EA041830B1 - БИСПЕЦИФИЧЕСКОЕ АНТИТЕЛО, СВЯЗЫВАЮЩЕЕ ГЛИПИКАН 3 И CD3ε (ВАРИАНТЫ), ФАРМАЦЕВТИЧЕСКАЯ КОМПОЗИЦИЯ, ВКЛЮЧАЮЩАЯ ЕГО, И СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ЭТОГО АНТИТЕЛА - Google Patents

БИСПЕЦИФИЧЕСКОЕ АНТИТЕЛО, СВЯЗЫВАЮЩЕЕ ГЛИПИКАН 3 И CD3ε (ВАРИАНТЫ), ФАРМАЦЕВТИЧЕСКАЯ КОМПОЗИЦИЯ, ВКЛЮЧАЮЩАЯ ЕГО, И СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ЭТОГО АНТИТЕЛА Download PDF

Info

Publication number
EA041830B1
EA041830B1 EA201790674 EA041830B1 EA 041830 B1 EA041830 B1 EA 041830B1 EA 201790674 EA201790674 EA 201790674 EA 041830 B1 EA041830 B1 EA 041830B1
Authority
EA
Eurasian Patent Office
Prior art keywords
amino acid
seq
antibody
cdr2
variable region
Prior art date
Application number
EA201790674
Other languages
English (en)
Inventor
Дзюнити НЕДЗУ
Ацуси Нарита
Такахиро Исигуро
Мика САКУРАИ
Хиротаке СИРАИВА
Наока ХИРОНИВА
Томоюки ИГАВА
Юмико КАВАИ
Original Assignee
Чугаи Сейяку Кабусики Кайся
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Application filed by Чугаи Сейяку Кабусики Кайся filed Critical Чугаи Сейяку Кабусики Кайся
Publication of EA041830B1 publication Critical patent/EA041830B1/ru

