DK175554B1 - DNA construct for use in filamentous fungi - comprising promoter operative in filamentous fungi to promote transcription of coding region - Google Patents

DNA construct for use in filamentous fungi - comprising promoter operative in filamentous fungi to promote transcription of coding region Download PDF

Info

Publication number
DK175554B1
DK175554B1 DK200200461A DKPA200200461A DK175554B1 DK 175554 B1 DK175554 B1 DK 175554B1 DK 200200461 A DK200200461 A DK 200200461A DK PA200200461 A DKPA200200461 A DK PA200200461A DK 175554 B1 DK175554 B1 DK 175554B1
Authority
DK
Denmark
Prior art keywords
promoter
coding region
region
sequence
plasmid
Prior art date
Application number
DK200200461A
Other languages
Danish (da)
Inventor
David Ivor Gwynne
Francis Paul Buxton
Mark Hudson Pickett
Roger Wayne Davies
Claudio Scazzocchio
Original Assignee
Dsm Ip Assets Bv
Priority date (The priority date is an assumption and is not a legal conclusion. Google has not performed a legal analysis and makes no representation as to the accuracy of the date listed.)
Filing date
Publication date
Priority claimed from US06/811,404 external-priority patent/US5198345A/en
Priority claimed from DK591686A external-priority patent/DK176017B1/en
Application filed by Dsm Ip Assets Bv filed Critical Dsm Ip Assets Bv
Priority to DK200200461A priority Critical patent/DK175554B1/en
Publication of DK200200461A publication Critical patent/DK200200461A/en
Application granted granted Critical
Publication of DK175554B1 publication Critical patent/DK175554B1/en

Links

Landscapes

  • Preparation Of Compounds By Using Micro-Organisms (AREA)
  • Micro-Organisms Or Cultivation Processes Thereof (AREA)
  • Peptides Or Proteins (AREA)
  • Saccharide Compounds (AREA)

Abstract

A novel DNA construct comprises a promoter operative in a filamentous fungus to promote transcription of a coding region when operatively associated. The promoter region naturally associated with the alcohol dehydrogeanse I (alcA) gene and the aldehyde dehydrogenase (aldA) gene of A. nidulans or naturally associated with the glucoamylase gene in Aspergillus niger may be used. The DNA construct may contain a promoter region in operative association with a signal peptide coding region and permits introduction of a region coding for a desired protein at a position 3' of and in reading frame with the signal peptide coding region. The promoter/signal construct is suitably provided with a flanking restriction site to allow precise coupling of the protein coding region to the signal peptide coding region.

Description

DK 175554 B1 iDK 175554 B1 i

Den foreliggende opfindelse angår ekspression og ekspression efterful|t\af> sekretion af proteiner fra filamentøse fungi.The present invention relates to expression and expression following secretion of proteins from filamentous fungi.

Et formål med rekombinant DNA-teknologi er indsætning af DNA-segmenter, som koder 5 for kommercielt eller videnskabeligt værdifulde proteiner, i en værtscelle, som er let tilgængelig på økonomisk måde. De gener, der udvælges til indsætning, er normalt gener, der koder for proteiner, som kun produceres i begrænsede mængder af deres naturlige værter, eller gener, som er naturlige for værter, der er for kostbare at dyrke. Overførsel af genetisk information på reguleret måde til en vært, som er i stand til at producere 10 proteinet enten i stort udbytte eller på mere økonomisk måde i et lignende udbytte, giver et mere ønskeligt medium til proteinproduktion.One object of recombinant DNA technology is to insert DNA segments encoding 5 commercially or scientifically valuable proteins into a host cell that is readily available in an economical manner. The genes selected for insertion are usually genes encoding proteins that are produced only in limited quantities by their natural hosts, or genes that are natural for hosts that are too expensive to grow. Transferring genetic information in a controlled manner to a host capable of producing the protein either in high yield or more economically in a similar yield provides a more desirable medium for protein production.

Gener, der koder for proteiner, indeholder promotorområder af DNA, som i det væsentlige er bundet til 5'-terminalen af det proteinkodende område. Promotorområderne indeholder 15 bindingsstedet for RNA-polymerase II. RNA-polymerase II katalyserer på effektiv måde samlingen af det messenger-RNA, der er komplementært med den relevante DNA-streng fra det kodende område. I de fleste promotorområder findes der en nukleotidbasesekvens, der er beslægtet med sekvensen, der normalt betegnes en MTATA-kasse", hvilken sekvens almindeligvis befinder sig i nogen afstand opstrøms for starten af det kodende område og 20 kræves til nøjagtig transkriptionsinitiering. Andre elementer, der er vigtige eller essentielle for, at det kodende område fungerer og regulerer på korrekt måde, er også indeholdt i promotorområdet opstrøms fra starten af det kodende område.Protein-coding genes contain promoter regions of DNA that are essentially bound to the 5 'terminus of the protein-coding region. The promoter regions contain the binding site for RNA polymerase II. RNA polymerase II effectively catalyzes the assembly of the messenger RNA that is complementary to the relevant DNA strand from the coding region. In most promoter regions, there is a nucleotide base sequence akin to the sequence, usually referred to as an MTATA box ", which sequence is usually located some distance upstream of the coding region and required for accurate transcription initiation. important or essential for the proper functioning and regulation of the coding region is also contained in the promoter region upstream from the beginning of the coding region.

Filamentøse fungi, især de filamentøse ascomyceter såsom Aspergillus, fx Aspergillus 25 niger, udgør en klasse af mikroorganismer, der er egnede som modtagere af fremmede gener, der koder for værdifulde proteiner. Aspergillus piger og dermed beslægtede arter anvendes for tiden i stor udstrækning ved den industrielle produktion af enzymer, fx til anvendelse i levnedsmiddelindustrien. Deres anvendelse bygger på mikroorganismens sekretionsevne. Eftersom de er godt karakteriserede og på grund af deres brede 30 anvendelse og godkendelse, findes der både et industrielt og videnskabeligt incitament til at benytte genetisk modificerede og forbedrede celler af A. niger og beslægtede arter, herunder A. nidulans, for at opnå nyttige proteiner.Filamentous fungi, especially the filamentous ascomycetes such as Aspergillus, e.g. Aspergillus 25 niger, constitute a class of microorganisms suitable as recipients of foreign genes encoding valuable proteins. Aspergillus girls and related species are currently widely used in the industrial production of enzymes, for example, for use in the food industry. Their use is based on the secretion ability of the microorganism. Because they are well characterized and because of their wide application and approval, there is both an industrial and scientific incentive to use genetically modified and improved cells of A. niger and related species, including A. nidulans, to obtain useful proteins. .

Ekspression og sekretion af fremmede proteiner fra filamentøse fungi er endnu ikke blevet 35 opnået. Det er på ingen måde klart, at de strategier, som har været anvendt med held i gær, vil være vellykkede i filamentøse fungi såsom Aspergillus. Det har vist sig, at gær er et uhensigtsmæssigt system til ekspression af filamentøse fungusgener (Pentilla et al.,Expression and secretion of foreign proteins from filamentous fungi has not yet been achieved. It is by no means clear that the strategies that have been successfully used in yeast will be successful in filamentous fungi such as Aspergillus. It has been found that yeast is an inappropriate system for expression of filamentous fungus genes (Pentilla et al.,

Molec. Gen. Genet. 194, 1984, s. 494-499), og at gærgener ikke udtrykkes i filamentøse fungi. Genetiske manipulationsteknikker er for nylig blevet udviklet for Aspergillus nidulans 40 og Aspergillus niger. Disse teknikker omfatter inkorporering af exogent tilføjede gener til Asperg/7/us-genomet i en form, i hvilken de er i stand til at blive udtrykt.Molec. Gen. Genet. 194, 1984, pp. 494-499) and that yeast genes are not expressed in filamentous fungi. Genetic manipulation techniques have recently been developed for Aspergillus nidulans 40 and Aspergillus niger. These techniques include the incorporation of exogenously added genes into the Asperg / 7 / us genome in a form in which they are capable of being expressed.

Indtil nu er ingen fremmede proteiner blevet udtrykt i og secerneret fra filamentøse fungi under anvendelse af disse teknikker. Dette har skyldtes mangel på hensigtsmæssigeUntil now, no foreign proteins have been expressed in and secreted from filamentous fungi using these techniques. This has been due to a lack of appropriate

I DK 175554 B1 II DK 175554 B1 I

I _________________________2 _ _ ....... . . _ _____________________ . _ _ II _________________________2 _ _ ........ . _ _____________________. _ _ I

ekspressionsvektorer og de bestanddele, der udgør dem. Disse bestanddele omfatter Iexpression vectors and the constituents that make them up. These components include I

I Asperg/7/us-promotorsekvenser som beskrevet ovenfor, det område, som koder for det IIn Asperg / 7 / us promoter sequences as described above, the region encoding it I

I ønskede produkt, samt de dermed forbundne sekvenser, der kan være tilføjet for at lede IIn the desired product, as well as the associated sequences that may be added to guide I

det ønskede produkt hen til det ekstracellulære medium. Ithe desired product to the extracellular medium. IN

I 5 II 5 I

I Som nævnt ovenfor kræver værtscellens ekspression af det fremmede gen tilstedeværelse IAs mentioned above, host cell expression of the foreign gene requires presence I

I af et promotorområde opstrøms for det område, der koder for proteinet. Dette II of a promoter region upstream of the region encoding the protein. This I

I promotorområde er aktivt til regulering af transkriptionen af det kodende område, IIn the promoter region is active for regulating the transcription of the coding region, I

I hvormed det er forbundet, til messenger-RNA, som til slut translateres til det ønskede IIn which it is linked, to messenger RNA, which is finally translated into the desired I

I 10 proteinprodukt. De således producerede proteiner kan kategoriseres i to klasser på basis af IIn protein product. The proteins thus produced can be categorized into two classes on the basis of I

I deres skæbne i forhold til værten. IIn their destiny in relation to the host. IN

I En første klasse af proteiner bevares intracellulært. Ekstraktion af det ønskede protein, når IIn A first class of proteins is preserved intracellularly. Extraction of the desired protein when I

det er intracellulært, kræver, at den genetisk manipulerede vært åbnes eller lyseres for at Iit is intracellular, requires that the genetically engineered host be opened or lysed in order to

I 15 frigøre produktet til endelig oprensning. Intracellulær produktion har flere fordele. IIn 15 release the product for final purification. Intracellular production has several advantages. IN

I Proteinproduktet kan koncentreres, dvs. pelleteres, med cellemassen, og hvis produktet er IIn the protein product can be concentrated, i.e. pelleted, with the cell mass and if the product is I

I labilt under ekstracellulære betingelser eller er strukturelt ude af stand til at blive IIn labile under extracellular conditions or are structurally unable to become I

secerneret, er dette en ønskelig produktions- og oprensningsmetode. Isecreted, this is a desirable production and purification method. IN

20 En anden klasse af proteiner er de proteiner, der secerneres fra cellen. I dette tilfælde IAnother class of proteins are those proteins that are secreted from the cell. In this case, I

I udføres der oprensning på det ekstracellulære medium og ikke på selve cellen. Produktet IIn this, purification is performed on the extracellular medium and not on the cell itself. Product I

I kan ekstraheres ved metoder såsom affinitetschromatografi, og kontinuerlig IYou can be extracted by methods such as affinity chromatography, and continuous I

I strømningsfermentering er mulig. Visse produkter ér også mere stabile ekstracellulært og IIn flow fermentation is possible. Some products are also more stable extracellular and I

I drager fordel af ekstracellulær oprensning. Forsøg har vist, at sekretion af proteiner i IYou benefit from extracellular purification. Studies have shown that secretion of proteins in I

25 eukaryoter næsten altid dikteres af et sekretionssignalpeptid (i det følgende betegnet I25 eukaryotes are almost always dictated by a secretion signal peptide (hereinafter referred to as I)

signalpeptid), der sædvanligvis befinder sig ved proteinets aminoterminal. Signalpeptider Isignal peptide) usually located at the amino terminal of the protein. Signal peptides I

I har karakteristiske fordelinger, hvilket er beskrevet af G. Von Heijne i Eur. J. Biochem, IYou have characteristic distributions, as described by G. Von Heijne in Eur. J. Biochem, I

I 1983, s. 17-21, og vil kunne genkendes af fagfolk. Når signalpeptidet genkendes af cellen, IIn 1983, pp. 17-21, and will be recognized by professionals. When the signal peptide is recognized by the cell, I

dirigerer det proteinet ind i cellens sekretionsbane. Under sekretionen spaltes Iit directs the protein into the secretion pathway of the cell. During secretion, I cleave

I 30 signalpeptidet fra, hvilket gør det muligt at høste proteinet i moden form fra det IIn the signal peptide off, enabling the protein in mature form to be harvested from it

I ekstracellulære medium. IIn extracellular medium. IN

I Begge proteinklasser, intracellulær og ekstracellulær, indkodes af gener, som indeholder et IIn both protein classes, intracellular and extracellular, are encoded by genes that contain an I

I promotorområde koblet til et kodende område. Gener, der koder for ekstracellulært IIn promoter region linked to a coding region. Genes encoding extracellular I

I 35 dirigerede proteiner, er forskellige fra gener, der koder for intracellulære proteiner, ved, at IIn 35 directed proteins, different from genes encoding intracellular proteins, in that I

I i gener, der koder for ekstracellulære proteiner, koder den del af det kodende område, der IIn genes encoding extracellular proteins, the portion of the coding region encoding I

I er tættest på promotoren (hvilket er den første del, der transkriberes af RNA-polymerase), IYou are closest to the promoter (which is the first part transcribed by RNA polymerase), I

I for et signalpeptid. Den nukleotidsekvens, der koder for signalpeptidet, og som i det II for a signal peptide. The nucleotide sequence encoding the signal peptide and as in it I

I følgende betegnes det signalpeptid-kodende område eller signalsekvensen, er i sig selv IHereinafter, the signal peptide coding region or signal sequence is itself I

I 40 operativt en del af det kodende område. IIn operationally part of the coding region. IN

I Der er nu udviklet et system, hvorved fi|amentøse fungi kan transformeres til at udtrykke IA system has now been developed which transforms phantom fungi to express I

I et ønsket protein. Med dette system kan transformation give en filamentøs fungus, der er i IIn a desired protein. With this system, transformation can produce a filamentous fungus that is in I

I stand til ikke blot at udtrykke proteinet, men også at secernere dette protein, uanset om IAble not only to express the protein, but also to secrete this protein, whether or not you

3 DK 175554 B1 proteinet er et naturligt secerneret protein eller ej. Desuden kan den mængde, i hvilken . proteinet udtrykkes, reguleres ifølge visse aspekter af opfindelsen. Det vil være klart for fagfolk, at det omhandlede system gør det muligt, at filamentøse fungi fungerer som værdifulde proteinkilder og udgør et alternativ, som til mange anvendelser er bedre end 5 bakterie- og gærsystemer.3 DK 175554 The B1 protein is a naturally secreted protein or not. Moreover, the quantity in which. the protein expressed is regulated according to certain aspects of the invention. It will be appreciated by those skilled in the art that the present system enables filamentous fungi to function as valuable protein sources and constitutes an alternative which in many applications is better than 5 bacterial and yeast systems.

I den foreliggende opfindelse identificeres og isoleres glycoamylase-promotorområdet fra A. niger, og forbindes hensigtsmæssigt i et funktionelt forhold med et andet, forskelligt kodende område uden for cellen, hvorefter det igen indføres i en filamentøs værtsfungus 10 under anvendelse af en hensigtsmæssig vektor. Transformerede værtsceller udtrykker proteinet fra det andet kodende område under kontrol af det indsatte promotorområde.In the present invention, the glycoamylase promoter region of A. niger is identified and isolated in a functional relationship with another, different coding region outside the cell, after which it is reintroduced into a filamentous host fungus 10 using a suitable vector. Transformed host cells express the protein from the second coding region under control of the inserted promoter region.

