи
- 39 045862 сании приводятся данные, которые демонстрируют превосходное связывание BCY8549 с нектином-4 человека в анализе связывания с использованием SPR, как показано в табл. 4.
В альтернативном варианте осуществления цитотоксическое средство представляет собой ММАЕ, бициклический пептид выбран из BCY8831, как определено в настоящем описании, и линкер выбран из PABC-Cit-Val-глутарила и линкер-цитотоксическое средство связаны с бициклическим пептидом в положении Lys3. Этот BDC известен в настоящем описании как BCY8550. В настоящем описании приводятся данные, которые демонстрируют превосходное связывание BCY8550 с нектином-4 человека в анализе связывания с использованием SPR, как показано в табл. 4.
В альтернативном варианте осуществления цитотоксическое средство представляет собой ММАЕ, бициклический пептид выбран из BCY8269, как определено в настоящем описании, и линкер выбран из PABC-Cit-Val-глутарила-. Этот BDC известен в настоящем описании как BCY8783. В настоящем описании приводятся данные, которые демонстрируют превосходное связывание BCY8783 с нектином-4 человека в анализе связывания с использованием SPR, как показано в табл. 4. Этот BDC также эффективно вызывал регрессию опухолей в модели немелкоклеточного рака легкого, как показано в примере 5.
В альтернативном варианте осуществления цитотоксическое средство представляет собой ММАЕ, бициклический пептид выбран из BCY8273, как определено в настоящем описании, и линкер выбран из PABC-Cit-Val-глутарила-. Этот BDC известен в настоящем описании как BCY8784. В настоящем описании приводятся данные, которые демонстрируют превосходное связывание BCY8784 с нектином-4 человека в анализе связывания с использованием SPR, как показано в табл. 4. Этот BDC также эффективно вызывал регрессию опухолей в модели немелкоклеточного рака легкого, как показано в примере 5.
В следующем варианте осуществления бициклический конъюгат лекарственного средства выбран из любого из: BCY7683, BCY7825, BCY7826, BCY8245, BCY8253, BCY8254, BCY8255, BCY8549, BCY8550, BCY8783 и BCY8784. В следующем варианте осуществления бициклический конъюгат лекарственного средства выбран из любого из BCY7683, BCY7825, BCY7826, BCY8245, BCY8253, BCY8254, BCY8255, BCY8783 и BCY8784. В следующем варианте осуществления бициклический конъюгат лекарственного средства представляет собой BCY8245. Конъюгат лекарственного средства BCY8245 продемонстрировал лучшую дозозависимую противоопухолевую активность, как продемонстрировано в данных, описанных в настоящем описании.
В одном варианте осуществления конъюгат лекарственного средства является отличным от BCY8245 и/или BCY8549.
Синтез.
Пептиды по настоящему изобретению можно изготавливать синтетическим путем стандартными способами с последующей реакцией с молекулярным каркасом in vitro. Когда это осуществляют, можно использовать стандартную химию. Это позволяет быстрое крупномасштабное получение растворимого материала для дальнейших экспериментов или подтверждения. Такие способы можно проводить с использованием общепринятой химии, такой как химия, описанная в Timmerman et al (выше).
Таким образом, изобретение также относится к производству полипептидов или конъюгатов, отобранных, как описано в настоящем описании, где производство включает необязательные дополнительные стадии, как объяснено ниже. В одном варианте осуществления эти стадии проводят для конечного полипептида/конъюгата, полученного посредством химического синтеза.
Необязательно аминокислотные остатки в представляющем интерес полипептиде можно заменять при получении конъюгата или комплекса.
Пептиды также можно удлинять, например, путем включения, например, другой петли и, таким образом, внесения множественной специфичности.
Для удлинения пептида его можно просто удлинять химически на его N-конце или С-конце или в петлях с использованием ортогонально выступающих остатков лизина (и аналогов) с помощью стандартной твердофазной химии или химии в фазе раствора. Стандартные способы (био)конъюгации можно использовать для обеспечения активированного или активируемого N- или С-конца. Альтернативно вставки можно вносить путем конденсации фрагментов или нативного химического лигирования, например, как описано в (Dawson et al. 1994. Synthesis of Proteins by Native Chemical Ligation. Science 266:776-779), или посредством ферментов, например с использованием субтилигазы, как описано в (Chang et al Proc Natl Acad Sci USA. 1994 Dec 20; 91(26): 12544-8 или в Hikari et al Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters Volume 18, Issue 22, 15 November 2008, Pages 6000-6003).
Альтернативно пептиды можно удлинять или модифицировать путем дальнейшей конъюгации через дисульфидные связи. Это имеет дополнительное преимущество, состоящее в позволении первому и второму пептидам диссоциировать друг от друга после того, как они оказываются в восстанавливающей среде в клетке. В этом случае, молекулярный каркас (например, ТАТА) можно присоединять в ходе химического синтеза первого пептида, чтобы он реагировал с тремя группами цистеина; затем можно присоединять дополнительный цистеин или тиол к N- или С-концу первого пептида, так чтобы этот цистеин или тиол реагировал только со свободным цистеином или тиолом второго пептида, образуя связанный дисульфидной связью конъюгат бициклический пептид-пептид.
Сходные способы в равной степени применимы для синтеза/присоединения двух бициклических и
- 40 045862 биспецифических макроциклов, потенциально создавая тетраспецифическую молекулу.
Более того, присоединения других функциональных групп или эффекторных групп можно проводить аналогичным образом с использованием соответствующей химии, осуществляя присоединение на N- или С-конце или посредством боковых цепей. В одном варианте осуществления присоединение проводят так, что не происходит блокирования активности любой из структур.
Фармацевтические композиции.
В соответствии со следующим аспектом изобретения предусматривается фармацевтическая композиция, содержащая пептидный лиганд или конъюгат лекарственного средства, как определено в настоящем описании, в комбинации с одним или несколькими фармацевтически приемлемыми эксципиентами.
Главным образом, пептидные лиганды по настоящему изобретению могут использоваться в очищенной форме вместе с фармакологически приемлемыми эксципиентами или носителями. Как правило, эти эксципиенты или носители включают водные или спиртовые/водные растворы, эмульсии или суспензии, включая солевой раствор и/или забуференные среды. Парентеральные носители включают раствор хлорида натрия, раствор декстрозы Рингера, раствор декстрозы и хлорид натрия и лактатный раствор Рингера. Подходящие физиологически-приемлемые адъюванты, если необходимо поддерживать полипептидный комплекс в суспензии, могут быть выбраны из загустителей, таких как карбоксиметилцеллюлоза, поливинилпирролидон, желатин и альгинаты.
Внутривенные носители включают жидкости и средства для восполнения питательных веществ и восполнения электролитов, такие как средства на основе раствора декстрозы Рингера. Также могут присутствовать консерванты и другие добавки, такие как противомикробные средства, антиоксиданты, хелатирующие агенты и инертные газы (Mack (1982) Remington's Pharmaceutical Sciences, 16th Edition).
Пептидные лиганды по настоящему изобретению можно использовать в качестве вводимых по отдельности композиций или совместно с другими средствами. Они могут включать антитела, фрагменты антител и различные иммунотерапевтические лекарственные средства, такие как циклоспорин, метотрексат, адриамицин или цисплатин, и иммунотоксины. Фармацевтические композиции могут включать коктейли различных цитотоксических или других средств совместно с белковыми лигандами по настоящему изобретению, или даже комбинациями выбранных полипептидов в соответствии с настоящим изобретением, обладающими различной специфичностью, такими как полипептиды, отобранные с использованием различных лигандов-мишеней, и их могут объединять или не объединять перед введением.
Путь введения фармацевтических композиций по изобретению может представлять собой любой из путей, широко известных средним специалистам в данной области. Для терапии пептидные лиганды по изобретению можно вводить любому пациенту в соответствии со стандартными способами. Введение можно проводить посредством любого подходящего пути, в том числе парентерально, внутривенно, внутримышечно, внутрибрюшинно, трансдермально, легочным путем или также в соответствующих случаях путем прямой инфузии с использованием катетера. Предпочтительно, фармацевтические композиции согласно изобретению можно вводить посредством ингаляции. Дозировка и частота введения зависят от возраста, пола и состояния пациента, сопутствующего введения других лекарственных средств, противопоказаний и других параметров, которые должен учитывать клиницист.
Пептидные лиганды по настоящему изобретению можно лиофилизировать для хранения и восстанавливать в подходящем носителе перед применением. Показано, что этот способ является эффективным, и можно использовать известные в данной области способы лиофилизации и восстановления. Специалистам в данной области будет понятно, что лиофилизация и восстановление могут приводить к различной степени потери активности, и что для компенсации этого уровни могут быть увеличены.
Композиции, содержащие пептидные лиганды по настоящему изобретению или их коктейль, можно вводить для профилактического и/или терапевтического лечения. В определенных терапевтических применениях достаточное количество для достижения, по меньшей мере, частичного ингибирования, подавления, модулирования, уничтожения или некоторого другого поддающегося определению параметра популяции выбранных клеток определяют как терапевтически-эффективная доза. Количества, требуемые для достижения этой дозировки, зависят от тяжести заболевания и общего состояния собственной иммунной системы пациента, но, как правило, они находятся в диапазоне от 0,005 до 5,0 мг выбранного пептидного лиганда на килограмм массы тела, причем более часто используют дозы от 0,05 до 2,0 мг/кг/доза. Для профилактических применений композиции, содержащие пептидные лиганды по настоящему изобретению или их коктейли, также можно вводить в сходных или несколько более низких дозировках.
Композицию, содержащую пептидный лиганд в соответствии с настоящим изобретением, можно использовать в профилактических и терапевтических условиях для способствования изменению, инактивации, уничтожению или удалению выбранной популяции клеток-мишеней у млекопитающего. Кроме того, пептидные лиганды, описанные в настоящем описании, можно использовать экстракорпорально или in vitro для селективного уничтожения, истощения или иного эффективного удаления популяции клеток-мишеней из гетерогенной совокупности клеток. Кровь от млекопитающего можно комбинировать экстракорпорально с выбранными пептидными лигандами, и при этом нежелательные клетки убивают или иным образом извлекают из крови для возвращения млекопитающему в соответствии со стандарт
- 41 045862 ными способами.
Совместное введение с одним или несколькими другими терапевтическими средствами.
В зависимости от конкретного состояния или заболевания, подвергаемого лечению, также в композиции по настоящему изобретению могут присутствовать дополнительные терапевтические средства, которые обычно вводят для лечения этого состояния. Таким образом, в одном варианте осуществления фармацевтическая композиция, кроме того, содержит одно или несколько терапевтических средств. Как используют в рамках изобретения, дополнительные терапевтические средства, которые обычно вводят для лечения конкретного заболевания или состояния, известны как подходящие для заболевания или состояния, подвергаемого лечению.
В некоторых вариантах осуществления настоящее изобретение относится к способу лечения описанного заболевания или состояния, включающему введение пациенту, нуждающемуся в этом, эффективного количества соединения, описанного в настоящем описании, или его фармацевтически приемлемой соли, и совместное введение одновременно или последовательно эффективного количества одного или нескольких дополнительных терапевтических средств, таких как средства, описанные в настоящем описании. В некоторых вариантах осуществления способ включает сопутствующее введение одного дополнительного терапевтического средства. В некоторых вариантах осуществления способ включает сопутствующее введение двух дополнительных терапевтические средства. В некоторых вариантах осуществления комбинация описанного соединения и дополнительного терапевтического средства или средств действует синергично.
Соединение по настоящему изобретению также можно использовать в комбинации с известными терапевтическими процессами, например, введением гормонов или лучевой терапией. В определенных вариантах осуществления предусматриваемое соединение используют в качестве радиосенсибилизирующего средства, особенно для лечения опухолей, которые демонстрируют низкую чувствительность к лучевой терапии.
Соединение по настоящему изобретению можно вводить отдельно или в комбинации с одним или несколькими другими терапевтическими соединениями, и возможная комбинированная терапия принимает форму фиксированных комбинаций, или введение соединения по изобретению и одного или нескольких других терапевтических соединений является поочередным или проводимым независимо друг от друга, или проводят комбинированное введение фиксированных комбинаций и одного или нескольких других терапевтических соединений. Соединение по настоящему изобретению, альтернативно или дополнительно, можно вводить, в частности, для терапии опухоли в комбинации с химиотерапией, лучевой терапией, иммунотерапий, фототерапией, хирургическим вмешательством, или их комбинацией. В равной степени возможна долговременная терапия, также как и адъювантная терапия, в контексте других стратегий лечения, как описано выше. Другими возможными способами лечения являются терапия для поддержания состояния пациента после регрессии опухоли или даже химиопрофилактическая терапия, например, у пациентов, имеющих риск.
Одно или несколько других терапевтических средств можно вводить отдельно от соединения или композиции по изобретению в качестве режима многократного дозирования. Альтернативно одно или несколько других терапевтических средств могут быть частью однократной дозированной формы, смешанной с соединением по настоящему изобретению в единую композицию. При введении в качестве режима многократного дозирования одно или несколько других терапевтических средств и соединений или композиций по изобретению можно вводить одновременно, последовательно или в пределах некоторого периода времени друг от друга, например, в пределах 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23 или 24 часов друг от друга. В некоторых вариантах осуществления одно или несколько других терапевтических средств и соединение или композицию по изобретению вводят в качестве режима многократного дозирования в пределах более 24 ч друг от друга.
Как используют в рамках изобретения, термин комбинация, комбинированный и сходные термины относятся к одновременному или последовательному введению терапевтических средств в соответствии с настоящим изобретением. Например, соединение по настоящему изобретению можно вводить с одним или несколькими другими терапевтическими средствами одновременно или последовательно в раздельных единичных дозированных формах или вместе в единой единичной дозированной форме. Таким образом, настоящее изобретение относится к единой единичной дозированной форме, содержащей соединение по настоящему изобретению, одно или несколько других терапевтических средств и фармацевтически приемлемый носитель, адъювант или наполнитель.
Количество соединения по изобретению и одного или нескольких других терапевтических средств (в композициях, которые содержат дополнительное терапевтическое средство, как описано выше), которые можно комбинировать с материалами носителей для получения единичной дозированной формы, варьируется в зависимости от хозяина, подвергаемого лечению, и конкретного способа введения. Предпочтительно, композиция по изобретению должна быть составлена так, чтобы можно было вводить дозировку 0,01-100 мг/кг массы тела/сутки соединения по изобретению.
В композициях, которые содержат одно или несколько других терапевтических средств, одно или несколько других терапевтических средств и соединение по изобретению могут действовать синергиче
- 42 045862 ски. Таким образом, количество одного или нескольких других терапевтических средств таких композициях может быть меньшим, чем количество, которое требуется в монотерапии с использованием только этого терапевтического средства. В таких композициях можно вводить дозировку 0,01-1000 мкг/кг массы тела/сутки одного или нескольких других терапевтических средств.
Количество одного или нескольких других терапевтических средств, присутствующих в композициях по настоящему изобретению, может быть не большим, чем количество, которое обычно бы вводилось в композиции, содержащей это терапевтическое средство в качестве единственного активного вещества. Предпочтительно количество одного или нескольких других терапевтических средств в описанных в настоящем описании композициях находится в диапазоне приблизительно от 50 до 100% от количества, обычно присутствующего в композиции, содержащей это средство в качестве единственного терапевтически активного вещества. В некоторых вариантах осуществления одно или несколько других терапевтических средств вводят в дозировке приблизительно 50%, приблизительно 55%, приблизительно 60%, приблизительно 65%, приблизительно 70%, приблизительно 75%, приблизительно 80%, приблизительно 85%, приблизительно 90% или приблизительно 95% от количества, обычно вводимого для этого средства. Как используют в рамках изобретения, выражение обычно вводимый означает количество одобренного FDA терапевтического средства, предоставляемое для дозирования в соответствии с одобренным FDA вкладышем или ярлыком.
Соединения по настоящему изобретению или их фармацевтические композиции также можно включать в композиции для нанесения покрытия на имплантируемое медицинское устройство, такое как протезы, искусственные клапаны, сосудистые трансплантаты, стенты и катетеры. Сосудистые стенты, например, используют для преодоления рестеноза (повторное сужение сосудистой стенки после повреждения). Однако пациенты с использованием стентов или других имплантируемых устройств имеют риск образования тромбов или активации тромбоцитов. Эти нежелательные эффекты можно предупреждать или смягчать путем предварительного покрытия устройства фармацевтически приемлемой композицией, содержащей ингибитор киназы. Другим вариантом осуществления настоящего изобретения являются имплантируемые устройства, покрытые соединением согласно настоящему изобретению.
Другие иллюстративные терапевтические средства.
В некоторых вариантах осуществления одно или несколько других терапевтических средств представляют собой ингибитор поли-ADP-рибозополимеразы (PARP). В некоторых вариантах осуществления ингибитор PARP выбран из олапариба (Lynparza®, AstraZeneca); рукапариба (Rubraca®, Clovis Oncology); нирапариба (Zejula®, Tesaro); талазопариба (MDV3800/BMN 673/LT00673, Medivation/Pfizer/Biomarin); велипариба (АВТ-888, AbbVie); и BGB-290 (BeiGene, Inc.).
В некоторых вариантах осуществления одно или несколько других терапевтических средств представляют собой ингибитор деацетилазы гистонов (HDAC). В некоторых вариантах осуществления ингибитор HDAC выбран из вориностата (Zolinza®, Merck); ромидепсина (Istodax®, Celgene); панобиностата (Farydak®, Novartis); белиностата (Beleodaq®, Spectrum Pharmaceuticals); энтиностата (SNDX-275, Syndax Pharmaceuticals) (NCT00866333); и чидамида (Epidaza®, HBI-8000, Chipscreen Biosciences, Китай).
В некоторых вариантах осуществления одно или несколько других терапевтических средств представляют собой ингибитор CDK, такой как ингибитор CDK4/CDK6. В некоторых вариантах осуществления ингибитор CDK 4/6 выбран из пальбоциклиба (Ibrance®, Pfizer); рибоциклиба (Kisqali®, Novartis); абемациклиба (Ly2835219, Eli Lilly) и трилациклиба (G1T28, G1 Therapeutics).
В некоторых вариантах осуществления одно или несколько других терапевтических средств представляют собой ингибитор фосфатидилинозитол-3-киназы (PI3K). В некоторых вариантах осуществления ингибитор PI3K выбран из иделалисиба (Zydelig®, Gilead), алпелисиба (BYL719, Novartis), таселисиба (GDC-0032, Genentech/Roche); пиктилисиба (GDC-0941, Genentech/Roche); копанлисиба (BAY806946, Bayer); дувелисиба (ранее IPI-145, Infinity Pharmaceuticals); PQR309 (Piqur Therapeutics, Швейцария) и tGr1202 (ранее RP5230, TG Therapeutics).
В некоторых вариантах осуществления одно или несколько других терапевтических средств представляют собой терапевтические средства на основе платины, также называемые платинами. Платины вызывают сшивание ДНК, так что они ингибируют репарацию ДНК и/или синтез ДНК, в основном в быстро репродуцирующихся клетках. В некоторых вариантах осуществления терапевтическое средство на основе платины выбрано из цисплатина (Platinol®, Bristol-Myers Squibb); карбоплатина (Paraplatin®, Bristol-Myers Squibb; также Teva; Pfizer); оксалиплатина (Eloxitin® Sanofi-Aventis); недаплатина (Aqupla®, Shionogi), пикоплатина (Poniard Pharmaceuticals) и сатраплатина (JM-216, Agennix).
В некоторых вариантах осуществления одно или несколько других терапевтических средств представляют собой соединение таксана, которое вызывает нарушение микротрубочек, которые необходимы для деления клеток. В некоторых вариантах осуществления соединение таксана выбрано из паклитаксела (Taxol®, Bristol-Myers Squibb), доцетаксела (Taxotere®, Sanofi-Aventis; Docefre®z, Sun Pharmaceutical), связанного с альбумином паклитаксела (Abraxane®; Abraxis/Celgene), кабазитаксела (Jevtana®, SanofiAventis) и SID530 (SK Chemicals, Co.) (NCT00931008).
В некоторых вариантах осуществления одно или несколько других терапевтических средств пред
- 43 045862 ставляют собой нуклеозидный ингибитор или терапевтическое средство, которое препятствует нормальному синтезу ДНК, синтезу белка, репликации клеток или иным образом ингибирует быстропролиферирующие клетки.
В некоторых вариантах осуществления нуклеозидный ингибитор выбран из трабектедина (гуанидин-алкилирующее средство, Yondelis®, Janssen Oncology), мехлорэтамина (алкилирующее средство, Valchlor®, Aktelion Pharmaceuticals); винкристина (Oncovin®, Eli Lilly; Vincasar®, Teva Pharmaceuticals; Marqibo®, Talon Therapeutics); темозоломида (пролекарство алкилирующего средства 5-(3-метилтриазен1-ил)-имидазол-4-карбоксамида (MTIC) Temodar®, Merck); инъекционного цитарабина (ara-С, антиметаболический аналог цитидина, Pfizer); ломустина (алкилирующее средство, CeeNU®, Bristol-Myers Squibb; Gleostine®, NextSource Biotechnology); азацитидина (пиримидиннуклеозидный аналог цитидина, Vidaza®, Celgene); омацетаксина мепесукцината (сложный эфир цефалотаксина) (ингибитор синтеза белков, Synribo®; Teva Pharmaceuticals); аспарагиназы Erwinia chrysanthemi (фермент для истощения аспарагина, Elspar®, Lundbeck; Erwinaze®, EUSA Pharma); эрибулина мезилата (ингибитор микротрубочек, антимитотическое средство на основе тубулина, Halaven®, Eisai); кабазитаксела (ингибитор микротрубочек, антимитотическое средство на основе тубулина, Jevtana®, Sanofi-Aventis); капацетрина (ингибитор тимидилатсинтазы, Xeloda®, Genentech); бендамустина (бифункциональное производное мехлорэтамина, предположительно формирующее межцепоченые сшивки ДНК, Treanda®, Cephalon/Teva); иксабепилона (полусинтетический аналог эпотилона В, ингибитор микротрубочек, антимитотическое средство на основе тубулина, Ixempra®, Bristol-Myers Squibb); неларабина (пролекарство аналога дезоксигуанозина, нуклеозидный метаболический ингибитор, Arranon®, Novartis); клорафабина (пролекарство ингибитора рибонуклеотидредуктазы, конкурентный ингибитор дезоксицитидина, Clolar®, Sanofi-Aventis); и трифлуридина и типирацила (нуклеозидный аналог на основе тимидина и ингибитор тимидинфосфорилазы, Lonsurf®, Taiho Oncology).
В некоторых вариантах осуществления одно или несколько других терапевтических средств представляют собой ингибитор киназы или антагонист VEGF-R. Одобренные ингибиторы VEGF и ингибиторы киназ, пригодные в рамках настоящего изобретения, включают: бевацизумаб (Avastin®, Genentech/Roche), моноклональное антитело против VEGF; рамуцирумаб (Cyramza®, Eli Lilly), антитело против VEGFR-2 и ziv-афлиберцепт, также известный как VEGF Trap (Zaltrap®; Regeneron/Sanofi); ингибиторы VEGFR, такие как регорафениб (Stivarga®, Bayer); вандетаниб (Caprelsa®, AstraZeneca); акситиниб (Inlyta®, Pfizer); и ленватиниб (Lenvima®, Eisai); ингибиторы Raf, такие как сорафениб (Nexavar®, Bayer AG и Onyx); дабрафениб (Tafinlar®, Novartis) и вемурафениб (Zelboraf®, Genentech/Roche); ингибиторы MEK, такие как кобиметаниб (Cotellic®, Exelexis/Genentech/Roche); траметиниб (Mekinist®, Novartis); ингибиторы тирозинкиназы Bcr-Abl, такие как иматиниб (Gleevec®, Novartis); нилотиниб (Tasigna®, Novartis); дасатиниб (Sprycel®, BristolMyersSquibb); босутиниб (Bosulif®, Pfizer); и понатиниб (Inclusig®, Ariad Pharmaceuticals); ингибиторы Her2 и EGFR, такие как гефитиниб (Iressa®, AstraZeneca); эрлотиниб (Tarceeva®, Genentech/Roche/Astellas); лапатиниб (Tykerb®, Novartis); афатиниб (Gilotrif®, Boehringer Ingelheim); осимертиниб (нацеленный на активированный EGFR, Tagrisso®, AstraZeneca); и бригатиниб (Alunbrig®, Ariad Pharmaceuticals); ингибиторы c-Met и VEGFR2, такие как кабозанитиб (Cometriq®, Exelexis); и мультикиназные ингибиторы, такие как сунитиниб (Sutent®, Pfizer); пазопаниб (Votrient®, Novartis); ингибиторы ALK, такие как кризотиниб (Xalkori®, Pfizer); церитиниб (Zykadia®, Novartis); и алектиниб (Alecenza®, Genentech/Roche); ингибиторы тирозинкиназы Брутона, такие как ибрутиниб (Imbruvica®, Pharmacyclics/Janssen); и ингибиторы рецептора Flt3, такие как мидостаурин (Rydapt®, Novartis).
Другие ингибиторы киназ и антагонисты VEGF-R, которые находятся на стадии разработки и могут использоваться в рамках настоящего изобретения, включают: тивозаниб (AveoPharmaceuticals); ваталаниб (Bayer/Novartis); луцитаниб (Clovis Oncology); довитиниб (TKI258, Novartis); чиауаниб (Chipscreen Biosciences); CEP-11981 (Cephalon); линифаниб (Abbott Laboratories); нератиниб (HKI-272, Puma Biotechnology); радотиниб (Supect®, IY5511, Il-Yang Pharmaceuticals, S. Korea); руксолитиниб (Jakafi®, Incyte Corporation); PTC299 (PTC Therapeutics); CP-547,632 (Pfizer); форетиниб (Exelexis, GlaxoSmithKline); квизартиниб (Daiichi Sankyo) и мотесаниб (Amgen/Takeda).
В некоторых вариантах осуществления одно или несколько других терапевтических средств представляют собой ингибитор mTOR, которые ингибирует пролиферацию клеток, ангиогенез и захват глюкозы. В некоторых вариантах осуществления ингибитор mTOR представляет собой эверолимус (Afinitor®, Novartis); темсиролимус (Torisel®, Pfizer); и сиролимус (Rapamune®, Pfizer).
В некоторых вариантах осуществления одно или несколько других терапевтических средств представляют собой ингибитор протеасом. Одобренные ингибиторы протеасом, пригодные в рамках настоящего изобретения, включают бортезомиб (Velcade®, Takeda); карфилзомиб (Kyprolis®, Amgen); и иксазомиб (Ninlaro®, Takeda).
В некоторых вариантах осуществления одно или несколько других терапевтических средств пред
- 44 045862 ставляют собой антагонист фактора роста, такой как антагонист тромбоцитарного фактора роста (PDGF), или эпидермального фактора роста (EGF) или его рецептора (EGFR). Одобренные антагонисты PDGF, которые можно использовать в рамках настоящего изобретения, включают оларатумаб (Lartruvo®; Eli Lilly). Одобренные антагонисты EGFR, которые можно использовать в рамках настоящего изобретения, включают: цетуксимаб (Erbitux®, Eli Lilly); нецитумумаб (Portrazza®, Eli Lilly), панитумумаб (Vectibix®, Amgen); и осимертиниб (нацеленный на активированный EGFR, Tagrisso®, AstraZeneca).
В некоторых вариантах осуществления одно или несколько других терапевтических средств представляют собой ингибитор ароматазы. В некоторых вариантах осуществления ингибитор ароматазы выбран из: экземестана (Aromasin®, Pfizer); анастазола (Arimidex®, AstraZeneca) и лектрозола (Femara®, Novartis).
В некоторых вариантах осуществления одно или несколько других терапевтических средств представляют собой антагонист каскада hedgehog. Одобренные ингибиторы каскада hedgehog, которые можно использовать в рамках настоящего изобретения, включают: сонидегиб (Odomzo®, Sun Pharmaceuticals); и висмодегиб (Erivedge®, Genentech), оба для лечения базально-клеточной карциномы.
В некоторых вариантах осуществления одно или несколько других терапевтических средств представляют собой ингибитор фолиевой кислоты. Одобренные ингибиторы фолиевой кислоты, пригодные в рамках настоящего изобретения, включают пеметрексед (Alimta®, Eli Lilly).
В некоторых вариантах осуществления одно или несколько других терапевтических средств представляют собой ингибитор рецептора 4 СС-хемокинов (CCR4). Находящиеся на стадии исследований ингибиторы CCR4, которые могут быть пригодными в рамках настоящего изобретения, включают могамулизумаб (Poteligeo®, Kyowa Hakko Kirin, Япония).
В некоторых вариантах осуществления одно или несколько других терапевтических средств представляют собой ингибитор изоцитратдегидрогеназы (IDH). Находящиеся на стадии исследования ингибиторы IDH, которые можно использовать в рамках настоящего изобретения, включают: AG120 (Celgene; NCT02677922); AG221 (Celgene, NCT02677922; NCT02577406); BAY1436032 (Bayer, NCT02746081); IDH305 (Novartis, NCT02987010).
В некоторых вариантах осуществления одно или несколько других терапевтических средств представляют собой ингибитор аргиназы. Находящиеся на стадии исследований ингибиторы аргиназы, которые можно использовать в рамках настоящего изобретения, включают: АЕВ1102 (пегилированная рекомбинантная аргиназа, Aeglea Biotherapeutics), который находится в фазе 1 клинических испытаний против острого миелоидного лейкоза и миелодиспластического синдрома (NCT02732184) и солидных опухолей (NCT02561234); и СВ-1158 (Calithera Biosciences).
В некоторых вариантах осуществления одно или несколько других терапевтических средств представляют собой ингибитор глутаминазы. Находящиеся на стадии испытаний ингибиторы глутаминазы, которые можно использовать в рамках настоящего изобретения, включают СВ-839 (Calithera Biosciences).
В некоторых вариантах осуществления одно или несколько других терапевтических средств представляют собой антитело, которое связывается с опухолевыми антигенами, т.е. белками, экспрессируемыми на поверхности опухолевых клеток. Одобренные антитела, которые связываются с опухолевыми антигенами, которые можно использовать в рамках настоящего изобретения, включают: ритуксимаб (Rituxan®, Genentech/BiogenIdec); офатумумаб (антитело против CD20, Arzerra®, GlaxoSmithKline); обинутузумаб (антитело против CD20, Gazyva®, Genentech), ибритумомаб (антитело против CD20 и иттрий-90, Zevalin®, Spectrum Pharmaceuticals); даратумумаб (антитело против CD38, Darzalex®, Janssen Biotech), динутуксимаб (антитело против гликолипида GD2, Unituxin®, United Therapeutics); трастузумаб (антитело против HER2, Herceptin®, Genentech); адотрастузумаб эмтанзин (антитело против HER2, слитое с эмтанзином, Kadcyla®, Genentech); и пертузумаб (антитело против HER2, Perjeta®, Genentech); и брентуксимаб ведотин (конъюгат антитело против CD30-лекарственное средство, Adcetris®, Seattle Genetics).
В некоторых вариантах осуществления одно или несколько других терапевтических средств представляют собой ингибитор топоизомеразы. Одобренные ингибиторы топоизомераз, пригодные в рамках настоящего изобретения, включают: иринотекан (Onivyde®, Merrimack Pharmaceuticals); топотекан (Гикамтин®, GlaxoSmithKline). Находящиеся на стадии испытаний ингибиторы топоизомераз, которые можно использовать в рамках настоящего изобретения, включают пиксантрон (Pixuvri®, CTI Biopharma).
В некоторых вариантах осуществления одно или несколько других терапевтических средств представляют собой ингибитор антиапоптотических белков, таких как BCL-2. Одобренные антиапоптотические средства, которые можно использовать в рамках настоящего изобретения, включают: венетоклакс (Venclexta®, AbbVie/Genentech) и блинатумомаб (Blincyto®, Amgen). Другие терапевтические средства, нацеленные на апоптотические белки, которые прошли клинические испытания и которые могут использоваться в рамках настоящего изобретения, включают навитоклакс (АВТ-263, Abbott), ингибитор BCL-2 (NCT02079740).
В некоторых вариантах осуществления одно или несколько других терапевтических средств пред
- 45 045862 ставляют собой ингибитор рецепторов андрогенов. Одобренные ингибиторы рецепторов андрогенов, пригодные в рамках настоящего изобретения, включают энзалутамид (Xtandi®, Astellas/Medivation); одобренные ингибиторы синтеза андрогенов включают абиратерон (Zytiga®, Centocor/Ortho); одобренный антагонист рецептора гонадотропин-рилизинг гормона (GnRH) (дегараликс, Firmagon®, Ferring Pharmaceuticals).
В некоторых вариантах осуществления одно или несколько других терапевтических средств представляют собой селективный модулятор рецепторов эстрогена (SERM), который препятствует синтезу или активности эстрогенов. Одобренные SERM, пригодные в рамках настоящего изобретения, включают ралоксифен (Evista®, Eli Lilly).
В некоторых вариантах осуществления одно или несколько других терапевтических средств представляют собой ингибитор резорбции кости. Одобренное терапевтическое средство, которое ингибирует резорбцию кости, представляет собой деносумаб (Xgeva®, Amgen), антитело, которое связывается с RANKL, препятствуя связыванию с его рецептором RANK, находящимся на поверхности остеокластов, их предшественников, и остеокласт-подобных гигантских клеток, которые опосредуют патологию костей при солидных опухолях с костными метастазами. Другие одобренные терапевтические средства, которые ингибируют резорбцию кости, включают бисфосфонаты, такие как золедроновая кислота (Zometa®, Novartis).
В некоторых вариантах осуществления одно или несколько других терапевтических средств представляют собой ингибитор взаимодействия межу двумя первичными белками-супрессорами р53, MDMX и MDM2. Находящиеся на стадии испытаний ингибиторы белков супрессии р53, которые можно использовать в рамках настоящего изобретения, включают ALRN-6924 (Aileron), сшитый пептид, который равноэффективно связывает и нарушает взаимодействие MDMX и MDM2 с р53. ALRN-6924 в настоящее время находится на стадии клинических испытаний для лечения AML, развернутого миелодиспластического синдрома (MDS) и периферической Т-клеточной лимфомы (PTCL) (NCT02909972; NCT02264613).
В некоторых вариантах осуществления одно или несколько терапевтических средств представляют собой ингибитор трансформирующего фактора роста-бета (TGF-бета или TGFP). Находящиеся на стадии испытаний ингибиторы белков TGF-бета, которые также можно использовать в рамках настоящего изобретения, включают NIS793 (Novartis), антитело против TGF-бета, находящееся на стадии испытаний в клинике для лечения различных злокачественных опухолей, включая рак молочной железы, легкого, печеночно-клеточный рак, рак ободочной и прямой кишки, рак поджелудочной железы, рак предстательной железы и рак почки (NCT 02947165). В некоторых вариантах осуществления ингибитор белков TGFбета представляет собой фрезолимумаб (GC1008; Sanofi-Genzyme), который проходит испытания для лечения меланомы (NCT00923169); почечноклеточного рака (NCT00356460); и немелкоклеточного рака легкого (NCT02581787). Кроме того, в некоторых вариантах осуществления дополнительное терапевтическое средство представляет собой ловушку для TGF-бета, как описано в Connolly et al. (2012) Int'l J. Biological Sciences 8:964-978. Одно терапевтическое испытание, в настоящее время проходящее клинические испытания для лечения солидных опухолей, представляет М7824 (Merck KgaA - ранее MSB0011459X), которое представляет собой биспецифическое соединение антитело против PDL1/ловушка для TGFe (NCT02699515); и (NCT02517398). М7824 состоит из полностью человеческого IgG1-антитела против PD-L1, слитого с внеклеточным доменом рецептора II TGF-бета человека, который функционирует как ловушка для TGFe.
В некоторых вариантах осуществления, одно или несколько других терапевтических средств выбраны из глембатумумаб ведотин-монометилауристатина Е (ММАЕ) (Celldex), антитела против гликопротеина NMB (gpNMB) (CR011), сшитого с цитотоксическим MMAE. gpNMB представляет собой белок, сверхэкспрессиремый множеством типов опухолей, который ассоциирован со способностью злокачественных клеток к метастазированию.
В некоторых вариантах осуществления, одно или несколько других терапевтических средств представляют собой антипролиферативное соединение. Такие антипролиферативные соединения включают, но не ограничиваются ими: ингибиторы ароматаз; антиэстрогены; ингибиторы топоизомеразы I; ингибиторы топоизомеразы II; активные в отношении микротрубочек соединения; алкилирующие соединения; ингибиторы деацетилазы гистонов; соединения, которые индуцируют процессы клеточной дифференцировки; ингибиторы циклооксигеназы; ингибиторы ММР; ингибиторы mTOR; антинеопластические антиметаболиты; соединения платины; соединения, нацеленные на/снижающие активность киназ белков или липидов и другие антиангиогенные а соединения; соединения, которые нацелены на, снижают или ингибируют активность фосфатаз белков или липидов; агонисты гонадорелина; антиандрогены; ингибиторы метионинаминопептидазы; ингибиторы матриксной металлопротеиназы; бисфосфонаты; модификаторы биологического ответа; антипролиферативные антитела; ингибиторы гепараназы; ингибиторы онкогенных изоформ Ras; ингибиторы теломеразы; ингибиторы протеасом; соединения, используемые для лечения гематологических злокачественных опухолей; соединения, которые нацелены на, снижают или ингибируют активность Flt-3; ингибиторы Hsp90, такие как 17-AAG (17-аллиламиногелданамицин, NSC330507), 17-DMAG (17-диметиламиноэтиламино-17-деметокси-гелданамицин, NSC707545), IPI-504,
- 46 045862
CNF1010, CNF2024, CNF1010 от Conforma Therapeutics; темозоломид (Temodal®); белковые ингибиторы кинезинов веретена вращения, такие как SB715992 или SB743921 от GlaxoSmithKline, или пентамидин/хлорпромазин от CombinatoRx; ингибиторы MEK, такие как ARRY142886 от Array BioPharma, AZd6244 от AstraZeneca, PD181461 от Pfizer и лейковорин.
Термин ингибитор ароматазы, как используют в рамках изобретения, относится к соединению, которое ингибирует продуцирование эстрогенов, например конвертирование субстратов андростендиона и тестостерона в эстрон и эстрадиол, соответственно. Термин включает, но не ограничивается ими, стероиды, особенно атаместан, экземестан и форместан и, в частности, нестероиды, особенно аминоглутетимид, роглетимид, пиридоглутетимид, трилостан, тестолактон, кетоконазол, ворозол, фадрозол, анастрозол и лектрозол. Экземестан выпускается в продажу под торговым названием Aromasin™. Форместан выпускается в продажу под торговым названием Lentaron™. Фадрозол выпускается в продажу под торговым названием Afema™. Анастрозол выпускается в продажу под торговым названием Arimidex™. Лектрозол выпускается в продажу под торговыми названиями Femara™ или Femar™. Аминоглутетимид выпускается в продажу под торговым названием Orimeten™. Комбинация по изобретению, содержащая химиотерапевтическое средство, которое представляет собой ингибитор ароматазы, является особенно пригодной для лечения опухолей, положительных по рецепторам гомонов, таких как опухоли молочной железы.
Термин антиэстроген, как используют в рамках изобретения, относится к соединению, которое является антагонистом эффекта эстрогенов на уровне рецепторов эстрогена. Термин включает, но не ограничивается ими, тамоксифен, фулвестрант, ралоксифен и ралоксифена гидрохлорид. Тамоксифен выпускается в продажу под торговым названием Nolvadex™. Ралоксифена гидрохлорид выпускается в продажу под торговым названием Evista™. Фулвестрант может выпускаться под торговым названием Faslodex™. Комбинация по изобретению, содержащая химиотерапевтическое средство, которое представляет собой антиэстроген, является особенно пригодной для лечения положительных по рецепторам эстрогенов опухолей, таких как опухоли молочной железы.
Термин антиандроген, как используют в рамках изобретения, относится к любому веществу, которое способно ингибировать биологические эффекты андрогенных гормонов, и включает, но не ограничивается ими, бикалутамид (Casodex™). Термин агонист гонадорелина, как используют в рамках изобретения, включает, но не ограничивается ими абареликс, гозерелин и гозерелина ацетат. Гозерелин можно вводить под торговым названием Zoladex™.
Термин ингибитор топоизомеразы I, как используют в рамках изобретения, включает, но не ограничивается ими, топотекан, гиматекан, иринотекан, камптотецин и его аналоги, 9-нитрокамптотецин и макромолекулярный конъюгат камптотецина PNU-166148. Иринотекан можно вводить, например, в форме, в которой он выпускается в продажу, например, под торговым названием Camptosar™. Топотекан выпускается в продажу под торговым названием Hycamptin™.
Термин ингибитор топоизомеразы II, как используют в рамках изобретения, включает, но не ограничивается ими, антрациклины, такие как доксорубицин (включая липосомальный состав, такой как Caelyx™), даунорубицин, эпирубицин, идарубицин и неморубицин, антрахиноны митоксантрон и лозоксантрон, и подофилотоксины этопозид и тенипозид. Этопозид выпускается в продажу под торговым названием Etopophos™. Тенипозид выпускается в продажу под торговым названием VM 26-Bristol. Доксорубицин выпускается в продажу под торговым названием Acriblastin™ или Adriamycin™ . Эпирубицин выпускается в продажу под торговым названием Farmorubicin™. Идарубицин выпускается в продажу под торговым названием Zavedos™. Митоксантрон выпускается в продажу под торговым названием Novantron.
Термин активное в отношении микротрубочек средство относится к стабилизирующим микротрубочки соединениями, дестабилизирующим микротрубочки соединениям и ингибиторам полимеризации микротубулина, включающим, но не ограничивающимся ими: таксаны, такие как паклитаксел и доцетаксел; алкалоиды барвинка, такие как винбластин или винбластина сульфат, винкристин или винкристина сульфат, и винорелбин; дискодермолиды; кохицин и эпотилоны и их производные. Паклитаксел выпускается в продажу под торговым названием Taxol™. Доцетаксел выпускается в продажу под торговым названием Taxotere™. Винбластина сульфат выпускается в продажу под торговым названием Vinblastin R.P™. Винкристин сульфат выпускается в продажу под торговым названием Farmistin™.
Термин алкилирующее средство, как используют в рамках изобретения, включает, но не ограничивается ими, циклофосфамид, ифосфамид, мелфалан или нитрозомочевину (BCNU или Глиадел). Циклофосфамид выпускается в продажу под торговым названием Cyclostin™. Ифосфамид выпускается в продажу под торговым названием Holoxan™ .
Термин ингибиторы деацетилазы гистонов или ингибиторы HDAC относится к соединениям, которые ингибируют деацетилазу гистонов и которые обладают антипролиферативной активностью. Они включают, но не ограничивается ими, субероиланилидгидроксамовую кислоту (SAHA).
Термин антинеопластический антиметаболит включает, но не ограничивается ими, 5-фторурацил
- 47 045862 или 5-FU, капецитабин, гемцитабин, деметилирующие ДНК соединения, такие как 5-азацитидин и децитабин, метотрексат и эдатрексат, и антагонисты фолиевой кислоты, такие как пеметрексед. Капецитабин выпускается в продажу под торговым названием Xeloda™. Г емцитабин выпускается в продажу под торговым названием Gemzar™.
Термин соединение платины, как используют в рамках изобретения, включает, но не ограничивается ими, карбоплатин, цис-платин, цисплатинум и оксалиплатин. Карбоплатин можно вводить, например, в форме, в которой он выпускается в продажу, например, под торговым названием Carboplat™. Оксалиплатин можно вводить, например, в форме, в которой он выпускается в продажу, например, под торговым названием Eloxatin™.
Термин соединения, нацеленные на/снижающие активность киназы белков или липидов; или активность фосфатазы белков или липидов; или дополнительные антиангиогенные соединения, как используют в рамках изобретения, включает, но не ограничивается ими, ингибиторы протеинтирозинкиназ и/или сериновых и/или треониновых киназ, или ингибиторы киназ липидов, такие как: а) соединения, нацеленные на, снижающие или ингибирующие активность рецепторов тромбоцитарного фактора роста (PDGFR), такие как соединения, которые нацелены на, снижают или ингибируют активность PDGFR, особенно соединения, которые ингибируют рецептор PDGF, такие как производное №фенил-2пиримидинамина, такие как иматиниб, SU101, SU6668 и GFB-111; b) соединения, нацеленные на, снижающие или ингибирующие активность рецепторов фибробластного фактора роста (FGFR); с) соединения, нацеленные на, снижающие или ингибирующие активность рецептора инсулиноподобного фактора роста I (IGF-IR), такие как соединения, которые нацелены на, снижают или ингибируют активность IGFIR, особенно соединения, которые ингибируют активность киназы рецептора IGF-I, или антитела, которые нацелены на внеклеточный домен рецептора IGF-I или его факторы роста; d) соединения, нацеленные на, снижающие или ингибирующие активность семейства рецепторных тирозинкиназ Trk, или ингибиторы эфрина В4; е) соединения, нацеленные на, снижающие или ингибирующие активность семейства рецепторных тирозинкиназ AxI; f) соединения, нацеленные на, снижающие или ингибирующие активность рецепторной тирозинкиназы Ret; g) соединения, нацеленные на, снижающие или ингибирующие активность рецепторной тирозинкиназы Kit/SCFR, такие как иматиниб; h) соединения, нацеленные на, снижающие или ингибирующие активность рецепторных тироззинкиназ С-kit, которые являются частью семейства PDGFR, такие как соединения, которые нацелены на, снижают или ингибируют активность семейства рецепторных тирозинкиназ c-Kit, особенно соединения, которые ингибируют рецептор c-Kit, такие как иматиниб; i) соединения, нацеленные на, снижающие или ингибирующие активность представителей семейства с-Abl, их продукты слияния генов (например, киназа BCR-Abl) и мутанты, такие как соединения, которые нацелены на, снижают или ингибируют активность представителей семейства с-Abl и их продукты слияния генов, такие как производное №фенил-2-пиримидинамина, такое как иматиниб или нилотиниб (AMN107); PD180970; AG957; NSC 680410; PD173955 от ParkeDavis; или дасатиниб (BMS-354825); j) соединения, нацеленные на, снижающие или ингибирующие активность представителей семейств сериновых/треониновых киназ протеинкиназы С (PKC) и Raf, представителей семейств MEK, SRC, JAK/pan-JAK, FAK, PDK1, PKB/Akt, Ras/MAPK, PI3K, SYK, TYK2, BTK и ТЕС, и/или представителей семейства циклин-зависимых киназ (CDK), включая производные стауроспорина, такие как мидостаурин; примеры следующих соединений включают UCN-01, сафингол, BAY 43-9006, бриостатин 1, перифозин; лимофозин; RO 318220 и RO 320432; GO 6976; lsis 3521; LY333531/LY379196; соединения изохинолинов; FTI; PD184352 или QAN697 (ингибитор Р13К) или АТ7519 (ингибитор CDK); k) соединения, нацеленные на, снижающие или ингибирующие активность ингибиторов протеинтирозинкиназы, такие как соединения, которые нацелены на, снижают или ингибируют активность ингибиторов протеинтирозинкиназ, включая иматиниба мезилат (Gleevec™) или тирфостин, такой как Tyrphostin A23/RG50810; AG 99; Tyrphostin AG 213; Tyrphostin AG 1748; Tyrphostin AG 490; Tyrphostin B44; Tyrphostin B44 (+) энантиомер; Tyrphostin AG 555; AG 494; Tyrphostin AG 556, AG957 и адафостин (адамантиловый сложный эфир 4-{[(2,5-дигидроксифенил)метил]амино}бензойной кислоты; NSC 680410, адафостин); 1) соединения, нацеленные на, снижающие или ингибирующие активность рецепторных тирозинкиназ семейства эпидермального фактора роста (EGFRi ErbB2, ErbB3, ErbB4 в качестве гомо- или гетеродимеры) и их мутанты, такие как соединения, которые нацелены на, снижают или ингибируют активность семейства рецепторов эпидермального фактора роста, особенно соединения, белки или антитела, которые ингибируют представителей семейства рецепторных тирозинкиназ EGF, такие как рецептор EGF, ErbB2, ErbB3 и ErbB4 или связываются с EGF или родственными EGF лигандами, СР 358774, ZD 1839, ZM 105180; трастузумаб (Herceptin™), цетуксимаб (Erbitux™), Иресса, Тарцева, OSI-774, Cl-1033, EKB-569, GW-2016, Е1.1, Е2.4, Е2.5, Е6.2, Е6.4, E2.11, Е6.3 или Е7.6.3, и производные 7Н-пирроло-[2,3d]пиримидина; m) соединения, нацеленные на, снижающие или ингибирующие активность рецептора cMet, такие как соединения, которые нацелены на, снижают или ингибируют активность c-Met, особенно соединения, которые ингибируют киназную активность рецептора c-Met, или антитела, которые нацелены на внеклеточный домен c-Met или связываются с HGF, n) соединения, нацеленные на, снижающие или ингибирующие киназную активность одного или нескольких представителей семейств JAK
- 48 045862 (JAK1/JAK2/JAK3/TYK2 и/или pan-JAK), включая, но не ограничиваясь ими PRT-062070, SB-1578, барицитиниб, пакритиниб, момелотиниб, VX-509, AZD-1480, TG-101348, тофацитиниб, и руксолитиниб; о) соединения, нацеленные на, снижающие или ингибирующие киназную активность PI3-киназы (PI3K), включая, но не ограничиваясь ими ATU-027, SF-1126, DS-7423, PBI-05204, GSK-2126458, ZSTK-474, бупарлисиб, пиктрелисиб, PF-4691502, BYL-719, дактолисиб, XL-147, XL-765 и иделалисиб; и; и р) соединения, нацеленные на, снижающие или ингибирующие сигнальные эффекты каскадов белка hedgehog (Hh) или рецептора smoothened (SMO), включая, но не ограничиваясь ими циклорамин, висмодегиб, итраконазол, эрисмодегиб и IPI-926 (саридегиб).
Термин ингибитор PI3K, как используют в рамках изобретения, включает, но не ограничивается ими, соединения, обладающие ингибиторной активностью против одного или нескольких ферментов семейства фосфатидилинозитол-3-киназы, включая, но не ограничиваясь ими PI3Ka, PI3Ky, PI3I<i5„ PI3Ke, PI3K-C2a, PI3K-C2e, PI3K-C2y, Vps34, р110-а, рПО-β, р110-у, р110-0, р85-а, р85-в, р55-у, р150, р101 и р87. Примеры ингибиторов PI3K, пригодных в раках настоящего изобретения, включают, но не ограничиваются ими ATU-027, SF-1126, DS-7423, PBI-05204, GSK-2126458, ZSTK-474, бупарлисиб, пиктрелисиб, PF-4691502, BYL-719, дактолисиб, XL-147, XL-765 и иделалисиб.
Термин ингибитор Bcl-2, как используют в рамках изобретения, включает, но не ограничивается ими, соединения, обладающие активностью ингибирования белка 2 В-клеточной лимфомы (Bcl-2), включая, но не ограничиваясь ими, АВТ-199, АВТ-731, АВТ-737, апогоссипол, общие ингибиторы Bcl-2 от Ascenta, куркумин (и его аналоги), двойные ингибиторы Bcl-2/Bcl-xL (Infinity Pharmaceuticals/Novartis Pharmaceuticals), Генасенс (G3139), HA14-1 (и его аналоги; см. WO 2008/118802), навитоклакс (и его аналоги, см. US 7390799), NH-1 (Shenayng Pharmaceutical University), обатоклакс (и его аналоги, см. WO 2004/106328), S-001 (Gloria Pharmaceuticals), соединения серии TW (Univ. of Michigan) и венетоклакс. В некоторых вариантах осуществления ингибитор Bcl-2 представляет собой низкомолекулярное терапевтическое средство. В некоторых вариантах осуществления ингибитор Bcl-2 представляет собой пептидомиметик.
Термин ингибитор BTK, как используют в рамках изобретения, включает, но не ограничивается ими, соединения, обладающие ингибиторной активностью против тирозинкиназы Брутона (BTK), включая, но не ограничиваясь ими, AVL-292 и ибрутиниб.
Термин ингибитор SYK, как используют в рамках изобретения, включает, но не ограничивается ими, соединения, обладающие ингибиторной активностью против тирозинкиназы селезенки (SYK), включая, но не ограничиваясь ими, PRT-062070, R-343, R-333, Экселлаир, PRT-062607 и фостаматиниб.
Дополнительные примеры ингибирующих BTK соединений и состояний, которые можно лечить такими соединениями в комбинации с соединениями по настоящему изобретению, могут быть найдены в WO 2008/039218 и WO 2011/090760, полное содержание которых включено в настоящее описание в качестве ссылок.
Дополнительные примеры ингибирующих SYK соединений и состояний, которые можно лечить такими соединениями в комбинации с соединениями по настоящему изобретению, могут быть найдены в WO 2003/063794, WO 2005/007623 и WO 2006/078846, полное содержание которых включено в настоящее описание в качестве ссылок.
Дополнительные примеры ингибирующих PI3K соединений и состояний, которые можно лечить такими соединениями в комбинации с соединениями по настоящему изобретению, могут быть найдены в WO 2004/019973, WO 2004/089925, WO 2007/016176, US 8138347, WO 2002/088112, WO 2007/084786, WO 2007/129161, WO 2006/122806, WO 2005/113554 и WO 2007/044729, полное содержание которых включено в настоящее описание в качестве ссылок.
Дополнительные примеры ингибирующих JAK соединений и состояний, которые можно лечить такими соединениями в комбинации с соединениями по настоящему изобретению, могут быть найдены в WO 2009/114512, WO 2008/109943, WO 2007/053452, WO 2000/142246 и WO 2007/070514, полное содержание которых включено в настоящее описание в качестве ссылок.
Дополнительные антиангиогенные соединения включают соединения, обладающие другим механизмом их активности, например, не связанным с ингибированием киназы белков или липидов, например, талидомид (Thalomid™) и TNP-470.
Примеры ингибиторов протеасом, пригодных для применения в комбинации с соединениями по изобретению, включают, но не ограничиваются ими, бортезомиб, дисульфирам, эпигаллокатехин-3галлат (EGCG), салиноспорамид А, карфилзомиб, ONX-0912, СЕР-18770 и MLN9708.
Соединения, которые нацелены на, снижают или ингибируют активность фосфатаз белков или липидов, представляют собой, например, ингибиторы фосфатазы 1, фосфатазы 2А или CDC25, такие как окадаиковая кислота или ее производное.
Соединения, которые индуцируют процессы дифференцировки клеток, включают, но не ограничиваются ими, ретиноевую кислоту, α-, γ- или δ-токоферол или α-, γ- или δ-токотриенол.
Термин ингибитор циклооксигеназы, как используют в рамках изобретения, включает, но не ограничивается ими, ингибиторы Сох-2, 5-алкилзамещенную 2-ариламинофенилуксусную кислоту и произ
- 49 045862 водные, такие как целекоксиб (Celebrex™), рофекоксиб (Vioxx™), эторикоксиб, вальдекоксиб или 5алкил-2-ариламинофенилуксусная кислота, такая как 5-метил-2-(2'-хлор-6'-фтораналино)фенилуксусная кислота, и люмиракоксиб.