Links

Description

Область техники, к которой относится изобретение
Настоящее изобретение относится к мультиспецифическим антигенсвязывающим молекулам, их применениям и т.п.
Предпосылки создания изобретения
Антитела привлекают внимание в качестве терапевтических средств благодаря их высокой стабильности в плазме и небольшому количеству нежелательных реакций (непатентные документы 1 и 2). Известно, что антитела индуцируют не только антигенсвязывающую активность, агонистическое действие и антагонистическое действие, но также и опосредуемые эффектором виды цитотоксической активности (которые называют также эффекторными функциями), такие как антитело-обусловленная клеточнозависимая цитотоксичность (ADCC), антителозависимый клеточный фагоцитоз (ADCP) и комплементзависимая цитотоксичность (CDC), и обладают противоопухолевыми действиями в отношении раковых клеток (непатентный документ 3). ADCC представляет собой обусловленную эффекторными клетками цитотоксичность в отношении нагруженных антителом раковых клеток-мишеней посредством связывания Fc-области антитела с Fc-рецептором, присутствующим на эффекторных клетках, таких как NKклетки и макрофаги. Комплекс системы комплемента связывается с комплементсвязывающим сайтом, присутствующим в структуре антитела. CDC является вредной для клеток в результате клеточной деструкции, при которой приток воды и ионов в клетки усиливается благодаря образованию пор на клеточной мембране нагруженных антителом клеток с помощью компонентов комплемента, присутствующих в комплексе. Создан ряд терапевтических антител с установленными очень высокими противоопухолевыми действиями в качестве фармацевтических средств для лечения рака (непатентный документ 4).
Для того чтобы антитело обусловливало ADCC, ADCP и CDC, необходимо наличие Fc-области в антителе и присутствие рецептора для антитела (FcyR) на эффекторных клетках, таких как NK-клетки и макрофаги, и различных компонентов комплемента, пригодных для связывания. У человека описаны изоформы FcyRIa, FcyRIIa, FcyRIIb, FcyRIIIa и FcyRIIIb в качестве семейства белка FcyR, кроме того, описаны соответствующие аллотипы (непатентный документ 5). Среди указанных изоформ FcyRIa, FcyRIIa и FcyRIIIa несут активирующий мотив на основе тирозина иммунорецептора (ITAM) во внутриклеточном домене и передают сигналы активации. С другой стороны, только FcyRIIb несет домен, известный как ингибирующий мотив на основе рецептора тирозина (ITIM), во внутриклеточном домене и передает сигналы ингибирования. Известно, что каждый из FcyR передает сигналы посредством перекрестного сшивания иммунными комплексами и т.п. (непатентный документ 6). Когда антитела фактически проявляют эффекторную функцию на раковых клетках, FcyR на мембране эффекторной клетки образуют кластеры на Fc-областях нескольких антител, связанных на мембране раковой клетки, и сигналы активации передаются эффекторными клетками. В результате проявляется цитоцидное действие, но поскольку FcyR перекрестно сшиваются только на эффекторных клетках, которые в это время присутствуют вблизи раковых клеток, установлено, что активация иммунитета происходит локально в раковых клетках (непатентный документ 7).
Встречающиеся в естественных условиях иммуноглобулины связываются с антигенами в их вариабельных областях и связываются с рецепторами, такими как FcyR, FcRn, FcaR и FcεR, и комплементами в их константных областях. FcRn является одной из связывающихся молекул, которые взаимодействуют с Fc-областью IgG, и установлено, что, поскольку каждая из тяжелых цепей антитела связывается с одной молекулой FcRn, две молекулы FcRn связываются с одном молекулой антитела IgG-типа. Однако в отличие от FcRn и др., FcyR взаимодействует с шарнирной областью антитела и СН2-доменом, и только одна молекула FcyR связывается с одной молекулой антитела IgG-типа (непатентный документ 8). Кроме того, каноническое встречающееся в естественных условиях антитело IgG-типа распознает и связывает единичный эпитоп через его вариабельную область (Fab); поэтому оно может связываться только с одним антигеном. С другой стороны, известно, что с раком и воспалением связано много типов белков и поэтому может иметь место перекрестная помеха между белками. Например, известно, что несколько воспалительных цитокинов (TNF, IL1 и IL6) могут участвовать в иммунологических заболеваниях (непатентный документ 9). Кроме того, известно, что одним из механизмов приобретения устойчивости рака к лекарственным средствам является активация других рецепторов (непатентный документ 10). В таких случаях канонические антитела, которые распознают единичный эпитоп, не могут ингибировать несколько белков.
Антитела (биспецифические антитела), одна молекула которых связывается с двумя или большим количеством типов антигенов, изучены в качестве молекул, которые ингибируют несколько мишеней. Можно получать связывающие активности с двумя различными антигенами (первый антиген и второй антиген) путем модификации встречающихся в естественных условиях антител IgG-типа (непатентный документ 11). Таким образом, можно не только нейтрализовать два или большее количество типов антигенов с помощью одной молекулы, но также усиливать противоопухолевую активность с помощью перекрестных связей между клетками, которые обладают цитотоксической активностью, и раковыми клетками. К настоящему времени в качестве молекулярных форматов биспецифического антитела описаны молекула, содержащая антигенсвязывающий сайт, добавленный к N- или С-концу антитела (DVD-Ig и scFv- 1 041830
IgG), молекула, имеющая различные последовательности двух Fab-областей антитела (содержащее общую L-цепь биспецифическое антитело и гибридная гибридома), молекула, в которой одна область Fab распознает два антигена (IgG два-в-одном), и молекула, имеющая петлю CH3-области в качестве нового антигенсвязывающего сайта (Fcab) (непатентный документы 12 и 13). Поскольку все биспецифические антитела взаимодействуют на их Fc-областях с FcyR, эффекторные функции антитела сохраняются. Таким образом, биспецифическое антитело связывается с любым антигеном, который оно распознает, и одновременно связывается с FcyR, и обусловливает ADCC-активность в отношении клеток, экспрессирующих антиген.
Если все антигены, распознаваемые биспецифическим антителом, специфически экспрессируются при раке, то биспецифическое антитело обладает цитотоксическим действием в отношении раковых клеток, когда оно связывается с любым из антигенов. Таким образом, по сравнению с каноническим фармацевтическим антителом, которое распознает один антиген, можно ожидать, что указанное антитело будет обладать более эффективным противоопухолевым действием. Однако в случае, когда любой один из антигенов, распознаваемых биспецифическим антителом, экспрессируется в здоровых тканях или клетках, экспрессируемых на иммуноцитах, то имеет место повреждение здоровых тканей или высвобождение цитокинов в результате перекрестного связывания с FcyR. (непатентный документ 14). В результате индуцируются сильные нежелательные реакции.
Перенаправляющее Т-клетку антитело, которое использует цитотоксичность, активируя Т-клетки в качестве эффекторных клеток, что является механизмом его противоопухолевого действия, известно с 1980-х годов (непатентные документы 15, 16 и 17). В отличие от антител, которые используют ADCC, активируя NK-клетки или макрофаги в качестве эффекторных клеток, что является механизмом их противоопухолевого действия, перенаправляющее Т-клетки антитело представляет собой антитело против любой одной из субъединиц, из которых состоит комплекс Т-клеточного рецептора (TCR) на Т-клетках, и представляет собой специфическое биспецифическое антитело, которое содержит антитело, связывающееся с эпсилон-цепью CD3, и антитело, связывающееся с антигеном на раковой клетке-мишени. Тклетки приходят в контакт с раковыми клетками посредством одновременного связывания эпсилон-цепи CD3 и ракового антигена с помощью перенаправляющего Т-клетки антитела. Это в результате приводит к противоопухолевому действию в отношении раковых клеток благодаря цитотоксической активности, обусловленной Т-клетками.
Катумаксомаб, известный в качестве перенаправляющего Т-клетки антитела, связывается на посредством двух Fab с раковым антигеном (ЕрСАМ) и с CD3ε- (CD3-эпсилон) цепью, экспрессируемой на Т-клетках. Катумаксомаб индуцирует опосредуемую Т-клетками цитотоксическую активность путем одновременного связывания с раковым антигеном и CD3ε и индуцирует цитотоксическую активность, опосредуемую антигенпрезентирующими клетками, такими как NK-клетки и макрофаги, путем одновременного связывания с раковым антигеном и FcyR. Благодаря указанным двум видам цитотоксической активности катумаксомаб обладает высоким терапевтическим действием в отношении злокачественных асцитов при внутрибрюшинном введении и поэтому его применение разрешено в Европе (непатентный документ 18). Кроме того, известны случаи, когда по имеющимся сведениям введение катумаксомаба приводит к образованию реактивных в отношении раковых клеток антител, что четко демонстрирует индукцию приобретенного иммунитета (непатентный документ 19). С учетом указанного результата привлекли внимание антитела, которые обладают как опосредуемой Т-клетками цитотоксической активностью, так и опосредуемыми FcyR действиями таких клеток как NK-клетки или макрофаги (указанные антитела обозначают как трифункциональные антитела), поскольку для них можно ожидать сильное противоопухолевое действие и индукцию приобретенного иммунитета.
Однако трифункциональные антитела связываются одновременно с CD3ε и FcyR даже в отсутствии ракового антигена и поэтому обеспечивают перекрестное сшивание экспрессирующих CD3ε Т-клеток с экспрессирующими FcyR клетками даже при отсутствии в окружении раковых клеток, что приводит к производству в больших количествах различных цитокинов. Указанная независящая от ракового антигена индукция производства различных цитокинов в настоящее время ограничивает применение трифункциональных антител внутрибрюшинным путем (непатентный документ 20). Трифункциональные антитела очень трудно вводить системно из-за серьезных напоминающих цитокиновый шторм нежелательных реакций. Фактически, на фазе I клинического испытания было установлено, что максимальной переносимой дозой при системном введении катумаксомаба пациентам с немелкоклеточным раком легкого является очень низкая доза, составляющая 5 мкг/организм, и что введение более высокой дозы вызывает серьезные нежелательные реакции (непатентный документ 21).
Так, созданные с помощью общепринятых методик биспецифические антитела могут связываться с обоими антигенами, при этом первый антиген представляет собой раковый антиген (ЕрСАМ), а второй антиген представляет собой CD3ε, одновременно с этим они связываются с FcyR; и поэтому с учетом их молекулярной структуры невозможно избежать нежелательных реакций, вызываемых одновременным связыванием с FcyR и вторым антигеном CD3ε.
При этом, в отличие от катумаксомаба, BiTE (биспецифический активатор (проводник) Т-клеток) не
- 2 041830 содержит сайт связывания Fcγ-рецептора и поэтому у него отсутствует перекрестное сшивание с рецепторами, которые экспрессируются на Т-клетках и таких клетках, как NK-клетки и макрофаги, зависимым от ракового антигена образом. Так, было продемонстрировано, что BiTE не вызывает независимую от ракового антигена индукцию цитокинов, которая обнаружена при введении катумаксомаба. Однако, поскольку BiTE представляет собой модифицированную низкомолекулярную молекулу антитела без Fcобласти, проблема заключается в том, что время его полужизни в крови после введения пациенту, существенно короче, чем в случае антител IgG-типа, которые обычно применяют в качестве терапевтических антител. Фактически, согласно опубликованным данным время полужизни в крови BiTE при его применении in vivo составляет примерно несколько часов (непатентные документы 22 и 23). При проведении клинических испытаний блинатумомаба его вводили путем непрерывной внутривенной инфузии с помощью мининасоса. Такой метод введения не только чрезвычайно неудобен для пациентов, но также имеет потенциальный риск медицинских осложнений, связанных с неисправностью устройства или т.п. Таким образом, нельзя считать, что указанный метод введения является желательным.
В последние годы применение Fc-области с пониженной способностью связываться с FcyR позволило сохранять сильную противоопухолевую активность, свойственную BiTE, и очень хорошие характеристики безопасности без индукции цитокинового шторма зависимым от ракового антигена образом, и обеспечило создание новых полипептидных структур с продолжительным временем полужизни в крови (патентный документ 1).
С другой стороны, когда происходит экспрессия созданного с помощью общепринятых методик биспецифического антитела, то экспрессируются два типа H-цепей и два типа L-цепей, что может приводить к получению десяти комбинаций. Из них только одна из полученных комбинаций обладает представляющей интерес специфичностью связывания. Таким образом, для получения представляющего интерес биспецифического антитела одно представляющее интерес антитело должны быть выделено из десяти типов антител, такой путь является очень неэффективным и сложным.
В качестве решения указанной проблемы был описан метод, заключающийся в предпочтительном секретировании IgG с гетеродимерной комбинацией H-цепей, например с комбинацией H-цепи против антигена А и Н-цепи против антигена Б, посредством интродукции аминокислотных замен в CH3область H-цепи IgG (патентные документы 2, 3, 4, 5, 6, 7 и непатентные документы 24 и 25). В качестве таких методов описаны методы на основе физического нарушения, т.е. выступа и впадины, и метод на основе отталкивания электрических зарядов.
Для получения представляющей интерес молекулы с повышенной эффективностью, описаны методы, основанные на применении L-цепей, которые могут связываться с двумя различными антигенами, даже хотя L-цепи имеют одинаковую аминокислотную последовательность (патентные документы 8 и 9). Однако аффинность к антигену может значительно уменьшаться при применении общих L-цепей и трудно найти общие L-цепи, при использовании которых сохраняется аффинность к антигену.
Перечень перечисленных документов
Патентные документы.
Патентный документ 1. WO2012/073985.
Патентный документ 2. WO96/27011.
Патентный документ 3. WO2006/106905.
Патентный документ 4. WO2007/147901
Патентный документ 5. WO2009/089004.
Патентный документ 6. WO2010/129304.
Патентный документ 7. WO2013/065708.
Патентный документ 8. WO98/050431.
Патентный документ 9. WO2006/109592.
Непатентные документы.
Непатентный документ 1. Nat. Biotechnol. 23, 2005, с. 1073-1078.
Непатентный документ 2. Eur J Pharm Biopharm. 59 (3), 2005, с. 389-396.
Непатентный документ 3. Drug Des Devel Ther 3, 2009, с. 7-16.
Непатентный документ 4. Clin Cancer Res. 16 (1), 2010, с. 11-20.
Непатентный документ 5. Immunol. Lett. 82, 2002, с. 57-65.
Непатентный документ 6. Nat. Rev. Immunol. 8, 2008, с. 34-47.
Непатентный документ 7. Ann. Rev. Immunol. 6, 1988, с. 251-281.
Непатентный документ 8. J. Bio. Chem., 276, 2001, с. 16469-16477.
Непатентный документ 9. Nat. Biotech., 28, 2011, с. 502-510.
Непатентный документ 10. Endocr Relat Cancer 13, 2006, с. 45-51.
Непатентный документ 11. MAbs. 1 марта 2012 г., 4(2).
Непатентный документ 12. Nat. Rev. 10, 2010, с. 301-316.
Непатентный документ 13. Peds 23(4), 2010, с. 289-297.
Непатентный документ 14. J. Immunol. 163(3), 1 августа 1999 г., с. 1246-1252.
- 3 041830
Непатентный документ 15. Nature 314 (6012), 1985, с. 628-631.
Непатентный документ 16. Int J Cancer 41 (4), 1988, с. 609-615.
Непатентный документ 17. Proc Natl Acad Sci USA 83 (5), 1986, с. 1453-1457.
Непатентный документ 18. Cancer Treat Rev. 36(6), октябрь 2010 г., с. 458-467.
Непатентный документ 19. Future Oncol. 8(1), январь 2012 г., с. 73-85.
Непатентный документ 20. Cancer Immunol Immunother. 56(9), 2007, с. 1397-1406.
Непатентный документ 21. Cancer Immunol Immunother. 56 (10), 2007, с. 1637-1644.
Непатентный документ 22. Cancer Immunol Immunother. 55(5), 2006, с. 503-514.
Непатентный документ 23. Cancer Immunol Immunother. 58(1), 2009, с. 95-109.
Непатентный документ 24. Protein Engineering, т.9, 1996, с. 617-621.
Непатентный документ 25. Nature Biotechnology, т.16, 1998, c. 677-681.
Краткое изложение сущности изобретения Задачи, положенные в основу изобретения
Настоящее изобретение было создано с учетом вышеуказанных обстоятельств. В основу настоящего изобретения была положена задача создать мультиспецифические антигенсвязывающие молекулы, которые обладают способностью приводить в контакт Т-клетки с раковыми клетками-мишенями и которые можно применять для лечения рака, используя цитотоксическую активность Т-клеток против раковых тканей-мишеней, которые содержат экспрессирующие глипикан 3 клетки, и представляют собой молекулярные форматы, которые можно получать с высокой эффективностью; разработать способы получения антигенсвязывающих молекул; и фармацевтические композиции, которые содержат антигенсвязывающие молекулы в качестве действующего вещества.
Средства решения указанных задач
При создании настоящего изобретения описана L-цепь, общая с доменом, который содержит вариабельную область связывающегося с глипиканом 3 антитела, и доменом, который содержит вариабельная область антитела, связывающегося с комплексом Т-клеточного рецептора, при этом общая L-цепь обладает способностью повышать аффинность к обоим антигенам. Это обеспечивает получение молекулярных форм с высокой эффективностью, и дополнительно описаны новые мультиспецифические антигенсвязывающие молекулы, которые сохраняют сильную противоопухолевую активность, характерную для перенаправляющих Т-клетки антител, таких как BiTE, и обладают очень хорошими характеристиками безопасности, не индуцируя цитокиновый шторм в зависимости от ракового антигена, а также обладают продолжительным временем полужизни в крови. Кроме того, при создании настоящего изобретения установлено, что мультиспецифические антигенсвязывающие молекулы, которые содержат общие Lцепи, нацелены на экспрессирующие глипикан 3 раковые клетки и вызывают повреждение клеток. На основе указанного открытия при создании настоящего изобретения установлено, что мультиспецифические антигенсвязывающие молекулы, предлагаемые в настоящем изобретении, вызывают повреждение раковых тканей, которые содержат экспрессирующие глипикан 3 раковые клетки.
Более конкретно, в настоящем изобретении предложено следующее.
1. Мультиспецифическая антигенсвязывающая молекула, которая содержит:
(1) домен, содержащий вариабельную область антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении глипикана 3, (2) домен, содержащий вариабельную область антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, и (3) домен, содержащий Fc-область с пониженной связывающей активностью в отношении Fcyрецептора, в которой вариабельные области L-цепи, содержащиеся в вариабельной области, указанной в подпункте (1), и в вариабельной области, указанной в подпункте (2), имеют общую аминокислотную последовательность; где мультиспецифическая антигенсвязывающая молекула обладает цитотоксической активностью, эквивалентной или более высокой по сравнению с активностью биспецифического антитела GPC3_ERY22_rCE115, которое содержит домен, связывающий глипикан 3, содержащий SEQ ID NO: 47 и 48, и домен, связывающий комплекс Т-клеточного рецептора, содержащий SEQ ID NO: 49 и 50.
2. Мультиспецифическая антигенсвязывающая молекула по п.1, цитотоксическая активность которой представляет собой зависимую от Т-клетки цитотоксическую активность.
3. Мультиспецифическая антигенсвязывающая молекула по п.1 или 2, в которой связывающая активность в отношении комплекса Т-клеточного рецептора представляет собой связывающую активность в отношении Т-клеточного рецептора.
4. Мультиспецифическая антигенсвязывающая молекула по одному из пп.1-3, в которой связывающая активность в отношении комплекса Т-клеточного рецептора представляет собой связывающую активность в отношении CD3ε-цепи.
5. Мультиспецифическая антигенсвязывающая молекула по одному из пп.1-4, в которой вариабельная область антитела, указанная в подпункте (1) в п.1, представляет собой вариабельную область антитела, которая содержит любую одну из комбинаций CDR1, CDR2 и CDR3 H-цепи, выбранную из указанных ниже в подпунктах (a1)-(a5), или функционально эквивалентную вариабельную область антитела:
- 4 041830 (al) CDR1, CDR2 и CDR3, идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и
CDR3-y4acTKoe, которые содержатся в SEQ ID NO: 40;
(a2) CDR1, CDR2 и CDR3, идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и
CDR3-yчастков, которые содержатся в SEQ ID NO: 197;
(а3) CDR1, CDR2 и CDR3, идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-yчастков, которые содержатся в SEQ ID NO: 206;
(а4) CDR1, CDR2 и CDR3, идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-yчастков, которые содержатся в SEQ ID NO: 211; и (а5) CDR1, CDR2 и CDR3, идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-yчастков, которые содержатся в SEQ ID NO: 215.
6. Мультиспецифическая антигенсвязывающая молекула по одному из пп.1-4, в которой вариабельная область антитела, указанная в подпункте (2) в п.1, представляет собой вариабельную область антитела, которая содержит любую одну из комбинаций аминокислотных последовательностей CDR1, CDR2 и CDR3 H-цепи, выбранную из указанных ниже в подпунктах (б1)-(б15), или функционально эквивалентную вариабельную область антитела:
(б1) CDR1, CDR2 и CDR3, идентичные аминокислотным последовательностям CDR3-yчастков, которые содержатся в SEQ ID NO: 52;
(б2) CDR1, CDR2 и CDR3, идентичные аминокислотным последовательностям CDR3-yчастков, которые содержатся в SEQ ID NO: 103;
(б3) CDR1, CDR2 и CDR3, идентичные аминокислотным последовательностям CDR3-yчастков, которые содержатся в SEQ ID NO: 122;
(б4) CDR1, CDR2 и CDR3, идентичные аминокислотным последовательностям CDR3-yчастков, которые содержатся в SEQ ID NO: 128;
(б5) CDR1, CDR2 и CDR3, идентичные аминокислотным последовательностям CDR3-yчастков, которые содержатся в SEQ ID NO: 129;
(б6) CDR1, CDR2 и CDR3, идентичные аминокислотным последовательностям CDR3-yчастков, которые содержатся в SEQ ID NO: 132;
(б7) CDR1, CDR2 и CDR3, идентичные аминокислотным последовательностям CDR3-yчастков, которые содержатся в SEQ ID NO: 142;
(б8) CDR1, CDR2 и CDR3, идентичные аминокислотным последовательностям CDR3-yчастков, которые содержатся в SEQ ID NO: 144;
(б9) CDR1, CDR2 и CDR3, идентичные аминокислотным последовательностям CDR3-yчастков, которые содержатся в SEQ ID NO: 164;
(б10) CDR1, CDR2 и CDR3, идентичные аминокислотным последовательностям CDR3-yчастков, которые содержатся в SEQ ID NO: 168;
(б11) CDR1, CDR2 и CDR3, идентичные аминокислотным последовательностям CDR3-yчастков, которые содержатся в SEQ ID NO: 421;
(б12) CDR1, CDR2 и CDR3, идентичные аминокислотным последовательностям CDR3-yчастков, которые содержатся в SEQ ID NO: 424;
(б13) CDR1, CDR2 и CDR3, идентичные аминокислотным последовательностям CDR3-yчастков, которые содержатся в SEQ ID NO: 426;
(б14) CDR1, CDR2 и CDR3, идентичные аминокислотным последовательностям CDR3-yчастков, которые содержатся в SEQ ID NO: 429; и (б15) CDR1, CDR2 и CDR3, идентичные аминокислотным последовательностям CDR3-yчастков, которые содержатся в SEQ ID NO: 430.
CDR1-, CDR2CDR1-, CDR2CDR1-, CDR2CDR1-, CDR2CDR1-, CDR2CDR1-, CDR2CDR1-, CDR2CDR1-, CDR2CDR1-, CDR2CDR1-, CDR2CDR1-, CDR2CDR1-, CDR2CDR1-, CDR2CDR1-, CDR2CDR1-, CDR2и и
и и
и и
и и
и и
и и
и и и
7. Мультиспецифическая антигенсвязывающая молекула по одному из пп.1-4, в которой вариабельные области антитела, указанные в подпунктах (1) и (2) в п.1, представляют собой вариабельные области антитела, которые содержат любую одну из комбинаций CDR1, CDR2 и CDR3 H-цепи, выбранную из указанных ниже в подпунктах (в1)-(в19), или функционально эквивалентные вариабельные области ан титела:
(в1 ) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 40; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-yчастков, которые содержатся в SEQ ID NO: 52;
(в2 ) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 40; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-yчастков, которые содержатся в SEQ ID NO: 421;
(в3) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков,
- 5 041830 которые содержатся в SEQ ID NO: 40; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям
CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 426;
(в4) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 40; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 429;
(в5) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 40; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 430;
(в6) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 197; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 128;
(в7) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 206; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 142;
(в8) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 206; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 144;
(в9) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 206; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 164;
(в10 ) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 206; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 168;
(в 11) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 211; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 142;
(в12 ) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 211; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 144;
(в13 ) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 211; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 164;
(в14 ) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 211; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 168;
(в15 ) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 215; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последова-
- 6 041830 тельностям CDR1-, CDR2- и CDR3-y4acTKoe, которые содержатся в SEQ ID NO: 103;
(в16 ) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 215; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-yчастков, которые содержатся в SEQ ID NO: 122;
(в17 ) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 215; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-yчастков, которые содержатся в SEQ ID NO: 129;
(в18 ) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 215; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-yчастков, которые содержатся в SEQ ID NO: 132; и (в19 ) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 215; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-yчастков, которые содержатся в SEQ ID NO: 424.
8. Мультиспецифическая антигенсвязывающая молекула по одному из пп.5-7, в которой CDR1, CDR2 и CDR3 представляют собой CDR1-, CDR2- и CDR3-yчастки, определенные на основе нумерации по Кэботу.
9. Мультиспецифическая антигенсвязывающая молекула по одному из пп.1-4, в которой вариабельная область антитела, указанная в подпункте (1) в п.1, представляет собой вариабельную область антитела, которая содержит любую одну из вариабельных областей H-цепи, выбранную из указанных ниже в подпунктах (a1)-(a5), или функционально эквивалентную вариабельную область антитела:
(a1) вариабельная область H-цепи, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 40;
(а2) вариабельная область H-цепи, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 197;
(а3) вариабельная область H-цепи, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 206;
(а4) вариабельная область H-цепи, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 211; и (а5) вариабельная область H-цепи, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 215.
10. Мультиспецифическая антигенсвязывающая молекула по одному из пп.1-4, в которой вариабельная область антитела, указанная в подпункте (2) в п.1, представляет собой вариабельную область антитела, которая содержит любую одну из вариабельных областей H-цепи, выбранную из указанных ниже в подпунктах (б1)-(б15), или функционально эквивалентную вариабельную область антитела:
(б1) вариабельная область H-цепи, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52;
(б2) вариабельная область H-цепи, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 103;
(б3) вариабельная область H-цепи, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 122;
(б4) вариабельная область H-цепи, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 128;
(б5) вариабельная область H-цепи, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 129;
(б6) вариабельная область H-цепи, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 132;
(б7) вариабельная область H-цепи, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 142;
(б8) вариабельная область H-цепи, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 144;
(б9) вариабельная область H-цепи, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 164;
(б10) вариабельная область H-цепи, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 168;
- 7 041830 (б11) вариабельная NO: 421;
(612) вариабельная NO: 424;
(613) вариабельная NO: 426;
(б14) вариабельная NO: 429; и (б15) вариабельная NO: 430.
область H-цепи, которая область H-цепи, которая область H-цепи, которая область H-цепи, которая область H-цепи, которая имеет аминокислотную имеет аминокислотную имеет аминокислотную имеет аминокислотную имеет аминокислотную последовательность SEQ ID последовательность SEQ ID последовательность SEQ ID последовательность SEQ ID последовательность SEQ ID
11. Мультиспецифическая антигенсвязывающая молекула по одному из пп.1-4, в которой вариабельные области антитела, указанные в подпунктах (1) и (2) в п.1, представляют собой вариабельные области антитела, которые содержат любую одну из комбинацией вариабельных областей H-цепи, выбранную из указанных ниже в подпунктах (в1)-(в19), или функционально эквивалентные вариабельные области антитела:
(в1) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 40; и вариабельная область Н-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 52;
(в2) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 40; и вариабельная область Н-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 421;
(в3) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 40; и вариабельная область Н-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 426;
(в4) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 40; и вариабельная область Н-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 429;
(в5) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 40; и вариабельная область Н-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 430;
(в6) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 197; и вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 128;
(в7) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 206; и вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 142;
(в8) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 206; и вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 144;
(в9) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 206; и вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 164;
(в10) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 206; и вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 168;
(в11) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 211; и вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 142;
(в12) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 211; и вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте
- 8 041830 (2) в п.1, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 144;
(в13) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 211; и вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 164;
(в14) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 211; и вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 168;
(в15) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 215; и вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 103;
(в16) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 215; и вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 122;
(в17) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 215; и вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 129;
(в18) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 215; и вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 132; и (в19) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 215; и вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 424.
12. Мультиспецифическая антигенсвязывающая молекула по одному из пп.1-11, в которой общая Lцепь, указанная в п.1, представляет собой общую L-цепь, которая содержит любую одну из комбинаций CDR1, CDR2 и CDR3, выбранную из указанных ниже в подпунктах (г1)-(г11), или функциональный эквивалент общей L-цепи:
(г1) CDR1, CDR2 и CDR3, идентичные аминокислотным CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 53;
(г2) CDR1, CDR2 и CDR3, идентичные аминокислотным CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 223;
(г3) CDR1, CDR2 и CDR3, идентичные аминокислотным CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 299;
(г4) CDR1, CDR2 и CDR3, идентичные аминокислотным CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 301;
(г5) CDR1, CDR2 и CDR3, идентичные аминокислотным CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 302;
(г6) CDR1, CDR2 и CDR3, идентичные аминокислотным CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 304;
(г7) CDR1, CDR2 и CDR3, идентичные аминокислотным CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 306;
(г8) CDR1, CDR2 и CDR3, идентичные аминокислотным CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 307;
(г9) CDR1, CDR2 и CDR3, идентичные аминокислотным CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 309;
(г10) CDR1, CDR2 и CDR3, идентичные аминокислотным CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 310; и (г11) CDR1, CDR2 и CDR3, идентичные аминокислотным CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 319.
последовательностям последовательностям последовательностям последовательностям последовательностям последовательностям последовательностям последовательностям последовательностям последовательностям последовательностям
CDR1-, CDR2CDR1-, CDR2CDR1-, CDR2CDR1-, CDR2CDR1-, CDR2CDR1-, CDR2CDR1-, CDR2CDR1-, CDR2CDR1-, CDR2CDR1-, CDR2CDR1-, CDR2и и
и и
и и
и и
и и и
13. Мультиспецифическая антигенсвязывающая молекула по одному из пп.1-11, в котором вариа бельная область L-цепи, указанная в п.1, представляет собой вариабельную область любой одной из аминокислотных последовательностей L-цепи, выбранных из указанных ниже в подпунктах (г1)-(г11):
(г1) L-цепь, содержащая аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 53;
(г2) L-цепь, содержащая аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 223;
(г3) L-цепь, содержащая аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 299;
(г4) L-цепь, содержащая аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 301;
- 9 041830 (г5) L-цепь, содержащая аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 302;
(г6) L-цепь, содержащая аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 304;
(г7) L-цепь, содержащая аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 306;
(г8) L-цепь, содержащая аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 307;
(г9) L-цепь, содержащая аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 309;
(г10) L-цепь, содержащая аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 310; и (г11) L-цепь, содержащая аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 319.
14. Мультиспецифическая антигенсвязывающая молекула по одному из пп.1-4, в которой вариабельные области антитела, указанные в подпунктах (1) и (2) в п.1, и вариабельная область общей L-цепи представляют собой вариабельные области антитела, содержащие любую одну из комбинаций CDR1, CDR2 и CDR3 H-цепи и CDR1, CDR2 и CDR3 L-цепи, выбранную из указанных ниже в подпунктах (д1)(д25), или функционально эквивалентные вариабельные области антитела:
(д1) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 197; CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 128; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области общей L-цепи антитела, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 53;
(д2) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 197; CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 128; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области общей L-цепи антитела и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 299;
(д3) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 197; CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 128; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области общей L-цепи антитела, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 310;
(д4) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 197; CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 128; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области общей L-цепи антитела, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 319;
(д5) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 206; CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 142; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области общей L-цепи антитела, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 223;
(д6) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 206; CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 144; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области общей L-цепи антитела, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 223;
(д7) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 206; CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 164; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области общей L-цепи антитела, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 223;
(д8) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в под
- 10 041830 пункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 206; CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 168; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области общей L-цепи антитела, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 223;
(д9) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 211; CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 142; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области общей L-цепи антитела, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 223;
(д10) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 211; CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 142; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области общей L-цепи антитела, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 299;
(д11) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 211; CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 144; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области общей L-цепи антитела, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 223;
(д12) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 211; CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 164; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области общей L-цепи антитела, и идентичные аминокислотным последовательностям SEQ ID NO: 223;
(д13) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 211; CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 168; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области общей L-цепи антитела, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 223;
(д14) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 215; CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 103; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области общей L-цепи антитела, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 53;
(д15) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 215; CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 103; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области общей L-цепи антитела, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 299;
(д16) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 215; CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 103; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области общей L-цепи антитела, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 301;
- 11 041830 (д17) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 215; CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 103; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области общей L-цепи антитела, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 302;
(д18) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 215; CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 103; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области общей L-цепи антитела, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 304;
(д19) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 215; CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 103; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области общей L-цепи антитела, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 306;
(д20) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 215; CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 103; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области общей L-цепи антитела, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 307;
(д21) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 215; CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 103; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области общей L-цепи антитела, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 309;
(д22) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 215; CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 122; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области общей L-цепи антитела, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 53;
(д23) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 215; CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 129; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области общей L-цепи антитела, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 53;
(д24) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 215; CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 132; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области общей L-цепи антитела, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 53; и (д25) CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 215; CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентичные аминокислотным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-участков, которые содержатся в SEQ ID NO: 424; и CDR1, CDR2 и CDR3, которые содержатся в вариабельной области общей L-цепи антитела, и идентичные аминокислот- 12 041830 ным последовательностям CDR1-, CDR2- и CDR3-y4acTKoe, которые содержатся в SEQ ID NO: 53.
15. Мультиспецифическая антигенсвязывающая молекула по одному из пп.1-4, в которой вариабельные области антитела, указанные в подпунктах (1) и (2) в п.1, и вариабельная область общей L-цепи представляют собой вариабельные области антитела, содержащие любую одну из комбинаций вариабельных областей, выбранные из указанных ниже в подпунктах (e1)-(e26), или функционально эквивалентные вариабельные области антитела:
(e1) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 197; вариабельная область Н-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 128; и вариабельная область общей L-цепи антитела, идентичная аминокислотной последовательности вариабельной области, которая содержится в SEQ ID NO: 53;
(е2) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 197; вариабельная область Н-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 128; и вариабельная область общей L-цепи антитела, идентичная аминокислотной последовательности вариабельной области, которая содержится в SEQ ID NO: 299;
(е3) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 197; вариабельная область Н-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 128; и вариабельная область общей L-цепи антитела, идентичная аминокислотной последовательности вариабельной области, которая содержится в SEQ ID NO: 310;
(е4) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 197; вариабельная область Н-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 128; и вариабельная область общей L-цепи антитела, идентичная аминокислотной последовательности вариабельной области, которая содержится в SEQ ID NO: 319;
(е5) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 206; вариабельная область Н-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 142; и вариабельная область общей L-цепи антитела, идентичная аминокислотной последовательности вариабельной области, которая содержится в SEQ ID NO: 223;
(е6) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 206; вариабельная область Н-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 144; и вариабельная область общей L-цепи антитела, идентичная аминокислотной последовательности вариабельной области, которая содержится в SEQ ID NO: 223;
(е7) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 206; вариабельная область Н-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 164; и вариабельная область общей L-цепи антитела, идентичная аминокислотной последовательности вариабельной области, которая содержится в SEQ ID NO: 223;
(е8) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 206; вариабельная область Н-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 168; и вариабельная область общей L-цепи антитела, идентичная аминокислотной последовательности вариабельной области, которая содержится в SEQ ID NO: 223;
(е9) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 211; вариабельная область Н-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 142; и вариабельная область общей L-цепи антитела, идентичная аминокислотной последовательности вариабельной области, которая содержится в SEQ ID NO: 223;
(е10 ) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 211; вариабель-
- 13 041830 ная область Н-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в
п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 142; и вариабельная область общей Lцепи антитела, идентичная аминокислотной последовательности вариабельной области, которая содержится в SEQ ID NO: 299;
(e11 ) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 211; вариабельная область Н-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 144; и вариабельная область общей Lцепи антитела, идентичная аминокислотной последовательности вариабельной области, которая содержится в SEQ ID NO: 223;
(e12 ) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 211; вариабельная область Н-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 164; и вариабельная область общей Lцепи антитела, идентичная аминокислотной последовательности вариабельной области, которая содержится в SEQ ID NO: 223;
(е13 ) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 211; вариабельная область Н-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 168; и вариабельная область общей Lцепи антитела, идентичная аминокислотной последовательности вариабельной области, которая содержится в SEQ ID NO: 223;
(e14 ) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 215; вариабельная область Н-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 103; и вариабельная область общей Lцепи антитела, идентичная аминокислотной последовательности вариабельной области, которая содержится в SEQ ID NO: 53;
(e15 ) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 215; вариабельная область Н-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 103; и вариабельная область общей Lцепи антитела, идентичная аминокислотной последовательности вариабельной области, которая содержится в SEQ ID NO: 299;
(e16 ) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 215; вариабельная область Н-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 103; и вариабельная область общей Lцепи антитела, идентичная аминокислотной последовательности вариабельной области, которая содержится в SEQ ID NO: 301;
(e17 ) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 215; вариабельная область Н-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 103; и вариабельная область общей Lцепи антитела, идентичная аминокислотной последовательности вариабельной области, которая содержится в SEQ ID NO: 302;
(e18 ) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 215; вариабельная область Н-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 103; и вариабельная область общей Lцепи антитела, идентичная аминокислотной последовательности вариабельной области, которая содержится в SEQ ID NO: 304;
(e19 ) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 215; вариабельная область Н-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 103; и вариабельная область общей Lцепи антитела, идентичная аминокислотной последовательности вариабельной области, которая содержится в SEQ ID NO: 306;
(е20 ) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 215; вариабельная область Н-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 103; и вариабельная область общей L-
- 14 041830 цепи антитела, идентичная аминокислотной последовательности вариабельной области, которая содержится в SEQ ID NO: 307;
(е21 ) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 215; вариабельная область Н-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 103; и вариабельная область общей Lцепи антитела, идентичная аминокислотной последовательности вариабельной области, которая содержится в SEQ ID NO: 309;
(е22 ) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 215; вариабельная область Н-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 122; и вариабельная область общей Lцепи антитела, идентичная аминокислотной последовательности вариабельной области, которая содержится в SEQ ID NO: 53;
(е23 ) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 215; вариабельная область Н-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 129; и вариабельная область общей Lцепи антитела, идентичная аминокислотной последовательности вариабельной области, которая содержится в SEQ ID NO: 53;
(е24 ) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 215; вариабельная область Н-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 132; и вариабельная область общей Lцепи антитела, идентичная аминокислотной последовательности вариабельной области, которая содержится в SEQ ID NO: 53;
(е25 ) вариабельная область H-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (1) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 215; вариабельная область Н-цепи, которая содержится в вариабельной области антитела, указанной в подпункте (2) в п.1, и идентична аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 424; и вариабельная область общей Lцепи антитела, идентичная аминокислотной последовательности вариабельной области, которая содержится в SEQ ID NO: 53; и (е26 ) мультиспецифическая антигенсвязывающая молекула, которая связывается с эпитопом, перекрывающимся с каждым из эпитопов глипикана 3, и комплекса Т-клеточного рецептора, который связывается мультиспецифической антигенсвязывающей молекулой, указанной в одном из подпунктов (e1)(e25), и которая имеет общую L-цепь.
16. Мультиспецифическая антигенсвязывающая молекула по одному из пп.1-15, в которой Fcобласть, указанная в подпункте (3) в п.1, представляет собой Fc-область с аминокислотной мутацией любой из образующих Fc-область аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 23-26 (IgG1-IgG4).
17. Мультиспецифическая антигенсвязывающая молекула по п.16, в которой Fc-область, указанная в подпункте (3) в п.1, представляет собой Fc-область с мутацией по меньшей мере одной аминокислоты, выбранной из аминокислот в следующих аминокислотных положениях, указанных согласно EUнумерации: положение 220, положение 226, положение 229, положение 231, положение 232, положение 233, положение 234, положение 235, положение 236, положение 237, положение 238, положение 239, положение 240, положение 264, положение 265, положение 266, положение 267, положение 269, положение 270, положение 295, положение 296, положение 297, положение 298, положение 299, положение 300, положение 325, положение 327, положение 328, положение 329, положение 330, положение 331 и положение 332.
18. Мультиспецифическая антигенсвязывающая молекула по п.16, в которой Fc-область, указанная в подпункте (3) в п.1, представляет собой Fc-область, которая содержит по меньшей мере одну аминокислоту, выбранную из указанных ниже аминокислот, согласно EU-нумерации: Arg в аминокислотном положении 234, Ala или Arg в аминокислотном положении 235, Lys в аминокислотном положении 239 и Ala в аминокислотном положении 297.
19. Мультиспецифическая антигенсвязывающая молекула по одному из пп.16-18, в которой Fcобласть, указанная в подпункте (3) в п.1, дополнительно содержит аминокислотную мутацию, усиливающую образование гетеродимерной Fc-области.
20. Мультиспецифическая антигенсвязывающая молекула по п.19, в котором гетеродимерная Fcобласть представляет собой указанную ниже комбинацию (ж1) или (ж2) аминокислотных последовательностей:
(ж1) комбинация аминокислотной последовательности, идентичной константной области Fcобласти, которая содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 57, и аминокислотной последовательности, идентичной константной области Fc-области, которая содержит аминокислотную по- 15 041830 следовательность SEQ ID NO: 58; и (ж2) комбинация аминокислотной последовательности, идентичной константной области Fcобласти, которая содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60 или 62, и аминокислотной последовательности, идентичной константной области Fc-области, которая содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61.
21. Мультиспецифическая антигенсвязывающая молекула по одному из пп.1-20, где мультиспецифическая антигенсвязывающая молекула представляет собой биспецифическое антитело.
22. Биспецифическое антитело по одному из указанных ниже подпунктов (з1)-(з25):
(з1) биспецифическое антитело, имеющее H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении глипикана 3, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 215, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 424, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60 или 62; и общую L-цепь антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 53;
(з2) биспецифическое антитело, имеющее H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении глипикана 3, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 215, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 103, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60 или 62; и общую L-цепь антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 53;
(з3) биспецифическое антитело, имеющее H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении глипикана 3, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 215, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 103, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60 или 62; и общую L-цепь антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 299;
(з4) биспецифическое антитело, имеющее H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении глипикана 3, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 215, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 103, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60 или 62; и общую L-цепь антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 301;
(з5) биспецифическое антитело, имеющее H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении глипикана 3, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 215, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 103, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60 или 62; и общую L-цепь антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 302;
(з6) биспецифическое антитело, имеющее H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении глипикана 3, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 215, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 103, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60 или 62; и общую L-цепь антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 304;
(з7) биспецифическое антитело, имеющее H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении глипикана 3, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 215, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 103, и константную область, кото-
- 16 041830 рая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60 или 62; и общую L-цепь антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 306;
(з8) биспецифическое антитело, имеющее H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении глипикана 3, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 215, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 103, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60 или 62; и общую L-цепь антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 307;
(з9) биспецифическое антитело, имеющее H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении глипикана 3, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 215, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 103, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60 или 62; и общую L-цепь антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 309;
(з10) биспецифическое антитело, имеющее H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении глипикана 3, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 215, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 122, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60 или 62; и общую L-цепь антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 53;
(з11) биспецифическое антитело, имеющее H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении глипикана 3, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 215, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 129, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60 или 62; и общую L-цепь антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 53;
(з12) биспецифическое антитело, имеющее H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении глипикана 3, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 215, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 132, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60 или 62; и общую L-цепь антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 53;
(з13) биспецифическое антитело, имеющее H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении глипикана 3, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 197, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 128, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60 или 62; и общую L-цепь антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 299;
(з14) биспецифическое антитело, имеющее H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении глипикана 3, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 197, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 128, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60 или 62; и общую L-цепь антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 310;
(з15) биспецифическое антитело, имеющее H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении глипикана 3, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 197, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; H-цепь антитела, которая обладает связывающей активно-
- 17 041830 стью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 128, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60 или 62; и общую L-цепь антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 319;
(з16) биспецифическое антитело, имеющее H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении глипикана 3, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 197, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 128, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60 или 62; и общую L-цепь антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 53;
(з17) биспецифическое антитело, имеющее H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении глипикана 3, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 211, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 142, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60 или 62; и общую L-цепь антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 299;
(з18) биспецифическое антитело, имеющее H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении глипикана 3, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 211, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 142, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60 или 62; и общую L-цепь антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 223;
(з19) биспецифическое антитело, имеющее H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении глипикана 3, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 211, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 144, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60 или 62; и общую L-цепь антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 223;
(з20) биспецифическое антитело, имеющее H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении глипикана 3, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 206, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 144, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60 или 62; и общую L-цепь антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 223;
(з21) биспецифическое антитело, имеющее H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении глипикана 3, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 206, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 142, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60 или 62; и общую L-цепь антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 223;
(з22) биспецифическое антитело, имеющее H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении глипикана 3, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 206, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 164, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60 или 62; и общую L-цепь антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 223;
(з23) биспецифическое антитело, имеющее H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении глипикана 3, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет
- 18 041830 аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 206, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 168, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60 или 62; и общую L-цепь антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 223;
(з24) биспецифическое антитело, имеющее H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении глипикана 3, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 211, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 164, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60 или 62; и общую L-цепь антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 223; и (з25) биспецифическое антитело, имеющее H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении глипикана 3, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 211, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, содержащую вариабельную область H-цепи антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 168, и константную область, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60 или 62; и общую L-цепь антитела, которая имеет аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 223.
23. Нуклеиновая кислота, которая кодирует мультиспецифическую антигенсвязывающую молекулу по одному из пп.1-20 или биспецифическое антитело по п.21 или 22.
24. Вектор, в который интродуцирована нуклеиновая кислота по п.23.
25. Клетка, содержащая нуклеиновую кислоту по п.23 или вектор по п.24.
26. Способ получения мультиспецифической антигенсвязывающей молекулы по одному из пп.1-20 или биспецифического антитела по п.21 или 22, заключающийся в том, что культивируют клетку по п.25.
27. Мультиспецифическая антигенсвязывающая молекула или биспецифическое антитело, полученная/полученное способом по п.26.
28. Фармацевтическая композиция, содержащая мультиспецифическую антигенсвязывающую молекулу по одному из пп.1-20 или биспецифическое антитело по п.21 или 22 и фармацевтически приемлемый носитель.
29. Фармацевтическая композиция по п.28, которая индуцирует цитотоксичность.
30. Фармацевтическая композиция по п.29, где цитотоксичность представляет собой зависимую от Т-клеток цитотоксичность.
31. Фармацевтическая композиция по п.28, которая предназначена для введения пациенту, нуждающемуся в этом, мультиспецифической антигенсвязывающей молекулы по одному из пп.1-20 или биспецифического антитела по п.21 или 22.
Настоящее изобретение относится также к набору, предназначенному для применения в способе, предлагаемом в настоящем изобретении, который содержат мультиспецифическую антигенсвязывающую молекулу, предлагаемую в настоящем изобретении, или мультиспецифическую антигенсвязывающую молекулу, полученную с помощью способа, предлагаемого в настоящем изобретении. Настоящее изобретение относится также к применению мультиспецифической антигенсвязывающей молекулы, предлагаемой в настоящем изобретении, или мультиспецифической антигенсвязывающей молекулы, полученной с помощью способа, предлагаемого в настоящем изобретении, для приготовления фармацевтической композиции для активации цитотоксической активности. Настоящее изобретение относится также к мультиспецифической антигенсвязывающей молекуле, предлагаемой в настоящем изобретении, или мультиспецифической антигенсвязывающей молекуле, полученной с помощью способа, предлагаемого в настоящем изобретении, для применения в способе, предлагаемом в настоящем изобретении. В контексте настоящего описания мультиспецифические антигенсвязывающие молекулы включают биспецифические антитела, предлагаемые в настоящем изобретении.
Кроме того, настоящее изобретение относится к мультиспецифической антигенсвязывающей молекуле, которая содержит следующие домены:
(1) домен, содержащий вариабельную область антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении глипикана 3, (2) домен, содержащий вариабельную область антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора;
в которой вариабельные области L-цепи, входящие в вариабельные области, указанные в подпунктах (1) и (2), имеют общую аминокислотную последовательность. Настоящее изобретение относится также к домену, указанному в подпункте (1), который более конкретно представляет собой домен, содержащий вариабельные области тяжелой цепи и/или легкой цепи антитела, которые обладают связы
- 19 041830 вающей активностью в отношении глипикана 3, и которые входит в состав мультиспецифической антигенсвязывающей молекулы. Настоящее изобретение относится также к домену, указанному в подпункте (2), который более конкретно представляет собой домен, содержащий вариабельную область антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, и который входит в состав мультиспецифической антигенсвязывающей молекулы. Компоненты доменов, указанных в подпунктах (1) и (2), могут включать указанные выше в пп.1-22. Мультиспецифическая антигенсвязывающая молекула может представлять собой биспецифическое антитело. Кроме того, мультиспецифическая антигенсвязывающая молекула может содержать домен, включающий Fc-область и Fc-область может обладать пониженной активностью в отношении связывания Fcγ-рецептора. Компоненты домена, содержащего Fc-область, могут включать указанные выше в пп.1-22. Настоящее изобретение относится к нуклеиновой кислоте, кодирующей мультиспецифическую антигенсвязывающую молекулу или домены, вектору, в который интродуцирована нуклеиновая кислота, клетке, которая содержит нуклеиновую кислоту или вектор, способу получения мультиспецифической антигенсвязывающей молекулы, заключающемуся в том, что культивируют клетки, и мультиспецифической антигенсвязывающей молекуле или доменам, которые содержат вариабельную область антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении глипикана 3 или связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, полученным с помощью способа. Кроме того, настоящее изобретение относится к фармацевтической композиции, содержащей мультиспецифическую антигенсвязывающую молекулу и фармацевтически приемлемый носитель. Фармацевтическая композиция может индуцировать повреждение клеток, повреждение клеток может быть обусловлено зависимой от Т-клеток клеточной цитотоксичностью, и композицию можно вводить пациенту, который нуждается в применении мультиспецифической антигенсвязывающей молекулы.
Настоящее изобретение относится также к мультиспецифической антигенсвязывающей молекуле, которая связывается с эпитопами, перекрывающимися и/или конкурирующими с эпитопами и глипикана 3, и комплекса Т-клеточного рецептора, связывающимися мультиспецифической антигенсвязывающей молекулой, указанной выше в одном из подпунктов (д1)-(д25) в п.14, мультиспецифической антигенсвязывающей молекуле, которая связывается с эпитопами, перекрывающимися и/или конкурирующими с эпитопами и глипикана 3, и комплекса Т-клеточного рецептора, связывающимися мультиспецифической антигенсвязывающей молекулой, указанной выше в одном из подпунктов (e1)-(e25) в п.15.
Касательно двух Fc-областей, описанных выше в подпунктах (ж1) и (ж2) в п.20, первая Fc-область может быть включена в H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении глипикана 3, а вторая Fc-область может быть включена в H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора; или первая Fc-область может быть включена в H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Тклеточного рецептора, а вторая Fc-область может быть включена в H-цепь антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении глипикана 3.
Эффекты изобретения.
В настоящем изобретении предложены новые мультиспецифические антигенсвязывающие молекулы, имеющие молекулярные формы, которые можно получать с высокой эффективностью, которые сохраняют сильную противоопухолевую активность, характерную для BiTE, и очень хорошие характеристики безопасности, что приводит к отсутствию индукции независимого от ракового антигена цитокинового шторма и т.п., и обладают длительным временем полужизни в крови. Фармацевтические композиции, которые активируют цитотоксическую активность, содержащие в качестве действующего вещества мультиспецифическую антигенсвязывающую молекулу, предлагаемую в настоящем изобретении, направленно воздействуют на раковые ткани, которые содержат экспрессирующие глипикан 3 раковые клетки, вызывая повреждение клеток, и их можно применять для лечения или предупреждения различных видов рака. Изобретение обеспечивает требуемое лечения, которое не только обладает высоким уровнем безопасности, но и снижает физическую нагрузку на пациентов и является очень удобным для пациентов.
Краткое описание чертежей
На чертежах показано:
на фиг 1 - схематическая диаграмма a: ERY22 и б: ERY27;
на фиг. 2 - график, иллюстрирующий цитотоксическую активность GPC3_ERY22_rCE115 и GPC3_ERY27_hCE115 при применении в качестве клетки-мишени NCI-H446. Закрашенными ромбами (♦) и закрашенными треугольниками (▲) обозначена цитотоксическая активность GPC3_ERY22_rCE115 и GPC3_ERY27_hCE115 соответственно;
на фиг. 3 - график, иллюстрирующий цитотоксическую активность GPC3_ERY22_rCE115 и GPC3_ERY27_hCE115 при применении в качестве клетки-мишени РС-10. Закрашенными ромбами (♦) и закрашенными треугольниками (▲) обозначена цитотоксическая активность GPC3_ERY22_rCE115 и GPC3_ERY27_hCE115 соответственно;
на фиг. 4 - график, иллюстрирующий цитотоксическую активность оптимизированных антител при
- 20 041830 применении в качестве клетки-мишени NCI-H446;
на фиг. 5 - график, иллюстрирующий цитотоксическую активность оптимизированных антител при применении в качестве клетки-мишени NCI-H446;
на фиг. 6 - график, иллюстрирующий цитотоксическую активность оптимизированных антител при применении в качестве клетки-мишени NCI-H446;
на фиг. 7 - график, иллюстрирующий цитотоксическую активность оптимизированных антител при применении в качестве клетки-мишени NCI-H446;
на фиг. 8 - график, иллюстрирующий цитотоксическую активность оптимизированных антител при применении в качестве клетки-мишени NCI-H446;
на фиг. 9 - график, иллюстрирующий цитотоксическую активность оптимизированных антител при применении в качестве клетки-мишени NCI-H446;
на фиг. 10 - данные о противоопухолевой активности in vivo оптимизированных антител при применении в качестве клетки-мишени PC-10;
на фиг. 11 - данные о противоопухолевой активности in vivo оптимизированных антител при применении в качестве клетки-мишени NCI-H446;
на фиг. 12 - зависимость между аминокислотными остатками, образующими Fc-области IgG1, IgG2, IgG3 и IgG4, и системой нумерации EU по Кэботу (обозначена в контексте настоящего описания как EUиндекс);
на фиг. 13-1 - последовательности вариабельных областей тяжелой цепи и их нумерация согласно Кэботу с соавт.;
на фиг. 13-2 - последовательности вариабельных областей тяжелой цепи и их нумерация согласно Кэботу с соавт.;
на фиг. 14 - последовательности вариабельных областей легкой цепи и их нумерация согласно Кэботу с соавт.
Варианты осуществления изобретения
Представленные ниже определения даны с целью облегчения понимания настоящего изобретения. Антитело.
В контексте настоящего описания антитело относится к встречающемуся в естественных условиях иммуноглобулину или иммуноглобулину, полученному полностью или частично путем синтеза. Антитела можно выделять из встречающихся в естественных условиях источников, таких как встречающиеся в естественных условиях плазма и сыворотка, или из супернатантов культур продуцирующих антитела гибридом. Альтернативно этому, антитела можно частично или полностью синтезировать с использованием таких методик, как генетическая рекомбинация. Предпочтительными антителами являются, например, антитела, принадлежащие к какому-либо изотипу иммуноглобулинов или его подклассу. Известные человеческие иммуноглобулины включают антитела следующих девяти классов (изотипов): IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1, IgA2, IgD, IgE и IgM. Из этих изотипов к антителам, предлагаемым в изобретении, относятся IgG1, IgG2, IgG3 и IgG4.
Методы получения антитела с требуемой связывающей активностью известны специалистам в данной области. Ниже представлен пример, в котором описан метод получения антитела (антитело к GPC3), связывающегося с глипиканом-3 (ниже в настоящем описании обозначен как GPC3), который принадлежит к семейству GPI-заякоренных рецепторов (Int J Cancer. 103(4), 2003, с. 455-465). Согласно описанному ниже примеру можно получать также антитела, которые связываются с комплексом Т-клеточного рецептора.
Антитела к GPC3 можно получать в виде поликлональных или моноклональных антител с помощью известных методов. Антитела к GPC3 предпочтительно получали в виде моноклональных антител, происходящих из организма млекопитающих. Указанные происходящие из организма млекопитающих антитела включают антитела, полученные с помощью гибридом или клеток-хозяев, трансформированных экспрессионным вектором, который несет ген антитела, с помощью методов генетической инженерии.
Гибридомы, продуцирующие моноклональные антитела, можно получать с использованием известных методов, например, описанных ниже. В частности, млекопитающих иммунизируют с помощью общепринятых методов иммунизации, используя белок GPC3 в качестве сенсибилизирующего антигена. Образовавшиеся иммунные клетки сливают с известными родительскими клетками с помощью общепринятых методов слияния. Затем гибридомы, продуцирующие антитело к GPC3, можно отбирать путем скрининга в отношении продуцирующих моноклональные антитела клеток с помощью общепринятых методов скрининга.
В частности, моноклональные антитела получают согласно описанному ниже методу. Сначала ген GPC3, нуклеотидная последовательность которого представлена в RefSeq под регистрационным номером NM_001164617.1 (SEQ ID NO: 1), можно экспрессировать с получением белка GPC3, последовательность которого представлена в RefSeq под регистрационным номером NP001158089.1 (SEQ ID NO: 2), который можно применять в качестве сенсибилизирующего антигена для получения антитела. Для этого генную последовательность, кодирующую GPC3, встраивают в известный экспрессионный вектор и соответст- 21 041830 вующие клетки-хозяева трансформируют этим вектором. Требуемый человеческий белок GPC3 очищают из клеток-хозяев или супернатантов культур с помощью известных методов. Например, для получения растворимого GPC3 из супернатантов культур удаляют путем делеции аминокислоты в положениях 564580, которые формируют гидрофобную область, соответствующую GPI-заякоривающей последовательности, применяемой для заякоривания GPC3 на клеточной мембране, из полипептидной последовательности GPC3 SEQ ID NO: 2, а затем образовавшийся белок экспрессируют вместо белка GPC3, имеющего SEQ ID NO: 2. В альтернативном варианте в качестве сенсибилизирующего антигена можно применять очищенный встречающийся в естественных условиях белок GPC3.
Очищенный белок GPC3 можно применять в качестве сенсибилизирующего антигена для иммунизации млекопитающих. В качестве сенсибилизирующих антигенов можно применять также неполные пептиды GPC3. В этом случае неполные пептиды можно получать химическим синтезом на основе аминокислотной последовательности человеческого GPC3. Кроме того, их можно получать также путем встраивания части гена GPC3 в экспрессионный вектор и осуществлять экспрессию в нем. Кроме того, их можно получать путем расщепления белка GPC3 протеазой, однако конкретный вариант осуществления изобретения не накладывает ограничения на длину и область пептида GPC3, применяемого в качестве неполного пептида. В качестве предпочтительной области можно выбирать любую последовательность из аминокислотной последовательности, которая соответствует аминокислотам в положениях 524563, или более предпочтительно любую последовательность из аминокислотной последовательности, которая соответствует аминокислотам в положениях 537-563 в аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 2. Предпочтительно можно выбирать любую последовательность из аминокислотной последовательности области, не содержащую аминокислотную последовательность, которая соответствует аминокислотам в положениях 550-663 в аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 2. Предпочтительно можно выбирать любую последовательность, соответствующую положениям 544-553, и более предпочтительно можно выбирать любую последовательность из аминокислотной последовательности, соответствующей положениям 546-551, в аминокислотной последовательности SEQ ID NO: 2. Количество аминокислот, образующих пептид, который можно применять в качестве сенсибилизирующего антигена, предпочтительно составляет по меньшей мере пять или более, или предпочтительно, например, шесть или более, или семь или более. Более конкретно, в качестве сенсибилизирующего антигена можно применять пептид, состоящий из 8-50 остатков, более предпочтительно из 10-30 остатков.
В альтернативном варианте в качестве сенсибилизирующего антигена можно применять слитый белок, полученный путем слияния требуемого неполного полипептида или пептида белка GPC3, с другим полипептидом. Например, для получения слитых белков, предназначенных для применения в качестве сенсибилизирующих антигенов, предпочтительно применяют Fc-фрагменты антитела и пептидные метки. Векторы для экспрессии указанных слитых белков можно конструировать путем слияния в рамке считывания генов, кодирующих два или большее количество требуемых полипептидных фрагментов, и встраивания слитого гена в экспрессионный вектор, описанный выше. Методы получения слитых белков описаны в Molecular Cloning, 2-е изд. (Sambrook J. и др., Molecular Cloning, 2-ое изд. 1989, 9.47-9.58, издво Cold Spring Harbor Lab. Press). Методы получения GPC3, предназначенного для применения в качестве сенсибилизирующего антигена, и методы иммунизации с использованием GPC3 конкретно описаны в WO 2003/000883, WO 2004/022754 и WO 2006/006693.
Конкретное ограничение, касающееся млекопитающих, подлежащих иммунизации с помощью сенсибилизирующего антигена, отсутствует. Однако предпочтительно выбирать млекопитающих с учетом их совместимости с родительскими клетками, применяемыми для клеточного слияния. В целом, предпочтительно применяют грызунов, таких как мыши, крысы, а также хомяки, кролики, и обезьян.
Вышеуказанных животных иммунизируют сенсибилизирующим антигеном с помощью известных методов. Общепринятыми методами иммунизации млекопитающих являются, например, внутрибрюшинная или подкожная инъекция сенсибилизирующего антигена. В частности, сенсибилизирующий антиген можно соответствующим образом разводить в ЗФР (забуференный фосфатом физиологический раствор), физиологическом соляном растворе или т.п. При необходимости с антигеном смешивают общепринятый адъювант, такой как полный адъювант Фрейнда, и смесь эмульгируют. Затем сенсибилизирующий антиген вводят млекопитающему несколько раз с 4-21-дневными интервалами. При иммунизации сенсибилизирующим антигеном можно использовать соответствующие носители. В частности, когда в качестве сенсибилизирующего антигена используют низкомолекулярный неполный пептид, то иногда для иммунизации требуется сочетать пептид, представляющий собой сенсибилизирующий антиген, с белком-носителем, таким как альбумин или гемоцианин лимфы улитки.
Альтернативно этому, можно получать продуцирующие требуемое антитело гибридомы с помощью описанной ниже ДНК-иммунизации. ДНК-иммунизация представляет собой метод иммунизации, который обеспечивает иммуностимуляцию посредством экспрессии сенсибилизирующего антигена в организме иммунизированного животного в результате введения ДНК-вектора, сконструированного таким образом, чтобы он обеспечивал экспрессию гена, кодирующего антигенный белок, в организме животного. По сравнению с общепринятыми методами иммунизации, при которых животным, подлежащим иммунизации, вводят белковый антиген, ДНК-иммунизация, по-видимому, имеет следующие преимущест- 22 041830 ва:
можно осуществлять иммуностимуляцию, сохраняя при этом структуру мембранного белка, такого как GPC3; и отсутствует необходимость в очистке антигена для иммунизации.
Для получения моноклонального антитела, предлагаемого в настоящем изобретении, с использованием ДНК-иммунизации сначала вводят животному, подлежащему иммунизации, ДНК, экспрессирующую белок GPC3. ДНК, кодирующую GPC3, можно синтезировать с помощью известных методов, таких как ПЦР. Полученную ДНК встраивают в соответствующий экспрессионный вектор и затем его вводят животному, подлежащему иммунизации. Предпочтительно применяемые для этой цели экспрессионные векторы включают, например, поступающие в продажу экспрессионные векторы, такие как pcDNA3.1. Векторы можно вводить в организм с помощью общепринятых методов. Например, ДНК-иммунизацию осуществляют с использованием генной пушки для интродукции золотых частиц, покрытых экспрессионным вектором, в клетки тела животного, подлежащего иммунизации. Антитела, распознающие GPC3, можно получать также методами, описанными в WO 2003/104453. После описанной выше иммунизации млекопитающего у него подтверждают в сыворотке повышенный титр GPC3-связывающего антитела. После этого получают из организма млекопитающего иммунные клетки и затем используют их для клеточного слияния. В частности, в качестве иммунных клеток предпочтительно применяют спленоциты.
Клетку миеломы млекопитающих применяют в качестве клетки, подлежащей слиянию с вышеуказанным иммуноцитом. Клетки миеломы предпочтительно содержат приемлемый маркер селекции для скрининга. Маркер селекции придает клеткам характеристики, обеспечивающие их выживание (или гибель) в специфических условиях культивирования. В качестве маркера селекции известны дефицит гипоксантин-гуанин-фосфорибозилтрансферазы (сокращенно обозначенный далее в контексте настоящего описания как дефицит HGPRT) и дефицит тимидинкиназы (сокращенно обозначенный далее в контексте настоящего описания как дефицит ТК). Клетки с дефицитом HGPRT или ТК обладают чувствительностью к гипоксантин-аминоптерин-тимидину (сокращенно обозначена далее в контексте настоящего описания как ГАТ-чувствительность). Клетки с ГАТ-чувствительностью не могут синтезировать ДНК в селекционной ГАТ-среде и в результате погибают. Однако, когда клетки сливают со здоровыми клетками, они могут продолжать синтез ДНК с использованием реутилизационного пути здоровых клеток, и в результате они могут расти даже в селекционной ГАТ-среде.
Клетки с HGPRT-дефицитом и ТК-дефицитом можно отбирать в среде, содержащей 6-тиогуанин, 8азагуанин (сокращенно обозначенный далее в контексте настоящего описания как 8AG) или 5'бромдезоксиуридин соответственно. Здоровые клетки уничтожаются, поскольку они включают эти пиримидиновые аналоги в их ДНК. При этом клетки с дефицитом этих ферментов могут выживать в селекционной среде, поскольку они не могут включать указанные пиримидиновые аналоги. Кроме того, к маркеру селекции относится устойчивость к G418, которая обеспечивается геном устойчивости к неомицину, придающим устойчивость к 2-дезоксистрептаминовым антибиотикам (аналоги гентамицина). Известны различные типы клеток миелом, которые можно применять для клеточного слияния.
Например, в качестве клеток миеломы предпочтительно можно применять следующие клетки:
P3(P3x63 Ag8.653) (J. Immunol. 123 (4), 1979, сс. 1548-1550);
P3x63Ag8U.l (Current Topics in Microbiology and Immunology 81, 1978, cc.
1-Ό;
NS-l (C. Eur. J. Immunol. 6 (7), 1976, cc. 511-519);
MPC-11 (Cell 8 (3), 1976, cc. 405-415);
SP2/0 (Nature 276 (5685), 1978, cc. 269-270);
FO (J. Immunol. Methods 35 (1-2), 1980, cc. 1-21);
S194/5.XX0.BU.1 (J. Exp. Med. 148 (1), 1978, cc. 313-323);
R210 (Nature 277 (5692), 1979, cc. 131-133) и т.д.
Клеточное слияние иммуноцитов и клеток миеломы, как правило, осуществляют с помощью известных методов, например метода, описанного у Kohler и Milstein и др. (Methods Enzymol. 73, 1981, с. 346).
Более конкретно, клеточное слияние можно осуществлять, например, в общепринятой культуральной среде в присутствии усиливающего клеточное слияние агента. Усиливающие клеточное слияние агенты включают, например, полиэтиленгликоль (ПЭГ) и вирус Сендай (гемагглютинирующий японский вирус мышей) (HVJ). При необходимости для повышения эффективности слияния добавляют также вспомогательную субстанцию, такую как диметилсульфоксид.
Соотношение иммуноцитов и клеток миеломы можно определять по усмотрению исследователя, предпочтительно, например, одна клетка миеломы на каждые 1-10 иммуноцитов. Культуральные среды, применяемые для клеточных слияний, включают, например, среды, пригодные для выращивания клеточных линий миелом, такие как среда RPMI1640 и среда MEM, а также другая общепринятая культуральная среда, применяемая для данного типа клеточной культуры. Кроме того, в культуральную среду пред- 23 041830 почтительно можно добавлять добавки в виде сыворотки, такой как фетальная телячья сыворотка (FCS).
Для клеточного слияния указанные выше иммунные клетки и клетки миеломы, взятые в предварительно определенных количествах, хорошо перемешивают в указанной выше культуральной среде. Затем к ней добавляют предварительно нагретый до температуры примерно 37°С раствор ПЭГ (например, средняя молекулярная масса которого составляет примерно от 1000 до 6000) в концентрации, составляющей, как правило, от 30 до 60 мас./об.%. Смесь осторожно перемешивают до получения требуемых слитых клеток (гибридомы). Затем указанную выше культуральную среду постепенно добавляют к клеткам и повторно центрифугируют для удаления супернатанта. Таким путем можно удалять агенты для клеточного слияния, которые являются нежелательными для роста гибридом.
Полученные таким образом гибридомы можно отбирать путем культивирования, используя общепринятую селективную среду, например ГАТ-среду (культуральная среда, содержащая гипоксантин, аминоптерин и тимидин). Клетки, отличные от требуемых гибридом (неслитые клетки), можно уничтожать путем последующего культивирования в вышеуказанной ГАТ-среде в течение достаточного периода времени. Как правило, период составляет от нескольких дней до нескольких недель. Затем осуществляют скрининг гибридом, продуцирующих требуемое антитело, и по отдельности клонируют с помощью общепринятых методов серийных разведений.
Полученные таким образом гибридромы можно отбирать, используя селекционную среду на основе маркера селекции, который несут клетки миеломы, применяемые для клеточного слияния. Например, клетки с HGPRT-или ТК-дефицитом можно отбирать путем культивирования с использованием ГАТсреды (культуральная среда, содержащая гипоксантин, аминоптерин и тимидин). А в частности, когда для клеточного слияния используют чувствительные к ГАТ клетки миеломы, то клетки, для которых характерно успешное слияние со здоровыми клетками, могут избирательно размножаться в ГАТ-среде. Клетки, отличные от требуемых гибридом (неслитые клетки), можно уничтожать путем культивирования в вышеуказанной ГАТ-среде в течение достаточного периода времени. В частности, требуемые гибридомы можно отбирать путем культивирования, как правило, в течение периода времени, составляющего от нескольких дней до нескольких недель. Затем осуществляют скрининг гибридом, продуцирующих требуемое антитело, и по отдельности клонируют с помощью общепринятых методов серийных разведений.
Требуемые антитела предпочтительно можно отбирать и по отдельности клонировать с помощью методов скрининга, основанных на известной реакции антиген/антитело. Например, GPC3-связывающее моноклональное антитело может связываться с GPC3, экспрессируемым на клеточной поверхности. Можно осуществлять скрининг указанных моноклональных антител с помощью метода разделения клеток на основе возбуждения флуоресценции (FACS). FACS представляет собой систему, которая позволяет оценивать связывание антитела с клеточной поверхностью посредством анализа клеток, контактирующих с флуоресцентным антителом, с использованием лазерного пучка, и путем оценки флуоресценции, испускаемой индивидуальными клетками.
Для скрининга с использованием FACS в отношении гибридом, которые продуцируют моноклональное антитело, предлагаемое в настоящем изобретении, прежде всего получают экспрессирующие GPC3 клетки. Клетки, которые предпочтительно используют для скрининга, представляют собой клетки млекопитающих, в которых происходит принудительная экспрессия GPC3. В качестве контроля можно избирательно определять с использованием нетрансформированных клеток млекопитающих в качестве клеток-хозяев способность антитела связываться с расположенным на клеточной поверхности GPC3. В частности, гибридомы, продуцирующие моноклональное антитело к GPC3, можно выделять путем отбора гибридом, которые продуцируют антитело, связывающееся с клетками, принудительно экспрессирующими GPC3, но не с клетками-хозяевами.
Альтернативно этому, способность антитела связываться с иммобилизованными экспрессирующими GPC3 клетками можно оценивать на основе принципа ELISA. Например, экспрессирующие GPC3 клетки иммобилизуют на лунках планшета для ELISA. Супернатанты культур гибридом приводят в контакт с иммобилизованными клетками в лунках и выявляют антитела, которые связываются с иммобилизованными клетками. Когда моноклональные антитела имеют мышиное происхождение, то антитела, связанные с клетками, можно выявлять с помощью антитела к мышиному иммуноглобулину. Гибридомы, продуцирующие требуемое антитело, которое обладает антигенсвязывающей активностью, отбирают путем описанного выше скрининга, и их можно клонировать методом серийных разведений или аналогичным методом.
Полученные таким путем гибридомы, продуцирующие моноклональные антитела, можно пересевать в общепринятую культуральную среду и хранить в жидком азоте в течение длительного периода времени.
Указанные выше гибридомы культивируют с помощью общепринятого метода и требуемые моноклональные антитела можно получать из супернатантов культур. Альтернативно этому, гибридомы интродуцируют и выращивают в пригодных для этой цели млекопитающих, и моноклональные антитела получают из асцитов. Первый метод пригоден для получения антител с высокой степенью чистоты.
Предпочтительно можно применять также антитела, кодируемые генами антител, которые клонированы из продуцирующих антитела клеток, таких как указанные выше гибридомы. Клонированный ген
- 24 041830 антитела встраивают в соответствующий вектор и его интродуцируют в хозяина для экспрессии кодируемого геном антитела. Методы выделения генов антител, встраивания генов в векторы и трансформации клеток-хозяев разработаны ранее (см., например, Vandamme и др., Eur. J. Biochem. 192(3), 1990, c.
767-775). Методы получения рекомбинантных антител также известны и описаны ниже.
Например, кДНК, кодирующую вариабельную область (V-область) антитела к GPC3, получают из клеток гибридомы, экспрессирующих антитело к GPC3. Для этой цели сначала из гибридом экстрагируют общую РНК. Методы, которые применяют для экстракции мРНК из клеток, включают, например: метод ультрацентрифугирования в присутствии гуанидина (Biochemistry 18(24), 1979, с. 5294-5299) и AGPC-метод (Anal. Biochem. 162(1), 1987, с. 156-159). Экстрагированные мРНК можно очищать с помощью набора для очистки мРНК (фирма GE Healthcare Bioscience) или аналогичного набора. В качестве альтернативы можно применять также поступающие в продажу наборы для экстракции мРНК непосредственно из клеток, такие как набор для очистки мРНК QuickPrep (фирма GE Healthcare Bioscience). мРНК можно получать из гибридом с использованием таких наборов. Кодирующие V-область антитела кДНК можно синтезировать из полученных мРНК с помощью обратной транскриптазы. кДНК можно синтезировать с помощью набора для синтеза первой цепи кДНК, содержащего обратную транскриптазу AMV (Reverse Transcriptase First-strand cDNA Synthesis Kit) (фирма Seikagaku Co.) или аналогичного набора. Кроме того, для синтеза и амплификации кДНК можно применять набор для амплификации кДНК SMART RACE (фирма Clontech) и основанный на ПЦР 5'δАСЕ-(быстрая амплификация концов кДНК)метод (Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85(23), 1988, с. 8998-9002; Nucleic Acids Res. 17(8), 1989, с. 2919-2932). При таком процессе синтеза кДНК соответствующие описанные ниже сайты, распознаваемые рестриктазами, можно интродуцировать на оба конца кДНК.
Представляющий интерес фрагмент кДНК очищают из полученного ПЦР-продукта и затем его встраивают путем лигирования в ДНК-вектор. Таким путем создают рекомбинантный вектор и интродуцируют в Е. coli или подобного хозяина. После селекции колоний требуемый рекомбинантный вектор можно получать из колониеобразующих Е. coli. Затем с использованием известного метода, такого как дидезокси-метод (метод терминации нуклеотидной цепи), определяют, имеет ли рекомбинантный вектор представляющую интерес нуклеотидную последовательность кДНК.
5'-RACE-метод, в котором используют праймеры для амплификации гена вариабельной области, как правило, применяют для выделения гена, кодирующего вариабельную область. Сначала конструируют библиотеку кДНК, применяемую для 5'-RACE (5'-RACE-библиотека кДНК) с использованием РНК, экстрагированных из клеток гибридомы, в качестве матрицы. Для синтеза 5'-RACE-библиотеки кДНК можно использовать поступающий в продажу набор, такой как набор для амплификации кДНК SMART RACE.
Ген антитела амплифицируют с помощью ПЦР, используя полученную 5'-RACE-библиотеку кДНК в качестве матрицы. Праймеры для амплификации гена мышиного антитела можно создавать на основе известных генных последовательностей антител. Нуклеотидные последовательности праймеров варьируются в зависимости от подкласса иммуноглобулина. Таким образом, предпочтительно предварительно определять подкласс с помощью доступного набора, такого как набор для изотипирования мышиных моноклональных антител Iso Strip (Iso Strip mouse monoclonal antibody isotyping kit) (фирма Roche Diagnostics).
В частности, например, для выделения генов, кодирующих мышиный IgG, применяют праймеры, которые обеспечивают амплификацию генов, кодирующих тяжелые цепи γ1, γ2а, y2b и γ3 и легкие цепи к и λ. В целом, праймер, сайт гибридизации (отжига) которого с константной областью расположен вблизи вариабельной области, применяют в качестве 3'-концевого праймера для амплификации гена вариабельной области IgG. При этом праймер, присоединенный к набору конструкций 5'-RACEбиблиотеки кДНК, применяют в качестве 5'-концевого праймера.
Амплифицированные таким образом ПЦР-продукты применяют для реконструирования иммуноглобулинов, состоящих из комбинации тяжелых и легких цепей. Требуемое антитело можно отбирать, используя в качестве показателя GPC3-связывающую активность реконструированного иммуноглобулина. Например, когда задачей является выделение антитела к GPC3, то более предпочтительно, чтобы связывание антитела с GPC3 являлось специфическим. Можно осуществлять скрининг GPC3-связывающих антител, например, с использованием следующих стадий, на которых:
(1) приводят в контакт экспрессирующую GPC3 клетку с антителом, содержащим V-область, которая кодируется кДНК, выделенной из гибридомы;
(2) определяют связывание антитела с экспрессирующей GPC3 клеткой и (3) отбирают антитело, которое связывается с экспрессирующей GPC3 клеткой.
Методы определения связывания антитела с экспрессирующими GPC3 клетками, являются известными. В частности, связывание антитела с экспрессирующими GPC3 клетками можно определять с помощью описанных выше методик, таких как FACS. Иммобилизованные образцы экспрессирующих GPC3 клеток можно применять для оценки связывающей активности антитела.
Предпочтительные методы скрининга антител, в которых используют связывающую активность в
- 25 041830 качестве показателя, включают также методы пэннинга, основанные на использовании фаговых векторов. Методы скрининга с использованием фаговых векторов имеют преимущество, когда гены антитела выделяют из библиотек подкласса тяжелой цепи и легкой цепи из популяции клеток, экспрессирующих поликлональные антитела. Гены, кодирующие вариабельные области тяжелой цепи и легкой цепи, можно сшивать с помощью приемлемой линкерной последовательности с образованием одноцепочечного Fv (scFv). Фаги, презентирующие на своей поверхности scFv, можно получать путем встраивания гена, кодирующего scFv, в фаговый вектор. Фаги приводят в контакт с представляющим интерес антигеном. Затем ДНК, кодирующую scFv, который обладает представляющей интерес связывающей активностью, можно выделять путем сбора фагов, связанных с антигеном. Указанный процесс можно повторять при необходимости для обогащения scFv, которые обладают представляющей интерес связывающей активностью.
После выделения кДНК, кодирующей V-область представляющего интерес антитела к GPC3, кДНК расщепляют рестриктазами, которые распознают сайты рестрикции, интродуцированные в оба конца кДНК. Предпочтительные рестриктазы распознают и расщепляют нуклеотидную последовательность, которая встречается с низкой частотой в нуклеотидной последовательности гена антитела. Кроме того, для встраивания однокопийного расщепленного фрагмента в правильной ориентации предпочтительно интродуцируют в представляющий интерес вектор сайт рестрикции для фермента, который образует липкий конец. Кодирующую V-область антитела к GPC3 кДНК расщепляют согласно описанному выше методу и встраивают в приемлемый экспрессионный вектор для создания экспрессионного вектора антитела. В том случае, когда ген, кодирующий константную область (С-область) антитела, и ген, кодирующий указанную выше V-область, сливают в рамке считывания, то получают химерное антитело. В контексте настоящего описания химерное антитело означает, что константная область и вариабельная область отличаются по своему происхождению. Так, помимо мышиных/человеческих гетерохимерных антител к химерным антителам, предлагаемым в настоящем изобретении, относятся также человеческие/человеческие аллохимерные антитела. Экспрессионный вектор химерного антитела можно создавать путем встраивания указанного выше гена V-области в экспрессионный вектор, который уже содержит константную область. В частности, например, последовательность, распознаваемую рестриктазой, которая вырезает указанный выше ген V-области, предпочтительно следует помещать в 5'-область экспрессионного вектора, несущего ДНК, которая кодирует константную область (С-область) требуемого антитела. Экспрессионный вектор химерного антитела создают путем слияния в рамке считывания двух генов, расщепленных одной и той же комбинацией рестриктаз.
Для получения моноклонального антитела к GPC3 гены антитела встраивают в экспрессионный вектор таким образом, чтобы экспрессия генов происходила под контролем регулирующей экспрессию области. Регулирующая экспрессию область, предназначенная для экспрессии антител, включает, например, энхансеры и промоторы. Кроме того, соответствующую сигнальную последовательность можно присоединять к аминоконцу таким образом, чтобы антитело секретировалось из клеток наружу. В описанных ниже примерах в качестве сигнальной последовательности применяют пептид, который имеет аминокислотную последовательность MGWSCIILFLVATATGVHS (SEQ ID NO: 3). Наряду с ней можно присоединять другие приемлемые сигнальные последовательности. Экспрессированный полипептид расщепляется на карбоксильном конце указанной выше последовательности и образовавшийся полипептид секретируется из клеток наружу в виде зрелого полипептида. Затем приемлемые клетки-хозяева трансформируют экспрессионным вектором и получают рекомбинантные клетки, экспрессирующие ДНК, которая кодирует антитело к GPC3.
ДНК, которые кодируют тяжелую цепь антитела (H-цепь) и легкую цепь антитела (L-цепь), встраивают по отдельности в различные экспрессионные векторы для экспрессии гена антитела. Молекулу антитела, имеющую H- и L-цепи, можно экспрессировать, осуществляя для этой цели контрансфекцию одной и той же клетки-хозяина векторами, в которые встроены соответственно гены H-цепи и L-цепи. В качестве альтернативы, клетки-хозяева можно трансформировать одним экспрессионным вектором, в который встроены ДНК, кодирующие H- и L-цепи (см. WO 94/11523).
Известны различные комбинации клеток-хозяев/экспрессионных векторов для получения антитела путем интродукции выделенных генов антител в соответствующих хозяев. Все эти системы экспрессии можно применять для выделения антигенсвязывающих доменов, включая вариабельные области антитела, предлагаемого в настоящем изобретении. Приемлемыми эукариотическими клетками, которые применяют в качестве клеток-хозяев, являются клетки животных, клетки растений и клетки грибов. В частности, клетки животных представляют собой, например, следующие клетки:
(1) клетки млекопитающих: СНО, COS, миеломы, почки детеныша хомяка (BHK), HeLa, Vero или т.п.;
(2) клетки амфибий: ооциты шпорцевой лягушки (Xenopus) или т.п. и (3) клетки насекомых: sf9, sf21, Tn5 или т.п.
Кроме того, в качестве растительной клетки известна система экспрессии генов антитела, в которой используют клетки, полученные из представителей рода Nicotiana, например Nicotiana tabacum. Для трансформации растительных клеток можно применять культивированные клетки каллуса.
- 26 041830
Кроме того, следующие клетки можно применять в качестве грибных клеток: дрожжи рода Saccharomyces, например Saccharomyces cerevisiae, и рода Pichia, например Pichia pastoris, и нитчатые грибы: рода Aspergillus, например Aspergillus niger. Кроме того, известны системы экспрессии генов антитела, в которых используют прокариотические клетки. Например, согласно настоящему изобретению можно применять бактериальные клетки, т.е. клетки Е. coli, клетки Bacillus subtilis и т.п. Экспрессионные векторы, которые несут представляющие интерес гены антитела, интродуцируют в эти клетки путем трансфекции. Трансфектированные клетки культивируют in vitro, и требуемое антитело можно получать из культуры трансформированных клеток.
Помимо указанных выше клеток-хозяев для получения рекомбинантного антитела можно применять также трансгенных животных. Это означает, что антитело можно получать из животного, в организм которого интродуцирован ген, кодирующий представляющее интерес антитело. Например, ген антитела можно создавать в виде слитого гена посредством встраивания в рамке считывания в ген, который кодирует белок, специфически образующийся в молоке. В качестве белка, секретируемого в молоко, можно применять, например, козий β-казеин. ДНК-фрагменты, содержащие слитый ген, в который входит ген антитела, инъецируют в эмбрион козы и затем этот эмбрион интродуцируют в самку козы. Требуемые антитела можно получать в виде белка, слитого с молочным белком из молока трансгенной козы, родившейся от козы, являющейся реципиентом эмбриона (или ее потомства). Кроме того, для увеличения объема молока, содержащего требуемое антитело, которое продуцируется трансгенной козой, трансгенной козе можно при необходимости вводить гормоны (Ebert К.М. и др., Bio/Technology 12 (7), 1994, с. 699-702).
Когда антигенсвязывающую молекулу, представленную в настоящем описании, вводят человеку, то в качестве домена антигенсвязывающей молекулы можно применять домен, происходящий из антитела, полученного путем генетической рекомбинации, которое искусственно модифицировано для снижения гетерологичной антигенности в отношении человека и других животных. Указанные антитела, полученные путем генетической рекомбинации, включают, например, гуманизированные антитела. Эти модифицированные антитела можно получать с помощью известных методов.
Вариабельная область антитела, применяемая для получения домена антигенсвязывающей молекулы, который включает вариабельную область антитела, представленного в настоящем описании, как правило, состоит из трех гипервариабельных участков (CDR), разделенных четырьмя каркасными участками (FR). CDR представляет собой область, которая в значительной степени определяет специфичность связывания антитела. Для аминокислотных последовательностей CDR характерна высокая степень вариабельности. С другой стороны, образующие FR аминокислотные последовательности часто обладают высокой идентичностью даже среди антител с различными специфичностями связывания. Таким образом, как правило, путем трансплантации CDR специфичность связывания конкретного антитела можно интродуцировать в другое антитело.