Det andet kodende område kan være et område, som er fremmed for værtsarten, i hvilket tilfælde værten udtrykker og i nogle tilfælde secernerer et protein, der ikke naturligt udtrykkes af den givne vært. Alternativt kan det andet kodende område være et område, 15 som er naturligt for værten, i hvilket tilfælde det er forbundet med et promotorområde, der er forskelligt fra det promotorområde, hvormed det naturligt er forbundet i den givne vært, hvilket giver modificeret eller forøget proteinekspression og -sekretion.The second coding region may be a region that is foreign to the host species, in which case the host expresses and in some cases secretes a protein that is not naturally expressed by the given host. Alternatively, the second coding region may be a region that is natural to the host, in which case it is associated with a promoter region that is different from the promoter region with which it is naturally associated in the given host, giving modified or increased protein expression. and secretion.

Hvis det andet kodende område er et område, der koder for et protein, som normalt 20 secerneres, indeholder det en sekvens af nukleotider ved sin 5'-terminal, dvs. et signalpeptid-kodende område, som efter transkription og translation vil resultere i tilstedeværelse af et signalpeptid ved proteinproduktets aminoterminal. Signalpeptidet kan genkendes af fungusværten, og proteinproduktet kan derefter styres ind i cellens sekretionsbane og secerneres.If the second coding region is a region encoding a protein that is normally 20 secreted, it contains a sequence of nucleotides at its 5 'terminus, i.e. a signal peptide-coding region which, after transcription and translation, will result in the presence of a signal peptide at the protein terminal of the protein product. The signal peptide can be recognized by the fungus host and the protein product can then be directed into the secretion pathway of the cell and secreted.

2525

Den foreliggende opfindelse giver mulighed for at indføre fremmede kodende områder i filamentøse fungi sammen med promotorer, hvilket gør det muligt, at værtsfungusen udtrykker forskellige proteiner, Den giver også mulighed for at regulere transkription af de individuelle gener, som naturligt forekommer deri, eller fremmede gener, der indføres deri, 30 via det promotorområde, der er blevet indført i værten sammen med genet.The present invention provides for the possibility of introducing foreign coding regions into filamentous fungi with promoters, allowing the host fungus to express various proteins, it also allows for the regulation of transcription of the individual genes naturally occurring therein, or foreign genes. , introduced therein, via the promoter region that has been introduced into the host along with the gene.

Ifølge opfindelsen induceres det promotorområde, der naturligt er forbundet med glycoamylase-genet i Aspergillus niger positivt ved hjælp af stivelse og andre sukkere.According to the invention, the promoter region naturally associated with the glycoamylase gene in Aspergillus niger is positively induced by starch and other sugars.

35 Foretrukne værter ifølge opfindelsen er filamentøse fungi af ascomycetes-klassen, især Aspergillus sp., herunder A. niger, A. nidulans og lignende.Preferred hosts of the invention are filamentous fungi of the ascomycetes class, especially Aspergillus sp., Including A. niger, A. nidulans and the like.

Den foreliggende opfindelse anvender promotorområdet fra Aspergillus niger-glucoamylase-genet til fremstilling af et hensigtsmæssigt vektorplasmid.The present invention uses the promoter region of the Aspergillus niger glucoamylase gene to produce an appropriate vector plasmid.

4040

Destinationen for proteinproduktet fra det kodende område, som er blevet udvalgt til ekspression under kontrol af den ovenfor beskrevne promotor, bestemmes af dette kodende områdes nukleotidsekvens. Hvis proteinproduktet naturligt ledes til det ekstracellulære miljø, vil det som nævnt iboende indeholde et sekretionssignalpeptid-The destination of the protein product from the coding region which has been selected for expression under the control of the promoter described above is determined by the nucleotide sequence of this coding region. If the protein product is naturally directed to the extracellular environment, as mentioned, it will inherently contain a secretion signal peptide.

I DK 175554 B1 II DK 175554 B1 I

I _____ ___________4 _________ __________________ II _____ ___________4 _________ __________________ I

I kodende område. Proteinprodukter, der normalt befinder sig intraceilulært, mangler dette IIn coding area. Protein products that are normally intracellularly lack this

I signalpeptid. IIn signal peptide. IN

I I nærværende beskrivelse er det derfor klart, at et "kodende område” koder for et protein, ITherefore, in this specification, it is clear that a "coding region" encodes a protein, I

I 5 der enten bevares intraceilulært eller secerneres. (Dette "kodende område" betegnes IIn 5 either intracellularly preserved or secreted. (This "coding region" is referred to as

I undertiden inden for teknikken et strukturgen, dvs. den del af et gen, som koder for et ISometimes in the art a structural gene, ie. the portion of a gene encoding a I

I protein.) Hvis proteinet bevares inde i den celle, som producerer det, mangler det kodende IIn protein.) If the protein is preserved inside the cell that produces it, the coding I is missing

I område sædvanligvis et signalpeptid-kodende område. Sekretion af det protein, der IIn region usually a signal peptide coding region. Secretion of the protein I

I indkodes inden for det kodende område, kan være en naturlig konsekvens af IEncoding within the coding domain can be a natural consequence of I

I 10 cellemetabolisme, i hvilket tilfælde det kodende område iboende indeholder et IIn 10 cell metabolism, in which case the coding region inherently contains an I

I signalpeptid-kodende område, der er forbundet naturligt i translationslæseramme med et IIn signal peptide coding region that is naturally associated in translation reading frame with an I

I segment fra det kodende område, der koder for det secernerede protein. I dette tilfælde IIn segment from the coding region encoding the secreted protein. In this case, I

I kræves der ikke indsætning af et signalpeptid-kodende område. IInsertion of a signal peptide coding region is not required. IN

I 15 Opfindelsen beskrives nærmere under henvisning til tegningen, hvor IThe invention is described in greater detail with reference to the drawing, in which:

I fig. 1A viser basesekvensen af det DNA, der udgør det kodende område og IIn FIG. 1A shows the base sequence of the DNA constituting the coding region and I

I promotorområdet i alkohol·dehydrogenase I- (a/cA)-genet fra Aspergillus nidulans, IIn the promoter region of alcohol · the dehydrogenase I (a / cA) gene of Aspergillus nidulans, I

I fig. IB viser basesekvensen af det DNA, der udgør det kodende område og promotor IIn FIG. 1B shows the base sequence of the DNA comprising the coding region and promoter I

I området i aldehyd-dehydrogenase- (a/c/A)-genet fra Aspergillus nidulans, IIn the region of the aldehyde dehydrogenase (a / c / A) gene of Aspergillus nidulans, I

I 20 fig. 2 viser i diagram en fremgangsmåde til konstruktion af plasmidet pDG6, der er IIn FIG. 2 shows in diagram a method for constructing the plasmid pDG6, which is I

I nyttigt ved transformation af en filamentøs funguscelle, IIn useful in transformation of a filamentous fungal cell, I

fig. 3 viser lineært en del af det i fig. 2 viste plasmid pDG6, IFIG. 3 shows a linear part of the part of FIG. 2, plasmid pDG6, I

I fig. 4 viser i diagram plasmidkortene over pGLl og pGL2, IIn FIG. 4 is a diagram showing the plasmid maps of pGL1 and pGL2, I

I fig. 5 viser et udvalg af syntetiske linker-sekvenser til indsætning i plasmidet pGL2, IIn FIG. 5 shows a selection of synthetic linker sequences for insertion into plasmid pGL2, I

25 fig. 6 viser nukleotidsekvensen af et fragment af pGL2, IFIG. 6 shows the nucleotide sequence of a fragment of pGL2, I

fig. 7 viser plasmidkortet over pGL2B og pGL2BIFN, IFIG. 7 shows the plasmid map of pGL2B and pGL2BIFN, I

I fig. 8 viser nukleotidsekvensen af et fragment af pGU2BIFN, IIn FIG. 8 shows the nucleotide sequence of a fragment of pGU2BIFN, I

I fig. 9 viser plasmidet pALCAlS og en fremgangsmåde til fremstilling deraf, IIn FIG. 9 shows the plasmid pALCA1S and a method for producing it, I

I fig. 10 viser plasmidkortet over pALCAlSIFN og en fremgangsmåde til fremstilling deraf, IIn FIG. 10 shows the plasmid map of pALCA1SIFN and a method of producing them, I

I 30 fig. 11 viser nukleotidsekvensen af et fragment af pALCAlSIFN, IIn FIG. 11 shows the nucleotide sequence of a fragment of pALCA1SIFN, I

I fig. 12 viser plasmidkortet over pGL2CENDO, IIn FIG. 12 shows the plasmid map of pGL2CENDO, I

I fig. 13 viser nukleotidsekvensen af et fragment af pGL2CENDO, IIn FIG. 13 shows the nucleotide sequence of a fragment of pGL2CENDO, I

I fig. 14 viser plasmidkortet over pALCAISENDO, IIn FIG. 14 shows the plasmid map of pALCAISENDO, I

I fig. 15 viser nukleotidsekvensen af et fragment af pALCAlSENDO, IIn FIG. 15 shows the nucleotide sequence of a fragment of pALCA1SENDO, I

I 35 fig. 16 viser plasmidet pALCAlAMY og en fremgangsmåde til fremstilling deraf, og IIn FIG. 16 shows the plasmid pALCAlAMY and a method for its preparation, and I

I fig. 17 viser nukleotidsekvensen af et segment af det i fig. 16 viste plasmid pALCAlAMY. IIn FIG. 17 shows the nucleotide sequence of a segment of the 16 showed plasmid pALCAlAMY. IN

I I den foreliggende opfindelse identificeres et promotorområde fra A. n/ger-glycoamylase- IIn the present invention, a promoter region of A. n / ger glycoamylase I is identified

genet. Fremgangsmåder til identifikation af hvert af de gener, som indeholder de ønskede Igene. Methods for identifying each of the genes containing the desired I

40 promotorområder, er ens, og af denne grund beskrives den måde, hvorpå afcA-genet og I40 promoter regions are similar, and for this reason, the manner in which the afcA gene and I are described

I promotoren deri lokaliseres og identificeres. Til dette formål induceres celler af den valgte IThe promoter therein is located and identified. For this purpose, cells of the selected I are induced

I art til at udtrykke det udvalgte protein, fx alcA, og ud fra disse celler isoleres messenger- IIn order to express the selected protein, e.g., alcA, and from these cells, messenger isolates are isolated.

I RNA’et. En del deraf, som endnu ikke er identificeret, koder for alcA. Komplementært DNA IIn the RNA. A portion of which has not yet been identified encodes alcA. Complementary DNA I

I til fragmenterne fremstilles ud fra mRNA-fragmenterne og klones i en vektor. Messenger- II to the fragments are prepared from the mRNA fragments and cloned into a vector. Messenger- I

5 DK 175554 B1 RNA isoleret fra induceret A. nidulans størrelsesfraktioneres for at beriges med alcA-sekvenser, endemærkes og hybridiseres til de cDNA-kloner, der er fremstillet ud fra alcA+-stammen. Den klon, der indeholder det cDNA, som hybridiserer til alcA+ mRNA, indeholder DNA-kopien af alcA mRNA'et. Dette stykke hybridiseres til en total DNA-genbank fra den 5 valgte Aspergillus-art for at isolere det valgte kodende område, fx alcA og de tilgrænsende områder. Det a/dA-kodende område blev isoleret ved analoge fremgangsmåder.B1 RNA isolated from induced A. nidulans is size fractionated to enrich with alcA sequences, end-labeled and hybridized to the cDNA clones prepared from the alcA + strain. The clone containing the cDNA that hybridizes to alcA + mRNA contains the DNA copy of the alcA mRNA. This piece is hybridized to a total DNA gene bank of the selected Aspergillus species to isolate the selected coding region, for example, alcA and the adjacent regions. The α / dA coding region was isolated by analogous methods.

Det kodende område starter ved 5'-enden med en kodon ATG, der koder for methionin sammen med andre kodende områder og proteiner. Hvis det udtrykte proteins 10 aminosekvens er kendt, kan det kodende områdes DNA-sekvens let genkendes.The coding region starts at the 5 'end with a codon ATG that encodes methionine along with other coding regions and proteins. If the amino acid sequence of the expressed protein 10 is known, the DNA sequence of the coding region can be readily recognized.

Umiddelbart "opstrøms" for ATG-kodonen findes den kodende del af messenger-RNA’et, foran hvilken promotorområdet ligger.Immediately "upstream" of the ATG codon is the coding portion of the messenger RNA in front of which the promoter region lies.

I ftg. 1A og IB er vist disse dele af den totale DNA-sekvens fra A. nidulans med 15 konventionéllé basenotationer. Den i Fig. 1A viste del indeholder promotorområdet og det kodende område fra a/cA-genet, som koder for enzymet alkohol-dehydrogenase I. Den i fig. IB viste del indeholder promotorområdet og det område, der koder for enzymet aldehyd-dehydrogenase, dvs. aldA. (I begge tilfælde betegner udtrykket "IVS" intervenerende sekvenser.) Aminosyresekvenserne for disse to enzymer er kendte i andre 20 arter. Ud fra disse er områderne 10 og 10' genkendelige som de kodende områder. Hvert kodende område starter ved 5'-enden ("opstrøms") med methionin-kodonen ATG ved 12.I ftg. 1A and 1B are shown these portions of the total A. nidulans DNA sequence with 15 conventional base notations. The one shown in FIG. 1A contains the promoter region and the coding region of the a / cA gene encoding the enzyme alcohol dehydrogenase I. The embodiment of FIG. IB shows the promoter region and the region encoding the enzyme aldehyde dehydrogenase, ie. ald. (In both cases, the term "IVS" denotes intervening sequences.) The amino acid sequences of these two enzymes are known in other 20 species. From these, regions 10 and 10 'are recognizable as the coding regions. Each coding region starts at the 5 'end ("upstream") with the methionine codon ATG at 12.

De relevante aminosyresekvenser, der indkodes af det protein-kodende område, er indsat under de respektive rækker i fig. 1A og IB med de konventionelle forkortelser.The relevant amino acid sequences encoded by the protein coding region are inserted below the respective rows of FIG. 1A and 1B with the conventional abbreviations.

Umiddelbart opstrøms for kodon 12 findes det område, der koder for messenger-RNA-25 leder- og promotor-området, hvis længde nu skal bestemmes eller i hvert fald bedømmes for at indeholde alle de essentielle strukturelementer, der gør det muligt for det at fungere som promotor. I hver af fig. 1A og IB er vist en sekvens på ca. 800 baser i hvert tilfælde opstrøms for ATG-kodonen 12.Immediately upstream of codon 12 is the region encoding the messenger RNA leader and promoter region, the length of which must now be determined or at least judged to contain all of the essential structural elements enabling it to function. as a promoter. In each of FIG. 1A and 1B are shown a sequence of ca. 800 bases in each case upstream of the ATG codon 12.