Термин бисфосфонаты, как используют в рамках изобретения, включает, но не ограничивается ими, этридоновую, клодроновую, тилудроновую, памидроновую, алендроновую, ибандроновую, ризедроновую и золедроновую кислоту. Этидроновая кислота выпускается в продажу под торговым названием Didronel™. Клодроновая кислота выпускается в продажу под торговым названием Bonefos™. Тилудроновая кислота выпускается в продажу под торговым названием Skelid™. Памидроновая кислота выпускается в продажу под торговым названием Aredia™. Алендроновая кислота выпускается в продажу под торговым названием Fosamax™. Ибандроновая кислота выпускается в продажу под торговым названием Bondranat™. Ризедроновая кислота выпускается в продажу под торговым названием Actonel™. Золедроновая кислота выпускается в продажу под торговым названием Zometa™. Термин ингибиторы mTOR относится к соединениям, которые ингибируют мишень рапамицина у млекопитающих (mTOR) и которые обладают антипролиферативной активностью, такие как сиролимус (Rapamune®), эверолимус (Certican™), CCI-779 и АВТ578.
Термин ингибитор гепараназы, как используют в рамках изобретения, относится к соединениям, которые нацелены на, снижают или ингибируют деградацию гепаринсульфата. Термин включает, но не ограничивается ими, PI-88. Термин модификатор биологического ответа, как используют в рамках изобретения, относится к лимфокинам или интерферонам.
Термин ингибитор онкогенных изоформ Ras, таких как H-Ras, K-Ras или N-Ras, как используют в рамках изобретения, относится к соединениям, которые нацелены на, снижают или ингибируют онкогенную активность Ras; например, ингибитор фарнезилтрансферазы, такой как L-744832, DK8G557 или R115777 (Zarnestra™). Термин ингибитор теломеразы, как используют в рамках изобретения, относится к соединениям, которые нацелены на, снижают или ингибируют активность теломераз. Соединения, которые нацелены на, снижают или ингибируют активность теломераз, в частности, представляют собой соединения, которые ингибируют рецептор теломераз, такие как теломестатин.
Термин ингибитор метионинаминопептидазы, как используют в рамках изобретения, относится к соединениям, которые нацелены на, снижают или ингибируют активность метионинаминопептидазы. Соединения, которые нацелены на, снижают или ингибируют активность метионинаминопептидазы, включают, но не ограничиваются ими, бенгамид или его производное.
Термин ингибитор протеасом, как используют в рамках изобретения, относится к соединениям, которые нацелены на, снижают или ингибируют активность протеасом. Соединения, которые нацелены на, снижают или ингибируют активность протеасом, включают, но не ограничиваются ими, бортезомиб (Velcade™) и MLN 341.
Термин ингибитор матриксной металлопротеиназы или (ингибитор ММР), как используют в рамках изобретения, включает, но не ограничивается ими, ингибиторы в виде коллагеновых пептидомиметиков и не пептидомиметиков, производные тетрациклина, например, гидроксаматный ингибиторпептидомиметик батимастат и его перорально биодоступный аналог маримастат (ВВ-2516), приномастат (AG3340), метастат (NSC 683551) BMS-279251, BAY 12-9566, ТАА211, MMI270B или AAJ996.
Термин соединения, используемые для лечения гематологических злокачественных опухолей, как используют в рамках изобретения, включает, но не ограничивается ими, ингибиторы FMS-подобных тирозинкиназ, которые представляют собой соединения, нацеленные на, снижающие или ингибирующие активность рецепторов FMS-подобной тирозинкиназы (Flt-3R); интерферон, 1-в-0-арабинофурансилцитозин (ara-с) и бисульфан; и ингибиторы ALK, которые представляют собой соединения, которые нацелены на, снижают или ингибируют каназу анапластической лимфомы.
Соединения, которые нацелены на, снижают или ингибируют активность рецепторов FMS-подобной тирозинкиназы (Flt-3R), в частности, представляют собой соединения, белки или антитела, которые ингибируют представителя семейства рецепторных киназ Flt-3R, такие как PKC412, мидостаурин, производное стауроспорина, SU11248 и MLN518.
Термин ингибиторы HSP90, как используют в рамках изобретения, включает, но не ограничивается ими, соединения, нацеленные на, снижающие или ингибирующие собственную АТР-азную активность HSP90, деградирующую, нацеленную на, снижающую или ингибирующую белки-клиенты HSP90 через убиквитиновый путь протеасом. Соединения, нацеленные на, снижающие или ингибирующие собственную АТР-азную активность HSP90, в частности, представляют собой соединения, белки или антитела, которые ингибируют АТР-азную активность HSP90, такие как 17-аллиламино,17-деметоксигелданамицин (17AAG), производное гелданамицина; другие родственные гелданамицину соединения; радицикол и ингибиторы HDAC.
Термин антипролиферативные антитела, как используют в рамках изобретения, включает, но не ограничивается ими, трастузумаб (Herceptin™), Трастузумаб-DM1, эрбитукс, бевацизумаб (Avastin™), ритуксимаб (Rituxan®), PRO64553 (антитело против CD40) и антитело 2С4. Под антителами подразумевают интактные моноклональные антитела, поликлональные антитела, мультиспецифические антитела,
- 50 045862 образованные из по меньшей мере 2 интактных антител, и фрагменты антител при условии, что они демонстрируют желаемую биологическую активность.
Для лечения острого миелоидного лейкоза (AML) соединения по настоящему изобретению можно использовать в комбинации со стандартными способами терапии лейкоза, особенно в комбинации со способами терапии, используемыми для лечения AML. В частности, соединения по настоящему изобретению можно вводить в комбинации, например, с ингибиторами фарнезилтрансферазы и/или другими лекарственными средствами, пригодными для лечения AML, такими как Даунорубицин, Адриамицин, Ara-С, VP-16, Тенипозид, Митоксантрон, Идарубицин, Карбоплатин и PKC412.
Другие проливолейкозные соединения включают, например, Ara-С, аналог пиримидина, который представляет собой производное дезоксицитидина с 2'-альфагидроксирибозой (арабинозид). Также включен аналог пурина гипоксантин, 6-меркаптопурин (6-МР) и флударабина фосфат. Соединения, которые нацелены на, снижают или ингибируют активность ингибиторов деацетилазы гистонов (HDAC), такие как бутират натрия и субероиланилидгидроксамовая кислота (SAHA), ингибируют активность ферментов, известных как деацетилазы гистонов. Конкретные ингибиторы HDAC включают MS275, SAHA, FK228 (ранее FR901228), Триихостатин А и соединения, описанные в US 6552065, включая, но не ограничиваясь ими, №гидрокси-3-[4-[[[2-(2-метил-1Н-индол-3-ил)этил]амино]метил]фенил]-2Е-2-пропенамид, или его фармацевтически приемлемую соль, и Н-гидрокси-3-[4-[(2-гидроксиэтил){2-(1Н-индол3-ил)этил]амино]метил]фенил]-2Е-2-пропенамид, или его фармацевтически приемлемую соль, особенно лактат. Антагонисты рецепторов соматостатина, как используют в рамках изобретения, относятся к соединениям, которые нацелены на, воздействуют на или ингибируют рецептор соматостатина, таким как октреотид, и SOM230. Подходы повреждения опухолевых клеток относятся к таким подходам, как ионизирующее излучение. Термин ионизирующее излучение, упоминаемый выше и далее, означает ионизирующую радиацию, которая встречается в качестве либо электромагнитных лучей (таких как рентгеновские лучи и гамма-лучи), либо частиц (таких как альфа- и бета-частицы). Ионизиующая радиация предусматривается в, но не ограничиваясь ими, лучевой терапии и известна в данной области. См. Hellman, Principles of Radiotherapy, Cancer, Principles and Practice of Oncology, Devita et al, Eds., 4th Edition, Vol. 1, pp. 248-275 (1993).
Также включены соединения, связывающие EDG, и рибонуклеотидные ингибиторы редуктаз. Термин соединения, связывающие EDG, как используют в рамках изобретения, относится к классу иммунодепрессантов, которые модулируют рециркуляцию лимфоцитов, таких как FTY720. Термин рибонуклеотидные ингибиторы редуктаз относится к пиримидиновым или пуриновым нуклеозидным аналогам, включая, но не ограничиваясь ими, флударабин и/или цитозинарабинозид (ara-С), 6-тиогуанин, 5фторурацил, кладрибин, 6-меркаптопурин (особенно в комбинации с ara-С против ALL) и/или пентостатин. Рибонуклеотидные ингибиторы редуктаз, в частности, представляют собой гидроксимочевину или производные 2 -гидрокси-1Н-изоиндол-1,3 -диона.
Также, в частности, включены соединения, белки или моноклональные антитела против VEGF, такие как: 1-(4-хлоранилино)-4-(4-пиридилметил)фталазин или его фармацевтически приемлемая соль, 1(4-хлоранилино)-4-(4-пиридилметил)фталазина сукцинат; Angiostatin™; Endostatin™; амиды антраниловой кислот; ZD4190; Zd6474; SU5416; SU6668; бевацизумаб; или антитела против VEGF или антитела против рецептора VEGF, такие как rhuMAb и RHUFab, аптамер против VEGF, такой как Макугон; ингибиторы FLT-4, ингибиторы FLT-3, IgGI-антитело против VEGFR-2, ангиозим (RPI 4610) и бевацизумаб (Avastin™).
Фотодинамическая терапия, как используют в рамках изобретения, относится к терапии, в которой используются определенные химические вещества, известные как фотосенсибилизаторы, для лечения или предупреждения злокачественных опухолей. Примеры фотодинамической терапии включают лечение соединениями, такими как Visudyne™ и порфимер натрий.
Ангиостатические стероиды, как используют в рамках изобретения, относятся к соединениям, которые блокируют или ингибируют ангиогенез, например, таким как анекортав, триамцинолон, гидрокортизон, 11-а-эпигидрокортизол, кортексолон, 17а-гидроксипрогестерон, кортикостерон, дезоксикортикостерон, тестостерон, эстрон и дексаметазон.
Имплантаты, содержащие кортикостероиды, относится к соединениям, таким как флуоцинолон и дексаметазон.
Другие химиотерапевтические соединения включают, но не ограничиваются ими: растительные алкалоиды, гормональные соединения и антагонисты; биологические модификаторы ответа, предпочтительно лимфокины или интерфероны; антисмысловые олигонуклеотиды или олигонуклеотидные производные; кшРНК или миРНК; или прочие соединения или соединения с другим или неизвестным механизмом действия.
Структура активных соединений, идентифицированных посредством номеров кодов, генерических или торговых названий, может быть взята из текущего издания стандартного справочника The Merck Index или из баз данных, например, международных патентов (например, международных публикаций IMS).
- 51 045862
Иллюстративные средства иммуноонкологии.
В некоторых вариантах осуществления, одно или несколько других терапевтических средств представляют собой средство иммуноонкологии. Как используют в рамках изобретения, термин средство иммуноонкологии относится к средству, которое является эффективным для усиления, стимуляции и/или активации иммунных ответов у индивидуумов. В некоторых вариантах осуществления введение средства иммуноонкологии с соединением по изобретению имеет синергический эффект при лечении злокачественной опухоли.
Средство иммуноонкологии может представлять собой, например, низкомолекулярное лекарственное средство, антитело или биологическое или низкомолекулярное средство. Примеры биологических средств иммуноонкологии включают, но не ограничиваются ими, вакцины против злокачественной опухоли, антитела и цитокины. В некоторых вариантах осуществления антитело представляет собой моноклональное антитело. В некоторых вариантах осуществления моноклональное антитело является гуманизированным или человеческим.
В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии представляет собой (i) агонист стимулирующего (в том числе костимулирующего) рецептора или (ii) антагонист ингибиторного (в том числе коингибиторного) сигнала на Т-клетках, оба из которых приводя к усилению антигенспецифических Т-клеточных ответов.
Определенные стимулирующие и ингибиторные молекулы являются представителями суперсемейства иммуноглобулинов (IgSF). Одним важным семейством мембраносвязанных лигандов, которые связываются с костимулирующими или коингибиторными рецепторами, является семейство В7, которое включает В7-1, В7-2, B7-H1 (PD-L1), B7-DC (PD-L2), В7-Н2 (ICOS-L), В7-Н3, В7-Н4, В7-Н5 (VISTA) и В7-Н6. Другим семейством мембраносвязанных лигандов, которые связываются с костимулирущими или коингибиторными рецепторами, является семейство молекул TNF, которые связываются с распознаваемыми представителями семейства рецепторов TNF, которое включает CD40 и CD40L, ОХ-40, OX-40L, CD70, CD27L, CD30, CD30L, 4-1BBL, CD137 (4-1ВВ), TRAIL/Apo2-L, TRAILR1/DR4, TRAILR2/DR5, TRAILR3, TRAILR4, OPG, RANK, RANKL, TWEAKR/Fn14, TWEAK, BAFFR, EDAR, XEDAR, TACI, APRIL, BCMA, LTpR, LIGHT, DcR3, HVEM, VEGI/TL1A, TRAMP/DR3, EDAR, EDA1, XEDAR, EDA2, TNFR1, лимфотоксин α/TNFe, TNFR2, TNFa, LTeR, лимфотоксин α1β2, FAS, FASL, RELT, DR6, TROY и NGFR.
В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии представляет собой цитокин, который ингибирует активацию Т-клеток (например, IL-6, IL-10, TGF-β, VEGF и другие иммуносупрессивные цитокины) или цитокин, который стимулирует активацию Т-клеток, для стимуляции иммунного ответа.
В некоторых вариантах осуществления комбинация соединения по изобретению и средства иммуноонкологии может стимулировать Т-клеточные ответы. В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии представляет собой: (i) антагонист белка, который ингибирует активацию Т-клеток (например, ингибиторы иммунной точки контроля), такой как CTLA-4, PD-1, PD-L1, PD-L2, LAG-3, TIM-3, галектин-9, СЕАСАМ-1, BTLA, CD69, галектин-1, TIGIT, CD113, GPR56, VISTA, 2B4, CD48, GARP, PD1H, LAIR1, TIM-1 и TIM-4; или (ii) агонист белка, который стимулирует активацию Т-клеток, такой как В7-1, В7-2, CD28, 4-1ВВ (CD137), 4-1BBL, ICOS, ICOS-L, OX40, OX40L, GITR, GITRL, CD70, CD27, CD40, DR3 и CD28H.
В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии представляет собой антагонист ингибиторных рецепторов на NK-клетках или агонист активирующих рецепторов на NK-клетках. В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии представляет собой антагонист KIR, такой как лирилумаб.
В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии представляет собой средство, которое ингибирует или истощает макрофаги или моноциты, включая, но не ограничиваясь ими, антагонисты CSF-1R, такие как антитела-антагонисты CSF-1R, включая RG7155 (WO 2011/70024, WO 2011/107553, WO 2011/131407, WO 2013/87699, WO 2013/119716, WO 2013/132044) или FPA-008 (WO 2011/140249; WO 2013/169264; WO 2014/036357).
В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии выбрано из средств-агонистов, которые связывают положительные костимулирующие молекулы, блокирующих средств, которые ослабляют передачу сигнала через ингибиторные рецепторы, антагонистов и одного или нескольких средств, которые системно увеличивают частоту противоопухолевых Т-клеток, которые обходят различные иммуносупрессивные каскады в микроокружении опухоли (например, блокируют связывание ингибиторного рецептора (например, взаимодействия PD-L1/PD-1), истощают или ингибируют Treg (например, с использованием моноклонального антитела против CD25 (например, даклизумаб) или посредством истощения с использованием гранул с антителом против CD25 ex vivo), ингибируют метаболические ферменты, такие как IDO, или обращают вспять/препятствуют истощению энергии Т-клеток) и средств, которые запускают активацию врожденного иммунитета и/или воспаление в областях опухоли.
В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии представляет собой антагонист
- 52 045862
CTLA-4. В некоторых вариантах осуществления антагонист CTLA-4 представляет собой антителоантагонист CTLA-4. В некоторых вариантах осуществления антитело-антагонист CTLA-4 представляет собой YERVOY (ипилимумаб) или тремелимумаб.
В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии представляет собой антагонист PD-1. В некоторых вариантах осуществления антагонист PD-1 вводят посредством инфузии. В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии представляет собой антитело или его антигенсвязывающую часть, которые специфически связываются с рецептором белка запрограммированной смерти 1 (PD-1) и ингибируют активность PD-1. В некоторых вариантах осуществления антагонист PD-1 представляет собой антитело-антагонист PD-1. В некоторых вариантах осуществления антителоантагонист PD-1 представляет собой OPDIVO (ниволумаб), KEYTRUDA (пембролизумаб) или MEDI0680 (АМР-514; WO 2012/145493). В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии может представлять собой пидилизумаб (СТ-011). В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии представляет собой рекомбинантный белок, состоящий из внеклеточного домена PD-L2 (B7-DC), слитого с Fc-частью IgG1, называемый АМР-224.
В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии представляет собой антагонист PD-L1. В некоторых вариантах осуществления антагонист PD-L1 представляет собой антителоантагонист PD-L1. В некоторых вариантах осуществления антитело против PD-L1 представляет собой MPDL3280A (RG7446; WO 2010/077634), дурвалумаб (MEDI4736), BMS-936559 (WO 2007/005874) и MSB0010718C (WO 2013/79174).
В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии представляет собой антагонист LAG-3. В некоторых вариантах осуществления антагонист LAG-3 представляет собой антителоантагонист LAG-3. В некоторых вариантах осуществления антитело против LAG3 представляет собой BMS-986016 (WO 2010/19570, WO 2014/08218), или IMP-731 или IMP-321 (WO 2008/132601, WO 2009/44273).
В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии представляет собой агонист CD137 (4-1BB). В некоторых вариантах осуществления агонист CD137 (4-1ВВ) представляет собой антитело-агонист CD137. В некоторых вариантах осуществления антитело против CD137 представляет собой урелумаб или PF-05082566 (WO 2012/32433).
В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии представляет собой агонист GITR. В некоторых вариантах осуществления агонист GITR представляет собой антитело-агонист GITR. В некоторых вариантах осуществления антитело против GITR представляет собой BMS-986153, BMS986156, TRX-518 (WO 2006/105021, WO 2009/009116), или MK-4166 (WO 2011/028683).
В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии представляет собой антагонист индоламин (2,3)-диоксигеназы (IDO). В некоторых вариантах осуществления антагонист IDO выбран из: эпакадостата (INCB024360, Incyte); индоксимода (NLG-8189, NewLink Genetics Corporation); капманитиба (INC280, Novartis); GDC-0919 (Genentech/Roche); PF-06840003 (Pfizer); BMS:F001287 (Bristol-Myers Squibb); Phy906/KD108 (Phytoceutica); фермента, который разрушает кинуренин (Kynase, Kyn Therapeutics); и NLG-919 (WO 2009/73620, WO 2009/1156652, WO 2011/56652, WO 2012/142237).
В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии представляет собой агонист ОХ40. В некоторых вариантах осуществления агонист ОХ40 представляет собой антитело-агонист ОХ40. В некоторых вариантах осуществления антитело против ОХ40 представляет собой MEDI-6383 или MEDI-6469.
В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии представляет собой антагонист OX40L. В некоторых вариантах осуществления антагонист OX40L представляет собой антителоантагонист ОХ40. В некоторых вариантах осуществления антагонист OX40L представляет собой RG7888 (WO 2006/029879).
В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии представляет собой агонист CD40. В некоторых вариантах осуществления агонист CD40 представляет собой антитело-агонист CD40. В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии представляет собой антагонист CD40. В некоторых вариантах осуществления антагонист CD40 представляет собой антитело-антагонист CD40. В некоторых вариантах осуществления антитело против CD40 представляет собой лукатумумаб или дацетузумаб.
В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии представляет собой агонист CD27. В некоторых вариантах осуществления агонист CD27 представляет собой антитело-агонист CD27. В некоторых вариантах осуществления антитело против CD27 представляет собой варлилумаб.
В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии представляет собой MGA271 (против В7НЗ) (WO 2011/109400).
В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии представляет собой абаговомаб, адекатумумаб, афутузумаб, алемтузумаб, анатумомаб мафенатокс, аполизумаб, атезолимаб, авелумаб, бинатумомаб, BMS-936559, катумаксомаб, дурвалумаб, эпикадостат, эпратузумаб, индоксимод, инотузумаб озагомицин, интелумумаб, ипилимумаб, исатуксимаб, ламбролизумаб, MED14736, MPDL3280A, ниволумаб, обинутузумаб, окаратузумаб, офатумумаб, олататумаб, пембролизумаб, пидилизумаб, ритук
- 53 045862 симаб, тицилимумаб, самализумаб или тремелимумаб.
В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии представляет собой иммуностимулирущее средство. Например, антитела, блокирующие ингибиторную систему PD-1 и PD-L1, могут высвобождать активированные реактивные в отношении опухоли Т-клетки, и в клинических испытаниях было показано, что они индуцируют длительные противоопухолевые ответы во все большем количестве гистологических образцов опухоли, включая некоторые типы опухолей, которые обычно не считаются чувствительными к иммунотерапии. См., например, Okazaki, T. et al. (2013) Nat. Immunol. 14, 1212-1218; Zou et al. (2016) Sci. Transl. Med. 8. Было показано, что антитело против PD-1 ниволумаб (Opdivo®, Bristol-Myers Squibb, также известное как ONO-4538, MDX1106 и BMS-936558), обладает потенциалом к повышению общей выживаемости у пациентов со светлоклеточным раком почки (RCC), у которых произошло прогрессирование заболевания в ходе или после предшествующей антиангиогенной терапии.
В некоторых вариантах осуществления иммуномодулирующее терапевтическое средство специфически индуцирует апоптоз опухолевых клеток. Одобренные иммуномодулирующие терапевтические средства, которые можно использовать в рамках настоящего изобретения, включают: помалидомид (Pomalyst®, Celgene); леналидомид (Revlimid®, Celgene); ингенол мебутат (Picato®, LEO Pharma).
В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии представляет собой вакцину против злокачественной опухоли. В некоторых вариантах осуществления вакцина против злокачественной опухоли выбрана из: сипулейцела-Т (Provenge®, Dendreon/Valeant Pharmaceuticals), который одобрен для лечения бессимптомного или имеющего минимальные симптомы метастазирующего кастрационнорезистентного (гормон-рефрактерного) рака предстательной железы; и талимоген лагерпарепвек (Imlygic®, BioVex/Amgen, ранее известный как T-VEC), генетически модифицированная онколитическая вирусная терапия, одобренная для лечения нерезектабельной кожной, подкожной меланомы и ее узловых очагов. В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии выбрано из онколитической вирусной терапии, такой как пексастимоген девацирепвек (PexaVec/JX-594, SillaJen/ранее Jennerex Biotherapeutics), вирус осповакцины с дефектом тимидинкиназы- (TK-), модифицированный для экспрессии GM-CSF, против печеночно-клеточной карциномы (NCT02562755) и меланомы (NCT00429312); пелареореп (Reolysin®, Oncolytics Biotech), вариант респираторного кишечного орфанного вируса (реовирус), который не реплицируется в клетках, которые не являются RAS-активированными, против многочисленных злокачественных опухолей, включая рак ободочной и прямой кишки (NCT01622543); рак предстательной железы (NCT01619813); плоскоклеточный рак головы и шеи (NCT01166542); аденокарциному поджелудочной железы (NCT00998322); и немелкоклеточный рак легкого (NSCLC) (NCT 00861627); энаденотуцирев (NG-348, PsiOxus, ранее известный как ColoAd1), аденовирус, модифицированный способами инженерии для экспрессии полноразмерного CD80 и фрагмент антитела, специфичный к белку CD3 Т-клеточного рецептора, против рака яичника (NCT02028117); метастазирующих или развернутых эпителиальных опухолей, таких как рак ободочной и прямой кишки, рак мочевого пузыря, плоскоклеточная карцинома головы и шеи и рак слюнной железы (NCT02636036); ONCOS-102 (Targovax/ранее Oncos), аденовирус, модифицированный для экспрессии GM-CSF, против меланомы (NCT03003676); и перитонеального заболевания, рака ободочной и прямой кишки или рака яичника (NCT02963831); GL0NC1 (GLV-1h68/GLV-1h153, Genelux GmbH), вирусы осповакцины, модифицированные способами инженерии для экспрессии бета-галактозидазы (бета-gal)/бета-глюкуронидазы или бета-gal/симпортера йодида натрия человека (hNIS), соответственно, которые исследовались против перитонеального карциноматоза (NCT01443260); рака фаллопиевой трубы, рака яичника (NCT 02759588); или CG0070 (Cold Genesys), аденовирус, модифицированный для экспрессии GM-CSF, против рака мочевого пузыря (NCT02365818).
В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии выбрано из: JX-929 (SillaJen/formerly Jennerex Biotherapeutics), вируса коровьей оспы с дефектом TK и фактора роста коровьей оспы, модифицированного для экспрессии цитозиндезаминазы, которая способна конвертировать пролекарство 5-фторцитозин в цитотоксическое лекарственное средство 5-фторурацил; TG01 и TG02 (Targovax/formerly Oncos), иммунотерапевтических средств на пептидной основе, нацеленных на случаи трудно поддающихся лечению мутаций RAS; и TILT-123 (TILT Biotherapeutics), сконструированного аденовируса, обозначаемого: Ad5/3-E2F-delta24-hTNFa-IRES-hIL20; и вируса везикулярного стоматита (VSV) VSV-GP (ViraTherapeutics), модифицированного для экспрессии гликопротеина (GP) вируса лимфоцитарного хориоменингита (LCMV), который может быть далее модифицирован для экспрессии антигенов, предназначенных для индукции ответа антигенспецифических CD8+ Т-клеток.
В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии представляет собой Т-клетку, модифицированную для экспрессии химерного рецептора антигена или CAR. Т-клетки модифицированные для экспрессии такого химерного рецептора антигена, называют CAR-T-клетками.
CAR конструируют так, чтобы они состояли из связывающих доменов, которые могут происходить из природных лигандов, одноцепочечных вариабельных фрагментов (scFv), происходящих из моноклональных антител, специфичных к антигенам клеточной поверхности, слитых с эндодоменами, которые представляют собой функциональный конец Т-клеточного рецептора (TCR), такими как сигнальный до
- 54 045862 мен CD3-3ema из TCR, который способен генерировать сигнал активации в Т-лимфоцитах. При связывании антигена такие CAR сопрягаются с эндогенными каскадами передачи сигнала в эффекторной клетке и генерируют активирующие сигналы, сходные с сигналами, инициируемыми комплексом TCR.
Например, в некоторых вариантах осуществления CAR-T-клетка представляет собой одну из клеток, описанных в патенте США 8906682 (включенном в настоящее описание в качестве ссылки в полном объеме), в котором описаны CAR-T-клетки, модифицированные так, чтобы они содержали внеклеточный домен, имеющий антигенсвязывающий домен (такой как домен, который связывается с CD19), слитый с внутриклеточным сигнальным доменом зета-цепи рецепторного комплекса Т-клеточного антигена (таким как CD3-зета). При экспрессии в Т-клетке CAR способен к перенацеливанию распознавания антигена на основе специфичности связывания антигена. В случае CD19 антиген экспрессируется на злокачественных В-клетках. В настоящее время проводят более 200 клинических испытаний с использованием CAR-T при широком диапазоне показаний. [https://clinicatrials.gov/ct2/results?term=chimeric+antigen+receptors&pg=1].
В некоторых вариантах осуществления иммуностимулирующее средство представляет собой активатор орфанного рецептора у, родственного ретиноевой кислоте (ROR/t). RORYt представляет собой фактор транскрипции, имеющий ключевую роль в дифференцировке и поддержании подгрупп эффекторов 17 типа, CD4+ (Th17) и CD8+ (Тс17) Т-клеток, а также в дифференцировке экспрессирующих IL-17 субпопуляций клеток врожденного иммунитета, таких как NK-клетки. В некоторых вариантах осуществления активатор RORyt представляет собой LYC-55716 (Lycera), который в настоящее время проходит оценку в клинических испытаниях для лечения солидных опухолей (NCT02929862).
В некоторых вариантах осуществления иммуностимулирующее средство представляет собой агонист или активатор toll-подобного рецептора (TLR). Подходящие активаторы TLR включают агонист или активатор TLR9, такой как SD-101 (Dynavax). SD-101 представляет собой иммуностимулирующий CpG, который проходит исследования для В-клеточной, фолликулярной и других лимфом (NCT02254772). Агонисты или активаторы TLR8, которые можно использовать в рамках настоящего изобретения, включают мотолимод (VTX-2337, VentiRx Pharmaceuticals), который проходит испытания для плоскоклеточного рака головы и шеи (NCT02124850) и рака яичника (NCT02431559).
Другие средства иммуноонкологии, которые можно использовать в рамках настоящего изобретения, включают: урелумаб (BMS-663513, Bristol-Myers Squibb), моноклональное антитело против CD137; варлилумаб (CDX-1127, Celldex Therapeutics), моноклональное антитело против CD27; BMS-986178 (Bristol-Myers Squibb), моноклональное антитело против ОХ40; лирилумаб (IPH2102/BMS-986015, Innate Pharma, Bristol-Myers Squibb), моноклональное антитело против KIR; монализумаб (IPH2201, Innate Pharma, AstraZeneca), моноклональное антитело против NKG2A; андекаликсимаб (GS-5745, Gilead Sciences), антитело против ММР9; и MK-4166 (Merck & Co.), моноклональное антитело против GITR.
В некоторых вариантах осуществления иммуностимулирующее средство выбрано из элотузумаба, мифамуртида, агониста или активатора toll-подобного рецептора и активатора RORyt.
В некоторых вариантах осуществления иммуностисмулирующее терапевтическое средство представляет собой рекомбинантный интерлейкин 15 человека (rhIL-15). rhIL-15 тестируется в клинике в качестве терапии меланомы и почечноклеточного рака (NCT01021059 и NCT01369888) и лейкозов (NCT02689453). В некоторых вариантах осуществления иммуностимулирующее средство представляет собой рекомбинантный интерлейкин 12 человека (rhIL-12). В некоторых вариантах осуществления иммунотерапевтическое средство на основе IL-15 представляет собой гетеродимерный IL-15 (hetIL-15, Novartis/Admune), слитый комплекс, состоящий из синтетической формы эндогенного IL-15 в комплексе с растворимым связывающим IL-15 белком альфа-цепью рецептора IL-15 (IL15:sIL-15RA), который проходит тестирование в клинических испытаниях фазы 1 для меланомы, почечноклеточного рака, немелкоклеточного рака легкого и плоскоклеточной карциномы головы и шеи (NCT02452268). В некоторых вариантах осуществления рекомбинантный интерлейкин 12 человека (rhIL-12) представляет собой NM-IL12 (Neumedicines, Inc.), NCT02544724 или NCT02542124.
В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии выбрано из средств, описанных в Jerry L. Adams et al., Big opportunities for small molecules in immuno-oncology, Cancer Therapy 2015, Vol. 14, pages 603-622, содержание которой включено в настоящее описание в качестве ссылки в полном объеме. В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии выбрано из примеров, описанных в табл. 1 Jerry L. Adams et al. В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии представляет собой низкомолекулярное соединение, нацеленное на мишень иммуноонкологии, выбранную из мишеней, приведенных в табл. 2 Jerry L. Adams et al. В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии представляет собой низкомолекулярное соединение, выбранное из соединений, приведенных в табл. 2 Jerry L. Adams et al.
В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии выбрано из низкомолекулярных средств иммуноонкологии, описанных в Peter L. Toogood, Small molecule immuno-oncology therapeutic agents, Bioorganic & Medicinal Chemistry Letters 2018, Vol. 28, pages 319-329, содержание которой включено в настоящее описание в качестве ссылки в полном объеме. В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии представляет собой средство, нацеленное на каскады, описанные в Peter L. Toogood.
- 55 045862
В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии выбрано из средств, описанных в Sandra L. Ross et al., Bispecific T cell engager (BiTE®) antibody constructs can mediate bystander tumor cell killing, PLoS ONE 12(8): e0183390, содержание которой включено в настоящее описание в качестве ссылки в полном объеме. В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии представляет собой конструкцию антитела, представляющую собой биспецифический активатор Т-клеток (BiTE®). В некоторых вариантах осуществления конструкция антитела, представляющая собой биспецифический активатор Т-клеток (BiTE®), представляет собой конструкцию биспецифического антитела CD19/CD3. В некоторых вариантах осуществления конструкция антитела, представляющая собой биспецифический активатор Т-клеток (BiTE®), представляет собой конструкцию биспецифического антитела EGFR/CD3. В некоторых вариантах осуществления конструкция антитела, представляющая собой биспецифический активатор Т-клеток (BiTE®), активирует Т-клетки. В некоторых вариантах осуществления конструкция антитела, представляющая собой биспецифический активатор Т-клеток (BiTE®), активирует Т-клетки, которые высвобождают цитокины, индуцирующие активацию внутриклеточной молекулы адгезии 1 (ICAM-1) и FAS на клетках-свидетелях. В некоторых вариантах осуществления конструкция антитела, представляющая собой биспецифический активатор Т-клеток (BiTE®), активирует Т-клетки, которые вызывают индуцированный лизис клеток-свидетелей. В некоторых вариантах осуществления клетки-свидетели находятся в солидных опухолях. В некоторых вариантах осуществления лизируемые клетки-свидетели находятся вблизи BiTE®-активируемых Т-клеток. В некоторых вариантах осуществления клетки-свидетели включают злокачественные клетки, негативные по опухолеассоциированному антигену (ТАА). В некоторых вариантах осуществления клетки-свидетели включают EGFR-негативные злокачественные клетки. В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии представляет собой антитело, которое блокирует систему PD-L1/PD1 и/или CTLA4. В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии представляет собой подвергнутую экспансии ex vivo инфильтрирующую опухоль Т-клетку. В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии представляет собой конструкцию биспецифического антитела или химерные рецепторы антигенов (CAR), которые прямо связывают Т-клетки с опухолеассоциированными поверхностными антигенами (ТАА).
Иллюстративные ингибиторы иммунной точки контроля.
В некоторых вариантах осуществления средство иммуноонкологии представляет собой ингибитор иммунной точки контроля, как описано в настоящем описании.
Термин ингибитор точки контроля, как используют в рамках изобретения, относится к средствам, пригодным для предупреждения ускользания злокачественными клетками иммунной системы пациента. Один из основных механизмов нарушения противоопухолевого иммунитета известен как истощение Тклеток, которое является результатом длительного воздействия антигенов, вызывающего активацию ингибиторных рецепторов. Эти ингибиторные рецепторы служат в качестве иммунных точек контроля для предупреждения неконтролируемых иммунных реакций.
PD-1 и коингибиторные рецепторы, такие как антиген 4 цитотоксических Т-лимфоцитов (CTLA-4, В- и Т-лимфоцитарный аттенуатор (BTLA; CD272), домен 3 Т-клеточного иммуноглобулина и муцина 3 (Tim-3), белок гена 3 активации лимфоцитов (Lag-3; CD223) и другие, часто указывают в качестве регуляторов точки контроля. Они выступают в качестве молекулярных стражей, которые позволяют внеклеточной информации определять, должно ли происходить прогрессирование клеточного цикла и других внутриклеточные сигнальные процессы.
В некоторых вариантах осуществления ингибитор иммунной точки контроля представляет собой антитело к PD-1. PD-1 связывается с рецептором белка запрограммированной клеточной смерти 1 (PD-1) для предотвращения связывания рецептора с ингибиторным лигандом PDL-1, таким образом, преодолевая способность опухолей подавлять противоопухолевый иммунный ответ хозяина.
В одном аспекте ингибитор точки контроля представляет собой биологическое терапевтическое средство или низкомолекулярное соединение. В другом аспекте ингибитор точки контроля представляет собой моноклональное антитело, гуманизированное антитело, полностью человеческое антитело, слитый белок или их комбинацию. В следующем аспекте ингибитор точки контроля ингибирует белок точки контроля, выбранный из CTLA-4, PDL1, PDL2, PD1, В7-Н3, В7-Н4, BTLA, HVEM, TIM3, GAL9, LAG3, VISTA, KIR, 2B4, CD160, CGEN-15049, CHK1, CHK2, A2aR, лигандов семейства В-7 или их комбинации. В дополнительном аспекте ингибитор точки контроля взаимодействует с лигандом белка точки контроля, выбранным из CTLA-4, PDL1, PDL2, PD1, В7-НЗ, В7-Н4, BTLA, HVEM, TIM3, GAL9, LAG3, VISTA, KIR, 2B4, CD160, CGEN-15049, CHK1, CHK2, A2aR, лигандов семейства В-7 или их комбинации. В одном аспекте ингибитор точки контроля представляет собой иммуностимулирующее средство, Т-клеточный фактор роста, интерлейкин, антитело, вакцину или их комбинацию. В следующем аспекте интерлейкин представляет собой IL-7 или IL-15. В конкретном аспекте интерлейкин является гликозилированным IL-7. В дополнительном аспекте вакцина представляет собой вакцину на основе дендритных клеток (DC).
Ингибиторы точки контроля включают любое средство, которое блокирует или ингибирует статистически значимым образом ингибиторные каскады иммунной системы. Такие ингибиторы могут вклю
- 56 045862 чать низкомолекулярные ингибиторы или могут включать антитела или их антигенсвязывающие фрагменты, которые связывают и блокируют или ингибируют рецепторы иммунной точки контроля, или антитела, которые связывают и блокируют или ингибируют лиганды рецепторов иммунной точки контроля. Иллюстративные молекулы точки контроля, на которые можно проводить нацеливание для блокирования или ингибирования, включают, но не ограничиваются ими, CTLA-4, PDL1, PDL2, PD1, В7-Н3, В7Н4, BTLA, HVEM, GAL9, LAG3, TIM3, VISTA, KIR, 2B4 (принадлежит семейству молекул CD2 и экспрессируется на всех NK, γδ, и CD8+(ae) T-клетках памяти), CD160 (также обозначаемый как BY55), CGEN-15049, киназы CHK1 и CHK2, A2aR и различные лиганды семейства В-7. Лиганды семейства В7 включают, но не ограничиваются ими, В7-1, В7-2, B7-DC, В7-Н1, В7-Н2, В7-Н3, В7-Н4, В7-Н5, В7-Н6 и В7-Н7. Ингибиторы точки контроля включают антитела или их антигенсвязывающие фрагменты, другие связывающие белки, биологические терапевтические средства или низкомолекулярные соединения, которые связывают и блокируют или ингибируют активность одного или нескольких из CTLA-4, PDL1, PDL2, PD1, BTLA, HVEM, TIM3, GAL9, LAG3, VISTA, KIR, 2B4, CD 160 и CGEN-15049. Иллюстративные ингибиторы иммунной точки контроля включают Тремелимумаб (блокирующее CTLA-4 антитело), моноклональное антитело против ОХ40, PD-L1 (антитело против В7-Н1; MEDI4736), MK-3475 (блокатор PD-1), Ниволумаб (антитело против PD1), СТ-011 (антитело против PD1), моноклональные антитело против BY55, АМР224 (антитело против PDL1), BMS-936559 (антитело против PDL1), MPLDL3280A (антитело против PDL1), MSB0010718C (антитело против PDL1) и ипилимумаб (ингибитор точки контроля против CTLA-4). Лиганды белков точки контроля включают, но не ограничиваются ими PD-L1, PD-L2, В7-Н3, В7-Н4, CD28, CD86 и TIM-3.
В определенных вариантах осуществления ингибитор иммунной точки контроля выбран из антагониста PD-1, антагониста PD-L1 и антагониста CTLA-4. В некоторых вариантах осуществления ингибитор точки контроля выбран из группы, состоящей из ниволумаба (Opdivo®), ипилимумаба (Yervoy®) и пембролизумаба (Keytruda®). В некоторых вариантах осуществления ингибитор точки контроля выбран из: ниволумаба (антитела против PD-1, Opdivo®, Bristol-Myers Squibb); пембролизумаба (антитело против PD-1, Keytruda®, Merck); ипилимумаба (антитело против CTLA-4, Yervoy®, Bristol-Myers Squibb); дурвалумаба (антитело против PD-L1, Imfinzi®, AstraZeneca) и атезолизумаба (антитело против PD-L1, Tecentriq®, Genentech).
В некоторых вариантах осуществления ингибитор точки контроля выбран из группы, состоящей из ламбролизумаба (MK-3475), ниволумаба (BMS-936558), пидилизумаба (СТ-011), АМР-224, MDX-1105, MEDI4736, MPDL3280A, BMS-936559, ипилимумаба, лирлумаба, IPH2101, пембролизумаба (Keytruda®) и тремелимумаба.
В некоторых вариантах осуществления ингибитор иммунной точки контроля представляет собой: REGN2810 (Regeneron), антитело против PD-1, протестированное у пациентов с базально-клеточной карциномой (NCT03132636); NSCLC (NCT03088540); кожной плоскоклеточной карциномой (NCT02760498); лимфомой (NCT02651662); и меланомой (NCT03002376); пидилизумаб (CureTech), также известный как СТ-011, антитело, которое связывается с PD-1, проходящее клинические испытания против диффузной крупноклеточной В-клеточной лимфомой и множественной миеломой; авелумаб (Bavencio®, Pfizer/Merck KGaA), также известный как MSB0010718C), полностью человеческое IgG1антитело против PD-L1, проходящее клинические испытания при немелкоклеточном раке легкого, карциноме из клеток Меркеля, мезотелиоме, солидных опухолях, раке почки, раке яичника, рака мочевого пузыря, раке головы и шеи и раке желудка; или PDR001 (Novartis), ингибиторное антитело, которое связывается с PD-1, проходящее клинические испытания при немелкоклеточном раке легкого, меланоме, тройном негативном раке молочной железы и развернутых или метастазирующих солидных опухолях. Тремелимумаб (СР-675,206; Astrazeneca) представляет собой полностью человеческое моноклональное антитело против CTLA-4, которое исследовано в клинических испытаниях при ряде показаний, включая: мезотелиому, рак ободочной и прямой кишки, рак почки, рак молочной железы, рак легкого и немелкоклеточный рак легкого, аденокарциному протоков поджелудочной железы, рак поджелудочной железы, герминогенный рак, плоскоклеточный рак головы и шеи, печеночно-клеточную карциному, рак предстательной железы, рак эндометрия, метастазирующий рак в печени, рак печени, крупноклеточную Вклеточную лимфому, рак яичника, рак шейки матки, метастазирующий анапластический рак щитовидной железы, рак уротелия, рак фаллопиевой трубы, множественную миелому, рак мочевого пузыря, саркому мягких тканей и меланому. AGEN-1884 (Agenus) представляет собой антитело против CTLA4, которое находится в фазе 1 клинических испытаний для развернутых солидных опухолей (NCT02694822).
В некоторых вариантах осуществления ингибитор точки контроля представляет собой ингибитор белка 3, содержащего домен Т-клеточного иммуноглобулина и муцина (TIM-3). Ингибиторы TIM-3, которые можно использовать в рамках настоящего изобретения, включают TSR-022, LY3321367 и MBG453. TSR-022 (Tesaro) представляет собой антитело против TIM-3, которое проходит испытания при солидных опухолях (NCT02817633). LY3321367 (Eli Lilly) представляет собой антитело против TIM-3, которое проходит испытания при солидных опухолях (NCT03099109). MBG453 (Novartis) представляет собой антитело против TIM-3, которое проходит испытания при развернутых злокачественных опухолях
- 57 045862 (NCT02608268).
В некоторых вариантах осуществления ингибитор точки контроля представляет собой ингибитор Тклеточного иммунорецептора с доменами Ig и ITIM, или TIGIT, иммунного рецептора на определенных Т-клетках и NK-клетках. Ингибиторы TIGIT, которые можно использовать в рамках настоящего изобретения, включают BMS-986207 (Bristol-Myers Squibb), моноклональное антитело против TIGIT (NCT02913313); ОМР-313М32 (Oncomed); и моноклональное антитело против TIGIT (NCT03119428).
В некоторых вариантах осуществления ингибитор точки контроля представляет собой ингибитор белка гена 3 активации лимфоцитов (LAG-3). Ингибиторы LAG-3, которые можно использовать в рамках настоящего изобретения, включают BMS-986016 и REGN3767 и IMP321. BMS-986016 (Bristol-Myers Squibb), антитело против LAG-3, проходит испытания при глиобластоме и глиосаркоме (NCT02658981). REGN3767 (Regeneron) также представляет собой антитело против LAG-3 и проходит испытания при злокачественных опухолях (NCT03005782). IMP321 (Immutep S.A.) представляет собой слитый белок LAG-3-Ig, который проходит испытания при: меланоме (NCT02676869); аденокарциноме (NCT02614833); и метастазирующем раке молочной железы (NCT00349934).
Ингибиторы точки контроля, которые можно использовать в рамках настоящего изобретения, включают агонисты ОХ40. Агонисты ОХ40, которые исследуются в клинических испытаниях, включают: PF-04518600/PF-8600 (Pfizer), антитело-агонист ОХ40, при метастазирующем раке почки (NCT03092856) и развернутых злокачественных опухолях и новообразованиях (NCT02554812; NCT05082566); GSK3174998 (Merck), антитело-агонист ОХ40, находящееся в фазе 1 клинических испытаний (NCT02528357); MEDI0562 (Medimmune/AstraZeneca), антитело-агонист ОХ40, при развернутых солидных опухолях (NCT02318394 и NCT02705482); MEDI6469, антитело-агонист ОХ40 (Medimmune/AstraZeneca), у пациентов с раком ободочной и прямой кишки (NCT02559024), раком молочной железы (NCT01862900), раком головы и шеи (NCT02274155) и метастазирующим раком предстательной железы (NCT01303705); и BMS-986178 (Bristol-Myers Squibb) антитело-агонист ОХ40, при развернутых злокачественных опухолях (NCT02737475).
Ингибиторы точки контроля, которые можно использовать в рамках настоящего изобретения, включают агонисты CD137 (также называемый 4-1ВВ). Агонисты CD137, которые исследуются в клинических испытаниях, включают: утомилумаб (PF-05082566, Pfizer) антитело-агонист CD137, при диффузной крупноклеточной В-клеточной лимфоме (NCT02951156) и при развернутых злокачественных опухолях и новообразованиях (NCT02554812 и NCT05082566); урелумаб (BMS-663513, Bristol-Myers Squibb), антитело-агонист CD137, при меланоме и раке кожи (NCT02652455) и глиобластоме и глиосаркоме (NCT02658981).
Ингибиторы точки контроля, которые можно использовать в рамках настоящего изобретения, включают агонисты CD27. Агонисты CD27, которые проходят исследования в клинических испытаниях, включают: варлилумаб (CDX-1127, Celldex Therapeutics), антитело-агонист CD27, при плоскоклеточном раке головы и шеи, карциноме яичника, раке ободочной и прямой кишки, почечно-клеточном раке и глиобластоме (NCT02335918); лимфомах (NCT01460134); и глиоме и астроцитоме (NCT02924038).
Ингибиторы точки контроля, которые можно использовать в рамках настоящего изобретения, включают агонисты глюкокортикоид-индуцируемых рецепторов фактора некроза опухоли (GITR). Агонисты GITR, которые проходят исследования в клинических испытаниях, включают: TRX518 (Leap Therapeutics), антитело-агонист GITR, при злокачественной меланоме и других злокачественных солидных опухолях (NCT01239134 и NCT02628574); GWN323 (Novartis), антитело-агонист GITR, при солидных опухолях и лимфоме (NCT02740270); INCAGN01876 (Incyte/Agenus), антитело-агонист GITR, при развернутых злокачественных опухолях (NCT02697591 и NCT03126110); MK-4166 (Merck), антителоагонист GITR, при солидных опухолях (NCT02132754) и MEDI1873 (Medimmune/AstraZeneca), гексамерную молекулу-агонист GITR-лиганда с Fc-доменом IgG1 человека, при развернутых солидных опухолях (NCT02583165).
Ингибиторы точки контроля, которые можно использовать в рамках настоящего изобретения, включают агонисты индуцируемого костимулятора Т-клеток (ICOS, также известный как CD278). Агонисты ICOS, которые проходят исследования в клинических испытаниях, включают: MEDI-570 (Medimmune), антитело-агонист ICOS, при лимфомах (NCT02520791); GSK3359609 (Merck), антитело-агонист ICOS, в фазе 1 (NCT02723955); и JTX-2011 (Jounce Therapeutics), антитело-агонист ICOS, в фазе 1 (NCT02904226).
Ингибиторы точки контроля, которые можно использовать в рамках настоящего изобретения, включают ингибиторы IgG-подобных рецепторов киллерных клеток (KIR). Ингибиторы KIR, которые проходят исследования в клинических испытаниях, включают: лирилумаб (IPH2102/BMS-986015, Innate Pharma/Bristol-Myers Squibb), антитело против KIR, при лейкозах (NCT01687387, NCT02399917, NCT02481297, NCT02599649), множественной миеломе (NCT02252263) и лимфоме (NCT01592370); IPH2101 (1-7F9, Innate Pharma) при миеломе (NCT01222286 и NCT01217203); и IPH4102 (Innate Pharma), антитело против KIR, которое связывается с тремя доменами длинной цитоплазматической хвостовой части (KIR3DL2), при лимфоме (NCT02593045).
Ингибиторы точки контроля, которые можно использовать в рамках настоящего изобретения,
- 58 045862 включают ингибиторы CD47, которые ингибируют взаимодействие между CD47 и регулирующим сигнал белком альфа (SIRPa). Ингибиторы CD47/SIRPa, которые проходят исследования в клинических испытаниях, включают: ALX-148 (Alexo Therapeutics), вариант-антагонист (SIRPa), который связывается с CD47 и препятствует опосредуемой CD47/SIRPa передаче сигнала, в фазе 1 (NCT03013218); TTI-621 (SIRPa-Fc, Trillium Therapeutics), растворимый рекомбинантный слитый белок, полученный путем сшивания N-концевого CD47-связывающего домена SIRPa с Fc-доменом IgG1 человека, действующий посредством связывания CD47 человека, и препятствующий доставке его сигнала не поглощать макрофагам, в клинических испытаниях фазы 1 (NCT02890368 и NCT02663518); СС-90002 (Celgene), антитело против CD47, при лейкозах (NCT02641002); и Hu5F9-G4 (Forty Seven, Inc.), при новообразования ободочной и прямой кишки и при солидных опухолях (NCT02953782), остром миелоидном лейкозе (NCT02678338) и лимфоме (NCT02953509).
Ингибиторы точки контроля, которые можно использовать в рамках настоящего изобретения, включают ингибиторы CD73. Ингибиторы CD73, которые проходят исследования в клинических испытаниях, включают: MEDI9447 (Medimmune), антитело против CD73, при солидных опухолях (NCT02503774); и BMS-986179 (Bristol-Myers Squibb), антитело против CD73, при солидных опухолях (NCT02754141).
Ингибиторы точки контроля, которые можно использовать в рамках настоящего изобретения, включают агонисты белка-стимулятора генов интерферонов (STING, также известный как трансмембранный блок 173, или ТМЕМ173). Агонисты STING, которые проходят исследования в клинических испытаниях, включают: MK-1454 (Merck), синтетический циклический динуклеотид, являющийся агонистом, при лимфоме (NCT03010176); и ADU-S100 (MIW815, Aduro Biotech/Novartis), синтетический циклический динуклеотид, являющийся агонистом, в фазе 1 (NCT02675439 и NCT03172936).
Ингибиторы точки контроля, которые можно использовать в рамках настоящего изобретения, включают ингибиторы CSF1R. Ингибиторы CSF1R, которые проходят исследования в клинических испытаниях, включают: пексдартиниб (PLX3397, Plexxikon), низкомолекулярный ингибитор CSF1R, при раке ободочной и прямой кишки, раке поджелудочной железы, метастазирующих и развернутых злокачественных опухолях (NCT02777710) и меланоме, немелкоклеточном раке легкого, плоскоклеточном раке головы и шеи, желудочно-кишечной стромальной опухоли (GIST) и раке яичника (NCT02452424); и IMC-CS4 (LY3022855, Lilly), антитело против CSF-1R, при раке поджелудочной железы (NCT03153410), меланоме (NCT03101254) и солидных опухолях (NCT02718911); и BLZ945 (метиламид 4-[2((1R,2R)-2гидроксициклогексиламино)бензотиазол-6-илокси]пиридин-2-карбоновой кислоты, Novartis), перорально доступный ингибитор CSF1R, при развернутых солидных опухолях (NCT02829723).
Ингибиторы точки контроля, которые можно использовать в рамках настоящего изобретения, включают ингибиторы рецептора NKG2A. Ингибиторы рецептора NKG2A, которые проходят исследования в клинических испытаниях, включают монализумаб (IPH2201, Innate Pharma), антитело против NKG2A, при новообразованиях головы и шеи (NCT02643550) и хроническом лимфоцитарном лейкозе (NCT02557516).
В некоторых вариантах осуществления ингибитор иммунной точки контроля выбран из ниволумаба, пембролизумаба, ипилимумаба, авелумаба, дурвалумаба, атезолизумаба или пидилизумаба.
Терапевтические применения.
Бициклическме пептиды по изобретению особенно применимы в качестве связывающих нектин-4 соединений.
Нектин-4 представляет собой молекулу поверхности, которая принадлежит семейству белков нектинов, которое включает 4 представителя. Нектины представляют собой молекулы клеточной адгезии, которые играют ключевую роль в различных биологических процессах, таких как полярность, пролиферация, дифференцировка и миграция, для эпителиальных, эндотелиальных, иммунных и нейрональных клеток, в ходе развития и взрослой жизни. Они вовлечены в несколько патологических процессов у человека. Они являются основными рецепторами для полиовируса, вируса простого герпеса и вируса кори. Мутации в генах, кодирующих нектин-1 (PVRL1) или нектин-4 (PVRL4), вызывают синдромы эктодермальной дисплазии, ассоциированные с другими аномалиями. Нектин-4 экспрессируется в ходе эмбрионального развития. Во взрослых тканях его экспрессия более ограничена, чем экспрессия других представителей семейства. Нектин-4 представляет собой ассоциированный с опухолью антиген в 50%, 49% и 86% карцином молочной железы, яичника и легкого, соответственно, в основном на опухолях с плохим прогнозом. Его экспрессия не обнаруживается в соответствующих нормальных тканях. При опухолях молочной железы нектин-4 экспрессируется в основном в тройных негативных и ERBB2+ карциномах. В сыворотке пациентов с этими злокачественными опухолями детекция растворимых форм нектина-4 ассоциирована с плохим прогнозом. Уровни сывороточного нектина-4 возрастают в ходе метастатического прогрессирования и снижаются после лечения. Эти результаты указывают на то, что нектин-4 может быть надежной мишенью для лечения злокачественной опухоли. Таким образом, на уровне техники описано несколько антител против нектина-4. В частности, Энфортумаб ведотин (ASG-22ME) представляет собой конъюгат антитело-лекарственное средство (ADC), нацеленный на нектин-4 и в настоящее время он проходит клинические испытания для лечения пациентов, страдающих от солидных опухолей.