Гуманизированное антитело называют также реконструированным человеческим антителом. В частности, известны гуманизированные антитела, полученные путем трансплантации CDR антитела животного кроме человека, такого как мышиное антитело, в человеческое антитело и т.п. Известны также общепринятые методики генной инженерии, предназначенные для получения гуманизированных антител. В частности, например, ПЦР с перекрывающимися праймерами представляет собой известный метод трансплантации CDR мышиного антитела в человеческий FR. При осуществлении ПЦР с перекрывающимися праймерами нуклеотидную последовательность, которая кодирует CDR мышиного антитела, подлежащий трансплантации, добавляют к праймерам, предназначенным для синтеза FR человеческого антитела. Получают праймеры для каждого из четырех FR. Принято считать, что когда осуществляют трансплантацию мышиного CDR в человеческий FR, то для поддержания функции CDR целесообразно выбирать человеческий FR, обладающий высоким уровнем идентичности с мышиным FR. Таким образом, как правило, является предпочтительным применять человеческий FR, который содержит аминокислотную последовательность, обладающую высоким уровнем идентичности с аминокислотной последовательностью FR, который примыкает к подлежащему трансплантации мышиному CDR.
Нуклеотидные последовательности, подлежащие лигированию, создают таким образом, чтобы они были соединены друг с другом в рамке считывания. Человеческие FR синтезируют индивидуально с использованием соответствующих праймеров. В результате получают продукты, в которых ДНК, кодирующая мышиный CDR, присоединена к ДНК, кодирующим индивидуальные FR. Нуклеотидные последовательности, кодирующие мышиный CDR каждого продукта, создают таким образом, чтобы они перекрывались друг с другом. Затем осуществляют реакцию синтеза комплементарной цепи для отжига перекрывающихся CDR-участков продуктов, синтезированных с использованием гена человеческого антитела в качестве матрицы. С помощью этой реакции человеческие FR встраивают путем лигирования через мышиные CDR-последовательности.
Полноразмерный ген V-области, в которую, в конце концов, лигированы три CDR и четыре FR, амплифицируют с использованием праймеров, гибридизующихся с 5'- или 3'-концом, которые добавляют с последовательностями, распознаваемыми приемлемыми рестриктазами. Экспрессионный вектор для гуманизированного антитела можно получать путем встраивания полученной согласно описанному выше
- 27 041830 методу ДНК и ДНК, которая кодирует С-область человеческого антитела, в экспрессионный вектор таким образом, чтобы лигировать их в рамке считывания. После трансфекции хозяина рекомбинантным вектором для создания рекомбинантных клеток рекомбинантные клетки культивируют и ДНК, кодирующую гуманизированное антитело, экспрессируют с получением гуманизированного антитела в культуре клеток (см. публикацию европейского патента EP 239400 и публикацию международной заявки на патент WO 1996/002576). Путем качественной или количественной оценки и измерения антигенсвязывающей активности гуманизированного антитела, полученного согласно описанному выше методу, можно отбирать FR человеческого антитела, которые позволяют CDR образовывать предпочтительный антигенсвязывающий центр при лигировании с использованием CDR. Аминокислотные остатки в FR при необходимости можно заменять так, чтобы CDR реконструированного человеческого антитела образовывали приемлемый антигенсвязывающий центр. Например, мутации аминокислотной последовательности можно интродуцировать в FR, используя ПЦР-метод, применяемый для трансплантации мышиного CDR в человеческий FR. Более конкретно, мутации неполной нуклеотидной последовательности можно интродуцировать в праймеры, гибридизующиеся с FR. Мутации нуклеотидной последовательности интродуцируют в FR, синтезированные с использованием указанных праймеров. Мутантные последовательности FR, имеющие требуемые характеристики, можно отбирать путем измерения и оценки активности мутантного антитела с аминокислотной заменой в отношении связывания с антигеном с помощью упомянутого выше метода (Sato K. и др., Cancer Res. 53, 1993, с. 851-856).
В качестве альтернативы, требуемые человеческие антитела можно получать путем иммунизации трансгенных животных, имеющих полный спектр генов человеческого антитела (см. WO 1993/012227; WO 1992/003918; WO 1994/002602; WO 1994/025585; WO 1996/034096; WO 1996/033735), с использованием ДНК-иммунизации.
Кроме того, известны методики получения человеческих антител путем пэннинга с использованием библиотек человеческих антител. Например, V-область человеческого антитела экспрессируют в виде одноцепочечного антитела (scFv) на поверхности фага с использованием метода фагового дисплея. Можно отбирать фаги, экспрессирующие scFv, который связывается с антигеном. Последовательность ДНК, кодирующую V-область человеческого антитела, которая связывается с антигеном, можно определять путем анализа генов отобранных фагов. Определяют последовательность ДНК scFv, который связывается с антигеном. Экспрессионный вектор получают путем слияния последовательности V-области в рамке считывания с последовательностью С-области требуемого человеческого антитела и последующего встраивания в приемлемый экспрессионный вектор. Экспрессионный вектор интродуцируют в клетки, пригодные для указанной выше экспрессии. Человеческое антитело можно получать путем экспрессии гена, кодирующего человеческое антитело, в клетках. Такие методы уже описаны (см. WO 1992/001047; WO 1992/020791; WO 1993/006213; WO 1993/011236; WO 1993/019172; WO 1995/001438; WO 1995/015388).
Домен, содержащий вариабельную область антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении глипикана 3 (GPC3).
В контексте настоящего описания фраза домен, содержащий вариабельную область антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении глипикана 3 (GPC3) относится к области антитела, которая содержит область, которая специфически связывается с описанным выше белком GPC3 или со всем или с участком неполного пептида белка GPC3, и является также комплементарной ему. Домены, содержащие вариабельную область антитела, можно получать из вариабельных доменов одного или множества антител. Предпочтительно домены, содержащие вариабельную область антитела, содержат вариабельные области легкой цепи и тяжелой цепи (VL и VH) антитела. Приемлемыми примерами таких доменов, содержащих вариабельные области антитела, являются одноцепочечный Fv (scFv), одноцепочечное антитело, Fv, одноцепочечный Fv2 (scFv2), Fab, F(ab')2 и т.д.
Домен, содержащий вариабельную область антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора.
В контексте настоящего описания фраза домен, содержащий вариабельную область антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора относится к области антитела, которая содержит область, которая специфически связывается со всем или с участком комплекса Т-клеточного рецептора, и является также комплементарной ему. Комплекс Т-клеточного рецептора может представлять собой сам Т-клеточный рецептор или адапторную молекулу, которая входит в комплекс Т-клеточного рецептора наряду с Т-клеточным рецептором. Пригодной в качестве адапторной молекулы является CD3.
Домен, содержащий вариабельную область антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении Т-клеточного рецептора.
В контексте настоящего описания фраза домен, содержащий вариабельную область антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении Т-клеточного рецептора относится к области антитела, связывающейся с Т-клеточным рецептором, полученной путем включения области, которая специфически связывается со всем или с участком Т-клеточного рецептора и является также комплементарной ему.
- 28 041830
Участок Т-клеточного рецептора, с которым связывается домен, предлагаемый в настоящем изобретении, может представлять собой вариабельную область или константную область, но предпочтительным является эпитоп, присутствующий в константной области. Примеры последовательности константной области включают а-цепь Т-клеточного рецептора, которая имеет регистрационный № RefSeq. CAA26636.1 (SEQ ID NO: 4), Р-цепь Т-клеточного рецептора, которая имеет регистрационный № RefSeq C25777 (SEQ ID NO: 5), γ1-цепь Т-клеточного рецептора, которая имеет регистрационный № RefSeq А26659 (SEQ ID NO: 6), γ2-цепь Т-клеточного рецептора, которая имеет регистрационный № RefSeq AAB63312.1 (SEQ ID NO: 7), и 5-цепь Т-клеточного рецептора, которая имеет регистрационный № RefSeq AAA61033.1 (SEQ ID NO: 8).
Домен, содержащий вариабельную область антитела, которая обладает CD3-связывающей активностью.
В контексте настоящего описания фраза домен, содержащий вариабельную область антитела, которая обладает CD3-связывающей активностью относится к CD3-связывающему участку антитела, который получают путем включения области, которая специфически связывается со всем или с участком CD3, и который является также комплементарным ему.
Предпочтительно домен содержит вариабельные области легкой цепи и тяжелой цепи (VL и VH) антитела к CD3. Приемлемыми примерами такого домена являются одноцепочечный Fv (scFv), одноцепочечное антитело, Fv, одноцепочечный Fv2 (scFv2), Fab, F(ab')2 и т.д.
Предлагаемый в изобретении домен, содержащий вариабельную область антитела, которая обладает CD3-связывающей активностью, может представлять собой любой эпитопсвязывающий домен, если эпитоп присутствует в последовательности γ-цепи, δ-цепи или ε-цепи, образующей человеческий CD3. Предпочтительно в настоящем изобретении можно использовать домен, содержащий вариабельную область легкой цепи (VL) антитела к CD3, и вариабельную область тяжелой цепи (VH) антитела к CD3, которые связываются с эпитопом, присутствующим во внеклеточной области ε-цепи комплекса человеческого CD3. Помимо вариабельной области легкой цепи (VL) антитела к CD3, и вариабельной области тяжелой цепи (VH) антитела к CD3, которые описаны в разделе Примеры, известные CD3связывающие домены, которые содержат вариабельную область легкой цепи (VL) антитела к CD3, и вариабельную область тяжелой цепи (VH) антитела к CD3 и полученные из антитела ОКТ3 (Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77, 1980, с. 4914-4917), можно применять в качестве указанных доменов. Соответственно можно применять содержащий вариабельную область антитела домен, полученный из антитела к CD3, которое обладает требуемыми свойствами, созданное путем иммунизации требуемого животного с использованием описанного выше метода γ-цепью, δ-цепью или ε-цепью, образующей человеческий CD3. Человеческие антитела и соответствующим образом гуманизированные антитела можно применять соответственно в качестве антитела к CD3 для создания домена, содержащего вариабельную область антитела, который обладает CD3-связывающей активностью. Что касается структуры γ-цепи, δ-цепи или εцепи, образующей человеческий CD3, то их полинуклеотидные последовательности представлены в SEQ ID NO: 9 (NM_000073.2), 10 (NM_000732.4) и 11 (NM_000733.3), а их полипептидные последовательности представлены в SEQ ID NO: 12 (NP_000064.1), 13 (NP_000723.1) и 14 (NP_000724.1) (в скобках указаны регистрационные номера в базе данных RefSeq).
Домены, содержащие вариабельные области антитела, в антигенсвязывающих молекулах, предлагаемых в настоящем изобретении, могут связываться с одним и тем же эпитопом. В контексте настоящего описания один и тот же эпитоп может присутствовать в белке, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 2 или 14. Альтернативно этому, домены, содержащие вариабельные области антитела, в антигенсвязывающих молекулах, предлагаемых в настоящем изобретении, могут связываться с различными эпитопами соответственно. В контексте настоящего описания различные эпитопы могут присутствовать в белке, который содержит аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 2 или 14.
Специфичность.
Понятие специфичность означает, что одна из молекул, участвующих в специфическом связывании, не обладает какой-либо значимой способностью связываться с молекулами, отличными от одного или нескольких партнеров по связыванию молекул. Кроме того, понятие используют также, когда домен, содержащий вариабельную область антитела, является специфическим в отношении конкретного эпитопа из нескольких эпитопов, входящих в антиген. Когда эпитоп, с которым связывается домен, содержащий вариабельную область антитела, входит в несколько различных антигенов, то антигенсвязывающие молекулы, содержащие домен, включающий вариабельную область, могут связываться с различными антигенами, которые содержат эпитоп.
Эпитоп.
Эпитоп означает антигенную детерминанту в антигене и относится к антигенному сайту, с которым связывается представленный в настоящем описании домен антигенсвязывающей молекулы, включающий вариабельную область антитела. Так, например, эпитоп можно характеризовать на основе его структуры. Альтернативно этому, эпитоп можно характеризовать на основе антигенсвязывающей актив- 29 041830 ности антигенсвязывающей молекулы, которая распознает эпитоп. Когда антиген представляет собой пептид или полипептид, то эпитоп можно определять по аминокислотным остаткам, образующим эпитоп. Альтернативно этому, когда эпитоп представляет собой сахарную цепь, то эпитоп можно определять по специфической для него структуре сахарной цепи.
Линейный эпитоп представляет собой эпитоп, который содержит эпитоп, у которого распознается первичная аминокислотная последовательность. Указанный линейный эпитоп, как правило, содержит по меньшей мере три и наиболее часто по меньшей мере 5, например примерно от 8 до 10 или от 6 до 20, аминокислотных остатков в определенной последовательности.
В отличие от линейного эпитопа конформационный эпитоп представляет собой эпитоп, в котором первичная аминокислотная последовательность, образующая эпитоп, не является единственной детерминантой распознаваемого эпитопа (например, не является обязательным, чтобы первичная аминокислотная последовательность конформационного эпитопа распознавалась специфическим в отношении эпитопа антителом). Конформационные эпитопы могут содержать большее количество аминокислотных остатков по сравнению с линейными эпитопами. Распознающее конформационный эпитоп антитело распознает трехмерную структуру пептида или белка. Например, когда белковая молекула уложена и образует трехмерную структуру, аминокислоты и/или полипептидные основные цепи, которые образуют конформационный эпитоп, выравниваются, и эпитоп становится распознаваемым для антитела. Методы определения конформаций эпитопов включают (но не ограничиваясь только ими), например, рентгеновскую кристаллографию, двухмерный ядерный магнитный резонанс, сайтспецифическое спиновое мечение и электронный парамагнитный резонанс (см., например, Epitope Mapping Protocols in Methods in Molecular Biology, под ред. Morris, т. 66, 1996).
Пример метода оценки связывания эпитопа тестируемой антигенсвязывающей молекулой, содержащей домен, который содержит вариабельную область антитела, обладающую GPC3-связывающей активностью, описан ниже, и метод, подтверждающий связывание с эпитопом тестируемой антигенсвязывающей молекулой, содержащей домен, который содержит вариабельную область антитела, обладающую связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, можно осуществлять также согласно приведенным ниже примерам.
Например, для подтверждения того, что тестируемая антигенсвязывающая молекула, содержащая домен, который содержит вариабельную область антитела, обладающую GPC3-связывающей активностью, распознает линейный эпитоп в молекуле GPC3, можно применять описанный ниже метод. Для указанной выше цели синтезируют линейный пептид, содержащий аминокислотную последовательность, образующую внеклеточный домен GPC3. Пептид можно синтезировать химически. Альтернативно этому, его можно получать с помощью методов генной инженерии, используя область в кДНК GPC3, которая кодирует аминокислотную последовательность, соответствующую внеклеточному домену. Затем оценивают связывающую активность между линейным пептидом, который содержит аминокислотную последовательность, образующую внеклеточный домен, и тестируемой антигенсвязывающей молекулой, содержащей домен, который содержит вариабельную область антитела, обладающую GPC3связывающей активностью. Например, иммобилизованный линейный пептид можно применять в качестве антигена при осуществлении ELISA для оценки связывающей активности антигенсвязывающей молекулы в отношении пептида. Альтернативно этому, связывающую активность в отношении линейного пептида можно оценивать по уровню ингибирования линейным пептидом связывания антигенсвязывающей молекулы с экспрессирующими GPC3 клетками. Эти анализы могут демонстрировать связывающую активность антигенсвязывающих молекул в отношении линейного пептида.
Кроме того, для подтверждения того, что тестируемая антигенсвязывающая молекула, содержащая домен, который содержит вариабельную область антитела, обладающую GPC3-связывающей активностью, распознает трехмерную структуру эпитопа, можно применять следующий метод. Для указанной выше цели получают экспрессирующие GPC3 клетки. Считается, что тестируемая антигенсвязывающая молекула, содержащая домен, который содержит вариабельную область антитела, обладающую GPC3связывающей активностью, распознает конформационный эпитоп, если она при контакте отличается сильным связыванием с экспрессирующими GPC3 клетками, но в незначительной степени связывается с иммобилизованным линейным пептидом, который содержит аминокислотную последовательность, образующую внеклеточный домен GPC3. В контексте настоящего описания связывается в незначительной степени означает, что активность связывания составляет 80% или менее, как правило, 50% или менее, предпочтительно 30% или менее и наиболее предпочтительно 15% или менее по сравнению с активностью связывания с клетками, экспрессирующими человеческий GPC3.
Методы анализа связывающей активности тестируемой антигенсвязывающей молекулы, содержащей домен, который связывается с антигеном GPC3, в отношении экспрессирующих GPC3 клеток, включают, например, методы, описанные в Antibodies: A Laboratory Manual (под ред. Harlow, David Lane, издво Cold Spring Harbor Laboratory, 1988, с. 359-420). В частности, оценку можно осуществлять на основе принципа ELISA или метода разделения клеток на основе возбуждения флуоресценции (FACS) с использованием в качестве антигена экспрессирующих GPC3 клеток.
В формате ELISA связывающую активность тестируемой антигенсвязывающей молекулы, содер- 30 041830 жащей домен, который связывается с антигеном GPC3, в отношении экспрессирующих GPC3 клеток, можно оценивать количественно путем сравнения уровней сигналов, возникающих в процессе ферментативной реакции. В частности, тестируемую антигенсвязывающую молекулу добавляют в планшет для ELISA, на котором иммобилизованы экспрессирующие GPC3 клетки. Затем тестируемую антигенсвязывающую молекулу, связанную с клетками, выявляют с помощью меченного ферментом антитела, которое распознает тестируемую антигенсвязывающую молекулу. Альтернативно этому, когда применяют FACS, приготавливают серийные разведения тестируемой антигенсвязывающей молекулы и титр антитела, связывающегося с экспрессирующими GPC3 клетками, можно определять путем сравнения активности связывания с экспрессирующими GPC3 клетками.
Связывание тестируемой антигенсвязывающей молекулы с антигеном, который экспрессируется на поверхности клеток, суспендированных в буфере или в сходной среде, можно выявлять с помощью проточного цитометра. Известными проточными цитометрами являются, например, следующие устройства:
FACS Canto™ II,
FACSAria™,
FACS Array™,
FACSVantage™ SE,
FACSCalibur (все товарные знаки фирмы BD Biosciences),
EPICS ALTRA HyPerSort,
Cytomics FC 500,
EPICS XL-MCL ADC EPICS XL ADC,
Cell Lab Quanta/Cell Lab Quanta SC (все товарные знаки фирмы Beckman Coulter).
Предпочтительные методы анализа связывающей активности тестируемой антигенсвязывающей молекулы, содержащей связывающей антиген GPC3 домен, в отношении антигена включают, например, следующий метод. Сначала экспрессирующие GPC3 клетки подвергают взаимодействию с тестируемой антигенсвязывающей молекулой, а затем ее окрашивают меченным с помощью ФИТЦ вторичным антителом, которое распознает полипептидный комплекс. Тестируемую антигенсвязывающую молекулу соответствующим образом разводят приемлемым буфером с получением комплекса в требуемой концентрации. Например, комплекс можно применять в концентрации, составляющей от 10 мкг/мл до 10 нг/мл. Затем определяют интенсивность флуоресценции и количество клеток с помощью FACSCalibur (фирма BD). Интенсивность флуоресценции, определенная с помощью анализов на основе программы CELL QUEST (фирма BD), а именно, выраженная в виде средних геометрических значений, отражает уровень связывания антитела с клетками. Это означает, что активность связывания тестируемой антигенсвязывающей молекулы, которая характеризуется количеством связанной тестируемой антигенсвязывающей молекулы, можно оценивать, определяя среднее геометрическое значение.
Имеет ли тестируемая антигенсвязывающая молекула, которая содержит домен, связывающий антиген GPC3, общий эпитоп с другой антигенсвязывающей молекулой, можно оценивать по конкуренции между двумя комплексами в отношении одного и того же эпитопа. Конкуренцию между антигенсвязывающими молекулами можно определять путем анализа перекрестной блокады или с помощью сходного анализа. Например, предпочтительным анализом перекрестной блокады является конкурентный ELISAанализ.
В частности, при осуществлении анализа перекрестной блокады белок GPC3, иммобилизованный в лунках титрационного микропланшета, предварительно инкубируют в присутствии антигенсвязывающей молекулы, рассматриваемой в качестве конкурента-кандидата, или без нее, а затем вносят тестируемую антигенсвязывающую молекулу. Количество связанной с белком GPC3 тестируемой антигенсвязывающей молекулы в лунках находится в обратной корреляции с активностью связывания антигенсвязывающей молекулы, рассматриваемой в качестве конкурента-кандидата, который конкурирует за связывание с одним и тем же эпитопом. Это означает, что чем выше аффинность антигенсвязывающей молекулы, рассматриваемой в качестве конкурента-кандидата, к одному и тому же эпитопу, тем ниже активность связывания тестируемой антигенсвязывающей молекулы с сенсибилизированными белком GPC3 лунками.
Количество тестируемой антигенсвязывающей молекулы, связанной через белок GPC3 с лунками, легко определять путем предварительного мечения антигенсвязывающей молекулы. Например, меченную биотином антигенсвязывающую молекулу оценивают с использованием конъюгата авидин/пероксидаза и соответствующего субстрата. В частности, анализ перекрестной блокады, в котором применяют в качестве меток ферменты, такие как пероксидаза, называют ELISA-анализом в конкурентных условиях (конкурентный анализ). Антигенсвязывающую молекулу можно метить также с помощью других предназначенных для мечения субстанций, которые можно выявлять или оценивать. В частности, известны радиоактивные метки, флуоресцентные метки и т.п.
Когда антигенсвязывающая молекула, рассматриваемая в качестве конкурента-кандидата, может блокировать связывание тестируемой антигенсвязывающей молекулы, которая содержит домен, связывающий антиген GPC3 по меньшей мере на 20%, предпочтительно по меньшей мере на 20-50% и предпочтительно по меньшей мере на 50% по сравнению со связывающей активностью, установленной в
- 31 041830 контрольном эксперименте, который проводят в отсутствии антигенсвязывающей молекулы, рассматриваемой в качестве конкурента, то считается, что для тестируемой антигенсвязывающей молекулы характерна выраженная способность к связыванию с тем же эпитопом, с которым связывается антигенсвязывающая молекула, рассматриваемая в качестве конкурента, или она конкурирует за связывание с тем же самым эпитопом.
Если структура эпитопа, связанного с тестируемой антигенсвязывающей молекулой, которая содержит домен, связывающий антиген GPC3, уже идентифицирована, то для решения вопроса о том, имеют ли тестируемая и контрольная антигенсвязывающие молекулы один и тот же эпитоп, можно сравнивать связывающие активности двух антигенсвязывающих молекул с пептидом, полученным путем интродукции аминокислотных мутаций в пептид, образующий эпитоп.
Для оценки указанных выше связывающих активностей, например, сравнивают связывающие активности тестируемой и контрольной антигенсвязывающих молекул с линейным пептидом, в который интродуцирована мутация, с помощью указанного выше формата ELISA. Помимо метода ELISA связывающую активность в отношении мутантного пептида, связанного с колонкой, можно определять, пропуская через колонку тестируемую и контрольную антигенсвязывающую молекулу и затем оценивая количество антигенсвязывающей молекулы, элюированной в раствор для элюции. Известны методы адсорбции мутантного пептида на колонке, например, в форме слитого с GST пептида.
Альтернативно этому, когда идентифицированный эпитоп представляет собой конформационный эпитоп, то для решения вопроса о том, имеют ли тестируемая и контрольная антигенсвязывающие молекулы общий эпитоп, можно применять следующий метод. Сначала получают экспрессирующие GPC3 клетки и клетки, экспрессирующие GPC3 с мутацией, интродуцированной в эпитоп. Тестируемую и контрольную молекулы добавляют в клеточную суспензию, полученную путем суспендирования этих клеток в приемлемом буфере, таком как ЗФР. Затем клеточные суспензии соответствующим образом промывают буфером и добавляют меченное с помощью ФИТЦ антитело, которое распознает тестируемую и контрольную антигенсвязывающие молекулы. Определяют интенсивность флуоресценции и количество клеток, окрашенных меченым антителом, используя FACSCalibur (фирма BD). Тестируемый и контрольный полипептидные комплексы соответствующим образом разводят приемлемым буфером и применяют в требуемой концентрации. Например, их можно применять в концентрации от 10 мкг/мл до 10 нг/мл. Интенсивность флуоресценции определяют с помощью анализа, для оценки результатов которого применяют программу CELL QUEST (фирма BD), а именно, определяют среднее геометрическое значение, которое отражает количество меченого антитела, связанного с клетками. Это означает, что связывающие активности тестируемой и контрольной антигенсвязывающих молекул, которые характеризуются количеством связанного меченого антитела, можно определять, оценивая среднее геометрическое значение.
При осуществлении описанного выше метода для решения вопроса о том, характерно ли для антигенсвязывающей молекулы незначительное связывание с клетками, которые экспрессируют мутантный GPC3, можно применять, например, следующий метод. Сначала тестируемую и контрольную антигенсвязывающие молекулы, связанные с клетками, которые экспрессируют мутантный GPC3, окрашивают меченым антителом. Затем определяют интенсивность флуоресценции в клетках. Когда для оценки флуоресценции используют проточный цитометр, то интенсивность флуоресценции можно анализировать с помощью программы CELL QUEST. На основе средних геометрических значений в присутствии антигенсвязывающей молекулы и без нее можно рассчитывать согласно приведенной ниже формуле используемое для сравнения значение (AGeo-Mean), характеризующее степень увеличения интенсивности флуоресценции в результате связывания с антигенсвязывающей молекулой:
AGeo-Mean=Geo-Mean (в присутствии антигенсвязывающей молекулы)/Geo-Mean (в отсутствии антигенсвязывающей молекулы).
Используемое для сравнения среднее геометрическое значение (значение AGeo-Mean для мутантной молекулы GPC3), определенное с помощью описанного выше анализа, которое отражает количество тестируемой антигенсвязывающей молекулы, связанной с клетками, которые экспрессируют мутантный GPC3, сравнивают с относительным значением AGeo-Mean, которое отражает количество тестируемой антигенсвязывающей молекулы, связанной с экспрессирующими GPC3 клетками. В этом случае концентрации тестируемой антигенсвязывающей молекулы, применяемые для определения относительных значений AGeo-Mean для экспрессирующих GPC3 клеток и клеток, экспрессирующих мутантный GPC3, наиболее предпочтительно регулируют таким образом, чтобы они были одинаковыми или практически одинаковыми. Антигенсвязывающую молекулу, для которой подтверждена способность распознавать эпитоп в GPC3, применяют в качестве контрольной антигенсвязывающей молекулы.
Если используемое для сравнения значение AGeo-Mean тестируемой антигенсвязывающей молекулы в отношении клеток, экспрессирующих мутантный GPC3, ниже чем используемое для сравнения значение AGeo-Mean тестируемой антигенсвязывающей молекулы в отношении клеток, экспрессирующих GPC3, по меньшей мере на 80%, предпочтительно на 50%, более предпочтительно на 30% и наиболее предпочтительно на 15%, то считают, что тестируемая антигенсвязывающая молекула незначительно связывается с клетками, которые экспрессируют мутантный GPC3. Формула определения значения Geo- 32 041830
Mean (среднее геометрическое значение) описана в руководстве по применению программы CELL
QUEST (фирма BD biosciences). Когда путем сравнения установлено, что относительные значения являются практически эквивалентными, то можно считать, что тестируемая и контрольная антигенсвязывающие молекулы имеют одинаковый эпитоп.
Вариабельный фрагмент (Fv).
В контексте настоящего описания понятие вариабельный фрагмент (Fv) относится к минимальной единице полученного из антитела антигенсвязывающего домена, который состоит из пары, включающей вариабельную область легкой цепи антитела (VL) и вариабельную область тяжелой цепи антитела (VH). В 1988 г. Skerra и Pluckthun обнаружили, что гомогенные и активные антитела можно получать из периплазматической фракции Е. coli путем встраивания гена антитела по ходу транскрипции относительно бактериальной сигнальной последовательности и индукции экспрессии гена в Е. coli (Science 240(4855), 1988, с. 1038-1041). В Fv, полученном из периплазматической фракции, VH ассоциируется с VL таким образом, чтобы связываться с антигеном.
Согласно настоящему описанию Fv предпочтительно включает, например, пару Fv, которые представляют собой антигенсвязывающую молекулу или т.п., содержащую:
(1) двухвалентный антигенсвязывающий домен, который представляет собой двухвалентный scFv, в котором один одновалентный scFv двухвалентного scFv сцеплен с одним полипептидом, образующим Fc-домен, посредством тяжелой цепи Fv-фрагмента, образующего CD3-связывающий домен, а другой одновалентный scFv сцеплен с другим полипептидом, образующим Fc-домен, посредством легкой цепи Fv-фрагмента, образующего CD3-связывающий домен;
(2) домен, содержащий Fc-домен, который не обладает связывающей активностью в отношении Fcγ-рецептора и который получен из аминокислот, образующих Fc-домен IgG1, IgG2a, IgG3 или IgG4, и (3) по меньшей мере один одновалентный CD3-связывающий домен, где легкая цепь и тяжелая цепь Fv-фрагментов в результате ассоциации образуют такой CD3-связывающий домен, который может связываться с антигеном CD3.
scFv, одноцепочечное антитело и sc(Fv)2.
В контексте настоящего описания понятия scFv, одноцепочечное антитело и sc(Fv)2 все относятся к фрагменту антитела в виде одной полипептидной цепи, которая содержит вариабельные области, полученные из тяжелой и легкой цепей, но не содержит константную область. Как правило, одноцепочечное антитело содержит также полипептидный линкер между VH- и VL-доменами, позволяющий образовывать требуемую структуру, которая, вероятно, обеспечивает связывание антигена. Одноцепочечное антитело подробно описано у Pluckthun в: The Pharmacology of Monoclonal Antibodies, т. 113, под ред. Rosenburg и Moore, изд-во Springer-Verlag, New York, 1994, с. 269-315 (см. также публикацию международного патента WO 1988/001649; US №№ 4946778 и 5260203). В конкретном варианте осуществления изобретения одноцепочечное антитело может быть биспецифическим и/или гуманизированным.
scFv представляет собой антигенсвязывающий домен, в котором VH и VL, образующие Fv, сцеплены друг с другом с помощью пептидного линкера (Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85(16), 1988, с. 58795883). VH и VL могут удерживаться в непосредственной близости с помощью пептидного линкера.
sc(Fv)2 представляет собой одноцепочечное антитело, в котором четыре вариабельные области двух VL и двух VH сцеплены линкерами такими как пептидные линкеры, с образованием одной цепи (J Immunol. Methods 231(1-2), 1999, с. 177-189). Две VH и две VL можно получать из различных моноклональных антител. Указанные sc(Fv)2 предпочтительно включают, например, биспецифический sc(Fv)2, распознающий два эпитопа, которые присутствуют в одном антигене, что описано в Journal of Immunology 152(11), 1994, с. 5368-5374. sc(Fv)2 можно получать методами, известными специалистам в данной области. Например, sc(Fv)2 можно получать путем связывания scFv с помощью линкера, такого как пептидный линкер.
Согласно настоящему описанию к форме антигенсвязывающего домена, образующего sc(Fv)2, относится антитело, в котором две единицы VH и две единицы VL организованы в следующем порядке: VH, VL, VH и VL ([VH]-линкер-[VL]-линкер-[VH]-линкер-[VL]), начиная с N-конца одноцепочечного полипептида. Порядок расположения двух единиц VH и двух единиц VL не ограничен указанной выше формой, и их можно организовывать в любом порядке. Пример порядка расположения в различных формах приведен ниже. [VL]-линкер-[VH]-линкер-[VH]-линкер-[VL], [VH]-линкер-[VL]-линкер-[VL]-линкер[VH], [VH]-линкер-[VH]-линкер-[VL]-линкер-[VL], [VL]-линкер-[VL]-линкер-[VH]-линкер-[VH], [VL]линкер- [VH] - линкер-[VL]-линкер- [VH].
Молекулярная форма sc(Fv)2 подробно описана также в WO 2006/132352. Таким образом, согласно указанным описаниям специалисты в данной области могут получать требуемый sc(Fv)2, предназначенный для создания антигенсвязывающих молекул, представленных в настоящем описании.
Кроме того, антигенсвязывающие молекулы, предлагаемые в настоящем изобретении, можно конъюгировать с полимером-носителем, таким как ПЭГ, или органическим соединением, таким как противораковое средство. Альтернативно этому, дополнительную последовательность сахарной цепи предпочтительно встраивают в полипептидные комплексы для того, чтобы сахарная цепь обеспечивала требуемое действие.
- 33 041830
Линкеры, предназначенные для связывания вариабельных областей антитела, представляют собой произвольные пептидные линкеры, которые можно интродуцировать с помощью генной инженерии, синтетические линкеры и линкеры, описанные, например, в Protein Engineering, 9(3), 1996, с. 299-305. Однако для целей настоящего изобретения наиболее предпочтительными являются пептидные линкеры. Длина пептидных линкеров специально не ограничена, и специалисты в данной области могут выбирать ее в зависимости от поставленной задачи. Предпочтительная длина составляет пять или большее количество аминокислот (при этом, верхний предел составляет (но не ограничиваясь только указанным), как правило, вплоть до 30 аминокислот или менее, предпочтительно 20 аминокислот или менее), и наиболее предпочтительно 15 аминокислот. Когда sc(Fv)2 содержит три пептидных линкера, то их длина может быть одинаковой или различной. Например, указанные пептидные линкеры включают:
Ser,
Gly· Ser,
Gly· Gly· Ser,
Ser·Gly Gly,
Gly Gly Gly Ser (SEQ ID NO: 15),
Ser Gly Gly Gly (SEQ ID NO: 16),
Gly Gly Gly Gly Ser (SEQ ID NO: 17),
Ser Gly Gly Gly Gly (SEQ ID NO: 18),
Gly Gly Gly Gly Gly Ser (SEQ ID NO: 19),
Ser Gly Gly Gly Gly Gly (SEQ ID NO: 20),
Gly· Gly Gly· Gly· Gly· Gly· Ser (SEQ ID NO: 21),
Ser Gly Gly Gly Gly Gly Gly (SEQ ID NO: 22), (Gly Gly Gly Gly Ser (SEQ ID NO: 17))n, (Ser Gly Gly Gly Gly (SEQ ID NO: 18))n, где n обозначает целое число от 1 или более. Специалисты в данной области могут выбирать длину или последовательности пептидных линкеров в зависимости от поставленной задачи.
Как правило, для перекрестного сшивания используют синтетические линкеры (химические перекрестносшивающие агенты), они представляют собой, например:
N-гидроксисукцинимид (NHS), дисукцинимидилсуберат (DSS), бис(сульфосукцинимидил)суберат (BS), дитиобис(сукцинимидилпропионат) (DSP), дитиобис(сульфосукцинимидилпропионат) (DTSSP), этиленгликольбис(сукцинимидилсукцинат) (EGS), этиленгликольбис(сульфосукцинимидилсукцинат) (сульфо-EGS), дисукцинимидилтартрат (DST), дисульфосукцинимидилтартрат (сульфо-DST), бис-[2-(сукцинимидоксикарбонилокси)этил]сульфон (BSOCOES) и и бис-[2-(сульфосукцинимидоксикарбонилокси)этил]сульфон (сульфо-BSOCOES). Эти перекрестносшивающие агенты поступают в продажу.
Как правило, требуется три линкера для соединения вместе четырех вариабельных областей антитела. Применяемые линкеры могут быть одного типа или различных типов.
Fab, F(ab')2 и Fab'.
Fab состоит из одной легкой цепи и СН1-домена и вариабельной области из одной тяжелой цепи. Тяжелая цепь молекулы Fab не может образовывать дисульфидные мостики с тяжелой цепью другой молекулы.
F(ab')2 или Fab получают обработкой иммуноглобулина (моноклональное антитело) протеазой, такой как пепсин и папаин, и они относятся к фрагменту антитела, получаемого расщеплением иммуноглобулина (моноклональное антитело) вблизи дисульфидных мостиков, присутствующих между шарнирными областями в каждой из двух H-цепей. Например, папаин расщепляет IgG перед дисульфидными мостиками, присутствующими между шарнирными областями в каждой из двух H-цепей, с образованием двух гомологичных фрагментов антитела, в которых L-цепь, содержащая VL (вариабельная область Lцепи), и CL (константная область L-цепи), сцеплены с фрагментом H-цепи, содержащим VH (вариабельная область H-цепи) и CHyI (γ1-область в константной области H-цепи), через дисульфидный мостик в их С-концевых областях. Каждый из указанных двух гомологичных фрагментов антител обозначают как Fab'.
F(ab')2 состоит из двух легких цепей и двух тяжелых цепей, содержащих в константной области СН1-домен и часть СН2-доменов, в результате между двумя тяжелыми цепями образуются дисульфидные мостики. F(ab')2, образующий антигенсвязывающую молекулу, представленную в настоящем описании, предпочтительно можно получать следующим образом. Полное моноклональное антитело или
- 34 041830 сходное антитело, содержащее требуемый антигенсвязывающий домен, частично расщепляют протеазой, такой как пепсин; и Fc-фрагменты удаляют путем адсорбции на колонке с белком А. Не существует ограничения касательно конкретной протеазы, если она обладает способностью избирательно расщеплять полное антитело с образованием F(ab')2 в соответствующих для данного фермента реакционных условиях, таких как значение pH. Указанные протеазы представляют собой, например, пепсин и фицин.
Fc-домен.
Fc-домен, который образует антигенсвязывающую молекулу, представленную в настоящем описании, предпочтительно можно получать следующим образом. Антитело, такое как моноклональное антитело, частично расщепляют протеазой, такой как пепсин. Затем образовавшийся фрагмент адсорбируют на колонке с белком А или белком G и элюируют соответственным буфером для элюции. Не существует ограничения касательно конкретной протеазы, если она обладает способностью избирательно расщеплять антитела, такие как моноклональные антитела, в соответствующих для данного фермента реакционных условиях, таких как значение pH. Указанные протеазы представляют собой, например, пепсин и фицин.
Антигенсвязывающие молекулы, представленные в настоящем описании, содержат Fc-домен с пониженной способностью связывать Fey-рецептор, которые включают аминокислоты, образующие Fcдомен IgG1, IgG2, IgG3 или IgG4.
Изотип антитела определяют на основе структуры константной области. Константные области изотипов IgG1, IgG2, IgG3 и IgG4 обозначают как Cy1, Cy2, Cy3 и Су4 соответственно. Аминокислотные последовательности Fc-домена полипептидов, которые образуют человеческие Cy1, Cy2, Cy3 и Су4, в качестве примера представлены в SEQ ID NO: 23, 24, 25 и 26 соответственно. Взаимосвязь между аминокислотными остатками, образующими каждую аминокислотную последовательность, и EU-нумерацией Кэбота (обозначена в контексте настоящего описания как EU-индекс), представлена на фиг. 12.
Понятие Fc-домен относится к области вне F(ab')2, которая содержит две легкие цепи и две тяжелые цепи, содержащие часть константной области, которая включает СН1-домен и область между СН1- и СН2-доменами, что позволяет образовываться дисульфидным мостикам между двумя тяжелыми цепями. Fc-домен, образующий антигенсвязывающую молекулу, представленную в настоящем описании, предпочтительно можно получать следующим образом. Моноклональное антитело в виде IgG1, IgG2, IgG3 или IgG4 или сходное антитело частично расщепляют протеазой, такой как пепсин, с последующей элюцией фракции, адсорбированной на колонке с белком А. Не существует ограничения касательно конкретной протеазы, если она обладает способностью избирательно расщеплять полное антитело с образованием F(ab')2 в соответствующих для данного фермента реакционных условиях, таких как значение pH. Указанные протеазы представляют собой, например, пепсин и фицин.
Fcy-рецептор.
Понятие Fcy-рецептор относится к рецептору, обладающему способностью связываться с Fcдоменом моноклональных антител в виде IgG1, IgG2, IgG3 или IgG4, и оно включает всех представителей, принадлежащих к семейству белков, которые кодируются главным образом геном Fcy-рецептора. У человека семейство включает FcyRI (CD64), включая изоформы FcyRIa, FcyRIb и FcyRIc; FcyRII (CD32), включая изоформы FcyRIIa (в том числе аллотип Н131 и R131), FcyRIIb (включая FcyRIIb-1 и FcyRIIb-2) и FcyRIIc; и FcyRIII (CD16), включая изоформу FcyRIIIa (в том числе аллотипы V158 и F158), и FcyRIIIb (в той числе аллотипы FcyRIIIb-NA1 и FcyRIIIb-NA2); а также все неидентифицированные человеческие FcyR, изоформы FcyR и их аллотипы. Однако Fcy-рецептор не ограничен указанными примерами. FcyR включает (но не ограничиваясь только ими) FcyR, полученные из антител человека, мышей, крыс, кроликов и обезьян. FcyR можно получать из любого организма. Мышиный FcyR включает (но не ограничиваясь только ими) FcyRI (CD64), FcyRII (CD32), FcyRIII (CD16) и FcyRIII-2 (CD16-2), а также все неидентифицированные мышиные FcyR, изоформы FcyR и их аллотипы. Указанные предпочтительные Fcyрецепторы включают, например, человеческие FcyI (CD64), FcyIIA (CD32), FcyIIB (CD32), FcyIIIA (CD16) и/или FcyIIIB (CD16). Полинуклеотидная последовательность и аминокислотная последовательность FcyI представлены в SEQ ID NO: 27 (NM_000566.3) и 28 (NP_000557.1) соответственно; полинуклеотидная последовательность и аминокислотная последовательность FcyIIA представлены в SEQ ID NO: 29 (ВС020823.1) и 30 (ААН20823.1) соответственно; полинуклеотидная последовательность и аминокислотная последовательность FcyIIB представлены в SEQ ID NO: 31 (ВС 146678.1) и 32 (AAI46679.1) соответственно; полинуклеотидная последовательность и аминокислотная последовательность FcyIIIA представлены в SEQ ID NO: 33 (ВС033678.1) и 34 (ААН33678.1) соответственно и полинуклеотидная последовательность и аминокислотная последовательность FcyIIIB представлены в SEQ ID NO: 35 (ВС 128562.1) и 36 (AAI28563.1) соответственно (в скобках указан регистрационный номер каждой последовательности в базе данных RefSeq). Обладает ли Fcy-рецептор способностью связываться с Fc-доменом моноклонального антитела IgG1, IgG2, IgG3 или IgG4, можно оценивать с помощью ALPHA Screen®анализа (гомогенный анализ усиленной за счет эффекта близости люминесценции (Amplified Luminescent Proximity Homogeneous Assay)), BIACORE-метода на основе поверхностного плазмонного резонанса
- 35 041830 (SPR) и др. (Proc. Nail. Acad. Sci. USA 103(11), 2006, с. 4005-4010), помимо описанных выше форматов
FACS и ELISA.
При этом понятие Fc-лиганд или эффекторный лиганд относится к молекуле и предпочтительно полипептиду, который связывается с Fc-доменом антитела, образуя комплекс Fc/Fc-лиганд. Молекулу можно получать из любого организма. Связывание Fc-лиганда с Fc предпочтительно индуцирует одну или несколько эффекторных функций. Указанные лиганды включают (но не ограничиваясь только ими) Fc-рецепторы, FcyR, FcaR, FcεR, FcRn, C1q и C3, маннансвязывающий лектин, маннозный рецептор, белок A Staphylococcus, белок G Staphylococcus и вирусные FcyR. Fc-лиганды включают также гомологи Fc-рецептора (FcRH) (Davis и др., Immunological Reviews 190, 2002, с. 123-136), которые представляют собой семейство Fc-рецепторов, гомологичных FcyR. К Fc-лигандам относятся также неидентифицированные молекулы, которые связываются с Fc.
Активность связывания с Fcy-рецептором.
Нарушение активности связывания Fc-домена с любым из Fcy-рецепторов FcyI, FcyIIA, FcyIIB, FcyIIIA и/или FcyIIIB можно оценивать, используя описанные выше форматы FACS и ELISA, а также ALPHA Screen-анализ (гомогенный анализ усиленной за счет эффекта близости люминисценции, BIACORE-метод на основе поверхностного плазмонного резонанса (SPR) (Proc. Natl. Acad. Sci. USA 103(11), 2006, с. 4005-4010).
ALPHA Screen-анализ осуществляют на основе технологии ALPHA, которая основана на описанном ниже принципе, с использованием двух типов гранул. Люминисцентный сигнал становится обнаруживаемым только тогда, когда происходит биологическое взаимодействие молекул, связанных с гранулами-донорами, с молекулами, связанными с гранулами-акцепторами, и когда обе гранулы находятся в непосредственной близости друг от друга. Возбужденный лазерным пучком фотосенсибилизатор в гранулах-донорах превращает кислород в возбужденный синглетный кислород. Когда синглетный кислород диффундирует из гранул-доноров и достигает гранул-акцепторов, локализованных в непосредственной близости, то индуцируется хемилюминисцентная реакция в гранулах-акцепторах. В итоге эта реакция приводит к испусканию света. Если молекулы, связанные с гранулами-донорами, не взаимодействуют с гранулами-акцепторами, то синглетный кислород, который продуцируется гранулами-донорами, не достигает гранул-акцепторов и хемилюминисцентная реакция не происходит.
Например, меченную биотином антигенсвязывающую молекулу иммобилизуют на гранулахдонорах, а меченный глутатион-S-трансферазой (GST) Fcy-рецептор иммобилизуют на гранулахакцепторах. В отсутствии антигенсвязывающей молекулы, содержащей конкурирующий мутантный Fcдомен, Fcy-рецептор взаимодействует с антигенсвязывающей молекулой, содержащей Fc-домен дикого типа, индуцируя в результате сигнал с длиной волны от 520 до 620 нм. Антигенсвязывающая молекула, содержащая немеченый мутантный Fc-домен, конкурирует с антигенсвязывающей молекулой, содержащей Fc-домен дикого типа, за взаимодействие с Fcy-рецептором. Относительную аффинность связывания можно оценивать, определяя количественно снижение флуоресценции в результате конкуренции. Методы биотинилирования антигенсвязывающих молекул, таких как антитела, с помощью сульфо-NHSбиотина или подобных агентов являются известными. Приемлемые методы введения GST-метки в Fcyрецептор включают методы, которые предусматривают слияние полипептидов, кодирующих Fcy и GST, в рамке считывания, экспрессию слитого гена с использованием клеток, в которые интродуцирован вектор, несущий ген, и последующую очистку с помощью содержащей глутатион колонки. Индуцированный сигнал предпочтительно можно анализировать, например, посредством подгонки к односайтовой модели конкуренции на основе нелинейного регрессионного анализа с использованием такой программы, как GRAPHPAD PRISM (фирма GraphPad; Сан-Диего).
Одну из субстанций, предназначенных для исследования их взаимодействия, иммобилизуют в качестве лиганда на тонком слое золота сенсорного чипа. Когда свет проникает на заднюю поверхность сенсорного чипа так, что имеет место полное отражение на границе раздела между тонким слоем золота и стеклом, то интенсивность отраженного света в определенном сайте частично снижается (SPR-сигнал). Другую субстанцию, предназначенную для исследования ее взаимодействия, инъецируют в качестве аналита на поверхность сенсорного чипа. Когда аналит связывается с лигандом, то масса иммобилизованной молекулы-лиганда возрастает. Это изменяет показатель преломления растворителя на поверхности сенсорного чипа. Изменение показателя преломления вызывает положительный сдвиг SPR-сигнала (и наоборот, диссоциация сдвигает сигнал назад в исходное положение). В Biacore-системе уровень описанного выше сдвига (т.е. изменение массы на поверхности сенсорного чипа) откладывают по вертикальной оси, и таким образом в качестве количественных данных получают график изменения массы в зависимости от времени (сенсограмма). Кинетические параметры (константа скорости ассоциации (ka) и константа скорости диссоциации (kd)) определяют из представленных в виде кривых сенсограмм, и определяют аффинность (KD) как соотношение указанных двух констант. BIACORE-методы предпочтительно применяют для анализа ингибирования. Примеры такого анализа ингибирования описаны в Proc. Natl. Acad. Sci. USA 103(11), 2006, с. 4005-4010.
В контексте настоящего описания пониженная активность связывания с Fcy-рецептором означает,
- 36 041830 например, что при использовании описанного выше метода анализа конкурентная активность тестируемой антигенсвязывающей молекулы составляет 50% или менее, предпочтительно 45% или менее, 40% или менее, 35% или менее, 30% или менее, 20% или менее или 15% или менее и наиболее предпочтительно 10% или менее, 9% или менее, 8% или менее, 7% или менее, 6% или менее, 5% или менее, 4% или менее, 3% или менее, 2% или менее или 1% менее, по сравнению с конкурентной активностью контрольной антигенсвязывающей молекулы.
Антигенсвязывающие молекулы, содержащие Fc-домен моноклонального антитела в виде IgG1, IgG2, IgG3 или IgG4, можно использовать соответственно в качестве контрольных антигенсвязывающих молекул. Структуры Fc-домена представлены в SEQ ID NO: 37 (А добавлен к N-концу последовательности, представленной в RefSeq под регистрационным номером ААС82527.1), SEQ ID NO: 38 (А добавлен к N-концу последовательности, представленной в RefSeq под регистрационным номером ААВ59393.1), SEQ ID NO: 25 (А добавлен к N-концу последовательности, представленной в RefSeq под регистрационным номером САА27268.1) и SEQ ID NO: 39 (А добавлен к N-концу последовательности, представленной в RefSeq под регистрационным номером ААВ59394.1). Кроме того, когда антигенсвязывающую молекулу, содержащую мутантный Fc-домен антитела конкретного изотипа, используют в качестве тестируемой субстанции, то воздействие мутации мутанта на активность связывания с Fcy-рецептором оценивают с использованием в качестве контроля антигенсвязывающей молекулы, содержащей Fc-домен такого же изотипа. Как описано выше, соответственно получают антигенсвязывающие молекулы, содержащие мутантный Fc-домен с действительно пониженной активностью связывания с Fcy-рецептором.
Такие известные мутанты включают, например, мутанты с делецией аминокислот 231A-238S (EUнумерация) (WO 2009/011941), а также мутанты C226S, C229S, P238S, (C220S) (J. Rheumatol 34, 2007, с. 11); C226S и C229S (Hum. Antibod. Hybridomas 1(1), 1990, с. 47-54); C226S, C229S, Е233Р, L234V, и L235A (Blood 109, 2007, с. 1185-1192).
В частности, предпочтительными антигенсвязывающими молекулами являются молекулы, которые содержат Fc-домен с заменой аминокислоты в положении 220, 226, 229, 231, 232, 233, 234, 235, 236, 237, 238, 239, 240, 264, 265, 266, 267, 269, 270, 295, 296, 297, 298, 299, 300, 325, 327, 328, 329, 330, 331 или 332 (EU-нумерация) в аминокислотах, образующих Fc-домен антитела конкретного изотипа. Изобретение не ограничено изотипом антитела, из которого получают Fc-домен, и можно использовать соответствующий Fc-домен, полученный из моноклонального антитела в виде IgG1, IgG2, IgG3 или IgG4. Предпочтительно следует применять Fc-домен, полученный из антител в виде IgG1.
Предпочтительными антигенсвязывающими молекулами являются, например, молекулы, которые содержат Fc-домен, содержащий одну из указанных ниже замен, положение которой определяется согласно EU-нумерации (каждый номер обозначает положение аминокислотного остатка согласно EUнумерации; и однобуквенный символ аминокислоты, который находится перед номером, обозначает аминокислотный остаток до его замены, а однобуквенный символ аминокислоты, расположенный за номером, обозначает аминокислотный остаток после замены), среди аминокислот, образующих Fc-домен антитела в виде IgG1:
(a) L234F, L235E, P331S;
(б) C226S, C229S, P238S;
(в) C226S, C229S;
(г) C226S, C229S, Е233Р, L234V, L235A;
(д) L234A, L235A или L235R, N297A;
(е) L235A или L235R, S239K, N297A, а также молекулы, которые содержат Fc-домен с делецией аминокислот в положениях 231-238.
Кроме того, предпочтительными антигенсвязывающими молекулами являются также молекулы, которые содержат Fc-домен, содержащий одну из указанных ниже замен, положение которой определяют согласно EU-нумерации, среди аминокислот, образующих Fc-домен антитела в виде IgG2:
(ж) H268Q, V309L, A330S и P331S;
(з) V234A;
(и) G237A;
(к) V234A и G237A;
(л) А235Еи G237A;
(м) V234A, А235Е и G237A.
Каждый номер обозначает положение аминокислотного остатка согласно EU-нумерации; и однобуквенный символ аминокислоты, который находится перед номером, обозначает аминокислотный остаток до его замены, а однобуквенный символ аминокислоты, расположенный за номером, обозначает аминокислотный остаток после замены.