30 Det kan véd analogi med andre kendte promotorer forudsiges, at alle de funktionelle essentielle elementer sandsynligvis er indeholdt inden for en sekvens med en længde på ca. 1000 baser, formodentlig inden for de viste 800 baser, og mest sandsynligt inden for de første 200-300 baser, dvs. tilbage til omkring stilling 14 i fig. 1A og IB. En essentiel funktion for et promotorområde er at tilvejebringe et sted for nøjagtig 35 transkriptionsinitiering, hvilket vides at være en TATA-kassesekvens. En sådan sekvens findes ved 16 på a/cA-promotorsekvensen i fig. 1A og ved 16' på aldA - promotorsekvensen i fig. IB. En anden funktion for et promotorområde er at tilvejebringe en hensigtsmæssig DNA-sekvens, der er aktiv til regulering af gentranskriptionen, fx et bindingssted for et regulerende molekyle, som forøger gentranskriptionen, eller for at gøre genet aktivt eller 40 inaktivt. Sådanne regulerende områder findes inden for det i fig. 1A og IB viste promotorområde for henholdsvis alcA- og a/dA-generne.By analogy with other known promoters, it can be predicted that all of the functional essential elements are likely to be contained within a sequence of about length. 1000 bases, presumably within the 800 bases shown, and most likely within the first 200-300 bases, ie. back to about position 14 of FIG. 1A and 1B. An essential function of a promoter region is to provide a site for accurate transcription initiation, which is known to be a TATA cassette sequence. Such a sequence is found at 16 on the a / cA promoter sequence of FIG. 1A and at 16 'of the aldA promoter sequence of FIG. IB. Another function of a promoter region is to provide an appropriate DNA sequence that is active to regulate the gene transcription, e.g., a binding site for a regulatory molecule that enhances the gene transcription, or to render the gene active or inactive. Such regulatory regions are within the range shown in FIG. 1A and 1B showed promoter region for the alcA and a / dA genes, respectively.

Den nøjagtige opstrøms 5'-terminal af den DNA-sekvens, der her anvendes som promotorområde, er ikke kritisk, forudsat den omfatter de essentielle funktionelleThe exact upstream 5 'terminus of the DNA sequence used herein as a promoter region is not critical, provided it comprises the essential functional

I DK 175554 B1 II DK 175554 B1 I

I____________ __________________ 6 . ______________________________ - II____________ __________________ 6. ______________________________ - I

I sekvenser som beskrevet. Overskydende DNA-sekvenser opstrøms for 5’-terminalen er IIn sequences as described. Excess DNA sequences upstream of the 5 'terminal are I

I unødvendige, men er sandsynligvis ikke skadelige ved den foreliggende opfindelse. IUnnecessary but probably not harmful to the present invention. IN

I Nar udstrækningen af den sekvens, der indeholder alle de essentielle funktionelle II When the extension of the sequence containing all the essential functional I

I 5 elementer til at udgøre et promotorområde i et givet gen, er blevet bestemt ved de i II 5 elements to constitute a promoter region in a given gene have been determined by those in I

I nærværende beskrivelse beskrevne teknikker, er næste trin at spalte DNA-kæden på et IThe techniques described herein are the next step to cleave the DNA chain onto an I

I passende sted nedstrøms for promotorområde-terminalen og at fjerne det protein-kodende IConveniently downstream of the promoter region terminal and removing the protein-coding I

I område, hvilket hovedsageligt efterlader en sekvens, der omfatter promotorområdet og IIn region, essentially leaving a sequence comprising the promoter region and I

I undertiden en del af det område, der koder for messenger-RNA-lederen. Til dette formål IIn sometimes part of the area encoding the messenger RNA leader. For this purpose I

I 10 skal der lokaliseres hensigtsmæssigt anbragte restriktionssteder, hvorefter DNA'et IIn 10, appropriately located restriction sites must be located, after which the DNA I

I behandles med de hensigtsmæssige restriktionsenzymer til udførelse af spaltning. IYou are treated with the appropriate restriction enzymes to perform cleavage. IN

I Restriktionssteder er genkendelige fra den i fig. 1A viste a/cA-sekvens. Til opstrøms IIn Restriction sites are recognizable from the one shown in FIG. 1A a / cA sequence. Upstream I

I spaltning vælges der et sted tilstrækkeligt langt opstrøms til, at der i den bevarede del er IIn cleavage, a location is chosen sufficiently far upstream that in the preserved part you are

I omfattet alle de essentielle funktionelle steder for promotorområdet. Hvad angår IYou included all the essential functional sites for the promoter area. As for you

I 15 nedstrøms spaltning, findes der ikke noget restriktionssted nøjagtigt ved ATG-kodonen 12 i IIn downstream cleavage, no restriction site is exactly found at the ATG codon 12 in I

I tilfælde af alcA: Det nedstrøms restriktionssted, der er tættest derpå, er sekvensen IIn the case of alcA: The downstream restriction site closest to it is the sequence I

I GGGCCC ved 13, ved hvilket kæden kan spaltes med restriktionsenzymet Apal. Om ønsket IIn GGGCCC at 13, at which the chain can be cleaved with the restriction enzyme Apal. If desired I

I kan de tilbageværende nukleotider fra stilling 13 til stilling 12 efter en sådan skæring IYou can enter the remaining nucleotides from position 13 to position 12 after such intersection I

I trinvis fjernes under anvendelse af en exonuklease. Da antallet af sådanne nukleotider, der IStep by step using an exonuclease. Since the number of such nucleotides that I

I 20 skal fjernes, kendes, kan exonukleasens virkning standses på hensigtsmæssig måde, når II 20 must be removed, known, the effect of exonuclease can be appropriately halted when

stilling 12 er passeret. Ved at lokalisere et lignende restriktionssted nedstrøms for Iposition 12 is passed. By locating a similar restriction site downstream of I

I methionin-kodonen 12 i det a/dA-kodende område vist i fig. IB udskæres dette IIn the methionine codon 12 in the α / dA coding region shown in FIG. IB is cut this out

I promotorområde på lignende måde til efterfølgende anvendelse. I mange tilfælde er IIn promoter area similarly for subsequent use. In many cases, you are

resterende nukleotider ved promotorområdets 5'-terminal ikke skadelige for og griber ikke Iresidual nucleotides at the 5 'terminal of the promoter region are not deleterious and do not interfere

I 25 væsentligt ind i promotorområdets funktion, når blot basetripletternes læseramme er I25 substantially into the function of the promoter region when the base triplets reading frame is I

I bevaret. IIn the preserve. IN

I I fig. 2 på tegningen er i diagram vist trinnene i en fremgangsmåde til fremstilling af IIn FIG. 2 of the drawing, the steps of a process for producing I are shown in diagram

I plasmidet pDG6, som kan anvendes til at danne Asperg/7/us-transformanter ifølge den IIn the plasmid pDG6, which can be used to generate Asperg / 7 / u

I 30 foreliggende opfindelse. I fig. 2 er 18 et rekombinant plasmid indeholdende det IIn the present invention. In FIG. 2, 18 is a recombinant plasmid containing the I

I endogluconase-kodende (cellulase) område 30 fra bakterien Cellulomonas fimi, nemlig et IIn endogluconase coding (cellulase) region 30 from the bacterium Cellulomonas fimi, namely a

I SamHI-endoglucanase-fragment fra C. fimi i den kendte vektor M13MP8. Det indeholder IIn SamHI endoglucanase fragment from C. fimi in the known vector M13MP8. It contains you

I relevante restriktionssteder for fcoRI, HindlU og Sam HI som vist samt andre, der ikke er IIn relevant restriction sites for fcoRI, HindlU and Sam HI as shown and others not

I vist og ikke har betydning for nærværende fremgangsmåde. Henvisningsbetegnelse 20 er IIn shown and not relevant to the present method. Reference numeral 20 is I

I 35 et rekombinant plasmid betegnet p5, der er konstrueret ud fra det kendte E co//-plasmid IIn a recombinant plasmid designated p5, constructed from the known E co // plasmid I

I pBR322 og indeholder et EcoRI-fragment fra A. nidulans indeholdende a/cA- IIn pBR322 and contains an A. nidulans EcoRI fragment containing a / cA-I

I promotorområdet, der er fremstillet som beskrevet ovenfor, sammen med en lille del af IIn the promoter region prepared as described above, together with a small portion of I

I det a/cA-kodende område, herunder startkodonen ATG. Det har restriktionssteder som vist IIn the a / cA coding region, including the start codon ATG. It has restriction sites as shown in I

I samt andre restriktionssteder, der ikke anvendes ved den foreliggende fremgangsmåde og IAnd other restriction sites not used in the present method and

I 40 derfor ikke er vist. Plasmidet p5 indeholder en DNA-sekvens 22 fra EcoRI-stedet (3’) til II 40 therefore not shown. Plasmid p5 contains a DNA sequence 22 from the EcoRI site (3 ') to I

I /7/ndIII-stedet (5’), som faktisk er en del af den i fig. 1A i den øverste række viste sekvens IThe I / 7 / ndIII site (5 '), which is actually part of the one shown in FIG. 1A in the upper row shown sequence I

I fra stilling 15 (sekvensen GAATTC derved udgør et EcoRI-restriktionssted) til stilling 17. II from position 15 (the sequence GAATTC thereby constitutes an EcoRI restriction site) to position 17. I

I " Sekvensen 22 i plasmidet 20 har en længde på ca. 2 kb. IThe sequence 22 of plasmid 20 has a length of about 2 kb

7 DK 175554 B17 DK 175554 B1

Plasmiderne 18 og 20 skæres dernæst med restriktionsenzymerne EcoRI og Hindlll for at udskære a/cA-promotorområdet og det endoglucanase-kodende område 30, som ligeres til det med Hindlll spaltede plasmid pUC12 til dannelse af en ny konstruktion, pDG5A, der indeholder disse sekvenser på pUCl2 som vist i fig. 2. Plasmidet pUC12 er et kendt, 5 kommercielt tilgængeligt E. co//-plasmid, som replikerer effektivt i E. coli, således at der kan fremstilles rigelige kopier af pDG5A, hvis dette ønskes. Den nye konstruktion pDG5A isoleres fra de øvrige produkter i konstruktionspræparationen. Dernæst forsynes konstruktionen pDG5A med en selekterbar markør, således at senere vundne transformanter af Aspergillus, i hvilke konstruktionen med held er blevet indført, kan 10 selekteres og isoleres. I titfælde af ArgB'- Aspergillus-værter kan der til dette formål hensigtsmæssigt anvendes et ArgB-gen fra A. nidulans. ArgB-genet koder for enzymet ornithin-transcarbamylase, og stammer indeholdende dette gen kan let selekteres og isoleres fra ArgS'-stammer ved standardteknikker for udpladning og dyrkning. ArgB -stammer kan ikke gro på et medium uden arginin.Plasmids 18 and 20 are then cut with restriction enzymes EcoRI and HindIII to excise the α / cA promoter region and endoglucanase coding region 30 which are ligated to the HindIII cleaved plasmid pUC12 to form a novel construct, pDG5A, containing these sequences on pUC12 as shown in FIG. 2. The plasmid pUC12 is a known, 5 commercially available E. coli plasmid that efficiently replicates in E. coli, so that copious copies of pDG5A can be produced if desired. The new design pDG5A is isolated from the other products in the design preparation. Next, the construct pDG5A is provided with a selectable marker, so that later-acquired transformants of Aspergillus into which the construct has been successfully introduced can be selected and isolated. In the case of ArgB'-Aspergillus hosts, a ArgB gene from A. nidulans can conveniently be used for this purpose. The ArgB gene encodes the enzyme ornithine transcarbamylase, and strains containing this gene can be readily selected and isolated from ArgS 'strains by standard plating and culture techniques. ArgB strains cannot grow on a medium without arginine.

1515

Til inkorporering af en selekterbar markør kan konstruktionen pDG5A i denne udførelsesform for opfindelsen som vist i fig, 2 ligeres med Xbal-fragmentet 32 fra plasmidet pDG3 ATCC 53006 (jfr. USA-patentansøgning nr. 06/678.578, Buxton et al., indleveret 5. december 1984), som indeholder Arg8+-genet fra A. nidulans, under 20 anvendelse af Xbal, hvilket giver den nye konstruktion pDG6, som indeholder det endoglucanase-kodende område, a/cA-promotorsekvensen og ArgS-genet. Plasmidet pDG6 anvendes derefter ved transformationen til fremstilling af nye Aspergillus-mutantstammer, der indeholder et endoglucanase-kodende område, under kontrol af a/cA-promotoren, hvilket er beskrevet nærmere i eksempel 1.For incorporating a selectable marker, the construct pDG5A in this embodiment of the invention as shown in Fig. 2 can be ligated with the XbaI fragment 32 of plasmid pDG3 ATCC 53006 (cf. U.S. Patent Application No. 06 / 678,578, Buxton et al., Filed 5 December 1984), which contains the A. nidulans Arg8 + gene, using XbaI, giving the novel construct pDG6, which contains the endoglucanase coding region, the α / cA promoter sequence and the ArgS gene. The plasmid pDG6 is then used in the transformation to produce new Aspergillus mutant strains containing an endoglucanase coding region under the control of the α / cA promoter, which is described in more detail in Example 1.

25 I fig. 3 er i lineær form vist den diagrammatiske sekvens af den funktionelle del af konstruktionen pDG6 fra Hindlll-stedet 24 til HindHI-stedet 26. Det indeholder a/cA-promotorområdet 22, ATG-kodonen 12 og en lille resterende del af det a/cA-kodende område nedstrøms for ATG-kodonen so’m vist i fig. 1, efterfulgt af det cellulase-kodende 30 område 30 fra plasmidet 18.In FIG. 3 is shown in linear form the diagrammatic sequence of the functional part of construct pDG6 from HindIII site 24 to HindHI site 26. It contains a / cA promoter region 22, ATG codon 12 and a small residual portion of a / cA -coding region downstream of the ATG codon as shown in FIG. 1, followed by the cellulase-coding region 30 from plasmid 18.

Plasmidet pDG6 er blot ét eksempel på en vektor, som indeholder en filamentøs funguspromotor bundet til et protein-kodende område, som er fremmed for fungusen. I en anden vektor, der er eksemplificeret heri under henvisning til fig. 16, og som betegnes 35 pALCAlAMY, er den filamentøse funguspromotor fra a/cA-genet koblet til den naturligt forekommende sekvens, der koder for o-amylaseenzymet, et produkt, som er fremmed for den transformerede fungusvært. Proteinprodukterne fra vektorerne pDG6 og pALCAlAMY udtrykkes i begge tilfælde af de respektive transformerede værter. Da det a-amylase-kodende område naturligt indeholder et signalpeptid-kodende område, kan dette produkt 40 yderligere secerneres af den transformerede vært under anvendelse af værtens sekretionsmaskineri på trods af dets fremmede forhold til værten.The plasmid pDG6 is just one example of a vector containing a filamentous fungus promoter bound to a protein-coding region that is foreign to the fungus. In another vector exemplified herein with reference to FIG. 16, designated 35 pALCAlAMY, the filamentous fungus promoter from the a / cA gene is linked to the naturally occurring sequence encoding the o-amylase enzyme, a product foreign to the transformed fungus host. The protein products of the vectors pDG6 and pALCAlAMY are expressed in both cases by the respective transformed hosts. Since the α-amylase coding region naturally contains a signal peptide coding region, this product 40 can be further secreted by the transformed host using the host secretion machinery despite its foreign relationship with the host.

I DK 175554 B1 II DK 175554 B1 I

I _____________________8 _____________________ ________II _____________________8 _____________________ ________I

I Identifikation og isolering af promotorområderne i fllamentøse fungi gør det således muligt IThus, in identifying and isolating the promoter regions in filamentous fungi, I

I at manipulere værten ved transformation med vektorer, der indeholder disse IIn manipulating the host by transformation with vectors containing these I

I promotoromrider koblet til et ønsket kodende område. IIn promoter regions linked to a desired coding region. IN

I 5 Hvis det kodende område på vektoren kræver et signalpeptid-kodende område, eller den II 5 If the coding region of the vector requires a signal peptide coding region, or the I

I eksisterende signalsekvens skal erstattes med et andet, fortrinsvis mere effektivt IIn existing signal sequence must be replaced by another, preferably more efficient I

I signalpeptid-kodende område, kan sådanne signalpeptid-kodende områder integreres IIn signal peptide coding region, such signal peptide coding regions can be integrated

mellem promotoren og det segment, der koder for det secernerede protein. Plasmiderne Ibetween the promoter and the segment encoding the secreted protein. The plasmids I

I pGL2 (fig. 4) og pALCAlS (fig. 9) udgør mellem-kloningsvektorer, der er særligt egnede til IIn pGL2 (Fig. 4) and pALCAlS (Fig. 9), intermediate cloning vectors which are particularly suitable for I

I 10 dette formål. Hver kan fungere som en kassette og tilvejebringe en promotor, en IIn 10 this purpose. Each can act as a cassette and provide a promoter, an I

I signalsekvens og et restriktionssted nedstrøms for signalsekvensen, hvilket muliggør IIn signal sequence and a restriction site downstream of the signal sequence, enabling I

I indsætning af et protein-kodende område i korrekt transkriptionslæseramme med IIn inserting a protein-coding region into the correct transcription reading frame with I

I signalsekvensen. IIn the signal sequence. IN

I 15 Det i fig. 4 viste plasmid pGL2 er dannet ud fra pGLl, der indeholder promotoren 40, IIn FIG. 4, plasmid pGL2 is formed from pGL1 containing promoter 40, I

I signalsekvensen 42 og en indledende det 46 af glucoamylase-genet, som alle blev afledt i IIn the signal sequence 42 and an initial one 46 of the glucoamylase gene, all of which were derived in I

I ét segment fra A. niger-DNA ifølge heri eksemplificerede metoder. I dette segment findes IIn one segment of A. niger DNA according to methods exemplified herein. In this segment you will find

I der et SssHII-restriktionssted nær enden af, men dog inden for, glucoamylase- IThere is an SssHII restriction site near the end of, but within, the glucoamylase I site.