- 59 045862
Полипептидные лиганды, выбранные в соответствии со способом по настоящему изобретению, можно использовать в терапевтических и профилактических применениях in vivo, диагностических применениях in vitro и in vivo, применениях для анализов и реагентов in vitro, и т.п. Лиганды, имеющие определенные уровни специфичности, являются пригодными в применениях, которые вовлекают тестирование на не являющихся человеком животных, где является желательной перекрестная реактивность, или в диагностических применениях, где перекрестную реактивность в отношении гомологов или паралогов необходимо тщательно контролировать. В некоторых применениях, таких как применения в вакцинах, способность индуцировать иммунный ответ на заданные диапазоны антигенов можно использовать для адаптации вакцины к определенным заболеваниям и патогенам.
По существу чистые пептидные лиганды с гомогенностью по меньшей мере 90-95% являются предпочтительными для введения млекопитающему, и наиболее предпочтительной для фармацевтических применений является гомогенность 98-99% или более, особенно когда млекопитающим является человек. После очистки частично или до гомогенности при желании выбранные полипептиды можно использовать в диагностических или терапевтических целях (в том числе экстракорпорально) или для разработки и проведения процедур анализа, иммунофлуоресцентного окрашивания и т.п. (Lefkovite and Pernis, (1979 and 1981) Immunological Methods, Volumes I and II, Academic Press, NY).
В соответствии со следующим аспектом изобретения предусматривается пептидный лиганд или конъюгат лекарственного средства, как определено в настоящем описании, для применения для предупреждения, подавления или лечения заболевания или нарушения, опосредуемого нектином-4.
В соответствии со следующим аспектом изобретения предусматривается способ предупреждения, подавления или лечения заболевания или нарушения, опосредуемого нектином-4, который включает введение пациенту, нуждающемуся в этом, конъюгата эффекторной группы и лекарственного средства пептидного лиганда, как определено в настоящем описании.
В одном варианте осуществления нектин-4 представляет собой нектин-4 млекопитающего. В следующем варианте осуществления нектин-4 млекопитающего представляет собой нектин-4 человека.
В одном варианте осуществления заболевание или нарушение, опосредуемое нектином-4, выбрано из вирусных инфекций, синдромов эктодермальной дисплазии и других аномалий, карциномы молочной железы, яичника и легкого, прогрессирования метастазов и солидных опухолей.
В следующем варианте осуществления заболевание или нарушение, опосредуемое нектином-4, выбрано из злокачественной опухоли.
Примеры злокачественных опухолей (и их доброкачественных аналогов), которые можно лечить (или ингибировать), включают, но не ограничиваются ими, опухоли эпителиального происхождения (аденомы и карциномы различных типов, включая аденокарциномы, плоскоклеточные карциномы, переходно-клеточные карциномы и другие карциномы), такие как карциномы мочевого пузыря и мочевыводящих путей, молочной железы, желудочно-кишечного тракта (включая пищевод, желудок (гастральная), тонкий кишечник, толстый кишечник, прямую кишку и анус), печени (печеночно-клеточная карцинома), желчного пузыря и желчевыводящей системы, экзокринные карциномы поджелудочной железы, почки, легкого (например, аденокарциномы, мелкоклеточные карциномы легкого, немелкоклеточные карциномы легких, бронхоальвеолярные карциномы и мезотелиомы), головы и шеи (например, злокачественные опухоли языка, ротовой полости, гортани, глотки, носоглотки, миндалевидных желез, слюнных желез, носовой полости и околоносовых пазух), яичника, фаллопиевых труб, брюшины, вагины, вульвы, полового члена, шейки матки, миометрия, эндометрия, щитовидной железы (например, фолликулярная карцинома щитовидной железы), надпочечников, предстательной железы, кожи и смежных органов (например, меланома, базально-клеточная карцинома, плоскоклеточная карцинома, кератоакантома, дисплатический невус); гематологические злокачественные опухоли (т.е. лейкозы, лимфомы) и предзлокачественные гематологические нарушения и нарушения пограничной злокачественности, включая гематологические злокачественные опухоли и родственные состояния лимфоидного происхождения (например, острый лимфоцитарный лейкоз [ALL], хронический лимфоцитарный лейкоз [CLL], В-клеточные лимфомы, такие как диффузная крупноклеточная В-клеточная лимфома [DLBCL], фолликулярная лимфома, лимфома Беркитта, лимфома из клеток мантийной зоны, Т-клеточные лимфомы и лейкозы, лимфомы из натуральных киллеров [NK], лимфома Ходжкина, волосатоклеточный лейкоз, моноклональная гаммапатия неуточненного значения, плазмацитома, множественная миелома и посттрансплантационные лимфопролиферативные нарушения), и гематологические злокачественные опухоли и родственные состояния миелоидного ростка (например, острый миелогенный лейкоз [AML], хронический миелогенный лейкоз [CML], хронический миеломоноцитарный лейкоз [CMML], гиперэозинофильный синдром, миелопролиферативные нарушения, такие как истинная полицитемия, эссенциальная тромбоцитемия и первичный миелофиброз, миелопролиферативный синдром, миелодиспластический синдром и промиелоцитарный лейкоз); опухоли мезенхимного происхождения, например саркомы мягких тканей, костей или хрящей, такие как остеосаркомы, фибросаркомы, хондросаркомы, рабдомиосаркомы, лейомиосаркомы, липосаркомы, ангиосаркомы, саркома Капоши, саркома Юинга, синовиальные саркомы, эпителиоидные саркомы, желудочно-кишечные стромальные опухоли, доброкачественные и злокачественные гистиоцитомы, и возвышающаяся дерматофибросаркома; опухоли центральной или периферической нервной системы
- 60 045862 (например, астроцитомы, глиомы и глиобластомы, менингиомы, эпендимомы, пиниальные опухоли и шванномы); эндокринные опухоли (например, опухоли гипофиза, опухоли надпочечников, опухоли островковых клеток, опухоли паращитовидной железы и медуллярная карцинома щитовидной железы); опухоли глаза и прилежащих тканей (например, ретинобластома); герминогенные и трофобластические опухоли (например, тератомы, семиномы, дисгерминомы, хорионаденомы и хориокарциномы); и педиатрические и эмбриональные опухоли (например, медуллобластома, нейробластома, опухоль Вильмса и примитивные нейроэктодермальные опухоли); или синдромы, врожденные или иные, которые делают пациента предрасположенными к злокачественным опухолям (например, пигментная ксеродерма).
В следующем варианте осуществления злокачественная опухоль выбрана из гемопоэтической злокачественной опухоли, например, выбранной из: неходжскинской лимфомы (NHL), лимфомы Беркитта (BL), множественной миеломы (ММ), хронического В-лимфоцитарного лейкоза (B-CLL), острого В- и Тлимфоцитарного лейкоза (ALL), T-клеточной лимфомы (TCL), острого миелоидного лейкоза (AML), волосатоклеточного лейкоза (HCL), лимфомы Ходжкина (HL) и хронического миелоидного лейкоза (CML).
В следующем варианте осуществления злокачественная опухоль выбрана из рака легкого (например, немелкоклеточный рак легкого), рак мочевого пузыря, рак поджелудочной железы и рак молочной железы. В настоящем описании в примерах 1-5 приводятся данные, которые демонстрируют, что выбранные бициклические конъюгаты лекарственного средства по изобретению демонстрировали противоопухолевую активность в этих моделях злокачественной опухоли.
Упоминание в настоящем описании термина предупреждение вовлекает введение защитной композиции до индукции заболевания. Подавление относится к введению композиции после индуцирующего события, но до клинического появления заболевания. Лечение вовлекает введение защитной композиции после проявления симптомов заболевания.
Модельные системы на животных, которые можно использовать для скрининга эффективности пептидных лигандов в отношении защиты от или лечения заболевания, являются доступными. Настоящее изобретение облегчает использование модельных систем на животных, что позволяет разработку полипептидных лигандов, которые могут перекрестно реагировать с мишенями из человека и животных, для обеспечения возможности применения моделей на животных.
Более того, в настоящем описании представлены данные, которые демонстрируют ассоциацию между варьированием количества копий (CNV) и экспрессией гена нектина-4 из множества типов опухолей. Таким образом, согласно следующему аспекту изобретения, предусматривается способ предупреждения, подавления или лечения злокачественной опухоли, который включает введение пациенту, нуждающемуся в этом, эффекторной группы и конъюгата лекарственного средства, представляющего собой пептидный лиганд, как определено в настоящем описании, где указанный пациент идентифицирован как имеющий увеличенное варьирование числа копий (CNV) нектина-4.
В одном варианте осуществления злокачественная опухоль выбрана из злокачественных опухолей, идентифицированных в настоящем описании как имеющие увеличенное CNV нектина-4. В следующем варианте осуществления злокачественная опухоль выбрана из злокачественных опухолей, идентифицированных в настоящем описании как имеющие увеличенное CNV нектина-4, а именно: рака молочной железы, матки, мочевого пузыря, аденокарциномы легкого, плоскоклеточного рака легкого, рака шейки матки, головы и шеи, поджелудочной железы, щитовидной железы, ободочной и прямой кишки, тимомы, саркомы, светлоклеточной карциномы почек (RCC), рака предстательной железы и желудка.
Изобретение дополнительно описано ниже с помощью следующих примеров.
Примеры
Сокращенные обозначения
1,2,4-TriAz: 3 -(1,2,4-триазол-1-ил)аланин
1Nal: 1-нафтилаланин
2FuAla: 2-фурилаланин
2MePhe: 2-метилфенилаланин
2Nal: 2-нафтилаланин
2Ра1: 2-пиридилаланин
3,3-DPA: 3,3-дифенилаланин
3MePhe: 3-метилфенилаланин
3Pal: 3-пиридилаланин
4,4-ВРА: 4,4-бифенилаланин
4,4-DFP: 4,4-дифторпролин
4MePhe: 4-метилфенилаланин
4Ра1: 4-пиридилаланин
4ThiAz: бета-(4-тиазолил)аланин
5FTrp: 5-фторТ-триптофан
Agb: 2-амино-4-гуанидиномасляная кислота
Aib: аминоизомасляная кислота
AzaTrp: азатриптофан
- 61 045862
Aze: азетидин
С5А: циклопентилглицин
Cha: 3-циклогексилаланин
Сра: циклопропилаланин
Суа: цистеиновая кислота
DOPA: 3,4-дигидроксифенилаланин
HArg: гомоаргинин
HGln: гомоглутамин
Hleu: гомолейцин
Hphe: гомофенилаланин
Hse(me): гомосерин(Ме)
HSer: гомосерин
НуР:гидроксипролин
Lys(Ac): лизин(ацетил)
Met(O2): метионинсульфон
Me: норлейцин
Oic: октагидроиндолкарбоновая кислота
Оха: оксазолидин-4-карбоновая кислота pCoPhe: пара-карбоксифенилаланин
PheOPhe: 4-феноксифенилаланин
Phg: фенилглицин
Pip: пипеколиновая кислота
Pro(4NH): 4-аминопролин tBuAla: трет-бутилаланин
TetraZ: тетразолаланин
Thi: тиени-аланин
ТНР(О): тетрагидропиран-4-пропионовая кислота
THP(SO2): диоксо-4-тетрагидротиопиранилуксусная кислота
Trp(Ме): метилтриптофан
Материалы и способы.
Синтез пептидов.
Синтез пептидов был основан на химии Fmoc с использованием устройства для синтеза пептидов Symphony, производимого Peptide Instruments, и устройства для синтеза Syro II от MultiSynTech. Использовали стандартные Fmoc-аминокислоты (Sigma, Merck) с подходящими защитными группами боковых цепей: когда это было применимо, в каждом случае использовали стандартные условия присоединения, за которыми следовало удаление защитных групп с использованием стандартной методологии.
Альтернативно, пептиды очищали с использованием ВЭЖХ и после выделения их модифицировали посредством 1,3,5-триакрилоилгексагидро-1,3,5-триазина (TATA, Sigma). Для этого линейный пептид разбавляли 50:50 посредством MeCN:H2O вплоть до ~35 мл, добавляли ~500 мкл 100 мМ ТАТА в ацетонитриле и реакцию начинали посредством 5 мл 1М NH4HCO3 в Н2О. Реакции позволяли протекать в течение ~30-60 мин при к.т. и лиофилизировали после завершения реакции (на основе данных MALDIMS). После завершения 1 мл к реакционной смеси добавляли 1М моногидрат гидрохлорида L-цистеина (Sigma) в Н2О на ~60 мин при к.т. для гашения любого избытка ТАТА.
После лиофилизации модифицированный пептид очищали, как описано выше, заменяя Luna C8 на колонку Gemini C18 (Phenomenex), и заменяя кислоту на 0,1% трифторуксусную кислоту. Очищенные фракции, содержавшие правильный ТАТА-модифицированный материал, объединяли, лиофилизировали и держали при -20°С для хранения.
Все аминокислоты, если нет иных указаний, использовали в L-конфигурациях.
В некоторых случаях пептиды конвертируют в активированные дисульфиды перед присоединения к свободной тиольной группе токсина с использованием следующего способа; раствор 4-метил(сукцинимидил 4-(2-пиридилтио)пентаноата) (100 мМ) в сухом DMSO (1,25 мол. экв.) добавляли к раствору пептида (20 мМ) в сухом DMSO (1 мол. экв.). Реакционную смесь хорошо перемешивали и добавляли DIPEA (20 мол. экв.). Мониторинг реакции проводили посредством LC/MS до завершения.
Получение бициклических конъюгатов пептид-лекарственное средство.
Получение BCY7826.
Условия разделения: фаза А: 0,075% TFA в Н2О, фаза В: MeCN.
Способ разделения: 18-48-55 мин, RT=53,5 мин.
Разделительная колонка: Luna200*25MM 10 мкм, С18, 110А и Gemini 50*30 мм, С18, 5 мкм, 110А, подсоединение, 50°С.
Способ растворения: DMF.
Чистота разделения: 95%
- 62 045862
Пептид синтезировали посредством твердофазного синтеза. Использовали 1,11 г амидной смолы Ринка МВНА (sub: 0,45 ммоль/г). К смеси, содержавшей амидную смолу Ринка МВНА (0,5 ммоль, 1,11 г, 0,45 ммоль/г) и Fmoc-Cys(Trt)-OH (0,87 г, 1,5 моль, 3,0 экв.), добавляли DMF (20 мл), затем добавляли DIC (3,0 экв.) и HOAt (3,0 экв.) и перемешивали в течение 1 ч. Для деблокирования использовали 20% пиперидин в DMF. Другие аминокислоты связывали с использованием 3,0 экв. активирующих реагентов, DIC (3,0 экв.) и HOAt (3,0 экв.) в DMF (20 мл). Мониторинг реакции проводили посредством цветной реакции с нингидрином или цветной реакции с тетрахлором. После завершения синтеза пептидную смолу промывали DMFx3, МеОНх3, а затем сушили при барботировании N2 в течение ночи. После этого пептидную смолу обрабатывали 92,5% TFA/2,5% TIS/2,5% EDT/2,5% H2O в течение 3 ч. Пептид преципитировали холодным изопропиловым эфиром (200 мл) и центрифугировали (3 мин при 3000 об/мин). Проводили промывание изопропиловым эфиром два дополнительных раза (200 мл). Неочищенный пептид сушили в вакууме в течение 2 ч. Использовали неочищенный пептид (т.е. после отщепления пептида и преципитации с изопропиловым эфиром, преципитат лиофилизируют для удаления остаточного изопропилового эфира и TFA), растворяли лиофилизированный порошок (0,5 ммоль) в 500 мл ACN/H2O (50:50), и добавляли 5 мл 100 мМ ТАТА. Добавляли 10 мл бикарбоната аммония в Н2О (1М) и перемешивали в течение 1 ч. После завершения циклизации реакцию необходимо было гасить 10,0 экв. цистеина относительно ТАТА. К раствору добавляли по меньшей мере 5 мл 1М цистеина, перемешивали и оставляли стоять в течение одного часа. Раствор лиофилизировали для получения неочищенного продукта. Неочищенный продукт очищали препаративной HPLC и лиофилизировали с получением продукта BCY7814 (144,1 мг, чистота 97,1%; выход 9,6%) в виде белого твердого вещества.
(Условия анализа HPLC) Устройство - Agilent 1200 HPLC-BE(1-614)
Градиент 20-50-20 +3 мин
Колонка Gemini-NX Cl 8 5 мкм 110А 150*4,6 мм
Подвижная фаза А: Н2О (0.1%TFA)
В: CH3CN
Скорость потока 1 mL/Min
Длина волны 220/254 nm
Температура сушильного шкафа 30°С
- 63 045862
BCY00007826
К раствору BCY7814 (61,80 мг, 21,29 мкмоль, 1,1 экв.) в DMA (4 мл) добавляли DIEA (7,50 мг, 58,05 мкмоль, 10.11 мкл, 3,0 экв.) и DM1-SO3H-SPDB-NHS. Смесь перемешивали при 25°С в течение 16 ч. LC-MS продемонстрировала, что DM1-SO3H-SPDB-NHS израсходовался полностью, и обнаруживался один пик с желаемым m/z. Реакционную смесь прямо очищали посредством препаративной HPLC (условия TFA). Соединение BCY7826 (0,0242 г, 6,31 мкмоль, выход 32,63%, чистота 99,7%) получали в виде белого твердого вещества.
Время удержания=13,99 мин, выявленная масса=1254,1 (М/3+1).
Получение BCY8549.
Условия разделения: фаза А: 0,075%TFA в Н2О, фаза В : MeCN.
Способ разделения: 18-48-55 мин, RT=53,5 мин.
Разделительная колонка: Luna20()*25\i\i 10 мкм, С18, 110А и Gemin150*30 мм, С18, 5 мкм, 110А, подсоединение, 50°С.
Способ растворения: DMF.
Чистота разделения: 95% BCY8234 синтезировали посредством твердофазного синтеза.
- 64 045862
BCY00008549
- 65 045862
Получение соединения 2.
Пептид синтезировали с использованием стандартной химии Fmoc.
1) Добавить DCM в емкость, содержащую смолу СТС (5 ммоль, 4,3 г, 1,17 ммоль/г) и Fmoc-Cit-OH (2,0 г, 5 ммоль, 1,0 экв.) при барботировании N2.
2) Капельно добавить DIEA (4,0 экв.) и перемешать в течение 2 ч.
3) Добавить МеОН (5 мл) и перемешать в течение 30 мин.
4) Слить и промыть DMF 5 раз.
5) Добавить 20% пиперидин/DMF и позволять протекать реакции в течение 30 мин.
6) Слить и промыть DMF 5 раз.
7) Добавить раствор Fmoc-аминокислоты и перемешать в течение 30 с, затем добавить буфер для активации при барботировании N2 в течение приблизительно 1 ч.
8) Повторить указанные выше стадии 4-7 для присоединения последующих аминокислот.
Примечание
# Материалы Реагенты для присоединения
1 Fmoc-Cit-OH (1,0 экв.) DIEA (4,0 экв.)
2 1-этоксикарбонилциклобутанкарбоновая кислота (3,0 экв.) HATU (2,85 экв.) и DIEA (6,0 экв.)
20% пиперидин в DMF использовали для удаления защитной группы Fmoc в течение 30 мин. Мониторинг реакции присоединения проводили посредством теста с нингидрином, и смолу промывали DMF 5 раз.
Расщепление и очистка пептидов.
1) Добавить буфер для расщепления (20%TFIP/80%DCM) в колбу, содержащую пептид с защищенной боковой цепью, при комнатной температуре и перемешивать в течение 1 ч два раза.
2) Профильтровать и собрать фильтрат.
3) Концентрировать для удаления растворителя.
4) Неочищенный пептид лиофилизировать с получением конечного продукта (1,4 г, выход 85,0%).
Получение соединения 3.
К раствору соединения 2 (1,65 г, 5,01 ммоль, 1,0 экв.) в DCM (30 мл) и МеОН (15 мл) добавляли EEDQ (2,48 г, 10,02 ммоль, 2,0 экв.) и (4-аминофенил)метанол (740,37 мг, 6,01 ммоль, 1,2 экв.). Смесь перемешивали при 15°С в течение 16 ч. LC-MS продемонстрировала, что соединение 2 израсходовалось полностью, и обнаруживался только один основной пик с желаемой величиной m/z. TLC показала, что соединение 2 израсходовалась полностью и образовывалось множество новых пятен. Реакционную смесь концентрировали при пониженном давлении для удаления растворителя с получением остатка. Остаток очищали флэш-хроматографией на силикагеле (ISCO®; 80 SepaFlash® Silica Flash Column, элюент: градиент 0-15 DCM/MeOH при 60 мл/мин). Соединение 3 (1,3 г, 2,99 ммоль, выход 59,72%) получали в виде желтого твердого вещества.
Получение соединения 4.
К раствору соединения 3 (1,3 г, 2,99 ммоль, 1,0 экв.) в DMF (10 мл) добавляли DIEA (2,32 г, 17,95 ммоль, 3,13 мл, 6,0 экв.) и бис(4-нитрофенил)карбонат (3,64 г, 11,97 ммоль, 4,0 экв.). Смесь перемешивали при 15°С в течение 1 ч. LC-MS продемонстрировала, что соединение 3 израсходовалось полностью, и обнаруживался только один основной пик с желаемой величиной m/z. Остаток очищали препаративной ВЭЖХ (нейтральные условия). Соединение 4 (1,0 г, 1,67 ммоль, выход 55,74%) получали в виде желтого твердого вещества.
Получение соединения 5.
К раствору соединения 5 (250,53 мг, 417,84 мколь, 1,5 экв.) в DMF (5 мл) добавляли HOBt (56,46 мг, 417,84 мколь, 1,5 экв.) и DIEA (108,01 мг, 835,68 мколь, 145,56 мкл, 3,0 экв.), ММАЕ (0,200 г, 278,56 мкмоль, 1,0 экв.). Смесь перемешивали при 35°С в течение 12 ч. LC-MS продемонстрировала, что ММАЕ израсходовалось полностью, и обнаруживался только один основной пик с желаемой величиной m/z. Реакционную смесь прямо очищали препаратвной ВЭЖХ (нейтральные условия). Соединение 5 (0,180 г, 152,74 мкмоль, выход 54,83%) получали в виде желтого твердого вещества.
Получение соединения 6.
К раствору соединения 5 (0,170 г, 144,26 мкмоль, 1,0 экв.) в THF (5 мл) и Н2О (5 мл) добавляли LiOH.H2O (12,11 мг, 288,51 мкмоль, 2,0 экв.). Смесь перемешивали при 15°С в течение 1 ч. LC-MS продемонстрировала, что соединение 5 израсходовалось полностью, и обнаруживался только один основной пик с желаемой величиной m/z. Доводили до рН=7 посредством АсОН и THF удаляли при пониженном давлении с получением остатка. Остаток очищали препаративной ВЭЖХ (нейтральные условия). Соединение 6 (0,185 г, неочищенный материал) получали в виде желтого твердого вещества.
Получение BCY8549.
К раствору соединения 6 (0,100 г, 86,93 мкмоль, 1,0 экв.) в DMA (4 мл) добавляли HOSu (10,00 мг, 86,93 мкмоль, 1,0 экв.) и EDCI (16,66 мг, 86,93 мкмоль, 1,0 экв.). После образования сложного эфира
- 66 045862
NHS добавляли e-Ala-BCY8234 (525,98 мг, 173,85 мкмоль, 2,0 экв.) и DIEA (33,70 мг, 260,78 мкмоль, 45,42 мкл, 3,0 экв.). Смесь перемешивали при 15°С в течение 4 ч. LC-MS продемонстрировала, что соединение 6 израсходовалось полностью, и обнаруживался только один основной пик с желаемой величиной m/z. Реакционную смесь прямо очищали посредством препаративной ВЭЖХ (условия TFA). Соединение BCY8549 (0,0528 г, 12,15 мкмоль, выход 13,98%, чистота 95,70%) получали в виде белого твердого вещества. Время удержания=11,48 мин. Обнаруженная масса=1386,4 (М/3+Н).
Получение BCY8245.
Условия разделения: фаза А: 0,075%TFA в Н2О, фаза В: MeCN.
Способ разделения: 18-48-55 мин, RT=53,5 мин.
Разделительная колонкаХипа 200*25мм 10 мкм, С18, 110А и Gemin150*30 мм, С18, 5 мкм, 110А, подсоединение, 50°С.
Способ растворения: DMF.
Чистота разделения: 95%.
BCY8234 синтезировали посредством твердофазного синтеза.
Схема реакции BCY8245 представлена ниже:
- 67 045862
HUBt DIL-A
DI LA DMA
Получение соединения 3.
Соединение 3 синтезировали способом твердофазного синтеза.
Получение соединения 4.
К раствору соединения 3 (1,3 г, 3,23 ммоль, 1,0 экв.) в DCM (10 мл) и МеОН (5 мл) добавляли EEDQ (1,60 г, 6,46 ммоль, 2,0 экв.) и (4-аминофенил)метанол (517,16 мг, 4,20 ммоль, 1,3 экв.). Смесь перемешивали при 20°С в течение 16 ч. LC-MS продемонстрировала, что соединение 3 израсходовалось полностью, и обнаруживался только один основной пик с желаемой величиной m/z. Растворитель удаля
- 68 045862 ли при пониженном давлении. Остаток очищали флэш-хроматографией на силикагеле (ISCO®; 40 г SepaFlash® Silica Flash Column, элюент: градиент 0~15 DCM/MeOH при 40 мл/мин). Соединение 4 (0,950 г, 1,87 ммоль, выход 57,94%) получали в виде желтого твердого вещества.
Получение соединения 5.
К раствору соединения 4 (0,950 г, 1,87 ммоль, 1,0 экв.) в DMF (5 мл) добавляли DIEA (1,21 г, 9,36 ммоль, 1,63 мл, 5,0 экв.) и бис(4-нитрофенил)карбонат (2,28 г, 7,49 ммоль, 4,0 экв.). Смесь перемешивали при 20°С в течение 1 ч. LC-MS продемонстрировала, что соединение 4 израсходовалось полностью, и обнаруживался только один основной пик с желаемой величиной m/z. Реакционную смесь прямо очищали посредством препаративной ВЭЖХ (нейтральные условия). Соединение 5 (0,400 г, 594,64 мкмоль, выход 31,77%) получали в виде белого твердого вещества.
Получение соединения 6.
К раствору соединения 5 (0,200 г, 297,32 мкмоль, 1,0 экв.) в DMF (5 мл) добавляли HOBt (52,23 мг, 386,51 мкмоль, 1,3 экв.) и DIEA (115,28 мг, 891,95 мкмоль, 155,36 мкл, 3,0 экв.), ММАЕ (192,12 мг, 267,59 мкмоль, 0,9 экв.). Смесь перемешивали при 20°С в течение 16 ч. LC-MS продемонстрировала, что соединение 5 израсходовалось полностью, и обнаруживался только один основной пик с желаемой величиной m/z. Реакционную смесь прямо очищали посредством препаративной ВЭЖХ (нейтральные условия). Соединение 6 (0,160 г, 127,84 мкмоль, выход 43,00%) получали в виде белого твердого вещества.
Получение соединения 7.
К раствору соединения 6 (0,160 г, 127,84 мкмоль, 1,0 экв.) в THF (3 мл) и Н2О (3 мл) добавляли LiOH.H2O (26,82 мг, 639,21 мкмоль, 5,0 экв.). Смесь перемешивали при 20°С в течение 1 ч. LC-MS продемонстрировала, что соединение 6 израсходовалось полностью, и обнаруживался только один основной пик с желаемой величиной m/z. THF удаляли при пониженном давлении и доводили до рН=7 посредством АсОН, смесь лиофилизировали. Соединение 7 (0,130 г, 105,05 мкмоль, выход 82,17%) получали в виде белого твердого вещества.
Получение соединения 8.
К раствору соединения 7 (36,27 мг, 315,15 мкмоль, 3,0 экв.) в DMA (6 мл) и DCM (2 мл) добавляли EDCI (60,41 мг, 315,15 мкмоль, 3,0 экв.). Смесь перемешивали при 15°С в течение 3 ч. LC-MS продемонстрировала, что соединение 7 израсходовалось полностью, и обнаруживался только один основной пик с желаемой величиной m/z. DCM удаляли при пониженном давлении. Реакционную смесь прямо очищали посредством препаративной ВЭЖХ (нейтральные условия). Соединение 8 (0,095 г, 71,18 мкмоль, выход 67,76%) получали в виде белого твердого вещества.
Получение BCY8245.
К раствору BCY8234 (66,41 мг, 22,48 мкмоль, 1,0 экв.) в DMA (4 мл) добавляли DIEA (8,72 мг, 67,44 мкмоль, 11,75 мкл, 3,0 экв.) и соединение 8 (0,030 г, 22,48 мкмоль, 1,0 экв.). Смесь перемешивали при 20°С в течение 16 ч. LC-MS продемонстрировала, что BCY8234 израсходовался полностью, и обнаруживался только один основной пик с желаемой величиной m/z. Реакционную смесь прямо очищали посредством препаративной ВЭЖХ (условия TFA). Соединение BCY8245 (0,0427 г, 10,16 мкмоль, выход 45,19%, чистота 99,30%) получали в виде белого твердого вещества. Время удержания=11,7 мин. Найденная масса=1043,9 (М/4+Н).
Следующие бициклические конъюгаты лекарственных средств получали аналогично BCY8245:
BCY № Масштаб (количест во используе мого пептида) Использова иное количество ММАЕPABC-vcглутаратNHS Выхо Д (мг) Выхо д(%) Чисто та (%) LCMS
Выявленная масса (истинная масса) RT (мин)
BCY7683 60 25 20,5 28,39 99,6 1285,1=М/3+ Н (3852.58) 14,52
BCY7825 84 35 34,1 31,22 99,0 1374,9=М/3+ Н 12,18
- 69 045862
(4122.85)
BCY8253 123 50 54,1 33,17 96,9 1406,7=M/3+ H (4219.95) 10,34
BCY8254 76 34 36,4 33,70 99,4 1405,6=M/3+ H (4214.94) 10,35
BCY8255 123 50 42,5 25,94 96,4 1405,7=M/3+ H (4215.93) 10,54
BCY8550 68 30 50,1 52,28 99,2 1058,0=M/4+ H (4227.1) 12,08
BCY8783 61 30 47,1 48,18 96,8 1404,l=M/3+ H (4209.89) 12,76
BCY8784 34 20 23,1 34,74 95,7 1415,3=M/3+ H (4245.94) 13,50
Биологические данные
Анализ прямого связывания нектина-4.
Аффинность пептидов по изобретению в отношении нектина-4 человека (Ki) определяли с использованием флуоресцентного анализа поляризации в соответствии со способами, описанными в WO 2016/067035. Пептиды по изобретению с флуоресцентной меткой (либо флуоресцеин, либо SIGMA, либо Alexa Fluor488™, Fisher Scientific) разбавляли до 2,5 нМ в PBS с 0,01% tween 20 или 50 мМ HEPES с 100 мМ NaCl и 0,01% tween pH 7,4 (оба упоминаются как буфер для анализа). Это комбинировали с титрованием белка в том же буфере для анализа, что и для пептида, с получением 1 нМ пептида в общем объеме 25 мкл в 384-луночных планшетах с черными лунками и дном, низким связыванием и низким объемом, как правило, включающем 5 мкл буфера для анализа, 10 мкл белка, а затем 10 мкл флуоресцентного пептида. Использование серийные разведения один к двум для получения 12 различных концентраций с максимальными концентрациями в диапазоне от 500 нМ для известных высокаффинных связывающих соединений до 10 мкМ для низкоаффинных связывающих соединений и анализа селективности. Измерение проводили на BMG PHERAstar FS, оборудованном оптическим модулем FP 485 520 520 с возбуждением при 485 нм и регистрирующем параллельное и перпендикулярное испускание при 520 нм. PHERAstar FS был установлен на 25°С с 200 промываниями на лунку и задержкой позиционирования, составляющей 0,1 с, причем измерение в каждой лунке проводили с интервалами 5-10 мин в течение 60 мин. Коэффициент усиления, использованный для анализа, определяли для каждой метки в конце 60 мин, когда в лунке не было белка. Данные анализировали с использованием Systat Sigmaplot версии 12.0. Величины mP аппроксимировали к выбираемому произвольно квадратному уравнению для получения величины Kd:
f=ymm+(ymax-ymrn)/Lig*((x+Lig+Kd)/2-sqrt((((x+Lig+Kd)/2)A2)-(Lig*x))).
Lig представляла собой определенную величину концентрации использованной метки.
Конкурентный анализ связывания нектина-4.
Пептиды без флуоресцентной метки тестировали в конкуренции с ACPFGCHTDWSWPIWCA-Sar6K(F1) (SEQ ID NO: 217) и (Kd=5 нМ - определенная с использованием описанного выше протокола), разбавляли до соответствующей концентрации в буфере для анализа, как описано в прямом анализе связывания с максимум 5% DMSO, затем подвергали серийному разведению 1 к 2. В планшет добавляли пять мкл разбавленного пептида, затем 10 мкл нектина-4 человека, а затем добавляли 10 мкл флуоресцентного пептида. Измерения проводили, как для анализа прямого связывания, однако коэффициент усиления определяли до первого измерения. Анализ данных проводили в Systat Sigmaplot версии 12.0, где величины mP аппроксимировали к выбираемому произвольно кубическому уравнению с получением величины Ki:
f=ymm+(ymax-ymrn)/Lig*((Lig*((2*((Klig+Kcomp+Lig+Comp-Prot*c)A2-3*(Kcomp*(Lig-Prot*c)+ Klig*(Comp-Prot*c)+Klig*Kcomp))A0,5*COS(ARCCOS((-2*(Klig+Kcomp+Lig+Comp-Prot*c)A3+9* (Klig+Kcomp+Lig+Comp-Prot*c)*(Kcomp*(Lig-Prot*c)+Klig*(Comp-Prot*c)+Klig*Kcomp)-27*(-1*Klig* Kcomp *Prot* c))/(2 * ((((Klig+Kcomp+Lig+Comp-Prot* c)A2-3 *(Kcomp * (Lig-Prot*c)+Klig*(Comp-Prot* c)+
- 70 045862
Klig*Kcomp))A3)A0,5)))/3))-(Klig+Kcomp+Lig+Comp-Prot*c)))/((3*Klig)+((2*((Klig+Kcomp+Lig+CompProt*c)A2-3*(Kcomp*(Lig-Prot*c)+Klig*(Comp-Prot*c)+Klig*Kcomp))A0,5*COS(ARCCOS((-2*(Klig+ Kcomp+Lig+Comp-Prot*c)A3+9*(Klig+Kcomp+Lig+Comp-Prot*c)*(Kcomp*(Lig-Prot*c)+Klig*(CompProt*c)+Klig*Kcomp)-27*(-1*Klig*Kcomp*Prot*c))/(2*((((Klig+Kcomp+Lig+Comp-Prot*c)A2-3*(Kcomp* (Lig-Prot*c)+Klig*(Comp-Prot*c)+Klig*Kcomp))A3)A0,5)))/3))-(Klig+Kcomp+Lig+Comp-Prot*c)))).
Все из Lig, KLig и Prot представляли собой определенные величины, связанные с концентрацией флуоресцентного пептида, Kd флуоресцентного пептида и концентрацией нектина, соответственно.
Анализ связывания нектина-4 с использованием Biacore.
Эксперименты Biacore проводили для определения величин ka (M-1c-1), kd (с-1), KD (нМ) мономерных пептидов, связывающихся с белком нектином-4 человека (полученным от Charles River).
Нектин-4 человека (остатки Gly32-Ser349; NCBI RefSeq: NP_112178.2) с сигнальной последовательностью gp67 и С-концевой FLAG-меткой клонировали в pFastbac-1 и бакуловирус, полученный с использованием стандартных протоколов Bac-to-Bac™ (Life Technologies). Клетки Sf21 в количестве 1х 106 мл-1 в среде Excell-420 (Sigma) при 27°С инфицировали при MOI 2 исходным вирусом Р1 и супернатант собирали через 72 ч. Супернатант подвергали связыванию партиями в течение 1 ч при 4°С с аффинной агарозной смолой против FLAG M2 (Sigma), промывали PBS, а затем смолу переносили на колонку и тщательно промывали PBS. Белок элюировали с использованием 100 мг/мл пептида FLAG. Элюированный белок концентрировали до 2 мл и загружали в колонку S-200 Superdex (GE Healthcare) в PBS при 1 мл/мин. Фракции объемом 2 мл собирали и фракции, содержавшие белок нектин-4, концентрировали до 16 мг/мл.
Белок случайным образом биотинилировали в PBS с использованием реагента сульфо-NHS-LC-LCбиотин EZ-Link™ (Thermo Fisher) в соответствии с протоколом, предложенным изготовителем. Белок тщательно обессоливали для удаления не связанного биотина с использованием центрифужных колонок в PBS.
Для анализа связывания пептида использовали устройство Biacore 3000 с чипом СМ5 (GE Healthcare). Стрептавидин иммобилизовывали на чипе с использованием стандартной химии присоединения аминов при 25°С с HBS-N (10 мМ HEPES, 0,15М NaCl, рН 7,4) в качестве подвижного буфера. В кратком изложении поверхность из карбоксиметилдекстрана активировали посредством инжектирования в течение 7 мин соотношения 1:1 0,4М 1-этил-3-(3-диметиламинопропил)карбодиимид гидрохлорид (EDC)/0,1 M N-гидроксисукцинимид (NHS) при скорости потока 10 мкл/мин. Для улавливания стрептавидина белок разбавляли до 0,2 мг/мл в 10 мМ ацетате натрия (рН 4,5) и улавливали путем инжектирования 120 мкл стрептавидина на активированную поверхность чипа. Остаточные активированные группы блокировали инжектированием в течение 7 мин 1М этаноламина (рН 8,5) и биотинилированного нектина-4, уловленного на уровне 1200-1800 RU. Буфер заменяли на PBS/0,05% Tween 20 и серию разведений пептидов получали в этом буфере с конечной концентрацией DMSO 0,5%. Максимальная концентрация пептида составляла 100 нМ с 6 дополнительными 2-кратными разведениями. Анализ с использованием SPR проводили при 25°С при скорости потока 50 мкл/мин с ассоциацией в течение 60 с и диссоциацией между 400 и 1200 с в зависимости от индивидуального пептида. В данные вносили поправку на эффекты объема после исключения DMSO. Для всех данных проводили двойное сравнение с инжектированием пустых растворов и эталонной поверхностью с использованием стандартных методик обработки, и обработку данных и кинетическую аппроксимацию проводили с использованием программного обеспечения Scrubber, версия 2.0с (BioLogic Software). Данные аппроксимировали с использованием простой модели связывания 1:1, допускающей эффекты переноса масс, когда это целесообразно.
Определенные пептидные лиганды по изобретению тестировали в упомянутых выше анализах связывания нектина-4, и результаты представлены в табл. 1.
- 71 045862
Таблица 1. Данные о конкурентном связывании для отдельных пептидных лигандов по изобретению
Название пептида Последовательность Молекулярны й каркас Ki (hM)
80-09-02-N006 F1-A-(SQ Ш NO: 1)-А TATA 5,0
BCY488 (80-10-00) A-(SEQIDNO: 31)-А TATA 208
BCY462 (80-10-12- Т01) VDW-(SEQ ID NO: 33)-А TATA 269
BCY3400 (80-10-13- Т01) QKW-(SEQ ID NO: 34)-A TATA 72
BCY471 (80-11-00) A-(SEQIDNO: 35)-A TATA 888
BCY472 (80-11-01) A-(SEQ ID NO: 36)-A TATA 502
BCY3406 (80-11-08- Т01) A-(SEQ ID NO: 37)-SRF TATA 30
BCY8208 (Карбоксифлуоресцеин)(8ЕР ID NO: 115) TATA 745
где А обозначает L-аланин и а обозначает L-аланин и * относится к среднему значению для 2 экспериментов.
Таблица 2. Данные конкурентного связывания для отдельных пептидных лигандов по изобретению
Бицикл № К (mkM) Количество экспериментов
BCY428 0,061 34
BCY429 0,0426 2
BCY430 0,3103 7
BCY431 0,412 2
BCY432 1,096 3
BCY433 0,0694 2
BCY3385 0,0286 13
BCY3386 0,0802 2
BCY3387 0,2343 2
BCY3388 0,1293 2
BCY3389 0,0998 7
BCY3390 0,3019 7
BCY3391 0,1981 2
BCY3392 0,0363 2
BCY3393 0,1729 3
- 72 045862
BCY3394 0,1016 2
BCY3395 0,0174 2
BCY3396 0,1024 2
BCY3397 0,0332 2
BCY3398 0,1639 2
BCY3399 0,4099 2
BCY3400 0,047 3
BCY3401 0,1536 2
BCY7265 0,0383 2
BCY7266 0,041 2
BCY7272 0,041 2
BCY7273 0,084 2
BCY7274 0,0905 2
BCY7275 0,0433 2
BCY7276 0,3256 2
BCY7278 0,069 2
BCY7279 0,0444 2
BCY7280 0,219 2
BCY7281 0,0229 2
BCY7282 0,0265 2
BCY7342 0,3097 2
BCY7344 0,0398 2
BCY7346 0,0649 2
BCY7347 0,0361 2
BCY7348 0,0206 2
BCY7350 0,01 2
BCY7352 0,1318 2
BCY7354 0,884 1
BCY7356 0,0434 2
BCY7357 0,0452 2
BCY7359 0,1605 2
BCY7360 0,0682 2
BCY7365 0,2819 2
BCY7367 0,0263 2
- 73 045862
BCY7368 0,023 2
BCY7369 0,0778 2
BCY7370 0,1445 2
BCY7372 0,0726 2
BCY7390 0,0171 20
BCY7391 0,0133 2
BCY7392 0,0272 5
BCY7393 0,232 1
BCY7420 0,0636 2
BCY7421 0,0285 2
BCY7422 0,0579 2
BCY7424 0,562 1
BCY7426 0,069 1
BCY7521 0,2237 2
BCY7535 0,064 2
BCY7536 0,069 2
BCY7537 0,0384 2
BCY7538 0,0085 2
BCY7539 0,0468 2
BCY7540 0,3567 2
BCY7541 0,0765 2
BCY7556 0,0261 2
BCY7557 0,0225 2
BCY7558 0,0219 6
BCY7559 0,017 2
BCY7580 0,0135 2
BCY7581 0,0194 2
BCY7582 0,0379 2
BCY7584 0,0135 2
BCY7585 0,0185 2
BCY7588 0,342 1
BCY7589 0,0345 2
BCY7590 0,0385 2
BCY7591 0,18 1
- 74 045862
BCY7592 0,0374 2
BCY7593 0,028 2
BCY7594 0,073 2
BCY7595 0,2189 2
BCY7596 0,353 1
BCY7597 0,169 1
BCY7598 0,0749 2
BCY7606 0,034 1
BCY7607 0,077 1
BCY7608 0,042 1
BCY7611 0,205 1
BCY7612 0,064 1
BCY7613 0,0444 2
BCY7614 0,021 1
BCY7615 0,0284 2
BCY7616 0,051 1
BCY7618 0,013 1
BCY7620 0,246 1
BCY7622 0,031 1
BCY7623 0,021 1
BCY7624 0,571 1
BCY7625 0,141 1
BCY7627 0,101 1
BCY7628 0,023 1
BCY7631 0,019 1
BCY7632 0,123 1
BCY7634 0,024 1
BCY7635 0,0152 4
BCY7636 0,522 1
BCY7639 0,49 1
BCY7640 0,086 1
BCY7643 0,019 1
BCY7656 0,0719 2
BCY7657 0,0232 2
- 75 045862
BCY7658 0,0336 2
BCY7659 0,0779 2
BCY7660 0,0262 2
BCY7661 0,0294 2
BCY7662 0,0148 2
BCY7663 0,0255 2
BCY7664 0,07 2
BCY7665 0,0241 2
BCY7666 0,0814 2
BCY7667 0,0273 2
BCY7668 0,4236 2
BCY7765 0,0087 22
BCY7793 0,042 1
BCY7815 0,032 1
BCY7816 0,036 1
BCY7817 0,014 1
BCY7819 0,012 1
BCY7820 0,01 1
BCY7821 0,084 1
BCY7822 0,027 1
BCY7876 0,0592 2
BCY7877 0,0095 2
BCY7879 0,0125 2
BCY7881 0,0144 2
BCY7883 0,1893 2
BCY7884 0,223 1
BCY7886 0,015 2
BCY7887 0,0214 2
BCY7889 0,0581 3
BCY7890 0,0989 4
BCY7891 0,005 2
BCY7892 0,0095 2
BCY7894 0,1263 2
BCY7895 0,0491 4
- 76 045862
BCY7896 0,044 2
BCY7897 0,166 1
BCY7902 0,004 1
BCY7903 0,041 1
BCY7904 0,008 1
BCY7906 0,006 1
BCY7907 0,01 1
BCY7908 0,02 1
BCY7911 0,013 1
BCY7912 0,009 1
BCY7913 0,016 1
BCY7914 0,062 1
BCY7915 0,02 1
BCY7916 0,045 3
BCY7973 0,004 1
BCY7979 0,191 1
BCY7993 0,038 1
BCY7996 0,021 1
BCY7997 0,022 1
BCY7998 0,135 1
BCY8000 0,06 1
BCY8028 0,0619 3
BCY8029 0,0778 3
BCY8030 0,0025 7
BCY8031 0,0036 3
BCY8032 1,064 1
BCY8036 0,0075 3
BCY8037 0,0056 3
BCY8038 0,008 5
BCY8039 0,0214 3
BCY8040 0,0108 3
BCY8041 0,0391 3
BCY8042 0,0204 3
BCY8043 0,0088 3
- 77 045862
BCY8044 0,1698 2
BCY8084 0,0264 2
BCY8085 0,0151 2
BCY8087 0,0179 2
BCY8088 0,0089 2
BCY8089 0,008 2
BCY8090 0,057 1
BCY8091 0,023 2
BCY8094 0,0289 2
BCY8120 0,003 2
BCY8121 0,004 2
BCY8122 0,003 2
BCY8123 0,0045 2
BCY8124 0,0035 4
BCY8125 0,0031 4
BCY8126 0,0027 6
BCY8127 0,0024 4
BCY8128 0,0022 4
BCY8129 0,0031 4
BCY8153 0,035 1
BCY8154 0,008 1
BCY8157 0,005 1
BCY8158 0,177 1
BCY8161 0,004 1
BCY8162 0,003 1
BCY8163 0,003 1
BCY8174 0,0123 2
BCY8175 0,0035 2
BCY8176 0,0035 2
BCY8177 0,0175 2
BCY8178 0,083 1
BCY8180 0,003 2
BCY8181 0,0035 2
BCY8182 0,002 2
- 78 045862
BCY8183 0,002 2
BCY8184 0,0032 4
BCY8185 0,0261 2
BCY8186 0,006 2
BCY8187 0,005 2
BCY8188 0,02 2
BCY8189 0,1658 2
BCY8191 0,0045 2
BCY8192 0,005 2
BCY8193 0,003 2
BCY8194 0,0035 2
BCY8211 0,0045 2
BCY8212 0,003 2
BCY8213 0,0035 2
BCY8214 0,0063 2
BCY8215 0,003 2
Определенные бициклические пептиды по изобретению тестировали в упоминаемом выше анализе SPR, и результаты представлены в табл. 3.
Таблица 3. Данные SPR для отдельных пептидных лигандов по изобретению
Бицикл № Kd согласно SPR для человека (нМ) η
BCY428 333,52 4
BCY3385 87,37 3
BCY7390 40,31 5
BCY7391 59,8 3
BCY7392 35,7 3
BCY7393 1383,33 3
BCY7559 14,9 2
BCY7618 17,6 1
BCY7765 24,94 15
BCY7793 47 1
BCY8030 1,71 1
BCY8038 44,53 3
BCY8120 0,67 1
- 79 045862
BCY8121 0,53 1
BCY8122 0,89 1
BCY8123 2,66 1
BCY8124 0,69 1
BCY8125 0,52 1
BCY8126 1,07 4
BCY8127 1,84 3
BCY8128 1,06 3
BCY8129 0,87 3
BCY8161 0,94 1
BCY8162 4,3 1
BCY8163 0,61 1
BCY8182 0,96 1
BCY8183 0,56 1
BCY8184 0,56 1
BCY8192 1,81 1
BCY8193 1,3 1
BCY8194 1,9 1
BCY8211 7,32 1
BCY8212 2,42 1
BCY8213 1,95 1
BCY8214 0,54 1
BCY8215 1,62 1
BCY8276 0,86 1
BCY8277 5,99 1
BCY8278 1,92 1
BCY8279 3,31 1
BCY8280 2 1
BCY8281 6,И 1
BCY8831 2,14 1
BCY8238 3,88 1
BCY8116 0,372 1
п=среднее количество экспериментов.
Определенные бициклические пептиды по изобретению конъюгировали с цитотоксическими средствами и тестировали в описанном выше анализе SPR, и результаты представлены в табл. 4.
- 80 045862
Таблица 4. Данные SPR для отдельных BDC по изобретению
Бициклический конъюгат лекарственного средства (BDC) № Пептид Kd согласно SPR для человека (нМ)
BCY7683 MMAE-PABC-Cit-Val-Glutapmi-BCY7556 27,10 (n=l)
BCY7825 ММ AE-PABC-Cit-Val-Glutapnn-BC Y7814 ll,60(n=l)
BCY7826 DM1-SPDB(SO3H)-BCY7814 12,10 (n=l)
BCY8245 MMAE-PABC-Cit-Val-Glutapmi-BCY8234 5,12 (n=4)
BCY8253 MMAE-PABC-Cit-Val-Glutapmi-BCY8231 6,22 (n=4)
BCY8254 MMAE-PABC-Cit-Val-Glutapmi-BCY8232 4,11 (n=l)
BCY8255 MMAE-PABC-Cit-Val-Glutaproi-BCY8235 8,58 (n=4)
BCY8549 ММАЕ-РАВС-циклобутил-(В-А1а)-ВСА8234 1,44 (n=l)
BCY8550 MMAE-PABC-Cit-Val-Gliitapnn-(Lys3)- BCY8831 0,27 (n=l)
BCY8783 MMAE-PABC-Cit-Val-Glutapiui-BCY8269 0,804 (n=l)
BCY8784 MMAE-PABC-Cit-Val-Glutapmi-BCY8273 0,662 (n=l)
Исследования in vivo.
В каждом из примеров 1-5 и 9 для каждого исследования использовали следующую методологию.
Тестируемые и положительные контрольные образцы
Номер Физическое описание Молекулярная масса Чистота Условия хранения
BCY7683 Лиофилизированный порошок 3852,59 99,6% Хранение при -80°С
BCY7825 Лиофилизированный порошок 4122,85 98,40% Хранение при -80°С
BCY7826 Лиофилизированный порошок 3821,83 99,70% Хранение при -80°С
BCY8234 Лиофилизированный порошок 2954,34 98,1% Хранение при -80°С
BCY8242 Лиофилизированный порошок 6346,46 97,40% Хранение при -80°С
- 81 045862
BCY8245 Лиофилизированный порошок 4173,85 99,60% Хранение при -80°С
BCY8253 Лиофилизированный порошок 4218,96 97,00% Хранение при -80°С
BCY8254 Лиофилизированный порошок 4213,96 99,40% Хранение при -80°С
BCY8255 Лиофилизированный порошок 4214,97 99,40% Хранение при -80°С
BCY8549 Лиофилизированный порошок 4157,81 95,70% Хранение при -80°С
BCY8550 Лиофилизированный порошок 4228,98 99,20% Хранение при -80°С
BCY8781 Лиофилизированный порошок 4173,85 99,0% Хранение при -80°С
BCY8783 Лиофилизированный порошок 4209,91 96,80% Хранение при -80°С
BCY8784 Лиофилизированный порошок 4245,96 95,70% Хранение при -80°С
Экспериментальные способы и методики.
(i) Наблюдения.
Все процедуры, касающиеся содержания животных, ухода и лечения, в испытаниях проводили в соответствии с руководством, одобренным Институциональным комитетом по уходу и использованию животных (IACUC) WuXi AppTec, в соответствии с руководством Международной ассоциацией оценки и аккредитации лабораторных исследований на животных (AAALAC). В момент стандартного мониторинга животных каждый день проверяли в отношении каких-либо эффектов роста опухоли и лечения на нормальное поведение, такое как двигательная активность, употребление пищи и воды (только посредством осмотра), увеличение/снижение массы тела, потускнение глаз/шерсти и любой другой аномальный эффект, указанный в протоколе. Смерть и наблюдаемые клинические признаки регистрировали на основе количеств животных в каждой подгруппе.
(ii) Измерение опухоли и конечные результаты.
Основным результатом было наблюдение, может ли быть замедлен рост опухоли, или могут ли мыши быть вылечены. Объем опухоли измеряли три раза в неделю в двух измерениях с использованием толщиномера и объем выражали в мм3 с использованием формулы
V=0,5 axb2, где а и b представляют собой длинный и короткий диаметры опухоли, соответственно. Затем размер опухоли использовали для вычислений величины Т/С. Величина Т/С (в процентах) является признаком противоопухолевой эффективности;
Т и С представляют собой средние объемы групп лечения и контроля, соответственно, в данный день.
TGI вычисляли для каждой группы с использованием формулы
TGI (%)=[1-(Τϊ-Το)Ζ (Vi-V0)]x100;
Ti представляет собой средний объем опухоли в группе лечения в данный день, Т0 представляет собой средний объем опухоли в группе лечения в день начала лечения, V; представляет собой средний объем опухоли в контрольной группе носителя в той же день с Ti, и V0 представляет собой средний объем опухоли в группе носителя в день начала лечения.
(iii) Статистический анализ.
Суммарная статистика, включая среднее значение и стандартную ошибку среднего значения (SEM), предоставлена для объема опухоли в каждой группе в каждый момент времени.
Статистический анализ различий в объеме опухоли среди групп проводили для данных, полученных в наилучший терапевтический момент времени после последней дозы.
Односторонний ANOVA проводили для сравнения объема опухоли среди групп, и, когда получали значимую F-статистику (соотношение дисперсии лечения и дисперсии ошибки), сравнения между группами проводили с использованием критерия Геймса-Ховелла. Все данные анализировали с использованием GraphPad Prism 5.0. Статистически значимым считали Р < 0,05.
- 82 045862
Пример 1. Тест эффективности in vivo BCY7683, BCY7825, BCY7826, BCY8245, BCY8253, BCY8254 и BCY8255 при лечении мышей BALB/c nude с ксенотрансплантатом NCI-H292 (модель немелкоклеточного рака легкого (NSCLC)).
1. Задача исследования.
Задачей исследования была оценка противоопухолевой эффективности in vivo BCY7683, BCY7825, BCY7826, BCY8245, BCY8253, BCY8254 и BCY8255 при лечении модельных мышей BALB/c nude с ксенотрансплантатом NCI-H292.