Кроме того, предпочтительными антигенсвязывающими молекулами являются молекулы, которые содержат Fc-домен, содержащий одну из указанных ниже замен, положение которой определяют согласно EU-нумерации, среди аминокислот, образующих Fc-домен антитела в виде IgG3:
(н) F241A;
- 37 041830 (о) D265A;
(п) V264A.
Каждый номер обозначает положение аминокислотного остатка согласно EU-нумерации; и однобуквенный символ аминокислоты, который находится перед номером, обозначает аминокислотный остаток до его замены, а однобуквенный символ аминокислоты, расположенный за номером, обозначает аминокислотный остаток после замены.
Кроме того, предпочтительными антигенсвязывающими молекулами являются молекулы, которые содержат Fc-домен, содержащий одну из указанных ниже замен, положение которой определяют согласно EU-нумерации, среди аминокислот, образующих Fc-домен антитела в виде IgG4:
(р) L235A, G237A и Е318А;
(c) L235E;
(т) F234A и L235A.
Каждый номер обозначает положение аминокислотного остатка согласно EU-нумерации; и однобуквенный символ аминокислоты, который находится перед номером, обозначает аминокислотный остаток до его замены, а однобуквенный символ аминокислоты, расположенный за номером, обозначает аминокислотный остаток после замены.
Другие предпочтительные антигенсвязывающие молекулы представляют собой молекулы, содержащие Fc-домен, в котором любая аминокислота в положении 233, 234, 235, 236, 237, 327, 330 или 331 (EU-нумерация) среди аминокислот, образующих Fc-домен антитела в виде IgG1, заменена на аминокислоту, которая находится в соответствующем положении согласно EU-нумерации в соответствующем IgG2 или IgG4.
Предпочтительные антигенсвязывающие молекулы представляют собой также молекулы, содержащие Fc-домен, в котором одна или несколько аминокислот в положениях 234, 235 и 297 (EU-нумерация) среди аминокислот, образующих Fc-домен антитела в виде IgG1, заменена(ы) на другие аминокислоты. Изобретение не ограничено типом аминокислоты после замены; однако наиболее предпочтительными являются антигенсвязывающие молекулы, содержащие Fc-домен, в котором одна или несколько аминокислот в положениях 234, 235 и 297 заменена(ы) на аланин.
Предпочтительные антигенсвязывающие молекулы представляют собой также молекулы, содержащие Fc-домен, в котором аминокислота в положении 265 (EU-нумерация) среди аминокислот, образующих Fc-домен антитела в виде IgG1, заменена другой аминокислотой. Изобретение не ограничено типом аминокислоты после замены; однако наиболее предпочтительными являются антигенсвязывающие молекулы, содержащие Fc-домен, в котором аминокислота в положении 265 заменена на аланин.
Мультиспецифическая антигенсвязывающая молекула.
Примеры предпочтительных вариантов мультиспецифической антигенсвязывающей молекулы, предлагаемой в настоящем изобретении, включают мультиспецифические антитела. Когда Fc-область с пониженной связывающей активностью в отношении Fcy-рецептора применяют в качестве Fc-области мультиспецифического антитела, то соответственно можно применять Fc-область, полученную из мультиспецифического антитела. Биспецифические антитела являются наиболее предпочтительными в качестве мультиспецифических антител, предлагаемых в настоящем изобретении. В этом случае биспецифическое антитело представляет собой антитело, имеющее две различные специфичности. Биспецифические антитела IgG-типа можно секретировать из гибридной гибридомы (квадромы), полученной путем слияния двух типов гибридом, продуцирующих антитело в виде IgG (Milstein С. и др., Nature 305, 1983, с. 537-540).
Кроме того, биспецифические антитела IgG-типа секретируют посредством интродукции в клетки в целом четырех генов, т.е. генов L-цепей и H-цепей, образующих представляющие интерес IgG двух типов, и их коэкспрессии. Однако теоретически существует десять комбинаций H-цепей и L-цепей IgG, которые можно получать такими методами. При этом трудно очищать IgG, состоящий из требуемой комбинации H-цепей и L-цепей из десяти типов IgG. Кроме того, теоретическое количество секретируемого IgG с требуемой комбинацией, также в значительной степени снижено, поэтому требуется осуществлять крупномасштабное культивирование. Это дополнительно увеличивает стоимость производства.
Таким образом, для мультиспецифических антигенсвязывающих молекул, предлагаемых к настоящем изобретении, можно применять методики, усиливающие ассоциацию между H-цепями и между L- и H-цепями, имеющими требуемые комбинации.
Например, методики подавления нежелательной ассоциации H-цепей путем интродукции электростатического отталкивания на поверхности раздела второго константного участка или третьего константного участка H-цепи антитела (СН2 или CH3) можно применять для ассоциации мультиспецифического антитела (WO 2006/106905).
При осуществлении метода подавления нежелательной ассоциации H-цепей путем интродукции электростатического отталкивания на поверхности раздела СН2 или CH3, примеры аминокислотных остатков, контактирующих на поверхности раздела с другим константным участком H-цепи, включают области, соответствующие остаткам, находящимся согласно EU-нумерации в положениях 356, 439, 357, 370, 399 и 409 в CH3-участке.
- 38 041830
Более конкретно, примеры включают антитело, содержащее два типа СНЗ-участков H-цепи, в которых 1-3 пары аминокислотных остатков в CH3-участке первой H-цепи, выбранные из пар аминокислотных остатков, указанных ниже в подпунктах (1)-(3), несут одинаковый типа заряда:
(1) аминокислотные остатки в CH3-участке H-цепи, которые находятся согласно EU-нумерации в положениях 356 и 439;
(2) аминокислотные остатки в CH3-участке H-цепи, которые находятся согласно EU-нумерации в положениях 357 и 370; и (3) аминокислотные остатки в CH3-участке H-цепи, которые находятся согласно EU-нумерации в положениях 399 и 409.
Кроме того, антитело может представлять собой антитело, в котором пары аминокислотных остатков в CH3-участке второй H-цепи, который отличается от указанного выше CH3-участка первой H-цепи, выбирают из вышеуказанных в подпунктах (1)-(3) пар аминокислотных остатков, в котором 1-3 пары аминокислотных остатков, которые соответствуют вышеуказанным в подпунктах (1)-(3) парам аминокислотных остатков, несущим такой же тип заряда, что и указанный выше для CH3-участка первой Hцепи, несут противоположные заряды относительно соответствующих аминокислотных остатков в указанном выше CH3-участке первой H-цепи.
Соответствующие аминокислотные остатки, указанные выше в подпунктах (1)-(3), при ассоциации располагаются близко друг к другу. Специалисты в данной области могут установить для требуемого CH3-участка H-цепи или константной области H-цепи сайты, которые соответствуют вышеуказанным остаткам, указанным в подпунктах (1)-(3), посредством моделирования гомологии и т.п., используя поступающую в продажу программу, и аминокислотные остатки этих сайтов можно подвергать при необходимости модификациям.
В указанных выше антителах имеющие заряд аминокислотные остатки предпочтительно выбирают, например, из аминокислотных остатков, которые входят в любую одну из указанных ниже групп (а) и (б):
(а) глутаминовая кислота (E) и аспарагиновая кислота (D) и (б) лизин (K), аргинин (R) и гистидин (H).
Касательно указанных выше антител то, что они имеют одинаковый тип заряда означает, например, что два или большее количество аминокислотных остатков все представляют собой аминокислотные остатки, включенные в любую одну из вышеуказанных групп (а) и (б). Понятие имеют противоположный заряд означает, например, что, когда по меньшей мере один из двух или большего количества аминокислотных остатков представляет собой аминокислотный остаток, включенный в любую одну из вышеуказанных групп (а) и (б), остальные остатки должны представлять собой аминокислотные остатки, включенные в другую группу.
В предпочтительном варианте вышеуказанного антитела CH3-участок первой H-цепи и CH3участок второй H-цепи могут быть перекрестно сшиты дисульфиднымм мостиками.
Согласно настоящему изобретению аминокислотные остатки, подлежащие изменению, не ограничены аминокислотными остатками константной области или вариабельной области описанного выше антитела. Касательно полипептидных мутантов или гетеромультимеров специалисты в данной области могут установить аминокислотные остатки, которые образуют поверхность раздела, посредством моделирования гомологии и т.п., используя поступающую в продажу программу, и аминокислотные остатки этих сайтов можно подвергать при необходимости изменениям для того, чтобы регулировать ассоциацию.
Другие известные методики можно применять также для ассоциации мультиспецифических антител, предлагаемых в настоящем изобретении. Полипептиды с различными аминокислотами в Fc-области можно эффективно ассоциировать друг с другом путем замены боковой цепи аминокислоты, присутствующей в одной из вариабельных областей H-цепи антитела, на более крупную боковую цепь (выступ) и замены боковой цепи аминокислоты в соответствующей вариабельной области другой H-цепи на меньшую боковую цепь (впадина) так, что выступ помещается во впадину (WO 1996/027011; Ridgway J.B. и др., Protein Engineering 9, 1996, с. 617-621; Merchant A.M. и др., Nature Biotechnology 16, 1998, с. 677-681 и US 20130336973).
Кроме того, другие известные методики можно применять также для ассоциации мультиспецифических антител, предлагаемых в настоящем изобретении. Ассоциацию полипептидов, имеющих различные последовательности, можно эффективно индуцировать путем комплементарной ассоциации CH3областей, используя сконструированный CH3-домен с обменом цепей, полученный путем изменения части CH3 в одной из H-цепей антитела на соответствующую полученную из IgA последовательность и интродукции в комплементарную часть CH3 в другой H-цепи соответствующей полученной из IgA последовательности (Protein Engineering Design & Selection, 23, 2010, с. 195-202). Указанную известную методику можно применять также для эффективного получения представляющих интерес мультиспецифических антител.
Кроме того, для получения мультиспецифических антител можно применять следующие методики: методики получения антител на основе ассоциации СН1 и CL антитела и ассоциации VH и VL, которые
- 39 041830 описаны в WO 2011/028952, WO2014/018572 и в Nat Biotechnol. 32(2), февраль 2014 г., с. 191-198; методики получения биспецифических антител с использованием в комбинации полученных по отдельности моноклональных антител (обмен плечей Fab, (Fab arm exchange, FAE), описанные в WO 2008/119353 и WO 2011/131746; методики регуляции ассоциации между CH3-доменом тяжелых цепей антител, описанные в WO 2012/058768 и WO 2013/063702; методики получения биспецифических антител, состоящих из двух типов легких цепей и одного типа тяжелой цепи, описанные в WO 2012/023053; методики получения биспецифических антител с использованием двух штаммов бактериальных клеток, которые индивидуально экспрессируют одну из цепей антитела, содержащего одну H-цепь и одну L-цепь, описанные Christoph и др., Nature Biotechnology т. 31, 2013, с. 753-758).
Альтернативно этому, даже, если представляющее интерес мультиспецифическое антитело нельзя получать эффективно, мультиспецифическое антитело, предлагаемое в настоящем изобретении, можно получать путем отделения представляющего интерес мультиспецифического антитела от полученных антител и его очистки. Например, описан метод, позволяющий осуществлять очистку двух типов гомомерных форм и представляющего интерес гетеромерного антитела с помощью ионообменной хроматографии, путем установления различия в изоэлектрических точках в результате интродукции аминокислотных замен в вариабельные области двух типов H-цепей (WO 2007/114325). К настоящему времени в качестве метода для очистки гетеромерных форм описан метод, основанный на применении белка А для очистки гетеродимерного антитела, содержащего H-цепь мышиного IgG2a, которая связывается с белком А, и H-цепь крысиного IgG2b, которая не связывается с белком A (WO 98/050431 и WO 95/033844). Кроме того, гетеродимеризованное антитело само можно эффективно очищать с использованием колонки с белком А путем изменения взаимодействия между каждой из H-цепей и белком А, путем применения Hцепей, в которых аминокислотные остатки в сайте связывания IgG-белок А в положениях 435 и 436 (EUнумерация) заменены на аминокислотные остатки, которые обеспечивают другую аффинность связывания с белком А, такие как Tyr, His или т.п., или с использованием H-цепей с различной аффинностью к белку А, которые получают согласно методу, указанному в приведенном для сравнения примере 5, для изменения взаимодействия каждой из H-цепей с белком А, и последующего применения колонки с белком А.
Альтернативно этому, можно получать общую L-цепь, которая может обеспечивать способность связываться с множеством различных H-цепей, и применять в качестве общей L-цепи мультиспецифического антитела. Для достижения эффективной экспрессии мультиспецифического IgG можно интродуцировать в клетки гены указанной общей L-цепи и множества различных H-цепей и экспрессировать IgG (Nature Biotechnology, 16, 1998, с. 677-681). Метод селекции общей L-цепи, для которой характерна выраженная способность к связыванию с любыми различными H-цепями, можно применять также для селекции общей H-цепи (WO 2004/065611).
Кроме того, Fc-область, отличающуюся улучшенной С-концевой гетерогенностью, можно применять в качестве Fc-области, предлагаемой в настоящем изобретении. Более конкретно, предложены Fcобласти, в которых отсутствуют глицин в положении 446 и лизин в положении 447 (EU-нумерация) в аминокислотных последовательностях двух полипептидов, образующих Fc-область, которая происходит из IgG1, IgG2, IgG3 или IgG4.
Несколько, например, две или большее количество, указанных методик можно применять в сочетании друг с другом. Кроме того, эти методики можно соответствующим образом и раздельно применять к двум H-цепям, подлежащим ассоциации. Кроме того, указанные методики можно применять в комбинации с описанной выше Fc-областью, у которой снижена активность связывания с Fcy-рецептором. Кроме того, антигенсвязывающая молекула, предлагаемая в настоящем изобретении, может представлять собой молекулу, полученную отдельно на основе антигенсвязывающей молекулы, подвергнутой таким описанным выше модификациям, что она имеет такую же аминокислотную последовательность.
Приемлемая мультиспецифическая антигенсвязывающая молекула, предлагаемая в настоящем изобретении, содержит:
(1) домен, содержащий вариабельную область антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении глипикана 3;
(2) домен, содержащий вариабельную область антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора; и (3) домен, содержащий указанную Fc-область с пониженной способностью связываться с Fcyрецептором, ее структура не ограничена указанной.
Согласно настоящему изобретению каждый из вышеуказанных доменов может быть сшит непосредственно с помощью пептидных связей. Например, когда применяют F(ab')2 в качестве домена, содержащего вариабельную область антитела, указанного в подпунктах (1) и (2), и указанные Fc-области в качестве домена, содержащего Fc-область с пониженной способностью связываться с Fcy-рецептором, указанного в подпункте (3), то полипептиды, образованные путем сшивания содержащих вариабельных области доменов, указанных в подпунктах (1) и (2), и содержащего Fc-область домена, указанного в подпункте (3), с помощью пептидных связей, могут образовывать структуру антитела. Такие антитела мож- 40 041830 но получать путем очистки из указанной выше культуральной среды гибридомы, а также путем очистки антител из культуральной среды требуемых клеток-хозяев, которые стабильно несут полинуклеотиды, кодирующие полипептиды, которые образуют антитело.
Примеры предпочтительной вариабельной области Н-цепи антитела, предлагаемой в настоящем изобретении, содержащееся в вариабельной области антитела со связывающей активностью в отношении глипикана 3, включают вариабельные области Н-цепи антитела, которые представлены в табл. 1, или вариабельные области Н-цепи антитела, которые имеют последовательности CDR, аминокислотные последовательности CDR1, CDR2 и CDR3 которых являются такими же, что аминокислотные последовательности CDR1, CDR2 и CDR3, содержащиеся в вариабельных областях Н-цепи, которые указаны в табл. 1, или вариабельные области Н-цепи антитела, которые функционально эквивалентны вышеуказанным вариабельным областям.
Таблица 1
Обозначение последовательности SEQ ID NO: Обозначение последовательности SEQ ID NO:
НОООО 40 GCH042 193
GCH003 170 GCH043 194
GCH005 171 GCH045 195
GCH006 172 GCH053 196
GCH007 173 GCH054 197
GCH008 174 GCH055 198
GCH010 175 GCH056 199
GCH012 176 GCH057 200
GCH013 177 GCH059 201
GCH014 178 GCH060 202
GCH015 179 GCH061 203
GCH016 180 GCH062 204
GCH019 181 GCH064 205
GCH022 182 GCH065 206
GCH023 183 GCH066 207
GCH025 184 GCH067 208
GCH026 185 GCH068 209
GCH027 186 GCH073 210
GCH029 187 GCH094 211
GCH032 188 GCH098 212
GCH034 189 GCH099 213
GCH035 190 GCH100 214
GCH039 191 Н0610 215
GCH040 192
Примеры предпочтительной вариабельной области антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Т-клсточного рецептора, предлагаемой в настоящем изобретении, включают вариабельные области антитела, обладающие связывающей активностью в отношении Тклсточного рецептора. Из Т-клеточных рецепторов предпочтительным является СОЗ, а наиболее предпочтительным CD3e. Примеры вариабельной области Н-цепи антитела, содержащейся в указанных вариабельных областях антитела, включают вариабельные области Н-цепи антитела, которые представлены в табл. 2, или вариабельные области Н-цепи антитела, которые имеют последовательности CDR, аминокислотные последовательности CDR1, CDR2 и CDR3 которых являются такими же, что аминокислотные последовательности CDR1, CDR2 и CDR3, содержащиеся в вариабельных областях Н-цепи, которые указаны в табл. 2, или вариабельные области Н-цепи антитела, которые функционально эквивалентны вышеуказанным вариабельным областям.
-41 041830
Таблица 2
Обозначение послед-ти SEQ ID NO: Обозначение послед-ти SEQ ID NO: Обозначение послед-ти SEQ ID NO:
ИСЕ115НА 52 TR01H036 99 TR01H074 135
СЕ115НА177 64 TR01H037 100 TR01H075 136
СЕ115НА178 65 TR01H038 101 TR01H076 137
СЕ115НА179 66 TR01H039 102 TR01H077 138
СЕ115НА180 67 TR01H040 103 TR01H079 139
hCE115HAa 68 TR01H041 104 TR01H080 140
TR01H006 69 TR01H042 105 TR01H081 141
TR01H007 70 TR01H043 106 TR01H082 142
TR01H008 71 TR01H044 107 TR01H083 143
TR01H009 72 TR01H045 108 TR01H084 144
TR01H010 73 TR01H046 109 TR01H090 145
TR01H011 74 TRO1H047 110 TR01H091 146
TR01H012 75 TR01H048 111 TR01H092 147
TR01H013 76 TR01H049 112 TR01H093 148
TR01H014 77 TR01H050 113 TR01H094 149
TR01H015 78 TR01H051 114 TR01H095 150
TR01H016 79 TR01H052 115 TR01H096 151
TR01H017 80 TR01H053 116 TR01H097 152
TR01H018 81 TR01H054 117 TR01H098 153
TR01H019 82 TR01H055 118 TR01H099 154
TR01H020 83 TR01H056 119 TR01H100 155
TR01H021 84 TR01H057 120 TR01H101 156
TR01H022 85 TR01H058 121 TR01H102 157
TR01H023 86 TR01H061 122 TR01H103 158
TR01H024 87 TR01H062 123 TR01H104 159
TR01H025 88 TR01H063 124 TR01H105 160
TR01H026 89 TR01H064 125 TR01H106 161
TR01H027 90 TR01H065 126 TR01H107 162
TR01H028 91 TR01H066 127 TR01H108 163
TR01H029 92 TR01H067 128 TR01H109 164
TR01H030 93 TR01H068 129 TR01H110 165
TR01H031 94 TR01H069 130 TR01H111 166
TR01H032 95 TR01H070 131 TR01H112 167
TR01H033 96 TR01H071 132 TR01H113 168
TR01H034 97 TR01H072 133 TR01H114 169
TR01H035 98 TR01H073 134 TR01H001 420
TR01H002 421
TR01H003 422
TR01H004 423
ГСЕ115Н 424
CE115HA121 425
CE115HA122 426
CE115HA124 427
CE115HA192 428
CE115HA236 429
CE115HA251 430
CE115HA252 431
Взаимосвязь между аминокислотными остатками CDR-участков, образующих аминокислотную последовательность H-цепи антитела, и EU-нумерацией Кэбота, представлена на фиг. 13.
Касательно вариабельных областей L-цепи антитела, содержащихся в вариабельной области антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении глипикана 3, и вариабельной области антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, предлагаемых в настоящем изобретении, предпочтительно следует получать общую L-цепь, которая может придавать связывающую активность H-цепи, которая обладает связывающей активностью в отношении глипикана 3, и связывающую активность H-цепи, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, и применять ее в качестве вариабельной области общей Lцепи мультиспецифической антигенсвязывающей молекулы.
Примеры вариабельной области общей L-цепи, которую можно применять согласно настоящему изобретению, включают вариабельные области L-цепи, указанные в табл. 3, вариабельные области Lцепи антитела, которые имеют последовательности CDR, аминокислотные последовательности CDR1, CDR2 и CDR3 которых являются такими же, что и аминокислотные последовательности CDR1, CDR2 и CDR3, содержащиеся в вариабельных областях L-цепи антитела, указанных в табл. 3, и вариабельные области L-цепи антитела, которые функционально эквивалентны вышеуказанным вариабельным областям.
- 42 041830
Таблица 3
Обозначение послед-ти SEQ ID NO:
L0000 53
L0002 217
L0003 218
L0006 219
L0007 220
L0008 221
L0009 222
L0011 223
L0012 224
L0013 225
L0014 226
L0015 227
L0016 228
L0032 229
L0038 230
L0039 231
L0041 232
L0042 233
L0043 234
L0044 235
L0045 236
L0046 237
L0047 238
L0062 239
L0063 240
L0064 241
L0065 242
L0066 243
L0069 244
L0075 245
L0079 246
L0082 247
L0085 248
L0089 249
L0090 250
L0091 251
L0093 252
L0104 253
L0106 254
L0107 255
L0109 256
L0113 257
L0115 258
L0117 259
L0120 260
L0122 261
L0123 262
L0124 263
Обозначение послед-ти SEQ ID NO: Обозначение послед-ти SEQ ID NO:
L0125 264 L0214 312
L0126 265 L0215 313
L0127 266 L0216 314
L0129 267 L0217 315
L0132 268 L0218 316
L0134 269 L0219 317
L0136 270 L0220 318
L0137 271 L0222 319
L0138 272 L0223 320
L0139 273 L0224 321
L0140 274 L0226 322
L0141 275 L0227 323
L0143 276 L0228 324
L0144 277 L0229 325
L0145 278 L0230 326
L0147 279 L0231 327
L0148 280 L0232 328
L0149 281 L0233 329
L0151 282 L0234 330
L0152 283 L0235 331
L0154 284 L0236 332
L0155 285 L0237 333
L0157 286 L0238 334
L0160 287 L0239 335
L0161 288 L0240 336
L0163 289 L0241 337
L0167 290 L0242 338
L0168 291 L0243 339
L0173 292 L0246 340
L0175 293 L0247 341
L0180 294 L0248 342
L0181 295 L0249 343
L0186 296 L0250 344
L0187 297 L0258 345
L0200 298 L0259 346
L0201 299 L0260 347
L0202 300 L0261 348
L0203 301 L0262 349
L0204 302 L0263 350
L0205 303 L0264 351
L0206 304 L0265 352
L0207 305 L0266 353
L0208 306 L0267 354
L0209 307 L0268 355
L0210 308 L0269 356
L0211 309 L0270 357
L0212 310 L0271 358
L0213 311 L0272 359
Взаимосвязь между аминокислотными остатками CDR-участков, образующих аминокислотную последовательность L-цепи антитела, и EU-нумерацией Кэбота, представлена на фиг. 14.
В настоящем изобретении фраза функционально эквивалентный означает, что аффинности связывания с антигеном эквиваленты или в альтернативном варианте означает, что цитотоксическая активность в отношении экспрессирующих глипикан 3 клеток или тканей, содержащих указанные клетки, эквивалентна при применении в качестве мультиспецифической антигенсвязывающей молекулы. Аффинность связывания и цитотоксическую активность можно измерять с помощью метода, указанного в настоящем описании. Клетки, применяемые для измерения цитотоксической активности, могут представлять собой требуемые экспрессирующие GPC3 клетки или требуемую ткань, содержащую указанные клетки, и, например, можно применять человеческие раковые линии клеток и PC-10 или NCI-H446, которые экспрессируют GPC3. Касательно константных областей антитела фраза может означать, что связывающая активность в отношении FcY-рецептора является эквивалентной.
Например, фраза вариабельная область H-цепи антитела, функционально эквивалентная вариабельной области H-цепи антитела, указанной в настоящем описании (т.е. исходной вариабельной области H-цепи), означает, что эта область имеет такую же аффинность связывания, когда ее объединяют с вариабельной областью L-цепи антитела, указанной в настоящем описании, которая образует пару с исходной H-цепью, или в альтернативном варианте означает, что область обладает такой же цитотоксической активностью в отношении экспрессирующих глипикан 3 клеток или тканей, содержащих указанные клетки, когда ее применяют для получения мультиспецифической антигенсвязывающей молекулы. Кроме того, фраза вариабельная область L-цепи антитела, функционально эквивалентная вариабельной области L-цепи антитела, указанной в настоящем описании (т.е. исходной вариабельной области L-цепи), означает, что эта область имеет такую же аффинность связывания, когда ее объединяют с вариабельной
- 43 041830 областью H-цепи антитела, указанной в настоящем описании, которая образует пару с исходной Lцепью, или в альтернативном варианте означает, что область обладает такой же цитотоксической активностью в отношении экспрессирующих глипикан 3 клеток или тканей, содержащих указанные клетки, когда ее применяют для получения мультиспецифической антигенсвязывающей молекулы.
Понятие эквивалентный не обязательно подразумевает наличие такого же уровня активности, и активность может быть повышенной. В частности, антигенсвязывающая аффинность, включает, например, случай, в котором коэффициент (величина KD/величина KD родительского антитела), полученный путем сравнения с аффинностью связывания вариабельной области антитела, которая служит в качестве контроля (величина KD родительского антитела) составляет 1,5 или менее. Коэффициент величина KD/величина KD родительского антитела предпочтительно составляет 1,3 или менее, более предпочтительно 1,2 или менее, 1,1 или менее, 1,0 или менее, 0,9 или менее, 0,8 или менее, 0,7 или менее, 0,6 или менее, или 0,5 или менее. При этом не существует нижнего предела, примеры включают коэффициенты, составляющие 10_1,10’2,10’3,10’4,10’5 или 10-6. Более конкретно, согласно настоящему изобретения коэффициент величина KD/величина KD родительского антитела предпочтительно составляет от 10-6 до 1,5x100, более предпочтительно от 10-6 до 10-1, еще более предпочтительно от 10-6 до 10-2 и еще более предпочтительно от 10-6 до 10-3. Касательно цитотоксической активности, примеры включают случай, в котором коэффициент (скорость ингибирования клеточного роста/скорость ингибирования клеточного роста родительским антителом), полученный путем сравнения со скоростью ингибирования роста клетки мультиспецифической антигенсвязывающей молекулой, которая служит в качестве контроля (скорость ингибирования клеточного роста родительским антителом), составляет 0,7 или более. Концентрацию добавленной мультиспецифической антигенсвязывающей молекулы можно определять соответствующим образом, но предпочтительно она составляет, например, 0,01, 0,05, 0,1, 0,5 или 1нМ; и предпочтительно измерения осуществляют при концентрации 0,05 или 0,1 нМ. Коэффициент скорость ингибирования клеточного роста/скорость ингибирования клеточного роста родительским антителом предпочтительно составляет 0,8 или более, более предпочтительно 0,9 или более, 1,0 или более, 1,2 или более, 1,5 или более, 2 или более, 3 или более, 5 или более, 10 или более или 20 или более. При этом не существует верхнего предела, коэффициент может составлять 10, 102, 103, 104, 105 или 106.
Кроме того, касательно цитотоксической активности примеры включают случай, в котором коэффициент (концентрация, вызывающая ингибирование клеточного роста на 50%/концентрация родительского антитела, вызывающая ингибирование клеточного роста на 50%), полученный путем сравнения с концентрацией исходной мультиспецифической антигенсвязывающей молекулы, вызывающей ингибирование клеточного роста на 50% (концентрация родительского антитела, вызывающая ингибирование клеточного роста на 50%), составляет 1,5 или менее. Концентрация, вызывающая ингибирование клеточного роста на 50%, означает концентрацию мультиспецифической антигенсвязывающей молекулы, необходимую для снижения скорости клеточной пролиферации наполовину по сравнению с вариантом, в котором не добавляют мультиспецифическую антигенсвязывающую молекулу. Коэффициент концентрация, вызывающая ингибирование клеточного роста на 50%/концентрация родительского антитела, вызывающая ингибирование клеточного роста на 50% предпочтительно составляет 1,3 или менее, более предпочтительно 1,2 или менее, 1,1 или менее, 1,0 или менее, 0,9 или менее, 0,8 или менее, 0,7 или менее, 0,6 или менее или 0,5 или менее. При этом не существует нижнего предела, примеры включают коэффициенты, составляющие 10_1,10’2,10’3,10’4,10’5 или 10-6.В частности, коэффициент предпочтительно составляет от 10-6 до 1,5x100, более предпочтительно от 10-6 до 10-1, еще более предпочтительно от 10-6 до 10-2 и еще более предпочтительно от 10-6 до 10-3.
Касательно домена, содержащего вариабельную область антитела, которая обладает GPC3связывающей активностью, величина KD, характеризующая связывание с GPC3 (например, человеческим GPC3) может составлять, например, 5x10-9 М или менее, предпочтительно 4x10-9 М или менее, например 3x10-9 М или менее, 2x10-9 М или менее, 1x10-9 М или менее, 8x10-10 М или менее, 5x10-10 М или менее, 4x10-10 М или менее, 3x10’10 М или менее, 2x10-10 М или менее, 1x10-10 М или менее, 8x10-11 М или менее, 5x10-11 М или менее, 4x10-11 М или менее, 3x10-11 М или менее, 2x10-11 М или менее, 1x10-11 М или менее, 8x10-12 М или менее, 5x10-12 М или менее, 4x10-12M или менее, 3x10-12 М или менее, 2x10-12 М или менее, 1x10-12 М или менее, 8x10-13 М или менее, 5x10-13 М или менее, 4x10-13 М или менее, 3x10-13 М или менее, 2x10-13 М или менее или 1x10-13 М или менее.
Касательно домена, содержащего вариабельную область, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, величина KD, характеризующая связывание с человеческим комплексом Т-клеточного рецептора, такого как человеческий Т-клеточный рецептор или более конкретно, например, человеческий CD3ε может составлять, например, 2x10-7 М или менее, предпочтительно 1,5x10-7 М или менее, например 1,4x10-7 М или менее, 1,3x10-7 М или менее, 1,2x10-7 М или менее, 1x10-7 М или менее, 3x10-8 М или менее, 2x10-8 М или менее, 1x10-8 М или менее, 8x10-9 М или менее, 5x10-9 М или менее, 4x10-9 М или менее, 3x10-9 М или менее, 2x10-9 М или менее, 1x10-9 М или менее, 8x10-10 М или менее, 5x10-10 М или менее, 4x10’10 М или менее, 3x10’10 М или менее, 2x10-10 М или менее, 1x10’10 М или менее, 8x10-11 М или менее, 5x10-11 М или менее, 4x10-11 М или менее, 3x10-11 М
- 44 041830 или менее, 2х10-11 М или менее, 1х10-11 М или менее,, 8х10-12 М или менее, 5х10-12 М или менее, 4х10-12
М или менее, 3х10-12 М или менее, 2х10-12М или менее или 1х10-12 М или менее.
Мультиспецифические антигенсвязывающие молекулы, предлагаемые в настоящем изобретении, предпочтительно имеют величины KD, характеризующая связывание с человеческим GPC3 и человеческим комплексом Т-клеточного рецептора (например, с человеческой CD3ε-цепью), которые составляют 5х10-9 М или менее и 2х10-7 М или менее соответственно и более предпочтительно 1х10-9 М или менее и5х10-8 М или менее соответственно.
В настоящем изобретении вариабельные области антитела, которые являются функционально эквивалентными не ограничены конкретными областями, если они представляют собой вариабельные области H-цепи и/или L-цепи антитела, которые удовлетворяют вышеуказанным требованиям. Примеры таких вариабельных областей антитела включают области, полученные путем интродукции замены, делеции, добавления и/или инсерции одной или нескольких аминокислот (например, 1, 2, 3, 4, 5 или 10 аминокислот) в аминокислотные последовательности вариабельных областей, которые представлены выше в табл. 1-3. Хорошо известный специалистам в данной области метод интродукции одной или нескольких аминокислотных замен, делеций, добавлений и/или инсерций в аминокислотную последовательность представляет собой метод интродукции мутаций в белки. Например, специалисты в данной области могут получать вариабельные области, которые являются функциональными эквивалентами вариабельных областей антитела, обладающих указанными выше функциями, путем интродукции соответствующих мутаций в аминокислотные последовательности с использованием таких методов как сайтнаправленный мутагенез (Hashimoto-Gotoh Т., Mizuno Т., Ogasahara Y. и Nakagawa M., An oligodeoxyribonucleotide-directed dual amber method for site-directed mutagenesis. Gene 152, 1995, с. 271-275; Zoller M.J. и Smith M., Oligonucleotide-directed mutagenesis of DNA fragments cloned into M13 vectors. Methods Enzymol. 100, 1983, с. 468-500; Kramer W., Drutsa V., Jansen H.W., Kramer В., Pflugfelder M. и Fritz H.J., The gapped duplex DNA approach to oligonucleotide-directed mutation construction. Nucleic Acids Res. 12, 9441-9456; Kramer W. и Fritz H.J., Oligonucleotide-directed construction of mutations via gapped duplex DNA Methods. Enzymol. 154, 1987, с. 350-367 и Kunkel T.A., Rapid and efficient site-specific mutagenesis without phenotypic selection. Proc Natl Acad. Sci. USA. 82, 1985, с. 488-492).
Когда аминокислотный остаток изменяют, аминокислоту предпочтительно заменяют в результате мутации на другую(ие) аминокислоту(ы), сохраняющую(ие) характеристики боковых цепей аминокислот. Примерами аминокислот с такими характеристиками боковых цепей являются гидрофобные аминокислоты (A, I, L, M, F, P, W, Y и V), гидрофильные аминокислоты (R, D, N, C, E, Q, G, H, K, S и T), аминокислоты, содержащие алифатические боковые цепи (G, А, V, L, I и Р), аминокислоты с содержащими гидроксильную группу боковыми цепями (S, T и Y), аминокислоты с содержащими атом серы боковыми цепями (C и M), аминокислоты с содержащими карбоновую кислоту и амид боковыми цепями (D, N, E и Q), аминокислоты с основными боковыми цепями (R, K и H) и аминокислоты с ароматическими боковыми цепями (H, F, Y и W) (в скобках представлены обозначения аминокислот в соответствии с однобуквенным кодом). Аминокислотные замены внутри каждой из указанных групп обозначают как консервативные замены. Хорошо известно, что полипептид, содержащий модифицированную аминокислотную последовательность, в которой один или несколько аминокислотных остатков в указанной аминокислотной последовательности подвергнут делеции, добавлен и/или заменен на другие аминокислоты, может сохранять исходную биологическую активность (Mark D.F. и др., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81, 1984, с. 5662-5666; Zoller M.J. и Smith M., Nucleic Acids Res. 10, 1982, с. 6487-6500; Wang А. и др., Science 224, 1984, с. 1431-1433; Dalbadie-McFarland G. и др., Proc. Natl. Acad. Sci. USA) 79, 1982, с. 6409-6413). Вариабельные области, предлагаемые в настоящем изобретении, содержащие указанные аминокислотные модификации, имеют аминокислотные последовательности, которые идентичны по меньшей мере на 70%, более предпочтительно по меньшей мере на 75%, еще более предпочтительно по меньшей мере на 80%, еще более предпочтительно по меньшей мере на 85%, еще более предпочтительно по меньшей мере на 95% аминокислотным последовательностям CDR-последовательностей, FR-последовательностям вариабельной области или полным вариабельным областям до модификации. В контексте настоящего описания идентичность последовательностей определяют в виде процента остатков, идентичных остаткам в исходной аминокислотной последовательности вариабельной области H-цепи или вариабельной области L-цепи, определенного после выравнивания последовательностей и интродукции соответствующих брешей для увеличения до максимума при необходимости идентичности последовательностей. Идентичность аминокислотных последовательностей можно определять с помощью описанного ниже метода.
Кроме того, функционально эквивалентную вариабельную область антитела можно получать, например, из нуклеиновых кислот, которые гибридизуются в строгих условиях с нуклеиновыми кислотами, которые содержат нуклеотидную последовательность, кодирующую аминокислотную последовательность вариабельной области, указанной выше в табл. 1-3. Строгие условия гибридизации, применяемые для выделения нуклеиновой кислоты, которая гибридизуется в строгих условиях с нуклеиновой кислотой, которая содержат нуклеотидную последовательность, кодирующую аминокислотную последовательность вариабельной области, включают, например, следующие условия: 6 М мочевина, 0,4% ДСН,
- 45 041830
0,5xSSC и 37°С или условия гибридизации в значительной степени эквивалентные указанным. Выделение нуклеиновых кислот с максимально высокой гомологией можно ожидать при применении более строгих условий, например следующих условий: 6 М мочевина, 0,4% ДСН, 0,1xSSC и 42°С. Условия промывки после гибридизации представляют собой, например, промывку с использованием 0,5xSSC (1xSSC представляет собой 0,15 M NaCl и 0,015 М цитрат натрия, pH 7,0) и 0,1% ДСН при 60°С, более предпочтительно промывку с использованием 0,2xSSC и 0,1% ДСН при 60°С, еще более предпочтительно промывку с использованием 0,2xSSC и 0,1% ДСН при 62°С, еще более предпочтительно промывку с использованием 0,2xSSC и 0,1% ДСН при 65°С и еще более предпочтительно промывку с использованием 0,1xSSC и 0,1% ДСН при 65°С. Последовательности выделенных нуклеиновых кислот можно определять известными методами, которые описаны ниже. Общая гомология нуклеотидной последовательности выделенной нуклеиновой кислоты составляет по меньшей мере 50% или выше, предпочтительно 70% или выше и наиболее предпочтительно 90% или выше (например, 95, 96, 97, 98, 99% или выше) при оценке степени идентичности последовательностей.
Нуклеиновые кислоты, которые гибридизуются в строгих условиях с нуклеиновой кислотой, содержащей нуклеотидную последовательность, которая кодирует аминокислотную последовательность вариабельной области, можно выделять также, применяя вместо описанных выше методов на основе гибридизации, методы амплификации генов, такие как полимеразная цепная реакция (ПЦР), в которой используют праймеры, синтезированные на основе информации о нуклеотидной последовательности, которая кодирует аминокислотную последовательность вариабельной области.
Идентичность одной нуклеотидной последовательности или аминокислотной последовательности можно определять с помощью алгоритма BLAST, описанного у Karlin и Altschul (Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90, 1993, с. 5873-5877). На основе этого алгоритма разработаны программы BLASTN и BLASTX (Altschul и др., J. Mol. Biol. 215, 1990, с. 403-410). Для анализа нуклеотидных последовательностей согласно BLASTN на основе BLAST устанавливают параметры, такие, например, как балл=100 и длина слова=12. С другой стороны, параметры, применяемые для анализа аминокислотных последовательностей с помощью BLASTX на основе BLAST, включают, например, балл=50 и длина слова=3. Задаваемые по умолчанию параметры применяют для каждой программы, когда используют программы BLAST и Gapped BLAST. В данной области известны конкретные методики указанных анализов (см. веб-сайт National Center for Biotechnology Information (NCBI), Basic Local Alignment Search Tool (BLAST); http://www.ncbi.nlm.nih.gov).
Комбинация вариабельной области антитела, обладающей связывающей активностью в отношении глипикана 3, и вариабельной области антитела, обладающей связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, входящая в мультиспецифическую антигенсвязывающую молекулу, предлагаемую в настоящем изобретении, не ограничена конкретной комбинацией, если она обладает указанными выше видами активности. Однако согласно настоящему изобретению цитотоксическая активность мультиспецифической антигенсвязывающей молекулы предпочтительно эквивалентна или выше, чем активность биспецфического антитела GPC3_ERY22_rCE115, описанного в примере 3. В контексте настоящего описания понятие эквивалентный необязательно подразумевает такую же степень указанной выше активности, и активность может быть более высокой. Молекула является эквивалентной GPC3_ERY22_rCE115, например, когда коэффициент (скорость ингибирования клеточного роста/скорость ингибирования клеточного роста (GPC3_ERY22_rCE115)) относительно скорости ингибирования клеточного роста GPC3_ERY22_rCE115 (скорость ингибирования клеточного роста (GPC3_ERY22_rCE115)) составляет 0,7 или более, предпочтительно 0,8 или более, 0,9 или более, 1,0 или более, 1,2 или более, 1,5 или более, 2 или более, 3 или более, 5 или более, 10 или более или 20 или более. В то время как не существует верхнего предела, показатель может составлять, например, 10, 102, 103, 104, 105 или 106. Концентрацию добавленной мультиспецифической антигенсвязывающей молекулы можно определять соответствующим образом, но предпочтительно она составляет, например 0,01, 0,05, 0,1, 0,5 или 1нМ; и предпочтительно измерения осуществляют при концентрации 0,05 или 0,1 нМ.
Кроме того, примеры включают вариант, когда коэффициент концентрация, вызывающая ингибирование клеточного роста на 50%/концентрация (GPC3_ERY22_rCE115), вызывающая ингибирование клеточного роста на 50%, полученный путем сравнения с концентрацией (GPC3_ERY22_rCE115), которая вызывает ингибирование клеточного роста на 50% (концентрация (GPC3_ERY22_rCE115), вызывающая ингибирование клеточного роста на 50%), составляет 1,5 или менее. Коэффициент концентрация, вызывающая ингибирование клеточного роста на 50%/концентрация (GPC3_ERY22_rCE115), вызывающая ингибирование клеточного роста на 50% предпочтительно составляет 1,3 или менее, более предпочтительно 1,2 или менее, 1,1 или менее, 1,0 или менее, 0,9 или менее, 0,8 или менее, 0,7 или менее, 0,6 или менее или 0,5 или менее. При этом не существует нижнего предела, примеры включают коэффициенты, составляющие 10-1, 10-2, 10-3, 10-4, 10-5 или 10-6. В частности, коэффициент предпочтительно составляет от 10-6 до 1,5x10-0, более предпочтительно от 10-6 до 10-1, еще более предпочтительно от 10-6 до 10-2 и еще более предпочтительно от 10-6 до 10-3.
Предпочтительные конкретные величины KD, характеризующие связывание с человеческим GPC3 и
- 46 041830 комплексом человеческого Т-клеточного рецептора (например, с человеческой CD3ε-цепью) также соответствуют указанным выше. Можно применять соответствующие экспрессирующие GPC3 клетки или соответствующую ткань, содержащую указанные клетки, и, например, можно применять человеческие раковые линии клеток PC-10 или NCI-H446, которые экспрессируют GPC3.
Примеры указанной комбинации вариабельной области антитела, обладающей связывающей активностью в отношении глипикана 3, и вариабельной области антитела, обладающей связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, включают комбинации вариабельных областей Hцепи антитела, которые представлены в табл. 4, комбинации вариабельных областей H-цепи антитела, которые имеют последовательности CDR, аминокислотные последовательности CDR1, CDR2 и CDR3 которых являются такими же, что и аминокислотные последовательности CDR1, CDR2 и CDR3, которые входят в вариабельные области H-цепи антитела, представленные в табл. 4, и комбинации вариабельных областей H-цепи антитела, функционально эквивалентные указанным вариабельным областям. В контексте настоящего описания понятие функционально эквивалентные имеет значение, указанное выше.
Таблица 4
Плечо СРСЗ/плечо комплекса Т-клеточного рецептора SEQ ID NO:
H0000/hCE115НА 40/52
Н0000/СЕ115НА251 40/500
Н0000/СЕ115НА236 40/429
H0000/TR01Н002 40/421
Н0000/СЕ115НА122 40/426
H0610/rCE115Н 215/424
H0610/TR01H040 215/103
H0610/TR01H061 215/122
H0610/TR01H068 215/129
H0610/TR01Н071 215/132
GCH054/TR01H067 197/128
GCH094/TR01H082 211/142
GCH094/TR01H084 211/144
GCH065/TR01H084 206/144
GCH065/TR01H082 206/142
GCH094/TR01H109 211/164
GCH065/TR01H109 206/164
GCH094/TR01H113 211/168
GCH065/TR01H113 206/168
Предпочтительная общая L-цепь для таких комбинаций вариабельной области антитела, обладающей связывающей активностью в отношении глипикана 3, и вариабельной области антитела, обладающей связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, включает, например, L0000, L0011, L0201, L0203, L0204, L0206, L0208, L0209, L0211, L0212, L0222 и общую L-цепь, которая имеет последовательности CDR (аминокислотные последовательности CDR1, CDR2 и CDR3), идентичные аминокислотным последовательностям CDR1, CDR2 и CDR3, указанным выше для общей L-цепи. Конкретные комбинации включают, например, комбинации вариабельных областей H-цепи антитела и общей L-цепи, которые представлены в табл. 5, комбинации вариабельных областей антитела, которые имеют последовательности CDR (аминокислотные последовательности CDR1, CDR2 и CDR3), идентичные аминокислотным последовательностям CDR1, CDR2 и CDR3, которые входят в вариабельные области общей L-цепи, представленные в табл. 5, и комбинации вариабельных областей H-цепи антитела и общей L-цепи, функционально эквивалентные указанным вариабельным областям. В контексте настоящего описания понятие функционально эквивалентные имеет значение, указанное выше.
- 47 041830
Таблица 5
Плечо СРСЗ/плечо комплекса Т-клеточного рецептора/общая L-цепь SEQIDNO:
H0610/rCE115H/L0000 215/424/53
H0610/TR01H040/L0000 215/103/53
H0610/TR01H040/L0201 215/103/299
H0610/TR01H040/L0203 215/103/301
H0610/TR01H040/L0204 215/103/302
H0610/TR01H040/L0206 215/103/304
H0610/TR01H040/L0208 215/103/306
H0610/TR01H040/L0209 215/103/307
H0610/TR01H040/L0211 215/103/309
H0610/TR01H061/L0000 215/122/53
H0610/TR01H068/L0000 215/129/53
H0610/TR01H071/L0000 215/132/53
GCH054/TR01H067/L0201 197/128/299
GCH054/TR01H067/L0212 197/128/310
GCH054/TR01H067/L0222 197/128/319
GCH054/TR01H067/L0000 197/128/53
GCH094/TR01H082/L0201 211/142/299
GCH094/TR01H082/L0011 211/142/223
GCH094/TR01H084/L0011 211/144/223
GCH065/TR01H084/L0011 206/144/223
GCH065/TR01H082/L0011 206/142/223
GCH094/TR01H109/L0011 211/164/223
GCH065/TR01H109/L0011 206/164/223
GCH094/TR01H113/L0011 211/168/223
GCH065/TR01H113/L0011 206/168/223
Не накладываются конкретные ограничения на Fc-область, входящую в мультиспецифическую антигенсвязывающую молекулу, предлагаемую в изобретении, если она представляет собой Fc-область с пониженной связывающей активностью в отношении Fсу-рецептора, но примеры предпочтительной Fcобласти, предлагаемой в настоящем изобретении, включают комбинацию участка Fc-области E22Hh и участка Fc-области Е22Нк, комбинацию участка Fc-области E2702GsKsc и участка Fc-области E2704sEpsc и комбинацию участка Fc-области E2702sKsc и участка Fc-области E2704sEpsc.
Примеры предпочтительной мультиспецифической антигенсвязывающей молекулы, предлагаемой в настоящем изобретении, включают биспецифические антитела, которые содержат вариабельную область антитела, обладающую связывающей активностью в отношении глипикана 3, и вариабельную область антитела, обладающую связывающей активностью в отношении CD3e. Более предпочтительно цитотоксическая активность является такой же или превышает активность биспецифического антитела GPC3_ERY22_rCEl 15. Примеры указанных биспецифических антител включают биспецифические антитела, содержащие Н- и L-цепи, указанные в табл. 13, и биспецифические антитела, которые связываются с эпитопом, перекрывающимся с эпитопом, связывающимся с указанными выше антителами, и которые содержат Fc-область с пониженной связывающей активностью в отношении Fcy-рецептора.
Распознает ли антитело эпитоп, который перекрывается с эпитопом, распознаваемым другим антителом, можно определять на основе конкуренции между двумя антителами за эпитоп. Конкуренцию между антителами можно оценивать с помощью анализов связывания в условиях конкуренции, таких как твердофазный иммуноферментный анализ (ELISA), метод на основе флуоресцентного резонансного переноса энергии (FRET) и метод на основе технологии флуорометрического микрообъемного анализа (FMAT (зарегистрированный товарный знак)). Количество антитела, связанного с антигеном, косвенно коррелирует со связывающей способностью конкурирующего антитела-кандидата (тестируемое антитело), которое конкурентно связывается с перекрывающимся эпитопом. Другими словами, если количество или аффинность тестируемого антитела к перекрывающемуся эпитопу возрастает, то количество антитела, связанного с антигеном, снижается, а количество антигена, связанного тестируемым антителом, возрастает. В частности, соответствующим образом меченое антитело и антитело, подлежащее изучению, добавляют одновременно к антигену, и антитело, которое в результате связывается, обнаруживают с помощью метки. Количество связанного с антигеном антитела легко можно определять с помощью предварительно меченого антитела. Указанная метка не ограничена конкретной меткой и метод мечения выбирают в зависимости от применяемой методики анализа. В частности метод мечения включает введение флуоресцентной метки, радиоактивной метки, ферментной метки и т.п.
Например, флуоресцентно меченое антитело и немеченое антитело или тестируемое антитело одновременно добавляют к гранулам, на которых иммобилизован GPC3 или CD3s, и меченое антитело выявляют с помощью технологии флуорометрического микрообъемного анализа.
В контексте настоящего описания ’’антитело, которое связывается с перекрывающимся эпитопом” означает тестируемое антитело, которое может снижать количество связанного меченого антитела по меньшей мере на 50% в концентрации, которая, как правило, выше в 100 раз, предпочтительно выше в 80 раз, более предпочтительно выше в 50 раз, еще более предпочтительно выше в 30 раз и еще более предпочтительно выше в 10 раз концентрации, в которой немеченое антитело снижает на 50% количество связанного меченого антитела (1С50).
-48041830
Мультиспецифические антигенсвязывающие молекулы, которые имеют антигенсвязывающие сайты антитела, связывающиеся с эпитопами, которые перекрываются с эпитопами, связывающимися вышеуказанными антителами, могут обладать очень высокой цитотоксической активностью.
Мультиспецифические антигенсвязывающие молекулы, предлагаемые в настоящем изобретении, получают с помощью такой же технологии, которая описана выше в качестве метода получения рекомбинантных антител.
Настоящее изобретение относится также к полинуклеотидам, кодирующим антигенсвязывающие молекулы, предлагаемые в настоящем изобретении, и их можно встраивать в требуемые экспрессионные векторы. Приемлемые клетки-хозяева можно трансформировать экспрессионными векторами с получением клеток, которые экспрессируют антигенсвязывающие молекулы. Антигенсвязывающие молекулы, кодируемые полинуклеотидами, можно получать путем культивирования клеток, которые экспрессируют антигенсвязывающие молекулы, и сбора продуктов экспрессии из супернатантов культуры. Таким образом, настоящее изобретение относится к векторам, которые содержат полинуклеотид, кодирующий антигенсвязывающую молекулу, предлагаемую в настоящем изобретении, клеткам, которые несут указанный вектор, и к способам получения антигенсвязывающих молекул, которые заключаются в том, что культивируют клетки и собирают антигенсвязывающие молекулы из супернатантов культуры. Их можно получать с помощью таких же технологий, которые описаны выше для получения рекомбинантных антител.
Фармацевтические композиции.
Другим объектом настоящего изобретения являются фармацевтические композиции, содержащие в качестве действующего вещества мультиспецифическую антигенсвязывающую молекулу, которая содержит: (1) домен, содержащий вариабельную область антитела, обладающую связывающей активностью в отношении глипикана 3, (2) домен, содержащий вариабельную область антитела, обладающую связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, и (3) домен, содержащий Fc-область с пониженной связывающей активностью в отношении Fcγ-рецептора. Кроме того, настоящее изобретение относится к фармацевтическим композициям, которые индуцируют повреждение клеток, содержащим в качестве действующего вещества антигенсвязывающую молекулу. Фармацевтические композиции, предлагаемые в настоящем изобретении, которые индуцируют требуемое повреждение клеток, прежде всего зависимую от Т-клеток клеточную цитотоксичность, предпочтительно вводят индивидууму, который страдает заболеванием, при котором необходимы указанные виды активности для предупреждения или лечения, или индивидууму, у которого возможен рецидив заболевания.
Кроме того, согласно настоящему изобретению индуцирующие цитотоксичность агенты и ингибирующие рост клеток агенты, и противораковые агенты, которые содержат в качестве действующего вещества мультиспецифическую антигенсвязывающую молекулу, которая содержит:
(1) домен, содержащий вариабельную область антитела, обладающую связывающей активностью в отношении глипикана 3, (2) домен, содержащий вариабельную область антитела, обладающую связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, и (3) домен, содержащий Fc-область с пониженной связывающей активностью в отношении Fcyрецептора, можно применять в способе индукции повреждения клеток, который заключается в том, что содержит стадию, на которой вводят индивидууму антигенсвязывающую молекулу, или можно применять антигенсвязывающую молекулу для приготовления индуцирующего цитотоксичесность агента и ингибирующего роста клеток агента.
В настоящем изобретении фраза содержит в качестве действующего вещества мультиспецифическую антигенсвязывающую молекулу, которая содержит:
(1) домен, содержащий вариабельную область антитела, обладающую связывающей активностью в отношении глипикана 3, (2) домен, содержащий вариабельную область антитела, обладающую связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, и (3) домен, содержащий Fc-область с пониженной связывающей активностью в отношении Fcyрецептора означает, что композиция содержит антигенсвязывающую молекулу в качестве основного действующего вещества; однако не имеется конкретных ограничений на относительное содержание антигенсвязывающей молекулы.
При необходимости мультиспецифические антигенсвязывающие молекулы, предлагаемые в настоящем изобретении, можно капсулировать в микрокапсулы (микрокапсулы, изготовленные из гидроксиметилцеллюлозы, желатина, поли(метилметакрилата) и т.п.), и можно включать в компоненты коллоидных систем, предназначенных для введения лекарственных веществ (липосомы, альбуминовые микросферы, микроэмульсии, наночастицы и нанокапсулы) (например, см. Remington's Pharmaceutical Science 16-ое изд., под ред. Oslo, 1980)). Кроме того, хорошо известны методы приготовления агентов в виде средств с замедленным высвобождением, и их можно применять для мультиспецифических антигенсвязывающих молекул, предлагаемых в настоящем изобретении (J. Biomed. Mater. Res. 15, 1981, с. 267-277; Chemtech. 12, 1982, с. 98-105; US № 3773719; опубликованные европейские патенты (ЕР) EP 58481 и EP
- 49 041830
133988; Biopolymers 22, 1983, с. 547-556).
Фармацевтические композиции, предлагаемые в настоящем изобретении, или индуцирующие цитотоксичность агенты и ингибирующие рост клеток агенты можно вводить пациенту орально или парентерально, и предпочтительным является парентеральное введение. Указанные примеры методов введения включают инъекцию, введение в нос, транспульмонарное введение и чрескожное введение. Примеры введения путем инъекции включают, например, внутривенную инъекцию, внутримышечную инъекцию, внутрибрюшинную инъекцию и подкожную инъекцию. Фармацевтическую композицию, предлагаемую в настоящем изобретении, или индуцирующий цитотоксичность агент и ингибирующий рост клеток агент можно применять местно или системно путем инъекции. Метод введения можно выбирать в зависимости от возраста пациента и симптомов. Дозу можно выбирать, например, из следующего диапазона: от 0,0001 до 1000 мг на 1 кг веса тела на каждое введение. Альтернативно этому, дозу можно выбирать, например, из следующего диапазона: от 0,001 до 100000 мг/пациента. Однако дозы фармацевтической композиции, предлагаемой в настоящем изобретении, или индуцирующего цитотоксичность агента и ингибирующего рост клеток агента не ограничены указанными дозами.
Фармацевтические композиции, предлагаемые в настоящем изобретении, или индуцирующие цитотоксичность агенты и ингибирующие рост клеток агенты можно приготавливать с помощью общепринятых методов (например, см. Remington's Pharmaceutical Science, последнее изд., изд-во Mark Publishing Company, Easton, U.S.A.), и они могут содержать также фармацевтически приемлемые носители и добавки. Их примерами являются (но не ограничиваясь только ими) поверхностно-активные вещества, эксципиенты, красители, ароматизаторы, консерванты, стабилизаторы, буферы, суспендирующие агенты, придающие изотоничность агенты, связующие вещества, разрыхлители, замасливатели, повышающие текучесть агенты и корригенты и можно применять другие общепринятые носители. Конкретными примерами носителей являются легкая безводная кремниевая кислота, лактоза, кристаллическая целлюлоза, маннит, крахмал, кармеллоза кальция, кармеллоза натрия, гидроксипропилцеллюлоза, гидроксипропилметилцеллюлоза, поливинилацетальдиэтиламиноацетат, поливинилпирролидон, желатин, триглицерид со средней длиной цепи, полиоксиэтиленированное гидрогенизированное касторовое масло 60, сахароза, карбоксиметилцеллюлоза, кукурузный крахмал, неорганическая соль и т.п.
В настоящем изобретении предложены также способы повреждения экспрессирующих в качестве антигена глипикан 3 клеток или опухолевых тканей, содержащих экспрессирующие антиген клетки, или способы подавления роста указанных клеток или опухолевых тканей путем приведения в контакт клеток, экспрессирующих в качестве антигена глипикан 3, с мультиспецифической антигенсвязывающей молекулой, предлагаемой в настоящем изобретении, которая связывается с антигеном. Мультиспецифическая антигенсвязывающая молекула, которая связывается с антигеном, описана выше в качестве антигенсвязывающей молекулы, предлагаемой в настоящем изобретении, которая связывается с антигеном, которая содержится в индуцирующих цитотоксичность агентах и ингибирующих рост клеток агентах, предлагаемых в настоящем изобретении. Клетки, с которыми связывается мультиспецифическая антигенсвязывающая молекула, предлагаемая в настоящем изобретении, которая связывается с антигеном, не ограничены конкретными клетками, если эти клетки экспрессируют антиген.
Согласно настоящему изобретению приведение в контакт можно осуществлять, например, добавляя мультиспецифическую антигенсвязывающую молекулу, предлагаемую в настоящем изобретении, которая связывается с антигеном, в культуральную среду экспрессирующих антиген GPC3 клеток, которые культивируют in vitro. В этом случае добавляемую антигенсвязывающую молекулу можно применять в пригодной для этой цели форме, такой как раствор или твердое вещество, полученное путем лиофилизации, или т.п. При добавлении в виде водного раствора он может представлять собой водный раствор, который содержит только мультиспецифическую антигенсвязывающую молекулу, предлагаемую в настоящем изобретении, или может представлять собой также раствор, содержащий, например, указанные выше поверхностно-активные вещества, эксципиенты, красители, ароматизаторы, консерванты, стабилизаторы, буферы, суспендирующие агенты, придающие изотоничность агенты, связующие вещества, разрыхлители, замасливатели, повышающие текучесть агенты и корригенты. На концентрацию добавляемой молекулы не накладывается специальных ограничений; однако конечная концентрация в культуральной среде предпочтительно составляет от 1 пг/мл до 1 г/мл, более предпочтительно от 1 нг/мл до 1 мг/мл и еще более предпочтительно от 1 мкг/мл до 1 мг/мл.
Кроме того, согласно другому варианту осуществления настоящего изобретения приведение в контакт осуществляют также путем обработки животных кроме человека, в организм которых трансплантированы экспрессирующие антиген GPC3 клетки, и животных, у которых эндогенно происходит экспрессия антигена. Метод введения может быть оральным или парентеральным, и предпочтительным является парентеральное введение. Указанные примеры методов введения включают инъекцию, введение в нос, транспульмонарное введение и чрескожное введение. Примеры введения путем инъекции включают, например, внутривенную инъекцию, внутримышечную инъекцию, внутрибрюшинную инъекцию и подкожную инъекцию. Фармацевтическую композицию, предлагаемую в настоящем изобретении, или индуцирующий цитотоксичность агент и ингибирующий рост клеток агент можно применять местно или системно, например, путем инъекции. Метод введения можно выбирать в зависимости от возраста под
- 50 041830 опытного животного и симптомов. При введении в виде водного раствора можно применять водный раствор, содержащий только мультиспецифическую антигенсвязывающую молекулу, предлагаемую в настоящем изобретении, или можно применять раствор, содержащий также указанные выше поверхностноактивные вещества, эксципиенты, красители, ароматизаторы, консерванты, стабилизаторы, буферы, суспендирующие агенты, придающие изотоничность агенты, связующие вещества, разрыхлители, замасливатели, повышающие текучесть агенты и корргиенты и т.п. Дозу можно выбирать из следующего диапазона: от 0,0001 до 1000 мг на 1 кг веса тела на одно введение.
Альтернативно этому, дозу можно выбирать, например, из следующего диапазона: от 0,001 до 100000 мг/пациента. Однако вводимое количество мультиспецифической антигенсвязывающей молекулы, предлагаемой в настоящем изобретении, не ограничено указанными дозами.
Описанный ниже метод предпочтительно используют в качестве метода оценки или измерения повреждения клетки, индуцированного в клетках, экспрессирующих в качестве антигена глипикан 3, который связывается доменом, который несет вариабельную область антитела, обладающую связывающей активностью в отношении глипикана 3, который входит в антигенсвязывающую молекулу, что является результатом контактирования клеток с мультиспецифической антигенсвязывающей молекулой, предлагаемой в настоящем изобретении. Примеры метода оценки или измерения цитотоксической активности in vitro включает методы измерения активности цитотоксических Т-клеток или т.п. Обладает ли мультиспецифическая антигенсвязывающая молекула, предлагаемая в настоящем изобретении, Т-клеточной цитотоксичностью, можно определять с помощью известных методов (см., например, Current protocols in Immunology, глава 7. Immunologic studies in humans, под ред. John E, Coligan и др., изд-во John Wiley & Sons, Inc., 1993). При измерении активности антигенсвязывающую молекулу, которая связывается с антигеном, отличным от глипикана 3, представляющим собой антиген, который не экспрессируется в клетках, применяемых для оценки, можно использовать в качестве контроля, который анализируют таким же образом, что и мультиспецифическую антигенсвязывающую молекулу, предлагаемую в настоящем изобретении, и активность можно определять, оценивая, обладает ли мультиспецифическая антигенсвязывающая молекула, предлагаемая в настоящем изобретении, более выраженной цитотоксической активностью, чем применяемая в качестве контроля антигенсвязывающая молекула.
Для оценки или измерения цитотоксической активности in vivo, например, клетки, экспрессирующие в качестве антигена глипикан 3, внутрикожно или подкожно трансплантируют подопытному животному кроме человека, а затем тестируемую антигенсвязывающую молекулу вводят внутривенно или внутрибрюшинно каждый день или с интервалами в несколько дней, начиная со дня трансплантации или на следующий после него день. Цитотоксическую активность можно определять путем ежедневного измерения размера опухолей, определяя различие в изменении размера опухолей. Аналогично методу, применяемому для оценки in vitro, можно считать, что антигенсвязывающая молекула, предлагаемая в настоящем изобретении, обладает цитотоксической активностью, если при введении контрольной антигенсвязывающей молекулы обнаружено, что размер опухолей в группе, которой вводили антигенсвязывающую молекулу, предлагаемую в настоящем изобретении, существенно меньшей, чем размер опухолей в группе, которой вводили контрольную антигенсвязывающую молекулу.
В качестве метода оценки или измерения подавляющего действия на пролиферацию клеток, экспрессирующих в качестве антигена глипикан 3, можно применять метод измерения поглощения меченного изотопом тимидина клетками или МТТ-метод. В качестве метода оценки или измерения подавляющего действия на пролиферацию клеток in vivo, можно применять метод, аналогичный описанному выше для оценки или измерения цитотоксической активности in vivo.
В настоящем изобретении предложены также наборы, которые можно применять в способах, предлагаемых в настоящем изобретении, которые содержат мультиспецифическую антигенсвязывающую молекулу, предлагаемую в настоящем изобретении, или мультиспецифическую антигенсвязывающую молекулу, созданную способом получения, предлагаемым в настоящем изобретении. Альтернативно этому, наборы могут быть упакованы вместе с дополнительным фармацевтически приемлемым носителем, растворителем и инструкциями с описанием метода применения.
Настоящее изобретение относится также к мультиспецифической антигенсвязывающей молекуле, предлагаемой в настоящем изобретении, или мультиспецифической антигенсвязывающей молекуле, полученной способом, предлагаемым в настоящем изобретении, для применения в способе, предлагаемом в настоящем изобретении.
Настоящее изобретение относится также к молекулам, обладающим GPC3-связывающей активностью, которые содержат домен, содержащий вариабельную область антитела, которая обладает GPC3связывающей активностью, мультиспецифической антигенсвязывающей молекулы, предлагаемой в настоящем изобретении. Кроме того, настоящее изобретение относится к молекуле, которая обладает GPC3-связывающей активностью, которая содержит вариабельные области H- и L-цепей антитела соответственно, содержащие три CDR H- и L-цепей (всего шесть CDR), которые входят в молекулу. Настоящее изобретение относится также к молекулам, обладающим связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, которые содержат домен, содержащий вариабельную область антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора,
- 51 041830 мультиспецифической антигенсвязывающей молекулы, предлагаемой в настоящем изобретении. Кроме того, настоящее изобретение относится к молекуле, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, которая содержит вариабельные области H- и L-цепей антитела соответственно, содержащие три CDR H- и L-цепей (всего шесть CDR), которые входят в молекулу. Указанные молекулы могут представлять собой антитела или полипептиды, содержащие антигенсвязывающие фрагменты антитела. Настоящее изобретение относится также к антителам, которые связываются с эпитопами, перекрывающимися или конкурирующими с указанными молекулами или полипептидами, которые содержат их антигенсвязывающие фрагменты. Приемлемыми примерами таких полипептидов, которые содержат антигенсвязывающие фрагменты антитела, являются scFv, одноцепочечное антитело, Fv, одноцепочечный Fv2 (scFv2), Fab и F(ab')2. Кроме того, указанные молекулы необязательно должны быть мультиспецифическими (биспецифическими), а могут связываться только либо с GPC3, либо с комплексом Т-клеточного рецептора (например, CD3ε-цепью).
Указанные молекулы включают молекулу, которая содержит домен, содержащий вариабельную область антитела, которая обладает GPC3-связывающей активностью, мультиспецифической антигенсвязывающей молекулы, подробное описание которой представлено в разделе Примеры в настоящем описании (которая содержит вариабельные области H-цепи, обладающие GPC3-связывающей активностью и вариабельную область общей L-цепи), молекулу, которая содержит домен, содержащий вариабельную область антитела, которая обладает связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора, мультиспецифической антигенсвязывающей молекулы, подробное описание которой представлено в разделе Примеры в настоящем описании (которая содержит вариабельные области H-цепи, обладающие связывающей активностью в отношении комплекса Т-клеточного рецептора и вариабельную область общей L-цепи), а также молекулу, обладающую способностью связываться с таким же антигенным белком (GPC3 или комплекс Т-клеточного рецептора), которая содержит три CDR каждой из Hи L-цепей (всего шесть CDR), которые входят в указанную выше молекулу.
Указанные молекулы имеют CDR, которые являются одинаковыми (общими) с CDR мультиспецифической антигенсвязывающей молекулы, предлагаемой в настоящем изобретении; и поэтому ожидается, что они будут связываться с эпитопом, перекрывающимся с эпитопом мультиспецифической антигенсвязывающей молекулы, предлагаемой в настоящем изобретении. Таким образом, указанные молекулы могут конкурировать с мультиспецифическими антигенсвязывающими молекулами, предлагаемыми в настоящем изобретении, при их совместном присутствии с мультиспецифическими антигенсвязывающими молекулами, предлагаемыми в настоящем изобретении. Таким образом, эти молекулы можно применять, например, в качестве регуляторных агентов для подавления различных видов активности (таких как антигенсвязывающая активность, цитотоксическая активность и противоопухолевая активность) мультиспецифических антигенсвязывающих молекул, предлагаемых в настоящем изобретении. Кроме того, указанная молекула может быть предварительно связана с белком-мишенью (GPC3 или комплекс Т-клеточного рецептора), и после добавления мультиспецифической антигенсвязывающей молекулы, предлагаемой в настоящем изобретении, можно выявлять молекулы, диссоциирующие в результате конкуренции. При таком применении молекула пригодна в качестве агента, предназначенного для оценки связывания мультиспецифической антигенсвязывающей молекулы, предлагаемой в настоящем изобретении, с белком-мишенью. Согласно настоящему изобретению молекулы можно метить соответствующими флуоресцентными субстанциями или т.п. Альтернативному этому, указанные молекулы можно применять для скрининга новых антител, которые связываются с эпитопами, перекрывающимися с эпитопами, которые связываются мультиспецифическими антигенсвязывающими молекулами, предлагаемыми в настоящем изобретении. Как указано выше, указанную молекулу можно предварительно связывать с белком-мишенью (GPC3 или комплекс Т-клеточного рецептора), а затем добавлять тестируемое антитело, при этом, если имеет место диссоциация связанных молекул, то тестируемое антитело является перспективным (кандидатом) в качестве антитела, которое связывается с эпитопом, перекрывающимся с эпитопом, с которым связывается мультиспецифическая антигенсвязывающая молекула, предлагаемая в настоящем изобретении. Это позволяет осуществлять эффективный скрининг новых мультиспецифических антигенсвязывающих молекул.
Приведенные в настоящем описании в качестве примеров комбинации в виде комбинаций каждого CDR мультиспецифических антигенсвязывающих молекул, предлагаемых в настоящем изобретении, можно применять непосредственно в качестве конкретных комбинаций CDR вариабельных областей Hцепи и L-цепи этих молекул. Аффинность к антигену этих молекул (величины KD) предпочтительно характеризуется величинами, приведенными в качестве примера KD мультиспецифической антигенсвязывающей молекулы, предлагаемой в настоящем изобретении, но не ограничена этими величинами.
Настоящее изобретение относится также к нуклеиновым кислотам, кодирующим эти молекулы, векторам, содержащим нуклеиновые кислоты, клеткам, содержащим нуклеиновые кислоты или векторы, способам получения молекул путем культивирования клеток и молекулам, полученным с помощью этих способов.
Все процитированные в настоящем описании документы, характеризующие известный уровень техники, включены в настоящее описание в качестве ссылки.
- 52 041830
Примеры
Ниже настоящее изобретение описано со ссылкой на конкретные примеры, которые не ограничивают объем изобретения.
Пример 1. Получение GPC3 ERY22 rCE115 и измерение цитотоксической активности.
(1-1) Получение GPC3 ERY22 rCE115.
Молекулу, в которой один из Fab заменяли на домен, связывающий CD3 эпсилон, получали, используя IgG против ракового антигена (GPC3) в качестве основной структуры. В этом случае Fc-область IgG, которую применяли в качестве основной структуры, представляла собой молчащую Fc с ослабленной аффинностью к FcgR ( Fey- (Fc-гамма) рецептор). Антитело к GPC3 Н0000 (SEQ ID NO: 40)/GL4 (SEQ ID NO: 41) применяли в качестве GPC3-связывающего домена. Антитело к CD3 rCE115H/rCE115L (SEQ ID NO: 42/SEQ ID NO: 43) применяли в качестве CD3-связывающего домена.
Конструкцию G1d, полученную удалением Gly и Lys на С-конце IgG1, применяли в качестве константной области H-цепи антитела и ее применяли в комбинации с H0000/GL4 и rCE115H/rCE115L. Когда константную область Н-цепи антитела обозначали как H1, последовательность, соответствующую Нцепи антитела, несущую Н0000 в вариабельной области, обозначали как Н0000-Н1. В настоящем описании аминокислотное изменение обозначали, например, как D356K. Первый алфавитный символ (соответствует D в D356K) представляет собой однобуквенный код аминокислотного остатка до модификации, следующий за ним номер (соответствует 356 в D356K) обозначает положение модификации согласно EU-нумерации, а последний алфавитный символ (соответствует K в D356K) представляет собой однобуквенный код аминокислотного остатка после модификации. G1dh (SEQ ID NO: 44), полученную путем удаления Gly и Lys на С-конце IgG1, ERY22_Hk (SEQ ID NO: 45), созданную путем интродукции мутаций L234A/L235A/Y349C/T366W в G1dh, a ERY22_Hh (SEQ ID NO: 46), созданную путем интродукции мутаций L234A/L235A/D356C/T366S/L368A/Y407V в G1dh, получали согласно методу, описанному в приведенном для справки примере 1. Мутации L234A и L235A интродуцировали в соответствующие Hцепи для ослабления аффинности к FcgR (Fcy-рецептор), а мутации Y349C/T366W и D356C/T366S/L368A/Y407V интродуцирлвали для эффективного образования гетеромеров каждой Hцепи при получении гетеродимерных антител, содержащих два типа H-цепей.
Гетеродимерное антитело GPC3_ERY22_rCE115, полученной заменой VH-и VL-доменов Fab против GPC3, создавали согласно методу, описанному в приведенном для справки примере 1 (фиг. 1а).
Серии экспрессионных векторов со встроенным полинуклеотидом, кодирующим каждую из конструкций GL4-ERY22_Hk (SEQ ID NO: 47), H0000-ERY22L (SEQ ID NO: 48), rCE115H-ERY22_Hh (SEQ ID NO: 49) и rCE115L-k0 (SEQ ID NO: 50), получали с помощью методов, хорошо известных специалистам в данной области, таких как методы на основе ПЦР с использованием добавленных праймеров, которые имели соответствующие последовательности, аналогичные применяемым в описанном выше методе.
Следующую комбинацию экспрессионных векторов интродуцировали в клетки FreeStyle 293-F для кратковременной экспрессии каждой молекулы-мишени.
Молекула-мишень: GPC3_ERY22_rCE115.
Полипептиды, кодируемые полинуклеотидами, встроенными в экспрессионные векторы: GL4ERY22_Hk, H0000-ERY22L, rCE115Н-ERY22_Hh, rCE115L-k0.
(1-2) Очистка GPC3 ERY22 rCE115.
Полученный супернатант культуры добавляли в колонку с антителом к FLAG M2 (фирма Sigma) и затем колонку промывали, после чего элюировали, используя пептид FLAG (фирма Sigma) в концентрации 0,1 мг/мл. Фракции, содержащие представляющую интерес молекулу, добавляли в колонку HisTrap HP (фирма GE Healthcare), а затем колонку промывали, после чего элюировали с использованием концентрационного градиента имидазола. Фракцию, содержащую представляющую интерес молекулу, концентрировали с использованием метода ультрафильтрации и затем концентрат вносили в колонку, заполненную Супердекс 200 (фирма GE Healthcare), и каждую из очищенных представляющих интерес молекул собирали только в виде мономерных фракций из элюированного раствора.
(1-3) Измерение цитотоксической активности GPC3_ERY22_rCE115 с использованием мононуклеарных клеток периферической крови человека.
Оценивали in vitro цитотоксическую активность GPC3_ERY22_rCE115.
(1-3-1) Получение раствора мононуклеарных клеток периферической крови человека (РВМС).
Получали образцы по 50 мл периферической крови здоровых добровольцев (взрослых) с использованием шприцев, предварительно заполненных 100 мкл (1000 ед./мл) раствора гепарина (Novo-Heparin 5000 ед. на инъекцию; фирма Novo Nordisk). Эту периферическую кровь двукратно разводили ЗФР(-), разделяли на четыре аликвоты и добавляли в пробирки для разделения лимфоцитов Leucosep (каталожный № 227290; фирма Greiner bio-one), в которые предварительно вносили 15 мл фиколл-пак PLUS и центрифугировали. После центрифугирования пробирок для разделения (2150 об/мин, 10 мин, комнатная температура) собирали фракции мононуклеарных клеток. Клетки во фракции мононуклеарных клеток однократно промывали с использованием модифицированной по методу Дульбекко среды Игла (фирма SIGMA), содержащей 10% FBS (далее в контексте настоящего описания обозначена как 10%FBS/D- 53 041830
MEM), а затем плотность клеток доводили до 4х106 клеток/мл с помощью 10% FBS/D-MEM. Полученную таким образом клеточную суспензию применяли в качестве раствора человеческих РВМС в последующих экспериментах.
(1-3-2) Анализ цитотоксической активности.
Цитотоксическую активность оценивали на основе степени ингибирования клеточного роста с помощью анализатора клеток в реальном времени xCELLigence (фирма Roche Diagnostics). Применяемые клетки-мишени представляли собой клеточную линию рака человека NCI-H446 или клеточную линию рака человека PC-10, экспрессирующую GPC3. Клетки NCI-H446 или РС-10 отделяли от чашек и высевали в планшет E-Plate 96 (фирма Roche Diagnostics) в виде аликвот 100 мкл/лунку, регулируя их количество на уровне 1х104, и начинали анализ жизнеспособных клеток с помощью анализатора клеток в реальном времени xCELLigence. На следующий день планшет удаляли из анализатора клеток в реальном времени xCELLigence и в планшет добавляли по 50 мкл каждого соответствующего полученного антитела в различных концентрациях (0,004, 0,04, 0,4 и 4нМ). После осуществления реакции в течение 15 мин при комнатной температуре добавляли 50 мкл раствора человеческих РВМС (2х105 клеток/лунку), полученного согласно методу, описанному в разделе (1-2) и клетки вновь помещали в анализатор клеток в реальном времени xCELLigence и начинали анализ жизнеспособных клеток. Реакцию проводили в атмосфере 5% газообразного диоксида азота при 37°С и степень ингибирования роста клеток (%) определяли с помощью приведенной ниже формулы с использованием величины клеточного индекса, определенной через 72 ч после добавления человеческих РВМС. Применяемую для расчета величину клеточного индекса стандартизовали таким образом, что величину клеточного индекса, определенную непосредственно перед добавлением антитела, принимали за 1.
Степень ингибирования роста клеток (%) = (А-Б) х 100/(А-1)
А обозначает среднюю величину клеточного индекса в лунках без добавления антитела (только клетки-мишени и человеческие РВМС), а Б обозначает среднюю величину клеточного индекса в каждой лунке. Измерение осуществляли в трех повторностях.
Когда мононуклеарные клетки периферической крови (РВМС), полученные из человеческой крови, применяли в качестве эффекторных клеток для анализа цитотоксичности GPC3_ERY22_rCE115, обнаружена очень сильная активность (фиг. 2).
Пример 2. Гуманизация H-цепи антитела к CD3, rCE115 и совместное использование общей Lцепи.
(2-1) Создание hCE115HA, гуманизированной вариабельной области Н-цепи антитела rCE115.
Гуманизировали вариабельную область H-цепи антитела rCE115 к CD3 (SEQ ID NO: 42). CDR и FR определяли по Кэботу (нумерация Кэбота).
Сначала выбирали последовательность человеческого FR путем сравнения последовательностей вариабельных областей человеческих антител в базе данных с крысиной последовательностью вариабельной области rCE115. В качестве базы данных применяли базу данных IMGT (http://www.imgt.org/) и NCBI GenBank (http://www.ncbi.nlm.nih.gov/genbank/). Гуманизированную последовательность вариабельной области H-цепи создавали, сшивая последовательность CDR вариабельной области H-цепи rCE115 с выбранной последовательностью человеческого FR. Таким путем получали гуманизированную последовательность вариабельной области H-цепи, hCE115HL(SEQ ID NO: 51).
Аминокислотный остаток в положении 93 согласно нумерации Кэбота представляет собой Ala в выбранной последовательности человеческого FR3 Н-цепи, но представляет собой Arg в последовательности вариабельной области rCE115. При использовании базы данных последовательностей крысиных и человеческих зародышевых линий (база данных IMGT (http://www.imgt.org/)) обнаружено лишь несколько последовательностей, которые содержат в этом сайте Arg. Известно, что аминокислотный остаток в положении 94 согласно нумерации Кэбота принимает участие в стабилизации структуры антитела путем образования верхнего ядра (Ewert и др., Methods 34(2) октябрь 2004 г., с. 184-199). На основе указанной информации создавали новую последовательность гуманизированной вариабельной области H-цепи, в которой аминокислотные остатки в положениях по Кэботу 93 и 94 в FR3 H-цепи заменяли на остатки, присутствующие в последовательности вариабельной области rCE115. Таким путем получали гуманизированную последовательность вариабельной области H-цепи hCE115HA (SEQ ID NO: 52).
(2-2) Создание общей L-цепи L0000 для антитела к CD3 rCE115 и антитела к GPC3.
Осуществляли перестановку FR/CDR вариабельной области L-цепи rCE115L (SEQ ID NO: 43) антитела к CD3 rCE115 и вариабельной области L-цепи GL4 (SEQ ID NO: 41) антитела к GPC3.
Выбирали последовательность FR GL4 в качестве последовательности FR L-цепи. CDR2 L-цепи был одинаковым в rCE115L и GL4. CDR1 L-цепи выбирали из последовательностей CDR GL4, a CDR3 Lцепи выбирали из последовательностей CDR rCE115L соответственно. Кроме того, вновь создавали CDR3 L-цепи путем замены аминокислотного остатка Asp в положении 94 по Кэботу выбранного CDR3 L-цепи на остаток Val, присутствующий в GL4.
Гуманизированную последовательность вариабельной области L-цепи создавали, сшивая отобранные FR и CDR, описанные выше. В результате получали гуманизированную последовательность вариа- 54 041830 бельной области L-цепи, L0000 (SEQ ID NO: 53).
(2-3) Оценка аффинности к человеческому GPC3.
Оценивали связывающую активность в отношении человеческого GPC3 при применении GL4 (SEQ ID NO: 41) и L0000 (SEQ ID NO: 53) в качестве вариабельных областей L-цепей. Для осуществления этого применяли молекулярную форму антитела с одним плечом, несущего один Fab, гетеродимеризованный в Fc-области человеческого IgG1 с помощью технологии knobs-into-hole. H0000 (SEQ ID NO: 40) применяли в качестве вариабельной области H-цепи антитела к GPC3.
Константны аффинности и связывания антитела к GPC3 в отношении антигена измеряли с помощью метода многоциклической кинетики на основе поверхностного плазмонного резонанса с использованием устройства Biacore™-Т200 (фирма GE Healthcare Japan). В качестве подвижного буфера применяли HBS-EP+ (фирма GE Healthcare Japan) и набор для аминного сочетания (фирма GE Healthcare Japan) применяли для ковалентного связывания белка A/G с СМ5-чипом (чип, покрытый карбоксиметилдекстраном). Каждое антитело к GPC3 приготавливали таким образом, чтобы примерно 100 RU захватывалось белком A/G. Человеческий GPC3, применяемый в качестве аналита, приготавливали в концентрации 8, 16, 32, 64 и 128 нМ, используя HBS-EP+. При осуществлении измерений сначала давали белку A/G связываться с раствором антитела, а затем инъецировали раствор человеческого GPC3 со скоростью потока 30 мкл/мин в течение 3 мин, давая пройти реакции. Затем раствор заменяли на буфер HBS-EP+ и осуществляли оценку фазы диссоциации в течение 15 мин. После завершения оценки фазы диссоциации сенсорный чип регенерировали, промывая 10 мМ Gly-HCl при pH 1,5. Аналогично осуществляли измерение при концентрации 0, давая белку A/G осуществлять захват в растворе антитела, осуществляя инъекцию HBS-EP+ в течение 3 мин, давая пройти реакции, и затем заменяя раствор на HBS-EP+ для оценки фазы диссоциации в течение 15 мин. После завершения оценки фазы диссоциации сенсорный чип регенерировали, промывая 10 мМ Gly-HCl при pH 1,5. Для анализа данных применяли только программу для Biacore-анализа, программу Biacore T200 Evaluation, версия 1.0 применяли для осуществления кинетического анализа для расчета константы скорости реакции связывания (ka), константы скорости реакции диссоциации (kd) и соотношения констант скорости на основе полученных сенсограмм. Результаты представлены в табл. 6.
Таблица 6
Вариабельная область Аффинность в отношении человеческого CD3
Вариабельная область Нцепи Вариабельная область Lцепи KD (М) ka (1/Мс) kd (1/с)
НОООО GL4 4,2х10'9 4,3*105 1,8х10’3
НОООО L0000 3,6х10'8 3,0х105 Ι,ΙχΙΟ'2
(2-4) Оценка аффинности к человеческому CD3.
Оценивали связывающую активность в отношении человеческого CD3 при применении hCE115HA (SEQ ID NO: 52) в качестве вариабельной области Н-цепи и L0000 (SEQ ID NO: 53) в качестве вариабельной области L-цепи. Для осуществления этого применяли молекулярную форму антитела с одним плечом, несущего один Fab, гетеродимеризованный в Fc-области человеческого IgG1 с помощью технологии knobs-into-hole.
Константы аффинности и связывания антитела к CD3 в отношении антигена измеряли с помощью метода одноциклической кинетики на основе поверхностного плазмонного резонанса с использованием устройства Biacore™-F200 (фирма GE Healthcare Japan). В качестве подвижного буфера применяли HBSEP+ (фирма GE Healthcare Japan) и набор для аминного сочетания (фирма GE Healthcare Japan) применяли для ковалентного связывания человеческого CD3 с СМ5-чипом (чип, покрытый карбоксиметилдекстраном). Антитело к CD3, применяемое в качестве аналита, приготавливали в концентрациях 5 и 20 мкг/мл, используя HBS-EP+. Измерения осуществляли путем первой инъекции каждого из растворов антитела к CD3 в концентрациях 5 и 20 мкг/мл в течение 3 мин при скорости потока 20 мкл/мин, давая пройти реакции. Затем раствор заменяли на HBS-EP+ и осуществляли оценку фазы диссоциации в течение 3 мин. После завершения оценки фазы диссоциации сенсорный чип регенерировали, промывая 10 мМ Gly-HCl при pH 1,5. Для анализа данных применяли только программу для Biacore-анализа, программу Biacore T200 Evaluation, версия 1.0 применяли для осуществления кинетического анализа для расчета константы скорости реакции связывания (ka), константы скорости реакции диссоциации (kd) и соотношения констант скорости на основе полученных сенсограмм. Результаты представлены в табл. 7.
Таблица 7
Вариабельная область Аффинность в отношении человеческого CD3
Вариабельная область Нцепи Вариабельная область Lцепи KD (M) ka (1/Мс) kd (1/с)
ГСЕ115Н rCE115L Ι,ΟχΙΟ7 5,9х104 6,0х10’3
hCE115HA L0000 1,2х107 1,9х105 2,ЗхЮ'2
(2-5) Получение GPC3 ERY27 hCE115.
IgG4 к раковому антигену (GPC3) применяли в качестве основной структуры для получения молекулы ERY27 (фиг. 16), в которой вариабельную область H-цепи одного из Fab заменяли на домен, связы- 55 041830 вающий CD3 эпсилон, а L-цепь была общей для обоих Fab. В этом случае Fc IgG4, которую применяли в качестве основной структуры, представляла собой молчащую Fc с ослабленной аффинностью к FcgR (Fey- (Fc-гамма) рецептор). Н0000 (SEQ ID NO: 40) применяли в качестве вариабельной области H-цепи GPC3-связывающего домена, a hCE115HA (SEQ ID NO: 52) применяли в качестве вариабельной области H-цепи CD3-связывающего домена. L0000 (SEQ ID NO: 53) применяли в качестве вариабельной области L-цепи. Мутации D356K и К439Е интродуцировали в соответствующие H-цепи для эффективного образования гетеромеров каждой H-цепи при получении гетеродимерных антител, содержащих два типа Hцепей (WO 2006/106905). H435R представляет собой модификацию, которая нарушает связывание с белком А, и ее интродуцировали для эффективного разделения гетеромера и гомомера (WO 2011/078332).
Серии экспрессионных векторов со встроенным полинуклеотидом, кодирующим каждую из конструкций f H0000-ERY27HK (SEQ ID NO: 54), hCE115HA-ERY27_HE (SEQ ID NO: 55) и L0000-k0 (SEQ ID NO: 56), получали хорошо известными методами.
Следующую комбинацию экспрессионных векторов интродуцировали в клетки FreeStyle 293-F для кратковременной экспрессии каждой молекулы-мишени.
Молекула-мишень: GPC3_ERY27_hCE115.
Полипептиды, кодируемые полинуклеотидами, встроенными в экспрессионные векторы: H0000ERY27HK, hCE115HA-ERY27HE и L0000-k0 (2-6) Очистка GPC3 ERY27 hCE115.
Каждую представляющую интерес молекулу очищали методом, описанным в примере 1-2.
(2-7) Измерение цитотоксической активности с использованием мононуклеарных клеток периферической крови человека.
(2-7-1) Получение раствора мононуклеарных клеток периферической крови человека (РВМС).
Раствор приготавливали согласно методу, описанному в примере 1-3-1.
(2-7-2) Оценка цитотоксической активности.
Цитотоксическую активность оценивали согласно методу, описанному в примере 1-3-2.
Когда РВМС, полученные из человеческой крови, применяли в качестве эффекторных клеток для оценки цитотоксичности GPC3_ERY27_hCE115, было обнаружено снижение активности в результате гуманизации H-цепи rCE115 и совместного использования общей L-цепи (фиг. 2).
Пример 3. Получение и оценка гуманизированных вариантов биспецифических антител для улучшения различных свойств.
Зависимая от Т-клеток цитотоксическую активность (TDCC-активность) биспецифического гуманизированного антитела к CD3-цепи (CD3 эпсилон) и к GPC3, полученного согласно методу, описанному в примере 2, GPC3_ERY27_hCE115 (SEQ ID NO: 54, 55 и 56), оказалась ниже, чем зависимая от Т-клеток цитотоксическая активность GPC3_ERY22_rCE115 (SEQ ID NO: 47, 48, 49 и 50). Это может являться результатом ослабления аффинности к GPC3 и CD3ε-цепи в результате гуманизации и совместного использования общей L-цепи. Касательно антигенов, таких как GPC3 и CD3ε-цепи, которые имеют независимые друг от друга последовательности, к настоящему времени отсутствуют данные о гуманизированных биспецифических антителах с повышенной зависимой от Т-клеток цитотоксической активностью и улучшенной аффинностью к обоим антигенам при использовании общей L-цепи антитела. Таким образом, представляется сложным получение гуманизированных антител с двойной специфичностью, обладающих эффективностью в качестве лекарственных средств, эквивалентной или более высокой, чем у антитела GPC3_ERY22_rCE115.
С учетом указанных обстоятельств при создании изобретения получали модифицированные гуманизированные биспецифические антитела с модифицированной аффинностью к человеческому GPC3 и человеческой CD3ε-цепи с помощью методов, известных специалистам в данной области, которые включали обширную замену аминокислотных остатков, кодируемых геном антитела, с получением вариантов антител против обоих антигенов, а именно человеческого GPC3 и человеческой CD3ε-цепи, осуществление различных оценок с помощью скрининга. Кроме того, аналогичные методы применяли для получения модифицированных гуманизированных биспецифических антител с модифицированными физикохимическими свойствами. Кроме того, путем объединения замен аминокислотных остатков, обладающих эффективностью в отношении модификации аффинности и физико-химических свойств, получали оптимизированные биспецифические антитела с TDCC-активностью, эквивалентной или более высокой, чем зависимая от Т-клеток клеточная цитотоксичность GPC3_ERY22_rCE115 до гуманизиации.
Интродукцию точечных мутаций, экспрессию и очистку антител, оценку аффинности к антигену и определение зависимой от Т-клеток клеточной цитотоксичности при оптимизации гуманизированных биспецифических антител осуществляли согласно методам, аналогичным описанным в примерах 1 и 2. CDR и FR определяли согласно Кэботу (нумерация Кэбота).
В зависимости от цели следующие конструкции применяли в качестве константных областей Hцепи антитела (номера соответствуют EU-нумерации): E22Hh (SEQ ID NO: 57), которую получали путем интродукции мутаций L234А/L235А/N97А/D356С/Т366S/L368А/Y407V/G446-делеция/K447-делецияв человеческий IgG1; E22Hk (SEQ ID NO: 58), которую получали путем интродукции мутаций
- 56 041830
L234А/L235А/N97А/Y349С/Т366W/G446-делеция/K447-делеция, и инсерционной мутации Ser-Ser непосредственно перед положением 118 в человеческом IgG1; G1dh получали путем интродукции мутаций
D356С/Т366S/L368А/Y407V/G446-делеция/K447-делеция в человеческий IgG1; none-Hi-Kn010G3 получали путем интродукции делеции 118-215 и мутаций C220S/Y349C/T366W/H435R в человеческий IgG1;
E2702GsKsc (SEQ ID NO: 60) получали путем интродукции мутаций
L235R/S239K/N297A/E356K/R409K/H435R/L445P/G446-делеция/K447-делеция в человеческий IgG4; E2704sEpsc (SEQ ID NO: 61) получали путем интродукции мутаций
K196Q/L235R/S239K/N297A/R409K/K439Е/l445Р/G446-делеция/K447-делеция в человеческий IgG4; и E2702sKsc (SEQ ID NO: 62) получали путем интродукции мутаций
L235R/S239K/N297A/E356K/R409K/L445P/G446-делеция/K447-делеция в человеческий IgG4. Кроме того, человеческую к-цепь (каппа-цепь) k0 (SEQ ID NO: 63) и E22L (SEQ ID NO: 432) получали путем интродукции мутаций R108A/T109S в человеческую к-цепь, применяемую в качестве константных областей L-цепи антитела.
Мутация, приводящая к замене Asp на Cys в положении 356 согласно EU-нумерации, мутация, приводящая к замене The на Ser в положении 366 согласно EU-нумерации, мутация, приводящая к замене Leu на Ala в положении 368 согласно EU-нумерации, мутация, приводящая к заменам Tyr на Val в положении 407 согласно EU-нумерации, мутация, приводящая к замене Tyr на Cys в положении 349 согласно EU-нумерации, мутация, приводящая к замене Thr на Tip в положении 366 согласно EU-нумерации, и мутация, приводящая к вставке Ser-Ser непосредственно перед положением 118 согласно EU-нумерации, представляют собой мутации, предназначенные для эффективного образования гетеродимерных молекул каждой H-цепи при создании гетеромерных антител. Аналогично этому, мутация, приводящая к замене Glu на Lys в положении 356 согласно EU-нумерации, и мутация, приводящая к замене Lys на Glu в положении 439 согласно EU-нумерации, также представляют собой мутации, предназначенные для эффективного образования гетеродимерных молекул каждой H-цепи при создании гетеромерных антител. Как ожидается, они должны повышать эффективность производства биспецифических антител.
Мутация, приводящая к замене Leu на Ala в положение 234 согласно EU-нумерации, мутация, приводящая к заменам Leu на Ala или Arg в положение 235 согласно EU-нумерации, мутация, приводящая к замене Ser на Lys в положение 239 согласно EU-нумерации, и мутация, приводящая к замене Asn на Ala в положение 297 согласно EU-нумерации, представляют собой мутации, предназначенные для ослабления аффинности к Fcy-рецептору и комплементу (C1q). Как ожидается, они должны подавлять связывание Fab с CD3 и опосредуемое Fc перекрестное сшивание Fcy-рецептора или комплемента и позволять избегать синдрома высвобождения цитокинов, который сопровождает повышение неспецифических эффекторных функций.
H-цепь, в которую интродуцированы делеционные мутации в положениях 118-215 согласно EUнумерации, можно объединять с полноразмерной последовательностью H-цепи с получением антитела, которое имеет только один Fab (одновалентное антитело), и ее можно применять для оценки аффинности.
Мутация, приводящая к замене Arg на Lys в положении 409 согласно EU-нумерации, и мутация, приводящая к замене His на Arg в положении 435 согласно EU-нумерации, представляют собой мутации, приводящие к модификации свойства антитела, приближая их к свойствам человеческого IgG1 и человеческого IgG3 соответственно.
(3-1) Модификация аффинности гуманизированного антитела к CD3 с помощью точечных мутаций.
Сначала интродуцировали точечные мутации в последовательность FR1, FR2, FR3, CDR1, CDR2 и CDR3 гуманизированного антитела к человеческой CD3ε-цепи, полученного согласно методу, описанному в примере 2, hCE115HA-ERY27HE (SEQ ID NO: 55), для получения модифицированных антител. Затем определяли аффинность указанных модифицированных антител к растворимой человеческой CD3ε-цепи. Объединяя сайты, которые обладают способностью повышать аффинность модифицированных антител, получали модифицированные антитела, аффинности которых представлены в табл. 8.
- 57 041830
Таблица 8
Название антитела KD (человеческий CD3)
hC Е115HA-E22Hh//-Hi-KoO10G3/L0000-k0 1.43E-07
TR01H083-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0212-k0 5.86E-11
TR01H040-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/^ 2.17E-O9
TROlH002-E22Hh/GLS3l08-kO/GL4-E22Hk/H0610-E22L 2.04E-09
TR01H040-E22Hh^one-Hi-Kn010G3/L0212-k0 2.17Е-Я9
TR0lH040-E22Hh/none-Hi-Kn0l0G3/L0235-k0 2.81 E-09
TR01H040-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0238-k0 2.91 E-09
TR01H040-E22Hh>none-Hi-Kn010G3/TR01L015-kD 2.52E-O9
TR01H083-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/La262-k0 2.45E-09
TR01H04O-E22Hh/none-Hi-Kri010G3/L0207-k0 2.6OE-O9
TR0lH040-E22Hh/none-Hi-Kn0l0G3/L0241-k0 3.48E-09
TR01H040-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0242-k0 Э.58Е-09
TRQ1HO4O-E22Hh/none-Hi-KnO1OG3/LQ2O6-kO 2.9QE-Q9
TR01H040-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/TR01L019-k0 3.20ΕΌ9
TR01H080-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0000-k0 3.25E-09
TR01H040-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0211-k0 3.22ΕΌ9
TRO1HOO2-E22Hh//-Hi-KnD10G3/GLC31O8-kO 4.61 E-09
TR01H040-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0209-k0 4.25E-09
TR01HC40-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L020S-W 4.16E-09
TR01H040-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0224-k0 5.06E-09
TR01H040-E22Hh/nane-Hi-Kn010G3/LQ236-k0 5.64E-O9
TR01H083-E22Hh/nane-Hi-Kn010G3/L0201-k0 4.42E-09
TR01H084-E2702GsKsc/none-Hi-E2704sE/L0011 -kO 4.14E-09
TR01H040-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L02l0-k0 5.06E-09
TR01H114.E2702GsKsc/nQne.H!-E2704sE/L0011-kO 4.22E-09
CE115HA236-E22Hh/GLS3108-кО/СЕ4-Е22Нк/Н06Ю-Е22Е 6.08E-09
TR01H077-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0200-k0 6.12E-09
TR01H071-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0200-k0 6.13E-09
TR01H111-E2702GsKsc/none-Hi-E2704sE/L0011 -k0 4.91 E-09
TR01H081-E22Hh/none-Hj-Kn010G3/L0262-k0 5.76E-09
TR01H001-E22Hh/AHi-Kn010G3/GLC3108-kO 8.22E-O9
CE115HA179-G1dh/M4l-Kn010G3/L0Q00-k0 8.35E-09
TR01H112-E2702GsKsc/nore-Hf-E2704sE/L0011-k0 5.12E-O9
TR01H113-E2702GsKsc/none-Ht-E2704sE/L0011-k0 5.14E-09
TR01H082-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0212-k0 4.75E-09
CE115HA236-E22Hh//-Hi-Kn010G3/GLC3108-k0 9.10E-09
TR01H040-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0231-k0 7.75E-09
TR0lH037-E22Hh/none-Hi-Kn0l0G3/L0000-k0 6.93E-09
CE115H A252-E22Hh//-Hi-KnO WG3/LQOOO-kO 9.48E-09
TR01H083-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0011-kO 6.70E-09
TR01H040-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0223-kO 8.15E-09
Τ^01Ηΰθ3-£22ΗΜ/ηοηθ-ΗρΚη0ΐ0ΰ3/10ΰ00-ω 6.83E-O9
TR01H071-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0000-k0 Э.85Е-09
TR01H067-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0212-k0 5.88E-O9
CE115HA178-G1dh//-Hi-Kn010G3/L0000-k0 1.09E-08
TR01H040-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0237-k0 1.02E-0B
TR01H083-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0222-k0 9.42E-09
TR01H084-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0262-k0 8.51E-O9
TR0lH071-E22Hh/none-Hi-Kn0l0G3/L0215-k0 9.51 E-09
TR01H040-E22Hh/none-Hi-Kn010G30218-kO 8 20E-09
TRQ1HO81-E22Hh/none-Hi-KnO1OG3/L02O1-kO 9.46E-09
TR01H071-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0222-k0 1.04E-08
TR01H040-E22Kh/none-Hi“Kri010G3/L0220“k0 9.15E-O9
TR01H067-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/TR01L018-k0 1.09E-08
TRO1HOO2-E22Hh/GLS31384<O/GL4-E22Hk/HD0OO-E22L 4.78E-09
TR01H067-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/TR0U019-k0 1.21E-08
TRO1HO38-E22Hh/none-Hi-KnO1OG3/L0OOO-kO 1.24E-08
TR01H06l-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0200-k0 1.27E-08
TR01H082-E2702GsKsc/nQne-Ht-E27Q4sE/L(X!11 -k0 1.01 E-08
CE115HA18O-G1dh/AHi-KnO1OG3/LD0OO-kO 1.68E-08
CE115HA251-E22Hh/L0000-k0/GL4-E22Hk/H0610-E22L 1.37E-08
TROlHl0O-E2702GsKsc/nore-Hi-E2704sE/L00l1-k0 1.11 E-08
TR01H040-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0228-k0 1.60E-08
TR01H081-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0011-k0 1.35E-08
TR01H061-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0215-k0 1.54E-08
TR01H110-E2702GsKsG/none-Ht-E2704sE/L0011-kO 1.26E-O8
TR0lH043-E22Hh/non©-Hi-Kn0l0G3/L0000-k0 1.52E-08
TR01H081-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0000^ 1.56E-08
CE115HA251 -E22Hh//-Hi-Kn010G3/L000D-k0 2.23E-08
TR01H091-E27Q2GsKsc/none-Ht-E2704sE/LQ011-k0 1.Э9Е-08
CE115HA236-E22Hh/GLS31 D8-kO/GL4-E22Hk/HOOOO-E22L S.95E-09
TR01H084-E22Hh/none-Hi-Kn0l0G3/L0201-№ 1.65E-08
TRO1HO72-E22Hh/none-Hi-KnO1OG3/L0OOO-kO 2.03E-0S
TR01H099-E2702GsKsc/nons>HHE2704sE/L0011 -kO 1 4SE-08
TR01H061-E22Hh/non©-Hi-Kn010G3/L0222-kO 1.88E-08
TR01HW0-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0239-k0 2.31 E-08
TR01H040-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0262-kO 1.81 E-08
TR01H040-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0234-k0 2.40E-08
TRO1HO12-E22Hh/nane-Hi-KnO1OG3/L0OOO-kO 7 94E-D9
TR01H061-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0000-k0 1.71 E-08
TRO1HO4O-E22Hh/none-Hi-KnO1OG3/L0243-kO 2.4SE-08
TR0lH109-E2702GsK8c/none-Hi-E2704sE/L0011-k0 1.84E-08
TR01H047-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0000-k0 2.04E-08
TR01H082-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0267-k0 2.29E-08
TR01H082-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0266-k0 2.29E-08
TR01H064-E22Hh/none-Hi“Kri010G3/L0011-kO 1.98E-08
TR01H040-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0250-k0 2.15E-08
TR01H040-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0204-k0 2.21E-08
TR01H084-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/LM00-k0 2.13E-08
TR01H040-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/LD213-k0 2.01E-08
- 58 041830 ^iCEDSHA^gHh^^^________
TR01H040-E22Hh/n0ne-Hi-Kn010G3/L0214-k0
TRD1H040-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0217-k0
TR01H071-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0226-k0
ТКО1Н040-Е22НП/попе-НкКп0ЮОЗ/к0200-к0
TRO1H074-E22Hh/none'Hi'Kn010G3/LO000’k0
TR01 H039-E22Hh/none-HI-Kn010G3/LO00G-kQ
CE115HA177-G1 dh/AHi-KnO1OG3/LOOOO-kO
TR01H040-E22Hh/none-Hi-Kri010G3/L0201-k0
TR01H082-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L02S3-k0
ТКО1Н040-Е22НЬ/попе-НкКп010СЗЛ_0000-к0
ТК01Н040Е22НП/ПОПе-НкКп010ОЗ/к0216-к0
TR01H051 -E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0000-k0
TR01 H003-E22Hh/AHi-Kn01 OG3/LOOOO-kO
TR01 Η082Έ22ΗΚ/ποπδΉί·Κη010Ο3/10264-Κ0
TR01 H04Q-E22Hh>none-Hi-Kn010G3/L0232 k0
TRO1H041 -E22Hh/rK»ne-Hi-KnO1OG3/LO0OO'kO
CE115HA122-E22Hh//-Hi-KnO1 DG3/L000D-k0
TR01H040-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0233-k0
TRD1H04G-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0215-k0
TRDlH040-E22Hh/none-Hi-Kn0l0G3/L0203-k0
TRO1HO15-E27O2GsKsc/GCHO19-E27iMsEpsG/L0OOO-kO TR01H04C-E22Hh/rt0n6-Hi-Kn010G3/TR01 L008-k0
TR01H040-E22Hh/none.Hi-Kn010G3?L0205-kO
TR01H015-E22Hh/L0000-k0/GL4-E22Hk/H0610-E22L
TR01H064-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0000-k0
TR01HO44-E22HIVnone-Hi-Kn010G3/LQ000-k0
TR01H082-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0262-k0
TR01H062-E22Hh/none-HhKn010G3/LO000-k0
CE115HA251 -E22HhiL0000-k0/GL4-E22Hk/H0000-E22L
TR01H040-E22Hh/rK>ne-Hi-Kn010G3/L0011-kO
TRO1 HQ40-E22Hh/rtone-Hi-Kn010G3/L0222-k0
CE115HA192-E22Hh/FHi-KnO10G3/L0000-k0
TR01H04G-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/TR01 LOIO-kO
TR01H025-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0000-k0
TR01 H082-E22Hh/none-Hi-Kn010G3rTR01 L023-kD
TR01H040-E22Hh/nane-Hi-Kn010G3/TR01L015-k3
TRO1H055-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/LtXl00-k0
TR0lH082*E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0260-k0
TR01 H040-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/TR01 L009-k0
TR01H040-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/TRCHLC11-kO
TR01 HOI 7.E22Hhinone-Hi-Kn010G3/L0000-k0
CE115HA122*E22Hh/L0000-k0/GL4-E22Hk/H0000-E22L
TR01H076-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/LO000-k0
TR01H082-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0258-k0
TR01H046-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0000-k0 rCE115H-G1dW-Hi-Kn010G3/L0000-k0
TR01 H082-E22Hh/none-Hi-Kn0l0G3/TR0l L024-k0
TR01H016-E22HtVnone-Hi-Kn010G3/L000O-k0
TR01H040-E22Hh/none-Hi-KnOlOG3?TR01 LGl8kO
TR01 H084-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0271-k0
TRO1HO84-E22Hh/none-Hi-KnO1OG3/LO27O-kO
TRCl1H040-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0000vk1-k0
TRO1HO4G-E22Hh/none-Hi-KnO1OG3/LO219-kO
TR01 HOI 4-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/LO000-k0
TRO1H061 -E22Hh(none-Hi-Kn010G3/L0226-k0
TR01H048-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/LM00-k0
TRD1H082-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0259-k0
ТН01Н028^22НК/гюпе-НнКп010ЙЭ/1СКЮ0-к0
TR01H082-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0201-k0
TRD1H040-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/TR01 L013-k0
TR01H033-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0a00-k0 hCEl 15HA-G1 dh//-HbKn010G3rLC00CM<0
TR01H040-E22Hh?none-Hi-Kn010G3/TR0U012-k0
TR01HQ65-E22H^non^Hi-Kn010G30000-kO
TRD1H079-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/LM00-k0
TR01 H042-E22Hh<none’Hi’Kn010G3/L0a00'-k0
TRO1 НО63^22НЬ/ПОПе-НнКпО1ОСЗ/1.СЮ0О-к0
TR01H084-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0272-k0
CE115HA121 -E22Hh//-Hi-KnD1 DG3/LOOOD-kO
TR01H026-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/LOO00-k0
TR01H067-E22Hh/nane-Hi-Kn010G3/LQ262-k0
TR01H073*E22Hh/none-Hi-Kn010G3/Lt)000-kO
7R01H045-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/LM00-k0
TR01H007-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/LtXK)0-k0
TR01H082Έ22Hh/πone-Hl·Kn010GЗ/L0203-k0
TR01H032-E22Hh/none-HI-Kn010G3/LCK}00-k0
TR01H006-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0000-k0
TRO1 HOI 3-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/LM00-k0
TR01H05G-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/LOa00-k0
TR01H067-E22Hh/nane-Hi-Kn010G3/L0200-k0
TR01 HOI 5-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0000-k0 hCEl 15HA-E22Hh/LOOOO-kO/GL4-E22Hk/HQOOO-E22L hCE115ΗΑ-Ε22δΐΗη/ηοη&-Ηΐ·&ίΚη010Ώ3/Ι00004:0
TR01H069-E22Hh/none’HhKn010G3/L0000-k0
TRO1 HOI 5*Е22НЬ/папе-НкКпО1ОСЗ/ТНО1 L003-k0
TR01H040-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0202-k0
TRO1H067-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0201-k0
TRO1 H02G-E22Hh/non^Hi-Kn010G3/L0000-k0
TR01 H082-E22Hh/none-Hi-Kri01QG3/L0011-k0