I signalsekvensen 42, hvis nukleotidsekvens er vist nedenfor i diagram 1. IIn the signal sequence 42, whose nucleotide sequence is shown below in diagram 1. I

I 20 II 20 I

I ~ Diagram 1 II ~ Diagram 1 I

I 5' ATG TCG TTC CGA TCT CTA CTC GCC CTG AGC GGC CTC GTC TGC II 5 'ATG TCG TTC CGA TCT CTA CTC GCC CTG AGC GGC CTC GTC TGC I

25« met set phe arg ser leu leu ala leu ser gly ley val cys I25 «met set phe arg ser leu leu ala leu ser gly ley val cys I

I BssH II II BssH II I

I II I

ACA GGG TTG GCA AAT GTG ATT TCC AAG CGC 3* IACA GGG TTG GCA AAT GTG ATT TCC AAG CGC 3 * I

I 30 thr gly leu ala asn val ile ser lys arg II 30 thr gly leu ala asn val ile ser lys arg I

I For at tilvejebringe et segment nedstrøms for signalsekvensen, dvs. en linker 44, som er i II To provide a segment downstream of the signal sequence, i.e. a linker 44 which is in I

I 35 stand til at modtage et protein-kodende område i læseramme med signalsekvensen 42, IAble to receive a protein-coding region in reading frame with signal sequence 42, I

udnyttes tilstedeværelsen af SssHII-stedet inde i signalsekvensen og Sstl-stedet Ithe presence of the SssHII site within the signal sequence and the Sstl site I are utilized

I nedstrøms derfor. I denne specifikke udførelsesform skæres segmentet 46 ud af pGLl og IIn downstream therefore. In this specific embodiment, segment 46 is cut from pGL1 and I

erstattes med én udvalgt linker ud af tre vist i fig. 5 og betegnet med A, B eller C. Hver Iis replaced by one selected linker out of three shown in FIG. 5 and denoted by A, B or C. Each I

I linker er i stand til at ligere med BssHll-enden og Sstl-enden. Linkerne er også udformet IThe linker is capable of aligning with the BssHll end and the Sstl end. The links are also designed

40 til at gendanne de terminale kodoner af signalsekvensen, som er gået tabt ved udskæring I40 to recover the terminal codons of the signal sequence lost by cut-out I

I af segmentet 46 med SssHII. Endvidere definerer hver linker unikke fcoRV- og II of segment 46 with SssHII. Furthermore, each linker defines unique fcoRV and I

BgliJ/Xho/J-steder inden for sin nukleotidsekvens, hvilket muliggør indsætning af det IBglI / Xho / J sites within its nucleotide sequence, allowing insertion of the I

I ønskede kodende område i vektoren pGL2. IIn the desired coding region of the vector pGL2. IN

9 DK 175554 B19 DK 175554 B1

Selektion af den egnede linker foretages med kendskab til i det mindste de første fi kodoner af det protein-kodende område, der skal indsættes i linkeren. For at det proteinkodende område kan translateres mærkbart, skal starten af det protein-kodende område enten være direkte koblet til eller være et specifikt antal nukleotider, dvs. i tripletter, fra 5 starten af signalsekvensen. Hvis det protein-kodende område, der skal indsættes, har ét eller to ikke-essentielle nukleotider (eller en ikke-tripletfaktor deraf) ved sit 5’-område, hvilket kan skyldes rutinemæssig udskæring, kan én af de i fig. 5 viste linkere følgelig kompensere for tilstedeværelsen af de ekstra, overflødige nukleotider og anbringe starten af det protein-kodende område i translationslæseramme med signalsekvensen.Selection of the appropriate linker is made with knowledge of at least the first five codons of the protein-coding region to be inserted into the linker. In order for the protein-coding region to be appreciably translated, the start of the protein-coding region must either be directly coupled to or be a specific number of nucleotides, i.e. in triplets, from the start of the signal sequence. If the protein-coding region to be inserted has one or two non-essential nucleotides (or a non-triplet factor thereof) at its 5 'region, which may be due to routine excision, one of the 5, the linkers shown thus compensate for the presence of the extra redundant nucleotides and place the start of the protein-coding region in translation reading frame with the signal sequence.

1010

De aminosyrerester, der indkodes af linkerne A, B og C, er vist under deres nukleotidsekvenser i fig. 5, hvoraf ses virkningen af tilsætning af et yderligere nukleotid til linkersekvensen på læserammen af linkeren og slutteligt på det indsatte protein-kodende område. Ved at udforme linkeme således, at restriktionsstedet altid er nedstrøms for 15 læserammemodifikationen, dvs. én, to eller tre adeninrester i linkerne henholdsvis A, B og C, kan læserammen af det kodende område, der indsættes i restriktionsstedet, bevares ved hensigtsmæssig linkerselektion.The amino acid residues encoded by linkers A, B and C are shown during their nucleotide sequences in FIG. 5, of which the effect of adding an additional nucleotide to the linker sequence is seen on the reading frame of the linker and finally on the inserted protein-coding region. By designing the links such that the restriction site is always downstream of the reading frame modification, ie. one, two or three adenine residues in the linkers A, B and C, respectively, the reading frame of the coding region inserted into the restriction site can be retained by appropriate linker selection.

Eksempler på plasmider, der benytter plasmidet pGL2 og specifikke linkersegmenter A, B 20 eller C, er pGL2BIFN, der anvender B-linkeren og resulterer i interferon α-2-sekretion, når det anvendes i filamentøse fungi, fx Aspergillus sp., transformation og pGL2CENDO, der anvender C-linkeren og resulterer i endoglucanase-sekretion, når sådanne filamentøse fungi transformeres med det.Examples of plasmids using the plasmid pGL2 and specific linker segments A, B 20 or C are pGL2BIFN which uses the B linker and results in interferon α-2 secretion when used in filamentous fungi, eg Aspergillus sp., Transformation and pGL2CENDO, which uses the C linker and results in endoglucanase secretion when such filamentous fungi are transformed with it.

25 Medens plasmidet pGL2 anvender en naturligt forekommende signalsekvens, ligger det inden for den foreliggende opfindelses rammer også at anvende vektorer, der indeholder syntetiske signalsekvenser. Et eksempel på en sådan vektor er pALCAlS, som i lighed med plasmidet pGL2 udgør en mellemvektor, i hvilken der kan indsættes et protein-kodende område til dannelse af en vektor, der kan transformere filamentøse fungi. I modsætning til 30 pGL2 anvender pALCAlS imidlertid a/oA-promotoren og benytter en syntetisk signalsekvens koblet til denne promotor. pALCAlS er vist i fig. 9, der viser et skema over dets fremstilling, og hvortil der henvises yderligere i eksemplerne. Eksempler på plasmider, der er dannet ud fra pALCAlS, er pALCAlSIFN, som resulterer i sekretion af · interferon a-2 fra en filamentøs fungus transformeret dermed, og pALCAlSENDO, som 35 resulterer i sekretion af endoglucanase fra en filamentøs fungusvært. I begge tilfælde opnås der sekretion på trods af, at det secernerede protein er fremmed i forhold til værten.While the plasmid pGL2 uses a naturally occurring signal sequence, it is within the scope of the present invention to also use vectors containing synthetic signal sequences. An example of such a vector is pALCA1S, which, like the plasmid pGL2, forms an intermediate vector into which a protein-coding region can be inserted to form a vector capable of transforming filamentous fungi. However, in contrast to 30 pGL2, pALCA1S utilizes the a / oA promoter and utilizes a synthetic signal sequence coupled to this promoter. pALCAlS is shown in FIG. 9, which shows a diagram of its preparation and to which reference is further made in the examples. Examples of plasmids formed from pALCA1S are pALCA1SIFN which results in secretion of interferon α-2 from a filamentous fungus transformed thereby, and pALCA1SENDO which results in secretion of endoglucanase from a filamentous fungus host. In both cases, secretion is achieved despite the fact that the secreted protein is foreign to the host.

Opfindelsen belyses nærmere ved nedenstående, ikke-begrænsénde eksempler.The invention is further illustrated by the following non-limiting examples.

4040

Hvert af nedenstående eksempler 1 og 2 er eksempler på vellykket transformation af en filamentøs fungusvært under anvendelse af vektorer, som har en fra en filamentøs fungus stammende promotor koblet til naturligt forekommende kodende områder, der ikke er fungale.Each of Examples 1 and 2 below are examples of successful transformation of a filamentous fungus host using vectors having a filamentous fungus-derived promoter coupled to naturally occurring non-fungal coding regions.

I DK 175554 B1 II DK 175554 B1 I

I __________________ io___________ _________________________ _____________ II __________________ io___________ _________________________ _____________ I

I EKSEMPEL 1 IIn Example 1 I

I Transformation af A nidulans under anvendelse af pDG6 ATCC 53169 {referenceeksempel) IIn Transformation of A nidulans Using pDG6 ATCC 53169 (Reference Example) I

I 5 Den i fig. 2 viste vektorkonstruktion pDG6 blev først fremstillet ved at følge det i fig. 2 II The embodiment of FIG. 2, the vector construction pDG6 was first prepared following that of FIG. 2 I

viste fremgangsmådeskema under anvendelse af standardteknikker til ligation og Ishowed the scheme of procedures using standard ligation techniques and I

I restriktion. Derefter blev konstruktionen pDG6 indført i argS'-mutantceller fra Aspergillus IIn restriction. Then, the construct pDG6 was introduced into Aspergillus I argS 'mutant cells

nidulans som følger: ^ Inidulans as follows: ^ I

I 10 500 ml komplet medium (Cove 1966) + 0,02% arginin + 10'5% biotin i en 2 liters konisk IIn 10,500 ml complete medium (Cove 1966) + 0.02% arginine + 10'5% biotin in a 2 liter conical I

kolbe blev inokuleret med 105konidier/ml af en A. nidulans argB'-stamme og inkuberet Iflask was inoculated with 105 conidia / ml of an A. nidulans argB 'strain and incubated I

I ved 30eC og med omrystning ved 250 omdr./minut i 20 timer. Myceliet blev høstet II at 30 ° C and shaking at 250 rpm for 20 hours. The mycelium was harvested

gennem Whatman-filterpapir nr. 54, vasket med sterilt deioniseret vand og suget tørre. Ithrough Whatman filter paper No. 54, washed with sterile deionized water and sucked dry. IN

I Myceliet blev sat til 50 ml filtersterilt 1,2M MgSO„, 10 mM kaliumphosphat, pH 5,8, i en ITo the Mycelium was added 50 ml of filter sterile 1.2M MgSO 4, 10mM potassium phosphate, pH 5.8, in a

I 15 250 ml's kolbe, hvortil var sat 20 mg Novozym 234 (Novo Enzyme Industries), 0,1 ml IIn 15 flasks of flask, to which was added 20 mg Novozym 234 (Novo Enzyme Industries), 0.1 ml I

I (=15.000 enheder) β-glucuronidase (Sigma) og 3 mg bovint serumalbumin for hvert gram II (= 15,000 units) β-glucuronidase (Sigma) and 3 mg bovine serum albumin for each gram I

I mycelium. Spaltningen lodes forløbe ved 37°C under let omrystning i 50-70 minutter, idet IIn mycelium. The cleavage was allowed to proceed at 37 ° C with light shaking for 50-70 minutes, with I

I der periodisk blev kontrolleret for sfæroplast-dannelse ved hjælp af et lysmikroskop. 50 ml IIn it, periodically checked for spheroplast formation by means of a light microscope. 50 ml I

I sterilt deioniseret vand blev tilsat, og sfaeroplasterne blev skilt fra ikke-spaltede IIn sterile deionized water was added and the spheroplasts were separated from non-cleaved I

I 20 fragmenter ved filtrering gennem 30 pm nylonsigter og høstet ved centrifugering ved 2500 IIn 20 fragments by filtration through 30 µm nylon screens and harvested by centrifugation at 2500 L

I x g i 5 minutter i en udsvingsrotor ("swing out rotor") i 50 ml’s reagensglas med konisk II x g for 5 minutes in a swing out rotor in 50 ml conical I tube glass

I bund og ved stuetemperatur. Sfaeroplasterne blev vasket ved resuspendering og IAt bottom and at room temperature. The spheroplasts were washed by resuspending and I

I centrifugering 2 gange i 10 ml 0,6M KCI. Antallet af sfæroplaster blev bestemt med et IIn centrifugation 2 times in 10 ml of 0.6M KCl. The number of spherical patches was determined with an I

hæmocytometer, og de blev resuspenderet i en slutkoncentration pi 108/ml i ι,2Μ Ihemocytometer and resuspended at a final concentration of 108 µl in ι, 2Μ I

I 25 sorbitol, 10 mM Tris/HCI, 10 mM CaCI2, pH 7,5. Alikvoter på 0,4 ml blev anbragt i plastrør, IIn sorbitol, 10 mM Tris / HCl, 10 mM CaCl 2, pH 7.5. 0.4 ml aliquots were placed in plastic tubes, I

I hvortil der sattes DNA fra pDG6 (samlet volumen 40 μ! i 10 mM Tris/HCI, l mM EDTA, pH IInto which was added DNA from pDG6 (total volume 40 µl in 10 mM Tris / HCl, 1 mM EDTA, pH I

8), og der blev inkuberet ved stuetemperatur i 25 minutter. Alikvoter på 0,4 ml, 0,4 ml og I8) and incubated at room temperature for 25 minutes. Aliquots of 0.4 ml, 0.4 ml and I

I derefter 1,6 ml 60%’s PEG4000, 10 mM Tris/HCI, 10 mM CaCI2, pH 7,5, blev sat til hvert IThen 1.6 ml of 60% PEG4000, 10 mM Tris / HCl, 10 mM CaCl 2, pH 7.5, was added to each I

rør sekventielt under let, men grunding blanding mellem hver tilsætning, efterfulgt af Istir sequentially under light but priming mixture between each addition, followed by I

I 30 yderligere inkubation ved stuetemperatur i 20 minutter. De transformerede sfæroplaster IFor 30 further incubation at room temperature for 20 minutes. The transformed sphere patches I

blev derefter sat til hensigtsmæssigt berigede minimalmedier 1%’s agaroverlejringer, plus Iwas then added to appropriately enriched minimal media 1% agar overlays, plus I

eller minus 0,6M KCI ved 45°C, og blev umiddelbart hældt ud i identiske (men kolde) Ior minus 0.6M KCI at 45 ° C, and was immediately poured into identical (but cold) I

I medier på plader. Efter 3-5 dage ved 37°C blev antallet af voksende kolonier talt (F. IIn media on plates. After 3-5 days at 37 ° C, the number of growing colonies was counted (F. I

I Buxton et al., "Gene 37, 1985, s. 207-214). Fremgangsmåden beskrevet af Yelton et al. IIn Buxton et al., "Gene 37, 1985, pp. 207-214). The method described by Yelton et al.