2. Схема эксперимента
Г руппа Лечение η Доза (мг/кг) Объем дозирования (мкл/г) Путь дозирования Схема
1 Носитель 3 10 в/в biw
2 BCY7683 3 5/3* 10 в/в biw/qw**
3 BCY7825 3 1 10 в/в biw
4 BCY7825 3 3 10 в/в biw
5 BCY7825 3 3 10 в/в qw
6 BCY7826 3 1 10 в/в biw
7 BCY7826 3 3 10 в/в biw
8 BCY7826 3 3 10 в/в qw
9 BCY8245 3 1/3/5а 10 в/в qw
10 BCY8253 3 1/3/5а 10 в/в qw
И BCY8254 3 1/3/5а 10 в/в qw
12 BCY8255 3 1/3/5а 10 в/в qw
13 BCY8245 3 3 мг/кг 10 в/в qw
14 BCY8245 3 3 мг/кг 10 в/в biw
15 BCY8245 3 5 мг/кг 10 в/в qw
16 BCY8253 3 3 мг/кг 10 в/в qw
17 BCY8253 3 3 мг/кг 10 в/в biw
18 BCY8253 3 5 мг/кг 10 в/в qw
19 BCY8255 3 3 мг/кг 10 в/в qw
20 BCY8255 3 3 мг/кг 10 в/в biw
21 BCY8255 3 5 мг/кг 10 в/в qw
Примечание: n: количество животных; объем дозирования: объем дозирования доводили на основе массы тела из расчета 10 мкл/г.
*Дозировка BCY7683 была снижена до 3 мг/кг с 7 суток.
** Схему лечения корректировали, исходя из массы тела в день введения.
3. Материалы.
3.1. Животные и условия содержания.
3.1.1. Животные.
Вид: Mus Musculus.
Линия: Balb/c nude.
Возраст: 6-8 недель.
Пол: самки.
Масса тела: 18-22 г.
Количество животных: 12 мышей для тестирования BCY7683, 21 мышь для BCY7825 и BCY7826, 18 мышей для BCY8245, BCY8253, BCY8254 и BCY8255 плюс запасные.
Поставщик животных: Shanghai LC Laboratory Animal Co., LTD.
3.1.2. Условия содержания.
Мышей содержали в индивидуально вентилируемых клетках при постоянной температуре и влажности по 3 животных в каждой клетке.
Температура: 20~26°С.
Влажность 40-70%.
Клетки: изготовлены из поликарбоната. Размер составляет 300 ммх180 ммх150 мм. Материалом подстилки были сердцевины кукурузных початков, которые заменяли два раза в неделю.
Рацион: животные имели свободный доступ к стерилизованному облучением сухому гранулированному корму в ходе всего периода исследования.
Вода: животные имели свободный доступ к питьевой воде.
- 83 045862
Идентификация клеток: идентификационные ярлыки для каждой клетки содержали следующую информацию: количество животных, пол, линия, дата получения, лечение, номер испытания, номер группы и дата начала испытания.
Идентификация животных: животных маркировали кодированием на ушах.
3.2. Тестируемые и положительные контрольные образцы.
4. Способы и процедуры эксперимента.
4.1. Культивирование клеток.
Опухолевые клетки NCI-H292 поддерживают в среде, дополненной 10% инактивированной нагреванием эмбриональной телячьей сывороткой, при 37°С в атмосфере 5% СО2 в воздухе. Опухолевые клетки стандартным образом субкультивируют два раза в неделю. Клетки, растущие в экспоненциальной фазе роста, собирают и подсчитывают для инокуляции опухоли.
4.2. Инокуляция опухоли.
Каждой мыши инокулируют подкожно в правый бок опухолевые клетки NCI-H292 (10x106) в 0,2 мл PBS для развития опухоли. Животных случайным образом распределяют на группы и лечение начинают, когда средний объем опухоли достигает приблизительно 158-406 мм3. Введение тестируемых образцов и количества животных в каждой группе представлены в следующей таблице схемы эксперимента.
4.3. Получение состава тестируемого образца
Лечение Доза(мг/мл) Состав
Носитель - 2,5% DMSO, 10% Kolliphor, 50 мМ Hepes, pH 7
BCY7683 0,5 Растворить 2,25 мг BCY7683 в 112 мкл DMSO, затем разбавить 22,5 мкл исходного раствора 20 мг/мл BCY7683 посредством 90 мкл Kolliphor, 45 мкл 1 мМ Hepes и 742,5 воды.
о,з Разбавить раствор для дозирования 0,5 мг/мл буфером из 2,5% DMSO, 10% Kolliphor и 50 мМ Hepes, pH 7.
Лечение Доза(мг/мл) Состав
Носитель - 25 мМ гистидин, 10% сахароза, рН=7
BCY7825 Буфер для составления 10% Kolliphor,50 мМ Hepes, рН=7
1 Растворить 3,2 мг BCY7825 в 3,2 мл буфера для составления
о,з Разбавить 270 мкл BCY7825 в концентрации 1 мг/мл в 630 мкл буфера для составления
0,1 Разбавить 90 мкл BCY7825 в концентрации 1 мг/мл в 810 мкл буфера для составления
BCY7826 Буфер для 25 мМ гистидин, 10% сахароза, рН=7
- 84 045862 составления
Растворить 3,2 мг BCY7826 в 3,2 мл буфера для составления
Разбавить 270 мкл BCY7826 в концентрации 1 мг/мл в 630 мкл буфера для составления
Разбавить 90 мкл BCY7826 в концентрации 1 мг/мл в 810 мкл буфера для составления
Тестируемый образец Конц. (мг/мл) Состав
Носитель - 25 мМ гистидин, pH 7, 10% сахароза
BCY8245 1 Растворить 1,61 mtBCY8245 в 1,604 мл буфера (носитель)
0,1 Разбавить 90 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8245 посредством 810 мкл буфера (носитель)
о,з Разбавить 270 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8245 посредством 630 мкл буфера (носитель)
0,5 Разбавить 450 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8245 посредством 450 мкл буфера (носитель)
BCY8253 1 Растворить 1,15 mtBCY8253 1,116 мл буфера (носитель)
0,1 Разбавить 90 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8253 посредством 810 мкл буфера (носитель)
0,3 Разбавить 270 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8253 посредством 630 мкл буфера (носитель)
0,5 Разбавить 450 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8253 посредством 450 мкл буфера (носитель)
BCY8254 1 Растворить 1,80 mtBCY8254 1,789 мл буфера (носитель)
0,1 Разбавить 90 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8254 посредством 810 мкл буфера (носитель)
0,3 Разбавить 270 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8254 посредством 630 мкл буфера (носитель)
0,5 Разбавить 450 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8254 посредством 450 мкл буфера (носитель)
BCY8255 1 Растворить 1,30 мг BCY8255 1,192 мл 50 мМ смеси ацетат/уксусная кислота, рН5, с 10% сахарозой
- 85 045862
0,1 Разбавить 90 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8255 посредством 810 мкл 50 мМ смеси ацетат/уксусная кислота, рН5, с 10% сахарозой
0,3 Разбавить 270 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8255 посредством 630 мкл 50 мМ смеси ацетат/уксусная кислота, рН5, с 10% сахарозой
0,5 Разбавить 450 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8255 посредством 450 мкл 50 мМ смеси ацетат/уксусная кислота, рН5, с 10% сахарозой
Тестируемый образец Конц. (мг/мл) Состав
Носитель - 25 мМ гистидин, pH 7, 10% сахароза
BCY8245 1 Растворить 10,56 мг BCY8245 в 10,518 мл гистидинового буфера
BCY8245 0,5 Разбавить 400 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8245 посредством 400 мкл гистидинового буфера
BCY8245 о,з Разбавить 240 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8245 посредством 560 мкл гистидинового буфера
BCY8253 1 Растворить 11,35 мг BCY8253 в 11,010 мл гистидинового буфера
BCY8253 0,5 Разбавить 400 мкл 1 мг/мл исходного раствора BCY8253 400 мкл гистидинового буфера
BCY8253 о,з Разбавить 240 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8253 посредством 560 мкл гистидинового буфера
BCY8255 1 Растворить 10,78 mtBCY8255 в 10,715 мл ацетатного буфера
BCY8255 0,5 Разбавить 400 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8255 посредством 400 мкл ацетатного буфера
BCY8255 о,з Разбавить 240 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8255 посредством 560 мкл ацетатного буфера
/. Гистидиновый буфер:25мМ гистидин, рН7, 10% сахароза 2. Ацетатный буфер: 50 мМ ацетат/уксусная кислота, pH 5, 10% сахароза 3. Исходные растворы BCY8245(1 мг/мл), BCY8253(1 мг/мл) и BCY8255(1 мг/мл) распределяли в индивидуальные пробирки и хранили при -80°С
4.4. Взятие образцов.
В конце исследования проводили взятие плазмы через 5, 15, 30, 60 и 120 мин после последнего дозирования.
5. Результаты.
5.1. Кривые роста опухоли.
Кривые роста опухоли представлены на фиг. 1-10.
5.2. Регистрация объема опухоли.
Средний объем опухоли с течением времени у самок мышей Balb/c nude, имеющих ксенотрансплантат NCI-H292, представлен в таблицах ниже.
- 86 045862
Таблица 5. Регистрация объема опухоли с течением времени
Лечение Сутки после начала лечения
0 2 4 7 9 11 14 16
Носитель, biw 175±4 321±28 407±51 538±35 620±27 712±60 879±88 -
BCY7683, 176±1 5/3 мг/кг, 162±18 97±16 88±17 72±14 58±16 47±9 -
biw/qw 1
Таблица 6: Регистрация объема опухоли с течением времени
Лечение Сутки после начала лечения
0 2 5 7 9 12 14
Носитель, biw 158±11 227±7 302±25 398±47 452±47 558±46 718±79
BCY7825,
1 мг/кг, 156±11 214±20 332±31 444±46 505±62 605±52 754±66
biw
BCY7825,
3 мг/кг, 159±28 195±29 119±30 102±35 103±35 65±21 73±24
biw
BCY7825,
3 мг/кг, 157±17 179±22 162±18 179±20 146±23 109±8 116±25
qw
BCY7826, 1 мг/кг, biw 157±15 223±3 297±13 350±10 449±69 530±71 625±111
BCY7826, 3 мг/кг, biw 158±27 171±32 121±25 110±29 99±22 87±16 91±19
BCY7826, 3 мг/кг, 157±10 183±14 215±32 284±35 319±33 247±14 298±16
qw
- 87 045862
Таблица 7. Регистрация объема опухоли с течением времени
Лечение Сутки после начала лечения
16 19 21
Носитель, biw 895±160 1026±175 1107±210
BCY7825,
1 мг/кг, 890±126 982±133 1063±139
biw
BCY7825,
3 мг/кг, 87±26 81±28 80±29
biw
BCY7825,
3 мг/кг, 130±30 133±28 177±34
qw
BCY7826,
1 мг/кг, 671±109 731±144 774±151
biw
BCY7826,
3 мг/кг, 88±19 75±23 93±33
biw
BCY7826,
3 мг/кг, 333±13 378±19 425±25
qw
Таблица 8. Регистрация объема опухоли с течением времени
Лечение 0 2 4 7 9 11 14 16
Носитель, qw 410±77 516±69 627±61 931=1=141 1118±225 1208±257 1495±365 1743±419
BCY8245, 1/3/5 мг/кг, qw 404±65 391±42 542±14 721±136 762±115 607±95 614±89 626±93
BCY8253 1/3/ мг/кг, qw 401±15 420±34 536±26 789±71 713±29 593±65 637±13 708±40
BCY8254 1/3/5 мг/кг, qw 408±65 442±48 601±71 737±76 747±73 565±47 543±53 599±26
BCY8255, 1/3/5 мг/кг, qw 408±62 482±50 582±39 750=Ы11 771±96 698±58 670±83 761±59
Лечение 18 21 23 25 28 30 32 35
Носитель, qw 1950±551 2149±639
BCY8245,
1/3/5 мг/кг, qw 611±93 654±152 732±139 755±132 713±114 762±165 968±290 1119±216
BCY8253
1/3/5 мг/кг, qw 658±95 697±140 685±110 737±81 930±100 965±163 1029±185 1293±26
BCY8254
1/3/5 мг/кг, qw 623±43 684±97 740±82 771±158 840±55 856±129 883±89 1004±171
BCY8255, 838±127 856±163 1003±170 1058±211 1103±233 1182±258 1259±226 1320±267
1/3/5 мг/кг, qw
- 88 045862
Таблица 9. Регистрация объема опухоли с течением времени Сутки после начала лечения
Лечение
0 2 4 7 9 11 14
носитель, qw 161±2 270±14 357±14 448±17 570±16 720±36 948±61
BCY8245, 3 мг/кг, qw 160±5 220±11 266±15 218±23 167±10 161±36 149±43
BCY8245, 3 мг/кг, biw 162±13 243±19 211±12 101±11 100±8 87±7 65±3
BCY8245, 5 мг/кг, qw 160±9 176±7 191±3 105±8 82±3 91±14 83±8
BCY8253, 3 мг/кг, qw 162±7 187±9 176±20 159±15 147±8 114=1=13 98±3
BCY8253, 3 мг/кг, biw 162±14 174±9 149±7 70±2 68±6 58±2 49±5
BCY8253, 5 мг/кг, qw 161±10 161±9 121±9 97±3 79±6 82±8 68±9
BCY8255, 3 мг/кг, qw 162±8 195±14 160±5 123±1 108±5 104±3 100±9
BCY8255, 3 мг/кг, biw 162±15 204±16 148±11 132±16 102±20 106±38 96±35
BCY8255, 164±8 171±8 103±9 101±5 89±11 87±32 97±44
мг/кг, qw
5.3. Анализ ингибирования роста опухоли.
Скорость ингибирования роста опухоли для BCY7683, BCY7825, BCY7826, BCY8245, BCY8253, BCY8254 и BCY8255 в модели с ксенотрансплантатом NCI-H292 на 14 сутки вычисляли на основе измерения объема опухоли.
Таблица 10. Анализ ингибирования роста опухоли
Лечение Объем (мм3)а опухоли Т/Сь (%) TGI (%) Значение Р сравнению носителем по с
Носитель, biw 879±88
BCY7683,
47±9 5,3 118,4 /?<0,001
5 мг/кг, biw/qw
а. Среднее значение ± SEM.
b. Ингибирование роста опухоли вычисляют путем деления среднего по группе объема опухоли для группы лечения на средний по группе объем опухоли для контрольной группы (Т/С).
- 89 045862
Таблица 11. Анализ ингибирования роста опухоли
Лечение Объем (мм3)а опухоли Т/Сь (%) TGI (%) Значение Р
Носитель, biw 1107±210
BCY7825,! мг/кг, biw 1063±139 96,0 4,3 /?>0,05
BCY7825, 3 мг/кг, biw 80±29 7,3 108,3 /?<0,001
BCY7825, 3 мг/кг, qw 177±34 16,0 97,9 /?<0,001
BCY7826, 1 мг/кг, biw 774±151 70,0 34,9 /?>0,05
BCY7826, 3 мг/кг, biw 93±33 8,4 106,9 /?<0,001
BCY7826, 3 мг/кг, qw 425±25 38,4 71,7 /?<0,01
Таблица 12. Анализ ингибирования роста
Лечение Объем опухоли (мм3)а Т/Сь (%) TGI (%) Значение Р сравнению носителем по с
Носитель, qw 2149±639
BCY8245, 1/3/5 мг/кг, qw 654±152 30,4 85,7 /?<0,05
BCY8253 1/3/5 мг/кг. qw 697±140 32,4 83,0 /?<0,05
BCY8254 1/3/5 мг/кг. qw 684±97 31,8 84,1 /?<0,05
BCY8255, 1/3/5 мг/кг, qw 856±163 39,8 74,2 /?<0,05
а. Среднее значение ± SEM.
b. Ингибирование роста опухоли вычисляют путем деления среднего по группе объема опухоли для группы лечения на средний по группе объем опухоли для контрольной группы (Т/С).
- 90 045862
Таблица 13. Анализ ингибирования роста опухоли
Лечение Объем (мм3)а опухоли Т/Сь (%) TGI (%) Значение Р сравнению носителем по с
Носитель, qw 948±61
BCY8245, 3 мг/кг, qw 149±43 15,8 101,4 /?<0,001
BCY8245, 3 мг/кг, biw 65±3 6,9 112,2 /?<0,001
BCY8245, 5 мг/кг, qw 83±8 8,8 109,8 /?<0,001
BCY8253, 3 мг/кг, qw 98±3 10,4 108,1 /?<0,001
BCY8253, 3 мг/кг, biw 49±5 5,2 114,3 /?<0,001
BCY8253, 5 мг/кг, qw 68±9 7,2 111,9 /?<0,001
BCY8255, 3 мг/кг, qw 100±9 10,6 107,9 /?<0,001
BCY8255, 3 мг/кг, biw 96±35 10,1 108,5 /?<0,001
BCY8255, 5 мг/кг, qw 97±44 10,2 108,5 /?<0,001
а. Среднее значение ± SEM.
b. Ингибирование роста опухоли вычисляют путем деления среднего по группе объема опухоли для группы лечения на средний по группе объем опухоли для контрольной группы (Т/С).
6. Обобщение и обсуждение результатов.
В этом исследовании оценивали терапевтическую эффективность BCY7683, BCY7825, BCY7826, BCY8245, BCY8253, BCY8254 и BCY8255 в модели с ксенотрансплантатом NCI-H292. Измеренные объемы опухоли во всех группах лечения в различные моменты времени представлены на фиг. 1-10 и в табл. 5-13.
Средний размер опухоли у мышей, которым вводили носитель, достигал 879 мм3 на 14 сутки. CY7683 в дозе 5 мг/продемонстрировал быструю регрессию опухоли после лечения, однако лечение индуцировало выраженное снижение массы тела, в результате чего дозирование прекращали на 3 сутки и доводили до 3 мг/кг на 7 сутки. Наконец, BCY7683 (TV=47 мм3, TGI=118,4%, p<0,001) имел очевидную противоопухолевую эффективность и все мыши выжили до конца лечения.
Средний размер опухоли у мышей, которым вводили носитель, достиг 1107 мм3 на 21 сутки. BCY7825 в дозе 1 мг/кг (TV=1063 мм3, TGI=4,3%, p>0,05) не индуцировал никакой противоопухолевой активности, BCY7825 в дозе 3 мг/кг biw (TV=80 мм3, TGI=108,3%, р<0,001) и 3 мг/кг qw (TV=177 мм3, TGI=97,9%, p<0,001) вызывал регрессию опухоли и продемонстрировал выраженную противоопухолевую активность.
BCY7826 в дозе 1 мг/кг (TV=774 мм3, TGI=34,9%, p>0,05) не имел заметной противоопухолевой активности, BCY7826 в дозе 3 мг/кг biw (TV=93 мм3, TGI=106,9%, р<0,001) и 3 мг/кг (TV=425 мм3, TGI=71,7%, p<0,01) qw обеспечивал зависимую от частоты дозирования противоопухолевую активность. Среди них BCY7826 в дозе 3 мг/кг biw индуцировал заметную регрессию опухоли.
BCY8245, BCY8253, BCY8254 и BCY8255 в дозе 1 мг/кг не обеспечивал значительной противоопухолевой активности, все четыре тестируемых образца продемонстрировали заметную противоопухолевую активность после увеличения дозировки до 3 мг/кг с 7 суток, однако эффективность далее не повышалась после увеличения дозировки до 5 мг/кг на 21 сутки. В этом исследовании все из протестированных животных продемонстрировали неизменное снижение массы тела в ходе режима дозирования, это может быть следствием опухолевой нагрузки и токсичности тестируемых образцов.
BCY8245 в дозе 3 мг/кг, qw (TV=149 мм3, TGI=101,4%, р<0,001), 3 мг/кг, biw (TV=65 мм3, TGI=112,2%, р<0,001) и 5 мг/кг, qw (TV=83 мм3, TGI=109,8%, p<0,001) имел значительную противоопухолевую активность.
- 91 045862
BCY8253 в дозе 3 мг/кг, qw (TV=98 mm1 * 3, TGI=108,1%,p<0,001), 3 мг/кг, biw (TV=49 мм3, TGI=114,3%, p<0,001) и 5 мг/кг, qw (TV=68 мм3, TGI=111,9%, p<0,001) имел значительную противоопухолевую активность.
BCY8255 в дозе 3 мг/кг, qw (TV=100 мм3, TGI=107,9%, p<0,001), 3 мг/кг, biw (TV=96 мм3, TGI=108,5%, р<0,001) и 5 мг/кг, qw (TV=97 мм3, TGI=108,5%, p<0,001) имел значительную противоопухолевую активность.
Все из протестированных образцов в дозе 3 мг/кг, qw, 3 мг/кг, biw и 5 мг/кг, qw продемонстрировали сравнимую противоопухолевую активность, эффективность не повышалась далее после увеличения дозировки или частоты дозирования.
В этом исследовании животные, которым вводили BCY8253 в дозе 5 мг/кг, продемонстрировали среднее снижение массы тела более 15% на 9 сутки, у мышей в других группах масса тела сохранялась хорошо.
Пример 2. Тест эффективности in vivo BCY7825, BCY8245, BCY8253, BCY8254 и BCY8255 при лечении мышей лечение CB17-SCID с ксенотрансплантатом НТ-1376 (модель рака мочевого пузыря).
1. Задача исследования.
Задачей исследования является оценка противоопухолевой эффективности in vivo тестируемых образцов при лечении мышей CB17-SCID с ксенотрансплантатом НТ-1376.
2. Схема эксперимента
Г руппа Лечение η Доза (мг/кг) Объем дозировани я (мкл/г) Путь дозирован ня Схема
1 Носитель 3 10 в/в qw
2 BCY7825 3 1 мг/кг 10 в/в qw
3 BCY7825 3 3 мг/кг 10 в/в qw
4 BCY8245 3 1/За мг/кг 10 в/в qw
5 BCY8253 3 1/За мг/кг 10 в/в qw
6 BCY8254 3 1/За мг/кг 10 в/в qw
7 BCY8255 3 1/Замг/кг 10 в/в qw
8 Носитель 5 10 в/в qw
9 BCY8245 3 3 мг/кг 10 в/в qw
10 BCY8245 3 3 мг/кг 10 в/в biw
И BCY8245 3 5 мг/кг 10 в/в qw
12 BCY8253 3 3 мг/кг 10 в/в qw
13 BCY8253 3 3 мг/кг 10 в/в biw
14 BCY8253 3 5 мг/кг 10 в/в qw
15 BCY8255 3 3 мг/кг 10 в/в qw
16 BCY8255 3 3 мг/кг 10 в/в biw
17 BCY8255 3 5 мг/кг 10 в/в qw
мг/кг в течение первой недели и 3 мг/кг в течение последующих 2 недель.
3. Материалы.
3.1. Животные и условия содержания.
3.1.1. Животные.
Вид: Mus Musculus.
Линия: CB17-SCID.
Возраст: 6-8 недель.
Пол: самки.
Масса тела: 18-22 г.
Количество животных: 21-41 мышь плюс запасные.
Поставщик животных: Shanghai LC Laboratory Animal Co., LTD.
3.1.2. Условия содержания.
Мышей содержали в индивидуально вентилируемых клетках при постоянной температуре и влажности с 3 или 5 животными в каждой клетке.
Температура: 20~26°С.
Влажность 40-70%.
Клетки: изготовлены из поликарбоната. Размер составляет 300 ммх180 ммх150 мм. Материалом подстилки были сердцевины кукурузных початков, которые заменяли два раза в неделю.
Рацион: животные имели свободный доступ к стерилизованному облучением сухому гранулированному корму в ходе всего периода исследования.
Вода: животные имели свободный доступ к питьевой воде.
- 92 045862
Идентификация клеток: идентификационные ярлыки для каждой клетки содержали следующую информацию: количество животных, пол, линия, дата получения, лечение, номер испытания, номер группы и дата начала испытания.
Идентификация животных: животных маркировали кодированием на ушах.
4. Способы и процедуры эксперимента.
4.1. Культивирование клеток.
Клетки опухоли НТ-1376 поддерживали in vitro в качестве культуры в виде монослоя в среде ЕМЕМ, дополненной 10% инактивированной нагреванием эмбриональной телячьей сывороткой, при 37°С в атмосфере 5% СО2 в воздухе. Опухолевые клетки стандартным образом субкультивировали два раза в неделю посредством обработки трипсином-EDTA. Клетки, растущие в экспоненциальной фазе роста, собирали и подсчитывали для инокуляции опухоли.
4.2. Инокуляция опухоли.
Каждой мыши подкожно инокулировали в правый бок опухолевые клетки НТ-1376 (5х 106) в 0,2 мл PBS с матригелем (1:1) для формирования опухоли. Животных случайным образом распределяли на группы, когда средний объем опухоли достигал 153-164 мм3. Введение тестируемых образцов и количества животных в каждой группе представлены в таблице схемы эксперимента.
4.3. Получение состава тестируемого образца
Тестируемый образец Конц. (мг/мл) Состав
Носитель - 25 мМ гистидин, pH 7, 10% сахароза
BCY7825 ОД Разбавить 90 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY7825 посредством 810 мкл 10% Kolliphor, 50 мМ Hepes, pH 7
BCY7825 о,з Разбавить 270 мккл исходного раствора 1 мг/мл BCY7825 посредством 630 мкл 10% Kolliphor, 50 мМ Hepes, pH 7
BCY8245 0,1 Разбавить 90 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8245 810 мкл буфера (носитель)
BCY8245 о,з Разбавить 270 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8245 630 мкл буфера (носитель)
BCY8253 0,1 Разбавить 90 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8253 810 мкл буфера (носитель)
BCY8253 о,з Разбавить 270 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8253 630 мкл буфера (носитель)
- 93 045862
BCY8254 0,3 Разбавить 270 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8254 630 мкл буфера (носитель)
BCY8255 0,1 Разбавить 900 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8255 810 мкл буфера (носитель)
BCY8255 0,3 Разбавить 270 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8255 630 мкл буфера (носитель)
Тестируемый образец Конц. (мг/мл) Состав
Носитель - 25 мМ гистидин, pH 7, 10% сахароза
BCY8245 0,5 Разбавить 400 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8245 400 мкл гистидинового буфера
BCY8245 0,3 Разбавить 240 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8245 560 мкл гистидинового буфера
BCY8253 0,5 Разбавить 400 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8253 400 мкл гистидинового буфера
BCY8253 0,3 Разбавить 240 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8253 560 мкл гистидинового буфера
BCY8255 0,5 Разбавить 400 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8255 400 мкл ацетатного буфера
BCY8255 0,3 Разбавить 240 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8255 560 мкл ацетатного буфера
1. Гистидиновый буфер:25 мМгистидин, рН7, 10% сахароза 2. Ацетатный буфер: 50 мМацетат/уксусная кислота, pH 5, 10% сахароза
4.4. Взятие образцов.
В конце исследования проводили взятие плазмы в группах 3, 4, 5, 6 и 7 через 5, 15, 30, 60 и 120 мин после последнего дозирования. Взятие плазмы в группах 11, 14 и 17 проводили через 5, 15, 30, 60 и 120 мин после последнего доз ирования. Извлечение опухоли в группах 11, 14 и 17 проводили через 2 ч после последнего дозирования. Извлечение опухоли в группах 8, 9, 10, 12, 13, 15 и 16 проводили через 2 ч после последнего дозирования.
5. Результаты.
5.1. Кривые роста опухоли.
Кривые роста опухоли представлены на фиг. 11-18.
5.2. Регистрация объема опухоли.
Средний объем опухоли с течением времени у самок мышей CB17-SCID, имеющих ксенотрансплантат НТ-1376, представлен в табл. 14 и 15.
Таблица 14. Регистрация объема опухоли с течением времени
Групп Сутки после начала лечения
а 0 2 4 7 9 11 14 16 18 21
1 Носитель, qw 168±37 220±47 274±56 391±73 442±75 503±82 576±84 649±81 801±84 884±81
2 BCY7825, 1 мг/кг, qw 165±26 222±42 280±36 385±31 431±21 478±31 546±17 636±37 603±94 772±101
3 BCY7825, 3 мг/кг, qw 165±23 195±26 209±12 307±24 365±21 358±15 412±13 423±19 467±14 545±9
4 BCY8245, 1/3 мг/кг, qw 164±16 184±12 206±14 265±21 291±10 281±28 335±16 354±11 309±19 347±14
5 BCY8253, 1/3 мг/кг, qw 163±37 201±47 240±42 333±49 358±19 305±28 370±33 386±41 348±15 448±19
6 BCY8254, 1/3 мг/кг, qw 162±17 156±18 200±22 305±28 338±55 326±33 419±36 429±42 453±34 539±75
7 BCY8255, 1/3 мг/кг, qw 162±28 198±40 257±43 352±49 375±81 332±22 385±45 440±12 514±144 549±149
- 94 045862
Таблица 9. Регистрация объема опухоли с течением времени
Сутки после начала лечения
Группа Лечение
0 2 5 7 9 12 14
8 Носитель, qw 153±16 266±30 398±41 529±56 721±76 908±91 1069±90
9 BCY8245, 3 мг/кг, qw 153±26 254±53 298±69 398±61 468±73 502±67 603±76
10 BCY8245, 3 мг/кг, biw 154±30 248±58 203±15 273±45 356±50 391±53 407±53
11 BCY8245, 5 мг/кг, qw 153±15 237±41 228±36 317±31 394±20 438±31 465±33
12 BCY8253, 3 мг/кг, qw 153±12 209±9 269±8 343±29 447±33 466±25 533±29
13 BCY8253, 3 мг/кг, biw 153±13 214±33 246±18 286±23 364±41 400±33 442±45
14 BCY8253, 5 мг/кг, qw 153±15 217±49 231±49 308±36 360±44 401±70 442±62
15 BCY8255, 3 мг/кг, qw 153±22 233±3 284±6 358±27 476±40 486±65 538±59
16 BCY8255, 3 мг/кг, biw 153±21 233±33 218±23 298±45 336±42 365±31 390±40
17 BCY8255, 152±17 233±30 290±4 338±10 406±26 459±68 516±64
мг/кг, qw
5.3. Анализ ингибирования роста опухоли.
Скорость ингибирования роста опухоли для тестируемых образцов в модели с ксенотрансплантатом НТ-1376 вычисляли на основе измерения объема опухоли на 21 сутки после начала лечения.
Таблица 16. Анализ ингибирования роста опухоли
Группа Лечение Объем опухоли (мм3)а Т/Сь (%) TGI (%) Значение Р по сравнению с носителем
1 Носитель, qw 884±81 - -
2 BCY7825, 1 мг/кг, qw 772±101 87,3 15,2 />>0,05
3 BCY7825, 3 мг/кг, qw 545±9 61,6 46,9 /><0,05
4 BCY8245, 3 мг/кг, qw 347±14 39,2 74,5 /><0,001
5 BCY8253, 3 мг/кг, qw 448±19 50,6 60,2 /><0,01
6 BCY8254, 3 мг/кг, qw 539±75 60,9 47,4 /><0,05
7 BCY8255, 3 мг/кг, qw 549±149 62,1 45,9 /><0,05
a. Среднее значение ± SEM.
b. Ингибирование роста опухоли вычисляют путем деления среднего по группе объема опухоли для группы лечения на средний по группе объем опухоли для контрольной группы (Т/С).
- 95 045862
Таблица 17. Анализ ингибирования роста опухоли
Г руппа Лечение Объем опухоли (мм3)а т/сь (%) TGI (%) Значение Р по сравнению с носителем
8 Носитель, qw 1069±90
9 BCY8245, 3 мг/кг, qw 603±76 56,4 50,9 /?<0,01
10 BCY8245, 3 мг/кг, biw 407±53 38,1 72,3 /?<0,001
И BCY8245, 465±33 43,5 66,0 /?<0,001
5 мг/кг, qw
12 BCY8253, 3 мг/кг, qw 533±29 49,8 58,5 /?<0,01
13 BCY8253, 3 мг/кг, biw 442±45 41,3 68,4 /?<0,001
14 BCY8253, 5 мг/кг, qw 442±62 41,4 68,5 р<0,001
15 BCY8255, 3 мг/кг, qw 538±59 50,3 58,0 /?<0,01
16 BCY8255, 3 мг/кг, biw 390±40 36,5 74,1 /><0,001
17 BCY8255, 5 мг/кг, qw 516±64 48,3 60,3 /><0,01
а. Среднее значение ± SEM.
b. Ингибирование роста опухоли вычисляют путем деления среднего по группе объема опухоли для группы лечения на средний по группе объем опухоли для контрольной группы (Т/С).
6. Обобщение и обсуждение результатов.
Группы 1-7.
В этом исследовании оценивали терапевтическую эффективность тестируемых образцов в модели с ксенотрансплантатом НТ-1376. Измеренные объемы опухоли во всех группах лечения в различные моменты времени представлены на фиг. 11-15 и в табл. 14 и 15.
Средний размер опухоли у мышей, которым вводили носитель, достигал 884 мм3 на 21 сутки. BCY7825 в дозе 1 мг/кг (TV=772 мм3, TGI=15,2%, p>0,05) не имел значительной противоопухолевой активности, BCY7825 в дозе 3 мг/кг (TV=545 мм3, TGI=46,9%, p<0,05) имел значительную противоопухолевую активность.
BCY8245, BCY8253, BCY8254 и BCY8255 в дозе 1 мг/кг имели значительную противоопухолевую активность, и лучшая эффективность была обнаружена после повышения дозировки до 3 мг/кг с 7 суток.
В этом исследовании некоторые мыши, которым вводили тестируемые изделия в дозе 3 мг/кг, имели снижение массы тела более 10%, одна мышь, которой вводили BCY8255 в дозе 3 мг/кг, была найдена мертвой на 16 сутки, мыши в группах носителя и 1 мг/кг BCY7825 сохраняли массу тела хорошо.
Группы 8-17.
В этом исследовании оценивали терапевтическую эффективность тестируемых образцов в модели с ксенотрансплантатом НТ-1376. Измеренные объемы опухоли во всех группах лечения в различные моменты времени представлены на фиг. 16-18 и в табл. 16 и 17.
BCY8245 в дозе 3 мг/кг, qw (TV=603 мм3, TGI=50,9%,p<0,01), 3 мг/кг, biw (TV=407 мм3, TGI=72,3%, p<0,001) и 5 мг/кг, qw (TV=465 мм3, TGI=66,0%, p<0,001) имел значительную противоопухолевую активность.
BCY8253 в дозе 3 мг/кг, qw (TV=533 мм3, TGI=58,5%,p<0,01), 3 мг/кг, biw (TV=442 мм3, TGI=68,4%, р<0,001) и 5 мг/кг, qw (TV=442 мм3, TGI=68,5%,p<0,001) имел значительную противоопухолевую активность.
BCY8255 в дозе 3 мг/кг, qw (TV=538 мм3, TGI=58,0%, p<0,01), 3 мг/кг, biw (TV=390 мм3, TGI=74,1%, p<0,001) и 5 мг/кг, qw (TV=516 мм3, TGI=60,3%, p<0,01) имел значительную противоопухолевую активность.
- 96 045862
В этом исследовании BCY8245 и BCY8253 в дозе 5 мг/кг qw вызвал снижение массы тела у животных более 10% в ходе режима лечения.
Пример 3. Исследование эффективности in vivo BCY8245, BCY8253 и BCY8255 при лечении мышей Balb/c nude с ксенотрансплантатом Panc2.13 (модель рака поджелудочной железы).
1. Задача исследования.
Задачей исследования является оценка in vivo противоопухолевой эффективности тестируемых образцов при лечении мышей Balb/c nude с ксенотрансплантатом Panc2.13.
2. Схема эксперимента________________________________________________________
Г руппа Лечение η Доза (мг/кг) Объем дозировани я (мкл/г) Путь дозирова НИЯ Схема
1 Носитель 5 10 в/в qw
2 BCY8245 3 3 мг/кг 10 в/в qw
3 BCY8245 3 3 мг/кг 10 в/в biw
4 BCY8245 3 5 мг/кг 10 в/в qw
5 BCY8253 3 3 мг/кг 10 в/в qw
6 BCY8253 3 3 мг/кг 10 в/в biw
7 BCY8253 3 5 мг/кг 10 в/в qw
8 BCY8255 3 3 мг/кг 10 в/в qw
9 BCY8255 3 3 мг/кг 10 в/в biw
10 BCY8255 3 5 мг/кг 10 в/в qw
3. Материалы.
3.1. Животные и условия содержания.
3.1.1 Животные.
Вид: Mus Musculus.
Линия: Balb/c nude.
Возраст: 6-8 недель.
Пол: самки.
Масса тела: 18-22 г.
Количество животных: 41 мышь плюс запасные.
Поставщик животных: Shanghai LC Laboratory Animal Co., LTD.
3.1.2 . Условия содержания.
Мышей содержали в индивидуально вентилируемых клетках при постоянной температуре и влажности с 3 или 5 животными в каждой клетке.
Температура: 20~26°С.
Влажность 40-70%.
Клетки: изготовлены из поликарбоната. Размер составляет 300 ммх180 ммх150 мм. Материалом подстилки были сердцевины кукурузных початков, которые заменяли два раза в неделю.
Рацион: животные имели свободный доступ к стерилизованному облучением сухому гранулированному корму в ходе всего периода исследования.
Вода: животные имели свободный доступ к питьевой воде.
Идентификация клеток: идентификационные ярлыки для каждой клетки содержали следующую информацию: количество животных, пол, линия, дата получения, лечение, номер испытания, номер группы и дата начала испытания.
Идентификация животных: животных маркировали кодированием на ушах.
4. Способы и процедуры эксперимента.
4.1. Культивирование клеток.
Опухолевые клетки Panc2.13 поддерживают в среде RMPI1640, дополненной 15% инактивированной нагреванием эмбриональной телячьей сывороткой и 10 единиц/мл рекомбинантного инсулина человека, при 37°С в атмосфере 5% СО2 в воздухе. Опухолевые клетки стандартным образом субкультивируют два раза в неделю. Клетки, растущие в экспоненциальной фазе роста, собирают и подсчитывают для инокуляции опухоли.
4.2. Инокуляция опухоли.
Каждой мыши подкожно инокулировали в правый бок опухолевые клетки Panc2.13 (5х 106) с матригелем (1:1) в 0,2 мл PBS для развития опухоли. 41 животное случайным образом распределяли на группы, когда средний объем опухоли достигал 149 мм3. Введение тестируемых образцов и количества животных в каждой группе представлены в таблице схемы эксперимента.
- 97 045862
4.3. Получение состава тестируемого образца
Тестируемый образец Конц. (мг/мл) Состав
Носитель - 25 мМ гистидин, pH 7, 10% сахароза
BCY8245 BCY8245 0,5 о,з Разбавить 400 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8245 400 мкл гистидинового буфера Разбавить 240 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8245 560 мкл гистидинового буфера
BCY8253 0,5 Разбавить 400 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8253400 мкл гистидинового буфера
BCY8253 о,з Разбавить 240 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8253560 мкл гистидинового буфера
BCY8255 0,5 Разбавить 400 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8255 400 мкл ацетатного буфера
BCY8255 о,з Разбавить 240 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8255 560 мкл ацетатного буфера
3. Гистидиновый буфер:25мМ гистидин, рН7, 10% сахароза 4. Ацетатный буфер: 50 мМацетат/уксусная кислота, pH 5, 10% сахароза
4.4. Взятие образцов.
В конце исследования опухоли во всех группах извлекали через 2 ч после последнего дозирования.
5. Результаты.
5.1. Кривые роста опухоли.
Кривые роста опухоли представлена на фиг. 19-21.
5.2. Регистрация объема опухоли.
Средний объем опухоли с течением времени у самок мышей Balb/c nude, имеющих ксенотрансплантат Panc2.13, представлен в табл. 18.
Таблица 18. Регистрация объема опухоли с течением времени
Группа. Лечение Сутки после начала лечения
0 2 4 7 9 И 14
1 Носитель, qw 149±1 2 202±1 2 240±9 321±1 7 410±2 7 479±3 2 545±1 7
η BCY8245, 149±3 160±3 191±3 215±5 242±6 259±5 271±5
2 3 мг/кг, qw 4 3 9 3 2 9 4
BCY8245, 148±4 170±3 204±5 216±5 236±5 241±6 231±5
3 мг/кг, biw 6 8 7 6 9 0 7
Л BCY8245, 149±1 180±1 231±3 242±3 248±4 231±3 238±4
4 5 мг/кг, qw 8 1 3 4 0 7 0
с BCY8253, 149±1 176±2 230±2 253±2 274±2 303±1 324±2
Э 3 мг/кг, qw 9 0 5 0 7 8 1
BCY8253, 149±4 175±3 217±6 216±5 222±6 213±6 219±6
О 3 мг/кг, biw 2 9 1 9 4 4 8
7 BCY8253, 148±7 159±8 195±5 190±5 173±1 168±1 170±2
- 98 045862
5 мг/кг, qw 1 2 3
8 BCY8255, 3 мг/кг, qw 150±3 5 184±3 9 234±5 2 267±5 2 277±5 4 297±5 5 310±5 8
Q BCY8255, 149±4 186±4 233±5 247±5 256±5 244±4 251±4
3 мг/кг, biw 1 3 2 3 4 4 4
10 BCY8255, 150±2 180±2 223±3 239±3 224±3 200±1 209±1
5 мг/кг, qw 7 7 7 9 1 8 9
5.3. Анализ ингибирования роста опухоли. Скорость ингибирования роста опухоли для тестируемых образцов в модели с ксенотрансплантатом Panc2.13 вычисляли на основе измерения объема опухоли через 14 суток после начала лечения. Таблица 19. Анализ ингибирования роста опухоли Значение Р но Объем T/Cb TGI Группа Лечение сравнению с опухоли (мм3)а (%) (%) носителем
1 Носитель, qw 545±17
2 BCY8245, 3 мг/кг, qw 271±54 49,6 69,2 /?<0,01
3 BCY8245, 3 мг/кг, biw 231±57 42,3 79,1 /?<0,001
4 BCY8245, 5 мг/кг, qw 238±40 43,6 77,5 /?<0,001
5 BCY8253, 3 мг/кг, qw 324±21 59,3 55,9 /?<0,01
6 BCY8253, 3 мг/кг, biw 219±68 40,2 82,2 /?<0,001
7 BCY8253, 5 мг/кг, qw 170±23 31,1 94,5 /?<0,001
8 BCY8255, 3 мг/кг, qw 310±58 56,8 59,5 /?<0,01
9 BCY8255, 3 мг/кг, biw 251±44 46,0 74,3 /?<0,001
10 BCY8255, 5 мг/кг, qw 209±19 38,2 85,1 /?<0,001
а. Среднее значение ± SEM.
b. Ингибирование роста опухоли вычисляют путем деления среднего по группе объема опухоли для группы лечения на средний по группе объем опухоли для контрольной группы (Т/С).
6. Обобщение и обсуждение результатов.
В этом исследовании оценивали терапевтическую эффективность тестируемых образцов в модели с ксенотрансплантатом Panc2.13. Измеренные объемы опухоли во всех группах лечения в различные моменты времени представлены на фиг. 19-21 и в табл. 18 и 19.
BCY8245 в дозе 3 мг/кг, qw (TV=271 мм3, TGI=69,2%,p<0,01), 3 мг/кг, biw (TV=231 мм3, TGI=79,1%, p<0,001) и 5 мг/кг, qw (TV=238 мм3, TGI=77,5%, p<0,001) имел значительную противоопу холевую активность.
BCY8253 в дозе 3 мг/кг, qw (TV=324 мм3, TGI=59,8%, p<0,01), 3 мг/кг, biw (TV=219 мм3, TGI=82,2%, р<0,001) и 5 мг/кг, qw (TV=170 мм3, TGI=94,5%, p<0,001) имел значителную противоопухолевую активность зависимым от дозы или частоты дозирования образом.
BCY8255 в дозе 3 мг/кг, qw (TV=310 мм3, TGI=59,5%, p<0,01), 3 мг/кг, biw (TV=251 мм3, TGI=74,3%, р<0,001) и 5 мг/кг, qw (TV=209 мм3, TGI=85,1%, p<0,001) имел значительную противоопухолевую активность.
- 99 045862
В этом исследовании животные во всех группах 5 мг/кг qw теряли в среднем более 15% массы тела, особенно животные в группах BCY8253 и BCY8255 5 мг/кг, которые утрачивали более 20% массы тела в ходе режима лечения.
Пример 4. Исследование эффективности in vivo BCY8245, BCY8253 и BCY8255 при лечении мышей Balb/c nude с ксенотрансплантатом MDA-MB-468 (модель рака молочной железы).
1. Задача исследования.
Задачей исследования является оценка in vivo противоопухолевой эффективности BCY8245, BCY8253 и BCY8255 при лечении мышей Balb/c nude с ксенотрансплантатом MDA-MB-468.
2. Схема эксперимента
Групп a Лечение η Доза (мг/кг) Объем дозировани я (мкл/г) Путь дозирован ня Схема
1 Носитель 5 10 в/в qw
2 BCY8245 3 3 мг/кг 10 в/в qw
3 BCY8245 3 3 мг/кг 10 в/в biw
4 BCY8245 3 5 мг/кг 10 в/в qw
5 BCY8253 3 3 мг/кг 10 в/в qw
6 BCY8253 3 3 мг/кг 10 в/в biw
7 BCY8253 3 5 мг/кг 10 в/в qw
8 BCY8255 3 3 мг/кг 10 в/в qw
9 BCY8255 3 3 мг/кг 10 в/в biw
10 BCY8255 3 5 мг/кг 10 в/в qw
3. Материалы.
3.1. Животные и условия содержания.
3.1.1. Животные.
Вид: Mus Musculus Линия: Balb/c nude.
Возраст: 6-8 недель.
Пол: самки.
Масса тела: 18-22 г.
Количество животных: 41 мышь плюс запасные.
Поставщик животных: Shanghai LC Laboratory Animal Co., LTD.
3.1.2. Условия содержания.
Мышей содержали в индивидуально вентилируемых клетках при постоянной температуре и влажности с 3 или 5 животными в каждой клетке.
Температура: 20~26°С.
Влажность 40-70%.
Клетки: изготовлены из поликарбоната. Размер составляет 300 ммх180 ммх150 мм. Материалом подстилки были сердцевины кукурузных початков, которые заменяли два раза в неделю.
Рацион: животные имели свободный доступ к стерилизованному облучением сухому гранулированному корму в ходе всего периода исследования.
Вода: животные имели свободный доступ к питьевой воде.
Идентификация клеток: идентификационные ярлыки для каждой клетки содержали следующую информацию: количество животных, пол, линия, дата получения, лечение, номер испытания, номер группы и дата начала испытания.
Идентификация животных: животных маркировали кодированием на ушах.
4. Способы и процедуры эксперимента.
4.1. Культивирование клеток.
Опухолевые клетки поддерживали в среде Лейбовитца L-15, дополненной 10% инактивированной нагреванием эмбриональной телячьей сывороткой, при 37°С в атмосфере 5% СО2 в воздухе. Опухолевые клетки стандартным образом субкультивировали два раза в неделю. Клетки, растущие в экспоненциальной фазе роста, собирали и подсчитывали для инокуляции опухоли.
4.2. Инокуляция опухоли.
Каждой мыши подкожно инокулировали в правый бок опухолевые клетки MDA-MB-468 (10х 106) в 0,2 мл PBS, дополненной 50% матригелем, для формирования опухоли. 41 животное случайным образом распределяли на группы, когда средний объем опухоли достигал 196 мм3. Введение тестируемых образцов и количества животных в каждой группе представлены в таблице схемы эксперимента.
- 100 045862
4.3. Получение состава тестируемого образца.
Тестируемый образец Конц. (мг/мл) Состав
Носитель - 25 мМ гистидин, pH 7, 10% сахароза
BCY8245 1 Растворить 10,56 мг BCY8245 в 10,518 мл гистидинового буфера
BCY8245 0,5 Разбавить 400 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8245 посредством 400 мкл гистидинового буфера
BCY8245 о,з Разбавить 240 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8245 посредством 560 мкл гистидинового буфера
BCY8253 1 Растворить 11,35 мг BCY8253 в 11,010 мл гистидинового буфера
BCY8253 0,5 Разбавить 400 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8253 400 мкл гистидинового буфера
BCY8253 о,з Разбавить 240 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8253 560 мкл гистидинового буфера
BCY8255 1 Растворить 10,78 мг BCY8255 в 10,715 мл ацетатного буфера
BCY8255 0,5 Разбавить 400 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8255 400 мкл ацетатного буфера
BCY8255 0,3 Разбавить 240 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8255 560 мкл ацетатного буфера
1. Гистидиновый буфер:25мМ гистидин, рН7, 10% сахароза 2. Ацетатный буфер: 50 мМацетат/уксусная кислота, pH 5, 10% сахароза 3. Исходные растворы BCY8245(1 мг/мл), BCY8253(1 мг мл) и BCY8255 (1 мг мл) распределяли в индивидуальные пробирки и хранили при -80°С
4.4. Взятие образцов.
На 21 сутки исследования проводили взятие плазмы в группах 2, 5 и 8 через 5 мин, 15 мин, 30 мин, 60 мин и 120 мин после последнего дозирования. Опухоли в группах 1, 3, 6 и 9 извлекали через 2 ч после последнего дозирования. Животных в группе 4, 7 и 10 продолжали содержать в течение 21 суток без какого-либо дозирования и опухоли в этих группах извлекали на 42 сутки.
5. Результаты.
5.1. Кривые роста опухоли.
Кривые роста опухоли представлены на фиг. 22-24.
5.2. Регистрация объема опухоли.
Средний объем опухоли с течением времени у самок мышей Balb/c nude, имеющих ксенотрансплантат MDA-MB-468, представлен в табл. 20 и 21.
- 101 045862
Таблица 20. Регистрация объема опухоли с течением времени (сутки с 0 по 21)
Группа Лечение Сутки после начала лечения
0 2 4 7 9 И 14 16 18 21
1 Носитель, qw 199±6 217±9 235±15 274±14 291±14 314±20 348±24 374±33 398±39 447±39
2 BCY8245, 3 мг/кг, qw 194±12 192±26 184±20 131±20 113=1=17 104±13 94±25 81±23 87±23 85±31
3 BCY8245, 3 мг/кг, biw 195±33 193±27 154±20 103±20 83±16 67±14 49±11 45±14 32±12 22±4
4 BCY8245, 5 мг/кг, qw 199±28 193±11 135±4 98±5 58±5 49±5 47±2 37±4 35±3 29±3
5 BCY8253, 3 мг/кг, qw 195±17 190±24 162±21 160±28 138±33 139±32 136±25 106±24 104±18 109±19
6 BCY8253, 3 мг/кг, biw 199±34 198±13 150±21 119±11 102±14 69±13 70±5 46±5 33±5 29±7
7 BCY8253, 5 мг/кг, qw 198±28 188±32 142±32 150±20 95±13 69±13 67±13 47±8 42±5 40±8
8 BCY8255, 3 мг/кг, qw 198±18 191±15 172±24 148±18 139=1=13 114±22 140±13 128±22 141=1=18 136±31
9 BCY8255, 3 мг/кг, biw 197±36 190±28 154±18 109±11 90±13 67±3 64±7 51±8 41±5 31=1=1
10 BCY8255, 5 мг/кг, qw 194±29 156±25 121±19 109±14 75±14 55±8 66±5 43±5 37±1 42±2
Группа Таблица 21. Регистрация объема опухоли с течением времени (сутки с 23 по 42)
Лечение Сутки после начала лечения
23 25 28 32 35 39 42
4 BCY8245, 5 мг/кг, qw 35±5 48±5 37±7 28±6 24±4 28±6 26±6
7 BCY8253, 5 мг/кг, qw 45±7 56±8 60±19 45±2 41±10 48±15 50±20
10 BCY8255, 5 мг/кг, qw 41±4 57±7 48±8 39±9 39±6 38±9 34±8
5.3. Анализ ингибирования роста опухоли.
Скорость ингибирования роста опухоли для тестируемых образцов в модели ксенотрансплантата MDA-MB-468 вычисляли на основе измерения объема опухоли на 21 сутки после начала лечения.
Таблица 22. Анализ ингибирования роста опухоли
Группа Лечение Объем опухоли (мм3)а Т/Сь Значиние Р по сравнению с носителем
(%) TGI (%)
1 Носитель, qw 447±39 -- -- -
2 BCY8245, 3 мг/кг, qw 85±31 18,9 144,2 /?<0,001
3 BCY8245, 3 мг/кг, biw 22±4 4,9 169,8 //<0,001
4 BCY8245, 5 мг/кг, qw 29±3 6,6 168,4 //<0,001
5 BCY8253, 3 мг/кг, qw 109±19 24,4 134,7 //<0,001
6 BCY8253, 3 мг/кг, biw 29±7 6,6 168,3 //<0,001
7 BCY8253, 5 мг/кг, qw 40±8 8,9 163,9 //<0,001
8 BCY8255, 3 мг/кг, qw 136±31 30,4 125,1 //<0,001
9 BCY8255, 3 мг/кг, biw 31±1 6,9 166,8 //<0,001
10 BCY8255, 5 мг/кг, qw 42±2 9,5 161,3 //<0,001
- 102 045862
а. Среднее значение ± SEM.
b. Ингибирование роста опухоли вычисляют путем деления среднего по группе объема опухоли для группы лечения на средний по группе объем опухоли для контрольной группы (Т/С).
6. Обобщение и обсуждение результатов.
В этом исследовании оценивали терапевтическую эффективность тестируемых образцов в модели с ксенотрансплантатом MDA-MB-468. Измеренные объемы опухоли во всех группах лечения в различные моменты времени представлены на фиг. 22-24 и в табл. 20-22.
BCY8245 в дозе 3 мг/кг, qw (TV=85 мм3 4, TGI=144,2%, p<0,001), 3 мг/кг, biw (TV=22 мм3, TGI=169,8%, p<0,001) и 5 мг/кг, qw (TV=29 мм3, TGI=168,4%, p<0,001) имел значительную противоопухолевую активность зависимым от дозы или частоты дозы образом.
BCY8253 в дозе 3 мг/кг, qw (TV=109 мм3, TGI=134,7%, p<0,001), 3 мг/кг, biw (TV=29 мм3, TGI=168,3%, р<0,001) и 5 мг/кг, qw (TV=40 мм3, TGI=163,9%, p<0,001) имел значительную противоопухолевую активность зависимым от дозы или частоты дозы образом.
BCY8255 в дозе 3 мг/кг, qw (TV=136 мм3, TGI=125,1%, p<0,001), 3 мг/кг, biw (TV=31 мм3, TGI=166,8%, р<0,001) и 5 мг/кг, qw (TV=42 мм3, TGI=161,3%, p<0,001) имел значительную противоопухолевую активность зависимым от дозы или частоты дозы образом.
Дозирование в группах 5 мг/кг прекращали с 21 суток, опухоли не демонстрировали никакого рецидива в ходе мониторинга в течение дополнительных 3 недель.
В этом исследовании BCY8253 и BCY8255 5 мг/кг вызывали выраженное снижение массы тела, среди них мышь 10-1 в группе 5 мг/кг BCY8253 была найдена мертвой на 20 сутки.
Пример 5: Тест эффективности BCY8549, BCY8550, BCY8783 и BCY8784 in vivo при лечении мышей BALB/c nude с ксенотрансплантатом NCI-H292 (модель немелкоклеточного рака легкого (NSCLC))
1. Задача исследования.
Задачей исследования является оценка in vivo противоопухолевой эффективности BCY8549 при лечении мышей Balb/c nude с ксенотрансплантатом NCI-H292.