43E-07 2 02E-O8 207E-08 2.51E-0B 287E-08 2.91E-08 2.61ΕΌ8 3 55E-08 2.81E-08 309E-08 3 60E-0B 253ΕΌ8 2.91E-0B 403E-08 3.44ΕΌΒ 386ΕΌ8
16E-08 428E-08
4.01E-08
3.37E-08 3 24E-0& 2.96E-08 2.93E-08
42E-O8 357E-08
3.07E-0B 352E-08 39SE-O8
13ΕΌ8 1 48ΕΌ8
48E-08 465E-08 50&E-0B Э28Е-08 386E-08
4.25E-08
3.95E-O&
3.Θ8Ε-08 453E-O8 356E-O8 357E-08
3.50E-0B
69ΕΌ8 478E-08 4.70E-08 423E-O8
5.76E-OB 476E-08 369E-0B 451E-0&
2.76E-08
2.76E-08 4.69ΕΌ8 3.94ΕΌ8 387E-08 471E-08 452E-08 5.07E-08 480E-08 449E-08 4.15E-O8 4.88ΕΌ8 6.50E-08 422E-08 431E-08 505E-08
4.48E-0&
4.35ΕΌ8 3 10E-08 678E-08
5.12E-0B
92ΕΌ8 597ΕΌ8 5.22E-O8 2.17E-08
4.07E-0B 573E-08 230E-0& 4.94E-08
5.76E-08 603E-08
13E-08 6 16E-08
5.17E-O8
7.11ΕΌ8
6.34ΕΌ8
6.19E-08
93E-08 6.48E-0B 595E-0B
- 59 041830
hCE115HA-E22Hh//-Hi-KnO10G3/LM00-k0 1.43E-07
TRC1H0B2-E22Hh/none-Hi-Kn010G37TR0lL018-k0 4.72E-08
TR01H015-E22Hh/none-Hi-Kn010G34R01L005-k0 6.53E-08
TRG1 Н052-Е22НИ/поге-НьКп01 OG3/LOOOO-kO 6.27Ε-0Θ
TR01 H036-E22Hh/none-Hi-Kn0l GG3A0000-k0 6.50E-08
TR01 H067-E22Hh/none-Hi-Kn0l GG3/L0203-kO 4.79E-C6
TR01 H03G-E22Hh/none-HiKn01 GG3/L0000-kG 6.54E-08
TR01H0l5-E22Hh/none-Hi-Kn0l0G3/TR0lL001-k0 6.56E-08
TRG1 Hl00-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/LOO11-kO 6.25E-08
TR01 H029-E22Hh/none-Hi-Kn0l OG3/LOOOO-kO 6.70E-08
TR01 H019-E22Hh/none-Hi-Kn01 QG3/L0000-kG 6.&5E-08
TRG1 H082-E22Hh/none-Hi-Kn0l GG3/L0000-kG 7.37E-08
TRG1 H0l8-E22Hh/none-Hi-Kn0l OG3/LOOOO-kO 6.93E-08
TR01 H027-E22Hh/none-Hi-Kn01 OG3/LOOOO-kO 6.95E-08
TR01 H049-E22Hh/rwe-Hi-Kn010G3/L000frk0 6.79E-08
TR01 H066-E22Hh/none-Hi-Kn0l GG3/L0000-kG 6.02E-08
TR01 H091-E22Hh/none-Hi-Kn0l OG3/L0011-kO 6.67E-08
rCE115H-E22Hh/ncne-Hi-Kn010G3/L0000-k0 8.00E-08
TR01H015-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/TR01L002-k0 7.14E-08
TR01 H040-E22Hh/nore-Hi-Kn01 OG3/L0226-kO 8.01E-08
TR01H067-E22Hh/none-Hi-Kn010G3HR0lL018-k0 5.26E-08
TRG1 H093-E22Hh/nore-Hi-Kn01 OG3/L0011-kO 6.80E-08
TR01 H067-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0215-kO 7.41E-08
TR01H015-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/TRC1L004-k0 7.34Ε-0Θ
TR01 H107-E22Hh/none-Hi-Kn01 OG3/L0011-kO 6.91E-08
TR01 H105-E22Hh/none-Hi-Kn01 OG3/L0011-kO 6.95E-08
TR01 HQ90-E22Hh/none-Hi-Kn01 OG3/L0011-kO 6.95E-08
TR01 H108-E22Hh/none-Hi-Kn01 OG3/L0011-kO 6.98Ε-0Θ
TR01 H094-E22Hh/none-Hi-Kn01 OG3/L0011-kO 7.00E-08
TR01 HI 09-E22Hh/nore-Hi-Kn01 OG3/L0011-kO 7.06E-08
TR01 H056-E22Hh/none-Hi-Kn01 OG3/LOOOO-kO 7.32E-08
TR01 H031-E22Hh/none-Hi-Kn01 OG3/LOOOO-kO 7.55E-08
TR01 H022-E22Hh/none-Hi-Kn01 OG3/LOOOO-kO 7.58E-08
TR01 H092-E22Hh/none-Hi-Kn01 OG3/L001 FkO 7.21E-08
TR01 H067-E22Hh/none-Hi-Kn01 OG3/LOOOO-kO 7.15E-08
TR01 H067-E22Hh/nore-Hi-Kn010G3A0Q1 FkO 7.1 BE-08
TR01 H040-E22Hh/nore-Hi-Kn010G3A.O248-k0 7.89E-08
TR01 Η009Έ22ΗΗ/πογθ-Ηϊ-Κπ01 OG3/LOOOO-kO 3.15E-08
TR01 H023-E22Hh/rone-Hi-Kn01 0G3/L00OT-k0 7.94E-08
TR01 Н096'Е22НЬ/попеНйКп01 OG3/L0011-kO 7.47E-08
TR01 H040E22Hh/none-Hi-Kn010G34RD1LDO7-kO 6.B2E-08
TR01 Н054-Е22НЬ/попе-НьКп01 OG3/LOOOO-kO 7.79E-08
TR01 Η021Έ22ΗΜποπβ-Ήϊ-Κπ01 OG3/LOOOO-kO 8.05E-08
TR01H W3-E22Hh/rore-Hi-Kn010G3/L0011-kO 7.72E-08
TRG1 Н09>Е22НЬ/гопе-НьКп01 0G3/L0Q1 FkO 7.74E-08
гСЕ115Н-Е22НМпоп<^НйКп010СЗЛ_0000¥к1-к0 8.52E-08
TR01H101-E22Hh/none-Hi-Kn01OG3/L0011 -kO 7.B7E-08
TR01 Н0БЗ-Е22НЬ/гопе-НкКп01 OG3A.OOOO-kO Β.23Ε-Ό8
TR01 H03S-E22Hh/none-Hi-Kn01 OG3AOOOO-kO B.49E-Q8
TRG1H067-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/TRQ1L015-k0 B.64E-08
TR01 Η104-Ε22Ηή/ΓθΓθΉί-Κη01 OG3/L0011-kO B.26E-08
TR01 Н075-Е22НИ/попе-НйКп01 OG3/LOOOO-kO 9.BBE-08
TR01 HD40-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/1.0227-k0 1.01E-07
TR01H1D2-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0011-k0 B.54E-Q8
TR01 Η034-Ε22ΗΜ/ΓΟΓ&Ήί-Κη01 OG3/LOOOD-kO 9.11E-08
TR01 H082-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0222-k0 1.01E-07
rCE115H-E22HhirCE115L-kO/GL4-E22Hk/HOOOO-£22L 9.37E-08
TRQ1 Н015-Е22НЬ/попе-Н|-Кл01063/ТК01Е006-к0 9.30E-0B
TRG1 H040-E22Hh/none-Hi-Kn010G3A_0246-k0 9 2ВЁ-С0
TRG1 H097-E22Hh/none-Hi-Kn01 OG3/L0011-kO B.76E-08
TRG1 HOI 1-E22Hh/rore-Hi-Kn01 OGS/tOOOO-kO 3.71E-0B
TR01 H010-E22Hh/none-Hi-KnD1 OG3/L0000-RO 3.73E-08
TRG1 H095-E22Hh/none-Hi-KnGl OG3/L0011-kG 9.09Ё-08
TR01 H082-E22Hh/none-Hi-KnD1 OG37TROt LO2O-kO 1.08E-07
TR01 H098-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/LOO11-ktJ 9.14E-08
TR01 H082-E22Hh/none-Hi-Kn01QG3/TR01L017-k0 1.09E-07
TR01 H04CbE22Hh/mna-Hi-Kn010G3/L0247-kD 1.00E-07
ГСЕ115H-E22Hh/ncne-Hi-KnO1OG3/fCE115L-k0 1.24E-07
TRQ1 H004-E22Hh//-Hi-Kn01 OG3/LOOOO-kO 1.35E-07
TR01 Н067-Е22НЬ/попе-Н|-Кл01 OG3fl_0222-kO 7.63E-08
rCE115H-E22HM-HE-KriO1OG3/rCE115L-kO 1.38E-07
TRD1 H008-E22Hh/none-Hi-Kn01 OG3A_OQOO-kO 4.22E-08
TR01 HO70-E22HMnora-Hi-Kn01 OG3/LOOOO-kO 1.20E-07
TR01 H106-E22Hh/none-Hi-Kn01 OG3A0011-kO 1.00E-07
TR01 H024-E22Hh/mns-Hi-Kn01 OG3/LOOOO-kO 1.OSE-07
CE115HA124-E22HW/-Hi-Kn010G3/L0000-k0 1.43E-07
TR01 H040-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/LO249-k0 1.11E-07
TR01 H082-E22Hh/none-Hi-KnD10G3/LO271-k0 8.82E-08
TR01 H057-E22Hh/non&-Hi-Kn01 OG37LOOOO-kO 1.12E-07
TRD1 HO58-E22Hh/mne-Hi-KnO1 OG3/LOO<JO-kO 1.15E-07
TR01 H068-E22Hh/none-Hi-Kn01 OG3/LOOOO-kO 1.01E-07
TR01 H082-E22Hh/none-Hi-Kn01 OG3/L0270-kO 7.42E-08
TRC1 H082-E22Hh/none-Hi-Kn01 OG3/L0272-kO 7.44E-08
hCE115HA-E22Hh/none-Hi-Kn010G3/L0000-k0 1.24E-07
TRC1 H082-E22Hh/none-Hi-Kn01 OG3/L026&-kO 1.36E-07
hCE115HAa-E22Hh/none-Hi-KnC1CG3/L0000-k0 1.08E-07
TR01 H067-E22Hh/norre-Hi-Kn01 OG3A0226-kO 1.32E-07
TR01 H067-E22Hh/none-Hi-Kn010G3A024B-k0 1.39E-07
(3-2) Модификация аффинности гуманизированного антитела к GPC3 с помощью точечных мутаций.
Сначала интродуцировали точечные мутации в последовательность CDR1, CDR2 и CDR3 биспецифического антитела, полученного согласно методу, описанному в примере 2, H0000-ERY27HK (SEQ ID NO: 54), для получения модифицированных антител. Затем определяли аффинность указанных модифицированных антител к растворимому человеческому GPC3. Объединяя сайты, которые обладают способностью повышать аффинность модифицированных антител, получали модифицированные антитела, аффинности которых представлены в табл. 9.
- 60 041830
Таблица 9
Название антитела KD (человеческий GPC3)
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0000-k0 3.&7E-09
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0222k0 1.40E-13
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0259-k0 3.52E-13
GCH054-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0262-k0 5.25E-13
GCH060-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0222-k0 6.42E-13
H06W-Gldh/none-Hi-Kn010G3/L0246-k0 1.21E-12
GCH0&7-Gldh/none-Hi^n0l0G3/L0222-k0 1.B5E-12
GCH054-G1dh/nons-Hi-Kn010G3/L0249-k0 3.31 ΕΊ 2
GCH055-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0222-k0 3.90E-12
GCH094-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0248-k0 4.12E-12
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0249-k0 6.86E-12
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3HR01L017-k0 8.27E-12
H0610-G1 dh/none-Hi-Kn010GM0265-k0 8.70E-12
H06l0-G1d№one-Hi-Kn010G3A026l-k0 1.07E-11
GCH065-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0262-k0 1.18E-11
GCH056-G1dh/none-Hi-Kn010G3iL0262-kD 1.19E-11
H0610-G1dh/none-Hi-Kn0WG3/L026a-k0 1.69E-11
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3nR01L020-k0 2.24E-11
GCH0M-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L024S-k0 3.15ΕΊ1
ССН054-С1йЬ/попе-НкКп010йЗ/Ю222-к0 3.15ΕΊ1
GCH073-G1dh/none-Hi-Kn0l0G3/L020l-k0 3.50E-11
H0610-G1dh/none-HhKn010G3/L0248k0 5.55E-11
GCH065-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L020l-k0 7.74E-11
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L022S-k0 9.ЗОЕ-11
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0093-k0 1.06E-10
GCH098-G1dh/none-Hi-Kn010G3)L0201-k0 1.11E-10
H0610-G1dh/non&-Hi-Kn010G3/LC267-k0 179E-10
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0228-k0 2.O2E-10
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/LD262-k0 2.11Е-Ю
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0266-k0 2.13E-10
H0619-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0264-k0 2.19E-10
HO6 W-G1 dh/none-Hi-Kn010G3/L0224-k0 2.43E-10
H0610’Gldh/noneHi-Kn010G3/L0167-k0 2.11E-10
CE115HA251-E22Hh/LOOOO-kO/GL4’E22Hk/HD6lO-E22L 2.36ЕЛ0
TROlHOl5-E22Hh/LOOOOAO/GL4-E22Hk/H06lO-E22L 2.S3E-10
CE116HA236-E22Hh/GLS3l 0&-kO/GL4-E22Hk/H0610-E22L 2.67E-10
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0259-k0 3.34ЕЛ0
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0227-k0 4.08E-1O
GCH065-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0272-k0 3.93E-10
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0269-k0 4.59E-10
HQ610-Gldh/none-Hi-Kn010G3/L0223-k0 4.75E-10
TR01 HC02-E22Hh/GLS3108-kC/GL4-E22Hk/H0610-E22L 475Е-Ю
GCH054-G1 dh/none-Hi-Kn010G3/LC212-k0 5.17Е-Ю
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0208-k0 5.30E-10
H0610-G1db/none-Hi-Kn010G3/L0263-k0 5.84E-10
H0610-G1 dh/none-Hi-Kn010G3/L0231 -k0 5.89E-10
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0143-k0 5.73E-10
GCH055-G1 dh/Wie-Hi-KnO1OG3iLO212-k0 6.14E-10
H0610-Gidh/none-Hi-Kn0i0G3/L0211-k0 6.47E-10
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/LQ238-kO 6.37E-10
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0214-k0 6.57E-10
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0243-kD 6.49E-10
GCH025-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0204-k0 6.70E-10
GCH054-G1 dh/none-Hi-Kn010G3HR01 L016-kO 7.63E-10
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L016S-k0 6.99E-10
GCH094-G1db/none-Hi-Kn0l0G3/L0271-k0 6.92E-10
GCH054-G1 dh/none-Hi-KnOIOGO/TROI L019-k0 8.71 ЕЛО
H0610-G1db/nons-Hi-Kn010G3/L0234-k0 7.78E-10
GCH098-G1 dh/none-Hi-Kn010G3/L0011 -k0 8.O2E-10
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0204-k0 7.27E-10
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0240-k0 8.48E-10
H3610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0239-k0 8.74E-10
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0212-k0 9.94E-10
GCH065-G1 dh/none-Hi-Kn010G3/L0011 -kO 8.S4E-10
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0200-k0 1.O4E-O9
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0124-k0 9.72E-10
GCH073-G1 dh/none-Hi-Kn010G3/L0011 -kO 9.10E-10
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3HR01L016-k0 1.08E-O9
GCH054-Gldh/none-Hi-Kn010G3/L0201-k0 1.08ΕΌ9
H06l0-Gldh/none-Hi-Kn0l0G3/L0090-k0 1.12E-09
Н9610-С^Мпопе-НьКп010СЗА0209-к0 1.12E-09
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0201-k0 1.1 ЗЕ-09
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0161-k0 9.73Е-10
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0206-k0 8.65Е-10
H06l0-Gldh/none-Hi-Kn010G3/L0186-k0 1Ό8Ε-09
H06l0-G1db/none-Hi-KnO10G3/TR01L019-kQ 1.15Е-09
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0085-k0 1.17Е-09
GCH055-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0200-kD 1.13Е-09
H0ei0-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0154-k0 1.01Е-09
H0610-G1dh/none'Hi-Kn010G3/L0229-k0 1.2ОЕ-09
GCH054-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0200-k0 1.18Е-09
GCH094-Gldh/none-Hi-Kn010G3/L0201-k0 1.17Е-09
- 61 041830
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L000C^0 3.97ΕΌ9
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0205-k0 1.01E-09
GCHC99-G1dh/ncne-Hi-KnCHOG3/LO2O1-kQ 1.29Е-0Э
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0242-k0 1.19E-09
GCH056-G1dh/none-Hi-KnGlOG3/L0201-kO 1 16E-09
H0610-G1dh/none-Hi-Kr010G3/L0213-k0 1.25E-09
GCH060-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0200-kO 1.34E-09
GOH065-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0000-k0 1 41E-O9
GCHWO-G1dh/ncne-Hi-KnD1OG3/LO201-kO 1.37E-09
H0310-G1dhinone-Hi‘Kn010G3/L00154<0 1.31 E-09
HQ610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0151-k0 1.25E-09
H0S10-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0237-k0 1.31 E-09
H0Sl0-Gldhinone-Hi-Kn0lOG3/LO220-k0 1.36E-09
H0610-G1dhinone-Hi-Kn010G3/L0155-k0 1.28E-09
GCH055-G1dhinone-Hi-Kn010G3/L0215-kO 1.52E-09
H0B10-Gldh/none-Hi-Kn01OG3/LO202-k0 1.22E-09
GCH056-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0215-kO 1.59E-09
H0510-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0012-k0 1.55E-O9
GCH054-G1dhincne-HkKnD10G3/L0215-kO 1.62E-09
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0215-k0 1.84E-09
GCHC98-G1dhrnone-HkKnOlOG3/LOOOO-kO 1.77E-09
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0125-k0 1.71 E-09
GCH057-G1dh/non©-Hi-Kn010G3/L0215-k0 1.83E-09
HQ610-G1dh/none-Hi-Kii010G3/L0217-k0 1.79E-09
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0014-k0 1.82E-09
HO610-Gldh/none-Hi-Kn0l0G3/L0216-k0 1.86E-O9
TR01HQ15-E2702GsKsc/GCHO19-E2704sEpSC/LO0OQ-k0 1.64E-09
H0610-G1dhinone-Hi-Kn010G3/TR01L015-k0 2.16E-09
H06l0-Gldh/none-Hi-Kn0l0G3/TRO1L0l8-k(> 2.17E-09
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0218-k0 1.99E-09
HO610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0000vk1-k0 2.16E-09
H0B10'G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0160'k0 2.12E-09
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0047-k0 2.23E-09
GCH073-G1dh/ncne-HkKnO1OG3/L0OD0-kO 2.00E-09
GCH054-G1dh/ncne-Hi-Kn010G3/TRC1L015-kO 2.45E-09
H0610-G1dh/none-Hi-Kr010G3/L0219-k0 2.28E-09
GCHQ94-G1dh/none-Hi-KnO1OG3/LO272-kO 2.ЮЕ-09
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0149-K0 2.16E-09
GCHO54-Gldh/none-HkKn010G3/TR0lL018*k0 2.59E-09
GCHC54-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0203-kC 2.48E-09
H0B10-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0122-k0 2.42E-09
HOBlO-Gldh/none-Hi-KnOlOG3/LOl34-kO 2.53E-09
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0152-k0 2.36E-09
HO610G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0203-k0 2.11E-09
HO610-G1dh/none-Hi-Kr010G3/L0075-K0 2.85E-09
H0B10-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0038-k0 2.75E-09
H0Sl0-Gldh/none-Hi-Kn0lOG3/L0011-k0 2.76E-09
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0157-K0 2.60E-09
H0610-G1dhinone-Hi-Kn010G3/L0145-k0 2.66E-09
HO610-Gldh/norie-Hi-Kr010G3/TR01LOl0-kC 2.92E-09
H0B10-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0009-k0 2.99E-09
GCH099-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0011-kD 2.78E-09
H0B10-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0006-K0 3.04E-09
H0610-G1dhinone-Hi-Kn010G3/L0173-k0 2.83E-09
H0810-G1dh/none-Hi-KnQ10G3/L0127-kO 3.12E-09
HO610-G1dhinone-Hi-Kr01QG3/L0082A0 3.43E-09
H0S10-Gldhinone-Hi-Kn010G3/L0064-k0 Э.37Е-09
H0B10-G1dhinone-Hi4<n010G3/L0008-k0 3.30E-09
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0013-kD 3.35E-09
H0610-Gldh/none-Hi-Kn010G3/L0140-kO 3.38E-09
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0039-k0 3.41 E-09
GCHO43-G1dhinone-Hi-Kn010G3/L0O00-kO 3.74E-09
H0610'G1dh/none’Hi'Kr010G3/TR01LOQ8'k(} 3.48ΕΌ9
H0B10-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L01484;0 3.28E-09
GOH062-G1dh/none-HkKn010G3/L0000-k0 3.73E-09
H0610-G1dh/none-Hi-Kr010G3/L0163-kD 3.38ΕΌ9
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0233-k0 3.55E-09
HQ610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L.O230-k0 4 00E-09
GCH006-G1dh/ncne-Hf-KnD10G3/L0030-kQ 4.06ΕΌ9
H0610-G1dh/none-Hi*Kn010G3/L0032-k0 3.72E-09
H0B10-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0181-k0 3.51 E-09
HO610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/TR01L009-k0 3.81 E-09
H06l0-Gldhinone-Hi*Kn010G3/L0l4l-k0 3.86E-09
H0610-G1dhinone-Hi-Kn010G3/L0079-k0 4.23E-09
GCH094-G1dh/nono-Hi-Kn010G3/L0270-k0 3.60E-09
GCH066-Gldh/ncne-Hi-KnO1OG3/L0O00-kC 4.2SE-09
GCHO64-G1dh/ncne-Hi-KnO1OG3/LOO00-kO 4.14E-09
H0B10-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L00S6-k0 4.20E-09
GCH027’G1dh/noneHkKnD10G3/LOOQO'kO 3.83E-09
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0003-k0 4.01 E-09
H05l0-G1dMnone-Hi-Kfi010G3/LQ042-k0 427E-09
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/TRD1L011-kO 4.02E-09
- 62 041830
H0610-G1dh/none-Hf-Kn010G3/L0000-k0 3.97Е-09
GCH015-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0000-k0 4 14Е-09
H0610-G1dh/none-H(-KnC10G3/L0175-kC 3.84Е-09
GCH100-G1 dh/none-Hi-Kn010G3/LO011 -kC 3.81 Е-09
GCH014-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L00D0-k0 4.20Е-09
GCH053-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0000-k0 4.05Е-09
hCE115HA-E22Hh/LOOQO-kO/GL4-E22Hk/HOOOO-E22L 428Е-09
GCH094-G1dh/none-H-Kn010G3/L0G11-kC 3.8ΘΕ-09
GCH045-Gldh/none-Hi-Kn0l0G3/L0000-k0 4.63Е-09
H0Sl0-GldWnone4TKnCl0G3^R01L012di0 4.25ЕД9
H0610-G1dh/nona-Hi-Kn010G3/L0115-k0 4.34Е-09
H0610-G1dh/none-H>Kn010G3/L0044-k0 4.57Е-09
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0107-k0 438Е-09
H0510-G1dh/none-Hf-KnC10G3/LC007-k0 4.39Е-09
GCH0l3-Gldh/none-HkKn0l0G3/L0000-kC 4 44Е-09
H0610-G1dh/none4d^Kn010G3/L0045-k0 4 66Е-09
GCH010-G1 dh/none-Hi-Kn010G3/L0000-k0 4.12Е-09
GCH04O-G1 dh/none-Hi-KnOI 0G3/L0G00-kG 4Θ0Ε-09
H0S10-G1dh/none-HFKn010G3/L0G02-k0 443ΕΌ9
H06W-Gldh/none^H^KnG10G3/LGG16-kO 4.44Е-09
GCH3O7Gldh/noneHKnClOG3/LOCOO0O 4.93Е-09
GCH042-G1dh/none4d^n010G3/L0000-k0 4 89Е-09
rCE115H-E22Hh/rCE115L-kO/GL4-E22Hk/HOOOO-E22L 4.57Е-09
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0120-k0 4.54Е-09
H0610-G1dh/none-Hf-Kn010G3/L0065-k0 4.79Е-09
GCH016-G1 dh/none-Hi-KnO 10G3/L0CQ0-kC 4.59Е-09
GCH035 G1dh/noneHKn0l0G3/L0G00kC 4.94Е-09
GCH039-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0000-k0 4.95Е-09
GCH099-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0000-k0 424Е-09
H0610-G1dh/non^H^Kn010G3/L0041-k0 4.85Е-09
GCH019-G1dh/none-HI-Kn010G3/L0000-k0 4.36Е-09
GCH029-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0O00-k0 501Е-09
GCH056-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0011-k0 4.31 Е-09
H061D-G1 dh/nona-Ht-Kn010G3/L0147-k0 4.38Е-09
GCH034-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0000-k0 5.О9Е-09
GCH0O3-G1 dh/none-H-KnC 10G3/L0G00-kG 520Е-09
HOSlO-Gldh/none-Hs-KnOlOGa/LOiag-kC 4 78Е-09
H0610-Gldh/none-HF-Kn010G3/L0C89-kC 524Е‘О9
H0610-G1dh/nona-Hi-Kn010G3/L0113-kO 4.82Е-09
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0180-k0 44ΘΕ-09
GCH005-G1dh/none^HKn010G3/L0000-k0 532Е-09
GCH067-G1dh/none-HI-KnC10G3/L0000-K0 524ΕΌ9
H06i0-G1dh/none-Hr-Kn0l0G3/LCl87-k0 4 92Е-09
H0610-G1dh/none-H^Kn010G3/L0043-k0 5.14Е-09
H0610-G1dh/nona-Ht-Kn010G3/L0117-kG 4.92Е-09
GCH061-G1dh/none-Hf-Kn010G3/L0000-k0 5.1 ЗЕ-09
GCH022-G1 d h/none-H-KnC 1OG3/LOGOO0O 4.92ΕΌ9
Н06Ю-б1йГ/попе-НьКп010йЗ/1.С091-к0 5.43Е-09
GCH023-G1dh/none-Ht-Kn0l0G3/L0000-k0 4.94Е-09
H0610-G1dh/none-HFKn010G3/L0G62~k0 5.28Е-09
H0810-G1dh/nona-Hf-Kn010G3/L0136-k0 5.04Е-09
H0610-G1 dh/none-Ηί-ΚηΟ 10G3/TR01 L003-k0 5О8Е-09
H0610-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0069-k0 532Е-09
Н0610-СШ/ПОПе-НьКп010СЗ/10123-к0 5 08Е-09
GCH025-G1 dh/none-HrKnO 10G3/L0000‘k0 5.О5Е-09
GCH100-G1dh/nona-Hj-Kn010G3/L0000*k0 539Е-09
H0810-G1dh/none-Hi-Kn010G3/LG046-k0 545Е-09
H0610-G1dh/none-HF-KnC10G3/L0144-k0 4.84Е-09
GCH026-Gldh/none-Hi-Kn010G3/L0000-k0 5.17Е-09
HO6W-Gidh/none-Ht-KnCiOG3/LOi30-kO 5 24Е-09
GCHO56-G1dh/npne-Hi-KnC1OG3/L0GO0-kO 5Q3E-09
H061D-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0129-k0 5.2SE-09
GCH032-G1dh/none’Hi-Kn010G3/L0000-k0 5.74Е-09
HOBTO-Gldh/none-HLKnCIOGa/TROILOOS-kG 537ΕΌ9
GCH012-G1 dh/none-Hi-KnO l0G3/L0G00-kG &.40Е-09
GCH055-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0000-kG 5 63Е09
H06i0-G1dh/nona4-h-Kn010G3/L0104-k0 590Е-09
GCH059-G1dh/nona-Hi-Kn010G3/L0000-k0 5.70Е-09
GCH054-G1 dh/none-Hi-ΚπΟ 1CG3/LOOOO-kO 530Е-09
GCH0G8-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0000-kC 555Е-09
H06l0-G1dh/none-Hi-KnCl0G3/LC232-k0 5.33Е-09
H0610-G1dh/none-Hi-KnC10G3/L0126-k0 5.62Е-09
GCH0S4-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0000-k0 5.89Е-09
H0610-G1dh/none-H4Kn010G3/L0132-k0 5.65Е-09
H0S1D-G1dWnone^Ht-KnC10G3/LC106-kG 56SE-09
GCH054-G1dh/none-Hi-Kn0l0G3/L0011-k0 5.25Е-09
Н0610-СШ/попе-НьКп010СЗ/1С109-кС 5.70Е-09
H0810-G1 dh/nona-Hr-Kn010G3/L0083-k0 6ОЗЕ-09
GCH068-G1dh/nona-Hi-Kn010G3/L0000-k0 623Е-09
GCH057-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0000-k0 5.61Е-09
H0610-G1 dh/none-НнКп010G3/L0137-kO____________________________________ (3-3) Модификация pI с помощью точечных мутаций. 587Е-09________
При коммерческом производстве биспецифических антител требуется высокой уровень чистоты.
При использовании ионообменной хроматографии эффективной является модификация изоэлектриче-
ской точки (pI) молекул (PLoS One. 2013;8(2):e57479). По этой причине интродуцировали мутации для
модификаций pI в последовательность CDR1, CDR2 и CDR3 гуманизированного антитела к человече-
скому GPC3, полученного согласно методу, описанному в примере 2, H0000-ERY27_HK (SEQ ID NO:
54), для получения модифицированных антител. Затем определяли аффинность указанных модифицированных антител к растворимому человеческому GPC3.
В результате установлено, что аминокислотным модификациям, которые могут приводить к сниже-
нию pI, сохраняя при этом аффинность к человеческому GPC3, следует подвергать аминокислоты в положениях 19, 43, 53 и 61 согласно нумерации Кэбота.
Объединяя сайты, которые обладают способностью поддерживать аффинность к человеческому GPC3 и снижать pI, получали антитела, аффинности и pI которых представлены в табл. 10.
- 63 041830
Таблица 10
Название антитела Рассчит. величина PI Название антитела KD человеч. GPC3 (гомомерное антитело) (гомомерное антитело (одноцепоч. антитело) (одноцеп. антитело)
Сайты мутации на основе H0610-E2704sEpsc
H0610-E27D4sEp5C/L00OD-k0 7.8 HO61(Wdh/non^Hi4<naiOG3/LO№ 4.16Е-09
GCH054-E2704sEpsc/LCD11-k0 6.2 GCH054-G1dh/none-Hi-Kn010G3/L0011-k0 5.25E-09 K19T/O43E/P52aG/K53E/G55P/Q61E
GCH065-E2704sEpsc/LOQ11 -kO 6.4 GCH06&G1dh/nQne-Hi-KnO1 QG3/L0011-kO 8.84E-10 K19T/Q43E/P52aG/K53P/G55P/Q61 E
GCH094432704sEpsc^0114cO 6;2 GCH094;G1d!Vn^^ (3-4) Модификация способности связывать внеклеточный матрикс с помощью точечной мутации.
Известно, что неспецифическое связывание с внеклеточным матриксом (ЕСМ) и т.п. может оказывать влияние на фармакокинетику (MAbs. 4(6), ноябрь-декабрь 2012 г., с. 753-760). Таким образом, ЕСМсвязывающую способность модифицированных антител, полученных согласно описанным в примерах методам, определяли с помощью метода, представленного в приведенном для справки примере 4. В результате было подтверждено, что гуманизированное биспецифическое антитело к человеческой CD3εцепи и к человеческому GPC3, GPC3_ERY27_hCE115 (SEQ ID NO: 54, 55 и 56), обладало высокой ЕСМсвязывающей способностью. Таким путем изучали любую из оцененных в примерах 3-1, 3-2 и 3-3 точечных мутаций в последовательности гуманизированного антитела к человеческой CD3ε-цепи hCE115HAERY27HE (SEQ ID NO: 55) в качестве комбинации для снижения ЕСМ-связывающей способности. В результате было установлено, что аминокислоты в положениях 11, 16, 52а, 53, 98 и 100 согласно нумерации Кэбота участвуют в поддержании аффинности к CD3ε и могут влиять на снижение ЕСМсвязывающей способности, и получали антитела с пониженной ЕСМ-связывающей способностью по сравнению со способностью варианта гуманизированного биспецифического антитела к человеческой CD3ε-цепи и к человеческому GPC3, GPC3_ERY27_hCE115 (табл. 11).
Таблица 11
Название антитела Соотношение связывания ЕСМ (стандарт = 1)
GPC3 ERY22 СЕ115 (rCE115H-E22Hh/rCE115L-k0/GL4-E22Hk/H0000-E22L) 4.0
GPC3 ERY27 (hCE115HA-E22Hh/L0000-k0/GL4-E22Hk/H0000-E22L) 50.9
СЕ 115НА236-Е22 Hh/G LS3108-k0/G L4-E22Hk/H0610-E 22L 429.9
CE 115HA236-E22 Hh/G LS3108-k0/G L4-E22Hk/H0000-E 22L 414.8
CE115HA251-E22Hh/L0000-k0/GL4-E22Hk/H0000-E22L 346.9
CE 115HA251 -E22Hh/L0000-k0/GL4-E22Hk/H0610-E22L 334.4
TR01 H002-E22Hh/GLS3108-k0/GL4-E22Hk/H0610-E22L 301.1
TR01H002-E22H h/GLS 3108-k0/GL4-E22 Hk/H0000-E22 L 216.9
TR01H015-E22H h/L0000-k0/GL4-E22Hk/ H0610-E22L 185.7
TR01H040-E2702GS Ksc/H0610-E2704S E ps c/L0208-k0 50.4
CE115HA122-E22Hh/L0000-k0/GL4-E22Hk/H0000-E22L 47.0
TR01H040-E2702GS Ksc/H0610-E2704S E ps C/L0211 -kO 15.5
TR01H040-E2702Gs Ksc/H0610-E2704s E ps c/L0206-k0 15.4
TR01H040-E2702Gs Ksc/H0610-E2704S E ps c/L0209-k0 7.4
rCE 115H-E22H h/rCE 115L-k0/GL4-E22Hk/ H0610-E 22L 4.6
TR01H040-E2702GsKsc/H0610-E2704sEpsc/L0204-k0 4.4
TR01H067-E2702GsKsc/GCH054-E2704sEpsc/L0212-k0 3.3
TR01H113-E2702GsKsc/GCH065-E2704sEpsc/L0011-k0 2.5
TR01 H082-E2702GsKsc/GCH065-E2704sEpsc/L0011-kO 1.7
TR01H113-E2702GsKsc/GCH094-E2704sEpsc/L0011-kO 1.6
rCE 115H-E22Hh/rCE 115L-k0/L0000-E22Hk/H0610-E22L 1.4
TR01 H084-E2702GsKsc/GCH065-E2704sEpsc/L0011-kO 1.3
TR01 H084-E2702GsKsc/GCH094-E2704sEpsc/L0011-k0 1.2
TR01H082-E2702GsKsc/GCH094-E2704sEpsc/L0201-k0 1.1
TR01H040-E2702GS Ksc/H0610-E2704S E ps c/LOOOO-kO 0.8
TR01H040-E2702GS Ksc/H0610-E2704S E ps C/L0201 -kO 0.8
TR01H040-E2702GS Ksc/H0610-E2704S E ps c/L0203-k0 0.8
TR01 H082-E2702GsKsc/GCH094-E2704sEpsc/L0011-kO 0.7
TR01H109-E2702GsKsc/GCH065-E2704sEpsc/L0011-k0 0.7
TR01H067-E2702GsKsc/GCH054-E2704sEpsc/L0222-k0 0.6
TR01H067-E2702GsKsc/GCH054-E2704sEpsc/L0201-k0 0.5
TR01 H109-E2702GsKsc/GCH094-E2704sEpsc/L0011-k0 0.4
TR01H113-E2702S Ksc/GCH065-E2704s E psc/L0011 -kO 0.3
МРАН-С1с1/МРАЕ-к01(стандарт) 1
(3-5) Модификации способности связываться с лигандом SuRe с помощью точечных мутаций.
Известен пример того, что связывание антитела с белком А зависит от последовательности вариабельной области (VH3) (J Biomol Tech. 22(2), июль 2011 г., с. 50-52). При очистке на белке А гуманизированного биспецифического антитела к человеческой CD3ε-цепи и к человеческому GPC3, удаление гомомерного антитела к CD3 являлось важным для подавления неспецифических реакцией посредством CD3. Таким образом, представляется желательным подавлять связывание гомомерного антитела к CD3 с белком А.
Вероятно, лиганд SuRe™ можно применять при коммерческом производстве и поэтому точечные мутации, влияющие на связывание с лигандом SuRe™, интродуцировали в CDR2 H-цепи вариантов гуманизированного антитела к CD3, TR01H082-E2702GsKsc и TR01H084-E2702GsKsc (SEQ ID NO: 398 и399), для получения модифицированных антител. Связывающую способность этих модифицированных антител с лигандом SuRe™ определяли с помощью метода, представленного в приведенном для справки примере 5. В результате было установлено, что аминокислоты в положениях 19, 57 и 59 согласно нумерации Кэбота участвуют в поддержании аффинности к CD3ε и могут влиять на способность связываться с лигандом Sure™, и получали антитела с пониженной способностью связываться с лигандом Sure по
- 64 041830 сравнению со способностью антител TR01H082-E2702GsKsc/L0011-k0 (SEQ ID NO: 398 и 410) или
TR01H084-E2702GsKsc/L0011-k0 (SEQ ID NO: 399 и 410) (табл. 12).
Таблица 12
Название антитела Связывание SuRe™ (RU) Сайты связывания на основе СЕ115НА000
TR01H084-E2702GsKsc/L0011-k0 5065.8 R16G/A52aD/N53Q/D72A/L78l/G98A/Y100G/A102l
TR01H082-E2702GsKsc/L0011-k0 4469.2 V11 UA52aD/N53Q/G98A/Y 100G
TR01H090-E2702GsKsc/L0011-k0 3606.3 V11L/ R16G/A52aD/N53Q/G98A/Y 100G
TR01H093-E2702GsKsc/L0011-k0 2459.7 V11 L/A52aD/N53Q/K64Q/G98A/Y 100G
TR01H094-E2702GsKsc/L0011-k0 2351.9 V11 L/A52aD/N53Q/K64S/G98A/Y 100G
TR01H114-E2702GS Ks C/L0011 -k0 1485.5 R16G/A52aD/N53Q/T57S/D72A/L78l/G98A/Y100G/A102l
TR01H092-E2702GsKsc/L0011-k0 1159.5 V11L/A52aD/N53Q/K64A/G98A/Y100G
TR01H100-E2702Gs Ks c/L0011 -kO 383.0 V11 L/A52aD/N53Q/T57S/G98A/Y 100G
TR01H111 -E2702Gs Ks c/L0011 -kO 50.7 R16G/R19K/A52aD/N53Q/D72A/L78l/G98A/Y100G/A102l
TR01H110-E2702GS Ks C/L0011 -kO 29.5 R19K/A52aD/N53Q/G98A/Y100G
TR01H091-E2702GsKsc/L0011-k0 27.5 V11L/R19K/A52aD/N53Q/G98A/Y100G
TR01H091-E2702GS Ks C/L0011 -kO 15.0 V11L/R19K/A52aD/N53Q/G98A/Y100G
TR01H112-E2702GS Ks c/LOO11 -kO 8.8 R16G/A52aD/N53Q/T57Q/D72A/L78l/G98A/Y100G/A102l
TR01H113-E2702GS Ks C/L0011 -kO 7.0 R16G/A52a D/N53Q/Y59V/D72A/L78I/G98A/Y100G/A1021
TR01H096-E2702GsKsc/L0011-k0 2.7 V11 L/A52aD/N53Q/T57G/G98A/Y100G
TR01H109-E2702GS Ks C/L0011 -kO 2.2 V11L/A52aD/N53Q/Y59V/G98A/Y100G
TR01H098-E2702GsKsc/L0011-k0 1.6 V11 L/A52aD/N53Q/T57P/G98A/Y 100G
TR01H107-E2702GSKSC/L0011-k0 1.4 V11 L/A52aD/N53Q/Y59Q/G98A/Y 100G
TR01H103-E2702Gs Ks c/L0011 -kO 1.4 V11 L/A52aD/N53Q/Y59G/G98A/Y 100G
TR01H104-E2702GS Ks C/L0011 -kO 1.0 V11 UA52aD/N53Q/Y59l/G98A/Y100G
TR01H105-E2702GS Ks C/L0011 -kO 0.8 V11 L/A52aD/N53Q/Y59L/G98A/Y 100G
TR01H099-E2702GsKsc/L0011-k0 0.6 V11 L/A52aD/N53Q/T57Q/G98A/Y100G
TR01H102-E2702Gs Ks c/L0011 -kO 0.5 V11 L/A52aD/N53Q/Y59F/G98A/Y100G
TR01H101-E2702GS Ks C/L0011 -kO 0.5 V11 L/A52aD/N53Q/T57 V/G98A/Y1 DOG
TR01H108-E2702GS Ks C/L0011 -kO 0.4 V11 L/A52aD/N53Q/Y59T/G98A/Y 100G
TR01H097-E2702GsKsc/L0011-k0 0.1 V11L/A52aD/N53Q/T57UG98A/Y100G
TR01H106-E2702Gs Ks c/L0011 -kO 0.0 V11L/A52aD/N53Q/Y59P/G98A/Y100G
TR01H095-E2702GsKsc/L0011-k0 -0.2 V11 UA52aD/N53Q/T57F/G98A/ Y100G
(3-6) Получение оптимизированных биспецифических антител путем объединения точечных мутаций, приводящих к улучшению различных свойств.
Оптимизированные модифицированные антитела можно получать, объединяя точечные мутации, которые приводят к улучшению различных свойств, описанных в примерах 3-1-3-5. В качестве примеров указанных модифицированных антител получали антитела, представленные в табл. 13, и у них оценивали зависимую от Т-клеток клеточную цитотоксичность (TDCC) с помощью методов, аналогичных описанным в примере 1. Результаты представлены на фиг. 4-9. В результате получали оптимизированные гуманизированные биспецифические антитела к человеческой CD3ε-цепи и к человеческому GPC3, обладающие эквивалентной или более высокой зависимой от Т-клеток клеточной цитотоксичностью, чем GPC3_ERY22_rCE115 до его гуманизации.
Таблица 13
Номер образца в анализе TDCC Название антитела
GPC3_ERY22_CE115 (rCE115H-E22Hh/rCE115L-k0/GL4-E22Hk/H0000-E22L)
GPC3_ERY27 (hCE115HA-E22Hh/L0000-k0/GL4-E22Hk/H0000-E22L)
CE115HA251-E22Hh/L0000-k0/GL4-E22Hk/H0000-E22L
CE115HA236-E22Hh/GLS3108-k0/GL4-E22Hk/H0000-E22L
TR01H002-E22Hh/GLS3108-k0/GL4-E22Hk/H0000-E22L
CE115HA122-E22Hh/LOOOO-kO/GL4-E22Hk/HOOOO-E22L rCE115H-E22Hh/rCE115L-kO/LO0OO-E22Hk/HO61O-E22L rCE115H-E22Hh/rCE115L-k0/GL4-E22Hk/H0610-E22L
TR01 HMO-E2702GsKsc/H0610-E2704sEpsc/L(X}00-k0
TR01 H04O-E2702GsKsc/H0610-E2704sEpsc/L0201-k0
TR01H040-E2702GsKsc/H0610-E2704sEpsc/L0203-k0
TR01 H04O-E2702GsKsc/H0610-E2704sEpsc/L0204-k0
TR01 H040-E2702GsKsc/H0610-E2704sEpsc/L0206-k0
TR01 H04O-E2702GsKsc/H0610-E2704sEpsc/L0208-k0
TR01 H040-E2702GsKsc/H0610-E2704sEpsc/L0209-k0
TR01 H040-E2702GsKsc/H0610-E2704sEpsc/L0211 -kO rCEH5H-E2702GsKsc/H0610-E2704sEpsc/L0000-k0
TR01 H061-E2702GsKso/H0610-E2704sEpsc/L0000-k0
TR01 H068-E2702GsKsc/H0610-E2704sEpsc/L0O00-k0
TR01 H071-E2702GsKsc/H0610-E2704sEpsc/L0O00-k0
TR01 H067-E2702GsKsc/GCH054-E2704sEpsc/L0201-k0
TR01 H067-E2702GsKsc/GCH054-E2704sEpsc/L0212-k0
TR01 H067-E2702GsKsc/GCH054-E2704sEpsc/L0222-k0
TR01H067-E2702GsKsc/ GCH054-E2704sEpsc/L0000-k0
TR01 H082-E2702GsKsc/GCH094-E2704sEpsc/L0201-k0
TR01 H082-E2702GsKsc/GCH094-E2704sEpsc/L0011-k0
TR01 H084-E2702GsKsc/GCH094-E2704sEpsc/L0011-k0
TR01 H084-E2702GsKsc/GCH065-E2704sEpsc/L0011-k0
TR01 H082-E2702GsKsc/GCH065-E2704sEpsc/L0011-k0
TR01 H109-E2702GsKsc/GCH094-E2704sEpsc/L0011-k0
TR01 H109-E2702GsKsc/GCH065-E2704sEpsc/L0011-k0
TR01H113-E2702GsKsc/GCH094-E2704sEpsc/L0011-kO
TR01H113-E2702GsKsc/GCH065-E2704sEpsc/L0011-k0 ______________38______________TR01H113-E2702sKsc/GCH065-E2704sEpsc/L0011-kQ____________________
В примерах 3-1-3-6 продемонстрировано, что указанные ниже аминокислотные остатки, например, являются важными для поддержания свойств оптимизированных биспецифических антител к человеческой CD3ε-цепи и к человеческому GPC3, которые обладали эквивалентной или более высокой зависимой от Т-клеток клеточной цитотоксичностью, чем GPC3_ERY22_rCE115 до его гуманизации.
В антителах к человеческой CD3ε-цепи присутствуют, например, Leu в положении 11, Gly в положении 16, Asp в положении 52а, Gln в положении 53, Ala в положении 72, Не в положении 78, Ala в положении 98, Gly в положении 100 и Ile в положении 102. В антителах к человеческому GPC3 присутст- 65 041830 вуют, например, Thr в положении 19, Glu в положении 43, Gly в положении 52а, Pro или Glu в положении 53, Pro в положении 55 и Glu в положении 61. Кроме того, в общих L-цепях присутствуют, например, Pro в положении 25, Pro в положении 27а, Pro в положении 27b, Не в положении 33, Gln в положении 34, Arg или Trp в положении 56 и Tyr в положении 89 (все положения обозначены согласно нумерации Кэбота).
Пример 4. Оценка эффективности in vivo.
Эффективность некоторых из описанных выше антител оценивали in vivo с использованием несущих опухоли модельных животных.
Оценку эффективности in vivo осуществляли для репрезентативных антител из представленных в табл. 13, для которых продемонстрировано наличие цитотоксической активности при оценке с использованием анализа in vitro, описанного в примерах 3-6. При оценке эффективности in vivo следует принимать во внимание любое влияние, вызываемое различиями в микроокружении из-за образования агрегатов опухолей, на результаты оценки. Для изучения использовали два типа клеточных линий человеческого рака с различной чувствительностью к действию применяемых в качестве лекарственных средств антител, т.е. линии РС-10 и NCI-H446, несмотря на то, что уровни экспрессии GPC3 в этих клетках были практически одинаковыми. Клеточные линии трансплантировали мышам с тяжелым комбинированным иммунодефицитом (NOD scid) и мышам NOD scid, у которых было подтверждено образование опухолей, трансплантировали Т-клетки, выращенные культивированием in vitro человеческих РВМС. Мышей (которых обозначали как модель с инъецированными Т-клетками) обрабатывали путем введения оптимизированных биспецифических антител к человеческой CD3ε-цепи и человеческому GPC3.
Более конкретно, в опытах по оценке эффективности в качестве лекарственных средств оптимизированных биспецифических антител к человеческой CD3ε-цепи и человеческому GPC3, в которых применяли клетки линии РС-10 на модели с инъецированными Т-клетками, осуществляли описанные ниже опыты. Т-клетки размножали культивированием с использованием РВМС, выделенных из крови здоровых доноров, и набора для активации/экспансии человеческих Т-клеток (Т cell activation/expansion kit/human) (фирма MACS Miltenyi biotec). Смешивали клеточную линию человеческого рака РС-10 (1 х 107 клеток) с матриксом базальной мембраны Matrigel (фирма BD) и трансплантировали подкожно в паховую область мышей NOD scid (фирма CLEA Japan, самки возрастом 6 недель). День трансплантации обозначали как день 0. За 1 день до трансплантации мышам внутрибрюшинно вводили антитело к асиалоганглиозиду M1 (асиало-GM1) (фирма Wako Pure Chemical Industries) из расчета 0,2 мг/мышь. Через 1315 дней после трансплантации мышей разделяли на группы в зависимости от веса тела и размера опухолей и вновь внутрибрюшинно вводили антитело к асиало-GM1 из расчета 0,2 мг/мышь. На следующий день внутрибрюшинно трансплантировали Т-клетки, полученные вышеописанным методом размножения культивированием, из расчета 3х107 клеток/мышь. Через 4 ч после трансплантации Т-клеток внутривенно через каудальную вену вводили оптимизированные биспецифические антитела к человеческой CD3ε-цепи и человеческому GPC3 из расчета 1 мг/кг. Оптимизированные биспецифические антитела к человеческой CD3ε-цепи и человеческому GPC3 вводили только один раз.
В результате установлена более выраженная противоопухолевая активность в группе, обработанной оптимизированными биспецифическими антителами к человеческой CD3ε-цепи и человеческому GPC3, по сравнению с группой, обработанной растворителем (фиг. 10а, б).
Аналогичными методами осуществляли опыты по оценке эффективности в качестве лекарственных средств оптимизированных биспецифических антител к человеческой CD3ε-цепи и человеческому GPC3, в которых применяли клетки линии NCI-H446, на модели с инъецированными Т-клетками. Для оценки воздействия на NCI-H446 оптимизированные биспецифические антитела к человеческой CD3ε-цепи и человеческому GPC3 вводили один раз через каудальную вену из расчета 5 мг/кг.
В результате установлена более выраженная противоопухолевая активность в группе, обработанной оптимизированными биспецифическими антителами к человеческой CD3ε-цепи и человеческому GPC3, по сравнению с группой, обработанной растворителем (фиг. 11а, б).
Приведенные для справки примеры.
Приведенный для справки пример 1. Получение экспрессионных векторов антител и экспрессия и очистка антител.
Аминокислотные замены интродуцировали методами, известными специалистам в данной области, например, с использованием набора для сайтнаправленного мутагенеза QuikChange (фирма Stratagene), ПЦР или набора для ПЦР-клонирования In-fusion Advantage (фирма TAKARA), для создания экспрессионных векторов. Нуклеотидные последовательности полученных экспрессионных векторов определяли с помощью метода, известного специалистам в данной области. Полученные плазмиды кратковременно интродуцировали в клетки клеточной линии, полученной из почки человеческого эмбриона HEK293H (фирма Invitrogen) или FreeStyle293 (фирма Invitrogen) для экспрессии антител. Из полученных супернатантов культуры антитела очищали с использованием колонки rProtein A Sepharose Fast Flow (фирма GE Healthcare) с помощью метода, известного специалистам в данной области. Измеряли абсорбцию при 280 нм растворов очищенных антител с помощью спектрофотометра, и концентрацию антител рассчитывали
- 66 041830 на основе определенных величин, применяя коэффициент абсорбции, рассчитанный с помощью метода
РАСЕ (Protein Science 4, 1995, с. 2411-2423).
Приведенный для справки пример 2. Определение ADCC-активности каждого из тестируемых антител с использованием мононуклеарных клеток периферической крови человека в качестве эффекторных клеток ADCC-активность каждого из тестируемых антител определяли с помощью описанного ниже метода.
Мононуклеарные клетки периферической крови человека (обозначены далее как человеческие РВМС) применяли в качестве эффекторных клеток для измерения ADCC-активности каждого из тестируемых антител согласно описанному ниже методу.
(1) Получение раствора человеческих РВМС.
Получали образцы по 50 мл периферической крови здоровых добровольцев (взрослые мужчины) с использованием шприцев, предварительно заполненных 200 мкл (1000 ед./мл) раствора гепарина (NovoHeparin 5000 ед. на инъекцию; фирма Novo Nordisk). Эту периферическую кровь двукратно разводили ЗФР(-), разделяли на четыре аликвоты и добавляли в пробирки для разделения лимфоцитов Leucosep (фирма Greiner bio-one), в которые предварительно вносили 15 мл фиколл-пак PLUS и центрифугировали. После центрифугирования пробирок для разделения, содержащих аликвоты периферической крови, при 2150 об/мин в течение 10 мин при комнатной температуре собирали фракции мононуклеарных клеток. Клетки в каждой фракции однократно промывали с использованием модифицированной по методу Дульбекко среды Игла (фирма SIGMA), содержащей 10% FBS (далее в контексте настоящего описания обозначена как 10%FBS/D-MEM), а затем плотность клеток доводили до 5х106 клеток/мл с помощью 10% FBS/D-MEM. Клеточную суспензию в приведенных ниже экспериментах использовали в качестве клетки-мишени.
(2) Анализ высвобождения хрома (ADCC-активность).
ADCC-активность оценивали по удельной скорости высвобождения хрома, определенной методом определения высвобождения хрома. Сначала растворы антитела в каждой из приготовленных концентраций (0, 0,004, 0,04, 0,4, 4 и 40 мкг/мл) добавляли в 96-луночный планшет с U-образным дном из расчета 50 мкл на лунку. Затем высевали клетки-мишени из расчета 50 мкл на лунку (1х104 клеток/лунку) и давали выстояться при комнатной температуре в течение 15 мин. Раствор человеческих РВМС, приготовленный согласно методу, описанному в подпункте (1), добавляли из расчета 100 мкл на лунку (5x105 клеток/лунку) и планшет выдерживали в инкубаторе в атмосфере, содержащей 5% диоксида углерода, при 37°С в течение 4 ч, после чего центрифугировали. Радиоактивность в 100 мкл супернатанта культуры в каждой лунке планшета измеряли с помощью гамма-счетчика. Удельную скорость высвобождения хрома определяли по следующей формуле:
удельная скорость высвобождения хрома (%)=(А-Б)х100/(Б-В), где А представляет собой среднее значение радиоактивности (cpm) 100 мкл супернатанта культуры в каждой лунке; Б представляет собой среднее значение радиоактивности (cpm) 100 мкл супернатанта культуры в лунках, в которых к клеткам-мишеням добавляли 100 мкл 2%-ного водного раствора NP-40 (Nonidet Р-40, фирма Nacalai Tesque) и 50 мкл 10%-ной среды FBS/D-MEM; и В представляет собой среднее значение радиоактивности (cpm) 100 мкл супернатанта культуры в лунках, в которых к клеткаммишеням добавляли 150 мкл 10%-ной среды FBS/D-MEM. Эксперименты осуществляли в трех повторностях и по результатам вышеуказанного эксперимента вычисляли среднее значение и стандартное отклонение удельной скорости высвобождения хрома (%), отражающей ADCC-активность, для каждого из тестируемых антител.
Приведенный для справки пример 3. Определение Tm модифицированных антител с помощью дифференциальной сканирующей флуорометрии.
При такой оценке определяли величину Tm (температура тепловой денатурации) модифицированных антител с помощью дифференциальной сканирующей флуорометрии с использованием устройства Rotor-Gene Q (фирма QIAGEN). Известно, что этот метод обеспечивает предпочтительную корреляцию с величиной Tm, установленной с использованием дифференциального сканирующего калориметра, что является широко известным методом оценки термостабильности антител (Journal of Pharmaceutical Science 4, 2010, с. 1707-1720).
5000-кратный концентрат SYPRO оранжевого (фирма Molecular Probes) разводили ЗФР (фирма Sigma) и затем смешивали с растворами антител с получением образцов для измерения. Аликвоты по 20 мкл каждого образца вносили в измерительные пробирки и температуру повышали с 30 до 99°С со скоростью повышения температуру 240°С/ч. Изменения флуоресценции, сопровождающие повышение температуры, определяли при 470 нм (длина волны возбуждения)/555 нм (длина волны флуоресцентного испускания).
Данные анализировали с использованием программы Rotor-Gene Q Series (фирма QIAGEN) для расчета температуры, при которой наблюдается переход флуоресценции, и эту температуру принимали за Tm.
- 67 041830
Приведенный для справки пример 4. Определение ЕСМ-связывающей способности.
Определение осуществляли согласно методу, описанному в WO 2012/093704. В целом, метод состоял в следующем: BD-Matrigel (фирма BD Biosciences, № 356237) получали в концентрации 2 мг/мл с использованием TBS (фирма Takara, № Т903) и переносили в 96-луночный планшет для измерения (фирма Meso Scale Discovery, № L15XB-3(High Bind, высокая способность связываться)) из расчета 5 мкл на лунку и затем давали выстояться в течение ночи в холодном месте. Затем в каждую лунку планшета вносили по 150 мкл блокирующего ECL-буфера (ЗФР, содержащий 0,05% Твин20, 0,5% БСА и 0,01% азида натрия) и давали выстояться при комнатной температуре в течение 2 ч или более.
Козий античеловеческий IgG(y) (фирма Invitrogen, № 628400) метили рутением с использованием сложного эфира NHS, меченного MSD-SULFO (фирма Meso Scale Discovery, №R91AN-2) согласно прилагаемым инструкциям. Его разводили ECL-буфером для разведения (ЗФР, содержащий 0,01% Твин20, 0,1% БСА и 0,01% азида натрия) до конечной концентрации 2 мкг/мл. Кроме того, стандартное антитело и тестируемые антитела разводили ЗФР-Т (ЗФР, содержащий 0,05% Твин20 и 0,01% азида натрия) до получения конечной концентрации 3 мкг/мл.
В 96-луночный планшет для проведения реакции (фирма Thermo scientific, Nunc № 145399), последовательно добавляли 10 мкл ECL-буфера для разведения, 20 мкл стандартного антитела и тестируемого антитела (3 мкг/мл) и 30 мкл меченного рутением антитела (2 мкг/мл), и давали прореагировать в течение 1 ч при комнатной температуре при перемешивании в темноте.
Блокирующий ECL-буфер удаляли из 96-луночного планшета для измерения путем опрокидывания, добавляли 50 мкл раствора образца из 96-луночного реакционного планшета и давали выстояться в темноте при комнатной температуре в течение 1 ч. После этого удаляли раствор образца из 96-луночного планшета для измерения (измерительный планшет) путем опрокидывания и немедленно добавляли 150 мкл 2хТ-буфера (4х MSD Т-буфер для считывания (фирма Meso Scale Discovery), двукратно разведенный с помощью ECL-буфера для разведения), осуществляли измерения ECL. Для измерений использовали устройство SECTOR Imager 2400 (фирма Meso Scale Discovery).
Анализы осуществляли путем деления интенсивности флуоресценции тестируемого антитела на интенсивность флуоресценции стандартного антитела, для расчета и сравнения интенсивностей, принимая величину для стандартного антитела за 1.
Приведенный для справки пример 5. Определение способности связывать лиганд SuRe™.
Способность связываться с лигандом SuRe оценивали, используя Biacore™-Т200 (GE Healthcare Japan). В качестве подвижного буфера применяли HBS-EP+ (фирма GE Healthcare Japan) и набор для аминного сочетания (фирма GE Healthcare Japan) применяли для ковалентного связывания лиганда Mab Select SuRe™ (фирма GE Healthcare Japan) с СМ5-чипом (чип, покрытый карбоксиметилдекстраном). Антитело, применяемое в качестве аналита, приготавливали в концентрации 5 мкг/мл с использованием HBS-EP+. Для осуществления измерений сначала инъецировали раствор с концентрацией антитела 5 мкг/мл со скоростью потока 10 мкл/мин в течение 3 мин, затем аналит заменяли на HBS-EP+ и оценивали ответ (RU) после пропускания потока в течение 0,5 мин. После завершения измерений сенсорный чип регенерировали, промывая 10 мМ Gly-HCl при pH 1,5. В контрольной проточной ячейке осуществляли такой же эксперимент без ковалентного связывания лиганда с чипом, и аффинность к лиганду SuRe™ анализировали на основе различия между ответами (RU).
Последовательности, соответствующие упомянутым выше номерам последовательностей (SEQ ID NO: ), представлены ниже в таблице.
- 68 041830
Таблица 14
SEQ ID NO: название SEQ ID МО:цазвание SEQ ID NO ;название
1 нуклеотидная последовательность GPC3 (NP_991164617.1) 81 TROT H018 154 TR01H099
2 аминокислотная последовательность GPC3 (NP_991158089.1) 82 TROT H019 155 TR01H100
3 сигнальная последовательность 83 TR01H020 156 TR01H101
4 пептид α-цепи Т-клеточного рецептора (САА 26636.1) 84 TR01H021 157 TR01H102
5 пептид β-цепи Т-клеточного рецептора (С25777) 85 TR01H022 158 TR01H103
6 пептид γΐ-цепи Т-клеточного рецептора (А26659) 86 TR01H023 159 TR01H104
7 пептид у2-цепи Т-клеточного рецептора (ААВ633 12.1) 87 TR01H024 160 TR01H105
8 пептид δ-цепи Т-клеточного рецептора (ААА61033.1) 88 TR01H025 161 TR01H106
9 нуклеотид γ-цепи CD3 (NM_000073.2) 89 TR01H026 162 TR01H107
10 нуклеотид δ-цепи CD3 (NM_000732.4) 90 TR01H027 163 TR01H108
11 нуклеотид ε-цепи CD3 (NM_000733.3) 91 TR01H028 164 TR01H109
12 пептид γ-цепи CD3 (NP_000064.1) 92 TR01H029 165 TR01H110
13 пептид δ-цепи CD3 (NP_000723.1) 93 TR01H030 166 TR01H111
14 пептид ε-цепи CD3 (NP_000724.1) 94 TR01H031 167 TR01H112
15-22 пептидный линкер 95 TR01H032 168 TR01H113
23 человеческий Cyl 96 TR01H033 169 TR01H114
24 человеческий Су2 97 TR01H034 170 GCH003
25 человеческий СуЗ 98 TR01H035 171 GCH005
26 человеческий Су4 99 TR01H036 172 GCH006
27 нуклеотид FcyR! (NM_000566.3) 100 TR01H037 173 GCH007
28 пептид FcyRI (NM_000557.1) 101 TR01H038 174 GCH008
29 нуклеотид FcyRIIA (ВС020823.1) 102 TR01H039 175 GCH010
30 пептид FcyRIIA (ААН20823.1) 103 TR01H040 176 GCH012
31 нуклеотид FcyRIIB (ВС146678.1) 104 TR01H041 177 GCH013
32 пептид FcyRIIB (AAI46679.1) 105 TR01H042 178 GCH014
33 нуклеотид FcyRIIIA (ВС033678.1) 106 TR01H043 179 GCH015
34 пептид FcyRIIIA (ААН033678.1) 107 TR01H044 180 GCH016
35 нуклеотид FcyRIIIB (ВС128562.1) 108 TR01H045 181 GCH019
36 пептид FcyRIIIB (AAI28563.1) 109 TR01H046 182 GCH022
37 Fc-обл. (доб. А к N-концу RefSeq per. номер ААС82527.1) 110 TR01H047 183 GCH023
38 Fc-обл. (доб. А к N-концу RefSeq per. номер ААВ59393.1) 111 TR01H048 184 GCH025
39 Fc-обл. (доб. А к N-концу RefSeq per. номер ААВ59394.1) 112 TR01H049 185 GCH026
40 НОООО, вариабельная область Н-цепи GPC3 113 TR01H050 186 GCH027
41 GL4, вариабельная область L-цепи GPC3 114 TR01H051 187 GCH029
42 гСЕ115Н, вариабельная область Н-цепи СЕ115 115 TR01H052 188 GCH032
43 rCE115L, вариабельная область L-цепи СЕ115 116 TR01H053 189 GCH034
44 G1dh 117 TR01H054 190 GCH035
45 ERY22_Hk 118 TR01H055 191 GCH039
46 ERY22_Hh 119 TR01H056 192 GCH040
47 GL4-ERY22_Hk 120 TR01H057 193 GCHO42
48 H0000-ERY22L 121 TR01H058 194 GCHO43
49 rCE115H-ERY22_Hh 122 TR01H061 195 GCH045
50 rCE115L-kO 123 TR01H062 196 GCH053
51 hCE115HL (тяжелая цепь гуманизированного CE115) 124 TR01H063 197 GCH054
52 hCE115HA (тяжелая цепь гуманизированного CEllS) 125 TR01H064 198 GCH055
53 L0000 (легкая цепь гуманизированного СЕ115) 126 TR01H065 199 GCH056
54 H0000-ERY27_HK 127 TR01H066 200 GCH057
55 hCEl 15HA-ERY27_HE 128 TR01H067 201 GCH059
56 LOOOC-kO 129 TR01H068 202 GCH060
57 E22Hh 130 TRO1H069 203 GCH061
58 E22Hk 131 TR01H070 204 GCH062
59 Hi-Kn010G3 132 TR01H071 205 GCH064
60 E2702GsKsc 133 TR01H072 206 GCH065
61 E2704sEpsc 134 TR01H073 207 GCH066
62 E2702SKSC 135 TR01H074 208 GCH067
63 kO 136 TR01H075 209 GCH068
64 CE115HA177 137 TR01H076 210 GCH073
65 CE115HA178 138 TR01H077 211 GCH094
66 CE115HA179 139 TR01H079 212 GCH098
67 CE115HA180 140 TR01H080 213 GCH099
68 hCE115HAa 141 TR01H081 214 GCH100
69 TR01H006 142 TR01H082 215 H0610
70 TR01H007 143 TR01H083 216 LOOOOvkl
71 TR01H008 144 TR01H084 217 L0002
72 TR01H009 145 TR01H090 218 L0Q03
73 TR01H010 146 TR01H091 219 L0006
74 TR01H011 147 TR01H092 220 L0007
75 TR01H012 148 TR01H093 221 L0008
76 TR01H013 149 TR01H094 222 L0009
77 TR01H014 150 TR01H095 223 LO011
78 TR01H015 151 TR01H096 224 L0012
79 TR01H016 152 TR01H097 225 LO013
80 TR01H017 153 TR01H098 226 L0014
- 69 041830
SEQ ID NO: название SEQ ID NO: название SEQ ID 1®:название
227 L0015 300 L0202 373 TR01L015
228 L0016 301 L0203 374 TR01L016
229 L0032 302 L0204 375 TR01L017
230 L0038 303 L0205 376 TR01L018
231 L0039 304 L0206 377 TR01L019
232 L0041 305 L0207 378 TR01L02O
233 L0042 306 L020B 379 TR01L023
234 L0043 307 L0209 380 TR01L024
235 L0O44 308 LO210 381 CE115HA122-E22Hh
236 L0045 309 L0211 382 CE115HA236-E22Hh
237 L0046 310 L0212 383 CE115HA251-E22Hh
238 L0047 311 L0213 384 GCH054-E2704sEpsc
239 L0062 312 L0214 385 GCH065-E2704sEpsc
240 L0O63 313 L0215 386 GCH094-E2704sEpsc
241 L0064 314 L0216 387 HQ610-E2704sEpsc
242 L0065 315 L0217 388 hCE115HA-E22Hh
243 L0066 316 L0218 389 rCE115H-E22Hh
244 L0069 317 L0219 390 r0E115H-E2702GsKsc
245 L0O75 318 LO220 391 TR01Η002Έ22ΗΊ
246 L0079 319 L0222 392 TR01H015-E22Hh
247 L0082 320 L0223 393 TR01H040-E2702GSKSC
248 L0085 321 L0224 394 TR01H061-E2702GsKsC
249 L0089 322 L0226 395 TR01 H067-E2702GsKsc
250 L0090 323 L0227 396 TR01 H06B-E2702GsKsc
251 L0091 324 L0228 397 TR01 H071-E2702GsKsc
252 L0093 325 L0229 398 TR01H082-E2702GSKSC
253 L0104 326 L023D 399 TR01 H034-E2702GsKsc
254 L0106 327 L0231 400 TR01 H109-E2702GsKsc
255 L0107 328 L0232 401 TR01H113-E2702GsKsc
256 L0109 329 L0233 402 TR01H113-E2702sKsc
257 L0113 330 L0234 403 GL4-E22Hk
258 L0115 331 L0235 404 LOOOO-E22Hk
259 L0117 332 L0236 405 H0000-E22L
260 L0120 333 L0237 406 H0610-E22L
261 L0122 334 L0238 407 rCE115L-kO
262 L0123 335 L0239 408 GLS3108-k0
263 L0124 336 L0240 409 LOOOO-kO
264 L0125 337 L0241 410 L0011-k0
265 L0126 338 L0242 411 L0201-k0
266 L0127 339 L0243 412 L0203-k0
267 L0129 340 L0246 413 L0204-k0
268 L0132 341 L0247 414 L0206-k0
269 L0134 342 L024B 415 L0208-k0
270 L0136 343 L0249 416 L0209-k0
271 L0137 344 L0250 417 L0211-k0
272 L0138 345 L0258 418 L0212-k0
273 L0139 346 L0259 419 L0222-k0
274 L0140 347 L0260 420 TR01H001
275 L0141 348 L0261 421 TR01H002
276 L0143 349 L0262 422 TR01H003
277 L0144 350 L0263 423 TR01H004
278 L0145 351 L0264 424 ГСЕ115Н
279 L0147 352 L0265 425 CE115HA121
280 L0148 353 L0266 426 CE115HA122
281 L0149 354 L0267 427 CE115HA124
282 L0151 355 L0268 428 CE115HA192
283 L0152 356 L0269 429 CE115HA236
284 L0154 357 L0270 430 CE115HA251
285 L0155 358 L0271 431 CE115HA252
286 L0157 359 L0272 432 E22L
287 L0160 360 TR01L001
288 L0161 361 TR01L002
289 L0163 362 TR01L003
290 L0167 363 TR01L004
291 L0168 364 TR01L005
292 L0173 365 TR01L006
293 L0175 366 TR01L007
294 L0180 367 TR01L008
295 L0181 368 TR01L009
296 L0186 369 TR01L010
297 L0187 370 TR01L011
298 L0200 371 TR01L012
299 L0201 372 TR01L013
Промышленная применимость
В настоящем изобретении предложены новые мультиспецифические антигенсвязывающие молекулы, которые сохраняют сильную противораковую активность, свойственную BiTE, и обладают очень высокой безопасностью, что проявляется в отсутствии индукции независимого от ракового антигена цитокинового шторма, а также обладают продолжительным временем полужизни в крови. Индуцирующие цитотоксичность агенты, которые содержат в качестве действующего вещества антигенсвязывающую молекулу, предлагаемую в настоящем изобретении, могут направленно воздействовать на экспрессирующие глипикан 3 клетки и опухолевые ткани, которые содержат такие клетки, и индуцировать повреждение клеток. Введение мультиспецифических антигенсвязывающих молекул, предлагаемых в настоящем изобретении, пациентам позволяет осуществлять требуемое лечение, которое не только отличается высоким уровнем безопасности, но также снижает физическую нагрузку на пациентов и является очень удобным.
-