35 ("Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81, 1980, s. 1370-1374) blev også anvendt. I35 ("Proc. Natl. Acad. Sci. USA 81, 1980, pp. 1370-1374) was also used.

I Kolonierne blev opdelt i to grupper. Threonin (11,9 g/liter) og fructose (1 g/liter) blev sat IIn the Colonies were divided into two groups. Threonine (11.9 g / L) and fructose (1 g / L) were added

I til inkubationsmediet i den ene gruppe til induktion af det deri inkorporerede cellulasegen. II to the incubation medium in one group to induce the cellulase gene incorporated therein. IN

I Der blev ikke sat inducer til den anden gruppe, som blev deaktiveret ved dyrkning på INo inducer was added to the other group which was deactivated by cultivation on I

I 40 minimalmedier med glucose som den eneste carbonkilde. Begge grupper blev analyseret IIn 40 minimal media with glucose as the only carbon source. Both groups were analyzed

I for generel proteinproduktion ved hjælp af et BioRad-Assay efterfulgt af dyrkning, filtrering II for general protein production using a BioRad Assay followed by culture, filtration I

I for at skille myceliet fra, frysetørring, formaling og proteinekstraktion med 20 mM Tris/HCI II to separate the mycelium, freeze drying, milling and protein extraction with 20 mM Tris / HCl I

I ved pH 7. II at pH 7. I

11 DK 175554 B111 DK 175554 B1

For at teste for cellulasedannelse blev der fremstillet plader af agarmedium indeholdende cellulase (9 g/liter, carboxymethylcellulose), og små stykker af glasfiberfiltermateriale, der var isoleret fra hinanden, og 75 μ9 totalt protein fra én af transkonjuganterne blev sat til hvert af filtrene. Pladerne blev inkuberet natten over ved 37°C. Filtrene blev derpå jernet 5 og pladerne farvet med congo-rødt for at bestemme de steder, hvor cellulase havde været til stede i det totale protein på filtrene, hvilket fremgår ved nedbrydning af cellulase i agarmediet nedenunder. Pladerne blev affarvet ved vask med 5M NaCI i vand for på synlig mide at detektere forskellene.To test for cellulase formation, plates of agar medium containing cellulase (9 g / liter, carboxymethyl cellulose) and small pieces of fiberglass filter material isolated from each other were prepared and 75 μ9 total protein from one of the transconjugants was added to each of the filters. The plates were incubated overnight at 37 ° C. The filters were then ironed 5 and the plates stained with congo red to determine the locations where cellulase had been present in the total protein on the filters, as evidenced by cellulase degradation in the agar medium below. The plates were decolorized by washing with 5M NaCl in water to detect visible differences.

10 Af fire transformanter, der var Induceret med threonin og fructose, viste tre klart tilstedeværelse af cellulase i det totale proteinprodukt. De ikke-inducerede, glucose-deaktiverede transformanter viste ikke tegn på cellulaseproduktion.10 Of four transformants Induced with threonine and fructose, three showed clear presence of cellulase in the total protein product. The uninduced glucose-deactivated transformants showed no evidence of cellulase production.

Tre kontroltransformanter blev også fremstillet af samme vektorsystem og stammer, men 15 under udeladelse af promotorsekvensen. Ingen af dem producerede cellulase med eller uden inducere. Tilstedeværelsen af det C. /7m/-endoglucanase-kodende område blev verificeret ved, at medium fra threonin-inducerede transformerede stammer udviste reaktivitet med et monoklonalt antistof dyrket mod C. ffm/-endoglucanase. Dette monoklonale antistof udviste ingen krydsreaktivitet med endogene A. nidulans-proteiner i 20 kontrolstammer.Three control transformants were also made from the same vector system and strains, but 15 omitting the promoter sequence. None of them produced cellulase with or without inducers. The presence of the C / 7m β -endoglucanase coding region was verified by the fact that medium from threonine-induced transformed strains exhibited reactivity with a monoclonal antibody grown against C. ffm / endoglucanase. This monoclonal antibody showed no cross-reactivity with endogenous A. nidulans proteins in 20 control strains.

EKSEMPEL 2 25 Transformation af A. nidulans under anvendelse af pALCAlAMY ATCC 53380 (referenceeksempel)Example 2 Transformation of A. nidulans using pALCAlAMY ATCC 53380 (Reference Example)

Vektorkonstruktionen pALCAlAMY blev fremstillet som vist i fig. 16 under anvendelse af rutinemæssige standardteknikker til ligation og restriktion. Under henvisning til fig. 16 blev 30 vektoren indeholdende et W/ncflll-EcoRI-segment, hvori A. nidulans-alkohol- dehydrogenase I-promotoren 22 befinder sig (som beskrevet tidligere), skåret ved EcoRl-stedet til indsætning af det kodende område af hvede-a-amylasegenet 72, der er indeholdt i et EcoRI-EcoRI-fragment defineret på plasmidet p501 (jfr. S J. Rothstein et al., "Nature 308, 1984, s. 662-665). Eftersom hvede-a-amylase er et naturligt secerneret protein, 35 indeholder dets kodende område 72 et signalpeptid-kodende område 76 og et segment 78, der koder for modent, secerneret a-amylase. Ligation af det kodende område 72 indeholdt i EcoRl-EcoRI-segmentet fra p501 inden for det med EcoRI spaltede sted i pALCAl giver plasmidet pALCAlAMY, i hvilket "AlcA-promotoren 22 er operativt forbundet med det a-amylase-kodende område. Den korrekte orientering af det fra p50l stammende a-40 amyiase-kodende område i pALCAlAMY bekræftes ved sekventering hen over ligationsstedet ifølge standardprocedurer. Nukleotidsekvensen af forbindelsen mellem promotorområdet og det kodende område er vist i fig. 17.The vector construct pALCAlAMY was prepared as shown in FIG. 16 using routine standard ligation and restriction techniques. Referring to FIG. 16, the vector containing a W / ncfIII EcoRI segment in which the A. nidulans alcohol dehydrogenase I promoter 22 is located (as described previously) was cut at the EcoR1 site to insert the coding region of wheat α The amylase gene 72 contained in an EcoRI-EcoRI fragment defined on plasmid p501 (cf. S. J. Rothstein et al., "Nature 308, 1984, pp. 662-665). Since wheat α-amylase is a natural secreted protein 35, its coding region 72 contains a signal peptide coding region 76 and a segment 78 encoding mature, secreted α-amylase. Ligation of the coding region 72 contained in the EcoR1 EcoRI segment of p501 within that of EcoRI cleaved site in pALCA1 gives the plasmid pALCAlAMY, in which the "AlcA promoter 22 is operatively linked to the α-amylase coding region. The correct orientation of the α-40 amylase-coding region derived from p50l in pALCAlAMY is confirmed by sequencing across the ligation site according to standard procedures. The nucleotide sequence of the link between the promoter region and the coding region is shown in FIG. 17th

iin

I DK 175554 B1 II DK 175554 B1 I

I _____________________12 ____________________________ II _____________________12 ____________________________ I

I A. nidulans kan transformeres ved den i eksempel 1 beskrevne procedure, idet prøver af IA. nidulans can be transformed by the procedure described in Example 1, with samples of I

I ekstracellulært medium tages fra og påføres pi glasfiberfilterpapirer anbragt på 1%'s IIn extracellular medium, glass fiber filter papers applied to 1% of

I opløseligt stivelsesagar. Filtrene fjernes efter 8 timer ved 37°C og vendes om på IIn soluble starch agar. The filters are removed after 8 hours at 37 ° C and reversed on I

I bægerglas indeholdende fast iod {i et 50°C varmt vandbad). Klare pletter er tegn på IIn beaker containing solid iodine (in a 50 ° C hot water bath). Clear spots are signs of I

I 5 stivelsesnedbrydning, medens den øvrige stivelse bliver dybt purpurrød, hvilket bekræfter IIn 5 starch degradation, while the other starch turns deep purple, confirming I

I tilstedeværelsen af secerneret α-amylase. IIn the presence of secreted α-amylase. IN

I I nedenstående eksempel 3-12 tilvejebringes der vektorer, i hvilke der i vektoren indføres IIn Examples 3-12 below, vectors are provided which introduce into the vector

I et sekretionssignalpeptid-kodende område for at opnå sekretion af et fremmed protein fra IIn a secretion signal peptide coding region to obtain secretion of a foreign protein from I

I 10 en filamentøs fungus transformeret med hele vektoren. IIn 10 a filamentous fungus transformed with the whole vector. IN

I EKSEMPEL 3 IIn Example 3 I

I 15 Fremstilling af plasmidet pGL2, en mellemvektor IPreparation of the plasmid pGL2, an intermediate vector I

I A) Kilde til promotor og signalpeptidsekvens ISource of promoter and signal peptide sequence I

Giucoamylase-genet fra A. niger blev isoleret ved undersøgelse af en genbank stammende IThe Giucoamylase gene from A. niger was isolated by examination of a gene bank originating in I

I 20 fra DNA, der var tilgængeligt i en stamme af denne mikroorganisme, der er deponeret hos II from DNA available in a strain of this microorganism deposited with I

I ATCC under deponeringsnummeret 22343. Undersøgelsen blev udført under anvendelse af IIn the ATCC under the deposit number 22343. The study was conducted using I

I oligonukleotidprober fremstillet med Biosearch-oligonukleotidsyntese-udstyr og med IIn oligonucleotide probes made with Biosearch oligonucleotide synthesis equipment and with I

I kendskab til den publicerede aminosyresekvens af glucoamylase-proteinet. Dataene for IKnowing the published amino acid sequence of the glucoamylase protein. The data for I

I aminosyresekvensen blev "tilbagetranslateret" til nukleotidsekvensdata, og proberne blev IIn the amino acid sequence was "back-translated" to nucleotide sequence data and the probes were

I 25 syntetiseret. Den bestemte genbank, der blev undersøgt, var et med Sau3A delvis spaltet IIn 25 synthesized. The particular gene bank under investigation was one with Sau3A partially cleaved I

I produkt fra det ovenfor beskrevne A. niger-DNA klonet i SamHI-stedet på det kommercielt IIn product of the above described A. niger DNA cloned into the SamHI site of the commercial I

I tilgængelige plasmid pUC12, som både er levedygtigt i og replikerbart i E. coti. IIn available plasmid pUC12, which is both viable and replicable in E. coti. IN

I Et tf/ncflll-fig/II-DNA-stykke indeholdende giucoamylase-genet blev subklonet i pUC12. IIn a tf / ncfIII-fig / II DNA piece containing the giucoamylase gene was subcloned into pUC12. IN

I 30 Derefter blev placeringen af det ønskede promotorområde, det signalpeptid-kodende IThen, the location of the desired promoter region, the signal peptide-coding I, became

I område og det protein-kodende område for glucoamylase identificeret i pUC12 IIn region and the protein-coding region for glucoamylase identified in pUC12 I

I indeholdende det subklonede fragment. £coRI/£coRI-fragmentet (se fig. 4) viste sig at IIn containing the subcloned fragment. The £ coRI / £ coRI fragment (see Fig. 4) showed that I

I indeholde en lang, åben translationslæseramme, når det blev sekventeret, og IYou include a long, open translation reading frame when sequenced, and I

I sekvensdataene blev analyseret under anvendelse af sekvensanalyseprogrammer fra IIn the sequence data were analyzed using sequence analysis programs from I

I 35 Wisconsin Universitet. IIn 35 Wisconsin University. IN

I I fig. 6 er vist resultater af analyse af nukleotidsekvensen af en del af området af IIn FIG. 6, results of analysis of the nucleotide sequence of part of the region of I are shown

I giucoamylase-genet mellem 5' EcoRI-stedet og 3' SssHII-stedet inden for Hindlll-BgUl- IIn the giucoamylase gene between the 5 'EcoRI site and the 3' SssHII site within HindIII-BgU1-1

I fragmentet. Dette område indeholder glucoamylase-promotoren og det signalpeptid- IIn the fragment. This region contains the glucoamylase promoter and the signal peptide I

I 40 kodende område. IIn 40 coding range. IN

I Inden for dette fragment, dvs. ved nukleotiderne 97-102, findes en "TATA-kasse" 48, der IWithin this fragment, i.e. at nucleotides 97-102, there is a "TATA box" 48 which I

I tilvejebringer et sted, som kræves af mange eukaryote promotorområder til nøjagtig IYou provide a site required by many eukaryotic promoter regions to exactly I

I transkriptionsinitiering (formodentlig et RNA-polymerase Il-bindingssted). Følgelig IIn transcription initiation (presumably an RNA polymerase II binding site). Accordingly, I

13 DK 175554 B1 bekræftes tilstedeværelsen af i det mindste en del af promotorområdet. Det kan endvidere ved analogi med andre kendte promotorområder forudsiges, at alle de funktionelle essentielle elementer sandsynligvis er indeholdt inden for en sekvens med en længde pi ca. 1000 baser og mest sandsynligt inden for de første 200 baser opstrøms for 5 startkodonen for det kodende område, dvs. nukleotiderne 206-208 eller "ATG" 49, kodonen for methionin. Promotoren og transkript-lederen ender således ved nukleotid 205. Identiteten af begyndelsen af promotorområdet er mindre vigtig, selv om promotorområdet skal indeholde RNA-polymerase Π-bindingsstedet og alle de øvrige elementer, der kræves, for at det fungerer. Medens £coRI-£?coRI-segmentet antages at 10 udgøre hele promotorområdet i glucoamylase-genet, indeholder det i plasmidet pGL2 anvendte plasmid således dette fragment i det meget større H/ncflll-SamHI/Bg/II-segment, hvilket sikrer, at hele promotoromridet korrekt inkluderes i det resulterende plasmid.The presence of at least part of the promoter region is confirmed. Further, by analogy with other known promoter regions, it can be predicted that all of the functional essential elements are likely to be contained within a sequence of length pi. 1000 bases and most likely within the first 200 bases upstream of the start codon for the coding region, i.e. nucleotides 206-208 or "ATG" 49, the codon for methionine. Thus, the promoter and transcript leader end at nucleotide 205. The identity of the beginning of the promoter region is less important, although the promoter region must contain the RNA polymerase Π binding site and all the other elements required for it to function. Thus, while the βcoRI-βCORI segment is thought to constitute the entire promoter region of the glucoamylase gene, the plasmid used in plasmid pGL2 contains this fragment in the much larger H / ncfIII-SamHI / Bg / II segment, ensuring that the entire promoter range is properly included in the resulting plasmid.

Da aminosyresekvensen for moden glucoamylase er kendt (jfr. Svensson et al., 15 Characterization of two forms of glucoamylase from Aspergillus niger, Carlsberg Res.As the amino acid sequence of mature glucoamylase is known (cf. Svensson et al., 15 Characterization of two forms of glucoamylase from Aspergillus niger, Carlsberg Res.

Commun. 47, 1982, s. 55-69), kan en nukleotidsekvens for signalpeptidet bestemmes nøjagtigt. Det signalpeptid-kodende område i gener, der koder for secernerede proteiner, vides at starte med methioninresten, der indkodes af ATG-kodonen 49. Bestemmelse af en tilstrækkelig stor indledende del af nukleotidsekvensen 3' efter ATG-kodonen, giver 20 informationer, ud fra hvilke aminosyresekvensen af denne del kan bestemmes. Ved sammenligning af denne aminosyresekvens med den publicerede aminosyresekvens kan signalpeptidet identificeres som den del af glucoamylase-genet, som ikke har noget modstykke i den publicerede sekvens, hvormed den blev sammenlignet. Det heri definerede glucoamylase-signalpeptid-kodende område er tidligere blevet bekræftet ved 25 denne metode.Commun. 47, 1982, pp. 55-69), a nucleotide sequence of the signal peptide can be accurately determined. The signal peptide-coding region of genes encoding secreted proteins is known to start with the methionine residue encoded by the ATG codon 49. Determination of a sufficiently large initial portion of the nucleotide sequence 3 'after the ATG codon provides 20 information, based on which amino acid sequence of this moiety can be determined. By comparing this amino acid sequence with the published amino acid sequence, the signal peptide can be identified as the portion of the glucoamylase gene which has no counterpart in the published sequence with which it was compared. The glucoamylase signal peptide coding region defined herein has been previously confirmed by this method.