2. Схема эксперимента__________________________________________________________
Групп а Лечение η Доза (мг/кг) Объем дозиировани я (мкл/г) Путь дозирован ня Схема
1 Носитель 4 10 в/в qw
2 BCY8549 3 3 10 в/в qw
3 BCY8550 3 3 10 в/в qw
4 BCY8783 3 3 10 в/в qw
5 BCY8784 3 3 10 в/в qw
3. Материалы.
3.1. Животные и условия содержания.
3.1.1. Животные.
Вид: Mus Musculus.
Линия: Balb/c nude.
Возраст: 6-8 недель.
Пол: самки Масса тела: 18-22 г.
Количество животных: 43 мыши плюс запасные.
Поставщик животных: Shanghai Lingchang Biotechnology Experimental Animal Co. Ltd
3.1.2. Условия содержания.
Мышей содержали в индивидуально вентилируемых клетках при постоянной температуре и влажности с 3 или 4 животными в каждой клетке.
Температура: 20~26°С.
Влажность 40-70%.
Клетки: изготовлены из поликарбоната. Размер составляет 300 ммх180 ммх150 мм. Материалом подстилки были сердцевины кукурузных початков, которые заменяли два раза в неделю.
Рацион: животные имели свободный доступ к стерилизованному облучением сухому гранулированному корму в ходе всего периода исследования.
Вода: животные имели свободный доступ к питьевой воде.
Идентификация клеток: идентификационные ярлыки для каждой клетки содержали следующую информацию: количество животных, пол, линия, дата получения, лечение, номер испытания, номер группы и дата начала испытания.
Идентификация животных: животных маркировали кодированием на ушах.
4. Способы и процедуры эксперимента.
4.1. Культивирование клеток.
Опухолевые клетки NCI-H292 поддерживали in vitro в качестве культуры в виде монослоя в среде
- 103 045862
RPMI-1640, дополненной 10% инактивированной нагреванием эмбриональной телячьей сывороткой, при 37°С в атмосфере 5% СО2 в воздухе. Опухолевые клетки стандартным образом субкультивировали два раза в неделю посредством обработки трипсином-EDTA. Клетки, растущие в экспоненциальной фазе роста, собирали и подсчитывали для инокуляции опухоли.
4.2. Инокуляция опухоли.
Каждой мыши подкожно инокулировали в правый бок опухолевые клетки NCI-H292 (10х106) в 0,2 мл PBS для развития опухоли. 43 животных случайным образом распределяли на группы, когда средний объем опухоли достигал 168 мм3. Введение тестируемых образцов и количества животных в каждой группе представлены в таблице схемы эксперимента.
Получение состава тестируемого образца_______________________________________
Лечение Конц. (мг/мл) Состав
Лечение Конц. (мг/мл) Состав
Носитель - 25 мМ гистидин, pH 7, 10% сахароза
BCY8549 1 Растворить 2 мг BCY8549 посредством 1914 мкл буфера для носителя
BCY8549 0,3 Разбавить 240 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8549 посредством 560 мкл буфера для носителя
BCY8550 1 Растворить 1,1 mtBCY8550 в 1091 мк 10% Kolliphor, 50 мМ Hepes, pH 7
BCY8550 о,з Разбавить 240 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8550 посредством 560 мкл 10% Kolliphor, 50 мМ Hepes, pH 7
BCY8783 1 Растворить 1 мг BCY8783 в 968 мкл буфера для носителя
BCY8783 о,з Разбавить 240 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8783 560 мкл буфера для носителя
BCY8784 1 Растворить 1,2 мг BCY8784 в 1148 мкл буфера для носителя
BCY8784 о,з Разбавить 240 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8784 560 мкл буфера для носителя
4.4. Взятие образцов.
В конце исследования проводили взятие плазмы мышей в группах 2 и 3 через 5, 15, 30, 1 и 2 ч после последнего дозирования.
5. Результаты.
5.1. Кривые роста опухоли.
Кривые роста опухоли представлены на фиг. 25-28.
5.2. Регистрация объема опухоли.
Средний объем опухоли с течением времени у самок мышей Balb/c nude, имеющих ксенотрансплантат NCI-H292, представлен в табл. 23.
Таблица 23. Регистрация объема опухоли с течением времени
Сутки после начала лечения
Групп
а 0 2 4 7 9 11 14
Носитель, 168±1 297±4 362±5 460±6 548±6 697±10 843±15
1 qw 6 8 8 2 9 2 2
BCY8549, 168±3 187±3 164±3 205±5 234±5
2 3 мг/кг, qw 0 6 1 0 7 240±98 251±66
BCY8550, 167±1 208±2 237±1 324±3 421±3
3 3 мг/кг, qw 8 1 6 5 5 489±44 545±77
BCY8783, 167±2 182±2 161±4 137±1 135±2
4 3 мг/кг, qw 8 7 0 9 2 97±20 97±19
BCY8784, 167±3 165±2 Ш±1 121±1
5 3 мг/кг, qw 6 8 9 2 123±8 99±10 94±7
- 104 045862
5.3. Анализ ингибирования роста опухоли. Скорость ингибирования роста опухоли для тестируемых образцов в модели с ксенотрансплантатом NCI-H292 вычисляли на основе измерения объема опухоли на 14 сутки после начала лечения. Таблица 24. Анализ ингибирования роста опухоли
Г руппа Лечение Объем Значение Р
опухоли (мм3)а Т/Сь
(%) TGI (%)
1 Носитель, qw 843±152 - - -
2 BCY8549, 3 мг/кг, qw 251±66 29,8 87,7 /?<0,05
3 BCY8550, 3 мг/кг, qw 545±77 64,7 43,9 /?>0,05
4 BCY8783, 3 мг/кг, qw 97±19 И,5 110,3 /?<0,01
5 BCY8784, 3 мг/кг, qw 94±7 И,1 110,8 /?<0,01
а. Среднее значение ± SEM.
b. Ингибирование роста опухоли вычисляют путем деления среднего по группе объема опухоли для группы лечения на средний по группе объем опухоли для контрольной группы (Т/С).
6. Обобщение и обсуждение результатов.
В этом исследовании оценивали терапевтическую эффективность BCY в модели с ксенотрансплантатом NCI-H292. Измеренный объем опухоли во всех группах лечения в различные моменты времени представлен на фиг. 25-28 и в табл. 23 и 24.
Средний размер опухоли у мышей, которым вводили носитель, достигал 843 мм3 на 14 сутки. BCY8549 в дозе 3 мг/кг продемонстрировал значительную противоопухолевую активность. В этом исследовании у всех мышей хорошо сохранялась масса тела.
Пример 6. Исследование ассоциации между варьированием числа копий (CNV) и экспрессией гена нектина-4 для множества типов опухолей.
Способы.
1. Выбрать все исследования на cBioPortal (http://www.cbioportal.org/) и провести поиск для нектина-4.
(a) Удалить предварительные исследования.
(b) Отменить выбор исследований с перекрывающимися образцами для предотвращения смещения выборки (на основе предупреждения cBioPortal) - всегда оставлять исследования PanCancer, если есть такая возможность.
(c) Исследования, отобранные для анализа (табл. 25).
- 105 045862
Таблица 25. Исследования, проанализированные из cBioPortal, и исследуемые элементы
Название исследование Элементы
Рак молочной железы (METABRIC, Nature 2012 & Nat Commun 2016) Экспрессия мРНК (микрочип)
Инвазивная карцинома молочной железы (TCGA, PanCancer Atlas) Экспрессия мРНК, нормализованная по партиям/объединенная из Illumina HiSeq_RNASeqV2 syn4976369
Карцинома эндометрия тела матки (TCGA, PanCancer Atlas) Экспрессия мРНК, нормализованная по партиям/объединенная из Illumina HiSeq_RNASeqV2 syn4976369
Карцинома уротелия мочевого пузыря (TCGA, PanCancer Atlas) RSEM (нормализованная по париям из HiSeq_RNASeqV2)
Аденокарцинома легкого (TCGA, PanCancer Atlas) Экспрессия мРНК, RSEM (нормализованная по париям из Illumina HiSeq_RNASeqV2)
Плоскоклеточная карцинома шейки матки (TCGA, PanCancer Atlas) RSEM (нормализованная по париям из Illumina HiSeq_RNASeqV2)
Плоскоклеточная карцинома легкого (TCGA, PanCancer Atlas) Экспрессия мРНК, нормализованная по партиям/объединенная из Illumina HiSeq_RNASeqV2 syn4976369
Плоскоклеточная карцинома головы и шеи (TCGA, PanCancer Atlas) мРНК Expression, RSEM (нормализованная по партиям из Illumina HiSeq_RNASeqV2)
Аденокарцинома поджелудочной железы (TCGA, PanCancer Atlas) Экспрессия мРНК, нормализованная по партиям/объединенная из Illumina HiSeq_RNASeqV2 syn4976369
Карцинома щитовидной железы (TCGA, PanCancer Atlas) Экспрессия мРНК, нормализованная по партиям/объединенная из Illumina HiSeq_RNASeqV2 syn4976369
Аденокарцинома толстого кишечника (TCGA, PanCancer Atlas) RSEM (нормализованная по партиям из Illumina HiSeq_RNASeqV2)
- 106 045862
Тимома (TCGA, PanCancer Atlas) Экспрессия мРНК, нормализованная по партиям/объединенная из Illumina HiSeq_RNASeqV2 syn4976369
Саркома (TCGA, PanCancer Atlas) Экспрессия мРНК, нормализованная по партиям/объединенная из Illumina HiSeq_RNASeqV2 syn4976369
Аденокарцинома желудка (TCGA, PanCancer Atlas) Экспрессия мРНК, нормализованная по партиям/объединенная из Illumina HiSeq_RNASeqV2 syn4976369
Аденокарцинома предстательной железы (TCGA, PanCancer Atlas) Экспрессия мРНК, RSEM (нормализованная по партиям из Illumina HiSeq_RNASeqV2)
Хромофобная аденокарцинома почки (TCGA, PanCancer Atlas) Экспрессия мРНК, RSEM (нормализованная по партиям из Illumina HiSeq_RNASeqV2)
Аденокарцинома прямой кишки (TCGA, PanCancer Atlas) Экспрессия мРНК, нормализованная по партиям/объединенная из Illumina HiSeq_RNASeqV2 syn4976369
Метастазирующий рак предстательной железы, SU2C/PCF Dream Team (Robinson et al., Cell 2015) Экспрессия/улавливание мРНК (RNA Seq RPKM)
Феохромацитома и параганглиома (TCGA, PanCancer Atlas) Экспрессия мРНК, нормализованная по партиям/объединенная из Illumina HiSeq_RNASeqV2 syn4976369
Светлоклеточная карцинома почки (TCGA, PanCancer Atlas) Экспрессия мРНК, RSEM (нормализованная по партиям из Illumina HiSeq_RNASeqV2)
Аденокарцинома предстательной железы (Fred Hutchinson CRC, Nat Med 2016) Экспрессия мРНК
Аденокарцинома ободочной и прямой кишки (TCGA, Nature 2012) RNA Seq RPKM
- 107 045862
Серозная цистаденокарцинома яичника (TCGA, PanCancer Atlas) Экспрессия мРНК, нормализованная по партиям/объединенная из Illumina HiSeq_RNASeqV2 syn4976369
Папиллярная карцинома почки (TCGA, PanCancer Atlas) Экспрессия мРНК, RSEM (нормализованная по партиям из Illumina HiSeq_RNASeqV2)
Низкодифференцировнная глиома головного мозга (TCGA, PanCancer Atlas) RSEM (нормализованная по партиям из Illumina HiSeq_RNASeqV2)
Аденокарцинома пищевода (TCGA, PanCancer Atlas) RSEM (нормализованная по партиям из Illumina HiSeq_RNASeqV2)
Карцинома надпочечников (TCGA, PanCancer Atlas) RSEM (нормализованная по партиям из Illumina HiSeq_RNASeqV2)
Мультиформная глиобластома (TCGA, PanCancer Atlas) Экспрессия мРНК, RSEM (нормализованная по партиям из Illumina HiSeq_RNASeqV2)
Аденокарцинома предстательной железы (MSKCC, Cancer Cell 2010) Экспрессия мРНК
Карциносаркома матки (TCGA, PanCancer Atlas) Экспрессия мРНК, нормализованная по партиям/объединенная из Illumina HiSeq_RNASeqV2 syn4976369
Острый миелоидный лейкоз (TCGA, PanCancer Atlas) Экспрессия мРНК, RSEM (нормализованная по партиям из Illumina HiSeq_RNASeqV2)
Кожная меланома (TCGA, PanCancer Atlas) Экспрессия мРНК, нормализованная по партиям/объединенная из Illumina HiSeq_RNASeqV2 syn4976369
Мезотелиома (TCGA, PanCancer Atlas) Экспрессия мРНК, нормализованная по партиям/объединенная из Illumina HiSeq_RNASeqV2 syn4976369
Холангиокарцинома (TCGA, PanCancer Atlas) RSEM (нормализованная по партиям из Illumina HiSeq_RNASeqV2)
- 108 045862
Педиатрический острый лимфоидный лейкоз - фаза II (TARGET, 2018) Нектин-4: экспрессия мРНК (RNA-Seq RPKM)
Диффузная крупноклеточная В- клеточная лимфома (TCGA, PanCancer Atlas) Экспрессия мРНК, RSEM (нормализованная по партиям из Illumina HiSeq_RNASeqV2)
Энциклопедия линий злокачественных клеток (Novartis/Broad, Nature 2012) Экспрессия мРНК (микрочип)
Увеальная меланома (TCGA, PanCancer Atlas) Экспрессия мРНК, нормализованная по партиям/объединенная из Illumina HiSeq_RNASeqV2 syn4976369
Педиатрическая опухоль Вильмса (TARGET, 2018) Нектин-4: экспрессия мРНК (RNA-Seq RPKM)
Опухоли мужских половых клеток (TCGA, PanCancer Atlas) Экспрессия мРНК, нормализованная по партиям/объединенная из Illumina HiSeq_RNASeqV2 syn4976369
Печеночно-клеточная карцинома печени (TCGA, PanCancer Atlas) Нектин-4: экспрессия мРНК, RSEM (нормализованная по партиям из Illumina HiSeq_RNASeqV2)
2. Экспортировать CNV и данные экспрессии РНК из cBioPortal.
3. Протестировать, ассоциированы ли CNV на значимых уровнях с изменениями экспрессии мРНК для нектина-4 (log2 не применялся).
(а) Провести непараметрический тест Крускала-Уоллиса в GraphPad Prism (7.04) и R/R studio (порог для значимости: р<0,01).
(i) GraphPad Prism: создать таблицу из столбцов, провести непараметрический тест без подбора или формирования пар и не предполагая гауссово распределение.
(ii) Пакеты программ, используемые в R:
1. XLConnect.
2. dplyr.
3. Критерий суммы рангов Крускала-Уоллиса: критерий Крускала.
4. Внести поправку на множественные сравнения (включая все возможные сравнения, даже если n=1 в пределах группы) в R/Rstudio с использованием критерия Данна (пороговое значение для значимости: р<0,025).
(а) критерий Данна со способом множестванных сравнений = bonferonni.
Результаты.
Результаты представлены в табл. 26 ниже. Среди 41 общедоступного набора данных TCGA, в которых описаны как данные CNV, так и данные экспрессии мРНК нектина-4 для опухолей, существует множество показаний, где были описаны случаи либо прироста числа копий нектина-4 (2-3 копии), либо их амплификации (>3 копий). Кроме того, было продемонстрировано, что отдельные случаи имеют мелкие делеции (< 2 копий) с редкими сообщениями об опухолях, содержащих крупные делеции, соответствующие потере более чем 1 копии или биаллельной потере нектина-4. Сообщения об обнаружении амплификации наиболее часто были для рака молочной железы (10-22%), рака мочевого пузыря (20%), рака легкого (5-7%) и печеночно-клеточной карциномы (8%). Показаниями, где наиболее часто обнаруживалась амплификация, были хромофобная опухоль почек (77%), светлоклеточная карцинома почки (RCC) (6,5%), саркома (10%), рак толстого кишечника (10%), рак головы и шеи (7%) и плосоклеточный рак легкого. Эти данные указывают на то, что существует диапазон CNV в пределах и среди опухолевых показаний и разнообразие паттернов числа копий среди различных опухолей.
В дополнение к CNV в пределах набора данных TCGA срединный уровень экспрессии мРНК нектина-4 на опухоль охватывает диапазон приблизительно 210. Таким образом, учитывая диапазон уровней экспрессии мРНК нектина-4 и CNV, наблюдаемые среди и в пределах типов опухолей, проводили статистическое тестирование для идентификации потенциальных ассоциаций между уровнями нектина-4 мРНК и CNV для нектина-4 в пределах индивидуальных наборов данных/показаний TCGA. Опухоли в соответствии с показаниями относили к 1 из 5 классов:
a) крупная делеция;
- 109 045862
b) мелкая делеция;
c) диплоидная;
d) прирост; или
e) амплификация.
Затем проводили тест Крускала-Уоллиса для определения того, различались ли распределения величин экспрессии мРНК на класс между классами (Р < 0,01). Для наборов данных TCGA с Р < 0,01 и для идентификации того, какие классы отличались друг от друга, проводили апостериорное тестирование посредством вычисления Z-статистики с вычисленными скорректированными значениями Р (Bonferonni). Для простоты интерпретации рассматривали попарные сравнения против диплоидных на показание (хотя были включены все значения Р для попарных сравнений). 18/41 исследований TCGA удовлетворяли Р <0,01 для теста Крускала-Уоллиса и Р < 0,025 для Бонферрони для сравнений прирост против диплоидного и/или амплификация против диплоидного, указывая на ассоциации увеличенной экспрессии мРНК нектина-4 мРНК с увеличенным количеством копий нектина-4. Эти 18 исследований соответствовали 14 независимым гистологиям опухоли: молочной железы, матки, мочевого пузыря, аденокарциномы легкого, плоскоклеточной карциномы легкого, шейки матки, головы и шеи, поджелудочной железы, ободочной и прямой кишки, тимомы, саркомы, светлоклеточной карциномы почки (RCC) и желудка.
Кроме того, 6 исследований имели сниженную экспрессию мРНК, ассоциированную со снижением числа копий. Четыре из этих шести исследований не только продемонстрировали ассоциацию между снижением CNV и сниженной экспрессией, но также сообщили о увеличении CNV, ассоциированным с высокой экспрессией: желудка, плоскоклеточный легкого, толстого кишечника и щитовидной железы.
Между тем, для двух показаний, хромофобный рак почки и рак предстательной железы, описаны только ассоциации со снижением CNV и низким содержанием транскрипта. Кроме того, существовало отдельное исследование рака предстательной железы (метастазирующий рак предстательной железы, SU2C/PCF Dream Team (Robinson et al., Cell 2015)), которое показало прирост числа копий, ассоциированный с высокой экспрессией (относительно диплоидного).
Эти наблюдения снижения CNV в опухоли и увеличения уровней экспрессии мРНК могут отражать механизм для экспрессии белка нектина-4 в опухоли при тех показаниях, при которых наблюдались такие ассоциации. Очевидно, существуют показания, где CNV, по-видимому, не влияли на уровни экспрессии мРНК в прогнозируемом паттерне, такие как печеночно-клеточная карцинома. Было продемонстрировано, что доклиническая эффективность in vivo определенных бициклических конъюгатов лекарственного средства против нектина-4 коррелирует с экспрессией белка нектина-4 при определении посредством IHC. Таким образом, если CNV нектина-4 в опухоли ассоциирован с уровнями мРНК и прогнозируемыми уровнями экспрессии белков, формально является возможным, что пациенты с опухолями, содержащими увеличение количества копий (прирост или амплификация), более вероятно могут отвечать на бициклические конъюгаты лекарственного средства против нектина-4 по изобретению. Если бы можно было идентифицировать пациентов с увеличенным CNV нектина-4, тогда эту информацию можно было бы использовать для выбора пациентов для лечения бициклическими конъюгатами лекарственного средства против нектина-4 по изобретению.
Таблица 26. Результаты исследования ассоциации между варьированием числа копией (CNV) и экспрессией гена для нектина-4
Количество образцов/группа (п=Х) Критерий КрускалаУоллиса Попарное сравнение, Z-статистика (скорректированное значение р), Бонферрони
Назван не исследо вания Элементы Крупн ая делеци я Мелк ая делец ня Диплоид ный Прир ост Амплифи кация Статист ика Крускал аУоллиса Значе ние р Крупна я делеция диплоид ный Диплои дный мелкая делеция Диплои дный Прирос т Ами лиф икац иядипл оидн ый
Рак молочно й железы (МЕТА BRIC, Nature 2012 & Nat Commun 2016) Экспрессия мРНК (микрочип) 0 И 745 706 404 380,4 < 2,2е- 16 N/A 0,568782 (1,0000) 11,89096 (0,0000) * 18,85 085 (0,00 00)*
- 110 045862
Инвазив ная карцино ма молочно й железы (TCGA, РапСапс er Atlas) Экспрессия мРНК, нормализов анная по партиям/объ единенная из Illumina HiSeqRNA SeqV2 syn4976369 0 13 244 640 97 219,5 < 2,2е- 16 N/A 1,186089 (0,7068) 12,30176 (0,0000) * 12,07 432 (0,00 00)*
Карцино ма эндомет рия тела матки (TCGA, РапСапс er Atlas) Экспрессия мРНК, нормализов анная по партиям/объ единенная из Illumina HiSeqRNA SeqV2 syn4976369 0 5 274 210 18 76,392 < 2,2е- 16 N/A 1,130854 (0,7743) 7,274308 (0,0000) * 5,601 260 (0,00 00)*
Карцино ма уротели RSEM (нормализов анная по 0 16 171 145 70 67,078 1,80Е- 14 N/A 0,060907 (1,0000) 3,323839 (0,0027) 8,054 269
я мочевог о пузыря (TCGA, РапСапс er Atlas) париям из HiSeqRNA SeqV2) * (0,00 00)*
Аденока рцинома легкого (TCGA, РапСапс er Atlas) Экспрессия мРНК, RSEM (нормализов анная по париям из Illumina HiSeqRNA SeqV2) 0 9 129 332 33 59,578 7,24Е- 13 N/A 0,237200 (1,0000) 6,244156 (0,0000) * 6,247 228 (0,00 00)*
Плоскок леточна я карцино ма шейки матки (TCGA, RSEM (нормализов анная по париям из Illumina HiSeqRNA SeqV2) 0 7 115 147 6 51,372 4,08Е- 11 N/A 1,093749 (0,8222) 6,170067 (0,0000) * 3,815 296 (0,00 04)*
- 111 045862
PanCanc er Atlas)
Плоскок леточна я карцино ма легкого (TCGA, PanCanc er Atlas) Экспрессия мРНК, нормализов анная по партиям/объ единенная из Illumina HiSeqRNA SeqV2 syn4976369 0 22 199 222 23 42,128 3,77Е- 09 N/A 2,819759 (0,0144) * 3,034709 (0,0072) * 4,860 629 (0,00 00)*
Плоскок леточна я карцино ма головы и шеи (TCGA, PanCanc er Atlas) мРНК Expression, RSEM (нормализов анная по партиям из Illumina HiSeqRNA SeqV2) 0 32 330 122 4 37,81 3,10Е- 08 N/A 1,736867 (0,2472) 4,848550 (0,0000) * 3,033 083 (0,00 73)*
Аденока рцинома поджелу дочной железы (TCGA, PanCanc er Atlas) Экспрессия мРНК, нормализов анная по партиям/объ единенная из Illumina HiSeqRNA SeqV2 syn4976369 0 7 105 50 6 36,863 4,92Е- 08 N/A 1,333193 (0,5474) 4,388701 (0,0000) * 4,166 401 (0,00 01)*
Карцино ма щитовид ной железы (TCGA, PanCanc er Atlas) Экспрессия мРНК, нормализов анная по партиям/объ единенная из Illumina HiSeqRNA SeqV2 syn4976369 0 3 451 26 0 31,882 1,19Е- 07 N/A 2,486724 (0,0193) * 5,021279 (0,0000) * N/A
Аденока рцинома толстого RSEM (нормализов анная по 0 40 266 80 2 31,309 7,32Е- 07 N/A 3,811621 (0,0004) 2,987223 (0,0084) 1,759 508
- 112 045862
кишечн ика (TCGA, PanCanc er Atlas) партиям из Illumina HiSeqRNA SeqV2) * * (0,23 55)
Тимома (TCGA, PanCanc er Atlas) Экспрессия мРНК, нормализов анная по партиям/объ единенная из Illumina HiSeqRNA SeqV2 syn4976369 0 0 95 22 2 26,213 2,03Е- 06 N/A N/A 4,962115 (0,0000) * 1,567 541 (0,17 55)
Саркома (TCGA, PanCanc er Atlas) Экспрессия мРНК, нормализов анная по партиям/объ единенная из Illumina HiSeqRNA 0 22 120 74 14 26,831 6,39Е- 06 N/A 0,410850 (1,0000) 4,582047 (0,0000) * 3,106 262 (0,00 57)*
SeqV2 syn4976369
Аденока рцинома желудка (TCGA, PanCanc er Atlas) Экспрессия мРНК, нормализов анная по партиям/объ единенная из Illumina HiSeqRNA SeqV2 syn4976369 0 И 253 134 9 19,096 0,0002 611 N/A 2,835658 (0,0137) * 2,921683 (0,0104) * 0,265 333 (1,00 00)
Аденока рцинома предстал ельной железы (TCGA, PanCanc er Atlas) Экспрессия мРНК, RSEM (нормализов анная по партиям из Illumina HiSeqRNA SeqV2) 3 15 437 29 3 19,125 0,0007 426 2,532734 (0,0566) 3,202764 (0,0068) * 1,351661 (0,8824) 0,509 151 (1,00 00)
- 113 045862
Хромоф обная аденока рцинома почки (TCGA, РапСапс er Atlas) Экспрессия мРНК, RSEM (нормализов анная по партиям из Illumina HiSeqRNA SeqV2) 0 50 14 1 0 13,851 0,0009 823 N/A 3,609735 (0,0005) * 0,058395 (1,0000) N/A
Аденока рцинома прямой кишки (TCGA, РапСапс er Atlas) Экспрессия мРНК, нормализов анная по партиям/объ единенная из Illumina HiSeqRNA SeqV2 syn4976369 0 И 91 33 1 14,056 0,0028 3 N/A 1,050760 (0,8801) 2,951363 (0,0095) * 1,809 506 (0,21 H)
Метаста зирующ ий рак предстат Экспрессия/ улавливание мРНК (RNA 0 3 75 37 2 12,336 0,0063 17 N/A 0,040058 (1,0000) 3,420479 (0,0019) * 0,362 109 (1,00
ельной железы, SU2C/P CF Dream Team (Robinso п et al., Cell 2015) Seq RPKM) 00)
Феохро мацитом а и параганг лиома (TCGA, РапСапс er Atlas) Экспрессия мРНК, нормализов анная по партиям/объ единенная из Illumina HiSeqRNA SeqV2 syn4976369 0 14 123 19 5 11,573 0,0089 98 N/A 1,271308 (0,6109) 2,597791 (0,0281) 2,201 970 (0,08 30)
Светлок леточна я Экспрессия мРНК, RSEM 0 22 297 32 1 11,314 0,0101 4 N/A 0,748380 (1,0000) 2,996852 (0,0082) 1,502 464
- 114 045862
карцино ма почки (TCGA, РапСапс er Atlas) (нормализов анная ио партиям из Illumina HiSeqRNA SeqV2) * (0,39 89)
Аденока рцинома предстат ельной железы (Fred Hutchins on CRC, Nat Med 2016) Экспрессия мРНК 0 1 59 66 7 9,8842 0,0195 8 N/A 0,677737 (1,0000) 0,409530 (1,0000) 3,028 793 (0,00 74)*
Аденока рцинома ободочн ой и прямой кишки (TCGA, RNA Seq RPKM 0 4 153 34 2 9,4054 0,02 N/A 0,062894 (1,0000) 1,860678 (0,1884) 2,514 653 (0,03 57)
Nature 2012)
Серозна я цистаде нокарци нома яичника (TCGA, РапСапс er Atlas) Экспрессия мРНК, нормализов анная по партиям/объ единенная из Illumina HiSeqRNA SeqV2 syn4976369 0 7 75 117 2 9,3101 0,0254 4 N/A 1,589035 (0,3362) 2,168253 (0,0904) 0,062 706 (1,00 00)
Паиилля рная карцино ма почки (TCGA, РапСапс er Atlas) Экспрессия мРНК, RSEM (нормализов анная по партиям из Illumina HiSeqRNA SeqV2) 1 19 239 15 0 9,1134 0,0278 2 1,607764 (0,3237) 0,569938 (1,0000) 2,552083 (0,0321) N/A
- 115 045862
Низкоди фференц ировнна я глиома головно го мозга (TCGA, РапСапс er Atlas) RSEM (нормализов анная по партиям из Illumina HiSeqRNA SeqV2) 0 И 462 32 2 4,769 0,1895 N/A 0,462462 (1,0000) 1,718955 (0,2569) 1,261 960 (0,62 09)
Аденока рцинома пищевод а (TCGA, РапСапс er Atlas) RSEM (нормализов анная по партиям из Illumina HiSeqRNA SeqV2) 0 8 78 86 9 4,267 0,234 N/A 0,747441 (1,0000) 0,768855 (1,0000) 1,756 911 (0,23 68)
Карцино ма надиоче чников (TCGA, РапСапс er Atlas) RSEM (нормализов анная по партиям из Illumina HiSeqRNA SeqV2) 0 9 54 И 2 4,0298 0,2583 N/A 0,157281 (1,0000) 0,131234 (1,0000) 1,984 800 (0,14 15)
Мульти формная глиобла стома (TCGA, РапСапс er Atlas) Экспрессия мРНК, RSEM (нормализов анная по партиям из Illumina HiSeqRNA SeqV2) 0 3 115 27 0 2,6252 0,2691 N/A 0,180194 (1,0000) 1,593755 (0,1665) N/A
Аденока рцинома предстат ельной железы (MSKC с, Cancer Cell 2010) Экспрессия мРНК 0 3 78 4 0 2,181 0,3361 N/A 1,423206 (0,2320) 0,454433 (0,9743) N/A
Карцино саркома матки (TCGA, Экспрессия мРНК, нормализов анная по 0 4 14 37 1 3,308 0,3465 N/A 0,104285 (1,0000) 0,539065 (1,0000) 1,764 353 (0,23
- 116 045862
PanCanc er Atlas) партиям/объ единенная из Illumina HiSeqRNA SeqV2 syn4976369 30)
Острый миелоид ный лейкоз (TCGA, PanCanc er Atlas) Экспрессия мРНК, RSEM (нормализов анная по партиям из Illumina HiSeqRNA SeqV2) 0 0 163 2 0 0,82638 0,3633 N/A N/A 0,909052 (0,1817) N/A
Кожная меланом a (TCGA, PanCanc er Atlas) Экспрессия мРНК, нормализов анная по партиям/объ единенная из Illumina HiSeqRNA 1 19 146 189 8 3,6483 0,4557 0,898187 (1,0000) 1,116994 (1,0000) 1,235317 (1,0000) 0,900 287 (1,00 00)
SeqV2 syn4976369
Мезотел нома (TCGA, PanCanc er Atlas) Экспрессия мРНК, нормализов анная по партиям/объ единенная из Illumina HiSeqRNA SeqV2 syn4976369 0 2 56 23 1 2,3747 0,4984 N/A 1,426445 (0,4612) 0,418206 (1,0000) 0,143 440 (1,00 00)
Холанги окарцин ома (TCGA, PanCanc er Atlas) RSEM (нормализов анная по партиям из Illumina HiSeqRNA SeqV2) 0 0 13 18 5 1,3058 0,5205 N/A N/A 0,653051 (0,7706) 1,121 055 (0,39 34)
Педиатр ический острый Нектин-4: экспрессия мРНК 0 4 66 10 1 2,2337 0,5253 N/A 0,133399 (1,0000) 0,504875 (1,0000) 1,375 728
- 117 045862
лимфои дный лейкоз фаза II (TARGE Т, 2018) (RNA-Seq RPKM) (0,50 67)
Диффуз ная крупнок леточна я В- клеточн ая лимфом а (TCGA, РапСапс er Atlas) Экспрессия мРНК, RSEM (нормализов анная по партиям из Illumina HiSeqRNA SeqV2) 0 2 25 9 1 1,4939 0,6837 N/A 0,374642 (1,0000) 1,170326 (0,7256) 0,405 844 (1,00 00)
Энцикло педия линий злокачес твенных Экспрессия мРНК (микрочип) 1 112 396 319 49 1,9013 0,7539 0,398204 (1,0000) 0,562427 (1,0000) 0,847920 (1,0000) 0,379 251 (1,00 00)
клеток (Novartis /Broad, Nature 2012)
Увеальн ая меланом а (TCGA, РапСапс er Atlas) Экспрессия мРНК, нормализов анная по партиям/объ единенная из Illumina HiSeqRNA SeqV2 syn4976369 0 0 72 8 0 0,067914 0,7944 N/A N/A 0,260603 (0,3972) N/A
Педиатр ическая опухоль Вильмса (TARGE Т, 2018) Нектин-4: экспрессия мРНК (RNA-Seq RPKM) 0 1 50 46 4 0,78538 0,853 N/A 0,165021 (1,0000) 0,815915 (1,0000) 0,090 701 (1,00 00)
- 118 045862
Опухол и мужски половых клеток (TCGA, РапСапс er Atlas) Экспрессия мРНК, нормализов анная по партиям/объ единенная из Illumina HiSeqRNA SeqV2 syn4976369 0 1 76 67 0 0,14279 0,9311 N/A 0,366969 (1,0000) 0,061216 (1,0000) N/A
Печеной ноклеточн ая карцино ма печени (TCGA, РапСапс er Atlas) Нектин-4: экспрессия мРНК, RSEM (нормализов анная по партиям из Illumina HiSeqRNA SeqV2) 0 1 89 224 34 0,2908 0,9618 N/A 0,082418 (1,0000) 0,188961 (1,0000) 0,363 341 (1,00 00)
Пример 7. Анализ экспрессии нектина-4 в 6 клеточных линиях.
1. Задача исследования.
Задачей исследования была оценка экспрессии нектина-4 в 6 клеточных линиях посредством проточной цитометрии, включая 2 клеточных линии рака молочной железы (T-47D, MDA-MB-468), 3 клеточных линии рака легкого (NCI-H292, NCI-H322, NCI-H526) и 1 клеточную линию фибросаркомы (НТ1080)).
2. Схема панели.
Панель для FCM в T-47D, MDA-MB-468, NCI-H292, NCI-H322 и НТ-1080
Флуорохром Пустой Изотипический Панель
PE - Изотипический контроль Нектин-4
Панель для NCI-H526
Флуорохром Пустой Изотипипический Панель
РЕ - Изотипический контроль Нектин-4
BV421 Живые/ погибшие Живые/погибшие Живые/ погибшие
3. Материал 3.1.
Образец.
Перечень клеточных линий
Положени е Клеточны е линии Тип злокачестве иной опухоли Поставщи к Свойства культуры Культуральная среда
1 T-47D Рак молочной железы АТСС- НТВ-133 приклепля ющаяся RPMI-1640+0,2 единицы/мл бычьего инсулина+10%FB S
2 MDA-MB- 468 Рак молочной железы АТСС- НТВ-132 Приклепля ющаяся Среда Лейбовитца L-15+10%FBS
3 NCI-H292 Легкого 91091815 Приклепля ющаяся RPMI- 1640+10%FBS
4 NCI-H322 Легкого 95111734 Приклепля ющаяся RPMI-1640+2 мМ глутамин+10% FB S
5 NCI-H526 Легкого CRL-5811 Округлые кластеры в суспензии RPMI- 1640+10%FBS
- 119 045862
3.2. Реагенты.
Антитела и набор для проточно-цитометрического анализа
Флуоресценция Маркер Каталожный номер Поставищик Комментарий
РЕ Нектин-4 FAB2659P R&D АААО0217021
РЕ Изотипический контрольный IgG2b IC0041P R&D От BICY- 20161117А
DPBS (Corning-21-031-CV).
Буфер для окрашивания (eBioscience-00-4222).
Буфер для фиксации (BD-554655).
3.3. Устройства.
Центрифуга Eppendorf 5810R.
Проточный цитометр BD FACS Canto (BD).
4. Способы и процедуры эксперимента.
4.1. Взятие образцов.
Собрать клеточные линии, растущие в экспоненциальной фазе роста. Подсчитать клетки посредством гемоцитометра с окрашиванием трипановым синим. Центрифугировать клетки при 400xg в течение 5 мин при 4°С, промыть клетки два раза буфером для окрашивания и суспендировать клетки в буфере для окрашивания до 1х107/мл.
4.2. Окрашивание антителом.
1) Распределить аликвотами 100 мкл суспензии клеток в каждую лунку 96-луночного V-образного планшета.
2) Добавить изотипический контроль или антитела к суспензии клеток и инкубировать в течение 30 мин при 4°С в темноте.
3) Промыть клетки 2х посредством центрифугирования при 400xg в течение 5 мин при 4°С и слить супернатант.
4) Ресуспендировать клетки с 100 мкл фиксирующего буфера и инкубировать в течение 30 мин при 4°С в темноте.
5) Промыть клетки 2х посредством центрифугирования при 300xg в течение 5 мин при 4°С и удалить супернатант.
6) Ресуспендировать клетки в 400 мкл буфера для окрашивания.
7) Проанализировать данные FACS с использованием программного обеспечения FlowJo V10.
4.3. Анализ данных.
Все данные FACS анализировали посредством программного обеспечения Flowjo V10 и Graphpad Prism или программного обеспечения Excel.
5. Результаты.
5.1. Стратегия гейтирования для панели.
Стратегия гейтирования для нектина-4 представлена на фиг. 29-32.
5.2. Анализ данных.
5.2.1. Жизнеспособность клеточных линий.
Жизнеспособность клеточных линий была такой, как показано ниже.
- 120 045862
Клеточная линия Тип злокачественной опухоли Жизнеспособность Количество жизнеспособных клеток/ миллион
1 T-47D Молочной железы 98,1 8,6
2 MDA-MB- 468 Молочной железы 98,7 5,3
3 NCI-H292 Легкого 98,7 10,4
4 NCI-H322 Легкого 98,5 6,6
5 NCI-H526 Легкого 79,9 4,0
6 НТ 1080 Фибросаркома 98,0 14,7
5.2.2. Положительная экспрессия нектина-4 в клеточных линиях.
Положительная экспрессия и MFI нектина-4 в 6 клеточных линиях соответствовала перечню.
Клеточная линия Нектин-4 MFIизотипический MFI-панель
1 T-47D 99,0% 132 1808
2 MDA-MB-468 99,0% 184 2324
3 NCI-H292 97,9% 180 729
4 NCI-H322 99,1% 145 1655
5 NCI-H526 0,21% 104 91,3
6 НТ1080 1,53% 134 134
6. Обсуждение.
Экспрессия нектина-4 была высокой в клетках рака молочной железы T-47D (99,0%), MDA-MB-468 (99,0%) и клетках рака легкого NCI-H292 (97,9%), NCI-H322 (99,1%). В NCI-H526 и НТ-1080, не было обнаружено экспрессии нектина-4.
Пример 8. Анализ экспрессии нектина-4 в 9 клеточных линиях CDX посредством проточной цито метрии.
1. Задача исследования.
Задачей этого проекта является оценка поверхностной экспрессии нектина-4 (PVRL-4) в 9 клеточных линиях, включая 1 клеточную линию рака молочной железы (MDA-MB-468), 4 клеточных линии рака легкого (NCI-H292, NCI-H358, NCI-H526, А549), 1 клеточную линию рака поджелудочной железы (Panc02.13), 2 клеточных линии рака ободочной и прямой кишки (НСТ-116, НТ-29) и 1 клеточную линию рака мочевого пузыря (НТ1376).
2. Схема панели.
Панель для FCM в 9 клеточных линиях
Флуорохром Пустой Изотипический Панель
РЕ - Изотипический контрольный IgG2b Нектин-4
BV421 Живые/погибшие Живые/погибшие Живые/погибшие
3. Материалы.
3.1. Образцы.
- 121 045862
Перечень клеточных линий
Пол оже ние Клеточная линя Тип злокачес твенной опухоли Поставщик Свойства культуры Культуральная среда
1 НТ1376 Мочевого пузыря ATCC-CRL- 1472 Прикрепля ющаяся ЕМЕМ+10% FBS
2 MDA-MB- 468 Молочно й железы АТСС-НТВ-132 Прикрепля ющаяся Лейбовитца L- 15+10%FBS
3 НСТ-116 Ободочно й и прямой кишки ATCC-CCL-247 Прикрепля ющаяся RPMI 1640+10% FBS
4 НТ-29 Ободочно й и прямой кишки АТСС-НТВ-38 Прикрепля ющаяся МакКоя 5а+10% FBS
5 А549 Легкого ATCC-CCL-185 Прикрепля ющаяся F-12K+10%FBS
6 NCI-H292 Легкого ЕСАСС- Суспензио RPMI 1640+10% FBS
91091815 иная
7 NCI-H358 Легкого ЕСАСС- 95111733 Прикрепля ющаяся RPMI 1640+10% FBS
8 NCI-526 Легкого ATCC-CRL- 5811 Прикрепля ющаяся RPMI 1640+10% FBS
9 Рапс02.13 Поджелу дочной железы ATCC-CRL- 2554 прикрепля ющаяся RPMI-1640+15% FBS+5 мкг/мл инсулина человека
3.2. Реагенты.
1) DPBS (Corning, 21-031-CV).
2) Трипсин 0,25% (Invitrogen- 25200072).
3) Буфер для окрашивания (eBioscience, 00-4222).
4) Буфер для фиксации (BD, 554655).
5) Антитело.
Флуоресценция Маркер Каталожны й номер Поставщик Комментарий
РЕ Нектин-4 FAB2659P R&D АААО0217021
РЕ IgG2b мыши IC0041P R&D
BV421 Живые/ погибшие L34964 Invitrogen -
3.3. Устройства.
Центрифуга Eppendorf 5810R.
Проточный цитометр BD FACS Canto (BD).
4. Способы и процедуры эксперимента.
4.1. Культивирование клеток.
Размораживание клеток.
1) Очистить замороженные флаконы 70% спиртом и быстро разморозить флаконы на водяной бане при 37°С.
2) Центрифугировать суспензию клеток при приблизительно 1000 об/мин в течение 5 мин, удалить супернатант и добавить предварительно нагретую среду во флаконы.
3) Инкубировать культивируемые флаконы в инкубаторе при 37°С, с 5% СО2.
Пассирование клеток.
1) Нагреть среду и трипсин на водяной бане при 37°С.
2) Удалить культуральную среду и ополоснуть клеточный слой DPBS.
3) Добавить 5 мл 0,25% раствора трипсина в колбу и разбавить трипсин 5 мл среды.
- 122 045862
4) Центрифугировать суспензию клеток при 1000 об/мин в течение 5 мин.
5) Добавить 15 мл свежей среды и ресуспендировать клетки посредством осторожного пипетирования.
6) Добавить соответствующую суспензию клеток в новые культуральные флаконы.
7) Инкубировать культуральные флаконы в инкубаторе при 37°С с 5% СО2.
4.2. Взятие образцов.
Собрать клеточные линии, растущие в экспоненциальной фазе роста. Подсчитать клетки с окрашиванием трипановым синим. Центрифугировать клетки при 400xg в течение 5 мин при 4°С, промыть клетки два раза буфером для окрашивания и суспендировать клетки в буфере для окрашивания до 5х106/мл.
4.3. Окрашивание антителом.
Распределить аликвотами 100 мкл суспензии клеток в каждую лунку 96-луночного V-образного планшета. Добавить изотипический контроль или антитела к суспензии клеток и инкубировать в течение 30 мин при 4°С в темноте. Промыть клетки 2 раза посредством центрифугирования при 400xg в течение 5 мин при 4°С и слить супернатант. Ресуспендировать клетки в 300 мкл буфера для окрашивания. Проанализировать данные FACS с использованием программного обеспечения Flow Jo V10.
4.4. Анализ данных.
Все данные FACS анализировали посредством программного обеспечения Flowjo V10 и Graphpad Prism или программного обеспечения Excel. 5.
Результаты.
5.1. Стратегия гейтирования для панели.
Стратегия гейтирования для нектина-4 представлена на фиг. 34-37.
5.2. Анализ данных.
Положительная экспрессия и MFI нектина-4 в 9 клеточных линиях соответствовала перечню.
Клеточная линия Нектин-4 MFIизотипический MFI-панель
1 НТ1376 92,4% 36,2 803
2 MDA-MB-468 97,1% 28,9 460
3 НСТ-116 1,85% 14,5 15,6
4 НТ-29 40,0% 20,5 88,3
5 А549 1,07% 20,5 21,6
6 NCI-H292 71,1% 22,9 149
7 NCI-H358 90,1% 26,5 361
8 NCI-526 1,22% 8,33 12,1
9 Рапс02.13 51,9% 36,2 128
6. Обсуждение.
Экспрессия нектина-4 была высокой в клеточной линии рака мочевого пузыря НТ-1376 (92,4%), рака молочной железы MDA-MB-468 (97,1%) и рака легкого NCI-H358 (90,1%). Экспрессия нектина-4 была умеренной в клеточных линиях НТ-29 (40,0%), NCI-H292 (71,1%) и Panc02.13 (51,9%). В НСТ-116, А549 и NCI-526 не было обнаружено экспрессии нектина-4. Эти данные также можно использовать в качестве ориентира для выбора модели для исследований эффективности.
Пример 9. Исследования эффективности in vivo.
Пример 9.1. Исследование эффективности in vivo тестируемых образцов при лечении мышей Balb/c nude с ксенотрансплантатом А549.
1. Задача исследования.
Задачей исследования является оценка in vivo противоопухолевой эффективности тестируемых образцов при лечении мышей Balb/c nude с ксенотрансплантатом А549.
- 123 045862
2. Схема эксперимента
Групп а Лечение η Доза (мг/кг) Объем дозирования (мкл/г) Путь дозирован ня Схема
1 Носитель 5 10 в/в qw
2 BCY8242 3 3 мг/кг 10 в/в qw
3 BCY8242 3 3 мг/кг 10 в/в biw
4 BCY8242 3 5 мг/кг 10 в/в qw
5 BCY8245 3 3 мг/кг 10 в/в qw
6 BCY8245 3 3 мг/кг 10 в/в biw
7 BCY8245 3 5 мг/кг 10 в/в qw
8 BCY8253 3 3 мг/кг 10 в/в qw
9 BCY8253 3 3 мг/кг 10 в/в biw
10 BCY8253 3 5 мг/кг 10 в/в qw
И BCY8255 3 3 мг/кг 10 в/в qw
12 BCY8255 3 3 мг/кг 10 в/в biw
13 BCY8255 3 5 мг/кг 10 в/в qw
3. Материалы.
Животные и условия содержания.
3.1.1. Животные.
Вид: Mus Musculus.
Линия: Balb/c nude.
Возраст: 6-8 недель.
Пол: самки.
Масса тела: 18-22 г.
Количество животных: 41 мышь плюс запасные.
3.1.2. Условия содержания.
Мышей содержали в индивидуально вентилируемых клетках при постоянной температуре и влажности с 3 или 5 животными в каждой клетке.
Температура: 20~26°С.
Влажность 40-70%.
Клетки: изготовлены из поликарбоната. Размер составляет 300 ммх180 ммх150 мм.
Материалом подстилки были сердцевины кукурузных початков, которые заменяли два раза в неделю.
Рацион: животные имели свободный доступ к стерилизованному облучением сухому гранулированному корму в ходе всего периода исследования.
Вода: животные имели свободный доступ к питьевой воде.
Идентификация клеток: идентификационные ярлыки для каждой клетки содержали следующую информацию: количество животных, пол, линия, дата получения, лечение, номер испытания, номер группы и дата начала испытания.
Идентификация животных: животных маркировали кодированием на ушах.
4. Способы и процедуры эксперимента.
4.1. Культивирование клеток.
Опухолевые клетки А549 поддерживали in vitro в качестве культуры в виде монослоя в среде F12K, дополненной 10% инактивированной нагреванием эмбриональной телячьей сывороткой, при 37°С в атмосфере 5% СО2 в воздухе. Опухолевые клетки стандартным образом субкультивировали два раза в неделю посредством обработки трипсином-EDTA. Клетки, растущие в экспоненциальной фазе роста, собирали и подсчитывали для инокуляции опухоли.
4.2. Инокуляция опухоли.
Каждой мыши подкожно инокулировали в правый бок опухолевые клетки А549 (5х106) в 0,2 мл PBS для развития опухоли. 41 животных случайным образом распределяли на группы, когда средний объем опухоли достигал 158 мм3. Введение тестируемых образцов и количества животных в каждой группе представлены в таблице схемы эксперимента.
- 124 045862
4.3. Получение состава тестируемого образца
Тестируемый образец Конц. (мг/мл) Состав
Носитель - 25 мМ гистидин, pH 7, 10% сахароза
BCY8242 0,5 Разбавить 510 мкл исходного раствора 20 мг/мл BCY8242 19,886 мл гистидинового буфера
BCY8242 о,з Разбавить 480 мкл исходного раствора 0,5 мг/мл BCY8242 320 мкл гистидинового буфера
BCY8245 0,5 Разбавить 400 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8245 400 мкл гистидинового буфера
BCY8245 о,з Разбавить 240 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8245 560 мкл гистидинового буфера
BCY8253 0,5 Разбавить 400 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8253 400 мкл гистидинового буфера
BCY8253 о,з Разбавить 240 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8253 560 мкл гистидинового буфера
BCY8255 0,5 Разбавить 400 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8255 400 мкл ацетатного буфера
BCY8255 о,з Разбавить 240 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8255 560 мкл ацетатного буфера
1. Гистидиновый буфер:25мМ гистидин, рН7, 10% сахароза 2. Ацетатный буфер: 50 мМацетат/уксусная кислота, pH, 5 10% сахароза
4.4. Взятие образцов.
В конце исследования опухоли всех групп, кроме групп 2, 3 и 4, извлекали через 2 ч после последнего дозирования. Опухоли в группах 2, 3 и 4 извлекали без какого-либо дозирования.
5. Результаты.
5.1. Кривые роста опухоли.
Кривые роста опухоли представлена на фиг. 38-41.
5.2. Регистрация объема опухоли.
Средний объем опухоли с течением времени у самок мышей Balb/c nude, имеющих ксенотрансплантат А549, представлен в табл. 27.
- 125 045862
Таблица 27. Регистрация объема опухоли с течением времени
Групп Сутки после начала лечения
а Лечение
0 2 5 7 9 12 14
1 Носитель, qw 158±13 235±24 278±26 346±39 387±35 471±45 568±49
2 BCY8242, 3 мг/кг, qw 157±13 215±19 221±12 257±28 282±32 329±6 356±26
3 BCY8242, 3 мг/кг, biw 158±10 224±29 189±38 205±44 232±55 239±41 261±41
4 BCY8242, 5 мг/кг, qw 157±16 189±23 169±17 182±30 191±39 162±33 191±29
5 BCY8245, 3 мг/кг, qw 157±10 208±15 197±25 257±40 293±41 341±54 356±53
6 BCY8245, 3 мг/кг, biw 157±14 183±27 158±16 184±6 182±8 190±15 194±27
7 BCY8245, 5 мг/кг, qw 157±14 179±22 147±10 172±23 173±24 204±36 228±33
8 BCY8253, 158±10 197±9 177±4 225±4 246±5 268±11 323±30
3 мг/кг, qw
9 BCY8253, 3 мг/кг, biw 158±12 207±9 168±9 210±15 219±17 234±10 247±11
10 BCY8253, 5 мг/кг, qw 158±7 203±18 149±7 199±20 187±15 178±15 203±6
И BCY8255, 3 мг/кг, qw 158±9 199±15 181±10 243±1 261±8 293±4 337±15
12 BCY8255, 3 мг/кг, biw 158±14 180±17 155±19 193±36 179±28 199±27 227±34
13 BCY8255, 5 мг/кг, qw 158±14 177±16 153±19 206±25 201±42 183±44 205±32
5.3. Анализ ингибирования роста опухоли.
Скорость ингибирования роста опухоли для тестируемых образцов в модели с ксенотрансплантатом А549 вычисляли на основе измерения объема опухоли на 14 сутки после начала лечения.
- 126 045862
Таблица 28. Анализ ингибирования роста опухоли
Группа Лечение Объем опухоли (мм3)а Т/Сь (%) TGI (%) Значение Р по сравнению с носителем
1 Носитель, qw 568±49
2 BCY8242, 3 мг/кг, qw 356±26 62,7 51,6 /?<0,05
3 BCY8242, 3 мг/кг, biw 261±41 46,0 74,9 /?<0,01
4 BCY8242, 5 мг/кг, qw 191±29 33,6 91,7 /?<0,001
5 BCY8245, 3 мг/кг, qw 356±53 62,8 51,4 /?<0,05
6 BCY8245, 3 мг/кг, biw 194±27 34,2 90,8 /?<0,001
7 BCY8245, 5 мг/кг, qw 228±33 40,2 82,6 /?<0,001
8 BCY8253, 3 мг/кг, qw 323±30 56,8 59,8 /?<0,01
9 BCY8253, 3 мг/кг, biw 247±11 43,4 78,3 /?<0,001
10 BCY8253, 5 мг/кг, qw 203±6 35,7 89,2 /?<0,001
И BCY8255, 3 мг/кг, qw 337±15 59,4 56,4 /?<0,01
12 BCY8255, 3 мг/кг, biw 227±34 39,9 83,4 /?<0,001
13 BCY8255, 5 мг/кг, qw 205±32 36,1 88,5 /?<0,001
а. Среднее значение ± SEM.
b. Ингибирование роста опухоли вычисляют путем деления среднего по группе объема опухоли для группы лечения на средний по группе объем опухоли для контрольной группы (Т/С).
6. Обобщение и обсуждение результатов.
В этом исследовании оценивали терапевтическую эффективность тестируемых образцов в модели с ксенотрансплантатом А549. Измеренные объемы опухоли во всех группах лечения в различные моменты времени представлены на фиг. 38-41 и в табл. 27 и 28.
Средний размер опухоли у мышей, которым вводили носитель, достигал 568 мм3 на 14 сутки. BCY8242 в дозе 3 мг/кг, qw (TV=356 мм3, TGI=51,6%, p<0,05), BCY8242 в дозе 3 мг/кг biw (TV=261 мм3, TGI=74,9%,p<0,01) и 5 мг/кг, qw (TV=191 мм3, TGI=91,7%,p<0,001) имел значительную противоопухолевую активность зависимым от дозы или частоты дозирования образом.
BCY8245 в дозе 3 мг/кг, qw (TV=356 мм3, TGI=51,4%,p<0,05), 3 мг/кг, biw (TV=194 мм3, TGI=90,8%, р<0,01) и 5 мг/кг, qw (TV=228 мм3, TGI=82,6%, p<0,001) имел значительную противоопухолевую активность зависимым от дозы или частоты дозирования образом.