Claims (3)

    ФОРМУЛА ИЗОБРЕТЕНИЯ
  1. (1) биспецифическое антитело, которое имеет тяжелую цепь антитела, включающую вариабельную область тяжелой цепи антитела с глипикан 3 связывающей активностью, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 206, и константную область, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; тяжелую цепь антитела, включающую вариабельную область тяжелой цепи антитела с CD3ε-связывающей активностью, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 142, и константную область, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60; и две идентичные легкие цепи, имеющие аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 410;
    (1) биспецифическое антитело, которое имеет тяжелую цепь антитела, включающую вариабельную область тяжелой цепи антитела с глипикан 3 связывающей активностью, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 206, и константную область, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; тяжелую цепь антитела, включающую вариабельную область тяжелой цепи антитела с CD3ε-связывающей активностью, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 142, и константную область, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60; и две идентичные вариабельные области легкой цепи антитела, имеющие аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 223; и
    - 74 041830 (2) биспецифическое антитело, которое имеет тяжелую цепь антитела, включающую вариабельную область тяжелой цепи антитела с глипикан 3 связывающей активностью, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 206, и константную область, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; тяжелую цепь антитела, включающую вариабельную область тяжелой цепи антитела с CD3ε-связывающей активностью, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 164, и константную область, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60; и две идентичные вариабельные области легкой цепи антитела, имеющие аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 223; и (3) биспецифическое антитело, которое имеет тяжелую цепь антитела, включающую вариабельную область тяжелой цепи антитела с глипикан 3 связывающей активностью, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 206, и константную область, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; тяжелую цепь антитела, включающую вариабельную область тяжелой цепи антитела с CD3ε-связывающей активностью, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 168, и константную область, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60; и две идентичные вариабельные области легкой цепи антитела, имеющие аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 223; и (4) биспецифическое антитело, которое имеет тяжелую цепь антитела, включающую вариабельную область тяжелой цепи антитела с глипикан 3 связывающей активностью, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 206, и константную область, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; тяжелую цепь антитела, включающую вариабельную область тяжелой цепи антитела с CD3ε-связывающей активностью, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 168, и константную область, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 62; и две идентичные вариабельной области легкой цепи антитела, имеющие аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 223;
    (5) биспецифическое антитело, которое имеет тяжелую цепь антитела, включающую вариабельную область тяжелой цепи антитела с глипикан 3 связывающей активностью, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 211, и константную область, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; тяжелую цепь антитела, включающую вариабельную область тяжелой цепи антитела с CD3ε-связывающей активностью, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 142, и константную область, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60; и две идентичные вариабельные области легкой цепи, имеющие аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 223; и (6) биспецифическое антитело, которое имеет тяжелую цепь антитела, включающую вариабельную область тяжелой цепи антитела с глипикан 3 связывающей активностью, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 211, и константную область, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; тяжелую цепь антитела, включающую вариабельную область тяжелой цепи антитела с CD3ε-связывающей активностью, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 164, и константную область, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60; и две идентичные вариабельные области легкой цепи антитела, имеющие аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 223.
    8. Биспецифическое антитело, связывающее глипикан 3 и CD3ε, выбранное из группы, включающей:
    (1) биспецифическое антитело, где вариабельная область, имеющая глипикан 3 связывающую активность, имеет вариабельную область
    - 73 041830 тяжелой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 206;
    вариабельная область, имеющая CD3ε связывающую активность, имеет вариабельную область тяжелой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 142, и обе вариабельные области, как имеющая глипикан 3 связывающую активность, так и имеющая CD3ε связывающую активность, имеют общую вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 223;
    (1) биспецифическое антитело, где вариабельная область, имеющая глипикан 3 связывающую активность, включает CDR1, CDR2 и CDR3 участки тяжелой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 26-32 (CDR1), 52-57 (CDR2) и 97-104 (CDR3) SEQ ID NO: 206 соответственно;
    вариабельная область, имеющая CD3ε связывающую активность, включает CDR1, CDR2 и CDR3 участки тяжелой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 26-32 (CDR1), 52-59 (CDR2) и 99111 (CDR3) SEQ ID NO: 142 соответственно; и обе вариабельные области, как имеющая глипикан 3 связывающую активность, так. и имеющая CD3ε связывающую активность, включают общие CDR1, CDR2 и CDR3 участки легкой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 24-39 (CDR1), 55-61 (CDR2) и 94-102 (CDR3) SEQ ID NO: 223 соответственно;
    (1) биспецифическое антитело, где вариабельная область, имеющая глипикан 3 связывающую активность, включает CDR1, CDR2 и CDR3 участки тяжелой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 31-35 (CDR1), 50-66 (CDR2) и 99-104 (CDR3) SEQ ID NO: 206 соответственно;
    вариабельная область, имеющая CD3ε связывающую активность, включает CDR1, CDR2 и CDR3 участки тяжелой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 31-35 (CDR1), 50-68 (CDR2) и 101111 (CDR3) SEQ ID NO: 142 соответственно; и обе вариабельные области, как имеющая глипикан 3 связывающую активность, так и имеющая CD3εсвязывающую активность, включают общие CDR1, CDR2 и CDR3 участки легкой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 24-39 (CDR1), 55-61 (CDR2) и 94-102 (CDR3) SEQ ID NO: 223 соответственно;
    1. Биспецифическое антитело, связывающее глипикан 3 и CD3ε, которое содержит вариабельную область антитела, имеющую глипикан 3 связывающую активность, вариабельную область антитела, имеющую CD3ε связывающую активность, выбранное из (1)-(5):
  2. (2) биспецифическое антитело, которое имеет тяжелую цепь антитела, включающую вариабельную область тяжелой цепи антитела с глипикан 3 связывающей активностью, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 206, и константную область, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; тяжелую цепь антитела, включающую вариабельную область тяжелой цепи антитела с CD3ε-связывающей активностью, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 164, и константную область, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 60; и две идентичные легкие цепи, имеющие аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 410;
    (2) биспецифическое антитело, где вариабельная область, имеющая глипикан 3 связывающую активность, имеет вариабельную область тяжелой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 206;
    вариабельная область, имеющая CD3ε связывающую активность, имеет вариабельную область тяжелой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 164 соответственно; и обе вариабельные области, как имеющая глипикан 3 связывающую активность, так и имеющая CD3ε связывающую активность, имеют общую вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 223;
    (3) биспецифическое антитело, где вариабельная область, имеющая глипикан 3 связывающую активность, имеет вариабельную область тяжелой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 206;
    вариабельная область, имеющая CD3ε связывающую активность, имеет вариабельную область тяжелой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 168; и обе вариабельные области, как имеющая глипикан 3 связывающую активность, так и имеющая CD3ε связывающую активность, имеют общую вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 223;
    (4) биспецифическое антитело, где вариабельная область, имеющая глипикан 3 связывающую активность, имеет вариабельную область тяжелой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 211;
    вариабельная область, имеющая CD3ε связывающую активность, имеет вариабельную область тяжелой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 142; и обе вариабельные области, как имеющая глипикан 3 связывающую активность, так и имеющая CD3ε связывающую активность, имеют общую вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 223;
    (5) биспецифическое антитело, где вариабельная область, имеющая глипикан 3 связывающую активность, имеет вариабельную область тяжелой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 211;
    вариабельная область, имеющая CD3ε связывающую активность, имеет вариабельную область тяжелой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 164; и обе вариабельные области, как имеющая глипикан 3 связывающую активность, так и имеющая CD3ε связывающую активность, имеют общую вариабельную область легкой цепи, включающую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 223.
    5. Биспецифическое антитело по любому из пп.1-4, в котором биспецифическое антитело дополнительно имеет Fc-область по меньшей мере с одной аминокислотной мутацией любой из образующих Fc-область аминокислотных последовательностей SEQ ID NO: 23-26 (IgG1-IgG4), где по меньшей мере одна мутация выбрана из аминокислот в следующих аминокислотных положениях согласно EU-нумерации: положение 220, положение 226, положение 229, положение 231, положение 232, положение 233, положение 234, положение 235, положение 236, положение 237, положение 238, положение 239, положение 240, положение 264, положение 265, положение 266, положение 267, положение 269, положение 270, положение 295, положение 296, положение 297, положение 298, положение 299, положение 300, положение 325, положение 327, положение 328, положение 329, положение 330, положение 331 и положение 332.
    6. Биспеццфическое антитело по п.5, в котором Fc-область биспецифического антитела представляет собой Fc-область, которая содержит по меньшей мере одну аминокислоту, выбранную из указанных ниже аминокислот, согласно EU-нумерации: Arg в аминокислотном положении 234, Ala или Arg в аминокислотном положении 235, Lys в аминокислотном положении 239 и Ala в аминокислотном положении 297.
    7. Биспецифическое антитело, связывающее глипикан 3 и CD3ε, выбранное из группы, включающей:
    (2) биспецифическое антитело, где вариабельная область, имеющая глипикан 3 связывающую активность, включает CDR1, CDR2 и CDR3 участки тяжелой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 30-35 (CDR1), 47-59 (CDR2) и 97-103 (CDR3) SEQ ID NO: 206 соответственно;
    вариабельная область, имеющая CD3ε связывающую активность, включает CDR1, CDR2 и CDR3 участки тяжелой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 30-35 (CDR1), 4761 (CDR2) и 99-110 (CDR3) SEQ ID NO: 164 соответственно; и обе вариабельные области, как имеющая глипикан 3 связывающую активность, так и имеющая CD3ε связывающую активность, включают общие CDR1, CDR2 и CDR3 участки легкой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 35-41 (CDR1), 51-56 (CDR2) и 94-101 (CDR3) SEQ ID NO: 223 соответственно;
    (3) биспецифическое антитело, где вариабельная область, имеющая глипикан 3 связывающую активность, включает CDR1, CDR2 и CDR3 участки тяжелой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 30-35 (CDR1), 47-59 (CDR2) и 97-103 (CDR3) SEQ ID NO: 206 соответственно;
    вариабельная область, имеющая CD3ε связывающую активность, включает CDR1, CDR2 и CDR3 участки тяжелой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 30-35 (CDR1), 4761 (CDR2) и 99-110 (CDR3) SEQ ID NO: 168 соответственно; и обе вариабельные области, как имеющая глипикан 3 связывающую активность, так и имеющая CD3ε связывающую активность, включают общие CDR1, CDR2 и CDR3 участки легкой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 35-41 (CDR1), 51-56 (CDR2) и 94-101 (CDR3) SEQ ID NO: 223 соответственно;
    (4) биспецифическое антитело, где вариабельная область, имеющая глипикан 3 связывающую активность, которая включает CDR1, CDR2 и CDR3 участки тяжелой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 3035 (CDR1), 47-59 (CDR2) и 97-103 (CDR3) SEQ ID NO: 211 соответственно;
    вариабельная область, имеющая CD3ε связывающую активность, включает CDR1, CDR2 и CDR3 участки тяжелой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 30-35 (CDR1), 4761 (CDR2) и 99-110 (CDR3) SEQ ID NO: 142 соответственно; и обе вариабельные области, как имеющая глипикан 3 связывающую активность, так и имеющая CD3ε связывающую активность, включают общие CDR1, CDR2 и CDR3 участки легкой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 35-41 (CDR1), 51-56 (CDR2) и 94-101 (CDR3) SEQ ID NO: 223 соответственно;
    (5) биспецифическое антитело, где вариабельная область, имеющая глипикан 3 связывающую активность, включает CDR1, CDR2 и CDR3 участки тяжелой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 30-35 (CDR1), 47-59 (CDR2) и 97-103 (CDR3) SEQ ID NO: 211 соответственно;
    вариабельная область, имеющая CD3ε связывающую активность, включает CDR1, CDR2 и CDR3 участки тяжелой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 30-35 (CDR1), 4761 (CDR2) и 99-110 (CDR3) SEQ ID NO: 164 соответственно; и обе вариабельные области, как имеющая глипикан 3 связывающую активность, так и имеющая CD3ε связывающую активность, включают общие CDR1, CDR2 и CDR3 участки легкой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 35-41 (CDR1), 51-56 (CDR2) и 94-101 (CDR3) SEQ ID NO: 223 соответственно, причем нумерация тяжелой цепи CDR1, CDR2 и CDR3 и легкой цепи CDR1, CDR2 и CDR3 основана на контактной нумерации.
    4. Биспецифическое антитело, связывающее глипикан 3 и CD3ε, которое содержит вариабельную область антитела, имеющую глипикан 3 связывающую активность, и вариабельную область антитела, имеющую CD3ε-связывающую активность, выбранное из (1)-(5):
    (2) биспецифическое антитело, где вариабельная область, имеющая глипикан 3 связывающую активность, включает CDR1, CDR2 и CDR3 участки тяжелой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 26-32 (CDR1), 52-57 (CDR2) и 97-104 (CDR3) SEQ ID NO: 206 соответственно;
    вариабельная область, имеющая CD3ε связывающую активность, включает CDR1, CDR2 и CDR3 участки тяжелой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 26-32 (CDR1), 52-59 (CDR2) и 99111 (CDR3) SEQ ID NO: 164 соответственно; и обе вариабельные области, как имеющая глипикан 3 связывающую активность, так. и имеющая CD3ε связывающую активность, включают общие CDR1, CDR2 и CDR3 участки легкой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 24-39 (CDR1), 55-61 (CDR2) и 94-102 (CDR3) SEQ ID NO: 223 соответственно;
    (3) биспецифическое антитело, где вариабельная область, имеющая глипикан 3 связывающую активность, включает CDR1, CDR2 и CDR3 участки тяжелой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 26-32 (CDR1), 52-57 (CDR2) и 97-104 (CDR3) SEQ ID NO: 206 соответственно;
    вариабельная область, имеющая CD3ε связывающую активность, включает CDR1, CDR2 и CDR3 участки тяжелой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 26-32 (CDR1), 52-59 (CDR2) и 99111 (CDR3) SEQ ID NO: 168 соответственно; и обе вариабельные области, как имеющая глипикан 3 связывающую активность, так и имеющая CD3ε связывающую активность, включают общие CDR1, CDR2 и CDR3 участки легкой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 24-39 (CDR1), 55-61 (CDR2) и 94-102 (CDR3) SEQ ID NO: 223 соответственно;
    (4) биспецифическое антитело, где вариабельная область, имеющая глипикан 3 связывающую активность, включает CDR1, CDR2 и CDR3 участки тяжелой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 26-32 (CDR1), 52-57 (CDR2) и 97-104 (CDR3) SEQ ID NO: 211 соответственно;
    вариабельная область, имеющая CD3ε связывающую активность, включает CDR1, CDR2 и CDR3 участки тяжелой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 26-32 (CDR1), 52-59 (CDR2) и 99111 (CDR3) SEQ ID NO: 142 соответственно; и обе вариабельные области, как имеющая глипикан 3 связывающую активность, так и имеющая CD3εсвязывающую активность, включают общие CDR1, CDR2 и CDR3 участки легкой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 24-39 (CDR1), 55-61 (CDR2) и 94-102 (CDR3) SEQ ID NO: 223 соответственно;
    (5) биспецифическое антитело, где вариабельная область, имеющая глипикан 3 связывающую активность, включает CDR1, CDR2 и CDR3 участки тяжелой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 26-32 (CDR1), 52-57 (CDR2) и 97-104 (CDR3) SEQ ID NO: 211 соответственно;
    вариабельная область, имеющая CD3ε связывающую активность, включает CDR1, CDR2 и CDR3 участки тяжелой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 26-32 (CDR1), 52-59 (CDR2) и 99111 (CDR3) SEQ ID NO: 164 соответственно; и обе вариабельные области, как имеющая глипикан 3 связывающую активность, так и имеющая CD3εсвязывающую активность, включают общие CDR1, CDR2 и CDR3 участки легкой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 24-39 (CDR1), 55-61 (CDR2) и 94-102 (CDR3) SEQ ID NO: 223 соответственно, причем нумерация тяжелой цепи CDR1, CDR2 и CDR3 и легкой цепи CDR1, CDR2 и CDR3 основана на нумерации согласно Chothia.
    3. Биспецифическое антитело, связывающее глипикан 3 и CD3ε, которое содержит вариабельную область антитела, имеющую глипикан 3 связывающую активность, и вариабельную область антитела, имеющую CD3ε-связывающую активность, выбранное из (1)-(5):
    - 72 041830 (1) биспецифическое антитело, где вариабельная область, имеющая глипикан 3 связывающую активность, включает CDR1, CDR2 и
    CDR3 участки тяжелой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 30-35 (CDR1), 47-59 (CDR2) и 97-103 (CDR3) SEQ ID NO: 206 соответственно;
    вариабельная область, имеющая CD3ε связывающую активность, включает CDR1, CDR2 и CDR3 участки тяжелой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 30-35 (CDR1), 4761 (CDR2) и 99-110 (CDR3) SEQ ID NO: 142 соответственно; и обе вариабельные области, как имеющая глипикан 3 связывающую активность, так и имеющая CD3ε связывающую активность, включают общие CDR1, CDR2 и CDR3 участки легкой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 35-41 (CDR1), 51-56 (CDR2) и 94-101 (CDR3) SEQ ID NO: 223 соответственно;
    2. Биспецифическое антитело, связывающее глипикан 3 и CD3ε, которое содержит вариабельную область антитела, имеющую глипикан 3 связывающую активность, и вариабельную область антитела, имеющую CD3ε связывающую активность, выбранное из (1)-(5):
    (2) биспецифическое антитело, где вариабельная область, имеющая глипикан 3 связывающую активность, включает CDR1, CDR2 и CDR3 участки тяжелой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 31-35 (CDR1), 50-66 (CDR2) и 99-104 (CDR3) SEQ ID NO: 206 соответственно;
    вариабельная область, имеющая CD3ε связывающую активность, включает CDR1, CDR2 и CDR3 участки тяжелой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 31-35 (CDR1), 50-68 (CDR2) и 101111 (CDR3) SEQ ID NO: 164 соответственно; и обе вариабельные области, как. имеющая глипикан 3 связывающую активность, так. и имеющая CD3ε связывающую активность, включают общие CDR1, CDR2 и CDR3 участки легкой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 24-39 (CDR1), 55-61 (CDR2) и 94-102 (CDR3) SEQ ID NO: 223 соответственно;
    (3) биспецифическое антитело, где вариабельная область, имеющая глипикан 3 связывающую активность, включает CDR1, CDR2 и CDR3 участки тяжелой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 31-35 (CDR1), 50-66 (CDR2) и 99-104 (CDR3) SEQ ID NO: 206 соответственно;
    вариабельная область, имеющая CD3ε связывающую активность, включает CDR1, CDR2 и CDR3 участки тяжелой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 31-35 (CDR1), 50-68 (CDR2) и 101-111 (CDR3) SEQ ID NO: 168 соответственно; и обе вариабельные области, как имеющая глипикан 3 связывающую активность, так и имеющая CD3ε-связывающую активность, включают общие CDR1, CDR2 и CDR3 участки легкой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 24-39 (CDR1), 55-61 (CDR2) и 94-102 (CDR3) SEQ ID NO: 223 соответственно;
    (4) биспецифическое антитело, где вариабельная область, имеющая глипикан 3 связывающую активность, включает CDR1, CDR2 и CDR3 участки тяжелой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 31-35 (CDR1), 50-66 (CDR2) и 99-104 (CDR3) SEQ ID NO: 211 соответственно;
    вариабельная область, имеющая CD3ε связывающую активность, включает CDR1, CDR2 и CDR3 участки тяжелой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 31-35 (CDR1), 5068 (CDR2) и 101-111 (CDR3) SEQ ID NO: 142 соответственно; и обе вариабельные области, как имеющая глипикан 3 связывающую активность, так и имеющая CD3ε-связывающую активность, включают общие CDR1, CDR2 и CDR3 участки легкой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 24-39 (CDR1), 55-61 (CDR2) и 94-102 (CDR3) SEQ ID NO: 223 соответственно;
    (5) биспецифическое антитело, где вариабельная область, имеющая глипикан 3 связывающую активность, включает CDR1, CDR2 и CDR3 участки тяжелой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 31-35 (CDR1), 50-66 (CDR2) и 99-104 (CDR3) SEQ ID NO: 211 соответственно;
    вариабельная область, имеющая CD3ε связывающую активность, включает CDR1, CDR2 и CDR3 участки тяжелой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 31-35 (CDR1), 5068 (CDR2) и 101-111 (CDR3) SEQ ID NO: 164 соответственно; и обе вариабельные области, как имеющая глипикан 3 связывающую активность, так и имеющая CD3ε связывающую активность, включают общие CDR1, CDR2 и CDR3 участки легкой цепи, идентичные аминокислотным последовательностям положений 24-39 (CDR1), 55-61 (CDR2) и 94-102 (CDR3) SEQ ID NO: 223 соответственно, причем нумерация тяжелой цепи CDR1, CDR2 и CDR3 и легкой цепи CDR1, CDR2 и CDR3 основана на нумерации согласно Кэботу.
    - 71 041830
  3. (3) биспецифическое антитело, которое имеет тяжелую цепь антитела, включающую вариабельную область тяжелой цепи антитела с глипикан 3 связывающей активностью, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 206, и константную область, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID NO: 61; тяжелую цепь антитела, включающую вариабельную область тяжелой цепи антитела с CD3ε-связывающей активностью, имеющую аминокислотную последовательность SEQ ID
    -
EA201790674 2014-09-26 2015-09-25 БИСПЕЦИФИЧЕСКОЕ АНТИТЕЛО, СВЯЗЫВАЮЩЕЕ ГЛИПИКАН 3 И CD3ε (ВАРИАНТЫ), ФАРМАЦЕВТИЧЕСКАЯ КОМПОЗИЦИЯ, ВКЛЮЧАЮЩАЯ ЕГО, И СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ЭТОГО АНТИТЕЛА EA041830B1 (ru)

Applications Claiming Priority (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
JP2014-197315 2014-09-26

Publications (1)

Publication Number Publication Date
EA041830B1 true EA041830B1 (ru) 2022-12-07

Family

ID=

Similar Documents

Publication Publication Date Title
US20210230311A1 (en) Cytotoxicity-inducing therapeutic agent
WO2017159287A1 (ja) 癌の治療に用いるための細胞傷害誘導治療剤
JP6175590B1 (ja) 癌の治療に用いるための細胞傷害誘導治療剤
CN114375302A (zh) 包含激肽释放酶相关肽酶2抗原结合结构域的蛋白质及其用途
RU2812875C1 (ru) Индуцирующий цитотоксичность терапевтический агент
EA041830B1 (ru) БИСПЕЦИФИЧЕСКОЕ АНТИТЕЛО, СВЯЗЫВАЮЩЕЕ ГЛИПИКАН 3 И CD3ε (ВАРИАНТЫ), ФАРМАЦЕВТИЧЕСКАЯ КОМПОЗИЦИЯ, ВКЛЮЧАЮЩАЯ ЕГО, И СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ЭТОГО АНТИТЕЛА
NZ730615B2 (en) Cytotoxicity-inducing therapeutic agent