Ved ovennævnte metoder blev det bekræftet, at W/nc/III-BamHI/Bg/II-fragmentet, der resulterede fra delvis Sau3A-spaltning og var inkorporeret i pUC12, indeholdt følgende elementer fra glucoamylase-genet: en indledende, måske irrelevant, sektion, 30 promotorområdet, det signalpeptid-kodende område og den resterende del af det kodende område. Dette fragment, indsat i plasmidet pUC12 ved spaltning med Hindlll og Bamhl/Bgltl og ligation, er vist skematisk i fig. 4 som plasmidet pGLl. Dette plasmid indeholder alle de elementer, der er nødvendige til replikation og lignende, således at det forbliver selekterbart og replikerbart i E. coli.The above methods confirmed that the W / nc / III-BamHI / Bg / II fragment resulting from partial Sau3A cleavage and incorporated into pUC12 contained the following elements of the glucoamylase gene: an initial, perhaps irrelevant, section , The promoter region, the signal peptide coding region, and the remaining portion of the coding region. This fragment, inserted into the plasmid pUC12 by cleavage with HindIII and Bamhl / BglII and ligation, is shown schematically in FIG. 4 as the plasmid pGL1. This plasmid contains all the elements necessary for replication and the like, so that it remains selectable and replicable in E. coli.

35 B) Konstruktion af plasmidet pGL2B) Construction of the plasmid pGL2

Under anvendelse af pGLl som precursor kan der som vist i fig. 4 fremstilles plasmidvektoren pGL2. Restriktionsstedet SssHII nær ved 3'-enden af signalsekvensen 42 40 anvendes sammen med det unikke nedstrøms Ssfl-sted til indsætning af en syntetisk linkersekvens A, B eller C som defineret i fig. 5. pGLl spaltes således med både BssHII og Sst, hvilket fjerner den indledende del af det giucoamylase-kodende område 46, der er indeholdt deri. Derefter indsættes og ligeres en udvalgt sekvens af de syntetiske linkersekvenser A-C, som er udformet således, at de er omgivet af BssHIl/Sstl-kompatible ____Using pGL1 as a precursor, as shown in FIG. 4, the plasmid vector pGL2 is produced. The restriction site SssHII near the 3 'end of signal sequence 42 40 is used in conjunction with the unique downstream Ssfl site for insertion of a synthetic linker sequence A, B or C as defined in FIG. Thus, pGL1 is cleaved with both BssHII and Sst, removing the initial portion of the giucoamylase coding region 46 contained therein. Then, a selected sequence of the synthetic linker A-C sequences inserted and ligated to be surrounded by BssHIl / Sstl compatible ____ is inserted and ligated.

I DK 175554 B1 II DK 175554 B1 I

I _____________14 _______________________________ II _____________14 _______________________________ I

ender, hvilket frembringer plasmidet pGL2. Afhængigt af, hvilken af de tre linkersekvenser, Iends, producing the plasmid pGL2. Depending on which of the three linker sequences, I

I der anvendes, dvs. A, B eller C, identificeres det resulterende plasmid som henholdsvis IIn use, i.e. A, B or C, the resulting plasmid is identified as I, respectively

I pGL2A, pGL2B eller pGL2C. IIn pGL2A, pGL2B or pGL2C. IN

I 5 De heri identificerede syntetiske linkersekvenser er hver forsynet med unikke EcoRV- og IThe synthetic linker sequences identified herein are each provided with unique EcoRV and I

I Eg/II-restriktionssteder som vist i fig. 5, i hvilke der kan indsættes et ønsket protein- IIn Eg / II restriction sites as shown in FIG. 5 in which a desired protein I can be inserted

I kodende område. Efter indsætningen kan det resulterende plasmid anvendes til at IIn coding area. After insertion, the resulting plasmid can be used to I

I transformere en vært, fx A. niger, A. nidulans og lignende. Tilstedeværelsen af IIn transforming a host, e.g., A. niger, A. nidulans and the like. The presence of I

I promotorområdet og det signalpeptid-kodende område, som begge genkendes af værten, IIn the promoter region and the signal peptide coding region, both recognized by the host, I

I 10 giver et middel, ved hjælp af hvilket ekspression af det protein-kodende område og II 10 provides a means by which expression of the protein coding region and I

I sekretion af det således udtrykte protein gøres mulig. IIn secretion of the protein thus expressed is made possible. IN

I EKSEMPEL 4 IIn Example 4 I

I 15 II 15 I

I Anvendelse af plasmidet pGL2 til fremstilling af pGL2BIFN II Use of the plasmid pGL2 to produce pGL2BIFN I

I Et eksempel på anvendeligheden af plasmidet pGL2 er beskrevet nedenfor under IAn example of the utility of the plasmid pGL2 is described below under I

I henvisning til fig. 7, der skematisk viser konstruktionen af plasmidet pGL2BIFN ud fra IReferring to FIG. 7, schematically showing the construction of the plasmid pGL2BIFN from I

I 20 pGL2B. IIn 20 pGL2B. IN

I Plasmidet pGL2B fremstilles som beskrevet generelt ovenfor for pGL2 med den undtagelse, IThe plasmid pGL2B is prepared as described generally for pGL2 with the exception of I

I at den i fig. 5 viste syntetiske linkersekvens "B" indsættes specifikt. IIn that the embodiment of FIG. 5, the synthetic linker sequence "B" is specifically inserted. IN

I Henvisningsbetegnelsen 44 er følgelig ændret i fig. 7 til "44B'\ For at tilvejebringe en IAccordingly, in the reference numeral 44 is changed in FIG. 7 to "44B '\ To provide an I

I 25 åbning i vektoren pGL2B skæres plasmidet med EcoRV ved stedet inde i linkeren 44B. IAt 25 opening in the vector pGL2B, the plasmid is cut with EcoRV at the site inside linker 44B. IN

I Skæringen medfører stumpe ender, som kan ligeres med et fragment, der flankeres af IIn the Cut, blunt ends result, which can be ligated to a fragment flanked by I

I stumpe ender, under anvendelse af ligaser, der vides at være nyttige til dette specifikke IAt blunt ends, using ligases known to be useful for this specific I

I formål. IIn purpose. IN

I 30 I den i fig. 7 viste udførelsesform indsættes et fragment 60 indeholdende det kodende IIn the embodiment of FIG. 7, a fragment 60 containing the coding I is inserted

I område for humant interferon a-2 til dannelse af pGL2BIFN. Et Ddel-BamHI-fragment 60 IIn the region of human interferon α-2 to form pGL2BIFN. A Ddel-BamHI fragment 60 I

I indeholdende det kodende område for humant interferon a-2 blev specifikt skåret ud fra ISpecifically, in the coding region for human interferon α-2 was excised

I plasmidet pN5H8 (ikke vist) på basis af dette gens kendte sekvens og restriktionskort. IIn the plasmid pN5H8 (not shown) on the basis of this gene's known sequence and restriction map. IN

I 35 Plasmidet pN5H8 kombinerer det kendte plasmid pAT153 med interferon-genet ved et IIn plasmid pN5H8, the known plasmid pAT153 combines with the interferon gene at an I

I SamHI-sted. Interferon-genet deri er beskrevet af Siocomb et al., "High level expression of IIn SamHI place. The interferon gene therein is described by Siocomb et al., "High level expression of I

I an interferon a-2 gene cloned in phage M13mp7 and subsequent purification with a IAn interferon a-2 gene cloned into phage M13mp7 and subsequent purification with an I

monoclonal antibody”, Proceedings of the National Academy of Sciences USA 79, 1982, s. Imonoclonal antibody ”, Proceedings of the National Academy of Sciences USA 79, 1982, p

I 5455-5459. II 5455-5459. IN

I 40 II 40 I

I For at sammenføje hæfteenderne af interferon-fragmentet i det spaltede EcoRV-sted i ITo join the adhesive ends of the interferon fragment in the cleaved EcoRV site of I

I pGL2B udfyldes Odel- og SamHI-hæfteenderne under anvendelse af revers transkriptase IIn pGL2B, the Odel and SamHI adhesive ends are filled using reverse transcriptase I

I og ligeres ved hjælp af en hensigtsmæssig ligase under anvendelse af standardteknikker. II and ligated by an appropriate ligase using standard techniques. IN

15 DK 175554 B115 DK 175554 B1

Fordelen ved at vælge linkersekvensen B til indsætning i pGL2 fremgår af fig. 8, som viser læserammen af det interferon α-2-kodende område og dets forhold til den genskabte signalpeptidsekvens med hensyn til nukleotidsekvens og aminosyresekvens, hvis det er hensigtsmæssigt.The advantage of selecting the linker sequence B for insertion into pGL2 is shown in FIG. 8, which shows the reading frame of the interferon α-2 coding region and its relationship to the restored signal peptide sequence with respect to nucleotide sequence and amino acid sequence, if appropriate.

55

Fig. 8 viser en del af promotorområdet 40 5' i forhold til signalsekvensen forbundet til en IFIG. 8 shows part of the promoter region 40 5 'relative to the signal sequence associated with an I

del af glucoamylase-signalpeptidsekvensen 42, der begynder med methionlnkodonen ATG ved 49 og ender med lysinkodonen AAG ved 50. Selv om det signalpeptid-kodende område strækker sig én rest længere, dvs. til CGC-kodonen for arginin ved 52, er denne 10 sidstnævnte rest i realiteten omfattet af den syntetiske linkersekvens 44B, der er manipuleret således, at der kompenseres for tabet af argininresten under skæring og ligation til indsætning af linkersekvensen. På denne måde forstyrres den genetiske sekvens af signalet ikke.part of the glucoamylase signal peptide sequence 42, beginning with the methionine codon ATG at 49 and ending with the lysine codon AAG at 50. Although the signal peptide coding region extends one residue further, i. to the CGC codon for arginine at 52, this latter residue is in fact comprised of the synthetic linker sequence 44B, which is engineered to compensate for the loss of the arginine residue during cutting and ligation to insert the linker sequence. In this way, the genetic sequence of the signal is not disturbed.

15 På lignende måde sørger linkersekvensen for indsætning af det interferon α-2-kodende område uden at ændre dets læseramme. Under henvisning til fig. 7 og 8 resulterer spaltning af linkersekvensen 44B med EcoRV i linkerfragmenterne 44B' og 44B", der har stumpe ender. Udskæring af det interferon α-2-kodende område ved Odel-stedet resulterer efter udfyldning af de af enzymet dannede hæfteender i den ønskede 20 nukleotidsekvens uden at skade dette kodende områdes sekvens. Ligation inden for den med EcoRV spaltede linkersekvens af interferonsekvensen udfyldt ved Odel-stedet bevarer den naturlige læseramme af det interferon-kodende område, hvilket ses ved tripletkodon-tilstanden mellem linkerdelen 44B’ og det interferon-kodende område 60. Hvis den i fig. 5 viste linker A var blevet valgt, hvilken linker bærer ét nukleotid mindre end linkeren B, ville 25 hele læserammen være blevet forskudt med ét nukleotid, hvilket ville medføre en meningsløs sekvens. Ved at vælge den syntetiske linker B gøres kodoner tilgængelige mellem signal peptidsekvensen og det interferon-kodende område, hvilket ikke ændrer læserammen for det kodende område, når IF α-2-fragmentet med stumpe ender er orienteret korrekt. Den korrekte orientering selekteres ved at sekventere kloner med 30 indsætninger tværs over ligationsforbindelsen.Similarly, the linker sequence provides for insertion of the interferon α-2 coding region without altering its reading frame. Referring to FIG. 7 and 8, cleavage of the linker sequence 44B with EcoRV results in linker fragments 44B 'and 44B "having blunt ends. Excision of the interferon α-2 coding region at the Odel site results after filling in the adhesive ends formed by the enzyme at the desired end. nucleotide sequence without damaging the sequence of this coding region. area 60. If the linker A shown in Figure 5 had been selected which carries one nucleotide less than linker B, then the entire reading frame would have been displaced by one nucleotide, which would result in a meaningless sequence. B, codons are made available between the signal peptide sequence and the interferon coding region, which does not alter the reading frame of the t coding region when the IF α-2 fragment with blunt ends is oriented correctly. The correct orientation is selected by sequencing clones with 30 inserts across the ligation compound.

EKSEMPEL 5 35 Ekspression og sekretion fra A. nidulans transformeret med pGL2BIFN ATCC 53371Example 5 Expression and secretion from A. nidulans transformed with pGL2BIFN ATCC 53371

Plasmidet pGL2BIFN blev cotransformeret, dvs. med et plasmid indeholdende arg£J+-genet som beskrevet mere detaljeret i USA-patentansøgning nr. 678.578 af 5. december 1984, i en argS'-stamme af A. nidulans med et separat plasmid indeholdende en selekterbar argB-40 markør. arg8*-transformanter blev selekteret, hvoraf 18 ud af 20 indeholdt 1-100 kopier af det humant interferon α-2-kodende område (detekteret ved Southern-blotanalyse).The plasmid pGL2BIFN was cotransformed, i.e. with a plasmid containing the arg £ J + gene as described in more detail in U.S. Patent Application No. 678,578 of December 5, 1984, in an argS 'strain of A. nidulans with a separate plasmid containing a selectable argB-40 marker. arg8 * transformants were selected, of which 18 out of 20 contained 1-100 copies of the human interferon α-2 coding region (detected by Southern blot analysis).