BCY8253 в дозе 3 мг/кг, qw (TV=323 мм3, TGI=59,8%,p<0,01), 3 мг/кг, biw (TV=247 мм3, TGI=78,3%, р<0,001) и 5 мг/кг, qw (TV=203 мм3, TGI=89,2%, p<0,001) имел значительную противоопухолевую активность зависимым от дозы или частоты дозирования образом
BCY8255 в дозе 3 мг/кг, qw (TV=337 мм3, TGI=56,4%,p<0,01), 3 мг/кг, biw (TV=227 мм3, TGI=83,4%, р<0,001) и 5 мг/кг, qw (TV=205 мм3, TGI=88,5%, p<0,001) имел значительную противоопухолевую активность зависимым от дозы или частоты дозирования образом.
В этом исследовании животные, которым вводили BCY8242 в дозе 3 мг/кг biw и 5 мг/кг qw, BCY8253 и BCY8255 в дозе 5 мг/кг qw теряли в среднем более 10% массы тела в ходе режима лечения. Животные в группе BCY8245 хорошо сохраняли массу тела. В этой клеточной линии, которая демонст
- 127 045862 рирует минимальную экспрессию нектина-4 в исследованиях FACS, рост опухоли сдерживался посредством BCY8245, однако не происходила регрессия опухоли, подтверждая, что для оптимальной эффективности требуется опосредование мишенью.
Пример 9.2. Исследование эффективности in vivo тестируемых образцов при лечении мышей Balb/c nude с ксенотрансплантатом НСТ116.
1. Задача исследования.
Задачей исследования является оценка противоопухолевой эффективности in vivo тестируемых образцов при лечении мышей Balb/c nude с ксенотрансплантатом НСТ116.
2. Схема эксперимента
Групп а Лечение η Доза (мг/кг) Объем дозирования (мкл/г) Путь дозирован ня Схема
1 Носитель 5 10 в/в qw
2 BCY8242 3 3 10 в/в qw
3 BCY8242 3 3 10 в/в biw
4 BCY8242 3 5 10 в/в qw
5 BCY8245 3 3 10 в/в qw
6 BCY8245 3 3 10 в/в biw
7 BCY8245 3 5 10 в/в qw
8 BCY8253 3 3 10 в/в qw
9 BCY8253 3 3 10 в/в biw
10 BCY8253 3 5 10 в/в qw
И BCY8255 3 3 10 в/в qw
12 BCY8255 3 3 10 в/в biw
13 BCY8255 3 5 10 в/в qw
4 BCY8245 3 5 10 в/в qw
3. Материалы.
3.1. Животные и условия содержания.
3.1.1. Животные.
Вид: Mus Musculus.
Линия: Balb/c nude.
Возраст: 6-8 недель.
Пол: самки.
Масса тела: 18-22 г.
Количество животных: 41 мышь плюс запасные.
3.1.2. Условия содержания.
Мышей содержали в индивидуально вентилируемых клетках при постоянной температуре и влажности с 3 или 5 животными в каждой клетке. Температура: 20~26°С.
Влажность 40-70%.
Клетки: изготовлены из поликарбоната. Размер составляет 300 ммх180 ммх150 мм. Материалом подстилки были сердцевины кукурузных початков, которые заменяли два раза в неделю.
Рацион: Животные имели свободный доступ к стерилизованному облучением сухому гранулированному корму в ходе всего периода исследования.
Вода: животные имели свободный доступ к питьевой воде.
Идентификация клеток: Идентификационные ярлыки для каждой клетки содержали следующую информацию: количество животных, пол, линия, дата получения, лечение, номер испытания, номер группы и дата начала испытания.
Идентификация животных: животных маркировали кодированием на ушах.
4. Способы и процедуры эксперимента.
4.1. Культивирование клеток.
Клетки НСТ116 поддерживали в среде, дополненной 10% инактивированной нагреванием эмбриональной телячьей сывороткой, при 37°С в атмосфере 5% СО2 в воздухе. Опухолевые клетки стандартным образом субкультивировали два раза в неделю. Клетки, растущие в экспоненциальной фазе роста, собирали и подсчитывали для инокуляции опухоли.
4.2. Инокуляция опухоли.
Каждой мыши подкожно инокулировали в правый бок опухолевые клетки НСТ116 (5,0х106) в 0,2 мл PBS для развития опухоли. 41 животное случайным образом распределяли на группы, когда средний объем опухоли достигал 166 мм3. Введение тестируемых образцов и количества животных в каждой группе представлены в таблице схемы эксперимента.
- 128 045862
4.3. Получение состава тестируемого образца.
Тестируемый образец Конц. (мг/мл) Состав
Носитель - 25 мМ гистидин, pH 7, 10% сахароза
BCY8242 0,5 Разбавить 510 мкл исходного раствора 20 мг/мл BCY8242 19,886 мл гистидинового буфера
BCY8242 о,з Разбавить 480 мкл исходного раствора 0,5 мг/мл BCY8242 320 мкл гистидинового буфера
BCY8245 0,5 Разбавить 400 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8245 посредством 400 мкл гистидинового буфера
BCY8245 о,з Разбавить 240 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8245 посредством 560 мкл гистидинового буфера
BCY8253 0,5 Разбавить 400 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8253 400 мкл гистидинового буфера
BCY8253 о,з Разбавить 240 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8253 560 мкл гистидинового буфера
BCY8255 0,5 Разбавить 400 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8255 400 мкл ацетатного буфера
BCY8255 о,з Разбавить 240 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8255 560 мкл ацетатного буфера
1. Гистидиновый буфер:25 мМгистидин, рН7, 10% сахароза 2. Ацетатный буфер: 50 мМацетат/уксусная кислота, pH 5, 10% сахароза
4.4. Взятие образцов.
В конце исследования на 14 сутки опухоли из групп 1, 2, 5, 8 и 11 извлекали для FFPE. Для групп 4, 7, 10 и 13 проводили взятие плазмы через 5 мин, 15 мин, 30 мин, 60 мин и 120 мин после дозирования. Опухоли также извлекали и хранили при -80°С.
5. Результаты.
5.1. Кривые роста опухоли.
Кривые роста опухоли представлены на фиг. 42-45.
5.2. Регистрация объема опухоли.
Средний объем опухоли с течением времени у самок мышей Balb/c nude, имеющих ксенотрансплантат НСТ116, представлен в табл. 29.
Таблица 29. Регистрация объема опухоли с течением времени
Групп Сутки после начала лечения
а Лечение
0 2 4 7 9 12 14
1 Носитель, qw 166±12 219±21 323±29 397±28 488±36 630±49 769±71
2 BCY8242, 3 мг/кг, qw 166±3 201±16 219±29 280±14 319±17 375±23 492±19
3 BCY8242, 3 мг/кг, biw 166±16 212±17 213±17 208±30 202±33 195±25 201±28
4 BCY8242, 5 мг/кг, qw 167±24 203±16 168±10 186±9 211±5 201±8 206±7
5 BCY8245, 3 мг/кг, qw 167=1=11 209±13 227±17 269±33 324±39 348±27 425±28
6 BCY8245, 3 мг/кг, biw 166±18 229±40 215±42 213±49 213±48 206±55 197±50
7 BCY8245, 5 мг/кг, qw 166±35 201±42 176±15 183±17 170±16 125±18 134±12
- 129 045862
8 BCY8253, 3 мг/кг, qw 166±10 210=1=11 254±31 288±8 305±3 316±13 354±6
9 BCY8253, 3 мг/кг, biw 167±15 200±3 175=1=11 186±8 195±8 197±17 199±9
10 BCY8253, 5 мг/кг, qw 166±37 179±37 143±31 150±41 115±28 90±30 92±29
И BCY8255, 3 мг/кг, qw 166±18 221±12 209±14 294±26 354±37 437±51 498±52
12 BCY8255, 3 мг/кг, biw 167±32 220±52 182±42 191±44 217±46 221±53 178±40
13 BCY8255, 5 мг/кг, qw 166±35 183±51 128±27 141±27 142±24 132±10 137±5
5.3. Анализ ингибирования роста опухоли.
Скорость ингибирования роста опухоли для тестируемых образцов в модели с ксенотрансплантатом НСТ116 вычисляли на основе измерения объема опухоли на 14 сутки после начала лечения.
Таблица 30. Анализ ингибирования роста опухоли
Группа Лечение Объем опухоли (мм3)а Т/Сь (%) TGI (%) Значение Р
1 Носитель, qw 769±71 - - -
2 BCY8242, 3 мг/кг, qw 492±19 64,0 45,9 /><0,001
3 BCY8242, 3 мг/кг, biw 201±28 26,2 94,1 /><0,001
4 BCY8242, 5 мг/кг, qw 206±7 26,7 93,5 /><0,001
5 BCY8245, 3 мг/кг, qw 425±28 55,2 57,1 /><0,001
6 BCY8245, 3 мг/кг, biw 197±50 25,6 94,9 /><0,001
7 BCY8245, 5 мг/кг, qw 134±12 17,4 105,2 /><0,001
8 BCY8253, 3 мг/кг, qw 354±6 46,0 68,8 /><0,001
9 BCY8253, 3 мг/кг, biw 199±9 25,9 94,7 /><0,001
10 BCY8253, 5 мг/кг, qw 92±29 12,0 112,2 /><0,001
И BCY8255, 3 мг/кг, qw 498±52 64,7 44,9 /><0,001
12 BCY8255, 3 мг/кг, biw 178±40 23,1 98,3 /><0,001
13 BCY8255, 137±5 17,8 104,9 /><0,001
мг/кг, qw
а. Среднее значение ± SEM; b. Ингибирование роста опухоли вычисляют путем деления среднего по группе объема опухоли для группы лечения на средний по группе объем опухоли для контрольной
- 130 045862 группы (Т/С).
б. Обобщение и обсуждение результатов.
В этом исследовании оценивали терапевтическую эффективность тестируемых образцов в модели с ксенотрансплантатом НСТ116. Измеренные объемы опухоли во всех группах лечения в различные моменты времени представлены на фиг. 42-45 и в табл. 29 и 30.
Средний размер опухоли мыши, принимавщей лечение достигал 769 мм3 на 14 день после начала лечсения. BCY8242 в дозе 3 мг/кг, qw (TV=492 мм3, TGI=45,9%,p<0,001), 3 мг/кг, biw (TV=201 мм3, TGI=94,1%, p<0,001) и 5 мг/кг, qw (TV=206 мм3, TGI=93,5%, p<0,001) имел значительную противоопухолевую активность зависимым от дозы или частоты дозирования образом.
BCY8245 в дозе 3 мг/кг, qw (TV=425mm3, TGI=57,1%, p<0,001), 3 мг/кг, biw (TV=197 мм3, TGI=94,9%,p<0,001) и 5 мг/кг, qw (TV=134 мм3, TGI=105,2%,p<0,001) имел значительную противоопухолевую активность зависимым от дозы или частоты дозирования образом.
BCY8253 в дозе 3 мг/кг, qw (TV=354 мм3, TGI=68,8%, p<0,001), 3 мг/кг, biw (TV=199 мм3, TGI=94,7%,p<0,001) и 5 мг/кг, qw (TV=92 мм3, TGI=112,2%,p<0,001) имел значительную противоопухолевую активность зависимым от дозы или частоты дозирования образом.
BCY8255 в дозе 3 мг/кг, qw (TV=498 мм3, TGI=44,9%, p<0,001), 3 мг/кг, biw (TV=178 мм3, TGI=98,3%,p<0,001) и 5 мг/кг, qw (TV=137 мм3, TGI=104,9%,p<0,001) имел значительную противоопухолевую активность зависимым от дозы или частоты дозирования образом.
В этом исследовании животные во всех группах 5 мг/кг qw теряли в среднем 10% массы тела, особенно животные в группах BCY8253 и BCY8255 5 мг/кг, которые теряли более 20% массы тела; BCY8253 и BCY8255 3 мг/кг biw также вызвал снижение массы тела 15% в ходе режима лечения.
В этой клеточной линии, которая демонстрирует минимальную экспрессию нектина-4 в исследованиях FACS, рост опухоли сдерживался посредством BCY8245, однако не происходила регрессия опухоли, подтверждая, что для оптимальной эффективности требуется опосредование мишенью.
Пример 9.3. Исследование эффективности in vivo тестируемых образцов при лечении мышей CB17SCID с ксенотрансплантатом НТ-1376.
1. Задача исследования.
Задачей исследования является оценка противоопухолевой эффективности in vivo тестируемых образцов при лечении мышей CB17-SCID с ксенотрансплантатом НТ-1376.
2. Схема эксперимента
Групп а Лечение η Доза (мг/кг) Объем дозирования (мкл/г) Путь дозирован ня Схема
1 Носитель 5 10 в/в qw
2 BCY8242 3 3 мг/кг 10 в/в qw
3 BCY8242 3 3 мг/кг 10 в/в biw
4 BCY8242 3 5 мг/кг 10 в/в qw
5 BCY8245 3 3 мг/кг 10 в/в qw
6 BCY8245 3 3 мг/кг 10 в/в biw
7 BCY8245 3 5 мг/кг 10 в/в qw
8 BCY8253 3 3 мг/кг 10 в/в qw
9 BCY8253 3 3 мг/кг 10 в/в biw
10 BCY8253 3 5 мг/кг 10 в/в qw
И BCY8255 3 3 мг/кг 10 в/в qw
12 BCY8255 3 3 мг/кг 10 в/в biw
13 BCY8255 3 5 мг/кг 10 в/в qw
4 BCY8245 3 10 в/в qw
3. Материалы.
3.1. Животные и условия содержания.
3.1.1. Животные.
Вид: Mus Musculus.
Линия: CB17-SCID.
Возраст: 6-8 недель.
Пол: самки.
Масса тела: 18-22 г.
Количество животных: 41 мышь плюс запасные.
3.1.2. Условия содержания.
Мышей содержали в индивидуально вентилируемых клетках при постоянной температуре и влажности с 3 или 5 животными в каждой клетке.
- 131 045862
Температура: 20~26°С.
Влажность 40-70%.
Клетки: изготовлены из поликарбоната. Размер составляет 300 ммх180 ммх150 мм. Материалом подстилки были сердцевины кукурузных початков, которые заменяли два раза в неделю.
Рацион: животные имели свободный доступ к стерилизованному облучением сухому гранулированному корму в ходе всего периода исследования.
Вода: животные имели свободный доступ к питьевой воде.
Идентификация клеток: идентификационные ярлыки для каждой клетки содержали следующую информацию: количество животных, пол, линия, дата получения, лечение, номер испытания, номер группы и дата начала испытания.
Идентификация животных: животных маркировали кодированием на ушах.
4. Способы и процедуры эксперимента.
4.1. Культивирование клеток.
Клетки опухоли НТ-1376 поддерживают в среде ЕМЕМ, дополненной 10% инактивированной нагреванием эмбриональной телячьей сывороткой, при 37°С в атмосфере 5% СО2 в воздухе. Опухолевые клетки стандартным образом субкультивируют два раза в неделю. Клетки, растущие в экспоненциальной фазе роста, собирают и подсчитывают для инокуляции опухоли.
4.2. Инокуляция опухоли.
Каждой мыши подкожно инокулировали в правый бок опухолевые клетки НТ-1376 (5х 106) с матригелем (1:1) в 0,2 мл PBS для развития опухоли. 41 животное случайным образом распределяли на группы, когда средний объем опухоли достигал 153 мм3. Введение тестируемых образцов и количества животных в каждой группе представлены в таблице схемы эксперимента.
4.3. Получение состава тестируемого образца
Тестируемый образец Конц. (мг/мл) Состав
Носитель - 25 мМ гистидин, pH 7, 10% сахароза
BCY8242 0,5 Разбавить 510 мкл исходного раствора 20 мг/мл BCY8242 19,886 мл гистидинового буфера
BCY8242 о,з Разбавить 480 мкл исходного раствора 0,5 мг/мл BCY8242 320 мкл гистидинового буфера
BCY8245 0,5 Разбавить 400 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8245 посредством 400 мкл гистидинового буфера
BCY8245 о,з Разбавить 240 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8245 посредством 560 мкл гистидинового буфера
BCY8253 0,5 Разбавить 400 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8253 400 мкл гистидинового буфера
BCY8253 о,з Разбавить 240 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8253 560 мкл гистидинового буфера
BCY8255 0,5 Разбавить 400 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8255 400 мкл ацетатного буфера
BCY8255 о,з Разбавить 240 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8255 560 мкл ацетатного буфера
5. Гистидиновый буфер:25 мМгистидин, рН7, 10% сахароза 6. Ацетатный буфер: 50 мМацетат/уксусная кислота, pH 5, 10% сахароза
4.4. Взятие образцов.
В конце исследования проводили взятие плазмы в группах 7, 10 и 13 через 5 мин, 15 мин, 30 мин, 60 мин и 120 мин после последнего дозирования. Опухоль в группах 7, 10 и 13 извлекали через 2 ч после последнего дозирования. Опухоль в группах 1, 5, 6, 8, 9, 11 и 12 извлекали через 2 ч после последнего дозирования. Опухоли в группа 2, 3 и 4 извлекали без какого-либо дозирования.
5. Результаты.
5.1. Кривые роста опухоли.
Кривые роста опухоли представлены на фиг. 46-49.
5.2. Регистрация объема опухоли.
Средний объем опухоли с течением времени у самок мышей CB17-SCID, имеющих ксенотранс- 132 045862 плантат НТ-1376, представлен в табл. 31.
Таблица 31. Регистрация объема опухоли с течением времени
Групп а Лечение Сутки после начала лечения
0 2 5 7 9 12 14
153±1 266±3 398±4 529±5 721±7 908±9 1069±9
1 Носитель, qw 6 0 1 6 6 1 0
BCY8242, 153±1 271±2 376±3 473±7 530±8
2 3 мг/кг, qw 7 231±1 1 1 0 1 570±92
BCY8242, 153±1 245±3 354±3 378±3 391±5
3 3 мг/кг, biw 5 220±8 7 5 8 2 428±66
BCY8242, 152±1 202±1 249±2 361±5 372±3 389±4
4 5 мг/кг, qw 3 4 2 4 7 0 459±34
BCY8245, 153±2 254±5 298±6 398±6 468±7 502±6
5 3 мг/кг, qw 6 3 9 1 3 7 603±76
BCY8245, 154±3 248±5 203±1 273±4 356±5 391±5
6 3 мг/кг, biw 0 8 5 5 0 3 407±53
BCY8245, 153±1 237±4 228±3 317±3 394±2 438±3
7 5 мг/кг, qw 5 1 6 1 0 1 465±33
BCY8253, 153±1 343±2 447±3 466±2
8 3 мг/кг, qw 2 209±9 269±8 9 3 5 533±29
BCY8253, 153±1 214±3 246±1 286±2 364±4 400±3
9 3 мг/кг, biw 3 3 8 3 1 3 442±45
BCY8253, 153±1 217±4 231±4 308±3 360±4 401±7
10 5 мг/кг, qw 5 9 9 6 4 0 442±62
BCY8255, 153±2 358±2 476±4 486±6
И 3 мг/кг, qw 2 233±3 284±6 7 0 5 538±59
BCY8255, 153±2 233±3 218±2 298±4 336±4 365±3
12 3 мг/кг, biw 1 3 3 5 2 1 390±40
BCY8255, 152±1 233±3 338±1 406±2 459±6
13 5 мг/кг, qw 7 0 290±4 0 6 8 516±64
5.3. Анализ ингибирования роста опухоли.
Скорость ингибирования роста опухоли для тестируемых образцов в модели с ксенотрансплантатом НТ-1376 вычисляли на основе измерения объема опухоли на 14 сутки после начала лечения.
Таблица 32. Анализ ингибирования роста опухоли
Г руппа Лечение Объем опухоли (мм3)а Т/Сь (%) TGI (%) Значение Р по сравнению с носителем
1 Носитель, qw 1069±90 - - -
2 BCY8242, 3 мг/кг, qw 570±92 53,3 54,5 /<0,01
3 BCY8242, 3 мг/кг, biw 428±66 40,1 70,0 /<0,001
4 BCY8242, 5 мг/кг, qw 459±34 43,0 66,4 /?<0,001
5 BCY8245, 3 мг/кг, qw 603±76 56,4 50,9 /><0,01
6 BCY8245, 407±53 38,1 72,3 /<0,001
- 133 045862
3 мг/кг, biw
7 BCY8245, 5 мг/кг, qw 465±33 43,5 66,0 /?<0,001
8 BCY8253, 3 мг/кг, qw 533±29 49,8 58,5 /?<0,01
9 BCY8253, 3 мг/кг, biw 442±45 41,3 68,4 /?<0,001
10 BCY8253, 5 мг/кг, qw 442±62 41,4 68,5 /?<0,001
11 BCY8255, 3 мг/кг, qw 538±59 50,3 58,0 /?<0,01
12 BCY8255, 3 мг/кг, biw 390±40 36,5 74,1 /?<0,001
13 BCY8255, 5 мг/кг, qw 516±64 48,3 60,3 /?<0,01
6. Обобщение и обсуждение результатов.
В этом исследовании оценивали терапевтическую эффективность тестируемых образцов в модели с ксенотрансплантатом НТ-1376. Измеренные объемы опухоли во всех группах лечения в различные моменты времени представлены на фиг. 46-49 и в табл. 31 и 32.
Средний размер опухоли у мышей, которым вводили носитель, достигал 1069 мм3 на 14 сутки. BCY8242 в дозе 3 мг/кг, qw (TV=570 мм3, TGI=54,5%, p<0,01), 3 мг/кг, biw (TV=428 мм3, TGI=70,0%,p<0,001) и 5 мг/кг, qw (TV=459 мм3, TGI=66,4%,p<0,001) имел значительную противоопухолевую активность.
BCY8245 в дозе 3 мг/кг, qw (TV=603 мм3, TGI=50,9%,p<0,01), 3 мг/кг, biw (TV=407 мм3, TGI=72,3%, p<0,001) и 5 мг/кг, qw (TV=465 мм3, TGI=66,0%, p<0,001) имел значительную противоопухолевую активность.
BCY8253 в дозе 3 мг/кг, qw (TV=533 мм3, TGI=58,5%,p<0,01), 3 мг/кг, biw (TV=442 мм3, TGI=68,4%, р<0,001) и 5 мг/кг, qw (TV=442 мм3, TGI=68,5%, p<0,001) имел значительную противоопухолевую активность.
BCY8255 в дозе 3 мг/кг, qw (TV=538 мм3, TGI=58,0%,p<0,01), 3 мг/кг, biw (TV=390 мм3, TGI=74,1%, p<0,001) и 5 мг/кг, qw (TV=516 мм3, TGI=60,3%, p<0,01) имел значительную противоопухолевую активность.
В этом исследовании BCY8242 в дозе 3 мг/кг biw и 5 мг/кг qw вызывал снижение массы тела более 10% и 20% соответственно, BCY8245 и BCY8253 в дозе 5 мг/кг qw вызывали снижение массы тела животного более 10% в ходе режима лечения.
Пример 9.4. Исследование эффективности in vivo тестируемых образцов при лечении мышей Balb/c nude с ксенотрансплантатами MDA-MB-468.
1. Задача исследования.
Задачей исследования является оценка in vivo противоопухолевой эффективности тестируемых образцов при лечении мышей Balb/c nude с ксенотрансплантатом MDA-MB-468.
- 134 045862
2. Схема эксперимента
Групп а Лечение η Доза (мг/кг) Объем дозирования (мкл/г) Путь дозирован ня Схема
1 Носитель 5 10 в/в qw
2 BCY8242 3 3 мг/кг 10 в/в qw
3 BCY8242 3 3 мг/кг 10 в/в biw
4 BCY8242 3 5 мг/кг 10 в/в qw
5 BCY8245 3 3 мг/кг 10 в/в qw
6 BCY8245 3 3 мг/кг 10 в/в biw
7 BCY8245 3 5 мг/кг 10 в/в qw
8 BCY8253 3 3 мг/кг 10 в/в qw
9 BCY8253 3 3 мг/кг 10 в/в biw
10 BCY8253 3 5 мг/кг 10 в/в qw
И BCY8255 3 3 мг/кг 10 в/в qw
12 BCY8255 3 3 мг/кг 10 в/в biw
13 BCY8255 3 5 мг/кг 10 в/в qw
4 BCY8245 3 10 в/в qw
3. Материалы.
3.1. Животные и условия содержания.
3.1.1. Животные.
Вид: Mus Musculus.
Линия: Balb/c nude.
Возраст: 6-8 недель.
Пол: самки.
Масса тела: 18-22 г.
Количество животных: 41 мышь плюс запасные.
3.1.2. Условия содержания.
Мышей содержали в индивидуально вентилируемых клетках при постоянной температуре и влажности с 3 или 5 животными в каждой клетке.
Температура: 20~26°С.
Влажность 40-70%.
Клетки: изготовлены из поликарбоната. Размер составляет 300 ммх180 ммх150 мм. Материалом подстилки были сердцевины кукурузных початков, которые заменяли два раза в неделю.
Рацион: животные имели свободный доступ к стерилизованному облучением сухому гранулированному корму в ходе всего периода исследования.
Вода: животные имели свободный доступ к питьевой воде.
Идентификация клеток: идентификационные ярлыки для каждой клетки содержали следующую информацию: количество животных, пол, линия, дата получения, лечение, номер испытания, номер группы и дата начала испытания.
Идентификация животных: животных маркировали кодированием на ушах.
4. Способы и процедуры эксперимента.
4.1. Культивирование клеток.
Опухолевые клетки поддерживали в среде Лейбовитца L-15, дополненной 10% инактивированной нагреванием эмбриональной телячьей сывороткой, при 37°С в атмосфере 5% СО2 в воздухе. Опухолевые клетки стандартным образом субкультивировали два раза в неделю. Клетки, растущие в экспоненциальной фазе роста, собирали и подсчитывали для инокуляции опухоли.
4.2. Инокуляция опухоли.
Каждой мыши подкожно инокулировали в правый бок опухолевые клетки MDA-MB-468 (10х106) в 0,2 мл PBS, дополненном 50% матригелем, для формирования опухоли. 41 животных случайным образом распределяли на группы, когда средний объем опухоли достигал 196 мм3. Введение тестируемых образцов и количества животных в каждой группе представлены в таблице схемы эксперимента.
4.3. Получение состава тестируемого образца
- 135 045862
Тестируемый образец Конц. (мг/мл) Состав
Носитель - 25 мМ гистидин, pH 7, 10% сахароза
BCY8242 0,5 Разбавить 510 мкл исходного раствора 20 мг/мл BCY8242 19,886 мл гистидинового буфера
BCY8242 о,з Разбавить 480 мкл исходного раствора 0,5 мг/мл BCY8242 320 мкл гистидинового буфера
BCY8245 0,5 Разбавить 400 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8245 посредством 400 мкл гистидинового буфера
BCY8245 о,з Разбавить 240 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8245 посредством 560 мкл гистидинового буфера
BCY8253 0,5 Разбавить 400 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8253 400 мкл гистидинового буфера
BCY8253 о,з Разбавить 240 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8253 560 мкл гистидинового буфера
BCY8255 0,5 Разбавить 400 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8255 400 мкл ацетатного буфера
BCY8255 о,з Разбавить 240 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8255 560 мкл ацетатного буфера
1. Гистидиновый буфер:25 мМ гистидин, рН7, 10% сахароза 2. Ацетатный буфер: 50 мМ ацетат/уксусная кислота, pH 5, 10% сахароза 3. Исходные растворы BCY8242(0,5 мг/мл), BCY8245 (1 мг/мл), BCY8253 (1 мг/мл) и BCY8255(1 mg/мл) распределяли в индивидуальные пробирки и хранили при -80°С
4.4. Взятие образцов.
На 21 сутки исследования проводили взятие плазмы в группах 5, 8 и 11 через 5 мин, 15 мин, 30 мин, 60 мин и 120 мин после последнего дозирования. Опухоли в группах 1, 6, 9 и 12 извлекали через 2 ч после последнего дозирования. Опухоли в группе 3 извлекали без какого-либо дозирования. Мышей в группе 2 умерщвляли. Животных в группах 4, 7, 10 и 13 продолжали содержать в течение дополнительных 21 суток без какого-либо дозирования, и опухоли в этих группах извлекали на 42 сутки.
5. Результаты.
5.1. Кривые роста опухоли.
Кривые роста опухоли представлены на фиг. 50-53.
5.2. Регистрация объема опухоли.
Средний объем опухоли с течением времени у самок мышей Balb/c nude, имеющих ксенотрансплантат MDA-MB-468, представлен в табл. 33 и 34.
5.3. Анализ ингибирования роста опухоли.
Скорость ингибирования роста опухоли для тестируемых образцов в модели с ксенотрансплантатом MDA-MB-468 вычисляли на основе измерения объема опухоли на 21 сутки после начала лечения.
- 136 045862
Таблица 33. Регистрация объема опухоли с течением времени (сутки с 0 по 21)
Г руппа Лечение Сутки после начала лечения
0 2 4 7 9 И 14 16 18 21
1 Носитель, qw 199±6 217±9 235±15 274±14 291±14 314±20 348±24 374±33 398±39 447±39
2 BCY8242, 3 мг/кг, qw 192±11 188±17 178±10 190=1=11 166±13 144±16 133±10 121±11 114±13 122±10
3 BCY8242, 3 мг/кг, biw 194±29 192±20 179±23 137±12 94±7 59±5 47±7 37±6 28±3 16±3
4 BCY8242, 5 мг/кг, qw 193±24 186±30 133±20 112=1=13 80±14 66±16 61±17 45±11 42±6 40±5
5 BCY8245, 3 мг/кг, qw 194±12 192±26 184±20 131±20 113=1=17 104±13 94±25 81±23 87±23 85±31
6 BCY8245, 3 мг/кг, biw 195±33 193±27 154±20 103±20 83±16 67±14 49±11 45±14 32±12 22±4
7 BCY8245, 5 мг/кг, qw 199±28 193=1=11 135±4 98±5 58±5 49±5 47±2 37±4 35±3 29±3
8 BCY8253, 3 мг/кг, qw 195±17 190±24 162±21 160±28 138±33 139±32 136±25 106±24 104±18 109±19
9 BCY8253, 3 мг/кг, biw 199±34 198=1=13 150±21 119=1=11 102±14 69±13 70±5 46±5 33±5 29±7
10 BCY8253, 5 мг/кг, qw 198±28 188±32 142±32 150±20 95±13 69±13 67±13 47±8 42±5 40±8
И BCY8255, 3 мг/кг, qw 198±18 191±15 172±24 148±18 139±13 114±22 140±13 128±22 141±18 136±31
12 BCY8255, 3 мг/кг, biw 197±36 190±28 154±18 109±11 90±13 67±3 64±7 51±8 41±5 31±1
13 BCY8255, 5 мг/кг, qw 194±29 156±25 121=1=19 109±14 75±14 55±8 66±5 43±5 37±1 42±2
Группа 4 7 10 Таблица 34. Регистрация объема опухоли с течением времени (сутки с 23 по 42) Сутки после начала лечения Лечение ------------------------------------------------------------------------------------- 23 25 28 32 35 39 42 BCY8242, 43±4 68±10 57±7 52±3 55±2 58±2 55±5 5 мг/кг, qw BCY8245, 35±5 48±5 37±7 28±6 24±4 28±6 26±6 5 мг/кг, qw BCY8253, 45±7 56±8 60±19 45±2 41±10 48±15 50±20 5 мг/кг, qw
13 BCY8255, 5 мг/кг, qw 41±4 57±7 48±8 39±9 39±6 38±9 34±8
- 137 045862
Таблица 35. Анализ ингибирования роста опухол
Г руппа Лечение Объем опухоли (мм3)а Т/Сь Значение Р по сравнению с носителем
(%) TGI (%)
1 Носитель, qw 447±39 - - -
2 BCY8242, 3 мг/кг, qw 122±10 27,2 128,2 /<0,001
3 BCY8242, 3 мг/кг, biw 16±3 3,6 171,8 /><0,001
4 BCY8242, 5 мг/кг, qw 40±5 9,0 161,5 /<0,001
5 BCY8245, 3 мг/кг, qw 85±31 18,9 144,2 /<0,001
6 BCY8245, 3 мг/кг, biw 22±4 4,9 169,8 /<0,001
7 BCY8245, 5 мг/кг, qw 29±3 6,6 168,4 /<0,001
8 BCY8253, 3 мг/кг, qw 109±19 24,4 134,7 /<0,001
9 BCY8253, 3 мг/кг, biw 29±7 6,6 168,3 /<0,001
10 BCY8253, 5 мг/кг, qw 40±8 8,9 163,9 /<0,001
И BCY8255, 3 мг/кг, qw 136±31 30,4 125,1 /<0,001
12 BCY8255, 3 мг/кг, biw 31±1 6,9 166,8 /<0,001
13 BCY8255, 5 мг/кг, qw 42±2 9,5 161,3 /<0,001
а. Среднее значение ± SEM.
b. Ингибирование роста опухоли вычисляют путем деления среднего по группе объема опухоли для группы лечения на средний по группе объем опухоли для контрольной группы (Т/С).
6. Обобщение и обсуждение результатов.
В этом исследовании оценивали терапевтическую эффективность тестируемых образцов в модели с ксенотрансплантатом MDA-MB-468. Измеренные объемы опухоли во всех группах лечения в различные моменты времени представлены на фиг. 50-53 и в табл. 33-35.
Средний размер опухоли у мышей, которым вводили носитель, достигал 447 мм3 на 21 сутки. BCY8242 в дозе 3 мг/кг, qw (TV=122 мм3, TGI= 128,2%, р<0,001), 3 мг/кг, biw (TV=16 мм3, TGI=171,8%,p<0,001) и 5 мг/кг, qw (TV=40 мм3, TGI=161,5%,p<0,001) имел значительную противоопухолевую активность зависимым от частоты или дозы образом.
BCY8245 в дозе 3 мг/кг, qw (TV=85 мм3, TGI=144,2%,p<0,001), 3 мг/кг, biw (TV=22 мм3, TGI=169,8%, р<0,001) и 5 мг/кг, qw (TV=29 мм3, TGI=168,4%, р<0,001) имел значительную противоопухолевую активность зависимым от частоты или дозы образом
BCY8253 в дозе 3 мг/кг, qw (TV=109 мм3, TGI=134,7%,p<0,001), 3 мг/кг, biw (TV=29 мм3, TGI=168,3%, p<0,001) и 5 мг/кг, qw (TV=40 мм3, TGI=163,9%, p<0,001) имел значительную противоопухолевую активность зависимым от частоты или дозы образом
BCY8255 в дозе 3 мг/кг, qw (TV=136 мм3, TGI=125,1%,p<0,001), 3 мг/кг, biw (TV=31 мм3, TGI=166,8%, р<0,001) и 5 мг/кг, qw (TV=42 мм3, TGI=161,3%, p<0,001) имел значительную противоопухолевую активность зависимым от частоты или дозы образом
Дозирование в группах 5 мг/кг прекращали с 21 суток, опухоли не демонстрировали никакого рецидива в ходе мониторинга в течение дополнительных 3 недель.
В этом исследовании BCY8242, BCY8253 и BCY8255 в дозе 5 мг/кг вызывали выраженное снижение массы тела животного, среди них мышь 10-1 в группе BCY8253 5 мг/кг была найдена мертвой на 20 сутки.
В этой клеточной линии, которая демонстрирует высокую экспрессию нектина-4 в исследованиях
- 138 045862
FACS, BCY8245 вызывает регрессию опухоли, подтверждая определяемую мишенью природу оптимальной эффективности.
Пример 9.5. Исследование эффективности in vivo тестируемых образцов при лечении мышей Balb/c nude с ксенотрансплантатом NCI-H292.
1. Задача исследования.
Задачей исследования является оценка in vivo протививоопухолевой эффективности тестируемых образцов при лечении мышей Balb/c nude с ксенотрансплантатом NCI-H292.
2. Схема эксперимента
Групп а Лечение η Доза (мг/кг) Объем дозирования (мкл/г) Путь дозирован ня Схема
1 Носитель 5 - 10 в/в qw
2 BCY8242 3 3 мг/кг 10 в/в qw
3 BCY8242 3 3 мг/кг 10 в/в biw
4 BCY8242 3 5 мг/кг 10 в/в qw
5 BCY8245 3 3 мг/кг 10 в/в qw
6 BCY8245 3 3 мг/кг 10 в/в biw
7 BCY8245 3 5 мг/кг 10 в/в qw
8 BCY8253 3 3 мг/кг 10 в/в qw
9 BCY8253 3 3 мг/кг 10 в/в biw
10 BCY8253 3 5 мг/кг 10 в/в qw
И BCY8255 3 3 мг/кг 10 в/в qw
12 BCY8255 3 3 мг/кг 10 в/в biw
13 BCY8255 3 5 мг/кг 10 в/в qw
4 BCY8245 3 10 в/в qw
3. Материалы.
3.1. Животные и условия содержания.
3.1.1. Животные.
Вид: Mus Musculus.
Линия: Balb/c nude.
Возраст: 6-8 недель.
Пол: самки.
Масса тела: 18-22 г.
Количество животных: 41 мышь плюс запасные.
3.1.2. Условия содержания.
Мышей содержали в индивидуально вентилируемых клетках при постоянной температуре и влажности с 3 или 5 животными в каждой клетке.
Температура: 20~26°С.
Влажность 40-70%.
Клетки: изготовлены из поликарбоната. Размер составляет 300 ммх180 ммх150 мм. Материалом подстилки были сердцевины кукурузных початков, которые заменяли два раза в неделю.
Рацион: животные имели свободный доступ к стерилизованному облучением сухому гранулированному корму в ходе всего периода исследования.
Вода: животные имели свободный доступ к питьевой воде.
Идентификация клеток: идентификационные ярлыки для каждой клетки содержали следующую информацию: количество животных, пол, линия, дата получения, лечение, номер испытания, номер группы и дата начала испытания.
Идентификация животных: животных маркировали кодированием на ушах.
4. Способы и процедуры эксперимента.
4.1. Культивирование клеток.
Опухолевые клетки NCI-H292 поддерживали in vitro в качестве культуры в виде монослоя в среде RPMI-1640, дополненной 10% инактивированной нагреванием эмбриональной телячьей сывороткой, при 37°С в атмосфере 5% СО2 в воздухе. Опухолевые клетки стандартным образом субкультивировали два раза в неделю посредством обработки трипсином-EDTA. Клетки, растущие в экспоненциальной фазе роста, собирали и подсчитывали для инокуляции опухоли.
4.2. Инокуляция опухоли.
Каждой мыши подкожно инокулировали в правый бок опухолевые клетки NCI-H292.
(10х106) в 0,2 мл PBS для развития опухоли. 41 животное случайным образом распределяли на группы, когда средний объем опухоли достигал 162 мм3. Введение тестируемых образцов и количества животных в каждой группе представлены в таблице схемы эксперимента.
- 139 045862
4.3. Получение состава тестируемого образца
Тестируемый образец Конц. (мг/мл) Состав
Носитель - 25 мМ гистидин, pH 7, 10% сахароза
BCY8242 0,5 Разбавить 510 мкл исходного раствора 20 мг/мл BCY8242 19,886 мл гистидинового буфера
BCY8242 о,з Разбавить 480 мкл исходного раствора 0,5 мг/мл BCY8242 320 мкл гистидинового буфера
BCY8245 0,5 Разбавить 400 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8245 посредством 400 мкл гистидинового буфера
BCY8245 о,з Разбавить 240 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8245 посредством 560 мкл гистидинового буфера
BCY8253 0,5 Разбавить 400 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8253 400 мкл гистидинового буфера
BCY8253 о,з Разбавить 240 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8253 560 мкл гистидинового буфера
BCY8255 0,5 Разбавить 400 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8255 400 мкл ацетатного буфера
BCY8255 о,з Разбавить 240 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8255 560 мкл ацетатного буфера
1. Гистидиновый буфер:25 мМ гистидин, рН7, 10% сахароза 2. Ацетатный буфер: 50 мМ ацетат/уксусная кислота, pH 5, 10% сахароза 3. Исходные растворы BCY8242(0,5 мг/мл), BCY8245 (1 мг/мл), BCY8253 (1 мг/мл) и BCY8255(1 mg/мл) распределяли в индивидуальные пробирки и хранили при -80°С
4.4. Взятие образцов.
В конце исследования опухоль во всех группах, за исключением групп 2, 3 и 4 извлекали через 2 ч после последнего дозирования. Опухоли в группах 2, 3 и 4 извлекали без какого-либо дозирования.
5. Результаты.
5.1. Кривые роста опухоли.
Кривые роста опухоли представлены на фиг. 54-57.
5.2. Регистрация объема опухоли.
Средний объем опухоли с течением времени у самок мышей Balb/c nude, имеющих ксенотрансплантат NCI-H292, представлен на фиг. 36.
- 140 045862
Таблица 36. Регистрация объема опухоли с течением времени
Групп а Лечение Сутки после начала лечения
0 2 4 7 9 И 14
1 Носитель, qw 161±2 270±14 357±14 448±17 570±16 720±36 948±61
2 BCY8242, 3 мг/кг, qw 160±1 214±13 197±15 159±2 175±7 119±8 92±10
3 BCY8242, 3 мг/кг, biw 162±12 221±9 176±17 146±36 131±49 79±25 73±28
4 BCY8242, 5 мг/кг, qw 163±8 185±18 133±4 145±18 131=1=12 91±5 81±5
5 BCY8245, 3 мг/кг, qw 160±5 220±11 266±15 218±23 167±10 161±36 149±43
6 BCY8245, 3 мг/кг, biw 162±13 243±19 211±12 101±11 100±8 87±7 65±3
7 BCY8245, 5 мг/кг, qw 160±9 176±7 191±3 105±8 82±3 91±14 83±8
8 BCY8253, 3 мг/кг, qw 162±7 187±9 176±20 159±15 147±8 114±13 98±3
9 BCY8253, 3 мг/кг, biw 162±14 174±9 149±7 70±2 68±6 58±2 49±5
10 BCY8253, 5 мг/кг, qw 161=1=10 161±9 121±9 97±3 79±6 82±8 68±9
И BCY8255, 3 мг/кг, qw 162±8 195±14 160±5 123±1 108±5 104±3 100±9
12 BCY8255, 3 мг/кг, biw 162±15 204±16 148=1=11 132±16 102±20 106±38 96±35
13 BCY8255, 5 мг/кг, qw 164±8 171±8 103±9 101±5 89±11 87±32 97±44
5.3. Анализ ингибирования роста опухоли.
Скорость ингибирования роста опухоли для тестируемых образцов в модели с ксенотрансплантатом NCI-H292 вычисляли на основе измерения объема опухоли через 14 суток после начала лечения.
- 141 045862
Таблица 37. Анализ ингибирования роста опухоли
Г руппа Лечение Объем опухоли (мм3)а Т/Сь (%) TGI (%) Значение Р по сравнению с носителем
1 Носитель, qw 948±61 - - -
2 BCY8242, 3 мг/кг, qw 92±10 9,7 108,6 /?<0,001
3 BCY8242, 3 мг/кг, biw 73±28 7,7 111,4 /?<0,001
4 BCY8242, 5 мг/кг, qw 81±5 8,6 110,4 /?<0,001
5 BCY8245, 3 мг/кг, qw 149±43 15,8 101,4 /?<0,001
6 BCY8245, 3 мг/кг, biw 65±3 6,9 112,2 /?<0,001
7 BCY8245, 5 мг/кг, qw 83±8 8,8 109,8 /?<0,001
8 BCY8253, 3 мг/кг, qw 98±3 10,4 108,1 /?<0,001
9 BCY8253, 3 мг/кг, biw 49±5 5,2 114,3 /?<0,001
10 BCY8253, 5 мг/кг, qw 68±9 7,2 111,9 /?<0,001
И BCY8255, 3 мг/кг, qw 100±9 10,6 107,9 /?<0,001
12 BCY8255, 3 мг/кг, biw 96±35 10,1 108,5 /?<0,001
13 BCY8255, 5 мг/кг, qw 97±44 10,2 108,5 /?<0,001
а. Среднее значение ± SEM.
b. Ингибирование роста опухоли вычисляют путем деления среднего по группе объема опухоли для группы лечения на средний по группе объем опухоли для контрольной группы (Т/С).
6. Обобщение и обсуждение результатов.
В этом исследовании оценивали терапевтическую эффективность тестируемых образцов в модели с ксенотрансплантатом NCI-H292. Измеренные объемы опухоли во всех группах лечения в различные моменты времени представлены на фиг. 54-57 и в табл. 36 и 37.
Средний размер опухоли у мышей, которым вводили носитель, достигал 948 мм3 на 14 сутки. BCY8242 в дозе 3 мг/кг, qw (TV=92 мм3, TGI=108,6%, р<0,001), 3 мг/кг, biw (TV=73 мм3, TGI=111,4%, p<0,001) и 5 мг/кг, qw (TV=81 мм3, TGI=110,4%,p<0,001) имел значительную противоопухолевую активность.
BCY8245 в дозе 3 мг/кг, qw (TV=149 мм3, TGI=101,4%,p<0,001), 3 мг/кг, biw (TV=65 мм3, TGI=112,2%, р<0,001) и 5 мг/кг, qw (TV=83 мм3, TGI=109,8%, p<0,001) имел значительную противоопухолевую активность.
BCY8253 в дозе 3 мг/кг, qw (TV=98 мм3, TGI=108,l%,/K0,001), 3 мг/кг, biw (TV=49 мм3, TGI=114,3%, p <0,001) и at 5 мг/кг, qw (TV=68 мм3, TGI=111,9%, p <0,001) имел значительную противоопухолевую активность.
BCY8255 в дозе 3 мг/кг, qw (TV=100 мм3, TGI=107,9%,p<0,001), 3 мг/кг, biw (TV=96 мм3, TGI=108,5%, р<0,001) и at 5 мг/кг, qw (TV=97 мм3, TGI=108,5%, p<0,001) имел значительную противоопухолевую активность.
Все из тестируемых образцов в дозе 3 мг/кг, qw, 3 мг/кг, biw и 5 мг/кг, qw продемонстрировали сравнимую противоопухолевую активность, эффективность далее не повышалась при повышении дозировки или частоты дозирования.
- 142 045862
В этом исследовании животные, которым вводили BCY8253 в дозе 5 мг/кг, продемонстрировали среднее снижение массы тела 15% на 9 сутки, мыши в других группах хорошо сохраняли массу тела.
В этой клеточной линии, которая демонстрирует высокую экспрессию нектина-4 в исследованиях FACS, BCY8245 вызывает регрессию опухоли, подтверждая определяемую мишенью природу оптимальной эффективности.
Пример 9.6. Исследование эффективности in vivo тестируемых образцов при лечении мышей Balb/c nude с ксенотрансплантатом NCI-H526.
1. Задача исследования.
Задачей исследования является оценка in vivo противоопухолевой эффективности тестируемых образцов при лечении мышей Balb/c nude с ксенотрансплантатом NCI-H526.
2. Схема эксперимента
Групп а Лечение η Доза (мг/кг) Объем дозирования (мкл/г) Путь дозиров ания Схема
1 Vehicle 3 10 iv qw
2 BCY8245 3 3 10 iv qw
3 BCY8245 3 3 10 iv biw
4 BCY8245 3 5 10 iv qw
5 BCY8255 3 3 10 iv qw
6 BCY8255 3 3 10 iv biw
7 BCY8255 3 5 10 iv qw
3. Материалы.
3.1. Животные и условия содержания.
3.1.1. Животные.
Вид: Mus Musculus.
Линия: Balb/c nude.
Возраст: 6-8 недель.
Пол: самки.
Масса тела: 18-22 г.
Количество животных: 21 мышь плюс запасные.
3.1.2. Условия содержания.
Мышей содержали в индивидуально вентилируемых клетках при постоянной температуре и влажности по 3 животных в каждой клетке.
Температура: 20~26°С.
Влажность 40-70%.
Клетки: изготовлены из поликарбоната. Размер составляет 300 ммх180 ммх150 мм. Материалом подстилки были сердцевины кукурузных початков, которые заменяли два раза в неделю.
Рацион: животные имели свободный доступ к стерилизованному облучением сухому гранулированному корму в ходе всего периода исследования.
Вода: животные имели свободный доступ к питьевой воде.
Идентификация клеток: идентификационные ярлыки для каждой клетки содержали следующую информацию: количество животных, пол, линия, дата получения, лечение, номер испытания, номер группы и дата начала испытания.
Идентификация животных: животных маркировали кодированием на ушах.
4. Способы и процедуры эксперимента.
4.1. Культивирование клеток.
Клетки NCI-H526 поддерживали в среде, дополненной 10% инактивированной нагреванием эмбриональной телячьей сывороткой, при 37°С в атмосфере 5% СО2 в воздухе. Опухолевые клетки стандартным образом субкультивировали два раза в неделю. Клетки, растущие в экспоненциальной фазе роста, собирали и подсчитывали для инокуляции опухоли.
4.2. Инокуляция опухоли.
Каждой мыши подкожно инокулировали в правый бок опухолевые клетки NCI-H526 (5,0х 106) в 0,2 мл PBS для развития опухоли. 21 животное случайным образом распределяли на группы, когда средний объем опухоли достигал 181 мм3. Введение тестируемых образцов и количества животных в каждой группе представлены в таблице схемы эксперимента.
- 143 045862
4.3. Получение состава тестируемого образца
Тестируемый образец Конц. (мг/мл) Состав
Носитель - 25 мМ гистидин, pH 7, 10% сахароза
BCY8245 0,5 Разбавить 400 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8245 посредством 400 мкл гистидинового буфера
BCY8245 о,з Разбавить 240 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8245 посредством 560 мкл гистидинового буфера
BCY8255 0,5 Разбавить 400 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8255 400 мкл ацетатного буфера
BCY8255 о,з Разбавить 240 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8255 560 мкл ацетатного буфера
1. Гистидиновый буфер:25 мМ гистидин, рН7, 10% сахароза 2. Ацетатный буфер: 50 мМ ацетат/уксусная кислота, pH 5, 10% сахароза
4.4. Взятие образцов.
В конце исследования на 14 сутки все опухоли извлекали для FFPE. 5.
Результаты.
5.1. Кривые роста опухоли.
Кривые роста опухоли представлены на фиг. 58 и 59.
5.2. Регистрация объема опухоли.
Средний объем опухоли с течением времени у самок мышей Balb/c nude, имеющих ксенотрансплантат NCI-H526, представлен в табл. 38.
Таблица 38. Регистрация объема опухоли с течением времени
Групп Сутки после начала лечения
а 0 2 4 7 9 12 14
1 Носитель, qw 181+3 2 262+5 6 431 ±9 0 563+72 729+11 5 1076+15 5 1365+20 8
2 BCY8245, 3 мг/кг, qw 180+3 2 256+5 1 403+7 2 545+68 657+83 1019+15 5 1205+79
3 BCY8245, 3 мг/кг, biw 182+4 3 232+4 9 308+7 9 440+11 2 530+12 1 810+197 1109+25 0
4 BCY8245, 5 мг/кг, qw 180+5 2 209+6 6 236+7 2 383+11 9 375+11 5 365+79 476+103
5 BCY8255, 3 мг/кг, qw 182+3 0 264+6 3 364+8 8 537+97 610+80 842+103 1146+12 5
6 BCY8255, 3 мг/кг, biw 181+2 9 264+4 6 313+5 6 393+62 440+67 520+76 715+163
7 BCY8255, 5 мг/кг, qw 182+3 5 227+5 7 256+6 381+90 395+76 474+100 704+101
5.3. Анализ ингибирования роста опухоли.
Скорость ингибирования роста опухоли для тестируемых образцов в модели с ксенотрансплантатом NCI-H526 вычисляли на основе измерения объема опухоли на 14 сутки после начала лечения.
- 144 045862
Таблица 39. Анализ ингибирования роста опухоли
Г руппа Лечение Объем опухоли (мм3)а Т/Сь (%) TGI (%) Значение Р
1 Носитель, qw 1365±208 - - -
2 BCY8245, 3 мг/кг, qw 1205±79 88,3 13,4 /?>0,05
3 BCY8245, 3 мг/кг, biw 1109±250 81,3 21,6 /?>0,05
4 BCY8245, 5 мг/кг, qw 476±103 34,9 75,0 /?<0,01
5 BCY8255, 3 мг/кг, qw 1146±125 84,0 18,5 /?>0,05
6 BCY8255, 3 мг/кг, biw 715±163 52,4 54,9 /?>0,05
7 BCY8255, 5 мг/кг, qw 704±101 51,5 55,9 /?<0,05
а. Среднее значение ± SEM;
b. Ингибирование роста опухоли вычисляют путем деления среднего по группе объема опухоли для группы лечения на средний по группе объем опухоли для контрольной группы (Т/С).
6. Обобщение и обсуждение результатов.
В этом исследовании оценивали терапевтическую эффективность тестируемых образцов в модели с ксенотрансплантатом NCI-H526. Измеренные объемы опухоли во всех группах лечения в различные моменты времени представлены на фиг. 58 и 59 и в таблицах 38 и 39.
Средний размер опухоли у мышей, которым вводили носитель, достигал 13653 на 14 сутки после начала лечения. BCY8245 в дозе 3 мг/кг, qw (TV=1205 мм3, TGI=13,4%, p> 0,05) и 3 мг/кг, biw (TV=1109 мм3, TGI=21,6%, p>0,05) продемонстрировал небольшую противоопухолевую активность, BCY8245 в дозе 5 мг/кг, qw (TV=476 мм3, TGI=75,0%, р<0,01) продемонстрировал значительную противоопухолевую активность.
BCY8255 в дозе 3 мг/кг, qw (TV=1146 мм3, TGI=18,5%, p>0,05) продемонстрировал небольшую противоопухолевую активность. BCY8255 в дозе 3 мг/кг, biw (TV=715 мм3, TGI=54,9%, p>0,05) имел умеренную противоопухолевую активность, но без статистической значимости. BCY8255 в дозе 5 мг/кг, qw (TV=704 мм3, TGI=55,9%, p<0,05) имел значительную противоопухолевую активность.
В этом исследовании, BCY8245 в дозе 5 мг/кг biw вызывал снижение массы тела животных более 10%, BCY8255 3 мг/кг biw и 5 мг/кг qw вызывали снижение массы тела животных более 15% в ходе режима лечения.
В этой клеточной линии, которая демонстрирует минимальную экспрессию нектина-4 в исследованиях FACS, рост опухоли сдерживался посредством BCY8245, однако не происходила регрессия опухоли, подтверждая опосредование мишенью оптимальной эффективности.
Пример 9.7. Исследование эффективности in vivo тестируемых образцов при лечении мышей Balb/c nude, с ксенотрансплантатом Panc2.13.
1. Задача исследования.
Задачей исследования является оценка in vivo противоопухолевой эффективности тестируемых образцов при лечении мышей Balb/c nude с ксенотрансплантатом Panc2.13.
- 145 045862
2. Схема эксперимента
Групп а Лечение η Доза (мг/кг) Объем дозирования (мкл/г) Путь дозирован ня Схема
1 Носитель 5 10 в/в qw
2 BCY8242 3 3 мг/кг 10 в/в qw
3 BCY8242 3 3 мг/кг 10 в/в biw
4 BCY8242 3 5 мг/кг 10 в/в qw
5 BCY8245 3 3 мг/кг 10 в/в qw
6 BCY8245 3 3 мг/кг 10 в/в biw
7 BCY8245 3 5 мг/кг 10 в/в qw
8 BCY8253 3 3 мг/кг 10 в/в qw
9 BCY8253 3 3 мг/кг 10 в/в biw
10 BCY8253 3 5 мг/кг 10 в/в qw
И BCY8255 3 3 мг/кг 10 в/в qw
12 BCY8255 3 3 мг/кг 10 в/в biw
13 BCY8255 3 5 мг/кг 10 в/в qw
4 BCY8245 3 10 в/в qw
3. Материалы.
3.1. Животные и условия содержания.
3.1.1. Животные.
Вид: Mus Musculus.
Линия: Balb/c nude.
Возраст: 6-8 недель.
Пол: самки.
Масса тела: 18-22 г.
Количество животных: 41 мышь плюс запасные.
3.1.2. Условия содержания.
Мышей содержали в индивидуально вентилируемых клетках при постоянной температуре и влажности с 3 или 5 животными в каждой клетке.
Температура: 20~26°С.
Влажность 40-70%.
Клетки: изготовлены из поликарбоната. Размер составляет 300 ммх180 ммх150 мм. Материалом подстилки были сердцевины кукурузных початков, которые заменяли два раза в неделю.
Рацион: животные имели свободный доступ к стерилизованному облучением сухому гранулированному корму в ходе всего периода исследования.
Вода: животные имели свободный доступ к питьевой воде.
Идентификация клеток: идентификационные ярлыки для каждой клетки содержали следующую информацию: количество животных, пол, линия, дата получения, лечение, номер испытания, номер группы и дата начала испытания.
Идентификация животных: животных маркировали кодированием на ушах.
4. Способы и процедуры эксперимента.
4.1. Культивирование клеток.
Опухолевые клетки Panc2.13 поддерживают в среде RMPI1640, дополненной 15% инактивированной нагреванием эмбриональной телячьей сывороткой, и 10 единиц/мл рекомбинантного инсулина человека при 37°С в атмосфере 5% СО2 в воздухе. Опухолевые клетки стандартным образом субкультивируют два раза в неделю. Клетки, растущие в экспоненциальной фазе роста, собирают и подсчитывают для инокуляции опухоли.
4.2. Инокуляция опухоли.
Каждой мыши подкожно инокулировали в правый бок опухолевые клетки Рапс2.13 (5х106) с матригелем (1:1) в 0,2 мл PBS для развития опухоли. 41 животное случайным образом распределяли на группы, когда средний объем опухоли достигал 149 мм3. Введение тестируемых образцов и количества животных в каждой группе представлены в таблице схемы эксперимента.
- 146 045862
4.3. Получение состава тестируемого образца
Тестируемый образец Конц. (мг/мл) Состав
Носитель - 25 мМ гистидин, pH 7, 10% сахароза
BCY8242 0,5 Разбавить 510 мкл исходного раствора 20 мг/мл BCY8242 19,886 мл гистидинового буфера
BCY8242 о,з Разбавить 480 мкл исходного раствора 0,5 мг/мл BCY8242 320 мкл гистидинового буфера
BCY8245 0,5 Разбавить 400 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8245 посредством 400 мкл гистидинового буфера
BCY8245 о,з Разбавить 240 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8245 посредством 560 мкл гистидинового буфера
BCY8253 0,5 Разбавить 400 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8253 400 мкл гистидинового буфера
BCY8253 0,3 Разбавить 240 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8253 560 мкл гистидинового буфера
BCY8255 0,5 Разбавить 400 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8255 400 мкл ацетатного буфера
BCY8255 о,з Разбавить 240 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8255 560 мкл ацетатного буфера
3. Гистидиновый буфер:25 мМ гистидин, рН7, 10% сахароза 4. Ацетатный буфер: 50 мМ ацетат/уксусная кислота, pH 5, 10% сахароза
4.4. Взятие образцов.
В конце исследования опухоли во всех группах, за исключением групп 2, 3 и 4, извлекали через 2 ч после последнего дозирования. Опухоли в группах 2, 3 и 4 извлекали без какого-либо дозирования.
5. Результаты.
5.1. Кривые роста опухоли.
Кривые роста опухоли представлены на фиг. 60-63.
5.2. Регистрация объема опухоли.
Средний объем опухоли с течением времени у самок мышей Balb/c nude, имеющих ксенотрансплантат Panc2.13, представлен в табл. 40.
Таблица 40. Регистрация объема опухоли с течением времени
Групп Сутки после начала лечения
а Лечение
0 2 4 7 9 11 14
1 Носитель, qw 149±12 202±12 240±9 321±17 410±27 479±32 545±17
2 BCY8242, 3 мг/кг, qw 149±31 172±33 201±46 240±40 275±49 293±48 334±49
3 BCY8242, 3 мг/кг, biw 148±10 169±6 192±1 226±13 245±14 223±11 227±22
4 BCY8242, 5 мг/кг, qw 149±37 172±32 190±38 211±37 214±37 199±31 218±41
5 BCY8245, 149±34 160±33 191±39 215±53 242±62 259±59 271±54
- 147 045862
3 мг/кг, qw
6 BCY8245, 3 мг/кг, biw 148±46 170±38 204±57 216±56 236±59 241±60 231±57
7 BCY8245, 5 мг/кг, qw 149±18 180±11 231±33 242±34 248±40 231±37 238±40
8 BCY8253, 3 мг/кг, qw 149±19 176±20 230±25 253±20 274±27 303±18 324±21
9 BCY8253, 3 мг/кг, biw 149±42 175±39 217±61 216±59 222±64 213±64 219±68
10 BCY8253, 5 мг/кг, qw 148±7 159±8 195±5 190±5 173=1=11 168±12 170±23
11 BCY8255, 3 мг/кг, qw 150±35 184±39 234±52 267±52 277±54 297±55 310±58
12 BCY8255, 3 мг/кг, biw 149±41 186±43 233±52 247±53 256±54 244±44 251±44
13 BCY8255, 5 мг/кг, qw 150±27 180±27 223±37 239±39 224±31 200±18 209±19
5.3. Анализ ингибирования роста опухоли.
Скорость ингибирования роста опухоли для тестируемых образцов в модели с ксенотрансплантатом Panc2.13 вычисляли на основе измерения объема опухоли через 14 суток после начала лечения.
Таблица 41. Анализ ингибирования роста опухоли
Группа Лечение Объем опухоли (мм3)а Т/Сь (%) TGI (%) Значение Р по сравнению с носителем
1 Носитель, qw 545±17 - - -
2 BCY8242, 3 мг/кг, qw 334±49 61,2 53,2 /?<0,01
3 BCY8242, 3 мг/кг, biw 227±22 41,6 80,0 /><0,001
4 BCY8242, 5 мг/кг, qw 218±41 40,0 82,4 /?<0,001
5 BCY8245, 3 мг/кг, qw 271±54 49,6 69,2 /?<0,01
- 148 045862
6 BCY8245, 3 мг/кг, biw 231±57 42,3 79,1 /?<0,001
7 BCY8245, 5 мг/кг, qw 238±40 43,6 77,5 /?<0,001
8 BCY8253, 3 мг/кг, qw 324±21 59,3 55,9 /?<0,01
9 BCY8253, 3 мг/кг, biw 219±68 40,2 82,2 /?<0,001
10 BCY8253, 5 мг/кг, qw 170±23 31,1 94,5 /?<0,001
11 BCY8255, 3 мг/кг, qw 310±58 56,8 59,5 /?<0,01
12 BCY8255, 3 мг/кг, biw 251±44 46,0 74,3 /?<0,001
13 BCY8255, 5 мг/кг, qw 209±19 38,2 85,1 /?<0,001
а. Среднее значение ± SEM.
b. Ингибирование роста опухоли вычисляют путем деления среднего по группе объема опухоли для группы лечения на средний по группе объем опухоли для контрольной группы (Т/С).
6. Обобщение и обсуждение результатов.
В этом исследовании оценивали терапевтическую эффективность тестируемых образцов в модели с ксенотрансплантатом Panc2.13. Измеренные объемы опухоли во всех группах лечения в различные моменты времени представлены на фиг. 60-63 и в табл. 40 и 41.
Средний размер опухоли у мышей, которым вводили носитель, достигал 545 мм3 на 14 сутки. BCY8242 в дозе 3 мг/кг, qw (TV=334 мм3, TGI=53,2%, p<0,01), 3 мг/кг, biw (TV=227 мм3, TGI=80,0%, p<0,001) и 5 мг/кг, qw (TV=218 мм3, TGI=82,4%, p<0,001) имел значительную противоопухолевую активность зависимым от дозы и частоты дозирования образом.
BCY8245 в дозе 3 мг/кг, qw (TV=271 мм3, TGI=69,2%, p<0,01), 3 мг/кг, biw (TV=231 мм3, TGI=79,1%, р<0,001) и 5 мг/кг, qw (TV=238 мм3, TGI=77,5%, p<0,001) имел значительную противоопухолевую активность.
BCY8253 в дозе 3 мг/кг, qw (TV=324 мм3, TGI=59,8%,p<0,01), 3 мг/кг, biw (TV=219 мм3, TGI=82,2%, p<0,001) и 5 мг/кг, qw (TV=170 мм3, TGI=94,5%, p<0,001) имел значительную противоопухолевую активность зависимым от дозы и частоты дозирования образом.
BCY8255 в дозе 3 мг/кг, qw (TV=310 мм3, TGI=59,5%,p<0,01), 3 мг/кг, biw (TV=251 мм3, TGI=74,3%, р<0,001) и 5 мг/кг, qw (TV=209 мм3, TGI=85,1%, p<0,001) имел значительную противоопухолевую активность.
В этом исследовании животные во всех группах 5 мг/кг qw теряли в среднем более 15% массы тела, особенно животные в группах BCY8253 и BCY8255 5 мг/кг, которые теряли более 20% массы тела в ходе режима лечения.
В этой клеточной линии, которая демонстрирует только умеренную экспрессию нектина-4 в исследованиях FACS, рост опухоли сдерживается посредством BCY8245, однако опухоль регрессии опухоли не происходит.
Пример 9.8. Исследование эффективности in vivo тестируемых образцов при лечении мышей Balb/c nude с ксенотрансплантатом MDA-MB-468.
1. Задача исследования.
Задачей исследования является оценка in vivo противоопухолевой эффективности BCY8781 и BCY8245 и BCY8234 в комбинации с BCY8234 при лечении мышей Balb/c nude с ксенотрансплантатом MDA-MB-468 для определения роли, которую связывание мишени играет в оптимальной эффективности.
- 149 045862
2. Схема эксперимента
Г руппа Лечение Доза (мг/кг) N Путь дозирования Схема
1 Носитель - 4 в/в Qw, 3 weeks
2 BCY8245 о,з 4 в/в Qw, 3 weeks
3 BCY8245 1 4 в/в Qw, 3 weeks
4 BCY8245 з 4 в/в Qw, 3 weeks
5 BCY8781 0,3 4 в/в Qw, 3 weeks
6 BCY8781 1 4 в/в Qw, 3 weeks
7 BCY8781 з 4 в/в Qw, 3 weeks
8 BCY8245+BCY8234 1+300 4 в/в Qw, 3 weeks
9 BCY8245+BCY8234 3+300 4 в/в Qw, 3 weeks
Примечание: N, количество животных в каждой группе.
3. Материалы.
3.1. Животные и условия содержания.
3.1.1. Животные.
Вид: Mus Musculus.
Линия: Balb/c nude.
Возраст: 6-8 недель.
Пол: самки.
Масса тела: 18-22 г.
Количество животных: 36 мышей плюс запасные.
3.1.2. Условия содержания.
Мышей содержали в индивидуально вентилируемых клетках при постоянной температуре и влажности с 4 животными в каждой клетке.
Температура: 20~26°С.
Влажность 40-70%.
Клетки: изготовлены из поликарбоната. Размер составляет 300 ммх180 ммх150 мм. Материалом подстилки были сердцевины кукурузных початков, которые заменяли два раза в неделю.
Рацион: животные имели свободный доступ к стерилизованному облучением сухому гранулированному корму в ходе всего периода исследования.
Вода: животные имели свободный доступ к питьевой воде.
Идентификация клеток: идентификационные ярлыки для каждой клетки содержали следующую информацию: количество животных, пол, линия, дата получения, лечение, номер испытания, номер группы и дата начала испытания.
Идентификация животных: животных маркировали кодированием на ушах.
4. Способы и процедуры эксперимента.
4.1. Культивирование клеток.
Опухолевые клетки поддерживали в среде Лейбовитца L-15, дополненной 10% инактивированной нагреванием эмбриональной телячьей сывороткой, при 37°С в атмосфере 0% СО2 в воздухе. Опухолевые клетки стандартным образом субкультивировали два раза в неделю. Клетки, растущие в экспоненциальной фазе роста, собирали и подсчитывали для инокуляции опухоли.
4.2. Инокуляция опухоли.
Каждой мыши подкожно инокулировали в правый бок опухолевые клетки MDA-MB-468 (10х106) в 0,2 мл PBS, дополненном 50% матригелем, для формирования опухоли. 36 животных случайным образом распределяли на группы, когда средний объем опухоли достигал 186 мм3. Введение тестируемых образцов и количества животных в каждой группе представлены в таблице схемы эксперимента.
- 150 045862
4.3. Получение состава тестируемого образца
Тестируемы й образец Чистота Конц. (мг/мл) Состав
Носитель - - 25 мМ гистидин, pH 7, 10% сахароза
BCY8245 99,4% 1 0,03 0,1 Растворить 5,0 мг BCY8245 в 4,97 мл гистидинового буфера1 Разбавить 36 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8245 посредством 1164 мкл гистидинового буфера Разбавить 120 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8245 посредством 1080 мкл гистидинового буфера
о,з Разбавить 360 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8245 посредством 840 мкл гистидинового буфера
BCY8781 99,0% 1 Растворить 2,5 мг BCY8781 в 49,5 мкл DMSO, разбавить 2,426 мл гистидинового буфера
0,03 Разбавить 36 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8781 посредством 1164 мкл гистидинового буфера
0,1 Разбавить 120 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8781 посредством 1080 мкл гистидинового буфера
0,3 Разбавить 360 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8781 посредством 840 мкл гистидинового буфера
BCY8234 98,10% 30 Растворить 147 мг BCY8234 в 4,807 мл гистидинового буфера
1. 25 мМ гистидин, pH 7, 10% сахароза
4.4. Взятие образцов.
На 21 сутки исследования опухоли в группах 5, 6, 7, 8 и 9 извлекали для FFPE. В конце исследования опухоли в группе 3 извлекали для FFPE.
5. Результаты.
5.1. Кривая роста опухоли.
Кривая роста опухоли представлена на фиг. 64.
5.2. Регистрация объема опухоли.
Средний объем опухоли с течением времени у самок мышей Balb/c nude, имеющих ксенотрансплантат MDA-MB-468, представлен в табл. 42-44.
5.3. Анализ ингибирования роста опухоли.
Скорость ингибирования роста опухоли для тестируемых образцов в модели с ксенотрансплантатом MDA-MB-468 вычисляли на основе измерения объема опухоли через 21 сутки после начала лечения.
6. Обобщение и обсуждение результатов.
В этом исследовании оценивали терапевтическую эффективность тестируемых образцов в модели с ксенотрансплантатом MDA-MB-468. Измеренные объемы опухоли во всех группах лечения в различные моменты времени представлены на фиг. 64 и в табл. 42-45.
Средний размер опухоли у мышей, которым вводили носитель, достигал 420 мм3 на 21 сутки. BCY8245 в дозе 1 мг/кг, qw (TV=204 мм3, TGI=92,1%, p<0,001), 3 мг/кг, qw (TV=27 мм3, TGI=164,9%, p<0,001) имел значительную зависимую от дозу противоопухолевую активность. BCY8245 в дозе 0,3 мг/кг qw или biw не демонстрировал никакой противоопухолевой активности.
BCY8781 в дозе 0,3 мг/кг, qw (или biw) (TV=283 мм3, TGI=58,3%,p<0,05), 1 мг/кг, qw (TV=232 мм3, TGI=80,l%,p<0,01), 3 мг/кг, qw (TV=91 мм3, TGI=139,4%,p<0,001) имел значительную противоопухолевую активность зависимым от дозы образом.
- 151 045862
BCY8245 в дозе 1 мг/кг, qw и 3 мг/кг, qw в комбинации с BCY8234 (свободный от токсина родственный пептид) в дозе 300 мг/кг, qw имели значительную противоопухолевую активность (TV=242 mm3, TGI=75,4%, p<0,01). По сравнению с BCY8245 отдельно, BCY8234 в дозе 300 мг/кг был антагонистом противоопухолевой активности BCY8245 в дозе 3 мг/кг (р<0,001). Это снижение эффективности посредством конкуренции со свободным от токсина пептидом демонстрирует важность связывания мишени для оптимальной эффективности. Ответ в виде эффективности, наблюдаемый для не связывающего ВТС, BCY8781, был сравнимым с ответом, наблюдаемым для BCY8245 в присутствии избытка свободного от токсина связывающего пептида. Это подтверждает преимущества опосредуемого мишенью связывания для оптимальной эффективности.
Группу носителя разделяли на две группы на 32 сутки и вводили дозу 5 мг/кг BCY8781 или 5 мг/кг BCY8245, соответственно, опухоли продемонстрировали заметную регрессию после однократной дозы.
В ходе последующего мониторинга мыши, которым вводили BCY8245 1 мг/кг qw, продемонстрировали отчетливый рецидив опухоли, в то время мыши, которым вводили BCY8245 3 мг/кг qw, не продемонстрировали никакого рецидива опухоли.
Таблица 42. Регистрация объема опухоли с течением времени (сутки с 0 по 21)
Г руппа Лечение Сутки после начала лечения
0 2 4 7 9 11 14 16 18 21
1 Носитель, qw 182+15 196+18 217+18 260+15 283+19 302+26 335+27 362+28 386+31 420+37
2 BCY8245 0,3 мг/кг, qw 188+21 189+19 211+21 235+28 252+25 253+33 275+26 277+27 295+26 300+27
3 BCY8245 1 мг/кг, qw 185+21 187+22 183+22 190+28 205+29 195+27 201+25 197+22 218+24 204+19
4 BCY8245 3 мг/кг, qw 181+14 171+17 163+10 141+21 113+16 92+5 66+4 58+2 41+2 27+1
5 BCY8781 0,3 мг/кг, qw 184+14 187+12 204+9 245+17 262+24 272+21 277+24 290+29 297+41 283+23
6 BCY8781 1 мг/кг, qw 184+12 175+16 188+21 206+25 223+26 213+29 202+31 200+24 211+34 232+32
7 BCY8781 3 мг/кг, qw 184+15 179+17 180+20 177+27 170+21 142+21 124+13 108+12 107+8 91+7
8 BCY8245+BCY8234 1+300 мг/кг, qw 184+15 189+22 194+28 212+30 221+34 221+39 223+36 211+38 221+51 242+67
9 BCY8245+BCY8234 3+300 мг/кг, qw 184+16 178+57 193+36 197+46 179+44 138+41 137+32 114+24 110+24 99+18
Таблица 43. Регистрация объема опухоли с течением времени (сутки с 23 по 32)
Г руппа Лечение Сутки после начала лечения
23 25 28 30 32
1 Носитель, qw 434+35 460+38 504+32 535+46 548+51
2 BCY8245 0,3 мг/кг, qw 284+14 268+10 254+15 240+21 241+32
3 BCY8245 1 мг/кг, qw 200+16 199+13 210+6 221+14 239+16
4 BCY8245 22+3 19+3 20+3 15+2 15+1
мг/кг, qw
- 152 045862
Таблица 44. Регистрация объема опухоли с течением времени (сутки с 35 по 91)
Сутки Группа 1, носитель qw, дозированный с BCY8781 5 мг/кг на PG-D32 Группа 1, носитель qw, дозированный с BCY8245 5 мг/кг на PG-D32 Группа BCY8245, мг/кг, qw 2, о,з Группа 3 BCY8245, 1 мг/кг, qw Группа 4, BCY8245, 3 мг/кг, qw
35 389+19 455+81 237+33 255+15 19+2
37 326+26 373+92 246+40 292+19 16+2
39 248+18 247+48 248+37 304+36 14+1
42 149+14 134+18 245+48 314+42 14+2
44 135+20 108+3 251+48 327+42 18+4
46 129+8 79+3 248+61 342+55 19+4
49 120+1 63+8 250+65 356+59 20+4
51 134+6 62+5 264+68 374+71 18+5
53 144+2 53+12 268+81 381+87 22+4
56 161+1 52+13 271+87 416+104 21+4
58 166+7 58+0 267+95 433+113 20+5
60 169+10 61+7 270+108 464+119 18+6
64 176+10 71+23 276+132 532+154 23+6
67 191+5 66+14 269+137 550+162 23+5
71 194+18 73+5 280+155 565+170 24+7
74 186+1 82+4 295+167 594+173 27+8
78 203+11 90+8 313+194 612+195 23+6
81 212+20 104+17 291+192 639+206 27+8
84 224+51 110+1 301+194 695+234 34+7
88 230+60 106+7 277+194 743+236 32+7
91 242+75 110+3 293+209 771+240 26+6
Таблица 45. Анализ ингибирования роста опухоли
Групп а Лечение Объем опухоли (мм3)а Т/Сь (%) TGI (%) Значение
Р по сравнени ю с носителем Комбинаци я по сравнению с BCY8245
1 2 3 4 5 6 7 Носитель, qw BCY8245 0,3 мг/кг, qw BCY8245 1 мг/кг, qw BCY8245 3 мг/кг, qw BCY8781 0,3 мг/кг, qw BCY8781 1 мг/кг, qw BCY8781 3 мг/кг, qw BCY8245+BCY82 420+37 300+27 204+19 27+1 283+23 232+32 91+7 71,4 48,6 6,5 67,4 55,2 21,6 52,7 92,1 164,9 58,3 80,1 139,4 /?>0,05 /?<0,001 /?<0,001 /?<0,05 /?<0,01 /?<0,001
8 34 1+300 мг/кг, qw BCY8245+BCY82 242+67 57,8 75,4 /?<0,01 /?>0,05
9 34 3+300 мг/кг, qw a. Среднее значение ± SEM. 99+18 23,5 135,9 /?<0,001 Р<0,001
b. Ингибирование роста опухоли вычисляют путем деления среднего по группе объема опухоли для
- 153 045862 группы лечения на средний по группе объем опухоли для контрольной группы (Т/С).
Пример 9.9. Исследование эффективности in vivo тестируемых образцов при лечении мышей Balb/c nude с ксенотрансплантатом MDA-MB-468.
1. Задача исследования.
Задачей исследования является оценка in vivo противоопухолевой эффективности BCY8245 отдельно или в комбинации с BCY8234 при лечении мышей Balb/c nude с ксенотрансплантатом MDA-MB-468. 2. Схема эксперимента
Г руппа Лечение Доза (мг/кг) N Путь дозирования Схема
1 Носитель 5 в/в Qw, 3 недели
2 BCY8245 1 5 в/в Qw, 3 недели
3 BCY8245 3 5 в/в Qw, 3 недели
4 BCY8245+ BCY8234 3+300 =300 5 в/в Qw, 3 недели
Примечание: N, количество животных в каждой группе.
3. Материалы.
3.1. Животные и условия содержания.
3.1.1. Животные.
Вид: Mus Musculus.
Линия: Balb/c nude.
Возраст: 6-8 недель.
Пол: самки.
Масса тела: 18-22 г.
Количество животных: 20 мышей плюс запасные.
3.1.2. Условия содержания.
Мышей содержали в индивидуально вентилируемых клетках при постоянной температуре и влажности с 5 животными в каждой клетке.
Температура: 20~26°С.
Влажность 40-70%.
Клетки: изготовлены из поликарбоната. Размер составляет 300 ммх180 ммх150 мм. Материалом подстилки были сердцевины кукурузных початков, которые заменяли два раза в неделю.
Рацион: животные имели свободный доступ к стерилизованному облучением сухому гранулированному корму в ходе всего периода исследования.
Вода: животные имели свободный доступ к питьевой воде.
Идентификация клеток: идентификационные ярлыки для каждой клетки содержали следующую информацию: количество животных, пол, линия, дата получения, лечение, номер испытания, номер группы и дата начала испытания.
Идентификация животных: животных маркировали кодированием на ушах.
4. Способы и процедуры эксперимента.
4.1. Культивирование клеток.
Опухолевые клетки поддерживали в среде Лейбовитца L-15, дополненной 10% инактивированной нагреванием эмбриональной телячьей сывороткой, при 37°С в атмосфере 0% СО2 в воздухе. Опухолевые клетки стандартным образом субкультивировали два раза в неделю. Клетки, растущие в экспоненциальной фазе роста, собирали и подсчитывали для инокуляции опухоли.
4.2. Инокуляция опухоли.
Каждой мыши подкожно инокулировали в правый бок опухолевые клетки MDA-MB-468 (10х 106) в 0,2 мл PBS, дополненном 50% матригелем, для формирования опухоли. 20 животных случайным образом распределяли на группы, когда средний объем опухоли достигал 464 мм3. Введение тестируемых образцов и количества животных в каждой группе представлены в таблице схемы эксперимента.
- 154 045862
4.3. Получение состава тестируемого образца
Тестируемы й образец Чистота Конц. (мг/мл) Состав
Носитель - - 25 мМ гистидин, pH 7, 10% сахароза
BCY8245 99,7% 1 Растворить 5,0 мг BCY8245 в 4,985 мл гистидинового буфера
0,1 Разбавить 140 мкл 1 исходный раствор мг/мл BCY8245 посредством 1260 мкл гистидинового буфера
о,з Разбавить 420 мкл исходного раствора 1 мг/мл BCY8245 посредством 980 мкл гистидинового буфера
BCY8234 98,10% 30 Растворить 147 мг BCY8234 в 4,807 мл гистидинового буфера
1. 25 мМ гистидин, pH 7, 10% сахароза
4.4. Взятие образцов.
В конце исследования опухоли в группе 3 извлекали для FFPE.
5. Результаты.
5.1. Кривая роста опухоли.
Кривая роста опухоли представлена на фиг. 65.
5.2. Регистрация объема опухоли.
Средний объем опухоли с течением времени у самок мышей Balb/c nude, имеющих ксенотрансплантат MDA-MB-468 представлен в табл. 46-48.
5.3. Анализ ингибирования роста опухоли.
Скорость ингибирования роста опухоли для тестируемых образцов в модели с ксенотрансплантатом MDA-MB-468 вычисляли на основе измерения объема опухоли через 28 суток после начала лечения.
6. Обобщение и обсуждение результатов.
В этом исследовании оценивали терапевтическую эффективность тестируемых образцов в модели с ксенотрансплантатом MDA-MB-468. Измеренные объемы опухоли во всех группах лечения в различные моменты времени представлены на фиг. 65 и в табл. 46-49.
Первоначальный размер опухоли намеренно был больше, чем использовался раньше для определения того, демонстрирует ли BCY8245 эффективность при этом большем размере. Средний размер опухоли у мышей, которым вводили носитель, достигал 773 мм3 на 28 сутки. BCY8245 в дозе 1 мг/кг, qw (TV=384 мм3, TGI=126,6%,p<0,001) и 3 мг/кг, qw (TV=50 мм3, TGI=234,6%, p<0,001) имел значительную противоопухолевую активность зависимым от дозы образом на 28 сутки. Среди них, мыши, которым вводили BCY8245, доза 3 мг/кг qw продемонстрировала некоторый рецидив опухоли после прекращения лечения, дополнительно дозирование с 76 суток не привело к полной регрессии опухоли.
BCY8245 в дозе 3 мг/кг qw в комбинации с BCY8234 300 мг/кг qw имели значительную противоопухолевую активность (TV=55 мм3, TGI=234,0%, p<0,001) на 28 сутки, и опухоли не продемонстрировали никакого рецидива в ходе всего мониторинга.
Мыши в группе носителя, которым вводили 10 мг/кг ADC против нектина-4 или 5 мг/кг BCY8245 и мыши в группе 2 (BCY8245, 1 мг/кг, qw), которым вводили 5 мг/кг BCY8245 на PG-D28, продемонстрировали эффективную регрессию опухоли в последующие 3 недели, после чего опухоли продемонстрировали повторный рост в последующие 4 недели после прекращения введения лекарственного средства.
BCY8245 был способен обеспечить регрессию опухолей приблизительно 450 мм3, а также при введении в группе, в которой ранее вводили носитель, в опухолях с начальным объемом приблизительно 770 мм3.
- 155 045862
Таблица 46. Регистрация объема опухоли с течением времени (Сутки с 0 по 28)
Г руппа Лечение Сутки после начала лечения
0 2 5 7 9 12 14 16 19 21 23 26 28
529 548 574 602 632 659 686 706 741 769 773
1 Носитель, qw 466+89 494+94 ±106 ±109 ±117 ±130 ±133 ±129 ±133 ±145 ±148 ±157 ±155
BCY8245 453 474 446 461 460 433 412 430 421 382 384
2 1мг/кг, qw 466+22 480+24 ±29 ±25 ±31 ±34 ±28 ±37 ±32 ±32 ±34 ±37 ±41
BCY8245 388 333 284 168 129 93 83 71 60 49 50
3 3 мг/кг, qw 464+28 451+24 ±25 ±30 ±26 ±24 ±20 ±23 ±17 ±19 ±17 ±17 ±17
BCY8245+BCY8234 401 389 309 205 150 125
4 (3+300) мг/кг, qw 467+45 457+46 ±47 ±42 ±25 ±9 ±9 ±5 95+3 90+5 78+5 66+4 55+5
Таблица 47. Регистрация объема опухоли с течением времени (сутки с 30 по 75)
Группа 2,
Группа 1, носитель, Группа 1, носитель, BCY8245,
Сутки после Группа 3, Группа 4,
дозированный в дозированный в 1 мг/кг, с
начала BCY8245, 3 BCY8245+BCY8234
количестве 5 мг/кг количестве 5 мг/кг заменой на
лечения мг/кг, qw 3+300 мг/кг, qw
BCY8781 BCY8245 на PG-D28 5мг/кг на PG- 4
На PG-D28 D28
30 700+57 625+27 351+42 44+18 49+8
33 537+88 477+31 213+29 43+20 33+10
35 443+70 405+65 151+18 44+20 31+10
37 297+71 237+36 98+16 50+24 31+10
40 203+64 148+33 89+17 55+29 36+14
42 161+47 142+33 95+16 66+32 40+13
44 139+50 132+69 103+20 71+33 35+11
48 103+35 146+100 106+21 80+36 43+14
51 114+45 171+122 103+21 91+43 45+18
55 108+44 227+166 104+20 108+53 42+13
56 119+50 264+182 120+23 125+58 43+12
62 118+50 288+206 145+29 146+70 40+12
65 129+55 316+212 163+31 147+74 41+14
68 124+51 347+215 173+32 155+81 46+13
72 142+62 368+242 180+36 170+89 45+20
75 146+50 385+245 196+40 223+115 43+19
Таблица 48. Регистрация объема опухоли с течением времени (сутки с 79 по 103)
Группа Лечение Сутки после начала лечения 79 82 86 89 93 96 100 103
BCY8245 3 3 мг/кг, qw 221+118 198+107 185+105 180+102 155+91 166+95 221+119 250+125
Таблица 49. Анализ ингибирования роста опухоли
Группа Лечение Объем опухоли (мм3)а Т/Сь (%) TGI (%) Значение Р по сравнению с носителем
1 Носитель, qw 773+155 - - -
2 BCY8245 384+41 49,7 126,6 //<0,001
3 1 мг/кг, qw BCY8245 50+17 6,4 234,6 //<0,001
4 3 мг/кг, qw BCY8245+BCY8234 55+5 7,1 234,0 //<0,001
3+300 мг/кг, qw a. Среднее значение ± SEM.
- 156 045862
b. Ингибирование роста опухоли вычисляют путем деления среднего по группе объема опухоли для группы лечения на средний по группе объем опухоли для контрольной группы (Т/С).
Пример 10. Испытания РК in vivo.
Животным с ксенотрнансплантатом MDA-MB-468 инъецировали BCY8245 (ВТ8009) в дозе 3 мг/кг. В различные моменты времени животных умерщвляли, проводили взятие плазмы и извлечение опухолей и их быстро замораживали. Образцы анализировали в отношении ММАЕ. Уровни в плазме ВТ8009 (BCY8245) взяты из исторических исследовании РК. Концентрации ММАЕ в плазме, ММАЕ в опухоли, и ВТ8009 в плазме представлены на фиг. 73. ММАЕ задерживался в опухоли дольше, чем в плазме, подтверждая гипотезу, что системная экспозиация является значительно меньшей, чем экспозиция в опухоли.
Пример 11. Анализ HCS.
Анализ HCS использовали в исследовании связывания BDC против нектина-4. Клетки инкубировали с тестируемым веществом, а затем промывали. Детекцию проводили посредством флуоресцентного антитела к ММАЕ. Клетки MDA-MB-468 демонстрируют умеренную экспрессию нектина-4, причем 20000 клеток давали наилучшие изображения. Клетки NCI-H292 демонстрируют низкую экспрессию в этом анализе, детекция ММАЕ была низкой даже для 20000 клеток.
Данные HCS на клеточной линии MDA-MB-468 представлены на фиг. 74 и в табл. 50.
Таблица 50
Тестируемое вещество Максимальная интенсивность Kd (нМ) Историческая Kd (нМ)
флуоресценции
ADC против нектина-4 33,63 0,2 0,28±0,07
BCY8245 13,34 3,52 5,18
BCY8781 3,15 >10000 >10000
ММАЕ 2,95 >10000 >10000
ADC против нектина-4 и BCY8245 удерживались в клетках и колокализовались с мембранным красителем. BCY8781 и ММАЕ продемонстрировали минимальное удержание. Kd для всех соединений на клеточной линии MDA-MB-468 согласовывались с историческими данными. ADC против нектина-4 продемонстрировал поддающуюся обнаружению аффинность связывания на клеточной линии MDA-MB468. BCY8425 продемонстрировал одноразрядную наномолярную аффинность с Bmax ниже, чем у ADC против нектина-4. Эта сниженная максимальная интенсивность флуоресценции является следствием того, что ADC против нектина-4 имеет соотношение ММАЕ и лекарственного средства 4, в то время как BCY8245 имеет соотношение ММАЕ и лекарственного средства 1. BCY8781 продемонстрировал только очень слабую аффинность связывания на клеточной линии MDA-MB-468, в то время как ММАЕ практически не продемонстрировал поддающейся обнаружению аффинности связывания на клеточной линии MDA-MB-468.
Пример 12. Эффективность in vivo BCY8245 в двух моделях PDX для рака легкого.
Цель.
Оценить эффективность BCY8245 в модели PDX для плоскоклеточного немелкоклеточного рака и аденокарциномы (оба немелкоклеточные карциномы).
Животные.
Вид: Mus Musculus.
Линия: Balb/c nude.
Возраст: 6-8 недель.
Пол: самки.
Масса тела: 18-22.
Тестируемые средства.
BCY8245 и ADC против нектина-4 или BCY8781.
Животные до исследования.
Каждой мыши подкожно инокулировали в правый бок фрагмент опухоли LU-01-0007 или LU-010412 (~30 мм3) для формирования опухоли. Животных случайным образом распределяли на группы, когда средний объем опухоли достигал 161 мм3 (LU-01-0007) или 147 мм3 (LU-01-0412).
Прижизненные измерения и конечные результаты.
Животных проверяли каждые сутки в отношении каких-либо эффектов роста опухоли и лечения на нормальное поведение, такое как двигательная активность, употребление пищи и воды (только посредством осмотра), увеличение/снижение массы тела, потускнение глаз/шерсти и любой другой аномальный эффект, указанный в протоколе. Смерть и наблюдаемые клинические признаки регистрировали на основе количеств животных в каждой подгруппе.
- 157 045862
Основным результатом было наблюдение, может ли быть замедлен рост опухоли или могут ли мыши быть вылечены. Объем опухоли измеряли три раза в неделю в двух измерениях с использованием толщиномера, и объем выражали в мм3 с использованием формулы
V=0,5 axb2, где a и b представляют собой длинный и короткий диаметры опухоли, соответственно. Затем размер опухоли использовали для вычислений величины Т/С. Величина Т/С (в процентах) является признаком противоопухолевой эффективности; Т и С представляют собой средние объемы групп лечения и контроля, соответственно, в данный день.
TGI вычисляли для каждой группы с использованием формулы
TGI (%) = Q-(Ti-T0)/(Vi-V0)]x100;
Ti представляет собой средний объем опухоли в группе лечения в данный день, Т0 представляет собой средний объем опухоли в группе лечения в день начала лечения, Vi представляет собой средний объем опухоли в контрольной группе носителя в той же день с Ti, и V0 представляет собой средний объем опухоли в группе носителя в день начала лечения.
Результаты этих испытаний представлены на фиг. 66 и 67.
Lu-01-0412 (фиг. 66): BCY8245 обеспечивал зависимую от дозы эффективность в этой модели PDX со снижением скорости роста опухоли при 1 мг/кг qw, но выраженной регрессией опухоли в дозе 3 мг/кг qw до исходного уровня. После прекращения дозирования (21 сутки) 5/6 животных продемонстрировали отсутствие повторного роста опухоли вплоть до 105 суток после начала исследования. Одно животное, демонстрирующее повторный рост, отвечало на 3 мг/кг BCY8245 и продемонстрировало восстановление регрессии до исходного уровня. Не связывающий BDC BCY8781 обеспечивал стабильное заболевание в дозе 3 мг/кг и при прекращении дозирования опухоль быстро росла с той же скоростью, как и в группе, в которой вводили носитель, подтверждая повышенную эффективность, которую придает этим средствам связывание нектина-4. Большие опухоли (группа, в которой вводили носитель) регрессировали в ответ на однократную дозу BCY8245 или BCY8781.
LU-01-0007 (фиг. 67): BCY8245 обеспечивал связанную с дозой эффективность, причем 1 мг/кг qw обеспечивала стабильное и 3 мг/кг обеспечивала полную регрессию. Дозирование необходимо было продолжать до 56 суток для достижения полной регрессии (когда дозирование прекращали). Не происходило повторного роста опухоли в этой группе после этого (вплоть до 126 суток после начала исследования). ADC против нектина-4 обеспечил сходную степень эффективности. Группа стабильного заболевания 1 мг/кг отвечала на повышение дозирования (3 и 5 мг/кг), указывая на то, что низкие дозы BCY8245 не приводят к развитию резистентности.
Пример 13. Оценка in vivo BCY8245 в моделях PDX с низким пассированием у мышей с иммунодефицитом с раком молочной железы, пищевода и мочевого пузыря человека.
Цель.
Оценить противоопухолевую активность бициклического средства в моделях Low Passage Champions TumorGraft Models у мышей с иммунодефицитом с раком молочной железы, пищевода и мочевого пузыря человека.
Тестируемая система.
Вид: мышь.
Линия: Athymic Nude-Foxnlnu (с иммунодефицитом).
Источник: Envigo: Индианаполис, Индиана.
Пол: самки.
Целевой возраст при начале дозирования: по меньшей мере 6-8 недель.
Целевая масса при начале дозирования: по меньшей мере 18 г.
Период акклиматизации: 3 суток.
Схема эксперимента.
Животные до исследования: когда достаточное количество животных достигают 1,0-1,5 см3, опухоли извлекают для реимплантации животным до исследования. Животным до исследования проводят одностороннюю имплантацию в левый бок фрагментов опухоли, извлеченных из исходных животных. Каждому животному проводят имплантации из конкретной партии пассирования и документируют.
Исследуемые животные: объемы опухолей до исследования регистрируют для каждого эксперимента, начиная через от семи до десяти суток после имплантации. Когда опухоли достигают среднего объема 150-300 мм3, животных будут подбирать по объему опухоли в группы лечения или контроля для применения для дозирования и дозирование начинают на сутки 0.
Тестируемые средства.
BCY8245 и конъюгат антитело-лекарственное средство против нектина-4 по сравнению с контролем в виде носителя. Может быть включено стандартное средство доцетаксел. Все средства подлежат дозированию qw внутривенным путем, дозы указаны на графиках.
Прижизненные измерения.
Эффективность в отношении объема опухоли: объемы опухоли измеряют два раза в неделю. Ко
- 158 045862 нечный объем опухоли определяют в день окончания исследования. Если возможно, конечный объем опухоли определяют, если животное считают умирающим.
Эффективность в отношении массы животного: животных взвешивают два раза в неделю. Конечную массу определяют в день, когда исследование достигает конечного результата, или если животного определяют как умирающее, если возможно. Животным, демонстрирующим снижение массы тела >10% по сравнению с 0 сутками, предоставляют DietGel® без ограничений. Любое животное, демонстрирующее суммарное снижение массы тела >20% в течение 7 суток, или если мышь демонстрирует суммарное снижение массы тела >30% по сравнению с сутками 0, считают умирающим и умерщвляют.
Анализ данных.
Токсичность средства: начиная на 0 сутки животных наблюдают каждые сутки и взвешивают два раза в неделю с использованием цифровых весов; данные, включающие индивидуальную и среднюю массу в граммах (средняя масса ± SEM) и среднее процентное изменение массы против 0 суток (%vD0) регистрируют для каждой группы и %vD0 наносят на график после завершения исследования. Смерти животных регистрируют каждые сутки и обозначают как связанные с лекарственным средством (D), технические (Т), связанные с опухолью (В), или неизвестные (U), исходя из снижения массы и простого осмотра; группы единственного средства или комбинации со средним значением %vD0 >20% и/или смертности >10% считаются группами доз выше максимально переносимой дозы (MTD) для этого лечения по оцениваемому режиму. Максимальное среднее значение %vD0 (максимальное снижение массы) для каждой группы лечения регистрируют при завершении исследования.
Эффективность средства.
Ингибирование роста опухоли. Начиная на 0 сутки, размеры опухолей измеряют два раза в неделю посредством цифрового толщиномера и данные, включающие индивидуальные и средние оцененные объемы опухолей (средний TV ± SEM) регистрируют для каждой группы; объем опухоли вычисляют с использованием формулы (1)
TV=ширина2хдлинах0,52.
После завершения исследования вычисляют процентное ингибирование роста опухоли (%TGI) и регистрируют для каждой группы лечения (Т) против контроля (С) с использованием первоначальных (i) и конечных (f) размеров опухоли по формуле (2) %TGI= 1 -(Tf-Ti)Z(Cf-Ci).
Индивидуальных мышей, для которых зарегистрирован объем опухоли <30% от размера на сутки 0 в течение двух последовательных измерений, считают частично отвечающими (PR). Индивидуальных мышей, лишенных пальпируемых опухолей (0,00 мм3 в течение двух последовательных измерений), классифицируют как полностью отвечающих (CR); CR, которая сохраняется до конца исследования, считается свободным от опухоли выживанием (TFS). Время удвоения опухоли (DT) определяют для групп введения носителя с использованием формулы
DT=(Df-Di)*log2Z(logTVf-logTVi), где D - сутки и TV - объем опухоли. Все данные, полученные в этом исследовании, обрабатывают в электронной форме и хранят на резервной серверной системе.
Результаты этих исследований представлены на фиг. 68-71.
BCY8245 был протестирован в четырех моделях PDX с низким пассированием, соответствующих раку мочевого пузыря (CTG-1771), эстроген- и прогестерон-негативному Нег2-позитивному раку молочной железы (CTG-1171), тройному негативному раку молочной железы (CTG-1106) и раку пищевода (CTG-0896). Во всех из этих моделей BCY8245 продемонстрировал превосходную эффективность, обеспечивающую регрессию опухоли, и в трех из четырех случаев полную регрессию до исходного уровня. Эффективность была сравнимой с ADC во всех случаях и была лучшей или равной доцетакселу SOC. Во всех моделях BCY8245 лучше переносился, чем доцетаксел.

Claims (20)

1. Пептидный лиганд, специфичный к нектину-4, содержащий полипептид, содержащий по меньшей мере три остатка цистеина, разделенных по меньшей мере двумя последовательностями петель, и молекулярный каркас, который образует ковалентные связи с остатками цистеина полипептида, так что на молекулярном каркасе образуется по меньшей мере две полипептидные петли, где указанный пептидный лиганд содержит аминокислотную последовательность, выбранную из
Ci-PZAZHyp-FZY-GZA-Cii-X1-X2-X3-WZ1-NalZ2-Nal-SZA-X4-P-IZDZA-WZ1-NalZ2-Nal-Ciii(SEQ ID NO: 38);
Ci-WZA-P-L-DZS-SZD-Y-W-Cii-Xs-R-I-Ciii (SEQ ID NO: 39);
Ci-V-T-T-S-Y-D-Cij-FZW-LZV-HZRZT-L-LZG-GZQZH-Ciij (SEQ ID NO: 40);
Ci-X6-X7-X8-Cii-X9-X10-X11-X12-X13-X14-X15-X16-X17-Ciii (SEQ ID NO: 41); и
Ci-WZAZY-PZA-L-DZSZA-SZDZPZA-Y-WZ1-Nal-Cii-X5-RZHArgZA-I-CUi (SEQ ID NO: 42);
где X1-X5 обозначают любой аминокислотный остаток, включая модифицированные и неприродные аминокислоты;
Х6 обозначает Gly; Pro или неприродное производное Pro, выбранное из азетидина (Aze), гидрокси
- 159 045862 пролина (НуР), 4-аминопролина (Pro(4NH)), оксазолидин-4-карбоновой кислоты (Оха), октагидроиндолкарбоновой кислоты (Oic) или 4,4-дифторпролина (4,4-DFP); Ala или неприродное производное Ala, выбранное из аминоизомасляной кислоты (Aib), или саркозин (Sar);
Х7 обозначает Phe или неприродное производное Phe, выбранное из 3-метилфенилаланина (3MePhe), 4-метилфенилаланина (4MePhe), гомофенилаланина (HPhe), 4,4-бифенилаланина (4,4-ВРА) или 3,4-дигидроксифенилаланина (DOPA); Tyr; или Ala или неприродное производное Ala, выбранное из 1-нафтилаланина (1-Nal), 2-нафтилаланина (2-Nal) или 2-пиридилаланина (2Ра1);
Х8 обозначает Gly; Ala; Asp; Lys или неприродное производное Lys, выбранное из ацетиллизина (KAc или Ly s(Ac)); Phe; Glu; Gln; Leu; Ser; Arg; или цистеиновую кислоту (Cya);
X9 либо отсутствует, либо обозначает Met или неприродное производное Met, выбранное из метионинсульфона (Met(O2)); Gln или неприродное производное Gln, выбранное из гомоглутамина (HGln); Leu или неприродное производное Leu, выбранное из гомолейцина (HLeu) или норлейцина (Nle); Lys; Ile; трет-бутилаланин (tBuAla); или гомосеринметил (HSe(Me));
Х10 обозначает Pro; Lys или неприродное производное Lys, выбранное из ацетиллизина (KAc или Lys(Ac)); Arg или неприродное производное Arg, выбранное из 2-амино-4-гуанидинмасляной кислоты (Agb), гомоаргинина (HArg) или N-метилгомоаргинина; Glu; Ser; Asp; Gln; Ala; гидроксипролин (HyP); или цистеиновую кислоту (Суа);
Х11 обозначает Asn или неприродное производное Asn, выбранное из N-метиласпарагина; Thr; Asp; Gly; Ser; His; Ala или неприродное производное Ala, выбранное из тиенилаланина (Thi), 2-(1,2,4-триазол1-ил)аланина (1,2,4-TriAz) или бета-(4-тиазолил)аланина (4ThiAz); Lys или цистеиновую кислоту (Суа);
Х12 обозначает Trp или неприродное производное Trp, выбранное из азатриптофана (AzaTrp), 5фтор-Ь-триптофана (5FTrp) или метилтриптофана (TrpMe); или Ala или неприродное производное Ala, выбранное из 1-найтилаланина (1-Nal) или 2-нафтилаланина (2-Nal);
Х13 обозначает Ser или неприродное производное Ser, выбранное из гомосерина (HSer); Ala; Asp или Thr;
Х14 обозначает Trp или неприродное производное Trp, выбранное из азатриптофана (AzaTrp); Ser; Ala или неприродное производное Ala, выбранное из 2-(1,2,4-триазол-1-ил)аланина (1,2,4-TriAz), 1нафтилаланина (1-Nal) или 2-нафтилаланина (2-Nal); Asp; Phe или неприродное производное Phe, выбранное из 3,4-дигидроксифенилаланина (DOPA); Tyr; Thr или неприродное производное Thr, выбранное из N-метилтреонина; тетрагидропиран-4-пропановую кислоту (ТНР(О)); или диоксо-4тетрагидротиопиранилуксусную кислоту (THP(SO2));
Х15 обозначает Pro или неприродное производное Pro, выбранное из азетидина (Aze), пипеколиновой кислоты (Pip) или оксазолидин-4-карбоновой кислоты (Оха);
Х16 обозначает Не или неприродное производное Не, выбранное из N-метилизолейцина (NMelle); Ala или неприродное производное Ala, выбранное из 3-циклогексилаланина (Cha) или циклопропилаланина (Сра); Pro или неприродное производное Pro, выбранное из гидроксипролина (НуР); Asp; Lys; циклопентилглицин (С5А); тетрагидропиран-4-пропановую кислоту (ТНР(О)); или диоксо-4тетрагидротиопиранилуксусную кислоту (THP(SO2));
Х17 обозначает Trp или неприродное производное Trp, выбранное из азатриптофана (AzaTrp) или 5фтор-Е-триптофана (5FTrp); Phe; Tyr; 1-нафтилаланин (1-Nal); или 2-нафтилаланин (2-Nal);
Hyp обозначает гидроксипролин, 1-Nal обозначает 1-нафтилаланин, 2-Nal обозначает 2нафтилаланин, HArg обозначает гомоаргинин и Ci, Cii и Ciii обозначают первый, второй и третий остатки цистеина, соответственно, или его фармацевтически приемлемая соль.
2. Пептидный лиганд по п.1, где указанные последовательности петель содержат три остатка цистеина, разделенных двумя последовательностями петель, первая из которых состоит из 3 аминокислот, и вторая из которых состоит из 9 аминокислот, и указанный пептидный лиганд содержит аминокислотную последовательность, выбранную из
С1-Х6-Х7-Х8-С11-Х9-Х10-Х11-Х12-Х13-Х14-Х15-Х16-Х17-С111 (SEQ ID NO: 41);
где Х6-Х|- являются такими, как определено в п.1.
3. Пептидный лиганд по п.1 или п.2, где
Х6 обозначает Pro или неприродное производное Pro, выбранное из азетидина (Aze), гидроксипролина (НуР), 4-аминопролина (Pro(4NH)), оксазолидин-4-карбоновой кислоты (Оха), октагидроиндолкарбоновой кислоты (Oic) или 4,4-дифторпролина (4,4-DFP)m, такое как Pro; и/или
Х7 обозначает Phe или неприродное производное Phe, выбранное из 3-метилфенилаланина (3MePhe), 4-метилфенилаланина (4MePhe), гомофенилаланина (HPhe), 4,4-бифенилаланина (4,4-ВРА) или 3,4-дигидроксифенилаланина (DOPA); Ala или неприродное производное Ala, выбранное из 1нафтилаланина (1-Nal), 2-нафтилаланина (2-Nal) или 2-пиридилаланина (2Pal), такое как Phe или 1нафтилаланин (1-Nal), в частности 1-нафтилаланин (1-Nal); и/или
Х8 обозначает Asp, Arg, Lys или цистеиновую кислоту (Суа), такие как D-Asp, D-Arg, D-Lys или DCya, в частности D-Asp; и/или
Х9 обозначает Met или неприродное производное Met, выбранное из метионинсульфона (Met(O2)); или Leu или неприродное производное Leu, выбранное из гомолейцина (HLeu) или норлейцина (Nle),
- 160 045862 такое как Met или Leu, в частности Met; и/или
Х10 обозначает Arg или неприродное производное Arg, выбранное из 2-амино-4-гуанидиномасляной кислоты (Agb), гомоаргинина (HArg) или N-метилгомоаргинина; или цистеиновую кислоту (Суа), такие как гомоаргинин (HArg) или цистеиновая кислота (Суа) (такая как D-Cya), в частности гомоаргинин (HArg); и/или
Х11 обозначает Asn или неприродное производное Asn, выбранное из N-метиласпарагина; Asp; или His; или цистеиновую кислоту (Суа), такое как Asn, Asp, His или цистеиновая кислота (Суа) (такая как DCya), в частности Asp; и/или
Х12 обозначает Trp или неприродное производное Trp, выбранное из азатриптофана (AzaTrp), 5фтор-Е-триптофана (5FTrp) или метилтриптофана (TrpMe), такое как Trp; и/или
Х13 обозначает Ser или неприродное производное Ser, выбранное из гомосерина (HSer), такое как Ser; и/или
Х14 обозначает Thr или неприродное производное Thr, выбранное из N-метилтиронина, такое как Thr; и/или
Х15 обозначает Pro; и/или
Х16 обозначает Ile или неприродное производное Ile, выбранное из N-метилизолейцина (NMelle); или Pro или неприродное производное Pro, выбранное из гидроксипролина (НуР), такое как Ile; или Pro или неприродное производное Pro, выбранное из гидроксипролина (НуР), в частности Ile, Pro или гидроксипролина (НуР), более конкретно гидроксипролин (НуР); и/или
Х17 обозначает Trp или неприродное производное Trp, выбранное из азатриптофана (AzaTrp) или 5фтор-Е-триптофана (5FTrp), такое как Trp.
4. Пептидный лиганд по любому из пп.1-3, где указанные последовательности петель содержат три остатка цистеина, разделенных двумя последовательностями петель, первая из которых состоит из 3 аминокислот и вторая из которых состоит из 9 аминокислот, и указанный пептидный лиганд соедржит аминокислотную последовательность, выбранную из
Ci-P-X7-X8-Cii-X9-HArg-X11-W-S-T-P-X16-W-Ciii (SEQ ID NO: 204);
где X7, X8, X9, X11 и Х16 являются такими, как определено в п.1 или 3.
5. Пептидный лиганд по любому из пп.1-4, где указанные последовательности петель содержат три остатка цистеина, разделенных двумя последовательностями петель, первая из которых состоит из 3 аминокислот и вторая из которых состоит из 9 аминокислот, и указанный пептидный лиганд содержит аминокислотную последовательность, выбранную из
Ci-P-F/1-Nal-dD/dR-Cii-M/L-HArg-N/H/D-W-S-T-P-I/P/HyP-W-Ciii (SEQ ID NO: 205).