I DK 175554 B1 II DK 175554 B1 I

I ____ _______16 _______________________________________ II ____ _______16 _______________________________________ I

I Flere transformanter blev dyrket pi stivelsesmedium for at inducere glucoamylase- ISeveral transformants were grown in starch medium to induce glucoamylase I

I promotoren, og det ekstracellulære medium blev analyseret for humant IF α-2 under IIn the promoter, and the extracellular medium was analyzed for human IF α-2 under I

I anvendelse af et CellTech IF α-2-assaykit. IUsing a CellTech IF α-2 assay kit. IN

I 5 Alle transformanter udviste nogen grad af syntese og sekretion af analyserbart protein. To IIn 5 All transformants exhibited some degree of synthesis and secretion of analyzable protein. To I

I kontroller, værtsstammen (ikke transformeret) og én argB+-transformant uden IIn controls, the host strain (not transformed) and one argB + transformant without I

I detekterbart humant IF α-2-DNA, udviste ingen detekterbar syntese af IF α-2-protein. I et IIn detectable human IF α-2 DNA, no detectable synthesis of IF α-2 protein showed. In one I

separat forsøg viste transformation af A niger og ikke A nidulans med pGL2BIFN under Iseparate experiment showed transformation of A niger and not A nidulans with pGL2BIFN during I

I anvendelse af mutatis mutandis samme procedure som beskrevet ovenfor, at A. niger var i IUsing mutatis mutandis the same procedure as described above that A. niger was in I

I 10 stand til at secernere IF α-2. IAble to secrete IF α-2. IN

I Selv om promotor- og signalområderne på pGL2BIFN. stammer fra A. niger, påvises de II Although the promoter and signaling regions of pGL2BIFN. descended from A. niger, they are detected I

således at være operative i bide A. nidulans og A. niger. Ithus being operative in biting A. nidulans and A. niger. IN

I 15 I den foreliggende opfindelse kan der anvendes andre promotorområder end IIn the present invention, promoter regions other than I can be used

I glucoamylase-promotorområdet. Egnede til anvendelse er promotorområderne for alkohol- IIn the glucoamylase promoter region. Suitable for use are the promoter regions for alcohol-I

I dehydrogenase I-genet og aldehyd-dehydrogenase-genet, vist i fig. 1A og IB. IIn the dehydrogenase I gene and the aldehyde dehydrogenase gene shown in FIG. 1A and 1B. IN

I 20 EKSEMPEL 6 IEXAMPLE 6 I

I Konstruktion af plasmidet pALCAlS, ATCC 53368, en mellemvektor (reference eksempel) IConstruction of the plasmid pALCA1S, ATCC 53368, an intermediate vector (reference example) I

I Til anvendelse i nærværende eksempel blev a/cA-promotoren anvendt, hvilken promotor IFor use in the present example, the a / cA promoter was used, which promoter I

25 var indeholdt i et 10,3 kb langt plasmid pDG6, der er deponeret hos ATCC i værten E. coli I25 was contained in a 10.3 kb plasmid pDG6 deposited with ATCC in the host E. coli I

I JM83 under deponeringsnummeret 53169. Et plasmidkort over pDG6 er vist i fig. 2 og for IIn JM83 under deposit number 53169. A plasmid map of pDG6 is shown in FIG. 2 and for I

I nemheds skyld i fig. 9, hvortil der henvises, til belysning af endnu en udførelsesform under IFor convenience, FIG. 9, to which reference is made to illustrating yet another embodiment of I

I anvendelse af a/cA-promotoren. IUsing the a / cA promoter. IN

30 pDG6 omfatter i sit W/ndlll-fcoRI-segment (første forekomst) promotorområdet 22 af I30 pDG6 in its W / ndlll-fcoRI (first occurrence) comprises promoter region 22 of I

a/cA-genet samt en lille 5’ del af det a/cA-kodende område 3' af startkodonen, hvilken del Ithe a / cA gene and a small 5 'portion of the a / cA coding region 3' of the start codon, which portion I

I er ligeret til det endoglucanase-kodende område 30. pDG6 omfatter endvidere et multipelt II is ligated to the endoglucanase coding region 30. The pDG6 further comprises a multiple I

I kloningssted 62 nedstrøms for det C. f/m/’-endoglucanase-kodende område 20. IAt cloning site 62 downstream of the C. f / m / '- endoglucanase coding region 20. I

I 35 For at genvinde a/cA-promotorområdet 22 blev pDG6 skåret med "Pstl og "Xhol, hvilket IIn order to recover the α / cA promoter region 22, pDG6 was cut with "Pst I and" XhoI, which I

I fjernede det meste af det endoglucanase-kodende område 30.1 et andet trin blev det IIn most of the endoglucanase coding region 30.1, a second step was removed

I lineariserede plasmid 64 tilbageskåret i én retning på kontrolleret måde med exonuklease IIn linearized plasmid 64, cut in one direction in a controlled manner with exonuclease I

I III (som vil tilbageskære fra Xhol, men ikke Pstt-spaltede DNA-ender), efterfulgt af II III (which will cut back from Xhol but not Pstt cleaved DNA ends), followed by I

I beskæring med nukleasen SI. Tilbageskæringen blev tilrettelagt således, at enzymet IIn pruning with the nuclease SI. The cut back was arranged so that the enzyme I

I 40 fjernede nukleotider indtil en stilling 50 baser 5' i forhold til alcA ATG-kodonen, hvilket IIn 40, nucleotides removed to a position 50 bases 5 'relative to the alcA ATG codon, which I

I efterlader TATA-kassen og messenger-RNA-startstedet intakt. IYou leave the TATA box and messenger RNA start site intact. IN

I Efter tilbageskæring blev vektoren 66 religeret (recirkulariseret), hvilket gav vektoren 68, IAfter cutting back, vector 66 was religated (recirculated) to give vector 68, I

der bærer Sa/I-Xbal-restriktionssteder umiddelbart nedstrøms for promotorområdet 22. Icarrying Sa / I-XbaI restriction sites immediately downstream of promoter region 22. I

17 DK 175554 B117 DK 175554 B1

Spaltning af vektoren 68 med Safl/Xbal gør det muligt at indføre et signalpeptid-kodende område på et passende sted i vektoren.Cleavage of the vector 68 by Saf1 / Xba1 allows insertion of a signal peptide-coding region at a suitable location in the vector.

Det bestemte signalpeptid-kodende område, der anvendes i nærværende eksempel, blev 5 syntetiseret til gendannelse af et karakteristisk signalpeptid-kodende område, der er identificeret i henhold til standardprocedurer som beskrevet af G. Von Heijne i fur. J.The particular signal peptide coding region used in the present example was synthesized to recover a characteristic signal peptide coding region identified by standard procedures as described by G. Von Heijne in Fur. J.

Biochem., 1983, s. 17-21. Det syntetiske signal blev manipuleret til at give en 5‘ flankerende sekvens komplementær med et Sa/I-spaltningssted og en 3* flankerende sekvens, hvilket muliggjorde ligation med Xbal-restriktionssekvensen.Biochem., 1983, pp. 17-21. The synthetic signal was manipulated to give a 5 'flanking sequence complementary to a Sa / I cleavage site and a 3 * flanking sequence, allowing ligation with the XbaI restriction sequence.

1010

Sekvensen af det syntetiske sekretionssignal 68 er vist nedenfor:The sequence of the synthetic secretion signal 68 is shown below:

Sal I jWill I j

TCGACATGTACCGGTTCCTCGCCGTCATCTCGGCCTTCCTCGCCACTGCCTTCGCCAAGTCGACATGTACCGGTTCCTCGCCGTCATCTCGGCCTTCCTCGCCACTGCCTTCGCCAAG

1---------+---------+·---i-----+---------+---------+---------+ 59 GTACATGGCCAAGGAGCGGCAGTAGAGCCGGAAGGAGCGGTGACGGAAGCGGTTC Me tTy r Ar gPh eLe uAl a Va 1 II eSe r Al aPh eLe uAl alti r Al aPh eAl aLy s1 --------- + --------- + · --- in ----- + --------- + -------- - + --------- + 59 GTACATGGCCAAGGAGCGGCAGTAGAGCCGGAAGGAGCGGTGACGGAAGCGGTTC Me tTy r Ar gPh eLe uAl a Va 1 II eSe r Al aPh eLe uAl alti r Al aPh eAl aLy s

Xba I TXba I T

oO------64oO ------ 64

AGATCAGATC

SerArgSerArg

Sekretionssignalet i sig selv begynder med Met og ender med den fjerde forekomst af Ala, hvilket er vist med pilen.The secretion signal itself begins with Met and ends with the fourth occurrence of Ala, which is shown by the arrow.

30 Efter frembringelse klones den syntetiske sekvens 68, der fungerer som signal, i Sa/I-Xbal-stedet på vektoren 70, hvilket giver plasmidet pALCAlS, som indeholder a/cA-promotorområdet 22 og det syntetiske peptidsignal-kodende område 68. Det forhold, at det signalpeptid-kodende område er indsat opstrøms for det multiple kloningssted 62, er signifikant, idet stedet 62 muliggør kloning af en række protein-kodende segmenter i dette 35 plasmid.Upon generation, the synthetic sequence 68, which acts as a signal, is cloned into the Sa / I-XbaI site of the vector 70 to give the plasmid pALCA1S which contains the a / cA promoter region 22 and the synthetic peptide signal coding region 68. that the signal peptide coding region inserted upstream of the multiple cloning site 62 is significant, the site 62 enabling cloning of a variety of protein-coding segments into this plasmid.

pALCAlS udgør således en værdifuld udførelsesform for den foreliggende opfindelse. 1 EKSEMPEL 7Thus, pALCAlS is a valuable embodiment of the present invention. EXAMPLE 7

Konstruktion af plasmidet pALCAlSIFNConstruction of the plasmid pALCA1SIFN

I DK 175554 B1 II DK 175554 B1 I

I _________________ ________________18__. ____ _____________________________ II _________________ ________________18__. ____ _____________________________ I

I Som et eksempel på anvendeligheden af pALCAlS henvises der til fig. 10, der viser IAs an example of the utility of pALCA1S, reference is made to FIG. 10, showing I

I fremstilling af pALCAlSIFN. Dette plasmid omfatter promotorområdet 22 for a/cA-genet og IIn the preparation of pALCAlSIFN. This plasmid comprises the promoter region 22 of the α / cA gene and I

I det syntetiske signalpeptid-kodende område 68, som begge stammer fra pALCAlS (fig. 9). IIn the synthetic signal peptide-coding region 68, both derived from pALCA1S (Fig. 9). IN

Desuden indeholder det det kodende område 60, der koder for humant interferon α-2 IIn addition, it contains the coding region 60 encoding human interferon α-2 I

I 5 stammende fra pGL2BIFN. IIn 5 derived from pGL2BIFN. IN

I Til opnåelse af det protein-kodende segment spaltes pGL2BIFN med EcoRI og spaltes ITo obtain the protein-coding segment, pGL2BIFN is digested with Eco RI and digested I

I delvist med BglU (på grund af tilstedeværelsen af indre Bg/11-sted er). Indsætning af det IIn part with BglU (due to the presence of internal Bg / 11 site is). Inserting it I

I protein-kodende område udføres ved spaltning af pALCAlS med BamHl og EcoRI, der IIn protein-coding region, pALCA1S is digested with BamH1 and EcoRI, which I

10 begge er tilgængelige i det multiple kloningssted 62, samt ligation af dette kodende I10 are both available in the multiple cloning site 62, as well as ligation of this coding I

I område deri, hvilket giver pALCAlSIFN. IIn area therein, giving pALCAlSIFN. IN

I Nukleotidsekvensen af det resulterende plasmid fra et sted 1170 nukleotider nedstrøms for IIn the nucleotide sequence of the resulting plasmid from a site 1170 nucleotides downstream of I

I Hindlll til EcoRI er vist i .fig. 11, idet de relevante steder for restriktionsendonuklease- IIn HindIII to EcoRI is shown in FIG. 11, with the relevant sites for restriction endonuclease I

I 15 spaltning er vist. Det fremgår af ark 3 af fig. 11, at det IP α-2-kodende område 60 er i IIn cleavage is shown. It can be seen from sheet 3 of FIG. 11, that the IP α-2 coding region 60 is in I

I korrekt læseramme med det syntetiske signalpeptid-kodende område 68. IIn correct reading frame with the synthetic signal peptide coding region 68. I

I EKSEMPEL 8 IEXAMPLE 8 I

I 20 II 20 I

I Ekspression og sekretion fra A. nidulans transformeret med plasmidet pALCAlSIFN IIn Expression and secretion from A. nidulans transformed with the plasmid pALCA1SIFN I

I Plasmidet pALCAlSIFN, der var fremstillet som beskrevet ovenfor, blev cotransformeret IIn the plasmid pALCA1SIFN prepared as described above, cotransformed I

I med A. nidulans for at tilvejebringe en selekterbar argB-markør, arg5+-transformanterne II with A. nidulans to provide a selectable argB marker, the arg5 + transformants I

I 25 blev selekteret og undersøgt for tilstedeværelsen af det humant interferon α-2-kodende II 25 was selected and examined for the presence of the human interferon α-2 coding I

I område, hvorefter de blev dyrket på et threoninholdigt medium for at inducere alcA- IIn area after which they were grown on a threonine-containing medium to induce alcA-1

I promotoren på samme måde som beskrevet i eksempel 3. Det ekstraceilulære medium IIn the promoter in the same manner as described in Example 3. The extracellular medium I

I blev analyseret for humant IF-2 under anvendelse af et CellTech IF α-2-assaykit. 11 ud af II was assayed for human IF-2 using a CellTech IF α-2 assay kit. 11 out of 1

I 20 transformanter udviste sekretion af interferon induceret i nærværelse af threonin og IIn 20 transformants, secretion of interferon induced in the presence of threonine and I showed

I 30 deaktiveret i nærværelse af glucose. IIn 30 disabled in the presence of glucose. IN

I EKSEMPEL 9 IEXAMPLE 9 I

I 35 pGL2CENDO - ATCC 53372 II 35 pGL2CENDO - ATCC 53372 I

I I overensstemmelse med de i de foregående eksempler beskrevne fremgangsmåder blev IIn accordance with the methods described in the foregoing examples, I

I der konstrueret et vektorplasmid med betegnelsen pGL2CENDO ud fra plasmidet pGL2C IIn there, a vector plasmid designated pGL2CENDO was constructed from the plasmid pGL2C I

I ATCC 53367 på analog måde med pGL2BIFN vist i fig. 7, men indeholdende det IIn ATCC 53367, analogously to pGL2BIFN shown in FIG. 7, but containing it

I 40 endoglucanase-kodende område i stedet for det interferon α-2-kodende område og under IIn 40 endoglucanase coding region instead of the interferon α-2 coding region and below I

I anvendelse af den syntetiske linkersekvens "C” (fig. 5) i stedet for linkersekvensen "B". Et IUsing the synthetic linker sequence "C" (Fig. 5) instead of the linker sequence "B".

I BamHI-fragment indeholdende det C. fimi endoglucanase-kodende område 30 blev indsat i IIn Bam HI fragment containing the C. fimi endoglucanase coding region 30 was inserted into

I Bg/II-stedet på pGL2C. A. nidulans-transformanter blev fremstillet med dette IIn the Bg / II site of pGL2C. A. nidulans transformants were prepared with this I

I vektorplasmid og udviste stivelsesreguleret sekretion af cellulase, analyseret som IIn vector plasmid and showed starch-regulated secretion of cellulase, analyzed as I

19 DK 175554 B1 beskrevet i eksempel 1. Kortet over vektorplasmidet pGL2CEND0 er vist i fig. 12 på tegningen, hvor 30 betegner det endoglucanase-kodende område (det endoglucanase-kodende område fra Cellulomonas fimi, beskrevet i forbindelse med fig. 2 og eksempel 1), 42 betegner det signalpeptid-kodende område af glucoamylase-genet, og 40 betegner 5 promotorområdet fra glucoamylase-genet. Nukleotidsekvensen er vist i fig. 13 og eksemplificerer, at anvendelse af linkersekvensen C (fig. 5) bevarer læserammen for det signalpeptid-kodende område 42 og det endoglucanase-kodende område 30.19 DK 175554 B1 described in Example 1. The map of the vector plasmid pGL2CEND0 is shown in FIG. 12 in the drawing, where 30 denotes the endoglucanase coding region (the endoglucanase coding region of Cellulomonas fimi, described in connection with Fig. 2 and Example 1), 42 denotes the signal peptide coding region of the glucoamylase gene, and 40 denotes 5 the promoter region of the glucoamylase gene. The nucleotide sequence is shown in FIG. 13 and exemplifies that the use of linker sequence C (Fig. 5) preserves the reading frame for the signal peptide coding region 42 and endoglucanase coding region 30.

10 EKSEMPEL 10EXAMPLE 10

Konstruktion af plasmidet pALCAlSENDO ATCC 53370 ( I overensstemmelse med de i de foregående eksempler beskrevne fremgangsmåder blev 15 der konstrueret et vektorplasmid betegnet pALCAlSENDO ved at kombinere det med EcoRI lineariserede plasmid pALCAlS som beskrevet i eksempel 5 (fig. 9) med et EcoRI-fragment fra plasmidet pDG5B (se fig. 2) (pDG5 med den omvendte orientering af Hindlll-fragmentet i pUC12) og indeholdende det endoglucanase-kodende område 30. Kortet over pALCAlSENDO er vist i fig. 14, og nukleotidsekvensen af dets relevante område er vist i 20 fig. 15. I disse figurer har promotorområdet stammende fra alcA henvisningsbetegnelsen 22, det syntetiske signalpeptid-kodende område har henvisningsbetegnelsen 68, og det endoglucanase-kodende område har henvisningsbetegnelsen 30.Construction of the plasmid pALCA1SENDO ATCC 53370 (In accordance with the methods described in the preceding examples, a vector plasmid named pALCA1SENDO was constructed by combining the EcoRI linearized plasmid pALCA1S as described in Example 5 (Fig. 9) with an EcoRI fragment from the plasmid pDG5B (see Fig. 2) (pDG5 with the reverse orientation of the HindIII fragment in pUC12) and containing the endoglucanase coding region 30. The pALCA1SENDO map is shown in Fig. 14 and the nucleotide sequence of its relevant region is shown in Figs. Figure 15. In these figures, the promoter region originates from alcA reference numeral 22, the synthetic signal peptide coding region has reference numeral 68, and the endoglucanase coding region has reference numeral 30.