6. Пептидный лиганд по п.1, где пептидный лиганд ^-^^7^8-^^9^10^11^12^13^14^15-^6X17-Ciii (SEQ ID NO: 41) содержит аминокислотную последовательность, выбранную из
CPFGCMETWSWPIWC (SEQ ID NO: 45);
CPFGCMRGWSWPIWC (SEQ ID NO: 46);
CPFGCMSGWSWPIWC (SEQ ID NO: 47);
CPFGCMEGWSWPIWC (SEQ ID NO: 48);
CPFGCMEDWSWPIWC (SEQ ID NO: 49);
CPFGCMPGWSWPIWC (SEQ ID NO: 50);
CPFGCMKSWSWPIWC (SEQ ID NO: 51);
CPFGCMKTWSWPIWC (SEQ ID NO: 52);
CPFGCMKGWSWPIWC (SEQ ID NO: 53);
CPFGCQEHWSWPIWC (SEQ ID NO: 54);
CPFGCIKSWSWPIWC (SEQ ID NO: 55);
CPFGCQEDWSWPIWC (SEQ ID NO: 56);
CPFGCMSDWSWPIWC (SEQ ID NO: 57);
CPFGCM[HArg]NWSWPIWC (SEQ ID NO: 59);
CPFGCM[K(Ac)]NWSWPIWC (SEQ ID NO: 60);
CPFGCM[K(Ac)]SWSWPIWC (SEQ ID NO: 61);
CPFGC[Nle]KSWSWPIWC (SEQ ID NO: 62);
CPFGCM[HArg]SWSWPIWC (SEQ ID NO: 63);
CPFGCM[dK]SWSWPIWC (SEQ ID NO: 64);
CP[dA]GCMKNWSWPIWC (SEQ ID NO: 66);
CPF[dA]CMKNWSWPIWC (SEQ ID NO: 67);
CPFGCM[dA]NWSWPIWC (SEQ ID NO: 68);
CPFGCMK[dA]WSWPIWC (SEQ ID NO: 69);
CPFGCMKN[dA]SWPIWC (SEQ ID NO: 70);
CPFGCMKNWSWP[dA]WC (SEQ ID NO: 71);
C[dA]FGCMKNWSWPIWC (SEQ ID NO: 72);
CPFGC[tBuAla]KNWSWPIWC (SEQ ID NO: 73);
CPFGC[HLeu]KNWSWPIWC (SEQ ID NO: 74);
- 161 045862
CPFGCMKNWSWPI[1Nal]C (SEQ ID NO: 75);
CPF[dD]CM[HArg]NWSWPIWC (SEQ ID NO: 76);
CPF[dA]CM[HArg]NWSWPIWC (SEQ ID NO: 77);
CP[3MePhe]GCMKNWSWPIWC (SEQ ID NO: 78);
CP[4MePhe]GCMKNWSWPIWC (SEQ ID NO: 79);
CP[HPhe]GCMKNWSWPIWC (SEQ ID NO: 80);
CPF[dD]CMKNWSWPIWC (SEQ ID NO: 81);
CPFGC[Hse(Me)]KNWSWPIWC (SEQ ID NO: 82);
CPFGCMKN[AzaTrp]SWPIWC (SEQ ID NO: 83);
CPFGCMKNWSFPIWC (SEQ ID NO: 84);
CPFGCMKNWSYPIWC (SEQ ID NO: 85);
CPFGCMKNWS[1Nal]PIWC (SEQ ID NO: 86);
CPFGCMKNWS[2Nal]PIWC (SEQ ID NO: 87);
CPFGCMKNWS[AzaTrp]PIWC (SEQ ID NO: 88);
CPFGCMKNWSW[Aze]IWC (SEQ ID NO: 89);
CPFGCMKNWSW[Pip]IWC (SEQ ID NO: 90);
CPFGCMKNWSWPIFC (SEQ ID NO: 91);
CPFGCMKNWSWPIYC (SEQ ID NO: 92);
CPFGCMKNWSWPI[AzaTrp]C (SEQ ID NO: 93);
CGFGCMKNWSWPIWC (SEQ ID NO: 94);
C[Aze]FGCMKNWSWPIWC (SEQ ID NO: 95);
CPF[K(Ac)]CMKNWSWPIWC (SEQ ID NO: 96);
CPFGCLKNWSWPIWC (SEQ ID NO: 97);
CPFGC[MetO3]KNWSWPIWC (SEQ ID NO: 98);
CPFGCMPNWSWPIWC (SEQ ID NO: 99);
CPFGCMQNWSWPIWC (SEQ ID NO: 100);
CPFGCMKNWSWPPWC (SEQ ID NO: 101);
CP[2Pal]GCMKNWSWPIWC (SEQ ID NO: 102);
CPFGCMKN[1Nal]SWPIWC (SEQ ID NO: 111);
CPFGCMKN[2Nal]SWPIWC (SEQ ID NO: 112);
CPFGCMKNWSWPI[2Nal]C (SEQ ID NO: 113);
C[HyP]FGCMKNWSWPIWC (SEQ ID NO: 114);
CPF[dD]CM[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 115);
CPF[dD]CM[HArg][dK]WSTPIWC (SEQ ID NO: 116);
CPF[dD]CM[HArg]NWSTPKWC (SEQ ID NO: 117);
C[Pro(4NH)]F[dD]CM[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 118);
CPF[dD]CMKNWSTPIWC (SEQ ID NO: 119);
CPF[dK]CM[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 120);
CPF[dD]CK[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 121);
CPF[dD]CM[HArg]KWSTPIWC (SEQ ID NO: 122);
C[Oxa]F[dD]CM[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 123);
CPF[dD]CM[HArg][Thi]WSTPIWC (SEQ ID NO: 124);
CPF[dD]CM[HArg][4ThiAz]WSTPIWC (SEQ ID NO: 125);
CPF[dD]CM[HArg][124TriAz]WSTPIWC (SEQ ID NO: 126);
CPF[dD]CM[HArg]NWS[124TriAz]PIWC (SEQ ID NO: 127);
CPF[dD]CM[HArg]NWST[Oxa]IWC (SEQ ID NO: 128);
CP[DOPA][dD]CM[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 129);
CPF[dD]CM[HArg]NWS[DOPA]PIWC (SEQ ID NO: 130);
CPF[dD]CM[HArg]NWS[THP(SO2)]PIWC (SEQ ID NO: 131);
CPF[dD]CM[HArg]NWSTP[THP(SO2)]WC (SEQ ID NO: 132);
CPF[dD]CM[HArg]N[5FTrp]STPIWC (SEQ ID NO: 133);
CPF[dD]CM[HArg]NWSTPI[5FTrp]C (SEQ ID NO: 134);
CPF[dD]CM[HArg]NWS[THP(O)]PIWC (SEQ ID NO: 135);
CPF[dD]CM[HArg]NWSTP[THP(O)]WC (SEQ ID NO: 136);
C[44DFP]F[dD]CM[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 137);
C[Oic]F[dD]CM[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 138);
CPF[dF]CM[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 139);
CPF[dE]CM[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 140);
CPF[dQ]CM[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 141);
CPF[dL]CM[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 142);
CPF[dS]CM[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 143);
CPF[dD]CM[HArg]NW[HSer]TPIWC (SEQ ID NO: 144);
- 162 045862
CPF[dD]CM[HArg]NWSTP[C5A]WC (SEQ ID NO: 145);
CPF[dD]CM[HArg]NWSTP[Cpa]WC (SEQ ID NO: 146);
CPF[dD]CM[HArg]NWSTP[Cha]WC (SEQ ID NO: 147);
CPF[dD]C[HGln][HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 148);
CPF[dD]C[C5A][HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 149);
CPF[dD]CM[HArg]N[Trp(Me)]STPIWC (SEQ ID NO: 150);
CPF[dD][NMeCys]M[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 151);
CPF[dD]C[HArg]NWS[NMeThr]PIWC (SEQ ID NO: 152);
CP[1Nal][dD]CM[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 155);
CP[2Nal][dD]CM[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 156);
CP[44BPA][dD]CM[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 157);
CPF[dD]CM[HArg]NWSTPPWC (SEQ ID NO: 158);
CPF[dD]CM[HArg]NWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 159);
CPF[dD]CL[HArg]NWSTPPWC (SEQ ID NO: 160);
CPF[dD]CL[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 161);
CPY[dD]CM[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 162);
C[Aib]F[dD]CM[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 163);
C[Sar]F[dD]CM[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 164);
CPF[dR]CM[HArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 165);
CPF[dD]CM[HArg]NWSTPKWC (SEQ ID NO: 166);
CP[1Nal][dD]CM[HArg]NWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 167);
CP[1Nal][dD]CM[HArg]HWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 168):
CP[1Nal][dD]CM[HArg]DWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 169);
CP[1Nal][dD]CM[HArg]DWSTPIWC (SEQ ID NO: 170);
CP[1Nal][dR]CM[HArg]NWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 171);
CP[1Nal][dR]CM[HArg]HWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 172);
CPF[dD]CM[NMeHArg]NWSTPIWC (SEQ ID NO: 173);
CPF[dD]CM[HArg][NMeAsn]WSTPIWC (SEQ ID NO: 174);
CPF[dD]CM[HArg]NWS[NMeThr]PIWC (SEQ ID NO: 175);
CPF[dD]CM[HArg]NWSTP[NMeIle]WC (SEQ ID NO: 176);
CP[1Nal][dD]CM[HArg][Cya]WSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 177);
CP[1Nal][dD]CM[Cya]DWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 178);
CP[1Nal][DCya]CM[HArg]DWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 179);
CP[1Nal][dD]CM[HArg]DWDTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 180);
CP[2Nal][dD]CM[HArg]DWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 181);
CP[1Nal][dD]CM[HArg]DWTTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 182);
CP[1Nal][dD]CM[HArg]DW[HSer]TP[HyP]WC (SEQ ID NO: 183);
CP[1Nal][dD]CM[HArg]DW[dS]TP[HyP]WC (SEQ ID NO: 184);
CP[1Nal][dD]CM[HArg]DWSSP[HyP]WC (SEQ ID NO: 185);
CP[1Nal][dD]CM[Agb]DWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 186);
CP[1Nal][dD]CMPDWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 187);
CP[1Nal][dD]CM[HyP]DWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 188);
CP[1Nal][dR]CM[HArg]DWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 189);
CP[1Nal][dR]CM[HArg]DWDTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 190);
CP[2Nal][dR]CM[HArg]DWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 191);
CP[1Nal][dR]CM[HArg]DWTTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 192);
CP[1Nal][dR]CM[HArg]DW[HSer]TP[HyP]WC (SEQ ID NO: 193);
CP[1Nal][dR]CM[HArg]DW[dS]TP[HyP]WC (SEQ ID NO: 194);
CP[1Nal][dR]CM[HArg]DWSSP[HyP]WC (SEQ ID NO: 195);
CP[1Nal][dR]CM[Agb]DWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 196);
CP[1Nal][dR]CMPDWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 197);
CP[1Nal][dR]CM[HyP]DWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 198);
CP[1Nal][dD]CL[HArg]DWSTPIWC (SEQ ID NO: 199);
CP[1Nal][dD]CL[HArg]DWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 200);
CP[1Nal][dR]CL[HArg]DWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 201);
CP[1Nal][dR]CL[HArg]HWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 202);
CP[1Nal][dR]CM[HArg]DWSTPIWC (SEQ ID NO: 203);
CP[1Nal][DCya]CM[Cya]DWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 208);
CP[1Nal][DCya]CM[HArg][Cya]WSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 209);
CP[1Nal][dD]CM[Cya][Cya]WSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 210);
CP[1Nal][dK]CM[HArg]DWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 211);
CP[1Nal][dD]CMKDWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 212);
- 163 045862
CP[1Nal][dD]CM[HArg]D[dW]STP[HyP][dW]C (SEQ ID NO: 215); и CPFGCM[HArg]DWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 216);
такую как
CP[1Nal][dD]CM[HArg]DWSTP[HyP]WC (SEQ ID NO: 169);
в частности
DDA-(SEQ ID NO: 45)-А (далее обозначаемую как BCY3386);
DTA-(SEQ ID NO: 46)-A (далее обозначаемую как BCY3388);
DSE-(SEQ ID NO: 47)-A (далее обозначаемую как BCY3389);
HDA-(SEQ ID NO: 48)-А (далее обозначаемую как BCY3390);
MDT-(SEQ ID NO: 49)-А (далее обозначаемую как BCY3391);
DPG-(SEQ ID NO: 50)-A (далее обозначаемую как BCY3392);
HDS-(SEQ ID NO: 51)-A (далее обозначаемую как BCY3393); (D-H)DS-(SEQ ID NO: 51)-А (далее обозначаемую как BCY7272);
A-(SEQ ID NO: 52)-TDK (далее обозначаемую как BCY3394);
A-(SEQ ID NO: 53)-LKD (далее обозначаемую как BCY3395);
A-(SEQ ID NO: 54)-ТТА (далее обозначаемую как BCY3396);
A-(SEQ ID NO: 55)-QME (далее обозначаемую как BCY3397);
A-(SEQ ID NO: 56)-LSE (далее обозначаемую как BCY3398);
A-(SEQ ID NO: 57)-STD (далее обозначаемую как BCY3399);
A-(SEQ ID NO: 59)-TNK (далее обозначаемую как BCY7265);
Ac-(SEQ ID NO: 59) (далее обозначаемую как BCY7660);
A-(SEQ ID NO: 60)-TNK (далее обозначаемую как BCY7266);
Ac-(SEQ ID NO: 60) (далее обозначаемую как BCY7616);
HDS-(SEQ ID NO: 61)-A (далее обозначаемую как BCY7273);
HDS-(SEQ ID NO: 62)-A (далее обозначаемую как BCY7274);
HDS-(SEQ ID NO: 63)-A (далее обозначаемую как BCY7275);
HDS-(SEQ ID NO: 64)-A (далее обозначаемую как BCY7276);
A-(SEQ ID NO: 66)-TNK (далее обозначаемую как BCY7349);
A-(SEQ ID NO: 67)-TNK (далее обозначаемую как BCY7350);
Ac-(SEQ ID NO: 67) (далее обозначаемую как BCY7538);
A-(SEQ ID NO: 68)-TNK (далее обозначаемую как BCY7359);
A-(SEQ ID NO: 69)-TNK (далее обозначаемую как BCY7360);
A-(SEQ ID NO: 70)-TNK (далее обозначаемую как BCY7361);
A-(SEQ ID NO: 71)-TNK (далее обозначаемую как BCY7365);
A-(SEQ ID NO: 72)-TNK (далее обозначаемую как BCY7370);
Ac-(SEQ ID NO: 73) (далее обозначаемую как BCY7535);
Ac-(SEQ ID NO: 74) (далее обозначаемую как BCY7536);
Ac-(SEQ ID NO: 75) (далее обозначаемую как BCY7541); [B-Ala][Sar5]-(SEQ ID NO: 76) (далее обозначаемую как BCY7556);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ ID NO: 76) (далее обозначаемую как BCY7558);
[B-A1a][Sar5]-(SEQ ID NO: 77) (далее обозначаемую как BCY7557);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ ID NO: 77) (далее обозначаемую как BCY7559);
Ac-(SEQ ID NO: 78) (далее обозначаемую как BCY7580);
Ac-(SEQ ID NO: 79) (далее обозначаемую как BCY7581);
Ac-(SEQ ID NO: 80) (далее обозначаемую как BCY7582);
Ac-(SEQ ID NO: 81) (далее обозначаемую как BCY7584);
Ac-(SEQ ID NO: 82) (далее обозначаемую как BCY7585);
Ac-(SEQ ID NO: 83) (далее обозначаемую как BCY7588);
Ac-(SEQ ID NO: 84) (далее обозначаемую как BCY7589);
Ac-(SEQ ID NO: 85) (далее обозначаемую как BCY7590);
Ac-(SEQ ID NO: 86) (далее обозначаемую как BCY7591);
Ac-(SEQ ID NO: 87) (далее обозначаемую как BCY7592);
Ac-(SEQ ID NO: 88) (далее обозначаемую как BCY7593);
Ac-(SEQ ID NO: 89) (далее обозначаемую как BCY7594);
Ac-(SEQ ID NO: 90) (далее обозначаемую как BCY7595);
Ac-(SEQ ID NO: 91) (далее обозначаемую как BCY7596);
Ac-(SEQ ID NO: 92) (далее обозначаемую как BCY7597);
Ac-(SEQ ID NO: 93) (далее обозначаемую как BCY7598);
Ac-(SEQ ID NO: 94) (далее обозначаемую как BCY7607);
Ac-(SEQ ID NO: 95) (далее обозначаемую как BCY7608);
Ac-(SEQ ID NO: 96) (далее обозначаемую как BCY7611);
Ac-(SEQ ID NO: 97) (далее обозначаемую как BCY7612);
- 164 045862
Ac-(SEQ ID NO: 98) (далее обозначаемую как BCY7613);
Ac-(SEQ ID NO: 99) (далее обозначаемую как BCY7614);
Ac-(SEQ ID NO: 100) (далее обозначаемую как BCY7615);
Ac-(SEQ ID NO: 101) (далее обозначаемую как BCY7618);
Ac-(SEQ ID NO: 102) (далее обозначаемую как BCY7620);
Ac-(SEQ ID NO: 111) (далее обозначаемую как BCY7663);
Ac-(SEQ ID NO: 112) (далее обозначаемую как BCY7664);
Ac-(SEQ ID NO: 113) (далее обозначаемую как BCY7667);
Ac-(SEQ ID NO: 114) (далее обозначаемую как BCY7668);
Ac-(SEQ ID NO: 115) (далее обозначаемую как BCY7765);
(SEQ ID NO: 115) (далее обозначаемую как BCY7793);
(MeO-dPEG12)(SEQ ID NO: 115) (далее обозначаемую как BCY8087);
(карбоксифлуоресцеин)(SEQ ID NO: 115) (далее обозначаемую как BCY8208);
(PEG3)(PEG3)(SEQ ID NO: 115) (далее обозначаемую как BCY7815);
(MeO-dPEG12)(PEG3)(PEG3)(SEQ ID NO: 115) (далее обозначаемую как BCY8094);
Ac-DDD-(SEQ ID NO: 115) (далее обозначаемую как BCY8028);
Ac-[dD][dD][dD]-(SEQ ID NO: 115) (далее обозначаемую как BCY8029); [B-Ala][Sar10]-(SEQ ID NO: 115) (далее обозначаемую как BCY7814);
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
116) (далее обозначаемую как BCY7816);
116) (MeO-dPEG12) linked to D-Lys6 (далее обозначаемую как BCY8084);
117) (далее обозначаемую как BCY7817);
118) (далее обозначаемую как BCY7818;
118) (MeO-dPEG12) linked to Pro(4NH)1 (далее обозначаемую как BCY8086);
119) (далее обозначаемую как BCY7819;
119) (MeO-dPEG12) linked to Lys5 (далее обозначаемую как BCY8088);
120) (далее обозначаемую как BCY7820;
120) (MeO-dPEG12) linked to D-Lys3 (далее обозначаемую как BCY8089);
121) (далее обозначаемую как BCY7821);
121) (MeO-dPEG12) linked to Lys4 (далее обозначаемую как BCY8090);
122) (далее обозначаемую как BCY7822);
122) (MeO-dPEG12) linked to Lys6 (далее обозначаемую как BCY8091);
123) (далее обозначаемую как BCY7876);
124) (далее обозначаемую как BCY7877);
125) (далее обозначаемую как BCY7879);
126) (далее обозначаемую как BCY7881);
127) (далее обозначаемую как BCY7883);
128) (далее обозначаемую как BCY7884);
129) (далее обозначаемую как BCY7886);
130) (далее обозначаемую как BCY7887);
131) (далее обозначаемую как BCY7889);
132) (далее обозначаемую как BCY7890);
133) (далее обозначаемую как BCY7891);
134) (далее обозначаемую как BCY7892);
135) (далее обозначаемую как BCY7894);
136) (далее обозначаемую как BCY7895);
137) (далее обозначаемую как BCY7896);
138) (далее обозначаемую как BCY7897);
139) (далее обозначаемую как BCY7902);
140) (далее обозначаемую как BCY7903);
141) (далее обозначаемую как BCY7904);
142) (далее обозначаемую как BCY7906);
143) (далее обозначаемую как BCY7907);
144) (далее обозначаемую как BCY7908);
145) (далее обозначаемую как BCY7911);
146) (далее обозначаемую как BCY7912);
147) (далее обозначаемую как BCY7913);
148) (далее обозначаемую как BCY7914);
149) (далее обозначаемую как BCY7915);
150) (далее обозначаемую как BCY7916);
151) (далее обозначаемую как BCY7973);
152) (далее обозначаемую как BCY7979);
155) (далее обозначаемую как BCY8030);
- 165 045862
Ac-(SEQ ID NO: 156) (далее обозначаемую как BCY8031);
Ac-(SEQ ID NO: 157) (далее обозначаемую как BCY8032);
Ac-(SEQ ID NO: 158) (далее обозначаемую как BCY8036);
Ac-(SEQ ID NO: 159) (далее обозначаемую как BCY8037);
Ac-(SEQ ID NO: 160) (далее обозначаемую как BCY8038);
Ac-(SEQ ID NO: 161) (далее обозначаемую как BCY8039);
Ac-(SEQ ID NO: 162) (далее обозначаемую как BCY8040);
Ac-(SEQ ID NO: 163) (далее обозначаемую как BCY8041);
Ac-(SEQ ID NO: 164) (далее обозначаемую как BCY8042);
Ac-(SEQ ID NO: 165) (далее обозначаемую как BCY8042);
Ac-(SEQ ID NO: 166) (далее обозначаемую как BCY8085);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ ID NO: 167) (далее обозначаемую как BCY8120);
Ac-(SEQ ID NO: 167) (далее обозначаемую как BCY8124);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ ID NO: 168) (далее обозначаемую как BCY8121);
Ac-(SEQ ID NO: 168) (далее обозначаемую как BCY8125);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ ID NO: 169) (далее обозначаемую как BCY8122);
Ac-(SEQ ID NO: 169) (далее обозначаемую как BCY8126);
(SEQ ID NO: 169) (далее обозначаемую как BCY8116);
флуоресцеин-(SEQ ID NO: 169) (далее обозначаемую как BCY8205);
[B-A1a][Sar10]-(SEQ ID NO: 169) (далее обозначаемую как BCY8234); [PYA][B-Ala][Sar10]-(SEQ ID NO: 169) (далее обозначаемую как BCY8846);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ ID NO: 170) (далее обозначаемую как BCY8123);
Ac-(SEQ ID NO: 170) (далее обозначаемую как BCY8127);
(SEQ ID NO: 170) (далее обозначаемую как BCY8206);
Ac-(SEQ ID NO: 171) (далее обозначаемую как BCY8128);
(SeQ ID NO: 171) (далее обозначаемую как BCY8207);
[B-A1a][Sar10]-(SEQ ID NO: 171) (далее обозначаемую как BCY8232);
Ac-(SEQ ID NO: 172) (далее обозначаемую как BCY8129);
Ac-(SEQ ID NO: 173) (далее обозначаемую как BCY8153);
Ac-(SEQ ID NO: 174) (далее обозначаемую как BCY8154);
Ac-(SEQ ID NO: 175) (далее обозначаемую как BCY8157);
Ac-(SEQ ID NO: 176) (далее обозначаемую как BCY8158);
Ac-(SEQ ID NO: 177) (далее обозначаемую как BCY8161);
Ac-[B-Ala][Sar10]-(SEQ ID NO: 177) (далее обозначаемую как BCY8278);
Ac-(SEQ ID NO: 178) (далее обозначаемую как BCY8162);
Ac-[B-Ala][Sar10]-(SEQ ID NO: 178) (далее обозначаемую как BCY8277);
Ac-(SEQ ID NO: 179) (далее обозначаемую как BCY8163);
Ac-[B-Ala][Sar10]-(SEQ ID NO: 179) (далее обозначаемую как BCY8276);
[B-A1a][Sar10]-(SEQ ID NO: 179) (далее обозначаемую как BCY8269);
Ac-(SEQ ID NO: 180) (далее обозначаемую как BCY8174);
Ac-(SEQ ID NO: 181) (далее обозначаемую как BCY8175);
Ac-(SEQ ID NO: 182) (далее обозначаемую как BCY8176);
Ac-(SEQ ID NO: 183) (далее обозначаемую как BCY8177);
Ac-(SEQ ID NO: 184) (далее обозначаемую как BCY8178);
Ac-(SEQ ID NO: 185) (далее обозначаемую как BCY8180);
Ac-(SEQ ID NO: 186) (далее обозначаемую как BCY8181);
Ac-(SEQ ID NO: 187) (далее обозначаемую как BCY8182);
Ac-(SEQ ID NO: 188) (далее обозначаемую как BCY8183);
Ac-(SEQ ID NO: 189) (далее обозначаемую как BCY8184);
[B-A1a][Sar10]-(SEQ ID NO: 189) (далее обозначаемую как BCY8235);
Ac-(SEQ ID NO: 190) (далее обозначаемую как BCY8185);
Ac-(SEQ ID NO: 191) (далее обозначаемую как BCY8186);
Ac-(SEQ ID NO: 192) (далее обозначаемую как BCY8187);
Ac-(SEQ ID NO: 193) (далее обозначаемую как BCY8188);
Ac-(SEQ ID NO: 194) (далее обозначаемую как BCY8189);
Ac-(SEQ ID NO: 195) (далее обозначаемую как BCY8191);
Ac-(SEQ ID NO: 196) (далее обозначаемую как BCY8192);
Ac-(SEQ ID NO: 197) (далее обозначаемую как BCY8193);
Ac-(SEQ ID NO: 198) (далее обозначаемую как BCY8194);
Ac-(SEQ ID NO: 199) (далее обозначаемую как BCY8211);
Ac-(SEQ ID NO: 200) (далее обозначаемую как BCY8212);
Ac-(SEQ ID NO: 201) (далее обозначаемую как BCY8213);
- 166 045862
Ac-(SEQ ID NO: 202) (далее обозначаемую как BCY8214);
[B-A1a][Sar10]-(SEQ ID NO: 202) (далее обозначаемую как BCY8231);
Ac-(SeQ ID NO: 203) (далее обозначаемую как BCY8215);
Ac-[B-Ala][Sar10]-(SEQ ID NO: 208) (далее обозначаемую как BCY8279);
Ac-[B-Ala][Sar10]-(SEQ ID NO: 209) (далее обозначаемую как BCY8280);
[B-A1a][Sar10]-(SEQ ID NO: 209) (далее обозначаемую как BCY8273);
Ac-[B-Ala][Sar10]-(SEQ ID NO: 210) (далее обозначаемую как BCY8281);
Ac-(SEQ ID NO: 211) (далее обозначаемую как BCY8831);
[B-A1a][Sar10]-(SEQ ID NO: 212) (далее обозначаемую как BCY8238);
(SEQ ID NO: 215) (далее обозначаемую как BCY11415);
[PYA][B-Ala][Sar10]-(SEQ ID NO: 215) (далее обозначаемую как BCY11942); и (SEQ ID NO: 216) (далее обозначаемую как BCY11414);
более конкретно
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ ID NO: 169) (далее обозначаемую как BCY8122);
Ac-(SEQ ID NO: 169) (далее обозначаемую как BCY8126);
(SEQ ID NO: 169) (далее обозначаемую как BCY8116);
Флуоресцеин-(SEQ ID NO: 169) (далее обозначаемую как BCY8205); и
[B-A1a][Sar10]-(SEQ ID NO: 169) (далее обозначаемую как BCY8234); особенно: [B-Ala][Sar10]-(SEQ ID NO: 169) (далее обозначаемую как BCY8234).
7. Пептидный лиганд по п.1, который содержит аминокислотную последовательность, выбранную из A-(SEQ ID NO: 1)-А (обозначаемой как 80-09-02-N002 или BCY428);
F1-A-(SQ ID NO: 1)-A (обозначаемой как 80-09-02-N006);
Ac-(SEQ ID NO: 1) (обозначаемой как 80-09-02-N008 или BCY7390);
Ac-[dD]-(SEQ ID NO: 1) (обозначаемой как BCY7606);
A-(SEQ ID NO: 2)-А (обозначаемой как 80-09-02-N003 или BCY429);
(1-Nal)A-(SEQ ID NO: 1)-А (обозначаемой как 80-09-02-N009 или BCY7420);
(2-Nal)A-(SEQ ID NO: 1)-А (обозначаемой как 80-09-02-N010 или BCY7421);
(33DPA)A-(SEQ ID NO: 1)-А (обозначаемой как 80-09-02-N011 или BCY7422);
(44BPA)A-(SEQ ID NO: 1)-A (обозначаемой как 80-09-02-N012 или BCY7521);
Ac-(SEQ ID NO: 3) (обозначаемой как 80-09-02-N017);
Ac-(SEQ ID NO: 4) (обозначаемой как 80-09-02-N018);
Ac-(SQ ID NO: 5) (обозначаемой как 80-09-02-N019 или BCY7537);
Ac-(SEQ ID NO: 6) (обозначаемой как 80-09-02-N020);
Ac-(SEQ ID NO: 7) (обозначаемой как 80-09-02-N021 или BCY7539);
Ac-(SEQ ID NO: 8) (обозначаемой как 80-09-02-N022 или BCY7540);
Ac-(SEQ ID NO: 9) (обозначаемой как 80-09-02-N023);
Ac-(pCoF)-(SEQ ID NO: 1) (обозначаемой как 80-09-02-N044);
Ac-(SEQ ID NO: 10) (обозначаемой как 80-09-02-N045);
Ac-(SEQ ID NO: 11) (обозначаемой как 80-09-02-N046 или BCY7657);
Ac-(SEQ ID NO: 12) (обозначаемой как 80-09-02-N047 или BCY7658);
Ac-(SEQ ID NO: 13) (обозначаемой как 80-09-02-N048 или BCY7659);
Ac-(SEQ ID NO: 14) (обозначаемой как 80-09-02-N049);
Ac-(SEQ ID NO: 15) (обозначаемой как 80-09-02-N050 или BCY7661);
SDN-(SEQ ID NO: 15)-А (обозначаемой как BCY3387);
Ac-(SEQ ID NO: 16) (обозначаемой как 80-09-02-N051 или BCY7662);
Ac-(SEQ ID NO: 17) (обозначаемой как 80-09-02-N052);
Ac-(SEQ ID NO: 18) (обозначаемой как 80-09-02-N053);
Ac-(SEQ ID NO: 19) (обозначаемой как 80-09-02-N054 или BCY7665);
Ac-(SEQ ID NO: 20) (обозначаемой как 80-09-02-N055 или BCY7666);
Ac-(SEQ ID NO: 21) (обозначаемой как 80-09-02-N056);
A-(SEQ ID NO: 1)-TNK (обозначаемой как 80-09-02-T01-N001 или BCY3385);
A-(SEQ ID NO: l)-TN(HArg) (обозначаемой как 80-09-02-T01-N003 или BCY7281);
A-(SEQ ID NO: l)-TN(D-K) (обозначаемой как 80-09-02-T01-N004 или BCY7282);
A-(SEQ ID NO: 22)-TNK (обозначаемой как 80-09-02-T01-N005);
A-(SEQ ID NO: 23)-TNK (обозначаемой как 80-09-02-T01-N006);
Ac-(SEQ ID NO: 1)-TNK (обозначаемой как 80-09-02-T01-N011 или BCY7391);
A-(SEQ ID NO: 24)-TNK (обозначаемой как 80-09-02-T01-N012 или BCY7342);
A-(SEQ ID NO: 25)-TNK (обозначаемой как 80-09-02-T01-N014 или BCY7344);
A-(SEQ ID NO: 1)-ANK (обозначаемой как 80-09-02-T01-N016 или BCY7346);
A-(SEQ ID NO: 1)-[dA]NK (обозначаемой как BCY7367);
A-(SEQ ID NO: 1)-ТАК (обозначаемой как 80-09-02-T01-N017 или BCY7347);
A-(SEQ ID NO: 1)-T[dA]K (обозначаемой как BCY7368);
- 167 045862
A-(SEQ ID NO: 1)-TNA (обозначаемой как 80-09-02-T01-N018 или BCY7348);
A-(SEQ ID NO: l)-TN[dA] (обозначаемой как BCY7369);
Ac-[pCoPhe]-(SEQ ID NO: 1) (обозначаемой как BCY7656);
A-(SEQ ID NO: 6)-TNK (обозначаемой как 80-09-02-T01-N020 или BCY7354);
A-(SEQ ID NO: 26)-TNK (обозначаемой как 80-09-02-T01-N022 или BCY7352);
A-(SEQ ID NO: 27)-TNK (обозначаемой как 80-09-02-T01-N026 или BCY7356);
A-(SEQ ID NO: 28)-TNK (обозначаемой как 80-09-02-T01-N027 или BCY7357);
A-(SEQ ID NO: 29)-TNK (обозначаемой как 80-09-02-T01-N041 или BCY7372);
A-(SEQ ID NO: 30)-TNK (обозначаемой как 80-09-02-T01-N042 или BCY7424);
A-(SEQ ID NO: 31)-А (обозначаемой как 80-10-00 или BCY488);
A-(SEQ ID NO: 32)-А (обозначаемой как BCY432);
DDW-(SEQ ID NO: 32)-А (обозначаемой как 80-10-11-Т01 или BCY433);
VDW-(SEQ ID NO: 33)-А (обозначаемой как 80-10-12-Т01 или BCY462);
QKW-(SEQ ID NO: 34)-А (обозначаемой как 80-10-13-Т01 или BCY3400);
Q[HArg]W-(SEQ ID NO: 34)-А (обозначаемой как BCY7278);
Q[K(Ac)]W-(SEQ ID NO: 34)-А (обозначаемой как BCY7280);
[Ac]QKW-(SEQ ID NO: 34) (обозначаемой как BCY7392);
Q[dK]W-(SEQ ID NO: 34)-A (обозначаемой как BCY7426);
Ac-AKW-(SEQ ID NO: 34) (обозначаемой как BCY7622);
Ac-QAW-(SEQ ID NO: 34) (обозначаемой как BCY7623);
Ac-QKA-(SEQ ID NO: 34) (обозначаемой как BCY7624);
Ac-[dA]KW-(SEQ ID NO: 34) (обозначаемой как BCY7634);
Ac-Q[dA]W-(SEQ ID NO: 34) (обозначаемой как BCY7635);
Ac-QK[dA]-(SEQ ID NO: 34) (обозначаемой как BCY7636);
Ac-Q[dD]W-(SEQ ID NO: 34) (обозначаемой как BCY7993);
Ac-QK[1Nal]-(SEQ ID NO: 34) (обозначаемой как BCY7996);
Ac-QK[2Nal]-(SEQ ID NO: 34) (обозначаемой как BCY7997);
Ac-(SEQ ID NO: 34) (обозначаемой как BCY8044);
A-(SEQ ID NO: 43)-A (далее обозначаемой как BCY430);
A-(SEQ ID NO: 44)-A (далее обозначаемой как BCY431);
A-(SEQ ID NO: 58)-PQA (далее обозначаемой как BCY3401);
QKW-(SEQ ID NO: 65)-А (далее обозначаемой как BCY7279);
Ac-QKW-(SEQ ID NO: 103) (далее обозначаемой как BCY7625);
Ac-QKW-(SEQ ID NO: 104) (далее обозначаемой как BCY7627);
Ac-QKW-(SEQ ID NO: 105) (далее обозначаемой как BCY7628);
Ac-QKW-(SEQ ID NO: 106) (далее обозначаемой как BCY7631);
Ac-QKW-(SEQ ID NO: 107) (далее обозначаемой как BCY7632);
Ac-QKW-(SEQ ID NO: 108) (далее обозначаемой как BCY7639);
Ac-QKW-(SEQ ID NO: 109) (далее обозначаемой как BCY7640);
Ac-QKW-(SEQ ID NO: 110) (далее обозначаемой как BCY7643);
Ac-QKW-(SEQ ID NO: 153) (далее обозначаемой как BCY7998);
Ac-QKW-(SEQ ID NO: 154) (далее обозначаемой как BCY8000);
A-(SEQ ID NO: 35)-А (обозначаемой как 80-11-00 или BCY471);
A-(SEQ ID NO: 36)-А (обозначаемой как 80-11-01 или BCY472);
A-(SEQ ID NO: 37)-SRF (обозначаемой как 80-11-08-Т01 или BCY3406);
Ac-(SEQ ID NO: 37)-SRF (обозначаемой как BCY7393);
DDA-(SEQ ID NO: 45)-А (далее обозначаемой как BCY3386);
DTA-(SEQ ID NO: 46)-A (далее обозначаемой как BCY3388);
DSE-(SEQ ID NO: 47)-A (далее обозначаемой как BCY3389);
HDA-(SEQ ID NO: 48)-А (далее обозначаемой как BCY3390);
MDT-(SEQ ID NO: 49)-А (далее обозначаемой как BCY3391);
DPG-(SEQ ID NO: 50)-A (далее обозначаемой как BCY3392);
HDS-(SEQ ID NO: 51)-А (далее обозначаемой как BCY3393);
(D-H)DS-(SEQ ID NO: 51)-А (далее обозначаемой как BCY7272);
A-(SEQ ID NO: 52)-TDK (далее обозначаемой как BCY3394);
A-(SEQ ID NO: 53)-LKD (далее обозначаемой как BCY3395);
A-(SEQ ID NO: 54)-ТТА (далее обозначаемой как BCY3396);
A-(SEQ ID NO: 55)-QME (далее обозначаемой как BCY3397);
A-(SEQ ID NO: 56)-LSE (далее обозначаемой как BCY3398);
A-(SEQ ID NO: 57)-STD (далее обозначаемой как BCY3399);
A-(SEQ ID NO: 59)-TNK (далее обозначаемой как BCY7265);
Ac-(SEQ ID NO: 59) (далее обозначаемой как BCY7660);
- 168 045862
A-(SEQ ID NO: 60)-TNK (далее обозначаемой как BCY7266);
Ac-(SEQ ID NO: 60) (далее обозначаемой как BCY7616);
HdS-(SEQ ID NO: 61)-А (далее обозначаемой как BCY7273);
HDS-(SEQ ID NO: 62)-A (далее обозначаемой как BCY7274);
HDS-(SEQ ID NO: 63)-A (далее обозначаемой как BCY7275);
HDS-(SEQ ID NO: 64)-A (далее обозначаемой как BCY7276);
A-(SEQ ID NO: 66)-TNK (далее обозначаемой как BCY7349);
A-(SEQ ID NO: 67)-TNK (далее обозначаемой как BCY7350);
Ac-(SEQ ID NO: 67) (далее обозначаемой как BCY7538);
A-(SEQ ID NO: 68)-TNK (далее обозначаемой как BCY7359);
A-(SEQ ID NO: 69)-TNK (далее обозначаемой как BCY7360);
A-(SEQ ID NO: 70)-TNK (далее обозначаемой как BCY7361);
A-(SEQ ID NO: 71)-TNK (далее обозначаемой как BCY7365);
A-(SEQ ID NO: 72)-TNK (далее обозначаемой как BCY7370);
Ac-(SEQ ID NO: 73) (далее обозначаемой как BCY7535);
Ac-(SEQ ID NO: 74) (далее обозначаемой как BCY7536);
Ac-(SEQ ID NO: 75) (далее обозначаемой как BCY7541);
[B-A1a][Sar5]-(SEQ ID NO: 76) (далее обозначаемой как BCY7556);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ ID NO: 76) (далее обозначаемой как BCY7558);
[B-A1a][Sar5]-(SEQ ID NO: 77) (далее обозначаемой как BCY7557);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ ID NO: 77) (далее обозначаемой как BCY7559);
Ac-(SEQ ID NO: 78) (далее обозначаемой как BCY7580);
Ac-(SEQ ID NO: 79) (далее обозначаемой как BCY7581);
Ac-(SEQ ID NO: 80) (далее обозначаемой как BCY7582);
Ac-(SEQ ID NO: 81) (далее обозначаемой как BCY7584);
Ac-(SEQ ID NO: 82) (далее обозначаемой как BCY7585);
Ac-(SEQ ID NO: 83) (далее обозначаемой как BCY7588);
Ac-(SEQ ID NO: 84) (далее обозначаемой как BCY7589);
Ac-(SEQ ID NO: 85) (далее обозначаемой как BCY7590);
Ac-(SEQ ID NO: 86) (далее обозначаемой как BCY7591);
Ac-(SEQ ID NO: 87) (далее обозначаемой как BCY7592);
Ac-(SEQ ID NO: 88) (далее обозначаемой как BCY7593);
Ac-(SEQ ID NO: 89) (далее обозначаемой как BCY7594);
Ac-(SEQ ID NO: 90) (далее обозначаемой как BCY7595);
Ac-(SEQ ID NO: 91) (далее обозначаемой как BCY7596);
Ac-(SEQ ID NO: 92) (далее обозначаемой как BCY7597);
Ac-(SEQ ID NO: 93) (далее обозначаемой как BCY7598);
Ac-(SEQ ID NO: 94) (далее обозначаемой как BCY7607);
Ac-(SEQ ID NO: 95) (далее обозначаемой как BCY7608);
Ac-(SEQ ID NO: 96) (далее обозначаемой как BCY7611);
Ac-(SEQ ID NO: 97) (далее обозначаемой как BCY7612);
Ac-(SEQ ID NO: 98) (далее обозначаемой как BCY7613);
Ac-(SEQ ID NO: 99) (далее обозначаемой как BCY7614);
Ac-(SEQ ID NO: 100) (далее обозначаемой как BCY7615);
Ac-(SEQ ID NO: 101) (далее обозначаемой как BCY7618);
Ac-(SEQ ID NO: 102) (далее обозначаемой как BCY7620);
Ac-(SEQ ID NO: 111) (далее обозначаемой как BCY7663);
Ac-(SEQ ID NO: 112) (далее обозначаемой как BCY7664);
Ac-(SEQ ID NO: 113) (далее обозначаемой как BCY7667);
Ac-(SEQ ID NO: 114) (далее обозначаемой как BCY7668);
Ac-(SEQ ID NO: 115) (далее обозначаемой как BCY7765);
(SEQ ID NO: 115) (далее обозначаемой как BCY7793);
(MeO-dPEG12)(SEQ ID NO: 115) (далее обозначаемой как BCY8087);
(карбоксифлуоресцеин)(SEQ ID NO: 115) (далее обозначаемой как BCY8208);
(PEGs)(PEGs)(SEQ ID NO: 115) (далее обозначаемой как BCY7815);
(MeO-dPEG12)(PEG3)(PEG3)(SEQ ID NO: 115) (далее обозначаемой как BCY8094);
Ac-DDD-(SEQ ID NO: 115) (далее обозначаемой как BCY8028);
Ac-[dD] [dD] [dD]-(SEQ ID NO: 115) (далее обозначаемой как BCY8029);
[B-A1a][Sar10]-(SEQ ID NO: 115) (далее обозначаемой как BCY7814);
Ac-(SEQ ID NO: 116) (далее обозначаемой как BCY7816);
Ac-(SEQ ID NO: 116) (MeO-dPEG12), связанной с D-Lys6 (далее обозначаемой как BCY8084);
Ac-(SEQ ID NO: 117) (далее обозначаемой как BCY7817);
- 169 045862
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
Ac-(SEQ ID NO
118) (далее обозначаемой как BCY7818;
118) (MeO-dPEG12) связанной с Pro(4NH)l (далее обозначаемой как BCY8086);
119) (далее обозначаемой как BCY7819;
119) (MeO-dPEG12) связанной с Lys5 (далее обозначаемой как BCY8088);
120) (далее обозначаемой как BCY7820;
120) (MeO-dPEG12) связанной с D-Lys3 (далее обозначаемой как BCY8089);
121) (далее обозначаемой как BCY7821);
121) (MeO-dPEG12) связанной с Lys4 (далее обозначаемой как BCY8090);
122) (далее обозначаемой как BCY7822);
122) (MeO-dPEG12) связанной cLys6 (далее обозначаемой как BCY8091);
123) (далее обозначаемой как BCY7876);
124) (далее обозначаемой как BCY7877);
125) (далее обозначаемой как BCY7879);
126) (далее обозначаемой как BCY7881);
127) (далее обозначаемой как BCY7883);
128) (далее обозначаемой как BCY7884);
129) (далее обозначаемой как BCY7886);
130) (далее обозначаемой как BCY7887);
131) (далее обозначаемой как BCY7889);
132) (далее обозначаемой как BCY7890);
133) (далее обозначаемой как BCY7891);
134) (далее обозначаемой как BCY7892);
135) (далее обозначаемой как BCY7894);
136) (далее обозначаемой как BCY7895);
137) (далее обозначаемой как BCY7896);
138) (далее обозначаемой как BCY7897);
139) (далее обозначаемой как BCY7902);
140) (далее обозначаемой как BCY7903);
141) (далее обозначаемой как BCY7904);
142) (далее обозначаемой как BCY7906);
143) (далее обозначаемой как BCY7907);
144) (далее обозначаемой как BCY7908);
145) (далее обозначаемой как BCY7911);
146) (далее обозначаемой как BCY7912);
147) (далее обозначаемой как BCY7913);
148) (далее обозначаемой как BCY7914);
149) (далее обозначаемой как BCY7915);
150) (далее обозначаемой как BCY7916);
151) (далее обозначаемой как BCY7973);
152) (далее обозначаемой как BCY7979);
155) (далее обозначаемой как BCY8030);
156) (далее обозначаемой как BCY8031);
157) (далее обозначаемой как BCY8032);
158) (далее обозначаемой как BCY8036);
159) (далее обозначаемой как BCY8037);
160) (далее обозначаемой как BCY8038);
161) (далее обозначаемой как BCY8039);
162) (далее обозначаемой как BCY8040);
163) (далее обозначаемой как BCY8041);
164) (далее обозначаемой как BCY8042);
165) (далее обозначаемой как BCY8042);
166) (далее обозначаемой как BCY8085);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ ID NO: 167) (далее обозначаемой как BCY8120);
Ac-(SEQ ID NO: 167) (далее обозначаемой как BCY8124);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ ID NO: 168) (далее обозначаемой как BCY8121);
Ac-(SEQ ID NO: 168) (далее обозначаемой как BCY8125);
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ ID NO: 169) (далее обозначаемой как BCY8122);
Ac-(SEQ ID NO: 169) (далее обозначаемой как BCY8126);
(SEQ ID NO: 169) (далее обозначаемой как BCY8116);
флуоресцеин-(SEQ ID NO: 169) (далее обозначаемой как BCY8205);
[B-A1a][Sar10]-(SEQ ID NO: 169) (далее обозначаемой как BCY8234);
[PYA][B-Ala][Sar10]-(SEQ ID NO: 169) (далее обозначаемой как BCY8846);
- 170 045862
Ac-[B-Ala][Sar5]-(SEQ ID NO: 170) (далее обозначаемой как BCY8123);
Ac-(SEQ ID NO: 170) (далее обозначаемой как BCY8127);
(SeQ ID NO: 170) (далее обозначаемой как BCY8206);
Ac-(SEQ ID NO: 171) (далее обозначаемой как BCY8128);
(SEQ ID NO: 171) (далее обозначаемой как BCY8207);
[B-A1a][Sar10]-(SEQ ID NO: 171) (далее обозначаемой как BCY8232);
Ac-(SEQ ID NO: 172) (далее обозначаемой как BCY8129);
Ac-(SEQ ID NO: 173) (далее обозначаемой как BCY8153);
Ac-(SEQ ID NO: 174) (далее обозначаемой как BCY8154);
Ac-(SEQ ID NO: 175) (далее обозначаемой как BCY8157);
Ac-(SEQ ID NO: 176) (далее обозначаемой как BCY8158);
Ac-(SEQ ID NO: 177) (далее обозначаемой как BCY8161);
c-[B-Ala][Sar10]-(SEQ ID NO: 177) (далее обозначаемой как BCY8278);
Ac-(SEQ ID NO: 178) (далее обозначаемой как BCY8162);
Ac-[B-Ala][Sar10]-(SEQ ID NO: 178) (далее обозначаемой как BCY8277);
Ac-(SEQ ID NO: 179) (далее обозначаемой как BCY8163);
Ac-[B-Ala][Sar10]-(SEQ ID NO: 179) (далее обозначаемой как BCY8276);
[B-A1a][Sar10]-(SEQ ID NO: 179) (далее обозначаемой как BCY8269);
Ac-(SEQ ID NO: 180) (далее обозначаемой как BCY8174);
Ac-(SEQ ID NO: 181) (далее обозначаемой как BCY8175);
Ac-(SEQ ID NO: 182) (далее обозначаемой как BCY8176);
Ac-(SEQ ID NO: 183) (далее обозначаемой как BCY8177);
Ac-(SEQ ID NO: 184) (далее обозначаемой как BCY8178);
Ac-(SEQ ID NO: 185) (далее обозначаемой как BCY8180);
Ac-(SEQ ID NO: 186) (далее обозначаемой как BCY8181);
Ac-(SEQ ID NO: 187) (далее обозначаемой как BCY8182);
Ac-(SEQ ID NO: 188) (далее обозначаемой как BCY8183);
Ac-(SEQ ID NO: 189) (далее обозначаемой как BCY8184);
[B-A1a][Sar10]-(SEQ ID NO: 189) (далее обозначаемой как BCY8235);
Ac-(SEQ ID NO: 190) (далее обозначаемой как BCY8185);
Ac-(SEQ ID NO: 191) (далее обозначаемой как BCY8186);
Ac-(SEQ ID NO: 192) (далее обозначаемой как BCY8187);
Ac-(SEQ ID NO: 193) (далее обозначаемой как BCY8188);
Ac-(SEQ ID NO: 194) (далее обозначаемой как BCY8189);
Ac-(SEQ ID NO: 195) (далее обозначаемой как BCY8191);
Ac-(SEQ ID NO: 196) (далее обозначаемой как BCY8192);
Ac-(SEQ ID NO: 197) (далее обозначаемой как BCY8193);
Ac-(SEQ ID NO: 198) (далее обозначаемой как BCY8194);
Ac-(SEQ ID NO: 199) (далее обозначаемой как BCY8211);
Ac-(SEQ ID NO: 200) (далее обозначаемой как BCY8212);
Ac-(SEQ ID NO: 201) (далее обозначаемой как BCY8213);
Ac-(SEQ ID NO: 202) (далее обозначаемой как BCY8214);
[B-A1a][Sar10]-(SEQ ID NO: 202) (далее обозначаемой как BCY8231);
Ac-(SEQ ID NO: 203) (далее обозначаемой как BCY8215);
Ac-[B-Ala][Sar10]-(SEQ ID NO: 208) (далее обозначаемой как BCY8279);
Ac-[B-Ala][Sar10]-(SEQ ID NO: 209) (далее обозначаемой как BCY8280);
[B-A1a][Sar10]-(SEQ ID NO: 209) (далее обозначаемой как BCY8273);
Ac-[B-Ala][Sar10]-(SEQ ID NO: 210) (далее обозначаемой как BCY8281);
Ac-(SEQ ID NO: 211) (далее обозначаемой как BCY8831);
[B-A1a][Sar10]-(SEQ ID NO: 212) (далее обозначаемой как BCY8238);
(SEQ ID NO: 215) (далее обозначаемой как BCY11415);
[PYA][B-Ala][Sar10]-(SEQ ID NO: 215) (далее обозначаемой как BCY11942); и (SEQ ID NO: 216) (далее обозначаемой как BCY11414).
8. Пептидный лиганд по любому из пп.1-7, где молекулярный каркас выбран из 1,1',1-(1,3,5триазинан-1,3,5-триил)трипроп-2-ен-1 -она (Т АТ А).
9. Пептидный лиганд по любому из пп.1-8, где фармацевтически приемлемая соль выбрана из свободной кислоты или соли натрия, калия, кальция, аммония.
10. Пептидный лиганд по любому из пп.1-9, где нектин-4 представляет собой нектин-4 человека.
11. Конъюгат лекарственного средства, содержащий пептидный лиганд по любому из пп.1-10, конъюгированный с одной или несколькими эффекторными и/или функциональными группами, где одну или более эффекторные и/или функциональные группы выбирают из группы, состоящей из радиохелатора, хромофора, антитела или его фрагмента, фермента, реактивной группы, хелатора металлов, функцио
- 171 045862 нальной группы, которая способствует захвату пептидного лиганда в клетки и/или лекарственное средство.
12. Конъюгат лекарственного средства по п.11, где лекарственное средство представляет собой цитотоксическое средство.
13. Конъюгат лекарственного средства по п.12, где указанное цитотоксическое средство выбрано из ММАЕ или DM1, в частности ММАЕ.
14. Конъюгат лекарственного средства по п.13, где цитотоксическое средство представляет собой ММАЕ и указанный конъюгат, кроме того, содержит линкер, выбранный из: -PABC-Cit-Val-глутарилаили -РАБС-циклобутил-Ala-Cit-eAla-, такого как -PABC-Cit-Val-глутарил-, где РАВС обозначает паминобензилкарбамат.
15. Конъюгат лекарственного средства по п.13, где цитотоксическое средство представляет собой DM1 и указанный конъюгат, кроме того, содержит линкер, который представляет собой -SPDB-(SO3H)-, где SPDB обозначает N-сукцинимидил 3-(2-пиридилдитио)пропионат.
16. Конъюгат лекарственного средства по любому из пп.11-15, который выбран из любого из: BCY7683, BCY7825, BCY7826, BCY8245, BCY8253, BCY8254, BCY8255, BCY8549, BCY8550, BCY8783 и BCY8784, таких как: BCY7683, BCY7825, BCY7826, BCY8245, BCY8253, BCY8254, BCY8255, BCY8783 и BCY8784, в частности BCY8245.
17. Фармацевтическая композиция, которая содержит пептидный лиганд по любому из пп.1-10 или конъюгат лекарственного средства по любому из пп.11-16 в комбинации с одним или несколькими фармацевтически приемлемыми эксципиентами.
18. Фармацевтическая композиция, которая содержит пептидный лиганд по любому из пп.1-10 или конъюгат лекарственного средства по любому из пп.11-16 в комбинации с одним или несколькими фармацевтически приемлемыми эксципиентами и одно или несколько терапевтических средств.
19. Применение конъюгата лекарственного средства по любому из пп.11-16 для предупреждения, подавления или лечения заболевания или нарушения, опосредуемого нектином-4.
20. Способ предупреждения, подавления или лечения злокачественной опухоли, который включает введение пациенту, нуждающемуся в этом, конъюгата лекарственного средства по любому из пп.11-16, где указанный пациент идентифицирован как имеющий увеличенное варьирование числа копий (CNV) нектина-4.
EA202190105 2018-06-22 2019-06-21 Бициклические пептидные лиганды, специфичные к нектину-4 EA045862B1 (ru)

Applications Claiming Priority (4)

Application Number Priority Date Filing Date Title
GB1810250.9 2018-06-22
GB1815684.4 2018-09-26
GB1818499.4 2018-11-13
GB1904632.5 2019-04-02

Publications (1)

Publication Number Publication Date
EA045862B1 true EA045862B1 (ru) 2024-01-11

Family

ID=

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US11453702B2 (en) Bicyclic peptide ligands specific for Nectin-4
US20220184222A1 (en) Bicycle toxin conjugates and uses thereof
US10624968B2 (en) Compounds for treating cancer
US20240293521A1 (en) Combination use of wt1 antigen peptide and immunomodulator
JP2023538906A (ja) ネクチン-4に特異的な二環コンジュゲート及びその使用
JP2023553866A (ja) Tead阻害剤、及びその使用
US20210315909A1 (en) Polymorphic compounds and uses thereof
WO2023114984A1 (en) Tead inhibitors and uses thereof
JP6077641B2 (ja) 新規ctlエピトープ5連結ペプチド
TWI851580B (zh) 對nectin-4具有專一性之雙環胜肽配體
EA045862B1 (ru) Бициклические пептидные лиганды, специфичные к нектину-4
AU2021201047B2 (en) Il-2 receptor binding compounds
US20240000883A1 (en) Method of sensitizing cancers to immunotherapy using immunomodulatory agents
KR20240119141A (ko) 암의 치료 방법