25 EKSEMPEL 11EXAMPLE 11

Ekspression og sekretion fra A. nidulans transformeret med pALCAlSENDO og pGL2CENDOExpression and secretion of A. nidulans transformed with pALCAlSENDO and pGL2CENDO

A. nidulans blev cotransformeret med en selekterbar argB*-markør og plasmidet 30 pALCAlSENDO eller pGL2CENDO, der var fremstillet som beskrevet ovenfor. Af de vundne cotransformanter udviste flere varierende niveauer af cellulase-sekretion (dvs. endoglucanase), hvilket blev bedømt på carboxymethylcelluloseplader og de monoklonale antistof-testsystemer som beskrevet i eksempel 1. Begge plasmidtransformanter udviste sekretion, som blev reguleret af den bundne promotor. Pfasmidet pGL2CENDO blev 35 induceret med stivelse, og pALCAlSENDO blev induceret med threonih.A. nidulans was cotransformed with a selectable argB * marker and the plasmid 30 pALCA1SENDO or pGL2CENDO prepared as described above. Of the obtained cotransformants, several varying levels of cellulase secretion (i.e., endoglucanase) exhibited, which were assessed on carboxymethyl cellulose plates and the monoclonal antibody assay systems described in Example 1. Both plasmid transformants exhibited secretion regulated by the bound promoter. The plasmid pGL2CENDO was induced with starch and pALCA1SENDO was induced with threonih.

EKSEMPEL 12EXAMPLE 12

40 Ekspression og sekretion fra A. niger transformeret med pGL2CENDO40 Expression and secretion from A. niger transformed with pGL2CENDO

A. niger blev cotransformeret med en selekterbar argB*-markør og plasmidet pGL2CENDO.A. niger was cotransformed with a selectable argB * marker and the plasmid pGL2CENDO.

Flere af transformanterne udviste varierende niveauer af endoglucanase-sekretion, hvilketSeveral of the transformants showed varying levels of endoglucanase secretion, which

I DK 175554 B1 II DK 175554 B1 I

I ________________________ 20. ________________________ II ________________________ 20. ________________________ I

I blev bedømt som beskrevet i eksempel 1. Denne sekretion blev induceret af II was judged as described in Example 1. This secretion was induced by I

I tilstedeværelsen af stivelse i mediet. IIn the presence of starch in the medium. IN

I 5 EKSEMPEL 13 IEXAMPLE 13 I

I Forøget kopital af regulerende gener IIncreased copy number of regulatory genes

I I Aspergillus niduians aktiveres a/cA-promotoren i nærværelse af den hensigtsmæssige IIn I Aspergillus niduians, the a / cA promoter is activated in the presence of the appropriate I

I 10 inducer såsom ethanol under indvirkning af genproduktet fra alcR, det positive regulerende IIn 10 induces such as ethanol under the action of the gene product of alcR, the positive regulatory I

I gen for alcA. IIn gene for alcA. IN

Forsøg med flerkopi-transformanter (indeholdende flere a/cA-promotorer) antyder, at alcR- IMulticopy transformants (containing multiple α / cA promoters) suggest that alcR-I

I genproduktet begrænser promotorfunktionen af de forskellige a/cA-promotorer, der kræver IIn the gene product, the promoter function limits the various a / cA promoters that require I

15 stimulering. I15 stimulation. IN

I Forøgelse af kopitallet for alcR-genet forøger ekspressionen af alcR og afhjælper denne IIncreasing the copy number of the alcR gene increases the expression of alcR and alleviates this

I situation. Beviset herpå er som følger: IIn situation. The proof of this is as follows:

I 20 Transformanter med flere kopier af a/cA-promotoren fusioneret til sit eget kodende område IIn 20 Transformers with multiple copies of the a / cA promoter fused to their own coding region I

I (ADH I) på en flerkopi-a/cfl-baggrund (hvilket har vist sig at overproducere alcR- II (ADH I) on a multi-copy a / cfl background (which has been shown to overproduce alcR-I

I messenger-RNA) vokser ikke godt på ethanol. Dette skyldes formodentlig den hurtige IIn messenger RNA) does not grow well on ethanol. This is probably due to the rapid I

I akkumulering af aldehyder, produktet fra ADH-nedbrydning af ethanol. ADH-aktivitet i IIn the accumulation of aldehydes, the product of ADH degradation of ethanol. ADH activity in I

I disse stammer er høj. Den forøgede ADH-aktivitet på grund af forøget kopital er formentlig IIn these tribes is high. The increased ADH activity due to increased copy capital is probably I

I 25 grunden til disse iagttagelser. IIn the reason for these observations. IN

I Transformanter med flere kopier af a/cA-promotoren fusioneret til interferon a-2 på en IIn Multiple Copy Transformants of the a / cA Promoter Fused to Interferon α-2 on an I

I flerkopi-a/cR-baggrund giver signifikant højere niveauer af secerneret interferon. I disse IIn multi-copy a / cR background, significantly higher levels of secreted interferon. In these I

I stammer har mange flere af a/cA-promotorerne, til forskel fra dem med enkelt-kopi alcR, IIn strains, many more of the a / cA promoters, unlike those with single-copy alcR, I

I 30 adgang til det a/cR-regulerende protein. IIn 30 access to the α / cR regulatory protein. IN

I Foretrukne udførelsesformer for den foreliggende opfindelse giver således midler til IThus, in preferred embodiments of the present invention, means for I

I indføring af et kodende område i en filamentøs fungusvært, som, når den transformeres, IIn introducing a coding region into a filamentous fungus host which, when transformed, I

vil secernere det ønskede protein. Særlig nyttige meliemplasmider til dette formål er Iwill secrete the desired protein. Particularly useful melem plasmids for this purpose are I

I 35 pALCAlS og pGL2 (A, B eller C). IIn 35 pALCA1S and pGL2 (A, B or C). IN

I Nyttige transformationsvektorer, der er dannet ud fra disse plasmider, omfatter IUseful transformation vectors formed from these plasmids include:

pALCAlSIFN, pGL2BIFN, pALCAlSENDO og pGL2CENDO. Kulturer af disse og andre, heri 1pALCAlSIFN, pGL2BIFN, pALCAlSENDO and pGL2CENDO. Cultures of these and others, herein 1

I nævnte plasmider holdes for tiden i en permanent levedygtig tilstand i laboratorierne hos IThe said plasmids are currently kept in a permanently viable state in the laboratories of I

40 Allelix Inc., 6850 Goreway Drive, Mississauga, Ontario, Canada. Plasmiderne vil blive holdt I40 Allelix Inc., 6850 Goreway Drive, Mississauga, Ontario, Canada. The plasmids will be maintained

I i denne tilstand under hele behandlingsperioden af nærværende patentansøgning og vil i IIn this state during the entire processing period of the present patent application and will in

I denne periode være tilgængelige for eksperter. Efter udstedelse af patent på nærværende IDuring this period be available to experts. After issuing a patent on the present I

I ansøgning vil disse plasmider uden begrænsninger være tilgængelige fra ATCC- IIn application, these plasmids will be available without restriction from ATCC-I

5 DK 175554 B1 21 deponeringsmyndigheden, anerkendt under Budapest-traktaten. De forskellige deponeringers deponeringsnumre fremgår af nedenstående tabel:5 DK 175554 B1 21 deposit authority, recognized under the Budapest Treaty. The deposit numbers of the various landfills are shown in the table below:

Plasmid Vært Deponerings # Deponeringsdato pDG6 E. coli JM83 53169 7. juni 1985 pGL2A " 53365 16. december 1985 10 pGL2B " 53366 16. december 1985 pGL2C " 53367 16. december 1985 pALCAlS " 53368 16. december 1985 pALCAlSENDO " 53370 16. december 1985 pALCAlSIFN “ 53369 16. december 1985 15 pGL2BIFN " 53371 16. december 1985 PGL2CENDO " 53372 16. december 1985 pALCAlAMY " 53380 20. december 1985Plasmid Host Deposit # Date of deposit pDG6 E. coli JM83 53169 June 7, 1985 pGL2A "53365 December 16, 1985 10 pGL2B" 53366 December 16, 1985 pGL2C "53367 December 16, 1985 pALCAlS" 53368 December 16, 1985 pALCAlSENDO "53370 December 16 1985 pALCAlSIFN "53369 December 16, 1985 15 pGL2BIFN" 53371 December 16, 1985 PGL2CENDO "53372 December 16, 1985 pALCAlAMY" 53380 December 20, 1985

Claims (4)

1. Fremgangsmåde til fremstilling af et polypeptid i en filamentøs fungusværtscelle, I I hvilken fremgangsmåde omfatter I I 5 I I (a) dyrkning af en værtscelle i et kulturmedium, der omfatter stivelse; I I (b) hvor værtscellen indeholder én eller flere kopier af en DNA-konstruktion; I I (c) hvor DNA-konstruktionen omfatter: I 10 (i) et reguleret DNA-promotorområde stammende fra glycoamylase-genet fra I I Aspergillus niger, hvilket promotorområde indeholder en DNA-sekvens, der er aktiv I I i regulering af gentranskriptionen, hvor DNA-sekvensen gør genet positivt I I induceret med stivelse; og I I (ii) et DNA, der koder for et polypeptid i operativ forbindelse med promotoren, hvor I I 15 DNA'et koder for et polypeptid, som er fremmed for promotoren; I I (d) hvor værtscellen dyrkes under betingelser, under hvilke tilstedeværelsen af stivelse I inducerer den transkriptionsfremmende funktion af promotoren; og eventuelt I I (e) genvinding af polypeptidet fra mediet. I I 20 IA method for producing a polypeptide in a filamentous fungus host cell, wherein said method comprises culturing a host cell in a culture medium comprising starch; In I (b), where the host cell contains one or more copies of a DNA construct; II (c) wherein the DNA construct comprises: In I (i) a regulated DNA promoter region derived from the glycoamylase gene of II Aspergillus niger, which promoter region contains a DNA sequence that is active II in regulating gene transcription, wherein the sequence makes the gene positive II induced by starch; and II (ii) a DNA encoding a polypeptide operatively in association with the promoter, wherein the DNA encodes a polypeptide foreign to the promoter; In I (d), where the host cell is grown under conditions under which the presence of starch I induces the transcription-promoting function of the promoter; and optionally recovering the polypeptide from the medium. I I 20 I 2. Fremgangsmåde ifølge krav 1, hvor værtscellen er Aspergillus nidulans. IThe method of claim 1, wherein the host cell is Aspergillus nidulans. IN 3. Fremgangsmåde ifølge krav 1, hvor værtscellen er Aspergillus niger. I I 25The method of claim 1, wherein the host cell is Aspergillus niger. I I 25 4. Anvendelse af en DNA-konstruktion som defineret i et hvilken som helst af de I I foregående krav til transformation af en filamentøs fungusværtscelle og ekspression af et I I protein under betingelser, hvor værtscellen dyrkes under betingelser, under hvilke I I tilstedeværelsen af stivelse inducerer den transkriptionsfremmende funktion af I I promotoren, som er indeholdt i DNA-konstruktionen. I I 30 IUse of a DNA construct as defined in any of the preceding two claims for transformation of a filamentous fungal host cell and expression of an II protein under conditions wherein the host cell is cultured under conditions under which the presence of starch induces the transcriptional promoter. function of the II promoter contained in the DNA construct. I I 30 I
DK200200461A 1985-04-15 2002-03-27 DNA construct for use in filamentous fungi - comprising promoter operative in filamentous fungi to promote transcription of coding region DK175554B1 (en)

Priority Applications (1)

Application Number Priority Date Filing Date Title
DK200200461A DK175554B1 (en) 1985-04-15 2002-03-27 DNA construct for use in filamentous fungi - comprising promoter operative in filamentous fungi to promote transcription of coding region

Applications Claiming Priority (8)

Application Number Priority Date Filing Date Title
CA479135 1985-04-15
US81140485 1985-12-20
CA479135 1985-12-20
US06/811,404 US5198345A (en) 1985-04-15 1985-12-20 Vectors in use in filamentous fungi
DK591686A DK176017B1 (en) 1985-04-15 1986-12-09 DNA construct for use in filamentous fungi - comprising promoter operative in filamentous fungi to promote transcription of coding region
DK591686 1986-12-09
DK200200461A DK175554B1 (en) 1985-04-15 2002-03-27 DNA construct for use in filamentous fungi - comprising promoter operative in filamentous fungi to promote transcription of coding region
DK200200461 2002-03-27

Publications (2)

Publication Number Publication Date
DK200200461A DK200200461A (en) 2002-03-27
DK175554B1 true DK175554B1 (en) 2004-12-06

Family

ID=27167509

Family Applications (1)

Application Number Title Priority Date Filing Date
DK200200461A DK175554B1 (en) 1985-04-15 2002-03-27 DNA construct for use in filamentous fungi - comprising promoter operative in filamentous fungi to promote transcription of coding region

Country Status (1)

Country Link
DK (1) DK175554B1 (en)

Also Published As

Publication number Publication date
DK200200461A (en) 2002-03-27

Similar Documents

Publication Publication Date Title
JP2868179B2 (en) Method for producing protein using filamentous fungal promoter
CA1341608C (en) Promoters of filamentous fungi and use thereof
NO840200L (en) GLUCOAMYLASE CDNA.
JP3122642B2 (en) Insect resistant plants
US7060465B2 (en) Modified chitin binding domain and uses thereof
Kumagai et al. Expression and secretion of rice α-amylase by Saccharomyces cerevisiae
JPH06104065B2 (en) Production of promoters for expression of foreign genes in yeast, plasmids comprising them, and polypeptides
JPH07500970A (en) Method for producing plants with reduced susceptibility to plant parasitic nematodes
EA018840B1 (en) A recombinant host cell for the production of a compound of interest
JP3878207B2 (en) Expression plasmid controlled by osmB promoter
US5374540A (en) Chitinase-producing bacteria and plants
CN113106114A (en) Factor for regulating and controlling trichoderma reesei protein expression efficiency, regulating and controlling method and application
CA2151146C (en) Use of a dna sequence coding for an oxalic acid degrading protein as a selection gene
DK175554B1 (en) DNA construct for use in filamentous fungi - comprising promoter operative in filamentous fungi to promote transcription of coding region
DK176017B1 (en) DNA construct for use in filamentous fungi - comprising promoter operative in filamentous fungi to promote transcription of coding region
AU5304286A (en) Dna sequence useful for the production and secretion from yeast of peptides and proteins
JP2752092B2 (en) Expression plasmid having DEO promoter and bacterial host containing the plasmid
JPH09505989A (en) .ALPHA.-1,4-Glucan lyase from fungi, its purification, gene cloning and microbial expression
JPH08256770A (en) Protease derived from yeast belonging to the genus pichia
KR100278109B1 (en) Method for preparing human plasma albumin using transformed yeast Saccharomyces cerevisiae containing human plasma albumin expression vector
EP0833926A1 (en) Chondroitinase production in recombinant proteus vulgaris strains
NZ219435A (en) Production of glucoamylase by recombinant techniques

Legal Events

Date Code Title Description
PUP Patent expired